Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS398550 | Orientia tsutsugamushi isolate Kato genome assembly, chromosome: I | 1 crisprs | RT,DEDDh | 2 | 1 | 31 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS398550_3 | 1880340-1880418 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS398550_3
|
1 spacers
spacers of LS398550_3
>3.1|1880364|31|LS398550|CRISPRCasFinder AAATTGCGGCTAATCAAAAGCTAAAACATCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS398550_3
The CRISPR arrays of LS398550_3 >merge|LS398550|3|1880340-1880418|CRISPRCasFinder CAAACTTCATTGTAATTGACTATAAAATTGCGGCTAATCAAAAGCTAAAACATCTCAAACTTCATTGTAATTGACTATA >LS398550|3|3|1880340-1880418|CRISPRCasFinder CAAACTTCATTGTAATTGACTATA AAATTGCGGCTAATCAAAAGCTAAAACATCT CAAACTTCATTGTAATTGACTATA
>LS398550.1|SPR12022.1|1880185_1880284_+|Uncharacterised-protein MNIRLQVEHHVTELITDIDIIEEMIIVNYNEV >LS398550.1|SPR12016.1|1879823_1880144_+|Acetyl-/propionyl-coenzyme-A-carboxylase-alpha-chain MRVTNNEREMQDAYNSARLDATYNFNDSRVFIEKFIQNLHHIEIQLLVGKYGNSICLGKRECSIQRHHQKIIEEAHSSFLSNDTRQKMYDKVLSLAKKVKYSQHEQ >LS398550.1|SPR12011.1|1879358_1879607_+|Uncharacterised-protein MGIKSAAVYSEADTNALHVQYADKSCFIGNSPVPESYISISYPKSKLSAYAPNHILLKLLELAELKLYFQIMCFYLKILNLL >LS398550.1|SPR12004.1|1878862_1879081_+|Uncharacterised-protein MLVNLMTLLSLFLYSNFIVIDYSYEFKTFKLRYYYAWCNAEIGVLWPEPAIEVLYKNSYISHEFKAAQNFRI >LS398550.1|SPR11998.1|1878406_1878856_+|Propionyl-CoA-carboxylase-beta-chain MTIITLAPINPNKPYDMNELVERVADEGYFFELQPDFAKNIIIGFGYMDGNPVGIIANQPLYLAVCLDINASRKAARFIRFCDVFSILLVTLVDTPGFLLCQNQESNDIIKHGVKLLYVYAEATVPKITFITRKAYGGAYIVNYNEVCV >LS398550.1|SPR11993.1|1878166_1878310_+|Uncharacterised-protein MEPYAGGAVYSPALIDLFRKFFNFLPLSNTHLTPYQETNDPADRVNM >LS398550.1|SPR11988.1|1877878_1878025_+|Propionyl-CoA-carboxylase-beta-chain MFLGDGVITCHGTINCRLVFVYSQDFTVLGCSLGEVYAKKICKLIALL >LS398550.1|SPR11983.1|1877722_1877815_+|Uncharacterised-protein MQGGGSSKIDIQHSKVKLTARERIEVLLDH >LS398550.1|SPR11978.1|1876365_1877475_-|tRNA-2-thiouridine(34)-synthase-MnmA MLNLKVAKEQATIVVAMSGGVDSSTVAAILKEDGYNVIGITMQLYNHDTAINRKGACCAGQDIYDAKFVANQLQIPHYVLNYKDKFKKSVIDNFIESYINGETPLPCVQCNQSVKFHDLLNFAKDLQADALVTGHYVRRIDTANGIELHKAVDSKKDQSYFLFATTKSQLQYLHFPLGNMTKDETRYHANRYGLHIADKPDSQDICFVADGSYHNVVARLKPNAKKPGKIVHIDGYILGEHQGIINFTIGQRRRIGISFSDPLYVINIDAQQNIVYVGPESKLFKTTFMIHSLNWLGPGNMLVEPLDVEVKVRSTHSAVQAKLYPYSNSMVKVILNEPEKAIAPGQACVIYKGDLVLGGGWIAKEQTQS >LS398550.1|SPR11973.1|1874788_1876132_+|Uncharacterised-protein MSNLYHILHKLPAIEHEDMMVEYENLAQSLVQSGKLRVDAEPKINFVRLSEPSLNVNIAISNEELNDPKLQHHTKAMLINIYKKIIEKDKVIHKVNQIVSVLQKKMAMQLAVEQDLLLKLARLFVQSAHPIVIHWLLLERVEVFISYSNQIGDVMDIATWKYAGQNSGMQSINGNNIAIYVSCGGNPFFFTQRYQEQSIYGDGWPAIARLQIIAAQELGHYADIYRDINANIVGRHSVNSSFTKAKPNVLHARRSDLSRCYKILQDLEYIGLNSLITYEKSVKFYRKNKVKGIKLLWARLLSFFYKQKLYFMIKQEDFIFVKVYKNEQYSGLMLKAMILDMISNLEPKAEVYKRDDPDAEEAIACVEALARVPQQVIKWGHITTMSIMQDLYYIYYKQVIPSLIDRYQYITGKTYMRNLNYVSQTLKYRIKKLWPFFKKTSLPSREV >LS398550.1|SPR12027.1|1880768_1881050_+|Uncharacterised-protein MVLLELSLYQKLQKFFLAAAIYIFIFEQKQVATIADQIVKQAKNIGTRWIVTILRGQIELQNAHSKKFSIQKLLKDTINSLKEIAEDREISLS >LS398550.1|SPR12032.1|1881102_1881318_+|ATP-binding-protein MQTILSQLISGAIRVNKGYQVDVIVRLFTSPYRKANEKDRILRFIVCNNGKGISQERLQEINAKFSDLHSN >LS398550.1|SPR12037.1|1881476_1881773_+|ATP-binding-protein MSHTIQSGDFGIQAKVNSTIRALKPFTENKGINLSCNFKNDIKDLIIVNSIQIQAVLTLLICNAINSKCSEISVEIDLLASTNQKTNHRILLLIVHDN >LS398550.1|SPR12042.1|1881847_1882003_+|hydrolase MLAFLNCEHINKLLDKLFLINHSFDKHINPDKVKKDIFYAKNIIAIKSEIQ >LS398550.1|SPR12046.1|1882925_1883276_-|transposase MKKCIITVYYLIDNFCKIYQEWERKRLMPSSNQRNRDGKLSLAELLTVVIYFYLSPCKDCKNYYLYYLSHKYKRYFCLPSYSRIIQLWPRMLLPLAILMHCLKGDETGIFTSILQS >LS398550.1|SPR12050.1|1884213_1884423_-|Uncharacterised-protein MQQCFLTLTVLILLIIMTTVFNPLVFIVNYFFIPMVGSCIISIIARIFGFFFRKKLDSLYAKTNIKKAI >LS398550.1|SPR12056.1|1884491_1885964_-|2-hydroxyacid-dehydrogenase MLKNIILLYNDMICYIPFTIIGIIGIWNLIIPFLIRKNFIKEILMLAISILHAINAILLYFSYKAGYEHYTTIFSIGSFDFSLRLSLLGSNILLLIAILWPISIIYTIGFLKAHSEPNQAKFLLCTNLCILISNYIVCSANFFTMLICYELLTFATIPLIRHVTSHRTSKVLSKYTQGLYLPSLLFLMPTLVALQYQYSTTDFVEIANILQSRTLLQVSPVIFALCILCGTAKAAIVPFHSWLPPAMIAPYPVSAILHAVAVVNVGIFCLITGILSVLGKETWLLNYIQYFIGYGIVYTSIKALFQTNIKRILAYSTISNLGIIALTAFMNSHESLLATITHIIAHSIGKITVFYSAGCLYTISKCTNVEDLTSMSYKAPIITSCLTIGSLSLIGIPPLAGFFSKHHIILEAANEHNYLVIAITVFSGITSCLYLSKIIKTAYSKIDNECNINSTNNIHSEQMIPKHMLYSTVSCASLVVLIPIINALIM >LS398550.1|SPR12061.1|1885973_1887464_-|cation:proton-antiporter MSNIFQAVKDHLVILEVLIPFFGSLIVVLYKKVESALIVSRLCAILGIILGIYGVLSMINSHPYFYAIGNWKAPIGIEYRVDQVNQIIIVFSYFILFLLLTFNSQLIKTNLLSSLNPSRSHLLYSILLLLHTGFCGIILSNDLFNIYVFIEIASLASYTLVSQGVDKRALIGSINYLILGTIGATFILIAIGFILSNTGSLNITDIISRLPQQRTKTLIAAIMFYITGCLLKVAMFPMSSWLISTYKYTSSVILSYFAPISCMVGFYILLYFVYQIIGITNINTLHSYYIINALGLAGAIFCSCYAVQQSNLKSIMAYSVLAETSYISLMAFNIQSSTIGAQIIVILLTSCILKSIIYSLISRIEVHYHDSELKHIAGIGSTYPVFGILFTLALISNLGLPLTIGFVNKLNIFLTVLQSLDYFGIIILAISSCMSFNYHYKIFHYLYSTQQTSHSSFTLNGNNSVAIILTIISYLMLIFYNHLLVYLQPFFLPKIM >LS398550.1|SPR12067.1|1887456_1887852_-|cation:proton-antiporter MILTSKLIYFCSAVLLSLGLYIILSSYNYVKKTIGLAVFQNAVLIFYIALAKAKEGIVPIDQCFNQLSQHCSSITYSSPVSHVLMLTAIVVGIATMSVSLSIIRQIYQSFNSCNENDILLELQKMELKPDE >LS398550.1|SPR12073.1|1887835_1888270_-|sodium:proton-antiporter MQNNNIIVASIIAKIITPYILLFALYIQINGEVSPGGGFQAGAILASAVIGYDIIYPQQLIKYKLAILPLSIIGALGVMIYGLTGLLALFYGKNYLNYYVITCTKYSQSLGIFIVELGVGIAVTASLLIIYYVFVINNDYDTNK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS398550_1 | 1.1|29099|49|LS398550|CRISPRCasFinder | 29099-29147 | 49 | LS398550.1 | 808301-808349 | 0 | 1.0 |
LS398550_2 | 2.1|497023|49|LS398550|CRISPRCasFinder | 497023-497071 | 49 | LS398550.1 | 808301-808349 | 1 | 0.98 |
LS398550_2 | 2.1|497023|49|LS398550|CRISPRCasFinder | 497023-497071 | 49 | LS398550.1 | 1548848-1548896 | 2 | 0.959 |
1. spacer 1.1|29099|49|LS398550|CRISPRCasFinder matches to position: 808301-808349, mismatch: 0, identity: 1.0
ccttcggctttaccttcggctttaccttcagctttaccgagctttatgc CRISPR spacer ccttcggctttaccttcggctttaccttcagctttaccgagctttatgc Protospacer *************************************************
2. spacer 2.1|497023|49|LS398550|CRISPRCasFinder matches to position: 808301-808349, mismatch: 1, identity: 0.98
ccttcggctttaccttcagctttaccttcagctttaccgagctttatgc CRISPR spacer ccttcggctttaccttcggctttaccttcagctttaccgagctttatgc Protospacer *****************.*******************************
3. spacer 2.1|497023|49|LS398550|CRISPRCasFinder matches to position: 1548848-1548896, mismatch: 2, identity: 0.959
ccttcggctttaccttcagctttaccttcagctttaccgagctttatgc CRISPR spacer ccttcggctttaccttcagctttacctttagcttcaccgagctttatgc Protospacer ****************************.*****.**************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS398550_3 | 3.1|1880364|31|LS398550|CRISPRCasFinder | 1880364-1880394 | 31 | MN694638 | Marine virus AFVG_250M1093, complete genome | 6247-6277 | 8 | 0.742 |
LS398550_3 | 3.1|1880364|31|LS398550|CRISPRCasFinder | 1880364-1880394 | 31 | MN694344 | Marine virus AFVG_250M1167, complete genome | 37690-37720 | 9 | 0.71 |
LS398550_3 | 3.1|1880364|31|LS398550|CRISPRCasFinder | 1880364-1880394 | 31 | MN693686 | Marine virus AFVG_250M1168, complete genome | 6759-6789 | 9 | 0.71 |
1. spacer 3.1|1880364|31|LS398550|CRISPRCasFinder matches to MN694638 (Marine virus AFVG_250M1093, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.742
aaattgcggctaatcaaaagctaaaacatct CRISPR spacer tagctgcggaaaatcaaaagctaaaacaata Protospacer *..***** ***************** .
2. spacer 3.1|1880364|31|LS398550|CRISPRCasFinder matches to MN694344 (Marine virus AFVG_250M1167, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
aaattgcggctaatcaaaagctaaaacatct CRISPR spacer ttgctgcggaaaatcaaaagctaaaacaata Protospacer ..***** ***************** .
3. spacer 3.1|1880364|31|LS398550|CRISPRCasFinder matches to MN693686 (Marine virus AFVG_250M1168, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
aaattgcggctaatcaaaagctaaaacatct CRISPR spacer ttgctgcggaaaatcaaaagctaaaacaata Protospacer ..***** ***************** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
8579 : 121065
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS398550|8579:121065|DBSCAN-SWA AATGAAATTCGATCAGATTAAAGAGTTAAAAGATGAAAAATTTCGTCGATTAACAGGAGTAAGGAAGGAAACATTTTCAAAGATGGTGGATATTTTGAGGAAAGCTGATGGTCTTAAGAAATCAAAAAGTTGGCGTAAAAATAAGCTTAATTTGAAAGCTCTAATAGTGGTAGACAAGGAAACGCATCAAGTAATATGTACAGATTTTTCTAACGGTAAAAAACATGACTTTAGATTATTTAAGAAATCCAAAATTCTTATTCATCCTAAGGTTAAAGCGATTACTGATACAGGATATCAAGGTATACAAAAAATTCACAATAATTCTGAATTACCAAAGAAAAAAAGCAAGAAAAATCCTTTAACTAAAAATGATAAGAAGTAAAATAATGATATTTAGAAAAAAAATTAGAAAACAGAATCTAAAAGCCATATCCAGATTTATCTGTTAGATAAGCTAGAAAAAAAGCAAGAAAATTCAAAGACACTAATGACGAAAAGAATATATCCAATGGAAGTAAGACGTCAACAATATAGCTAAGCTAATATAAAACAGTTATTTTATATTGAAAAAATAGTTTCAATATAAATCAAAAAGAATCAAATATCACTGTGCTTAGATATGCTGTTCAAAAAGTATATAACATATAACTGTTTTATACTAGTTTGGCTATATTAGAGTATTTACTGCTTTATTCTCCTGATTTAAATCCTATTACACTTGAAATTTTCTTTAAAATATATACTATTAGTTGAATTACTTGAATTGTGTGGTACGATAAGATACAAGTTATAATGATAGCTTATTCGAAGGTTTATATATTCTCTTTTTTCAGTAACTACATTCAGAGAATTTAACTATATATGCAAAGATATATTGATTAATGAGGGCTTTAAATGCTTAAAGACAGAATTACAGAAAGTATATTAGCAACGAAGTTATTTAAAACATTAATAGCTTCTAATCAATCTAAATTTACAGAAGAAGATATTTTATTGTTAAGTAAAAATCTTATAAGAACCTTAAGCGGCATTTCTGAAAAAAACAGTGTAGCAAGTATAGAAGAATACCAAGCATGTTTTTCTGATTTAGATGATCGAGACTTAAGCAAAGTATTGAAAGTATTACAGGATATTTTTGCAGGTGAGGAGCATAAAGAATTCAGAAAAATTATTGAGTTACCACTTTTAGATAGGCTAACTACACAATTTAAAATAGAACGTATACAAGAATTAAATAATCAACAAGCAGGAAATTTTAATAAAAACTTAAGCAATAACAATATTGAGGAGCTGCTGCGTGATAAAAACATTGCTAAACAAGAGGAATTTTCTCCTAAAGGTCCTAAACAAGCTGGGATTTCTGCAGGATATATTGCTACTGAAAAGTCTAGTGGCAATACTTTTCTTCTAAAGCAGTTTTATAAAAGCAATACTAGTGCTAAAAAAAGCTCAACAAGTATTTTATGTTGTATAAAATCACAGACATCAGACCAATATCAAAGTGATATGATAGATGCTATACAAGAATTACTAGCATCACAGATGTATCAATTATTATTATATGATCGAGCTCCTAAAGAAGCGTTAACAATGCCAGATAAATTGAATTCAAAATTTCTTTATATACGATCTAAATTTCTTAAGAATGCAGTAACACTTTCTGAGTTTTCTGGCTTGAAAGGTGTTACTTGTGTTGATCCAAGAGCCAGCTGTCTAAAACAATTAGATGGATTTGAAAAAGTAATTGCTGCTTGCCATATGTTAGGAGATATAGATTATCATGGTGCTAATTTAATGGTACTTGATGGTAAAACTGTAGCTAAAATAGATCATGGCAGATCATTTATGCAATATCATAAAGATTTTGCAAGTATGGTTAGCACAACATATAAAAGCTTTAAAAGAGAAAGTAAAAAGTATGATTTAGCAATTCAATGTGGTAACTTACGCTTTGATATTAATAAATATAATACTGCACTAAAAAAAATGATAGGTCAATTGAATGAAGATCAGATAGATGCTATAATAGAGCAAAAAGTTGCCGAGCTGAGAAAGCTAGGATTTAATCCAAATGACTTAATTGTACGAGCTGGATTTGAAAGTGGTATAGTTAATAGTACTGTCATAAGTGACTACAAAGATCTCGAAGAATTTTATAAAAAAAATCTGAAAAAAAACCTTCAAAATATGAAAGAAATAGCTAAAGCAACAAATATAGTAGCTAAGTTTAGCAATGTATCTCAAGAGTTTAAAGAGGGAGGATGGTTAAAAGCTTTTGCTACTTCTACAATACAAGATCCAGTATTATATGCACATAATACTAATATTGCAATTAATAAGAAAAGGGCCTTAGAATGGGCTATTGCTAATAATTATGATATTAAACATTATGACAGTGATATATACTATGATTGGCAACAAGAATGGCTAAAAAGTAATCATGATAAATTGCAAAAAATAAAACAGTGTGTTTTAGAGCAAGAAAAAAAAATAGTTGAATTTAATGCTGCAGATTGTACGATAGAAAGCGAAAATCATCAAAAAAGTTTAAGTAATAAAATTGATTTTTTATCAAGTAGTAAAGAAGTTTTACTAAAGTCTGAAGTAAGTCATAAGTTTGATATTAACCAAAAAAAAGAACCTGCAGTATTTAAGCTCAAACCTAAAACTTCACAAGGAAGGAGCATGGTTTGACTATATAGTCTAACTCATCAAATGTATCAATTTATAGATTATCTTGTTTATTACACTTCATGAAATGTAATAAACAGTTTAATATTTTTTCCTTCTATAAAAATCCCTAGTCCAATATAAGGAGATAGGTTAGAGTATATTTAGAATATGGATTACAAGAATAGATTAACAGGAATATATGATAGACGTAATAGAAAAAAGAGAACTGAATATGATCCCATAGTAGATCTTTTCTAGATAATAGGTGATTTTTGCAAATATTTTAAAGAATGGATAAAAAAATATATGATACCAAACCCTATACAGAAGTGTAAAAGGAGTTGTAGGTGCGTCAAGAAAAGGTGAATTAACCTTACTGGTGAAAGTGCAGTTATGGAAGGAGAAGCTAGATCCAACATATAGCAAGTCTTGTGCTGCTGAAGGTAACGACAGTAGTAAAGCGTAGACAGTGAAACATTCGAGCCGAAACCAAATGGTAAACGTGATAGCCCCGAAAGGCTTATATAGTGGAAGCCGATATGCTCTACTACATAGTAGGCAAAAGAAGATTGGAGGTCAAACTAGTGAAAATCCAAAAATTTTCAACCACCGGGGTCGCAGGCGTCAGCGAGTTTGTAAAGATTAATGACACAACTTGAGAAGTCCTTATAACTCTTACGTAATTAAGTAAGTATTCAAAGTACAAGTGTTGAAACATAAGGCTTTGGAGATGGTGTAAGGATGGCTGAGTTAACCATAGTAGTGATGAAACCAAGTAATGTTGGTGGAGCGAAGGGTTAGCAGAAAAGTAAGAATGCAAGAGGGAAACAATGGCTGTACACAGCATAGACAGAAATACATGGTTAACGAAACTTGAGCGTATAAAGTTGCTATCATCGAAAAATCAAGACATAAAGTTTAATAATCTTGGACATATTATCGATTTAAAGATGTTAGAAGAACAATATAAGGAACTCGATAGCAATAAAGCTATTGGAATAGATGGTATAACCAAAGAGGATTATGGTAAGAAATTGAAAGCAAATCTGCTCTCGCTTCTTACTAGAATTCGCAAAGGGCAATATCAAGCTAAACCTGCACGAATAGTGAAAATTCCAAAAGAAGATGGAGGCAAAAGACCTTTGGTAATATCATGCTTTGAAGATAAGATAATCGAGTCTGCAGTAAGCAAGATACTAAACTCTGTGTTTGAGCCAATATTCTTAAAGTATTCATATGGATTTCGACCTAAGTTAAATGTACACGATGCTTTAAGGGAGTTAAATAGACTTACGTATAACTTCAATAAAGGGGCTATAGTAGAGATTGATATAACAAAGTGTTTCAATGCAATCAAGCATTGTGAGTTGATGGAATTTCTAAGAAAGAGAATATCTGACAAGAAATTTCTAAGACTAGTTATGAAACTGATTGAAACACCAATCATAGAAAATGGTACTATAGTTACTAACAAAGAAGGTTGTCGTCAAGGCTCAATAGTTTCGCCGATTCTGGCAAATGTCTTTCTGCATTATGTTATAGATAGTTGGTTTGCAAAAATCAGCGAAGAAAACTTAATTGGACAAACAGGAATGGTGAGGTATTGCAACGATATGGTATTTGTCTTTGAAAGGGAAGCAGATGCGAAAAGGTTTTATGATGTTTTGCCTAAAAGGTTAAATAAGTATGGGCTAAATATCAATGAAGCTAAATCACAAATGATTAAATCTGGTAGAGACCATGCTGCAAATTTAGCAAAACAAGGCAAAAAGATCGCAAGTTATAATTTTCTTGGATTTACTTGCTATTGGGGCAAATCAAGATTTGGTACAACATGGAGACTAAAATATACCTCAAGGAGAGATTGTTTTACCGAGAAACTGAAAGGACTGAGAAAATATTTGCGTAGTCAGCTAAACAAGCAAGATAAAACACAAACATTATCACAAGTCATTAGAGTTATTAGGTGAATGGATCAACTATCATGGTATATTGGATAACAAAAGACGAGTAAGTTCATTTATCAACCAAAGTACACGTGCAATATATAACTGGTTCAATAGAATGGGAGGAAAACGTAAGATGAATTGGAAAAGACTAACCGAGATACTTAAAAGAGTAAATTTTCCTAAAATTGGAAAGATTGTCTCAATGTTCTAGACAACAAATAAGGCATAATGCTTATCTTATTTTTGAGAGCCAGAATGCGGTAATTCTGCAAGTCCGGTTCTGAGGAGGGGCCTAATTGAGCGATTGGTTAGGTCTACTCACACTAGCGATGGTAAAAAAATATATGCAGTAGCTAGAGGCATAATCTCTGAAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS398550|8579:121065|66055_67195_-|SPR02546.1|integrase|DBSCAN-SWA MVVILYFTQIAISKIKPPKEKRDVYRDTKDKGLFLEVLYGGTKTLYLGITIKGVYRKIKLGNFPNISVNYARKKTLILKGQIAKGIDPLKTKNASTLKEVYDLYINHRKLKDSSKILYKGIMNKYLKNLHYIHVSNIRKEDIYKIFNNAKKGGKYSANKTLKLIKAILNIAVELELIEKNPANGIKIHKMQARDRYITLEEMPRFLAAVEEDKNPYLKYFVYISLYTAARRNNVLSMRWENIRLEEGVWYIPETKNGESQTVPLINLLIEKLKQYPYSSESEWVFPGQRRNSGHLTSINVAWKRVCKRAGLKNLRIHDLRRTVGSWMARFGISMAIITKLLNHNDPQSTKIYTQLNTDVVRDAIQKFANEIAKCTNLQD >LS398550|8579:121065|95239_95647_-|SPR02710.1|DBSCAN-SWA MDEVNLKIKERKMRTRRLIEMGGLVAKANLDHLSANTLFGAIVSLKETLTQHPNVQDHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKFASEPNENTKRYIRLHGLKWNSFRQEWCGHVKDIESLKNGLLNVQYKLDIIKPIS >LS398550|8579:121065|101335_102004_-|SPR02734.1|DBSCAN-SWA MSGNKNLLAVDAAKFTLKNSGKYFYFKSNKSDEDNHMFIIGNSGNSIHTKLDLETYNMFKAMLNNDDCMDLETFETFSIRKNITANNEDISTNNLVNTLTFFSKILPDISNISLHKEVITNVIKYIIALRGVRSDVVLDTLINEICENINLDKNIFSLEFEDHHFDEYDADGGVLVEKNKQTVTNIDSQNLKTATYDESNAGFDSISVMIGENECLVTKSSM 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MKIGVEMAIQFARIEFLRRSEGGDSCRKAAYNARTIVKNKQTGIRYNFSRKKDNVYHTVLIPDYVNQDFKNIQTLMNEVERTETRENSKLLKDIVIALPDEKELNLEHRIELTHRIVDAMEWVQNGLGVQIDIHKPQIGDKNWHVHILVTTRRFKENGEELGDKAVDLEAKFITVKGQWRIIKDSKMIHEIAKEETNAYFAELGLPYRVDEISEVPGKHIGPPRIRSLINEVVNENELRKEAHLKIINDADVITDSITHYKSIFTKQDVEKAVKDIPDPTAREQLVQQVLSSNRILELYHDDGESSKYFTTIEVRNEETRIIRIANKINNQVYYNDIYNLKSDIEGLANVSEEQKQALRHILLSTSGVRVLRGRAGTGKSYVLIKAHELATNRGQKVIGLAPTHKAVSELRSKGYTEVYTVKGFLYNRKKIFMQDSLIVVDEAGMVGTKAYAELFRVVRKNHCQLILAGDEKQLASIERGGMFEMLSNIFGSHVLVNIRRQSKNWSREAAMEFAESNILSGITLLRQNNSVRFDNTLQDSMSKLIYNWSLSKFKPHEKLVITVRNKDVDILNSSIRSLLKANGTLKGTEYERSIDGRKKSYMAGDRIVFQKSYKDLQIQNSEFATLTSVSKNKFIAKTDTGKEVSFDPSEIQFKHGYASTVYKVQGASIKDVYVLHNGVSNISSSYVAMTRHIKSLKLYCNKEATGSINSLINQLSRPNEKSASITLKTAHDLEKERTKTTVFSKIENWFKSIINDINDRSHVNKEYYHFTAKPEEEAKVEKVQLKDISTPLFMHIKEQRQYDYDVTILSAEGKAISSFQEAGIDSRMVYSSNVNNLKYYQPFQGEKILIAANNDKQNKEYVNTINEAAKVLTSKGAITSIVVPSECEVFNDMLKNKGAVAVKELMIPEIMKLINTQNVKTEPEQIVKADIAPKIRIRR >LS398550|8579:121065|14459_14939_+|SPR02286.1|DBSCAN-SWA MSVACIQHLQRNITILPEQSYAGKAKQQLTNLKIKFDKNSEFIDSEIAFLSSIGDIFPIYDYIILESISGVTILDSSSELIASYTLVQHLKEVITEIRRAVTSLGAKQVSNEHLERYLKELNRVQLFANEKWTSLQTDANRIDKRARLIEQHLIAKEKS >LS398550|8579:121065|28493_28892_+|SPR02347.1|DBSCAN-SWA MDEVNLKIKERKMRTRRLIEMGGLVAKANLDHLSANTLFGAIVSLKETLTQHPNVQDHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKIASEPNEDTKRHIRLHGLKWNSFRQEWCGHVKDIEALKNGLLNVQYSIELVV >LS398550|8579:121065|69680_69830_-|SPR02564.1|DBSCAN-SWA MILKFSSEPDENTKRHIRLHGLKWNSFRQEWCGNVKDIEALTWPSQCSV >LS398550|8579:121065|49444_50590_-|SPR02463.1|DBSCAN-SWA MKNIYKLAITIILPLMLLNTAIPAEESKLVQQNSIKDKNVLAKEYSNIGSSFLRLKKYQESIENFDIAIKYDPSYASAYNSKGIALDDLGKLLEAIENYNLAIKHKPDFAEAYNNKAVSYEKLGKDKEAIIFYDLAIKYKPNFAKAYNNKGAALNTLGQYEDAMENFDIAIRYNFSYPEAYYNKGIALMNLGYIQNAIENYDIAIKYRPDYAEAYINKGLTLAFLGQLQKAIEHFDLAIKYDPSCVKSHCNKGYVLSLLKRYSEAVESCNLAIKYDPNCADIYYNKGMIFEKLGKHQEAVENFDIAIKYKPNFAENYLEKGISLVSLRQYSKAKENFNLAIKYMPNLIAEYEATIKRLTEFENFTIAKDYEQKLQILKKYS >LS398550|8579:121065|54554_55238_-|SPR02476.1|DBSCAN-SWA MFMILISHLSTVDASPTGFLWYNDKHDHELNNSSSKLMSGTHDHRIEELKEQFNRAQRIALDNPTLENVITAQRLQKQIMEKAHKFATMWQLATLLDYQLINAHEPANSLHRKLYQEKSEQKNDFKLKNIAKNWGLILQVKEDCLLCKAFIPIVQSFANKYAFQLLAVSKNNELLNKLNPKHIVPVLYLVASDGKKIYAVARGIISEDKIIDNILAIDRYYHKLETR >LS398550|8579:121065|30030_30255_-|SPR02356.1|DBSCAN-SWA MKMIQTLVNQDKVELLLIKLLDRLDNIKTVFIKPDKRRQEIILETQQEFIHLAEYLKLQEIAIELNKYCELYAT >LS398550|8579:121065|70849_71416_+|SPR02587.1|DBSCAN-SWA MRRFREDGTGLGDIAVDLNAKIITVNGKKVVIKDPEMIHERVKEIINAYFAKLGLPYRVKDTSKVPQKHIGPPRIRNLINEVLNENELRKEAHLKIINDADVITDSITHYKSIFTKQDVEKAVKDIPDLTAREQLVQKVLSSNRILELYHDDGESSKYFTTIEVRNEETRIIRFITTIFTILKVISKV >LS398550|8579:121065|68715_69594_+|SPR02562.1|transposase|DBSCAN-SWA MHLSRFLDPKNDVAFKKIFGSEKNKDILIHFLNDILLFEGNREITEVEFLGTILDADIASKKESIVDVLCKDKNGAQYIIEMQVDPTQGFEKRAQYYAAKAYGRQPNRGKEGKYSDLKEVIFIAIADYKLFPNKEDYISRHVILDKKTYEHDLKDFSFTFIELPKFKKNRVEELNDITEKWCYFFKHAKETTLDGYNKIIGEDLIIKRAYEALDQFNWSEDELITYEQELKRIWDNKAVEDYKLERAKAEGKAEAKKAFAIKLLKSELSVETIAEYTDLSIQEVLNLKNSVK >LS398550|8579:121065|115198_115360_+|SPR02798.1|DBSCAN-SWA MYRDRIRLHHSAPHRMELMLGLLRDYVAWANSIQGHYYYNILDGKHRFLLLEV >LS398550|8579:121065|55249_56941_-|SPR02480.1|DBSCAN-SWA MKQLIVLVLIILNINCCLASMQSSYNEASNYNVNLGNSSNTQELFHQGSNVNYPNNDEDLTYHGRNQLSTESGAMLFQAENSKNNALTQHNINDQNYMIANSMRIESDPLSALDSSNFVTQTSTTNTEIIQSCTEGSKFNIELIRELNVECKLENVWLPWQSRQMEFATEEIKENHSNWINSRSDVYDESGSQIYCLVDDPEAIERQMKRAIANRLGASTQHIGRNFLLEVNEKICILHYDYRDKTQELRKVAEYWKVLNPELEQLTESNECYEVNRINYDGGDRVFFDKFKVNRPYWKQKIVFSCTSDPKDGCKHLKIQNCELKNSTCQKSVANICLLWQHDYSCSTEKQTMLHSSLRNNSIFCLGGNCNTPTIIPNRDIAKVAHLAMLNQMSKDIKTNPVSVFSGKHRKCKKDVFSFLNCCSSMTGWGRDIGLSQCKSKEQELALYRKKGYCYYIGTYCSSRIPILGICLARKSTYCCFQSKLARIFQEEARKQLKIDFGTPECPNCRGLTVKELQKVDFTKINMDELFGDILTKAQNSMNKDIIAGIKDKVHRMQQSQSK >LS398550|8579:121065|76620_77544_+|SPR02612.1|DBSCAN-SWA MAIFNFVFFKIIAILLNVIIGFLAGKWSKVDRDSIAGLLFYFIAPIVFFSIPAHTKLDLHEISIAIVTFVIASALCYLSRLVFKRYWQDATQNILAMAAGTANTGYFMLPIAAKLFDEYTLSLYMMATIGVSIYESSIGFYICVKSLKNTRESIIQVLKFPNLNAFILGCIFSLSGLTLPKFLDSFIADMIKVYSVLGMIIIGLSVSNLVKFTVDSRFTLAAFISKFIFYPLAINIFIILDKITFAIYTTSHYNALKLLSLAPMAANIIVISSIIKFHPERSAATVLLSCIFALFYIPLMIALTLQL >LS398550|8579:121065|47684_49439_-|SPR02459.1|DBSCAN-SWA MNFQNQGNFTRGSQLFAHKLRMFGQGSTNVFIIGLGLSIFWIICRLYQKVCLSSLYYFVIERYVQLKLAIGEHFYDIDQIGIKFYSLRFKKWMHLNAQDFLHEFYTGQHGFKIQQLWEFLINSALLEGLIVFAIGVIISIVFFTAQGKNTIIKAKIRGADFVECKCLSKMLKSAKKASKICFGGLPLVKNSERLHILITGTTGTGKTNMLNELLPQIRLYKDRAIIVDTTGAFTDRFFDPKCDRLLNPFEKNSEQWLPWNDCFEAADFHDIASSFSNYTPKLDDFFAKNAELVLSEALKLYQDDKDIIKLIHTIIYSDNRQFAKAFRNTAVSGIISESALETSAGIQSTLGKNITSLQYLKPGGSFSIKEWFSNSNETGWLFITANPSQRATLCPLISAWISIAIKALMCRNPNHDNKNMWFILDELPALQKVSFLPVALAESRKYGGCFVAGLQNIHQLEAIYGAAECASMLDLFNSKFIFRVSDQVTAYKSALTLGEQEIIETQENLSYGSNTMRDGVNMNNVERKKILVMPSEIMNLPDLTCYVKLAGNFPITKLTMQLQNLNTAFVWGYKLLKKLKLVEY >LS398550|8579:121065|63401_63737_-|SPR02523.1|DBSCAN-SWA MFIYQKSRLNMLKPTFGIQWNNVVVGLLIIIITACVFSFEPALADTLEGQLNKIDGLFSGKLKTIGISSATILSSIWAVARGNIKLAGVMVAIGVILGFYLDWIAGGMKIN >LS398550|8579:121065|81088_82228_-|SPR02630.1|DBSCAN-SWA MAVHSIDRNTWLTKLERIKLLSSKNQDIKFNNLGHIIDLKMLEEQYKELDSKKAIGIDGITKEDYGKKLKANLLSLLTRVRKGQYQAKRARIVKIPKEDGGKRPLVISCFEDKVIESTVSKILNSVFEPIFLKYSYGFRPKLNAHDALRELNRLTYNFNKGAIVEIDITKCFNAIKHCELMEFLRKRISDKKFLRLVMKLIETPIIENDTIVTNKEGCRQGSIVSPILANIFLHYVIDSWFAKISKENLIGQTGMVRYCDDMVFVFESEADAKRFYDVLPKRLNKYGLNINEAKSQMIKSGRDHAANLAKQGKKIASYNFLGFTCYWGKSRFGTTWRLKYTSRRDCFTEKLKGLRKYLRSQLNKQDKTQTLSQVIRVIR >LS398550|8579:121065|91721_92564_+|SPR02682.1|DBSCAN-SWA MLPKRKRLADYYPLTPEDAVILQRMSSRSFNIYFINQLLLKLSNKYPNRHFVNKIAVLNYMAKALANELLTTEQANSGNFRFNDVGRFKEQYLANIESGTDRSMKAQLKRKIAGVFEADMAYKILTSCDFGAGVKNKYYIKLLKNITLSDHIKFKILQEVRAVHGNDIEQLQVIPFDESKQVTNSTMEYQKTTVLQQQISDEDYFSELSKELGSNSILFKVRKYILQHYEYEQVIDKIWFSKLEVVNEDNVIKKIFIKALTSFADSYIKSNFKPILRVCF >LS398550|8579:121065|62040_63363_-|SPR02519.1|DBSCAN-SWA MEQDNSDNNNTKEEDLELNDKLKAESGVRSNSKLSELTNIIRRKPVIALTFISITIMVVSYFLSESGKTKESIIFIENRESREAISGVEQAVDLRAKWTEEILNEVKTLKDRLESVIESRYLETTAQINNFNQKLEILENQPKQLLYNNDSDEFSSDLNHHISNSPHDNKTEQAPVQSFVNLRRAKSEPKKNVENYVTSGSSARAVLLTGVVVGTGTNSSSSPEPIVLQLLDTAILYDKYKTDQIKKAILIGSCNGEMSSERAKCRIETLSVVNNQGDIIEKKVEGWLIGEDGRSGIKGIVVDKSSNIASMAALNGVFSSIAKFLQSKAIKPDVLPTLNLVAGGQQQEFQIGDALQSGACSGASNAFDKLADFAIKRADSMSPVIVVASGRIIDVVFKKGFDLCEHKKKPHNSTYSPSTSHEKVNSHNQFDQSQRLEEHL >LS398550|8579:121065|13635_14265_+|SPR02278.1|DBSCAN-SWA MSIRIRVYVIAALFSLQAPVSLAWNIENVFQGMSVNVTRSGSYQDQAAGYYAAGGLSARTSQTSFQPFAITPPSLNMSCSGIDAYLGSFSVISGEELVQLMKNIGSQAKVYAFSLGLKTFAPQIENALKDLRNLAMEMNQFAKGDCELTKALFATALPKNWAMREAVCRDIQSQSGFDYFAAGKKCRNYLDQKQALQQAQNKDSELMLE >LS398550|8579:121065|65179_65515_-|SPR02536.1|DBSCAN-SWA MRNLMLQLRLKVIMQNQKLCWALSRPLKYMGLSIDEWGVVLAGVAPGIVLLNSRHAKLGLAFMVGGIALCYCFKKFKKVSENFLLKSFLVAKGLLPAPLGYSRLLGKKVGK 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>LS398550|8579:121065|108155_108542_-|SPR02780.1|integrase|DBSCAN-SWA MSVIVFKFTQAALNKIKVQTKAEKIFKFRDTKERNLLFIISYTGFRRLYLGININGIYYKIKIGNSPDLTVAEARKKIQKLKRDIARGINPMEERRKINKERRDKREKKLELQNELTFKQLHEKYINE >LS398550|8579:121065|36021_36831_-|SPR02395.1|DBSCAN-SWA MSVAVANKSKPFLHWIGSKRRIVNKLIEHLPQGPHYNYYEPFLGGGALFFQVRHLFKQCFLSDINLDLITSYNAVKNNPNEVNRLLSLYHKHHSKDYYYKVKNKYSNNPNEITAKFIYLNKYSFRGIYRVYKNGQSAQTFSGECYIKLHIASRINQCSSLLHGVSIYATDFSFIEPQQNDFVYFDPPYHKSGERFYTRLPFDEKDQIRLRDFVQELTNKGVKIMISNNNTAFIRDLYKDFNINTVTVVYSINEQRNPVNELIITNYKTC >LS398550|8579:121065|78656_80168_-|SPR02625.1|DBSCAN-SWA 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101 | Pseudomonas_phage(18.75%) | transposase,integrase | attL 85883:85898|attR 122472:122487 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
137710 : 189609
