Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022301 | Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001C, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
CP022298 | Acinetobacter johnsonii strain IC001 chromosome, complete genome | 2 crisprs | cas14j,csa3,RT,cas3,DEDDh,WYL,c2c9_V-U4,cas3f,cas1,TnsE_C | 1 | 0 | 12 | 0 |
CP022300 | Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001B, complete sequence | 2 crisprs | NA | 0 | 3 | 0 | 0 |
CP022302 | Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001D, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP022299 | Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001A, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022301_1 | 1474-1572 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022301_1
|
1 spacers
spacers of CP022301_1
>1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder CGGTTTTATCAAAAATCAGCAAATAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022301_1
The CRISPR arrays of CP022301_1 >merge|CP022301|1|1474-1572|CRISPRCasFinder ATCAAAGAAAGGCAAAAAAGGTCAAATAAAAGCAAACGGTTTTATCAAAAATCAGCAAATAAGATCAAAGAAAGGCAAAAAAGGTCAAATAAAAGCAAA >CP022301|1|1|1474-1572|CRISPRCasFinder ATCAAAGAAAGGCAAAAAAGGTCAAATAAAAGCAAA CGGTTTTATCAAAAATCAGCAAATAAG ATCAAAGAAAGGCAAAAAAGGTCAAATAAAAGCAAA
>CP022301.1|AZN65868.1|1228_1432_+|hypothetical-protein MNEAEKERLKEIFRISKGIVDHEFSQEVIDACKPYEDARHQRILNGETTLEQEEAALMAEWRRLNPK >CP022301.1|AZN65867.1|869_1202_+|type-II-toxin-antitoxin-system-mRNA-interferase-toxin,-RelE/StbE-family MTSKKTAKDKRAVLPRSSDYTKEFLADWQRLSRSGRYDMAKLKQVMMLIIANDEPLGAEWVDHALSGNQWKNCRELHVGGDFLLIYRIEPLSKFEMVVFVRTGTHSELFK >CP022301.1|AZN65866.1|616_892_+|type-II-toxin-antitoxin-system-antitoxin,-RelB/DinJ-family MTSQTSMLHVRIDDETKLQAQQALKSMGMSVSDAVRIFLTRVVAEQAIPFDVRVPNTTTVAAMNEADALIQAKKARFETVEDLFNDLEKNS >CP022301.1|AZN65869.1|2102_2573_-|hypothetical-protein MQQPVLQIKEDTIEQNLFWEINGSIDLAIIPGNTIKGIPHDLPIRLQNGYAKGRNGFGYLHILRNHGQEFNRLRPPTDVFGFLVKKLGQGGSFHHQTDKRKGLYLAMLPSGVIILDYVAKGRDSFFTIITAYTTNRSIDGKEIGRYISTFQVKPKK >CP022301.1|AZN65870.1|2866_3088_+|hypothetical-protein MRPLFLCYKNKELVYFRELSYGGMPIAELRHLTGRIGELYVAMMTLGQLADSVNQRGYDVVSSTGRLCCTKIS >CP022301.1|AZN65871.1|3197_3698_+|hypothetical-protein MLQNFFEKGRFLVIIVIINCILSSIFLYLSTIYLLIDAIIFIIKNIYATNFEVKIVVVKFLKILDVSLIAITFHLISAGFYKLFIQQAIFDNSSFLKTLSINKFHDLKVIILHLSIVVIVILFLEDLVVFGGTLANLYAGISSSLVILAIIFTCKLFDNDHHKDDE >CP022301.1|AZN65872.1|3921_4899_+|hypothetical-protein MDVLFSNFLDKPVWMWIFFILIVLVLLILDLGVFHRKVREIGVKESLALSAFYITLGLLFGAWVWWYLGPTAGINYVTGFVIEKSLAMDNIFVIAMIFSYFSIPRIYQHRVLFWGIIGVIFLRAIMIGVGATLVSQFSWVLYIFAAFLIFTGIKMWLSVDKEYEVGNSPILNFIKKRFRVTEQLHAEKFWVKKIDPKTNQLTWFMTPLFLALIMIEFVDLIFAIDSVPAIFAITTDPFIVYTSNIFAILGLRALYFALSAMVDRFHYLKYALAVLLVFIGSKIFIADGLGIAKIPPPVSLSITFIILFTGILYSLWKTKDQSTHR >CP022301.1|AZN65873.1|5306_5861_-|DNA-binding-protein MAKLSLSEVSNRFNVSRSTLYRAIKEGRISRSSDGLFDIAEVIRCFGEPIKKHEQKQEVNQSKDDADLRQLVDFMKKEIESYKDREKRYLDQIDRFQLLLGHKESEEKMSHDAPVTHPNDAPCDNSSETRETIDNNKYGEISTSHETPVTHPNETPKHVSKTHYETKKKRGLFGRVLNAVFDND >CP022301.1|AZN65874.1|5853_6810_-|RepB-family-plasmid-replication-initiator-protein MKNDLVVKDNALINASYNLEVTEQRLILLSIIRARETGQGISSDSKLEIHASDYASRFDVTKEAAYNALKNAVNNLFERKFSFKEIHKDTNKEIVVKSRWVSRIAYVDDLATLEVTFAPDVVPLITRLEKHFTSYQLKQVAQLTSKYAIRLYEFLIAWRDVGKTPVISLSEFREKLGLDINEYQKMVNFKSRVLEPAIKQINELTDIHVKYEQYKTGRSISGLSFTFKHKKIDSIPSERDPNTVDLFTQMTDAQRHMFANKLSELPEMGRYSQGTESYPQFAIRIAEMLKNPDRIKELYPYLKKVGYMPSSKKDVANG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022301_1 | 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder | 1510-1536 | 27 | NZ_CP022301 | Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001C, complete sequence | 1510-1536 | 0 | 1.0 |
CP022301_1 | 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder | 1510-1536 | 27 | MH892363 | Streptococcus phage SW14, complete genome | 24454-24480 | 5 | 0.815 |
CP022301_1 | 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder | 1510-1536 | 27 | MH892376 | Streptococcus phage SW1151, complete genome | 23831-23857 | 5 | 0.815 |
CP022301_1 | 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder | 1510-1536 | 27 | MG708273 | Streptococcus phage vB_SthS_VA698, partial genome | 6520-6546 | 5 | 0.815 |
CP022301_1 | 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder | 1510-1536 | 27 | NC_031020 | Morganella phage vB_MmoM_MP1, complete genome | 61897-61923 | 5 | 0.815 |
CP022301_1 | 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder | 1510-1536 | 27 | MN693163 | Marine virus AFVG_25M177, complete genome | 21949-21975 | 6 | 0.778 |
CP022301_1 | 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder | 1510-1536 | 27 | NZ_CP045273 | Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence | 132413-132439 | 6 | 0.778 |
CP022301_1 | 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder | 1510-1536 | 27 | MN850656 | Flavobacterium phage fF4, complete genome | 9636-9662 | 6 | 0.778 |
CP022301_1 | 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder | 1510-1536 | 27 | NZ_CP010903 | Acinetobacter nosocomialis strain 6411 plasmid p6411-66.409kb, complete sequence | 59199-59225 | 7 | 0.741 |
1. spacer 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022301 (Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001C, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
cggttttatcaaaaatcagcaaataag CRISPR spacer cggttttatcaaaaatcagcaaataag Protospacer ***************************
2. spacer 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder matches to MH892363 (Streptococcus phage SW14, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cggttttatcaaaaatcagcaaataag CRISPR spacer catttttatcaaaaaaaagcaaataaa Protospacer *. ************ *********.
3. spacer 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder matches to MH892376 (Streptococcus phage SW1151, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cggttttatcaaaaatcagcaaataag CRISPR spacer catttttatcaaaaaaaagcaaataaa Protospacer *. ************ *********.
4. spacer 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder matches to MG708273 (Streptococcus phage vB_SthS_VA698, partial genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cggttttatcaaaaatcagcaaataag CRISPR spacer catttttatcaaaaaaaagcaaataaa Protospacer *. ************ *********.
5. spacer 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder matches to NC_031020 (Morganella phage vB_MmoM_MP1, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
cggttttatcaaaaatcagcaaataag CRISPR spacer cacttttttcaaaaatcagaaaataaa Protospacer *. **** *********** ******.
6. spacer 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder matches to MN693163 (Marine virus AFVG_25M177, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cggttttatcaaaaatcagcaaataag CRISPR spacer aggttttctcaaaaatcagcaaactta Protospacer ****** ***************. .
7. spacer 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP045273 (Bacillus megaterium strain FDU301 plasmid pFDU301A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cggttttatcaaaaatcagcaaataag CRISPR spacer tatttttatgaaaaataagcaaataaa Protospacer .. ****** ****** *********.
8. spacer 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder matches to MN850656 (Flavobacterium phage fF4, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
cggttttatcaaaaatcagcaaataag CRISPR spacer aaattttatcaaaaatcaggaaattat Protospacer ..**************** **** *
9. spacer 1.1|1510|27|CP022301|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP010903 (Acinetobacter nosocomialis strain 6411 plasmid p6411-66.409kb, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
cggttttatcaaaaatcagcaaataag CRISPR spacer tttttttatcaaaaaacagcaaatttc Protospacer . ************ ********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022298_1 | 814876-814968 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022298_1
|
1 spacers
spacers of CP022298_1
>1.1|814900|45|CP022298|CRISPRCasFinder AGTTTTCTAAATTCCCGATATTAGGTTTTATAAGGTTCTATTCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022298_1
The CRISPR arrays of CP022298_1 >merge|CP022298|1|814876-814968|CRISPRCasFinder TTTTAAAGCAGTCCGAAAAACTAAAGTTTTCTAAATTCCCGATATTAGGTTTTATAAGGTTCTATTCTCTTTTAAAGCAGTCCGCAAAACTAA >CP022298|1|1|814876-814968|CRISPRCasFinder TTTTAAAGCAGTCCGAAAAACTAA AGTTTTCTAAATTCCCGATATTAGGTTTTATAAGGTTCTATTCTC TTTTAAAGCAGTCCGCAAAACTAA
>CP022298.1|AZN63254.1|814124_814418_-|hypothetical-protein MTNKTKTYDAADMHDLASLSESDMNWMCTAISHIRKEVLKLNKLAESGKEVSQYHFSEIVTQLDMYEYLAEDRHRNHAKGAEAYKAEWEAAKQKANA >CP022298.1|AZN63253.1|813939_814128_-|hypothetical-protein MNKPNDTPKTRYEKKRKQKLVSFNTENSHDADLLAHANKLDDFSGWVKEQLNEDMKEKKGSQ >CP022298.1|AZN63252.1|812717_813383_-|DNA-transfer-protein-p32 MVAAAVIAGGAAIAGGAMASSASKKAAKTQAASADRASQIQQENFEQTREDLMPYKQAGDTSLKQLMGQMGANGYFNQTYAGQDIYSDPSYQFRLQQGQNAIQSSAAAQGGLLSGATLKALQNYGQESASQEYSNAYNRFNADQTNRYNRLSNLVGIGQNAAAQVGNAGAQTAQAVANNTMAGANSIAAGQVGSANAWSNTANDLGSMAAAYGIMNKKGVI >CP022298.1|AZN63251.1|812267_812636_-|hypothetical-protein MKKIILICGLLTSSFSFGADWVVLDRSHGQESQIDMSSIKKLPSDKRLVWYRSITKAEEAKYVYLTFRAEIDCTRETLQNNDLVIHINDKHISQTTVENPKPFSPPPESSGQKIIQTTCKVP >CP022298.1|AZN63250.1|810935_811982_+|(p)ppGpp-synthetase MTQHALEVPTKSSVRKAGDKLKDPSLDHTEALDILSKWRALHSYPINTFQATLRRKVEALGLKKAIIAQRLKRLPSIVSKLQRINGMKLDRMQDIGGVRIVLSSTKDVYALYENLLQSNRRFEHEPQLPPKDYIQQPKSDGYRCLHQVFKYKSRTHPELNGLCIELQIRTHLQHAWATAVETLGIVEKLSFKTGEGSEDFKTFFKLTSALFSIKEATPILDEYSHYSFDELKEEARLLEQKLQIFIKLRGLSITNRHIESATSESADYHLIELSRVDDIWRVSLTPFTKAQLDFAEQMYELREQKTKNAPNSDVVLVSVGSLKQLKKAYPNYFLDTEEFIKQLSIMLK >CP022298.1|AZN63249.1|810490_810817_+|single-stranded-DNA-binding-protein MANLNRVTVMGVLGRDPETKQFPNGGSVTTFSVATTEFWKDKTTGERKEATEWHRIATSNRLAEIASKYLKKGGKVYIEGSLRTRKYKDKSGSEKEITEIRADELQLL >CP022298.1|AZN63248.1|809941_810454_+|hypothetical-protein MSIGKALELIRMAKSYQCVLYWDPPDRIRFASQSLIPDELLSEVKAHKHVLIEYFKHTDRDLTPLLGRAFDGYLYCLNQMRERHSSAALSDCHVSTLYWRSTVKATLQVSNPELKLIEMLLIQSEQLKYLDDSNTALITPEQEQQKYSTDADANTAFNYLLSKHRQFVYC >CP022298.1|AZN63247.1|807521_809639_+|hypothetical-protein MLDYDHPKELITPDDILNECTQLVSFNDAYSSHPLIQRFGSPEQPIYVDDGNVDINGVTYAQPLIMPIYDGQMELVQCAVMQDGQRVAVMPDGLARGFARYGDFDHAQPVIITYSLEAFFKVAQTGYAVALVLLPTLCNKHQTELKPYDFEQIQFVINQLSQAGYKQLYLPVRIEHINLEPFKKLEQNTAVRLLCQYLRIGVNQFEIGLSQDESVSEVLAFIEEAIELLSKPTDWGDLLPLSQSETVLNPYPIHALPPLAQEAVKAISEHVQSPIAMTAQCVIGAMSHIAQAKVNAPHPFNAHGEPCSLFLLTEGQSGSRKSTSRNLADQAIIKHERKQYEAYRQELEQWKSAQAGLPKKDREAYCAENPPPNDPSTLYSDITLESIAGLFIDGVLNNASIASDEAGQFFGGHSMKADTRNQALGGYAKLFDDGFVERTRSKSNLNGSGRAYDVRLTFNLQGQHEVLAEALKDPVLRGQGFLPRFILTIPENLAGTRLQDAIYRNKNASTDHRLIAYWTRCEYLLDDCPQVKAEHELHNGRYVLPMNEEAKEIDAAFYNMFEELQGKGKRYEYLQAFASRASQLARRLATVFAYFEGLQWIDAKTLKGACEVVKHSLNEWAMYADIEVKTETEAERLIKWIAKKCNEQKTDRIAYSNVQTSCPRPMQKNKNLLEMVVEQLIDSNHIKIESIGRTRYVVIHPCLVK >CP022298.1|AZN63246.1|807127_807529_+|hypothetical-protein MPNQINKTAQNFLENSQVIIESLEGTLLRLYVSYEQHDISDAKAKAMLSVCEMLASAALEDIESASAKTILDISMIVSRATGILYTLEELAHLNLAKGHTAAAINGLTLACSTLNELLETAVDYVMKGGSHNA >CP022298.1|AZN63245.1|806823_807135_+|hypothetical-protein MKNKSFNIANMPKYGYINRALGKISKLALVGYHQLAHTVRLKGFFCMCIFSMRSHVMAELEGEAFALASLLIDWSTNPFQLCHPHLVVNGKASKNQLGAHSHA >CP022298.1|AZN63255.1|815833_816970_+|integrase