Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483298 | Streptococcus pyogenes strain NCTC8225 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DEDDh,cas3,DinG,csa3 | 0 | 0 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483298_2 | 944506-944606 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483298_2
|
1 spacers
spacers of LS483298_2
>2.1|944529|55|LS483298|CRISPRCasFinder ATGTTTGACAAGACATTGTGGATATTATATACTGTAAACATAATGTTTTTATCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483298_2
The CRISPR arrays of LS483298_2 >merge|LS483298|2|944506-944606|CRISPRCasFinder TATAATTAGACTATACCAATTTTATGTTTGACAAGACATTGTGGATATTATATACTGTAAACATAATGTTTTTATCGGTATAATTAGACTATACCAATTAT >LS483298|2|2|944506-944606|CRISPRCasFinder TATAATTAGACTATACCAATTTT ATGTTTGACAAGACATTGTGGATATTATATACTGTAAACATAATGTTTTTATCGG TATAATTAGACTATACCAATTAT
>LS483298.1|SQE38614.1|943924_944482_+|signal-peptidase-I MVKRDFIRNILLLLIVIIGAILLRIFVFSTFKVSPETANTYLKSGDLVTIKKNIQPKYKDFVVYRVGKKDYVSRVIAVEGDSVTYMDDIFYLNNMVESQAYLEKMKAHYLNHAPFGTLYTDDFTVATITADKYQKVPKGKYLLLNDNRKNTNDSRRFGLINASQIKGLVTFRVLPLSDFGFVEVE >LS483298.1|SQE38613.1|942204_943707_+|pyruvate-kinase MNKRVKIVATLGPAVEIRGGKKYGEDGYWAGQLDVEESAKKIAELIEAGANVFRFNFSHGDHKEQGDRMATVRLAEEIARQKVGFLLDTKGPEMRTELFADDAKEFSYVTGEKIRVATTQGIQSTRDVIALNVAGSLDIYDEVEVGHTILIDDGKLGLKVIDKDIATRQFIVEVENDGIIAKQKGVNIPNTKIPFPALAERDNADIRFGLEQGLNFIAISFVRTAKDVEEVREICRETGNDHVQLFAKIENQQGIDNLDEIIEAADGIMIARGDMGIEVPFEMVPVFQKMIITKVNAAGKAVITATNMLETMTEKPRATRSEVSDVFNAVIDGTDATMLSGESANGKYPVESVRTMATIDRNAQTLLNEYGRLDSSAFPRTNKTDVIASAVKDATHSMDIKLVVTITETGNTARAISKFRPDADILAVTFDEKVQRALMINWGVIPVLAEKPASTDDMFEVAERVAVEAGLVQSGDNIVIVAGVPVGTGGTNTMRVRTVK >LS483298.1|SQE38612.1|941128_942142_+|6-phosphofructokinase MKRIAVLTSGGDAPGMNAAIRAVVRKAISEGMEVYGINRGYAGMVDGDIFPLGSKEVGDKISRGGTFLYSARYPEFAQLEGQLAGIEQLKKHGIEGVVVIGGDGSYHGAMRLTEHGFPAVGIPGTIDNDIAGTDYTIGFDTAVNTAVEAIDKLRDTSSSHGRTFVVEVMGRNAGDIALWAGIASGADQIIVPEEEFDIEKVASTIQYDFEHKGKNHHIIVLAEGVMSGEAFAQKLKEAGDKSDLRVTNLGHILRGGSPTARDRVIASWMGSHAVELLKEGKGGLAVGIHNEELVESPILGTAEEGALFSLTEEGKIIVNNPHKARLDFAALNRSLSQ >LS483298.1|SQE38611.1|937938_941049_+|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MFAQLDTKTVYSFMDSLIDLNHYFERAKQFGYHTIGIMDKDNLYGAYHFIKGCQKNGLQPVLGLEVEILYQERQVLLNLIAQNTQGYHQLLKISTAKMSGKLHMDYLCQHLEGIAVIIPSKGWSDTLVVPFDYYIGVDQYTDLSHMDSKRQLIPLRTVRYFAQDDMETLHMLHAIRDNLSLAETPVVESDQELTDCQQLTTFYQTHCPQALQNLEDLVSGIYYDFDTNLKLPHFNRDKSAKQELQELTEAGLKEKGLWKEPYQSRLLHELVIISDMGFDDYFLIVWDLLRFGRSKGYYMGMGRGSAAGSLVAYALNITGIDPVQHDLLFERFLNKERYSMPDIDIDLPDIYRSEFLRYVRNRYGSDHSAQIVTFSTFGPKQAIRDVFKRFGVPEYELTNLTKKIGFKDSLATVYEKSISFRQVINSRTEFQKAFAIAKRIEGNPRQTSIHAAGIVMSDDTLTNHIPLKSGDDMMITQYDAHAVEANGLLKMDFLGLRNLTFVQKMQEKVAKDYGCQIDIAAIDLEDPQTLALFAKGDTKGIFQFEQNGAINLLKRIKPQRFEEIVATTSLNRPGASDYTTNFIKRREGQEKIDLIDPVIAPILEPTYGIMLYQEQVMQIAQVYAGFTLGKADLLRRAMSKKNLQEMQKMEEDFIASAKHLGRAEETARGLFKRMEKFAGYGFNRSHAFAYSALAFQLAYFKAHYPAVFYDIMMNYSSSDYITDALESDFQVAQVTINSIPYTDKIEASKIYMGLKNIKGLPRDFAYWIIEQRPFNSVEDFLTRTPEKYQKKVFLEPLIKIGLFDCFEPNRKKILDNLDGLLVFVNELGSLFSDSSFSWVDAKDYSATEKYSLEQEIVGVGMSKHPLIDIAEKSTQTFTPISQLVKENEAVVLIQIDSIRIIRTKTSGQQMAFLSVNDTKKKLDVTLFPQEYAIYKDQLKEGEFYYLKGRIKERDHRLQMVCQQVQMAISQKYWLLVENHQFDSQISEILGAFPGTTPVVIHYQKNKETIALTKIQVHVTENLKEKLRPFVLKTVFR >LS483298.1|SQE38610.1|937382_937754_-|GntR-family-transcriptional-regulator MSWKFDEKSPIYAQIAQYVMMQIISQEIKSGDQLPTVREYAEIAGVNPNTMQRAFTELEREGMVYSQRTAGRFVTDDQKLIARKRRELAISELESFITNMTKMGFSHTEIIPVLTSFLKEDSQ >LS483298.1|SQE38609.1|936684_937383_-|ABC-transporter-family-protein MAHLLQLHHVSKSYREKKAIDDLTITIPNGKIIGLLGPNGSGKTTLIKLINGLLQPNKGEIVIDGYRPCVETKKIISYLPDTTYLNENMRIKDMLEFFSDFYSDFDKSKATSLLRDLELDPEDRFKTLSKGNKEKVQLILVMSRKARLYVLDEPIGGVDPAARDYILKTIINSYCENASVIISTHLISDIEPILDEVIFLKQGRLFLSGNADDLRQEYQQSIDSLFRETYKV >LS483298.1|SQE38608.1|935889_936675_-|ABC-transporter-permease-protein MFGKLLKYEFRSIGKWYFALNAFVIAIAAILSFTIKLFAQSNSDGLFGVLTNKMLPLTLGLTFGSLIAGSLLSTLLIIIKRFSKSVFGREGYLTLTLPVNSHQIILSKLLASFICSVFNTIILAFAIAIVIVPMFNINELLEGFFNSFKMDYFINMLTVLAYVLLSTFTSILLIYLSISIGQLFSNRRGLMAFIAYFILVILISVAATYVHSHIFNINTSADSFPFTEQKTIYLLILEQFIEMIMFYLATNFIIKNKLNLQ >LS483298.1|SQE38607.1|935144_935759_+|membrane-protein MTKRNSKAYILWQKIIKILGIIALIGTFFLAFWLYRLGILNDSNALKDLVQRYRLWGPFVFIVVQIIQIVFPVIPGGLTTVAGFLIFGPVTGFIYNYVGIIIGSIVLFLLVKTYGRKFILLFVNDKTFYKYERRLETPGYEKLFIFCMASPVSPADIMVMITGLTDMSLKRFVTILLITKPISIIGYSYLFIFGKDVISWFLQH >LS483298.1|SQE38606.1|934365_934554_+|paratox MLTYDEFKQAIDRGYITGDTVMIVRKNGQIFDYVLPHEKVKNGEVVTEEIVEEVMVELDYIK >LS483298.1|SQE38605.1|933327_934128_-|streptodornase MSKSNRRTWQGLVVILIAILTTFTTSTVTAARKIRNFPDTTEILLGTKATETPGILPFTGSYQLVLGDLDNLQRPTFAHIQLKDQDEPNIKRKGLKFNPPGWHNYKLTDANGKTTWLMDRGHLVGYQFSGLNDEPKNLVTMTKYLNTGFSDKNPLGMLYYENRLDSWLALHPNFWLDYKVTPVYHKNELVPRQVVLQYVGIDENGDLLQIKLGSEKESVDNFGVTSVTLDNVSPLAELDYQTGMMLDSTQNEEDSNLETEEFEEAA >LS483298.1|SQE38615.1|944657_946472_+|glucosamine-fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKALSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSRESTYTMLIHAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLTTTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >LS483298.1|SQE38616.1|946667_947003_+|phosphonoacetate-hydrolase MSLPNCLQCQSEYVYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVFDSNGVRLSDGDTITVIKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >LS483298.1|SQE38617.1|947109_947751_+|histidine-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKVPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTAANRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >LS483298.1|SQE38618.1|947760_948390_+|histidine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKADAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >LS483298.1|SQE38619.1|948405_949242_+|polar-amino-acid-ABC-uptake-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKSLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGKCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKERQNKVAFTDSYMRNEQIIVVKKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVATANIKS >LS483298.1|SQE38620.1|949610_950384_+|protein-B MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANLQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIEATVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDMGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKSFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQNALETALKS >LS483298.1|SQE38621.1|950753_951989_-|cation-diffusion-facilitator-transporter-family-protein MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLLLSAAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVAVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMILEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLVDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQHTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKRQLHHTHYRIVKM >LS483298.1|SQE38622.1|952108_953431_-|amino-acid-symporter MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGIYLTSRLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYAEGVLAIKYRTKDANGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFAGSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQMVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLAVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNESVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFILMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >LS483298.1|SQE38623.1|953959_956278_+|DNA-helicase-II-/-ATP-dependent-DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALSLNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLIKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANSLGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTGYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEAAEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPFGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >LS483298.1|SQE38624.1|956639_956888_+|transglycosylase-associated-family-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
36589 : 48952
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483298|36589:48952|DBSCAN-SWA GATGTCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGACTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGCCTTGTAAAAGAGTTGACACATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGACTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTACTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACCGTCTTTTGACGGAAGCTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTATTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAACCCTGTTGATTCGCGTTTCAAGGACATTACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTATCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAAATTATAAAGCTGACGATTTTGCGGCCTATAAGGCAGATCAGGGCTTGGCTATGGAGATCGATGACCTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGACGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAATTGAAGAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGACAACTTATGACAAATATATCGCCATGCGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAAACACTTATGGATATGGCGACTATTTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAACGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTGAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAACGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTCGGTGGAGCGGCGACTTGTATCGGTGGTGCTATTCGTGACCCATTGTCAGGGCGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATCACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTTCCACAACAAGTTATTTCTAAAACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGTGATGTGGTAATCTTGCTTGGTGGTAAAACAGGGCGTGATGGTGTCGGCGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCAGGAGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATCGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTGATCAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCTATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTCCCACTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCAAGTGATGTGGATGCCTTCATCGCAGCTTGCAACAAGGAAAATATCGATGCCGTTGTAGTTGCGACAGTTACCGAGAAACCGAATCTTGTCATGACTTGGAATGGTGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTATTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCACGCTAGTCAAAAAGGTCTTCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGCTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGTTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGTATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTACTTTGAGCGTATGGATAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGTTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGACTTGACAGTACCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGTGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGATTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGCGAAAACATTTACTATATCCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGATCTTATCAAGGCTAACTTTAGCCAGTTTGAGGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACAGCTGCCTCAGCCGCTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGTTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACGCGGTGAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGCGCTAGCCTTCTAGCAGCCTTCGAAGGCAAATTTGAAGAGGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCTGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAGTATGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGATTGCTATTGCTGAGTCAGTTGACACTATGGTTGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGCTTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACGAGAAGGTCCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATTGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCGAACCAACACGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATGCCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCACGCCATTCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAATGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGACACTCAGAACGCTGGGAAGACGGACTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAACCCTCTTTGCAAGTGCTGTAAAATACTTTACAGGGAAGTAAAAAGGTTCAGTGAACCTTTTTAGCCTTCGCCTTGAAGTAGTGAAGGGCGAGGTTAGAAAGAATCTCGCTTGATTTTTGAGAAATAGTAAACACGGGCGATAAGTTGTGCGAAAAACTTTCTATTTTCGCTTTACTTGACAGCCTTTGTATCGAGGTAAAAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGGCATCCTCATGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGAGCTGGTATTGTTTCAAATGACAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGGCTTCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCCTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTAATGCATTTGATTCGTCGAAGCCATAACTCAAATTTCATGGGAAAGGTAAAAGAAGCTCTAAATACAGTAAAGGGTGGCTTTGCCTATCTACTGATGACAGAAAATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTATTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGAATTAAGGGAACAAGGTGTTCGAATGAAACTATCAGCGGTATCTGGTGTTGTCAAAGGAAAGCGCGTTGTTATG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ATGGCATAGTAGGTACTAGACCATTAAAACCTAAAAGGATTACTCCTGAGACCAAAAAACGATGAAATTTTTTCATTAATTACCTCCTGTAACTTATTATTCGAAAGCAAGAAACAAAAAATGTTATTTTTAGATGATTATTTTGAAAATTGGCTTTACTTGATATTAAATAACTGTTTGATTGGCTAATAGAGTGTTCCTTATTTCAAGAATTGTGGTCTACTATCACATTTTTACAATGTTTCAATTATTGATAATTAATACATTGTATAAAAAGGCGAACGTTTATGATATAATATCTAATTATAATACGAAAGAGGTGGATGTTTTGAAATTACTTGTTGTTGGTTCAGGTGGTCGTGAACATGCGATTGCTAAGAAGTTGTTAGCGTCTAAGGGTGTGGATCAGGTTTTTGTGGCACCTGGTAATGATGGTATGACCTTGGATGGTCTGGACTTGGTGAATATAGTAGTTTCCGAACATTCCAGGTTGATTGCCTTTGCTAAGGAGAATGAGATTTCTTGGGCCTTTATTGGTCCTGATGATGCGCTAGCAGCTGGTATCGTTGATGATTTCAACAGTGCTGGACTCAGAGCTTTTGGTCCAACCAAGGCAGCAGCGGAGCTAGAGTGGTCAAAAGACTTTGCCAAGGAAATCATGGTCAAATACAATGTCCCAACAGGAGCCTATGGCACATTTTCAGACTTTGAAAAAGCCAAAGCCTACATCGAAGAGCAGGGCGCACCTATCGTGGTCAAGGCTGATGGCTTGGCGCTAGGTAAGGGTGTGGTCGTGGCTGAAACCGTTGAGCAGGCGGTAGAGGCGGCGCAAGAGATGCTTCTGGACAATAAGTTTGGCGATTCAGGAGCGCGTGTGGTTATCGAGGAATTCTTGGATGGCGAGGAGTTTTCCCTCTTTGCCTTTGTTAATGGTGATAAGTTCTACATCATGCCGACAGCTCAGGATCACAAGCGTGCCTTTGACGGAGACAAGGGGCCAAACACTGGTGGTATGGGTGCCTATGCGCCAGTTCCTCATCTACCTCAGAGCGTGGTGGATACAGCGGTTGAGACGATCGTTAGGCCTGTCCTTGAGGGTATGATTGCCGAAGGGCGTCCTTATCTAGGCGTCCTCTATGCGGGGCTTATCCTGACGGCTGATGGTCCTAAGGTTATCGAGTTCAACTCACGTTTCGGTGACCCTGAAACTCAGATTATCCTCCCTCGCCTGACTTCCGATTTCGCTCAGAATATTGACGATATCATGATGGGCATTGAGCCTTACATCACTTGGCAGAATGACGGTGTGACTTTGGGTGTTGTCGTTGCCTCAGAAGGCTATCCGCTCGATTACGAGAAAGGTGTGCCACTGCCTGAAAAGACCGACGGCGATATCATCACCTACTATGCCGGAGCTAAGTTTGCGGAAAATAGCGAGCTACTTCTCTCAAACGGAGGACGTGTCTATATGCTCGTCACCACAGAAGACAGCGTCAAAGCAGGGCAGGACAAAATCTATACCCAACTGGCCCAACAAGACACAACAGGTCTCTTCTACCGAAATGACATCGGAAGCAAAGCTATAAGAGAATAAGACTAATCATTCAAATATTAGCGTCAGCAATCAGCGACCGAAGGTCGCTCCAAAAAGAAAGAAGAAAGGAACTGAACACGGGACTAATTTCCTAGGAAAAAAGATAAAACTACCTGGACGCAAGCGTCATCGTTAGTTTTCTGCGTCGTAGGCGTCTGATGCTAAAGCACCTAGTCGCCCTGACGTAGGTTCGTCTTCGAAATCAAAGATTTCGGACTTACCGCATATTTTTCTACGGAAAGTTTCGACAAGTCGAAACGCCCCTTTGTATCTTAATTATGAAAACTCCAATTATTTCTATTATCATGGGCTCCAAATCTGACTGGGCAACCATGCAAAAAACGGCTGAAGTTCTAGACAACTTTGGCATTGCTTACGAGAAGAAAGTCGTCTCTGCTCACCGCACGCCCGACCTCATGTTCAAGTATGCTGAGGAAGCACGTGGTCGTGGCATCAAAATCATCATCGCAGGAGCAGGTGGGGCAGCTCACTTGCCTGGTATGGTGGCAGCTAAAACAACGCTGCCTGTTATCGGTGTGCCTGTCAAATCACGTGCCCTTTCAGGTTTGGATTCACTCTATTCGATTGTGCAGATGCCTGGCGGTGTGCCTGTGGCAACCATGGCTATCGGAGAAGCGGGAGCGACTAACGCTGCCCTGACAGCCCTCCGTATTCTCTCCATCGAGGATCAAAATCTGGCTGATGCGCTAGCTCACTTCCATGAGGAACAAGGAAAAATCGCAGAGGAGTCAAGTGGTGAACTCATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483298|36589:48952|45947_46664_-|SQE37698.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGG >LS483298|36589:48952|36589_40363_+|SQE37692.1|DBSCAN-SWA MSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDRLLTEAEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKADQGLAMEIDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKFPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPSDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVIDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTVSVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEDLTVPPTLVAFGVTTADSRKILSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKFEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEIAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANANSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK >LS483298|36589:48952|42005_43028_+|SQE37694.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGVLGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYVATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVNGIGHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADASVVIK >LS483298|36589:48952|46826_48182_+|SQE37699.1|DBSCAN-SWA MFQLLIINTLYKKANVYDIISNYNTKEVDVLKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTGAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFVNGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVETIVRPVLEGMIAEGRPYLGVLYAGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQNDGVTLGVVVASEGYPLDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGAKFAENSELLLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDTTGLFYRNDIGSKAIRE >LS483298|36589:48952|45539_45878_-|SQE37697.1|DBSCAN-SWA MVQNENTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGDQILRVGEYFTVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL >LS483298|36589:48952|40523_41978_+|SQE37693.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPHAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSNFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTENKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >LS483298|36589:48952|48460_48952_+|SQE37700.1|DBSCAN-SWA MKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKYAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVIGVPVKSRALSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >LS483298|36589:48952|43933_45481_+|SQE37696.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDNAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSILRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKIFRHTAAYDALIAEYFTTQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPIDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDSPTVVVLKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQTQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >LS483298|36589:48952|43195_43750_+|SQE37695.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI |
9 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
96129 : 106253
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483298|96129:106253|DBSCAN-SWA TCTAAAAAGGTAATTCATACTTATAGTCATCAATTTTTGAACTAACTACAATCTGAATGTTTTCATTCAAAAGCTGATCAACATGCCCTGAAGAATTTTTTGCAAAAACAAATTCTTCTTTAAATTCTTTTATTATGTACTCTTTTATATTTTTACCAACAATTTGAAGCAACTCATTTGTAAAAATATTTTGAAAATTGGTAGGTAAGTTAGTGAACTTATCATAAATTTCTTTATTTTGTTTTTCCAAAGAAGCTTTTACGGTAACGACTTCTACTTGCTGATAATTACGTTTAATTTCTTCAATATCAACAGGATTGTCAGGCTTATTAGTATTGATATGAAATTCAAACTCAACTTTATACTCTAGAGTAGCAACTGGTATATCTCTATCTAAAATTTTTATGAATGTAAATATGTTTCCGCTATCTTCGTCGCTAAAATATTTTATTTCATAATCTATTGGCGAATAATCAAAAAAATCATCTGAGGTAATACCTAGAGTGTTACAAATTTTATTTACCGTTTCATAATCAACTTGTTTTGATTTATTTGAAGTAATTTTAGAAATTGTTGATTGTGCAATCCCTGTATCACTTGCTAAACGTGCGCCACTCATTGACCTTTCAGCTAATAATATAGCCAATCTATTTATTAACATTATTACACCTCTTTTTTTATTTATTATAGCGCACACGCTAATAAAAGTAAAACATAAAATAATAATTTGAGTGTTGACAATATATTTTGTATGGTGTATTATTTTATTAAATTAGTCATTACGCTATATTGATTAGTTGATAAAAAATAATAAGGAGCGGTTATGCTAAAGAATAATTTATTGATTGTTTTTGCTGAAAAAAAGACCAAAGCTAGCAAAGTTTCTAAAGAAACAGGTATAGCGGAATCTACAATTTCAAACTTAGCAAACAACAAAACTGATGTGAAACTTTCTACTCTTATCAAACTTTGTAATGCTTTGAAAGTTCGTCTATCTGATTTAATTGAATTTTCGCCAGAGTAATAATAAAGGAGCAATCTATGGACAAAGCAGAAACATGGAACGGATATACTATCCGATTTGTAGAGCACCAAGGCGAATGGTGGGCGGTGCTAGCTGATATTGCTAAAGCACTAGAACTGAATCCAAAATTTATTAAACAACGTTTGGGAGATGAGGTTGTTTCAAACAACCACGTCACAGACAGTTTAGGGCGTCAACAAGAAATGTTAATCGTTAATGAGTTTGGCATTTATGAAACTATCTTCTCGAGCCGTAAGAAGGAAGCCAAAACCTTTAAATTATGGGTATTTGAAACCATTAAACAGTTAAGACAAAGCACAGGCCTAGAGGGCTTCCAAGTATTTAGAATGTTTGATAAAGAACATCAGAAGCAGGCAATGAATAGGCTTGTCAATGGCTTACAAAATGCAACTAAGAAAGACCTTATCAAAGCAAACACTATCGCAAACAAAGCCGTTTCTGACCTATATGGTTATCCTAAGATGGTTAGTAAAAACGAGATGACAGAAAACATGTTGCGAGACCGTGAGCCTATCCTTGATGAAACGGTTGAACTAATCAAGGTTAAAGAAAAATACGGCTTAAATTTTAGCGTATCTGAAGCTATCTATAACCAAAACACAATAAAAAAAGCGCAGTGATGCGCGTGGATAAAGGAGAAATGATTATGAAAGCAACAACTTACAAAGAGTTGAAGAAATGGATTGATGAAGGTGTTGATTTAGCTGAGCTAGCACAGGGTTACGCTGACAAAGTACCAAATGCAGATCGCGAACAGTTTGAAGCAATCACACAGGAAATTTTCAACGTATTGGAAGGCGTATCGCTCATGCTTGATGACAAAGTGCTAATCTATAATCGCAAAGCAGAGCAAAAGCGTTTGAATGACATTGAACAAGGCAATTATTAATCAATAATCAAGAGCAACAAAAAAAGGCTTTGACAGCGACCAAACTTCCAAGCCTTCAACTAGTATAACTAAACTCAATTAATAAAGCAGGCAAGCTATTATTAAAGGGGTTTTATATCTTAAATTATAGCATATTGAAGCTATTTTGACCATACGTAGGGAGCTACCCCTTAAAACTAGCATGAATCTAGTATAAGAAACAAGCAACTACACAGAAAATAAGAATTAATAAGGAAGATAAAATGACATCAGTTAGAACCGCACAATTACTTAACAATGGTTTAGGATTGGTTGGCCAAGACCTAAAAGACGTCTTATCAGCTCTAGCCAATAGCGTCAATCCAAGTATTGAAAAACAGATTTCTCACATCATGATAGATAGAGCTAATACTGGCGAATGGTTGGCAAATGTAGGCAAAAAATGAGGTAAAACATAATGAAATATAGAGTAGAAACAAATCCTTTTTCAAAAGATAGATACACTCCTGAACAGCTAGAAATGTTCAAAAATCGCCAACTCAGCAAAGATAAAGCTGAAGTCTATTTCACTCGACTATATAACCAACATATTGCTTGGGTAATTATTGCTAACGTTATGACAGAATACGTCATTAAATTCAGAAAAAGTGCTACCAGCTTTGAAGAAGCATGGGACGCTTTAGACTATCAACGAACCACAGAGATTGTCTTTAGAGCCGTTAACGGTTTACCTTGTTCAGAGAAAGACTCAGGGGAGCTAGAAACTTATTTAAGTGAGGTATCGGCATGAGGAGTATTGAAGAATTAAAAGCGATTGCTGAATATATTTTGGAACGCATGACGGATAGTGGAAAAGCCCATTTTCCTAACATGACAAGAGAAGAAATAAAAGGATTGATAATTAAATATGACAGTTCAAGAACTTAACCTCACACCAACACAGACGCTTATTCTATTCTTTGTTTTAGGTCTCTTAGGGCTTCTTCTTAGCCGTTCTAAGTCATTAATAGACATTGATTTACCAGAAGATACCCAAGTCCCTAAACCACGTCAGAACGCAAACTATGGGGCTTATATTCAATCACAGAACCATTATTACAATTAGGGAGGAACTGAATGACACTACCAGAGAATTATAGACGTGTCCTTAATCTGATCAAGGTTGGAGCAGACAACCCCATTACAGGGGCAGAGATTAGCTTAATACTGAAACTTGAAGAACGCTCCGTCCAAAGTATCATCAGTAGCTTAATCACGCGCTATAACGTCCCTATTATCGGCATTAGACACGGATTCAATCGTGGGTACTTTATCCCAGCTAACAAAGAAGAATTACTAGATGGTGCTAAAGCCTTTTATAATCAAGTACAAAAGGAACAGGAACGCCTAAGTGTGTTATTGAATGCCGATTTAACCAGTTATAAGGAATTACTCAAAGGAGGTTAGGCATGAACGTATTTAGTCAAGATTATGAAGCCAAACTCTTAGAACAAAACCTGACCGCTTTTAATCGCTTTTTGGAAGCCTACCAGAAACCTAAACCAAGAGTTTTAGGGTTGATCACGGCCGAACAAGTCAAAGAGGAATTAAATATCAAAGGTAAAACCCTAAAACGGTGGGAAAATGCTGGGTTAAGACGATACCAACCACCACTAGAAGACACCAGGAAACATTATTACAAGGTCAGTGATATTCTTATCTTTTTGGGGGTAAATGTGTAGATGGCTATTTATGAAGCAAGAGGCTTTAGCTCTTATTTGTACCCCTACAAAGGACCTTTAGAACCATTTGACTATATTGCTCAGTTTAGACCTTTGAAACCGCCTGAGGATATTGATATTGAAGAATACAAGCGAACACAAGCCCCCTACTGCCTAAGTGGCAAGGTCACAGCAGAGAAAAACGGTAGCTATAAGCGCAATAATGCTAGTTTAGTTTATCGCGATTTGATTTTTCTTGACTATGACGAGATAGAAACAGGCGTCAACCTACCTAAAATCGTTTCTCAGACGCTTTGGGAGTATAGTTATATTATTTATCCAACGATTAAACACACCCCCGAGAAGCCCCGTTATCGCCTTGTCATGAAGCCTAGTGACGTGATGACTGAAGCAACTTATAAACAAGTGGTCAAGGAGATAGCCGATAAGATTGGACTGCCTTTTGATTTAGCTAGTCTTACCTGGTCGCAATTACAAGGCTTACCCGTTACAACAGGCGACCCAGAGGACTATCAGCGCTATGTGAACCATGGTCTTGATTATCCTGTTCCTAAAAATGGTAGCACGCCAAACAGACAAGTTGTTACTACTTACACGCCACGCCCTAGAAGTCAGCGTTCTATTACCATGAGGGTCATAGATACCTTGTTTAATGGTTTTGGAAACGAAGGCGGGCGCAACGTGGCTTTAACTAAATTTGTTGGCTTGCTATTTAATAAATGGGTGGATTGTGATTTAGAGACGGCTTATGAGCTGGTACAAATAGCTAACAGCGTGACAACTAAGCCACTACCCATTGATGAGATAGATACAACCTTTAGAAGTATACTTGATAAAGAATTAAGAAAGAGAGGAATCAAGCCATAGACAAAGAAGAATTGAAAGACTATCAAAATAAACTATCGCAAGCCACTCAACCTGCTTTTGCCCCTGCTTTCAGGACACGAAAAGGTAGAGGAGACAAAGAATATGTCATTAGTAGCCCCTACAATGTCGGTAAGGTTTTTGAATTTTACGAAAATATCTATACAGGTATTAAATACAACGAATTTGAAAAAACTATTGAAATCACTAAAGCAGTTCCTTGGTCTAAAGAAAAAGGGCTATGGACGAACGAGCAGACCAGCCTTTGTATTGCATTCATTGATGAAAAATATCGGTTTACCCCTCGTAAAGAACATATAGAGGTAGCTATTACCGCTTTAGCTAAAAAGAACACTTATCACCCCATTAAACAGCGTATTGAAAGTCAAAAATGGGATGGTAAAGCTAGAGGAGAACGCTACTTTATTGATCTATTAGGCTGTGCTGATAATTCCTATAATAGAGAAATTGCCAAAGTATGGCTAACAGGTCTCATGGCTAG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TCAGCGGTTGGATCATAACCGGTATAATAGGATACTTGCCCTTCTGTTAATGCTTTGACAAGGGCTTGTTCATCAGTCGTTTGAAAGACCAAGCCACGAGCTTTGAGTTCTTCAAAAATATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483298|96129:106253|97169_97793_+|SQE37756.1|DBSCAN-SWA MDKAETWNGYTIRFVEHQGEWWAVLADIAKALELNPKFIKQRLGDEVVSNNHVTDSLGRQQEMLIVNEFGIYETIFSSRKKEAKTFKLWVFETIKQLRQSTGLEGFQVFRMFDKEHQKQAMNRLVNGLQNATKKDLIKANTIANKAVSDLYGYPKMVSKNEMTENMLRDREPILDETVELIKVKEKYGLNFSVSEAIYNQNTIKKAQ >LS483298|96129:106253|104225_104372_+|SQE37771.1|DBSCAN-SWA MSKKNAIRKLKEFHRWQRIANSLDLSYNERYQFDIEYHPTRRKHLEIS >LS483298|96129:106253|96951_97152_+|SQE37755.1|DBSCAN-SWA MLKNNLLIVFAEKKTKASKVSKETGIAESTISNLANNKTDVKLSTLIKLCNALKVRLSDLIEFSPE >LS483298|96129:106253|102578_102752_+|SQE37767.1|DBSCAN-SWA MKIKLFYQKHKESLDDFEYRVNLFTLSVSVIDIKFQEATYGNYEDMDSRTGLLVLYR >LS483298|96129:106253|102327_102582_+|SQE37766.1|DBSCAN-SWA MNPNYTNHGVKKMRYNYDDLPNDQLYRLELPNGQCGYDFITKINFNTKSRPGDCDFTRPELIRRGYRWVFDCGFAIPVEKGAKT >LS483298|96129:106253|103013_103502_+|SQE37769.1|DBSCAN-SWA MLELAIESIIKPMKTQGKTRVTGTIGDQPITIDLDNLVIHYNHQDLLLETIPGTYGGKRYFFLCPDCEKRCRKLFKISHDFACGSCQKVHQATLNRSKTDCQYYWRLAFRECLKVDPKARHKHGYYSHDDFPKRPKYMRIAKYLYHWKRFHYYMDKGDRYWL >LS483298|96129:106253|103888_104251_+|SQE37770.1|DBSCAN-SWA MGAKEQLKELKPLFALMTLFEEQRDKDIKLMNAFRNPELLNGIEKGTAKQLLYLAKERDKRLAMIATLQDERQIAVIKARYVDDLSWDEIPDKLGYSRNTVFKLHREALEVLDEQEERYS >LS483298|96129:106253|97792_98062_+|SQE37757.1|DBSCAN-SWA MRVDKGEMIMKATTYKELKKWIDEGVDLAELAQGYADKVPNADREQFEAITQEIFNVLEGVSLMLDDKVLIYNRKAEQKRLNDIEQGNY >LS483298|96129:106253|99762_100629_+|SQE37764.1|DBSCAN-SWA MAIYEARGFSSYLYPYKGPLEPFDYIAQFRPLKPPEDIDIEEYKRTQAPYCLSGKVTAEKNGSYKRNNASLVYRDLIFLDYDEIETGVNLPKIVSQTLWEYSYIIYPTIKHTPEKPRYRLVMKPSDVMTEATYKQVVKEIADKIGLPFDLASLTWSQLQGLPVTTGDPEDYQRYVNHGLDYPVPKNGSTPNRQVVTTYTPRPRSQRSITMRVIDTLFNGFGNEGGRNVALTKFVGLLFNKWVDCDLETAYELVQIANSVTTKPLPIDEIDTTFRSILDKELRKRGIKP >LS483298|96129:106253|96129_96789_-|SQE37754.1|DBSCAN-SWA MLINRLAILLAERSMSGARLASDTGIAQSTISKITSNKSKQVDYETVNKICNTLGITSDDFFDYSPIDYEIKYFSDEDSGNIFTFIKILDRDIPVATLEYKVEFEFHINTNKPDNPVDIEEIKRNYQQVEVVTVKASLEKQNKEIYDKFTNLPTNFQNIFTNELLQIVGKNIKEYIIKEFKEEFVFAKNSSGHVDQLLNENIQIVVSSKIDDYKYELPF >LS483298|96129:106253|99489_99762_+|SQE37763.1|DBSCAN-SWA MNVFSQDYEAKLLEQNLTAFNRFLEAYQKPKPRVLGLITAEQVKEELNIKGKTLKRWENAGLRRYQPPLEDTRKHYYKVSDILIFLGVNV >LS483298|96129:106253|98304_98487_+|SQE37758.1|DBSCAN-SWA MTSVRTAQLLNNGLGLVGQDLKDVLSALANSVNPSIEKQISHIMIDRANTGEWLANVGKK >LS483298|96129:106253|104993_106253_-|SQE37772.