CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
CP029610	Acinetobacter pittii strain ST220 chromosome, complete genome	1 crisprs	cas3,DEDDh,WYL,csa3,RT	0	0	12	0
CP029611	Acinetobacter pittii strain ST220 plasmid unnamed, complete sequence	0 crisprs	NA	0	0	1	0

1. CP029610

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: CP029610_2

• CRISPR_ID: CP029610_2
• CRISPR_location: 1584257-1584346
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of CP029610_2

Consensus_repeat	Method
AGAGATTGATTATCTCTTACTTTTTCGCAAGA	CRISPRCasFinder

spacers of CP029610_2

>2.1|1584289|26|CP029610|CRISPRCasFinder
TGAACAATATGTTGTGAGTAGATAGT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029610_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of CP029610_2

>merge|CP029610|2|1584257-1584346|CRISPRCasFinder
AGAGATTGATTATCTCTTACTTTTTCGCAAGATGAACAATATGTTGTGAGTAGATAGTAGAGATCGATTATCTCTTACTTTTTCGCAAGA

>CP029610|2|2|1584257-1584346|CRISPRCasFinder
AGAGATTGATTATCTCTTACTTTTTCGCAAGA	TGAACAATATGTTGTGAGTAGATAGT
AGAGATCGATTATCTCTTACTTTTTCGCAAGA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
CP029610.1|AZP28962.1|1587552_1588938_-|ethanolamine-ammonia-lyase-subunit-EutB	unknown	unknown	gnl|CDD|237897
CP029610.1|AZP28955.1|1580087_1580741_-|oxygen-insensitive-NAD(P)H-nitroreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|182929
CP029610.1|AZP28950.1|1574046_1574925_-|pseudouridylate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|211332
CP029610.1|AZP28963.1|1588952_1590389_-|ethanolamine-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|129986
CP029610.1|AZP28968.1|1596017_1597730_+|helicase	unknown	unknown	gnl|CDD|350795
CP029610.1|AZP28952.1|1577496_1578441_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA	unknown	unknown	gnl|CDD|234626
CP029610.1|AZP28964.1|1590609_1592121_-|aldehyde-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|143434
CP029610.1|AZP28951.1|1575540_1577490_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL	unknown	unknown	gnl|CDD|234630
CP029610.1|AZP28965.1|1592263_1593454_+|transcriptional-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|183114
CP029610.1|AZP28966.1|1593450_1594419_-|alpha/beta-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|225176
CP029610.1|AZP28960.1|1585403_1586429_+|IS30-like-element-ISAba125-family-transposase	unknown	unknown	gnl|CDD|225382
CP029610.1|AZP31362.1|1575074_1575548_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE	unknown	unknown	gnl|CDD|376771
CP029610.1|AZP28961.1|1586726_1587542_-|ethanolamine-ammonia-lyase-subunit-EutC	unknown	unknown	gnl|CDD|235482
CP029610.1|AZP28954.1|1579190_1580048_+|EamA/RhaT-family-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|307170
CP029610.1|AZP28956.1|1580879_1581110_+|hypothetical-protein	unknown	unknown	unknown
CP029610.1|AZP28967.1|1594614_1595787_-|L-threonine-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|341467
CP029610.1|AZP28969.1|1597767_1598133_+|5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|238324
CP029610.1|AZP28957.1|1581117_1581837_-|UDP-2,3-diacylglucosamine-diphosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|235420
CP029610.1|AZP28953.1|1578522_1579050_+|RNA-chaperone-Hfq	unknown	unknown	gnl|CDD|179001
CP029610.1|AZP28958.1|1581852_1582362_-|peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|238901

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
CP029610.1|AZP28962.1|1587552_1588938_-|ethanolamine-ammonia-lyase-subunit-EutB	gnl|CDD|237897	PRK15067, PRK15067, ethanolamine ammonia-lyase subunit EutB.	0
CP029610.1|AZP28955.1|1580087_1580741_-|oxygen-insensitive-NAD(P)H-nitroreductase	gnl|CDD|182929	PRK11053, PRK11053, oxygen-insensitive NAD(P)H nitroreductase.	2.38029e-141
CP029610.1|AZP28950.1|1574046_1574925_-|pseudouridylate-synthase	gnl|CDD|211332	cd02558, PSRA_1, Pseudouridine synthase, a subgroup of the RluA family. This group is comprised of bacterial proteins assigned to the RluA family of pseudouridine synthases. Pseudouridine synthases catalyze the isomerization of specific uridines in an RNA molecule to pseudouridines (5-ribosyluracil, psi). No cofactors are required. The RluA family is comprised of proteins related to Escherichia coli RluA.	2.12931e-121
CP029610.1|AZP28963.1|1588952_1590389_-|ethanolamine-permease	gnl|CDD|129986	TIGR00908, putative_ethanolamine_permease, ethanolamine permease. The three genes used as the seed for this model (from Burkholderia pseudomallei, Pseudomonas aeruginosa and Clostridium acetobutylicum are all adjacent to genes for the catabolism of ethanolamine. Most if not all of the hits to this model have a similar arrangement of genes. This group is a member of the Amino Acid-Polyamine-Organocation (APC) Superfamily. [Transport and binding proteins, Amino acids, peptides and amines].	1.05915e-170
CP029610.1|AZP28968.1|1596017_1597730_+|helicase	gnl|CDD|350795	cd18037, DEXSc_Pif1_like, DEAD-box helicase domain of Pif1. Pif1 and other members of this family are RecD-like helicases involved in maintaining genome stability through unwinding double-stranded DNAs (dsDNAs), DNA/RNA hybrids, and G quadruplex (G4) structures. The members of Pif1 helicase subfamily studied so far all appear to contribute to telomere maintenance. Pif1 is a member of the DEAD-like helicases superfamily, a diverse family of proteins involved in ATP-dependent RNA or DNA unwinding. This domain contains the ATP-binding region.	5.69426e-81
CP029610.1|AZP28952.1|1577496_1578441_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA	gnl|CDD|234626	PRK00091, miaA, tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase; Reviewed.	1.58067e-139
CP029610.1|AZP28964.1|1590609_1592121_-|aldehyde-dehydrogenase	gnl|CDD|143434	cd07116, ALDH_ACDHII-AcoD, Ralstonia eutrophus NAD+-dependent acetaldehyde dehydrogenase II-like. Included in this CD is the NAD+-dependent, acetaldehyde dehydrogenase II (AcDHII, AcoD, EC=1.2.1.3) from Ralstonia (Alcaligenes) eutrophus H16 involved in the catabolism of acetoin and ethanol, and similar proteins, such as, the dimeric dihydrolipoamide dehydrogenase of the acetoin dehydrogenase enzyme system of Klebsiella pneumonia. Also included are sequences similar to the NAD+-dependent chloroacetaldehyde dehydrogenases (AldA and AldB) of Xanthobacter autotrophicus GJ10 which are involved in the degradation of 1,2-dichloroethane. These proteins apparently require RpoN factors for expression.	0
CP029610.1|AZP28951.1|1575540_1577490_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL	gnl|CDD|234630	PRK00095, mutL, DNA mismatch repair endonuclease MutL.	0
CP029610.1|AZP28965.1|1592263_1593454_+|transcriptional-regulator	gnl|CDD|183114	PRK11388, PRK11388, DNA-binding transcriptional regulator DhaR; Provisional.	1.66629e-09
CP029610.1|AZP28966.1|1593450_1594419_-|alpha/beta-hydrolase	gnl|CDD|225176	COG2267, PldB, Lysophospholipase [Lipid metabolism].	8.17126e-32
CP029610.1|AZP28960.1|1585403_1586429_+|IS30-like-element-ISAba125-family-transposase	gnl|CDD|225382	COG2826, Tra8, Transposase and inactivated derivatives, IS30 family [DNA replication, recombination, and repair].	6.13114e-93
CP029610.1|AZP31362.1|1575074_1575548_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE	gnl|CDD|376771	pfam02367, TsaE, Threonylcarbamoyl adenosine biosynthesis protein TsaE. This family of proteins is involved in the synthesis of threonylcarbamoyl adenosine (t(6)A).	1.64912e-53
CP029610.1|AZP28961.1|1586726_1587542_-|ethanolamine-ammonia-lyase-subunit-EutC	gnl|CDD|235482	PRK05465, PRK05465, ethanolamine ammonia-lyase subunit EutC.	1.50728e-116
CP029610.1|AZP28954.1|1579190_1580048_+|EamA/RhaT-family-transporter	gnl|CDD|307170	pfam00892, EamA, EamA-like transporter family. This family includes many hypothetical membrane proteins of unknown function. Many of the proteins contain two copies of the aligned region. The family used to be known as DUF6. Members of this family usually carry 5+5 transmembrane domains, and this domain attempts to model five of these.	0.000150495
CP029610.1|AZP28967.1|1594614_1595787_-|L-threonine-dehydrogenase	gnl|CDD|341467	cd08188, PDDH, 1,3-Propanediol (1,3-PD) dehydrogenase. This family includes 1,3-propanediol (1,3-PD) dehydrogenase, a key enzyme in the microbial production of 1,3-PD that has been previously characterized as the product of dhaT gene in Klebsiella pneumoniae. 1,3-PD dehydrogenase is a member of the family III metal-dependent polyol dehydrogenases, which are shown to require a divalent metal ion for catalysis. However, some members of this family showed a dependence on Fe(2+) or Zn(2+) for activity.	0
CP029610.1|AZP28969.1|1597767_1598133_+|5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate-isomerase	gnl|CDD|238324	cd00580, CHMI, 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase (CHMI) is a trimeric enzyme catalyzing the isomerization of the unsaturated ketone 5-(carboxymethyl)-2-hydroxymuconate to 5-(carboxymethyl)-2-oxo-3-hexene-1,6-dionate. This is one step in the homoprotocatechuate pathway, one of the microbial meta-fission pathways that degrade aromatic carbon sources to citric acid cycle intermediates. Despite the structural similarity of CHMI with 4-oxalocrotonate tautomerase (4-OT) and macrophage migration inhibitory factor (MIF), there is no significant sequence similarity among these protein families, and therefore, they are not combined in one hierarchy.	2.23014e-36
CP029610.1|AZP28957.1|1581117_1581837_-|UDP-2,3-diacylglucosamine-diphosphatase	gnl|CDD|235420	PRK05340, PRK05340, UDP-2,3-diacylglucosamine hydrolase; Provisional.	1.34787e-118
CP029610.1|AZP28953.1|1578522_1579050_+|RNA-chaperone-Hfq	gnl|CDD|179001	PRK00395, hfq, RNA-binding protein Hfq; Provisional.	7.55532e-47
CP029610.1|AZP28958.1|1581852_1582362_-|peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase	gnl|CDD|238901	cd01920, cyclophilin_EcCYP_like, cyclophilin_EcCYP_like: cyclophilin-type A-like peptidylprolyl cis- trans isomerase (PPIase) domain similar to the cytosolic E. coli cyclophilin A and Streptomyces antibioticus SanCyp18. Compared to the archetypal cyclophilin Human cyclophilin A, these have reduced affinity for cyclosporin A. E. coli cyclophilin A has a similar peptidylprolyl cis- trans isomerase activity to the human cyclophilin A. Most members of this subfamily contain a phenylalanine residue at the position equivalent to Human cyclophilin W121, where a tyrptophan has been shown to be important for cyclophilin binding.	3.78691e-78

