Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP018585 | Staphylococcus caprae JMUB145 DNA, complete genome | 7 crisprs | WYL,csa3,DEDDh,cas3,DinG | 0 | 2 | 9 | 0 |
1. AP018585
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP018585_1 | 472790-472879 | Orphan |
NA
Consensus repeat of AP018585_1
|
1 spacers
spacers of AP018585_1
>1.1|472816|38|AP018585|CRISPRCasFinder TTGTTTAGAGGAATACAATAGACCAGGTCTATTGCATA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around AP018585_1
The CRISPR arrays of AP018585_1 >merge|AP018585|1|472790-472879|CRISPRCasFinder AGAATTTCTACAGATTAAAATCTTAGTTGTTTAGAGGAATACAATAGACCAGGTCTATTGCATAAGAGTTTCTACAGATTAAAATCTTAG >AP018585|1|1|472790-472879|CRISPRCasFinder AGAATTTCTACAGATTAAAATCTTAG TTGTTTAGAGGAATACAATAGACCAGGTCTATTGCATA AGAGTTTCTACAGATTAAAATCTTAG
>AP018585.1|BBD89041.1|472392_472770_+|putative-glyoxalase MMHSMWFNLNVKDLDRSEQFFKTLGFEINKNPDMLDKMVGISIGQTIVILIENNHFESVSHQEVDAHPNEVMISLGVKENKEVDELVEKVESAGGTIIDPPGVKQGYYGAMFADPDGHKFNFLVC >AP018585.1|BBD89040.1|471537_472356_+|hypothetical-protein MTKSILVIGATGKQGNAVVKQLLEDGWHVRAFTRNKNNEKLTSIENEHLEIFEGDLSNEDSLAQAMQDQYGLYSVQPIIPDNVEEELRQGEMIIDTAERQGVNYVVYSTTGGVNRDRTGPHFEALAQLENKIKASRLNFTIIKPSFFMDNFLRITKVENGEIKIPEFINPNVKFAMISSIDIAKIASTLFEDAESYNHQELEIASDELTLNEVVKTFATVTGKPTEIEGAFSSGTAERSWLEEKGYVIDFVQMERINPTRLTLDKWIAEVDF >AP018585.1|BBD89039.1|471225_471525_+|hypothetical-protein MSLNKEQRRITAIELQEHFNESTLSMEDIANKMSISVEEVEKVLNMNAPNGFFGNQLQRFIHLVWDIRDVMNSNIKENGDTPEEYTYLKGEKEDYWFLQ >AP018585.1|BBD89038.1|470552_471095_-|TetR-family-regulatory-protein MRKDALENRQRIEEKAIELFKEHGVDTVSMNRISKELGIGMGTLYRHFKDKSDLCYHIIEHDFDEIIHQMKRVASTSQSKEEIMKQSLDVFLKFKFENSDLLNCIEESNTKTQFHHSQFFSDLFDFYYDLFHDGHDERWATFKTDMLLKSLSTKAYEIQRSKRQLSNNEIRDNLMRLYLN >AP018585.1|BBD89037.1|469833_470538_-|putative-short-chain-oxidoreductase MDRVTLITGGNKGLGYEAAKELKAKGYKVYIGSRNEERGQKASNELGVDYVQLDVSDDESVQQAFKTLSEKEGRVDVLINNAGISGGFAKVADITVEDVEKVYNTNVFGIVRMMNTFIPLLEQSQQPVVVNVSSGLGSFGMVTNPDKAESKVNSLAYCSSKSAVTMLTLQYSKGLPHMQINAADPGSTNTDLVGDFSNNSKPASEGVKPIVELATINADGPTGTFIDGDGPMPW >AP018585.1|BBD89036.1|468718_469723_-|hypothetical-protein MKSINFEEHYVVDDIQKETMKYMSSDPNGVPMQTMLKGLEQKSGFTNADDITKHDERIKFMDEHDVEMQVLSYGNGAPSNLEGERAIELCQQANDTLAKYVNEHPDRFVGFATLPINEPQAAVEEFKRCIKELGFKGALIMGHPKNGFLDQDQYDDLFATAEALNVPIYLHPSPVQSDVYQAYYKGNYSDVTAATFACFGYGWHVDVGIHAIHLVLSGVFDRHPNLNMIIGHWGEFVPFFLERMDDILFADHLEHPISYYFKNNFYITPSGMLTKPQFDLVKAEVGVDRILYSADYPYVEPDKLGTFLDELDLTEEEKEKISYKNGAKLLGLEK >AP018585.1|BBD89035.1|467856_468693_-|putative-hydrolase METLELHGAKLRYHKIGKGPVLILIPGANGTGDIYMPLAKQIQDHFTVVAVDRRGYGQSELTEPLPEEVSNPDSRYRVKRDAQDIAELAKSLSDEPVYVLGSSSGAIVAMHVLKEHPDVVKRIAFHEPPINTFLPNAKYWQDKNEEIIDIAVNEGMPQAMKLFGETLKTSQLDQQYMSKPAQSEDDAESKKRFEEMLGWFKYEIRQYTESDISIEDLNQHKDIITLLNGTDSKGSFPQEVNFFIKDETGIEIVDIPGGHLGYIQKPEGFAEVLLNIWN >AP018585.1|BBD89034.1|467201_467822_-|hypothetical-protein MLFERNKPYTNETLLDKENILELIQFERFCRDNALWDSMRSCFAEDSRVNISWFDGTGEEFVKSSEEMNRYAPHQIYNTQMWINDNRAIAMMQATIQFRVDIKNVEMQLDSDAKIIYSLEKNEEGIWLIKGLGSIYEKDKLTPVIPTTINLPNSDFEGYRKSYACLSYALNELGYDVNHDLPGIDRPEAVNKYYEQLDHWLTQNEE >AP018585.1|BBD89033.1|467080_467254_+|hypothethical-protein MALVLYRKEADAFLIITFNFVVSTIGIVKIIFLNDISVLLLILHFELTNDRAVRNIY >AP018585.1|BBD89032.1|466067_467012_-|amidohydrolase-family-protein MKKIDLHAHYISPGFSQFLDDYFDGKGDGVKTPPFSPESYINLMKEQDIEYGVLSISSPHISAAPDDKMLELAEEVNTYAADITQQYSDQIGFFATLPLPLAEESVNTIDKALDDQQALGFTLPTNARGVYLGDERLDPVLEKLNERQATVAIHPNEPKPAIKAMSEEVPPPLMEFIFDTTRTIIYMSQKNVFSKYPNIKWIVPHCGALLPVIAQRVAMGNKMFGSEKQPDDLEQVMKNLYFDLAGKVLPYQLPTLLEMVDPDKIVYGSDAPYTTNQVVSMLANEIESTDLITIDSKIHMLYDNGKALLDKMKY >AP018585.1|BBD89042.1|472948_473179_-|hypothetical-protein MKLLDRINQLANKEKVESLSIEEKQEQHQLRQEYLKMIRGQVLTTFSTMKVLDPLGQDVTPDKVYELRKEYGNIQE >AP018585.1|BBD89043.1|473398_473965_-|hypothetical-protein MDATKIDPRIIRTKKLLVNAFQKVSREKKLSQVSVKDITDEATVNRATFYAHFTDKYDILDYTLSVTILKDLNDTLNISEVINEEILSNIFISIAYYMVEVQDSCEMNSEEFCNQAHKRINNELEDIFTIMLENSFPSHEREILVNSASFLAAGVCGLAKHWLETSKLTPETFIKKNLPFLIQHITQL >AP018585.1|BBD89044.1|474215_475613_+|D-serine/D-alanine/glycine-transporter MADKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGASIHLAGPSILLTYIIVGFILFMFMRAMGELLLSNLGFKSFGDIAHHHIGSMAGFMVGWTYWLTWIISGMAEVTAVAKYVDFWYPEMPNWITAAATILILVALNLFSAKLFGELEFWLSIIKVITIFALIIIGIVMIVFAMKTQYGPATVTNIWKEGGFFPNGASGFFMSFQMAIFSFIGIELIGITAGETKDPHTTIPQAINNVPFRILIFYIGSLAVIMSVVPWDKLNPDDSPYVKLFGLIGIPFAAGIINFVVLTAAASSCNSGIFANSRTMFGLAGRKQGPAFLHKTNKNGVPYYAILVTCGLLSISVILNAIFKDATKVFVQITTFSTVLNILIWAVIMVAYLGFLKHNPELHKESNYRMPGGKYMAYGILVFFAFIFVILLINSSTRLAVLSIPVWIGVLFLMYQKYKKESRKTEIPTETEEDVEEA >AP018585.1|BBD89045.1|476070_477129_+|putative-regulatory-protein MSAIRNIDGPKDFIFRVLSGVAIGIVAGLVPNAILGEIFKYFMQYHPIFKTLLGVVQAIQFTVPALIGALIAMKFNLTPLAIAVVASASYVGSGAAQFKNGAWVIAGIGDLINTMITAAIAVLLILLVEERVGSMALIVFPTIIGGLSATIGVFTLPYVRLITTGIGNMLNSFTELQPVLMSMLISMVFSFIIISSLSTVAIAMAIGLSGIAAGSASIGIAATEAVLLIGTSQVNRLGIPLSIFFGGVKMMMPNMVKYPVIMVPIFITAALSGIASGMIGIGGTKESAGFGFIGMVGPINAFKFMHVDSPWLSVLLIVVAFFVVPFLVAWILDLLLRKVIRLYSNDIFKFMG >AP018585.1|BBD89046.1|477632_479039_+|polyphosphate-kinase-2-family-protein MSYNIEALQLKVAQLSRKTHELGIPVMILFEGVPASGKTRLSNELLLNLDAKYTDFIATKSPEAHNLRYQFLQKYWNTLPQKGNINIYFRSWYSHYLDYKENQIKQNQYSNYDVLIRQIDDFENMLKKDNYEIIKFFIEINEEKRQEHIEQTKENPLMKWKVQEYEKVIPQDIYISEMRQIINDSDDWKVIDYTERKQAIENMYLHIIERLESAIDNFQTHESVIDGNFNKNFSTSLFDIEVPKIHKKEYKDQMEILQNRMRELQFALYERKIPLVLVFEGMDAAGKGGNIKRIREKLDPTGYQVHGISAPTDVEKNHHYLWRFAKEMPKSGHVEIFDRSWYGRVLVERVEGFAEQAEWKRAYKEINQFEQMWTDEGALIIKFFLCLDKKEQLKRFKDREKNPDKQWKITHEDWRNREKWDLYLEASYDMIKHTNMNEAPWHVIPADHKKTSRIKVLQTIINRCEEVL >AP018585.1|BBD89047.1|479487_480192_+|putative-transglycosylase-IsaA MKKTVISTSLALSLGVAGFALTGHEAHASEATNVDQAHLADLAQNHPDQLNAKPVQAGAYDIHFVNNGFEYNFTSNGTNWSWSYQAAGSQSSSADYTQSYNQESSNQSVSSNTQSSNTNVEAVSAPTTSHHNYSTSTTSYSAPSSSSASTGGSVKAQFLAAGGTEAAWNAIVMPESGGNPNAVNPAGYRGLGQTMESWGTGSVASQTKGMINYANSRYGSLSNAIDFRASHGWW >AP018585.1|BBD89048.1|480382_480874_+|putative-Glycosyl-4,4'-diaponeurosporenoate-acyltransferase MMKNIKKLAQLVILHSVFWFSVQMSIAQLGTRIPLRFFDKNAHFFRPFQWEKGGQIWGDTLQISKWKKLIPEGTKLNSAIYDKSDLTNNIEETRHLLLEMRRAELVHWLSMVPLIVFIKTSKYIKYINLLYVVFSHVPIIIVQRYNRPRIERFIRLVEKRGKK >AP018585.1|BBD89049.1|480873_482364_+|diapolycopene-oxygenase MTKSVIVIGGGLGGIAAAIRMAQSGFNVKLFEQNNHIGGKVNRLDESGFGFDLGPSILTMPYIFEKLFNYSDKKMSDYVEIERLPLQWRNFFSNGETIDLYENNEATVLNNVQLNEKDKAELDRYFKYTERIYRFTEKGYFNHGLDTLPEILKYHGPLKALHGFDYFSTMQQAIHRYISNPRLREILGYFIKYVGSSSYDAPAVLSMLFHMQQEQGLWYVKGGIHHLAQALEQLAIEEGVELHTGTSVNNIKTYHHNVTGVRLANGDIVEADYIISNMEVIPTYKYLLHFSQQKIDQLEKTYEPASSGYVMHLGVNRSYPQLAHHNFFFSNDSKRNYDEVFHQKVLPQDPTIYLVNSNKTDLQQAPDEFENIKVLPHIPYIQDKPFKKEDYEAFKTRVLTKLEKMGLTDLRKHMIYEDMWTPEDIRQHYHSHRGAIYGVVADKKKNKGFKFPKHSKYFDNLFFVGGSVNPGGGMPMVTLSGLQVADKINAIEAQKE >AP018585.1|BBD89050.1|482370_483492_+|glycosyltransferase,-group-2-family-protein MKMIQFILTILSTISLICGRLIFNQRHRLLSSQSPIIHSNEVTIIIPARNEERRLPHLLQSLQGQQGIYEVIVMDDGSKDNTKEIAQTFGATVYETEQNFDRQWFGKSHACYQGATNAQSELLMFVDADVTFGHPHAIEKILNTYRKQHNHGLLSVQPFHETGKFYESLSAIFNLMTVVGVNQFSSLARQSNNDIAFGPITLMHRDDYFKTDGHKNAQHSIIEGFALGEKFESVQLPVTVYEGGNDVKFRMYEDGIQSLIQGWTKHFSVGANKTQPQIMLAIVMWLMGSITSTLTLLISVFTKPASRIVSYLFYVLYTCQFVRLHRRVGAFSMVLLILHPVLFIFFIFIFANSWRHTHFSKKVEWKGRSFKIN >AP018585.1|BBD89051.1|483529_484393_+|squalene-desaturase MTTNEENFKYCHQIMKEHSKSFSYAFDFLPEQERQAVWVIYAVCRIIDDSIDVHENPQILKDIHEDISYIENTSDISHHEFKSNQSIMVALYVVSQHYTIEYQSFYNLIQSVYEDQNFEMFETDEALLNYCYGVAGTVGEVLTPVLAQSPNKETYATARKLGEALQITNILRDVGEDFENGRIYFSESSLARFDVSIENEFNHRISNQYIDLWEYFAAIAEDDYEIALSNIDTFNKEAQPIIELAAVIYRAILDEVRKASYTLHRRVYVSKLNKAKLYRKIKNKYQL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP018585_2 | 491208-491350 | Orphan |
NA
Consensus repeat of AP018585_2
|
1 spacers
spacers of AP018585_2
>2.1|491241|77|AP018585|CRISPRCasFinder ACTTGCATTGCCCGTAGGATTTCTTGAGGAAATCCTCTGTGTTGGGGCCCCGACCCCAACTTGCATTGCTTGTAGGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around AP018585_2
The CRISPR arrays of AP018585_2 >merge|AP018585|2|491208-491350|CRISPRCasFinder TCTTATGAGGAACCCCTTGTTGTTAGGGCCCCAACTTGCATTGCCCGTAGGATTTCTTGAGGAAATCCTCTGTGTTGGGGCCCCGACCCCAACTTGCATTGCTTGTAGGGTTTCTTGAGGAAATCCTTTGTGTTGGGGCCCCG >AP018585|2|2|491208-491350|CRISPRCasFinder TCTTATGAGGAACCCCTTGTTGTTAGGGCCCCA ACTTGCATTGCCCGTAGGATTTCTTGAGGAAATCCTCTGTGTTGGGGCCCCGACCCCAACTTGCATTGCTTGTAGGG TTTCTTGAGGAAATCCTTTGTGTTGGGGCCCCG
>AP018585.1|BBD89058.1|490709_491105_-|hypothetical-protein MQKKYIIITIIIIIFVGPGLIFNIGKYIYFNYQSHEEAKTKAKVHRLLKQKGWEDKIKTEKPNFTLNTRENNVEVTFKDEPYNTYQYDVNDDGKVTGDAELKMKYKERFDNDKKYREYRKRHRFEEKYDLK >AP018585.1|BBD89057.1|490325_490532_-|hypothetical-protein MKTLLKGVISVLIILGIIKTFQDHDILNEAGHYYEQAKSGEIVQDFSNFNFNNFKDLDLENLKPSDFF >AP018585.1|BBD89056.1|490120_490279_+|hypothetical-protein MFNNIENKNTYVIDKDYARVIAFIFKKLSEQSKDQACEMEKLLNVYLLVLKI >AP018585.1|BBD89055.1|487668_490056_-|copper-exporting-P-type-ATPase-A MTHKTTTLDITGMTCAACSNRIEKKLNRLDDVSAQVNLTTEKATIEYDADQYDSKSFISEIQKLGYDVRTEKQELDITGMTCAACSNRIEKVLNKTEGIQHATVNLTTEQALVSYYPNAINTDRIIQRIQKLGYDAEPINNDDDQQTSRKEQELKAKRTKLIISAILSAPLLLMMFVHLLPLHLPAIVMNPWFQFILATPVQFIIGWQFYVGAYKNLRNGSANMDVLVAVGTSAAYFYSLYEMIQWLTHHVNEPHLYFETSAILITLILFGKYLEARAKSQTTNALGELLSLQAKEARILRNNQEVMVALDEVIEGDTLIIKPGEKIPVDGEVIKGSTSIDESMLTGESIPVEKVIGDTVIGSTLNKNGSVHVKATKVGRDTALSNIIKVVEEAQSSKAPIQRLADIISGYFVPIVVGIAIVTFIVWIVFVHTGQFEPALLAAISVLVIACPCALGLATPTSIMVGTGRAAENGILFKGGEFVERTHHIDTIVLDKTGTITNGKPKVTDYAGDLETLQLLASAEKASEHPLAEAIVTFAEDKGLSLLDNESFNARPGHGIEAMINETHVLIGNRKLMHDFDITIDADNEQKLAQYERQGQTAMMIAIEQELKGIIAVADTVKDTAKQAVSELQNMNIEVVMLTGDNKQTAQAIAQEVGIDRVIAEVLPEQKAEQVSLLQEEGRNVAMVGDGVNDAPALVKADIGIAIGTGTEVAIEAADITILGGDLLLLPKAIKASKATIRNIRQNLFWAFGYNVAGIPIAALGLLAPWIAGAAMALSSVSVVTNALRLKNMKL >AP018585.1|BBD89054.1|487372_487579_-|mercuric-ion-binding-protein MTKETIQVEGMSCEHCKDAVESSLAKLNGVHTAEVNLNEKHVRVVYDDSKVNVAQMKEAIEDQGYDAK >AP018585.1|BBD89053.1|486134_487295_+|N-succinyldiaminopimelate-aminotransferase MVISDRLAAIPDSYFGKTMGRKVEHGPLPLINMAVGIPDGETPKGIVNHFSEALRIPENQKYGAFHGKESFKEAIVNFYQRQYGVTLHKDDEVCILYGTKNGLVALPTCIVNPGETVLLPDPGYTDYLAGVMLADAKPVPLELEPPDYLPDWNKIDPQTLKETKLIYLTYPNNPTGSTATQSVFDEAIEKFKDTDTKIVHDFAYSAFGFDAKNPSILASKDGKEVAIEIFSLSKGYNMSGFRVGFAVGNKEMIQALKKYQTHTNAGMFGALQDAATYALNHYDDFLKEQNETFRKRRDMFEAKLQEAKLPFVHSKGGIYSWLHTPPGYNSEEFEQYLLQEKSILVAPGIPFGENGNDYVRISLALDDEQLEEAAERLTQLANMYDV >AP018585.1|BBD89052.1|484405_485911_+|4,4'-diapophytoene-desaturase MNIAVIGAGVTGLAAAARLASQGNRVTIFEKNNRIGGRMSQFTKDGFTFDMGPSIVMIPEVYRAVFEECGKNFEDYVEMEQLPYIYDVYFGKNDKVRVPTDLAELQETLESIEPGTTHGFMSFLTDVYQRYEIARYHFLEKTYRKASDFYNLESIIQGLKLKTLNNADNLIENYIDNERIQKLLAFQMLYIGIDPKRGPSLYSIIPMVEMMFGVHFIKGGMYGMTQGLVQLNKDLGVEIQLNAQIDEIIIDPKYKQADGVRVNGLVQRFDKVLCTADFPYAAEKLMPSHSRVKKYKPSKIERLDYSCSAFMMYIGIDKDITDEVMLHNVVFSKRFRQNNDEIFGGRISEDPSIYVYVPAVGDSSLAPKGKTGLYILMPTPELKTGQINWKDESIIEQVKDIIYHQLETIDALEDVRSHVISETVFTPIDFEKEYNAKFGTAFGLMPTLAQSNYYRPPNVSRDYKDLYFAGASTHPGAGVPIVLTSAKITVNEMLKDIENGV >AP018585.1|BBD89051.1|483529_484393_+|squalene-desaturase MTTNEENFKYCHQIMKEHSKSFSYAFDFLPEQERQAVWVIYAVCRIIDDSIDVHENPQILKDIHEDISYIENTSDISHHEFKSNQSIMVALYVVSQHYTIEYQSFYNLIQSVYEDQNFEMFETDEALLNYCYGVAGTVGEVLTPVLAQSPNKETYATARKLGEALQITNILRDVGEDFENGRIYFSESSLARFDVSIENEFNHRISNQYIDLWEYFAAIAEDDYEIALSNIDTFNKEAQPIIELAAVIYRAILDEVRKASYTLHRRVYVSKLNKAKLYRKIKNKYQL >AP018585.1|BBD89050.1|482370_483492_+|glycosyltransferase,-group-2-family-protein MKMIQFILTILSTISLICGRLIFNQRHRLLSSQSPIIHSNEVTIIIPARNEERRLPHLLQSLQGQQGIYEVIVMDDGSKDNTKEIAQTFGATVYETEQNFDRQWFGKSHACYQGATNAQSELLMFVDADVTFGHPHAIEKILNTYRKQHNHGLLSVQPFHETGKFYESLSAIFNLMTVVGVNQFSSLARQSNNDIAFGPITLMHRDDYFKTDGHKNAQHSIIEGFALGEKFESVQLPVTVYEGGNDVKFRMYEDGIQSLIQGWTKHFSVGANKTQPQIMLAIVMWLMGSITSTLTLLISVFTKPASRIVSYLFYVLYTCQFVRLHRRVGAFSMVLLILHPVLFIFFIFIFANSWRHTHFSKKVEWKGRSFKIN >AP018585.1|BBD89049.1|480873_482364_+|diapolycopene-oxygenase MTKSVIVIGGGLGGIAAAIRMAQSGFNVKLFEQNNHIGGKVNRLDESGFGFDLGPSILTMPYIFEKLFNYSDKKMSDYVEIERLPLQWRNFFSNGETIDLYENNEATVLNNVQLNEKDKAELDRYFKYTERIYRFTEKGYFNHGLDTLPEILKYHGPLKALHGFDYFSTMQQAIHRYISNPRLREILGYFIKYVGSSSYDAPAVLSMLFHMQQEQGLWYVKGGIHHLAQALEQLAIEEGVELHTGTSVNNIKTYHHNVTGVRLANGDIVEADYIISNMEVIPTYKYLLHFSQQKIDQLEKTYEPASSGYVMHLGVNRSYPQLAHHNFFFSNDSKRNYDEVFHQKVLPQDPTIYLVNSNKTDLQQAPDEFENIKVLPHIPYIQDKPFKKEDYEAFKTRVLTKLEKMGLTDLRKHMIYEDMWTPEDIRQHYHSHRGAIYGVVADKKKNKGFKFPKHSKYFDNLFFVGGSVNPGGGMPMVTLSGLQVADKINAIEAQKE >AP018585.1|BBD89059.1|491409_492279_+|dehydrogenase MSLLDFHKEIKGYTQDRQPGIEADMNPKPIAELDEYKAAGKLQGKVALITGGDSGIGRSVAILYAKEGANVAIGYYDEHQDAEDTVRRLEELGVKAKAYAHDLKDEKQSKQLIDNVVKDFGGLNILVNNGGVQFPRDNFEDITPDQVKETFMTNIFGMMFLSQAAVPHLSEGDAIINTTSVTAYRGSGHLIDYSATKGAIVSFTRSLATTLMEKSIRVNAVAPGPIYTPLIPSTFDEEKVENQGGGTPMGRRGQPAELAPSYVFLATHADSSYITGQVIHVNGGDYITT >AP018585.1|BBD89060.1|492367_492928_+|putative-acetyltransferase MTEKEKMLAHQWYDANFDDELKKDRLKAKELCFDLNHTRPSDEEKRDRIMNELFGYQTENVGISIPFDTDYGWNVKFGKNVFINTNCYLMDGGGITFGDNVFIGPNCGFYTATHPLNYKERNKGLELAEPIVVGSNTWFGGHVSVMPGVTIGDGSVIGAGSVVTKDIPPNSLAVGNPCKVIKSIEQ >AP018585.1|BBD89061.1|493091_495599_+|TarF-like-protein MKNFKNFIANQSRRKINFITSPINMMNKSNYNHQVMTYAKYYGDLKVKDHQILYQVRNGKNITGNPYAIFLYLVNHKEYRRFLHKWVVDSKETLNFYKNKFKNYNNVDFVIIDSSDYLKSLAESKYLINDSTFPLYFAKKENQIYINTWHGTPLKYMGLDMDNNVQGSQNIIKNFLSSDYIISSNRHTTNIFKSAFNLHHIYNGEILEKGYPRIDLTLKNQKSQILNTLKGLISENEEKILLYCPTWRGEDLNNPDINIESILNEAKELEAHLNYKVLVKVHPFIYEEAKKDCDLKNYLIPDYVDTNELLAIVDLMVTDYSSIFFDYLVTNKPIIFYTPDYDDYKFCRGMYINPNELPGPVCTHINDVISSINNKSYENHQIKNNYEKFKTTYVSLEDGHASKNIVEHIFNRKAESPKRNTTRKKTILIYPGGMKNNGITTSIINLLENIDYHQYDITIFLNYSKKEEMLSNLDRVNPNVRIIFRRGPLLASLKECYKVDFVKQRGLQSFLEKLLYPKKVYQREFRKIFGDSHFDYAIDFSGYSMFWANLILASNAKRKLVYLHSDIKADMERRINGVRPHYQNLKGLVSLYPYFDKLVSVSEATSLLNKEKINNPLLSDKYCSSRNTINLNKIHTLVEDDSDRFEKNGESVLINIKNGNVQTVEFSNNDFKIVSIGRLSPEKGFDLLINAVAKLVPKYPNIKLYIMGEGPLKKSLQSLIKKLKMRNHVFLLGHRKNPFYVMKQSNLFALTSHYEGQSMVLLEALTLGVNVLASDIVANRYVLKDGKYGTLVINEIEEIAKGIETFILGQNEKYEKFDAEAYNAKAIKEFYDLLQ >AP018585.1|BBD89062.1|495650_496592_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-familyprotein MKALITGGAGFIGSHISERLTNEGVEVHVIDNLSTGRLENIHFIPKEHFYLKDITDVTFVSELIKKEQFDYIFHLAAMVSVVETIEKPVISNETNINATINLLEATRKWDSQIKKFIFASSAAVYGDLPDLPKSTINSKVAPLSPYAIQKFSGEQYAHIYHHLYNVPTVCLRFFNVYGPKQNPNSDYSGVLSILNAKFINKEQFTFYGDGEQTRDFVYIDDLVSAIWTVLYSKDTNGGIFNVGAGSETSLNTVFKSFEKVFGYTIPHIYKECRIGDIKHSYADITPLKRLGYSPQFNIHSGINAYVSYSKNSH >AP018585.1|BBD89063.1|496787_497513_-|intercellular-adhesion-protein-C MFHGGAVTYFIVIIFQFYLLHWLFSKYLIGLNPIKMIVISILITTMYWAMRTFISPPNNPILAAIWDREGWMIFIGWLSYFLLGFYIGTYYEAFMNKIKDYTWHIIIGAFLSIIFMFLNYILGISTWVESKRVDTPIYVTMVILLFFLFSSYIKYVPKFIVFISNYSYCIYLIHYFFVHDLGLLSRNPIKNVLFNTIVTLTLAITVGYLFNLFKFGKYIVGGIGKIKYENIYESYQNNNMD >AP018585.1|BBD89064.1|497661_497847_+|hypothethical-protein MASKNSDINTNIGVLNINNSWNSRRDVLCGTSCIFEKVVVIEWIITILKQAMERIQKITDV >AP018585.1|BBD89065.1|498176_499721_+|1-pyrroline-5-carboxylate-dehydrogenase MVVPFKNEPGIDFSVQDNVDRFNEELKKVKGQLGQDIPLVINGEKIDKSDKFESLNPADTSQLVAKVSKATKDDVENAFKAANEAYQSWKKWSHKDRAELLLRVAAIIRRRKEEISAVMVYEAGKPWDEAVGDAAEGIDFIEYYARSMMDLADGKPVLDREGEHNKYFYKPIGTGVTIPPWNFPFAIMAGTTLAPVVAGNTVLLKPAEDTVLTAYKLIEILEEAGLPKGVVNFVPGDPKDIGDYLVDHKDTHFVTFTGSRATGTRIYERSSVVQEGQHFLKRVIAEMGGKDAIVVDENIDTDLAAEAIVTSAFGFSGQKCSACSRAIVHKDVHDEVLKKAVQLTKELTLGNTENNTFMGPVINQKQFDKIKNYIEIGKDEGQLEQGGGTDDSTGYFIEPTIFSGLKSSDRIMQEEIFGPVVGFIKVDNFDEAIDVANDTEYGLTGAVITNNREHWIKAVNEYDVGNLYLNRGCTAAVVGYHPFGGFKMSGTDAKTGSPDYLLNFLEQKVVSEMF >AP018585.1|BBD89066.1|499821_500373_-|TetR-family-transcriptional-regulator MNENDLRVIKTKKALSTSLYELLEKRSFEVISVNQICNHAMVHRTTFYKHFYDKYDLLVYLFKLLTKDYFSTDLKERLNNPFQTIEATFTNKEELERIEKVQKDDVSFAKIFREFCVDIMKADIKENIHRISVDTAIPENLVFYIYGSTLDGFMEWIKQEDIDWPASEIDAVFHKAINLSISE >AP018585.1|BBD89067.1|500586_500814_+|FeoA-family-protein MLNVKNGLKDKKYRIKHIGITNKKMLYRLGAMGVTKGSEISIKQQCLLNGPSIVEINGQYLSIRQSDARLIALED >AP018585.1|BBD89068.1|500819_502814_+|ferrous-iron-transport-protein-B MSETFCILGNPNVGKTSLFNALTGSYEYVGNWSGVTVEKKIGKLKGSLGSLIDLPGIYDLSPISKDETVVTDYLLTTNFTGAINIIDASQLKRNMQLTIQLMELNVPLIIGLNMVDVATQRGIKIQFDQLMKRLKIPMFPIVARKSKGTNDILHELEFLKPDDRQVFKIDYGKEIEDAIERMSLIIKTNSNFPKERIRFIAIQYLLDNVQISQKLSDAILEQIAPIKQELNHQSDLYAREQIEKIRNNYINEILEGAVEYPEEEKQFLTATIDKLLINKYLGIPIFLGIMWLIFQTTFTWIGTPLSDQMDSFIGGPFTDWVKLLMNDLHVLPFLQDLITDGIIAGVGSVLVFVPQIVVLFFFISLLEDSGYMARIAVLMDRTMETIGLSGKSFIPMIIGFGCNVPSIMAARSIENEKERLITILIAPFMSCSARLPVYALFVGVFFKAYQSLVVLSLYLLGILVALIVSTILNRCILKNSDSIFIVELPTYRVPSFKTLWRSTWEKAKGFVRKAGTFIFGGSVVIWALTYIGPHGVNVKINQSFIHILGEAVSPIIAPLGFGTWQAGATLIPGFLAKEVIISSMAILYSSSEDGLVHVIQQQFTPLSAYAFMIFILLYVPCISTVATIRKETCSWKWTLFALIYPIITAYGLTLAFYQISKLFI |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP018585_3 | 659989-660071 | Orphan |
