Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| CP032542 | Coxiella burnetii strain 2014-PE-15890 chromosome, complete genome | 0 crisprs | cas5f,cas7f,cas6f,DEDDh,cas3 | 0 | 0 | 5 | 0 |
1. CP032542
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
520707 : 582648
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP032542|520707:582648|DBSCAN-SWA TTTAGGCGCCACAGCGATACGTTTCTTGGCGTGTTAAAAGCGCCCAAATGATCGGCGCATTTTTATTCGCTAACGCCACACAAGCGCGATTCATTCCGCGGCGCTCAATGAGTGCTTTTAACCACAGACTCTTTTTATCCGTTTTATTTTTTACATGACGCAATAGCGCACGGGCGCCATGAATCAATAACGTCCTTAACATCACATTGCCGCGTTTACTAATCCCCAACAACACCTCCTTATTCCCACTCGAATGTTGTCGAGGGACCAACCCAATAAACGCCGACAACTGCCGGGAACGATGAAATTGATGAATGTCACCCACGCTCGCATAAACCGAGAGCGCCGTTAAATAACCCACCCCCGGGATGCTCTGTACCCGTTGACAATCCTCATTGGCTTTTGCCACCGCTTTTAATTCCTCCTCGTAATCACCAATCGCTTCGTCCCGGTTCAACAATTCGGTATACAAACAATTCAACACCCGTTTCATCCGCGGTGTTAATCCCACCGCTTCGCTCGCTAAAATCAACGGGAGCTCTTCATAAAATCGCTTGGCACCACGCGCCATCGTGAGTCCGTATTCTTGCAACAACCCCCGAATCTCATTGATCAGCGCCGTGCGGCTTTTGACTAAACGATCGCGTATCTTTAACAGCGCTTGAACGTCTTGTTGTTCCACCGTTTTACCCCGCACAAACCGCATCGAGGCGCGGGAAGCCGCTTCAGCTATCGCCTGCGCATCGTTACGATCATTCTTGTTACTTTTGACATACGGTTTGACGTGCTGCGGACTGATCAACTGCGTTGGGATACCCATCCCCATAAACGTCCGATACCAATGGTTCGCTCCTCCACACGCTTCCATCACCACGCAGCCCACCTTAAGACTGGCTACGGTGGATACATACTGAGCACGCTTAACCCGTCTCGTGTAGATCACTTTACCCCACTCATCAATTCCACACAGTTGAAAAACATCTTTTGCAATATCAACACCCAGTATTTTAATATCTTTCATGGACCTTCTCCTTTTTTTGAAAATAGAAATTCTATGTTGGCGCATTATGACGCCGTCTTTAAGGGGTGGGTCCATTTCATTGGGCTACTTGAAAACCTACACGTTAAATAGCCAACTTATAGCCCACACTAAAGGTAAAAAGATCAGAATGGGGCGAAGGCAATTTTTGAATGGCTCCAGACGAAGCGCGGCCATAACCATTGACATGAAGGTACTGAAGAGTAAAAAACCAATACCAATTCAAATAATACTGCAAACCCACGGCAAATAAAGGCGACCAAAAATCGCCATTTTGTGTTAAGTCGTTAACAGGCGTAAAGTTTATCCGCGTGCGGATATTCAAGCCCGCAGCGCCCACTTTGCTATACGCATATAAATTTCCGCAAATCGGAAAAGCCAATTTAAGCGCGATGTAGCCTAACCAAGAGTGTTCGCTAATCCTACCGTCCGCCACGGGGAGACCAGAAGGCACAAGATAACGCACGGTTGGTAAATGAATCCAACCGATCTCAGCGGCAAAATAACGATTCCATTGGTACCCCACATCCACACCCGCAACAGAACCGCCTTTTCCTCGCTTCACAAAGGGGCCAAACGGGGGACCGTCACCTTGCAAAGCAGCTACATAAGTTTGGTAAGGAAGATACGATTCCCAATCGCGCGAGGCATATCCATAGAGCCCTTCAACATAGACACCCGAGTATACAAAGGGGATCGGAATATAATGGGGAACTTCAATTCCACCCGCAGCGGCGTTAGTGGGAATTAAAAATAAAGCAGATAGAAGACAAAAAAGATATAAAATACAACGACCCATGGATTTCCCTTTCTGTTGATGTCCAAAAAAACGTTTTTAGTTTAGCAATACTTTATTGCGTTGGCTAGCGAATGTAAGTTTTTCATCACGGCCATCGGGCCAAAGTCGCTCCTTGTTTAAGCCTGGGCTGATTGTTCTTGGTTTTTTATTTAAATCCCCAATCATCCAACTCCTTCCTCAGCAATGCTGATGGGGTAGGGGTTAATTGAATCGCTGAGAATTCATTTCGCAATGGGAAGTGCCGGCGTAGGTATTCAAATTGATCGGGATTCTCTGCAAGCGTCTCGCGCATCCTTTGGCTTTCGCGGCCAGGATCGAATAACGTTAATAAAATATCTTCAGCGTTGCGGCCGTCCTGAATATTTAGCGTCATTGTTTCCTGCAACTGCTGCAACTCGCTAAATCGGCGCGTATCCGATAAATGAAAATATTTTAGAAAAGCGTCGTAAATCATCAGCGTTGCACGCAATTTCGCCTGCTTGCTATAGCCGGCAATGTGAGGAGTGGCAATGGTTGTTTTTTCCAATAATTGTAAATTAACAGTGGGTTCATTTTCCCAAACATCTAAGCAAGTTATAACGTGGTCACACTGTAATAAAGCATTATTATCAATAACAGCCCCTCGCCCGGCGTTTAGTAATACGCTGCCAGGTTTTAACATTTTAAGAAAACGATTATCAATTAAATGATAGGTCGGAAAGTTTCCCCTTTTAACTAAAGGCGTGTGTAAACAAACGAGATCAACGTTGGCCAGCGAGGCTAAAGGAACTGAAATAAAATCCTTTTCCAGCTGCGCGCGCGGGGGGTCGTTATGAAAAACCGTAAAACCAATTTTTCTCAATCGATCAGACACAACACAACCCACATGGCCAACGCCAATGATTGCCGCTGTGGCTGATTTGCGCGGCAATAAGTTTTTCTTATGCAAATAAGCCACGCAATGAAGCACGTATTCCGCTACGGCCGTCGCATTAGCGCCAGGCGCATAGGCCCAATGGATAGATTGTTTTTTGAGCCACGTAGAATCGATATGATCGAATCCTGCTGTCGCACTGCCAACAAATTCGACAGCCGTCCCCTCCAGCAAGGCGGAATCTACGGAAGTAATAGACCGAGTCAGCAACGCATTAACAGCGAGAAGATCACGATTTTGAATGTGAGCCCCCGGCTTTAATATCAGTTCACCGAAGTCGCTAAAGAGCTCGGAAACAAAGGGGATGCGGTCATCAGCTAAGATTTTTATCATGATCGAAAACTGTAGCTGAAAATCCACCGATTCGCCATTGAAAGGATTTATAAGTTAGAATAGACTCCAATTCCTTAGGAGAGTTTTTACTCCATGAAGGCGGCTGTTTACATAGGATTTTTTTTGCTAATTTTATTTTCCGAAATGGGCAGCTATGGAAACTTCGCCTTACCCGCTCCGTGCACAACCATGGTAGAAAGCCATGCTTATTTTCATCCGCATGCGCCATTAACCCCACTTCCCTTCCCACGCGCCTTCCATCAAAGAGCCAAGCACTTGAGCTTAAGCGAAGCCATTTTCTTAGCGCTTCGCAATAATCCCGATGTGATCAGCAGCGAGTTGCAGCGGGTGGTTGATAAATTTGCATTGGAAGTAGCGCATAATGAATTTGAACCGCAATTCACCTTAGGTGGCACGGCGGGTTACGCCTGGCGGAGCAAGCCGACTTATTCATTCAACGCCGGCGTGAGTGTAAAGACTCCCTTAGGGACTGTGCTGGAAACCAGCTACGGCACTTCTTTTACCGGTGGCCCGGGGAGCGCGACAATAACGATAACGCAACCTTTATTGAAAGGAGCGGGTTGGGCCTACAACATCATTGATTTCGCCAACGCGGTTGATGATGAAAGGGTGGCGCGATTAACTTTTAAAAATAGCATTATTACTGCGGTTGATGCGGTCATTAAAGCCTACCGAACATTGGTCGAAGATTATAATAAGCTGACCATTCAAAGACGAACCTTATTGCGCATAGAACAAACGGTCAGACAATCTGAATTACGAGTGAAAGCCGGAAAACTCGCACCCAGCGATTTATTACAACAACAAGCAAACCTTGCCAGTACCCGTTTATCCATGATGCAGCAACAGAGCAGTTTAGATGCCGATTATCAAGCATTTTTAAAGACTTTAGGATTGACAGCGACGGCAAAGGTCATCATTGACCAACGGATAGAAGAAGCCATCTATCCTATTCCCTCCGTAGACGCAGCCATCCGATTGGCACTTTTAAACAATATTGATTATCAAACTTCCGTTATTCAATTGCGTGCAGCAAGACGCGCTGTAATCTCTGCAAAGAATCAAGCACGGTGGCAATTAGATGTTGTGGCAAGCACGACCATCGGCAACGGCAACGGTAACGGGGGCGGTAGTTCTATTTCACCTATTTCCCAAGGTTCGGCACCGATTACGGGTGGCGGAGGGGGTCCCAGTTTAGGATTTACGCTTAACATTCCTATTAACGACGTTCAGGCAAAGGCGCAAATTATTGACGCGCGTATCGAGCTCGAACAGGCTAAATTAGCCCTCGAAGAAAAAAAAGAAGACCTTATTAGAAACGTGACAAATCAAATCAATCAACTCCATAATCAATATGCCCAGATTAAAGTCGCCGAACACGGCGTTGAGCTGCAACGGCGAACGTTGGAAAACGCGCAGCTCAAATTGCGTTTTGGAAAAACAACCGTTTTTGAAGTTAACCAATTACAAGATCAATTGCTGGAGCAAGAAACCGATTTAGTGGCTCAGCGGATTGAGTTCTTAAACGCGATTACAGATCTCGATAACACATTGGGAATTACTTTGGATAAATGGGGAATTACTTTGAGGTACTAGCCATGAGAAAACGAATGTTTCAATGGGGAGTTTGTTTAATGCTGGCAGCAGCCGTCTTTTTTACCGGTTGTAAAAGAGATGAAAAAAAAGAGCCAGAAAAAGACAGGCAAATTATCGTAGCCAAGCTGCAACCTAGCGTGACCCAGCTTTATTTTAAAGGCTCGTTGGCACCGTTGAGAACGGTACCTGTTTTAAGCCCCGTTGACGGAACCGTCACGAAATTATTTTTCACGTACGGCGCTTCTGTTGAAGAAAATCAAAATATCGTTGAAATTCATTCTCAAAAATTGGCCGAGGAT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54 | Streptococcus_phage(54.55%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
687051 : 737575
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP032542|687051:737575|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(71.43%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
805671 : 861077
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP032542|805671:861077|DBSCAN-SWA 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54 | Streptococcus_phage(42.86%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_4 |
1624464 : 1675930
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP032542|1624464:1675930|DBSCAN-SWA 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47 | Streptococcus_phage(16.67%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
2071220 : 2080140
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP032542|2071220:2080140|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP032542|2071220:2080140|2077787_2078267_-|AZV76330.1|DBSCAN-SWA MKPIAIYPGTFDPLTNGHVDIIERALPLFNKIIVACAPTSRKDPHLKLEERVNLIADVLTDERVEVLPLTGLLVDFAKTHQANFILRGLRAVSDFDYEFQLAHMNYQLSPEIETIFLPAREGYSYVSGTMVREIVTLGGDVSPFVPSLVARHLQKRREK >CP032542|2071220:2080140|2077301_2077514_+|AZV76328.1|DBSCAN-SWA MAVSPREKIMLQSTGKTKAGKPTGTFYTTYKNKRNTTDKLNIKKFDPRAWNSETSKCGMHVLFKEKKIPK >CP032542|2071220:2080140|2074137_2075553_-|AZV76325.1|DBSCAN-SWA MAAQGKINQWNVPEIVPATLFRAYDIRGPVTSEALTPGLAYAVGLSIGSEAREQGQKAIVVGRDGRLSGPKLTAALIQGLCETGLAVLNVGLVPTPLVYFATNRLETNSGVMVTASHNPGHHNGFKIVLNGKTLRSEEIATIRTRILERRFVKGHGAVVDVDIIEDYESYITKHIQLDRPLKVVVDCGNGIAGKVAPALYRKLGCEVVELFCEVDGHFPNHHPDPTIPANLTDLIHKVKETQADLGLAFDGDADRLGIVTDKGEIIWPDRQMMLFSMDVLSRLPGSDIVFDVKCSRSLAEIIKKYGGNPVMWRTGHSILKAKLFEIGAPLAGEMSGHIFFKDEWFGFDDGIYVGARLLRIISQTNQRTSEIFAELPDSVNTPELKLPMTEEKKQPFMQALLKKADFGNAKLITIDGLRVEFEDGWGLIRPSNTSPYLILRFEADTEEKLKRIQEIFRTQLRMIDNALELPF >CP032542|2071220:2080140|2077051_2077291_+|AZV76327.1|DBSCAN-SWA MAKVCQVTGKRPQSGNNVSHANKKTNRRFLPNLKKRRFWLPDEKRFITLTVSTHGMRIIDKLGINAVLKKIREREKESK >CP032542|2071220:2080140|2075530_2076016_-|AZV76326.1|DBSCAN-SWA MCLTGGRSAMTHSVQLKILDKRLGSEFPLPAYATTGSAGLDLRACLDEPLKIEPDETCLISTGLAIYLGHSNVAATILPRSGLGHKHGIVLGNLVGLIDSDYQGPLMVSCWNRGKEPYTINPGDRIAQLVVLPILKAQFAVVEEFELTERGAGGFGSSGQN >CP032542|2071220:2080140|2072027_2072675_+|AZV76323.1|DBSCAN-SWA MCNNDFMNQATEIAKLLLNIKAVTLNLHEPYRYTSGILSPIYCDNRLIISYPEKRKMIIEAFLQLIEKNHLSFDIVAGTATAGIPHAAWIADRLDLPMIYVRAKAKTHGKQNQIEGRIRKGQRALIVEDLISTGKSALAAGLALREKGVTVTDCIAIFSYQLPQAQQNFSDANINCHALSHFDTLIEMAVDEGYIDEIEKQKALAWNKDPEHWQP >CP032542|2071220:2080140|2078820_2080140_-|AZV76332.1|DBSCAN-SWA MFKPSQWRKISYLLRFERKKDRPRVIKRKNHSISRSDISPNALRVLYRLSKSGYEAYLVGGGVRDMLLSYHPKDFDIATNARPHEIRKLFKNSHLIGRRFRLVHVYFPNEIIEVSTFRANAEELLKEEPLSEMQKTGATMLSEDNTYGTIEEDAWRRDFTVNALYYNITDFSVIDFTGGMRDLHQRLIRMIGDPTQRYHEDPVRLLRAIRLAAKLDFKIHPDTEEPLKKLHNLLRHVPSARLFTEVLKIFFEGHAVRSYQLLKQTHYMRTLFPEAATILEKTRQPLYENLIKLALKATDERFHNQQSLNPGFLFAIFLWPPVQELMQQHFKKHKRLFPALYHGINTALQRQVTILPLPRRLTAMMRSVWMLQYHLERRRHTRVYRIAQQRFFRAAFDFLELRERAGEPLTEIVYWWRAFRDGTSKQREQLINELARKTQ >CP032542|2071220:2080140|2071220_2072000_-|AZV76322.1|DBSCAN-SWA MRIITLNLNGIRAAARRGFFDWLKRQKADIVCLQETKACLEITNGDQFHPKGYHCYYHDAEKSGYSGVGIYCREKPDRVTTRLGWEHADKEGRYIQADFGSLSVASLYMPSGTTGEHRQKIKFDFMDRYMKRLKNIVHSKRSFIICGDWNIVHKEIDIKNFKSNQKHSGCLPEERAWLDEVFTKVGLVDAFRVVNQKPDQYTWWSSRGRAWEKNVGWRIDYQVITSDLKNSVKSERIYKDKRFSDHAPLIIDYEREISD >CP032542|2071220:2080140|2078263_2078824_-|AZV76331.1|DBSCAN-SWA MTIAYVGVGANLDNPLKQVQIAVSNLSTLPQTACLGYSSFYRSKPLGPTDQPDYINAVAAVETTLSPQMLLKALQRLEEKQGRCRGGKRWGPRIIDLDILLYGDLALQSDELCLPHPGLFVREFVLYPLAEVAEDLILPGGESILELKAKCPDRGIERIIKNPSSLLPFPFRGKGLEKEGDTKALA >CP032542|2071220:2080140|2077527_2077773_-|AZV76329.1|DBSCAN-SWA MALKITEECINCDVCEPECPNDAISMGELIYEINSNRCTECVGHFDEPQCRQVCPVDCIPLDFHESKEDLMKKYQRLQDEK >CP032542|2071220:2080140|2072671_2074141_+|AZV76324.1|DBSCAN-SWA MRYKRHMEAKEEALDIDFAIECFRKSRETNLIDLANAFIEASNREDISSTALIAWKIREFFNDKPHEDCVNYFNYITQLPDDIPAKSYLLGMAYFLGVGVKQNTGRAKFFLRKATKAGEPNATVELFEIYSEEREKDQAQIYLNQALEKNHPRAQWLAANHSLEKEELENAKTLFQKAAIQGMPLAKHNLFLYQRQNLTPLFEAVQAGSVEALARLFAVCGNKYQIKEAKRCYEAVLFTNNPYAIYRFACFLEHEKYSKDAWGLFLLLSEWTETAPLLLSLVFSSIAYMLYEKRIGQESNLDAIVYYGKAIEYCIEAIENEHFEALNKLEEIFTWIPKIFNLSNWNYFYDAILNKGLLEDNTTLLPLAIKHCNSLKNYLISNYQSLSLENKSKLRRALEIANTLLSQPFHTAEAYLGDEIKEKKLNALVNWLTARENREENLSFIKNVMSNITPNRLSIKTIFKRSKSEETLEQEGKQEQRHSKQSFTF |
11 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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