Protein sequences

>CP029610.1|AZP28958.1|1581852_1582362_-|peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase
MSFPQVELNTNKGRIVLELNTEKAPKTVANFLEYVRDGFYDGVIFHRVIDGFMIQGGGMDENFKEKATRDSIENEADNGLSNDVGTIAMARTQAPHSASAQFFINVKNNSFLNHTSKTAQGWGYAVFGKVVEGMDVVEAIKGVRTGNRGYHADVPLENVVIESAKIISE
>CP029610.1|AZP28957.1|1581117_1581837_-|UDP-2,3-diacylglucosamine-diphosphatase
MTYLFISDLHLSPEHPRLVRGFLDLLVHYQNKQTQLYILGDWFNAWIGDDYSAPWLDEIVEALKDFNKKGNRIYFQVGNRDFALNQIFLNKFNGVLLPDIYYLNIAGHQYRLEHGDALCTDDVSYQRFRKIIRNPLLVAFLRRTPLSFRTKLVNGFRKRSSADKQQKSYEIMDVNEQAVISALEDADILIHGHTHRPAIHQVQAKQRIVLGDWREDQAYILEIDPSSNMQQLELVTWNY
>CP029610.1|AZP28956.1|1580879_1581110_+|hypothetical-protein
MIDLMPTDAKRKLREIRIVKAFIIFAFVLSLLILYIEYHNHAHISWKFVFIASLCAIYDFDLNNKIKDLKVEIKSN
>CP029610.1|AZP28955.1|1580087_1580741_-|oxygen-insensitive-NAD(P)H-nitroreductase
MDLLNTVKSRYTTKAYDSEKKIPQEKIKKLLEILRFTPSSVNIQPWHFVVADNLAAKERIAKALTGKYAYNAPKVLESSHTLVFCTKTDITSEYLNQLLEQDDLNGRFKDEKAKLGQKDTRHGYVEFYRNEQKNLFGWMENQTFIALGQLLFAAGLEGIDATPMGGFDEEILNTELGLTEKGLRSSVIVSLGYRSENDFNAKLPKSRLPDEVIFTYL
>CP029610.1|AZP28954.1|1579190_1580048_+|EamA/RhaT-family-transporter
MLLILAAAFSSVLVSILLKNLKRKGYQPLQMIAWNYASASLLCFWWFQPDIQHVSIQHTPWWLIFALGIILPSIFLCLAKSLEYAGIVRTELAQRLSVVLSLLAAYFFFHEQFNTLKLWGVGLGICAVLLVLFGQISSSANHQSRKAIFALLSVWCGYAAVDILLKYTSSLGLQFTLTLNLIFITAFILSISYLLLQKTQKWQFKSTIAGLILGILNFSNIALYVKAHILLKDSPAIVFASMNILVVLFGILSGVILYKEKLKWPTILGILLGISGVVCLASAMA
>CP029610.1|AZP28953.1|1578522_1579050_+|RNA-chaperone-Hfq
MELKMSKGQTLQDPFLNSLRKERIPVSIFLVNGIKLQGHIESFDQYVVLLKNTVSQMVYKHAISTVVPARNPRPAGAQGTGFPAQGGTQGGFGGQGSGFGGGQGGGFGGGQGGGFGGAQGGFGGQGGFGGQGGFGGQGGFGGQGGFGGQGGFGGHQGGFDNDSKFEDGQDDENNR
>CP029610.1|AZP28952.1|1577496_1578441_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-dimethylallyltransferase-MiaA
MSNQLPVINLMGPTASGKTALACELYERGNFELISVDSALVYKDMDIGTAKPTREEQELYPHHLIDIITPLEVYSAAQFVEDACKLIDEMHSRGKTPILVGGTMLYFKALLEGLSGNLPSADAQVRAAIEEKALNEGWQAVYDELVSVDPAAAIKFNVTDKQRIIRALEVYKITGEPITKLQAEQPKNVPYRYIFHNYALLPDRVELHQRIEQRLSKMWDIGFLSEVEALIEKYDLDENLPSMRSVGYRQALEFLLKSDLSLKSKREMEDKALFATRQLAKRQYTWLRSLQEIHDFKTYLTIKQAKEDLRNSYG
>CP029610.1|AZP28951.1|1575540_1577490_+|DNA-mismatch-repair-endonuclease-MutL
MTDEKLTQRRIHTLDAALANQIAAGEVIERPSSVVKELLENSIDAGATELIVRIAQGGSTLIEIIDNGHGIHPDDLALAVMRHATSKIKTAEDLHAIVSLGFRGEALASIAAVSRLTLTSSQDESGIGHQVEVNGTAFDHQEVQAVAAQKGTHIRVQDLFFNVPARRKFLKKPTTEFGHIEEIVRRLALTHFDIRFVLEHNDNIRINLPIADSGELRFQRVQQLLGSQFVQNAYWMDAESISMRLSGWLGHPSDARAQADMQYVYVNGRIVKDKTISHALRMAYDGILHGHQHSSYLLFLEVDPENIDVNVHPTKHEIRFLNQREVHEFVRHYAKETLAQFQTASADLAQAMKADESSDYSVQPQPKYQEQFSLHRANETLNSDSEARTQPAPTELLTDFNASRPQAVHYADQTPKYNGSALLNNALKTYLAPLRDQPTSFSVNEDVEPVAKVDEFPLGIAIAQLHGIYILAQNTEGLIIVDMHAAHERILLQQMKNAWDKPEFWTSQQLLIPKVISISRMQAVRVEELKPQLERLGLEIDLYGDEQIIVRGVPAILQKADFENLIPELLNDLDPNDEAQGLLQKRDELLAGMACHGAVRAHRQLSLSEMNALLRQMEQTEFASQCNHGRPTWRAFPLSQLDKLFARGE
>CP029610.1|AZP31362.1|1575074_1575548_+|tRNA-(adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase-complex-ATPase-subunit-type-1-TsaE
MSYSLKLLLNHEEDTERLARALAQHVQSGVIYLIGDLGAGKTTLTRYFLQALGHKGSVKSPTYTLVEPYKINDKEIFHFDLYRLNDPYELELMGIRDYLDITDALFLFEWPSKGGDEIPQADIIIDIQKSDDELTRLVTLTLPTENLYHTLQEQLHD
>CP029610.1|AZP28950.1|1574046_1574925_-|pseudouridylate-synthase
MIDGVSASQVYLPQQKDTQTIYEYLCGHFAHIRTDEWKQRFQDGLIYGANGQKLTLDSPYQSNSHIFYYRFLAYEVHVPFEHRILFENDDLLVVDKPHFLTISPTGQYVQETLLVRLKKQTGNEFLTPIHRLDRETAGVVLFCKRVESRGIYHQLFAERRVNKIYHAIAPYKKDLNFPQTLYLHLDKGHPFYTMQVIENVKANTQTDIELIEHNEIWAKYRLTPTTGKQHQLRVHLNYLEIPIKNDPFYPVVQHKAEDDFSEPLQLLAKHISFTDPLTKEGMSFNSKFELTL
>CP029610.1|AZP28960.1|1585403_1586429_+|IS30-like-element-ISAba125-family-transposase
MEYIKLSYHHLNFEDRTALMLESRKEGFSARKFAELIKRHPSTIYRELKRNSINDVYQARYASDNTFARRRRGHRKLKIDSILWKFIVEAIRCLWSPQQIAKRLKTFPDLDQTMNVSHTTIYSTIRALPKGELKKDLLSCLRHENKKRKANGEPKKDSILQDIKTIHERPAEVQERKIPGHWEADLIKGKDNKSSIATLIERNTRLCILATLPDAKAESVRKALTEALKYLPAELRKTLTYDRGREMSEHKILEEDLGIDVYFCDPHSPWQKGTCENMNGLIRQYLPKGIDLNQADQHYLNQVAMSLNTRPRKALDWLTPLEKFAQLVDYHMAFETVAPHV
>CP029610.1|AZP28961.1|1586726_1587542_-|ethanolamine-ammonia-lyase-subunit-EutC
MKLNRDIQYPSSTHQDQWEKLKQFTDARIALGRAGCSIPTRALLEFQLSHAQAKDAVYQEMDVSYLSEQLTQRQLQSLHVQSNAPNKEIYLKRPDLGRQLSNPSKEALIKKYAENTQQYDVCIVVGDGLSARAIEANAISFITMLNEQIQQENWSLAPIALATGSRVALGDEVAEIFKAPMLVMLIGERPGLSSPDSMGIYYTWNAYSGCLDAKRNCVSNIRSAGLSIPVAVQRLIALIKKSKQLGFSGVNLKDEHQLSNIDFEETQKLLF
>CP029610.1|AZP28962.1|1587552_1588938_-|ethanolamine-ammonia-lyase-subunit-EutB
MSYRNIVANQQYHFADLKTLMAKATPLRSGDELAGVAARDATEHVAAQMTLADVPLKTFLNEVVVDYETDEITRLIIDEHDLAAFAPISHFTVGDFRNWLLGEEATAQSLKALASGLTPEMVAAVSKIMHNQDLIYVASKCEVVTQFRNTIGLKGHLSTRLQPNHPTDDVLGISASILDGLMYGNGDAVIGINPATDNLHNLSELLKLLDHVIQEYQIPTQSCVLTHISSGIQLAEKNVPIDLMFQSIAGTQLANEGFGISLDLLQEGYEATLALKRGTIGQNVMYFETGQGSALSSNAHHGVDQQTLETRAYAVARKYNPLLVNTVVGFIGPEYLFNGKQIIRAGLEDHFCGKLLGVPMGCDICYTNHADADQNDMDVLLTLFGAAGINFIMGIPGSDDVMLNYQTTSFHDALYLRQLLGLKPAPEFSAWLEQQGIFKQQNSQICWADHMPDQFSRLLMN
>CP029610.1|AZP28963.1|1588952_1590389_-|ethanolamine-permease
MNQPETASVISSKTEVSSAEYFAQRQLKQGTVGWLLLIGLGVAYVISGDFAGWNFGIAQGGWGGMFIATALAAIMYLCLCLSMSEMSTMMPTAGGGYSFARAAFGPFGGYLTGTAILIEYAIAPAAIAVFIGGYCESLFGINGWMIYLACYAIFMGIHLKGAGEALKIMFAITLVAAVALVVFIGAMIPHFKAQNLFDIPVGTGVGASLFLPHGYLGIWAAVPFAIWFFLAVEGVPLAAEEAKDPAKSLPRGLIGAMLILTAFAILILFLGAGAAGASTLQNSGAPLVDALVKVYGTNTWLATFVNFVGLAGLIASFFSIIYAYSRQIFALSRAGYLPTSLSLTNKNKAPYLAIIIPGIIGFLLSLTKEGDSLILIAVFGATISYVLILLSHIKLRLSKPDMPRPYKTPGGIVTSSIALVLAVAAVVAGFVVNPKVWFIAAAIYVVFIAYFLFYSRYHLVKGTPEEEFANIKAAEQEL
>CP029610.1|AZP28964.1|1590609_1592121_-|aldehyde-dehydrogenase
MRYIDPNQPGSKVQFKSQYENFIGGEWVAPLKGAYFDNVSPVDGKAFTRIPRSSAEDIELALDAAHKAKATWNKASPTVRSNILLKIADRLEANLEMLAVAETWDNGKAVRETLAADLPLAIDHFRYFAGCIRAQEGGISEIDEDTIAYHFHEPLGVVGQIIPWNFPILMAAWKLAPALAAGNCVVIKPAEQTPVGILLVAELIQDILPPGVLNIVNGFGSEVGRPLATNPRIAKIAFTGSTQTGQMVMQYATENIIPVTLELGGKSPNLFFEDIMDKEDDFLEKTLEGFAMFALNQGEVCTCPSRALVQESIADQFLEMAVERVKRIKTGHPLDTETMIGAQASLQQQEKILRCINTGREEGAELLLGGSGRKEVGDGYYVDPTIFKGHNGMQVFQEEIFGPVLAVTTFKDFDDAIKIANDTMYGLGAGVWSRSAHISYRAGRAIEAGRVWTNCYNIYPAHAAFGGYKKSGIGRENHKMMLDHYQQTKNLLVSYSTKPMGFF
>CP029610.1|AZP28965.1|1592263_1593454_+|transcriptional-regulator
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>CP029610.1|AZP28966.1|1593450_1594419_-|alpha/beta-hydrolase
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>CP029610.1|AZP28967.1|1594614_1595787_-|L-threonine-dehydrogenase
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>CP029610.1|AZP28968.1|1596017_1597730_+|helicase
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>CP029610.1|AZP28969.1|1597767_1598133_+|5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate-isomerase
MAMPHVIVDYSENLTGLNAKQLLEEINTTLIDTELFSPEDIKSRARKDDVFLIGLGAEQAYIHAKVYILSGRTAEQKQLLGEQLLAALSNKKYLQPEFHKEIQLCVELVDMPREDYFKQVV

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	931311 : 952645	32	Acinetobacter_phage(31.25%)	tail,head	NA
DBSCAN-SWA_2	1248316 : 1263129	10	Acinetobacter_phage(100.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	1532413 : 1568562	46	Mannheimia_phage(19.23%)	tail,head,plate,transposase	NA
DBSCAN-SWA_4	1678968 : 1725446	68	Acinetobacter_phage(90.91%)	tail,head,terminase	NA
DBSCAN-SWA_5	1772292 : 1812676	44	uncultured_virus(50.0%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_6	1996044 : 2058057	49	Enterobacteria_phage(23.08%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	2651094 : 2700636	57	Acinetobacter_phage(28.0%)	tRNA,integrase,transposase,terminase,tail,head	attL 2656200:2656256|attR 2699419:2699475
DBSCAN-SWA_8	2722511 : 2729887	9	Acinetobacter_phage(50.0%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_9	2759792 : 2845299	97	Acinetobacter_phage(60.66%)	tRNA,terminase,tail,head,capsid	NA
DBSCAN-SWA_10	3097476 : 3154804	53	Enterobacteria_phage(16.67%)	holin,tRNA,transposase	NA
DBSCAN-SWA_11	3179879 : 3223326	68	Acinetobacter_phage(58.7%)	portal,integrase,transposase,terminase,tail,head,capsid	attL 3173852:3173869|attR 3211652:3211669
DBSCAN-SWA_12	3365353 : 3458553	95	uncultured_Caudovirales_phage(25.0%)	tRNA,portal,plate,transposase,terminase,tail,head,capsid	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP029610|931311:952645|DBSCAN-SWA
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>CP029610|931311:952645|941277_941784_+|AZP28409.1|DBSCAN-SWA
MRWSEQQLEAHLKAHRNRAISSKANQKAENDAKVRQRLQTRLKLKTKQNTTGEENEILNAEIWMIPPSVNHYWIAKGKKRALSQKAMEFHNYVRTIVPMLMTDMRLKLEVTFYFPDRKTRDIDNYLKATIDSLVKCQFCLDDEQFDVLHVKRGEMVKGGLIEIKVWEI

Homologous phage analysis in the prophage region

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AZP28397.1|933432_933657_-	hypothetical protein	A0A0P0J067	Acinetobacter_phage	1.3e-06	44.1
AZP28398.1|933657_933876_-	Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP28399.1|933885_934434_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28400.1|934473_936012_-	hypothetical protein	J7HXB6	Pseudomonas_phage	3.0e-62	52.4
AZP28401.1|936031_936910_-	hypothetical protein	G9L6A3	Escherichia_phage	3.5e-23	31.6
AZP28402.1|936911_937805_-	hypothetical protein	Q775A9	Bordetella_phage	9.9e-42	76.3
AZP28403.1|937807_938005_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28404.1|938209_938953_-	alkaline phosphatase	A0A1B1P9J5	Acinetobacter_phage	4.1e-81	61.1
AZP28405.1|939052_939244_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28406.1|939252_939588_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28407.1|939602_940511_+	replication protein	NA	NA	NA	NA
AZP28408.1|940503_941109_+	restriction endonuclease	NA	NA	NA	NA
AZP28409.1|941277_941784_+	hypothetical protein	A0A1X9SFE9	Acinetobacter_phage	5.1e-27	50.9
AZP28410.1|941794_942211_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28411.1|942207_942609_+	hypothetical protein	I2GUC9	Acinetobacter_phage	2.2e-09	36.0
AZP28412.1|942743_943097_+	hypothetical protein	I2GUD2	Acinetobacter_phage	7.0e-07	39.5
AZP28413.1|943098_943680_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28414.1|943676_943958_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28415.1|943954_944176_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28416.1|944255_944591_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28417.1|944593_944782_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28418.1|944781_946428_+|head,tail	phage head-tail adapter protein	A0A2H4J3N6	uncultured_Caudovirales_phage	2.2e-127	45.7
AZP28419.1|946424_946988_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28420.1|946980_947664_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP31323.1|947685_948591_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28421.1|948651_948975_+	hypothetical protein	A0A0S4L5D5	Pseudomonas_phage	6.8e-33	72.4
AZP28422.1|949036_949600_+	hypothetical protein	A0A2H4JCY7	uncultured_Caudovirales_phage	5.0e-31	40.9
AZP28423.1|949599_951684_+	carbohydrate-binding protein	A0A2H4J6H2	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-69	28.4
AZP28424.1|951686_952136_+	GNAT family N-acetyltransferase	A0A2H4J9Z5	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-20	35.4
AZP28425.1|952138_952645_+	hypothetical protein	A0A218MN86	uncultured_virus	3.8e-14	29.8

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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MNQTIDLSVSKKSAKAGDSIPHESAHLHVTGQATYIDDLPELENTMHLAVGFSNCAKGKIIKFDLDAVRQADGVRAVFSAKDIDVENNWGPIVKDDPIFAEEQVEFYGQALFVVVAESYQQARQAVRLAKIEYVPETPILTIQDAIKKESWVLPPVEFSHGEVEQAFQNAAHQLSGAIELGGQEHFYLEGQISYAIPQENQSLKVYCSTQHPTEMQLLICHALGMNMHQVSVESRRMGGGFGGKESQSAQWACIASLAAQKTGRPCKLRLDRDDDMSATGKRHGFAYEWSVAFDDSGVLQGLKVQLASNCGFSADLSGPVNERAICHIGNAYYLNAVELRNLRCKTNTVSNTAYRGFGGPQGMFVIENIIDDIARYLGCDPVEIRQRNFFAEQPGAGRDRMHYGAEVRDNVAPKLVAELLQTSDYAKRKQDIHAFNQNNHIIKRGIALTPLMFGISFNAVHYNQAGALVYVYMDGTVAITHGGTEMGQGLYTKVRQIAAHELGLPIDSVRLIATDTSRVPNTSATAASSGADLNGKAVQNACIKIRERLAKLAAEISQSEAEQVQFEDSMVSTANGHSWTFPDLVQRAYMARVQLWDSGFYKTPEIHYDQVNHLGRPFFYYAYGAAVSEVAIDTLTGEMKVLRADILHDVGRSINPAIDIGQIEGGFVQGMGWLTTEELYWQPQGPHAGRLFTHAPSTYKIPTSVDIPHIFNVKLFNNQNQADTIYRSKAVGEPPFMLALSVFSAIRQAVQAAIPEKAPLVLNAPATAEEILRAIAIGRGQALANRLQAKM
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MNIQQALNHITKNIHLTQPQMEEIMRSIMQGEATEAQIGALMMGLRMKGESIDEMTAAARVMREFAIKIDVSDIKHLVDIVGTGGDGQNLFNVSTASSFVIAAAGATIAKHGNRGVSSKSGSSDLLEQAGIHLDLDMQQTERCIREMGVGFLFAPNHHKAMKYAAGPRRELGIRSIFNLLGPLTNPAGVKRFVIGVFSDELCRPIAEVMKQLGAEHVMVVHSKDGLDEISLAAPTAIAELKDGEITEWTLNPEDVGIESQTLNGLVVADATASLKLIKDALSKNKSDIGEKAANMIALNAGAGIYVAGITKTYAQAVTFAQDIIYGGQALEKMSVLAEFTKTLKQSQAD
>CP029610|1248316:1263129|1253009_1253993_+|AZP28666.1|DBSCAN-SWA
MQHLQWWADFVAWQVDAVPMVLVTVVRADGSTPREVGATMLLRFNLQQQWQQSDTIGGGHLEFQAIDIAKAMLKETETSVRRIERFNLSARLGQCCGGVMWLLFEKISPAEIASDLSGSLQAWRAGKHIWRNVSHQYASTWQTMDMEQQPSFEFHSGSSEEWQFGQQIQPNVMQVLICGAGHVGEAIVRCLLPIGVRVKWIDPRDDIFPPDLLQQVQCLTTDTLDAEIEHFDRLGAILILTHDHQLDLQLCFSALKPAAKPFAYVGMIGSKSKRAIFEKRMQIRGYTQETLQRLVCPIGVEGISSKQPAMIAIAVVAQLLQVFDVKK
>CP029610|1248316:1263129|1254708_1255515_-|AZP28668.1|DBSCAN-SWA
MINIQNTILGKIVDRKHEELAARLKQRNLQDVEELAKAATPVRGFANALKHKRPGVIAEIKKASPSKGIIRADFNPAEIAQQYEQAGAACLSVLTDVDFFQGADENIAIARNHCALPALRKDFLIDPYNVVEARALHADCILLIVACLSDQQLEEMSKTAFEHQLDVLVEVHDEEEMERALKLSEQCLLGVNNRNLKTFDVDLNTSIRLKKLLPTSRLLITESGIATPDDVHMMQEHDIHSFLVGESFMKQPRPDQAFTALFGQPQTV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AZP28663.1|1248316_1248871_-	GTP cyclohydrolase I FolE	A0A0P0HSD2	Acinetobacter_phage	7.9e-98	99.5
AZP28664.1|1249126_1250626_+	xanthine dehydrogenase small subunit	A0A0P0IVM8	Acinetobacter_phage	1.5e-271	93.8
AZP28665.1|1250627_1253003_+	xanthine dehydrogenase molybdopterin binding subunit	A0A0P0I429	Acinetobacter_phage	0.0e+00	97.5
AZP28666.1|1253009_1253993_+	xanthine dehydrogenase accessory protein XdhC	A0A0P0IKN7	Acinetobacter_phage	4.7e-178	93.0
AZP28667.1|1254003_1254699_-	DNA mismatch repair protein MutS	A0A0P0IDT4	Acinetobacter_phage	5.1e-118	96.5
AZP28668.1|1254708_1255515_-	indole-3-glycerol phosphate synthase TrpC	A0A0P0IR83	Acinetobacter_phage	6.2e-144	97.4
AZP31344.1|1255524_1256574_-	anthranilate phosphoribosyltransferase	A0A0N7IRD9	Acinetobacter_phage	6.3e-189	99.4
AZP28669.1|1256931_1259664_+	TonB-dependent receptor	A0A0P0I887	Acinetobacter_phage	0.0e+00	95.9
AZP28670.1|1259671_1262443_+	M1 family peptidase	A0A0P0IY26	Acinetobacter_phage	0.0e+00	97.9
AZP28671.1|1262544_1263129_-	aminodeoxychorismate/anthranilate synthase component II	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	3.9e-111	99.5