NA
Consensus repeat of AP018585_3
|
1 spacers
spacers of AP018585_3
>3.1|660014|33|AP018585|CRISPRCasFinder TGCATTTGTCCAAAGACAAATGTAAACATATGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around AP018585_3
The CRISPR arrays of AP018585_3 >merge|AP018585|3|659989-660071|CRISPRCasFinder AAACTTTAGTTTTTAGATTCGCTTATGCATTTGTCCAAAGACAAATGTAAACATATGGAAACTTTAGTTTTTAGATTTGCTTA >AP018585|3|3|659989-660071|CRISPRCasFinder AAACTTTAGTTTTTAGATTCGCTTA TGCATTTGTCCAAAGACAAATGTAAACATATGG AAACTTTAGTTTTTAGATTTGCTTA
>AP018585.1|BBD89216.1|658675_659956_+|proton/sodium-glutamate-symport-protein MALFKRKISLPTQVIIALVLGVIAGLLLFGQDNVANYIKPFGDIFLNLIKMIIIPIVFCALALSISNLGDSKKVGSYGWKAILYFEIITTVAIGLGIIIGNLFKPGSGLDPDKLPKGDISKYQSSAQSAEQATTYGNHLIDTIVNIVPTNLFESLAKGDLLPIIFFAVFFGLGLAAIGEKAEPVKGFLNGTLEAVFWMINKILKLAPIGVFAFICTTVMTFGASALIPLLKLLVVVVFAMIFFVVVVLGIVARMVGVSIFSIMKILKSELLLAFSTSSSEAVLPVIMKKMEKFGAPKDVTSFVIPIGYSFNLDGSALYQSIAALFVAQMFDIHLSLTQQIVLMATLMIASKGMAGVPGVSIVVLLTTLGSMHLPAQGLALIIGIDRLLDMVRTCVNVMGNALSTIVISKWENVYDKEKGQEYLKTL >AP018585.1|BBD89215.1|658130_658496_+|exported-protein MSRKQVIFRIIIILIISLILAVVFFFGLKTYQGHKNIELMDSYIKEHHLQDKIKKQETLYSAKKGMYYKQIVYKDEPNVTYVLQPISTNKGIFSEGFDSETKKSIKKAKHSDFDKNYKPSK >AP018585.1|BBD89214.1|657380_658010_+|NAD(P)H-flavin-oxidoreductase MSRINDFNEILNERKSVKVFDSDYKIPHEEMDEIIIKATKAPSSVNMQPWRIVVVDSDEGKAKLKDAFGFNSRQLTTSSAMIIIFGDLQNYEKAEQIYSDAVDQQHMTEEIKTQMLEWILPYYKGLSKEGMKDIVNIDSSLMAMQFMLTAKAYGYDTNPIGGFDKENIAEIIGYDSERYIPVLAIAIGKKAQEAHSSVRLPVHEIREYL >AP018585.1|BBD89213.1|656769_657216_-|HTH-type-transcriptional-regulator-SarZ MYVENSYLSKQLCFLFYVSSKEIIKKYTNYLKEYELTYTGYIVLMAIEDDEKLNIKKLGERVFLDPGTLTPLLKKLEKKNYVVRSREEKDERNLQISLTERGKEIKKTLSDISMKVYSEFNINQDEAKELIANLQNFVSKNFDKNLEK >AP018585.1|BBD89212.1|656063_656480_-|Hsp20/alpha-crystallin-family-protein MNSNEFFNNNFFKNDPSELFKDIGKQVYNQFSSSAFPTNIYDTDEAYIVEAELPGVSKEDISLKFEQNILLIKANKKLKNENQKIQLNERSTGELERHFKFDDINKEAITANHAEGVLYVTLPKVIDEDEKATTIAIQ >AP018585.1|BBD89211.1|654784_655960_+|nitrite-extrusion-protein-NarK MKKGVYQLTLQTLSLIVGFMAWSIISPLMPFITQDIQISASQVSVILAIPVILGSVLRVPFGYLTNIIGAKWVFFSSFIILLFPIFFLGQAQSTTMLMVCGFFLGVGGAIFSVGVTALPKYFSKDKVGLANGIYGMGNIGTAISSFCAPVLAGLIGWQSTVRSYLIIIGLFAVLMFLLGDNKETKVKVPLMSQMKVLSKNYKLYYLSLWYFITFGAFVAFGLFLPNYLVHHFEIDKVDAGIRSGVFIALATFLRPLGGVLGDKFNAVKMLIIDFMFLIIGGMILSLFDGMIHFTIGCLAISICAGIGNGLVFKLVPSYFSKEAGSANGIVSMMGGLGGFFPPLVITFVTGLTGSSHLAFGLLVLFALIALMTMIHLYKKENVSNISTIYDK >AP018585.1|BBD89210.1|653773_654430_+|oxygen-regulatory-protein-NreC MKIVIADDHAVVRTGFSMILNYQEDMEVVATAADGVEAYQKVLEYRPDVLILDLSMPPGESGLVATSKISESFPETKILILTMYDDEEYLFHVLKSGAKGYILKNAPDEQLILAVRTVYRGETYIDMKLTTSLVNEFINQSNQEEVNYSSDPFKVLSKRELEILPLIAKGYGNKEIAEKLFVSVKTVEAHKTHIMNKLNLKSKPELVEYALKKKLLEF >AP018585.1|BBD89209.1|652719_653754_+|oxygen-sensor-histidine-kinase-nreB MQSKLEGSIEALLHKYYDATTEKIVFVNHLGKIIAMNDAASDILSEEDNYNAMTHAICNRCEGYSNEYDIQSCENCFLEENQLQKSNFQVFMKTKDNKVEPFTATYQTIDSDRGISAFTLQNVSPQIERQEKMYQQKMLHKSIQAQENERKRISRELHDSVIQEMLNIDVELRLLKYKYQDENLVDSAQHIEGLVSQLIDDIRNLSVELRPSSLDDLGIEAAFNSYFKQFEENYGIQINYQSNIKGMRFDNEVETVVYRVIQEAVLNSLKYAEVNEIEVNINKSDNRLLAEVVDRGKGFNIEDKPKGSGLGFYGMKERAELVNGNINIESHINKGTIVTLDIPI >AP018585.1|BBD89208.1|652248_652710_+|putative-nitrogen-regulatory-protein-A MGKLKPESLLHNKSLQDNLDRLRKNEGYDFGAIAMYEHYHRSSPIKWKYVSGNTNERYKLIILRKGRGLAGTVMKTGKRMVIADVDMALTQAEKIKFPIILNEALTAVVAVPLWLDEQMYGVLLLGQRNHQPLPQTLEQLDIQSQIGFFTEMN >AP018585.1|BBD89207.1|651560_652238_+|nitrate-reductase-gamma-chain MLNQFIWIIYPYLCLTIFIIGHLARYKYDQFSWTAKSSELIEKKQLKWGSLLFHLGVIPVFFGHVVGLLVPANWLEAVGVNNHIYHIGAVYIGSIFGIITLLGMMLLTLRRLTIKNVRRLSSFSDIFVNILLCIILIMGCYSTIFTNAVQPDFDYRQTIAIWFRHLFMFSPNADLMLNVPLSFKVHILLGFTIFALWPFTRLVHVWSVPLSYMNRRYIIYRKNKV >AP018585.1|BBD89217.1|660140_660491_-|hypothetical-protein MKNKKALGFGLIAIMLIVCIVLVIMMMTGGKKDTYYGIMKNSTTIDKMISEKDEKIEKNVKLPSNANVSVKKEDFVMIFKDEKSGKITKVKKVDHDDVPHGLMSKIHDMKGMHHGM >AP018585.1|BBD89218.1|660669_661092_-|general-stress-protein-26 MDKQQATQAIEKVLDNSKVGVLSTAYNNKPNSRYMVFYNDDLTLYTKTNINSVKVEEIEDNPYAYILLGYNETTNNSFVEIDAQIEVVKDQKVIDWLWETQDKTFFDSKQDPELCVLKVQPKSIKLMNDDDLDTPITIEV >AP018585.1|BBD89219.1|661162_663196_-|putative-transcription-regulatory-protein MFSLTNDLKITINGETKDLDNHIAIINQTDIYYVNQSSNLVTLSIPVFYFYNEDNQFFKCYFDRHLLQSSGFVKNIILQSIHRFMNNEEQDNQAISKIIQTLYKESVIRYKGKYIPKVAINHPIFVEGLTYIHTKVSEMLSLRQVAQHCNISESYCSNLFVRYLNMNFKDYFTSLKVIHAIKLLLSTDDSINAISEHSGFSSHTNFTNQFKNYLGFSPKQFRSYISKIELNPTIQFINENYSEFKDLINQFEFNDQLATEITEKDIDQFNPKDRTKSSKAFIRFENFNELFQFVFNEYYDIDFSYLPQPVVFIQDISDIVVSHINFNLLNRCFEKLFEKDIGLAMKIKTTQQFEAINQVILSFLQSNQDYKTNKKLVKLMLVFDSESMSVNEIHLCHLKIKNKNREIRYGMTVEGLLRESASIDHTYDIMKRLNFDYYFIDIENLETKNLLLNKRKTYHHSSTHFENYKQFMLDSGISSTRFVYNNLSLKCFKYTNNGANPLQLSDLVCHLIALMRYGGGISYQLIDDDSQYISLFNSYGSPLPLMHIYKMVASFVDEPLEVGNNYLMSRKGGNYHFLLFNKINDRYLSDSKQKFIFKNQLNVNSLIIINTLNNEHGSIQNLLPKSKELLYIERSILEELDKCNHPKTELAVQEENHKPFQLTLKHDEVKYICIKPL >AP018585.1|BBD89220.1|664286_664664_-|hypothetical-protein MKERGKIEKLWSEEKYHVLLHHQHAYDNIRDMLKGDPSLKEVQNEIANALAITPTKGSIINAYDHMWGYFKKVATDEEQHKALLLKNKFNDNQLNQLTLLNYLKELSDKYEVRYLQNSTVLKQLK >AP018585.1|BBD89221.1|664907_665855_-|cationic-transporter MITAYKHASSNSNEIIETTVDHSASWINVVEPEREEIENLMEFYNIPEDFIRDPLDSEESARIEYDEDTGYSLIIIDLPIVNSTNRRVLSFVTIPLGIIIGNGMIMTVCDAENEFLENFARQDDIHLNFHSRFALEILLTIANHYNRNLRLLNKSRIRIEKDLKNNITNKQLFKLMEVEKSLVYFLAALKGNDTIIKKLFRLPAIKRFEEDEELLEDLVIENNQAIETTELHQRILESITTSYASLLSNDMNTIMKTLTLFTVLLTLPTLVFSFFGMNVPLPIDAHSYASWVIVVGISLILVAIVSIFLWRKQKL >AP018585.1|BBD89222.1|665924_666536_-|hypothetical-protein MKEDRRIRKTKSSIKKAFTTLLQNKDLDKITIRDITSEADVNRGTFYLHYEDKYMLLTDMEDECISELSHLTHFNHINGETVEEISQLFIENVLTKILQHIDDNLEFYHTILQLERTSKLEEKISELMKENMSRYMSINHEIDGIPEMYFHSYVAGATINTIKYWVLDPHRISVEELTHHIYKIVFNGPLRIMAEYKYQKNNA >AP018585.1|BBD89223.1|666698_667976_+|hypothetical-protein MNIFKSKLLWFAPIAAIVILVIFSLAFYPAFNPKPKDLPIAIVNNDEGTTIQSNKVDIGKKIEDKLLDSDSDKIKWVKVDKESDLQKGFDNEKYYGAVVFEKDFSKNAMSKTQKVVMDSKKSEMKEKVESGEIPAQQAQKMKQKMGNQSVDVKQANLKTIVSQGSNLQASNIVTNVLSGIGENLNKQITKQSLSTLQKQNVDVSPKDIQGITNPVKVDNQKVNKVKDHQGGGNAPFLMFMPVWMGSMITSVLLFFAFRTSNNFAIQHRIIASVGQMVTTVIAAFLGSFAYIYFMKGVLGFHFDHPNRVALFIALAIMGFVGLILGIMVWLGMKSLPIFILLMFFSMQMVTLPKQMLPGGYQKWAYGWNPFTHYTTSLKELIYMNKAIELNGTMWMFIGFMIFGIVSSLVAAIVRKHSTKRTEVPS >AP018585.1|BBD89224.1|668163_668946_+|putative-oxidoreductase MMSVLDQFKLDDKVAIVTGGASGLGKAMGKALAEAGANLVIADMNLEVGQETAKEFEEATDNKAIACEVDVTNLEQVNAMVKETMDTFGHIDILFNNAGINEHVKFEDMPYDRWKKTMDVNLNSMVLVTNAVGEVFRKQQHGVIVNTSSMSGVIVNSPQPQAAYNTSKAAVIMLTKSLANEWAEHNIRVNTIAPGYMKTELTKDYFAKGGDMIDTWMNMTPMKRPGVPEELQGAALYLASDASSFVTGSVITVDGGYTAL >AP018585.1|BBD89225.1|669132_669552_+|MarR-family-regulatory-protein MNLTFQYLIRSLAHQMKNYADKRLDDFGITQEQSHTLGYIYRHQEEGMTQKTLLEAFDRKGSTVSSTLKILESKGLIYRKVNPKDTRSKLLKLTDEGITLVESFIKIFDEIEENMLKDFTDNDKEKLREYFDRMMNNLK >AP018585.1|BBD89226.1|669689_671048_+|multidrug-export-protein-MepA MKDEQLYYFEKSPIFKAMMHFSIPMMIGSLLSVIYGILNVYFIGFLDNSHMISAISLTLPIFAVLMGFGNLFGVGGGTFISRLLGAKDYSKGKHVGSFSTYAGFILGIIIAMIALPFTDQIAHILGASGETLTYTSNFLKVMFLSSPFVIVFFILEQFARAVGKPIISMIGMLSSVVLNMILDPIFIFGLDLNVVGAALGTAISNVVAALFFVIYFSKNNESISLRLKDATPTSEMLAEIFKIGIPAFLMVVLMGVTGLVLNLFLAKYGNYAIASYGIQFRLVQFPELIIMGLSEGVIPLIAYNFVSNKDRMKDTIKAVIISIAIIFVISMSVVLLFGHQIIQLFSTDVHIVHLATFMLKVTMTSLLLNGIGFLFTGMLQATGQGRGATIMAILQGTVIIPVLFVMEHLFGLTGVVWSLLIAETLCALAAMLIVYLLRNQLAVDRDELLAEA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP018585_4 | 1095185-1095307 | Orphan |
NA
Consensus repeat of AP018585_4
|
1 spacers
spacers of AP018585_4
>4.1|1095217|59|AP018585|CRISPRCasFinder ATTCCTTCCCGGAATGAGATATAGGTGCAAGTCCTATCTTCCGCTCCATTAAATTTTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around AP018585_4
The CRISPR arrays of AP018585_4 >merge|AP018585|4|1095185-1095307|CRISPRCasFinder ATTAAGCGGGAGTAGTTCAACTCTTAGAACACATTCCTTCCCGGAATGAGATATAGGTGCAAGTCCTATCTTCCGCTCCATTAAATTTTATATTAAGCGGGAGTAGTTCAACTTTTAGAACAC >AP018585|4|4|1095185-1095307|CRISPRCasFinder ATTAAGCGGGAGTAGTTCAACTCTTAGAACAC ATTCCTTCCCGGAATGAGATATAGGTGCAAGTCCTATCTTCCGCTCCATTAAATTTTAT ATTAAGCGGGAGTAGTTCAACTTTTAGAACAC
>AP018585.1|BBD89648.1|1092268_1092430_+|hypothetical-protein MSGGQFDWGGRLLKGNGGAQRFPQNGWKSFTECKGIRELDCETYKSSRVERRT >AP018585.1|BBD89647.1|1087026_1087482_+|FUR-family-transcriptional-regulator MSADLESIEHELEESIASLRKAGIRITPQRQAIIRYLISSHSHPTADEIYQALSPDFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDASSRFDFNTHNHYHVICEKCGKIVDFHYPQLDEVEHLAQHVTDFDITHHRMEIYGTCKECKEKDNN >AP018585.1|BBD89646.1|1085980_1086931_+|putative-D-3-phosphoglycerate-dehydrogenase MKIVSLIRLKDLEDELIKKFPNEEFKFYKKAETIPTEDRETLDILIGYDGSIDKAFIEECKNLKWIAWYATGVNNLPLDYINERGIIVTNGRGVQAKQLSEYIIAFILDDYKKMRTSYENQLAHRFDSKLTGHRVNGETLLFLGTGAIAQKTAYLAKAFGMKIVGVSKSGHMKDHFDETYTIEEIDKVIGEANIIVNSLPETNETIHLLQKHHFEQMRDDALFINIGRGTVVDELLLIDVLRNQIIRHAYLDVFENEPLASDNPLYDLNNVTITAHITGNDKHINRDVTAIFEKNLKHFLNKNDVIENRVDLNKGY >AP018585.1|BBD89645.1|1085519_1085975_+|putative-bacterioferritin-comigratory-protein MLNKGEQFPSFSLENQNGEVITNETLKGRKAILYFYPRDNTPTCTTEACDFRDHLSDFNELDVDVYGINGDSKKKHQNFIEKHQLNFDLLVDEDYKLANEVGVYQLKKSFGKESMGIVRTTFVIDENGYIMDVIEKVKVKTQIEELKNILG >AP018585.1|BBD89644.1|1084146_1085439_-|glutamate-1-semialdehyde=2,1-aminomutase-2 MNFTESERLQELSNEYILGGVNSPSRSYKAVGGGAPVMMKEGHGAYLYDVDGNKFIDYLQAYGPIITGHAHPHITEAIQDQAAKGVLYGTPTELEIDFSKKLREAIPSLEKIRFVNSGTEAVMTTIRVARAYTKRNKIIKFAGSYHGHSDLVLVAAGSGPSQLGSPDSAGVPQSVAQEVITVPFNDIESYREAIDYWGDEIAAVLVEPIVGNFGMVMPQPGFLEEVNKISHDNGTLVIYDEVITAFRFHYGAAQDLLGVKPDLTAFGKIVGGGLPIGGYGGRQDIMEHVAPLGPAYQAGTMAGNPLSMRAGIALLEVLEQDGVYEKLDQLGRRLEEGLLKLIEKHNITATINRIYGSLTLYFTDEKITHYEQVENSDGEAFAKFFKLMLHQGINLAPSKFEAWFLTTEHTEEDIDQTLEAADYAFSQMKN >AP018585.1|BBD89643.1|1082568_1083663_-|hypothetical-protein MRLGARIFKTGIAIILAMSIASLLPANIGLKALAGVSAVVAMQPSVYRSIKTVSEQAIGNIIGAILAVTMVTIFSNNFIIMGVTVILLIAILFKFNLAHVATLASVTALVIMGQHTGSFYVAAFFRFALVMIGVLSSSIVNLVFLPPKFETKIYYNSMNISSDIFVWFKLVLNDTSEFHNIKQDCSQLNSRITKLEQIYDYYNEEKPLTKKHIYQQNRKKILFKEVVRTTRQAYEVLNRMSRFQNDLHQLNNQLLLQIKLELDSLVAVHEQIYKSLSKKAKYDVTQLDYEVDNPQKKNLMDAFQQELINNPHQTRYSYGNMMQIIAAIEEYRYHLEHLDRIRLSFFTYHRSDSDIDISDEDFDL >AP018585.1|BBD89642.1|1080733_1082470_+|ABC-transporter-(ATP-binding-protein)-homolog MIKRYLKFVQPYRYRIIATIIVGIIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHSLSNSEKFSHLGVAIGIALFIFLIVRPPIEYIRQYLAQWTSNKILYDIRKQLYNHLQALSARFYANNQVGQVISRVINDVEQTKDFILTGLMNIWLDCVTIIIALSIMFFLDVKLTIAAIFIFPFYILTVYFFFGRLRQLTRVRSQALAEVQGFLHERVQGMSVIKSFAIEDNEAKNFDHRNGHFLKRAFQHTRWNAYSFAAINTVTDLGPIIVIGVGAYLVINGSITVGTLAAFVGYLEQLFGPLRRLVSSFTTLTQSFASMDRVFQLMDEDYDIKNGIGAQPIEIKKGQIDLNHVRFKYNENESEVLHDINLTINKGETVAFVGMSGGGKSTLISLIPRFYDVTAGEINIDGNNVKDFLTGSLRNQIGLVQQDNILFSDTVRENILLGRPDATEEEIVEAAKMANAHDFIINLPEGYDTEVGERGVKLSGGQKQRLSIARIFLNNPPILILDEATSALDLESEAIIQEALDVLSKDRTTLIVAHRLSTITHADKIVVMENGQIVETGTHQELIAKKGAYEHLYSIQNL >AP018585.1|BBD89641.1|1079908_1080451_+|hypothetical-protein MVKESIPKEGESIKIQSYKHDGNIHRVWSETTILKGTDHVIIGGNDHTLVTESDGRTWITREPAIVYFHSEYWFNVICMFREDGIYYYCNLSSPFVCDEEALKYIDYDLDIKVYPNGKYHLLDEDEYEQHMNQMNYPHDIDVILRRNVDILQQWIEQKKGPFAPDFIKVWKERYKKIRDY >AP018585.1|BBD89640.1|1078761_1079805_+|putative-A/G-specific-adenine-glycosylase MYQNESFKKNIVDWFEKNQRDLPWRETTNPYYIWLSEVMLQQTQVNTVIDYYYRFIHRFPTVASLSEAHEDEVLKYWEGLGYYSRARNFHTAIKEVEAQYDGEVPSEPELFKKLKGVGPYTQAAVMSIAFDQPLATVDGNVFRVWSRLNNDYRDTKLQSTRKAFEQELNPYVQEASGTFNQAMMELGALICTPKSPLCLFCPVQENCEAFHEGTTQELPVKTKNIKKKTVNQKVLLIRNSKGQYLLEKRQEKLLNGMWQFPMREESDADAQLSDYLGLHVQSLEEPIYELRHQFTHMTWNIKVYSVPETHDIPDDELPSNMKWFDLDDREAHTFPVSMDKIYRFIVG >AP018585.1|BBD89639.1|1077631_1078609_-|putative-inner-membrane-protein MDTATHIVMGVGLTALATQDPVMAGSFAATATTLVAGSLIPDGDTVLKLKDNATYISHHRGITHSIPFTILWPILITFLIFVIFNHTEPLHVWLWAQLAVFLHVFVDIFNSYGTQALRPITNKWIQLSVISTFDPIIFTLLCIGVLLWIVGVHPYLAFFPIVAILVVYYIVRFMMQATIKKEALKRIDRSHNAVKVFVAPTIKFHVWRVAIQTEQHDYVGTARWKDVEFTDKVKRQSMTPDTLLWKVKGNKDIFTFLNFSSIYRWQTTPLEDGATEIRLMDLRYLNNGRYSFVAIAHLTQDNEIDHSYIGWVFSEDKLQRKLYSQ >AP018585.1|BBD89650.1|1096142_1096880_-|hypothetical-protein MLLYLFFTLLIIFAVSTVVLIILLIISKVNKKSIKPYVISTSITLVLTIIFLVLTIFFHHINERNKKEMYPPKTVELKDGSYEVGKDLEPGHYTISSKNNKGYIEIKTVEDWSFEEKFGKDYGTLDNATTPTITTYLMEGDKINLDKAELTTFKPKHQTFTNPISTGVWIVGKDVKPGKYKIYTTFSHDIGGNFKIFNRDGSLDKEYILVGKDSDRPYDTEGAVTLKSGQILILNHMYSVSLEKK >AP018585.1|BBD89651.1|1097091_1097412_-|DNA-binding-helix-turn-helix-protein MSAKSARTIFSENLQRLMRNKNVDQKELAETIGVTQPTISNWIKEIKYPRIKRIQLLADYFNVPKSELTEEHSIVTKNAIAAYITPDVTEEEMKEIINFIEYIKSK >AP018585.1|BBD89652.1|1097757_1098816_+|regulatory-protein-PfoS/R-homologue