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS398550|137710:189609|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS398550|137710:189609|141660_142458_-|SPR02922.1|DBSCAN-SWA MHNGVSNISSSYVAMTRHIEKLQLYCNKKATPSINSLINQLSRPNDKSASITLKTAHDLEKELTKTTVFSRIENWFKSIINDINDRSHVNEEYYYFTAKPEEEAKVEKVQLKDISTPLFMQIKEQRQYDYDVTILSAEGKAISSFQEAGIDSRMVYSSNVNNLKYYQPFQGEKILIAANNYKQNKEYVSTINEAAKVLTSKGAITSIVVPSEGEDFNEMLKNKGAIAVKGLMIPEIMKLINTQNVKTEPEQIVKADIAPKIRIRR >LS398550|137710:189609|185540_187022_+|SPR03121.1|DBSCAN-SWA MTQINLKQRFIPTISSKSLEKVQENFEELFNKITNEQIKVGTVVKGKVVEIDDEVVIVDIKLKNEGRIPLSEFKLASDVPIPQIGDLVDVYVEKIEGRNGCTILSREKALREEAWSVLEEAQKNGSLVDGVIFGKVKGGFTVDLSGVVAFLPGSQVDVRRPIKNITPLMNIVQPFQILKMDKKLGNIVVSRRAVLEEARAGIRQEVLSKIQVGMILNGVVKSIVYYGAFIELTGSDELTFDVKVDGLLHSINILWRKINHPGEELQIGQQVRVVVIGIDISTGQISLGMKQLSANPWDDIENSLQIGDIKVGKVKSIAEYGAFIEVTKDLEGLCHSGHLGWEKINQNPKKSLTIGQEVVFKILDIDKERHRISLSLKLCKPNPWEVLAEKYQVGTVIRAPLRNITNFGMFVALSVTTNAVKYEIDGKEYEIGEMTYQIDGMIHESDILKHGDTNSNSLKNYTKGDEIECMVLAVDVEKERINLGIKQLADYKR >LS398550|137710:189609|177249_177975_+|SPR03067.1|DBSCAN-SWA 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MTDKINDSNNFNNIHNSKTEIENSKANSLNHNVAIKLINGDIADGIVLLSDNNSLRADNTLKESINQLINDWKNSKFEPQDRLIIAGHKEAENINQNIRNYMKENGALKGPEYSILISGAESKKYANYMAGDRIVFQTNDKDLQIQNSEFATLVSIDENKFVAKTDTGNEVSFDLNKISFKHGYATTVCNPQTAVKKDVYVLHNNGVGIESSNISMIGNAEQVRLYYNVQATKNVANLIEQLSTAKTDSINSKEENNDVQANEVRQYQSAQNYRKNDYYSNSEEDLQKLRDAIAYRADTIARDILGDPNNRLSRHGRLRWGDTGKIQVTTEDKYAGKWYDFSTGQKGDLLSLVQIKRGYSFFEAKEYLKSMVGMSNISQRYQKRPKTDDSQQYTQQPESVKIAKVQNLYELSSKIHGYDIDKNPHAEVVNKYLENRGITFDKSTASSDLKASILFDTQTRENYPAFTAFARNSKGEITGVQAVYLNLAGDKANISINRRSFGKISGSFITIAKRNANDPNITIIAEGAETALSLQQSGIKGNIIASAGISNLTNYSPFPGEKIIIAADNDSKNSITNNTVIKAAKMLEMKGAITCIIKPPENGDFNNLLQSCGDQSIRDIIEPEITKLTKAIETTKLTQTENNSIAKQNDITNVKELYNKSSSLYYFKQEEEAKVETIVVNKYLENHTGIYSAKIFNNSNLRANMVFDEETQKSWPALTIFVKNEAGEITGAKILTLNSKTCNKADIPEKSVGTISGSFAEIAQQNSKYSPVTIITKDIETALTIRQAGVEGKILCAIEAENLQNYNPGPKEKIILAVKNDVNTEKAEKVLEDKEAVVCTVKNDFNNVLKTQGLYAVRNIISPEIRKLNEKIESIQTNIQPGLCPKH >LS398550|137710:189609|153627_153891_-|SPR02968.1|DBSCAN-SWA 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MSHTIKSGDFGIQAKVNNTIRALKPFTENKGINLSCNFKNDIKDLIIVNSTQIQKVLTLLICNATNSKCSEISVEVDLLPSTNKKTNYRILQLIVRNNGIGISAEKVKKINNELRNLHIKSYAVLESELLLVKPFIHEMTGKIKLESKQDQYTAFTCSIPCMIKISEIAIK >LS398550|137710:189609|149535_149781_-|SPR02945.1|transposase|DBSCAN-SWA MRGASRISRTGNSDLRKSFYMPAMSALRHNCIIKQFSQRLSDTGKPKMLILIAAMRKLLHIIYGVLKHNSPFNPNVLINQK >LS398550|137710:189609|178796_179033_+|SPR03080.1|transposase|DBSCAN-SWA MVDNQTYQVICTDFSNGKKHNFRLFKESKILIHRKVNAITVSITGYQGIQKIHNNSELPKKKSKKNPLTKNDKKIIVG >LS398550|137710:189609|161478_161616_+|SPR03002.1|DBSCAN-SWA MLSYKKNLNKQGIIQHEKMYYNSILFNRQFLQDILRVGEKETNTK >LS398550|137710:189609|137710_138670_-|SPR02914.1|transposase|DBSCAN-SWA MTKQLKHDSLAKTIMSDPVAAQEFLEYYLPSDFKSLIDLSQIKVEQESYIEESLKKKYSDIVYRVATKKHGNAFIYILIEAQSTVDYWTALRLWRYTLLLCERHKKEKTKLPLVYNLVIYNGKEVYNAPRNLWDLFTDSMIAKQLMTSDYQLVDLQSMSNDEIVRKKHIGMLEYMLKHIHQRDMLKLWEEFLIKFKHVLILDKEKGYVYLRSFLWYTDTKLLESQQPELEQVLAKYLSEEEKSNIMRTIAAKYIDEGIEIGETKGIAKGIAKGIEIGEVKAKQELARNLLKAGFSVEFISENTGLSKEEVINLKNNIEY >LS398550|137710:189609|155629_156274_-|SPR02981.1|DBSCAN-SWA MILKSKTKYTLHSAIQDGDIKKVKQLINKDSTLVNSKYKNGTTALSVALKYKNLPIAEILLSNGANVNAQDNDGHTALHLVVDTIQVYYEFFEKYPVYCNDHIALLLKYNADVNIENNQGNTPLSDAVECRCIEPLAIMLKHNSTGINKKYDEGETLLHIAVRNKIIDIIQLLIDYGADIDAKDDNGMTTIDYAAKSGNADIFNFLTEQWVLWY >LS398550|137710:189609|172889_173927_+|SPR03045.1|DBSCAN-SWA MSIIKTVRNIFINNANKLKEVYLFITSLPSYIAQKVALAKQHILEVKSKFKNLGATNVDLGIYHLQNGNYNEAIIRFKIVLMLLKKCSDQANYWLSFAYLIKGNYNKSLQHAKLVNQQDITELRNILENHYTLHSVPRQIWSIYKNITFEYYNSRFIGKDINVAKEFVYTLLEVVEELPQDCKILDYGCGNGIIGHTICEMIVKEFTLIGVDCYDRLNEIVNAKHQIYDQVMSLWPQDFIEQNSTKEQFNIVIAFASIAYSIDINSIITTLYQVLLPGGYLGIVLPANRSNTVFDLQYLWFSYNVCDVEKNLQNFNEQGQFNLVRAREIKIPDQNLSYSILILRK >LS398550|137710:189609|163378_164941_+|SPR03011.1|DBSCAN-SWA 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>LS398550|137710:189609|154265_155075_+|SPR02972.1|DBSCAN-SWA MSVAVANKSKPFLHWIGSKRRIVNKLIEHLPQGPHYNYYEPFLGGGALFFQVRHLFKQCFLSDINLDLITSYNAVKNNPNEVNRLLSLYHKHHSKDYYYKVKNKYSNNPNEITAKFIYLNKYSFRGIYRVYKNGQSAQTFSGECYIKLHIASRINQCSSLLHGVSIYATDFSFIEPKKGDFVYFDPPYHKSGERFYTRLPFDEKDQIRLRDFVYELHNKGVKIMISNNNTAFIRDLYKDFNINTVTVVYSINEQRNTVNELIITNYKTC >LS398550|137710:189609|182627_183149_+|SPR03111.1|DBSCAN-SWA MSRRCTEVKRKSLPSNKYQSISAATPNQIMLASKLINKLTHHGNKELVEKMLDKIIQHIKHKYKADGFEVLESACNNVKPSLQVESLRIGGATYQVPSPVNELRSYTLAIKWIINSAANRTFEKSMWQKIAEELYEASNGRGGAVKKKDDNHKMAEANQAFSHLITKRRSRGN >LS398550|137710:189609|166988_167162_-|SPR03020.1|transposase|DBSCAN-SWA MTLDYLRNPKFLFKLKEDVNQYSDAYQYERAEWLGASKSSIQKALKRYYIHLNILLL >LS398550|137710:189609|173986_174820_+|SPR03049.1|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,integrase | attL 160785:160826|attR 180286:180327 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
200723 : 241119
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS398550|200723:241119|DBSCAN-SWA 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49 | uncultured_Mediterranean_phage(14.29%) | tRNA,integrase,terminase,transposase | attL 191519:191544|attR 241624:241649 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
249679 : 334809
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS398550|249679:334809|DBSCAN-SWA 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98 | Salicola_phage(18.18%) | protease,tRNA,integrase,transposase | attL 261172:261200|attR 284314:284342 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
351109 : 409924
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS398550|351109:409924|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS398550|351109:409924|392178_393840_+|SPR04209.1|DBSCAN-SWA MEKASFQEILLHPGIFLILSSAILYIFRYFKIFNMLAVFLPVIAAIICIMQPYNVYYNFYEIWQFSFQYNYYNKIACLCILLCSSCINLSAWKNQHCSNFSVIIAMLYTGISIISMLSVDFSTMVYSLEFASLAAVLMIYNKTNESQIETAYQYLIVHSLSIMLILAGSSIIISSYGLPITNLAKLIENFEYNYLTLAAIVILLGLLINIACPIFSYWLVDSYSISKTTASVYLSMLTTTINLIWIFKLFLGLKILIIIGTFITLFGIIYSILENEIKRSFSYSSIAKTGIILVMLGIYEHNTDYNALSNYNQEAVLMLLCISYIPCQCVIMLICGWLKDKYTLTSFTDFSNKMVTIDPVLLIAISYSLALFFATPFTTFYYTNVLALKNNNIIYFLNIIMATQLLCIPLTSICKNVRIIKFSQVYGIDGTKYINIAEYIAIICFITINLILYFYIADFTYLLQQLTIITAGLIASYVSCPTKISGKILLPENILYNKACNFIDLCSNKFFSWQSKLQFPKILRLSNNLELSNSLSIVATILILLTIIIIDII >LS398550|351109:409924|351597_351750_-|SPR04037.1|integrase|DBSCAN-SWA MKVLAEKENSQLTEEKKQSKISEKLFLFIALFTAACSGNILVMRCERDKP >LS398550|351109:409924|399788_400337_-|SPR04235.1|DBSCAN-SWA 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60 | Aeromonas_phage(20.0%) | tRNA,integrase,transposase | attL 350339:350355|attR 383002:383018 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
422648 : 512359
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS398550|422648:512359|DBSCAN-SWA 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95 | Wolbachia_phage(10.0%) | tRNA,transposase,integrase | attL 438772:438789|attR 514792:514811 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
555292 : 712587
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS398550|555292:712587|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS398550|555292:712587|586095_586365_+|SPR05017.1|DBSCAN-SWA MATKKAGGSSKNGRDSAGRRLGLKKSDGQLVNAGNIIVKQRGTKFYPGKNVGLGKDHTIFSLVSGKVKFFRKKKNRVFISVVVDDSTAA >LS398550|555292:712587|650234_651464_-|SPR05326.1|DBSCAN-SWA MRHNFCSTRPWLKVTNVFDDFIKHGGGVVLLIKIQNYNNLLLIAANKRLKQIFQKFKLILSTICKVYVSKHYVFQWDYYFIIVFPKIDKSKVSTIAYDIYYKSQMVTFDKDKLFLKCKISSIKFPEYGTKLLLLIKYLKSYLDDSSFLGYYSEFNFLEFTTGLKKEFEALALFKEAQMSEKLFFAYQPIVESRTGKILYYECLLRILDAANKLTSAEPFILLAEKNGFINVIDKMVLQVAIKELSSVPDLTLAINISNIGVLDSSLIAMADELLSSYPVADRLTIEITETAFNNDVIKTIEFIEAMHNKGCQVAIDDFGAGFFSFKHLQMLQVDIIKIGGCFIRDINDNYYNKSIVKTLVETAAGRGIETVAEFVENGQIAKILMDINVNYMQGNFFAPAMHYKPWNSG >LS398550|555292:712587|679135_679888_-|SPR05438.1|DBSCAN-SWA MNNLRYNRLLIKLSGAALKGDSNTDNFDIKKLKYIAQEILAIKNMGIEVALVTGGGNIFRGNSAEYWKIERAEADNVGMLGTIINALMLKAALEKESNYKVRVMSAIKIEAVAEPFIRSRALSHLDKGYLIILAAGIGQPFITTDYTAAQRALELRCDAMLVAKHGVNGVFDSNPKEDNNARQYCTLAYDDFLINQLNIMDHSAVLLAKQHNLPIHIFNFDQKLAAKDICLGKNIGTYISSNTKMQFSNE 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MKIMKITKFYILLVLILLLIPSASFAKSNKTMSKDISNYLKNMNINASYYIATDKNKIIARGAVGHFDCSTKQHKIKYDVLMPIASITKSMTAVAIMILYEQGKLKLDDCIAKHIPENYWPNGKIPTWSNTVSIHQLLSHTSGIVDPKGINSSDVSKKLFRPEMSDMEIKQIILNSIVDQQLHSVGQYHYSNIGYFILGLIIENVSKQELKDFFAENLFKPLKMNNTYLLNFQEGFKIQMLGSKRIPDTCVFQRDMNQKDVSLVKLQSRVLATFSAGGVISNVHDLHKWNLALHNMQIISKDSYIKMTTSHAVINDTDENELFTESYYGYGLKIGLLANGKKVYGHNGNYCARSELWYVPSKSVSIAMLSNVFIPKLLINDPAAEQFNVQSLLNYVITRLYCC >LS398550|555292:712587|656448_656571_-|SPR05345.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTLLVCKRFKIIADKYRNRRKRFGIRFNLISGIFNFELR >LS398550|555292:712587|696025_696649_+|SPR05514.1|DBSCAN-SWA MSIGNEGQNKINKLTEKLSTEGINITTIKLIDTELQKLYCQLEKSGQVSINFIDWIQYFRRIVNNYDKKKINIIASLNGIIFLFRQYIASTNIRVETFNIESLINNSVIRMRKNFENENINLNVQNDIKPILIGDSFRIKAVISQLIGSAVINSSKNSKIIVNVNQNSEILQFTVQNIGLSTSKEKLERINAELENLNLVTYQELGE >LS398550|555292:712587|566894_567590_-|SPR04935.1|DBSCAN-SWA 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MKLKCSFMVYLRTGLFFIMISIVSVAFLPIMFVVLLCSRNNYKVKYFIAKLYVKIFINLLKIICGLNFQVRYDAKLPLGPAVVLSNHQSFWENAVVLLLFPMQSWVVKRELFNIPVFGWGLRLMDPVHVNRNDFWSVRKILTIGQQKIKDGLWMIMFPESARVPIDADKKFKPSGVKLASLSKVPIVLMTHNAGVFWPARTLLIKPGIIKIILGPVIEYKDYKMLAIRELNNLVESLIVERKKLLLKNVITNSQ >LS398550|555292:712587|647296_647908_-|SPR05306.1|DBSCAN-SWA MHKDSNIIDELIFSFAQLPGLGNRSARRIVLYLMQDKEVRIKNLNNQLTSVLNNIMECDYCGNLDIVSICNICKHSERDSSTIAVVESVADLWALERSKVFKGWYHVLGKTLSAVSGNDAVNSLKLPKLLNRIREYKVQEIILATNSTIDGQMTAFFVIDYLKDENLKISKLASGIPLGGELDYLDEGTLLAAFKARQSHDLL >LS398550|555292:712587|680115_681207_-|SPR05442.1|DBSCAN-SWA MLYNLLVSHINSCYIFSIFYNVIVRSGIAILLSFSISFSLIPILIKYFKYWKNLAQPIRNLGHKSHIAKAGTPTMGGIAIIFSIIISTLMLADYKNIYVLTTIFGMLSLAILGLIDDYQKVTKKNTKGINATCKLISQIMVSIICCMIVNYNLNSEIANHLIIPFFKKLTIDLSIFYIPFALFIIIGSSNAVNLTDGLDGLVTVPIIIVSFCLGLMCYLADNAQYININHLQILHVQQTSELTVLCSAIIGASLGFLWYNIQPAKIFMGDVGSLSLGGAIGIISVISKNEIRLGIIGGLFVIEALSAIIQIYSIRYLGGKRVFKMAPIHHHFEQIGWSESKIVSRFWLLSIIFSLIGLSSLIL >LS398550|555292:712587|593179_593455_+|SPR05062.1|integrase|DBSCAN-SWA MGRFLHVLCGEATPLIRDFALLALYTRARKSNVLEMEWDNIDFERKIWHIPKTKNGRAQNIPLTNEIIEILQARKLTSKSKWVLPSDSSKS |
160 | Wolbachia_phage(11.54%) | tRNA,integrase,transposase | attL 556706:556730|attR 712960:712976 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
770805 : 852584
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS398550|770805:852584|DBSCAN-SWA 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>LS398550|770805:852584|799948_800251_+|SPR06113.1|DBSCAN-SWA MNYLNQFRKISNIYAVEYELEADNLLKLEISDSGPTRINLKDEKINDIFMYPQNAAEVILHKSGYLFIAPREEGNKLYLTVIGEHKTIPICSIMTLIQKN >LS398550|770805:852584|819346_821062_-|SPR06210.1|DBSCAN-SWA MRPVVFDFLTNSCNFVKNNSNNNDTIFYNFIGSIIPPEWRKLTGDNGKALSKTSKQLLSFIVYRLHIYYNKDIDELQESYQLYEDKLNVGQRRVRQCLVELRDAGFIEVENRTIIKNNFKLRNVPCIKLLKNFQRFTEKETKGEKIIDLTQKIFRSNLKEISGEPEKSFRYIYRYNNNKKNNNRSRSTEDKLVENDQNKNEDQQQNLKFKYTEYDDFIEIELVENEKENQQQQQNLNFYELSDFSNKKPSNKDYEQNSELATPAITKDSEVEKNECYPKRKRLADYYPLTPEDAVILQRMSSRSFNIYFINQLLLKLSNKYPNRHFVNKIAVLNYMAKALANELLTTEQANSGNFRFNDVGRFKEQYLANIESGTDCSMKAQLKRKIAGVFEADMAYQILTSYDFGAAVKNKYYIKLIKNITLSDHIKFKILQEVRAVYGNDIEQLQVIPFDESKQVANSITEYQKTTVLQQQISDEDYLSELSKELGSNSTWYKVRESLIKSYGQAIDKSWFSPLKVANEDNVNKKIFIKAKTEFEDSYIRENYLKDLEPAFKAQGFSFELVKFSNFNKI >LS398550|770805:852584|834788_835334_-|SPR06265.1|DBSCAN-SWA 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88 | Tupanvirus(18.18%) | tRNA,transposase,integrase | attL 790363:790384|attR 820575:820596 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
861325 : 907646
