CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
CP035573	Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed2	0 crisprs	NA	0	0	0	0
CP035575	Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed4	0 crisprs	NA	0	0	0	0
CP035574	Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed3	0 crisprs	NA	0	0	0	0
CP035572	Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed1	0 crisprs	csa3	0	0	1	0
CP035571	Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 chromosome, complete genome	0 crisprs	csa3,cas3,DEDDh,DinG,WYL	0	0	7	0

1. CP035572

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	531 : 46521	45	Staphylococcus_phage(30.0%)	holin,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP035572|531:46521|DBSCAN-SWA
TCTAGGCAATCAGCTGGTAGACGCGTGTGAACATATTGGCCTGATTGGAGAAGCCATAACAAGCACGTTTGAGCTCCTTGACCTTACGGTTGATGCCCTCTATCGGTCCGTTAGAGTAGGACGATTTGGCGGCGTTAATTACGCCATTAAGATTCTTTCGTAGGGTATGCATGGCCGTATCTAGGGGCGTGCCGTTAGGCTGATAGTTAGTGATGATATTCTTGAGTTCATCAGCGTGACGCCCCATCAAAGCATCGTGGAGGTCGATGTAGGTTTCATAAGCTGTTTTGAAGGCCGGAAACGTATCGGTTCCAATATCAATAGCGTTCTGTTCGGTCGAGTACTCATTCAGGCCGAAGAGGTAGCGGCTCTTTTGTGCGTCAGGGTTGGCCTTGTGGAATAGGCGCCATAGTGATTTCAGTACTTTATATTCCCGCGAATGCTTGTCGAGTTGCTTTAAACATTGAGTGCGAATGGTATCCATCGTCCGGCCCATTAATTGAATAATGTGGAACCGATCAATAATGAGTTCGGTGTTAGGGAATAGTTCGTGCACGAATACCTGATAGGAGGCATTCATGTCCATGATGACGCGTTGAACCGCGGCCCGTTCTGCGGTGCTGTACTGACTAAGAAAGAACTGTTTGATGGTTCTATTAAGGTGGTCGCTAAGTACTTTAACTGATTTGTGAGTGTCGGCGTCAATGCAAATAAACGACATGGAGCCGTGCGTGGAACGGAATTCATCAAAGCATAGATTAATCGGTAACCGACGGCTCGCGTGTGGATGAATATTAGCCGTCAAAATACGCTGACCTGAGTTTGTCGAAATACCGGTGAGACTGGCAATAGTCTTAGCCGGGAGTGATTTACTGGCTAGCTTCAGCTCATGAGTCGCTAGTCCGTGACCGATGGCGTGGTTGGTTGATACCACTGGAGTGGTGGCCGTACAAGTGCTATGGCAGTTACTACAACGCCAGCGTTGCTTGTTTAGCTCTAGAATTACGGGCCGGTCCATGGGTCCTGCAATGTGGACATGAGTGAGCTTGTGTCCGTTAGGGTGCAACGTATTGTATCCACAGTTGGGACAGCGCCTGAGTGTGTAGGTAAGCTCTGTCTGGATGACCAAATACTTTTTGCGACCCGAGCCCCGACCATGAAATTCCTCACGAGTACCGAACACCTGAATGTTTGTGTCTGTAATTCCCAGTAATTTAAGTGTATTATCTAGTTGAGAACGTGTTTAGAATCTTTTCAAGAGTATTCGCAGGAAGGCTAAGCTAATCATCATCTTACTGGTGTTCAGCTTTCGCTCACAATTGCGCCAGAGGCGCCGATGTTTTCCTAGCCAGCTAAAACTGCGTTCGATAACCCAGCGTTGCGGGGTCACTTGACCGTGCCTAAGGTCACTCTGTTTAGCAATAATGACTTCAGCGTTAATCATTGCCTGAACTGATTGAGCAAAGTTGTTACCAGTATAACCACCATCGGCCATTACTCGTTGAACCAGGTCAAACTGTGATTTGTTTAACGCCAGTAGCGCATTGGCGCCATCACGCTCAGAAACATTGGCGGTTGTCACATGGACTGCCATCGGCAGCCCATTGATATCTACAGCAAGATGGCGCTTAATCCCACTCACCTTTTTACCACCATCGTAGCCGCTACTTTCAGCAGGATCGGTATTCTTGACACTTTGAGCATCTAGAATGATGAACGATGTATAAACTGAACGCTTCTGAGCCAACCGATGTTGGCTGACAATTTTTTTAAAACCTTATCCAGAGGAGTGATACCAGCAGGAGATGGCGTTTTAGTCCAAAGTAACCAGTAATAATAGACGGTTTCCCATTTAGGAAAATCGCTGGGTAAATCGCGCCAAACGCACCCATTTTTCAAGGTATAAAGCAGGGCGCAAAAGATATCATATAAATCAACCTTTCTTGGCTTAGTCCGCTTACGTATGCCTTCTAGATCTGTCCGGATTAGTTCAAATTGTTCACGAGAGATGTCGCTACTATAATGGTGTGCAAAGCTTTTCATGGATTAAAAACTCCTGTTTTTGACCTAATTTAACTGAAATCAAATCGAATGTCAAAGTATCCAAACACGTTCTGAGACATCTATTCCTACCCCGCTTATCTTGAGTTTCGTCGCTTAAAGCATAGCACTAGGGAGGCTTAGATGCCTTTTTTTGTTGACGAATTTACAATTGAAGTGCAACAAATGATCAAAAAGAAGACTCACAGCCTGAGTCCTTGTAAAATATAGTCACCACAACTTACTTACAAGGAGGACTCAGACTATGAGCCTATATCATCATCTTACCTTAAATGACCGTGAATGCCTACTAGTTGGGCTAACTTTAAAACAGTCTTACCAGGCCATTGCCCAACGCATCGGTTGTTCTAAAGCGACTATTTCACGGGAAGTTAGCCGGAATGGTGGTCGTTCTAAATATTCCGCAGTTAATGCGCAACTAAATTATGAGCGTCAACGTTTGAAAAGTCGACGGCCACGGATCTTATCGCAAACTGATATCCGGGCATTTGTCATTAATTGTATCGTTCATCGTAAATGGTCCCCAGAACAAATCGCAGGACGGCTAAATTTTGAGCATAGTAACTGGAAAATCAGTTACAACACAATTTATCGTGGAATTGCTTTGAATAATCTTGGTGAAAAGCGTAAAAGTCATGGTGCCCGTGGATTCGCCCGCCAATTAAGACATCGAGGTAAAACGCGCAAAGTTAAGGGAACTATCAAGGAACGGCGTGGTCGTTTTAACGATGTACCTTCAATCCACGACCGCCCACTTTCGGCTGAAAATAGAACTCGGTTTGGTCACTGGGAAGGTGACACAGTGCGTGGTAAAACCGGACGTTCAGCGCTGGTGACGCTGGTAGACCGTAAATCACGGTATTTATTAGCGGAACGGGTAAGTAAAGTCGCAGCTAAACCCGTGGCACAAGCTATGATGGACTTATTAAATAGCGTCACACCGGAACGGGTAAAGACACTTACACCTGATCGTGGAACTGAGTTTGCCAATTATCAAGACGTCATTGACACTTTAGAAATACCGGTATTTTTTCCAGATCCACACGCACCACAACAACGTGGAACCAATGAAAATACTAACGGTTTAATTCGTGAATATTTCCCCAAAGGAACTGATTTGAACGATTTAAATGACCAAGAGATTATCGCATTCGTCACAGATTTAAATAACCGTCCACGTAAGGTCTTGGGATGGAAAAGTCCAAGTGAAGTTTTCTTCGGCAAAAAGTTGCGCTTGATTTGACAATTCGTCTTATCAAAAAGGGCCTAGTACTTTTGGAATGGAAATATTTTCCAACACCAAAAATTCTAGACCCAGAAAAATACGGAGAGCTAGAATTTTATAGCTTTTCCGTATTTTTGTATGCCACATTGCGAATTTCTGGTAGTGGGATAAACCGATCAGCATTAATCACAATATCATTTGCATTGTAGCCATGGATCAAGGTGGTGATATCTGGTAAATGGCGGTTGTTTTGGTCAACCGTTTTTAATTGAATGGTCACTGGTTGCTGACGCTGATATGCGTCCGCCAATACCTCGGTAATTGTTGCTAAGGATTGTTGCGGTCGTGGAACGTATACTGCATTCAACTGCTGGTTCTGTTGGTTTAATGCGGCAGTATGATCGGATAAATAGAAGCCCTGCCATTTCCTCATGCCCCGGTCATGGTAATCATGTTCAAAAAAATGCTTAACCGTGGCTAAATCAAATTCTTGATTATTCAAGTGGCACCCGCTTTCGTTGAATCAGCTTTTGGCTTGCAGGCCACCGTTCCCCAGTAAAGCCGACAAATTCAATCGTTAGCTTTATATCTTGTCGTAATGCTTTTAGTAATTTTTCTAAACCAGCTAAATCATAGTGAGCTAATTTATGTAAGGGAACAGATTGCAAGCGCTCATTAGCCCGTTGACTGTTGAAAAACAAATTATAGGTCTGATCGTAGGTGTCATTAGTCAACATTAACCAATAGCGGGTTTGGGGACGCCGCTTAAACAATAAGGTTAACCGCCCCTTAATAATCTCGATATCGCTATTCATAGCTATTGCCTCCATTATGTCCGCCCACTAGTGAAGCCCGCTTGATAGCGGTGCCTCCCTTTAATAAACTAGTCGCGTAAACTAGTTTGGTGAACCCAAATTGCCGGTGAATTTCATCAATCACCTGGTTTAACCGGCTATGGCGAATTTGGTTGCGCGGGGTTTCAAATAAATTAAGTTGTTGGCCGGAGTTGGCACTTAGTTTACTGCTATAAACGCTAATATTCCGGACAGCTTGACCGTCCCAATTCTGACGGAATAACCACAATAATTGTTGCGTCAAAACTTGATTGTCATTAGTTGGTTCAATTTTTAAAGTCTGGTTAAAACCACCGCGACCATCTGCTTCAGCTGCAGCATAGGAAAACCCAATGCTTAGCGATAGACAACCGGCCAGTTTATGGTGGTGCCGAAGCCGCGCCGCCACCTGTCCCCCAATTTCTTTAATGACGGTTTCAATTTCGACTTGGTTAAAATAATCTCGTGGCAATACTTGCGAATTACCCAGGCTAGTTTCTTTAACCTTAGTTGGTTCCGTGACTTGTGCGCGATCAATTCCCCAGGCCGTAGCAAATAATTGGCCACCAATGACGCCAAGTTGCTGTTTGAGTAAATAAGGGTTGGTGTGGGCTAGCTCATACATATTGTGAATTTGAAGCCGGTTCAAACGTTTAGCCATACGGGGGCCAATCCCCCAAACGTCCGTTAATTCGTTGATTGACCAAATTTTATCCGGCACCGTTTCGTAATGGATTTCACCGATCAATTCATGATTATGTTTAGCGTAAAGGTCTAAGGCTAATTTAGCTTGCACCGGATTGTCACCAATTCCCACGGTGGTATACAAGCCTAGCTTTTGCCGAACTGTCTTTTGAATCAAGCGCGCCACTTCGCGAACG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MIISCANEKGGTGKTSTTALISWELSNMGYKVLMVDCDPQANLTDLMIKTKSHENSSITIDPSLFALLINGKDLNDGIINIKNGLDLIPAAADMNLFSRWVDKQDINEKAKVSYLKNSLSNISSKFDFVFLDVSPTMSLTNDNVFMCCDWIIVMLQTQQRALLGAKSFLSYLQTNLIDEFGAKVDVAGILPVLTKGQSIIDNAVLKQAVEEFGEDNIFENVITAMERVKRYDLTGITESSRSVWDKATHSTYTAVATELISRLEAE
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>CP035572|531:46521|14347_14542_-|QBA81809.1|DBSCAN-SWA
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>CP035572|531:46521|42957_43305_+|QBA81835.1|DBSCAN-SWA
MNYTDYAMVIKAMGDASRLEIIDMLSCGEMCACDILDHFDFTQPTLSHHMKVLQTAGIVDAQKDGKWQHYSLNSKFITSFPEFTHQLLQVEEICVCHPTVEDKGCNKCNLETTGD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
QBA81796.1|531_1713_-|transposase	ISL3 family transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.8e-35	28.6
QBA81797.1|1773_2573_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
QBA81798.1|2835_3834_+|transposase	IS30 family transposase	W5R8L2	Staphylococcus_phage	2.9e-50	38.9
QBA81799.1|3931_4318_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81800.1|4310_4631_-	acetyl-CoA carboxylase	NA	NA	NA	NA
