Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035114 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed1 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP035115 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed2 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP035117 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed4 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP035116 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed3 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
CP035113 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 chromosome, complete genome | 2 crisprs | csa3,DinG,cas3,DEDDh | 2 | 10 | 5 | 0 |
CP035118 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103295 plasmid unnamed5 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
11575 : 65008
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035114|11575:65008|DBSCAN-SWA GATGCAGCTAATGGTCAAAGTAGGGGGCTGGTTGGGATTAATCTTAATCGAACAATGGGCCACCGGGGTGTGCTTAACTGGGCTGCAAGCTAAGTCCGTGGGCGCCACCATCTTCTTACTGGGTAGTGGCACACTGGTGTTAATCGTTTTGGCGTTAGGTCTGGGTTATGGTGATCGTCAGCTCTGGTGGCGCCCCATTGATCATTGGCGACCGGTTTTAATTAAGGGGGGCTTGGCCTTAGTTAGTCTGTTGGGGCTTAGTCTTATGATGATGGGCATTATGCATTATAGCGGACAAACCACTACCGCTAATCAACAAGCTTTGACCGCCTGGTTGGTTAGTTTGCGCGGGTGGCGCCAATTCTGGTTGAGCAGCCAACTGGTTATAATCGCCCCCATGCTAGAAGAATTGTTGTTTCGAGGCTTATTTTGTCGCTGGTTTTTGGGGAACCATCAACGCTGGCAAGCCATTGTTAGTGCTGGGGATTTTGCAAGCGTCCATGAAATGCGGCCCAGTTTTAGTTGGTTACTGTATTTTGGGGCCGGTTTGATCTTAGCTTGCTTATACCAGCGGCAACACGACTTGCGCCTTAATTTGGTGGTGCATAGTTTATATAATGGCTTGAGTTTGATTTAGTTCCAGGGTGGGGTTGGAAGTGGCTGTTAAACGCGGGCAATGACTAAAATAAATGATAAAATGAGGGTAAAAATGAATGAAGAAAAAATAAATCAAGCACGGCCAAAAATTAAAGCTGATAAATGGCAGGTTGAAGACCATGCTGGCGGTGAAGATTGTTGTGAAGCTTTATTATTGAAGATGCCAGCTGGTCAGCGTGAGTTTTCGTTACCATTGTCAGTGGTGATAAACTGTTTATGGATCGCTGAAAAGGAAGGCTATGTTCCACCATTAGCGGATCAGTGGTGGATAGACATACGCAATGCAATGAGCTGAAATGAGGCGTTGAAATGAATCAATTCAAATTGAAACTAAGAAAAAATAAACGTCACTAAAAATGCCTGTATACCAGCACTCATATTGGCTTTTGAGTGAGCACTTGGAAGCGATAGCGATGGTTGCTTAGGGCTGGGCTAGACTAGGGTGTTATTTAAATCCTAGCCGTCTCGTAGACCACAAGTAAAGCCAGATAGACATTATGAACAAGCAATTAGACAATGGATAAATTAGCTAAAATGCACGCTGTGAATACCGTAGTATCGGTAGTTACAGCGTGCATTATGTTATACTATGCTAGTAGAGAAGTTAAGGCGGTGGCTATTTCCAGTATTGGAGGTGGTGCTTATGGTGTAAACCTAATAAGCCAACCCAGATTCCAGGAAAGGAGTAGCCCAAGTGTCCGTGTCGGACGCTTTACAATTAATGCTGGCTTTCGGTACGTTTATCGTAGCCTTAATCGCATTAATTGTTGAGCTGATTAAAAGTCAGCAAAAAAAATAACCGCCTTAGCTTGGCAGAGCTAGCGGTTATTTAATCGTATTAAGTTATGCCACCGTCTTAAACGGCTCTACACGGGAAGCCCTGTACAAGCAAGGCTTCCTTTTTCTATGATTTATTTTACCACAAAAATTAAAAAAACGCTCGTAATGAGGATTGCGAACGTTCATCGGAAACTGTGTGAAAAAATTGATTAGGCTATATACCGCAATGTCAAAACAGGAGAAGATTTGGCACTCTTAAAATAACGTATATTGGAAAATTTAGCAATCAATATACAACCGGTTACTTGCAAGAAACATTTCAGTGGCTAAAAGGCCGTTCTAAGAACAAAAAGCCACTCATAATGGGGGTTATAAGTGGTCGGAGTAGAAAATATAGTACATAGGACTAATCTTTGTACAAAAAGGCTTACTTTGGAGAAGTAATATAATACGACTTTTACTTTAGTACAGTGCGAGCCGTAATGCAAGCATCGGTACTCATAACAAATATTTCTGGAGGGTGAGTTTAACGCTAAGGTCGTTAGGCTGGTAAGCTGGGACTAAATTAATGTTAGGAGTGCAAATTATGACGACGGTAATTTTAGCAGAAAAACCCAGCCAGGCCCGGGCATATGTGGCGGCCTTTCAAAAGAGTCAGAAAAAGTCGGGTTACTATGAGGTTAGTGCTCCAGTGTTACCCAATGATACGCTAGTGACACACGCGCTGGGTCATTTGGTCGAACTCGTCCCGCCAGAAAAATATGATGCGAAGTATCGCAATTGGGATTTAGCCAACTTGCCAATATTTCCAACCACCTATCAATTCGAAGTTATTGCGGACAAGCAAAAGCAGTTTCAGGTGGTTAAAACGCTGTTAAATCGGGCTGATACGATTATTGTGGCTGGTGATAATGGTCGTGAGGGTGAAAATATCGCTTGGTCAATCATGAAACAAGCTAAAATTGATGTCGAACACAAAACGATGCAACGGTTGTGGATCAACAGTTTGGAAAAAGAGACCATTATCGCGGGCTTTCGCGATTTGAAAGATGGGTGGCAATTTTATCCGAATTACCAAGAAGCCCAGACCAGACAGATCAGTGATTGGCTCGTTGGCATGAATGCTAGTCCATTGTACACCTTGTTATTACGGCAACACGGGTTGTCGGGGGTGTACTCCATTGGCCGCGTTCAAACGCCAACGCTATATATGGTCTATCAAAGAGATCAACTGATCAAAAACTTTAAACCGGAGCCCTACTTGGAACTAAATGCTGAAGTTTTAGCCAATCAGCAAAAATTCGAGGCAAAATTAGACCCCTATCAGCGCTTTAAAGACGAAAAAGGATTAACGATATTCATGCAGGCTAAAAGCGTTCAGCGGGGCCCGCAGACAGCTTTAATAAAAGATGTCCAAAACATCGTCAAAAAGACCCCTAGTCCCCGGCTGTTTTCACTATCTAGTCTACAAAGTGCGGTTAACCAGCGGTTTCATGCGAGTGCGATTGAAACCCTAGCGGCGGTGCAGGCCTTATATGAAGCCAAGTGGTTAACTTATCCGCGCACTGATAGTGAGTACCTTACGAAGCAAGAGTTTGATTATCTGGCGGCGAACCTGGATCATTACCAAGAATTATTGCCTGAAAAAATGGCTTTACCACAGACCACGCCGCAAAAGCGCTATGTCAATGGTCAGAAGGTGACGGAACACCCCGCGATTATTATGACGAAAGTAGTGCCTAGTTCAGCGCAATTGGCTAAGTTACCCGTCTTACAACGCCAGGTCTATGATTTGGTGTTAAAAACCACGTTAGCTATGTTTGCGGCCCCTTATGAATATACAGAAACGACCATCACGACGCAGGTCGGACAAGCACTGTTTAAATCAGTGGGCAAAGTCCCAATTAATCCTGGCTGGCAACGCCTCTTCGAGGCAAAATCAGTGGAGCAGGTGAAAGGTACACTACCAGTGGTCACGCCTGGTCAAACGGTACAAGCTGTCTTAACAAGCCCGACGAAACAAACCACCCCACCGAAGCCGTTTACCGAAGGAACCTTAATTACAGCCATGAAAACGGCCGGAAAGACTTTGGACGCAGACGAAGCGGCGGTGTTAAAAGATGTCGAGGGAATTGGCACCGAAGCTACGCGTGCCAATGTGTTAGAAACGCTGAAACGGCGGCACTATTTAGTTACGAAGAAAAATGAGTTACATGCTAGTGGCACTGGCGTGACACTGTGCCAAGCGGTAGCGTTAGAACCACTGTTAACGAGTCCGTCGATGACGGCTAAATGGGAACTAGCTTTAAAAGAAATTGGTGAGAAAAAGCGCACGCCCGAAAACTTTTTAGGCCAGATCAAGTTGTTAAGCCAAAAATTGCTTAAAGAAGTTCCCGAGCAGTTTGCCCAGAATGCGGACTTACAGACGCAACTGGTGGCCCAACAACAGGTGGAACAAAAACAGCAAGCGCAGGCCGCCGTGGGGGTTTGTCCAATATGTAAAACGGGTGAGATTTCAGATCGTGGCAAGTTTTATGGGTGTTCCAACTATCAAAAGGGGTGTCAGTTCTCGTTGCCCAAACAATGGAGTGGCAAGAAATTGCCAATAAGTGCCATTAAACAACTGATCAAGACTGGTGAAACGGCCCAACTCAAAGGCTTTAAGAGTAAGAAAACGGGAAAAACATTTAGTGCCAAGTTGAAGTTAGAAGCTGGCAAACTAAAATTTGATTTTGATAAGTACAAGTAGTAGTAAGCCTCTTTGGTCAGCACAAGTTACAGTGTTGATTAAAGGGGCTTTTTGTATTTGAAATCTCAAAATAATAAGTACAGGAGGTTAATGAAGGTGAAAGTCAATTTATCAAAGTATCTATATAAATTTGTTCCATATTGGGAAAACATTTAGTGCCAAAAGAAAGTTATATTAACAGGTTTCAACCTCTTTTATCAGTAGTAAGTATCCTTACTGGTAAAGGAGGTCTTTTTTTATGGCGTTACAACTTGCGGATTACGTTAGCTATGCTGGGCTGCCCTTTAAACATGAAGGCTGGTATTTACGCTCACAGGAACACGATTCACTCATTATTGATACCCGCAAAAATTACTTTATTTGGAACAGCCAAGGCTTAGTTGGTAATTTGAGTCAATTCATTAAGGCCTATTACGGTATCAGTGACCGTGAAATGCACTTTCGACTCAAAGCTTTTACCAAGACTAATCCCCAGCAGAAAGCCACAGTGAAAGCTGACTATCTCAAGAAGTCAGCGGTGGGATCGGTAGCGCCGTTAGATGCGGCTGGCATGGCTTATCTGACTCAGTATCGGCATCTGGACCCACGCTTAATTACCTTTGCCGTGCGGCAAGGTTTATTAGGCAGTGATGGCTATCATAATGTGATTTTTAACTGGTTTGATGCGGCCGGCGCCTTGGTGGGCCAAGATGTGCAAGGCACTGTGATCAATCGACAACGTTACCCCAAACATGGCTCGTTAAAGCAGATTAAAGCCGGTTCCAAGCCGCATTACGGGTTTAATGTCCGGTTTAGAGGGCCGTTTAAACACTTG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45 | Lactobacillus_phage(40.0%) | protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
787 : 62543
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035115|787:62543|DBSCAN-SWA CTTAAACGGCCTCATTCCAGTATTCAGCTGGGGTGAGGTCGTTTCTTGCTGGTGAACAATCTAGTTGATTAAAATAGTTGATGCCTTCTTCGACCAAGGCCACTAATTCTTTATAGGTAACTGGTTTAGCGTGTCGATCAATCCAGCGCAATTTGAACTCGTTCCACCAACGTTCCATTGGTGCGTTATCATACGGCATTCCTGGTCGTGACATACTACGGGTGACTTCATGTTGCGCCAAAAAGTTATTGAATGTTCCTGATGTGCATGCCGAACCTCGGTCAGTATGCACTACAGGGTGGACGTCACCCGCAAAATTAAAGGCCCGTTGAAAAACCTGAACTTTTGCCTTCGAAGTTTCAGTTTCACTTAATTTATGGGCAATTAGATGGCGACCGTAAAGATCCAGCGCGCCGCTCAAACGCACTTTATACTGACCGTTAACACCATAGGTCAATTCCGTTGAATCAGCTAACCAAACCTGGTTTGGTTGGTTAACGCTAAAACGCTGATTTAAAACATTATCTTGTAAGTATTGCTCCTGTTGTTTGATTCGTGAATGCTTTTTCTGACGAACCTGGCAACGAATGTCTAGCTTGCTCATAATCCGCTTAACTTGCTTTAACGTCACCTGTTCGGTGACGGCCGGGTCTTTTCTGAGATTAGATAATATTTTGGTACTACCAATACCTTGATGATGCTGGTTATACCAATATTGAACCCGTCCAGTTAAGAAGTTATCTCGAATCCCCCAATCCGTTACGTTACGATGTACCCTATCGTATCCACTTGTAAACTCAACAAACGCTAGTAACAAATAAGTGACCCGGTGGCCATTTTTAAATGGATTTCAATAAGGTAGCTTAGTGGGATCTTACGTGTAGTAACTTGAAATGGAGACGAAATATGAATTGGCAAAAAATTTGGGCGGTAAATAAATATTGGGTAATGTCGAAATCACAGCAACAATATGACCACATTCGTTTATTGGCAAAAAATAATCAATGGACGCCACAAAAGTCACAAGAGTTAGATAAAATTCTTGATTCACTCGGGTCAGTTTCACCAACAAGAAAAACGTTAGTAACGACTTATCAACATATCTGGGGATATTTCAAGAAGAAATGTACCGATGAAGAGTTACATCAATATCTGAAGCTTTTAGATGAGCTACAACCTGATAATGATAGTCTCGGTCCTTTCTTAGTTCAATTAACTGCCAAATACCAAATTGATTACCTCCAAAAATCTAGACTTATAATTGAGCTTAACGAAAGAGAAGGCCAATCAATTTCTAAGAATTAGACTTTTAATTCACCGGTTCCAATCAATTATGCCTTTGAAAAGAACGATTAGCGTTGCCCAACAATTCAGCCACTCCAAAATTGATTGCTAAAATTAGGACTAACCAAAGAAGTGTAATCAGAAATTGCTGGTTACTTGACTATCTTCCAGAATATTTGCACCAGAATCGAAAGAAGTATAGGCATAACTTCATGGACGCAAAAACGCCTCACCACTGGATTTGATTCCGGCGATGAGGCGTTTTTTAGTATGTGCTGTATTTGTATCTATAATTCAATGCTCTCTCAATCATTGAAATATCAGCTGCATCAAATTCCTTTTTTGCCATCTGTACCGATGATAAGAAGTCTTTGTTTTTTTTTAAAGATTTAGCCAGCAACTTTTTATCCTTATCATCGAGCTTGATTTTATAAAGCAAGTTTGCCATCGAAATAATCATAGTTTTGTGAGTCTTAAAATAGCGTCTGTACAATTCGCTTTCAGATACACACAACTTATCAAAATCCTGCTCTGAATATTTGGGTTGAAGCCCCAAAATTGGATTAACAAGTAGCGCGGTGGATGCTTCCATTAGATTGACATATGCACCCAACTCATACTGTTGAGCCTCCGTCATCTTGGTGTAGTCAGTTCCGAAGGTTTCTATCTTCACAATGGCTTCTCTTAATTTCTCAGATTCATCTATGATTCTTGTAATGCGCTTACTTAGTTCGACAATAGCAAGTTCGTATGATTTGATGTCACGGTTACTAATAAGCGTGTATGTATTCTCAAGTCTTTCCTTATCGCTGTTTGTCTTAAAAAACATCAGACCGCTTGCTACAATAGAAACGCCGGCAATCGTCCAGCCAACAGGTCCCGCAAGTGCTAAAAAGGCGCTGCCCGCAGCCATTCCACCGCCACCAGTAGCTAAAGCACCTCCACCTAACCATGCCAGCGCTGCATTTGTAAATGCTGCACCACTCAAAGCAGATATTGCTGTTCCGGTAGAAGCCGCTCCAAATGTGGTCGCAATACCCATAGCAGCTGTAGGGCCAAGCGCAGCAACAGCAACACCGGCACCAACACCAGCAACGCCTTGACCAGTAGCTTTTACCTCCGCTTTCTTATATTCCAGTTCTATTTTCTCAGCCTGCTGTTTCCAGTTAACTCTGATTGTTTTTAACTTCTCATATTTCAGCATGTTTTTTTCCGGCACATTGCGAATGCGGTCAAATAACGACTGTATCGTGGTCAATGAGGTGTACAATGAACTGGTATATTTTCCCAGCTCATTTATTTTTTGATTCGTTTTCTGTGCAGCAGCTTTTGCTTTCTGTTGCGCTTTTTTAAGTTTTGATGACTTCTTTGCCATATTATTTTCCTCCAAAGTACTTGTCGATGTCCGGCTTACTTTTCAGAATTCTATTTACGGGAACATTACGCACTTCTGCTAATGTTACTGATTTTCCAAAAGCTTCTATATAAGCATCGCTTTTTTCGAAGTCACTGATAAACATTAACAGGTGGTGGTCGTCGTACTGATGTGCCAGAATTTTCAGACCCTCTATGTAATTGCTAACAATAACGGTTTCCTTTGACGCAAAATCGAATTCTTTCTTTGCGTGATTATAGGAAATCGCTCTCCTCGTTTCACCATAGAGAGATATTGCAAATCGTCCGACTCCGACAACGTTAAGTCGTAAGACAAACTCTACCGCATTAAAAGTACCTCCACCAGCTATAAGCGATCTGCCCACTGCATCACCGACATCAACCAAACAGAATGTACCATGTGCAACCGTCAACATTCGCTTAACTGTAGCATTCGAGAATGGTTCACATTTCTTCCACATGAGCGCAAAGGAGCGTTCTGTCTTTGGAATTTCTGAAAAATATCTGAATAGACGGCGAATAGCATAAATGAGTCTAACAAGAAGCTCGTTCAAAAATACTGGTATAGCCTGAGCTGTCTGGAACCGAATATCATAGCCTTTTTCAAAAATGTTTAGAGCCAGCTCATTCATAGTTTTGTCCGTTTCAGTTACACTAAGTCCCAATTTAGCTTTTATGGCAATAATGTCATTGGTCCATGTCCACAATGGAGATGGAAGGCCCGTGCCGCGATTACCTTTGGCCGCACTTGACGATGAACCGGATACATCCGAAATAAGATGACCTATCCAGTTAGCAAATCCACAGAACAGCTTACTTGGAATATTTCCGCCTCGTAGTTCCCATTTTTCATCTGCCTGTTGCAAAGAAACAAGTTGACCGTCTGTAACAAAATGAGATGTATTGCTGAACTGGTCGAGTATCGAAAAGAACAGCCCCAACAAACTCGGATTGTGTGCAAGAGATTTGAAATGATGATTTTTGGCAGTCAAATCGAAAATGGTCTTTCCAGCGTCACCCAGTCCGGTCTGGTCATATGGAACCTTAAATTTCTTCTCCAAGAATCTCAATGCGGAATCAAGGCTATCAAAATTTTTCTTTTCCGGATCGCACAGTTTTGCAAAATCTATCGTTCTGGCTACAAACCATTTATCCGTAATATTACCTAAAGGTGACTCACCAGGCTTACCCACTAAAAAAATGTCGATGATACCACACAAGGCACCAGAACTTGTAGCCAAAATATAATCCAACTTATCACAGTCTGGTTTCAGACCTTTAATCGAATCTACCGTTTCATTCAAAACGACAAGCTCTGTTTCAGCTTTCGCCATTGCATCAGCAATCGATGTAGAAAAATCAAAGCCCCCATCCTCAACGCTTAAATTAAGGAGAATATCCTTTTTTATGATTGCATTATCCATTTACGCACCTCACTCAAGATGATCATTATTCTGACCATGTCTTTTGATTTGATATTGTTGCACTCAAACTGGTTCTGGTGCAAAGTTCAATAAATGACTGAGTTCTACCCGTTGGTAGATTGTAAAATTTAAGTTGAACATATTAGTGGACAGAAAAACCCATAAAGGTCTTTAATGGTGTCACCACAACATTCCACTAGAAAGAAGGACCTTTATGGGCACCACTATTTTATCATTTGAAGACCGCGTTGTCATCGAAACACTTCATCATGAAAAGCACTCACTTCAATATATTGCCGATTATTTAGGCTTTAGTAAAACCACTATCTTTAATGAGGTTCATCGCTTAGCTGGTGAGTATCACGCAGTTAAGGCTCAAACTGACCATGAAGTTAAACTTAGTCATCGTGGTCGTAAAACCATCTTAACGACTAACCTAAAGCGATTGATTGAAGAAAAAATCAAGATCCAAAAATGGTCAATTGAACAAGTGGCTCATGTAGTTAGAATTGCCTACAAAACCATCTATAACTGGATTGATCAGGGACTACTGGATATTAATGTAACTGATTTACCTAACCATGGTATTCGTCGCAAACGAGTACTACGCCGCTTCATTCCCAAAGGTCAACCGATTGATGAGATTACCGATGATGAATTGATTCAAATTAACTGGTATTTGAATTCCCGACCACTCAAATGTTTAAATTGGCGAACACCGATTGAGATCTTTTTGCGTGATCTGCGTTACTAAATTTGTTCAAGTTATTTCTCGCAATCTGCCTGACTAAAAAGAAATTAACAAAATCGTCTGACAAAATAGTGAGTGGTGTTTTTGGCGGTATTGCCGAATATTTTGGTTGGGATAAGGCAATTGTGCGGATCATCGGTGCATTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035115|787:62543|57433_59602_+|QAR39367.1|DBSCAN-SWA MVTSTPEMENTYFYLNNLVNIPSNGEIPLHYDQEALKAYFEETVKPKTKQFDSLNAKLNYLVDEDYIDPSILEQYSHKFVQSLFDQMRDHHFRFRSFLGAYKFYTQYAMKTNDGQQFLEDFVDRVVFNALYLANGDEQLANDIADELISQRYQPATPTFLNAGKKRRGEMVSCFLIDMADSMLSIGRGVNSALQLSRIGGGVGVNLSNLRASGDPIKQISNASSGVVPVMKLLEDSFSYSNQLGQRNGAGVVYLNVFHPDILHFLDTKKENADEKIRVKTLSLGLIVPDKYYELLKTNEPMYLFSPYDVEREYRTPFAYIDITKEYNNMAANPNIKKSVFNARKLEQKISQLQQESGYPYILNIDTANQTNPVDGKIIMSNLCSEILQPQEPSKLDDDLSYKTIGTDISCNLGSTNIMNMIDSPDFGHSVEVAVRALTLVTDTTDVKEVPTVKHGNELYHTIGLGAMGLHTALARHQIEYGSPEALEFTDAYFLALNYYSLVTSNRIARERHETFAKFDQSKYADGSYFDQYLNADFKFKSTKVAKIFKNIKLPSVTDWKALKQAVITGGLYHRNRLAVAPNGSISYVNETSASLHPITQLVEQRQENKVGSIFYPAPYLSNETLPYYTPAYDIDQRKIIDTYAVAQKHIDQGMSLTLFMRSVLKPDLYEWKDNDNLKMTTRDLNRLRNYAWTKGIKSLYYIRTFTEDDEIKTANECESCMI >CP035115|787:62543|5103_5643_+|QAR39321.