Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033065 | Pseudoalteromonas agarivorans strain Hao 2018 chromosome I, complete sequence | 1 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,RT,WYL,csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP033066 | Pseudoalteromonas agarivorans strain Hao 2018 chromosome II, complete sequence | 1 crisprs | csa3,cas3,DinG | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP033067 | Pseudoalteromonas agarivorans strain Hao 2018 plasmid unnamed, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033065_1 | 3054966-3055084 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP033065_1
|
1 spacers
spacers of CP033065_1
>1.1|3055008|35|CP033065|CRISPRCasFinder ATTCTGGCAACTGAACTAGTGCCGCTTTAAAGATT |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP033065_1
The CRISPR arrays of CP033065_1 >merge|CP033065|1|3054966-3055084|CRISPRCasFinder GTCAGTAATTTGTCCGTTGGTGCGCGACAGGTCGCGTCCTACATTCTGGCAACTGAACTAGTGCCGCTTTAAAGATTGTCAGTAATTTGTCCGTTAGTGCGCGACAGGTCGCGTCCTAC >CP033065|1|1|3054966-3055084|CRISPRCasFinder GTCAGTAATTTGTCCGTTGGTGCGCGACAGGTCGCGTCCTAC ATTCTGGCAACTGAACTAGTGCCGCTTTAAAGATT GTCAGTAATTTGTCCGTTAGTGCGCGACAGGTCGCGTCCTAC
>CP033065.1|AYM87682.1|3053875_3054304_+|YjbQ-family-protein MSWQQTQITLKPRARGFHLIDDEILAQLSELANYKVGLLHLFIQHTSASLTINENADPTVRMDMESHFNHFVPERQPYYRHDYEGDDDMPAHIKTSTLGCELSIPINNGRLALGTWQGIYLGEHRDAGGARRIIATLQGETF >CP033065.1|AYM87681.1|3053411_3053879_+|chemotaxis-protein-CheX MNVEFINPFLSSLINVLSTMAQTELKPGKPRIKTDEVACGDVSGLIGMVGAQTRGSFSITFDENLALTIMERMLGERPDNIDDEVTDMVGEITNMVTGGAKNLLGEKGYDFDMATPIVVAGKGHTITHKSKGKKIIMPFSCDAGDANIEVSFDKL >CP033065.1|AYM88239.1|3052904_3053339_+|transcriptional-repressor MNIESLVSKAKQVCDNRGARFTPIREKVFRLLASAQGGVGAYDLLEQLKVTETGAKPATIYRALDFLSELGFIHKIESTNAFMLCHHFDHIHPVQLLICDSCGFVKELHSTVISHELNNLAAESGFVVSGQTIEAHGKCESCRS >CP033065.1|AYM87680.1|3052189_3052810_-|MarC-family-protein MHELVAIFIFFFAVIDPIGTVPVFIAVTRGEDEKFKRKVVFKAVGVSAVVLLFFVIAGEQLLNAIEIPLSAFQIAGGIVLLIFALSMIFGESKPESEIKSVRDSTETAIFPLAIPSIASPGAMLGAVLMTRNEEYTWVEQVTTSSMMLVVLVVVLVLLLLANHVHKLIGDSGASIISRIMGLILSSVAVTNILNGIAHYFGLQIYS >CP033065.1|AYM88238.1|3051317_3052091_-|DUF2884-family-protein MAVFSRSMLVLCLALSSAAVLAQSQCDVELSHGLIITDDVIRILDKGQTRVQINNNNQLFIRGYWVDLSTEESKVLQQFSNGIRHTVPELVNLATDGVNLGLSAIEHVVEGMSEKEPEVLKTQLQYVERALMDKFKRGDDFFFIAPQSLSQIDDFFTKEISQQIHSAVHGSLGAILMSLGDAFKSREGNIEDRINDMGQRMDIISKEIDKSLQKKAQQLELKASEYCECLNALDVTESRLQAIVPGMADFDLVQIKS >CP033065.1|AYM87679.1|3050328_3051255_+|manganese-dependent-inorganic-pyrophosphatase MSMYVVGHKIPDSDSICGAIALAYLKNQIDEPAIPTRLGEVSPETQFILDKFGFEAPELKLSYAGEDVYIVDHTEKTQAPDDIDQARVVGVVDHHKLGDLTSSTPLECWIRPVGCSNTIIKMMYDFYNVEIPKDIAGIMLCAILSDTVIFKSPTCTTADIKCVEALAEIAGIEDFKELGMDMFRVKSAVEDTPVRDLVMRDFKDFNMNGHLVGIGQLEVIDLAVFDEIKADLEADIAKLKIEGNRHSVFLLLTDIMKEGSQMLIASDDANLVEQAYGEKPSEDKVWLDGVLSRKKQVVPPLQDVFAKL >CP033065.1|AYM87678.1|3049694_3050210_-|hypothetical-protein MRLGRKGWNNVIIFSMLIMIFFLNGWHKQFLGGEDEPTLQPVLPLQSFVLTLSFVDQKIERIGTSWRTTALKENTPVRWDASQQQLAELINHWQTAALMQVNESVVFNPNSPLYVATFELAGERLPWVYLLYKGNGKYYLLEKNSQRVMGLDLATAKQLFPSVDFSKSELH >CP033065.1|AYM87677.1|3048885_3049695_-|bifunctional-DNA-formamidopyrimidine-glycosylase/DNA-(apurinic-or-apyrimidinic-site)-lyase MPELPEVEVSRLGITPHVENQVVTKVNIYNASMRWPVPDDVYQLEGLRVERIERRAKYLLLHCELGSAILHLGMSGNLRVVDRREPLKKHDHVEFVLSNDKALRLNDPRRFGCCLWQAPGDVHKLLSKLGPEPLTDDFFAKRVYEQSRNKKVPVKQFIMDNAVVVGVGNIYANESLFKAGIHPKREAGKVSLKRYQTLIPIIKDTLAAAITQGGTTLKDFAQSDGKPGYFAQQLLVYGRKGEPCVTCKTPLEEIRLGQRSTVFCKHCQK >CP033065.1|AYM87676.1|3048379_3048880_+|DUF3299-domain-containing-protein MILFKSALYYCMLVSCLLISFVSSANPPKEIFWEDLIPQGHVQIDTQAQANHEGSEQNWVQPELDAPVVEALNGQSVSVPGFVVPLEGDSEVITEFLLVPYFGACIHVPPPPPNQIVHVTVKGGVPIESLYDAIVVTGVISTETWSGEIAQVGYKMKAVGVAPFEL >CP033065.1|AYM87675.1|3047061_3048366_+|ABC-transporter-permease MILTKLAYKSLLNRRASVLLTLFTIAISVMLLLSIERIRVDAKTSFSNTISGTDLIVGARTGDIQLLLSSVFRIGYANNGVSWQSYQYIAAQRGVKWSIPISLGDSHKGQAVLGTSRDYFTHYRFGKKQTLSFQQGHAFEHLNQVVLGSDVASRLGYTLGDNIVISHGMGNTSFHHHKDNPFTVIGILNATGTPVDKTLHIPLAAIDLIHGGSHSANNDDDEHDEHDEHDEHDEHDEHDEHDEHNNLIGEPSQITAFLMGFDSPLYTLQIRRNINQYKKEPLLAIMPTVTLKELWQMLAIVEKVLLLFSGVVILVSLLGMLTTLLANLNQRRRELAILRSVGARPWQLFTLISMESLFTTLLGCLVGCGLYYGVMLISSSYLQSHAGISVNIAMLSYYELTLIGVIMAAGFIIGLIPATRAYFYSLSDGMSIKT >CP033065.1|AYM87683.1|3055214_3055760_-|oligoribonuclease MTINESNLIWLDLEMTGLEPATDKILEIATVVTDADLNILAEGPTIAIHQSDELLDGMDEWCTTQHGKSGLTARCKASTYDEAYAVDQTLNFLKQWVPAGKSPMCGNSIGQDRRFMNKYMRELEDFFHYRNLDVSTIKELARRWKPEVLEQVNKKGSHLALDDIKDSIMELKVYREKFFNL >CP033065.1|AYM87684.1|3055885_3056944_+|small-ribosomal-subunit-biogenesis-GTPase-RsgA MAKQKKLSKGQSRRIKANHQKRLNNADTKLAKGGAQEWQTDNLGATENAVVISRFGQHADVETQEGDVLRCNIRRTVTNLVCGDKVLFRRAKVSEGDLAGVIEATQERRSQLTRPDFYDGVKVIAANIDQILMVSAVLPEFTPSIIDRYLIACEDMGIEPILVLNKIDLIDDEGLNEIQKVLDIYRGLGYQVLLVSSVTGEGIDDLKNVLVDKNNIFVGQSGVGKSTLVNTVLPDAEILTKEVSENSGLGQHTTTVSRLHHLPSGGNLIDSPGIREFGLWHLDVERVTWCFKEFREFIGGCRFRDCKHLNDPGCIIQQAVADGDISQLRFDSYHRILETMADGRAGARAPRV >CP033065.1|AYM88240.1|3056998_3057838_+|phosphatidylserine-decarboxylase MPKHFISRVVGKLAAAKAGALTTTLIKLFIKQYKVDMNEALYEDPAHYKTFNEFFTRPLKDGVRPMAQGENVITHPVDGAISQLGDIVDGQLIQAKGHDYSLQALLGGSEDDTTPFLGGKFATIYLAPKDYHRIHMPIDGTLSKMIYVPGDLFSVNPLTARNVPNLFARNERVVAIFETEIGPLAMVLVGATIVASIETVWAGTVTPPAGSDVFSWNYPTKGENAITLKKGEEMGRFKLGSTVVLAWGADKADILDVQLPETVTRLNTAFATIKESEEL >CP033065.1|AYM87685.1|3058107_3058857_-|HesA/MoeB/ThiF-family-protein MNKLSDKETLRYSRHLLLKEVGLEGQLALKAATVAVVGAGGLGSPALLYLAAAGIGTLIVIDDDAVELSNLQRQVLYKVNHLGQSKVAAAGKVLTSLNNQIEIVTHCKKLDDNNAGELLKNADIVLDCSDNFATRYSVNRYCFTHKLPLIAGAAIASRGQLMGFDFRQNNSPCYGCVFAKSDAAPAVNCSNAGVISPLLGIIGSMQAQLTLNMLLGHVEGSVFISFDALSLKQQHFKMIKDINCKECGE >CP033065.1|AYM87686.1|3058849_3060376_-|thiamine-phosphate-synthase MNNLVWTIAGSDSGGGAGIQADIKAMQSFGVHGCTAITALTAQNSLGVEAINAVSTDIIESQLLALESDMKAKVIKIGMLANVQQIQLISEHIAHYKAKWPVPPVIVYDPVAIASSGDVLTEEDTVSAIKECLMPLVDVITPNTHETQLLTGVYLIGPSAVKDAAKKLLSWGAKAVVIKGGHWDYPTGYCIDYCTQNGEEYWLGNKKIQSPHSHGTGCSMASVIAACLAKDYPLKDAFILAKAYINQGLKQSVRYGEGIGPVAHTAFPTQLDDYPQVIEPGSWLGDELDFDVPLEFNMAADFAPCESKKLGLYAVVDSLDWLDKCLQQGITTAQLRVKNKTDLELEELIKQAVELGKKYHAHVFINDYWQLAIKHGAYGVHLGQEDLETANLAAIKEAGLRLGLSTHGFYEMLRAHNYRPSYMAFGAIYPTTTKDMSGQIQGLDKLKKCVPLMQSYPTVAIGGIDLTRASEVANTGVGSVAVVRAISEADDYIAAISALKSAINQPNE >CP033065.1|AYM87687.1|3060389_3061181_-|thiazole-synthase MQGNDCLTIYGEQLNSRLLIGSALYPSPAVMEESIKASGAQIVTVSLRRQQSAAAGDDFWQLIKNTGLKILPNTAGCHSVKEAVTLAKMCREVFATDWIKLELIGDDYNLQPDPFALLEATKILIDDGFKVLPYCTDDLVLCQRLNALGCEVLMPWGAPIGTGKGLLNSYNLKTIRERLPNTTLIVDAGLGLPSHACQALELGYDAVLLNSAIAGAGCPITMSRAFKVAVEAGRFAHNAKAMPEKDLAAPSTPTMGMPFWHQQ >CP033065.1|AYM87688.1|3061185_3061380_-|sulfur-carrier-protein-ThiS MTITINGELLTIKSAVLVDVLQNFGAKPPFAVALNGEFIPQSLHASTTINEGDSIELLSPIQGG >CP033065.1|AYM88241.1|3061387_3062389_-|FAD-dependent-oxidoreductase MFYNIAVVGFGLAGRLAALELSKSHHVTVFEASDEHTQNSAGKVAAAMLAPLAESVLCETDLAIMGLNSLKRWPEIVSELEGEVFYQQKGTLVVAHQQDKGDLQSFSQRIKPIAGHSAQALNAQQITQLEPELANRFNQGVFLPCEGQIDNQAFYKASFTMLNKRKVKFVFNQRVSIQNGEVNNRGFDYIIDCRGLGAKGDKPLRGVRGEVARLHAPEVNLTRPVRLMHPRYPIYIAPKPNNEYVIGATEIESDDSGPATVRSTLELLSAAYTVHSGFAEARLLNIQSGLRPAFSDNRPAVLKTGNVISINGLYRHGYMLGPALVANALSQIG >CP033065.1|AYM87689.1|3062444_3064397_-|phosphomethylpyrimidine-synthase-ThiC MSNTTNKSTRRETRAAASDYIYNLTGQPFPSSQKVYVEGSQSGVRVGMREITLSDTFIGGDEQNPVYEPNDPLRVYDTSGPYTDPNFELDVRKGLPKFREQWIKERNDTEVLDSVTSQFAQQRMADDGLDHIRFDHLPKIRRGKAGKNVTQMHYARQGIITPEMEYVAIRENMGRAQIREELLAAQHKGESFGASIPDFITPEFVRDEIARGRAILPNNINHPETEPMIVGRNFLVKVNANIGNSSVSSSIEEEVEKMVWSTRWGADTVMDLSTGRYIHETREWVVRNSPVPIGTVPIYQALEKVNGVAEDLTWEIFRDTLIEQAEQGVDYFTIHAGVLLRYVPMTAKRVTGIVSRGGSIMAKWCLAHHKENFLYTHFEDICEILKQYDVCFSLGDGLRPGSIADANDEAQFSELRTLGDLTKIAWKHDVQVFIEGPGHVPMHMIKANMDEQLEHCGEAPFYTLGPLTTDIAPGYDHITSGIGAAQIAWYGCAMLCYVTPKEHLGLPNKEDVKEGLITYKIAAHAADLAKGHPGAQERDNALSKARFEFRWHDQFNIGLDPERAREYHDETLPQESGKVAHFCSMCGPKFCSMKITQEVRDYAKDLESRGIDPNNVGDAIEIKMVDVEAQMKAKSEEFKQTGSEIYHKAI >CP033065.1|AYM87690.1|3064741_3065119_-|META-domain-containing-protein MLLIGLCIGCTATGTVTTEQLKYTQWQLSKVDGLAVPASYSASMSFIEALQVNGFAGCNKFFGEGELKDSSISVNKLGMTRKSCGADVDELEQQFLQALREGATLTMQGSQLVMQGDQTFLFIAK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
2722198 : 2730474