QBA81801.1|4623_5925_-	Y-family DNA polymerase	M1Q231	Streptococcus_phage	2.5e-78	38.9
QBA81802.1|6158_6263_-|holin	putative holin-like toxin	NA	NA	NA	NA
QBA81803.1|6860_7124_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81804.1|7568_8519_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	A0A0E3XCL7	Enterococcus_phage	2.0e-24	77.8
QBA81805.1|9313_9451_-	ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA81806.1|10773_11211_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA81807.1|11805_12309_+	type 1 glutamine amidotransferase	NA	NA	NA	NA
QBA81808.1|13052_13973_+|transposase	IS30 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	2.3e-49	36.8
QBA81809.1|14347_14542_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81810.1|14561_16331_-	oleate hydratase	NA	NA	NA	NA
QBA81811.1|16754_16973_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81812.1|17867_17984_+	ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA81813.1|18260_19427_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
QBA81814.1|19526_20543_-	general stress protein	NA	NA	NA	NA
QBA81815.1|20564_21935_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
QBA81816.1|22101_22350_-	GlsB/YeaQ/YmgE family stress response membrane protein	NA	NA	NA	NA
QBA81817.1|22697_22892_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81818.1|22869_23343_+	DUF4355 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA81819.1|24136_25876_-	pyruvate oxidase	A0A0P0CDR3	Ostreococcus_lucimarinus_virus	9.6e-33	26.8
QBA81820.1|25900_26395_+	RepB family protein	NA	NA	NA	NA
QBA81821.1|26640_26988_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81822.1|26989_27790_-	ParA family protein	F0PIG8	Enterococcus_phage	5.5e-68	51.0
QBA81823.1|28229_28436_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81824.1|28584_28917_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81825.1|29278_30078_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
QBA81826.1|30271_31056_-|transposase	IS5 family transposase	NA	NA	NA	NA
QBA81859.1|31299_31608_+	replication protein	NA	NA	NA	NA
QBA81827.1|31866_32148_+	type II toxin-antitoxin system RelB/DinJ family antitoxin	NA	NA	NA	NA
QBA81860.1|32329_32644_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81828.1|32934_33144_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81829.1|35545_36187_+	conjugal transfer protein	NA	NA	NA	NA
QBA81830.1|36201_36612_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81831.1|38874_39090_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81832.1|39093_40218_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81833.1|40372_40462_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81834.1|41473_42868_-	CoA-disulfide reductase	NA	NA	NA	NA
QBA81835.1|42957_43305_+	ArsR family transcriptional regulator	A0A2H4PQT4	Staphylococcus_phage	1.7e-18	44.3
QBA81836.1|43307_44603_+	arsenic transporter	A0A2H4PQU3	Staphylococcus_phage	6.9e-145	63.7
QBA81837.1|44979_45516_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81838.1|45600_46521_-|transposase	IS30-like element ISLsa1 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	1.2e-50	38.2

2. CP035571

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	44451 : 111465	55	unidentified_phage(38.46%)	transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_2	378847 : 427086	48	unidentified_phage(21.43%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_3	742855 : 751369	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	953765 : 1001964	59	Lactobacillus_phage(64.71%)	portal,transposase,terminase,protease,capsid,integrase,holin,tail	attL 953670:953685|attR 970322:970337
DBSCAN-SWA_5	1295960 : 1379113	87	Lactobacillus_phage(70.73%)	portal,head,terminase,protease,tRNA,integrase,capsid,holin,tail	attL 1289080:1289097|attR 1353515:1353532
DBSCAN-SWA_6	1861062 : 1962499	93	Lactobacillus_phage(80.0%)	portal,head,transposase,terminase,protease,tRNA,capsid,integrase,holin,tail	attL 1914765:1914781|attR 1956775:1956791
DBSCAN-SWA_7	2679177 : 2739738	54	uncultured_Mediterranean_phage(25.0%)	bacteriocin,tRNA,transposase,protease	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>CP035571|44451:111465|DBSCAN-SWA
TATGGCAAATTTCTACGGAAATGATCCTTTTTTCAACAATGATATGGATGATGTTTTCAATCAATTATTTCGGCGCATGGATAATCAAAATTCGGAGCGTGCACGGTATTTAGTTAATGGACAATCGCTGACACCGGATGAGTTTGCTCAATACCGAGCAACTGGTAAGCTACCCCAAAATAATAAAACAATAGAAGTATCTAAAGATGGTAAACAGGCTGTTAAAAAAGGGGGAATTTTAGAAAAGTTAGGGACTAATTTGACGGAACAGGCTCGTGATGGATTACTAGATCCAGTGATTGGACGTGAGAATGAGATTCAAGAAACTGCAGAAATTTTGAGTCGTAGGACGAAAAATAATCCAATCTTAGTTGGTGATGCCGGTGTAGGTAAAACTGCAGTCGTCGAAGGTCTGGCACAAGCAATTGTGGCTGGTAAAGTTCCAGAAACGATTCAAGATAAAGAAATCTATTCGATTGATTTATCGTCTTTGGAAGCAGGAACTCAATATCGCGGTTCTTTTGAAGAAAATATTAAACAGCTAGTAAAGGAAGTTAAAGCAGCTGGTAATATTATTCTATTCTTCGATGAAATTCATCAGATTATCGGCACGGGCACCACTGGTGGTGAAGATGGTGGCAAAGGATTGGCTGATATCATTAAACCTGCTTTGTCACGTGGCGAGCTGACTGTAATCGGGGCTACGACTCAAGATGAATATCGCAATACTATTTTGAAAAATGCGGCTTTGGCACGGCGATTCAATGATGTTGTGATTAATGAACCGACGGCCGCTGACACTTTACGTATATTACAAGGTGTTAAAAAGCTGTACGAAAAGCATCATCATGTTGTATTACCAGATGATGTTTTGAAGGCGGCTGTGGATTATTCAATCCAATATATACCACAACGCACTTTGCCAGATAAAGCTATCGATTTGATCGACATGACTGCGGCTCATTTAGCGGCTAAAAATTCGCAAACTGATGTTGAGACATTGGATCAACGCGTTAAAAAATTAGAGGCAGCTAAGGAGGCCGCCGTTAAATCGGAGGACTTTACAAAAGCCGCTGATATCAAGAAGTCGATCGAGGAAACCAAGCAAAAAATTAAAAAAACGGATCAAAAAGAAAAAATCACTGCCACGATTGATGATGTGGCACAATCGGTTGAACGTTTAACTGGTATACCAGTTGCTGATATGGGCGCTAATGATATTGAGCACTTGAAAAATCTTGATAAGCGTCTGAAAAGTAAGGTAATCGGTCAAGATGAAGCGGTTGAAATGGTAGCGAAGGCAATTCGGCGTAACCGTGCGGGCTTTTCAGAGGGTGATCAGCCAATTGGAAGTTTTCTGTTTGTGGGCCCAACTGGCGTAGGAAAGACTGAATTAGCTAAGCAATTAGCCTTAGATATGTTTGGAAATAAAAATGCGATTATTCGGCTAGATATGAGTGAATATGCTGATCGTACAGCTGTGTCGAAATTAATTGGTACCTCGGCTGGATACGTAGGCTATGAAGATAATGCTAATACTCTAACCGAACGGGTTCGGCGTAATCCATATTCCATTGTATTATTAGATGAAATTGAAAAGGCTGATCCACAAGTATTAACGTTACTGTTACAAGTGATGGATGATGGGCGCTTAACGGATGGACAAGGCAATGTCATTAATTTCAAAAATACGATTATTATCGCTACTTCTAATGCTGGCTTTGGTAATGAAGCATTAAGTGGTGACAAGCAACGAGATCAGTCATTAATGGATAAGTTAGCACCATTTTTCCGCCCAGAATTTCTGAACCGTTTTAATGGAATCGTGGAATTTTCACATCTGACTAAGCAAGACTTAAGTCAAATTGTCGATTTGATGTTGGCGGATGTACAAAAAACGTTAGCCAAAAAATCCATCAAACTTGAGGTAACTAAAGCGGCCAAAGATTGGCTGATGGAACAAGGCTATGATGAAGCGATGGGTGCGCGGCCATTACGGCGAGTAATTGAACAACAAATTCGTGACAAGGTAACGGATTTCTACCTTGACCACTTAGATGTCAAAAACTTGAAGGCTGATTTAGTGGATGCTGAGATTGTGATATCGGCAGCTTAGCTTAAATCAGTGTTCATAAATAACTTTATGTAAGAGGAGATTGCTTGATAGATCTCCTTTTTTCGTTGATTTTCACCATTTGATATTAATCTATTGAGTAATGTGAATTAGTGAAATTAAGTCTAGTTTGACTTGTAATCTAAGGAAAAATTAAGGGGGAGTATCGATGAAACTGATTTATATTAACGATCTTTTTACATGAAACTTTAGTTTCGTATGAATAATTAAACTGATGTATCTTTAAATGTTTATTTCTAGTCTTAAAACAATATTGAATAATTAATCTATTTATGTATTCTTTTCAATTAATTAATACTGTTTTAAACTGTTGATACAGGTATGTATTTGAGCATTATAGGAGTGGGATATGGAAAAGCCAGAACAAAAACTATTGCTTTATAAATTAAGCGATCGGTTATTCGCTGCGATTCAAAAGAATCTTCAACTAGAAAGACGGCAGGCATTACTAGTTAAACTAGGCATTGATACTGTATTAAATGTTATTCCTAAGCTGATAATTACTATTATCTTAGCGTTGCTGCTACACGAGTTGGTCCCAGTGTTAGTTTTTATGGGTAGTTTTTTAGTTTTGCGTGGCTTTGCCTATGGACGTCACTTGGAATCGGATTTGTTATGTACGATATTAACTATCTTTGTGTTTGTGGGTGTGCCGTATGTGATTGGAACTGGTATTTCTGAAGTATACAGATTGTTATTAAGTTTAATATTTGTAATAATCATAAGTATTTTTGCTCCAGCTGATACGGTAAAGAATCCTATTACATCGAAGTCATTGAGAAAAAAATTAAAGCGACGGGCAATTGGATTGTCATTAATTTTGAGTTTGTTACAAATAGTTAGTAATAATTATTTTGGCACAATCATTTTAATTGCGATGGCATTAGCCGCTTTATTACTAATGCCCTATGAAAGGAGGGAAAATTATGAAAGAAAAAATGTATAAAGTACTTAGCCATCTTTTTCAATACGTAGGTACTAAACAGTTGGTTATGTGCTGCCATGGGATATTATTCGAAACTAAAATTCCTGATGAATTAAAAAGCAAGGATTAGTGTAGATATATGTTAATGATTGTCTTCCAAGAATTATCTATCTATTTGATAATTAAATCTTTGTTGAGAAATATATTTTTTGTGAGACTTTTTGATGTTATATTCTTATCCGTCTGTATGCTGATGAGTTATATTTTTTTAGCAAAGTTAGGAATTAGTTTTTCTTTTTTAATGTTAATGATGTTTATATTTTTCACTTGGTGGTATGTACGAGTTCTAAGCGGTGCACTATGTATAACATTTCAAGTGTTCATATGGTCGATTATGGTTGACCATATTTGTGATATATTAACTCGTTTAATGAAAGTTCCTAATGGGTATGTGGTAGTGTTTGTCATATTGAGTGTCGTAAGCTTAATTTTTCTTAATATTGTAATGGATCGCACGAATTTCAGTCCCACGTTTAGTAATCAGAGCTTAAATCGCATAACCGCACTATTATTAATGATAATATACTTGTATATTATGTTGAGTGAAGGTCTGGAAAATCAGTTCCAGGTTATATTAAGTAATTTAATTATATTGTCAGTTGTAATGGGGTTAGTATTGGTGATTTATAACGAATATTTAAAAAATGTAAGAGCCAAATATGAAGTCCAAAAGCAAAGAATACAAATACAAAATGATACTCGCTATATGAATGAAATCGAAGCTCACTATAATGAGTTGCGACGTTTCAGACATGACTATCAGAATATGTTGATTTCGATAGATGAATATTTGAAAACTGATGATTTAGAAGGTTTACAAGAATATTATCAAAAGAATCTTGCACCGGTTTCAAATCGGGTGTTAAAAGAAAAATATAATCTTGAAGATTTGAGTCGAGTCAAAGTGAAGTCGATTAAGAGTATCCTATTTAGTAAGTTGAGCTATGCACAATCGCAAGAGATTGAAGTTCATTTTGATTTAAAGGAACCATTAATTGACATTACTGTTAATGAATTGGATTTAGACATTGCATTAGGGATTATGTTGGATAATGCAATCGAAGCATCGGTAGGACATGCTGATGGAGAGATTATGAGTGCCATTTTTATCGAAAAAAATAGTACGGTGTTCTTGATTCAAAACAATGTTTTTGAACAGTTACCACCCTTATGGAAGCTGAAAGAGGCAGGTTATTCCACTAAGGGCAAGAATCGGGGGATTGGATTGAATAGTTTAAGTAAGATTGTTAATCGCAATGAGAACATGATACTCGAAACCAGAGTCTTAGGAGCGGTATTCTTACAACGCTTGACGGTGAAGCGAGTATCTCAGAATGATTAGTGTCTATATTTGCGAAGATGATCCGAAACAATTACAACAAATACGGCAAATCATTACTAAGGTAATCGTCGATCAGCAGCTAGACATGAGTATCTGTTTAGCATGCCAAGATCCCCACGAATTGTTAGACAAGGGTTAATGCACAGCAGCCTCAAAAGGCAATCTATGTGTTAGATATTGCCCTTAATTCAGATATTAATGGTATTCAACTAGCTAGCCAGATTCGTGACATGGGCCGTCGCAGCAAGATTATTTTTATCACGACACACACGGAGTTATCTTTGATGGTGTTTCAATATCAAGTTGAGGCATTAGATTTTATTCTTAAGGATTTTCCAGATTCCTTGTATGAGCGATTTAGCAAGGTTTTACACGTGGCGCAAGATCGTTTTCAAACCGATGAAAATGACCAAGACGACTATGTTCAAATAAAAATTGGTGAGACGGTCAGATCAATTAATGTTAAAAGCATTATATTTTTTGAAAGTTCAACCAGTCCCCATAAAATCGTAGTCCATTTGGATGATGGTGAATTAGAA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MSENLVEVSDYLRDQLIFLHTSFKTSKELFTAINAKAQENGFVTDQFLPKIIKREATFPTGLQLEHRGVAIPHTDADTINKEFVAVVVNDDPIAFSRMDDPEQKVAAKLVFVLGLNKPHAQLDMLQALMSIIQDDELVNSLENADNANQIHQLLSR
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MKKLNVLVACGAGIATSTVVMKKVEDLFAENNIDANLIQIKIAEAASKQDDADMLISTTVLPTEYKIPAIKAMGFLTGLGVDKLQDEILTKAREIQAQ
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MKSKIMKFVLWDSVVTTKKALFDQVATLLQENGVIESPRQAIKLWQQREKAGSTMIDQLLAAPHAQGRSIKRNTVVLVHTCKPIQQWDEHDDAQNFIFCCIQQDISKLDADTITRTLKLAISGDSQHAFQQNAKAQIIKILDF

Homologous phage analysis in the prophage region

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QBA79001.1|47510_47639_+	cyclic lactone autoinducer peptide	NA	NA	NA	NA
QBA79002.1|47648_48911_+	GHKL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA79003.1|50003_50441_+	Spx/MgsR family RNA polymerase-binding regulatory protein	NA	NA	NA	NA
QBA79004.1|50598_52053_-	catalase	A0A2K9L572	Tupanvirus	5.7e-103	46.2
QBA79005.1|52398_52644_+	GlsB/YeaQ/YmgE family stress response membrane protein	NA	NA	NA	NA
QBA79006.1|52660_52795_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79007.1|52989_53538_+	folate family ECF transporter S component	NA	NA	NA	NA
QBA79008.1|53574_53769_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79009.1|53733_54105_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79010.1|54572_55778_+	NAD(P)/FAD-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
QBA79011.1|55916_56603_-	N-acetylmannosamine-6-phosphate 2-epimerase	NA	NA	NA	NA
QBA81717.1|57120_58308_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
QBA79012.1|58551_59439_+	adhesion protein	NA	NA	NA	NA
QBA79013.1|59696_62087_-	phosphoketolase family protein	NA	NA	NA	NA
QBA79014.1|62242_63010_-	DeoR/GlpR transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA79015.1|63338_63809_+	PTS sugar transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
QBA79016.1|63852_64149_+	PTS galactitol transporter subunit IIB	NA	NA	NA	NA
QBA79017.1|64183_65455_+	PTS galactitol transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
QBA81718.1|65535_66594_+	sorbitol dehydrogenase	A0A2K9L7I1	Tupanvirus	4.4e-12	24.5
QBA79018.1|67079_68558_+	PRD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA79019.1|68554_68986_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79020.1|69000_69462_+	PTS fructose transporter subunit IIA	NA	NA	NA	NA
QBA79021.1|69475_69793_+	PTS fructose transporter subunit IIB	NA	NA	NA	NA
QBA79022.1|69826_70942_+	PTS fructose transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
QBA79023.1|70955_71648_+	ribulose-phosphate 3-epimerase	NA	NA	NA	NA
QBA79024.1|71660_72314_+	fructose-6-phosphate aldolase	R9TM64	Synechococcus_phage	3.3e-50	49.3
QBA79025.1|72343_74341_+	transketolase	NA	NA	NA	NA
QBA81719.1|74413_75229_+	sugar-phosphatase	NA	NA	NA	NA
QBA79026.1|75454_76285_+|transposase	IS30 family transposase	H7BW61	unidentified_phage	2.5e-15	31.2
QBA79027.1|76326_77256_+|transposase	IS30-like element ISLpl1 family transposase	H7BW61	unidentified_phage	1.3e-20	30.2
QBA79028.1|77530_78505_+	choloylglycine hydrolase family protein	M1HS66	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	5.8e-27	33.5
QBA79029.1|78605_78842_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79030.1|78933_81234_-	DUF4968 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA79031.1|81264_82686_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
QBA79032.1|82855_83833_+	LacI family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA79033.1|84079_86284_+	glycoside hydrolase family 65 protein	NA	NA	NA	NA
QBA79034.1|86505_87354_+	PRD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA79035.1|87522_88452_-|transposase	IS30-like element ISLpl1 family transposase	H7BW61	unidentified_phage	6.5e-20	29.9
QBA79036.1|88568_90569_+	PTS beta-glucoside transporter subunit EIIBCA	NA	NA	NA	NA
QBA79037.1|91545_91638_-	ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA79038.1|91664_92594_+|transposase	IS30-like element ISLpl1 family transposase	H7BW61	unidentified_phage	6.5e-20	29.9
QBA79039.1|93187_94636_+	glycoside hydrolase family 1 protein	A0A0B5JD41	Pandoravirus	5.9e-36	26.5
QBA79040.1|94882_95728_+	PRD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA79041.1|95852_97718_+	PTS beta-glucoside transporter subunit IIABC	NA	NA	NA	NA
QBA79042.1|97710_99171_+	glycoside hydrolase family 1 protein	NA	NA	NA	NA