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS398550|861325:907646|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS398550|861325:907646|884952_885306_-|SPR06526.1|DBSCAN-SWA MKLLSFKQNCYLKPLLMLCFLVLLLSTSSIVSANGSADDDIIGKKLCNIVGILSGRTTKALCLVAIVVLGITTFMGRVNMSTAIITVCAIVIVTQSSTVLKFISGNDASDCKAEQAS >LS398550|861325:907646|886386_887886_-|SPR06543.1|DBSCAN-SWA MAISKIKLFFSRLAIHLWPVHRHELQKFIPTSLLMFFILFNQNILRILKDSIVIPEISAEITSFIKAYCVTPTAALLVILYAYMVNNLNYEKIYRYLTLAFLSFFLCFAFWFYPKASIFHLNIKKVNELMLIYPHFKWYIALAANWSYIIFYVLSELWPNIFYALLFWQLVNEVTTTEEAKRFYMLFSLFGNSSLIVVGLIVMHLASSNSILQGYFLGVSNNILLVQSSIAIMAASSICSIFLVRFIYYNAIQKTQLQHKMPHEREVRPKMNLRESFKYIISSRYLWLILICTASFGFSMNLVEGIWKAQVKNLYSTTNTYAEFNGSCVVWTGVVIIFLTIIGNSVLRYHSWFVVAIITPIIIITTGTIFFIFVVFDKDILLWVNMLSSAQPIAIAVMAGAIQNIIAKGAKYSIWDTSKEMLYIPLDKELKTKGKAAVDIISAKVGKSSSGLIQSFLFVLFPTASYISLSPALMIIFIVVCIVWIFAVKQIYSEYKKIA >LS398550|861325:907646|871445_871910_+|SPR06437.1|DBSCAN-SWA MSIRVLRFMIGLIALVKFSDVYAVEYGLEADNLLKLEISDSGPTRINLKDEKINDIFMYPQNAAEVVVHESGFLFIAPREEGNKLYLTVIGEYKTIQDLMLTFTPKTPNPVMLVNAATKIEEKDNSKQNNANLFSNDVNTKELTAKLSNFTCDN 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MRNLMLQLRLKVIMQNQKLCWALSRPLKYMGLSIDEWGVVLAGVAPGIVLLNSRHAKLGLAFMVGGIALCYCFKKFKKVSENFLLKSFLVAKGLLPSPLGYSRLLGKKVGK >LS398550|861325:907646|883270_884239_-|SPR06517.1|tRNA|DBSCAN-SWA MTIKIGNIELSAPVILAPMSGVTDLPFRKLVKQFGAGLVVSEMVASRAMIQETRRSMMKSAIIENDITGSCVQLAGCEPDVIADAAKMNQDMGAQIIDINFGCPAKKVVGGYAGSALMRDESLAAKILAETVKSVSIPVTLKMRTGWDESCRNAHIIAKIAEDCGIQMITVHGRTRCQFYSGKSDWVFIRKVKESIKIPVVANGDITSVDDAIDCLQISGADGVMVGRGAYGKPWLLSQISHYLAFQDYLPSPSSIEQKQIILNHYESMLSYYGTEAGMKMARKHLGWYSKGLPNATEFRSKVTTITSVEQVKEIINQFFQM >LS398550|861325:907646|874005_874134_-|SPR06454.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRNECIERIKIILKNKIVFIDEFGIEDNAYLNYGSSSICSR >LS398550|861325:907646|869207_869372_+|SPR06405.1|integrase|DBSCAN-SWA MESITLTLKLTDKLIRKIKIPTERTSTIKDKIEPVLKLRISPTGRKTWSFEKKI >LS398550|861325:907646|866765_866912_+|SPR06396.1|transposase|DBSCAN-SWA MGLRLFTNLRKDMKTYLLDIQDNRLLNKRSLIESVFNVLKKTYAFRAY >LS398550|861325:907646|879174_879666_-|SPR06486.1|DBSCAN-SWA MSDTLIQDVHLSDLSASLTTEPKVVSQPVLPKKDKLGYSYGTGRRKCAVARVWIKQGTGITTVNKKPIASYFKRLAHTQIALSALTITDVAQQFDVKCTVKGGGLSGQAGAIQLGISRALNNFNPELHSVLKKHKLLTRDSRIVERKKYGRHKARKKTQFSKR >LS398550|861325:907646|904213_905185_+|SPR06642.1|DBSCAN-SWA MITLTDTLQSTASFLEWTAGTVLSEIKDYVEGVKDDTSKFYCSFSKETKEGCEKIKNVIYGDEFHGFEAVKEVLKEVLKMLLEQIKCVQKFLLARKGEAALLSIAIPVVGKIIAPVILGSTLMIYALDKVIKKPGPEKSDVANTKQDIEECFPNPDKMRKYPKLSDLAQKYTEMDVTAPNVASLSSDILPSLVENCAKFTKESLMKLNGLEEEIICLNNLSLNSTEDFTVAKNTLENILAKLTTEVSMLSEHISCLGNTRNLVESSMKDEIEAKHIPQKLTSALALDNGQAAAESTSNNRSNKAAANINSSSKNSKSRFHDFQ >LS398550|861325:907646|891315_891870_-|SPR06567.1|DBSCAN-SWA MNSATKPEFSFSSDTLVIAKKIINNYPAGKEASAVLAILDLAQNQNNNWLSNSCIEYVAKLLKMPYIKVYEIASFYTMFNLQPVGKYHIQICCTTPCWLRGSDDIMNFCKKLLKIETGKTSQDKLFTVSETECLGACRNAPVVQINHDYYENLTNDKIEEIINNLHAKDLQKKSELKPDNKTDL >LS398550|861325:907646|898354_898507_+|SPR06613.1|transposase|DBSCAN-SWA MAYFLYQTRVMNSIILEIDVSNDTFDTAMLINNKVQTKKFNNNALNGFTN >LS398550|861325:907646|885784_886141_-|SPR06538.1|DBSCAN-SWA 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>LS398550|861325:907646|869988_870435_+|SPR06414.1|integrase|DBSCAN-SWA MEWDNIDFERKIWHIPKTKNGKAQNIPLTDEAMEILQARKFTSESKWVLPSASSESGHLSHPNTAWKIICKKASIKNFRIHDLRRTFGSCMSDAGASQRTISTALNHMNSNSTMHYTIACMELVRQYMSKATRIIRECAENYNIYNTI >LS398550|861325:907646|898786_898942_-|SPR06619.1|DBSCAN-SWA MDLTVISITIMLVSYFLYESGKTKESIAFSENRELREEISGVEQVVDLRAK >LS398550|861325:907646|871296_871449_+|SPR06432.1|DBSCAN-SWA MNGVLISGTLRYWFSDSKHIAIYKTYFLTYKRTPNYLLLLTGVKENGIKK >LS398550|861325:907646|894785_895004_+|SPR06597.1|DBSCAN-SWA MNTGMKTKLMKLVEVINQKPWLKYSLFFVLMSVATYVNYKLVSKDRPELFDSKLAKQKHEESLRNQKSSKST >LS398550|861325:907646|893669_894185_-|SPR06583.1|DBSCAN-SWA MSENTFSDTTSIYNQNLSNQGFILANLENLVSWARTRSLWPMTFGLACCAIEMMQTAGSRYDMDRYGMLFRPSPRQADVMIVAGTLTNKMAPALRRVYDQMTEPKWVISMGSCANGGGYYHYSYSVVRGCDKIVPVDIYVPGCPPTPEALLYGILQLQKKINRTQQVKFKR >LS398550|861325:907646|877130_877550_-|SPR06466.1|transposase|DBSCAN-SWA 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>LS398550|861325:907646|870895_871288_+|SPR06426.1|DBSCAN-SWA MNHLFKQNAIQELVKYNKCLLSVTILLAAANIIAIMAAINKEEKWLLIPAMEPDRKMMVSSKNYHETYLKEWAIYVTKLLFTTSPNEVERQIADMKVASSNTESLNKFFHDHLQFVKGSNVSSVFFFEEG >LS398550|861325:907646|882903_883242_+|SPR06511.1|DBSCAN-SWA MSHHLQHYWYLDSITNSIFINLKVKAGAKINKIIGLYHINNKSFLYISINTIPENNKANQAIIKFLSQWLEIGRSNIKIVYGLHSNLKVISVINTNANISNLIRSKLKSIHL >LS398550|861325:907646|878093_878840_-|SPR06482.1|DBSCAN-SWA MNDNDIDLVKKFCLYTLSNDSAKMQLLLFSEFEKQLLSIIANSKTAFSGLIKLSWFYEQIQISKHKKSYLGNKLMNNINEIYDHNQKIILLDFVRLFDSIVERKKFDSLEELNNQILLPLASIYTKFFLTLEPKIDAYLSIRQVFYIYAALVFIRLQKYFIFHQWYCFGQNFNSDLYDTYFNNLITKLYSIHKLHNYSFKLPKLLKFLLKANKIYLIHYLLHIRKYGYNCPDINQGIVRIKLALAVIF >LS398550|861325:907646|885362_885722_-|SPR06531.1|DBSCAN-SWA MKLLNFKQNCYLKPLLILCFLMLILSTSIVSTQAADNTDPIGEKLCNIIGILRGKTIKALCLIAIVVLGITTFMGKVNMSTAVITICAIIITTQSDKVYEFVAGKDANGGNTQCEASKP >LS398550|861325:907646|879669_880152_-|SPR06491.1|DBSCAN-SWA MKTYSAKPAEISKKWILIDATNLVLGRLAAKVAVVLRGKDKPTYTPHMDCGNNVIIINAEQVKLTGDKSNAKNGKFYYRHSGFPGGIKVTTAGKILQSNYPERIIQLAVKRMLPSNKLGRKQFSNLYVYKGQTHPHAAQTPVLYDFAGKNSKNIRNQNIV >LS398550|861325:907646|881999_882740_-|SPR06506.1|DBSCAN-SWA MCNNSTIDQDEIEKFNTIANEWWNPNGKFKQLHLMNPARIRFIKQKILSHYNLIDSITKPFHGLKIADIGCGGGITSIPMAKLGATVTGIDASSKNIAVAKMHANKIEVQVNYIHSSIEEYVKISNEKYDVVLCLEVIEHVSNIQSFILYLSKILKLGGMLIISTINKTLKSYVFAISLAEYLLRYLPIGTHDFNKFLKPSTINNILLSHNMTLKEIQGLSYNPILQQWRLTNDISVNYIMYITAI >LS398550|861325:907646|872716_872911_-|SPR06445.1|integrase|DBSCAN-SWA MAKGIDPREVKRQQQIEENEKRLKARQDITFKQLCDKCEEYSKIYNTSSKGSTARIHNYGKPLF |
53 | Mannheimia_phage(33.33%) | tRNA,capsid,transposase,integrase | attL 865667:865700|attR 874248:874281 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
915480 : 946884
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS398550|915480:946884|DBSCAN-SWA TTTAGGATAAGAAGTCAGAAGAAGAAGAAGAGACAAGATAGGGATTAAGTTTAGAGATAGAATAACTAGCAAGAGAATCAATTATATGAACAAAGAAATTAAGAGGAGAACGGTGTCTAGTATGCTCTAAAAGCATATGTTTTTTTAGTACATTAGACCTCTTTCGAAACTGGTTAAGGTAGTTCAAAATTATTGCTGATAAATATCGAAATAGACGTGAAAGATTCGGTCTTAGATTTAATTTGATCTCTGACATTTATAATTTTGAACTACCTTAACCAGTTTCGAAAGAAGTCTATTAAAGACAGACTCAATTAAAGAACGTTTATTTAATAACTTCTTATCTTGTATGTCCAATAAATATGTTTTCATATCTTTACGAAGATTAGTAAATAAACGTAGACCATTGGTAAGCAGTTGATGAAATAACTCTTTAGATATGTAAGCTTTATCACCAAACAATTTACCAGCCTTCAAAAATAACTAAAGCTATAGATAGATCGCTTTTATTGCCTTTAGTAATTTTAACTGACATTATTTCGCCTTTATTATTGATTATAAGATGTGCTATAGGTAAAATTGGCCTTCTAAGGCAGATAGTATAAGTATGAAGATTTATATAGGTTTGGCATAATGATTTTTGTCAACCTTTTGTCAACCTTTTGCATAAAAATTTGATGGTAATTTGTAAAAAAATTATTTTCTAAAACACCTACTATAGCTGTATTTTTGGAGATGAAAAATGCGACCTGTAGTATTCGATTTTTTAACTAATAGTTGTAATATTTTTAAAAAAATAGTAACAATAATGACACAATATTTTATAACTTTATTGGAAATATCATTCCACCAGAATGGAGAAAGCTAAGTGGAGATAATGGAAAAGCATTAAGTAAAACATCTAAACAGCTTTTATCCTTTATAGTATATAGACTACATATCTATTATAACAAAGATATAGATGAATTACAGGAAAGTTATTACTTTTTTGAAAATGAGTTAAACCTTCGTTACCGCAGAGTTAGACAATGCTTGGTTGAATTAAGAAATGCAGGTTTTATTAAAGTTGAAAATAGAACAATAATTAAATGCAATCTCAAGTTACGTAATGTTCTTTGTGTAAAACTTCTAAAAAATTTTCAGCGTTTCACTGAAAAAGAAAAAAAAGAAGAAAAAATTGTCCTTCTACAACAAAAAAATTTTCACATCAATTTGCAAGAATTTGCAGGTGAACCTGCAAAAAATTGCAGCTACATATATAGATATAATAATAATAAAAAAAATAATAATAGATCTGGATCTACTGAAGATAAGTTAATAGAGAATGATCAAAATAAAAATGAAGATCAACAGCAAAATTTGAAGTTTAAATATACGGAATCTGATGATTTTATAGAAATTGAGTTAGTAGGAAATGAAAAAGAAGATCAACATCAACAACAGAATTTGAATTTCTATGAGCTTAGTGATTTTAGCAATAAAAAGTCATCAAACAAGGATTATGAGCAAAATAGTGAGTTATCAACTCCAGCTATTACTAAGAATTTAGAGGTTGAAAAGAATGAATGCTGCTCCAAAAGAAAAAGACTAGCAGATTATTATCCACTAACGCCAGAAGATGCAGTTATACTGCAACGTATGTCTAGTAGAAGCTTCAACATATACTTCATAAATCAATTACTGTTGAAGTTATCAAATAAATATTTACTCCGTCATTTTGAAAATAAGACAGCAGTGCTAAACTATATGGCAAAAGCATTAGCAAATGAATTACTAACTACTGACCAGGCTAATAGCGGAAATTTTAGATTTAATGATGTAGGAAGATTTAAAGAACAGTATCTAGCAAATGTTGAATCTGGTACAGATCGTAGTATGAAGGCTCAGTTGAAGCGTAAAATAGCTGGAGTTTTTAAAGCGGATATTGCTTATCAAATTTTAACATCTTGTGATTTTGTGGCAGCAGTTAAAAACAAATATTACATCAAGTTGCTTAAAAATATCACACTAACAGAATGTGATGGATCAAAGATATTACAAGCTGTACAAGATGTATATGGATACGAAATTCAAGAATTGCAAGTTACACCATTTGAGCAACCTACAACTGTTTCACAGAAACAAATCAATGAAGAAGAGTATCTCTTGAATCTCAGTAAACAACTGAGCTCTAACTCAACTTGGTACAAAGTACGAGAATCTTTAGTTACATGTTATGGTTAAGCTATGGATAAATCATGGTTTAGTCCATTGAAAGTTGTAAATGAAGATAGTGTTAATAAAAAAATATTCATCAAAGCAAAAACAGAATTTGAAGATGATTACATTAGAAACAACTGTATGCAAGGTCTTGAATATGCTTTTAAAGCTCAAGGATTTTCTTTCGAGCTAGTTAAGTTTAGTAATTTTAATAAAATTTAAAGGGTGATATGGAAAAAGATTTAACTATTGCAAAGATTGCTCCAAGTAATATTCAGGCGGAGCAAATGATACTTGGGGCAATTCTGATTAACAATCGTGCGCTATATAACATTAACGAATTTTTACTGCCGGAACATTTTTATGAACCATTACATGGCAAAATATACAAGTCAATTAATCTCATTATTAGTAAAGGAATTAGCGCTACTGTAATTTCGCTCAAAAATATGCTAGGCAATGAACCCTCATTTGATGAAATAGGTGGAGTGGATTATCTAGCTAAACTTACAACTTTAGCATTAAGTATAGTTAATGTTAATGAGTACGGCAAAATAGTATATGATCTTGCGCTGCGGCGTTATTTAATTGAAATTGGAGAAAAAATAGTAACAAATGCATATTCTTCTACTTTAGCAGATTTAGCTATAAGTCAGATCGAAACTGCTGAATCTCAATTATATGATCTAGGTTCAAGGGGAACTTTAAGTAAAGGATTTATAAAATTACAAACTTCAATTGAAGAATCATGGACATCAATTTCATCTGCTATTAAAAATAAAAACTCTATTAATGGTATCAGTAGTGGACTACTTGACCTTGATTCAAAGCTTGGAGGGTTTAAAAATTCTGACCTAATAATATTAGCTGGCAGGCCATCAATGGGTAAAACTGCTTTAGGAGTTAACTTAGCAATAAATGCTTGTAAATATTTTCTTACTCAAAAAAATACTAAAGATAATGTAGTACCATCAGTTGGCTTCTTTTCTTTAGAAATGTCATCTCAGCAAATCTCAACTCGAATTCTTTCTATAGAATCTGAAATTAATAGCTCTGCATTATTTAACGGTAAAATAGGTGAACAAGATGTTGATAAGTTAAAGACTGTACAAGACGAAATACAAAAGTGGAATTTTTTTATAGATGATGCTCCAGCAATCTCGATATCTGCAATTAGATCTCGAGCTCGTAGACTTAAACGTACTCATAATTTAGCAATATTATTTGTTGATTATTTACAGCTAATAAAAATTGATAACAGAAGAAGTCAGTATAATAGAGTGCAGGAGATTTCTGAAATTACTCAGAGCTTAAAAGCTCTTGCTAAAGAGCTCAATATTTCAATAATTGCGTTATCTCAATTGTCTAGAGCTGTAGAACAAAGGTCAGATAAAAAGCCTATTCTCTCAGATCTAAGAGAATCAGGCTCAATTGAACAGGACGCCGATATTGTAATGCTTATATATCGTGACGAATATTACTTGTCTAGATCAGAACCGAATCCAGGTACTCCAGAATATACAGAATGGGTTACAAAACAAAATAAATGTTATAACACTGCTGAAATAATTGTTGCTAAACACCGTAATGGGCCAGTTGGTACAGTGAAGTTGCACTATAATAGTAGGTATTCTAAATTTGGCAATATTATAATGTAACTATAGTTATGCCTTCCGCTATATATAGAACTCATATTTTTCTAGCATACATTCGCATCAAAAGCTTGCTAAGTTTTTGTAAAAAGGGTTACAAACTATGTGTCTCAAAATCAGAAGAACCTATGTTGCCTAATGCTTGCATGTCATAATGGAATGAAGATTCATGTGTTAATAGATCTTGTGGAATATATTCGTATGCATCATAAAATACATCATCTGATACCTGTGATTCAGAATGAGGTAAAATTTCGCTTGTTGATTGCTCTGGTATATTCTCTTGTGCATCATAGAACACCTCCTCTAACGTCTCTGATTGATAAACAAATTCATCAGTGCATATCAATTCACATATATATTCTTCTTTGGCAATATTTGTTTTTAACTTATTCCAAACCCAATATGGAATTCTATGTACTATGTATCCATAACTTTTCAATAATTCAGTATTAAGCCTAGTTGAAAAATTGGGAGCATTATTGTCATCAAAATGTGATGGGCCATCTACTTGAATTACTGTATTTTTCTCTTTAATAAAGATATCAACACTAGAAGTAATCTGCTTAATATGATACTCGCTTTTAACAGTGTGTTGTGCTAATACTTTTTTGACTACCTTCAGAACATTTAGTTGTAAATTTGAAGTATGACAAGGTGTTAATTTGGTTTTAAACTTTTTTTCAAGAAGTTGACGATTTTGTGAAGTTAATATTCCTACACCTTGTTTACCAAAATAATAATGCGCTTTTAAAATTTGACCAATATCTTCAATATTTTCATCAAACAGTTCAATATTTTGATTAACAGCAGAAATAAATTGCTGTGGTACTTTAATTTTAGAGTTACATAAAACATTTAATGTGAATATTCCATAAATAGAATTAGCTAACTCTTGAAGACTAAAGTTATCAATAGTTTTAGTAGCATGATGTATCCAAGCTTGAATGAATTGATCTGATGGATGAATTTCTAACTGTCCAAATGCCCATATGGAATTAGCTAAATTTTGAGTATTAAAGTTATCAATAGTTTTAGTAGCATGATGTATCCAAGCATTAATGAATTGATATGATGGATGAATTTCTAACTGTCCTAATGCCAATATTGAATTAGCTAACCCTTGAGTATTAAAGTTATCAATAGTTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS398550|915480:946884|945770_945932_+|SPR06899.1|DBSCAN-SWA MRFEHRKKQQWCIIQDLMLANFSTTITQAEIEFTASKTIPAHDNISKFSSFGL >LS398550|915480:946884|927809_929525_-|SPR06797.1|DBSCAN-SWA MQNANVTIETKDNFKKIYWHSIDWKEIIQKVNNLRRRIYRASANGNMKLVGNLQRLMLRSRANRLLAIRRVTQINKGRKSPGIDKIVVNTDKERSLLMEKLADNNLSSVKPIKRVYIPKSNGKSRPLGLPTILDRCRQAVVKSALEPYWEAKFEGCSYGFRPGRSAHDAIQRISSIVRPGTTRNWILDADIKGAFDNIDHNFLLKIIGNFPARNWIQAWLKSGVMQDYQIIKTTTGTPQGGLISPLLLNITLHGMGDILNIIYNEYDHLHSKSEYALVRYADDFVICAKSESSCIRAKSIINDWLSIRGLELSKEKTRILHINEGFDFLGFNIRQYNTNSTRRGVALLVKPSKDSIKSFKKRISIEWKKGFSWNIDRIIDNLNSKIFGWCSYFNKVVSKKIFSNLDCWMWIRQARFVCRKHPKKSWKWLKKKYWGRIKGRNDNWVFMNKDLYLWKLQWTTIKRHILVKGKSSPDNSKLREYWHKRQADSSKYLFKSRQILWRRQKGKCLVCFDLIDNGENVHVHHITPIRCGGTDHINNLCLLHENCHRQVHSNRGQLIAAVCKLLEPYAE >LS398550|915480:946884|917705_917900_+|SPR06726.1|DBSCAN-SWA MDKSWFSPLKVVNEDSVNKKIFIKAKTEFEDDYIRNNCMQGLEYAFKAQGFSFELVKFSNFNKI >LS398550|915480:946884|916221_916347_+|SPR06715.1|DBSCAN-SWA 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>LS398550|915480:946884|926917_927061_-|SPR06786.1|DBSCAN-SWA MVIIKKIKNFDEISDSIKNKAVKKKICNSTFDLAIITANQKFKGEFL >LS398550|915480:946884|938644_938899_-|SPR06828.1|DBSCAN-SWA MSVACIQRLQQNITILPEQSYAGKAKQQLTNLKNKFDHNTEFSNHEIAFLSSIGDIFPIYDYITLESISGISKSISEQFVLFCN >LS398550|915480:946884|919424_921089_-|SPR06737.1|DBSCAN-SWA MHRGSSTQFNIQAMGSIQLCKMLKDRDVLSKPIITEIYNRALFLLQTEDARYNRVQFDARGLATILYQFAKLNYVIGSEFIDAWTNKAINLMDDFNPQELANSIWAFGRLEIHPSDQFIQAWIHHATKTIDNFNTQNLANSIWAFGRLEIHPSDQFIQAWIHHATKTIDNFNTQGLANSIWAFGRLEIHPSDQFIQAWIHHATKTIDNFNTQGLANSILALGQLEIHPSYQFINAWIHHATKTIDNFNTQNLANSIWAFGQLEIHPSDQFIQAWIHHATKTIDNFSLQELANSIYGIFTLNVLCNSKIKVPQQFISAVNQNIELFDENIEDIGQILKAHYYFGKQGVGILTSQNRQLLEKKFKTKLTPCHTSNLQLNVLKVVKKVLAQHTVKSEYHIKQITSSVDIFIKEKNTVIQVDGPSHFDDNNAPNFSTRLNTELLKSYGYIVHRIPYWVWNKLKTNIAKEEYICELICTDEFVYQSETLEEVFYDAQENIPEQSTSEILPHSESQVSDDVFYDAYEYIPQDLLTHESSFHYDMQALGNIGSSDFETHSL >LS398550|915480:946884|917908_919336_+|SPR06732.1|DBSCAN-SWA MEKDLTIAKIAPSNIQAEQMILGAILINNRALYNINEFLLPEHFYEPLHGKIYKSINLIISKGISATVISLKNMLGNEPSFDEIGGVDYLAKLTTLALSIVNVNEYGKIVYDLALRRYLIEIGEKIVTNAYSSTLADLAISQIETAESQLYDLGSRGTLSKGFIKLQTSIEESWTSISSAIKNKNSINGISSGLLDLDSKLGGFKNSDLIILAGRPSMGKTALGVNLAINACKYFLTQKNTKDNVVPSVGFFSLEMSSQQISTRILSIESEINSSALFNGKIGEQDVDKLKTVQDEIQKWNFFIDDAPAISISAIRSRARRLKRTHNLAILFVDYLQLIKIDNRRSQYNRVQEISEITQSLKALAKELNISIIALSQLSRAVEQRSDKKPILSDLRESGSIEQDADIVMLIYRDEYYLSRSEPNPGTPEYTEWVTKQNKCYNTAEIIVAKHRNGPVGTVKLHYNSRYSKFGNIIM >LS398550|915480:946884|930204_932220_+|SPR06802.1|DBSCAN-SWA MKIGVEMAIQFARIEFLRRSEGGDSCRKAAYNARTIVKNKQTGIRYNFSRKKDNVYHTVLIPDYVNQEFKNIQTLMNEVERTAKKGNSQLLKDIVIALPDDKELNLEHRIEITHQIVDAMQWVQNGLGVQIDIHKPRIGDKNWHAHILVTTRRFKENGKELGDKAVDLEAKFITVKGQWRIIKDPEMIHERVKEIINAYFAKLGLPYRVDEKSKVPGKHIGNIKYIEIRNLINEVVNENELRKEAHLKIINDADVITDSITHYKSIFTKQDVEKAVKDIPDPTAREQLVQQVLSSNRILELYHDDGESSKYFTTIEVRNEETRIVRIANKINNQVYYNDIYNLKSDIEGLANVSEEQKQALRHILLSTSGVRVLRGRAGTGKSYVLIKVHELATNRRQKVIGLASTHKAVSELKSKGYTEVYTVKGFLYNRKKIFMQNRLIVVDEAGMVGTKAYAELVRVVSKNNCQLILAGDEKQLASIERGGMFEMLSNNFGSHVLIDIRRQSENWSREAAMKFAESNILSGITLLRQNKCVKFDNTLQDSISKLIYDWSLSKFKLHEKLVITVRNKDVDILNSSIRSLLKANGTLQGTEYRRSIAGRKESYMAGDRIVFQKSDKDLQIQNSEFATLTSVNKNEFVAKTDAGKEVSFDSVKYNLNMAMQVLFIRLRELL >LS398550|915480:946884|926359_926821_-|SPR06781.1|DBSCAN-SWA MLTDKYFNKGNSFFKLRKYQEAIKKFNLAIKCNPDSAEAYNSKGIALDELGQHQEAIENYDIAIKCNPDLVEAYINKGIALYELGQYQEAIDNYDIAIKHKLDLAEAYMNKGDTLKQLGQGEKAIKNFELAIKYNPGLIAPYISNVLKKLEMQ >LS398550|915480:946884|941626_942013_-|SPR06870.1|integrase|DBSCAN-SWA 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MVELRNAGFIKVENRTIIKCNLKLRNVLCVKLLKNFQRFTEKEKKEEKIVLLQQKNFHINLQEFAGEPAKNCSYIYRYNNNKKNNNRSGSTEDKLIENDQNKNEDQQQNLKFKYTESDDFIEIELVGNEKEDQHQQQNLNFYELSDFSNKKSSNKDYEQNSELSTPAITKNLEVEKNECCSKRKRLADYYPLTPEDAVILQRMSSRSFNIYFINQLLLKLSNKYLLRHFENKTAVLNYMAKALANELLTTDQANSGNFRFNDVGRFKEQYLANVESGTDRSMKAQLKRKIAGVFKADIAYQILTSCDFVAAVKNKYYIKLLKNITLTECDGSKILQAVQDVYGYEIQELQVTPFEQPTTVSQKQINEEEYLLNLSKQLSSNSTWYKVRESLVTCYG >LS398550|915480:946884|933297_935967_+|SPR06812.1|DBSCAN-SWA MTDKINDSNNFNNIHNSKTDIENSKANSWNHNVAVKLINGDIADGIVLLSDNNSLRADNTLKESINQLINDWKNSKFELQDRLIIAGHKEAENINQNIRNYMKENGALKGPEYSILISGAESKKYANYMAGDRIVFQTNDKDLQIQNSEFATLVSIDESKFVAKTDTGNEVSFDLNKISFKHGYATTVCNPQTAVKKDVYVLHNNGVGIESSNISMIGNAEQVRLYYNVQATKNVANLIEQLSTAKTDSINSKEENNDVQANEVRQYQSAQNYRKNDYYSNSEEDLQKLRDAIAYRADTIACDLLGDPNKRLSKYGKLRWGDTGKIQVTTEGKYAGQWYDFSTGQKGDLLSLARRERGYGFFEAIEYLKSIVGMSNISQRYQRLPKTDDSQQYTQESESVKIAKVQNFYERSNRIHGYEIDTSPSAEVEIVKKYLENRGITFDKSTASSDLKASILFDTQTRKNYPALTAFARNSKGEITGVQAVYLNLAGDKANISINRRSFGKISGSFITIAKRNANDPNITIIAEGAETALSLQQSGIKGNIIASAGISNLRNYSPFPGEKIIIAADNDSKNSITNNTVIKAAKTLEMKGAITCIVKPPENGDFNNLLQSCGDQSIRDIIEPEITKLTKAVETTKLTQTENNSIEKQNDITNVKELYNKSSSLYYFKQEEEAKVETIVVNKFLENHTGIYSSKIFNNPNLRANMVFDEETQKSWPALTIFVKNDKDEITGAKILALNSKTCNKADVAEKSVGTISGSFAEIAQQNSKYSPVTIITKDIETALTIQQAGVEGKILCAIEAENLQNYNPGPKEKIILAVKNDVNTEKAEKVLEDKEAVVCTVKNDFNNVLKTQGLYAVRNIISPEIRKLNEKIESIQTNIQPGLCPKH >LS398550|915480:946884|927144_927600_-|SPR06794.1|DBSCAN-SWA MANLMQQKITLQQKKARLIMDEVNLKIKERKMRTRRLTEMGGLVAKAKLDHLSTNTLFGAIVSLKETLTQHPNVQDHWTTIGKDIFDKEQQNKAAVILKFTSEPDENTKRHIRLHGLKWNSFRQEWCGHVKDIESLKNGLLNVQYKLELVS >LS398550|915480:946884|942618_942861_-|SPR06882.1|integrase|DBSCAN-SWA MPVILLNFTQSALNKIQVPTKEEKIIQFRDTKERNLLFIISYTGFRRFYLGINIGGIYYKIKIGTLPDLTVTEARKKVMN >LS398550|915480:946884|946161_946884_-|SPR06902.1|transposase|DBSCAN-SWA MVLRNQKVGVIKNKLNLEEQLLMALEYLRGYRTYFHIGQNYGISESSAYKAVKCVEDTIVKHPNFALPGHKALMKSDMNYEVVLIDATETPIERHKKKQKFYYSGKKKRHTLKTQIVLDKKTHQVICTDFPNGKKHDFRLFKKFEILIHPKVKVTTDTGYQGIQKIHNNFELQKKKSKKNPLTKNDKKNNRRLAGERVVNENVIGMLKRFKIIADKYRNRRKRFGLRFNLISGIYNFDLP >LS398550|915480:946884|939093_939723_-|SPR06835.1|DBSCAN-SWA MSIRIRVYAITMLLLLQAPVSLAWNIENVFQGMSVNVTRSGSYQDQAAGYYAAGGLSARTSQTSFQPFAITPPSLNMSCSGIDAYLGSFSVISGEELVQLMKNIGSQAKVYAFSLGLKTFAPQIENALKDLRNLAMEMNQFAKGDCELTKALFATALPKNWAMREAVCRDIQSQSGFDYFAAGKKCRNYLDQKQALQQAQNKDSELMLE >LS398550|915480:946884|937071_938664_-|SPR06823.1|DBSCAN-SWA MYYFVIERYVQLKLAIGEHFYDIDQIGIKFYSLRFKKWMHLNAQDFLHEFYTGQHGFKIQQLWEFLINSALLEGLIVFVIGVIISIVFFTAQGKKTIIKAKIRGADFVGYKCLAKMLKSAKKASKIRFGGLPLVKNSERLHILITGTTGTGKTNMLNELLPQIRLHKDRAIIVDTTGAFTDRFFDPKCDRLLNPFEKNSEQWLPWNDCFEAADFHDIASSFSNYTPKLDDFFAKNAELVLSEALKLYQDDKDIIKLIHTIIYSDNRQFAKAFRNTAVSGIISESALETSAGIQSTLGKNITSLQYLKPGGSFSIKEWFSNSNETGWLFITANPSQRATLCPLISAWISIAIKALMYRNPNHDNKNMWFILDELPALQKVSFLPVALAESRKYGGCFVAGLQNIHQLEAIYGAAECASMLDLFNSKFIFRVSDQVTAYKSALTLGEQEIIETQENLSYGSNTMRDGVNMNNVERKKILVMPSEIMNLPDLTCYVKLAGNFPITKLTMQLQNLNTAFVWGYKLLKKLKLVEY >LS398550|915480:946884|941268_941574_-|SPR06865.1|DBSCAN-SWA MRNLMLQLRLKVIMQNQKLCWALSRPLKYMGLSIDEWGVVLAGVAPGIVLVNSRHAKLGLAFMVGGIALCYCFKKFKKVSENFLLKSFLVAKGLLPAPLGY >LS398550|915480:946884|915480_915735_-|SPR06706.1|transposase|DBSCAN-SWA MSEIKLNLRPNLSRLFRYLSAIILNYLNQFRKRSNVLKKHMLLEHTRHRSPLNFFVHIIDSLASYSISKLNPYLVSSSSSDFLS >LS398550|915480:946884|932276_933032_+|SPR06806.1|DBSCAN-SWA MTRHIEKLQLYCNKKATVSINSLINQLSRPNEKSASITLKTAHDLEKERTKTTVFSKIENWFKSIINDINDRSHVNKEYYYFTAKPEEEAKVEKVQLKDISTPLFMQIKEQRQYDYDVTILSAEGKTISSFQEAGIDSRMVYSSNVNNLKYYQPFQGEKILIAANNDKQNKEYVSTINEAAKVLTSKGAITSIVVPSEGEDFNEMLKNKGATAVKELMIPEIMKLINTQNVKTESEQVVKTNIAPKIGVRR |
37 | Streptococcus_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 915760:915779|attR 947038:947057 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
963007 : 1008762
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS398550|963007:1008762|DBSCAN-SWA 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55 | Geobacillus_virus(16.67%) | tRNA,integrase,transposase | attL 967223:967246|attR 1007756:1007779 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1024281 : 1060722
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS398550|1024281:1060722|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS398550|1024281:1060722|1025064_1025652_+|SPR07398.1|DBSCAN-SWA MLAFLNCEHINKLLDKLDLINHSFNKRINLDKVKKAIFYAKKYHSNQKRDTGEPYYMHPLKVAYMVVEYSFETDTIITAILHDVIEDIKLTKEKIAMEFNNNIAEQVVALTRNIGGKKTSSMKMIQTLVNQDKVELLLIKLLDRLDNIKTIFIKPAKRRQEIILETLQEFIPLAEYLKLPEIAIELNKYCELYAT >LS398550|1024281:1060722|1050322_1051117_-|SPR07524.1|DBSCAN-SWA MYNLNTIINKLLNMFRFICTLFVLLCFTNCIVFAKEKTTITCLSEDDAYSRAELLFQKKKYNAAAKQFFDIFVQHLGSNTATKAELMRGYSLYLAGQYSEASEVLDNFIRLHPVHQKIADVYYLKALAEYKQAHNQQDLEQLLHARLELQQVIDKFPKSDFAIKAKEKINVISKNLAGSQIDIGKFYLNKKNPIAALNRFNTVVDKYSHTSYYPEAIYRIAQSYALLGRKQEMKEQLAILNSKFPNSTWSKRASSLLQLNDCNA >LS398550|1024281:1060722|1045901_1046435_-|SPR07509.1|DBSCAN-SWA MKHKIAGSFEAAMAYQILTSCSFGPAVRTRFFVKLLKNITLTECDESKILQAVQDVYGYEIQELQVTPFEQLKTVSQKQINEEEYLLNLSKQLGSNSIWYKVRESLIKSYGQAIDKSWFSKLEVINEDSVNKKIFIKAKTEFEDSYIRENYLKDLESAFKAQGFSFELVKFSNFNKI >LS398550|1024281:1060722|1031347_1032043_-|SPR07456.1|DBSCAN-SWA 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MIDFYSESLINKLFRTNIRFNTKIDLDKVERAIKYAKKYHSQQKRDTGELYYTHPLEVAYMVSDYSFETDTIITAILHDTLEDTKLTKERIRYEFGKKIAEQVSDLTRVRDDKKISAMEMIQILRSQNKTELLLIKLFDRFHNITTIFIKPPYKRQEIIFETQQEFIALAKYLKLPEIGERLSEYCKLHAS >LS398550|1024281:1060722|1024281_1024407_-|SPR07388.1|transposase|DBSCAN-SWA MIAGLCNNQIIAPVIFEGNCNKAIFTTYVETILIKELPLDK >LS398550|1024281:1060722|1030191_1030323_-|SPR07446.1|DBSCAN-SWA MKVAESHEIIVAKHRNGPVGTVNLHYDNRYSKFGNIVKNSQQG >LS398550|1024281:1060722|1042314_1043322_+|SPR07494.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSKRILSGIQVTGKQHLGNYLGSIQKWVQMQSKFQSIFFLANLHSITTSQESLKLSESIFSSACMLLACGINPKQSIIFLQSDVKEHSELTWILNCVTPLGQLKRMTQFKDKATKCSSNNINLGLLAYPVLMAADVLLYQADLVPVGADQKQHLELVRDIVKIIHHKFNDDTIFKLPELFIDHTAGKIMSLKDGRKKMSKSDISDFSRINLTDSQDIIFRKLQKAKTDCYTQITYDPTGRPEISNLINIFAALSNKTTNDIVKEYEYAELTKFKKDLAMLIIDCLNPILKEYNNYMNNLDYVNQVLITGANQAKIIAEKTITKVKQKFGLQILST >LS398550|1024281:1060722|1034659_1036054_+|SPR07473.1|DBSCAN-SWA MLVISTLIDELKDIEKYTDILDDNILTTDQYIQQIIDILNINKIKLDSEYNTSSKLLNNLITNVGIDEQNKTFELSDKEINDLIDEIVGSNNGNYLVIKIIDYVTDLINIRNEVIKFVKKYKIAEAQHLITFQTKNDNLSDFIRKMQVMHIGLKYAIENQDPELFKFFIQNSHEHIKYITHFNNHHNDIIRLENIIVCWTLQHIVEATNTYSLSNVYAAKMLDDMFSVFSSLNFDFDPCITRCKLRFDTDKTLVNALNIVINGNKVVPTLELLKIYNGDNTKLKVFNNNIISTEIMLLLKINDFVNYQCCNSSILQEMFSFESSTNLLQHKLPHKEFYELKAAADSVKASKQIDLQKLQTIKLDNICDDDSSINNESYDYAKLFKKLLFRSNSYKLQKCERSNHQEVIVRQSGYAPTHEKKDNYYSEKQLLHEITLEHHYDDNTTFDVDSISIGNDIQYTTITL >LS398550|1024281:1060722|1056438_1056888_-|SPR07553.1|DBSCAN-SWA MPGKHIGNIKYIEIRNLINEVVNENELRKEAHLKIINDADVITDSITHYKSIFTKQDVEKAVKDIPDLTVREQLVQQVLSSNRILELYHDDGENSKYFTTTEVRNEETRIVRIANKINNQVYYNDIYNLKSDIEGLTNVSEEQKQALIL >LS398550|1024281:1060722|1055669_1056473_+|SPR07547.1|DBSCAN-SWA 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>LS398550|1024281:1060722|1030336_1031338_-|SPR07451.1|DBSCAN-SWA MNFYELSDFSNKKPSNKNYEQNSELATSAITKDSEVEKNECCPKRKRLADYYPLTPEDAVILQRMSSRSFNIYFINQLLLKLSNKYPNRHFENKTAVLNYMAKALANELLTTDQANSENFRFNDVGRFKEQYLANIESGTDHSMNAQLKREIAGVFEADMAYKILTSCDFGAAVKNKYYIKLLKNITLSDHIKFKILHEVRAVHSNDIEQLQVIPFDESKQVTNSTTEYQKTTVLQQQISDEDYLSELSKELGSNSILFKVRKYILQHYEYEQVIDKIWFSKLEIVNEDNVNKKIFIKAVTSFANSYIKSNFKPILECAFEAQGFSFELVQCK >LS398550|1024281:1060722|1052696_1053020_+|SPR07534.1|DBSCAN-SWA MNEVERTEKRGNSKLLKNIVIALPDDKELNLEHRIELTHQIVDAMEWVQNGLGVQIDIHKPQIGDKNRHAHILVTTRRFKENGEELCSKAVDLEPKFRTVKVQPYII >LS398550|1024281:1060722|1025773_1026334_+|SPR07403.1|transposase|DBSCAN-SWA MHLSRFLDPKNDVAFKKIFGSEKNKDILIHFLNDILLFEGNRKIIEVEFLGTILDADIASKKESIVDVLCKDKNGAQYIIEMQVDPTQGFEERAQYYAAKAYGRQPNRGKEGKYSDLKKEVIFIAIADYKLFPNKEDYISRHVILDKKTYEHDLKDFSFTFIELPKFKKNRVEELNDITEKWCYFF >LS398550|1024281:1060722|1032194_1032752_+|SPR07462.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MFLNINATTVIAIIFLMLNIIASIYYRGSTNSIQKYALGRRKFATVAIATSIIGTYFSCNIFHYALLYTLQPGILKLSMLATAVSFIIQSLILAPRIQKFLGKLSVADVMGSLYGNHIKVITAIGSIVISLTISAMEIKLLYNIIQYISYNWLFIIAITIIIYLSCIGIRAIVFTDMFHCFTIIFLYAALFVFFNKVADFSTIITTLTTNQIFDFKGFIDYTNPLIMQYWWVLAFNILPIVRPLMFYKYLIVTNSRQVVNVLNTLSVVIFAATILLIIFATILLPIDIRNANPSDILTEVIKRCSDPEFTQLMIIVMIVITISTAISHISIAAVICFNDLCNPLGILKQYSPKNKLRIVRLFVILFTIASVLISFTNQELWNMHILGEHFYSPIIGAPLLVTVLGFRSTSKVILSGMISGGVSLLLLDWYNQSVTEVYHIVLAIIINFTVMMTMHYGLQEPGRWENYKIVSKLHEAYCKRENNAINWLRALLQYFEWNRILAYSSDMLRHQHYCLYTSIFTILSLSIMSVLSISSNSLDNSQIINILLLLSFGLTTIFTVYQFLSLTPNNNKYLGLIWLIFIFFALILTNTALLVVSEFHKVSLICFIVNLIVVGILIRWQVALIMIISGVIIAIGILSIFEPQISLIPPTDSGLIPTTLMVGSVLLMFIKIKQEEYILEQNMRSKAENKIKSMNIRLNIKKEILNHLSHEVRTPLQGVKSCIDLLIKHCNEYSNSEQLLRIVNRVNSSVERVCNHIDNLLDLSKIEANKMAFNIQQCNLRTLLNEIVFDFNTLQLSKQHKIDINYPQQVTEAVDCDRGRITQVMLNLISNAIKYSKPGPILISVKQDNENIYVSVKDNGDGIPKHKLNTIFQPFEQCGYDKFRISSTGLGLNVCKELITKHNGNIWAENQSNGGGSEFCFSLPLYRYHKQHSHANKPKISLPMLNKKITILIIDDDQIILDSMHLLIDTTNYQITTANNGEDAINLIKSNPALYQVILLDISLPDKNADMVLKEIQPILKQYNIPVVIQSGYLHDDKSKQYLLSLGATAFITKPYSQDALFSIITDVTRQSSAN >LS398550|1024281:1060722|1034191_1034290_+|SPR07468.1|DBSCAN-SWA MNENVIGMLKNGSKLLLKNIEIDVKDSVLDLT >LS398550|1024281:1060722|1051411_1051918_+|SPR07530.1|DBSCAN-SWA MLLEQVIYIMCNLEVSKNSSRNKLWSLIFGIQLLIIDQLVKSFFINFLKKTPEIAISIFKYFKISYVWNYGISFGIFNYYYDISNNFFLIVNTIIVLCICYLITKAKKLLQFNAYMLIIIGGTSNIIDRMLYGAVFDFIDIYLIIFNLADLYIFVGTILLVIYYSYYE >LS398550|1024281:1060722|1053029_1055339_+|SPR07540.1|DBSCAN-SWA MIHERVKEIINAYFAKLGLPYRVKDTSKVPQKHIGNIKYIEIRNLINEVVNENELRKEAHLKIINDADVITDSITHYKSIFTKQDVEKAVKDIPDPTAREQLVQQVLSSNRILELYHDDGESSKYFTTTEVRNEETRIVRIANKINNQVYYNDIYNLKSDIEGLANVSEEQKQALRHILLSTSGVRVLRGRAGTGKSYVLIKAYKLATNRGQKVIGLAPTHKAVSELKSKGYTEVYTVKGFLYNRKKIFMQGSLIVVDEAGMVGTKAYAELFRVVRNNNCQLILAGDEKQLASIERGGMFEMLSNIFGSHVLVNIRRQSKNWSREAAMEFAESNILSGITLLRQNKCVKFDNTLQDSISKLIYDWSLSKFKLHEKLVITVRNKDVDILNSSIRSLLKANGTLQGTEYRRSIAGRKESYMAGDRIVFQKSDKDLQIQNSEFATLTSVNKNEFVAKTDAGKEVSFDPSKIQFKHGYASTVYKAQGASIKDVYVLHNGISNISSSYVAMTRHIENLQLYCNKKATASINSLINQLSRPNDKSASITLKTAHDLEKERTKTTVFSKVFSKVENWFKSIINDINDRSHVNEEYYHFTAKPEQKAKVEKVQQENSIKQCTTKDISTPLFMQIKEQRQYDYDVTILSAEGKAISSFQEAGIDSRMVYSSNVNNLKYYQPFQGEKILIAANNDKQNKEYASTINKAAKALKSKGAITSIVVPSEGEDFNEMLKNKGAVAVKELMIPEIMKLINTQNVKTESEQVVKTDIAQKIVIRR >LS398550|1024281:1060722|1058601_1059720_+|SPR07563.1|DBSCAN-SWA MNDPNITIIAEGAETALSLQQSGIKGNIIASAGISNLRNYSPFPGEKIIIAADNDSKNSITNNTVIKAAKTLEMKGAITCIVKPPENGDFNNLLQSCGDQSIRDIIEPEITKLTKAVETTKLTQTENNSIEKQNDITNVKELYNKSSSLYYFKQEEEAKVETIVVNKFLENHTGIYSSKIFNNPNLRANMVFDEETQKSWPALTIFVKNDKDEITGAKILALNSKTCNKADVAEKSVGTISGSFAEIAQQNSKYSPVTIITKDIETALTIQQAGVEGKILCAIEAENLQNYNPGPKEKIILAVKNDVNTEKAEKVLEDKEAVVCTVKNDFNNVLKTQGLYAVRNIISPEIRKLNEKIESIQTNIQPGLCPKH |
