Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483300 | Staphylococcus aureus strain NCTC7485 genome assembly, chromosome: 1 | 6 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 2 | 0 | 12 | 1 |
1. LS483300
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483300_1 | 630523-630609 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483300_1
|
1 spacers
spacers of LS483300_1
>1.1|630549|35|LS483300|CRISPRCasFinder ATGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTAAGGCACAAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483300_1
The CRISPR arrays of LS483300_1 >merge|LS483300|1|630523-630609|CRISPRCasFinder TGCATAAAAGCCTCTAATCGCTAAAGATGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTAAGGCACAAATGCATAAAAGCCTCTAATCACTAAAG >LS483300|1|1|630523-630609|CRISPRCasFinder TGCATAAAAGCCTCTAATCGCTAAAG ATGAAGAGGAACGCAGTTGGATGCTAAGGCACAAA TGCATAAAAGCCTCTAATCACTAAAG
>LS483300.1|SQE32991.1|629758_630394_+|endonuclease-III-domain-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHVLELPIETLQSLIRPSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKAELRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIEFIPDSYTRKIYDKLGYENTKSYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >LS483300.1|SQE32990.1|628144_629461_-|transposase MNNVILNTFDLKDKNIIFDGKLEKIEYKGRKCFFYYAKLIYTPEVCPNCNCKNINGNLIKNGSKTSRITMPKISEYPTYIMLRKQRFKCKTCERYFTAETPEVDKYCFISKKPRSAVLNKAAEIRSEKSIAKSCSVSATTVSRIIDEAAQSLHQSPYSALPEHIMMDEFKSVKNVSGKMSFIYAYAQTHHIIDIVEDRRLSELKKYFYRFSLKARKRVKTVSIDMHEGYMTLIKEMFPNAKIVIDRFHIVQLLNRALNGIRVTVMNELRATNQPLYNRFKRYAKLLLKPEEDLEAFEYRKVALFKERKTQKGIVKYLLDQDDSLNDAYQYINQLRFKLKHNDYGGFIHELKHMPLSQTHSVVQRAIKTLNKHVYFIKNTFDYYNLSNGPLEGINNKIKLIKRTSFGYGSYNHLRNRILLCSKLYAPKSKKEVKQCLVA >LS483300.1|SQE32989.1|626392_628054_+|Arginyl-tRNA-synthetase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGYVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKRPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVAAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >LS483300.1|SQE32988.1|625979_626396_+|Uncharacterized-beta-barrel-protein-ywiB MDKKVSIQTMQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >LS483300.1|SQE32987.1|624694_625705_+|Alcohol-dehydrogenase MRAAVVTKDHKVSIEDKKLRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >LS483300.1|SQE32986.1|623689_624196_+|Putative-cytosolic-protein MSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVKGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >LS483300.1|SQE32985.1|622351_623647_+|Deoxyguanosinetriphosphate-triphosphohydrolase MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVSPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >LS483300.1|SQE32984.1|621835_622312_+|acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSHFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >LS483300.1|SQE32983.1|621130_621667_+|putative-NAD(P)H-dependent-FMN-containing-oxidoreductase-ywqN MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDIEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYSNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >LS483300.1|SQE32982.1|619982_620921_+|Oxidoreductase-ion-channel MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYIDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLVSGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFIPGVFEENVRRVKALESLAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKRAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >LS483300.1|SQE32992.1|630641_631529_+|Periplasmic-binding-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNDKQGSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYIKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK >LS483300.1|SQE32993.1|631679_632630_+|transporter MTFNKVLLSWMVILIITTSIYLFWQLGDINDVFNQSILINVRLPRLLEALLTGMILTVAGLIFQTVLNNALADSFTLGLASGATFGSGLALFLGLSTLWIPVFSITFSLITLITVLVITSVLSQGYPVRILILSGLMIGALFNSLLYFLILLKPRKLNTIANYLFGGFGDAEYSNVSIIAITFIIALFGIFIILNQLKLLQLGELKSQSLGLNVQLITYIALCVASMITAINVAYVGIIGFIGMVIPQLIRKWQWKQSLGRQLALNIVIGGQIMVMADFIGSHILSPVQIPASIIIALIGIPVLFYMLISQSKRLH >LS483300.1|SQE32994.1|632684_633404_+|L-2-haloalkanoic-acid-dehalogenase MDLNQIKAVVFDLEGTLLDRVKSREKFIEEQYERFHDYLVHVQLADFKKAFIELDDDEDNDKPDLYKEIIKRFHVDRLTWKDLFNDFEMHFYRYVFPYYDTLYTLEKLSQKGFQIGVIANGKSKIKQFRLHSLGLMHVINYLSTSETVGFRKPHPKIFEDMIDQLGVLPEQIMYVGDDALNDVAPARAMGMVSVWYKQEDAEIEPLEEEVDFTITTVEELLTILPIKNDNKGENYGSIY >LS483300.1|SQE32995.1|633387_634188_+|3-oxoadipate-enol-lactonase MDLFTRKDGTSIHYSTLGEGYPIVLIHTVLDNYSVFNKFAAELAKSFQVVLIDLRGHGYSDKPRHIEIKDFSDDIVELLKYLYIEEVAFVCHEMGGIIGADISVRYPEFTSSLMLVNPTSIEGELPEERLFRKYAHIIRNWDPEKQDKFLNKRKYYRPRKMNRFLKHVVDTNEISTKEEIQAVKEVFKNADISQTYRNVVVPTKIIAGEFGERTTRLEAKEVADLIQNADFEVYQESSAFPFVEEQERFVADTASFINKHHDEKHV >LS483300.1|SQE32996.1|634323_634830_+|exported-protein MKKLLTASIIACSVVMGVGIANTSAEAASGNSIDTVKQLIKGDQSLENVKIGESIKDVLTKYKNPMYSYNEDGTEHYYEFHTKKGMLLVTTDGKKNNGKVTHISMMYNDANGPTYQAVKNYVGKAVTHTEYSKVAGNFGYIEKGKTTYQFASAPKDKNIKLYRIDLEK >LS483300.1|SQE32997.1|634991_635708_+|Uncharacterised-protein MRINDKILLENIEDYFNHKGLSPHLIDDIKEKVITDIKNSEKKDQDYIEYKRKSPAQIILMIQRNLFALQMNPVIFFIINFILISYLYDKQYVQFQAITGMSLFYCLVIFPMTIVVYLRVSQKNYLRSNKIEMIMGTIIAIISLLLIILQAFNITWGVIPITNFGHQFFFFIGIILVIVGIFYKRLEFSGIGLLFCQKTVDAMIHNPQSAQIFSLIIWILLVVLVIYFTIRLSSRTRL >LS483300.1|SQE32998.1|635876_636665_+|hypothetical-esterase/lipase MNKVTINPQIQLTYQIEGKGDPIILLHGLDGNLAGFEDLQHQLASSYKVLTYDLRGHGKSSKSESYDLNDHVEDLKILMEKLNIHEAHILGHDLGGVVAKLFTDKYAYRVKSLTTIASKKDDLIHSFTQLLIQYQDDIAGFNKSEAYILLFSKLFRNQEKTMKWYQKQRIYSIKSEDDSAVAIRSLILHKDEPMYLKKRTCVPTLLINGEHDPLIKDKNHFKLEAHFLNVTKKIFEHSGHAPHIEEPEAFMNYYLNFLKSVS >LS483300.1|SQE32999.1|636917_637292_-|Staphylococcal-accessory-regulator-A-(SarA) MAITKINDCFELLSMVTYADKLKSLIKKEFSISFEEFAVLTYISENKEKEYYLKDIINHLNYKQPQVVKAVKILSQEDYFDKKRNEHDERTVLILVNAQQRKKIESLLSRVNKRITEANNEIEL >LS483300.1|SQE33000.1|638239_639169_-|Integral-membrane-protein MLLFYIIGVLVGMLIPIQTSVNSRLSLYTKSPFYTSFISFSVGTICLIILNIIINPEVFTIHFYNNQSFNYTWVVGGLLGVSFLTGNLLLLPKLGATLTVIATVAGQIIMGVIIDTFGLFGATIHDFNLIKAIGVLLLIIGIVIMNQFNKNNLLLTDQKYLLFWLLLGFIFGFFPPIQTTINSALASHTHSPAFASLVSFTIGSITLLILTAIFNRSLKLKTSHLKFGKLKPIYFTGGILGMAFVTANIILMPHMGAALTTLIGMFGQILMGILIDHFGLFGSPKIAMTSRKTIGLLCILTGIILLRLF >LS483300.1|SQE33001.1|639363_639588_-|Protein-of-uncharacterised-function-(DUF2922) MTKTLELSFKSSLDKPVKLQLPQLNNVVTEQVARDSMNALVDLNIIKSNSGTITKVHSAQIIDKTTTVLFEDKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483300_2 | 844272-844357 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483300_2
|
1 spacers
spacers of LS483300_2
>2.1|844298|34|LS483300|CRISPRCasFinder GGCGAGTTGGGGGGGCGGGGCCCCAACACAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483300_2
The CRISPR arrays of LS483300_2 >merge|LS483300|2|844272-844357|CRISPRCasFinder ATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAAGGCGAGTTGGGGGGGCGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAAACAA >LS483300|2|2|844272-844357|CRISPRCasFinder ATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAA GGCGAGTTGGGGGGGCGGGGCCCCAACACAGAGA ATTTCAAAAAGAAATTCTACAAACAA
>LS483300.1|SQE33198.1|843146_843968_+|Methionine-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGDVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >LS483300.1|SQE33197.1|842433_843129_+|Methionine-ABC-transporter-permease-protein MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >LS483300.1|SQE33196.1|841415_842441_+|Methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIVLITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHTVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKYAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSVDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >LS483300.1|SQE33195.1|840869_841166_+|Thioredoxin MNNSLDIKDVTKFYEEDKHLIFGYTPTCGTCKLSERMLDIANEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFKSVTDLLENLK >LS483300.1|SQE33194.1|840487_840877_+|DNA-primase/-small-primase-like-protein MMAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSDDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPFLPNINNERLVLVNE >LS483300.1|SQE33193.1|839132_840011_+|Putative-cytosolic-protein MLNIQDVSHLSKKEQKVYNRFVESVENGNLPILPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLDDLSEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLKDIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDVLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >LS483300.1|SQE33192.1|839017_839131_+|Uncharacterised-protein MKENLLGAIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGS >LS483300.1|SQE33191.1|838573_838954_+|Glycine-cleavage-system-H-protein MAVPNELKYSNEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >LS483300.1|SQE33190.1|838059_838416_+|Arsenate-reductase MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >LS483300.1|SQE33189.1|837595_837916_-|Thioredoxin MQAIKSNESFKSVTNSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >LS483300.1|SQE33199.1|844616_844811_+|CsbD-like-protein MADESKFEQAKGNVKETIGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >LS483300.1|SQE33200.1|845044_845896_-|membrane-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISNIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIFPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNGDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWIVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >LS483300.1|SQE33201.1|846223_846985_+|iron-sulfur-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >LS483300.1|SQE33202.1|847082_848390_+|Iron-sulfur-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVKGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >LS483300.1|SQE33203.1|848504_849746_+|Selenocysteine-lyase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFEAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF >LS483300.1|SQE33204.1|849735_850200_+|Iron-sulfur-cluster-assembly-scaffold-protein-IscU MNFNNLDQLYRSVIMDHYKNPRNKGVLDNGSMTVDMNNPTCGDRIRLTFDIEDGIIKDAKFEGEGCSISMASASMMTQAVKGHSLGEAMQMSQEFTKMMLGEDYVITEEMGDIEALQGVSQFPARIKCATLAWKALEKGTVAKEGKAEGTTEEE >LS483300.1|SQE33205.1|850350_851748_+|Scaffold-protein-sufB MAKKAPDVGDYKYGFHDDDVSIFRSERGLTENIVREISNMKNEPEWMLDFRLKSLKLFYKMPMPQWGGNLSELNFDDITYYVKPSEQAERSWDEVPEEIKRTFDKLGIPEAEQKYLAGVSAQYESEVVYHNMEKELEEKGIIFKDTDSALQENEELFKKYFASVVPAADNKFAALNSAVWSGGSFIYVPKNIKLDTPLQAYFRINSENMGQFERTLIIADEGASVHYVEGCTAPVYTTSSLHSAVVEIIVHKDAHVRYTTIQNWANNVYNLVTKRTFVYENGNMEWVDGNLGSKLTMKYPNCVLLGEGAKGSTLSIAFAGKGQVQDAGAKMIHKAPNTSSTIVSKSISKNGGKVIYRGIVHFGRKAKGARSNIECDTLILDNESTSDTIPYNEVFNDQISLEHEAKVSKVSEEQLFYLMSRGISEEEATEMIVMGFIEPFTKELPMEYAVEMNRLIKFEMEDSIG >LS483300.1|SQE33206.1|851815_852376_-|phage-related-integrase MMREEFEERIKNIEEQDYRELFTLMFYTGLRIGEAMALVWTDYNKYKKEISINKTMDTSNRTIYPRPKTDSSEDIVPLPKFINKMLTERHQREKELNKYFDERSYFIFGGMAPKHYSHVQKKFQKAFPHYNIHALRHSYASYLANNGVDIFVLQSLMRHAQITETMGTYSHLYTQKKHDAIAIFDK >LS483300.1|SQE33207.1|853037_853271_+|Phage-holin MKQKSFWVAILSAIFLFAQNIAKAIGYDIQVYTEQLTDGLNAILGFLVLTGVIQDPTTKGIGDSHQALEYEEPSRKY >LS483300.1|SQE33208.1|853282_854038_+|Autolysin MKTYSEARARLRWYQGRYIDFDGWYGYQCADLAVDYIYWLLEIRMWGNAKDAINNDFKNMATVYENTPSFVPQIGDVAVFTKGIYKQYGHIGLVFNGGNTNQFLILEQNYDGNANTPAKLRWDNYYGCTHFIRPKYKSEGLMNKITNKVKPPAQKAVGKSASKITVGSKAPYNLKWSKGAYFNAKIDGLGATSATRYGDNRTNYRFDVGQAIYAPGTLIYVFEIIDGWCRIYWNNHNEWVWHERLIVKEVY |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483300_3 | 915837-915981 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483300_3
|
2 spacers
spacers of LS483300_3
>3.1|915877|27|LS483300|PILER-CR ATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGT >3.2|915944|19|LS483300|PILER-CR CTGTGTTGGGGCCCACTCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483300_3
The CRISPR arrays of LS483300_3 >merge|LS483300|3|915837-915981|PILER-CR AACTTGCATTGCCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAGAATCTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCCAACTCGCATTGCTTGTAGAATCTCTTTTCGAAATTCTC >LS483300|3|1|915837-915981|PILER-CR AACTTGCATTGCCTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGC TCCGCGTCCAACTTGCATTGCTTGTAG AATCTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACTCCCC AACTCGCATTGCTTGTAGA ATCTCTTTTCGAAATTCTC
>LS483300.1|SQE33266.1|915523_915832_+|Putative-cytosolic-protein MEEALKDSILGALEMVIDPELGIDIVNLGLVYKVNVDDEGVCTVDMTLTSMGCPMGPQIIDQVKTVLAEIPEIQDTEVNIVWSPPWTKDMMSRYAKIALGVS >LS483300.1|SQE33265.1|914585_915410_-|hydrolase MQPHLICLDLDGTLLNDNKEISSYTKQVLNELQQRGHQIMIATGRPYRASQMYYHELNLTTPIVNFNGAYVHHPKDKNFKTCHEILDLGIAQNIIQGLQQYQVSNIIAEVKDYVFINNHDPRLFEGFSMGNPRIQTGNLLVHLKESPTSILIEAEESKIPEIKNMLTHFYADHIEHRRWGAPFPVIEIVKLGINKARGIEQVRQFLNIDRNNIIAFGDEDNDIEMIEYARHGVAMENGLQELKDVANNITFNNNEDGIGRYLNDFFNLNIRYYC >LS483300.1|SQE33264.1|913217_914534_-|Coenzyme-A-disulfide-reductase MPKIVVVGAVAGGATCASQIRRLDKESDIIIFEKDRDMSFANCALPYVIGEVVEDRKYALAYTPEKFYDRKQITVKTYHEVIAINDERQTVSVLNRKTNEQFEESYDKLILSPGASANSLGFETDITFTLRNLEDTDAIEQFIKANQVDKVLVVGAGYVSLEVLENLYKRGLHPTLIHRSDKINKLMDADMNQPILDELDKREIPYRLNEEIVAINGNEITFKSGRVEHYDMIIEGVGTHPNSKFIESSNIKLDRKGFIPVNDKLETNVPNIYAIGDIATSHYRHVDLPASVPLAWGAHRAASIVAEQIAGNDTIEFKGFLGNNIVKFFDYTFASVGVKPNELKQFDYKMVEVTQGAHANYYPGNSPLHLRVYYDTSNRQILRAAAVGKEGVDKRIDVLSMAMMNQLTVDELTEFEVAYAPPYSHPKDLINMIGYKAK >LS483300.1|SQE33263.1|912657_913047_+|Protein-of-uncharacterised-function-(DUF1516) MLHLHILSWVLAIILFIATYLNISKNQGGTPYFKPLHMVLRLFMLLMLISGFWILIQSFMNGGANHMLLTLKMLCGVAVVGLMEVSIAKRKRHEQSHTMFWITIALIIITMVLGVILPLGPLSKLFGIG >LS483300.1|SQE33262.1|911429_912332_+|Fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >LS483300.1|SQE33261.1|907610_911264_+|ATP-dependent-nuclease,-subunit-A MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQILTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNITAKIKEANEMMVDALKDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRMDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVNYDESAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLIEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTRSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLALSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQVEDSSRPNVNISIIYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >LS483300.1|SQE33260.1|904133_907610_+|helicase-exonuclease-AddAB,-AddB-subunit MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKCADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFKQSYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGYHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNLPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNINIDDEFGGEQ >LS483300.1|SQE33259.1|903398_903974_+|Signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKYNFNPENTKN >LS483300.1|SQE33258.1|902858_903383_+|Signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHGNNQHDSRQFGLVDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >LS483300.1|SQE33257.1|902278_902854_+|SNARE-associated-Golgi-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRSKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >LS483300.1|SQE33267.1|916469_917156_+|acyltransferase MNKTKGFTKYKKMRYMPGLDGLRAIAVLGIIIYHLNKQWLTGGFLGVDTFFVISGYLITSLLLKEYDDTGIIKLKRFWIRRLKRLLPAVIVLLMIVGTATLLLKSDNIIRVKHDIIATIFYVSNWWYIAKDVNYFEQFSFMPLKHLWSLAIEEQFYIFFPVILVTLLLTIKKRYKIGFIFWGVSIISLGLMMFIYSINGGSFTSVFWNRYKITDIVTGCYFSFFMATV >LS483300.1|SQE33268.1|917112_918285_+|acyltransferase MLLGVILAFLWPPFKLKNDPPKVVKYVIDSIGSLSFIVLILLFFIINDETNWIYDGGFYLISILTLFIIASVVHPSTWIAKIFSNPVLVFIGKRSYSLYLWHFAVISFVHSYYVDGQIPVYVYFIDISLTIIFAELSYRFIETPFRKEGIKALNWRPSYIPQFIRMAIVVTLLIPFMLILVGSFNKYGKDIIGEKANSFDTTIEDNYLMRIAPIDNIHIDGLVSEKKKESSDVYNNIKPLLIGDSVMVDIGESFKSSVPKSRIDGKVGRQLYQTLPLVKANYSQYKKSSDQVVLELGTNGDFTVKQLDDLLNQFGKAKIYLVNTRVPRIYEANVNRLLADAAKRKSNVTLIDWYKRSQGHSEYFAPDGVHLEYKGVLALKDEILKALKKK >LS483300.1|SQE33269.1|918487_921097_+|chaperone-protein-ClpB MDINKMTYAVQSALQQAVELSQQHKLQNIEIEAILSAALNESESLYKSILERANIEVDQLNKAYEDKLNTYASVEGDNIQYGQYISQQANQLITKAESYMKEYEDEYISMEHILRSAMDIDQTTKHYINNKVEVIKEIIKKGRGGNHVTSQNPEVNYEALAKYGRDLVEEVRQGKMDPVIGRDEEIRNTIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVKKDVPESLLDKTVFELDLSALVAGAKYRGEFEERLKAVLKEVKESDGRIILFIDEIHMLVGAGKTDGAMDAGNMLKPMLARGELHCIGATTLNEYREYIEKDSALERRFQKVTVSEPDVEDTISILRGLKERYEVYHGVRIQDRALVAAAELSDRYITDRFLPDKAIDLVDQACATIRTEMGSNPTELDQVNRRVMQLEIEESALKNESDNASKQRLQELQEELANEKEKQAALQSRVESEKEKIANLQEKRAQLDESRQALEDAQTNNNLEKAAELQYGTIPQLEKELRELEDNFQDEQGEDTDRMIREVVTDEEIGDIVSQWTGIPVSKLVETEREKLLHLSDILHKRVVGQDKAVDLVSDAVVRARAGIKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELAKSLAASLFDSEKHMIRIDMSEYMEKHAVSRLIGAPPGYIGHDEGGQLTEAVRRNPYSVILLDEVEKAHTDVFNVLLQILDEGCLTDSKGRSVDFKNTIIIMTSNIGSQVLLENVKETGEITEPTEKAVMTSLNAYFKPEILNRMDDIVLFKPLSIDDMSMIVDKILTQLNIRLLEQRISIEVSDDAKAWIGQEAYEPQYGARPLKRFVQRQIETPLARMMIKEGFPEGTTIKVNLNSDNNLTFNVEKIHE >LS483300.1|SQE33270.1|921155_922025_-|LysR-family-regulatory-protein MNLDWYYTFVILAKTLNYRLASEEINLTIPSIHKQIKNLEQHLNVKLFETYKNQIILTEDGHTFLPIAQNFIEQYESGIKHIQLKKTMFQSKLNVVVSSYIATFIMPKFLKSFFNEHPFIDVSLQVKNENIEKDINNHTYDIGISRNQPKLREVHSEKVCEGKIVLIAPNKENNYLLTEASLFEKYKIISDNHPEYWSSLKNNILNIYEKAQFLSINDVHTSIKLIEMNQGISFLPIYITTNSNYNISVINTKILQAPISFTYIYSKKESPEILAFIKSFKKYIANEQL >LS483300.1|SQE33271.1|922155_922671_+|Phospholipid-binding-protein MKIKTEFKRNNIPYEYAAGADVSDSINGNPIKSFPFEVTELPEGTKYLAWSLIDYDAIPVCGFAWIHWSVANVGVSGNSISIKADLSRTKGDYVQGKNSFTSGLLAEDFSEIENHYVGPTPPDKDHQYELTVYALDHSLNLKNGFYLNEFLKEVNQHKIDQTSINLIGRKI >LS483300.1|SQE33272.1|922981_923416_+|cell-surface-like-protein-Map-w MKLKSFITVTLALGMIATTGATVASNEVSAAEKDKLPATQKAKEMQNVPYTIAVDGIMAFNQSYLNLPKDSQLSYLDLGNKVKALLYDERGVTPEKIRNAKSAVYTITWKDGSKKEVDLKKDSYTANLFDSNSIKQIDVNVKTK >LS483300.1|SQE33273.1|923672_923858_-|Protein-of-uncharacterised-function-(DUF2929) MKHLVTFFWALLLMQMVNFVLNSLVGGDSLNVVNPIIMAVLFTIFTAIFAAVIKPPKDSSQ >LS483300.1|SQE33274.1|924152_925094_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-synthase,-KASIII MNVGIKGFGAYAPEKIIDNAYFEQFLDTSDEWISKMTGIKERHWADDDQDTSDLAYEASVKAIADAGIQPEDIDMIIVATATGDMPFPTVANMLQERLGTGKVASMDQLAACSGFMYSMITAKQYVQSGDYHNILVVGADKLSKITDLTDRSTAVLFGDGAGAVIIGEVSEGRGIISYEMGSDGTGGKHLYLDKDTGKLKMNGREVFKFAVRIMGDASTRVVEKANLTSDDIDLFIPHQANIRIMESARERLGISKDKMSVSVNKYGNTSAASIPLSIDQELKNGKLKDDDTIVLVGFGGGLTWGAMTIKWGK >LS483300.1|SQE33275.1|925105_926350_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-synthase,-KASII MSQNKRVVITGMGALSPIGNDVKTTWENALKGVNGIDKITRIDTEPYSVHLAGELKNFNIEDHIDKKEARRMDRFTQYAIVAAREAVKDAQLDINENTADRIGVWIGSGIGGMETFEIAHKQLMDKGPRRVSPFFVPMLIPDMATGQVSIDLGAKGPNGATVTACATGTNSIGEAFKIVQRGDADAMITGGTEAPITHMAIAGFSASRALSTNDDIETACRPFQEGRDGFVMGEGAGILVIESLESAQARGANIYAEIVGYGTTGDAYHITAPAPEGEGGSRAMQAAMDDAGIEPKDVQYLNAHGTSTPVGDLNEVKAIKNTFGEAAKHLKVSSTKSMTGHLLGATGGIEAIFSAFSIKDSKVAPTIHAVTPDPECDLDIVPNEAQDLDITYAMSNSLGFGGHNAVLVFKKFEA >LS483300.1|SQE33276.1|926403_926664_-|transposase MPLSQTHSVVQRAIKTLNKHVYFIKNTFDYYNLSNGPLEGINNKIKLIKRTSFGYGSYNHLRNRILLCSKLYAPKSKKEVKQCLVA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483300_4 | 1197738-1197823 | Unclear |
NA
Consensus repeat of LS483300_4
|
1 spacers
spacers of LS483300_4
>4.1|1197768|26|LS483300|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483300_4
The CRISPR arrays of LS483300_4 >merge|LS483300|4|1197738-1197823|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >LS483300|4|3|1197738-1197823|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACATAGAAGCTGGCGG AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>LS483300.1|SQE33534.1|1197076_1197427_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR >LS483300.1|SQE33533.1|1196236_1196974_+|tRNA-(Guanine37-N1)--methyltransferase MKIDYLTLFPEMFDGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQTRVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >LS483300.1|SQE33532.1|1195733_1196237_+|16S-rRNA-processing-protein MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEYYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKGSKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >LS483300.1|SQE33531.1|1195270_1195546_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >LS483300.1|SQE33530.1|1193561_1194929_+|Signal-recognition-particle,-subunit-FFH/SRP54 MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIILVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >LS483300.1|SQE33529.1|1193203_1193536_+|Signal-recognition-particle-associated-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKQHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >LS483300.1|SQE33528.1|1191966_1193217_+|Signal-recognition-particle-receptor-protein-FtsY-(=alpha-subunit) MSFFKRLKDKFATNKENEEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLIARYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >LS483300.1|SQE33527.1|1188400_1191967_+|putative-chromosome-partition-protein MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIIVTVHDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLEERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISNEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEAKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQVYRYNEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIQSRVVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKASLKRLEDEIERYTKLSKEGKESVTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIVLNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAVFKQLFGGGNAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >LS483300.1|SQE33526.1|1187522_1188254_+|Ribonuclease-III MSKQKKSEIINRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDVFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >LS483300.1|SQE33525.1|1187173_1187407_+|Acyl-carrier-protein-/-HmrB-protein-involved-in-methicillin-resistance MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >LS483300.1|SQE33535.1|1197896_1200503_-|integral-membrane-protein