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>CP029610|1532413:1568562|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AZP28897.1|1532413_1533952_-|tail	phage tail protein	NA	NA	NA	NA
AZP28898.1|1533948_1534485_-	DUF2313 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP28899.1|1534481_1535528_-	hypothetical protein	A0A0M3LQN4	Mannheimia_phage	1.2e-25	26.5
AZP28900.1|1535529_1535892_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28901.1|1535894_1536374_-|plate	baseplate assembly protein	F6MIL4	Haemophilus_phage	1.4e-13	40.2
AZP28902.1|1536370_1537426_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28903.1|1537415_1538588_-	multidrug DMT transporter	NA	NA	NA	NA
AZP28904.1|1538659_1540780_-	hypothetical protein	A0A0M3LPB6	Mannheimia_phage	3.4e-40	30.5
AZP28905.1|1540783_1540981_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28906.1|1541010_1541322_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28907.1|1541329_1541707_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28908.1|1541826_1542636_-|tail	phage tail protein	A0A0M3LQC3	Mannheimia_phage	3.2e-23	35.7
AZP28909.1|1542646_1545667_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28910.1|1545670_1546021_-|tail	phage tail protein	NA	NA	NA	NA
AZP28911.1|1546024_1546636_-	DUF1834 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP28912.1|1546629_1547058_-	DUF1320 domain-containing protein	A0A0M3LP98	Mannheimia_phage	3.9e-20	41.8
AZP28913.1|1547061_1547970_-|head	head protein	H1ZZF0	Pseudomonas_virus	5.8e-98	59.6
AZP28914.1|1547966_1548377_-	hypothetical protein	A0A2P9JZJ1	Alteromonadaceae_phage	8.1e-23	45.7
AZP28915.1|1548379_1549456_-	hypothetical protein	A0A2D1GNS3	Pseudomonas_phage	2.8e-46	38.2
AZP28916.1|1549535_1550012_-	phage morphogenesis protein	F8TVC6	EBPR_siphovirus	2.7e-14	37.9
AZP28917.1|1550008_1551268_-|head	phage head morphogenesis protein	I6PBD2	Pseudomonas_phage	1.9e-75	37.2
AZP28918.1|1551267_1552881_-	DUF935 domain-containing protein	A0A0M5MS00	Ralstonia_phage	6.9e-110	42.3
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AZP28920.1|1554000_1554687_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28921.1|1554735_1556373_-	hypothetical protein	A0A219VH72	Ochrobactrum_phage	5.9e-117	46.0
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AZP28925.1|1557545_1557893_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28926.1|1557889_1558390_-	hypothetical protein	Q775E1	Bordetella_phage	9.8e-39	49.7
AZP28927.1|1559057_1559717_-	XRE family transcriptional regulator	A0A2I7S9A5	Vibrio_phage	5.6e-26	38.9
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AZP28930.1|1560544_1561432_+	hypothetical protein	Q6QID9	Burkholderia_phage	1.2e-26	31.5
AZP28931.1|1561434_1563186_+|transposase	transposase	Q5ZR04	Pseudomonas_phage	1.6e-99	36.0
AZP28932.1|1563195_1564473_+|transposase	transposase	Q6QIE1	Burkholderia_phage	1.6e-93	46.7
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AZP28937.1|1566333_1566606_+	DNA-binding protein HU	A7KV42	Bacillus_phage	3.5e-22	62.2
AZP28938.1|1566605_1566785_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28939.1|1566924_1567638_+	DUF2786 domain-containing protein	A0A2H4JCP9	uncultured_Caudovirales_phage	1.9e-27	38.8
AZP28940.1|1567634_1567922_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28941.1|1567915_1568128_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP28942.1|1568124_1568562_+	regulatory protein GemA	A0A0C4UQU3	Shigella_phage	7.6e-11	32.6

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>CP029610|1678968:1725446|DBSCAN-SWA
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MLKDLRNLSDAEQQEYLDRFIMANEEQKFPQEVVALYLDCSPWTLARMRCDQSSLPFSKIGRRVSYKKKDVLKYEQSRTVLNTAQLATV
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MSNFVFKRGDTFNLNLQLVDMDEALQFPPDDVRRAIDLTGYTFTSQVKALADGAAVATLTCAALNQSTQKGWLNIKSSASTATWPLGLCQMDIKAVVSGTTQHTETLTFQVIDGVTA

Homologous phage analysis in the prophage region

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AZP29042.1|1680242_1681325_-	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	A0A0A7RTT7	Clostridium_phage	1.2e-30	28.6
AZP29043.1|1681361_1681973_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29044.1|1682110_1682380_-	DNA-binding protein	A0A0N7IRE8	Acinetobacter_phage	7.8e-43	98.9
AZP29045.1|1682380_1682638_-	hypothetical protein	A0A0P0J0B1	Acinetobacter_phage	1.6e-45	95.3
AZP29046.1|1682641_1682926_-	hypothetical protein	A0A0P0HSI5	Acinetobacter_phage	2.3e-45	100.0
AZP31369.1|1682922_1683339_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29047.1|1683459_1683756_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29048.1|1683784_1684906_-	AAA family ATPase	A0A0N7IRE0	Acinetobacter_phage	1.0e-208	98.1
AZP29049.1|1684917_1685241_-	hypothetical protein	A0A0D4DCB5	Acinetobacter_phage	9.7e-56	97.2
AZP29050.1|1685243_1685684_-	hypothetical protein	A0A0N7IRF7	Acinetobacter_phage	6.3e-74	96.6
AZP29051.1|1685887_1686421_-	DUF4411 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP29052.1|1686423_1687545_-	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
AZP29053.1|1687701_1687917_-	hypothetical protein	A0A0P0I8I5	Acinetobacter_phage	6.7e-29	95.8
AZP29054.1|1687931_1688696_-	LexA family transcriptional regulator	J7I4M9	Acinetobacter_phage	1.0e-140	98.4
AZP29055.1|1688773_1688959_+	hypothetical protein	J7HXD2	Acinetobacter_phage	1.4e-27	98.4
AZP29056.1|1688968_1689325_+	transcriptional regulator	J7I452	Acinetobacter_phage	8.8e-58	98.3
AZP31370.1|1689380_1689656_+	hypothetical protein	A0A0P0IVP2	Acinetobacter_phage	8.3e-40	96.7
AZP29057.1|1689652_1689949_+	hypothetical protein	J7HXM0	Acinetobacter_phage	1.7e-46	95.9
AZP29058.1|1689945_1690149_+	hypothetical protein	J7I4N3	Acinetobacter_phage	7.0e-28	98.5
AZP29059.1|1690299_1691229_+	DUF1376 domain-containing protein	A0A0P0I481	Acinetobacter_phage	1.1e-171	99.4
AZP29060.1|1691221_1691971_+	hypothetical protein	A0A0N7IRF0	Acinetobacter_phage	6.2e-138	99.6
AZP29061.1|1691967_1692441_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29062.1|1692440_1692842_+	DUF559 domain-containing protein	A0A0P0I8E8	Acinetobacter_phage	5.1e-62	90.1
AZP29063.1|1692838_1693315_+	hypothetical protein	A0A2H4J548	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-25	40.3
AZP29064.1|1693286_1693541_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29065.1|1694003_1694357_+	hypothetical protein	A0A0P0HSF5	Acinetobacter_phage	3.2e-12	36.3
AZP29066.1|1694555_1694792_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29067.1|1695455_1695911_+	hypothetical protein	A0A0P0HSF5	Acinetobacter_phage	3.5e-83	98.7
AZP29068.1|1695972_1696407_+	hypothetical protein	A0A0P0IVP9	Acinetobacter_phage	1.4e-78	97.9
AZP29069.1|1696375_1697017_+	hypothetical protein	A0A0P0I449	Acinetobacter_phage	2.0e-116	92.5
AZP29070.1|1697076_1697634_+	DUF2280 domain-containing protein	A0A0P0IKR0	Acinetobacter_phage	5.7e-80	89.2
AZP29071.1|1697617_1698934_+|terminase	terminase	A0A0N7IRE3	Acinetobacter_phage	1.5e-264	98.9
AZP29072.1|1698973_1700314_+	DUF4055 domain-containing protein	A0A0P0IDW1	Acinetobacter_phage	1.2e-248	96.9
AZP29073.1|1700323_1701430_+|head	phage head morphogenesis protein	A0A0P0IR98	Acinetobacter_phage	3.1e-194	93.2
AZP29074.1|1701438_1701867_+	hypothetical protein	J7I4P3	Acinetobacter_phage	5.2e-73	100.0
AZP29075.1|1701965_1702202_+	hypothetical protein	A0A0D4DC19	Acinetobacter_phage	4.8e-36	94.9
AZP29076.1|1702214_1702439_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29077.1|1702560_1703112_+	hypothetical protein	A0A2I7RHW2	Vibrio_phage	1.1e-17	66.7
AZP29078.1|1703221_1703977_+	hypothetical protein	A0A0P0J090	Acinetobacter_phage	1.6e-130	100.0
AZP29079.1|1703990_1704941_+	methyltransferase	A0A0P0HSG2	Acinetobacter_phage	6.2e-175	97.5
AZP29080.1|1704985_1705321_+	HeH/LEM domain protein	A0A0N7IRE4	Acinetobacter_phage	2.0e-51	98.2
AZP29081.1|1705324_1705705_+	hypothetical protein	A0A0P0IVQ3	Acinetobacter_phage	1.5e-52	84.1
AZP29082.1|1705704_1706073_+	glutamate 5-kinase	A0A0P0I456	Acinetobacter_phage	1.7e-64	98.4
AZP29083.1|1706110_1706824_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29084.1|1706879_1707284_+	hypothetical protein	A0A0P0IKR8	Acinetobacter_phage	1.4e-67	94.7
AZP29085.1|1707255_1707624_+	hypothetical protein	A0A0D4DBN1	Acinetobacter_phage	4.3e-60	91.8
AZP29086.1|1707580_1708024_+	hypothetical protein	A0A0D4DBX3	Acinetobacter_phage	5.2e-68	88.4
AZP29087.1|1708025_1708244_+	hypothetical protein	A0A0P0I8C2	Acinetobacter_phage	3.2e-26	86.1
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AZP29091.1|1711023_1711539_+	hypothetical protein	A0A0P0J095	Acinetobacter_phage	6.3e-73	99.3
AZP29092.1|1711466_1711796_+	hypothetical protein	A0A1B1P9F7	Acinetobacter_phage	2.2e-23	55.1
AZP29093.1|1712038_1712338_+	DUF4258 domain-containing protein	A0A0P0IE58	Acinetobacter_phage	7.4e-50	100.0
AZP29094.1|1712346_1712805_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0P0IRJ4	Acinetobacter_phage	1.1e-84	100.0
AZP29095.1|1712910_1713087_+	hypothetical protein	A0A0R6PIB1	Moraxella_phage	8.2e-09	57.7
AZP29096.1|1713095_1713419_+	DUF4236 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP29097.1|1713437_1714154_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29098.1|1714272_1718610_+|tail	phage tail tape measure protein	A0A0D4DC37	Acinetobacter_phage	0.0e+00	70.3
AZP29099.1|1718700_1719288_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29100.1|1719380_1719779_+	hypothetical protein	J7I0X8	Acinetobacter_phage	3.1e-72	97.7
AZP29101.1|1719778_1720285_+	DUF1833 domain-containing protein	A0A0D4DCA4	Acinetobacter_phage	1.2e-87	92.9
AZP29102.1|1720281_1720644_+	hypothetical protein	A0A0D4DCJ1	Acinetobacter_phage	2.6e-65	98.3
AZP29103.1|1720636_1724083_+	hypothetical protein	J7HXG3	Acinetobacter_phage	0.0e+00	99.3
AZP29104.1|1724151_1724541_+	hypothetical protein	A0A0P0I8L9	Acinetobacter_phage	5.6e-66	98.4
AZP31371.1|1724582_1725128_+	hypothetical protein	A0A0B5L5G0	Acinetobacter_phage	1.1e-94	93.9
AZP29105.1|1725128_1725446_+	anaerobic dehydrogenase	E5KY21	Escherichia_phage	4.3e-24	58.5

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>CP029610|1772292:1812676|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AZP29145.1|1772292_1773939_+|transposase	IS66-like element ISAba17 family transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	5.0e-140	52.6
AZP29146.1|1774151_1774445_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29147.1|1774711_1775140_+	IS66 family insertion sequence hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29148.1|1775136_1775472_+	IS66 family insertion sequence hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29149.1|1775546_1777193_+|transposase	IS66-like element ISAba17 family transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	5.0e-140	52.6
AZP29150.1|1777216_1777924_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP29151.1|1777918_1778182_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29152.1|1778717_1779221_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
AZP29153.1|1779259_1779565_-|transposase	transposase	A0A218MNC9	uncultured_virus	3.4e-18	52.5
AZP29154.1|1779983_1780475_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29155.1|1780890_1782135_+	D-amino acid dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AZP31373.1|1782179_1782806_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29156.1|1782924_1783416_+	2-C-methyl-D-erythritol 2,4-cyclodiphosphate synthase	NA	NA	NA	NA
AZP29157.1|1783403_1783928_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29158.1|1784120_1785041_-	ornithine carbamoyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP31374.1|1785153_1785873_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP29159.1|1786073_1787567_-	sigma-54-dependent Fis family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP29160.1|1787553_1788663_-	PAS domain-containing sensor histidine kinase	NA	NA	NA	NA
AZP29161.1|1788829_1788958_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29162.1|1789005_1790349_+	30S ribosomal protein S12 methylthiotransferase RimO	NA	NA	NA	NA
AZP29163.1|1790401_1791130_+	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
AZP29164.1|1791214_1791769_+	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
AZP29165.1|1791774_1792527_+	di-trans,poly-cis-decaprenylcistransferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	2.5e-22	41.5
AZP29166.1|1792526_1793351_+	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP29167.1|1793351_1794548_+	1-deoxy-D-xylulose-5-phosphate reductoisomerase	NA	NA	NA	NA
AZP29168.1|1794549_1795905_+|protease	RIP metalloprotease RseP	NA	NA	NA	NA
AZP29169.1|1795962_1798449_+	outer membrane protein assembly factor BamA	NA	NA	NA	NA
AZP29170.1|1798490_1798991_+	OmpH family outer membrane protein	NA	NA	NA	NA
AZP29171.1|1798995_1800066_+	UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)glucosamine N-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP29172.1|1800072_1800558_+	3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase FabZ	NA	NA	NA	NA
AZP29173.1|1800554_1801343_+	acyl-ACP--UDP-N-acetylglucosamine O-acyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP29174.1|1801401_1802277_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29175.1|1802701_1803184_-	regulatory protein RecX	NA	NA	NA	NA
AZP29176.1|1803243_1804290_-	recombinase RecA	A0A2D1GPX2	Mycobacterium_phage	2.5e-113	62.2
AZP29177.1|1804435_1804864_-	RNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
AZP31375.1|1804847_1805510_-	haloacid dehalogenase	NA	NA	NA	NA
AZP31376.1|1805957_1806251_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29178.1|1806288_1806825_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP29179.1|1806853_1807303_-	Lrp/AsnC family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP29180.1|1807450_1808701_+	kynureninase	NA	NA	NA	NA
AZP29181.1|1808741_1810148_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
AZP29182.1|1810155_1810902_+	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP29183.1|1811508_1811736_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29184.1|1811743_1812676_+|transposase	IS5 family transposase	Q1MVF0	Enterobacteria_phage	6.7e-57	41.4

