Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP034563 | Flammeovirga sp. L12M1 chromosome 2, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh,cas3,WYL,RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
| CP034562 | Flammeovirga sp. L12M1 chromosome 1, complete sequence | 0 crisprs | DinG,WYL,DEDDh,cas3,cas6,RT,csa3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
| CP034564 | Flammeovirga sp. L12M1 plasmid unnamed1, complete sequence | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 0 | 0 |
1. CP034562
Click the left colored region to show detailed information
0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
232182 : 301386
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP034562|232182:301386|DBSCAN-SWA ATTATTTTTTCTTCTTAGTCTTCGTTTCCTTCACGTCAGGATGAGCTTTTAAATAGTTATCCCATAAATCAGGTCTACGTAGTTGAGTACGTTTTACAGATTCCTCTAAACGCCACTCATCAATTTTAGATTCATGGCCAGATAATAGAATGTCAGGAACTTCTTGTCCTTTCCATTCTTTAGGTCTTGTATAAACAGGAGGTGCTAACAAACCATCTTGGAAAGAATCAGTTAATGCTGATGTCTCATCACCTAGAACTCCTGGTAAAACACGAATTACAGCATCTGCAACAATTGCAGCAGCAAGTTCGCCTCCAGATAGTACATAATCTCCAATGCTAATTTCTCTAGTAATTATTTCATCACGTACCCTTTGATCAATCCCTTTGTAATGACCACATAAAATAATAATGTTTTCACAAGAAATAGAAAGGTGATTAGCAATTTGTTGATTAAAAACTTCACCATCAGGTGTCATGTAAATTACCTCTTGATAATCTCGTTCCTTTTTTAAATCATTAATACAATTAAAAATAGGATCAGCCATTATTACCATACCTGCACCATGTCCATAAGCATAATCATCTATTCTATTGTGCTTATTATTAGCATACTTTCTTAAGTCATGAACATGAACTTCAGAAAGTGCTTTATCATTTGCTCTCTGTAAAATAGAGTGAGAAAATGGACTATCTAAAAGTTTAGGAACACATGATATGATATCTATACGCATGATGAACTATTTAATATCTGATTTAATAATTTTATCAATTTTCACAAAGGTACAAACAAAGCCGATATAATCGTTTTCTTCGCCTTGTAAGGTTCACATGTGTTACGATAAGTTTGTAAAACATGTGAACAATTGTTAACTTTAGAGAAGTAGAAGTCACGCTCTACGCTGATTATCAAAAATAATATAACACTATGAAATATCTAAAACTACTGCTACTACTCTTGTTTATGATGGGAATGACTAGCTGTGTGTCTTATAAAAGTGCAGTACAGGCGGGTTATAACCCCAATGATACTGACAATATTTATCACTTGGCACACGAATAAGATAAATGCTAAACGTACTCTTTAAATAGTAAGGAGTACGTTTTTTTTATGATCAATCTTACTTTAAGTGAATAAGAAGTTAATGGTTTGTCTTTCCAATTAGTTAGAGAGTAAATAAAGATAAAAATACTTGTAAAAATCAATGATTCATCGAACTTTGTCTTAGTTTTAATTAAACCGAATTTCATGCTTTTTGCACAAGTACCCGGAGCGTCAGACGTTAAGAAATTATTGATTCAAGTTGCAGAGCAAAAAAAAGTTGCTCATGCTCAATTATTTATAGGAAAAGAAGGAGGGGCTCAGTTAGGAGTAGCACTTGCTTATGCTACTTACTTAAATTGTGAGAACCCAACTCCTGAGGATGCTTGTGGTACATGTAGATCGTGTAGGAATGCGGCAAAATTAATGTATCCAGATCTTCACTTTGTGTTGCCAACAGCAGTAACAAAGAAAGTGACGAAAAGAGACCAAGCTACAACAGAAAAATTTTTACCAGATTGGAGGTCGTTTATAACCGAAGAAAATGGACTTTATAAAAATGTAGCCGATTGGGTAGATCATATTGGTGGAGAAAATAAACAAGCTATAATCACTCGTCAGGAAAGTCGAGAAATAATAAAAGCATTATCTGTTAAAGCACATCAAGGTGGATATAAAATTGTATTAATATGGATGCCAGAATTAATGCAAGCACCTGCGGCAAATGCTGTTTTAAAGATATTAGAAGAGCCACCAGAAAAGACATTGTTCTTTATGGTAACGAATGATGCAGAGAAATTAATTGCAACAATCTTATCAAGAACACAAAAAATATATGTTCCTACGCCTAGTGATGAAGATTTGACCTCTTTCTTGGTAAGCCAAGATATGGAGCCTGAAAAGGCAAAGAGGGTTGCATTTCTTTCTGATGGGAATATAAGAGAGGCATTAAGAATAGCTTCGGATGTTCCCGACCAGAGTGAGCATTTGTTTAAATCTTGGATGAGGTCTTGTTTTAAAGCAAGCTATACTGAAATTATTACACAGTGGTCTGAAGAGTTCAATAAACTAGGAAAAGAAGGGCAGAAGAACTTTTTTAAATTTGGACTTACTTTACTAAGAGAGGCAATGCTTATTAAGAACGAAGCTGATGCAGTTGTGAGGCTAGATCAAGAAGCCCATGAGTTTGCTAAAAACTTTTCTTCTGTATTAACCGATACAAATCTTCCGGTACTGGTAAATAGTTTCAATGATGCTTATTACTTTATCGAAAGAAACGGAAATGCAAAGATAATTTTTGTGAGTTTATCAATTAAAGTTGGAAGAGCTTTTGGTAGAAGGTGAATTTTTTCGAAAAAACTTCAAAAAAAACACTAATCAGTAAAGATTTTTCTTCTCTCGTAACGGTATTATTTTATATTTGTATAGGGAAGTATAAAAAATCCCTCTGATAAAACGTTTTTTATTAGAAAATCATTACTAATAAGCGAAAACTCATAAAATTTTAATATATGGACTTTAAGAACGAATTCAAGAAATTTGCCATGAAAGATCAAGGCATTTCAAGCCTTCACATGGATAGCTATATTGGTAATTTTGAAAACATGACGCGTACAGTAATTGAAGAGCGTGATCGTCGATTTGCAGAAATTGATGTATTCTCTCGTCTAATCGCTGACCGTATCATTTTTATGGGTACTCAAGTAGATGATAATATTTCAAATATTGTGATTGCTCAATTACTATTTTTAGAGTCACTTGATGCTAAAAAAGATATCTTGATGTATATCAATAGCCCTGGTGGTTCTGTATATGCTGGTTTAGGTATGTATGATACTATGCAGTATGTACGTCCAGACGTTGCAACAATCTGTACAGGTCTTGCTGCATCTATGGGTGCTGTGTTATTAGCAGGTGGTGCTGAAGGTAAAAGAGCTGCACTTCCACATTCAAGAATCATGATCCACCAACCATTAGGAGGTGCTCAAGGTCAAGCTTCTGATATTGAAATCACAGCTCGTGAGATTCAAAAATTAAAGAAGGAGTTGTACGAAATTCTAGCAAAACATTCAGGACAACCTTATGATAAAGTATGGCAAGATTCTGACCGTGATTACTGGATGCGTGCACAAACAGCTAAGGAATATGGTCTAATCGATGAAGTATTGACTAGAAAGCCAGACGATAAGTAATAAATAATCATTTTTCTATTTGTAATAATCTTTATTTGATAACAATAAGTGTTTATCATAAATTAAAATTTTGCAAATAGTGTGAATGAATAATTAGAAGAGGGAAGTGTTTGTACATTTCCCTCTTACTCATTGTATAAAAGTGCAATTAAATATGTAACTTGCACTTTAATTATATGAATAAACATCTTGATTATTAAGATGTTTCTGTGAAGAGAAGGGATCTCTTCATCATTTAGGAGAGAAAAGGCAAGGAGAGAATAAATGAAAGGTAATTTCTGTTCATTTTGTGGCGCACCGAAAGACACGGTTGAATTAATGGTTTCAGGCCAGAACGCCCAAATATGTAATAACTGTATTGAGCAAGTACACCAAATCTTAATGGAGGAAAGAAAACCTCGTAAAAAAGATGAGGAGTCGTCTGAATTTGCTCTGAAAACACCTGCAGAAATGAAAAAACATCTTGATGAATATATTATTGGTCAAGATAAAGCAAAAAGAGTATTATCTGTAGCTGTATATAACCACTATAAACGTCTAAATCAAAAATCAGATCCTGATGATATCGTGATTGAAAAATCAAATATTATCATGACTGGAAATACGGGTACTGGTAAAACTTTGTTAGCTAAAACATTAGCAAAAGCATTGCAAGTACCATTCTGTATAGCAGATGCAACTGTAATTACAGAGGCAGGGTATGTTGGTGAAGATGTAGAAACAATTTTAACACGCTTATTACAAGCTGCAGACTATAATGTTGAGCAAGCTGAACGTGGTATTGTTTACATTGATGAAATTGATAAAATTGCTCGTAAATCTGATAACCCATCAATCACTCGTGATGTAAGTGGTGAAGGTGTACAGCAAGCATTATTGAAATTATTAGAAGGTTCTATTGTAAACGTTCCACCTCAAGGAGGACGTAAGCACCCAGAACAAAAACTGATTTCAGTAAATACAGAAAACATATTGTTTATCTGTGGTGGTGCATTTGCAGGAATTGCAGATATGATTGCTTCTAGATTAAATACACGTCCTATCGGATTTGCAGGCAAGAAAGAAGATCTACCAGTACTAGATAAAGAAGAGTTATTAGAGTTTGTAACAGCTCAAGACTTAAAACGTTTTGGTATCATTCCAGAACTTATTGGTCGTTTGCCATTAGTTACATACTTAAAGCCTTTAGATAGAGCAGCATTAAGAAGTATTCTAACAGAACCGAAGAACGCATTGATTAAACAATATCAAAAATTGTTTGCAATGGAGGATGTCGAGTTAGAAATTACTGGTGATGCATTAGATTACATTGTTGATAAAGCAATGGAATACGATCTAGGAGCAAGAGGGTTACGTAGTATCTTAGAAGCAATTATGCTAGATGCAATGTACGAAATCCCATCAGGCGAAGAGAAAATTGATAAATTTGTTGTGGATAGAGAATATGCTTCATTGAAATTTGAAAGCTCATCTCACGCAAAAAACTTAAGAGTAGCTTAAGTTAGATTTACAACTCCATTTATTTCATAAAATAGCAAACAGCAAAGACACTCTAAGAGTGCTTTGCTGTTTGTGTTTATATTTAACCTCACATAAATCGATATAGTATGGATTTTAGCAATATGTTTGGACAACTTAAAGATGTTCAAGAAAAATTAAAACTAGCACAAGAAGAGTTAGTGAATGTAACAGCAGAAGCAGATGCAGGAGGAGGAATGGTTCGTGCAACTGCTAACGCAAAAAAACAAGTCATTAAGTTAGAAATCG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP034562|232182:301386|234733_235414_+|AZQ60827.1|protease|DBSCAN-SWA MDFKNEFKKFAMKDQGISSLHMDSYIGNFENMTRTVIEERDRRFAEIDVFSRLIADRIIFMGTQVDDNISNIVIAQLLFLESLDAKKDILMYINSPGGSVYAGLGMYDTMQYVRPDVATICTGLAASMGAVLLAGGAEGKRAALPHSRIMIHQPLGGAQGQASDIEITAREIQKLKKELYEILAKHSGQPYDKVWQDSDRDYWMRAQTAKEYGLIDEVLTRKPDDK >CP034562|232182:301386|296558_297515_-|AZQ60877.1|DBSCAN-SWA MKNLFYILLLFTLPSYASKVTFRVDMTGEKVHTEGIHLSGNVNNWKLKETQLINTTGTIYEVTLEVETNKTYEYKYFNGTDWNTGEYAFGPCANGGFRTIRVDGDTILPIVPFNGCAEKFNLKDKIRVACVGNSITYGHGIPERYANCYPTQLQHRLGDNYLVNNFGNSGRTLSKGVNDSYWVTAAFKQSHTIFLPNKVVIMLGTNDSKPQIWDIRKTYFEEDLNAFITSYASLASNPEIYLATPPMIYPNTFDIRNQIVEEEIIPILIKVAKERNIKIIPIHEVTKNMKSDFPDGVHPSTKGATVIAEEIYKVLIRE >CP034562|232182:301386|247695_248760_-|AZQ60838.1|DBSCAN-SWA 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|
57 | Agrobacterium_phage(14.29%) | coat,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