MLKKWLNSNVKQFLVITFMSVILTLILFSTHIYEYIVNGTVFSGAGDGFRQMMPFQMYLYEHLSSFSSLYDASFGLGGDYMKGLSYYYSLSPLIWLNFLFIKIGETVGIFNPTTIHFWPTNQLIMAMIRAIITFVVTFYLFKILHFKRSTNMIATILYGMSTVVIYFNFTWSFYGNLLYLLPLSILGLERYFQQRKIGIFIVAIALTLFSNFYFSYYQAIIIGCYYLYRLIFTYKYDIVSRTQKLICVISATVLSVLSSVFGLFTGISAFLENDRKQNPNVDIPFLTPLDYHYFFFSDGFFITISILTIVALLSFKLYRFYFYRLFAIITWILFIGSLSQYFDSAFNGFSFPERRWVYILALSSSALCGLFIQHLSTLNMKYYLIRTIPVIIIALLYVLLSPTHPLALIVGIILLMVLAVILKFSLWRYKKLTVAILVLIVMIQQIVILDNNKNMAIKPYQQSLSTLKQHDYHSNYVNQLIKKINQNATGPFNRIDYMSDYALNSPFIYHYNGISLYSSIFNGDILKYYDKTLQINMPIDKNSTYRLLGNRQNLLSLWNVNDRIRVNHDDNLPYGFKINSEHKDNKVRWIHSKNTIHYPSAHITNKVFSNKELKSPLDKEQAMLQGIVSNNTKDVNTHFKANKNLLTDSTIKLNSAAWQSPTKHLLQVKQNNGGLTVQLPKSVSNQFKDLYFEMDLELLSPDKAHDVKVNEYTQERNKLTYKYRRFVTPVTIRIKASDRIRLSLPKGKYRVNLKGIYGEDYTTLKDASNSLEAVKVSKTKQGYTITKNKNSSGYIVLPTAYNQGMKATSGDQSLKVEQVNGVMTGIKAPKNITKIQLSYTPPYYYLLITITIFGIICSIIFTRWARQK >LS483300.1|SQE33536.1|1200903_1201788_+|50S-ribosomal-subunit-maturation-GTPase-RbgA MVIQWYPGHMAKAKREVSEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDEVINQKPRVVILNKKDMSNLNEMSKWEQFFIDKGYYPVSVDAKHGKNLKKVEAAAIKATAEKFEREKAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLAKRSIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGNALQLLDTPGILWPKFEDEEVGKKLSLTGAIKDSIVHLDEVAIYGLNFLIQNDLARLKAHYKIEVPEDAEIIAWFDAIGKKRGLIRCGNEIDYEAVIELIIYDIRNAKIGNYCFDIFKDMTEELANDANN >LS483300.1|SQE33537.1|1201771_1202539_+|Ribonuclease-HII MTLTIKEVTQLINAVNTIEELENHECFLDERKGVQNAIARRRKALEKEQALKEKYVEMTYFENEILKENPNAIICGIDEVGRGPLAGPVVACATILNSNHNYLGLDDSKKVPVTKRLELNEALKNEVTAFAFGIATAEEIDEFNIYKATQIAMQRAIDGLSVQPTHLLIDAMTLDNALPQVSLIKGDARSVSIAAASIMAKVFRDDYMTQLSKDYPEYGFEKNAGYGTKQHLLAIDDIGIMKEHRKSFEPIKSLL >LS483300.1|SQE33538.1|1202647_1203814_+|Succinyl-CoA-ligase-[ADP-forming]-beta-chain MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAEEAVEKAKEFNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYAKELLGKTLVTHQTGPEGKEIKRLYIEEGCAIQKEYYVGFVIDRATDQVTLMASEEGGTEIEEVAAKTPEKIFKETIDPVIGLSPFQARRIAFNINIPKESVNKAAKFLLALYNVFIEKDCSIVEINPLVTTADGDVLVLDAKINFDDNALFRHKDVVELRDLEEEDPKEIEASKHDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDAGGSATREKVTEAFKIILGDENVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVEAVKEVDLTLPLVVRLEGTNVELGKKILKDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >LS483300.1|SQE33539.1|1203835_1204744_+|Succinyl-CoA-ligase-[ADP-forming]-alpha-chain MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTKIVAGVTPGKGGQVVEGVPVFNTVEEAKNETGATVSVIYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVLDMVKVKRYLQGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNEDDETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFIGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAEEKIKTLNSCGVKTAATPSEIGSTLIEAAKEAGIYESLLTVNK >LS483300.1|SQE33540.1|1205065_1205938_+|DNA-processing-protein MLNHILLKLIWSRFTTAQIHLLLKTFPSCCEVDEYERMHILENFCKLLADKKIDAKVNRYKEISVDEIETTIQKTQLNYITCFDHNYPYLLKETYNYPIILFYKRNINHLSYSHTLAVVGSRLSGDYTLKALNHLFASFQQMSFCVVSGLAQGADAMAHQIALKYNLPTIAVLAFGHQTHYPKSTLALRNKIEEKGLVISEYPPHTPIAKYRFPERNRIISGLSKGVLITEAKEQSGSHITIDFALEQNRNVYVLPGSMFNPMTKGNLLRIQEGAKVVLNANDIFEDYYI >LS483300.1|SQE33541.1|1206111_1208187_+|DNA-topoisomerase-I MTLADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDTEDNYEPKYITIRGKGPVVKELKKHAKKAKNVFLASDPDREGEAIAWHLSKILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKNPREIEMNLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWIIEGEFRYKKSKFNAKFLHYKNKPFKLKTKKDIEKITAALDGDQFEITNVTKKEKTRNPANPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMVAQQLYEGIDLKKQGTIGLITYMRTDSTRISDTAKAEAKQYITDKYGESYTSKRKASGKQGDQDAHEAIRPSSTMRTPDDMKSFLTKDQYRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVSLDITQGDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVETKDDIDSEKENKLPKLEQGDKVTATQIEPAQHYTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLESKRFVPTELGEIVHEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDITWRKVIDGFFSSFKQDVERAEEEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKSIGVKCPKCNDGDVVERKSKKNRVFYGCSKYPECDFISWDKPIGRDCPKCNQYLVENKKGKTTQVICSNCDYKEAAQK >LS483300.1|SQE33542.1|1208342_1209650_+|tRNA:m(5)U-54-MTase-gid MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAERGIKVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNGVGVLKEEMRRLNSIIIEAADKARVPAGGALAVDRHDFSGYITETLKNHENITVINEEINAIPDGYTIIATGPLTTETLAQEIVDITGKDQLYFYDAAAPIIEKESIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEDEFNRFYDAVLEAEVAPVNSFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPYAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIKLIPGLENVDIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELISQPNIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGINLAHKILGKGEVVFPRETMIGSMAYYISHAKNNKNFQPMNANFGLLPSLETRIKDKKERYEAQANRALDYLENFKKTL >LS483300.1|SQE33543.1|1210068_1210965_+|Site-specific-tyrosine-recombinase MNHIQEAFLNTLKVERNFSEHTLKSYQDDLIQFNQFLEQEHLQLNTFEYRDARNYLSYLYSNHLKRTSVSRKISTLRTFYEYWMTLDENIINPFVQLVHPKKEKYLPQFFYEEEMEALFKTVEEDTSKSLRDRVILELLYATGIRVSELVNIKKQDIDFYANGVTVFGKGSKERFVPFGAYCRQSIENYLEHFKPIQSCNHDFLIVNMKGEAITERGVRYVLNDIVKRTAGVSEIHPHKLRHTFATHLLNQGADLRTVQSLLGHVNLSTTGKYTHVSNQQLRKVYLNAHPRAKKENET >LS483300.1|SQE33544.1|1210961_1211507_+|ATP-dependent-protease-HslV MSNTTLHATTIYAVRHNGKAAMAGDGQVTLGQQVIMKQTARKVRRLYEGKVLAGFAGSVADAFTLFEKFETKLQQFSGNLERAAVELAQEWRGDKQLRQLEAMLIVMDKDAILVVSGTGEVIAPDDDLIAIGSGGNYALSAGRALKHHASHLSAEEMAYESLKVAADICVFTNDNIVVETL |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483300_5 | 1881289-1881416 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483300_5
|
1 spacers
spacers of LS483300_5
>5.1|1881327|52|LS483300|CRISPRCasFinder ATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTAGTATTA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483300_5
The CRISPR arrays of LS483300_5 >merge|LS483300|5|1881289-1881416|CRISPRCasFinder AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTCATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTAGTATTAAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTC >LS483300|5|4|1881289-1881416|CRISPRCasFinder AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTC ATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTAGTATTA AATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTC
>LS483300.1|SQE34157.1|1879568_1880630_-|Regulatory-protein MSNAKNADNKQFFSKILNSIGAGVVIALVPNALLGEVLKIFKSGNEILELTYQLVILIQSFMAFIIGVLAAHQFKFNGAGAAIVGTSAMIGSGAVVYSNNSFMLKGIGDIINTSLVVIIACLIYMVLQNKLGSFELIILPVLVPIVSGGIGLITLPYIRKITQAIGNVIHSFTELNPLLMSILISVAFSLLMVTPISLVAIATAISLNGLGSGAANLGIVAACVTFLFGSLRVNSIGVNAVLLIGAAKMMIPVYLKNLIISIPLTINGIITGIIAYVLQVKGTPLSAGFGYTGLVGPINAFNRMSGDPTMNIILLALGYFVIPFVSAFIVHELCKKFIPIYSNDIYKFEVPKQ >LS483300.1|SQE34156.1|1877852_1879310_-|extracellular-glutamine-binding-protein MKCLIRFILVLGLLISSAMGYINPTAHAEQDQTWDKIKERGELRVGLSAGYAPMEFEHTVNGKTEYAGVDIDLAKKIAKDNNLKLKIVNMSFDSLLGALKTGKIDIIISGMTSTLERKKQVDFSDSYMMTKNIMLVKKDKVNEYKDIKDFNNKKVGAQKGTEQEKIAQTEIENASITSLSRLPDVILALKSGKVEAAVVEKPVAEAYLKQNPKLGISNVKFNEEEKDTVIAVPKDSPKLLSQINKTIKEVKDKGLIDKYMTNAANAMNDDSGFISKYGSFFLKGIKITILISLIGVALGSILGAFVALMKLSKIKIISWIASIYIEILRGTPMLVQVFIVFFGITAALGLDISALVCGTIALVINSSAYIAEIIRAGINAVDKGQMEAARSLGLNYRQTMKSVIMPQAIKNILPALGNEFVTLIKESSIVSTIGVGEIMFNAQVVQGISFDPFTPLLVAAALYFVLTFVLTRIMNMIEGRLNASD >LS483300.1|SQE34155.1|1877137_1877866_-|Glutamine-transport-ATP-binding-protein-glnQ MPVIKINNLNKVFGDNEVLKDINLEINQGEVVAIIGPSGSGKSTLLRCMNLLEVPTKGQVIFEGNDLTEKGTQVDKLRQKMGMVFQNFNLFPHKKVVDNIILAPKLLKKDNNDELHKEALSLLDKVGLKEKADVYPNQLSGGQKQRVAIARALAMHPDVILFDEPTSALDPEVVGDVLKVMKDLAKEGMTMVVVTHEMGFAKDVSDKVIFMADGVVVESGTPVEIFEQPQHERTQNFLARVL >LS483300.1|SQE34154.1|1875859_1876987_-|iron-sulfur-cluster-binding-protein MDTKQLKQDIIDYAYTIGIDSIGFTTADPFDELKQKLEAYHANGYASGFEESDIALRTEPKLSLPTARSIIAIAVGYPNKLKGAPKSVRGDRRGLFARASWGQDYHTIMRKRLDMLAAFIESKVPDVEIKSMVDTGVLSDRAVAERAGLGFVGRNGFVINPKLGTWTYLGEMLVSIPFEPDDPLLDSCGDCTICVDRCPTSALVGNGQLNSQKCISFLTQTKGYMPDQYRYKIGNRLYGCDTCQQVCPKNRGINIEQDDIILEPEILKPRLVPLLRMSNKEFKQTYGHLAGAWRGKKPIQRNAILALAHFNEVDAIPELKKVATTDERPMIRATAYWAIGQILGEEARDFINANYDQEDAEVQNEMIKGMDTRRE >LS483300.1|SQE34153.1|1875384_1875855_-|tRNA-(cytosine34-2-O-)-methyltransferase MTNHIVLYQPEIPANTGNIARTCAGTNTHLHLIKPLGFRTDDKMLKRAGLDYWEFVNITYHDSIEAFFEATNGEYYLLTKFGKKTYSDFDFSNHDKDFYFIFGKETTGLPDWVKEKYQDTALRIPMSEHIRSLNLSNTAALLIYEALRQQDFPGLN >LS483300.1|SQE34152.1|1874626_1875226_-|glucosamine-6-phosphate-deaminase MAMNFKVFDNSQLVAEYAADIIRKQFNNNPTTIAGFHLDTDQAPVLDELKKNIEKHAVDFSQINILDYDDKKSYFEALGVPAGQVYPIAYEKDAIELIADKIKTKENKGKLTLQVVSIDEQGKLNVSIRQGLMEAREIFLVVTGANKRDVVEKLYQENGKTSFEPADLKAHRMVNVILDKEAAAGLPEDVKAYFTSRFA >LS483300.1|SQE34151.1|1874449_1874602_-|putative-staphylococcal-protein