Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP034159 | Chryseobacterium carnis strain G0081 chromosome, complete genome | 0 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,WYL,PD-DExK | 0 | 0 | 3 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
334537 : 344231
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP034159|334537:344231|DBSCAN-SWA AATGGAAGAAAATATTTTAGACTGTGTTATTATTGGCTCCGGACCTGCGGGATTTACAGCCGCAATTTACGCTGCCAGAGCAGACTTAAAACCAGAATTATTTACAGGCCTGGAACCGGGCGGACAATTAACAACAACTACTGAAGTCGATAATTTCCCGGGCTATCCGAGCGGAATTACAGGTCCGGAAATGATGATGGATCTGCAAAAACAAGCCGAACGATTTGAAACCAAAGTTCATTATGAAATGATCACAAAAGCTGAATTCTCTACAGAAGTTGGCGGTGTTCATAAATTATGGGCAGGAAACAGAGAGATCTTGGCAAGAACCGTGATTATTTCTACGGGTGCCACTGCAAAATATTTAGGTTTAGACGACGAAAAAAAATACATGGGCGGTGGTGTTTCTGCGTGTGCTACGTGTGACGGATTTTTCTACAAAGGCAAAGATGTTATTGTCGTTGGTGCCGGAGATACGGCTGCAGAAGAAGCAACCTATTTGGCAAAATTGGTGAATAAAGTGACCATGTTGGTGCGCAAAGATTACATGAGAGCTTCAAAAGCCATGCTTCACCGCGTGAGCAATACGCCCAATATTGAAGTGAAATTTAATCACGAGTTGATCGGCATTGAAGGAGAAAACAATCTTGTGGAAAGGGGAGTCGTCATCAATAATCTAACTCAGGAAAAATCAACGATCGATGTTCACGGAATTTTTATTGCCATCGGACATAAACCAAATACTGAGATTTTCAAAGGCCAGATCGATTTGGATGAAAACGGATATATCAATACCATTCCAGGAACCTCTAAAACCAACTTGCCCGGAGTTTTTGCGGTAGGAGATGTTCAGGACAGTCATTACCGCCAGGCGATTACCGCTGCAGGAAGTGGTTGTATGGGCGCTATGGATGCTGAGAAATATTTGGGAGAATTGGTGTAACGAAGAATGCATAAGTGAGAAGAACAAAGTAAAAAGAGCCAGGTAAAAAGAGCCAAGTAAAAAGAGCCAGGTAAAAAGAGCCAGGTAAAAATTGTAGAAAACCCCGGTGAATTTGTTTGCCTAACTTTCTACAACCTAATACCTAAAACCCAACACCTAACATCTAACAATTTCCACTCATCAGAAATATATTCTACATATTTATAGGCGGCGGATTAGGAAGCGTACTGCGTTTCCTGATCTCCAACTATACCCAGAAGTTGTGGAATGTGAATTCCTTTCCTATGGGGACTTTTGTGGTGAATATCATAGGGTGTTTTTTAATCGGCGTGCTCACTTCTTATTTCCTCAAAGTGGACAATTATCTGAAGTTTCTCTTGATCACGGGATTTTGTGGAGGCTTTACGACCTTTTCAACTTTTTCCGCGGAAAACTTTTCTTTATGGCAAAACGGAAACTATCCCGTCCTTCTGCTTTATGTTTTATTAAGCATTATAGTGGGTTTAATTGCGGTTTATCTGGGATTACAAGTCGCTAAAAATTAATTTTTATTTTGATAATGAAGCGTTTAAAAAAAAAATTCTAAAATAATTTGGTCAAGATGTAAAAGTGTTTTATATTTGCACCACTGAAAATGAGAGATCATTTTTAAAGGAGGAATGGCAGAGTGGTCGATTGCGGCAGTCTTGAAAACTGTTGACTGTAACAGGTCCCGGGGTTCGAATCCCTGTTCCTCCGCTTAAATCCCTATAAGTTAATACTTGTAGGGATTTTTTTTTTAGGATTGGTGCCAAGTTTCTTTCATTCCACAAGATTAACACCTACCGCAACATTATGGTGTTTACAAAAAAAATAGGTACTACATTAGACTCTCAATAAATTCGTTCTTTTGTTAACATGAGCTAATATCATGACGCCAAATTATCACCGTATCTAATTTCAAATTAAGCATTGATCAAATACATTCAGAATAAAACCCATTACACCGAAGTTCTGCAGAAGTGCAAAACCGTTAAACGCACGTTATGGATTGGAACAGCTGATATTAAAGATGTTTATGTGAAGGATGGGCTTTCGGGGTCGAAACCTTTCTTGAGTGTGCTGAACGATCTATTGAAAAGTGGAGTAGAGATCCGTTTGCTCTACGCTAAAGATCCCGGTCCGAATTTTAGAGAAGATTTTGATAAATATCCTTTGCTCGCCAAACACTTGGAGCAGGCACATTGTCCACGCGTTCATTTCAAAATTTTCGTTTTTGATTCGTGCGAAGTTTATATCGGTTCCGCTAATCTCACGGGCGCCGGCATAGGAATGAAAGGCGAACAGAGCCGCAATTTTGAAGCTGGCATACTCACCGATCTTCCGGAACTCGTGGAGCCGGCTATTTCCCAGTTCGACGAAGTGTGGAACGGTTCCCAATGCACCAACTGCGGGCGGAAAAAATATTGCCCCCTGCCGATTGCGGAGTATTAACTTTATAGTTATCACATTTGCGTTCGGACTTAAGTCCCGTTTTTCTTCTATGCAGCACCCAGATCATCGTAAAATTTGTCAGCATAGATCGTGCTCAGAATTTTAACTGAGGTAAAAAAAGAGATAAGAAGTCTTTTAATGCGCGGCTAATTAATAAAAAAACAAAATGGTAAGAAGCTTCATCTAAGTTCTTTTTTCCTGAATTTTAAAAAAGTATTTTTACAAACTTTAAAATCATAAAACGAAACATGAAAATAACCTCTTTGCACTATAAACCCCACAATCTACTATTTTTAGTCCTCCTAAGTATTGCATTATATTCCTGTTCCGCCAACAGAGGCAACGCGTCCTCTTCCTATCAATCGACCACGGTTTCTTATTACGCCAACAAATTTAATGGTAACAAAACGGCCAGCGGAGAAGTTTACAAACATTCTAAAATGACGGCTGCGCACAAAAGCCTGGCTTTTGGTACCAAAGTGGAAATCATCAATCCCGAAAATTCAAAAAAAGTAATTGTAATCGTGAATGACAGAGGTCCATTAAAAGCAGGCAGAGCCTTCGATCTGAGCCAGGGGGCTTTCAAAAAAATAGGGAATTTGAACGATGGGGTTTTGAAGGTGAAATATAAAGTAATGAAGTAGGGTGGATTTTAATGATGATGTAACAGTTCTTACATTGGGGTAATCACCCTTTTTTAAATTGAAACTCTGGTTTTGAAAGTGGAGTTTTTTTAAAAATTTTAATTTTTATGACTAAGAACTTTTCATATATTTACAACAGACTATAATGTATGAAATGATATTTACTGAAGATTCATGAGTTAAAATCCCGGCAATTCTGCATTTGATGCGACTGGGTTATCAATATATTCCATTTAAAGACCAGCAAAGAATAGAAGAGAATAATATTTTTCCCACTATTTTTGTTTCCCAAATTTCAAAATATGAGTAAAAAATTATTTTCGGAAAGAGATATTTGTACCAAGTTTATTACACCCGCCTTGGAAAGCGCTGGTTGGGATAAAATCAAACAATTTCGTGAAGAAGTGAGTTTTACTGATGGTAGGATAATTGTTCGTGGCAAGTTATCTACCCGTGGAAAAAAGAAAAGAGCAGATTATATTCTATATTATAAACCCAATATTCCCATTGGAATTATTGAGGTGAAGGAAAACAACCATGAAGTTGGTGCAGGCATGCAACAGGGTTTAGAATATGCAGATGTTTTACAGTTGCCTTTCGTGTTTTCAACCAACGGGGATCGCTTCCTATTTCACGATAAAACAAATCCAAACACTATTGAAAATGAAATAGAATTGGACAACTTTCCTTCTCCTGAAATTTTATGGGAAAAATATTTACAGTTTAAAGGACTTGCAAATGAACAGTCTAAACAGATTGTGGAACAGGATTATTTCTTTGATGGATCCGGAAGAGCACCACGATATTACCAGCAGAATGCTATCAATTTAACTCTTGAAGCAATAGCAAAAGGTCAAAACCGAATTTTGCTGGTCATGGCAACGGGAACTGGAAAAACATATACCGCATTTCAAATTGTACATCGTCTTTGGAAATCAAGAACAAAAAAAAGAATCTTATTTCTCGCAGATCGAAACTCATTAATTGATCAAACGAAGAGAGGTGATTTCAAGCATTTCCGTGATAAAATGACAATTGTTCAGAAAAGACAAGTCGATAAATCTTACGAAATATATTTAGCAATTTATCAAGGTCTTACCGGAAATGAGGAAGAAAAAAATATCTTTAAACAGTTCAGTCCGGATTTTTTTGATCTTATTATTATTGATGAGTGTCATCGTGGAAGCGCCAAAGAAGATTCTGCCTGGCGTGAAGTTCTTACGTATTTTAAGTCTGCCACTCAGATTGGTTTAACCGCTACTCCCAAAGAGACAGATACTGTCAGCAATTCAGAATATTTTGGTGATCCTATTTATACCTATAGTTTAAAACAGGGAATCGATGATGGTTTTTTGGCGCCGTATCAGGTGATTCGTGTAAGCATGGATCTAGATGTGGAAGGATGGCGACCGGAAAAGGAGAAAAAAGATAAAGATGGAAACCTTGTTGAAGACCGAATTTATAACCGTAAAGATTTTGACAGAAATCTGGTAATCGATGAAAGAACACAAACTGTTGCCAGAAAAGTAACTGAGTTCTTAAAGAATACCAGTCGCTTCAATAAAACAATAGTTTTCTGCAGAGACATTGATCATGCCGAAAGAATGAGGTCGGCTTTAGCGAATTTGAATTCAGATTTGGTGTTGCAGAATCACAAATATGTTATGCGAATTACTGGAGATAACGATGAAGGAAAAAGGGAACTCGATAATTTTATTGATCCCGAACAAACCTATCCAGTAATTGCTACAACTTCTGAATTAATGACAACCGGCGTTGATGCGCAAACCTGTAAGTTAATTGTTTTGGATACCGAGATTGGTTCAATGACAAAATTCAAACAAATTATTGGACGCGGAACGCGGGTAAATGAAGAATTCGGCAAACTTTATTTTACCATCATTGATTTTAGAAATGCGACCGATAATTTTGCCGATCCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP034159|334537:344231|341280_342726_+|AZI31922.1|DBSCAN-SWA MSISGVIESIRKIMWQDSGLNGDAQRLEQLGWMLFFKVFCDKDQEMELMDEAYESPIPERFRWENWASDDEGMTGDELLNFVDRELFPALRNLDLSTGNQRAVIVHEVFDGNNNYMKSGINIRKVLNKLNEIDFNSTKDRHSFGDVYESLLKDLQSAGKSGEFYTPRAITQFITHILDPKLGEKILDPACGTGGYLTAVIENIKKNVSSVEDLKLLQQNIIGWEYKPLPYLLATTNLILHDIEIPNITFRDSLDKPLSEYREKDRVDVIEANPPFGGIVANNNENNFPQNYRTKESADLFLILMIHLLKIGGRAGIVLPDGSLTGDGVKQRVREKLLKDCRLHTIIRLPNSVFQPYATVATNLLFFDKMHHNNETSDFATQEVWYYEHRLPEGQKSYSKTKTIKEAEFDPIKEWWNNREESEVCWKVDIDTLRQRNFDLDIKNPHKVEEVQEFSSAELIEKLSCSLTKTNKLLSELKEAIG >CP034159|334537:344231|334537_335479_+|AZI31916.1|DBSCAN-SWA MEENILDCVIIGSGPAGFTAAIYAARADLKPELFTGLEPGGQLTTTTEVDNFPGYPSGITGPEMMMDLQKQAERFETKVHYEMITKAEFSTEVGGVHKLWAGNREILARTVIISTGATAKYLGLDDEKKYMGGGVSACATCDGFFYKGKDVIVVGAGDTAAEEATYLAKLVNKVTMLVRKDYMRASKAMLHRVSNTPNIEVKFNHELIGIEGENNLVERGVVINNLTQEKSTIDVHGIFIAIGHKPNTEIFKGQIDLDENGYINTIPGTSKTNLPGVFAVGDVQDSHYRQAITAAGSGCMGAMDAEKYLGELV >CP034159|334537:344231|342725_344231_+|AZI31923.1|DBSCAN-SWA MAKIEYSEYLKKLPVSTLVAESIFSDLSSSCKLYKLSKICKTSSGGTPLRSRIEFYDGDIPWLKSGELNDGLITKCNEFITELGLKNSSAKLQPKGSILLAMYGATAGRVGILDFEASTNQAVCAIFPDEGKLDKDFLYWFLRQHRYKFIEISKGGAQPNISQKVINDTLVPLPHISLQRELALLFFDIEKNDKLDINLIPVQFQDKVNSVFHSKNNVEIISFELKNQLSLISQLRQAFLKEAMQGKLVSNETSDGKTGADLLAEIQTEKEKLIKEKKIKKGKPLPPISEEEIPFDIPENWVWCRLENICIKITDGFHHSVQKVSEGYPYISAMHIRENSIKWDNGIFVPEKDHRELFKKAKPKRDDIIITNRGAGCGTPAIIDVDYEFSFQNAGLIGFVNHLISSKYIYYFIIFQRQSIVEFFVNGGLQPMLSNVMLSKLEIPLPPLEIQNRIVSKLEELMTYCDDLETSVKESQNYNEQLLQQVLREALEVKEVAGEVK >CP034159|334537:344231|337200_337596_+|AZI31918.1|DBSCAN-SWA MKITSLHYKPHNLLFLVLLSIALYSCSANRGNASSSYQSTTVSYYANKFNGNKTASGEVYKHSKMTAAHKSLAFGTKVEIINPENSKKVIVIVNDRGPLKAGRAFDLSQGAFKKIGNLNDGVLKVKYKVMK >CP034159|334537:344231|340693_341251_+|AZI31921.1|DBSCAN-SWA