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MKKLVRYVCAVVAMLFLVAGCSSNSTQKEGSSTHSHSSEKTEMHEHTGSKKVHGLKKAEQPKYKAGTKVKLTADHMKGMKDANATIVNAYDSKLYAVDYKSTSDKKMVKDHKWVTINEIEGNRKEYKKGDKVTLKADHMAGMKNSSATIVEIQKGPAYMVNYQPTNGGKQVTNHKWVAEDEIEKR >CP035115|787:62543|29116_29407_+|QAR39340.1|DBSCAN-SWA MLLSPHRGHQPRIARFSSRSAGPKTTSRVVAIITTKEGCPVFDKHQRCNKDGKLTVTPKADKTAEYAGNPAKPTMPAPKPTVTKVVKLIQTGHHQT >CP035115|787:62543|41635_42412_+|QAR39353.1|DBSCAN-SWA MATRNGHKYLKEAITSILCQSFSDFEFIICNDHSSDDTAKIIEHFRKNDNRIKVFENEFPDGFTSALNYGLEHCEGKYIARMDDDDISHPDRLAIEAEYLDQCPMISIVSSNVNFFDSSGIYGRTSKINLPTNKDIWRGKIFTHPAVMFRKKILSLVGQYSTSKDVTRIEDYDFWCKFYSYGLKGINLPNTLLDYREDHFSLKKRNAIRKVRLVKCMHKWRKRLNIPIYYDVFMVYELMKILVPQRLIGTYHRVHFKL >CP035115|787:62543|34188_34791_-|QAR39347.1|integrase|DBSCAN-SWA MINIYYNVEPLRSNEEITDFVNKARSGTHGERNTLLILIGLNTGLRMSDILNLKVGQIRYHDIVHITEKKTKKRRVILLTRLRPQINHYIKDLPDNEYLFTNRQHQPLSVNAVYKLFQTIARKMHRTDIGTHTLRKTFGYHYYQQTHDIGTLMMIFNHSSEAITKRYIGLNQDVILKQLAGFSLGIDANKNIIHANQKTE >CP035115|787:62543|37374_38145_+|QAR39349.1|DBSCAN-SWA MMDQAVSFDFFIRLIRKYWRAIVSFTLVGLIVAAGLTFFVITPKYQSSVQILVNRKNTNAATEYIGQQADVQMITTYKGLIAGQVVLKPAKQQLSKRYGIERSLNTLKSEVSVTSTTNSQVFSIAVTDADAKASATIANQIARSFKNQVQKIIKVNNVTIVAPAETPSGAVSPKKPLNMLIGLVVGLLLGFVYAAIRMLTDHRVHDADFLTDELGLTSLGLVNHQHHYSMKKQALNLNGGYHTHNDRTSSQAMKRV >CP035115|787:62543|12893_13796_-|QAR39331.1|DBSCAN-SWA MTKVIALSNQKGGVGKSTNNVMFAITVAKLFNKKVLHIDMDLQANSTFMLSLTFDQTTWPASITKCLDDKDLEEGIVHLTDNLDAIAGDKDFRNWGTWLADNVKGTHNRTFYFKPLLDKIKDRYDYVFIDTPPATDIKVDNIMVATDYVVVVQETKRFAFEGSKDLTSSYLQTLYNDFNDEINIQVAGILLVLLDKNHSVEQRIVKKTTEYFGKENIFGQIIKNHLRLENYGEYGVQFNDWHDSRMLALFSDLFQELEERIEQFEKYGDIKPGYQYEPKYVINNRLTTLGKKELKPNGLD >CP035115|787:62543|1692_2091_+|QAR39318.1|DBSCAN-SWA MNWQKIWAVNKYWVMSKSQQQYDHIRLLAKNNQWTPQKSQELDKILDSLGSVSPTRKTLVTTYQHIWGYFKKKCTDEELHQYLKLLDELQPDNDSLGPFLVQLTAKYQIDYLQKSRLIIELNEREGQSISKN >CP035115|787:62543|36021_36123_-|QAR39348.1|DBSCAN-SWA MVNTILKEADLFCPNSVRINFTIYLLTKHVIEV >CP035115|787:62543|54450_55005_+|QAR39364.1|DBSCAN-SWA 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MVFYFGVLGLYIIFGIIINFSFENKAARLFQSLSMIVILGGLSAARAVSVGADTQLYNNLYSWDFEAGNWQNILSSKYPLYSLYTYCLHFISSNPQIIIVMNSLIIVTSVAITIYSYSENVFLSNILYVTLYFFFNSMNISRQFLAIGILLVATVCLNKNKIWLFWILYIGACLVHSTALVGIVFFVIHVIHWNKTRFILLSGALGIVLLIFSKRILNLFIVLFPAYSMYSIGTSDTNVETLSSQSNGGTLLVTIFYLLFICIATLCKVRFQDENREKRFAFLTVVMIIAVVFGIVFYKNILMTRVISYLSIFSIVYISEVIDLFILNIDTTSVNRGYTRFLVVCGVIAITCVPLYVQLNKNLSDVIPYVSFVAR >CP035115|787:62543|19050_19260_-|QAR39334.1|DBSCAN-SWA MSQSNLEKQEAKLKALNQKIKDEKNKIEQRLGKQIISQANLDYANLSNDNIKSLSKKVSEFLKEKPVDH >CP035115|787:62543|47138_48593_+|QAR39359.1|DBSCAN-SWA MLVSVRSKYQSLPKQVKASIWFLLCSFLQKGISMITTPIFTRLLSTSQYGQFNVFNSWLSIVTIVVSLNLCYGVYTQGLIKFDKDRAEYSSSLQGLTLLLVLIWTVIYIFSSSFWNQLFSLTTVQMLAMLLMVWTSSVFNFWAAEQRVVLRYKALVVVTVLVSLAKPIVGMILVVNADDKVTARIVGLALVEVIGYTGLFILQMRRGKRFYSKRFWIHAVLFNLPLVPHYLSQIVLSSADRIMIAKMVNSESAGIYSLAYSLSQIMILFNTALSQTLSPWIYQKIKDKRAPDIAGVAYGALVLIATVNIILIAFAPEAVAIFAPKAYYDAKWIIPPVATSVFFMFAYDLFAKFEFYYERTSLIMLASTIGAVLNIALNYLLIPIFGYYIAGYVTLLCYILYAIFHYIFMNQICRSELGTQPYNTKLLLGITSVFIAISLLFLVSYTNVLLRYMLILMIIIIGIVKRKYLMQIIGLMVKMRKQHR >CP035115|787:62543|9985_10384_-|QAR39326.1|DBSCAN-SWA MNEKEFDLGIVKRFFEHDYHDRGLMKWQGFYLSDHTAALNQQKIQDKQQYPPKPQQSLSIVGQILSTAYTQNQPVNLQLNTVDHNNQHFATITTPILGYNGATIVIANHQFININDIQHIELVRSTNWTGNQ >CP035115|787:62543|43601_44318_+|QAR39355.1|DBSCAN-SWA MSIPKILHYCWFGKNAISDDARRNQISWEKNCPNFKIYEWNEDNFDINGFAYTQKQYARGRYDLVSDFVRLFVVEKYGGIYIDTDVEILKPLDPLLKNNCFWGMEDFDLINSGLIFGSEAHYQSIRDLMKIYIRNSNDNSFLDMNCVKITTDYFRRLGFKYINKTQNISGNKIYSTQYFCPIKYGSRILRITNCTFTIHHYAECSSDVRRHIMIGRAIRRMIGREKFEHMIENKRNVF >CP035115|787:62543|32872_34048_+|QAR39346.1|transposase|DBSCAN-SWA MNELTTEIIAALAQKQDLDEVFRHHLEIAINQLLQTELAEFLGYERYSYAGINTGNNRNGSYERSFDTKYGQLNLTIPRDRNGRFENHTLPAYGRHSDNLETTVIQLYTKGITTAEIAELIEKMYGAHYSKATVSNMTKAVNEQVQAFQQRRLASQYAAIFLDATYLPLKRDTVQKEAVHIAIGIRPNGTKEVLNYQVAPTESTGIWTELLGTLIKQGVKDVLLFVADGLVGLDEGLNRHFPKAKRQRCLVHVGRNLMNKVRVKDRKAVISDFKQVHRAANREAAELKLNEFANNWHQTYPKLIKDLLKMPNLLTFMDFPPAIRQSLYSTNLIENFNKHLKRTTHHKEQFPTEDSLDRFLVFQFNVYNEKSLKRIHRGFKGLQGTLEASFI >CP035115|787:62543|56326_56416_+|QAR39365.1|DBSCAN-SWA MSVFQTLSLMLLFGTFLIALLSYIDKHHK >CP035115|787:62543|60649_61600_+|QAR39369.1|DBSCAN-SWA MSYKTINWDIIEDELDEYVWDKATAQYWLDTRVPVSNDLRDWRTLSGTEKSVINRVVGGLALLDTLQSEEGVDVMRPDVRTRKEAAVLNDFLMMESIHAKSYGTILTSLNDQATVDEVFKWMNNNPRMQYKAKRINDIYQTGNNLEKKVASVFLEGILYYTNFFTPLWYRGNNKLANLSEVIKLVIRDESVHGTYLGYKFQLGYNELSVTEQKPFKKWMDELLDDLLENEFAFTEEVYAPIGLAEDVKQFVHYNANKALQNMGFESRFPNAEIKDINPIVMNGISTETANHDFFSQVGAGYLMGNAEAMSSGDYDF >CP035115|787:62543|46015_47056_+|QAR39358.1|DBSCAN-SWA 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MKIKFLTKKFFRPRLSEFISVQTDNFLRKLKPRPFFTEYIEQVFRKNVEPNVSQNCLTLSVLTDTHEKAVASSSYYGLNGVRHIIEANKACDSLPVDYNIHLGDLIDGSDKPEISRGLLQFTMENYQNSQRPFYVLEGNHDENDKYDEHKFITSASFRRDDYYNLVTKHDFEQPEIKRLSLGSKVAWIDKGDIRVIFLNTSDIPYILNGGTKKYDFKKVRGIREQQIEDLISILEKTIDKHVVVFGHANLISQSGRSALNFNGDLVQKIFTSFNNKDSGQLKNELSGDFGVNVRYNFTDTGISTISNYICGHMHYEKCYKVNGINHIILNCSALMGKKHGPTTDYNKKWDRRYNEISELAGYFININPDKMLLQIFGYGAATRFVSFEI >CP035115|787:62543|12637_12907_-|QAR39330.1|DBSCAN-SWA MALIKKDADALHVNVEKTVDDTRKQKTITAKDRKSLRVDPDTYDTIKSLAYIKDKKIYEIENEMVEAYKRDKLSPREREIFDSMNRSAK >CP035115|787:62543|6767_7766_-|QAR39323.1|transposase|DBSCAN-SWA MSPYTHLTLKDRECILLGVTLHHTYQVIADQIGCSKATVSREIKRNGGRGAYSAVKAQQNYQQRRLKSRRLRVLENLKLRDFVLHCILQRQWSPEQIAGRLSLENSNWHISYNTIYRGIERNNLGVKRKSHGARGFARKLRHRGKTRKVKGTVNERRGRFNNVPSVHERPVSCENRTRFGHWEGDTVRGKIGRSGLVSLVDRKSRYLLSERVPKVNAKNVTQAMIDLLHTVTPKRVRTLTPDRGTEFAGYREVGKELGISVYFPDPHAPQQRGTNENTNGLIREYFPKETDLDELTDQDIAKFVRDLNNRPRKVLVWKTPSEVFFGKRLHLI >CP035115|787:62543|21849_22005_+|QAR39336.1|DBSCAN-SWA 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MKRYQDDFKASIVKMHREEKRSIRSLSEEYGVSPAAIHNWAKGAKSVELEDGTEVTSKEFKQLQKENQRLKEELEIFKSCGGVTGKALGRINCLVFIEDQLLRHRLSIILSALKLPRSTYYHWKRYQPSQHERVDNQLKEKIKLIWENNYRAYGYPRITMVLRKSGICVGSKRILRLMREMEIHSLMNRRFKKPGTHVDHSQRPNLIKHQPNARIWRADITYLELRPGTWVYLSSIYEPKVHQVLAFKIGRQMEATLVVETINQALECHQKPQYFHSDMGSQYTSNEVETLLERHQISHSYSKQGYPYDNGPIEAFHSLLKREFAFQTTFSNFEDMVIRTSNYISWFNSDRIRTSV >CP035115|787:62543|12104_12416_+|QAR39329.1|DBSCAN-SWA MNTVQLQKFISDNSQVEAIFMQKALAYINSKSKKRQPAKRWNEEQITRQAERMYAQVVENLYGKLHTQVKANRFTPAEKWLKFINENEVLDGMEESMIELDFS >CP035115|787:62543|52958_53012_+|QAR39377.1|DBSCAN-SWA MSQWRQLPHDFPKCQKV >CP035115|787:62543|9649_9913_+|QAR39325.1|DBSCAN-SWA MYSIFWGIGNKTYLPLLTLIPIFNIVWVFVVGFKGNEWAWQKGDYQDVETFKAVQTTWNRAGIVQFIISIAIFVLYMFFFDSLVANI >CP035115|787:62543|39704_40373_+|QAR39351.1|DBSCAN-SWA MEHGENSLETVIIDQMRIQRRYGYRFVKRGFDILASLMGLILLSPLFLIVAIAIKVDDPRGKVFYSQIRLGRGERPFKMFKFRSMVSNADKLMVQLTEENEVSGAMFKMREDPRVTRVGRIIRKYSIDELPQLINVVIGSMSLVGPRPPLPQEVSEYTEYDKQRLLIKPGCTGLWQATVRNGVGFDEMVRLDLIYVKRQSSLYDLWILLLTVKIILKPNNAY |
57 | Staphylococcus_phage(20.0%) | integrase,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
7878 : 63804
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035116|7878:63804|DBSCAN-SWA GTTATTTTTTTTGCTGACTTTTGATCAGCTCAACAATTAATGCGATTAAGGCTACGATAAACGTACCGAAAGCCAGCATTAACTGTAAAGCGTCCGACACGGACACTTAGGCTACTCCTTTCGTTAGGATTTATGGGCTTTAAAGGTTTAACACCATAAGCACCACCTCCGATTGGAAATAGCCACCGCCTTAACTTCTCTACTAACTTTAATTATACAGGAGGAATAAAATATTGGCCAGGTTACAAGAAATCATTTCAGAAGCTAAGGCTAATAGCAATTTCATTTATCGAGGGTGTGCATTTGAAAAATATGATTTAGTTCCAACTCTAGCTAGAAAGTTAAAAGCAGACGTCAGTTTTGACCAATATAATATTTATTCTGACGTTGTTAAAAAAGCCGCTGAACGAGGGTATTCAGAAGTAGGTATGAATGGGCTGGCAGATGGCCTTTCTCAACACTACGGACTCAGCACTAGTTATCTCGACTGGAGTTATTCGGTCTATGTAGCTTTATACTTTGCATTCACCAGTTATATTAAACAGTTTGTTAATGACAATATTTTGGATCAACATATCGATCGTAAAATGTATTGTCTTAGAGACGAATTCAACAAGCACAAGTATTGCATATATAGACTTAATAAGACCTTATATGATGAGTTAAAGAATCAATATCCTGAATTACCGCTAAAATTATCTGATACAGATGATAAAAACGAAAGAATGAAAGCACAACAGGGGCTGCTATCTAGCATAGATAGCGCAAAAGTAAACAATGAGGCTAAAATTCGAAGCTCTCAAATTAAAATATTGGCTGATTGGCTTCAATCTAATAATCCTGATGATTTTTTGAAGCAATCCGGCAATAAATACTCATGGAATAATGAAACTCTTTTAGAAAAAATAACTTTCGAACTACCGCAAAGAGATCGAAATTATTTACAAAAATGTTTAAAAGAAAACGGAGCCATCAGTACCATATTATTTCCGGATTTTGAGGGTGTTAAAAAGAACATAGAGTTTTCAGAAGATTATAATATTTTGAGAGATTGGGAAATCGCCTATCAAGAATCTCCTTTTCATTCAAAAGCTACAGCCCTAGAAGATTTATTGCAAATGGCAAATGGAAATCAAAAAGTTATAAATTCAAGTTTAAATACGGATCGTCTAGGGGAAGGAGAATTTTTTCCTTTTCAATAAGTTAGCTTTATGGTCATTAGGGTATACCCTAATAGTCATTTGCGTTTTTATACTATACTAGGAGCTGTAGACGTGCATTAGGACTGTCAAAAAGGAAAACGTTGAGACTTGCTAAAATTGGTTACGCTCGTTTGAGTTCCCAAGAGCGACGGTTAGATTGGCAGTGAAATTCTTCGATAAACTGTTATGGATAGGTTAATAAACATAAGTTGGAAATATACTTATGAATGACAGTGGTTTAATTGTGTAGGCAGCAATCATTATCATAATAGTATAGAGCTAATAAAAGGTAGGAAAGAATGGCGTATAATTCTCTCCTACCTTTTTTATTGTTGCTAGTCTGATTAACCATTGATTTGCTATCGGTCAAAATTTCTATTATGAGATTAGACAAATTAAATATATGCTTTTGGTAGATTGTAAAATTAATCCGAACGCTGTTCGGACAAAAAAGATCAGCTTCCTTTAAAATGGTGTTTACCACAAACCCATCTTTTAGGAGCTGATCTTTTGTCTAGTATAACCTATTTCGAACGAATTAAAATCGAAACCTTTTGTGAACTAGGGCTGTCCAATATCCAAATGGGCGTTCGGCTGAACCGATCACCGTCAACAATTTCTTATGAATTATCTCGATGTCAACCTTATCAGGCTGAATTAGCACAAACAGATGCCGAATACAAGCGATCACGATGTGGTCGGAAAACTAAGCTGAGCGATGAGTTAAAGCAAAAAATTCTCAACCATTTACGTCTAAGCTGGTCACCAGGAATGATTGCTCACGAATTTAAACTAGCTACTAAATCTATTTATAATTGGCTAAATCAGGGGAGAATTGGTTTCTCCTTGAATGATCTACCTGAACATGGCGTACGCCAACGGCGTAACGTTGACCAACGATCCAAATATAATCAATCTTTGGGGCGATCAATTGAACAGCGTCCCATGATGATTAATCAACGTAAGCGCATCGGCGATTTTGAACTAGATACAGTCGTTGGTCCTCGTGGGCATAGTAAGGCAGTTTTATTAACTTTAATCGATCGCAAATCACGGTTCCTTTGGGCATACCGGTTAAAAGATCGGACGACAGCGACTGTTAATGAAGCACTAACTAAGTTCCTAACCACTTTTAATGGTCCGGTGCACAGCTTTACTGTGGACCGTGGCACTGAGTTTAGTGGGCTAGTATCACTTGAATCACAATATGGTATTAAGACCTATTACTGCCATGCTTATACGCCAGCTGAACGTGGTAGTAATGAACGCTTTAATCGGAATTGACGTTATTTTTATCCTAAAGGGACTCGTTTTGAGCACATTAGTGCTCAAGATTTAACGACGACGTTACTCCAAATTAACCAGCGACCGCTTAAAATACTCGACTGGCAAACACCGTATCAGGTTATGCTGACAAATTTGTCCAAAAATTCGGATTAAATTTGCAATCTACCATGAAAAAGAACAGCATTTTTAAGGGATATTCGAGGTATGTAAAAAATACCTAAATCTCTTAATAAATGCTGTTCTTTTTACGTATATTCAGTTATGGATTGAAGTCAATATTTGAGACAGGTTTTAAGAGACATTCAGAACCGCGTTTACCTTCCACAGCTCAAATAAATCATTAATCGGATAGTTAAAAAACAGCCCAAAACCGCCAGTGTTGATCGCAAGGAAGTCCTGCTTTCAGAAATCAAAGATCTACTCGAAAATCAGCAAAAATGAAAACAGCCGGCTTGCTCAAATTGCTTTCAACCCCCCAATTAATTGCGATTACCGGATATTTGAACTAGTATTAACTTATAGATGATTTTCACAAATGGAAATACTTGAGAAGAGGTTTTGTTATGAGAACGTTTGCGATAAGGGCTCGTGATGGGGTCATGGAAATCAATTATTCAGAGAATTCCAATAAGCCCCCTTTTAGGAAGTTTATGATCACCTACAACCCCAAATTTTCAATTGGCGATAATCTTGAGAACATTAAGGCTGCCCTCACTGGGGTGCCAATTGATGCAGCAATTATTGAGAATTCATTGAACTATGAATTCTCTGACACGATCATCGGTATTAATCATCAAAAGATCGATATTGGCCTAGCAATTGCCAACATGATGAATATTCCGGTCGTTAACCTGCATAAGGTTCAAGATGTTGGTTTGGAAAAAGCAGTGGCAGAAAAACAGGAATATTTGAAGTGGCACCTTGATTATTATGGTGAGTACAGCGGCAAGCGTAACTATGGGCAAGAGGCCATGCTGACAATCGGTAACGGCTACTTTGGCCTGCGGGGTGCGTATGTCGAAGCGAACGCCAACCAGGATAATTACCCTGGGATGTACGTTGCTGGTGTCTACAATCAACTCACAACCAAAATTAACGGTCGGGATGTTGTCAACGAAGATCTAGTAAACCTCCCCAATGCTCAATACATCAGTTTTGGGGTGGATCATCAACAACCGTTTGAAATTAAAAAAGAAGATATTCAAGATATTTATCGAAGCCTAAATTTGCGAACCGGTGTTCTAACAACCACCTTGCATATTCAATTATCAACTGGCCACATTTTGCAAGTTCGGGCTACCAAAGTTGCCAATATGACAAATTGGCATCGTTATTCCATCAAGTATGAATTAAAACCAATCAACTTTTCTGGGAGCATTCAACTCTATTCAAAAATTGACGGGACTGTTATTAATGGCAATGTTGAGCGCTATCAGGATTTCGATCAACACCATATCGACGTCATTGGCATGGCTGCCCACGATAACCAGATTTCGTTAACCGGTCAAACCAAGACGTCCCACGTTAACTTTGTGATTAATTCTAAGCTTTCTAGCAAAGATATCGATACCACCAAGTTAATTTCAGCTGAAACTGAAGATAAACAAATCCAGCAAAAATTGGATATCCAAGTAGAACCTGAGAAACCGTATGTATTTGAAAAATGTGTCACAGTATTTACCAGCCAAACTCAGGATGCCAACTTGAAACAACCCGCCCAAAGGGAACTGAACGCTTCTTCGTTCAATGACACCCTCGCCGACAGTCAAAAGTTCTGGAGCAACGTTTGGCAGAATTCAGATATCCAAATTGATAATGATATGACCAGCCAAAAACTGACGCGGGTTAACATTTACCATATGCTTGTGACAAGTGCCGCCTTGGCTTCTGGTCAATTAGATTCCTCAGTCGGCGCTCGTGGCTTGCACGGTGAAGCTTATCGAGGCCACATCTTCTGGGATGTCACCTTTGATCTACCGTTTTATGCTATTCATTACCCAGCAATTGCTAAACAGTGCTTGTTATATCGCTATAATCGAATCGGTGAAGCGCGCAAATACGCCGCCTCGGAAGACAAGCAAGGGGCAATGTATCCTTGGCAGTCAGGGATGTATGGGGATGAACAATCTCAATTTGTTCACTTGAACCCGGTTAGTGGTGAATGGGGTCCGGATAACAGTCGCTTGCAACGTCACGTTTCACTGTCAGTTGCCTACGATGTCATTAATTATGTTCATTTAACAGGTGATACCGAATTCATGAAGAACTACGGATTAGAAATGTTATTGTCAATTTGCAAGTTCTGGGTCAGCATGGCAAGCTACGATAAAAAAGATGATCGTTACGATATTCATCACGTCATGGGACCAGATGAATTCCACGAAGAATATCCAAACTCTGATGATCACGGACTCACTAATAATGCTTATACCAATATCATGGTTTCTTGGTTATTTGATAAAGTCGCAGAGCTGATGAGTCATGAAGATCCTAAGATAATCAAATCTGCCA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MTELIKAYFWPLIGGIMGLLLAVLIITFGFFKTLFVLIFMAIGITAGYYIQKTGILTNVFK >CP035116|7878:63804|39836_40259_+|QAR39409.1|DBSCAN-SWA MIVVYTTPGCASCRKAKNWLDKYNITYEEQNIFQQPPTTEEIVKILKLTERGTEEIISRRSSGYGKLKEKLADLTLGELCNLINEDPHLLRRPIIVDENRLQVGYNEEDIRKFLPHEIRKEEFFDIMHEDKRLRTENIIE >CP035116|7878:63804|24683_26351_-|QAR39396.1|DBSCAN-SWA MTHKWWQNAVIYQIYPQSFQDSNNDGIGDLHGIIKRLPYLKKLGVDVLWLNPIYQSPLKDNGYDIADYEKILPEYGTMTDFDELLKEVHAHGLKLLMDLVVNHTSDQHRWFQESKQSKDNKYADYYMWRDPVDGHEPNNWHAAFGGSAWTYVPERGQYYLHLFAPGQPDLNWENPAVRESVWNIMRFWLDKGIDGFRMDVINLISKPEGLPDAPDPGTYPLTEGLVADGPKLNDYLHEMNDKVLSHYDVMTVGEMPSSKPEDAISYTGLDSHELNMVFQFQHVALEPNPDKLLGKWNDQPVKLPELKTALSRWQKALDGKGWNSLYWNNHDQPRAVSRFANDDPKYRVRAAKMLGTTLHMMQGTPFVFEGEELGMANVHYTSIDQYEDLESINAYRELVEEKKLVDGPTMLKYLANISRDNARTPMPWDAGKNAGFSDVKPWFALNPTYKEINAKAVLEDKDSVFYHYQKLIQLRHDSDLVKFGTYDEIDPDDAEVFAYRRHYQSKTLLVISNFTANTVTRDYDQGKADKLVISNYDDDQGTELRPYESKVYVFN >CP035116|7878:63804|23110_23317_+|QAR39393.1|DBSCAN-SWA MGDTVSSSKEVIPKKLHKKKHPPTGIGERHTKVNSFTDYYIMAGAIFKALGDKLGSKSKGTRLPVRLQ 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53 | Lactobacillus_phage(25.0%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
74749 : 135355
