Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029758 | Clostridium sp. AWRP chromosome, complete genome | 4 crisprs | cas3,RT,WYL,csa3,DEDDh,cas8b1,PD-DExK,cas3HD | 0 | 6 | 6 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029758_1 | 2028394-2029679 | Orphan |
II-B
Consensus repeat of CP029758_1
|
19 spacers
spacers of CP029758_1
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029758_1
The CRISPR arrays of CP029758_1 >merge|CP029758|1|2028394-2029679|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTTATTTACGTCACATGTTAAGGTTCAACGAGATAAAGTTTGCATAGATTGTGGAACTTATTAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTGGCCTTCTGCAACTAGCATACGTCCAGAAACTATCATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGATATAAAGGGGGATTGTAGTTGGACGCTTACATCTAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAAGATGCATCTTTAAACCAGTCCCAAAGAAAAGCAGATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTGATATAGGAGTAGAAAAACCAACAAAATGGGTAAAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGCTTCCATTTATCAATAGGGCATCCACAATATATACAAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACAATATTTAAAGATAATAATTTATAGGGGGTTTATAAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATTATTAAAGGATAAACCTAAATATTTAATTGGTAAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGAAAATAGCAGTAATTACGATGCTTGTGGAAGTGGATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACATTTAAAAATTATGAACAAATGGAAGAATATGCAGAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTCATTTCATCTAATATTTCATTTGTTGCCAACAATGATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTCTTTGTTCTTCTTCGCTCTTTACATTTAATATGCATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGTGCATCTCGGTTTATGCGATATTTTCTAGCTAATTGATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACGGTGTTCTTCCATGTAATCAACTCCTATCTATCCAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTACTTGGATTATTAAACTTTATAGTAAATTTTTCATATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTCATTTGAAGATTGCTTCATTAATTTTGAAGATTGATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACTTTATTCAAATTGTCAATAGGGAAGGAGGAATTTTAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACCGGTAAGAAAAAGGTTTAAGAAAGTAGGGCAAAGATAATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACCCATACTTTCCATGTACGCCCCTTTTACCACGGTGGATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC >CP029758|1|1|2028394-2029679|CRISPRCasFinder TTTTATTTACGTCACATGTTAAGGTTCAAC GAGATAAAGTTTGCATAGATTGTGGAACTTATTA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC TTGGCCTTCTGCAACTAGCATACGTCCAGAAACTATC ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC GATATAAAGGGGGATTGTAGTTGGACGCTTACATCTA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC AAGATGCATCTTTAAACCAGTCCCAAAGAAAAGCAG ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC TGATATAGGAGTAGAAAAACCAACAAAATGGGTAAA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC GCTTCCATTTATCAATAGGGCATCCACAATATATACAA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC AATATTTAAAGATAATAATTTATAGGGGGTTTATAA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC ATTATTAAAGGATAAACCTAAATATTTAATTGGTAA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC GAAAATAGCAGTAATTACGATGCTTGTGGAAGTGG ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC ATTTAAAAATTATGAACAAATGGAAGAATATGCAGA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC TCATTTCATCTAATATTTCATTTGTTGCCAACAATG ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC TTCTTTGTTCTTCTTCGCTCTTTACATTTAATATGC ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC GTGCATCTCGGTTTATGCGATATTTTCTAGCTAATTG ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC GGTGTTCTTCCATGTAATCAACTCCTATCTATCCA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC TACTTGGATTATTAAACTTTATAGTAAATTTTTCAT ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC TTCATTTGAAGATTGCTTCATTAATTTTGAAGATTG ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC TTTATTCAAATTGTCAATAGGGAAGGAGGAATTTTA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC CGGTAAGAAAAAGGTTTAAGAAAGTAGGGCAAAGATA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC CCATACTTTCCATGTACGCCCCTTTTACCACGGTGG ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC >CP029758|1|1|2028394-2029679|CRT TTTTATTTACGTCACATGTTAAGGTTCAAC GAGATAAAGTTTGCATAGATTGTGGAACTTATTA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC TTGGCCTTCTGCAACTAGCATACGTCCAGAAACTATC ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC GATATAAAGGGGGATTGTAGTTGGACGCTTACATCTA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC AAGATGCATCTTTAAACCAGTCCCAAAGAAAAGCAG ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC TGATATAGGAGTAGAAAAACCAACAAAATGGGTAAA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC GCTTCCATTTATCAATAGGGCATCCACAATATATACAA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC AATATTTAAAGATAATAATTTATAGGGGGTTTATAA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC ATTATTAAAGGATAAACCTAAATATTTAATTGGTAA ATTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC 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GGTAAGAAAAAGGTTTAAGAAAGTAGGGCAAAGATAA TTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAACC CATACTTTCCATGTACGCCCCTTTTACCACGGTGGA TTTAAATACATCTCATGTTGAGGTTCAAC
>CP029758.1|AZV59068.1|2027570_2028101_+|hypothetical-protein MNKTVDSKVSSETSDTSTSSKPTKPKEEQKQKIYKLGEEGTSGNWGIKVLDVQELTTIQGGDSSDNRTTQQKFIMVKLQLNNKSQAAAQYSNEEFILDDTKTKAQYKSSMEAGETANQKETIYNKNSEFVGINEDVNPNTPKQTYVVFEVPKDFNMENGILIHGDNDGKAVGYNIK >CP029758.1|AZV56816.1|2026935_2027298_+|hypothetical-protein MTFAGDMKVLSTDDGKYNVIDDCYPNQSYSIYVILTPQEVSELRDSYYNPPKSDFNWIDYFTDQLVNKGIINSTTMARNVAKAIWLHSQSSWDCLAGTNENLLILQGADETIFVTARVAR >CP029758.1|AZV56815.1|2026590_2026917_+|hypothetical-protein MNKKLKILSSVICGLALSSGIALTSVQAAPAKINGNNGISIKAIIPSQKYSYYTTVSDDIKVKIEDYIYKNGDSSTADGIRNILINGGVNKTIANNLSFSLLDLSYKK >CP029758.1|AZV56814.1|2024659_2025349_-|hypothetical-protein MNKKVKFLSSTLAALLLTSGVVLTNVQAQGIQNTVKPTLNVKATQSYDFTTYCSLTHDQVQEVYTYLHSTNGSNFIDFLVDNNIVSSRSVANKIGRSLFIFGVGNILIRSDEGNGVLFLRSSQDPDKFTVVPNSPRFYNYNYNIYYELSSSNLSKILNYINTSHPTNSNQVANFIESNDIIPKSSYSNNVAAAILASPKAAGSDDMGDGILILEPTTNYGTRHVATPAF >CP029758.1|AZV56813.1|2023238_2024471_+|IS256-family-transposase 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MITERDKRILKWIENFNSITIDQCSKLFFSTSKMSYDLARKRLRYLNREGAIKRYRKDPKSETVYFMDKRLKVHDLKILDVIVALQQFNTTTNEIILQNKIQINQFISYIVDATIVIGNDYPILIEVDYTHYTNDKKIINIINHLEGKHNRKYVFLIVRQTIEEVSVENVGMKSKLVLVNWKFNSSDKLLRSLRSLLEP >CP029758.1|AZV56818.1|2031196_2031700_-|hypothetical-protein MLRRRKKWSLCRSHRSSLYQSAITVQQVIINLYGELYKNFDEKTIGNRIEKSRLIKNLSQSQLGKLISVNHSTIQDYESGMCFPSTNILTKISKVLNMPIEYYYDNYYKFIFSDYSNMIKNWRIKNNLSYWQAGKLTGIDYRSFKNWENGGAIDRFHYEKLKPYLNT >CP029758.1|AZV56819.1|2032425_2034060_-|recombinase-family-protein 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>CP029758.1|AZV56822.1|2035737_2036724_-|hypothetical-protein MYCIDAGSEYCPCHLAETNDCILCSQLSGEEFCQCKDWCGVCIYEQYISNGKKAKNLRKTYDCPILDKKVAKDSLCMFTLEAPENLVRELSNPGSFVFLRNKESVNYYDVPISIINADNTNNTLDVAIKSSGTKTKVLFKLNKGDKILLRGPFSNGIMGLSNISNAKDGISLIIARGIGIAPSIPVMKKLYSNKNKLISIIDTQFKENFYEDYFKGCKSKVLDCTILDDGNLSEKFKLMLKKILRENSINLVHCGGPDIMSYKIIDFIDKINSSQNKFINFSCCNNSKMSCGEGICASCTKHYDGDIVRRLCKVQMDPRDLFKGRRLL >CP029758.1|AZV56823.1|2036867_2037734_+|EamA-family-transporter MLKKGYIYSVLSAILFGTCGIIIKIAFSEGANSINILTLQYMMSIPIMFLGILIIDSKALKIGKKDLYHTAVLGIVGNTFMTIFYYMAFNYLDVSMVTILLYTYPAMVFIYSVVFQKMQVSSNKIFALIVTFIGCFLALGLNQGIKTFSTKGFMYGILAAVFYAFMNVYTEKKMDKLNPLAVNFYSIIFSFLSLIIFKFPVDVFRQDLNGKLIACIVILGVFCEIIPLTLLYAAIKHIGALKVSIIGNLEIPTAMFLSFFILKEHLTLLQVFGAALVIYAVYSIKKMD >CP029758.1|AZV56824.1|2038188_2039562_+|ISNCY-family-transposase MNENAKYNIIKKLVESNGNKQRAAVQINCTVRHINRMIKGYKEQGKAFFIHGNRGKKPVHALDNSTKQTIVDLYRTKYEGTNLTHFSELLKEFEGIKVSSNTIRSILLQEFILSPKAKRSSKKALYTKLKDMQKSTKSKKQASVIQSSILAIEDAHPRRPRCAYFGEMLQMDASLHPWFGGEKSQLHIAVDDATGAIVGAYFDVQETLNGYYHVLEQILKTYGIPYMFYTDRRTVFEYKQKKSPSIEEDTFTQFGYACKQLGIEIKTSSIPQAKGRVERMFQTLQSRLPIELRLAGISTIEQANEFLNSYIKKFNARFALPVDNIKSVFETQPDIEKINLILGVLDSRKVDNGSCVKYNKRYYLPVDANGHPVYYHKGTCGIVIKAFNNDLYFCANEKVYALELLPDHVPSSKNFDLAKTSKTPKKHYIPPMSHPWKQASFEHYCNKQAHRQKENIA >CP029758.1|AZV56825.1|2039876_2041331_+|cell-wall-binding-repeat-containing-protein 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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029758_2 | 2858169-2858278 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP029758_2
|
1 spacers
spacers of CP029758_2
>2.1|2858207|34|CP029758|CRISPRCasFinder AATTTGGGTAACTCCTTCTCCTTATCAGTCGAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029758_2
