Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| AP017632 | Helicobacter pylori DNA, complete genome, strain: ATCC43504 | 0 crisprs | DEDDh,cas14j,cas2,cas3 | 0 | 0 | 3 | 0 |
1. AP017632
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
58365 : 69253
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >AP017632|58365:69253|DBSCAN-SWA AATGGGTTTTGAAAAAAGCATTTTAGACAATTTGAACGGGGTGCAAAAAATCGCTGCAAGCCACATTCAAGGGCCATTGCTCATTTTAGCGGGAGCTGGGAGCGGTAAGACTAAGACTTTAACGAGCCGTTTAGCGTATTTGATTGGCGCTTGTGGCGTGCCTAGCGAGAACACTTTAACGCTCACTTTCACCAATAAAGCGAGTAAAGAAATGCAAGAAAGGGCTTTGAAATTGTTGAAAAACCAAGCCCTTATCCCCCCCTTGCTTTGCACTTTCCATCGTTTTGGTTTGCTGTTTTTAAGGCAACACATGAGCCTTTTAAAAAGAGCATGCGATTTTTCGGTGCTAGATAGCGATGAAGTCAAAACGCTGTGCAAACAGCTCAAAATTTCAAACTTTAGAGCCAATATTTCTCAAATCAAAAACGGCATGATGGATTTGAGCGTGCAAGATAGCGAATGCTATAAAGCGTATGAGCTTTATCAAAACGCGCTTAAAAAAGACAATTTAGTGGATTTTGACGACTTGCTTTGTTTAAGCCTTAAGATTTTACAAGATAATGAAAAACTCGCCAAAGAGACTAGCGAACGCTACCATTACATTATGGTAGATGAATATCAAGACACGAACGCCTTGCAATTGGAATTTTTAAAACAATTGAGTTGCACGCATCATAATTTGTGCGTGGTGGGCGATGACGATCAGAGCATTTATGGTTTTAGGGGGTCTGATATTTCTAATATTTTAAATTTTTCCAAGCATTTTAAAGGGGCTAAAATAGTGAAATTAGAGACCAACTACCGCTCCAGCGCTGAGATTTTAGCGTGTGCTAATTCTTTGATTAGCCATAACCAACACCGCCATATTAAAACGCTTCAAAGTTTCAAAGGCTCGCATAAAAGCGTGATTTGTAAAGAATATTTGACGCAAAAAGAAGAGAGTTTGGATGTGGCTTATCAAATCAAAGCCCTTTTAAAGAAGGGCGAAAATTTAGAAAATATCGCTATTTTGTATCGCTTAAACGGGCTTAGCCGCAGCATTGAAGAGAGCTTGAACGCTTTGAATATCCCCTATAGGCTCATTGGAGCGGTGAGTTTTTATGAAAGAGCCGAGGTTAAAGACGCTTTGGCGTTCATGCATTTAGTGGCTAAAAAAGACGATCGCTTTTTTATCAAGCGCGTTTTAAACAAGCCCCCAAGAGGCCTTGGCAAGATCACTCAAGAATGGATTTTTTCTCTTTTAGATGAAGAGGATTTGAATTTAGAAGAGGCGTTAAAACTTGGGGCGTTTAAAGACAAATTAAACCCTAAAAACGAATACGCTTTGAACAAATTTATCGCTATGATAGGGCGTTTGAGGGAGGCTTTTGAAATTTCAGTAGAGGAGTTTTGCGCTCGGTTTTTAGAAGAGACTAACCTTTTAAAAAGCTATGAAAAAGAAGACAATTACGAAGAAAGAGAGGGCTTTGTTAAAGAGCTTTTAAGTTTAGTGAAAGAGCATTTTAAAACTAACCCCACGCATTCTTTACTGGATTTTTTGAATGAAAGCGTTCTGGATGCCCATAATACAGAAAACGCGCAAAAAGTGAGTTGCATGAGCGTGCATATGAGTAAGGGGTTAGAGTTTAAGCATGTGTTTGTGATCGGGTTAGAAGAGGGGTTTTTCCCGCATAGGGGGTTCAATCAAGAAAGCGATTTAGAAGAAGAAAGGCGCTTGGCTTACGTAGCGATCACTAGGGCTAAAGAAGGATTGCAGCTCTCTTATGTGAAAGAGCGTTCGTATTTTGGGAGGAAAATTTCTTGCTCGCCCTCTGTGTTTTTAGAAGAAGCCAAGCTGCTCAATCAAGACAACCCCCCTAAACAGGATCACCAAAAAGACGCGCCCATTAAAGTGGGGGACTTGATTAAGCATAAGATTTTTGGCACCGGGAGGGTTTTAGGCGTAGAAAAAGGCTTGAGCGGTGTGTGCTTGAAAATCAATTGCGGAGGGAATGTCTATGATAAAATCTCAGAAAAATTTGTAGAAAAAGTGGATAACGAGTTTTGAAAATTTTAATCCTTTTTTTGATAAGTTTAAACGCGCTCTTCGCCCTAGATTTGAACGCGCTTAAAACAGAGATTAAAGAAACTTACCTTAAAGAATACAAAGACTTGAAATTAGAAATTGAAACCATTAATTTAGAAATCCCAGAGCGTTTTTCTCACGCTTCCATTTTAAGCTATGAATTGAGCGCTTCTAACAAGCTTAAAAAAGATGGGGTCGTGTTTTTAAGGTTGGAAAATGAGCCTAATTTACGCCTACCGGTGCGTTATAGCGTGATAGGCAGCATGCAGGCTTTTAAAAGCATAGAGGCGATTAAAAAAGACGAAAACATCACCGCTAACAACACTCAAAAAGAGCGCATTCCTTTTGGCGTGCTTTCTAACCCCTTATTAGAGGGTGCGATTGATAGAGTGAGCGCGAAAAATTTTATCCCCCCTGACACGCTTTTAAGCGTGGATAAAACCCAAGCTTTAATCATCGTGCGTAAAAACGACATTATCACTGGGGTGTATGAAGAGGGGCAAATCAGCATAGAAATAAGCCTAAAAGCCCTAGAAAATGGCGCGCTTAATCAAATCATTCAAGCCAAAAATTTAGAAAGCAATAAAATCTTAAAAGCAAAAGTGTTGAGCGGCTCTAAAGCGCAAATCTTATAAAGGATATTCATGAAATTAGTTTTAGGCATCAGCGGAGCGAGCGGGATACCCCTAGCCTTGCGGTTTTTAGAGAAATTACCTAAAGAAATTGAAGTTTTTGTCGTGGCGTCTAAAAACGCGCATGTCGTGGCGTTAGAAGAATCTAACATTAACCTTAAAAACGCCATGAAGGATTTACGGCCTAGTGGTACTTTTTTCAACGAGCAAGACATTCATGCGAGCATCGCTTCAGGGAGTTATGGTATCCATAAAATGGCGATCATTCCAGCGAGCATGGACATGGTGGCTAAAATCGCGCATGGCTTTGGAGGGGATTTGATTTCTAGGAGCGCGTCTGTGATGCTTAAAGAAAAGCGCCCCTTACTCATTGCCCCTAGAGAAATGCCTTTAAGCGCTATCATGTTGGAAAATTTGCTCAAACTCGCCCATTCTAATGCGATCATTGCGCCGCCGGTGATGACTTATTACACCCAGAGCAAGACTTTAGAAGCGATGCAAGATTTTTTAGTGGGGAAGTGGTTTGACAGCTTAGGGATAGAAAATGACTTATACCCACGATGGGGAATGAACTGATGCAAAAAATCGGCATTTACCCAGGCACTTTTGATCCGGTCACTAACGGGCATATAGACATTATCCATCGATCCAGCGAATTGTTTGAAAAGCTCATTGTCGCTGTGGCGCATTCAAGCGCTAAAAACCCCATGTTTAGTTTAGATGAGCGCTTAAAAATGATGCAACTCGCCACTAAAAGTTTTACAAATGTAGAATGCGTGGCGTTTGAAGGGCTGTTAGCCAACTTGGCTAAAGAGTATCATTGTAAGGTGTTAGTTAGGGGCTTAAGGGTGGTGAGCGATTTTGAATACGAATTGCAAATGGGTTATGCGAACAAATCCTTAAACCACGAATTAGAGACCTTGTATTTCATGCCCACTTTACAAAACGCTTTCATAAGCTCTTCTATCGTGCGATCCATTATCGCGCATAAGGGCGATGCGAGCCATTTAGTGCCTAAAGAAATTTATCCTTTTATTTCAAAGGCTTAAAATGTATGTGGTGTTAGAAGGCGTTGATGGCGCGGGCAAAAGCACTCAAATAGGATTATTAAAAGACCGGTTTAAAAACGCCCTTTTTACCAAAGAGCCAGGGGGGACGAGAATGGGCGAGAGTTTAAGGCGTATCGCTTTAAATGAAAACATCAGCGAATTAGCCCGAGCGTTTTTATTCTTAAGCGATAGGGCTGAGCATATAGAAAGCGTGATCAAACCGGCATTGAAAGAAAAAAGACTCATTATTAGTGATAGGAGTTTGATTTCTGGCATGGCTTATAGCGAGTTTTCAAGCTTAGAATTAAACCTGCTCGCTACTCAAAGCGTCTTGCCTGAAAAAATCATTCTTTTAGTGATAGACAAAGAGGGTTTAAAACAGCGCTTAAGCCTTAAAAGTTTAGACAAAATAGAAAACCAAGGCACAGAAAAATTGCTCACCATCCAGCAAAAGCTCAAAACCCACGCTTATGCGTTAAGAGAAAAATTCGGGTGCGAAGTTTTGGAATTAGACGCTCAAAAAAGCGCTAAAAACTTGCACGAAAAAATCGTAGCCTTTATTGAATGCGTTGTTTGACTTGTTTGAAGCTTTCTTTTAAGCCCCTTTGTCCAAATTGCTTGAACGATTTGCCCTTAAGCTTAAAAGTAAGGGTTTTAGAGGGCGTGAGCGTGTATAGTTTTTACGCTTATAGCGAAATAGAAGAGCTCATTAAAAGCAAATACGCGCTGATTGGCTCTCGCATTTTGCCCTTGCTTTCTCAAAAAGCCGGTGCGGAATTTGTGAAAATCCTGCAAGAACAAGGTTTGAATATTCCCTTTTATGGCATCGCCATTGATGATAAAATCAAATCCTTTTACTCGCATTCCGCCGCGCTTTTAAAAGGCTTTTGTCAAGGCAATTTAAAGCCCACTTATGGGACTTTAAGGGCTAATAATGCTGTTTCGTATGCCGGGAAAAGCCTGGAATTTCGCGCCAACAACCCACGGGATTTCACTTTCAAAGGCGATGAGAATTTAGATTATTTTTTATTAGATGACATTATCACCACCGGCACCACCCTAAAAGAAGCCCTAAAATACCTTAAAACCCTAAACATCAAAGCCCACTTTGCGATCGCGCTTTGCAGCGCGGATGAATGAGTTATAATTTTATTTTTAAAAAGGATAAAACCATGCAAGCTTTTCGGTTAGAAGATGATGTTGATGACTATGTTAAAAAAGAATTGATTAATTTAGGGCTTATGAAAAATAAGGATTTTAACGTTAAAAGCCAAATGAGTCCTAGCCTTAAAAGCGCCCTTTTGAATGCGAGTAAAACTAAAGACAAAACTTCTTATGGCGAGCCAGATTTCAGCTTAGAAAAATACACGCACCCTAAAAATAAAGGAAGCGTTATCCCTATAATCATAGAAAACAAACTCTACGCTAAAAATTTGAAAAAGCTCAAAAACAGCACGCTTGCAAACGATGATCATTCCATTTCAAAATTCGCCGTGAATGGGGCTTTACATTACGCTCAAAATATCCTAAGAGACAAAGAAAAATATAAAGAATGTATCGCCATAGGCATAGCCGGCGATGATGAAGAAAACCTTTTGATAGAAGTGTATTATGTTTTTGCAAGCGGGATCAATTCGCACAAGCTCACTAGCGCTAAAAACCTGCATTTTTTAGAAAATCAAGAATCGTTTAACGCTTTTTATAAAGAATGCACGCTCACTGAAGAAGAAAAGCATTTTATCTTAATCAAAACCAAAGCCGAGTTGAACGAAACCGCTAAAAAACTCAACCGCCTGATGCATAACCACAACATCACCGCGCCTCAGCGCGTGCTATACGTGAGCGGCATGCTTTTATCCATGCAAGAAATTAAGGGCAAAAAAGGGGGCTTAAAACCAAGCGATTTAAAAGGCGAAATAACCGACACTAGCCGTGATGGCGTTTTAGTGTTTAACCAAATTAGCGAATTTTTAAAAACCAAAAACTTGAGCGAAGAAAAACGAGAATTAATGCTCGCCAGTTTTAAAGAAATCAGTAAAGACCCGCAGCGCGATAAAGAAACGAGCCTGGATAAAGCCATAAGCATGCTTTTAGAAAAAGATTCAAGCATCACCAAGCAAATTTTTACCTTTCTTTATGAATTTGTCCATAAGCCCATTAATGAAAGCGACAATACCGGTCATTTAGACATCATGGGCGAACTTTATAGCGAATTTTTAAAATACGCTTTAGGGGATGGTAAGGAATTAGGCATTGTTTTAACCCCGCCTTATGTAACTAAAATGATGAGTGAGCTTTTAGGGGTTAATGCGAAATCCTTTGTGATGGATTTAGCCGCAGGGAGCGCGGGATTTTTAATTTCTTCTATGGTGCTAATGATTGAAGACATTGAAAAAACCTATGGTAAAAACACCACTAAAGCGAATGAAAAAATCAAAGACGCAAAAACCACGCAGCTTTTAGGCGTGGAGCTTAACGCTGAAATGTTTTCGTTAGCCACCACGAACATGATTTTAAGAGGCGATGGCTCAAGCTTGATCATCAAAGGCAACACTTTTGAAACCAATAAAAAGATTTATGAAGATTTTAAACCCAATATCCTTTTATTAAACCCTCCTTTTAGCTACGAAGAAAACGGCATGCCTTTTATCAAGCTTGGATTAGAGTATATGCAAAAAGGCGCTTTAGGAGCGATCATTATCCAAGATAGCGCAGGGAGCGGGCAAGCGTTAAAATCCAATGTTGAAATTTTAAAAAAACATTCGCTTTTAGCGAGCGTTAAAATGCCCACCGATTTATTCATGCCTCAAGCCGGAGTGCAAACAAGCGTCTATATTTTTAAAGCTCATGAGCCGCACGATTATGAAAGGCCCGTTAAATTCATAGACTTTAGAAACGACGGCTTCAAACGCACCAAAAGAGGCTTGAATGAAACCTCTAACCCCACCAAACGCTATGAAGAAATCATTAAAATTTACAAAGCCGGCTTAAACGCTAAGGTTTCTAAAGAGCTGTGGGGCGATTTAGAAACAATCTATATTGAAGACTTTATCGCTAAGCCGCACGAAAACAAGCATGCTAAAGACTTTAATTTTGAAGCGCACCAAAAGAATGAGACTAAACCCGAATTAGAGGATTTTAAAAGAACGATAGCCGATTACCTTTCTTATGAAGTGGGCTTGATTTTAAAAAACCAAACGCCCCCAAAGTGATTGGCCCCCTTAATAGCCAACTCAACGCTATTAAGTGGGGCGAGTTCAGATTGGGGGATTTGTTTGAAGCGAGTAACGGCGATTTTGATATTCAAAAACGCCACATCAATCATAAGGGCGAATTTGTCATCACCGCAGGGCTTAGCAATAATGGCGTTTTAGGGCAAAGCGATATAAAAGCAAAAGTTTTTGAAAGCCACACCATTACTATTGACATGTTTGGTTGCGCGTTTTATCGCAGTTTTGCTTATAAAATGGTAACACATGCTAGGGTATTTTCTCTCAAACCTAAATTTGAAATCAGCCATAAAATCGGCTTGTTTTTATCCACGCTATTTTTTGGTTACCCTAAAAAATTCGTCTATGAAAACATGTGTTCATGGGCAAAAATTAAAAACGATAAGGTCATTCTACCCCTAAAACCCACCGCTAACGCTCAAACCCTTGAGAATATTGATTTTGATTTCATGGAAAAATTCATAGCCGAACTTGAGCAGTGTCGGCTCGCCGAACTTCAGGCTTATTTAAAAGCTACAGGGCTAGAAAACACCACCCTTTCTAGCGATGAAGAAAACGCCCTTAATGTTTTCAATAATTCTATTGGGGGTAATACCCCATGCGGCTTAACATGGCAAAGCTTCAAAATTGTAGATATTTTTGAAGTCAAAAACACAAGAAATATTTTAGCAAGGGATGTTGTCAAAGATAGTGGGACAACCCCCTACTTGTGTGCTAGTAAAGAGAATAATGCTGTAAATTCTTATATTAATTACAACGCGGATTTTTTGGATAGGGGCAATTGTATTTTTATTGGTGGTAAAACTTTTGTTGTTACATATCAACAAAAAGACTTTTATTCAAACGATAGCCATAATTTAGCTTTGTATCTTAAAGACACACATTCAAAAACCAAACTTAACCAACTATTTATTATTACTTGCATTTATAAAGCTTTAAATAATAAATATTCTTGGGGTGATAGCATAAGTAACGCAAAGATACAAAATGATAGCATTCTACTCCCCACCAACCAACATGGTAAAATTGATTTTCATTTCATGCGCACCCTCATCAACGCCCTGATGAAGCAAACCATTCAGGGCGTGGCTCAATACTGCGACGCTAAAATACAGGCCACAAAAGAGATTATCAGACAAGAAACACCCATTCAAAAAGACTCGTTGTTTTGAAAGAGATGAGGTCCAGCTTGTGTTACAATAAACTTAAAATTTGCTTGATTGAAGAGGGTTGAACCATGGAGCAGCCAGTCATTAGAGAGGGGACTTTAGCGTTAATTGATACCTTTGCGTATTTGTTTAGAAGCTATTACATGAGCGCTAAAAATAAGCCTTTAACCAACGATAAGGGCTTTCCTACAGGGCTTTTAACGGGGCTTGTGGGCATGGTTAAAAAATTTTATAAAGACAGAAAAAACATGCCTTTTATCGTGTTCGCTCTAGAAAGCCAGACTAAAACTAAAAGAGCTGAAAAATTGGGCGAATACAAACAAAACCGCAAAGACGCCCCTAAAGAGATGCTTTTACAAATCCCTATCGCCTTAGAATGGTTGCAAAAAATGGGTTTTACTTGCGTGGAAGTGAATGGGTTTGAAGCTGATGATGTTATCGCCACTCTAGCCACGCTAAGCCCTTATAAAACCCGCATTTATTCTAAAGATAAGGATTTTAACCAGCTTTTGAGCGATAAAATCGCACTTTTTGATGGCAAAACGGAATTTTTGGCGAAAGATTGCGTGGAAAAATACGGGATTTTGCCGAGTCAATTCACGGATTATCAGGGCATTGTGGGGGATAGCAGCGATAATTACAAGGGGGTTAAAGGCATTGGGAGCAAGAACGCTAAGGAATTGTTGCAGCGATTAGGGAGCTTGGAAAAAATCTATGAAAATTTAGACTTGGCGAAAAATTTACTCAGCCCTAAAATGTATCAAGCCTTGATACAAGACAAAGCAAGCGCGTTTTTAAGCAAAGAATTAGCCACTTTAGAAAGAGGATGCATTAAAGAATTTGATTTTTTAAGTTGCGCTTTTCCTAGCGAAAACCCCTTATTGAAAATCAAAGATGAATTGAAAGAATATGGTTTCATTTCTACCTTAAGGGATTTAGAAAATTCCCCTACGCCTTTAATTTTAGAAAACACGCCCGCATTAGAAAACGCCTCCGCATTAGACGGCGCCCCTAAAAAATCGTGCTTAATCGTTTTGGAAAGCGTCGCGCTTTTGAGCGCGTTTTTAGAAAAGTTAGAAAAAACTAACGCTAGGATTTTTGCGCGTTTGGTGCTGAATAAAGAAAAAAAAGTTTTGGCCCTAGCGTTTTTATTACAAGATCAAGGCTATTTTTTACCCCTAGAAGAGGCGTTATTTTCGCCTTTTTCTTTAGAATTTTTGCAAAACGCTTTTTTTAAAATGTTACAGCATGCGCAAATCATTGGGCATGATTTAAAGCCCTTATTGAGCTTTTTAAAAGCCAAATACCAGGTGTCTTTAGAAAACATCCGCATCCAAGACACTCAAATTTTAGCGTTTTTAAAAAATCCGGAAAAAGTGGGGTTTGATGAAGTTTTAAAGGAATATTTAAAAGAAGAATTAATCCCGCATGAAAAAATCAAAGATTTTAAGATTAAAGCGGAGAAATTAGAACTTTTAAGCGTGGAATTAAGCGCTTTAAAGCGTTTGTGCGAATACTTTGAAAAAGGGGGGCTAGAAGAGAATTTGCTTATTTTGGCTAGAGAGATTGAAACGCCGTTTGTGAAAGTTTTAATGGATATGGAATTTCAAGGCTTTAAAATTGATGCGCCTTATTTCAAGCGCTTAGAGCAGGAGTTTAAAGATGAATTAAAAGTTTTAGAGCGCCAAATTTTGGATCTAATCGGCGTGGATTTTAACCTCAATTCGCCTAAGCAACTTGGCGAGATTTTGTATGAAAAATTAGAGCTTCCTAAAAATAAAAGCCATTCTACTGATGAAAAAAGCTTGTTAAAAATCCTAGACAAGCACCCAAGTATCCCTTTGATTTTAGAATACAGGGAATTGAATAAGCTTTTTAACACTTACACCACCCCCTTATTGCGCTTAAAAGACAAAGACGATAAAATCCATACCACTTTCATCCAAACCGGCACAGCTACCGGGCGTTTAAGCTCGCATTCGCCTAATTTGCAAAATATCCCAGTGCGATCGCCTAAAGGCTTACTCATTCGTAAGGGCTTTATCGCTAGCTCTAAAGAATATTGTTTATTAGGAGTGGATTATTCGCAGATTGAATTGCGCTTATTAGCCCATTTCAGCCAGGATAAGGATTTAATGGAGGCGTTTTTAAAGGGGCGAGACATCCATTTAGAAACTTCTAAGGCGTTGTTTGGAGAAGATTTGGCTAAAGAAAAACGATCCATCGCTAAAAGCATTAATTTTGGGCTGGTGTATGGCATGGGGAGTAAGAAATTGAGCGAAACTTTAAACATTTCTTTAAATGAGGCTAAAAGCTACATAGAAGCGTATTTCAAGCGATTCCCTAGCATCAAAGATTATTTAAACCGCATGAAAGAAGAGATTTTAAAAACTTCTAAAGCCTTCACTTTGCTTGGGCGTTATCGGGTGTTTGATTTTACCGGCGCAAATGACTATATCAAGGGCAATTATTTGCGAGAGGGCGTGAATGCGATTTTTCAAGGGAGTGCCAGCGATTTATTGAAATTAGGCATGCTCAAAGTGAGCGAGCGTTTCAAAAATAACCCTTCGGTGAGGCTGCTTTTGCAAGTGCATGACGAATTGATTTTTGAAATTGAAGAAAAAAACGCATTAGAGTTGCAGCAAGAAATCCAACGCATTCTTAATAATGAAGTGTATCCTTTGAGGGTGCCACTAGAAACGAGCGCGTTTGTGGCGAATCGTTGGAATGAACTAAAAGGTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >AP017632|58365:69253|61073_61637_+|BBI21990.1|DBSCAN-SWA MKLVLGISGASGIPLALRFLEKLPKEIEVFVVASKNAHVVALEESNINLKNAMKDLRPSGTFFNEQDIHASIASGSYGIHKMAIIPASMDMVAKIAHGFGGDLISRSASVMLKEKRPLLIAPREMPLSAIMLENLLKLAHSNAIIAPPVMTYYTQSKTLEAMQDFLVGKWFDSLGIENDLYPRWGMN >AP017632|58365:69253|63282_65322_+|BBI21994.1|DBSCAN-SWA MQAFRLEDDVDDYVKKELINLGLMKNKDFNVKSQMSPSLKSALLNASKTKDKTSYGEPDFSLEKYTHPKNKGSVIPIIIENKLYAKNLKKLKNSTLANDDHSISKFAVNGALHYAQNILRDKEKYKECIAIGIAGDDEENLLIEVYYVFASGINSHKLTSAKNLHFLENQESFNAFYKECTLTEEEKHFILIKTKAELNETAKKLNRLMHNHNITAPQRVLYVSGMLLSMQEIKGKKGGLKPSDLKGEITDTSRDGVLVFNQISEFLKTKNLSEEKRELMLASFKEISKDPQRDKETSLDKAISMLLEKDSSITKQIFTFLYEFVHKPINESDNTGHLDIMGELYSEFLKYALGDGKELGIVLTPPYVTKMMSELLGVNAKSFVMDLAAGSAGFLISSMVLMIEDIEKTYGKNTTKANEKIKDAKTTQLLGVELNAEMFSLATTNMILRGDGSSLIIKGNTFETNKKIYEDFKPNILLLNPPFSYEENGMPFIKLGLEYMQKGALGAIIIQDSAGSGQALKSNVEILKKHSLLASVKMPTDLFMPQAGVQTSVYIFKAHEPHDYERPVKFIDFRNDGFKRTKRGLNETSNPTKRYEEIIKIYKAGLNAKVSKELWGDLETIYIEDFIAKPHENKHAKDFNFEAHQKNETKPELEDFKRTIADYLSYEVGLILKNQTPPK >AP017632|58365:69253|65318_66512_+|BBI21995.1|DBSCAN-SWA MIGPLNSQLNAIKWGEFRLGDLFEASNGDFDIQKRHINHKGEFVITAGLSNNGVLGQSDIKAKVFESHTITIDMFGCAFYRSFAYKMVTHARVFSLKPKFEISHKIGLFLSTLFFGYPKKFVYENMCSWAKIKNDKVILPLKPTANAQTLENIDFDFMEKFIAELEQCRLAELQAYLKATGLENTTLSSDEENALNVFNNSIGGNTPCGLTWQSFKIVDIFEVKNTRNILARDVVKDSGTTPYLCASKENNAVNSYINYNADFLDRGNCIFIGGKTFVVTYQQKDFYSNDSHNLALYLKDTHSKTKLNQLFIITCIYKALNNKYSWGDSISNAKIQNDSILLPTNQHGKIDFHFMRTLINALMKQTIQGVAQYCDAKIQATKEIIRQETPIQKDSLF >AP017632|58365:69253|58365_60411_+|BBI21988.1|DBSCAN-SWA MGFEKSILDNLNGVQKIAASHIQGPLLILAGAGSGKTKTLTSRLAYLIGACGVPSENTLTLTFTNKASKEMQERALKLLKNQALIPPLLCTFHRFGLLFLRQHMSLLKRACDFSVLDSDEVKTLCKQLKISNFRANISQIKNGMMDLSVQDSECYKAYELYQNALKKDNLVDFDDLLCLSLKILQDNEKLAKETSERYHYIMVDEYQDTNALQLEFLKQLSCTHHNLCVVGDDDQSIYGFRGSDISNILNFSKHFKGAKIVKLETNYRSSAEILACANSLISHNQHRHIKTLQSFKGSHKSVICKEYLTQKEESLDVAYQIKALLKKGENLENIAILYRLNGLSRSIEESLNALNIPYRLIGAVSFYERAEVKDALAFMHLVAKKDDRFFIKRVLNKPPRGLGKITQEWIFSLLDEEDLNLEEALKLGAFKDKLNPKNEYALNKFIAMIGRLREAFEISVEEFCARFLEETNLLKSYEKEDNYEEREGFVKELLSLVKEHFKTNPTHSLLDFLNESVLDAHNTENAQKVSCMSVHMSKGLEFKHVFVIGLEEGFFPHRGFNQESDLEEERRLAYVAITRAKEGLQLSYVKERSYFGRKISCSPSVFLEEAKLLNQDNPPKQDHQKDAPIKVGDLIKHKIFGTGRVLGVEKGLSGVCLKINCGGNVYDKISEKFVEKVDNEF >AP017632|58365:69253|62674_63250_+|BBI21993.1|DBSCAN-SWA MRCLTCLKLSFKPLCPNCLNDLPLSLKVRVLEGVSVYSFYAYSEIEELIKSKYALIGSRILPLLSQKAGAEFVKILQEQGLNIPFYGIAIDDKIKSFYSHSAALLKGFCQGNLKPTYGTLRANNAVSYAGKSLEFRANNPRDFTFKGDENLDYFLLDDIITTGTTLKEALKYLKTLNIKAHFAIALCSADE >AP017632|58365:69253|62111_62687_+|BBI21992.1|DBSCAN-SWA MYVVLEGVDGAGKSTQIGLLKDRFKNALFTKEPGGTRMGESLRRIALNENISELARAFLFLSDRAEHIESVIKPALKEKRLIISDRSLISGMAYSEFSSLELNLLATQSVLPEKIILLVIDKEGLKQRLSLKSLDKIENQGTEKLLTIQQKLKTHAYALREKFGCEVLELDAQKSAKNLHEKIVAFIECVV >AP017632|58365:69253|61636_62110_+|BBI21991.1|DBSCAN-SWA MQKIGIYPGTFDPVTNGHIDIIHRSSELFEKLIVAVAHSSAKNPMFSLDERLKMMQLATKSFTNVECVAFEGLLANLAKEYHCKVLVRGLRVVSDFEYELQMGYANKSLNHELETLYFMPTLQNAFISSSIVRSIIAHKGDASHLVPKEIYPFISKA >AP017632|58365:69253|66577_69253_+|BBI21996.1|DBSCAN-SWA MEQPVIREGTLALIDTFAYLFRSYYMSAKNKPLTNDKGFPTGLLTGLVGMVKKFYKDRKNMPFIVFALESQTKTKRAEKLGEYKQNRKDAPKEMLLQIPIALEWLQKMGFTCVEVNGFEADDVIATLATLSPYKTRIYSKDKDFNQLLSDKIALFDGKTEFLAKDCVEKYGILPSQFTDYQGIVGDSSDNYKGVKGIGSKNAKELLQRLGSLEKIYENLDLAKNLLSPKMYQALIQDKASAFLSKELATLERGCIKEFDFLSCAFPSENPLLKIKDELKEYGFISTLRDLENSPTPLILENTPALENASALDGAPKKSCLIVLESVALLSAFLEKLEKTNARIFARLVLNKEKKVLALAFLLQDQGYFLPLEEALFSPFSLEFLQNAFFKMLQHAQIIGHDLKPLLSFLKAKYQVSLENIRIQDTQILAFLKNPEKVGFDEVLKEYLKEELIPHEKIKDFKIKAEKLELLSVELSALKRLCEYFEKGGLEENLLILAREIETPFVKVLMDMEFQGFKIDAPYFKRLEQEFKDELKVLERQILDLIGVDFNLNSPKQLGEILYEKLELPKNKSHSTDEKSLLKILDKHPSIPLILEYRELNKLFNTYTTPLLRLKDKDDKIHTTFIQTGTATGRLSSHSPNLQNIPVRSPKGLLIRKGFIASSKEYCLLGVDYSQIELRLLAHFSQDKDLMEAFLKGRDIHLETSKALFGEDLAKEKRSIAKSINFGLVYGMGSKKLSETLNISLNEAKSYIEAYFKRFPSIKDYLNRMKEEILKTSKAFTLLGRYRVFDFTGANDYIKGNYLREGVNAIFQGSASDLLKLGMLKVSERFKNNPSVRLLLQVHDELIFEIEEKNALELQQEIQRILNNEVYPLRVPLETSAFVANRWNELKG >AP017632|58365:69253|60407_61064_+|BBI21989.1|DBSCAN-SWA MKILILFLISLNALFALDLNALKTEIKETYLKEYKDLKLEIETINLEIPERFSHASILSYELSASNKLKKDGVVFLRLENEPNLRLPVRYSVIGSMQAFKSIEAIKKDENITANNTQKERIPFGVLSNPLLEGAIDRVSAKNFIPPDTLLSVDKTQALIIVRKNDIITGVYEEGQISIEISLKALENGALNQIIQAKNLESNKILKAKVLSGSKAQIL |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
387080 : 397077
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >AP017632|387080:397077|DBSCAN-SWA AATGAGCAAATATAATTGTATAGATTTATTTAGTGGGGCTGGTGGTTTATCATTGGGTTTTGCGAATACAAATAGATTTAATATTTTAGCCCACATTGAGTGGGAAAAACCTATGGTTGCTACACTGAGAAATGCTTTAATCAAACGCTTTAAAATCAGTGAGTATGAGGCAAAAAAGAGAGTTATTAAATTTGATATTCAAAAAACGGATGAATTGATAAATGGCTCTTGGAGTGGTGAAACTCTTAAAATTTATGGATCTGATAATGATGAAAGCGTTAGCCAACTTGGGTTAAATGGCGTAATTAGTGGTAAAAAAATAGATGTTATCTTTGGCGGTCCTCCTTGTCAAGCTTATTCTCTTGTGGGTAGAGCGCAAGATAAACACTCTATGAAATATGATTATAGGAATTATCTTTTTGAAAGTTTTGTTAAGATAGTTGATTATTACCAACCACAATGCTTTGTGTTTGAAAATGTTCCTGGCATGCTTAGTGCAAAACCGGGCAATCAATTTGTAAAAGATAGGATTTATGAATCTTTTTCAAAAATAGGGTATGAAATTAAAAAACCAAATGAAATGAAAGAGATAATCTATTCTAGCGATGATTATGAAGTCCCACAAACTAGAAAACGAGTAATTATATTTGGCGTTCGTAAAGATAATAAAGAATGGTTATTCAAATTTTATCAAAATTTAGACAATCTCAAATCAAAAAAACCACCACTTACCGTTAGAGACGCTATTGGCCATTTACCCAAGTTTAGACCGCTCAAAACACCCCTAAAAACTAGCAATAAAAACATTTCTCACGAACTTATTGGTGCAAATAATTTGACACAAAATTTTCCACGATATAATAATTTACGAGATTTAAAAGCGATGGAATTTTGGATTGAAAACAACATGAATAACGCTTCTGCAAAAGAAAAGCTTGACTTTTACACTAAAATTACGGGAAAAGTCTCAAACCATAACAAATACAGAAATTTAGAATGGGATAAACCATCGCCAACCTTAGTGGCGCATTTGCAAAAAGATGGTTTTATGTTTATACACCCAGAAGCTAATCAAAGCCGCTCTATCACCATAAGAGAAGCAGCAATCTTGCAGACTTTCCCTAATGATTTTGAATTTATCGGATCGCAAGCGGCTTGTTTTAAAATGATAGGCAATGCAGTGCCAGTTAATTTTGCTAAAAATATAGCCCTAGCAGTGGCAAAGGTTTTAGATGAAAAAAACTAATATAAATATTTTAGTAGCTTGTGAAGAAAGCCAAAGGGTGTGCAATGAATTTAGAAAGCTTGGTTTCAACGCTTATAGTTGTGATCTATTAGAGTGTAGTGGCGGGCATCCTGAGTGGCATTTTAATTGCGATGTTTTTGAAGTGATTGGAAATAAAGGCGGTGTTTTGCAAAATGGCAAACATGTAAAAGTTTCGCAATGGGATATGATGATAGCGCACCCGCCTTGCACTTTTTTAGCTGTTAGTGGAGCGAAGTGGTATTACCACCCTAGAGATAAAGATTTGCCCATAGAACAAAAAAGACCCCATCCCAAATTCCCCAACCGCACAAAAGACAGAGAGGAAGCTTCAAAATTCTTTATGGATTTAGTGGAAGCAAAAATCCCTTATATTGCAATAGAAAACCCCATTGGCATAATGAATACAAGATACAAAAAGCCCGATCAAATAGTCCAACCTTACCACTTTGGCGATAGTGCATCAAAAAAGACTTGTTTGTGGCTTAAAAACTTACCACCCTTAAAATACACAAACATCGTTGATCCTGGCGAGTTTATAGAATTTAAAAGCGGTAAAAAAATAGCAAAATGGTATAGCGATGGACTGACTAAAACAAAATCAGCCAAAGAGCGTCAAATTTGGAGGAGTAAAACATTTCCAGGATTTGCAAAGGCGATGGCAGAGCAGTGGGGGGAGTTTGTAAAAAATGAGATGTTTAAAAAGGTGAAAAATGAAAGTTTATTTGAGGAAAATTGATAATCAATGCATTAACAAACAAATCAGTATTACAAGAGATATTTTAGAGCATTTTTTTGATAACGCCAACAACCAAGACGAAGTAGATATGAGGGGTATCTTATCTAACTATAACGATAAAGTTAGCATCCTCTTAGCAACAGATCCTAGACTTGGTGGAGGAATTAAGAGAATCATTAATGCAGAAACTGATAAAATAAAAGAAACCCGATTGGATTATGAGTTAAAAATTGATGATATTCTGCTTTTTACTTATATATCTTATAAAAAATACACATTAGAAATCATTTTACCCACTGATACAAGATACAATGTTTTAAATGGCTTAATCAGTAATAGCAAGCATTTATTGGTTTTTGGTGAGAATGAAACGAGTCTTTTAGATGATGGTAAAATAGATGAAAGCGTTAGAATAGATGGGGGAAAAAATATCATCCTTTATGGTGTTCCTGGTAGTGGCAAAAGTTATACTTTACAAAGAGATTATTGCAATGATAATAGTGTGGTAGAAAAGATAGTGTTCCATCCTGATTATTCTTATAGTGATTTTGTGGGACAGATTATGCCAAGCGTGAATGATGGCGGTATCGTTAGTTATAAATTTAATCCTGGACCTTTTACAAACATCCTAAAAAAAGCGTATCATAACCCACAAACTAAGCATGTCCTAGTGATTGATGAAATCAATCGTGGTAATGCGCCTGCCATATTTGGAGAAATTTTTCAACTTCTTGATAGGCTTAAACATGACAAAGGTGGCTTTAAAAAAGGCTCTAGTGAGTATGCTATCAATAATATGGATATTGCAAATATTGTCCATAACGATAAAAATGCAAGTATAAGAATCCCATCAAATTTATGGATAATCGCTACAATGAATACGAGCGATCAAAATGTATTCACACTAGATACTGCTTTTCAGCGTAGATTTGCTATGCAACTCATTGAGAATTCCTTTGAAAATGTTGATAATGGTTTTAAAAATATGAAAATTTTAGACACTGATATTACTTGGCAAAAATTTTGCACCACCATCAATGAAAAAATAGCTCAAAACAACGAGGGGCTGAGTTCTATGGAGGATAAGCGGTTTGGCGTTTATTTTGTGAATATTGATGATCTAAAGAGCAAAGAAAATTTTGCACATAAAGTCATCAAATACCTTTGGGACGATGTCTTTAAATTTGATAGAAATATCATATTTGATACTACAAAATTTAATACGCTTGAAGCTGTTGTGAAGAATTTTACCAAAGAAAAAGGCAGAACCCAATTTGATATTTTTAGCGATGGTGTGAAAGAACTTTTATTTGATGTTTGATTTAAAAAAGTGCTGTTTTACAGACAATAAATTGAACGACAATTTTGTAGGCATTAGAAGTATCAATAATGATTTACAAATTTGTTTCCCATTAGGATTTGATATAAGCGATGATAAAAACATTAGAGCAGATATAAAAAATCTTATTTCTATTCTTTTAGAATATAATAAAACAATTGTATGTGAAAATTTGTTAAATAATAAAAATGGGATTATAAGATCAAATTTTCCACTCACAGCGTATAAAAATGTCATAGAATATTTTTTATCGCATGGTTATTATACAGAAAATAAAAGTTATTATGAAAATAGTGCAAAAGGTAAAATAAATTTTTCCAAAACGATTAAGAAAAACAGACCTATTATTCAAACTTTTAACAATAAAAACTCTTGTGTCTATACTCGTTTTCAAGTTAAAAGGAAAATGGTAAATGAAAATGAATTGATAACAGCGATAAACAAATATTGTGTGCATGAAGCGTTTTCTAAATTTGGTTTTGTGTTTAGCTCGTTTATGCCACCAATATTCAAACTACCTGCTGATAAAAATTATTGCATTTATCTGCTTGAAAACAGGTTAAACAGCACATTTAATGATGACAGGAAAATCCTTTTTCAATCTATGAAAAATATTCTTTTACAAGATGATAATACTTTGGATAAGACTGATTTTAAATTTGGAACATATAATTTTTATGTTATTTGGGAAAGAATGATAGACAAGGCATTTGGTATAAAAAATAAAGAAGTTTATTTTCCTAAAACAAAATGGAATTTGCGGTGCTCCGATCAAAAACCTGATTATTTATTGCAACCAGATAGCATCATGCTGTTTGACGATAGAATTTACATATTAGATGCAAAATATTATAAATATGGTATAAGTGGGGTTGCAAGCGATTTACCCAGTAGTGCATCCATCATAAAACAGATTGTTTATGGTGAATATGTGGCAAAACTAGAAACAAAAAAAGAGATTCACAATATCTTTTTAATGCCATTCAACAGATTTAACAATCCGCTAAAATTGAGTAATATTTTTGAGAATATAGGTTTTGCAAATGGAGAGTGGAGAGGTAATCTGAAACAATATGAAAATATACAAGGAATTTTAATGGACACTAAATTTTTAATGCAAAATTATAACAAGAAATCCAATGATCTTTTAAAATTACTAGCAAAAAATGTGGAAGAAACTAAAATATAATTTTTAAAAATTTTAGTCTAAAATCAAATCTAAAACCATAAAACAAAATTTAAAACCCCCATTTTTTAATCAAAACAAACCTACAGTGAGCGTTCTATATCATCAACGCTTAAAGGGGTGTTGGCTTTTAAAAATTTTGATGCCTTTTGGCCTAAAATTTCTTTATAGAATTTAGGGTGTAAGCCAAGGTTGGGGCGTAAGGCTTTGATATTGTTTTCAGTCAATGCTTCGCCTTTTTGAATATCCTTAATAACAAATAAAGAGCGCATAAAGAATCTTCGCTCCTCTAAAGTCTTTGGATTGATTTTAGGCTCTTTTTCGCCTAAGGCTAAAACGCTTTGTTTGATCGCTTCAACCATGCTTTTAAATCCGTTAAAATCCATGCTAAAAGCGCTGTCTGGGGTTTGTAAGGATTTGTTTAAAATGAAATGCTTTTCTATCATGCTCGCTCCTAAAGTGGTGGCTAGAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >AP017632|387080:397077|389056_390403_+|BBI22308.1|DBSCAN-SWA