MSLTDVMCKKAQPQEKQYRLSDTNGLSLRIDPNGKKYWSIRYTENGQRKSKALGVYPELSLKRAREIALDLRYKLKNTVEVEEDQPCFKEVAEDWFNNQKETWSSKHISNVRASLDELYIALANKRINQIQAPEILQIIKKIEARGSLEVAKRTLSRCGMVMKYAIAHGYRYDNPAGDLVYALKNKRVKNLASLAATEMPEFLRRIKAYPADVQTHHAIILIMLTGVRVSELLQARWDEFDLEGRKWDIPEDRMKNRLPHRVPLTDMMIDELQALRLTHNQDLLFPHRLNNKEPMRSESILAVIKRSGYAGRMTTHGFRSLFSTVVNESNLFNPDAIERQLAHVPQNRIRSAYNRAQYWDERVKIMEWYGEHAKSWVS >CP022298.1|AZN63256.1|817201_819805_+|hypothetical-protein MKNITHDSKYKSTFFKQLKVLYEGERYSKFDSNEFFSVLPLISVYALLDFAVPYLIDNLEDGVCNLDQHLRFQSVASLLDALKQVHVFPEMSKFRNVGDEFLECRAFNCFVQRVQNGSVVIHSQNSQSLDNRVNGESHFADDGYAEVFLKKYIEWRGNKSTSCLLDARLNSSNVVLANLEQLKNKINPEIDSILDQTGFIYVAAFRVVIHSIDVDELHSNELLNVFQSFGQLDEIKHAMALSCSKLKESESYYVVCLLQKKYSPNENHIAQKIREVVQKEIDRSVSKRLQIDVHCLNEKFRALEPSMHDDTLFILKGNDDSSRLIRETVFDFAEHLLKFGQLSYVQVESKERREKLSDLELLSGLPNLLDRALPKHNSLKRTLPKHDLFWVKCNEFENYQSLWNLLQGSKGSKRFKLIWDQKHLSENSKEYFTQASMIVVEQLAIWGLSKFTDLVIKIEFFILTFMESSVIGFYPFVKDYRFKRWSDPVSFEQIATRQLIQFAEISKNRELLHELAVKLQGKFISKTLAHFFSVFRNQIGDSYSSGLLYRFLYIDLEAERNQEQIEDLLAVYQFKEVLFFHPQNNIKNNQSALPAKFEFKEETKGEQDVIKTYMNRSSTLSIGCNDSSNSLTIDGTPFQKYINTLPARPVEGQSSHLLHMQRHKTRLIKVKEMLRFAMRQDVVIIRCLFSEQSKDRITQQDLSKIFSNMLQINKKSLPFSFITGYLGYWEGIERTTTNKILGFAANVLFVFNAQVLTQCPDLLDALTEAWKKSCRNYGLEKRDSDCIDGVVEQLKLAYSVPELNCTQLILETTHKKLAKIFIHHVAPIAVYQDLLDDEIYQTLPKWLIKKNVKMSSSKTVKLRKTKT >CP022298.1|AZN63257.1|820795_822015_+|IS3-family-transposase MKKPNYTPEIRERAIQLLIESEKDYPSTWAAITAIAPKIGCTPETLRSWHQKYLNQQNPIKVQQLSDQERIKQLERENKELQRANEILRKAAGFFRPGGARPPTQIMVDFIHNNKELYGVEAICRILPIAPSTYYRTLDLADNPEHRAKRDLHDLHHAEQIKRIWKESSGRYGVRKVWQKLKREGYIIARCTVARLMQKLGIQGVWRGKNKQTTRSRDDQKRADDLVKRNFSADHPNQLWVGDFTYIQTHSGWVYTAFVIDVFSRAIVGWKVSTRMNTDMVLDALEQALHDRGMPKNVIHHSDRGVQYLSIRYTNRLEAANLRASVGTRGDSYDNALAETVNGLYKTEVIKYLKADWQGLADVQLATLNWVDWFNKTRVHSALGYVSPFEFEAMYYDKINPLGQVA >CP022298.1|AZN63258.1|828903_830123_+|IS3-family-transposase MKKPNYTPEIRERAVQLLIESEKDYPSTWAAITAIAPKIGCTPETLRSWHQKYLNQQNPIKVQQLSDQERIKQLERENKELQRANEILRKAAGFFRPGGARPPTQIMVDFIHNNKELYGVEAICRILPIAPSTYYRTLDLADNPEHRAKRDLHDLHHAEQIKRIWKESSGRYGVRKVWQKLKREGYIIARCTVARLMQKLGIQGVWRGKNKQTTRSRDDQKRADDLVKRNFSADHPNQLWVGDFTYIQTHSGWVYTAFVIDVFSRAIVGWKVSTRMNTDMVLDALEQALHDRGMPKNVIHHSDRGVQYLSIRYTNRLEAANLRASVGTRGDSYDNALAETVNGLYKTEVIEYLKADWQGLADVQLATLNWVDWFNKTRVHSALGYVSPFEFEAMYYDKINPLGQVA >CP022298.1|AZN63259.1|830294_831439_-|IS3-family-transposase MEYFMARRPRRNHSNDFKAKVALAAIKAEKTLAELSAEFDVHQNQIIDWKNQLISASSQAFDQSKAPTEPPIDLKKLHAKIGEQALEIGFFRRCVEETGPLQPQKLIDDSLQISVSKQAQLLKVSRGCYYYRPKPVSASDLKLMRCMDELHMQYPFAGSRMMRDLLNRQGHHIGRRHTRTLMKKMGINALYCKPNLSQANQAHRKYPYLLKGLAIQRSNQVWSTDITYIPMAKGFVYLCAVIDWHSRKVLAHRVSISMEVTFCIETLNEAIEKYGRPEIFNTDQGSQFTSDAFIDVLKSNDIQISMDGKGRWVDNVMVERLWRSVKYEEVYLKAYSNVLDAKKQLNAYFEFYNLKRPHSSLDKMTPDEFYYDQLPQQNKVA >CP022298.1|AZN63260.1|832107_832419_+|hypothetical-protein MSENNELELKPINDLLGLSFYIPAYQRGYRWTKRQVTELLDDIKEFQRNSEASSKEVFYCLQPIVVKKYKDSWELVDGQQRLTTIDLFHKSFFTQFQIIDPSN >CP022298.1|AZN63261.1|832377_832848_-|IS5/IS1182-family-transposase MPQKFQYKGLKKQKKSYSGKKKAHTFKVQAIVHYKTQQILSLCTSRGAVHDFELFKRNLNQIPASAFILADKGYQGIYTVYRNSLLPLKAKKRCKLDPELKLYNREINKRRIGIEHVFGSLKTFKILAERYRNRGKRLGLRFNLIAGIYNLELSKK >CP022298.1|AZN63262.1|832789_833191_-|DDE-transposase-family-protein MKYIYSKKLSETQFKRYTGISWSTFNLMVEQLKMHVPAKGRPSKLSLEDQILLCLSYWREYRTLFHVATSYGVSEPTASRIVHHVEDCLIKSNLFNLPKHLPEGEGIDWNVVIVDATEIPIQRPKKTEEKLQW >CP022298.1|AZN63263.1|833245_834838_+|hypothetical-protein MGRFLIYERDLIFIILTYLKGILDLLGKSRYQLSYETRENSAEFLNHIDENQGNQNIDFYHIVQAKKAIDEWFKKQEGTYQIKFIQTLLNDDDTGKNIKVIWYQIGESENATEVFTRLNMGKIPLVNAELVKALFLKSSNFTKEGKAAKHLQQLNIAQEWDVIEKRLQDDAFWYFISNKTTETNRIEFVLSLAARNLDGEGIIDSDKLKVFLQFNRLLSEKSADVVQEWLKIKQCYMTLEEWFNDRALFHVIGYLVSQDVAIDTLFDLSQTSKTKYTFRQSLINLVLKKSFGYQELNALPENWIDEALSTLTYDSGSKRLRSILLLFNIASLLSNPATNARFQFDKYKGDRWDIEHIRSVASEMPVQKEKQKAWLDNVISYISEDASFDIEGKKTEDNSKEQAIKKDAITLMDSTSFDNDQFEAIYMRVISHYDPRGDEDVDNSIGNLTLLDSSTNRSYKNAVFPIKRARIITLDKEATFVPLCTKNAFLKYYSKQVDKMLYWEPRDSQDHQRAMSEIILGFFCGKGVHQ >CP022298.1|AZN63264.1|834834_837309_+|hypothetical-protein MSKGNSLTFYGLFDIVDVIEIPILQRDYAQGRTEESEVRTLFLNSLFEALNLNENTARQTLDLDFVYGSFEDGNEKVFSVLDGQQRLTTLFLLHWYLAVENKCSQNFRDRFMTSDGRSRFTYKTRPSTTEFFNMLISTDIVLLKGRVSDHIRDAQWFYLSWQQDPTVQACMTMLDAIQIRFSGKSSKFYDRLINTSTPYITFQFLDLHSFGLSDELYIKMNARGKPLTIFENFKAKLEQKIKSFKTPWPIYNLPFKAGNIEAYEYFIHKIDTDWADLFWPYRNECSQDNTFDDELMNFFRLIIAYQYLLNNKKSEENLAEAKSNLFGSGGDLEATELSKYEELNCLNKDLIIRLINFLDLINNNGLTDNKIKKYLTERYYYSEEDTFKKVLANIAGYDDKLRFYAFYNYLSKLPISQELNEWVRVIYNLTQNTIINTVDEFYKALFAIDELCQFETPILVNLKKGIDISGFSSAQLLEEKIKAHLLLKSKEWREIIIQLEKHSFLDGQIGCILNFSGVLAFYREHEACDWDEMQDRHYREQFSKYAQSITAVFDLIKNSSSSIDFLWERAVLSKGIYFTEKSGAKYNLLSSRDTRNNIPRDHSWRRLLRINTSLIEQKQEYVKQVFDDPNFDAKDIIGSLKIICKDALSLLDANDWRILFVERPELFGVCEQGFIINNSNEFILLHQSQRNHTHSELYSKYLYLQLKAEHFNSEPFTIFKYVPTIGTDYFTHISLEGFHDDELHYEIHVWYESKQYHIVFFKIGTKPYPQSLIDILIQTDFIESPYEEYKDAYRYECFTPNNSKIKLIELCKTLSKFNKRMLTD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP022298_3 | 3040326-3040437 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022298_3
|
2 spacers
spacers of CP022298_3
>3.1|3040349|26|CP022298|CRISPRCasFinder TGGAATCTTAAGGCATTAAACAATTT >3.2|3040398|17|CP022298|CRISPRCasFinder TTTGAAGATTTGAAGAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022298_3
The CRISPR arrays of CP022298_3 >merge|CP022298|3|3040326-3040437|CRISPRCasFinder TTGTATTTTTTAAGATTTGAAACTGGAATCTTAAGGCATTAAACAATTTTTAGCTAGTTGAAGATTTGAAGATTTGAAGATTTGAAGATTTGAAGATTTGAAGATTTGAAGA >CP022298|3|3|3040326-3040437|CRISPRCasFinder TTGTATTTTTTAAGATTTGAAAC TGGAATCTTAAGGCATTAAACAATTT TTAGCTAGTTGAAGATTTGAAGA TTTGAAGATTTGAAGAT TTGAAGATTTGAAGATTTGAAGA
>CP022298.1|AZN65245.1|3039969_3040248_-|hypothetical-protein MAQKHAGNVIVEDIFKFNFYCMMLAMSPLLLKKAPPKNDVEMTIFEEKQHMEMRHQVLSQSAQERRKAYLMSAFFGFLMSSLMMSFILMLDK >CP022298.1|AZN65244.1|3039077_3039947_+|AraC-family-transcriptional-regulator MKYQILDQLQQHKAQLLDSVELGSGMQLAMWQNNQDRVSVCSNHHTLSMYIQGGYHSYQKTAQGWHNGGGPDHMCLMPQDFESTWDLRDPLTFVHLYYTEQHLQRVAEQVWDREPSQIILNPQSFVADPQIAMIYRHFLLNGAWQNRENHLQMSTATTLLLNHLIKNYSHTEWQVPEVKGGLSPYTLKQLLEWIDQHIQQSLTLSDLAEQTQLSEYHFAHMFKQSMHMPPHQYVMQRRLELAHQALQHTSANMTDISEQYGFSSSSHFSHRFKKYFGYSPSQMRKSEKN >CP022298.1|AZN65243.1|3037992_3038898_-|EamA-family-transporter MNALLYALVVVIWGTTWIAISLQQQSGISTNVAVFWRFFISALVLFTFVVLCRKLQKLAVKDHLFCMLQACCIFGFNFVCFYYAVQYISSGLEAVIFSMAVIFNTLNAKLFFGQQVSTRFYPAALLGGLGIIALFWHDVVGSTLNNHTLMGIGLCVLGTYGFSLGNMISARHQKNGLDIFTTNAYGMLYGSILMALIAGFKQDEFFPAMEFSAVSALLYLAIFGSVIGFTAYFYLVGRIGAGKAAYSTLLFPLVALVISTIWEGYQWHMNAVIGVILILCGNAIFFIKPPKLKFSQMLKRS >CP022298.1|AZN65242.1|3037373_3037883_-|damage-inducible-protein-DinB MDLKMFELFARYNVWSTQKLNQVLKNVSDEDFNAECGLFFKSISGTLNHLLVGEHYLWFPRFSSKPSPTLKLNTIVERDKDKLMFELESRAYNWIDFLKHVDVEKFGHDLQYKTSAGQEMSLPYAATLLHVFNHGTHHRGQVTAALTSMGYPCPEIDMVYMLIEENLPV >CP022298.1|AZN65241.1|3036307_3037318_+|hypothetical-protein MNKKLLPILIVTTFSLTACNESKQHQTPSDSTTAYKNLSTANPADIKADLDALDQISNKNSQAILNVQDALKAARQNKEVDTIPALLEQLKTHSLAFNTALDATNFKSQEGAALREKFKQVHLLGVELAQEDTKNPPQMDRITGLEAQISVIQQSSVSEMRALQQMVYPQLNSGALDNTRQQPKPNTEPHVAARTAPQTTSHLSQDNAADIKHDLIALGAQSSAAKQEAENSIWEIKHAMEKKDLRALKTAIEKSNKRIQSLNQNYDMVSLKSSEVAAAREKLKKDNNLQIEMGEIILSTSPDKQKFEELQKKRSNSQKMVEIEMEALRIKANTAS >CP022298.1|AZN65240.1|3033962_3036104_+|phosphate-acetyltransferase MKTILLVPTGEGVGLTSACLGLVYALECQGVKAGFLKPFSQELTTGADRTTALYHHVSKNETVEPISYHTILQQLSAGENDELLEDAVRLHRAIARKHDLIIVEGLVPNSRDSFASELNAQLAQALDAKVIIVSNADINKPSATAEKVDSQLRYFGGASSERTAGVLLMRTKGLPDDSAHIPVTFDPSLRLISDTNKFIIELQKTHAKLGSDKLPVIGLVPFSNTLSVPRISDLASHIQAEWINQGDATQRRVLHSSLIASNIEHELHKFVAGELIISASDRIDVLLASSLASSNGIPLAGLVLTEHHTPNEQVLAFCQTAIKQGLPILHTALSTFDTAQSLANLSNEIPVDDTERAEQVTRFVSSHINEEWLTAMLNGSYQPRLSPSAFRHELVQKSIAAKKRIVLPEGDEPRTVQAAAICQSRGIAHCILLAKPEAVVEVAKARGIELPHDLEIIDPDLIRENYVEKMVELRKGKLNELQAREQLQDTVVLGTMMLALDQVDGLVSGAIHTTANTVRPAFQLIKTAPEYSLVSSVFFMLLPDEVYVYGDCAINPDPNAEELAEIAIQSADSAKAFGLDPRIAMISYSTGTSGAGAEVEKVAEATRIAKERRPDLLIDGPLQYDAASVESVGRSKAPDSKVAGRANVFIFPDLNTGNTTYKAVQRSANVVSVGPMLQGLNKPVNDLSRGALVDDIVFTIALTAIQAEQQATA >CP022298.1|AZN65239.1|3032689_3033907_+|acetate-kinase MSTSVLVINCGSSSIKYALVSERREDRIFGLAENLGSADARIKGITAGGQPLELSIPHADHEKALETILERLSHYNPQAIGHRVVHGGTLTKAELLTEEIVERIRAATPLAPLHNPAHLVGIDATMRLFPELPQVAVFDTAFHQTMPAHAYRYAVPKFLYTEHNVRRYGFHGTSHAYVSERGSELAGSFKQGGWLTAHLGNGSSTCAIWNGQSVDTSMGLTPLEGVVMGTRSGDVDPSLHSFLANNLGWDIYKIDKMLNSQSGLLGLSDLSNDMRTLIEASEQGNEDATLAIEVFCYRLAKSLAALSCGLPRLDGLFFTGGIGENSAYIREKTVAFLPHFGFNLSKEANDSLKRGTEGRIDTGTGPQIWVVPTDEEGRIAKETASVADEVIQTAAKKSEDNVAIA >CP022298.1|AZN65238.1|3030812_3032078_+|glutamate-5-semialdehyde-dehydrogenase MQESIEQYMQTVGQQARQASRILARASTETKNNALSAIYTALVNSEPTILAANQADMNKAHSNNLDSALLDRLELSPARFKGMLQGLKDVISLKDPVGEITDMAYRPSGIQLGKMRVPLGVVGMIYESRPNVTLEAASLALKSGNAIILRGGSEALESNKAIAEAIQRGLKLAGLPEHAVQVINTADRTAVGQLITLTEFVDVIVPRGGKGLIERISNEARVPVIKHLDGNCHVYVEAQADLQKALPIALNAKTHRYGVCNAMETLLVDEKVADEFLPRVAELYTEKQVELRGCAETQRILGTAVKTATEEDWYTEYLGPILAVKVVSGVEEAIEHINKYGSHHTDSIITENYSLAREFLAAVDSSSVMINASTRFADGFEYGLGAEIGISTDKIHARGPVGLEGLTSQKWIVFGDGQIRQ >CP022298.1|AZN65237.1|3029174_3030506_-|alpha/beta-hydrolase MNSMIQRDAELDDANLRLGFFDVYHRNSFKEPARTTWIEGWKVEYMAIARPESFHRTPIVIIGGAFQNFNSYKYCVEQLLDAGPIVLIDLPSMGANQQIRNIDTGLSAGTLELGDLAKMLGVWFDIEGLDKVSVMGMSLGSVVASCLADQRPELIDRMILMGVMQKTRKSWRMLLEESLHLMREQRMDEFGQAVILYLVNHAKMDKTKMSPTAKRLFFRQMAEFTATEQERYEINCNRLLRLTDVPIPQCKVLVACGQYDSFTLPHENANFALQCPDMEYAQIANADHVPQLQRRKETMHLFATFLKDESIQHLDGIIPFSRAQMLEMERRGEERVQIQQPETFLSYRHSDLVIATEVVDLNYFGVFLRFESDLAAVAAKYPRDLALHLSDEEGEFQIECLIFAEDGAYIRALFKHGSFELAERLLRFVGRQKQEQTLLEAVS >CP022298.1|AZN65236.1|3028234_3029110_+|leucine-carboxyl-methyltransferase MTDALSAHRHISFTAHYTGYIWYSMGISHPVFATRKGKLLAKLVHPLESWAEKHVGGSMRTTLKQRHQMIDDHLSALIQQYPTLQVLEIASGLSPRGWSFRQQYPEIDYRELDLPDMAQIKTQALKQIDQTSPVVLSADLFSADFARAFEVFDPNRPLVVVSEGLINYFSKDMLAQLLQGIVQYGQQFDQLYYLTDLYPEPVKNKLANFIWSSSKLLKWMSRSAFGFHFVSPPEATQFFKQAGFHTVTVHQPTLAFNSTQADTSNLDQQDHLGDLVWLVHSQWQKPNQPEQ >CP022298.1|AZN65246.1|3040897_3042424_+|fumarate-hydratase MTTIIKQDDLITSVKDALQFISYYHPQDFIQAMNRAYDREENKAAKDAIAQILINSRMCAEGHRPICQDTGIVNVFVEVGMDVKFDLTMSLDDAINEGVRQGYLENSNVLRASVLADPAFGRKNTKDNTPAVIYHKLVPGNKVDITVAAKGGGSENKSKLAMLNPSDSIVDWVLKTVPTMGAGWCPPGMLGIGIGGTAEKAMMLAKESLMEEINMDELLRRGPENKIEELRMEIFEKVNALGIGAQGLGGLTTVLDIKIKDYPCHAAGKPVGMIPNCAATRHAHFQLDGTGVAHIQAPKLEDYPSVTWDSSTSKRVDLDTITQEEMNAWQPGDTLLLNGTIYTGRDAAHKRMVDMLNNGEELPVDLKGKFIYYVGPVDPVGDEVVGPAGPTTATRMDKFTRQVLEATGMFGMIGKADRGPAAVEAIKDNKATYLMAVGGAAYLVSKAIREAEVVAFADLGMEAIYKFVVKDMPVSVAVDVNGTSIHATAPKIWQAKIGKIPVVDAAAG >CP022298.1|AZN65247.1|3042527_3043076_+|hypothetical-protein MKKLNHILCGITLCVLSTASFAKPATEASVEKALKLGDIKGTLAQSQQEMRPVYDQQAEEIIKNIFKTSTLNAEQQKAAKQIAEITASFSSKLISDPKFMQMLKNVYMQTFTEEEVLANIQFLETPLGQSINKKSSKMMSEIMRNSIAMSAEMMQDPAIQLEMNRQIEKTLAPLFEQAKKVQ >CP022298.1|AZN65248.1|3043081_3043798_-|hypothetical-protein MRAMTITLLSSLILLGCHGKATVEQPELISTLSHEVDFEHDPGMVEQYRIGVFSVGGWVNQKLGQRFQRVQPQHEQAAMVYLYRPDSKWNRQEIVASSLFINKERIPSLLNNHYYWVELPAGTYRLSSSRPLGINHFQKPKYIDFSVEAGQSYFIKYDEENLSTRRDVSGPLAVIPEKIAIQEIAFTQLKSNSYNFVAEDQHTGELRKKAQKLKPAKYDPSEDVQLMKPFKLWNPLTW >CP022298.1|AZN65249.1|3043956_3045267_-|ATP-dependent-protease-ATP-binding-subunit-ClpX MSEHPQGQKHCSFCGKTQSEVGKLIAGEDAYICNECVDVCLDLVQTSQQVESGDWAAKPLPKPHEIRAALDQYVIGQDVAKKTLSVAVYNHYKRLKATHGGHKHDDAVEIAKSNILLVGPTGSGKTLLAQTMARLLDVPFAMADATTLTEAGYVGEDVENIVQKLLQKADYDVEKAQKGIIYIDEIDKITRKSENPSITRDVSGEGVQQALLKMIEGTVASIPPQGGRKHPQQEFIQIDTANILFICGGAFSGLEKIVQQRQEKGGIGFTAEVKKKDEGKKLSDLFRQVEATDLVKFGLIPEFIGRLPVIATLEELDEEALMQILTEPKNALTRQYQHLFDMENVDLVFEDSALRAVAKKALDRNTGARGLRSILENTLLETMYDLPSRTDVGTVVVNEDVINGTATPLFKPERLPRIEQKDAAKVDLKVINSKSA >CP022298.1|AZN65250.1|3045295_3045901_-|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MYIPTIDNALVPMVVEQSSRGERSFDIYSRLLRERVIFMTGEVEDNMANLIVAQMLFLEAENPDKDIHLYINSPGGSVTAGMAIYDTMQFIKPDVVTYCMGQAASMGAFLLNAGAKGKRYCLENARVMIHQPLGGFRGQASDIEIHAREILFIKERLNRLMAEHSGQDYETVARDTDRDNFMTAQAAKEYGLVDEVLSKRP >CP022298.1|AZN65251.1|3046093_3047425_-|trigger-factor MQVTSEAVSGVTRRLNVSVPTSRVNEQFEARLKRTAKTVKINGFRPGKVPVNVVRREYGAGIYQEVVSDIIRDTVFEAIQQEKINAVGMPNIEKSELKDDALVYEATVEVYPEVNVKFDGLEVERKASEVNDKDVDQMIENLQKQRASWAETKGMAKKDMQVTFDFEGSVDGEKFEGGSAEDFKLVLGSGRMIPGFEDGIVGMKKGEEKVIDVTFPEDYQAENLAGKSAQFKITVKLVEKQKLPEVDAEFLKIFGLTEEEGIEKLKADVRKNMEREVKNGLRNQVKGAAFDALVAANEVELPASMVAQEVDRQRQQMIQQFTQQFGAQGAKAFDSSMLPDELFKEQAEKSVKLGVLVSKVLADAKIEVDQARVDAYIEDMASSYEDPAEVIEYFKNDKQQRSQIEAVVLEDQVVDHILASAKVTDTAVSYEDLLKEQQARQQG >CP022298.1|AZN65252.1|3047698_3049882_+|TonB-dependent-receptor MSKFNLHPLSLALLGAITTPVFAETTTEDSSTHQLSTIVVSAAGFEQDIKKAPATMTVITAEDLKNKRINSIADALSDIEGVDISPTAGKTGGLNIRIRGMDSEYTLVLIDGRRQNSTGDITPNGFGESNNSFIPPISAIERIEVIRGPASTLYGSDAIGGVVNIITKKVSNEWTGAVTLEGTLLPNSSDFGNQRSVDAYVTGPLIPNLLGIQLRGRKAERDQSNVIRSDDEGTETKLTQGQNPTKSDLENIGVRLTLTPTDQHDISAEYEQTDQWYDNSKGQLGTLGANGGYDKSQEYNREKMILSHTWRSNIGTLESSLANTQTETVGRLIPARAQNMSQAITPRLLESEDTIFDTKFTTNYINGHNITLGGQWWDASIRDGLRVQKEVSFEQLGLFAEDTWSLNDSLALTLGLRYDNHDTFGDFWTPRAYLVWNANENWTFKGGYSEGYKAPRLERLTTGIYNVSGQGRTPVFGNPDLKPETSKNLELGTYFTNNSNFDFNITGFFSEIEDKIMTGNAELRCNTDTNKQQCEDYMLSVGTPWTMDYNRGAPDTWNVTRPINAEEAEVYGIETGLNWEFAENWKLGLNYTWTETEIKDKQLNNPVLNDTPKHMANASLKWQAADFVNLWARGEYRSERARFTSNYENLTAANQAVYDALGDYKAYTLFHIGSNFIVNDNWDVGVALYNVFDKDFNDYEKIGTGYYNRYSNTQEGRRVQLSTTFKF >CP022298.1|AZN65253.1|3050213_3052559_+|TonB-dependent-siderophore-receptor MAFIKTRKKLVSSAIASTLSVVAVNAVAQDQIAQLETIHTEAAAEQSLKVDKSANSKFVAPLLNTPKSVSVISKQLIEDTQVTTLSDALRTVPGITLGAGEGGNPNGDRPFIRGYNSESSMYVDGVRNSTSQNREMFAIEQVEITKGSASAMGGAGTTGGSINMISKVAKKGDFLEGSVGAGTDDYQRITLDGNKDFGNGIAARVAVMGHHNDKAGQEDGTEYARAGIAPSITFGLDSDTRATLSYYYLKTDDTPDSGIPYNNPFGAPRTGAIDYRPLNGNGKPIDVKQGTYYGWKDRDFQKQENQSGTIKLEHDLTDNLTLSNTAVYNKSKNDYLWTNPDDSQGNFYNKPEFTNQLVGNVWARANSRVADTDTFTDQLALTGKFNTGRLKHNFNLGAEYSDQETDRTQYIIDGLTTTGAANSSCNAAAIASGWCTSVQNPNRGQWTGTISTEGADRYNIENENTSVYFLDSIEFSPQWILDLGLRWDDYSAKQTMTYGARNSAVLGSSTTPPTAKAGDKVAIKNDSDFINYQVGLVYKPAENGSIYASYATSSNPVGVDGGDGSEGITAAIQNLKPEEVKTYEIGTKWDVLNEKLNLTAAIFRTEKTNTRATTDEGTTQNIGETRVDGIELGVNGNITDKWAVSAGYTYLDSELIDGGFENIGTTAAPIYAPNSNNGKQVQNVAKNSATLWTTYQVMPQLTLGAGAIAMDKVYANAANTKWVPGYVRYDAMARYNVNKNVDLQLNVNNLADTRYFTKAYASHYATEAEGRSAVLSLNFKY >CP022298.1|AZN65254.1|3052674_3053358_+|Fe2+-dependent-dioxygenase MIHHIPNVLSKEQVQYFRNEMAKVEWIDGKKTTGSLSKNVKQNQQLPEDHPLTQHLGNIILEALGQHPLFMSAALPLDILPPYFNRYEQGETFGFHVDNAIRWVAGSKDRIRTDVSCTVFLSEPDEYEGGDLVVEDTYGYHEVKLPAGDMILYPSTSVHEVTPVTSGCRVASFFWVQSMIRDDADRHILFNLDQTIQNLRVQLGDQHQEVVKLTSLYHNLMRKWAEL >CP022298.1|AZN65255.1|3053407_3054514_+|alpha-hydroxy-acid-oxidizing-enzyme MTSKTVLPPLTQIPASLQTIADYEIEAEKHLPEMVWHYLQGGAMDEISVRNNLAQFQNLHLIPRMLRDLTQGNTSCEILGQTFPHPIFVAPIGHQQQFHPEAEAATALAAEVLGSNMILSTFTNTDMRTFKPENPYKWFQLYWQGDRDKSLALLKLAEAQNFTAIVITVDSPHTGVRDRERRAFFHLPENMQHPHTPAHIPLPELQEGDHPVFNGLMKIAPTWDDIAWMVQQTDLPILLKGIVSPLDAHLAIQQGVQGLILSNHGGRVLDTCIPPLKALQLIKKAVPHDFPLLYDGGVRRGSDVFKAIALGASAVLVGRPCIYGLATAGALGVAHVLKILKEEFEITMALMGAATLADIQPDMVIEFS |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022298_3 | 3.2|3040398|17|CP022298|CRISPRCasFinder | 3040398-3040414 | 17 | CP022298.1 | 3040422-3040438 | 0 | 1.0 |
CP022298_3 | 3.2|3040398|17|CP022298|CRISPRCasFinder | 3040398-3040414 | 17 | CP022298.1 | 3040430-3040446 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.2|3040398|17|CP022298|CRISPRCasFinder matches to position: 3040422-3040438, mismatch: 0, identity: 1.0
tttgaagatttgaagat CRISPR spacer tttgaagatttgaagat Protospacer *****************
2. spacer 3.2|3040398|17|CP022298|CRISPRCasFinder matches to position: 3040430-3040446, mismatch: 0, identity: 1.0
tttgaagatttgaagat CRISPR spacer tttgaagatttgaagat Protospacer *****************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
24301 : 78891
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022298|24301:78891|DBSCAN-SWA 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MEYFMARRPRRNHSNDFKAKVALAAIKAEKTLAELSAEFDVHQNQIIDWKNQLISASSQAFDQSKAPTEPPIDLKKLHAKIGEQALEIGFFRRCVEETGPLQPQKLIDDSLQISVSKQAQLLKVSRGCYYYRPKPVSASDLKLMRCMDELHMQYPFAGSRMMRDLLNRQGHHIGRRHTRTLMKKMGINALYCKPNLSQANQAHRKYPYLLKGLAIQRSNQVWSTDITYIPMAKGFVYLCAVIDWHSRKVLAHRVSISMEVTFCIETLNEAIEKYGRPEIFNTDQGSQFTSDAFIDVLKSNDIQISMDGKGRWVDNVMVERLWRSVKYEEVYLKAYSNVLDAKKQLNAYFEFYNLKRPHSSLDKMTPDEFYYDQLPQQNKVA |
41 | Helicobacter_phage(15.38%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
189412 : 218869
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP022298|189412:218869|DBSCAN-SWA TATGCCTTCCATAAAGCCATCGCTGTTTGCAAACATCAAACGGAATGTATTTCTCAGCACTGTCGTGATTCTGGTGCTTTTTCTGGCCTTGATTCTTTTTGACCCAAGTGGTTTTGAGGCTTTAACCAAACATTTAAATCAATGGATTATTGACTCATTTAGCTGGTTTTACGTTTTATCTGTCGCGTTATTTCTGATCTTACTGATCTTTATTGCACTCTCCGATATGGGGAAAATCAAACTCGGCCCTGATCATAGTCTGCCTGAATATAGCAGTGGTTCTTGGTTCGCCATGCTGTTTACCGCAGGGATGGGGATTGGTTTGATGTTCTTCGGTGTCGCTGAACCCGTGATGCATTATGTCAACCCGCCAACAGGGGAAGGGCAAACCTTAGATGCCGCACAACAAGCGATGCGGATCACCTTTTTCCACTGGGGATTACATGCATGGGCCATTTATGCACTTGTGGGATTGTCACTGGCCTATTTCTCTTTCCGACATAATTTGCCTTTAAAGGTTCGCTCTGCTTTATATCCTTTGGTGGGCAAAAAAATCTATGGTGCAACGGGAGATGCAGTTGATACCTTTGCAACCTTAGGCACCATTTTCGGGGTTGCGACCACACTTGGTTTTGGGGTGACCCAAATTAATTCGGGACTGAATTATCTTTTTGGTATCCAGCAAAGTATTGGTATTCAGGTCGGGCTAATCATTTTTGTCACTTTTTTAGCTTCGCTCTCAGTCGGTTTTGGTTTGGACAAAGGCATTAAACGGCTGTCTGAATTGAACTTGGTGCTGGCAGTGGTTTTACTGTTATTTGTGTTTTTTGCCAGTTCTTCCATTTATATCTTACAAACCAGTATTCAAAATGCAGGGCAATATGTATCTAATCTGTTCACGATGACCTTCAACCTGTATGCCTACCAACCTAATGGTTGGATTGGTGGTTGGACCATCATGTATTGGGCGTGGTGGATTTCTTGGTCGCCTTTTGTGGGAATGTTTATTGCCCGAGTGTCTAAAGGTCGAACCATTCGTGAGTTTATTGTCGGGGTGTTGTTCATTCCAACAGGTTTTACTCTGATATGGATGGGCTTCATGGGGAATGCAGCGCTGTTCAGTATTATTCAAGATGGGCACACTTCGTTAATCTCAGCGGTACAACAAGATTCATCCGTCGCACTGTTTGAATTTTTGACCCATTTACCTTTCTCTCAAATCTCGAGCCTGATTGCGACCGTTCTGGTGGTGCTATTCTTTGTGACTTCAGCCGACTCAGGCTCATTGGTCATTGATTACTTAACCGCAGAAACAGAAAATTCACCTTTATGGCAACGATTGTTTTGGACCATTTTGATTGCGTTACTGTCGATAATCTTACTGATGGCAGGCGGACTTTCGGCCTTACAATCGGCCACCATTATGAGTGCCTTGCCCTTTACTTTGATTATGTTACTGGTCTGTTGGGGCTTAGTGAAAGCACTGCGTTTGGATGTCACCAAAATGCGTGCACTACAAGATGCGCGAATCACGCCACGTGCGATTCAAAATCCACGCAGTTGGCAACAGCGTCTAGGTCTGATTATGCATTATCCACATACTCAGTCTGAGGTTGAAGAATTCATTGGTCAGCAAGTACAACATGCATTTTCAGCGGTGCAAAAGGAATTTCAGCGCCGTCAGCTAGACGTGACCATCCAACCGATTGAGCATGGCTTGCAGTTACGCGTAGATCACCATAATGAAATTAACTTCATCTATCAGGTGGTTGCCCGTGAAACCCAGCCACCTAGTTTTATGGCAGATCGACTTGAAGAACAGCAGTTTTATCAAGCTGAAGTTTTCTTAAGAGAAGGTGGGCAGAATTATGATGTGATGGATTGGACTTTAGATGATCTATTACAAGATATTATTGACCAGTACGAACGTCATTTATATTTCTTAAACTTAGTGAGAACTCCCCAATAAAGAAAAGGACGCTTAAAAGCGTCCTTTTCTATATTCAGTTTCTAAATGAAATTAGAAGCGGAATTTAGCGTTTACGCCAACAGTTTGAGTATCAAGATTCTCAGTATTGTCTTTAGCGTTAGCATTTACATAGCTTGCGCCTACAGCAACTGCTGGAGTGATGAAGTAGTTAACGTTTGCACCCCAAGCTGAATCTGGAGTACCAGCAAAGCTTGATTCAACATAAGAAGCGCCAACACTTAACGCAGGAGTTAAGTAAAGGTCAGTTTTAAGTTGGTAAGCGGTGTCTTCACCGTAAACAAGACCAGCTTCTAAGCCGAGCGCCATGTTTGTACCGTCGATGTTACCTACGTATTTAGTACGTGCAGTAACCGCGTCTTGATCTTCACCGATCGTAGCAGCTTCACCAACAGCTTTAACAACACCATTGCCCATTACGTTGAACGCATCAAGAGCAAATTGGTCAGCAACGCTAGTATAACCTACAGCAACCAAGAAGTTCGGAGCAGCTAAAGCACCCACTTCAAGTGCATAACGGTCACCATTGTCATCAGGCGTTTCGCTGTTTTTACCATCCAAATGCGTGTGGCTATAAGACGCACTTGCATATGCTGGAACGAATTTAGTAGGAATATACGCTTCAGCTTTAGCGCCGTAGTTGTGTGCGATGAAATCAGTACCGTCAGTGCCTAATTCAGCATAGTTATATGCCAAAGAAACATTTGAAGCTTGGTTTAAAAAAGCAGCTTCAGCTAAAGGACCTTTAGATGAATCAACATCTTTAAAGTAGAAAGTACCTTGTAAACCGCCAGTAAAATCTTTGTCATTTGCATCAGATGCATCGATGTATTCAGATTGACCTTGTACTTCGAATTGGTATGCTTGAGCACCGGTCATGGCTAATAATAAAGCAGTGGCTAAACCGAGTTTTTTCATGATATTTACCAGATTGTTAACATTGGATTAAACTAATGCTATTCTATTGTAACAATTTATTAAGTCAATGAGCTCTAATGGTATTATATTATTGAGTAATTACTCTAGCTATGTTAGAGGTTAAAAATTGCTCAATTGAGTGTATCCATGTCAACCAAAAAAAACTTACAGCAGAACAATAGGGTATACCTATTTAGAAAACAGAGAATGCAGGAAAATGAATTGTACTGAACTTGATTTTTAATTGGTAAATTAGATTGAATATATGGATATAAACGGTAAAAAAGTTAAATAAGGCACCTCAAATATAGGCGTTTTTGTGTCCTAAATCTAAAAAACGCCTAAAATTAGCGCAAAAAGCTCGTTTTTTGCTTGCATAATGTACATATCCTCTGAGTATTTGTGATAATTTTCACGATAATTATAGCGTTGTGTTAATCCATAGTGCTTTAGTTGGCTTTACAAGTGAACGGATTTATTTCATAATGACTTTAGCGAATCATTTAACAATATTGTTGTTTTCTGAGAAGCTAATTCTCCACAAACAGTTTTTGTTTATCTGCCCAACTTTCCCCAAGGTTGGGCTTTTTTTTATTTAAATTTTCGAGATCTTCTTTTTTCTGAATAAAAATCTATTGGAGTTTAATGCGCCATAATGGTGCAATTGTGAGTCTATATTTTTTCATTAAAAACTTTTATTCGGGCAAAAAAAAACCAACTTCTAAAAGAAGTTGGTTTTTTTCGTCAAAACTTGTGGGAAAATTAGAATATCTGCTGAGGATATACTCTAATTCGCCCCAATATTGTGCATTATGCACTTAAATGTCGCATGTGTAAATATAGGCACTTTAAAAAATGGGAATTAAAAATATTGAATGAAATTTACACTAAACATGAATATTATTAAGGATGGATTGACTCAGCTTTCATAGGTGCGTGAAAGTTTAGCCATGATTATTTGGGGATGATGAAATCTTAAAACGATGCAAAACAAAGAATTAATCACTTAAATACACGATATACTGTTCGTATAATAAACAGTTAATTTAGTTTTCTTTTATTTAGGAATGGGGGCGTGGTTGAAGTATGCGAGAAATACGCTCTGAGTATTTGAGTCAAAAGCTGTATATTGCAATGAGCATTATTATTTTGTCATTGTGCAGCTTATCCATTCCGTTGATAGTTAAAAGTTATCGTGATTACAACAAAACCAACCAAGCTTTAACTGAAATACAAGCCTTACAGGCTGTTGCAGACTTGGCCAATAAGATTTCACGAGAGCGTGCGCCCGCCAATAAACTCATGTCGAGTAATCAACAAGATTTTGCCAAACACGTGCTTGAGTTAAAACTATATCGGCTCACGGTGGATGAGCAGATGAAAAAGGCTTTAGAAGTTTTAAAGCACTCGAACCTCCCAAATTTAGATTTAAGTTTAGTTGACCGTTTAGATGAAGCTTTAACACAAGGCAGACAACAGGTAGATGCTTATGCAGCTCTACCACGTGAGCAACGTAATGCCGAGACCATGGATCAAGCCATCCTAAAAATGTTCAATGCTTGGGATCGTAGTCATGATGTTTTAAAAGACGTAATCGCTGTATCTGAAGGCAAAGACACCGCTGTTTCAAACTTCTATGTCCAAATTTTATTATTAGCGGACTTACGCGATCAGGCTGGTCGTGCTGCATCCAATGTGATGGCGCATGTAGCTTTTAAACAACCGATTCCTGAAACCAATTTAGCACGTTCTTTACAGACTCGGAAGCAAGTGATGTATTTGTGGGAACTCATTGATACCTTACAGCCTGAGCGTGATAAAACCGAAGAATTTAAGGTGCTGCATCAAGCGGTTTATAACGAGTTTTTAGCCAAAGGGCTATTGATTGTTGAACGCTTGATGAATGAAAGTATTTACCATCGACCGTACTATTTAACGGGGACACAGTTAACTGAAGCAATCGTTGATAAATTTTCGACCGTGGTGGAATTGCAAAATTATTTACTCAAATATAGCGTTGAAAAAGCCATCATTGAAAAGCATAAAGCACAAAATATTTTGCTTACAACGGTGGGTATTTCACTCATTTCAATTT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22 | Escherichia_phage(28.57%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
231827 : 288946
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP022298|231827:288946|DBSCAN-SWA 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48 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase,integrase | attL 231752:231811|attR 279639:280920 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
761851 : 832848
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022298|761851:832848|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP022298|761851:832848|809941_810454_+|AZN63248.1|DBSCAN-SWA MSIGKALELIRMAKSYQCVLYWDPPDRIRFASQSLIPDELLSEVKAHKHVLIEYFKHTDRDLTPLLGRAFDGYLYCLNQMRERHSSAALSDCHVSTLYWRSTVKATLQVSNPELKLIEMLLIQSEQLKYLDDSNTALITPEQEQQKYSTDADANTAFNYLLSKHRQFVYC >CP022298|761851:832848|807127_807529_+|AZN63246.1|DBSCAN-SWA MPNQINKTAQNFLENSQVIIESLEGTLLRLYVSYEQHDISDAKAKAMLSVCEMLASAALEDIESASAKTILDISMIVSRATGILYTLEELAHLNLAKGHTAAAINGLTLACSTLNELLETAVDYVMKGGSHNA >CP022298|761851:832848|805725_805944_+|AZN63242.1|DBSCAN-SWA MNNTQLKQVLAHLKQGKTISQAEAIDLFNCYRLSAIIQRLRNAGYDIVTHNERNKSGIGRHARYELINQVAA >CP022298|761851:832848|796077_797091_-|AZN63234.1|DBSCAN-SWA MTYTFNRPAFPATRMRRIRKNEHLRSMVRETHLTTDHLIYPVFVLPGQNQTQDIPSMPNVQRLSADLLLKKAERLLELGVSKLALFPVTPQEDKSLSAEAAWREDGVVQNTLRLLKKELPEMVLITDGALDPYTTHGQDGIIDDTGYVLNDETVEALIKQGLSHAEAGADVFAPSDMMDGRIGAIRQAFEANGHIYTSIMAYSAKYASSFYGPFRDAVGSSSNLKGGNKYNYQMDVGNRAEALHEIALDIQEGADMVIVKPGMPYLDIVREVKDNFGVPTFVYQVSGEYAMLAAAIQNGWLSDSVIIESLMSCRRAGADGIWTYFAEEAALKLKDMK 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59 | Escherichia_phage(21.43%) | transposase,integrase,tRNA | attL 792831:792848|attR 818788:818805 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1035223 : 1106375