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>CP029610|1996044:2058057|DBSCAN-SWA
GATGAAGAAGCCTACACCTAAAATCTATCGTACAACCAATTGGTCCTCGTATAACCAAGCTTTAATCAAGCGAGGAAATATTTCAATCTGGTTTGATCCTAAGACGCAATGGTATGCACAACCACAAGGCAAGCAAGGACGAAATCAAACTTATTCCGATACAGCGATTCAATGCTGTTTAATGATCAAATCTCTATTCCGTCTTTCTTTACGTATGGTTACTGGCTTTGTTCAAAGCCTGATTAAACTCTGTGGCTTGAATTGGACAGCACCAGATTACTCCACCCTTTGTAGACGACAAAAGTATATTGATATTGCGATAAGCTATCAGAAAAGTCATGATGGGTTACACCTACTTGTCGACTCTACGGGTTTAAAGTTTTTAGGTGAAGGCGAATGGAAGCGTAAAAAACATCAGCCTGAATACCGTCGGCAATGGCGTAAACTGCATATTGGTATAGATGCTGAAACACTGCAAATACGTGCCGTTCAGCTTACTACAAATAATGTCAGTGATTCACAAGTACTAGGTGATTTACTGGATCAAATTCCACTAGATGAGCGAATAGATTCTGTCTATACCGATGGCGCGTACGACACGAAGTGCTGCAGAAAAGTGATTTCAGATCGTCAAGCACATGCAGTAATTCCACCCAGAAAGAATGCCAAGCCCTGGAAAGATTCTAAAATAAGTTCAATAGAACGAAATGAGTTACTTCAAACGGTTAAACATTTAGGCAGAACCCTATGGAAAAAATGGTCGGGTTATCACCGTCGTAGTTTGGTGGAAACCAAGATGCATTGCATCAAATTATTAGGTGATAGGCTGACGGCAAGACATTTTCAAAGTCAGGTCAATGAAATTCATGCGCGTGTGGCAGTTCTGAATAGATTTACGGAATTAGGTAGACCTCGCACCCAAGTTGTGTCTTAAATTTGAATGGATTGGGGAGAACTCAGCTTTTGAATGTTTATGCAACAAAGCCCCTCGAATATAAAAATGCAATGTTTGAGCTCAATAAATTAAAAAACAAAGATTTTTAACCCCCAACAATCCGCTTCTCAAGCATCTCCATAAAAGTTTTTAAAATAAAATTATGATTTTTTGATTAAAATTAATAAGATGAAGGCCGCTAGTTACTTAATCTTCATAAACTTTATTTTATCAAAAGATAAAGAAAAATTGAATAATATGTTTTTTTGTGTAAAATAAAGTTCTTATACGTACAATTCTGTCTATAAAATGTTAACTAAGAATTTTATAACTTCTTCCCTTATTCTTTTTGCGGGTTTTCACCAATATGTCTATGCGATTGAAGATGTTTCTTTGCCCAGCCAGGTGCTTCAAGATCAACGTTTAAAAGAGCTTAACCAGCAATTACAAGACCAGCTTGCTCAGCAAACTCCTTATGAAAATACAAAACCATTACAGGATTTTAAGCATTTAGTTGTTGAAGAAAGCCCATGTGTAACGGTTAAAGAAATTAGTCTTATCCCTTTAAATGGTCAGTCGCAGTCTGACTTACAGCAATTTAACTTTGTGGTTAAAGCTATAAAAAAACACCCACAGAATGTTTTGGGTAAATGTATTGGAACCCAAAGTTTACATAACATCGTGAACTATGCCCAAAATGAACTTTTAAAAAAGGGTTTTATTACCAGTCAAATTGTCGTGAGTCCACAAGACTTAAATCAAGGTAATTTAAACCTGAGTGTGCAAATTGGTCGCTTGAATAAAATCATAATTCAGGAAGGTAAAATTTCCTCATTACAGCTTAAGACAGGGTTGCCATTTAAAGCGGGCGACATTGTAAATCTAAAAAAACTCGATCAGGGGCTAGAAAATCTAAAACGTGTCTATGCGGTAGATATGCAAATTACTCCCGCAAGTGCTCAAGATAAAGAATTAACGGGCTATAGCGATTTAATACTCAAACTTCAACCACTACAAAAATTTAATTTCAATTTAAGTGTAGATGACTCGGGTAATCAGGACACTGGTACCTATATGGGAAATATCGGGATAGGCGTCAATAATCCATTTCATTTAAATGATATTTTATCGTTAAACGTGAGTCACTCTTTAGATGACTTTAATGAAGACTTAAACCGAAGTTATTTCATTAGTTATCAGTTACCCGTTGGTTATTATGATTTAGGTCTTAGTTATAATGACTATCAATATAAGCAAACAGTCTTAGGGGGGAATGGTCCACTGCTTTACCATGGCAACAGTCAGCAAGCCAACCTAAATTTATCTCGTGTCATTAGCCGTAGTGGACAACATAAAACCAGTGTCTATGGAAAGCTTTATCATAAGGAAAGCCAAAGTTTTATTGATGATATTGAAATTAATGTCTTACACCGAAGAACCTCAGGCTGGAATTTAGGGTTTCAGCACCGTCAATATTTAGGAAATGCAGTATTAGACGGCAGCATCGATTACCGTCGTGGGATGGGAGTAGGTGCCCGAACTGCACCAGAAGAAAACATTACGGATGTTTATGGAAACCATCTTCCTGTTGAAGGTTACTCACGTGCTCCACTTTGGAGTGCAGATCTGCGTTATACCACACCATTTCTTTTGCTCGAAAAACCAGCTCAATATCGCCTTAACTGGCGTGGACAATATGCACCTAAAATTTTAGTACCGAATGACCGCTTCTATATTGGCGGGCGCTATAGCGTACGAGGTTTTGATGGTGAGCTCATGCTTTCCGGAGATAACGGTCAGTATCTACAGCAAGAAATCAGCTTGAATGCACCAATTCCAAATACCCAGTTTTATATGGCAGTTGATCAGGGCTGGGTCAATGGCCGCAATAGCATACCGGGTCAGCGTTATTTACTCGGAAGTGTTTTGGGGCTGCGCACTTATCAAAATAGTTTTTATCTGGATGCCTTTACAGGTCGGGGACTAATTGCACCTGACAGCATAAAAAAAGACTGGGTTACCGGTTTTAGTATCAACCTTTCTTATTAATTTACTTTAGAAAAGACTTTATTCATGAACAAGAATAGTTATCGCATTATTTATAGCAAAGCACGTCAAATGTTTGTGGCCGTGGCTGAAAATGTACGAAGCCAGACCAAGACATCGGGTCAAAGTGAAGCAAGTACCCAGACCAATATTGATAACACTGAATCTCAGGCATTTCATCAACTCTGGCAAGTGAAAGCACTTGTTGCCAGTATTAGCTTGTGGATGCCTTTAGCACCTGTTTATGCGGGTATTGTAGAGGATAGTGCTGCAAATGCTGCGAATAGAGCAGTCATTGGTGCTGGAAAGAACTCGGCAGGTACAGTCGTTCCTGTCGTTAATATTCAAACTCCGAAAAATGGGATATCCCATAATATTTATAAACAGTTTGATGTATTGGCAGAAGGTGCAGTCCTGAATAACAGCCGTCAGGGTGCTACGACAAAAACAGTAGGAAACGTTGCAGCCAACCCGTTTTTAGCCACAGGCGAAGCGCGAGTTATTTTAAATGAAGTAAATTCATCAGCCGCTTCACGTTTTGAAGGGAACTTGGAAGTTGCAGGGCAAATGGCTGATGTCATTATTGCCAACCCGTCTGGTATTAATATTAAAGGTGGTGGTTTTATTAATGCCAACAAGGCAATTTTTACCACAGGTAAACCCCAGTTAAATGCTGATGGCAGCATCAAACAGTTTACGGTTGACCAAGGGAAAATTACGGTCTCAGCGAACCCCAATTCTAAATTTGGTTTGGGTGGAAATAATAACGATGCAAATTATGTGGATCTCTATGCGCGTGCATTAGAGCTTAGTGCTGAGCTACGTGCTAAAAATGATATTCAGGTGATTGCTGGAGCAAATAATGTCAGTGCAGATTTACAGGATGTTACACCTAAAACAGGTACTGGAACTGCACCGACATTGGCGGTAGATGTTAAAGCGCTAGGTGGGATGTATGCCAATAATATCTATTTGATGGGAACTGAAAAAGGCTTAGGCGTGACTAACGCAGGGACTGTTCAGGCAGTTAACAATCTGGTGATTACCAGTGCCGGAAAAATTGAACACAGTGGCACAATCAGTTCGACCAGTAAAACCCAAGGTTTAGTGAACATACAAACAACGGGTACGGGTGCAGCTGCCGATATCAACTCATCAGGCAGTATTAACAGTAATAGTGCCTTAAATATCGATTCAGGCAATAACCTGAATGTAAATGCTAAAGAAATTATTATTAATAACGGCAGCTTAGCTTCGTCACCTTTAATTGTTAATGCCAAAGGTAATATCAATCTGGCAGCAGATACCCGCATTATGGATGATTCACAAGGAGGGGATGTCTATATTGATGCAGCAAATATCAATCTTGCCGCTGGATCGGAACTCAAAAGTAACCGTGGTACAGCAACCATACAAGTACAAAAAGACTTGGTCGCAGCCAAAGGCGCAAAACTGATTGCTGCCAAAGATTTAAATGTTTTAAGTAATGGTAAGTTATCACTTACAGAGAACCATATACAGGCATCATTAGGTTCAATCAACCTACAAGCAAATTCGGCTAATATTCAAAACCTGATTGATCTTCAAGGTGGGACGATCTATGCGGGTAAAGATCTCAACCTGTATAGTTCAGGAGATCTAAACCTAAAGAATCTTGGTTTTTCACTTGAAAACGCTGCAACACGTGTCAAAAACATTAAAGCCTATAGTGGACGTGATCTGGTCTGGAATAATGCTGACAAGGCACTTCCGCTTATTACAGGTCTGGTTCAGCTGGATGCAGCCAATAATTTAACTGTTACAGCAAAAGAAATTTCCAATAAAGACAGTATTCAACTACATGCCAATCAAATAGCACTCAATAGTGCACTGACTTCACAAAAAAATATTGATGTGAGTTCTGAAATTGCTGACCTTGTTTTAAGTCAGGCACTCAAGGCTCAAGGTGATATTAATCTAACCGCACTTGCTGGTGGAGTTACTGCAAATAGCTTAAAGGCCACATCTTCTGCTGGAAAGA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MNLDMFNNESLKDSEPTPCDFFSGEDAIAKAKELGLPDPHIVIQAIMVGDSEFRTNTIYNRSRFIARWGKIGEQLALLLRKSDPAWVYHNESQPRLENVDKKIQIIFMSGNLALGHPELVLSALCEKGYMTLKNIKENQSSYDDASKLRTWILYFPSTSHPAYTATDIPTIPFEIAYPTSFVQTPDKTKIDILPSNHTCRIAFEIDNTHPVDNDPKKPILEPSNEIKPDDFDIQLVV
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MSYSEHFRRKILAKLEEGYSIRAVAAQFEINKNTIVEWKKRIEIKKTRVRKPSKINDDALREDVEKYPDAYQYERAARFNCGVSSIGAALKRLNITVKKRR
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MLQVNELEKNHPIIYLDESGFKSHDYRPHGYSRKGVPCLGQYNWQLKNQTNAIGAIHKGYLFSVGLFDCKINSDVFHFWIEQFLIPALPENSVVVMDNAAFHKRADIQELLEQQGHKILWLPAYSPDLNPIEQMWAWVKRKRKEWLIDSVDELFRVFFESCMNNKVV

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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AZP29348.1|1997286_1999026_+	ShlB/FhaC/HecB family hemolysin secretion/activation protein	A0A0R6PI85	Moraxella_phage	6.6e-74	31.2
AZP29349.1|2002077_2003724_-|transposase	IS66-like element ISAba17 family transposase	A0A218MNE7	uncultured_virus	5.0e-140	52.6
AZP29350.1|2003798_2004134_-	IS66 family insertion sequence hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29351.1|2004130_2004559_-	IS66 family insertion sequence hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29352.1|2004652_2008252_+	hypothetical protein	A0A0R6PJK4	Moraxella_phage	5.7e-72	34.3
AZP29353.1|2008264_2008747_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29354.1|2008980_2009898_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP29355.1|2009995_2011378_+	aspartate aminotransferase family protein	NA	NA	NA	NA
AZP29356.1|2011486_2013055_+	methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase (CoA acylating)	NA	NA	NA	NA
AZP29357.1|2013158_2014550_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
AZP29358.1|2014609_2015695_-	HlyD family secretion protein	NA	NA	NA	NA
AZP29359.1|2015691_2017269_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
AZP29360.1|2017435_2018056_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP29361.1|2018110_2018416_+|transposase	transposase	A0A218MNC9	uncultured_virus	3.4e-18	52.5
AZP29362.1|2018454_2018958_+|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
AZP29363.1|2019025_2020603_-	aldehyde dehydrogenase (NADP(+))	NA	NA	NA	NA
AZP29364.1|2020618_2022406_-	dihydroxy-acid dehydratase	NA	NA	NA	NA
AZP29365.1|2022493_2023669_-	fumarylacetoacetate hydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP29366.1|2023780_2024716_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP29367.1|2024929_2025901_+	NAD-dependent epimerase	NA	NA	NA	NA
AZP29368.1|2025934_2027311_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
AZP29369.1|2027310_2028183_+	NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AZP29370.1|2028299_2029643_-	PepSY domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP29371.1|2029967_2030987_+	ABC transporter substrate-binding protein	NA	NA	NA	NA
AZP29372.1|2030989_2032000_+	iron ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
AZP29373.1|2031996_2032761_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	2.8e-16	25.1
AZP29374.1|2032757_2033249_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP29375.1|2033534_2034419_+	ribose-phosphate pyrophosphokinase	A0A076G6G0	Escherichia_phage	2.2e-33	38.3
AZP29376.1|2034430_2035924_+	nicotinate phosphoribosyltransferase	A0A1W6DY18	Aeromonas_phage	2.7e-140	50.6
AZP29377.1|2035984_2036752_+	NUDIX domain-containing protein	G3MA14	Bacillus_virus	1.9e-25	33.0
AZP31387.1|2036866_2038213_+	methylenetetrahydrofolate reductase	NA	NA	NA	NA
AZP29378.1|2038888_2039821_-|transposase	IS5-like element ISAha3 family transposase	Q1MVF0	Enterobacteria_phage	5.1e-57	40.6
AZP29379.1|2040198_2041362_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29380.1|2041594_2042566_+	acid phosphatase	NA	NA	NA	NA
AZP29381.1|2042578_2043223_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29382.1|2043258_2043699_-	HD domain-containing protein	A0A0B5H2U9	Vibrio_phage	9.6e-14	35.5
AZP29383.1|2044504_2045086_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP29384.1|2045086_2046196_-	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	A0A0A7RTT7	Clostridium_phage	1.8e-29	27.4
AZP29385.1|2046208_2046922_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29386.1|2047131_2047650_+	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP29387.1|2047902_2048844_+	HicB family protein	NA	NA	NA	NA
AZP29388.1|2048969_2049896_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP29389.1|2050003_2050903_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP29390.1|2050997_2051840_-	KR domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP29391.1|2051885_2052746_-	KR domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP31388.1|2052776_2053691_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP29392.1|2053882_2054902_+	AraC family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP29393.1|2057124_2058057_+|transposase	IS5-like element ISAha3 family transposase	Q1MVF0	Enterobacteria_phage	5.1e-57	40.6