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP033065|2722198:2730474|DBSCAN-SWA CTTAAAGGTCAGACTCAGCGCCTAATACGTCTTCGCCATCTTCTGGCTCAACCGTTGCTTTTAATAGCAACATATCACGTAACTTACCTTCAATTTCATCTGCAATTTCTACGTTTTCTTTCAAAAACTTAATAGAGTTTGATTTACCTTGGCCTACTTTATTGCCGTTGTAGCTGTACCAAGCACCTGCTTTTTCAACAATTTTGTGCTTAACACCTAAATCAATTAACTCACCTTGTTTAGAAATACCTTCACCATACATAATGATGAATTCAGCTTGTTTAAACGGTGGTGCAACTTTGTTTTTAACTACTTTAACGCGGGTTTCGTTACCTACTACCTCATCGCCTTCTTTAACAGAGCCAATACGACGAATATCAATACGCACTGATGCGTAAAACTTAAGTGCATTACCACCTGTTGTTGTTTCAGGGTTACCAAACATTACACCAATTTTCATACGAATTTGGTTAATGAAAATACATAGCGTATTTGAGCGTTTAATATTACCTGTAAGTTTACGTAGTGCTTGCGACATTAAACGTGCTTGTAAGCCCATGTGCGAGTCGCCCATGTCGCCTTCAATTTCAGCTTTTGGTGTAAGCGCAGCAACAGAATCGACAATAACAACATCTACAGCACTTGAACGTACTAACATGTCACAAATTTCTAGTGCTTGCTCACCGGTATCTGGCTGAGAAACTAACAGCTCATCAATGTTAACACCTAACTTTTGTGCGTATACCGGATCAAGAGCATGCTCAGCATCAACAAAGGCACATGTTTTGCCTTCTTTTTGAGCCTGCGCGATAACTTGCAAAGTAAGCGTTGTTTTACCTGAAGACTCAGGGCCATACACTTCAACAATACGCCCCATAGGCAAACCGCCTATGCCTAAAGCAATATCAATCCCAAGTGAGCCTGTAGATACAGCATCAATGTTTAGGGCTTTGTTATCGCCCAGTTTCATAATTGATCCTTTACCAAATTGACGCTCAATTTGTGATAGTGCAGCGTCCAGCGCTTTTTGTTTATTATCGTTCATTCTGTTCTCCAAATCCGGCTAATGCGAACAAGTATACTGTATGAAATTACAGTATCAAGTGAAATTTATAATTTTATCTTCTCGATAGTGCTTTTCAATGCAAATTCAATAGCTTGCATTCTAACTTGTGCTCTATCGCCGTTAAATATTTGCTTAAACGTAAATTGTTCATTGGCAATTTGTATGCAAAACCACACAAAGCCAACTGGTTTGTCGGACGTAGCACCACCTGGCCCTGCAATGCCTGAAATTGCCACTGCAATATCAGCTTTGGCAACGCTTGCGGCACCAAAAGCCATCTCTTTTACTGTTTGCTCACTCACCGCACCAAATTGCTCTAGCGTAGTATTGGCCACATTAAGCAGTTCATGCTTAGCTTCATTACTATAAGTAACAAATGCGCGGCCCAAATAACCTGAGCTACCTGGCGTATCTGTAAGCGCATAACTCACCCCGCCACCAGTACATGATTCAGCGGTAGTGATCCATAAGCGTTTATCCGTTAAAATAACGCCCAATTGCGCAGCAAGTGTTTTAATCTCTTGATGTAATTCCATATTCAGCCTTTGGGTAAATACATGTCGTTTGATCTTTATGCACCGCACACTATAAAACAACAAACCCCTATGATGCAGCAGTATCTAAAAATAAAATCAGAGCATCGCGATATTTTATTGTTTTATCGTATGGGGGATTTTTATGAACTCTTTTTTGACGACGCTAAACGCGCGGCCCAACTACTCGATATTTCGCAAACGCATCGCGGTAAAGCCGGCGGCGATCCTATTCCTATGGCGGGTGTCCCTTATCATGCAGTAGAAAACTATTTAGCTCGTTTAGTGCAAATGGGCGAATCGGTTGCTATATGTGAGCAAGTTGGCGATCCTGCAACCAGTAAAGGGCCTGTAGAGCGCAAAGTCGTACGTATCGTTACACCGGGTACTATTTCAGATGAAGCGCTATTGCAAGAACGCCAAGATAACTTACTCACTAGCGTATGGCAAAATAAAAAAGGGCTATACGGTATTGCCTACCTTGATATAAATTCAGGGCGTTTCAACGTAGTTGAAGTTAACACCGACGAAGCATTTACTTCAACCCTACAGCGCTTAGCACCCGCTGAGCTTTTATACTGTGAAAGCTTTGAAAACACACATTTAATTGAGCATATAAAAGGGGCACGCCGACGCCCTGAGTGGGAGTTTGACCTAGACACTGCTCAACACTTACTGTGCGAGCAGTTTGGCACCAAAGATTTAGTTGGTTTTGGTGTAGATAAAGCGCATGCTGCTTTGGTCGCTGCGGGTTGTTTAATGCAATACGTTAAAGATACACAGCGCATTGCGCTCCCTCACATTCGCGCTATTACACTTGAGCATAACGAGCACGCAGTTATATTAGATGCGGCAACGCGCAAAAATTTAGAACTAACCGTTAATTTATCGGGCGGCTTTGAAAACACCTTAGCGCAGGTACTTGATAAAACCGCCACGGCCATGGGGTCGCGTTTACTTAAACGCCGTATTCATACACCTGTGCGTAATAAAAATGAGCTTAACTCACGTTTAAATGCCATTAGCGCAATTTTAGATGTGCAGTTATATGGCGAGTTGCACGACTCATTAAAAGAAATTGGCGACATAGAACGCGTAATAGCACGACTTGCTTTATGCACCGCACGCCCGCGCGATTTAACCCGACTGCGCAGTGCCCTACAAGCACTCGCACCACTGCACGCATTATTAAACGATGCTAATGATGAGCGTATCGCGAGCATTGTTCGCCATTCTCCAGAGCTGCCTGAACTACAAGCTTTACTTGAGCGTGCTGTTATTGATAACCCACCGGTACTAATTCGCGATGGGGGCGTTATTGCACCAGGCTACAACAGCGAACTCGATGAATGGCGAAACTTGAGTAAAGGCGCTACCGATATACTTGAGCAACTAGAGCTTAGAGAGCGCGAGCGCACCGGGATCAGCACATTAAAAATTGGCTATAACAAGGTGCATGGCTTTTTTATCGAGGTAAGTCGTGCAAATTCACACTTAGTACCTGCTGATTATATTCGCCGCCAAACGCTTAAAAATAATGAACGCTACATAATACCTGAACTAAAAGAGCACGAAGATAAAGTGCTTGGCAGCCAATCAAAAGCTCTTGCGCTTGAAAAACAATTATATGAAGAGCTATTTGAGTTTATAGCCCCGCATATTGAACAGCTTCAAATGATGGCTGGCGCATTAGCTGATTTAGATGTATTGAATAACTTAGCAGAGCGAGCCCAAACGCTTAACTATGCTAAACCACAGCTATGCGATGATGACAATATAAGTATTAAACAAGGTCGCCACCCTGTGGTAGAGCAAGTAATGAAAGAACCTTTTATTGCCAACCCTGTGGAGCTAAATAGCCAGCGTAAAATGTTGATTATCACCGGTCCAAACATGGGTGGTAAATCAACCTATATGCGCCAAACAGCACTTATCGTATTGATGGCGCATATTGGCTGTTATGTCCCTGCTGATAGTGCAAAAATTGGTAATATTGACCGTATATTTACACGCATTGGTGCAAGCGACGATTTAGCCTCTGGTCGCTCTACTTTTATGGTAGAAATGACCGAAACTGCCACAATTTTAAATAATGCAACTGCGCAATCTTTGGTATTAATGGATGAAATAGGCAGAGGCACCAGTACCTACGATGGCTTGTCACTTGCTTATGCAACGGCTGATCATCTGGCACAAAAAATATCTGCTAAAACATTATTTGCTACGCACTACTTTGAATTAACGGAACTTGCTGAGCAAAAAACTGGGCTGGTGAATGTGCACTTAGATGCCATAGAGCACAACGACACCATTGCATTTATGCATACTGTGCTTGATGGTGCAGCAAGTAAAAGCTTTGGCTTACAGGTCGCAGCGCTTGCCGGCGTGCCTAAAGCCGTGATAGCCCAAGCAAAACAAAAGCTTAAACTGCTCGAAAACCACCAAAGTGTAACAGCGCCTAATGCTGAGCAACAGGCGTTTTCATTTGCTAATGAGTTACCTGCGCCTGAGCCTTCTGAGGTTGAGGAGCAGCTCAGTGCCATTGACCCTGATAATCTATCGCCGCGTCAAGCACACGAACTTCTTTATAAATTAAAAGCACTACTTTGAATATAGGTAACTTGAGCGGTGGTTAAGAGGCTGATAATACTGTAAATAGTATTTCTTGGGGGCATACCATTTGTACTAAATTAGGCCCCTTTTATAGTGTCTAATACCGATTTAAAATAAATTTATGACCCCAAATTTGGGGTCATAAGACATAAAAAAGCTGAAGGTTTTATCCTTCAGCTTTTAAACACATAGACAGTATAAAAGGGAGTTACGAGAACTGGTCAAACAAACTTTCTGTACTTAACCCTTCTTGTTGTAAAATATCTTTTAAACGACGTAATGCTTCTACCTGAATTTGTCTTACGCGCTCTCGCGTTAAACCAATTTCACGGCCAACATCTTCAAGTGTTGATGGCTCATAGCCAAGTAAACCAAAGCGACGCGCTAATACTTCACGTTGTTTAGGGTTTAACTCACCTAACCAATCAACAATATGTTTGTTAATATCATTGTTTTGAACTTCGCCCTCAGGGCCTGCGCTTTTTTCATCGGCAATAATGTCTAACAGTGCGCTGTCGTTCTCACCGCCAATTGGCATATCAACTGAGGCAATTTTTTCGTTTAAGCGTAGCATTTTAGTTACGTCTTCTACGGGTCTACCTAAGCTTTCAGCAATTTCTTCAGCAGTTGGCTCATGGTCTAGCTTTTGTGTCAGCTCGCGTGCTGTACGCAAGTAAACATTTAATTCTTTAACTACATGTATTGGTAGGCGAATTGTGCGCGTTTGATTCATAATGGCGCGTTCAATTGTTTGGCGTATCCACCACGTTGCATAAGTCGAAAATCTAAAACCGCGTTCTGGGTCAAACTTTTCAACAGCGCGAATTAAACCTAGGTTACCTTCTTCAATTAAATCTAGAAGTGCTAATCCTCGGTTGTTATAACGGCGGGCAATTTTTACAACTAAACGTAGGTTACTTTCAATCATACGCTTGCGAGATGCTTCACATCCTCGTAGCGATTTGCGGGCAAAAAAGACTTCTTCTTCAGCGCTAAGTAGGGGAGAAAAACCAATTTCTCCTAAATAAAGTTGGGTTGCATCAAGGTTTTTAGTTACTTCCTCTTTTGCAAATATCTCTTCTTCGTTATCAACCTCTTCAAGTAATGCTGCAGTTTCTTCTACTGCGGTGTCATCAAATTTTTCGTCGGTGGTGTTTTTGTCAAGTTTTGCTGCGTTAGCCATAAGCCTTCTCCCGAGCAATTATCAATACCTAAAAATTAGGGAAGGTATTTAGCAGGATTGACAGCTTGCCCACGGTAGCGAATTTCAAAACGAAGCGCAGTGACCGAAGATTCTGACTTGCCCATTTCTGCTATTTTTTGTCCTGCCTTAACTTTCTGCTTTTCTCTAACAAGTAGTTTCGAGTTATGTGCATAAGCACTTAGGTAATCATCATTATGTTTCAAAATGATTAAATTACCGTACCCTCGAAGCGCATTACCCGCATACACCACCGTTCCTTGTGCTGCGGCTAAAACTGAAGCCCCTGTACGGTTAGCAATCTGTAAACCCTTGTAACCGTTTTCCTTATTAGAAAAGCGTTTAGTCACTTTGCCCTTTGCAGGCCAAAACCACTTTACTTTACTGCTCGACGAAGGTTTAGCATTACTAACTATTTTATTGGCTTGTTTTTGAACATACTCTCGTTGTTTCGGCTGATCAAGATTTTTCTTTAATTTTTTGTTAGTTTTTTGTTTTGTTTTAGTGGGTGTTATTTTTTGTTTAACGGGTGAATTGCTAGCAACCGCATGGCTACTGGTGGCTACAAGCGAAATAACTTGCCCAGGATAAATAACATAAGGTGATGGAATTGAATTGTTTTTTGCAAGCGACCTAAAATCTTGCCCTGCACTAAAGGCAATGGAATATAAAGTATCACCCTTTTGTACTGTGTATTTATTTCCATTAATGTTAATGCCTTTTTGAAAATCATTAACATTAGTATTGAGGCTACTAACAGGAGCAGGAATATGGCGAGATGAACACCCCGAAATCAAAACAGCAATAAATACAACCACATATAATACGTACTGACTATTCAAGGTGTTTTGCTCCGAAATTTAAAAAGTACTACTTTTGCTAGTTAGCGTAATAAAAAGTAAGCAACCGCTATTAATATAACTAAACCCCAGCCAAGTACTTCAACATATTGACGTAATTTTTGCTCCATTTTAACCCCGCCCCACTTCATTAAAGCAGAAACTAAAAAGAAACGCGCACCACGGCCAACGGCAGACGCTATTAAAAATGGTAAAAATGCCATTTGTAATACCCCTGCACCAATAGTAAATACCTTATAAGGGATAGGTGAAAAGCCCGCTAAAAATACCACCCACACGCCATACTCTTTAAACCATGTAAGCGCTGTTTCAAACTTTTCTTGCCAGTGCATCTGCTCAATAAAGGGCTGTACAACAGGCTCAAATAACCAGTAACCTAAAAAGTAACCTACAATCCCCCCAAGCACTGATGCAACCGTTGCAAAGCTTGCAAAGCGCCACGCTTTACTTGGCTGAGCAAGCGACATAGGAGCAAGCATTACATCCGGTGGTACCGGAAAAAAAACGGACTCAGCAAAGCTCATGGCTGCTAAATAGCGCTCAGCAAAGCGGTGTTTTGCCCACACTAGGGCCATATCGTATAACTTAGTAAACAATTTCAACGTGAATTCCTATTCAATATCACCAGGGACGAGAGGGACAAACCGAACTGGTGCAATAACATGCTCTGTGAAGCTATCGCCTTGGCGAATAACCATGGTTAATTTTTGTTCTTGCTCTCCAATGGGGGCAAGGAGTACACCGCCATCAGCTAGTTGTGCAAGTAAGTCTTGAGGTACTTTCGATGCGGCCGCGGTAACTATAATACCATTAAACGGGGCCTGCGATTGCCAGCCTTGCCAGCCATCTGCGTGTTTCATGGTTACATTGTATAAATCAAGTTGATGTAAACGGCGTTTAGCCTGCCATTGCAGTGCTTTTATACGCTCGACCGAATACACCTTATTAAAACACTTGGCTAACACTGCGGTTTGATAACCAGAGCCTGTGCCAATTTCTAACACTTTGTCGCGTACGCCAGCCAAATGAAGCAGCTCGGTCATACGCGCCACAATATAAGGCTGCGAAATAGTCTGCCCTTGCCCTATTGGCAACGCCGTGTTTTCGTACGCCTTGTGTTTTAGTACATCATCAATAAAGGCATGACGTGGTATATCTGCAATGGCTTTTAATACCTGTTTGTCTTCTACCCCTTCTTGCTCTAATAGCTTAGAAAGCGCAATAGCACTGCGCGAGTAATTAGCCAGCACGGTTTATCTCCATTTCAGCTAACCACTGCCCAACCGCTTCAATACTTTCTTTTGCTGTCATATCAACACTTAACGGTGTAACTGAAGCATAGCCATTATTAACAGCGTAAAAATCAGTGCCCTCACCGGCATCGCTTTCAATACCAAGCGAGCCATACCAAAAAATATCACGCCCCCATGGGTCCGTTTGTTTGGTCATGGTTTCGGCTTTATGTCGAGCGCCTAAACGCGTAACTTGCACCCCTTTTAGCTCACTTAGAGGAATATCGGGTACATTTACATTGATAATTTGATCTTTAGGCAGTGGGTGCGATGCCAGCCCTTTAATTATATTAACGGTCACAGCTGCTGCGGTTTCAAAGTGCTCACCATGGTGCGAGCAAAGCGACACGGCAATAGCAGGCAAGCCTAAATGGCGCCCTTCGGTCGCCGCAGCCACAGTGCCTGAATACAATGTATCATCGCCCAAATTAGCGCCGTGGTTAATACCTGCTACGACTAAATCAGGCGTTTCATCAACTAACTGATTAACCCCTAAATGAACACAATCAGTAGGCGTGCCATTAACCGATATAAAGCCGTTTTCAAGCGTGGTAGAGCGCAGTGGGTTTATTAACGTTAACGAGTTACTGGCACCACTACAGTTACGATCAGGGGCTACAAGGGTTACATCGGCAATTTGCGTAAGAGCCTGGTATAAAACAGCAATCCCTTTAGCGTTTACACCGTCGTCGTTACTTAGCAGTATCTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP033065|2722198:2730474|2726617_2727592_-|AYM87391.1|DBSCAN-SWA