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022298|1035223:1106375|DBSCAN-SWA TATGCCTCGTACCATGCTGACAGATCAACACTGGCAAAAGTTGAAAGCTATTCTGCGTAATTTATCCATTCACCACAACTCAACTTTACGCAATTTTATTGAAGCTATTCTCTATAGAATTAGAACAGGCTGTCCGTGGCGAGATATTCCTTCTTGTTTTGGTCATTCAAACTCTATTTTCAAACGTTTTAATCGTTGTTCAAGCAGCGGTAAGTTACTTAGATTATTCAAATTGCTAGCCTCATGCCCCGATATGGAGTGGATTTTTATTGATGGCTCTCATGTACGTGCTCATCAACATTCTGCTGGCATAGCGAATCAATCTATTTCTAAAAGTGTAGGAGGAAACTCCTCAAAAATACATTTGATTGTTGATGCACATGGCAATCCTATTGATTTCATAATTACCGATGGAACCACACATGATGTTAAAGTTGCACCTGATTTAATATCAACATTAGATTTAAAAGAGACAAAAGTGGTATGCGCAGATAAAGGCTATGATTCAGAACCACTGCGTGAACAGATCAGGAAAACAGGGACTAAAGCGAATATACCAAAGAAAACGAATAGCCAATCTAACAATGACCATATGGACTGGTATTTATATAAAATGAGGCATTTAGTTGAAAATATGTTTTGTAGATTAAAGCAATTTAGAGGAATAGCTACTCGATATGACAAGCTCAAAAGAAATTATCAAAGTTCTGTTGCTTTAGCCTGTATATTTTTATGGCTACCTTTATAGGGTTAATTATGAACAGTAAGTGTCAACAGACCCTAAATAACATACAGAAAATACTTGTTTTTATACCATTTGACCTATTTTTTAATCACTCGATTGCAAAAAAGCGAAAACAAGCCGAAAAGCGTTTGACAGCCTGTAAAGATTCTCTATAATGCACCTCACAAACGATAAAGACGTTAAGGGCGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAATGTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGCGCCCACCAAGCCTTTACGTTAAAGATCTTACGTGCAGCGGTAGTTCAGTTGGTTAGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGGGTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCTGCGCCACTTAAGATTTTTAATATTGTTTGTACCACATTAGTGACTTTGTGTAAGTGCAGCGGTAGTTCAGTTGGTTAGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGGGTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCTGCGCCATTTATACAGAATCCTTAATGAGGGCGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAATGTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGCGCCCACCAGATTTTTTGCGATGCAGCGGTAGTTCAGTTGGTTAGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGGGTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCTGCGCCATTTAAAGAATCGATTAAATTTAAGTTCCTCAGCTTAAGTTTAAAAACTAAGACTGACAATCTTAAATCAGGGCGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAATGTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGCGCCCACCATATTTTACGACGCAGCGGTAGTTCAGTTGGTTAGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGGGTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCTGCGCCATTTAAAATATAAATTTAAGTCCCTGAGCTTAAATTTGAAAACTAAGACTGACAATCTTAAATCAGGGCGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAATGTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGCGCCCACCATATTCAAGCTGTAAAGCTTAATGACCCTAATTGCATTCGCAATTACCGTTGCAGCGGTAGTTCAGTTGGTTAGAATACCGGCCTGTCACGCCGGGGGTCGCGGGTTCGAGCCCCGTCCGCTGCGCCATTTTCTAGATCCCTTGTGCTAGTAAATGGAATCAAGCAAGATTTCTTTCTTGCATCATAAAAATAGCGTCGCTATTTTTATTTCTCAAGGGCGCTTAGCTCAGTTGGTAGAGCGTCTGCCTTACAAGCAGAATGTCGGCGGTTCGATCCCGTCAGCGCCCACCATATTCCTTGTCGTAAAAACCTTGCTTATCTCAAGATGTTTTCATACACTTCTGTGCAATAATAATTTTAAAATATGACAGATTTATGAGAAACCCATATCAACGCAAAGCTGCGTCTAAAAATCAAAATATTGCTTACGACCCTCTTGAAATCTATCGTCTTTTTATCGAAACTATCGTGCATCAAGGCCATGTTATTGCCTTATACCAAGATGGCTGGGCTTTATGTGCTACGCCAACCGGTCAACGTTCATTTGCGATGTGGCAGAGTAAAGGTTTAGCACAGCTTTTAGTGAAAGATAATTGGGCAGGCTACGAAATCCAGAGTATTGGTCTTAGCGATTTAGTCGAAAAAGTGATTCCATTCTTACGTGCAGAAAAAACCACGGTTTCGATGAATTTAAGCCCAGAAGGGCAGAATGTCTTGGTTGCACCAGAAAAATTATTATTAGATATCAAAAACTATTTATACCAATTTTCAATGCAGAAACCTGAATTATTTAAACAATTACAATTACCATCACCACGGACAATTCGCCTCCATTAATTCATGATGACCTCATTTTAGTATTCATTGAGTAGCCAACCACTACAATACGCAAAATATTCACGTAACCAGGCATTATAGCGAGTGGCAAGAGGTGTCTGAGCGCTGGTCATGATAGGCGTTTGATAACCCTGACGTATGGCTATAGCACGACTACGGGGGATATGAAAATCGCTGGTCACAATAGCAATCGGTTGCTGTAGGGAAATATGCTGCTTGGCTAAAATCTTTTTACTATTGATCAGATTTAACTCGGTACTGGTACTTTGATCTTCGGTGTAAATACGCTGTGCTGGGATATGGTGTACATCAATCAGATACTGCCGCATTGCTTCAGCTTCACTATTTTTTTGCTGAAAAGATAGGCCACCACTGACGACCACAATGCTGTTGGGATGTAGCTTGGCATAGTTTGCCGCTTGATCTAAACGGCTGGCCAATGTTGGACTCGGTTTTCCATGCTTCAGACCACTCCCAAGAACTACAATAGCGGGTACAGCAACATGATGGGTATTTTGTTGATTTGAAAACCCTAAAAAGACGAAGAAAATGACTAAGCTAAAAACCCAAACAAAGAAAATCGCCCAAGCCCAACGCCATATTGATTGTCTGATTGTATTGGTTTGAATATAGGCGATAAGTTTAGGATAGGCGAGTGCATAAATGATCAGACCTAGTCCAATCAATAAGGGCAGGAGCGTGCCAAAATTAAAGCGTAGTTGTAAAACAAAATATAAGCCGTCTGCGAACAGTAATGACCCGATAATAAAACTAATGACTCTTTTTGATTTTTGCATACAGGCTTGTGGGGTATCGTTTGCATGATTCTAGCAAATTTACGCATGAAAAAACCGAGCGCTGTGGCTCGGTTTTTTCATTTAGACTTAGTGTTTAGTAAACATCGCGACGGTAACGACCTTCTTGACGTAATTGATCTAATTTTTCTTCGCCTAAGATTTCAATTAGGGCAGCATCGACATCGCTCGCCATCCCAGTAATGCTTCCGCAGACATAAATGACGGCACCATTTTCAACCCATGTTTTAAGCCCAGTGGCTTGTTCACGTAGTTTATGGTGTACATAGACTTTCTCTGCTTGATCTCGCGAGAACGCTAAATCTAAGCGTTTTAGCATGCCTGTGGTTTGCCACGCTTCAATCGTACTTTGATAGAAGAAATCATGTTCACGTTGACGCTCACCAAAGATCAACCAGTTTTGCGTATATTCTAGGCGGGTACGTGCATGGAGTAGACTCATTAAACCTGCGATGCCTGTGCCGTTCCCAATACAAATGATAGGACGGTTGTCATTGATCAAGTGGAATGATTCATTAGTACGAATACGTAGTGCGATAGGTTGTTGAAGTTCGGCATGTTGGGTTAACCAACCAGAACCTAAGCCCAGTTCACCTGCTGAATCCTGCTGTTGGCGCACGACCAAACGTAACACTTGTTGAGTCGGTACACTTGCAATCGAGTATTCACGTGTAGGTAAAGGGCTCAATTGTTCCAGTAAATGTTCCAAATTGGCAAAAGGTTCAATCTCTGCGCTGAGGTTTTTATCCCAAAGCGCTTGCTCAATCGAAATGGCTAAAGACTCAACGATGCTCTGCGCTGCAATGTGATGCTTTTGCATAAAGGCTTGGATACGTGCGGTGCTGTTACCTGGTTGAACTTCAGCAATATCACCTGCTTGCCATGTTGCATCGAAGTTGGTTTTGAGCTCAATATTATAAGCATGTGCTCCGACACTATTTGGATTGAGTACTTCACGTTGTGCCAAATTCCATTGATCAAAGGTTTTGTCAATATTCATGGCTTGAAGCTCAAGTTTGGTTGCAGAGGCAAGAGCACTGTTCCAACGTTGAATATCATTGTTATCTGCGTTGTTGACTTCAATGATTTCAAATAAAGCATGTGCGCCATTGGCTTTTAACCAACTATCAATGCGATGTCCAAAACTACAATAGGAGTCAGGATATTCTTGAGAGCCTAAAGCCAACACGGCATAGTGAAGGTGTGACAAATCCAAAGTTGTATTTAAAAATTTCTTTTCAAAACTACTGGCTAAGTCAGGTGCTTCACCCGTGCCATAAGTACTTGCAACAAAAAGCACTTGCTCAGCAGCTTTTAAGTCATCCTGTGTTAAGTGTTGCACAGCTTTAACGCTTACAGGTTGTCTTGCTTCTTGTAAGCTGGTTGCAGTACGCCAAGCAATTTGTTCAGAAACACCCGTTTGAGTTGCATAGGCAATGAGCCATGGTTTCGCATTTGGATCAACCGTAACATTCAACGCTCCACCACGTGCTTGCTGCGTGAGTTTCTTTTGTTTACGACGTTTCAGATAGAGCATCCACCCCGTTATAAAGAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP022298|1035223:1106375|1064558_1065356_-|AZN63459.1|DBSCAN-SWA MSEQQGRVSREVRGSLFLIGLDRAAKRNAFDSHMIHDLSLALTEYEDDPSLRCAVIFAHGEHFTAGLDLVELQPKLTAGVFDFPATQINPWGTSSRPRTKPVVVAVQGFCFTAGIELMLNADVVIADANTQFAQMEVQRGILPFGGATVRFVQAAGWNKAMRYLLTGDSFNAQVAFDLNLITEVVEASTPNAALERALSLAESIAQAAPLAVQATLASAQQAVQHGADYAFAHLQEHLSPLLKTQDVQEGVMAMLQRRPAQFKGQ >CP022298|1035223:1106375|1041598_1042159_-|AZN63440.1|DBSCAN-SWA MTAKNLYAYTLQPVTYEITEAEQRDAQLKIWRSTNKISIKAWIIMAVVTALSILGLILLKNYSTIFCWVAIACVVVYLLVRKFGLEWYVKRKMNEFPVQEIKGIRLGVQPHGLIMRQQMGMQEGVGAIGWKDIYEWYNTPEFLLIKFKVKGQEGAYILPKRMDSKNFSFNTIRKHLKETVGEAQPL >CP022298|1035223:1106375|1097667_1098210_+|AZN63488.1|DBSCAN-SWA MNNLSTTLWSHIRTVQDFPKPGICFFDLTPLFMSNIEPLTDALIASIPAEQLAEVDSFVAVEARGFVLASLLAQRLGKGLLLVRKAGKLPPPVVGVGYSLEYGLDRLEMAANTPSQKVIIVDDVLATGGTLKAVNQLVAKCNHEVLGASIFLDLPDLHADLGLKIWSVLDDKSKPESVAA >CP022298|1035223:1106375|1044560_1045760_+|AZN63442.1|DBSCAN-SWA 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MRTQHLKGIFLHFLKLGCLSFGGPAAHLVFFHRHFVQQLRWLSDAEYAQLVALAQLLPGPTSSQVGIAIGYQLQGYRGACAAWLGFTLPSMLLMACFAVLGQQYFNQLSAMTLHSIQLIVFAVVVWAFWQMLTSFCKTIWQYVLMLLSTLFLYFVPWSFSQVIVIFVAALVGIYFASDSTSKLQDSSLKSKVQAKQTYLWLIAFVLPFVIFMVLHSSSSLFSQSLFSFYQAASLVFGGGHIILPLLHQDFVASHILSAEQFDLGYALAQLMPGPLFSFASYLGALLPLTPFVWLNAILATLAIFLPSFFLIFATLPYWSWLMQQAAIRKAVIGINAAVVSLLLCLVIQMGQSYFKHWTDLVFVIAVILMLRTKLPIWLSLILSFALYQLLFYFSG >CP022298|1035223:1106375|1089979_1090795_-|AZN63481.1|protease|DBSCAN-SWA MTELTPPQIKTKFDVHLWWITAVIIAVNVGLFFWQVLHGMDVSNPSTADAIRWGADYAPLTFLAEPMRLLSSMFFHFGLVHLMLNMWALYIFGSVLEQMFGRVYFLALYVLAGLMGSLLSGYIAIQDSYELIREGLANPELLPRVGAGASGAVMGLGAALTVLSLLPMLPQQRFILDKKTLLIVMGINLAMGFMISGINNAAHIGGMLMGAVLATLWYLSQKTQQRWIMPLSLVLAACGSYWFYLHCQNLVVYIQPLWSEVLMMMRQQLNF >CP022298|1035223:1106375|1066137_1066407_+|AZN63461.1|DBSCAN-SWA MLIDFKQIQLAQFESVIERLKGSPQQYLDFASVADFYQATWLDDLPSSASWAVTGLDDGAEHFDIRLACFERVVFIHIADDIVIQNGTH >CP022298|1035223:1106375|1042244_1044419_-|AZN63441.1|DBSCAN-SWA 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59 | Klosneuvirus(14.29%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1332068 : 1462525
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP022298|1332068:1462525|DBSCAN-SWA TATGAAAAGTCGCGCGATACACACTGGTTTTTTTGCTGTTGCATGTACAATGGCTGCGGTACAAACACACGCAGCACCTGTTGATTTCTCAAACTTGGTTGAGCAAGTCAGCCCTGCTGTAGTGAGTGTCAATGTGGTTAAAAAGATGACTCAAGAAGAGTTAATGCAACAGCAGATACCTGAAATTTTAAAGCGTTTCTTTGGCAATCAAGTGATTATTCCACAGCAGCAAGCACCGCAAGAAAAAACGGCTTATGGCAGCGCATTTTTTATTAGTAAAGATGGTTATTTACTGACAAATCACCACGTCGTAGAAGATGCATCGAAAGTCACGATTATGTTTAATGATCGTCGTGAACTGGATGCAACCGTAGTGGGTAGTGATGAACGAACCGATGTGGCCTTGCTTAAGGTGAATGGTGCGAATTTTCCGTCACTCCGTGCAGGCAATGTTGATCAACTGCGCGTAGGCGAACCTGTGCTTGCAATCGGTTCACCGTTTGGTTTCGACTATTCTGCTTCAGCGGGAATCGTGAGTGCGAAAATGCGTAATATGATGGGGGAGACATCAGTACCCTTCATTCAAACCGACGTAGCTCTCAACCCTGGAAACTCAGGCGGTCCGTTATTCAACCAACAGGGTGAAGTAGTTGGTGTGAACTCGCGTATCTTCAGTGGTACGGGTGGTTATATGGGGCTGTCTTTCTCGATTCCAATTGATGTCGCAATGGATATTGCTGACCAACTTAAGAAAACAGGCAAAGTTACGCGTTCTTATTTAGGCTTTAATCTACAAGATCTAGACCGCAATTTGGCAGAGTCTTATAATTTGCCGAAACCTGAAGGTTCACTGATTACCAATGTTCAGCCAAATTCACCTGCACAGAAAGCAGGGCTAAAAGCAGGCGATATTATTTTAAAATTCAATGGAACGCCGATTTCACGTACCTCTGAGTTATTGAACTATTTAAATCGTACCATGCCAAATCAAACGGTACAGCTAGAAGTACTGCGTGATGATAAAAAGCGTAATATATCGGCAACATTAACCACTGCACCAGATGATACACCTGCAAAATCAGATACAGTTACACAAAGTAAAGGGCCTGTCTTAGGTATTGCTATCCGAAATTTAGCACCTGCTGAATTGTCACAGCTCAATGTGAAAGGTGGTGTGTTAATTCAAGAAGTGAAACGTGGCGGCGCAGCAGCACAGTCAGGTATGGCGGCTGGTGATGTGGTCACTCACATTAATAGTAAAGTCGTAAAAGACACCAATGATTTTGTCCAAGCGGCATCTGAATTGAAAAAAGGTCAGGTTGCCCGCGTTGGAATCATCCGACAAGGCACACCAGCCATTTTAGGGATGCGCATCCAATAAGCGAGAAAAAGCCACTCTTCGGAGTAATGCTGATCAGTTAAGACAAAATAGCTGAAATGCGGTAAAAATGAGCGTATCCAGATACGCTCATTTTTTTATGACTTTTTCTCAGAATTTAAGTTCAGCATTTCAGCAGACAGCTCCTTCACTTTCTAATTTTAGCGAATTAATTGATTTAAACTGGATTGAAGACTGTTTAAAACGGACCGGGAAAGCATCGGTCAGAAAAAGAAAACTCCCCGCAGAGCATGCTGTATGGCTAGTTATTGGACTTGCATTGTTCCGCGACCAGCCCATCTGGTATGTTGTTCAGCAGCTGCAGCTGGTTTTTGGCACGGCTGAAAGCTGCGCCCCAAGCGCATCAGTGCAGGCCAGACAGCGCTTGGGTCTGGAGCCTTTAAATGTCCTGTTCAATACACTGAGTCAGACATGGTTTGAAGATTCTCAGCCGCAATATTCCGCCTTTCATGGCCTAAGCATCTGCGCTGTAGATGGAGCCGTCTGGTCCATGCCCCACACAGATGAGAACTTCAGGCACTTCGGTTCTTCCAAAGGCAAAACGATAGCAGCACCTTGGCCGCAAGCCAGAGCGGTTTGCCTGATCAACACCAATACTCATGAAGTGATTGATGCCGGGATTGGAAGTATGGATCAAGGCGAGCTGACTTTAGCGAAGAAATTGAAAGTGCCTGCAAATAGCCTGACTTTATTTGACCGGGCCTACTTCTCTGCTGATTTCTTATCAGGGTGGCAGTCTCGGGAAAACTGCCATTGGCTTATGCGGGCTAAAGACAATCTGCGCTATGAAATTATCAGGAAAAACTCAGCGCATGACTTTCAAATCAGAATGCCTGTTTCTCCAAGAGCGAAGAAACTGAATCCGGATTTAGGTGACTATTGGGAAGCCCGCCTGATTGAAACTGAACAGTCTGGAAGGGTTAGACGATACGTTACATCATTATTAGATTCAAAGGCTTATCCTCTGGAAGAGGTCAGTACGCTGTATGCTCAGCGCTGGGAAATCGAGATGTGCTACCGTGAAATCAAGAGCGACCTGCAAGATGGGATGCATTTAAGAAGCAAGCAGCCTGAATTGGTGTATCAGGAATTATGGGGTGTATTGATTGCTTATAATATTCTTAGAAGGCAAATGAAATTTATGGCTCAACGGGCGAAAGTCAGCCCTTTGCGTATCAGTTTCCATATTGCTTCAATCAGCATTATCAATATATTAAGGCATACTCCGCTGGAATCGGCAGGGAATTTGCCCAAGCATTTAGAGCGTTTGCTGGAACAGTCTAAAATGTTTGTTTTGCCTGAAAGAAGATCAAGGCAATGCCCTAGAGTCGTCAAAATAAAGCCTCAAAAGTACCCAAGAAAATGCCAGTCAATTTCTTAACTGACTGGCATTAACTCTTCGGAGTGGTTTTTTATTTTTTGCAATTTGATGATGTCTGTTATTTGCGTACACTGCCATCTTCATAGGGATATTTAGATTCAATAGAGTGTTTATGAGTAGTATTTTTGACTTAAGACTTAAGGTGCAAGCAGAACATATCGACCAGTTAGGCCATGTGAATAATGTGGTTTATATGCATTGGATGCAGGATGTTGCAACAGCACATATTGATGCACTGGGTTTAGGCTTAAAAGAATATATCGAGTTAAAACATGCAATGGTTGCGGTTGAGCATCATGTGCAGTACCGAAAAGCTGCATTTAAAGAGGATGAAATAATCCTACGTACATGGTTTGACGATATAAATGCATTATATTCTTCACGCCAATATGTGTTTTATAGACCCAAAGACAATAGCATTTTATTTGTTGCTCAAACCAAGTGGGCTTGCGTAGAGATTGAAACCGGACGCGCGAAACGTATGTCACCCAGTTTTACCCAAGCTTACCAACCGCTTGCAAAAGATGTGAATGCCTTAGATTTTTCAATGGATTACTCAAAAAGCCCAGTGAAAAGCGAAAACACGTAAAAAAGCGTCAGAGTTGTGAAAAGGAAGCGTATTAATATGGATACTTTAAAAAAACCATCTGTTATAATCCTTCGCAATTTCTATTCGGCTTTTGTTGTGCATCGAAATTTGTCTGCATAACGCTTCATTTTGTTCAAGGTAGCCCATGGCGCAAGCTAAAAAATCTGTTGATATTAAAAATATCCGTAATTTCAGTATTATTGCTCACATTGACCACGGGAAGTCAACGCTCGCTGACCGCTTTATTCAAACCTGTGGTGGTTTGCAAGATCGTGAAATGCAAGCACAAGTACTTGACTCCATGGAACTTGAACGTGAGCGTGGTATTACCATTAAAGCTGCGTCGGTTACTTTGTATTACACCCATCCAAATGGTCAAGAGTATCAATTGAACTTTATTGATACACCAGGGCACGTCGACTTTTCATATGAAGTGTCACGCTCATTGGCTGCTTGTGAAGGTGCATTGTTGGTTGTAGATGCAGCGCAAGGCGTGGAAGCACAGTCAGTTGCGAACTGTTATACCGCAATTGAGCAAGGTCTCGAAGTTCTACCAGTGCTCAATAAAATAGATTTACCGCAGGCTGAACCTGAACGTGTGATTCAAGAAATTGAAGACATTATTGGTATTGAAGCGACTGAAGCGCCAACCTGTTCGGCAAAAACAGGTCTTGGGATTGATAGCGTTTTAGAAACCCTTGTTAATGTCATTCCTGCACCTACTGGTGATCGTAATGCGCCATTACAAGCTTTAATTATCGACTCTTGGTTTGATAACTACTTAGGCGTGGTTTCTTTGGTACGTGTGAAAGAAGGTCGTGTGCGTAAGGGCGACAAGATGTTGATGAAATCAACAGGCCAAACGCACATCATTACTTCTGTAGGTATTTTCAATCCTAAGCATACTGAGACAGACATCCTTGAAGCGGGTGAAGTTGGTTTCGTAATTGCAGGGATTAAAGACATTTTTGGTGCGCCAGTGGGTGATACGATTACCCTTGCCAACACACCAGAAGTCAAAACCTTACCGGGCTTTAAAAAAGTGAAGCCGCAGGTTTATGCAGGTTTGTTCCCAATTGATTCAAGTGAATTTGAACCGTTCCGTGAAGCTTTGCACAAACTTCAGATCAATGACTCGGCGTTATTCTTTGAACCTGAAAGTTCAGATGCTTTAGGTTTTGGCTTCCGTTGTGGCTTCTTAGGCATGCTGCACATGGAAATCGTACAAGAGCGTTTAGAGCGTGAGTATGATTTAGACCTCATTTCATCTGCACCGACCGTGATTTATGAAGCGGTGATGAAGAATGGTGAAACGATTTATATCGATAGCCCATCTAAAATGCCAGATGGTTCAACAGTCGAAGACTTACGTGAGCCGATTGCTGAGTGCCATATCCTTGTACCGCAAGAGTATTTGGGTAATGTCATGACTTTGTGTGTAGAACGCCGTGGTGTTCAAAAAGACATGAAGTTTATGGCGAACCAAGTTTCAATTACCTTTGAAATTCCAATGGCGGAAGTGGTGATGGACTTCTTTGATAAATTGAAGTCGTGTTCACGTGGTTTTGCTTCGCTCGATTATAACTTTGTACGTTTTGAAAGTTCATCATTGGTAAAAGTCGATGTTCTAA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120 | Escherichia_phage(12.9%) | transposase,head,tail,tRNA,integrase,protease | attL 1374281:1374295|attR 1404446:1404460 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1633090 : 1755705
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP022298|1633090:1755705|DBSCAN-SWA 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108 | Escherichia_phage(25.93%) | transposase,integrase | attL 1683633:1683649|attR 1738395:1738411 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1776369 : 1839438
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP022298|1776369:1839438|DBSCAN-SWA 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52 | Paenibacillus_phage(30.0%) | transposase,integrase | attL 1835217:1835232|attR 1840737:1840752 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1991828 : 2114882
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP022298|1991828:2114882|DBSCAN-SWA TATGGAGTATTTTATGGCACGTAGACCAAGAAGAAATCATTCAAATGATTTTAAAGCTAAGGTAGCACTTGCTGCGATTAAAGCAGAAAAAACACTTGCTGAATTGAGTGCTGAATTTGATGTTCATCAAAACCAAATTATCGACTGGAAAAATCAACTGATTTCAGCTTCCTCGCAAGCTTTCGATCAATCAAAAGCTCCAACAGAACCACCCATCGATCTAAAAAAACTACATGCAAAAATCGGTGAGCAGGCATTAGAAATTGATTTTTTAGAAGGTGTGTTGAAGAAACTGGGCCGCTTCAACCACAAAAGTTAATCGATGACTCACTTCAGATTTCAGTATCTAAGCAAGCTCAGCTGCTGAAAGTCTCCCGTGGTTGTTATTACTATCGCCCAAAACCTGTGAGTGCATCAGATCTGAAGCTGATGCGGTGTATGGATGAGTTACATATGCAATACCCTTTTGCAGGTAGCCGTATGATGCGTGATTTGTTGAATCGTCAAGGACATCATATAGGACGACGTCATACACGTACTTTAATGAAGAAAATGGGCATTAATGCGTTATATTGCAAACCAAATTTAAGCCAGGCTAATCAAGCTCACCGCAAATATCCATATCTGCTCAAAGGATTGGCTATTCAGCGCAGTAATCAAGTGTGGTCTACGGATATAACGTATATCCCTATGGCAAAAGGCTTTGTTTATTTATGTGCTGTGATTGATTGGCATAGCCGCAAGGTACTTGCGCATAGAGTATCGATTAGTATGGAGGTTACATTTTGCATAGAAACATTAAATGAAGCTATTGAAAAATATGGTCGACCTGAAATATTTAATACAGACCAAGGCAGTCAGTTTACCAGTGATGCATTTATTGATGTATTGAAATCAAATGACATCCAAATCAGCATGGATGGTAAAGGTCGATGGGTTGATAATGTGATGGTTGAACGATTATGGCGGAGCGTTAAATATGAAGAGGTGTATCTCAAAGCCTACAGCAATGTTTTGGATGCGAAGAAGCAATTAAACGCATATTTTGAATTTTATAATTTGAAACGACCTCATTCGAGTCTGGACAAAATGACTCCAGATGAGTTTTACTATGACCAGCTACCACAACAAAATAAGGTAGCTTAACTAGAGCAGAGTATCACTTATAAATAAGCTTTTAGTTGTTCAAACATGTGGGACCACCTCTGAGTTCACCTGATAGTATGGGCATTTACTATACATGGAAAGCAGCCTCAGGCACGTTGGATGCTAAACGGAACTGTATTTCAAATGTTCGACCTGCGGGCTTAAGCATTCTTGTTGCAGTACAACGACTAATGTCTCTCATGCGTGGCTCTAAGAAACTCGGTTACTCAGGTGTAGACTTAAAAGATGAACATGAAATGGTCAGTCTAGACACGGAACATACGCCTAAACGTTTATTTTAATTTGGAGCAGATCAGCCGTGATTTTACGGCTGATCTTAAATAGCGTGTTCTGTTAACTTGGCTTTTTAGCTCGCTTTGTTTAACGCTTGTTCTACAAAATGTAGGCGATCTTGGCCCCAATACATTTTATCACCCACAAAGAATGTCGGTGCGCCGAAAATGCCACGTTGAATGGCTTGTTCTGTTTCAGTGATCAGTTTTTGTTTCACAACATCCGCCTGAACCATACTCATAATATCTTCTACAGAAAAACCACTTGGTTTTAGCACTTCTGCCAAGACAGTAGGTTCATTCAGATTTTGTGGTGTAGCAAACATCGCATCGAATAAAAGTTTTAAAACTTGCTCAAACTTTTCTAGGTGCAACAATTGAACGCCTGTCAAAATGCGCATTAGGGTTAAAGTGTTCATCGGGAAATGCGGATTCATTTGCATTGGAATATGGTAATACTCCGCCCAGCGCTGCATATCTAAGATTGAATAAACCCCTTTGACAGGAATCTCAATCGGACTACGATTGCCTGTTGCTTTAAACACCCCGCCCAATAAAATAGGCTTATAGACAATCTGAATCTCTTGCTGCTCTGCTATTTGCAGTAAACGATAGTAGGCCAAATAGCTATATGGGCTGCCTAAATCAAAATAAAATTCTACGCTTTTCATGCTTTGTCCTTTTACCACGTTTCCATCCAAGGTCTTAAATCTAACTCATGCGTCCATGCATCGCGCGGTTGTTGCGACAAATGCCAATAGTTTTCTGCAATATGCACGGGATTTAATATGCCATCGTGTTCTTTGCGCGCGTACATCTCAGGAAAAGTGTCTTTAATAAAATCGGTATCAATTGCACCATCCACCACCACGTGTGCCACATGAATATTTTTCGGGCCGAGCTCACGCGCCATACTTTGGGCTAAGGCACGCAGTGCATGTTTCGCCCCAGCAAAAGCGGCAAAGTTTGCTGCACCTCTTATTCCTGCGGTTGCACCCGTGAAAATAATACTTCCGTGTTCACGCACGACCATACGCTTCGCCACTTCACGCCCAGTCAAAAACGCGCCAAAGCATGCCATTTCCCAAATTTTAAAATACTTGCGTGCAGTTTCTTCTAAAATACTACATGGCACATTCGCTCCAATGTTAAACACCAAAACATCGATTTCACCAATATTGGCTTCAATTTCTTCCACCAAGGCGATGACTTGCTCTTCTTTACGTGCATCAGAAGCAAAACCATATGCAAGGCCACCTGCGGCTTCTATCTCTGCAATTAAGGGCTGGAGTTTTTCGGCATTTCTTCGCGTCATGCAGGCGATGTATCCACCACGTGCAAATCGTTTCGCGATTTCGCCCCCTGTAGCATCTCCTGCGCCAATCACTAATGCTACCTTCTTTTTAGCATCAGTCTTTTGCAACTGCTGTTCTGGCTGTAATCCATCCATAAATACACTCCCTTTATGAAATAACGATCGTTATCATAACGATCACTATGTTATAGTTTTCAGCATCAGTCAATTTTATTTTGATGAAACTCCTATGCGCTATAAAACAGGCTATAAAGAAGAAAAACGTCAAGAGCTGCTTAAAATCAGTGCTCAACTGGCCAAGAAGCAAGGCTTTACCAATACTGGCGTCGACGGTTTTATGAAAGCGGCTCAAATGACCAGCGGTGCTTTTTATTCGCATTTTTCATCAAAACATGAATTGTTTGAAGCACTGATCCAGTCCGAGTTACAACACAGCTTTCAAACATGGCAAGCCAATCCGCATGACAACCTCGAAGAGTGGATTGACTTCGAACTTGAACGCTATTTAGCGCTGTCTCATGTGCAACGTCCAGATCAAGGCTGTGTTATTCCCTCTCTTGCAGCCGAAGTAGCACGTAGTAGTGAAACAACAAAACTGTGTTTTCAACAGGAAATGCTTCGTGGTCACGCACTCTTTACACAACACCTAGGCAATGAAATACAAGCTTGGGCGGTACTGTGTCAACTGGTCGGTGCAATCGTCATGGCGCGGAGCATGGCGGATGAACATCTACAAAGAGAAATTTTAAGCTCAAGCAAATGGATGATTAAAAACATGCTGCAGCTCAAGTAAAATCTTGGATTGAATTTATAGTTTTTTTCTACATATTTTCTGATTTATTGCCTTCAACTTCTACGCATTTCCCTGTACATTTTTATACTTCTTTAACCCCTGTGAACGAGCCAGCTATGATGACACTACCCGATACCATATACGCGATTCAGCATCTTGCTTTTGAAGATTTGGGCGCATGGGAAGATGTGTTATATCAATTGGGTTATCGGGTACGATATTTTGAAGCCGGCAAAGATGATTTAGCTAAAGCATTGAACTACACAGGTCTAACCGTCATTTTAGGTGGGCCAATTGGGGTATATGAAACTGAAGACTACCCTTTCTTACAACAAGAAATAGACTTACTCAAAGTTCGTTTAGAAAAGAATTTACCCACTTTAGGCATTTGCTTAGGTGCACAGTTGATTGCACATGCACTCGGTGCAAAAGTATATGCAGGTCATAGCAAAGAAATTGGCTGGAGTCAGTTACAGCTCAATATCGTTGAACATAACCCATTACAAGCACTGGTAGGAACTGAAGTACTACATTGGCATGGAGACACCTTTGAACTCCCTGCTCAAGCTGAACTGTTGGCCAGCTCAGAAGTTTATCCCAACCAAGCTTTTCGTGTAGGCAAAACTATTCTAGGCTTACAGTTCCATCCTGAAGCCGCAGCAGACGGTTTAGAAAAATGGCTAATCGGGCATACTGCTGAACTTCGTCAAGCGAACATCAACATTCCAGCATTGCGTGCAGACAACCAACGCTGTGCAACTCAACTAGAACATGTCTCTGGACAAGTTTTAGCAGCGTATTTAAAAGCACTGGTTTAATAATTCAGCCATAATCCGTTCAATGTGTTTGTTGCTCTAACTTTTAAGTTTAGTGTCTTGTCCTGAAATAGATTGACAGTATTCCACTTCAAACCGAGTTAAGCAATTAGCTCGGTTTTAGTTTGCTCATACATCTGATTCGGGGTGTTCATATTTAAACAGAGGTGGATCAGGAAATTTGAACAACACTTATAAGTGATATTTTGCTCCCCAAATGATGTTATAAACATCAATATATGGAGTATTTTATGGCACGTAGACCAAGAAGAAATCATTCAAATGATTTTAAAGCTAAGGTAGCACTTGCTGCGATTAAAGCAGAAAAAACACTTGCTGAATTGAGTGCTGAATTTGATGTTCATCAAAACCAAATTATCGACTGGAAAAATCAACTGATTTCAGCTTCCTCGCAAGCTTTCGATCAATCAAAAGCTCCAACAGAACCACCCATCGATCTAAAAAAACTACATGCAAAAATCGGTGAGCAGGCATTAGAAATTGATTTTTTAGAAGGTGTGTTGAAGAAACTGGGCCGCTTCAACCACAAAAGTTAATCGATGACTCACTTCAGATTTCAGTATCTAAGCAAGCTCAGCTGCTGAAAGTCTCCCGTGGTTGTTATTACTATCGCCCAA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111 | Escherichia_phage(13.04%) | holin,transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2246154 : 2256929
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP022298|2246154:2256929|DBSCAN-SWA CATGAGCAATTCGGGAATCATAACTGATTTGTCCACCCTCACTCCCATGATGCAACAATACATGGGCGTCAAAATGCAACATCCGCACTCTTTGATGTTCTATCGTATGGGTGACTTCTACGAGCTGTTTTTTGAAGATGCACACAAGGCCGCTAAACTTCTCGGAATTACCCTGACCCATCGTGGCAAAGCCAATGGTGAACCCATCCCTATGGCAGGTGTTCCTTACCACGCAGCTGAAGGCTACCTTGCACGCTTAGTGAAAAAAGGCGAAACCGTCGTCATCTGCGAGCAAATCGGTGAAGTTACAGGCAAGGCTCCTGTTGAACGTGGCGTTGTCCGGATTATTACACCAGGTACACTGACTGACGATGCTTTACTGACGGCACATCAAAGTTCAAACCTTGTCGCTCTTTGCGTACAACAAAACGAAATTGGTATTGCGCTGTTAGATTTGAGTGCAGGTTTATTCAAAGTTCAGCAACAAGAGTTCCAACTTGAACAACTCGGTATTGAACTGTCTCGCCTCATGCCAAGTGAAATTTTGGTCGATGAAAATATTGTCGACCCCAATATCATTGAACACATTAAAAAACTGCTCGACTGCTCTGTGACACGCCGTCCAAATGTCGACTTTAACCTAAACAATGCACAAAAAACTTTATGTGATCAGTTTGCAGTATCGACTTTAGCCGGTTTCGGTATTGACCATTTGCCACTTGCAAAAGCGGCGGCGGCTTCGCTGATTCATTATGCCAAAGAAACGCAAAAAACAGCCTTACCGCATATTCGCTCTATTCAGCTTGAACAAAGCAGTGATTTCATTGCGCTTGACCCTGTGACACGTAGAAACTTAGAGCTAGTTGAGCCTCTGTTTGAACACGGCACGTCATTATTTCAACTCATCAATGACTGTCAAACGGCAATGGGTGGACGTTTACTTAGTCGTACACTGATGCAACCGTTACGTGATACCAAGCTCTTAGACGCACGTTTAGATGCCACCAAGAGTCTTGTGGATGGTTACCATGAATCACCAGTCCGTTTAGTATTAAAAGAGATTGGAGACATCGAACGTGTCCTCAGTCGGGTGGCTTTAGGTAGCGCCCGTCCGCGTGACTTAGTGCAACTGCGCCAAGCCTGTGCGCAAGTCCCTTATTTACGTCATGCCATTCAACCCGTGATCCAAAGCAAACAGTCCGCACTCATTACCCAATTGAATGAGGAATTGGGTGATTTCCATGGCTTACATCAACGTTTAATGTCTGCCATCGTTGAACATCCACCTGTGCTTTTACGAGATGGAAATGTAATAGCCGAAGGCTTCGATCATGAACTGGATGAACTCCGTAAAATCCGCGATCATGCAGGACAGTACTTGATCGACCTTGAAATTCAAGAACGTCAAAATACTGGAATTTCGACCTTAAAAATTGGCTATAACCGTGTCAGCGGGTATTACATTGAACTGACCCGTGCGCAAGCCGAACAAGCGCCTGATCACTACATTCGTCGTCAAACCTTGAAAAATGCTGAGCGTTATATCACGCCTGAGCTAAAAACCTTTGAAGACAAGGTACTTTCGAGTGAATCCCGTGCATTAGCTCGCGAAAAAATGCTGTTCGAAATGCTTTTAGATGAACTGCGCGCCGATATTGGTCATTTACAAATGATGAGCAGCGCTATTGCGCAGATTGACCTCTTAGCCAACTTTTCACATCAGGCTCGCTTACGCAATTGGTCACGTCCTGAGTATAGTCCAGAAATTGGGGTTAAAATTATTGCGGGACGTCATCCAGTGGTTGAGGCTTTGAATAAGGCTACATTTACACCGAATGACACGACACTTGATTTCAACCACCGTATGGCCATTATTACTGGTCCTAACATGGGGGGTAAATCAACCTTTATGCGTCAAACGGCTTTAATTTGCTTATTGGCCTATTGTGGCTCATATGTACCAGCCCAATCAGCAGTCTTAGGTCCTATTGATCGAATCTTTACCCGTATTGGTTCTGCGGACGACCTATCTACAGGCAAATCGACCTTTATGGTGGAAATGACTGAGACCTCGCAAATCCTACATCATGCAACCAATCAGTCGCTGGTTCTGATGGATGAAGTTGGTCGTGGCACCAGTACCTATGATGGTTTATCCTTGGCATGGGCTTGCGTACTTGACTTAACCAAACGCATTAAATGCTTATGTTTATTTGCCACACATTACTTTGAACTAACCGAGCTAGCCAAAGAAACTGCTATTGATAACTACCATGTCACCGCAAAAGAACTCAATGGCAACCTCATTTTGTTACATAAAGTCCAACATGGGCCAGCGAGCCAAAGTCACGGCTTACAGGTAGCAAAATTGGCGGGTATTCCTGCCAGTGTGATCAAAGAAGCACAAAATCGTCTGAAAATTTTAGAGAAGCAACAACTGCAAAAACCTAAAGTCGTTCAAAATGATTTGTTTGCCGCGATAGAAACACCTGAACTTGAAATCATTGAACGTGTGGTCGAAATTGAGAAGCCTTCTGCCGCACTTGAACTACTCAAGAGCATTGATGTCGATAACTTAAGTCCACGTGAAGCCTTACAGCAGCTTTATGCATTAAAAGATCAGTTACATTCATAGTAGTTTTCTATTTTTGTAAACCGTCTAGACCGTCAAAATGACGGTCTTTTTTATTGTAAAAAGCAATTTTCAGCAGAATGTTCAGTTTTTATCAAATTTAACAGCCGTGCATATAACAAATATCAATAAAAGCAATTGTTAGTTGGTGCTGTTTTTGCCTAAAATACACATTAGTTATTAGAACCATATTTTTAGGTAGCCTTCGCCATGACCTTTGTTGTCACTGAAAATTGTATTAAATGTAAATATCAAGACTGCGTAGAAGTTTGTCCAGTAGACTGTTTCTATGAAGGTCCAAACTTTCTAGTGATCAATCCGGATGAATGTATCGATTGCGCACTTTGTGAACCTGAATGTCCAGCAAATGCAATTTTCTCTGAAGATGAACTGCCAGAAGGTCAAGAAGTATTTATTGAACTAAATGCTGAGTTATCACAAACTTGGCCGAACATTACCCAGATTGGTGACCAACCTGCTGACCGTGAAGAATGGAACGGTAAAGCAGATAAGTTACAATACTTAGAAAAGTAAGCCAAAAAAAGATCAGCATAAGCTGATCTTTTTTTATACCTAAAACACACATTTGATTGCAATATTTCCAATTTTTCCTCACAAATTTGGATTAAAATAATAGGCGTATATTTTAAATATTTGATTTCTATAATGAAGAAATTTTTAAAGGGATTATTTGCGGTTAGCATAATCCCCTTGGTGATGATTGGCTGTACGACTTCATCCCACAAAGGACAGACCATCACAACTCCTGATGGAAAACGTATTTTTATCCCACAAGAGAAAATTAGTTTTGACCGCCCTGCTCCACCTAAAATTATTCCTTATACCTACAATGCTTGGATGTCTGTCGGTGACACGCTAGCACGCGTACGTGAGTATGAAGTTTTTCTTGAACGCAATGGCGTGGGAAATATCATCCCAAGCTTTGAACTGCTCAGAACAGCACGTGACTGGCAAAAATGTGGTCGAGCACAATATATGGTACCCAATCGTGAACTTTGGAAAAACCAAATTGCGACCTTAAAAGTGTTCAAATATTTAGTTGCAGCCAAAGTACTGACCGATTTTGAAGTCACTTCGGTTTATCGTGACCTGCCTTTAAACCAATGTGCAGGCGGTGCAAACTCATCACGCCACTTATTCAATTCTGCCATCGATTTTCGAATTGGGTCTGAAAACCCACAACCTGAAGATTATGCTTATATTGAAAATACAAAATATCGTCTATGCCAATTTTGGACCCAACATGGTCAGAGCTTGAACATGGGCTTAGGTTTATATGCTTCTGGCCAGATTCACATTGATACACAAGGATATCGTACATGGGGCCCAGACCTCAGTCGCAATTCTTCGATGTGTAGTTACTAATCTTTAAAAATTAAAAGGGGTCAATATGACCTCTTTTTTTTTGAGCATTGATTTCAACAAATATGGTCGGAAAAATTGCACTCTGAAAATAAAAGTTTAAAATGCTCCACATCGCAACCAAGGTGAACATGCTATGCAACAAATGTGGACAGAGATTGATAACTATATCGATGCACATTTAATTCCTGAAGATCCCATTCTACTGCAAACTTTAGAAAATACAGAGAAGCATGGTTTTCCAGATCACTTAGCTGTTGCACCGAACCAAGGTATGCTTTTACAGATGTTGATTCAAATGAATCAGTGTAAACGTGTGCTAGAACTCGGCACTTTTGCTGCCTATAGCACCATGTGGTTAGCGCGCGCCTTACCTGAAGATGGTTATATTTTAACGATTGAAGGTCGTGATACGCATGCCGCGATGGGCCAAGAAAATATCGACAAAGCTCAGCTCAAACAAACCATTGAACTCAAATGTGGACGTGCAGCAGATATCCTTAAATCACTGCCTGCAGACATTGAACCTTTCGACTTTATTTTTATTGATGCCGATAAACAAAGCTACCCAGAGTATTTGGAATTAAGCCTGAACCTATCTCATTCAGGTACTTTGATTTTCCTTGATAACGTGATTCGTGCAGGCGATATTATCAATCCTGAAAATCATAAACCAAGTATTGAAGGGATTCGAAATATGTTCAAAGCGATGCAAAACCATCCGAAAATTTTGTCGTGCACCGCACTTCAAACTGTTGGTAGCAAAGGACATGATGGATTTGCCTTAGCTATTGTAAAATAAGCTAAAACTTAGATTAAAAAACAATCGATTAATTTAAGCTTATATAAATTATAAACTTACATTTACTGTCCATATAGTTATCCACAATTAATGCGGATAACTATGGATAAAACAGTTTCAATTTAGAGAAATCACTCTAAATTAACGGGCGACCAGTAAAGGAACTTTGGCATTCCTAAAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP022298|2246154:2256929|2255408_2255948_-|AZN64538.1|DBSCAN-SWA MASYILLEQARYVEALVLDVDGILSDGFVTLTNSGDEIKSFDIRDGLGMKLVQQAGVKVIIITGRKSQIVEKRMSDLGVDLVYQGREDKGVALREACAKFGISPEDCLYMGDDWPDLSAFAIAGMKVTVPNGHLEVRRRADLVTQAMGGRGAVREICDMILQAKGVYETLLEKYTAVPH >CP022298|2246154:2256929|2252082_2252694_-|AZN64533.1|DBSCAN-SWA MTDPLLKYREQHKHRLNYMPWLYWSLKPKNRVWAEEWQQEYQAYLMEMETVEIGQNCFISPLAHIFAEPGRKIVIGDNTFIAADCTLHGPLDIGSEVAINHHCILDGGRVGIKLHDQVRIAAYCHLYAFDHGMALSNPIYQQPVRSQGIEIGRDVWLGAHVGVKDGVKIGAHAVVGMNSMVTKDIAEQSIVAGNPAQFIRLRD >CP022298|2246154:2256929|2254831_2255374_-|AZN64537.1|DBSCAN-SWA MDTKVLYITAVAIAAISSGYYYYSGKGQKLEVDGAQSMTYSAEQIQLTQTDEEGNLYVRAKVDRLEQDMQKKTSKLENLNAEMYKDGKVDATFYAKQANGINDNEKVVLTNQVVAKKMLDQGQMQFETAELTAFPQTRELESQHQVVVTTPQAEFVSQGLKANLNTGQYDFFHIRGKYEP >CP022298|2246154:2256929|2255951_2256929_-|AZN64539.1|DBSCAN-SWA MSNPIDFQKVALETLEIERQALSVLAKQIDDRFSRACEIILKCKGRLVITGMGKSGHIGRKMAATFASTGTPSFFMHPGEAGHGDLGMLVAGDVLIAISNSGKSDEIMMLMPLIKYLGVPLITISGDDRGPMPQNADVALTLGNIQEACPLGLAPTSSTTATLALGDALAVALLDARGFTSDDFARSHPAGALGKRLLLHVKHLMHTGDELPKVSPDTAMNKVLYEISNKRLGLTTIVDDNDHLLGIFTDGDLRRLIDKQQGFDVNLAVSDVMIKSPLTISPEARAVEALERMNEKKINQFVVVDESNKVIGVLSMHDLIQAGVN >CP022298|2246154:2256929|2253529_2254276_-|AZN64535.1|DBSCAN-SWA MEQTLNQPQTLCIKHLAKNYSKRWVVKDVSFSMQSGQIVGLLGPNGAGKTTSFYMVVGLVRMDKGEIHLDDLDMSDLAMHERARKGIGYLPQEASIFRKLTISENIMSILETRKDLNKEQRKQRLHELLADFKISHIKDSLGMSVSGGERRRAEIARALAADPKFMLLDEPFAGVDPISVGDIKDIIRTLKDRGIGVLITDHNVRETLAICERAYIVSEGAVIAEGSPDEILANETVRQVYLGDDFTV >CP022298|2246154:2256929|2246154_2248788_+|AZN64528.1|DBSCAN-SWA MSNSGIITDLSTLTPMMQQYMGVKMQHPHSLMFYRMGDFYELFFEDAHKAAKLLGITLTHRGKANGEPIPMAGVPYHAAEGYLARLVKKGETVVICEQIGEVTGKAPVERGVVRIITPGTLTDDALLTAHQSSNLVALCVQQNEIGIALLDLSAGLFKVQQQEFQLEQLGIELSRLMPSEILVDENIVDPNIIEHIKKLLDCSVTRRPNVDFNLNNAQKTLCDQFAVSTLAGFGIDHLPLAKAAAASLIHYAKETQKTALPHIRSIQLEQSSDFIALDPVTRRNLELVEPLFEHGTSLFQLINDCQTAMGGRLLSRTLMQPLRDTKLLDARLDATKSLVDGYHESPVRLVLKEIGDIERVLSRVALGSARPRDLVQLRQACAQVPYLRHAIQPVIQSKQSALITQLNEELGDFHGLHQRLMSAIVEHPPVLLRDGNVIAEGFDHELDELRKIRDHAGQYLIDLEIQERQNTGISTLKIGYNRVSGYYIELTRAQAEQAPDHYIRRQTLKNAERYITPELKTFEDKVLSSESRALAREKMLFEMLLDELRADIGHLQMMSSAIAQIDLLANFSHQARLRNWSRPEYSPEIGVKIIAGRHPVVEALNKATFTPNDTTLDFNHRMAIITGPNMGGKSTFMRQTALICLLAYCGSYVPAQSAVLGPIDRIFTRIGSADDLSTGKSTFMVEMTETSQILHHATNQSLVLMDEVGRGTSTYDGLSLAWACVLDLTKRIKCLCLFATHYFELTELAKETAIDNYHVTAKELNGNLILLHKVQHGPASQSHGLQVAKLAGIPASVIKEAQNRLKILEKQQLQKPKVVQNDLFAAIETPELEIIERVVEIEKPSAALELLKSIDVDNLSPREALQQLYALKDQLHS >CP022298|2246154:2256929|2251111_2251954_-|AZN64532.1|DBSCAN-SWA MKRVIACIDSSPCINALAEAAAWIAKQTGRELVLLQVLDYYPASYHLGEISGVIGFESNAMLLKELAELEQKQSELALSYSNNLLDHISKLILETHGLHTTHIQEKGDFLEQSFNLLHEDDIVVIGRVGEKSAERNKPLGSNVENFIRGANCTVMTVGDSFKPPTRFIFAYEYSPTCVKMMKRIAQSDLLRLLQCHLVYVGDHPEILREPEQYLKDANLDVITEYRYGDVAENILEYQNEHGIQLIVLGAFSHSKIHQFFLGSIATTIFRNAKVPLLVAR >CP022298|2246154:2256929|2252686_2253283_-|AZN64534.1|DBSCAN-SWA MPFTISSLVSYEEDIKKSRFQAFAVPVENEQAVKDFLEQYKDIGTTHQCWAWKIGHNVRFNDDGEPSGTAGRPILATIEGNELTNILVLVNRWYGGVKLGTGGLVRAYGGTAGQCLLLAEKIELIEKKKVYFACQFNEWAIFQYELNSQQIEFNEQYTADGVLVEALLQVHQIEALALKIQDVTRGREALKIVDDHHD >CP022298|2246154:2256929|2254275_2254842_-|AZN64536.1|DBSCAN-SWA MNHNPKFSISKTFLKQTLALSLGVAVSTFALALPSDRSKAISLVADRATFNEKTGVTTYTGNVIIEQGTMKLQADSIVANLNQTRQISTITANGKPARFQQQVSTNKGIAKGQAQKIIYNAETGIITLSGSALLEQDGASIRGNTLRYSMNKGDIEAIGTPNNSGSSSGRVQIVIPPSSSQSFPGARD >CP022298|2246154:2256929|2249451_2250171_+|AZN64530.1|DBSCAN-SWA MKKFLKGLFAVSIIPLVMIGCTTSSHKGQTITTPDGKRIFIPQEKISFDRPAPPKIIPYTYNAWMSVGDTLARVREYEVFLERNGVGNIIPSFELLRTARDWQKCGRAQYMVPNRELWKNQIATLKVFKYLVAAKVLTDFEVTSVYRDLPLNQCAGGANSSRHLFNSAIDFRIGSENPQPEDYAYIENTKYRLCQFWTQHGQSLNMGLGLYASGQIHIDTQGYRTWGPDLSRNSSMCSY >CP022298|2246154:2256929|2250304_2250970_+|AZN64531.1|DBSCAN-SWA MQQMWTEIDNYIDAHLIPEDPILLQTLENTEKHGFPDHLAVAPNQGMLLQMLIQMNQCKRVLELGTFAAYSTMWLARALPEDGYILTIEGRDTHAAMGQENIDKAQLKQTIELKCGRAADILKSLPADIEPFDFIFIDADKQSYPEYLELSLNLSHSGTLIFLDNVIRAGDIINPENHKPSIEGIRNMFKAMQNHPKILSCTALQTVGSKGHDGFALAIVK >CP022298|2246154:2256929|2248995_2249319_+|AZN64529.1|DBSCAN-SWA MTFVVTENCIKCKYQDCVEVCPVDCFYEGPNFLVINPDECIDCALCEPECPANAIFSEDELPEGQEVFIELNAELSQTWPNITQIGDQPADREEWNGKADKLQYLEK |
12 | Indivirus(14.29%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2938780 : 3026818
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP022298|2938780:3026818|DBSCAN-SWA 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90 | uncultured_Caudovirales_phage(32.35%) | transposase,terminase,head,tail,tRNA,portal,capsid,integrase,protease | attL 2971004:2971021|attR 3011339:3011356 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
3399560 : 3448139
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP022298|3399560:3448139|DBSCAN-SWA 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MQSELFKIPAFPEQANATFKFIDLFAGVGGFRMALQNLQGNCVFSSEWNKSAQETYEKNYGEKPAGDITLEETKAQIPQYFDILCGGFPCQAFSIAGYQKGFQETRGTLFFDIAEIAKKHQPRAIFLENVKNLLTHDKGNTFQVIKNTLRELGYEVYFQVLNSMTHANVPQNRERIFIIAFHEQQVPNHSEFKFPDEIPLTKTIHDFLEKEKVDQKYYYKEDHMYYPTLAESMTSRDTLYQWRRVYVRENKSNVCPTLTANMGAGGHNVPLLIDDFGIRKLTPKECFAFQGYPVDKMVFPEKMANSALYMQAGNSVTMPLIQRIGEQILKVIK >CP022298|3399560:3448139|3432095_3433055_-|AZN65601.1|DBSCAN-SWA MEQLNPSDLKAILYSKRANLYYLEHCRVMQKDGRVLYLTEAKNENQYWNIPIANTTVILLGTGTSITQAAMRMLASAGVLVGFAGGGGTPLFMGCEIEWMTPQSEYRPTEYMQGWMQFWFDEAKRLDVAKHFQLARVEYIQKIWSKDRDLKEYTFHVDDLDIQQALTGYAARISQQTKVGDLLLAEAATTKQLYKIAATRTGLKDFSRNPEQGDLANDFLNHGNYLAYGLAATTLWVLGIPHGFAVMHGKTRRGALVFDVADLIKDAVVLPYAFICAKEKMTEQEFRQQILQKFTEHKCLDIMFDQVKAQAGKNHDVDG >CP022298|3399560:3448139|3422616_3423210_-|AZN65592.1|DBSCAN-SWA MIESWLFVLAMIAVLMIPGPTNALLASSAHQQGLAKTSLLVPAELFGYFYAINLWALLIHLSTPTWPYLIDLLHALSTVYVFWLAFHLWKSSHLEKHNQRFTSIRPKQLFFSTLKNPKAVLFAAGIFPYEAWDNPTNFFLVFAVFSLVLLPTALFWMSFGRAILSGESKQIKADLLYKGSAMLLLVCMFPVILRFFA >CP022298|3399560:3448139|3400746_3400953_-|AZN65574.1|DBSCAN-SWA MVSEGASDSSQDLAYTSIDKNQKNNVLLFDVINGEIQVINLKRKAFNISDCDEYSSDTNAEKILVLWI >CP022298|3399560:3448139|3434255_3434846_-|AZN65603.1|DBSCAN-SWA MNQTSNYYNQHAQAFFENTYQVEMESLYTPFLRYLPEQALILDLGCGSGRDTLAFKKKGYQVEAIDYSIELVEKARELTGIEVRQQSFYELNEVAKYDGIWACASLLHCERDRLTEVLGRLFKALKPNGVCYMSFKYGNTDREKEGRSFTDLNEQQAHDLLKQIDQALLLQQWITVDKRPDRTEEWLNILIRKMQA >CP022298|3399560:3448139|3434997_3435327_+|AZN65604.1|DBSCAN-SWA MGFRFRKSIKILPGLKINLTHKGISSASIGKPGASLNVGKKGTRTSVGIPGTGLSYSKHQPYKKRVGNQKNPTQEQQPFYTSRTEQPKSNVWIWVVFGLFCFIVGAIIF >CP022298|3399560:3448139|3420837_3421173_-|AZN65590.1|DBSCAN-SWA MTTLSLAAGAWAKDDHIILQEAAKNHVSVSAIAKLKDETAVTLKGTLLKHLNEDHYEFSDGIGDILLDIDDDLWKASNIKAGDKVQVVGEVDTHRYKPTDIEVVKIEKVLK >CP022298|3399560:3448139|3424750_3425143_-|AZN65595.1|DBSCAN-SWA METQLLIKIVHMSAVSLACVVILARAMTLFKGVQGNQPNPAGRTAFVALQHLSMLVIVLTGIVLLVMKNFDVQTWFYAKVVLFLVMLSSLSKAYKKEDSILLTQRRAGLFLAVVAMISILGLVMIKPNFG >CP022298|3399560:3448139|3437722_3438397_+|AZN65607.1|DBSCAN-SWA MDLTSELLLKFPATQISTLKNFKKRRITIHPQAYGFNLCYLNMFKNLTADLDISNRIKELHVWKTSEFDDYSIFNNINLYLSYLKQDINEVTLIIHHQQSFSEDELAFLMELCSREFIQFIKSTKFDIRSLNPRKTLHLINTHLSRQTLLTLNKESSLKPHHQMSLELLAQLLSCSRNQLNQRTKNIKQQRTHIFNELSLNSRCVKELVDHSDSCISTEKIWRS >CP022298|3399560:3448139|3415426_3416374_-|AZN65586.1|DBSCAN-SWA MTNNNYTELSHSDDCEKYVNQFIQEFPLRSAEIGQGTVIKRALPSRHKRMIGAWCFLDHAGPVTFPQGDGLDVGPHPHIGLQTFTWMIEGTMMHTDSLGSKQLIRPKQVNLMTAGHGISHTEVAPDTETKMHAAQLWIALPDAKIAVEPRFDHYPELPVVEKDGVEFTVLVGAFLNTTSPVSVYTELLGVDLSAAESTKTRLTLNPNFEYGFMALEGTATVNGHELTEDNMVVLEQGVSAIEIEIHAGSRLLLLGGEPFESPILLWWNFVGRTQEELKIARDQWIAQDERFGFIPDYEGPRLEAPAFPDQMRASK >CP022298|3399560:3448139|3399560_3400649_+|AZN65573.1|transposase|DBSCAN-SWA MSLVASESLPINVSERQACDVLNVCRNSMRAARRRYYFCGPPSPYRRKRTKTAQPKALSTQEREHVKELLGSDEYVNQPPVQVYYRLLQQSIYLCSISTMHRILREAEMNGERRQQRPGCAQPVPRLQATGPNQVWSWDIAKLATQKRGEYLSLYVVMDLYSRYIVAWMLSRKENSALSSQLITQAHERYAIEPGALTLHQDRGAPMTAHCYLDLLGELAVTASHSRPRVSNDNAFSEAQFKTMKYQPDYPRRFDSYQHAMLWCEDYVSWYNNDHHHSALGGFTPQQVFTGQHVEIAKVRQATLDEAFAKHPERFSRGRPTVPMPPQEVCINPVPVGADQETIEKGVNFPTLPRAIEKQLNF >CP022298|3399560:3448139|3440787_3441931_+|AZN65609.1|transposase|DBSCAN-SWA MEYFMARRPRRNHSNDFKAKVALAAIKAEKTLAELSAEFDVHQNQIIDWKNQLISASSQAFDQSKAPTEPPIDLKKLHAKIGEQALEIGFFRRCVEETGPLQPQKLIDDSLQISVSKQAQLLKVSRGCYYYRPKPVSASDLKLMRCMDELHMQYPFAGSRMMRDLLNRQGHHIGRRHTRTLMKKMGINALYCKPNLSQANQAHRKYPYLLKGLAIQRSNQVWSTDITYIPMAKGFVYLCAVIDWHSRKVLAHRVSISMEVTFCIETLNEAIEKYGRPEIFNTDQGSQFTSDAFIDVLKSNDIQISMDGKGRWVDNVMVERLWRSVKYEEVYLKAYSNVLDAKKQLNAYFEFYNLKRPHSSLDKMTPDEFYYDQLPQQNKVA |
39 | uncultured_Caudovirales_phage(30.77%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022300_1 | 4124-4196 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022300_1
|
1 spacers
spacers of CP022300_1
>1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder AGGCCAAAGAGGACGGCTTTAATGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022300_1
The CRISPR arrays of CP022300_1 >merge|CP022300|1|4124-4196|CRISPRCasFinder GTGAGACAAGTCCATCCGTATTACAGGCCAAAGAGGACGGCTTTAATGCGTGAGACAAGTCCGTCCGTATTAC >CP022300|1|1|4124-4196|CRISPRCasFinder GTGAGACAAGTCCATCCGTATTAC AGGCCAAAGAGGACGGCTTTAATGC GTGAGACAAGTCCGTCCGTATTAC
