Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033932 | Chryseobacterium bernardetii strain G0229 chromosome, complete genome | 4 crisprs | DEDDh,WYL,cas3,PD-DExK,csa3,cas1,cas9,c2c10_CAS-V-U3 | 0 | 1 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP033932_1 | 1205474-1205572 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP033932_1
|
1 spacers
spacers of CP033932_1
>1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder TCTTAAATGATTTTATTGGCAGAAAAAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP033932_1
The CRISPR arrays of CP033932_1 >merge|CP033932|1|1205474-1205572|CRISPRCasFinder TTTATTATCTTATTGAAAATGATTAAGTTTGTTATTCTTAAATGATTTTATTGGCAGAAAAAAATTTATTATCTTATTAAAAATGATTAAGTTTGTTAT >CP033932|1|1|1205474-1205572|CRISPRCasFinder TTTATTATCTTATTGAAAATGATTAAGTTTGTTAT TCTTAAATGATTTTATTGGCAGAAAAAAA TTTATTATCTTATTAAAAATGATTAAGTTTGTTAT
>CP033932.1|AZB27559.1|1202837_1205372_-|ATP-dependent-Clp-protease-ATP-binding-subunit MDYKFSQGLSQVFKQSKSEAKRLKSEFLNTEHLLLGIIKTENSAKEILQNLNADLTQIRRKIETLNTASLNPISEEVTNISFTKMADHAIKRAELECRQYKSNEINTVHLLLGILYKYEDPTSNILGAYDIDYEGVSREYQTMLKNSGQSPQMSAYDDDDEREEFEQMRKPTGNLGSAKSKTPTLDNFGRDLTSLARDGKLDPVIGREKEIERVSQILSRRKKNNPLLIGEPGVGKSAIAEGLALRIQQKKVSRVLYGKRVITLDLASLVAGTKYRGQFEERMKAIMTELEKNRDVILFIDELHTIVGAGSSTGSLDASNMFKPALARGEIQCIGATTLDEYRQYIEKDGALERRFQKVMVEPTSIEETIQILNQIKDKYEEHHNVIYTPEAIAACVNLTSRYITDRFLPDKAIDAMDEAGSRVYIKNMKVPTEIIDFEKKIEEIKELKQKAVKAQDYLEARKLKDEEERLQMELNAAQEKWDKDVKEKKETVTEENVAEVVSMMSGVPVTKVGKNELDKLANMDGKLNGKVIGQEDAVKKVVKAIQRNRAGLKDPNRPIGTFIFLGTTGVGKTELAKVMARELFDSDEALIRIDMSEYMEKFAVSRLVGAPPGYVGYEEGGQLTEAVRRKPYAVVLLDEIEKAHPDVFNILLQILDEGHVTDSLGRKIDFRNTIIILTSNIGTRDLKDFGDGVGFGTSAKKSTSDTRARSTIENALKKAFAPEFLNRIDDIIIFNSLVQDDIKKIIDIELNKLYGRLEKLGYKVELTDEAKDFISEKGWDKDFGARPLKRAIQKYIEDLLAEMLVNKQLNEGETVVLDLNEAKDGLVGKTSKPKKSSAAEKSS >CP033932.1|AZB24140.1|1202680_1202872_+|hypothetical-protein MLTITMLVFIEMEFSSSYKKDNIKLALVQTYIKAKTPGISRCFLLKFNYLFNIKKISQQLKTS >CP033932.1|AZB24139.1|1201994_1202522_+|hypothetical-protein MKKFIISIMLIVSGSAFSQVSIGTPVQENNRWTFGGGIGLGFGSNSSFYLQASPRVGYRLTEDLEAGAVGSVSWQTSDYYRSTMFGIGPFANYYIARSFYLSANFQHYFINYKDKYYDYKYNREENALYLGGGYMQRIGNNSFMQIGLMYNVLWKENSSVFSNGLVPNIGFVVGL >CP033932.1|AZB24138.1|1200605_1201793_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MKIVVGLSGGVDSSVTAYLLQQQGHDVVALFMRNWNDASVTLEDECPWIEDSNDALMVAQKLGIPFQVIDMSELYKERIVDYMFAEYEKGRTPNPDVLCNREVKFDVFMKTAMSLGADKVATGHYARVHSTIDENGKEIFHLLAGKDNNKDQSYFLCQLSQDQLSKALFPIGELTKPQVREIAKEIGLVTADKKDSQGLCFIGKVSLPQFLQQQLKPNEGEIVEIFKDSPLFAEETPEFSTKEEELQFLSRKINYKKADGKVIGKHQGAQFFTIGQSKGLGIGGHKESCFIVSRDMENNILFVGEGSHFPGLYKKALKIDNSELHWVREDLRLRNGETMEVMARFRYRQPLQKATLYQFEDAFYIEFEEPQSAIAEGQFASWYIDEELIGSGVIS >CP033932.1|AZB24137.1|1200167_1200521_+|hypothetical-protein MKKLIIHSIPVVISCIWLVAEFQTFNPIPLKGTEFLKFYSILIVGFYISIFIVKSRKEIISRVTIYFTILILGVGIIKLIRGIILGKPIGFLVMILMAESIAVFLLMSWKLNDKIKQ >CP033932.1|AZB24136.1|1199438_1200146_+|hypothetical-protein METKMLLKDESLWNRIQGFSLDASDADFPFSKKLAKEENWSLEFTRKAIEEYKKFVYLCCILPKGASPSEIVDKVWHLHLIYTQNYWEEFCPKILKRPLHHHPSKGGFNEKLKHQNWFTDTLKSYQDIFQAEAPRDIWLNRNTIDKTKNKLRIGKFIPFLMLILLLTSCLGEVITTIGSIFFSFVGILVFGGVIASIKKFKDKNDGNSDSSCGGSSCSGGGGCGGGCGGCGGCGG >CP033932.1|AZB24135.1|1198429_1199326_-|hypothetical-protein MKKDDILHLEKLMNFLSRQFLKKNHWEDVTKTEWSYICAELNELIITEYSEKEIKKKPDLLGNNYLYEHLIINKLKKFRQNENAVLSRPNLAKLSLIVKVLGYSNYIDFINSNTESFNFNDLKIDMNNVKPNITLLERLVGCWYSYNRNLPENPTQAREDRIWRSAMEIYKSETTGEYFIERSGGDHHKYFGKVTAYSDYVFIIMNSNTFIRQRHFISRIKDSKEKLKNPDYKLHELHFISTCISFNQEPIALFEIFLKADRKNFISDSISFPIDSDEIPESILKQLEDTESNRIDYR >CP033932.1|AZB24134.1|1197025_1198294_-|hypothetical-protein MEYYELYDVLKSHFDSRKGIVKIKDLNVTIESIPFESRVCHLAYGSDNTDCTEHHHPLKINENAYLIYHQPSIDIKDFDIECNKRFEYHILKRADVETANGCIIFFHGLNEKKWDKYLPWAYELAQKTGKAVILFPIAFHMDRAEAIWSDRHQMTEIVKFRKEKYPENTHFSYVNAATSSRLEAHPQRVFWSGLQTYSDIIEVVKDIKSDKIKGISPDASLDLFGYSIGSFLSMIIKMADPHGFFTQSKVFCFCGGMTIDRMFPISKYIMDSQATIKMQSVFTELLSSDFKYDNRLKHYQDDELHPQESWFKKMLRYNYFQKEREERIHEIQSQIKAYVLEKDSIAPPMEALNTLRGGYRNINVDVEIRDFPFDYSHMVPFPLTHKHKTEITEAFHQFIKSASDFYSRPSGVENGEEKPEKK >CP033932.1|AZB24133.1|1196235_1196979_+|DNA-binding-response-regulator MIKTVIIEDEKPASRKLERMLGSFPDIEVVAKIESVEEGVAWFSENEHPQLIFSDIVLGDGLSFDIFEKVPTKGFIIYTTAFDQYTLKAFKLNSIDYLLKPILEEDLSGAIEKFKSFLPSNSDIGSQDIKQLIRKEKSILSRVLVKIGYNLKIVQTQEISCFFSENKIVYLQTDERSYPSDFTLDELADILDDKKFFRVNRQFIINSDYIKNIHTSPYYKVDLEFQPQEEITVSRDRVKDFKDWLVS >CP033932.1|AZB24132.1|1195906_1196179_+|hypothetical-protein MDYNNAYNRVQQLKKFYKNLIWFGIVSAIIIGNDWFNDELHYRIFGGHLFLAIWALFLGIKAVSLFIFNDEWEKEMMRKETQKNKKAIDF >CP033932.1|AZB24141.1|1205587_1205812_+|uroporphyrinogen-decarboxylase MNPEITTYIGYSASVFIVLSFILKDVRKIRVVNMIGCICFVIYGFFSGPLWPVIIPNGLICFIQVYHLLLGKKA >CP033932.1|AZB24142.1|1205811_1206924_+|glycosyltransferase MKKKIIISAFSNLYTDQRIEKICRTLYENGYEIDLIGNDWNGAEEIQRPYSFSRIHLASKSLKTAYLEFNWKLYHILKKKADQNTILHANDIDALYPNYLIARKLNIPLVFDSHEIFSEMPAVQGKMSQKLWRYVEKTVIPNLKWMITASGSYGKWFEKKYGIDPVIVQNAPREIGFTDDLPENNPKILLYQGAVNPFRGIDKVILAMHYLDHVQLKIAGDGPRKKEYEELVIREKLEHKVQFLGKLKPEDLRKVTLTADCGMSIEENGGESYLYSLPNKVLDCIQARVPLILSNLPELKNIKDQFDVGELIKDHQPENIAAAVNKVLAKGRGNYQLELEKAAKVLRWENEEIKLLQVFRKASNASGFKG >CP033932.1|AZB24143.1|1207020_1207440_+|SufE-family-protein MTIKEKQQEIIDEFAFLDDWEQKYEYIIDLGKELKGLPDDKKTEENLIKGCQSKVWIDAEFKDGKLFFNADSDGILPKGIVSLLVSIYSGHSTQEILDSDFEFISEIGLQEFLSPSRANGLMAMTKQIKFYAVAYQLKS >CP033932.1|AZB27560.1|1207490_1208408_+|lipopolysaccharide-heptosyltransferase-family-protein