MIDIELANKEFSESMIIELQKAAEYSKSIKFKKVALDFKNNKILHSQIENLENVIYIIKIKDDCNVKAETICTAINGFKGDGNVNIKFPKVNNCAENSENKILYVGKSKGKIKGRFISHLTSNSPSVYGLHLEYWKNNPILNELELDLYYAQIDLNPEDNDYDILELLETALHKKYKPILGRSGH >CP034159|334537:344231|336430_336952_+|AZI31917.1|DBSCAN-SWA MIKYIQNKTHYTEVLQKCKTVKRTLWIGTADIKDVYVKDGLSGSKPFLSVLNDLLKSGVEIRLLYAKDPGPNFREDFDKYPLLAKHLEQAHCPRVHFKIFVFDSCEVYIGSANLTGAGIGMKGEQSRNFEAGILTDLPELVEPAISQFDEVWNGSQCTNCGRKKYCPLPIAEY >CP034159|334537:344231|340286_340697_+|AZI31920.1|DBSCAN-SWA MCTISEKIILCTCEIKNVDNLKHYWILFRYDPEQGELFVGEPLGLYEFLQAENPKNTAFLLDKLNTENLFDQPLEFKGKDRLQISIHFKENEYATDFGFEYKNGKWKILEFDFFDWKSEHVEIKEGKIKNALSRKK >CP034159|334537:344231|337898_340277_+|AZI31919.1|DBSCAN-SWA MSKKLFSERDICTKFITPALESAGWDKIKQFREEVSFTDGRIIVRGKLSTRGKKKRADYILYYKPNIPIGIIEVKENNHEVGAGMQQGLEYADVLQLPFVFSTNGDRFLFHDKTNPNTIENEIELDNFPSPEILWEKYLQFKGLANEQSKQIVEQDYFFDGSGRAPRYYQQNAINLTLEAIAKGQNRILLVMATGTGKTYTAFQIVHRLWKSRTKKRILFLADRNSLIDQTKRGDFKHFRDKMTIVQKRQVDKSYEIYLAIYQGLTGNEEEKNIFKQFSPDFFDLIIIDECHRGSAKEDSAWREVLTYFKSATQIGLTATPKETDTVSNSEYFGDPIYTYSLKQGIDDGFLAPYQVIRVSMDLDVEGWRPEKEKKDKDGNLVEDRIYNRKDFDRNLVIDERTQTVARKVTEFLKNTSRFNKTIVFCRDIDHAERMRSALANLNSDLVLQNHKYVMRITGDNDEGKRELDNFIDPEQTYPVIATTSELMTTGVDAQTCKLIVLDTEIGSMTKFKQIIGRGTRVNEEFGKLYFTIIDFRNATDNFADPTFDGDPVRIKVIDEDTPADDHFEEEDSNPEDDKPAVVPSVKEGQKDYTKPSPFDEKKTKPEKIYINGVDVTILNTRELYFDKNGKPITLSLKDYTKDLLSEKYESLDQFLYLWKNSDRKEAIVKELEDQGIMVNELLESVNKECDLFDIICHVAFDQKPLTRKERVNNVKKRNYFAKYGEQARNVLTALVDKYADEGLDTLESMEVLKLNPISDFGSPVEIVKTFGGKKQYLDALKELENEIYSLA >CP034159|334537:344231|335658_336024_+|AZI34410.1|DBSCAN-SWA MRNIFYIFIGGGLGSVLRFLISNYTQKLWNVNSFPMGTFVVNIIGCFLIGVLTSYFLKVDNYLKFLLITGFCGGFTTFSTFSAENFSLWQNGNYPVLLLYVLLSIIVGLIAVYLGLQVAKN |
9 | Orpheovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1252268 : 1380062
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP034159|1252268:1380062|DBSCAN-SWA 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107 | Leptospira_phage(33.33%) | tRNA,integrase,transposase | attL 1319974:1320000|attR 1367362:1367381 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1402309 : 1453723
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP034159|1402309:1453723|DBSCAN-SWA 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46 | Leptospira_phage(28.57%) | protease,integrase,transposase | attL 1403276:1403335|attR 1436715:1436841 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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