The CRISPR arrays of CP029758_2 >merge|CP029758|2|2858169-2858278|CRISPRCasFinder AGTAAGTAGATTCACACCAAATCGAAGATTTGGGTTCTAATTTGGGTAACTCCTTCTCCTTATCAGTCGAATGAGTAAGTGATTCACACCAAATCGAAGATTTGGGTTCT >CP029758|2|2|2858169-2858278|CRISPRCasFinder AGTAAGTAGATTCACACCAAATCGAAGATTTGGGTTCT AATTTGGGTAACTCCTTCTCCTTATCAGTCGAAT GAGTAAGTGATTCACACCAAATCGAAGATTTGGGTTCT
>CP029758.1|AZV57460.1|2857241_2858147_-|glycoside-hydrolase MKKKIIIEALLLICVCVSPVKALTDDYYTTMKQDILCLMMAYPEYITDLEKGNDGKVYVLTKSGKKILYDDKSSKSFQQKMYDTDLQDMMEQSYPIGTINGVMEKNFDPGRIRTYPLLKEVYGCDRKSIESNLKMANLGYRRFQFNGNNNASKSLENAVKELLPISQTNPKVSRALFPSSGTFNYRCISGTSLLSPHSFGIAIDLARDRRDYWKWVTKEEGDKRIQEYPKEIVDAFEKNGFVWGGKWSHFDILHFEYRPEIILKSRYFGQKNSDSKFWYSQAPHNNKLVNGYIQKIDEKLK >CP029758.1|AZV57459.1|2856019_2857117_-|amidase-domain-containing-protein MKISLKKRFLQIMVITLFIFLICPFCRPKGEEISTKEEVANSIQDIFQNRNRAILNGDLKLIEDNYDRSTKYGKWAYEHEEQKMKYLKNWGEKQGVKFTEIMPEVMINRIRGKDDKYSVNLICSTKYSYIYEDDPIKVNSCKIGTSHVLNISKKGNNWVISKEWYKDPFADSLNLGNLKVDAINQYIKSQQSRDFSNMNNRRKGAVKYADRYCGIASDKEYGYSYNRKYRNYNSRGGDCANFASQILHEGGKFRKNSGWSYDGSGATRSWLNADGFKSYMIYSGRASLVAHGSYEKVYKASYKLLPGDFVAYEKKGDITHISVVTGADSKGYSLVSCHNTDRNRVPWDLGWSDKNIKFWLVHVNY >CP029758.1|AZV57458.1|2854416_2855943_+|hypothetical-protein MSTLIKTIFMASLNGSVLVILILLIKMLLKKKLKAEFHYFIWFLLIIKLIMPYGPESNLSIFNIFSAVTEKEETISSKYYLKTSNISKNKLKDSNVPGNLSKNKNIESLNKKINYKSILFFIWLMGIVFFIANTLYEIRKIQLIKKNAISNKDSNFNNILNSCLNIMNINKSVSLMYPYKSINPCLCGLIKPTIFIPQNIIKNISEDEFKHIIIHELCHLKRKDLLINWIIIILNTVYWFNPIIRYGFYKMKQDCETSCDAYALRYLGIDRNINYGNTIIKILQLENNSPSLITSAPMAVNNSEIKRRITMISKHKKSSLKNIICGILVITAITTVGLTSGISKAKPNSNNYNSKPYYESIMNYLINSMKGHGSVYNMNSSENNNFASNNSLNFNSTDEFQFEELDFNGFQKYWSSNFQNNIFAADFDFFNGIESYKITSHKTSYSIKINTDIKSGNVSIKIYNDKKVLFEKINPTNKTLTISKEDAKNIKLDCIGIKAKGNITLELN >CP029758.1|AZV57457.1|2854030_2854405_+|CopY/TcrY-family-copper-transport-repressor MNEISSISDAELTIMKIIWKSPNITANKIIEQLSDKTKWKPNTVKTLINRLLKKNVIGFNKEGKEYYYYAVVQEENYINAESNSFLNKIFNGSVISMVLNFVENKKLSESEIKELKDILNKKHE >CP029758.1|AZV57456.1|2853177_2853849_+|FMN-dependent-NADH-azoreductase MKKLLYITANTKPESLSVSKTVGRNFVKEFLSKNADYMVEELDLYNENIPEINHRIFKGRAELVSGNDYNALSDEDKRIVDRINELCNQFLSADTYVIAAPMWSVSYPARLKSYLDCIIINNRLIKISEEDIKGLLDDKKRNMVYIQSSAAVYPKIFNSKFNHAIDYFRDVFKFLGVNKFDYILVEGTEDSSVGKSKAIGNVQNNIKSVVNKFTENIPLMDRM >CP029758.1|AZV57455.1|2852543_2852996_-|hypothetical-protein MLFKLSKTQQITGNIYVVRSLISNFFIYSDFKTTICFDTGFIPSLVNRELKKINIEPKSVSHVFLTYPNFYHAGCIKLFKNADIYFSAETSLRKSGKSMFSCKSEENEKYKKLKDGDVVDVDGIRIKSIVFPKHKLGSISYMVNDDILFI >CP029758.1|AZV57454.1|2851987_2852356_-|GntR-family-transcriptional-regulator MDVEFDSNIPIYMQIIDIVKRKIVKEELKPGDKLLSVREMSSKLKVNPNTIQRAYQELERNDIAYKQRGTGTFIKEDISMVEKLKEEMAQNIIYSFIIGMKELGFSSDEIIKIVEEKVQEGK >CP029758.1|AZV57453.1|2851289_2851985_-|multidrug-ABC-transporter-ATP-binding-protein MEPLLKSTDLKKIYFRKQALDGLNLEIQKGKITGLLGPNGSGKTTFLKIAAGILRQSSGEILINGNKPGTKTKAEVSYLPDKDYLFKWMRIEDAVNFFKDMYADFDEDKAQDMLKFMNLDPDSKVKTLSKGMSEKLYLSLVLSRKAKLYILDEPLGGVDPTTREKILDAILENYTENSSVLITTHLVSDIERLFDDVAFISEGKIVLFGNAEELRNEKKMSIDEIYREVFK >CP029758.1|AZV57452.1|2850504_2851290_-|hypothetical-protein MFKLVKYDLQGYFKDFLIMISAIVILNVALFTRVNVWNSASILALNMAIGFAAEIIVVIWNVKLFSRDIHEDTSILLFTLPKSGKNILMNKIVTALIQMVIVQFVIFIFTAMWIQIFKVVQGGVIDIKVTFLELIRIVNVKFVLFSIIVVLIIYITFLLTVYISITLSKVAIKNRRFGKLGSFIIFVILCITQGKIDESISGIFPQSFKLNVLNFNMASHTPVNITTSGVDINIASIFMSIAILVGLFYATAYLIENKLDL >CP029758.1|AZV57451.1|2849566_2850250_-|DNA-binding-response-regulator MSKTILMVDDEERMRFLIEAYLKSEGLNMIPAGNGQEALEKFKENHVDLVVLDIMMPVMDGWTACKELRKISNVPIIMLTARAEDEEQLLGFQLGTDSYVTKPVSPKVLVAKIKALLKRTYSEEENQNKQNSYDGLYINKEGHEVKVDNENVYLSPKEFELLCYLIKNKDIVLSREKILDAIWGIDYYGDLRTVDTHVKRLREKLGVKSYLIATVRGVGYKFEVKKQ >CP029758.1|AZV57461.1|2858468_2859605_+|aldo/keto-reductase MQYRKFCKDGFKVSTLGFGCMRLPIMNNDSSKINEKEALKIIRHAIDNGVNYLDTAYPYHGGNSEILVGKVLKDGYREKVRIATKMPVWLVEKYEDFDKYLNEQLKRLGIDCIDYYLLHAMTKDRMDKLENLGVFKFLNKALEDGKINHVGFSFHDNLMAFKHIINLFPWEFCQIQFNYLDEDYQAGIDGLEYAADKGLSVVVMEPLKGGLLSGNLPEDINNIFNKSKVKKSPVDWALSWVLNHPEVSVLLSGMNSLEQVNENISIASKTFPNSISEEDMDLIEQAKEKFNALMKIKCTRCGYCSPCKVDLDIPNIFSMYNNYFMYKSKESIFNKYNNMPKKSKASSCIHCGKCEDNCPQHLPIRVLLRQVKSTFEEN >CP029758.1|AZV57462.1|2860153_2863360_-|carbamoyl-phosphate-synthase-large-subunit 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>CP029758.1|AZV57463.1|2863455_2864520_-|carbamoyl-phosphate-synthase-small-subunit MNSILYLEDGTVFMGKAIGYKAITAGELVFNTSMTGYQEILTDPSYRGQIITMCYPYIGNYGINYNFSQSGEIQAKGMVIKNMYNNTSHYLSENSFENFLKENKVVGISGIDTRSITKKIRSSGTMKCVICSENESISEIKRMLNCYENKNLVSQVSTNSIKHISGNGPKVALLDFGSKKNIIENLKDRDCDITIFPYNTSYESIMSINPKGILLSNGPGDPKNLGEIMGTIKKLIGNLPIFGICLGHQLLSLALGGDTYKMKFGHRGGNHGVYDKDIDKAFITSQNHGYAVKRESLNKDSIEVTHFNLNDHTVEGIKHKTLPIFSAQFHPEGSPGPTDTGYLFDKFLRLMTLV >CP029758.1|AZV57464.1|2864534_2865536_-|ornithine-carbamoyltransferase MIDLKGKSFLTLKDFTKEEIKYFIDLAKKLKKEKYSGTEKKRLQGKNIALIFEKDSLRTRCSFEVSAYDEGANVVYIGAQGSHMGKKESVKDTARVMGRMFHGIEYRGFSQRDMEVLAEYSKAPVWNGLSDEDHPTQVLADFLTIEEHIDKPLKDVNFVYIGDGRNNMANALMIGASKVGMNFKIAAPKELFTEDDLVKECKKVAGESGGTITITEDLYKAVEGADVLYTDVWLSMGEEKELWKKRIETLMPYQINSKLIEACKNKNVKFMHCLPAFHNTETKVGEEIYKKFGYEALEVTEEVFEGPNSIVFDEAENRLHTIKAVMVATLSNI >CP029758.1|AZV57465.1|2865828_2866731_-|hydrolase 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You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029758_3 | 3756415-3756969 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP029758_3
|
8 spacers
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RT |
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The CRISPR arrays of CP029758_3 >merge|CP029758|3|3756415-3756969|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GCAAATGTACATCTCATGTTAAGGTTCAACTATAAATTAGATAAGAAGATTAATTATGTTTCACGATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACACATTGATTTCCTTTAAGGAAGCATATACTGTATCTATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACAATTTAAAGTCTTCATAAAAGCCACCCCTCTTAAGAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACGTAGCAATTGCCGCCAAAGCATCAACTTGTATAGATATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTAAATATTCTTATACCGCTTACTATAAGCAAAAAACATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACGTATCAAAAGAATTAAAAAAAGTGGGTCTACAGTCGATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACCCGAAAATAATGGAGGTACCATAATTCTTTACAAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACGGTTGGCACAAACGGAACTATATATTCAAGTGCAGGATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTGGGA >CP029758|3|3|3756415-3756969|CRISPRCasFinder GCAAATGTACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TATAAATTAGATAAGAAGATTAATTATGTTTCACG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC ACATTGATTTCCTTTAAGGAAGCATATACTGTATCT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC AATTTAAAGTCTTCATAAAAGCCACCCCTCTTAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GTAGCAATTGCCGCCAAAGCATCAACTTGTATAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TAAATATTCTTATACCGCTTACTATAAGCAAAAAAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GTATCAAAAGAATTAAAAAAAGTGGGTCTACAGTCG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CCGAAAATAATGGAGGTACCATAATTCTTTACAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GGTTGGCACAAACGGAACTATATATTCAAGTGCAGG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTGGGA >CP029758|3|2|3756415-3756969|CRT GCAAATGTACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TATAAATTAGATAAGAAGATTAATTATGTTTCACG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC ACATTGATTTCCTTTAAGGAAGCATATACTGTATCT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC AATTTAAAGTCTTCATAAAAGCCACCCCTCTTAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GTAGCAATTGCCGCCAAAGCATCAACTTGTATAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TAAATATTCTTATACCGCTTACTATAAGCAAAAAAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GTATCAAAAGAATTAAAAAAAGTGGGTCTACAGTCG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CCGAAAATAATGGAGGTACCATAATTCTTTACAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GGTTGGCACAAACGGAACTATATATTCAAGTGCAGG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTGGGA >CP029758|3|2|3756480-3756903|PILER-CR ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC ACATTGATTTCCTTTAAGGAAGCATATACTGTATCT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC AATTTAAAGTCTTCATAAAAGCCACCCCTCTTAAGA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GTAGCAATTGCCGCCAAAGCATCAACTTGTATAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TAAATATTCTTATACCGCTTACTATAAGCAAAAAAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GTATCAAAAGAATTAAAAAAAGTGGGTCTACAGTCG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CCGAAAATAATGGAGGTACCATAATTCTTTACAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC
