Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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CP034243 | Acinetobacter baumannii isolate 09A16CRGN003B chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas3,DEDDh,WYL,csa3 | 0 | 0 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1156261 : 1217401
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP034243|1156261:1217401|DBSCAN-SWA ATTAGTAGCTTTCTGGTACTGCACTTAAGAATTCACGGCGCGCTTCTTTATCGGTTTTAAAATCTCCGACAAATGAAACTGTACGGGTGGTAGATTCTTGTTTACCTACACCACGCATCATCATACACATATGTGCTGAATCGATGACTACAGCAACGCCACGAGCACCAGTCACTTCTGCAACAGCTTCAGCGATTTGCTGAGTAAGGTTTTCCTGAATTTGCAAACGACGAGCAAACATCTCGGTAATACGTGCAAATTTAGATAAGCCAAGAACTTTGCCTTCTGGTAAATAGGCAACATGAACACGGCCATAGAATGGGAGAAGATGGTGTTCGCAGAGCGAATAAAATTCAATATTCTTCACCAATACCATTTCATGGTTATCTGATGGGAAAACAGCATTATTGGTGACTTCTTCTAAAGTTTTACTATAGCCAGAAGTTAAATATGAAAAAGCTTTAGCCGCACGCACAGGCGTATCTTTAAGGCCGGGACGATTAAGGTCTTCACCGACGGCAGTCAGAATATTTGCGTACGATTGCTGCATTGACATAAGACGTATAAATTTACTCTATTAGACAAGCTCGGCATTGTATCAGAAACATGACCTGATGTTCATAAATCCTCGCACTATATTTATTTTGGTTTTTCCGTACGCTTGATAAAAGATGAATAAATTTCATGTTTTTTATCGTTAATAGTCAAGTGTTTGGACATGAAATGTGCGCTTAATATTGATAAGTTCTAAATGATCGCCTAATGGCATCATATTTGCACAGAAGCATTATTATAAAGCATAAGGATAAAACATGTTAGAACGTCCAATCACCTTCTTTTTCCGTGGTGGTCAGCAGCAAGTAGAAAATATAGTACCCACAATGACGGTTTTACAATTTCTGCGAGAATATACTCAAACTGGTAAGACTAGGCAGACTGGTACAAAAGAGGGATGTGCTGAGGGCGATTGTGGTGCATGTACAGTAGTGATTGGTGAATTGGTCAATGACAACCTGCAATTACGTAGTGTGAATGCGTGTATTCAGTTTTTACCAACTTTAGATGGTAAAGCCTTATTTACAGTAGAAGACCTTCATAGCTTATTGCCTGTACAAGATGGCACACTTCATCCTGTACAACAGGCGATGGTCGATATACATGGTTCACAATGCGGTTTTTGTACACCCGGTTTTATCATGTCGTTATGGTCAATGTATGAAAATGAACAACAGTCTCTAAGCAAAGATAAAATCAGTGATTATCTTTCTGGAAACTTATGTCGCTGTACAGGCTATCGCCCTATTTTAGATGCAGCACAAAAAGCTTATGACTATCCACGTGTGGTATTAGAACGTCAAAAAGTAATTGATGTATTAAAAGAGATCAGAACATTACCTGCATTGTATTTGAATGATCAAAAGCAGCAATTTTTTGCACCCAAGACTTTGCAGGATTTTGCTACTTTACGTTTACAGTTGCCGCAAGCACGTATTGTTGCAGGTAGCACAGATGTAGGTTTGTGGGTAACAAAGCAGGGCCGTGATTTGGGCGATATGCTTTATATTGGTCAAGTTGAAGAGCTAAAAAAGATTGTAGTCACAGACCTTGCTTTAACGATTGGGGCAAATGTAAGTTTGAGCGATGCACTCATTAAAATTTCAGATTTTTATCCCGATTTTCAAGAATTACAGCGCCGTTTTGCTTCCATGCCGATTAAAAATGCAGGCACACTAGGGGGAAATATTGCCAATGGTTCGCCTATTGGTGATTCAATGCCGGCATTAATTACGCTAGGTACACGATTGATTTTGCGTGTAGGTAAGCAGACTCGTGAAATTGCTTTGGAAGACTTTTATTTAGACTATCAAAAAACAGCATTACAACTTGGTGAGTTTGTTGAGGCGATTGTTATTCCGCTTCGTGAAGGGCAGACACGTTTTAAATTTGCCAGCTATAAAATTGCCAAACGATTTGAGCAAGATATTTCTGCGGTATGTGCAGCTATTTCTTGTGAGTTAGATAATGATGATGTCACTCACAATGTAAGAATTGCTTTTGGTGGCATGGCAGCTATTCCCAAACGTGCAAAATATGCAGAAGCCATATTAGAAGGCCAGCAAATTACAGCAGAATTGATCGTTCAGGCGCAGCAGGCATTGTCGCAAGACTATCAGCCTTTAGATGATGGACGTGCTAGCTCAGCGTATCGTTTACACGTCGCGAAAAACTGTTTAAAGCGCTTTTATTTAGAAAAAATTCTGTCTCAAACACTCACTCGTGTGAATGACCTGATTGCTATGGTGGAGATCTAATATGAATCAAACCATTGACTTAAATATTTCTAAAAAATCAGCTAAAGCAGGTGATTCGATTCCACACGAAAGTGCACATTTACATGTGACTGGGCAGGCAACTTATATTGATGATTTACCCGAGCTTGAAAATACCATGCATTTGGCAGTTGGATTTTCAAATTGTGCCAAAGGCAAAATCAGTAAGTTTGATTTGGATGCAGTACGTCAAGCTGATGGTGTCCATGCAGTTTTTTCTGCAAAAGATATTGAGGTTGAAAATAATTGGGGGCCAATTGTTAAAGATGATCCAATTTTTGCCGAGGAACAGGTTGAGTTTTATGGACAAGCCTTGTTTGTGGTTGTGGCCGAGAGTTATCAGCAAGCCCGTCAGGCAGTTCGCTTAGCAAAAATTGAGTATGTGCCCGAAACCCCAATTTTAACGATTCAAGATGCGATTAAAAAAGAATCGTGGGTGTTGCCGCCTGTTGAATTTAGCCATGGTGAAGTTGAGCAGGCATTTCAAAACGCAGCACATCAACTTTCAGGTGCTATTGAGCTGGGTGGGCAAGAGCATTTTTATCTTGAAGGGCAAATTTCCTATGCGATTCCACAAGAAAATCAGAGCTTAAAAGTCTATTGCTCGACACAACATCCAACCGAAATGCAGTTACTGATTTGTCATGCATTAGGCATGAATATGCATCAGGTCAGCGTGGAAAGTCGCCGTATGGGTGGCGGTTTTGGTGGTAAAGAGTCACAGTCAGCGCAGTGGGCATGCATTGCATCTTTGGCAGCAAAAAAAACGGGCCGTCCGTGTAAATTACGCTTAGATCGTGATGATGACATGAGTGCTACAGGCAAACGTCACGGTTTTGCTTATGAGTGGTCTGTAGCTTTTGATGACACTGGTATTTTGCAAGGCTTAAAGGTGCAATTGGCTTCAAACTGTGGTTTTTCGGCTGATCTTTCTGGGCCAGTGAATGAACGTGCGATTTGCCATATTGGCAATGCCTATTATCTAAATGCAGTTGAGCTACGTAACTTACGTTGTAAAACCAATACTGTTTCCAATACGGCATATCGTGGTTTTGGTGGACCGCAAGGTATGTTTGTCATTGAAAATATTATTGATGACATTGCTCGTTATTTAGGTTGTGATCCAGTTGAAATTCGTCAGCGCAATTTCTTTGCCGAGCAGCCCGGTGGTGGACGTGACCGTATGCACTATGGGGCAGAAGTCCGTGATAATGTTGCGCCAAAATTGGTAGCCGAACTATTGCAAAGTAGTGATTACGCGAAGCGTAGACAGACTATTCATGCCTTTAATCAGAACAATGACATCATTAAGCGTGGTATTGCGTTAACCCCATTAATGTTTGGTATTTCATTTAACGCCGTGCATTACAATCAGGCAGGTGCACTGGTCTATGTGTATATGGATGGTACTGTCGCGATTACACATGGTGGTACAGAAATGGGACAGGGGCTATATACCAAAGTACGGCAGGTTGCTGCACATGAGTTGGGTTTACCCATCGATAGCGTTCGTTTAATTGCAACCGATACTTCTCGTGTGCCAAATACTTCGGCAACTGCAGCATCGAGTGGCGCAGATCTAAACGGTAAAGCTGTTCAAAATGCCTGTATTAAAATTCGTGAGCGTCTGGCAAAACTTGCAGCCGAAATAAGTCAAAGTGAAGCTGACCAAGTCCAGTTTGAAGATAGTATGGTTTCAACAGCGAATGGTCATTCATGGACATTTCCTGACTTGGTTCAACGGGCATATATGGCACGTGTACAACTATGGGATAGTGGTTTTTATAAAACGCCAGAAATTCACTATGATCAGGTCAACCATTTAGGGCGTCCATTTTTCTATTATGCCTATGGTGCAGCGGTTAGCGAGGTCGCAATAGATACCTTAACTGGGGAAATGAAAGTATTACGTGCTGACATTTTGCATGACGTTGGGCAGTCAATTAACCCTGCAATTGATATTGGGCAAATTGAAGGTGGGTTTGTGCAAGGGATGGGATGGCTCACGACAGAAGAGTTGTATTGGCAGCCGCAGGGTCCACACGCAGGCCGATTATTTACCCATGCACCTTCAACTTACAAAATCCCGACCAGTGTGGACATTCCTCATATTTTTAATGTCAAACTATTTAATAATCAAAATCAGGCAGACACCATCTATCGCTCTAAAGCGGTAGGTGAACCGCCATTTATGTTGGCATTATCGGTTTTCTCTGCAATTCGTCAGGCAGTACAGGCGGCTATTCCAGAAAATGCACCGCTCGTACTCAATGCTCCGGCAACTCCCGAGGAAATTTTACGTGCAATTGCTATTGGACGGGGACAAGCTTTGGCTGCTCGCCCACAGGCTAAAATGTAGAAGATTATGCAACATTTACAATGGTGGACTGATTTTGTAGCGTGGCAAGCCGATGCGTTGCCTATGGTATTAGTCACAGTGGTCCGTGCTGATGGTTCAACACCACGAGAGGTTGGTGCAACGATGTTGTTGCGATTTAATTTGCAACAGCAATGGCAGCAGTCAGATACGATCGGTGGTGGGCATTTAGAGTTTCAGGCGATTGATATTGCTAAAGCAATGTTAAAAGAATCGGAAACTTGTGTGAGGCGTATTGAACGCTTTAACCTCAGTGCTCGGCTTGGGCAGTGTTGTGGCGGAGTAATGTGGTT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74 | Acinetobacter_phage(98.61%) | transposase,head,terminase,plate | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1376717 : 1394846
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP034243|1376717:1394846|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP034243|1376717:1394846|1378603_1379308_+|AZK40954.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPFKGRHFQRDIILWAVRWYCKYGISYRELQEMLAERGVNVDHSTIYRWVQRYAPEMEKRLRWYWRNPSDLCPWHMDETYVKVNGRWAYLYRAVDSRGRTVDFYLSSRRNSKAAYRFLGKILNNVKKWQIPRFINTDKAPAYGRALALLKREGRCPSDVEHRQIKYRNNVIECDHGKLKRIINATLGFKSMKTAYATIKGIEVMRALRKGQASAFYYGDPLGEMRLVSRVFEM >CP034243|1376717:1394846|1381674_1382466_+|AZK40957.1|DBSCAN-SWA MREAVIAEVSTQLSEVVGVIERHLEPTLLAVHLYGSAVDGGLKPHSDIDLLVTVTVRLDETTRRALINDLLETSASPGESEILRAVEVTIVVHDDIIPWRYPAKRELQFGEWQRNDILAGIFEPATIDIDLAILLTKAREHSVALVGPAAEELFDPVPEQDLFEALNETLTLWNSPPDWAGDERNVVLTLSRIWYSAVTGKIAPKDVAADWAMERLPAQYQPVILEARQAYLGQEEDRLASRADQLEEFVHYVKGEITKVVGK >CP034243|1376717:1394846|1387155_1387929_+|AZK43287.1|DBSCAN-SWA MDKNDVVKKILESKKYENLDSDIVEKVVSISEKKYKLKEVENYSKKKLHQIWGSYYSAYPNWDKLLKKYNQGQLSIEDLLKIHSSTNERVATLNDFYTYVFGNIKHVSSILDFGCGFNPLALYQWNENEKIIYHAYDIDRAEIAFLSSIIGKLKTTIKYRFLNKESDVYKGTYDVVFLLKMLPVLKQQDVNILDFLQLFHTQNFVISFPIKSLSGKEKGMEENYQLWFESFTKGWIKILDSKVIGNELVYITSGFQK 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17 | Escherichia_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 1376655:1376714|attR 1396795:1397614 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1576184 : 1626971