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>CP029610|2651094:2700636|DBSCAN-SWA
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MSDQNANLTIGQLFELNQGKNPTQIADSEAHARKAAKSLGLDYDKMTETPEQIVSVADEINTQKRVNDVVASDPVLGKYALNPNQAAVSLDDFENLKDISGKVSLLGSSLSKPYQSVSYEDIQNVLNKGTSPEQKQRLKELGVYEGPQKKIKPNVNTNLIDSFSSTLVPQTSDQVFNEHYDRIKKTAGVMSAERFKKYYENQVYWMEHTATAEPTNPQEQGNRYVNAAIRAVAAIGQTEGAVISATTGNDSLLNLATRVKNKAAPSQEMSQALYQAQLAAQTNDAGVLGAAQELISNADAGLVGEFLIEQAPPALAGYWAGAGAGGVLTNSLIRNTAKYAPMVMNLEKAATLVRGVTVAGNAAQGALGAGTADAIVSYGQNMAEAREKFLTKQEQIDYAAAKTWGSAKYSALGGALMPVTFGGPLRTVGGQAVIQSAAGMYSVQGAADAVGEKADPVEMALEGLLEVATAAPEVAITSASKVKNQRTAQFALDQLRQDQQEDAVRSSTFASVLNNLIDRNKESKTAQRDDSASQAFIKQAIEEHGAVEEVYIDGQTFNQLLRDRNIEPSDLFERAPSLQDQLGTAETFNGTVQIPVNEFVSAMSVVERPTDFVENVRSDPNMPTYREAQENLAKTTEQMQQEANVFMEEQARFESAEDAKELVATEVQNQLASVGTFTAKYNRAAGELTSAFYSTLGDKLGINAKEAFDRYPIRIADEPNTDKGTSFNQSASPEQTISVDDFVKGIKKQYGIELGLKGSQSSNVLSLHKIVVPEAMRNQGTGTKAMQDIINYADSQNKTIALTPSSDFGGNKNRLTGFYKKLGFVENKGRNKDYEISESMYRSPNGRKYNQTSILKQTDTISFKKWFGDSQVLDANGNPQIRYHGTRDNWSQWDKSRAGGLIHTTSDVDIAERYAQGAGGGRKRSDPVYKDNKENIFELDGNEYVNKSDGTRLSFQDIQDMLDSGDLNPFYPDGRIEPIYVRAENPLDLNTKEGLKILASIQATSRFGRSVVDQAKAGVFDWNSTKHEFKNKHWADDLVPKLKELGYDAVIFADDGHQTLSVFDSEQIKSVNNNGDFNSEDPNIYKQANGGTRGSITFSIGQDGSTIVLSKNADFSTFVHELGHHFLEMNMQIALSPDAPEQVRADMETVMKWASPETTDLGEWDFFTDAEKTSVHEKFAETFEQYVFTGKAPSASLKQVFNRFRQFMIAVYRNIEKFMGINDRAELNADITGVMDRMLASSSAIAEAQAASNLEMLIHQDDAMRLGISPKDYDEMRQDHEIATELSINTLEQKSLRNMVWYQKQKSKYMKTLQKEADKKRAAVREDMAKEIAQQPVYQAMAFLRQPLDPVAKRDSTKVEPSQDNLFEAVAKFGGLDANEVESTWGIDEAAKTKSGVGNKPVVRSSKSRIKGLSIESMAEKLSEEGYLTLDEHGKFDTRELEDKFADQLRGINQYSTQVDPELLDYSQDMDLLRRYAEGRTTKGKLSLDWIEAKYGRDSAIYQSISKGAYGFAQRGGENPDVVAEMFGYESGDALIRDLLNSPSPKQKIDELTDARMAVQYSEFYDQQSIVEAVEAALHNDVRARFLSAEMAALNGMLGRKSALNEAAKTVAQDIVQRQKIKDIRPHVRAQDDARLGRMANDAFRKGNTVEAARHKRNQLVQFYATKYSYDAKDQIQKNLDLVKKVFGNNEKLSKNRDFDFVTAARGILGKYDLGRESTNYEHQLELIRKYDPTTYAEIQNIGALPENQSYRELTLEQFNAVMSAVETLWHRSKENKIWHTTNEAFEREQVREELIQQSSGKKSIEKIQQNLLGKNKAAELKTKFMELGASAKRVDQVVTWLDGGPNGKFRNYLINPMQDALAKYRTEKAKMLKEVVDTFEGFGKLDNSKIAAPELNNFTFVGKQSLLHAILHTGNMSNKERLVLGYGWGARLEDGSVDFSAWDKFFNRMINENVITKNDMDTIQKLWNLFDKYKEQAQITHKKINGRYFDELPRTPISTPFGEYEGGYVPAAYDRMRSNEQDRIQDKNLAENNLQALDIATTGANFTKSRADRYHDQLELNMSRLPSHLDKELRYIHLELQIRQIGRLMLNKDFRNEIERVMPFGVKQVFNPWLKAIANQTVDESSGVHLLDNIFRVLRRNTGIAIMAGNLKNAIEQFTGFTQVSVAVPPKQLLKAQAHYFTSVATREDMANSIMEMSDFMKTRFDRAADEYRYAVDEIVFQKGAIQTVKDFTMKHAYVLQTTIQRPMEMISWQAAFNHYTEQGYTQYDAVHAADAVIRQYMTDMSPEGISNLERGTPAKRMFLMFYNWFNMIWNTTSSEAKLALEASNGSWVQASPRLGYIALMMISIPSILSELLSVIFAGGLQDGDDDGDKWDDLSAKLALSQLKMLSAFVPYAGNVVNAAISNTDDSVVNDRYTASPVFSMGESGLSLIQHAKRALDEDKEVNQGKAAKDMLNTATLATGIPFAVLGKPIGYWLAVAQGKKEAPDSIYDATRGTITGKHAPEDDK
>CP029610|2651094:2700636|2698654_2699284_-|AZP29960.1|DBSCAN-SWA
MKKFKIICTLIFSFLFFLSCSIFFKHQFNIDGDYLSAFSTIVAATAAFYFYTDWKDEHKFNLLKQHQDYLKIKGAKLLEHFRKSQVLFATIEGSTVQEGEKKWIDACVEIRLFSLELTNIQKSLLEYKSCLSTFDSNEILEKHRDRLEKYSTRISQINDEFVSKLPFYTISTSPQCSDVLESWRDSIIKFDFFCSVEMSDFYFKYLKTK
>CP029610|2651094:2700636|2654689_2656111_+|AZP29912.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MQPFVLYNSEQRKKVEFVPRKEGHIDMYVCGMTVYDYCHIGHARVMVAFDYIIRFLRSQGWNVRYIRNITDIDDKIIKRANENGETIQQLTTRFIDAMNEDAANLGCLAPDEAPKATEYIDQMQNMIGNLVNKGAAYPASNGDVYFEVTKFEKYGRLSGRKLDDMQAGASERVDVEVEKKHPFDFVLWKHAKENEPSWASPWGNGRPGWHIECSAMSTCCLGNHFDIHGGGSDLMFPHHENEIAQSEASTGEQYVNYWIHVGFINVDGEKMSKSLGNFFTIRDVMEKFHPEVIRYFIVSSHYRSPVNFSDVALKEAKTSLTRFYHSFKAYQQVYGQTTTETLDQSFIERFNNAMCDDFNTAEAMAVLFELNKELNRAVKEEQADQATVLYSTLRHLTNILGLVQHNVDDFLKSDIGQEALALSDAEIEDFIQQRVDAKKAKDFAKADGIRQSLLDQGVVLEDTRQGTVWRRAD
>CP029610|2651094:2700636|2689513_2689735_-|AZP29944.1|DBSCAN-SWA
MTNLTEHKCKNKCPEFKGEQCNHCLVQPVEMRKIEDMGDDRHIENHVSKNCQVFSCDESVHLSRAFIAMGEVS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AZP29907.1|2651094_2651838_-	LPS export ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.8e-20	28.2
AZP29908.1|2651837_2652386_-	lipopolysaccharide transport periplasmic protein LptA	NA	NA	NA	NA
AZP29909.1|2652369_2652918_-	LPS export ABC transporter periplasmic protein LptC	NA	NA	NA	NA
AZP29910.1|2652955_2653495_-	HAD-IIIA family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP29911.1|2653498_2654476_-	KpsF/GutQ family sugar-phosphate isomerase	A0A2P0VNK5	Tetraselmis_virus	7.3e-38	31.7
AZP29912.1|2654689_2656111_+|tRNA	cysteine--tRNA ligase	M1PG92	Moumouvirus	1.9e-55	30.6
2656200:2656256	attL	NA	NA	NA	NA
AZP29913.1|2656464_2657478_+|integrase	integrase	A0A0R6PHH4	Moraxella_phage	1.7e-69	41.5
AZP29914.1|2657502_2657697_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29915.1|2657836_2658460_-	lysozyme	A0A075DXC6	Acinetobacter_phage	6.6e-69	64.5
AZP29916.1|2658470_2658842_-	hypothetical protein	A0A2H4JFC0	uncultured_Caudovirales_phage	5.8e-28	50.4
AZP29917.1|2658955_2662630_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29918.1|2662705_2662996_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29919.1|2663110_2663350_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29920.1|2663466_2670999_-	GNAT family N-acetyltransferase	Q775D4	Bordetella_phage	1.9e-93	25.4
AZP29921.1|2671088_2671760_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29922.1|2671764_2674059_-	transglycosylase	NA	NA	NA	NA
AZP29923.1|2674059_2674677_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29924.1|2674673_2675147_-	DUF2833 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP29925.1|2675143_2677177_-	hypothetical protein	Q775D1	Bordetella_phage	6.0e-135	40.0
AZP29926.1|2677176_2677731_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29927.1|2677745_2678111_-	hypothetical protein	A0A0F6TJP2	Escherichia_coli_O157_typing_phage	2.4e-26	55.0
AZP29928.1|2678179_2678437_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29929.1|2678439_2678844_-	hypothetical protein	A0A193GYT9	Enterobacter_phage	2.3e-14	40.3
AZP29930.1|2678858_2679854_-	hypothetical protein	Q775C7	Bordetella_phage	4.0e-92	53.3
AZP29931.1|2679871_2680543_-	hypothetical protein	A0A2I7RHR0	Vibrio_phage	1.6e-12	33.8
AZP29932.1|2680511_2680841_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29933.1|2680837_2682526_-|head,tail	phage head-tail adapter protein	G9L6C2	Escherichia_phage	7.3e-70	32.8
AZP29934.1|2682527_2682818_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29935.1|2682890_2684513_-|terminase	terminase	Q775B9	Bordetella_phage	3.9e-185	59.7
AZP29936.1|2684496_2684769_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29937.1|2684796_2685537_-|terminase	terminase small subunit	A0A1Y0SUQ3	Pseudomonas_phage	1.8e-49	47.7
AZP31425.1|2685537_2685747_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29938.1|2685749_2686097_-	RusA family crossover junction endodeoxyribonuclease	A0A1X9SFE9	Acinetobacter_phage	6.4e-29	53.9
AZP29939.1|2686093_2686837_-	DNA replication protein	A0A0D4DBZ2	Acinetobacter_phage	1.6e-56	50.6
AZP29940.1|2686838_2687720_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29941.1|2687716_2688082_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29942.1|2688078_2688657_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29943.1|2688653_2689517_-	hypothetical protein	E2GLY5	Acinetobacter_phage	4.8e-17	27.5
AZP29944.1|2689513_2689735_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29945.1|2689793_2690150_-	transcriptional regulator	J7I452	Acinetobacter_phage	4.2e-44	79.7
AZP29946.1|2690158_2690347_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29947.1|2690450_2691176_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A0P0I8E0	Acinetobacter_phage	4.9e-63	51.3
AZP29948.1|2691178_2691484_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29949.1|2691646_2692021_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29950.1|2692088_2692967_+	hypothetical protein	I6NVL7	Burkholderia_virus	2.5e-29	35.7
AZP29951.1|2693096_2693669_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29952.1|2693670_2694651_+	recombinase	A0A0A7RWR9	Clostridium_phage	2.1e-48	36.3
AZP29953.1|2694662_2695595_+	transcriptional regulator	A0A2H4J6I3	uncultured_Caudovirales_phage	1.0e-52	66.7
AZP29954.1|2695666_2697148_+	ATP-dependent helicase	A0A075DXT4	Acinetobacter_phage	8.7e-67	34.6
AZP29955.1|2697144_2697378_+	protein ninH	NA	NA	NA	NA
AZP29956.1|2697374_2697686_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29957.1|2697682_2698030_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29958.1|2698026_2698230_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29959.1|2698334_2698631_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29960.1|2698654_2699284_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29961.1|2699788_2700292_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
2699419:2699475	attR	NA	NA	NA	NA
AZP29962.1|2700330_2700636_-|transposase	transposase	A0A218MNC9	uncultured_virus	3.4e-18	52.5