>CP029758.1|AZV59140.1|3756172_3756343_-|hypothetical-protein MEKTNKQNNLYEQFLKYSYWDLKELFKNAKTKEEQDFYITLSNLVLQKEQKRVISE >CP029758.1|AZV59139.1|3755760_3756045_-|hypothetical-protein MRRSTELGYKKAADVLPSELVSQIQDYIDGEYIYIPRKQCNRKTWGEKSGSRNMLFYRNLEIYSKYRKGASIDYLSEMYYLSPKTIQKILSKMK >CP029758.1|AZV58235.1|3755010_3755628_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVSIRLEEEKDYKTVEYMTREAFWNVYKPGCDEHLVVHNIKKVSAFIKELSFVAIDGGKIVGSIIYSKAKIVDDKNRKFEILCMGPISVRPSYQGLGIGSLLMNHSVEKAGQLGYKAIIIFGNPKYYHRFGFKNAKEYGIQTSSGENFEEFMVLELYKGALAGISGKFYADKVFEIKKKELEAFEKEFPYKEKLITDTQLNQKQ >CP029758.1|AZV58234.1|3754074_3754881_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKLKVLVDNNTYIDRYYFGEPAVSYYIEDEDIKILFDTGYSDIFLKNSAALGVDLNNIDIIAISHGHNDHTGGLKYYFQKNCKNKISILAHPDAFKEKIDGDLKICSPILEEELKEKCNLILSKEPKKISKHITFLGEIPRTNDFENKKPIGKQASGKALVDDYVMDDTALVYKSEKGIYIITGCSHSGICNIVEYAKKVCSDNRVLGIIGGFHLFQVNSGVRKTIEYLRKNDVKELYPCHCTSFAVKAEIHKYLPIKEVGVGLEINW >CP029758.1|AZV58233.1|3753180_3753933_-|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MMDLGLTDKVALITGGIRGLGRAIAEKLAAEKVKIVVTGTNEERARKAADEISSAYGVEALGLKHDVSSEESTKEVVKSIIAKFKKIDILINNAGVTSDGIVMTMKKENWDKVINTNLTGTFNCTKFVSKQMLRQRSGSIVNIASVVGIIGNVGQANYAASKAGVIGFTKATARELAGRGIVVNAVAPGYISTDMTSVLSDKVTEEMLSKIPMKAYGKAENVANAVLFLVSNMCQYITGQVINVDGGMAM >CP029758.1|AZV58232.1|3752770_3753160_-|hypothetical-protein MKKNLMTYFTRIINIVFLTSTAISFFIAYRGIRNKFAAKFLMAYLFFTFFYIVYMLLAAVINLKKLKWIEVKRRTLRLILLFALFSVLDCILYYIFGITNRSLLSGIWMSLALAFGMSFMDIVFKKNNT >CP029758.1|AZV58231.1|3751989_3752625_-|DUF4004-domain-containing-protein MEEENLISKKELLKVTGISYGQLYRWKRKKLIPEEWFIKRSSFTGQETFFPRVEILDRVEKIKNFKDDVSLDELANIFSPNLSKVILKENDISSHNIVSQPTFTLYKDVHKESSEFNFNELLFMTVVDRFLKSGKVSLEEAKLVLDTLEKNYEKFYGRYCDVVLIRKLGVAVCFLMLIPNEVYVETEAMLVLKINAGECVEQLKSKLTLTL >CP029758.1|AZV58230.1|3751241_3751970_-|cell-shape-determination-protein-CcmA MEENLKDVKISGAGIIRGGRYDEVKISGTAKMNGDIECSSYKVSGSSSVSGNLKSKITKISGSTKICGNLDCEELTVSGSSHIVGSVTAKKVKISGSSRIDSNLHTEEISISGSASISGDCEAENFNARGGFNIDGLLNAGNINIEMYGKCTAKDIGGENISVKLGEGHFFMKMMNLFSNSAKLVTGTIEGDDIYLENTCAKVVRGNNVTIGGNCDIETVEYRNKVDVGKNSKIVCKKIADN >CP029758.1|AZV58229.1|3749469_3750033_-|flavodoxin MLNGGITMKKVLQVVLILLVVIIVGTILFFKWVVNANSIVHKSDERKLLLSSSSKKALVIYQPSRTKLTSTMASTIAETLQKSGYEVTINYPSQELNYDISKYDVLVFGTPIYVGKYSTVLESYMKTIKDFSNKRVMIFSTGGDNKVTKEIDPLVQLAKGANKVKGIKLLKGQTTKAADAIKNLTGE >CP029758.1|AZV58228.1|3748852_3749464_-|CDP-alcohol-phosphatidyltransferase MKKYLRYAVPNFITLLRVVLTGIFTLFLNKKLALDGNDELFTYLVMIFFAIYVTDFIDGKIARYFKSVSSFGSFLDVLADFLFILCATGILIKYKLIAWWFLIVIIAKIIDFFVTSKIINNYKLGVKETFVFDFMGRAAAISFYIMPFIVLCMNEYLNGRCVFQVMFLTYMSTIIALISLFQRIILCIQIKRRQAMKHDGSTI >CP029758.1|AZV58236.1|3757073_3758306_+|IS256-family-transposase MKEIEVPDIDYKEEVKKCKTMEDVVGRNGLLQRLLKDVIQNMLEAEMEELLGREKYQRSEDSENKNYRNGYSKKSIRSSVGDVNLDIPRDRKADFEPKVVKKYETVCNELDKKIIGLYARGMSTRDIQSELEELYGIDVSPTMISKITDKVMDSAAQWQNRALDDVYPIVYMDAIHFKVREENKIVTKAAYICMALDMKGYKDILGIWIGEAEGAKFWLSVCNDLRNRGVKEILIACMDGLKGLPDAIKSVFPDVSIQNCIIHQIRNSIKYIASKDKKEFIKDLKCVYKAPTEDSAINGLDNLKKKWDQKYSIVIESWYNNWDKLSTYFNYSPEIRKIIYTTNALEGFNRQLRKFTKIRTVFPNDEALRKSLYLATEKVMEKWTSPSQNWGMTLAQLTIVFNDKLGEEIL >CP029758.1|AZV58237.1|3759754_3760426_-|transcriptional-regulator-YeiL MQIIQDPTVISTYINKFPINNIFDFDIMPYIHLVQFNMGEFIMNEGSTPKQLYCLIDGKAKLYLTHKNGKVSIINFIESPCFIGEMELIRSQTESNSVQALTICNCFAISVINCRDKLLNDIKFLKYLCVFLGKKAITNTNNYTKNQSYPLENRLAAFILLTSNKLLYTEKHTEASEFLGVSYRHLLYVLADFCKRGILHKEDCGYRIMDLNSLNKLVKKMNI >CP029758.1|AZV58238.1|3760524_3761157_+|SAM-dependent-methyltransferase MEQKEYWNLAAEKKEFTTPFHFKEFAKFVDKKDIILDVGCGYGRTLNQLYGEGYHNLIGIDFSENMIERGKKQYPYLDLRLKQGKAIDMEDNCFDAVILFAVLTCIIDNAEQIALLKEIERVLKPNGIIYINDFLLNADERNLNRYQLFKDKYQYGVFELPEGAVVRHHDIKWVEQCVNSFEKLILKQVVYTTMNGNNSNGYYFIGRKHK >CP029758.1|AZV58239.1|3761967_3763281_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MINELLGIQYNIEKARLDGKVQNLAYYINESAIIASHKEMDRKKAKGIDGVSKDDYSVNLKANVERLLKQMRNGSYQPEPIRRTYIPKDGSKKMRPLGISCYEDKLVENVIAKILIEVYEPKFFNESYGFRPNRNCHQAIREIIEDVQYHKVSYIVEADIKGFFNNVDHEWLIKFLEHDIADKKFIEIIKKFLKAGIMENGKYLDSERGTPQGNGASPVLANIYLHYVLDYWFAVKIKRKCKGEAYLIRYCDDFVCCFQNKWEADGFYQKLIERFDKFGLEFALEKTKILEFGRFAKKNRANRGLRKPETFDFLGFTFYCSEDGKKGFFRCKVKTSKKKFRSKVKTMKEWIKKNRIMPVGELIKKINQKLRGHYQYYGVTDNTRSVKCYQNVVKWLLFKWLNRRSQRKSYTIETFYNGLLRTFPLLEPKISVSLFYR >CP029758.1|AZV58240.1|3763893_3764292_+|polyketide-cyclase MKESTITTTFKADIKKVWEVVTNNNKYEWRSDLSKIDVSEDGNSFTEYTKNNFPTKFNITLKKPYERYEFDMSNKNMEGHWIGAFSPANNGTQIEFTEKVSVNNPIMNLFAGLYLKKQQSLYIADLKKELGE >CP029758.1|AZV59141.1|3764308_3764815_-|nucleotide-kinase MKNLIFINGTMGVGKTAASKELQKLLPKCVFLDGDWCWNMSPFIVTDETKRMVINNITYMLNNFISCSEYENIIFCWVMHMQSILDDVLSRINKRGCKVYKFSLICSEKSLIERITKDIENGTRTEDVIDRSVPRLNNYLKMDTDKIDVNEISAKDAAEIMYKRIIAT >CP029758.1|AZV58241.1|3764842_3765385_-|nitroreductase MIEEISARRSIRKYIDREVENEKILQLIEGARLAPSGSNTQPWHFIVVKSESNRQKISRVCHNQKWMLSAPVFIACVADIRCRIDEKIAVSLDENSPEEELKQIIRDTSISVEHILLGANNMGLGTCWVGWFIQNEIRPILNIPDDKYVIGIITLGYADEKPKPRPRKKLEEIIHYESWK >CP029758.1|AZV58242.1|3765518_3766277_-|short-chain-dehydrogenase MKYVLITGGTSGIGFEFAKNFARDGYGIVIVSSNIKKLQEVKKKLEDKFKTSVFVYQQDMGKLGAASQLYSITKKDNLNISILVNNAGIGLVGPTDKIDFKRDESMMILNVINLVELCKLYISDMYRQKYGKILNISSIGAFQPGPYTSTYFASKAFVLSYSRAIRYEAKEKGVQVCTLCPGATTTNFFTLEGTKVPKSAMTAESVAGYAYRRFMKNKNITVPGITNKIKNWIPMSLKMIFVAKMKNKKGTA >CP029758.1|AZV58243.1|3766396_3766981_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MNVSEYLEAGLGIKIEESTADMINKEAFFIKFSAKHIVLLEGMKSTSLYFIIHGIVRGYYIDDQGNDITKCFSSDNEFFSSEGLRVECVSSFTIECLEDCECIQLPYKLIHKIITKDEKLNSIFVRYYLREVGKLEDRVRNLALMNAEERYIDFCRQYPHFNDRVELKYIASYIGIRAASLSRIRRKLKNNSSN >CP029758.1|AZV58244.1|3767022_3767901_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNKSKINYYYKDMPNRNFFVDIFKVKVNKLGATFEENWHEHLQFFYFIQGSALIRCNYKSIHVKAGDFIIVNSNELHYCESLCDNLIYYIIRVDLSFLFSSQMDSCQTKFMVPLAKNLILFKNLVRNDKEILNCADKIIEEYFSKRLGYELAVKAYIYELIVLLFRRYVEKILTAKQFNCRVDNLNRLKNIFLYINENFTEKITLDEISEMAHISKEHFCRTFKQITGRSLTNYINNLRIQKADSLLQKTDLNITEIALNCGFSDVNYFSRIYKKVKNVSPLNFRKNFCSNL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP029758_4 | 3758507-3759463 | Orphan |
III-B
Consensus repeat of CP029758_4
|
14 spacers
spacers of CP029758_4
>4.1|3758537|36|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTCCTTTGCTATGTTCCAGTTCTATAATCTTTTTCT >4.2|3758603|36|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAATATGAAAAATTCTATCTGTTGCAGAAGGAGAC >4.3|3758669|37|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTCACTATCTCCAGTAATCATAAAGTATCTAGGTTG >4.4|3758736|35|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTAAAGTTACTTCCTTCTAGTCCTTTTTCTGCTGT >4.5|3758801|36|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGTAATTTTTGTAACACAATTCGACAAATTAATTGA >4.6|3758867|36|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GAAGTATGTTAGTTCTAAGTTTTTAGGTAAAAAGCT >4.7|3758933|37|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTACTTCTGTGACAAGTGTCCCATCTACTTTATCGT >4.8|3759000|37|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTTAACACTTTCATCTTGTATTTTGTTTACTAAAGAT >4.9|3759067|36|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TAGCCTTGTGCCTTATGTCCATTTACAAAAATATCG >4.10|3759133|36|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TGGTGGAGACAGTACATCGATAGCACAGGCTATATT >4.11|3759199|37|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTTATTCGGATGTTAGAAATAAGGTTTCTGATTGGAT >4.12|3759266|35|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTGCTGAAGGTGTTGCTAATTTTAATAGTAATGG >4.13|3759331|36|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT AGACTCTATTTTCCAAATCATAACAGGATGCAATAA >4.14|3759397|37|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GGAAGGTAGGATTAAAGATGTATAGATATTATTCAAC |
RT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP029758_4
