Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029694 | Streptococcus pyogenes strain ABC020055975 chromosome, complete genome | 1 crisprs | cas3,csn2,cas2,cas1,cas9,csm6,DinG,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029694_1 | 896589-896689 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029694_1
|
1 spacers
spacers of CP029694_1
>1.1|896612|55|CP029694|CRISPRCasFinder ATGTTTGACAAGACATTGTGGATATTATATACTGTAAACGTACTGTTTTTATCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029694_1
The CRISPR arrays of CP029694_1 >merge|CP029694|1|896589-896689|CRISPRCasFinder TATAATTAGACTATACCAATTTTATGTTTGACAAGACATTGTGGATATTATATACTGTAAACGTACTGTTTTTATCGGTATAATTAGACTATACCAATTAT >CP029694|1|1|896589-896689|CRISPRCasFinder TATAATTAGACTATACCAATTTT ATGTTTGACAAGACATTGTGGATATTATATACTGTAAACGTACTGTTTTTATCGG TATAATTAGACTATACCAATTAT
>CP029694.1|AYO92700.1|896007_896565_+|signal-peptidase-I MVKRDFIRNILLLLIVIIGAILLRIFVFSTFKVSPETANTYLKSGDLVTIKKNIQPKYKDFVVYRVGKKDYVSRVIAVEGDSVTYMDDIFYLNNMVESQAYLEKMKAHYLNHAPFGTLYTDDFTVATITADKYQKVPKGKYLLLNDNRKNTNDSRRFGLINASQIKGLVTFRVLPLSDFGFVEVE >CP029694.1|AYO92699.1|894287_895790_+|pyruvate-kinase MNKRVKIVATLGPAVEIRGGKKYGEDGYWAGQLDVEESAKKIAELIEAGANVFRFNFSHGDHKEQGDRMATVRLAEEIARQKVGFLLDTKGPEMRTELFADDAKEFSYVTGEKIRVATTQGIQSTRDVIALNVAGSLDIYDEVEVGHTILIDDGKLGLKVIDKDIATRQFIVEVENDGIIAKQKGVNIPNTKIPFPALAERDNADIRFGLEQGLNFIAISFVRTAKDVEEVREICRETGNDHVQLFAKIENQQGIDNLDEIIEAADGIMIARGDMGIEVPFEMVPVFQKMIITKVNAAGKAVITATNMLETMTEKPRATRSEVSDVFNAVIDGTDATMLSGESANGKYPVESVRTMATIDRNAQTLLNEYGRLDSSAFPRTNKTDVIASAVKDATHSMDIKLVVTITETGNTARAISKFRPDADILAVTFDEKVQRALMINWAVIPVLAEKPASTDDMFEVAERVAVEAGLVQSGDNIVIVAGVPVGTGGTNTMRVRTVK >CP029694.1|AYO92698.1|893211_894225_+|ATP-dependent-6-phosphofructokinase MKRIAVLTSGGDAPGMNAAIRAVVRKAISEGMEVYGINRGYAGMVDGDIFPLGSKEVGDKISRGGTFLYSARYPEFAQLEGQLAGIEQLKKHGIEGVVVIGGDGSYHGAMRLTEHGFPAVGIPGTIDNDIAGTDYTIGFDTAVNTAVEAIDKLRDTSSSHGRTFVVEVMGRNAGDIALWAGIASGADQIIVPEEEFDIEKVASTIQYDFEHKGKNHHIIVLAEGVMSGEAFAQKLKEAGDKSDLRVTNLGHILRGGSPTARDRVIASWMGSHAVELLKEGKGGLAVGIHNEELVESPILGTAEEGALFSLTEEGQIIVNNPHKARLDFAALNRSLSQ >CP029694.1|AYO92697.1|890021_893132_+|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MFAQLDTKTVYSFMDSLIDLNHYFERAKQFGYHTIGIMDKDNLYGAYHFIKGCQKNGLQPVLGLEVEILYQERQVLLNLIAQNTQGYHQLLKISTAKMSGKLHMDYLCQHLEGIAVIIPSKGWSDTLVVPFDYYIGVDQYTDLSHMDSKRQLIPLRTVRYFAQDDMETLHMLHAIRDNLSLAETPVVESDQELTDCQQLTTFYQTHCPQALQNLEDLVSGIYYDFDTNLKLPHFNRDKSAKQELQELTEAGLKEKGLWKEPYQSRLLHELVIISDMGFDDYFLIVWDLLRFGRSKGYYMGMGRGSAAGSLVAYALNITGIDPVQHDLLFERFLNKERYSMPDIDIDLPDIYRSEFLRYVRNRYGSDHSAQIVTFSTFGPKQAIRDVFKRFGVPEYELTNLTKKIGFKDSLATVYEKSISFRQVINSRTEFQKAFAIAKRIEGNPRQTSIHAAGIVMSDDTLTNHIPLKSGDDMMITQYDAHAIEANGLLKMDFLGLRNLTFVQKMQEKVAKDYGCQIDIAAIDLEDPQTLALFAKGDTKGIFQFEQNGAINLLKRIKPQRFEEIVATTSLNRPGASDYTTNFIKRREGQEKIDLIDPVIAPILEPTYGIMLYQEQVMQIAQIYAGFTLGKADLLRRAMSKKNLQEMQKMEEDFIASAKHLGRAEETARGLFKRMEKFAGYGFNRSHAFAYSALAFQLAYFKAHYPAVFYDIMMNYSSSDYITDALESDFQVAQVTINSIPYTDKIEASKIYMGLKNIKGLPRDFAYWIIEQRPFNSVEDFLTRTPEKYQKKVFLEPLIKIGLFDCFEPNRKKILDNLDGLLVFVNELGSLFSDSSFSWVDAKDYSATEKYSLEQEIVGVGMSKHPLIDIAEKSTQTFTPISQLVKESEAVVLIQIDSIRIIRTKTSGQQMAFLSVNDTKKKLDVTLFPQEYAIYKDQLIEGEFYYLKGRIKERDHRLQMVCQQVQMAISQKYWLLVENHQFDSQISEILGAFPGTTPVVIHYQKNKETIALTKIQVHVTENLKEKLRPFVLKTVFR >CP029694.1|AYO92696.1|889465_889837_-|GntR-family-transcriptional-regulator MSWKFDEKSPIYAQIAQHVMMQIISQEIKSGDQLPTVREYAEIAGVNPNTMQRAFTELEREGMVYSQRTAGRFVTDDQKLIARKRRELAISELESFITNMTKMGFSHTEIIPVLTSFLKEDSQ >CP029694.1|AYO92695.1|888767_889466_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAHLLQLHHVSKSYREKKAIDDLTITIPNGKIIGLLGPNGSGKTTLIKLINGLLQPNKGEIVIDGYRPCVETKKIISYLPDTTYLNENMRIKDMLEFFSDFYSDFDKSKATSLLRDLELDPEDRFKTLSKGNKEKVQLILVMSRKARLYVLDEPIGGVDPAARDYILKTIINSYCENASVIISTHLISDIEPILDEVIFLKQGRLFLSGNADDLRQEYQQSIDSLFRETYKV >CP029694.1|AYO92694.1|887972_888758_-|ABC-transporter-permease MFGKLLKYEFRSIGKWYFALNAFVIAIAAILSFTIKLFAQSNSDGLFGVLTNKMLPLTLGLTFGSLIAGSLLSTLLIIIKRFSKSVFGREGYLTLTLPVNSHQIILSKLLASFICSVFNTIILAFAIAIVIVPMFNINELLEGFFNSFKMDYFINMLTVLAYVLLSTFTSILLIYLSISIGQLFSNRRGLMAFIAYFILVILISVAATYVHSHIFNINTSADSFPFTEQKTIYLLILEQFIEMIMFYLATNFIIKNKLNLQ >CP029694.1|AYO92693.1|887227_887842_+|TVP38/TMEM64-family-protein MTKRNSKAYILWQKIIKILGIIALIGTFFLAFWLYRLGILNDSNALKDLVQRYRLWGPFVFIVVQIIQIVFPVIPGGLTTVAGFLIFGPVTGFIYNYVGIIIGSIVLFLLVKTYGRKFILLFVNDKTFYKYERRLETPGYEKLFIFCMASPVSPADIMVMITGLTDMSLKRFVTILLITKPISIIGYSYLFIFGKDVISWFLQH >CP029694.1|AYO92692.1|885866_886487_-|DUF3862-domain-containing-protein MTKKHLLTLLLISFFTSFLVACSTTKDKEPQPSDSEIITPRLHQAAHQDKRANFEKIKLATVDSSFTGGTSLEELISLFGEPSQHDPKTAGEVTIDAYTWQFDQVTLTVNLYQNSSIVKTISNFTFARELGLSQKEYQQLQKRMSYEDVKKILTEPDNYSQASSSDHQTLQAIWVSGLKTDTSGANISLVFENNQLTEMSQVGLEE >CP029694.1|AYO92691.1|883345_885610_+|glycogen/starch/alpha-glucan-family-phosphorylase MTRFTEYVETKLGKSLTQASNEEIYLSLLNFVKEEASHKAKNSAKRKVYYISAEFLIGKLLSNNLINLGIYKDIKEELAAAGKSIAEVEDVELEPSLGNGGLGRLASCFIDSISSLGINGEGVGLNYHCGLFKQVFKHNEQEAEPNYWIEDDSWLVPTDISYDVPFKNFTLKSRLDRIDVLGYKRDTKNYLNLFDIEGVDYGLIKDGISFDKTQIAKNLTLFLYPDDSDKNGELLRIYQQYFMVSNAAQLIIDEAIERGSNLHDLADYAYVQINDTHPSMVIPELIRLLTEKHGFDFDEAVAVVKNMVGYTNHTILAEALEKWPTAYLNEVVPHLVTIIEKLDALVRSEVSDPAVQIIDESGRVHMAHMDIHFATSVNGVAALHTEILKNSELKAFYDLYPEKFNNKTNGITFRRWLEFANQDLADYIKELIGDEYLTDATKLEKLMAFADDKAVHAKLAEIKFNNKLALKRYLKDNKDIELDEHSIIDTQIKRFHEYKRQQMNALYVIHKYLEIKKGNLPKRKITVIFGGKAAPAYIIAQDIIHLILCLSELINNDPEVSPYLNVHLVENYNVTVAEHLIPATDISEQISLASKEASGTGNMKFMLNGALTLGTMDGANVEIAELAGMENIYTFGKDSDTIINLYATASYVAKDYYDNHPAIKAAVNFIISPELLAFGNEERLDRLYKELISKDWFMTLIDLEEYIEVKEKMLADYEDQDLWITKVVHNIAKAGFFSSDRTIEQYNEDIWHSR >CP029694.1|AYO92701.1|896740_898555_+|glutamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKALSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSRESTYTMLIHAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLTTTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >CP029694.1|AYO92702.1|898750_899086_+|alkylphosphonate-utilization-protein MSLPNCLQCQSEYVYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVLDSNGVRLSDGDTITVVKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >CP029694.1|AYO92703.1|899192_899834_+|amino-acid-ABC-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKIPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTATNRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >CP029694.1|AYO92704.1|899843_900473_+|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKADAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >CP029694.1|AYO92705.1|900488_901325_+|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKSLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGKCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKERQDKVAFTDSYMRNEQIIVVKKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVATANIKS >CP029694.1|AYO92706.1|901694_902468_+|hypothetical-protein MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANFQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIEATVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDMGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKPFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQNALETALKS >CP029694.1|AYO92707.1|902837_904073_-|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLLLSVAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVAVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMIPEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLIDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQRTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKRQLHHTHYRIVKM >CP029694.1|AYO92708.1|904192_905515_-|sodium:alanine-symporter-family-protein MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGIYLTSRLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYAEGVLAIKYRTKDANGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFAGSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQMVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLAVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNEPVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFVLMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >CP029694.1|AYO92709.1|906044_908363_+|DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALALNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLIKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANILGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTGYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEAAEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPFGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >CP029694.1|AYO92710.1|908725_908974_+|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
36871 : 49260
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029694|36871:49260|DBSCAN-SWA TATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGCCTTGTGAAAGAGTTGACACATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGACTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTACTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACCGTCTTTTGACGGAAGCTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTATTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAACCCTGTTGATTCGCGTTTCAAGGACATTACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTATCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAAATTATAAAGCTGACGATTTTGCGGCCTATAAGGCAGATCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGACCTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGACGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAATTGAAGAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGACAACTTATGATAAATATATCGCCATGCGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAAACACTTATGGATATGGCGACTATTTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAACGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTGAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTCGGTGGAGCGGCGACTTGTATCGGTGGTGCTATTCGTGACCCATTGTCAGGGCGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATCACGACTCCGATTGCGGAAACACGTACTGGTAAATTGCCACAACAGGTTATTTCTAAGACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGACTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGCATGGAGCTTGGAGCTGTGGTCGGAGCGGCACATAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGTGATGTGGTAATCTTGCTTGGTGGTAAAACAGGGCGTGACGGTGTCGGCGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAGTCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATCGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTCTTCCGTGATGGTGAAGTGACTCGTCTCATCAAAAAATCAAACGACTTTGGTGCTGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCTCTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCAAATGATGTGGATGCCTTCATCGCAGCTTGCAACAAGGAAAATATCGATGCCGTTGTAGTTGCGACAGTTACCGAGAAACCAAATCTTGTCATGACTTGGAATGGTGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGTTAAATTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGATCTCAACCATGCTAGTCAAAAAGGTCTTCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGTTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGTTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAACAACTGCATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCAGAGTGGTCACCTTATCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTACTTTGAGCGTATGGATAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGTTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGACTTGACAGTACCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGCGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGTGGCTGGCGAAAACATTTACTATATCCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAGCCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACAGCTGCCTCAGCCGCTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGTTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACGCGGTGAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGCGCTAGCCTTCTAGCAGCCTTCGAAGGCAAATTGGAAGAGGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCTGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAGTATGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGTTGCTATTGCTGAGTCAGTTGACACTATGGTTGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGCTTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACGAGAAGGTCCGCGCAGCTATTGACAACTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAAGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCCAACCAACACGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATCCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGACACTCAGAACGCTGGGAAGACGGACTCTTCCAAAATATTCCTGGTAACAAAGACCAAACCTTGTTTGCTAGTGCAGTAAAATATTTTACAGGAAAATAATTTTTTCAAATTTTTTCATAAAACAGATAAGGAAACAAGAGCGAAGCGAGCTTAACTGTATCTTTCTGTCGTAGTGGTATTTGGGAGCCGTTGAGGCTAAGACTCAATGATTAGCTTGAAAATAGCTTGATAGATTTTCTATTTTGATGTTGGCATTGGTGACGATAGATCCAAAATTGAGAAAATCATCAAAGCTACTTAAGAAGAGATACAAAAAGAATTAGGAAAAAAGAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGGCATCCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGAGCTGGTATTGTTTCAAATGACAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGGCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCCTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACTCAAGTTTCATGGGAAAGGTAAAAGAAGCTCTAAATACAGTAAAGGGTGGCTTTGCCTATCTACTGATGACAGAAAATAAACTCATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATCGTGGTATTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGAATTAAGGGAACAAGGTGTTCGAATGAAACTATCAGCGGTATCTGGTGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029694|36871:49260|45846_46971_-|AYO91879.