3827417 : 3837976
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP034562|3827417:3837976|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP034562|3827417:3837976|3831151_3832171_-|AZQ63575.1|DBSCAN-SWA MKSSILITGGAGFIGANFVPYFLEKYHDYQLINLDKLTYAGDLVNLSEIEVNHLSYTFIEGDICNRVLVEELFNQYDIKGVIHFAAESHVDNSITGPEAFIQTNVNGTFTLIDVARKYWMNAPFDYKEEYKNCRFHHISTDEVYGTLGETGLFTEETPYAPNSPYSASKASSDMIVRSYFHTYGMNVVTTNCSNNYGPKQHKEKLIPTIIRKALASEPIPIYGDGKNIRDWLYVLDHCKGIDLVYHKGKEGETYNIGGRNERDNLYIVDKICTLLDIKHPLKDSTSYKELITFVNDRPGHDQRYAIDATKLESELGWKADEDFESGIVKTVNWYLEEYR >CP034562|3827417:3837976|3833139_3833673_-|AZQ63577.1|DBSCAN-SWA MNITPTKLKDCYILQPQIFGDDRGYFYESFHFQKFSEVTGLVVTFVQDNQSSSTYGVIRGLHFQKGAAAQAKLVRVISGRVIDVAVDLRPESSTYGQYEAVELSAENRKQLFVPRGFAHGFSVLSESVEFVYKCDNYYNPKEEDGIIYNDPTLNIDWGIPHGEEIISKKDLKLPRLS >CP034562|3827417:3837976|3827417_3828626_-|AZQ63572.1|DBSCAN-SWA MNPEVVMVGLGYIGLPTAALIAQNKVKVHGVDVNPHVVETINQGKIHIVEPELDKAVANAVAGGFLKADVKPVEANAYLIVVPTPFKDKNEPDISFVEAATKAVLPLLKEGDLYIIESTSPVGTTEKMANLIYSERPELEDKLNIAYCPERVLPGNVMYELVNNDRVIGGIDEESTEKALAFYSQFVSGELHATNARTAEMCKLVENSSRDVQIAFANELSLICDKADINVWELIDLANKHPRVNILQPGCGVGGHCIAVDPYFIVSEYPMESQIIGKAREINNYKAFWCAEKIQNEKLKFELEHGRKPNIALMGLAFKPNIDDLRESPAKYIVQKVLQNANNDNYFIVEPNVEGHNVFKLTDCNEAVEKADIIVLLVAHDEFKELSLKNKIILDFCGIEKL >CP034562|3827417:3837976|3834617_3835649_-|AZQ63579.1|DBSCAN-SWA MGQNNKDQSLDNKNSNQNDEIDLIDLFSIIGNKVSQLFKGIWSMVLAVLVYSYTKIYQFKIIIIIGVLVGGMLGYLSKNTSQYYASKATVKSQFLTGVDFSTELNELNALCTDEGRPMLAKALNLPLATVENISEIVAEGYFVKYRNNLEQDSLYYRALEDETRFQINIKTSVQSITKTEIQEGFDYFFSNNEYIKKRMTIHKENLNRNIETTQKEIEVLNEFSDAYKQIIIQQSKIQSTTKSNSNVLLFKSSEEEGLVKQSGDLALQAMGELALKNEELKDLSTQLILVEPVQFVNRFSELYTVSLSTGGKTLIGMFIGFMIVIGVLLLLDINTFMKKAAKL >CP034562|3827417:3837976|3835721_3836699_-|AZQ63580.1|DBSCAN-SWA MLTRKKILITGAAGFIGSNLAEKFLAQDNEVVCLDNFSTGKKENIIDFEKHPKCKFITGDIRNLEDCKAAIDGVEIVFHQAALGSVPRSINDPITTNEVNISGFLNMLTASKDAEVKRFIYAASSSTYGDHPGLPKEEDKIGKPLSPYAVTKYVNELYADVFSKTYGIETIGLRYFNVFGRRQDPHGAYAAVIPKFVIAMLNGESPVINGDGENSRDFTYIDNVLHANEQAAITINQKAVNEVYNVAFGERTDLKELYSYLQEFLLIYESKVKDIELTFGPSRQGDVKHSLASIEKAKSLIEYNPQYSIQKGLKDVVEWYYNYLR >CP034562|3827417:3837976|3836710_3837976_-|AZQ63581.1|DBSCAN-SWA