Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026503 | Lactobacillus crispatus strain AB70 chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas2,cas3,c2c9_V-U4,cas14j,RT,DinG,csn2,cas1,cas9,DEDDh,csa3 | 1 | 10 | 19 | 1 |
CP026504 | Lactobacillus crispatus strain AB70 plasmid pLcAB70, complete sequence | 0 crisprs | c2c9_V-U4 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP026503_1 | 272530-272630 | TypeV |
NA
Consensus repeat of CP026503_1
|
1 spacers
spacers of CP026503_1
>1.1|272559|43|CP026503|CRISPRCasFinder ATGCAAACTAATGGTATTAATGGTACTGATACTGACGGAAATG |
cas14j |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026503_1
The CRISPR arrays of CP026503_1 >merge|CP026503|1|272530-272630|CRISPRCasFinder CAGCAGCGAAATTAGCAACTATGAATTTAATGCAAACTAATGGTATTAATGGTACTGATACTGACGGAAATGCAGCAGCTAAATTAGCAACTATGAATTTA >CP026503|1|1|272530-272630|CRISPRCasFinder CAGCAGCGAAATTAGCAACTATGAATTTA ATGCAAACTAATGGTATTAATGGTACTGATACTGACGGAAATG CAGCAGCTAAATTAGCAACTATGAATTTA
>CP026503.1|AZR14762.1|270750_270942_+|hypothetical-protein MKPLKDELIQSRLDEDELADFDKVKKLLDVKSNSVAIRQMIKDEMRKPEMNGSKVILTLYQRY >CP026503.1|AZR14761.1|269996_270527_-|transposase MAKKRTVNGRIKGAQSKKYLKTRIKLQASYQRAQNIQTDLIHKFTTELVNNYDQIAIEDLGVKGMLMSHVASKGMHRSMFGLFRKLLTYKCEWYGKELIIANKLYPSTQRCAACGLVKKGDEKITLQGNKKHGTKHNEFVCYNPSCPNYNKKVDRDENAMANLTLLVKHPELNRAL >CP026503.1|AZR14760.1|268240_269500_+|site-specific-integrase MVAVVSNTKTKYSGVYRDAKGKYFYNIFLGRDLNGKQKFKKGRRDALGHPFSSARAAHKEAERVKQLYKNIDLNDISYAKFMKDRFLPKYKGDVEESTYNTHGRMFAKAIDFLGDTNLKKITVADCERYRTWLLTDAGYSQSYASIIYTAFRQSLDYAVEISLLTNNPSLKTKSIPKGKAVEKYWTKEEFEKVINCISTNSFYENAIYITFLFFYRMGCRVSEGFALKWTDIDLENGRVRIFHNMRYRSKFDYEIKPYTKTDSGKRTLTIDDELLELLKAWKARQAENGVHEFVLSFDDCPLNKSTLSRWLERYAKIAGVPRINGRGLRHSNASYLIAELGADVLTVAHRLGHKSPMVTLKYYAHMFPDNDVTIASRMEGSMKLTPAKASKISFNGNQNISGDKIKSLPIVCQNKKKAM >CP026503.1|AZR14759.1|268049_268229_+|DUF3173-domain-containing-protein MRTVTYKDLMKLGFKENQAHDIIRRTKQYLVQKGYGYYNGRRIGVVPAWAVHEIVAIDL >CP026503.1|AZR14758.1|267461_267971_+|hypothetical-protein MVRVTILAVLEPQASGSWHLHCLIKKKDGKFPFIDNNETLEPMWRQGFTNIKKLKDSDNIAAYLMAYLTNVPKDEIIPGTKDKAIIKGARLHFYPSGVHIYRTSRGIRIPKKLEGSKQAILKEYGLSVNEVADAAFFHEHHFSDDRTAKFVTEFYDNVGNKKEASHGNE >CP026503.1|AZR14757.1|267085_267511_+|hypothetical-protein MKTQNNKKRINKHTKVNAYKYGNVLEMTNSVASHDATILPLSGNEYVDLSTGEIKQFKNRNKLRVQSPVNLKKTFRKLRRIILDNFSGGDLWVTLTYKQDNGKPMTDTARVYKDFKAFWRRFIAAYGSSDYLSSSRTAGKW >CP026503.1|AZR14756.1|266124_266970_+|cell-division-protein-FtsK MNTSLYKVALSKSFSWDAAKQINALVGGTRGSGKSFFALGALVQLASFPRFDESKLLGIGTLPTPIFTIDFKNSDIARLGELLPKKRVAVNKKEAIAVLTHFDQLMHRRLKVIRDYSFGATASKLKMPLYYLIIDEWSATNAAFMSGMTKADKDLRYRWQALIQDISMLGRAAGFGLIVISQQISVTNSGISSAVQEEAGLKLHFGDAEMSSYRLTFGNEVQIPDVQLNVGEAFAWIEGVTSSGYVIPFAAPYVDAANIWNILTQALASQDDDYYLDYRLR >CP026503.1|AZR14755.1|265853_266123_+|hypothetical-protein MEMGIVIQDPNRLDSVYVPKVEQISDGRLKVEAIGDLRKRLVSESFIWGLESYLNGSGFDIFVQSANYRLDGCVYFTLVRGTRSDRMSF >CP026503.1|AZR14754.1|265174_265546_+|hypothetical-protein MAGLKGLRGFQKFDISGFLSGKQLLLMGMEDLKDRESGKVVGAKIKTVIWTDDTAYSKEGINNEGSELDVKIEGLNAETVDRNNRGFVKLRNPRGTVYGDFQNQLSVKADGFDYVDEKKNGEK >CP026503.1|AZR14753.1|262280_264944_+|restriction-endonuclease-subunit-R MAKTQKGSARNKPFPTLEKARNSINSLFFDNDKHDFAYLKDNLKHKLRRYQESALLYLYWSQIQDNADEQYNQLLFNMATGSGKTDVMAAAILYLYHEQGFKNFIFISNTTAVVDKTQENFFNSSSSKYLYSSPIIIDGERISFNYVNSTFPVNPEENTIYIKLTTIQTLSNELNDPGENGLTYDDLAKFKIAILADEAHHFNVDTKKSNKKAKEENSWESVLDHIRGLNSANRQLEFTATIDVDKPEVYEKYKNKVIYKYDLDQFMNEGYSKKVFRLQANTDNNQKLLNAVLLNEYRKRIAKKLGIPNFKPVMLVKSNRIKTSQQVEQDFLEMINNLSSADLESFILRNQKLNAKSRALSKAYEYWLSQDLSQAVAEIQQDFNLRTTINVNEGGTKGILSDSNDFKNLNSLEDENNPFRIIFAVAKLTEGWDVLNLYDIVRISEAKESITMNTTNAEAQLIGRGARYYPFVYQGRKSYTRRFDTGRDATFENQLLETLYYHTINDSKYIDNLNKSFDKMDLIVNKDGEYDTYTATVKPSFMRTNFYKQGNLYYNKTEKVPDANYASIGDYGINNLTIDVDYNQSTTESNLHDKYYDNVVRESDVRYDVVADFSNPSDYRLIERALARNKFYRFSTMKKYLPMVKSIREFITSDDWLGNLKVQAKVPNEYNQILSPFEKLHILDNALKIIQKNIVKNYQKERGTNQFIPIAVKDVVKYYQKVIPKLSNKTISEVIKPKPMSKANWFPYDWAIADQLETSLINRIESWLDELKQTHKNIYLIRNEETISTWSLHEFENNEVKHYEGYMPDFILVLDDGDIMYQVYMEPKGDQLLERDEWKQELLESIRPENIEIIGETKDVRLYGVKFYTTGDGRGIYDELKKKEIFH >CP026503.1|AZR14763.1|275545_275725_+|hypothetical-protein MEDQPIIPLAPNQIKKAKEENNLLFKYSTPDIELHFYKDMNQDLIMKILDKVVKDDKSE >CP026503.1|AZR14764.1|275708_276056_+|IS66-family-insertion-sequence-hypothetical-protein MINLSDLGQVYIVCGKTDMRKGIASLGYIIKSRFELDPFSGEVFLFCGGKKDRFKALYWDGQGFWLLYKRFESGKLSWPDNEDEVQKLSAEQVDWLMKGFSIAPKIKDAKPREFY >CP026503.1|AZR14765.1|276111_276342_+|hypothetical-protein MAEINYPELVAQLTETNRELTKQVALLTEQVQYLTNKIYARSSEKTNFQPGQTNLFDDEDLGQDDDGDSPYSRNRG >CP026503.1|AZR14766.1|276301_277549_+|transposase MMMETLPIPVTEVKSYHRKKHNETKQEIIDNLPGKRVDHVLEDKNCPDCHHEMHDIGSSVKKEVIFKPAVLERLDHYQHAYRCNYCSDHNYSDKIIKAPMPKTPLDSALGSASLIAHTIHDKFKLKLPAYRQESELKRLGLPISRQTMTNWHIKVCDYYLGKIYDLLHQELLEEKVIHADETPYQVLESETAKTYYWTFLSGRYSDKKITTYHHGSRKGIEAVNFLQDFDGFVHCDQYGGYFQLKDVTLVGCWAHARRKFYEAQPQEYDDTSISQKALAYINQIFHLDSQWAELTSEERYENRKKQLKPLIEKFINWCHKKQRNVLRNSKLGKAFSYFLSHEDKFRNVLRNGDLVLTNNMAERSIKELVMGRNNWIFSQSFKGAQSVAIILSIIKTGERNDLDPLKYIQYTHGAS >CP026503.1|AZR14767.1|277628_278486_+|IS982-family-transposase MNCLKLKRFSHHLQVSFKDLVIICRHWYRLYAPAEFTHRRNIDQIKTTDSLILALLIWQAKTGIESQRRFCECFNCLSHSRFNRRSRQLLQLIYQIRQEMNKKVDLNGHFLIIDSFPVPVCQPIRNYRAKIFRGYANIGYKATKKIYFYGFKVHAIVSDDGSILDYVVTKASVHDAKETVELLENAHPSNYYLLGDEGYLGKELHQQLKQMGYELWTPYRKNMTGAKKHNDHQLMAIRRTIESDFSLLTYYNAENNRARSLIGFQSRLEIAILAYNLAYCLERFN >CP026503.1|AZR14768.1|278849_279365_-|hypothetical-protein MKSANYTRKHHMYLMNHKNGDVIEVRMDKKNKTFKKIRLYRQDGLGNYYLDPHAEFKDQKSPATKENIVEAGKKVSDHISSAENWHHKVRPIFNAEHKIVDFEPRLHLEHHTKIQNAKRYLRHLERRHADFIFRKNSKTPLLIPWNYIKDMIYEDRNKEMVLAHKVHKLRK >CP026503.1|AZR14769.1|279626_280805_-|IS256-family-transposase MNDFTKDFAQALFNPDKINDLLRKELQQAVNNLLEAELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGPIEVQVPRDRNGQFHQHTLPDYKQHSDILESMIIKLYSNGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYLPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTEMLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKTALARTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDREKIMNEFKQVHQQTNKEEATAVLHDFYTKWGKVYSHVIRSLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDAFIGIQAMSYNDRYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD >CP026503.1|AZR14770.1|280775_280967_+|hypothetical-protein MSKIFGKIIHEGVLLSVCVFFVQTNHTRKELLFLMFKEINLRNHSSLHKLFYSLLLEYAVLHI >CP026503.1|AZR14771.1|281057_282407_-|transposase MNSIEQIDTENDTKSLISSFINLIGLAKLTKQVNFKRKSTVSLTMIISWLMSVHFARLSLFRAKDDKRFSVRTARNVLNDGRINWQKLLCLIAARLIGCLKPFIDKRRRLAFIVDDTLMARSFSKKTELLAKVYDHDKHEYLNGYRGLTLGWSDGNTFLPVNFALMSTKTKKNMIGAAPITADERSISGKRRNQAQRKMNDVTVELIRQALRLGVEAKYVLFDSWFSSPRMFWILKKIGLDGLGMIKKSSKIYYIYRHRRYSVKDLYDRFAASNIRKKKHYLYSSIVEAQYHGHSFLLKLVFVSNRGNKNKHLVLATTQTKLSPEEIIQLYGRRWQIETYFKTSKQYLALDKSQVQSYDGQCGYIAVTAITYDLLTWQERQNTDDKTIGDLFYLMNESLPDIRFVDALVYLISELKELKQNSFEKIDEVINDFINQLPRFIQIALKQII >CP026503.1|AZR14772.1|282543_283653_+|chloride-channel-protein MINFVWHVLFDKLPVPSQALPFFICIPFGFIIGILIKRLGSYPLTIEEVLMSVKQEGKINYHNWWKSLTLGLISLAAGGSIGPEASTTVLGSGMVNWLGDRLRLIAYSSDWKWNHFWDTIVSKKQLKKLPKFSSLFKSKLHQKVFCLIMVMIGVVGAAIVFKLFPEEGLFGIHHRHILWQWHYSMYVIIPLIVGWSFGMFFLWSEKWSDYFAKKITISPIIKATIWGIVLALLTLITSYALYSGEFQIVPFVHQALQISPLFLLVIAVIKTLSTNIGFSLGWRGGKIFPSIFASVAVGAAIAQFLPIMPVMCVAITVSASIAVILGKPLLTAILLILLLPIELAPVILVSAYLAACLTKVSYSFRQKNN |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP026503_3 | 1238673-1239159 | TypeII |
NA
Consensus repeat of CP026503_3
|
7 spacers
spacers of CP026503_3
>3.1|1238709|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT AGAAAACAGGTATTCCAGGCGCGATAGTGG >3.2|1238775|85|CP026503|CRISPRCasFinder TACCTCACACCTCTATTATTTATTTCTTTAGATCTAAACCTCATTGATCTAAAACCGTACGTTGGTACCGCCGCAAAAGCTAATA >3.3|1238896|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT GTCTTACGCATGTAAACGCCGTTTTCACGG >3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT CCGCGTTAATGTTGATTTTTCTAAATTCGA >3.5|1239028|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT GTTCCTAGCAGGGACAAGATTCAAGTGCTT >3.6|1239094|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT ACGTAAGCACCTTTTGAATTGGAGACTACT >3.7|1238775|19|CP026503|CRT TACCTCACACCTCTATTAT >3.8|1238830|30|CP026503|CRT CGTACGTTGGTACCGCCGCAAAAGCTAATA >3.9|1238775|30|CP026503|PILER-CR TACCTCACACCTCTATTATTTATTTCTTTA >3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR AACCGTACGTTGGTACCGCCGCAAAAGCTAATA >3.11|1238910|30|CP026503|PILER-CR GTCTTACGCATGTAAACGCCGTTTTCACGG >3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR CCGCGTTAATGTTGATTTTTCTAAATTCGA >3.13|1239042|30|CP026503|PILER-CR GTTCCTAGCAGGGACAAGATTCAAGTGCTT >3.14|1239108|30|CP026503|PILER-CR ACGTAAGCACCTTTTGAATTGGAGACTACT |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026503_3
The CRISPR arrays of CP026503_3 >merge|CP026503|3|1238673-1239159|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTTCTGACTCCCATGATCTAACAATCATCTAAAACAGAAAACAGGTATTCCAGGCGCGATAGTGGGATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAACTACCTCACACCTCTATTATTTATTTCTTTAGATCTAAACCTCATTGATCTAAAACCGTACGTTGGTACCGCCGCAAAAGCTAATAGATCTAAACCTCATTGATCTAACAACCATCTAAAACGTCTTACGCATGTAAACGCCGTTTTCACGGGATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAACCCGCGTTAATGTTGATTTTTCTAAATTCGAGATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAACGTTCCTAGCAGGGACAAGATTCAAGTGCTTGATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAACACGTAAGCACCTTTTGAATTGGAGACTACTGATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC >CP026503|3|3|1238673-1239159|CRISPRCasFinder TGTTCTGACTCCCATGATCTAACAATCATCTAAAAC AGAAAACAGGTATTCCAGGCGCGATAGTGG GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC TACCTCACACCTCTATTATTTATTTCTTTAGATCTAAACCTCATTGATCTAAAACCGTACGTTGGTACCGCCGCAAAAGCTAATA GATCTAAACCTCATTGATCTAACAACCATCTAAAAC GTCTTACGCATGTAAACGCCGTTTTCACGG GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC CCGCGTTAATGTTGATTTTTCTAAATTCGA GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC GTTCCTAGCAGGGACAAGATTCAAGTGCTT GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC ACGTAAGCACCTTTTGAATTGGAGACTACT GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC >CP026503|3|1|1238673-1239159|CRT TGTTCTGACTCCCATGATCTAACAATCATCTAAAAC AGAAAACAGGTATTCCAGGCGCGATAGTGG GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC TACCTCACACCTCTATTAT TTATTTCTTTAGATCTAAACCTCATTGATCTAAAAC CGTACGTTGGTACCGCCGCAAAAGCTAATA GATCTAAACCTCATTGATCTAACAACCATCTAAAAC GTCTTACGCATGTAAACGCCGTTTTCACGG GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC CCGCGTTAATGTTGATTTTTCTAAATTCGA GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC GTTCCTAGCAGGGACAAGATTCAAGTGCTT GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC ACGTAAGCACCTTTTGAATTGGAGACTACT GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC >CP026503|3|1|1238739-1239159|PILER-CR GATCTAAACCTCATTGATCTAACAATCATCTAAAAC TACCTCACACCTCTATTATTTATTTCTTTA GATCTAAACCTCATTGATCTAAAACCGTACGTTGGT ACCGCCGCAAAAGCTAATAGATCTAAACCTCAT TGATCTAACAACCATCTAAAACGTCTTACGCATGTA AACGCCGTTTTCACGGGATCTAAACCTCAT TGATCTAACAATCATCTAAAACCCGCGTTAATGTTG ATTTTTCTAAATTCGAGATCTAAACCTCAT TGATCTAACAATCATCTAAAACGTTCCTAGCAGGGA CAAGATTCAAGTGCTTGATCTAAACCTCAT TGATCTAACAATCATCTAAAACACGTAAGCACCTTT TGAATTGGAGACTACTGATCTAAACCTCAT TGATCTAACAATCATCTAAAAC