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP035116|74749:135355|DBSCAN-SWA 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MSDLTKGNSLKLIFFFTIPLLIGNLFQQLYNVSDTVVVGQTLGVKALAAVGATGSINFLIIGFAQGLTAGLAIITATRFGARDYKGVRQSFAASIIISILMTIVLTVLSLTFVDPILKLMQTPASIFANARIFISTIFAGIFASMAFNLLSNIIRALGDSRTPLIFLVIGTVVNVVLELLFILVFHMGVAGAGWATVISQVVASLLCVVYIIRSIPLLHITRDDFKVSANELWQHFSTGMPMGFQLSIIAIGTMVMQAALNSLGTDSVAASTAASKVDQLCSLPMSSFGVTMATFAAQNFGAGKYGRIMEGVKKTLWLSGSFAVFAGALVIFFGKPIVTLIIGTADEHVIQLSQTYFNIIGSTYLLLSVLFIIRNTLQGLGRRVLPTLAGVGELTMRVFAALVMVKAFGYAGAVSAEPLAWLGSCAILIPSWIRAVRQLRNLQRSVEVVEGEPATTALPKKPCQQIPIRQ >CP035116|74749:135355|108073_108283_-|QAR39465.1|DBSCAN-SWA MSQSNLEKQEAKLKALNQKIKDEKNKIEQRLGKQIISQANLDYANLSNDNIKSLSKKVSDFLKEKSVDH >CP035116|74749:135355|122370_122970_+|QAR39472.1|DBSCAN-SWA MVVKTLGKSILAVIVITIICGIYTLIVSAIGQTFFTSQANGSLVRSDQTVRGSALIAQLFTSKKYLWGRQMDITVGDITGQKNNKNIMYSVASQMSPNDKSYQKEIIDKEKTIKRLNPNATYRHVPIDLVTNSGSGLDPEISPTAAKYQVKRIAKARHVSVQKIQRVIDQNTKTRTLGILGEPRVNVLETNLALDKLSK >CP035116|74749:135355|105754_105835_+|QAR39497.1|DBSCAN-SWA MVNTILKEADLFCPNSVRINFTIYHI |
50 | unidentified_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035113_1 | 347778-348275 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP035113_1
|
13 spacers
spacers of CP035113_1
>1.1|347796|18|CP035113|CRT GCCGCTAAGAAACATAAG >1.2|347832|30|CP035113|CRT CACAAGAAGAAAGCGGCCAAGAAACATAAG >1.3|347880|18|CP035113|CRT GCGGCCAAGAAACATAAG >1.4|347916|18|CP035113|CRT TCTTCTAAGAAGCATGGC >1.5|347952|18|CP035113|CRT TCTTCGAAGAAGCACGGC >1.6|347988|18|CP035113|CRT TCTTCGAAGAAGCACGGC >1.7|348024|18|CP035113|CRT TCTTCCAAGAAACACGGC >1.8|348060|18|CP035113|CRT TCTTCTAAGAAGCACGGC >1.9|348096|18|CP035113|CRT TCTTCCAAGAAACATGGC >1.10|348132|18|CP035113|CRT TCTTCCAAGAAACATGGC >1.11|348168|18|CP035113|CRT TCTTCCAAGAAGCACGGC >1.12|348204|18|CP035113|CRT TCTTCCAAGAAGCATGGT >1.13|348240|18|CP035113|CRT TCATCTAAGAAGCACGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035113_1
The CRISPR arrays of CP035113_1 >merge|CP035113|1|347778-348275|CRT AAGGCGCATAAGAAGAAGGCCGCTAAGAAACATAAGAAGTCGCACAAGAAGTCACACAAGAAGAAAGCGGCCAAGAAACATAAGAAGTCGCACAAGAAGAAAGCGGCCAAGAAACATAAGAAGCCGCACAAGAAGAAGTCTTCTAAGAAGCATGGCAAGTCGCACAAGAAAAAATCTTCGAAGAAGCACGGCAAGTCCAATAAGAAGAAGTCTTCGAAGAAGCACGGCAAGTCCAATAAGAAAAAGTCTTCCAAGAAACACGGCAAGTCGCACAAGAAAAAGTCTTCTAAGAAGCACGGCAAGTCCAATAAGAAAAAGTCTTCCAAGAAACATGGCAAGTCCAGTAAGAAGAAGTCTTCCAAGAAACATGGCAAGTCGCACAAGAAGAAATCTTCCAAGAAGCACGGCAAGTCCAATAAGAAGAAATCTTCCAAGAAGCATGGTAAATCCAGTAAGAAGAAATCATCTAAGAAGCACGGCAAGTCTAACAAGAAAAAA >CP035113|1|1|347778-348275|CRT AAGGCGCATAAGAAGAAG GCCGCTAAGAAACATAAG AAGTCGCACAAGAAGTCA CACAAGAAGAAAGCGGCCAAGAAACATAAG AAGTCGCACAAGAAGAAA GCGGCCAAGAAACATAAG AAGCCGCACAAGAAGAAG TCTTCTAAGAAGCATGGC AAGTCGCACAAGAAAAAA TCTTCGAAGAAGCACGGC AAGTCCAATAAGAAGAAG TCTTCGAAGAAGCACGGC AAGTCCAATAAGAAAAAG TCTTCCAAGAAACACGGC AAGTCGCACAAGAAAAAG TCTTCTAAGAAGCACGGC AAGTCCAATAAGAAAAAG TCTTCCAAGAAACATGGC AAGTCCAGTAAGAAGAAG TCTTCCAAGAAACATGGC AAGTCGCACAAGAAGAAA TCTTCCAAGAAGCACGGC AAGTCCAATAAGAAGAAA TCTTCCAAGAAGCATGGT AAATCCAGTAAGAAGAAA TCATCTAAGAAGCACGGC AAGTCTAACAAGAAAAAA
>CP035113.1|QAR36727.1|343813_347497_+|LPXTG-cell-wall-anchor-domain-containing-protein MYTENTGKHHRNGLPVWLLPLLVVISFWGVSQNIMVVDASSSVTVLPGNGGTLPLVNQLVIKQNDTALQGITNNAGDRSSLTPKNGAQRVLIHKVKDSDTITSTYGTVGTFHGQEVTAKVTISHIKVHDDSHKAPSGMKQTDGAFQIGPGFSSDTTMSNVAQFNVSYEFYYADTHAAVNIQNAFITLSSLDGPVAGTSTGFEYTAYLGAGKIYTVENSIVKQIANSLGGGQLVMAGQTARDASWPYTSSTAATFGVSGTELEFIYGTTRVNSGNSWLQPVYNVSTITLGTPAIATPTLSATQSATDKQNRTLTYDLQQKVNVLDQDLMTKYKDWSENITIPANAKYAKGEVVNDAGQALPSTAYQVSYDEKTHQVKWHLTDSGLKSLPFKGETYHFKAQVQFSDDVDDQTKVTATGQTAIDKQTKTSNTVTNTIDNQATITVHHYMTDSTDKVAPDETVKVGYGKAYDVTKQVKTITGYKRNATLDEHTRGTASKTTKEAVMYYDPLPYNIHVNYLLTDGQKLDELDVTGLYGDTYTTEATDFEDLYTVDTDRLPTNAQGTVTEKPTTVNYYYQPTTGQWVDVGNQSSVLVRQDTKHNVRSVSQIYANDSGFTVKYNQDAAQVAIAASDTNGTQDNSLVFDYNSKYTFELSKNETVTFKVDDQGQVTATRVLGAEQTVTTFDKSGQLKTVTTVTNANGTKSQQTNTVDGLKSMVTGEQYDLGLLNGLKVTAQKEINPSQAATTESKTTTDTSQSGSNQSTSTTATDQTGTNESTAGSSTNATNASSSVDASSANSQGDTEATSQSGTSASADSKTDSSVASSTSQTTDGETTNTGDTTTGTTTGSGLGFKSPFTEDQNTSSALGSAQTSSSLNSDTSAAVQALIAEPNSTPVVLGEDASFEEGVPVNDPVFSNDEGVSPNNNPSSAATPLAQATNTRARLTQNGKLLYEGTLKADQGEQNLYVSPNTTVEVDGGADGDGFYLDTYDGDKGMAYTLGSGYAWAAENNDVTAAPASSATTSSESAASESNTNSSDSSRTASSAVDHSTSSASTSDASQSSHSTSSGESSHPESSSGSSTTSDSADADKQAAARSSQTQSNSVNGSSQAVSSSTVTSQSSVPTKANTKQASSTPTTKANRATVAAATSSTAPRKSRATTASASVPSVTSASAVAASRDKQQSAFKKQHPILNQILPKTNSAVATWLVWLGVGLLLLAVGITMVIKKRGRD >CP035113.1|QAR36726.1|342504_343227_+|aquaporin-family-protein MMKDPLALQLLGEFLGTFILILLGDGVVAGVTLNKSKAQNAGWVAITLGWGFAVTMGVYASSFMSPAHLNPAVSLGMAVAGKFPWAYVIPYSAVQIAGGVIGGLVVWLHYYPHWQATKDAGAILGIFATGPGIRRYFWNFISEVIGTFVLVFGLLAFTKGQFTAGLNPIVVGILIIAIGLSLGGTTGYAINPARDLGPRIAHAVLPIANKGTSDWAYSWVPIAGPLVGGALGALLFNVLP >CP035113.1|QAR36725.1|340660_342490_+|type-1-glycerol-3-phosphate-oxidase MAFSATTRQQNIERLQNETLDLLVIGGGITGAGVAIQSTAMNMKTGLIDMQDFAEGTSSRSTKLVHGGIRYLKTFDVGVVADTVKERAVVQGIAPHIPKPDSMLLPIYDETGATFDLFSVKVAMDLYDKLAEVKDPKFTNYTLSREEVLQREPQLNPKHLVGGGVYLDFRNNDARLVIENIKKAHENGGIMASHVKATGLLHDDDGRINGITAEDLLTGASFEIHARIVINTTGPWSDTIRKMDHTEKYQSQMRPTKGVHLVVDAEKLPVPQPTYFDSGDQDGRMIFVVPRENKTYFGTTDTDYHGDLKHPTVTQEDVDYLLEIVNRRFPTAKITLDDIEASWAGLRPLIAANGSSDYNGGNSGKISDKSFKEVIKVVDQFESQEASREDVESVLNDLETSLAEDKLSPSAVSRGSSLTSSPDGLLTLAGGKITDYRKMAAGAMALIAKILADKYDAHFNEINSKNLPVSGGDIDPHNVDATIAFYAKQGTDNGLTNDEALRIANMYGSNAARVFSLIGKVEPTHGLSLAETISLRYALDEEMTLTPVDYLLRRTNHLLFMRDTLDGLKDGVIATMADYLGWDAATVKAQTELLNQTIAESDLTALKQG >CP035113.1|QAR36724.1|339128_340646_+|glycerol-kinase MTDKYIMAIDEGTTSTRAIIFDHAGHKVADSQREFPQYFPQPGWVEHNANEIWNAVLSTIANAFIESGIKPAQISGIGITNQRETTIVWDKQTGLPIYNAIVWQSRQTAPIAEKLVKDGYGDLIHQHTGLVTDAYFSATKIRWILDHVKGAQERAEKGELLFGTIDTWLLWKLTGGATHVTDYSNASRTMLFNIHDLKWDDQILQLLNIPAAMLPEVRTNSEVYGKTKDYHFFGSEVPISGMAGDQQAALFGQLAFEPGTVKNTYGTGAFIVMNTGEKPQLSDNNLLTTIGYGINGKVYYALEGSIFVAGSAIQWLRDGIRLVESAPDSERAARESHNENEVYVVPAFTGLGAPYWDSEARGSVFGLTRGTTREDFIKATLQALAYQTRDVVETMKKDSGIEIPVLKVDGGAARNDWLMQFQADILDTQIMRAANLETTALGAAFLAGLSVGYWQDLEELKASYKPGTSFDPEMGPAERTNLYEGWQAAVKATQVFKHTPYHAGK >CP035113.1|QAR36723.1|337331_338663_+|NAD(P)/FAD-dependent-oxidoreductase MAEQYDVVVIGGGPAGNAMASGLKAQGKTVLIVEADLWGGTCPNRGCDPKKILLSAVEARQAAQHLQGQGLIGASKIDWPALMAHKRGYTDGINDGTLNGLKGQDIATLHGQAHFQSDNQLAVGDRVVSATDYVIATGQRPAILPITGHEYFKTSTDFLDLDQMPKRVTFVGGGYVGFELATIANAAGADVHVIHHNDRPLKAFDADLVKDLMAAMTADGITFDLNTDVQAITKTATGLQLTADNFELTTDLVISSAGRIPNADQLGLANVGVTFDRHGIQVNDHLQTANPHIYAIGDVSDTPVPKLTPVAGFEARYLVGELTHPGAAIKYPVVPTQVFAAPKLAQVGISAAAATEHPDEYRVNTLDMTKWFTYYRFGAQQAQAKIVVAKASGQVVGATLLSDVADEMINYFTLLIEKHVTLPDLQRLVLAYPTPASDLQYLY >CP035113.1|QAR36722.1|336282_337254_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MTTAIEFQHVQKDFNGQTVIPDLNLTIDQGELFVLVGTSGSGKTTSLKMINCLEPLTAGKILVNGTDTTTIPVRSLRWQMGYVLQQIALFPTMTVAQNIAVIPEMKGTAKKEINQTIDELLAEVGLDPKEYRDRMPSELSGGEQQRIGILRAIAAQPDIVLMDEPFSALDPISRQQLQDLVLRLHARYHNTIVFVTHDMNEALKLGDRIGVMQHGQLIQVDTPAALAQHPVNDFVRNFFGASRAKNVYDVYVGRVGLIQGYLTEKPSVASGRIQSLDVQATLRTAFTALTDHDYVAVTEENRVVGYLDRQRIVAYLSQHEEVS >CP035113.1|QAR36721.1|334755_336282_+|ABC-transporter-permease/substrate-binding-protein MQTLIQTFIDRRGDLLTALWQHLGISLASLVIAMVIAIPLAIWVVRRPRWAEGLLQLTSVLQTIPSLALLGLLIPLVGIGTVPAVIALVIYALLPIFQNTYLGISEIDASIEEAADAFGMSRMRKLFKVELPIALPQIIAGIRTALVLIIGTATLAALIGAGGLGTFIMLGIDRNDTSLLLIGAISSALLAILLSALVRWFQTAKPRHALIVFVGILALLGGGGAYSVYANRVETITIAGKLGSEPEILINMYKQLIEAEDEHVHVTLKPNFGKTTFLFSALKNNQVDIYPEFTGSVLETLVKGNNPAGQTANQTYQLAKQRLAKQEQMTYLKPMQYNNTYALAVTKKFQQEHHLKTISDLTQVESILKPGMTLEFIDRNDGLKGIKKTYGLDVTAKSMEPALRYEAISKGKINLVDAYATDSELRQYHLALLKDNKHFFPTYQGAPLMKTSFANKHPKVVKALNKLAGKISETDMQEMNYEVNVKKQSASTVAHRYLVKHGLLKEGR >CP035113.1|QAR36720.1|334071_334518_-|ribonuclease-H MATIHLYLASTNHQLTNITATTPAAWVVILRYADHQKTLNDGGYGYTETSLALSALTTALATLKRHDLPVHIHTTTEQVAAVISEQRYLSWRQNNWDVPEADQPDLPQWQTLIPIIEKFPNLTITYHPVDDPAMTTATTTLTAVMTKL >CP035113.1|QAR36719.1|332019_333900_+|hypothetical-protein MVIVGGLVSILTVGISYCCYLVKHAGVTNLLTIILSLGCVMATLGLTIMMPGLPEKIGVIGVVILAATMNYLMFWHEKRTAREDDTQFDWIDSGNQHMGFQHIIQNHGEAFAAQGVSQTAIPKLVAKAVNSYHRSWGHFDKWQPYHRVLLTIHYRYRKHLLAVTLSRDQYIISAYPAPLLDKYPRVKKIRIMLEYGCYPIWLYDEKGNLISNDLPQVLRKDATLNKKLLVLQKQYDSLFTNNQHDFSYNGFATAADEQQFLRAFMVIHKDLKRRLGGKYAVLNKITGKVDKVFPTATTVASSQAIPSEAELNSAIVNKPKPVVDKKAKTHVRTYPGLKADLLKVYQNFDIENLGPTYDALVDITKLYRRRFTKYTGQVTLKTVQQSTAKDYILGHTDKNLSEIVANNKDMVAKNIGNAAMCRQVMQLIDIMSRYTLDELCFKCNLARLQLSTTNAHKRLLKTCPDCGAVFVNNKLTNITITGLPANKLQVKMYLRKTGVVSMAAATESIDTTMPKRKIRLFMEWGSSFIWVYNEDNELIKNGLPDELYPDSGLVAKVNVLNRQYSELFTNNGYEFRYNGFKTHEDENAFERDFNAIYEEIAERTRGKYRVINEYYFTSNTEDVRDL >CP035113.1|QAR36718.1|330680_331580_+|oxidoreductase MSQPRVILITGASSGIGKATALKLQAQGNIVYGAARRIEKMTDLAAAGVHVLKVDVTDEATLIAAVKTIQVEQGRIDVLINNAGYGSYGSLEDVPVAEGEYQFKVNVFGVMRLTQLVLPLMRAQHRGRIINVSSIGGKIYQPLSAWYMGTKHAIEGMSDSLRMEVAPFGIDVVIVEPGGIKTEWAGIAEKKLLAVSGEMAYHEQAVKVGAMLSLFDQFASNPGVIAKLMVHAVNDVKPKTRYHAGMGAGVSLTARQWLSDRQFDRIMNSAVNGAAKLSKVTRRKDRRTGSRHYRHGKIG >CP035113.1|QAR39168.1|349093_349324_+|hypothetical-protein MVEYSRRKVIPGGEITESQKITEQQLLTSLRAAVKEAMSRGYTYEVPIRIDNWELIFSSPRRVGQLPVLIHARYIP >CP035113.1|QAR39169.1|349354_349870_+|hypothetical-protein MKVEKLENNVSKEEMEIDYYVPVSISFPENDLEEEGLYYYRFINKEYSFIEFKINSVSKKIVNVTVTSINDIQNGEFIFNGSISKANPIIDIYEFEYEAVITNNNSFEFYMGEKKIFFILDNEEISSMIMISNHFFALLNSENDIVGAQIANFNDEDWNALVGNLKEAGKI >CP035113.1|QAR36728.1|349987_350266_+|hypothetical-protein MLVFIVIGLITAVITIGLGYWSYILGKRNKSNLVGSVIPVGYFIVRLVFVLVLGEGVRELITSLVGNLVITVIYVLLFVWGRQRFNRQKQTK >CP035113.1|QAR36729.1|350933_351200_+|hypothetical-protein MKHVASIRKITGKKLLTKNEYKKEAISVVKHGKYVPKLHAFIKKATKAKKKRDGYNYEFVGIDIKTARITTLHVKTTRVLRKKGVILE >CP035113.1|QAR36730.1|351228_351621_+|hypothetical-protein MIRVLQVDPPDDPEYRDPFVLLSDGNMQIWVFADEFNNKIGDKYQYPYMTLFPLLEGDVEMQKGKVFAVKALSDIQYSYDLYGQINENWKLKVGEFVIDSGEENYEGFKRGDFVHFRCDRVDLIDFNKFI >CP035113.1|QAR36731.1|351836_352157_+|hypothetical-protein MFTKYNDLDLLELFWSESESLTGEIDDGEVLYRREISDFELTLFIYTYEMKCNVFLSYKDEDILSIELDNISELKKNEDQLYFYSNESVKLSVIFGKIFSINFQDK >CP035113.1|QAR36732.1|353303_353567_+|hypothetical-protein MATIIIIGVVIIGITLGLGYWSYLLGKKNQSNFVGTIIPVAYFAVRAILAVMTQTATHGLVSSLVGSLLFSLIYYGLFVWGKHRANK >CP035113.1|QAR36733.1|353668_353947_+|hypothetical-protein MLVFIVIGLITAVITIGLGYWSYILGKRNKSNIVGSVIPVGYFIVRLVFVLVLGEGVRELITSLVGNLVITVIYVLLFVWGRQRFNKQKQTK >CP035113.1|QAR39170.1|354035_354134_+|hypothetical-protein MTDLVGYNDIYTMITGKDAATGKKRSRLVGAA >CP035113.1|QAR36734.1|354140_354320_+|hypothetical-protein MNFVPVSKVAKLAKAVKILATSKKAEILAKRKPAPKAKHQQAKPKKTSHGTKHKTTKKQ |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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CP035113_2 | 1084172-1088205 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP035113_2
|
45 spacers
spacers of CP035113_2
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CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP035113_2
The CRISPR arrays of CP035113_2 >merge|CP035113|2|1084172-1088205|CRT 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MQSHRHQSLEEINQSVAVPDVHQTAFWRKFLAYSGPGALVAVGYMDPGNWLTSLAGGGQFQYRLLAVLALAIIVAMFMQGLAIRLGVVARQDLAQAIASKLPRPVRYAVWILNEVAMMATDMTGVIGTAIALKMLFGLPLLAGILLTIADVLVVLLFLRFGIRRVEVIVLVAILTVGIIFGIEVGRAHVQFGNVLLGLVPTPLIVKNHTALVLSLGILGATIMPHNLYLHSSLAQSRRYDYHNPAQVTEALRFANWDSTVHLIAAFLINALLLVLGGTLFFGHTNALASLQAVFDGLKSTTVVGALASPVMSWLFALALLITGLISSITSTLAGQIVMEGYLHIRLPLWQRRLLTRAVTLIPILIIGMLVGFSDAAFENLIIYAQVALSIALPFTLLPLVALTNDASLMKAHVNRPAVTWVGYGLAGIITVLNIYLVYSLF >CP035113.1|QAR37371.1|1068045_1068243_+|hypothetical-protein MGAGCTGEFLPSIATSDNVAILSDRRYIAGYDYLSLKIGKLVSTIIELEYQKAINLRICFAVDGL >CP035113.1|QAR37370.1|1066610_1067447_-|metallophosphoesterase MVKIAVLSDVHGNATALEAVLADAQKQHVDEYWTVGDMTVRGPESERCLTLLDRVHPTAYVLGNHEENYQKVMAANPNTFTKPKQIMATVLTAFDRRQLSSTHFERLLNLPMTVIKHVGPLTIRLQHVLPTVASGHALAPTASQANFDQAAEGDVDIVIYAHTHQPIMRYATTGQLILNAGTVGLPTAINPHLRQPRANYLLLTIDETGLQHADYRAVDFDWQRAITIAQNTHLPYFEFYEQTLRTNTYQYAPSAVAAYNTQHDMAREARKILLENRH >CP035113.1|QAR37379.1|1088953_1090588_+|glycosyl-transferase-family-1 MQKSVIQKLKQALIDNGNLESHENDMVVLAVSISDRRHRANVKFYRDKAFNTLWTTVANDLNTAPKNSWVRIDLVQAMQKLRRSIFETKLAKVPKMNYWRYGVSFDADFKHALLEMEINGQNFFKPDKDFVVGEPPAKSWADYHQIENYLRERESNPTIDISGAQNVWIFTTAAIFSDGQKIRPLAVDGFLTAGIRTITNKRKEIKKVIEDGEAYLINQLDKDGKFIYGYFPARQRVLSSYNILRHFSTIYALLETSQFSQHSESYRKAKLAIQWGIDASLVVIDNAAYVNDHGELKLGAQAMLILAICKYQEVTHDQIFLPTLKQLFKGVRSFWNSSTGFVHVLDVNLAPKGKFRTIYYDGEIVFALTRMYELDPSIQIEATISEMLDYMVKLDYGQYHDHWLAYAVNGALDLFPEARAYMALGAKNIFTHLNYIQRRKHASPTLLELINASQKMVYKVKKSGNDDLLAPYDVLKLSQLADQRASYEIQTGAWYAEIAMYLYHPQKFIGGFYARDDSFRTRIDDCEHFLSGLINYYNYTYRQA >CP035113.1|QAR37380.1|1090614_1092123_+|glycosyltransferase MFYFINEYILGKNSSVEHAAINRVKLFNHYKAPARIVTKMYDRLLHQTMGTFQLANQQVLNMFDYFQQTTDVPTKVLHTDDMHLPVEYAVEVGANFSKIFNGDEHVSNVGFIPGTIGRVFYQEFFDNQGNLSSTDLWDWRGFKSSTQYFGQNGKLVLERFYNLQGETVIEQYYVPDTNGNPLASRLILKNYRDQAERFFQDANHLFRFFLAELSHLDKQTTTFISDRPGTSVKPLLELQDDSHKYVTVPIYQAKDINDPIHSPLDGFLTPAFDNLQHFDGFITATESQAQHLRTRFPKAKVTVLPTVTTSPLAQSKLQPITARPKQLLYVGRLAPDRQLDQLIRTIALVKQQVKEIQCDFYGYGDPEYLKTLNKLVEELKLTNNVHLLDYHPDLETRYDDYQLLLNTDIVDGGPMSMPEAMSHGIPVISYRFNYGPKDWIDDGHDGFIVDPGNQLALRDRVIELMTDTKKLTAFSEAAFKKLHTSQTDLKVWHRWQQLLGIK >CP035113.1|QAR37381.1|1092133_1093660_+|accessory-Sec-system-glycosyltransferase-Asp1 MYYFLNDNMQFSKSGIEQAEINRLTLFKKHHVAAKIVTRVFAMNLHDVLEGANIADADFVNLFDFFCGSQSVKRQRFDLADFEVPADAIKTRKDNQIQVMERGKLIMIIYLRAGTEAVSNVQYFDVNGRTLKMSWWDTRGFKCLEQLFDWDGKIAQEAYFGPDGLIHVEKLHLLNHAGQERITWRVLNYNEQSHTFNGMNELTRYFYDELNQLNDEQNVFICDRTVECAWGLFNMTTPAKKVLHLHNNHVSDAKDIMHSTLNNNYANALNNWAAWDAVISATPEQTKDVEARFGKDIPAFTIPVGYVDNATLKAAPVKFDQRQKDLVVQVARLAPEKQQNHSIEAFVEVHKQFPDAKLELWGYANGDIEKQLHAQVAAAHLEDVVLFKGYTTDVNAVYNRAQLGLLPSRAEGFSLMLLEAQAHGLPMVANDVKYGPSDIIQDHKSGILTTDGDVQQLTKTILELLKNQGQLAQYSAQAYENAKRYSEEAVFKQWQALLDYFKPAKVTA >CP035113.1|QAR37382.1|1093689_1093887_+|hypothetical-protein MLMIMTIYGTVKMFTRMIVYCGIGGLVLIVRHHNRKKRRNEMDEGTKRIMRNTPKDENGKYPWEK >CP035113.1|QAR37383.1|1093982_1094579_-|SAM-dependent-methyltransferase MHEFNKGVTLIQLSSALAYSHALMNQVVNPGDHVIDATVGNGHDTVYLANLVGTTGHVDGFDIQSAAIEATTTALDKAALTHQVTLWQTGHEHIADKIAADQPIKCAVFNLGYLPGGDKQIITKPTTTLTAIKAIQERLVTNGLIILLVYAGHPGGATEAQAVLDYVTNLDQHQFQVLQYQFINQVHVPPYLLAIQKR >CP035113.1|QAR37384.1|1094578_1095229_-|phosphatase-PAP2-family-protein MKQRSWQRSDSLILLIFIGWLGWTAAVWQRAPWLTHFDTTVANFWHHSPQWFQHAMVTYTQLGNPHTITIITLIIGLALWLGHNPRGAVFFWVTTWLIAGYGNYLIKQVIMRPRPTAWRLVQIGGYSYPSGHSTTTTVLIGSLLVLAFDYWHRNALTGWLTALGITAILLMMISRVIVGVHYPSDTIGGLLLGSVLLYISARFSMRYRHGPLRLRP >CP035113.1|QAR37385.1|1095724_1098151_+|leucine--tRNA-ligase MAYNHKVIERKWQHYWKENKTFKTLDTTDKKKYYALDMFPYPSGQGLHVGHPEGYTATDIMSRFKRMQGYNVLHPMGWDAFGLPAEQYALKTGHNPKDFTAKNIKNFKRQIRSLGFSYDWDREVNTTDPSYYKWTQWIFEQLYKKGLAYESETLVNWAPDMMGGTVVSNEEVVDGKTERGGYDVYRVPMKQWSLKITAYADRLIDDLDDIDWPENIKEQQRNWIGRSVGASIRFKVAGQPDDTEIEVFSTRPDTLFGASYMVLAPEHDLVEQLTTPEQADAIKAYKAKIASKSDLERTDLNKDKTGVFTGSYGINPVNGEKLPIWIADYVLASYGTGAIMAVPAHDDRDFEFAQKFDLPIKPVIAGDNDYDQQAYTGDGEHINSGFVDGLAKQPAIDKMIDWLGEHHAGEKKVNYRLRDWIFSRQRYWGEPIPVIHWEDGETTLVPEDELPLRLPATKNLEPSGTGESPLANIDDWVNVVDENGRKGKRETNTMPQWAGSSWYFLRYVDPHNREALADYDKLKYWSPVDLYVGGAEHAVLHLLYARFWHKFLYDLGVVPTKEPFQKLVNQGMILGDNHEKMSKSRGNVVNPDDIVDQYGADTLRLYEMFMGPLEASIPWSTDGLHGANKWIERVWRLMIDENNRVRDRITTINDGKLTKIYNETVKKVTEDYEAMRFNIAISQMMVFVNEAYKVDDLPIIYIEGFVKLLSPIAPHLSEELWSLLGHDDTITYATWPTYDESKLVEDTVQIVLQVNGKVRSHAEVAKDMGKDELEKLALADEKIQEFTAGKTVRKVIAIPGKLVNVVAN >CP035113.1|QAR37386.1|1098674_1100345_+|polysaccharide-biosynthesis-protein MSEESKANQPQNAHVNSEAEAHQKMVRGSAWMTAGSLFSRVLGAIYIIPWVIWMGADYTQGNALYAKGYNIYSFFLLIAIGGIPSAISKQLSEYNAMNEYAVGQRLFKRGLLLTSAFGIIGAIILWFGAGLISTAFGGYDANLIPVLHALAIALVILPSMSLTRGFFQGYQQMAPSAISQFVEQVFRVIYMLGATYFIMRVAHGDWVNAVTQSTFAAFVGAAASFLLLGWYYFRKRPELNALAAQSENKLVIPVWQLFRDIIIQAIPFIVIDTATTVFNLLDQATFQPMMRLVYHLGTKQIDTLYAYFAFNANKLVMIIVSLASAIAVTVVPILSESLASHNMRNIRKQLEDSIILFLFIMIPGALGMAAVAQPLNTLFYSYDQIGTLILQISAFTAIALGFFTVISALMQGLSRNRDIIRYYLIGLLVKIVIQLPCIYFLSTAGPLVATAIGMMVASLMAMYDLEVNFGIRYVKLLPKINRILVYSILTYVTARLVVYGLNFVLNEHSKTQSFLIVALAVIAGGAVYVYLALRSRMADLMIGTKAAGLRRKLRIK >CP035113.1|QAR37387.1|1100352_1101093_+|16S-rRNA-pseudouridine(516)-synthase MRVDKFLHAMRIGTRTQVRRLIKDGHITANGEPVISGKQQINPGSDTVFLDDVQVRYQQYFYYVMNKPVGVITATTDSAAKTVMDLFNTTDFRDDLFPVGRLDKDTEGILVITNDGTLSHDLLSPNHHVTKVYEAEVTGEITAAQLANFNDGITLKDGTELQPAQAEIVQFHEIENFTTIRIMIHEGKYHQVKRMVGTLGERVVGLRRIKFGSLTLPVGLLAGNYRALTDDELTALKADANQPVGE >CP035113.1|QAR37388.1|1101229_1102066_-|NAD(P)H-hydrate-dehydratase MQPITTEIVSRTIIKRPADSHKGNYGRIMLIGGNQNFGGAIIMAATAATYSGAGLVTVATDPSNFTSLHARLPEAMVIDYHQTDTLLNLLAGMDVIVIGPGLGTDTVADQLLTAVLAATHVPQRLVIDGSALTLLAQQARPLPATDIVVTPHQMEWQRLSGIAIKDQTPTANHDAQQRLGVTAVVKAHRTTVYTDERVWFNPGGTPAMATGGMGDTLAGMIGGFVSQFHNFTDAVLSAVYLHSAIADDLAATRYVVLPHQISTRIPTYMHRFSQIERP |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035113_1 | 1.1|347796|18|CP035113|CRT | 347796-347813 | 18 | CP035113.1 | 2856471-2856488 | 2 | 0.889 |
CP035113_1 | 1.12|348204|18|CP035113|CRT | 348204-348221 | 18 | CP035113.1 | 1236855-1236872 | 2 | 0.889 |
1. spacer 1.1|347796|18|CP035113|CRT matches to position: 2856471-2856488, mismatch: 2, identity: 0.889
gccgctaagaaacataag CRISPR spacer gccgctaaggaacatcag Protospacer *********.***** **
2. spacer 1.12|348204|18|CP035113|CRT matches to position: 1236855-1236872, mismatch: 2, identity: 0.889
tcttccaagaagcatggt CRISPR spacer tcttccaagaacaatggt Protospacer *********** *****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | NZ_CP023562 | Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence | 21244-21265 | 1 | 0.955 |
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15865-15886 | 1 | 0.955 |
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9802-9823 | 1 | 0.955 |
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9946-9967 | 1 | 0.955 |
CP035113_2 | 2.11|1085140|40|CP035113|CRT | 1085140-1085179 | 40 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 1753-1792 | 2 | 0.95 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 152041-152068 | 2 | 0.929 |
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | NZ_CP023562 | Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence | 21082-21103 | 2 | 0.909 |
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15469-15490 | 2 | 0.909 |
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15577-15598 | 2 | 0.909 |
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15703-15724 | 2 | 0.909 |
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | NZ_LT009691 | Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2 | 9640-9661 | 2 | 0.909 |
CP035113_2 | 2.28|1086622|22|CP035113|CRT | 1086622-1086643 | 22 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 2077-2098 | 2 | 0.909 |
CP035113_2 | 2.31|1086820|28|CP035113|CRT | 1086820-1086847 | 28 | NZ_CP035292 | Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence | 19970-19997 | 2 | 0.929 |
CP035113_2 | 2.10|1085080|34|CP035113|CRT | 1085080-1085113 | 34 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15595-15628 | 3 | 0.912 |
CP035113_2 | 2.10|1085080|34|CP035113|CRT | 1085080-1085113 | 34 | NZ_CP047808 | Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence | 15721-15754 | 3 | 0.912 |
CP035113_2 | 2.11|1085140|40|CP035113|CRT | 1085140-1085179 | 40 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 1507-1546 | 3 | 0.925 |
CP035113_2 | 2.11|1085140|40|CP035113|CRT | 1085140-1085179 | 40 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 3379-3418 | 3 | 0.925 |
CP035113_2 | 2.11|1085140|40|CP035113|CRT | 1085140-1085179 | 40 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 3691-3730 | 3 | 0.925 |
CP035113_2 | 2.11|1085140|40|CP035113|CRT | 1085140-1085179 | 40 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 151897-151936 | 3 | 0.925 |
CP035113_2 | 2.11|1085140|40|CP035113|CRT | 1085140-1085179 | 40 | CP052430 | Klebsiella pneumoniae strain C16KP0129 plasmid pC16KP0129-3, complete sequence | 1075-1114 | 3 | 0.925 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 154096-154123 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 154132-154159 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 1183-1210 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 1561-1588 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 2131-2158 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 1255-1282 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 1489-1516 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 3097-3124 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 3361-3388 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.31|1086820|28|CP035113|CRT | 1086820-1086847 | 28 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 152023-152050 | 3 | 0.893 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 157426-157453 | 4 | 0.857 |
CP035113_2 | 2.12|1085206|28|CP035113|CRT | 1085206-1085233 | 28 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 151879-151906 | 4 | 0.857 |
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CP035113_2 | 2.11|1085140|40|CP035113|CRT | 1085140-1085179 | 40 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 155746-155785 | 8 | 0.8 |
CP035113_2 | 2.26|1086472|46|CP035113|CRT | 1086472-1086517 | 46 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 155710-155755 | 8 | 0.826 |
CP035113_2 | 2.8|1084936|46|CP035113|CRT | 1084936-1084981 | 46 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 156358-156403 | 9 | 0.804 |
CP035113_2 | 2.8|1084936|46|CP035113|CRT | 1084936-1084981 | 46 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 154258-154303 | 10 | 0.783 |
CP035113_2 | 2.8|1084936|46|CP035113|CRT | 1084936-1084981 | 46 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 2767-2812 | 10 | 0.783 |
CP035113_2 | 2.26|1086472|46|CP035113|CRT | 1086472-1086517 | 46 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 3223-3268 | 10 | 0.783 |
CP035113_2 | 2.16|1085476|76|CP035113|CRT | 1085476-1085551 | 76 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 3013-3088 | 21 | 0.724 |
CP035113_2 | 2.18|1085668|76|CP035113|CRT | 1085668-1085743 | 76 | LR134125 | Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5 | 156292-156367 | 21 | 0.724 |
CP035113_2 | 2.18|1085668|76|CP035113|CRT | 1085668-1085743 | 76 | CP052500 | Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed | 3013-3088 | 24 | 0.684 |
1. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer cgattcggactcagacagtgat Protospacer ****** ***************
2. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer cgattcggactcagacagtgat Protospacer ****** ***************
3. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer cgattcggactcagacagtgat Protospacer ****** ***************
4. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 1, identity: 0.955
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer cgattcggactcagacagtgat Protospacer ****** ***************
5. spacer 2.11|1085140|40|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 2, identity: 0.95
cgacagtgattctgactcggacagcgattcggactccgac CRISPR spacer cgacagtgattcggactctgacagcgattcggactccgac Protospacer ************ ***** *********************
6. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 2, identity: 0.929
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactctgacagcgattcggatagcgac Protospacer ******.*****.***************
7. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer tgattcagactcagacagtgat Protospacer .***** ***************
8. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer tgattcagactcagacagtgat Protospacer .***** ***************
9. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer tgattcagactcagacagtgat Protospacer .***** ***************
10. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer tgattcagactcagacagtgat Protospacer .***** ***************
11. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer tgattcagactcagacagtgat Protospacer .***** ***************
12. spacer 2.28|1086622|22|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 2, identity: 0.909
cgattctgactcagacagtgat CRISPR spacer cgattctgactctgacagtgac Protospacer ************ ********.
13. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 2, identity: 0.929
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agatagcgacagcgactctgattcagac Protospacer ****************** ***** ***
14. spacer 2.10|1085080|34|CP035113|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
cgactctgatagcgactcagattcagacagtgat CRISPR spacer agactcagatagcgactccgattcagacagtgat Protospacer ***** *********** ***************
15. spacer 2.10|1085080|34|CP035113|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
cgactctgatagcgactcagattcagacagtgat CRISPR spacer agactcagatagcgactccgattcagacagtgat Protospacer ***** *********** ***************
16. spacer 2.11|1085140|40|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.925
cgacagtgattctgactcggacagcgattcggactccgac CRISPR spacer ggacagcgactctgactcggacagcgattcggactccgac Protospacer *****.**.******************************
17. spacer 2.11|1085140|40|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.925
cgacagtgattctgactcggacagcgattcggactccgac CRISPR spacer ggacagtgattccgactctgacagcgattcggactccgac Protospacer ***********.***** *********************
18. spacer 2.11|1085140|40|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.925
cgacagtgattctgactcggacagcgattcggactccgac CRISPR spacer ggacagtgattccgactctgacagcgattcggactccgac Protospacer ***********.***** *********************
19. spacer 2.11|1085140|40|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 3, identity: 0.925
cgacagtgattctgactcggacagcgattcggactccgac CRISPR spacer tgacagtgactctgactcggacagtgattcggactccgac Protospacer .********.**************.***************
20. spacer 2.11|1085140|40|CP035113|CRT matches to CP052430 (Klebsiella pneumoniae strain C16KP0129 plasmid pC16KP0129-3, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.925
