Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP035566 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,cas3,DEDDh,DinG,WYL | 0 | 0 | 8 | 0 |
CP035568 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 plasmid unnamed2 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP035570 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 plasmid unnamed4 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP035567 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 plasmid unnamed1 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP035569 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103300 plasmid unnamed3 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
796570 : 805084
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035566|796570:805084|DBSCAN-SWA CATGATGGCGAAAGTTGGTTTGATTATGGGGTCAATTTCTGATTGGCCAACCATGCAATTAGCGGCAGAACAGTTAACGGCACTGGGAGTCTCTTATGAGCGTCACGTTATTTCGGCCCACCGAATGCCCCAGACATTACAATCCTATGGTGAAGAAGCAGCGTCACGGGGAATTCAAGTTATTATTGCGGGTGCGGGGGGCGCTGCCCATTTACCCGGGATGCTAGCTGCCAATACACTACTCCCGGTAATTGGGGTGCCCATTAAGACCCATACGTTGAACGGAGTTGATTCGTTATTGTCAATCGTACAGATGCCAGCTGGCGTACCCGTGGCGACGATGGCGATTGGTGATGCGGGGGCTAAGAATGGTGCGCTAATGGCCGCCCAAATTATCGGTTTACGGGAACCACAAGTACAACATGCAATTGGAGAATTTCGTGCTCGTCAACGTCAGGAGGCTGAACAAAGTGAACGCCAATTTTAAGGAAGCACTCTTACCACCCGCAACGATCGGAATCGTTGGTGGCGGTCAACTCGGTCAGATGATGACGCTTAGCGCGAAGGCGATGGGCTATCGGGTAGGTGTCCTTGACCCGACACCCAAAGCACCGGCAGCCCAGGTCGCAGATTTTCAGATTGTTGCGGCTTATGATGATCAGGCGGCTTTACTTGATCTAGCGCGCCGTAGTGATGTCTTGACCTACGAGTTTGAAAACGTTGATGAGAATGCTTTGATTGCTGCGCAAGCCTATGCAAAGTTACCGCAGGGCACTGCACTCCTGCATATTACTGGAGATCGTCTTAATGAGAAGCAATTTCTTCATGATCATGGCATCCCAGTCACATCTTTCGCACCGGTGACGGATTTACAGTCATTAAATTACGCCCTCAACCGTGTTGGTACGCCGGCAATTCTCAAAACGGCGGCAGGTGGCTACGATGGTCACGGACAAACGGATCTAGACACAGCAGTGGTGACAAAAGCCGCTAGTGCCTTATTGACACAGCCGTGCATTCTAGAGGCGCGGCAGAAATTTCGAACAGAAGTTTCCATGATGGTGACGCGTAGTGCTGCTGGTGTTGTTACGACTTTTCCGTTAGTTGAAAATCAGCATCAACATCATATCTTACACACAACGATTGCCCCGGCTAATGTTCAGCCCAGTGTTCATAGTGCGGCCCGCAAAATTGCGGTTTCGATTGCTGAAGCCCTAGAACTACGTGGCGTGCTAGGAATCGAATTCTTTGTTTTACCGGATGATACTTTATTAGTCAATGAACTGGCACCACGCCCACATAATTCTGGTCACTATACGATTGAGGCCTGCAACATCTCGCAGTTTGAGGCCCATATTCGAAGTATCTGTGGCTTACCGATTCCGGCCATTACGCAGACCAGTCCGGCAGTGATGCGTAATCTGCTAGGTGATGACTTAACAGTGGCACGGCAACAGTTGGTTGAACACCCAGAATGGCATTTTCACGACTACGGTAAGGCGGCCATTAAGCCCCAGCGCAAGATGGGCCATGTCACCGTATTAAATCACGATATTGACGCAGCATTAGCGTCGGTGGCAAATTTGAAAGGGGAACAATAATAATGACGGCAGCGATTGAGAAACAAGCTTTGCTTTACACGGGTAAAGCGAAAGCGATGTATGCCACTAATGATCCTGAAATTCTATGGGTCGAATACTTAGATCAAGCAACAGCGCTAAATGGTAAGCGGAAGGTTCCCATTGACCAGAAAGGCCGATTGAATAATCGCATCGCGAGTTTGATTTTCAAAGACTTAGCCAATCACGGCATTGCCAACCATTTTATTGAGCAACCTTCAGACTACGTGCAACTTGTCCGTCGCGTGACCATGATTCCCTTGGAGACAGTTGTTCGGAATGCGGCTTCGGGTAGTTTTGAGCGTAAATTTGCCGTGCCACACTTAACCAAATTTGCAGAACCAGTACTGGAATTTTTCTATAAGAGTGATCAGCTGGATGATCCATTTATCAATGATTCACAAATCCACGCGCTAAATGTTGCAACACCGGCAATCGTGGCAGAAATTAAACGGCAGGCCTTACAGGTTAACCAGCGTTTGACGGCAATTTTTGCGGCGATGGGGGTACAGCTCGTTGATTTTAAAATCGAATTTGGGTTGACGACCACCGGTAAAGTCTTACTGGCTGATGAAATCTCACCAGATAGTTGTCGGTTAGTCGACCTAAAGACCGGTGCATCGCTTGATAAGGATGTCTTCCGCAAGGATCTGGGCGACTTGACTAGTGTTTATCAGGAAGTATTGACGCGGCTAGCAACCGTCGAGGAGGCCTAACATGTACTTAGTTAAAATCTATGTGACTTATAAGCAATCAATTCTAGACCCCAAGGGTGAGGCGATTCATGATGCCTTACACCGACTTGAATATACGAATGTCGATGCCGTTGAATTAGGTAAGTATTTTGAGGTGAAAATTCACGCGGATGATCGGCCAGTTGCCGCTGAAATCGACGAGATGTGTGATCGCTTGTTAGCCAACGTTAATATGGAAACTTATCGTTACGAAATTACTGAGATGGAGGCTTTGTAATGATGAAATTTGCCGTACCAGTCTTTCCTGGTTCTAATTGTGATCATGACATGGTGAATGCCTTGCGCGATATTTTACACGTTACGGCTGATTTGATTCCGGCGACAGCGACCTCATTAGCAGGTTATGACGCGGTGGTGTTACCTGGTGGCTTTTCGTACGGTGATTATTTACGGAGTGGTGCGATTGCCCGCTTTGCACCCATCATGCCGGCCGTTATTGCATTTGCTAACGCTGGTAAACCAGTCATCGGAATCTGCAATGGCTTTCAAGTCTTGACCGAAGCCGGATTATTACCTGGTGCATTGCAGGCCAATCGCTCAGCGAAGTTTATTTGTCAGGACAGCCCATTACGAATTGCCAATCATGAGACGATTTTTACCACCGCATACGGATCGACAGATCAAATTAGTTTACCGATTGCCCACGGCGAAGGCAATTATTATTGTGATGAGGCCACCTTGGCGCAATTACGTGCTAATCATCAAATCATCTTCGAATACGTCGAGAATCCAAATGGCAGCACGGCTAATATTGCTGGCATTACAAATGAAGCGGGAAATGTGCTTGGGATGATGCCCCATCCGGAACGGGCCGTGGAGATGATCTTAGGTTCCACGGACGGTCTCGGAATTTTTCAATCGGTCATTGCGAGTCAAGAGGAGGTCACCCATGCTTAAAAAGCAACCATTATCACCTACAGATGTTCGCGATTCTAAGGTCTATCGGGATTGGGGCTTAACCGATGCTGAGTATCAATTATTAACGGATAAGGTCCTTCAACGCTTACCTAACGAGACTGAAACCGGATTGTTTTCCGGCATGTGGAGCGAACATTGCTCCTACAAGAATTCAAAACCAGTCTTGAAAAAATTTTGGACGCAGGGTGAACAGGTACTTGAAGGGCCTGGTGAAGGCGCCGGTATTATCGACATCGGTGATGGTCAGGCCGTGGTCTTTAAAGCTGAAAGTCATAATCATCCGTCTGCAGTTGAACCTTATGAGGGTGCGGCAACGGGTGTGGGTGGTATCATTCGGGACATCTTTTCGATGGGGGCCCGGCCGATTGCGCTGCTGGACAGTCTTCGCTTTGGGGAACCGACTGATGCTCATACGAAATACTTGATTTCGCAAGTAGTCGCCGGCATTGGCGGTTATGGCAACTGTATTGGAATTCCGACAATCGGTGGTGATACGGTATTTGATGCGAGTTATCAGAAGAACCCGTTGGTGAACGCCATGTGTGTTGGAATCTTGGATCAAGCTGATATTCAGAAGGGCCAAGCAACAGGAATTGGCAACGCCGTTATTTATGTCGGCGCAAAAACGGGGCGTGACGGCATTAACGGTGCGTCCTTTGCCTCTGCTGAATTTAATGACGCCAATGAAACCCAGCGTTCCGCGGTTCAAGTTGGTGATCCCTTTATGGAAAAATTATTGATGGAGGCGTGTCTCGAGGTTATTCATGAACATCGTGATGTTTTAATCGGGATTCAAGATATGGGCGCGGCGGGCCTAGTTTCCTCCTCAGCCGAAATGGCGTCCAAAGCAGGCAGTGGGTTGTCACTGAATCTTGACTTGGTACCACAACGTGAAACTGGCATGACGCCGTTTGAACTGATGCTCTCTGAATCACAGGAGCGGATGTTACTATGTGTCAAAGCTGGTGCCGAAGCAGAAATTTATCAAGTCTTTGAAAAGTACGGTCTTGATGCTGTCACAATTGGTAAAGTGACAGCCGGCCACCAGTATCAATTATTCCATCATGGTAAGTTAGTTGCAGATGTTCCCGTCGATGCACTTGCGACCAAAGCGCCGGTCTATGAACGCGAAAAGAAACGACCAACGCGCTTGAACCATCAGAGCCATCATCAATTTATGCCACGACTAGTTGATGCAACTGGCACATTGAAGAAGATGCTCCAACAGCCAACGATTGCTTCCAAAGCGTCGTTATATGGAACGTATGACTCGCAGGTCCAAACGAATACGGTCGTCAAGCCGGGTTCCGATGCGGGGGTCATACGGATTCGACATACGGATAAGGCGTTGGCGGTCACCACCGATGTTAACGGGCGATACTTATACTTAAACCCCCGTGTCGGTGGGGAAATCGCCGTTGCGGAAGCTGCTCGAAACATTGTCGCTTCCGGTGGGCAACCTTTAGGCATCACTGATTGCTTGAACTATGGTAATCCAGAGAAACCTGAACAATTTTACGATTTGGACGAATCGGCGATGGGCATCGCTCGTGCATGCCAATTATTCAATACGCCCGTGATTTCTGGCAATGTCTCGTTGAACAATGAATCGAACGGGGAAGCCATCTATCCCACCCCAATGATTGGGATGGTCGGGTTAATTAAGCATCAGAAAGATATTACGACTAGCGATTTTAAACACGCTGGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035566|796570:805084|799832_802052_+|QBA76585.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEADFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >CP035566|796570:805084|802036_803491_+|QBA76586.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >CP035566|796570:805084|798172_798904_+|QBA76582.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >CP035566|796570:805084|797039_798170_+|QBA76581.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASALLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAEALELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ >CP035566|796570:805084|796570_797056_+|QBA76580.1|DBSCAN-SWA MMAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >CP035566|796570:805084|803487_804513_+|QBA76587.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSPDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAITADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVAGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLIVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTTSVVFEEAEHA >CP035566|796570:805084|804505_805084_+|QBA76588.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANVPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIELVLLAGYMRIIGPTLLNAYAHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFAAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >CP035566|796570:805084|799159_799840_+|QBA76584.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >CP035566|796570:805084|798905_799160_+|QBA76583.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLEYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
