Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026505 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A chromosome, complete genome | 0 crisprs | DinG,DEDDh,cas3,csa3,WYL | 0 | 0 | 12 | 0 |
CP026508 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed3, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 1 | 0 | 0 |
CP026506 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed1, complete sequence | 0 crisprs | csa3 | 0 | 0 | 1 | 0 |
CP026507 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP026510 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP026509 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026508_1 | 5567-5676 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP026508_1
|
1 spacers
spacers of CP026508_1
>1.1|5601|42|CP026508|CRISPRCasFinder ATTTCATCAGGTTGTCTAAGGTTATTCAACCAACTAGACTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP026508_1
The CRISPR arrays of CP026508_1 >merge|CP026508|1|5567-5676|CRISPRCasFinder TCTAGATTATTCTTTCTAGATTGTATCAATAGACATTTCATCAGGTTGTCTAAGGTTATTCAACCAACTAGACTATTCTAGGTTATTCTTTCTAGATTGTATCAATAGAC >CP026508|1|1|5567-5676|CRISPRCasFinder TCTAGATTATTCTTTCTAGATTGTATCAATAGAC ATTTCATCAGGTTGTCTAAGGTTATTCAACCAACTAGACTAT TCTAGGTTATTCTTTCTAGATTGTATCAATAGAC
>CP026508.1|QBJ57329.1|3858_4857_-|IS30-family-transposase MSPYTHLTLKDRECILLGVTLHHTYQVIADQIGCSKATVSREIKRNGGRGAYSAVKAQQNYQQRRLKSRRLRVLENLKLRDFVLHCILQRQWSPEQIAGRLSLENSNWHISYNTIYRGIERNNLGVKRKSHGARGFARKLRHRGKTRKVKGTVNERRGRFNNVPSVHERPVSCENRTRFGHWEGDTVRGKIGRSGLVSLVDRKSRYLLSERVPKVNAKNVTQAMIDLLHTVTPKRVRTLTPDRGTEFAGYREVGKELGISVYFPDPHAPQQRGTNENTNGLIREYFPKGTDLDELTDQDIAKFVRDLNNRPRKVLVWKTPSEVFFGKKLHLI >CP026508.1|QBJ57328.1|3196_3754_+|DUF1541-domain-containing-protein MKKLVRYVCAVVAMLFLVAGCSSNSTQKEGSSTHSHSSEKTEMHEHTGSKKVHGLKKAEQPKYKAGTKVKLTADHMKGMKDANATIVNAYGSKLYAVDYKSTSDKKMVKDHKWVTINEIEGNRKEYKKGDKVTLKADHMAGMKNSSATIVEIQKGPAYMVNYQPTNGGKQVTNHKWVAEDEIEKR >CP026508.1|QBJ57327.1|2802_3015_+|hypothetical-protein MVNTILKEADLFCPNSVRINFTIYLLIIFPGNIIGGTILYAVTALVMTDPTQGDHSDDGDSVIKGEFREK >CP026508.1|QBJ57326.1|0_1740_-|pyruvate-oxidase MAQKASEQLVDVLIDWHVKHVYGLPGDSIDTTVDALRKQQDQIGFVQVRHEEVASLAAAAEAKLTGKLGVCLSIGGPGAIHILNGLYDAKMDHVPVLALLGQVDTQFLNEEYFQEVNTPQLFADVAVYNKLISATDNLAEIVDEAIRTAYEKHGVAVLTIPDNLPEQRVSDHYISSASSFQLTSPQIDDNRLNTAAKLIRDSKKPLALVGLGAKKAGSQVAAFLEQNHIPFISTLPAKGIIGDNHPNSLGNVGKLGTKPAYEAMQNTDLLLMFGTNYPYTAYLPKPGRAKSIQINTSASAIGKRYPADVGLVADIKDVIKQLNSSETTILHPDDGFLKACQENVANWNRWMTGKRELDSKPVAPEALFNDINETAPHNTIYSIDVGTATSWSARFLNVSPTQKFILSSYLGTMGCALPGAIAAKINYPDRPVISVNGDGAFAMVMQDFITAVKYKLPLINIVLNNSKLAFIEYEQQAAGQLNYQIDLQDMDYAKFADAAGGVGITAKTSEEFKNALNRAYRVQNMPVLINAYVSDDAPLPGKIVGQEAKGYMKFGSQYLKEEKKIPELPPLKDILRQFF >CP026508.1|QBJ57330.1|6585_6828_-|hypothetical-protein MLGSLLQLLGLSRWYHHEQHADKSNARKASGQSAFSYQDLKGLRKLAFWLFVISVFMNWGMFGAIMLIAWIAMWAVSLLF >CP026508.1|QBJ57331.1|7079_7313_-|hypothetical-protein MADDFLNKLAQQANQQLGDNESPFKQKKEVTRPVQVRESTYKMVKDIAYHKDAKIVDVIDSMLKYAINSDEFSENNK >CP026508.1|QBJ57332.1|7305_8094_-|ATPase MTCKTLLHFNFKGGVGKTTLSVMDTYLLGELGHKVLLIDLDPQANATEIMRTTYNVKTEPNVDLFNGLLKLDLTHSIIELTDNVSMIPADWSLSLWPGKVEKIRNHDRMLILKTLIEQFKSQFEYIIIDVPPTLSIFTNNAILASDYVSLVLQTQKQAYTSVLKTAQYMYQLKNDYHATFDVSGVILYLVKRDAKVDREITKAATESFGDAVFINRIWQQERVKLFSNAGIKDEDYWDKKAISMYTMVLKEELHRIEEINNG >CP026508.1|QBJ57333.1|8648_9647_-|IS30-family-transposase