MSNSHVNGKSFFNNILNAVGAGVVIALLPNALLGELLKFFKEGNHLLETVYQLVIVIQSFMAFIIGVLAAHQFKFKGAGAAIIGTSAMLGSGVVHFSNKGIELKGIGDIINVIVVVALACFIYMFLEGKLGSFEMIILPVLVPVISGVIGLLTLPYVQVITQSIGRVVNGFTELNPLLMSILICVTFSLLMVTPISLVAIATAISLTGLGSGAANMGIVAACVTFLFGSLRVNSIGVNLVLLIGAAKMMIPVYLKHLIIAIPLTVNGIICGIVAYVLNIKGTPLSAGFGYTGLVGPINALNRMSGDTSFNIIMLIIGYFVVPFTGAFIVHHLCKKFIHSYSDEIYQFEIPKE >AP018585.1|BBD89653.1|1098958_1100416_+|polar-amino-acid-ABC-transporter,-inner-membrane-subunit MNKTFKIIIVIAILISSAMIYINPIASAKEDSNWNKIKQRGEIRVGLSADYAPLEFEKTVHGKTEYAGVDIELAKKIAKDNHLKLKIVNMQFDSLLGALKTGKIDIIISGMTTTPERKKEVDFTEPYMMTNNTMLVKKSEKNQYKSLKDFDGKKIAAQKGTEQEKIAQNEINNGQISSLSRLPDAILALKSGKVVGTVIEKPVAEAYLKQNPELDFADVKFNEEKKPTCIALPKDSPELLKHLNQTIDEVKSKNLIDSYMNKAAEDMQDDGNFFTKYGSFFIKGIKDTILISSIGVILGSILGALIALMKLSKFKPLSWLASIYIEFLRGTPMLVQVFIVFFGTTAALGLDVSALICGTIALVINSSAYIAEIIRAGINAVDKGQTEAARSLGLNYSQTMKFVVMPQAIKNILPALGNEFVTLIKESSIVSTIGVGEIMFNAQVVQGISFDPFTPLLIAAVLYFILTFALSRIMSLVEGRMKASD >AP018585.1|BBD89654.1|1100408_1101131_+|glutamate-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIKIKNLNKTFGHNEVLKDINLEVKQGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLETPTKGQVIFEGNDLTEKNVHLDELRQKMGMVFQSFNLFPHKKVIENIMLAPKLLHKDNQGTIKEIALNLLDKVGLKDKAEAYPNQLSGGQKQRVAIARALAMKPDVLLFDEPTSALDPEVVGDVLKVMRDLAKDGMTMVIVTHEMNFAKEVSNKVVFMADGVVVESGSPVDIFEHPQHERTQNFLSRVL >AP018585.1|BBD89655.1|1101290_1102418_+|iron-sulfur-(Fe-S)-cluster-binding-protein MDYKQLKREIIDYAHSIGIDSIGFTTADPFDELKQKLESYHSRGYASGFEESDIALRTEPKLSLPSARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVRGDRRGMFARASWGQDYHTIMRKRLDKLSEFLRERVPNVEIQSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFVGRNGFVISPELGTWTYLGEMLVSIPFEPDDPILDSCGDCTICVDRCPTGALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYLEDEYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINTQHDDIVLEPEILKPRLVPLLQMSNKEFKNTYGHLAGAWRGKKPIQRNAIIALAHFKEENAIPELKEVALNDPRPMIRGTAYWAIGQIQGEDARHFINENFEKEIEEVQVEMKKGLEMRRD >AP018585.1|BBD89656.1|1102420_1102891_+|putative-tRNA-(cytidine/uridine-2'-O-)-methyltransferase MTNHIVLFQPEIPANTGNIARTCAGTLTHLHLIKPLGFSTDDKMLKRAGLDYWEHVNITYHESIEAFFESTEGNYYLLTKFGKQTYSDFNFSNTEEEHYFIFGRETTGLPNWVKEKYADTALRIPMSDKIRSLNLSNTAALLIYEALRQQQFPNLS >AP018585.1|BBD89657.1|1103070_1103670_+|hypothetical-protein MAMNFKVFDNNERVAEYAADIIRKQFNNNPTTIAGFHLDKDQAPVLDELKKNVDTHAVDFSQINILDYDDNRSYYEALGVPESQVYSISYEKDAIEFISDKMKTKENKGKLILQVLSIDESGKLDVSVRQGLMEAREIFLVVTGSNKRDVIEKLYRENGKSSYEPADLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKEYFTARFV >AP018585.1|BBD89658.1|1103694_1103874_+|hypothetical-protein MAKEQESKLNYHEEENAMVTDLDDLKELGKEMEQISEENDEDKLNQSHDEDIRSDLQDK >AP018585.1|BBD89659.1|1104109_1104508_+|membrane-protein MLGKYWIHLMIATVIISLISVKGFPLALGALYLPLLFKIVQLQLNLSKGLVDDVSAQTFIKSNQSGVIISVICCLAITGILIYTLNDFYSRLTGILGFLVQISPITIVISAILFILLAIAIVQATKTKYKHS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP018585_5 | 1678000-1678093 | Orphan |
NA
Consensus repeat of AP018585_5
|
1 spacers
spacers of AP018585_5
>5.1|1678032|30|AP018585|CRISPRCasFinder CTTTTGGTAATACTTGAATCTACGCTTCAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around AP018585_5
The CRISPR arrays of AP018585_5 >merge|AP018585|5|1678000-1678093|CRISPRCasFinder GCATAAGAGCCACTAACCGATGAATCGGTAAGCTTTTGGTAATACTTGAATCTACGCTTCATGCATAAGAGCCACTAACCGATGAATCGGTAAG >AP018585|5|5|1678000-1678093|CRISPRCasFinder GCATAAGAGCCACTAACCGATGAATCGGTAAG CTTTTGGTAATACTTGAATCTACGCTTCAT GCATAAGAGCCACTAACCGATGAATCGGTAAG
>AP018585.1|BBD90176.1|1677580_1677796_+|hypothetical-protein MSINIDPEKFAELVVSSNPAKSDEPEDIAKESLTLYINAYRLAERYSNIATNCYDTAEIIREINDADLQLK >AP018585.1|BBD90175.1|1676623_1677418_-|phosphoesterase-family-protein MRILFIGDIVGKIGRNAISTYLPKIKQSYHPTVSIVNAENAAHGKGLTEKIYKQLLREGVDFMTMGNHTYGQREIYEFIDNANRMVRPANFPEEAPGVGMRFIQINEIKLAIINLQGRTFMQDIDDPFKKADQLIEEARQVTPYIFVDFHAETTSEKNAMGWYLDGRVSAVVGTHTHIQTSDNRVLPKGTGYITDVGMTGYYDGILGINRDEVIHRFITSLPQRHVVPDEGRSVLSGVIIDIDKEGKTTQIERILINDDHPFQG >AP018585.1|BBD90174.1|1674728_1676489_-|2-oxoglutarate/2-oxoacid-ferredoxin-oxidoreductase-subunit-alpha MKSQISWKVGGQQGEGIESTGEIFATAMNRKGYFLYGYRHFSSRIKGGHTNNKIRVSTSPVHAISDDLDILVAFDQETIELNHHEMRNDSIIIADSKAKPEKPEDCKAQLIDLPFTSTAKELGTALMKNMVAIGATSALMNLDTSTFEELITNMFSKKGEKVVEMNIQALNEGYRLMQAQLNAIEGDFELEENNENPHLYMVGNDAIGLGAISAGSKFMAAYPITPASEIMEYMIANLPKVGGTVIQTEDEIAAATMAIGSNYAGVRGFTASSGPGLSLMMESIGLSGMTETPFVIVNTQRGGPSTGLPTKQEQSDLMQMIYGTHGDIPKIVVAPTDAEDAFYLTVEAFNLAEEYQCPVIILSDLQLSLGKQTVKALDYNKIEIKRGELLQSDIEREEDDKSYFRRYALTGSGISPRPIPGVKGGIHHITGVEHNEEGKPSEAASNRQAQMEKRMRKTENLVIEKPVESNERHEHADILYIGFISSKGAIMEGSERLEEQGIKVNTLQIRQLHPFPKDTIQQSIDKASKVVVAEHNYQGQLSSILKMNIQLQDKLVNQTKYDGTPFLPHEIETKGLEIVKEIKELV >AP018585.1|BBD90173.1|1673861_1674728_-|2-oxoacid-ferredoxin-oxidoreductase,-beta-subunit-homologue MATFKDFRNNVKPNWCPGCGDFSVQAAIQKAAANVGLEPEEVAIITGIGCSGRLSGYIKSYGVHAIHGRALPLAQGVKMANKDLTVIASGGDGDGYAIGMGHTIHALRRNMNMTYIVMDNQIYGLTKGQTSPSSAVGFVTKTTPKGNIEKNVAPLELALSSGATFVAQGFSSDIKALTKLIEDAINHDGFSFVNVFSPCVTYNKVNTYDWFKEHLTNIDDIENYDTSDKQLAMKTVLEHESLVKGIVYQDTETPSYESQIDELEDEALAKKDIHISEETFNDLTAQFV >AP018585.1|BBD90172.1|1673083_1673704_-|hypothetical-protein MDKFKSMKILEKKTIENEDWEIEIEDKDSDVSILAIHGGGIEPGTTELAQVIAEKGGYNYFSFKGIRSKGNNELHVTSTHYDNQQALDLVKKSERAITVHGCKGEESVVYIGGDDYQLIDILSETLQDIGIKVEGAPHTMAGTQNRNITNQTKNDAGVQLELTSELRKSLFVNHKSSRKSRENRDNWGDLMYDFADATSKAIQQVQ >AP018585.1|BBD90171.1|1672703_1673000_-|hypothetical-protein MNDTLMSVQIVPRTPNNQDVIPYVDEAIKIIDESGLHYRVGPLETTVQGDMSECLILIQKLNERMVELECPSIISQVKFYHVPEGIEIETLTGKYDQE >AP018585.1|BBD90170.1|1670957_1672502_-|tRNA-2-methylthio-N6-dimethylallyladenosine-synthase MNEEQRKAGTINILAERDRKAEKDYSKYFEQVYQPPSLKEAKKRGKQEVQYNRDFHIDEKYKGMGNGRTFLIKTYGCQMNAHDTEVMAGILKALGYSATSDINQADVILINTCAIRENAENKVFSEIGNLKHLKKERPECLIGVCGCMSQEESVVNKILKSYQNVDMIFGTHNIHHLPEILEEAYLSKAMVVEVWSKEGDVIENLPKVREGSIKAWVNIMYGCDKFCTYCIVPFTRGKERSRRPEDIINEVRELAREGYQEITLLGQNVNSYGKDIEGLDYGLGDLLEDISKIDIPRVRFTTSHPWDFTDRMIEVIANGGNIVPHIHLPVQSGNNAVLKIMGRKYTRESYLDLVSRIKNAIPDIALTTDIIVGYPNETEEQFEETLSLYDEVEFEHAYTYLYSQRDGTPAAKMKDNVPTEVKKERLQRLNKKVGEYSQKAMSQYEGEIVTVLCEGSSKKDDTVLAGYTAKNKLVNFKAPKEMIGKLVDVKIDEAKQYSLNGTFVGEHQSEMVVQ >AP018585.1|BBD90169.1|1670590_1670956_-|hypothetical-protein MYSKEDILKHADTLANRINNLEIVKDYQTIEKQIHNNKTIENKMKNLKKQQKQSVNFQNYGKDNAFQQSENQIHHIEDEINQLPIVEEFRSAQYDANDLLQMMIKTMEDRLNEHNEREHKE >AP018585.1|BBD90168.1|1670072_1670567_-|hypothetical-protein MKVRKLTITAILIAINIVLSSLIVIPLGPIKAAPVQHFINVLCAVFVGPWYGLAQAFISSIFRVSFGTGSVFAFPGSMIGVFLSSLFYMYRKHIFMAAVGEVLGTGVIGSLMCIPLAWFMNFDNFLVRPLMIAFIVSSVIGSLISYILLIVLKRRGLLDKFNKK >AP018585.1|BBD90167.1|1669862_1670033_-|hypothetical-protein MGLKQFCLMLKRTFLYTFLVKRVVFIYVKMYELKAYVKKIKIRKIFINKGCENRNG >AP018585.1|BBD90177.1|1678106_1679666_-|putative-ribonuclease MNLLSLLLILLGIILGVVVGYVVVRNLLHQKQVQSRQTAEDIVNHANKEADNIKKEKLLEAKEENQILREQAESELRERRGELQRQETRLLQKEENLDRKSDLLDKKDEILEQKESKLEERQQQVDAKESSVQTLIMKHEQELERISGLTQEEAVNEQLHRVEEELSQDIAILVKEKEKEAKEKVDKTAKELLATTVQRLAADHTTESTVSVVNLPNDEMKGRIIGREGRNIRTLETLTGIDLIIDDTPEAVILSGFDPIRREIARTALVNLVSDGRIHPGRIEDMVEKARKEVDDIIRDAGEQATFEINVHNMHPDLVKILGRLNYRTSYGQNVLKHSIEVAHLSGMLAAELDEDITLAKRAGLLHDVGKAIDHEVEGSHVEIGVELAKKYGENETVINAIHSHHGDVEPTSIISILVAAADALSAARPGARKETLENYIRRLERLEALSESYDGVEKAFAIQAGREIRVVVSPEEIDDLKSYRLARDIKNQIEEELQYPGHIKVTVVRETRAVEYAK >AP018585.1|BBD90178.1|1679908_1680961_-|recombination-protein-RecA MDNERQKALDTVIKNMEKSFGKGAVMKLGDNKGRRVSSTSSGSVTVDNALGVGGYPKGRIIEIYGPESSGKTTVALHAIAEVQKNGGVAAFIDAEHALDPVYAQALGVDIDNLYLSQPDHGEQGLEIAEAFVRSGAVDIVVVDSVAALTPKAEIEGEMGDTHVGLQARLMSQALRKLSGAISKSNTTAIFINQIREKVGVMFGNPETTPGGRALKFYSSVRLEVRRAEQLKQGQDIVGNRTKIKVVKNKVAPPFRVAEVDIMYGQGISKEGELIDLGVENDIVDKSGAWYSYNGERMGQGKENVKNYLKENPQIKEEIDRKLREKLGIFDGDVEETESEEDTPKTLFDEE >AP018585.1|BBD90179.1|1681125_1682277_-|competence-damage-inducible-protein MKISIIAVGSELLLGQIANTNGQYLSKLFNSIGKSVVEHTVIGDNPKRLEYVIKQGLERFDTLVLTGGLGPTKDDLTKHTVAKVLGRELVTDESSLSYIESYFREQGQEMTPNNKQQALVIEGSKVLPNKTGMAPGMLVEKEEKKVVLLPGPPKEMKPMAKNELLPYLLDDDRVIFSELLRFAGIGESKVETILMDLIDNQSNPTIAPLAGTHEVYIRLTANADTQTECEKLIQPIKKEILNRIGEYYFGSDDITIEESVMSKVKRTFAIYDGVTNGALYTRLKNVDTDNLLKGILPHSSVFVENDENIHAQLLSAAQYVRDLYQTELGIVLLNKDGEVYLAIYDGENLNIDTFKMAQSRNLLRNRSQNYAMIRLLKWFEQQE >AP018585.1|BBD90180.1|1682462_1683044_-|CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate-3-phosphatidyltransferase MNIPNQITVFRVILIPVFILFALVDFGFGQVSFLGGYHIRIEILISAITFIIASLSDFADGYLARKWQLVTNMGKFLDPLADKLLVASALIVMVQLGFTNSVVAIIIIAREFAVTGLRLLQIEQGFVSAAGQLGKIKTAVTMVAIIWILLGDPLVHFIHFPLGVTLLYIGVFFTILSGIEYFYKGRDVFKQSK >AP018585.1|BBD90181.1|1683075_1683468_-|Cro/CI-family-transcriptional-regulator MKTVGEALKGRRERLGMTLNELEQRTQLKRQTLIHIENNDFDLLAKKDYTEGFIRKYANVVNIEPNQLIEAHRDEIPSNQHQMDQLMTTFSNGQVPSYRSKSKETIQLVMLIGMIVIVSLIIWILAVLIL >AP018585.1|BBD90182.1|1683486_1684314_-|hypothetical-protein MTVAERKEWYLEYEITINRAGLLGDISSLLGMLGISIVTINGVDQGKRGLLIKTDKLEKVERFEQIVKEINEIDITKLRIPELRDRLAVRHGRYIEQDADDKKTFKFEREDLGLLVDFLAELFKEEGHKLIGIRGMPRVGKTESIVAGSVCAHKRWLFISSTLIKQTVRSSLIKGEYESNHVYIIDGAVTARESNPKHQDLVREVMTLPSIKVVEHPDLFVEACNYSMDDFDYIIELRENENQEIHYDEMKKQTVQSKNSLEFGDPFGGGFGFFE >AP018585.1|BBD90183.1|1684498_1685203_-|3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-reductase MKALVIGGSGSIGTAIVDRLLDEGYEVIIHYNTADLTSLKEKYKNNNVEFIQCDLAQDITLSEYFGHLNDIDCLIYTSGTALYGMLQDMSDEDIDYSYALHVRQFIRLSRYFVDTLRKSNNGRIIVISSIWGETGASMESIYSAMKSAQIGFVKALSQELALTSVTVNAIAPGFVSGNMSNAWSKEEMESIVVELPQNRMIEPYEVAHVCAYLCHPMSRSITGTVQKVNGGWYL >AP018585.1|BBD90184.1|1685202_1686489_-|processing-proteinase MKVHNYELIDEKVFEHELDNGLKLFIIPKPGFQKTFVTYTTQFGSLDNHFKPLGSNEFVKVPDGVAHFLEHKLFEKEEEDLFTAFAEENAQANAFTSFDRTSYLFSATNHLESNIKRLLTMVETPYFTEETVNKEKGIIAEEIKMYQEQPGYKLMFNTLRAMYSKHPIRVDIAGSVDSIYDITKDDLYLCYETFYHPSNMVLFVVGDVDPQSIVDLVDNHEKQRNKTNQPQIERAQIKEPEEVNTHTVTEKMKLQSPRLMLGFKNQPLNESSEKYVQRDLEMTFFYELIFGEETDFYQDLLNKDLIDETFGYQFVLEPSYSFSIITSATQHPDELKELLINELKKYRGHLADQEAFDLLKKQFIGEFISSLNSPEYIANQYAKLYFEGVSVFDMLEIVENITLESVNETSKLFLDFDHLVDSRLELKE >AP018585.1|BBD90185.1|1686488_1687763_-|processing-proteinase-like-protein METMNHDHSNIHINVLPTEKFKTTMVTFKFMAPLDYETITSRSILSKVLVRATQKWPNDKALNRHLSNLYGAYINSFVTKFKDKHVITISLEIVNERYLKDSTPLFEKGLEMLKELIWNPLIEDEQFNEKYVAQEKSLLTKKIEAMTDNKAQYSFLKLMNYMFKDEPYKYIATGQLEQIPQVTAQNLYDTYKSMIHNDECAIYVVGNVNEQETRNLIQNNFEIKPFELEKGSPLTQINHIGSPKVIIEEDEVDQAKLNLGYRFPTYYGKQNYYAFVVFNMMFGGDPSSVLFNEVREKQSLAYSIHSQIDGKNGFLFVLSGVSADKYERAKDTILEEFDKLKNGEFDETKLELAKKIIISHRHESTDRPKSMIELLHNQLLLDEYQSDEDFIKAINQVTKEDVIELANEAVLDTIYVLTKGGQSE >AP018585.1|BBD90186.1|1687800_1688511_-|hypothetical-protein MSEMNAIYRVKQYILNMIKNGELENGGKLPSNLSIARALNVKTDDVYDGIGELITEQIVTDNFEEGTSVKAQPPFFYPLDKLISISTMIEEAGYKAGIEYLNFDEQPATILDAEHLGIETKQPVTIIERLRTADHKPVVYCLDKIAKQYLTCLDYQKSNGSMLRAIKDATGHEVTHAEMDLEAISYEPHISEVLNASPHEGLMLLKVVHYDENGQPILYSLNYLKSSLVKFKVNKN |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP018585_6 | 1744763-1744993 | Unclear |
NA
Consensus repeat of AP018585_6
|
3 spacers
spacers of AP018585_6
>6.1|1744792|30|AP018585|CRISPRCasFinder TGAGCTTTAGCTCAGGCGTTCCTTTTTACT >6.2|1744851|27|AP018585|CRISPRCasFinder GTTGTGCCAACAACTGTATACCATACT >6.3|1744907|58|AP018585|CRISPRCasFinder TGAGCTTTAGCTCAGGCGTTCCTTTTTATTGCGCTTTAGCGCTTATAAAGTATCACTT |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around AP018585_6
The CRISPR arrays of AP018585_6 >merge|AP018585|6|1744763-1744993|CRISPRCasFinder GCACTTTAGTGCTTAGTGTTTCTTATGCATGAGCTTTAGCTCAGGCGTTCCTTTTTACTGCACTTTAGTGCTTAGTGTTTCTTATGCAGTTGTGCCAACAACTGTATACCATACTGCACTTTAGTGCTTAGTGTTTCTTATGCATGAGCTTTAGCTCAGGCGTTCCTTTTTATTGCGCTTTAGCGCTTATAAAGTATCACTTTCATTTCAATGATTAGTGATACTTACACA >AP018585|6|6|1744763-1744993|CRISPRCasFinder GCACTTTAGTGCTTAGTGTTTCTTATGCA TGAGCTTTAGCTCAGGCGTTCCTTTTTACT GCACTTTAGTGCTTAGTGTTTCTTATGCA GTTGTGCCAACAACTGTATACCATACT GCACTTTAGTGCTTAGTGTTTCTTATGCA TGAGCTTTAGCTCAGGCGTTCCTTTTTATTGCGCTTTAGCGCTTATAAAGTATCACTT TCATTTCAATGATTAGTGATACTTACACA
>AP018585.1|BBD90231.1|1744434_1744668_-|HmrB-protein MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKYINSLEK >AP018585.1|BBD90230.1|1743568_1744315_-|ribonuclease-3 MANQKKIDMVKDFQQTFTNKMNEWGFSFNNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPHLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIDLNELILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFVGALYLDQGLETVWAFAEKVIFPYVEDNELVGVVDFKTQFQEFVHRQNKGDVTYRLIKEEGPAHHRLFTSEVILENKAVAEGKGKTKKESEQKAAEQAYKSMKKNEKLRHH >AP018585.1|BBD90229.1|1739900_1743470_-|chromosome-partition-protein-Smc MVYLKSIDAIGFKSFADHTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGAKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVKLKLDNQSKKLQIDSDELVVTRRLYRSGESEYYLNNDRARLKDIIEIFLDSGLGKEAFSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESINKLDHTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYQQLSKQMEQSDVIVTVHDIDQYNEDNRQLDNRLNELKSQQADKEAQQAQINQLLQKFKGERQQIDHDIEKLNYELVKTTETYEQLAGKLNVLEERKKNQSETNARYEEELENLNEHIKSIDEEKRQNEEILSELKDKQKQLNKEVQDLESLLYVSDEQHDEKLEEIKNNYYTLMSEQSDVNNDIRFLEHTINENEAKKSRLDSRLVEAFNQLKEIQNNITETEKNYKASKKEMSEAEQQINRLEKELTASKKLQSEYEDKLYQAYRYNEKLKSRIDSLATQEEDYTYFFNGVKHILKAKNNELNGIHGAVAEVIDVPSQMTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQYLKQRGLGRATFLPLNVIKPRQIASDIKDIARNTDGFINIASDAVKVSSKYQSIVENLLGNTIIVDDLKHANDLARAIRYRTRIVTLEGDVVNPGGSMTGGGARKTKSILSQKDELSTMRHQLEAYQRQTAEFERHFKEQKDKAEKLSEQYFDASQQYNTLKEKVHHHELELDRLRTQETHLKNEHEEFEFEKNDGYQSDKSKETLTQKQTRLSEIQQQLSELESDIERYTQLSKEGKESTTQTQQQLHQKQSDLAVVKERIKSQKQAIERLDKQYESTQLQIKDVQEKIRLFNSDEMMGEQAFENLKSQIQEQEEERDRLNHQLTDIKQQRIELNETIERNESQLQECHQDILSIENHYQDIKAKQSKLDVLINHAIDHLNDVYQLTVERARTLYESDEPIESLRKKVKLTKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLNEQRTDLREAKETLEQIINEMDREVEGRFKETFHAVQSHFTTVFKQLFGGGQAELRLTEDDYLAAGVDIIVQPPGKKLQHLSLLSGGERALSAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAQYLNELSEQTQFIVITHRKGTMEFSDRLYGVTMQESGVSKLVSVNLNTIDEVMKEEQA >AP018585.1|BBD90228.1|1738647_1739904_-|signal-recognition-particle MSFFKRLKDKFSGKSEDDIQKELTEDVESDASSDSDTSTESDDLNLNETAEDSKPKKKPKKLSEADFDEDGLISIEDFEEIEAQKIGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMKLTDELRTEAQRRNIQETEDLREVIVEKIVEIYHQEDEHSEAMNIEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYQQEGKKVMLAAGDTFRAGAIQQLQVWGERVGVEVVSQSEGSDPAAVVYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKSNLMQELDKMKRVISRAIPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARSFKEVTNVSGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEKLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEDIPDELVESSNETEEGTQDGPK >AP018585.1|BBD90227.1|1738328_1738661_-|DNA-binding-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTQKQRNYLELFYLQDYSLSEIADTFEVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYESKLGLYRRFEKRQEIYNLMKQSLNQPDLLKQYIKQLEELE >AP018585.1|BBD90226.1|1736929_1738297_-|signal-recognition-particle-protein-Srp54 