Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
CP037437 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM8, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP037430 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM1, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP037434 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM5, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP037432 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence | 1 crisprs | NA | 0 | 2 | 0 | 0 |
CP037438 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM9, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP037433 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM4, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP037439 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM10, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP037431 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM2, complete sequence | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP037429 | Lactobacillus plantarum strain EM chromosome, complete genome | 0 crisprs | csa3,DinG,cas3,DEDDh | 0 | 0 | 7 | 0 |
CP037436 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM7, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 0 | 0 |
CP037435 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM6, complete sequence | 0 crisprs | RT | 0 | 0 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP037432_2 | 32398-32553 | Orphan |
NA
Consensus repeat of CP037432_2
|
1 spacers
spacers of CP037432_2
>2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder ACCCGCATGATACCGTTGAACCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGAAACCCGCATGATACCGTTTCTGATACGCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around CP037432_2
The CRISPR arrays of CP037432_2 >merge|CP037432|2|32398-32553|CRISPRCasFinder TGAATCCCTTGGTGCAAGCGGACTTCTCAAAAGAGAAACCCGCATGATACCGTTGAACCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGAAACCCGCATGATACCGTTTCTGATACGCCTGAATCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGA >CP037432|2|2|32398-32553|CRISPRCasFinder TGAATCCCTTGGTGCAAGCGGACTTCTCAAAAGAGAA ACCCGCATGATACCGTTGAACCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGAAACCCGCATGATACCGTTTCTGATACGCC TGAATCCCTTGGTACAAGCGGACTTCTCAAAAAGAGA
>CP037432.1|QBK74633.1|31127_31376_+|hypothetical-protein MSLDSFNHKKDEEMRESYETTLKDNKKDAVAFLKNISRKEVERKRSVTFSITESQLKKMDTAARKNGFKNRSEFLASIIDAI >CP037432.1|QBK74632.1|29283_29931_-|hypothetical-protein MASAILTATYIPTSRASADTTQLKQTNVIKDADQTTETAKLSDSENNQLTENQINQLDPYVKVVNNQYVLQLPENNNVSQSMVTEIEDELSQVNADIKSNGYTIKTNDKTYGASTSAAFGVVLAKSSSNPTIKRFWWGIRVYMRNKTAVNKEIAEFKNGQAIAEFGSLVSPPVGVTLSVYFSNIADHLTNMRDAHPHSKLYMDINRFGVYKIKTY >CP037432.1|QBK74631.1|28973_29213_-|hypothetical-protein MSLTELGSFVLLISLVYWWFLMWHSFKLTRKTLVILNTVGTALMTVLTWPITYGMLLIPILIIYAVSTFIIFKLPLAAK >CP037432.1|QBK74630.1|26143_26479_+|conjugal-transfer-protein MKFSKVKALATTGVTAIYLGLMNAQVVLAADGGEVKSKLTSAGKTIQGILTGLVVLVGICVALFIIIKRMPDADDPREKSEVYHAVGRVAGLVALAAAIIWLLPWVYSLFT >CP037432.1|QBK74629.1|25527_26142_+|hypothetical-protein MKVESWQGINGKLVHDDQKAIVVDDDHALTDPKQLQAILDQDGQPIDEVRQAMIKKTVKRQLKTEPLKLSGWFNRHQDSQNAKKAEKLVSNKPTHQYKQIKNEMTFFGESFLEGFLGFYGLEVDNALGRYEHNLHVLEAQELGQSEKEYYVATSENGRVKLATDPLPSQQIAEEQLNKFYQREPEETQAEQIQLRTSEDDGKEE >CP037432.1|QBK74628.1|25180_25492_+|hypothetical-protein MANKQKWHSLAQASRELGHGRNYVSAWLSRHREEFPEELILGSGKSKLISDEGIEWIKKHIKKEGVLVSSRVANGDQHLEPQLLGVTLLTIHFTGRVRGKLVF >CP037432.1|QBK74627.1|23038_25099_+|nickase MAIFHMSFSNISAGKGRSAIASAAYRSGEKLFDDKEGRHYFYARSVMPESFILTPKNAPEWASDREQLWNEVEKKDRKSNSRYAKEFNVALPVELSESEQKELLTKYVQENFVDQGMVADVAIHRDHPDNPHAHVMLTNRPFNPDGTWGIKSKKQYILDKNGNKTYTKSGYARNRKIWLTDWDKKEKINQWRHNWAVSVNQVLEQKNIPDRISEKSFENQGIDEVPTQHEGINSKRHERKEFNQQVKDHRKAKASYKNNQEKVINRGHLDSLSKHFSFNEKRVVKELSHELKTYISLENLDDKRRMLFNWKNSTLIKHAVGEDVTKQLLTINQQESSLKKADELLNKVVDRTTKKLYPELNFEQTTQAERRELIKETDSEQTVFKGSELNERLMNIRDDLLTQQLLTFTKRPYVGWKLLMQQEKEVKIELKYTLMIHDDSLESLEHVDQGLLEKYSPTEQQKITRAVKDLRTIMAVKQVIQTQYHEVLKRAFPKGDLDGLPLTKQEQAYTAVMYYDPTLKPLKVETMEQWQSNPPQVFSTQEHQLGLAYLSGQLSLDQLENHHLQRVLKHDGTKQLFFGECKVDPTIKNSQIEKIQKQLKEQQAKDDQYRKVNIGHYQPLNYKPVSPSYYLKTAFSNAIMTALYARDEDYERQKQAQGLKETEWEMTKKQRQHQTRNRHEDGGMHL >CP037432.1|QBK74626.1|22560_22770_-|hypothetical-protein MSQSNLEKQEAKLKALNQKIKDEKNKIEQRLGKQIISQANLDYANLSNDLIKLLAKQFSEFLKVKSVDH >CP037432.1|QBK74625.1|22259_22538_-|hypothetical-protein MPNQYEKLVEQQARLKQKIDQEDFKLRQSKYYENRQARKARSRRLIQKGALLEKYFQADNLSVEQTEELLKTFADYVNAHKPNKLKNDQPNN >CP037432.1|QBK74624.1|21448_22270_+|filamentation-induced-by-cAMP-protein-fic MTKTQSYMDKYQFTVAENKRFARTNFTKLVHTNARFEGVNTTLPQTQTIMDGMSVAGVPVEDILTIVNLKRGWQYITDQNAPLTLTMEKQINKIVAAEDALVPGELRQGKGGVDLGSEDFFEPPLINEKQEQSFLQKILADPQTTTTDKALTVMYHNMRQQIFWDGNKRTATLSANKIMIDGGAGLINVPLDKWDQWNELIANYYRTNDMAKIKRWTYDNGIQGLQIRANLELKSVEDEIGKRIQEQLKDFADQNSEIKPKNDPENKNDRPSY >CP037432.1|QBK74634.1|34586_34796_-|hypothetical-protein MSQSNLEKQEAKLKALNQKIKDEKNKIEQRLGKQIISQANLDYANLSNDLIKLLAKQFSEFLKVKSVDH >CP037432.1|QBK74635.1|37207_37519_+|hypothetical-protein MANKQKWHSLAQASRELGHGRNYVSAWLSRHREEFPEELILGSGKSKLISDEGIEWIKKHIKKEGVLVSSRVANGDQHLEPQLLGVTLLTIHFTGRVRGKLVF >CP037432.1|QBK74636.1|37554_38169_+|hypothetical-protein MKVESWQGINGKLVHDDQKAIVVDDDHALTDPKQLQAILDQDGQPIDEVRQAMIKKTVKRQLKTEPLKLSGWFNRHQDSQNAKKAEKLVSNKPTHQYKQIKNEMTFFGESFLEGFLGFYGLEVDNALGRYEHNLHVLEAQELGQSEKEYYVATSENGRVKLATDPLPSQQIAEEQLNKFYQREPEETQAEQIQLRTSEDDGKEE >CP037432.1|QBK74637.1|38170_38506_+|conjugal-transfer-protein MKFSKVKALATTGVTAIYLGLMNAQVVLAADGGEVKSKLTSAGKTIQGILTGLVVLVGICVALFIIIKRMPDADDPREKSEVYHAVGRVAGLVALAAAIIWLLPWVYSLFT >CP037432.1|QBK74638.1|38526_38889_+|conjugal-transfer-protein MKKGKEFIFPENVDKDYGIWKDYTLKDFGYAALAGLVGLIFIAIPPYGLILVLIKIVIVVLAMTIVMAILTIRPVAARKNIKVRDNFKLKRRYANGQKLFYLKPKKRGELNAFEEEQNRQ >CP037432.1|QBK74639.1|38857_39517_+|conjugal-transfer-protein MRLKKSKTANKTAKLDWDYQPPKINGGKETIDDMSLVVGMYGNYEVTKTGHLVGILEVSGINLDLLNETEQQDVFEDYGAFLMSTLGEGVDDTLQFLEPTIPVNMTTYLNGLKRRYLALQKGHPEQQFKIQLIASYLDHFTKVQESKNMTTKQHLLIVKVAIKDKSVKSLNLAVNHLDEKIEQVKRDIENALTDFDVTAKVLTSQEVQEILKNLINFNG >CP037432.1|QBK74640.1|41298_42474_-|IS256-family-transposase MNELTTEIIAALAQKQDLDEVFRHHLEIAINQLLQTELAEFLGYERYSYAGINTGNNRNGSYERSFDTKYGQLNLTIPRDRNGRFENHTLPAYGRHSDNLETTVIQLYTKGITTAEIAELIEKMYGAHYSKATVSNMTKAVNEQVQAFQQRRLASQYAAIFLDATYLPLKRDTVQKEAVHIAIGIRPDGTKEVLNYQVAPTESTGIWTELLGTLIKQGVKDVLLFVADGLVGLDEGLNRHFPKAKRQRCLVHVGRNLMNKVRVKDRKAVISDFKQVHRAANREAAELKLNEFANNWHQTYPKLIKDLLKMPNLLTFMDFPPAIRQSLYSTNLIENFNKHLKRTTHHKEQFPTEDSLDRFLVSQFNVYNEKSLKRIHRGFKGLQDTLEASFI >CP037432.1|QBK74641.1|42899_44318_+|conjugal-transfer-protein MSKSNQLLNIEVGTFKRQGNKLILELNHNQFRYDQLSELNELKQADANFLQLVNVVEQDQKVVLTYTLPDKVRSLKELPHENKAIRAAIAKEIMAQKVVADSQYHIALNPANLWYYPMQHVWYAYRANELMPYDDKHSNLAKYKALILFCLTGTPYERLLSNPKEALAKHPDDYLQQVAKATSLNELTEVVNSIEDFVSYHEWQEVETAQQKTKQRLWLSVAGVAIVAVLAVGLVHKSDERKYQSLANQNQAQVTRLKYSGQIQTALNDHKWSEAQKDMQRAGYPATKQVNVFLKHGQYQQALKVDPSQLNKVVNMAYANKDSGQVAKWELPTKATSKQKDQLKLEKAIVNYDTNTLNNQLSFTTNADVLLRMGQAFLAHNDTQDAQTVQTKLAGVNSPKAKYLKALLSLNSAKNEVSDAQKKLDDANKIDGSKDKDKDKKVDSAKSDLKNAQSDQSAAQKQVDQAKRKVGD >CP037432.1|QBK74642.1|44318_45473_+|CHAP-domain-containing-protein MQILSLEYKKKKWKLIAYIVGGAILLIVLLIAAITGQLQENSCDNSTTTETQLDSKSMTENAKNIYAHWKQKYGATPQAAAGILGVLQLESRLDPNSVNSSSGATGLAQWLGGRKDKLEDLAHKENKPATNLGVQLDYLDQELNSSYYASNKQIFKYTDVHKATKSWLMDYEGMSKNPEQWYLSQRYGYADHWYSVLGASDPVAGNTLDNASSGDLTELGCDSDPSYSGGSIVKNAESMKGDFYYVQTHPSPDLGSDLKNPNKTGGTDCSGFVWLALNKAGYKVPANMGWFTGSMASDAKGSHQYLKQISENDAKAGDIVIVNQGAGAGNNGHTAILLDKWQGKATKIIEQGGVGDKVNESTFGTAFYSLLNGSDVTLARPIKK >CP037432.1|QBK74643.1|45486_46104_+|hypothetical-protein MKRSMVLSIAIGSLILIMSLGANAYQHSQIKQAQQQISRLQQQKRQVSRQLTKTNQQKQLLSTQIDSYKTYQNNKDKSQAELSFNTVVTKFFDVMNNFKPKTYGQRKDGVKDLISDKLYQQYFSNKGTYGDSNSVSAKLDQLNLYTQSKQGQNMKGLAVVSYESKSGDNDWQKTTVLYQVTFDTTTNRITAVQNLGSSFKASDLN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP037432 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence | 20406-20487 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP037432 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence | 32435-32516 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP035575 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed4 | 27498-27579 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP013756 | Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence | 12390-12471 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP013756 | Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence | 60460-60541 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP028280 | Lactobacillus plantarum strain SRCM100995 plasmid unnamed5, complete sequence | 15337-15418 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP013752 | Lactobacillus plantarum strain KP plasmid unnamed3, complete sequence | 33084-33165 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP023177 | Lactobacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2C, complete sequence | 2282-2363 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP023492 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed2, complete sequence | 1320-1401 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP014919 | Lactobacillus paracollinoides strain TMW 1.1994 plasmid pL11994-4, complete sequence | 2235-2316 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP035016 | Lactobacillus plantarum strain 12_3 plasmid pldD, complete sequence | 8776-8857 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP020096 | Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed3, complete sequence | 31876-31957 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP026507 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed2, complete sequence | 35988-36069 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP032465 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence | 8940-9021 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP032465 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence | 41816-41897 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP019723 | Lactobacillus plantarum strain CLP0611 plasmid pUnnamed, complete sequence | 30206-30287 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP053913 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain G1 plasmid p1, complete sequence | 4551-4632 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP031319 | Lactobacillus plantarum strain DR7 plasmid unnamed1, complete sequence | 27217-27298 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP029350 | Lactobacillus plantarum strain HAC01 plasmid pLP-HAC01, complete sequence | 2645-2726 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NC_015429 | Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02, complete sequence | 17641-17722 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP032467 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence | 10898-10979 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP032467 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence | 43774-43855 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP018868 | Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence | 5943-6024 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP018868 | Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence | 54801-54882 | 22 | 0.732 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP028231 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101222 plasmid unnamed2, complete sequence | 18509-18590 | 22 | 0.732 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP013752 | Lactobacillus plantarum strain KP plasmid unnamed3, complete sequence | 33084-33166 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP023177 | Lactobacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2C, complete sequence | 2282-2364 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP037432 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence | 20405-20487 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP037432 | Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence | 32434-32516 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP035575 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed4 | 27497-27579 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP013756 | Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence | 12389-12471 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP013756 | Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence | 60459-60541 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP028280 | Lactobacillus plantarum strain SRCM100995 plasmid unnamed5, complete sequence | 15336-15418 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP031319 | Lactobacillus plantarum strain DR7 plasmid unnamed1, complete sequence | 27217-27299 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP029350 | Lactobacillus plantarum strain HAC01 plasmid pLP-HAC01, complete sequence | 2645-2727 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NC_015429 | Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02, complete sequence | 17641-17723 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP032467 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence | 10898-10980 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP032467 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence | 43774-43856 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP018868 | Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence | 5943-6025 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP018868 | Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence | 54801-54883 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP028231 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101222 plasmid unnamed2, complete sequence | 18509-18591 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP023492 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed2, complete sequence | 1319-1401 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP014919 | Lactobacillus paracollinoides strain TMW 1.1994 plasmid pL11994-4, complete sequence | 2234-2316 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP035016 | Lactobacillus plantarum strain 12_3 plasmid pldD, complete sequence | 8775-8857 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP020096 | Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed3, complete sequence | 31875-31957 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP026507 | Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed2, complete sequence | 35987-36069 | 23 | 0.723 |
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CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP032465 | Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence | 41815-41897 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP019723 | Lactobacillus plantarum strain CLP0611 plasmid pUnnamed, complete sequence | 30205-30287 | 23 | 0.723 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP053913 | Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain G1 plasmid p1, complete sequence | 4550-4632 | 23 | 0.723 |
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CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP014901 | Lactobacillus backii strain TMW 1.2002 plasmid pL12002-2, complete sequence | 12373-12454 | 23 | 0.72 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP014884 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1991 plasmid pL11991-3, complete sequence | 21803-21884 | 23 | 0.72 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP014875 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1989 plasmid pL11989-2, complete sequence | 21765-21846 | 23 | 0.72 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP014627 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1988 plasmid L11988-3, complete sequence | 5895-5976 | 23 | 0.72 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP014892 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1992 plasmid pL11992-2, complete sequence | 29785-29866 | 23 | 0.72 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP040738 | Lactobacillus futsaii strain Y97 plasmid p2, complete sequence | 9385-9467 | 24 | 0.711 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP014884 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1991 plasmid pL11991-3, complete sequence | 21803-21885 | 24 | 0.711 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP014875 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1989 plasmid pL11989-2, complete sequence | 21765-21847 | 24 | 0.711 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP014627 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1988 plasmid L11988-3, complete sequence | 5895-5977 | 24 | 0.711 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP014892 | Lactobacillus backii strain TMW 1.1992 plasmid pL11992-2, complete sequence | 29785-29867 | 24 | 0.711 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP014901 | Lactobacillus backii strain TMW 1.2002 plasmid pL12002-2, complete sequence | 12372-12454 | 24 | 0.711 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP035561 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5 | 2455-2537 | 24 | 0.711 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP035561 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5 | 44108-44190 | 24 | 0.711 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP028336 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101167 plasmid unnamed2, complete sequence | 2281-2363 | 24 | 0.711 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP035561 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5 | 2455-2536 | 24 | 0.707 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP035561 | Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5 | 44108-44189 | 24 | 0.707 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP028336 | Lactobacillus plantarum strain SRCM101167 plasmid unnamed2, complete sequence | 2281-2362 | 24 | 0.707 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP012278 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1533 plasmid pL21533-3, complete sequence | 43262-43343 | 24 | 0.707 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP012278 | Pediococcus damnosus strain TMW 2.1533 plasmid pL21533-3, complete sequence | 43262-43344 | 25 | 0.699 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NZ_CP032745 | Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed1, complete sequence | 39956-40037 | 32 | 0.61 |
CP037432_2 | 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder | 32435-32516 | 82 | NC_016607 | Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-4, complete sequence | 3708-3789 | 33 | 0.598 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NZ_CP032745 | Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed1, complete sequence | 39955-40037 | 34 | 0.59 |
CP037432_1 | 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder | 20405-20487 | 83 | NC_016607 | Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-4, complete sequence | 3707-3789 | 35 | 0.578 |
1. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037432 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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2. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037432 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer ************************************************************
3. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035575 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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4. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013756 (Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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5. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013756 (Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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6. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028280 (Lactobacillus plantarum strain SRCM100995 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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7. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013752 (Lactobacillus plantarum strain KP plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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8. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023177 (Lactobacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2C, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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9. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023492 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed2, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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10. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014919 (Lactobacillus paracollinoides strain TMW 1.1994 plasmid pL11994-4, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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11. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035016 (Lactobacillus plantarum strain 12_3 plasmid pldD, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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12. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020096 (Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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13. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026507 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed2, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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14. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032465 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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15. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032465 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer ************************************************************
16. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019723 (Lactobacillus plantarum strain CLP0611 plasmid pUnnamed, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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17. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053913 (Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain G1 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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18. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031319 (Lactobacillus plantarum strain DR7 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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19. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029350 (Lactobacillus plantarum strain HAC01 plasmid pLP-HAC01, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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20. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NC_015429 (Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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21. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032467 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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22. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032467 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer ************************************************************
23. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018868 (Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
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24. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018868 (Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer ************************************************************
25. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028231 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101222 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 22, identity: 0.732
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer ************************************************************
26. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013752 (Lactobacillus plantarum strain KP plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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27. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023177 (Lactobacillus plantarum strain BDGP2 plasmid pLtBDGP2C, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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28. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037432 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ************************************************************
29. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP037432 (Lactobacillus plantarum strain EM plasmid pEM3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ************************************************************
30. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035575 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103303 plasmid unnamed4) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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31. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013756 (Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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32. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013756 (Lactobacillus plantarum strain DF plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ************************************************************
33. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028280 (Lactobacillus plantarum strain SRCM100995 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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34. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031319 (Lactobacillus plantarum strain DR7 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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35. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP029350 (Lactobacillus plantarum strain HAC01 plasmid pLP-HAC01, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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36. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NC_015429 (Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC02, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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37. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032467 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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38. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032467 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K8 plasmid pK8, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ************************************************************
39. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018868 (Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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40. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018868 (Lactobacillus alimentarius DSM 20249 plasmid pLDW-11, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ************************************************************
41. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028231 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101222 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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42. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023492 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB 700965 plasmid unamed2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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43. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014919 (Lactobacillus paracollinoides strain TMW 1.1994 plasmid pL11994-4, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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44. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035016 (Lactobacillus plantarum strain 12_3 plasmid pldD, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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45. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020096 (Lactobacillus plantarum strain K25 plasmid unnamed3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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46. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP026507 (Lactobacillus plantarum strain NCIMB700965.EF.A plasmid punamed2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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47. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032465 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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48. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032465 (Lactobacillus plantarum strain ATG-K6 plasmid pK6, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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49. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019723 (Lactobacillus plantarum strain CLP0611 plasmid pUnnamed, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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50. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP053913 (Lactobacillus plantarum subsp. plantarum strain G1 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.723
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51. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040738 (Lactobacillus futsaii strain Y97 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.72
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccctttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer ***********************.************************************
52. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014901 (Lactobacillus backii strain TMW 1.2002 plasmid pL12002-2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.72
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer *********************************.**************************
53. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014884 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1991 plasmid pL11991-3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.72
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer *********************************.**************************
54. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014875 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1989 plasmid pL11989-2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.72
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer *********************************.**************************
55. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014627 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1988 plasmid L11988-3, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.72
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer *********************************.**************************
56. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014892 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1992 plasmid pL11992-2, complete sequence) position: , mismatch: 23, identity: 0.72
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer *********************************.**************************
57. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040738 (Lactobacillus futsaii strain Y97 plasmid p2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccctttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ************************.***********************************
58. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014884 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1991 plasmid pL11991-3, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer **********************************.*************************
59. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014875 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1989 plasmid pL11989-2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer **********************************.*************************
60. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014627 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1988 plasmid L11988-3, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer **********************************.*************************
61. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014892 (Lactobacillus backii strain TMW 1.1992 plasmid pL11992-2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer **********************************.*************************
62. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014901 (Lactobacillus backii strain TMW 1.2002 plasmid pL12002-2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer **********************************.*************************
63. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035561 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgtatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ******.*****************************************************
64. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035561 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgtatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ******.*****************************************************
65. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028336 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101167 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.711
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgtatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ******.*****************************************************
66. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035561 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 24, identity: 0.707
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgtatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgt Protospacer *****.*****************************************************.
67. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035561 (Lactobacillus plantarum strain SRCM103297 plasmid unnamed5) position: , mismatch: 24, identity: 0.707
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgtatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgt Protospacer *****.*****************************************************.
68. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP028336 (Lactobacillus plantarum strain SRCM101167 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.707
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgtatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgt Protospacer *****.*****************************************************.
69. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012278 (Pediococcus damnosus strain TMW 2.1533 plasmid pL21533-3, complete sequence) position: , mismatch: 24, identity: 0.707
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer acccgtatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer *****.***************************.**************************
70. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012278 (Pediococcus damnosus strain TMW 2.1533 plasmid pL21533-3, complete sequence) position: , mismatch: 25, identity: 0.699
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer aacccgtatgataccgttgaaccccttggtacaaacggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer ******.***************************.*************************
71. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032745 (Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 32, identity: 0.61
acccgcatgataccg-ttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer -agccaatgaaatcgcctaaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer * **** *.** .*.*****************************************
72. spacer 2.1|32435|82|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NC_016607 (Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-4, complete sequence) position: , mismatch: 33, identity: 0.598
acccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc CRISPR spacer agccattaaaatcgcctgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccgc Protospacer * **.. .* * .********************************************
73. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP032745 (Lactobacillus paraplantarum strain DSM 10667 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 34, identity: 0.59
aacccgcatgataccg-ttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaaccc CRISPR spacer -gagccaatgaaatcgcctaaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaaccc Protospacer . * **** *.** .*.****************************************
74. spacer 1.1|20405|83|CP037432|CRISPRCasFinder matches to NC_016607 (Pediococcus claussenii ATCC BAA-344 plasmid pPECL-4, complete sequence) position: , mismatch: 35, identity: 0.578
aacccgcatgataccgttgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg CRISPR spacer gagccattaaaatcgcctgaaccccttggtacaagcggacttctcaaaaagagaaacccg Protospacer .* **.. .* * .*******************************************
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation |
---|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
321049 : 406623
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP037429|321049:406623|DBSCAN-SWA 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83 | Lactococcus_phage(25.0%) | transposase,tRNA,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
538337 : 636069
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP037429|538337:636069|DBSCAN-SWA 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119 | Lactobacillus_phage(31.91%) | holin,tail,capsid,plate,integrase,terminase,tRNA,head,protease,portal | attL 536631:536646|attR 570579:570594 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1249614 : 1260171
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP037429|1249614:1260171|DBSCAN-SWA TGTGGCACGTGACGGGACCGTCACAGAGACAAATGATTTAAAATTGCACGCATTAGGGGAGATTATCGGGATGAACGAACAAGAAGCATATGTAACGACATTTTATTGGCTCGCGGATTGTTGGTTGGAAACTAGCTATCTGGGACTTGAGGATGAATTTGACGACGATGAAATCGATGACGCCGTCAAGTCACTACTAAATCGGATGCAAGCCGGGGCAATTTATGAGGTAACGGCGGATGATCCAATGTGGCAAGCATGGAAGCGGGCAGTTAGGGCCGTGCTTACGCCCAATGATCATGCTGAACATGAAGTTGATGAGACCGACGGAGAGGATGAATTAGTGCTGCCAGCTGGGGTACGACCAGAACGTCAATTAGAAGAAGTTCAAGCCTATGCAGCGATGAACGCGTTTTTGCAGGCACAAGATCAGGAATATCTGCAAGAAATTGGTAAACGGGCGGCCACTCAGGTCAGTGGTGCCGGGTGGCAAGTGTGGCGTGCACATCGCCAGAGCATGCATCCGGAGTCTGCCGCCCCGCTGACGTTGACTGCTGAGCAATTACCAGCCGTGATGTGGGCCTTTTTCGATAAGTACCAGGATACTGAGGACTCTTTTGAGATTTTTGAATTGGTTAGCCAACTTGAACAATGGCAAAAAAGTGCTGATCGAGATTTGGACGCGCAATGGTCACAGCTTGTGGCGAAAAGTCAGATTGATCCGGCCGCAATTACGCTCATGCAGGGCTTGTCGTTAGCTATTGAGTTCTTTGATCAGCTTGAGTGGGACGGTGATTTGACTGCCAAGGCAACTTTGCAGAATAAATTGATGCAACGCACGCTCGATGACACGCTCAATGATGAGACGACAGCCAACTGGGCGGATGCCTGGCAACACTGGGATTTAGCAGATCCGTTGACAACTGAACAGTGGGCCCGACGGTTTGATCCGGCGGACGACTATGAAGAAGATGAAGACGAGAGTAAAGAAGATGGCTCGGCTCGGCCAGCTTGGCAACTTGGTGCGAGTTATAGTACCGTTTTGATTGCAATGCGCTTAGTCGCTTACGGTGTACTGCGGCCTGAGAGTGTGCCTGGTATGGCAACTGTGAAGATGGCGAACCGTGCACTGGCAGCTACCGTCAGTATTGGTATCGTGTTAGTTGCTTGGCTGGTCACAGCTATTCTGATTACAATTGTAATTTGGGGATGGCGGTGGCTGCGTAAGCTGATTTTTTAGTGCAGCTGAACGGCCAACTGAATCACAATAGTGCCGATTGACTAGGCTGAAGTTTGTGAATCCAGTAGTTGAAGCTGAAAGGACGGGGCGTCAGTGGTAGTGCTTCATGATGGTTTGTAACTCGGACAGAAAGTCGGCATCTAAATGGGGCGATTGTCCTAATTGTAATGGTGCCAATGGCTGATATAACGTTGGTATGTCTGGCTTTAACGGCTGGTTATTGAAGTATTGCTGACCATGGATTTTGACGGTCGCTTTGAGCGTTCCAATCGTCATGACGGCCACGGCGGTATTTAAAAAGACGCCACCATTGAGACTAGTATATCCAGCGGAAGAACGCCCAACTAAAGTAACGTGCGGGTTACGTTTTAGCGCCATGATGGTCACCTCCGCGGCACTCGCTGTCTGGTTACCAATAATGGCATAAATATGACGAAAGTGGGCCGCTGTTGGTTGCGAAAAGTTAAAGTCATCTTGACCGAGTCCACCAGTGATTCGGCCATGGTACATCATACGTGGCCGGTTGCGATGATGGTTCGTGATGCCGGTGTAGAGGGTGCCGTCTGGAATGATGGCGGCCAGGCCAGCAATCATCGGTGCCGAACTACCACCAGTATTTGCTGCGAAGTTTAAGATTAAATCGGTTGTCGGCTTAGTTTGTTTAATCAGGTGCTGGAGTTGTGTCCAATACTGTTTTTGTAATTGGTGCTGACTGCTGTAAAATGCTGGCACATTGATGATGGTGAGGCCGGCACTCATTGTCTTGGTCGGACGGGTGGCATGTTCGAATTGGCGGAGATTGGCGACGGCGAATGAATGTAAATTTGCAGCGCGCAGAATTTGATTGGGTTGGGTCAGTGACGTGATTTTGCGACCATGATCAGTCGCATGTAGCATGGCTTGCCATTGCGTGCGATGGTTGATAATGCCATATTTTGACATGTAGGTGATAGCCGGCATAGCGTTGAAGGACGCACGGAGCCGATTAGAAGCGGAAAGACCAAACGTTAGGACTATCGAAATTAGACCTACCAGTCCGTAACGGCATTTATTCGTTATCATGATAAGCCATCCTTACTTTTCGTGACTAGATTAGCATGTATTGGTTAGCTAAAGTGTAGGCGTGGCGTCAAAATTTCGCAACGAAAAGCATATCTTAACTGGTGCGTCTTTGAAATAATGGTTACTGTTAAAATACCCATCTACATTGGCCGTCTTAACGGCTAAGCAGATGGGTATTTGTTGTATCATGAAATTGTTGACGATTGTGCCAGATCGGCTTCTAACTGGGTTAAGAAGATCGTCACCAAGTCTTTTTCCACCTGGTTCAGTGAATGCTCGGCTGGAAAGGCAATGAAATAATTCAGGGACATTAACGCTTGGGGCAAAGGTAAGATGTTATAGCGTTCTGGATCAGGTTGGGTATGCACACTGTCTGGTAAAAAGGTAATACCCAGTCCAGCAGTGGCTAGTTTGGTGATGGTGGCGGTATTCGTGCTCTCAATTACGATATTCGGTGTCACGTTGTGCTTTTGTAATAAGTAGTCAACTTGGCGTCGAATCGATGACCCGTGGGGAGACAAGACTAGAGGCGCTTGTAGCAGGTCGTTAAGGGGGAGCGCTCCCGGATTAATGAAGGCCTGATGTGGTTGGTACCAGTTGACGGTGTTCGGGATAATCGCGTAATACCCGTCCCGACCGCGGTCATAACTTTCAAGCCCCGGCGCGATGGTTTCCGGATTTTGACCAATTAAGAAGTCCAGTTCACCGTGGAGCACGCGCTGTTCGTTGCGACTAGCGATATCTTCGGTTAATTCGATCTTAGTGGCCGGGTGGGCTTTCAAAAAAGCAGGTAAAAATAGGGGCAATAAGTAATAGCCGAGGCTAGATAAGACGCCCAGCCGAATTACTTGCTGGTTGGCATGTGTGTATTGCCTAATTTGCTTATTAAAGTAATCCTTCTCGTTTTCGAGCGCCGTCAAATATTGATAATAAGTCCGCCCAGCCGTGGTCAGTCGCAGTGGCGTGACTTCACGATTGATGATGGTGACGCCCAATTCTTTTTCAACATTGCGGATGCTTTGGGTGAGGTAAGGTTGTGAAATGTAGAGATCTTTAGCCGCCCGGGTAAAATTGCCGTGCTTGAGCAACACATCTAAAAACCGTCGCATTTCGCTAGAATCTGATTTTGGCATAAAGCGCCTTCCTCTCGCATTGTGATTAGGTGAGTATTCGTTTGATTGCTGATTTGGTCATGTTGAGTTAGTTGCATCGCCATAAGGACGTTCAAAACATGTTCAATAAGTTCTGTCAACATCCTGGCGATAGTGGCTAAATAGCATTATGACCAACCATTTTAACATGATTAATTTTAACGCGAATCGTCGACATAGTAAATTTGTTATCGGGGTATAGATAAATAAATATTTCACAAGCAGAGCGCTTTCACGTACACTAATCAGTATTAAGAGTGGCCAATCATTCAATAGCTACTCGTCGAAAACGACTGTTTAAATCATCCTGAAAGGATCTGAAATTATGAAATTTGTTGGGATTGTTGGGACGAATGCAACCAAATCGACCAACCGGCAGTTACTGCAATATATGCAACGGCATTTTCAGCAACAAGCCACGATTGAAATTTGTGAAATAAAAGATTTACCGGCTTTTAATGAACCGGAAGACCGAACAGCACCAGTAGCAATTCAACAGCTCAGTGATAAGATCACCGCAGCAGATGGCGTGATCTTTGCCACGCCGGAGTATGATCATTCAATTCCGGCCGTACTAAAAAGTGCAATCGAATGGCTGTCATATACCACGCGGCCGTTAATTAATAAACCAGTTATGATTGTTGGGGCCTCGAACGGCTCACTGGGAACCTCACGCGCTCAAGCGCACTTACGCCAGATTTTAGAGGCGCCGGAATTAAAAGCACTGGTGATGCCAAATATTGAATACTTACTAGGCCGTTCACTACAAGCTTTTGATGATCAGGGCGACCTGACTTATCCGGATAAAGTTCAGGAATTAGACAATGCGTTTGGCGAATTCATTGATTTTGTAGATTTAACGAATAAAATCATGCCGTCGAGTCAGTTTTTCGAAAAGAGTAAGCAGTTCTCGTGGCGGCAAGTGACTGGGGAGGAATAAACATGAAATTTGTTGGAATTGTTGGAACGAATGCTCAGCATTCGTACAATCGGATGTTGCTGGAATTTATGCAACGACATTTTGCGACACAAGCCGAAATCGAAATTTTAGAATTGACTGATGTCCCGATGTTTGATGAATCGAATGATCAAACTGACAGTACCATCATTCAAAACTTTGCCACTAAAATTGCGACGGCTGACGGGGTTATCATTGCCTCACCGGAACACAATCATTCCGTGCCTTCCGCGTTGAAAAGCATTATTGAATGGTTATCATTCAAAATTCACCCATTAGATGGTCAAGCAGTAATGATTGTTGGGGCTTCATACAGCGTCCAAGGATCGTCACGCGCGCAACTACACCTGCGCCAGATTTTAGACGCTCCCGGTGTTAACGCCAGTGTCATGCCCGGTTCAGAATTCTTATTAGGTCGTGCCCAAACGGCTTTTGACGATCAAGGTAATTTAAAGGTGCAAGGGACGGTTGATTTTCTGGACAGTTGTTTTGCAAAGTTTCAGAAGTTTGCGACCATCGTCGCCGAGATGCGGGCACCAGAAGCGCTTAGCTTTGCCCCGGGTACTTATCAGGTGACGGCCACTGGACA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP037429|1249614:1260171|1258536_1260171_-|QBK72662.1|transposase|DBSCAN-SWA MQDYYNMNQTTLSIALDYQPEDHHSARYINQLVESLKLKYDYQFGRPREYNLGAMLKLVLLAYSYGIFSSRKIERFARENKPAGWLIADQIPSYRTICRFRISDELATLTTDSLSQLTQYLRQNGMIDDVSFIDGTKILADANKYSFVWKKNTIRFDKMNREKLVDLLGELHEAKIVGEIPAGSELTPELLDIMISKVEDHLVVLNETVEATKQVSPNPAKQQRRTVKSQKRKLDKRRDKMREHQAQQAIYGQRNSYSKTDHDATFMRVKEDPMQNGQLKPAYNVQIATSNQFITGYRLFQNPTDTRTLQPFIEHLKANNVLGHTIVTDAGYGSESNYRYLEDEFGQHTVLIPYGTMLKENSRKWQSDDRKVMNWDYHEKDDYFINPQNVRFNFNAYRRRTDKYGFTRDFKEYIAEKYDENHQLIAAALTPKGYLKRISVNENWEYFKSKQRELLSAPETGQIYAQRKIDVEPVFGKMKASLHFNRFSVRGFDKVTKEAGIVILALNIMKLVTVGTNFKNQRRKQMGRETKITGIVVGARLRNY >CP037429|1249614:1260171|1250943_1251915_-|QBK72654.1|DBSCAN-SWA MITNKCRYGLVGLISIVLTFGLSASNRLRASFNAMPAITYMSKYGIINHRTQWQAMLHATDHGRKITSLTQPNQILRAANLHSFAVANLRQFEHATRPTKTMSAGLTIINVPAFYSSQHQLQKQYWTQLQHLIKQTKPTTDLILNFAANTGGSSAPMIAGLAAIIPDGTLYTGITNHHRNRPRMMYHGRITGGLGQDDFNFSQPTAAHFRHIYAIIGNQTASAAEVTIMALKRNPHVTLVGRSSAGYTSLNGGVFLNTAVAVMTIGTLKATVKIHGQQYFNNQPLKPDIPTLYQPLAPLQLGQSPHLDADFLSELQTIMKHYH >CP037429|1249614:1260171|1254008_1256447_+|QBK72657.