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP034243|1576184:1626971|DBSCAN-SWA 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76 | Acinetobacter_phage(95.38%) | transposase,head,tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2659422 : 2688096
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP034243|2659422:2688096|DBSCAN-SWA 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38 | Acinetobacter_phage(93.75%) | head,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2692054 : 2704402
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP034243|2692054:2704402|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP034243|2692054:2704402|2694451_2695333_-|AZK42137.1|DBSCAN-SWA MSNFVPNSFQVPNAFVDEVLNKISDAACKIYLVICRKTRGWNKEMDSISLTQFEEITGKSRPTVVKCLNELIKVGLVVEQPSTIHGNTFKLGNDTSVGLVLKFPSKNFLLPEIYGQTSKNSLPLLVKNFNYTSKNFLPLLVKIFNTQSITIKNNSQSNKKINKKRGSVSEKPKTEKPNEFNPRSVELPACVDSELWNNFVDMRISIKKPLSENAVKLILKKLISFGPLANQSLENSIIGNYQGVFEPRQNQIQENPQSHNVPEEPGYFTQMYAESNRSNVIDVTPVSQDFGGY >CP034243|2692054:2704402|2703023_2703275_+|AZK42153.1|DBSCAN-SWA MKDQYKKVSQKHMLGFMYYLQLLGYVIVRQGMDQAMFLTKHYAVPVAWRRITIDYHNRLNKPAQQLYKEFVEWTKEEYAEMVA >CP034243|2692054:2704402|2695955_2696276_-|AZK42140.1|DBSCAN-SWA MSKVLNELPASASNNESLILQALNASNQRQVAEMINVDASILSRMKTEKKSNGWTEIEFISFLLTAIGLKVVQESDVYCSPEIAEATRVYLAHAFTSPEYMRILFK >CP034243|2692054:2704402|2699910_2700354_+|AZK42148.1|DBSCAN-SWA MNVKATPFNSFAFVSMAALAISGGSLVACQLQPAFQTKDAPTLFTPKTQPSTYSVLTAKITGKHSGVAVIKLDSFRLNVSFDFEAHPDSYGVPGSEFTTVDITQLTVNEITDINGKSYNDFTEFEDIRNINSLLKGFIERNKLVEAA >CP034243|2692054:2704402|2695325_2695550_-|AZK42138.1|DBSCAN-SWA 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24 | Acinetobacter_phage(95.65%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
3623603 : 3702247
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP034243|3623603:3702247|DBSCAN-SWA 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74 | uncultured_Caudovirales_phage(23.53%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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