MAFEGLSERLQSTMQKMRGKGKVTEADIKTMMREVRLALLEADVNFKVVKEFVKTVSDRALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQEELTSLMGGENTSIKMANKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAGDIYRPAAIDQLQTVGKQIDIPVYSESDQVPPQQIVENALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELQEVKEISKPDEIMLVVDAMTGQDAVNVAQSFDDQLDVSGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRDSSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSDKQIDHIKAIIQSMTPKERSNPETLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKAKRNQMQNMLKGMNLPF >AP018585.1|BBD90225.1|1736438_1736714_-|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQLGTYNPAHVNAPEVKIDEELALKWLHDGAKPTDTVHNILSREGILKKFDEQKNAK >AP018585.1|BBD90224.1|1735811_1736315_-|ribosome-maturation-factor-RimM MEVEVGQIVNTHGIKGEVKVKSNSDFTATRFQPGENLIVKHNNNDIQYTIASYRIHKGFHMLKFEGINNINDIEHLKGDYLYQERDHEDIELDEHEYYYSDIIGCTVFDDNNTPIGRVINIFETGANDVWVVKGDKEYLIPYIEDVVKDIDVEGKSIRITPMEGLLD >AP018585.1|BBD90223.1|1735074_1735812_-|tRNA-(guanine-N(1)-)-methyltransferase MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKEIIDVNAINFRDYSVNKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMQDLKRDENTRVILMCPQGRPFTQEIAQELSEAQHIVFICGHYEGYDERIREHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEASHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREYKEMKVPDVLLSGNHAHIEEWRHKQKLIRTYEKRPDLLEKYELTNNDKEILETYKKQLKNN >AP018585.1|BBD90222.1|1734619_1734970_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPTFRSGDTLRVHVRIVEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >AP018585.1|BBD90232.1|1745092_1745827_-|3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein)-reductase MSKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKDKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVANGDEVKAMIKEVVSQFGSVDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKVTPQMLRQRGGSIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVVGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKDQMLEQIPLARFGEDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >AP018585.1|BBD90233.1|1745819_1746746_-|malonyl-CoA-acyl-carrier-protein-transacylase MSKTAIIFPGQGAQKVGMASDLYNEETRSTEILNQAQTSLDFDLLETMFTDEEGKLGETENTQPALLTHSVALLTALKDLNADYTMGHSLGEYSSLVASGVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPNGVGSMAAVLGLDYEEVDKICKDLSNEDELIEPANINSPGQIVVSGHKTLIDKLVEEGKSLGAKRVLPLAVSGPFHSSMMSVIEEDFASYINQFNWNDAQFPVVQNYNAQGETDAEVIKHNMVKQLYSPVQFIKSTEWLIEQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKITSIQTLEDVKGWNENE >AP018585.1|BBD90234.1|1746738_1747725_-|fatty-acid/phospholipid-synthesis-protein MVKIAVDMMGGDDAPGIVLDAVKKAVEDFKDLEIILFGDKEQYNLNHDRIDFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTTDGKGFVFLDVGANADAKAEHLLQYAQLGNIYAQKIRGINNPSVSLLNIGTEAAKGNSLTKKAYELFEKNNSFNFQGNIEAKTLMDGNTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKETIMGSLKNKLAGAVLKKDLETFAKKMDYSEYGGSVLLGLDGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEENIVQTMRETVGGKSE >AP018585.1|BBD90235.1|1747717_1748287_-|transcription-factor-FapR MKLKKDERRIAIRNAIEANPFITDNELCEKFDVSIQTIRLDRTHLNIPELRKRIKLVAEQNYGQIKSIEANEIIGDLIQVEPDVKAQSLIEITEDYVFAKTQIARGHILFAQSNSLCVALIHNPTVLTQESQVEFVEKVKLNDTVRAEAQVINKTSKHYVIEVNSFVKDKLVFKGKFKMFYISEDEFNG >AP018585.1|BBD90236.1|1748629_1750678_-|ATP-dependent-DNA-helicase-recG MTKVHLIESPYTLDKIKGIGPKRLTLLEELNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSTVTVQGEVYSTPAVAFFGRNKSKLTVHIMVNNIAVKCVFFNQPYLKKKIELHGTVTVKGKWNRAKQEINGNRMFFNEQTTQDDVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDNIRQALEDVTIHEWLSDDLREKYKLETLEYTLRTLHHPKDKQSLLRARRTYAFTELFMFELRMQWLNRLEKTSDEAIEIDYDINKVKEFIDHLPFELTDAQKTSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLIELFRDTMNVALLTGSVKGKKRRILLEQLENGSIDCLIGTHALIQDDVIFENVGLVITDEQHRFGVNQRQSLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITSWAKHERYDQVLTQMTSELRKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQYYGTEKVGLLHGKLTAEEKDDVMQRFSNHEIDILVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSEHQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANIVEDYRMLEVARDEAAQLIQTGQFFQNNYTQLRNFIQNNLLDTNFD >AP018585.1|BBD90237.1|1750900_1751755_-|nuclease-like-protein MEKIIFLLLLLTLCSVVISVQKYVTRKYNVKSTHFFSLILIFTILLSTLGQSLNLNQAQAANGLHKEKATLVKVVDGDTVKLNYKGKVATFRLLLIDTPETKDPRKPVQKYGPEASAFTTKMMTNAKKIEVEFDKGQKTDKYGRYLAYVYADGVMVNNALVRDGLARVKYVYPPNNTYEKMIRESEAKAKTEKLNIWSEENAVNTSLTSAKNIKTAKHTATTKKSITHYSSKKSKKSSRAKAKKEYFKNCTALRKKYPHGVRKGHPAYQPKLDRDKDNYACEVR >AP018585.1|BBD90238.1|1752031_1753099_-|leucine-dehydrogenase MIFETMEQKDYEQIVFCQDKATGLKAIICIHDTTLGPALGGCRVRNDYASEQEAIEDAMNLARGMTYKNAAAGLDLGGGKTVVMGAPDKENEEAFYRALGRYVNTLNGRYYTAEDVGTSEHVMNLIYKETPYVCGTSKSFGSAGNPSPMTAYGIYIAMKRTAKEKFENESLEGKTVAVQGVGHVSYELCRLLNEDGVNLIVTDINKDNAQRAVDDFNAQFVEPDDIFSVDADIFAPCALGGILNDDTIPQLKVKAVCGSANNQLKDEDAHSKMLEDKGILYAPDYIVNSGGVINTADELNGYNEDRAKESIEGIDQILKHIFDISKEQNETPLEASQHFAEKRMEQMSHIHDIRK >AP018585.1|BBD90239.1|1753335_1754994_-|hypothetical-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTITSGREEVENNLSQNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIENEKEINAQQLADSFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAQAAVEKAQDTEDCVELMEHTISAAKESLDNTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKGLKGEKVEAKTPKLDTETLVNEDHDFHGVINTEDIVYGYCTEMMVRFGKNKKPFEEQEFRNDMSEFGDSLLVINDDEIVKVHVHTEHPGDVFNYGQQYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQNGQDRKDQDAPQTVETAVITISMGEGISELFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSKCKRAIILPNNKNILMASEQAASIVDAETVVIPTKSIPQGITALFQYDEASSLDENKNHMETALETVQSGSVTFAVRDTKIDGIEIKKDEFMGLAEDKIVTSDADQFTAVKGLLEKLLSEDSEILTMIIGEDSNQSVTDQLIEWIESTYPYVEIEQHEGGQPIYQYFFAVE >AP018585.1|BBD90240.1|1755008_1755383_-|alkaline-shock-protein MTLEISNDYGKIDISNEVIASVVGGKAVESYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHENYAKGIKVREENGTIDVDMYIIVSYGVKISEVASNLQSTVKYTLEKTLNVKVNSINIFVQGVRVNDTGKKL >AP018585.1|BBD90241.1|1755761_1755950_+|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCYVTGRKASTGNNRSHALNANKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP018585_7 | 2260222-2260322 | Orphan |
NA
Consensus repeat of AP018585_7
|
1 spacers
spacers of AP018585_7
>7.1|2260257|31|AP018585|CRISPRCasFinder AACTGAAAATGACTTATTTTTTCCTTAGTAC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around AP018585_7
The CRISPR arrays of AP018585_7 >merge|AP018585|7|2260222-2260322|CRISPRCasFinder TTCTTATGCAATGGACACCAGTCCATTGTAATCCTAACTGAAAATGACTTATTTTTTCCTTAGTACTTCTTATGCAATGGACACCAGTCCATTGTAATCCT >AP018585|7|7|2260222-2260322|CRISPRCasFinder TTCTTATGCAATGGACACCAGTCCATTGTAATCCT AACTGAAAATGACTTATTTTTTCCTTAGTAC TTCTTATGCAATGGACACCAGTCCATTGTAATCCT
>AP018585.1|BBD90757.1|2259318_2260191_+|bacitracin-resistance-protein-(putative-undecaprenol-kinase)-homologue MFLIELIKGIILGIVEGLTEFAPVSSTGHMILVDDMWLKSTKFLGEQSAFTFKVVIQLGSVFAAAWVFRDRFLEILHIGHHKPDNQASVQRRSQPKRLNLMHVLVGMIPAGILGFLFDDLIEKYLFSVPTVMIGLFLGAIYMILADKYSEKVQHPQTVDQINYFQAFVIGISQAIAMWPGFSRSGSTISTGVFMKLNHKAASDFTFIMSVPIMLAASGLSLLKHYEYIHLAHIPFYLLGFLAAFIVGLIAIKTFLHLISKVKLIPFAIYRIVLVVIIAILYFGFGIGKGI >AP018585.1|BBD90756.1|2257463_2259092_-|putative-ATP-binding-cassette,-subfamily-C,-bacterial-CydD MKKLTNLVFKYKIYPVLMCIVSIFLSITVVIQNISIARFLNHVLYNHKQPLIYLFIVILVVLIARATFNMLNQRIGDHMAYKVKTDLRRQVINKNSPRAIGEQMNILTESIDGIAPFFQSYLPQVFKSMMIPVAIIIAMCFVHLPTALIMMVTAPFIPMFYIIFGLKTRDESKDQMTYLNQFSQRFLNTAKGLITLKLLNRTKQTKAHLYEDSTRFRDLTMRILKSAFLSGLMLEFISMLGIGLVALEAALSLVVFNSISFVTAAIAIILAPEFYNAIKDLGQAFHTGKQSEGSSDVVFDFLEAEDQLPSPTPKVNNNQEPQIKVENVSYRYPGSEQYALRNINITIYQNDKIAIVGPSGAGKTTLAHILSQSVKPSDGEAIFNMEETRIGFLSQNPYIFTDTIKNNIAMYDYEISDEDIIQVLDEVGLKDKVLTLKDGIDTRIGEGGEMLSGGQMRRLELSRLLLMKPELVIFDEPATGLDIETERTIQAVLQDHFKETTMLIIAHRDTTINQAERRIYLENGQLIKDDATISVSQSEVNR >AP018585.1|BBD90755.1|2255763_2257461_-|ABC-transporter-ATP-binding-cassette MKPHIHFRIDKDLILAILVGVLGGLVALAMFFLSGYMVTQSALGAPLYALMVLVVSVKMFGFLRAITRYIERLLSHKTTFTMLRDVRVQFLEKLIPVVPDVYRKFNSSDLISRMISRVEALQNIYLRVYYPPVVIGLTAIVSIITFIFFTPMHALLIAVSMILTLWIVPWLSAKRARTLKQQVALQQSDFLQRFYDYKEGNEELKRFKQTHTFKTDVLNHLEHFDALQARERRFLSLYDYMLNLIAMISIFLSLVIGAQQVHAGHLDVVYLTSIVLMVLTLFEQAVPMSNVAYYKADTDQALAEINEVIDVSESRDDAHFESEKTKTELFEVEHVTFKYWNQQTPVLHDINLTIKKGEKVAIIGPSGSGKSTLLQVMLGLYQVEQGHVTLNGQVVTDIDNEEKYRYINGMLQSQHMFDGTVRDNLFSDKEDAELEGVLQSVGLGYLDLDRNVSLNGENLSGGEVQRLSLARLLLRDDARIWILDEPTTALDIDNTKKVMNLIEEASETLIVATHDLDVLSRFDKIVVMLDGEMKEIGSYDRLLNEDSYLHQMLELNNKTSPLVKD >AP018585.1|BBD90754.1|2255176_2255620_+|putative-transcriptional-regulator MSDQHNLKEQLCFSLYNAQRQVNRYYSNKVFKKYNLTYPQFLVLTILWDESPVNVKKVVTELALDTGTVSPLLKRMEQVDLIKRERSEVDQREVFIHLTDKSEMIRPELSSASEKVATASSLSKEEVKELNRLLGKVIDAFTEAKEK >AP018585.1|BBD90753.1|2254025_2254952_-|CobW/HypB/UreG,-nucleotide-binding-domain-protein MRNNKDEKISISIISGFLGSGKTTLLTHYMSELLKIDEKISVIMNEFGSFDVDGNHLTDMVEVYSILNGCVCCDLKLDLVNQLEVLINEKDVNHIIIEATGIAHPIEIIMACQDPRIVQYVHQPQVIGVVDAERFLNREQYTESTKRLMEEQLEVSNVLIVNKIDLISEEEQQHLEEALNRINANVPHILTTYGKVDVSKLSQFRDEVVTQHTHSHHHGINSMQYTFSGPIDRQLFYQFILRLPDEVLRLKGYVQFRDHPNATYEFQYAYGLPDYGVIDKVLPLTIVIIGEQLDVNRLRNKLDMLQFS >AP018585.1|BBD90752.1|2253711_2254008_-|hypothetical-protein MNNEDKREKQIKFERNLITFPYLGFAIVVLLFNIFYPDIKVTMALFGIFFAYNLGMLFIAFIRHFKRTLILTLILTILSGAAFFTLLYVFGLRHDIFG >AP018585.1|BBD90751.1|2252634_2253576_-|malate-dehydrogenase MSTRRKISIIGAGNTGSTLAFILAQKELADIVMIDRPQSEGFVKGKALDILESGPIFGFDTQVQGSVQIEDIQDSDIVVMTAGIPRKPGMTRDDLVQTNEEIVYQTSRNIAKYAPQATIIVLTNPVDAMTYTALKASGFPKERVIGQSGVLDTARYQCFIAEELQVSVKDINGLVLGGHGDTMVPLVESTQVNGVPVKDLISKEVLERIVERTRKGGAEIVELLGKGSAYYAPATAIYEMIEAILKDQKRLLPSIAYLDGEYGFSDICLGVPTILGNHGIEKIVEVNLNDKEQEQLQHSAQSVENVKNALKNN >AP018585.1|BBD90750.1|2250880_2252431_-|putative-di-and-tricarboxylate-transporter MTKGNHEAQTQSQHSQSKKAYKPLWIIISFALLIGILLLPTPAGLPIMAKAALAILAFAVIMWVTEAVSYPVSAVLILGLIILLLGLSPVQNLSEKLGNPKSGDAILKGSELLGTNNALSHAFSGFSTSAVALVAAALFLAAAMQETNLHKRLALLVLSIVGNKTRNIVIGAILVSIVLAFFVPSATARAGAVVPILLGMIAAFNMSKESKLASLLIITSVQAVSIWNIGIKTAAAQNIVAINFINQNLGHDVSWGEWFLYAAPWSILMSIALYFIMVKVMPPERDAIEGGKELIKKELKDLGPVSAREWRLIVISILLLLFWSTEKVLHPIDSASITLIALGVMLMPKVGVITWKGVEKKIPWGTIIVFGVGISLGNVLLKTGAAQWLSDQTFGLMGLKGLPIIATIALITLFNILIHLGFASATSLSSALIPVFISLTSTLHLGDHAIGFVLIQQFVISFGFLLPVSAPQNMLAYGTGTFTVKDFLKAGIPLTIVGYILVIIFSLTYWKWLGLV >AP018585.1|BBD90749.1|2249165_2250539_-|putative-deoxyribodipyrimidine-photolyase MKVGVILNRVFRLENNPLFEYISQNKEDIDQCYFIIPQEKFDKEAEMKANYYYGTLQKFVDTLHDYDIQPFLVDYDELTHFCKDKGISEVVLAGDIMSYHEEKYDILQQSASFKNEGISVVSVRANHYFKPSKTRNNKGEPYKVFTSFYKKWRPYLMKRSVFSYDIKDIAKMGVKSQQKVKGDYSQYGISEADAQYRWSDFLDKDIENYNTNREYLPEVLTSQLSIYLAYGVLDIIQIFNDLLENYDKDEQNYESFIRELIFREFYYVLMTYYPETAHQSFKDKYRDLQWSYNKENFNLWKEGKTGFPIIDAAMGELNTTGYMHNRMRMVVSQFLTKDLFIDWTWGEEYFRQKLIDYDSASNVHGWQWSASTGTDAVPYFRMFNPVRQSERFDKDALYIKKFVQTLNDIDAKYLHDTHKYERQIKEQGIELGKDYPKQIVNNSESRTHVMSEFKALE >AP018585.1|BBD90748.1|2248810_2249089_+|hypothetical-protein MIFNITLLIIILIVLQLIVGHFWHDIGFSYTQSILLMCLPLGIGLFLMQVFYYERRYPNWEVPLNIKLRLKYMYILTLLEYVAVYICLFILK >AP018585.1|BBD90758.1|2260578_2261265_+|hypothetical-protein MDNKKLIKTLINVLPIVIVPLVVERKRIKEHPDVRKATDATSKATSKATSAISNKASDVKEYVGDKKQEYDNKRELKKIAKENDPEYIEKKGEKLAKKNRKEADKMDKKLQKNIEKRHKEEDKQREENQKQRIKDMKKSQKYEEKVGLTPGKLDDKTEKKGEKLEKDNRKDVKKLDKKLQKNIEKRHKKEEKQREEAKKARKKEFKKYDDYVADSVVKQNKESDDSKA >AP018585.1|BBD90759.1|2261268_2261718_+|hypothetical-protein MMTKVIIDGDACPVVNSVIELTEGTGIFVTVLRSFSHFSHQIQPEHVKTVYVDDGPDAVDYKIVQIATSEDIVITQDYGLASLLIDKVRVVMHHKGSIYRSDNIQSLLDQRYLNAQIRKQGGRHKGPPPFTREDRLKFEQAFSKIIKQL >AP018585.1|BBD90760.1|2261728_2262298_+|hypothetical-protein MIRRIAVYCGASKGNDPSYVKEAYELGKYMAEQGYELVFGAGSVGIMGAIQDGVLDHGGKAIGVMPKMLDEREITSQKVSELILVDSMHERKNKMTELADAFVMAPGGAGSLEEFFEMYSWAQIGIHQKPIGVFNLNGFFEPLQALIEHMIKEGFIDKKYKKLAPLFDTKEALIEGLHNYKPLGVRTYD >AP018585.1|BBD90761.1|2262643_2263204_-|hypothetical-protein MGTYIETERLKLRDWEEKDLLPFQQMNANRQVRRYFPSLLSYRRSELDMRKMDEIIKEKGIGLFAVELKETGEWIGFIGVNYLPKESKYPFKELPLYEIGWRLIPEVWGNGIATEGAEAVMDYAMEKGITELYSFTSETNLPSRKVMEKIGMTFLDNFEFPDLSKYHPLKRHVRYYKELLPSQSEG >AP018585.1|BBD90762.1|2263325_2263622_-|hypothetical-protein MHEQDFNILEGKNLTLPELGRELENITGRTIVDSTSEIKRVIAHLPNFESDTDTFVATYRLNHQNDFIDATFTAPKEQRDRLKEIPVHVELISYISKA >AP018585.1|BBD90763.1|2263778_2264234_-|hypothetical-protein MKKWLTLLLASTLMLTACGKSNEKASLEKSINQLEKENKDLKKQKKDLQTQKDKLKDKQDRLQKDIDELPAEDTSKKSSKESKSNSSKENGSDEASSNDSKQSTETSKSDQSKASSKDAKQSSEQNQNVDKKTQDKASTNKNKDSKSTSNS >AP018585.1|BBD90764.1|2264291_2264747_-|acetyltransferase,-GNAT-family MKVITIEDKIWLNEIAKIHEHLISENESNYQVTTTSISLRYEMLKARLKYSQDAIFVSEQNTTLEGFIWAHYEPQMSVVQIEVLYVKPEYRKQSIATHLKNTIEEWAISIGATVIESTVNIDNHSMIQLNNHLGYHTTHLKMTKNLKGKNE >AP018585.1|BBD90765.1|2264892_2265582_+|hypothetical-protein MKSTAQLTKENNVKSLRLNNTDREIFENYMTYIRADLSVNPHDSELMLNRILKHLIRAEDKGMLAMEFFDHDPKAHAKKELKSLPNETIRNIFKYIYHNFIFLIGIFCFLKGFIGFFIGGDSNYLYLYTFPITVIVGLFIIFLFIWMSFRTVQLQCFSNSYWVWWLTYGVIALLLVALFYVFFIPQSFLAFGPYINVSNWTFIIIAIVITPIAFYINHHFYNKDANTRV >AP018585.1|BBD90766.1|2265770_2266259_-|hypothetical-protein MSVILWILIILMFILAFVGLVKPIIPSILVMWIGFLIYQFGFNDGHLSWVFYVAMIIFTVLILIADFMMNKYFVARFGGSKLGEYTALAGVILGCFVFPPFGIILVPLVAVFVVELLNGFDVKNALKVSLGSVVAFLASTVAQAIIMVIMVIWFFIDVFLFN >AP018585.1|BBD90767.1|2266265_2267474_-|transporter,-major-facilitator-family-protein MFTALLQIKNYKLFVVNMLLLGMGIAVTVPYLVLFATKDLGMTTTQYGLLLALAAISQFTVNSIIARFSDTHNVNRKILIISALFMGAVSFSIYFYVHQIWLFIVLYAIFQGLFAPAMPQLYASARESINISSSRDRAKFANTVLRSMFSLGFLFGPFIGAQLIELKGYSGLFGGTIAIILFTLILQIFFYQNLPAEQQISSQQHVEKAAPNMFKDKTLLVPFIAFILLHIGQWMYTMNMPLFVTDYLKEKEGYVGYLASLCAGLEVPFMVILGILSAKLPTRTLLIIGSIFGGAFYFSIGVFKNFYMMLAGQVCLAIFLAILLGLGISYFQDILPDFPGYASTLFANAMVIGQLCGNLLGGAMSHWVGLENVFFVSAGSIFVGMVLIFFTKDQKITEENME |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP018585_3 | 3.1|660014|33|AP018585|CRISPRCasFinder | 660014-660046 | 33 | NZ_CP023514 | Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence | 110127-110159 | 7 | 0.788 |
| AP018585_5 | 5.1|1678032|30|AP018585|CRISPRCasFinder | 1678032-1678061 | 30 | MT822287 | Erwinia phage pEp_SNUABM_11, complete genome | 472-501 | 8 | 0.733 |
1. spacer 3.1|660014|33|AP018585|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023514 (Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
tgcatttgtccaaagacaaatgtaaacatatgg- CRISPR spacer tatttttgtccaaagataaatgtaatca-atgct Protospacer *.. ************.******** ** ***
2. spacer 5.1|1678032|30|AP018585|CRISPRCasFinder matches to MT822287 (Erwinia phage pEp_SNUABM_11, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cttttggtaatacttgaatctacgcttcat CRISPR spacer cgtccattaatacttgaatctccgcttcgg Protospacer * *... ************** ******.