The CRISPR arrays of CP029758_4 >merge|CP029758|4|3758507-3759463|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACCTCCTTTGCTATGTTCCAGTTCTATAATCTTTTTCTATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTTAATATGAAAAATTCTATCTGTTGCAGAAGGAGACATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTTTCACTATCTCCAGTAATCATAAAGTATCTAGGTTGATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTTAAAGTTACTTCCTTCTAGTCCTTTTTCTGCTGTATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTGTAATTTTTGTAACACAATTCGACAAATTAATTGAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACGAAGTATGTTAGTTCTAAGTTTTTAGGTAAAAAGCTATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACCTTACTTCTGTGACAAGTGTCCCATCTACTTTATCGTATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTTTAACACTTTCATCTTGTATTTTGTTTACTAAAGATATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTAGCCTTGTGCCTTATGTCCATTTACAAAAATATCGATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACTGGTGGAGACAGTACATCGATAGCACAGGCTATATTATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACCTTATTCGGATGTTAGAAATAAGGTTTCTGATTGGATATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACGTTGCTGAAGGTGTTGCTAATTTTAATAGTAATGGATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACAGACTCTATTTTCCAAATCATAACAGGATGCAATAAATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAACGGAAGGTAGGATTAAAGATGTATAGATATTATTCAACATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC >CP029758|4|3|3758507-3759463|PILER-CR ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CTCCTTTGCTATGTTCCAGTTCTATAATCTTTTTCT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTAATATGAAAAATTCTATCTGTTGCAGAAGGAGAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTTCACTATCTCCAGTAATCATAAAGTATCTAGGTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTAAAGTTACTTCCTTCTAGTCCTTTTTCTGCTGT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TGTAATTTTTGTAACACAATTCGACAAATTAATTGA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GAAGTATGTTAGTTCTAAGTTTTTAGGTAAAAAGCT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CTTACTTCTGTGACAAGTGTCCCATCTACTTTATCGT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTTAACACTTTCATCTTGTATTTTGTTTACTAAAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TAGCCTTGTGCCTTATGTCCATTTACAAAAATATCG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TGGTGGAGACAGTACATCGATAGCACAGGCTATATT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CTTATTCGGATGTTAGAAATAAGGTTTCTGATTGGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GTTGCTGAAGGTGTTGCTAATTTTAATAGTAATGG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC AGACTCTATTTTCCAAATCATAACAGGATGCAATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GGAAGGTAGGATTAAAGATGTATAGATATTATTCAAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC >CP029758|4|4|3758507-3759463|CRISPRCasFinder ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CTCCTTTGCTATGTTCCAGTTCTATAATCTTTTTCT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTAATATGAAAAATTCTATCTGTTGCAGAAGGAGAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTTCACTATCTCCAGTAATCATAAAGTATCTAGGTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTAAAGTTACTTCCTTCTAGTCCTTTTTCTGCTGT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TGTAATTTTTGTAACACAATTCGACAAATTAATTGA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GAAGTATGTTAGTTCTAAGTTTTTAGGTAAAAAGCT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CTTACTTCTGTGACAAGTGTCCCATCTACTTTATCGT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTTAACACTTTCATCTTGTATTTTGTTTACTAAAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TAGCCTTGTGCCTTATGTCCATTTACAAAAATATCG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TGGTGGAGACAGTACATCGATAGCACAGGCTATATT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CTTATTCGGATGTTAGAAATAAGGTTTCTGATTGGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GTTGCTGAAGGTGTTGCTAATTTTAATAGTAATGG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC AGACTCTATTTTCCAAATCATAACAGGATGCAATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GGAAGGTAGGATTAAAGATGTATAGATATTATTCAAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC >CP029758|4|3|3758507-3759463|CRT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CTCCTTTGCTATGTTCCAGTTCTATAATCTTTTTCT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTAATATGAAAAATTCTATCTGTTGCAGAAGGAGAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTTCACTATCTCCAGTAATCATAAAGTATCTAGGTTG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTAAAGTTACTTCCTTCTAGTCCTTTTTCTGCTGT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TGTAATTTTTGTAACACAATTCGACAAATTAATTGA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GAAGTATGTTAGTTCTAAGTTTTTAGGTAAAAAGCT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CTTACTTCTGTGACAAGTGTCCCATCTACTTTATCGT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TTTAACACTTTCATCTTGTATTTTGTTTACTAAAGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TAGCCTTGTGCCTTATGTCCATTTACAAAAATATCG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC TGGTGGAGACAGTACATCGATAGCACAGGCTATATT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC CTTATTCGGATGTTAGAAATAAGGTTTCTGATTGGAT ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GTTGCTGAAGGTGTTGCTAATTTTAATAGTAATGG ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC AGACTCTATTTTCCAAATCATAACAGGATGCAATAA ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC GGAAGGTAGGATTAAAGATGTATAGATATTATTCAAC ATTTAAATACATCTCATGTTAAGGTTCAAC
>CP029758.1|AZV58236.1|3757073_3758306_+|IS256-family-transposase MKEIEVPDIDYKEEVKKCKTMEDVVGRNGLLQRLLKDVIQNMLEAEMEELLGREKYQRSEDSENKNYRNGYSKKSIRSSVGDVNLDIPRDRKADFEPKVVKKYETVCNELDKKIIGLYARGMSTRDIQSELEELYGIDVSPTMISKITDKVMDSAAQWQNRALDDVYPIVYMDAIHFKVREENKIVTKAAYICMALDMKGYKDILGIWIGEAEGAKFWLSVCNDLRNRGVKEILIACMDGLKGLPDAIKSVFPDVSIQNCIIHQIRNSIKYIASKDKKEFIKDLKCVYKAPTEDSAINGLDNLKKKWDQKYSIVIESWYNNWDKLSTYFNYSPEIRKIIYTTNALEGFNRQLRKFTKIRTVFPNDEALRKSLYLATEKVMEKWTSPSQNWGMTLAQLTIVFNDKLGEEIL >CP029758.1|AZV59140.1|3756172_3756343_-|hypothetical-protein MEKTNKQNNLYEQFLKYSYWDLKELFKNAKTKEEQDFYITLSNLVLQKEQKRVISE >CP029758.1|AZV59139.1|3755760_3756045_-|hypothetical-protein MRRSTELGYKKAADVLPSELVSQIQDYIDGEYIYIPRKQCNRKTWGEKSGSRNMLFYRNLEIYSKYRKGASIDYLSEMYYLSPKTIQKILSKMK >CP029758.1|AZV58235.1|3755010_3755628_-|GNAT-family-N-acetyltransferase MNVSIRLEEEKDYKTVEYMTREAFWNVYKPGCDEHLVVHNIKKVSAFIKELSFVAIDGGKIVGSIIYSKAKIVDDKNRKFEILCMGPISVRPSYQGLGIGSLLMNHSVEKAGQLGYKAIIIFGNPKYYHRFGFKNAKEYGIQTSSGENFEEFMVLELYKGALAGISGKFYADKVFEIKKKELEAFEKEFPYKEKLITDTQLNQKQ >CP029758.1|AZV58234.1|3754074_3754881_-|MBL-fold-metallo-hydrolase MKLKVLVDNNTYIDRYYFGEPAVSYYIEDEDIKILFDTGYSDIFLKNSAALGVDLNNIDIIAISHGHNDHTGGLKYYFQKNCKNKISILAHPDAFKEKIDGDLKICSPILEEELKEKCNLILSKEPKKISKHITFLGEIPRTNDFENKKPIGKQASGKALVDDYVMDDTALVYKSEKGIYIITGCSHSGICNIVEYAKKVCSDNRVLGIIGGFHLFQVNSGVRKTIEYLRKNDVKELYPCHCTSFAVKAEIHKYLPIKEVGVGLEINW >CP029758.1|AZV58233.1|3753180_3753933_-|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MMDLGLTDKVALITGGIRGLGRAIAEKLAAEKVKIVVTGTNEERARKAADEISSAYGVEALGLKHDVSSEESTKEVVKSIIAKFKKIDILINNAGVTSDGIVMTMKKENWDKVINTNLTGTFNCTKFVSKQMLRQRSGSIVNIASVVGIIGNVGQANYAASKAGVIGFTKATARELAGRGIVVNAVAPGYISTDMTSVLSDKVTEEMLSKIPMKAYGKAENVANAVLFLVSNMCQYITGQVINVDGGMAM >CP029758.1|AZV58232.1|3752770_3753160_-|hypothetical-protein MKKNLMTYFTRIINIVFLTSTAISFFIAYRGIRNKFAAKFLMAYLFFTFFYIVYMLLAAVINLKKLKWIEVKRRTLRLILLFALFSVLDCILYYIFGITNRSLLSGIWMSLALAFGMSFMDIVFKKNNT >CP029758.1|AZV58231.1|3751989_3752625_-|DUF4004-domain-containing-protein MEEENLISKKELLKVTGISYGQLYRWKRKKLIPEEWFIKRSSFTGQETFFPRVEILDRVEKIKNFKDDVSLDELANIFSPNLSKVILKENDISSHNIVSQPTFTLYKDVHKESSEFNFNELLFMTVVDRFLKSGKVSLEEAKLVLDTLEKNYEKFYGRYCDVVLIRKLGVAVCFLMLIPNEVYVETEAMLVLKINAGECVEQLKSKLTLTL >CP029758.1|AZV58230.1|3751241_3751970_-|cell-shape-determination-protein-CcmA MEENLKDVKISGAGIIRGGRYDEVKISGTAKMNGDIECSSYKVSGSSSVSGNLKSKITKISGSTKICGNLDCEELTVSGSSHIVGSVTAKKVKISGSSRIDSNLHTEEISISGSASISGDCEAENFNARGGFNIDGLLNAGNINIEMYGKCTAKDIGGENISVKLGEGHFFMKMMNLFSNSAKLVTGTIEGDDIYLENTCAKVVRGNNVTIGGNCDIETVEYRNKVDVGKNSKIVCKKIADN >CP029758.1|AZV58229.1|3749469_3750033_-|flavodoxin MLNGGITMKKVLQVVLILLVVIIVGTILFFKWVVNANSIVHKSDERKLLLSSSSKKALVIYQPSRTKLTSTMASTIAETLQKSGYEVTINYPSQELNYDISKYDVLVFGTPIYVGKYSTVLESYMKTIKDFSNKRVMIFSTGGDNKVTKEIDPLVQLAKGANKVKGIKLLKGQTTKAADAIKNLTGE >CP029758.1|AZV58237.1|3759754_3760426_-|transcriptional-regulator-YeiL MQIIQDPTVISTYINKFPINNIFDFDIMPYIHLVQFNMGEFIMNEGSTPKQLYCLIDGKAKLYLTHKNGKVSIINFIESPCFIGEMELIRSQTESNSVQALTICNCFAISVINCRDKLLNDIKFLKYLCVFLGKKAITNTNNYTKNQSYPLENRLAAFILLTSNKLLYTEKHTEASEFLGVSYRHLLYVLADFCKRGILHKEDCGYRIMDLNSLNKLVKKMNI >CP029758.1|AZV58238.1|3760524_3761157_+|SAM-dependent-methyltransferase MEQKEYWNLAAEKKEFTTPFHFKEFAKFVDKKDIILDVGCGYGRTLNQLYGEGYHNLIGIDFSENMIERGKKQYPYLDLRLKQGKAIDMEDNCFDAVILFAVLTCIIDNAEQIALLKEIERVLKPNGIIYINDFLLNADERNLNRYQLFKDKYQYGVFELPEGAVVRHHDIKWVEQCVNSFEKLILKQVVYTTMNGNNSNGYYFIGRKHK >CP029758.1|AZV58239.1|3761967_3763281_-|group-II-intron-reverse-transcriptase/maturase MINELLGIQYNIEKARLDGKVQNLAYYINESAIIASHKEMDRKKAKGIDGVSKDDYSVNLKANVERLLKQMRNGSYQPEPIRRTYIPKDGSKKMRPLGISCYEDKLVENVIAKILIEVYEPKFFNESYGFRPNRNCHQAIREIIEDVQYHKVSYIVEADIKGFFNNVDHEWLIKFLEHDIADKKFIEIIKKFLKAGIMENGKYLDSERGTPQGNGASPVLANIYLHYVLDYWFAVKIKRKCKGEAYLIRYCDDFVCCFQNKWEADGFYQKLIERFDKFGLEFALEKTKILEFGRFAKKNRANRGLRKPETFDFLGFTFYCSEDGKKGFFRCKVKTSKKKFRSKVKTMKEWIKKNRIMPVGELIKKINQKLRGHYQYYGVTDNTRSVKCYQNVVKWLLFKWLNRRSQRKSYTIETFYNGLLRTFPLLEPKISVSLFYR >CP029758.1|AZV58240.1|3763893_3764292_+|polyketide-cyclase MKESTITTTFKADIKKVWEVVTNNNKYEWRSDLSKIDVSEDGNSFTEYTKNNFPTKFNITLKKPYERYEFDMSNKNMEGHWIGAFSPANNGTQIEFTEKVSVNNPIMNLFAGLYLKKQQSLYIADLKKELGE >CP029758.1|AZV59141.1|3764308_3764815_-|nucleotide-kinase MKNLIFINGTMGVGKTAASKELQKLLPKCVFLDGDWCWNMSPFIVTDETKRMVINNITYMLNNFISCSEYENIIFCWVMHMQSILDDVLSRINKRGCKVYKFSLICSEKSLIERITKDIENGTRTEDVIDRSVPRLNNYLKMDTDKIDVNEISAKDAAEIMYKRIIAT >CP029758.1|AZV58241.1|3764842_3765385_-|nitroreductase MIEEISARRSIRKYIDREVENEKILQLIEGARLAPSGSNTQPWHFIVVKSESNRQKISRVCHNQKWMLSAPVFIACVADIRCRIDEKIAVSLDENSPEEELKQIIRDTSISVEHILLGANNMGLGTCWVGWFIQNEIRPILNIPDDKYVIGIITLGYADEKPKPRPRKKLEEIIHYESWK >CP029758.1|AZV58242.1|3765518_3766277_-|short-chain-dehydrogenase MKYVLITGGTSGIGFEFAKNFARDGYGIVIVSSNIKKLQEVKKKLEDKFKTSVFVYQQDMGKLGAASQLYSITKKDNLNISILVNNAGIGLVGPTDKIDFKRDESMMILNVINLVELCKLYISDMYRQKYGKILNISSIGAFQPGPYTSTYFASKAFVLSYSRAIRYEAKEKGVQVCTLCPGATTTNFFTLEGTKVPKSAMTAESVAGYAYRRFMKNKNITVPGITNKIKNWIPMSLKMIFVAKMKNKKGTA >CP029758.1|AZV58243.1|3766396_3766981_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MNVSEYLEAGLGIKIEESTADMINKEAFFIKFSAKHIVLLEGMKSTSLYFIIHGIVRGYYIDDQGNDITKCFSSDNEFFSSEGLRVECVSSFTIECLEDCECIQLPYKLIHKIITKDEKLNSIFVRYYLREVGKLEDRVRNLALMNAEERYIDFCRQYPHFNDRVELKYIASYIGIRAASLSRIRRKLKNNSSN >CP029758.1|AZV58244.1|3767022_3767901_-|AraC-family-transcriptional-regulator MNKSKINYYYKDMPNRNFFVDIFKVKVNKLGATFEENWHEHLQFFYFIQGSALIRCNYKSIHVKAGDFIIVNSNELHYCESLCDNLIYYIIRVDLSFLFSSQMDSCQTKFMVPLAKNLILFKNLVRNDKEILNCADKIIEEYFSKRLGYELAVKAYIYELIVLLFRRYVEKILTAKQFNCRVDNLNRLKNIFLYINENFTEKITLDEISEMAHISKEHFCRTFKQITGRSLTNYINNLRIQKADSLLQKTDLNITEIALNCGFSDVNYFSRIYKKVKNVSPLNFRKNFCSNL >CP029758.1|AZV58245.1|3768056_3769511_+|MFS-transporter MEYKNKYGILLVVISMTFMSCLVSNIVNVALPVMSKKLSVPMVSIEWVVASYIISICSTILIFGRLGDIIGKMKVFKFGMVVFTIASFTCGISTSFTELIIFRIIQGIGASAYMANNQGIITQVFPRNERGKALGILASSVALGTLIGSPAGGFITYYLSWNYIFFVNVPIGVIAFIAALKVLPHSKNQNKEINSKLDVKGSTFIFLSMVLLFGSLIQGQKVGYNNPIIITIFIVSILFIAVFIVLENKIEKPLIQMKIFKNNVFSLSLFCAFISFVCLNASIIIIPFYLQDAMKLNSSITGLIMIVQPLVMAVISPLSGNLSDKIGSKLLSFLGLLLMSISFIFLSFLNQYSSITKIILYIVVLALGQSLFQPSNNSLIMSTVPKNELGIAGSVNSLVRNLGQIIGIILSTSLLYSFMSIKIGYRVTDYVTGRDDIFVYGMKYVYIVLTIVCAFGALLTAFRMHNKKITQIDQSAADVHGKNF |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP029758_4 | 4.12|3759266|35|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3759266-3759300 | 35 | HQ316603 | Cyanophage S-SSM6b genomic sequence | 21777-21811 | 8 | 0.771 |
CP029758_4 | 4.12|3759266|35|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 3759266-3759300 | 35 | NC_020875 | Cyanophage S-SSM4 genomic sequence | 60451-60485 | 8 | 0.771 |
CP029758_1 | 1.1|2028424|34|CP029758|CRISPRCasFinder,CRT | 2028424-2028457 | 34 | MG945904 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 3036-1602, partial genome | 1324-1357 | 9 | 0.735 |
CP029758_1 | 1.7|2028822|36|CP029758|CRISPRCasFinder,CRT | 2028822-2028857 | 36 | NZ_CP032531 | Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_3, complete sequence | 36133-36168 | 9 | 0.75 |
CP029758_1 | 1.20|2028425|34|CP029758|PILER-CR | 2028425-2028458 | 34 | MG945904 | UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 3036-1602, partial genome | 1324-1357 | 9 | 0.735 |
CP029758_1 | 1.26|2028823|36|CP029758|PILER-CR | 2028823-2028858 | 36 | NZ_CP032531 | Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_3, complete sequence | 36133-36168 | 9 | 0.75 |
CP029758_3 | 3.6|3756774|36|CP029758|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3756774-3756809 | 36 | NZ_AP014817 | Geminocystis sp. NIES-3708 plasmid pGM02, complete sequence | 39331-39366 | 10 | 0.722 |
CP029758_3 | 3.6|3756774|36|CP029758|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 3756774-3756809 | 36 | LR214966 | Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 12 | 2533-2568 | 10 | 0.722 |
1. spacer 4.12|3759266|35|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to HQ316603 (Cyanophage S-SSM6b genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gttgctgaaggtgttgctaattttaatagtaatgg CRISPR spacer ggtgctgaaggtgttgctaatattgatttgtctgg Protospacer * ******************* **.** ***
2. spacer 4.12|3759266|35|CP029758|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_020875 (Cyanophage S-SSM4 genomic sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.771
gttgctgaaggtgttgctaattttaatagtaatgg CRISPR spacer ggtgctgaaggtgttgctaatattgatttgtctgg Protospacer * ******************* **.** ***
3. spacer 1.1|2028424|34|CP029758|CRISPRCasFinder,CRT matches to MG945904 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 3036-1602, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gagataaa---gtttgcatagattgtggaacttatta CRISPR spacer ---atttatctgtttggatagattgtgtaacttatat Protospacer ** * ***** ********** *******
4. spacer 1.7|2028822|36|CP029758|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP032531 (Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aatatttaaagataataatttatagggggtttataa CRISPR spacer tatatttaaagaaaacaatttatagggtataactga Protospacer *********** **.*********** .* *.*
5. spacer 1.20|2028425|34|CP029758|PILER-CR matches to MG945904 (UNVERIFIED: Microviridae sp. isolate 3036-1602, partial genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.735
gagataaa---gtttgcatagattgtggaacttatta CRISPR spacer ---atttatctgtttggatagattgtgtaacttatat Protospacer ** * ***** ********** *******
6. spacer 1.26|2028823|36|CP029758|PILER-CR matches to NZ_CP032531 (Bacillus megaterium NCT-2 plasmid pNCT2_3, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.75
aatatttaaagataataatttatagggggtttataa CRISPR spacer tatatttaaagaaaacaatttatagggtataactga Protospacer *********** **.*********** .* *.*
7. spacer 3.6|3756774|36|CP029758|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP014817 (Geminocystis sp. NIES-3708 plasmid pGM02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gtatcaaaagaattaaaaaaagtgggtctacagtcg CRISPR spacer gcccccaaagaattaaaaaaagtgcgtttacatagt Protospacer *. .* ****************** **.****
8. spacer 3.6|3756774|36|CP029758|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to LR214966 (Mycoplasma fermentans strain NCTC10117 genome assembly, plasmid: 12) position: , mismatch: 10, identity: 0.722
gtatcaaaagaattaaaaaaagtgggtctacagtcg CRISPR spacer gggtaaaaagaattaaacaaagtggctctactccgt Protospacer * .* ************ ******* ***** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
897358 : 906174
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029758|897358:906174|DBSCAN-SWA CATGAATGTTGAAAAAGCGAACAAAAATGACGGTGGCAATTTATCTTTTTTAGAATCATTTTTTAAATTGCCGGAAAACAATACTACTGTAAGGACGGAGATTTTAGCAGGTGTTACTACTTTTATTACTATGGCCTATATAATCTTTGTAAATCCAACTATACTTATGCAGGCAGGAATGAATGTACATGGGCTTATGGGAGATGCAGCGGTTAAAGCTGGGGTATCTGCAATAAACGACCCTATTGTAGGCTCTATATTTACGGCAACTTGCATAGCAGCGGCTGTTGGAACTTTCATAATGGCACTTTATGCAAATCTACCTTTTGCACAGGCACCAGGAATGGGACTTAACGCATTTTTTACTTACAGTGTTTGTTTAGGTATGCACTATACATGGCATCAAGCACTGGCAGCAGTTTTAGTATCAGGAATAATTTTTATTATAATAACGGTAACTTCTATAAGGGAAAAAATTGTAGATGCGCTTCCATTTAATTTAAAACTTGCTATATCAGGAGGTATCGGACTTTTTATAGCTCTTATAGGATTAAAAAATGCAGGAATTGTAATATCAGATCCTTCTACATTGGTTGCTTTTGGAAAACTAACTAGTGCACCTGTTTTACTGTCAATTATAGGTATTTTAATTACAGTTATACTTATGGCAAGAAATGTTAAAGGATCAATTTTAATAGGAATAATATTAACTACTATAGTTGGTATACCTTTAGGAGTGACACATCTTACAGGAATAAAGGTTATAAGTGCACCACCATCACTTGCACCTACATTCTTTGCTTTTGATTTTAAAGGACTTTTGGGAATAGGAAAAGCAGGTGTAGTAGGAGGTTTAACTAGCATAATTATGGTAGTCATAACATTTACTTTAGTAGATTTGTTTGATACTATAGGAACACTTGTTGGAACAGCTGAAAAAGCTGGCATGGTTGATGAAAATGGAAGAGTTAAAAATATGCACAAGGCTCTTTTTGCAGATTCCCTTGCAACTACTATTGGTTCAATGTTAGGAACAAGTACTGTTAATACATATGTAGAATCCACTTCAGGTGTATCTGCAGGAGGTAGGACAGGACTTACATCATGTGTTGTCGGAATATTATTTATACTTTCACTATTCTTTAGTGGACTAGTTGGAATAGTTCCTACCCAAGCTACAGCTCCAGCACTTATAATTGTAGGGGCGCTTATGATAGGAGTAGTTACTAAAATAGACTTTAGTGATTTTACAGAAGGACTTCCAGCTTTCTTTGCTATAGCATTTATGCCATTTAGTTACAGTATAGCAAATGGTATAGCAGCAGCAATAATATTTTATCCAATAGTTAAAATAGTTACAGGAAAATATAAGGAAGTTCATCCAATAGTATATGTACTTGCAGCTCTATTTATATTTAGATTTGCTATGCTTTCATAATTGAAGATAAAAAATAACTGGTTAGAAAAATTTGTTTTCTAACCAGTTATTTTTTTAATTAATAGTTAAGAATGAAGAATTAATAGTTAATGTGGATTTTTTTCGTTACACTACAAAAAATCTTCCTTCACTGTCAATTGTCCACTATCAACTATCAACTTAAAAACTTTTCGAAGTAAAGTCTTTATATATTTTAGTCTACAAAACTATTCCAGTAATTTGAATAATCAATTGCTACAGGTGATACATTGGAATAGTTTACATCATAGTGTTCAGCTAATGCATTTATGAATTCTTTTGCAGGCATTCCGGATTTTTCTATCAAACCTTCAATTTCTTTTTGTAAGTCCTCTGGTATTTTAGAAAAACAGTAGGTAGTATTCATTTTAACAAATCCCCCTTATAATATAGTACTAACATTTAATATATTATATGACATATAACTTTTTAAGTGTAATACATATGCTGAATTCCTATATTTAGTATAGCATTATGCGCAAAAAAATTCAATAAAGACTAGCCTATAGCACACTATTTTTTATGTGATTCTTTGAAAGAAAGTAGTTTTTTATATACATTTTGTGCTTCTATTAGAGTAAGTGTTTTTTGTATACATTCGGCCATTAATTTATGGCCTAGTGCTGTAGGATGAATTCCATCTATAAATAAATCGTCATTGGTGTTTGCTCCTAATTTTTCTTGGAAGCAACTATAAAAGTCTGCATAAAAAAGATTATTTTTAGTGCAAAAATCTATTATCCAATTTCTGTATTCACTTTCTAGTTTACTTACTTTCTCATAATCTAAAGTGCTATCCCATTTTTCCTTAGCTAATTTTTTGTATACAAGAGGTTCTATACCTATTATTGTAATTATTTTTGAAGATAGGGATTCCTTTACGAGCTCCTTTAAATTATCTGTTACTAGTTTTAGAGTCCTTCCAGTCATAAAGTCATTGCATCCAACTGTAATGAGTACATGACTAGGGCTATTTTGAATTATATCTTTATAAGAACGTGACAACAATCCTGAAGCTGTATCTCCACATACTCCTTTGTTTAAAATATCTATTTGAAGTTTTTCTTTTAGAATGGATACAAAACATTCACTGTTAGAAACACCATATCCAGCAGTTAAGCTGTCTCCTATACATACCATTTTCATAGTTATGCCATCTCCTTTCAATTTTTAAAACGTAAAATAATGTTCGATATGGTATGAACATTACTATCATATATTTCCTTACAATCTTAAAATATACGAATATTATGTAGTGAATTAGTTTAAACGTATTGAATTATACAATTTGATATGATAATATAAGTATATCATAAATAAATGAATAGAATATCCATATAATCCTAATAATGAGGTTTAGGAGTATCTACAGAGAACCGTAAAATTCTCACAGCTATGGATAACTTTATTTAAAGCTGGATATTTTTATATCAAGTTTTAGTTAAGGTTACTAGCTTAAGGTTTCACATAGATTCTCAATTGTAGATTTTATTGAAACCTTTTTATTATACTTTTGGTAATATAATCTAACATTTGTTGTTTAAGGAGGACGAATATGAAAGTAGCAATTATATTTGGAAGTAGTTCCGACATTGACAAGATGAAAGGAGCTGCCAAAGCCTTAAAAGAATTTGATATTCAATATGAGGCATATATTTTATCAGCTCACAGGGTTCCGGAAAAGCTTTTGGAAACTGTAAAAAAATTAGAAGAAGAAGGCTGTGAATGTATTATTTCAGGTGCTGGTCTTGCAGCACATCTTCCAGGAGTTATTGCAGCTAATACAACTATTCCAGTTATAGGAGTTCCACTTAATGCAGCTATTTCTGGACTTGATTCTCTCTTTTCAATAGTACAGATGCCAAAATCCATACCTGTAGCTACAGTTGGAATAAATAACAGTTACAATGCAGGCATGCTGGCAGTAGAGATTTTAGCACTTAAATATTCTGAAATTAAAAAGAAATTAATTGAATATAGAAAAAATATGAAAGAAAAGTTTATAAGTGAAAACGGAAAAGGAGTGGAATTATAAAATGGAAAAAGGAAAAATGATATATGAAGGAAAAGCAAAAAAGGTATATGAAACAGAAGACAAGGACAAAGTAATAATTTATTATAAAGATGATGCTACAGCTTTTAATGGAGAGAAAAAGGGACAGATATCAGATAAAGGAGTATTAAATAATACAATTACTTCAATGCTCTTTGAGTTACTTGAAAAACATGGTATAGAAACCCACTTTGAAGAAAAATTAAATGATAGAGAACAACTTTGTAAAAAGGTAGAAATAGTTCCTTTAGAAGTAATTGTTAGAAATGTAGCAGCAGGAAGTATGGCAAAGAGATTGGGATTAGAGGAAGGCAGCGCACTTAAAACTACAGTATATGAATTAAGCTATAAAAATGATGAACTTGGAGATCCTCTTATAAATGATTATCATGCAGTTGGAATTGGAGCTGCTACTTTTGATGAGCTTAAAACTATATATAAGATGACTGAATCCATAAACAATATCTTAAAAGAATTTTTCTTGAAACAGGGAATAAAATTGATAGATTTTAAATTGGAATTTGGTAAGTTTAATGGAAAAATAGTTTTAGCTGATGAGATATCACCAGATACATGCAGACTATGGGATGCAAAGACTAATGAAAAATTAGATAAAGATAGATTTAGAAGAGATATGGGAAATGTAAAAGAAGCTTATGTAGAAATATTGAAGAGAATAAGTAAAAATTAGCAGCTGCCTTAATTTTATGGTTAAAAGGAGAGAATTTTTGATGTGCACTTTAAATGATAAATTTAATACTTGCTCCTGTATTGATTTGGAGGAAGATAAATTCAAGGATGAATGCGGTGTATTTGGAATATTTTCTAAGAACAATATAGATGTAGCATCTTTAACTTATTATGGACTATATGCTCTCCAGCATAGGGGACAGGAAAGTGCAGGTATTGTGGTCTCTGATGGAAGTGAATTTAAGTATCATAAAGGGATGGGACTTGTAGCAGATGTATTTAATAAGGATGTATTAGAAGGACTTAAAGGAAAAAGTGCTATAGGTCACGTAAGGTATTCTACAGCAGGCTCAAGTACTTTAAACAATGCCCAGCCGCTTATGGTGAAGTATAAACTTGGATCTATTGCTATAGCACACAATGGTACTTTGGTCAATGCAGATGTCATAAGAGGACTTTTAGAAGATGCAGGATATATCTTTCAGACATCTGTAGATTCAGAAGTTATTTTAAGTCTTATTGCAAGAGAGGCTAGGAGAGATATAGGTAAAGCTGTAGTAGATACAGTTCAGGCAGTGAAAGGTTCTTATGCAATTACTATTTTAACGGAAAATGAACTTATAGGTGTAAGAGATCCAAATGGGATAAGACCGCTTTGTATAGGTGAAATAAACGGAGATTATATACTCTGTTCTGAAAGCTGTGCCCTGGATTCTATAGGAGCAAATTTTATAAGAGATGTAAAGCCTGGAGAAATTGTAATTATAAACGATGATGGAATTAAATCTATAAATTTTGCAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP029758|897358:906174|901597_903043_+|AZV55835.1|DBSCAN-SWA MCTLNDKFNTCSCIDLEEDKFKDECGVFGIFSKNNIDVASLTYYGLYALQHRGQESAGIVVSDGSEFKYHKGMGLVADVFNKDVLEGLKGKSAIGHVRYSTAGSSTLNNAQPLMVKYKLGSIAIAHNGTLVNADVIRGLLEDAGYIFQTSVDSEVILSLIAREARRDIGKAVVDTVQAVKGSYAITILTENELIGVRDPNGIRPLCIGEINGDYILCSESCALDSIGANFIRDVKPGEIVIINDDGIKSINFAEKTKCETCSFEYIYFARPDSTIDDINVYTSRVKAGRILYRENPVEADVVIGVPDSGIPAALGYSEESGIPYAIGFIKNKYVGRTFIAPSQELRSKAVAVKLNPLKVNVEGKRVVIVDDSIVRGTTSGKLVEILRKAGATEVHFRVSSPVVKYPCYFGIDTPYRSQLIGSNAKIEEIRDKIGADSLGYISIDGILKSLQCTESKGYCLGCFNGIYPISVPIEKDKNYLE >CP029758|897358:906174|900368_900848_+|AZV55833.1|DBSCAN-SWA MKVAIIFGSSSDIDKMKGAAKALKEFDIQYEAYILSAHRVPEKLLETVKKLEEEGCECIISGAGLAAHLPGVIAANTTIPVIGVPLNAAISGLDSLFSIVQMPKSIPVATVGINNSYNAGMLAVEILALKYSEIKKKLIEYRKNMKEKFISENGKGVEL >CP029758|897358:906174|903056_904052_+|AZV55836.1|DBSCAN-SWA MVTYKDSGVNIEEGYKSVKLMKEYSSKTFIPGVLNGLGSFAGMFELGKCKNPVLVSGTDGVGTKLKIAFQMKMYDTVGIDCVAMCVNDVLCHGAKPLFFLDYLACSNLEAEVAADLVKGVSDGCIQAGCALIGGETAEMPGFYSKGDYDMAGFTVGVVERDNIINGSTVEEGDVLVGIASSGVHSNGYSLVRKIVKDFDEDFLGTPIGKVLLTPTKIYVKPVLKLLDKFKIKAMAHITGGGFFENIPRMFKDDFTAVIDKKSFEVPPIFKHLMELGVEEKQMYNTYNMGIGFVLCVDNKDAKNVVEELNKMGEKAYVIGSVKKGEKAVCLK >CP029758|897358:906174|904674_906174_+|AZV55838.1|DBSCAN-SWA MINRALISVYNKNGLLDLAKFLINRGVEIISTGGTYRYLVENNIKVTEVSKVTGFDEILDGRVKTLHPVIHGGILAKRDNKEHMDTIKSKNIKPIDMVVVNLYPFFDKVCDNITFDEKIEFIDIGGPTMIRAAAKNFQDVIVVTDVNDYSQIINEIETSGDVKYEFRRKLAGKVFNLMSAYDGAISNFLLEDEYPEYLSLSYKKSQSLRYGENPHQSAAYYTETVGKAPMKDFEQLNGKALSYNNMRDMDMAWKAVNEFEEVCCVAVKHNTPCGVALGKDLHEAYVKAYECDSTSIFGGIIAVNRKLDAKTAEEIAKIFVEIVIAPDFDKDAIEILKAKKNLRIIKCDVKPTNSFEISKLDGGILVQSSDDKLVDETKVVTEKEPSKEEMDNLIFGMKVCKYVKSNAIVVVKDFMAKGIGGGQVNRIWPACQALDRAGDGVVLASDAFFPFSDVVCEAAKHGIKSIIQPGGSIKDKDSIDECNKNGISMVFTGVRHFKH >CP029758|897358:906174|904039_904654_+|AZV55837.1|DBSCAN-SWA MFKIAVLVSGGGTDLQSIIDAVESGYIKSCSIEAVIGDRPGIYALERAEKHNIKSYVLDKKIYKSNISQEILKMLKDKVDLIVCAGWLSILKGELISEFRNKIVNIHPSLIPSFCGDGMYGIKVHEKAIEYGVKVSGCTVHFVDEGTDSGAIIIQKTVPVHFEDTPEMLQKRILEEEHKALPEVIKLISENKIVVKNRIVKVCN >CP029758|897358:906174|898988_899180_-|AZV55831.1|DBSCAN-SWA MNTTYCFSKIPEDLQKEIEGLIEKSGMPAKEFINALAEHYDVNYSNVSPVAIDYSNYWNSFVD >CP029758|897358:906174|900849_901557_+|AZV55834.1|DBSCAN-SWA MEKGKMIYEGKAKKVYETEDKDKVIIYYKDDATAFNGEKKGQISDKGVLNNTITSMLFELLEKHGIETHFEEKLNDREQLCKKVEIVPLEVIVRNVAAGSMAKRLGLEEGSALKTTVYELSYKNDELGDPLINDYHAVGIGAATFDELKTIYKMTESINNILKEFFLKQGIKLIDFKLEFGKFNGKIVLADEISPDTCRLWDAKTNEKLDKDRFRRDMGNVKEAYVEILKRISKN >CP029758|897358:906174|897358_898795_+|AZV55830.1|DBSCAN-SWA MNVEKANKNDGGNLSFLESFFKLPENNTTVRTEILAGVTTFITMAYIIFVNPTILMQAGMNVHGLMGDAAVKAGVSAINDPIVGSIFTATCIAAAVGTFIMALYANLPFAQAPGMGLNAFFTYSVCLGMHYTWHQALAAVLVSGIIFIIITVTSIREKIVDALPFNLKLAISGGIGLFIALIGLKNAGIVISDPSTLVAFGKLTSAPVLLSIIGILITVILMARNVKGSILIGIILTTIVGIPLGVTHLTGIKVISAPPSLAPTFFAFDFKGLLGIGKAGVVGGLTSIIMVVITFTLVDLFDTIGTLVGTAEKAGMVDENGRVKNMHKALFADSLATTIGSMLGTSTVNTYVESTSGVSAGGRTGLTSCVVGILFILSLFFSGLVGIVPTQATAPALIIVGALMIGVVTKIDFSDFTEGLPAFFAIAFMPFSYSIANGIAAAIIFYPIVKIVTGKYKEVHPIVYVLAALFIFRFAMLS >CP029758|897358:906174|899326_899959_-|AZV55832.1|DBSCAN-SWA MKMVCIGDSLTAGYGVSNSECFVSILKEKLQIDILNKGVCGDTASGLLSRSYKDIIQNSPSHVLITVGCNDFMTGRTLKLVTDNLKELVKESLSSKIITIIGIEPLVYKKLAKEKWDSTLDYEKVSKLESEYRNWIIDFCTKNNLFYADFYSCFQEKLGANTNDDLFIDGIHPTALGHKLMAECIQKTLTLIEAQNVYKKLLSFKESHKK |
9 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1154445 : 1174253
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP029758|1154445:1174253|DBSCAN-SWA AATGCCAAGAAAAGCTACGAAGGCAGCAGGAAATGTATATTATAAAGCACGAATTGAAGCTGCTAATACTAATGACAAATTAAACAGCAGGGAAGGAGCTGCAGAAATAATTGGGATTGATAGGACAAGGCTAGCACGAATAGAGCTTGACAGTATTTGTGCATATCCAGAAGAAATTTTGATGATGGCTGATGTTTATAATGCTCCTGAATTAGAAAATTATTTTTGTTGTGAACAATGTCCTATAGGTAAACATAGTGTTTCACACATTGAGGTTTTAGAAATAGATAGAATTACAATTCAAATTATATCTTCACTAGAAAATATTAATGGTGTCAAAAAGGAATTGTTAGATATTACGGAAGGCGGAATTATTACAGAAGATGAAAAACCAAAATTAGAACATGTTGTTAAAGCACTAGATAAAATTGCAATCGGATCTCGAGAACTAAAACTTTGGATTCAGAAAAATTTTAGATAGAAAGGAGACAGTAGGAAGTGGCACGTGAAATAACAGGAACAGTTAGTTGGCCCCAGGCTATGAAAGATATGTTGGAAGTTCAAAGACGCTTTACTAAAGGCCTCGGATTGATGATTGAGGATGATGTGAATAAGAAAAAAATAAATATGGATCAACTTGATTTCATTATAGAAGAGTTAGGCAAGTGTAAGTGGCATGAACCAATTTTAAGAACGGAGGAGAATTGAGTAATTTACAGATTTCAAAAGAACAGCAATTAATACCTGTAAAAGAGAATGAGAAAGAATAAATTTAAAAGTTTGGAAGAGGAGGCTATATAAATGGCTAAGAGTTTAGAAGAAAGAGTTGTATCACTTGAAAAAAGAGTAGCTGCACTTGAAGGACAAGTTCGAGCACAGCCAAAGAAGTTTATTTCAGAAGACAGTAATGGAATTTGTGATGACTTAACCCCAAGTAAATGTCCTAAAAGCAAAGATGACTTAAAACATTTATTTAATGGAGAAAGGACATATCCTTAAAGATTATTTCTTAAATAATCAGTATCGCATTTTACGTTATACCATGCAGCTTCTTCTGTTAAAGCAGCAACAAATAGTCTATCATTTGAATCCGTGTACTGTTTTAATTTATCTCTTAATGAAACGCATGTTTCGTCAGTACCTATGATCCAAGTAGATTCTGTAACTCTAGCCCAAACAGAGTAGGATTTTATAAAATCTATTAAATCTTTGTAGTCTTTACCAGGAGCACATAAATCATAAGACACAATTTTACTACTAGCCATAATTTATCACCTCACTTTCTAGGTGATAATTCTACAAAATAATGTAAGAACCTTTAGAAGATAATACCAAATAAATCAAAGGAGGATTCAGATAGAGCTTTTGATTAAAAATCATATTTTATTAGTAACTTTGGAGCAAAGGAAAGGTGCAAAGGTTAAAAGTAAGTTTGAATCAATACAAAAAGAGATTGGAAGGAGGAAAAATCATGGTATTTGAAAATTTGTTGGTACTTTTAATAGCTGCTAAGGAAAAATGCCCTCAGGAAGTGGCTTTCAAATACTTAGATAGATATTTAGAACATGGAACTAATTTTAAAAGACCTCCTGTATTTAGCTGGACACCTGAGGATATACAGGATGTGATGAAATTTAAGCAGGAAGGTATTAGTAATGAGGAGATAGGTAGCTATTATGGGGTAAAGGCAAATACCATAAAGAGTTTATTTTATAAAAAAACTACTCAATCACCAGTAGATGAACCTAGAAGACGTGGGACCAAGCTTGAAGTACAGGAAATGTTGAAACTAAATAAGCAGGGATGGAAGCCAAGAGAATTAGCAGAAAAATTTGATATTAAAATACACACTGTATACAGCAGAATCAAAAAAGCAAAACAGAAAGCGGAGGTGTGATATGGAGATGGACGTGCTTAAAGAAAAGTTAAATAAATATATAGATTTATATGGTCGCCTTGATAAAAGGACTTTAGAAGTTAGCCAGGAACTTGACAAGCTAATAGTTAAAGAAATGAAGGATGGAAAGGAGGAGGATAAGTAAATGAATGGATATTTACAATGCTTGATAGACCAGTACGTAACTAAGGCTAATAAGGCTTTAGATCCAGAAAAAAGAAACATATACAGAGAAGTTTTAAATGATTTGTTGAAGTTTAAAGAGTATGTTGAAATGCCACAAGAAACTAGTACTGATGATGTACCTAAGAAACATATTGCACTTGATTTTGTTGGAACAATGCCAGGACTTATGGAATACTTAAAAAATTTAAGTTTGAGGGAAGGAGGTATTAAATGAACATAAGTGAAAGAAAAGTATTTTTACAAATAAAAAAGGCCCTCTGCCAAAGGACCAAAAGAAATTTATAAATCTATTCCTATTCTATATGAGAATGGGGAAAAAATCAAATTGGAGGTTTACAGATGTCAAATAGAATTGTTTTAAAAGGATTGTATCTTAAGAATTTTAAAGGAATTAAAGAGCTAGATATAGATTTTGAGAATACAACAAATATATACGGAGATAACGGTACAGGTAAAACTACTGTGTTTGATGCATTTGCATGGCTGTTGTTTGATAAGGATAGTCAGAATATAAGTAAATTTGACGTGCAGCCACTTGATAAGAGCAATAATATAATCCACAGAATTGATACAGAAGTTATTGGATCACTTGAAATAGATGGAGTTAAAATAGTTTTGAGAAAGGTTTTAAAAGAAAAATGGGTTAAGCCTAAAGGTAAGCCTGAGTCAGAGCTTAAAGGTGTAACTACTACTTATTACATTGATGATGTACCTAAGAAACAGGGTGAATATAAGGAAAAAATAAACAGTATTATTCCAGAAGATATATTCAAATTAGTAACTAATCCTTCATATTTTTCAACCAACATGAAATGGCAGGACAGAAAGAAAATACTTATGGATATTATAGGTGAACTTACGGATGAAAATGTTATTGATTTTAAAAAGGATTTGGAACCTCTAAAAGATTTGTTAGGAAACAAGAGTATAGAAGAACTTAAAAAAAGTATAAACGCGTCAAGAAAAAAATTGATTAAAGATAGAGAATCGATCCAGCCTAGAATTGATGAATTAAACATGGCTGTAAAGGATGATATTAATTTTCAACAATTAGAGGTTAAGAAACAAGAAATAGTTTCAAAGATAAACAATATAGAAGAGCAGCTTATAGATAAATCTAAAATAAATGACGAATTGTTTAAAGAAAAAGATAAGTTATATGGACTTAAATCCAAACTCAAGGATATTGAAAGAGATGAACTTCGGAAAGCTGGAAGTGGTAAAGACAAAATAGCAGAGGAATTATACAGTATTACTGGTGAAATAGCTGATATTAAATTTCATGTCAAATCAATTGAATCTGAAAAAAATAATAACCTTAATTTAATAGAAACCATTGAAAATGATGTTAAAAATTTAAGGAAAGAGTGGTATGAGGAAAACAATAAACCATTCGAACTTCCGGAAGACGCTCGTATATGTCCTTTGTGTAAAAGGCCTTTTGATGAAGAAGATGTTGAAAAGCACAAACAGGAATTAGAAGAAAACTTTAAGCAAAACAAATCAAAAATTCTTAAAGAGATAACTAGAAAGGGTAGTAGTAAGGCAGATGAAATTGAAAAGTATGAGAAAAAGATATCTGAGAATGAAATTGAATTAGGGGGATTACTTAAAAAATTAGATGATTTTAATAATAAAAAGGATGAATTGCAAAGCAAATTTGATAATTTTAAGGCAGCTGTTGATCTTAATAGTAATAAAGAATATCAGAATACATTAAATCAGATAGAAATACTTGAAAATGAGTTATCTAAGCCAATAGAAGGAAATTCAAAAATTGAAGAGCTTAAGAAAAGAAAAGCACTTTTAGGCATTGAACTAGAAAATGTTAATTATGACTTAGGTTACAAAGAAATTAATGTTAATACTAAATCAAGGATTAAAGAACTTCAGGATAAGGAAAAGACTCTAGCACAACAAATTGCAGACCTTGAAAAGCAAGATTTTATGTGTGATGAATTTATAAAAACTAAAGTTAAACTTATGGAATCCAGTATAAATTCTAAGTTTAAATATGTTAAGTTTAGGTTCTTTAAAGCCCAAGTTAACGGAGGAATTGAAGAGGATTGTGAGCCTCTTATAGATGGGGTTCCGTTCTCAACAAACTTGAACTCAGGTGCCAGAATTAATGCTGGAATAGATATTATAAATACACTATCAAGTCATTACGAAATTAAAGCTCCTATATTTATAGATAACAGGGAAAGCACCACAAGGCTTATAGATACAGAAAGCCAAATAATTAATTTGGTTGTAAGTAGTATGGATAAGAAATTAAGAGTTGAGAATAGTTCGGAAGTAGAACAGACAGAATTAGCAGGTTAATAAATTCAAAGAAAGGGTGATACGAAATGTCAAGTGAAAATACAGCTTTAACTTTGGCTAAGGAAGAAGCTTTAAACCAAGTAACAACGAAAATTAATGAATTAAGGAAAAATAATGATATAGTTTTTCCAAAAAATTATTCTGTAGCTAATGCACTTAATAGTGCATGGCTGCAGCTCCAAGAAGTCAAAGATAAGAATGATAAACCTGCGCTTGAAGTATGTACTAAGAACTCAATTATAGGTTCATTATATGATATGTGTTTACAAGGGTTAACACCTGCTAAGAAGCAATGTTATTTTGTAGTATACGGAAAACAGCTACAGCTTATGAGAAGCTATATGGGGACTGTAGCAGTAACTAAAAGATTAGAAGGAGTAAAGGATATAAAAGCTTACTGTATATATGAAGGTGATGAATTTGAAGAAACATATGATTTGGATACAGCAACGCTAAACATTAGCAAATTTAATCCCAAGTTTGAAAATATAGATATTGATAAAATCAAAGGTGCGTTTGCAGTAGTAATTGGAGAGAATGGTCCTATTCATACTGAGGTAATGAACATTAATCAGATACAAAAGGCATGGGG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31 | Clostridium_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1230638 : 1239337
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029758|1230638:1239337|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP029758|1230638:1239337|1238233_1239337_+|AZV56133.1|DBSCAN-SWA MKFKKSLSYIIITFILFNICSYTVFADDKNLSFREPNINARCAIAMDSRSKVVMYQKNASELVPMASTTKIMTVLVAMKYGKLDKKVQISSRSSGIRGSVVGYKKGENITLKELLYGLMLRSGNDAAIAISEGVSGSVEEFVKLMNEYASEIGVINTHFKTPHGLDKEEHYSTAYDLAVLTSIAKNNALFNEIVSSKDVDGPENGFTRSYHNINKILWKIPDANGVKTGYTGKAGKCLVTSTKVQGNDVIIVVLNCPGRWKETEKIYKYVDKNFKFNKLFSKGDKALELRVNKKDLKLECEDDIIVPIKNGFKCSVKIIKPQRIKYSINKGDRIGMLCIYEGDKKIYSTSLRASNSIKVKKFMKWTF >CP029758|1230638:1239337|1234939_1235515_+|AZV56129.1|DBSCAN-SWA MRNDNEKSTSSEIDEKKNLTKDEYFSIIESLLFVSGEPLTLKQIASIIKLSSKRTKDLLKDMEVKYRQKSRGIKILNSDDKYGLVTKTKNSYYVEELLGNNSRQSLSQASLETLAIIAYKQPITRIDIDEIRGVKSDRAISTLVERKLIKENGRLSVPGRPILYGTTEEFLKYFGLENINEIPSIEEFHLD >CP029758|1230638:1239337|1237574_1238078_-|AZV56132.1|DBSCAN-SWA MLIKLLISFILILFVLVFIPIPLKIRINCSNKTFSLKIYNLNVIDKINLKDNNPSLKGKKKSSSLINNFKINLKSLKNLKFKPHIKIKVKLVYGLDDAAYTAITYGLIPTLITFIFALIKNIFVVKKKEIHVKPVFNSFYFNLEISSIIYISLAKIIYMYTKLFKHS >CP029758|1230638:1239337|1234194_1234950_+|AZV56128.1|DBSCAN-SWA MSLNIKIENFEGPFDLLLHLIKKNKMNIYDIKIYEITEQYLQYVNNMREMDLDMASEFIVIAASLIEIKSKMLLPKTQLNEDDNEDEKDPRKELVDKLLQYKKFKAAAEFLKKREIGLEKMFGKKPEIIEQVHMGTSPEQFLKGITMLDLYRVYSHLMDSYVNKLNNGNVMGREISLDKFKLQDKMLYIREIIQTKPQIRFSVVLKKCSFKIEKVVTFIALLELIKLKVVYVMQYENFDEIYVERVIENEK >CP029758|1230638:1239337|1237056_1237494_-|AZV56131.1|DBSCAN-SWA MDNHPIENLLKSTMENLKDMIDVNTIVGDAVESKDGSLIIPISRVSFGFASGGSEFDVSHEESPNPEYPFGGGSGAGVTVKPVAFLVTKGDSIRLLSLDQNNTYDKIVDSIPQVMDVIRGMMNSKSPKSKHNSDKKMEEEKKEEE >CP029758|1230638:1239337|1231655_1232867_+|AZV56126.1|DBSCAN-SWA MRKKQRAFRIVSNILVLFFITILWLPVVNAEPLSESDKKEMNSTGSGLNINARSALLMEPASGKVIFEKDSHEKLEPASVTKIMTMLLTMEAVDSGRISLSDKVTVSENAKKMGGSSMLLDTGEVRSVEDLIKGIGIASGNDAAVAMAEYLGGSEDQFVQLMNKRAAELGMKDTSFKNCTGLSEDGHLTTAYDIALMSRELLKHTRILKYTGTYMETISEGRKTPIELVNHNKLVRFFKGCDGLKTGFTSSAKYCISATATRDGARMLAVIMGSPTYKVRNKDASMMMNYGFSKYFGKNILKKGADVEKIPLNKTGDRFFIAKASEDLKVVVEKGKESKITYKCVIDKNKKQYKKGEKVGYCDVYVNGEALGKVNLYSDRDVKKLGILGNFKDSLKNILQKGQ >CP029758|1230638:1239337|1230638_1231517_+|AZV56125.1|DBSCAN-SWA MDGLLLGYEETLEKKHMSKNTMDAYVRDITRFYNFIKNRDENVENVEVVSIMAYVQYLQKEGRAISSIVRNIVSLRNFYKYLMLKGVLNENPVLYYQIPKVEHKVPKILTIEEVDKLLGSPNLDTNKGIRDKAMLEVMYAAGMKVMELLSLTIYDIDLKLSYVRCRSLKEEERIVPIGSVAVKYLKNYLNIRPKLNIYNLDILFLNLRGVQMSRQGFWKIVKYYAKEANIDKNINAFTLRHSFAVHLLQNGADIKSVQELLGHKELSATQIYSAVIKRNKIAQVYKKCHPRA >CP029758|1230638:1239337|1235682_1236924_-|AZV56130.1|transposase|DBSCAN-SWA MARKKDVYKVKPMTDGKRNIITSLISEYDIKSAEDIQDALKDLLGGTLQEMLEGEMDNHLGYEKYGRSDEANYRNGKKSKKVRSKYGEVEVDVPQDRNSTFQPQAVAKRQKDISSIEDKIISMYAKGMTTRQISEIIEDIYGFEASESMISNITDRILPEIEQWQQRPLSTVYPIVFIDAVHFSVRDNGIVKKLAAYIIMGINDAGIKDVLSINIGENESSKYWLGVLNELKNRGVKDILILCADGLSGIKESINASFPDTEYQRCIVHQTRNTLKYVSYKHKKDFAKDLKSIYQAPSEETAHKNLEIVTKKWNDKYPGSMRSWLKNWDAITPIFKFSPEVRKVIYTTNAIESLNSTYRRLNSQRSVFPSDTALLKALYLATFEATKKWTSVLRNWGKVYGELSIMYDGRLPE >CP029758|1230638:1239337|1233027_1234194_+|AZV56127.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNILGAFTIDQIQIINLIKAICKGNGIKAYIVGGAVRDAFLGNKVKDIDICIDKNPNFIIGKLNGIKCFQYYDKFQTAFLLFENEVNIDLIRCRKEYYVRDGELPIIEPSNIYDDLQRRDFTVNSLAYDIITGSLIDIYGGVEDIKNKSLQKIHLNSYREDPTRIFRAVKYAVRYGFDLKDKDEIINCVNEGVFDLISNDRIVKEVYLLCKEKMWIESILMCDNLKIFNVNREKLEIANENYNNIDKRILRLFYALADKKCAHILGENSVLDSKLKISIKNFAENYQKITGAVLNAMDNYELYKILKSIDDYGLILLKWNDKFKYKIYNYVHNMYHYKSSLNGKFVSSLGIQNGKAIGEVLNYMTKIELNSMIKYGKKYLVKNLGEII |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(42.86%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1982461 : 2039562
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP029758|1982461:2039562|DBSCAN-SWA ATTATTTTTTGTCCTTATTTAAGAGCTTGCTATCAGTTTTTAAAGATGCTTTTATCATTTCTACATATGAATCGTCTATTTCGCCGTCCTCACCAATAAGCCCATCTTCAAATAGTTTCTTTATTATGAGTGTAGTATATAAACCTTTAGATATGACTTCATTTTCATCATCATTTTTGTGTTTCTTTATATAATCCTCTAAGAGTTCGTTACATTTTTCCATGATTTCCTCTGATTTTGGATTAGGTTTAATATAACCTGTTTCCTCTAATAGTTGATTTGTGGATTTACCTAAAATCTTAGCTATCTTGCATATTGTATCAAGGGTAGGTTCCACTTTTTTTCCACTACGAGGGTCAATACCTTTTTCGAGCTTATCAATGTATGCGTGACTTAATCCACATCTGTCACCGAAATCTCTTAAAGATAAGTTGTTATTATTTCTATATTTTTTAATTAACTCACCCAATGTTTTCATTTTACGACACCTCATTTATATTATACCATGTCAACTATTGTTTACAAAAAATAGTTTGTATTTATTTTGTAAATCATAGTTGACAAAAATAAAAGAAAGTATTAGAATAAAACTTGTAAACCAAGAATGACACAAACAAAGGAGACGTAATATATGGTTAACAGAATTGCTTATTATAGAAAAAAATCAAAAATTTCGCAAGATCAACTCGCTAAATCAATAAATATATCTAGGCAATATTTATCAAAAATTGAAAACAATAAAGCTAATCCAGCTTATAATATTGTTTTAAAAATAAGTAAATTTCTAAGAAAAGATGTAAATGAAATTTTTTTTGAAAACAATGTAAACCATGATAAACAAACTGCTTAAATTTTAAATTAATCCTTTCAGCCTAAAAAATCAATTCAAAAGGCTAAAAATTAAATCATATCTTTTGAAAATTTAAAATAGGACAATCATTAACTTTCATAAGAATAAACTAGGAGGCGATTAAGCTGAAAAACAAAATTAAATCTGTTACTGTGAGTTATCCAGAAACTGATGAACTAAAAGATGAATTACAACTTAGATACGTAAAAGTATTAGCAAAAATTATTGTTAATATGCCTCCAGAAAGATTAAAAAAATTATCAAACTTATAGTAAAAAGATTGCAGCTAAGGTTATAAAAGCAGTGAACTAAAGATAAAAAATATATAAACATTCTTTTATATATTAATTTTAGCAATAAAATAGCATAAATTAACTACAATTTCATACAACTTTCATTGCTAAAAAGTGTAATTTGATTAAAGAAAAGAGATGAAAACATATGGGTAGAAACATAAAAGATACTGATACTGTCTATAAAAAGGCAAGAATAGAAGCATCAAGTTTTAATGACAAACTTAGAAGTAGAGAAGGCACGAGTGAAATACTTGGAGTAAGCCCTAGTTCATTATTAAATTATGAAACAGGAGTATGTAAGCAAATACCTACTGATGTGGTAGTTAAAATGGCTGAAATTTATAATGCACCAGAACTTATGAATTATTACTGTTGTAAGGAGTGTCCTATAGGGAAATATAGTGTTCCACACATTGAAGTTTTAGAAATGGACAGAATTACAATTCAAATTGTATCTTCACTAGAAAATATTAATGAGGTGAAAAAAGAACTATTAGATATTACAGAGGATGGAATCATTACAGAATATGAAAAACCGAAGTTGGATCATATTGTGAAAACATTGGATAAGATTTCAGTTGAATCTCAGGAATTAAAGCTTTGGGTCCAGAAAAATATTGAAAGGAAAGGAAGTTATTAATATGGCTGAAATGCCAGAAAACATAAAAAATCTTTTAAGAGATTTAAAGGAGGGAAGGGAATGTTTAATCCAGAGAAAGTAAAAGGTTTTAGCAAATTGGACAAAGAGGGTAGAGAAGTTTTTAGAAGGTTTTGTGAGAAATTTTACAAGGCATGGGAGCATCCAGAGGATCATGTGCCAACTTCAGTAAAAAGAATAGACAGTAAGTATCTTAAAGTTGTTTTAAGTGATGGCGACTGGTTGCATATCTTAAAAGATGGAAGTTGGTATTAAAGGAAGGAGGTAAAACTATGGTATTTGAAAATATGGTAGCACTTTTAATAGCTGCTGAGAAAAAATGCCCTCAGGAAGTGGCTTTCAAATACTTAGACAGGTTGGCGCATGAAACTGAGTTTAAAAGAGCTCCTGTATTTAGCTGGACATATGAAGATATACAAGATGTATTGAAATTTAGGCAGGAAGGTATTAGTGATGAAGAAATAGGTAGTTATTACGGAGTAAAAGCAGGTACTATAGTAAGACTATTTTATAAGAAAATTAATACATCAATATCAATGAAACCTAGAAAACGTGGGACAAGAGCTGAAATAGAAAAAATGTTGGAATTGAGTAATCAAGGATTTAGTGCAAGAGAATTATCAGATAAATTTCATATCAACATACAAACTGTATATAACAGAATTCAAAAAGCAAGAAAGAAAGAGGTGTGTGGAAATGACTGATTTTAGAAAAAATAAGGTAAATGATCTTAGGGAAAAACTGGATAGGTATGCTTATGAGCATGGAACATTAGATCAAAAAACATTGGAGATAAGTCAAGAGGTGGATAAGTTTATAGTCGAAGATATGAAAAGAATCCTCTGCAAAGGATTCAATTAAAACTAATATCGTTATTTTGGTTAGGGTACTCTGCAAAGTACCTTAGCCACATTATAGCATGTATGGAGGTGAATTTTCAATAAGAATTAACTTAATGCACATCTATAAATCAATTCTATTAAAAAATTATAGATTAGGAGATGTATTTACTTATGGCAAAATATAGATATGTATATACGAGCTTTTGGGAAGATCCAAAAGTTACAGAAAAGTTTACACCAGAGGATAAGCTATTTTTCATATACCTCTTAACAAATCCTCATACGACACAAATAGGTATATATAAAATAACTAAAAAACTTATAGCATTTGAAATGGGATATTCTATAGAATCGGTAGATAGTTTGATGGTTAGATTTGTAGATCATCATAAGTTAATTAGGTATAATGCGGAGACTAGAGAGATTGCTATAAAAAATTGGGGTAAATTTAATCTTAATAAAGGCGGCAAACCTATCATAGATTGTGTGAATAAGGAATTGACGGCAGTAGAAGACAGGGAGCTTATAGACTATGTAAGCCAAGGTATAAAAAGTCAAACTATAAGGGATTTATTTCTAAAATCAATAGGTAAGTTGGATGATCAAAAAGCATTTGATTCACCTGAAAATGATCAATCAAAAACAGATGAAAATAATGAAGAATTGGGCGATACGCCCACGTATCGTGAACGATACGTGGACAAAACTAAAACTAAAACTAAAACTAAAACTAAAATTAAAAGTAATAGTAATAATAATAGTCAAGATGAAAATAATATCAAGCCTGTGGATAATGTGCATAATGTGGATAACTCTGAACTGTTAGATGAAAAATCTAATAATCAAAATAAAATACCTTATGCTGAAATAGTGCAGTATTTGAATTCTAAAGCAGAAACTAATTACAGAGCTACAACGGAATCTACAAGGTCAAAAATTAAAGCTAGGTGGAATGATGGTTTTAGATTAAATGATTTTAAAACCGTTATATGCAAAAAGACAGAAGAATGGACAGGTACAGATATGGAAAGATACCTTAGGCCAGAGACGTTGTTTGGTACCAAATTCGAAAGTTATCTTAACCAAAAAGTTGTAGCAGGAAACACTAAAAATAATTCAAATAAGAGTACTTTTAACAACTTTAAACAACGTGATTATGATTTTAAAGAGTTGGAAAAGAAATTACTTGGGATAAGTTAAGGGCTGTAAATTGATATTAAAAAGAGGTTGATAAAGAATGAAAAAGGTAAGCATTGTAAATATAAAGGGCGGAGTTGGTAAGACTGTAAGTACTGTTAACATAGCAGCATGTTTAGGAGAACTAAACAAGAAAGTTTTGATAGTTGATGCAGACGCACAAAGTAATGCTACGCAGTATTTAAACTGTTATTCTCCAGAAGGAATTTCAACCTATGATGTGCTTATGGACAAGGATATAGATGTAAATACGGTAATAAAAAATACAAGTGTAAAAGGTGTAAGTGTAATACCGGCTAATATAAAGCTGATATTATGTGAAAATGAGATAGTAAATGATACTAGGAGAAGTAGAGAGAATAGGTTAAAAAAAGCATTGGACGCTTTAAAAGAAGAATATGATTATGTGATTATAGATTGTCCACCAAGTTTAGGCGTTGTAACTACCAATGCACTGGTAGCATCTGATTATATCTTAGTTCCAATTAAGATAGACCGATTTGCATTAGATGGATTTGGATATTTACTTGATACTATAGACCAGATAAGTGACGAGTTTAATCCAAAATTAAATTTTACAGGTGCATTTATAACAATGGATAAGAGGACTGCAATAAATAGGAAAATGAAAGCAGAACTTAAAGAGGCTCTTAAAGATAAGCTTTTCAATGTGTCTATTAGAGAAAATGTTAAAGTAATACAGTCAACATTTGAGCAACAGCCTGTTATAACATACTGTAAAAATGCCATAAGTAGCAAGGACTATAGAGCTCTTACCCAGGAGGTAATGAAGCATGTCATTTAATTTTAAAGGCATTGCAGATAGAGTAAATCACCTTGATAGTAAACAGGATTTCAATTTGAAAAACATTGATATAGAACAAATAGTACCAAATGAAAAGAATTTTTATGGTATGAGAAATATAGAAGAGCTTATGGAAGATATAAAAGCTAACGGACTTTATCACAATCTAGTTGTAACACCTTTTGATGATGGCAAATATAAAATAATCTCTGGTGAAAGAAGGTACCTTGCATTAAAAAAGTTAGGTTATAAAAAGGTACCATGTCAGGTAAGAGAAAATATAAATGCGATAGACAGTGAGATAATGCTTATTCAGGCGAATGCAAAAACTAGGGAACTTACAAATGCTGAA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60 | Clostridium_phage(46.88%) | terminase,plate,integrase,transposase,head,protease,tail,portal,capsid | attL 1990976:1991035|attR 2023131:2024659 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
3343192 : 3416694
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP029758|3343192:3416694|DBSCAN-SWA AGTGATTAAATTGTTACAGAAACAGAAAATTATTTTAAAACACATTGAAGGAATGAGCAATAGAGCCATTGCAAGGGAGTTACATATTAGCAAGGATACCGTCAACAAGTATATTAAAGAATATCAGAATCAAAAGTCAGAATTACTACAAACTAATCCAGAAATGGACCCTTCAGAGCTTATTCAAGCAATTGTAGAGAAACCTAAATACAATTCTGATGGACGCAGACCTACTAAAGTAACACCTGAAATGATGGAGGAAATTGAAGTCCTTTTAGAACTCAACCGTAAAAAACGTGCAGAAGGAAGACAAAAACAAACTCTCAAGAAACTTGATATACATGAAGAATTGTTAAAAAAAGGGTTTAATATAAGTTATGCCACTGTAAAACGTCTTGTAAAAGAGATATGTGAAAAACACAAGGAAGCCTTTATTCGCCAGGAATATGATTATGGTGACGTGTGTGAATTTGACTGGGGAGAAGTTAAACTTAATATAGGTGAAGAAGGCTTTAAAAAATATCAGATGGCAGTATTTACTGCTGCTAAAAGCAACTATCGCTTTGCAATGTTGTTTAAATCACAAGATACTCCAGCATTTCAACAGGCACATGCTGATTTTTTTGAACACTGTCAGGGTTCTTTTAGAAGTATGGTTTATGACAATATGAAAGTTGCAGTTAGAAAGTTTGTCGGGCCCTATGAAAAAGAACCAACAAAAGCTCTTATGGGACTCTATATATATTACGGATTCAATTTTCGATTTTGCAACATTGCTGCTGGAAATGAGAAAGGACATGTAGAGAGAAGCGTTGAATTTGTAAGAAGAAAAGCATTTAAAATTAAGGAATGTTTTGACTCTATTTCAGATGCTAACAAGCATCTATTAGAATGCTGTATGCAGATAAATAGTAAACCTATTTCTAATGATACAGTTCCATTAGAAGTATTTCATCAGGAAAAAATGCATTTAAATCCACGCTTGCCTATATTTGAAAGCTGTATTGCCCTAGAATATAGAGTAGACAAATATTCGACTATTATAATAAGTCAAAATCATTATTCAGTACCTGATTTCCTTGTTGGGAAAATGCTGCTAGTTAAAGTATATACAGATAAAATTGTTATTTATCATGAAAATATCATTGTTGCAGTTCATAAAAGAAACTATCTTAATCACAGCTGGAATATTCAGCTCAAACATTATCTTAAAACTCTATATAAAAAACCAGGTGCCCTACATAAAAGCACAGCACTGCTTCAAGAGGACACCAAAATACAAAACATATTCAACAAATATTATAGCAAAGATGCAAAAACATTTCTAGAAGTTTTAGAGATTATCTATGAAAGAGGTGTTGATGATGTTGCCAGTGCCTTAATAAAATTAGAAAGAATATCGCCACTGGATATGAGTAGAGATAAAGTGATGGCTATTTGCGATTATACTTCACAAACTAAATACAGTACTAGGAAAAACTATACAGATACCCTGTCGGAAAAGTCAAGGACAAGCCTTTCTTTGTACAATAAGCTTGCTAATCTACAATTTGAAAGGACGGTATAGGGATGAAAATAAAATTCAATGAAGAGATTAAAGAATTCTGCAATATACTCAAACTCAGAGGAATACATGACCACTTTGAGGAAGTTATTGAGGAATCCAGAGATTATGAAGAATTTTTGCACAAACTACTGCTGCTTGAGATTGATGAAAAAGATAAACGTGGAGTTGAGTGCCGGATACGTAATGCAAAGTTTCCATATAGAAAATACCTTGATGATATTGACATAAAATATCTGCCTGAAGGTATGCAGAAAAAGCTTCCTGAACTCAGTACTCTGGCATTTATAGAAAAAGGTCAAAACGTAATTTTAGTAGGTAATCCAGGTACAGGTAAAACGCATGTAAGTATAGGACTAGGTATAAAAGCTTGTATGGAAGGATACAAAGTGTTGTTTACCACTATTCCATTGCTAATAACTAAGCTTAAGGAATGTAACAGCCAGAAAACATTAACTTATTTTGAACGTAGATTTGAAAAGTATGACTTAGTAATAGCAGATGAACTTGGATATATTTCTTTTGATAAAGAAGGTGCTGAGCTGCTTTTTACAAATCTTTCTTTAAGGGCATCAAGAAAATCAATAATAATAACCACCAATTTATCCTTTGACAGATGGGAAGAAATATTTGCTGACCCAGTTATAACAAGTGCTATGGTAGACAGGCTTACACACAAAGCACATATCATAGACATGACAGGTGACTCCTATAGACTTCATGAGTCTCTTAGCCAATGCTAAAATTTAGCACCTATGAAAATTCATAGGTGTAACATCTTATAATTAGTGACCTAAAATTCAATGAGCAGATGACCTAAATTTCACTTGACATATACAACAATTTAGTAAATCATCAGTATCACTTATATTACTCACTTTATTTACTTGAAAATTATACTTAATTTTACTTTCAAGTTCTAATTGTTCATAATAATTTTCTATTTGACGCTGCTCTTCATCATCATCTTCTTGTTTTTTCTTTTGTTTTAATTCTCTAGCTTTTTCAATTTCAGCTAGTTTCTTAGGTGACGGTACAGAGCCACCACTTTCAACCCATGATCCATCTTCATTAAAAGTTATGGTAGCCGGGGTTTGAATATCACCTCGAGCCGCAAGAAAACTGTTATGAGCAGGCTGCTGTGCAAAAAAATCTTTTATAACACTGTCAACATACTTCTTTTTTTCTGGATTAGCAGCCATTTCTTTCTGCAATTTAAGTGGTATTGTTATAGTTGTCATTGTTCAAAATTCATCACAAACAACACTTGTAGAATTATGTTTACCGTCTAAACTGCTAATTAAGTTTTGTTCATTCATTATTTCGTTAAAATCATACTTACCATTTACCTGCTGCTTTAAGTTTCTTTCTAAGTTAAAACTATTGTTTAACAGATTGCTTACTTTTTCCATGACAAATTCCACCTTCCATAAAATATACGTATAATTTGCTGTATCTTTTCACAAATATTATTCGTAATACTTACTCCATAGTTATTACATGTCTGTAGTAACTACAAATTTAATGACAGTTTTGACTAAATACGTAAAAATTATATCATATTTGTAATACTATTACATAAATATGTTAATGAAATTTTTGTTGGCGAAATTAATGATTATAATTTAAATCAGCTTTACAACAAATTTAGAAAGCAGCATAATATTGTTTCTTTGTAAAAATAAGAAAATGCCCTAAAAGTACACCATTGTCATTACTTTTAGGGTACAGTAAGTTTACTTCACATTTTTACGCTTTTTTACACTAGTTTCACCTTTAACTTGAATAGTATTGTTATCACTATTTTTCTCTTTTGAATCAACTTTATTATGTACTTCAACTGTTCTATCATCTGCATTAGGCTTATTCTCTGTAGATTTTACTGGATTATCTTTTTTCTTGATTTTATCCAATTGCTTTTTATATTCTCCAATTCCTTTTTGAATTAACTTTGCACTTTGTGATGTTTTTTTTATCTCAGACGAAGTATAATTTAATGCTATTTCAGCTTGTCCCATATTTCCTTTTGCTTTAGCCTTTTTATATTCAGAATATGCAACTCTTCCATTCCTTTGATGAAACGAAGCTGACATAAGTCCCATCATAATTTCTTTATTTATACCCTGAGATTTGTCATAAGCTTCTTCTTCCGTTTCTTGTTTAGTATCTTCTTTAGTTTCTGATTTTTTATCCAACTTATTAGACTTTTCTTCTAACAAACGTTTTTGAATTTCCTTAATTGACTCATCTTTTGTTTCTTCAGAAACATCACTTTCCTCAATTTTTTTCATTTGCTGCTGCAGCTGTAATTTTTCTTTATCTAGAGGACTTGACTTACCAGTGCTAGTACTATTTGCTTTATGTTTCATATTATTAATCATTGTATTTGATATAATATTTATTTTCATGTATATACCTCCATTTTGTCAAATAAAATTATATATAAATTCTCGGAAAGTATTTACTTAAAATAATATATATTGTTGTGAACATGCTTTTATTTGTAGTGAATATATATCAAATTTGAAACATAATATTTAATATAAACATATTTTCTCTGCTTTCAATATATGTATTTCCAAAATATTTATCCGCAATATTTTGTATGTTCATCATACCTATTCCATGATTTACATAATCACATTTATCAGTAGAAATATGCTTCTCTTTTATATAGCCTTTCATACTATTTTTTATTTCAAACACTATAAATGATTTATTAATAGTACTCGTTATATGTATATATTTTTTTATGCTATTATCTGTAATTTTTTCACAAGCTTCTATCGCATTATCCAGGGCATTACCAAGTACTATACATAAATCGAAAGGATCAACTTTTATTTTATTAGGTATCTTGGCATCACACTTAAAATCTATCCCTTTGTCTATACTTATATTATATTTCTCACTTATAACGGCATCTGCAAATGAATTTCCTGTACTTACCCTTAAACTAATTTTTTCTAATGAACTGGTTATTTTTTTCAAATAACTCTCTGTACTTTTTATGTCACCCTGAAGTAATAAGTTTTTGATACAAATCAAATGATTATTTATATCATGTCTAAATGTTCTTGTATTTCTAATTTGTACTTGTAAATCTTTGTAATGCTGAGTTTGTATACTAAACTGTTGTTTTAAAAGTAATTCCCTTTCTCTTATAATACTTTCTTGTGCAATTTTAGCTAAAGTTATTACTGTAAATACGGCACAAATTAATCCAGTGAATGCAAAACCCAACATTTTGATATTACCTAGTAACGAATTTCTCATATTATTTTTATAATATAGTTTAAAATATTCACATATTAATGATACTATGAATACATTAGGGACAACAAAAAATATCGTATACTTAAAATTCTTAAATTTATAATCAAAATAATGATTTTTCACTATAAAATTGAGTATTAAGAGATACAACAATTGTAAA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67 | Clostridium_phage(44.74%) | terminase,plate,transposase,tail,portal,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
4432084 : 4457856
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP029758|4432084:4457856|DBSCAN-SWA 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32 | uncultured_Caudovirales_phage(26.32%) | portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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