cgacagtgattctgactcggacagcgattcggactccgac CRISPR spacer tgacagcgactctgactcggacagcgattcggactccgac Protospacer .*****.**.******************************
21. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagcgattcggatagtgac Protospacer ***********.***********.***
22. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagcgattcggatagtgac Protospacer ***********.***********.***
23. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer tgattccgacagtgattcggacagcgac Protospacer **.*****************.******
24. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagtgattcggattccgac Protospacer ********************* ****
25. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagtgactcggacagcgac Protospacer **************.*****.******
26. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattcggattcggac Protospacer ********************** ***
27. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattcggattcggac Protospacer ********************** ***
28. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattcggattcggac Protospacer ********************** ***
29. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattcggattcggac Protospacer ********************** ***
30. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggatagcgacagcgactcggattcggac Protospacer .*****************.***** ***
31. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattcggactcggac Protospacer *********************. ***
32. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattccgattcggac Protospacer ****************** *** ***
33. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgactcggattctgac Protospacer ***************.****** .***
34. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagcgattcggattcggac Protospacer ************.********* ***
35. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattccgattcggac Protospacer ****************** *** ***
36. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattccgattcggac Protospacer ****************** *** ***
37. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattccgattcggac Protospacer ****************** *** ***
38. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattccgattcggac Protospacer ****************** *** ***
39. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattccgattctgac Protospacer ****************** *** .***
40. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattccgattctgac Protospacer ****************** *** .***
41. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgattccgattcagac Protospacer ****************** *** ***
42. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggattccgacagtgattcggattctgac Protospacer ***.****************** .***
43. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagcgattcggatgctgac Protospacer ************.*********. .***
44. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggattccgacagtgattcggattctgac Protospacer ***.****************** .***
45. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagtgattcggactctgac Protospacer ********************. .***
46. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagcgattcggattctgac Protospacer ***********.********* .***
47. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagcgattcggattctgac Protospacer ***********.********* .***
48. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagcgattcggattctgac Protospacer ***********.********* .***
49. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer tgactccgacagcgattcggattctgac Protospacer ***********.********* .***
50. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggattccgacagtgattcggactcggac Protospacer ***.*****************. ***
51. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagcgattcggattctgac Protospacer ***********.********* .***
52. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer tgactccgacagcgattcggattctgac Protospacer ***********.********* .***
53. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer tgactccgacagcgattcggattctgac Protospacer ***********.********* .***
54. spacer 2.12|1085206|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
ggactccgacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagcgattcggattctgac Protospacer ***********.********* .***
55. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agatagcgacagcgattcagacagcgat Protospacer ***************.*****. ***.
56. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agatagcgacagcgattcagacagcgat Protospacer ***************.*****. ***.
57. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agatagcgacagcgattcagacagcgat Protospacer ***************.*****. ***.
58. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agatagcgacagcgattcagacagcgat Protospacer ***************.*****. ***.
59. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agatagcgacagcgattcagacagcgat Protospacer ***************.*****. ***.
60. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgactccgacagcgactcggattccgac Protospacer **. ************.*********
61. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgactccgacagcgactcggattccgac Protospacer **. ************.*********
62. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgactccgacagcgactcggattccgac Protospacer **. ************.*********
63. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggactccgacagcgactcggattccgac Protospacer .**. ************.*********
64. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggactccgacagcgactcggattccgac Protospacer .**. ************.*********
65. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgattcggacagcgactcggattccgac Protospacer *** ***********.*********
66. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgattcggacagcgactcggattccgac Protospacer *** ***********.*********
67. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggattcggacagcgactcggattccgac Protospacer .*** ***********.*********
68. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgattcggacagcgactcggattccgac Protospacer *** ***********.*********
69. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgattcggacagcgactcggattccgac Protospacer *** ***********.*********
70. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgattcggacagcgactcggattccgac Protospacer *** ***********.*********
71. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgattcggacagcgactcggattccgac Protospacer *** ***********.*********
72. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgattcggacagcgactcggattccgac Protospacer *** ***********.*********
73. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggattcggacagcgactcggattccgac Protospacer .*** ***********.*********
74. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgactccgacagcgactcagactccgac Protospacer **. ***************.******
75. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggattctgacagcgactccgattccgac Protospacer .*** .*********** *********
76. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggattctgacagcgactcagactccgac Protospacer .*** .**************.******
77. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggatgctgacagcgactcggattccgac Protospacer .***. .***********.*********
78. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agactcagacagcgactcagattcagac Protospacer ***. ***************** ***
79. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agactcagacagcgactcagattcagac Protospacer ***. ***************** ***
80. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_CP047808 (Staphylococcus aureus strain UP_1612 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agactcagacagcgactcagattcagac Protospacer ***. ***************** ***
81. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agactcagacagcgactcagattcagac Protospacer ***. ***************** ***
82. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to NZ_LT009691 (Staphylococcus aureus strain NZAK3 plasmid 2) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer agactcagacagcgactcagattcagac Protospacer ***. ***************** ***
83. spacer 2.10|1085080|34|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
cgactctgatagcgactcagattcagacagtgat CRISPR spacer agacagcgatagcgactctgattcagacagcgat Protospacer *** .*********** ***********.***
84. spacer 2.11|1085140|40|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 6, identity: 0.85
cgacagtgattctgactcggacagcgattcggactccgac CRISPR spacer tgactccgattcggactctgacagcgattcggactccgac Protospacer .*** .***** ***** *********************
85. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggactctgacagcgactcggattccgac Protospacer .**. .***********.*********
86. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgactctgacagcgactcggattccgac Protospacer **. .***********.*********
87. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgactctgacagcgactcggattccgac Protospacer **. .***********.*********
88. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgactctgacagcgactcggattccgac Protospacer **. .***********.*********
89. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgactctgacagcgactcggattccgac Protospacer **. .***********.*********
90. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggactcggacagcgactccgattccgac Protospacer .**. *********** *********
91. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer ggactctgacagcgactccgattccgac Protospacer .**. .*********** *********
92. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer cgactctgacagcgactccgattccgac Protospacer **. .*********** *********
93. spacer 2.31|1086820|28|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
agatagcgacagcgactcagattccgac CRISPR spacer tgactctgacagcgactccgattccgac Protospacer **. .*********** *********
94. spacer 1.2|347832|30|CP035113|CRT matches to NZ_CP006988 (Rhizobium sp. IE4771 plasmid pRetIE4771b, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
cacaagaagaaagcggccaagaaacataag CRISPR spacer cacaagaataaagccgccaagaagctccgg Protospacer ******** ***** ********.* . .*
95. spacer 2.10|1085080|34|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
cgactctgatagcgactcagattcagacagtgat CRISPR spacer agatagcgatagcgactctgattcagacagcgat Protospacer **. .*********** ***********.***
96. spacer 2.10|1085080|34|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
cgactctgatagcgactcagattcagacagtgat CRISPR spacer agatagcgatagcgactctgattcagacagcgat Protospacer **. .*********** ***********.***
97. spacer 2.10|1085080|34|CP035113|CRT matches to NZ_CP023562 (Staphylococcus aureus strain TF3198 plasmid pTF3198, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
cgactctgatagcgactcagattcagacagtgat CRISPR spacer tacatcagatagcgactcagattcagacagcgac Protospacer .. ** ***********************.**.
98. spacer 2.11|1085140|40|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 7, identity: 0.825
cgacagtgattctgactcggacagcgattcggactccgac CRISPR spacer tgacagtgattccgactctgacagcgattcggatagtgac Protospacer .***********.***** **************. .***
99. spacer 2.26|1086472|46|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 7, identity: 0.848
tgatagtgacagtgactccgactcggacagcgattcagactcagac CRISPR spacer ggactccgacagtgactccgattcggacagcgattccgactcagac Protospacer **. .**************.************** *********
100. spacer 1.2|347832|30|CP035113|CRT matches to NC_042345 (Phage Salvo, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cacaagaagaaagcggccaagaaacataag CRISPR spacer ccggggaagtaagcggacaagaaacatact Protospacer * ..**** ****** ***********
101. spacer 2.8|1084936|46|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 8, identity: 0.826
agatagcgacagtgactccgactcggacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgactccgattcggacagtgattcggattcggac Protospacer .**. ***************.****************** ***
102. spacer 2.10|1085080|34|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cgactctgatagcgactcagattcagacagtgat CRISPR spacer agatagcgatagcgactcagactcagacagcgac Protospacer **. .**************.********.**.
103. spacer 2.10|1085080|34|CP035113|CRT matches to NZ_CP035292 (Staphylococcus haemolyticus strain ATCC 29970 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.765
cgactctgatagcgactcagattcagacagtgat CRISPR spacer agatagcgatagcgactcagactcagacagcgac Protospacer **. .**************.********.**.
104. spacer 2.11|1085140|40|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 8, identity: 0.8
cgacagtgattctgactcggacagcgattcggactccgac CRISPR spacer tgacgccgacagtgactctgacagcgattcggactccgac Protospacer .***. .**. ****** *********************
105. spacer 2.26|1086472|46|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 8, identity: 0.826
tgatagtgacagtgactccgactcggacagcgattcagactcagac CRISPR spacer ggactccgacagtgactccgactccgacagcgattcagactcggat Protospacer **. .***************** *****************.**.