34 | Wolbachia_phage(40.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1076909 : 1107568
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS398550|1076909:1107568|DBSCAN-SWA 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MDYVIYTFGGGDLLWHVFNGIGRVFASNSEYFTPVGHLALTIGGIWAATRAIFRGNIGIFAMEWFFPSIFIFTLLFAPKSTVWLKDEVSMSAPVKVDNIPIGIAMFASLSSQTSYFVSKMLENHLLPAYEGLSSRKTGIMFGAKAVAKIRDVQIHDPVTLTNTKEFLRQCFMKPYIIGNILGKKAAAQQTNDIIGFIEQNIPNNFGIYYREPSNLGISFKTCRQATPLIKAAIHKELNEGLLTKFAAAIGVQSDQSSMLSQRLKVMTGDTLKYLQREQQDIHEWMKQAMLLNANRESYDDWREKFSLSRIYPNLVSMHAIRGLFQKSFSYLVAGEMAAHMMPILQSVFLH |
38 | Lymantria_dispar_multicapsid_nuclear_polyhedrosis_virus(50.0%) | integrase,transposase | attL 1071607:1071624|attR 1086720:1086737 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1119607 : 1191912
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >LS398550|1119607:1191912|DBSCAN-SWA 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>LS398550|1119607:1191912|1153899_1154448_+|SPR08095.1|DBSCAN-SWA MNVLKSILQPCYAVILAFVVLSSPSICTANNNVNFNAFKDSIDTSQFYIKFSTGIATNYDTLEAGIGYRLDRHRMDVRLGFMCHHNCRDNFVQGNYYYNIIEGNKASIFVTGGLVSAFNSDSGTGIDLGVGTTINLSRDTYLDGVGTTINLSRDTYLDIECSTIANYRPLPIHIRFGLRVHI |
60 | Streptococcus_phage(18.18%) | integrase,transposase | attL 1120080:1120107|attR 1198029:1198056 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1197861 : 1260696
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >LS398550|1197861:1260696|DBSCAN-SWA 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50 | Streptococcus_phage(21.43%) | tRNA,integrase,transposase | attL 1192167:1192192|attR 1216451:1216476 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1273802 : 1316210
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >LS398550|1273802:1316210|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_16 >LS398550|1273802:1316210|1275457_1278895_-|SPR08716.1|DBSCAN-SWA 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>LS398550|1273802:1316210|1308943_1310227_-|SPR08878.1|DBSCAN-SWA MSTVKKIGFWSVLSIVISSQVGSGVFLLPSTLAPFGYIGILSLLLTGLCATLLALIFANLCRQFPKTGGPHAFVYKAFGIKAAFFTAWTYWIISWISSVALVLTAVSYISYIFDCYNIYITITLKVAITIISMLLNLNGLYASRWLDFALTLLKIPSLVILPLICIPSINYSYFFINENYTIHSYLQALQAAAFITFWGFIGVETATAPAEAVINPTKTIPRAIIIGTSCVIAMYLLSNIAILGTVPNNILKVSTAPFAEAANIILGGHWNKIIAFTAIIICLSTLNAWILTSGQIALGAAKDQLFPQLFLKTNQQGAPIWGIIISSLGMVVLILCTINSNLAEQINFVINISVVAFLWIYAICTISYLKILSISNHKQINYSSIIISVIALTFCIWIMLGSGWYMLLSSLFFITTGIPVYLYITRV >LS398550|1273802:1316210|1313112_1313439_+|SPR08887.1|transposase|DBSCAN-SWA MVLEYLREYRTYFHICQNYGISESSAYKAVKWVEDTLVKHLNFALTGLKAIMKSDMNYEVVLIDATETPIERPKKTKILLFRKEEKAYTKNSNSVRQANIPSNMYRFS >LS398550|1273802:1316210|1298968_1299187_-|SPR08828.1|DBSCAN-SWA MQDYTGAPSLVDLGSMRDTVAHTGGDINKINPLIPIDLIIDHSIQVDVYGTNYAKQKNTELKIKRNIERYEF >LS398550|1273802:1316210|1274958_1275159_-|SPR08711.1|DBSCAN-SWA MLTFINIFNQALTLTINIITIFVNITKKLKQKVDKRLTENLGNWWPVFNLEVNLMIEKYIQPGIDK >LS398550|1273802:1316210|1279633_1280302_+|SPR08721.1|DBSCAN-SWA MQRKIVLDTETSGLDHKQGHRIIEIGAVELDSDCTEIRNTFHYYINPERDISKEAYKVHGLSRDFLSDKPKFREIVDEFLQFIDGAQLIMHNANFDMQFLNSELFRIRKSAIPNTCVIDTLTLARKRFPKERVNLDALCYKFRIDTSDRLLHGALKDAQLLALVYGRMMHGMQVVLLDDTKHNKEIIISNCATNINNTVVVEPTCDEIIQHQQLLSKIHKHL >LS398550|1273802:1316210|1300964_1302104_+|SPR08851.1|DBSCAN-SWA MWFYYFTEPIFRYVGRIFKNPMALVPYIFIKKWTLAIYTTSIIVIYLIFTNKVVQEKLLVFTQIMNYELGEAKAIAKHCTSHLANGQWSELWKCIGDHPKYESTEHDQILEEGDAQEINNDLEQVERYQEIIKKKDQRNYNNSCSELLATINVQSSRAQTLREERETFKNECKAYQAQSNKITSTALSTDSQVLARQEILLQAKRQVILQKQTKLNTEMMETKMRINSLIPYIRSNMRSSIDHEFVKRLHQLKGSLDEKLAEGLSYESSELEYQEGELLDQEQKTKEKETALETEFQQNKYETKVLEEKLKRIIESNNDFAEKNRIELRLKQISIQQQKLMQEKRLLHTKITMLQTQKNELSQKKADLKARIEIFNQTS >LS398550|1273802:1316210|1291389_1293195_+|SPR08786.1|DBSCAN-SWA MQQQSNIRNFAIIAHIDHGKSTLADRLIEYCNALEAREMCQQVLDSMDIEKERGITIKAQTVRLVYKADDGCVYHLNLMDTPGHVDFAYEVSRSLAACESSLLVVDASQGVEAQTLANLYQAVDNNHKILIVLNKIDLPAANPQQVQQQIEDVIGIDASDALMISAKIGLGIKDVLQAIVTKLPSPNGDSQSQLKALLIDSWYDSYLGVVILVRVVDGKIEKGMRIRMCSNNAVYTVENVGFFSPKKQISGVLYTGEIGFVTAAIKQVADCRVGDTITDDKKPCAQILPGFKPNLPVVFCGLYPSDASQFNHLKDSLQKLRLNDASFEFEQESSGALGFGFRCGFLGLLHLEIIQERLEREFDLDMITTAPSVMYKVYLNTGKVIDVHNPADLPEMQKIKSMSEPWVEATIFIPDQYLGAILGLCTEKRGVQVDLTYVNGRAKLVYLLPLNEIVFDFYDKLKSYSKGYASFDWQMNSYKQSDLIKLSILVNGNPVDALSTIVHRSKAEFRGRELCKRLKDLIPAHLFQIAIQAAIGSRIIARETIRALRKDVLAKCYGGDITRKRKLLEKQKAGKKRMRNIGNVEIPQSAFIAALKITNKD >LS398550|1273802:1316210|1300160_1300811_+|SPR08845.1|DBSCAN-SWA MNRLLLLLKHEIYIYHKVYTIPQYVFIHAITAILALSMITTPQNLSTFGTLLTLIVYILAILNLSVFGIKKDLEDGSLDNLLIVENAYHITVAKIISLFTVVIIPFILTIPIIAILYNLTCDQIAKLLSSLLLFLQISSITTLTSIIQSYFYVNSYLISVIIIPLIIPGLIITGLIIEYSNNIENFLPILVGITLLFLSISVLLGEYLIKNIYNIQ >LS398550|1273802:1316210|1293503_1293764_+|SPR08792.1|DBSCAN-SWA MNIQHIKFSTLMCCMLLLLNHIDALYYTISSKLYSTLRRPCFNTTMFLTYLQCLRLLCYYKHLLVAKGLLLAPLGYPRLLGKKVGK >LS398550|1273802:1316210|1299558_1300164_+|SPR08838.1|DBSCAN-SWA MLTCQNISLISSNNTVIFANLSITLLPGAIAIIRGKNGAGKSSLLKIIGNIQSPTAGEVYIHNIQTNKLQKPFLGYIGHQLGLKLDLTVEDNLVMWAKFYDSVTLIPAAVTYFRLTDFLSEKVYKLSSGMKKKVALARLMACYSKIWLLDEVETNLDEGNRKLVYNLIAIHTNSGGIVLWASHSPSPWPNALEVNLEQYKK >LS398550|1273802:1316210|1303021_1304218_+|SPR08862.1|DBSCAN-SWA MEHSSKRPKNSIIEWINYRLPIFSFFKHLASYQVPKNLNYFWNLGSIAGIALVIQIISGIFLAMHYTPHVDHAFDSVENIMRNVNYGWLIRYMHAVGASMFFAVVYIHIARGLYYGSYKAPRELLWHIGIVIFLCMMATAFMGYVLPWGQMSYWGATVITNLFSAIPLIGKSIVTWLWGGFSVANPTLNRFFALHYLLPFVITALVGLHLIALHVHGSNNPTGIDIKSKKDTIPFHPYYTVKDFFGFGIYFLIFAAFIFYQPNYLGHPDNYIPADPLLTPHHIVPEWYFLPFYAILRAVPSKLGGITLMFSSILLLFFLPWLDHSKVRSCNYRPIYRIAFWLFIIDCLVLGYVGGKPAEEPYLTVSRLAATYYFLHFLVLVPFISRYEQTLPTPSNII >LS398550|1273802:1316210|1282105_1282897_+|SPR08738.1|DBSCAN-SWA MNVKNIRYFTSNLARSAQIANELQQKYNILPLSDKDNYSDSIDTIIVIGDDGVFLHALKNFLHLNVSFYGINVGNLGFLMNSYNNKHDLIEQISSAKVVSIHPLRAKVAYNDATEEKFCFAFNECTILRYSSQAIKLDIQTNNVFRLILFGDGVLVATAVGSAAYNYAAGGMVLPLTANLLSMTPVSPFRPKGWRGALIPNYSSIDITIHDYTTRPGYFTADLQEIYNVTTVNITEAQDQKVKLLFNAESDLEDKLLKEQFST >LS398550|1273802:1316210|1285630_1286650_+|SPR08758.1|DBSCAN-SWA MDYLSCKFIRLRRNRQYEWLRDLVAETSILSSDLILPIFITDGMNKEIIINTMPSIKIVSPDLALQKVEEAIDYGIKAVALFPSISAAQKSNDAAEACNANNLICQTIRLLKSNNRFRKVGIIADVALDPYTIHGHDGLLTDDCLDIDNDRTLAVLCKQSLKLADAGADIIAPSDMMDGRVKAIRGYLNSKGYCNTIILSYAVKYASNFYGPFRNVVGAKLSSGPSSKKTYQMDYRNTREALKAVEINIQEGADMVVVKPAMTYLDIISNVKNNFNIPVFAYQTSGEYSMIKYAALNGCMDFDQAILESIQCIKRAGATAIFTYAAIKLARFLAANHSI >LS398550|1273802:1316210|1313392_1313695_+|SPR08893.1|transposase|DBSCAN-SWA MLDKQTYQVICTDFPNGKKHDFRLFKESKILIHPKVKAITDTGYQGIQKIHNNSELPKKKSKKNPLTKNDKKNNPRLAGERVVNENVIGMLKRFKIIADK >LS398550|1273802:1316210|1298329_1298728_-|SPR08821.1|DBSCAN-SWA MTPLVLPEIIGVKLTNSLRAGVNATDLVLTVTKILREKGVVGKFVEFFGTRVDNLSLPNRAIISNMCPEFGATCAYFPIDQEIIKHLTLTGRKSEDIELVEKYAKKQLLWRNTNDEIIIIVVMFKLSHYHIL >LS398550|1273802:1316210|1295724_1296192_-|SPR08806.1|DBSCAN-SWA MAGSLNRVTLIGNLGHDPEIRKTNDGKEIAAFSLATTETWRDKHSNEKKEKTEWHRIVVFNDGIVNIIKSYVKKGSKVLIEGSLQTRKWQDSSGQEKYTTEIILQNYNASLILLDSKSSSDASSLHTKTPSDTLSVQNKTQSNLSQSLDDDDLPF >LS398550|1273802:1316210|1315733_1316210_+|SPR08915.1|integrase|DBSCAN-SWA MCIPKTKSKNAKTLYIGLADKLIEVLQTRKLCSKSEWVLPSPTDNSKHISSSTIHRAWAKIRKKAGIQNVTIHDLRRTFATWMKNNGETLDTISQILGHSDTNITKIYIVHSLAKAKIATNKVVENMLSIFGPNVCLNEILSGILPSLSCGEEKLTTT >LS398550|1273802:1316210|1284770_1285460_-|SPR08753.1|DBSCAN-SWA MLEHSSLTSQISIISAFLSADIICKTVMVTLIISSIWSWAIIFYKYYHFNNIKKEINTFNKLLQSNQQVDELYSKINKNNGNSISSMLTIVLNECKNEHNVTAGNNSNLKDRLLYTIELTKNQISEQLETYLIVLATISSTAPFVGLLGTVWGIMHSFQAIAATKNTSIAVVAPGIAEALLATAIGLFAAIPAGIFYNILTHKVSLIENKLENFIRKFYTVLCKTIDKR >LS398550|1273802:1316210|1314891_1315782_+|SPR08910.1|integrase|DBSCAN-SWA MPVTVFKFTQAALNKIKVPTKEEKIIKCRDLIQRNLLFIISYTGFRRLYLGININGVYYRIKIGDSPDLTVAEARKKIQQLKRDIAKGINPMDERRKINKERREKREKRLKLKNELTFGQVHVKYTEYSSLYHKSWKIMAQRVKRYLESLYNKKISEITKEDIQKIFDEITARKHYVTANGILKLLSPIFNKAIEWGLIEKNPVCGIKRHKEESRSRYVTSEEMGRVMKVLAEKENSKLTEEQKQSKISEKLFLFTALFTAARSGNILGMRWDEISLSEKYCVYQKLRVKMLKLYI >LS398550|1273802:1316210|1284306_1284765_-|SPR08748.1|DBSCAN-SWA MDNNTINAISNVFAKKRSKRALISNINVTPLVDVMLVLLIVFMVTSPMLTLGVNINLPKTSASQPLSEQSEPLTISIDKSNNIYIFKTKISKTQLVNKLKALTRTKGKFNTRIFIKADQNLQYGEIAKLLAEITSAGFTKVALITDNCNEHK >LS398550|1273802:1316210|1280521_1281031_+|SPR08726.1|DBSCAN-SWA MEHQQQEQFKIGDKVVYPSHGVGEVIGIENQVFCGKELRVYVVSFPMDKMTLKVPVNSKSASGLRAISYKTDTDKIYKILCSQSQPGNRMWSRRAQEYENKINSGDLCSIAEVVRDLYKNAEVDRSYSERTIYESAITRLARELAILESVKYEEIIEKLTEILKNRNTV >LS398550|1273802:1316210|1288208_1289813_+|SPR08777.1|DBSCAN-SWA MTFLRNVLNYFILPAHKTESLTKVILSDFEAKEDWYHIAVFHINRIFENEVFHCEKAIDAVFKINKTSERDKYAFVSTVLKYNILYDEENWARYLKFSDKLQKFSTGVYNTLNTAILYKKISTFILKGDKNNAEKYIEKLHESLPKEIIHLEYRLNFDSNFDYSNEIQRVYDIKAEIDQQKLMIAGRILSEPLERVLIKFWQHFDTCNNDPECNKIQQIYADLAKYHSLSSTQDDITNLLNNSSIKNKPASDVIVANDLKKYDISDKRKNNQGISQKKASLNDYATTSSHKKSQVTTKNDLEQNVETKSGDAVDFLDNVNTDEVSEVDENIDNSCVNNTVFDEQYTPDEFYTKLMQVYKKHPDLFTRHDKHQHIHCHTKKHTYCTFDPDVKKCTWNGKTYYCAISKDLKLDSVKQMYYRNALEKEFVSSNINQSGIKCLPNKMFELKVCKEDFRLLACNTYVDNKGNYFIIFNKETNHTGISNIISNSTLSNDPILTESCKDCNDEADSTTVNTDITPCVIGQMLNQTEYYNDC >LS398550|1273802:1316210|1302215_1302881_+|SPR08856.1|DBSCAN-SWA MSNIDKNIEAAKSIADANIDKRSTRQTQKLNNVSLNQTLSSDLNLSTSNDDSNTKVTRRDFMVLTATSMASIGAVSSLWPFIDSLNPAANVSALSSVEVDIDKIQCGQAITISWQGKPVFIKHRTDEEIKEARAVNLSELIDPEEDNTRVKSGYDQWLVVIGICTHLGCIPTDRSGEYNGWFCPCHGSHYDTSGRIRKGPAPKNLEIPPYQFITDKKIKIG >LS398550|1273802:1316210|1311909_1312716_-|SPR08882.1|DBSCAN-SWA MNHKFISAVKALKWYSYMCIDDNIIYDGTASLNQCNSISISKAKTLIAQNSAGFNNNQNTHLAVLSDSRQLADSVHTLEDLKSSVTSFDGCLLKKTALNTVFGDGIPSAPIMLIGEAPGQNEDKHGIPFCGESGKLLDNMLQSINLSRTKNVYITNTVFWRPPANRRPTSDELVICRPFVEKHIAIINPKLIILVGSTAATSMLGDHVKISKIRQEYFLYKNCYLTFSIPITAIFHPAYMLRQPLQKKACWFDLLKIQQFILQKYITI >LS398550|1273802:1316210|1299134_1299338_-|SPR08833.1|DBSCAN-SWA MPYSLRIILKNILRHSHNNNNVIETINSFSNWIANPKAVKSEIEFMPGRINAGLYRCSIISRLRFYA >LS398550|1273802:1316210|1273802_1274825_-|SPR08706.1|integrase|DBSCAN-SWA MPSISSSSKFTKRLLNKIKIPKGETLVIIHHPDIIGLKLKISCTVCGGKVRKTWILEQKYKNQSLKIRIGEFPYLSIKEAIKKAIELKTLMANGIDPRAVKRQQKIEENENRIKERERKANDITFKELCYRYIEEYAKIYTINWEEYTDRVHTYAQSLYGKKISQIRMSDIQQIFNDISKEGKYATANLLLATLRTMFNKAIKWGLIENNPTLGIEQHKLQARERRLSYDEMGRLLHVLCGETTPLIRDFALLALYTGARKSNVLEMECDNIDFERKIWHIPKTKNGKAQNIPLTDEAMEILQARKLTSKSKWVLQSDSSKSGHLESHMKHGIGFVKRQA >LS398550|1273802:1316210|1296563_1297238_+|SPR08810.1|transposase|DBSCAN-SWA 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MNTSNNFYVFFLISFSCHLILSYAAILFTSQQPQLHNKIISLELVQMNKVTNKTTSNAQKATNNKQTTFQLKQNNLRKPNIKHNARNNLTNYNSISNKIKPITTPAPSPTLPITPKVTEPPLKIDSIEQKASTSNVPEKIASAPQATQKVIEPTLKSPPIEHKANVATTTESSASTTQPITPKVTEPPLKIDSIEQKASTSNVPEKIASAPQATQKVIEPTLQSSLIEHKTNVATTTESNASTTQPIIPKVIDPPLKSSHIEDKTSVPHTNDTSHSITQKNNLATSNIAAEQQYIANNHASRQNTNNTDNTNSTSYTDTIKYQIQAHWNHTIGFIPGISTVLMVNLTLDGTIENITDISHNCPNNNTTVCNVFIQNVKRAIWAASPFQELPKEEYNAWQQIVLEFNPED >LS398550|1273802:1316210|1297694_1297820_-|SPR08815.