>CP022300.1|AZN65845.1|2320_2644_+|partition-protein MIMDMNSVGVVGPAGFKELLAANSVQDTVIRCQDEGLVIALKVGGKDFVLGLSRGGVRYFRSFDAAASMLIQNGICRFESDLTGWHPRMFAKNKKGGNLLGSTGDEL >CP022300.1|AZN65844.1|2008_2233_+|chromosome-partitioning-protein-ParB MSKSISTLSAGRPSVRNDKAKAATLASLADDAGGMKRVNFELSPALHSKLKIYAAKQGMSIKELLTHYVDSLPE >CP022300.1|AZN65843.1|1347_1980_+|peptide-transporter MKVIAVLNQKGGSGKTTIATHLARALQLDGADVLLVDSDPQGSARDWAAVREDQPLTVVGIDRPTIDRDVKNVARKVDFVVIDGAPQAADLAVSAIKAADFILIPVQPSPYDIWATSDLVDLVKQRIELTDGKLQAAFVVSRAIKGTRIGSEVAEALAGYELPILDARITQRVSYPGTAAAGSTVMDAEPEGDAAKEIRALMAEIAQKLV >CP022300.1|AZN65842.1|413_1268_+|resolvase MNKNATTGLLLGYARVSTDDQDLTNQRAELQAAGCIKLFSEKITGTRRDRPELARMLDHLRPGDVVTVTRLDRLARSTRDLLNIAERIQGAGAGLRSLAEPWADTTTPAGRMVLTVFAGIAEFEHSLIIDRTRGGREAAKARGVKFGPKPTLTAAQIDHARELIDLEGRTVKETAALLGVHRSTLYRALERSEEVTLAEAKRRGAFREDALSEADAVAAVGDLVERQEEMPFFDDESGPSDDLPPPPYRTQSLPETLAALTDDELASWPGDFADEERARRQLLK >CP022300.1|AZN65847.1|4448_4700_+|hypothetical-protein MPVPAALDALGVYWKRDPDFVPVKDKMTVRLNVSLGGGVVELLATGPKWYDTRAEKGGGGAVDLAMHLLRLDFVNAVKRLQSN >CP022300.1|AZN65848.1|6268_6781_-|signal-peptidase-II MLIIGKKLSPYALLSMSGLLAASDQAVKWLVQQSMAYGEYVSVTPFFNWVHLWNTGAAFSLFANGGGWQRYFFIGIAVVVSIFLINLILENRHKGEAIAYSLILGGALGNLIDRVFRGYVVDSFDFYWRDWHWPAFNLADIAIVLGALLFVSSSLLGKKANTNAESDGSD >CP022300.1|AZN65849.1|6784_7681_-|sodium:proton-antiporter MSKSCGGACGGDATSAADTDIQASSEAPGRWVSVYAVPKMDCPSEERMIRLALNGFEEIRALSFDLSNRRLKVVHDGEVEPVTSKLKTLGLGASLQETVAANPETIKAAEFSAASAKQESGTLRWLLGINALLFVVEMTAGLIARSTGLIGESLDNFADAAVYGLALYAVGHSVKMQVRAAHLAGVLQLILAVGVLVEVVRRFVFGSEPESLVMMAIAFVALIANTSCLLLISKHREGGAHMKASWIFSANDVVINLGGITAGALVAWTGSNYPDLIIGTIAGGIVLNGARRILALKG >CP022300.1|AZN65850.1|7776_8184_+|Cd(II)/Pb(II)-responsive-transcriptional-regulator MRIGQLAQLVGVETQTIRFYEQQGLLPPPDRQDNGYRVYTEKHGEGLSFIRRCRILGLSLAEIHELQSYQDDPHQPCTAVNALLDDHISHVRSQITALQALEKQLVSLRASCNDDREVEACGVLAGISEGNMHQQ >CP022300.1|AZN65851.1|8275_9262_-|ferredoxin-NADP-reductase MPIIKINNNPISIQSSTDHSMLTDLLNAGIGYPYECVTGKCGLCKFELIQGNIIKTEENPTGLSSRDLKKGNRYLACKCKLNSDLDIKVKLDNKFIQKTKISKIRSSVISKELLTHDFIKITLKPDENMSWLPGQFCLLSDPLLPSIDRAYSIANNYIKDGHIDFYIKRVPDGIFSNHIFDKINIDSTLILKGPFGHSYYQRSNRKLLIIGGGSGLSYAASIAKQAFSEGKDFLFYYGSRSTQDIPNWSSLVFTNNEIIDIKTVLSQSNNEWTGPTGFLHEVVNEDLGASLCEFDIYLAGPPVMVECSIKSFFDQGVPSENIHYDSFY >CP022300.1|AZN65852.1|9274_9589_-|hypothetical-protein MNVTDLRQRITNSVGEDSGLNAKVKFDLGNNEVIFIDGISIPNNVHDSDIDSDITIKIKPENLTKILDKELNPKLAIMTGRMKLRGDIKIALRLDKVFGLEPSE >CP022300.1|AZN65853.1|9601_9922_-|(2Fe-2S)-binding-protein MNKKWVKACMESDILENSIFKFSRPGKSPIAIYRIEGKFYATEDTCTHGIASLSEGEIDGDVIECPFHGGAFNICTGEPESEPCTVALKTYQVDIVNNEVLILEEQ >CP022300.1|AZN65854.1|9931_10753_-|alpha/beta-hydrolase MKSIDYSEKYLNADGIETRYLEAGEGSPVILIHGGGAGAESEGNWKGVIPILAENFKVYAVDMIGFGKTAKPKIEYSQQIRTKHLVSFIKALGLEGKVSLVGNSMGGATALGVCVERPELVKNLVLMGSAGLVVELHEDLKPIVNYDFTETGMYKLVEALTNDDFQIDPKMVKKRVEYALDAETREAYASTMTWIKQQGGLFYPDEYIKKVKVPTLVVQGKEDKVVPITTAYKFLDLIEDSWGYIIPKCGHWAMIEHPTDFANATELFLKLRT >CP022300.1|AZN65855.1|10739_11546_-|catalytic-subunit-of-meta-cleavage-enzyme MANIVSSCATSHIVMSANGCEDQARNVIEGMKKLGNIIKKSKPDIILIISSDHMCNFDLSLQPRFAIGISDEYTTMGDMDIPIENIKGSRLLANTIVETADQDGFDLCQSEELKLDHGIMIPLTFMDLKNYPIVPLIVNINTSPMAEASRCVSLARTIKKSINELDEKLNISVIAAGGLSHWLCIENHGEVSEKFDHMIMDRLCNGEQEIITNMGNERIIQEGGNAGIEILTWLMASEISGNVSGEKIYYEPMRKWFTGVGGINFEVN >CP022300.1|AZN65856.1|11538_11814_-|hypothetical-protein MSNYKIDKIVQRIIKETQFREKLLENIDYLKELNLTNEEFNALVKAEPALLSAVGMHPILQMHYMMFRTPEIGIHVSVNDCLAIKNGDYHG |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP022300_2 | 4842-4972 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP022300_2
|
2 spacers
spacers of CP022300_2
>2.1|4862|35|CP022300|PILER-CR ACCAGGCTTTTTAGATCAATTTGTGAACAACTTAC >2.2|4917|36|CP022300|PILER-CR AGTAGCCGGCGACTCTCTACAGGGCCTTCCAGCTTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP022300_2
The CRISPR arrays of CP022300_2 >merge|CP022300|2|4842-4972|PILER-CR AAATAAAGTTTGATCAAAAAACCAGGCTTTTTAGATCAATTTGTGAACAACTTACAAATAAAGTTTGATCAAATTAGTAGCCGGCGACTCTCTACAGGGCCTTCCAGCTTAAAATAAAGTTTGATTAAAAT >CP022300|2|1|4842-4972|PILER-CR AAATAAAGTTTGATCAAAAA ACCAGGCTTTTTAGATCAATTTGTGAACAACTTAC AAATAAAGTTTGATCAAATT AGTAGCCGGCGACTCTCTACAGGGCCTTCCAGCTTA AAATAAAGTTTGATTAAAAT
>CP022300.1|AZN65847.1|4448_4700_+|hypothetical-protein MPVPAALDALGVYWKRDPDFVPVKDKMTVRLNVSLGGGVVELLATGPKWYDTRAEKGGGGAVDLAMHLLRLDFVNAVKRLQSN >CP022300.1|AZN65846.1|2829_4176_+|replication-protein MAVAQLALFDGAEEARAYHDPGRSGFFSILVDVNGDKRQSSHRLIEMPTVLGLIDKTRDTWLTQAEFIRPNRRVVNLARIGLLFADLDTYRIPGLTGRTPDALAASVLYHCHQEGIPTPSMLIFSGRGIQAKWLLDSPVPRQALPRWNACQKYLVDRLASVGADVGAKDASRVLRLVETVNTKSGEACRVVHVENGTDGQPIRYGFEYLAEVLLPVARWEIEQQRRERAERRQLKLLPGAKTDNLRGFSGRQLAWHRLEDLRKLATLRGGVGEGERMKHLFWRLNFLLLSGATHSGAMYHEATALARELAPHWNDYRSKELMTLYAKAKQYEAGEKISFGGKEYAPLYTPRNDTLISLFQITDAEQAELRTVISKGVARERDRKRKEGHRRAAGAVDRETYESQSASRQKPWEALGMSRASWYRAGKPLPASETSPSVLQAKEDGFNA >CP022300.1|AZN65845.1|2320_2644_+|partition-protein MIMDMNSVGVVGPAGFKELLAANSVQDTVIRCQDEGLVIALKVGGKDFVLGLSRGGVRYFRSFDAAASMLIQNGICRFESDLTGWHPRMFAKNKKGGNLLGSTGDEL >CP022300.1|AZN65844.1|2008_2233_+|chromosome-partitioning-protein-ParB MSKSISTLSAGRPSVRNDKAKAATLASLADDAGGMKRVNFELSPALHSKLKIYAAKQGMSIKELLTHYVDSLPE >CP022300.1|AZN65843.1|1347_1980_+|peptide-transporter MKVIAVLNQKGGSGKTTIATHLARALQLDGADVLLVDSDPQGSARDWAAVREDQPLTVVGIDRPTIDRDVKNVARKVDFVVIDGAPQAADLAVSAIKAADFILIPVQPSPYDIWATSDLVDLVKQRIELTDGKLQAAFVVSRAIKGTRIGSEVAEALAGYELPILDARITQRVSYPGTAAAGSTVMDAEPEGDAAKEIRALMAEIAQKLV >CP022300.1|AZN65842.1|413_1268_+|resolvase MNKNATTGLLLGYARVSTDDQDLTNQRAELQAAGCIKLFSEKITGTRRDRPELARMLDHLRPGDVVTVTRLDRLARSTRDLLNIAERIQGAGAGLRSLAEPWADTTTPAGRMVLTVFAGIAEFEHSLIIDRTRGGREAAKARGVKFGPKPTLTAAQIDHARELIDLEGRTVKETAALLGVHRSTLYRALERSEEVTLAEAKRRGAFREDALSEADAVAAVGDLVERQEEMPFFDDESGPSDDLPPPPYRTQSLPETLAALTDDELASWPGDFADEERARRQLLK >CP022300.1|AZN65848.1|6268_6781_-|signal-peptidase-II MLIIGKKLSPYALLSMSGLLAASDQAVKWLVQQSMAYGEYVSVTPFFNWVHLWNTGAAFSLFANGGGWQRYFFIGIAVVVSIFLINLILENRHKGEAIAYSLILGGALGNLIDRVFRGYVVDSFDFYWRDWHWPAFNLADIAIVLGALLFVSSSLLGKKANTNAESDGSD >CP022300.1|AZN65849.1|6784_7681_-|sodium:proton-antiporter MSKSCGGACGGDATSAADTDIQASSEAPGRWVSVYAVPKMDCPSEERMIRLALNGFEEIRALSFDLSNRRLKVVHDGEVEPVTSKLKTLGLGASLQETVAANPETIKAAEFSAASAKQESGTLRWLLGINALLFVVEMTAGLIARSTGLIGESLDNFADAAVYGLALYAVGHSVKMQVRAAHLAGVLQLILAVGVLVEVVRRFVFGSEPESLVMMAIAFVALIANTSCLLLISKHREGGAHMKASWIFSANDVVINLGGITAGALVAWTGSNYPDLIIGTIAGGIVLNGARRILALKG >CP022300.1|AZN65850.1|7776_8184_+|Cd(II)/Pb(II)-responsive-transcriptional-regulator MRIGQLAQLVGVETQTIRFYEQQGLLPPPDRQDNGYRVYTEKHGEGLSFIRRCRILGLSLAEIHELQSYQDDPHQPCTAVNALLDDHISHVRSQITALQALEKQLVSLRASCNDDREVEACGVLAGISEGNMHQQ >CP022300.1|AZN65851.1|8275_9262_-|ferredoxin-NADP-reductase MPIIKINNNPISIQSSTDHSMLTDLLNAGIGYPYECVTGKCGLCKFELIQGNIIKTEENPTGLSSRDLKKGNRYLACKCKLNSDLDIKVKLDNKFIQKTKISKIRSSVISKELLTHDFIKITLKPDENMSWLPGQFCLLSDPLLPSIDRAYSIANNYIKDGHIDFYIKRVPDGIFSNHIFDKINIDSTLILKGPFGHSYYQRSNRKLLIIGGGSGLSYAASIAKQAFSEGKDFLFYYGSRSTQDIPNWSSLVFTNNEIIDIKTVLSQSNNEWTGPTGFLHEVVNEDLGASLCEFDIYLAGPPVMVECSIKSFFDQGVPSENIHYDSFY >CP022300.1|AZN65852.1|9274_9589_-|hypothetical-protein MNVTDLRQRITNSVGEDSGLNAKVKFDLGNNEVIFIDGISIPNNVHDSDIDSDITIKIKPENLTKILDKELNPKLAIMTGRMKLRGDIKIALRLDKVFGLEPSE >CP022300.1|AZN65853.1|9601_9922_-|(2Fe-2S)-binding-protein MNKKWVKACMESDILENSIFKFSRPGKSPIAIYRIEGKFYATEDTCTHGIASLSEGEIDGDVIECPFHGGAFNICTGEPESEPCTVALKTYQVDIVNNEVLILEEQ >CP022300.1|AZN65854.1|9931_10753_-|alpha/beta-hydrolase MKSIDYSEKYLNADGIETRYLEAGEGSPVILIHGGGAGAESEGNWKGVIPILAENFKVYAVDMIGFGKTAKPKIEYSQQIRTKHLVSFIKALGLEGKVSLVGNSMGGATALGVCVERPELVKNLVLMGSAGLVVELHEDLKPIVNYDFTETGMYKLVEALTNDDFQIDPKMVKKRVEYALDAETREAYASTMTWIKQQGGLFYPDEYIKKVKVPTLVVQGKEDKVVPITTAYKFLDLIEDSWGYIIPKCGHWAMIEHPTDFANATELFLKLRT >CP022300.1|AZN65855.1|10739_11546_-|catalytic-subunit-of-meta-cleavage-enzyme MANIVSSCATSHIVMSANGCEDQARNVIEGMKKLGNIIKKSKPDIILIISSDHMCNFDLSLQPRFAIGISDEYTTMGDMDIPIENIKGSRLLANTIVETADQDGFDLCQSEELKLDHGIMIPLTFMDLKNYPIVPLIVNINTSPMAEASRCVSLARTIKKSINELDEKLNISVIAAGGLSHWLCIENHGEVSEKFDHMIMDRLCNGEQEIITNMGNERIIQEGGNAGIEILTWLMASEISGNVSGEKIYYEPMRKWFTGVGGINFEVN >CP022300.1|AZN65856.1|11538_11814_-|hypothetical-protein MSNYKIDKIVQRIIKETQFREKLLENIDYLKELNLTNEEFNALVKAEPALLSAVGMHPILQMHYMMFRTPEIGIHVSVNDCLAIKNGDYHG >CP022300.1|AZN65857.1|11861_13019_-|carbazole-dioxygenase MSNVSEDILKKVKGWPGYVDAKYGFRNHWYPVMFSKDIAEGEVKKIKLLGEPLLVKRIDGKLHCIKDRCLHRGVPLSEKLDCKTKDTITCWYHAWTYKWETGELCDIMTNPSSAQIGRHKLKVYPVEEAKNCVFIFLGDGEPHPLAHDTPPEFLDDGLEILGIAREVKSNWRLGVENGFDPSHIYIHKDSILVQGNDLVLPLGFAPGEDRSKQTKVIADDSEGGRKGVYDLIGDASVPVFEGTIDGELVREGNYGSTLVANNISIWLPGVLKVNPWPNHDMMQFEWYVPVDENTHIYFQTLGKKCETEEEIKAYEHSFDHKWKEMALIGFNDDDIWAREAMVDFYADDKGWVNEILFEPDEAIVEWRKLADKHNKGIQTLENIKG |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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CP022300_2 | 2.1|4862|35|CP022300|PILER-CR | 4862-4896 | 35 | NZ_CP022300 | Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001B, complete sequence | 4862-4896 | 0 | 1.0 |
CP022300_2 | 2.2|4917|36|CP022300|PILER-CR | 4917-4952 | 36 | NZ_CP022300 | Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001B, complete sequence | 4917-4952 | 0 | 1.0 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NC_003078 | Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymB, complete sequence | 1165718-1165742 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP019586 | Sinorhizobium meliloti strain CCMM B554 (FSM-MA) plasmid pSymB, complete sequence | 1135758-1135782 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021799 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymB, complete sequence | 1231941-1231965 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021828 | Sinorhizobium meliloti strain KH35c plasmid psymB, complete sequence | 738203-738227 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021823 | Sinorhizobium meliloti strain KH46 plasmid psymB, complete sequence | 854413-854437 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021795 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1157 plasmid psymB, complete sequence | 376058-376082 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021806 | Sinorhizobium meliloti strain T073 plasmid psymB, complete sequence | 453741-453765 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP019484 | Sinorhizobium meliloti strain B401 plasmid pSymB, complete sequence | 1306479-1306503 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP019487 | Sinorhizobium meliloti strain B399 plasmid pSym, complete sequence | 1078851-1078875 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NC_020560 | Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB, complete sequence | 1165724-1165748 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NC_019849 | Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4d, complete sequence | 567950-567974 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NC_017326 | Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d, complete sequence | 556226-556250 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NC_017323 | Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB02, complete sequence | 150126-150150 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP009146 | Sinorhizobium meliloti strain RMO17 plasmid pSymB, complete sequence | 561178-561202 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NC_018701 | Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMB, complete sequence | 553884-553908 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021802 | Sinorhizobium meliloti strain USDA1021 plasmid psymB, complete sequence | 1220781-1220805 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021820 | Sinorhizobium meliloti strain M162 plasmid psymB, complete sequence | 909601-909625 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021831 | Sinorhizobium meliloti strain HM006 plasmid psymB, complete sequence | 814726-814750 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021814 | Sinorhizobium meliloti strain M270 plasmid psymB, complete sequence | 477005-477029 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021810 | Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymB, complete sequence | 1342675-1342699 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP021218 | Sinorhizobium meliloti RU11/001 plasmid pSymB, complete sequence | 706866-706890 | 6 | 0.76 |