106. spacer 2.8|1084936|46|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 9, identity: 0.804
agatagcgacagtgactccgactcggacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer ggactccgacagtgactccgattcggacagtgactcggattcggac Protospacer .**. ***************.***********.****** ***
107. spacer 2.8|1084936|46|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 10, identity: 0.783
agatagcgacagtgactccgactcggacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactccgacagtgactccgactctgacagcgattcggactctgac Protospacer **. ****************** *****.********. .***
108. spacer 2.8|1084936|46|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 10, identity: 0.783
agatagcgacagtgactccgactcggacagtgattcggatagcgac CRISPR spacer cgactctgacagtgactccgactccgacagcgattcggattctgac Protospacer **. .***************** *****.********* .***
109. spacer 2.26|1086472|46|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 10, identity: 0.783
tgatagtgacagtgactccgactcggacagcgattcagactcagac CRISPR spacer cgactccgacagtgactccgattcggacagcgattccgacagcgac Protospacer .**. .**************.************** *** ***
110. spacer 2.16|1085476|76|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 21, identity: 0.724
ggacagcgacagtgactcagattcggacagtgattcggactcggacagcgattcagactc CRISPR spacer cgacagcgacagtgactcggattcggacagtgattcggactcggacagcgattcggatgc Protospacer *****************.***********************************.**. *
111. spacer 2.18|1085668|76|CP035113|CRT matches to LR134125 (Klebsiella aerogenes strain NCTC10006 genome assembly, plasmid: 5) position: , mismatch: 21, identity: 0.724
ggacagcgacagtgactccgattcggacagtgattcggactcggacagcgattccgactc CRISPR spacer ggattcggacagtgactcggattcggacagtgattcggactcggacagcgattccgactc Protospacer ***. *********** *****************************************
112. spacer 2.18|1085668|76|CP035113|CRT matches to CP052500 (Klebsiella pneumoniae strain B17KP0021 plasmid unnamed) position: , mismatch: 24, identity: 0.684
ggacagcgacagtgactccgattcggacagtgattcggactcggacagcgatt------c CRISPR spacer cgacagcgacagtgactcggattcggacagtgattcggactcggacagcgattcggatgc Protospacer ***************** ********************************** *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
515513 : 606468
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035113|515513:606468|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035113|515513:606468|532099_532789_+|QAR36882.1|DBSCAN-SWA MAKKSKQYQDAAKLVDRDKAYDVTEAVDLVKKMDFAKFDATVEVAFKLNVDTKQADQQLRGAVVLPNGTGKDQTVIVFAKGDKAKEAEEAGADFVGETDLVQKIQDGWLDFDVAIATPDMMAQVGRLGRVLGPKGLMPNPKTGTVTMDVAKAVNDSKAGKVTYRTDRDGNVHVPVGKVSFDTDKLVGNFKTIEDTIVKARPASVRGTFIQNLVVTSTFTPAVRVDLASF >CP035113|515513:606468|594661_595459_-|QAR36961.1|DBSCAN-SWA MTIKAVIFDWAGTTIDYGSRAPIVAFQKAFANVGIQISEAEIRQDMGLDKYTHIHKIMDLPAVQNDWQARFRVLPTEDDCNQIFSNFKAILLSSLIEFGQLKPGMSAVIDYLTAHNISYGTTTGYDAEMLALVLPIAAKQGYRPAVNITSEQTGGVGRPAPAMLALAAEQLTITDPTTVMKIGDSVNDILEGNNADAVSVGIIDGSNIMGLSELAFNALSPAEQAERRAHVTAAYQRAGADYILQSMAELPALLDQINQPVATDH >CP035113|515513:606468|531573_531999_+|QAR36881.1|DBSCAN-SWA MAKKVANVVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKDFNARTADQAGMIIPVVITVYEDRSFDFITKTPPAAVLLKKAAGVESGSGEPNTKKVATVTKDQVKQIAETKMQDLNAADVEAAMRMIEGTARSMGFTVEG >CP035113|515513:606468|604981_605659_+|QAR36971.1|DBSCAN-SWA 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MNEKLNLMQKLNEAAKSIGAVHKDGKNSFQNYEFQSEGAIKAAVEHAIQGVGIRIIPNYEIINQYDKASKKGGSNHFVDVMGTFLITDGSESQTGSMPGSGQDSGEKAMAKACTSAQKYFYKQLFNITDQEEDPDTTDSNATDGEPLIDSQQKNHLDRLFEALAGVTNKDKEFVAKAYFKKVGSVDKLTHSSANTLIELVTNKLDSYVDKEDQSA >CP035113|515513:606468|537430_538465_-|QAR36889.1|DBSCAN-SWA MKINAVDLFCGVGGLTCGLNQAGINVIAGIDIEEKCRYPYEYNNHSKFIQGDLKTIKSESIANLYPSDTDITVLAGCAPCQPFSSYSYRYKGTNVLINKMDLLDTFGRIVHDILPDIVSMENVPQLAKEPIFKKFICTLKQNNYAVNWHVVFAPEYGVPQTRKRLVLLASRVGDIDLIAPLFNKSNYPTVRQTIYNLPKINAGETSSTDPMHKAVKLNPINLQRIKQSIPGGTWHDWDEELLLEAYKKQSGKSYTSVYGRMKWDNPAPTVTTKFYGYGNGRFGHPSQNRAISFREGAMLQTFPKNYVFFDTQHPITTRDLGIMIGNAVPVKLGVAIGKSILNKV >CP035113|515513:606468|540748_541003_+|QAR36893.1|DBSCAN-SWA MVQLYVVGKKKIDVLLAWHGYTQKSLSSRVNIGPSYMSSIINGKKPVGKRTAKKIADKLGVEVTDIFFIPNVDKSYTKPKEAAK >CP035113|515513:606468|555207_555855_+|QAR36917.1|DBSCAN-SWA MSEEPKNPETNPEGGKPSDEPVTFTDEQQAKIDELIGQQHAKWSKKLDQQQADFKKQLADTQKQAEERAKMTAEQKAEADRKQREADMAKHDQELATQIQEYKTKSMLLDKGISPDMLPLVMGADEDSTSDNLELLQKYVDNQVQAATEKLLTGKQAVTTGSNNTSPLEAGTDNPWSKDGWNLTKQTEIYNTDKEQAQQLIASAQPISQSFYVGK >CP035113|515513:606468|565009_566191_+|QAR36928.1|DBSCAN-SWA MMIQYPKLTISDRLNQQRERLPLADLQETFKESWTVNEKWQVTFAITDSLVYEQAIKLLDVQNIVHYDGQSYVITQCAKTVSGGLSVYEVTASHLFYRLANNVRQNNVKTGTLTYGLTDAVNFMIANNDQGITANFVGDFPKIQIENLGNSSFSKFLQDYTSKFDASYTIDNQQITFYSATYLKQQPVIDTLFYQHDVENVKLSLDTTSLVNEVHCLGKPIDQGSGTNNSQTKYQVDFIYRDDDSVKKWGLQRGDPLSDERFTDQESMTEYARQTVQAQPIATLTTTAWDVVIRQCETVKLIMPNLDWQTNIALNSYERNPFNQFSLPTITFDNASLAVNDINVAMFKHITNAHDTVGKTMTQLQATLGDLQDGDLITDDDTIDKLNELGEIS >CP035113|515513:606468|588750_589080_+|QAR36954.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFHQF >CP035113|515513:606468|569570_569702_+|QAR36934.1|DBSCAN-SWA MFSLVQQSYQAGWYTLDNVKTFVLANMITKDEYKSITGTDYAA >CP035113|515513:606468|526669_527080_+|QAR36873.1|DBSCAN-SWA MQVDYQQLNGIALAYLGDAVYEPFIRQHLIESGFTKATKLHHHATHYVSAKAQAALIERMQAEEVLTPTEVDVFKRGRNAKSHTSAKHTDVVTYRISTGFEAVFGYLQLTQQADRIAELAQWCIKQVDEGRVSSVK >CP035113|515513:606468|541361_541544_+|QAR36894.1|DBSCAN-SWA MQAIKNHKRELVDSIIELLPAVSPSLINAKTFWMSEDELQELIAMIRDGDRNEFYEMINS >CP035113|515513:606468|545631_545919_+|QAR36903.1|DBSCAN-SWA MNWGNQLVKLAANHAYESSALHWTKQRMKRHLKAGGSAQDEVCAHEYKLFALEVLIIEYQRDGLNFDLTQCWGKPAEYFIDLEQARQGLQTEVSA >CP035113|515513:606468|572011_572548_+|QAR36938.1|DBSCAN-SWA MTSKLYDPMDIANYLVVLANRSGKTITNLKLQKILYFVNAKYLVDNQGMALMDEKFQRWAYGPVMYNVYSNFRDCGAGAIEETVGTFELNQDNPFESKYNPFDDDKIDSSVKSVAKAVFDSLIDVDPFKLVRFTHEESLWSSYKEQIDQRTAPEYTDDEIYKYFKDHPEKCVWKSNNE >CP035113|515513:606468|533552_533921_+|QAR36884.1|DBSCAN-SWA MAFDKDAIIDSLKEASISDLNDLVKAIEEEFDVSASAPVAVAGAAGGDAAAAKDSYDVELTESGDQKVKAIKAVRDITGLGLKDAKGLVDNVPSIIKEGVSEDEANDMKAKLEEVGGVVTLK >CP035113|515513:606468|536351_537473_-|QAR36888.1|DBSCAN-SWA 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>CP035113|515513:606468|527838_528387_+|QAR36875.1|DBSCAN-SWA MKQQLLIVDAYNMIGNWPELNHLKQTDRLPQARDELISMLTEYKKITGLNISLVFDAMYVPGNSKSYRQADLEIIWTSKDQTADSYIEKYAGEKQSRVLQVTVATSDQAEQWVIFSEGALRVPALELRHRVKTALKDVRHTAVRTQDLGAVRKSPWNDDQLSALDQYRQQLERNHVKHHHRS >CP035113|515513:606468|580381_582547_-|QAR36945.1|DBSCAN-SWA 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>CP035113|515513:606468|599267_599993_+|QAR36965.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKLLAIDTSNRPLSVAVLEDTQILATTTTNVGRNHSSTLLPIIEQAMAQAKLAPADLDRIVVAAGPGSYTGLRIGVTTAKTLAFTLDKALVGVSSLAVLAGNIVTEGQLVAPLFDARRDNIFAGLYRIKNQRPVAVIADQHISVTEWGQRLASYDEPITFVGADVDQYADALQQSLAKQFVRAAPQLDLPQAVVLGLMGRTLTPVSEIHNFVPNYLRLTQAERDWQAKHPEKEHAPYVEKI >CP035113|515513:606468|532987_533491_+|QAR36883.1|DBSCAN-SWA MSKETIAVKAQEVEEVAEQLKSSVSAIVVDYRGLTVEQVTDLRKQLREAGVKMRVIKNKIMVRAADKAGFEDLKPVFAGPTAVAFSEEDPVAPAKILANFAKTADALQLKGGVIEGKVADLETVQEYATMPSREELLATIANLLQAPVRNVAYAVKAVAEKGDEDAA >CP035113|515513:606468|587438_587690_+|QAR36952.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKEVFDEQLLSTLNAAKLDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK >CP035113|515513:606468|530584_531472_+|QAR36880.1|DBSCAN-SWA 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>CP035113|515513:606468|590586_591483_+|QAR36957.1|DBSCAN-SWA METQQSFADHAGIGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVATLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQTGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIAANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLARRHETVVLYESPFRVAKTLTLLATVCEGTRPIVACRELTKRYEEFARGTLAEMVTWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDKDEPETTDELAQLPVKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES >CP035113|515513:606468|575908_578512_+|QAR36942.1|DBSCAN-SWA 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>CP035113|515513:606468|557648_558203_+|QAR36921.1|tail|DBSCAN-SWA MANNYDQIPVVTFSIDVDYFNQLFEAARGLARNGMPEALDEANKEYRRAVALSKAFIKNAGAREQEAAQGLERTQVGHSKSGYEPTGTLQGSIEIKLSDDGKSVSIKPMATVADQKRALAAIAGSGSKKPITSQDGVDYYGVYVEYGTYRMAAEPFMKPTGEKIAMRLDNEFERIMRLAVLGSD >CP035113|515513:606468|547157_547538_+|QAR36906.1|DBSCAN-SWA MSKVVIKGELPSLNEYIKAERANRYAAAKLKKRYTALCSVYARASHNSGVEFNWPCKLKFTWYTKNNRKDADNIAFAKKFVLDGFMKAGLLGNDNRKHITGFQDEFAVDKRNPRVEIDEITEDEDA >CP035113|515513:606468|574936_575605_-|QAR36941.1|DBSCAN-SWA MHHAKKLVVALTSLLILTGCTTGNQQAANHTSVKTKTVRVEKRTAANKAAWAKAKAASRANAASAKALSSNTTQLAIATSQAKRQSEQLKAKHDDAMASSKSASQAAAKSAASEAAAQSRSQSEAQSASAVAAASQSKQAVKASSQAAAQSQQTQTSTATTSRQNNFSGDTDTAQTGRIVGNRNSKIYHVETGQNYRMAGKNAVYFSTEDAARAAGFRKSFR |
112 | Lactobacillus_phage(27.27%) | protease,head,capsid,portal,tail,holin,tRNA,integrase,terminase | attL 512389:512406|attR 569984:570001 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1180004 : 1189849
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP035113|1180004:1189849|DBSCAN-SWA TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACACGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGAAGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGAGGATGAATTAGTGCTGCCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAAATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGCCAGAGCATGCATCCGGAGTTTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAACAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAACCAGCTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCTCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCTATTGAGTTCTTTGATCAGTTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCTAACTGGGCGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGAAAATGAAGACGAGAGTGAAGAAGATGACGCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCTACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCCAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCTAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGTGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTCGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAATGGGGCGATTGTCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCCTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTTCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGTCACCATTGAGACTAGTATATCCAGTGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGTATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCCGTTGGTTGCGAAAAGTTAAAGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATGCCGATGTAGAGGCTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGCTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGACTTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGAGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGCAACATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAATTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGATGCGTCTTTGAAATAATGGTTCCTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGTAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGCTGGGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAGACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGTAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGGGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAGTACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCCCCGGCGCGATGGTTTCCGGATTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGCTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAAAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGTGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGCAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAATTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGCAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTGGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTGAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGAGTTAGTTGCATCGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTGGCGATAGTGGCTAAATAGCATTATGACCAACCATTTTAACATGATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGGGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCGGAGCGCTTTCACGTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATACGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGCGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAAGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCGGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTAGATTTAACGAATAAAATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGACGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGCGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCTACTGGACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP035113|1180004:1189849|1188091_1188229_+|QAR37457.1|DBSCAN-SWA MATDQSGQVSKAVTLPQTSENHQSLLIAILGLALLLLMLVWLPAK >CP035113|1180004:1189849|1188853_1189849_+|QAR37458.1|DBSCAN-SWA MQNPRLTIIVPCYNVEAVLPKSAHILDGILTDLIQHKQVNAASKLLFVDDGSQDKTWKLIKSLEKQYSTVTGLKFSRNFGHQNALMAGMQVASPTAEIVITIDADLQDDPQVIPEMVARYRAGSDIVLGVRNDRSSDSLFKRWTADGFYRLMKRIGVQLVPNHADFRLLNQRAVQALLTYEETNLFLRGIVPRLGFPTTKLYYHRQPRFAGVSKYPLRKMVAFAFDGITSFSIAPIKVILLFGMVISGGSLMMMLYALIQGLLGTATSGWSSLMTSLWFLGGMQLIGISIVGEYVGKIFAEVKHRPRYIIETDDYTATQQPAIVNSQRVHG >CP035113|1180004:1189849|1182490_1183438_-|QAR37452.