Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028841 | Streptococcus pyogenes strain CCUG 4207 chromosome, complete genome | 2 crisprs | DinG,csm6,cas9,cas1,cas2,csn2,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3,DEDDh,csa3 | 6 | 8 | 8 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028841_2 | 1050901-1051002 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP028841_2
|
1 spacers
spacers of CP028841_2
>2.1|1050925|54|CP028841|CRISPRCasFinder CCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028841_2
The CRISPR arrays of CP028841_2 >merge|CP028841|2|1050901-1051002|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATACCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACATAAAATTGGTATAGTCTAATTATA >CP028841|2|2|1050901-1051002|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATA CCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA TAAAATTGGTATAGTCTAATTATA
>CP028841.1|QAB34689.1|1049035_1050850_-|glutamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKSLSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSREATYTMLIHAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLATTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >CP028841.1|QAB34688.1|1048504_1048840_-|alkylphosphonate-utilization-protein MSLPNCLQCQSEYVYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVLDSNGVRLSDGDTITVVKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >CP028841.1|QAB34687.1|1047757_1048399_-|amino-acid-ABC-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKIPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTAANRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >CP028841.1|QAB34686.1|1047118_1047748_-|amino-acid-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKADAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >CP028841.1|QAB34685.1|1046266_1047103_-|amino-acid-ABC-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKSLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGRCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKERQDKVAFTDSYMRNEQIIVVKKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVATANIKS >CP028841.1|QAB34684.1|1045123_1045897_-|hypothetical-protein MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANFQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIETTVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDMGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKPFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQDALETALKS >CP028841.1|QAB34683.1|1043519_1044755_+|cation-efflux-system-protein MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLSLSVAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVAVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMIPEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLIDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQRTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKKQLHHTHYRIVKM >CP028841.1|QAB34682.1|1042077_1043400_+|sodium:alanine-symporter-family-protein MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGIYLTSHLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYAEGVLAIKYRTKDANGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFAGSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQMVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLAVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNEPVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFILMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >CP028841.1|QAB34681.1|1039230_1041549_-|DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALALNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLIKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANILGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTGYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEAAEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPFGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >CP028841.1|QAB34680.1|1038618_1038867_-|GlsB/YeaQ/YmgE-family-stress-response-membrane-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN >CP028841.1|QAB34690.1|1051025_1051583_-|signal-peptidase-I MVKRDFIRNILLLLIVIIGAILLRIFVFSTFKVSPETANTYLKSGDLVTIKKNIQPKYKDFVVYRVGKKDYVSRVIAVEGDSVTYMDDIFYLNNMVESQAYLEKMKAHYLNHAPFGTLYTDDFTVATITADKYQKVPKGKYLLLNDNRKNTNDSRRFGLINASQIKGLVTFRVLPLSDFGFVEVE >CP028841.1|QAB34691.1|1051800_1053303_-|pyruvate-kinase MNKRVKIVATLGPAVEIRGGKKYGEDGYWAGQLDVEESAKKIAELIEAGANVFRFNFSHGDHKEQGDRMATVRLAEEIARQKVGFLLDTKGPEMRTELFADDAKEFSYVTGEKIRVATTQGIQSTRDVIALNVAGSLDIYDEVEVGHTILIDDGKLGLKVIDKDIATRQFIVEVENDGIIAKQKGVNIPNTKIPFPALAERDNADIRFGLEQGLNFIAISFVRTAKDVEEVREICRETGNDHVQLFAKIENQQGIDNLDEIIEAADGIMIARGDMGIEVPFEMVPVFQKMIITKVNAAGKAVITATNMLETMTEKPRATRSEVSDVFNAVIDGTDATMLSGESANGKYPVESVRTMATIDRNAQTLLNEYGRLDSSAFPRTNKTDVIASAVKDATHSMDIKLVVTITETGNTARAISKFRPDADILAVTFDEKVQRALMINWGVIPVLAEKPASTDDMFEVAERVAVEAGLVQSGDNIVIVAGVPVGTGGTNTMRVRTVK >CP028841.1|QAB34692.1|1053365_1054379_-|ATP-dependent-6-phosphofructokinase MKRIAVLTSGGDAPGMNAAIRAVVRKAISEGMEVYGINRGYAGMVDGDIFPLGSKEVGDKISRGGTFLYSARYPEFAQLEGQLAGIEQLKKHGIEGVVVIGGDGSYHGAMRLTEHGFPAVGIPGTIDNDIAGTDYTIGFDTAVNTAVEAIDKLRDTSSSHGRTFVVEVMGRNAGDIALWAGIASGADQIIVPEEEFDIEKVASTIQYDFEHKGKNHHIIVLAEGVMSGEAFAQKLKEAGDKSDLRVTNLGHILRGGSPTARDRVIASWMGSHAVELLKDGKGGLAVGIHNEELVESPILGTAEEGALFSLTEEGKIIVNNPHKARLDFAALNRSLSQ >CP028841.1|QAB34693.1|1054458_1057569_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MFAQLDTKTVYSFMDSLIDLNHYFERAKQFGYHTIGIMDKDNLYGAYHFIKGCQKNGLQPVLGLEIEILYQERQVLLNLIAQNTQGYHQLLKISTAKMSGKLHMDYFCQHLEGIAVIIPSKGWSDTLVVPFDYYIGVDQYTDLSHMDSKRQLIPLRTVRYFAQDDMETLHMLHAIRDNLSLAETPVVESDQELADCQQLTAFYQTHCPQALQNLEDLVSGIYYDFDTNLKLPHFNRDKSAKQELQDLTEAGLKEKGLWKEPYQSRLLHELVIISDMGFDDYFLIVWDLLRFGRSKGYYMGMGRGSAAGSLVAYALNITGIDPVQHDLLFERFLNKERYSMPDIDIDLPDIYRSEFLRYVRNRYGSDHSAQIVTFSTFGPKQAIRDVFKRFGVPEYELTNLTKKIGFKDSLATVYEKSISFRQVINSRTEFQKAFAIAKRIEGNPRQTSIHAAGIVMSDDALTNHIPLKSGDDMMITQYDAHAVEANGLLKMDFLGLRNLTFVQKMQEKVAKDYGCQIDITAIDLEDPQTLALFAKGDTKGIFQFEQNGAINLLKRIKPQRFEEIVATTSLNRPGASDYTTNFIKRREGQEKIDLIDPVIAPILEPTYGIMLYQEQVMQIAQVYAGFTLGKADLLRRAMSKKNLQEMQKMEEDFIASAKHLGRAEETARGLFKRMEKFAGYGFNRSHAFAYSALAFQLAYFKAHYPAVFYDIMMNYSSSDYITDALESDFQVAQVTINSIPYTDKIEASKIYMGLKNIKGLPRDFAYWIIEQRPFNSVEDFLTRTPEKYQKKVFLEPLIKIGLFDCFEPNRKKILDNLDGLLVFVNELGSLFSDSSFSWVDTKDYSVTEKYSLEQEIVGVGMSKHPLIDIAEKSTQTFTPISQLVKESEAVVLIQIDSIRIIRTKTSGQQMAFLSVNDTKKKLDVTLFPQEYAIYKDQLKEGEFYYLKGRIKERDHRLQMVCQQVQMAISQKYWLLVENHQFDSQISEILGAFPGTTPVVIHYQKNKETIALTKIQVHVTENLKEKLRPFVLKTVFR >CP028841.1|QAB34694.1|1057753_1058125_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSWKFEEKSPIYAQIAQHVMMQIISQEIKSGDQLPTVREYAEIAGVNPNTMQRAFTELEREGMVYSQRTAGRFVTDDQKLIARKRRELAISELESFITNMTKMGFSHTEIIPVLTSFLKEDSQ >CP028841.1|QAB34695.1|1058124_1058823_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAHLLQLHHVSKSYREKKAIDDLTITIPNGKIIGLLGPNGSGKTTLIKLINGLLQPNKGEIVIDGYRPCVETKKIISYLPDTTYLNENMRIKDMLEFFSDFYSDFDKSKATSLLRDLELDPEDRFKTLSKGNKEKVQLILVMSRKARLYVLDEPIGGVDPAARDYILKTIINSYCENASVIISTHLISDIEPILDEVIFLKQGRLFLSGNADDLRQEYQQSIDSLFRETYKV >CP028841.1|QAB34696.1|1058832_1059618_+|ABC-transporter-permease MFGKLLKYEFRSIGKWYFALNAFVIAIAAILSFTIKLFAQSNSDGLFGVLTNKMLPLTLGLTFGSLIAGSLLSTLLIIIKRFSKSVFGWEGYLTLTLPVNSHQIILSKLLASFICSVFNTIILAFAIAIVIVPMFNINELLEGFFNSFKMDYFINMLTVLAYVLLSTFTSILLIYLSISIGQLFSNRRGLMAFIAYFILVILISVAATYVHSHIFNINTSADSFPFTEQKTIYLLILEQFIEMIMFYLATNFIIKNKLNLQ >CP028841.1|QAB34697.1|1059744_1060359_-|TVP38/TMEM64-family-protein MTKRNSKAYILWQKIIKILGIIALIGTFFLAFWLYRLGILNDSNALKDLVQRYRLWGPFVFIVVQIIQIVFPVIPGGLTTVAGFLIFGPVTGFIYNYVGIIIGSIALFLLVKTYGRKFILLFVNDKTFYKYERRLETPGYEKLFIFCMASPVSPADIMVMITGLTDMSLKRFVTILLITKPISIIGYSYLFIFGKDVISWFLQH >CP028841.1|QAB34698.1|1060949_1061138_-|Paratox MLYIDEFKEAIDKGYILGDTVAIVRKNGKIFDYVLPHEKVRDDEVVTVERVEEVMVELDYIK >CP028841.1|QAB34699.1|1061358_1062114_+|exotoxin-type-A MENNKKVLKKMVFFVLVTFLGLTISQEVFAQQDPDPSQLHRSSLVKNLQNIYFLYEGDPVTHENVKSVDQLLSHDLIYNVSGPNYDKLKTELKNQEMATLFKDKNVDIYGVEYYHLCYLCENAERSACIYGGVTNHEGNHLEIPKKIVVKVSIDGIQSLSFDIETNKKMVTAQELDYKVRKYLTDNKQLYTNGPSKYETGYIKFIPKNKESFWFDFFPEPEFTQSKYLMIYKDNETLDSNTSQIEVYLTTK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028841_4 | 1317644-1317938 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of CP028841_4
|
4 spacers
spacers of CP028841_4
>4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT GAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACA >4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT GCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAA >4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT TAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTT >4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT CTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTT >4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR GAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACA >4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR GCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAA >4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR TAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTT >4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR CTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTT |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP028841_4