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIFEELKARGLVFQTTDEQALVKALTEGQVSYYTGYDPTADSLHLGHLVAILTSRRLQLAGHKPYALVGGATGLIGDPSFKDAERSLQTKETVLEWSDKIKGQLSTFLDFENGDNKAELVNNYDWFSQISFIDFLRDVGKYFTVNYMMSKDSVKKRIETGISYTEFAYQIMQGYDFYELNDKHNVTLQIGGSDQWGNMTAGTELLRKKADKTGHVMTVPLITDSTGKKFGKSEGNAVWLDADKTSPYEMYQFWLNVMDDDAVRFLKIFTFLSLDEIAEIETQFNAARHERLAQKTLAREVVTLVHGEEVYKQALNITEQLFAGNIKNLSANELKQGLSNVPNYHVQSEDSLNLVDMLVTAGISPSKRQAREDVQNGAIYINGDRVQDLDYQLSNDDKIDDQLTVIRRGKKKYAVLKFN >LS483298|96129:106253|100640_102035_+|SQE37765.1|DBSCAN-SWA MKDYQNKLSQATQPAFAPAFRTRKGRGDKEYVISSPYNVGKVFEFYENIYTGIKYNEFEKTIEITKAVPWSKEKGLWTNEQTSLCIAFIDEKYRFTPRKEHIEVAITALAKKNTYHPIKQRIESQKWDGKARGERYFIDLLGCADNSYNREIAKVWLTGLMARIYLRKVKFEVVPILIDKRQGTGKSTVTKRLLPNYHTDSEIKFGKNDSDYQKIQANAIIELGELKGMSKAEIETVKSFISSDSDTYREPYERKATPHPRHCVFIGTANKKSFLKDSGTERRFFPIECGINDVKKHPMEVEEDYFLQVLAEAKVWFNNYEPLTPSKELMNQLADIQEDYKVEDVDKEIIDQLLNEFQIVEGWDSLSQYEQRQYVLKQLGEPLDNAQSYSDYPSAQTDCLLQVTSPNHIAYLGFNQKPTQGGKALISQKIRDYLDNDDGWKKGENPTRKRLFKGGTPVSYYERV >LS483298|96129:106253|98498_98831_+|SQE37759.1|DBSCAN-SWA MKYRVETNPFSKDRYTPEQLEMFKNRQLSKDKAEVYFTRLYNQHIAWVIIANVMTEYVIKFRKSATSFEEAWDALDYQRTTEIVFRAVNGLPCSEKDSGELETYLSEVSA >LS483298|96129:106253|98827_98968_+|SQE37760.1|DBSCAN-SWA MRSIEELKAIAEYILERMTDSGKAHFPNMTREEIKGLIIKYDSSRT >LS483298|96129:106253|99157_99487_+|SQE37762.1|DBSCAN-SWA MTLPENYRRVLNLIKVGADNPITGAEISLILKLEERSVQSIISSLITRYNVPIIGIRHGFNRGYFIPANKEELLDGAKAFYNQVQKEQERLSVLLNADLTSYKELLKGG >LS483298|96129:106253|98948_99146_+|SQE37761.1|DBSCAN-SWA MTVQELNLTPTQTLILFFVLGLLGLLLSRSKSLIDIDLPEDTQVPKPRQNANYGAYIQSQNHYYN >LS483298|96129:106253|102757_102940_+|SQE37768.1|DBSCAN-SWA MKLKLHTLMAFISYHDQQAEHLSMNYQEMNQDDLGAILETISQAFNHLYDMVVEGQLLVK |
19 | Streptococcus_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
192610 : 236073
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483298|192610:236073|DBSCAN-SWA CATGACAGATTATCCGATTAAGTATCGCCTTATCAAAACAGAAAAGCACACCGGTGCACGCTTGGGCGAAATTATCACACCTCACGGGACCTTTCCGACACCAATGTTTATGCCAGTGGGAACTCAGGCTACTGTTAAAACACAGTCTCCAGAAGAGTTAAAAGCTATTGGGTCAGGGATTATTTTATCAAACACTTATCACCTCTGGTTGCGTCCAGGAGATGAGTTGATTGCTCGCTCTGGTGGTCTGCACAAGTTTATGAACTGGGATCAGCCAATCTTAACCGATTCGGGTGGTTTTCAAGTTTACTCTTTAGCCGATTCACGAAACATCACTGAAGAAGGAGTGACTTTCAAAAATCACTTGAATGGCTCAAAAATGTTTCTATCACCCGAAAAAGCCATTTCCATTCAGAATAACCTTGGCTCAGACATCATGATGAGTTTTGACGAGTGCCCGCAATTTTACCAACCTTATGATTACGTGAAAAAATCCATTGAACGTACTAGCCGTTGGGCAGAACGTGGCTTAAAAGCCCATCGTCGTCCTCATGACCAAGGATTATTTGGAATTGTACAAGGAGCTGGATTTGAGGACCTTCGTCGTCAGTCTGCGGCAGATTTGGTGGCTATGGATTTCCCAGGTTATTCTATTGGTGGTTTAGCTGTTGGGGAGAGCCATGAAGAAATGAATGCCGTCCTTGACTTTACGACTCCCCTCTTACCAGAAAATAAACCTCGTTACCTGATGGGAGTGGGAGCACCAGATAGCTTGATTGATGGTGTGATTCGTGGTGTAGATATGTTTGACTGTGTCTTGCCAACGCGTATCGCCCGTAACGGAACTTGCATGACTAGTGAGGGGCGTCTTGTGATTAAAAATGCCAAATTCGCTGAAGATTTTACCCCACTTGATCATGACTGTGACTGCTACACTTGTCAAAACTATAGCCGTGCCTACATTCGTCACTTGCTAAAAGCGGACGAAACTTTTGGTATTCGTTTGACAAGCTACCACAACCTTTATTTCTTGGTTAACTTGATGAAAAAAGTACGTCAGGCTATTATGGACGATAACTTACTTGAATTCCGCCAAGATTTTCTTGAACGGTATGGTTATAATAAATCAAACCGTAATTTCTAATTAAAAATGCTATGATCCTGGAACTGAGGGCGATCTATCGTCTTTGGTTTCAGGTTTTTTTGTGTAGACGGATGTCCTATTGCTTTCAACTGATAGGTCACTCTTTAAAGGGAAGTTCTTGTTTTACGTGTTCTTTTTCAGAAAACAGTTACCCTTTTGTAAAAATATAGTTGACAAATCATAAGCTTTTGATTAAACTGTTACAAGAGGATGAGATATGACGGACTGTTTTGGAATTGAACTTGACCAAGAGTATCGGTGCCTACATTATCATACCCCGCTTGATATTGTTGGGCTCAAATGTGCTTTTTGTCAGACGTATTATGCTTGTTACCATTGCCATGACCAGTTAACAGAGCATGCCTTTGTGCCAACAGGGCCTGCTGAAATGTTTCCTGTGATTTGTGGCCATTGTCGAAAGCTCTTGAGCCTAGCTGAGTATGGTTGTGGATGCTGTCCTTATTGTCAAAGTCCCTTTAATCCAGCCTGTCATAGGCACAAGGATATCTATTTTTTAAAGGAGTCGTAACAGATGTTTACAACCAAGGAACTTGTTAAGGTGGCTATGATGACCACTTTGATTATTATTTTAGGCTTTATTCCTGCTATCCCGCTAGGCTTTATCCCAGTCCCTATTGTTTTACAAAACTTAGGTGTCATGTTGGCTGGATTGATGCTGGGTGGTAAAAAAGGAACCTTATCTGTTTTCTTATTTTTAGTGATTGGGCTTTTCTTACCTGTTTTCTCAGGCTCAAGAACAACCATTCCAGTATTGATGGGGCCATCTGCTGGCTATGTTATTGCCTACCTTCTTGTGCCTATTGTCTTTTCATTACTTTACCGCAACTGGTTCTCAAAAAGCACGCCATTAGCATTCCTAGCTCTTTTAATCTCAGGAGTTGTACTGGTTGATGTTCTGGGTGCTATCTGGTTGGCAGCCTACACTGGCATGTCTCTTGTGACATCGCTTTTGTCAAACTTGGTCTTTATTCCAGGAGATACCATCAAAGCAATCATTGCGACCATTATCGCTGTTAAATACAAAGATAGTTTTTTGAATACAAAACAGTAATCTAATCATCAAATAGTTAAGTTGTGTTGAACAGGTCTTGGCAGATTTATCTGCTAGGACCTGTTTTTGGTGGGTCTCAATCCTCTTTGACACTAATTTTTGTTATAATAAGAGTTAAAGCAAGAAAGAAGGGTTTGAGATGAAATTAACCACCTTAGGGTCTTGGGGAGCCTATCCCTATCAAGATGCAGGCACAACCTCTTATTTGGTCACAGGACATGACGGCTTTCAGTTATTGATGGATGCTGGTAGTCGAGCGCTCAATGAGCTGGAAAAAGAAATCAGTCCTCTCGATTTGGATGCAGTGATTATTAGCCATTACCATCCAGACCACGTGGCCGATTTAGGCGTGTTGCGCCATTATTTTCAACTTTATCCTAAACACCTGTGGCAGCCTAAAGTATTGCCCATTTATGGGCATGATGAGGACCGACACGAATTTGCTAAGTTAAGCATTCCTGATGTTTCAGAAGGTAGAGCCTATGATGTCACTGGAGTTGAACAGATTGGTCCTTTTGACATTACCTTTCTTAAAACAGTTCATCCAGTTGTGTGTTATGCCTTTCGAATTGTAGAAAGAGCGACTGGTCAGGTACTTGTCTTTACTGGAGACAGTGGTTATTTTGAAGGATTGGCAGACTTCGCAAAAGAAGCAGACCTTTTCTTAGCAGATGTTTACTTATACGAAGGCAATGAAAATCATATGGCCCATTTGACCAGTAAGGAAGCAGGACTAATGGCTAGCCAGGCAGGTGTTAAGAAGCTTGTCTTGACCCACATGCCACCGGTTCCTCCAGAAGGTATTGATCCTGACAATCACTTGGAAGTGTTGAGGCAAGAAACACAAGCCTATGCAGGTAATATTCCTGTTGACCTTGCCTTACCACACAAATCTTGGAACTTGGGGAGTCTTTCTTGATGCCATATAGTTTAGAAGAGCAAACTTATTTCATGCAAGAGGCTTTAAAAGAAGCCGAAAAATCCTTACAGAAAGCTGAAATCCCCATTGGCTGTGTCATTGTCAAGGATGGTGAGATTATTGGTCGTGGGCACAATGCGCGTGAAGAGAGTAACCAAGCCATTATGCACGCTGAAATGATGGCCATTAACGAGGCTAACGCTCATGAAGGCAACTGGCGTTTATTAGACACCACACTCTTTGTGACCATCGAGCCTTGTGTGATGTGTAGTGGTGCCATTGGGCTAGCAAGGATTCCGCATGTTATTTATGGAGCCAGCAATCAAAAATTTGGTGGAGCAGACAGCCTTTACCAGATTTTGACAGATGAGCGCTTAAACCACCGCGTACAAGTTGAACGAGGCCTGCTAGCAGCAGACTGTGCTAACATCATGCAAACCTTTTTCCGCCAAGGGCGAGAGCGCAAAAAAATAGCTAAGCATTTGATCAAGGAACAGTCAGATCCCTTTGATTAGAGTTTTAAGGAGCTTGTTATCACATGCATTTTTGGTGAAGGGTAACCTGTCAAAATAATGAGTGAAACGTTAGACCATTTTTCCAATGGTTGTTAGATTCAACATACGAAGATAGAATATACAAAAGGGCGTTTCCAAGTACTAGAAGCGCTCTTTTTCAGACCCAATCGAGGTGAAAACAATCGAAAAATAAAACACGTGATGACTAGATGAGTTAGTCATTCTTAAAAAGATTTACTATCTAAAAACAGATAGTAATGGCTCACCTTATTTTTGTTTTTAGTAAACTTATCCAGCTCAGACTTCTAAGGCTCAGAGCTGTCAGTTATCTGTGGCGTAGATTGACACTGACACAGGGATTAAAAACAAGTGACTTATAGGCATGGCTTGAGTTATTTAATCTTTTGTCTTAGCTGATATATTTTGCTAAAGCATTAAAAAAGAGCTCATCACTGTTGCTAATGTTACAAGCATTAGATGTGCTCAATCTGAAAAGGTTATATCTATTGAAGACGGTTAGAATAATAATCGTCTTCAATTGTGTCAGTATATCAATTTCTTGTAATGTTTGACAAAGATAATCATCTTAACTTTGTGTTTCATGTGTCTAAACCTAGTTCCTACTAGCAAATGAAATACTAAGAGTCTCTGGTAAGAGTCCATAGGTAAAGCCCGTATAATTATTCCAATACTGATTGAAAAGGTTATGATAACCTGTTTGATTCGTCGTTAAATCAGTTACCATCTGTTGATAATCATCTTGATGAGCAAATTGTAGACATAGTTGCTCTTGTCTATTTAACAACTGATTTTCAAGGCTTGCAAGGATGGCGTCACTGTCAAACGTTGAGATATAGCTTTGATGACGTTTAGAATAAAGCAAAGAATCATCTGTACAAGAAGGTATAGTCCAAACATTTTCAAAACGTTCTTTAGTATTAAAAGCAATGTCTTTGCTTGGCTGATGTGATAAGGCCATTAGATAATCTGGCAGGCATAGAAAACTGTAATTGATAGTTCCTTGCTTTTGATGTGAGAGATGGTTATCAAAAACAGGGTCACCCCAAGTGACATCAACGCCATAATAAGTGTTATTAATTTGAACAGCATTCCATGCATGTGCAAAAGATTGCTGAGGTTGCTGAGATGTACCAGTTCCACGGATATAGGCGACTGGAATGCCAGCTTTTTGACAAAGAAACTGAAAGGCTTGGGCATAGCCATTACAAACAGATAAATGATCAATAAAAACACTTTTAATGTCTTGATTAGAAGCGACCTGGGCTTGACTGCCTGATTGATAGGCTTCAAAGGCTTTTTTATTGTAGTCTGTGTCTCGAATGATGACCT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66 | Streptococcus_phage(55.56%) | terminase,portal,protease,tRNA,tail,capsid,integrase,holin | attL 191496:191513|attR 236070:236087 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