MKVYLRKIDNQCINKQISITRDILEHFFDNANNQDEVDMRGILSNYNDKVSILLATDPRLGGGIKRIINAETDKIKETRLDYELKIDDILLFTYISYKKYTLEIILPTDTRYNVLNGLISNSKHLLVFGENETSLLDDGKIDESVRIDGGKNIILYGVPGSGKSYTLQRDYCNDNSVVEKIVFHPDYSYSDFVGQIMPSVNDGGIVSYKFNPGPFTNILKKAYHNPQTKHVLVIDEINRGNAPAIFGEIFQLLDRLKHDKGGFKKGSSEYAINNMDIANIVHNDKNASIRIPSNLWIIATMNTSDQNVFTLDTAFQRRFAMQLIENSFENVDNGFKNMKILDTDITWQKFCTTINEKIAQNNEGLSSMEDKRFGVYFVNIDDLKSKENFAHKVIKYLWDDVFKFDRNIIFDTTKFNTLEAVVKNFTKEKGRTQFDIFSDGVKELLFDV >AP017632|387080:397077|387080_388325_+|BBI22306.1|DBSCAN-SWA MSKYNCIDLFSGAGGLSLGFANTNRFNILAHIEWEKPMVATLRNALIKRFKISEYEAKKRVIKFDIQKTDELINGSWSGETLKIYGSDNDESVSQLGLNGVISGKKIDVIFGGPPCQAYSLVGRAQDKHSMKYDYRNYLFESFVKIVDYYQPQCFVFENVPGMLSAKPGNQFVKDRIYESFSKIGYEIKKPNEMKEIIYSSDDYEVPQTRKRVIIFGVRKDNKEWLFKFYQNLDNLKSKKPPLTVRDAIGHLPKFRPLKTPLKTSNKNISHELIGANNLTQNFPRYNNLRDLKAMEFWIENNMNNASAKEKLDFYTKITGKVSNHNKYRNLEWDKPSPTLVAHLQKDGFMFIHPEANQSRSITIREAAILQTFPNDFEFIGSQAACFKMIGNAVPVNFAKNIALAVAKVLDEKN >AP017632|387080:397077|388311_389082_+|BBI22307.1|DBSCAN-SWA MKKTNINILVACEESQRVCNEFRKLGFNAYSCDLLECSGGHPEWHFNCDVFEVIGNKGGVLQNGKHVKVSQWDMMIAHPPCTFLAVSGAKWYYHPRDKDLPIEQKRPHPKFPNRTKDREEASKFFMDLVEAKIPYIAIENPIGIMNTRYKKPDQIVQPYHFGDSASKKTCLWLKNLPPLKYTNIVDPGEFIEFKSGKKIAKWYSDGLTKTKSAKERQIWRSKTFPGFAKAMAEQWGEFVKNEMFKKVKNESLFEEN >AP017632|387080:397077|390395_391610_+|BBI22309.1|DBSCAN-SWA MFDLKKCCFTDNKLNDNFVGIRSINNDLQICFPLGFDISDDKNIRADIKNLISILLEYNKTIVCENLLNNKNGIIRSNFPLTAYKNVIEYFLSHGYYTENKSYYENSAKGKINFSKTIKKNRPIIQTFNNKNSCVYTRFQVKRKMVNENELITAINKYCVHEAFSKFGFVFSSFMPPIFKLPADKNYCIYLLENRLNSTFNDDRKILFQSMKNILLQDDNTLDKTDFKFGTYNFYVIWERMIDKAFGIKNKEVYFPKTKWNLRCSDQKPDYLLQPDSIMLFDDRIYILDAKYYKYGISGVASDLPSSASIIKQIVYGEYVAKLETKKEIHNIFLMPFNRFNNPLKLSNIFENIGFANGEWRGNLKQYENIQGILMDTKFLMQNYNKKSNDLLKLLAKNVEETKI >AP017632|387080:397077|391690_392713_-|BBI22310.1|DBSCAN-SWA MLQRPKIVAELSANHNQDLNLAKESLHAIKESGADFVKLQTYTPSCMTLNSKEDPFIIQGTLWDKENLYELYQKASTPLEWHAELFELARKLDLGIFSSPFSSKALELLESLNCPMYKIASFEIVDLDLIEKAARTQKPIILSSGIATHTELQDAISLCRGVNNFDITLLKCVSAYPSQIEDANLLSMVKLGETFGVKFGLSDHTIGSLCPILATTLGASMIEKHFILNKSLQTPDSAFSMDFNGFKSMVEAIKQSVLALGEKEPKINPKTLEERRFFMRSLFVIKDIQKGEALTENNIKALRPNLGLHPKFYKEILGQKASKFLKANTPLSVDDIERSL >AP017632|387080:397077|395571_397077_+|BBI22314.1|tRNA|DBSCAN-SWA MFSNQYIQQRIHKANSLREEGKNPYQNGLKRSLTNAAFLEKYAYVKDLEEPKDKEKCESIVGRVKLLRLMGKACFIKIEDESAILQAYVSQNELNDEFKSLKKHLEVGDIVLVKGFPFATKTGELSVHALEFHILSKTIVPLPEKFHGLSDIELRYRQRYLDLIVNPSVKDVFKKRSLIVSSVRKFFEMEGFLEVETPMMHPIPGGANARPFITYHNALEVERYLRIAPELYLKRLIVGGFEAVFEINRNFRNEGMDHSHNPEFTMIEFYWAYHTYEDLIELSKRLFDYLLKTLNLDSKIIYNDMEVDFNQTSVISYLDALETIGGISRGILEKEDRLLAYLLEQGVKVEPNLTYGKLLAEAFDHFVEHQLINPTFVTQYPIEISPLARRNDSNPNIADRFELFIAGKEIANGFSELNDPLDQLERFKNQVAEKEKGDEEAQYMDEDYVWALAHGMPPTAGQGIGIDRLVMLFTGSKSIKDVILFPAMRPVKNDFNVESEE >AP017632|387080:397077|393358_394633_-|BBI22312.1|DBSCAN-SWA MRLILFNQNALLLACMFVSSVYVNAVLDAYAIENPYISITLTSLLAPLSMLAFLKTPRNSAFALGFFVGALLFYWCALSFRYSDFTYLLPLIIILIALVYGVLFYLLLYFENPYFRLLSFLGSSFIHPFGFDWLVPDSFFSYSVFRVDKLSLGLVFLACIFLSAQNLKKYRIIGVLLLLGALDFNGFKTSDLKKVGNIELVSTKTPQDVKFDSNYLNDIENNILKEIKLAQSKQKTLIVFPETAYPIALENSPFKAKLEDLSGNIAILIGTLRTQGYNLYNSSFLFSKESVQIADKVVLAPFGETMPLPKFLQKPLEKLFFGESAYLYRNASNFSDFTLDDFTFRPLICYEGTSKPAYSNSPSKIFIVMSNNAWFSPSIEPTLQKTLLKYYARRYDKIILHSANFSTSYILNPSLLGDILFRKR >AP017632|387080:397077|392717_393359_-|BBI22311.1|DBSCAN-SWA MIKAINISHAFEKPLYNGVNLRIKPKESLAILGVSGSGKSTLLNHLATMLKPDSGTISLLEHQDIYALNSKKLLELRRLKVGIIFQSHYLFKGFSALENLQVASILAKQEINHSLLEQLGIAHTLKQGVGELSGGQQQRLSIARVLSKKPKIIIADEPTGNLDTTSANQVISMLQNYITEKEGALVLATHDEHLAFTCSQVYRLEKEVLIKEK >AP017632|387080:397077|394767_395562_+|BBI22313.1|DBSCAN-SWA MIALKIIGVFGAFLSAHYLYARYMRERFGFRVNYIDLALLVVVVAFGIRGFYHGFVSEVAGILGIVLGVYLASRYSVAVGHLFSQHLYDLKNETMMNLVGFLLVLASIWVFFLAFGVLLGKVLVFSGLGIIDKALGFIFSCLKTFLVLSFILYALSKMEVMKDANAYLQEKSAFFSTMKSVASKIMRLDGVKHVEQNLKDNLEEMSDEVKNKESFNKNKESFNKAMDKGVESLKEKAKDLPKNMLDPKANQTPPNPTPSNKEPL |