MTVPVFKEFLEQNPGVEIVMVSRKNFEALFAGIPNVIFKGINVDDYKGFFGLRKLGDELIKEFKPDYIANLHDVIRTKILDRIYRRKGLKVFKIDKGKEEKEHLTDVWNLNKVQLKKTVERYADVFREMGFKVELSQKLRPVSEHKSGIGFAPFAQHKGKMLPLEKSFELARLLAQKHTVYFFGGGKKETETLESWESKIPNTKSLSGKLSLTEELQKISELEVMISMDSANMHLASLMGTRCVSIWCETHPYAGFLGFGQSEEDVVQVKDLSCRPCSVFGDKECYRGDWACLEEFTIQKVIEKI >CP033932.1|AZB24144.1|1208412_1209297_+|glycosyltransferase MKLSICIPVYNFDVRELVFDLKKEIDSQKIDAEIILIDDASDAAFKSINEELQDQVEKLVFLNKNIGRSRIRNLFLQYSLGEYLLFLDCDVKIPGKRFLWNYISEINKHPDLELIYGSFTIDPKYASTLRNRYSVEREIFSGNRSYDFALFKTVNFIISKKILEKFPFDETLTEYGYEDFVFAKLLEQNEVKFLAMANPVIHIDDTNNAIFLGKAEIGMESLFRLSKNPINKAFIKDIKVYKAAVILKRLGLIPLFLSIYKILEEKIRTNLLSGNPNIRYFDFYKLNVLARKMK >CP033932.1|AZB24145.1|1209683_1210928_-|bifunctional-folylpolyglutamate-synthase/dihydrofolate-synthase MTNEQYQEAIDWLFVQMPNYQIDGQKAYKPGLDNITKLCAYFGNPQDKIKCIHIGGTNGKGSSSNMLASVLQEVGYKVGLYNSPHLIDFTERIKVNGKNCHKEFVFDFIQKLKNIPEDIRPSFFEFTTIMAFEYFYQQQVDYAIIEVGLGGRLDSTNIIKPLASAITNVQLDHQNILGDTIEEIAAEKAGIIKKSVPIISGDENEAVKAIIREKAMKEEASFIDATLLHTDLASDLKGNYQRKNIRVVLSIIEELRKQGINITDKNVENGLLNVHKNTGFIGRWFEFSKDPLTICDTGHNQAGLEYVFSQLNSINRRKHVILGFVNDKKIDEVMNLLPENSEFYFAKPSINRGRHPEDYEKLLQEAKIFYKIFNSVQEAYLSAKERCTSEEMIFIGGSNFIVGDFLEKNLEFKE >CP033932.1|AZB24146.1|1211111_1212434_+|TolC-family-protein MKKVWIIVFGLGSLGLSAQKKWSLKECVSYAVEHNLQVIQNQYTKQNQEYNLKAAKKDYLPSVSGSMMNGVSFGQGSLGAGSYRNDRFNNSVGVSADVLVYNNGRLEKNVRKLQFDVEASQYDIEAIKNDISVQIAQQYLTALLNKEIVKISQSAVENAKKQYDRAKITTQVGTTAQTVLAEAEAALAREKQNLKTAEVNVGRALFAIAQLLQLSDYKDFDVENVDVPEALDSQLVTADEVLTKAYDVQPQIKAAESRIRSAEAQTEVSKTAFWPTLTASAGLNTFYNKSFNVPPGVVQGTFFEQYKDQFGQNVGLSLNIPIFNKGKTKLQVEQSKLNESVSKISLEQQKQAVRQNIQKAQFDADANYESYLAALEAEKSSKLALDFADKSYAAGKTTIYDVNVARNNYANAQGSVAQAKYNYLFSLKLLNFYAGIPLSL >CP033932.1|AZB24147.1|1212435_1213026_+|transcription-elongation-protein-SprT MSIQSLEKYLPQNTLKYLKIWFSDYYIHIKVTRNRNSKLGDYRKLPDNSHEITVNSTLTPQLFFFVLTHELAHMIAFEKYGRRISPHGNEWKETFRNMLLESLEIYDEDLKPIIVKFSKSPKANFMASPDLVRYFHTEKQDDRLYFIEQLQKGEFFIYRNEKYLLEGLIKKNYLCKNLATGRKYSFKPLARVEKCS >CP033932.1|AZB24148.1|1213058_1214111_+|mannose-1-phosphate-guanylyltransferase MAGGIGSRFWPMSTQKFPKQFQDILGTGRTMIQQTYDRISKIIPKEHIFVITNKEYVALSHQQLPEIPEENIVGEPLMKNTAACNLYMANKIAEINPNATMIVLPADHLILKEDVFLEKVMLAFDLASKHDYLVTLGITPTRPDTGYGYIQFVEKKNSEYFKVKIFTEKPILEIAQSFLESGDFLWNAGIFIWNIKSIQHAFEMYLPEMTQHFMACEYNSEKENSCIETIYPKVQKISIDNGILEKAKNVYVIPSDLGWSDLGTWTSVYENTEKDKDGNAVKLKHLLAYNSKGNIIRLKNNNKAVIIDGLENYIVVDTDKALLICPRDNDQLIKDYVLDLKNFKKGDKFM >CP033932.1|AZB24149.1|1214143_1214809_+|hypothetical-protein MIKFALRFTTLILLLFTILGYAQDKKKFSSIPNILQRIEPGANVDSWVLVYNNYGKGEEIKISGGKINYTPQFSGFNLFPSEDSFYYIAYSSGGKINYILDTEALKTFVGKIDNAQEAAIILAADGYMVDEEFKDLAGNYHEDQKNYYLDLGKLTSQECPYQKTHYTLTVNKATGLVTNVKDNGTYIELYNKKCANNPRLLKVEKKEEPKKDESSKTSKRR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP033932_4 | 2615345-2615425 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP033932_4
|
1 spacers
spacers of CP033932_4
>4.1|2615369|33|CP033932|CRISPRCasFinder TGTGGGTTTTCTCGGAATTGCGCTCATTTCGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP033932_4
The CRISPR arrays of CP033932_4 >merge|CP033932|4|2615345-2615425|CRISPRCasFinder TTCGGAATTGCACTCATTCCAAAATGTGGGTTTTCTCGGAATTGCGCTCATTTCGATTTCGGAATTGTACTCATTTTAAAT >CP033932|4|4|2615345-2615425|CRISPRCasFinder TTCGGAATTGCACTCATTCCAAAA TGTGGGTTTTCTCGGAATTGCGCTCATTTCGAT TTCGGAATTGTACTCATTTTAAAT
>CP033932.1|AZB25273.1|2614057_2615155_+|hypothetical-protein MANPDKDFRLIRNKFEIKNEIVQERIRVGNRFVDDFIFDDNEAADIPINALRVIFNIISIISNEQFRPEDRPKQLSLFDEEFETDNNIFASIRIRNSKISPSGSTQQVVDAYEFLARFKMGWYKSLNSKGKEIKTFGGLISAPSYDKRGYTTFLVSSYWLKQLLVIPEYNYILYNLVYSVRNNKHIIFAIWLSKIPESGTVLKLSTLNKKFGLNYKTANDFCFKFLKLARISLDKYNSLSFNYQYKGDSIFIFPYKTKMSSDVLMSENSKKTPKITKRLSYFRKRFGLQENEMNQFFHQYRNIPQTRILIEKAFTRFIKICRLKKIQSVTFRGIAFLQEIQKLVIEIYQESRTGKLIPNGYPIIL >CP033932.1|AZB25272.1|2613776_2613998_+|hypothetical-protein MSKKEVTISDLKPGQKVCINGMLAEYKGIQKVRIFNLGKADKRVFKGEEVNIFKYYSLADGSKTLKSEKIKLI >CP033932.1|AZB25271.1|2613101_2613737_+|hypothetical-protein MYYLELIQRFWDFNRIAKISPTEIAVYLYLLKIGYEKDRYDFKTSDVELAKELGLTRVTIKSSKEKLKNRGLIQFQTSNGLPCYYRLLLDYSFQTEPETKEEKKGTDTENLLEAASLEISPIIEDVANESSIIPSLQEFMSYAKALESYESQLDFSIEKKYKSWVDKGWKNAFNRPISNWKATLKSALPYMNNSNVDNPISLKDIPNIKHP >CP033932.1|AZB25270.1|2612846_2613098_+|DUF3853-family-protein MKVINLKTPICDLTVGEFLEILKNVVAEQKYEYGLKGLAKILGCSISKASEIKSSGILDKAIIQKGNIIIIDKEKALKLFAQK >CP033932.1|AZB25269.1|2612295_2612850_+|hypothetical-protein MKQSKNIISFFGSFIQDSRMYPSHISLYVSLFQLWSSNKFQNPFRICREELMKLSKIKSFATYHKCINEIHNAGFINYSPSYNSYEGSSIEIIDFETVDKNKNEISLEEKNLQEEKINFSIPMLYEIEMYFNERDVVSEEAYQFYSLYQSKDWRLTNSNPMKCWKSAARNWISKIKNINQNQNL >CP033932.1|AZB25268.1|2612015_2612279_+|DNA-binding-protein MAISIITKEDLQQFKIELLEAIKELLQGNTTEQKLWLRTSEVKKMLNISSGTLQNLRINGTLSYSKIGGTLYYNYKDIEKLLKDFKH >CP033932.1|AZB25267.1|2610568_2611414_+|RteC-protein MNGQNFKKKVDQLWKDLSTAVDQINRSENDIVIRTEEILMETDASIRQLKDLLRQYQFPDWSNEIYFFKNTKPQFVAVYIYYSKVLAIEASKPYADSQALRSYYENERSNLLYFYNEQRDFISYYRRKSTYLDKKYFVRLKFDFKLKLSPELYSYDEEFSTSHDHIVSQIIANDLLEQYLTNKIDSKESRENSINHIKNLEWTAPKVALIELLYAVHQTKCFNGGHSDLAEIFRWAENSLNIGLGNYHKTFSEIRLRKTDRTKFLSLLQHNFNQYLDDLDL >CP033932.1|AZB25266.1|2608858_2610517_+|AraC-family-transcriptional-regulator MTQGQEIQQQSYKEISRLIDSYSENDERAMVFVKMYIDKAKNDHNLKKQIRGYEEAIYYSKETGRKLSYADSAITSASKLNDQDQIARAYAGKGIIYYYNLRQYKKALKEYLIAFKYSKNSKDGYLKNKIIYHLGMIKSYLGYYKYAAVHFEETADFFEKNAKESLDRNIRFNNESGYYNSIYRLSTCYRNLKLYNKEDSLINIGLEKLHNNSEQVIEFGYFQKGRGVQLLRKGRADEALKHFKVSQDILSSNQDYASLTSVYFYIGKLYRSKGNRAESLKYFNKVDSLVNKFWFITPEIRSTYLYLIDDAKKNRNSERKMYYSEKLLKADSIINADFVMLTDKIYSEYDTDNLIEEKKQMIRGHQVILYSFIGAGLVILFFLIWRFRKREKELNARYQEVLEKLNSSKETISFDVIPPASSDEDNLDLYSSEIIEDIKTNLKIFEDEKQFLQPNLTLEIVGKMIGSNRTHLSYVLNVHFDVTFPTYLKALRIRYITNLLVEDTKYLSYKIETLAKICGMANRQIFSAHFLEINSIRPRDFIRMRQEELKKT >CP033932.1|AZB25265.1|2608298_2608547_-|hypothetical-protein MKKYISLLSLTAAFLMQSCERTDSVSEITEQKQQSIEIPNNKESSKNADGSSETNGSNNFKTGDDDEPKKDKQHWRIVQDTI >CP033932.1|AZB25264.1|2607656_2608085_-|hypothetical-protein MKTFKTGIIEFISYFFILLFCYAAMGKLMDFDEFQTRISESPLLNRFSQFLPYTIIIAEFFIAGLLCYRKTRNIGLIGSLILMLVFTGYIALIISTSDNLPCSCGGILEKMSWHQHLYFNIGCVILSVIALGLNLRYSRPAE >CP033932.1|AZB25274.1|2615573_2616407_+|DNA-primase MNCEEIKQKIGIRTVLESFNLFPSKENRRTAFYFAIDREERTPSLSVDFVKNKAFDFGTGKSYDVISIVQQINQCSVSDALKYLAKFDFFLRNDIQKVESNQEVEYEILKTSEIRHFALVQYLTSRRVYEQKDLVKEVHYKMNGKKYFGIGFLNDSGGFEIRNKYSKICLGKKDVTLIKTQNNFDEIAIFEGFFDYLTYRNMEKEQSTDYLILNSTSMLFKIENELKKYDKISLFLDNDSNGKSVKTKIENQYKNVEDCSLIYNGFEDLNKWYCERK >CP033932.1|AZB25275.1|2616703_2616880_-|histone-H1 MKELIEKINAEFEAFTTEANQQVEKGNKAAGTRARKSALELSKLFKDFRKISVEESKK >CP033932.1|AZB25276.1|2617539_2617938_+|single-stranded-DNA-binding-protein MSTIIGRVTKNAEISILKNDKQVVNFSVAINDSYKNKQGEKVEQTTYYNCAYWQSPNVAKSLTKGTLVELSGRTSSNAWIGKDGEIRSGLNFHTSNIKFHGGGKREGVQNFVTEKAQDKKTFAEDTDDDLPF >CP033932.1|AZB25277.1|2617950_2618160_+|addiction-module-toxin-RelE MEAQFNFQIKQKKDEREWEDIEVYYVTNCDRITAIRYARNISKIFKSEIRLTQGKEPFRTSGTYIYENN >CP033932.1|AZB25278.1|2618172_2618652_+|hypothetical-protein MANRCNNKVTFKGNQASLNQVSDLFRTMIDNESKGKIGQLPDFIQSEYGYFSEIYKDETEECSFHYDTRWSPNIEVLWTIANHFDVEFVLSYEESGCMLLGKTFYENEILKDYCLNQSDFQDCSYNEEENNYQFEGNIYEYKDEIMKILLGRKIAFGQS >CP033932.1|AZB25279.1|2618708_2619140_+|hypothetical-protein MKKSIKPTEYLLIKAKSEWDDCDFAIIHISEEWKKIQKNRLKVVKIVENDSDLKWLNYEDVNVEFFKFSKENYPQIEEWLSEKNQFFVVLEKDDLKQLLQPEHDLHNHQMQVFRSGNAIYNAFGKHTSEEFFTEQFSLVELIK >CP033932.1|AZB25280.1|2619173_2619725_+|PRTRC-system-protein-E MQTNFFRHIAKMDLTGDLQITLRPTTENCFVLSILLNNERCGDEARKLIPPLNLRGTAEELDNGFFEQITTPLQTASGLMVDMEAFMKQLEEVKKKSAMEKEKSDKDKKEKDAKEKKYKEALQKAEELEKEGKYKDAWTALPKASEYPDFAEIIRSKQDEYSKHLAPNLFTEASDENVPIETI >CP033932.1|AZB25281.1|2619742_2619961_+|PRTRC-system-protein-C MLLATLLERVFVLKDNGHEIKLTDPEPKWSVEAVMNFYANTYPILTTAKVSAPQIKDDTIQYKFESVMGTKG >CP033932.1|AZB25282.1|2620038_2621202_+|hypothetical-protein MNATKKNYIGKNKVARRKTTRKVTSTIGQVRSLASKTKDLERNSERQTEICTNNNASNGFLRCKFLPKQEEVSHFQDSKKILNTERDFYKSLSKFSKQYGVEPMQTKDFGFPYNLALAIWDIETKMKQANADWNQFKLIRTNEKFHFAKEEQFCTNTSLHFIPVVPLFKMLHDKNYKKNAQLLLSVFSYLYHIANVPYYRQQDSYLYWIYEMHEEWMEQEEEEAREDSQNYWREFKMSKNIGDKIEKKLFNLKNLDFFEQRLNCFKIQNEFDIICHKVAFEAFALYSEYPNTTIFRNKPSSEENPYDDDYSNKAISMDMYISFVANTKGCLYNNIEDSINAEFNEYGSIEEPTIYLPINGTEIPKADFDFENRLFTLMEELHQVLTY >CP033932.1|AZB25283.1|2621211_2621934_+|PRTRC-system-protein-B MNNVIDTNKYLGMLYEPKSALVFYESLYKNEMYVEHFDMDRNGNPINAHPLTVNEAKTLAKSLVIDKEIEKAFLKSKGILANNILHINPSQKGSVIWYTKAQERQMYFVKNLEIPSGKAKVPAMLWIADKENLSVFALSNDKRPTENTTLHYAPFFNVYNDGDVCMGNVDIKIQNSTSVEEFIEQWESYFFNSYFSHLVGGHNPIDGNLVNLWKKLLKSNEAFPNEILKKNNKTLKNLLR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033932_3 | 2615157-2615265 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP033932_3
|
1 spacers
spacers of CP033932_3
>3.1|2615181|60|CP033932|CRISPRCasFinder TCGGAATTGCGGTAGCTGAAGTTAAAAAAATCTTAAAATATGAAATTTTCAGTTATTGTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP033932_3
The CRISPR arrays of CP033932_3 >merge|CP033932|3|2615157-2615265|CRISPRCasFinder TTCGGAATTGCGCTCATTCTGATTTCGGAATTGCGGTAGCTGAAGTTAAAAAAATCTTAAAATATGAAATTTTCAGTTATTGTTTTCGGAATTGCGCTCATTCCAAAAT >CP033932|3|3|2615157-2615265|CRISPRCasFinder TTCGGAATTGCGCTCATTCTGATT TCGGAATTGCGGTAGCTGAAGTTAAAAAAATCTTAAAATATGAAATTTTCAGTTATTGTT TTCGGAATTGCGCTCATTCCAAAAT
>CP033932.1|AZB25273.1|2614057_2615155_+|hypothetical-protein MANPDKDFRLIRNKFEIKNEIVQERIRVGNRFVDDFIFDDNEAADIPINALRVIFNIISIISNEQFRPEDRPKQLSLFDEEFETDNNIFASIRIRNSKISPSGSTQQVVDAYEFLARFKMGWYKSLNSKGKEIKTFGGLISAPSYDKRGYTTFLVSSYWLKQLLVIPEYNYILYNLVYSVRNNKHIIFAIWLSKIPESGTVLKLSTLNKKFGLNYKTANDFCFKFLKLARISLDKYNSLSFNYQYKGDSIFIFPYKTKMSSDVLMSENSKKTPKITKRLSYFRKRFGLQENEMNQFFHQYRNIPQTRILIEKAFTRFIKICRLKKIQSVTFRGIAFLQEIQKLVIEIYQESRTGKLIPNGYPIIL >CP033932.1|AZB25272.1|2613776_2613998_+|hypothetical-protein MSKKEVTISDLKPGQKVCINGMLAEYKGIQKVRIFNLGKADKRVFKGEEVNIFKYYSLADGSKTLKSEKIKLI >CP033932.1|AZB25271.1|2613101_2613737_+|hypothetical-protein MYYLELIQRFWDFNRIAKISPTEIAVYLYLLKIGYEKDRYDFKTSDVELAKELGLTRVTIKSSKEKLKNRGLIQFQTSNGLPCYYRLLLDYSFQTEPETKEEKKGTDTENLLEAASLEISPIIEDVANESSIIPSLQEFMSYAKALESYESQLDFSIEKKYKSWVDKGWKNAFNRPISNWKATLKSALPYMNNSNVDNPISLKDIPNIKHP >CP033932.1|AZB25270.1|2612846_2613098_+|DUF3853-family-protein MKVINLKTPICDLTVGEFLEILKNVVAEQKYEYGLKGLAKILGCSISKASEIKSSGILDKAIIQKGNIIIIDKEKALKLFAQK >CP033932.1|AZB25269.1|2612295_2612850_+|hypothetical-protein MKQSKNIISFFGSFIQDSRMYPSHISLYVSLFQLWSSNKFQNPFRICREELMKLSKIKSFATYHKCINEIHNAGFINYSPSYNSYEGSSIEIIDFETVDKNKNEISLEEKNLQEEKINFSIPMLYEIEMYFNERDVVSEEAYQFYSLYQSKDWRLTNSNPMKCWKSAARNWISKIKNINQNQNL >CP033932.1|AZB25268.1|2612015_2612279_+|DNA-binding-protein MAISIITKEDLQQFKIELLEAIKELLQGNTTEQKLWLRTSEVKKMLNISSGTLQNLRINGTLSYSKIGGTLYYNYKDIEKLLKDFKH >CP033932.1|AZB25267.1|2610568_2611414_+|RteC-protein MNGQNFKKKVDQLWKDLSTAVDQINRSENDIVIRTEEILMETDASIRQLKDLLRQYQFPDWSNEIYFFKNTKPQFVAVYIYYSKVLAIEASKPYADSQALRSYYENERSNLLYFYNEQRDFISYYRRKSTYLDKKYFVRLKFDFKLKLSPELYSYDEEFSTSHDHIVSQIIANDLLEQYLTNKIDSKESRENSINHIKNLEWTAPKVALIELLYAVHQTKCFNGGHSDLAEIFRWAENSLNIGLGNYHKTFSEIRLRKTDRTKFLSLLQHNFNQYLDDLDL >CP033932.1|AZB25266.1|2608858_2610517_+|AraC-family-transcriptional-regulator