1000139 : 1050360
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP035566|1000139:1050360|DBSCAN-SWA 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62 | Lactobacillus_phage(52.94%) | capsid,integrase,tail,terminase,holin,portal,head | attL 1010947:1010967|attR 1051090:1051110 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1878004 : 1886697
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP035566|1878004:1886697|DBSCAN-SWA CCTAGTTAGTGGCTAAAGTTTGTAACGCCTGTAAACTAGCCGTACTGAGTACATCCACCGGCTGGCTTAATCCCGGTTGAAAGAAAAAGTCACCATAGGCTAATTGCTCGAGCGTTGCTCCCATCTGGATTGCGAGCGAAACGGTATTGATGACCGCCGTTAATTCTGCTGTAGACATTATTTGTGCACCTAGTATCCGATGAGTTTTATCATAAAACAACTTAAAATGAACGGTCGCATTCAATCGAGCTGGTGCGGATGCCACCAATCGGGGAACCGCGATGTAAGTTGCTAACACTGGTTGTTGCATACGGACAGCTAGTTGCGTGTTTAGGCCCGTAGCAGCAAAGTAATATCCCGCCGCATTAAGCGCGGACGTTGCCTGAACGCCGGGAAACACAATTCGCTGATCCGTTAACAAGTTATGCGCTAATAACCGACCGGCATGACTGGCCGCGCTGCCTAAAGTGATCCGCTCTTTAGTACCCGTGGGCGTAAACCGAACTTTAGTCGCATCGCCAATCGCGTAAATATCTGGAACACTTGTTTGAAAATAATCATCCGTCTCAATTAATCCCTCAGAATCTAGCGTCAAAGTTCCCCGTAGCCATGCAGTATTCGGCCGATTGCCGACTGCGACAAGGACTAAGTCGGCAGCATACTGACCACGATTCGTTTGTACCGCTGTCACGTGTGTTGAACCTAATATGGCCGTCACCCGCTCTTCCATCTTTAATTGCAGCCCATTCTCAACACTTGCTGCAGCTAAAATTTGCGTAAATTCTGAATCAAGATTGTGACTGAATGGCCGAGCGTTCACATCAATAACAGTTACTTGCTTGCCGGTTTGTTTAAATAAGGCTGCAAAATCCATCCCAATATAGCCGCCTCCAATCACGACCACGTTTTTAATTGCTGCTGACTTAGCGGCCAATTTTAACTCATTGATGCTGGCACGGTTTTGAATCGATCGAACACCAGATAATTCGGCTCCGGGAATCGGTAACTGGATTGGTAACGATCCAACGCTCAATACCAATCGATCGTAATGATCAGTCTGTAATTGCCCCCGTTGATTACGAGCAGTAATCGTGTGGGTCGCTGGGGTAATTTTTGTGACCGTCGTTTGGTCGAATAGAGTCACCTGCTGGGACAAGGCCAACCGCTCTTTTTCAGCATCCGCCGGAGCCCAATCCAAAGCCGTCGCGAATTGCCCGTGCTCGTACCAATGAATCTCATTATCCGTATTAGCTGCTAATAAGCCATTGACCGTTTCGCGGCCGCCATGTGCAGCCCCGACAATAATAATTTTTGCCATATTTTCCGCCTCTGATTACTTAAATTATTGTTAACAACGCTATTTAAGATACACGTTGTCTTTAACTACAACAATCGTTTGGCTACGGAAATCACTATTATTAAGGCACAAAAAGCAGTAAACTGTTTCTAAAACCAATTAGGAGATCTTTTTGTGACCCAACTCAATCAACGTCGACGTGGCAACCGACTGGAAAACGCGATTTATGACACCACCTATACCCTGCTTAGTCAATACGGCCTCGACCAGGTCACTTTTTCACGAGTAGCCACTGCGGCCGCTACCAGCCGCAGTGTTCTTTATCGCTACTGGGATTCGACCTTTGACCTCATCTTTCATACTATTATTCATCAAATACAAAAGACTCCCATTGCACTTACGACCACGCCATTAGATACTGGCAGTCTTCGTACCGATCTCATTCTGTTAGCGCAACGCTTTATCCAACAAACTAGTACGGGGCCCTTCCGCTATTTTCGGCTATTGTTTGCCACAGCCTTGAACGCGCAGAACCAGCGCGATCTCACGCAGTTAGTGACTCAAATTGATCATGCCAACTTGACCTTGATCGAGCCACTTCTGACGAATGCACAAAACCACGGTGAACTTCAGATTTGGCCTAACCAAGCCGCACAATTAGTATTATTTCAACAATTACGGTACTGCGACATCATCAACCAACCGATGAACACTGATCAGCAACTCACCAATCTCATTGATCAAGTCGTTTTGCCGGCATTGCGAGCAAGTGGCGTTGCTAACCGGCATTTTCATCATTAAAGAACCTCTTCCTCACAAGTCAAATAAAGTCTGATTTCCTAGCCCATACTGCGTTGGAAATCAGACTTTATTTTTAATATTGAACCAGCGTCACCCTTAACTAGCCAAAACCAGGCGACGCCCCCCTTTACCCGTCTAACAAATTGTAATCTGGCGCTTATTGACGATAATCTGCCCTTCAGCCGCCAATTGTTTAAACTGACGACTCAGGGTTTCGGGAGTAATCCCCAAAATATTCGCCAATTCCTTCTTCTTCAACGGCAATTCAAATTCGATTTGTCCGGATTCAACGGCACAATCGCGCAAATACGCCATCAAACGCGCTTTAGCATCCAGCAAATCTCGTCGCAATTGATTCTTCTCAGCTTCAATCAATTGGTTCCCAAAATTATTGATCATTGCTAATGATAAACTGGCTGATTCACCTAATAATCGCTGAAAATCATCATATTGAATGGAACAGACCCACGCATCACTCGTGGCTTGAATAAATCCCTGATTCTCATGCGGTGCAAATAGCCAGTGTTGTCCGACGACATCACCACTACGCAACAACTCAATAATTTTCTCCTTACCATTAGCAGCTAAGGCATAAATTTTAGCCGTTCCCTCATCTAAAATGAGCATGCCTTCCTGATGGTCGAGTGGCTGACGAATCAACTGCCCTTTTTGATAAAATTTCCGGTGATGGGTCACCGTGATTAATTTGGCTTTCACCGCTGGCGCTAGCGGTGAAAATAATGGTGAACGACTCACACAATCCATTTTTGAATGCATAATTTCTCCTTTTCTTGATCTATGTCAATTTTTATATGATTAGAATAGCATATACTGACCATATAATGAAGAACTGGAGGAATTATTCATGACTAAAAAATACGTTGCTAACATCGTCCCGCTGAACGCCGAAGGAATCGGTATTGCCCCCCACGGCACAGCGACTTTCACTGAAACTGGTAACCAATTACACGTCACCATTGAAATGTTCGATACCCCGGCCAACACGCAACACTGGGAACATTTCCACGGCTTTCCAGATGGCAAAGCAGCACAGATTGCTACTATGGCCCAAGATGTCAATCACGACGGCTTTGTAGACTTGCCTGAAACTGAACCTGTTTCTGGGACGACGATGGTCCCATTTGATAATGCGCCCCATCATATGGACGTACCGAATGATAATTACCCAGTTGCCGACGCGCAGGGCCACTTCGCTTATGAAATCGACGTGCCCTTAGCCGACCTACAGGCTAAGTTCAAAGAAGTCTTCGGTACCGATGACTTAGAACTAGACAAGCGGGTCATTTATATTCACGGCGTCCCACAAGACTTAGCCCTACCTGCATCAGTCGCTGGTGAAGTGGGCATGTATGATGCTCACGTAACCCTACCAATTGCAGTTGGTAAGATTGAGGTTACGGAAGACTAGGCAATTATTACTTAAACTCACAACCAAAAACTAAGACCGCTTACCACTATCAGTTAGTAGTGGTAAGCGGCCTTAATTTTTTATGAAATCAGCAAAAGCAAATCCTTTATTTGAATTGCACGATATCATTACTATGTTAGGCTATTTTTAACCAACATTAAATTGAGGTGTTTTCAATGACCAACGAACAACGAGTTATTCATATGGCAAATTCTATAATTAATCCGAACAGAAATTAAAAAGCCCAAAGCAATCACTTACAATGGTAGTAACTAATTCCAACCAATATAGGGAGTGATTACTTTGGGTACATCTACTTTATCACGTTTTCAACGTGGCGCACTAGCACAACTGGTCAATGAGGGGAATAAATCTTACCAAGTAATGGCTGACGCCTTAGGCGTCGCCAAAGCTACGATTAGCTATGAGTTGGACCGGGTTAAACCTTATGATCCAGAATTAGCTCAGCAAGATGCAAATCGCAAAAGGCGGAATTGCGGTCGTCGTTCGATGCTGACGGCAGCATTAGCGACTTTAATTACCAATCACTTACGATTAACCTGGTCACCAGAAACCATTGCGGCCGCTTATAACTTGAGCACTGCGTCAATTTATAATTGGCTTAATCGTGGCTGGCTCCCCTTCAAATTGACTGATCTACCCAATCGGAATGTCCGCCAGCACCGAGTGAGCGAAAATCGTGGGAAATTTACAAGTGGGACTTCCATCGAACAACGGCCAACAACTGTTAATCAACGGTTAGCTTTTGGTCATTGGGAAGTAGATACGGTGCTTTCTAGTCGAAGTGAGTCACGATCATGTCTGGTTACATTCGTAGAACGTAAGACCCGACTTCTATGGGCCATCAAAGCCCCTAATAGAACGGCTAAGGCTCTAAACACCGTCTTTGGCAAGTTTATGGGGGACTTCGGTCCCCAAGTAAAATCCATTACTGTTGATCATGGTAAAGAGTTTGCCAATTATCAGGCCTTAGAACAGGATTATCAGATCAAAGTTTATTTTTGCCATCCATATTCACCATGGGAGCGAGGTTCCAATGAATATTTTAATAGACGGTTACGCTGGTTCTTCCCGAAAAAGACCAATTTTAGCCAAGTAACGACTGATGAGATCCTAGCAGCACTTGAACTAATTAATCAACGACCATTAAAAATACATCATCAACAGACTGCCATTGAAAGATTCCGGGCTTGTTCGGATTAAACTTGTAATTTGCCATATTATTAAAACAACTCCTGCTTTAATGACGATTCTTCAATTAATTCAAGACTGTCATTTAAAACAAGGCGCATTGGCGGCTGGTAGCATCCGTAATACTGTTTGGCAAGTACTCAGCGGGCAGCCAGTGATGTTCAACAGTGATATTGACGTCGTCTTTTTTGACCCTGAGCGACCAGCCAGCGATGATTTAAAAATCTATCAGCAACTTACTGATAAAGCCCCACAATACCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP035566|1878004:1886697|1881833_1882754_+|QBA77562.1|transposase|DBSCAN-SWA MGTSTLSRFQRGALAQLVNEGNKSYQVMADALGVAKATISYELDRVKPYDPELAQQDANRKRRNCGRRSMLTAALATLITNHLRLTWSPETIAAAYNLSTASIYNWLNRGWLPFKLTDLPNRNVRQHRVSENRGKFTSGTSIEQRPTTVNQRLAFGHWEVDTVLSSRSESRSCLVTFVERKTRLLWAIKAPNRTAKALNTVFGKFMGDFGPQVKSITVDHGKEFANYQALEQDYQIKVYFCHPYSPWERGSNEYFNRRLRWFFPKKTNFSQVTTDEILAALELINQRPLKIHHQQTAIERFRACSD >CP035566|1878004:1886697|1883810_1885025_-|QBA77565.1|DBSCAN-SWA