CP022300_1 | 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder | 4148-4172 | 25 | NZ_CP026527 | Sinorhizobium meliloti strain AK21 plasmid pSymB, complete sequence | 577712-577736 | 6 | 0.76 |
1. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022300 (Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggctttaatgc Protospacer *************************
2. spacer 2.1|4862|35|CP022300|PILER-CR matches to NZ_CP022300 (Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
accaggctttttagatcaatttgtgaacaacttac CRISPR spacer accaggctttttagatcaatttgtgaacaacttac Protospacer ***********************************
3. spacer 2.2|4917|36|CP022300|PILER-CR matches to NZ_CP022300 (Acinetobacter johnsonii strain IC001 plasmid pIC001B, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
agtagccggcgactctctacagggccttccagctta CRISPR spacer agtagccggcgactctctacagggccttccagctta Protospacer ************************************
4. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NC_003078 (Sinorhizobium meliloti 1021 plasmid pSymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
5. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019586 (Sinorhizobium meliloti strain CCMM B554 (FSM-MA) plasmid pSymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
6. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021799 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1106 plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
7. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021828 (Sinorhizobium meliloti strain KH35c plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
8. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021823 (Sinorhizobium meliloti strain KH46 plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
9. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021795 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1157 plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
10. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021806 (Sinorhizobium meliloti strain T073 plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
11. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019484 (Sinorhizobium meliloti strain B401 plasmid pSymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
12. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019487 (Sinorhizobium meliloti strain B399 plasmid pSym, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
13. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NC_020560 (Sinorhizobium meliloti 2011 plasmid pSymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
14. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NC_019849 (Sinorhizobium meliloti GR4 plasmid pRmeGR4d, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
15. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NC_017326 (Sinorhizobium meliloti SM11 plasmid pSmeSM11d, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
16. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NC_017323 (Sinorhizobium meliloti BL225C plasmid pSINMEB02, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
17. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP009146 (Sinorhizobium meliloti strain RMO17 plasmid pSymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
18. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NC_018701 (Sinorhizobium meliloti Rm41 plasmid pSYMB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
19. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021802 (Sinorhizobium meliloti strain USDA1021 plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
20. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021820 (Sinorhizobium meliloti strain M162 plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
21. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021831 (Sinorhizobium meliloti strain HM006 plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
22. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021814 (Sinorhizobium meliloti strain M270 plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
23. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021810 (Sinorhizobium meliloti strain Rm41 plasmid psymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
24. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP021218 (Sinorhizobium meliloti RU11/001 plasmid pSymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
25. spacer 1.1|4148|25|CP022300|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026527 (Sinorhizobium meliloti strain AK21 plasmid pSymB, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.76
aggccaaagaggacggctttaatgc CRISPR spacer aggccaaagaggacggcttgtgaat Protospacer ******************* . ..
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
3291 : 70064
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP022299|3291:70064|DBSCAN-SWA TTTAGAAATTAAGTTGCTTTTCAATAGCCCGTGGCAGGGTCGGGAAATTGACTCCTTTTTCAATGGTTTCCTGATCGGCGCCTACCGGTACCGGATTGATGCAGACCTCCTGTGGAGGCATCGGTACGGTGGGGCGCCCTCGGCTGAAGCGCTCGGGGTGTTTGGCAAAGGCTTCATCAAGCGTAGCCTGTCGCACCTTGGCGATTTCAACGTGCTGTCCGGTAAATACCTGCTGCGGTGTAAAGCCGCCCAGAGCACTGTGGTGATGGTCGTTGTTGTACCAGCTGACATAGTCCTCACACCAGAGCATGGCGTGCTGGTAGCTATCGAATCGCCGCGGATAGTCAGGCTGGTATTTCATGGTTTTGAACTGAGCCTCACTGAAGGCGTTATCGTTGCTGACACGTGGCCGACTGTGGCTGGCAGTGACTGCCAACTCACCAAGCAAATCCAGGTAACAGTGGGCAGTCATCGGAGCTCCCCGATCCTGATGCAGGGTCAGCGCTCCAGGCTCGATGGCATAGCGCTCATGAGCCTGGGTAATCAGCTGGCTCGATAACGCACTGTTCTCCTTGCGCGAGAGCATCCAGGCCACGATATAACGGCTGTACAGGTCCATGACCACATACAGTGACAGGTATTCGCCCCGCTTCTGGGTGGCCAGCTTGGCAATGTCCCAGCTCCAGACCTGGTTGGGGCCGGTGGCCTGAAGCCGTGGTACGGGCTGTGCACAACCAGGGCGCTGTTGACGGCGCTCGCCGTTCATTTCCGCCTCGCGCAGTATCCGGTGCATGGTGCTGATGGAGCACAGGTAAATACTCTGTTGCAGCAGGCGGTAATACACCTGAACGGGCGGCTGGTTAACGTACTCGTCGCTGCCAAGCAGCTCTTTGACGTGCTCGCGTTCTTGCGTGCTCAGGGCCTTGGGCTGCGCAGTCTTGGTGCGCTTGCGTCGGTATGGGCTGGGTGGCCCGCAGAAGTAATACCGCCTGCGGGCCGCACGCATGCTGTTACGGCACACGTTCAGTACGTCACACGCCTGACGTTCAGAAACGTTGATAGGCAGCGACTCAGAGGCTACCAAGCTCATGACTCGTTCTCTTCGAGACTGTCCAGCAGCGCCAATGCTTTTTTTTGGAGCAGTAAACAGCCATCCTTGACTTCAATCTGGCGGCGCAGGCGCTGGTTCTCTTTTTCCAGCTGTTCAATACGTTTCTGTTCAGCGGTGTTCTTGGGCGCTGGGCCGGGTACGGACTTTTGCAGGCCGGCTACGCCCTGTTCGGCAAATTCGCGACGCCACTGAGCCAGCTGGTTTGAATACAGCTTCTCGCGCCGCAGCAGAGCTCCCAGCTCACCGTGCTTGCAAGCATCGGCTTGCTGGAGGATCGATAACTTGTACTCGGCCGTGAAGATGCGGCGGGTGCGCTTTTCCAGCTTGGGATCAGGCATGACCTTCGGCTCAACAGTGGTAATGGGTTTCGGCATTGTGCTCTCCTGAGCGCCCTGATTTATATGTTATCTCAAAATCAATTGGCTCAGGCTTAGGTTGACACACAGGGACCTCTACAACGAGATTGTAGCGATCAAACCAGAATGGCATAGCGATGATCTAAACGATGGTGTTATCAAGGTGGTGATGACCTCATCTGCTTCTGATGGTAAGGAGATTGCCAAACACCATACGACCAAGCAGCAGCGCCAAATCCTGGCCAATCGTATGAAGGACAACGACGATAAGCTGAAACTCGTGATTGTGCGTGATATGTGGCTGACTGGTTTCGATGCGCCGAGTATGCACACGCTCTACATCGACAAGCCAATGAAAGGCCATAACCTCATGCAAGCGATTGCACGAGTGAACCGAGTCTACAAAGACAAGATTGGTGGCTTAGTTGTCGATTACCTTGGTATCGCATCTGACCTGAAAGAAGCACTTTCATTTTACTCTGAAGCAGGTGGTAAGGGTGACTCTGCATTAGTGCAAGACGAAGCTGCAACCATTCTACAAGAGAAGTTCGAAGTCATTGATGGCATCATGCATGGCTTCAATTACCAAGAATATTTCACAGCCAATACTTCTCGTAAGCTCAACATTATCCTTGAAGCAGAAGAACACATCTTAGGTGTAGACCAAGGAGAAGGTAAGACTCGCTTCCTGACAGCAGTTGCAGCTATGTCACAGGCATTTGCTTTAGCAGTGCCTCATCCTCATGCGATGGAAGCAGCACCAGTAGTTGCCTTCTTCCAAGTAGTGAAAGCGCGACTTGCGAAGTTCAGTGATGGCTCAGGCAACGTCTCAGGCATGAGTAATGCTGAGCTTGAAGCTAAAGTGAAGCAAACCATTGACCAAGCACTTGTTACAGAACAAGTGGTCGACATCTTCGATGCAGCAGGAATCCAGAAGCCAGACATCTCAATTCTCTCAGATGAGTTCATGCAGGAGATGAAAGGCTACAAGCACAAGAACATTGCACTTGAAACATTGAAGAAGCTACTTGGTGATGAGATCAAGGTAAGAGAACAGCGGAGTGTCACGCAAGGTAAAAAGCTAATGGATATGCTGAGCTCTGCAATCAAGGGCTATCAGAACAAGGTACACTGACTGCAGCCGAAGTCATTGATGAACTCATCAAGTTGGCTAAGGCGATTCAAGAGTCTGACAAAATGGCAGAGGAACTCAATCTTACTGAATACGAATATGCATTCTACTCAGCAGTCGCAGACAATTAGAGTGCGCGTGAGTTGATGCAGAAAGAGATCCTACGAGAACTCGCTATCGTTCTGACAGAATCCATTCGTAAGAACGTAACCTTGGACTGGACCATCAAAGAGGCTCCTAGGGCGAAGCTACGAGTCATCGTGAAGCGATTACTCAAGAAGTATGGCTATCCACCTGACATGGCTTTATTGGCAACAGAGACTGTACTTGAACAGGCAGAGCAATTGGCTGAAGAATTAGCAACGGCAGCTTAGTTGTCACCACTAAATTACAACTCAAACACAACAAGGGGGTCAGTTTTTTAATGTCATTAGGGGGTCATTTTTACACTGCCGCTAACAAGCTTTTAGATCAGGATAAATTGGTTGAAAATTTCATATCTGGAGCAGATAAAAGAGTTAAGGATCTAGAAGTTTCACAAAAGAAATTCGTTCGTTGTACCTTTTCTTTAAACCAAAAATTAAGTGAATTAATTGATTGGTATAAAAATAAAGTTAGTAAATAAATTATATAAATCAAATATTTTGTTATTAAATATTAAATTTGTTTGATTTAATTTTATTTATTTTGGGACTATATTAGTCTATTATTTTAACGCTAAAAATAACTCAACTGTGCAGAAAAAATGATGACACCATTACACCATTGCATAATTGATGCATTAACAATATCTGAAGGCAGGTTTAAAAAACCATGCCCTGTTTTAGTTTTGAAAATGATGTTACTTAATGGGGAAAAGAGCAGGTTTTCAGAAGAAATTAAGAATCAAGCATTACTACTGCTCGCGATATATCGTAAGTTGCTGCTTGCTGTCGATCGGGATTTATTTAATGTAAAAACTCTAAAGAACAGTGTGAAAAGAAGACACTGGGCTAAAGTGGATAAAGCACAGAATAAGATGGTGGTTGCAAAAGAACTTCGACTAAAGCATTTAGATCTAGACGAAATGCCTTTATTTTTTCATACACAGCATTTTTTAAAAAAACTACCGATTTCCTTTGTTCAAAAATTGGTAGATTGGGCACCACCGGTGGTGAGTGGTACTTTTTTAATCGAAAATATTTTAGCAGGTTATATCGCCCAGAAGCTTTTGCCATTAGAAAAAATTAAAGTAAAAGAGCTTGGCAAGTCTGTGCAACCCTATTTTCACATAGCTGACTTTTTTGTATTTTTACCTCGACTGGAGGAACTTTATCAAAAACATCAGCAGCAAATTGTTTGTGTGGCACCAACCGCAGAAATTGCTTTAGCTTTAACAGACTTTAAGAAAGCATGGATCTATCGTCTTAGGAGCAGTTTATGAATATTTATTTTAAGCAGCTCATAGAATGGATGAAGCAGCATGAAAATATAGAAGAACAAGAACTTATCCAAGCATTATTTTTGTTGCGTGCACATTATAGCTTAGCTGGTATTGTTGTCATTTGTCAGCGAATTTTCACATTGATTGGTGATCATGAATTACCAATATTTCGTAATGAGCTTAATACTTTAAAGATAATTAGTACATTACAGAATTCTGATCAACATTCACATTTTTTCTCAGAAACAACAGATAGAAACAAACATAAACTCACGCCATTACGTCCATACACTGGAGACAGTGGAATTTGTGATTTGCTATTGATTCAAGCAGGACTAAGTCGAAATAATGAGCGTTTTGATACTGTAATTATTTGGTTTTTAGAGCAAATATTTCACTTTCAAAAAAATGTACATACTCTAAAGCTTTATAGTCATTATTTAAAGGGTGATGGAAGCATAAAGCTGAAAGATCAAAAAGGATCTCGTGTGTATAACGCCTTTTTAGCGATCAGGCTATTGGGTGATCCAAGTAATGAGGATATTTTAGAACAAGTCGAAAAATTACTGACTAAAAACGGACCGAAACAACTGATTCATTTGATGTCCGCTGGTTCTGAAGACAAACGATTAAATGAAGTTTTTTATGCATTAAAGCTCTTTTTATCACAAATTTGGCAAAAGAATCGACTAAAAAATAAGAAAAAACGTCGAGAGTTTTTACACCGTATAGGGTTAAAGCATCAAAAACTGATCTTGCAACGATACGGCTCATTAAGTATTGCTATCCAACCTTTAGAGGATGTAGATGAAATTCATCGTGGTCTAGTCTCTGAAGTATTTGAGGATGATGAGATTGAAGAAGATGAAACACCATTGGAGCCATTGTTTACATTTTTTTTGGCCGAACAATCCGATTTAATTCGAGGGCTTTATGCATCTAAGTCTACTTCTCAACATATTGAAGCTGCAAATGTTG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MAGDIGMYAQTLLLSLTAHGLGGVPQTILGFYGETIRKELGVDPSLKLLFGISLGYPDVTHPANQYRINKEPVGESVTFHQ >CP022299|3291:70064|29488_30454_+|AZN65781.1|DBSCAN-SWA MNNIIDVRVQQMRYESENILSIQLAPIHSKLLPHFNSGAHIDLHLPHGKVRQYSLISPLQDRRYYEIGVLKEPKSAGGSRYIHEQLRVGDLIQISEPRNLFELDDTDQKVLLIAGGIGITPILSMWSSLAIDQRKCDLHYCTRQPNIPFIDRINEFHIMNRDSHYVTYIGNQHTNGFDIATVLQQETVNTHIYVCGSATFIQSIESQALVMQWTKPFIHKECFKNTNTALQLTSSQEHIIEIASTGQKIPLLQIDNIAEVLNKAGYVVPLSCEQGICGTCTLRYTEGELHHQDMILNDEDHLTMFTPCCSKIKSKYIVIDL >CP022299|3291:70064|50911_51133_+|AZN65800.1|DBSCAN-SWA MITCKLSSLMGDRKILKLSEVVHATGINRNTLTSMYYDRAIRIELPVADKLCKYFNCTMNDLFEFKEEIEEKD |
57 | Leptospira_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 47104:47128|attR 66651:66675 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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