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
41411 : 90378
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >AP018585|41411:90378|DBSCAN-SWA 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46 | Staphylococcus_phage(84.62%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
585740 : 602020
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >AP018585|585740:602020|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >AP018585|585740:602020|590441_591113_-|BBD89153.1|DBSCAN-SWA MSRILIIEDDRDIQELIKLSLSNQGITNIDCASEISKAKEMIEQTHYQVILLDLNLNSEDGYQLIKYVNLNETAIIVVTAKNTSIDVYRGFENGAVDYIKKPFDPMELYYRVALHLNNDKTSYCYKNLKIDFNSTEVKVKDKTINLTSREYDLLLFLVNNRNQVLSKDQIYEKVWGFHTSVDDNTLMVHIRTLRKKIESDANHPQLIKTVRGKGYMYKEVKDE >AP018585|585740:602020|592838_594197_-|BBD89156.1|DBSCAN-SWA MVEVNVKGGTINGISDGQIDRFLGIPYAQPFNATSRFKHSQLNHGISNSYIDARKVQPIPPQPYNALEDFFSTQQNGFNSFIQNENCLYLNIWRKSCSSKIKPVVVYFYGGGFTQGHGTADLYNPYHIVEHEDIIVITFNYRLGALGFLDWSALDPQFDYNNGLSDQMNALKWVHHYIEYFGGDPNNVTLMGQSAGSMSILALMQIPELDTYYHKVMLLSGALFNETKENAQLKANHFSTLINTYYPGKSLESLTHEDILRLMDLHESERGKSRSLDLIYRPIQSPIMTRTIDDFPKPVFMSFTNSEGDIYIENESRTLSPSRFVEVMKLYDIDISKNHARTAQQQRELITQYYFIEPAIHLLQHIHTPHKWLARFDWCRPNSTHFKTAYHILDIVFWFGHLDILTTNQYDIIKSDIDLSQRMISDLAYFARYSEMPWSPYQRDTQSTFIYK >AP018585|585740:602020|599732_600368_+|BBD89161.1|holin|DBSCAN-SWA 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>AP018585|585740:602020|588134_588911_+|BBD89151.1|DBSCAN-SWA MSSTALCLTALLLLIPIFISYKEGLHIIKDLVIATIRAAIQLIILGFLLHYIFKINEKWLLMICVLVIIINASWNTISRASPVMHHVFWISFVAIFVGTALPLAGTIATGAIKFTANEVIPIGGMLANNGLIAINLAYQNLDRAFVQDISGIESKLTLAATPKLASKSSIRESIRLAIVPTIDSVKTYGLVSIPGMMTGLIIGGVPPLQAIKFQLLVVFIHTTATIMSALIATYMSYGQFFNARHQLIARTADVKEED >AP018585|585740:602020|587479_588142_+|BBD89150.1|DBSCAN-SWA MLLKVENLTYEADKRTILDDINLNIEKGETIAIIGPSGSGKSTLLKQLNNLISPTKGKLYLHDKLYEDYSPEELRSRVSYLMQQSELISSTIEDNMKFPCEARGDKFDKEKAKQLINQVGLGNYDLDAEIEHMSGGERQRITIARQLMYEPEVLLLDESTSALDTKNKENIEKIIFEFAKKGIAILWITHSDDQSMRHFQRRITITDGKISNDEELSGHE |
16 | Bacillus_phage(33.33%) | protease,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1134128 : 1175157
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >AP018585|1134128:1175157|DBSCAN-SWA 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33 | Staphylococcus_phage(96.3%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1292907 : 1302048
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >AP018585|1292907:1302048|DBSCAN-SWA TATGGATAAAAGAATGGTCGATCAAGAATTTCATGATGAAGACTCGGCTTTTGAATTGTCATTAAGGCCTACAAAACTTAAACAATATATCGGTCAATCCTCTATTAAAAGTAATCTAGAAGTATTTATAAAAGCTGCTAAATTAAGAGAAGAACCACTCGATCACGTTCTATTATTTGGCCCTCCTGGACTAGGTAAAACGACACTTTCCAATATTATTGCTAATGAGATGGAAGTGAACATAAGAACGATTTCTGGTCCGTCTTTAGAGAGACCAGGCGATTTAGCAGCTATTTTATCTGGATTACAACCAGGCGATGTATTATTTATTGATGAGATCCATCGTCTTAGTAGTGTTGTAGAAGAAGTACTCTATCCTGCGATGGAAGACTTTTTCCTAGATATCATCATAGGTAAAGGTGATGAAGCAAGAAGTATCAGAATTGATTTACCACCATTTACTCTTGTTGGAGCGACGACGAGAGCTGGTAGTTTAACTGGTCCGCTTAGAGATAGATTTGGTGTTCATTTAAGACTTGAATATTATAATGAAAATGAACTAAAAGAAATTATCACACGTACTGCTGAAGTACTTGATACAGGAATTGATGAAGAAAGTGCCCTAGAATTAGCACGTCGTTCACGAGGTACACCGAGGGTTGCAAATAGATTATTAAAACGTGTGAGAGATTTCCAACAAGTGAATGAAGATGATCAAATCTATATTGAAACAACCAAAAGGGCATTACAATTATTACAAGTTGATCAAGAAGGTTTGGATTACATAGACCACAAAATGATGAATTGTATTATCAACCAATATAATGGTGGCCCTGTAGGCTTGGATACGATTGCTGTATCTATAGGTGAAGAACGTATTACAATTGAAGACGTTTATGAACCGTTTTTAATTCAAAAAGGCTTTTTAGAGAGAACGCCACGTGGTAGAAAAGCTACGGCATTCGCTTATGAGCATTTTAAAAACATAGATGAAAAGAGGAAGTAAGTTGAATATTGAAGAATTTGACTATCATTTGCCAGAATCTTTAATCGCTCAAACACCCTTAAAAAATAGAGACCAGAGTCGCTTGCTTGTACTTCAAAGAGAAACTGGCGAAATGGCTCACCTTCATTTTAAAGATGTCATAGATTATTTGAATCCTGGTGATACGTTAGTTCTAAACGATACACGTGTGATGCCGGCACGTCTCTTCGGTTTAAAAGAAGAGACCGGCGCCAAAGTTGAAATGCTAATGCTCACTCAAATCGAAGGTAACGATTGGGAAGTTTTGCTAAAACCAGCTAAAAGAATTAAAGTTGGGAATCGTTTAAGTTTTGGTGATGGTAAGATTGTTGCTGAATGCGTTAAAGAATTAGAGCAGGGTGGACGTATTATGCGTTTACATTATGAGGGTATATTACAGGAACGTTTAGATGAGCTAGGTGAAATGCCACTTCCACCATATATCAAAGAGCGTTTAGATGATCCAGACCGTTATCAAACAGTTTATGCTAAAGAGAGTGGATCAGCTGCTGCTCCGACTGCAGGACTTCATTTCACGGAAGCGTTACTTGATCAAATTAAAGCTAAAGGGGTAAATATAACATTTATTACCTTGCATGTAGGTTTAGGCACTTTCCGTCCAGTTAGTGTAGATAATATTGACGATCATGAAATGCATAGTGAATATTATCAAATGACGAGTGAAACTGCAGAATTATTGAATCAGACAAGAGCGAATGGAAATAGAATCATTTCTGTAGGAACTACTTCTACTCGTACTTTAGAAACAATACGACGTGACCATGAGCAATTTGTTGAGAAAAGTGGATGGACTGATATCTTTATTTACCCGGGATTTGAATATAAAGCAATTGACGGTTTAATTACTAATTTCCATTTACCGAAATCTACATTAGTCATGTTAGTCTCTGCTTTCAGTACGAGAGATAATATTTTAAACGCATATCAAACAGCAGTTGAAATGAAATATAGATTCTTTAGTTTTGGAGATGCAATGTTAATTATTTAATAGAATGTGAGGTTTAACATATGCCTGCAGTAACTTATGAGCATATAAAAACATGTAAACAATCAGGAGCAAGATTAGGTATCGTACATACACCACATGGTTCTTTTGAAACACCAATGTTTATGCCTGTTGGTACGAAAGCTACTGTTAAAACAATGAGTCCTGAGGAATTAAGAGATATTGAAGCAAAAATTATTTTAGGAAACACATATCATTTGTGGTTGCAACCTGGAAATGATATCATCAAGCGTGCTGGGGGACTGCATCAATTCATGAATTGGGACGGTCCGATACTAACTGATTCTGGTGGATTTCAAGTTTTCAGTTTAAGCAATTTACGTAAAATAACTGAAGAAGGTGTCGAATTTAGACACCATACAAATGGGTCAAAACTATTTCTTAGTCCTGAGAAATCAATGCAAATTCAAAATGATTTAGGTTCAGATATCATGATGGCATTTGATGAATGCCCGCCAATGCCTTCTGAATACGATTATGTGAAAAATTCAATTGAAAGAACAACACGATGGGCTGAAAGATGTTTAAAGGCACATCAACGTCCTGAAGACCAAGCTTTATTTGGTATTATTCAAGGCGGAGAATATAAAGATTTACGTGAACAAAGTGCGAGAGAACTTGTTGATCTAGACTTTCCTGGATATGCCATTGGTGGTTTATCTGTAGGAGAGCCTAAACCAGTTATGTATGAAATGGTTGAACATACAGAGCAATTTATGCCTAAAGACAAACCAAGATACCTTATGGGCGTTGGTTCACCTGATGCACTTATAGAATGTAGTATCAGAGGTATGGATATGTTTGATTGCGTTTTGCCTACTAGAATCGCTAGAAACGGTACATGTATGACGACTAAAGGACGTGTAGTGATCAAAAATGCGAAATATGCTGATGATTTAGGACCTTTAGATGAACATTGTGATTGTTATACATGTCGCAATTACACAAGAGCCTATATCAGACATTTAATCAAAGCGGAAGAGACTTTTGGTATCCGTCTTACTACTATTCATAATTTACATTTTCTGCTAAAATTAATGGAAGATATAAGACAAGCCATTCGAGAAGACCGTCTTTTAGATTTCAAAGACGAGTTCTTTGAACAGTATGGATTAAATGTAGAAAACCCTAAAAACTTTTAAAGAGGAGAATTAACAATGGGCCAATTTGCATCATTAATTTTGCCGATCCTATTATTGGCAGTTATGTGGTTCTTTTTAATTAGACCACAACAAAAGCGTGCTAAAGCACATCGTGAAATGATTAGCCGTGTAGAATCAGGTCAAAAGGTTACTACAATCGGTGGTATTAAAGGAACTGTTAAATCTGTAGATGAAACTACAGTTGTGATCACAGTAAATGGTCATGGTACGGAAATGACTTTCGAGAAACCAGCCATTAAACAAGTAGATCCTTCATAAAACAGAAGTCATTTTGACAAAGTTAAGGCTGGGACATAATTAATTGTCTCAGCCTTCTTAACATATTGGCAGTAGATGTCTGAATTAAAAGTGCGCTTATATCAATCTTCTTTTAACCCTAGCCATCCTTGTCGGCGGGGCCCCAACATAGAGAATTTCTTAAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGAGCGGGACAACGAAAATAATTTTGCTAAATTATATTTCTGTCCCGCTCCCTTTTTTTATTATCATTTAATTATGATGTTTTAATGACAAAACTCCATTCTTTTAGCCAACAATTTCACTATTAAGTGTAGTATGTTAATATAGATAGGTCGTTAAAGTGAACGTAATATCATTTTAACTTGCATGATAATTTATTCATCGAGTATTCTAAATACATAAGTAAATAATGAGGTGTTCATGTGAAGAAAAGTAGTAGATTAGTTGCATTCATACTCCTCGTGGTTCTATTGTTTGCTGGAATGGGACTAACGTATAAGAATGTAGTTAAAAATGTTAATTTAGGACTTGATTTGCAAGGTGGTTTCGAAGTACTTTTCCAAGTTGATCCTTTACATAAAGGTGAGAAGATAGATAAGAAAGCACTTCAAGCTACATCTCAAACACTTGAAAGTCGTGTCAACGTCTTAGGTGTTTCAGAGCCTAAAATTCAAATTGAAGACCCTAATCGTATTCGTGTTCAATTAGCGGGGATTAAAGACCAAGCACAAGCACGAAAAATGTTATCAACGCAAGCCAATTTAACAATTAGGGATGCAGAAGACCATGTTCTTATGTCTGGTTCAGATATTAAACAAGGTTCAGCAAAACAAGAATTTAAACAAGAAACAAATCAACCAACTGTTACATTTAAAGTTAAAAGTAAAGATAAATTTAAAAAAGTCACTGAAAAGATTTCAAAAAAACGTGACAATGTAATGGTCGTTTGGATGGATTTCAAAAAAGGTGATAGCTACAAAAAAGAGGCTAAAAAACAGCAAGAAGGTAAAGAACCTAAATATGTCTCAGCAGCAAATGTAGATCAACCTATTAATTCAGACAGTGTTGAAATTTCTGGTGGATTCAATGGTAAAAAAGGTGTGAAAGAAGCTAAGCAAATTTCTGAGCTATTGAATGCTGGTTCATTACCTGTAGATCTTAAAGAAATTTATTCAAATTCTGTAGGTGCACAGTTCGGTCAAGATGCACTCAATAAAACAATATTCGCGTCATTTATTGGTGTCGCAATTATTTATTTATTCATGTTAGGATTCTATAGATTACCTGGTTTAGTAGCGATTATCGCTCTAACTACATATATCTACTTAACATTAGTAGCATTTAACTTTATTTCAGGTGTACTTACGTTGCCAGGACTCGCTGCGTTAGTTCTAGGTGTAGGTATGGCTGTAGATGCTAATATTATTATGTACGAACGGATAAAAGACGAACTTAGAATAGGACGAACGCTTAAACAAGCTTATTCTAAAGCTAATAAGAGTTCATTCTTAACTATCTTTGACTCCAACCTTACAACTGTTATCGCCGCAGCAGTATTATTCTTCTTCGGTGAAAGCTCAGTTAAAGGTTTCGCAACAATGCTCTTACTAGGTATCTTGATGATATTTGTCACTGCCGTCTTCTTATCTCGTGGTCTTTTAAATTTATTAGTATCATCTAATTTCTTCAAGAAACAATACTGGTTATTTGGTGTTAAGAAGAAAGACCGTCATGATATGAACGATGGTAAAGATGTTCATGATCTTAAGACCTCATTTGAAAAATGGAACTTTGTTAAGTTAGCGAAACCGCTTATCGCATTAAGTATATTAATCGTCGTAGTTGGTTTAGTTATTTTAGCAGTCTTTAAACTTAACTTAGGTATCGATTTCTCATCTGGTACAAGAGCTGATATTAATGCGAAACAACCTTTAACACAAGCTAAAGTTGAAAAAGCTGTTAAAGATGTAGGTTTAGAACCAGATCAAATTCAAATTAATGGTAGCAGCAATAAAGGAGCTACAGTACAATTCAAAAAAGACTTATCACGTGCTGAAGATAATAAATTGAGTGATAAGATCAAATCTGAATTTGGCGATACACCTCAAATCAATACCGTATCTCCATTAATTGGTCAGGAATTAGCCAAAAACGCAATTACTGCACTTATATTAGCGTCATTAGGTATCATTATTTATGTATCATTACGCTTCGAATGGCGAATGGGCTTATCTGCTGTACTTGCCTTATTACATGACGTCTTTATTATCGTTGCGGTATTTAGCTTATTCAGAATTGAAGTCGACCTTACATTTATCGCTGCTGTCTTAACGATTGTAGGTTATTCAATCAATGATACGATTGTTACATTTGACCGAGTAAGGGAGAACTTACACAAACTTAAAGTCATTACAAGTCCTGAACAAATTGACGATATGGTCAATCGCTCAATTAGACAAACAATGACAAGATCAATTAATACAGTGTTAACTGTAGTTGTTGTAGTTGTGGCAATCCTCATTTTTGGTGCGCCAACAATCTTTAACTTCTCATTAGCATTATTAATTGGTTTAATCTCAGGTGTATTCTCATCTGTATTCATAGCTGTGCCTTTATGGGGCATCATGAAAAAACGTCAATTGAAAAAATCTCCAAACCATAAGCTAAAAGTATACAAAGAGAAGAAATCTAATGACGAAAAAATATTAGTATAATTCCCAATTTATCTGCCAATAGAGCACATCGCTTTATTGGCAGTTTTTTTATGTAAATTTTCAAACCACAACGGGTTGTACTTTTTATTTTATTTAAATTTCGGTATAATGACTTTTGGAAATGAGGACGATTGTTATGATTAAACCTAAATATAATTGGGATTTAGCTGAACCAACTGAATACATAACAGAAGAACTTGCAAAGGAACTCAAACTTTCTCCGATAGTCAAAAAGGTTTTAGAGAGTAAAAATTTAGTACAAGAAGAAATGATTCAAGATGTACTACAAGATAAAATCATTAATCATGATCCTTGGGCGCTCAGTGATATGCAAAAAGCAGTAGATCGTATTAATTTAGCTATTGATAAAAGTGAGCGTATTTTAGTATATGGTGATTATGATGCTGATGGTGTGACTTCAACCACTATACTTGTTAATACGCTGAGTCAATTAGGCGCGCAAGTAGGATGGTATATTCCTAACCGCTTTAGTGAAGGATATGGTCCAAACGCACTTGCTTTTCAAAATGCATATGAAGAGGGCACGTCACTTATCATCACTGTTGATAATGGTATCCAAGGGCACGAAGAGATAAAAATGGTGCAAGACTTAGGGGTAGATGTGATTGTAACTGACCATCACGAAATAGGTCGCACTTTACCTGAAGCTTATGCGATTGTACATCCAATGCATCCTGAGTTTAGTTATCCTTTTCAATATTTATGTGGTGCTGGAGTGGCGTACAAACTTGCACAAGCTTTAATAAGTCATCCACCTCAACAATTTCTAGCGCTAGCAGCTATAGGGACTATTGCAGACTTAGTATCCCTCACTGATGAGAATCGTTCTATCGTTAAACAAGGTCTAAATATACTTAATAACAATGCACCTGTGTCTATTCAAGCCATATTAAAGCAGGCTGGATATAACGATAATATCAACGAAGAAACGATTGGTTTTATCATCGGACCGAGATTAAATGCTGTAGGACGTTTAGAAGATGCGTCGCTTGCTGCTGAATTATTAATGTCAGAAGAGATAGAAGAAGCAGAATTTTTAGCTGAACAAGTCGAACATTTTAATCAAGAAAGAAAAGACATCGTTTCTGAGATTACTGAAGAAGCATTAGCATTAGCTGAAGAACAAGTTCAACAAGGACATTTATTCTTATTATTAGCGAAAGAGAATTGGCATGAGGGTGTATTAGGTATTGTGGCTTCTAAAGTTGTCGAAACATACGCTTTACCCACGCTGATACTAAACATTGATTTAGAACAAAATCATGCCAAAGGGTCTGCGCGTTCGATAGATCAAGTATCTATGTTCGAGATTTTAAATGCGCACCAAGATTTAATTTCAAAATTTGGTGGTCATCATATGGCTGCTGGAATGACTATGGATATTGAGAATATCGATGAACTGCGCAAAGGATTAAATGACTGGATGCGTCAACTTGCTGAAACGACATCATTAGAACCAAGAAAGCATGTTGATGTTTTACTTGATGAAAGAGAAATTTCTGTTAAAAATATTCGAGACATTCAAAGACTACGTCCATTTGGTACAGATTTTAATAGCCCAACATTTGAACTCAAAGATTTAAATGTACAGTCTATCAAAGCGATAGGCCAAGATGGGAAACATTTGAAATTATCACTCGGTGAAAATCAAATCGCAGCACTCTATTGGAGTAATGGGCACCTTGCAAATGAATTAGAAATAGGGCAACCTGTTAACTTAATAGGACAATTACAAATCAATGAATGGAATGGCAATCAATCGCCACAGCTTATTATTCAAGATATAGCTATGGAAACACTACAGATTTTAGACTATCGTAGTAAACGTAAGCATTATCAATTCTCAGAAGATGATGTGAACACTGCCTATGTCATTCATCCTAGAAAAGAAAAAACAACAAATCATCATTATCATTATGGTGAGGAAATTTCGACAAATTATGATAAAGTCGTATTTAGAGATTTGCCAAATACGATGGATGAAATTGAGCAAACATTAAATCAATTACAATTATCTCAACTTTATCTTGTATTACAACACGAGCAGTCAATCTATTTTGAAGGTATGCCAAGCAAAGATCTTTTCAAAAATTGTTATAAAGCATTAATTAATAAAAAGGAAACAAACCTCGTTGAAGAGGGTATGATGTTATGTGAATATTTAAAAGTTAAGCCTGAATTACTTAAATTTATGCTTAAAGTATTCAAAGATTTAGAATTTATTTATGATGATCAAGGAATTATTAAAATAAATAGCCAGCCAAGTAAGCAAGCTATAGAATCAAGTCATATTTATCAATTGAGACAGTCACGAATGGAAGTTGAAAAACGATTATTGTATGATGACTTTTCGAATATTAAAGAATGGATAAAATCTCAGTTAAGTTAATTTATAGGAGGAAATTTAATGGATTTAAAACAATATGTTTCAGAAGTTGAAGATTGGCCAAAACCGGGTGTGAGCTTTAAAGATATTACAACGATTATGGATAATGGTAAAGCATATGGATATGCGACTGACCAAATCGTTGAATATGCGAGAGAAAAAGAAGTAGACGTGGTTGTTGGACCGGAAGCTAGAGGATTTATTATTGGATGTCCTGTTGCTTATTCAATGGGCATTGGATTTGCTCCTGTTCGTAAAGAAGGTAAGCTACCTCGAGAAGTTATCCGTTACGAATATAGTTTAGAATATGGCACTAATATTTTAACGATGCATAAGGATGCGATTAAACCAGGTCAACGCGTGTTAATCACTGATGACTTACTCGCTACTGGAGGTACAATTGAAGCGGCGATTAAACTTGTCGAGAAGTTAGGCGGAATTGTCGTTGGTATCGCATTTATTATTGAATTAAAATATCTCCATGGTATTGAAAAAATTAAAGATTACGACGTCATGAGCCTTATTTCTTATGATGAATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >AP018585|1292907:1302048|1301529_1302048_+|BBD89828.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVEDWPKPGVSFKDITTIMDNGKAYGYATDQIVEYAREKEVDVVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYSLEYGTNILTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLHGIEKIKDYDVMSLISYDE >AP018585|1292907:1302048|1299237_1301511_+|BBD89827.1|DBSCAN-SWA MIKPKYNWDLAEPTEYITEELAKELKLSPIVKKVLESKNLVQEEMIQDVLQDKIINHDPWALSDMQKAVDRINLAIDKSERILVYGDYDADGVTSTTILVNTLSQLGAQVGWYIPNRFSEGYGPNALAFQNAYEEGTSLIITVDNGIQGHEEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGRTLPEAYAIVHPMHPEFSYPFQYLCGAGVAYKLAQALISHPPQQFLALAAIGTIADLVSLTDENRSIVKQGLNILNNNAPVSIQAILKQAGYNDNINEETIGFIIGPRLNAVGRLEDASLAAELLMSEEIEEAEFLAEQVEHFNQERKDIVSEITEEALALAEEQVQQGHLFLLLAKENWHEGVLGIVASKVVETYALPTLILNIDLEQNHAKGSARSIDQVSMFEILNAHQDLISKFGGHHMAAGMTMDIENIDELRKGLNDWMRQLAETTSLEPRKHVDVLLDEREISVKNIRDIQRLRPFGTDFNSPTFELKDLNVQSIKAIGQDGKHLKLSLGENQIAALYWSNGHLANELEIGQPVNLIGQLQINEWNGNQSPQLIIQDIAMETLQILDYRSKRKHYQFSEDDVNTAYVIHPRKEKTTNHHYHYGEEISTNYDKVVFRDLPNTMDEIEQTLNQLQLSQLYLVLQHEQSIYFEGMPSKDLFKNCYKALINKKETNLVEEGMMLCEYLKVKPELLKFMLKVFKDLEFIYDDQGIIKINSQPSKQAIESSHIYQLRQSRMEVEKRLLYDDFSNIKEWIKSQLS >AP018585|1292907:1302048|1293913_1294939_+|BBD89823.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYHLPESLIAQTPLKNRDQSRLLVLQRETGEMAHLHFKDVIDYLNPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNRLSFGDGKIVAECVKELEQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTEALLDQIKAKGVNITFITLHVGLGTFRPVSVDNIDDHEMHSEYYQMTSETAELLNQTRANGNRIISVGTTSTRTLETIRRDHEQFVEKSGWTDIFIYPGFEYKAIDGLITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRDNILNAYQTAVEMKYRFFSFGDAMLII >AP018585|1292907:1302048|1296809_1299101_+|BBD89826.1|DBSCAN-SWA MKKSSRLVAFILLVVLLFAGMGLTYKNVVKNVNLGLDLQGGFEVLFQVDPLHKGEKIDKKALQATSQTLESRVNVLGVSEPKIQIEDPNRIRVQLAGIKDQAQARKMLSTQANLTIRDAEDHVLMSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKSKDKFKKVTEKISKKRDNVMVVWMDFKKGDSYKKEAKKQQEGKEPKYVSAANVDQPINSDSVEISGGFNGKKGVKEAKQISELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALNKTIFASFIGVAIIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTLKQAYSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRGLLNLLVSSNFFKKQYWLFGVKKKDRHDMNDGKDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIALSILIVVVGLVILAVFKLNLGIDFSSGTRADINAKQPLTQAKVEKAVKDVGLEPDQIQINGSSNKGATVQFKKDLSRAEDNKLSDKIKSEFGDTPQINTVSPLIGQELAKNAITALILASLGIIIYVSLRFEWRMGLSAVLALLHDVFIIVAVFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLHKLKVITSPEQIDDMVNRSIRQTMTRSINTVLTVVVVVVAILIFGAPTIFNFSLALLIGLISGVFSSVFIAVPLWGIMKKRQLKKSPNHKLKVYKEKKSNDEKILV >AP018585|1292907:1302048|1296114_1296378_+|BBD89825.1|DBSCAN-SWA MGQFASLILPILLLAVMWFFLIRPQQKRAKAHREMISRVESGQKVTTIGGIKGTVKSVDETTVVITVNGHGTEMTFEKPAIKQVDPS >AP018585|1292907:1302048|1292907_1293912_+|BBD89822.1|DBSCAN-SWA MDKRMVDQEFHDEDSAFELSLRPTKLKQYIGQSSIKSNLEVFIKAAKLREEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTISGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNENELKEIITRTAEVLDTGIDEESALELARRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDDQIYIETTKRALQLLQVDQEGLDYIDHKMMNCIINQYNGGPVGLDTIAVSIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATAFAYEHFKNIDEKRK >AP018585|1292907:1302048|1294959_1296099_+|BBD89824.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRDIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKRAGGLHQFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPSEYDYVKNSIERTTRWAERCLKAHQRPEDQALFGIIQGGEYKDLREQSARELVDLDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYEMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTTKGRVVIKNAKYADDLGPLDEHCDCYTCRNYTRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKDEFFEQYGLNVENPKNF |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1431722 : 1441558