>CP026503.1|AZR15601.1|1237736_1238573_+|kinase/pyrophosphorylase MVETKDQNELNIIIISDAAGDTAFSNATAAAAEFPNCNINYRRYPFITNQKKLDEVLTEIEKYPNLVIIYSLVKDEMQMPVIKFAREHNVECVDIFSPVVEAIQQTTHMTPDQKIGAQHSLNQKYFDRISAMEFAVMYDDGKDPKGFLEADVVLLGVSRTSKTPLSLFLANKNLKVANLPLVPETHIPKEIYEIDPKKIIGLTNDPSVLNEIRRQRMIAYGLNPDTTYSNMDSINKELESAQALYKKLGCYVINVAHRSIEETAALILEHLGIDDYAK >CP026503.1|AZR15600.1|1237332_1237509_-|30S-ribosomal-protein-S21 MAKTIVHENESIDDALRRFKRSVSRSGTLQEYRKREFYEKPSVRRKLKSEAARKRRHY >CP026503.1|AZR15599.1|1236728_1237172_-|GatB/YqeY-domain-containing-protein MSLSDQIMADMKSAMKNHDKTTLNTVRMIKSALMNEKIKAGHDLTPDEELTVLNREKKQREESIDEFIKANRDDLAEETKKELAVVEKYMPKQMNQDELRAAVKETIDEVGAKGKSDFGKVMKALMPKIKGRADGKAASQSVRDQLN >CP026503.1|AZR15598.1|1235743_1236703_-|PhoH-family-protein MAQTTFTPQRPENIQKLVGVNDGNLKLLSEGYDLSVSDVGNEIVIAGDDEEKIKKVVAVLKALDSVVNTGVNIGAPDTVSAMKMADKGTTEYFADLYKKVLIRDAKGRPIRVKNMGQKRYVEAIDKSDVVFGIGPAGTGKTFLAVVCAIAAFKKGEVSRIILTRPAVEAGESLGFLPGDLKEKVDPYLRPIYDSLYAILGTNTTDRLMERGVIEVAPLAYMRGRTLDDAFVILDEAQNTTDAQMKMFLTRLGFNSKMVVNGDMTQVDLPGRQHSGLIDARHILKNIDQIKFINFSANDVVRHPVVAKIITAYEKEDIKH >CP026503.1|AZR15597.1|1235216_1235741_-|rRNA-maturation-RNase-YbeY MDPIDITYNDEVGFLDDEKRNWQDWIMKLLLLAKKEIGKDNNLEMSINFVDEDRSHEINLKYRDKDRPTDVISFAIEDGEDSIDLAAFADDPDFQEDIGDLFMCPSVIKRHSKEYGTGFDREFGYTIVHGFLHLNGYDHIKPDEAKEMFGIQGKVLEDYGLPLYPDQLDEGRGK >CP026503.1|AZR15596.1|1234314_1235217_-|GTPase-Era MEEKEFKSGFVALVGRPNVGKSTLMNYLVGQKVAITSNKPQTTRNRISGIYTSDEMQVVFVDTPGIFKPHSKLDDYMDKASVSSLNDVDLVLFMVEPEEMGKGDQYIANLLKEVKVPVLLVINKVDEIHPNKLLPIMDSYHKLEGFKEILPISATQGIGIEDLLKTIKEYLPVGPQYYGADQITDRPEYFVVAELIREQILRLTSQEVPHATAVAVDHMNTHQNGKLLIEATIYVEKDGQKGIIIGKGGKMLKQIGINSRQEIERLLGEKVNLRLWVKVQHNWRSDPNFLKRIGYDKKEL >CP026503.1|AZR15595.1|1233189_1233945_-|DNA-repair-protein-RecO MARELKEVQGIIFKRQKYKEADLLAKIMTKQDGIMTLIVKGALRPKSRLSAATLNFSIGTYVIYTSEKGLSNLRTYKGARQFDGLYNDLTKNAYISFIFDLIDHAFVEYQPIGKYYDLALFALKKIDSGVDAEMITQIVQMKILAAYGVEPQLKHCVICGKEKGVFDYSIKMGGVICSDHFSTVTSRMHLKPKETAVIRTIGLLPIERLGDIKINEETKRATRKAIDRIYHETIGLNLKTKKFLDELKLFS >CP026503.1|AZR15594.1|1232012_1232930_-|glycine--tRNA-ligase-subunit-alpha MADKKLNIQNMIFKLEQFWSSKGCMIMPSYDVEKGAGTMSPYTFLRAVGPEPWAACYVEPSRRPADGRYGENPNRLFQHHQFQVVIKPAPKDIQQYYLDSLKVLGIDPLEHDIRFVEDNWANPSMGCAGVGWEVWLDGMEVSQFTYFQVVGELDVKPTMSEITYGVERLASYIQDVNSVFDLEWGNGILYRDIFKQPEYEHSKYAFEESNQEQLLQFFDIYEATAKRLLDKNLVHPAYDYILKCSHTFNLLDARGAVSVTERAGYLSRIRNLAHEVAVKFVEEREKRGFPLLKSAEDKKAGVENG >CP026503.1|AZR15593.1|1229956_1232020_-|glycine--tRNA-ligase-subunit-beta MAKDYLFEIGTEEMPAHVVPRSVKQLADRTRKFLKENGLKFKDIKTFSTPRRLTILVEDLAEKQDDIDEVKKGPAKKIAQDQDGNWTKAAQGFARGQGMTTDDIYFEELKGTEYAYVHVQKEGKKASDILLGMSDIIKAMTFPTKMRWDSNDFEFVRPIHWLVSLFGSDVIPVKILDITAGRKTQGHRFLGDSVVLANADDYEDALKDQFVIADADERKDMIVRQMNELVKKNNWQVKPDRDLLEEVTYLVEYPTVFAGSFDEKYLKIPDEVLITSMKDNQRYFEVYDETGKLINHFIAVRNGNKDYLDNVISGNEKVLVARLDDAQFFYDEDRKYPLSHFVDRLKNVSFHDKIGSMAEKMQRVRMIGDYLAKRWDLPENVVKDFDRASELYKFDLVTQMVGEFAELQGVMGMHYARLAGEDEEVSVAIKEHYMPATAEGPLPETTVGSLLSIADKIDTIVTFFGAGMIPTSSNDPYALRRYAYGIVRILLNEKWSLPFNEVLPEIISMLNGVTPAKLPKSDADQEIADFIRDRVKQYLQKNDFKYDIIDAVLASSQQDPSQILAAATVLQLHHDDEEFKPVVESLTRIDNILKKAKFKSNTAVDESLFDDNSEKELYAGVQNLQDIESLADLYQGFVQLQPVIDQYFETNMIMAKDEKVKNNRLAQLYAVNELADRLGDLSKLVIK >CP026503.1|AZR15592.1|1228106_1229927_-|DNA-primase MAGRIPEDFISEVRSNVNIVDVISQYVSLEKKGKDYIGLCPFHQEKTPSFTVNADKQFFKCFGCGKGGNVFKFLMYKDDLTFPESVERVAEFAHIAMPNGYGHNSGTKLNPLMQMHQDAVDFYHRVLLTTKAGERGMQYAQKRELDQEILDHFKIGYAPKADNVLITYLRSKGYQDDDLAQSGLFVQARDGQLYDRFRDRLMFPLDNENGRTIGFSGRRISDDKTEAKYMNSPETGIFTKSKVLFHFAEAKKAARGEGHLVLYEGYMDVIAAYKAGVKSGIASMGTSLTDDQIYLLRRITPNIIINYDGDDPGVHAEERAARMFNKDGNFNLGIVVLPEKLDPDEYVKKYGAEKYLEEVKGALTPTDFFLKRLEQKYNLDNDREKIAYLGEAVKEIAQVRNPVEQDMYTEKLAKSSGVSIASLKANLAKERRRNNRARNHVRNSQRNSPDYPIDVPLPGDEDVPTEQSVVEKNPSQTRLLYLFIHSTDAQKYMLEGQFHFPNQDFETLAQDWLKYAETHENPQIDGFLDFIPEQLQGIIVDAEMAQMPKDSTIQEVDALVLALKRRNIYSRLNELQAQLQDAKRKNDAQGIIAITQEIIGLKRILG >CP026503.1|AZR15602.1|1239191_1239440_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MLTPYAIIETVLKIHQEYNLDSIPVFCNVAHYLDETQLKELSKIVRQLKLKIILIEFTDKKYGVAVKDAQVAYIDRDLVDWY >CP026503.1|AZR15603.1|1239502_1240681_-|IS256-family-transposase MNDFTKNIAQALFNPDKINDLLRKELQQAVNNLLEAELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGPIEVQVPRDRNGQFHQHTLPDYKQHSDVLESTIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMLPKVEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYLPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTEMLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKAALTRTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDREKIMNEFKQVHQQTNKEEATAVLHDFYTKWGKVYSHVIRSLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDAFIGIQAMSYNDRYFNRIHKCFGQVQDTLESYFD >CP026503.1|AZR15604.1|1240802_1241237_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MIVSYLSHKKICLKDGINVICTQSPIAYKDLVLGFQALNDLIVCSDDEYNNKSISKSFDFVGAPLLNDNIMAKYMNVIIKNFISNLDEVNRNRILKSFYSLETVLNDSLLLEDLPLEIDFSEDIKKLLKMVNIHLDAQLMLTRL >CP026503.1|AZR15605.1|1241233_1241539_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPTDTAAERKEYRQFRKALINEGFLMIQFSVYERVCVTRQTANFLEKRIRKFMPSKGVVQSLMVTEKQYSDMHFLVGDAVKDIRNTSDRTVIL >CP026503.1|AZR16676.1|1241516_1242425_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRNVIITQHAKLTYSMNMLIVQTKDGINQIPIEDINLVLISTSQAVITSALISKLAKNQCKVIFVDDKYQPVTETVNYYPGARDIKKLKMQFEWNERRKENLWTKIVAAKLKNQISVLKNYRIDETEVEQELYKLEVNDLSNREAAAARKYFMKLFGKDFIRRNSGVINAALDYGYSILLSSFDREIAMNGYLTYLGIHHHSVENQFNLACDLMEPFRSIVDYWVKAHENITSFTPDIKYGLVELLSLQIKFNGRNTILTNAISVYVRSCLRYLSGETDDIRIEMSLCNEVPNDAINDNV >CP026503.1|AZR15606.1|1242628_1243672_-|hypothetical-protein MVNLKSLVLILKKENEILKKTKNFDFVAKLLGSKAPNEIRSQQGKVLFEKNKIRLQFNKAYNYKYMLVSRDTTTKNQEMFGMTIYPRAERDIAKSRKLIEKRKGFSTDIYGGYTGTAAAYMAIVRINKTKSSQYKVIAVPMTKRAILNKAEKEGNYEKILKQILSPSILYNDKGKRKAGVISFDIIKGKVPYNQVVQDGNKKFLLKSAIYLCNAKQLVLSEEAMRVITGHWLDSDKQDQELLDVYDEILEKIDRYLPLFDIRDFRNKLHKGREKFLKLNAEDKFKAIIQILKGLHDNSDTGELKDIGITVPFGQLQNNSGITLSSDTILVYQSPTGLFEKRVKISSL >CP026503.1|AZR15607.1|1243625_1244246_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MQLGRDAYTGKPINIDEVSQYYDIDHILPQSFIKDDSLNNRVLVAKPINNGKSDGVPLKLFGDNLATGLGITVKQMWNNWADKGLINKAKQNNLFLDPENINKHQASGFIRKQLVETSQIIKLATTILQAEYPKTKIIVVKASSNHYLRNEFDLYKSREVNDYHHAIDAYLTTICGNLLYQAYPKLRPFFVYGQFKKFSSDPKKRK >CP026503.1|AZR15608.1|1244389_1246081_+|IS5/IS1182-family-transposase MYKNYITGQTALTLNLDFAIPANHLANVISWFVDSIPEDVLVGKTAKTGRPAYHPAMMLKILLFAYSRRVFSGRKIELMLEENLPMMILADQQKISYHTINNFRSSSHANELIKKSFIYFTNLLEDEGLINEGAAFIDGTKIEADANRYTFVWRKAVEKYHEKLKGQAVELYDELITKEVVKEMEKEKVQTSQGLKELAQETEAEINKLTKEIEQENKAIPGGSPRKAKRRGLKKILHRLRKDYVPRMQKYEEAEEIFAGRNSYSKTDHDATFMHMKEDHMKNGQLKPGYNIQAVTTDQYVVDYAIFPNPTDFKTLEPVLDQMTVLDKFDKIVADAGYGSEYNYSMLEEKYPDKKYFIPYTMYEKEQTRKYKNDPTKLINWYYNEKDDYYIDHHGVRFNFKYYSQRKDRSTGQVRDFKVYEADEFQLTPELEQLAKTASGRQRQVRYNPNWQYLKEKAKEVLQSEEGRHIYGMRKYDVEPVFGHLKNVFGMRRTHLRGKEKVETDIGIAFMMMNLNKYCQRRWLKGRFLLLKILKRTKKRSRFLKKEILIVFIHLEASFFPDT >CP026503.1|AZR15609.1|1246018_1248592_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTKLNNEYMVGLDIGTNSCGWVATDFDNNILKMHGKRALGSHLFDEGVSAADRRAFRTTRRRIKRRKWRLKLLEEIFDEEMAKVDPNFFARLKESGLSPLDTRKNVSSIVFPTKKMDKQFYKKFPTIYHLRNALMKQDKKFDLRAIYIAIHHIVKYRGNFLSNSSISNFSASKIEIDRFVNELNDLYSIFLPESGVIFDAGNASKVEDIIRNEQMFKLDKIKEIADVLPDTENKSGLKLSKKISKEISKAILGYKAKFEIILQVNVDKTDSSIWNFKLNDENADVNLSEITSDLTDTQLQILDLVRNLFSAISLLNIVDEGSTLSESMIRKYNDHAQDLKLLKTVIKNHSDRKKAHNLQLAYDKYVNNRHFVDVETKKAFPNKHLYRKSDFYEIVKKNLDASKEAVQIRKEIALDKFMPKQRSDENGVIPFQLNQIELDKIIENQGKYYPFLKEINPIKAHRMQAPYKLDELIRFRVPYYVGPMIEPTNSSYPQTRQNQSFAWMVRKAKGRITPWNFDEKVDRQKSANNFIKRLTTKDTYLFGEDVLPANSLLYQKYTVLDELNKISVNGKKLSVSVKQELYEDLFKKNNTVSAKQLKNWLIENQKLPYIKIKGLADQTKFNSSLSTYIKLKKSGLFVDKLDSNEFRDDFEKIIEWSTIFEDKQIYIQKLQTIDWLTAKQIQFLQNIRLQGWGRLSKKLLTAIVDSNGQNIIEQLWNSQQIFMSIVNKADIKGTITDANQDLMHSNSMEDILSEAYTSPANKKMIRQVVKVVHDIQKAASGQAPKQIAIEFARESRRNSKLSQTRGHKLQDIYQKISGDIVNKNLKDKLAEYIKNNQLSVWEKTSFQMNKNDQDFLF >CP026503.1|AZR15610.1|1248750_1249929_+|IS256-family-transposase MNDFTKDFAQALFNPDKINDLLRKELQQAVNNLLEAELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGPIEVQVPRDRNGQFHQHTLPDYKQHSDVLESTIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMLPKIEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYLPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTDMLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKTALARTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDREKIMNEFKQVHQQTNKEEATAVLHDFYTKWGKVYSHVIRSLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDAFIGIQAMSYNDRYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026503_4 | 1252395-1252662 | TypeII |
NA
Consensus repeat of CP026503_4
|
4 spacers
spacers of CP026503_4
>4.1|1252418|38|CP026503|CRISPRCasFinder TAAGCCTCATCTTTTGGCTGATGTAACGACTTGGATCA >4.2|1252479|38|CP026503|CRISPRCasFinder AAACGGCTGTGGCGTTGACACAGCTCAAAGTAGGATCA >4.3|1252540|39|CP026503|CRISPRCasFinder CTAACTGGATACCAGTCATCACCGTTAACAGTAGGATCA >4.4|1252602|38|CP026503|CRISPRCasFinder CTGCCTTGTCTCCCGTGCCCTTCAAGATGATAGGATCA |
cas9,cas1,cas2,csn2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026503_4
The CRISPR arrays of CP026503_4 >merge|CP026503|4|1252395-1252662|CRISPRCasFinder CCTCCACATGTGTGGAGAATACTTAAGCCTCATCTTTTGGCTGATGTAACGACTTGGATCACCTCCACATGTGTGGAGAATACTAAACGGCTGTGGCGTTGACACAGCTCAAAGTAGGATCACCTCCACACACGTGGAGAATACGCTAACTGGATACCAGTCATCACCGTTAACAGTAGGATCACCTCCACATGTGTGGAGAATACTCTGCCTTGTCTCCCGTGCCCTTCAAGATGATAGGATCACCTCCACACTCGTGGAGAATACA >CP026503|4|4|1252395-1252662|CRISPRCasFinder CCTCCACATGTGTGGAGAATACT TAAGCCTCATCTTTTGGCTGATGTAACGACTTGGATCA CCTCCACATGTGTGGAGAATACT AAACGGCTGTGGCGTTGACACAGCTCAAAGTAGGATCA CCTCCACACACGTGGAGAATACG CTAACTGGATACCAGTCATCACCGTTAACAGTAGGATCA CCTCCACATGTGTGGAGAATACT CTGCCTTGTCTCCCGTGCCCTTCAAGATGATAGGATCA CCTCCACACTCGTGGAGAATACA
>CP026503.1|AZR15612.1|1250965_1251532_-|peptide-methionine-(S)-S-oxide-reductase MTENNKQAKTTDTKAKPNNDTAIFAGGCFWCMVEPFDTVDGVEKVVSGYTGGHVANPTYEQVCSGTTGHTEAVEITFDPAKISYDQLLNYYWQVTDPTDAMGQFQDRGDNYRPVIFYNSPAQKEAAEKSKQRLQASGKFDKPIVTKIEPAKPFYPAEEYHQDFYKKDPLRYAMEEAGGRAKFIKEHWD >CP026503.1|AZR15611.1|1250271_1250895_+|M23-family-peptidase MKFRKLIISLLGTALLTSSVGLSTTTASADTLDDSQNTTEVQPKNLKWAYPFKANKKNGVRPMYNAQTFGITNYMRSTTPPSYFHDGWDFGFSEVGHSNVYAIHQGTVKKVAYGNGLGWFIWVISPDNYVEVYQEGFNKKKDIYVKTGQKIKLDQKIGKLTGSHLHLGVTQTNKDYINKYGFPCKNWNVNNGTWLNPIEVIKSNLKK >CP026503.1|AZR15610.1|1248750_1249929_+|IS256-family-transposase MNDFTKDFAQALFNPDKINDLLRKELQQAVNNLLEAELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGPIEVQVPRDRNGQFHQHTLPDYKQHSDVLESTIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMLPKIEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYLPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTDMLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKTALARTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDREKIMNEFKQVHQQTNKEEATAVLHDFYTKWGKVYSHVIRSLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDAFIGIQAMSYNDRYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD >CP026503.1|AZR15609.1|1246018_1248592_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MTKLNNEYMVGLDIGTNSCGWVATDFDNNILKMHGKRALGSHLFDEGVSAADRRAFRTTRRRIKRRKWRLKLLEEIFDEEMAKVDPNFFARLKESGLSPLDTRKNVSSIVFPTKKMDKQFYKKFPTIYHLRNALMKQDKKFDLRAIYIAIHHIVKYRGNFLSNSSISNFSASKIEIDRFVNELNDLYSIFLPESGVIFDAGNASKVEDIIRNEQMFKLDKIKEIADVLPDTENKSGLKLSKKISKEISKAILGYKAKFEIILQVNVDKTDSSIWNFKLNDENADVNLSEITSDLTDTQLQILDLVRNLFSAISLLNIVDEGSTLSESMIRKYNDHAQDLKLLKTVIKNHSDRKKAHNLQLAYDKYVNNRHFVDVETKKAFPNKHLYRKSDFYEIVKKNLDASKEAVQIRKEIALDKFMPKQRSDENGVIPFQLNQIELDKIIENQGKYYPFLKEINPIKAHRMQAPYKLDELIRFRVPYYVGPMIEPTNSSYPQTRQNQSFAWMVRKAKGRITPWNFDEKVDRQKSANNFIKRLTTKDTYLFGEDVLPANSLLYQKYTVLDELNKISVNGKKLSVSVKQELYEDLFKKNNTVSAKQLKNWLIENQKLPYIKIKGLADQTKFNSSLSTYIKLKKSGLFVDKLDSNEFRDDFEKIIEWSTIFEDKQIYIQKLQTIDWLTAKQIQFLQNIRLQGWGRLSKKLLTAIVDSNGQNIIEQLWNSQQIFMSIVNKADIKGTITDANQDLMHSNSMEDILSEAYTSPANKKMIRQVVKVVHDIQKAASGQAPKQIAIEFARESRRNSKLSQTRGHKLQDIYQKISGDIVNKNLKDKLAEYIKNNQLSVWEKTSFQMNKNDQDFLF >CP026503.1|AZR15608.1|1244389_1246081_+|IS5/IS1182-family-transposase MYKNYITGQTALTLNLDFAIPANHLANVISWFVDSIPEDVLVGKTAKTGRPAYHPAMMLKILLFAYSRRVFSGRKIELMLEENLPMMILADQQKISYHTINNFRSSSHANELIKKSFIYFTNLLEDEGLINEGAAFIDGTKIEADANRYTFVWRKAVEKYHEKLKGQAVELYDELITKEVVKEMEKEKVQTSQGLKELAQETEAEINKLTKEIEQENKAIPGGSPRKAKRRGLKKILHRLRKDYVPRMQKYEEAEEIFAGRNSYSKTDHDATFMHMKEDHMKNGQLKPGYNIQAVTTDQYVVDYAIFPNPTDFKTLEPVLDQMTVLDKFDKIVADAGYGSEYNYSMLEEKYPDKKYFIPYTMYEKEQTRKYKNDPTKLINWYYNEKDDYYIDHHGVRFNFKYYSQRKDRSTGQVRDFKVYEADEFQLTPELEQLAKTASGRQRQVRYNPNWQYLKEKAKEVLQSEEGRHIYGMRKYDVEPVFGHLKNVFGMRRTHLRGKEKVETDIGIAFMMMNLNKYCQRRWLKGRFLLLKILKRTKKRSRFLKKEILIVFIHLEASFFPDT >CP026503.1|AZR15607.1|1243625_1244246_-|type-II-CRISPR-RNA-guided-endonuclease-Cas9 MQLGRDAYTGKPINIDEVSQYYDIDHILPQSFIKDDSLNNRVLVAKPINNGKSDGVPLKLFGDNLATGLGITVKQMWNNWADKGLINKAKQNNLFLDPENINKHQASGFIRKQLVETSQIIKLATTILQAEYPKTKIIVVKASSNHYLRNEFDLYKSREVNDYHHAIDAYLTTICGNLLYQAYPKLRPFFVYGQFKKFSSDPKKRK >CP026503.1|AZR15606.1|1242628_1243672_-|hypothetical-protein MVNLKSLVLILKKENEILKKTKNFDFVAKLLGSKAPNEIRSQQGKVLFEKNKIRLQFNKAYNYKYMLVSRDTTTKNQEMFGMTIYPRAERDIAKSRKLIEKRKGFSTDIYGGYTGTAAAYMAIVRINKTKSSQYKVIAVPMTKRAILNKAEKEGNYEKILKQILSPSILYNDKGKRKAGVISFDIIKGKVPYNQVVQDGNKKFLLKSAIYLCNAKQLVLSEEAMRVITGHWLDSDKQDQELLDVYDEILEKIDRYLPLFDIRDFRNKLHKGREKFLKLNAEDKFKAIIQILKGLHDNSDTGELKDIGITVPFGQLQNNSGITLSSDTILVYQSPTGLFEKRVKISSL >CP026503.1|AZR16676.1|1241516_1242425_-|type-II-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MGWRNVIITQHAKLTYSMNMLIVQTKDGINQIPIEDINLVLISTSQAVITSALISKLAKNQCKVIFVDDKYQPVTETVNYYPGARDIKKLKMQFEWNERRKENLWTKIVAAKLKNQISVLKNYRIDETEVEQELYKLEVNDLSNREAAAARKYFMKLFGKDFIRRNSGVINAALDYGYSILLSSFDREIAMNGYLTYLGIHHHSVENQFNLACDLMEPFRSIVDYWVKAHENITSFTPDIKYGLVELLSLQIKFNGRNTILTNAISVYVRSCLRYLSGETDDIRIEMSLCNEVPNDAINDNV >CP026503.1|AZR15605.1|1241233_1241539_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MRLMIMFDLPTDTAAERKEYRQFRKALINEGFLMIQFSVYERVCVTRQTANFLEKRIRKFMPSKGVVQSLMVTEKQYSDMHFLVGDAVKDIRNTSDRTVIL >CP026503.1|AZR15604.1|1240802_1241237_-|type-II-A-CRISPR-associated-protein-Csn2 MIVSYLSHKKICLKDGINVICTQSPIAYKDLVLGFQALNDLIVCSDDEYNNKSISKSFDFVGAPLLNDNIMAKYMNVIIKNFISNLDEVNRNRILKSFYSLETVLNDSLLLEDLPLEIDFSEDIKKLLKMVNIHLDAQLMLTRL >CP026503.1|AZR15613.1|1252879_1253758_-|YitT-family-protein MDQLDKFNRRYNFLSKLSAAFFYSIAVAVALNFFWTPGHMYSSGITGFAQLINTVSERYLPFTLSTSMMYFLLNFPLFILAWFKIGHKFTFFTIVAVVLGSIMMHAIQPWQMHLDPLVCAIFGASINGIGTGMALKNGISTGGLDIIGIVIRQKTGISYGKFNIFINLIIIAAAGYMFGWPRALYSALTIFINGRVIDAVYTQHQKMQVMIVTQHPQHIIDGIQNRMHRGITILHDAEGAYSHIEKTVLITIIDRYDMYDIRQIVQGADPYAFMSVSEVEKVYGRFKEQEIV >CP026503.1|AZR15614.1|1253928_1254576_+|temperature-sensitive-replication-protein MSSYYELMWRDDELTSYTTDKLNFIYNAIDHPLSVRYRQLYPNRLDWQKAVNRHNAAIQKVKDLLIERKDSHNIREAWFKLDPNARTKANNGFTVEQLANKFPYMAKQLGAFMEIENIEIKYFDGEFKPRYDLDDFSDIFSANYPTSGFKQSGITQEALLKLYPNISAKNLDQILKMADCELEQENGTEVIPYWYAVNAKRMLIDGDSFAATFDD >CP026503.1|AZR15615.1|1254601_1255465_-|homoserine-kinase MIIKAPASTANLGPGFDSLGMAVSLYLEVEVLSLADRFQVDHVMKGIPHDEKNLIVKTALTVYPGLPPLHLRVKSNIPLAHGLGSSSSAIAAGIELANQIGKLGLSDEEKVQLGAKIEGHPDNIAPTILGGLVVGAEVNHHFDAVEAPLPPYALVAYVPDYNLETKTARAVLPKELAFGVATHGSAVANTLIASLFAQDYPKAGELMEQDVFHEVYREKLVPELVKVREVAHSKHALATYLSGAGSTIMTWIEDKHVAGFLSGLRKHDLKDETLILHPDEHGVQIIQ >CP026503.1|AZR15616.1|1255478_1256714_-|homoserine-dehydrogenase MAIKIALLGLGTVGSGVLKIIKNNKKKIRQTSGEEIIIEKALVRNPEKHRNLANEVMLTTDFDSILQDPEIKIIVELIGGLHPAKEYITAAINAGKNVVTANKDLMATFGSELINLAASKKCDLMYDASVAGGIPILRTLATSYSSDIISEIQGIINGTTNYILSQMGEKGLSYEEALKNAQELGFAEADPTNDVTGKDAAYKIVILSKFAFGTKISIDDFTIQGINNLKDFDIKQAQKLGYVIKLIGIAKNINGKLFVEVAPCLLPENAIMAHIKNELNALQIKSQSLGTAVFTGPGAGSSATANSVMSDVITEIKNVVKKTTGQPFSNFSHVMQLTSSEDVKYSYYLSFEAEETLFDLSKLLSDLEIPVREIKQVQSRIVVVTENISRQQLQDLAIQDQYLKASYKILQ >CP026503.1|AZR15617.1|1256825_1258316_+|threonine-synthase MQYRSTRGSKENTLTAPQAIIQGLAQDGGLYVPVAFPQANFKLEDLSKLSYKQIAAMVISLFFDDFTKEQITTAVQSAYSEQWDDRSIVPIEKHDNHFYMELFHGPTLAFKDIALQMLPQLMTRAVQIEKIDKDIIILTATSGDTGTASMRGFANQKGTDVIVFYPEGGVSPVQLKQMLSQRGNNLRAIAIKGNFDDAQTEVKKIFNNDSFKNRLNANGYQFSSANSMNIGRLVPQISYYLYTYGQLVRRQEIKLGDEVNFAVPTGNFGDILAGYYAKKLGLPIKKLICASNENNVLTDFFNNGVYDKRRKFHLTNAPAMDILVSSNLERLLFDLYGENNYEVASLMNQLTQRGHYQVSGEVFTKLQKNFAAGFATEEEVKSEIKRVYNYDRYVIDPHTAVGSFVANQYQKKTGDQTPMVIVSTASPYKFPETVYEAITGGPSMQTGVGAIKELHDELGGQLSIGVRALFDREPKTEKIIEPNDMEKEISSILDLK >CP026503.1|AZR15618.1|1258335_1259703_+|aspartate-kinase MKVVKFGGSSLASGNSVDKALSIINADPERQVVVVSAPGKRTEDDIKVTDLMITYAYMSLRSNNYQDIATRIFKRYELIAQYFELPEAELEDINQLLLTLPKLSYPNNDYRMATFKAHGERLNAILIAKILNHQGIKARFLEPKDVGLIVTGTSNNAEVNPETYVNLKRIKAAKDEKIIFPGFYGITPSGHIATFSRGGSDITGAILARGLNADLYENFTDVDAIFSANPHIVDQPKPIKRMTYQEMRELSYAGFSVFHDEALIPAIQGEIPVNVKNTNAPEKPGTMIVPEDGFIPKHTITGIAGGKNFAALYLRKYMLNKGAGFTLKLMEILQKHHVSYEHMPSGIDDITIIFKKDVLTDQLIDVICNEIQTSLNPDQMQWIDDYAITMVVGEGMKDKLTLCASLLYPLGKKNISIQMINQGASQISIMIGTRRQDEEVVIKTIYDNFIAQDKI >CP026503.1|AZR15619.1|1259793_1260354_-|histidine-phosphatase-family-protein MTTVYFVRHAQPDLSVHDDLTRPLTEKGLQDRKKVTDYFRDKHIDQAFSSPFKRAIDTIQPVIDEKKLTLSSISDFRERKIGDEWISNFHEYCERQWEDFDYKLRNGESLKETQKRNVAALKLVLSKYQDQTMIIGGHGTAIGSVINYYDPSFKYEAFAMIQPKNPFIVKMNFDGEKYLEYKVVTF >CP026503.1|AZR15620.1|1260507_1261686_+|IS256-family-transposase MNDFTKDFAQALFNPDKINDLLRKELQQAVNNLLEAELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGPIEVQVPRDRNGQFHQHTLPDYKQHSDVLESTIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYLPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTDMLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKTALARTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDREKIMNEFKQIHQQTSKKEAAAVLHKFYARWNKAYSNVIKGLKEIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDAFIGIQAMSYNDRYFNRIHKGFGQVQDTLESYFE >CP026503.1|AZR15621.1|1261901_1264217_+|phospholipase MGLEILNHTDQKLISNADFWQLVDFQRESNKFSEFKGVSFVSNIKFIEQNLIPRFDQITLILGLTDNGSNSIGKRIDQILNKRRDLIEYSYEHQDSPFTKRILDGSLQLFFTKQNLIHTKLYLMENQSKYSAFSGSMNLTDTAVNKNMEQLVWDYGNTSDPLFNCYQQMFQDNLNQATTYINAKKLSGYLEDKNKDDLRIHVMQDSSLEIKNSPNSTGKDIIILPAEEIKKYRDHYSKDDELKKLSENEKLVASQTVTLFGEGGNKRRKLDTIGQDLYSLTQHIIRQDKKAKADTSQIEKEEDLFPVPVQFYNNGQLFQASKIGDNIPSEVITSDLTEGQLKNALQLFCDITHEYNTYKEVGEGWQACDFMLFLYESPWLWKIRNLYELSGSNVSREDVPIATALIGQGRTGKSTLGKRLAAKLIGAHNFLDSGMMDPKNYALGKSNINMTITNTLSDYVYTNGPVSPLMIDDVSPELTTRTYFERFIKEVTNNRNLTHPSPAFIFTMNRQESSIKSQFSLKPEIMRRLWYLSFESTFSGESDQRNAALTSLFSRANDDLFKYCQVELAKFFTNVSVEDAQKIERDFLYPIKHVLKTALDKFDMYNQVSKYFEENYDYSLFVGRNDWGMLINQAKIGSDILFIKQDDRLKAQINKELFNKISDQTAKNSGSTMLDRYFKYLPRKYHIASQQTSTGFIIDVENFDKWLDDDTLMNKYQNSSSFRDKQQRDNQAQLTQTVDMLAKAMLEDREQRRKEEAKKKRSWLGNFFHRN >CP026503.1|AZR15622.1|1264274_1264646_-|nuclear-transport-factor-2-family-protein MDKEQIIRNYFRAWLSPNLEVVQNTFDENAIYSECYGPVYRNKKEIISWFENWNKQGKVIAWPIERLIINGDTSIAEWHFKCNYQGKISEFDGVSIIEFNDQNKIISVKEYQSKSKHYYPYSK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026503_5 | 2312476-2312540 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP026503_5
|
1 spacers
spacers of CP026503_5
>5.1|2312501|15|CP026503|CRISPRCasFinder AGATTTTTGCTATAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026503_5
The CRISPR arrays of CP026503_5 >merge|CP026503|5|2312476-2312540|CRISPRCasFinder TTTACTTTATAAAGGAAATAATATGAGATTTTTGCTATAATTTACTTTATAAAGGAAATAATATG >CP026503|5|5|2312476-2312540|CRISPRCasFinder TTTACTTTATAAAGGAAATAATATG AGATTTTTGCTATAA TTTACTTTATAAAGGAAATAATATG
>CP026503.1|AZR16608.1|2312071_2312449_+|AraC-family-transcriptional-regulator MWDYFKPELTKRLSELSVDDSTSARVRSILTELLPNGEFTIDDVAKKLGYSKQTLQRKLSSENTTFQKQLNSTREVLALNYLQNTDMTTSDIAYLLGYQEFNSFLRAFSIWKGISISEYREKMNK >CP026503.1|AZR16607.1|2311471_2312068_+|AraC-family-transcriptional-regulator MNHFILDGRYEDLLSFNVEEALKKANIPEDCFKKLHPSMSEQQYYNFMAAIGDQISDPFTPIEIATTNPIESFSPPIFAAYSSRNGDIFIKRLAKYKKLIGPLSFKIDEDSKQLSITLTPSNQQYSLPSFLVLSEFAFLVGLLRKTTKEAISPLKITMTSPVNDEQVINFFGCKIESGKRNTITFAKKDLQVNFISYN >CP026503.1|AZR16606.1|2311070_2311265_+|hypothetical-protein MPGPLQAVYYATKAYVTSWSNALWREVQGTGVTVSCLMPSAMQTGFISRGDLSSTQLFAHAVSP >CP026503.1|AZR16605.1|2310664_2311108_+|KR-domain-containing-protein MTTQEGKTALITGSYGGLGTQFVNIHASHGGDLILVGRNAKKLADQQKEARRKYNVTAHIIDVDLSQPDAAQKIYDTCKKNGWTIDYLINNAGFGGQGEFIKRSMEQDMSMIAVNIETPTRLTKLFLPDFVKRGRYAWPTSSRLLRY >CP026503.1|AZR16604.1|2310149_2310482_+|toxin-MazF MRTNDIVDIYVAYIDKPGGKNRPVLIIKLLNSKAWLLKITSKYKEKSENIRKHYFPIFDWKKYNLDKPSYIDTKNYLIVTISDLNIEKYRGHFSIADLRKLKDFIDENSN >CP026503.1|AZR16603.1|2309893_2310160_+|type-II-toxin-antitoxin-system-antitoxin,-RelB/DinJ-family MKSYKKIQANVDSSLALQAEGIFQDIGLNTTTAINVFLKKVVATGGIPFELKETPEQKASRELIQSISKIPHKEAKTKKEIEDWLDED >CP026503.1|AZR16602.1|2308811_2309669_-|IS982-family-transposase MNCLKLKRFSHHLQVSFKDLVIICRHWYRLYAPAEFTHRRNIDQIKTTDSLILALLIWQAKTGIESQRRFCECFNCLSHSRFNRRSRQLLQLIYQIRQEMNKKVDLNGQFLIIDSFPVPVCQPIRNYRAKIFRGYANIGYKATKKIYFYGFKVHAIVSDDGYILDYVVTKASVHDARETVELIENTHPSNYYLLGDEGYLGKELHQQLKQMGYELWTPYRKNMTGAKKHNDHQLMAIRRTIESDFSLLTYYNAENNRARSLIGFQSRLEIAILAYNLAYCLERFN >CP026503.1|AZR16601.1|2307441_2308752_+|NCS2-family-permease MNAISNFFHLKENNTSFKTELLAGLTTFVSMSYILFVNPNVLGASGMDKGALFTVTALSAAFTCIVMGLIANYPIASAPTLGLNAFFTYTVCLGMKVKWQTALAAVFVASILFILLTVFKVREMIIDAIPADIKYAISAGIGLFIAFIGLQGGKLIQNSDSTLVTIGSLNNPTVWITIFGLIITIFLMIARVPGAIFIGMIAAAVFGIVTGQIPMPKGVISSVPSIAPTFGQAVFHIGDINTVQMWIVVFTFLLVTFFDTTGTLIGLVQQAGLMKDNKMPRAGEALAADSSGMLVGSVLGTSPVGAFVESSAGIAVGGRTGLTAVWVGIFFLISTIFSPILSVFTTQVTAPALIIVGVLMAENLAHVHWTNLEIAIPCFLIALGMPLTYSISDGLGWGLIVYPVSMIAAKRFKEITPMMWILFIVFVIYFVVLNVK >CP026503.1|AZR16600.1|2306532_2307261_-|MerR-family-transcriptional-regulator MSEYTIGDLAKKLNITTRTIRYYDQKGLVKPSRVSESGYRLYSDEQVKQLKLIIFLKELGFSLKDIQKILEDKNGDKLIDLLLEDQLKRNKAETQKLEEQNKKIIQLQKVLSKPNNIAEVTDITKIMNNETRYKEVTRSMWKLSAVEITVELVGMAFIAYCIINKMNTAAYISVAILVVSLIAMSFVLLKNYYQKVAYICPNCDYKFVPELKSFMFAAHTPHTRKLRCPNCHKKSYCLETVR >CP026503.1|AZR16599.1|2304446_2305625_-|IS256-family-transposase MNDFTKDFAQALFNPDKINDLLRKELQQAVNNLLEAELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGPIEVQVPRDRNGQFHQHTLPGYKQHSDILESMIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYLPLRRETFEREAVYIAIGIKPNRHKEVIDYRIAPSENIEVWTDMLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKTALARTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDREKIMNEFKQVHQQTNKEEATAVLHDFYTKWGKVYSHVIRSLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDAFIGIQAMSYNDRYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD >CP026503.1|AZR16610.1|2313828_2314602_-|Cof-type-HAD-IIB-family-hydrolase MSKPKIIFFDIDGTLIEKKKSITPKMLETLHALQDNGIMICIASGRPPVQLPKLGVDFDAYLTFNGSYCYNDQDIVFDNPLRQGDVLHMIQNAQKINRPLAVATKTRIAANGVDEDLKEYFAIGGTDLRVAPDFDVVVDQDTVYQIMVGCREKDYDGLVANTQNAKVTAWWDRAADIIPATGSKGVAIEKVLDYYQIPVSEAIAFGDGGNDIEMLKTVGHGVAMGNATDDVKEIADDICGSVQDDGIFTYCKKHNLI >CP026503.1|AZR16611.1|2314755_2316066_+|NCS2-family-permease MQTLEKVFHLQDAHTTVKRELIAALTTFVSLSYILFVNPNILHAAGIPKGAAFTVTALATAVGCFLMGFIANYPIALAPTLGSGAFFAYNVCVGMHISWETALAAVLVASVLFILITVFKLRELVVNAIPQDMKYAISAGIGLFIAFIGLKNGQLIVNSDSTLVTLGKFSTPAVWITLFGLILTVVLMALNVPGSIFIGMIVTAIFGMIIGQIPLPHNIVSGAPSIAPTFGQAVFHIKDINTAQLWMVVLTFLLVTFFDTAGTLIGMTEQAGMVDKDGKIPRIGRAFLADSTAMVEGAVFGTAPLGTSVESSAGIAMGGRTGLTAIFVGIFFIISMIFSPLLQVIPTTVTAPALIIVGVLMASNLKKIDWEKFEIAFPAFLTVVGMPLTYSISDGLALGLIAYPITMIASKRYKEVSPMMYILFVVFIIFFLVTNL >CP026503.1|AZR16612.1|2316307_2317486_+|IS256-family-transposase MNDFTKNMAQALFDQDKVNDFLRKEIQTAVNQLLKVELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGPIEVQVPRDRNGQFHQHTLPDYKQHSDILESMIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMLPKVEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYLPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTDMLQNMKARGLKQVELFLSDGVVGMKTALARTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDREKIMNEFKQVHQQTNKEEATAVLHDFYTKWGKVYSHVIRSLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPNEQSLDTFIGIQAMSYNERYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD >CP026503.1|AZR16613.1|2317554_2318283_+|hypothetical-protein MKIKKVLLTTSLLTISLITLSGCSFHLFTNKNSGPTIKRTLSSKKFNSLKVASDITDVELHASNQYKVIYHGLKRFKPSVNVKNGQLKITQTSNGVSYNIKEGNTVAIYLPAKELQNININLSDGDIDADGKVQAKNVKLHSDDGDVNFDDLRISSGKITSDDGDISVSNLLTRKGATVESDDGDIRIRKSNASGYRLTSDDGDVTFKGDTSDNDDGGSYYKNTKSSNLLSAHSDDGDVNVN >CP026503.1|AZR16614.1|2318466_2320035_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MKKFIDLKWFSLSIILSCLSGLSLSFSTWSYSEIFALITGKSIPNTVRMIIVITVLQILLVIVEYLNNRVINRNVALFNQEVREYLMQTDFVKTGEKEISNRISFINNDLNLIEEKYFRQLFSLVSTVVKIVGIVTIALINSVVLTLVFVAFASLSSLIPSLFSKKTANQSSNWSKSTGSYVTFMSDLLKNINTVLNYNVLSLFVKKGSKVIKNSVENKRERDDTIAKSDFYVDLLAYSLDFLPIGIGIIMVIQGHIALASFVAVQYSSAWIVNSFFSINSIRNQIAATKPMTAKLLSFKPLTTKQDEAPVKFKQLNMYNVTFGYQADSPVLNNVSLCVNKGDKILLTGKSGEGKSTLLKVLMGKLSPQKGRVLVNDQAVETQIFSEVQQSSQIFNVTLRFNLTLGKQFDQKQIVAAAQQAGLTNYLQKHGLDTVIEENGHNLSGGERKRIELARAFLFQREILVVDEGTASLDPQTAEQIHNVFLNSPLTVIEIDHHISSTTMKKFTHHFDLENGKLVNIF >CP026503.1|AZR16615.1|2320136_2320946_-|XRE-family-transcriptional-regulator MEINTALKKARQSRGLTQEQFVAGILSPAHYSKIERGLHEISAKDLMAILQKNKISFDEFFKQNSVAQADDENNLGDQLQTAYYNQDFNQVRKLVTEIQQLPHHDLLKIKAKLILTLLEGKRKFDVKDKNIVLQRLFAGDNWLQDKFSLDLLANFGTSIFTHDDFAFFFQKIFTTYNDKMSEQTEKMQTTIATICVNYLYTCAENKFVKDNKEPIYLLGQLSQTPSLVLYKIIGHFYQCYFAGDTEQVLAIKKLIKASNLENILSILPE >CP026503.1|AZR16616.1|2321884_2322298_-|hypothetical-protein MKRNKKILTLTAKAALALSLVSVSTSALVQSNHVQAATQSTESKGFVEHIWYQRQYYHDQGTYVYYTVRRGNEVFRGYLEKMYTVPMGHNPTGIMYGGYLYNTKLKSYPIPTLASKKKMMTNFVVNDNEQLGNENKQ >CP026503.1|AZR16617.1|2322445_2323291_-|XRE-family-transcriptional-regulator MTIGEALKQTRKSMKLSQTEMAGDVLSTSYYSKIERGLNDIQTQDLIDLLKQHGLQASIFLERIENEDSENDLAHKNLIWQKQLEDAYYHQQIERLEDLKIEIGKYKNQSQNIFNLYALVVFSIASLKKQIDQISENIKRQVRQIVFDSDEWSESTLQIFAMTMMIYAPEDMDFLINSIFRTYRHNVSNLSGQLQEIMSAIAINYLANVYVQRRKIDLNLIYDFISKLPEIPRNAFAKIVANYYHYCFDGKNEEVDQIIEFMKSNGMSHLIKNFIVENCHL >CP026503.1|AZR16618.1|2323479_2323857_+|cupredoxin-domain-containing-protein MDVTKIIILVVAIALIGFILWWFFGKHDEAIGKASVNQGTQEANIVVNGGYSPSTIVLKQGVPAKVNFDMQDSTACLSHVVFEQLGVDKDLTKQKVTTVDIPTDKKGTYNFACGMDMFHGKVIVK >CP026503.1|AZR16619.1|2323869_2324157_+|cupredoxin-domain-containing-protein MSIFSKNQTKKVVVNAENHGYKPNTVTFKQGKPAQLKFIPSDNMGCMNEVVSKDLNFDQKLDGKKEVTIDIPTDKPGTYTYACGMDMFRGKVVVK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026503_3 | 3.1|1238709|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238709-1238738 | 30 | CP026503.1 | 1095494-1095523 | 1 | 0.967 |