QBA79043.1|99516_100251_+	MurR/RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA79044.1|100363_102289_+	PTS 2-O-a-mannosyl-D-glycerate transporter subunit IIABC	NA	NA	NA	NA
QBA81720.1|102337_104881_+	alpha-mannosidase	NA	NA	NA	NA
QBA79045.1|104884_106015_+	glycerate kinase	W6LM47	Streptococcus_phage	3.7e-33	33.7
QBA79046.1|107997_109638_+	HAMP domain-containing protein	Q9EYF3	Enterobacteria_phage	2.6e-19	34.4
QBA79047.1|109637_110396_+	response regulator	NA	NA	NA	NA
QBA79048.1|110407_110509_-	ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA79049.1|110535_111465_+|transposase	IS30-like element ISLpl1 family transposase	H7BW61	unidentified_phage	6.5e-20	29.9

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>CP035571|378847:427086|DBSCAN-SWA
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MDLKQSDGWRYLAGWSFILLMVASATLQHDAEIILPEIGALTAGTWVYRKTAWTRQPLKLFLVPSGTAIIGFLVNQLPWSYALKVLVGLLLMLLLLKGLKSNLAPAFATGLLPIIINATHWTFIVAIFFWTICLMIGAWIQRPRSISRVTEASASRWQMLGFISLVFVWVGIVWLAGQPQMAAIPPVIVVFFEAAQQSEYTVTTALKQWLALSAAASIGVGIHLLIASWLLTTVIALPLVYLWLRALNLQLPAAYAFPLLALVLPANMFNKLPTSTGLAAAFFLGSLLIYHQILGWVRMAVTES
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MSKYQNNEVTPVAHQSRTAELVLGIIGGIFGIIAGLLAMTIGGIGSALETSGSAGVSNLGVGCIIVSVLAIILSVMINRNHVLMGWLIILCGILNFVFVSFFGILSGLLIVIAGGLALRK
>CP035571|378847:427086|405020_405596_+|QBA81729.1|DBSCAN-SWA
MQRAFIKLLSEQSFQQLTVQNIITKAGVARGTFYRYYLDKFDLLNRCEDQLIHESDYIFRQYRRPDLARIAAHPTNDAFFKLMEYLYQNRQIVITLINCSASDLWRKIHDLVAVAIGTHATDQIDQNFEITPDLARELLVQNVMTLLKYWLTQPTVITPTGAYQVFIKSRTLSPVDLAQELAANKPVSRLD
>CP035571|378847:427086|410164_410416_+|QBA79316.1|DBSCAN-SWA
MAIFKTKSLKKPEYLLVSKQGIILSMIPDGDSPNGQRFEKNNPVIQIHNVSDNLEDIKLQFDSIRKGDMTISDQGMAAEFFDF

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
QBA79285.1|378847_380110_+|transposase	ISL3-like element ISP1 family transposase	NA	NA	NA	NA
QBA79286.1|380342_381272_+	foldase	NA	NA	NA	NA
QBA79287.1|381447_382140_+	DUF1275 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA79288.1|382229_382919_+	response regulator transcription factor	W8CYM9	Bacillus_phage	4.8e-36	35.8
QBA79289.1|382935_384096_+	HAMP domain-containing histidine kinase	W8CYF6	Bacillus_phage	6.2e-28	30.8
QBA79290.1|384165_385500_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	B6DZZ7	Stx2-converting_phage	9.7e-09	26.2
QBA79291.1|386085_386583_+	N-acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
QBA79292.1|386719_387505_+	branched-chain amino acid ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
QBA79293.1|387525_387876_+	AzlD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA79294.1|387935_388658_+	sulfite exporter TauE/SafE family protein	NA	NA	NA	NA
QBA79295.1|389130_389490_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79296.1|389599_390034_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79297.1|390085_390640_-	DUF4352 domain-containing protein	D7RWL3	Brochothrix_phage	1.5e-11	26.8
QBA79298.1|390648_391011_-	DUF4064 domain-containing protein	D7RWL4	Brochothrix_phage	4.5e-09	45.1
QBA79299.1|391035_392142_+	serine/threonine protein kinase	NA	NA	NA	NA
QBA79300.1|392474_393389_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79301.1|393470_394664_-	class I SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
QBA79302.1|394806_395844_+	cell surface protein	NA	NA	NA	NA
QBA79303.1|396215_397370_+	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
QBA79304.1|397463_398393_-|transposase	IS30-like element ISLpl1 family transposase	H7BW61	unidentified_phage	1.3e-20	30.2
QBA79305.1|398419_398512_+	ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA79306.1|398563_399646_+	AI-2E family transporter	NA	NA	NA	NA
QBA79307.1|399721_400414_+	2,3-diphosphoglycerate-dependent phosphoglycerate mutase	NA	NA	NA	NA
QBA79308.1|400788_401574_+	methyltransferase domain-containing protein	A0A097BYE1	Leuconostoc_phage	1.8e-39	37.0
QBA79309.1|401588_401858_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79310.1|402067_402778_+	MBL fold metallo-hydrolase	A0A1X9I5D3	Streptococcus_phage	3.1e-06	40.8
QBA79311.1|402838_403204_+	DUF4260 family protein	NA	NA	NA	NA
QBA79312.1|403542_404052_+	DUF3533 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA79313.1|404036_404972_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81729.1|405020_405596_+	TetR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA79314.1|409050_409143_-	ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA79315.1|409169_410099_+|transposase	IS30-like element ISLpl1 family transposase	H7BW61	unidentified_phage	6.5e-20	29.9
QBA79316.1|410164_410416_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79317.1|411332_412175_-|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X2	Lactobacillus_phage	2.8e-155	98.6
QBA79318.1|412228_412480_-|transposase	IS3 family transposase	Q6J1X3	Lactobacillus_phage	9.2e-38	96.4
QBA79319.1|412957_414370_-	NAD-dependent succinate-semialdehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
QBA79320.1|414409_415324_-	short-chain dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
QBA79321.1|415457_416039_+	TetR/AcrR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA79322.1|416265_416394_+	autoinducer-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA79323.1|416393_417644_+	GHKL domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA79324.1|417648_418395_+	response regulator transcription factor	NA	NA	NA	NA
QBA79325.1|418889_420791_+	asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)	R4TIC1	Phaeocystis_globosa_virus	6.8e-32	29.4
QBA79326.1|420922_421552_-	murein L,D-transpeptidase	NA	NA	NA	NA
QBA79327.1|422082_423288_-	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
QBA79328.1|423414_423777_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA79329.1|424147_424801_+	HAD family phosphatase	A0A1D8KNV9	Synechococcus_phage	3.8e-14	29.0
QBA79330.1|424936_425761_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79331.1|426156_427086_-|transposase	IS30-like element ISLpl1 family transposase	H7BW61	unidentified_phage	6.5e-20	29.9

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>CP035571|742855:751369|DBSCAN-SWA