MTQGQEIQQQSYKEISRLIDSYSENDERAMVFVKMYIDKAKNDHNLKKQIRGYEEAIYYSKETGRKLSYADSAITSASKLNDQDQIARAYAGKGIIYYYNLRQYKKALKEYLIAFKYSKNSKDGYLKNKIIYHLGMIKSYLGYYKYAAVHFEETADFFEKNAKESLDRNIRFNNESGYYNSIYRLSTCYRNLKLYNKEDSLINIGLEKLHNNSEQVIEFGYFQKGRGVQLLRKGRADEALKHFKVSQDILSSNQDYASLTSVYFYIGKLYRSKGNRAESLKYFNKVDSLVNKFWFITPEIRSTYLYLIDDAKKNRNSERKMYYSEKLLKADSIINADFVMLTDKIYSEYDTDNLIEEKKQMIRGHQVILYSFIGAGLVILFFLIWRFRKREKELNARYQEVLEKLNSSKETISFDVIPPASSDEDNLDLYSSEIIEDIKTNLKIFEDEKQFLQPNLTLEIVGKMIGSNRTHLSYVLNVHFDVTFPTYLKALRIRYITNLLVEDTKYLSYKIETLAKICGMANRQIFSAHFLEINSIRPRDFIRMRQEELKKT >CP033932.1|AZB25265.1|2608298_2608547_-|hypothetical-protein MKKYISLLSLTAAFLMQSCERTDSVSEITEQKQQSIEIPNNKESSKNADGSSETNGSNNFKTGDDDEPKKDKQHWRIVQDTI >CP033932.1|AZB25264.1|2607656_2608085_-|hypothetical-protein MKTFKTGIIEFISYFFILLFCYAAMGKLMDFDEFQTRISESPLLNRFSQFLPYTIIIAEFFIAGLLCYRKTRNIGLIGSLILMLVFTGYIALIISTSDNLPCSCGGILEKMSWHQHLYFNIGCVILSVIALGLNLRYSRPAE >CP033932.1|AZB25274.1|2615573_2616407_+|DNA-primase MNCEEIKQKIGIRTVLESFNLFPSKENRRTAFYFAIDREERTPSLSVDFVKNKAFDFGTGKSYDVISIVQQINQCSVSDALKYLAKFDFFLRNDIQKVESNQEVEYEILKTSEIRHFALVQYLTSRRVYEQKDLVKEVHYKMNGKKYFGIGFLNDSGGFEIRNKYSKICLGKKDVTLIKTQNNFDEIAIFEGFFDYLTYRNMEKEQSTDYLILNSTSMLFKIENELKKYDKISLFLDNDSNGKSVKTKIENQYKNVEDCSLIYNGFEDLNKWYCERK >CP033932.1|AZB25275.1|2616703_2616880_-|histone-H1 MKELIEKINAEFEAFTTEANQQVEKGNKAAGTRARKSALELSKLFKDFRKISVEESKK >CP033932.1|AZB25276.1|2617539_2617938_+|single-stranded-DNA-binding-protein MSTIIGRVTKNAEISILKNDKQVVNFSVAINDSYKNKQGEKVEQTTYYNCAYWQSPNVAKSLTKGTLVELSGRTSSNAWIGKDGEIRSGLNFHTSNIKFHGGGKREGVQNFVTEKAQDKKTFAEDTDDDLPF >CP033932.1|AZB25277.1|2617950_2618160_+|addiction-module-toxin-RelE MEAQFNFQIKQKKDEREWEDIEVYYVTNCDRITAIRYARNISKIFKSEIRLTQGKEPFRTSGTYIYENN >CP033932.1|AZB25278.1|2618172_2618652_+|hypothetical-protein MANRCNNKVTFKGNQASLNQVSDLFRTMIDNESKGKIGQLPDFIQSEYGYFSEIYKDETEECSFHYDTRWSPNIEVLWTIANHFDVEFVLSYEESGCMLLGKTFYENEILKDYCLNQSDFQDCSYNEEENNYQFEGNIYEYKDEIMKILLGRKIAFGQS >CP033932.1|AZB25279.1|2618708_2619140_+|hypothetical-protein MKKSIKPTEYLLIKAKSEWDDCDFAIIHISEEWKKIQKNRLKVVKIVENDSDLKWLNYEDVNVEFFKFSKENYPQIEEWLSEKNQFFVVLEKDDLKQLLQPEHDLHNHQMQVFRSGNAIYNAFGKHTSEEFFTEQFSLVELIK >CP033932.1|AZB25280.1|2619173_2619725_+|PRTRC-system-protein-E MQTNFFRHIAKMDLTGDLQITLRPTTENCFVLSILLNNERCGDEARKLIPPLNLRGTAEELDNGFFEQITTPLQTASGLMVDMEAFMKQLEEVKKKSAMEKEKSDKDKKEKDAKEKKYKEALQKAEELEKEGKYKDAWTALPKASEYPDFAEIIRSKQDEYSKHLAPNLFTEASDENVPIETI >CP033932.1|AZB25281.1|2619742_2619961_+|PRTRC-system-protein-C MLLATLLERVFVLKDNGHEIKLTDPEPKWSVEAVMNFYANTYPILTTAKVSAPQIKDDTIQYKFESVMGTKG >CP033932.1|AZB25282.1|2620038_2621202_+|hypothetical-protein MNATKKNYIGKNKVARRKTTRKVTSTIGQVRSLASKTKDLERNSERQTEICTNNNASNGFLRCKFLPKQEEVSHFQDSKKILNTERDFYKSLSKFSKQYGVEPMQTKDFGFPYNLALAIWDIETKMKQANADWNQFKLIRTNEKFHFAKEEQFCTNTSLHFIPVVPLFKMLHDKNYKKNAQLLLSVFSYLYHIANVPYYRQQDSYLYWIYEMHEEWMEQEEEEAREDSQNYWREFKMSKNIGDKIEKKLFNLKNLDFFEQRLNCFKIQNEFDIICHKVAFEAFALYSEYPNTTIFRNKPSSEENPYDDDYSNKAISMDMYISFVANTKGCLYNNIEDSINAEFNEYGSIEEPTIYLPINGTEIPKADFDFENRLFTLMEELHQVLTY >CP033932.1|AZB25283.1|2621211_2621934_+|PRTRC-system-protein-B MNNVIDTNKYLGMLYEPKSALVFYESLYKNEMYVEHFDMDRNGNPINAHPLTVNEAKTLAKSLVIDKEIEKAFLKSKGILANNILHINPSQKGSVIWYTKAQERQMYFVKNLEIPSGKAKVPAMLWIADKENLSVFALSNDKRPTENTTLHYAPFFNVYNDGDVCMGNVDIKIQNSTSVEEFIEQWESYFFNSYFSHLVGGHNPIDGNLVNLWKKLLKSNEAFPNEILKKNNKTLKNLLR |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033932_5 | 2691837-2691918 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP033932_5
|
1 spacers
spacers of CP033932_5
>5.1|2691860|36|CP033932|CRISPRCasFinder GTGGATAGGCTCATATACTTCAAAGTTAAAAAAATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP033932_5
The CRISPR arrays of CP033932_5 >merge|CP033932|5|2691837-2691918|CRISPRCasFinder TTACTAATGGAATTAGTATATGAGTGGATAGGCTCATATACTTCAAAGTTAAAAAAATCTTTCTAATGGAATTAGTATATGA >CP033932|5|5|2691837-2691918|CRISPRCasFinder TTACTAATGGAATTAGTATATGA GTGGATAGGCTCATATACTTCAAAGTTAAAAAAATC TTTCTAATGGAATTAGTATATGA
>CP033932.1|AZB25346.1|2691123_2691819_-|RNA-polymerase-subunit-sigma MNVEQKKTDEIVFETLPSDELIDYISFKEEYPEEAAAAFTEFCSRFERDILQKAEIYCNKFNYSEVVALEIATCAFARVWKYHSFNKSKAKYPDDIDRSILLWLYPIVYTQLVKYGDLNTCAEPDEDDLSIVENIDDLISLTVGDDDIQKKRELKIRLEIIERAMLGLSEKHKIVYLTYKAYENTGKKNIPRSVGKKLRDRLNLVQNSIQVYKKEANDHINNYLKAFNGNR >CP033932.1|AZB25345.1|2690792_2691137_-|hypothetical-protein MGIDKKYIGKVTETNLDDWLHSTGFLFPQNKTQIERFNKLYEDYDFKLKNTGINVKSIIDGSFCVEKESKIISIDTNLSHEIESLKMVARKGQSNISQSVFDKMKQNQKKKKGD >CP033932.1|AZB25344.1|2689999_2690800_-|ImmA/IrrE-family-metallo-endopeptidase MIDSSSLSKIKKLAGSISGNFNTEKIIPLHLIAESEDIEVFYDHYDKGTFDGMTVYDDNEFYIHINIDNHNRFNSPRSRFTLAHELGHYFIDTHRVGLKLGILEPHPSKIDRVQFDKIEREADYFAACLLMPEESFQRNLWKRKKFSFKVIDELSKEYNVSKTSCALRFAEIGNHPIKIVYAENGFVKWQKNSQGFPFWNLLNDKKVPEGLAMADYFKNVKTSIENPEEIFAIDCFENVKSEDSRRIFYEHCIVYENCALSIIWED >CP033932.1|AZB25343.1|2689423_2689645_-|hypothetical-protein MSEMSDFKKNYFKHLEEEVTAILKENQNIVSVFINFAQSKNINLIEQELKYAQMSGITVNSKDLFLKLNEDIL >CP033932.1|AZB25342.1|2686850_2689121_+|copper-oxidase MNRYKKIPIRILQTVLILLCTQTLFAQKVVHYDLYVKDTLVNYAGKQKRAIAVNGQIPMPTLTFTEGDTAEIVVHNQLKESTSLHWHGVFLPNKEDGVPWLTQKPIAPGTTYTYRFPIIQHGTHWYHSHSGLQEQIGMYGSFVMKKRDNDRTFRKGIDDLPTVPIILSEWTNLNPDNINRMLHNANDWAAIKKNATQSYAEAIKEGYFKTKIKNEWKRMLAMDVSDVYYDKILINGNHTTDLKSVDGKTLKAGDKVRLRVSNGGASSYFWLRYAGGKITVVANDGNDVEPVEVDRLIIAVSETYDIVVTIPEDGVSYEFLATTEDRTQSASYFVGNGIKQLISPLPKLKYFEGMKMMNDMMKMNGDLDDMGMKMSLNQMDMNVVMYPEITGDAKQKQDHSQHNMNMDNDPNRYNANALGDIKTLNYAMLQSPYNTTLPKDAPVKELKFTLTGNMNRYVWSMDNKILSETDKIPVKKGEILRITIYNNSMMRHPMHLHGFDFRVINGKGEKSPLKNVLDIMPMETDTIEFLANEEGDWFFHCHILYHMMSGMNRVFAVDDYQNPYLPNKKQAYNKLQRESNMSHFMAQNDFATNGNDGDAMFQNARWSLGTEWRLGYNDMHGYEVETHLGRYIGKMQWFMPFIGFDWRYRKMGIDEHETNLFGQRNEKDTRRAISLGFMYTLPMLVNFQAEVYHDGIVRLSLMREDIPITKRLRAGFMVNTDMEYMTELRYIINKNVGIRTHYDSDMGFGVGLSLNY >CP033932.1|AZB25341.1|2686360_2686837_+|cytochrome-C MNNKLRKLKPFNIAVGILIIISICIQFIQPLRNQSDVVPATHIERVYTVPQNVKTILAQSCYDCHSNNTRYPWYSRIQPGAWYMAEHIKKGKEELNFSEFGEYSARRQRNKFRAMAGQVKDGEMPLSSYTLIHRNAVLSPEDKQVLMAWFGTMEDSIK >CP033932.1|AZB25340.1|2685131_2686349_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKYYLVITIALLMSVLLSCKDNKHDHAGNNDGSYYTCSMHPQVVSDKPGHCPICHMELVRVEKSKQADPNTIQLNSEQIKLGNIKTDTLKDGLLGDRVILTGVLNFNQYNMQSVSSRVMGRVEKLHYKNVGDFVTKGSPLMEIYSEELNNAKQEYLLALEKKKTFGNINSIDFDQLIQSSKNKLLLWGMTDNQVRALQSAGKISATTTFYSTASGYITSLQVVEGGYVAEGGTIVDLADLSTIWAEAQAYSSQMSLINQTKTATVQIPDLNNKVITGKIDFSNPELNPSSRINLIRITVPNPNKDLKPGMPVYVFLETPKTKGITMPVDAVIRNGKSETVWVQTGEKTFKSRMVKTGTEIDNRIEIVSGLVDGDIVVVSGAYLLNSEYIFRNGADPMAGHDMSSM >CP033932.1|AZB25339.1|2683865_2685128_+|efflux-RND-transporter-periplasmic-adaptor-subunit MKYIICFLMIILVLYSCNNNTDKTSHPDNSHTAKNSPTYTCPMHPEVTSNKPGKCPKCGMELVQKTVNTNETESIELNTLLKPTNEFVISDIPTIRMQSEHKDITVQALGNIAYDTRQTGNISARISGRIEKLYIRYKFQKIAKGQKVMDIYSPELMEAQVNLLFLLKNDATNNMMINAAKQKLLLLGMSENQLQSIIQKGKPDLSVSVYSNYAGHIHETGTAGSMGSSTSPSNSMGEISETSSELSLKEGMYVQKGQTIFNVFNPGKSWVLLNIFPEDVPLVKTGQTVSIIPEVAPEKKFIGTIGFIEPFFRPGSKTLSVRVYFDNNRMQLPIGSQVKSEISTAGISGNWIPKEAVISLGLTKVILKKVDRGFIVNKIETGNEANGYIEVLQGLLPVEEIAGNAQYLMDSESFVRTKNN >CP033932.1|AZB27643.1|2682621_2683869_+|TolC-family-protein MKKIIFTAFIVCLFTNINAQVISLQNVIDSIQTNHPIVKMYDNEIRSMDEAAKGARSWMPPTIGVGQFMTPYNVNLWKRDGEMKGMGSAMLSIEQMIPNKKKLDAEEAYMNAMSSVEKENKGAGINEIIQDAKLLYSEWIVLLKRLDVVAENEKMLNFMIKNAEIRYKNGVGKIGAYYKAKAALGSTHNMQIMYENDIKEKRIRLNTLMGRNPMAPFEIDTIFSFNDYSDMVFDTALFNKNRSDLKSLDQQIRLTTLKQETERQSLKPEFGVRFENMYGFGGQPMQYTAMAMVKLPFVNWASKMSKANIASLKWKADALSSQKNMMINEYSGMAYGMRNEFDLKKNQLSLYRDDIIPALKNNFKTMQLGYEQNTEELFMLYDAWEKLNMTQLEYLDILSKAFEMQITIDRLIERK >CP033932.1|AZB25338.1|2680658_2682605_+|efflux-RND-transporter-permease-subunit MKIKWFKKKANKNVGYEKIPEEVRLSIIEKSCKQVSRGVFFSTIIIITSFLPVFLLTGQEGKLFHPLAYTKTFILVVDALLVLTLAPVLISFFMKGKFKSEHSNPINRGLEKLYEPVIKWCVKWRKTVLGINIAALIISIPMILNLGREFMPPLDEGSLLFMPVTLPDVSNSEAKRILQVQDKIIKSVPEVAHVLGKAGRANTATDNSPISMIETIILLKPQNEWRDGIKKNDIINELNAKLQMPGVTNGWTMPIINRINMLSTGIRTDVGIKVYGQNLDSIYSLSQKIKTELDGVAGIKDMYVEPITGGKYVDIVINRDEIARYNISIDDVNNLVESALGGMKLTTTIEGRQRFSVNARYGQDFRNNIEALKRLPVQTMDFGSIPLGSVAEVKLSEGAPMINSENAMLRGTVLFNVRERDLGSTVEEAKAKLNNMMLKMPQGYFLEWSGQYENLIRGEQTLKWIMPIVLVIIFLSMYFAFHSMREAFFNLISIPFALIGGVFMISLWGVNLSVAVAVGFIALFGLAVETGIVMVIYLNDAMQQLVLLKGNSRETITNEDLREYVIHGAAKRLRPKIMTVCVTLFGLVPILWSTGVGSDMMKPIVLPMVGGVFTSAIHILLVTPIIFLMQKEYELKKFGKIDVLDAAH >CP033932.1|AZB25347.1|2692423_2693410_+|nucleotidyltransferase MKLSDKDLQFFISKIKLQPENMGKYRDQVNNLKEKLDKKIAEDDRHGLKVEKYLLAGSWKKHTILKPTGDHPIDIDLVLFVTGDEDIHNDIGKLFDFIVEYLEEIYPQKDISKDVDAAGNTKSVTIYFSGSGLSVDIVPVVPLSTPKDYVWQPSRHGNGKKYITSISKQLSFSLNRRQENSAYTSIVRAIKWWRNYKELKPSDNEPGLSSFTIELIVAYLDINKGIQTNIEEGIIRFFEFVSSTEFPEIIFQDSIRSVPTQYDSAIYVADNTNKENNVAKRMTKPRWAEIIEEAEEAFDTLNFAQARNNEGDTIQEWKSVFGPTFNIK >CP033932.1|AZB25348.1|2693418_2693928_+|hypothetical-protein MYGTNTKTNTYTVLDIRKTFESCEADIRTIARRTNKWTMEYVDKVFHDVLKYAEKYYLQSVSITLINTNTGLPVKAAKFIVNDLGDATDSERAGKNNDWPDTDNTSLSIILSHTQKWRNLTSEEKTNFQKELKLSWGSTDINTNFPHLQQSDAQLYASNGYELQKKNFK >CP033932.1|AZB25349.1|2693930_2694815_+|AAA-family-ATPase MSTIFDNITELPSREIAERAKHLIGFENKYNRILSNLKLLLDQEGLVEWSKKFHKTELPVISQLKEKYPLIILAGDAGTGKTVSAEAIADRMLRELKKEGFFLKLSTRVRGEGLHGQMGNLVNDAFAELKTQAGKKRIAFLLIDEADAIASTRSTMQMHQEEKAAVNTLIQKIDEIRELNGRAILFMSTNRLHFLDEAIVRRAAIILEFERPTFEERVLLFKTSLAGVEITDKQLEELANLSGEESNNGLSFSFSDIRLRILPEAVAKCFPDKALDFETVAETIKKLNPSPKIV >CP033932.1|AZB27644.1|2694859_2695633_+|hypothetical-protein MVGGYIEKGNWTESKYSTTGYITLLTFIVTFVYENYNRLGFYFQSKVLLKNTDVRVSISYLYRIKVENEYLLVKSRTRKYFQPVGGCYKTLPGCERKFEELDVRPDRKFETEKGIAKNDLRVHVKGKNLIEFLKWFDSKEDREISPWREFCEELIATEILTWRPFRYIDYRFKKKIQSPIIDLDMGGKGLFIYEVFDLVINDEQMPLLKDLKNKTSENYIWVTDEVIQTLGHETGSKSFPHEIGPHTKYAQNLKWSK >CP033932.1|AZB25350.1|2696254_2696659_-|transposase MARSRYLLYKSREKWTLSQKQRASILFTQYPDLEQAYGLTDGLRKIYNQNISKSVAMTKLAHWFRNVEEADFKSFSTLRKTIMNRYRNILNYFDQRSTNAAAESFNAKIKNFRMQLRGVKDRTFFIFRLAKLFA >CP033932.1|AZB25351.1|2697022_2699071_+|hypothetical-protein MNKFYFLIVFFITQFFYCQLDNTHYLQPIVFGAYGSTAATISEEYIYLSTPSASNISVTIRMADGTTIPRLSVYNINAATSSIVTNGVVTFSNTSPLRLSVINASNVVLAPGTSPMTVATTRAGTIIPANVGGMIFQSTSDFFVNYRGADPSQAGSSLTKGKVALGKNFFWGGTPNEFTTQVPEVGNMVSIMATEDNTIITINNIDSGTEFINGANATPLTGTTFTRTLQKGQSFILYAKVKINTFSLQDKGWLGAKISSDKNIAVTVGGLMQQGSVDTGTVSDSRDFAVDQLVPVDQLGNEYIVMQGNGGVYERVIVIATESNTTITMNANTNPSYTLANVGDYAIVPATFFTNKNMYIKTNKAVYVFHKIFGSSSLATNSFMFIPPISCFGQTSVNMIPDAKQIGSTVYPNTELAVLAASGAANAPVVTVSGSAAIAPIVAGGTAVPGNPNWRSYRYDIANAAGGTATVKNLRVSSAATIQAELIGASGNAGFGGYYSGFGTSPIVNISVSNSPTIRPCTGNTGNSSLSVSSGLGSYQWYKNNTLIAGATTNSYAIPAGDTTSADYNVIITVPGGCVLYSNVVRSYACPCYKPGATGTPEITKIGISTRASKSTANWPADINNGFIALESNDKGVVITRVSDPETSITNPIDGMIVFDTDDICLKIYDGTKWGCINQTCN >CP033932.1|AZB25352.1|2699073_2699586_+|hypothetical-protein MKAIILFLLIILSSPIKAQIGFEKTIIDGSGLIDFPIGTTKGIILPQVADNTSMTDVSEGTFIFDGTTSRVKYYNGITWIELTGQTGTSRTLLPGAENNQSKGIIIGASDSDAKGVLILESQDKALILPKVIDPATNVKSPSPGMMCYDPVLKLVCFYNGTSWAFWGNID >CP033932.1|AZB25353.1|2700236_2700995_+|LuxR-family-transcriptional-regulator MEQIKRFFNEKNEVSKDADIDFSQDGEYLEAVKALARTTYQSLYVINYQTKGFEYVSENPLFLCGKTSAEVKNLGYAFYFQNVKPEDVEMLIKINEAGFKFYDKIPVEDRKLYYISYDFYLINGQKNMILVNHKLTPMFLTEDGQVWKALCAVSLSNNTSSGNVVLSKEGSDEIWRYDLTADKWEKDERVKLSSREHEILSLYASGLTISEIAEKLFITADTVKFHRKKLFEKIEVSNIAEALSYAKTNKLL >CP033932.1|AZB27645.1|2701121_2702150_+|murein-L,D-transpeptidase