449019 : 509236
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483298|449019:509236|DBSCAN-SWA 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72 | Streptococcus_phage(80.77%) | terminase,portal,tail,tRNA,integrase,holin | attL 461661:461677|attR 492388:492404 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
763888 : 853285
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483298|763888:853285|DBSCAN-SWA 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96 | Erysipelothrix_phage(35.42%) | terminase,portal,tail,tRNA,capsid,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
875083 : 935759
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483298|875083:935759|DBSCAN-SWA 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85 | Streptococcus_phage(41.94%) | head,terminase,portal,tail,integrase,holin,transposase | attL 886035:886094|attR 934629:934724 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1185619 : 1240904
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483298|1185619:1240904|DBSCAN-SWA 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53 | Bacillus_phage(28.57%) | protease,tRNA,head,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1277158 : 1287761
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483298|1277158:1287761|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483298|1277158:1287761|1280361_1281714_-|SQE38947.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHVSYERGFEQNGVNRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKAIVDVLVEEMAVGGPCLHPHSEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFGLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNGKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >LS483298|1277158:1287761|1281934_1282276_-|SQE38948.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADASASQLFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK >LS483298|1277158:1287761|1277158_1278301_-|SQE38943.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTIPYGEALKTYQEVATKIYGNPSSLHQLGTNASRILEASRKQIAGLLGVKSEEIFFTSGGTESANWAIKGIAFEKTAFGKHIIISAIEHPAVSESVKWLLTQGFEVSYAPVTTQGVVDVNALAELIRPDTILISIMAVNNEMGAIQPIRAISNLLANQPTITFHVDAVQAIGKIPLCDYMTNRVDLASFSGHKFHSVRGVGFLYKKAGKRLNPLLSGGGQEQELRSTTENVAGIASMAKALRIVTEKQVSVLPKLTAMRDVIYKALSVYPDVTVFSAQEGFAPNILTFGIRGVRGEVIVHAFEKYEIYISTTSACSSKAGKPAGSLVAMGIPVKTAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYDKTQKVR >LS483298|1277158:1287761|1283596_1284283_-|SQE38950.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >LS483298|1277158:1287761|1285550_1287761_+|SQE38952.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYDNSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNTKNRE >LS483298|1277158:1287761|1282336_1283503_-|SQE38949.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGPSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEKEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >LS483298|1277158:1287761|1279005_1279296_+|SQE38945.1|DBSCAN-SWA MTTYDSISWIHTFKANGRKTDLARMAWLLEALGRPQDKFPAIHVVGTNGKGSVTAYLQHILSTSGYQVGTFTSPFIISFHDRICLNGQPISDLELA >LS483298|1277158:1287761|1279329_1280274_+|SQE38946.1|DBSCAN-SWA MSLETNWDRPTEFELVTLIMFCYFANLKPVDIAIIEAGIGGKTDATNVFHALAVVCPSISFDHQERLGYSLAEIAHQKAEVIKAKEPVIIGQLEQEASQVFQQVTQKAGSRLYQLGKDFLLNPSEKTFSFQHDNLNLTKLRLKLLGQHQKANACLAIMTAQLLRKSFPKISPKTIQKGIEATTWPGRSEFIQPNLLLDGAHNPDSIAKLKSLLQEEFPKRPIHILFAGLKRKPLADLLAQLDTFEVSVTTFDFPEANLLEDYPDKYPQVKDYRDWLQGSVTSDELFVVTGSLYFISEVRQYCLSNANIFKNIFP >LS483298|1277158:1287761|1284279_1285443_-|SQE38951.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >LS483298|1277158:1287761|1278535_1278976_+|SQE38944.1|DBSCAN-SWA MSSHYSRQQKPRKSGGVPTEHIKTGFTAFQKSIALIGSILSIIVATITITRALQPVPDKTSNDTPKESSNTIVKIIEKESSQGNQNHTGTSETTDDNKTTLPSSSTTPSHNETTPTAPETPSATEGTQLPNATGAEDANTGLPTNS |
10 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1481320 : 1524479
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483298|1481320:1524479|DBSCAN-SWA ATTAAGCTTGTGCATCTGGACGTGACTTGCGAGCAATGTCTGCCAAGATGTTTTCCACAAATTCTTCCACAGATTCAGTGTGAGTCGCCTTACTACCATAGCGGCGAACATTGACTGATTTGTCTTCCATTTCTTTGTCCCCAACAATTAATTGGTAAGGAATTTTGCTGGTTTGAGACGCACGAATCTTGTACTGCATTTTTTCATTGCGGTCATCGACATCTGCACGAACACCACGGTCACGAAGGGTTTTTGCTACTTCCCAAGCATAGTCAATGTGGGCTTCATTTGAAATTGGAATCACGGTTACTTGGTGAGGTGCCAACCAAGTTGGGAAAGCACCCTTGTAAGTTTCAATAAGGATAGCAGTGAAACGTTCCATAGTTGAGATAACACCACGATGAATCATGACTGGGCGGTGTTCTTCGCCATCTGCACCAATGTATTTAAGGTCAAAACGTTCTGGCAACAAGAAGTCCAACTGAATGGTTGATAGAGTTTCTTCGTTACCAAGAGCTGTTTTCACCTGAATATCAAGCTTAGGCCCATAAAAGGCTGCTTCACCTTCTGCTTCAAAGTAATCTACACCCATCTCATCAAGTGCAGCTTTAAGCATACTTTGAGCATTTTCCCACATCTCATCATTGTCATAATATTTATGAGTATCGTTAGGGTCTCGGTATGACAAACGAAAACGATAATCAGTCAAGTTGAAGTCAGCATAAACATCAATGATTAATTGAAGGGCACGTTGAAATTCTTCCTGGATTTGCTCTGGTGTTACGAAAATGTGGCCATCATTCAAGGTCATTTCACGTACCCGTTGAAGTCCTGATAGGGCACCTGATTTTTCGTAACGGTGCATCATGCCAAGCTCGGCAATACGAATAGGCAATTCACGATAAGAACGCACATGATTTTTATACACTTGAATGTGGTGTGGGCAGTTCATTGGACGAAGAACAAACTCCTCACCATCTCCCATATCCATTACAGGGAACATATCTTCTTGATAATGATCCCAATGACCTGATGTCTTGTACAATTCTACAGAAGCAAGTGGTGGTGTGTAAACGTGTTGGTAGCCTGATGCTAATTCTTTATCTGTGATGTAGCGCTCAAGTGTACGACGAATAGTCGCTCCATCTGGTAACCAAAACGGCAAGCCTTGACCAACTTCTTGACTAATCATGAACAAGTCAAGCTCTTTACCAAGCTTACGGTGATCACGTTCTTTGGCTTCTTCTAGACGAGTCAAGTAAGCTTTGAGGTCTTTTTTATCAAACCAAGCTGTTCCATAGATACGTTGCATCATGTTATTGTCGCTGTTACCACGCCAGTAAGCACCCGCCACATTTAGCAAGTGGAAGACTTGGATACGGCCTGTTGATGGCACATGAGGGCCACGGCAAAGATCCACAAATTCACCTTGACGGTAAACCGTCAAGCCAGCACCAGCATGCTCATTAATCAATTCTACCTTGTAAGGATCATCTTTGAACAATTCCAAAGCTTCTTCTTTGGTCACTTCTTCACGGATACATGGGTAATTTTCTGTCACGATTTTTTGCATTTCAGCTTCGATACGTGGCAAATCTTCGTTTGAAATTTGGCCTTCTGCATTATCTGTATCATAGTAAAAGCCTTCTGCAATGGCAGGGCCCACACCCAAATGAAGATTTGGGAACAAGCGTTTTGCAGCTTGGGCAAATAAATGGGCTGCAGAGTGACGAAGCACCTCATAAGCATCTTTGTGATCAGGTGTCACGATTTCAATACTGCCATCTTCTTCAATGGCACGAGTGGTGTCAATGAGTTGATCATTGAACTTACCAGCTAAAGCTTTTTTAGCCAATGATTTGCTGATGGACTCAGCAATGTCAAACGTTGTTACGCCAGATTCAAATTCACGCACGGCGCCATCTGGAAAAGTAATCTTAATCATTTGCTTTCTCCTTTAAGTCAGTTAAGATTTCCACTAAAACATGGATAGTAAGACAAATTAGGGACAAGAGGTTAGTGAATAGCTCAACACCACCACGTAGAAGAACAATACCTTATTCACGAATCTACCCTCCCTAGTCCTTAAAAACAAGGCTAATCCCCTCCAAAACAAAAAAACTGACCGCATCCCAAAGGACGCAATCAGCGTGGTTCCACCTTAATTTATGCAGGACAAAAAACATGCCTTGCACCTCTAGTGGCGATAAGGGGGCCACCCTTTTATGTTTGCATAAAAACCAGGAAGGAGTATTAGATTAGCTATCCTTGTGCTCTTTCCACCAACCAGCACTCGCTTAAAAGATTCTGTCCAATCTAACTTGTCTTCAAGATAATTATAGCAAGTTTTCAAAAATTTACAAGCCTTAATCCAGAAAATCTTTGATAGCATGGACCAGCTTGATAGGAGCCTTGACTACTTTTACTGAGGTGATAGCTGTGACCTTAGCAGCACGTTTAGGCAAGTGAATAGCACCTTGCACTAATTTTAGAGAACTACTTTTACCAGAATGATTAAGATAAAGACTCAGCTTTTGAGCTTCTTTGCTATTTCTAGCAATTAACGTATCTAAATAGAACGTGTAAATAGATTTTCCAAAGTGCTGTGCTGAGATTTCATAACGTTTTTTTGCTAATAACCGTTTATCCATAACTGGTGTTTTTAGTATGGCATCAATAATAGCATCAGTTAAATCTGTTTCAGCGTAATAAAGAGTGCCAAACATTTTATCAGTCACCACATCATCTAAATAAGGATTGCCATGAGCAATAATAGGAGTGCCACTAGCCAAACTTTCAATATAGGTCAAGCCCTGAGTCTCACTGGTCGATGCTGAGATAAAGAAATCACAAGCCTTATAGTACAGAGCAACCTTATCATGAGGCACCATGCCTGTAAAGGTCACGTGTTTGTCAACCTCTAACTGCATCGCCAAGTGTTTCAAATCTTGCAAATAGGGGCCATCTCCTACAATAATAAGCTTTATCTTGGCATTTTCAGCCAAAATAGCTGGCATCTGATTGATGATAGCTTGAATATTTTTTTCATAAGAAATCCGTGACAAACTCAATAACATGGTTTCATCACCAGCAATGCCCAATTCTGCTTTTAAGTTGGTTACTTCTTCTGCTGTGATGTCATCACGAATATATTTTTCCAAAGGAATGCCTGTTGGGATAACCCGCTTAGGGATAGTAACTTCGTAACCTTCTAGAAGATTGAGGACAATCCTACTTGGGCAGATAACCCCATCCAAATCCTTCAAATAGCCCCTAAGAAGAGGTTTGACCATACTTGGTCGAATGATTTTTCCGTTGGCAATATAACTCACGTAGTCCTCATATTGGGTATGGTAAGTATGGACAACAGGAATTCGCAAAGCTTTGCCTATCATTTTCCCTAATAAGCCTAAGCTAAACTCAGTTTGCGTATGAATAATATCAAGATTATAGTGTTTTGCAATTTTGTATGACGAAATGAGGCCACGATAAACCACACGTCTATCCGTAAATGACACAAAAGGAACACTTGGCAGTCGAATAATGGTCGGGTCTTCAAAGCGTTTGACATCTCTATCAGTAGTGGTGAAAATATAAACTTCGTGACCTTCTTTTTCTAGCTCTTCTTTTAACGTACGAATACTAGTAGCGACTCCTGAAACTTGTGGAAAATAGGTATCTGTGAATAGACCTATACGCATCTTATAACTCCATTACTTTTTTATAGACATCTACTAAGGCATGGCCAACCGTTTCTAGGCGACGACTCTGGGCAACCTTGTAACCAGCTTCAACTTTGTTGCTGGCACCAGAAAAGACTTTTTTCAGAGCTTCTATAAAACCTGGTATATCGGTTGCTAATTCCGCACTACTTTGATCAACCCATCCGTAGTAAACTGGTATATCACGTAAAACAAGGTGCTGGCGACTGGCCAAGGCTTCTAAGACAACAATGCCTTCTGTTTCTTCACGACTTGGAAAGAAAAAGGCATCTGCACCAGTCATGGCACCTTCATAAACATCCCCTTTAATGTATCCTGGGAAAATAAGATTTTTCGGGTGGTTACCATTGACCATTTGGCGAACTTGAGCAGGAATGACCCATTTGTTGGTCTCGCCAAACCAGATAAAACGAACATCTGGCATAGCTTGGGCAACTTTGACAAAGTCATCAATTCCTTTCCTCAGAAAAAATAATCCTGCTCCCATAACCACTTTTTCACCCTCTTTAATGTCAAAGTAGCGACGAAAAGCTGCTTCCTTTTTAGGATCTGCTCCGTACTGCTCCAAATCAATCCCATTTGACACTGCAAAAATAGGTGACTTCACTCCATAACTCTCAATCAAAGACTTAGAATATAGGGTAGGGGTAATGATAGCATCTGCCTTATTGTAAAAGTGACAAAGGTATTTTTTAAACCAAGGAGATAATAGATTTGAAAAAATAAAAGAATTTCTAAAATCTTCTTCTGTAGAATGCCCATGCATGATAACCTTCTTACCAGCTTTTTGTGCTTTTATCATCAGCAGCCAACTTTTTAAACCATAGGTATTGAGATGAACCAAATCATAAGTTTCTCTTGGATTAGTCGTAAAATGTTGACCAACAAGTGACAAGGCTTTAGCCTGATGCTTAATCGCTCGACCAATTCCTGATTTTCTTAGATAATTTTCTGCTTCTAAATACAATAAGACTTTCATAAGTTCTATTATAGCTCATTTTATAGTATTTTTCACTAAGACATGCAAAAATCAGCCCTAAGGCTGATTTTAGTATTGAAGAAACAGTCTATTGTGATACTTTTTGTTAGATGGTGCTCATAAGTCACAGTTACTTAGTTGTCCCACGTTTTTTAATACCATGATTCAAAAGAATTTCTTTTTCTTCCAACTCTTCTTTGTTCATGATTTTAGTCAACATCCGCATGCTAACAGCACCTAAGTCATAAACAGGTTGACTGATAGAACTCAAATTGGGACGAGTGTATTGAACCACTGGT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50 | Tupanvirus(11.11%) | bacteriocin,tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1558624 : 1564656
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483298|1558624:1564656|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483298|1558624:1564656|1564020_1564656_-|SQE39220.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQLIPLLKQKVAQDILTTREPGGVAISEHIRELILDINHTAMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGQLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLIKADIQWLNEFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARINANQQREVNRLDLETIEIHQRVRKGYLALAKEHPKRIVTIDATKPLKEVVSVALEHVLTLLLA >LS483298|1558624:1564656|1562142_1562466_-|SQE39217.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSHLEHETVAKNPSKQRKDHLEGIYDEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK >LS483298|1558624:1564656|1558624_1559452_+|SQE39212.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTGESPRALLSRAVLDTLVAQDADIIAIQETKLSAKGPTKKHIETLLSYFPNYLHVWRSSVEPARKGYAGTMFLYKSTLNPVITFPEIGAPTTMDAEGRIITLEFEDFFVTQVYTPNAGDGLRRLDDRQIWDHKYADYLTELDTQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSPGFTDEERQGFTNLLARGFTDTFRHLHGDIPHVYTWWAQRSKTSKINNTGWRIDYWLASNRIVDKVKRSEMISSGERQDHTPILLDIDL >LS483298|1558624:1564656|1560179_1560809_+|SQE39214.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQVSRVELCNNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKKISVATMIRPRGGDFVYNDLELKAMEEDILKAVEAGSDALVLGLLTTENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDHIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKSLVTYANKRIDIMIGGGVTAENCQSLSQLTGTAIVHGTKII >LS483298|1558624:1564656|1562869_1563109_-|SQE39218.1|DBSCAN-SWA MGKRSLSKDLPLATKVAAHKGKKAFEENTAFATDLMKEVSRLITQNQLEMTFINSVFPLDQHVVLIPFSAEEHMDFYNC >LS483298|1558624:1564656|1560855_1561248_-|SQE39215.1|DBSCAN-SWA MTEDQATILILGVYGIILAVFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWYSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIASLIVAFGKTYTTQECHPVPHLLN >LS483298|1558624:1564656|1559525_1559882_-|SQE39213.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMAELKQLVSDFEAIDIKVNPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRELGLKDKIDQLSLDKAAELLATDGMLIKRPILIKDGKVLQVGYRKPYQELDLG >LS483298|1558624:1564656|1561274_1562138_-|SQE39216.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKHFDIATKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLISGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDSDIAVVALPGASAGITALIASGLAPQPHVFYGFLPRKAGQQKAFFEDKHHYPETQMFYESPYRIKDTLTNMLACYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGSISEILSYLEETPLKGECLLIVAGAQVDSEVELTADVDLVSLVQKEIQAGAKPNQAIKTIAKAYQVNRQELYQQFHDL >LS483298|1558624:1564656|1563127_1564003_-|SQE39219.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPNVYQAFQTILKKDRLNHAYLFSGDFANEEMALFLAKVIFCEQKKDQTPCGHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYENKRQVFIIKDCDKMHVNAANSLLKYIEEPQGEAYIFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLYQLAQEKGLLNHQAKLVAKLATNTSHLERLLQTSKLLELITQAERFVSIWLKDQLQAYLALNRLVQLATEKEEQDLVLTLLTLLLARERAQTPLTQLEAVYQARLMWQSNVNFQNTLEYMVMSE |
9 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1830940 : 1846660