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >AP018585|1431722:1441558|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >AP018585|1431722:1441558|1434017_1434560_+|BBD89968.1|DBSCAN-SWA MDNQGILEALLYTSGDEGLDQKQLMEILDVDKNELENLIQSYQSSGLVIQKFGTTYVLTTKKDASSYIEQLIEQKSKMKLSQAAMETLSIIAYNQPLTRSDIEMIRGINSDGAVKTLIARGLVEAKDVDHSRSHHLITTDLFLNVFGIENLEALPTTEEDDEEMDEFFSNLVNQKGDSNE >AP018585|1431722:1441558|1432662_1433196_-|BBD89966.1|DBSCAN-SWA MEDALIHFYYQFHKNQHYFLCHDILEEVWKAYPSFSKNDAVVSLILFATACYHYRRGNHKGALKSYEKSLSVISNAADSEQLHLDIHNYKKLIRHQITSLRENQSFVPVKLPLETSFNQYIKKVYPDYVFTSFVISEPYIVHHHLKRDRSEVIQAREEAKQIRHKKLQQPYHTLKDQ >AP018585|1431722:1441558|1438872_1439121_-|BBD89973.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEDEPFDGDALKFE >AP018585|1431722:1441558|1436131_1437898_+|BBD89971.1|DBSCAN-SWA MMNRLNSVVIKLWLTIILIVATVLILLSVSLITFIQYYFTQETENSIKEDAKRISSLVEKSKNKSLAIQNSQKLIDGPGGLIIMKDFNDKPASSYNNTKIQMLKEIKHNDNFKKVFQKGEFETQNVTIKNHGDTQSYILLGYPMKAQKDAHGKHSGVFIYKDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFIAASTIFAFFLSNKITKPLRQLKTQAQKVSEGDYSHISSVKTKDEIGDLSRAFNNMNYEIQEHIEALSSSKNIRDSLINSMVEGVLGINDQRDVIISNKMADDIIHKIDDFSKELIEKQIEQTFKSEGTEFQEIEINTRYYVFITSYINRIQPNGRNGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIANVSHELRTPISLLQGYTESIVDGVVTEPDEIRDSLAVVLDESKRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVEKEVQPIDDLLNKMKAKYRMQAEDLDLTMEFNSGNDNQLWDYDMDRMDQVLTNLIDNASRYTQPGDTIAVTTAKDNRYNILYISDTGTGIAPEHLQQVFDRFYKVDASRKRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGKIEVESELGKGTTFIIKLPQPHIKNN >AP018585|1431722:1441558|1435425_1436151_+|BBD89970.1|DBSCAN-SWA MANEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFEIHEASNGKEAYELAMENNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKETPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSANSEQSEPHARDIIEFNHLVIDNDAHRVLADNEQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSNDAAQMIQTVWGVGYKFEVKASDEPTK >AP018585|1431722:1441558|1431722_1432610_+|BBD89965.1|DBSCAN-SWA MNTIIEEYLNFIQIEKGLSSNTIGAYRRDLNKYKTYLEERKITHIDFVDRQVIQECLGHLIDLGQSSKSLARFISTIRSFHQFALREKYAAKDPTVLIETPKYEKKLPDVLEVQEVLDLLETPDLTKNNGYRDRTMLELLYATGMRVSEIIQLEVEDVNLMMGFVRIFGKGNKERIVPLGDAVIEYLTTYIETVRPQLLKQTVTHVLFLNMHGKPLSRQGIWKMIKQNGIKANINKTLTPHTLRHSFATHLLENGADLRAVQEMLGHSDISTTQLYTHVSKSQIRKMYNQFHPRA >AP018585|1431722:1441558|1434552_1435290_+|BBD89969.1|DBSCAN-SWA MSKEQERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVSVNGQVVTELGTKVSNSDTVEVEGIKIEQEDKMYILFYKPTQVITSVSDDRGRTVVTDYFDDIETRIYPVGRLDYDTSGILLLTNDGEFTNLMTHPRYHIKKKYVAKLKGYLMREEVKELEKGIQLEDGFTQPAQVKIKKQDKEKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHQVNKLTRIQFGPLDLKGLNAGEGRVLTPHEVKTLRHLAENGK >AP018585|1431722:1441558|1433293_1434025_+|BBD89967.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFNGPLDLLLHLIQKFEIDIYDIPMKALTEQYMQYVHAMNQLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQTSVEDDIEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILNDMKNERDCYYTKYPTDLSHLETDESWDPNQTIDLTELIVAYQRVKNRVELNTPKSVEIKKETFTIQQATEQVTNRLKEHESFNFFSLFTFHEPVEQVVTHFLAILEMSKSGIVNINQQHQFEDIDIIRGVNYNIG >AP018585|1431722:1441558|1439229_1440192_+|BBD89974.1|DBSCAN-SWA MNHILFYAINHAYNYKTNKSIYNILIGKKSHQTFFDASSQQLLSLYHSLPNLKYPTFERFILQMDDFESKFTIKTNSRYTYDSLIQTFSCIQLLIQTLSHTRKQSFKFIPAVQNTFIQQKVKQLYSHIKTNHLEEDLIKEIYLLFETIQKKHNTNYLHYYLQGYDEPMYTRQQISLIEEMKQSELFEIEMVQLIDLIEEIEHELRYPILSQTLILPPLLNQTYLSYQKLRSGMTMKEIAERQNVKINTVEDHVLEIFIKGYQKDYSTYIEEMRLKQFVSYYNNHKGLRLREYKNKFEDLTYFQIKLVIVGIERGDLNARG >AP018585|1431722:1441558|1438170_1438710_+|BBD89972.1|DBSCAN-SWA MQQNKRLITISMLSAVAFVLTFIKFPIPFLPPYLTLDFSDVPTLLATFILGPLAGVIVALIKNILNFLFNMSDPVGPVANFLAGVSFLLSAYYVYVRKRRSRSLINGLIVGTIVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLGDVVKNVKIVIVSGVIPFNIIKGIVISVIFVLLYRRLKNILK >AP018585|1431722:1441558|1440178_1441558_+|BBD89975.1|DBSCAN-SWA MLEDKLKDWFGFKTFKPGQKDIIQSVLEGKHTLGILPTGSGKSLCYQFPTYLIEKPTLVISPLISLMDDQVMQMKLNGESQVAYIHSGMDEVEKRNNIKRLPQSRFIYLSPEYILQPQNFKLISRIDFGLIVLDEAHCLSEWGYDFRPHYALIGQIISHFKHARVLALTATAPPHLDEDLTQILNVKLNVIKTSMSRENISLQHRNFNDDDEKIEWLIPFLNYSGPTIIYISSKKKCLELANLIYDAGFLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFLNNDIPVIVATSAFGMGINKKDIRTVIHFHLSSSPSNYLQEIGRAGRDGKLSQAISLYQPDDRFLLETLLFTDMITDEDISMFELGDFLPPDKKEILETLYRQFSVSELRSIFKKSYQRKRLGYMRMLGYKDIDQCRRNYLLEFFNEHPDKPNQCCDNDTDLKEIKNFNRKKVKRKMTYEEKLKNLFEP |
11 | Bacillus_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1791097 : 1858570
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >AP018585|1791097:1858570|DBSCAN-SWA 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92 | Staphylococcus_phage(89.39%) | head,tRNA,portal,terminase,tail,holin,integrase | attL 1796845:1796862|attR 1857326:1857343 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1948671 : 1957141
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >AP018585|1948671:1957141|DBSCAN-SWA TCTATTTAATGATTTTAGCGATAACTCTTGGATAAAGTTCATATTCTAAATTTTTGACTCTCTCTTCTAAATCTTCTTTTGTGTCGTCCGGTTTAATATCACATTGTTGTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATGCCACTATCAACAAAGTGTACAGTTGAACCTGTCACTTTATCTCCACTTTCATATGCTTGTCCTATTGCATCTAACCCCTTATATTTAGGCAATAGTGAAGGATGTATATTTAACATACGGCCTTCATATGCATGAAGTAAATCTTCACTGACCAATCTCATATATCCTGCTAAAACAATCCATTGAACCCCTTCGTTGGATAACAGTTTTAGTAAGTGTTGTTCATATGATGATTTAGATATAAAATCTTTCGGTTGATTGATGTGGACTGGAATATTTAATTTTTCAGCACGTTCAATGCACTTTACACCCGCTTTGTCCGTATATAGCGCCGTGACTTCAATACCAGGTAAATCCCCTTTTTGCACACGATTTACAATATTTTCAAAGTTACTACCAGAACCAGAAGCAAAAATCGCTATCTTAATCACGATTCTACCCCCAGTAAATGTATAGGTGTTTCCGCATCTTCAATAATTTCACCAATTTCATATGCTTGTGTATCAAGTGCACGTAAAGTTGTTAAGGCGGTTTGAACATCCTTTTTATCTACGATAATTGTGTATCCAATCCCCATATTGAAAATATGATACATTTCATCAGTACTAATCTTTGCTTGTTGTTGTAACCAATCAAAGACTTTTAATGTTGGGAAAGATTGTGTATCGATTTGTGCTGATAAGCCTTTAGGCAACGCTCTTGGTATATTTTCATAAAAACCGCCACCAGTAATATGATTCATCGCTTTAATATTAATATGCTTTTTCAGTTCAAGTATCGGTTTCACATACAATTCCGTAGGTGTTAAGAATGTATCTAAATATGATTGACCATGAAAATCATCGTTCAAATTGATGCCTGATTGAGCGATTAATTTACGAACTAAACTATAACCATTAGAATGTACACCGTTAGATGCTAAGCCTATAACAACTTGACCTGCTTCAACTTTAGAACCATCAATGTAGTCTTCTTTCTCGACAGCCCCTACAGCAAAACCAGCAATGTCGTATTCACCTTCATGATACATTTCACCCATTTCGGCAGTTTCGCCACCGATTAATGCTGTGTTCGTTTGTTCGCAACCATCACTTACACCTTTAACAATCTGCTCAATGATTTCTGGTACCACTTTATTCGTCGCTATATAATCTAAGAAATATAATGGTTCAGCACCTGTAGTTAAAATGTCATTCACACACATTGCTACTGCATCGATGCCGATGGTGTCGTGTTTATTGTAATCAATAGCTAGTTTTAATTTCGTACCAACACCGTCTGTACCTGAAACTAGTACAGGTGCTTTCATATTGAGTTGAGACAAATCGAAAGTAGCACCAAAGCCACCTAATCCACCTAAGACTTCTTTACGCATTGTTCGTTCAACATGACTTGAAATTCTTTCTACCGCTTCGTAGCCTGCATGAATATTTACACCTGATTGTTCATAAGCTTTAGACATGTAAATTTCCCTCACTATCAAAATAATGTTTATTATTTGCTATATATGCTTTTTGACGATCACTTAAATGCGCTTTGTAATTCTTTTCATAGTCATAAAGTCCAGCAGGATAATCTCCTGTAAAGCTCTCCACGCATAATCCGTTATACGGTGCGTCGTAATTTAATCCTATTGAATCGATAAGTCCATCAACACTTAAATACGCTAGTGAATCAGCACCAATATAGTCTCTAATCTCTTCAGGTGACTTACTCGCTGAAATCAATTCAGCAGTTGTGGAAACATCGATACCATAAAAACTTGGGAACATAAATTCTGGCGAAGCAATTCTTACATGCACTTGGTTGGCCCCTGAGTCTTTCAACATCTTCACGATTCGTTTTGATGTTGTGCCTCTCACAATAGAATCATCAACCAGAATGATATCCTTTCCATCAACAATATCTTTAACTGCTGACAGTTTGACACGTACGCCTTGTTCACGTAATTCTTGAGTCGGTTGGATAAACGTACGGGCTACATATTGGTTCTTCACAAGTCCCATTTCATATGGCAGACCGATTTGTTCAGCGTAACCACTGGCAGCTGATAATGAAGAGTTTGGAACGCCAATAACCATGTCCGCTTCTGCAGGACTTTCTTCTGCAAGTCGCTTACCTGATGCTTTTCTTACAGCATGCACGTTTTTACCTGCGATGGTTGAGTCAGGTCTTGCAAAATAAATATATTCCATTGCAGAAATAGCAGTATTCGTATGACGTGTATATGATTTCACTTCGATGCCTTCATCGTTAATAATGACGTATTCGCCAGCATGTATATCTTGGACATACTCCGCACCTAATACATCAATAGCACATGTTTCACTTGCTAAAATGTATGCACCATTTTCAGTTTTACCGACTACAAGTGGACGAATCGCATTAGGATCAACCGCACCATATAATGCATCTTTTGTTAGTATTGCAAAGGTGAAACCACCTTTAATTTGACGTAAGCTTTCTTTTAGTGCCTCTTCGAATGAAGGCGCCTTACTACGTCGAATTAAGTGCATAATCACTTCTGTATCTGAAGACGAATGGAAAATGGCGCCATGCTTTTCCAAGTTTTGTCGTAAAGATTGTGCATTGATTAAATTACCGTTATGGCAAATCCCTACGCTCATGTCATAGAAGTGATATAAGAAAGGTTGAATATTTTCAATCCCTTTATTTCCTGAAGTGGCATAACGGACATGTCCAATCGCATGAGGATGACCTTTTAATTGTTCTAATTGCGTATCTTTAATCGCTTCTGTGAGTAATCCTAATCCTCTTTCTCCTTTAAGATGTTCATCATTAGAAACCACGATACCTGCACCTTCTTGACCACGATGCTGTAAACTATGAAGTCCCATATACGTTAATTGTGCTGCTTCAGGATGATTCCAAATACCAAATACGCCACATTCCTCATTTAGTCCTGAGTAGTTAAACATTGAGCAATTGCTCCTTCCCATGTTTGTTTAATGTCTGAGACCTTTTCCGAAATAGAAATTTCTGAATTAGATACTTTGAATAATCCATCTTGAGTAAATCGTCCAATTTCTTTAGCATGGTCGATATCTAGGGTTTGCCCTTCTTTAACCGATACAATATAGCGTCCTTGCGTTTCACTAAATAATTGTGCATTAGTGACATCAAGTTGAACCTCAAGTCCCATGTTATAATAAGCGCTAATTTTAGCTAATGTAAGGAGTAATCCGCCTTTACCTACTGTCTGAACATGTGACGCTATACCATGACGAATGGCATTCTTAATTTGTTCACCCTTTTCAACTTCATCACTTAAATCAATCGCTTCAAATTCATGATTTACTGAACCGTATAATAATTTCTCAATTTGGCTTCCACCGAAATCATCACGTGTATCCCCAACTAAATAAAGTGTCTCCCCAGCTTTAGGATGGAAATCATTTAAATAGTTAATATCTTCAATCAGTCCTACCATGCCTACAACTGGTGTTGGGAAAATAGATGTACCACGCGTTTCGTTATATAAAGAAACATTACCTGACACTACAGGTGTCTTTAGTACTTCACATGCTTCAGACATGCCTTTCGTCGAATCAATTAATTGTTGATAAATTTCTTTCTTTTCAGGAGAACCGTAATTCAAGCAATCTGTCATCGCAAGTGGTGTAGCACCTACAGCAATTAAGTTACGATAGGCTTCTGCAACGACCATCTTTCCACCTTCATAAGGTTGATTAAATACGTAACGTGCTTCTCCATCGATCGTTGAAGCAATCGCTTTATTTGTACCTTCAACACGTACGACTGAAGATTGTAATCCAGGTTTAATAATAGTATTTGCGCCTACTTGCTGATCATACTGCTCATATAAATAATGTTTCGATGCAATGGTTGGATGTTTTAATAATTTTGAAAAGACATCTTGCACATCAACATGGCTGTAATCATTTTTAGAAGTGTTATATTCCTTTTCTTCTCCTTCAAGAATATATACAGGTGCTTCATCAGATAGAGGTTGTACAGGAATATCAGCAAATACTTCGTCTTCATATGTTAAAACGAATCTGTCAGTATCCGTCACTTCACCAATAACTGCACTATCAAGTTCATGTTTATCAAATAAGTCTAGGAACTTTTGTTCAGTGCCTTTTTCAACAACGAGTAGCATTCGTTCTTGTGTTTCAGAAAGCATCATTTCATAAGGTGAAATACCAGGTTCTCTAGTTGGAACTTGATCGAGTCTTAAATGAAGACCACTTCCACCTTTTGCAGCCATTTCTGAGGAAGAAGAGGTTAAACCAGCAGCACCCATATCTTGAATACCAACAAGCTCGTCATAAGTAATTGCTTCGAGTGTAGCTTCCATGAGTTTCTTACCTACAAATGGATCACCAATTTGTACTGAAGGACGTTTACTTTCACTTTCTTCTGTTAGTTCTTCAGAGGCAAATGTTGCACCATGAATGCCATCACGACCTGTTTTCAAACCGACGTAAATCACTGAATTACCGACACCTTTTGCAGTCCCTTTTTGAACCATGTCGTGATCAATGACACCCACACACATCGCATTGACAAGAGGATTGCCATCATAACGATCGTCGAATTCAATTTCTCCTGCTGTTGTAGGAATACCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATCCCACTCACTACACCTTTAAGTAAACGTTGATTTTGTTTGACTGATAATTCACCAAATCGCAAACTATTAAGTAAGTTAATTGGACGTGCACCTATTGAGACGATATCTCTTATGATGCCGCCTACACCAGTTGCTGCACCTTGATAAGGTTCAATTGCTGATGGATGGTTATGTGATTCCACTTTGAATACAACGGCTTGATTATCTCCAATATCCACGACACCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >AP018585|1948671:1957141|1950261_1951746_-|BBD90455.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNDEHLKGERGLGLLTEAIKDTQLEQLKGHPHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAQSLRQNLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPSFEEALKESLRQIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKTENGAYILASETCAIDVLGAEYVQDIHAGEYVIINDEGIEVKSYTRHTNTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKRLAEESPAEADMVIGVPNSSLSAASGYAEQIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKDIILVDDSIVRGTTSKRIVKMLKDSGANQVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIRDYIGADSLAYLSVDGLIDSIGLNYDAPYNGLCVESFTGDYPAGLYDYEKNYKAHLSDRQKAYIANNKHYFDSEGNLHV >AP018585|1948671:1957141|1954836_1955544_-|BBD90459.1|DBSCAN-SWA MSLLYEGKAKRVYTTDTEHQLRVEYKDEVTAGNGVKKDTMPGKGKLNNQITSIIFDYLTHHDINNHFIKQLSETEQLVEQVDIIPLEVVVRNIATGSITKRLGFEKGHKFEEPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLHIANDEEIAQLKQMAKEINQVLVQLMDEMSLRLVDFKVEFGKTHDGTILLADEISPDTCRIWDKHSDTNFDKDVYRNDTGSLIETYQTFLDKLEDLKS >AP018585|1948671:1957141|1953906_1954578_-|BBD90457.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKSGVDAAYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIINEVKRLAQEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLTITNNQTPFTHLYEANQEVVYPVAHGEGHYYCTDDMFTELERNNQIILKYTDNPNGSYEDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFESMVKSWREQHV >AP018585|1948671:1957141|1948671_1949238_-|BBD90453.1|DBSCAN-SWA MIKIAIFASGSGSNFENIVNRVQKGDLPGIEVTALYTDKAGVKCIERAEKLNIPVHINQPKDFISKSSYEQHLLKLLSNEGVQWIVLAGYMRLVSEDLLHAYEGRMLNIHPSLLPKYKGLDAIGQAYESGDKVTGSTVHFVDSGMDTGEIIEQQQCDIKPDDTKEDLEERVKNLEYELYPRVIAKIIK >AP018585|1948671:1957141|1956658_1957141_-|BBD90461.1|DBSCAN-SWA MRVAVIMGSSSDWEIMKESCKMLEEFEIPYDKKVVSAHRTPQLMFEFASEARQNGYDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARMLGINNSTVQKNLENYEKSLVNKVEAMQNELQ >AP018585|1948671:1957141|1949234_1950269_-|BBD90454.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERISSHVERTMRKEVLGGLGGFGATFDLSQLNMKAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYNKHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEIIEQIVKGVSDGCEQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDIAGFAVGAVEKEDYIDGSKVEAGQVVIGLASNGVHSNGYSLVRKLIAQSGINLNDDFHGQSYLDTFLTPTELYVKPILELKKHINIKAMNHITGGGFYENIPRALPKGLSAQIDTQSFPTLKVFDWLQQQAKISTDEMYHIFNMGIGYTIIVDKKDVQTALTTLRALDTQAYEIGEIIEDAETPIHLLGVES >AP018585|1948671:1957141|1951724_1953914_-|BBD90456.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSIEEIKLEKLYQDMGLSDKEYDKVVEILGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVSGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGVIDHDMVQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTDRFVLTYEDEVFADIPVQPLSDEAPVYILEGEEKEYNTSKNDYSHVDVQDVFSKLLKHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQSSVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEVLKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIEDINYLNDFHPKAGETLYLVGDTRDDFGGSQIEKLLYGSVNHEFEAIDLSDEVEKGEQIKNAIRHGIASHVQTVGKGGLLLTLAKISAYYNMGLEVQLDVTNAQLFSETQGRYIVSVKEGQTLDIDHAKEIGRFTQDGLFKVSNSEISISEKVSDIKQTWEGAIAQCLTTQD >AP018585|1948671:1957141|1954579_1954840_-|BBD90458.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMTVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVIDEKENA >AP018585|1948671:1957141|1955544_1956672_-|BBD90460.1|DBSCAN-SWA MSFNKLKFGSTIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVIVLDPNEDSPCRYVAHQFIHAEYDDEQALNELGEKTDVITYEFENISSKQLKQLTEHYNVPQGFQAIQLLQDRLTEKQTLQEAGAQIVPFLQIKNSQDLTQAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQILVKQESDIQEAMSLIENQECVAEQYLDIDKEVSLTVTIGNEQQTTYFPLQENEHRNQILFKTIVPARTDKEKEARKEIDKITNVIHFVGTFTVEFFIDRNNKLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDFSQFDTHILAVTGQKLPQQIEVLKPAVMMNLLGRDLDLLENEFGNHPEWHVHIYGKSQRKPDRKMGHMTLLTDDVNQTEQYMLMKFEGRDK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2199484 : 2208399