MKKTFLYACLCAVLLTSCKKEIEKISDTFKDTVSASEIPETEKDTVKKDSVPVVKKESVPPMMQENGFYNAFVIPKDKKLRDSVYAEFSKKYNEQERTAILALNRLDSKSKWNADTLVVPAKIDTTLMAYSPFPMQLDVLSGVKKFVIFSYPIQAYAVYSNGSLVKWGPTSMGKKSAQTTRGLTFANWKKKLSISTVSSEWKLPYNFNIHNIGGIGWHEYTLPGYPASHSCLRLLRKDAQWLYSYADTWILNPGGATTKARGTAVMVFGDYNWGGRKPWKKLLDDPNANNISVEELTKLLEPDVPKMLKEQANREKVADSIKTAKAMAAPIQNERATDTLSK >CP033932.1|AZB25354.1|2702142_2702670_-|hypothetical-protein MTTEETTLDRIRTRPRFKMFTHLTKEEYAQNLKKYLAEHKKEFSGNINKEVATIWVETEYDNYWKPRLALRVEIEDEETVIRGVFGPSSAVWTFFMFLYFSFSILWMTFFTMYYVEKQIKSAEYPWALSASFVMLFFILLTYVAARFGQHKGKDEMLKLRQFAEESTLQFEKKII |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065458 | Streptococcus phage IPP17, complete genome | 12566-12594 | 6 | 0.793 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065495 | Streptococcus phage IPP58, complete genome | 11963-11991 | 6 | 0.793 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065470 | Streptococcus phage IPP29, complete genome | 14220-14248 | 6 | 0.793 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065494 | Streptococcus phage IPP57, complete genome | 11963-11991 | 6 | 0.793 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | MG592499 | Vibrio phage 1.124.O._10N.286.49.B1, partial genome | 31536-31564 | 7 | 0.759 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | MG592531 | Vibrio phage 1.164.O._10N.261.51.A7, partial genome | 32360-32388 | 7 | 0.759 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | MG592611 | Vibrio phage 1.246.O._10N.261.54.E10, partial genome | 29199-29227 | 7 | 0.759 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065462 | Streptococcus phage IPP21, complete genome | 14891-14919 | 7 | 0.759 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065454 | Streptococcus phage IPP12, complete genome | 13770-13798 | 7 | 0.759 |
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CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065453 | Streptococcus phage IPP11, complete genome | 14265-14293 | 7 | 0.759 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065469 | Streptococcus phage IPP28, complete genome | 13017-13045 | 7 | 0.759 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065460 | Streptococcus phage IPP19, complete genome | 11736-11764 | 7 | 0.759 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065499 | Streptococcus phage IPP63, complete genome | 12638-12666 | 7 | 0.759 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KT337342 | Streptococcus phage phiARI0131-2, complete genome | 21360-21388 | 7 | 0.759 |
CP033932_1 | 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder | 1205509-1205537 | 29 | KY065459 | Streptococcus phage IPP18, complete genome | 14258-14286 | 7 | 0.759 |
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3. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to KY065470 (Streptococcus phage IPP29, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
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4. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to KY065494 (Streptococcus phage IPP57, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
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5. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to MG592499 (Vibrio phage 1.124.O._10N.286.49.B1, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
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6. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to MG592531 (Vibrio phage 1.164.O._10N.261.51.A7, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
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7. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to MG592611 (Vibrio phage 1.246.O._10N.261.54.E10, partial genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
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8. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to KY065462 (Streptococcus phage IPP21, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
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15. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to KY065460 (Streptococcus phage IPP19, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
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16. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to KY065499 (Streptococcus phage IPP63, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
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17. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to KT337342 (Streptococcus phage phiARI0131-2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
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18. spacer 1.1|1205509|29|CP033932|CRISPRCasFinder matches to KY065459 (Streptococcus phage IPP18, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
539014 : 566538