The CRISPR arrays of CP028841_4 >merge|CP028841|4|1317644-1317938|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CTTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACGAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACAATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACGCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAAATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACTAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTTATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACCTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTTATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC >CP028841|4|4|1317644-1317938|CRISPRCasFinder CTTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC TAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC CTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC >CP028841|4|1|1317644-1317938|CRT CTTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GAGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC GCTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAA ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC TAAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC CTGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTT ATTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC >CP028841|4|1|1317645-1317938|PILER-CR TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACG AGTTTACTCGCTCAAATCAAGGTATGCGGACAA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACG CTGTGACATTGCGGGATGTAATCAAAGTAAAAAA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACT AAAGCAAACCTAGCAGAAGCAGAAAATGACTTA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGACC TGATGTAATTGGTGATTTTCGTGATATGCTTTTTA TTTCAATCCACTCACCCATGAAGGGTGAGAC
>CP028841.1|QAB34969.1|1316773_1317484_-|cytochrome-c-biogenesis-protein-CcdA MTLSLVLMVSVFGAGLLSFFSPCIFPVLPVYLGILLDADDSKTITIFGKKLYWYGIVKTLAFIFGLSTIFVILGYGAGFLGNILYAVWFRYLLGALVIILGIHQMGLITIKSLQFQKSLTFHNNKNRNGLFNAFILGLTFSFGWTPCVGPVLSSVLALVASGGNGAWQGGVLMIIYTLGLGIPFLLISFASGIVLKQFNKLKPHILLLKKVGGVLIIVMGILLMTGTLNNLAQLFG >CP028841.1|QAB34968.1|1316137_1316761_-|TlpA-family-protein-disulfide-reductase MKKGLLVTTGLACLGLLTACSTQDNMAKKEITQDKMSMAAKKKDKMSTSKDKSMMADKSSDKKMTNDGPMAPDFELKGIDGKTYRLSEFKGKKVYLKFWASWCSICLSTLADTEDLAKMSDKDYVVLTVVSPGHQGEKSEADFKKWFQGTDYKDLPVLLDPDGKLLEAYGVRSYPTEVFIGSDGVLAKKHIGYAKKSDIKKTLKGIH >CP028841.1|QAB34967.1|1314988_1316095_-|peptide-methionine-(R)-S-oxide-reductase MEHKWKLWLFIVGVVLLIGGASVLIQKGQAKAFSQGKPQLPAKKVKSTKVDPNAPVDQKVIYLAGGCFWGVEEYFSQVDGVLDAVSGYANGRGDTTNYQLIHQTGHAETVEVAYDANRISLKELLLHFFRIIDPTSLNKQGNDRGSQYRTGIYYTDKADLAIIDEVFKEKAKDYKKKIVVEKAPLKHFIKAEDYHQDYLKKNPNGYCHIDINQATYPVIDESKYPKPSATEIKEKLSADEYRVTQKNETEKAFSNRYWDSFDAGIYVDVVTGEPLFSSKDKFESGCGWPSFSRPISPDVVRYKEDKSFNMTRTEVRSRSGNSHLGHVFTDGPKDQGGLRYCINSLSITFIPKADMEAKGYGYLLSSVE >CP028841.1|QAB34966.1|1314160_1314901_-|DNA-binding-response-regulator MYSLLIVEDEYLVRQGIRSLVDFSQFKIDRVNEAENGQLAWDLFQKEPYDIVLTDINMPKLNGIQLAELIKQESPQTHLVFLTGYDDFNYALSALKLGADDYLLKPFSKADVEDMLGKLRKKLELSKKTETIQELVEQPQKEVSAIAMAIHERLADSDLTLKSLAQQLGFSPNYLSVLIKKELGMPFQDYLVQERLKKAKLLLLTSNLKIYEIAEQVGFEDMNYFSQRFKQLVGVTPSQYKKGGQA >CP028841.1|QAB34965.1|1312430_1314164_-|sensor-histidine-kinase MKRYPLLVQLISYVFVIVIALITTLGLLYYQTSSRNIRQLIERDTRQSIRQSSQFIDAYIKPLKETTSVLAKNTEIQAFASQIHQENDKQVLQLMKMVLATNSDLQAAVLVTKDGRTVSTNSQLTMKTSSDMMAEPWYKAAIDRQAMPILTPARQLSLSSKKEWVVSVTQEVVDRAGHNLGVLRLDIAYPTIKASLDQLQLGRQGFAFIVNDKHEFVYHPKKSVYSSSKEMAAMKPYLAIQNGYTKDKTSFVYQKLIPNSQWTLVGVASLDQLHRVQRQIFWSFLGTGLLACLICGFATVLVLRRWIRPIQQLQQVILAIQKGDRQLRAQETGSPELTDLAQQFNALLDQIDSLMVAVADKEKAIGQYRLQALASQINPHFLYNTLDTIIWMAEFNDSKRVVEVTKSLAKYFRLALNQGNEYIRLADELDHVSQYLFIQKQRYGDKLSYEVQGLDVYADFVIPKLILQPLVENAIYHGIKEVDRKGMIKVTVSDTAQHLMLTVWDNGKGIEDSSLTNSQSLLARGGVGLKNVDQRLKLHYGEGYHMTIHSQSDQFTEIQLSLPKMHELMADDTQENE >CP028841.1|QAB34964.1|1311278_1312358_-|MmcQ/YjbR-family-DNA-binding-protein MSLATDYFSRQTPIVEKLMAYGFEKRDNGYFYNERFMEGEFEAQLRIDEAGNIWDRVIDCDLEEDYLPLQQAAWQGTYTGQVRAAYLELLERLSVACFEATPFQSMQANRLAKHITKEWSDPMDYPFEKHPDLATYRVGGKWYAMIFSLLADKLDQIPERLVGQTCEVMTVKVNPKAFPQLLQQEGIYPAYHMSKKNWISIILDDKVTDDKLWTLVTQSRQLVNPNGLSNPNGPDYWVIPANLKYYDIDAEFAANDVILWTQKAGIAVGDYVLIYITAPVKSIRYVCQVLETDIPNEGYRKNPNIDKLMRLRKCQQYKDGLLSFDLMKKHGVAAVRGPRRLSPQLIAFLKEKEYFKENN >CP028841.1|QAB34963.1|1310548_1311265_-|hypothetical-protein MVEFVADQSFWELFPGAKLGVVLLKDVQNQAESPEDVKQLLADSHELAKAYLTADNFSDNQVVQVYRKAYQHFKTKKGARSSIEALLKRVSNGQSIPSINPLVDIYNAASLRFGLPAGAEDSDSFIGDLRLTITDGGDDFYLIGDADNNPTLPNELCYKDDIGAVCRCLNWRDGERTMVTEHTKNAFLIIEALDQEGQNRLQEALKFIEGSAKMYLHAITSVHVLDKDNPHVPLFTEN >CP028841.1|QAB34962.1|1309909_1310383_+|arginine-regulator MNKKETRHQLIRSLISETTIHTQQELQERLQKNGITITQATLSRDMKELNLVKVTSGNDTHYEALAISQTRWEHRLRFYMEDALVMLKIVQHQIILKTLPGLAQSFGSILDAMQIPEIVATVCGDDTCLIVCEDNEQAKACYETLSHYTPPFFFSNK >CP028841.1|QAB34961.1|1309087_1309768_-|Crp/Fnr-family-transcriptional-regulator MIRREDYQYLRKLNDFRYFSIEQFDKIVGQMEFRKAKKDHILFFEGDKRDKLFLVTSGYFKVEQSDQSGTFMYTDFIRHGTIFPYGGLFTDDYYHFSVVAMTDVTYFYFPVDLFEDYSLENRLQMKHLYSKMSKLLELHELRVRNLITSSASSRVIQSLAILLVEMGKDSDTLPFQLTTTDIAQISGTTRETVSHVLRDLKKQELITIKGKYLTYLDKDYFLQYTK >CP028841.1|QAB34960.1|1307578_1308814_-|arginine-deiminase MTAQTPIHVYSEIGKLKKVLLHRPGKEIENLMPDYLERLLFDDIPFLEDAQKEHDAFAQALRDEGIEVLYLETLAAESLVTPEIREAFIDEYLSEANIRGRATKKAIRELLMAIEDNQELIEKTMAGVQKSELPEIPASEKGLTDLVESNYPFAIDPMPNLYFTRDPFATIGTGVSLNHMFSETRNRETLYGKYIFTHHPIYGGGKVPMVYDRNETTRIEGGDELVLSKDVLAVGISQRTDAASIEKLLVNIFKQNLGFKKVLAFEFANNRKFMHLDTVFTMVDYDKFTIHPEIEGDLRVYSVTYDNEELHIVEEKGDLAELLAANLGVEKVDLIRCGGDNLVAAGREQWNDGSNTLTIAPGVVVVYNRNTITNAILESKGLKLIKIHGSELVRGRGGPRCMSMPFEREDI >CP028841.1|QAB34970.1|1318086_1318380_-|CRISPR-associated-endonuclease-Cas2 MMVLVTYDVNTETPAGRKRLRHVAKLCVDYGQRVQNSVFECSVTPAEFVDIKHRLTQIIDEKTDSIRFYLLGKNWQRRVETLGRSDSYDPDKGVLLL >CP028841.1|QAB34971.1|1318390_1319416_-|type-I-C-CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKKLLNTLYLTQEDFYVTKEGDNIVIKQEGKVLKRFPFRIIDGIVCFSYLGVSSALVKLCTENQINLSFHTPQGRFCGRYIGSTNGNVLLRREHYRLSDREESLEYAKRFILAKISNSRKYLLRFKRDHRQQIDTKLFEAVNDELIWALEMVQAADNKDSLRGIEGQAANQYFRIFNDLVLTDKKTFYFQGRSKRPPLDCVNALLSFGYSLLTFECQSALEAVGLDSYVGFFHTDRPGRASLALDLVEEFRSYIVDRFVFSLINKGQLQKKHFEVKENGSILLTENGRAIFIDLWQKRKHTEVEHPFTKEKVKLMLLPYVQAQLLAKAIRGDLESYPPFMV >CP028841.1|QAB34972.1|1319412_1320087_-|CRISPR-associated-protein-Cas4 MVYAEDDYLMLSGIQHFQFCKRQWALIHIEQQWLDNEATAHGQVLHTKADNPYIKEKRKELLVSRAMPISSAELGLSGIMDVVEFYKDDQGVSLRGKRGKWLPKVVEYKRGKPKKDTRDIVQLVAQTMCLEETLDCDINEGCLYYHSVNQRVIVPMTSALRQEVKELAAEMHEVYQSQMLPKAAYFKNCQLCSLVDICKPRLSKKTRSVSRYINEAMTSEEMDL >CP028841.1|QAB34973.1|1320088_1320937_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas7/Csd2 MLEHKIDFMVTLEVKEANANGDPLNGNMPRTDAKGYGVMSDVSIKRKIRNRLQDMGKSIFVQANERIEDDFRSLEKRFSQHFTAKTPDKEIEEKANALWFDVRAFGQVFTYLKKSIGVRGPVSISMAKSLEPIVISSLQITRSTNGMEAKNNSGRSSDTMGTKHFVDYGVYVLKGSINAYFAEKTGFSQEDAEAIKEVLVSLFENDASSARPEGSMRVCEVFWFTHSSKLGNVSSARVFDLLEYHQSIEEKSTYDAYQIHLNQEKLAKYEAKGLTLEILEGL >CP028841.1|QAB34974.1|1320941_1322837_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas8c/Csd1 MDFFTSLLKTYEKAELADLVDHQKRNNEPVLLPIYHTSLKSNGKNIISVKLDKDGQFHKAEFMADKQMIIFPVTADSVARSGSHPAPHPLVDKFAYYSAEMGQIQYDSFHKQLNNWIDYCEEGDVKKFLTFVQQFILKPEFLTLILDSLIGPDYQHNQLKVTFCDATGKEKLIDLSACFLEFSIDQFQGFKNESVSTFKALHQSYISFVEANRENLGICNISGREEQLTDKHRGLMGNAKIISVSNKREAYKGRFREREDVFSVGYETSEKIHLMLKYLLENKNTSTWLGSSQYLINWFSDDLTNDSRLDIVSPIFDDGLEEDDDDDTPPVITLATEDNKRIGKSFIKGQKLFANDATYYVAILNKTSNGRIALKYFRQLQASQLLTNLNKWQETYSWESRSKFGKSRLRTPTFHDILNVSYGVDRDRFLELDNDNFKSDQIQKLVASLIDGKPMPQSIVKKLGNNVKERHRYRKHWYQVEQVCLAILHKQNGEEFSPMLDHTNQNRSYLFGRLLAIFELIETLRYGLDGNNNDRITNAERYWTAYTGQPTKLMMLLENKIKPYEEPLKLNRRGSWMKLEKEKEEILELLNPLLETETMEKPLDYRFIFGYYAEKNYYYTKQNTEVTESEE >CP028841.1|QAB34975.1|1322836_1323565_-|type-I-C-CRISPR-associated-protein-Cas5 MYRSRDFYVRVSGQRALFTNPATKGGSERSSYSVPTRQALNGIVDAIYYKPTFTNIVTEVKVINQIQTELQGVRALLHDYSADLSYVSYLSDVVYLIKFHFVWNEDRKDLNSDRLPAKHEAIMERSIRKGGRRDVFLGTRECLGLVDDISQEEYETTVSYYNGVNIDLGIMFHSFAYPKDKKTPLKSYFTKTVMKNGVITFKAQSECDIVNTLSSYAFKAPEEIKSVNDECMEYDAMEKGEN >CP028841.1|QAB34976.1|1326258_1328907_-|valine--tRNA-ligase MTELSPKYNPAEVEAGRYQKWLDADVFKPSGDQKAKPYSIVIPPPNVTGKLHLGHAWDTTLQDIIIRQKRMQGFDTLWLPGMDHAGIATQAKVEERLREQGISRYDLGRDKFLDKVWEWKDEYATTIKEQWGKMGLSVDYSRERFTLDEGLSKAVRKVFVDLYKKGWIYRGEFIINWDPAARTALSDIEVIHKDVEGAFYHMNYMLADGSRALQVATTRPETMFGDVAVAVNPEDPRYKDLIGKNVILPIVNKLIPIVGDEHADPEFGTGVVKITPAHDPNDFEVGQRHNLPQVNVMNDDGTMNELAGDFAGMDRFEARQATVAKLEELGALVNIEKRVHSVGHSERSGAVVEPRLSTQWFVKMDELAKQAMDNQETDDRVDFYPPRFNDTFLQWMENVHDWVISRQLWWGHQIPAWYNAEGEIYVGEEAPEGDDWTQDEDVLDTWFSSALWPFSTMGWPDTDVEDFKRYFPTSTLVTGYDIIFFWVSRMIFQSLEFTGRQPFQNVLIHGLIRDEEGRKMSKSLGNGIDPMDVIEKYGADSLRWFLSNGSAPGQDVRFSYEKMDASWNFINKIWNISRYILMNNEGLTLEDAESNVAKVAASEAGNVTDQWILHNLNETIAKVTENFDKFEFGVAGHILYNFIWEEFANWYVELTKEVLYSDNEAEKVITRSVLLYTLDKILRLLHPIMPFVTEEIYAQYAQGSIVTVDYPVVRPAFENEAAHKGVESLKDLIRAVRNARAEVNVAPSKPITILVKTADSELEDFFNSNINYIKCFTNPEKLEISSAIAAPELAMTSIITGAEIYLPLADLLNVEEELARLDKELAKWQKELDMVGKKLGNERFVANAKPEVVQKEKDKQADYQAKYDATQERIAEMKKIKS >CP028841.1|QAB34977.1|1328908_1329472_-|shikimate-kinase MNLIIIGAQASGKMTIGQEVARQTGMTLFHNHDSIDFVLRFMPWSQESTALIERIRFAFFETFAKTGQDMIFTIVIDFNDPNDVAMLEKIQAVFQSYDQEVLFVELKTDIEERLKRNRTENRLKHKPLKRNIEWSEQDIQSTMAYAVFNPEEPPKTLTHYQKINNTQLTAAETAQLIIQKMTHIKEN >CP028841.1|QAB34978.1|1329468_1329669_-|N-acetyltransferase MGFTLLDLHKIELGCYDYNKQSQAVARKLGFTLEANARDRKDVQGRRCGDMRFGLLRSEWEEQKQK >CP028841.1|QAB34979.1|1330072_1330468_-|hypothetical-protein MAKQKNRKKALKLEMKRNGLLKKAGQVFDKAVESVETAVDKTISAGKNLVEKGSQTVENLTASKERLTLDEFAGQPVVAGIRSDLVETLYAEGIHSAQAFKEWTEKDLLALKGIGPATVKKLVENGASFKK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028841_4 | 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317807-1317839 | 33 | CP028841.1 | 551171-551203 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR | 1317808-1317840 | 33 | CP028841.1 | 551171-551203 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | CP028841.1 | 850316-850348 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | CP028841.1 | 850316-850348 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317741-1317774 | 34 | CP028841.1 | 1388206-1388239 | 2 | 0.941 |