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >AP018585|2199484:2208399|DBSCAN-SWA ATTAAACTGAGTCAAAAGTAGCTTCATCATAATAAAGACAAATACGTTGTCCTCTTATCTCTTCTATACGGACATCCATTTCATATAATTTCTTCAATATGTCAGACTGAATAACATTATCTTTAACATCAGCTTTAACAATTTCACCCTGTTTAAGTGCAATAATATTGTCTGAATAACAAGAAGCAAAATTAATATCGTGTAATACGATAATGATTGTTTTATTTAATTTACGACACAATTCTCGTAACGTTTGCATTATTTGTACAGAATGTTTCATATCTAAATTATTTAGAGGTTCATCCAGTAATATATAGTCAGTATCTTGAGCAATCGTCATAGCAATATATGCACGCTGACGCTGACCTCCTGATAGTGTTTTGATATTACGATTTCTAATTTCTTTTAGTTGTAATAAATCTAAGGCATAGTCTACTTTGTCATAGTCTTCTTTCTTCATTCGTCCTTTCGAATATGGAAAACGACCAAAGTTAACTAATTGCTCAACAGTAATATTCATTTCAGTATGATTGGATTGTTTTAAAATACTTAATTTTTTAGCTAAATCATCAGTTTTATAATCTGATATTACTTTGTCTTCAATCGAAATTGTGCCATTGTCACAGTTAAATAAGCGACTCATCGCAGATAATAATGTACTTTTGCCAGCACCATTAGGTCCTATTAAAGAAGTCAGTTTCCCTTTTTCAATATCAACACTAATATCCTTTAAAATAGGTTTATTCTCAATCGTTTTGTCTAAATTTTGAATTTGAATCAATTTGCACTTCTCCTTTTAACAAGTAAATAAATGAAGTAACTACCACCTACTAAATCCACTATTAAACTGAATTCAGTGGTTGCTTCAAATAGGTTTTCAACTACCCATTGCGCCATAAATAAACTGATCCAACTAAAAAGTATGGTCGTAGGTAAAATATATTTATGTTCATAGGTCTTCATGAATTCATGTGCTAAGTTGACTGTTAATAAACCAAGAAACGTTACAGGGCCTATTAATGCAGTGGATATAGAGACAAGTAAGGCAACCAAAATAAGTAATAACCGCGTCATGTTTTCATAAGATACACCTAAATTAATTGCTTGCGCTCGCCCTAATAGAAGTACATCTAAATAAGGTCGAAGTATAATTGTTACAACAATTAAGATAACTAACAATATGCCTGAGACACTTACTAAATTAGAATTTGATGCTTCAAAGCTAGCAAACATGACACTTTGAACCGCTAAGAAAGATTCTGGATTCATTATAAGTTGGAGGAAACTTGTAATACTACGGAAGAATGTTCCTAATATCACGCCGACTAATAGGATAAAATAGACTGAAAAGTGACCTAGTTTAAATATGACTTGAAATAGTAGTAATGAAAATAACACCATAACAATCAAGGTAATTAAAAAATTAAGATAGATGTTTGTGACTACGGCAGCTTGCTCACCTAATATAAAAATGGGTAATACTTTGACAAATAAATAAACTGAATCAAGTCCCATAATGGAAGGAGTTAATAATCTGTTTGTAGTAATAGATTGAAAAATAACTACTGAGGTTCCTATTGCTGCACCTACTAATAGGATAAGAATGAATTTTTTAAAACGACTTTGGAATTGATATTCAAATATATTAAAGTCTAAACCTACAAATAAATAAAAAATGGCCATACAAATTGCTATAACGACTAGTATACTTATTTTTTTGTTAGAGCTCATTTGCATAATTTTTCCTACCTTTCATTAGCAAGATTAGGAAAATAATTGTGCCAAACACACCTATCGTTAACCCAATATTAATCTCATAAGGATAAACTATTATTCTGCCAATAATATCAGCAATTAATACAAAAATCGCACCGAGCATGAGTGTGTGCGGTAATGCATTTTTCAAATGATCACCTCTGTAAATAGAGATAATATTCGGTACAATTAATCCTAAAAATGGTAGCGTTCCTACTGTAACAACGACTAAAGCTGTTAGCGTTGCAGTAATAAATAATGCGATGTTAATGATTTTTTCATAACTTACACCTAAATTATGACTAAAGTCTTTTCCCATACCTGCAATTGTAAAATGATTTGCAAAAACAAACGCTAGAATAAGTAAAGGTATAGTGAGATACAATACCTCATAACGACCACTCGTTATAATGGCAAAATTTCCAGTTAACCAATTGCCAATGCTTTGTAACGCATTTGTTCTTAACGCTATAAATGTGGTAAAGCTGGATATAATACCACCAATCATAATCCCTAAGAGTGGAACAAAAATGACCTCTTTTACACGTATAAGATTAATTAATCGAACAAATATAAAAGTCCCAATAATACTTAAAGCAACAGCGAATAATAATTTGATTAAAATATGTCCATTTGGAAAGAACAGTAGTGAAATTAAAATACCTAATTTCGCCCATTCCATAGTACCTGCAGTGGTAGGGCTTACAAATTTATTTTGCATCATCTGTTGCATAATTAATCCTGCTAATGCAAGTGAGCTTCCTGAAAGGAGGATACTCACCGTTCTAGGAATTCGGCTTGAAAACAAAATGTTCATTTGTTCATCATTTAAATGAAAAATATCTAAGAGAGAGAGCTGACTCACTCCTATAAATAAAGAGACAATAGTTAAAATCACTAATAAAATAAATAAGGTATAACCTTTAAATATAAATTTCATTAGTCATTCTCCTTAATAAATATGTATGATGCGAAGTAAATAACCGACTTAAATGATAATGATTATCATTACCATTAATATTATAGATTATGTTATCGTTTTTCAATAGCTTTTCACATTTTTTGAAATTTTCTTTATAAATATTTCTATACAATAATTCGTAATACATAACATTATTTATCATTTATAACTTTTTACACGCAAAAAAGGAGATTCCTACTCAATTTAATAGGAATCTCCTTAATATATGTCATCTTATTTATCGAAAATAAAGTCTTCATCTTGTAAAGCCTCTACGTTTAACGCTAACGTATAGCCATCACCTTTAACTGAGAAGAAGTCATGGTTCTTAGTAGATGTATCCAATGCATTTTCAATAATAGGATTAAATTCACGTTCTTCAAAATATGGTTCAAATCCTAAGTTAGATAATGCTTTATTACCGTTATAACGTACATAGTTTAGAACATCTTCAGTTAAACCAATATCATCATATAGTAAATGCGTATATGAAACTTCATTATCATAAAGTTCATTTAATAATTTATACATTTCTTGATCAGCTTTTTGCTTTTCACTTTCTGAAAGTTCATTACGTAAACTTTGAGCATCTAGGCCAGTGAATACGCCATGAATTGATTCATCTAATAAAATTTTACGAATAATTTCACCAGAAGTTGTCATTTTACCTTGTCCAGCAAGATAAAGAGGATAATAGAAACCAGAATAGAATAAGAATGTTTCTAAGAATACACTTGAAACTCTCGCTATATATTGGTCAAAGATTGAAGCTTCTTTTCCCCAGAGTTTATGATAATTATCGATAATTTTATCTGATTTATATTTTAAATGAGGTTCTTCAATAACCCATGTATCTAGTAAATAGTTTGTTTCACTAGATGGAAGTAATGTTGTAAAAATATGAGAGTAACTCTTAGCATGAATTTGTTCCATCATAGCCATAAATGAGTACACGGCTTTTTTTCTTAAATCAGTCGTGTGTAACATAATCAAAGGCATACCATCATCTGCTTGATGTGTATCCAGACCAGTTAACCCTGCTAATGCTTTTTTAAATGTTTCTCTTTCAGAATCTGATAGTGTCTTCCAACTTGCAATATCTTTTGAAACTTTAAACTCTGTTTCTACCCACATTTGTGAGATATTTTGACGCCAAAACATATTCGTCATATCTTCTTGGGTATTCCAGTTGACTGCCTTCATGAAAATCCTCCTGTCTGTTTATGTATAATGTAGAGCATTTCAATCATAGAAATGGATGAATGTCATCATTTCTATATGATTGAAATATTCTCTAGTGGTTGATTTGTTTGAGTTATCTAATTAAATTGCACAACTTGTACACTCTTCTACACTTAATAGTTTATTTCTTGTGTAATAAAGTGATTTTAATCCTTTGTAATGTGCATAAACATATAATCTTGAAAGTTCACGTGTAGATATTTCTGAATTAACATATAAAATAGTTGAAATACCTTGGTCTACGTGAGTTTGAATTGTTGAAACTAAATCAATTAATTTCATTTGGTCAGTATTAAATGCTGATTTGTAATACCACATTGTTTCAGGTGACAAGAAAGGCATAGGATAAAACGTTTCAGCATTGCCATAAGTACGACGTTCAATCTGATCTACAATTGGCATTACAGAACTTGTTGCATTTTGAACATATGAAATACTTTGAGTAGGCGCAATCGCTAATCTATACGCATGATATAGTCCATATTGTTCAACTTCTTTTTGTAATGCTTTCCAATCATCTGATGTTGGAATATCTAGACCTTCGAATAATTGACGAACTTTTTCAAATTGAGGTTCAAATTCTTGTGAAGTATAAAATTCAAAATATTTACCATTAGCATAATCTGAAGACTCAAAATCTTGATATCTTTCTCCACGTTCTTTAGCAATTTCCATTGAACGTTCAATTGAATAGTAGTTCATCATCATGAAGAAAATGTTAGCAAAATCTTTTGCTTCCTCAGATTCATAGCCGATTTTATTTTTAGCAAGATAGCCATGAAGATTCATTACACCTAAACCAACAGAATGTAATTCGCTGTTTGCTTTTTTAACACCTGGTGCATTCTGAATATTAGCTTCATCACTCACTACAGTTAAAGCATCCATTCCAGTATGGACTGAATCTCTGAATTTACCTGATTCCATCACGTTAACAATGTTTAAAGAACCAAGATTACAAGAAATATCACGCTTAATTTCGTCTTCAGTACCGTAATCATTAATAACAGATGTTTCTTGTAGTTGGAAAATTTCAGTACATAAATTACTCATTTTGATTTGGCCAATATTAGAGTTCGCATGTACTTTATTAGCATTGTCTTTAAACATAAGATATGGATATCCAGATTGCAATTGCGTTTGGGCAATTGTATTTAACATTTCACGAGCATCTTTTTTCTTCTTCTCGATATTTGGATTAGCAACCATATCATCATAATACTTCTCTAAATCGATATCATCTAAAGTTACACCATATTCCTGTTTAACTGTATGTGGTGCAAACATATAGAAATCTTTGCCTTCTTTAGCCAAATCAAAGAATTTAGATGGAACGATAAGACCAGTAGAAATTGTAGATAAACGTAAATCTTCGTCAGCATTTACCTTTTTAGTATCTAAAAACTCTTCCACATCATAATGGAAAATATTTAAATATACAGCGCCAGCACCCGGACGTTGACCTAATTGATCCGCATAACTAAATCCACCTTCAAGTGCTTTTGCCACTGGTAATACACCTTTAGCAACGCCTTTGATCCCTTTAATAGCTTCGCCACGTGCACGTAGTTTAGATAAGTTGATCGCCACACCGCCACCGATTTTACTCAATTGCTTAGCTGTTGAATCGATAAAATTAATAGAATTTAAACTGTCATCTACTTCTAATAAGAAGCATGAAACAAGTTCTCCACGACGCGCACGTCCTGCGTTTAAGAAAGTTGGCGTTGCTGGTTGATAACGTTGTTCAACCATAGAAGAAATAAATTGTTTAGCTTGTTTAGTGTCACCATTTGCCAAATAGAGGGCAACAATTGCTACGTGTTGATTATAATCTTCTAAAAATTGACTTTTATCATTTGTTTTTAGAGCATAGTCTTTATAAAACTTACTTGCAGACATATAACTAGCAAATTGGAAATGGATTGATTTAGCAAACTCAGTAATTTCTCTTAAACTTTCTTCAGTATATTTTTCAAACACATTAAAATAGAAATTATTATCTACAAGATAATGTAAACGTTCGATTTCGTCATCGAAATATATAGTCTTATCATGGATTTCTTCAAGATAAACTTTTAAAGCTTCTTGATCTTTCTCTAAGTCGAAAAAACCATTATCTTTTCGCTTAGTTACTTCATTATTTAATTCAATATGATTGTATTTCTTCTCGTCCATGGTTTTCATTGAAATTACCCACCTTATCCTTAAATTCAATTACATCGTTATTCGTGCCTTGTACTTCAAATTTCATCAATAACGGAACATTATATTCCTCTGAGATTGTGCGGCCTGCTTTCGCAAAATTTTGTCCCCAATTGCGATTTCCACTTGCAGCTACCGCTTGTAATTGAGCGTGATTTACCTCTAAAAAAGATTGAACGGGTTGTGGCACTTCTCCAAATCCAATAGTGCCAGTAACTAAGATATAAGGTTCACTTACTGATTCTGTACAATTATCTTGAGTAATTTCCATCGTGTCATCAATTCCTGCTCTTTGAATAAAGTGTCTGACATTGCCTGAAAATGAGAAATATACTACTTTCATTGGATCACCTTCTTTCCTCAATCTTTAGCTGTCATGGTTATATCGAGTACTCACTAGCTCAAAAAATAAAATCACCACTAAAATAGAGGTGTACATCGATATAATTTTGTATTTAAAAGTTTTGATACTTAAATTTACTGTATCGAAAAGCATATCTATAAATGCGACTGGGACATCATTGATTAACTTAGCCTCATTTAATATATGAGCAGTCGATGTCTGAAATGAAAGTTGCTTATATCAAGTTGCTCTCAATCCTAGTCATCCATGCCGTCAGGGTCCCAACATAGAAAATTTCTTAATAAAGAAATTTTGCAAACAATGCAAGTTGGATGTGGAACAACGAAATTAATTTTACTAATTTATTTCAGTTCTACTCCCTTTTTAATGCTTTTAGTATCTCTATAAGTAAATAACCCCTATATATAGTAGCCAAAACTTAAATCATCACTATATGACAAATTATCTTTTTTGTAACTGATTACTAAAATAGCAATAATTTATCATATTCTTTAGTGTGAATTTGCATTAAAATGATTGTATTTCACATATTAACTTTTAATTCGTAAACACAATATGTAGTGTTTGATTTTGAAATTTAATACTATATTCTGTGTTTCATTATACATAAGTGCTCAAATTTATGAAAGTTAAAGTTTATTGACGAAAAATAGTTAATCTTTCAGAAAGTGCACCACTACGTTATTAGAGCTCATTATTCTGAAATAAAAAATTTTTTCAAGGGTCTTCACTTGCTTTTTAACCCAAAATAGTCATACCTCTCTACGATGCACTTGAGGTCAAAATCTCGCACAGATGTTTCATACAACCTACAACAACAAGTATTTTATGTCTTTATGTTTTCATTAATCACAATTAAATTCTTATAAGATATAACTCCCCTACAATAGAACGTGTGTTCGTATTTAGATTATATAACTCTATTTTTAATTTTGCAAGGACTTATGCATAGCCATTTTATTTATGCTAATATAGTTACGTTAATCTTATAGTATTGAGGCGATAATATTGAATCCAAAAGTAAAAGGTATTATTGCTATTTTAATTTCTGCAGTGGGATTTAGCTTTATGTCAGTCTTTTTCAGGCTTGCAGGAGATTTACCTGTATTTCAGAAATCGCTCGCTAGAAATTTTGTAGCTATGTTTATACCATTATTTTTTATTTTTAAATATAAACAACCAATGTTTGGGAAGTTGAGCAGTCAACCTCTACTCATATCTCGCTCAACTTTAGGTCTAATAGGTGTATTACTAAATATATATGCTATTGACCATATGGTTCTAAGTGATGCCGATACACTTATGAAATTAAATCCATTTTGGACGATTCTTTTAAGTCTAATTTTCCTACATGAAAAGGTACGTAAATATCAAATATCAGCTATGATTATAGCCATATTAGGTATGTTATTAATTGTAAAACCAGAATTTTCTTCTTCTGTTATCCCTTCAATAGCAGGATTATTCTCAGGTATCTTTGCCGCATCAGCTTATACATGCGTTCGTGCACTAAGCACTCGTGAGAAACCATATACAATTGTATTTTATTTCTCTTTATTCTCGGTGGTCGTATTGATACCTTTCTCAATTTTTACATTTGAACCTATGACAACAGTGCAAATCTTATATCTACTAGGTGCAGGATTGTCAGCAGCCGTTGGACAAATTGGTATCACACTTGCATATGGTTTTGCTCCTGCAAAAGATATTTCAATCTTTACGTATGCTTCAATCATTTTCACAGCATTATTCGGCTTTATCTTATTCGGAGAAACACCTGATATGTTTGCGACTGTAGGTTATGTTGTGATTATCGGTGCAAGTTACTATATGTTTGAAAAGGCACGAAGAGAATCTAGTATAAAAGAAAGTTAAAGGAGCCAATATAATGGAACAAGGACGTCAAAAAGATGAATTACAAGATATTACATTACTAGGAAATCAAAACAATACGTATGATTTTGATTATAGACCAGATGTTTTAGAAACATTCGATAATAAGCATCAAGGGCGTGACTATTTCGTTAAATTTAATTGCCCAGAGTTTACATCATTGTGCCCTATTACAGGCCAACCAGATTTTGCAACAATTTATATTTCATATATTCCTAATATCAAAATGGTGGAGTCTAAATCATTAAAGCTATATTTATTCAGCTTTAGAAATCACGGCGATTTCCATGAGGATTGTATGAATATTATTATGAATGATTTAATTGAATTAATGGATCCACACTATATTGAGGTTTGGGGTAAATTCACTCCTAGAGGTGGCATTTCAATTGATCCTTATACAAACTATGGTCGCCCGAATTCAAAATATGAAAAAATGGCAGAACATCGCTTAATGAACCATGATATGTATCCAGAAAAAATAGATAATCGTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >AP018585|2199484:2208399|2203522_2205628_-|BBD90707.1|DBSCAN-SWA MKTMDEKKYNHIELNNEVTKRKDNGFFDLEKDQEALKVYLEEIHDKTIYFDDEIERLHYLVDNNFYFNVFEKYTEESLREITEFAKSIHFQFASYMSASKFYKDYALKTNDKSQFLEDYNQHVAIVALYLANGDTKQAKQFISSMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKALEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNIEKKKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSVINDYGTEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHTGMDALTVVSDEANIQNAPGVKKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNYYSIERSMEIAKERGERYQDFESSDYANGKYFEFYTSQEFEPQFEKVRQLFEGLDIPTSDDWKALQKEVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLVSTIQTHVDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >AP018585|2199484:2208399|2207898_2208399_+|BBD90710.1|DBSCAN-SWA MEQGRQKDELQDITLLGNQNNTYDFDYRPDVLETFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNIKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDMYPEKIDNR >AP018585|2199484:2208399|2200260_2201220_-|BBD90703.1|DBSCAN-SWA MQMSSNKKISILVVIAICMAIFYLFVGLDFNIFEYQFQSRFKKFILILLVGAAIGTSVVIFQSITTNRLLTPSIMGLDSVYLFVKVLPIFILGEQAAVVTNIYLNFLITLIVMVLFSLLLFQVIFKLGHFSVYFILLVGVILGTFFRSITSFLQLIMNPESFLAVQSVMFASFEASNSNLVSVSGILLVILIVVTIILRPYLDVLLLGRAQAINLGVSYENMTRLLLILVALLVSISTALIGPVTFLGLLTVNLAHEFMKTYEHKYILPTTILFSWISLFMAQWVVENLFEATTEFSLIVDLVGGSYFIYLLVKRRSAN >AP018585|2199484:2208399|2205590_2205989_-|BBD90708.1|DBSCAN-SWA MKVVYFSFSGNVRHFIQRAGIDDTMEITQDNCTESVSEPYILVTGTIGFGEVPQPVQSFLEVNHAQLQAVAASGNRNWGQNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFEVQGTNNDVIEFKDKVGNFNENHGREEIQSY >AP018585|2199484:2208399|2202161_2202362_-|BBD90705.1|DBSCAN-SWA MINNVMYYELLYRNIYKENFKKCEKLLKNDNIIYNINGNDNHYHLSRLFTSHHTYLLRRMTNEIYI >AP018585|2199484:2208399|2207018_2207885_+|BBD90709.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAVGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNFVAMFIPLFFIFKYKQPMFGKLSSQPLLISRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADTLMKLNPFWTILLSLIFLHEKVRKYQISAMIIAILGMLLIVKPEFSSSVIPSIAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREKPYTIVFYFSLFSVVVLIPFSIFTFEPMTTVQILYLLGAGLSAAVGQIGITLAYGFAPAKDISIFTYASIIFTALFGFILFGETPDMFATVGYVVIIGASYYMFEKARRESSIKES >AP018585|2199484:2208399|2202433_2203402_-|BBD90706.1|DBSCAN-SWA MKAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSDSERETFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLIMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDTWVIEEPHLKYKSDKIIDNYHKLWGKEASIFDQYIARVSSVFLETFLFYSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQSLRNELSESEKQKADQEMYKLLNELYDNEVSYTHLLYDDIGLTEDVLNYVRYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTSTKNHDFFSVKGDGYTLALNVEALQDEDFIFDK >AP018585|2199484:2208399|2201203_2202178_-|BBD90704.1|DBSCAN-SWA MKFIFKGYTLFILLVILTIVSLFIGVSQLSLLDIFHLNDEQMNILFSSRIPRTVSILLSGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILISLLFFPNGHILIKLLFAVALSIIGTFIFVRLINLIRVKEVIFVPLLGIMIGGIISSFTTFIALRTNALQSIGNWLTGNFAIITSGRYEVLYLTIPLLILAFVFANHFTIAGMGKDFSHNLGVSYEKIINIALFITATLTALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKNALPHTLMLGAIFVLIADIIGRIIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYANEL >AP018585|2199484:2208399|2199484_2200264_-|BBD90702.1|DBSCAN-SWA MIQIQNLDKTIENKPILKDISVDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAMSRLFNCDNGTISIEDKVISDYKTDDLAKKLSILKQSNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRMKKEDYDKVDYALDLLQLKEIRNRNIKTLSGGQRQRAYIAMTIAQDTDYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRELCRKLNKTIIIVLHDINFASCYSDNIIALKQGEIVKADVKDNVIQSDILKKLYEMDVRIEEIRGQRICLYYDEATFDSV |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(71.43%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
