Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP033930 | Chryseobacterium indologenes strain H5559 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,DEDDh,PD-DExK,RT,WYL,cas3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. CP033930
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
1067000 : 1128463
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP033930|1067000:1128463|DBSCAN-SWA CATGGCAATAGGAATTAATGGGAAATATTCTATAGGAATTTTATCCACGTTTATACTTCTGGCAGCTACAATGCTGTATGTTTTTCCTGCCATTTACATGATTACGGGAATAAAAAGTATTACAATACTCAGTTTTTCACTCAGCAGAATCGCATTGTGGATTATTTTGCTGCTTATATTTTTATACAGTTACTGTATAGAAAGAGGCTCTTTCTTACTGAAGGAAGAGAGGCCGTATAGCATATTGTTCTCCATAAAAGCTATTGTAAGCTTATATCTTATCTGTATTATCGGCGGGGCGTTTATCAATGCGGCGGTTCAGTTTCTGGCCCAGGAAAAAATAAGTGACAAGCTTTTTGAACTTACTTCTCTATTCAGAAATAATTATTTTTTAATTATTTTTACATGCTTTACAGCAGGTGCTGTGGAAGAGTTTTTGATGCGAGGGTACGTACAACCCCGGATTGAGAAAATATACAGGAGTCCTCTTGCCGGAGTTTTGGTTTCGGCCGTTCTGTTTGGAATTCTTCACAGTACGTACGGAACCATAGGCCAGGTTGTCATTCCTTTCTTTATTGGAGTCGTTTTTGCTGTATTTTATAAAATCTATTCAAATATTAAAATTCTGATCATCTGTCATTTTATGATTGACTTTGTGTCGCTGATGATTATGAATAGTCTTGATATTAAACACTTATCTGTATTTTAACATTATGAAAATTGTAACATCACCTGCGAAATTAATGAATGTAGAAAACTCAACAGACCTGTTGAAATCAACTACCCCGAAGTTCATTGAAGACGCAGCATTTATACAGTCTTATTTAAAGGAAAAATCACCTAAATATCTTTCTGAGCTGATGGAGATATCTCCAAAGCTGGCTGATGAAAACTGGGAAAGAAACCAAAAATGGAAATCCAAACCTACGGCAAAAGAATCTGCACCGGCAATGTTTGCCTTTACAGGAGAAGTTTACCGTGGATTGGACGCCAAGACCCTTGATAAAGACGCAGTAGATTACCTGCAAAAAAATTACAGAATACTTTCCGGGCTCTATGGATTGTTGAAGCCATCAGATAAGGTGATGCTTTACAGATTGGAAATGGGGCGTCCCTTTGAATTTGATGAATATAAAAATTTGTATGCTTTCTGGAAAGAAAAGGTTACTGAACAACTGAATTCTGAAATGAAAAAAGGCGAAATTCTCCTCCATCTTGCCAGCAATGAATACGGAAAAGTCATCGACAGAAAGAAGCTGAATCATCCCGTTGTCGACTTTGATTTTTACGAGTTGAAGGAAGGAAAATTAAAAACCATCGTAGTGTACACCAAACACGCCAGAGGGCTGGTTGTAAGATATTGTGCAGAAACCAATGCCAAAACTTTAGATGATGTAAAAGGATTCAACTACGAAGGTTATCGAATTGATGAGGAAAAATCTACGGACACAAAACTGGTTTTTACAAGATAATGACAATTTCAACTTTTAAAAAATATTTCAAAACTGAACTTTCCGACCTTTACACTGAGTCGGAAAGCGCTTTTTTGTGCGCTATATTCTTACATAAAATCGTAGGTCTGGATACTTTCCAACAGAGAAGATTTTCAGATCAGGAGCTTTTGACGGATGATGAAAAACAGCTGCTCCATATTATTTCCGATCTGAAGACCGGCCAACCTTACCAACAAATCCTGGGCGAAACTGAATTTTACGGCATGAAATTCTTTGTAGACCAACATGTATTGATTCCACGTCCTGAAACAGAAGAGCTGCTAGAGATCGCCATCCGTGAAGTTCAACGGTTAAAACCCGCTACTCGGGAGATGAAAATTCTTGACATAGGTACGGGAAGCGGTGTTATTCCTCTTGTTTTGAAAAAACAATTTCCCGGTGCCAGCGTTTCTTCTATAGATTTTTCTGCCGAAGCTTTACAGACTGCTCGGAGAAATGCTGAGCATCATAAGCTTGACATCAATTTTATTCACGCTGATTATCTGAGTTTCGAACTGCAGGAGCAGTATGATATGATTATCTCCAATCCTCCTTATATCGGGATCGAGGAAGAGATCGAAATCGCTGATTCAGTCAAAGAATTTGAACCTAAAATGGCATTATTCTCTCCCACTTCCGATGCCTTGATTTTTTACCGGAAAATTGCGGAAGATTCTGAAAAGCATCTACATGACGGAGGTTTTTTATTTTTGGAAATCAACCAGAAACTAGGCTCCGAAACATTAGAGCTGTACCGGAACCTTCCTATGGCACAACTCTTAAAAGACTTGTCTGAAAATGACAGGTTTATTTATGCGAGAAAATAGGATCCACTATGCTTACAAATTATTATCTTTAGGACCTTAAACGAATTCACCATGGTCATCAAATCACACGAGATCAACAATATAAGAATAGCGGAAGTAATTTCCGATGAAGTCATTATACAATCTGCTCAGGACGGGCTTGATCTTATGGGAAATATTTATTATCAGGGATTTGATAAAATTGTCCTGTATGAAGAAAATATTACCCCTGATTTTTTTGACCTGAAGACAAAAATTGCGGGTGAAATTCTCCAAAAGTTTTCAAACTACCGTATCGGACTGGCCATTGTAGGTGATTTCAGCAAATTTGAAAGCAAAAGTATGAGGGATTTTATTTTTGAAAGCAATAAAGCCCAACATATTAATTTTGTGAATATGCTGGAAGAAGCATTAGAAAATTTTTCAAGATAAATCAATTATATTTAGCTGAAATAAATTATAAAGACTATTTTTTTCGAATATTCCCATAAAATGTTTTTATGGGTTTTTTATTTTCATTATCCATAAATAAAACAGTATCAATATCTTATACTCCAACAGCAAATAAAATAAACATTATTATTGAATATTTTCATGAAAATTTAAATAATAATTGAAAATATAATTAAAATTTTAAACTAAATTAAATTTTACATCTGGAATACAAGGTGTTAAGATAATTTATTTGTACATTCGCAGCAAACACAAGGATTATGAACATTATTTATTTACCAGCCGAAATATTTCGATACGATAAAATCACGGCTATTTAAACCACATTTTTTTCACTCGTCTTTTTACAGAATTTTGCAGACTCTATTTTCATAGATGCTTCCTGTAATATCTGTTACTTTTTGCGTAGCACAAATTAACCTTATGCTTATCAAAATAAGCTGTTAAAGCTTTTTTTTTGCTATTCAAAGCCAATTCTGTATCAAAAAAACTAAATATCCTGTAAAAACACAAATTGTTCTAGAGAGAGCTAAGTTTAACATAAAATACACACTATGATCAAAAATCATTTCTTATCGATCACTTTTTTATTAATTACTTTAATTTGCAAAGCCCAGGTAGGGATTAATACAGCTACACCAGACAACAGTGCTGCACTTGATGTGTACAGTCAGAACAGAGGAATGCTGATTCCGAGACTGACAACAGCTCAAAGAAATGCTATTACCAGCCCTGCGAATTCTCTCCTGATTTATGACACTGATAAAAAATGTTTAAGCCAGAATATCGGTACTCCGTCTACCCCGGACTGGTTATGCATCAGTGGTAATTCGGTAAAAATGTTTTATATGCCGAGCGTTTCGTTTGATACTTCCAGAAATGCCACTGCCCAGACTAAGGACTTATATACCTTGTACAAAAATCAGTTTGGCTCTCCGAAAGCGAAAAGTACGAGCGCTCCTGCCTCTATTCCCTTCTTTCCATCCAATAAAGACCTTTATTATTATGTGACTGATGCTGATTCCAGTGTATTCAGTAATATTTCAATTTCTGATAGCGGTGTCATGACCTATGATGTAAAAGCAGCTGCTACAGATTGTTCTTTTATTAATATTGTATTTGTTGTGAAATAATCGGGTTATGGTAGAAAGTATCTCAATGACAACATTCAAAAAGCTCTTGTTGACTGTAATGGTATTTATCTTTTCTCAAAGTATTACCGCACAGAATGAGCAGGGAACAGGTTATCCTTATTTTGTAAGTTTTACTCAGGGTTTACAGCCTCAGGAAGCTTATAAAGTAACGACAAGCGGGGTTCAAAATGATGCAACGTTTACCACTGACGGTTTAAGGCTTACACGAAATGTAAACAATACTTCCGGAGGGGTTATTCTTGCAGACAGGATATTTAAAAGTGACCAGGGTATTAAATTTGAATTTGAATATGTCATCTACGGAGGCGGCTCCAATGGCGGGGATGGAATTTCAATATTTCTGGTAGACGGATCAATTCCCAAGCAACAGCTTAATCTCGGCTATTTTGGTGGAGGATTAGGCTATACTTTTGTGATGAGAAACTCAAGACAGGGAGGAAACCTTGAGGGATTGAGAGGTGCCTATTTAGGCATCGGTCTGGATGAATTTGGAAATTTCAAAACAAGATTTCGCCAGGGAGACAGAACCAGAAACGGACTTACGGATGTTTCAATAGCCAGCTGGCGAAGCAATGTAACATTGAGGGGAAAACGGGGAAATCAATATCTTTCATATTCTGAGCCGGCCGGATACAACGGATATCCGTTACTTTACAGTACTGCCACCAATACTTCTCCTGCGAGCAATAACCGATCTGTATATCTGGATGTTCAGACCGGGAAACATGTTGGCACTAAAAGTCCTGATTTTAGTCAGTTTAACTTAGAAAGTGGCGGAAACTCCATCCCTCAGAATGATACTGATGCAAGATTCCGGAAAGCCTATGTGACATTGGTTCCAAATCCTTCAGGAGGTTATAATATTACCCTTGAGATACAGCATGGTAATGTTAAAGAAAAGATCATCGATAACTACTACTATCCCACTTCTTTAAAATACACGGAAAATGCAATGCAAAATAACCAGGTCAGAACGCTGGACACTAGTCCTCCTGCAACCTTCAGAATCGGATTTGCGGCATCTACGGGTGATGCCAGAAATATACATTTATTAAAAAATCTGGGGGTAAGTAAGCCCTATGCAGCTGAAGTAA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57 | Bacillus_phage(20.0%) | integrase,bacteriocin,protease | attL 1074945:1074959|attR 1131459:1131473 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
3296470 : 3302339
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP033930|3296470:3302339|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP033930|3296470:3302339|3300004_3300820_-|AZB18953.1|DBSCAN-SWA MTNKGMAKDTLDILAKKYYINEYNEKINIENELEISKKETTLFTPEQLSEIAESSLPETAFETRFETRNCSSLKAILELAEEENQEKLMCLNFASAKNPGGGFINGAEAQEESLARTSGLYESLLQAWDYYTIHRAMESCFYTDTMIYSPKVPVFRKDKGDLLPTPVLCNFITSPAVNAGVVKRQEPGREHEILPAMDVRMNKMLSLALHEGNEVLILGAWGCGVFRNDPKEIAGLFKKHLQGKYKNKFKKVVFAVLTKNEEMLKPFEEIL >CP033930|3296470:3302339|3298810_3299497_-|AZB18951.1|DBSCAN-SWA MKKLTILSGAGISAESGIQTFRDGDGLWENHNVTDVASPEGWRKDRALVLEFYNQRRRQLHEVQPNEAHHLLAELEKHFDVQIITQNIDDLHERAGSTHILHIHGELFKSCSCNNKNLIYEQKEDINIGDKAEDGAQLRPFIVWFGEDVPLYQTAREIVKEADILLVIGTSLQVYPAAGLIHDIKDDCLLIVINPNETGFGYGQRAVVMKETATQGMKLLFDKLIDLA >CP033930|3296470:3302339|3299501_3300008_-|AZB18952.1|DBSCAN-SWA MKIELIKGDITKIQTDVIVNAANSSLLGGGGVDGAIHRAGGPEIVEECREVRNRQGKCNTGEAVVTGAGNLPAKYVIHTVGPVWNGHAEKVSKLLAECYYNSLKLAESLGVKTIAFPNISTGIYRFPKNLAGKIAVDEVRNFRSDIIEKVIFVCFDDENEMIYKKLLD >CP033930|3296470:3302339|3301257_3301851_-|AZB18955.1|DBSCAN-SWA MKEFEIRADYKNETLIAYQAYNKAIAQSAVENQKFSAPFSFNRMTWIKPSFLWMMERSNYGQKSNQECILAIHIKREAWEKALSKAILTSPEKRVYPDPRNWEKDFENAEIYVQWDPERNIKGTKLNYRSIQVGISRSLIEEFNEEWIVKIEDYTPLVKKILNLIKSGEFDRAKKLLPVEKNYPLSKELALRIGASV >CP033930|3296470:3302339|3300822_3301236_-|AZB18954.1|DBSCAN-SWA MKTTTLYRPVGEKEMILIMESGFKKFPPRLEWQPIFYPVLNEEYASEIAEKWNTRDEAGNYLGFVTRFEVLEDVANQYPVQNVGARNHNELWVPSEELNSFNEAIVGDIKVTKVFIGNDCKKAGNTGLENLILNIKN >CP033930|3296470:3302339|3297863_3298811_-|AZB18950.1|DBSCAN-SWA MKNKVKGGIMGVCIGDALGVPVEFKSREYLKKFPVTTMQEFGSHHQPKGTWSDDSSMTLCLAEELTKGYDLEKIGQSFVQWVKFGHWTAHGRLFDIGNTTREAIGRLIRGESAEFSGNVFEEDNGNGSLMRILPLAFYLKDEEDLEKLHKTVKEVSTITHGHFRSVFACFVYVLFAIQLMKGKSKAEAYKYMQDIALEYAEKQYFSINEVERFQRVLKYDISTYSEAEIKSGGYVLHSLEASLWCFLNSESYSEAVLKAVNLGEDTDTTGAVTGGLAGIFYGFENIPQEWISELARKDDIEKLSGKLNHKYGVIK >CP033930|3296470:3302339|3301862_3302339_-|AZB18956.1|DBSCAN-SWA MKTIQYIKGDATVPQAKGMKIIAHICNDLGGWGKGFVLAVSKRWDSPEKEYRNWHRFRSENNFALGEIQMVQVEKYMYVANIIGQKGIKTGSNAVPVRYDAIEKALEKLSHEALQINASIHMPRIGCGLAGGKWEEIEPIIERTLLAKNVEVYVYDFE >CP033930|3296470:3302339|3297201_3297744_-|AZB18949.1|DBSCAN-SWA MNEIEKKKISKFLSLILRHQPESIGLILDENGWAPVDELRAKSALKRMFFSFDELEEVVETNNKKRFAFNDDKTKIRASQGHSIDIDLALKAQQPPDYLYHGTAETNIVSILGKGIEKRNRQHVHLSADKETATKVGMRHGKPVILTVRTGKMYEDGLPFYLSANGVWLTDFVDPQYISK >CP033930|3296470:3302339|3296470_3297199_-|AZB18948.1|DBSCAN-SWA MKRTLVVGDIHGGFKALQQIFERAGVTSQDQLIFLGDYVDGWSQSSDIIRFLIEVSENQDCIFIKGNHDAWCEEWLSMEQAPDIWLSNGGRSTVESYTGYSQEEKNLHLEFFQKMKNYHVDDQNRLFIHAGFASMHGPGKEVYSSNYRWDRTLWETAVAMDRKLAKNSALYPKRLLLYNEIFIGHTPTLDIGIPTPVHKANIWNMDTGAAYTGALSVMDINTNEFWQSDPLPFLYPNEKGRN |
9 | Cellulophaga_phage(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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