CP028841_4 | 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR | 1317742-1317775 | 34 | CP028841.1 | 1388206-1388239 | 2 | 0.941 |
1. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 551171-551203, mismatch: 0, identity: 1.0
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer *********************************
2. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to position: 551171-551203, mismatch: 0, identity: 1.0
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer *********************************
3. spacer 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 850316-850348, mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
4. spacer 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR matches to position: 850316-850348, mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
5. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to position: 1388206-1388239, mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
6. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to position: 1388206-1388239, mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448961 | Streptococcus phage Javan494, complete genome | 33452-33484 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448766 | Streptococcus phage Javan465, complete genome | 34324-34356 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317807-1317839 | 33 | MK448690 | Streptococcus phage Javan169, complete genome | 23669-23701 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317807-1317839 | 33 | MK448694 | Streptococcus phage Javan179, complete genome | 22038-22070 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448961 | Streptococcus phage Javan494, complete genome | 33452-33484 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448766 | Streptococcus phage Javan465, complete genome | 34324-34356 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR | 1317808-1317840 | 33 | MK448690 | Streptococcus phage Javan169, complete genome | 23669-23701 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR | 1317808-1317840 | 33 | MK448694 | Streptococcus phage Javan179, complete genome | 22038-22070 | 0 | 1.0 |
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448779 | Streptococcus phage Javan497, complete genome | 33182-33214 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448792 | Streptococcus phage Javan521, complete genome | 33433-33465 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | NC_004584 | Streptococcus prophage 315.1, complete genome | 33026-33058 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448962 | Streptococcus phage Javan496, complete genome | 24582-24614 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448770 | Streptococcus phage Javan477, complete genome | 33433-33465 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448978 | Streptococcus phage Javan532, complete genome | 32920-32952 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.1|1317676|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317676-1317708 | 33 | MK448785 | Streptococcus phage Javan507, complete genome | 32921-32953 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317807-1317839 | 33 | MK448955 | Streptococcus phage Javan478, complete genome | 24096-24128 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448973 | Streptococcus phage Javan522, complete genome | 12058-12092 | 1 | 0.971 |
CP028841_4 | 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | NC_028700 | Streptococcus phage T12, complete genome | 12019-12053 | 1 | 0.971 |
CP028841_4 | 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448778 | Streptococcus phage Javan493, complete genome | 12073-12107 | 1 | 0.971 |
CP028841_4 | 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448686 | Streptococcus phage Javan157, complete genome | 14021-14055 | 1 | 0.971 |
CP028841_4 | 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448949 | Streptococcus phage Javan460, complete genome | 13943-13977 | 1 | 0.971 |
CP028841_4 | 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448958 | Streptococcus phage Javan486, complete genome | 11818-11852 | 1 | 0.971 |
CP028841_4 | 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448950 | Streptococcus phage Javan464, complete genome | 12065-12099 | 1 | 0.971 |
CP028841_4 | 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT | 1317872-1317906 | 35 | MK448782 | Streptococcus phage Javan501, complete genome | 14704-14738 | 1 | 0.971 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448779 | Streptococcus phage Javan497, complete genome | 33182-33214 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448792 | Streptococcus phage Javan521, complete genome | 33433-33465 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | NC_004584 | Streptococcus prophage 315.1, complete genome | 33026-33058 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448962 | Streptococcus phage Javan496, complete genome | 24582-24614 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448770 | Streptococcus phage Javan477, complete genome | 33433-33465 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448978 | Streptococcus phage Javan532, complete genome | 32920-32952 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR | 1317677-1317709 | 33 | MK448785 | Streptococcus phage Javan507, complete genome | 32921-32953 | 1 | 0.97 |
CP028841_4 | 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR | 1317808-1317840 | 33 | MK448955 | Streptococcus phage Javan478, complete genome | 24096-24128 | 1 | 0.97 |
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17. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
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18. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028700 (Streptococcus phage T12, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
19. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
20. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448686 (Streptococcus phage Javan157, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
21. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448949 (Streptococcus phage Javan460, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
22. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448958 (Streptococcus phage Javan486, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
23. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
24. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
25. spacer 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448779 (Streptococcus phage Javan497, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
26. spacer 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448792 (Streptococcus phage Javan521, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
27. spacer 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR matches to NC_004584 (Streptococcus prophage 315.1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
28. spacer 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
29. spacer 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448770 (Streptococcus phage Javan477, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
30. spacer 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448978 (Streptococcus phage Javan532, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
31. spacer 4.5|1317677|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448785 (Streptococcus phage Javan507, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
gagtttactcgctcaaatcaaggtatgcggaca CRISPR spacer gagtttactcgctcaaatcaaggcatgcggaca Protospacer ***********************.*********
32. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaaacctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ***************************.*****
33. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
34. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to NC_028700 (Streptococcus phage T12, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
35. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
36. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448686 (Streptococcus phage Javan157, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
37. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448949 (Streptococcus phage Javan460, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
38. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448958 (Streptococcus phage Javan486, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
39. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
40. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer ******************************.****
41. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448960 (Streptococcus phage Javan492, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
42. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448762 (Streptococcus phage Javan447, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
43. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
44. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
45. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
46. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
47. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448783 (Streptococcus phage Javan503, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
48. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
49. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448954 (Streptococcus phage Javan476, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
50. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448749 (Streptococcus phage Javan39, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaagcctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ********.******************.*****
51. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
52. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgaacctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ******.********************.*****
53. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
54. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
55. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
56. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
57. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK449012 (Streptococcus phage Javan94, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtgattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer *******.**********************.****
58. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
59. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
60. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
61. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
62. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448772 (Streptococcus phage Javan483, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
63. spacer 4.4|1317872|35|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgccattt Protospacer ******************************. ***
64. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to MK448960 (Streptococcus phage Javan492, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
65. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to MK448762 (Streptococcus phage Javan447, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
66. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
67. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
68. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
69. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
70. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to MK448783 (Streptococcus phage Javan503, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
71. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
72. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to MK448954 (Streptococcus phage Javan476, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941
gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.*****
73. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448749 (Streptococcus phage Javan39, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcaagcctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ********.******************.*****
74. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
75. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgaacctagcagaagcagaaaacgactt Protospacer ******.********************.*****
76. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
77. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
78. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939
taaagcaaacctagcagaagcagaaaatgactt CRISPR spacer taaagcgagcctagcagaagcagaaaatgactt Protospacer ******.*.************************
79. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
80. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK449012 (Streptococcus phage Javan94, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtgattggtgattttcgtgatatgcctttt Protospacer *******.**********************.****
81. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
82. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
83. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
84. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgacatgcctttt Protospacer *************************.****.****
85. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448772 (Streptococcus phage Javan483, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
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86. spacer 4.8|1317873|35|CP028841|PILER-CR matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943
ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgcttttt CRISPR spacer ctgatgtaattggtgattttcgtgatatgccattt Protospacer ******************************. ***
87. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909
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88. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909
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89. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774411 (CrAssphage cr273_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
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90. spacer 4.3|1317807|33|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT774410 (CrAssphage cr272_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
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91. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MT774411 (CrAssphage cr273_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
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92. spacer 4.7|1317808|33|CP028841|PILER-CR matches to MT774410 (CrAssphage cr272_1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.727
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
36609 : 48922
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP028841|36609:48922|DBSCAN-SWA TATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGTATTAAATCGGCTAGTCTTGTGAAAGAGTTGACGCATAATCTACAACTGACCTCTTTGAAGGCTTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTGCTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACTGTCTTTTGACGGAAACTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTATTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTATACTTGGTCAATAAGGATATTACAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAACCCTGTTGATTCGCGTTTCAAGGACATTACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTATCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAACTTATCAAGCTGACGATTTTGCGACTTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGACCTTCTCTTCATCCAAAATTATTTCAAATCAATCGGATGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAATTGAAGAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGACAACTTATGACAAATATATCGCCATGCGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAAACACTTATGGATATGGCGACTATTTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAACGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTGAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAACGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTCGGTGGAGCGGCGACTTGTATCGGTGGTGCTATTCGTGACCCATTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATCACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTGCCACAACAAGTTATTTCTAAAACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGCGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGCGATGTGGTCATCTTGCTCGGTGGTAAAACAGGTCGTGATGGTGTCGGTGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATTGAAGAACGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTTATTAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCTCTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCAAATGATGTGGATGCCTTCATCGCAGCCTGCAACAAGGAAAATATCGATGCAGTCGTTGTTGCGACCGTTACTGAAAAACCAAATCTTGTCATGACTTGGAATGGCGAAATCATCGTTGATTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAATGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCACGCTAGTCAAAAAGGTCTTCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGTTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGTTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAACAACTGCATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCAGAGTGGTCACCTTATCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTACTTTGAGCGTATGGATAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGTTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGACTTGACAGTACCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGCGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGCGAAAACATTTACTATATCCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGATAACTTTAGCCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACAGCTGCCTCAGCCGCTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGTTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACGCGGTGAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGCGCTAGCCTTCTAGCAGCCTTCGAAGGCAAATTGGAAGAGGTTTACCCAACAGAATTTGAGCAGACAGATGTTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAATACGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGTTGCTATTGCTGAGTCAGTTGACACTATGGTTGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGTTTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACGAGAAGGTCCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAATGATGCTAATCAGCATGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATTCCAGTTTCACATGGTGAAGGTAAACTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGACACTCAGAACGCTGGGAAGACGGACTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAATCCTCTTTGCAAGTGCTGTAAAATACTTTACAGGGAAGTAAAAAGGTTCAGTGAACCTTTTTAGCCCTCGCCTTGAATTAGTGAAGGGCGAGGTTAGAAAGAATCTCGCTTAATTTTTGAGAAATAGTAAACACGGGCGATAAGTTGTGCGAAAAACTTTCTATTTTCGCTTTACTTGACAGCCTTTGTATCGAGGTAAAAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGACATCCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGAGCTGGTATTGTTTCAAATGACAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGGCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCCTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACTCAAGTTTCATGGGAAAGGTAAAAGAAGCTCTAAATACAGTAAAGGGTGGCTTTGCCTATCTACTGATGACAGAAAATAAACTCATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATCGTGGTATTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGAATTAAGGGAACAAGGTGTTCGAATGAAACTATCAGCGGTATCCGGTGTTGTCAAAGGAAAGCGCGTTGTTATGATTGATGACTCAATTGTAAGAGGAACGACTTCTAGAAGGATTGTCGGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP028841|36609:48922|43905_45453_+|QAB33735.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTKVTLDDAGVETIAIDDVTRFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDITYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTTQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYTYKADPVSIFGGIIVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >CP028841|36609:48922|36609_40335_+|QAB33731.1|DBSCAN-SWA MNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKALRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDCLLTETEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAQLYLVNKDITEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFETYQADDFATYKAEQGLAMEVDDLLFIQNYFKSIGCVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPNDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGEIIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTTTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEDLTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKDNFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKLEEVYPTEFEQTDVLEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEVAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKLVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQILFASAVKYFTGK >CP028841|36609:48922|43167_43722_+|QAB33734.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKVAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYERRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI >CP028841|36609:48922|40495_41950_+|QAB33732.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSSFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTENKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDRGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHSVDEVCDIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >CP028841|36609:48922|46887_48153_+|QAB33737.1|DBSCAN-SWA MKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFANGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVEMIVRPVLEGMVAEGRPYLGVLYVGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQKDGVTLGVVVASEGYPFDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGVKFSENSELLLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDTTGLFYRNDIGSKAIRE >CP028841|36609:48922|41977_43000_+|QAB33733.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGALGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGQDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVKGIGHITGGGFIENIPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADASVVIK >CP028841|36609:48922|48430_48922_+|QAB33738.1|DBSCAN-SWA MKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKHAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVIGVPVKSRALSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >CP028841|36609:48922|45510_46635_-|QAB33736.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGDQILRVGEYFIVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
336789 : 342823
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP028841|336789:342823|DBSCAN-SWA GATGATCACAGGAAAACTCATAACCGTTGAAGGTCCAGATGGCGCAGGGAAAACGACTGTTTTAGAGCAACTCATTCCACTGTTAAAACAAAAAGTGGCTCAGGATATCTTGACAACAAGAGAGCCTGGAGGTGTTGCCATTTCAGAACACATTAGAGAACTTATTTTAGACATCAACCATACTGCTATGGACCCTAAAACAGAACTCTTACTTTATATTGCGGCTCGAAGGCAGCATTTGGTGGAAAAGGTACTACCAGCTCTTGAAGCAGGCCAGTTGGTTTTTATTGATCGTTTCATCGATAGTTCAGTAGCTTATCAAGGTGCGGGACGCGGTTTGATCAAAGCAGACATTCAGTGGCTCAACGAGTTCGCAACAGATGGTTTAGAGCCTGACTTGACCCTTTATTTTGATGTTCCTTCTGAAATTGGTTTAGCACGGATTAACGCGAACCAACAAAGAGAAGTCAATCGTTTAGATTTGGAAACAATAGAGATACATCAACGAGTACGAAAAGGATACCTAGCCTTAGCTAAGGAGCATCCAAAACGTATTGTCACAATTGATGCGACTAAACCATTGAAAGAAGTTGTCTCTGTCGCTTTGGAACATGTCTTAGCCTTGCTTTTAGCCTAGGATAAGGGAGGGTAGGAATGGATTTAGCGCAAAAAGCTCCTAACGTTTATCAAGCTTTTCAGACAATTTTAAAGAAAGACCGTCTGAATCATGCTTATCTTTTTTCGGGTGATTTTGCTAATGAAGAAATGGCTCTTTTTTTAGCTAAGGTCATCTTTTGTGAACAGAAAAAGGATCAGACGCCCTGCGGGCATTGTCGCTCTTGTCAATTGATTGAACAAGGAGATTTTGCCGATGTGACGGTATTGGAACCAACAGGGCAAGTGATTAAAACGGATGTGGTCAAAGAAATGATGGCTAACTTTTCTCAGACAGGATATGAAAACAAACGACAAGTTTTTATTATCAAAGATTGTGACAAAATGCATATCAATGCCGCTAATAGCTTGCTAAAATACATTGAGGAGCCTCAGGGAGAAGCTTACATATTTTTATTGACCAATGATGATAACAAAGTGCTTCCGACCATTAAAAGTCGGACACAGGTTTTTCAGTTTCCTAAAAACGAAGCCTATCTTTACCAATTGGCACAAGAAAAGGGATTATTAAACCATCAGGCTAAGCTAGTAGCCAAACTTGCCACAAACACCAGTCATCTAGAACGTCTGTTGCAAACGAGCAAGCTTTTAGAACTGATAACTCAAGCAGAGCGTTTTGTATCTATTTGGCTGAAAGATCAGTTGCAGGCATATTTAGCGTTGAACCGTCTGGTACAGTTAGCAACTGAAAAAGAAGAACAAGATTTAGTTTTGACCCTTTTGACCTTGCTCTTGGCAAGAGAGCGTGCGCAAACGCCTTTGACACAATTGGAGGCTGTCTATCAGGCTAGGCTCATGTGGCAGAGCAATGTTAATTTTCAAAACACATTAGAATATATGGTGATGTCAGAATAAGTGCAATTGGAATTCGTTATGGGGAAACGAAGCTTGTCAAAAGACTTGCCCGTAGCGACCAAAGTAGCGGCGCATAAGGGCAAAAAAGCTTTTGAAGAAAATACTGCCTTTGCAACAGATTTGATGAAAGAAGTATCACGATTAATAACACAAAATCAACTTGAAATGACGTTTGTTAATAGTGTCTTTCTCTTAGATCAGCATGTTGTCCTAATTCCCTTTTCAGCAGAAGAGCACATGGATTTTTACAACTGTTAAAAGATTTAGCGGTCGATTTTAGGTCAAGAAGTGAGCTGCCCCAGATTAACAGCCAAGAAGATTTCATTTTCTATGGAGGCTATGGACCGTGTGGCAGGCCACTGTGCTGCTTTCGTTTTTGGGAAAATTTCTGACAGTATCTATTAAAATACTAAAAAGTCAAGGGTTATCATTGACTTTGGGTAAAGCAACAAGCCCTTATGGCCGTTTGCTTTGCTGTCTCTATGATGAAGGTGTCTTTTACCAATAAAGCAAGAAAAAATTCCCTGAATATGGTACCATAGTAGAGACAAGTGATGGCCCTGCAACAGTAGCAGCCGTTGATATATTTACAGATCCCATTAAGGTGCGGTTAAAAGACCAGTTGACCTTAGTCACTTATGCTTTAGAGGAGGTTAAAGTAGGTGAATAAAAAAGAATTATTCGATGCTTTTGATGGATTTTCCCAAAATTTAATGGTTACTTTAGCTGAAATTGAAGCCATGAAAAAACAAGTCCAATCACTAGTAGAAGAAAACACGATTCTTCGCCTAGAAAATACAAAACTACGGGAACGTTTGAGTCACCTAGAACATGAAACGGTAGCTAAAAATCCTTCCAAACAAAGGAAGGATCACTTAGAGGGAATTTATGATGAAGGGTTTCATATCTGCAATTTTTTCTATGGACAACGTCGTGAAAATGATGAAGAATGTATGTTTTGCAGAGAATTATTAGATAGAAAGTAAGGGCATGCAGGTTCAAAAAAGTTTTAAAGACAAAAAAACAAGCGGAACCTTGTATTTGGTTCCAACCCCAATTGGCAATCTGCAGGACATGACCTTTAGAGCAGTGGCAACGTTAAAAGAGGTTGATTTTATTTGTGCAGAAGACACAAGAAACACAGGTCTTTTGCTAAAACACTTTGATATTGCTACCAAGCAAATCAGCTTTCATGAGCACAACGCCTATGAGAAGATTCCTGATTTAATTGATTTATTAATATCAGGACGGTCACTAGCTCAGGTGTCTGATGCAGGAATGCCATCGATTTCTGATCCTGGGCATGATTTGGTCAAGGCTGCTATTGATAGTGATATCGCAGTCGTTGCTTTACCAGGTGCCTCAGCAGGGATTACAGCTTTGATTGCTAGTGGACTGGCTCCTCAACCCCATGTTTTTTATGGGTTTTTACCCAGAAAAGCAGGGCAACAAAAGGCTTTCTTTGAGGACAAACACCATTACCCAGAGACACAAATGTTTTATGAATCACCCTATCGCATCAAAGATACCCTGACCAATATGTTGGCTTGTTATGGTGATCGTCAAGTGGTGCTTGTCAGAGAATTAACCAAGCTTTTTGAGGAGTACCAACGGGGGTCGATTTCAGAAATCTTGTCCTACCTTGAGGAAACACCCCTCAAAGGGGAGTGTCTGCTGATTGTGGCTGGAGCCCAAGCAGACAGTGAGGCTGAGCTGACAGCTGATGTTGACTTAGTGTCTCTAGTGCAAAAAGAAATTCAAGCAGGAGCCAAGCCAAATCAGGCTATTAAAACAATTGCTAAAGCTTACCAGGTAAATCGCCAAGAGCTTTACCAACAATTTCATGACTTATAAGTCATCGTAGATTAGGAGAAAAACAAATGACAGAAGATCAAGCAACTATCCTTATTTTAGGAGTATACGGAATCATATTGGCTGTATTCTTATTATCAGCTTTATTATGCCTTATCGCTAACTGGCGACTCTTTAAAAGAGCAGGTTACAAAGGATGGTATAGTCTCATTCCTTTCTATGCAGGTTTTGTCAAACACAAAATCACTTTTGGAGAAGATAATAAATGGTTTTACTTTATTGGTTGGGTCATTGCTATTTATTATTACTATGTGCACTTTTGCTATGTCCGTGCTTTTGGTGGATCAAAGGGTCTAGCAGTATTTGGCTTGTTTTTCCCAGGCATTGCTTCTTTGATAGTGGCTTTTGGAAAAACTTATACCACACAAGAATGCCACCCTGTGCCACATCTTTTAAACTAAGAGAAAAAAGACCATCAATTGGATTTATTGATGGTCTTTTAGGTGTTTAAATGATTTTAGTCCCGTGAACAATGGCCGTTCCAGTGAGTTGACTCAAGCTTTGGCAATTCTCAGCAGTGATGCCTCCCCCAATCATGATTTCAATGCGTTTATTGGCATAGGTCACAAGACTTTTAAGCTGTTCCACATTGTCTGTAATAGGAGTAGCTTCAGGTGAGCCATGAGTTAGCACACGCACAAAGCCATAATCAATCAGTTGGTCAAGCGCTTGGTGCTGGTGATCAGTCGGAATCCGGTCAAAAGCCATGTGGAAAACCAGTGGCAAGCCTTGTGTAGCAGGCAGTAATTGCTCGATAGCGTCGGTATCCAGTTGATTTTCTGTGGTCAGCAAGCCTAAGACTAGCGCATCTGAGCCAGCTTCAACAGCTTTTAAGATATCTTCTTCCATAGCTTTTAGTTCGAGGTCGTTATAGACAAAATCGCCACCGCGAGGTCGAATCATGGTCGCTACGCTAATCTTTTTATCGTGTAAGAGCTGACAGGCTTCTTTGATGACGCCATAAGATGGCGTGGTCCCTCCGACAGCTAGGTTATCACAGAGTTCCACACGACTGATTTGACCAGCATCAAGGGTTGGCAGTAGTGTGAGGTTCTCAGCACAAAATTCTTTAATCATTTTTAGATCTCCTTTATCAGTAATATTATAGCACGAATGAAGCTAGTCATCAGGAAACATTTTTGTCAAATCATGGACATTATGCTATACTCACTAGTATTAAAAGTAGGCCAAAACAGCAGCAAATACTTTGAAAAAAGATTGCTATGTTCTACGGCAATATCAGTCTTTACCAACGAACTCTCAAGAAGAAAAGAAAGACAAAGCTTAGCATTTTAAAAAAGCCCCCTTTTTTTTGTGAAATGATGACCAAAAACAGGCGCCTCACGCCTAAAACAGTTACACTAAAGGAGAACAAATGATTACGATTTACCAATACCCAAAATGTAGCACCTGCCAAAGAGCCATGGCTGAATTAAAGCAACTGGTTAGTGACTTTGAAGCCATTGACATCAAAGCTAATCCACCCAAAGCTCAGGACCTCAAACATTGGATGGAAACATCTGGTTATACCATCAAAAATTTCTTTAATACCAGTGGTAACAGCTACCGCGAATTGGGACTTAAAGATAAAATAGACCAGCTTAGCCTTGATAAAGCTGCTGAACTTTTAGCCACAGATGGTATGTTGATTAAACGGCCTATTCTGATTAAGGACGGTAACGTCTTACAAGTTGGCTATCGCAAGCCATATCAAGAGTTGGATTTAGGATAATGCGACAAAGTCTCAAAAAAGGACAAGGCAACATTATAACGCCTTGTCCTTTTTTGGGATCTGTTTTTAGAAATTAGAGATCAATATCTAGTAAAATTGGCGTATGGTCTTGGCGTTCCCCAGAAGAAATCATTTCAGAACGCTTAACCTTATCCACAAGTCGGTTTGAAGCTAGCCAATAGTCAATTCTCCAACCGGTATTATTGATTTTGCTGGTTTTGCTACGTTGTGCCCACCAGGTATAAACATGAGGAATATCGCCGTGCACGTGACGAAAAGTATCTGTAAAGCCTCTTGCTAATAGGTTAGTAAAGCCTTGACGTTCTTCGTCGGTAAAACCAGGAGAACGTCGATTGCTGTTTGGATTTGCCAAATCAATCTCTTTATGGGCAACGTTGTAATCTCCCGTAGCCAAAACAGGCTTTTGAGCATCCAGTTCAGTCAAATAATCAGCGTATTTGTGGTCCCAAATTTGACGGTCATCTAAACGTCTAAGGCCATCACCAGCATTAGGCGTGTAAACCTGTGTGACGAAAAAGTCTTCAAATTCTAGGGTAATGATACGGCCCTCAGCATCCATTGTTGTTGGGGCACCAATTTCTGGAAAAGTAATGACAGGGTTTAACGTGTTTTTGTACAGGAACATGGTGCCAGCATAGCCTTTCCTAGCAGGCTCAACTGAAGAACGCCACACATGCAAATAGTTTGGAAAGTAACTAAGTAGGGTCTCGATATGTTTTTTGGTAGGCCCCTTAGCAGATAATTTAGTTTCTTGGATGGCAATAATATCCGCATCTTGAGCGACTAAAGTGTCTAAAACAGCGCGTGATAAAAGCGCACGAGGGGACTCTCCTGTGAGAGCAGCATTTAAGGAATCAATGTTCCATGAAATCAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP028841|336789:342823|341995_342823_-|QAB34005.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTGESPRALLSRAVLDTLVAQDADIIAIQETKLSAKGPTKKHIETLLSYFPNYLHVWRSSVEPARKGYAGTMFLYKNTLNPVITFPEIGAPTTMDAEGRIITLEFEDFFVTQVYTPNAGDGLRRLDDRQIWDHKYADYLTELDAQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPNSNRRSPGFTDEERQGFTNLLARGFTDTFRHVHGDIPHVYTWWAQRSKTSKINNTGWRIDYWLASNRLVDKVKRSEMISSGERQDHTPILLDIDL >CP028841|336789:342823|338980_339304_+|QAB34000.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSHLEHETVAKNPSKQRKDHLEGIYDEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK >CP028841|336789:342823|339308_340172_+|QAB34001.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKHFDIATKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLISGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDSDIAVVALPGASAGITALIASGLAPQPHVFYGFLPRKAGQQKAFFEDKHHYPETQMFYESPYRIKDTLTNMLACYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGSISEILSYLEETPLKGECLLIVAGAQADSEAELTADVDLVSLVQKEIQAGAKPNQAIKTIAKAYQVNRQELYQQFHDL >CP028841|336789:342823|336789_337425_+|QAB33997.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQLIPLLKQKVAQDILTTREPGGVAISEHIRELILDINHTAMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGQLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLIKADIQWLNEFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARINANQQREVNRLDLETIEIHQRVRKGYLALAKEHPKRIVTIDATKPLKEVVSVALEHVLALLLA >CP028841|336789:342823|337442_338318_+|QAB33998.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPNVYQAFQTILKKDRLNHAYLFSGDFANEEMALFLAKVIFCEQKKDQTPCGHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYENKRQVFIIKDCDKMHINAANSLLKYIEEPQGEAYIFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLYQLAQEKGLLNHQAKLVAKLATNTSHLERLLQTSKLLELITQAERFVSIWLKDQLQAYLALNRLVQLATEKEEQDLVLTLLTLLLARERAQTPLTQLEAVYQARLMWQSNVNFQNTLEYMVMSE >CP028841|336789:342823|340198_340591_+|QAB34002.1|DBSCAN-SWA MTEDQATILILGVYGIILAVFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWYSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIASLIVAFGKTYTTQECHPVPHLLN >CP028841|336789:342823|341565_341922_+|QAB34004.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMAELKQLVSDFEAIDIKANPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRELGLKDKIDQLSLDKAAELLATDGMLIKRPILIKDGNVLQVGYRKPYQELDLG >CP028841|336789:342823|338336_338576_+|QAB33999.1|DBSCAN-SWA MGKRSLSKDLPVATKVAAHKGKKAFEENTAFATDLMKEVSRLITQNQLEMTFVNSVFLLDQHVVLIPFSAEEHMDFYNC >CP028841|336789:342823|340637_341267_-|QAB34003.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQISRVELCDNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKKISVATMIRPRGGDFVYNDLELKAMEEDILKAVEAGSDALVLGLLTTENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDRIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKSLVTYANKRIEIMIGGGITAENCQSLSQLTGTAIVHGTKII |
9 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
514861 : 569981
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP028841|514861:569981|DBSCAN-SWA TATGACTATTAAGGCAGAAATTAAGGCGCTCGCCAAAGAAATTGGTATCTCTAAAATTGGTTTTACGACGGCAGATAACTTTGATTATTTGGAAAAGTCATTGCGTGCTTCTGTGGAAGAGGGGCGCAATTCAGGATTTGAACATAAAGTCATAGAGGATCGTATCTACACTGAAAGGCTTTTAGAATCGGCTAAAACGATTATTTCAATTGGCGTTGCTTATCCTCACAAACTTCCTCAGCAACCTCAAAAAACACCTTATAAACGTGGAAAAATTACACCTAGTTCGTGGGGGCTTGATTATCATTATGTGGTCGGCGAAAAGTTAGACAGACTATCAAAAGGCATTGAAGAGCTGTGTCGAGATTTTCCTTTGCAACAAAAAGCAATGGTCGATACTGGAGCTTTAGTTGATACTGCAGTTGCCCAAAGAGCGGGTATTGGTTTTATAGGAAAAAATGGTCTAGTTATTTCTAAAGAATATGGCTCTTATATGTTTTTGGGAGAATTAATTACCAATTTAGAGATCGAGCCAGACAAGCCTGTCGATTATGATTGTGGTGACTGTCGTCGTTGTCTAGATGCCTGTCCAACTTCTTGTTTAATTGGTGATGGCTCAATGAATGCCAAGCGTTGTCTATCATTTCAAACCCAAGATAAGGGAATGATGGACATAGAGTTTCGAAAAAAGATTAAAACAGTTATCTATGGTTGTGATATTTGCCAAATTTGCTGTCCTTATAACAAGGGTATAAACAATTCACCAGCTACAGAGATTGATCCTGAGTTGGCTCAACCAGAATTAATACCATTTTTGAGTTTATCAAATGGAAAATTTAAAGAAAAATTTGGTATGATTGCTGGAAGTTGGCGAGGTAAAAATATTTTACAGCGTAATGCCATTATTGCGCTAGCAAATGCTCATGATAAAACTGCAGTGGTCAAATTAATAGAGATTATTGATAAAAATAATAACCCTATTCATACTGCAACAGCTATATGGGCATTGGGAGAAATTGTCAAAAAACCAAACGATGAGATACTGGCGTTTATGAGTCATTTAACCTTAAAAGATGAAGATAGCCGAAAAGAGTTGGAATTAATCCGTCATAAATGGCAATTTTAAGCCTTTTATGGTATTTTTAAGAACCTTATGATAAAATAAAACAGATTAACAAAGATTGGAGAAATCTCATGGAAGTGGCTGAAATTCGCCAAAAAATAGTAGAAAATAAAGAGAAGTTGACTAGCTTCAGGAGGTCTCTTTGACTTAGATCGTTTGGAAGAGGAGATTGCTCTTCTTGAAAATCACATGACTGAGCCAGACTTTTGGAATGACAATATTGCAGCGCAAAAGACATCTCAAGAACTAAATGAGTTAAAAGGTAAGTATGATACTTTCCATAATATGCAAGAATTATCTGACGAAACAGAACTCTTACTTGAGATGCTTGACGAAGATGATTCTTTGAAAGAAGAATTAGAAGAAAATCTAATGCAGCTAGATAAGATAATGGGTGCTTATGAAATGACGCTTCTCTTATCTGAACCCTATGACCACAATAATGCTATCTTAGAAATCCATCCTGGTTCAGGAGGAACTGAAGCGCAAGATTGGGGAGATTTACTCTTACGAATGTATACCCGTTTTGGCAATGCTAATGGTTTCAAAATAGAAGTATTGGATTATCAAGCAGGAGATGAAGCTGGTATTAAATCGGTTACCCTCTCTTTTGAAGGCCCCAATGCTTATGGTTTGTTGAAATCAGAAATGGGAGTTCATCGCCTCGTTCGTATATCACCTTTTGATTCGGCTAAACGTCGTCATACCTCATTTGCTTCAGTTGAAGTGATGCCAGAGTTAGATGATACGATTGAAGTAGAAGTACGTGATGATGACATTAAAATGGATACTTTCCGTTCCGGAGGAGCTGGTGGTCAGAATGTCAATAAAGTATCAACAGGTGTTCGTTTGACGCATATTCCAACTGGAATTGTGGTATCGTCTACCGTTGACCGTACTCAATATGGAAACCGCGATCGCGCTATGAAGATGTTGCAGGCTAAGCTATATCAGTTAGAACAAGAAAAGAAAGCACAAGAAGTAGATGCTCTCAAGGGTGATAAAAAAGAAATCACTTGGGGAAGTCAGATTCGTTCTTATGTTTTCACCCCTTATACGATGGTGAAGGATCATCGTACTAACTTTGAGCTTGCTCAGGTAGATAAGGTTATGGATGGAGAGATCAATGGCTTTATTGATGCCTACCTTAAGTGGCGCATTGAAGACTAAAAATAATAAAGGAGAAACATGGCACTAATAGAAATGTCTGGTGTTACTAAAAAATACCGCCGCTCAACGACCGCCCTCAGAGACGTCAATGTTTCTGTTAACCAAGGTGAGTTTGTTTATCTCGTAGGCCCATCAGGTGCTGGTAAATCAACTTTTATCAAACTCCTTTACCGTGAAGAACAACTGACAACTGGTAAGCTATATGTGGGTGAATTCAATTTAACTAAGCTAAAAGCACGTGATGTTCCGATTCTTCGTCGTCACATCGGAGTAGTTTTTCAAGATTACAAACTGCTACCAAGAAAAACAGTCTTTGAAAATGTAGCTTACGCCATGGAAGTTATTGGTGAAAAGCGCCGCCACATTAAAAAACGCGTGCCAGAGGTACTCGATTTAGTTGGCTTGAAACATAAGATGCGTTCTTTTCCAAGTCAGCTATCAGGAGGGGAGCAGCAACGTGTGGCCATTGCGCGTGCGATTGTTAACAACCCTAAATTATTGATTGCAGATGAACCGACAGGGAATTTAGATCCTGAGATTTCATGGGAAATTATGCAGTTACTTGAACGTATTAATGTTCAGGGAACAACTATCTTAATGGCGACACACAACAGTCATATTGTGAATACATTCCGTCATCGTGTTGTTGCTATTGAAGATGGTCGCATAGTACGTGATGAAGAAAAAGGAGATTATGGTTACGATGATTAGATACTTTTTCCGTCATATTTGGGAATCCATTAAAAATCTTAAACGCAACTTTTGGATGACATTTGCTTCAGTTAGTATGGTGGCTGTTACATTGACTTTAGTTGGTGTTTTTGCGGCGACATTGTTGAATATACAGCGTGTTGCTTCGGGTGTTGAAAATAATGTCCATATCAATACCTACTTACAAGTTGATTCAACTGATGCTGCAAAAGTTATTCAAAATACTGCCGGTGAACCTGTTAATAACGATAACTACCACAGTGTTTACGACAAAATTGCTCAGATAAAAGGTGTCAAAAAGATTACATTTTCTAGCAAGGATGAACAATTGAAAAAATTGCAAGAAACCTTAGGTGATGTTTGGAATATGTATGACCAAGACACTAATCCGCTCCAAGATATCTATCTTATTGAGACCCAGACGCCTAAACAAGTTAAGGCGATCACTAAAAAGATCAGAACGATTGAAGGCGTAGAAGCCGCAGATTATGGAGGGATTAACTCCGATAAACTATTTAAGTTTTCAACATTAATTCAAACTTGGGGGCTGATCGGAACAGCAATGCTATTATTTGTAGCTGTCTTTCTCATTTCAAACACTATTCGTATGACTATTATGTCTCGTAAACGTGACATTGAAATTATGCGGTTAGTTGGTGCTAAAAATTCTTATATTCGAGGGCCTTTCTTTTTTGAAGGGGCTTGGGTTGGCTTGTTAGGAGCTGTTTTACCATCTCTTCTGATTTATTATGGATATGATCTTGTTTATAAGCATTTTGCACAAGAATTACAACGTAATAATCTCTCGATGTATCCGCTTGATCCTTATGTATATTACCTGATTGGTGCTTTGTTTGTCATAGGTATTATGATTGGTTCGCTTGGTTCAGTGCTTTCTATGAGACGTTATTTAAAATTCTAAAAAAAGCGCTGCTGACGAAACGTAGCGACCCTCAAAAGTTGGACCTCTTATGTTATTCCAAGGACCTCGTTTTGTATTGCACAGGACTGGTCCTTTTCATTTTGTTTTGATTCATTTGTTTATTTGTAATAGGCAATACAGTTTAAAATAGCAGTTTCTAAGGTTTCAAGAGAAGAAAAGCACCCCAAAAGTTAGATGTTTGATGTATCTAACTTTTGGGGTGTCATTCAAAATTTAGTGGCTCTTTTTTAGTAAAATACTATGATTTCAGTTTTAGGATAACCTCAAACAGTATCTAAAATAGCTATGTCAATGAAAAAAGGGGTTAGCATTTTTTTCGTGACAAATGGTAGTAGAAGGACCATGCCCAGGATAAACTCGGTAATGATTAGGTAAGGTGAATAGTTCTTGGCGAATACCAGTAATGAGGTCCTCAAAGTTACTGGTAGGTAAGTCAGTACGACCGATAGTTTCACGAAATAGAGCATCGCCAGTAACGACTAATTCATCTGAGTGGAAAACAAATGAGACTCCTCCCCAAGAATGACCAGATGTTGGTAAAACTGTGAATTCAAAACCATTTAGTTGATAGGGTTGCTTTAATTTAAAAAAGTTCTCTGCCGGTCTTGCTATAACAGTAATGATATCATCATGACGGCCTAAGCCAGATAAATTATCATCTGGGGAAGATAGCCAAGCGGCTTCTTTTTCTGAAACATAAACAGGTGGATGATCAAAAGCATCTCTGACCAAATCTAAACTAAAAATATGATCATAGTGAGTATGCGTTAAGAGGATAGCCACTAAAGGTTTTTCAAAGGATTTAATTTTAGCAATGATTTCTTGGCCGTTACTTCCTGGATCAATGAGGATAACAGCTTGATCATTAACGAGGTAATAAGTATTTTCACCAGCAATGTGGTTTATTGTTTTATAGATTTTCATAAGGATAGTGTACCAAAAAATCAAGACTTTGTTAAAAAAAGAGTAGCGGAAAATAAATGGCAATTAGTTTCAGAAAATATGAGATCTCACAGCAATTTCTTGACACCGTTTTCATAAAGGTGTATCATA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>CP028841|514861:569981|569149_569506_-|QAB34236.1|DBSCAN-SWA MTKTTAQRKKSIYINGALEKVYDECCNGMRNRTFSGRVMDIAERYDVLMGLTEIPELTPQQQMILGEAVLGAFMDRNKIRYLHDAIADTEIDGCLDLAKIVRDLDYTQRLKLIESINI >CP028841|514861:569981|540666_540951_+|QAB34204.1|DBSCAN-SWA MTTDELLQNLRDDLNKIINVLKNDWKALLFLAIAIFGMMVTVSYFSYRDARQYYESQITGLRTQLSRTQKQLKRASEQNQRQTKRIADLTNNGG >CP028841|514861:569981|540065_540260_+|QAB34202.1|DBSCAN-SWA MTTTKKHVVRVYNKGITATYAIYDKKLFKEHEFATKNEAMRFIRQLELANDKRATEYYLREVEK >CP028841|514861:569981|564707_565136_+|QAB34229.1|DBSCAN-SWA MDLTLKNKDLNTFYSVLDKIKITNMRANRGRAKLLAKVVDKINEYAKDEADIIDLYALKNKDGKFVIDEHKNIKIEDPKKIDELNDLLTELGNEDITIKGHEYSKRFIDFLEYLAESEDEFTSEEIVLIDNILEQFEESKGE |