1. spacer 3.1|1238709|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1095494-1095523, mismatch: 1, identity: 0.967
agaaaacaggtattccaggcgcgatagtgg CRISPR spacer agaaaacaggtattccaggcgcggtagtgg Protospacer ***********************.******
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026503_3 | 3.8|1238830|30|CP026503|CRT | 1238830-1238859 | 30 | MT856905 | Enterococcus phage vB_EfaM_A2, complete genome | 144972-145001 | 6 | 0.8 |
CP026503_3 | 3.8|1238830|30|CP026503|CRT | 1238830-1238859 | 30 | MW004544 | Enterococcus phage EFGrKN, complete genome | 144224-144253 | 6 | 0.8 |
CP026503_3 | 3.8|1238830|30|CP026503|CRT | 1238830-1238859 | 30 | NC_029009 | Enterococcus phage EFDG1, complete genome | 144333-144362 | 6 | 0.8 |
CP026503_3 | 3.8|1238830|30|CP026503|CRT | 1238830-1238859 | 30 | MN241318 | Enterococcus phage PEf771, complete genome | 127689-127718 | 6 | 0.8 |
CP026503_3 | 3.8|1238830|30|CP026503|CRT | 1238830-1238859 | 30 | MN027503 | Enterococcus phage vB_OCPT_Ben, complete genome | 6344-6373 | 6 | 0.8 |
CP026503_3 | 3.9|1238775|30|CP026503|PILER-CR | 1238775-1238804 | 30 | NC_013940 | Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence | 68217-68246 | 6 | 0.8 |
CP026503_3 | 3.8|1238830|30|CP026503|CRT | 1238830-1238859 | 30 | MH880817 | Enterococcus phage EfV12-phi1, complete genome | 147967-147996 | 7 | 0.767 |
CP026503_3 | 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR | 1238841-1238873 | 33 | MN241318 | Enterococcus phage PEf771, complete genome | 127689-127721 | 7 | 0.788 |
CP026503_3 | 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR | 1238841-1238873 | 33 | MN027503 | Enterococcus phage vB_OCPT_Ben, complete genome | 6344-6376 | 7 | 0.788 |
CP026503_3 | 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR | 1238841-1238873 | 33 | MT856905 | Enterococcus phage vB_EfaM_A2, complete genome | 144969-145001 | 7 | 0.788 |
CP026503_3 | 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR | 1238841-1238873 | 33 | MW004544 | Enterococcus phage EFGrKN, complete genome | 144221-144253 | 7 | 0.788 |
CP026503_3 | 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR | 1238841-1238873 | 33 | NC_029009 | Enterococcus phage EFDG1, complete genome | 144330-144362 | 7 | 0.788 |
CP026503_3 | 3.3|1238896|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238896-1238925 | 30 | MT075871 | Klebsiella phage vB_KleS-HSE3, complete genome | 26997-27026 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.3|1238896|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238896-1238925 | 30 | MH363700 | Vibrio phage VP-1, complete genome | 49935-49964 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.3|1238896|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238896-1238925 | 30 | NC_048765 | Vibrio phage VAP7, complete genome | 73696-73725 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | MH102284 | Salmonella phage vB_SenS_PHB07, complete genome | 5861-5890 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.6|1239094|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1239094-1239123 | 30 | NZ_KP688397 | Vibrio parahaemolyticus strain V36 plasmid pVPH1, complete sequence | 177468-177497 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.8|1238830|30|CP026503|CRT | 1238830-1238859 | 30 | AP014119 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C36-MedDCM-OCT-S41-C69, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 13062-13091 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR | 1238841-1238873 | 33 | MH880817 | Enterococcus phage EfV12-phi1, complete genome | 147964-147996 | 8 | 0.758 |
CP026503_3 | 3.11|1238910|30|CP026503|PILER-CR | 1238910-1238939 | 30 | MT075871 | Klebsiella phage vB_KleS-HSE3, complete genome | 26997-27026 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.11|1238910|30|CP026503|PILER-CR | 1238910-1238939 | 30 | MH363700 | Vibrio phage VP-1, complete genome | 49935-49964 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.11|1238910|30|CP026503|PILER-CR | 1238910-1238939 | 30 | NC_048765 | Vibrio phage VAP7, complete genome | 73696-73725 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | MH102284 | Salmonella phage vB_SenS_PHB07, complete genome | 5861-5890 | 8 | 0.733 |
CP026503_3 | 3.14|1239108|30|CP026503|PILER-CR | 1239108-1239137 | 30 | NZ_KP688397 | Vibrio parahaemolyticus strain V36 plasmid pVPH1, complete sequence | 177468-177497 | 8 | 0.733 |
CP026503_4 | 4.3|1252540|39|CP026503|CRISPRCasFinder | 1252540-1252578 | 39 | MN855989 | Bacteriophage sp. isolate 357, complete genome | 3292-3330 | 8 | 0.795 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | MN694034 | Marine virus AFVG_250M807, complete genome | 23905-23934 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | KT264834 | Gokushovirus WZ-2015a isolate 86Rcn01, complete genome | 3659-3688 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | MH729819 | Citrobacter phage Sazh, complete genome | 41305-41334 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | NC_047823 | Citrobacter phage CF1 DK-2017, complete genome | 23055-23084 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | MT478992 | Escherichia phage vB_EcoS_011D2, complete genome | 9563-9592 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | NC_047898 | Salmonella phage YSP2, complete genome | 8797-8826 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | KU726251 | Enterobacteria phage SEGD1, complete genome | 71479-71508 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | KY657202 | Salmonella phage GJL01, complete genome | 42988-43017 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT | 1238962-1238991 | 30 | LR535912 | XXX | 167568-167597 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | MN694034 | Marine virus AFVG_250M807, complete genome | 23905-23934 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | KT264834 | Gokushovirus WZ-2015a isolate 86Rcn01, complete genome | 3659-3688 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | MH729819 | Citrobacter phage Sazh, complete genome | 41305-41334 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | NC_047823 | Citrobacter phage CF1 DK-2017, complete genome | 23055-23084 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | MT478992 | Escherichia phage vB_EcoS_011D2, complete genome | 9563-9592 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | NC_047898 | Salmonella phage YSP2, complete genome | 8797-8826 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | KU726251 | Enterobacteria phage SEGD1, complete genome | 71479-71508 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | KY657202 | Salmonella phage GJL01, complete genome | 42988-43017 | 9 | 0.7 |
CP026503_3 | 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR | 1238976-1239005 | 30 | LR535912 | XXX | 167568-167597 | 9 | 0.7 |
1. spacer 3.8|1238830|30|CP026503|CRT matches to MT856905 (Enterococcus phage vB_EfaM_A2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer cccacgttggtaccttcgcaaaagctattg Protospacer * .*********** .*********** *.
2. spacer 3.8|1238830|30|CP026503|CRT matches to MW004544 (Enterococcus phage EFGrKN, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer cccacgttggtaccttcgcaaaagctactg Protospacer * .*********** .*********** *.
3. spacer 3.8|1238830|30|CP026503|CRT matches to NC_029009 (Enterococcus phage EFDG1, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer cccacgttggtaccttcgcaaaagctattg Protospacer * .*********** .*********** *.
4. spacer 3.8|1238830|30|CP026503|CRT matches to MN241318 (Enterococcus phage PEf771, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer cccacgttggtaccttcgcaaaagctattg Protospacer * .*********** .*********** *.
5. spacer 3.8|1238830|30|CP026503|CRT matches to MN027503 (Enterococcus phage vB_OCPT_Ben, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer cccacgttggtaccttcgcaaaagctactg Protospacer * .*********** .*********** *.
6. spacer 3.9|1238775|30|CP026503|PILER-CR matches to NC_013940 (Deferribacter desulfuricans SSM1 megaplasmid pDF308, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
tacctcacacctctattatttatttcttta CRISPR spacer aaattaacacctctattatttttttctgta Protospacer * .* *************** ***** **
7. spacer 3.8|1238830|30|CP026503|CRT matches to MH880817 (Enterococcus phage EfV12-phi1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer tccacgttggtaccttcgcaaaagctactg Protospacer . .*********** .*********** *.
8. spacer 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR matches to MN241318 (Enterococcus phage PEf771, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aaccgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer aaacccacgttggtaccttcgcaaaagctattg Protospacer ** * .*********** .*********** *.
9. spacer 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR matches to MN027503 (Enterococcus phage vB_OCPT_Ben, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aaccgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer aaacccacgttggtaccttcgcaaaagctactg Protospacer ** * .*********** .*********** *.
10. spacer 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR matches to MT856905 (Enterococcus phage vB_EfaM_A2, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aaccgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer aaacccacgttggtaccttcgcaaaagctattg Protospacer ** * .*********** .*********** *.
11. spacer 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR matches to MW004544 (Enterococcus phage EFGrKN, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aaccgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer aaacccacgttggtaccttcgcaaaagctactg Protospacer ** * .*********** .*********** *.
12. spacer 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR matches to NC_029009 (Enterococcus phage EFDG1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.788
aaccgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer aaacccacgttggtaccttcgcaaaagctattg Protospacer ** * .*********** .*********** *.
13. spacer 3.3|1238896|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT075871 (Klebsiella phage vB_KleS-HSE3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtcttacgcatgtaaacgccgttttcacgg------ CRISPR spacer gtcttacgcaagtaaacgccg------cagaacgcg Protospacer ********** ********** *.*
14. spacer 3.3|1238896|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH363700 (Vibrio phage VP-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtcttacgcatgtaaacgccgttttcacgg CRISPR spacer accttacgcatgtaatcgccgttatgaata Protospacer ..************* ******* * * .
15. spacer 3.3|1238896|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_048765 (Vibrio phage VAP7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtcttacgcatgtaaacgccgttttcacgg CRISPR spacer accttacgcatgtaatcgccgttatgaata Protospacer ..************* ******* * * .
16. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH102284 (Salmonella phage vB_SenS_PHB07, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgcgt Protospacer *************** ***** .. **
17. spacer 3.6|1239094|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KP688397 (Vibrio parahaemolyticus strain V36 plasmid pVPH1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
acgtaagcaccttttgaattggagactact CRISPR spacer gcaattgggcctttttaattggagactact Protospacer .*. * .****** **************
18. spacer 3.8|1238830|30|CP026503|CRT matches to AP014119 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-GF-C36-MedDCM-OCT-S41-C69, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer tttctgtaggtactgccgcaaaagctaaat Protospacer . * .** *****.**************
19. spacer 3.10|1238841|33|CP026503|PILER-CR matches to MH880817 (Enterococcus phage EfV12-phi1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
aaccgtacgttggtaccgccgcaaaagctaata CRISPR spacer aaatccacgttggtaccttcgcaaaagctactg Protospacer ** . .*********** .*********** *.
20. spacer 3.11|1238910|30|CP026503|PILER-CR matches to MT075871 (Klebsiella phage vB_KleS-HSE3, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtcttacgcatgtaaacgccgttttcacgg------ CRISPR spacer gtcttacgcaagtaaacgccg------cagaacgcg Protospacer ********** ********** *.*
21. spacer 3.11|1238910|30|CP026503|PILER-CR matches to MH363700 (Vibrio phage VP-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtcttacgcatgtaaacgccgttttcacgg CRISPR spacer accttacgcatgtaatcgccgttatgaata Protospacer ..************* ******* * * .
22. spacer 3.11|1238910|30|CP026503|PILER-CR matches to NC_048765 (Vibrio phage VAP7, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gtcttacgcatgtaaacgccgttttcacgg CRISPR spacer accttacgcatgtaatcgccgttatgaata Protospacer ..************* ******* * * .
23. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to MH102284 (Salmonella phage vB_SenS_PHB07, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgcgt Protospacer *************** ***** .. **
24. spacer 3.14|1239108|30|CP026503|PILER-CR matches to NZ_KP688397 (Vibrio parahaemolyticus strain V36 plasmid pVPH1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
acgtaagcaccttttgaattggagactact CRISPR spacer gcaattgggcctttttaattggagactact Protospacer .*. * .****** **************
25. spacer 4.3|1252540|39|CP026503|CRISPRCasFinder matches to MN855989 (Bacteriophage sp. isolate 357, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.795
ctaactggataccagtcatcaccgttaacagtaggatca CRISPR spacer ttaatcggataccagtcatcaccgttaacagtattaatc Protospacer .***..*************************** * .
26. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN694034 (Marine virus AFVG_250M807, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer gacagttaatgttgatttgtctaaagctta Protospacer ************** ****** .. *
27. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to KT264834 (Gokushovirus WZ-2015a isolate 86Rcn01, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer tgtaggtaatgttgattattctaaattaat Protospacer . * *********** ********* .
28. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH729819 (Citrobacter phage Sazh, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
29. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047823 (Citrobacter phage CF1 DK-2017, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
30. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT478992 (Escherichia phage vB_EcoS_011D2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
31. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_047898 (Salmonella phage YSP2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
32. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to KU726251 (Enterobacteria phage SEGD1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer cgcaactaatcttgatttttctaaattgat Protospacer * ..**** **************** .
33. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY657202 (Salmonella phage GJL01, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
34. spacer 3.4|1238962|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to LR535912 (XXX) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer cgcaactaatcttgatttttctaaattgat Protospacer * ..**** **************** .
35. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to MN694034 (Marine virus AFVG_250M807, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer gacagttaatgttgatttgtctaaagctta Protospacer ************** ****** .. *
36. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to KT264834 (Gokushovirus WZ-2015a isolate 86Rcn01, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer tgtaggtaatgttgattattctaaattaat Protospacer . * *********** ********* .
37. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to MH729819 (Citrobacter phage Sazh, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
38. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to NC_047823 (Citrobacter phage CF1 DK-2017, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
39. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to MT478992 (Escherichia phage vB_EcoS_011D2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
40. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to NC_047898 (Salmonella phage YSP2, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
41. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to KU726251 (Enterobacteria phage SEGD1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer cgcaactaatcttgatttttctaaattgat Protospacer * ..**** **************** .
42. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to KY657202 (Salmonella phage GJL01, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer acgcgttaatgttgatgtttctccgcgtgt Protospacer *************** ***** .. .*
43. spacer 3.12|1238976|30|CP026503|PILER-CR matches to LR535912 (XXX) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ccgcgttaatgttgatttttctaaattcga CRISPR spacer cgcaactaatcttgatttttctaaattgat Protospacer * ..**** **************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
29001 : 105854
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026503|29001:105854|DBSCAN-SWA 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>CP026503|29001:105854|35436_36339_+|AZR14565.1|DBSCAN-SWA MLERVPKYTLRKLSVGLASVMIGSGILMNSPKVLADTINPNEGTSTAVQPSSQDKDNSEPSTQSGATQDENIDSNAAVQERSDNSVTEPATTTNAEEKVVATNTQDTTQDKDKQTNANETTQNTTNVDKKDTEVTPTNDATTATPKTTAKVNAPAAPTAMKAAATAETPDPTVPDNSANTAIINDKNSLEKIWLETSTARAQVYTTVKGTDQKIYVSSYAEFGKRLNSLIFTNRFDPNSLELHIEYQVLKDRVQNFIVNWGDWLRLDTSRIGKDGLTFTTDTGEKVAYTLTPGWGEVQNL >CP026503|29001:105854|88127_89489_+|AZR14596.1|DBSCAN-SWA MIGMKFKFKFGEFFLGLATLIVIVLSIVLWIFIMTSDQRFSNIGQQNQNNITKEQTRSHNFKSLYDLYIPTTSYGFANGNLCQLYDSKNNLTLEFTKEIKKAKATNKIKKIVDTRTKYEEYLNNPNYVQLVYPDEITFSLFNQLNNAANDNREFNRFFISQSNHWIYLGNDQTNEIYQVKIAGANFDKLRKYACNAKSKYPVRLVRLKEGYSPFYIKTMNAKVYSYLTNHQSYSYFVSRLLGTSGVTSKTNKNGQTVYSLNYYTRLRVPDSNSGEHNYLYTHYEKNKIPNTTNRLLDSVYYVHQLGLTEQDLRFFDADGANVSYLNYIEGIPVFLNKHDLQVKTTFSTDSINVAFNSVNFQIPIPFDGQTKRLKPTQDVVDELVNHGLKQEDIQRIIVGFAEEKDSSHHSLINLIPTYYIKAYDEWKSLGEWEKQDVSTYREADQLTVNEGGK >CP026503|29001:105854|42693_43728_+|AZR14566.1|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(23.08%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
205228 : 270527
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP026503|205228:270527|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACTAAAGTCTTTTTGGTTATGTGTGGCTACGTTGTAATCATATAGTTGATCATTGATAATCAGAGCATAAATGGTTCTGATTAGTTTATGAATTGAAGCAATAGCTATCTTTTTGAACCCTTTGGTTTGAGAGGATAGCTTTTTGCTTTCATAATAATCTGCTATATGACACGGATTTGTCTTAGCTGCATTATCAATTTGTCCAATAGCTCGATAAAGCAACTTACGTGCGACTGCATTGCCATGTTTAGTAATACTTAAATTAGAGTCCATTTCTCCTGACTGATATCTGCCTGGATCAATTCCGATAAAAGCATTGATTTTATTAGGATTACTAAATCTGCGTAAATCTCCTAACTCTGCTAAAACTCTGACAGCAGTGGTCTGTGCAAAGCCTGGAATGCTTTCTAGGTTTTCTAAATCATGATTAGGCAAAGACTTCGCTAACTTAACCATTCTTGCGATTAAATTTTCTCTTTGATCACTTAAATTAAGCAATCTGTGTGCATAATACTGCACTTGCTCGACTTCTATGCTAGAGCAAGATACAACTGGATAAGCTTGATAAGCTAATTCAATTAATTTATCTGCAGTCCTTAGAGCGTGTTTAAAAGCAATCCCCTTTAAGCTCATTAACCAGTTAATAAGCTGTTTTTTATCTTCTCTTCTTACTAAGTCACAATGAGGATATCGCACAACTATTTGCCAGTAATTTTTACCTTTAGCAGAAGAAAATAGATTTTCAATTTCAGGAAAAGTCGATTGTAGAGCTTGGTAAAGTCGATTTTTAGCCATTACTAAGTCAGCTGTTAACTGGTCATAGAAGCGGCTCAAAGCATTAAGCTGCTTATAAGTTTGAGATTGAAGTTGATTAATTGGATGATGATATAGTCTTTGAATTAAGGCTAAATGATAAGCATCAGTTTTATCAGTCTTATTATGACGTAGTCCCATATCCATTTCTTTTTTAGCTTTAAGAGGATTAAGAATTACATAATCATAGCCATAGTCTTCCAGAAAAGATTGCAGTGTACGTGAATAAACACCGGTAGCTTCAAAAATAATTTGCGGATGTTTAGAAAAAGCGGTTAATTCATGAAGCAATTGAATAAAACCAGGACGATTATTAGTAATGGTTAGTTCATTTTTGCTTTCACCAATTAGTTCACAAACAGTAGAAGTAGACTTGCTTACATCAATTCCAAAAGTAACTTGCATAATAAAAACCTCCAAAACTTAGTAGTAAAACGTATTTACTTAAGAAATCAGATCTAATTTTCTAAACTCGACATCTAGTGTCCACATTCTTCGAAGAGACTATTGAAAACTTAAGTAAAACTGCCAGTTTATTATGCGACATCAAGTGTCTAAAGACCTCAGGGCATATCGTTTTACTACTACTTTAATTCTACAAAAGAATAAAAATAGTGAATCAATTATCCCGTCGGATAACTAATTCACTATTTAGCTTAGAATGTTTTGTATCCAATGATAAAATAAGGGCTAAGAGGAATAACTGATAATTAGCTGATTTAAAGGTGATTAGAATGAAAAAGATAATAACAATGGCACTAGCCAGTGCTGCACTATTTGGATCTTCTGCAACAACTGTTCAAGCTGGGACATATAATCCTAAGAACATTACCAGTTTTAATATTAATAGGCGTAACTATGTAGCTAAGGGAAAGATTTATAAACTCCATTTACCCGCAGCTGGTAGATTAGTTACTAATGGCAATGTTACTTTAAAAAATAGTATGGAATGGACCTGTATTCCTTATGGTAAGGACAAAAATACGTATTATCTGCGTAAAGGCACATATTATTTAACTAGTTCAAAGAATATTAGTGTGAAGACTACTTATACTCGTTTAACTAAGATCCGTAAGAATTTAGAAACTTACGTTGAAACAAAGAAGAATAATGACAACAGTAGTCTTAAAGCTAGAAAGATTGAAATTGGTCAAGATATTAAAGCAATGGGTGAAATGTACGATTACGATAGTGTCGACTACTACACATTTACTATTGACTCACCTCAAATGGTTACGATGAGGATGATCAATAATCCGATTTATCAGCTTGGAAAAGGTAACATTTTCAGCAAGATGAATGTAATCATGTTCAGTGAAAATAATCCAGTTGGCGGTAGTACGATGCTTTACCCAGAGAGTTTCGAAATTAATGGCAATAAGATTGCTAGTCAAAGCTGGTACTTGTCTAAAGGAAATTATACTTTTAGTGTAAATACTCGTGGACTTTATAATTTTCAATTAACGGCTGTTCCTGATACGCGTGTGGTACCGGCAGATACTGAGATAGAATCTTTACAAAACACTAAGGATGGTATGGTTGCTAACTTAAGGGATGCACGTCATGCGAAGACTTATGAACTTGCATGGCGTGAAAAAGGCTCAAAGGCAGCTCCATTCACTTCTAGTAGCAATACTACAGAAGTAAGTACTGCACCTGCTACACGTTACATAGACAAAAATGATCGTAAAATCCCAGTTTCAATTGGTAAAAAATTAGTTAATGGTCAAAGCTACTATTTTGTAGCTCGCGGTGTAAGCAATCCTGATTACATTCGTTACGGCAATCCGGAAAAAGATAATTATTTTGGTGCTTGGAGTAATTCAGTAGAACACACTTACTATGCACCTTCAGATGCAACACCAGGTGCAGTTGATTTAACCACTGCTAAAGCTGACAGTACTTATCACAACATTCATGTGGCTTGGAATAAAATTGCTAGTGCACAAAGTTATCGCATTGCCTACCGCCAAAAAGGTACAAATAAGTGGTACTATGAAGTAACTGATCAGGCTACTAACGCGATTACTGGTATTACTAGAAATAGAAATTATGAAGTGAAATTGCAAGCATTGAATGGTGAAAAAACTGGTCCATGGTCCGCAATTAAAACAATTTTTGTAAAATAGCGGTTGACTAAAACTATTTTTCTCGTTAATATCATAACTAACAAATGAGTAGCGAGTCGGCTCAGCGTTCAGAGAACTAGCGGTTGGTGTGAGCTAGACAGGCCGATTTTAGCGAAGTACTTAATAGGGTTGCTCCTTTACCGGCTTGAATAAGGCGCAGCAGCGCAAACGTGGGTGGTACCACGGCTAATAATGTAATTTAGTCGTCCCTTGGTCTTTTGACCAGGGGACGTTTTTTATTGGAGGAAAAACTATGGCAAAATTTGATATTTTGGAAGATTTAAAATGGCGTGGTGCCATTAATCAAGAAACTGATGAGGAAGGTTTGAGAAAGTACTTAGCAGAACATGACGATTGGGCATTGTACTGTGGTACTGACCCAACTGGTGATTCCCTTCATATTGGACACCTTATTCCATTCATGATCTTGAAGAGATTCCAAATGGCGGGCTACCATCCAGTAATTTTAATTGGTGGTGTTACTGGTGCGATTGGTGACCCATCAGGCCGTAAGACTGAACGTACTTTACAAACTGCGGAACAAGTTAAGCACAATGAAGAAAGCTTAACTAATCAAATGAAGAAGTTATTTGGTACTGAAAATTTTGAAATTAGAAACAATGCTGAATGGCTAAGCAAGCTTAACTTGATCGACTTCTTGCGTGATTATGGCAAGTTATTCCAAGTTAACAATATGATTAACAAGGATGTTGTAGCTAGCCGTCTTGAAAATGGTATTTCATTTACTGAATTTACTTATCAAATTTTGCAAGCAATTGATTTCTACCACTTGAATAAAGATGATGGTGTTCAACTTCAAATTGGTGGTAGTGATCAATGGGGTAACATTACTGCTGGTATTGATTTAATCCATAAGCTTGAAGGCGCAGATCGTCCAGCCTTTGGTTTAACTATTCCATTGATGCTTAAGGCTGATGGTACTAAGTTTGGTAAATCTGCTGGTGGTGCTGTTTGGCTTGATCCAGAAAAGACTAGTCCTTATGAATTTTACCAATTCTGGATTAATCAAGATGACCGTGATGTGGTTAAATACTTGAAGTACTTCACTTTCCTTAGCCGTGAAGAAATCGAAGATTTAGCTGAAAAGACTGAGAAAGAACCTTGGAAACGTGCTGCACAAAAGAAGCTGGCTGAAGAAGTTACCAAGTTTGTTCATGGCGAAGCAGGTCTTGAAGAAGCTAAAATGATTACTGATGCCTTGTTCTCGGGCAATATCAAGAACTTATCAGTTGCTCAAATTGAACAAGGCTTGAAGAATGCTCCAAGTGCGGAAGCTGGCAATGAAAAGAAGAATATTGTTGATTTCTTAGTTGACACTAAGATTGAACCTTCTAAACGTCAAGCTCGTGAAGATGTAAAGAATGGTGCCATTTATGTTAATGGCGATCGTGAGCAAAGTACTGATTTCGAAGTTGATCCATCAAGTGACTTTGATGGTAAGTACGTTATTATTCGTAAAGGAAAGAGAAAGTATACTTTAGTTACAATTAAATAATTAAATATATGATTTTAACATTTTATATATAAAAATAGAGGGATTTTTTCCTCTATTTTTTTAGCTAATAATCGGAGATATTTACTACCAACTAATATTTGTAAAAGATAAAGATAATGATTTGTGTAAAATAATATTTTACTTCTTAAATTGTTATTTTATTTTCTAAAATCAATTGCTACAATCTATTTATTAAGTTATTCACAAATTCACATTATTACTATACAATTTGTTATTTCAAGTGTAATACCAATATAAAATAGCTGCGTATACCTTTTGCAAATGCTGATGCAAAGCACTCTATTAAAAACTGACTCTTAATAAAAATATGTGAAAAGCAGCACTATCTGCTTTACTTCTAATCAAACAGTGTTATAGTAATAGTGTAAAGAGAAAGTAAGTAAATAGAAAGAGGTTATTAAAATGTTAGAATCTAAGAAAGCTATTAAGATTATTTCAAGTTTGGTAATCGGTTTGAGTTTAGGCTGTGTTCTTACTCCTATTGCTCAAGCTACTTCATTTACTGCTCCTA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59 | Phaeocystis_globosa_virus(10.53%) | protease,tRNA,integrase,transposase | attL 223407:223423|attR 278712:278728 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