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS >CP035113|1180004:1189849|1186924_1187485_+|QAR37455.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATSDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW >CP035113|1180004:1189849|1181333_1182305_-|QAR37451.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQLNQILRAANLHSFAVANLRQVEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTADLILNFAANTGGSSAPMIAGLAAIIPDGSLYIGITNHHRNRPRMMYHGRITGGLGQDDFNFSQPTAAHFRHIYTIIGNQTASAAEVTIMALKRNPHVTLVGRSSTGYTSLNGDVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLRPDIPTLYQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELRTIMKHYH >CP035113|1180004:1189849|1187555_1187996_-|QAR37456.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAQNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPKGDFIGEIL >CP035113|1180004:1189849|1183781_1184396_+|QAR37453.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYTQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE >CP035113|1180004:1189849|1180004_1181243_+|QAR37450.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEHEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQNQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPEFAAPLTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVNQLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITLMQGLSLAIEFFDQFEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWADAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEENEDESEEDDAARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF >CP035113|1180004:1189849|1184398_1186837_+|QAR37454.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIATADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGMTAAAKVLQAGHQAVVLEKYPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFVALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGAIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAQQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDPDAHVLNTDGQIIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA |
9 | Lactobacillus_phage(87.5%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1696083 : 1783069
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP035113|1696083:1783069|DBSCAN-SWA CTTAATTGACCGCAAACATTTTGAACGGCTTGTACCGCTGTTCGTCCGGTCGATAACTATATAGACATTTTAGGCTGTTTTGGTAAACTAACGCAACCATCGTGTTCGCATCTGGATCAGTTTGTTGCCCTTCTGCCGCCGTAATAAAGGCCCCATTTTTGACCCGTTGCCACTGCTCATCCGTTAACGTGACTCGCGGGTACTGACTTAAAGCTTTATCAATTGGCGCCAATAATGCTCCGGCCGTTCCAGCATCGACGTGGGCCGCGATTTCCTCAAAGGTCACGGTTTCATCTAAAGTAAAGCCGCCACTCCTTAATCGGGTCAAATCACTCATCACAGCGGGTACCCCGAGCACTTTGCCGACATCCACCGCTAGCGTGCGAACATAAGTCCCTTTACTACAAGCGACCGTAAAATAGATCGTCTGAGTCTGGGTTGCCGAGTCATAGGTAGATGCCTGCCGTTGCTTGAAGCTGCTAATTGTGATATGCCGTTCTGGGCGCTCGACAGTTTCACCACTGCGCGCATAGTCATATAAACGCCGCCCATTTACTTTTACTGCTGAAAACATCGGTGGAATTTGCGTAATGGCCCCCGTCATCTGTGCCAGTGCAGCATCAACTTGGTCACTTGTGAACGGCTCTGTGACCGCTTGGCGCGCAATCTCCTCACCATCTAAATCTTCAGTAGTCGTTGCAAATCCGAGGGTAATGCTCCCTTGGTATTCTTTGCCAGAAGCCACTAAAAATTGCACAACTTTAGTCGCATTCCCAATACAAATCGGTAAAACGCCATCCACATTTGGGTCCAGTGTCCCTGAATGACCTACTTTGCGGGTCTGATAGAGTCGTCGGATTTTAGCGACACAGTCAAAGCTCGTCATCCCACGAGGTTTATATAATGGTAGAATCCCGTTCAACATAAAAAACGCCTTCAATCATTTAAATTCGGTTTCTAGTGGCAGCCAATCGCCGTGCCACGGATTCGATCGTTCTTAATCGACGGTTTTCAGTATACCACACCTCACAAATATGTAAGCGGATTATCACAGAATTCAAGGCCCTGAGCACCACAACTAAGATACCCAAAATCGACACGCTGGTCCACCACGTATGTGCCTGACAAAGCCGTATTTAACTCATTGATCCAGAAAACCGTGAGCTTAATCCCTATTAGTCAAATAAAACGACTGAAAAACAAGAATCGCACAAATTAGTCCCCTTATCAAGGGGATACCGCGCGGGACCGTCCCTAATTACGCCGATGACTTTCAACATATGCTGCCATCAAAAAAGCGTGCAACGGCCTTAGTGTGGCTGATGTACGCTTATTCAATGTTATCGTTTTAAAATACAACCGGCACGCTAACCACAGTTGACAGTTACATGGTTCTTCAAGCCTGGAGCGCAACTGGTTGCTGATTCAGCCACTGCTGAATTTGGCGGGCAATCTGCTGGGGTGTCAGTTGATCGGTTGCGATTGTCAAATCGGCCGCAGCGGCATATAAGGCTTGGCGCCGCTGCTTCAACGCAATCAGTGCCCCTGTATCCAATTCATTGACAAGTGGTCGGCTAGTATCATTTTTAACACGGTTAATAGTGGTTTGATCACTAGCCGTCAACCAGATAACTGGCACCGCGCTTTGTTTCAGACTAATTGCATTCATTGCAATGGTCGGAGTACCACCACCGGTCGATAAAATCCCGGGTGTTTCGAGTGCTTGGAGCAAAGTCTGATGCTCCAATTGCCGGAAGTACCCCTCTCCTTGCTCCGCAAAAATAGTCGTAATCGACCGTCCCGCCCGCTGAACAATCAAATCATCTAAATCAGCATGTTTAGTTGCTAACCCGGCCGCCAAAAGCCGACCGTTGTTTTCCCACTACCCATAAATCCAATTAAAATTGCTCGCATTCTTAATTCCTCCTTACAATCTGATAACCCGCATCAGCTAACAACGACGATGCTTGTGTTCTCGTCTTTAGATCACTAAATGTCAGTTGCAAGACACCATCAATCTCTTCACGAATCTCTAAAATATGAATATTGACTAAGCTCAGCTGAGCCTGTGCGAGAGAGCGCCAACACGGTCGGGGACGTTCAAAAACAAATCATAAAAGTTTGGTAGTCCTCCCAACTGTTCCGGTCCCAAGTGATCACGCGTCACCTTAGCTGTCGCAAAAAATTCGTACAATGTTGCTTGATCATGCACCCTAATGGCTGTCTTGATGCGCAACAGTTGGTCAATATAATCCTGCAATTGATTGGTTATTAGTTCAGCATTAGTCATCAGGATGGCCGCCCACATCGTGGGGTCCGAACTGGCAATCCGAGTAATACTTTTAAACCCACCAGCCGCTAATCGCAACCCGAGTGCCGAATCTGCCAAAGCCACCTGAGTCTGATCAACTAAAGCCGCAGCGACAATATGTGGCAAATGACTTAACTGTCCTACAATCCGGTCATGCTGTATTGCAGTGACCGTCAACCATTTGACGTGAGTCGCTTGTAACAATGCTTGCAGCCGTTGAACGGCTGCTTGATTAGTCCGGCCCGGCACCAACAAGTAAAAGGCGTTCTCGAATAAGTTGGCGCGGCCAGCCGTCACACCCGATTTATGTGAACCCGCCATTGGATGACCGCCGATGAAAGTCACACCGTGCTGTTGTATGGCAAGCGCGGCATGCATCACCACTTGTTTAGTACTCCCGACATCCGTCACAAGCACCCCTGCCTTGAGTGGCATCATAGCCAGTCGGTGCAAGTCTGCAACGATCACATCAACTGGCCCCGCTAAAATAATCACATCAGCGTCGCTAGCATCGATCATACCCTGTTGACGCGCATAACTCAGGCTGACATCGTCACGATCAATCCCAATAATGTGCACCGTGGGATGGGCCTGCTTAATGCTTAGTGCCAACGAACTGCCAATTAGCCCCAAACCTTTGATCAATACAGTTGTCATCTTCACACCCCCTGGCTTAAACGTGCTAAATCTTCAAAGAACGTCGGGTATGAAATGTTCACAGCTTCGGCGGACTCTAGTTCGGCGGGAGCGGCTAATCGCAACGCTGCAATTGCCATCATCATACCGATTCGGTGATCGCCATGGCTGGCTAATGGCTCGGTCGGCTGCCGCCAAGACTTGCGACCATCAATCACGAAGCCATCCGGTTGCGAAGTGATCTGAACACCAAGTTTTCGAAGCTCGGTCACAATCGTTGCAATGCGATCGGTTTCCTTGACTCGTAATTCAGCAGCCCCACTGATTGTGCTAATACCATTCGCAGTCGCAGCCAACAATGCAACTAGTGGCAATTCATCGATTACGGCAGGAATTTCAGTAGCAGTGACTTGGACCGGGTGCAGTTGTGCAAACCGCACGTCAAGCGTGCCAACTGGTTCGCCCATCCAGTGTTCATGATCGACCGTCACTTGACCCCCCATCCGGCGCAAAATGTTTAAGAAACCCGTTCGTGTCGGATTCAGTCCCACGTTCGTTAACCGGACATGTGAATTTGGAATAATCGTCGCGGCTGTCACGAAAAAAGCAGCCGAGGAAAAATCACCAGGAATCGTTAGTGACCGACCAACCAAGACTGGCTGCGGTTGGACCGTGATTGTTCGTTGATCAGGCGCCGTTTCAATTTGACCACCAAATTGTTGCAACAACCGTTCAGTATGGTCACGAGTCGGTAATTTTTCAATAATCGTACTTGATTGATCGGCTTGCAGGGCTGCTAAAATCAAGGCGCTCTTAACTTGTGCACTAGCGACCTGCATCTCGGTACGACTACCATGTAAAGTCCGACCAGTGATCGTCATCGGTAAGTGCCCGGCTGTTAATTGTACCTGCGCCCCCATGGCTTGTAATGGTTGACGCACTCGCTCCATCGGCCGTTGACTAAGGGACGTATCGCCGACCAAGGTCGTCTCAAACGGTTGACCGGCTAACAACCCAGTTAATAAGCGAGTGGCCGTCCCCGCATTCCCCATGTCTAATGGTTGTTGTGGTTGGGTCAGCCCACGTAAGCCGCGGCCACTGATCGTAACGGTCGTATCGACACGCTTGATTGGCACCCCTAACTTTTGCAGCGCCGTTAAAGTCGATAAGCAATCGGCGGCTGGCAAAAAGTGGTGCAAGGTCGTCGTCCCTTGACTAATTGCCCCTAAAATCAAGCCTCGATGTGAGACACTTTTATCGCCTGGTACACTTAAGTCACCTTGTAACCCACTAGCTGGTTGAATACTTAGTTTTTTTATCATTAATCATCATCACCTAATTTATTTGATAGACGCACCACACCATCGAAGGTGTCAAACGTGCAAGTTCACGTTCATGAGTCGTCAGTGTCACGTTTTTCTCATTAGTTAGCACGTAGGCCGCCTGATTACGTTGATAAGCCTGATACGCTAAATACTTACTGGCGACTGTTTGCACCACGACCTGATGCACGACCCTCGTCAACAATTGGGCGGTCGCTGCATGCGTGTAACCAATTTGATTATCGGCATTTACTCGTTGGAGCACGACGAGTGGATCGAGCTGGGTCATAAAACAACTGGTCAACGTTAATTGGGACAATAATGCGTAATGTATATCCCCCCAACTGGCATTCAGTGTGTCTGATTTGAAAGCAGCTGGTATCACCAGTTGGTCACCAGAATAGGCCGTTAAATCAGTTAAAATGGCTTCAAAGCTCGGGTGTTCGACAATCACCGCTTGGTCCTGCCAGTTGCGATGATTATAAACTTGCGCGGCCGCGTAACTATCCGTGGCGGTCGGGCCTAAAGTATGAATCTGCATAGGCCCTCCTAATATTGCCGGAGTTCTTCGCGGTATGCCGTCACTGTTTGCTGGAGGCGAGCTAAGTTACTCCCGTCAAACGTTGCCGTCAATGCTCGCGTTAATTCAATCGCTACCACACTTTCAACCACAATCGAGGCGGGGACGATGGCCGTCGTATCTGAACGCTCTACGCTTGCCTTTTGGCTGA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92 | Lactobacillus_phage(78.57%) | protease,lysis,capsid,holin,tail,portal,transposase,tRNA,integrase,terminase | attL 1721602:1721619|attR 1789831:1789848 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2075189 : 2082522
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP035113|2075189:2082522|DBSCAN-SWA CCTAAGCTTCAATTTTTCCACGCAGTTGTTGAATCATACTGACAACTTGATACGGTGTCTTTGTCATATCAGTTACTCTGTTTTGATACCAGAATTGTGTCAGCAAGGACACCGCAAAATCGTACTGTTTATAGACAGTCAGATCTTCATTCTTGCTAACGGCCGTCTGCACGTAGTCCTTAGCGGCGTCTAAATAGCTTTGAATCATTGGATCATCTTCGGTTACATCGATTCGCAGGCTTAGTTTAATGTCGTCTACAGTCACTGACAACTAATCACTTCCTCATAAGTTTAACTTTACTCTCATAAAATTATATGGTATAAATATAGAGTACTCATTGCTCGGTAGTTCAGCGGTAGAATAATTGACTGTTAATCAAGAGGTCGCTGGTTCGATCCCAGCCCGAGCAGTTTCCAAAACACATATTTATCATAAAAGGCCGTGACCTTGAAGTCACGGCCTTTTTATTACCAAGTCATAGCATAATAGATTACCTCAAACACTTTAAAAGCAACATATGCGGCGAATACATACGTGATGATAATACCACTGTATGCAAGGATAAATGTGTTCTTCATGGAATCACTCCTAAAATTATAGCTGTACGCTCTATTAAAATCTGATAAGCGTTATCATCATACTATCACTTGTTGCTTGAAATCCCACTCATTTTGTCTTCCTATTTACCAGCAGTCGCAGTTCCTAACGCCACGTTGATTACAGCGGTTTTATCAATCACTTCATAATCATTCCGCACAATTACGGAAAGACCTTGGCTGAACTGGTCGAACTTGTCCCATTGGGCAGTTACTTGGTTACGCCGGAAAACAGCCACCGCTTGTGATAAGTCCCCCGCAATCATTGGGAACGTCCCGTCCGCGTTGTTAGCCAGTAATTTATCACTGATCATGACGATTGGTGCCCCTAATAAGGTGAAACCACTGGGTGCTGTTGGATTAGGCTGTAATAAGTAACGGCCCTCGGTGTCCTTGAGTGTATCAAGGTAATTAAACCCGGATTGGTTCACTAGCCACATCTTGCTCAAGGCGGGATCTAACGTCACGTTGAAAATCTTTTTAAGATCATCAATACTGGTGGCCGTTGCTTTAGCAAAGTTACTACCCGTTAACAGTCCCATGATCTGCGTGTTGTCCGTGTTATCAACCAATTGTTGTAATTGCGTTTTGACTTCACTGACAATATCAACTTCGGCGTCTTCCACTACTTCGTTAGATAAGGCAATTTTACCCGCCCGGGTTTTCACATCAAACGGCACTTCCGTAAACATGTTTGCGTCAACGTCGGCAATGTCCGCTAGTTCGTTCTTAGTAGCCAGCACCGCAGATTGTTGACTAGTGGCAATTGGATAAGTCCCGGAACCGCTAGAAACTTGCTTAACCGTTGCATATTGGGCAAGGTTGTAATTAGATTGCTTTAATTGGAAAACAGGGGTAATCAGTTCCTTAGGAATAACGGCACTAGCACCGTCCGTCTTTAAACCGTCCCGAGTTTCCCCGTGCGTCCGGACATATTGTTCAAAAGCGGGAATACCAGTTTTGTTTTCGTTACCATTGTCATTGTTATTGGGATCAATAATTGTTTGTTTTGCCATGTTGTCAGGCTCCTTTTCTTGGTTAATAAATTTTTCATAGCTACGGGTATCAACTTGAACATTGGTATCGTCATAAGCGGGAACAGCAACCACTGAAACATCGAACAAGCTCTTAACTTGATTAATGGTTCGGGTGATATTGCCATCATCATCTTTAGCCCATTCATCGGTGTTGTCGTCACTATCAAAGCCAAATGAACAGGAATCAACGTTCCCACTTTGAACTTCTTCGTATACATCATTAGCAAAAGACGTATTTGGTAGTTGCGCAATGAAATGTAGCCCCTTATCGTCCGTTTCTAGCGTTAACGTGCCCGCCTTGACACTGGCTAACACTTGGGTATAGTCGTGGTTATTAAGCATAAGAACGTTTGATAAATCGACACCATCAAGCGCCTTGGGGGTTACAATCTCGGTGAAGCCACCTAAGTCTTTACTTGGCGAGTTCCATACAATTGCATAACCACTAATTGTTTTGCCCTTGCTTGTTTGGGAATCTTTAGGTTGCGGGTCTGCTGAATTTTCAGCTGGCCCGTCTTCGGGTGTTTCTGACTGCGGCGTTTGTGCTCGCAATTCGGCGTCAATCGTTAACCGTCGGTCTTGTTTCATGAATTAGTCACTCCATTCTTTTGTAAGTTTAAGAAAATATTGCCATCGTCAGTTGGTGGCAAGCCAATCTTGGCCCGAGCTTCGTTACGGCTCATAACGCCGCCAGTGAAACCAGCCACCGCTTGGGCTTGTTGCGTTTGCGGATCAAGGCTCAATAGCTTGTCCGTATTAAACGTAAAGTCATGACCAAACTTGAACGACAGCTCGCTGGTAAAGCTATCAAAGTAATGTTGCAACGTGCCTTGCAGGTATTGCACGCCGCTTTGTTCTTGGTTAGAATGATCGTTTTCAACCCCTAAGCGCTCCGGTGGTAAGCCAAAGGCTTTAGCAATTTGCCGGGTCGTCCAGTCATTCGAGTTGACCAGTTTTAACACATCGGTATTTAAGGATAAGTTACTAATATCCATCGTGTCATCGGTCACAATCGTGTTGATCGCGTTATCACCCGTATTGGCTTCATCAAACTGGTTACGAATATTGCCCTTGGCTTCCGGCCCTAAATCAGATTGATGGACTTTAATAATCGTGGTGCCATGCACACCCGCAGTAAAAAAGCCGGTTAGCAATTTATTGCCGGCCGACTGAATCTGGCGCTCATCTTTGAGGGCATATAGAGGACTAATTCCCGATACGCCGTCTTTGGTGAAATATTTAAAATGTAAAATGTTATTAGGCGCGATCTGACGACTGTTACCACCAATCGGGGTATAGGTGTAGGTTAACGCCCCACTGACGTCATCTTGTTCAACTGTCAATTGGTTATTGGCAATCAATTTCAACGTATGATTAGGCAAAATCTCCGCAAAACTATTGCCATTGAGTAACAGGTTGGCCGCCAACGCATATTTGAAATGGTAGCCGTCCATTTGGCTATTGGGGGTCTGATTAATCATCGTGTTAAAAATGGCCGTATCGCAAACAATCGGATTGCTGGCAATATCGCTCGCAATAATGTTAATTGCCGCGTAAATGTCACTATTACGCAACACCGCCGCACTCACAAACGTATACGGGTCATTGCTTGATAAACTAACCAAGGCGTCAGCTACCGGATCATGCGTGCCGCTGGTGTTACTGCTTTTAACGAAAAAACTCATTTAATCACCTCTTTGCTTTTCATAATTAATCAGCAAGGCCAACAGAATCATGGCTATACCAGCCAATATTAACCCCGCTTGCCAACTGATCCAGCAGCCAAAACCAATCACTAAGCAGATTAAGCCAATCACCAACAAGATCGTTTGTACATAATCAGAACAAATCTGCCGCAGTCGCTGTTTTGTAGTAATCTTCTGCATGTTGTTGATCCTCACTTTCTTGGTAATAGTCCATACCCGCTACAAACGCGTTAATCAACGCCGCAATCGGGTCAATCCGGTTACTATTACGGGCTTTATCCAGTTGCCAACCATTGTTTAGCACTTTCAAAATGGCGTTATTGACCGCATAAGCGAGAATCTTGTTACCGTTATGTTTAATCTTGTCATCGTAAAGCTGATCACGAAAATTGCGGGTTGGAATATTCAAAGTCTTGGTGCCTTGTCGCACTTCAAACAGTGGGTAGCTTAATTTCTCGAATTTTGTAATTAACGTTTGCGCGTTATACGGGTCATAAGCGACAGCTTTCACTTTCCAGTTGTATTTTCCGACCAGTTTTTGTACAAAATCAAATAGATCATCATAGTCGATAATGCCGCTATCTAATCTGGTAATGCTACACTCACCCGCCCGTTCCATTGACCGGTAATCAATCCCATCACGTTTAATCTTAGAATCAAGGCCGTACTTAGTGCCCACAAACGAATGACTATCACAATAAAACTGACCATTGCCAATTGGTATCAACCAACTAACCGCGGTCAAGTCATTACTTTTTGATAAATCAATGCCAATATAGGCGTCACGATTATGTAAGTCGGGTACCTTGGCCAATTTACCGGCGGCCCAATCGTCGGCTGAAATATAGCTGTCCTCACTGGCTTGCAACCACATATTGAAGTTCTTAACCAGTACCGGAATAAGGTTATTTTGCTTAATTGCAAGGTCAACATCGGCCTGAATTTTCTCCGTCATGCGTTGCTTAACGTGTGGTTCACTGAATAACGGGTTCGCCTTGATCCAATTAGCTTGATCGTAAACTTCTTCGCGGTCGTCCAGTTCCCAGATTGCCACAAAGTAACGGTCAGCTTCAGTCTTGCCCTTTAAAACGTCCGTCAGCATGTCATACTCGGCGTGCATTGGGACATTAAGGTTAAGGCCCGAGGTGGAAATTACCGCCAGCAGGGAGTTATCTTCTTGTGCTTGACCAGACTTTAAAACGTTGTACACCTTGCGGTCTTTAGCTTCGTGCCATTCATCTAAAATAACGGTAGTCCCGGCATAACCATCAAGCGTACTGGTATCACTGGCAAGGGCTAAGGCTTGCGAATCAGTTTCTAAGTCAGTAATGGCTTGCTTCTGTACCTTAATCCGTTGCCGCATGTACTTCGATTGCTTGCGGACTTGCCGTAGCCCACTTGATAGCATGTCGTAGCCTAATTTAGCTTGTTTAAGGGCGTTGCTGACGAATAATACTTGTCGGTTACGGGCGGGCTGACGTTCTCTTAAAAGACCATTAGCGGCCATACCAGAAGCCAGATAGGTTTTACCGTTCTTCCGAGCCATACTAATGAATGCTCGATCATAGCGCCGATTACCGGTTGCTTTTTCACGCCAGCCATACAGCTCACTAATAATCCATTTTTGAAAGGGTTGCATGGTGAGTTGGCTACCGTCAGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP035113|2075189:2082522|2082183_2082522_-|QAR38292.1|head,tail|DBSCAN-SWA