9 | Streptococcus_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1296610 : 1303166
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >AP017632|1296610:1303166|DBSCAN-SWA CATGCAAACCTTGTTTAAAGAAATTACCCCTAAACGCTATGTCAATGGCAATGAGATGAAAGAAAATTCTAGCAATGTCCTAGATCAGTATTTCACTAAGCCTAGTGTGGCTTTAAAGTGCTTTCAAAAAGCTTGTGAAGTGATTAAAAAATACGAAAATCCAGATGGCTTTATTTTTTTAGAGCCAAGTGCAGGCGATGGGGTGTTTTATGACTTGTTTCCTAAAAATAGGCGCATTGGTATAGACATTGAACCCAAAAGAGATGGATTTATTCCATGCGATTTTGTGAATTACCCAACCGCTAAAGCGATTGGGCTTTTTCTTGCTTCATAGCTCCATAACTAGCTAGATCCAATATGTTTCCATATTTAGAACTAACCCCGTTAGAGGAAGCTCCACAAGCTTTGACACACTCATTAGTGTGATGAGTGTAATCGCTTCGGATAATCCCTACCCTAGCTTTATCTGTCTTTACTTTATGCCTATCATCTAGCATGCCTAAAGCGTAGTTTCTGATATTGACGCTCGCATTATAATCTCTGTGGTGTGTGGTTTTACAATGAGGACAAGTGAATTTAGTGATGCTTTCATGTTTTTTGCCTGTATTGACCCCACAATAAGAACATAATTGAGAGCTAGGGAAAAATCTGTCTATGCCTAATAGGGTTTTGCCTTTTCTTTGGGCTTTGTATTCCAACATAGTAAGGAATTTCCCCCAACTCGCATTAGCAAGGCTTTTAGAATGATAGGTTTTCATAAGAGCTTTAATATTCAAAGTTTCTACTCCTATCAAATCGTATTGATTGGTTATCTCATTACTGATTTTATGCAAGTAGTCATCTCTAGTGTTTGAACAAGCTAAATGCAATCTGGATACCTTTTTAGCTTGTTTTTTCCTGTTGTTGGAACCTTTTACTTTTTTACTTAACCTCCTTTGCGCTTTAGTGAGTTTCTTTTCTAATTTTTGATAAAAGCGAATGTGTGGGTATTCTATTTTATCGCTTGTAACAATGAGCGTTCTTAAGCCCATGTCTAAACCTACCGCTTTTTTGATAATGGTGGGGTTAGGGATAGGCTCTTTAGTTTCATAGGATAGAGAACAAAAATATTGATCCGCTATGCAAGAAATAAAAGCCTGTTTGATAACGCTATCTTTAGGCAAGTCTCTGTGTAATTTAGCCTTAATGCCCTCTTTGAATTTAGGGAGAGCGATGGTTTGAGTTTCTGTTTTGATTTCTATGTTTTGAGGGATTGCAAAAGATTGTTTAGCGTTTTTCTTGGATTTGAATTTAGGGTATCTCGCTCTTTTACTGAAGAAATTATCATAAGCGCTCACCAGCTGTCTTAACGCCATTTGCAAGCTTTGAGAATTGCATTCATTGAGATAATGGTATTTTTCTTGCCGCTTGATTTGGGTTAAGACTTTTTGCATGGTGAAGTAAGTTTCTTTAATGCCTTTTGCGTATTGCTTTTGCCGGTAATCTAAAAAGTAGTTATACACGACTCTAGAACAGCCAAAATGTTTAGAAATCAATTCTTTTTGTTGGGCGTTAGGATAAATTCTAAACTTGATAGCGTTAAGCAAAAATAACTCCTTATCTTTATCTTGTATTATTATACAATGTTTTTATAAATAATGAATAAGGATAGAGGAATGAGGAAAAACCATTATCCATTAAGGGGGTATATTCCAACCAACAGAAGTAAGCATAATCTAAAAGCCCATTTGATTTTAGTGTGTAAATACAGAAAAAAGTTATTGCAAGGGGATTTGAATAACTTTATTAAGTCTGTTATAGATGAGATAGCCACCCAAAGCAATCTCATTATCATTGCGATGGAAAGCGATATAGATCATTTGCACTTAATGGTTCAATATATCCCTAGAATGTCTATTAGTTCCATTATTGCTAAAATCAAACAAATCACTACTTATAGAGTTTGGCGCGATAAAAGATTTATCCCCTTATTGCAAAAACACTTTTGGAAAGAAAAAACTTTTTGGACTGATGGATTTTTTGCTTGCTCTATCGGTGAGGCTAACCCTGAAACGATCAAGGCGTATATAGAAAATCAAGGTTAGTTTTACTTAAGGTTTTTATAGTTCCTAGCGGAACTAAAGCATTCATCCCAAACACTAAAGATATTTGGGATTTCTGCTTGGGTGGTTTAAATTATAAACTGCCTACGCATCAAAAAGTGATTTGCTTGGGCAACCCTCCTTTTGGGCATCGTGGGGTTATGGCGTTAGAATTTATCAACCATGCTAAAAGTTGTGATTTTGTGTGTTTTATCCTACCCATGTTCTTTGAAAGTCAAGGAAAAGGCTCTATTAAATATCGTGTGAAAGGTTTGAATCTGCTTTATAGCGAACGCTTAGAAAAAAATGCGTTTATAGATTTTAAAAATAAAGAAGTGGATGTGCATTGCGTGTTCCAAATTTGGAGCAAGAAGTATCAAAACAAAAAAAGTGAATTTTCTTGGTATAAGAATCGCCATAAAGAACCCTTTGGCGAGTATATCAAGGTTTTCACGGTTTCATTAGCTAAAAACAGAGAATGCGGTAAAGAGTGGATTTTTAATCAAAAAGCGTCTTTTTACATTTCATCAACTTTTTATAAAAGCACACAAATTGTAGAGAACTTTGAGGAAGTTAAGTATCAATCTGGTATTGCTGTGGTATTTACTAGCACTAACAAGGCTTTAAACGCTAAATTAAAAAAACTATTCCAAGAAATTGATTGGACAAAATACGCAAGTTTAGCGACTAATTCTTGCTATCATTTAGGAAAAAGTCATATTTTTCAAGCCTTATATGATCATTTGGATAGCTTAAAGGATAATTGATGGACTTAGAACAAACTTTTTTGAAAATTATTGAAAAAAAACATAAAGAATTGAATTTAGGGCAAGACTACAACGCTATTTTTTCAAAAATTAGAGATTTTGAAGCCAACGCTATAGGGCAGATTGGCGAAGAGTTTTTAAAAAATGTGCTTAACGCTATAGATGAAGTGATCAATGATGGCATTATTCATGATGAATACGATATTATGACAAAAAGCGGTGTATCCTTTGAAGTTAAAACAGCACAAAAAGGCAGAACTAACAACACTTTTTTAGTTCAATGGTATAAACCCACGATACAACTATGATTTTTTGGTTTGCTTAGGAGTGTGCGAAGACAAATTGCTTTATAGAATTTTTAAAAAAGATGGAATCCATTACATTCATAAAGAAAGAAAATACTTTATGAAACAAAATGAGTTTAAAAAGCAACTAGTGCCAATGAATCCTGATAATCAAGTCAATTATAAACTCACTCTCAATATTAAAGAATTGAAAGAAATTACAAACCTCATCAAAGAGTTAAAAAGGGTTTTAGGGTTAGATTAATATTTTTAGATAGAATTGGGTGGAATAAAATGTTTTTAGGAATAGAGTTTGCTTATCTTGTCTTTAAGAAAGTCCAATGAAGTGGAGGATAAGATGTCTAAGATTTCAAATAATTATAACCCGTCTTTGATGGTAAGGGATTACCACAGGGTTGGTTCGCGCACAAGAAAAGAAGAAAATAAGGAAATTCAAAATCTTTCAGAGAATGATGAAAAAATCAAATTAGCCAAACAAGCTAAGCATGATAACCTAGCCATAGGGGATTTAGAAAGTCGCCTTAAAAGCTTAAAAGGCATGGATAAAGACGCTAAAGAATTGGTGGGGATTTCTAAAGCTTACGCTCACAATAATGAAAAAGATCGAAGCGATTTTGAGCATTTTAAAAGCCGTTTGGACAAAGCGATTGATTCTTTCAACCAAAAATCAGGCAATGATAGTTTGAAACTCCCTGGCAATATTGACATTGACGACACGAAGGCTTTGGAAAAATTTTCAAAATCATTAGAAAGTGAGAAAGAAAACATTCAAAACTCTTTGCACCAGTGGAAAAAACAGCTCGCTGAAACGAATCATTTAAACAAGGAATACAACACCTTAGATAAAACAAGACTGAACGCTCAAAAATTCCAAGATGTCCATGACACAAGCAAGATCACCCCATCTCGCTTGCAAGACTTGCTCGCTTGAAAGAGTTTGCTTATAGCGAGCCTTGTTTAGACGAAGAAGATAAAAAGGCTGTTTTAGAGGTTTTAAATTCCAAACAGCTCACGCAAGGCAAACGCTCTCTTTTGTTTGAAGAAGCTTTGTGCGAGTTTCTGGGCGTTAAGCATGCGTTAGTGTTTAACAGCGCGACTTCAGCCCTTTTAACGCTCTATAGGAATTTTAGCGATTTTGACGCTGATTGTAATGAAATAATCACCACCCCTATAAGCTTTGTAGCGACGGCTAACATGCTTTTAGAAAGCAGTTACAAACCCGTATTTGCTGAAGTCAAAAACGATGGCAATATAGATGAATTAGCCCTAGAAAAGCTCATTACTAAAAAAACCAAAGCCATAGTGAGCGTGGATTATGCCGGTAAAAGCGTGGAAGTAGGAAGCATTCAAAAGCTTTGCAAAAAACATTCTTTGAGTTTTCTTTCTGACAGCTCGCATGCTTTAGGGAGCGAGTATCAAAACAAAAAAGTAGGAGGCTTTGCGTTAGCGAGCGTGTTTAGTTTCCATGCCATTAAGCCTATCACTACGGCTGAAGGGGGAGCGGTCGTTACTAATAATAGCGAATTGTATGAAAAAATGAAATTGTTTCGCTCTCATGGCATGCTCAAAAAAGATTTTTTTGAAGGCGAAGTCAAAAGCATAGGGCATAACTTCCGCTTGAATGAAATCCAAAGCGCTTTGGGTTTGAGCCAGCTTAAAAAAGCCCCCTTTTTAATGCAAAAAAGAGAAGAAGCCGCTCTAACCTATGACAGGATTTTTAAAGATAACCCTTATTTCACCCCTTTACACCCCTTGTTAAAAGATAAAAGCTCTAACCACCTTTACCCTATTTTAATGCACCAAAAATTTTTTGCATGCAAAAAACTCATTTTAGAAAATTTGCACAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >AP017632|1296610:1303166|1299769_1300006_+|BBI23180.1|DBSCAN-SWA MVCLGVCEDKLLYRIFKKDGIHYIHKERKYFMKQNEFKKQLVPMNPDNQVNYKLTLNIKELKEITNLIKELKRVLGLD >AP017632|1296610:1303166|1300054_1300693_+|BBI23181.1|DBSCAN-SWA MLILSLRKSNEVEDKMSKISNNYNPSLMVRDYHRVGSRTRKEENKEIQNLSENDEKIKLAKQAKHDNLAIGDLESRLKSLKGMDKDAKELVGISKAYAHNNEKDRSDFEHFKSRLDKAIDSFNQKSGNDSLKLPGNIDIDDTKALEKFSKSLESEKENIQNSLHQWKKQLAETNHLNKEYNTLDKTRLNAQKFQDVHDTSKITPSRLQDLLA >AP017632|1296610:1303166|1296610_1296943_+|BBI23175.1|DBSCAN-SWA MQTLFKEITPKRYVNGNEMKENSSNVLDQYFTKPSVALKCFQKACEVIKKYENPDGFIFLEPSAGDGVFYDLFPKNRRIGIDIEPKRDGFIPCDFVNYPTAKAIGLFLAS >AP017632|1296610:1303166|1296911_1298195_-|BBI23176.1|transposase|DBSCAN-SWA MLNAIKFRIYPNAQQKELISKHFGCSRVVYNYFLDYRQKQYAKGIKETYFTMQKVLTQIKRQEKYHYLNECNSQSLQMALRQLVSAYDNFFSKRARYPKFKSKKNAKQSFAIPQNIEIKTETQTIALPKFKEGIKAKLHRDLPKDSVIKQAFISCIADQYFCSLSYETKEPIPNPTIIKKAVGLDMGLRTLIVTSDKIEYPHIRFYQKLEKKLTKAQRRLSKKVKGSNNRKKQAKKVSRLHLACSNTRDDYLHKISNEITNQYDLIGVETLNIKALMKTYHSKSLANASWGKFLTMLEYKAQRKGKTLLGIDRFFPSSQLCSYCGVNTGKKHESITKFTCPHCKTTHHRDYNASVNIRNYALGMLDDRHKVKTDKARVGIIRSDYTHHTNECVKACGASSNGVSSKYGNILDLASYGAMKQEKAQSL >AP017632|1296610:1303166|1302140_1303166_+|BBI23183.1|DBSCAN-SWA MEVSRKKIYNPNSTESVNERKIFGGNPTSMFDLNKIKYQWADHLWKTMLANTWFAEEVSMNDDKRDYLKLSAEEKIGYDRALAQLIFMDSLQTNNLIDNINPFITSPEINLCLVRQAYEEALHSHAYAVMVESISANTEEIYDMWRNDMQLKSKNDYIAQVYMELAKNPTEENILKALFANQILEGIYFYSGFSYFYTLARSGKMLGSAQMIRFIQRDEVTHLILFQNMINALRNERADLFTPQLINEVIGMFKKAVEIEALWGDYITQGKILGLTSSLIEQYIQFLADSRLSKVGIAKVYGVQHPIKWVESFSSFNEQRSNFFEARVSNYAKGSVSFDDF >AP017632|1296610:1303166|1300689_1301817_+|BBI23182.1|DBSCAN-SWA MKEFAYSEPCLDEEDKKAVLEVLNSKQLTQGKRSLLFEEALCEFLGVKHALVFNSATSALLTLYRNFSDFDADCNEIITTPISFVATANMLLESSYKPVFAEVKNDGNIDELALEKLITKKTKAIVSVDYAGKSVEVGSIQKLCKKHSLSFLSDSSHALGSEYQNKKVGGFALASVFSFHAIKPITTAEGGAVVTNNSELYEKMKLFRSHGMLKKDFFEGEVKSIGHNFRLNEIQSALGLSQLKKAPFLMQKREEAALTYDRIFKDNPYFTPLHPLLKDKSSNHLYPILMHQKFFACKKLILENLHKRGILAQVHYKPIYQYQLYQQLFNTAPLKSAEDFYNAEISLPCHANLNLESVQNIAHGVLKTFENLKIE >AP017632|1296610:1303166|1298770_1299457_+|BBI23178.1|DBSCAN-SWA MGGLNYKLPTHQKVICLGNPPFGHRGVMALEFINHAKSCDFVCFILPMFFESQGKGSIKYRVKGLNLLYSERLEKNAFIDFKNKEVDVHCVFQIWSKKYQNKKSEFSWYKNRHKEPFGEYIKVFTVSLAKNRECGKEWIFNQKASFYISSTFYKSTQIVENFEEVKYQSGIAVVFTSTNKALNAKLKKLFQEIDWTKYASLATNSCYHLGKSHIFQALYDHLDSLKDN >AP017632|1296610:1303166|1299456_1299765_+|BBI23179.1|DBSCAN-SWA MDLEQTFLKIIEKKHKELNLGQDYNAIFSKIRDFEANAIGQIGEEFLKNVLNAIDEVINDGIIHDEYDIMTKSGVSFEVKTAQKGRTNNTFLVQWYKPTIQL >AP017632|1296610:1303166|1298264_1298693_+|BBI23177.1|transposase|DBSCAN-SWA MRKNHYPLRGYIPTNRSKHNLKAHLILVCKYRKKLLQGDLNNFIKSVIDEIATQSNLIIIAMESDIDHLHLMVQYIPRMSISSIIAKIKQITTYRVWRDKRFIPLLQKHFWKEKTFWTDGFFACSIGEANPETIKAYIENQG |
9 | Aureococcus_anophage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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