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQSSFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKIVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGDQILRVGEYFTVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL >CP029694|36871:49260|47225_48491_+|AYO91880.1|DBSCAN-SWA MKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNTAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFVNGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVEMIVRPVLEGMVAEGRPYLGVLYVGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQKDGVTLGVVVASEGYPFDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGVKFSENSELLLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDPTGLFYRNDIGSKAIRE >CP029694|36871:49260|42312_43335_+|AYO91876.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGVLGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGVALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVNGIGHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADASVVIK >CP029694|36871:49260|48768_49260_+|AYO91881.1|DBSCAN-SWA MKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKHAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGIVAAKTTLPVIGVPVKSRALSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >CP029694|36871:49260|40830_42285_+|AYO91875.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSSFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTENKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDRGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >CP029694|36871:49260|43502_44057_+|AYO91877.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI >CP029694|36871:49260|36871_40597_+|AYO91874.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDRLLTEAEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKADQGLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRTGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAHKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGEVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPNDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDVKFVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTTTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEDLTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKVAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKLEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEVAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDNFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK >CP029694|36871:49260|44240_45788_+|AYO91878.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDNAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDITYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTTQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPIDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVVVLKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
319710 : 371165
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029694|319710:371165|DBSCAN-SWA 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>CP029694|319710:371165|339808_340003_+|AYO92160.1|DBSCAN-SWA MGRAGSNPAVSITQRLHAVTLRNVIKAKRITELCDVHRELTPLFDIGVPLRRIRNLGSVLMIKT >CP029694|319710:371165|337090_337375_+|AYO92156.1|DBSCAN-SWA MTTDELLQNLRDDLNKIINVLKNDWKALLFLAIAIFGMMVIVSYFSYRDARQYYESQITGLRTQLSRTQKQLKRASEQNQRQTKRIAEMTGNGG >CP029694|319710:371165|343860_344874_+|AYO92165.1|head|DBSCAN-SWA MTTRKSKYWRDRIKKEMDAKEADDISLEQSMKQLHDYHFRNIEKEIESFYQRYADKEKIDLSEARKRASELDISAYQKKAKELVAKAEKLRKEGRTVTRDDFTHQENADMSIYNLAMKTNALELLRLNIDLEMQELANGEHKLTKKFLDEGYRKETEFQAGLLGLSVASQASVKSLADAVINANFKGAKWSDNIWDRQDKLRSIISQSVQSAILRGKNGLTIARDIRREFDVSASYAKRLAITEHARVQMEVGRLSMAENGFAMFDILPEPKACDVCKDIAKHGPYHLDKWRIGGNSPPFHPYCRCAVVGLDKKQEEKVNDKSEKFEKHNTESHAVI >CP029694|319710:371165|331446_332229_+|AYO92142.1|DBSCAN-SWA 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MPISYLKISTPQRKERGKTMIKKYTKKDGTTAYCLRAYLGVDPVTGKQVRTTRQGFKTEREAKRAEVKLIDDFQRQGAWKSNDRTTFDDVAKLWFEQYKNTVKPSTFLVNQNYYKTILKPHLGQLQMTKITVMICQKFVNCLSRYSGYTLYLSLANRIFKFAVNLGIIDNNPMSKTLRSKCTYKNVNTLTKKYYTKEELNTFLRIVEAEESLEMRLIYRLLSYGGFRIGELMALKDTDFEFHNNTISITKTIAYTKEGWAVQSPKTKKSTRAISMDAETMSLAKLYIKQSIKPLHGSFKLFNFSCDTVRNRLDKLILKHGLKRITPHGFRHTHASLLFEAGIPAKIAQERLGHAKIAITMDLYTHLSKKSKDDVADKLAELVAV |
77 | Streptococcus_phage(40.68%) | terminase,capsid,tail,portal,protease,integrase,holin,head | attL 322618:322635|attR 366596:366613 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
478737 : 538349
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029694|478737:538349|DBSCAN-SWA AATGTCTAAAAAACTTACCTTTCAAGAAATCATCTTGACCTTACAACAATATTGGAATGATCAGGGTTGTATGCTCATGCAGGCCTATGACAATGAAAAAGGAGCTGGGACCATGAGTCCTTACACGTTCTTACGTGCTATAGGTCCTGAGCCATGGAATGCGGCTTATGTAGAGCCATCACGTCGTCCTGCAGATGGCCGTTACGGAGAGAACCCAAATCGTCTTTACCAACACCACCAATTTCAAGTGGTCATGAAACCATCACCATCAAATATTCAAGAACTTTACCTTGCTTCTTTGGAAAAATTGGGCATCAATCCTTTAGAACATGATATTCGTTTTGTTGAAGATAACTGGGAAAACCCATCAACAGGATCAGCAGGGCTTGGTTGGGAAGTTTGGCTTGATGGAATGGAAATCACACAATTTACGTATTTCCAACAAGTTGGTGGCCTTGCGACATCTCCAGTGACAGCAGAAGTAACTTATGGTCTTGAGCGCTTAGCTTCCTATATTCAAGAAGTGGATTCGGTCTATGATATTGAGTGGGCACCAGGTGTTAAATATGGTGAAATCTTCTTACAACCTGAGTATGAGCATTCAAAATATTCCTTCGAAATATCAGACCAAGACATGCTGCTTGAAAACTTTGAAAAGTTTGAAAAAGAAGCCTCGCGTGCCCTAGAAGAAGGTTTGGTTCACCCAGCTTATGATTACGTGCTCAAATGTTCTCATACGTTTAACCTGCTGGATGCCCGTGGCGCTGTTTCCGTCACAGAACGCGCAGGCTACATTGCTCGTATCCGTAATTTGGCACGTGTCGTTGCTAAGACCTTTGTTGCAGAACGCAAGAAGCTTGGATTTCCACTGTTGGATGAAGCAACACGCGCAATCTTGCTAGCTGAAGATGCGAATAAGTCGATTTAAAGATGATCTAGTTGCGAGCTTTGTAATCTTAAGAGCGAGCAAGAAGTGGGCGACCGAAGGTCGCCGAGTCAAGGTTACTCCCGCTGTAGTGACAATTCGGTAAGGTTACTTATCGAACGAGGGAGTTGGCGAGACTTTAGGCTGGCTAACTAGGAATGGAACACTTTTGTTTTCTGAAATTATCCACTGGATAATTTCACCTTGCGTACCCCTACCTAAGGGAACAATCAAAAAGATACTTTTTAGAGAAAGGAACTGAACACGGGCTACGGACTATGTCAAAAAGACAAAGACTTCCTAGGTGCAAGCACCTGCGTTGCTTTGCTATTTTGATGGGGTCCACTTAACGCCCTTGGTATCTTAATTATGAGTAAAAATCTACTAATCGAACTTGGTCTGGAAGAACTTCCAGCCTACGTGGTCACACCAAGTGAAAAACAACTGGGAGAGCGCTTGGCGACTTTCTTAACAGAAAATCGTCTCTCTTTTGAAGATATACAAACCTTTTCAACTCCACGCCGTTTGGCAGTGCGTGTGTCTGGGTTAGCTGCTCAGCAAACGGATTTGACTGAGGACTTTAAAGGGCCTGCTAAGAAAATTGCCCTTGATGCTGATGGGAATTTCTCAAAAGCTGCTCAAGGATTTGTTCGTGGCAAAGGCTTGACCACAGATGCTATCGAATTCCGCGAAGTCAAAGGAGAAGAATACGTTTATGTGACCAAACACGAAGCTGGAAAACCTGCTAAGGAAGTGCTTCTAGGCGTTACTGAAGTGTTGTCAGCAATGACCTTCCCAGTCAGCATGCACTGGGCTAACAATAGTTTTGAATACATTCGTCCTGTTCACACCTTGACAGTTCTGTTGAATGATGAGGCCTTGGAACTTGACTTCTTGGATATTCATTCTGGACGCGTCAGCCGTGGTCACCGTTTTTTAGGTACCGAAACCACTATCACAAGTGCTGATTCTTATGAGGCTGATTTGCGCAGCCAGTTTGTTATCGCTGATGCTAAAGAGCGTCAAGAGATGATTGTGGAGCAAATCAAGGCAATTGAGGCGGCCCAAGGAGTACAAGTGGATATTGATGCTGACTTGCTCAACGAGGTCTTGAACTTGGTCGAATTCCCAACGGCCTTTATGGGAAGTTTTGATGCGAAATACCTTGATGTTCCCGAGGAAGTGCTTGTGACATCGATGAAAAACCACCAACGCTATTTTGTGGTACGTGATCAAGAAGGTCATTTGATGCCAAACTTTGTATCAGTTCGTAATGGGAATGATCAAGCCATTGAAAATGTTATTAAAGGGAACGAAAAAGTTTTGGTAGCTCGCTTAGAAGATGGTGAATTCTTCTGGCGTGAGGATCAGAAATTGCAAATTGCTGATTTGGTTGCCAAATTGACCAATGTGACCTTCCATGAAAAAATCGGCTCTCTTGCTGAACACATGGATCGTACGCGTGTCATTGCCGCATCACTTGCTAAGGAAGCCAACCTATCTGCTGAGGAAGTCACAGCTGTTGACCGTGCTGCCCAAATTTACAAATTTGACCTTTTAACAGGTATGGTTGGTGAATTTGATGAGCTGCAAGGGATTATGGGTGAAAAATATGCCCGTCTAGCTGGTGAAGATGCTGCTGTGGCAACAGCAATCCGTGAACACTACTTACCTGATGCTGCAGGAGGTGCGCTACCTGAAACCAAAGTTGGCGCTGTCCTAGCTTTAGCAGATAAATTGGATACTCTCTTGTCATTCTTTTCTGTTGGCTTGATTCCATCTGGTTCAAACGACCCTTATGCTCTACGTCGTGCAACCCAAGGGATTGTCCGTATTCTAGATCATTTTGGATGGCGCATCCCAATGGATAAGCTGGTAGATAGCTTATATGACTTGTCCTTTGATAGTTTGACCTATGCCAATCAGGCGGATGTGATGAACTTTATCCGTGCTCGTGTGGATAAGATGATGGGCAAAGCAGTTCCAAAAGATATTCGTGAAGCAGTTTTAGAGAGTTCAACCTTTGTGGTTCCTGAAATGTTAGCGGCAGCTGAAGCACTTGTCAAAGCCAGCCATACGGAAAATTACAAACCAGCAGTTGAATCTTTGTCACGTGCTTTTAATTTGGCAGAAAAAGCGGACGCTTCTGTTCATGTGGACCCTAGCCTCTTTGAAAATGAGCAAGAAAACACTTTGTTTGCAGCTATTCAAGGCTTGACTCTAGCAGGCAGTGCTGCCCAGCAGTTAGAACAGGTCTTTGTCCTTAGCCCAGTGATTAATGATTTCTTTGATAACACAATGGTTATGGCAGAAGATCAAGCCCTTAAGAACAACCGTTTAGCTATTTTATCAGATTTAGTAAGCAAAGCTAAGACCATTGCTGCTTTTAACCAACTAAACACCAAGTAAATAGAAAGGAAAGAGCCGTTAGGGACTTAACTAGAAAAGTGAGTTCAGTACCCGAGTGGAAAAAACAAGGCCTTTAAACATTGCTTTTCACAGTGAGAGTCAAGTCAGTTTTTTAAGACTTATACTTTTTTCCCAGGCTCTTAGTGGCTTAACATGGATCCTAAAAAAATTGCTCGTATCAATGAGCTGGCTAAAAAGAAAAAAACGGTAGGCTTGACTGGACCTGAAAAAGTGGAACAGGCAAAACTCCGTGAAGAATACATTGAAGGCTATCGTCGCTCTGTCAGACACCATATCGAAGGCATCAAATTGGTGGACGAAGAAGGAAACGACGTGACCCCTGAAAAATTAAGACAGGTGCAACGTGAAAAAGGCTTGCACGGCCGTTCATTAGATGACCCAAAATCATAAGACAAAAAGCAGCTCTGAACTGCTTTTTGTTTATCGTGATGACTGTTAGCTTTTATTTTAAATGGTATGATACTTCAAAGTGACCACACGTTTTTATATTGTATAGTCAAAATATTAGGAAAAACCATGTGTTTGAGTTATAATAGAAGAAATCAAAGAAAGAAGGTAGTACTTATGACAATTAAAAAATTCTCTCTACTAGCCATAGCCAGTCTCTCTTTACTCAGTCTTGCAGCCTGTGATATGGATGATAAAGACGATCATATGGATAATCAACCAAAGACAAGTCAAACTAGCAAGAAAGTTAAACTTTCAGAAGACAAAGCCAAATCAATTGCGTTAAAAGATGCTTCTGTTACGGAAGCTGATGCTCAAATGCTATCAGTTACACAAGATAATGAAGATGGCAAAGCCGTGTATGAAATCGAGTTTCAAAACAAAGATCAAGAATACAGCTATACCATTGACGCCAACTCAGGGGATATTGTGGAAAAATCTTCTGAACCAATCAATGACTAATCAAGAACTGTAATGAATAAGACAGCCTTAACTCTTGTGTCCAATTGTCTTTGCCTCTTAGGCGCGGCTGTTTGATACCGTGTTGCCTTTGAGGCTTAGTTCTCTTTATGACCCAATGATGACTCTGGATTAGCAGAGTGATTGTTGGGTCTTTTGATTTTCTTTGATAAGAAAGATTACCTCGTTAGAAATGAGGAGACGTGGTTGTCATCAGTGGATTTTTCAAGATCATCTAGTGGGATAAGCTACCTATCTTATCAGCTTTTTTTAGCTTTAAAAATTCTTGATAATATATTTCTGATAAAATTAGCTATAATAGAATCAAATAGGAAAACGCTTACTTAAAGGAGGGTAATGAATGTCGCAAGAAAAGTATATCATGGCTATTGATCAGGGAACAACAAGTTCACGAGCGATTATTTTCAATCAAAAAGGGGAAAAGGTTAGCAGTAGCCAAAAAGAATTCCCTCAGATTTTCCCACACGCTGGTTGGGTAGAGCACAATGCTAATCAGATTTGGAATTCGGTTCAGTCTGTTATTGCGGGTGCTTTTATTGAGTCCAGCATCAAACCAAGCCAAATTGAAGCAATCGGAATTACCAACCAACGTGAGACCACAGTGATTTGGGACAAAAAAACGGGTGTACCTATTTATAATGCTATTGTGTGGCAATCACGGCAGACGGCACCAATTGCTGAGCAACTCAAACAAGATGGCCATACAAAAATGATCCAT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64 | Streptococcus_phage(78.0%) | terminase,capsid,tail,portal,integrase,holin,tRNA,bacteriocin,head | attL 477722:477738|attR 537244:537260 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
572711 : 635086
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029694|572711:635086|DBSCAN-SWA CATGATAAAATTATTATTTATGGGAACTCCCCAATTTTCAGCAACTGTATTGAAGGGCTTGCTAGATAATCCTGCCTATGAGATTTTAGGAGTGGTTACTCAGCCTGATCGAGCTGTTGGACGCAAAAAAGATATTAAGGTAACACCTGTAAAGCAATTAGCTCTTGAGCATGGAATATCAATCTATCAGCCGGAAAAATTATCAGGCTCTCAAGAACTCATTGAGATTATGGGACTTGGTGCAGATGGTATTATTACAGCAGCATTTGGCCAATTTTTACCAACAATATTACTTGATTCAGTTTCATTTGCTATTAATGTACATGCATCATTGTTACCTAAATATCGAGGTGGAGCACCTATCCATTATGCTATTATGAATGGAGATAAAGAGGCCGGCGTTACTATTATGGAAATGATTAAAGAAATGGATGCAGGTGACATGGTCGCTAAAGCAAGCACTCCAATTCTTGAAACCGATAATGTAGGTACTCTTTTTGAGAAATTAGCCATCATTGGTCGAGACTTACTTTTGGATAGTTTGCCAGCTTATCTTTCTGGAGAATTAAAACCTATTCCTCAAGATCACAGCCAAGCTACTTTTTCACCTAATATCTCTCCAGAACAAGAAAAATTAGATTGGACAATGTTTAATCAAGAAGTGTTCAATCATATTCGAGGTATGAACCCTTGGCCGGTAGCGCATACGTTTTTAGAGGGGCAACGTTTAAAAATTTACGAAGCTCAACTAGCTGAAGGAGAAGGATTGCCTGGACAAGTTATTGTCAAAACCAAAAAATCTTTGGTAATAGCTACTGGACAAGGTGCTTTGTCCTTGATCGTTGTGCAACCGGCTGGTAAACCTAAAATGTCAATAATAGACTTTTTAAACGGCATTGGTAGAAAACTTGAAGTAGGGGACATCATTGGCAGATAATTGGAAAAAAAGTACGCGAGGCAAAGCCCTCCTTGTCATTGAAGCTATTTTTGATCAGGGGGCTTACACAAACATAGCGCTTAATCAGCAGCTAAGCAATAAAGCTTTATCTGCTAAGGACAGAGCTCTATTAACTGAGATTGTATATGGTACCGTTTCACGTAAAATTAGCTTGGAATGGTATTTAGCCCATTATGTCAAAGACCGAGATAAATTGGACAAATGGGTTTATTATCTCCTTATGCTCAGTCTTTATCAACTGACTTATTTAGATAAGTTACCAGCGCATGCCATTGTTAACGATGCGGTTGGTATTGCCAAAAATCGTGGCAATAAAAAAGGTGCAGAGAAGTTTGTCAATGCTATTTTACGTCAATTCACCAGCCATCCTCTCCCAGATATGGAAACAATTAAGCGTCGAAATAAGTATTATTCGGTCAAGTATTCACTGCCTGTTTGGTTGGTTAAAAAGTTAGAAGACCAATTTGGTTCTGACAGATCAGTGGCCATCATGGAAAGTTTATTTGTGCGTAGTAAGGCTAGTATTCGCGTGACAGACCCTTTGAAGCTAGAGGAAGTTGCTGAGGCTTTAGATGCAGAACGTTCCCTTTTATCAGCAACTGGTTTAACCAAAGCGTCAGGTCATTTTGCAGCCAGTGATTATTTCACAAATGGGGACATCACTATTCAAGATGAAAGCAGTCAGCTTGTAGCTCCTACTTTAAACATTGACGGTGACGACATAATTCTTGATGCGTGTAGCGCTCCAGGGGGCAAGACCTCTCATATAGCATCTTACTTAAAAACAGGTAAAGTTATTGCCTTAGACCTCTATGATCATAAACTAGAGTTGGTGAAGGAAAATGCTAACCGCTTAGGAGTTGCTGATAACATTGAGACAAGAAAACTAGATGCCAGAGAGGTTCATCGTCATTTTGAAAAGGATAGCTTTGATAAGATTTTGGTGGATGCTCCTTGCTCAGGAATTGGTTTGATTCGTCGAAAACCCGATATCAAATATAATAAAGAAAGTCAAGATTTCAATGCTCTGCAAGCTATCCAGCTAGAGATATTGTCTAGTGTTTGTCAAACCTTGCGTAAAGGTGGTATAATAACATACAGTACTTGCACTATTTTTGATGAGGAGAATCGTCAAGTCATCGAAGCATTTTTACAAAGTCATCCTAATTTTGAACAAGTAAAACTGAACCATACACAAGCAGATATTGTCAAGGATGGTTATCTTATTATCACACCAGAACAATACCAGACTGATGGCTTCTTTATTGGACAAGTCAGACGAGTCTTGTAGTATTTTAGGAGGAAACTGACTGAGTCAGAAAAAACGTATGAAGATTTCATTAAAAACAGACATTGGGCAAAAACGCTCAAACAATCAAGATTTTATCAATAAGTTTGATAATAAAAAAGGCATCACTTTAGTGATTTTAGCAGACGGTATGGGTGGCCACAGAGCTGGAAATATTGCTAGTGAGATGACAGTCACAGACCTGGGAAGAGAATGGGTAAAAACAGACTTCACAGAGTTAAGTCAGATTAGAGATTGGTTATTTGAAACTATCCAGTCAGAAAATCAACGGATTTATGATCTAGGCCAATCAGAAGACTTTAAAGGAATGGGAACGACTGTTGAAGCAGTAGCTTTAGTTGAATCTAGCGCCATTTATGCTCATATTGGTGATTCACGGATTGGACTTGTCCATGATGGGCATTATACCTTATTGACCAGTGATCATTCTTTAGTGAATGAGTTGGTTAAGGCAGGACAGATCACAGAAGAAGAAGCTGCTAGCCATCCACAAAGAAATATTATCACTCAATCTATTGGTCAAGCTTCCCCAGTAGAGCCTGATTTAGGAGTGAGGGTTTTGGAGCCAGGGGATTATCTTGTCATTAACAGTGATGGTCTAACCAATATGATTTCAAATGATGAAATTGTGACTATCTTGGGCAGTAAGGTTAGTCTTGATGAAAAAAACCAAGAAATGATTGACTTAGCTAACCTAAGAGGAGGCCTAGATAATATTACAATCGCTTTGGTTCACAACGAAAGTGAGGACGTCGAATGATTCAGATTGGCAAATTATTTGCTGGTCGTTATCGCATTCTGAAATCTATTGGCCGCGGTGGTATGGCGGATGTTTATTTAGCAAATGATTTGATCTTAGATAATGAAGACGTTGCAATCAAGGTCTTGCGTACCAATTATCAAACAGATCAGGTAGCAGTTGCGCGTTTCCAACGAGAAGCGCGAGCCATGGCTGAATTGAACCATCCCAATATTGTTGCCATCCGGGATATAGGTGAAGAAGACGGACAGCAATTTTTAGTAATGGAATATGTGGATGGTGCTGATCTAAAGAGATACATTCAAAATCATGCTCCATTATCTAATAATGAAGTGGTTAGAATTATGGAAGAAGTCCTTTCTGCTATGACTTTAGCCCACCAAAAAGGAATTGTACACAGAGATTTAAAACCTCAAAATATCCTACTAACTAAGGAGGGTGTTGTCAAAGTAACTGATTTCGGCATCGCAGTAGCCTTTGCAGAAACAAGCTTGACACAAACTAATTCGATGTTAGGCAGTGTTCATTACTTGTCTCCAGAACAGGCTCGCGGCTCCAAAGCTACGATTCAAAGTGATATTTATGCGATGGGGATTATGCTCTTTGAGATGTTGACAGGCCATATCCCTTATGATGGCGATAGTGCTGTTACGATTGCCTTGCAACATTTTCAAAAGCCTCTTCCATCTATTATCGAGGAGAACCACAATGTGCCACAAGCTTTGGAGAATGTTGTTATTCGAGCAACAGCCAAGAAATTAAGTGATCGTTACGGATCAACCTTTGAAATGAGTCGTGACTTAATGACGGCGCTTAGTTATAATCGTAGTCGGGAGCGTAAGATTGTCTTTGAGGATGTTGAAAGTACCAAACCCCTCCCCAAAGTGGCCTCAGGTCCCACCGCTTCTGTAAAATTGTCTCCCCCTACCCCAACAGTGTTAACACAGGAAAGTCGATTGGATCAAACTAATCAAACAGATGCTTTACAGCCCCCCACCAAAAAGAAAAAAAGTGGTCGTTTTTTAGGTACTTTATTCAAAATTCTTTTTTCTTTCTTTATTGTAGGTGTAGCACTCTTTACTTATCTTATACTAACTAAACCAACTTCTGTGAAAGTGCCTAATGTAGCAGGCACTAGTCTTAAAGTTGCCAAACAAGAACTGTATGATGTTGGGCTAAAAGTGGGTAAAATCAGGCAAATTGAGAGTGATACGGTTGCTGAGGGAAATGTAGTTAGAACAGATCCTAAAGCAGGAACAGCTAAGAGGCAAGGCTCAAGCATTACGCTTTATGTGTCAATTGGAAACAAAGGTTTTGACATGGAAAACTACAAAGGACTAGATTATCAAGAAGCTATGAATAGTTTGATAGAAACTTATGGTGTTCCAAAATCAAAAATCAAAATTGAGCGCATTGTAACTAATGAATATCCTGAAAATACAGTCATCAGTCAATCGCCAAGTGCGGGTGATAAATTTAATCCAAACGGAAAGTCTAAAATTACGCTCAGTGTTGCTGTTAGTGATACGATCACTATGCCTATGGTAACAGAATATAGTTATGCAGATGCAGTCAATACCTTAACAGCTTTAGGTATAGATGCATCTAGAATAAAAGCTTATGTGCCAAGCTCTAGCTCAGCAACGGGCTTTGTGCCAATTCATTCTCCTAGTTCTAAAGCTATTGTCAGTGGTCAATCTCCTTACTATGGAACGTCTTTGAGTCTGTCTGATAAAGGAGAGATTAGTCTTTACCTTTATCCAGAAGAAACACACTCTTCTAGTAGCTCATCGAGTTCAACGTCAAGTTCAAACAGTTCTTCAACAAATGATAGTACTGCACCAGGTAGCAACACTGAATTAAGCCCATCAGAAACTACTGCTCAAACACCTTAACAAAGAATAGTTAGTCTCATGTTTTACTAGCATGCCACTAACTATTCTTTTTAACTACTCGTCATATAAAGATGCAAT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69 | Streptococcus_pyogenes_phage(55.17%) | capsid,tail,portal,integrase,tRNA,holin,head | attL 593095:593110|attR 607722:607737 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
710759 : 770926
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029694|710759:770926|DBSCAN-SWA AATGAAATTAAAAGAGACACTTAATCTAGGAAAAACAGCCTTTCCAATGCGCGCAGGTCTTCCTAATAAAGAACCACAATGGCAAGCAGCTTGGGAAGAAGCAGATTTGTACACAAAACGCCAAGAACTTAATGCTGGCAAACCAGCTTTCCATCTTCATGATGGTCCTCCATATGCCAATGGAAATATTCACGTTGGGCATGCTCTTAATAAAATTTCAAAAGATATTATTGTTCGCTCTAAGTCTATGTCAGGCTTCCATGTACCTTATGTTCCAGGTTGGGATACACATGGTCTTCCAATCGAACAAGTCTTGGCTAAACAAGGTGTGAAGCGTAAGGAAATGGATTTGGCTGACTATCTTGATATGTGCCGTCAATACGCTTTAAGCCAAGTGGATAAACAACGTGATGACTTCAAACGTCTGGGTGTGTCAGCGGACTGGGAGAACCCTTACGTGACTTTGGACCCACAATTTGAAGCTGATCAAATCCGTGTCTTTGGAGCGATGGCTGATAAAGGATACATCTATCGTGGCGCTAAACCAGTTTATTGGTCTTGGTCTTCAGAATCGGCCTTGGCAGAAGCTGAAATTGAATACCATGATATTGATTCAACCTCTTTATACTACGCCAATAAAGTTAAAGATGGTAAAGGTATCCTTGACACCAATACGTATATCGTTGTTTGGACAACAACACCATTTACCGTTACAGCATCACGTGGATTGACAGTTGGGCCTGATATGGATTATCTTGTGGTGAAACCTGCTGGTTCAGACCGTCAGTATGTTGTGGCAGAAGGCCTTTTAGATAGCCTTGCTGGAAAATTTGGTTGGGAGTCTTTTGAGACTTTAGCTAGTCATAAAGGAGCTGATCTAGAGTACATCGTGACAGAACACCCTTGGGATACTGACGTAGAAGAACTCGTTATCCTTGGTGACCATGTTACCCTTGAATCAGGAACAGGGATTGTCCACACAGCACCAGGTTTTGGTGAAGATGACTACAATGTTGGTACAAAATATAAACTGGAAGTTGCTGTGACAGTTGATGAACGTGGTCTCATGATGGAAAATGCAGGACCAGATTTCCACGGACAATTTTATGATAAGGTAACGCCAATTGTCATTGATAAACTTGGTGACCTCTTATTAGCACAAGAAGTGATCAATCACTCCTACCCATTTGACTGGCGGACGAAAAAACCAATCATCTGGCGTGCTGTACCGCAATGGTTTGCTTCTGTTTCTGACTTCCGTCAGGATATTTTAGATGAAATTGAAAAAACAACTTTCCATCCTTCTTGGGGTAAAACACGTCTTTATAATATGATTCGTGATCGTGGTGATTGGGTTATTTCTCGTCAACGTGCTTGGGGTGTTCCACTTCCAATCTTCTATGCGGAAGATGGCACAGCTATTATGACTAAGGAAGTGACAGATCATGTGGCCAATTTATTCCAAGAAAATGGCTCAATCATTTGGTGGCAAAAAGAAGCTAAAGACCTATTGCCAGAAGGCTTCACTCATCCAGGGTCACCAAATGGTGAGTTTACAAAAGAGACTGATATCATGGATGTTTGGTTTGACTCTGGTTCTTCTTGGAATGGTGTTATGAATGCTAGGGACAACCTATCTTATCCAGCTGACCTATACCTAGAAGGTTCTGACCAGTATCGTGGTTGGTTCAATTCATCCTTAATCACTTCTGTGGCTGTTAACGGTCATGCTCCTTATAAGGCTATCTTATCGCAAGGCTTTGTTCTTGATGGTAAGGGAGAAAAAATGTCTAAATCAAAAGGCAATATCATTTCTCCAAATGATGTGGCTAAACAATATGGTGCAGATATTCTCCGTCTCTGGGTAGCTTCTGTGGATACCGATAATGATGTCCGTGTTTCTATGGAGATTCTTGGTCAAGTCTCTGAAACCTACCGTAAAATCCGTAACACCCTTCGCTTCTTGATTGCTAATACATCTGATTTCAACCCTGCTACGGATACAGTAGCTTATGCAGACTTAGGAGCTGTTGATAAGTACATGACAATTGTCTTTAATCAGTTGGTAGCAACGATTAATGACGCTTATGAGCGTTATGACTTTATGACTATTTACAAAGCAGTGGTGAACTTTGTTACGGTTGATTTATCAGCCTTCTATCTTGATTTTGCTAAAGACGTTGTCTATATTGAAGCTGCCAACAGCTTAGAACGTCGTCGCATGCAGACAGTCTTCTATGATATCTTGGTTAAGATTACGAAGTTATTGACGCCAATCTTGCCTCACACTACTGAAGAAATCTGGTCTTATCTAGAGCATGAGTCAGAAGCATTTGTTCAATTGGCAGAGATGCCTGCGGCAGAAACCTTCTCAGCTCAAGAGGATATTTTAGAAGCTTGGTCAGCTTTCATGACTTTGCGTACCCAAGCTCAAAAAGCTTTGGAAGAAGCGCGAAATGCCAAGGTTATTGGGAAATCATTGGAAGCTCATTTAACTATCTACGCTAGCGAAGAAGTGAAAACCTTGTTGACAGCGTTGGATAGCGATATTGCTTTACTTTTGATCGTGTCTCAATTAACCATCGCTGACTTGGCAGATGCTCCTGCTGATGCCGTAGCATTTGAAGGTGTTGCCTTTACAGTTGAACATGCAGTGGGAGAAGTTTGTGAGCGTTCACGCCGTATTGACCCAACTACTCGCATGCGTTCTTACAATGCATTTGTCTGCGACCATAGCGCTAAGATCATTGAAGAAAATTTCCCAGAAGCTGTTGCTGAAGGGTTTGAAGAGAGTGGCAAATAAGTCTTATCAAGACTTGAAGTGACACTGAGTAAGAAGACAACCATCGGGTCTTAGGACCTGATGGTTTTTTAGTAGAGCTGATTACGTCCATTAGCCAGCTTTAACGAGAGACAAAGTAGGAGAAATTTAGACTACTTTTTTAATTTCTTTTAAGAAAATTGCTGGCTTCATATAAGGACTATTAAGATAGAGTTCACCTTTCGCTAATAAAAAAACTTAGCTCTTTTAGAAGGGCTAAGTTTTGTCTGAATAGCTGGCTGCTGTTTATACAGAAGTTTGAAATGAAATTTCAATAAGGTTATTCGTGTGAAGTGTTTTTGATTGTCCAGGAATAACAATTTTAGGATCAATTTTACGTTTTAAAAAAAATTCGCGAATGATATCAAGTTCATCCTCCTTGATGGCACGGTATTTATTTGAAATAAGTAGTTCGTAATGTTTTGGTGCTTGGGTAAAAATGACATCTGTATTCCCTGCTGAGTATACTTCGACTAAATAGGCATCGGTGTTTTTTAGCTGATTTCTGATGAGTTCTGGGTGACTGCTAGTGGTATTGATGAGTCTCATAAATGTCCTCCTTAGTATTCCTGTACCTATTATAGCACTAATTTAAAGCCTTAGTTAGTAGAATGATGCTTTTTTTGCCATTCCTTGACTCCCCATTGATGGCTCTCTCGTTTTAATTTAGCAATTGCCTCGATAGGAGAAAACCAACCTAAGTTATTAAAATCTTCTAAGGGCTTAGAAACGGCTTGAAATGCAGTTACTTCATAAAGATAGGCAGGATGGTAGAAGTGGGTATCACGATGGCGAGAGTAGAAATATTCATCAGCCTGACCGTAATATGAACCAATAGTAGCAGAAAAACCAAGTTCTTCAATCAGTTCACGCTCTAGGGCCTGAAGCTGACCTTCACCTGCTTCAATTTCACCACCAGGTAAAAACCAGGAACCATTAGGAGCTTGAACAAGAATAATTTTTGTTTGTTCGTGATTGGGAATGATAGCATAGACACCGTAACGTGTGACATAGTCTTTATGTGCATTTTTATGTCCAAATGTTGGAATCATCATTTTATTTACCTTTCCTTTTTCTTCATTATACTAAATTTTTGCTAATTATTCTTATCAATTTGTTTAGTTTAATAAAAAATTGATAGAAAAAGAGAGAGTCTCCTTATAGAAACTCTCTTAGCTAACGTTAATCGAGAGACTCTTCGTTAAGAAAAGAATCTCCCTCTTTAACAGCTTTAATCGTGATATTTTCACTGTTTGTCATCAGTGCACGTAACTGTTTTTCAGTTGGGTGCTCTAAATAATAGTCTGTAATGGCATCTTCTATATAATCTTGGATAGTACGACGGAGCGGCCGAGCGCCCATTTTAGGATCATAGCCTAAATCTACTAATTTTTCTTTGACCTTTTGTGTCACATCAAGATGAATCCCATTATAGCCTAAGCGCTCATTAACATCTTCCAGCATTAAATCAACGATATGCAGCAAATGCTCTTTAGATAAAGCTTTGAATTCAATAATACCATCGAAACGATTCATAAACTCTGGGCTGAAGAAGTTGCTTAATTCACCAAGGACAGAACTTGTCCGTCCTTCTCTAGCAGCACCAAATCCGACAGAAGCTTCGCTTTTACCTGTTCCGGCATTAGAGGTCATGATAATAATGGTGTCCTTGAAGCTGACTGTTCGTCCTTGACCATCTGTTAAACGGCCATCATCAAGAACTTGTAAGAACATGTGCATGACGTCAGGATGGGCTTTTTCCACCTCATCTAAGAGAATAAGTGAATATGGATTGCGACGAACTTGTTCGGTTAGCTGTCCAGCTTCTTCATAGCCGACATAACCTGGAGGAGCCCCGACTAATTTGGCGACAGCGTGTTTTTCCATGTATTCGGACATGTCAAAGCGAATCATATTGTTTGTCGAACCAAAGAGTTCAATGGCTAGTTGTTTAGACAATTCAGTTTTACCAACCCCAGTCGGTCCAACGAATAAGAAAGAACCAATAGGGCGATTTGGAGTTCCTAATCCCACACGGTTACGACGAATAGCCTTAGCGATTTTATCAACAGCATCGTCTTGCCCGATCACGTGTGCTTTCAGATCATTGGCTAAGTTTACGAGTTGAGACTGTTCCTTTTCTTTTAAGTCCCCAACTGGAATATTAGTTTTTTGCTCT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>CP029694|710759:770926|744976_745321_+|AYO92561.1|DBSCAN-SWA MSQLRADKKGTHRVAFEKNKRKLLKTTNLCGICGKPVDKTLKYPHPLSAAIDHIVPIAKGGHPSALENLQLTHWQCNRQKSDKLFANQASNEPKTIGNRNLPQSRDWSSFTLKK >CP029694|710759:770926|748581_748806_+|AYO92565.1|DBSCAN-SWA MEPKLHRQLRQKYDDAEKQYLEKFGEDSLDRVFFWEPDVYFDEWKKVLPDATLELNKAINSGVAIDPDPENAIY >CP029694|710759:770926|736409_736721_+|AYO92544.1|DBSCAN-SWA MPKAEITYRAVDVNETASHGDYKHLIQQWEGLTVATAKQWATEMRDHPDFKQFVLNPTHRIVFIDYKGFKLFVQWKSRNRYKTKKETLPEMLENIKFEKRVGV |
73 | Streptococcus_phage(64.91%) | terminase,capsid,tail,portal,protease,integrase,tRNA,holin | attL 733069:733088|attR 767469:767488 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1219707 : 1230311
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029694|1219707:1230311|DBSCAN-SWA CTTACCTAACTTTCTGTGTTTTATCATAAATCTGTTTGAATATGGTCAAAAATTGCTCTACTTGTCCCATATCGTTGTCATCGTCTAGACTAATACGAACGGCTGTCTGGGCAGTTTTTACAGGAATCCCCATAGCCACTAGGCTTCCTGCTGGCTTACCTGCTTTGGACGAACATGCACTTGTGGTCGAAATATAAATCTCATATTTTTCAAAGGCGTGGACAATAACTTCTCCTCGAACCCCTCTAATCCCAAAGGTCAAAATATTGGGCACAAAGCCTTCTTGAGCTGAAAATACTGTCACATCTGGGTAAGCGGACAAAGCTTTGTAAATCACATCTCGCATCGCTGTTAGTTTAGGTAAGACGCTCACTTGTTTTTCAGTGACTATTCTTAATGCTTTGGCCATGCTAGCAATTCCTGCAACATTTTCAGTGGTTGAACGTAACTCCTGCTCTTGGCCGCCGCCTGACAAGAGAGGATTGAGTCGCTTGCCTGCTTTTTTATAAAGGAAGCCAACACCACGAACACTATGAAATTTGTGCCCTGAAAAAGAAGCCAAATCCACACGATTAGTCATATAATCACAGAGTGGTATTTTACCAATGGCTTGAACAGCATCAACGTGAAAGGTGATCGTTAGTTGGTTAGCCAATAGGTTTGAAATGGCTCTAATCGGTTGGATAGCTCCCATTTCATTATTAACAGCCATAATCGAGATTAAGATGGTGTCTGGTCTAATCAGCTCAGCTAAAGCATTCACATCAACAACTCCCTGTGTTGTCACTGGAGCATAAGAAACTTCGAATCCTTGTGTGAGAAGCCATTTGACACTTTCACTCACGGCAGGGTGTTCAATGGCTGAGATAATAATATGTTTGCCAAAAGCGGTTTTTTCAAAAGCAATTCCCTTAATAGCCCAATTAGCACTTTCAGTCCCACCAGACGTAAAAAAGATTTCTTCTGACTTAACACCCAACAAACCAGCAATCTGTTTACGGGAAGCTTCTAAAATGCGAGATGCATTTGTCCCTAGTTGGTGCAGACTTGAGGGATTGCCATATATTTTTGTTGCTACTTCTTGGTAAGTTTTAAGAGCCTCTCCATAAGGTATGGTTGTGGCTGCATTATCAAAATAAATCATGTGTCACCTTCATTTTTACTCAATACTTTATTCTATCACAAAATAGCTAAAATGAAATCAAGAATATTCGTATTACAATAAGCCCAAAGGACTTCCTTGTCCTAGACATAAGGTAAACCGTTGACTTCACTTTTTTTCTAGATTATACTGATAGATGAAGTGTTAAAGAGGAGCTAGGACTTCTATTTCCTCCTCCTTAATCTTGGCATTACGATGATTTTAAAGGAGAAAAATATGTCATCACATTATTCCCGTCAACAAAAACCTCGTAAATCAGGAGGTGTCCCTACCGAGCATATTAAAACAGGTTTTACAGCTTTCCAAAAATCCATTGCACTTATTGGTAGTATTTTGAGTATCATTGTGGCAACCATTACCATTACAAGAGCACTGCAGCCTGTACCAGATAAGACCTCTAATGATACACCCAAAGAATCGAGTAATACCATTGTCAAGATTATTGAAAAAGAGTCTTCTCAGGGTAATCAAAACCATACAGGTACTTCAGAAACCACAGATGATAATAAGACAACTCTTCCGTCATCTTCTACCACACCTTCTCACAACGAGACAACTCCTACAGCCCCTGAGACACCATCAACCACTGAAGGGATGCAACTCCCTAATGCAACTGGAGCTGAAGATGCTAATACTGGTCTTCCTACGAACCCTTAGAAGCATTGTTAGAAGGACAAGAAATAGTAATGACTACCTATGATAGCATTTCCTGGATTCATACCTTTAAGGCTAATGGTCGCAAGACCGATTTGGCCAGAATGGCTTGGTTACTTGAGGCACTAGGCCGGCCACAAGACAAATTCCCTGCTATTCACGTTGTTGGAACTAACGGCAAGGGCTCTGTGACAGCCTACTTACAGCATATCCTGTCAACTTCTGGTTATCAGGTCGGAACCTTTACATCTCCTTTTATCATCTCTTTTCACGATCGGATCTGCCTTAATGGCCAGCCCATTTCAGACCTAGAATTGGCGCAATGTGTGAGCGTGATTAGACCCATTCTCACTAAAATGTCCCTTGAAACAAATTGGGATAGACCTACCGAGTTTGAGTTAGTGACTCTCATAATGTTTTGCTACTTTGCCAATCTTAAACCTGTTGATATTGCCATTATTGAGGCAGGGATTGGTGGGAAAACCGACGCAACCAATGTCTTTCATGCTCTGGCCGTCGTATGCCCTTCCATTAGTTTTGATCACCAAGAACGTTTAGGTTATAGCCTAGCAGAAATTGCTCACCAAAAAGCAGAAGTTATCAAAGCTAAAGAACCCGTTATTATCGGTCAACTTGAGCAGGAGGCTAGTCAAGTCTTTCAACAAGTTACCCAAAAAGCCGGTTCACGCTTATATCAATTAGGAAAAGATTTTTTGCTCAATCCTTCAGAAAAGACGTTTTCCTTTCAACACGATAACTTGAATTTAACCAAACTCCGTCTCAAACTATTAGGTCAACATCAAAAAGCGAATGCCTGTTTAGCCATTATGACAGCTCAATTACTTAGAAAATCCTTTCCTAAAATATCTCCAAAAACGATTCAAAAAGGAATTGAGGCAACAACTTGGCCTGGCCGGTCCGAATTTATTCAACCTAATCTTCTATTAGACGGCGCTCACAATCCAGATTCCATTGCTAAATTAAAGTCTTTACTGCAAGAAGAATTTCCCAAACGTCCTATTCATATCCTCTTTGCAGGTCTCAAACGTAAGCCTTTAGCCGACTTGCTGGCTCAACTAGATACTTTTGAAGTATCTGTCACGACTTTTGATTTCCCTGAAGCAAATCTTTTAGAGGATTATCCTGATAAATACCCACAGGTAAAAGATTACAGAGACTGGTTACAAGGTTCCGTAACATCTGATGAACTCTTTGTTGTTACAGGGTCACTTTATTTTATCTCCGAGGTAAGGCAATATTGTCTGAGCAACGCAAATATCTTTAAAAACATATTCCCCCTAATCACCTAACAAAAAACGATGCTAGCAGTTTAGAAGACTTTCCTCGAAAACTGTTAACATCATTTTTTATTGCCTTAGGCTACATTTTTTAGCGCATGGTGACAAATTCTTCTGAGCCAGTTGGGTGAATAGCAACGGTGTTATCAAAATCCGCCTTGGTTGCTCCCATTTTGATAGCTACTGCAAAGCCCTGAATCATTTCGTCAACCCCATAGCCGATTCCGTGAAGACCAACTATTTTTTCGGTATCTCCGACTGTTACCAACTTCATCAGACAAGGTTGGCGATGGTTAGTGATAGCAGTAAACATAGACGTAAAACGTGATTGATATGTTTTAACTGCTTCTTGCCCATACTGTTTGACTGCTGCTTCTTCTGACAAGCCAACAGAGCCAATAACAGGGTGACTAAAAATCACAGTAGCAACGTTTTGGTAGTCCAATTTCTCGTCTGTTTTGCCATTGAAAAGACGCTCTGATAGGCGACGTCCAGCTGCCACAGCAACTGGAGTTAAAGCCAGTTTCCCATTAACATCTCCCACGGCATAAATACCTTTGACAGACGTGTTTTCATAGGCATCTGTCTCAATATAACCTTTATCATTTAACGTCACTCCAGTTTTGTCAAGACCAAAACCTTCTAGATTAGGCTTGCGACCGATAGCCCAAATGAGCTGGTCAACCTCAACTTCTTGGCCATCTTTGAGGTAAAGGGTCAAGGACTCATCAGTATTTTTGACAACCTTTGCCACTTCTGAATGAGGGTGTAAGCAAGGACCACCAACTGCCATTTCCTCAACTAAAACATCCACAATGGCTTTGTCAAAACTTCTTAAAGGTCGATCGTGACGGATAAACAAATCCGTCTTCGACCCCAAAGCATGCAAAACACCGGCAAGTTCCACAGCAATATAGCCTGCCCCAACCACAGCCGTACGTTTTGGTACCTCATCTAAGGCAAAAAAGCCGTCCGAGCTGATACCGTATTGTGCCCCCTCAATATCTGGAAAAACAGGATGTCCTCCTGTGGCAATCAAAATATGCGGTGCGGTATAAAGCTGCCCTGCAATTTCTACCGTATGAGCATCTTTGAAGACAGCATAATCATAAATACGGTTAACACCATTCTGCTCAAAGCCTCGCTCATAAGAAACATGAATCCGATCAATATAAGCTTGACGATTTGCTTTCAATTGTTTAAAATCAAATGCTTTCTCTTTAAAGTCAAATCCATAATCCTTAGCGTAAGTCCCTAAAATATCTGCTACTTGAGCGCCATACCACATGACTTTTTTAGGAACGCAGCCTAGGTTAACACAGGTTCCCCCAATCTCTTTACCTTCAGCTAACAATACTTTGGCCCCATGCATGGCTGCCCTGTTCGCAGAAGCAATACCTGCACTCCCTCCACCAATAACAATATAATCATAAGGAATAACCATTTTTATCACCTTTTACTTTCTAATACTGATGTTTTAGCATAGCCAGTTAGCAGACAATTTGCCTTCATTAAAGCCACTACTGGCCTGCTATTTTGGTCACTTTATTTGACTATATCACAAATAAGAAAGAGGCTCAACTTTCTGATACAAAGAAAATAAACACTAAAAAACAGATCCTGACGAGCTGCCAGCAATCTGTTTTTTTCCTATCTTAATTGGCTTACTTGACTAAATCTTTCAACGGAGCAAAGACGATACGTTCAATATCACTCATGTAAACAGATAAGGCCTGCTGCGCTTCAAAATAAGCTTTTAGCTGGTCATTAGCTTCAATCTTTTGGCTAAGTTCTTGAATGCTTGTTTGTTCTTCAGCCGTTGGCATTTGGCCTGATTGCATCATCCCTTGGATTTTTTCTTGCATAGCGACAAACTCATCAAACAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029694|1219707:1230311|1224484_1224826_-|AYO93002.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADASTSQLFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK >CP029694|1219707:1230311|1221084_1221525_+|AYO92999.1|DBSCAN-SWA MSSHYSRQQKPRKSGGVPTEHIKTGFTAFQKSIALIGSILSIIVATITITRALQPVPDKTSNDTPKESSNTIVKIIEKESSQGNQNHTGTSETTDDNKTTLPSSSTTPSHNETTPTAPETPSTTEGMQLPNATGAEDANTGLPTNP >CP029694|1219707:1230311|1222911_1224264_-|AYO93001.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHVSYERGFEQNGVNRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKAIVDVLVEEMAVGGPCLHPHSEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFGLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNGKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >CP029694|1219707:1230311|1228100_1230311_+|AYO93006.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYDNSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNTKNRE >CP029694|1219707:1230311|1226829_1227993_-|AYO93005.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLETKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >CP029694|1219707:1230311|1221554_1222832_+|AYO93000.1|DBSCAN-SWA MTTYDSISWIHTFKANGRKTDLARMAWLLEALGRPQDKFPAIHVVGTNGKGSVTAYLQHILSTSGYQVGTFTSPFIISFHDRICLNGQPISDLELAQCVSVIRPILTKMSLETNWDRPTEFELVTLIMFCYFANLKPVDIAIIEAGIGGKTDATNVFHALAVVCPSISFDHQERLGYSLAEIAHQKAEVIKAKEPVIIGQLEQEASQVFQQVTQKAGSRLYQLGKDFLLNPSEKTFSFQHDNLNLTKLRLKLLGQHQKANACLAIMTAQLLRKSFPKISPKTIQKGIEATTWPGRSEFIQPNLLLDGAHNPDSIAKLKSLLQEEFPKRPIHILFAGLKRKPLADLLAQLDTFEVSVTTFDFPEANLLEDYPDKYPQVKDYRDWLQGSVTSDELFVVTGSLYFISEVRQYCLSNANIFKNIFPLIT >CP029694|1219707:1230311|1226146_1226833_-|AYO93004.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >CP029694|1219707:1230311|1219707_1220850_-|AYO92998.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTIPYGEALKTYQEVATKIYGNPSSLHQLGTNASRILEASRKQIAGLLGVKSEEIFFTSGGTESANWAIKGIAFEKTAFGKHIIISAIEHPAVSESVKWLLTQGFEVSYAPVTTQGVVDVNALAELIRPDTILISIMAVNNEMGAIQPIRAISNLLANQLTITFHVDAVQAIGKIPLCDYMTNRVDLASFSGHKFHSVRGVGFLYKKAGKRLNPLLSGGGQEQELRSTTENVAGIASMAKALRIVTEKQVSVLPKLTAMRDVIYKALSAYPDVTVFSAQEGFVPNILTFGIRGVRGEVIVHAFEKYEIYISTTSACSSKAGKPAGSLVAMGIPVKTAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYDKTQKVR >CP029694|1219707:1230311|1224886_1226053_-|AYO93003.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGPSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEKEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF |
9 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1265721 : 1361995
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP029694|1265721:1361995|DBSCAN-SWA 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107 | Streptococcus_phage(55.07%) | terminase,capsid,tail,portal,protease,holin,tRNA,bacteriocin,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1536030 : 1542064
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029694|1536030:1542064|DBSCAN-SWA AATGAAACTGATTTCATGGAACATTGATTCCTTAAATGCTGCTCTCACAGGAGAGTCCCCTCGTGCGCTTTTATCACGCGCTGTTTTAGACACTTTAGTCGCTCAAGATGCGGATATTATTGCCATTCAAGAAACCAAATTATCTGCTAAGGGGCCTACCAAAAAACATATCGAGGCCTTACTTAGTTACTTTCCAAACTATTTGCATGTGTGGCGTTCTTCAGTTGAGCCTGCTAGGAAAGGCTATGCTGGCACCATGTTCCTGTACAAAAACACGCTAAACCCTGTCATTACTTTTCCAGAAATTGGTGCCCCAACAACAATGGATGCTGAGGGCCGTATCATTACCCTAGAATTTGAAGACTTTTTCGTCACACAGGTTTACACGCCTAATGCTGGTGATGGCCTTAGACGTTTAGATGACCGTCAAATTTGGGACCACAAATACGCTGATTACTTGACTGAACTGGATGCTCAAAAGCCTGTTTTGGCTACGGGAGATTACAACGTTGCCCACAAAGAGATTGATTTGGCAAATCCAAGCAGCAATCGACGTTCCCCTGGTTTTACCGACGAAGAACGTCAAGGCTTTACTAACCTATTAGCAAGAGGCTTTACAGATACTTTTCGTCACGTGCACGGCGATATTCCTCATGTTTATACCTGGTGGGCACAACGTAGTAAAACCAGCAAAATCAATAATACCGGTTGGAGAATTGACTATTGGCTAGCTTCAAACCGAATCGTGGATAAGGTTAAGCGTTCTGAAATGATTTCTTCTGGGGAACGTCAAGACCATACGCCAATTTTACTAGATATTGATCTCTAATGTCTAAAAACAGATCCCAAAAAAGGACAAGGCGTTATAATGTTGCCTTGTCCTTTTTTGAGACTTTGTCGCATTATCCTAAATCCAACTCTTGATATGGCTTGCGATAGCCAACTTGTAGGACTTTACCGTCCTTAATCAGAATAGGCCGTTTAATCAGCATACCATCTGTGGCTAAGAGTTCAGCAGCTTTATCAAGGCTAAGCTGGTCTATTTTATCTTTAAGTCCCAATTCGCGGTAGCTGTTACCACTGGTATTAAAGAAATTTTTGATGGTATAACCAGATGTTTCCATCCAATGTTTGAGGTCCTGAGCTTTGGGTGGATTAGCTTTGATGTCAATGGCTTCAAAGTCACTAACCAGTTGCTTTAATTCAGCCATGGCTCTTTGGCAGGTGCTACATTTTGGGTATTGGTAAATCGTAATCATTTGTTCTCCTTTAGGGTAACTGTTTTAGGCGTGAGGCGCCCGTTTTTGGTCATCATTTCACAAAAAAAGGGGGCTTTTTTAAAATGCTAAGCTTTGTCTTTCTTTTCTTCTTGAGAGTTCGTTGGTAAAGACTGATATTGCCGTAGAACATAGCAATCTTTTTTCAAAGTATTTGCTGCTGTTTTGGCCTACTTTTAATACTAGTGAGTATAGCATAATGTCCATGATTTGACAAAAATGTTTCCTGATGACTAGCTTCATTCGTGCTATAATATTAGTGATAAAGGAGATCTAAAAATGATTAAAGAATTTTGTGCTGAGAACCTCACACTACTGCCAACCCTTGATGCTGGTCAAGTCAGTCGTGTGGAACTCTGTAATAACCTAGCTGTCGGAGGGACCACGCCATCTTATGGCGTCATCAAAGAAGCCTGTCAGCTCTTACACGATAAAAAGATTAGCGTAGCGACCATGATTCGACCTCGCGGTGGCGATTTTGTCTATAACGACCTCGAACTAAAAGCTATGGAAGAAGATATCTTAAAAGCTGTTGAAGCTGGCTCAGATGCGCTAGTCTTAGGCTTGCTGACCACAGAAAATCAACTGGATACCGACGCTATCGAGCAATTACTGCCTGCTACACAAGGCTTGCCTTTGGTTTTCCACATGGCTTTTGACCATATTCCGACTGATCACCAGCACCAAGCGCTTGATCAACTGATTGATTATGGCTTTGTGCGTGTGCTAACTCATGGCTCCCCTGAAGCTACTCCTATTACAGACAATGTGGAACAACTTAAAAGTCTTGTGACCTATGCCAATAAACGCATTGAAATCATGATTGGAGGAGGCGTCACTGCTGAGAATTGCCAAAGCTTGAGTCAACTCACTGGAACGGCCATTGTTCACGGGACTAAAATCATTTAAACACCTAAAAGACCATCAATAAATCCAATTGATGGTCTTTTCTCTCTTAGTTTAAAAGATGTGGCACAGGGTGGCATTCTTGTGTGGTATAAGTTTTTCCAAAAGCCACTATCAAAGAAGCAATGCCTGGGAAAAACAAGCCAAATACTGCTAGACCCTTTGATCCACCAAAAGCACGGACATAGCAAAAGTGCACATAATAATAATAAATAGCAATGACCCAACCAATAAAGTAAAACCATTTATTATCTTCTCCAAAAGTGATTTTGTGTTTGACAAAACCTGCATAGAAAGGAATGAGACTATACCATCCTTTGTAACCTGCTCTTTTAAAGAGTCGCCAGTTAGCGATAAGGCATAATAAAGCTGATAATAAGAATACAGCCAATATGATTCCGTATACTCCTAAAATAAGGATAGTTGCTTGATCTTCTGTCATTTGTTTTTCTCCTAATCTACGATGACTTATAAGTCATGAAATTGTTGGTAAAGCTCTTGGCGATTTACCTGGTAAGCTTTAGCAATTGTTTTAATAGCCTGATTTGGCTTGGCTCCTGCTTGGATTTCTTTTTGCACTAGAGACACTAAGTCAACATCAGCTGTCAGCTCAACCTCACTGTCTACTTGGGCTCCAGCCACAATCAGCAGACACTCCCCTTTTAGGGATGTTTCCTCAAGGTAGGACAAGATTTCTGAAATCGACCCCCGTTGGTACTCCTCAAAAAGCTTGGTTAATTCTCTGACAAGCACCACTTGACGATCACCATAACAAGCCAACATATTGGTCAGGGTATCTTTGATGCGATAGGGTGATTCATAAAACATTTGTGTCTCTGGGTAATGGTGTTTGTCCTCAAAGAAAGCCTTTTGTTGCCCTGCTTTTCTGGGTAAAAACCCATAAAAAACATGGGGTTGAGGAGCCAGTCCACTAGCAATCAAAGCTGTAATCCCTGCTGAGGCACCTGGTAAAGCAACGACTGTGATATCACTATCAATAGCAGCCTTGACCAAATCATGCCCAGGATCAGAAATCGATGGCATTCCTGCATCAGACACCTGAGCTAGTGACCGTCCTGATATTAATAAATCAATTAAATCAGGAATCTTCTCATAGGCGTTGTGCTCATGAAAGCTGATTTGCTTGGTAGCAATGTCAAAGTGTTTTAGCAAAAGACCTGTGTTTCTTGTGTCTTCTGCACAAATAAAATCAACCTCTTTTAACGTTGCCACTGCTCTAAAGGTCATGTCCTGCAGATTGCCAATTGGGGTTGGAACCAAATACAAGGTTCCGCTTGTTTTTTTGTCTTTAAAACTTTTTTGAACCTGCATGCCCTTACTTTCTATCTAATAATTCTCTGCAAAACATACATTCTTCATCATTTTCACGACGTTGTCCATAAAAAAAATTGCAGATATGAAACCCTTCATCATAAATTCCTTCTAAGTGATCCTTCCTTTGTTTGGAAGGATTTTTAGCTGCCGTTTCATGTTCTAGGTGACTCAAACGTTCCCGTAGTTTTGTATTTTCTAGGCGAAGAATCGTGTTTTCTTCTACTAGTGATTGGACTTGTTTTTTCATGGCTTCAATTTCAGCTAAAGTAACCATTAAATTTTGGGAAAATCCATCAAAAGCATCGAATAATTCTTTTTTATTCACCTACTTTAACCTCCTCTAAAGCATAAGTGACTAAGGTCAACTGGTCTTTTAACCGCACCTTAATGGGATCTGTAAATATATCAACGGCTGCTACTGTTGCAGGGCCATCACTTGTCTCTACTATGGTACCATATTCAGGGAATTTTTTCTTGCTTTATTGGTAAAAGCCACCTTCATCATAGAGACAGCAAAGCAAACGGCCATAAGGGCTTGTTGCTTTACCCAAAGTCAATGATAACCCTTGATTTTTTAGTATTTTAATAGATACTGTCAGAAATTTTCCCAAAAACGAAAGCAGCACAGTGGCCTGCCACACGGTCCATAGCCTCCATAGAAAATGAAATCTTCTTGGCTGTTAATCTGGGGCAGCTCACTTCTTGACCTAAAATCGGCCGCTAAATCTTTTAACAGTTGTAAAAATCCATGTGCTCTTCTGCTGAAAAGGGAATTAGGACAACATGCTGATCTAAGGGAAAGACACTATTAATAAATGTCATTTCAAGTTGATTTTGTATACATTAATCGTGATACTTCTTTCATCAAATCTGTTGCAAAGGCAGTATTTTCTTCAAAAGCTTTTTTGCTCCTATGCGCCGCTACTTTGGTCGCTACGGGCAAGTCTTTTGACAAGCTTCGTTTCCCCATAACGAATTCCAATTGCACTTATTCTGACATCACCATATATTCTAATATGTTTTGGAAATTAACATTGCTCTGCCACATGAGCCTAGCCTGATAAACAGCCTCCAATTGTGTCAAAGGCGTTTGCGCACGCTCTCTTGCCAAGAGCAAGGTCAAAAGGGTCAAAACTAAATCTTGTTCTTCTTTTTCAGTTGCTAACTGTACCAGACGGTTCAACGCTAAATATGCCTGCAACTGATCTTTCAGCCAAATAGATACAAAACGCTCTGCTTGAGTTATCAGTTCTAAAAGCTTGCTCGTTTGCAACAGACGTTCTAGATGACTGGTGTTTGTGGCAAGTTTGGCTACTAACTTAGCCTGATGGTTTAATAATCCCTTTTCTTGTGCCAATTGGTAAAGATAGGCTTCGTTTTTAGGAAACTGAAAAACCTGTGTCCGACTTTTAATGGTCGGAAGCACTTTGTTATCATCATTGGTCAGCAAAAACATGTAAGCTTCCCCCTGAGGCTCCTCAATATACTTTAGCAAGCTATTAGCGGCATTGACATGCATTTTGTCACAATCTTTGATAATAAAAACTTGTCGTTTGTTTTCATATCCTGTCTGAGAAAAGTTAGCCATCATTTCTTTGACCACATCCGTTTTAATCACTTGCCCTGTTGGTTCCAATACCGTCACATCGGCAAAATCTCCTTGTTCAATCAATTGACAAGAGCGACAATGCCCGCAGGGCGTCTGATCCTTTTTTTGTTCACAAAAGATGACCTTAGCTAAAAAAAGAGCCATTTCTTCATTAGCAAAATCACCCGAAAAAAGATAAGCATGATTCAGACGGTCTTTCTTTAAAATTGTCTGAAAAGCTTGATAAACGTTAGGAGCTTTTTGCGCTAAATCCATTCCTACCCTCCCTTATCCTAGGCTAAAAGCAAGGTTAAGACATGTTCCAAAGCGACAGAGACAACTTCTTTCAATGGTTTAGTCGCATCAATTGTGACAATACGTTTTGGATGCTCCTTAGCTAAGGCTAGGTATCCTTTTCGTACTCGTTGATGTATCTCTATTGTTTCCAAATCTAAACGATTGACTTCTCTTTGTTGGTTCGCGTTAATCCGTGCTAAACCAATTTCAGAAGGAACATCAAAATAAAGGGTCAAGTCAGGCTCTAAACCATCTGTTGCGAACTCGTTGAGCCACTGAATGTCTGCTTTGATCAAACCGCGTCCCGCACCTTGATAAGCTACTGAACTATCGATGAAACGATCAATAAAAACCAACTGGCCTGCTTCAAGAGCTGGTAGTACCTTTTCCACCAAATGCTGCCTTCGAGCCGCAATATAAAGTAAGAGTTCTGTTTTAGGGTCCATAGTAGTATGGTTGATGTCTAAAATAAGTTCTCTAATGTATTCTGAAATGGCAACACCTCCAGGCTCTCTTGTTGTCAAGATCTCCTGAGCCACTTTTTGTTTTAACAGTGGAATGAGTTGCTCTAAAACAGTCGTTTTCCCTGCGCCATCTGGACCTTCAACGGTTATGAGTTTTCCTGTGATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP029694|1536030:1542064|1537585_1538215_+|AYO93307.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQVSRVELCNNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKKISVATMIRPRGGDFVYNDLELKAMEEDILKAVEAGSDALVLGLLTTENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDHIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKSLVTYANKRIEIMIGGGVTAENCQSLSQLTGTAIVHGTKII >CP029694|1536030:1542064|1536931_1537288_-|AYO93306.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMAELKQLVSDFEAIDIKANPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRELGLKDKIDQLSLDKAAELLATDGMLIKRPILIKDGKVLQVGYRKPYQELDLG >CP029694|1536030:1542064|1538261_1538654_-|AYO93308.1|DBSCAN-SWA MTEDQATILILGVYGIILAVFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWYSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIASLIVAFGKTYTTQECHPVPHLLN >CP029694|1536030:1542064|1536030_1536858_+|AYO93305.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTGESPRALLSRAVLDTLVAQDADIIAIQETKLSAKGPTKKHIEALLSYFPNYLHVWRSSVEPARKGYAGTMFLYKNTLNPVITFPEIGAPTTMDAEGRIITLEFEDFFVTQVYTPNAGDGLRRLDDRQIWDHKYADYLTELDAQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSPGFTDEERQGFTNLLARGFTDTFRHVHGDIPHVYTWWAQRSKTSKINNTGWRIDYWLASNRIVDKVKRSEMISSGERQDHTPILLDIDL >CP029694|1536030:1542064|1540535_1541411_-|AYO93311.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPNVYQAFQTILKKDRLNHAYLFSGDFANEEMALFLAKVIFCEQKKDQTPCGHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYENKRQVFIIKDCDKMHVNAANSLLKYIEEPQGEAYMFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLYQLAQEKGLLNHQAKLVAKLATNTSHLERLLQTSKLLELITQAERFVSIWLKDQLQAYLALNRLVQLATEKEEQDLVLTLLTLLLARERAQTPLTQLEAVYQARLMWQSNVNFQNILEYMVMSE >CP029694|1536030:1542064|1541428_1542064_-|AYO93312.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQLIPLLKQKVAQEILTTREPGGVAISEYIRELILDINHTTMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGQLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLIKADIQWLNEFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARINANQQREVNRLDLETIEIHQRVRKGYLALAKEHPKRIVTIDATKPLKEVVSVALEHVLTLLLA >CP029694|1536030:1542064|1539548_1539872_-|AYO93310.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSHLEHETAAKNPSKQRKDHLEGIYDEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK >CP029694|1536030:1542064|1538680_1539544_-|AYO93309.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKHFDIATKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLISGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDSDITVVALPGASAGITALIASGLAPQPHVFYGFLPRKAGQQKAFFEDKHHYPETQMFYESPYRIKDTLTNMLACYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGSISEILSYLEETSLKGECLLIVAGAQVDSEVELTADVDLVSLVQKEIQAGAKPNQAIKTIAKAYQVNRQELYQQFHDL |
8 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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