MANAAKLDKNTTDEKFDDTAVEETAALLEEVDNEEEIFAKEEVTKNLDATQLYLGEIGFSPLLSAEEEVFFARKSLRGCEASRKRMIESNLRLVVKIARRYNNRGLALLDLIEEGNLGLIRAVEKFDPERGFRFSTYATWWIRQTIERAIMNQTRTIRLPIHVVKELNVYLRTARELTQKLDHEPTAEEIAESLGRPVEDVTKMLRLNEKIASVDMPIGGENDSALLDIIADEKSAGPEGEVQNNDINKHIVDWLGELNPKQREVLARRFGLLGYEPSTLEDVGREIGLTRERVRQIQVEALRRLKDILQQEGLSTESLFDQFS >CP033065|2722198:2730474|2727627_2728452_-|AYM87392.1|DBSCAN-SWA MNSQYVLYVVVFIAVLISGCSSRHIPAPVSSLNTNVNDFQKGININGNKYTVQKGDTLYSIAFSAGQDFRSLAKNNSIPSPYVIYPGQVISLVATSSHAVASNSPVKQKITPTKTKQKTNKKLKKNLDQPKQREYVQKQANKIVSNAKPSSSSKVKWFWPAKGKVTKRFSNKENGYKGLQIANRTGASVLAAAQGTVVYAGNALRGYGNLIILKHNDDYLSAYAHNSKLLVREKQKVKAGQKIAEMGKSESSVTALRFEIRYRGQAVNPAKYLP >CP033065|2722198:2730474|2729081_2729720_-|AYM87394.1|DBSCAN-SWA MLANYSRSAIALSKLLEQEGVEDKQVLKAIADIPRHAFIDDVLKHKAYENTALPIGQGQTISQPYIVARMTELLHLAGVRDKVLEIGTGSGYQTAVLAKCFNKVYSVERIKALQWQAKRRLHQLDLYNVTMKHADGWQGWQSQAPFNGIIVTAAASKVPQDLLAQLADGGVLLAPIGEQEQKLTMVIRQGDSFTEHVIAPVRFVPLVPGDIE >CP033065|2722198:2730474|2728493_2729072_-|AYM87393.1|DBSCAN-SWA MKLFTKLYDMALVWAKHRFAERYLAAMSFAESVFFPVPPDVMLAPMSLAQPSKAWRFASFATVASVLGGIVGYFLGYWLFEPVVQPFIEQMHWQEKFETALTWFKEYGVWVVFLAGFSPIPYKVFTIGAGVLQMAFLPFLIASAVGRGARFFLVSALMKWGGVKMEQKLRQYVEVLGWGLVILIAVAYFLLR >CP033065|2722198:2730474|2723307_2723799_-|AYM87389.1|DBSCAN-SWA MELHQEIKTLAAQLGVILTDKRLWITTAESCTGGGVSYALTDTPGSSGYLGRAFVTYSNEAKHELLNVANTTLEQFGAVSEQTVKEMAFGAASVAKADIAVAISGIAGPGGATSDKPVGFVWFCIQIANEQFTFKQIFNGDRAQVRMQAIEFALKSTIEKIKL >CP033065|2722198:2730474|2722198_2723242_-|AYM87388.1|DBSCAN-SWA MNDNKQKALDAALSQIERQFGKGSIMKLGDNKALNIDAVSTGSLGIDIALGIGGLPMGRIVEVYGPESSGKTTLTLQVIAQAQKEGKTCAFVDAEHALDPVYAQKLGVNIDELLVSQPDTGEQALEICDMLVRSSAVDVVIVDSVAALTPKAEIEGDMGDSHMGLQARLMSQALRKLTGNIKRSNTLCIFINQIRMKIGVMFGNPETTTGGNALKFYASVRIDIRRIGSVKEGDEVVGNETRVKVVKNKVAPPFKQAEFIIMYGEGISKQGELIDLGVKHKIVEKAGAWYSYNGNKVGQGKSNSIKFLKENVEIADEIEGKLRDMLLLKATVEPEDGEDVLGAESDL >CP033065|2722198:2730474|2723820_2726406_+|AYM87390.1|DBSCAN-SWA MSFDLYAPHTIKQQTPMMQQYLKIKSEHRDILLFYRMGDFYELFFDDAKRAAQLLDISQTHRGKAGGDPIPMAGVPYHAVENYLARLVQMGESVAICEQVGDPATSKGPVERKVVRIVTPGTISDEALLQERQDNLLTSVWQNKKGLYGIAYLDINSGRFNVVEVNTDEAFTSTLQRLAPAELLYCESFENTHLIEHIKGARRRPEWEFDLDTAQHLLCEQFGTKDLVGFGVDKAHAALVAAGCLMQYVKDTQRIALPHIRAITLEHNEHAVILDAATRKNLELTVNLSGGFENTLAQVLDKTATAMGSRLLKRRIHTPVRNKNELNSRLNAISAILDVQLYGELHDSLKEIGDIERVIARLALCTARPRDLTRLRSALQALAPLHALLNDANDERIASIVRHSPELPELQALLERAVIDNPPVLIRDGGVIAPGYNSELDEWRNLSKGATDILEQLELRERERTGISTLKIGYNKVHGFFIEVSRANSHLVPADYIRRQTLKNNERYIIPELKEHEDKVLGSQSKALALEKQLYEELFEFIAPHIEQLQMMAGALADLDVLNNLAERAQTLNYAKPQLCDDDNISIKQGRHPVVEQVMKEPFIANPVELNSQRKMLIITGPNMGGKSTYMRQTALIVLMAHIGCYVPADSAKIGNIDRIFTRIGASDDLASGRSTFMVEMTETATILNNATAQSLVLMDEIGRGTSTYDGLSLAYATADHLAQKISAKTLFATHYFELTELAEQKTGLVNVHLDAIEHNDTIAFMHTVLDGAASKSFGLQVAALAGVPKAVIAQAKQKLKLLENHQSVTAPNAEQQAFSFANELPAPEPSEVEEQLSAIDPDNLSPRQAHELLYKLKALL >CP033065|2722198:2730474|2729709_2730474_-|AYM87395.1|DBSCAN-SWA MKILLSNDDGVNAKGIAVLYQALTQIADVTLVAPDRNCSGASNSLTLINPLRSTTLENGFISVNGTPTDCVHLGVNQLVDETPDLVVAGINHGANLGDDTLYSGTVAAATEGRHLGLPAIAVSLCSHHGEHFETAAAVTVNIIKGLASHPLPKDQIINVNVPDIPLSELKGVQVTRLGARHKAETMTKQTDPWGRDIFWYGSLGIESDAGEGTDFYAVNNGYASVTPLSVDMTAKESIEAVGQWLAEMEINRAG |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033066_1 | 419365-419516 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP033066_1
|
1 spacers
spacers of CP033066_1
>1.1|419420|42|CP033066|CRISPRCasFinder CACTTTGTAGAAATTAAGGTGGGTGTCACTTCAAGAAAGGCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP033066_1
The CRISPR arrays of CP033066_1 >merge|CP033066|1|419365-419516|CRISPRCasFinder TTTTTGGACAGTTAAAAAACATAAATTCACTAGTTAACTTTAACTTTTTGTAATTCACTTTGTAGAAATTAAGGTGGGTGTCACTTCAAGAAAGGCTTTTTTGGACAGTTAAAAAACATAAATTCATTAGTTAACTTTAACTTTTTGTAATT >CP033066|1|1|419365-419516|CRISPRCasFinder TTTTTGGACAGTTAAAAAACATAAATTCACTAGTTAACTTTAACTTTTTGTAATT CACTTTGTAGAAATTAAGGTGGGTGTCACTTCAAGAAAGGCT TTTTTGGACAGTTAAAAAACATAAATTCATTAGTTAACTTTAACTTTTTGTAATT