2226439 : 2235427
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >AP018585|2226439:2235427|DBSCAN-SWA CTTATAAATTCTCCAAAATCTTAGTTTTATCGTGAAATTCTTGCACTTCATTTTCAGGGATAGAATCAATTGTAATACCAGCGCCCACCCCATAAATCGCCTCTTGATTTCTATATTCAATTGTACGTATAGGAATATTAAATATCATACGGCCATCTGGCAACAACACACCAATCGTGCCACAATAAATTGATCGAGGCGATGTTTCCAACTGTTGAATATACTTCATGGTACTTAATTTAGGCGCACCAGTGATAGAACCACATGGAAATAGTGCGCGCATGATATCGACTAAATTTGTCTGTGGCTTTAATTGACCGCTCACCATACTCGTCATTTGAAATACGGTATCATAACATTCAATCATAAATGGTTGATCAACGTTTATCGTGCCACTTTGCGAAATTCGAGTAATATCATTTCGAAGTAAATCCACTATCATGACATTTTCGGCTCTATCCTTTGCTGAATGCTTCAAAGCGTAGTATAACTGTTCATCTTCCTCGATTGACCGACCTCTTGGCATCGTGCCTTTCATCGGTTTACTTAAGATGACATTGTCATGCTCTTTGAAATCTCCTTTTTGGAAGAATAACTCTGGTGAAATCGAAGCCACTTGTATCTCTGGTGTATCTAATAAAGCTGTGTAGTGTCCATTCTGATGTGCTGTTAGTTTGTCATATAATGCTGTTATAGGAAAATGAATGGCCGAATACAAACGAGTCGTATAGTTCACTTGATAGGTATGCCCTTCTACAATTGCTTGTTGTATTAATTTAATTTTTCTCATCATGGCATCATCACTTTCATGAAATTTAAAATGATGCCTTTGTTTTGTGGAATTTAATTTTCTGTTGTGACTTGCACTAGCATTTTCTTTTTTATGCCGAACATCTTTAAATGAATAAGCTACTGCCAATATTTGATTTTCTTCTATTATATTGACGCTCATTTTATCATTAAAATAAGGTGCCGCTTCGTACGTCATATATAATGCCACATAACGCCCTTTTTGTTGTTCATTTTCCGCAAAATTAACAACCTCTCCCACTTCATCAAGGTGATAAGCAATTGCAGAGTCTAAACATTCTTCCATAATTAAATGATAATCTTTAGATTGATTCTCATCTTCGTAATATCGATAATTGAATTCAATATGCATATTGAACGCCTGCCTCATTTAAAAATAACTTAAGCTGTTCGTGTCCATACTCACTTAATATAGATTCTGGATGATATTGAACACCATAAACATGAAAATCGCGGTGCTGTACGGCCATAACAATTCCTTCATTATTATAAGCAGTAACCTTTAGTGAATGAGGTATTTGTAATGGATCGGCCATAAGCGAATGATATCGCATTACATTAAAGTATAAAGGAAGGTCCTTAAAGATTCCTTCATTTGAATGATGCAACGTTGTGGTATGACCATGAACTGGTTTATCATTATGTATAATTTGCCCACCAAAATGTTCAACGATGACTTGAAAGCCCAAACATACCCCTAATATAGGCACCTCTCGATAATATTCCGTGAGTATGGTTGCAAGTATAGGATAATCACTTGGACGACCAGGCCCAGGAGAAATAACAATTGCCTGAGGGTCTAATTGTTTAAGCATTGGAATCGTGACTTGATCAACGGATATGACCTGAACATCATCAGTTGTTTGGACTGTAAGATAATCTATTAAATTATATGTAAATGAATCATGGTTATCTATCATTACTATCATAAATGTGCTCCGTAGTTAAATTTTAATCATTTTTACTTTTGTCACTCTATTATCACAGAACGTGACTTGATTTTATATAGTATATCGTTTATTCTATTTTGCGTACAAAAATAAATAAAAAGAGGTTCCTAGCAGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACAAGTATTCTACTACTATGAATGCGAGTATACATATACTTTTAGTTATAACATTAAAATGATATGTGTCCTTACATCTTCACGTCTATCTTTTTTATAGAGATAGACTTTTTTTATGCACAAAATTAATAACGATAAGGAGCTATACTAATGACTGAAAGTGACTTAAACAAAGATAAAGCAATTGTCGTATTTAGTGGCGGCCAAGATAGTACGACATGTTTGTTTTATGCTAAGAAACATTTTAAAGAAGTTGAACTCGTTACATTTAATTATGGTCAAAGACATGATACCGAAATTGAAGTAGCGAAAAAAATTGCCAACGAGCAAGGTTTAAAACATCACATCTTAGACATGTCATTATTATCTCAACTCACACCAAATGCACTTACACAACATGATTTAGACATTGAAGAAAATGAAGACGGTATCCCCAATACATTTGTCCCAGCACGTAATTTATTATTCTTATCCTTTGCAGGCGCATTAGCCTATCAAATCAACGCAAAACACATCATTACTGGTGTTTGTGAAACTGACTTCTCAGGATATCCAGATTGTAGAGATAGCTTCATTAAATCTATGAATGTTACGCTTAGCCTCTCGATGGGTAAAGATTTTGTCATCCATACACCACTGATGTGGTTGGATAAAGCCCAGACTTGGGAATTAAGTGACGAATTAGGTGTATTAGACTATATTCGTTACAATACGCTGACATGCTACAACGGTATCATCGGTGATGGTTGTGGCGAGTGTCCTGCTTGTAAATTAAGAGCCCGTGGTTTACATCATTACCTCAAAAGTAAAGGAGCTGAATAGCATGATGCAACAAATTTATCCAAGTGTCACACATCCTTATCAATTTGAATTAAATAAAGATTTCAATTTTTCTGCAGCACATTACATTCCAAGTGAAGATGCTGGTAAATGCATGAGAACACATGGCCATACGTATTTCATTAATATAACAATTGCCGGAGATACGTTGGATCATAATGGTTTTTTAGTGAATTTTAGTGATTTGAAAAAGTTAATACATGATCAATTTGACCATTATTTGTTGAATGACTTAACACCTTTTAAAGGAAAAAGTCCTTCTACAGAAATCGTCGCACAAACGATTTACAATATGGTACAAGATTATTTAAGCGATCGTGATAACCAACCTCAATGTGTACAAGTATATTTACGCGAAACTCCTACAAGTTATGTTGTTTACCGACCAAAGGAAGCGAAGTAAATCATGGCTAAAATACCTGTTTTAGAAGTATTCGGCCCTACAATACAAGGAGAAGGTCGTGTAATCGGACGTAAAACCATGTTTGTGCGTACAGCAGGTTGTGATTACCGCTGTAGTTGGTGTGATTCTGCTTTCACTTGGGATGGAAGCGCTAAAGAAGATATACGCCTTCTCTCTGCCGAAGAAATATATGAGGAATTACGCGAAGTTGGTGGAGATAATTTTAACCATGTCACGATTTCAGGTGGAAATCCTGCCTTGATTAAAGGTATTCAAGATTTAGTCGACTTATTCGAGGAAAAGAATATTTATACAGCTCTAGAAACGCAAGGCAGTAAATTCCAACCGTGGATGACACAAATTAATGATTTAACGATCAGTCCTAAACCACCAAGTTCCACAATGAAACCTAATTTAGATATTTTAGATTCAGTAATAGAACAATGTGTACACCATACCCTCAATCTCAAAGTTGTCATATTTAATGAAGAAGATTATGAATTTGCGAAAATGATTCACCATCGTTACCCATCCATTCCATTTTATCTCCAAGTGGGTAATCCTTATTTAGAGGATGACGTCGAGCATCATACTTACAAACTACTAGAGAGATATGAAAAACTAGTTGACCGTGTCATGGAAAGTAGTGATATGAATCATGTATATGTACTTCCACAATTACATACATTATTGTGGAGTAATAAAAAAGGCGTTTAAAATAATTAAGTTAAGACTTATTGAGTGTTTTGTAATGATTAAGTTTATGTTAATTGATATAATGTTGAAATGAAAGTCAAGTCCAGACTCCTGTGTAAAATGCTATACAATGTTTTTACCATTTCTACTTATCAAAATTGATGTATTTTCTTGAAGAATAAATCCATTCATCATGTAGGTCCATAAGAACGGCTCCAATTAAGCGATTGGCTGATGTTTGATTGGGGAAGATGCGAATAATCTTTTCTCTTCTGCGTACTTCTTGATTCAGTCGTTCAATTAGATTGGTACTCTTTAGTCGATTGTGGGAATTTCCTTGTACGGTATATTGAAAGGCGTCTTCGAATCCATCATCCAATGATGCGCAAGCTTTTGAATATTTTGGTTGATCGATATAATCATGAATCAATCGATTTTTAGCCTCACGCGCTAAGTTAATATCTGTGAACTTAAAAATTCCTTTAACAGCTTCTCTGAAAGATTTTGAATTTTTTTTAGGAATGGTGGTAAAGATATTTCTTAGGAAGTGAACTTGGCATCTTTGCCAACTTACGTTGGTGAAGGATTTTCTAATGGCAGAGACTAATCCTTTGTGCGCATCAGAAATAACGAGTTCCGTACCTTGTAAACCGCGTTCTTTTAGGTATTCAAAAAATGTTGTCCAGGTCTCTTCGCTTTCGCCACTTTGAATCATGAAGCCGATAATTTCACGGTCGCCATCTTTGGTTATTCCAATCGCTATATGACAGCTTTTTGAGAGTACTCGATTTTCTTCTCGTACTTTTATATAGAGTACATCGGTCATTAAGTAAGGATAATTTTTTTCTGATAATAAACGATTCTGCCACTCGTTAACCATAGGTTCTAGCTGTTCTGTTAAGCTAGAAACGAAGGACTTAGAGACGGATTTACCACAAAGTTCTTCCACAATTTTTGATACTTTACGAGTTGAAACGCCTGATACATACATTTCCAACATTGAAGCCATGAGGGCTTTTTCGTTTCGTTGATAACGTTCAAACACTGTGGGTGAAAAATGGCCATCACGTGTTCTGGGTACTTTTAATTCTAGCGTGCCTACACGTGTCGTAAAGCTGCGCTCATAATAGCCATTTCGTTGACTTTGTCGGTTTTCTGTTCGTTCATATTCTTTTGCTTGAATATATTCTGTTCGTTGATTTTCCATTAGTTGATTAAATACCGTTGTTAAAATATTTTTAGAAACGTCATCCTTTACAGAATATTCAATAATGCTTTGAATCTCTTCGCTTTTCAGTGTAAAATGTACTTGGGTCATGTAAAAGTCCTCCTGGGTATGTTTTTGTCGTTAAAAACATTGTACCGTAAAAGGACTGTTATATGGCCTTTTTACTTTTACACAATTATACGGACTTTATCGAAATGAAGAATTGTGGATAGGAGTTCAACATGATTATATATATATTAGTTAATATAGCCGTCGTCTTGCTTATTGTTGGCTTTGACCTTTATCGGCATCAATTCAATCAACTTAAGTTTAGCTCCATATTATTAGCGATATCGCTTAACAGTATTATTGATATTTATGTGATAGATAAGTTTAATTTCATTACTTTATCTACTGTATTGTTATTTTTAATATGGACATTTTTACAAATATATTTAAATAAAAAATTATATCCATTTCAGATTACAGAACAAAAATTTATAGCTACAATCTTTGCTATTGTTATAAGCCTTTCCCAATTTATCACTGATATTTCTAGTGAACAATCTGTATACATGTCTATACCATATTTAGCACCAGCAATATTTATCTTCGGTGCAGTGTTAGTATTTATCGGGACCTTTAAGATGTCTGAAATTGAACACATCTCTTTGTTAACCAAAGTTAAAAGACCTATTACTACCGGAACCATTGTCATCATCTTATCTTTTATAATAATGATGATTTTAACACCGTTTTGGTATGTATACGTGATTGTTTACTTCCTATTCATAGCATTTATTTTATGGCAAGGCATTTTCTTCGTAAAAAGAAAACAATAGCACTCATATTTATTCTAAATAAATTACTCAGATTGGGTTATCAATCCCAAAATACTTAGCTCTAAGATCATTTCTAATTTGGTGGGCAATCCAAAAGTTAGTTTAAAATTTAACTTTATGGTGCTCACTACCTGATAGAAATTGTCTTAGAGCTTATTTTATATCATTGTTCGTTTTAATCTCTTTAAAGACACAAATTTCCTAATAAACTGTTGCTTGATATTTAAGCAGATATATTTTTTCTTCTTTTAATCCCCTCTATCTACCATCACACTATTTATACATTCATTATCAAAAGTATAAATAAAAAGAATTTTGATTTAATTCTTTTTTAAATGTAGTTAAGAAATAGTTAATGGTTTAAAAATGTTATCCCGCTTAAACTAATCTTAAATACATATAGAAAAGAGGAATACATCATGAATACAAAATATTTATTTGCAGTCGGCGCAATTGTCACATCACTTACATTAGGTGCGTGTGGAAATTCTAATTCTGATCAAGAACATTCTCAACACAAAGATAAGCAACAAGAAGAAAGTAAAGTTAAAACTGATAAAACGAAAAAACTATTCGGTACGTTTAAATCCAAAAATGGTGAAAAAGTAGAAGGCACGGCTAAAATTGAAAATGGTAAATTAATGTTAGAAAATTATAAGTCATCTAAAGGTCCAGATTTATATGTCTTCTTAACTAAAGACGGTGATATCAAATCAGGTAAGAAAATCTCAACTGTAGATTACAATAAATCAAAACAAACTTTTAATTTAAAAAATGTCGATTTAAATAAATACAATGAAGTTACAATTTATTGCGAAAAGGCACATGTTATTTTCGGTGGAGCGAAATTGAAATAACTTAAATTAGCTTATTCATACGTTTGCAACTAGAGAAAGAGAGAGGATTAACTATGAAGAAATTAAGTTTATTAATCATTATTATCATTCGTATTATTTCAGGTATTGTGATTTTCAGACAAGGCTTGGAAAAATTTACGGGAGATTTTACTTTAAATGGATTAGTGCCTGTCATTCGTGATAATACCGATTCACCTCAATGGTATAAATGGTTCTTTGAAAATATCGTCTCACATTCAACAGGTTTGTTTAATTTTATCATTCCGTTAGGAGAAATGGCTATCGGTTTAGGACTCATCTTAGGCGTCTTCGCATATGCTGCAAGTTTCTTTGGCGCCTTTGTTATGATAAATTATATCTTAGCAGATATGATTTTTACGTACCCTCTACAATTAGCTTTCTTTATTATTTTATTGATGAGTCACTCATTACTAAATAAAGTTTCACTTAAAGAAGTTATCACTCATTTGAGAGAACGTAACAACCGAGGTGAAGACAAGCATGACACATTTACTGATCGTGGATGATGAGCAAGACATTGTAGATATATGCCAAACATACTTTGAATATGAGGGCTATCAAGTCACTACGACAACGAATGGAAAAGAAGCAATCCAATTATTATCATCAGACATCGATGTCATGATTTTAGATATCATGATGCCTGAAGTTTCTGGTTACGATATTGTTAAAGAAATGAAAGCAAAGCAACTTGATATTCCTTTTATTTACTTAACGGCTAAAACACAGGAACACGACACAATCTATGCACTTACACTAGGCGCAGATGATTATGTTAAGAAACCGTTTAGTCCTAGAGAACTCGTATTACGAACAAATAACCTACTCACGCGAATTAGTAAATATCAATCTTCTAATAGAATAGAACAACTCGAATTTAATGGATTAATATTAAATAATTCAAGTAAAACATTAACTATAGATAATCAAGAAATTCCTATGCGTATAAAAGAATTTGAATTACTATGGTATCTGGCTTCGCGAGAAAATGATGTCATATCTAAATCCGAACTTTTAGAAAAGGTTTGGGGATATGACTATTATGAAGACGCCAATACTGTCAACGTTCATATCCATAGAATACGTGAAAAATTAGAGAAACATCATTTCATCACATATACAATTACAACAGTATGGGGGTTAGGATATAAATTTGAAAGGAGCCGATAAGCATGTTCTCTATTCGTAGCCAAATTACCATCGGCGTCATTTCAAGTGTACTCTTAACTACCATTATACTTGTCATTGCATACAAACTGATGTGGTTCAACGGTCATATGACCTTCACATTAACCATTACGACAATGATAACAAGTTGTTTAACACTTTCAATTTGTAGTATTTTTATTACGCCATTAATCCAGAAAATTAAACAATTCAACATCAAGACAAAGCAATTCGTTAACGACGAGCATTTAATTGACGATGATACATTTCAATCTCCAAGAGAAATTAAAGAACTTAATGATTCATTTAACAAGATGGCAGACGCAATCACTAAACAAATGGACATGATTAAAAACGAACAACAGGAAAAAACGGAAATTATTCAAAATCTTGCCCATGATTTAAAAACGCCACTCGCAGGAATTCTCTCATATACAGAAGGATTACGCGACGGGGTCATTAGTGAGAAACAAGAAGTTCACGCTGCTTATGACGTACTCATTAAACAAGCAAATCGTCTTTCTACATTATTCGATGACATGACGCACGTGATTTCACTTAACACTGGTCGTTCTTATCCTTTGGAATTAATTCAACTCGACCAATTACTAGTCACTATTCTTCAAACTTATGAACAACGAATTAAGCAAGAGAATCGAACACTAGAGGTCAATTTCAGTAACAATATTGATGCATTCTACCAATATCGACCTCCATTAGAACGTATTTTGACTAATTTATTAGAGAACGCTTTAAAGTTTTCTAATTATGGTAGTCGCATCGATATTATTATTTCTGAAAATGAAGAAAACGATTGTATCAACATCGCAATTAAAGATGAAGGTATTGGAATTGTACCTGAACTTCAATCTCGTATTTTTGAGCGGACTTTCAGAGTAGAAGACTCAAGAAATACTAAAACAGGTGGTTCAGGATTAGGATTGTACATTGCTAATGAACTTGCTCAACAAATTGATGGATCAATCATTGTTGGAAGTGAACTTAATGTGGGAACTACAATGACACTCAAGTTAAAGAAATTTGATATTTCATCACATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >AP018585|2226439:2235427|2229579_2230293_+|BBD90728.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEVFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKEDIRLLSAEEIYEELREVGGDNFNHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFEEKNIYTALETQGSKFQPWMTQINDLTISPKPPSSTMKPNLDILDSVIEQCVHHTLNLKVVIFNEEDYEFAKMIHHRYPSIPFYLQVGNPYLEDDVEHHTYKLLERYEKLVDRVMESSDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >AP018585|2226439:2235427|2228483_2229155_+|BBD90726.1|DBSCAN-SWA MTESDLNKDKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKKIANEQGLKHHILDMSLLSQLTPNALTQHDLDIEENEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQINAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLSMGKDFVIHTPLMWLDKAQTWELSDELGVLDYIRYNTLTCYNGIIGDGCGECPACKLRARGLHHYLKSKGAE >AP018585|2226439:2235427|2229156_2229576_+|BBD90727.1|DBSCAN-SWA MMQQIYPSVTHPYQFELNKDFNFSAAHYIPSEDAGKCMRTHGHTYFINITIAGDTLDHNGFLVNFSDLKKLIHDQFDHYLLNDLTPFKGKSPSTEIVAQTIYNMVQDYLSDRDNQPQCVQVYLRETPTSYVVYRPKEAK >AP018585|2226439:2235427|2232740_2233178_+|BBD90731.1|DBSCAN-SWA MNTKYLFAVGAIVTSLTLGACGNSNSDQEHSQHKDKQQEESKVKTDKTKKLFGTFKSKNGEKVEGTAKIENGKLMLENYKSSKGPDLYVFLTKDGDIKSGKKISTVDYNKSKQTFNLKNVDLNKYNEVTIYCEKAHVIFGGAKLK >AP018585|2226439:2235427|2230417_2231590_-|BBD90729.1|transposase|DBSCAN-SWA MTQVHFTLKSEEIQSIIEYSVKDDVSKNILTTVFNQLMENQRTEYIQAKEYERTENRQSQRNGYYERSFTTRVGTLELKVPRTRDGHFSPTVFERYQRNEKALMASMLEMYVSGVSTRKVSKIVEELCGKSVSKSFVSSLTEQLEPMVNEWQNRLLSEKNYPYLMTDVLYIKVREENRVLSKSCHIAIGITKDGDREIIGFMIQSGESEETWTTFFEYLKERGLQGTELVISDAHKGLVSAIRKSFTNVSWQRCQVHFLRNIFTTIPKKNSKSFREAVKGIFKFTDINLAREAKNRLIHDYIDQPKYSKACASLDDGFEDAFQYTVQGNSHNRLKSTNLIERLNQEVRRREKIIRIFPNQTSANRLIGAVLMDLHDEWIYSSRKYINFDK >AP018585|2226439:2235427|2233231_2233705_+|BBD90732.1|DBSCAN-SWA MKKLSLLIIIIIRIISGIVIFRQGLEKFTGDFTLNGLVPVIRDNTDSPQWYKWFFENIVSHSTGLFNFIIPLGEMAIGLGLILGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLAFFIILLMSHSLLNKVSLKEVITHLRERNNRGEDKHDTFTDRG >AP018585|2226439:2235427|2227589_2228177_-|BBD90725.1|DBSCAN-SWA MIVMIDNHDSFTYNLIDYLTVQTTDDVQVISVDQVTIPMLKQLDPQAIVISPGPGRPSDYPILATILTEYYREVPILGVCLGFQVIVEHFGGQIIHNDKPVHGHTTTLHHSNEGIFKDLPLYFNVMRYHSLMADPLQIPHSLKVTAYNNEGIVMAVQHRDFHVYGVQYHPESILSEYGHEQLKLFLNEAGVQYAY >AP018585|2226439:2235427|2233679_2234369_+|BBD90733.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYQVTTTTNGKEAIQLLSSDIDVMILDIMMPEVSGYDIVKEMKAKQLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRTNNLLTRISKYQSSNRIEQLEFNGLILNNSSKTLTIDNQEIPMRIKEFELLWYLASRENDVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKHHFITYTITTVWGLGYKFERSR >AP018585|2226439:2235427|2234371_2235427_+|BBD90734.1|DBSCAN-SWA MFSIRSQITIGVISSVLLTTIILVIAYKLMWFNGHMTFTLTITTMITSCLTLSICSIFITPLIQKIKQFNIKTKQFVNDEHLIDDDTFQSPREIKELNDSFNKMADAITKQMDMIKNEQQEKTEIIQNLAHDLKTPLAGILSYTEGLRDGVISEKQEVHAAYDVLIKQANRLSTLFDDMTHVISLNTGRSYPLELIQLDQLLVTILQTYEQRIKQENRTLEVNFSNNIDAFYQYRPPLERILTNLLENALKFSNYGSRIDIIISENEENDCINIAIKDEGIGIVPELQSRIFERTFRVEDSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQIDGSIIVGSELNVGTTMTLKLKKFDISSH >AP018585|2226439:2235427|2226439_2227600_-|BBD90724.1|DBSCAN-SWA MHIEFNYRYYEDENQSKDYHLIMEECLDSAIAYHLDEVGEVVNFAENEQQKGRYVALYMTYEAAPYFNDKMSVNIIEENQILAVAYSFKDVRHKKENASASHNRKLNSTKQRHHFKFHESDDAMMRKIKLIQQAIVEGHTYQVNYTTRLYSAIHFPITALYDKLTAHQNGHYTALLDTPEIQVASISPELFFQKGDFKEHDNVILSKPMKGTMPRGRSIEEDEQLYYALKHSAKDRAENVMIVDLLRNDITRISQSGTINVDQPFMIECYDTVFQMTSMVSGQLKPQTNLVDIMRALFPCGSITGAPKLSTMKYIQQLETSPRSIYCGTIGVLLPDGRMIFNIPIRTIEYRNQEAIYGVGAGITIDSIPENEVQEFHDKTKILENL >AP018585|2226439:2235427|2231721_2232321_+|BBD90730.1|DBSCAN-SWA MIIYILVNIAVVLLIVGFDLYRHQFNQLKFSSILLAISLNSIIDIYVIDKFNFITLSTVLLFLIWTFLQIYLNKKLYPFQITEQKFIATIFAIVISLSQFITDISSEQSVYMSIPYLAPAIFIFGAVLVFIGTFKMSEIEHISLLTKVKRPITTGTIVIILSFIIMMILTPFWYVYVIVYFLFIAFILWQGIFFVKRKQ |
11 | Pandoravirus(12.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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