459619 : 604035
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP026503|459619:604035|DBSCAN-SWA 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118 | Staphylococcus_phage(15.15%) | protease,tRNA,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
612687 : 661467
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP026503|612687:661467|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP026503|612687:661467|630574_631615_-|AZR15089.1|DBSCAN-SWA MAILEVKDLAKSYNGKTKVLKDISFSVKNGDLVSILGPSGCGKTTTLRIIAGLIPATDGQVLVDGEDVGKVPVYKRNFGMVFQSYALFPHMTVFNNVAFGLKMKKMSKSDIQKRVDQILKITGLSKLASRYPKELSGGQQQRVSLARALVVNPQLLLMDEPLSNLDAKLRIKMRSEIRELQQKLKMTVLFVTHDQRECFAISDKVLIMKDGKIDQYDTPENIFHHPSSEYVARFIGYDNFINVDEIINDRQIKSKDLVFLTDENNIQAKVLTIRPENILINSEENPSNNLIDGTITSLEYLGQSFKYKVSTSLGDFTVEESRKSMRSSGDKVQLYLPSKHLHPLSR >CP026503|612687:661467|656837_657710_+|AZR15121.1|DBSCAN-SWA MNNGKKIFNWIMAILFVVVVLVAGYIGISRPGINGTASGDRWNSENNVSSIKRRGYLRIAVFGDLPPYGWVNSQGKRVGYDVRLARRVAKDLGVKPKFIQVNANNRIDTLNSNKADIVLANFTLTPERKSVASWTKPYMKVSVGVISPKSAPVTNAKQLKGKSVIVTKGTTAENYFTKQKGVNLLKFDSKTQQFNAIKNGRGAALADDNSYLYAWVKRNPKFTVGIKTIGPNQYISGAVKKGNKSLQKWMDREITKLNRESFFTYDYNKELKPYFGKEIRPSDIVLPQGK >CP026503|612687:661467|647607_648492_+|AZR15109.1|protease|DBSCAN-SWA 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47 | Corynebacterium_phage(25.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
673122 : 826707
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP026503|673122:826707|DBSCAN-SWA 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115 | Bacillus_phage(18.18%) | protease,tRNA,integrase,transposase | attL 799946:799973|attR 812241:812268 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
859400 : 914082
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP026503|859400:914082|DBSCAN-SWA AATGACATCAATAATATTTATGGGAACACCGGAATTTTCAGTTCCAGTACTTGAAGGGTTAATTGATGAAGGCTATGAGATTAAAGCCGTGGTCACTCAACCTGATAAAAAGGTAGGACGTAAGCAGAAAATTACTAAGTCACCAGCCAAGATCGCAGCAGAAAAGCATGATTTGCCAATCTTTCAACCGGTTAAGTTGTCTGGATCAGACGAAATGCAGAAATTAATTGATATGCATGCAGATTTGATTGTAACTGCAGCATATGGGCAATTTTTACCAACTAAGTTTTTGAATTCGGTTAAAATTGCGGCAGTTAATGTTCACGGCTCACTTTTACCTAAATACCGTGGCGGTGCACCAATTCAATATTCACTAATTAACGGTGATAAAGAAACTGGAATTACCATTATGGAAATGGTTAAGAAGATGGATGCTGGTGATATTTATGCTCAAGAAGCAATTAAGATTGAGCCTGATGATAACGCTGGCACTTTATTTAGTAAATTATCAATTGTTGGGCGGGACTTATTGCTTAAGACTTTACCAGCAATTATTGATGGCTCAATTAAAAAGGTTCCACAGGATCCAGAAAAGGTCGTCTTTTCACCTAACATCACTAAAGAACAAGAAAAGCTTAATGTTGATATGACAGCAGAAGAGGCCAACGATATGATTCGTGCTTTGAATCCAGATCCTGGTGCTTATTTGATGATTGAAGGCAAACGTTTCAAGATCTGGAAGGCAGAAGTTGCATCTGATTCATCAAGTTTAAATGCCGGCTCTGTTGTTGCTAACAAAGGACGTTTTGCCATTAGTTTTGCTGATAATTCAGTACTTAACTTACTTGAAGTTCAACCAAGTGGCAAAAAGAGAATGGACATCAAGAGCTTTTTAAATGGTCAAGGTAGTAAGTTTGTCCCAGGTGAAGAAATTGTCGATCGATAAGAGTGCACGTGCAGTCAGCTTAGAGACATTGATCAAGGTCTTAGATCAAGGCTCCTATTCTAATATTAGTTTGAATAACAGCTTAAAGCACTCTAACTTGTCAAATGCAGACCAAAATTTAGCTACTAATATTGTTTATGGCACGATTCAGTATCGATTGTTTTTAGAATATCAGTTAAAAGGCTTAGTTAGGACAAAACTGACCGAAAAATATATTAAGCCATTATTGTTAATGTCACTTTACCAGTTGATTTTTTTGGATAAAGTGCCTGATCGTGCTGTACTTGATGAGGCTAATAAACTTGCTAAGCAATATGGCAAGCGACATTCAGCTGGCTTTCGGTTGGTAAATGGGATTTTGCGTTCGTTTACTAGGCGCGGGGTGATTTTACCAGCTGAAAATAATCCAGTTAAATATTTAAGTGTCAAAGAAAGCGTACCTGAATGGTTAGTTCAATATTTAATTGATAGCTGGGGCCTAGACAAAGCAAAATCAGTTTTAAACAGTATTAATGAGCCAGCTAAAAACAGTGTACGTATTTCAAAGTTGGCAGATAAAGAGCAAGTTTTTGCCCAGTTAGAGCGCGATAACTATCAACCACAATGGTCTAAGTTATCAAGCGATGATGTGATTTTGAGTCACGGTGGCATTAGCGAAAGTGATTTGTTTGAAGAAGGCAAGTTAACAATTCAAGATGAGGCTGCCAGTTTAGTTGTAGAGGCTTTTGACTTTGAACAAGATGAGCATGTGCTTGATGCTTGTTCTGCTCCCGGTGGGAAAACCGTGCAAATTGCCGAAAGCATTGTTAATGGTGATGTGACTGCCTTAGATATTCATGATAAAAAATTACGTTTAGTACGAGATAATGCCCAGAGAATGCACGTTGCAAATAAGGTAAAGACTAAGGCATGTGATGCACGTAAGGCTACAGAGATTTTTGCAGCAGGTGAATTTACCAAAATTTTAGTCGATGCCCCTTGTTCTGGGCTTGGATTATTGCGTCGTAAGCCTGAAATTCGCTATACTAAGAGACAACAGGACTTACAAAATTTACAAAAAATTCAATTGGCAATCTTAACTGCAGTAAGTTCACTCTTAAAAAAGAATGGCGAGTTGGTTTATTCAACTTGCTCAATTTCAATGGAAGAAAATGAAGAGGTAGTTAAGAAGTTTTTGCAAGCACATCCTGACTTTGAACTAGTTCCATTTAAGTTAACTAAACTTGAATCAAAGACAGGGATGTTGAAAATAATGCCTGATCTAGATGGCAATGATGGATTTTTCATTGCTAAATTTAAGTTACGAGGTTAGATTTTTGATTGAAACAGCATACGCTTCGAGTATTGGTAAGGTACGGAAAAGCAATCAAGATTTTGTAAAAGTTTTTAAAAATCAAAAGGGAATTGTCTTAGCAATTGTCTGTGATGGTATGGGCGGCCATCAAGGTGGTGACGTTGCTTCAACAATGGCAGTCACCCATTTAGGACATAATTTTAGTATGACTGACTTTGCAGATGCTAATCTTGCTCATAAATGGCTTGATGTGCAATTAAATTCTGAAAATGAAACAATTTTAAAGACTGCTGATAAGTTTCCTGACTTAAATGGAATGGGGACAACGATTGTATTGGCGTTTGCATTTGATAAAAATGCCTTAATTGCTCATTTAGGTGATTCTCGGGCTTATAGTTATTCTGAAGGTAAATTTGTCCAATTAACTGAAGATCATTCTTTGGTTAACGAATTAGTTAAGATGGGTCAGATTACTAAAGAACAAGCTAAACACCATCCCCAGAAAAATATTATTACGCAAGCATTAGGCGTCTCAAGTACGATTGATCCTGAATTTGATGAGATCAAGATGGGGGGAAACGACATTATTTTGCTCTGTACTGATGGCCTAACCAATTCACTTAGCGATCCACAAATCCAACAAATTTTGGCAACTAAGGAGCTTAGCTTAAGAGAACGTTGTAATAAATTGATTAGTGAGGCCAATCGATTAGGTGGTGGTGATAATATTACTGTCTGCTTAATTTGGAACAAGGAGGACGAGAGCAGTGATCGATAAAGGTTATCTGCTTGGGGAACGTTACCGCATCATCGATACCTTAGGTGAAGGCGGAATGGCCAATGTCTATCTAGCGGAAGATATTATCCTGCAACGTAAGGTGGCAGTTAAAATTTTACGCCTTGATTTGCAGAATGAACCGCAAACCCAAGCTCGTTTTCAAAGAGAGGCATTAGCTACAAGTGAATTAAGTCATCCTAATATTGTTTCTGTACTTGATGTAGGTACCGATCATGGTTTGCCATACATGGTAATGGAGTATGTTGATGGTCCTAATCTAAAAGAATATATTCAAAAAAATTCACCTTTGGATTTAAATGAAATTATTCGAATTATGGATCAGATATTGAGTGCAGTTGCATTAGCTCATAAGCACAATGTTATTCATCGTGATCTAAAACCACAGAATATTTTGATGGATAAGCGCGGCAATATTAAAATAGCTGATTTCGGAATTGCCGTTGCTTTGAATCAAAGCTCGATTACACAAACTAATTCAGTAATGGGTTCAGTTCATTATATGTCTCCTGAGCAAACGCGTGGCGGAATGGTTACTAAACAATCTGACATCTATTCCTTGGGAATAATTTTATATGAATTGATCACAGGAACTGTTCCGTTTAACGGTGATACACCAGTGGCAATTGCACTGAAGCATGCGCAAGAACCAATTCCTTCAATTCGCAAGAAAGATTCAAGTGTACCACAGGCGCTGGAAAATGTTGTTTTAAAGGCAACCGCGAAAGATCCACGAGATAGATATGCTACAGCTCAGGAAATGAAAGCAGATTTGGATAGTAGCTTGGATCCTGAACGGGCAGATGAACCGTTTTTTGTACCATATCATGGTAATAACGATGATAAAACAATTGTATTGCCTGGATTTAAGCCACAAAAGGAAGAAAAAGAAGTGGTGGAGCCAGCAAAAACCGAATCAGTAGAATCAAGCAAGCTAGTAAAGAAAAAGACTTTTTTACAGAATGTCAAAAGTCACAAATGGTGGTGGCTGATCTCAATTATTGCCGCGGGTTTAATCATTTTTATGATGATTTTCGCTTTAAGTGGTACTGGAAATAAACGACAGGATGTTAATATTCCTGATGTAACTAATATTGCAGAAAAAGCAGCTGAGAGTAAACTTGAAGCAGCAGGCTTACAGGTTGGAAAAATTATTAGGCGACAATCAGATGATATAAAAAAAGGCCGGGTTATTGCGACAAAACCAACTGCAGGCAATAGTCTAGAGCGGGGAAAGAGCGTTGATTTAATTGTTTCCAGCGGTTCTAGTATGGTTAAAGTTCCTGATATGGTTGGGAAGAACTATGCCGAAGCGGCAGAAAAATTAGAAAATATGGGCTTTAATGTAGTTAGAGAGGACCAATATTCTAATAAAGTTGACGAAAATCAAGTTATTTCTCAAAGCATTGCTGCAGGTGTAGAGGTTAAGCCGACGCAGACTACAATTACGTTGATAGTTTCACGTGGCAAGCAGGCTAGATCACATTCAAATATGGTTACCTTGAAAGACTTAAGTAATTATTCTTTGAAGAGTGCTCAAGACTATGCCAAAGAACATGGCCTGACTTTACAAATCAATCAAGAATATTCTGATGATGTTCAGAAGGGCTTAGTAATTTCGATGGAGCCAGGTCCGGGTACTAAGGTTGAGCGTGGTTCAACTGTTACCATCAAGGTCTCGAAAGGTCCAAAGGAAGACAAGGAAACTACTGTAACTAAGACCTTTACCGTTAACTATGTTGGTGATGATCTTTCTAAGAGTGAGAAGCCTGATAATGATAAAGGAAGCAATGACTCTGAGTCAGAATCCGTTAATGGCAAGGGTGATCATGTCCAGATCTATATTAAGGATGATGATCATTCCTTGAACAATATTTATCGTGACTTGTATATTAAGCATGATATGAGTTTCTCGATTCCATTTAACATTAGAGAAGGCAGTGGACAATTAAAGGTTGTTCGCA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49 | Staphylococcus_phage(31.82%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
918363 : 982995
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP026503|918363:982995|DBSCAN-SWA 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52 | Corynebacterium_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1023274 : 1108535
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP026503|1023274:1108535|DBSCAN-SWA 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91 | Lactobacillus_phage(36.67%) | tRNA,transposase,terminase,portal,holin,tail,protease,capsid,integrase | attL 1070530:1070547|attR 1105851:1105868 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1160041 : 1169978
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP026503|1160041:1169978|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP026503|1160041:1169978|1166310_1167489_-|AZR15542.1|transposase|DBSCAN-SWA MNDFTKDFAQALFNPDKINDLLRKELQQAVNNLLEAELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGPIEVQVPRDRNGQFHQHTLPDYKQHSDILESMIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYLPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTDMLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKTALARTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDREKIMNEFKQVHQQTNKEEATAVLHDFYTKWGKVYSHVIRSLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDAFIGIQAMSYNDRYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD >CP026503|1160041:1169978|1161972_1163040_-|AZR15538.1|DBSCAN-SWA METAKYLELIQIEVNKLPDFVKQFNLGTNHSLTTTYQYLTEIRRFFDWLRQENISSASDNAHVTTDTLANLRRNDIMLYIDYLGHTRNKQGRLNSPTTINRSINALRSLFKFLTITADNNHGEPYFERNVMLKINSLNDTQTLNYRAHVLESHMYTGKLKFEFLTFIDQDYINHCNKQAKIGFKQNKERDMAIAALILGTGIRVSECAGVDLSDLNLKDAVLDVTRKGGQKDSVPIAEWTLPYIKRYKGIRNERYHADSKQVAFFLTQWHGQTRRITTNAIEKMINKYSAAFGHPLTPHKLRHTVASELYEVTKDQVLVAQQLGQKGTSATDLYTHVDQKKQRAALNEISKKNHD >CP026503|1160041:1169978|1163542_1164001_+|AZR15539.1|DBSCAN-SWA MTEEISVNFQAKNPSGIKLLNRLYDGHLVLNDIGVRLDEQLNNEDEELTVPTQADVDNLSETFGKTVTVFSDIADAYGDVNNFAKNFGGTTKIFAQKLITELVDFNNGIADIGDSEGGLENYDNDKLNDWINQVMSDIVETNEAFNALIDDK >CP026503|1160041:1169978|1164806_1165964_-|AZR15541.1|DBSCAN-SWA MFKRKSIIKLACATMLTNAGVTLLSQMTRFSDSESIVQASSTSVVAKALGIDVASYQSADLTAHAKAGSQFAIVKVSEGTSYRNPKAANQIKSAIANDMMPMAYHFATFSSSSSAAKREAQYAISSAKALGLPAGSYLACDYETGQGNIITNGKNVTAKAIIAFMDQIKAAGYQPLLYASSSVLQNNINTPSIVNKYPNSLWVAAYAISGRVDQPNFKYFPSMDGVAIWQFTDNWRGMNTDGNITVLPLSIAGNAAVSQAPKASNTKKTATVMYKSYVYDKNSNRTNDFYNAYSSIAYYDNKVRIKGKSMIRVGEDKYVMASNVLGNSRVFKADAKVYKNDGTINTKWSTKKSGSPIKTYGPKHYINNEAYYRIGKNAYVKADKF >CP026503|1160041:1169978|1160041_1161919_+|AZR15537.1|DBSCAN-SWA MKNINNNQNLNFTQVKDILAQQAITIAAKEQLSSVQPSSNLHKVEQLLNETEEAVKILKLRQHIPFASSEDIEHLITKAEKGLILTPDDLEKVAEFLRVNRLLQRFLARHEQLAPLLNAYVQDMTLLPDIEDAIYTTIEHGQVRDEADRELAKMCRDLKKSVTELKTALNHFLTSKPNQKMIRDAMIVEKEGYATIPIKANYKNQLSGTIVAVSNGGQTVYFQPAKVVRLNQQITNLKAQIRNLELAILGALTAKIYDVKDDIKRNIELITLLDMIFARGKFAQKYNCIRPKINRENSLVLRAVRHPLIINPVPLTLELTQENSVLMITGPNAGGKTVALKTTGLMILMTELGLFLPSDKPCDIPLMDDVFTLIGDHQDLDNSLSTFSAEMKDIAMITKYAQFHSLVLLDELGTGTDPNEGSALAIGILQELYLRGCLIMATTHYSSIKDFAKQHDGFITAAMDFDLKNLQPTYKLKIGSIGNSRALWIAKKSGIPENVLHQAEAILAGNNLPLSLKKRFVHQRKNKSNLVVKKEFHKGDIVYATNLKEEGIFYKYLPTQNAAKIFVTKEFVEVPLRRLQLRRLAKDLYPKGYNLDLLFVKDWQDYKFNRDLDRGSKKAYKKLKH >CP026503|1160041:1169978|1164045_1164657_-|AZR15540.1|DBSCAN-SWA MKFKKKLALFLGLGVLLLSLTGCSDFQNWELSMRSKIGALPLTVSTYDSNGQKIDQIKAKSVNIHTDKKMSQKSSNGTEHSSVIDVDYGNNRMIHVGSTMIAYEGLKNYEDAFNKKVKIDDQNRSVPLLNTMYQNFKNDWNGSSRVVMIRSQLGMPIAVFIGNHVSIHKSDMKNATQFVIDGHRLFVYRADYTVYPMSSLKSN >CP026503|1160041:1169978|1168799_1169978_+|AZR15543.1|transposase|DBSCAN-SWA MNDFTKDFAQALFNPDKINDLLRKELQQAVNNLLEAELTAFLGYDPYARNGWNTGNSRNGAYFRKVDTQFGPIEVQVPRDRNGQFHQHTLPDYKQHSDILESMIIKLYSKGVTTREIADLIEKMYGSHYSPAQVSNISKQMIPKVEAYHKRKLSDKFFCVYLDATYLPLRRETFEREAVYIAIGIKPNGHKEVIDYCIAPSENIEVWTDMLQNMKSRGLKQVELFLSDGVVGMKTALARTYPKAHFQRCLVHVMRNICAKVRVDDREKIMNEFKQVHQQTNKEEATAVLHDFYTKWGKVYSHVIRSLKDIEPDLLVFYNYPKQIRASIYSTNMIESFNNVIKRKAKPKAEFPTEQSLDAFIGIQAMSYNDRYFNRIHKGFGQVQDTLESYFD |