MKNYNLSRLNKRVQFGTVKSVENPINGTTKQQFVPLFTVWCGEYTLTISNTISLAGTTATTNQLIAVRHDDRITTTLEAILDGVTYRIAGVSSDSEMNAYDVVTLTKVNGHG >CP035113|2075189:2082522|2075189_2075459_-|QAR38285.1|head,tail|DBSCAN-SWA MSVTVDDIKLSLRIDVTEDDPMIQSYLDAAKDYVQTAVSKNEDLTVYKQYDFAVSLLTQFWYQNRVTDMTKTPYQVVSMIQQLRGKIEA >CP035113|2075189:2082522|2077406_2078507_-|QAR38287.1|portal|DBSCAN-SWA MSFFVKSSNTSGTHDPVADALVSLSSNDPYTFVSAAVLRNSDIYAAINIIASDIASNPIVCDTAIFNTMINQTPNSQMDGYHFKYALAANLLLNGNSFAEILPNHTLKLIANNQLTVEQDDVSGALTYTYTPIGGNSRQIAPNNILHFKYFTKDGVSGISPLYALKDERQIQSAGNKLLTGFFTAGVHGTTIIKVHQSDLGPEAKGNIRNQFDEANTGDNAINTIVTDDTMDISNLSLNTDVLKLVNSNDWTTRQIAKAFGLPPERLGVENDHSNQEQSGVQYLQGTLQHYFDSFTSELSFKFGHDFTFNTDKLLSLDPQTQQAQAVAGFTGGVMSRNEARAKIGLPPTDDGNIFLNLQKNGVTNS >CP035113|2075189:2082522|2075868_2077410_-|QAR38286.1|capsid|DBSCAN-SWA MKQDRRLTIDAELRAQTPQSETPEDGPAENSADPQPKDSQTSKGKTISGYAIVWNSPSKDLGGFTEIVTPKALDGVDLSNVLMLNNHDYTQVLASVKAGTLTLETDDKGLHFIAQLPNTSFANDVYEEVQSGNVDSCSFGFDSDDNTDEWAKDDDGNITRTINQVKSLFDVSVVAVPAYDDTNVQVDTRSYEKFINQEKEPDNMAKQTIIDPNNNDNGNENKTGIPAFEQYVRTHGETRDGLKTDGASAVIPKELITPVFQLKQSNYNLAQYATVKQVSSGSGTYPIATSQQSAVLATKNELADIADVDANMFTEVPFDVKTRAGKIALSNEVVEDAEVDIVSEVKTQLQQLVDNTDNTQIMGLLTGSNFAKATATSIDDLKKIFNVTLDPALSKMWLVNQSGFNYLDTLKDTEGRYLLQPNPTAPSGFTLLGAPIVMISDKLLANNADGTFPMIAGDLSQAVAVFRRNQVTAQWDKFDQFSQGLSVIVRNDYEVIDKTAVINVALGTATAGK >CP035113|2075189:2082522|2081801_2082191_-|QAR38291.1|DBSCAN-SWA MAKPMKQCEHPGCRTLVAYDTRYCEKHHKATNKWRYHKRMYDSDESKYQQFYKSSAWRKLSRRFLESNPVCVQCYQDGVIRKADVVDHVIEIKDDWSRRLDESNLQPLCYRHHNRKTRLAREQREQQTK >CP035113|2075189:2082522|2078661_2080365_-|QAR38289.1|terminase|DBSCAN-SWA MIEYVDQVLSGQVLAGQKIKWACERFKRDLSRSKDDSFPFYYDEDEAAQAVKFIELMPKTDGSQLTMQPFQKWIISELYGWREKATGNRRYDRAFISMARKNGKTYLASGMAANGLLRERQPARNRQVLFVSNALKQAKLGYDMLSSGLRQVRKQSKYMRQRIKVQKQAITDLETDSQALALASDTSTLDGYAGTTVILDEWHEAKDRKVYNVLKSGQAQEDNSLLAVISTSGLNLNVPMHAEYDMLTDVLKGKTEADRYFVAIWELDDREEVYDQANWIKANPLFSEPHVKQRMTEKIQADVDLAIKQNNLIPVLVKNFNMWLQASEDSYISADDWAAGKLAKVPDLHNRDAYIGIDLSKSNDLTAVSWLIPIGNGQFYCDSHSFVGTKYGLDSKIKRDGIDYRSMERAGECSITRLDSGIIDYDDLFDFVQKLVGKYNWKVKAVAYDPYNAQTLITKFEKLSYPLFEVRQGTKTLNIPTRNFRDQLYDDKIKHNGNKILAYAVNNAILKVLNNGWQLDKARNSNRIDPIAALINAFVAGMDYYQESEDQQHAEDYYKTATAADLF >CP035113|2075189:2082522|2080361_2080835_-|QAR38290.1|terminase|DBSCAN-SWA MSQKVKALASMKKHLTNDERDQRKDAEKALFDYPVLDLTPPDWLHDRALTEWQRVAPYLKANTPISELDRAMLASYCRTYATVQTCENDIRKNGLVQTNQETGARKPNPYVALQSQAMKDLKALANDLGMSLSSRARMELNKQKDKTPEDTFEAMLS >CP035113|2075189:2082522|2078507_2078708_-|QAR38288.1|DBSCAN-SWA MQKITTKQRLRQICSDYVQTILLVIGLICLVIGFGCWISWQAGLILAGIAMILLALLINYEKQRGD |
8 | Lactobacillus_phage(40.0%) | head,capsid,portal,tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2769540 : 2777792
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP035113|2769540:2777792|DBSCAN-SWA TTTATGACTGGCTAATGATTCGGGCTAAGCGGTCCGCCATCCGTTCCAGATTGGCTGGTCCCTGCGCCATGGCTTGATCTAAGGTCATGACTTGATCGACAATCGGTAAAACAGCCGTGACCCCCTGTTTGGCAAATGTTTCATTTGCACCTTTTTGCCGACCAACTAATAAATAGCAAGGCTTGCCGGCCGCTTGGGCTAACTGACTGAGCTGAATTGGTACCTTGCCCATAAAACTCTGATCGTCGACTTGGCCTTCACCAGAGATAACTAGATTCGCTTGGGCCACTTTCGTTTTAAGATTGCTCATTTCAGCTAACAATTGAAAACCAGAGCAAACGCGGGCGTGTAAAAAGTAACGTAATGCAAACCCAATACCACCGGCAGCCCCATCGCCTTCGTGGGCACTCACCGCACCAGCTGCGACCGTCATATAGTGAACTAAAGCGGCATCGTGAACCTGAATTTGAGCAACCGGTAATCCTTTTTGTGGGCCAAAAATCTTAGCTGCGCCGTTCGGTCCCGTTAGCGGATTCGTCACGTCCGCTGCACTAATGAACGAGACTTCAGCTAATTGTGGCAACACATGTCGATCGTCAATCTTAGTGACCCGACTTAAATCAGCGCCAGTCATGGCTAACTCTTGACCATCGGCAGCCCAAAAACGATAACCGAGCGCACGTAGGATTCCGGCACCACCGTCGACCGTTCCGCTACCACCTAAGCCCAGAATAATCTGACGGGCGCCACGCTCAATCGCATCTTTAATCAGTAGCCCGGTCCCATAGGTATTCGTTGCTAACGGCGCCAAGGTCGTCGTGACAAACTGGATTCCGGATGCAGCCGCAACCTCAATCACTGCCATTTTTTCAGTGGCAAAGTAGCCATACGTTGCAGTCACTGGCCGTTGCGCCAGATCCACCGTTGATGCCGTAATAGCTTGTCCACCAGCATGGTTAGCCAGCCACGCCGCCACCGTTCCTTCACCACCATCGGCAATCGCAACTTGAGTAGCGGTGATTCCGTGAGCCGCAAATCGTTTAGCCACTATTCGGTTGGCCTGAATGCTCGTGATGGAATTTTTAAATGAATCAATTGCGATCAAAGCGTGCATATTAACGTCTCCCTATTGACATAATTACTTTTAGTATAATCATTACAGCGGGCGCGAGCAATTCATATCAGTTGTCAGGTTTCTTAAAACTCGTTAAGCTTAAGTTACCAAAATTTTAATGGAGGCTGATAAATCATGACAAACAAATACGATTACGATGTGTTATACATTGGTGCGGGTCACGCCACGTTTGATGGCGCCGCACCACTCGCCAAGACTGGTGTTCGCGTCGGTGTGATTGAGAGTGGTCTGATTGGGGGCACCTGCCCTAATCGTGGTTGTAACGCCAAAATCACTCTTGATGAACCTGTCAAATTAACGCGGGAAGCAGCACGCCTCAATGATATTTTGAGCAGTGCACCAACCATTAATTGGACGGCCAACGTGGCCCATAAACAAGAGATTATTGATCCCTTACCAGCAGGCCTGACAGCTCGTTTGGAAGATGGTGGCGCAACGATCATTCATGGTCATGCCACGTTCAAGGACGCTCACACCGTTGTCGTTGATGATCAGCAAAACATTACCGCTGAAAAAATCGTTATTGCGACTGGTTTAAAGCCCCATCGTTTAGATATTCCGGGGACCAAGCTCGCCCACGATAGTAGTGATTTTATGAACCTTAAACGGTTACCACAAAGTATCGTCATCATTGGCGCAGGCTATATTGGTATGGAATTTGCCACCATCGCTAACGCAGCCGGTGCCCAAGTGACAGTCATGTTACATGGTGACCAGGCCCTCCGTGATTTTTACCAACCATTCGTTGCACAAGTGGTTGACGACTTAACCGAACGTGGGGTAACCTTCATCAAAAATGCCAACGTGCAAGCATTTACCAAACAGGATGACCAGTTCCAAGTTAGTTATGGCGACCACCAGCAATTAACGACCGACTGGATCCTAGATGCGACTGGTCGAATTCCAAACTTAGATGGCTTAGGCTTAGACCGGATTGGCGTCAAATATGACCGCCACGGCGTTTATGTCAACGACCACTTACAAACCAACGTTCCTAACATCTATGCAGCCGGTGATGTCCTTGCCAATGACTTGCCAAAGGTCACACCTGCAGCCTACTTTGAGTCCAAATACTTGATGCGTTTGTTCTCTGGTCAAACCAGTGCTCCCATTGACTATCCGGTAATTCCATCGGTCGTCTTTACTTCACCACGAATTGCGCAAGCCGGCATGAAAATACCGGCCGCTGAAAAGGCCGGCTTAACCGTTAGTGATAACGATTTAGCAGATTACTGGTATTATCAAGTCTCCAAGGAACCGATTGCCGCTAGTAAACAGGTCCATGACCAAGACGGCCATCTCGTTGGCGTGACTGAAATCAGTGATCAAGCTGAAGATGCCGTCAACGCACTACTGCCAGCTATCGAATATCAATTAGACCGTGAACAAATCGACCGTTTGATCGGTATTTTCCCAACCATCGGCTACGCAGCTTGGCACCGGGCTTAAAACAGAAAACACTGCTGCGACCGCCGCTTGATTAATCCCTTATTAATAACCAGAGCCGCCAATGAGCGGGGGTCATTGGCGGCTCTGGTTATGTTCGTTCCATTACTTTAGAAACCAACTCGGGCCTGCACATCAAGCATACTGACCATGCTATAATTGCGCCTATCTCAACGATTGAAAGGTTGGTCCTAACAATGGATGTGGATGCTCAAAAATTATTTACCTTAGTAGATGCTGCTTATAATCAGCCGATTACCAATCAACCATCCGATTCCTACCGCCAAGCGCTACTGGCAGCTGCAATCGACCTGAATAACAACGTTTCGCCACAGCAAGTAACCATCCAGCTATATCAAGCCTATTATCGTAACTATATGGTCCCAATGACTCTACCACGCCAGCATCGTGACCTCTACCAATACGTTCACACCCAATTACAGCGCCTCACGCGCAAAGAACAGCGTCATATGGCACTTGGGTATGGTCTGATTGCGACGCACCTAACATTTGGTCCCTTGAACTGAAATCAAGGTACTTACACGCATTGCGCTAGTTATCGTTTAGTATGAAGCATGATTAAACCGTGCCATTATCAAGGTCGAAATAGGACGCGCATCGGCTGACGAATAAACAGCCCATCTTTTTAGCACGTTTTAATCATAATAAAAGCCCCAGCGATTACTCATCGCTGGGGCTTCATCGTTTTTAAATTAATCGTCTAATCCCAATCGTTTGAAAATATCATCAACGTGGCGAAGATGGTAATGATAGTCAAACGCATCATCAATCGCAGCCTGGTCCAAATGTTCACGAATCTCGGCGTTACCTTCAACAAGTGGCTTGAATTGTAACTGTTCATCCCATGACTTAGCCGTCAGTGGTTGAACGAGGTCATAAGCACTTTCACGAGACATCCCCGTATCAATCAACTTGAGCAAGACACGTTGACTGTAGATCAACCCGTAAGTCGCATCCATGTTTTGCTTCATCCGTTCTGGGAACACCGTCAGCGTCTTAATAATCTTATTGATTCGAGTTAAGATATAATCCACTAAAATCGTGGTATCTGGTAAGATGATCCGCTCCGCAGAAGAGTGGGAAATATCCCGTTCATGCCACAATGGCACATCTTCATAGGCGGTCATCATGTGGCCGCGAATAACTCGTGCCAACCCCGTCACGTTCTCAGAACCGATGGGATTACGCTTGTGAGGCATTGCTGATGAGCCTTTCTGACCTTTATTAAAGAATTCTTCAACTTCATGAGTTTCAGATTTTTGCAAACCACGAATTTCGGTTGCAAACACTTCAACGCTTGTTGCAATCAAGGCCAAACTAGCAATGTATTCGGCATGTAAGTCCCGTGGTAAAACTTGCGTCGAAATTTCTTGTGCGCGCAATCCAAGTTGTTTGCAGACAAATTCTTCAACAAATGGTGGAATGTTCGCAAAAGTCCCAACGGCCCCACTGATTTTACCCGCTTCAACGCCTGCGGCCGCGTGTTCAAAACGCTCGATATCCCGATTAATTTCAGAATACCACCGGGCAATCTTCAATCCAAATGTGGTTGGTTCAGCGTGGACGCCGTGTGTCCGCCCCATTTCAACCGTATATTTATATTTTTTCGCTTGTTGTGCTAGTGTCGCCCGTAAATCTTGTAAGTCTTGGCGAATAATCGCGTTAGCCTGCTTCAACCGGTAACCTTGCGCCGTGTCGACAACGTCAGTACTGGTCAGCCCATAGTGAACCCACTTACGTTCTGCACCCAACGACTCGGAAACATCGCGCGTAAAAGCAACCACATCATGATGCGTTACGGCTTCAATCTCCGCGATCCGGTCAACATCAAACTTGGCATTCTCTCGAATTTTAGCAACATCACTTGCTGGAATCTTCCCTAATTCAGCCCAGGCCTCGTCGGCAGCAATCTCTACCTCCAACCATGCTTGGTACTGATTTTCTAACGACCATACTTTGCCCATCGCGGGACGCGTATAACGATCAATCATTGCTAATCCTCATTTCTTTTTAGGTATTCACTAACAAAACACGAACATTATTATAGCATACCCCTCGAGTAATTAATAGAGACGAACAATGAAAAAATACTGTTATTTTTCACTTCGTTTCCATATTAAGGACTTGTTTTCGAACTAATTCACCTTAATTATGAACGATTATTTGTGCTCAAAACAAGAACATTCGGTTTTTGGGTTGCGTTTTGACGTTAAAGTTGCTATACTCTTTCCTGTTGGAGTGGTGAACGTTTAACTACTCTTTAGGATTAATTATTCATAATTAAACTATTTAATGAGGTGGAAGAATATGGCATCAGTCGTAGTAGTAGGTAGCCAGTGGGGCGATGAAGGTAAAGGAAAGATCACGGACTTTTTGAGTCAGGAAGCAGATGTGGTAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP035113|2769540:2777792|2772317_2772647_+|QAR38883.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MDVDAQKLFTLVDAAYNQPITNQPSDSYRQALLAAAIDLNNNVSPQQVTIQLYQAYYRNYMVPMTLPRQHRDLYQYVHTQLQRLTRKEQRHMALGYGLIATHLTFGPLN >CP035113|2769540:2777792|2769540_2770653_-|QAR38881.1|DBSCAN-SWA MHALIAIDSFKNSITSIQANRIVAKRFAAHGITATQVAIADGGEGTVAAWLANHAGGQAITASTVDLAQRPVTATYGYFATEKMAVIEVAAASGIQFVTTTLAPLATNTYGTGLLIKDAIERGARQIILGLGGSGTVDGGAGILRALGYRFWAADGQELAMTGADLSRVTKIDDRHVLPQLAEVSFISAADVTNPLTGPNGAAKIFGPQKGLPVAQIQVHDAALVHYMTVAAGAVSAHEGDGAAGGIGFALRYFLHARVCSGFQLLAEMSNLKTKVAQANLVISGEGQVDDQSFMGKVPIQLSQLAQAAGKPCYLLVGRQKGANETFAKQGVTAVLPIVDQVMTLDQAMAQGPANLERMADRLARIISQS >CP035113|2769540:2777792|2775780_2776758_+|QAR38886.1|DBSCAN-SWA MGMEIFDYEDIQLIPNKCVINSRSEADTTVELGGRRFKIPVVPANMATVINDEIAKWLATNDYFYIMHRFAPETRRAFIETMHAAQLYASISVGVKSSEYDFIDDLAANQIVPEYITIDIAHGHADSVIAMIKHIKDVLPDSFVIAGNVATPAAVRDLENAGADATKVGVGPGKACITKVKTGFGTGGWQLAAVRWCAKAARKPIIADGGVRTNGDIAKSIRFGATMVMIGSMLAGHQESPGNILKIDGKTYKQYYGSASETQKGEHKNVEGKQMLVPYRGRLVDTLNEMQEDLQSSISYAGGRDLKAITKCDYVVVKNSIYNGD >CP035113|2769540:2777792|2774448_2775738_+|QAR38885.1|DBSCAN-SWA MASVVVVGSQWGDEGKGKITDFLSQEADVVSRYQGGDNAGHTIVFNGQTFKLRLIPSGIFFHDKLAVIGNGVVLNPKSLVEELQYLRDKGVNPDNLRISNRAHVILPYHITLDGAQEKAKAGGKIGTTNKGIGPAYMDKAERIGIRVADLLDKDTFAALLKRNLAEKNQIITKLYDLEPLKFEDIFDDYYAYGQTLKPFVTDTSVVINDALDNGQRVLFEGAQGVMLDIDQGTYPYVTSSNPVAGGVTIGSGVGPSKINNCVGVLKAYTSRVGDGPFPTELFDEVGDFIRETAHEYGTVTKRPRRIGWFDSVVLRHAKRVSGFTHLSLNCLDVLTGLKTIKVCTAYDLNGETIYHYPASLKELEACKPIYEEVPGWDEDITGVKTFEELPTNAQNYLRKLEELVGVKIATFSVGPDREQTNVIDHNIWG >CP035113|2769540:2777792|2776850_2777792_-|QAR38887.1|DBSCAN-SWA MTNERTPLLAAKHLEIAFGQEKREFVAVKDANFDIYRGETLALVGESGSGKTTIGRAILGVIPTKKGTIAFHEQLINQHLAIDAQREVMRKIQMIFQDPAASLNERATIEYIISEGLLNFHLFHSEQDRRDQVEQMIKAVGLLPEHLYRYPHEFSGGQRQRIGIARALIMRPELVVADEPISALDVSIRAQILNLLRQFQQESQLSYLFIAHDLSVVRFIADRVAVIHNGRILELAPTAELFTHPLHLYTQSLLAAIPIPDPQLARQKQLVTYHESVHDYTTDPAQFVELVPGHFIYANQSELVTYRQQLSMT >CP035113|2769540:2777792|2770788_2772123_+|QAR38882.1|DBSCAN-SWA MTNKYDYDVLYIGAGHATFDGAAPLAKTGVRVGVIESGLIGGTCPNRGCNAKITLDEPVKLTREAARLNDILSSAPTINWTANVAHKQEIIDPLPAGLTARLEDGGATIIHGHATFKDAHTVVVDDQQNITAEKIVIATGLKPHRLDIPGTKLAHDSSDFMNLKRLPQSIVIIGAGYIGMEFATIANAAGAQVTVMLHGDQALRDFYQPFVAQVVDDLTERGVTFIKNANVQAFTKQDDQFQVSYGDHQQLTTDWILDATGRIPNLDGLGLDRIGVKYDRHGVYVNDHLQTNVPNIYAAGDVLANDLPKVTPAAYFESKYLMRLFSGQTSAPIDYPVIPSVVFTSPRIAQAGMKIPAAEKAGLTVSDNDLADYWYYQVSKEPIAASKQVHDQDGHLVGVTEISDQAEDAVNALLPAIEYQLDREQIDRLIGIFPTIGYAAWHRA >CP035113|2769540:2777792|2772833_2774132_-|QAR38884.1|DBSCAN-SWA MIDRYTRPAMGKVWSLENQYQAWLEVEIAADEAWAELGKIPASDVAKIRENAKFDVDRIAEIEAVTHHDVVAFTRDVSESLGAERKWVHYGLTSTDVVDTAQGYRLKQANAIIRQDLQDLRATLAQQAKKYKYTVEMGRTHGVHAEPTTFGLKIARWYSEINRDIERFEHAAAGVEAGKISGAVGTFANIPPFVEEFVCKQLGLRAQEISTQVLPRDLHAEYIASLALIATSVEVFATEIRGLQKSETHEVEEFFNKGQKGSSAMPHKRNPIGSENVTGLARVIRGHMMTAYEDVPLWHERDISHSSAERIILPDTTILVDYILTRINKIIKTLTVFPERMKQNMDATYGLIYSQRVLLKLIDTGMSRESAYDLVQPLTAKSWDEQLQFKPLVEGNAEIREHLDQAAIDDAFDYHYHLRHVDDIFKRLGLDD |
7 | Streptococcus_phage(16.67%) | bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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