CATGATGGCGAAAGTTGGTTTGATTATGGGGTCAATTTCTGATTGGCCAACCATGCAATTAGCGGCAGAACAGTTAACGGCACTGGGAGTCTCTTATGAGCGTCACGTTATTTCGGCCCACCGAATGCCCCAGACATTACAATCCTATGGTGAAGAAGCAGCGTCACGGGGAATTCAAGTTATTATTGCGGGTGCGGGGGGCGCTGCCCATTTACCCGGGATGCTAGCTGCCAATACACTACTCCCGGTAATTGGGGTGCCCATTAAGACCCATACGTTGAACGGAGTTGATTCGTTATTGTCAATCGTACAGATGCCAGCTGGCGTACCCGTGGCGACGATGGCGATTGGTGATGCGGGAGCTAAGAATGGTGCGCTAATGGCCGCCCAAATTATCGGTTTACGGGAACCACAAGTACAACATGCAATTGGAGAATTTCGTGCTCGTCAACGTCAGGAGGCTGAACAAAGTGAACGCCAATTTTAAGGAAGCACTCTTACCACCCGCAACGATCGGAATCGTTGGTGGCGGTCAACTCGGTCAGATGATGACGCTTAGCGCGAAGGCGATGGGCTATCGGGTAGGTGTCCTTGACCCGACACCCAAAGCACCGGCAGCCCAGGTCGCAGATTTTCAGATTGTTGCGGCTTATGATGATCAGGCGGCTTTACTTGATCTAGCGCGCCGTAGTGATGTCTTGACCTACGAGTTTGAAAACGTTGATGAGAATGCTTTGATTGCTGCGCAAGCCTATGCAAAGTTACCGCAGGGCACTGCACTCCTGCATATTACTGGAGATCGTCTTAATGAGAAGCAATTTCTTCATGATCATGGCATCCCAGTCACATCTTTCGCACCGGTGACGGATTTACAGTCATTAAATTACGCCCTCAACCGTGTTGGTACGCCGGCAATTCTCAAAACGGCGGCAGGTGGCTACGATGGTCACGGACAAACGGATCTAGACACAGCAGTGGTGACAAAAGCCGCTAGCGCCTTATTGACACAGCCGTGCATTCTAGAGGCGCGGCAGAAATTTCGAACAGAAGTTTCCATGATGGTGACGCGTAGTGCTGCTGGTGTTGTTACGACTTTTCCGTTAGTTGAAAATCAGCATCAACATCATATCTTACACACAACGATTGCCCCAGCTAATGTTCAGCCCAGTGTTCATAGTGCGGCCCGCAAAATTGCGGTTTCGATTGCTGAATCCCTGGAACTACGCGGCGTGCTAGGAATCGAATTCTTTGTTTTACCGGATGATACTTTATTAGTCAATGAACTGGCACCACGCCCACATAATTCTGGTCACTATACGATTGAGGCCTGCAACATCTCGCAGTTTGAGGCCCATATTCGAAGTATCTGTGGCTTACCGATTCCGGCCATTACGCAGACCAGTCCGGCAGTGATGCGTAATCTGCTAGGTGATGACTTAACAGTGGCACGTCAACAGTTGGTTGAACACCCAGAATGGCATTTTCACGACTACGGTAAGGCGGCCATTAAGCCCCAGCGCAAGATGGGTCATGTCACCGTATTAAATCACGATATTGACGCAGCATTAGCGTCGGTGGCAAATTTGAAAGGGGAACAATAATAATGACGGCAGCGATTGAGAAACAAGCTTTGCTTTACACGGGTAAAGCGAAAGCGATGTATGCCACTAATGATCCTGAAATTCTATGGGTCGAATACTTAGATCAAGCAACAGCGCTAAATGGTAAGCGGAAGGTTCCCATTGACCAGAAAGGCCGATTGAATAATCGCATCGCGAGTTTGATTTTCAAAGACTTAGCCAATCACGGCATTGCCAACCATTTTATTGAGCAACCTTCAGACTATGTGCAACTTGTCCGTCGCGTGACCATGATTCCCTTGGAGACAGTTGTTCGGAATGCGGCTTCGGGTAGTTTTGAGCGTAAATTTGCCGTGCCACACTTAACTAAATTTGCAGAACCAGTACTGGAATTTTTCTATAAGAGTGATCAGCTGGATGATCCATTTATCAATGATTCACAAATCCACGCGCTAAATGTTGCAACACCGGCAATCGTGGCGGAAATTAAACGGCAGGCCTTACAGGTTAACCAGCGTTTGACGGCAATTTTTGCGGCGATGGGGGTACAGCTCGTTGATTTTAAAATCGAATTTGGGTTGACGACCACCGGTAAAGTCTTGCTGGCTGATGAAATCTCACCAGATAGTTGTCGGTTAGTCGACCTAAAGACCGGTGCATCGCTTGATAAGGATGTCTTCCGCAAGGATCTAGGCGACTTGACTAGTGTTTATCAGGAAGTATTGACGCGGCTAGCAACCGTTGAGGAGGCCTAACATGTACTTAGTTAAAATCTATGTGACTTATAAGCAATCAATTCTAGACCCCAAGGGTGAGGCGATTCATGATGCCTTACACCGACTTGGATATACGAATGTCGATGCCGTTGAATTAGGTAAGTATTTTGAGGTGAAAATTCACGCGGATGATCGGCCAGTTGCCGCTGAAATCGACGAGATGTGTGATCGCTTGTTAGCCAACGTTAATATGGAAACTTATCGTTACGAAATTACTGAGATGGAGGCTTTGTAATGATGAAATTTGCTGTACCAGTCTTTCCTGGTTCTAATTGTGATCATGACATGGTGAATGCCTTGCGCGATATTTTACACGTTACGGCTGATTTGATTCCGGCGACAGCGACCTCATTAGCAGGTTATGACGCGGTGGTGTTACCTGGTGGCTTTTCGTACGGTGATTATTTACGGAGTGGTGCGATTGCCCGCTTTGCGCCCATCATGCCGGCCGTTATTGCATTTGCTAACGCTGGTAAACCAGTCATCGGAATCTGCAATGGCTTTCAAGTCTTGACCGAAGCCGGATTATTACCTGGTGCATTGCAGGCCAATCGCTCAGCGAAGTTTATTTGTCAGGACAGCCCATTACGAATTGCCAATCATGAGACGATTTTTACCACCGCATACGGATCGACAGATCAAATTAGTTTACCGATTGCCCACGGCGAAGGCAATTATTATTGTGATGAGGCCACCTTGGCGCAATTACGTGCTAATCATCAAATCATCTTCGAATACGTCGAGAATCCAAATGGCAGCACGGCTAATATTGCTGGCATTACAAATGAAGCGGGAAATGTGCTTGGGATGATGCCCCATCCGGAACGGGCCGTGGAGATGATCTTAGGTTCCACGGACGGTCTCGGAATTTTTCAATCGGTCATTGCGAGTCAAGAGGAGGTCACCCATGCTTAAAAAGCAACCATTATCACCTACAGATGTTCGCGATTCTAAGGTCTATCGGGATTGGGGCTTAACCGATGCTGAGTATCAATTATTAACGGATAAGGTCCTTCAACGCTTACCTAACGAGACTGAAACCGGGTTGTTTTCCGGCATGTGGAGCGAACATTGCTCCTACAAGAATTCAAAACCAGTCTTGAAAAAATTTTGGACGCAGGGTGAACAGGTACTTGAAGGGCCTGGTGAAGGCGCCGGTATTATCGACATCGGTGATGGTCAGGCCGTGGTCTTTAAAGCTGAAAGTCATAATCATCCGTCTGCAGTTGAACCTTATGAGGGTGCGGCAACGGGTGTGGGTGGTATCATTCGGGACATCTTTTCGATGGGGGCCCGGCCGATTGCGCTGCTGGACAGTCTTCGCTTTGGGGAACCGACTGATGCTCATACGAAATACTTGATTTCGCAAGTAGTCGCCGGCATTGGCGGTTATGGCAACTGTATTGGAATTCCGACAATCGGTGGTGATACGGTATTTGATGCGAGTTATCAGAAGAACCCGTTGGTGAACGCCATGTGTGTTGGAATCTTGGATCAAGCTGATATTCAGAAGGGCCAAGCAACAGGAATTGGCAACGCCGTTATTTATGTCGGCGCAAAAACGGGGCGTGACGGCATTAACGGTGCGTCCTTTGCCTCTGCTGAATTTAATGACGCCAATGAAACCCAGCGTTCCGCGGTTCAAGTTGGTGATCCCTTTATGGAAAAATTATTGATGGAGGCGTGTCTCGAGGTTATTCATGAACATCGTGATGTTTTAATCGGGATTCAAGATATGGGCGCGGCGGGCCTAGTTTCCTCCTCAGCCGAAATGGCGTCCAAAGCAGGCAGTGGGTTGTCACTGAATCTTGACTTGGTACCACAACGTGAAACTGGCATGACGCCGTTTGAACTGATGCTCTCTGAATCACAGGAGCGGATGTTACTATGTGTCAAAGCTGGTGCCGAAGCAGAAATTTATCAAGTCTTTGAAAAGTACGGTCTTGATGCTGTCACAATTGGTAAAGTGACAGCCGGCCACCAGTATCAATTATTCCATCATGGTAAGTTAGTTGCAGATGTTCCCGTCGATGCACTTGCGACCAAAGCGCCGGTCTATGAACGCGAAAAGAAACGACCAACGCGCTTGAACCATCAGAGCCATCATCAATTTATGCCACGACTAGTTGATGCAACTGGCACATTGAAGAAGATGCTCCAACAGCCAACGATTGCTTCCAAAGCGTCGTTATATGGAACGTATGACTCGCAGGTCCAAACGAATACGGTCGTCAAGCCGGGTTCCGATGCGGGGGTCATACGGATTCGACATACGGATAAGGCGTTGGCGGTCACCACCGATGTTAACGGGCGATACTTATACTTAAACCCCCGTGTCGGTGGGGAAATCGCCGTTGCGGAAGCTGCTCGAAACATTGTCGCTTCCGGTGGGCAACCTTTAGGCATCACTGATTGCTTGAACTATGGTAATCCAGAGAAACCTGAACAATTTTACGATTTGGACGAATCGGCGATGGGCATCGCTCGTGCCTGCCAATTATTCAATACGCCCGTGATTTCTGGCAATGTCTCGTTGAACAATGAATCGAACGGGGAAGCCATCTATCCCACCCCAATGATTGGGATGGTCGGGTTAATTAAGCATCAGAAAGATATTACGACTAGCGATTTTAAACACGCTGGCGATGCAGTCTACGTGTTAGGTACCACAGAAGCCGATTTCAATGGTAGTGAGCTGCAAAAGATGTTGACGGGAACAATCAGTGGCGAGCTGTTTGATTTTGACCTTGTGACTGAAAATCGTAATCAGCGTCTATTGTTAACTGCGATTCAAAAAGGACTAGTTGCTAGTGCCCACGACGTTTCTGAAGGTGGCTTGATTACGACGATTGCCGAATCATGTTTTCCACAAAATATCGGGGTGGAACTGGCCAGTGACTTGCCCGCTGCCAACTTCTTTGCGGAAACGCAGTCACGATTTGTTATCTCGGTGACACCAGCACAGCAAGCCGCGTTTGAAAGTTTAATGGAACCATATGTGACCTATTTAGGACGAACAACTGCAACGGATCGGCTACACGTTCAAACTGCTGATCAGGCGTTTGATATTAAGGTTAGTTTCGCCAAACAGTTGTGGGAAGGGGCCTTACCATGCCTACTGAAGTAAGAAGTCTGAATGAAGAATGTGGCGTCTTTGGGGTTTGGGGCTCGCCGGACGCCGCCCAATTAACGTACTTTGGGCTCCATGCGTTACAACACCGGGGGCAAGAAGGAGCCGGTATCACGGCGAATGATCACGGCAAACTGCAGACGGAACGTGGACTAGGGTTGTTGGCTGATGTCTTTCGGGACCCACGGCGGTTGGCACGTTTGACGGGTCAAGCTGCAGTCGGCCATGTACGTTATGCCACGGCTGGTAATCATGGATTGGAAAACATTCAACCCTTGAGTTTTAATTTTAGCGACTCACAGTTTGCACTCGCACATAACGGCAATTTGACGAACGCGGTGACACTGCGGCGACGGTTGGAACAGCATGGTGCCATTTTTCATGCTAGTTCTGATAGTGAGATTTTAATGCATCTGATTCGACGCAGCCCCGCAGCAACGTTAACGGAACAGGTTAAGGATGCTTTACGTCAAGTCCACGGAGGCTTTGCTTACTTACTACTAACGAATGATTGTTTGATTGCCGCTTTGGATCCTAACGGGTTACGACCATTAGTCGTCGGTCAGTTACCCACGGGCGGGTACGTCGTTTGTAGTGAAACTTGCGCGCTTGATACGATTGGTGCGACGTTTGTTCAAGATGTTCAGCCGGGAGAATTGTTAACGATCGATGATCATGGTTTGACGATCGACCATTATACGACTGATACACAGTTGGCGATTTGTTCAATGGAGTTTATCTACTTTGCACGTCCAGATTCTGATATTCACGGCGTCAACGTCCATTCTGCACGTAAACGAATGGGTGCTCAGCTCGCTGTTGAACAGCCCGTGGACGCCGACATTGTTGTCGGGGTACCCAATTCATCTTTATCAGCGGCGACCGGCTATGCGGAAGCGAGTGGCCTGCCTTACGAGATGGGATTAATTAAAAATCAATATTCGTCACGGACCTTTATTCAGCCGACCCAAGCATTGCGAGAACAGGGGGTTCGGATGAAGCTTTCAGCGGTCAAAGGTGTTGTCGCTGGTAAACGAGTCGTCTTAATCGATGATTCGATTGTACGTGGTACCACCAGTCGGCGGATCGTCAAATTATTGAAAGATGCGGGTGCAAAGTCAGTTCATTTACGAATTGCATCGCCACCATTACGCTATCCATGTTTTTACGGTATCGATATTCAATCGACTAATGAATTGATTGCGGCTCAGCAAACGATTCGGGAGATGTGTCAGACGTTTGGTGCGGACTCACTTGGTTTTCTCAGTGAACAGGGCGTCGTTGATGCAGTTGGCTTGTCGACCACCGAACCGTATGGTGGACTATGCATGGCCTATTTTAATGGGGATTATCCAACGGCCCTGTATGATTACCAAGCCGAGTATGATGCGGAAATTGCGCAATTACAAGCCAATCATGAAGGGGTGATCAAGTGAGCGATGCGTATAAGCGGGCTGGCGTTGATATCAACGCTGGTTACGACGTCTTAAAGACGGTCAAACAAATGAGTGGCAATCAGCAATTAGGCGCGTTTGGGGGGGCGTTTCCACTTAGTCCGGATGCAACTGCCAACGATCCCGTGTTAGTAGCGGGGACGGATGGTGTGGGGACTAAGCTCTTAGTCGCAATCGCTGCTGATCAACATACCACGATTGGAATTGACTTGGTCGCAATGTGTGTGAATGATATTTTGGCACAAGGCGCGACCCCCCAGTTCTTTTTAGATTACTTAGGTCTTGGACATACGGATCAGAAGCGGGTCAAAGCCATTTTGACTGGCGTCGTCACGGGCTGTCAGCAGGCCCATACAGCGTTGATTGGTGGCGAGACTGCGGAGATGCCCGATATGTATGGTCAGGACCATTACGACCTCGCTGGTTTTGCGGTCGGAATTGCGAACCGCGCGGACCTGTTATCACCAGCAAATGTTCGGGCTGGGGACGTCTTGATTGGGTTGCCGTCTAATGGCCTCCACTCGAATGGGTTTAGTCTAGTTCGTGATATTTTATTCAAACAACACGACTACCAATTGACCACGGTTTTTGACGAACTTGGTCATGATTTACAAACGGAAATTTTACGACCAACGACCATTTACGTTGATGCAGTTCAACCATTGTTACAGCAGAAATTAGTGACGAGTATCGCCCACATTACCGGGGGCGGCTTGATTGAGAACGTCGCCAGAGCGTTACCGGCGGGCTTGAGTGCGCACCTTGAATTGGGTCAATGGCCGGTACCGCCAATTATGACGTTACTGGCCGAACTCGGTGGGCTGACTGCTACGGATCTTCGGTCGACCTTTAACCTGGGCTTGGGAATGGTTCTGATCGTTCACCCCGACCAAGTGGCAGCTGTGACGGCTAATTTGACGGCCAACGCTCAGTCCTATTATCGAGTTGGAACAGTCCAAACTGATACGACACCCGTCGTTTTTGAGGAGGCTGAGCATGCCTAATAAAATTGCAGTATTTGCTTCGGGTAATGGCACCAACTTTGTTGCACTCCACCAAGCGATTATTGAACGACAATTACCGGTAGTGATTGGGTTACTTGTGTGTGATCAACCGACAGCGCCGGTAATTGACAAGGCCCGGGCAGCTAACGTACCGATATTAATTGTTGATTTTCATGATTATGCGAATAAAGCGGCCGCGGAAGCAATCATTTTGACGGCCTTGCAAGCACGGCAAATTGAACTGGTATTATTGGCCGGGTACATGCGCATTATTGGTCCGACCCTCTTGAATTCGTATGCTCATAAAATCATCAATATTCACCCAGCATTGTTACCAAAGTTTCCTGGTCGTCACGGCATCGAGGATGCTTTTGCCGCTGGTGTGACTGAGACGGGCGTTACCATTCACTATATCGATGCCGGAATCGATACCGGGCAAATTATTGCCCAGCGGGTCGTTCCGGTTGCACCAGACGATACGCTAGCCAGCCTGGCGACCCGGATTCATGATTGTGAACACCAATTTTATCCAGATGTATTACAGACACTCATTAATGAAGGAGCAATTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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>CP035571|742855:751369|744457_745189_+|QBA79605.1|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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QBA79605.1|744457_745189_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	M4SM18	Cyanophage	1.6e-37	37.3
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QBA79608.1|746117_748337_+	phosphoribosylformylglycinamidine synthase subunit PurL	A6N228	Microbacterium_phage	4.5e-144	39.3
QBA79609.1|748321_749776_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	2.5e-50	34.0
QBA79610.1|749772_750798_+	phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	A0A0E3F760	Synechococcus_phage	4.2e-60	40.7
QBA79611.1|750790_751369_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	2.1e-21	33.3

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>CP035571|953765:1001964|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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953670:953685	attL	NA	NA	NA	NA
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QBA79795.1|959476_959908_-	hypothetical protein	O03904	Lactobacillus_phage	1.4e-70	87.4
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QBA79812.1|969017_969560_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81746.1|969595_969793_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA79813.1|969886_970552_+	helix-turn-helix domain-containing protein	A0A1S5SAA7	Streptococcus_phage	2.1e-44	53.3
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QBA79820.1|976544_976949_+	hypothetical protein	A5GYM1	Lactococcus_phage	2.7e-07	30.5
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QBA79836.1|993006_993126_+	XkdX family protein	NA	NA	NA	NA
QBA79837.1|993140_994355_+	collagen-like protein	A0A0P0ID94	Lactobacillus_phage	7.7e-45	72.9
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>CP035571|1295960:1379113|DBSCAN-SWA
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MKEVWKKIRGYTGYEVSNLGRIKSNGRKIIQSNGHPMTLPSKILKLNVSDRGYLYVVLAENKKHTTKRVHRLVAEAFIQNPYNKPQVHHINHVKSDNRADNLMWVTSKENVSFEQDRTFYIRDSHGRFLNVRVRGEDKMVFVLSDNNAVIAVYSNKENARTARKKLRDQEIKITAVPFCHSAKLN
>CP035571|1295960:1379113|1297425_1298391_-|QBA80106.1|DBSCAN-SWA
MENLSNRLVKKSIEAFVMGIEIYNKPTIHYRIEGFSFFAINAWELMLKAELLNRGESIYYKDDPDRTLSVSNVIAKIYTDKNTRIRLNLEKIIDLRNISTHYITEDYEFKYAPLFQACVLNFVTEINRFHSINMTDYIPQNFLTISASYEPLTNEQIQLKYPPEIAEKFITQANEIDVLSQEYDSDRFSINIKQNLYITKKKGEADFTVRVDRSSSNGVAFIKDLKDPSDTHKYSYNNVIKAVQTRLTKKNIKLGYSSGFNQYVLNLVIDFYNIKQNSNYAYQHVIGKQHSYTYSQQFVEFIVKQIENNPTTFVQSLKSKK
>CP035571|1295960:1379113|1308598_1309030_+|QBA80123.1|DBSCAN-SWA
MATMIKFRAWDKVQNKMLLPDNIELINGQAYWAEASTDGNGSYSNDGKADGIGALFELEQFTGLTDVSGKDIYEGDVLQPVISYTKRNIGKPFEVKKGNYVYGKWIAKDVSSKEFGVDGYYFSNEMRLIGNIHNNPELLEDNE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
1289080:1289097	attL	NA	NA	NA	NA
QBA80105.1|1295960_1297124_-|integrase	site-specific integrase	B4XYR4	Lactobacillus_phage	7.1e-56	36.2
QBA80106.1|1297425_1298391_-	DUF3644 domain-containing protein	A0A0N9RUA4	Staphylococcus_phage	1.9e-86	51.8
QBA80107.1|1298464_1298779_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80108.1|1299819_1300296_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80109.1|1300305_1300740_-	XRE family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA80110.1|1300994_1301204_+	XRE family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA81757.1|1301237_1301957_+	phage regulatory protein	D2IZW4	Enterococcus_phage	2.0e-69	58.2
QBA80111.1|1301968_1302178_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80112.1|1302191_1302440_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80113.1|1302434_1302656_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81758.1|1303218_1303482_-	SinR family protein	A0A0M3LS55	Mannheimia_phage	2.7e-11	42.4
QBA80114.1|1303567_1303858_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80115.1|1304023_1304227_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA80116.1|1304239_1304488_+	tagatose-bisphosphate aldolase	E9LUT6	Lactobacillus_phage	2.7e-29	76.1
QBA80117.1|1304490_1304691_+	hypothetical protein	E9LUT7	Lactobacillus_phage	1.0e-26	89.4
QBA80118.1|1305146_1305404_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80119.1|1305479_1306037_+	HNH endonuclease	X2KXT0	Enterococcus_phage	1.1e-22	51.4
QBA80120.1|1306826_1307612_+	ATP-binding protein	E9LUN6	Lactobacillus_phage	3.1e-132	91.2
QBA80121.1|1307747_1308056_+	hypothetical protein	E9LUN7	Lactobacillus_phage	6.2e-44	86.3
QBA80122.1|1308048_1308207_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLB5	Lactobacillus_phage	7.9e-19	96.2
QBA81759.1|1308326_1308527_+	hypothetical protein	E9LUP1	Lactobacillus_phage	7.1e-25	93.1
QBA80123.1|1308598_1309030_+	hypothetical protein	A0A1I9KKG9	Lactobacillus_phage	4.3e-35	55.0
QBA80124.1|1309026_1309197_+	hypothetical protein	E9LUP4	Lactobacillus_phage	3.2e-18	89.3
QBA80125.1|1309177_1309603_+	transcriptional regulator	E9LUP5	Lactobacillus_phage	4.1e-62	80.9
QBA80126.1|1310013_1310328_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80127.1|1310311_1310971_+	HNH endonuclease	E9LUP6	Lactobacillus_phage	5.3e-16	85.4
QBA80128.1|1310997_1311300_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80129.1|1311534_1311969_+|terminase	phage terminase small subunit P27 family	B8R648	Lactobacillus_phage	8.3e-18	37.7
QBA80130.1|1311955_1313872_+|terminase	terminase large subunit	A0A0M7RDK9	Lactobacillus_phage	1.3e-134	42.0
QBA80131.1|1314091_1315210_+|portal	phage portal protein	Q9AZM4	Lactococcus_phage	1.8e-64	39.2
QBA80132.1|1315181_1315787_+|head,protease	HK97 family phage prohead protease	B8R651	Lactobacillus_phage	8.2e-40	49.1
QBA80133.1|1315793_1317176_+|capsid	phage major capsid protein	A0A0M7RF71	Lactobacillus_phage	4.9e-96	60.1
QBA80134.1|1317266_1317545_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLF2	Lactobacillus_phage	2.2e-32	73.6