7 | Lactobacillus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1229956 : 1324291
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP026503|1229956:1324291|DBSCAN-SWA 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92 | Corynebacterium_phage(20.69%) | tRNA,transposase,terminase,tail,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1328358 : 1406052
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP026503|1328358:1406052|DBSCAN-SWA 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81 | Lactobacillus_phage(28.57%) | tRNA,transposase,protease,head,integrase | attL 1321780:1321794|attR 1344456:1344470 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1409888 : 1470347
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP026503|1409888:1470347|DBSCAN-SWA 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53 | unidentified_phage(27.27%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1577252 : 1631440
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >CP026503|1577252:1631440|DBSCAN-SWA TTTAATCAAAGTAGGATTCTAAGGTATCCTGAACCTGACCAAAGCCTTTGTGGATTCGATTGAAATAGCGTTCGTTGTAGCTCATTGCTTGAATGCCAATAAAAGTATCAAGCGACTGTTCATTTGGAAACTCTGCTTTAGGCTTAGCTTTGCGCTTGATCACATTGTTAAATGATTCAATCATGTTAGTCGAATAAATTGAAGCTCTGATCTGCTTGGGATAGTTATAAAAGACCAGCAGATCTGGTTCTATGTCTTTCAAGCTTCTGATAACATGGCTGTAAACCTTGCCCCATTTGGTATAGAAGTCATGCAGGACAGCTGTGGCTTCTTCTTTGTTTGTCTGTTGATGCACCTGTTTGAATTCGTTCATGATCTTTTCACGATCGTCGACGCGTACTTTAGCGCAGATATTGCGCATGACATGAACCAAACAGCGTTGAAAATGAGCTTTAGGATAAGTCCTGGCCAAGGCTGTTTTCATGCCAACAACACCATCAGAAAGAAAAAGCTCAACTTGCTTTAAGCCTCGGGATTTCATGTTTTGAAGCATATCTGTCCAGACTTCAATGTTCTCGCTAGGCGCAATGCAGTAGTCAATGACCTCCTTGTGCCCATTAGGCTTGATGCCAATGGCAATATAGACTGCTTCACGCTCAAATGTTTCTCGGCGCAAAGGAAGGTATGTCGCATCCAAATAGACGCAGAAAAACTTGTCGCTTAGCTTGCGTTTGTGGTAAGCCTCAACCTTTGGAATCATCTGCTTGGAAATATTTGATACCTGAGCTGGACTGTAATGGCTGCCATACATCTTTTCAATTAGATCGGCTATTTCCCTGGTGGTCACGCCCTTGGAGTAAAGCTTGATAATCATGCTTTCCAAGATATCCGAGTGCTGCTTGTAGTCAGGCAGCGTGTGCTGATGAAACATGCCGTTGCGGTCCCTAGGCACCTGAATTTCAATCTCGCCAAATTGTGTATCAACTTTACGGAAATAAGCACCATTGCGAGAATTACCGGTATTCCAACCAGCTCTATCATAAGGATCATAACCTAAAAATGCGGTTAATTCAGCTTCTAATAGATCATTAACTGCTTGTTGGAGTTCTTTACGCAATAAATCGTTTATTTTGTCTTGATTGAATAGAGCTTGTGTCATATTTTTGGTAAAATCATTCATGAAGGAATCTCTTTTCTAGTATGTTTTTCGTTCAAATCAATCATACGGGAAAAGGATTCCTTTTTCTAATATTCAGGGAAATAAAATTAAGGAAATATTCATCCTTACACAAACTATTTTACAGTCTCTCTATTTAAGCCTTGGTGCGATTCTTTAATGTTACCTATCTAATTCTTGATTTTGGTAGAATGATTTAATTCTTTTAGTTTTTAGGTCATTAATGTCAATATCTTTTTGCGAAATTTCGTTGCTCAAATGATACGCAACTTCGTTCTTGCTAGGTAAAGTTTCTATCATTCGGTCCAAAGCTTTGTCTTCTTGTTCTCTAGTATCTGCACGATAAAATCTCATGAGGCTAATCATAAATTCAGCGTGGTCTATGTTGTCAAAAGGAAGGGTTAAATAATCTCTGGTTTCCCAGGTATCTCGAGCAGAGTTTGCGGCAATTAGCGCTGTTCTTTTATTTCCGTCCTGGAATGGTTGAAGCTTGGATAAGCTTGCAAATACTCTCCACGCATCTTTAGTAGTCTGTTTAGACGAGTTGTATTGTTCAATTATTTCATCTAAGTCTTCGGGGTAGACGTTTTCTGGAGCAAAGTATGCACCTTTAGCTGTGCCTTTAGCTGTGCCTTTAGGGTCTGTGATAATGACAATTGCGTCGTCTGGATTATAACTTGCATGTCTTAAGCGCCCTGGAATACTTGGGTCTTCTTCTTCGCTATGGGTAAAGGCTTTATTAATTTCAATAATTCCTTGTCTTGTAAATCCGAATTTCTTTGCTGCAGCTATGCCATCTAAAGCATCTTTTAAGATGGCACCATCGTGGTGTTGATGTACAAGCTTAGATAGGTCATTAAGATCTAAGGCTCTTTTTGTTTGCAACACAGTACTACTGTAGTCATTCATACTACCAAAAGAGACTATGAAGTTTGCAAGGTCTAGGTTTTCAATCATTTGTTCTCACTTACTTTCCGTTTAGTTAGATTACTTACAATTTTAGCACTATTTAATTAATAATCCTTGTTTTTGGAGCGGCACATACGCAAGCGGTATGTGCTTCTTTTTTACATTAAATTAGCAGTTAGTTTTTGATTAGCTGCTCTTTCTTATTATTTATCTTTCTAATCTTTGATCTCTTCTTCGCATAATATGATATCCATGAGGTATATATTTAACCTGCTTATTCAAAGTTTGTTCTAATCTCTTCACTTTTTTTCTCCTTTACACTACAATAAATTTAATTGAAGAAGCAATTTTCAAATTAAGGTTTTGAATTTTCAATTCAGGTGGCTCGCTGCCTTGTCGTATGGCAAAAGAGAGCGTAGTGCATTGCTTTTCAAAAAGTCCTTCGATGTTTGGAGGGACTTTTCTTTTACACTTTTTCTTATTGAATATGTGTTAAAAAAAGTTTAAGAATAGCAGTAGAAATTAAGGATCATTACTTGATCATGTTGCCCACTGCCTTGACGATATGCTAGTCAGAATGTCTATTATTCATTAATTTATCCTTTCATGTTACAATGTAGGTAAAGATCACAGTGCAAATTAAAGAGTTGTATTTACAACTTGGCTGCCTACTACCTTAGCGATATGCTAGCTTAAAGAAGGCGAGGAATAGATCAGTGAGACTCATTAAAGAGCGGCATATACGGAAAGCGGTATGTGCTTCTTTTTTTGCATTAAATTAGCAGCTAGTCACTGACTAACTGCTTTTTCTATATGCTTATCTTTCTAATCCTTGGTCTCTTCTCAAATAAGCCGATCGCTTTTCAAATTCTTGTCCTGGTAATGTTCTGGTTGTATGCTTAGATTTTTGTTTTCCTTGTTGCATTTTCCGAAAAGCTTTTAAGGTGTCATTCCAATCTTTACCTAATTTTTCACTAGGTTTACAGTATTTAACTTTAGGAAATTTAGATTGAATATCTTTAACAAATCTTTTTCCAGCTTCATCATTATCTACACCTAAACCTACACTTTTAAGAATTCGACCTTCTTTTTGTAATTGTGCTGCTGTTTGTGTTATATACGAGTCAAACACTTCTTTTTTAAGGCCATCCATTGAAACAAACCTAGTATTTTTCATTCCACCCTTTACTTTTACCTTAGACAAGTCAAAGAAACTAATTGCATCAATTGGTGATTCAAAAAATCTAATATTTTCTGGAGTTTTTCCATTCATACCTGGTGAATCGAATGAAAAACCATATCCCTTGGTAGAATTTTTTTCAATCATTTTGAGGGTTCCTCTTCTACCATATTTTTGATGATTAATTTTTGTACCTTGTTTTGATACTCCTTTAACTTGTCGTCTATCTTGAGGATCAAGCCACAAAAAAAGTGCGTTACCCAATTTATCTTGTGCAAGCACTTTGTCTCTATGTAATTGATCTATAGTTTGACTCGAAATTCCACGTTGATTGTGCAAGTATCCCCATACTCGATTAATTTTATTTTCTGAATCTATTTGATTTTTATCAAACTTGAAGGATTCTTTTTGGACCTGATAAACTTTGCCATCACCTACTCCACTAGTTAACACCTTATCCATTGCCTTTAGGAATTTCTCTTTTTCATTTAAATTGCTACCTGACAATTCATACAATGTAGAAAAGCTTAATGCACCTTTTCCATGAACTTGTCTTGAATTCCAGTAAAAAGAATTTTTGGATGGTGTAATTACCAATGAATCATGTTCTACCCCTTTAAATTCATCGCTGCCTGTTTGACGTAAATCAATTCCTGCACTCCTTGCATATTCAACAATACTCGCTGAATTAGCTGCCTTAATTTGTTCCTTTGTAAAAGTAAGCATTTATTTTTCTCCTATTCTTTAACGTCAAAAAAGCAAGTAGTAAAACTACTTGCTAATTTCCCCACCTATACCCGACTAACTATATAGTCACAAATTAAGATGATTCTATTCTAATTCTCGTTCAACTTCATTTTGCAATTTCTCAAATTCACGTAAGTTCTTCTTGGTTTCAATATCCGCATTTGTCTTTTCAAATACTTTTTCTTGGTTAGATTTAATTTTTCGTATTTGACTTTGACTGATAAAAGGCTTTTTTAAGTAAATATGTCCTTTTAGATTTTTTCTACGCTTAATAATATGTGAATGAAGTGTATAGTCGTCATTTGATTTTATCTTATTATTTTGTATTGTTGTATCCTTACGAATTTCTTTCAATGCGGATTGAATATATTCGTTTGGATCAACTTTATCTTTAAAATTAATCCTATGTCTTTGATTATGGTTAGCTTGCTTATCAATTTTTCTTAAATCAGCTAGCAATGCGTTACCATTTCTTGCATAAATTCCTTCTTTGCCATATAGTTGGTTAATTGCATAATTCTTATTTTCACGTTTACTTTTACCATATAAGTCTTGTCGGTCATCTTGCATTTTCCAAACTAAGTCTTTATATTTTTGAAAATCGGAGTTATATTTTAGCAATTCATCAACCAAATGATCCGACATCTTTTTTTGATTTTTATCTAACTTGTTGTAAAACCATTCTCTTCTTGACTCAGGCAATGCTCTAACAAATTGATTTATCTCTGCTTGAAAAGTTGGCTGTTCAACTTGACTAGTCAAATTAACCTGAATTGCTTCTCTAATAGCTTGACGTCTCTGAGATAATTCTTTAGTCATCTCTGAAGAACCAATCAACTCATTAGCAAAACCACTTTTCATATGATCAATTATTTTTTGTGGTCGCCTACCCTTAGGTTGACTAATCCCTTCACGGTTTATAATTTTTCTTCTTGGGTCTTTCTCAACTGTTGCAATGTGAATATGAACATTATCAGTATTTCTATG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59 | Lactobacillus_phage(50.0%) | head,terminase,tail,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1641084 : 1645978
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP026503|1641084:1645978|DBSCAN-SWA GTCATTTTTTATTACCTCCTAGATAGATGTCACTCATTCCAAGTTGATCACAGATGCTTGCGATAATTTCACTGTTGAGATCTTGAAGATCTTTGATAGTTGCTGGACGTGTAACACCACCGTTGCCATCGAACTCTTTAACCATTCCAAACTCTGTTTTTGAATTATTAAGTTCATTGAGTGCTTCAAGTTCTTCACGTATGTTTTTGTAGCAATTCATTTCAATCACCTCCTATGCAATGTCGTCACGTTCAATCAGTGGCAAAATGTCGTTATCTTTTAGAACGTCGTAGATAAGTTTTCTACCTGCTTGCGTCCAATAAGTTGAAAGACTAGTTCTGTTGTTGCCTTTGTGATCCTTATAGATAAATGGCTTAGTAGTTACATAGTTCTTACCCATGTAGGCTCTGTATAAAATCCATTGACCATTTACACGATGTTGAATCCCAACTTTATGAAGTAATCTGTTGAAACTTACTGCACCGTATCCGTAGTCTGCTGCAATCTGTGAAATTGCTAATGCATCAGGTGTTCCTAAAATCACATCAAGGTAATCAGCTTTTTTATTGCTTTCCTCAAGTTGAATGCTCAAGTTTTTGTTTTCTAACTTAAGTTGTTTGATTCGAGCATTTGAAAATTCCAATGCTCTATGCATAACCATTTCTGGGCTGTTCCATTTACGCTCTAGGTCTAGGAAATATTCTCTATAAAGCTTTGACTTTTCTGTTCTTGCCATCATTGCTAATTGCTTAGCCATTTCAATGGTTAATAAATAATCATCTAACTCACGAACAGCTCCGTTGTTAACAACCGTACTTGATGTACACTTGTAAAAATCCTCATTTTCAGTGAATAGTTCTGAATTAGTTTTGAACCATCTGCTAAATCTTCCTTTTAGTCCAAGACCTTTATGTAAGTCTCTTGCACTAACAAGTTGACGATCGTTTTTGACTTGAACTTTCATTAGTTCTTCCATTTTTTGCTCTCCTCTTCTTCTCAAAACGGGTAACTTTATTTCAAAAAAATATCTGGTGAGATACCTAATGCTTTTGAAAAAGCCATTGCAAAATCAGCATCAAACTTATATCTTCCGTTAAGCCTTCCGCTTAGTGTTGGCTCGCTAATGCCTAGTTTATCAGCTAGCCAGCTTTGCTTAATGCCATGTTCACGCAAGTATTGTTTAGCCAATTTTCTTGCGTTATCTTTCAAGACACTTGCCATCCGACCATTTCCTTTCTTCTCATTTCGTGTAAATCGATTACAGTTATATAATACTACCCGTTTTGAGAAGAGTCAACATATTTATTTACTTTTTGACAAGAAATGTTTTCAAATAGCGAATAAGAATTTACAATATACTCGTAAAGAGAAGAAATTAAACGCGAAGAGGTGTAATTATGAGTGTTTTTAGTAACAGATTAAAAGCAATGCGAGAAAATGTAGGCTGGACTAAGACATATGTTGCTACAAGACTGCATCTTCCATTAACTACTTATGCAAATTATGAATATGGTAAACGAGAGCCAGATATAGAAACTATCACGGCAATTTCAAGACTTTTCAATACATCTACTGATTATTTGATGGGAAAGACTGATGATCCTAATTCTACTGATCGTCCCTCTGATACTGCTCTTACGTGGGAGGATTTAAAGACACCTATGCCTTATAACGGAAAGATGCCGGAAGAGCTAAAAGATACTTACGCCAATATTGCTCAAAGTTTCTTTAAATATCACCCAGAATATTTGAACAAGAATCGTGAACATCATGAAGATTAAATTAATTGACGAGCTATCTATAGAAAACAAAGAAAACTACGACAGGCTTATAAAATATCTGATGAATGCTGCAATGTTTGATTATCACATTGGTGTAGAGTTTACCAATCAGCTTCCACCACTTGCGCCGCCTATCAGTTATAACAACATGGGTCGATTAATTATTATGAATGCACGTTGGCCATACCCATTGGAAATTCCTTTTCAGTTAGCTCATGAAATCGCACATGTCTTAAATGAAGATCAGCATTATTACAACTTAAATGATCGAACCGTGAATCGTGGTGAGGCTGATGCAAATATTTTCGCTATTAAGTTGCTTCATAACTATTGCGATGATAACGAGTATCATTTCGACAGTTACTATAAATTTGCTGAAGCCTTTTGCATTCCTCAGAACCTTTATTACCTATTTAATGATGGTTGCATAGTCCAGAACCAGTAAATCGTCCAGGGCAAACGACACCAATGACGTTAAACTTCGTGCCTTATTGTGGAGGATTAATTATGAATAAATTTGTTAAAATGGCTGCTGTTTCATTAGCCTTACTTGGCGGATCCTATACAGTAGCGGCTTCATCTACTAGCTCTGTTCAAGCTTCAAGTATCTATCCTTACTCTTCTTCTCACTGGGATAAGAACCGAAAAGTGAGAGTTAATATCACAAAAGTAACTTTCAGAAGATACGATGCTTTGAAAGATAGATTCGTTCGTGGCACTAAGAAATATTATTACTCAGATGTAATTAGAGTTAGAAAAGCCGGTGAGTTTGAAGGCTGGGTATTAGTCGGCACCAAACCTGGCAGTCGCTATTGGTGGGTTAACACACGTGCGAACACCAAATGGTTTAGAGACTACTACAAGCTTCATAAAACCGGCTGGAATGGTAACACTCTTACAGATGAACGTGGAAATAAATTAACTGTTGATTCTATTCAAGTCGTTGACTTTGAAGAAAGCGGACTCCCAAATACTGATGTCTTAATCAATGGCTCCTTCAAATCTAATAGAATTTATACTCCTTTAAAGCCTACTAGTTGGATAGATAAGAATGTCTTTGTTTATCCAAGCGACAAAACGAGCAAGGATACTTTGTTCACACAAGATGATCAAATCGATTTAAGTCCATTTGAAGGAATTGATGCAAAGGCAGTAATGAACTCTGATAAAGAGTTCTTCTCTGAGGATGGTACTGTTAGCGTATCTATTCCACTTACAGCTACAAAAGCCAGTGACGTTTCTAGTTCATACACAATAGAAGACTTCGATGGTCATAAAAAGACTTTTCCAGCAACTCGTGTAACTTTAAAGCAATACAAGCCAAACTTTGACTTTGATTTTGAGGATGATGAGGATTAATTAGAAGAATCGAATAATAATCATTTGTATGCTATAATTAGTTTATCGGCAGAATGGTGCCGACCATATGCATTATGCTATGGTCTTATTTATAAGTATTGCTCAGAATGTTGAGCGAGGCATACAAGTTATCTTGTATGCCTCTTTTTTTATTCAAGTATTTTGGAGGTAAAGAATTATGAAACATAGATTTTTAACTGCTGCAATGGCTTCAATCATGTTAGCTGGTGGCGTTGGTGCTATTTCTACAGCTACGGCACCTACTCAAACCGTGCAAGCCATTAGCAAGTACTCACACCACTGGCACTGGGTAAAGGTAACCAAGGAAACACCAATATATAAGGTCAAGGTTGGTCGCTACATGTATCAAAGCAAGCTCACACACAAGACTTACATTGAGAAAGGATCAGACTTGAAGGTTATGTATTCCGGTCATGACTACCCTTGGCGTGTATACGGTGGCTGGCGTGGTCACTGGGTTGCTTTAAGACAATCAGCGAACTGGTTCAAAAACGAATAGAAAACAAAAATCCTGCCTACCCTATTCAGGTAAGCAGGATTTATTACACAGTTGGTTAGAACGTTAGTTTGAAAGGATGATGATATATGCCTCGTAGAAAAGACAATGAGATCTACAAGTACAAATTGAAGTCGGGCAAGGTCAAGTACGGATTTAAAACGTATATTGGAACTGATCCAGAAACCGGTAAGGCAGTTAAGCCATCTCGCCAGGGCTTTGACAGCTACAAAGAAGCGGAAGCAGCTAAGACCAAACTAAAAGAAGAGGGTCCTAGTAAGTTTACTCATAAGAAAGAACAGAAAGAAAACCGAAAAACGGTTCAAGAAGTATATGAGATTTGGCTAGAAGTTTATAGAGCCGATGTACGTGGGTCTACGCTAAGAACTCGGAAATCTAATTGGAAGAACAACATAGAGAAAGAATTTGGAGGCGTATATATCGACGGTATCGATATTAACCACTTACAAAGCTTTGCTACTAAATTGGCGGAAACTCATATTAATTACCGTTCTATTTTAAACTTATTACACAGAGTAATTAAGTATGCTATTCTACGTGATTGGTGCGACAGAGACCCTTTTGATAAAATTGTGATGCCTAAAAAAACGAAGGCAAAAAGTAAGCACCCTGCTAATAACTTCTATAGTTTAAGCGAATTGAAAACATTTCTTGAATGTGCCAAAAAGTATAAAGAGAAATATTACGTTTACTTTATGACAGTGGGTAATTTAGGCTGTCGCCCAGGTGAGGCACTGGCTTTAAAGTGGAAAAATATCGACTTCAAAAACAAGGAAATTTTTATTCAGCATTCTATCAGTACAGATGAAAATGGCAACAAAATCTATGGTCCTACCAAAACACCTGCGTCCGTTCGCAAAGTCCCCTTATCAGATCAGTTGGCTATAGTACTAAAGGAGTATAAAGAAGAAACAATCTATAAAAAAGGCAATGATTTTATCTTCCACAAAGATAATGGCGATTTTTATGAGCGTAGCGCACCAGATCATTGGATTACGACGCTCTATAACAACTATCCGCTACGAAGAATCACTCCTCATGGCTTTAGACACACACTGGCTACTTTACTAAATAATAGAAAAAATAATGCAAACATTAAAGATATACAATACTTGCTCGGTCATAAAAAAGCTTCAACAACCATGGATACTTACTCTCACTTTACAAAGGAAAATGAAGAGCATGTTGCGGAATCGATCAACAAATTGGATATATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_14 >CP026503|1641084:1645978|1644401_1644743_+|AZR16008.1|DBSCAN-SWA MKHRFLTAAMASIMLAGGVGAISTATAPTQTVQAISKYSHHWHWVKVTKETPIYKVKVGRYMYQSKLTHKTYIEKGSDLKVMYSGHDYPWRVYGGWRGHWVALRQSANWFKNE >CP026503|1641084:1645978|1641315_1642059_-|AZR16003.1|DBSCAN-SWA MEELMKVQVKNDRQLVSARDLHKGLGLKGRFSRWFKTNSELFTENEDFYKCTSSTVVNNGAVRELDDYLLTIEMAKQLAMMARTEKSKLYREYFLDLERKWNSPEMVMHRALEFSNARIKQLKLENKNLSIQLEESNKKADYLDVILGTPDALAISQIAADYGYGAVSFNRLLHKVGIQHRVNGQWILYRAYMGKNYVTTKPFIYKDHKGNNRTSLSTYWTQAGRKLIYDVLKDNDILPLIERDDIA >CP026503|1641084:1645978|1643371_1644223_+|AZR16007.1|DBSCAN-SWA MNKFVKMAAVSLALLGGSYTVAASSTSSVQASSIYPYSSSHWDKNRKVRVNITKVTFRRYDALKDRFVRGTKKYYYSDVIRVRKAGEFEGWVLVGTKPGSRYWWVNTRANTKWFRDYYKLHKTGWNGNTLTDERGNKLTVDSIQVVDFEESGLPNTDVLINGSFKSNRIYTPLKPTSWIDKNVFVYPSDKTSKDTLFTQDDQIDLSPFEGIDAKAVMNSDKEFFSEDGTVSVSIPLTATKASDVSSSYTIEDFDGHKKTFPATRVTLKQYKPNFDFDFEDDED >CP026503|1641084:1645978|1641084_1641303_-|AZR16002.1|DBSCAN-SWA MNCYKNIREELEALNELNNSKTEFGMVKEFDGNGGVTRPATIKDLQDLNSEIIASICDQLGMSDIYLGGNKK >CP026503|1641084:1645978|1644829_1645978_+|AZR16009.1|integrase|DBSCAN-SWA MPRRKDNEIYKYKLKSGKVKYGFKTYIGTDPETGKAVKPSRQGFDSYKEAEAAKTKLKEEGPSKFTHKKEQKENRKTVQEVYEIWLEVYRADVRGSTLRTRKSNWKNNIEKEFGGVYIDGIDINHLQSFATKLAETHINYRSILNLLHRVIKYAILRDWCDRDPFDKIVMPKKTKAKSKHPANNFYSLSELKTFLECAKKYKEKYYVYFMTVGNLGCRPGEALALKWKNIDFKNKEIFIQHSISTDENGNKIYGPTKTPASVRKVPLSDQLAIVLKEYKEETIYKKGNDFIFHKDNGDFYERSAPDHWITTLYNNYPLRRITPHGFRHTLATLLNNRKNNANIKDIQYLLGHKKASTTMDTYSHFTKENEEHVAESINKLDI >CP026503|1641084:1645978|1642853_1643309_+|AZR16006.1|DBSCAN-SWA MKIKLIDELSIENKENYDRLIKYLMNAAMFDYHIGVEFTNQLPPLAPPISYNNMGRLIIMNARWPYPLEIPFQLAHEIAHVLNEDQHYYNLNDRTVNRGEADANIFAIKLLHNYCDDNEYHFDSYYKFAEAFCIPQNLYYLFNDGCIVQNQ >CP026503|1641084:1645978|1642094_1642304_-|AZR16004.1|DBSCAN-SWA MASVLKDNARKLAKQYLREHGIKQSWLADKLGISEPTLSGRLNGRYKFDADFAMAFSKALGISPDIFLK >CP026503|1641084:1645978|1642480_1642864_+|AZR16005.1|DBSCAN-SWA MSVFSNRLKAMRENVGWTKTYVATRLHLPLTTYANYEYGKREPDIETITAISRLFNTSTDYLMGKTDDPNSTDRPSDTALTWEDLKTPMPYNGKMPEELKDTYANIAQSFFKYHPEYLNKNREHHED |
8 | Lactobacillus_phage(66.67%) | integrase | attL 1640257:1640269|attR 1647895:1647907 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1666576 : 1734798
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >CP026503|1666576:1734798|DBSCAN-SWA 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66 | Streptococcus_phage(23.53%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1665009:1665025|attR 1685838:1685854 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1762074 : 1875213
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >CP026503|1762074:1875213|DBSCAN-SWA ATTATTTATTCTCCCCTAGATTACGTTCATATCTTTCAGGACGATCATAGTCATCTTTTAACTTGTCATTTTCATAATGATGGGTTGTTTCCATATTAGGAAAACCTTGCTGGCGTAAAGCTTCTAGCAAAACCATTGCTACAGAATTAGACAAGTTATAACACCGAATGTTATCAGACATTGGGATACGTAAATTACGGTCATAGTATTCACGCATAAAAGTTTCTGGCAAACCAGTTGTTTCTTTACCAAAAACAAAGTAATAATTCTTGTTAGGATCAGTATAATCGACTTGTGCATAATTTTTTGATGAGAATTTAGAAATTAAATACATCTCATCATTAGGCCCTAAAGTCTTCAAAAAGGCATTCAAGTCATCATGTCTGCGTACATCGACCTTATCCCAATAATCAAGACCTGCTCGCTTCATTTTTTTATTATCGATTTGAAAACCAAGTGGTTCAATCAAATCAAGGACAGTGTTAGTCCCCGCACAAGTACGAGCAATATTGCCAGTATTAGCTGGCATCAATGGTTCATACAAAACTACATGATTAGTCATTCAAAAAACTCCTTATCAAAAAAAGCGTAGCTTTTAAGCCACGCTTTAAAACTATCTAGTATTTATTCGCTTTCGTCATGATCTGCATCCCCCGTGGTCGAAGAAACAGCATTCTCTTCAAAGAGTTTAGACTCTCTTCGATAATAATTGTACACGCGAGACACAATAATCTTCAAGATCGCATAAATTGGAATACCGAAAACTACACCCCATAAGCCCCAGACGGCACTAGCACCAATCAAGAGTAAAATTGTTGTAATTGGGTGCATTTCCATTTTATTCCCCATTACCCATGGGCTAAGAATTCTTGATTCAATTGTTTGTTCAATAGCAAAAACAATTAAGACCTTAATTAACATTGAACCTGAAGTCATAATTGAAATTACAATTACAGGAATCATTGCTAATGGTGTACCAAAGTATGGGATTAAGTTCATAAACCCAGCTAAAATTGCCAAAGCCACGCCATATGGTAAACCAATTAGAATGTAACCCAATGAGAACATCACACCTACCCAAAAGGCAACAGTAATTTGACCACGGACATATGAAGCAACAGCATAGTTAATATCATATAATAATTTGCTAAAACTAGGTTGCCATTTTTCAGGTGCAAACTTGGTAATATATGGCCGCAGTTGATGACCATCTTTTAACATGAAGAATAAAATAAACGGTGCAGTTAACAAAGTCATAGCCACCATTGTAATAATGCTGACGGCAGATGAAATATTGCCGATAGTTGCATTGATGGTACTTTGTCCAGACTTAAATAAGGTCTTCTGCGTATTATCAATCATGCCTTTGATACTGCCTTTAAATGAATGTAAACGCGGATCTTGCAACGCATTTTGTGTTGCATTAACCGCATCATTCCAAATATGAGGCCAGTTCTTTATCAATGAATTAATCTGATTCTGTGCAATTGGAACCAAGATATTAATAATCCAAATTAATGCGACAACTACTAGTAAGAATAAAACTATAATTGTCACCACTCGCGGAATCTTAAATTTTCTTTCACACCAATCAACAACCGGATTCATGATATAGTACTGAATTACCGCTAATAATAATGGCGGTAAAATTGCACTAAAGAAGATCCAGGCAGGATTCAATACAAAAGATACTTTATTAAAGACCCAAATAATTAAAAAGAATAGCAGGACGTTTAATAAAACAATACTAAAACGATTATCTAAGAACCATTTTTTAAAAACAGTTCCACCCCTATGTTGGTTATTTTCCATCTATTCATCCTAATTTTTAAATGTGTTCATAAACAATATCATCATCAACCTTAAAATTAGGTAATGGTTGATCAATATCCGGATCAAAGTAGATCGCATTAGCAAGTGGCGTCTTAGAAACGGGACGGTTAAAGAACAAGGTTGCGTGTCCCAATGCCTTCATGTTGCTCTCTACCATCGGACCAACATAGTTTGCAACATAGGTTTGACCATCAACAGTGATTGTATCGCCTTTTTTAAAAACAAAACCACTAACTGGCGTCTCAGTACTGAATTTTTGAATGACAGAAACGTCTTCCAAATCCTTATTAGCACCCTCGCCAAATAAAATTACCATGCCATCTTTATTATCGACGGCCTTTTTACCAATTTTTTTAATATTTGCAATCCATTTCATAATATAATCTCTCCTTAAAAATAATTTTAGCATAAGAAAAGCTGCTTAAAAACTTAAGCAGCCCAAAATCGGCGATTATTTTTTGCTCAACAGGAAATCGTGTTTTTAAGCGTCTAATCCGCTTTCATGCTATACTTTATTTTAGACTTATTTTTATTTAGAGATGGAGGCCCACACATATGAAGGTTTTAATCGGAGGTTACACCAAAAAAACTTCCAAAGGGATTTATGAATTACCTATTACCAGTGCAGCAAATGATGCCCGTTTAGGCAAAGCTGAGAATATTATTAGCGTTGGTGGTCCAACTTATTTCCGAAAAGATGGTAATTTAATTTTTACTGTTAATAACGCTGGCGATAAAGGTGGAATCAGCGTCTTTCAATTAAGTGATCAAGGCGCAAACGAAGTTGACCACTATTTAACTCCAGGCTCTTCGCCAGCTTATGTAGGAATTAACCGCACCAAAAAGTTGATTTACACTGCTAACTATCATACTGCTGTCTTGTCCGTTTTCCGCTACAACGACAGTGGCAAGCTCGATCTAGTTGATACTGTAACTCACAAAGCTGAAACGTTGGGTCCGCGTCCTGAACAAGTTGACGGTCCTCACCCTCACTTCTTTGATGAAACCCCAGCTGGTAACTTGGTTAGTTGTGATCTAGGCAATGATACCGTTGATTTTTATAGATTAGAAAATGATCAATTAAAACACATTGCTCAATATAAGTGCGAAACTGGCTTTGGTACACGTCATATCGTCTTCAGTAAAGATGGCAATTACTTCTACGTTGTCGGTGAACTTTCTAGTCAAATCAATGTCGTTAAATTTAACGAAGACACTTGGGACTTTGAAAATATTGCTACTTATAAGACAATTCCCGCTGATTTTACTGACCATAACGGAGCTGCTGCCTTATATATTAGTCAAGATGGCAAATATGTTTACACTTCCAACAGGGGACATAATTCAATTGCTGTCTTCAAAGTTAACGACGATCATACTTTGAGCCTGGTTCAACGTGTATCCACTTTTGGTGACTTCCCTCGTGATTTTAATTGGGATAAAGATCAGCGCTACGTCGTTGTCGCTAATCAAAATACAGATAATGCTACTCTTTACACAAGAAACGCTGGTACTGGTAGCCTAACTCCTATTCAAAAAGAAATTTCCGTACCAGAAGGCACTCGCGTTCTTTTCACCAAATAGTAATTAGCATTAGTACCAAAGTCATGGCGCAATAGAACGTCATGGCTTTTTTATTCCTACAACTTAAAGTAAAATAGAAATAAATGAAACAAAATATAAGAAGGTGACAAAGTGAAAAGAAAAATAATTCGAATATTACTTTTCATTCTTGGCGGGATATTAGGGTTACTACTTCTGTATAAACTCTATTTAAATTACCGTCCTGAATTGAATTTATTACTTCATTTTGATCACCATAATGAAGAAGTACTCGTTAACATGGTCCGTAGCCATGGTATTGAAGACTTAGCCTTTTTATTTTTACTTAATGCGATCTGTGTAGCAATTCCTGGCTTATCCAACGGAATCTTTTGTGTTCTCAACGGAATCCTTTATGGCCCTGCCTGGGGATTTATTGTTAATTGGATCAGTGACATTTTAGGCCAAATAATTTTAATGGAACTTTTGCAAAAACTCTATGACATGAAAAAGATGTCTAACAGTAAAGTTTATAAGTTATTGACTGGATTAAAATCACCAATGCTTGGATTAATTATTGGATATATGATTCCATTTATTCCGAGTGCGACAGTTAGCTATGTCAACATTATGATTAATAAGGAGCAACGTAAAAAACAGCTAATACCAATCATTATCGGTGTCATCCCCTTCGCTTACTTATATGCTTATGGTGGCGATTCAATCTTGCACTTAGACGGAACACGATTGATTAAAGTTGTAATCTCATTCGTTGTCATTGCTTTAATTGCAGTAGCTATTTTGCTTAGTCTGAGAGCAATCAAAAAGCGTACAAAAAAAGCTTGAATTTACTCAAGCTTTTTTATTATGCCTAGCATATTTAAACTAAGTTAGCTTCTTCTAACAGTTCTTCGACCCAAGTTCTCTTGATTTTCTTCATCCCTGTTTTGAGAGCTAACTTCTCAGGTAATGGCATCTCTTGATCAACTAATTTCTTCTTGTCAGACATGTAGTACATCGCACGAAGCAATTGACGAATATCATAAATTGAGTCAAATACTTCAGGTACACCACGGTCAACGTTAAGCAATGTATAAACAGCTTCCATGGCAGTTCTGACAGAATATTCGGTGGTAAAGACAGTGTCTCTAGTTGGTGATTCGGCAAAATTGCCAATAAAGGCAATATTAACTGATCCTTCTGGAACAACATCTGGACGGTCCCCATCATGACGAGGCATAAAGTAACTAGTGATATATGGCATGTAAACTGGTACGGTATTCATATTTTCTTCACTAGCCAATTCGCTGATTTGACTCTCTGGCACGCCTAAGTGATAGAGCATTTCCTCGGCAATTTCTTTACCAGTACAGTCAACGACTCTCTTCTTGATGTAATTACCCTCAGTATCAGAATACAAAGCATAAATCCAAACAACGATTTGATCTGGATTCTGGCTCTTAAAGTGAGGTTGACGGTGAATAGTAAAGCTAAGTTCCCAATTAGAGTCAACAACAGTGATAATTCCACCAGTATTAACTTTACCATCGTAAAGGCTGCGCTTAGTCAAGCGTTCAAAGTATGGAGCTATTTTCTTATTTTCCAAGGTAGCTGTAGCTGATACG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98 | Corynebacterium_phage(16.0%) | protease,tRNA,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1946679 : 2074486
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >CP026503|1946679:2074486|DBSCAN-SWA 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108 | Streptococcus_phage(20.0%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_18 |
2091957 : 2190277
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >CP026503|2091957:2190277|DBSCAN-SWA 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MIGTIVNTCALLVGTTVGCLVKKGLNKRYEDVLFIAMGLAALGIGWENVTNSMPKSHYPVLFIVSLALGGVVGTALNIAGRFNHLVDKAGKSNLAKGLATEILLCCIGALSIVGPVMAAVKGNNTMLFTNAMLDLVTSMVFGASFGWGMLAVVPVLFCWQGSIYLVAKFLSADFFTGPLVTELSIVGGFLIACSGLSLLKIRDVKTLNFLPSLLVPVIFFIIKDLTGWF |
104 | Corynebacterium_phage(14.29%) | holin,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
2246426 : 2309669
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >CP026503|2246426:2309669|DBSCAN-SWA 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MNFIKSYFQLDKYKTNIRTEFIAGLTTFISMSYILFVNPSVLGASGMNTGAVFTATALAAALGTAIMGIVANYPIGEAPALGINAFFAYTVCIGMHVSWETALASVFVASIIFILITLFKLREKIIDSIPADLKFAISSGIGLFIAFLGLQNGKLIVANKSTLVGLGSLHDPLVWITIFGLLVTVILMILNVPGAIFIGMVLAAIFGICTGQIALPHKVISTAPSLAPTFGQAIFHVKDINTVQMWVVVLTFLLVTFFDTAGTLIGLAQQAGFMKNNKMPRVGKALAADSSAMAVGSILGTSPVGAFVESSAGIAVGGRTGLTAVFVAIFFLISMIFSPLLGVFTSQVTAPALIIVGVLMAQNTAHIHWNKLEIAVPAFLIILGMPLTYSISDGLSWGMITYPICMLAAKRGKEVTPMMWVLFVVFLIFLWVLNF |
56 | Planktothrix_phage(11.11%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026503.1|AZR15495.1|1106408_1106636_+|hypothetical-protein |
1106408_1106636_+
Protein sequences of CP026503.1|AZR15495.1|1106408_1106636_+|hypothetical-protein>CP026503.1|AZR15495.1|1106408_1106636_+|hypothetical-protein MIFNNSYTFFEIYQVKIFIFLFLFDIIVAERVMSAPRMKRLSKMFLMTSADRKKFEGVEKPLRTFSLVTFSFCPK |
75 aa aa | NA | NA | NA | 1023274-1108535 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|1238709|30|CP026503|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP026503 position: 1095494-1095523, mismatch: 1 agaaaacaggtattccaggcgcgatagtgg CRISPR spacer agaaaacaggtattccaggcgcggtagtgg Protospacer ***********************.****** |