MDTMKKVAAALAALKRGELIIVADDETREAEGDMVGLAAKATTATVNRMITSARGLLCVPMAPSIATRLHLTPMTSEHDAFGTAFTVSADHQTTSTGISAADRATTIQALANPNSQAADFYHPGHVFPLIARTGGLLARRGHTEAAVTLAQLAGVTPAAYICEVIKKNGLMARRRDLKALAEGLQLPLITIEDITTYVIQTGAAQLTTTPSVNLPTKDGQFTMTGFEVPGHMALPVALQAGDISDDEPVLVRLHSECFTGDVLGSQRCDCGDQLHAALQKISQAQRGVFVYLRQEGRGIGLANKLAAYALQEHGVDTYDANVQLGFQPDERRYDIAALILRQMGITRVRLLTNNPDKVEQLRAAGIDVVERVPLEIPANQYDQAYLKTKRDRFHHQLTLTEGHE >CP035566|1878004:1886697|1880236_1880878_-|QBA77560.1|DBSCAN-SWA MHSKMDCVSRSPLFSPLAPAVKAKLITVTHHRKFYQKGQLIRQPLDHQEGMLILDEGTAKIYALAANGKEKIIELLRSGDVVGQHWLFAPHENQGFIQATSDAWVCSIQYDDFQRLLGESASLSLAMINNFGNQLIEAEKNQLRRDLLDAKARLMAYLRDCAVESGQIEFELPLKKKELANILGITPETLSRQFKQLAAEGQIIVNKRQITIC >CP035566|1878004:1886697|1885026_1885629_-|QBA77566.1|DBSCAN-SWA MFSGIIQTKGRVSQVHQQGLEMTLTITAPSLMTPSLKIGDSIAVNGICLTVTIRQADAFSVVVMPETVRRTNLKILVVGSLVNLERALQVNAHLDGHIVQGHIDYCGQVLQRQSDAHALRLLISLPSEYRALVVTKGSVAVDGVSLTVVAVTETTFEVDLIPHSQAVTTLSELQVGTLVNVETDILGKYLARQLALEGSH >CP035566|1878004:1886697|1882794_1883304_+|QBA77563.1|DBSCAN-SWA MTILQLIQDCHLKQGALAAGSIRNTVWQVLSGQPVMFNSDIDVVFFDPERPASDDLKIYQQLTDKAPQYQWQIKNEVYMAHYNFDKDPEFTSVTDAIGHFVEVPTCIGAFLDENQIKLIAPYGVDDLINFRCSPIPYYRQDAKHMAIYQQRMAQKQWHQQWPKLQIDGI >CP035566|1878004:1886697|1879474_1880101_+|QBA77559.1|DBSCAN-SWA MTQLNQRRRGNRLENAIYDTTYTLLSQYGLDQVTFSRVATAAATSRSVLYRYWDSTFDLIFHTIIHQIQKTPIALTTTPLDTGSLRTDLILLAQRFIQQTSTGPFRYFRLLFATALNAQNQRDLTQLVTQIDHANLTLIEPLLTNAQNHGELQIWPNQAAQLVLFQQLRYCDIINQPMNTDQQLTNLIDQVVLPALRASGVANRHFHH >CP035566|1878004:1886697|1880966_1881530_+|QBA77561.1|DBSCAN-SWA MTKKYVANIVPLNAEGIGIAPHGTATFTETGNQLHVTIEMFDTPANTQHWEHFHGFPDGKAAQIATMAQDVNHDGFVDLPETEPVSGTTMVPFDNAPHHMDVPNDNYPVADAQGHFAYEIDVPLADLQAKFKEVFGTDDLELDKRVIYIHGVPQDLALPASVAGEVGMYDAHVTLPIAVGKIEVTED >CP035566|1878004:1886697|1885629_1886697_-|QBA77567.1|DBSCAN-SWA MLTDFMQMAIDQAKLAGVATYQNPQVGAVLVKDGHVLAQGYHHYFGGDHAEVDVLRQATPEQARGATLFVTLEPCSHYGKTPPCSARIVAAGIRQVVIGQLDPHPIVGGKGRQYLLNHGVDVVTGCLTDKVRALNPHYNHFYVQQRPWITLKTAITLDGKINTETPTRTLVSNHASYIDSQCLRSQFQAILIGERTLTIDDPQLTVRLTAMVQPPVRLVVLNTSTVALNHRLVQDGQAPTWLLCRQAAASDDQLRNSPNVHVLIGNWTSAAIGQLCVEQGWQSLLVEGGAHLQAEFVAAELIDEWVSYIAPMMIGGTGLPAVTGAAAMTPLTFEQPTVTCLGTNIRLRAVRKEVK >CP035566|1878004:1886697|1883334_1883814_-|QBA77564.1|DBSCAN-SWA MTTFNGKINGNGLKIGIVVARSNAFVTQQLLTGAQESLVQHGVNEIDIDVAWVPGAFEIPLTVQKMITTKRYDGVIALGAVIRGATAHFDYVCSGVTTGIATVSLATDTPIMFGVLTTDTIEQAMDRAGFKSGNKGADCAVSLLETLDVQRAILKADLA >CP035566|1878004:1886697|1878004_1879321_-|QBA77558.1|DBSCAN-SWA MAKIIIVGAAHGGRETVNGLLAANTDNEIHWYEHGQFATALDWAPADAEKERLALSQQVTLFDQTTVTKITPATHTITARNQRGQLQTDHYDRLVLSVGSLPIQLPIPGAELSGVRSIQNRASINELKLAAKSAAIKNVVVIGGGYIGMDFAALFKQTGKQVTVIDVNARPFSHNLDSEFTQILAAASVENGLQLKMEERVTAILGSTHVTAVQTNRGQYAADLVLVAVGNRPNTAWLRGTLTLDSEGLIETDDYFQTSVPDIYAIGDATKVRFTPTGTKERITLGSAASHAGRLLAHNLLTDQRIVFPGVQATSALNAAGYYFAATGLNTQLAVRMQQPVLATYIAVPRLVASAPARLNATVHFKLFYDKTHRILGAQIMSTAELTAVINTVSLAIQMGATLEQLAYGDFFFQPGLSQPVDVLSTASLQALQTLATN |
10 | Staphylococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1892402 : 1964744
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP035566|1892402:1964744|DBSCAN-SWA TTCATCCGTGCACCCGTTGCGAATTCACAATAGCTGGCTGTTGAGTTGCCGTATAATCATCCGTTTCAATAATATAGCGGGGCCGGTGCTTGACTTCCACAAAAATTTTTCCTACATACTCGCCAACAATACTAATACCAATCAATTGCATCCCACCTAAAAACCATAGACTTGTCATGAGTGAGGACCAGCCACTCGTTGCGGTCCCTAGTAATCCTTGTATTAACGCATATAGCATCATCATCAAACTACCGCCACTAATCACCATACCGAACAATAAAATTACTTTAATCGGTGCGATTGAAAATGACGTGATCCCATCAAAAGCAAAAGCCACCATCTTACGTAATGGATACTTTGAAACACCCGCAAAACGTAGTTGGCGATGATAATAAAGTTTAGTTGTTGGAAAACCTAGTCGTGGTACGATTCCACGCAAGAATAAATTGGTTTCCTCATAGGTTAACAGTGCCTGAACTGCCCGTTGACTTAATAATCGAAAATCGGCGTGATTAGGTACTAATTGCACACCAATACGCTTCATTAGCCGATAAAAGCCGTCCGCGGTCCATCGTTTGAAAAGTGAATCACTACTTCGATCATTGCGGACACCTAATACAATATCACTACCAGCACGATAGCGTGCCACCATTTCTGGGATCACCTGTGGGTCATCTTGCAAATCAGCATCAATCGTAATGACTATTTCAGCAGTCGGACTGGCGACCTGCATCCCAGCCATCAACGCGTTTTGATGACCAAAATTACGACTAAACTTAAGACCCGTCACGGTTGAGTACTGTTTTTCCAACGACTTAATCAGTTTCCAAGTCTTATCTTGACTACCATCGTCAACAAATAATAACTTACTTGCCGCATTGACCTGTTTGTGTTGGATCAGATCCGTCAAAATACCATCCAAGATGTGTGCAGACTTAGGTAACACCGCTTCTTCATTGTAGCAAGGCACAATAATGGTTAACCGTGGATTTTGCATGCCAATTCCCCCAATATGACTCAAATAGTTTTACGAAATAACAATTATAATTGCAACTTTCGGTATCATTAGCGCCATGCGATTGTGGCCCAAATTAGACACTTAACGAAAAACATTCCGGTATCATTAATAACGCAGAATATCTGCCCCCACAACTATCCACGACTAATTTTATAATCATTAATGCCTGACACCCACAATCCTCAAAGGCAAGCTTACGACTATTACTGTAATTATTTATCACAATCATCCAACCATTGACCTAGGCAACTGTCAGTGGTCACACAGCTCAATAGTTCAAATTGATAGTACCAATATCTTCCTCGCAATTCAAACAAAGCAACGATTTCGGTACCAACCATTAACAAATTATCCGAACTTAACCCCCGTGCTAGTACCACCCATTATTACGAACCGGTACAAAGAAAATGCGGAAATAACCTTGTGTTACGAACCATTCAGAATTCCAACCGAATCTTCAAAACCGATTTATTTAAGATTAAGTGACGGACTTATTATTAACCACAACAATCCATTTAAGCTCACAAAAATGGGCCTTCATAATTTCTGAAAGCCCATTATATAACTCTAAATCCATTGCATTCTAATTTCAGTCAAACAATAACTTATTTAGCTGGTAACCATACAAGCATCAACAACAATAAGGCAAGTCCAAGTATTGCAATGAGCAAGCTCTGGTGATTCTCGCTCGTTTGTGGTAACGTTACTGCCTTCGAAACTTGACCGGATTGATCTGCAGCCACCGCTAGTGAGCCATTTCCAGTTGAACCCACGCTATCTTGACCATTAGGTACGGTTACGTTTGAGTCAGTAGTGCCGTTATTGAGCCCCGTTATTTGACTAGTATTCGTACTTGATTGTTCTGGTATGGTCGTACTAGATTCTGCTGGTTTTGTCGAACTAGGCTGTTTCGGCTCTGACGTGCTAGGTTCCGCCGGTTTGGTGGTACCAGGCTGTTTCGGCTTTGTCGGACTAGGCTGGGCTGATTCTGTGTCACCAGGTTGTTCCGGCTTTATCGGACTAGGCTTAACTGGCTTTGTTGCACCAGGCTGTTCTGGCTTTATCGGTTGCACCAGTTGATCGGTAGCCTTCACTGTCACTGCCGCCGTCTGACCTTCAACAATGGTAAAGTCTAACGGTGTCTGATTCAAAGCATAGCCTGCTGGCGCTTTAGTCTCAATAAATTGATAACGACCAGGAACTAGTTCATCTACCCGAATTTGCCCCCGCGTATCAGTCTTTAAGCCATGCCGAATGGTTTGTCCGGCGCCATCTTTTAGATTATAAATTGCGCCAGCTAAGGTTTGACCGCTGTTAGCAGCCACCTTCGTTAAAACAACTGAACCGGTAACCACCGCTGTTTCATCAAATTGCGTCACTTCAACCGGCGTTGCGACCGTATCGGCATCAATCTTAAAATTAATAGGTGTTGAATTCAGCGTATAGCCCACGGGTGCTTTAGTCTCCACGAATTGATACTGCTCAGGAATTAAATCAGTGATATTTATGTCACCATTCTCATTAGTAGTCAGCCCCGATTCAATGACCTCCCCGGTACTATCCCGTAACTGGTATTCGGCGCCACGTAAAACCGCCTTAGTCGTTGAATCCCGTTTGGTCAACGTCACACTGCCGAGCTGATTATCACCATGTCCGGTCCCATTGCCACCATAACTGACATTGCCACTGAAGGTGGTTCCGTTCATGGATGCCGAGTTAGTCCAATCATTACTTCCTTCATTAACTTTCGTCAGTTTACTATTATAAACCATATTAACTGCAGTTGTGACGTTGCTGAAAGTAAAGGTTAGTTGATTACCATTAACGACAACTTGTGGAACGATTGTACCTGATTGTACGAAGTTCCCAGCATTATTATATGATCCAGTCTGAGCAACTACCGAACCCGGCAAATAACTTTGGTTGGGGCCCAATGTATCATTGACGACAACCGTTCCAATATTTTGACCAGTTGGATTGAAGGCAATGTTCCACGTTAAGGTTGCCGGCAATCCATGATCATCGTAACTCCCAATCCAACCAATTTTATTGAGTTTCCAATCAAAATGAACGTCAGAATCGGCGGTTCCCTTAACATAAAATTGTAGTGTTCCAGCACGGTTTGTCCCCGTTTGTGCCAATGTATCATTAAAAGTAATCTCTCCAGACGTTTCACCTGCCTTAATCGTAAAAATACCAACAACCCGGCCATTATCATTCTTCAATGGGAAACTCAAATCAACAGGCGCCACTGTACCGGCGGGCAAATCAACGGTCGCCGTATCACCCGCTGCAATTGGCTGACCGTCACGTACGGACCAATCATACTTAACAGTATAATCACTCCATTTACTCAAGGTACTTGTCTCTGTGACCACCTTACCATCACGATCCGTAATTACAGCCGCTCCCCCAGTCAGGCCAGTCGCTGGAATCACCGCCGCTTTCACGGTCCGCCCTAACACTAAGACTGTTGCTAAAACTGTTAACAGACCTAGCAGGACTGAAAACAATTTAACTCGCATAAAATTGCCTCCATTCTTTTTTAAACACAACCAAACATTGACAACTAGAACGTTAATTGAAATCTTCAATCGTTCTATTAACAAGTTATATTAAGCCCATCTTTTTTATCGCTGTTATTAATAAGTTGCCATTGATAAATTTACAAACAAATAGATATAAGTCCAATCTGCATTAGTTATACGGAGAACTTCGCCAGATAACGTCAACTAACTGTATTCGACCATATTTCCGCTTAATATTGAGACGTCTATACTAGCCACTTATCAAGTGTTATCAGCATTCCCATCACAACGCAATCTAGTAGTTAAAAATAAATTGACGTTGACCCCCAAAATCTCTAAAATTAAGCCATTAGTCTTTTTACTAAATTAACTTTAAGGAGTATCTTCATGGCACAAATTTATCTTGCTAGTCCGTTTTTCAGTCCTGAACAAGTGACACGGGTCACACAGCTCGAGGAAGCCCTCACTAAAAATCCAACGGTCACGGATTTTTATTCACCACGTCTACACCAGGACGCTCAAGCCGAACAGTTCACCAAAACTTGGGCGACCGAAATTTTCCACCGTGACATGGCCCAAATCGCAGCCGCGCAAGTCATCGTGACTGTCTTAGACTTTGAAGCCAAAAACTTAGATTCTGGTACCGCCTACGAGCTAGGTGTGGCTACCATGCGCGACTTGCCCATCATCGCCTTGCAGGAAAAAGATGAAGCCGTCAATCTGATGATTACCGAAAGTTTACACTGGTATACCAAACAAGTGAGTGACTTTGAAACTTACGACTTCCGACAATTGCCCCAAGGCGACTTTGTCGGTGAAATTTTATAATAAGGTAGATTGTAAAATTAATCCGAACGCTGTTCGGACAAAAAAGATCAGCTTCCTTTAAAATGGTGTTTACCACAAACCCATCTTTTAGGAGCTGATCTTTTGTCTAGGGACTGTCTGAAAACTAAAAATTCAGGTATAATCTGAGGAAAAACGAATCGAGGCATTCAGATGACAACACCTAAACGATACGAACTGGAAGATGCTCAGTGGGACCGAATCAAAGGATACTTCCCGCCATACCGGACTGGCCGTCCATCAAGCCTAGACAACCGTACCGCCCTCAACGCTATCCTCTGGCTCATGCGCAGCGGGGCTCCTTGGCGTGATCTACCTGAACGCTATGGCTCTTGGAAAACGGTGTATAGTCGCTTCCGAGCCTGGGTAAGTTCAGGCTTGTTCGAACAGGTTTTTCTCGAATTGATTGACGATCCCGACATGGAAAACTTGAGCTTAGATTCAACGATCGTTCGAGCGCATCAAAAGGCCACTGGGGCAAAAAAAATGCCGAATGTATGGTCGAAAATCAAGCTATTGGATTAAGTCGAGGTGGCCGAACGACCAAGATTCACGCACTCGTTGACGGATTAGGGAATCCCTTGGGTTTTCGCCTAACAGGTGGTCAA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58 | Lactobacillus_phage(70.83%) | transposase,tail,tRNA,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1970004 : 2002745
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP035566|1970004:2002745|DBSCAN-SWA 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44 | Lactobacillus_phage(94.12%) | capsid,integrase,protease,tail,terminase,portal,head | attL 1966055:1966070|attR 2000470:2000485 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2153700 : 2160767
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP035566|2153700:2160767|DBSCAN-SWA TGTGATTAATATTTATTACAATGTTGAGCCCTTACGTTCCAATGAAGAAATCACTGATTTCGTTAATAAGGCTCGGAACGGTACGCACGGTGAGCGTAACGCGTTGTTAATTCTAATTGGTTTAAATACTGGACTTCGAATGAGCGATATTCTTAACTTAAAGGTTGAACAAGTTCGCAATCACGATATCGTCTACATTACTGAAAAAAAGACCAAAAAAAAGCGTGTGATTTTACTCACACGCCTACGTCCACAAATCAATCACTATATTAAAGATTTACCAGATAATGAATATCTTTTTACCAATCGACAACATCAGCCACTAAGTGTTAATGCCGTTTATAAACTTTTCCAAACCATCGCCCGTAAAATGCACCGAACGGATATTGGTACCCATACGCTCCGTAAAACTTTTGGCTACCATTATTATCAGCAAACCCACGACATTGGAACTTTAATGATGATCTTCAATCATTCTAGTGAAGCAATTACGAAACGGTATATTGGGCTCAATCAGGATGTTATTTTGAAACAAATGGCTGGATTTCAATTGGGATTAGAATACGAAAAAGCCACTAATATGCGATAATCCCTTTACGGTTGTCAGATGGAATATCATAATTCATCTGATAATCATGGAGGAATTTTCGTATGCCCAGAGCTAAACACACAGCTGCTGAGAAACTGGCGATATTGGAAGCACTCAGGAAATCAGGCGAGCACGTCGGCATCTTTGCCCAAGCACATGGTGTCGATCCGCATACCATGCGGGATTGGCAAGCACTGTATGAACGTGATGGTTTTGCAGGGTTGGCGGAGGCCAGGAAGAACCAGCATTATTCACAGGGGCTCAAGCTGGCGGCGGTTACCACGTACCTGAACGGTGAAGGCTCGCTAAGAGAATTAGCGATTAGATTCGGTCTGCGATCAAAACAGCAACTATTAGATTGGCTCAACAAGTATAATGGGAATAAAACTTTGACGGCTTCGCCGTCCAGAAAGCAGATTCCCATCATGAGTCGTAAAACTACCTTTGAAGAGCGCATCGAAATCGTTGAATACGTTACAAAGCACAAGCACAGTTATGCCGAAGCCGCCGAACACTTCCAGGTTTTCCTATCAACAAGCCCGTTCGTGGGTCATTAAGGCTCAGAAGAACGGCTATGAGGCGCTGGTAGATAAGCGCGGCCACCGCAAATCAGCGGCTTAGTTGACAGAAGTGAACAAACTCAGACTTGAGAACCGTCAGCTTAAATCACAACTGGCCGACAAGAAATTAGTAGAGGCATTCGCAAAAAAATTGCTGGAACTTCAGCGCAGGGGGCGACCAAACAACGACGACTGGCTTACGACGCAATCAAAGTAGTCAGTCAAGGTAATCGAGGTGCCGTATCAAAGTTAATCGCAGTCCTCGATGTCAGCAGGCAAGCGTACTATCAGGGTTTGAAACGTCAAGAGACCGAATGGGAAAGCCATGACCGCGTGCTTAAGGCGCGCACGCAGTACTGGCTTAATTTTCATCGTCGTGGCATCGGGGCCGGAAATCTATTGACTAGAACACAACAACCAGATAACCGTCCCCGTTACGTTCAAAATGGTTCGTCGGGTGATACTTGAGCTTGGTTTGCGTTGTCAAGTCCGGCCGAATAAGCGTAGTCGAATCAAGCAGCAAGACCAGTATGTCCAGGACAATCTGCTTAACCAGAATTTCGACGTGGACGCACCTAACCAGGTGTGGTTATCCGACTCTACTGAATTGGCTTATGGGATCATATGGTGAGCACAAGATCCGTTTAGGTGGCGTCATGGATCTCTATGATCGGCGCATCCTAGCATACAACCTTAGCATCACGGAAACCAGTGCCGCCGAGATTCAAGTTTTTCAGCGTGCTTTCGCCACCGCTCGCAATGTCCACCCGATGATTCATACGGATCGTGGTTCTGCCTACACATCAGGGGCCTTCAATCATTACCTCCCCGCCAATTTGAGATCACACGCAGTATGTCACGTCCCAGGACACCATATGACAATGCGCCAATGGAACGTTGGTGTAATGAATTTAAATTACGTTGGATGGTGAGTCATCCAATGGCAAAGACGTACGAAGAACTGGTTCAGCTAGTTGAAGCTGGGATCGATTATTTTAACCACCACAATCGTTCGGCACAAAGAAATGGCCTCACCCCAGATGAATACTGGAGTGAAGCCATTTAAAAGCAAACAAAACTTTATATTATTTCATCTGTCAACTTGACAGGGCCTAGTACAATACTTAGTGGCTTTTTATTATATTCTCTCTGCTACTCAAGGCTCTCTAGAAACTCACTCAATGCTTCCTGCCAAGTCAAAATATGGTAACCAGTTGCCTTGGCTTTATCCAAATTCATCACTGAATGCTGTGGCCGGTAAGCCTTTTGTGGGAATTGTTCAGAAGTAACTGGTGCTACTTCAACATCAGTATCCTTCAAAATTTCCTTCGCAAAGTCATACCAAGTAGCTGTATTATCGTTACTTAATTGATAGGTCCCTGAAGCGGCTTCAGTTTTCACCAGGTGGGCCATAAATTCTGCTAATGTTCGCGTCCAGGTTGGTCGTCCAAGTTGATCATTGACGACTGTCAACTTGTCATGCGTCTTTGCTAAATTCTGCATTGTGAAGACAAAGTTATGCCCAAATTCGCCGAAAACCCAGCTAGTCCGAACAATATAATAATCAGCACCGCTGTGACGAACGGCTTCTTCACCAGCCCACTTAGCACGCCCATACTCATTCTTGGGGTTGGCTGGATCATCTTCTAAATATTCACCTTTATTAGTGCCATCAAAAATGTAGTCAGTAGAAACATAAACCAATTTAACACCCTGTTCAGCTGCTACTTGGGCTAAATTTTTTGTTCCATCAACATTGACCAGCCAATTGAGGGCTTTGCCTTCATCTTCGGCCTTATCAACTGCTGTGTAAGCCGCGCAATCATATAAGACCGCTGGTTGTAATTCTGCAATCTTAGCTTTGACTGCATCTAGATCTGTAATATCCAATTCTTTTTCAGTCAGCGCGTCAAATGCAATTCCTTGTTCATTTAATAGTCGTTGTAACTCATGACCTAACTGACCATTGGCACCAACAATCATTACTTTAGCCATTTTCATTTCCTCCTAAAAAATAAGCGAACTGTCAATCGACACTCCGCTTATTCAAAATCTTCTGTGTTTTTATTGCCCGTTCTTGGCATAGTTTGATTCAACCTTGTTCTTATCTGCTTGCCACCAGTCTTGATGGTCAGTATACCAATCAATCGTTGCTTTCAAACCAGACCGGAAGTCAGTAAACTCTGGCTGCCAACCTAATTCCGTGCGCAACTTAGTTGAATCGATCGCATAACGTAAATCATGGCCGGGACGGTCCTTAACAACATCATAAGCATCTTTAGGCTGACCCATTAATTCAAGAATCATTTCCAAGACGTCCTTATTGTTCATTTCGCCATCGGCACCAATCAGGTAGGTCTCGCCAATCTTACCCTTGGTTAAAATATCCCAAACGGCCGCAGAATGGTCGTTCGTGTGAATCCAGTCACGAACATTTTTACCACTACCATATAATTTCGGCCGAATACCACTTAAAATATTGGTAATTTGGCGTGGAATAAATTTCTCAATATATTGATAAGGGCCATAGTTATTTGAGCAGTTTGAAATGGTGGCTTGTAAGCCAAACGAACGCACCCAAGCCCGAACTAAGAGATCACTGCTGGCCTTAGATGAAGAGTATGGGCTGGAAGGCTTATACCGACTAGTTGGTGTAAACTTCTCGCCAACACTCTCACCATGGCCCGGTAAATCTTCCCGTAATGGTAAATCACCGTATACTTCATCAGTAGAAACATGGTGGAAGCGTTTGTTAAACTTATGTGCGGATTGAATCAGCGTATAAGTCCCAATAATATTCGTTTCGATGAATGGCCATGGATTCTTCAATGAATTATCATTATGGCTTTCAGCGGCGTAATGGACAACCGCGTCAGTTTGTTGCATTAATTCATCAACTAAGGGCGCATCACAAATGTCACCCACAACTAATTTAACCCGGTCGCCTAGAATTCCCTCCAAGTTGGCCCGATTACCAGCATAAGTTAACTTATCTAACACGGTAATCTGGACTTCGGGATGATGATTATAAACATAGTGAACAAAGTTAGAACCAATAAAGCCGGCACCACCGGTAACTAATAAGTTTTCCATGACGTCTCCTTAAATTTCGCCGTAAACAAACGGATTATTCTGTTCAAATTCTTTGAAAGTCTGTTGTTTAGCATCCTTATCAGAAGTAATAGCTTGATCGTAGTCAATAGGCCAGTTAATGTTTAAATCTTTATCCATAAAGGTGATTCCACCATCAGCTTCAGCATTGTAGTAGTTATCACACTTGTATAAGAAATTAACATTATCAGTCAATGTCACAAATCCATGGGCAAAGCCACGGGGGACTAACAATTGACGGTGGTTACTTTCAGAGATAATGTAGCCTTCCCATTCACCGTACGTAGGTGAGCCAGCACGAACGTCCACAATAACATCAAGCACGGCACCAGTCACCACGCGAATTAATTTAGTTTGCGCTGCCTTGCCACGTTGAAAATGCAGTCCCCGCAAAACACCCGCTTCCGCTGACAATGATTGATTATCCTGAATGAAGTCAAAATCAATGCTAGCTTCTTTGAAGTCACGATCCGAGTAGGTTTCCGTAAAGAACCCGCGTTTGTCACCAAAAACTGCTGGTTCAATAATCTTAACATCTTGTAACTTAGTCGTTGTTACCTTTAATTTACCCATTATAAATTTTTTACCCCTTTCACCTTAATGAATTCACCAATACTCATACTTACGATAACTTATTTTTCATATATAATTTGTGGTGTCTTCGTAACCAGAACTGTCTGACCAGAAACTTCAAGTACATGCTCATCATCCATAGTCCAACAAACAATCCTATCGCGCTGGCCATTTTTTTTATATTTCAATACGAAGTCACGTGCATCACTGTGCAACCGTTCATCAAAAGAATAACCATCTAAGTTACTTAGCAATTGTGAGATTAATCTAGCACTTTGCTTCGACACATAATGGGGACTCATTCCCTTGTATAGCCCCCATTCACCACTACCATTCTTTTCATCAACAAGTGCATATAATGAAATAATCGGCTGATGCATCATGTCCAGCACGAATATACTTCGTGCTAAATAATTTGCTTGGTCTTCCTCAGACCAACTACCAAAGTGAGACTTACTCATTGAATATCCCATTTCCGTGGTAACAAGTGGAATCGACCTTACTGCTTTTTTTGAATTATCTGCTGTCAGACTAAGCAAAAATTTCCGAGAATTTAACTTCAGTAAATTCTCTGGAGCTCCATTATCTGGATAACTACTCGACAAATAGGGATGATTAGCTAATGCATCTCCATATTTGGTTATGTGATTCTGAATTGCAAGTCTCATGGCCTGTTTTGAATCACTATAATTTCCAGCAATTGCACCAGCCAAAAAGACAGAATTTGGATCATATCTACGAACGTATGCGAAAATCTTGGCATTAAAGTCAACCCACGTCCTGACCTGAGCCGCATTTGTACCACTATTACTTTGGTTAAACCAAAACAAACCATTGGGCTCATTCCACATTTGCCAAATCACACCGTGATCACGATATTTGATAATAACTGAACGAATTAATCTTTCGTATTTATTTAAAACTGCTCGTTTATTCTTTGCATATTCATTGGCATCTACCGAATCATTTGAAGAAAACACTACAATAGGAACAAGACCATTTTCTTTAATCGCTTTCATTGCAAAATCAAACTCTTCAAAATCAAATTTTCCTTTATTCACATACTTATTATTAAATAAGATAGATATCACAACGTAATGTAGATGAGTACTATGAGCAGCTATAACTTGTGACTTAATGTAGTCTCTATTCCTTGTTGATCCTTTCTTATAACCATAAAGCCACACAAAACCACCTACTTTATCCGTAAGTGGCTTATTGGTAGTCAACACAGCTTGTCGATTGGTAGCCTGCGAACTCTGCAGTCGATATTGATTAGCAATGACCAAAGCCGTGCAAGAAAGCAATACAATACTAATTAATATCCAAGTGTAAACTTTTTTTTTCATATTATCGGATACTCATTCTTAACTACTCAACCAGTGATGCAAGATACTGTCCATAGCGCGTTTTATGTAGCGGCGCGGCAAGAGATTGTAGTTGTTTGCTATCAATATACCCCATACGAAAAGCGACCTCTTCAATGCTTGCAATCAAAATATTTTGTCGGCGTTCCACTGTTTGAATGAATGACGAGGCATCTTGCAATGATTCATGCGTCCCTGTATCCAACCAGGCAAAGCCCCTACTTAATAATTCGACCTTCAATTTTTTCCTTTTCAAATACACATTATTAATATCCGTAATTTCGAGCTCTCCTCGAGCAGACGGTTTAATACTTTCAGCAATAGATACAACATCATTATCAAAAAAGTATATCCCGGTTACCGCAAAATCACTTTTAGGATCAGTTGGCTTTTCCTCAATACTAATCACATTCTTTTTATTATCAAAACTTACAACGCCAAAACGTTCTGGATCCTTGACTCTATAACCATAAACAATTGCTCCATCTTTTAACCGAACGGCTTTTTGTAAAGTTTCAGAAAGACCGTTACCATAAAAAATATTATCCCCGAGAATCAGACAAACCGAATCATCACCTATAAATTGCTTACCTATAATAAAGGCTTCCGCTAATCCATTAGGTTCTTGCTGAATTGCATATTCTATATGAATGCCAAGTTCTGAACCATCACCAAGTAAAGCTTTAAAGCTATTCGAATCACGCGACGTGGAAATGATTAATATCTCCTTAATTCCTGACAACATGAGCGTTGAAAGTGGATAATAAATCATAGGCTTATCATAAATGGGTAACAACTGTTTGGAAGTAACCTTTGTTACTGGATATAAACGAGTCCCTGAACCACCAGCTAATATAATTCCTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP035566|2153700:2160767|2153700_2154288_+|QBA77782.1|integrase|DBSCAN-SWA MINIYYNVEPLRSNEEITDFVNKARNGTHGERNALLILIGLNTGLRMSDILNLKVEQVRNHDIVYITEKKTKKKRVILLTRLRPQINHYIKDLPDNEYLFTNRQHQPLSVNAVYKLFQTIARKMHRTDIGTHTLRKTFGYHYYQQTHDIGTLMMIFNHSSEAITKRYIGLNQDVILKQMAGFQLGLEYEKATNMR >CP035566|2153700:2160767|2154350_2154845_+|QBA77783.1|transposase|DBSCAN-SWA MPRAKHTAAEKLAILEALRKSGEHVGIFAQAHGVDPHTMRDWQALYERDGFAGLAEARKNQHYSQGLKLAAVTTYLNGEGSLRELAIRFGLRSKQQLLDWLNKYNGNKTLTASPSRKQIPIMSRKTTFEERIEIVEYVTKHKHSYAEAAEHFQVFLSTSPFVGH >CP035566|2153700:2160767|2156000_2156843_-|QBA77784.1|DBSCAN-SWA MAKVMIVGANGQLGHELQRLLNEQGIAFDALTEKELDITDLDAVKAKIAELQPAVLYDCAAYTAVDKAEDEGKALNWLVNVDGTKNLAQVAAEQGVKLVYVSTDYIFDGTNKGEYLEDDPANPKNEYGRAKWAGEEAVRHSGADYYIVRTSWVFGEFGHNFVFTMQNLAKTHDKLTVVNDQLGRPTWTRTLAEFMAHLVKTEAASGTYQLSNDNTATWYDFAKEILKDTDVEVAPVTSEQFPQKAYRPQHSVMNLDKAKATGYHILTWQEALSEFLESLE >CP035566|2153700:2160767|2158591_2159881_-|QBA77787.1|DBSCAN-SWA MKKKVYTWILISIVLLSCTALVIANQYRLQSSQATNRQAVLTTNKPLTDKVGGFVWLYGYKKGSTRNRDYIKSQVIAAHSTHLHYVVISILFNNKYVNKGKFDFEEFDFAMKAIKENGLVPIVVFSSNDSVDANEYAKNKRAVLNKYERLIRSVIIKYRDHGVIWQMWNEPNGLFWFNQSNSGTNAAQVRTWVDFNAKIFAYVRRYDPNSVFLAGAIAGNYSDSKQAMRLAIQNHITKYGDALANHPYLSSSYPDNGAPENLLKLNSRKFLLSLTADNSKKAVRSIPLVTTEMGYSMSKSHFGSWSEEDQANYLARSIFVLDMMHQPIISLYALVDEKNGSGEWGLYKGMSPHYVSKQSARLISQLLSNLDGYSFDERLHSDARDFVLKYKKNGQRDRIVCWTMDDEHVLEVSGQTVLVTKTPQIIYEK >CP035566|2153700:2160767|2156912_2157941_-|QBA77785.1|DBSCAN-SWA MENLLVTGGAGFIGSNFVHYVYNHHPEVQITVLDKLTYAGNRANLEGILGDRVKLVVGDICDAPLVDELMQQTDAVVHYAAESHNDNSLKNPWPFIETNIIGTYTLIQSAHKFNKRFHHVSTDEVYGDLPLREDLPGHGESVGEKFTPTSRYKPSSPYSSSKASSDLLVRAWVRSFGLQATISNCSNNYGPYQYIEKFIPRQITNILSGIRPKLYGSGKNVRDWIHTNDHSAAVWDILTKGKIGETYLIGADGEMNNKDVLEMILELMGQPKDAYDVVKDRPGHDLRYAIDSTKLRTELGWQPEFTDFRSGLKATIDWYTDHQDWWQADKNKVESNYAKNGQ >CP035566|2153700:2160767|2159903_2160767_-|QBA77788.1|DBSCAN-SWA MKGIILAGGSGTRLYPVTKVTSKQLLPIYDKPMIYYPLSTLMLSGIKEILIISTSRDSNSFKALLGDGSELGIHIEYAIQQEPNGLAEAFIIGKQFIGDDSVCLILGDNIFYGNGLSETLQKAVRLKDGAIVYGYRVKDPERFGVVSFDNKKNVISIEEKPTDPKSDFAVTGIYFFDNDVVSIAESIKPSARGELEITDINNVYLKRKKLKVELLSRGFAWLDTGTHESLQDASSFIQTVERRQNILIASIEEVAFRMGYIDSKQLQSLAAPLHKTRYGQYLASLVE >CP035566|2153700:2160767|2157950_2158532_-|QBA77786.1|DBSCAN-SWA MGKLKVTTTKLQDVKIIEPAVFGDKRGFFTETYSDRDFKEASIDFDFIQDNQSLSAEAGVLRGLHFQRGKAAQTKLIRVVTGAVLDVIVDVRAGSPTYGEWEGYIISESNHRQLLVPRGFAHGFVTLTDNVNFLYKCDNYYNAEADGGITFMDKDLNINWPIDYDQAITSDKDAKQQTFKEFEQNNPFVYGEI |
7 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 2144784:2144796|attR 2155779:2155791 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2755259 : 2808639
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP035566|2755259:2808639|DBSCAN-SWA TTTATTTTATCTCTGTCATACCATGCATGTAAGGTTGGAGCACCTTAGGAATCTTAACCGTGCCATCGGCTTGTTGATAATTTTCCAAAATCGCAGCTACCGTCCGGCCAACAGCAAGTCCAGAACCATTCAACGTGTGGACGTAATCGACCGTCCCATCAGCTTTCCGGTAACGAATCATCGCCCGCCGTGCTTGGAAGTCCAAGCAGTTAGAGCATGAACTGATTTCCCGATAAACGCCTTGTTCTGGCATCCATACTTCCACATCATAGGTCTTGGCTGATGAGAAACCAGTATCCCCCGTTGAAAGCTTAATAACATGGTATGCAAGCCCTAATTCGCGCAACACTTCTTCGGCATTATCCGTTAATTTTTCGAGCTCATCGTATGAATTCTCAGGTTTACAGTACTTGACCATCTCGACTTTGTGAAATTGGTGCATACGAATCAAGCCCCGGGTATCACGCCCCGCACTCCCAGCTTCGGAGCGATAACAAGGCGTCATCGCCGTGAAGTACGTTGGCAATTGATCTTCAGATAAGATTTCATTCGCATAGTAATTGGTCAGCGGTACTTCAGCCGTCGGGATCAACGTCATTCCTGAAGATTCAACTGTGTAGACGTCTTCTTTGAACTTCGGAAATTGCCCAGTTCCATACATTGTCTGAGCGTTCACCAAGTATGGCGGAATAATTTCATGGTACCCTTGCTTTTGTGTGTGCAGATCTAGCATAAAGCTGTAAACCGCCCGTTCTAAGAGTGCACCCGCATCCTTATAATAAACAAAGCGCGCGCCCGCGACTTTTGCTGCCCGGTCAAAATCCAAGATTCCTAAGCTTTCGCCCAATTCCCAGTGCGCCTTAGGTTTAAAATCAAACGTTGGAATATCGCCGTGCTTACGCATCTCAACATTGCTATCTTCGTCAGGACCGACTGGTACATCATCGGCAGGTAAATTCGGGAAGCGAATCGCTAAGTAATGAAGCCGATCGTTTACTTCCGTTTGGGCCGCTTCCGTACTCTTAATATCACCATTCAGCTGTTTGACTTGTTGAATGAGGGCTTGGCCCGCTTCCGATTGCGGATCACTTTGCCCAATTTGTTCCGTCAACTGGTTTTTCTGTTTCTTCAATCCTTCAACCTTGGTAATTGCATCCCGGTTTTGTTGGTCTAACTGTAAGTATTCATCAACCTCAGCCGGATCAACCTTCCGAGTCTGGAGCTTAGTCTTAACAAGTTCTGGGTTATTACGAACAAACTTTGGATTTAACATACGAAAAGCCTCCTTAAAATTAAAACGTCCCATAGTCTTCACCTAAAAGACTATGGGACGTTTTTTATCAACGTGGTACCACCCAATTTACTGCTCTACGAGTATATCGTCTCACCGCGACCTCTTAAAAATGAAGTCAAACGCTAAATGGCGGATTCATCAGTCCAATCAACCAACTTTCAGCAACCGTTGGCTTTCTAAATAACCAGATTAACTACTAACCCATTATGTTTGCGCTTTCAATTTACACTTATAATCTATACCTCCCGCCATTTATTGTCAATAGTTTTTTATTATCATTTTATTTTTCTATTATCAAGAGAACCATTTATTGTTACCATGTATTTTCGCAACACCAGTTGTCACTGTGAATATCGGTGACCTAATCAAGCCCGTGGCCGTCCAACAAAAAAAGCACACCAACAATTCGCTGGCGTGCTTTACTCTTAATTCTACCGTACTAAATTTATGCCTTCACTTTACCAGTCTGGTTAGCGGCATCGATGAATGCCTTGAATAACCCTTCTGGACGGTTAGGCCGTGATAAGAATTCTGGATGATATTGTGAGGCCACGAAGAAGCGCTTCTTTGGTAATTCAATCACTTCGACGAGCCGGTTGTCAGGCGAAGTTCCGGAGAAGACCATGCCCTTAGCAGCCATTGCTTCACGATACTTATTATTGAATTCATAACGGTGGCGATGACGTTCCATCACAACTTCTTCATTGTGATAAGCTTTAGCCGCCACAGTTCCCGGCTTCAGCTTGCAAGGGTAAGCGCCTAAACGTTGCGTTCCACCCATGTCTTCAACGTCTTCTTGGTCGGCCATCAAATCAATAATATTGTCCGGCGTCTTCGGATCGATTTCAGCAGAGTTAGCATCCTTCAATCCAAGTACGTTACGTGCAAATTCGACACTGGCCATTTGCATTCCCAAGCAGATACCTAAGAATGGCACGTCGTTTTCACGGGCATACTTGATTGCCGTAATCTTACCTTCAATTCCCCGATCACCAAAGCCACCAGGAACTAAGATTCCGTCAGCATCGCCGAGTAGTTCTTCGACATTTTCTGGCGTAACATCTTCAGCAGAAATCTTCTTCAAATCAATGTCGGCATCATCCGTATAGCCAGCATGCTTCAATGCTTCCGTCACTGAGATATAAGCATCCTGTAAAGCGACGTATTTTCCGACTAGCGCAATCTTGATGGTCCGTGATAAGTTCTGAACATGATGTTCTAAGTCAATCCATTCACTCATGTCGGCCTTAGGTGCCTGTACATCAAAATGGTCAAGGACGATTTGGTCCATGTTTTGTTTCTGAACATTCAACGGAATTGAATAAATCGTCTTAACGTCTAAGGATTCAATGACTGCTTCTGGTTCCACGTCACAGAAGGACGCAATCTTATTCCGCATTTCCCGCGTAATTGGTTGTTCAGTCCGGACAACTAACATGTTCGGCTGAATCCCATAACTCCGCAATTCCTTAACAGAATGTTGCGTTGGCTTCGTCTTCATTTCACCAGCTGCCCGTAAATATGGGATCAATGTGGTATGGATATAGAAAACATTGTCGGAACCTAAATCACTCTTCATTTGCCGTAGCGCTTCAATAAATGGCAAGGATTCGATATCACCGACCGTCCCACCGATTTCAGTAATCACGATATCGGAATCCGTCGTCGTACCCGCACGCATGATTTTTTCCTTGATAGCGTTCGTGATATGCGGAATCACTTGCACCGTGGCGCCTAAATAATCGCCCCGCCGTTCCTTTTGCAGAACTTCTGAATAAATCTTACCGGTGGTAACATTTGAATATTTATTAAGGTTAATGTCGATAAACCGTTCATAATGTCCAAGGTCTAAGTCAGTTTCGGTCCCATCATCGGTCACGAAGACTTCACCGTGTTGATAAGGACTCATCGTACCAGGATCAACGTTGATATAGGGATCAAACTTTTGAATCGTGACCTTTAAGCCCCGGTTCTTCAATAAACGCCCTAGCGAAGCAGCGACGATACCTTTACCAATGGATGACACAACGCCACCAGTTACAAAAATATATTTGGTCATGTGATAACTCCTTAAAGATTTATTTCGTGGGGTGGTATAAATAAAGAAAGCTCCCTATTTCAGCAGAAATAGGGAGCTAATACGATCGTTTGTCTCAGGTATTTCTACCAGAGAGCCCAAATAAGATAATACAAGGAGATTCCCTTTTCGTCAAGGAAAAATCTTGAAAAGCTTATTTCGATTCGTCGTCTTCGTCATCGTAGTCGTCATCATCATCGTCATCATTTAACTCTGATAATTGACCCTCGATACCGTCTGGCAACGTTTCATCAGCAACATCGTCGTCTGTGTCATCAACACCCGCAAGTTCATCGTACTTGCTGCTTGCTGAATCATCAGTATCGTCGTCCTGATCATCATCGTCATCGTAGTTATCGTCATCTTCGGGATCATCGTCATCGTAATCGATCACGTCGTCATCATCCCCGGCATCGGCCAAGAAGGCGTTAACCTTCTTACGCTTCTTGCGCTTTGGCCGATCCTCATCTTCGTCATCGTCCGTATGAATAACGGCTTCGTCAATGGATTCAAATGGGTACCATGCACGCAGGCCCCACATATTGTCACCGAGCGAAATGAAACTACCATCGATATTAAGATCGGTATAAAATTGTGATAAACGCTCCCGAATTTCTTCGTCGCTTTTACCTAAATATGATTGCACAGCGTTGGTCAAGTCGGCAAAAGCCATCACATCACCATGTTGTGATAAGATCGCGTGAGCAACCTCGATTAAAGATAATTCGGACTTTTTTTGTCCATCAAATTGTTTTAGTTCCAAACTGGTGCACGTCCTTTCCACAGTTTATAGTACATAATACCAAATTAGGCCGTGAATTGCAATCGCAACTTGTAGTTACCAAGTAGCTGCTCACCCGCGTATAAATCGTAATCAACGTTCACCTCACCTGAAAATGGCCGTTCACGTAGCCGTACTCGTAACATCGGCGTCACCGTTTCAACAGGTAGCATCCCCATAGGCGTTTGATAATGAGCACGCACCCGTTTACCATTGGAAAAGTGCAACCGAAGTCGGTTCTCCGCACTCCGCGTCAACACGACGTCCCCATTAGCTGCCAGCTTAATCGTCACTGGAATCGGTTCTGGCGCATCATCGTTAACTTCCTTATACCGTAAATAAAACGCGTCACCCATCTGAACCAATTGACCATCGACATCCAGTGCATAGTTCGCCGTATCGTCATCTTGCCGCGCCTGCGTCTCTAAATGAATCGCCACTGGCACACCAGTTGTTAAATCATCCATACTTGGACCTCCTAATATTTCAAAATCACACGCTGAACGCCCGTCTACGATCACCGTGTTACCACACTCGCTATATCCTTTTCAGCGTTCACGACCGCGCGACTCCCATCACGCCCATCGTAAAACTTCCTGTTTAATTATAAGCCATTCATGCCAAAATAACTAAAAATAGGACTAAAAGCGGTCAGCTTAGATCTGCTGGGAAAAGTTCGAACCCGCGTAAACTTTTTGAGTCGGCTGTGTTCCAACAATTGTCCCTCAGCCCCGGAGGTCGAAATAGGCCGCACGTTGCTGACGAACAAAAAACCAACTAACTTGCACGTTTCATTATCCTATGATGGTATGCTACAGATTAAGTTGATTTGTCTAAGCCAATGCAAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP035566|2755259:2808639|2769774_2770611_-|QBA78301.1|DBSCAN-SWA MKVRRSERLIDMTRYLLERPHTLVSLTYFAERYASAKSSISEDLTILKKVFQARGTGILETIPGAAGGARFIPYILKEEAQEFIDEMTTKVADKSRVLPGGYVYLSDILGQPDILRQVGRVIATQYLNQKIDAVMTVATKGIPIAQSVATYLNVPFVIVRNDSKITEGSTVSVNYVSGSSERIKKMELSKRSLTEGANVLIVDDFMKGGGTINGMKTLIEEFDANLIGITVFAEASFVGNRLIDDYTSLLRVTNVSDSDKAIKVVAGNYLEKVFGAEV >CP035566|2755259:2808639|2776770_2777547_-|QBA78310.1|DBSCAN-SWA MRIFDSHTHLNSEEFIQEVPRYLQQAADLDVTRMAIVGSNTQLNADAIKLAETYPQLVAIVGWHPEDAKNYDQAAEKLLIEQVQHPKVVALGEVGLDYHWDTSPQDVQRQVFARQVAIAKEMQLPISVHNRDAFEDTYKILKAADIRDTGGVMHSFNGDPEWLKRFLDLGMHISYSGVASFKNAREVHESVKQTPLTQMLVETDAPYLTPEPYRGKQNEPGYTRYVVEAIAKLRETTPEIIAAQTYQNAEEFFKIEKD >CP035566|2755259:2808639|2802825_2803515_-|QBA78333.1|protease|DBSCAN-SWA 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49 | uncultured_Mediterranean_phage(28.57%) | protease,tRNA,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_8 |
3124395 : 3135605
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP035566|3124395:3135605|DBSCAN-SWA TCTAAGCTTGTGAGTCGTCATCCCAAAGGTCCTCCTCCTCATAAGGTTCGTATGGCAAGGAGATATAGAACGTAGACCCCTTACCTTCAACACTATCAACCCAAATACGACCGCCGAGCATCTGAACAACTTCTTTTGAAATCGCCAAACCGAGGCCAGTCCCACCTTGGGCCCGTGACCGCGCCTTGTCGACTCGGAAGAATCGGTCAAAGACGTGTCCTAAGTCGGCCCGTGGGATACCCAAGCCCTGATCACTAATACTAATGATCACTTGGTTATGCGTCTCTAACAGACGACAAGTCACGACACCGCCATCAGGTGAATACTTGATCGCATTATTCATAATGTTATCCAATACTTGAGTGAATTTATCGGTATCAATTTCAACCCACAGATCACGCTTGGTAAACTCGCGCTTAATAGTGTAATACTTAGCTGGATTATCATCCTTCTTTAAGATCATATCAAACCGATCAAGCACGTAATTGAACATCTCATTAATATTGACCAATTCCATATCGACCCGGGTGGTCCCTGAGTCCATCCGTGATAGACTTAAGAGTTCATTGATCATTCGAATCATACGATCGGTTTCTTCTTGAGTGACCTTCAAAAATCCTGGGGCCACTTCAGGATCCTTCCACGCACCATCACTCAGTGCTTCAATATAACTCCGCAAACTAGTCAGTGGTGTCCGTAATTCATGAGACACGTTCGAAACAAATTGTTTCCGGTCATTATCAATCTTTTGTTGTTCCGTGACATCGTGGAGCACACAGACTAACCCACTAATAAACCCAGACTCCCGTTGAATTAACGAGAAGTAGGCATTCAAGATTAGGTCACGCTCGTTCGAAGAAAAATCAAGCATCAATTCATCTTGATTTTCAATCAAATCACGCAATGAATAATCATCACGGATTTTTAAAATATCTAAAATCGAGTTACCGATTGCCTTTTCGGCCGTAACGTCCATAAAGTCCGAGGCTGTTTCATTGATGATGGTAATATTACCCCGGCGATCCGTGGCAATCACGCCATCACTCATGTGTGAGAGCACACTATCCAACCGGCGTCGCTCAGCTTCTGTCGACTCTTGCGATTCTTCCACTCGAATCGACAAGTTATTAATGGCTTTAGCCAACTGGCCCAACTCATCATCGCTATAAACTCGGACTTGCCCCGCATAATCACCACGGGCAATTCGTTGCGTCTGCTGCTTCATTTCTTCGATTGGACGAGTTATTGCCCGGGCAATAATGATTGCAATTCCCAGTCCCAAGACCATCGCAGCAAGTGACGCAATCACAAAGATTCCCATAATGTTGTTAATCGTACTGTAGACAGACTTCATATTTGCCCGTACATACAGTACCCCAACTAACTGACTGCTATTACCCGCTGAATTGGAGCTATATAGCGGCACGATTGAAACGTAGTAGCGTCCATTATTCTGAGTGTCATAGGTACTTTTAGTGTAAGTTCGATTATTATAGATCGCATTCTTGACGTTTCGATCGGTCGTTTTTTGTCCAACTACTGACTGATCATTAACATCACTCGTCCCACGAATTGTTCCTTTGCTGTCAACAACTTGGATTTCATCAACATTCGTATTGTTGTAGTTCGACAAAATCGTCTTGATTTGGCCGTTGGCCTTGCGCGTACTGCTGACGGTCAATTGTTCGGACAACGAATTATCAATATAAGTTGGAATTTGCACCGACTGTTTAAAATCCTGGATGTTCTTTGATTCCAACTGTTTCACAAAGATTGCACCCACGATTTCCAACGTAATCAATAATAGAAGGGCAAACACGAGCGCAATTTTGAAATTAATTGTTTTAAAAAAATTTTTCCGTTTAAATCTCAACACGGTTTAGCAACCTCTACTCATTTTCAGGATTGCGGAGATAGTAACCCACGCCCCGCCGCGTCACCAGCCATTTTGGATGACTCGGGTTATCTTCAACTTTTTCACGTAACCGCCGCACGGTCACATCAACTGTCCGGACATCACCAAAGTAATCATAGCCCCAGACCGTCTGTAACAAGTGTTCCCGCGTCATGACTTGGCCGATATGTTGGGCTAAGTAATGTAACAGTTCAAATTCACGGTGCGTTAATTCGATGTTTTCACCGCGTTTGGAAACCATATAAGCTTCTGGATGGATCACCAGATCGCCAATTTCAATGTCTGAATTTTCTTCAACTTCAGCTGGTTGGGCACTTGGTGCACCTTGCCGCCGCAGATTTGCTTTGACTCGAGCCACGAGTTCCCGGTTTGAGAACGGTTTGGTCACATAGTCGTCCGCGCCCAGTTCCAAGCCCAACACCTTGTCTAATTCAGAGTCCTTTGCCGTTACCATGATAATTGGCACATCATAGTTCTTCCGTACTTGTCGAGCAACTTCCAAGCCATCCATCTTAGGCAACATCAAATCTAACAAAATCAAATCAGGGTGGACTTCATCCACTTTTTGTAAGGCTTCCTCTCCGTCAGCTGCAACGTGAACTTCATAGCCTTCTTTGGTCAGATTAAATTTCATGATATCAGAGATGGGCTTTTCATCATCAACTACTAAGATTTTTTTCATAACGATTCTTCCTCCTTAGGGGAAAACAGGTTTACATTTCAATTTTTAGGGTGATTCGCGATATATTACGAGAAAACAGGTCCTTTCTCGTGTCAGGGTTGGTTGAAACTAAATTCAACACTGGTTTTAGTATATCACAAATGTAGTTGGCTTTCTTTGATTGCTAATCCGCGTGGCCGTAGTATTTCCCGGGAAATCATTTGCCAGTTCAAGCAATCGTTTTCACCAATTAATTACTCAAAAAATCACTTTTTTTGAAAAAACTTTCGAAATAGTGTTGTCAGAACTCAAAATTCATGATATTATATTTTTTGTTGAGTTATGGGCAGTTAGCTCAGCTGGCAGAGCAACGGACTCTTAATCCGTGGGTCCAGGGTTCGATCCCCTGACTGCCCATCATAAACCATTAACCAGTTTTCATGCAGTGTCAAAAACACCGTGATTACTGGTTTTTTTGTGTTTTAAATGCAAGCACCGTTATCATCAGTTGTCATCTTTTTTCAATAAAAGTAAGCCAATTAGTAAGCCAGAAATATAACAAAAAAGCCACTGTTTCCAGTGACTCAATACTTGCGCGGGGCAGTGACTGTTAACCATATTGGTTAGCAGTTTTTTTTGTCGATATGAAAATATTCTTTGGGTGCGTCATTCGGCTTTCCTTGCTTCCAATGACTTTTTGCAGAACCATACTTAGTCGGTTCAGGATTAGGACTAATCGCAACAAATCGACGCCCAACTGAATCCATAAATATGATTATCCGACGATATTCTTCAGTTGGTGTAATCAACGTACAGTTTTCATGCTTAATGCCATAAACATCTGTAAAGTCCATATTTCACATTGCTTTCCCGTATGTTTCAGTGCCATAAAATAAAAAACTGCCTTATTACAAAGCAGTTTCATCAGTATCAAAATAAATTATTGTGGAACAACATTCGTTGCTTGAGGGCCACGATCCCCTTGTTCAACTTCATAGCTTACCTTTTGACCTTCATCAAGGCTTTTAAACCCATCTGTTTGGATTGATGAGAAATGAACGAATACATCTTTATTATCCGAACCGGTGATAAATCCAAAGCCCTTATCCGCGTTAAACCATTTCACTGTACCACTTTGCATATACTTAATATTCCTCCTAGAAACTAAATCAAAGTAACCAGCCGAATTAACATCTAAGAAAATTATAGATAGCAAGTTTAATGATACTTAAAACTTCCGAATATGTTAACTGTGTTCAGTATATCACGGAGTTCGAAGATAGTTTAATTTAAACACTTCAAGTGCCCGGTTCTTTAAATAATTGAACTTGCTAACGCTAACCGATAATTGTTCACAGGCTTCATTCCGGCTGAAACGTTTCTCAATAATGTAATCATGTAAGATAAATTGATATTGTGGATCATCAATTGCATTGAGGGCGTCTTCGACCTCTTTTAGCTGGTAAGACAGGTCAACATGGTTTATCAGGCGGCTTTCAGCGCCGTTTCGGCTGCTATGGCTTGATACTCCATCGAATGAGGGGCTAGAAACTTGATTAAAAGCCGTGAAATCACGTTTTAGTTTGGCATATTGCTTTAATAAATTACGAATTTTCTTAACATCTTGACGCATTGGAATCACACTTTCTAATTCCAGATATATGTATTAAAAAACGGGGCTATTACACCCCGTTCCGACTAATATCAACACAATGAATACTTATATTATAACACTTAAAACAAATATTTTCACTTATAATTGTTTCACATGAAACACATTCACTTTAAAACTTATCCGGTTACTAAGCCGCGCAATTGTTGGATCATGCTGACAACTTGATACGGTGTCTTTGTCATATCGGTTACTCGGTTTTGATACCAGAATTGTGTCAGCAATGACACCGCAAAATCGTACTGTTTGTAGATAGTCAAATCCTCACTTTTGCTAACGGCCGTCTGAACATAGTCCTCGGCGGCGTCTAAATAGCTTTTAATCATTGGATCATCTTCGGTCACATCAATTCGCAGGCTTAGTTTAATATCATCAACGGTTACAGCCATGTAATCACTCCTTTTTAGGGGGAAACGAATCGTGCCCCCTTAGTTTTAATTTATGTATAGGGGGTGTCTAAAAATGGACACCCCTTTGTATAGCCGTGCCCAAAAGTGGGTACGATTATTTACCAGCAGTTGCGGTTCCTAACGCCACGTTAATTACAGCGGTCTTATCAATCACTTCATAATCATTCCGCACAATGACGGAAAGCCCTTGACTGAACTGATCGAACTTGTCCCATTGGGCGGTTACTTGGTTACGCCGGAAAACAGCCACGGCTTGTGATAAGTCCCCCGCAATCATTGGGAACGTCCCGTCCGCGTTGTTAGCCAGCAACTTATCACTAATCATAACAACTGGTGCCCCTAATAAGGTGAAACCACTGGGTGCCGTTGGGTTCGGCTGTAATAAGTAACGACCCTCGGAATCTTTCAAGGTATCAAGGTAGTTGAACCCGGACTGGTTCACTAACCACATTTTGCTCAAAGCGGGATCTAACGTCACATTGAAAATCTTTTTAAGATCATCAATATTGGTAGCCGTTGCTTTGGCGAAACTGGTTCCCGTTAACAGGCCCATAATCTGCGTGTTGTCCGTGTTATCAACCAGTTGTTGTAATTGCGTTTTAACTTCACTGACAATATCCACTTCGGCGTCTTCCACCACTTCGTTAGATAAGGCAATCTTACCCGCCCGGGTCTTCACATCAAACGGCACTTCCGTAAACATGTTTGCGTCAACATCGGCAATGTCAGCTAGTTCGTCCTTAGTAGCCAGTACAGCTGATTGTTGACTAGTGGCAATTGGATAAGTCCCGGAACCGCTAGAAACTTGCTTAACCGTTGCATATTGGGCAAGGTTGTACTTAGATTGCTTTAATTGGAAAACGGGGGTAATCAGTTCCTTGGGAATAACGGCACTGGCACCGTCCGTCTTTAAACCGTCCCGTGTTTCCCCGTGTGTCCGTACATATTGTTCAAATGCTGGAATACCGGTTTTGTTTTCATTGCCATTAGGATCAATAATTGTTTGTTTTGCCATATCATCAGGCTCCTTTTCTTGATTGATAAATTTTTCGTAACTACGCGTATCAACTTGTACATTGGTATCGTCATAAGCGGGAACAGCTACCACTGACACATCGAACAAACTCTTAACTTGATTAATGGTGCGCGTGATATTACCGCCATCATCTTTAGTCCATTCGTCGGTGTCGTCGTCACTATCAAAGCCAAATGAGCAGGAATCAACGTTCCCACTTTGAACTTCTTCGTAAACATCATTAGCAAACGACGTATTCGGCAACTGTGCGGTGAAATGTAGCCCCTTGTCGTCCGTTTCTAACGTTAATGTGCCCGCCTTGGCACTGGCTAACACTTGGGTATAGTCGTGGTTATTAAGCATAAGAACGTTTGATAAATCGACACCATCAAGGGCCTTAGGGGTAACAACCTCAGTGAAGCCGCCTAAGTCTTTACTTGGTGAGTTCCATACAATTGCATAACCACTAATTGTTTTGCCCTTGCTTGTTTGGGAATCTTTAGGTTGCGGGTCTGCTGAATTTTCAGCTGGCCCGTCTTCGGGTGTTTCTGGTTGTGGCGTTTGTGCCCGCAACTCGGCGTCAATCGTTAATCGTCGGTCTTGTTTCATGAATTAGTCACTCCATTCTTTTGTAAGTTTAAGAAAATATTGCCATCGTCAGTTGGTGGCAAGCCAATCTTGGCCCGAGCTTCATTGCGGCTCATAATGCCACCCGTATAGCCCGCTACTGCTTGGGCTTGTTGCGTTTGCGGATCAAGGCTCAATAGCTTGTCCGTATTAAACGTAAAGTCATGACCAAACTTGAACGACAGCTCGCTGGTAAAGCTATCAAAGTAATGTTGCAACGTCCCTTGTAGATACTGCACGCCACTTTGCTCTTGGTTAGAATGATCGTTTTCAACCCCTAAGCGCTCCGGTGGTAAGCCAAAAGCTTTAGCAATTTGTCGGGTCGTCCAGTCATTCGAGTTGACCAGTTTTAACACATCGGTATTTAAGGATAAGTTACTAATATCCATCGTGTCATCGGTCACAATCGTGTTGATCGCGTTGTCACCCGTATTGGCTTCATCAAACTGGTTGCGAATATTGCCCTTAGCTTCCGGCCCTAAATCAGATTGATGGACTTTAATAATCGTGGTGCCGTGCACACCAGCAGTAAAAAAGCCGGTTAGCAATTTATTGCCGGCCGACTGAATCTGGCGCTCATCTTTGAGGGCATATAGAGGACTAATTCCCGATACGCCGTCTTTGGTGAAATATTTAAAATGTAAAATGTTGTTAGGCGCAATCTGACGACTATTACCGCCAATTGGGGTATAGGTGTAGGTCAACGCCCCACTGACGTCATCTTGTTCAACTGTCATTTGGTTATTTTGCACAAATTTAAGTGTGTGATTAGGCAGAATCTCCGCAAAACTATTGCCATTGAGTAACAGGTTGGCCGCCAACGCATATTTGAAATGGTAGCCGTCCATTTGGCTATTGGGGGTCTGATTAATCATCGTGTTAAAAATGGCCGTATCGCAAACAATCGGATTGCTGGCAATGTCGCTCGCAATAATGTTAATTGCCGCGTAAATGTCACTATTACGCAACACCGCCGCACTCACAAACGTATAGGGGTCATTGCTTGATAAACTAACCAAAGCGTCAGCCATCGGATCATGTGTGCCGCTGGTGGTATTGCTTTTAACAAAAAAACTCATTTAATCACCTCTTTGCTTTTCATAATTAATTAGTAAGGCCAGCAGAATCATGGCTATACCAGCCAATATTAGCCCCGCTTGCCAGCTGATCCAGCAACCAAAACCAATCACTAAGCATATTAAGCCAATCACCAGCAGGATCGTTTGAAAATAATCAGAACAGATCTGCCGCAGTCGCTGTTTTGTAGTAATCTTCTGCATGTTGTTGATCCTCACTTTCTTGGTAATAGTCCATACCCGCTACAAACGCGTTAATCAACGCCGCAATCGGGTCAATCCGGTTACTATTGCGGGCTTTATCTAGTTGCCAACCATTGTTTAGCACTTTCAAGATGGCGTTATTGACCGCATAAGCTAGAATCTTGTTGCCGTTATGTTTAATCTTGTCATCGTAAAGCTGATCACGAAAATTACGAGTTGGAATATTCAAAGTCTTGGTGCCTTGTCGCACTTCAAACAGTGGGTAGCTTAATTTCTCGAATTTTGTAATTAACGTTTGCGCGTTATACGGGTCATACGCGACGGCTTTCACTTTCCAGTTGTATTTTCCGACCAGTTTTTGTACAAAATCAAATAGATCGTCATAATCAATAATGCCGCTATCTAGTCGGGTAATACTACATTCACCCGCCCGCTCCATTGACCGATAATCAATGCCATCACGTTTAATCTTAGAATCAAGGCCATACTTCGTGCCAACAAACGAATGACTATCACAATAAAACTGACCATTGCCAATTGGTATCAACCAACTAACCGCGGTCAAGTCATTACTTTTAGATAAATCAATGCCAATATAGGCGTCACGATTATGTAAGTCGGGTACCTTGGACAATTTACCAGCGGCCCAATCGTCTGCTGAAATATAACTGTCCTCGCTGGCTTGCAACCACATATTGAAATTCTTAACCAGTACCGGAATGAGATTATTTTGTTTAATGGCAAGGTCAACATCGGCCTGAATCTTTTCCGTCATGCGTTGTTTAACGTGTGGTTCACTGAATAACGGGTTGGCCTTGATCCAATTGGCTTGATCGTAAACTTCTTCGCGGTCGTCCAGTTCCCAGATTGCCACAAAATAACGGTCAGCTTCGGTTTTGCCCTTTAAAACGTCCGTCAGCATGTCATATTCGGCGTGCATTGGGACATTGAGATTAAGGCCCGAGGTGGAAATTACCGCCAGTAGAGAATTATCCTCTTGTGCTTGACCAGACTTTAAAACGTTGTACACCTTGCGGTCTTTAGCTTCGTGCCATTCATCTAAAATAACAGTAGTCCCGGCATAACCATCAAGCGTACTGGTATCACTGGCAAGGGCTAGGACTTGCGAATTAGTTTCTAGGTCGGTAATGGCTTGCTTCTGTACCTTAATGCGTTGCCGCATATACTTCGATTGCTTGCGGACTTGCCTTAACCCACTTGAAAGCATGTCATAGCCCAATTTAGCTTGTTTGAGGGCGTTGCTTACGAATAATACTTGTCGGTTGCGGGCGGGCTGTCGTTCTCTTAAAAGGCCATTAGCGGCCATGCCAGAAGCCAGATAGGTTTTACCGTTCTTTCGGGCCATACTAATAAACGCCCGATCATAACGGCGGTTACCAGTAGTTTTTTCACGCCAGCCATATAACTCACTGATAATCCATTTTTGAAAGGGTTGCATGGTGAGTTTGCTACCGTCAGTCTTCGGCATTAATTCGATAAATTTAACCGCTTGTGCCGCTTTGTCTTCATCATAGTAGAACGGGAAGCTAGTTTCCTTAGAACGGCTTAAATCGCGTTTAAATCGCTCACACGCCCATTTAATCTTTTGACCAGCCACCACTTGGCCCGATAAAACTTGGTCAACATATTCAATCATGACAACATCGCCTCGAAAGTATCTTCGGGTGTATTATCTTTCTGCTTGTTTAATTCCATGCGGGCCCGGCTCGATAGCGACATGCCTAAATCATTGGCTAAGGCTTTTAAATCTTTCATAGCTTGTGACTGCAAGGCCACGTAAGGGTTCGGTTTACGGGAACCAGTCTCTTGATTAGTCTGTACTAGTCCATTTTTACGAATATCATTCTCACAAGTCTGTACCGTGGCATAAGCGCGGCAATAACTGGCTAACATCGCCCGGTCAAGTTCACTAATTGGGGTATTGGCCTTTAAATAAGGCGCTACCCGTTGCCATTCAGTCAAGGCCCGATCGTGTAACCAATCCGGCGGGGTTAAATCAAGCACCGGATAATCAAACAGGGCCCGTTCAGCGTCCTTGCGTTGATCACGTTCATCATTGGTTAAATGTTTCTTCATACTAGCTAAGGCTTTTACTTTTTGGCTCATTCGGAGCACTCCTTTCGTTTAAATTTACGTACCAAAAAGCCCCCACGGGTTAGACCCATAGCGGCTGATTGATACATATATCCAGAATCCGTTTATTATATCTATATTATCGCACATATTCCGATAAAGTGCAATTAATAACATGTTTATATTTACATATCACCCCCTGACTGTTTATTTGTTCAAATTTCGCATTATTAGTAGTGATATTTCACAATCCAGCAAAATAAGCAAAAAATCAAAGTTCAAAAGGGACTTTTATAAACACAAAAGTATGCTGTCCGCTCCTTTTTGGTCGACCATAGCCCCCATATCAACGTTTCTGGGCTGTCATGCCGTTTTGAATTAGTCTCGTGGACGAAAATTGCGCAGCCAAATTGGATTGCTCACTCGGCCGAAAACTTGGCGCAGTCAATTGCCACTTTTGGCAACGTAGACGCAAAATGCGGGTTGGTTAGGTCAGCGGAAAACTCCGCTTAGTAGCTCGGCTGAAAGTTCAGCGCAGTATTGCGCAGATCTACTACCTGCGTGATCCTATTCCGCACATTTGCAGAAACGTCTTTATAATATGAACCTTGAGTTGTAGGTATAAAATTGCAACTCACAATAGGTAGCACAAGCAACCTGTCACGTCATCTTAGCGAGTCAGCTAGTGCACCAAGTTAGTGCGTTACGACAGGTGTGTGCCACGTTAAAATGAACATTTACTGTTATAGTATGTAATAGGGTTAATTTAGCAGATACTTAAAAAAGCGCCGCACCTTTAAGCACGACACTCATTGATTATTTAGTTTGTTGTTTCCGTTGTTCTCTAACCAATCCCGTTTTTCGGTTATGGTGTCGGTAGCACAATGGCTGTAGGTTGCTTTCATCAAGTCGCCTTGACCAATCGTCTTTGATTTCGATAACATGATCGACCACATCGGCTTTACGGATCACCCCATCTTGGTAGCACTGTACACATACCGGATTGCTTTCAAGGAACCGCCGTGACAGCTTGCGCCATGCTGACGACTTATAGAACTGTTGATACTTGCTTTCGTCTGAATCATACATGCGTTTATGATAACGCCACTTGTTAGTGGCCTTGCGGTGCTTCTCGCAGTAGCGTGTGTCATAGGCAATCAACGTCCGACAACCCGGGTGCTCGCATTGCTTCATTGGCTTAGCCATGGCCGTTGACCTTAGTTAGTGTTACCACGTCATAGGCATTCAGTTCGCTATCAGAACTAACGCCAGCAACCTTATACTCAACACCATCTAACAACGCTAGTAGTGCTGTGGTAATACGTTCATCATGGCGCACCGCAATTAGCTGGTTAGTTGTCGCAGTCGTACCAGTAAGGCTAATAGTGTTACTGATGGTCAACGTATACTCACCACACCAGACAGTGAACAGTGGCACGAATTGTTGCTTGGTTGTGCCGTTTATTGGGTTCTGAACAGACTTGACGGTGCCAAACTGTACCCGCTTATTTAATCGACTTAGATTATAGTTCTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP035566|3124395:3135605|3126283_3126991_-|QBA78620.1|DBSCAN-SWA MKKILVVDDEKPISDIMKFNLTKEGYEVHVAADGEEALQKVDEVHPDLILLDLMLPKMDGLEVARQVRKNYDVPIIMVTAKDSELDKVLGLELGADDYVTKPFSNRELVARVKANLRRQGAPSAQPAEVEENSDIEIGDLVIHPEAYMVSKRGENIELTHREFELLHYLAQHIGQVMTREHLLQTVWGYDYFGDVRTVDVTVRRLREKVEDNPSHPKWLVTRRGVGYYLRNPENE >CP035566|3124395:3135605|3128234_3128612_-|QBA78623.1|DBSCAN-SWA MIPMRQDVKKIRNLLKQYAKLKRDFTAFNQVSSPSFDGVSSHSSRNGAESRLINHVDLSYQLKEVEDALNAIDDPQYQFILHDYIIEKRFSRNEACEQLSVSVSKFNYLKNRALEVFKLNYLRTP >CP035566|3124395:3135605|3131927_3133631_-|QBA78628.1|terminase|DBSCAN-SWA MIEYVDQVLSGQVVAGQKIKWACERFKRDLSRSKETSFPFYYDEDKAAQAVKFIELMPKTDGSKLTMQPFQKWIISELYGWREKTTGNRRYDRAFISMARKNGKTYLASGMAANGLLRERQPARNRQVLFVSNALKQAKLGYDMLSSGLRQVRKQSKYMRQRIKVQKQAITDLETNSQVLALASDTSTLDGYAGTTVILDEWHEAKDRKVYNVLKSGQAQEDNSLLAVISTSGLNLNVPMHAEYDMLTDVLKGKTEADRYFVAIWELDDREEVYDQANWIKANPLFSEPHVKQRMTEKIQADVDLAIKQNNLIPVLVKNFNMWLQASEDSYISADDWAAGKLSKVPDLHNRDAYIGIDLSKSNDLTAVSWLIPIGNGQFYCDSHSFVGTKYGLDSKIKRDGIDYRSMERAGECSITRLDSGIIDYDDLFDFVQKLVGKYNWKVKAVAYDPYNAQTLITKFEKLSYPLFEVRQGTKTLNIPTRNFRDQLYDDKIKHNGNKILAYAVNNAILKVLNNGWQLDKARNSNRIDPIAALINAFVAGMDYYQESEDQQHAEDYYKTATAADLF >CP035566|3124395:3135605|3130672_3131773_-|QBA78626.1|portal|DBSCAN-SWA MSFFVKSNTTSGTHDPMADALVSLSSNDPYTFVSAAVLRNSDIYAAINIIASDIASNPIVCDTAIFNTMINQTPNSQMDGYHFKYALAANLLLNGNSFAEILPNHTLKFVQNNQMTVEQDDVSGALTYTYTPIGGNSRQIAPNNILHFKYFTKDGVSGISPLYALKDERQIQSAGNKLLTGFFTAGVHGTTIIKVHQSDLGPEAKGNIRNQFDEANTGDNAINTIVTDDTMDISNLSLNTDVLKLVNSNDWTTRQIAKAFGLPPERLGVENDHSNQEQSGVQYLQGTLQHYFDSFTSELSFKFGHDFTFNTDKLLSLDPQTQQAQAVAGYTGGIMSRNEARAKIGLPPTDDGNIFLNLQKNGVTNS >CP035566|3124395:3135605|3129146_3130676_-|QBA78625.1|capsid|DBSCAN-SWA MKQDRRLTIDAELRAQTPQPETPEDGPAENSADPQPKDSQTSKGKTISGYAIVWNSPSKDLGGFTEVVTPKALDGVDLSNVLMLNNHDYTQVLASAKAGTLTLETDDKGLHFTAQLPNTSFANDVYEEVQSGNVDSCSFGFDSDDDTDEWTKDDGGNITRTINQVKSLFDVSVVAVPAYDDTNVQVDTRSYEKFINQEKEPDDMAKQTIIDPNGNENKTGIPAFEQYVRTHGETRDGLKTDGASAVIPKELITPVFQLKQSKYNLAQYATVKQVSSGSGTYPIATSQQSAVLATKDELADIADVDANMFTEVPFDVKTRAGKIALSNEVVEDAEVDIVSEVKTQLQQLVDNTDNTQIMGLLTGTSFAKATATNIDDLKKIFNVTLDPALSKMWLVNQSGFNYLDTLKDSEGRYLLQPNPTAPSGFTLLGAPVVMISDKLLANNADGTFPMIAGDLSQAVAVFRRNQVTAQWDKFDQFSQGLSVIVRNDYEVIDKTAVINVALGTATAGK >CP035566|3124395:3135605|3133627_3134101_-|QBA78629.1|terminase|DBSCAN-SWA MSQKVKALASMKKHLTNDERDQRKDAERALFDYPVLDLTPPDWLHDRALTEWQRVAPYLKANTPISELDRAMLASYCRAYATVQTCENDIRKNGLVQTNQETGSRKPNPYVALQSQAMKDLKALANDLGMSLSSRARMELNKQKDNTPEDTFEAMLS >CP035566|3124395:3135605|3135266_3135605_-|QBA78631.1|head,tail|DBSCAN-SWA MKNYNLSRLNKRVQFGTVKSVQNPINGTTKQQFVPLFTVWCGEYTLTISNTISLTGTTATTNQLIAVRHDERITTALLALLDGVEYKVAGVSSDSELNAYDVVTLTKVNGHG >CP035566|3124395:3135605|3124395_3126270_-|QBA78619.1|DBSCAN-SWA MLRFKRKNFFKTINFKIALVFALLLLITLEIVGAIFVKQLESKNIQDFKQSVQIPTYIDNSLSEQLTVSSTRKANGQIKTILSNYNNTNVDEIQVVDSKGTIRGTSDVNDQSVVGQKTTDRNVKNAIYNNRTYTKSTYDTQNNGRYYVSIVPLYSSNSAGNSSQLVGVLYVRANMKSVYSTINNIMGIFVIASLAAMVLGLGIAIIIARAITRPIEEMKQQTQRIARGDYAGQVRVYSDDELGQLAKAINNLSIRVEESQESTEAERRRLDSVLSHMSDGVIATDRRGNITIINETASDFMDVTAEKAIGNSILDILKIRDDYSLRDLIENQDELMLDFSSNERDLILNAYFSLIQRESGFISGLVCVLHDVTEQQKIDNDRKQFVSNVSHELRTPLTSLRSYIEALSDGAWKDPEVAPGFLKVTQEETDRMIRMINELLSLSRMDSGTTRVDMELVNINEMFNYVLDRFDMILKKDDNPAKYYTIKREFTKRDLWVEIDTDKFTQVLDNIMNNAIKYSPDGGVVTCRLLETHNQVIISISDQGLGIPRADLGHVFDRFFRVDKARSRAQGGTGLGLAISKEVVQMLGGRIWVDSVEGKGSTFYISLPYEPYEEEDLWDDDSQA >CP035566|3124395:3135605|3131773_3131974_-|QBA78627.1|DBSCAN-SWA MQKITTKQRLRQICSDYFQTILLVIGLICLVIGFGCWISWQAGLILAGIAMILLALLINYEKQRGD >CP035566|3124395:3135605|3127910_3128111_-|QBA78622.1|DBSCAN-SWA MQSGTVKWFNADKGFGFITGSDNKDVFVHFSSIQTDGFKSLDEGQKVSYEVEQGDRGPQATNVVPQ >CP035566|3124395:3135605|3128761_3129031_-|QBA78624.1|head,tail|DBSCAN-SWA MAVTVDDIKLSLRIDVTEDDPMIKSYLDAAEDYVQTAVSKSEDLTIYKQYDFAVSLLTQFWYQNRVTDMTKTPYQVVSMIQQLRGLVTG >CP035566|3124395:3135605|3134884_3135274_-|QBA78630.1|DBSCAN-SWA MAKPMKQCEHPGCRTLIAYDTRYCEKHRKATNKWRYHKRMYDSDESKYQQFYKSSAWRKLSRRFLESNPVCVQCYQDGVIRKADVVDHVIEIKDDWSRRLDESNLQPLCYRHHNRKTGLVREQRKQQTK >CP035566|3124395:3135605|3127593_3127824_-|QBA78621.1|DBSCAN-SWA MDFTDVYGIKHENCTLITPTEEYRRIIIFMDSVGRRFVAISPNPEPTKYGSAKSHWKQGKPNDAPKEYFHIDKKNC |
13 | Bacillus_phage(25.0%) | capsid,tail,terminase,portal,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
5405 : 71365
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035568|5405:71365|DBSCAN-SWA 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59 | unidentified_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
8678 : 68061
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP035567|8678:68061|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(21.05%) | integrase,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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