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKCIIVVYYLIGNFCKIYQERERNRLIPSIIKETEMESYP >LS398550|1273802:1316210|1313743_1314061_-|SPR08900.1|DBSCAN-SWA MYTSYSLHFIFQLIIIWRLKELGQYRQAIEIFNTTILYKPDLAVAYYAKGISLCELGQHQKEIKHYGTAIQYNPNDADFYIGKGISLYELGQHQEAIDLFRNWLR >LS398550|1273802:1316210|1287357_1288041_+|SPR08771.1|DBSCAN-SWA MKAKKKKHNKVVNLKNKTEKTANNSAAEQQIMEINAAFSDRIKKSLYEGGVLESIFTCALKTEDIETLKIIESQNIKINTECIIELFVGFITEFSKYKFAIQWLQEQFSSIIDDLVTETPKIIKCMIIDSCENRDDELISFIIKNYSNKIDIDEAFDNLVTLNFGRGITLLLNNCKVTQESIQKAIKTAQRLGNIAAEKILNPNIKLKKPPRKKKVTYNILISKKLK >LS398550|1273802:1316210|1305642_1308561_+|SPR08873.1|DBSCAN-SWA 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>LS398550|1273802:1316210|1314114_1314474_+|SPR08905.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKCIITVYYLIDNFCKIYQEWERKRLIPSSNQRNRDGKLSLAELLTIAIYFYVSPCKDCKNYYLYYLSYKYKGYFCLPSYSRIIQLWPRMLLPLVVLTHYLKGEEIGIYYIPFMFKMI >LS398550|1273802:1316210|1294784_1295645_-|SPR08801.1|DBSCAN-SWA MNYSVFVARKKNLELVLINLLISLLLSSYINTSYNARVNRANKVVQNTEMKHDIIKTNKFLLTVFHKITNPNTNFVFYIEGDGLIYYNDSISNNPTPLLPLVVELATIDPRPNVVYIARPCQYTPLSLQKNCVKEYWTNKRFAKEIVDAINEAIVKISNNQLCDIIGYSGGGGLAVLVAAINPNVRTITTIAGNLDHIAFNNFHNNPHMTDSLNPIDYAEQVKYIPQLHLSGMKDKIVPPFIADKFVQHVNFAKVIKFESISHDKGWKSIWRKFCTRHEAYIAKPL >LS398550|1273802:1316210|1293763_1293976_+|SPR08797.1|DBSCAN-SWA MNHLFKQNAIQELVKYNKCLLSVTILLAAANIIAIMVAITKEEKWLLIPAIELDRKMSVSSKNYHDTYLK >LS398550|1273802:1316210|1286864_1287029_-|SPR08765.1|transposase|DBSCAN-SWA MLRNEFTKTIKIIPKDKIALIDESGIEDTAYRNYGGSRRYCEKAYQHTQRVSMI >LS398550|1273802:1316210|1304952_1305210_-|SPR08868.1|transposase|DBSCAN-SWA MKCVIQGKSCNAASVKFDIAANTVRNWYKRYQLEGYYKEKSHFGKKGKIDKIEKIYFAKSKSNSGTSRKTFWNFNKGRELLHEKI >LS398550|1273802:1316210|1290134_1290998_-|SPR08781.1|DBSCAN-SWA MSNIAIKENDIEFIHNIEQEWKKLQEEAKKLQVECLFTSDVDVNDCFLDINAGAGGTESNDWASMMLRMYLRFAESMNFKTEVVYLLDGEEAGVKSASVKICGHNAYGWFKTESGVHRLVRNSPFNALGKRMTSFASAWVYPVINDNIQVVIEDKDIRIDTYRASGAGGQHVNTTDSAIRITHFPTKIVVQCQNDRSQHKNKAEAMRMLKAKIYELEQKKQNEIINNHNAAKTDNSWGYHIRSYVLQPYQLVKDLRTNVETSDTKRVLDGDLEKFIYASLIHQNITF |
40 | Mannheimia_phage(16.67%) | tRNA,integrase,transposase | attL 1304778:1304793|attR 1318124:1318139 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1332106 : 1369511
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >LS398550|1332106:1369511|DBSCAN-SWA 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38 | Streptococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_18 |
1376953 : 1405827
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >LS398550|1376953:1405827|DBSCAN-SWA 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42 | Wolbachia_phage(50.0%) | transposase,integrase | attL 1385748:1385763|attR 1412257:1412272 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_19 |
1414309 : 1453150
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >LS398550|1414309:1453150|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_19 >LS398550|1414309:1453150|1452964_1453150_-|SPR09766.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKCIITVYYLIDNFCKIYQECERKRLISSSNQRNKDGKLYLAELLMAEKDIITKVCKGNI >LS398550|1414309:1453150|1440808_1441684_+|SPR09699.1|transposase|DBSCAN-SWA MKKCIITVYYLIDNFYKIYQEWERKRLIPSSNQRNRDGKLSLAELLTIAIYFYLSPCKDFKNYYLYYLRYKYKEYFCLPSYSRIIQLLPRMLLPLAVLMHYLKGDETGIYYIDSTKLAICHNKRTSSNRVFNRFSKIGKSSYGWFLGFKLHLIINNKDKIMSVKITKGNKSDLSIASVISKVLSGKLFGDKAYISKELFHQLLTNGLRLFTNLLKDMKTYLLDIDDKRLLNKRSLIESVFNVLKKHMHLEHTRHRFPINFFVHIISSLASYSISKLNPHLISSSSSPGSLS >LS398550|1414309:1453150|1445000_1445372_+|SPR09721.1|DBSCAN-SWA MGLSFGEIIVVVIIATLVAKPHDIKYLLKQIYSLKLLLQRAYHEILSSLDLDDKEDEDYNNHTLNLISNTNSDIDKSKVDQMNFYLQKIAEQGETYHGDYNLPSIKKYFIMIKKQSYNKKKDS >LS398550|1414309:1453150|1426506_1426806_-|SPR09627.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISINEVQSIANYCKLRFNEQELNHMVKQLSSIVEMMNKLEKIDCTAVPPMRHFEENNRMRKDQVEQNITVDQLLSNVPQSSATIAKNTKYFVVPKIIE >LS398550|1414309:1453150|1426888_1428625_-|SPR09632.1|DBSCAN-SWA 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36 | Wolbachia_phage(16.67%) | protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_20 |
1490330 : 1538395
Sequences of DBSCAN-SWA_20
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_20 >LS398550|1490330:1538395|DBSCAN-SWA 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|
43 | Pseudomonas_phage(25.0%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1502829:1502846|attR 1517075:1517092 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_21 |
1548696 : 1577436
Sequences of DBSCAN-SWA_21
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_21 >LS398550|1548696:1577436|DBSCAN-SWA 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32 | uncultured_Mediterranean_phage(27.27%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1569914:1569928|attR 1580731:1580745 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_22 |
1597738 : 1655299
Sequences of DBSCAN-SWA_22
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_22 >LS398550|1597738:1655299|DBSCAN-SWA 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56 | Pseudomonas_phage(11.11%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_23 |
1660224 : 1716559
Sequences of DBSCAN-SWA_23
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_23 >LS398550|1660224:1716559|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_23 >LS398550|1660224:1716559|1703438_1704140_+|SPR11096.1|DBSCAN-SWA MENNHIDLIQYIRHIVNNCNKAKWNILELIGYKQDAVAKITDTLGLLDEQMDHLNDTICVFRKDIESKNVELENFSLQTFVKDTVARLKAIAEDDRIDLKSNFQANIKDSIIGDSFRIRAVLSQLVGSAIIHGTKCTTINICVHLLPSQDGKTDSKDKILQFVVQSIGPSIQKEKLQKINSELSNSNLTKHQELGQGLVFIKQLTHQMKGNLKIDQGSNYISSSFEVPIQLYT >LS398550|1660224:1716559|1663109_1663547_-|SPR10873.1|transposase|DBSCAN-SWA MKFDQIKELKDEKFSRLTGVRSGTFAKIVDILRKDDGLKKLKDGRKNKLNLWEQLLMVLEYLREYRTYFYIGQNYRISESSAYKAVKCVEDTLVKHPNFALLGRKALMKIDMNYEVVLIDATETPIERHKKNKNSIIHERRKGIH >LS398550|1660224:1716559|1689122_1689548_+|SPR10991.1|DBSCAN-SWA MIDFYSESLINKLFRTNVRFNTKIDLDKVERAIKYAKKYHGQQKRDTGELYYTHPLEVAYMVSDYSFETDTIITAILHDTLEDTKLTKERIRYEFGKKIAEQVSDLTRVRDNKKISAMEMIQILRSQNKTELLLIKLLEKT >LS398550|1660224:1716559|1705036_1705615_+|SPR11111.1|DBSCAN-SWA 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58 | Streptococcus_phage(21.43%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_24 |
1734511 : 1769503
Sequences of DBSCAN-SWA_24
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_24 >LS398550|1734511:1769503|DBSCAN-SWA 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MKKIYQAKSYKTLRTANMIRLALIDVLHSNKLHTDLFECKITVTKVLAQAGQGMYHCYILPFSNSKLSQDKLMHAINDSLPIIRRMITQKINLKYSPELRIFYDYGFDNAANVDKILKSL |
43 | Indivirus(33.33%) | integrase,transposase | attL 1735685:1735703|attR 1765228:1765246 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_25 |
1777170 : 1897449
Sequences of DBSCAN-SWA_25
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_25 >LS398550|1777170:1897449|DBSCAN-SWA 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>LS398550|1777170:1897449|1897071_1897188_-|SPR12123.1|transposase|DBSCAN-SWA MKSDMNYEVVLIDATETPIERYKKNKNSIIHERRKGIH >LS398550|1777170:1897449|1856094_1856190_+|SPR11871.1|DBSCAN-SWA MKLSGKRNTGNPYITFNVVGDGNCDNQTTEP >LS398550|1777170:1897449|1877722_1877815_+|SPR11983.1|DBSCAN-SWA MQGGGSSKIDIQHSKVKLTARERIEVLLDH |
113 | Bacillus_phage(20.0%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1776745:1776767|attR 1896561:1896602 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_26 |
1901666 : 1961244
Sequences of DBSCAN-SWA_26
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_26 >LS398550|1901666:1961244|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_26 >LS398550|1901666:1961244|1937452_1937797_+|SPR12353.1|DBSCAN-SWA MYYFVIERYVQLKLAIGEHFYDIDQIGIKFYSLRFKKWMHLNAEDFLHEFYTGQHGFKIQQLWEFLINSALLEGLIVFAIGVIISIVFFTAQGKKTIIKAKIRGADFVECKWPI >LS398550|1901666:1961244|1933872_1934244_+|SPR12328.1|integrase|DBSCAN-SWA MERQNIPLTDEIIEILQARKLTSKSKWVLSTDRSKSGHLENPYRRWYKICKKAGIKNLRIHDLRRTFASCMGDVGAGQYIISAALNHSDIKSTSIYTKVSLEPVRQYMSKVTQMISDCSRIDI >LS398550|1901666:1961244|1901666_1901867_-|SPR12149.1|transposase|DBSCAN-SWA MITDTGYQGIQKIHNNSELPKKKSKKNPLTKNDKKNNLRLAGARVVNETVIGMLKRFKIIAEQISK >LS398550|1901666:1961244|1903079_1905929_-|SPR12170.1|DBSCAN-SWA 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60 | Acinetobacter_phage(25.0%) | tRNA,transposase,integrase | attL 1912287:1912315|attR 1970713:1970741 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_27 |
1971822 : 2013306
Sequences of DBSCAN-SWA_27
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_27 >LS398550|1971822:2013306|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_27 >LS398550|1971822:2013306|1999304_1999778_-|SPR12685.1|DBSCAN-SWA MRHGDAKHNINDFARPLSELGRQVVTNASYFLNKFNIEKVLCSPSARTLETLNIVKTVSSISINDNNIDIIDKMYQSNVENIIDIIQQQPDDIQSLLIIGHNPYLYEFYRLTVAQQKKNNFKLVPACVIVIQYADVTSWASSLLGLGTVYDIFMPNY >LS398550|1971822:2013306|1975907_1976018_+|SPR12559.1|integrase|DBSCAN-SWA MTIRVFPDLSIKEARKIARELKRLMTNGIDSREVKC >LS398550|1971822:2013306|1971822_1971939_-|SPR12530.1|transposase|DBSCAN-SWA MKSDMNYEVVLIDATETPIERHKKNKNSIIQERRKGIH >LS398550|1971822:2013306|1982967_1983093_-|SPR12627.1|DBSCAN-SWA MKVVSSLKSLKNRDKSCQVVKRRGKIFVINKKNKKFKARQG >LS398550|1971822:2013306|2004706_2005729_-|SPR12715.1|DBSCAN-SWA 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>LS398550|1971822:2013306|1981084_1981219_+|SPR12607.1|transposase|DBSCAN-SWA MLFEVIMKFDQIKELEDEKFRRLTRSKEGNILKDSGYFEASLRS >LS398550|1971822:2013306|2012004_2013306_-|SPR12747.1|tRNA|DBSCAN-SWA MRLSQYFLPLLKEDPAGAEIISHKLMLRAGMIKQACAGIYNWLPLGIKVLQNIQDIVRKNMNAAQCIELLMPCIQPASLWKESSRYNAYGKEMLKIKDRHDNDLLFGPTNEELITDIFRSCIQSYKDLPKNFYHIQWKFRDEIRPRFGVMRSREFIMKDAYSFDIDQDSAIQSYNLMYLTYLKIFKDLGLKVIPVQADNGAIGGKLSHEFHIITATGDSKIYYDSTKFNPFDYNQDLSLNKLEQLYIVTEDKHKTDQNQILNDKISTISGIEVGHIFYFGTKYSELMKACIQMQNGKLTAVEMGSYGIGISRLIGAIIEANHDEYGIIWPQNVAPFKVSVINLLPNNDKCKQTSNQLYQILTQQKTDALLDDTSSSAGHKLAAHDLIGIPYQIIIGKNFIETATIEFKYRHNQQLQKLSIDALINQLTEISKH >LS398550|1971822:2013306|1983829_1983931_+|SPR12631.1|DBSCAN-SWA MVAECSYDLRKRVIKLIEEGETIAKAGCLINRR >LS398550|1971822:2013306|2005933_2007013_-|SPR12720.1|DBSCAN-SWA 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48 | Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus(12.5%) | protease,tRNA,transposase,integrase | attL 1970713:1970736|attR 1983381:1983404 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_28 |
2024377 : 2081208
Sequences of DBSCAN-SWA_28