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNAQHSYNRMLLEFMQRHFATQAEIEILELTDVPMFDESNDQTDSTIIQNFATKIATADGVIIASPEHNHSVPSALKSIIEWLSFKIHPLDGQAVMIVGASYSVQGSSRAQLHLRQILDAPGVNASVMPGSEFLLGRAQTAFDDQGNLKVQGTVDFLDSCFAKFQKFATIVAEMRAPEALSFAPGTYQVTATGHNGELPMRVTLSADRIENIEIDTSSETQGIADVAFERIPKEIIAGQTLAVDAISGASITSHGVIDGVARAVKEAGANPDDLKKRRATKQVAQPAVKEVTTDVVVVGAGGAGMTAAAKVLQAGHQAVVLEKFPAVGGNTVRAGGPMNAADPDWQRQFAALPGEKQTLKDLSERDESTIAPEYRADFRKLKQQIDAYLTANTNQKGTLFDSTLLHRIQTYLGGQRTDLNGQEIHGQYDLVKELTDNALDSVKWLQSIGVKFDESQVTMPVGAIWRRGHKPMGDLGFAYIKTLRAFVEQQGGTIMTETPVKELLVTDGQVRGVIATNAAHEKVIVHADAVILASGGFAANTKMLQKYNTYWTAIDDDVKTTNSPAMTGDGIRLGTSVGAALVGMGFSQMMPVSDPETGELFSGLQVPPANFVMVNQQGKRFVNEYGSRDELTQAAIDNGSLFYLIADDEIKKTAYNTTQAKIDQQVANGTLFRADTLTDLAHQIGMDPAALTKTIADYNRYVDAGEDPEFHKTAFDLKVAVAPFYATPRKPATHHTMGGLKIDPDAHVLNTDGQIIDGLYAAGEVAGGIHAGNRLGGNSLSDIFTFGRIAAAHAVAEHVDPVTA >CP037429|1249614:1260171|1257950_1258418_+|QBK72660.1|DBSCAN-SWA MRNKLFSVLLGLLTVLVTVIVLGRIGQADDVSTAGLTGNEARVTDRYGNVITDTSQLSKWEDFTVEYDWAIRNGQPIAAGDTELPNGTVAPVDLGFPLKDDNGRVAGHFKIKAGETAGLITFNDALSQMGTNRASTLQFYVKGTADSDVYFDWKL >CP037429|1249614:1260171|1258392_1258656_+|QBK72661.1|DBSCAN-SWA MYILIGSYDEHGLPATLTWNIAFNPSGKKLGTVVVNDTLGSNQSYLSDSVIAQTGAYNDAGNFGFSSHLLTPLIFKVGPYRDQFHNV >CP037429|1249614:1260171|1252100_1253048_-|QBK72655.1|DBSCAN-SWA MPKSDSSEMRRFLDVLLKHGNFTRAAKDLYISQPYLTQSIRNVEKELGVTIINREVTPLRLTTAGRTYYQYLTALENEKDYFNKQIRQYTHANQQVIRLGVLSSLGYYLLPLFLPAFLKAHPATKIELTEDIASRNEQRVLHGELDFLIGQNPETIAPGLESYDRGRDGYYAIIPNTVNWYQPHQAFINPGALPLNDLLQAPLVLSPHGSSIRRQVDYLLQKHNVTPNIVIESTNTATITKLATAGLGITFLPDSVHTQPDPERYNILPLPQALMSLNYFIAFPAEHSLNQVEKDLVTIFLTQLEADLAQSSTIS >CP037429|1249614:1260171|1256534_1257095_+|QBK72658.1|DBSCAN-SWA MQKPMPVAVTNIADNITHQPAYMTIVLNDHKYSTARKKTPFILKALNEGAAAHGRLTITPSRLSLADERGTVFQTLAPIPTVITDVELGLYRSIVRQLGNGVRMKARYTLAVTLTSDTATYQMLNTDLSVLKPLLAWITDFHLHLTDSLQLATSDIDWPNLTADQFEALTKGTPYFAWQQTIGAHW >CP037429|1249614:1260171|1249614_1250853_+|QBK72653.1|DBSCAN-SWA MARDGTVTETNDLKLHALGEIIGMNEQEAYVTTFYWLADCWLETSYLGLEDEFDDDEIDDAVKSLLNRMQAGAIYEVTADDPMWQAWKRAVRAVLTPNDHAEHEVDETDGEDELVLPAGVRPERQLEEVQAYAAMNAFLQAQDQEYLQEIGKRAATQVSGAGWQVWRAHRQSMHPESAAPLTLTAEQLPAVMWAFFDKYQDTEDSFEIFELVSQLEQWQKSADRDLDAQWSQLVAKSQIDPAAITLMQGLSLAIEFFDQLEWDGDLTAKATLQNKLMQRTLDDTLNDETTANWADAWQHWDLADPLTTEQWARRFDPADDYEEDEDESKEDGSARPAWQLGASYSTVLIAMRLVAYGVLRPESVPGMATVKMANRALAATVSIGIVLVAWLVTAILITIVIWGWRWLRKLIF >CP037429|1249614:1260171|1257165_1257606_-|QBK72659.1|DBSCAN-SWA MAQIYIASPFFSPEQVTRVTQLEEALAKNPTVTDFYSPRLHQDAQAEQFTKTWATEIFHRDMAQIAAAQVIVTVLDFEAKNLDSGTAYELGVATMRDLPIIALQEKDEAVNLMITESLHWYTKQVSDFETYDFQQLPKGDFIGEIL >CP037429|1249614:1260171|1253391_1254006_+|QBK72656.1|DBSCAN-SWA MKFVGIVGTNATKSTNRQLLQYMQRHFQQQATIEICEIKDLPAFNEPEDRTAPVAIQQLSDKITAADGVIFATPEYDHSIPAVLKSAIEWLSYTTRPLINKPVMIVGASNGSLGTSRAQAHLRQILEAPELKALVMPNIEYLLGRSLQAFDDQGDLTYPDKVQELDNAFGEFIDFVDLTNKIMPSSQFFEKSKQFSWRQVTGEE |
10 | Lactobacillus_phage(90.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1810378 : 1817610
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP037429|1810378:1817610|DBSCAN-SWA TTTACAGTGTCTCACTGCTCCTTTCTTTATTTTGTGCGTTGAAACCTGATAAATCAGGTCCGGAATTATCCTTCTTTTCAATTAAATGATCTTTCATTCGATATGATCGACCAGTGATTCGGATAACTTTAGCGTGATGAACCAAGCGATCTAAAATGGCGTTAGCTAACATCTTATCTGAAAAGGCGTTTCCCCACTTAGAAAGCGGAATATTAGTGGTGATAATGGTTGATTTCCGTTCGTATCGTCTTTCAATTAACTGAAAAAACAGCTTAGCGCCCACTGACTCAATTGGAAGATAACCAATCTCATCAATGATTAGAATTTGAAAACGGGCATACCGGCGTAGCACTTCTTCGCTCCGGCCTTGAACTTGTGCTGTTTGAAGCTTGTTGATGAGGTCGCTACATCGAATAAACTGCGTTGAAATTCCTTGTTTACACCCTTCAATTCCAATGGCGGTGGCTAGGTGAGTTTTACCGACACCGGAGGTGCCGACAAACAAAACGTTTTGATTCTCTTGGGTGAATCTTAGTGATCCCAAGTCCTCAATTATCCCTTGGTTAATTCCCGGTTGATAACTAAAGTCAAAGTCAGCTAACGTTTTTTCATATGGAAAGCGGGCTAGTTTAATTCTCAAATTAATCTTTTTTTGTTCCCGGTATTTAAGCTCAGCCGTTGTCAATTCGAATAAGGCATCACTCAAGGACTTGGGTGCTTCATCTTGATGATCCAATAGGTAGCCTAAATGTTCGGCGAAACGATCTAACTTTAATTGTCTAAGGTTGGTGTATAAAGCTTGGTAATTGGCCATTTTCTCACTCCATTTCATCAAACATCTTCAGGTTTCGGTCGACGTAATCATCAATGACTCGGTCATCACGATTCTTATAAAGGTCTGATCGGACAATCTCTTCCATGTCATCGCGAAGGTAAGTAAATCTTTTCAGTGAAATAGGGTGAGAACGAATTAATTCTCCGTTATAATAAATGTATAGAGTATTGTCATCGTGTTTAATTTGTACGGTTTCGTCAATATATCTTATGGGGACGGAGTATTTCCGATTTTGAAAGACAATCATTGATTCCTTGCTAACTTTCCTTGCGATGGTTTGGCTGGCATAGGCATCGAGTAAGTCGTGATCAAAATCATGGAGATACTCTTTTTCTTTATCAAGCAATAAATAAGGCGGAATTTGAGTCGCCTGAGACTTCTCATGATTCAGCTGATCACACGTCAAATGGACGATCTCGGCTAAGTCTAGCGGCTCTTCAAACTCGTGGTTGTAAACTTTGATTCGCTGAGTAGTTCTGGCCAGCGCCTCAACCTTTCCTTTGGTTTGTGGCCGAAACGGTCGACAAGCAATTGGCTTGAAACCAGCGTCCTTAGCGTATTCAACGAAGGTTTCATTAAATACCGGCTTACCAAAATTACTTTTATGATGATCGACGACAACCTTTTGGTTGTCAAACCAGATTTCTTTCGGCACACCCCCGGTTGCCCAAAAGGCATTAGTTAAGCAATCAAAAAAGGTAATTTGGCTGCGACTGAAGGTAAATTGCATGTATTTCATTCGCGAGTACCCTAAAACATATAAGAAGATGTTGCCTTTGACAATCTCTCCATGCCGAGAAACCAACGTTAAATCTTCTTTCCAATCAACCTGGGCTGAAAGCCCTGGCGAGGTTTCAATCCGGATAGTGGCTTTTTTCGTTGCGGCTTTTCTGATGGTTCGACAATAGTCTCTGAGAATACTTTGCTTTCCTTGATAGCCACGTTCTTTGATAAAGTAATAAATTGCCGTTGCCGAACAGCCTTCTAGAACCTTTTCTTCAATCGTTTTTCGATAATCGTCAAGTTTACTCGGCCGCCGTAAGGGTTGTGGCTGCTCATCTGGGGGCGTAAGCCCTAAATTGTAGTATCTTTTTACCGTTCGTGGATCAACACCGTATCGCCGACCAATTTCAGCGAAGTTGGGCTTTATTTTGTTCATAATATATTGCTGGACACACTGCTCAACATCTAAACGCATTTCAGTTCCTCCAAATTTGAGATGCGTTTATTTTACCGTAAAAAAATGTTGGAAAACCGACATTTTCTAATCGGTATTTTCCAACATTTTACAACCGTTGCTGATAGCCATTGACCCAAACCTTTTTTATCAATGAAAAAAACACATCACCTACTTTCGTAAAATGTCATGAATTACAGCATTGTTTGCTTGATCCTACGGTTGAACCATTACATAGATACTAGCATGGTTTCCAATACAAAAATTGAATCACGGGCTAATCGTGGTGCATTCTATATTATGTTAAATCATTACCCCAGTGAAACCGGCATTGAACCACAAGATTTCAATATCTTGCATTTTGCTAACAGTTACAATTTAGAATCAAAACATTTATTGTTTATTCGTAATGTTGCTGAACAAGAGCTTGGTATTAAAATTAACCAAGGCGCATTCATACTTTAGTGACTATGTATGATAAATACTAGATTTATAAGATATTTACTTTGAAAATAAAAATTTGGAGGAAGTTACTATGAGTAAAAAATATGATGTTTGTGGAAACAAATTAAAAATGTTTAAGTCCGTTCCTGTGATTGATGGTAAAGTCTGCCACGATTGTATGAAGAAAATTGGTGTGGATTACGTTGAGCTACCGCTTTCAATGTCTATAGAAGAAATTTTGACTGTTAAAGAAATTAAAGACTTACAAGCTAACAACCAAATTATTGATCCACAAAAGCGCTGGGCGGAGTATAAAAATAAGTTAAAACAAGAAAAAATTTAAAAAAAGAAGATATCTCTGCTGAAAAAGATAAATACGATCAACTTAAGGCTGCCATTAAAGCAGATGAACCTGTCAAAAAAGGTAAAGTCTATTTAGATTTTGTTAAAAAGCAAATCTTCATTGATAAAACTATTCTTGAAGACTATCGCCTTTTCAGATTTTCAGATTTAACTAGTTACAAGACAATTAAAAGCCCTACCACTATTAACAAGAATCATAGTTTGTCTCGTTCCATAGTCGGTGGCTTAGTTGCTGGGCCTACCGGTGCTGTATTAGGTGCTTTTTCAGGAAACAAGTCCTATGACGCAGTTTCAAAGATGGCAGTAGTTTTATACTTTAATAACAACTACTCTAAGCAATTAAACTACATATCCACTGAAACAAAAATCGACAGCATGTACTATCGAGATGAACAAGAAAAAATGCAACGATTCTGTGTTCGATTGGATAAAATTTTAGTCGAAAATGAAAATAATGAACCTACCACTCTATCTACACCCACTAACAGTGCCGATGAGCTACGTAAACTTAAAAGCCTCCTGGACGATGGCATTCTAACCGAAGAAGAATTCGCAGCAAAAAAGAAACAAATTCTGGGGATCTAATCACTGTTTATTCATAATGTTGCTGAACAAGAGCTTGGTATTAAAATTAGCCAAGGTGCATTCATCCTTTAGTTAACTGTGTATGATAAATACTAGATTTATAAGATATTTACTTAGGAAATAAAACTTTGGAGGGATTTAATTATGGCTAAAAAATGTGATATATGCGGAAAGAAAATCGGACTCATGGCTAGTCGGCTTGACATAAAGGATGGGATTATGTGTGTCGACTGCTCAGAACAAATTGGATTAAAAACTGGCCTGCAGTCTATATCCGTCGCCAAAGATTTGACTATTGATGATGTTAAAAGCTATCAAGACTCCCATACTAAAATAGACATCGCAAAGTATTTAGACGATATGAAAAGCAAACCTGCTGAGCCTTCACAGAAAGATTCTAACACTAAAATCAAACACCCTTGTGCGGTTTGTAATCGTGAAATAGGTTTATTAGGTGGCTTCAAATTAACTGATGGAAAAATTTGTGACGACTGTGCTTCTCGAGTTGGTTTAAAAAATAACTTTAGCTCACAATCTGCCGTCGAATATTTAACTGTCCAAGATATCAAAAATTATCAAGACACTAATACCCAGATAGATTTAAAGAAATATTTAGATGATATGAAAAACAAACCAACCGTATCTGCTCACCAGGATTCTAATACTAAAATCAAACACCCCTGTGCGGTTTGTGGTCGTGAAATAGGTTTATTAGGTGGCTTCAAATTAACTGATGGGAAAATTTGTGACGACTGTGCTTCTCGAGTTGGTTTAAAAAATAACTTTAGCTCACAATCTGCCGTCGAATATTTAACTGTCCAAGATATCAAAAATTATCAAGACACTAATACCCAGATAGATTTAAAGAAATATTTAGATGATATGAAAAACAAACCAACCGTATCTGCTCACCAGGATTCTAATACTAAAATCAAACACCCCTGTGCGGTTTGTGGTCGTGAAATAGGTTTATTAGGTGGCTTCAAATTAACTGATGGGAAAATTTGTGACGACTGTGCTTCTCGAGTTGGTTTAAAAAATAACTTTAGCTCACAATCTGCCGTCGAATATTTAACTGTCCAAGATATCAAAAATTATCAAGATACTAATACCCAGATAGATTTAAAGAAATATTTAGATGATATGAAAAACAAACCAACCGTATCTGCTCACCAAGATTCTAATACTAAAATCAAACACCCCTGTGCGGTTTGTGGTCGTGAAATAGGTTTATTAGGTGGCTTCAAATTAACTGATGGGAAAATTTGTGACGACTGTGCTTCTCGAGTTGGTTTAAAAAATAACTTTAGCTCACAATCCGCTGTCAAATATTTAACTGTCCAAGATATCAAAAATCATCAAGACTCTCATACTCAGATAGATGCCAAACAATTGCTTTTTGACAATAAATCAGAATATGAAAAATTACTGATTACTTTCAAAAAAGAAGGTAACGGTCATATCGGAAAAGTTTATCTCAGTGACAAACGCAAACAATTTTTAATTAAGCTAAGTTTCATGGAAAACTTAGCTGATGAACCATTCCAACTATATGACTACAGTGACTTAGAAGGATATGATCCTATTGAAAATGGGACTACTATTGAAGATAAACATGGACTATCTCGAGCAATAGCTGGCGGTTTAATTGCTGGTCCAACTGGTGCTGTATTAGGCGCATTTTCTGGTAATAAATCGTATGCTGCCGTTTCTAAAGTCTCTGTCGTGCTTTATTTCAAAGGCGACCATCGCGTGGAAGCAGTCTTACTTAACGAAACTACTAAAACAGATAGCAGTGCCTACCATATCACTCAACAAGAATTACTTAGATTCTGCCATGATCTTGATACAATTATTGCCAACAACAATAGCAACGTTAATGAACCTGCAACTCCAGTCTCTGCTACTGACAGTGCCGATCAACTACGCAAACTCAAGGGACTTCTTGATGATGGTATCTTAACTGAAGAAGAATTCACAGCAAAAAAGAAACAAATTCTTGGGATTTAATTAAGGGGGAAATAACATGTGGTTACTACTATTAATCTTGCTCATAGTCGGGGCATTTAAACTTATGGGTAAGGCTGCACGCTACGTTGTTCTCGCAGCAGTCCTGACTTATCTCTACTACCTTGTTAAAGGTATCTTCTCATTCATCTGGCGAGTTGTATCTAGTACGCCAGGGATAATCACCATTATTACTATTGCGTTAATAGTAATTGTTTATTTCATTGTAAAAGCTAATAGATGTGACGTCTGCAATAACAAGCACAAAAGTGATGAGTTAGTGCACATTCAAAATGGTAAAGTCTGTACTGATTGCTTACAGAAAATTGGTGTTGACTACACTGCCCTCCCGAAGGATGTACTAGTTGAAAAGACACTTACTGTGCAAGAGATTGAAGACTTACGAGATAGCAATACTATCATTGATCCAATTCAACGTTGGGAAAATTATCAAGAACAGCGGAAGGCCAAAGAACAAGCAGCTAACTCAGCCAATATTGTCCCCACTAACATCGGCTCAAGTGAAGTTGATGAGTTGCACGAATTGAAACAGCTGCTTGATGACGGCGTGATTACCCAAGACGACTTTGATGCTAAGAAGAGACAGATTTTAGGACTGTGAATTATTTGGCCGAATCAGATTGGAGACTGTTCTAATGGATATTAAATTTATTTCCACTATAATTATAACAATATAACCCACCGCATTTGCAATCATCAGATATATATACCTATACGCATTGTGCTAGTTAATTAACCAAGACTTTAGTTGTGAAAAAATGCCTAACCAAGCTACACTTCAAGCAGCGCAAACAAAGGAGTGTGTCTTATGTTAGACCAATTTTATCATAACCAATTTGTGATTAGTCCGCGAGCAAATTCAAAACCGCCGTAACGTCAATCAAGGCAAGCTTTCAGACGTCTTATTGTTATCATTACTTTGTTGACAAGTTGATTTAAAAATGACCGTCCGAACTAGGTTCTATGAAGTGACCCCCATAAATTGGAGTAAATTTCTAAGCTGCTAATTGGCTGGTATATTCCCGATATTTTACCGGGGACATACCGACCAATTTTGTTTTGATACGACGCTGATTGTAATAATCTACGTAGTTTATAATGGCGGATTCTAGCTCTTCATAGTTCTTGTATTGATAATTGTGAACCGTGCCAACTTTAAGAATGTGAAAGATACTTTCAGCTACCGCATTATCTAGGCATGTGGCCTTGCGGCTCATGCTTTGGAAAACGCGAGCTTGTCGCAAAATATTCACGTACCTACAGTTCTGATACTGAACCCCTGATCCGAATGAATTATCATACGGTATGGTAAGCCTGAACGTCTTGCCACTAATCGTTCAAGGGGGTGTGTGACGAAGGCTACCGTTGGTTTACGTCCAATGGCCTATTCAATAATTTCTCCGTTATAAAGGTCAATATAAACTGTAAAGTATGCACGTTTGTTGATTGTTTGATTCCCCCAACGGACCTCCGTTACATCAGTAACGATTTTTTGAAATGGGCGATCCATTTTAAAACGACGGTTTAAACGGTTATGAGCAACTGTACCAACAGTTCCTTTATAAGAGTTATATTTCTTCGTTCGACGATTGAATGCCTGACAAAGGAGATTATTTTCACGCATAATACGAAGTACTGCCTTGTGATTAACGTTGATTCCCTTATTTTTAAGCGCTAAAGTCACGGTTCGGTAACCGTAATCGGGATTGGCCAAACGAACGCTTTTAATCTCATCAACTAACGTTGATGAGCCTGATTGATATTTACAGTGAAATGCATCGTGGTAATTACTACTCGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP037429|1810378:1817610|1810378_1811191_-|QBK74437.1|DBSCAN-SWA MANYQALYTNLRQLKLDRFAEHLGYLLDHQDEAPKSLSDALFELTTAELKYREQKKINLRIKLARFPYEKTLADFDFSYQPGINQGIIEDLGSLRFTQENQNVLFVGTSGVGKTHLATAIGIEGCKQGISTQFIRCSDLINKLQTAQVQGRSEEVLRRYARFQILIIDEIGYLPIESVGAKLFFQLIERRYERKSTIITTNIPLSKWGNAFSDKMLANAILDRLVHHAKVIRITGRSYRMKDHLIEKKDNSGPDLSGFNAQNKERSSETL >CP037429|1810378:1817610|1813925_1815791_+|QBK73173.1|DBSCAN-SWA MAKKCDICGKKIGLMASRLDIKDGIMCVDCSEQIGLKTGLQSISVAKDLTIDDVKSYQDSHTKIDIAKYLDDMKSKPAEPSQKDSNTKIKHPCAVCNREIGLLGGFKLTDGKICDDCASRVGLKNNFSSQSAVEYLTVQDIKNYQDTNTQIDLKKYLDDMKNKPTVSAHQDSNTKIKHPCAVCGREIGLLGGFKLTDGKICDDCASRVGLKNNFSSQSAVEYLTVQDIKNYQDTNTQIDLKKYLDDMKNKPTVSAHQDSNTKIKHPCAVCGREIGLLGGFKLTDGKICDDCASRVGLKNNFSSQSAVEYLTVQDIKNYQDTNTQIDLKKYLDDMKNKPTVSAHQDSNTKIKHPCAVCGREIGLLGGFKLTDGKICDDCASRVGLKNNFSSQSAVKYLTVQDIKNHQDSHTQIDAKQLLFDNKSEYEKLLITFKKEGNGHIGKVYLSDKRKQFLIKLSFMENLADEPFQLYDYSDLEGYDPIENGTTIEDKHGLSRAIAGGLIAGPTGAVLGAFSGNKSYAAVSKVSVVLYFKGDHRVEAVLLNETTKTDSSAYHITQQELLRFCHDLDTIIANNNSNVNEPATPVSATDSADQLRKLKGLLDDGILTEEEFTAKKKQILGI >CP037429|1810378:1817610|1817193_1817610_-|QBK73176.1|DBSCAN-SWA MSSSNYHDAFHCKYQSGSSTLVDEIKSVRLANPDYGYRTVTLALKNKGINVNHKAVLRIMRENNLLCQAFNRRTKKYNSYKGTVGTVAHNRLNRRFKMDRPFQKIVTDVTEVRWGNQTINKRAYFTVYIDLYNGEIIE >CP037429|1810378:1817610|1816804_1817026_-|QBK73175.1|DBSCAN-SWA MSRKATCLDNAVAESIFHILKVGTVHNYQYKNYEELESAIINYVDYYNQRRIKTKLVGMSPVKYREYTSQLAA >CP037429|1810378:1817610|1815807_1816410_+|QBK73174.1|DBSCAN-SWA MWLLLLILLIVGAFKLMGKAARYVVLAAVLTYLYYLVKGIFSFIWRVVSSTPGIITIITIALIVIVYFIVKANRCDVCNNKHKSDELVHIQNGKVCTDCLQKIGVDYTALPKDVLVEKTLTVQEIEDLRDSNTIIDPIQRWENYQEQRKAKEQAANSANIVPTNIGSSEVDELHELKQLLDDGVITQDDFDAKKRQILGL >CP037429|1810378:1817610|1812578_1812854_+|QBK73170.1|DBSCAN-SWA MNYSIVCLILRLNHYIDTSMVSNTKIESRANRGAFYIMLNHYPSETGIEPQDFNILHFANSYNLESKHLLFIRNVAEQELGIKINQGAFIL >CP037429|1810378:1817610|1811195_1812410_-|QBK73169.1|transposase|DBSCAN-SWA MRLDVEQCVQQYIMNKIKPNFAEIGRRYGVDPRTVKRYYNLGLTPPDEQPQPLRRPSKLDDYRKTIEEKVLEGCSATAIYYFIKERGYQGKQSILRDYCRTIRKAATKKATIRIETSPGLSAQVDWKEDLTLVSRHGEIVKGNIFLYVLGYSRMKYMQFTFSRSQITFFDCLTNAFWATGGVPKEIWFDNQKVVVDHHKSNFGKPVFNETFVEYAKDAGFKPIACRPFRPQTKGKVEALARTTQRIKVYNHEFEEPLDLAEIVHLTCDQLNHEKSQATQIPPYLLLDKEKEYLHDFDHDLLDAYASQTIARKVSKESMIVFQNRKYSVPIRYIDETVQIKHDDNTLYIYYNGELIRSHPISLKRFTYLRDDMEEIVRSDLYKNRDDRVIDDYVDRNLKMFDEME >CP037429|1810378:1817610|1813397_1813781_+|QBK73172.1|DBSCAN-SWA MSRSIVGGLVAGPTGAVLGAFSGNKSYDAVSKMAVVLYFNNNYSKQLNYISTETKIDSMYYRDEQEKMQRFCVRLDKILVENENNEPTTLSTPTNSADELRKLKSLLDDGILTEEEFAAKKKQILGI >CP037429|1810378:1817610|1812924_1813176_+|QBK73171.1|DBSCAN-SWA MSKKYDVCGNKLKMFKSVPVIDGKVCHDCMKKIGVDYVELPLSMSIEEILTVKEIKDLQANNQIIDPQKRWAEYKNKLKQEKI |