>CP033066.1|AYM88611.1|418287_419262_+|transposase MAIARKRQVSLVDTKYYHCISRCVRRAFLCGEDRFTGQSYEHRRGWVEDKLGELAKVFCIDVCAYAVMSNHTHLVLYVDDKKANRLNDKAIVIRWHKLCKGTLLTQKYIQGEKLSKVELIFFNQTVKQYRERLASISWFMRLLNEDIARRANKEDNCTGRFWEGRFKSQALLDEAAIAACMAYVDLNPIRAKMANTPEESDHTSAQVRLICAKEGKQPKQLLRFAGMPRQIMPKGLPFELKSYLELVELTGRAMREDKHGHIDNMTLPLLERLNISSENWLKLTTQFTRVFHGAVGRPASQEGYCENLNRKRRANISNCAKLFA >CP033066.1|AYM88610.1|417607_418105_+|hypothetical-protein MRINFPKLKPNKWSLTNLAVVLILATVFYYLGKFTVVNSLLLGLCCVLLAVTLLVLMRWKAYINFLKQVGEDIDRDSFYGSEHTVSMVPFKKLQIAVHARMGDSALLIKKANCYIAINFEDIDSFEPTEYFGQPVAKVILAAHKDLVYPLYVPWSEEMAQHKIFE >CP033066.1|AYM88609.1|417014_417473_+|nuclear-transport-factor-2-family-protein MYKLLLLFVFLPLSFTANAVLSEGELEQLARKFVEAKNARQQPETTIQDIDAFINLIADEFVDEHVKFKVTITEKSALREGMIAKMSDKIYYSSIVINEIMTGGNVAIIKMTESGKVRPNHLDKDITYSSVNIVTLEFNDDKLITHIRRHHG >CP033066.1|AYM88608.1|416371_416830_-|hypothetical-protein MQIGSSTSALPITPAQKSGNNLPPNTPVTGNMQPEKPFIRELAESFDPKNMSYKESMELANALMKAGEGDLSSAFLPPPLLKVNSDGSVSDMRGTPEGEAKMNAKFNMFDVLEARIDFNKSMNMPTKLLEDSYSFLEKIQVARNTPSINEYT >CP033066.1|AYM88607.1|413462_415718_+|acyl-CoA-dehydrogenase MSLRTKLKKVLPSISITEQEALDAGDVWLEGSIYQGKPDFSALRDVPAATLSADEQAFLDGPVQELLGMIDDSVIQNGIHLPDDILEFLKKERFFSLIIPKSFGGLEFSPYANSTIVATIATKSSAVAVTVMVPNSLGPGELLLHFGTQEQQAHYLPRLANGRDIPCFALTSPEAGSDAGGIPDIGTVTKGMYNGEEVLGLEITWDKRYITLAPIATVLGLAFKVVDPEGLLGGKENLGITCALIPKDHPGVELGNRHDPMGIRFYNGTTRGNKVFVPMDFIIGGQKNIGRGWQMLVSCLGAGRGISLPALGVSTSQVAFKSASEYAAVREQFGLAIGQFEGIQEKLADIAGKTYLQEAMRVLTTEGLGMGLKPSVVTAIAKYHMTELGRDVLDSAMDIQAGKAIQNGPQNTLASGYVAQPIAITVEGANILTRNLMIFGQGVMRCHPYLQSMVESIHSEDKGADKEFNGILRKTIGYSTANSLRAFRLGVLPFTASANSALPEVREYEKAVHKLSAKLAVYADFSLLVLGGKLKQAEMLSARLGDVMSFLYAAMASIKYYEQKVASSEREQAAPYFHYATRFALQSAEEALHKFLDNFPASGTRKFIRFVTMNYSTKMPKISDDLIRELAKQAQLDTAFKAQITHLVKPVEGDGHHINEQAYKAKMASLVELAKVKKALRAKTIKPGTRFAITLDNALATNVITADEHAQLIDYNKKREKAIRVDEFDFDMNLLDDNAQPVNPLKSVVNQ >CP033066.1|AYM88606.1|412169_413198_+|oxidoreductase MSNTELSHQGSTLQTMRAIVLSQPDEQICLQDVEVDIPECADNELLVKLEYVGLNPADAYFAKTGFCKWQYPHILGLDAVGVVVKANKGVFPGVGERVMWHANIGKQGVLSEYTTVPNFAVSVVPDGLCPAKAATLPCAGMAALISLDKIAITEGDQILIEGGSGAVGQFAIQYAKQRGADVFTTASKRNHKLVKQLGADVVFDYNDKKLRDKIRRELGPQGFDAVIDTMGGESTLRNIELMRFCGRIACLNSLPHFDQDLMYHRAPNISVVSIGGAWLANSLCAQQRLSFMGNLLLEGALSGDIKTPAITAVDFTADSVSAALNNQIAGGFTGKHVVQISS >CP033066.1|AYM88605.1|410745_412155_+|TolC-family-protein MTNLIAKPIKMRLTLSAVLVAAFLSGCASKIDTQSEQNAINDFVAQANIASNVAIADETNWWHKLESKQLNALVNSALTNNYNLQTSQLTLKSTLARLGEQKAQYLPQGGVNIGAARSDAPSVFDRQSSANIALDWQLDLFGRITALVDAANASAMSQAEQVRSLQIEVVSSVVKGFVSYQGNVEKQHIIAMQINALEQSIEVLQARVDEGVANELDLNRTMAQLRQQEALMPAIEYAKYSDLSTLAVLTGKLAQDIAIDNEQNLLEQSFSVALKNANSAIALRPDISRALYDFSQANSLSVAASKALLPDISLSAFAGVVSIDSTGLKNTDRQWQVAPQLQWSILSYPALLAQRDAQQFLSEAAYSDYQQIVLNAVTQSELSLQMLVNQQQQERYAKQRYGFANKAFLQAQAMYEEGQIPYLELLDARQDVLMAQENAVDTTIATLLAKVNAYQAFNGQWSYALSSTK >CP033066.1|AYM88604.1|407600_410753_+|multidrug-efflux-RND-transporter-permease-subunit MKFSHFFIQRPIFAAMLSLVILIAGGISLFQLPVSEYPEVVPPTVVVTANYPGANPTVIAQTVATPLEQEINGTENMLYMFSQGTSDGRMTLTVTFALGTDLDRAQVQVQNRVNSALPRLPEEVQRLGVVAEKSSPDLTMVVHLYSPENSHDTAYLSNYADIHIKDEIARLPGVGDIRLFGGGKYSMRVWLNPDALAARELTATDVVAALRSQNQQVAAGSLGAQPISNDSQFQILLNVKGRLNSVEEFEKVIIKVGEQGQLTRLSDVARVDLGQDTYALRAELDNQPALAMPVFQRPGSNAIELSDQVRETMARLSQDFPAGVEYDIVYDPTVFVRGSIDAVIATLLEAIVLVVIVVIVFLQTWRASIIPLIAVPISLIGTFAVMQWLGVSINTLSLFGLVLAIGIVVDDAIVVVENVERNIEQGLSPLEATRVAMSEVTGPIIAIALVLCAVFIPTAFITGLSGQFYKQFALTITISTVISAFNSLTLSPALSALLLKSHDAKPDAFTRLLNKLFGAWLFKPFNRVFDRGAKGYEKLVQKLIRMSVIVMVAYVALVGGTIKLFDTVPGGFIPQQDKQYLVAIAQLPDAASLDRTEDVLSQMQKIALEVPGVAHTVAFPGLSVNGFTNSPNSGIVFTPLESFDKRTDPSQSAMAIAAQLNQRFAAIDEAFVAVFPPPPIQGLGTTGGFKLQIEDRANKGFDALFNSLQTIIGKAQQDPALMGLYSSFRIQVPQMDIDIDREQALIQGIPLDEVFDALQIYLGSVYVNDFNMFGRTYQVNAQADADFRLDPEQILNLKVRNSAGNMVPLGSVLTVTPTIGPDRVMHYNGYPSAELNGSPAPGYSSDQAQTAIETILADNLPTGIEYEWTEVTYQQVLAGNTMVYVFPLVVLLVFMVLAAQYESLRLPLAIILIVPMTIFSALLGVWFVGSDNNIFTQIALIVLVALASKNAILMVEFARDQHGGGLTHFEAILAACRMRLRPILMTSIAFTAGVVPLVLATGAGAEMRHAMGNAVFAGMIGVTVFGLLFTPVFYMLVVKKQQKAKGVSHD >CP033066.1|AYM88603.1|406424_407591_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MNKHLIAAALAAATLSLAGCADESAPNAQQQQLQPIDVAQVLIKPVQSWHTYTTRLESPQEVALMPRVSGVIDSIEFKEGDVVKQGDVLFQLDERPFAAVVASLEAQIHSAEAALEQAKSEDKRAVRLLERKAISIEQAQARTSTLRQREAQLAALQAQLTSAKLDLEFTSVVSPIDGVISRANITKGNNVLAGQSVLTSIVSNKAMYAYFDVDERTWNSAFNDVTAQSRQTVVMQKVGQKEFAYQGYINFIDNQINSATGTLRVRAVFEQDNNQLRAGSFARVKLAANEVSEKVIIPERAIGTDLKNRFVLTVGENNVLEYKLIEVGERYGALRAVTAGLNEGDVIAVNGPARVGPGMPISPNTVTIDTSGVAFTLSNDNAQLMAKQ >CP033066.1|AYM88602.1|405365_406304_-|LysR-family-transcriptional-regulator MDTTSRLLMLLEVVEQGSFAKAAEIRNIDRSVISKQISRLEDELGVRLLNRTTRSFSLTAAGAEMIKKASELRELLGETVRMAENYHLEPRGVLKVTSSTLIGRRYLQPVLNDFQKRFPQVEVELRLDDRLVDIVSEGFDLAFRIGEPKDSSLIARKIARNRLLIVAAPEFIKTYGMPQTIEELVQLPAASYASNAMRVETIDYYDSKGEPCELKIKSVYRANDAEVLLMKAISGTTYFVAPAFIIDKEITQGQLVPILTDVKLKEFSHMYAVYPHRDLPVRTRLFFDAVREYLGKDKPIWENNIPNFEQMY >CP033066.1|AYM88612.1|419636_420596_+|DUF1679-domain-containing-protein MAFYLPLLQPHFKHIEMGDTLTSLWSGCGSIVECRLDAEPCVIKAIKIPSHINHPKIKQSEFALKRKQQSYKVEYNFYRLYSAYLPTSAKSITCINAINDGDDYALVFKNFTQYGFAQASSQHIKAILNWLAFFHAFNLNKPAKGLWQQGNYWHLSTRPDEFNKLKQSADKKSDIKNAAHKINKILQSSHYKTLIHGDAKLANFAANEQSEILAYDFQYVGAGVGICDVMYFMTSCLSDEQLHTCADEYLHYYFSQLKNALLVFQPQINADDVIAKWHALWPLAWADFYRFLAGWSPTHFKINSYMMAQVNLTLSDNNL >CP033066.1|AYM88613.1|420739_421372_+|uracil-phosphoribosyltransferase MSIHVISHPLVQHKLGLMRAHGISTKSFRELCSEVGTLLTYEATKNLQLEDNEITGWDGNKLKVEHIKGKKITVVPILRAGLGMMDGVMSLLPAAKVSVVGLERNEETLEPVPYFEKLVGNIDERLSLVIDPMLATGGSMIATIDMLKKAGCKDIKVIVLVAAPEGVEKTLAAHPDIEIFTASVDSHLNEKGYIIPGLGDAGDKIFGTVY >CP033066.1|AYM88614.1|421381_422620_+|uracil-xanthine-permease MQNNSTFSIKTILTGAQMLFVAFGALVLVPLLTGLDPSVALFTAGIGTLLFQVVTKGKVPIFLASSFAFIAPIIASVQMWGVPATMGGLMAAGCAYMLLALLVKFKGVATLHKILPPVVVGPVIMVIGLALAPVAVNMAMGKSGDGSIELIAYDKAIIISLFSLVVTLIFAVWGKGVYKLIPILAGVISGYVLSLVMGVVEFGSVNEASWLAVPNFTWPEFKWQAILFMVPVAIAPAIEHIGDMMAISQVTNKDFLKKPGLHRTLFGDGLATAAASLFGGPPNTTYSEVTGAVMLTKNFNPKVMMWTAIIAVVLAFVAKMGAGLQTIPVPVMGGIMILLFGSIAVVGLNTLVKSGDDLTAPRNLSIVALILVCGIGGMHIGGSQFSLEGVSLCAILGIVLNLVLPKAEPETD >CP033066.1|AYM88615.1|422756_424502_+|HAD-IIB-family-hydrolase MSEASIVDITPFLAKHQLPLKYQYLSEQFFIPLAHDILESKKNNTPIFVAINGCQGSGKTTLADFLVTWFSNNTPFTSVALSIDDFYLSKAHRQGLAKDVHPLFATRGVPGTHDVGLMNTTISRLLAKEVGVPLPKFDKHHDDCSPEQTWQCNNKPIDIIILEGWCVGSEPQPLFSLSEPINELETQHDKEGVWRRCVNSCLANEYKSVFSKIDYTVMLKAPSFEDVFKWRQEQEQKLIAAKGEGDGTMSDEQLVHFISHFERITRENLNTLSAKANALIELDSNRDISAMHLTSDDTLQPIIFTDLDGTLLDHADYNTKNISSLLQDLQAAHIPVVFNTSKTFCEVVELKNELNIQQPFIVENGAAAYLPVDYFELKPIGCTQVGVYWCYAFASPLSNLLSDLDSLSSEYKSHYKLFSDLSSEQISSLTGLDEAHARRAQTRDFSDPLYWHGSDELLNAFVNDVKGLGYEIKIGGRFIHIAKNTDKSAAQQWLVKQISQHFRKPLTVIALGDSDNDKQMLEQADIAIIIHNPSSKKPVKLTHNKARYSQSPAPLGWIEEITTLPCISSILNTIEERKSHG >CP033066.1|AYM88616.1|424494_425718_+|glycosyl-transferase MADFYQNGIITTLHNIADRPVEALEEELISFSKQRPMGLILPSLFSELEGPALQNIVKELREVPYLSQITIGLDRADESQYRHALGFFKELNQNHKVLWNDGPRLQALDKELQELGVAPRELGKGRNVWYCMGYKLATSEVESIALHDCDILTYDRGLLARLIYPVAHPRFNYEFCKGFYPRTANGKINGRVSRLLVTPLLRSFKTILGNTDYLEYMDTFRYPLAGEFSFRRDVLNDIRIPSDWGLEIGVLSEMYRNYSHNRLCQVDIADNYDHKHQELSLDDQNAGLSKMSIDITKALFRKLATQGVTFTSETIRSLKATYYRIGLDFIETYHNDALMNGLTLDVHQEEKAVEMFAKNVMEAGQHFLDNPMEAPFVPSWNRVVSAMPDVFERLREAVDLDNKEFSE >CP033066.1|AYM88617.1|425742_427521_+|alpha-amylase MNTVSELFLQRVEQHLHIIYKDVELPLSITELAEQLITIILGDSPLRDPTPHTNRWDEQDIILIAYGDSIIKHDEGDQAVAKPVEAPLKTLHRFIKEQCDMQLNALHILPFYPYSSDEGFAVMNYVQVNESLGDWQDIKNIAKDVKLMADLVINHCSSRSVWFENFLNDLDPGKDYFKTASLTDDLSNVVRPRTSPLLNTVTTPSGEKHVWCTFSHDQVDFDFGNPEVLKEFISIIRHYLDNGVRLFRLDAVAFLWKQLNTNCINLPQTHEAVRLIRTLIEHTEPSVVIITETNIPNQENLSYFGNANEAHSIYNFALPPLLLHTLLSGDSTAIKHWMMSMPPAQNGTTYFNFIASHDGIGLRPIEGLLQPSEVASLVSTSMQFGGRVSMRTSNDGTHTPYELNIALFDALQGTHNGQDKFGLERFMCAHAIMFALEGIPGLYIHSLLGTTNDYERFENSQHNRAINRHRWQESKLLSALGDKYSHHHKVFNGIKHLLGIRKKQSAFHPNATQFTLHLAGGLFGFWRQSIDRRQSIFCVYNISDKPQLLTLADLNLINTQQWFDLVANETITEDQLTIELEPYQSVWLSNIK >CP033066.1|AYM88618.1|427626_430467_-|TonB-dependent-receptor MKRHNLLSTSIKCALITAAATASNSVLAQDEQATKIERVEVTGSRILREGAIAPAPVTVISGEQLINTGAVNIGEALNNLPALGNTYSMANSGRFIGTAGLNILDLRNMGTDRTLVLVNGKRHVSSSAGSQAVDTNTIPSVWVERVEIITGGASAVYGADAVTGVVNFILKDNIEGMDFSVTRGFADLNSYNNEKATFSYGSNFDNDRGNAAFAIEYSGQDSLNALDHPWTSTSFSSLRNQAQTDENKDSADFPDKILTPNAGYYAINNAGVYALEDGFTNSFNPDSSARDLYIGNNVDGLSCANCDSFNLGQFEEIQPEFERYNVNFKVNYDVTDDLNVYFDAKYVNSQGESIGQPAFFFFDSDNSIKIDNPYLDPDIKARMEEEGVDSIMVNRMMSDLGRRVENNTRETTRFVTGLKGTVFEDWELDTSVVYGQTDLERENGANMILANYFNALDAVEDADGNIVCRSAAAQADGCVPVNIMGFGAPSQQAIDYINTVSVGTSTIKQTVVSGSLANGAIFELPAGYVGVAFGAEYRKEESETKEPDNAEGTFFNALGEDKGSFNVREVFFEATMPILTDLPLIQDLVFDTAVRHADYSTIGEATSWKLGLDWTVNDELRVRVTQSAALRAPNISEVFGAASQTFYNVDDPCRAENIANLSNAATRTANCAALGVASDFNSGYDSASLDGLTSGNRDVKGEESTSTTVGIVYQPEFLDNAVLTIDYWEIDLENAIDTIDAQEILDRCVDSTTGIDNQYCNLITRNASGEISLIQNSVLNVAGQKASGVDFELGYDFDALEGSFKTRLIGTYLIERKDYPFQDDPSSYIEYAATTGEAKWQTNLSVSYAMDNFYSTVETRFISEVDLYTNVELASNSNPSNQMSYGKYFITDMTVGYNFDSGLGVKVGVDNLFNRKLPYGSRGTSAGSASYDNIGRFGYINLSYSL >CP033066.1|AYM88619.1|431030_433883_-|TonB-dependent-receptor MKTFNIVSHSIKAALCLSTAGLAFSSLAAEEDEKKLERIEVTGSKISRVGAIAPAPVTVISGEDLINTGAVNIGEALNKLPALGNTYSLANSGRFIGTAGLNILDLRNMGTDRTLVLVNGKRHVSSSAGSQSVDTNTIPSVWVERVEIVTGGASAVYGADAVTGVVNFILKDNIEGLNVSVTKGVSDLSDYNNEKATFSYGKNFDNGRGNAAFAVEYSGQDSLNALDHPWTDGSYSSLRNQAQTDANKDDPNFPDKIYTPNAGYYAINNAGVFSVGNGYVNTFNPDGTQRDIYIGDNVDGLLCADCDSFNLAQFDEIQPEFERYNVNFKVNYDVTEDLNAYFEAKYVNSEGESIGQPAFFFGDPRNTISIDNPYLDDSVRTLMEEANDGEGVDSINVLRMMTDLGRRIENNTRETTRFVAGLKGTVLEDWDLDASVVRGKTELERVNGANMILDNYSYALDAIEDDEGNIVCRSEAARADGCVPVNIMGFGAPSQEAIDYINTVSTGTSEITQTVVSASLANGALFEVPAGYVGMAFGVEYRKEESETIEPDNAEGTFFNALGEDKGEFDVNEVFAEATIPLVSDLPFVQDLVLDAAVRYADYSTIGDATSWKLGLDWTVNDQVRLRFTQSEALRAPNIGEIFGAPSQTFYNVDDPCLADNLNDLQNSDTRRANCAALGVPVGFESDYDSQTLEGLQSGNRDVKGEESTSTTIGLVYQPDFIENAVLTVDYWKIELEDAISTIASQEILDRCVDSTSGIENQYCDLITRDANSEITLIQNSVLNVSGQEASGIDFELAYDFDALEGSFATRLIGTYLIERKEFPFQDEPEEFIEYAGTTGEAEWQANINIEYSYERFYTSLSTRYIEQVSLYTEQELEDNPNPSSLMNYGTYIISDITVGYNFDNGMGVKLGVDNVFNRELPYGTRGTGSGSASYDNIGRFGYVNLSYDF >CP033066.1|AYM88620.1|434409_434799_+|hypothetical-protein MKFLVLFFTFLFSTAAISEQEVDLEVNMKNTGLAYKNAVQAVGIGGFNTAIDKFITLVETSKKATFHKEAQMSLQGLDKVIAQAKLAKKLANERGLDAAKPALKNIDDLRKKYHELHEPPGFFDLLFGN >CP033066.1|AYM88621.1|434999_435386_+|hypothetical-protein MEISVSLLEGQKQSAKFGDLEVISDQSISAGGGAEHPEPFDYFLVSMVLCAGFYARKFCEQRDISTQGMTLTQNNENVDEEGKKLFSIEINLPDGFPQKYKKALIAAVNTCTVKKVIQAQPEFSVVVK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
76626 : 100640
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP033067|76626:100640|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP033067|76626:100640|90899_93878_-|AYM89048.1|transposase|DBSCAN-SWA MAIKNEITILTRAEQADLYSPPIFSIEEQRLYFSLNDAELAVFRSIRLRAHRCYFVAILGYFKSKPVILDIAYSQVSKDLMFISKELLGGKGLRPFTPSQKQKDRLYAKVLDLAGYHKWDESQHFNSLFDHLVQVGNAWLEPRYLFDTAIEFLTSHSIAIPRYTVLQRLISRAMQQVRKDLAHQLNQLTSPELHVFLDSITAIDDGLSLNQLRGGAKSLTVPELKKELALYHQLAPWRTQINGVIDGLNLSLKNRQHFGELINYYGSKLKRFKRAQQHLWLLCHLTERIQLALERLTDGFIYHIRKQQEAANTFAQQAVFLSWQSAADNVTKAAELLHLFVDENIDDNQPFSVVRQQALKVMNDRDIQTLCLYLKKQKRTVEEYQWQHYDEQCNLLEQLLRQVFLCLECEAGKGSEAVVAQLQQMQTEIAFGGPLKTMDTSLIPKKHLPWLVKQDNVNPQRYEWLLYRQLTSRLNGRIYLPNVTKYRALEDDLIPQTSQDTLLASSTLDRLKQPAELLLQEKQHRLESALKDVALHIDEGDNRNVIMKNRTGTRWRLPTKSATSLVNNPFFKRMQPVGIADVLRYVERETGFMKCLTHVLPIQKQGFTHQDDLLAILIANATHRGVYGMAQISDRSYEHLSTVQANYIRPETLHDASDVINNAVAALPIFRHYHIQEDQLHASADGQKFETHLETFKTRYSSKYFGTNKGITAMTLVANHSALNARIIGSNEHESHYIYDLLQSNSSEIKPDVLSTDTHGVNHVNFALLDLCGYSFAPRYAQFSSVINDLFDVTESEQGSTILALKKPIRTNVITTGWQDIRRIVLSLQTKRTTQAMLVRKLSGYPSGHPILQALTEYNRLVKAQYLLDYIDDASLRQYVQRALNRGEAWHFLRRAIASVNGDQFRGKNESEIAIWNECARLLANAIIYFNSAILSHLLGHFEARGDEEKAGITRAVSPVAWQNINLSGTYNFTNTGKLPNIGEITRPIVDD 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>CP033067|76626:100640|81444_83601_-|AYM89038.1|DBSCAN-SWA MITQINLGNVASYRNTTTLNTDKKVNIIYGLNGTGKSTFSNYFYALDPLKYKDCSHTNDGCKVLVYNQKFIRDNFYSKDSINGIFSLSKENKEAKEKVEQLGKDIDQLSEKSNGYQADINKESDALKKATDMAEKKAWEIKTNYSGGDRVLKFCLDRLMGNKTVLFNHLVSVPLPAAKPIKTIEQLKEEVAAIDGDKATTYSVLPKISLSELLPEELELLKEIVIGNEDSPIAKLINQLKNSDWVSDGLQYLDDIEDETCPFCQSKTITPELILQIKDYFDETYEASKQNISNILTKYQKIVDSLTDLDTYKTSPFSADFLAEMTESYASIAGTLKSNLFKVQQKEQTPSLKVELEELCDHVTSFNKHVDAVNTSIGIHNQKIANSEQELKRIKDEFWKIIRWEYDQTIKIYEVSKADYSEKTTKLIEDKKAIDVDIITLEVERTEKQKETINIDESIDSINKGLIDIGITDFHIEKHEEDLYRLVRTGTEGPIFLSLSEGEKMIISFLYFRELFKGKQTADEAHVKKIAVIDDPVSSLSHIFVYNIGQLIKNDFFNGDGAEQVFVLTHSLYFFYELVDSNHKRRKENQSLYRLSKNTKGTTIETMKYEEVQNDYQSYWSVINDKDQPAALIANCMRNVVEYFFNFVQKSDLSNVMQKQELQDVKYQAFIRYINRESHSLGQNIIDFKEFDYGAFREGLRLLFEITGYPEHYQKMSQI >CP033067|76626:100640|87286_87634_+|AYM89042.1|DBSCAN-SWA MNQKKSNLPMIGGIIAALGAGVCCVGPLLLLLLGVSGSWIGNLTAFEPYRPLFIAFVVLLFGYSGWKIYRPVEECEPGTACAIPKKQQQRKVIFWLSAIVATILVTSNYWILLFA |
19 | Sodalis_phage(16.67%) | integrase,transposase | attL 92704:92717|attR 101252:101265 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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