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_28 >LS398550|2024377:2081208|DBSCAN-SWA GTTAAGGTAGTTCAAAATTATAAATGCCAGAGATCAAATTAAATCTAAGACCGAATCTTTTACATCTATTTCGATATTTATCAGCAATAATTTTGAACCGTTTTAGCATACCAATAACGTTTTCATTGACAACTCTTTCTCCTGCTAAGCTACGATTATTCTTTTTATCATTTTTAGTTAAAGGATTTTTCTTGCTTTTTTTCTTTAGTAATTCAGAATTATTGTAAATTTTTTGTATACCTTGATATCCTGTAATTGAATCAGTAATCGCTTTAACATTAGGATGGATAAGAATTTTGGATTCATTAAATAATCTAAAGTTATGCTTTTTACCGTTAGAAAAATTTGTACATATTACTTGATGCGTTTTCTTGTCTACCACTATATTGAGTTTTTAGTGTATGCCTTTTCTTCTTTCCTGAATAATAGAATTTTTGTTTTTTTTAGGTATTTCTATAGGAGTCTCAGTAACATCAATCAAGACTACTTCATAATTCATATCGCTCTTCATTAGAGCTTTACGACCTGGAAGAGCAAAATTCAGGTGCTTAACTAGGGTGTCTTCTACCCATTTATGGAAGTAAGTACGGTATTCTCTAAGGTATTCTAAGGCCATCAGCAACTGTTCCTTCAAATTAAGCTTATTTTTACGCCAACTTTTTGATTTCTTAAGACCATCAGCTTTCCTCAAAATATCCACCATCTTTGCAAATGTTCACTTCCTTACTCATTGTTAATTAACGAAATTTTTCATCGCCTAACTCTTTAATCTGATCTAATTTCATTATTACTTCAAATCAGATTTTTATAACACCATTTTACATCATCGTCTAGTTTCGAAAGAAGTCTAATGTTTATTAATTAATATAAACATTACAATATAGGTAATTATGGCTTCAATAGCATTAAAGTTTACAAAACTGTCGTGTAATAAAGAAACGTTTCCACATCTCTGTCCTAAGAACAGTACGTGATGTTTTGGTATCATATGGCTCAAGCATCTTTAAGTTCAATTCCTATTGAACCTGTTCTACTCTATAAGTTTGTTAACACTGCTATTATGCTTTACAATTAGAAGAGTTAGTTCTTCTTCTTATGAGTTCTTTATATAGCTGACAATGCTTCATTAACTCAGCATGATTGCCTTGAGCATTAACTTTTCCATTGTCTAGTACTATAATATTATCTGCTTGCTCTATAGCACTAATTCTGTGTGTAACAACAATTATTGTTTTTTGTGGAGAAATACTACGAAGATTATTTAAAATTATCTTTTCAGTTTTACTGTCAATAGCATTAGTAGCCTCATCTAAAAGCATTACAGGAGCTTTAGTAATTAATCCTCGAGCAATTGCTAATCTTTGTTTTTGGCCACCTGACAGCATATTTCCTTTTTCTCCGATAAAGCTATTCAAACCATCTGGCATTTTCGTTAAAAACTCATCAAGCAGTGCTACTTGTATAGCATATGCAATATCCTCACTACTTGCATGTTGATTTGAGAAAAGAATATTATTTTTTATTGTATCTGAAAAAATATAAGTCTCTTGTGGAATGTAACTGAAATTTTTTCGCAGTTGAGGCAAGTGAACTGAACTAATATCTACATTATTTATTTGAATAGTGCCTGTTGTAGGATCATAAAACTTAATTAATAGTTGTAATATTGTACTTTTACCAGCACCAGATTTACCAACTATGCCAACAAATTGACCAGGAGCAATTGACAAACTACAATTGGATAGTATTGCAATATTTGGCCTTGATGGATAGGAAAAACTGACGTTGCTAAATTTAATAACTCCATTATGGAGCTCGCTGGTTGATAAATTACTTTCAACACTATCAATCTCAAATAAGCTAAAAACTTTTTCTGCAGCCATAAAGTATCCAGGAAATTTTGCAAATGATTCGATAATGCCTCCTAAACTCGCTACTGCAACAATTGCATAATAAAGGAATGACGTTAAGTCTCCAGATGACATAACTCCAACAGCTATATCATTGCTACCAAGCCAAATAATAAAAGTGACAGCACTAATAACTAACGCCATTGTTAGTGCAAAGAACATTGATCTTAACTTTATTTTACGTTTAAACTCAACAAAATATTCTCGTTGAATTGTATTAAGTGTATCAACTTGATGTGATTGCTGATTAAAAGCATATATTAATTTGATATTATTAAATGATTCATCAATCTTAGAATGAATTTTTAATAGCTCAAATTGAGTAATATGAGCTAAAGTGCGAATATAATGTCCTATTTTTATCATTGGCAATGCTATAGTAATAAACATTATTATTACTAAATAGGTAAACTTATTACTTTGCGCAAACATTAGCATTAAGCTTCCAAGAAACATAATACTGTTTCTAAGAATGAACGAGAATAAATTGTTAATAAGTTCTCCAATACTATTAATATTTGATAAAAGTCTATTATTAATGTCTGTAACTTTTAATTTAGCAAAAGTGCTAATTCTTAGTTTTAGCAAATGCTTAAATAAGTCTGATCTAATATCTAATATTAAATTTTCACTAATACTATTAATTGTGAAAGATCTAAGAAAGCTAAATATACTGAATATTACAATTGTAATGCTGATTTGAGCTATAATTATATTAACACAACTACAATTATGATCTATTAAAAGTTTAATTGCACTGCCTACATAAAGCAATGATCCAGAAACCATAATTAAAGATATTAATACAATGAAAATTTTAAATCTATAAGGTTGAAGATATTTAAGAAATAAATGTAATATTTTATAATTACTCATTAGATGCATTTAAATGAATATTAAAACCTGTAAGTTGATTTATTTCTGTCTGTATTAAAGTACATATATCTTGCTTGTCACGATTAAGCCACTTATTGTCAATATAACTAAAATGATGAGGTCCGCTTATTGGGGATACTAACCATATTTGACGAGCAAATGTGTGACCAGTAATAACAAATTGCTTAGTTGATATAGTGATATATAAAATCATTTCATCAATGAAGTTAACATCAATTATTCCATCCAAGTCTTGTGATATAATACTATCAGCAATTTGACTGATGACTTGACTAGCTAGTACTATAAAATTCCTTTCTAGCATAAACTACAACCTTATTAATAATATATAAATAATATTACGTTATTTTAATAAATCAAAATAAATTTATATTAGATATCTTTCCAAACTAGCGTTAGATTCAAAGTTACAAATGTAAGCAATAAGGTATAAATATAAATATAAACTTTTACACATGTTTCGATATCTTTAAGAGATTATTTTGAGATGTTTTAACATGTCAATAACATTTTCATTAAGAAATCTTTAAATAAATAATTAGGTGTTAAGGCTGTAAATTTAAATCCTCAGTTTTGAACAGTGCTGGTCAAACATTTTATTATTCCAGAATTAGAGATGCTTCATGAAAAAATAAAAGAAATAATTAATGCATTTTTCGCTAAATTAGCCCTACCAAATAGAGTTGATAAAACAAGTACAGTGCCGCAAGTCTATTATTGGAATAACTAGAGTTAGAGATACCGTATTAAAAACCAAGAAAAGAAATAATAATTTTATAAAAAAAATAAAGAAATAGAACAGATGATTAATGATCATATTAAGAATAACAAAGATCTTTTCGATAAAGCTGCATTCTTGTATAAATACTATGTGTAGAATCAAAAACATAAACTATAGTTTTTGCTTTTTTAGATAATATTGAAAAATTTAGTTCTGCTAAACAAGTTGTAGCTGTAGCTTTTGTAGATCTTGATCCTAAGCATCGCAAATTCTGTAGTTCTGTGCGTGGTGTTAGTAGAATCTCTAGAACTTGTAATTCAAACCTGCGTAAAGCTTTTTATATGCCTGATATGTCTGCATTAAAACATAATTGTATTATTAGGCAATGCTAAACGTTTATCTGAAGTAGTAAACATAAAATGCTTATCCTTATTGTTGTTATGCGTAAATTATTCATATTATTTATGGTGTTTTGAAGAATAATTCTTCATTTGATGCCAATGTTTCAATTTTTCAGAAATAAGAAGTTTATAAAAACCGACATTCTTTTTATAAACTTCTTATTTAGTTTTCTGCCTTATTCTTATTGACAGTCTAAAAACTTTGATTACTATTTACATAGTGAATATAATTAAATATATATGTTTATTTAAATTATTAGCTATAGATTTACAATAAATATGTTATTTTACTAGGAGCAAAATTGTTATGGCCAATGATCAAGACTTATCCAATCCTGAATATTTATATACTGAAGATGATATTAATCAGCTGTTAAAGCATTATTTAGGTTTAGATGACAGGATTAGTATAATACAGCATGTTGCACTAAATGAAAGTCTGCTGCTTAAGCAGACTTTACATCAAGTCTTATCTGATATTTTTAGTGGCATGCAGGAAAAAGCAGTTATACCACTACATACTGGTAATAATCATTGGGTAGCAATGGCAATTAAGAAAGGTATGAATGATGATATTGTTATTTCATATAATGATCCAATGGGTGTATCAATAGATGATAAAGTTACACTTATAAACTGCATAAAAGAGCTATGCCCTGGTGCCAAAATCAATGATTTACAAACGGTTCAGCAAACTAATGTCTATGATTGTGGTCCATTTGTTGTAGATAATTTAATTAAAATGTCTCAAGGACAGCCTATACTTAGTACCGAAGAAGCCAAGCAACAAGCGCAAAACATTAGACAATCACAGGTAAATTTTCTTTCTGAAAATAGAATGATAACTAGTGCTGCTGCAGCTCTTGCAGATACATTATTGGAGAATAATAACAGAATTACCGAAGGTGTCTTAGTAGATAGGATTTTTGATAATAAAATTTTGTCTGTACAAGAAAAGCAACAACTACTTAATAATTTATTAGATAATCATATTAAAGAAAATAAATCTTTAACTAAAGAAAGTTTAACAAGAATGTTGGCTAGTACGCATTTTGTGCAGCAGCAAGCTAA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53 | Bacillus_phage(12.5%) | transposase,integrase | attL 2045275:2045295|attR 2082943:2082963 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_29 |
2135963 : 2175607
Sequences of DBSCAN-SWA_29
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_29 >LS398550|2135963:2175607|DBSCAN-SWA TCTAACTTATATGGAAATAAGTACGGTATTCTCTAAGGTATTCTAATACCATCAGCAACCGTTCCTCCAAATTGTGCTTATTTTCACGCACACCTTTTGATTTGTTAAGACCATCAAATTTCCTAAAAATATCCACCATCTTTGAAAATGTTCCCTTCCTTACTTCTGTTAATCGACGAAATTTTTCATCACCTAACCCTTTAATCTGATCTAATTTCATTATTACTTCAAATCAGATTTTTATAACACCATTTTACATCATTGTCTAGTTTCGAAAGAAGTCTAATATAGTATAGTTTCAAGAAAATATATATTTTGATTAATTAAGCAGAGAAATAAAAAGTAGAGTAGATGTATGAATGAAAGTTAGAGTAATAGATAATGCATGCAGAGATTTTAAAAATATAGATTATACAGAAGTATCAGCAAATAAAATAGGTTACAGATGGCAGATTTTTTTAGAGAAATAGATAAGAAAGTAATGCAAGTAATATGTACAGATTTTTCAAATGGTAATGAAATTCCAGTAAAGAAAAAAAACCGCACCGACCAAACCAACATCAAATAATTATAGTCAAAAAAACGTGAATCCAAGGTTAGAAGCTTTATTAAAGAATAAGCTTATACGCAATATGTGCTCCATAAAGAGCGCTGCTAAAAAATGAGTACTCATTAGCTGATTGAATGTTAAAAAAAGAAGTTTGTGCTAGCAAAATCAAAAAAACCATGCTAACTTAAAACTCAGGTGAGAATTGATGTTGAGATGGCGATACAGTTTGCAAGGATTGAATTTTTAAGTAGAAGTAAAGGAGGTGATAGTTGTCGTAAGGCAGCGTATAATGCAAGAACTATTGTTAAAAACGAAAAGACAAATATAAGATATAACTTCTCTCGTAAGAAAGATAACGTATATCATACAGTACTGATACCAGCTTATGTAAATCAAAAATTCAATAATATTCAAACATTAATGAATGAGGTGGAACGAACCGAAAAAAAAGGAAATAGTAAGTTGTTAAAGGATATAGTAATAGCATTGCCAGACGATAAGGAGTTGAATTTAGAAGATAGAATAAAGATTACACGAAATAGTTGATGCAATGGAATTGGTGCAAAATGGTCTTGGAGTGCAGATAGATATTCATAAGCCTCATACAGGAGATAAAAACTGGCATGCACATATATTGGTTACTACAAGAAGATTTAAAGAGAATGGTGAAGAATTGAGAGCTAAAGCTGTTGACTTAGAGCCTAAATTCAGAACAGTTAATGGCAAAAAGTTTGTTATTCAAGATTCCGAGATGATTCATGAAAAAGTAAAAGAAATAATTAATGCGTTTTTCGCTAAATTAGGCTTATCAAATAGAGTTGACGAGATAAGTGCAGTGCCGCAAAAGCATATTGGGCCTACTAGAATTAGAAGTTTAATTAATGAAGCAGCAAATGAAAATGAGTTACGTAAAGAGGCTAATTTAAAAATTATTAAGGATGCTGATGTAATAACGGATTCTATAACACATTACAAATCTATTTTTACTAAGCATGATATCGAAAAAGCTATAAAAGATATACCATATTCAGCAGAAGCAGAAAGGGAACTGTTAGTTCAGCAAGTGCTTAGTTCAAATAGAATACTAGAGTTATACCATGATGATGGTGAAAGTAGCAAATATTTTACGACAAGTGAGGTTCGAAATGAGGAGACGAGAATAATCAGAATAGCTAATAAAATCAATGATCAGGTTTATTACAACGATATTTACAATCTTAAAAGCGATATAGAAGGACTAACAAATGTTAGTGAAGAACAGAAACAAGCGCTAAGGCATATTTTTTGCTTAGCACTAGTGGAGTTAGAGTCTTAAGAGGAAGAGCTGGTACAGGAAAATCTTATGTTTTAGCAAAAGCGTATGAGCTTGCAACAAATCGTAGAAAAAAGTTATTGGCCTTGCTCCCACTCATAAGGCAGTATCAGAGCTGAAGAGCAAAGGTTATACAGATGTCTATACAGTAAAGGGATTTTTGTATAATCGAAAAAAAAATTTTTGTGCAAAATAGGTTAATAGTAGTAGATGAAGCTGGAATGGTAGGTACTAAAGCTTATGCAGAGCTATTTAGAGTAGTTAGAAACAATAATTGTCAACTGATACTCGCTGGGGATGAAAAGCAGTTAGCTTCAATAGAAAGAGGCGGAATGTTTGAGATGCTGAGTAATATTTTCGGTTCACATGTTTTAACAGATATTCGAAGACAAAGTGAAAACTGGAGCAGAGAGGTAGCAATGAAGTTTGCTGAGAGTAATATTTTAAGCGGTATAACCTTACTGAGGCAAAATAACTGCGTTAAGTTTGATAATACGTTGCAGGACTCAATGAGTAAGTTAATATACAACTGGAGTCTAAGCAAGTTTAAACCACATGAAAAATTGGTAATTACAGTACGTAATAAAGATGTCGACTAATTTTTTTCTATTGGTTCCATTCTTAATTGTTCTTGCGATTTCAGGTCCATATATAGGAGATTCTTGTTTAGAATTTTTATACCAATCTAGAACTTCAAGATTATTTGAATATCTTGCTAGTACGTTAGTATTATTTGGTAATAAGTACATACTATATATAGTTTTATCGCTCCTACCAATCTTAATATTTTGCATTTTTTGTATTTCTTGTTCACATCTTTGAGCTAATTCGTTTAAATTTGGTGAATTTTGTATAAAATTTGTATTCTGTGTAACAATTTTTGAGTTAATATCTTTACTAAAGTGTCTTTTACAGCATGAGTTATGAATAATTCAAGCACTTCTTTTTCATATGTATTTAATGCATTATTATTAATAATATCAATATAAAGATAGTCCTGTAATTCAATTTCAAGATTATTATGATTCAACAAAAGCTTTACACTGTCTATGTGACATCTGGCAGCAGCATAATGCAAAGCAGTATTTCCACAAATATCCTGTAAATTACTAATTTTAGAATTATACTTTAACAGTAACTTTATACTACCTATGTTACCATGCAAAGCAGCATAATGTAAAGCTGTACATTTATTCTGATTAAGTAAATTAATAACATCAGAACTATGCTTCAATAAAAGCTCTACAATATCTCATATCCAAAGGATTATGGGAACAATTGCTGCACAATATATTGACGAAGGCATAGCTAAAGGCAGAGCTGAAGCTGCACAAGAGCTTACAATGAACTTATTAAAAGCTGGCTTTTCAGTTGAATTTATTTCTGAAACTACTGGGTTATCAAAAGAAGAAGTGGTTAATGTAAAAAATAACATGGATTATTAACTTTTAAATTAATAATCCACTAACTTAAGTTTTTTGAGCAATGTATATCCCCAAACAAAAGCTATATTTAAGTTTTGTAGCTGCATAGTTAGTTTTGTGATGGGAAAGTTACCAGCAAGCTTTACATAACATGTAAGGTCTGGTAGATTCATAATTTCAGATGGCATAACTAAGAGCTTTTTACGCTCAACATTATTCATATTTACTCCATCTCGCATGGTATTTGAGCCATAGGACAAGTTTTCTTGAGTTTCAATTATCTCTTGCTCACCTAGTGTTAATGCTGATTTATAAGCTGTAACCTGGTCGCTAACTCGAAAAATAAATTTACTATTAAACAAATCAAGCATAGAAGCACATTCAGCAGAACCATATATTGCTTCTAATTGATGAATGTTCTGCAATCCAGCAACAAAGCAGCCTCCATACTTTCTACTTTCAGCTAAAGCAACTGGTAAAGACGAAACTTTTTGTAGAGCTGGCAGTTCATCGAGTATAAACCACATGTTTTTGTTATCATGATTAGGGTTTCTGTACATCAAAGCCTTGATAGCTATGCTTATCCATGCTGAAATAAGTGGGCATAAAGTAGCTTTTTGACTTGGGTTAGCTGTTATAAATAACCATCCAGTTTCAGCAGAATTACTAAACCATTTCTTAATGCTAAAACTACCTCCAGGCTTTAAATATTGTAGCGAAGTAATATTCTTTCCAAGAGTAGATTGAATTCCTGCAGAAGTTTCAAGTGCGCTTTCGCTTATAATACCTGATACAGCAGTGTTTCTAAAAGCTTTTGCAAATTGTCTATTATCAGAGTAAATGATTGTATGAATTAGTTTTATGATATCTTTATCATCCTTATATAGCTTCAACGCTTCAGACAAGACTAATTCAGCATTTTTAGTAAAAAAGTCATCAATTTTATGGGTATAATTACTAAAACTACTAGCTATATCATGAAAATCAGCTGCTTCAAAACAATCATTCCAAGGCAACCATTGCTCACTATTTTTTTCCAAAGGATTAAGCAGTTTATCGCATTTAGAATCAAAATTTGATCGATATCATAAAAATGTTCACCAATTGCTAACTTAAGCTACACATATCTTTCAATTACAAAATAATACAAACTGCTCAAAAAAAGTTTTTGATATAATCGACATATAATCCATAATATCGATAATCCTAACCCAATTGTAAAAACATTTGTACTACCTTGCCCAAACATTCTGAACTTATGGGCAAATAACTGCGATCCCCTAGTAAAATTACCTTGATTCTGAAAATTCATCTATCTCAAGAGTATTTTTTCAAAATCTGTAGTTTTTGCTCGTAGTCTTTTGCAATAGTAAAATTCTCAAATTCTGTTAACTTTTTAATTGTTAGTTTATATTCTTCTATAAGATTAGGCATATATTTAATAGCTAAGTTAAAATTCTCCTTAGCCTTTGAGTATTGTCCTAAACTTACTAATGAAATTCCTTTTTCAAGATAATTTTCAGCAAAATTAGGTTTGTACTTAATAGCTATATCATAATTTTCAATAGCCTCTTGAATGTAGCCTAACTTCATTAATACTGTACCTCTGTTATAATAAGCTTCTGGATTATCAGATCTGTACTTAATAGCAATGTTAAAATTTTCCATTGCTTCTTTATACTGTCCTAAATCATTCAAAGAAGCTCCTTTATTA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49 | Bordetella_phage(22.22%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_30 |
2185771 : 2229009
Sequences of DBSCAN-SWA_30
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_30 >LS398550|2185771:2229009|DBSCAN-SWA 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50 | Moraxella_phage(25.0%) | transposase,integrase | attL 2209273:2209332|attR 2229066:2229181 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_31 |
2239373 : 2290781
Sequences of DBSCAN-SWA_31
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_31 >LS398550|2239373:2290781|DBSCAN-SWA 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56 | Mannheimia_phage(33.33%) | tRNA,transposase,integrase | attL 2252690:2252706|attR 2290870:2290886 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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