9 | Lactococcus_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2111211 : 2146627
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP037429|2111211:2146627|DBSCAN-SWA TCTATTTGATAATCAATTTTGTGCCCGGATAAATCGTTGAATAGATACTATCACCGTTTTGCGCTGCCAACGTGTAGACGCTTAAACCGTTGCGTTGAGCAATCGCCCACCATGAATCACCGTACTTGACCGTGTAATACGTGTGAGAAGCACTAGTTTCGACGTATTCCAGCGTATTGCTTGCTGGGCCAGTTGCTAGATAGCCATAACCATTAAAGCGTGGCTGGCGTACCCAACGATAGCCGCCCTGAATAATGGCCTGATCAGTCTTGACCGTAGTTCCAGCTGGCAAAATAGCAATCGTGTTTGATGACGTTGAAGCACCAGTACGGAGTTTTACCGCCTTCTTGAGCGTGTAAGTCTTCGACTCCTTAACCCACTTGGCTGACGTAGATGGCTTGGAAGTGTGTTTGTTAGCTTCTCTGTTGTTATCTTTGACTGCATCTTTATCAGTCGGCTTGACAGTTGATTTCTGATCAGCAGTGTAGTAGTTGCTATTTAATTGGCTAACATCGAAGCCCCCATAGCTAATACGAAACTTAGCCGTTGATGACCACTGCCATGCGTGGTTAGTTGAGTACCAGTTTTTGCCACTGACAACATATGGATATGACGCAATCCAACCAGTTCTACCTTTAATAGTCATCTTGTTATTAGCCCATGATCCTGACGTATAAATATCAGTTCGGTAGCCAAACTTTTGAATCTCTTTCATGAAAGCCGCATTATTACGATCATTCGTTGCCTTAGATTGGTTGTTGGCTTCCTGTGATTCCACATCAGTCGCTAGTACCGCGCCAATAGGTAGTCCTGCTGCTTTAGCCGCTTGACCGGCAAAGTCAGCTTCGGCGATTGCTTGTGCCTTAGTGGCGTAGCGTGCAAAGTGATACCCATTGATATACAAACCAGCGGCCTGAACATTGGCAATGTTACTAGCGGCATATGGGTCCTTGTACGTACCGCCTTCACTAATCTTGACCGTGACAGCCTTAACGCCAAATTCATTACGCATTGACGTGTATTCGGCCGTTGACATATAGCCGTTGTTATTCGACACATCGACCATATCCATACGAGCGGCGCTGGCATTCATGCCTAAAAAAAGAGCAGCCATTGTGGCCGCTCCTGTCAGTGCTAGTTTATTTTTGAATTTCACCCTGATCGCCTCCATTTACTTTTGTTGGTGCTTCACTACCCTTCATAATAGTGTCGTTATCGAAGTAAGCAATCAACGCCGCTACAATCGTAAACGTCAAACTTACCCAGTCGTTAACTTGATCGCTAGTAATCGGCAATAAGTTGTGACCAGTAAGTGATAATCCTTGATTTACCAAGGCCAATAATAGCACGGCAAACTTGGCCACACTCGTTTTATTAATGTTTTTCCAAAAATCCTTCATAATCAATTCCTCCATACTTAGCGTGATAAGCATCATTTTCAGCTTTAAGCAGTCTGATTCTAGCCCGTAAACGTTGATTTTCCTCTTCTTTCAACCCAATCTGCTCATTAAGTTGCCGCACAGTGGTCTCGTGTAACTGACGTAGCTCTTGATAGTCATGCTTAGCTTGCTTGATGTCAGCGTTAGTCTCTCGATTTTGTTGTTGCATCACCCGCATTACATACTTCTGCATTGAGTTATCGTCACGTTTGTTCTTAATCCATAGGCCACCCACGACGCCCACCACAGTACCCACGGCCGTCAGAAACTGGCCCAGTGGGATTAAGTTGTGTGTGGTCCAATCAATCATCGTGCCAGCCTCCTTTTATTGCCGTGCCAAATAGTAGTGCTAGTGCCAGACAAGCAAACAACCAAGTTAGATTAAAACGGAAGTCAAAAAAACCCCGCACAATAAAGGCGAAAGCTAAGGAACCGTATAAAGGGGCGATCATAATCAACCCGACATTGCGAAAAAGCCGTTTGTCCAGCAAGACGCCAATCAGCAGGATTATCCCAGCCAATACCAATAAACTTGCGAACCACCAATCGTCCGCAAAGCCAAAACTAGCCCGTTCCCACATTGCGGGAGGCGGCGGTGTCGTAATGCGAGGATCATCTAAATAGTTCAGATGGTCAAAAACATACAGCCCACCAATTAGTGTAAACAGGCCATAACTGAAATAAGACCAGTACACGAGAATCTGCTGGCCTAATCGTTTTAATTTATTGACCACATTCCATCATCTCCATTGCTTTGTATCCCATTCAAAATTATTGTATAAAAATGGCGCCCGCCATTAAGACGAGTGCCTTTAATTTGTGCTTATTCAATTGTCTGCCTCCTACATCAGCCGCCCATAACAAAAGCCCCGCTCGTTTGAGTGAGGCTTACTTATGTACTGTTTATTTTCTAAGCGACAATTTGTGTTACTAAGCTGGTTGAGTTTTAGCTACCACATCATAATCTTGACCAGTAACTGTCTTATAGTCATCTTTACTGATTGCGCCACACTGAACATAGACTTTGTAGAAATCTAAATTATGATTTCCCCAGTCGTTCCAAAAAAATTGAAGCATTTGTACTTGTGTCATCATTATGCTGTTACCTCCTTAGTTTTTTCGATTGCTTGTTGCTGATTAGCAGTCATAAACATTTGTTGTAATTATTTAATCTGGGTTGCTTGTTGAGCATTAGCAGCCTGCAGCTTTGCATTCGCTTGGTTCTGTTGCATCATCATAGATTGAAGAATAGTAATCTGTTGTGCTTGTTGCATCAATAACTGTTCTGTTGATGAAGGATTGTGAACAACGATTGGTTGGGGCGGTAATTCTCCAGCTTGCAAAGCATAATCATCTGGCACTGATACCTCCCGAATACCAATTTCACTGACCCGATAAATTACTTTCATTTTACCTACCCTCCTAAACTTGAACCCAAAGATTACCTACTCGTAGGAATTCAATCGCTTCATTGACTTGAGTCTTATAATCAGCGCTTCCTCTCATCACTAGATGATTGTCTCCAGCGCTATCAAGATTACCAGCGTGATGGAACGTAATGGGATTCCAGCAAAAGCAAACTAATCGCCGACCATTTTGATATTGATAATCAGTCACCGGAGCAATCGTCGCAATTGTCCGAGCCTCACCATTGGTTGCCAGTACTACATAGGATTGATAAGGGTCAAGAACGACTAGATCATTTGTAGAATTATCCGCCGTATAACTAGAATAGCTTTGAGCGGATGCATAACCCGAAGAATGCTGATTCATCATGTCTTGATGACTAATATTTTTTTGTGCCATGCCTGCAAATAGAGCGTCAATACGTGAATAGCCATTGTAATGAATGTTAGCCACCTTGTCGTAGTTAGCCTGCGTATTACTGTCTAAATATGTTCTGAAGAAAGTTGGTTGAAGATCAACAGCACTAATGCCGTCTCTTGTCTCCATCCAGAGTTCAACTTCAAATTCAACTGTTTCACTACGAGTCGTTCTTGTCCAGAATACGTAAAATTTATAAAATTCAGAAGTATCATAAAATCCTGTGAGCGACTTTGTTCCAATGTTGACAGCTAAATTATCCGGTTTATCAAAATAAGCTGAAATATAGACATCACTAACGTTATGAACCACATTGTCTTCACCGTTTGTACAACGAAGTGCAAGTGTGAACCGTCGAGCTTTACGCTCAACTTGTTTCGTGATCTGCGTGGGATCACTTTGTAACTTCAGTGAGCCAAGATACGTACAATTATTTTCATCGAATGACGGTGTTGAATAAACCTTGTACTGATCGTATTGTGGAATCAAATTTGTTGTAGGGCCAAGAACGTCATTGTTGTAAGTAACAGGCATTATATCAGCTTCCTTTCAATATAGCTTTTTAAGGCTTGTTCAGCAATTGATAAATTATCAGTACTATTTGAATCGTCAAAAAACGAAAACGGTTTGTTCAAATGCCACCAAGCGAATCCGATGATATTGCGATCTTCTTGCATGAAGCGGAACAGTGCCTTCATGAGATACGCAGTTACTTCATAGTCATTAGCGCCTTTGCTTGAATCGTAGTCTGAAGGTATCAGTGCCGCCAGCCCTCCCATCGTTGGGATACAACCAGTTTCGGTGATTAAAGCCGGTTTCTGTAACTCATCACATACTTGGTCAATATCGGCGGCGATATTCTCACCGGTGACCGTGTTATAGAACGCTTGAACTAGATAGGAAACAGGTAATGACTCATCGTAACTGTCAATAATGTAACCTGGATAGACGTTAAGACCGATAATGTCTAATTTTTGTAGTAGGTCCTTATGCTCCGGATCAACAATTTCAAAATTCATATATGCGGCAGTTAACTTTAGATTCTGATATTTCTGACGAATTTGATTAATGATGTCTGTCCAGTAATCCAAGTATTTGTTTTGTGTCAAAATGTAGTGCTCGCATTCAATACATAGGATTGGAATATTATTCGAATTGCAGATGTCTGCATAGGACATCAGTATGCTACCCCAGTTTTTCATCGCTGATATTACATCGGTAGGATTATAATTTGCCCGATAAAAATTATCGGACCAATTTATACCAAGATGTGGCTTTAGCATTTGGATGGGGACGCTATGTTTTTTGCATAAATCTATAACACGTTGCATCTCATGACCATAAGATTTTGTTGGATTAGCGTCAGTCGCGCTTTGAATATTAACCATATCAACCAAAGCTAAACTAGCTCCGATGGTAGCCAGATGCTCGATCTGATTTTCTGAAATAGTTCCGTTTACGCCTACAGGATCGGTAGTTCCAGAAACCATTTTATAAGGAAGAACACGATAACCATTCTGATTTAGCGTTTCAATCTGGGCGTTCATCTTTGCGACATCATCTTGATATGTGGTTTGAAATTCTGCCAATCGTTCAGTAACGACGTCTTGAATAGTTTGCTTAAAAGCATCGGCTTCGGCCTGCGTAAATAGCCCGTCCTGTGTGATCTTGGTTTCTAGATCACTGATCTGTTTCTGGAGATTCTGCAACATCGTCTGGGTATCAGTTCCCATCTTG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MQKSFNYQDGFGEELSLAINPSSGFLLATDDVGGDSVAMSISFDELRRLAKLIDDEVPHGENDKK >CP037429|2111211:2146627|2145751_2146048_-|QBK73486.1|DBSCAN-SWA MEVTQEQLHEMVQSEVNAAIAAKSLAPVKAKNTAWMELKNDISKFVNEKYGKNPKAYSLSDAVKTIIRFHVGVSNVYQINESNIDEARRIFELLKANI >CP037429|2111211:2146627|2135281_2135461_-|QBK73462.1|DBSCAN-SWA MAKMIRSKYGYEPPEWVQADARLDKWYKDKKRRAKQHGAFSLDKNKEVQHASTKEAGSY >CP037429|2111211:2146627|2144045_2144177_-|QBK73483.1|DBSCAN-SWA MNGYDSWLIDQEEAAEGWRDDEPTEEELIESGVIADEEDDEND >CP037429|2111211:2146627|2114071_2115007_-|QBK73440.1|DBSCAN-SWA MPVTYNNDVLGPTTNLIPQYDQYKVYSTPSFDENNCTYLGSLKLQSDPTQITKQVERKARRFTLALRCTNGEDNVVHNVSDVYISAYFDKPDNLAVNIGTKSLTGFYDTSEFYKFYVFWTRTTRSETVEFEVELWMETRDGISAVDLQPTFFRTYLDSNTQANYDKVANIHYNGYSRIDALFAGMAQKNISHQDMMNQHSSGYASAQSYSSYTADNSTNDLVVLDPYQSYVVLATNGEARTIATIAPVTDYQYQNGRRLVCFCWNPITFHHAGNLDSAGDNHLVMRGSADYKTQVNEAIEFLRVGNLWVQV >CP037429|2111211:2146627|2125448_2125967_-|QBK73448.1|DBSCAN-SWA 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>CP037429|2111211:2146627|2124810_2125452_-|QBK73447.1|DBSCAN-SWA MSFTEINTNSIVFQKHRYRLDLSFRMVLLYFKAIRDEGLTIPERVEVSLKALVLDDTSKLRFEDKGQLLSEIFNTKINNDRDRVRAKVLKSGKRSFDFDEDESLIKAGFQQQYGIDLDRDSLSWERFTTMLDGLNEDTQFKKVVRFRLAKVSDDMDADMQTYLKQMKLIYGLKQAHTDGDGKLTPDELSIELANLDMPHKALRMKELREQGKI >CP037429|2111211:2146627|2113579_2113744_-|QBK73438.1|DBSCAN-SWA MMTQVQMLQFFWNDWGNHNLDFYKVYVQCGAISKDDYKTVTGQDYDVVAKTQPA >CP037429|2111211:2146627|2116682_2116973_-|QBK73442.1|DBSCAN-SWA MTAQLATNELSAVNDEPFRKVLISNFEIIQQYLNKFDELADEVNSDQSQQSADLDKKFTDMQQQMNDKINRITMGTDEDTIRLVVTAILQEQGVIK >CP037429|2111211:2146627|2127543_2127933_-|QBK73452.1|DBSCAN-SWA MDDIIDPIPIELLDDAIEVTPCDANKAKQDSWTTSSDSDGSDDYTIRHVRVEPATSVSVQSVIGNASVQVVTGAYTLIVDSTNSTPLDRLPKLNDKIEVQSTHQSLIVKSLDPIYDFGTHVHHWEGVLQ >CP037429|2111211:2146627|2136369_2136579_+|QBK73464.1|DBSCAN-SWA MNLIPVISSDLSEVGYNPSTQQLEIVFNSGGVYLYSDVTSDEYQGLMNASSKGRYFHASIIHHPYVRIN >CP037429|2111211:2146627|2112349_2112646_-|QBK73436.1|DBSCAN-SWA 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56 | Lactobacillus_phage(56.25%) | tail,capsid,plate,terminase,portal | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2153502 : 2164437
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP037429|2153502:2164437|DBSCAN-SWA CATGTCAGTAACAAAACTTAATAATGGTAAATGGCAAGCCCGTGTCTCTTATAAAGATGATGACGGTAGCTATAAGTCGGTTACTCATTTAGAAAAGCGCAAAACTGACGCTGTTGAGTGGGAAACTAAAACTAAGAATGCTCTGTTGGAAGGTGCTGACTTATCACGTAGTACTGAGAGTCTAAAGCATTACTTTCTTGATTGGATCAGAATTTACAAAACTGACGGTGTATCGCGTCATACTCACGAGCTATATATGGGCAACTGGCGTCACATCTCTGCATATTTTAAGGATAAACCTATGAGCGCAATTAAACGTCCAGATTACCAGAAGTTCCTGAATGAATTTGGCCGCAGTCATGGAATTGCCACATCTCACAAGCTTCATCAACAAGTACACACTGCAATCAAAGACGCCGTAGCTGATGGTATTCTAAAACGAGACTTTGCTTACAAGGCACACGTCACTGGACGCCCTCCCAAGCCCGTAGAGGAAAAGTATCTGACGTTATCCGATTATAAGAAGCTGCGTAAATATCTCATTAAAACGGCTGATTATGACCACATGACTATGCTAATGATGCTGTTTCAACTAGAAACTGGAACCAGGTTCGAGGAAGCCGCTGGCCTAACGTGGGATAATTTGGATTTGAATAATGGAATAGTTCACATAAAACAGCAATGGGACGCCCGTAGACAGACTTTCCGTCCAACTAAGGGAAATGGACAGGCCGATGGAGATATAACCATAGGACCCGCCTACTGTCGTTTTATGAGGAGCTATCGTAACACGCAGAAGGATTATTTAGAATTGCACGAAATGAAGAATCCTAAGAACCTCGTATTTTGGTCCAAACTAGGAAAAATAGTGGGCAATGGGAATGCAAACGAAGAGCTAGGACGTATTTGTACCCGTCTAAAGATCAACAAAGTTACAACACACGCCATGAGGCACACACACGCTTCGATTCTTATCCTAAATCATGAGTCCCTTCCCTATGTTCAGCATCGCCTTCGACATCAAAAACTAGAAACGACCGTTAACACCTACGTCCATCTTATTGAAGAAGAAAACGGCGTATCAGATAAGAAGGCTACCGAGCTAATGGACGAAGGATTTTAAAAATGATAATTTTATGATTGCTGTAGTCCTTGTGCCGCAAGGGATTACAAAATCATTTGTTAATTTTTCTTCCAAAAACTGCTATATTTTGGCTACTTTTTTCGTTTTTGGAAGAATCGTGGAAGAACATATCGTGTTTGAGTGGTTTTCGAGTGTAAAACAAAAGCACCAAAACGCCTTTATATCAGCGTTTTGGTGCTTTGTCGTTTCTCTATATTTGTCGACTTATCACCCGCACGGGGATCGAACCCGTAACTCCGCCTTGAGAGGGCGACGTCTTAACCAATTTGACCAGCGGGCACAAATTCATTTATTATCTTACCGAATGATAAGCGGCTTGTCAAATATAATTAAGATTTTTGCCACCTAAAAATCGTCACAACAACTAAACCAACGAATAAGAGCAAACAGTAGGCCACACTACACCAAAAAACGAAAGTCAATAATTGGGGTAACAAAAAGCTGCGCATAACTGCTAATCCGATGGCCGTGACCGCCCATACGATCAATTGTTGTCGCAGATGATCGAATAAATGATCTAATTCTGACTTCGACATACACTCACCTTCCATTTAACTAGTTTAGCCACCAACTGATACGATATTCAAGCAAAAATGCAAAAAATAGACACAAAGTTTCAGCAAAGTCTTGACAGTATTTGCTGGAAAAGTTACTATTAAATAGTTGTTATTGGGTATTCGCCAAATTGGTAAGGCAGCGGACTCTGAATCCGTAATTTACTGGTTCGAGCCCAGTATACCCAATATTCGTTATCAGCTGTTATCATTGGTTGTCAAAAACACCGTGATTGCAGCTTTTTTATTACTTTAGTTTATCATTAATTGTCATCTCTTTTCACTAAAAGTCAGCCAAAAGGACAGCCAAAAATATAACAAAAAAGCCACTGTTTCCAGTGACTTAATACTTGCGCGGGGTAGTGACTGTTAGCCAACTTTGGTTAGCAGTTTTTTTCGTTAGGCCATTAGTCTAACGCTTATTATCAAGGCAATGACTGCAATAGTAATGTGTATCACAAAAATAACCTTTCTTATAGTTTTAGGTTCATGATAATCAAACGGCCACTGAATAAAGTCAAATACTGACAGAATCATAAAGTTAAACGCTAATAAATTTAGCCCATAAACAGTCACCGGCATAGACAAGCTGAAAGCCATGCGGCCATATTGTAATATGCTACACGTTATCAAATATGCTGGAATAATCAACAATGTAATATTTACAGTAACTTCGAAAAACCATTTTTTAATGAAATAACTCATTTACAAGGACACTCCAGTAAATATTTAACTGCACATTATTAATTATACAGTAAAATTGTTGAAGTTGGGCTATAGTAGCATTCAAACCGTTAGATCACTGTAAAATTTTGCAAAAGCGTGTAATGCTTCATTCTTCATATAATTAAACTTGCTAACACTAACCGATAATTGGTTACAAGCTTCATTGCGGGTGAAATGCTTCTCAATAACGTAATCATGTAAAATAAATTGATATTGTGGATCATCAATTGCATTTAGGGCGTCTTCGACTTCTTTTAGCTGGTAAGACAGGTCAACATGGTTTATCAGGCGGCTTTCAGCGCCGTTTCGGCTGCTATGGCTTGACACTCCATCGAATGAGGGGCTGGAAACTTGATTAAAAGCCGTCAAATCACGTTTTAGTTTGGCATATTGCTTCAATAAATTACGAATTTTCTTAACATCTTGACGCATCGGAATCACACTTTCTGATCCCAGATATATGTATAAAAAAGAGGCTCGGGGGAGAGCCTCTCACTATAGGATATGATAATCGCCGTTATTACGGGAAAGTAATATTAGGACAAATTACAACATTAATTTTAGTACCAATCATTTCATATGTCAAACCTAAGCTTCAATTTTTCCACGCAGTTGTTGAATCATACTGACAACTTGATACGGTGTCTTTGTCATATCAGTTACTCTGTTTTGATACCAGAATTGTGTCAGCAAGGACACCGCAAAATCGTACTGTTTGTAGACAGTCAGATCTTCATTCTTGCTAACAGCCGTCTGCACGTAGTCCTTGGCGGCGTCTAAATAACTTTGAATCATTGGATCATCTTCAGTTACATCAATTCGCAGGCTTAGTTTAATGTCGTCTACAGTCACTGCCAACTAATCACTTCCTCATAAGTTTAACTTTACTCTCATAAAATTATATGGTATAAATATAGAGTACTCATTGCCCGGTAGTTCAGCGGTAGAATAATTGACTGTTAATCAAGAGATCGCTGGTTCGATCCCAGCCCGGGCAGTCTCCAAAACACATATTTATCATAAAAGGCCGTGACCTTGAAGTCACGGCCTTTTTATTACCAAGTCATAGCATAATAGATTACCTCAAACACTTTAAAAGCAACATATGCGGCGAATACATACGTGATGATAATACCACTGTATGCAAGGATAAATGTGTTCTTCATGAAATCACTCCTAAAATTATAGCTGCACGTTCCATTAAAATCTGATAAGCATTATCATCATACTATCACTTGTTGTTTGAAATTCCACTTACTTTGTCTTCCTATTTACCAGCAGTTGCAGTTCCTAACGCCACATTAATTACAGCGGTCTTGTCAATCACTTCATAATCATTCCGCACAATGACGGAAAGCCCTTGACTGAACTGGTCGAACTTGTCCCATTGGGCGGTTACTTGGTTACGCCGGAAGACAGCCACGGCTTGTGATAAGTCCCCCGCAATCATTGGGAACGTCCCGTCGGCGTTGTTGGCCAGTAACTTGTCACTAATCATGACGACTGGTGCCCCTAACAAGGTGAACCCACTGGGTGCCGTTGGGTTCGGCTGTAATAAGTAACGGCCTTCGGAATCCTTCAAGGTATCAAGGTAATTGAACCCGGATTGGTTCACTAGCCACATTTTGCTCAAGGCGGGATCTAACGTCACATTGAAAATCTTTTTAAGATCATCAATACTGGTTGCCGTTGCTTTAGTAAAGTTGCTACCAGTTAACAAGCTCATAATCTGCGTGTTGTCCGTGTTATCAACCAGTTGTTGCAATTGGGTTTTAACTTCGCTAACAATATCCACTTCGGCGTCTTCCACCACTTCATTAGATAAGGCAATCTTACCCGCCCGGGTCTTTACATCAAACGGCACTTCCGTAAACATATTCGCGTCAACATCGGCAATATCGGCTAATTCGTCCTTAGTAGCCAGTACCGCAGATTGTTGGCTGGTGGCAATTGGATAAGTACCGGAACCACTAGAAACTTGCTTAACCGTCGCATATTGGGCGAGGTTGTAATTGGATTGTTTTAATTGGAAAACGGGGGTAATCAGTTCTTTAGGAATAACCGCACTGGCACCGTCAGTCTTTAAACCGTCCCGTGTTTCCCCGTGTGTCCGCACATATTGTTCAAAGGCGGGAATACCGGTTTTGCTTTCGTTACCATTGTCATTGCTGTTAGGATCAATAATTGTTTGTTTTGCCATGTTGTCAGGCTCCTTTTCTTGGTTAATAAATTTTTCGTAGCTACGGGTATCAACTTGCACATTTGTATCGTCATAAGCGGGAACAGCTACCACCGACACGTCGAACAAACTCTTAACTTGATTAATGGTGCGCGTGATATTACCACCATCATCTTTAGTCCATTCGTCGGTGTCGTCGTCACTATCAAAGCCAAATGAACAGGAATCAACATTCCCACTCTGAACTTCTTCGTAGACGTCATTAGCAAACGACGTATTCGGCAACTGCGCGGTGAAATGTAGCCCCTTGTCGTCCGTTTCTAGCGTTAACGTGCCCGCCTTGGCACTGGCTAACACTTGAGTGTAGTCGTGGTTATTAAGCATAAGAACGTTTGAT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GTTCAAATTGTTCACGAGAGATGTCGCTACTATAATGGTGTGCAAAGCTTTTCATGGATTAAAAACTCCTGTTTTTGATCTAATTTAACTAAAATCAAATCGAATGTCAAAGTATCCAAACACGTTCTAAGTTAAACTTAGCCAGTCTGATTCACTTTAGCGGGAAATTCCGCTCTACTAAAAAGCGCCGCGCCTTTCAGCACGACACTCATTGGTTATTTAGTTTGTTGCTCCCGCTGTTCTCTAGCCAGTCTAGTCTTCCGGTTATGATGTCGGTAACATAATGGTTGTAGGTTGCTTTCATCTAAGCGACGTGACCAATCATCTTTGATTTCAATAACGTGATCGACCACATCGGCTTTACAGATCACCCCATCTTGGTAGCACTGTACACATACCGGATTGCTTTCAAGGAACCGCCGTGACAACTTGCGCCATGCTGACGACTTGTAGAACTGCTGGTACTTACTCTCATCTGAATCGTACATGCGTTTGTGATACCGCCACTTGTTAGTTGCCTTGCGGTGCTTCTCGCAATAGCGTGTGTCATAGGCAACCAACGTCCGACAACCCGGGTGCTCGCATTGCTTCATTGGCTTAGCCATGACCGTTGACCTTAGTTAGTGTGACCACGTCATAAGCATTCATCTCGCTATCAGAACTAACGCCAGCAACGCGATACGTCACCCCATCTAATATTGCTTCCAAGGTTGTCGTGATTCGATCGTCATGGCGTACCGCAATTAGCTGGTTAGTTGTCGCAGTCGTACCAGTAAGGCTAATAGTGTTACTGATGGTCAACGTATACTCACCACACCAGACAGTGAACAGTGGCACGAATTGTTGCTTGGTTGTGCCGTTTATTGGATTTTCAACTGACTTGACGGTGCCAAACTGTACCCGCTTATTTAGTCGGCTTAGATTATAGTTCTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >CP037429|2153502:2164437|2161685_2162159_-|QBK73507.1|terminase|DBSCAN-SWA MSQKVKALASMKKHLTNDERDQRKDAEKALFDYPVLDLTPPDWLHDRALTEWQRVAPYLKANTPISELDRAMLASYCRAYATVQTCENDIRKNGLVQTNQETGVRKPNPYVAMQSQAMKDLKALANDLGMSLSSRARMELNKQKDETPEDTFEAMLS >CP037429|2153502:2164437|2153502_2154624_+|QBK73498.1|integrase|DBSCAN-SWA MSVTKLNNGKWQARVSYKDDDGSYKSVTHLEKRKTDAVEWETKTKNALLEGADLSRSTESLKHYFLDWIRIYKTDGVSRHTHELYMGNWRHISAYFKDKPMSAIKRPDYQKFLNEFGRSHGIATSHKLHQQVHTAIKDAVADGILKRDFAYKAHVTGRPPKPVEEKYLTLSDYKKLRKYLIKTADYDHMTMLMMLFQLETGTRFEEAAGLTWDNLDLNNGIVHIKQQWDARRQTFRPTKGNGQADGDITIGPAYCRFMRSYRNTQKDYLELHEMKNPKNLVFWSKLGKIVGNGNANEELGRICTRLKINKVTTHAMRHTHASILILNHESLPYVQHRLRHQKLETTVNTYVHLIEEENGVSDKKATELMDEGF >CP037429|2153502:2164437|2156513_2156783_-|QBK73502.1|head,tail|DBSCAN-SWA MAVTVDDIKLSLRIDVTEDDPMIQSYLDAAKDYVQTAVSKNEDLTVYKQYDFAVSLLTQFWYQNRVTDMTKTPYQVVSMIQQLRGKIEA >CP037429|2153502:2164437|2162756_2163556_-|QBK73508.1|transposase|DBSCAN-SWA MKSFAHHYSSDISREQFELIRTDLEGIRKRTKPRKVDLYDIFCALLYTLKNGCVWRDLPSDFPKWETVYYYWLLWTKTPSPAGITPLDKVFKKIVSQHRLAQKRSVYTSFIILDAQSVKNTDPAESSGYDGGKKVSGIKRHLAVDINGLPMAVHVTTANVSERDGANALLALNKSQFDLVQRVMADGGYTGNNFAQSVQAMINAEVIIAKQSDLRHGQVTPQRWVVERSFSWLGKYRRLWRNCERKLNTSKMMISLAFLRILLKRF >CP037429|2153502:2164437|2158730_2159831_-|QBK73504.1|portal|DBSCAN-SWA MSFFVKSSTTSGTHDPVADALVSLSSNDPYTFVSAAVLRNSDIYAAINIIASDIASNPIMCDTAIFNTMINQNPNSQMDGYHFKYALAANLLLNGNSFAEILPNHTLKFVQNKQLTVEQDDVSGALTYTYTPISGNSRQIAPNNILHFKYFTKDGVSGISPLYALKDERQIQSAGNKLLTGFFTAGVHGTTIIKVHQSDLGPEAKGNIRNQFDEANTGDNAINTIVTDDTMDISNLSLNTDVLKLVNSNDWTTRQIAKAFGLPPERLGVENDHSNQEQSGVQYLQGTLQHYFDSFTSELSFKLGHDFTFNTDKLLSLDPQTQQAQAVAGFTGGIMSRNEARAKIGLPPTDDGNIFLNLQKNGVDNS >CP037429|2153502:2164437|2154974_2155181_-|QBK73499.1|DBSCAN-SWA MSKSELDHLFDHLRQQLIVWAVTAIGLAVMRSFLLPQLLTFVFWCSVAYCLLLFVGLVVVTIFRWQKS >CP037429|2153502:2164437|2157192_2158734_-|QBK73503.1|capsid|DBSCAN-SWA MKQDRRLTIDAELRAQTPQLETPEDGPAENSADPQPKGFQTSKGKTISGYAIVWNSPSKDLGGFTEVVTPKALDGVDLSNVLMLNNHDYTQVLASAKAGTLTLETDDKGLHFTAQLPNTSFANDVYEEVQSGNVDSCSFGFDSDDDTDEWTKDDGGNITRTINQVKSLFDVSVVAVPAYDDTNVQVDTRSYEKFINQEKEPDNMAKQTIIDPNSNDNGNESKTGIPAFEQYVRTHGETRDGLKTDGASAVIPKELITPVFQLKQSNYNLAQYATVKQVSSGSGTYPIATSQQSAVLATKDELADIADVDANMFTEVPFDVKTRAGKIALSNEVVEDAEVDIVSEVKTQLQQLVDNTDNTQIMSLLTGSNFTKATATSIDDLKKIFNVTLDPALSKMWLVNQSGFNYLDTLKDSEGRYLLQPNPTAPSGFTLLGAPVVMISDKLLANNADGTFPMIAGDLSQAVAVFRRNQVTAQWDKFDQFSQGLSVIVRNDYEVIDKTAVINVALGTATAGK >CP037429|2153502:2164437|2155598_2155904_-|QBK73500.1|DBSCAN-SWA MSYFIKKWFFEVTVNITLLIIPAYLITCSILQYGRMAFSLSMPVTVYGLNLLAFNFMILSVFDFIQWPFDYHEPKTIRKVIFVIHITIAVIALIISVRLMA >CP037429|2153502:2164437|2159985_2161689_-|QBK73506.1|terminase|DBSCAN-SWA MIEYVDQVLSGQVLAGQKIKWACERFKRDLSRSKDDSFPFYYDEDKAAQAVKFIELMPKTDGSQLTMQPFQEWIISELYGWREKTTGNRRYDRAFISMARKNGKTYLASGMAANGLLRERQPARNRQVLFVSNALKQAKLGYDMLSSGLRQVRKQSKYMRQRVKVQKQAITDLETDSQALALASDTSTLDGYAGTTVILDEWHEAKDRKVYNVLKSGQAQEDNSLLAVISTSGLNLNVPMHAEYDMLTDVLKGKTKADRYFVAIWELDDREEVYDQANWIKANPLFSEPHAKQRMTEKIQADVDLAIKQNNLIPVLVKNFNMWLQASEDSYISADDWAAGKLAKVPDLHNRDAYIGIDLSKSNDLTAVSWLVPIGNGQFYCDSHSFVGTKYGLDSKIKRDGIDYRSMERAGECSITRLDSGIIDYDNLFDFVQKLVGKYNWKVKAIAYDPYNAQTLITKFEKLSYPLFEVRQGTKTLNIPTRNFRDQLYDDKIKHNGNKILAYAVNNAILKVLNNGWQLDKARNSNRIDPIAALINAFVAGMDYYQESEDQQHAEDYYKTATAADLF >CP037429|2153502:2164437|2155985_2156366_-|QBK73501.1|DBSCAN-SWA MIPMRQDVKKIRNLLKQYAKLKRDLTAFNQVSSPSFDGVSSHSSRNGAESRLINHVDLSYQLKEVEDALNAIDDPQYQFILHDYVIEKHFTRNEACNQLSVSVSKFNYMKNEALHAFAKFYSDLTV >CP037429|2153502:2164437|2159831_2160032_-|QBK73505.1|DBSCAN-SWA MQKITTKQRLRQICSDYVQTILLVIGLICLVIGFGCWISWQAGLMLAGTAMILLALLINYEKQRGD >CP037429|2153502:2164437|2163716_2164106_-|QBK73509.1|DBSCAN-SWA MAKPMKQCEHPGCRTLVAYDTRYCEKHRKATNKWRYHKRMYDSDESKYQQFYKSSAWRKLSRRFLESNPVCVQCYQDGVICKADVVDHVIEIKDDWSRRLDESNLQPLCYRHHNRKTRLAREQREQQTK >CP037429|2153502:2164437|2164098_2164437_-|QBK73510.1|head,tail|DBSCAN-SWA MKNYNLSRLNKRVQFGTVKSVENPINGTTKQQFVPLFTVWCGEYTLTISNTISLTGTTATTNQLIAVRHDDRITTTLEAILDGVTYRVAGVSSDSEMNAYDVVTLTKVNGHG |
13 | Lactobacillus_phage(50.0%) | tail,transposase,capsid,integrase,terminase,head,portal | attL 2153372:2153387|attR 2158487:2158502 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2365317 : 2373831
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP037429|2365317:2373831|DBSCAN-SWA CTTAAATTGCTCCTTCATTAATGAGTGTCTGTAATACATCTGGATAAAATTGGTGTTCACAATCATGAATCCGGGTCGCCAGGCTGGCTAGCGTATCGTCTGGTGCAACCGGAACGACCCGCTGGGCAATAATTTGCCCGGTATCGATTCCGGCATCGATATAGTGAATGGTAACGCCCGTCTCAGTCACACCAGCGTCAAAAGCATCCTCGATACCGTGACGACCTGGAAATTTCGGTAACAATGCTGGGTGGATGTTGATAATTTTATGCGAATACGCATTCAAGAGGGTCGGACCGATAATACGCATGTACCCGGCCAATAAGACCAGTTTAATTTGTCGCGCTTGCAAGGCCGTCAAAATGATGGCTTCCGCGGCCGCTTTATTCGCATAATCATGAAAATCAACAATCAATATCGGTATGTTAGCTGCCCGGGCTTTATCAATGACCGGCGCCGTGGGTTGATCACAGACGAGTAACCCAATCACCACCGGTAACTGCCGTTCAATAATCGCTTGGTGGAGTGCAACAAAGTTGGTGCCGTTCCCCGAAGCAAATACCGCAATCTTATTAGGCATGTTCAGCCTCCTCGAAAACGACGGGGGCCGTCCCAGTTTGGACTGTTCCGACGCGATAATAGGACTGCGCGTTGGCCGTCAAATTAGCCGTCACAGCCGCCACTTGGTCGGGGTGAACGACCAAAACCATTCCCAGGCCTAAGTTAAAGGTCGACCGAAGATCCGTGGCAGTCAGCCCACCGAGTTCGGCCAATAACGTCATAATTGGCGGCACCGGCCATTGACCCAATTCAAGGTGCGCACTCAAGCCCGCCGGTAACGCTCTGGCGACGTTCTCAATCAAGCCGCCCCCAGTAATGTGGGCGATACTCGTCACTAATTTCTGCTGTAATAATGGTTGAACTGCATCAACGTAAATGGTCGTTGGTCGTAAAAGTTCCGTTTGTAAATCATGACCAAGTTCGTCAAAAACCGTGGTCAATTGGTAGTCGTGTTGTTTGAATAAAATATCACGAACTAGACTAAACCCATTCGAGTGGAGGCCATTAGACGGCAACCCAATCAAGACGTCCCCAGCCCGAACATTTGCTGGTGATAACAGGTCCGCGCGGTTCGCAATTCCGACCGCAAAACCAGCGAGGTCGTAATGGTCCTGACCATACATATCGGGCATCTCCGCAGTCTCGCCACCAATCAACGCTGTATGGGCCTGCTGACAGCCCGTGACGACGCCAGTCAAAATGGCTTTGACCCGCTTCTGATCCGTATGTCCAAGACCTAAGTAATCTAAAAAGAACTGGGGGGTCGCGCCTTGTGCCAAAATATCATTCACACACATTGCGACCAAGTCAATTCCAATCGTGGTATGTTGATCAGCAGCGATTGCGACTAAGAGCTTAGTCCCCACACCATCCGTCCCCGCTACTAACACGGGATCGTTGGCAGTTGCATCCGAACTAAGTGGAAACGCCCCCCCAAACGCGCCTAATTGCTGATTGCCACTCATTTGTTTGACCGTCTTTAAGACGTCGTAACCAGCGTTGATATCAACGCCAGCCCGCTTATACGCATCGCTCACTTGATCACCCCTTCATGATTGGCTTGTAATTGCGCAATTTCCGCATCATACTCGGCTTGGTAATCATACAGGGCCGTTGGATAATCCCCATTAAAATAGGCCATGCATAGTCCACCATACGGTTCGGTGGTCGACAAGCCAACTGCATCAACGACGCCCTGTTCACTGAGAAAACCAAGTGAGTCCGCACCAAACGTCTGACACATCTCCCGAATCGTTTGCTGAGCCGCAATCAATTCATTAGTCGATTGAATATCGATACCGTAAAAACATGGATAGCGTAATGGTGGCGATGCAATTCGTAAATGAACTGACTTTGCACCCGCATCTTTCAATAATTTGACGATCCGCCGACTGGTGGTACCACGTACAATCGAATCATCGATTAAGACGACTCGTTTACCAGCGACAACACCTTTGACCGCTGAAAGCTTCATCCGAACCCCCTGTTCTCGCAATGCTTGGGTCGGCTGAATAAAGGTCCGTGACGAATATTGATTTTTAATTAATCCCATCTCGTAAGGCAGGCCACTCGCTTCCGCATAGCCGGTCGCCGCTGATAAAGATGAATTGGGTACCCCGACAACAATGTCGGCGTCCACGGGCTGTTCAACAGCGAGCTGAGCACCCATTCGTTTACGTGCAGAATGGACGTTGACGCCGTGAATATCAGAATCTGGACGTGCAAAGTAGATAAACTCCATTGAACAAATCGCCAACTGTGTATCAGTCGTATAATGGTCGATCGTCAAACCATGATCATCGATCGTTAACAATTCTCCCGGCTGAACATCTTGAACAAACGTCGCACCAATCGTATCAAGCGCGCAAGTTTCACTACAAACGACGTACCCGCCCGTGGGTAACTGACCGACGACTAATGGTCGTAACCCGTTAGGATCCAAAGCGGCAATCAAACAATCATTCGTTAGTAGTAAGTAAGCAAAGCCTCCGTGGACTTGACGTAAAGCATCCTTAACCTGTTCCGTTAACGTTGCTGCGGGGCTGCGTCGAATCAGATGCATTAAAATCTCACTATCAGAACTAGCATGAAAAATGGCACCATGCTGTTCCAACCGTCGCCGCAGTGTCACCGCGTTCGTCAAATTGCCGTTATGTGCGAGTGCAAACTGTGAGTCGCTAAAATTAAAACTCAAGGGTTGAATGTTTTCCAATCCATGATTACCAGCCGTGGCATAACGTACATGGCCGACTGCAGCTTGACCCGTCAAACGTGCCAACCGCCGTGGGTCCCGAAAGACATCAGCCAACAACCCTAGTCCGCGTTCCGTCTGCAGTTTGCCGTGATCATTCGCCGTGATACCGGCTCCTTCTTGCCCCCGGTGTTGTAACGCATGGAGCCCAAAGTACGTTAATTGGGCGGCGTCCGGCGAGCCCCAAACCCCAAAGACGCCACATTCTTCATTCAGACTTCTTACTTCAGTAGGCATGGTAAGGCCCCTTCCCACAACTGTTTGGCGAAACTAACCTTAATATCAAACGCCTGATCAGCAGTTTGAACGTGTAGCCGATCCGTTGCAGTTGTTCGTCCTAAATAGGTCACATATGGTTCCATTAAACTTTCAAACGCGGCTTGCTGTGCTGGTGTCACCGAGATAACAAATCGTGACTGCGTTTCCGCAAAGAAGTTGGCAGCGGGCAAGTCACTGGCCAGTTCCACCCCGATATTTTGTGGAAAACATGATTCGGCAATCGTCGTAATCAAGCCACCTTCAGAAACGTCGTGGGCACTAGCAACTAGTCCTTTTTGAATCGCAGTTAACAATAGACGCTGATTACGATTTTCAGTCACAAGGTCAAAATCAAACAGCTCGCCACTGATTGTTCCCGTCAACATCTTTTGCAGCTCACTACCATTGAAATTGGCTTCTGTGGTACCTAACACGTAGACTGCATCGCCAGCGTGTTTAAAATCGCTAGTCGTAATATCTTTCTGATGCTTAATTAACCCGACCATCCCAATCATTGGGGTGGGATAGATGGCTTCCCCGTTCGATTCATTGTTCAACGAGACATTGCCAGAAATCACGGGCGTATTGAATAATTGGCAGGCACGAGCGATGCCCATCGCCGATTCGTCCAAATCGTAAAATTGTTCAGGTTTCTCTGGATTACCATAGTTCAAGCAATCAGTGATGCCTAAAGGTTGCCCACCGGAAGCGACAATGTTTCGAGCAGCTTCCGCAACGGCGATTTCTCCACCGACACGGGGGTTTAAGTATAAGTATCGCCCGTTAACATCGGTGGTGACCGCCAACGCCTTATCCGTATGTCGAATCCGTATGACCCCCGCATCGGAACCCGGCTTGACGACCGTATTCGTTTGGACCTGCGAGTCATACGTTCCATATAACGACGCTTTGGAAGCAATCGTTGGCTGTTGGAGCATCTTCTTCAATGTGCCAGTTGCATCAACTAGTCGTGGCATAAATTGATGATGGCTCTGATGGTTCAAGCGCGTTGGTCGTTTCTTTTCGCGTTCATAGACCGGCGCTTTGGTCGCAAGTGCATCGACGGGAACATCTGCAACTAACTTACCATGATGGAATAATTGATACTGGTGGCCGGCTGTCACTTTACCAATTGTGACAGCATCAAGACCGTACTTTTCAAAGACTTGATAAATTTCTGCTTCGGCACCAGCTTTGACACATAGTAACATCCGCTCCTGTGATTCAGAGAGCATCAGTTCAAACGGCGTCATGCCAGTTTCACGTTGTGGTACCAAGTCAAGATTCAGTGACAACCCACTGCCTGCTTTGGACGCCATTTCGGCTGAGGAGGAAACTAGGCCCGCCGCGCCCATATCTTGAATCCCGATTAAAACATCACGATGTTCATGAATAACCTCGAGACACGCCTCCATCAATAATTTTTCCATAAAGGGATCACCAACTTGAACCGCGGAACGCTGGGTTTCATTGGCGTCATTAAATTCAGCAGAGGCAAAGGACGCACCGTTAATGCCGTCACGCCCCGTTTTTGCGCCGACATAAATAACGGCGTTGCCAATTCCTGTTGCTTGGCCCTTCTGAATATCAGCTTGATCCAAGATTCCAACACACATGGCGTTCACCAACGGGTTCTTCTGATAACTCGCATCAAATACCGTATCACCACCGATTGTCGGAATTCCAATACAGTTGCCATAACCGCCAATGCCGGCGACTACTTGCGAAATCAAGTATTTCGTATGAGCATCAGTCGGTTCCCCAAAGCGAAGACTGTCCAGCAGCGCAATCGGCCGGGCCCCCATCGAAAAGATGTCCCGAATGATACCACCCACACCCGTTGCCGCACCCTCATAAGGTTCAACTGCAGACGGATGATTATGACTTTCAGCTTTAAAGACCACGGCCTGACCATCACCGATGTCGATAATACCGGCGCCTTCACCAGGCCCTTCAAGTACCTGTTCACCCTGCGTCCAAAATTTTTTCAAGACTGGTTTTGAATTCTTGTAGGAGCAATGTTCGCTCCACATGCCGGAAAACAACCCGGTTTCAGTCTCGTTAGGTAAGCGTTGAAGGACCTTATCCGTTAATAATTGATACTCAGCATCGGTTAAGCCCCAATCCCGATAGACCTTAGAATCGCGAACATCTGTAGGTGATAATGGTTGCTTTTTAAGCATGGGTGACCTCCTCTTGACTCGCAATGACCGATTGAAAAATTCCGAGACCGTCCGTGGAACCTAAGATCATCTCCACGGCCCGTTCCGGATGGGGCATCATCCCAAGCACATTTCCCGCTTCATTTGTAATGCCAGCAATATTAGCCGTGCTGCCATTTGGATTCTCGACGTATTCGAAGATGATTTGATGATTAGCACGTAATTGCGCCAAGGTGGCCTCATCACAATAATAATTGCCTTCGCCGTGGGCAATCGGTAAACTAATTTGATCTGTCGATCCGTATGCGGTGGTAAAAATCGTCTCATGATTGGCAATTCGTAATGGGCTGTCCTGACAAATAAACTTCGCTGAGCGATTGGCCTGCAATGCACCAGGTAATAATCCGGCTTCGGTCAAGACTTGAAAGCCATTGCAGATTCCGATGACTGGTTTACCAGCGTTAGCAAATGCAATAACGGCCGGCATGATGGGCGCAAAGCGGGCAATCGCACCACTCCGTAAATAATCACCGTACGAAAAGCCACCAGGTAACACCACCGCGTCATAACCTGCTAATGAGGTCGCTGTCGCCGGAATCAAATCAGCCGTAACGTGTAAAATATCGCGCAAGGCATTCACCATGTCATGATCACAATTAGAACCAGGAAAGACTGGTACGGCAAATTTCATCATTACAAAGCCTCCATCTCAGTAATTTCGTAACGATAAGTTTCCATATTAACGTTGGCTAACAAGCGATCACACATCTCGTCGATTTCAGCGGCAACTGGCCGATCATCCGCGTGAATTTTCACCTCAAAATACTTACCTAATTCAACGGCATCGACATTCGTATATCCAAGTCGGTGTAAGGCATCATGAATCGCCTCACCCTTGGGGTCTAGAATTGATTGCTTATAAGTCACATAGATTTTAACTAAGTACATGTTAGGCCTCCTCAACGGTTGCTAGCCGCGTCAATACTTCCTGATAAACACTAGTCAAGTCGCCTAGATCCTTGCGGAAGACATCCTTATCAAGCGATGCACCGGTCTTTAGGTCGACTAACCGACAACTATCTGGTGAGATTTCATCAGCCAGCAAGACTTTACCGGTGGTCGTCAACCCAAATTCGATTTTAAAATCAACGAGCTGTACCCCCATCGCCGCAAAAATTGCCGTCAAACGCTGGTTAACCTGTAAGGCCTGCCGTTTAATTTCCGCCACGATTGCCGGTGTTGCAACATTTAGCGCGTGGATTTGTGAATCATTGATAAATGGATCATCCAGCTGATCACTCTTATAGAAAAATTCCAGTACTGGTTCTGCAAATTTGGTTAAGTGTGGCACGGCAAATTTACGCTCAAAACTACCCGAAGCCGCATTCCGAACAACTGTCTCCAAGGGAATCATGGTCACGCGACGGACAAGTTGCACATAGTCTGAAGGTTGCTCAATAAAATGGTTGGCAATGCCGTGATTGGCTAAGTCTTTGAAAATCAAACTCGCGATGCGATTATTCAATCGGCCTTTCTGGTCAATGGGAACCTTCCGCTTACCATTTAGCGCTGTTGCTTGATCTAAGTATTCGACCCATAGAATTTCAGGATCATTAGTGGCATACATCGCTTTCGCTTTACCCGTGTAAAGCAAAGCTTGTTTCTCAATCGCTGCCGTCATTATTATTGTTCCCCTTTCAAATTTGCCACCGACGCTAATGCTGCGTCAATATCGTGATTTAATACGGTGACATGACCCATCTTGCGCTGGGGCTTAATGGCCGCCTTACCGTAGTCGTGAAAATGCCATTCTGGGTGTTCAACCAACTGTTGACGTGCCACTGTTAAGTCATCACCTAGCAGATTACGCATCACTGCCGGACTGGTCTGCGTAATGGCCGGAATCGGTAAGCCACAGATACTTCGAATATGGGCCTCAAACTGCGAGATGTTGCAGGCCTCAATCGTATAGTGACCAGAATTATGTGGGCGTGGTGCCAGTTCATTGACTAATAAAGTATCATCCGGTAAAACAAAGAATTCGATTCCTAGCACGCCGCGTAGTTCCAGAGATTCAGCAATCGAAACCGCAATTTTGCGGGCCGCACTATGAACACTGGGCTGAACATTAGCTGGGGCAATCGTTGTGTGTAAGATATGATGTTGATGCTGATTTTCAACTAACGGAAAAGTCGTAACAACACCAGCAGCACTACGCGTCACCATCATGGAAACTTCTGTTCGAAATTTCTGCCGCGCCTCTAGAATGCACGGCTGTGTCAATAAGACACTAGCGGCTTTTGTCACCACTGCTGTGTCTAGATCCGTTTGTCCGTGACCATCGTAGCCACCTGCCGCCGTTTTGAGAATTGCCGGCGTACCAACACGGTTGAGGGCGTAATTTAATGACTGTAAATCCGTCACCGGTGCGAAAGATGTGACTGGGATGCCATGATCATGAAGAAATTGCTTCTCATTAAGACGATCTCCAGTAATATGCAGGAGTGCAGTGCCCTGCGGTAACTTTGCATAGGCTTGCGCAGCAATCAAAGCATTCTCATCAACGTTTTCAAACTCGTAGGTCAAGACATCACTACGGCGCGCTAGATCAAGTAAAGCCGCCTGATCATCATAAGCCGCAACAATCTGAAAATCTGCGACCTGGGCTGCCGGTGCTTTGGGTGTCGGGTCAAGGACACCTACCCGATAGCCCATCGCCTTCGCGCTAAGCGTCATCATCTGACCGAGTTGACCGCCACCAACGATTCCGATCGTTGCGGGTGGTAAGAGTGCTTCCTTAAAATTGGCGTTCACTTTGTTCAGCCTCCTGACGTTGACGAGCACGAAATTCTCCAATTGCATGTTGTACTTGTGGTTCCCGTAAACCGATAATTTGGGCGGCCATTAGCGCACCATTCTTAGCCCCCGCATCACCAATCGCCATCGTCGCCACGGGTACGCCAGCTGGCATCTGTACGATTGACAATAACGAATCAACTCCGTTCAACGTATGGGTCTTAATGGGCACCCCAATTACCGGGAGTAGTGTATTGGCAGCTAGCATCCCGGGTAAATGGGCAGCGCCCCCCGCACCCGCAATAATAACTTGAATTCCCCGTGACGCTGCTTCTTCACCATAGGATTGTAATGTCTGGGGCATTCGGTGGGCCGAAATAACGTGACGCTCATAAGAGACTCCCAGTGCCGTTAACTGTTCTGCCGCTAATTGCATGGTTGGCCAATCAGAAATTGACCCCATAATCAAACCAACTTTCGCCATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >CP037429|2365317:2373831|2366910_2368365_-|QBK73687.1|DBSCAN-SWA MPTEVRSLNEECGVFGVWGSPDAAQLTYFGLHALQHRGQEGAGITANDHGKLQTERGLGLLADVFRDPRRLARLTGQAAVGHVRYATAGNHGLENIQPLSFNFSDSQFALAHNGNLTNAVTLRRRLEQHGAIFHASSDSEILMHLIRRSPAATLTEQVKDALRQVHGGFAYLLLTNDCLIAALDPNGLRPLVVGQLPTGGYVVCSETCALDTIGATFVQDVQPGELLTIDDHGLTIDHYTTDTQLAICSMEFIYFARPDSDIHGVNVHSARKRMGAQLAVEQPVDADIVVGVPNSSLSAATGYAEASGLPYEMGLIKNQYSSRTFIQPTQALREQGVRMKLSAVKGVVAGKRVVLIDDSIVRGTTSRRIVKLLKDAGAKSVHLRIASPPLRYPCFYGIDIQSTNELIAAQQTIREMCQTFGADSLGFLSEQGVVDAVGLSTTEPYGGLCMAYFNGDYPTALYDYQAEYDAEIAQLQANHEGVIK >CP037429|2365317:2373831|2368349_2370569_-|QBK73688.1|DBSCAN-SWA MLKKQPLSPTDVRDSKVYRDWGLTDAEYQLLTDKVLQRLPNETETGLFSGMWSEHCSYKNSKPVLKKFWTQGEQVLEGPGEGAGIIDIGDGQAVVFKAESHNHPSAVEPYEGAATGVGGIIRDIFSMGARPIALLDSLRFGEPTDAHTKYLISQVVAGIGGYGNCIGIPTIGGDTVFDASYQKNPLVNAMCVGILDQADIQKGQATGIGNAVIYVGAKTGRDGINGASFASAEFNDANETQRSAVQVGDPFMEKLLMEACLEVIHEHRDVLIGIQDMGAAGLVSSSAEMASKAGSGLSLNLDLVPQRETGMTPFELMLSESQERMLLCVKAGAEAEIYQVFEKYGLDAVTIGKVTAGHQYQLFHHGKLVADVPVDALATKAPVYEREKKRPTRLNHQSHHQFMPRLVDATGTLKKMLQQPTIASKASLYGTYDSQVQTNTVVKPGSDAGVIRIRHTDKALAVTTDVNGRYLYLNPRVGGEIAVAEAARNIVASGGQPLGITDCLNYGNPEKPEQFYDLDESAMGIARACQLFNTPVISGNVSLNNESNGEAIYPTPMIGMVGLIKHQKDITTSDFKHAGDAVYVLGTTEANFNGSELQKMLTGTISGELFDFDLVTENRNQRLLLTAIQKGLVASAHDVSEGGLITTIAESCFPQNIGVELASDLPAANFFAETQSRFVISVTPAQQAAFESLMEPYVTYLGRTTATDRLHVQTADQAFDIKVSFAKQLWEGALPCLLK >CP037429|2365317:2373831|2373345_2373831_-|QBK73693.1|DBSCAN-SWA MMAKVGLIMGSISDWPTMQLAAEQLTALGVSYERHVISAHRMPQTLQSYGEEAASRGIQVIIAGAGGAAHLPGMLAANTLLPVIGVPIKTHTLNGVDSLLSIVQMPAGVPVATMAIGDAGAKNGALMAAQIIGLREPQVQHAIGEFRARQRQEAEQSERQF >CP037429|2365317:2373831|2365317_2365896_-|QBK73685.1|DBSCAN-SWA MPNKIAVFASGNGTNFVALHQAIIERQLPVVIGLLVCDQPTAPVIDKARAANIPILIVDFHDYANKAAAEAIILTALQARQIKLVLLAGYMRIIGPTLLNAYSHKIINIHPALLPKFPGRHGIEDAFDAGVTETGVTIHYIDAGIDTGQIIAQRVVPVAPDDTLASLATRIHDCEHQFYPDVLQTLINEGAI >CP037429|2365317:2373831|2370561_2371242_-|QBK73689.1|DBSCAN-SWA MMKFAVPVFPGSNCDHDMVNALRDILHVTADLIPATATSLAGYDAVVLPGGFSYGDYLRSGAIARFAPIMPAVIAFANAGKPVIGICNGFQVLTEAGLLPGALQANRSAKFICQDSPLRIANHETIFTTAYGSTDQISLPIAHGEGNYYCDEATLAQLRANHQIIFEYVENPNGSTANIAGITNEAGNVLGMMPHPERAVEMILGSTDGLGIFQSVIASQEEVTHA >CP037429|2365317:2373831|2371497_2372229_-|QBK73691.1|DBSCAN-SWA MTAAIEKQALLYTGKAKAMYATNDPEILWVEYLDQATALNGKRKVPIDQKGRLNNRIASLIFKDLANHGIANHFIEQPSDYVQLVRRVTMIPLETVVRNAASGSFERKFAVPHLTKFAEPVLEFFYKSDQLDDPFINDSQIHALNVATPAIVAEIKRQALQVNQRLTAIFAAMGVQLVDFKIEFGLTTTGKVLLADEISPDSCRLVDLKTGASLDKDVFRKDLGDLTSVYQEVLTRLATVEEA >CP037429|2365317:2373831|2365888_2366914_-|QBK73686.1|DBSCAN-SWA MSDAYKRAGVDINAGYDVLKTVKQMSGNQQLGAFGGAFPLSSDATANDPVLVAGTDGVGTKLLVAIAADQHTTIGIDLVAMCVNDILAQGATPQFFLDYLGLGHTDQKRVKAILTGVVTGCQQAHTALIGGETAEMPDMYGQDHYDLAGFAVGIANRADLLSPANVRAGDVLIGLPSNGLHSNGFSLVRDILFKQHDYQLTTVFDELGHDLQTELLRPTTIYVDAVQPLLQQKLVTSIAHITGGGLIENVARALPAGLSAHLELGQWPVPPIMTLLAELGGLTATDLRSTFNLGLGMVLVVHPDQVAAVTANLTANAQSYYRVGTVQTGTAPVVFEEAEHA >CP037429|2365317:2373831|2372231_2373362_-|QBK73692.1|DBSCAN-SWA MNANFKEALLPPATIGIVGGGQLGQMMTLSAKAMGYRVGVLDPTPKAPAAQVADFQIVAAYDDQAALLDLARRSDVLTYEFENVDENALIAAQAYAKLPQGTALLHITGDRLNEKQFLHDHGIPVTSFAPVTDLQSLNYALNRVGTPAILKTAAGGYDGHGQTDLDTAVVTKAASVLLTQPCILEARQKFRTEVSMMVTRSAAGVVTTFPLVENQHQHHILHTTIAPANVQPSVHSAARKIAVSIAESLELRGVLGIEFFVLPDDTLLVNELAPRPHNSGHYTIEACNISQFEAHIRSICGLPIPAITQTSPAVMRNLLGDDLTVARQQLVEHPEWHFHDYGKAAIKPQRKMGHVTVLNHDIDAALASVANLKGEQ >CP037429|2365317:2373831|2371241_2371496_-|QBK73690.1|DBSCAN-SWA MYLVKIYVTYKQSILDPKGEAIHDALHRLGYTNVDAVELGKYFEVKIHADDRPVAAEIDEMCDRLLANVNMETYRYEITEMEAL |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
DBSCAN-SWA_1 |
0 : 2767
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP037435|0:2767|DBSCAN-SWA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >CP037435|0:2767|1465_2767_+|QBK74728.1|DBSCAN-SWA MFFDQEPHGVFFLIDNKSFYSICEAVARGLNPLKVPLVVLSEAENTNGGLILATSPEAKQLFHLKANVSRKRDLPNDPRLWVVPPRMNLYIQRNLQINHIFHQFASEKEVWPYSIDESILDMTHSWRLFGNSIREVARLIQKTIRQQLGLYTTVGIGDNPVQAKLALDNYAKHNHELIGEIHYETVPDKIWSINELTDVWGIGPRMAKRLNRLQIHNMYELAHTNPYLLKQNLGVIGSQLFATAWGVDRTQLTEPIKTKEASLGNSQVLPRDYLTQNEIETVIKEIGEQVAARLRHHHKLAGCLSLSIGFSYAAAETDGRSGFHQALKIEPTNDNQALTQQLLWLFRKNWDGQAVRNIGVYSSKLSPDAGQQLNLFESPLNQIQHSKLNQVIDEIHRRFGFTKLVYATSLLPGGTAIERAALVGGHNGGNSYE >CP037435|0:2767|901_1189_+|QBK74727.1|DBSCAN-SWA MGLLNRDNIDSKPKIDVRNEPTKIDDDAKITYGEKGFKAKDRKPVQVDPPVLELIQNLSYAKDMPMYKVVDVAMNAYLATLTASERAIYDMRRKK |
2 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
DBSCAN-SWA_2 |
9616 : 13415
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP037435|9616:13415|DBSCAN-SWA GTTAGCTAGCCACTGCCGCCTTGGCGGCGTGGCGCCGGACTCGCTTGCATTCGGCACTGAAGACTTCCTCGGTGGTCCGATAGTCTTGGTTGCGTCGTGGCAGTTGGTTGATCTTAGCTTCGACTTTGGCCACAGCGGCGGGACTCACAGTATCTAGTGACTGGCCCTTAGGAAAGTCTCTGCGTACCATCTTGTTGTGAACCTCGTTGGTACCCCGTTCACTGGATCGGTATGGATGTGCGTAGTAGACCGTCGCCACGCCATTCAGTACTGATTCAAGCTCGGCAAACTCGGAGCCGTTGTCTGCCGTGATGGTCTTGATGATGTCCCCGTATTCACCGATGATACCGCGCATCGCGTAATTCACCGAATCAGCATCACGCCCGTCGATCAAGCGCATGAATTGGAAGCGTGATTTACGCTCAATCAGGGTCATGATGACACTCTCTTGGCCGTTGCGCTTGCCTACGATCGTGTCGAGTTCAAAGTGACCAAACTCACGTCGGCTCTCGACTCGCTTAGGCCGCTCATCAATACTTCTGCCTTGAAGCATGCGCTTGTGAGTCGTATTGGCATTTCGTTTCGTACGCCGGCTGGTTTGCTCGAGCAGATCAATGTTCTTGATCTCCAGTAGCTGCGCCTCGATATAGCTGTAAAGCGTAGCCGTGCAGACCATTTCGGCCGGTTGGTAGAGCTTGTCGTGCTTCGCTCGCCCAACCACCGCATCGGGAGACCACCCGTCCTCCTTGAAACGTGCGGTGAAGTAAGCAATGAAGTCAGCTGCCTGCGTCAGCTTGAGTGGTCGGTGACAGCGGCGCCGGTTCTCAACGTATCGCGCCTGTGCGGCCTCAGGGCTATATATACGTGAGTACTGGCGTTGCCCATTGACCTTCTTGACCTGATCGATCTCGCCGCGAGCAAGCTCATTAGCCACCGTTTGACGGCAAACGCCGATCACCTTTGCGATGTCGCGATTAGACTTCTTCTCAGCATGTAAAGCGGCAATTTGACCGCGTTCTACGGCAGTAAGATGGTGACCCTTTGGGCGAGACATGGTAAGCTGTTCTTGCATCAAGACGATACCTCTTTCATTGTTTGTGTAGGAACTTCAATGATAACAGGTCGTATCGACTTGGTGTTTTTATTTTTTCCGCTCGACGACGATAGTGGCTAACTTGATTCTAAAACGCGGGATTAAACAAATACCTGTCATCTTTGTCTTTTATGATTGCTATTGATTTTAAAGACTCTGATTCATTAGGAATAGTGATAATAACGTACATTCTAATATGATTGTCTACTGTCCCCTGTTCACTTAAAATATACGTTTCAATTTGTGCCTGATTATATTGATATTCAAACAACCAACATCCCACTTCATTTTTCGTTAACCCTTCAATATTTCTTAATGCATCTGTAAAATCCACGCATTTTCCTACCTTTCTATGCTTGATCAAGAAATCAATTTAAACCTTCGCTGTTGCGTGCGTTTACTAATCCCCGTCCTTCGTTCAATCATCTTATAAGTCATGCCTTGTTTTCGCAACTCATAAGCAAATCTGATCTGTTCATCAGAATACGTTTTCGGTCGCCCTTCCCGAAACAACGGATCATGTTGCTTGGCATACACTTTACCTTCTTGTGTGCGCGTGACAATCATATCGCGTTCAAACTGCGCAAAGGCGCTAAATATTGTAAAGACTAGATGGCCAGTCGGTGTATTGTCAATTAAGCCCATATTCAAAATGTTAACTTTGACATTTTCTTTAAACAACTCTTGGATAATGGCTAACGCCTCGCGCGTGTTCCGTGCAAACCGATCCAACTTAGTGACAATCAAAGTATCGCCTGTTTTTAGAACTCGCAACAATTTTTGAAACTCCGGTCGTTCAGTAGTTGTGCCGGTAAACTTTTCTTGAAAGATTTTTTCTGCTCCTGCCAATTTTAGTAACTCAATTTGATTTGCTAATTTTTGATCAGTGGTACTGACCCGCGCATAGCCATATTTCATCTTTTTCTCTCCTTACTTATGTCATTAAGTAATGACACGGTTCTAACCCTTTAATTATACAGCATCAAAAAACAGGCCACAACTGTTAAGTTGTGACCTGTTTTGGCTCTATTTAAACATTTTACAATCTACCCTTTAACTACTTGACCAAAAATCTATTAAAAATATTAGCTACAGACTGCCATTTAAGGCTTATGAGCTTATTAAAAATAAAATTTTAGTTTTCCAAATGATAGTGATAGGTTGGTTATCGAAAGAATTACATTATAAATAGATGTTAATTTGATGTTGACATTTTAATTCTTTTGACTATAATTTTTAATTAAATTGATATAATGAAAGCAATGAGAAGATGAGTAGTCTCAGAACGGTATTGAGAGAGTTCACATTTGATGAGAGTGAATTGCCGGGAATTGATGAATATGGTCTTTGAGCTGGAGGTTATTGAGCCGTTAGCAAAATAACCTGGTAAACGCACCTTACAGCGTAATAGTTCAATGAATCCTTATTATTTATAAAACAATGGGATTGTCAGTTTTTTTGGACTTGATAAGTCACTTAGCGCAAGTTATGTGAAAATTAAGGTGGTAACACGACAATATCGTCCTTATACAGATCAATTCTGTATAAGGACTTTTTTTATCAAAAAATACTAATAGGAGTGATTAAGATGACAATAGCAATTAGAGAAAGTTTCCCCTACAGATATGATGAAGTAGGTAGTTTATTACGTCCAGAAAAATTAAAACAGGCCCGTGATAATTTTCGCAATAATAAAATTGATGAATATGCCCTTCGAAGAGTTGAAAACAAAGAAATTGATCGTATCGTAGAAAAGCAAGTAGAAATTGGCTTGAAAGCGGTGACTGATGGCGAATTTCGCCGCAGTTGGTGGCATCTTGATTTTCTTGCCGGATTAAATGGAACACAATATTTTATCCCCCAAAAAGGTTATAAATTTCAGGGTGAAGAAACAAGAAGTGGTGGCATCAAGATTATTGACAAGGTAACCTACAATCCTGACCATCCATTCTTTAGAGACTTTAAATACCTCAATAGCATTGTACCAGATGGAATTACAGCTAAACAGACAATTCCCAGTCCCTCAGTTCTATTTCCCAATGAACAAGCTGAAGTTTTTGACGAATACTACAATGGTGACTTTAATGAATTTCTAAATGATACGATCGAAGCTTATAAAAGAACGGTTCAGCATTTTTATGACTTGGGTTGTCGTTATCTTCAACTTGATGACACGTCATGGGGAATGTGGGCAAGCTTCTCTAAAGGAACTTTATCGCCTGAACTCAGACCCTTTGCTGAAGCAACAGTGAAGGCAATTAATAGCATTGCTGATAGCAAGCCAGATGACTTAACGCTAACAATGCATGTCTGCAAGGGAAATTATGATTCCCATTATGCCGGCGGTGTTGGTGCTTATGATTCAGTTAGCCCATATTTGGCCCAACTGCATATCGATGGTTACTTTTTAGAATATGATGATAATCGTGCTGGAGGGTTTGAACCATTGAAACTAATTTCTGAAAATGGCCGTCAACAACGTGTGGTTATTGGTATTGTTACCAGTAAGCGACCCGATTTAGAAAACATAGACTTCTTAAGAGGACGGATTGAGGATGCTAGTCAATATATTGCATTGGAAAATCTTTGTATTTCACCACAATGTGGATTTGCCTCAACAGAGGAAGGTAATCGTCTAACTGAGGAGGATCAGTGGAATAAATTAAATTTAGTGATTGATACAGCTAAGAGTGTTTGGAAAGACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >CP037435|9616:13415|11068_11626_-|QBK74740.1|DBSCAN-SWA MKYGYARVSTTDQKLANQIELLKLAGAEKIFQEKFTGTTTERPEFQKLLRVLKTGDTLIVTKLDRFARNTREALAIIQELFKENVKVNILNMGLIDNTPTGHLVFTIFSAFAQFERDMIVTRTQEGKVYAKQHDPLFREGRPKTYSDEQIRFAYELRKQGMTYKMIERRTGISKRTQQRRFKLIS >CP037435|9616:13415|10796_11042_-|QBK74739.1|DBSCAN-SWA MDFTDALRNIEGLTKNEVGCWLFEYQYNQAQIETYILSEQGTVDNHIRMYVIITIPNESESLKSIAIIKDKDDRYLFNPAF >CP037435|9616:13415|9616_10687_-|QBK74738.1|transposase|DBSCAN-SWA MQEQLTMSRPKGHHLTAVERGQIAALHAEKKSNRDIAKVIGVCRQTVANELARGEIDQVKKVNGQRQYSRIYSPEAAQARYVENRRRCHRPLKLTQAADFIAYFTARFKEDGWSPDAVVGRAKHDKLYQPAEMVCTATLYSYIEAQLLEIKNIDLLEQTSRRTKRNANTTHKRMLQGRSIDERPKRVESRREFGHFELDTIVGKRNGQESVIMTLIERKSRFQFMRLIDGRDADSVNYAMRGIIGEYGDIIKTITADNGSEFAELESVLNGVATVYYAHPYRSSERGTNEVHNKMVRRDFPKGQSLDTVSPAAVAKVEAKINQLPRRNQDYRTTEEVFSAECKRVRRHAAKAAVAS >CP037435|9616:13415|12296_13415_+|QBK74741.1|DBSCAN-SWA MTIAIRESFPYRYDEVGSLLRPEKLKQARDNFRNNKIDEYALRRVENKEIDRIVEKQVEIGLKAVTDGEFRRSWWHLDFLAGLNGTQYFIPQKGYKFQGEETRSGGIKIIDKVTYNPDHPFFRDFKYLNSIVPDGITAKQTIPSPSVLFPNEQAEVFDEYYNGDFNEFLNDTIEAYKRTVQHFYDLGCRYLQLDDTSWGMWASFSKGTLSPELRPFAEATVKAINSIADSKPDDLTLTMHVCKGNYDSHYAGGVGAYDSVSPYLAQLHIDGYFLEYDDNRAGGFEPLKLISENGRQQRVVIGIVTSKRPDLENIDFLRGRIEDASQYIALENLCISPQCGFASTEEGNRLTEEDQWNKLNLVIDTAKSVWKD |
4 | unidentified_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_3 |
18313 : 24782
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP037435|18313:24782|DBSCAN-SWA TATGGAAAATGCATCAGCGGCAAAGTCGATGAGACATGCCCAATACTACAACATGACAGGAATTTTTGATAACTTATATGAGGCAAGTAAGTTTGGAAGTATATTTCCAGACCTGATGACAACTATATTGTCCCAAAATAATATCTTGCTGAGTTATAGAAATATCAAAAATAATGCTGGTAGTTTAACTCCTGGAACCGATAATAAGAATATTCAAGATCTGGAAAAACTAGATAAAGATGAATTTGTTAACATTGTGCGAGGTAAAGCGCGCACGTATCGTCCTCGGCCAGTTCGGCGGGTAACGATTCCAAAGCCAAATGGAGATACAAGACCCCTAGGAATACCATCAATCTGGGACCGTATTATACAGCAATGTATTCTTCAAGTACTAGACCCAATTATGGAAGCAAAATTCTATAAACATAGCTATGGGTTCAGACCGAATAGGTCTGCACATCATGCCTTAGCTCAAGCGGTTAGACTAGCTCAATTGTCAAAGCTATCCTATATTGTTGATATAGATATCAAAGGATTTTTCGATAATGTGAATCATGCAAAATTAATACGTCAACTCTGGACGCTTGGTATACGAGATAAATGGCTAATTGGTATGATTAGAGCGATGCTACATGCACCAATAATATTCCCAGATGGACATGTGGAACACCCCAAAAAAGGCACTCCACAAGGAGGTATATTATCTCCCATACTAGCAAATATCGCACTAAATGAACTTGACTGGTGGATAGTATCTCAATGGGAAAACCATCCTACTAAATATAATTATGACCAGGTAAAAGATAAAGTTGTCAATAAGGGAAATCGATATAGAGCCCTCAGAAAGACACGTTTGAAAGAAATGTATATCGTCAGATATGCAGATGACTTCAAAATCTTCTGCCGAAAGCGTAGTGATGCAGACAAGGTATTTCTAGCAACTACCAAATGGTTGGAAAAGCGCCTTAAACTCAAAGTGAATACTGACAAATCAAAGGTTGTAAATCTTAAGAAGCAAAATTCCAATTATTTAGGATTTACGCTGCGCTTAATTAAGAAGCGTCAGACCCTTGTGGTAAAAAGTAATATTAGTCCGAAAGCCAAAAAACAAATCAAATTAAAACTAGTACGCCAGATTAAGAAGATACAGCATGCCGAGAACTTGATAAAACAAAATATGGAAGTAGATAAATACAACTCCATGATTGTGGGTATCCATCAATATTATAAGAAAGCTACGCATGTGAGTGCTGATTGCCCAGACATAAATCAATCAGTACGAGCAGTGCTCAAGAATAGACTACGCTTAGAAAAACATGGAATCCCACCAAGTGATTTTATTAAGAAGAATTACGCTAAATCAAAGCAGCTAAGATGGCTAAATGGGAAACCAGTAATTCCCATCGGTTATATAAAACATTCGTATACTTCCCTACCAAAGAATGGAATATGCAAATACACACCAGTTGGAAGAGAGTTGATTCATAAATATCAAGAATTTCCAGTTGAAATTATAAATGCTCTTATGAAGAAGACAACTAATTCAGAGAGTGTAGAATTTAATGATAATAAAATATCAAAATATTCTATGCAACGAGGAAACTGTAAAATCTTAAAAATACCTCTAGAACTCAATGAAATTAGTTGTCACCGAATAGTGCCTAAGGCACTTGGAGGTAGTGATAAGTACAATAATTTAGTGATACTGCATCTGAATATTCACAAACTAATACACATTACGAGTGCAATAACCGCGAAAAAAATAGCCTTAAAAATGAAATTATCGGTTGATCAGATAGACGCAATAAATAACTACCGCATGAAACTGAAATTGATGGAAATGTAGAAAATTATAATGTAAGTGTATATGATACTTGAGAGAATATGTGATGGAACGCCGTATGAGGTGAAAGTCTCACGTACGGTGTGGATCGGGGGAAAGGCAGGAGAGCAGCTGTCAAACAACTAGCTCAAGTGTTTACCTATCGATATCTAGTTGCGAGGCCGTTGCCCGGGGACTTAACCCCTTAAAAGTCCCATTAGTGGTCCTTAGTGAAGCTGAAAATACCAATGGCGGACTCATTTTAGCCACGTCACCCGAAGCTAAGCGCTTATTTCATCTTAAAGCCAACGTCTCCCGTAAACGTGACTTACCCAATGACCCCAGGTTGTGGGTCGTGCCACCGCGCATGAACCTTTATATTCAACGTAATTTGCAGATCAATCAGATCTTTCATCAATTTACTACTGAAAAAGAGGTTTGGCCGTATTCAATTGATGAAAGCATTCTTGATATGACCCATACTTGGCGGCTGTTTGGCAATTCCGTTCGCGAAGTGGCACGCTTGATTCAAAAGACAGTTCGGCAAAAGCTAGGCTTGTATACCACCGTGGGAATTGGTGACAATCCGGTGCAAGCTAAATTAGCCTTAGACCTTTACGCTAAACATAATCATGAATTGATCGGTGAAATCCATTACGAAACTGTGCCGGATAAAATTTGGTCAATTACTGAATTAACGGACGTTTGGGGGATTGGCCCCCGTATGGCGAAACGTTTGAACCGCCTTCACATTCACAATATGTATGAGCTAGCCCATACCAACCCTTATTTACTCAAACAGCAGCTTGGCGTCATTGGTAGCCAGTTATTTGCTACGGCCTGGGGAATTGATCGCGCGCAAGTTACGGAACCAACTAAGGTTAAAGAAGCTAGCCTGGGTAATTCGCAAGTATTGCCACGAGATTATTTTAACCAAGTTGAAATTGAAACCGTCATTAAAGAAATTGGTGAACAGGTGGCGGCGCGGCTTCGGCACCACCATAAATTGGCGGGGTGTCTATCGCTAAGCGTTGGTTTTTCCTATGCTGCGGCCGAAGCAGATGGCCGTGGTGGCTTTCACCAGGCTTTAAAAATTGACCCGACTAACGACAATCAAGTTTTGACGCAACAATTATTGTGGTTATTCCGTCAGAATTGGGACGGTCAAGCTGTCCGGAATATTGGCGTTTATGGCAGTAAACTAAGTGCCAATTCCGGCCAACAACTTAATTTATTTGAAACCCCGCGCAACCAAATTCGCCGTAGCCGGTTAAACCAAGTGATTGATGAAATTCACCGGCAATTTGGGTTCACCAAATTAGTTTACGCGACCAGTTTATTAAAGGGGGGCACCGCTATCAAGCGGGCTTCACTAGTGGGCGGACATAATGGAAGTAATAGCTATGAATAGCGATATCGAGATTATTAAGGGGCGATTAACCCTATTGTTTAAGCGGCGTCCCCAAACCCGCTATTGGTTAATGTTGACTAATGATACCTACGATCAGACCTATAATCTGTTTTTTAACAGTCAACGGGCTAACGAGCGCTTGCAATCTGTTCCCTTACATAAATTAGCTCACTATGATTTAGCTGGTTTAGAAAAATTACTAAAAGCATTACGACAAGATATAAAGCTAACGATCGAATTTGTCGGCTTTACTGGGGAACGGTGGCCTGCAAGCCAAAAGCTGATTCAACGAAAGCGGGTGCCACTTGAATAATCAAGAATTTGATTTAGCCACGGTTAAGCATTTTTTTGAACACGATTACCATGACCGGGGCATGATGAAATGGCAGGGATTCTATTTATCTGATCATACTGCCGCTTTAAACCAACAGAACCAGCAGTTGAATGCAGTATACGTTCCAAGACCGCAACAATCCTTAGCAGTAATTACCGAGGTATTGGCGGACGCATATCAGCGTCAGCAACCAGTGACCATTCAACTAAAAACGGTTGACCAAAACAATCGTCATTTGCCAGATATCATCACCTTGATCCATGGTTACAATGCCAATGATATTGTGATTGACGCTGATCGTTTGATTCCACTACAAGAAATTCGCAATGTGGCAGACAAAAAGACGGAGAAACTATAAAAAACAGCTCGCCGTCTTTCTGCATGAGCATCTTAGGCTAACTAGTTCACTAGCCATTAATTATCATTATATCCAAACTTAGGATTTCGGGAATCAAAAGTGTTTTTCCACCATGTTTCACGTTTTAAAATTAAAGAATCATCGACTCGTGCATTATAGTTTTCTAATATGGAATACTGAAAATATTTTTTGACATAATCAAAGCCTCGAGTCATTACTAAATTTTTGAGGCTTTTATTTCCTCCATGACCATTAGCTATGTAACTTTTCCATCTATTGACATAGGAGCAACTTTCTTATCAGCTTTCGTCATTAACGTTCAGTTGTAACCTCTTTTTTTAATTTGTTTTTTCTTGTATTCATTTATGAATGATTGTAGCTAAATAAGACGTTTTAATACTACAACTACTCATAAACTAACAATAAAATAACATATGGATAAAAATTTGTCAACGCCGATGTGAAAATGTCGTTTTTTGCCGATTAAAAAATGCTGTTTTTTACCGATAAAGTTTACAGTGTCTCACTGCTCCTTTCTTTATTTTGTGCGTTGAAACCTGATAAATCAGGTCCGGAATTATCCTTCTTTTCAATTAAATGATCTTTCATTCGATATGATCGACCAGTGATTCGGATAACTTTAGCGTGATGAACCAAGCGATCTAAAATGGCGTTAGCTAACATCTTATCTGAAAAGGCGTTTCCCCACTTAGAAAGCGGAATATTAGTGGTGATAATGGTTGATTTCCGTTCGTATCGTCTTTCAATTAACTGAAAAAACAGCTTAGCGCCCACTGACTCAATTGGAAGATAACCAATCTCATCAATGATTAGAATTTGAAAACGGGCATACCGGCGTAGCACTTCTTCGCTCCGGCCTTGAACTTGTGCTGTTTGAAGCTTGTTGATGAGGTCGCTACATCGAATAAACTGCGTTGAAATTCCTTGTTTACACCCTTCAATTCCAATGGCGGTGGCTAGGTGAGTTTTACCGACACCGGAGGTGCCGACAAACAAAACGTTTTGATTCTCTTGGGTGAATCTTAGTGATCCCAAGTCCTCAATTATCCCTTGGTTAATTCCCGGTTGATAACTAAAGTCAAAGTCAGCTAACGTTTTTTCATATGGAAAGCGGGCTAGTTTAATTCTCAAATTAATCTTTTTTTGTTCCCGGTATTTAAGCTCAGCCGTTGTCAATTCGAATAAGGCATCACTCAAGGACTTGGGTGCTTCATCTTGATGATCCAATAGGTAGCCTAAATGTTCGGCGAAACGATCTAACTTTAATTGTCTAAGGTTGGTGTATAAAGCTTGGTAATTGGCCATTTTCTCACTCCATTTCATCAAACATCTTCAGGTTTCGGTCGACGTAATCATCAATGACTCGGTCATCACGATTCTTATAAAGGTCTGATCGGACAATCTCTTCCATGTCATCGCGAAGGTAAGTAAATCTTTTCAGTGAAATAGGGTGAGAACGAATTAATTCTCCGTTATAATAAATGTATAGAGTATTGTCATCGTGTTTAATTTGTACGGTTTCGTCAATATATCTTATGGGGACGGAGTATTTCCGATTTTGAAAGACAATCATTGATTCCTTGCTAACTTTCCTTGCGATGGTTTGGCTGGCATAGGCATCGAGTAAGTCGTGATCAAAATCATGGAGATACTCTTTTTCTTTATCAAGCAATAAATAAGGCGGAATTTGAGTCGCCTGAGACTTCTCATGATTCAGCTGATCACACGTCAAATGGACGATCTCGGCTAAGTCTAGCGGCTCTTCAAACTCGTGGTTGTAAACTTTGATTCGCTGAGTAGTTCTGGCCAGCGCCTCAACCTTTCCTTTGGTTTGTGGCCGAAACGGTCGACAAGCAATTGGCTTGAAACCAGCGTCCTTAGCGTATTCAACGAAGGTTTCATTAAATACCGGCTTACCAAAATTACTTTTATGATGATCGACGACAACCTTTTGGTTGTCAAACCAGATTTCTTTCGGCACACCCCCGGTTGCCCAAAAGGCATTAGTTAAGCAATCAAAAAAGGTAATTTGGCTGCGACTGAAGGTAAATTGCATGTATTTCATTCGCGAGTACCCTAAAACATATAAGAAGATGTTGCCTTTGACAATCTCTCCATGCCGAGAAACCAACGTTAAATCTTCTTTCCAATCAACCTGGGCTGAAAGCCCTGGCGAGGTTTCAATCCGGATAGTGGCTTTTTTCGTTGCGGCTTTTCTGATGGTTCGACAATAGTCTCTGAGAATACTTTGCTTTCCTTGATAGCCACGTTCTTTGATAAAGTAATAAATTGCCGTTGCCGAACAGCCTTCTAGAACCTTTTCTTCAATCGTTTTTCGATAATCGTCAAGTTTACTCGGCCGCCGTAAGGGTTGTGGCTGCTCATCTGGGGGCGTAAGCCCTAAATTGTAGTATCTTTTTACCGTTCGTGGATCAACACCGTATCGCCGACCAATTTCAGCGAAGTTGGGCTTTATTTTGTTCATAATATATTGCTGGACACACTGCTCAACATCTAAACGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >CP037435|18313:24782|20300_21545_+|QBK74747.1|DBSCAN-SWA MSSCEAVARGLNPLKVPLVVLSEAENTNGGLILATSPEAKRLFHLKANVSRKRDLPNDPRLWVVPPRMNLYIQRNLQINQIFHQFTTEKEVWPYSIDESILDMTHTWRLFGNSVREVARLIQKTVRQKLGLYTTVGIGDNPVQAKLALDLYAKHNHELIGEIHYETVPDKIWSITELTDVWGIGPRMAKRLNRLHIHNMYELAHTNPYLLKQQLGVIGSQLFATAWGIDRAQVTEPTKVKEASLGNSQVLPRDYFNQVEIETVIKEIGEQVAARLRHHHKLAGCLSLSVGFSYAAAEADGRGGFHQALKIDPTNDNQVLTQQLLWLFRQNWDGQAVRNIGVYGSKLSANSGQQLNLFETPRNQIRRSRLNQVIDEIHRQFGFTKLVYATSLLKGGTAIKRASLVGGHNGSNSYE >CP037435|18313:24782|23567_24782_-|QBK74749.1|transposase|DBSCAN-SWA MRLDVEQCVQQYIMNKIKPNFAEIGRRYGVDPRTVKRYYNLGLTPPDEQPQPLRRPSKLDDYRKTIEEKVLEGCSATAIYYFIKERGYQGKQSILRDYCRTIRKAATKKATIRIETSPGLSAQVDWKEDLTLVSRHGEIVKGNIFLYVLGYSRMKYMQFTFSRSQITFFDCLTNAFWATGGVPKEIWFDNQKVVVDHHKSNFGKPVFNETFVEYAKDAGFKPIACRPFRPQTKGKVEALARTTQRIKVYNHEFEEPLDLAEIVHLTCDQLNHEKSQATQIPPYLLLDKEKEYLHDFDHDLLDAYASQTIARKVSKESMIVFQNRKYSVPIRYIDETVQIKHDDNTLYIYYNGELIRSHPISLKRFTYLRDDMEEIVRSDLYKNRDDRVIDDYVDRNLKMFDEME >CP037435|18313:24782|21537_21858_+|QBK74770.1|DBSCAN-SWA MNSDIEIIKGRLTLLFKRRPQTRYWLMLTNDTYDQTYNLFFNSQRANERLQSVPLHKLAHYDLAGLEKLLKALRQDIKLTIEFVGFTGERWPASQKLIQRKRVPLE >CP037435|18313:24782|22750_23563_-|QBK74771.1|DBSCAN-SWA MANYQALYTNLRQLKLDRFAEHLGYLLDHQDEAPKSLSDALFELTTAELKYREQKKINLRIKLARFPYEKTLADFDFSYQPGINQGIIEDLGSLRFTQENQNVLFVGTSGVGKTHLATAIGIEGCKQGISTQFIRCSDLINKLQTAQVQGRSEEVLRRYARFQILIIDEIGYLPIESVGAKLFFQLIERRYERKSTIITTNIPLSKWGNAFSDKMLANAILDRLVHHAKVIRITGRSYRMKDHLIEKKDNSGPDLSGFNAQNKERSSETL >CP037435|18313:24782|18313_20158_+|QBK74746.1|DBSCAN-SWA MENASAAKSMRHAQYYNMTGIFDNLYEASKFGSIFPDLMTTILSQNNILLSYRNIKNNAGSLTPGTDNKNIQDLEKLDKDEFVNIVRGKARTYRPRPVRRVTIPKPNGDTRPLGIPSIWDRIIQQCILQVLDPIMEAKFYKHSYGFRPNRSAHHALAQAVRLAQLSKLSYIVDIDIKGFFDNVNHAKLIRQLWTLGIRDKWLIGMIRAMLHAPIIFPDGHVEHPKKGTPQGGILSPILANIALNELDWWIVSQWENHPTKYNYDQVKDKVVNKGNRYRALRKTRLKEMYIVRYADDFKIFCRKRSDADKVFLATTKWLEKRLKLKVNTDKSKVVNLKKQNSNYLGFTLRLIKKRQTLVVKSNISPKAKKQIKLKLVRQIKKIQHAENLIKQNMEVDKYNSMIVGIHQYYKKATHVSADCPDINQSVRAVLKNRLRLEKHGIPPSDFIKKNYAKSKQLRWLNGKPVIPIGYIKHSYTSLPKNGICKYTPVGRELIHKYQEFPVEIINALMKKTTNSESVEFNDNKISKYSMQRGNCKILKIPLELNEISCHRIVPKALGGSDKYNNLVILHLNIHKLIHITSAITAKKIALKMKLSVDQIDAINNYRMKLKLMEM >CP037435|18313:24782|21850_22237_+|QBK74748.1|DBSCAN-SWA MNNQEFDLATVKHFFEHDYHDRGMMKWQGFYLSDHTAALNQQNQQLNAVYVPRPQQSLAVITEVLADAYQRQQPVTIQLKTVDQNNRHLPDIITLIHGYNANDIVIDADRLIPLQEIRNVADKKTEKL |