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>CP029610|2722511:2729887|DBSCAN-SWA
ATTATGAATTCTGAAGAATCACAATATTTGAAGCTTGTGGGCCTTTTTTACCCTGTACTACAGTAAACTCAACACGTTGGCCTTCTAAGAGAACCTTAAAACCTTGTGTTTGAATATCGGTAAAATGAGCGAAAATATCCTTACCTTCATCAGCCGCAATAAAACCAAAACCTTTAGTTTCATTGAACCATTTTACTGTACCAGTAGAAGTAGACATATATTTATCCTAAATTTTAAAATATTATAACTTATTATTGGGGAAACCAATTTAACTAAAAAATAGACGTGAAAACTTAAATATCTGAATGAACCGAAGACTTATAAATAAAACTGCGAAATAGAAATTTATGATGACAAGAATATTTTGTTAGTTATGCTCGACTATACACGCTTCAAAATCATTTGCAATCGATATTCAAAATAATTAAAGCAAGAAAAATTCTATACTGCTGGTTCTACATCTTTCATCTTGATTTGATTAAAGATCCTTTCAATTAAAAATCTAATATTCTATATTTTAATTGAAAGAAGTACTTTTAATTCTTGAGTTACTGACGCCATTAATAGAATTTCTGTTCACCAGCAGGACGTGTTTTAAAGCGTCGATGAAACCACATGTATTGTGTAGGGGCAATGCGAATTTGGTTTTCAATAATCTTGTTTACCCTTTCAGCGTCACTGACTTCACAGCCACTCGGGAAATTTTCTAATTTAGGTTCTACTAAAACATGATATTGCGGATTACGAATATCACCACTACGGTAAAAATATAAAGGCACGGCTGCTGCTTTTGAGATATCCATTAGTCTGCGATGCGCTGTAACGGTAGCTGCCTGAATACCGAAAAATGATGCCATTACGCCTTGTTTTAAGCCAAAATCCTGATCTGGGCTATACCATATCGCATGCCCATGTTTAAGGTTTTGTATGAGTCCACGCATGTTGTCTCGAGCAATTTGGTTTTTATACACTCGCGCACGACTACGATGAATCAGAAAATCTAAAAACGGATTGTTTTGAGGTCGGTAAACCACGTCCATATTAAAGAATAAAGTACACGCCGCTCCACCTGCATCTAAAAGCGTACTGTGGGTACCTAATAAAAGTACGCCATTTTCCTGATTATTGGTTAAATTTTCTAAACCATCTATGTGAACACGACTTTTAAACCAATTTGGGCAATACCAAGCATTTAAAGCTTCAAATACACCCGTTAAAGTATCAACAAAAACCTGTTTAGCTTTTGCCTCAATTTGCAAAGGTGTTTTTTCTGGGAAACATGCTTGTAAATTACGTAGTGTAGTTTTTCTTCGAGAACTTAAAGATTTCCACGCTATTTTTGATAGTAAGTCAGCAAGGCGCCATTGAATAGCCCAAGGTAACATCGCAAATAACATTAGAATAAAAGCTAAAAACCATATACCCCAATATTTAAACGCTAAAAAGGAAAATTGAAACTCGCCAGATTTAAACTGCCGTTCATTTTTCGTCATACTATAGATTTCTTGAGGTATAGACTTAGTATACTAACATGCTCAATTTTTAACGTTGTGTGTTTATGTTGCTTTCACTTTTATAGTTTTATATGCCCTATTTATTTATACAAATCTATATTTTAAATATTTAATCTATGTAAGACTTAAATATACATAACCTTCTGTATACAACGATTATTTTCTCATTTAAAGTAACCGCACAATCTTGCCTCAATTGATAAATAGGATATATCAGCGTGAGCGGTCTTTTAGTATTTATAACAATAGCATTTCTTACCCTATTAAGCCCAGGACCGGGAGTTTTATTTACTGTCACAAATTTAATTAACTATGGTGTTAAAACTGCTTTGTTTGGAATAAGTGGTTTAATTATTGGTATGTTTGTGATTGCTGTAATTTCTGCCAGCGGTGTAGGACTTATTATTACTAGTAACCCTACTATTTTTACGGTTTTAAAATTTATTGGTGCATTTTATTTAATGTATCTCGGATATAAAAACTTTACTAAAAAACTTGCAACCCAAGAGTTAATGACCGATCAACAAAAAGATAAAGCTGTAAGTAAATCTAAATTGTTTTATCAGGGCCTATTCGCATCTTTGCTTAATCCTAAAACAATCGTATTTTTTATCGCACTCTTCCCTCAATTTATTGATATCAAGAAAGAGATTTTAAATCAATTTTTAATTCTTTCTTTAACCTTTTGTTTTATTGGTTTTTTAATTCATTTAGTTTACGCAAACTTCTCTTCAATTTTTAAAGAGAAAATGTTAGCTGGAAATAATTTCACGATACTCAATAAAATTAGTGGTGCTATTTTCTTTCTACTTGCCATTTTACTTATCGCACAATAAAGCATTGCTCGACCTATTATTTGTTAAAAAGCCTTAACTCATGGTTAGGCTTTTTAACTCATTAGATCTTTAAGCATGTTCTTTTCTAATACATTTTTAGAGTGTTACTCTGTTTAATATCCAACCATAAAAGAAATCTTCGTAGTTAGGGTTGTTCTCGGTAATTTCAATATAATGCTGCCCTTGCATAATATTTAAAATGCGCACGAGTACTTTTTCACCCTCTTTATTACGTCTATTTAAGTACGTAGCCAGTGCTTGCAAAGTAAGAGGTCCGTACTGGCCATCTACCACAAGATTTGACCAACCTTCCTTCCCCTGCTTATTCAGCAGATTTAAAGCACGTTGTAATAAAGGCTTTGTAAAATTGATGCCACAATTTATAGCTGTATCCAGTAACTCTTCTGCAATAGCTGGGCTAATCGCATTAATCTGGTCAAACTGTGGTTCAAGCCAGTATTTTTGCTTATAAATAGATTTGGCGACACTTAAGGGCAAGTCTTGCATGTTGCCTTGATATCCGTTCGATCGAGCGACTGCTTCTGTAATGCCAAATTTAGTCGCATGGCCATGATCTGATGGATGGTTAACATATCCGCCTTCTCGGCTGATAACTTTTTCTAAGTATTGATCAATATTCATTTTATTCTACCTTTATATTTAAAGCTGTCTTTAGCTATTTTGGAGATCATCTTTTGCTTTTTTTAGGTCTTTAATGACCTCTACAATCGTTTTACCTTCTTGTTTATTGATGAAGTTAAATATCCATCTCACAATAGCCCAGCCCGGTAAACCACAGATGAAGAAAAATCCAGATAGGGTGATCATTCCCCAAATATCGGATACCCATTCATGCAGGTTCCATTTCATAATAATGAATGAGCCGCCTGTCAGGCTTGAAACTACTGTACAGATGAGAGCAACAATCCATTCTTGTGGAGAACGAGGAAAACGCATCATCAATACAACTGCGACAACTAAGCTGACTGCCAAAGCCACCATAATTGCAATACTATAAAAATTTAAAAATGTGGCTAACCCACTGCTAGAAACTGTTTCCATGACTTTGTCCTGCGCTAAAGGGTAAAACTTGAAAACTCATCACGTTGACCAGCTTGTGGTTTTCAATGTTTATTAATTCCTTCGTTTTCTTTATTACAGTCAATAAAAAACACTAACGCTTTAAAGCAGCGCTAAATTGCAAGACGAACTTATCCTTGACCCCATTTATTTCAGGGGTCCGAGAAAGAATGTTTGTATGCTAAAGCCTGTTAGTGTGCACCGTTTAAGGCTTGTTCAATCAACTCAATCACTGTGATTGCACCAATCGCTTTTTGCATAGAGACTTGATCATCGAATTCGAATGCGTCATCTTCAAGCTCATTTACAATCTGCTTGGCCTCCTCAAGTGCCCTTTTTATTTTTTGTACCTTATATTTGTTTACGTCTTTGGCAATTGTCGGGATATACCCTCCACGTTTTGCATTTTTAAGTTGTTTAGCTCTGTTCTGCATTGCTGTAGTCATTCACTATCTCCAACTCAATGTACTCGTTAGTAAGGCGTCTTTATCGTTTGTTATTCTTGAGGTTTTGATACATTCTTTGAGCAATATAGCTAAGCTATGACTACAAATGTGTGTTCAAAACGTTTCATCTGGTACAACAATCATAAAGAGCCCAACTATATGCAATTAAGCCACTAATTTATAAACAAATATTTCCTTTTCTAAAAATGTAAAAAAGTATTAAATTTTGTGGATTTAAGCTTTTTACACGCCTTAATTTTTTGACCAAAAAGTTCATATAAAGCTTTGCCGTATATCGGAAACTTTTGTTAGGTCTCACAATCTTTGTTAAATTCTTCATGTTCTTGATACCCTTTATCGACGAACATTAAGCCTGATCCACGGAATCGGGCTTTTTTTATTCCAATTTTTGTTTTGATAGCCTGTTTGCAAATAATAATTGAGCTATCTCCCTTTTATTCTGCTACCTGTAGAAACAAAATAAATTTAGCTTCCATCTCAAAGCTTTGATAAAGCGATAAATAGTGACTTAGGTACCATTTAAATTTTCTCTATTCATCTTGAGATATAACTGATATTATAACTATAGTTATTATTAGTCAATAACTATAGTTGTTTTACTCTATATAACTTAAGTTATATATTTGTTATAAGTTTACTGGTGTAACCATTATGGCTCTTAAAGACCGTTTAAAAGACTCTAGAATTAAAGCCAAAAAAACTCAGGCTGAAGTGGCAGAAGCTGTAAAGATGTCGCAACCTGCCTATCAGGCTTTAGAGTCAGGGAAAAATTTAAAATCTGCATTTCTTCCTTTAATTGCTCAATTTTTAGGAGTGGATGGTTATTGGTTAACGACAGGGAATACTGAAGATTCTTTTAGAGAAAGTGATGTATTTAGCCCGACTGTAGTAAGTGCAGAAGCTACCGATCAATATGTCTGGATTGAAGTTGTAGAAGCTAACTTTTCTTGCGGGACAGGTGAATCTATTGAATTTCACTTTGATGCTATTAATGGAAAAATTCCATTCCCTGCTTCATTCTTTAAAGAAAAACGCGTTGCTCAAGAATGCATGCGTATTATTAAAGCTAAAGGCGATAGCATGACCGACTACATTAAAGACGGAGATTTGGTGGGTATTGATATCTCTCAAACAGAAGTCATTGATGGCGAGATTTATGCGGTTTACTTTGCTGGCGAAGGAATGATTAAACAGATTTTTAAAGAGGCAGATGGCTCTTTAATTTTGCATAGCTTAAATGAAAAATTTAGAGACCGACGTGTAACAGAAGAGAACGGTAAAAACTTTAAGGTTATGGGCCGCCAGTTTTGGCGAGCAGGTTAATTTAGTTATTAAATATAATTAAAATAATAATACGAGCGTTTTAATCATTTCAGCCTTTTTATAACTTTAATTATTTATATAACCTGTAGACATAAAAAACCTATCTCCTTTAAAAGAGATAGGTTCTCTCGCTTTATTACCATGGTTTTATCAACAATATGTATTTAAACGATAAAGTTGATTAAACCCGGTATAGAAGCTTTTACCATCTTGGTTTAACTCAATTTCTTCACCAGATTGAAGTTGAATTTTTTTACCAACTTCGACCCAACGATATCCAACGAGAGAGTTTTGTTTACGCACGTGAGGAACAATCCTCACATTAATTTCGTTGCCATTTACGGCTGTGGCAATGTGCCACTCATTTACTATATTCACAATCATTCACTCATCACTGAGCTCATGTGATTTTACGGTATGTAATTAGAACGCTAGATTTAGGGTATGGACAGTTCGTCTAGAATTTAATATTTAGCTTTATATAGGGTTATTTATAAGCTAATTGCTTTTCATAATTTTCGTATTATGAAAAGTGGTACATCACAGAGCATAATATTTTTGGATGCGGGAGTCGGATTTGAACCAACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCAGACTGCTCCACCCCGCAATTGGAAGTAAGCTTTATACGCTCATATATTTTATAAAGCAAACTTTATTTTTTAATCGGTTGTAATTATTAACAATTCTCTTTTTATTATTTTTTCATTTTAACCATTCAGTCTAAATTCACTTATCAATTTCAATTTTTAATTCTTTAAATTGTTGTATTTATTTTTAATAGAACCCGATATTCATAGACAACAATTGCCTTGGTTGGATGGCTTTTATACTATCTAGATTGGTCCTTTAATTTTTAGTTCGTATGTCTGAACCTCAGTTTTCCCTTAGTGAATATCTCGGCACAGTTCAGGAAGTCATACGTGTGGCTTTTGATGAGCCAGTTTGGGTAAAAGCAGAAATTCGAAATTTAAATATTAAGGGCGGCCATTACTATTTAGAACTTGCAGAAAAAGATGCAGAGACTGATAAAGTCATTGCCAGCTGTAAAGCCACGATCTGGAAATTTTCAGCGAGTAAAATTGTTTTAAAGTTTGAACGTGAAACTGGTATTGAGATTTCGAGCGACTTAAATGTACTCATCAAAATTAGAGCACGTTTTGATCCTCAATATGGATTTTCGGTCAACATCGAAGAGATTGACTCAAGCTTTACGTTGGGTGAAATTGCTAAACGTTATCAGCAAATTATTGAACGACTTACTCAAGAAGGTTTAATCCATAAAAATAAACTTCTTCCCACTCCTTTTGATATTCAAAATGTTTTAGTCATTGCTCCTCAAAATGCTGCGGGCCTTGGTGACTTTAAAAAAGATGCAGATGCACTTGAGCGAAATGGGGTTTGCCATTTTGTGTATCAGACCGCTACTTTTCAAGGAAACACGGCTGCAACTAGTTTGATTGAATCTTTAGGTTCAGGTTTAAGACAATGGGCCAGTACATTTAACTTTCCACCTGATTTGATTGTGATTATTCGCGGTGGTGGATCGGTGAATGATTTAGCTTATTTAAATGATTATGAACTTGCCGCCCTACTTTGCAAACGCAGTGTACCGATTTGGGTAGGTATTGGTCATGAAAAAGACCGTACTATTCTTGATGAAATTGCCCATCGCTCATTTGATACACCAAGTAAAGTGATTGCTGGCATCCGAAACCACATTGTTGAACGCGTCCAAGAAGCTGTAGATAGCCTACAAACGATTAAGCTACTTTCTCAGCATCAAATCACAACCTATCAAAGCAAAAATGATCAACTGCTTCATCACATTAAGTCATCCGCACAGAGTCAACTTAGCTCAGCGCATCGTTTGCTTGATCAGATGAAAGAACGTATTCAATTTAGCTCACAGCAACAAGTTAAATTTTCATTAGCCCAAATCGAATCTTTGATGAAAGAAATCCTTTTGCAAAACCCAAAACAGGTTCAGGCCAAAGGCTATGCAATTGTTAGATCAGAAGGAAAAGCGATTCGCTCTATACATCAAATTTCAAGCCCCGCCATTGCTATTGAGATGCAAGATGGTGTGCTTGAAGCCAACATTACGCAGGTAATTCCAAATGAAGAATGA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

>CP029610|2722511:2729887|2723070_2724003_-|AZP29989.1|DBSCAN-SWA
MTKNERQFKSGEFQFSFLAFKYWGIWFLAFILMLFAMLPWAIQWRLADLLSKIAWKSLSSRRKTTLRNLQACFPEKTPLQIEAKAKQVFVDTLTGVFEALNAWYCPNWFKSRVHIDGLENLTNNQENGVLLLGTHSTLLDAGGAACTLFFNMDVVYRPQNNPFLDFLIHRSRARVYKNQIARDNMRGLIQNLKHGHAIWYSPDQDFGLKQGVMASFFGIQAATVTAHRRLMDISKAAAVPLYFYRSGDIRNPQYHVLVEPKLENFPSGCEVSDAERVNKIIENQIRIAPTQYMWFHRRFKTRPAGEQKFY
>CP029610|2722511:2729887|2724242_2724860_+|AZP29990.1|DBSCAN-SWA
MSGLLVFITIAFLTLLSPGPGVLFTVTNLINYGVKTALFGISGLIIGMFVIAVISASGVGLIITSNPTIFTVLKFIGAFYLMYLGYKNFTKKLATQELMTDQQKDKAVSKSKLFYQGLFASLLNPKTIVFFIALFPQFIDIKKEILNQFLILSLTFCFIGFLIHLVYANFSSIFKEKMLAGNNFTILNKISGAIFFLLAILLIAQ
>CP029610|2722511:2729887|2725532_2725922_-|AZP29992.1|DBSCAN-SWA
METVSSSGLATFLNFYSIAIMVALAVSLVVAVVLMMRFPRSPQEWIVALICTVVSSLTGGSFIIMKWNLHEWVSDIWGMITLSGFFFICGLPGWAIVRWIFNFINKQEGKTIVEVIKDLKKAKDDLQNS
>CP029610|2722511:2729887|2726131_2726386_-|AZP29993.1|DBSCAN-SWA
MTTAMQNRAKQLKNAKRGGYIPTIAKDVNKYKVQKIKRALEEAKQIVNELEDDAFEFDDQVSMQKAIGAITVIELIEQALNGAH
>CP029610|2722511:2729887|2728621_2729887_+|AZP29996.1|DBSCAN-SWA
MSEPQFSLSEYLGTVQEVIRVAFDEPVWVKAEIRNLNIKGGHYYLELAEKDAETDKVIASCKATIWKFSASKIVLKFERETGIEISSDLNVLIKIRARFDPQYGFSVNIEEIDSSFTLGEIAKRYQQIIERLTQEGLIHKNKLLPTPFDIQNVLVIAPQNAAGLGDFKKDADALERNGVCHFVYQTATFQGNTAATSLIESLGSGLRQWASTFNFPPDLIVIIRGGGSVNDLAYLNDYELAALLCKRSVPIWVGIGHEKDRTILDEIAHRSFDTPSKVIAGIRNHIVERVQEAVDSLQTIKLLSQHQITTYQSKNDQLLHHIKSSAQSQLSSAHRLLDQMKERIQFSSQQQVKFSLAQIESLMKEILLQNPKQVQAKGYAIVRSEGKAIRSIHQISSPAIAIEMQDGVLEANITQVIPNEE
>CP029610|2722511:2729887|2727058_2727730_+|AZP29994.1|DBSCAN-SWA
MALKDRLKDSRIKAKKTQAEVAEAVKMSQPAYQALESGKNLKSAFLPLIAQFLGVDGYWLTTGNTEDSFRESDVFSPTVVSAEATDQYVWIEVVEANFSCGTGESIEFHFDAINGKIPFPASFFKEKRVAQECMRIIKAKGDSMTDYIKDGDLVGIDISQTEVIDGEIYAVYFAGEGMIKQIFKEADGSLILHSLNEKFRDRRVTEENGKNFKVMGRQFWRAG
>CP029610|2722511:2729887|2727880_2728114_-|AZP29995.1|transposase|DBSCAN-SWA
MIVNIVNEWHIATAVNGNEINVRIVPHVRKQNSLVGYRWVEVGKKIQLQSGEEIELNQDGKSFYTGFNQLYRLNTYC
>CP029610|2722511:2729887|2722511_2722727_-|AZP29988.1|DBSCAN-SWA
MSTSTGTVKWFNETKGFGFIAADEGKDIFAHFTDIQTQGFKVLLEGQRVEFTVVQGKKGPQASNIVILQNS
>CP029610|2722511:2729887|2724956_2725502_-|AZP29991.1|DBSCAN-SWA
MNIDQYLEKVISREGGYVNHPSDHGHATKFGITEAVARSNGYQGNMQDLPLSVAKSIYKQKYWLEPQFDQINAISPAIAEELLDTAINCGINFTKPLLQRALNLLNKQGKEGWSNLVVDGQYGPLTLQALATYLNRRNKEGEKVLVRILNIMQGQHYIEITENNPNYEDFFYGWILNRVTL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AZP29988.1|2722511_2722727_-	cold-shock protein	A0A1X9IGI9	Lactococcus_phage	5.9e-17	61.7
AZP29989.1|2723070_2724003_-	lauroyl acyltransferase	A0A1W6JP29	Morganella_phage	3.6e-42	34.2
AZP29990.1|2724242_2724860_+	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
AZP29991.1|2724956_2725502_-	hypothetical protein	A0A0N7IRE7	Acinetobacter_phage	3.0e-73	71.3
AZP29992.1|2725532_2725922_-	hypothetical protein	A0A0P0IYC0	Acinetobacter_phage	3.0e-51	76.7
AZP29993.1|2726131_2726386_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP29994.1|2727058_2727730_+	LexA family transcriptional regulator	A0A1B1P9J5	Acinetobacter_phage	9.1e-64	55.8
AZP29995.1|2727880_2728114_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
AZP29996.1|2728621_2729887_+	exodeoxyribonuclease VII large subunit	M1NLU2	Moumouvirus	1.4e-12	30.4