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP033932|539014:566538|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP033932|539014:566538|539014_539368_+|AZB23572.1|transposase|DBSCAN-SWA MLSDHDLLKLLLPEFLVEHFDILKAETHDAELHIYFEERNSIPHEFKERRFESKGFLPEIIVDDYPLRGKIVKLHVKRRRWTDKSSGEILQRDWQLVAKGTRMTKDLAGFLKKISRH >CP033932|539014:566538|541650_542538_-|AZB23575.1|integrase|DBSCAN-SWA MLDKFIEYLQFEKRYSPHTITSYKKDLDDFSHFYLRTESSGDISKADKKIIRNFIVDLSENNISKRSINRKLSSLRSFYLFLLKIGEITVSPAEGISSLKFYAEKQIPMSKEEMADLNDRIFDQECDILEKCIMEVLYQTGMRKAELCGLIFENVDIIGNELKVIGKGNKERVVPISEELSGLLKSYLQIRNPQTEYKSYFFVNKKGKKLNEKFVYVVVNKYLSLITTKEKRSPHILRHSFATHVLDNGAEISKVKKILGHSSLASTQVYTNANIEQLKKVFNQAHPRASKKEEL >CP033932|539014:566538|560185_560395_-|AZB23589.1|DBSCAN-SWA MKTLKIPYKELMWSIPWPIVLRMLYDLPNQKYIEKDDEKNSDDEVKELTPQTSNDFKKYLDKINQQNKK >CP033932|539014:566538|561903_562380_-|AZB23593.1|DBSCAN-SWA MGIEPRFNMNQINSYLQERINTLDELMIRNLNYLGMECVNLAKNLDTYQDQTGNLRNSIGYVVVKHGNVLSSVFTNEASGPESGNNDKSGKDIGEAYAKELAKDFGNGYAVIVVAGMDYASYVEDIHHLDVLKPAEVLAKTRINQIAKSIVNTMRRAQ >CP033932|539014:566538|566319_566538_+|AZB23602.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MGKFKKLSKEQLKEVNGGVKWTEYWLEEVPDYEEEMKDLLVKVDEEQCLLGYVTSDTHCDLEELLTKLKTES >CP033932|539014:566538|565321_565717_+|AZB23599.1|DBSCAN-SWA MKKILIALSLTLIFASCSSEIDTFDYDPKYLIEIDFKTGLLKEGGKVLQAASPELSDICLKALRNETLPEGYKAEVICQGSGGNNVLFYYIKLISSNGSNYYLVSSNGSVTMVHIVTHYDQNNCLKRWIKN >CP033932|539014:566538|539387_540326_+|AZB23573.1|transposase|DBSCAN-SWA MAEFFGIKGKTFQRQYKNNLSEYHSWEQKPHAEDWIIYPENVSASLSLDEVALSDGELYTVLTSKKAKGRKGSIVAMIKGTQSDFVITHLLKISRKLRMKVNEITLDMAGSMKRIAQRCFPDAVQVIDRFHVQKLSIEALQEIRIRHRWEAIEMENNPFNSHSAETEVFANGDTRKQLLARSRYLLYKSREKWTLSQKQRASILFTQYPDLEQAYELTDGLRKIYNQNISKSVAMTKLAHWFRNVEEAEFKSFSTLRKTIMNHYRNILNYFDQRSTNAAAESFNAKIKNFRMQLRGVKDRTFFIFRLAKLFA >CP033932|539014:566538|545198_545417_-|AZB23578.1|DBSCAN-SWA MEIEGEVLKVKKRYTRIQLKDGTIIDLMYRKSDNYIVYNLKKGDWMRAVVEVKNYKLWRMRVVAYFLHIVKP >CP033932|539014:566538|548092_550873_-|AZB23583.1|DBSCAN-SWA 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MTQGALHFDALLSVNNFDQGITRIKNGIREASGLAVKEAQVMDSAFKNLGTAIGGYFSAQALFSFTKEIINVRGEFQKTEIAFSTMLGNADQAKQLMGQMVDLAAKTPFSLQDVSAGAKQLLAFQVPASEVVDTLTRMGNIAAGLGVPLERINLIYGQVKAKNKLMGQELLQFTEAGIPMLAELAKKFNKNESEISDMVSAGKIGFKDVQDVLFKMTNEGGMFFELMEKQSASLSGQVANLGDAWDQMLNKIGEGSEGILYKGIEGLTFLVDNYQKVLDIIEGLVVAYGSYKAAVIVASAAQNLGNRTIQSEIALLGISEKMKLGRALVTQRQAEATARDAAAELASTRAKYASLQAEVSSLAVKKQAAIQAGITAAAKAQEARVQLSLARMELSSIQAVGTARQIELAQKRVEAAQNTVLATQESASIARKRALAVATEFNTAKQSLENTAKAVGTAQGALAVATETAQTAAKNANSIATARLTLLTTLRTAATRLATQAQALLNATMLNNPIVLVIAAAVALTYAYLKLRDTSTAASIAEKQLNDERQRSSKLIEELKTKTQELTSVIFSDTSTKLQQIEAYKALGKIMPDMLKQMDLETFKKLGSTEAQKKLNAELDKFSTQNIRSNIEKSQKSIEEYSAKIEELNKILKKRNGDSGIYLEQLEIAKKNLEAQKINLEKYNNELDQRLENERLSTMSLAEQKRYWEGQVKSINEQISALEKSNIKKAEALDKVNNIHSLVKSTSIGLINWNINPLLNQLNKAQQEIMKINKAQSGASVDKNKAYWEAQKKAAEDLVASMPTSKEGSPAWREAKKKWLEADAALKKYDLSDKQFLKDQKEREKERLRLEKGAEKSFLKGSLARLEQEISLREEALKRSSGDTVQMRYIDKYGKERFSKEVKSVKEINDELLALRKEKAERERLFEVKTFQESIDETKRQIDVRDKLLQLGYSKETVDGMFPEIKDKSFLQYLNDTNASLEKKSGNEAAENLIKIKKIISEYIGEETFLEGVNKEIDQIKAKFEGNELIDKLEKFKKVYATEMTGENRNAKDLAIDKALKDEKQKQQDFYNSFVKDKETFEQRKLAIESRYNELRKRIQDSNVSDAEKARQTEEANKAQTKEISAMSWEMFQKTDAYVKAFGDLEKIGPRTLKKIRDQFKAFLDSDAGKALNAQDLKAYNDVLKNLNESISKDPFSKLSESIKKYREEKKKLADIEKKFGKDSEQYKIKLDETNHALVGIFNAAGAAGDAAIDFAINLGSALGMMSEESQQALKDVQQLFDGVVNTVAGYVNKNYGQMVSGIISMVSSIAKLANGDTDREKSIRQWQQAINDLKYSYEQLNHIIEKTAGEAQLKMQKDLIANLKEQQAVLIKMRKTENEKKNTDTDKIASYNQQIQEINDKIEEIVDNFKRQVTTVEFKDLSEKIADALISAFSQGEDAAKSFDKVVDDVMRSAVQNALKMKFLDEAAKNMVDSIYTSMGFGKGDTTANQAKIKEYEAKVKALEEKLLTADYYEKPLFEKQRQGYLQLIGKLKQQIANSEIDGSFDGLTKEERDAIKSMGEKAMKDYMEALKQYEDLFGQSAENAQGLKGDIKGITEKTAGALEGQINAMRINVAEALKIHRANQDIFRNQLQIQSQIEKNTRPIEAMYKEIKEMNSKIKSGLAGIP 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MLIIPVKDGESIDRALKKYKRKFDKTGTVRQLRARQQFIKPSVTLRQARLKAAYKQRALSKEEQA >CP033932|539014:566538|550897_551890_+|AZB23584.1|DBSCAN-SWA MKKNNFNFLRLLFSTLVIFSHSFDLTGGEDFLFAITKTTSFGAIAVAFFFVLSGYLIFQSLENSKSLFDYFWKRSLRLFPALFVMLCFSMVIIAFLNYKVLFHKDFWLYLPNNLSLYRVQYNVYGIFKNNPYPNAVNGSLWSLAYEFTMYILISFLFFVKTSISKRNILIIAFIVSVLCTALNPNFLSIFYKSIHLEPALFYKLSALFFGGALMNYVKIKFNIKFFILLLGILSISFYYEVFHITSSFIFPILIIPLGNSYFKHFQLPEKLGDISYGVYIYAFFIQQVFMNFFNLTPILLFILSTIVTYILSYFSWHLVEKQTKRYKSII >CP033932|539014:566538|563020_564127_-|AZB23596.1|DBSCAN-SWA MAKETTVFGSVADADTLQMMIDTRLEKFNTAWYTQYFDFALPQISLTYSSVLGNSVITPAASYVTRDGETPLRSRETLEAMSGKIPPIKVMRDLDEEQYRNYKVLQEMKGIKDQEKKNQALKLIWDDMKYVTEAVDKRIDLTVAQAISTGKITITADNNPDGIVIGDIDLKMPSENKVNASENWSDAVNSKPLTDIVNLVNDASDRGLTFGKILIDGRTLLQFMKSKEVKETVGTFFGLSAAARNSQTAPITNDRINEYMTAAKLPVFEVTDIRVPVEKDGTPSIIRPFEESNLAFIPDGKLGEIKNALAMEEMEPVNNVIYAKKGRTLISKWNQNEPFKEWTKAELNAFPVVNTIKYIYLLSTTKAF >CP033932|539014:566538|543614_544784_+|AZB23577.1|integrase|DBSCAN-SWA 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>CP033932|539014:566538|561508_561907_-|AZB23592.1|DBSCAN-SWA MITTFELKSIAFNIVKNSTIKSIINGEVCIDQRPFNSTKNDVVIGSLSVATDPLHSSVVLVNIYAQDIQSGTSYFPNLALLNNATKLLMPLFDKVYLEDKKTYLEIEYQRDYKVDGKNEWVSVIRLQTRTIN |
31 | Riemerella_phage(57.14%) | transposase,integrase,holin,bacteriocin | attL 538228:538243|attR 568378:568393 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
572159 : 586637
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP033932|572159:586637|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP033932|572159:586637|584658_585414_-|AZB23637.1|DBSCAN-SWA MSKKDSYYFSHDSNARNDEKLLAVRMKLGAEGYGIYFMILERLRDERDNMSVKDYNILAFDFRVSSEKVKSVIEDFGLFEFTDDKKSFFSKRMVENMNFKNEKSEKARKSAEIRWNKSEKNANALPTQNEGNALKESKGKESKRKESNTVIDIPFSPSGDSNPVKSFKQFSKQEFYESLKIFVKEFGKDTVRDFFDYWTEPSASGKMRFQLEKTWSAKGRLGTWKRNEPKFGGSNLVNNKIEQNIPGPWAS >CP033932|572159:586637|573436_573754_+|AZB23621.1|DBSCAN-SWA MKTLETILTEIKDLYDLNLNYYKGEYEGKEFKIRFNKDHARNFNRNDDDSISNLSLINIYGSAFDEVNIYRNNDRTVQAQIWGILDWEDAKKEIENFLQELTWLD >CP033932|572159:586637|581587_582004_-|AZB23633.1|DBSCAN-SWA MDNNIKEQLDSMVGKSFHYEKQNIKILKYKEIAGNICIVTDQRTFQFYPDEFYTNFLGKISEHKEVGTFSPPSEIERKSFVALPEENLKIKDTLMEALKKVKEDPSFLLQAKAICEITNTMVNIQKTEIELIKLQKDL >CP033932|572159:586637|579063_579468_-|AZB23628.1|DBSCAN-SWA MKKTFLFSVALFSLLSLTSCWEWSRQQDIKDAEAKGIATLKESESSKKAMVETAKAENESATLKAEAMVKIAKAQANAEIERAKGVAEANKIIGNSLQGNEDYLKYLQIEAIKESKGSKVYIPTEAGLPILEVK >CP033932|572159:586637|572159_573212_-|AZB23620.1|DBSCAN-SWA 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21 | Riemerella_phage(18.18%) | portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