6 | Lactococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
30811 : 31930
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP037435|30811:31930|DBSCAN-SWA GATGACAATAGCAATTAGAGAAAGTTTCCCCTACAGATATGATGAAGTAGGTAGTTTATTACGTCCAGAAAAATTAAAACAGGCCCGTGATAATTTTCGCAATAATAAAATTGATGAATATGCCCTTCGAAGAGTTGAAAACAAAGAAATTGATCGTATCGTAGAAAAGCAAGTAGAAATTGGCTTGAAAGCGGTGACTGATGGCGAATTTCGCCGCAGTTGGTGGCATCTTGATTTTCTTGCCGGATTAAATGGAACACAATATTTTATCCCCCAAAAAGGTTATAAATTTCAGGGTGAAGAAACAAGAAGTGGTGGCATCAAGATTATTGACAAGGTAACCTACAATCCTGACCATCCATTCTTTAGAGACTTTAAATACCTCAATAGCATTGTACCAGATGGAATTACAGCTAAACAGACAATTCCCAGTCCCTCAGTTCTATTTCCCAATGAACAAGCTGAAGTTTTTGACGAATACTACAATGGTGACTTTAATGAATTTCTAAATGATACGATCGAAGCTTATAAAAGAACGGTTCAGCATTTTTATGACTTGGGTTGTCGTTATCTTCAACTTGATGACACGTCATGGGGAATGTGGGCAAGCTTCTCTAAAGGAACTTTATCGCCTGAACTCAGACCCTTTGCTGAAGCAACAGTGAAGGCAATTAATAGCATTGCTGATAGCAAGCCAGATGACTTAACGCTAACAATGCATGTCTGCAAGGGAAATTATGATTCCCATTATGCCGGCGGTGTTGGTGCTTATGATTCAGTTAGCCCATATTTGGCCCAACTGCATATCGATGGTTACTTTTTAGAATATGATGATAATCGTGCTGGAGGGTTTGAACCATTGAAACTAATTTCTGAAAATGGCCGTCAACAACGTGTGGTTATTGGTATTGTTACCAGTAAGCGACCCGATTTAGAAAACATAGACTTCTTAAGAGGACGGATTGAGGATGCTAGTCAATATATTGCATTGGAAAATCTTTGTATTTCACCACAATGTGGATTTGCCTCAACAGAGGAAGGTAATCGTCTAACTGAGGAGGATCAGTGGAATAAATTAAATTTAGTGATTGATACAGCTAAGAGTGTTTGGAAAGACTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >CP037435|30811:31930|30811_31930_+|QBK74752.1|DBSCAN-SWA MTIAIRESFPYRYDEVGSLLRPEKLKQARDNFRNNKIDEYALRRVENKEIDRIVEKQVEIGLKAVTDGEFRRSWWHLDFLAGLNGTQYFIPQKGYKFQGEETRSGGIKIIDKVTYNPDHPFFRDFKYLNSIVPDGITAKQTIPSPSVLFPNEQAEVFDEYYNGDFNEFLNDTIEAYKRTVQHFYDLGCRYLQLDDTSWGMWASFSKGTLSPELRPFAEATVKAINSIADSKPDDLTLTMHVCKGNYDSHYAGGVGAYDSVSPYLAQLHIDGYFLEYDDNRAGGFEPLKLISENGRQQRVVIGIVTSKRPDLENIDFLRGRIEDASQYIALENLCISPQCGFASTEEGNRLTEEDQWNKLNLVIDTAKSVWKD |
1 | uncultured_virus(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
36830 : 43298
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP037435|36830:43298|DBSCAN-SWA TATGGAAAATGCATCAGCGGCAAAGTCGATGAGACATGCCCAATACTACAACATGACAGGAATTTTTGATAACTTATATGAGGCAAGTAAGTTTGGAAGTATATTTCCAGACCTGATGACAACTATATTGTCCCAAAATAATATCTTGCTGAGTTATAGAAATATCAAAAATAATGCTGGTAGTTTAACTCCTGGAACCGATAATAAGAATATTCAAGATCTGGAAAAACTAGATAAAGATGAATTTGTTAACATTGTGCGAGGTAAAGCGCGCACGTATCGTCCTCGGCCAGTTCGGCGGGTAACGATTCCAAAGCCAAATGGAGATACAAGACCCCTAGGAATACCATCAATCTGGGACCGTATTATACAGCAATGTATTCTTCAAGTACTAGACCCAATTATGGAAGCAAAATTCTATAAACATAGCTATGGGTTCAGACCGAATAGGTCTGCACATCATGCCTTAGCTCAAGCGGTTAGACTAGCTCAATTGTCAAAGCTATCCTATATTGTTGATATAGATATCAAAGGATTTTTCGATAATGTGAATCATGCAAAATTAATACGTCAACTCTGGACGCTTGGTATACGAGATAAATGGCTAATTGGTATGATTAGAGCGATGCTACATGCACCAATAATATTCCCAGATGGACATGTGGAACACCCCAAAAAAGGCACTCCACAAGGAGGTATATTATCTCCCATACTAGCAAATATCGCACTAAATGAACTTGACTGGTGGATAGTATCTCAATGGGAAAACCATCCTACTAAATATAATTATGACCAGGTAAAAGATAAAGTTGTCAATAAGGGAAATCGATATAGAGCCCTCAGAAAGACACGTTTGAAAGAAATGTATATCGTCAGATATGCAGATGACTTCAAAATCTTCTGCCGAAAGCGTAGTGATGCAGACAAGGTATTTCTAGCAACTACCAAATGGTTGGAAAAGCGCCTTAAACTCAAAGTGAATACTGACAAATCAAAGGTTGTAAATCTTAAGAAGCAAAATTCCAATTATTTAGGATTTACGCTGCGCTTAATTAAGAAGCGTCAGACCCTTGTGGTAAAAAGTAATATTAGTCCGAAAGCCAAAAAACAAATCAAATTAAAACTAGTACGCCAGATTAAGAAGATACAGCATGCCGAGAACTTGATAAAACAAAATATGGAAGTAGATAAATACAACTCCATGATTGTGGGTATCCATCAATATTATAAGAAAGCTACGCATGTGAGTGCTGATTGCCCAGACATAAATCAATCAGTACGAGCAGTGCTCAAGAATAGACTACGCTTAGAAAAACATGGAATCCCACCAAGTGATTTTATTAAGAAGAATTACGCTAAATCAAAGCAGCTAAGATGGCTAAATGGGAAACCAGTAATTCCCATCGGTTATATAAAACATTCGTATACTTCCCTACCAAAGAATGGAATATGCAAATACACACCAGTTGGAAGAGAGTTGATTCATAAATATCAAGAATTTCCAGTTGAAATTATAAATGCTCTTATGAAGAAGACAACTAATTCAGAGAGTGTAGAATTTAATGATAATAAAATATCAAAATATTCTATGCAACGAGGAAACTGTAAAATCTTAAAAATACCTCTAGAACTCAATGAAATTAGTTGTCACCGAATAGTGCCTAAGGCACTTGGAGGTAGTGATAAGTACAATAATTTAGTGATACTGCATCTGAATATTCACAAACTAATACACATTACGAGTGCAATAACCGCGAAAAAAATAGCCTTAAAAATGAAATTATCGGTTGATCAGATAGACGCAATAAATAACTACCGCATGAAACTGAAATTGATGGAAATGTAGAAAATTATAATGTAAGTGTATATGATACTTGAGAGAATATGTGATGGAACGCCGTATGAGGTGAAAGTCTCACGTACGGTGTGGATCGGGGGAAAGGCAGGAGAGCAGCTGTCAAACAACTAGCTCAAGTGTTTACCTATCGATATCTAGTTGCGAGGCCGTTGCCCGGGGACTTAACCCCTTAAAAGTCCCATTAGTGGTCCTTAGTGAAGCTGAAAATACCAATGGCGGACTCATTTTAGCCACGTCACCCGAAGCTAAGCGCTTATTTCATCTTAAAGCCAACGTCTCCCGTAAACGTGACTTACCCAATGACCCCAGGTTGTGGGTCGTGCCACCGCGCATGAACCTTTATATTCAACGTAATTTGCAGATCAATCAGATCTTTCATCAATTTACTACTGAAAAAGAGGTTTGGCCGTATTCAATTGATGAAAGCATTCTTGATATGACCCATACTTGGCGGCTGTTTGGCAATTCCGTTCGCGAAGTGGCACGCTTGATTCAAAAGACAGTTCGGCAAAAGCTAGGCTTGTATACCACCGTGGGAATTGGTGACAATCCGGTGCAAGCTAAATTAGCCTTAGACCTTTACGCTAAACATAATCATGAATTGATCGGTGAAATCCATTACGAAACTGTGCCGGATAAAATTTGGTCAATTACTGAATTAACGGACGTTTGGGGGATTGGCCCCCGTATGGCGAAACGTTTGAACCGCCTTCACATTCACAATATGTATGAGCTAGCCCATACCAACCCTTATTTACTCAAACAGCAGCTTGGCGTCATTGGTAGCCAGTTATTTGCTACGGCCTGGGGAATTGATCGCGCGCAAGTTACGGAACCAACTAAGGTTAAAGAAGCTAGCCTGGGTAATTCGCAAGTATTGCCACGAGATTATTTTAACCAAGTTGAAATTGAAACCGTCATTAAAGAAATTGGTGAACAGGTGGCGGCGCGGCTTCGGCACCACCATAAATTGGCGGGGTGTCTATCGCTAAGCGTTGGTTTTTCCTATGCTGCGGCCGAAGCAGATGGCCGTGGTGGCTTTCACCAGGCTTTAAAAATTGACCCGACTAACGACAATCAAGTTTTGACGCAACAATTATTGTGGTTATTCCGTCAGAATTGGGACGGTCAAGCTGTCCGGAATATTGGCGTTTATGGCAGTAAACTAAGTGCCAATTCCGGCCAACAACTTAATTTATTTGAAACCCCGCGCAACCAAATTCGCCGTAGCCGGTTAAACCAAGTGATTGATGAAATTCACCGGCAATTTGGGTTCACCAAATTAGTTTACGCGACCAGTTTATTAAAGGGGGCACCGCTATCAAGCGGGCTTCACTAGTGGGCGGACATAATGGAAGTAATAGCTATGAATAGCGATATCGAGATTATTAAGGGGCGATTAACCCTATTGTTTAAGCGGCGTCCCCAAACCCGCTATTGGTTAATGTTGACTAATGATACCTACGATCAGACCTATAATCTGTTTTTTAACAGTCAACGGGCTAACGAGCGCTTGCAATCTGTTCCCTTACATAAATTAGCTCACTATGATTTAGCTGGTTTAGAAAAATTACTAAAAGCATTACGACAAGATATAAAGCTAACGATCGAATTTGTCGGCTTTACTGGGGAACGGTGGCCTGCAAGCCAAAAGCTGATTCAACGAAAGCGGGTGCCACTTGAATAATCAAGAATTTGATTTAGCCACGGTTAAGCATTTTTTTGAACACGATTACCATGACCGGGGCATGATGAAATGGCAGGGATTCTATTTATCTGATCATACTGCCGCTTTAAACCAACAGAACCAGCAGTTGAATGCAGTATACGTTCCAAGACCGCAACAATCCTTAGCAGTAATTACCGAGGTATTGGCGGACGCATATCAGCGTCAGCAACCAGTGACCATTCAACTAAAAACGGTTGACCAAAACAATCGTCATTTGCCAGATATCATCACCTTGATCCATGGTTACAATGCCAATGATATTGTGATTGACGCTGATCGTTTGATTCCACTACAAGAAATTCGCAATGTGGCAGACAAAAAGACGGAGAAACTATAAAAAACAGCTCGCCGTCTTTCTGCATGAGCATCTTAGGCTAACTAGTTCACTAGCCATTAATTATCATTATATCCAAACTTAGGATTTCGGGAATCAAAAGTGTTTTTCCACCATGTTTCACGTTTTAAAATTAAAGAATCATCGACTCGTGCATTATAGTTTTCTAATATGGAATACTGAAAATATTTTTTGACATAATCAAAGCCTCGAGTCATTACTAAATTTTTGAGGCTTTTATTTCCTCCATGACCATTAGCTATGTAACTTTTCCATCTATTGACATAGGAGCAACTTTCTTATCAGCTTTCGTCATTAACGTTCAGTTGTAACCTCTTTTTTTAATTTGTTTTTTCTTGTATTCATTTATGAATGATTGTAGCTAAATAAGACGTTTTAATACTACAACTACTCATAAACTAACAATAAAATAACATATGGATAAAAATTTGTCAACGCCGATGTGAAAATGTCGTTTTTTGCCGATTAAAAAATGCTGTTTTTTACCGATAAAGTTTACAGTGTCTCACTGCTCCTTTCTTTATTTTGTGCGTTGAAACCTGATAAATCAGGTCCGGAATTATCCTTCTTTTCAATTAAATGATCTTTCATTCGATATGATCGACCAGTGATTCGGATAACTTTAGCGTGATGAACCAAGCGATCTAAAATGGCGTTAGCTAACATCTTATCTGAAAAGGCGTTTCCCCACTTAGAAAGCGGAATATTAGTGGTGATAATGGTTGATTTCCGTTCGTATCGTCTTTCAATTAACTGAAAAAACAGCTTAGCGCCCACTGACTCAATTGGAAGATAACCAATCTCATCAATGATTAGAATTTGAAAACGGGCATACCGGCGTAGCACTTCTTCGCTCCGGCCTTGAACTTGTGCTGTTTGAAGCTTGTTGATGAGGTCGCTACATCGAATAAACTGCGTTGAAATTCCTTGTTTACACCCTTCAATTCCAATGGCGGTGGCTAGGTGAGTTTTACCGACACCGGAGGTGCCGACAAACAAAACGTTTTGATTCTCTTGGGTGAATCTTAGTGATCCCAAGTCCTCAATTATCCCTTGGTTAATTCCCGGTTGATAACTAAAGTCAAAGTCAGCTAACGTTTTTTCATATGGAAAGCGGGCTAGTTTAATTCTCAAATTAATCTTTTTTTGTTCCCGGTATTTAAGCTCAGCCGTTGTCAATTCGAATAAGGCATCACTCAAGGACTTGGGTGCTTCATCTTGATGATCCAATAGGTAGCCTAAATGTTCGGCGAAACGATCTAACTTTAATTGTCTAAGGTTGGTGTATAAAGCTTGGTAATTGGCCATTTTCTCACTCCATTTCATCAAACATCTTCAGGTTTCGGTCGACGTAATCATCAATGACTCGGTCATCACGATTCTTATAAAGGTCTGATCGGACAATCTCTTCCATGTCATCGCGAAGGTAAGTAAATCTTTTCAGTGAAATAGGGTGAGAACGAATTAATTCTCCGTTATAATAAATGTATAGAGTATTGTCATCGTGTTTAATTTGTACGGTTTCGTCAATATATCTTATGGGGACGGAGTATTTCCGATTTTGAAAGACAATCATTGATTCCTTGCTAACTTTCCTTGCGATGGTTTGGCTGGCATAGGCATCGAGTAAGTCGTGATCAAAATCATGGAGATACTCTTTTTCTTTATCAAGCAATAAATAAGGCGGAATTTGAGTCGCCTGAGACTTCTCATGATTCAGCTGATCACACGTCAAATGGACGATCTCGGCTAAGTCTAGCGGCTCTTCAAACTCGTGGTTGTAAACTTTGATTCGCTGAGTAGTTCTGGCCAGCGCCTCAACCTTTCCTTTGGTTTGTGGCCGAAACGGTCGACAAGCAATTGGCTTGAAACCAGCGTCCTTAGCGTATTCAACGAAGGTTTCATTAAATACCGGCTTACCAAAATTACTTTTATGATGATCGACGACAACCTTTTGGTTGTCAAACCAGATTTCTTTCGGCACACCCCCGGTTGCCCAAAAGGCATTAGTTAAGCAATCAAAAAAGGTAATTTGGCTGCGACTGAAGGTAAATTGCATGTATTTCATTCGCGAGTACCCTAAAACATATAAGAAGATGTTGCCTTTGACAATCTCTCCATGCCGAGAAACCAACGTTAAATCTTCTTTCCAATCAACCTGGGCTGAAAGCCCTGGCGAGGTTTCAATCCGGATAGTGGCTTTTTTCGTTGCGGCTTTTCTGATGGTTCGACAATAGTCTCTGAGAATACTTTGCTTTCCTTGATAGCCACGTTCTTTGATAAAGTAATAAATTGCCGTTGCCGAACAGCCTTCTAGAACCTTTTCTTCAATCGTTTTTCGATAATCGTCAAGTTTACTCGGCCGCCGTAAGGGTTGTGGCTGCTCATCTGGGGGCGTAAGCCCTAAATTGTAGTATCTTTTTACCGTTCGTGGATCAACACCGTATCGCCGACCAATTTCAGCGAAGTTGGGCTTTATTTTGTTCATAATATATTGCTGGACACACTGCTCAACATCTAAACGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >CP037435|36830:43298|41266_42079_-|QBK74774.1|DBSCAN-SWA MANYQALYTNLRQLKLDRFAEHLGYLLDHQDEAPKSLSDALFELTTAELKYREQKKINLRIKLARFPYEKTLADFDFSYQPGINQGIIEDLGSLRFTQENQNVLFVGTSGVGKTHLATAIGIEGCKQGISTQFIRCSDLINKLQTAQVQGRSEEVLRRYARFQILIIDEIGYLPIESVGAKLFFQLIERRYERKSTIITTNIPLSKWGNAFSDKMLANAILDRLVHHAKVIRITGRSYRMKDHLIEKKDNSGPDLSGFNAQNKERSSETL >CP037435|36830:43298|40053_40374_+|QBK74773.1|DBSCAN-SWA MNSDIEIIKGRLTLLFKRRPQTRYWLMLTNDTYDQTYNLFFNSQRANERLQSVPLHKLAHYDLAGLEKLLKALRQDIKLTIEFVGFTGERWPASQKLIQRKRVPLE >CP037435|36830:43298|42083_43298_-|QBK74758.1|transposase|DBSCAN-SWA MRLDVEQCVQQYIMNKIKPNFAEIGRRYGVDPRTVKRYYNLGLTPPDEQPQPLRRPSKLDDYRKTIEEKVLEGCSATAIYYFIKERGYQGKQSILRDYCRTIRKAATKKATIRIETSPGLSAQVDWKEDLTLVSRHGEIVKGNIFLYVLGYSRMKYMQFTFSRSQITFFDCLTNAFWATGGVPKEIWFDNQKVVVDHHKSNFGKPVFNETFVEYAKDAGFKPIACRPFRPQTKGKVEALARTTQRIKVYNHEFEEPLDLAEIVHLTCDQLNHEKSQATQIPPYLLLDKEKEYLHDFDHDLLDAYASQTIARKVSKESMIVFQNRKYSVPIRYIDETVQIKHDDNTLYIYYNGELIRSHPISLKRFTYLRDDMEEIVRSDLYKNRDDRVIDDYVDRNLKMFDEME >CP037435|36830:43298|40366_40753_+|QBK74757.1|DBSCAN-SWA MNNQEFDLATVKHFFEHDYHDRGMMKWQGFYLSDHTAALNQQNQQLNAVYVPRPQQSLAVITEVLADAYQRQQPVTIQLKTVDQNNRHLPDIITLIHGYNANDIVIDADRLIPLQEIRNVADKKTEKL >CP037435|36830:43298|36830_38675_+|QBK74756.1|DBSCAN-SWA MENASAAKSMRHAQYYNMTGIFDNLYEASKFGSIFPDLMTTILSQNNILLSYRNIKNNAGSLTPGTDNKNIQDLEKLDKDEFVNIVRGKARTYRPRPVRRVTIPKPNGDTRPLGIPSIWDRIIQQCILQVLDPIMEAKFYKHSYGFRPNRSAHHALAQAVRLAQLSKLSYIVDIDIKGFFDNVNHAKLIRQLWTLGIRDKWLIGMIRAMLHAPIIFPDGHVEHPKKGTPQGGILSPILANIALNELDWWIVSQWENHPTKYNYDQVKDKVVNKGNRYRALRKTRLKEMYIVRYADDFKIFCRKRSDADKVFLATTKWLEKRLKLKVNTDKSKVVNLKKQNSNYLGFTLRLIKKRQTLVVKSNISPKAKKQIKLKLVRQIKKIQHAENLIKQNMEVDKYNSMIVGIHQYYKKATHVSADCPDINQSVRAVLKNRLRLEKHGIPPSDFIKKNYAKSKQLRWLNGKPVIPIGYIKHSYTSLPKNGICKYTPVGRELIHKYQEFPVEIINALMKKTTNSESVEFNDNKISKYSMQRGNCKILKIPLELNEISCHRIVPKALGGSDKYNNLVILHLNIHKLIHITSAITAKKIALKMKLSVDQIDAINNYRMKLKLMEM |
5 | Lactococcus_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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