QBA80135.1|1317545_1317893_+|head,tail	head-tail adaptor protein	A0A2P0ZLF0	Lactobacillus_phage	1.4e-55	92.2
QBA80136.1|1317895_1318303_+	HK97 gp10 family phage protein	A0A2P0ZLE6	Lactobacillus_phage	1.0e-62	90.9
QBA80137.1|1318302_1318683_+	DUF806 family protein	A0A2P0ZLF4	Lactobacillus_phage	1.4e-58	90.5
QBA80138.1|1318697_1319351_+|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLH1	Lactobacillus_phage	2.0e-108	89.9
QBA80139.1|1319426_1319801_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLH4	Lactobacillus_phage	4.6e-57	92.7
QBA80140.1|1319845_1320031_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80141.1|1320061_1324906_+	peptidase M23	A0A2P0ZLG0	Lactobacillus_phage	0.0e+00	66.0
QBA80142.1|1324970_1326743_+|tail	phage tail protein	A0A2P0ZLH2	Lactobacillus_phage	0.0e+00	93.1
QBA80143.1|1326810_1329225_+	hypothetical protein	A0A2P0ZLF8	Lactobacillus_phage	0.0e+00	91.5
QBA80144.1|1331987_1332227_+	hypothetical protein	A0A2K9VDF6	Lactobacillus_phage	6.1e-31	94.8
QBA80145.1|1332375_1332735_+	hypothetical protein	E9LUR7	Lactobacillus_phage	2.3e-45	79.8
QBA80146.1|1332746_1333910_+	LysM peptidoglycan-binding domain-containing protein	E9LUR8	Lactobacillus_phage	1.1e-197	89.0
QBA80147.1|1333909_1334173_+|holin	holin	E9LUR9	Lactobacillus_phage	1.1e-33	87.4
QBA81760.1|1334186_1334561_+|holin	holin	A0A2H4PBB2	Lactobacillus_phage	1.1e-13	83.3
QBA80148.1|1335342_1336554_+	FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein	NA	NA	NA	NA
QBA80149.1|1337032_1338775_+	ABC transporter permease subunit	NA	NA	NA	NA
QBA80150.1|1338793_1339585_+	ABC transporter ATP-binding protein	G3M9Y6	Bacillus_virus	4.5e-30	36.8
QBA80151.1|1339565_1340735_+	LytR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA80152.1|1340886_1341459_+	helix-turn-helix domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA80153.1|1342210_1343152_-	glycosyltransferase	V9QJB1	Oenococcus_phage	2.4e-78	49.0
QBA80154.1|1343597_1343990_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80155.1|1344153_1344546_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80156.1|1344581_1345751_+	hydroxymethylglutaryl-CoA synthase	NA	NA	NA	NA
QBA80157.1|1345800_1346430_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80158.1|1346981_1347614_-	transcriptional repressor LexA	A0A1B2APZ1	Phage_Wrath	2.3e-16	56.2
QBA80159.1|1347765_1348005_+	DUF896 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA80160.1|1348102_1348339_+	YneF family protein	NA	NA	NA	NA
QBA80161.1|1348396_1349032_-	1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
QBA80162.1|1349143_1349902_+|tRNA	tRNA1(Val) (adenine(37)-N6)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
QBA80163.1|1349885_1350191_+	GIY-YIG nuclease family protein	NA	NA	NA	NA
QBA80164.1|1350275_1351274_+	D-2-hydroxyacid dehydrogenase	M1HKI4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	2.3e-47	34.9
QBA80165.1|1351562_1352285_-	HAD family hydrolase	NA	NA	NA	NA
QBA80166.1|1352509_1353313_+	30S ribosomal protein S2	NA	NA	NA	NA
QBA80167.1|1353415_1354294_+	elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
1353515:1353532	attR	NA	NA	NA	NA
QBA80168.1|1354493_1355216_+	UMP kinase	NA	NA	NA	NA
QBA80169.1|1355217_1355781_+	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
QBA80170.1|1355900_1356680_+	isoprenyl transferase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	1.1e-23	43.1
QBA80171.1|1356695_1357481_+	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
QBA80172.1|1357518_1358796_+|protease	RIP metalloprotease RseP	NA	NA	NA	NA
QBA80173.1|1358835_1360545_+|tRNA	proline--tRNA ligase	NA	NA	NA	NA
QBA80174.1|1361038_1365352_+	PolC-type DNA polymerase III	A0A1X9SH08	Bradyrhizobium_phage	1.0e-14	34.0
QBA80175.1|1365647_1366124_+	ribosome maturation factor RimP	NA	NA	NA	NA
QBA80176.1|1366144_1367362_+	transcription termination/antitermination protein NusA	NA	NA	NA	NA
QBA80177.1|1367406_1367706_+	YlxR family protein	NA	NA	NA	NA
QBA80178.1|1367695_1368001_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80179.1|1368015_1370592_+	translation initiation factor IF-2	A0A2H4UTS4	Bodo_saltans_virus	9.6e-21	23.3
QBA80180.1|1370614_1370968_+	30S ribosome-binding factor RbfA	NA	NA	NA	NA
QBA80181.1|1371616_1373071_+	MFS transporter	NA	NA	NA	NA
QBA80182.1|1373063_1374233_+	chorismate synthase	NA	NA	NA	NA
QBA80183.1|1374241_1374769_+	amino acid biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
QBA80184.1|1374782_1376081_+	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
QBA80185.1|1376083_1377181_+	prephenate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
QBA80186.1|1377183_1377705_+	shikimate kinase	NA	NA	NA	NA
QBA80187.1|1378189_1379113_+|tRNA	tRNA pseudouridine(55) synthase TruB	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>CP035571|1861062:1962499|DBSCAN-SWA
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MKVQTERVIWEDATFDKAKNQVYTRLVYSTQAFVTRPAINLELTEHMAFLWMKPELILTNIRIVSYLKPILTRLV

Homologous phage analysis in the prophage region

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QBA80645.1|1865497_1865725_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80646.1|1868063_1869059_-	glycosyltransferase	S5FKN0	Shigella_phage	3.1e-52	38.8
QBA80647.1|1869685_1871653_-	hypothetical protein	A0A2P0ZL91	Lactobacillus_phage	1.7e-54	72.2
QBA80648.1|1871753_1872674_-|transposase	IS30-like element ISLsa1 family transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	9.2e-51	38.3
QBA80649.1|1872912_1873893_-	HD domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA80650.1|1873902_1876380_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80651.1|1876369_1877590_-	DNA repair exonuclease	NA	NA	NA	NA
QBA80652.1|1877659_1878004_-	YlbF family regulator	NA	NA	NA	NA
QBA80653.1|1878094_1880224_-	PBP1A family penicillin-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA80654.1|1880517_1880640_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80655.1|1880717_1881179_-	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
QBA80656.1|1881356_1882478_-	aminotransferase	NA	NA	NA	NA
QBA80657.1|1882543_1883152_-	amino acid transporter	NA	NA	NA	NA
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QBA80661.1|1887450_1888107_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80662.1|1888790_1890785_-	ATP-binding cassette domain-containing protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.1e-35	40.4
QBA80663.1|1891054_1891531_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80664.1|1891779_1893042_+|transposase	ISL3-like element ISP1 family transposase	NA	NA	NA	NA
QBA80665.1|1893177_1894866_-|tRNA	arginine--tRNA ligase	A0A2I2L3K1	Orpheovirus	1.2e-75	32.9
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QBA80667.1|1895972_1896218_-	DUF2187 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA80668.1|1896344_1897736_-	MATE family efflux transporter	NA	NA	NA	NA