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483298|1830940:1846660|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483298|1830940:1846660|1831823_1832057_+|SQE39455.1|DBSCAN-SWA MVFKSKGGVDLKKNKVRGYRNMLGFTQEELGNKLGITKQSYHNKEVGKNSFKDSEKLVFKELLLPLFPDITLEDIFF >LS483298|1830940:1846660|1843891_1844098_-|SQE39473.1|DBSCAN-SWA MPCFSKKIDKEKAATVSASRAKELEDRLSHQPLIDDYREKMQDASDVTQYITKRIEDQLNKELTNGKN >LS483298|1830940:1846660|1835569_1837258_+|SQE39464.1|DBSCAN-SWA MLKQNTEREGRTIEQEDLKNLENEITEARENEDKYFSTFKGVRGQLIKECQEMKDEAFKIAYDGVMADSKHLENVKAGRLTEVQHEELAKEKGQEASEKALPKTPLGVAIMLKHYLRFIRVKPEAQGQKAPLYFFHPDHGVWLEDNEFLQDLISVIFPNATEKQAFDTLYKIARQSQLKEIQRQYTVIGNQLYNYKTGQFEELTPDITVTRKIKTGYNKKAKEPTIKGWKPTAWLLELFDGDAELYNLAIQIIKASITGQSLQKIFWLFGEGGTGKGTFQQLLINLVGMDNVASLKITELAKSRFTTSILLGKSIVIGDDIQKDAVIKDTSDIFSLATGDIMTIEDKGKRPYSIRLNMTVVQSSNGLPRMNGDKSAIDRRFRILPFTKVFKGKPNKAIRNDYINRKEVLEYLLKLAIETPITDINPKASIEILEEHHKEMNPVIDFVSKFFTDELTSEFIPNSFVYHVWKGFLEYYDIKQIKSERGLHKEIKSNLPEGFEAGQKVIPVGRQLHTGFYPKEDLPLFASASYANGRASPEKRKKPKNERGYYNHWPTHKKQKKT >LS483298|1830940:1846660|1833935_1834127_+|SQE39460.1|DBSCAN-SWA MQELNLTPTQTLILFFVLGLLGLLLSRSKSLIDIDLPEDTQVPKPRQNANYGAYIQSQNHYYN >LS483298|1830940:1846660|1834743_1835601_+|SQE39463.1|DBSCAN-SWA MAIYEARGFSSYLYPYKGPLEPFDYIAQFRPLKPPEDIDIEEYKRTQAPYCLSGKVTAEKNGSYKRNNASLVYRDLIFLDYDEIETGVNLPKIVSQTLWEYSYIIYPTIKHTPEKPRYRLVMKPSDVMTEATYKQVVKEIADKIGLPFDLASLTWSQLQGLPVTTGDPEDYQRYVNHGLDYPVPKNGSTPNRQVVTTYTPRPRSQRSITMRVIDTLFNGFGNEGGRNVALTKFVGLLFNKWVDCDLETAYELVQIANSVTTKPLPIDEIDRTFTSIAKAEYRKRG >LS483298|1830940:1846660|1833711_1833933_+|SQE39459.1|DBSCAN-SWA MKSIKELNEIANDILVDYEDLCGQLMDILDVLDLAAQEYSKETTRAIINTSCSALKCLISDHDKTTRKYRKEL >LS483298|1830940:1846660|1830940_1831732_-|SQE39454.1|DBSCAN-SWA MKTHNAQVGERVKKIRLSLGESMEQFGSRFNTSKGTVNNWEKGRNLPNKENLKKIADLGNKEVVELLYGNYEDRIFDELRNAAWLYNFDDIDLHELSKQVNDDIISRYGYFSDFKLPYVDISNYISFALDRLLMNKKVFEISSDSFYKINAIPTYSIKNEDPKNEGLTLSSFTNLEIVFNDFETEEDIDKVQIKYSTLLEIDFVIIHNHLEKIVFEGLEKIEQPRYNSFFKKEILDKFKQKISKQVFEFAKKDYSLMISRLKD >LS483298|1830940:1846660|1837544_1837718_+|SQE39465.1|DBSCAN-SWA MKIKLFYQKHNESLDDFEYRVNLFTLSVSVIDIKFSEATYGNYEDMSTTTSLLVLYR >LS483298|1830940:1846660|1844240_1844678_-|SQE39474.1|DBSCAN-SWA MNKMERQQQIKRIIQAEHIGTQEDIKNHLQKEGIVVTQATLSRDLREIGLLKLRDEQGKLYYSLSEPVATPFSPEVRFYVLKVDRAGFMLVLHTNLGEADVLANLIDNDAIEDILGTIAGADTLLVICRDEEIAKRFEKDLAAGL >LS483298|1830940:1846660|1834138_1834468_+|SQE39461.1|DBSCAN-SWA MTLPENYRRVLNLIKVGADNPITGAEISLILKLEERSVQSIISSLITRYNVPIIGIRHGFNRGYFIPANKEELLDGAKAFYNQVQKEQERLSVLLNADLTSYKELLKGG >LS483298|1830940:1846660|1832532_1833150_+|SQE39457.1|DBSCAN-SWA MNIVYMDGKKEPYTLSSIVAECAGVQHHTITRTIRKQFERFERLGKVGFKIQASESGQQTKDYILNEQQATLLITFLKNTEQVAQFKETLVTAFFEMREELTQIRLQRSLEAPKRKTLNEAIKTWEHAPKMAYPTVYNLLLKAVTGKNSKQLKATRGGYSGIDCLNSIELAQYTALEDMAIALINLNFTYQDIKTMALKNTLQCA >LS483298|1830940:1846660|1832111_1832519_+|SQE39456.1|DBSCAN-SWA MARTPFTQELLHQIFDDTGTMSLELIAERLPDWSEKDIKLRLAAWRYRNNIAYTMANGEIDTFEIINNRKAISEEVSAGRQLKLEEYFKQVQATAEIINKPTASDTNRLKAIQLQQVAMDEIPDQYFKELTELYG >LS483298|1830940:1846660|1833383_1833725_+|SQE39458.1|DBSCAN-SWA MKYRVETNPFSKDRYTPEQLEMFKNRQLSKDKAEVFFTRLYNQHIAWVIIANVMTEYVIKFRKSATSFEEAWDALDYQRTTEIVFRAVNGLPCSEKDSGELETYLSEEQHEKH >LS483298|1830940:1846660|1837723_1837897_+|SQE39466.1|DBSCAN-SWA MKLKLHTRGGNTITIQGDRTLYDELIKYLLSGQQPNWVASPSAIINLSDIIAITKEK >LS483298|1830940:1846660|1841349_1843905_-|SQE39472.1|DBSCAN-SWA MAKTNISPGMQQYLDIKKDYPDAFLLFRMGDFYELFYEDAVKAAQLLEIGLTSRNKNAENPIPMAGVPHHSAQQYIDVLIELGYKVAVAEQMEDPKQAVGVVKREVVQVITPGTVVDSAKPDSANNFLVAVDFDGCRYGLAYMDVSTGEFCVTDLADFTSVRSEIQNLKAKEVLLGFDLSEEEQTILVKQMNLLLSYEETVYEDKSLIDGQLTTVELTAAGKLLQYVHKTQMRELSHLQALVHYEIKDYLQMSYATKSSLDLVENARTNKKHGSLYWLLDETKTAMGMRLLRSWIDRPLVSKEAILERQEIIQVFLNAFIERTDLSNSLKGVYDIERLSSRVSFGKANPKDLLQLGHTLAQVPYIKAILESFNSPCVDKLVNDIDSLPELEYLIRTAIDPDAPATISEGSIIRTGFDERLDHYRKVMREGTGWIADIEAKERQASGINNLKIDYNKKDGYYFHVTTSNLSLVPEHFFRKATLKNSERYGTAELAKIEGQMLEAREESSSLEYDIFMCIRAQVETYINRLQKLAKTLATVDVLQSLAVVAETNHYIRPQFNDNHMITIQEGRHAVVEKVMGVQEYIPNSISFDQQTSIQLITGPNMSGKSTYMRQLALTVIMAQMGSFVAADHVDLPLFDAIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMMEANQAIKRASDNSLILFDELGRGTATYDGMALAQAIIEYIHDRVGAKTIFATHYHELTDLSTKLTSLVNVHVATLEKDGDVTFLHKIAEGPADKSYGIHVAKIAGLPKSLLKRADEVLTRLETQSRSTEIISVPSKVEPSSAAREGQLSLFPDEDKSQEIIHTLEAIDVMNMTPLQAMTTLYELKKLL >LS483298|1830940:1846660|1838481_1838970_+|SQE39468.1|DBSCAN-SWA MLELSIENIIKPMKTQGKTRVTGSIGDQAIRIDLDGLVIHYNGQGLLLETIPGTYGGKRYFFVCPDCERRCRKLFKASHAFACGSCQKVHQATLNRSKTDCCYYWQLAFKECLKVNPEARHIHGYYSRDDFPKRPKYMRLTKYLYHWRRFHYYMDKGDRYWL >LS483298|1830940:1846660|1840290_1840953_+|SQE39471.1|DBSCAN-SWA MKKKLVLATALLTVGVATNVKAEAYGNQRIWGFRTDWQEGRDFGAKPIRKGDNEIKVKTAPEAVLTVYEWKNNKWELIKDEVRNGGIYSHETYREEGGSNEQIPRRVLSGGDGLITFPLKKNAQLGDKYKLILTVGGFYLAGGEWTVGESIPKDEEEKDEVEIQKFIDGLEQKEREAEEQKYAEELFKQQQQEEAKKTWHQRLSDSIQDQWWNFKDWWRG >LS483298|1830940:1846660|1834470_1834743_+|SQE39462.1|DBSCAN-SWA MNVFSQDYEAKLLEQNLTAFNRFLEAYQKPKPRVLGLITAEQVKEELNIKGKTLKRWENAGLRRYQPPLEDTRKHYYKVSDILIFLGVNV >LS483298|1830940:1846660|1839369_1839732_+|SQE39469.1|DBSCAN-SWA MNAKEQLKELKPLFALMTLFEEQRDKDIKLMNAFRNPEEIKNIEKGTAKQLLYLAKERDKRLAMIAALQDEKQIAVIKARYVDGLSWDEIPDKLGYSRNTVFKLHREALEVLDEQEERYS >LS483298|1830940:1846660|1837898_1838408_+|SQE39467.1|DBSCAN-SWA MRTFSDTPKTFTFHYTFKDFDTAQVACHAILGYMTGTYEQPVIDATYHNDDQGGHANQLVLKYVEDRKLSKVFKRICDSFKDYYNQPEDMTDEELDHQRVVSLSKSTQGKVNNRDTLIAFISDHNQLAEHLSMNYKEMTPEDLGAILESISQAFNHLYDMVVEGQLLVK >LS483298|1830940:1846660|1844968_1846660_+|SQE39475.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDTKTLIASEIAKVVPELEQDAIFNLLETPKNSDMGDLAFPAFSLAKVLRKAPQMIASELAEQIDESQFEKVVAVGPYINFFLDKAKISSQVLEQVITAGSDYAQQDEGQGRNVAIDMSSPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSLANIFAKMGYQPVKINHLGDWGKQFGMLIVAYKKWGDEAAVQAHPIDELLKLYVRINAEAETDPTVDEEAREWFRKLEDGDKEATELWQWFRDESLLEFNRLYDQLHVTFDSYNGEAFYNDKMDEVLDLLEAKNLLVESKGAQVVNLEKYGIEHPALIKKSDGATLYITRDLAAALYRKRTYDFAKSVYVVGNEQAAHFKQLKAVLKEMGYDWSDDMTHVAFGLVTKGGAKLSTRKGNVILLEPTVAEAINRAASQIEAKNPNLADKEAVAHAVGVGAIKFYDLKTDRMNGYDFDLEAMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKADFTPSATTTYSLADAESWEIIKLIQDFPRIIKRTSDNFEPSIMAKFAINLAQSFNKYYAHTRILDDNSERDSRLALCYATATVLKEALRLLGVDAPNEM >LS483298|1830940:1846660|1839706_1840090_+|SQE39470.1|DBSCAN-SWA MSKKNAIRKLKEFHRWQRIANSLDLTYTELYQFDIEYHPTRRKHLEISRECALEELDAIRYAINQLSKVEYRQILIECYLISEEKTQQDIMEELNRSQSWYYESKKRALLEFVEFYRDGTLKNNVRL 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22 | Streptococcus_phage(61.54%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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