MSPYTHLTLKDRECILLGVTLHHTYQVIADQIGCSKATVSREIKRNGGRGAYSAVKAQQNYQQRRLKSRRLRVLENLKLRDFVLHCILQRQWSPEQIAGRLSLENSNWHISYNTIYRGIERNNLGVKRKSHGARGFARKLRHRGKTRKVKGTVNERRGRFNNVPSVHERPVSCENRTRFGHWEGDTVRGKIGRSGLVSLVDRKSRYLLSERVPKVNAKNVTQAMIDLLHTVTPKRVRTLTPDRGTEFAGYREVGKELGISVYFPDPHAPQQRGTNENTNGLIREYFPKGTDLDELTDQDIAKFVRDLNNRPRKVLVWKTPSEVFFGKKLHLI >CP026508.1|QBJ57334.1|10273_10651_+|hypothetical-protein MIYDISVITMLALFLFSFVVLIRWILKKFFKINIPNLSRIRIVVVSLLSGLLIVGLGYQFRTSAQKRMDEQSESKAAIESSKKAKTKKPKQQYKNIETIFNMHSIKYLSKNVFRIFSRVFAGRLS >CP026508.1|QBJ57335.1|10610_11410_-|IS5/IS1182-family-transposase MKSFAHHYSSDISREQFELIRTDLEGIRKRTKPRKVDLYDIFCALLYTLKNGCVWRDLPSDFPKWETVYYYWLLWTKTPSPAGITPLDKVFKKIVSQHRLAQKRSVYTSFIILDAQSVKNTDPAESSGYDGGKKVSGIKRHLAVDINGLPMAVHVTTANVSERDGANALLALNKSQFDLVQRVMADGGYTGNNFAQSVQAMINAEVIIAKQSDLRHGQVTPQRWVIERSFSWLGKYRRLWRNCERKLNTSKMMISLAFLRILLKRF >CP026508.1|QBJ57336.1|11384_11687_-|plasmid-mobilization-relaxosome-protein-MobC MANIKANSDKQTKRINFRLNELEYEKLSQSASTYGLTVSSYAKQLALKSNLRKPYFSASDTQQIILELRTCLDTLTFDLILVKLDQKQEFLIHEKLCTPL >CP026508.1|QBJ57337.1|12053_12383_-|hypothetical-protein MNELEKIEQLEKQLKARKREALKKGYEKLGRKFYKKTGAKNITTAENMLDHTPVFEKRETASPTLTTEQFQQLQNIANAMTYNGNFWKIEDLKDVSQWLSQFRTENEQS >CP026508.1|QBJ57338.1|12385_13312_-|replication-initiation-protein MSNELVKYQPELNTIPLRKFTPTEMNLFFSIVSRMRDKGDQTVRFSFEQLKELSNYKPTANRRFIDDIKRTYDHLMDLRFGSQSKSGLSFTRFVMFTKFQINGDADEPYVDVEVYRDAIPLLNNLESWVRYALTEFRDLKSSYAKTMFRLLKGYRTTGYAYFSKNDFFELLAIPVSYSTKMANVDSKVLAPIKEELTPFFRGLTIRKKYGKGRGKPVIGYAFAWKAERKDAEDVHVSKTERLKTAKFNIEHNGELSDKEKWRAIDKIKGLKLGTTEAEHNKQEQAKREEQIRADERKKTLEELRKGWH >CP026508.1|QBJ57339.1|14348_14792_+|hypothetical-protein MSTISSDTKFLGNGKWVNQDTGEMIEVNEVVKRVPRSGFEITYLTYFMDLFDKLGGQKYQVFKYIIENRSRDNNTLVTTNKELSRLTKTSTKTVQDTINLLKEAGLIERRMGAIMLNPKLVHRGSNQKEKYLLQRFEAFDQADSTEK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP026508_1 | 1.1|5601|42|CP026508|CRISPRCasFinder | 5601-5642 | 42 | NZ_CP026508 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed3, complete sequence | 5601-5642 | 0 | 1.0 |
CP026508_1 | 1.1|5601|42|CP026508|CRISPRCasFinder | 5601-5642 | 42 | NZ_CP023494 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed4, complete sequence | 19689-19730 | 0 | 1.0 |
1. spacer 1.1|5601|42|CP026508|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026508 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed3, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atttcatcaggttgtctaaggttattcaaccaactagactat CRISPR spacer atttcatcaggttgtctaaggttattcaaccaactagactat Protospacer ******************************************
2. spacer 1.1|5601|42|CP026508|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023494 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed4, complete sequence) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
atttcatcaggttgtctaaggttattcaaccaactagactat CRISPR spacer atttcatcaggttgtctaaggttattcaaccaactagactat Protospacer ******************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
49314 : 57927
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026505|49314:57927|DBSCAN-SWA CATGTATCGGGCACTATATCGGGTTTGGCGTCCCCAACGCTTTGATGAGATTGTCGGGCAACAGATGATTACCCAGACACTAAAAAATGCCATTATGACCCACCAGACGAGTCATGCGTATCTGTTTACCGGTCCCCGGGGAACTGGGAAAACGTCGGCAGCGAAGATTTTTGCCAAGGCAATCAACTGTCACCATCTTGTTGATGGGGAACCTTGCAATGAATGTGAGACTTGTACGGCGATTACCAAGGGGCAACTAAATGATGTCATCGAAATTGATGCGGCTTCTAATAATGGTGTGGAAGAGATTCGTGATATTCGGGACAAAGCGAAGTATGCCCCAACGCAAGCGGACTATAAAGTCTACATTATTGATGAAGTTCATATGTTATCGACTGGCGCGTTTAATGCGTTGCTCAAAACGCTAGAAGAACCCCCGGCTAACGTTATATTTATCTTAGCGACAACGGAGCCCCATAAGATTCCATTAACGATTATTTCACGGACGCAACGGTTTGATTTTCGGCGGATTACGGCTAAGGATAGCTACGATCGAATGGTGTACATCCTCAATGAGAAGGATGTGACCTATGATGAAAAAGCGCTACGCGTCATTGCAGCGGCTGCTGAAGGTGGAATGCGGGATGCTTTAAGTATTCTGGATCAAGTAATTTCGTTTGGGGATAACACGGTTACGTTGGATGATGCGTTAATGGTGACGGGAAGTGTGACCAAGCAGTTGCTGGCTAACTATGTCAGTGAGGTCACCGACCATGATACGAAGCCGGCACTAGAGACGATGCGACAAATCTTACAAGAAGGTAAAGATGCGAACCGTTTCATTGAAGATTTGATCAGTTATACGCGTGACGTGTTACTCTATCAACAGGCCCCTGAAATGGTCGATAGTGTGGCGATGGGCGAGGATGATCAACAATTTGAAGCATTTGCCAAGCAAATCGATGCTGAAGTCCTGTACCAAATGGTCAAGACGTTGAACGATATTCAACAACAAATGCGGTTCACGACGCACCCCGACGTTTATTTAGAAGTGTTGACGGTCAAGCTAGCTCAGTTGGATGGTCAAGCGGCCGTTCAACCGGTAGCTGCGGCAACGGTCAATCCTGAAGATCCCACTGTGCATAAACTGGCACAACAAGTTGAACAGTTGCAAAGCGAGGTCAAAACGTTACGTTCTCAAGGTGGTAGTGTCACTAAACCTGCACCGGCTAAGCCGCGGTCGAGTAATGGCCCGGTTGTTAAGAAGGTTAATGTCAGTCAGATTTATCCTATTCTGGGAGCGGCAACGAAGAATGATCTCATTAAGGTGCGCGATGTTTGGACTGATTTGATGAATATTTTGAGTGTGACGCAACGGGCCCTAATGCACGTGGCCCAACCAGTTGCGGCCAGTTCAGAAGGTGTTGTGGTTGCGTTTGACTATGCGTTTGTTTATCAAAAAGCGATTGATGACCAGACCTTGATCGATGCACTCGGAAATGGTTTGGATCGGCTGATGGGACAGGCACCCAAGATTGTCTGTGTGCCTAAAGAACAGTGGCCACAAATTCGTAAGGATTATTTGGCCACTCACCAGCCAGGAGGTGCAACATCAGAGCAACAAGCACCGGCCAAAGAACCGGTCGTTGAAGAAGCTAAGAATATGTTCGGTGATTTAGTTGAAGTACAGCCGGACTAAAGACGAAAGGAACTGATAATTATGATGCGTGGAATGGGCAATATGCAAAGTATGATGAAACAAATGAAGAAGATGCAGGCGCAAATGACAGCCGAACAAGCGGCTTTAAATGAACAAACCTTCACGGGTGCGGCGCCAGACGACATGGTCAAAGTCACTTTTACTGGTGATAAGAAGATGAAGGATATTACGATTAACCCTGATGCTGTTGATCCTGATGATGTGGATATGTTACAGGACTTAGTCGTTGTTGCGGTGAACGACGCGTTGACTAAGGTCGATGAACAGACACAAAGTACGATGGGAAAATATACTAAGGGATTACAGTAAAAACGAGGTAAGTACATGCAGTATCCAGAACCAATTGCTAAGTTGATTGATAGTTATATGAAGTTGCCCGGCATTGGTGGCAAGACTGCGACGCGGCTGGCGTTTTATACAATTGATATGAACGGTGATGACGTCACCGAGTTCGCTAAGTCGCTGATTGCGGCCAAACGGGACCTGCATTTTTGTAGTATTTGCGGTAATATCACCGAAGATGATCCGTGTGTGATTTGTAAGGATAAGTCGCGTGATCAAAGCACCGTTCTGGTTGTTGAAGAGGCCAAGGATGTCATGGCAATGGAAAAGATTAAGGAATACAACGGGCTGTATCACGTCTTACATGGGGTATTGTCACCCATTGATGGCAAAGGTCCGGAAGATATCAACATTGCCAGTTTATTGAAACGGCTACAGCAAAATGAAGCCATCAAGGAAGTCATTATTGCCACCAACGCTACGCCTGAAGGTGAAGCAACAGCGATGTACATCTCGCGGTTAGTTAAGCCGGCGGGAATCAAAGTGACCCGATTGGCGCACGGCTTGTCGGTTGGTAGTGATATTCAATATGCGGATGAAATGACCTTATTTAAAGCAGTTGAAGGTCGCCAAGAAATGTAATTGGAGGTGCCACCATGTTTAAACGTAAACAGAAGATCAAGCATCCCAAGGAAGTTTTTGATGAACAGTTGTTGTCGACCCTGAATGCCGCTAAGTTGGACTGGGACCGTGCGAAGCAGAACCAAGAAGCGGTCTATGATAATAATACGAGTGAACTAGTTACGCAGACCGCCTTAGCGCGTGCTAAGTATTTATATCTGTATCGTGAAGCACGTTTACGTCAAGTTCATGGGCAGACGATTCAGCGCTCGGTCATTGATAAATAGACTGTTAGTGATTTAAGAGATAACTTGTTTCAAAATAAAGACGCACGTCGTTGATTTTTGTAAATCTATGGCGTGCGTCTTTTGATTTAGAACCCTAGCATTATTTTACCAGTTAATCTGTCATGCATTGTGATTAAGACATGCTAGGTGCGGCAATTGGAATCTACTAATGAATAACAAACTAAAATCGGTATTTATCAATCGTGGGTAGTACTACCTAATAACTTTTTAGCAATTCACCGAATAAATTATCAAAACCACAATTGGTAGTAGCTATCGTCCCTAAAATCGGTCAAAAAATACCCTCACTAGTGGCAACCGGATTAGACAGGCCTTCCAAAATCAAGTACAATTGCTACATATAAGAAAATAGATGGGATTGGGAATGTTGACAGGAAAATTAGTTACTTTTGAAGGGCCAGACGGTGCCGGCAAAACGTCAGCTTTAAACGCGATTGTGGCCAAATTACAGCCACAATTAGGGGATCGCTTAGTTGTGACGCGTGAACCGGGCGGGAATCAAATCTCAGAAGCAATTCGAAAAATCATTTTAGACCGTCATAATACGGCGATGGACGACCGTACGGAAGCGTTACTCTATGCGGCAGCACGGCGACAACATATCGTCCAAACCATTCAACCAGCATTGCAGAACGACCAACTTGTCTTGTGTGATCGCTACATCGATAGCTCGGTCGCTTATCAGGGGGCCGGTCGTGGTATTGGAGAACAAGCGGTTTATGATATGAATCAGTTCGCGACCGCGGGGCTAACCGCAGATTTAACGTTGTATTTTGACGTAGATGCTGCCGTTGGATTAAACCGCATTCAACAACATCGCCAAAATGAAATTAATCGCTTGGACGTGGAAGCCTTAAGTTTCCATCACCGGGTGCAAGCAGCGTATTTGAGATTACTGGCTGATCATCCTGACCGTATCAAGCGCGTCGATGCAAGTCAGCCATTGGACCAAGTTGTGACGCAGGCCTTAGAGATTATGGCGTCACAGTTACCGACTTATGTGGCATCCAAGGGAGGGGAAGACCAATGAAATTAATTATTGCAATCGTTCAAGATAAGGACAGTAACCGGTTGAGCAGCCAGTTCATTGAAGCCAATGTTCGGGCCACGAAGCTCTCAACGACGGGAGGCTTCCTACGTTCAGGTAATACCACTTTTATGATCGGTATTGATGATGACCGTGTGGATGAAGTTTTAGCCATGATTAAAGAAACGAGTCATGCGCGGGAACAGTTTATGACACCACCAGTCAATCTAGACGTGACGATGGATGGCGCAGCTGCCTATCCAGTTGAAGTTCAAGTCGGTGGCGCCACGGTCTTTGTTCTACCAATTGAACAATTTCACCAATTTTAATGAAGGATGATTATTAATGGCAACAACCGAGTCATTTGCGCAAACGTTAGCGGCGAAACAGCCCCGCTTATTAGCGGCATTTAAACACATCATCGCCCAGAACCATCTGGCCCACGCGTACTTATTCGCGGGGATGGAAGGCGCTGGACAACCAGAACTGGCCCATTGGATTGCGCAACGGTTGTTCTGCCTGCATATTAATGATGGTGAACCAGATGGCACTTGTGAGGAGTGCGTCCGGATTGCTAATGGGTCGCACCCTGATATTGTGACAGTGGCTCCCGAGGGTCAGCGAATTCACGTTGATCAGGTTCGTTACTTAAAAGCTGAATTCTCTAAGAGTGCGGTCGAAGGTAACCGGAAACTGTTCATCATTAATGATGCGGAGAAGATGACAGCGAGTGCTGCCAATAGCTTATTGAAGTTTATTGAGGAGCCAAGTGGTAACGTCACGGCCTTGTTATTAACGACTAATAAGCAACTGATGCTACCAACGATTATTTCACGAACCCAGGTGATCGAATTCCCACCATTAAATGCGCAGGCGTTACAGCAGACGTTTGAACAGGCCGGGATTGCGCCAAACCAAGCACAGATGTTACGGGGCCTGACAAATAGCGTGACCCAGGCGCAGGCGTTGCTAGCGGATGATTGGTTACCACAAGCTGCGCAAGCATTGTGGCGGTGGTTTGACCAGGCTGTTAAGGGTGACCCACGGAGTTTTGTGGCTGTGCAGGTCAATTTAGTTGGTTTGGCTAAGGACGCTGATCATCAGCTGGTTATGTTGGATTTAATTGCGGCCTTGTTCCAAGATCTATTGCAATTACATTTTGAGGTGGCAACGACAGCGTTAACCTTTGGTCAGTACCAAAAAGAATTGGCCGGGTTAACGGCTGAAGTCAGCGATGAGCAGTTGATTGCGGCGACAGAACTAGCTTTAACGGCCAAGCGCCAGCTAGCTAGCAATATTAGTTTTCAAAATGTCTTAGAAGGCTTAACGTTAAAGTTATGGCCGATTTTTCAAACAAACGCTTAAATAAAGGAAAACGAGGGTGAAGCGCGTGGATAAGCGTGATTTATACGATAGTTTCGGTGAGATGGAACAACAGATGCAACAAATGCTAGACAAAATGGCCAAGTTACGCGCCGATATGACAACGGTGTTAGAGAAAAACGCGGAATTGGTCATTGAAAATGAACATTTACGTGAACACATGGTCGAAATTGAAAATGAATTGCCGAAAAAAGCGGCTAGCACGACCACGCTCTCAAAGTCACGGCAAAACTTGGAAAAACTCTATGATGAGGGCTTCCACGTCTGCAACCAGTTTTACGGCAAACGGCGTGACGATGACGAATCCTGCGTTTTTTGTTTGGAAGTCATTTATGGTGAACGTGAACGCGCATAGTCGAAAAAGTCTGGGAGTAGTCCCAGACTTTTTGTGCTTTTCACCACGAGTCACTCATAGGAACAAGTCACGGTCGAGAGGATTGTTAGGAGGACGTTTTGGAAACACAACAAAGTTTTGCAGATCATGCGGGTATCGGGACCTTGTACTTAGTACCGACGCCAATTGGCAACTTACAGGATATGACTTATCGGGCAGTGGCGACGCTTAAAACGGTTGACCTAATTGCCGCAGAAGATACCCGGAATACCCAAAAGTTATTGAATCATTTTGAAATTACAACGAAACAAATTAGCTTTCATGAACATAACACCCAAGAACGGATTCCCCAGTTAATTGAAAAATTACAGACGGGCGTTAACTTAGCACAAGTTAGCGATGCGGGGATGCCGTCAATCAGTGATCCCGGCAAAGAACTTGTGGCAGCCTGCATTGCCGCGAATATTCCAGTCGTGCCACTACCAGGTGCCAATGCCGGCCTGACTGCGCTGATTGCTTCTGGCCTAGTGCCACAGCCATTTTATTTCTACGGCTTTTTACCGCGTAAGAAGAATGAACAAAAAGCTGATTTAGCTAAATTGGCTCGACGACATGAAACAGTGGTCTTGTACGAATCGCCATTCCGTGTTGCCAAGACCTTGACCCTCCTAGCGACCGTCTGTGAAGGGACGCGGCCAATTGTGGCGTGCCGGGAATTGACTAAGCGTTACGAGGAATTCGCGCGTGGAACCTTGGCTGAAATGGTGACGTGGGCGCAGGATCATCAGTTAAAGGGCGAATTTGTCCTTTTGATCGGTGGTAATCCGGATAAGGATGAACCAGAAACAACGGATGAATTGGCACAGTTGCCAGTCAAAGCCCAAGTCGAAGCGTTGATTGCAGCCGGAGATAAGCCCAACGTGGCCATTAAGACGATTGCGAAGCGACGAAATATTCCCCGGCAAAGCGTTTATAATCAATTTCATGAACTAAATACCAACGATGAGGAGTCTTGATGAATGGCAACTTTAGGCGCAAATGCGAGTCTTTACAGTGAACAGCACCGGATTACGTATTATGAATGTGACCGCACTGGTCGCGCAACCTTAACGACATTAATTGATATTGCCGTACTGGCATCAGAGGATCAAAGCGACGTCCTTGGTTTAACGACGGAAATGGTGCAAAGCCATGGTGTCGGTTGGGTCGTCACGCAATATGCCATCGATATTACACGGATGCCCCGCCAAGACGAAGTCGTTACGATTGCCGTTCGGGGTAGTGCTTATAATCCATATTTTGCTTACCGTGAATTTTGGATTCGGGATGCAGATGGTCAACAGTTGGCCTATATTACGAGTATCTGGGTCATGATGAGTCAAACGACCCGGCGAATCGTAAAAATTTTACCAGAACTGGTCGCGCCGTATCAGTCGGAAGTCGTCAAGCGCATTCCGCGCTTGCCACGACCGATTAGTTTTGAAGCGACCGATACAACGATTACGAAGCCGTACCATGTCCGCTTCTTTGACATTGATCCCAACCGGCATGTTAATAATGCACACTATTTTGATTGGCTCGTAGATACGCTACCCGCGACGTTCTTGCTTCAACATGATTTAGTTCACGTTGACGTTCGCTATGAAAATGAAGTCAAGTACGGGCAAACGGTGACTGCTCATGCGAACATCTTACCGAGCGAAGTGGCCGATCAGGTCACGACGAGTCATTTGATCGAAGTTGATGATGAGAAGTGTTGTGAGGTCACGATTCAATGGCGGACTTTACCAGAGCCGATTCAGTAATTTGCTGGGTTAGTATTTACACTAGTGTGTTAATGATGTGATCGTGAGCGACTTGGTCGATTAGAACGCACGTTTTTATTAGAGTCGCTGGCGATTCAGTATGCTATGATTAATACATCCGTACAGGGGAGGTTCATTATGTCAATTTTAGTTTTAGGGGGAGCTGGCTACATTGGTTCTCACATGGTCGACCGGTTAGTAGAACACGGTACGGACGTCGTGGTCGTTGATAATTTGGTCACGGGACACCGTGCTGCTGTTAATTCGGCGGCCAAGTTTTATCAGGGTGATTTGCGGGATGCGGATTTTTTGAATCACGTTTTTGATACTGAGGATATTGAAGCTGTCGTGCATTTTGCCGCCTTTTCAATCGTACCAGAATCAATGAGTAAGCCACTGAAGTACTTTGATAACAATACTGGTGGGATGATCACGTTACTTGAAACGATGCAGGCCCATAATGTGAAGCAAATCGTCTTCTCATCAACGGCCGCTACTTATGGGACACCTAAGCAGATTCCAATTAAAGAAACTGATCCACAGTTACCAATCAACCCGTATGGCGCTAGCAAGTTAATGATGGAACAGATTATGCACTGGGCGGACGTCGCCTATGGCATTAAGTTTGTCGCGTTACGTTACTTTAACGTTGCGGGTGCCAAGCCAGATGGCAGTATTGGCGAAGATCATGGCCCCGAAACACATCTGGTTCCAATCATTTTACAAGTTGCGCAAGGAAAACGCGATGAACTTAAAATCTTCGGTGATGACTATAATACGCCGGATGGGACGAATGTGCGTGACTATGTGCATGTTATCGACTTAGCTGATGCACACATCTTGGCTTTGAAGTACTTGGCTGCAGGAAATGACAGTAATGCCTTTAACCTGGGTTCTTCAACTGGTTTCTCTAACAAACAAATGTTAGCGGCTGCTCGTGAAGTTACCGGGCAACCAATTCCAGCTAAGTTAGCGCCACGGCGGCCTGGTGATCCAGACTCATTGGTTGCGGCGAGTGATAAGGCGCGTGACGTGCTAGGATGGCAACCAAATTATGACAATGTTAACGATATTATTGAAACAGCGTGGGCTTGGACGCAGAAGCATCCCAATGGCTACGATGATCGTGACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026505|49314:57927|53270_53600_+|QBJ54604.1|DBSCAN-SWA MKLIIAIVQDKDSNRLSSQFIEANVRATKLSTTGGFLRSGNTTFMIGIDDDRVDEVLAMIKETSHAREQFMTPPVNLDVTMDGAAAYPVEVQVGGATVFVLPIEQFHQF >CP026505|49314:57927|53616_54636_+|QBJ54605.1|DBSCAN-SWA MATTESFAQTLAAKQPRLLAAFKHIIAQNHLAHAYLFAGMEGAGQPELAHWIAQRLFCLHINDGEPDGTCEECVRIANGSHPDIVTVAPEGQRIHVDQVRYLKAEFSKSAVEGNRKLFIINDAEKMTASAANSLLKFIEEPSGNVTALLLTTNKQLMLPTIISRTQVIEFPPLNAQALQQTFEQAGIAPNQAQMLRGLTNSVTQAQALLADDWLPQAAQALWRWFDQAVKGDPRSFVAVQVNLVGLAKDADHQLVMLDLIAALFQDLLQLHFEVATTALTFGQYQKELAGLTAEVSDEQLIAATELALTAKRQLASNISFQNVLEGLTLKLWPIFQTNA >CP026505|49314:57927|54661_55009_+|QBJ54606.1|DBSCAN-SWA MDKRDLYDSFGEMEQQMQQMLDKMAKLRADMTTVLEKNAELVIENEHLREHMVEIENELPKKAASTTTLSKSRQNLEKLYDEGFHVCNQFYGKRRDDDESCVFCLEVIYGERERA >CP026505|49314:57927|51033_51342_+|QBJ54600.1|DBSCAN-SWA MMRGMGNMQSMMKQMKKMQAQMTAEQAALNEQTFTGAAPDDMVKVTFTGDKKMKDITINPDAVDPDDVDMLQDLVVVAVNDALTKVDEQTQSTMGKYTKGLQ >CP026505|49314:57927|52608_53274_+|QBJ54603.1|DBSCAN-SWA MLTGKLVTFEGPDGAGKTSALNAIVAKLQPQLGDRLVVTREPGGNQISEAIRKIILDRHNTAMDDRTEALLYAAARRQHIVQTIQPALQNDQLVLCDRYIDSSVAYQGAGRGIGEQAVYDMNQFATAGLTADLTLYFDVDAAVGLNRIQQHRQNEINRLDVEALSFHHRVQAAYLRLLADHPDRIKRVDASQPLDQVVTQALEIMASQLPTYVASKGGEDQ >CP026505|49314:57927|51971_52223_+|QBJ54602.1|DBSCAN-SWA MFKRKQKIKHPKEVFDEQLLSTLNAAKLDWDRAKQNQEAVYDNNTSELVTQTALARAKYLYLYREARLRQVHGQTIQRSVIDK >CP026505|49314:57927|56931_57927_+|QBJ54609.1|DBSCAN-SWA MSILVLGGAGYIGSHMVDRLVEHGTDVVVVDNLVTGHRAAVNSAAKFYQGDLRDADFLNHVFDTEDIEAVVHFAAFSIVPESMSKPLKYFDNNTGGMITLLETMQAHNVKQIVFSSTAATYGTPKQIPIKETDPQLPINPYGASKLMMEQIMHWADVAYGIKFVALRYFNVAGAKPDGSIGEDHGPETHLVPIILQVAQGKRDELKIFGDDYNTPDGTNVRDYVHVIDLADAHILALKYLAAGNDSNAFNLGSSTGFSNKQMLAAAREVTGQPIPAKLAPRRPGDPDSLVAASDKARDVLGWQPNYDNVNDIIETAWAWTQKHPNGYDDRD >CP026505|49314:57927|49314_51012_+|QBJ54599.1|DBSCAN-SWA MYRALYRVWRPQRFDEIVGQQMITQTLKNAIMTHQTSHAYLFTGPRGTGKTSAAKIFAKAINCHHLVDGEPCNECETCTAITKGQLNDVIEIDAASNNGVEEIRDIRDKAKYAPTQADYKVYIIDEVHMLSTGAFNALLKTLEEPPANVIFILATTEPHKIPLTIISRTQRFDFRRITAKDSYDRMVYILNEKDVTYDEKALRVIAAAAEGGMRDALSILDQVISFGDNTVTLDDALMVTGSVTKQLLANYVSEVTDHDTKPALETMRQILQEGKDANRFIEDLISYTRDVLLYQQAPEMVDSVAMGEDDQQFEAFAKQIDAEVLYQMVKTLNDIQQQMRFTTHPDVYLEVLTVKLAQLDGQAAVQPVAAATVNPEDPTVHKLAQQVEQLQSEVKTLRSQGGSVTKPAPAKPRSSNGPVVKKVNVSQIYPILGAATKNDLIKVRDVWTDLMNILSVTQRALMHVAQPVAASSEGVVVAFDYAFVYQKAIDDQTLIDALGNGLDRLMGQAPKIVCVPKEQWPQIRKDYLATHQPGGATSEQQAPAKEPVVEEAKNMFGDLVEVQPD >CP026505|49314:57927|56007_56793_+|QBJ54608.1|DBSCAN-SWA MATLGANASLYSEQHRITYYECDRTGRATLTTLIDIAVLASEDQSDVLGLTTEMVQSHGVGWVVTQYAIDITRMPRQDEVVTIAVRGSAYNPYFAYREFWIRDADGQQLAYITSIWVMMSQTTRRIVKILPELVAPYQSEVVKRIPRLPRPISFEATDTTITKPYHVRFFDIDPNRHVNNAHYFDWLVDTLPATFLLQHDLVHVDVRYENEVKYGQTVTAHANILPSEVADQVTTSHLIEVDDEKCCEVTIQWRTLPEPIQ >CP026505|49314:57927|51357_51957_+|QBJ54601.1|DBSCAN-SWA MQYPEPIAKLIDSYMKLPGIGGKTATRLAFYTIDMNGDDVTEFAKSLIAAKRDLHFCSICGNITEDDPCVICKDKSRDQSTVLVVEEAKDVMAMEKIKEYNGLYHVLHGVLSPIDGKGPEDINIASLLKRLQQNEAIKEVIIATNATPEGEATAMYISRLVKPAGIKVTRLAHGLSVGSDIQYADEMTLFKAVEGRQEM >CP026505|49314:57927|55107_56004_+|QBJ54607.1|DBSCAN-SWA METQQSFADHAGIGTLYLVPTPIGNLQDMTYRAVATLKTVDLIAAEDTRNTQKLLNHFEITTKQISFHEHNTQERIPQLIEKLQTGVNLAQVSDAGMPSISDPGKELVAACIAANIPVVPLPGANAGLTALIASGLVPQPFYFYGFLPRKKNEQKADLAKLARRHETVVLYESPFRVAKTLTLLATVCEGTRPIVACRELTKRYEEFARGTLAEMVTWAQDHQLKGEFVLLIGGNPDKDEPETTDELAQLPVKAQVEALIAAGDKPNVAIKTIAKRRNIPRQSVYNQFHELNTNDEES |
11 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
254747 : 309932
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP026505|254747:309932|DBSCAN-SWA TTTGTCTAGTATAACCTATTCCGAACGAATTAAAATCGAAACCTTTTGTGAACTAGGGCTGTCCAATATCCAAATGGGCGTTCGGCTGAACCGATCACCGTCAACAATTTCTTATGAATTATCTCGATGTCAACCTTATCAGGCTGAATTAGCACAAACAGATGCCGAATACAAGCGATCACGATGTGGTCGGAAAACTAAGCTGAGCGATGAGTTAAAGCAAAAAATTCTCAACCATTTACGTCTAAGCTGGTCACCAGGAATGATTGCTCACGAATTTAAACTAGCTACTAAATCTATTTATAATTGGCTAAATCAGGGGAGAATTGGTTTCTCCTTGAATGATCTACCTGAACATGGCGTACGCCAACGGCGTAACGTTGACCAACGATCCAAATATAATCAATCTTTGGGGCGATCAATTGAACAGCGTCCCATGATGATTAATCAACGTAATCGCATCGGCGATTTTGAACTAGATACAGTCGTTGGTCCTCGTGGGCATAGTAAGGCAGTTTTATTAACTTTAATCGATCGAAAATCACGGTTCTTTTGGGCATACCGGTTAAAAGATCGGACGACAGCGACTGTTAATGAAGCACTAACTAAGTTCCTAACCACTTTTAATGGTCCGGTGCACAGCTTTACTGTGGACCGTGGCACTGAGTTTAGTGGGCTAGTATCACTTGAATCACAATATGGTATTAAGACCTATTACTGCCATGCTTATACGCCAGCTGAACGTGGTAGTAATGAACGCTTTAATCGGAATTTACGTTATTTTTATCCTAAAGGGACTCGTTTTGAGCACATTAGTGCTCAAAATTTAACGACGACGTTACTCCAAATTAACCAGCGACCGCTTAAAATACTCGACTGGCAAACACCGTATCAGGTTATGCTGACAAATTTGTCCAAAAATTCGGATTAAATTTGCAATCTACCTTGCTTTTTTGAAAAAATAGTTTGAATTGGGGTAGCATACCTGAATTCTTCAAACACGTCTTTAACCAGCAAAGTTTAAGGACATTATTGATAAGATAGCCGAGTTGGTTCTCTGTCAATTGATGTTGCGAATAGTGCTACGGGTGCTTAGTCAAACAATGGCAAGCGCCTTTTTCAATTCGAATTGTTCAATAGTCCATGATTAAAATACAAATAAAGATATCTGTCGCCAGTAATCACGTATTTAGTTAATTACCAACAACAGTTATTTCAGAGCTAATATAAAAACGCTCGCGACCAGTCAGTGGTTGCGAGCGTTTTGTTTGATGAGCAAAATTATAAGTGTTGATTGACTTTCACGTCAGCTAAGTCTTGCGCATAATCGACGACGCGAATTTGATCGCCATCGATGTCGATGCGAGTGACGCTCCCGTTTTTGGGGCCGTTCGTGATGTCGATTTCAGGGGCAAAATGTGCGACCATACTGCGGATTGTCGTGCCGTGGGTAACCACGAGGACTTTTTGATGGTGATCGTGGTGAGCTTTCAAGTAGTCAAAGCCCTGGTTGATCCGTTCCCAGTACATCGAGTTGTCTTCAGCTTCATGCCAAGGGTCGATTTCACGCATCAGGTCGCGAGTCTGATCGATAGGCACGTGTTCAAGAAGTTCGTGCATGCTGGTGACCCCGTATTGGCGGCCAACTAGTGACCAGGTCCGACTTGAATCGTCACCTTCAAAATAACCATAGAAAACTTCCCGAAAGTTCATCAGTGTTTTAAAGGGCTGGGCGGTGGCACCCGCCGCTTGTCGAATGAGCTGAGCGGTGTCGATTGCCCGCTTAGAATCACTACTGTAGTAGTAGTCAAAAGTCGTGTTCGCTAGTGCTTGACCGACCTTGGTTGCGGTGGCTTGTCCGTATTCGGTTAACGGCGAGTCAGACCAGCCTTGCATGCGATTATATAAGTTGAAAAAAGTCTGTCCGTGTCGAACAAAGTAAATTGAAAATTGAGCCATGTGTTTCTCCTTATTTAGTCGAGATGGTCTTTGCGGCCAAAGTAGTCTAACGTCACATCGTTGTCGCTAATTGTGAATTTCGTGACGCTCCCATTTTGGGGCCGTGCTGGTGAGGTCAGTGCGGCAAAACGAGCAGCAATACTGTAAATCGTATTGCCGTGGCTGACGACCAAAACTTTGTCCCCGTCGTGATGGTGAGCACGTAACGTATCGAGACCGCCATTGACCCGTTGCCAGAATTCGGCGTTATTTTCGGCGCGATGGAACGGGTCAGCTTCTTTACAGAAATCTTTGGCTTTTTCGATGCCGTATTGTTCAATAATTGCGGACAAGCTAGGTGCTTGATGGGGCGCACCAACCATGAACCAGGTCTGCGACGTGTCATCACCTTCAAAATAGCCATAAAAGGCTTCACGGAAGGCGGCCATTGGTTGAACCGTCAAATCGGTATTGCCACTGGCAGGAAGAATTAATTCTGCGGTGCGCATTGCCCGCGTCATGTCACTGGCGTAAACGGCATCGAAATCAATACCGTTGAGCATTTTACCCGCATTGCGAGCGTCCTGTTCGCCGACAGCTGTGAGGGGGGAATCACACCAGCCCTGCATTCGGCGGTACTTGTTAAAGTAAGTTTGACCATGACGAATCATGTAAACGGAAAAAGTTGCCATTATTTACTCCTCTACTTGGTGTTCAAAACTAAGCCATAATGTGTTTAGTTTACCATAAAATGTACTGCGATTAATTAGCAGTTGCTAAGGCTTGTCGAATCTGAGCGGCCGTCTGCTTATTCCCGGTAAAGATTAAACGGTCACCGTACATAATCGTCGTGTTCCCATTGGGCGCAATCAGTTTCCGATTACGGATGACTTGACTAATGGTAATATCCTGAGCAAACTGTAAGTTCTTAATTTGAACATCAGTATAGAGATGGTTGAGGACCCGGACTTCGTAGATGCTGTTTTCAGTATCATTGAGCAATAACAAGGTTGACGGTGATTCAATTAAGGCGCGCAGTAAAGTAATGTTGGCCTCTGGTGTATTGTAGACTTCGACGCCTAGTTCTCGGAGTTCATCTTCATGTTCGTTGAGCACATTGCGGTCTTCAAACCGAACGATGATCCGCCGTACACCGTATGCTTTGGCGGCTTTAGCAAGCTCGTAGTTACGCTCGGCATCAATATGGCCGAGTACCAAAATATCCGTGTCAAAGACGCCGTGATCCTGTAAGTCCTGGGCTGTGAAGTTTTCCATTAAGGTCACTGGTACTTGCGCGTGGTAGGTCTGATAATTCTCAGGATGATTCGTGTACATTGACACGTCGTACCAGCCTTTTCGTAGCTGTTGTGCAACGGGTACGGTGCTTAAGTTAGCGCCGATAAAGTGGACCGCTGTTTTGACCAGGTCTTCTTTCTCAGCTGAATAAAACTTGTTAAAAATCAGGGGTGAGATGACACAAGTGAGTAGCGCTGCGAGTAAGAAAGCGCCGGACTGGTCACTAGTAATTGTCTTCATTGACTTGGCAACTCGAAGAACGGCTAATACCATTGTCATTGTCGTTGCAGTCAGCGCGGTACCGGCTAAAGCATTGGCTTGCTTGAACCGTAACTTTAGGACCCAGTAGCCGCCAATCTTGGCAACCATGTATGCTAAGAAAAATAGTGGAATTAATAGTAAGATTTTGCCACTTGTTAATAAGGTCCGTAAGTTCAAATCGACGCCAGTCGTAATGAAGAAAATCGGGATGAAGAAGCCGTAACCAATAGCATCCAAGCGTTCGCGGGTCGTTTCACTAGGGTTCAAGAGTTTCAAGACGATTCCGGCCACAAAAGCGCCCAGGATGTTTTCAGCACCGACGGATTCGGCCACCGTGACCATCGTTACAATCAAGAAGAAGGCTAACCGAATATCTAGTTGTGTCGTCGATTTGTTAATATTTTGATAGAAGCGGAAGAATGGTTTGAACCGTAAGAGTAATAGTGCGGCAACGGCTAAAATGAGTAATAGTAACCAGAGACTTTGTGAGTTACTGCCGTAGACGGATGCATAGAGCGTCAGTCCCATCATCGGTACAAGTTCACCAAAGACCGAGATGAGCAGAATCGTTTGTCCGAAAGCCTTACTAAGCAATTCCTGTTCTTTTAAAGCTGCAATTACAATACCAAGTGAAATCGTGCCAAATAAAATCGCGGCAAGCCAGAAATCACTGAAGAGGCCGCTGACTTTAAAAGCAGCGGCGAGTAACAGCGATAGAACAATAATTGTGCTGTAGGCGTACACCGAAAGTCGAACTGGCGAATATTTCGGTGTGTTGACCGCGTTTTTTTGTTCTAAAGGTGTTAACGCCGTGCGCCGCTTCTTAAATAGGCTAAAGTCAATTTCAAGTCCACTTAAGAACAGCAGGACGATGACGCCAATCGTTGAGAGTTGTGAGATAAGGTCAGAGGTGTTCACAAAGTTAAACACGCTGGGGCCAATTACGATACCGACAATGATCTCCATGACGGCCGTTGGCAAACTGTTGATTTTGAATTTAGCCATGATAAGCGGAATTAATAATGCGGCTAATAAAATAATGACTAAGGAAACTTGATCCATGAATAAATACCTCGATTCGTTTTAGTACACACGGAGCTGATCATCATCAAAGCCCCAGAAAGCTTCGCTAGCATGTGCATCGGTGAAAACTTTCAGGATTTGGTCGACACCAGGGGCTAATTTGTCAGGCGTCAGTTGGCTCAATGGTTGCCAACTAATAGCACCCTCGTATGAGCCGGCTAGCAAATCACCGTGATAGTGACTAGTGGTGTATAAGGTACCAAGCGACACGTCGCCGTCCGCATTTTCGACCCACGTTACGGTGCCAACTAATTTCAATTGATCGACGTGCAAGCCGGTTTCTTCTAATACTTCACGCTTCATCGCGGTTACTTGTGATTCACCGCGATCAACATGGCCGCCAGGAAAAGTTAACCCCGACCACTGTGCGTCAATCTTATTTTCAACCAGGACATCGCTGGTCGCTGGATTGGTGATGAGGC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|
39 | unidentified_phage(40.0%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
451122 : 512585
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP026505|451122:512585|DBSCAN-SWA 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49 | Bacillus_phage(25.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
993054 : 1053535
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP026505|993054:1053535|DBSCAN-SWA 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56 | unidentified_phage(12.5%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1205845 : 1303582