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QBA80671.1|1902254_1903211_-	bifunctional oligoribonuclease/PAP phosphatase NrnA	NA	NA	NA	NA
QBA80672.1|1903200_1903824_-	adenylyl-sulfate kinase	A0A2K9L4R9	Tupanvirus	4.8e-27	40.6
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QBA80675.1|1907505_1909812_+	5-methyltetrahydropteroyltriglutamate-- homocysteine S-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
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QBA80680.1|1914017_1914443_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
1914765:1914781	attL	NA	NA	NA	NA
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QBA80682.1|1918148_1918400_-	hypothetical protein	A0A2K9VDF6	Lactobacillus_phage	1.7e-28	93.1
QBA80683.1|1918392_1921173_-|tail	phage tail protein	E9LUR4	Lactobacillus_phage	1.3e-236	74.4
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QBA80710.1|1944657_1945443_-	ATP-binding protein	E9LUN6	Lactobacillus_phage	4.8e-133	91.6
QBA80711.1|1945442_1946240_-	replication protein	Q9AZA0	Lactobacillus_prophage	4.8e-56	65.3
QBA80712.1|1946289_1946982_-	hypothetical protein	E9LUU3	Lactobacillus_phage	2.0e-130	98.3
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QBA80716.1|1949421_1949676_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80717.1|1949688_1949892_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
QBA80718.1|1949981_1950311_-	DUF771 domain-containing protein	E9LUT3	Lactobacillus_phage	8.7e-52	85.3
QBA80719.1|1950404_1950614_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80720.1|1950784_1951555_-	phage repressor protein/antirepressor Ant	E9LUT0	Lactobacillus_phage	1.5e-57	95.6
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QBA80722.1|1951949_1952615_+	LexA family transcriptional regulator	D7RWF2	Brochothrix_phage	9.3e-53	48.2
QBA80723.1|1952740_1953613_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80724.1|1953932_1954295_+	hypothetical protein	E9LUS2	Lactobacillus_phage	5.2e-58	94.2
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QBA80726.1|1954623_1955361_+	hypothetical protein	U5U717	Lactobacillus_phage	3.5e-32	38.1
QBA80727.1|1955521_1956658_+|integrase	site-specific integrase	E9LUS1	Lactobacillus_phage	2.2e-211	98.1
QBA80728.1|1957302_1959573_-	excinuclease ABC subunit UvrA	A0A1B1IVR3	uncultured_Mediterranean_phage	8.8e-119	31.5
1956775:1956791	attR	NA	NA	NA	NA
QBA80729.1|1959634_1959922_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80730.1|1960036_1960549_+	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA80731.1|1960662_1961142_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA81770.1|1961833_1962499_+|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>CP035571|2679177:2739738|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

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QBA81339.1|2680915_2682529_-	CTP synthase	A0A1J0FA14	Only_Syngen_Nebraska_virus	1.2e-143	49.9
QBA81340.1|2682701_2683310_-	DNA-directed RNA polymerase subunit delta	NA	NA	NA	NA
QBA81341.1|2683354_2683795_-	DUF1934 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA81342.1|2684157_2685090_+	lipoate--protein ligase family protein	NA	NA	NA	NA
QBA81343.1|2685104_2686457_+	HD domain-containing protein	A0A1B1ISR1	uncultured_Mediterranean_phage	4.0e-26	32.9
QBA81344.1|2686476_2687286_+	sugar-phosphatase	NA	NA	NA	NA
QBA81345.1|2687514_2688777_+|transposase	ISL3-like element ISP1 family transposase	NA	NA	NA	NA
QBA81346.1|2688896_2689883_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81347.1|2689965_2690988_-	YdcF family protein	NA	NA	NA	NA
QBA81348.1|2691276_2692257_-	ribose-phosphate diphosphokinase	A0A2K9L8D8	Tupanvirus	4.9e-42	36.3
QBA81349.1|2692604_2693447_-	serine hydrolase	NA	NA	NA	NA
QBA81350.1|2693682_2695065_-	bifunctional UDP-N-acetylglucosamine diphosphorylase/glucosamine-1-phosphate N-acetyltransferase GlmU	A0A2K9L140	Tupanvirus	5.7e-28	33.2
QBA81351.1|2695133_2695970_-	pur operon repressor	NA	NA	NA	NA
QBA81352.1|2696462_2696726_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81353.1|2696740_2697283_-	ankyrin repeat domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA81354.1|2698362_2699166_-	metal ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
QBA81355.1|2699152_2699851_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A1V0SGN0	Hokovirus	1.2e-15	27.8
QBA81356.1|2700118_2701063_-	alpha/beta hydrolase	NA	NA	NA	NA
QBA81357.1|2701372_2702239_-	4-(cytidine 5'-diphospho)-2-C-methyl-D-erythritol kinase	NA	NA	NA	NA
QBA81358.1|2702371_2702623_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81359.1|2702727_2703618_-	16S rRNA (adenine(1518)-N(6)/adenine(1519)-N(6))- dimethyltransferase RsmA	NA	NA	NA	NA
QBA81360.1|2703614_2704178_-	ribonuclease M5	NA	NA	NA	NA
QBA81361.1|2704164_2704941_-	TatD family deoxyribonuclease	NA	NA	NA	NA
QBA81362.1|2705187_2705676_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81363.1|2706238_2707129_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA81364.1|2707162_2708347_-	Bcr/CflA family efflux MFS transporter	NA	NA	NA	NA
QBA81365.1|2708627_2709002_-	hypothetical protein	NA	NA	NA	NA
QBA81366.1|2709488_2711540_-|tRNA	methionine--tRNA ligase	A0A1V0SHR2	Klosneuvirus	2.7e-90	35.8
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QBA81368.1|2712847_2713690_-	DUF72 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
QBA81369.1|2713689_2714394_-	NAD-dependent protein deacetylase	NA	NA	NA	NA
QBA81370.1|2714415_2715375_-	IpaB/EvcA family protein	NA	NA	NA	NA
QBA81371.1|2715367_2716642_-	hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, degradative	NA	NA	NA	NA
QBA81372.1|2716687_2717605_-	Ppx/GppA family phosphatase	NA	NA	NA	NA
QBA81373.1|2718046_2719060_-|tRNA	tRNA-dihydrouridine synthase family protein	NA	NA	NA	NA
QBA81374.1|2719172_2719919_-	MurR/RpiR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
QBA81375.1|2720068_2720965_-	ROK family protein	NA	NA	NA	NA
QBA81789.1|2722539_2723895_-	PTS sugar transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
QBA81376.1|2724117_2724540_-	DUF3284 domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
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QBA81382.1|2729767_2732077_+	ATP-dependent DNA helicase	NA	NA	NA	NA
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QBA81384.1|2732512_2733199_-|protease	CPBP family intramembrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
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QBA81387.1|2735575_2736952_-	HlyD family secretion protein	NA	NA	NA	NA
QBA81388.1|2736967_2739118_-	peptide cleavage/export ABC transporter	W8CYL7	Bacillus_phage	6.1e-45	27.9
QBA81389.1|2739384_2739555_+|bacteriocin	two-peptide bacteriocin plantaricin EF subunit PlnE	NA	NA	NA	NA
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