MNKTIGVIGLGYVGLPLAVEFAKNNVKVIGFDINQTRIEELNTSKDHTLEVAEEELKAVKGIISYSSNINDLKDVDIYIVTVPTPIDEYKTPDLTPLKKASETVGSVLSEGNIVVYESTVYPGCTEEQCVPVLEKISGLEFNKDFFAGYSPERINPGDHVHRVHNIMKVTSGSTPEIAEEIDKMYQVVVKVGTHKASCIKVAEAAKVIENSQRDLNIAFVNELSKIFDKVGIDTLEVLEAAGTKWNFLPFRPGLVGGHCIGVDPYYLTYKSESLGYHPEVILAGRRINDGMGAHVANKVLRLMMEKTSSIKKGAKVLMLGITFKEDCPDIRNSRAIDVIRELQAFNLEVEVYDPHADAQEVKDEYDLDLLPKIGNDYAAIIHAVAHKSFREEINWEQLIEKDTIVYDVKSVLDKKYITDRL >CP034562|3827417:3837976|3828635_3829754_-|AZQ63573.1|DBSCAN-SWA MKKILIVFGTRPEAIKMAPLVKEFQKDKTNFETKVCVTAQHREMLDQVLEFYDIKPDFDLDLMKPNQNLYSLTADIIVGMKPVLENFSPDYVFVHGDTSTTMSAGIAGFYSGAKVCHIEAGLRTYNKRAPFPEEINRQITGRIADYHFAPTTTSKNNLLKENTAESTILVTGNTVIDALMYSVEKVLNLENNLEIENLKTIVDSNKDLVLVTGHRRENHGQGFLNICEALKTIAETTNAQIIYPVHLNPNVQKPVYEILADVENVHLIDPLSYPAFVWLMNQSKIIITDSGGVQEEAPSLGKPVLVMRDTTERPEAVEVGTVLLVGTNAELIVNETTSLLTNNNRYKKMSSLHNPYGDGKASKRVVEFILKN >CP034562|3827417:3837976|3832216_3833077_-|AZQ63576.1|DBSCAN-SWA MQKEILVTGARGQLGSELNYLANTIEARFKFVDLDELDITNQDDVNSFFTQRNFSHCINCAGYTAVDKAESDEETARKVNVLGTKNLAIACKENNVTLFHISTDFVFDGNQITPYSEEIIPSPISVYGVTKLEGENEVIKTMTNYFIIRTAWLYSSFGNNFVQTMLRLANERDELGVIVDQIGSPTYARDLAKAILSIITQESTAYGVYHYSNEGVASWYDFAQSIFLLSKTNIKVNPLPTSAYPTPAKRPKMSVMDKSKFRTSFNITIPYWQSSLIDCLKVLGDK >CP034562|3827417:3837976|3829753_3831151_-|AZQ63574.1|DBSCAN-SWA MGKDIKNICCIGAGYVGGPTMAVIALKNPQIQVNIVDINEQRITDWNDTDLDKLPIYEPGLKEVVEETRNKNLFFSTDVDTAIDNADMIFISVNTPTKTYGKGKGQAADLKYIELCARQIARVSKTDKIVVEKSTLPVRTAEALQGILSSTGNGVKFEILSNPEFLAEGTAIDDLLIPDRVLIGGNNTVSGKEAKNALSSIYEAWIPKERVLQTNVWSSELSKLTANAFLAQRISSINAMSVLCEETEADVDEIARAIGMDSRIGPKFLKSSVGFGGSCFQKDVLNLVYIAKSYGLDEVAEYWDQVIKLNDYQKRRFADKIIKESYNTVSGKKIAFFGWAFKKDTNDTRESAAIYVADHLLDEQADIIVYDPKVSEERIYADLEYLNTHSSEEIRNRVKVVSSHSEAVNNAHAIAILTEWDEFKAYNWKEIYSKVLKPANVFDGRNILDKEKLVNVGFNVYNIGK >CP034562|3827417:3837976|3833682_3834543_-|AZQ63578.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLHPLTLAISKQLMPVYNKPMIYYPLSTLMLAGIQEILIISTPEHLPLFQELLGDGKKLGCTFSYAVQEKPEGLAQAFLIGEDFIGDDKVSLILGDNIFYGSGLSSLLQSNNDIEGGCVYAYHVNDPERYGVVEFDGNNRAVSIEEKPSKPKSNYAVPGLYFYDNKVIKIAKNIQPSERGELEITSINEEYLKRGKLNVSILNRGTAWLDTGTFASLMQAGEYVRVIEERQGLSVGCIEEVAYRMGYIDKNQLKILAKPLVKSGYGQYILNLLK |
10 | Escherichia_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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