72 | Streptococcus_phage(56.9%) | tail,terminase,capsid,head,protease,portal,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
663085 : 673688
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP028841|663085:673688|DBSCAN-SWA ATTATTCTTTATTTTTGGGGTTATCCTCTTTTAGTTCAGAAGTTGCCGCGTCAGCTTCTACGGGATTTAGTTCTAAGTAAGATGGTGCTTTAAAAAGTTTCTGAGTTGATTTATGACCATTTTTACTGTATAAACTTGTTGACTCTGATCCGAGTTTTGCTGAAATATCTTTCAGTTGTTTTAACTGCTTAGTGTAGATAAACTGGTTAGGATCAATAGCTTTTAGACCATTTTGAGTATCAAAGCGCAGGAGATCACCCGTTTGAATAGCGTCGCTAGCTGCTAGTTGTTGAGCAACAGCAGAGCGAATTTCCTTAGTTTTGGCTATAGTCATTTCATCGGGATTAGTGATTTCTAAACCTGTTTGCGTGTTGTACAGACGTCCACTATAGTTAGTGTATTCAGGAGTCATATAAGTCCCAGATGTTCGTTGTGCCACAATCTGGCTATTTTGAGGTGATAATAAATCTTGTCCTAATTGAACAAACTGACTAGTGTCAATACCAAGTATGTGGAGTAAAGTAGGAAGAGCATCGATTTCACCGCCAAAGGTTTCTTTGATACTACCATTCGTATAACCTGGAATATGGATCATATACGGGACTCGTTGTAGCATAGCATTATCATATTCAGACCAAGTTTCAGAATCTTTACCAAGAAGTGGAGCAAGACTAGAATTACGAGAATTTGAAATACCATAATGATCACCATATAAAACAAAAATAGAATTGTCGTACAAACCAGTGGCTTTCAAGTAATCAAAAAAAGATTTAAGGGCAGCGTCTAAATAATTGGCAGTAGCAAAGTAACCATTGATCGTTTCATCGTCTGTTTTGGCTAAAGGAAAACCTTCTTCACTACTTTCGCCTTTTAGACTAGTATAAGGATAGTGATTACTCACAGTGATAAACTTGGTATAAAAAGGTTGTTGCATCTGTTCAAGATATTTTATGGAATCCTTAAACATGTACTTATCATTTAACCCATATTGAAAAGAGTTCTTACTATTTTGTTTAGAGAAGTAGCTAGAATCAAAAAAATAATTATAGCCCCATTGTTTATAAGCATTATTGCGATTCCAGAAAGTTCCAACGTTACCATGAAAGACAGCGCTGGTATAGCCACCTTTTTGGGCTAAAATACTTGGAGTAGCAAATTGTGTATTTTCACCACCGTAGTTCACCATAAAAGAACCACTATTTAAACCAAATAAGGAATTCTCCATCATGGTTTCAGCATCAGAAGTTTTACCTGCTTTAACCTGATGAAAAAAGTTAGGGAATGCTAAGGTAGCATTTGAGTGATAAAGTGAGTTGATAAAAGGCGTTACCTCATATTCTTTATCTCCTTCTTTTAGTTTATAATCTATTAAGAATTGTTGAAAGCTTTCTAAATGAAGAACAATAATATTTTTGCCTTTTCCAATTCCAAAATACTGAGGATCAGGTGCTGCATAATGTCCTTTGACATAAGTTTTAACATCAATTAATTCTTCTGCAGTAGCTCCATTTCGTTCTTTTTGAGCTTGATAGGTTTGATTGCCGCTATAGAGGGTAAACGCTGGTAGTCCTAAAGCTCTCACAATATAAGTATTTGAAAAGCCACGTGTTAATAGTTCCGGACGATCAATTTCTGCTAAAAAAAGATTAATAGAAAGCAATAGACTAGATAAAGCGGTGATGGCAAATGCTGCGCGCTTGTTAAAAGGACGTTGATCATTTTTGATTTTTTTAGCGATAGATAAACTAATTAGAATAATAAAATCAAGAATATAGATAATATCCCAGATGCGTAAAAGGTTTAAAGCAGAGTCCCCTAATCCAGCGGAGACTTTACTACTAGCTAGCATGGCACTCACTGTAATAAAGTCTGAAAATTCTCGGTAATATATAGAATTTGATATCAAGAGAATGTTAAGGATAATATAAACCACCCAAGAACAGATATAAAAGGCTCGGGTATTCCTAACGTAAAGAGCAACCCCCAAAAGTAAAAAAGCTAGTGGGATTGGATTGATAATAGTTAGAAAGACTTGGTATATATTTCCCAAATCTAGTGAAAAGTCTGTATGATATGCCCACAGGGTCTTTATCCAGTAACAAAAGAGTAGAGTAATTATAAAACCCAATCTTGTGTTGATAAAACCTGTGATAAGTGTTTTAAATTTCTTCACAGTAGCAACTTCCTTATCGTTTTTTCCTAAAGATGTCATCTCCAAATAAAATCTCAGATTAAATTATACCAAAAATGTGAAGCTAATGCTTGTTGTAAGTTCAAATTTAGTAGGATTTTTTATCAGATTTTGTTATAATAAAAACTATGAATAAACTCTATATTGATTCTTTTGTCGAAAAGAAGCTGACAGCAGGGGTACAATTATTAGATGAAAAAGATTTTTCTAATATAAAGGAAAAAAATCAGTTGGTTCAACTGGTGACCAAGTCCAATCGTCCCATTGGAACAGCATATATCTCTAAGCAAAATAAAGGAATTGGTTGGTATCTAGGACCAGAAAAAATCGACTTGTCTATCTCTTATTTTGTTAGTCTATTTTCAGTTGCTAAGGCCAAAAGACAAGATTTTGCTCAATCGGACGAGACCAATGCTTATCGCCTTTTTAATCAAGAAGGAGACGGTTTTGGTGGAGTAACAATTGATCTTTATAAAGATTTTGCAGTCTTTTCATGGTACAATGCCTTTGTCTATGACAAAAAAGAAATGATTATGGAGGCTTTTCAACAGGTTTTTCCTGAAGTCAAAGGAGCTTATGAAAAGTGTCGCTTTAAAGGTCCAGATACTGAAACTGCTCATCTGTATGGTGAGCTGGCACAAGAAACCTTTTCGATTTTAGAAAATGGCATAGCCTATCAAGTCTTCTTGAATGAGGGCTTAATGACAGGTATTTTTCTAGACCAGCATGATGTTAGAAGAGCACTAGTAGATGGTTTAGCTATGGGCAAGTCCCTTCTTAACCTATTTTCCTATACAGCTGCCTTTTCTGTAGCAGCTGCTATGGGTGGTGCTATCGAGACCACTTCTGTGGACTTGGCTAAACGATCGAGAGAATTATCACTAGCTCATTTTGAGCATAACCAGTTAAACTTAGCCTCACATCATTTTGTGGTGATGGATGTTTTTGAATACTTCAAATATGCCAAACGGAAAAAATTAATCTTTGATGTGATTGTGATTGACCCACCAAGCTTTGCTAGAAATAAAAAACAAACTTTCTCTGTGAGCAGGGACTACCACAAATTAATCACAGAGGCCTTGGACATATTGAGTCCTAAGGGAACTATTATAGCTTCAACAAATGCTGCTAATATGACTGTTAGCCAGTTCAAAAAGCAAATTATCAAAGGATTTGGAAGTCGTCGTCCTGAGTCTATGACTCTCCAGCAGCTTCCGAGTGACTTTACTATCAATAAAGCAGATGAAAGAAGTAACTATTTAAAGGTATTTACTATAAAGGTACGAGAATGAGAATTGTAGCACCAGTCATGCCAAGACATTTTGACGAGGCTCAAGCCATTGATATTTCTAAATATGAAGATGTTAATTTAATTGAATGGCGAGCAGACTTTCTTCCCAAGGATGAGATTGTCGCAGTAGCACCAGCTATTTTTGAAAAATTTGCCGGAAAAGAAATTATCTTTACCCTTCGGACCGTTCAAGAAGGGGGGAATATTACCCTTTCAAGTCAGGAGTATGTTGATATTATCAAAGAAATCAATGCTATTTATAATCCAGACTATATTGACTTTGAGTATTTTACGCACAAGTCAGTATTTCAAGAAATGCTTGATTTTCCAAATCTTATTTTGTCTTATCACAACTTTGAAGAGACTCCTGAAAATTTAATGGAAGCTTTTTCAGAAATGACCAAGTTGGCACCGCGTGTGGTTAAAATTGCTGTGATGCCCCAGAGTGAACAAGATGTTCTAGATTTGATGAACTATACCAGAGGCTTTAAGACGCTCAATCCTGAGCAAGAATTTGCAACTATATCTATGGGGAAATTAGGAAGATTGTCTCGTTTTGCGGGAGATGTCATTGGCTCTTCCTGGACATACGTTTCATTAGATCATGTTAGCGGTCCAGGTCAAGTGACTCTCAATGATATGAAACGTATTATTGAGGTCTTAGAAATGGATATCTCTAACTAGTGAATGGTCTAAAAATATTATTTCTACAATAGTTAAGAAATGATGTTTTTAGATTAATGTTTTTAAAATAAGTGGAACCAAAAAGGAGAAAAATTGCGTTATTTAACAGCAGGAGAATCTCATGGGCCATCCTTAACAGCTATTATTGAAGGTATACCAGCAGGATTAACTCTTCATCCAGCGGATATTGATCACGAATTACAGCGACGTCAAGGAGGTTATGGCCGTGGTGCCAGAATGTCTATTGAGACTGATCGGGTTCAAATATCCTCAGGAGTTCGTCATGGTAAAACAACAGGGGCCCCCATTACCTTAACGGTAATTAATAAGGACCACCAAAAATGGCTAGATGTCATGGCTGTAGGAGACATTGAAGAGACTCTCAAGTTAAAGCGTCGTGTTAAGCATCCTAGACCAGGACATGCGGATTTGGTAGGAGGTATTAAATATCATTTTAACGATTTAAGAGATGCTTTAGAGCGTTCCTCGGCTAGAGAAACAACGATGAGAGTGGCTGTAGGCGCTGTTGCTAAACGTATCTTAGCTGAACTTGGAATTGATATGTTACATCATATCTTAATATTTGGTGGTATAACGATCACAATACCTTCTAAGCTCTCTTTTAGAGAGCTGCAAGAAAGGGCTCTCCATTCAGAATTATCTATTGTTAATCCAAAGCAAGAAGAAGAAATTAAAACGTATATTGATAAGATAAAAAAAGAAGGGGATACCATTGGTGGTATTATCGAAACGATAGTTCAAGGGGTGCCAGCAGGTCTTGGATCTTATGTCCAATGGGATAAAAAATTAGATGCCAAGCTGGCTCAAGCAGTTCTTTCCATTAATGCTTTTAAAGGGGTGGAATTTGGAGCTGGGTTTGATATGGGATTCCAAAAGGGCTCTCAGGTAATGGATGAAATCACCTGGACACCTACCCAGGGCTATGGTCGTCAAACAAACCACTTAGGTGGCTTTGAAGGTGGCATGACCACAGGACAACCTCTTGTTGTTAAAGGGGTTATGAAGCCCATTCCTACTTTGTATAAACCACTCATGTCGGTAGATATTGATAGTCATGAACCTTATAAAGCAACGGTGGAACGCTCTGATCCGACGGCCTTACCAGCTGCAGGGGTTATCATGGAAAATGTGGTGGCGACGGTGCTTGCCAAAGAGATTTTAGAGACTTTTTCTTCTACTACCATGTCTGAATTGCAAAAAGCTTTTTCGGACTATCGTGCCTACGTCAAGCAATTTTAGATAGCGAGATACTGGCTTTTATGGTATCATACAGGTATTAATGAACAAAAGGAGACTGTCATGTCACAAGAAATTTATGACTATGCTAATCAACTTGAAAGAGCAGTTCGTGCTCTGCCAGAATACCAAAAAGTGTTAGAAGTAAAAGAGGCCATTCAAGCAGACGTTAGTGCTAGCGAACTGTTTGATGAGTTTGTCGCTATGCAAGAAAAAATCCAAGGGATGATGCAATCAGGCCAAATGCCAACGGCTGAAGAACAAACAAGCATTCAAGAACTTAGCCAAAAGATTGAAGCTAATGACCAGCTAAAAGCTTATTTTGAAGCGCAGCAGGCCTTATCTGTTTACATGAGTGATATTGAGCGTATTGTATTTGCTCCGTTGAAAGATTTAGTCAAGTAAGCCAATTAAGATAGGAAAAAAACAGATTGCTGGCAGCTCGTCAGGATCTGTTTTTTAGTGTTTATTTTCTTTGTATCAGAAAGTTGAGCCTCTTTCTTATTTGTGATATAGTCAAATAAAGTGACCAAAATAGCAGGCCAGTAGTGGCTTTAATGAAGGCAAGTTGTCTGCTAACTGGCTGTGCTAAAACATCAGTATTAGAAAGTAAAAGGTGATAAAAATGGTTATTCCTTATGATTATATTGTTATTGGTGGAGGGAGTGCAGGTATTGCTTCTGCGAACAGGGCAGCCATGCATGGGGCCAAAGTATTGTTAGCTGAAGGTAAAGAGATTGGGGGAACCTGTGTTAACCTAGGCTGCGTTCCTAAAAAAGTCATGTGGTATGGCGCTCAAGTAGCAGATATTTTAGGGACTTACGCTAAGGATTATGGATTTGACTTTAAAGAGAAAGCATTTGATTTTAAACAATTGAAAGCAAATCGTCAAGCTTATATTGATCGGATTCATGCTTCTTATGAGCGAGGCTTTGAGCAGAATGGTGTTGACCGTATTTATGATTATGCTGTTTTCAAAGATGCTCATACGGTAGAAATTGCAGGGCAGCTTTATACCGCACCGCATATTTTGATTGCCACAGGAGGACATCCTGTTTTTCCAGATATTGAGGGGGCACAATACGGTATCAGCTCGGACGGCTTTTTTGCCTTAGATGAGGTACCAAAACGTACGGCTGTGGTTGGGGCAGGCTATATTGCTGTGGAACTTGCTGGTGTTTTGCATGCTTTGGGATCGAAGACGGATTTGTTTATCCGTCACGATCGACCTTTAAGAAGTTTTGACAAAACCATTGTTGATGTCTTAGTTGATGAAATGGCAGTTAATGGGCCGCGTTTACACACTCATGCAGAAGTGGCAAAGGTTGTCAAAAATACTGATGAGTCCTTGACCCTTTACCTCAAAGATGGCCAAGAAGTTGAGGTTGACCAGCTCATTTGGGCTATCGGTCGCAAGCCTAATCTAGAAGGTTTTAGTCTTGACAAAACTGGAGTGACGTTAAATGATAAAGGTTATATTGAGACAGATGCCTATGAAAACACGTCTGTCAAAGGTATTTATGCCGTGGGAGATGTTAATGGGAAACTGGCTTTAACTCCAGTTGCTGTGGCAGCTGGACGTCGCCTATCAGAGCGTCTTTTCAATGGCAAAACAGACGAGAAATTGGACTACCAAAACGTTGCTACTGTGATTTTTAGTCACCCTGTTATTGGCTCTGTTGGCTTGTCAGAAGAAGCAGCAGTCAAACAGTATGGGCAAGAAGCAGTTAAAACATATCAATCACGTTTTACGTCTATGTTTACTGCTATCACTAACCATCGCCAACCTTGTCTGATGAAGTTGGTAACAGTCGGAGATACCGAAAAAATAGTTGGTCTTCACGGAATCGGATACGGGGTTGACGAAATGATTCAGGGCTTTGCAGTAGCCATCAAAATGGGAGCAACCAAGGCGGATTTTGATAACACCGTTGCTATTCACCCAACTGGCTCAGAAGAATTTGTCACCATGCGCTAAAAAATGTAGCCTAAGGCAATAAAAAATGATGTTAACAGTTTTTGAGGAAAGTCTTCTAAACTGCTAGCATCGTTTTTTGTTAGGTGATTAGGGGAATATGTTTTTAAAGATATTTGCGTTGCTCAGACAATATTGCCTTACCTCGGAGATAAAATAAAGTGACCCTGTAACAACAAAGAGTTCATCAGATGTTACGGAACCTTGTAACCAGTCTCTGTAATCTTTTACCTGTGGGTATTTATCAGGATAATCCTCTAAAAGATTTGCTTCAGGGAAATCAAAAGTCGTGACAGATACTTCAAAAGTATCTAGTTGAGCCAGCAAGTCGGCTAAAGGCTTACGTTTGAGACCTGCAAAGAGAATATGAATAGGACGTTTGGGAAATTCTTCTTGCAGTAGAGACTTTAATTTAGCAATGGAATCTGGATTGTGAGCGCCGTCTAATAGAAGATTAGGTTGAATAAATTCGGACCGGCCAGGCCAAGTTGTTGCCTCAATTCCTTTTTGAATCGTTTTTGGAGATATTTTAGGAAAGGATTTTCTAAGTAATTGAGCTGTCATAATGGCTAAACAGGCATTCGCTTTTTGATGTTGACCTAATAGTTTGAGACGGAGTTTGGTTAAATTCAAGTTATCGTGTTGAAAGGAAAACGTCTTTTCTGAAGGATTGAGCAAAAAATCTTTTCCTAATTGATATAAGCGTGAACCGGCTTTTTGGGTAACTTGTTGAAAGACTTGACTAGCCTCCTGCTCAAGTTGACCGATAATAACGGGTTCTTTAGCTTTGATAACTTCTGCTTTTTGGTGAGCAATTTCTGCTAGGCTATAACCTAAACGTTCTTGGTGATCAAAACTAATAGAAGGGCATACGACGGCCAGAGCATGAAAAACATTGGTTGCGTCGGTTTTCCCACCAATCCCTGCCTCAATAATGGCAATATCAACAGGTTTAAGATTGGCAAAGTAGCAAAACATTATGAGCGTCACTAACTCAAACTCGGTAGGTCTATCCCAATTTGTTTCAAGAGACATTTTAGTGAGAATGGGTCTAATCACGCTCACACATTGCGCCAATTCTAGGTCTGAAATGGGCTGGCCATTAAGGCAAATCCGATCGTGAAAAGAGATAATAAAAGGAGATGTAAAGGTTCCGACCTGATAACCAGAAGTTGACAGGATATGCTGTAAGTAGGCTGTCACAGAGCCCTTGCCGTTAGTTCCAACAACGTGAATAGCAGGGAATTTGTCTTGTGGCCGGCCTAGTGCCTCAAGTAACCAAGCCATTCTGGCCAAATCGGTCTTGCGACCATTAGCCTTAAAGGTATGAATCCAGGAAATGCTATCATAGGTAGTCATTACTATTTCTTGTCCTTCTAACAATGCTTTTAAGGGTTCGTAGGAAGACCAGTATTAGCATCTTCAGCTCCAGTTGCATTAGGAATTTGCGTCCCTTCAGTGGCTGATGGTGTCTCAGGAGCTGTAGGAGTTGTCTCGTTGTGAGAAGGTGTGGTAGAAGATGACGGAAGAGTTGTCTTATTATCATCTGTGGTTTCTGAAGTACCTGTATGGTTTTGATTACCCTGAGAAGACTCTTTTTCAATAATCTTGACAATGGTATTACTCGATTCTTTGGGTGTATCATTAGAGGTCTTATCTGGTACAGGCTGCAGTGCTCTTGAAATGGTAATGGTTGCCACGATGATACTCAAAATACTACCAATAAGTGCAATGGATTTTTGGAAAGCTGTAAAACCTGTTTTAATATGCTCGGTAGGGACACCTCCTGATTTACGAGGTTTTTGTTGACGGGAATAACGTGATGACATATTTTTCTCCTTTAAAATCATCGTAATGCCAAGATTAAGGAGGAGGAAACAGAAGTCCTAGCTCCTCTTTAACACTTCATCTATCAGTATAATCTAGAAAAAAAGTGAAGTCAACGGTTTACCTTATGTCTAGGACAAGGAAGTCCTTTGGGCTTATTGTAATACGAATATTCTTGATTTCATTTTAGCTATTTTGTGATAGAATAAAGTATTGAGTAAAAATGAAGGTGACACATGATTTATTTTGATAATGCAGCCACAACCATACCTTATGGAGAGGCTCTTAAAACTTACCAAGAAGTAGCAACAAAAATATATGGCAATCCCTCAAGTCTGCACCAATTAGGGACAAATGCGTCTCGCATTTTAGAAGCTTCCCGTAAACAGATTGCTGGTTTGTTGGGTGTTAAGTCAGAAGAAATCTTTTTTACGTCTGGTGGGACTGAAAGTGCTAATTGGGCTATTAAGGGAATTGCTTTTGAAAAAAACGCTTTTGGCAAACATATTATTATCTCAGCCATTGAACACCCTGCCGTGAGTGAAAGTGTCAAATGGCTTCTCACACAAGGATTCGAAGTTTCTTATGCTCCAGTGACAACACAGGGAGTTGTTGATGTGAATGCTTTAGCTGAGCTGATTAGACCAGACACCATCTTAATCTCGATTATGGCTGTTAATAATGAAATGGGAGCTATCCAACCGATTAGAGCCATTTCAAACCTATTGGCTAACCAACCAACGATCACCTTTCACGTTGATGCTGTTCAAGCCATTGGTAAAATACCACTCTGTGATTATATGACTAATCGTGTGGATTTGGCTTCTTTTTCAGGGCACAAATTTCATAGTGTTCGTGGTGTTGGCTTCCTTTATAAAAAAGCAGGCAAGCGACTCAATCCTCTCTTGTCAGGCGGCGGCCAAGAGCAGGAGTTACGTTCAACCACTGAAAATGTTGCAGGAATTGCTAGCATGGCCAAAGCATTAAGAATAGTCACTGAAAAACAAGTGAGCGTCTTACCTAAACTAACAGCGATGCGAGATGTGATTTACAAATCTTTGTCCGCTTACCCAGATGTGACAGTATTTTCAGCTCAAGAAGGCTTTGCGCCCAATATTTTGACCTTTGGGATTAGAGGGGTTCGAGGAGAAGTTATTGTCCACGCCTTTGAAAAATATGAGATTTATATTTCGACCACAAGTGCATGTTCGTCCAAAGCAGGTAAGCCAGCAGGAAGCCTAGTGGCTATGGGGATTCCTGTAAAAACTGCCCAGACAGCCGTTCGTATTAGTCTAGACGATGACAACGATATGGGACAAGTAGAGCAGTTTTTGACCATATTCAAACAGATTTATGATAAAACACAGAAAGTTAGGTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP028841|663085:673688|670572_671841_-|QAB34316.1|DBSCAN-SWA MTTYDSISWIHTFKANGRKTDLARMAWLLEALGRPQDKFPAIHVVGTNGKGSVTAYLQHILSTSGYQVGTFTSPFIISFHDRICLNGQPISDLELAQCVSVIRPILTKMSLETNWDRPTEFELVTLIMFCYFANLKPVDIAIIEAGIGGKTDATNVFHALAVVCPSISFDHQERLGYSLAEIAHQKAEVIKAKEPVIIGQLEQEASQVFQQVTQKAGSRLYQLGKDFLLNPSEKTFSFQHDNLNLTKLRLKLLGQHQKANACLAIMTAQLLRKSFPKISPKTIQKGIEATTWPGRSEFIQPNLLLDGAHNPDSIAKLKSLLQEEFPKRPIHILFAGLKRKPLADLLAQLDTFEVSVTTFDFPEANLLEDYPDKYPQVKDYRDWLQGSVTSDELFVVTGSLYFISEVRQYCLSNANIFKNIFP >CP028841|663085:673688|667343_668510_+|QAB34313.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGPSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEEEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGAGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >CP028841|663085:673688|666563_667250_+|QAB34312.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >CP028841|663085:673688|672545_673688_+|QAB34318.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTIPYGEALKTYQEVATKIYGNPSSLHQLGTNASRILEASRKQIAGLLGVKSEEIFFTSGGTESANWAIKGIAFEKNAFGKHIIISAIEHPAVSESVKWLLTQGFEVSYAPVTTQGVVDVNALAELIRPDTILISIMAVNNEMGAIQPIRAISNLLANQPTITFHVDAVQAIGKIPLCDYMTNRVDLASFSGHKFHSVRGVGFLYKKAGKRLNPLLSGGGQEQELRSTTENVAGIASMAKALRIVTEKQVSVLPKLTAMRDVIYKSLSAYPDVTVFSAQEGFAPNILTFGIRGVRGEVIVHAFEKYEIYISTTSACSSKAGKPAGSLVAMGIPVKTAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYDKTQKVR >CP028841|663085:673688|671870_672311_-|QAB34317.1|DBSCAN-SWA MSSRYSRQQKPRKSGGVPTEHIKTGFTAFQKSIALIGSILSIIVATITISRALQPVPDKTSNDTPKESSNTIVKIIEKESSQGNQNHTGTSETTDDNKTTLPSSSTTPSHNETTPTAPETPSATEGTQIPNATGAEDANTGLPTNP >CP028841|663085:673688|669132_670485_+|QAB34315.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHASYERGFEQNGVDRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKTIVDVLVDEMAVNGPRLHTHAEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFSLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNGKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >CP028841|663085:673688|663085_665296_-|QAB34310.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVRNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSIAKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYDNSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNPKNKE >CP028841|663085:673688|665403_666567_+|QAB34311.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >CP028841|663085:673688|668570_668912_+|QAB34314.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADVSASELFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK |
9 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
818559 : 877783
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP028841|818559:877783|DBSCAN-SWA 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75 | Streptococcus_phage(89.13%) | integrase,tail,holin,terminase,capsid,head,protease,portal,tRNA | attL 812069:812088|attR 856833:856852 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1027428 : 1103152
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP028841|1027428:1103152|DBSCAN-SWA 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92 | Streptococcus_pyogenes_phage(66.15%) | integrase,tail,holin,terminase,capsid,head,portal,tRNA | attL 1060780:1060839|attR 1099691:1099786 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1221252 : 1259402
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP028841|1221252:1259402|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(71.74%) | integrase,tail,holin,terminase,capsid | attL 1223457:1223476|attR 1256787:1256806 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1326258 : 1402151
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP028841|1326258:1402151|DBSCAN-SWA 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MAKVVVELGGIKRKVSPQALAKGKLIMNNQVMMSMNPYVPYRDGALRGSSRANSVGVTWSGPHARAQFYGGAYNKYKSFKFKKYTTPGTGKRWDKRALANATIVKDWEKSLLRGMGFK >CP028841|1326258:1402151|1350346_1352041_-|QAB34996.1|DBSCAN-SWA MTIYHALKDYQEVMTRGDYLVFDTPLTCRFIGRFFRFENQKALLAELATSKYFQWIEEGQAEVTMKHFFNRQLAKDAFTLKISEDKEIIIESQNLRGFRYAQEALLKVMTFKGDKLYLPIVSVKHSPSFAMRGIIEGFYGTPWTREERLDCLRFIGNKRMNTYMYAPKDDDYQRKLWRDLYPEDWVTYFKELLAVAKEEGLDFWYMISPGLDFDYTKEADYQLLYQKLQQLLALGVCHFGLLLDDIDYQIVDAVERRFKKTAYAQAHLATEVHHFLNQQHAAPELVICPTEYDNHHDSIYLQELSERIPKEVAFFWTGPSTLASQISQADIETMAAVYQRPIIIWDNIPVNDYQKDPERLFLTPFANRSPFLCQPDYQVKGIVSNPMISWELSKLTLTDMSHYLWDANRYQPSHSWLETLTDYTEDTELALALQAFAWHNGNRHLHRDLPFEVEEALLAKDVSTLSAWVAELVERVNTLRKLDKPAFQQAIAPWFERVAKDQDFWQAMLNQEPQLETLYADLQEDKHRIGSDIPSRYYRIYYQQQDKLTANQGQVTQARPEDYA >CP028841|1326258:1402151|1363768_1364293_-|QAB35005.1|DBSCAN-SWA MHALFVANYIIEYSNKKGYKINNLKLQKLLYFVNVRNILENGAPLFEESMEKWKYGPVVPDVYHEYKRFGAFSISTDEMIMEYVEFSVSPFGELSDLEITEYDSQKVENTQLIENTVDALHGFGPFELVDITHDHTPWKKYEDRIMDGVQGIKYTIEEIKDFFGHNPGAKIWVQ >CP028841|1326258:1402151|1396487_1396739_-|QAB35048.1|DBSCAN-SWA MDNILMSLSDWIKEFIEKTVNKLVQMKLDELNAELWTREKVAERLNMSPSTFDKYYRRDKNFPKELPAVRWKKAEIIAWLNNK >CP028841|1326258:1402151|1333534_1333840_-|QAB34983.1|DBSCAN-SWA MIENLSQLVQYHDHQVASRSLSRLLGLSQSIVLYAMAQGESISQETSPRDKVILVLEGQLIFDLEDQKQVLTQESLIAIPAQKVHHLEAKTDCKLLQVLLD >CP028841|1326258:1402151|1334232_1334988_-|QAB34985.1|DBSCAN-SWA MVTKEVGHDFLARLGKKRLRPGGVEATNWLIEQGQFSQDCHVLEVACNRCTTAIELAKTFGCQIDAVDLNPKVVKEAQERVAVEGLTRHITVSQASALSLPFPDNHFDIVINEAMLTMLNAQAKEKALNEYWRVLKPGGRLLTHDVAYEDPKTRQVLDELRQTIHVNVAPLSLTGWQALYQEHGFSQVTYHHGKMSLMTPRGMIKDEGLMNTLNIMRRGLKKENRQQFLKMRRFFTRTGKNLCYIAVKSVK |
82 | Temperate_phage(50.0%) | integrase,tail,holin,terminase,capsid,tRNA | attL 1389575:1389592|attR 1416756:1416773 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
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CP028841.1|QAB34980.1|1330485_1330740_-|DUF1912-domain-containing-protein |
1330485_1330740_-
Protein sequences of CP028841.1|QAB34980.1|1330485_1330740_-|DUF1912-domain-containing-protein>CP028841.1|QAB34980.1|1330485_1330740_-|DUF1912-domain-containing-protein MSYEKEFLKDFEDWVKTQIQVNQLAMATSQEVAQEDGDERAKDAFIRYESKLDAYEFLLGKFDNYKNGKAFHDIPDELFGARHY |
84 aa aa | NA | NA | NA | 1326258-1402151 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.2|1317741|34|CP028841|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP028841 position: 1388239-1388206, mismatch: 2 gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.***** 2. spacer 4.6|1317742|34|CP028841|PILER-CR matches to CP028841 position: 1388239-1388206, mismatch: 2 gctgtgacattgcgggatgtaatcaaagtaaaaa CRISPR spacer gctgtgacattgcggaatgtaatcaaagcaaaaa Protospacer ***************.************.***** |