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP026505|1205845:1303582|DBSCAN-SWA 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101 | Lactobacillus_phage(66.0%) | tRNA,transposase,head,holin,capsid,portal,protease,tail,integrase,terminase | attL 1248755:1248772|attR 1310515:1310532 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1594501 : 1657864
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP026505|1594501:1657864|DBSCAN-SWA 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78 | Lactobacillus_phage(41.03%) | plate,transposase,head,holin,capsid,portal,tail,integrase,terminase | attL 1642907:1642928|attR 1657147:1657168 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1993251 : 2057906
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP026505|1993251:2057906|DBSCAN-SWA 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51 | Bacillus_phage(33.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2129898 : 2195629
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >CP026505|2129898:2195629|DBSCAN-SWA 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54 | unidentified_phage(23.08%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
2241936 : 2297402
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >CP026505|2241936:2297402|DBSCAN-SWA 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49 | Erysipelothrix_phage(18.18%) | holin,tRNA,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
2387301 : 2448826
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >CP026505|2387301:2448826|DBSCAN-SWA 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>CP026505|2387301:2448826|2415283_2415517_-|QBJ56656.1|DBSCAN-SWA MIMKIIMQLGTLTCPSCMTKIEKAVANHDGVENVKVLFNASKVKANFDPEVTNADDLAQVVTGLGYEVENVKVKWEE |
57 | unidentified_phage(10.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2787675 : 2844967
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >CP026505|2787675:2844967|DBSCAN-SWA 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58 | unidentified_phage(30.0%) | transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2861616 : 2895652
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >CP026505|2861616:2895652|DBSCAN-SWA 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30 | Bacillus_phage(28.57%) | tRNA,bacteriocin,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
18952 : 61855
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP026506|18952:61855|DBSCAN-SWA 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MLNTFLSNWVIFGSERVALVDQLLFRKLKQQPYLHGDETPIQVLREPGKSATSKSFLWEMRSAANAATSIIHFHYDPSRSEKVARAIYEGFNGTLVCDGYAGYNHIPPGIRRAGCWAHGRRKFVDGTNGIESQRSLGRKFVKKFDQLFAIERKAQGFSPQQLLEIRQRESKPIVDSIWQLMSETTPINKSKLGRAYTYMVNQREQLEVFLNDPGVAISNNIAERSIKTSVIGRKNWLFSTGQRGAKANALFLGLFETAIANHLDFKKYLVYLFTYLPRLGDSPTDEELEAYLPWAKAVQQSCAA >CP026506|18952:61855|59523_59802_+|QBJ57274.1|DBSCAN-SWA MLDLRDCEIAFTGRLTTMNRDQAFSLAKVFGAKPQNWVTKQTDYLVVGLIETALGEEPITKKLLTGTPTISERDFLDWCQARLAQWSRSLGG >CP026506|18952:61855|43374_44028_+|QBJ57261.1|DBSCAN-SWA MKSRTSNYLKTIYETSYTQRWTCNKQLATMLGVLPGSVTEAVNRLISQKLVVKNKGQINLTKRGYQLVADLMYRYRLCEIWLADNIQLSLPEVPRQAWLMSAIDSSVVMAKLNQQMAYPKTSPFGGALKLESFSKYQYPTLLSLLSIPVGKEVKIISFLETPATIHYFQHSGLHLGQVLTINSKNTVLPNISITDVKDNEYLIDNSMAVYIYCELLS |
38 | Streptococcus_phage(16.67%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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