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>CP029610|2759792:2845299|DBSCAN-SWA
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MSTDAARDKAIRIEAQEDLYFFTRYMFKERRGYKWMQNWHHLEICEALMKVYRGEIKRLIINVPPRYSKTEIAVINFMAWCFGKNPDCEFIHISYSAMLAANNAFQIRTLVQEEAYRKVFPELTLRDDSKAKDFWRTSQGGVCYATGTGGTITGFGAGKLRKGFGGCIIIDDPHKAHEASSKTIREGVIDWFQNTLESRTNSPDTPIIVIMQRLHEDDLAGWLLGDRKDGVPVAGGNGEVWEHLCLSAIQEDGSALWPAKHNIQKLRLMEQAAPYVFAGQYRQMPSPPAGGFFKPDNIQIVEALPADVLKQVRAWDFGATENEGDFTVGVREALGADGFTYIVDVTRGQLGPDNVNKRLEQTAKLDGKKVSVRLPQDPGQAGKSQANSFVKLLAGYNVIAKPISGDKLTRAQPFAAQVNVGNVRMLKGEWNKDFIDELRHFPNGTHDDQVDAASDAFNELHEGFEAFFADMGFAR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AZP30024.1|2759792_2760509_+|tRNA	tRNA (guanosine(46)-N7)-methyltransferase TrmB	NA	NA	NA	NA
AZP30025.1|2760681_2761308_+	glutathione S-transferase	NA	NA	NA	NA
AZP30026.1|2761321_2762101_-	DUF2520 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP30027.1|2762194_2763622_-	OmpA family protein	NA	NA	NA	NA
AZP30028.1|2763835_2765080_-	aspartate carbamoyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP30029.1|2765083_2766100_-	aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit	NA	NA	NA	NA
AZP30030.1|2766224_2766572_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30031.1|2766790_2769022_+	bifunctional 23S rRNA (guanine(2069)-N(7))-methyltransferase RlmK/23S rRNA (guanine(2445)-N(2))-methyltransferase RlmL	NA	NA	NA	NA
AZP30032.1|2769040_2769457_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30033.1|2769725_2770220_+	damage-inducible protein CinA	A0A218MNG4	uncultured_virus	1.3e-27	42.7
AZP30034.1|2770270_2772850_-	ATP-dependent chaperone ClpB	K4FB40	Cronobacter_phage	1.3e-123	32.7
AZP30035.1|2773149_2773959_+	M23 family peptidase	G9BW84	Planktothrix_phage	1.0e-16	34.5
AZP30036.1|2773955_2774381_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP30037.1|2774476_2774899_-	OsmC family protein	NA	NA	NA	NA
AZP30038.1|2774977_2775097_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30039.1|2775337_2776045_+	cAMP-activated global transcriptional regulator CRP	NA	NA	NA	NA
AZP30040.1|2776204_2777254_+	NADP(H)-dependent aldo-keto reductase	NA	NA	NA	NA
AZP30041.1|2777308_2778088_-	M48 family peptidase	NA	NA	NA	NA
AZP30042.1|2778203_2778521_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30043.1|2778643_2779963_-	adenylosuccinate synthase	A0A2P1EKE7	Megavirus	3.7e-69	36.2
AZP30044.1|2780026_2781193_-	ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit	NA	NA	NA	NA
AZP30045.1|2781376_2782468_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30046.1|2782633_2783653_-	aldehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AZP30047.1|2783923_2786560_+|tRNA	alanine--tRNA ligase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	6.3e-76	38.4
AZP30048.1|2786846_2788049_+	DUF4102 domain-containing protein	A0A0R6PHZ3	Moraxella_phage	1.6e-103	50.4
AZP30049.1|2788304_2789012_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30050.1|2789107_2789773_+	DUF159 family protein	A0A218MNF5	uncultured_virus	1.3e-54	47.9
AZP30051.1|2789866_2790361_+	DNA polymerase V	A0A2H4J538	uncultured_Caudovirales_phage	4.8e-46	61.5
AZP30052.1|2790364_2791663_+	DUF4113 domain-containing protein	A0A2H4JBL5	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-155	60.2
AZP30053.1|2791697_2792468_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30054.1|2792725_2793271_-	hypothetical protein	J7I0Y1	Acinetobacter_phage	1.1e-96	95.0
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AZP30056.1|2793758_2794301_-	DUF4376 domain-containing protein	A0A172Q0F8	Acinetobacter_phage	4.8e-31	45.3
AZP30057.1|2794297_2803603_-|tail	phage tail protein	A0A0R6PIC9	Moraxella_phage	0.0e+00	64.4
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AZP30060.1|2805080_2805779_-|tail	phage minor tail protein L	A0A0R6PIG8	Moraxella_phage	4.8e-92	68.1
AZP30061.1|2805788_2806145_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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AZP30063.1|2806663_2810713_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A0D4DC37	Acinetobacter_phage	1.7e-173	42.7
AZP30064.1|2810837_2811437_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30065.1|2811518_2811923_-	type II toxin-antitoxin system HicB family antitoxin	A0A0D4DCG1	Acinetobacter_phage	1.7e-57	82.1
AZP30066.1|2812012_2812195_-	type II toxin-antitoxin system HicA family toxin	A0A0D4DC32	Acinetobacter_phage	6.9e-27	91.7
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AZP30080.1|2819955_2820192_-	hypothetical protein	A0A0D4DC19	Acinetobacter_phage	4.8e-36	94.9
AZP30081.1|2820188_2821292_-|head	phage head morphogenesis protein	A0A0D4DBL9	Acinetobacter_phage	4.0e-202	97.3
AZP30082.1|2821293_2822745_-	DUF4055 domain-containing protein	A0A0D4DCP1	Acinetobacter_phage	1.5e-284	99.6
AZP30083.1|2822741_2824169_-|terminase	terminase	J7I460	Acinetobacter_phage	1.4e-268	98.9
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AZP30092.1|2830153_2830549_-	HNH endonuclease	K7P7B7	Enterobacteria_phage	2.2e-25	49.2
AZP30093.1|2830545_2830953_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP31433.1|2830949_2831348_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30094.1|2831347_2831464_-	putative phage replication protein	A0A0P0IR92	Acinetobacter_phage	9.8e-11	91.7
AZP30095.1|2831460_2832417_-	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A1V0E8B1	Vibrio_phage	1.4e-17	41.3
AZP30096.1|2832413_2832740_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30097.1|2832791_2833292_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30098.1|2833352_2833616_-	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30099.1|2833749_2834499_+	XRE family transcriptional regulator	H1ZZB6	Pseudomonas_virus	6.4e-10	31.4
AZP30100.1|2834706_2835156_+	hypothetical protein	A0A0N7IRE9	Acinetobacter_phage	2.6e-75	98.6
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AZP30102.1|2835483_2836605_+	AAA family ATPase	A0A0N7IRE0	Acinetobacter_phage	5.2e-213	100.0
AZP30103.1|2836601_2837603_+	hypothetical protein	A0A0P0IKV7	Acinetobacter_phage	4.1e-185	97.9
AZP30104.1|2837604_2837850_+	hypothetical protein	A0A0P0IVN4	Acinetobacter_phage	1.5e-40	100.0
AZP30105.1|2837853_2838303_+	DUF551 domain-containing protein	A0A0P0HSE1	Acinetobacter_phage	4.6e-80	93.8
AZP30106.1|2838299_2838509_+	hypothetical protein	A0A0P0IRG7	Acinetobacter_phage	6.3e-32	94.2
AZP30107.1|2838505_2838721_+	hypothetical protein	I2GUB6	Acinetobacter_phage	4.5e-33	94.4
AZP30108.1|2838722_2838938_+	hypothetical protein	A0A0R6PG25	Moraxella_phage	3.7e-11	55.9
AZP30109.1|2839147_2840428_+	aspartate kinase	NA	NA	NA	NA
AZP30110.1|2840674_2840929_+	carbon storage regulator	A0A2I7RT00	Vibrio_phage	8.8e-12	66.7
AZP30111.1|2840996_2841563_-	ribonuclease HII	E3T5H8	Cafeteria_roenbergensis_virus	3.1e-25	42.6
AZP30112.1|2841635_2842076_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30113.1|2842262_2842820_+	cytochrome b	NA	NA	NA	NA
AZP30114.1|2842864_2843863_-	adenosine deaminase	NA	NA	NA	NA
AZP30115.1|2843979_2845299_-	NCS2 family permease	A0A0R6PHV4	Moraxella_phage	3.1e-60	36.0

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>CP029610|3097476:3154804|DBSCAN-SWA
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MVGANVAIMMKDKQNAIRGDNHRDIGMSCIMHSLKKTRDILPVSCLKIKVCSIKKANYRNDSLPR
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MIRIMQNTDVDIVVQIEKSVQTHPWSRQQFIESLNSYQCTVIESQNRVVGFCILQPVLDEANLLLMAVDPKMQGQGLGYELLSASIEKLENQPVQIFLEVRESNKAAIGLYEKTGFHQIDLRRNYYPTQDGGREHAVIMVKTCTDDFASLFND
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MGVYHAFKFRQHMSEEKKNWTGNIHLGAKTDLTVVLNQLCKAFNSSPFFKHSGMIMRVVDGHIEGYIEMQPNLIGNLAFQILHGGVAATLLDSIGGIVAMEHLYRRSTPETLTETIKQVSRLATVDMRVDYLAPGRGKYFIARAEVLRLGRKGCTMRMTMVNDEDKAIAAGIASYAY
>CP029610|3097476:3154804|3133417_3134266_-|AZP30341.1|DBSCAN-SWA
MCQLLGMNCATPTDITFSFRGFSQRAGITSDHSDGFGIAFFEDKACRLFVDNQSAVESPIADLVRNYPIKSRNVIAHIRKATQGKITLENSHPFIRELWGRHWIFAHNGDLHDFNPPLSGRFTPVGNTDSERAFCYLLDQLVEAFGYEEPSLEQIFEVLEKISPQIAEYGTFNYCLSNGKALFSYAITKLHWLVREYPFNHAHLIDLDVEVDFSQVTTPEDRVAVITTEPLTHNENWTAYQPGEMILFQHGQPIKKAITFVERLKREQENPELKRITRADQY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
AZP30312.1|3097476_3098409_+|transposase	IS5-like element ISAha3 family transposase	Q1MVF0	Enterobacteria_phage	5.1e-57	40.6
AZP30313.1|3098884_3099085_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30314.1|3099215_3099731_-	acyl-CoA thioesterase	NA	NA	NA	NA
AZP30315.1|3099982_3100597_-	MarC family protein	NA	NA	NA	NA
AZP30316.1|3100608_3102675_-|holin	high-affinity choline transporter BetT	A0A2I7QNT1	Vibrio_phage	2.7e-18	26.0
AZP30317.1|3102795_3104418_-	BCCT family transporter	A0A2I7QNT1	Vibrio_phage	2.7e-21	25.9
AZP30318.1|3104670_3105306_+	transcriptional regulator BetI	NA	NA	NA	NA
AZP30319.1|3105298_3106771_+	betaine-aldehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AZP30320.1|3106866_3108525_+|holin	choline dehydrogenase	A0A1V0S9M4	Catovirus	1.2e-56	31.3
AZP30321.1|3109384_3110317_-|transposase	IS5-like element ISAha3 family transposase	Q1MVF0	Enterobacteria_phage	3.9e-57	40.6
AZP30322.1|3111101_3113087_-	gamma-glutamyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP30323.1|3113390_3114914_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
AZP30324.1|3114920_3116072_-	EmrA/EmrK family multidrug efflux transporter periplasmic adaptor subunit	NA	NA	NA	NA
AZP30325.1|3116339_3116873_-	thioesterase family protein	NA	NA	NA	NA
AZP31455.1|3116979_3117993_+	porphobilinogen synthase	NA	NA	NA	NA
AZP30326.1|3118018_3119134_+	FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
AZP30327.1|3119125_3120031_-	TIGR01777 family protein	NA	NA	NA	NA
AZP30328.1|3120114_3120567_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30329.1|3120947_3121325_+	VOC family protein	NA	NA	NA	NA
AZP30330.1|3121386_3121899_-	peroxiredoxin	NA	NA	NA	NA
AZP30331.1|3122024_3123293_+	exonuclease SbcCD subunit D	NA	NA	NA	NA
AZP30332.1|3123302_3126899_+	ATP-dependent dsDNA exonuclease	Q5ULP4	Lactobacillus_virus	4.5e-08	27.4
AZP30333.1|3127099_3127792_-	YggS family pyridoxal phosphate-dependent enzyme	NA	NA	NA	NA
AZP30334.1|3127918_3128956_+	type IV pilus twitching motility protein PilT	NA	NA	NA	NA
AZP30335.1|3128975_3130094_+	type IV pilus twitching motility protein PilT	NA	NA	NA	NA
AZP30336.1|3130163_3130601_-	ferric iron uptake transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30337.1|3130712_3131111_+	outer membrane protein assembly factor BamE	NA	NA	NA	NA
AZP30338.1|3131175_3131490_-	RnfH family protein	NA	NA	NA	NA
AZP30339.1|3131489_3132557_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP31456.1|3132483_3132681_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30340.1|3132710_3133166_-	bacteriohemerythrin	NA	NA	NA	NA
AZP30341.1|3133417_3134266_-	class II glutamine amidotransferase	NA	NA	NA	NA
AZP30342.1|3134374_3135157_-	GNAT family N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP30343.1|3135279_3136185_-	acetylglutamate kinase	NA	NA	NA	NA
AZP30344.1|3136200_3137619_-	phosphomannomutase/phosphoglucomutase	A0A127AWJ1	Bacillus_phage	1.5e-39	26.9
AZP30345.1|3137816_3138269_-	dUTP diphosphatase	Q2NP83	Xanthomonas_phage	1.5e-46	57.5
AZP30346.1|3138293_3140333_-	ATP-dependent DNA helicase Rep	A7KV33	Bacillus_phage	9.3e-112	37.7
AZP30347.1|3140526_3141180_-	OmpA family lipoprotein	NA	NA	NA	NA
AZP30348.1|3141426_3142353_+	acyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP30349.1|3142369_3143416_+	preprotein translocase subunit SecA	NA	NA	NA	NA
AZP31457.1|3143563_3144265_+	septum site-determining protein MinC	NA	NA	NA	NA
AZP30350.1|3144331_3145144_+	septum site-determining protein MinD	NA	NA	NA	NA
AZP30351.1|3145146_3145419_+	cell division topological specificity factor MinE	NA	NA	NA	NA
AZP30352.1|3145502_3145790_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30353.1|3145831_3146452_-	threonine export protein RhtC	NA	NA	NA	NA
AZP30354.1|3146603_3149657_-	DNA translocase FtsK	S5VNE3	Mycobacterium_phage	6.6e-77	47.2
AZP30355.1|3149926_3150874_+	thioredoxin-disulfide reductase	A0A2I2L5E1	Orpheovirus	1.3e-60	42.5
AZP30356.1|3150996_3151728_+|tRNA	leucyl/phenylalanyl-tRNA--protein transferase	NA	NA	NA	NA
AZP30357.1|3151746_3152562_+	arginyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP30358.1|3152547_3153009_-	ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP30359.1|3153115_3153934_-	metal-dependent hydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP30360.1|3153956_3154460_-|transposase	IS630 family transposase	NA	NA	NA	NA
AZP30361.1|3154498_3154804_-|transposase	transposase	A0A218MNC9	uncultured_virus	3.4e-18	52.5