993805 : 1033749
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP033932|993805:1033749|DBSCAN-SWA 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31 | Klebsiella_phage(50.0%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
3460602 : 3520377
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP033932|3460602:3520377|DBSCAN-SWA 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52 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | transposase,integrase | attL 3462060:3462076|attR 3498631:3498647 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3742748 : 3792941
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP033932|3742748:3792941|DBSCAN-SWA 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43 | uncultured_Mediterranean_phage(14.29%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
4272842 : 4295882
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP033932|4272842:4295882|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP033932|4272842:4295882|4284035_4284935_+|AZB26662.1|DBSCAN-SWA MPTWNEIVEEINNQPNPFDLIRRKYIKQLSDKTGRNVLTYYSGWLQKGHLSSHGFRFDITDSDKMGFMSTINGLDKTKGLDLVLHTPGGSIGATESIVNYLKSIFGNDIRAIIPQTAMSAGTMIACSCKEILMGKHSNLGPIDPQLGIGIPAHGIIEEFEKAKAEIIANPLTIPVWQTILSKYNPTLIGECEKAIKWSEDMVKNWLKDNMFNGEADSETKANAIIAELGSHALTLSHDRHLSPVILKGLGLKIIDLESEQDLQDKVLSVHHASIITLTQTPTYKIIENQEGKAYVQLVD >CP033932|4272842:4295882|4293246_4293441_+|AZB26668.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MKNQTSLKAKKLSKKELKTIAGGMLDCMPAQEICLPHMEPCQSNVDENGCAMISPYCGQKICRP >CP033932|4272842:4295882|4282097_4282544_+|AZB26658.1|DBSCAN-SWA MGTFCFSQTVTKKFNSYYNRYEYYDSSSNLIGYEKYNSYSGQWEYYSLKSPQQSRQPYQYKDPQELDISNLGNAATTLQNRYNSNQKNAQSVVDDILYQIKSLNISDDRKNRIIESFNKTVINNMESLYRGNVSWLYDAANTIIKNTK >CP033932|4272842:4295882|4279251_4280037_-|AZB26655.1|DBSCAN-SWA MDTKESYAVVTGASQGLGKAFAENLARKKINVVLVSLPDQNLKELSRKLEEIYQIKAYCYEVDLSVNENVMKLTEWLNSSFNIHILINNAGLGGTKRFTEATPDYINTILQVNVTATSLITHQLLPNLLKQPNAYILNVSSMAAFSPIGFKTVYPASKSFIHSFSRGLREELKDTNVFVSVVNPGAMKTNADVCRRIEKQGFWGRLTLLNPDKVAARCIRQLFKKDSVIMVNPISWLVMKILPIWIKLPLMTQAIKREIKA >CP033932|4272842:4295882|4274307_4275156_+|AZB26651.1|DBSCAN-SWA MTISAFKKYFKAELSDLYTESESAFLISLFIQKIAGFNSFEQRRFSEQELLKDDEQELRSMVSELKTGKPYQQIIGETEFYGMTFLVDEHVLIPRPETEELLEIAIREIQNSGNKDSELKILDVGTGSGVIPLVLKKHFPEAAITSIDFSEKALETAKRNADYHQLDVKFIHADYLNTQLTEEYDVIISNPPYIGIEEETEIEYYVKGFEPTMALFSPTSDALIFYRKIAEDSREHLKKNGLLFLEINQKLGSETLELYQHFTNAQLLKDLSENDRFIYGKK >CP033932|4272842:4295882|4283823_4284036_+|AZB26661.1|DBSCAN-SWA MKTIEAEKIRLDKQKEAEQLFKKLGIEEKSKTEIFGFGIDKFVSNKDDNKKTKLHWTRLSINSNATHTID >CP033932|4272842:4295882|4293045_4293216_+|AZB27741.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MKSKSPSKGKKLNKKELRSINGGLLMCLDPSLRCRQYHPKCAEDQCKPDLPLEPWN >CP033932|4272842:4295882|4282549_4283476_+|AZB26659.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>CP033932|4272842:4295882|4273548_4274307_+|AZB27738.1|DBSCAN-SWA MKIVTSPAKLMNVEYSTDLLKSTTPKFIEEAAIIQTYLKEKSPKYLSELMEISSKLADENWERNQKWKSKPTAKESAPAMFAFTGEVYRGLDAKTLDKAAVDYLQKNYRILSGLYGLLKPSDKVMLYRLEMGRPFEFDQYKNLYEFWKEKITEQLNTEMKKGEILLHLASNEYGKVIDRKKLNHKVIDFDFYELKDGKLKTIVVYTKHARGLVVRFCAETNAQTLDDVKAFNYEGYRINEEKSTDTKLVFTR >CP033932|4272842:4295882|4294591_4295530_-|AZB26671.1|DBSCAN-SWA MEKIAHSSLEDFYREMTAKLGKSLEDIFPKGLHKDIGHFNVFDIAQTIERIKNTSEMPYNRRKYYKISLIRGRNRAEYADKTVSIEKNALLFATPKVPYHWIPEDARQSGSFCVFTEDFFIKDTSYNALENQPIFQPGGVPVFEIDDELADEIELLFKKIKNEIDSDYIFKYDLIRNYVWELIHYGQKLQPATRISMAKDASMRVVSLFIELLERQFPIESKEQRLQLKTANDYAERLSVHVNYLNKRLKESTGKTTTEFIGDRIIQEAKILLKQTRWNVSEISYALGFEEIAHFSNFFKRKTSFTPIEFRS >CP033932|4272842:4295882|4278283_4279255_-|AZB27739.1|DBSCAN-SWA MKKVFVTGATGLLGTNVIIKLLQSGYSVTALVRQKSKYLGEKNENLKLIEGSLASDLSPYLANIDCFIHIAAETSQNLICYDDYKKINSDMTLNLFSQAESCGIRRFLFVSSANTIGYGDREQPGDERKLQKYPFTDSFYAQSKLEAENYLLMNCKNTEIVILNPTFMIGAYDTKPSSGKLIFWAWKKKLVFYPKGGKNFVDVQDAASGILSAVQNGRAGEKYLLANENLSYREFFKKVNRITDQNPIMIAIPNWVLNFLGLMGDGLRKLKIKTNLSTCNMKALQINNYYSHQKSVEELGIQYHPVDKAVEDAIRYFIKNNKY >CP033932|4272842:4295882|4285048_4285690_-|AZB26663.1|protease|DBSCAN-SWA MDIFVLIIIAATCIFSYMGFNNTVLFEKYKFNVGAIANRKEYIRLISSAFLHADFMHLFFNMLSLYFFQGVVVHFFGQIGFLIIYFGSMILGNLFSLQIYQKQPWYSAIGASGAVSGIIFASIAMAPNEISVNFLPGWLFGTLYFGYSVYMMLNPKQWDNLGHAAHLGGAFFGLVYSIVLHPQLAMSNILYLGVMSLPLIYLGYQIFVRKRIR >CP033932|4272842:4295882|4288832_4290722_-|AZB26666.1|DBSCAN-SWA MSQEINPTYSEENIRTLDWQEHIRLRPGMYIGKLGDGSSADDGIYILLKEILDNSIDEFRMRAGKRIEIKLDDGKVTVRDFGRGIPLGKVVDAVSKMNTGGKYDSKAFKKSVGLNGVGTKAVNALSDYFRVRSFRDGKMKVAEFSRGMIKENFDEKDTSDRNGTEISFIPDGEIFLHFKYRKEYIERMLRNYAYLNPGLKILFNGETYFSENGLKDLLEEELESDILYPIVHLKDDDIEVAITHSDKSQTETYFSFVNGQNTTQGGTHLNAFREAYVKTIREFFNKSFDASDIRKSIIAAISINVEEPVFESQTKTKLGSNDMGPNGPTVRTFVIDFLKSKLDNFLHKNPEIAEAIQRKILISERERKELSGIQKLARERAKKVSLHNKKLRDCRQHYNDQKAERKGDTQIFITEGDSASGSITKSRDVETQAVFSLKGKPLNCYGLTKKVVYENEEFNLLQAALNIEESLEDLRYNQVIIATDADVDGMHIRLLMITFFLQFFPDLIKNGHLYILQTPLFRVRNKKETRYCYSEAERVKALNELGKNPEITRFKGLGEISPDEFKHFIGKDIRLEPVVVGKDQTIDQLLEFYMGKNTPDRQTFILENLVVEDDSDIDKKQILDEVSSE |
27 | Bacillus_phage(66.67%) | transposase,protease,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
5099455 : 5145100
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP033932|5099455:5145100|DBSCAN-SWA 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50 | Bacillus_phage(41.67%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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