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>CP029610|3179879:3223326|DBSCAN-SWA
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MAVLRTQGTNVFISDGTAITKAICITAIDLGSDSTSKLENTCLEETSSKSYLTGLNDPGDGSITFNLDPENETHVQLLEWADAHKELTFYIGASDSTAEPTIATGTVTVPTTRTFWTYKASLAPSTPTFEADSLVSYQVTMQRSTGVQIIPKA

Homologous phage analysis in the prophage region

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3173852:3173869	attL	NA	NA	NA	NA
AZP30382.1|3179879_3181094_+|integrase	integrase	A0A0P0IRB7	Acinetobacter_phage	7.7e-122	55.9
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AZP30386.1|3182158_3182509_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30387.1|3182690_3183827_+	acyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP31459.1|3183865_3186868_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30388.1|3186966_3189801_-	hypothetical protein	A0A1B1P9G8	Acinetobacter_phage	0.0e+00	94.4
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AZP30392.1|3191132_3193685_-|tail	phage tail tape measure protein	A0A2H4J326	uncultured_Caudovirales_phage	4.8e-57	28.0
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AZP30393.1|3194188_3194482_-	hypothetical protein	A0A2H4PI34	Pseudomonas_phage	2.3e-08	42.3
AZP30394.1|3194508_3194856_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30395.1|3194898_3195360_-	hypothetical protein	A0A2H4J511	uncultured_Caudovirales_phage	4.2e-52	64.9
AZP30396.1|3195432_3195795_-	DUF3168 domain-containing protein	A0A2H4J359	uncultured_Caudovirales_phage	1.7e-37	63.4
AZP30397.1|3195791_3196253_-	hypothetical protein	A0A2H4J6A2	uncultured_Caudovirales_phage	5.1e-50	64.4
AZP30398.1|3196306_3196621_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30399.1|3196717_3197807_+|transposase	IS4 family transposase ISAba1	NA	NA	NA	NA
AZP30400.1|3198031_3198379_-|head,tail	head-tail adaptor protein	A0A286S2A2	Klebsiella_phage	8.9e-15	40.6
AZP30401.1|3198386_3198680_-|head,tail	phage gp6-like head-tail connector protein	A0A2H4JAM4	uncultured_Caudovirales_phage	8.9e-24	56.1
AZP30402.1|3198676_3200137_-|portal	phage portal protein	A0A2H4JB65	uncultured_Caudovirales_phage	2.3e-168	61.0
AZP30403.1|3200402_3201737_-|capsid	phage major capsid protein	A0A2H4JBZ9	uncultured_Caudovirales_phage	1.1e-132	58.6
AZP30404.1|3201733_3202327_-	peptidase U35	A0A2H4J367	uncultured_Caudovirales_phage	1.6e-83	76.1
AZP30405.1|3202417_3203410_-	hypothetical protein	K4I381	Acinetobacter_phage	9.3e-49	39.9
AZP30406.1|3203505_3205179_-|terminase	terminase	A0A2H4J6B3	uncultured_Caudovirales_phage	6.0e-250	76.1
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AZP30408.1|3205388_3205838_-	hypothetical protein	A0A2H4J8R0	uncultured_Caudovirales_phage	5.0e-42	64.7
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AZP30410.1|3206158_3206926_-	hypothetical protein	B5WZZ4	Pseudomonas_phage	1.2e-22	50.0
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AZP30413.1|3207449_3207656_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP31461.1|3207706_3208177_-	hypothetical protein	A0A0D4DC11	Acinetobacter_phage	1.5e-25	45.2
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AZP31462.1|3211542_3211788_-	hypothetical protein	A0A0D4DBT5	Acinetobacter_phage	8.2e-07	39.8
3211652:3211669	attR	NA	NA	NA	NA
AZP30421.1|3211934_3212303_-	hypothetical protein	A0A068CDI0	Acinetobacter_phage	1.8e-13	42.9
AZP30422.1|3212460_3212649_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30423.1|3213417_3214449_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
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AZP30442.1|3222550_3222751_+	AlpA family phage regulatory protein	NA	NA	NA	NA
AZP30443.1|3222852_3223326_+	SsrA-binding protein SmpB	W5RAM5	Staphylococcus_phage	5.5e-23	41.6

Sequences of DBSCAN-SWA_12

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12

>CP029610|3365353:3458553|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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AZP30561.1|3369689_3370988_+	ImmA/IrrE family metallo-endopeptidase	NA	NA	NA	NA
AZP31476.1|3370984_3371533_-	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30562.1|3372220_3372712_-	flavin reductase	NA	NA	NA	NA
AZP30563.1|3372897_3373941_-	methionine synthase	NA	NA	NA	NA
AZP30564.1|3373962_3374949_-	DUF1852 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
AZP30565.1|3375317_3376190_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30566.1|3376445_3377054_+	LysE family translocator	NA	NA	NA	NA
AZP31477.1|3377155_3378181_-	fatty acid desaturase	NA	NA	NA	NA
AZP30567.1|3378396_3379404_+	AraC family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30568.1|3379461_3380829_-	amidohydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP30569.1|3380862_3382248_-	long-chain fatty acid transporter	NA	NA	NA	NA
AZP30570.1|3382410_3383457_-	AbrB family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30571.1|3383506_3385006_-	tripartite tricarboxylate transporter TctA	NA	NA	NA	NA
AZP30572.1|3385018_3385465_-	tripartite tricarboxylate transporter TctB family protein	NA	NA	NA	NA
AZP30573.1|3385519_3386572_-	tripartite tricarboxylate transporter substrate binding protein	NA	NA	NA	NA
AZP30574.1|3387366_3388296_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30575.1|3388573_3389884_+	MFS transporter	Q6JIH2	Burkholderia_virus	1.2e-51	31.2
AZP31478.1|3389997_3390741_+	PROX protein	NA	NA	NA	NA
AZP30576.1|3390903_3391833_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30577.1|3391936_3393343_+	FAD-dependent tricarballylate dehydrogenase TcuA	NA	NA	NA	NA
AZP30578.1|3393332_3394466_+	tricarballylate utilization 4Fe-4S protein TcuB	NA	NA	NA	NA
AZP30579.1|3394543_3395077_-	HPP family protein	NA	NA	NA	NA
AZP31479.1|3395174_3395723_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30580.1|3395737_3396397_+	glyoxalase-like domain protein	NA	NA	NA	NA
AZP30581.1|3396481_3397711_-	CoA transferase	NA	NA	NA	NA
AZP30582.1|3397762_3399085_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
AZP30583.1|3399310_3400531_-	acyl-CoA dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AZP30584.1|3400776_3401724_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP30585.1|3401812_3402988_-	zinc-binding dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
AZP30586.1|3403390_3404386_+	adenosine deaminase	NA	NA	NA	NA
AZP30587.1|3404938_3406099_-	DUF3596 domain-containing protein	A0A2H4JGM5	uncultured_Caudovirales_phage	2.9e-73	41.2
AZP30588.1|3406185_3406926_-	DNA polymerase III subunit epsilon	A0A0S0NDC6	Pseudomonas_phage	1.4e-25	33.0
AZP30589.1|3407682_3408015_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30590.1|3408017_3408449_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30591.1|3408515_3409109_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30592.1|3409137_3411858_-	hypothetical protein	A0A077K8T2	Ralstonia_phage	1.2e-178	39.0
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AZP30596.1|3412582_3412927_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP31480.1|3412969_3413530_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30597.1|3414027_3414561_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30598.1|3414728_3415355_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30599.1|3415392_3416418_+|transposase	IS30-like element ISAba125 family transposase	A0A2K9V2S9	Faecalibacterium_phage	2.0e-25	30.4
AZP30600.1|3416481_3416862_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30601.1|3416854_3417874_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30602.1|3417896_3418112_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30603.1|3418115_3418550_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30604.1|3418536_3418839_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30605.1|3418952_3419153_+	Com family DNA-binding transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
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AZP30608.1|3421408_3421831_-	oxidoreductase	Q9ZXJ9	Pseudomonas_virus	6.1e-34	52.1
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AZP30610.1|3424478_3424598_-|tail	GpE family phage tail protein	A0A0M4R2P3	Salmonella_phage	7.5e-06	53.8
AZP30611.1|3424606_3424942_-|tail	phage tail assembly protein	E5G6P9	Salmonella_phage	2.8e-13	40.7
AZP30612.1|3425007_3425526_-|tail	phage major tail tube protein	A0A2H4J916	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-50	57.3
AZP30613.1|3425536_3426709_-|tail	phage tail protein	A0A077K9Y4	Ralstonia_phage	3.7e-161	69.7
AZP30614.1|3426914_3427154_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30615.1|3429408_3430014_-|tail	phage tail protein I	A0A0F7LA36	Escherichia_phage	8.5e-29	38.7
AZP30616.1|3430013_3430916_-|plate	baseplate assembly protein	S4TNY7	Salmonella_phage	1.9e-72	50.0
AZP30617.1|3430912_3431257_-|plate	baseplate assembly protein	Q7Y4D7	Escherichia_virus	2.4e-20	44.9
AZP30618.1|3431253_3431913_-|plate	phage baseplate assembly protein V	K4HZZ9	Acidithiobacillus_phage	1.0e-11	30.4
AZP30619.1|3431985_3432438_-	phage virion morphogenesis protein	A0A0M3UL83	Salmonella_phage	4.7e-24	45.6
AZP30620.1|3432438_3432939_-|tail	phage tail protein	A0A2H4J906	uncultured_Caudovirales_phage	5.7e-39	62.9
AZP30621.1|3432935_3433790_-	hydrolase	A4JWU0	Burkholderia_virus	5.2e-48	43.9
AZP30622.1|3433786_3434059_-	hypothetical protein	Q9ZXL7	Pseudomonas_virus	1.7e-08	38.4
AZP30623.1|3434055_3434412_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30624.1|3434414_3434627_-|tail	phage tail protein	E5G6M9	Salmonella_phage	4.2e-15	60.6
AZP30625.1|3434623_3435073_-|head	head completion protein	E5E3S2	Burkholderia_phage	1.4e-12	34.5
AZP30626.1|3435174_3436065_-|terminase	terminase	Q9ZXM2	Pseudomonas_virus	5.8e-42	44.4
AZP30627.1|3436071_3437082_-|capsid	phage major capsid protein, P2 family	A4PE30	Ralstonia_virus	6.5e-106	58.8
AZP30628.1|3437129_3437960_-|capsid	capsid protein	A0A2H4J928	uncultured_Caudovirales_phage	1.5e-55	50.6
AZP30629.1|3438138_3439917_+|terminase	terminase	A0A2H4JGK4	uncultured_Caudovirales_phage	1.4e-228	67.7
AZP30630.1|3439916_3440972_+|portal	phage portal protein	A0A2H4J922	uncultured_Caudovirales_phage	2.9e-117	61.8
AZP31481.1|3441009_3441621_-	hypothetical protein	A0A0R6PJ56	Moraxella_phage	2.2e-16	36.1
AZP30631.1|3441647_3442640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30632.1|3442926_3443436_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30633.1|3444588_3445653_-	quinolinate synthase NadA	NA	NA	NA	NA
AZP30634.1|3445797_3447018_-	bifunctional glutamate N-acetyltransferase/amino-acid acetyltransferase ArgJ	NA	NA	NA	NA
AZP30635.1|3447151_3447631_-	methylated-DNA--[protein]-cysteine S-methyltransferase	M1PFU9	Streptococcus_phage	1.3e-24	43.2
AZP30636.1|3447643_3447964_-	QacE family quaternary ammonium compound efflux SMR transporter	NA	NA	NA	NA
AZP31482.1|3448113_3448905_-	cation transporter	NA	NA	NA	NA
AZP31483.1|3449137_3449866_-	copper resistance protein CopB	NA	NA	NA	NA
AZP30637.1|3449879_3451817_-	copper resistance system multicopper oxidase	NA	NA	NA	NA
AZP30638.1|3451856_3452252_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP30639.1|3452355_3453177_-	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP30640.1|3453533_3454220_-	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
AZP30641.1|3454404_3454677_+	DUF2218 domain-containing protein	A0A218MNG7	uncultured_virus	8.3e-08	45.3
AZP30642.1|3454682_3455528_-	S-formylglutathione hydrolase	NA	NA	NA	NA
AZP30643.1|3455496_3456948_-	peptidase C13 family protein	NA	NA	NA	NA
AZP30644.1|3457084_3457876_-	methyltransferase	NA	NA	NA	NA
AZP30645.1|3457887_3458553_-|tRNA	tRNA (adenosine(37)-N6)-threonylcarbamoyltransferase complex dimerization subunit type 1 TsaB	NA	NA	NA	NA

2. CP029611

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	8418 : 51311	37	Escherichia_phage(30.0%)	transposase,integrase	attL 7971:7986|attR 19608:19623

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP029611|8418:51311|DBSCAN-SWA
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MLRTTEQKKKYIQATRAQNYQASLKLEGITTTAQTTQQSKAEILQKYKKYSQPET

Homologous phage analysis in the prophage region

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19608:19623	attR	NA	NA	NA	NA
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AZP31601.1|28168_28288_+	mercury resistance protein	NA	NA	NA	NA
AZP31548.1|28271_28508_-	mercury resistance protein	NA	NA	NA	NA
AZP31549.1|28504_28870_-	mercuric resistance transcriptional repressor protein MerD	NA	NA	NA	NA
AZP31550.1|28887_30573_-	mercury(II) reductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	1.3e-39	28.2
AZP31551.1|30611_31037_-	mercury transport protein MerC	NA	NA	NA	NA
AZP31552.1|31064_31340_-	mercuric transporter periplasmic component	NA	NA	NA	NA
AZP31553.1|31353_31704_-	mercuric transporter	NA	NA	NA	NA
AZP31554.1|31775_32231_+	Hg(II)-responsive transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
AZP31555.1|32596_33301_-|transposase	IS6 family transposase IS1007	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.2e-114	83.6
AZP31602.1|33316_34465_+|transposase	IS4 family transposase	NA	NA	NA	NA
AZP31603.1|34712_34940_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP31556.1|35533_36238_-|transposase	IS6-like element IS1006 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	4.2e-120	85.3
AZP31557.1|37162_37414_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP31558.1|37307_37610_-	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
AZP31559.1|37696_38512_-	sulfonamide-resistant dihydropteroate synthase Sul2	A0A0B5J4J5	Pandoravirus	5.9e-09	27.6
AZP31560.1|38601_39693_+|transposase	IS4 family transposase ISAba1	NA	NA	NA	NA
AZP31561.1|39889_40375_-	phenol hydroxylase	NA	NA	NA	NA
AZP31562.1|40561_41065_-|transposase	IS630 family transposase	S5VXX4	Leptospira_phage	2.5e-05	24.8
AZP31563.1|41103_41409_-|transposase	transposase	A0A218MNC9	uncultured_virus	3.4e-18	52.5
AZP31564.1|42489_43422_+|transposase	IS5-like element ISAha3 family transposase	A0A1V0E8E1	Vibrio_phage	4.1e-62	42.3
AZP31565.1|43679_44084_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
AZP31566.1|44164_45472_+	TolC family protein	NA	NA	NA	NA
AZP31567.1|46939_50086_+	CusA/CzcA family heavy metal efflux RND transporter	NA	NA	NA	NA
AZP31568.1|50119_50485_+	copper-binding protein	NA	NA	NA	NA
AZP31569.1|50606_51311_+|transposase	IS6 family transposase	A0A077SL39	Escherichia_phage	1.8e-118	84.5