MSKDKDPKLNYHEEENSMVTDFEDLKDLGKEMEQISDQNDQEKNSEEDSQ >LS483300.1|SQE34150.1|1873568_1873964_-|membrane-protein MLGKYWIQLLIATVIISLISIKAFPLAIGALYLPVIFKVIKLQLNLSKGLIDDVNAQTFIKSNQSGIVISVICCLLITGILYYTLDGFYASLTGVLGTLVALNPYTTIVSAVLYILTAIATVEATKTKYRN >LS483300.1|SQE34149.1|1871987_1873373_-|Fumarate-hydratase-class-II MSVRIEHDTFGEIEVPADKYWGAQTERSKRNFPVGKERMPIEVVYGFAQLKRAAALANFDLGKLSEAKKDAIVYACDQILSGELDEHFPLVVWQTGSGTQSNMNVNEVVSYVANMYLKDHQSDESIHPNDDVNKSQSSNDTFPTAMHVALYQEVETKLEPALKLLRNTLKEKEDKFDSIIKIGRTHLQDATPIKLGQEISGWRYMLDRCETMLSESKKHILNLAIGGTAVGTGINAHPEFGDKVAHYISENTGYPFVSSENKFHALTAHDEVVQLHGTLKALAGDLMKIANDVRWLASGPRAGLAEISIPENEPGSSIMPGKVNPTQCEMLTMVAVQAMGNDTVVGFASSQGNFELNVYKPVIMHNTLQSIYLLADGMETFNNNCAVGIEPIEENIDNYLNQSLMLVTALNPHIGYEKAAQIAKKAHKEGLTLKESAIQTGYVTEEQFEAWIKPEDMVDPH >LS483300.1|SQE34148.1|1870715_1871537_+|ribosomal-large-subunit-pseudouridine-synthase-D MKFKIPENFNDLSLRDIFQQLKVPKKDLHHLNMSKDITINDKPARLMDKVHTDDDVFVPTIDEKSNYVPSYRYAQIKYEDDDMAIVMKPKGVKTHPNDLKESNTLMNHVIYTVDSDYVEPIHRLDQETVGLLIVAKNPLMKKILDRMLEDNDITRIYKANVKALLPLKPQTIDMPIGKDKFHSNKRRVSPTGQRAITHILTSKMIKETVCQLEIKLDTGRTHQIRVHLAEIGHPVIGDPLYGDSTLRQLELESYKIEFVHPLTKEVISVSLDD >LS483300.1|SQE34158.1|1889484_1889931_-|Peroxide-stress-regulator-PerR,-FUR-family MSVEIESIEHELEESIASLRQAGVRITPQRQAILRYLISSHTHPTADEIYQALSPDFPNISVATIYNNLRVFKDIGIVKELTYGDSSSRFDFNTHNHYHIICEQCGKIVDFQYPQLNEIERLAQHMTDFDVTHHRMEIYGVCKECQDK >LS483300.1|SQE34159.1|1890027_1890987_-|D-3-phosphoglycerate-dehydrogenase MTYMRVVGLNRMREVETELQQRFSDVDFKFYKKASEIPESDLADLDILVGYDGGINEAFLRRCPNLKWIAWFATGVNTLPLDYISDHGILLTNGKGVQAKQLSEYILAFILDDYKKMKLSYDNQRQHIYDSKITGKRLSGQTVLFLGTGAIATRTAKLAKAFNMNLIGLSKSGQNKHEFDEIYTIESLESTLPNADIVINALPETQETIHLLKKNHFELMKDEALFINIGRGSIVKEALLIEVLKSRVIRHAYLDVFENEPLKPNHELYELDNVTITAHITGNDYEAKYDLLDILKNNLVNFLNKNGLIENEVDAKKGY >LS483300.1|SQE34160.1|1890983_1891439_-|Thiol-peroxidase,-Bcp-type MLQKGEQFPIFKLENQDGTVITNDTLKGKKTIIYFYPRDNTPTCTTEACDFRDNLEMFNDLDVAVYGISGDSKKKHQNFIEKHGLNFDLLVDEDFKLAKETGVYQLKKSFGKESMGIVRTTFIIDEQGKVLDVIEKVKVKTQIEELKNILG >LS483300.1|SQE34161.1|1891519_1892809_+|Glutamate-1-semialdehyde-aminotransferase MNFSESERLQQLSNEYILGGVNSPSRSYKAVGGGAPVVMKEGRGAYLYDVDGNKFIDYLQAYGPIITGHAHPHITKAIQEQAAKGVLFGTPTELEIEFSKKLRDAIPSLEKIRFVNSGTEAVMTTIRVARAYTKRNKIIKFAGSYHGHSDLVLVAAGSGPSQLGSPDSAGVPESVAREVITVPFNDINAYKEAIEFWGDEIAAVLVEPIVGNFGMVMPQPGFLEEVNEISHNNGTLVIYDEVITAFRFHYGAAQDLLGVIPDLTAFGKIVGGGLPIGGYGGRQDIMEQVAPLGPAYQAGTMAGNPLSMKAGIALLEVLEQDGVYEKLDSLGQQLEEGLLKLIEKHNITATINRIYGSLTLYFTDEKVTHYDQVEHSDGEAFGKFFKLMLNQGINLAPSKFEAWFLTTEHTEEDIKQTLKAADYAFSQMK >LS483300.1|SQE34162.1|1893101_1894196_+|integral-membrane-protein MRLGARIFKTGIAIILAMSIASLLPDDVGLKALAGVSAVVAMQPSIYRSFKTVSDQALGNIIGAILSVTMVTIFSDNFIIMGVTVIVLIAILFKFNLAHVATLASVTALIIMGQHTGSFYITAFYRFVLVMIGVISSSLVNFVFLPPKFETKIYYNSLNISSDIFMWFKLVLNDTTEFNNIKQDSHNLKQRVEKLEKIYDYYSEERPITKKHIHQQNRKKILFREVVQTTRQAYEVLNKLSRYQNDLYLLNNNFLLQIKLDLDSLTAFHEQILASLSKKARYNVTHVDYELDNPQKKDLLSTFQHELINHPYQTEYSFANVMQIVAAIEEYRHHLEHLDRIRISFFTYHRSDADIEIVEEDFDL >LS483300.1|SQE34163.1|1894386_1896123_-|Lipid-A-export-ATP-binding/permease-protein-MsbA MIKRYLQFVKPYKYRIFATIIVGIIKFGIPMLIPLLIKYAIDGVINNHALTTDEKVHHLTIAIGIALFIFVIVRPPIEFIRQYLAQWTSNKILYDIRKKLYNHLQALSARFYANNQVGQVISRVINDVEQTKDFILTGLMNIWLDCITIIIALSIMFFLDVKLTLAALFIFPFYILTVYVFFGRLRKLTRERSQALAEVQGFLHERVQGISVVKSFAIEDNEAKNFDKKNANFLTRALKHTRWNAYSFAAINTVTDIGPIIVIGVGAYLAISGSITVGTLAAFVGYLELLFGPLRRLVASFTTLTQSFASMDRVFQLIDEDYDIKNGVGAQPIEIKQGRIDIYHVNFQYNDNEAPILKDINLSIEKGETVAFVGMSGGGKSTLINLIPRFYDVTSGQILIDGHNIKDFLTGSLRNQIGLVQQDNILFSDTVKENILLGRPTATDEEVVEVAKVANAHDFIMNLPQGYDTEVGERGVKLSGGQKQRLSIARIFLNNPPILILDEATSALDLESESIIQEALDVLSKDRTTLIVAHRLSTITHADKIVVIENGHIVETGTHRELIAKQGAYEHLYSIQNL >LS483300.1|SQE34164.1|1896412_1896955_-|Putative-cytosolic-protein MVRESIPKEGENIKIQSYKHDGKIHRVWSETTILKGTDHVVIGGNDHTLVTESDGRTWITREPAIVYFHSEYWFNVICMFREDGIYYYCNLSSPFVCDEEALKYIDYDLDIKVYPNGKYHLLDEDEYEQHMNQMNYPHDIDIILRRNVDILQQWIEQKKGPFAPDFIKVWKERYKKIRQY >LS483300.1|SQE34165.1|1897257_1898295_-|A/G-specific-adenine-glycosylase MYQQSSFKENLIHWFDENQREMPWRQTTNPYYIWLSEVMLQQTQVKTVIDYYHRFVERFPTVEVLSQASEDEVLKYWEGLGYYSRARNFHTAIKEVHDKYEGLVPKDPDQFIALKGVGPYTQAAVMSIAYNVPLATVDGNVFRVWSRLNDDYRDIKLQSTRKSYEQELLPYVTTESGTFNQAMMELGALICTPKNPLCLFCPVQENCVAFDKGTFEKLPVKSKNVSKKVIEQSVFLIRNNQGQYLLQKRSEKLLHGMWQFPMFESEHARREMTEKIGHDIQPVETPIFELKHQFTHLTWKIKVYAVSGTINIETLPDDMIWFDLSDRDQYTFPVPMSKIYQFING >LS483300.1|SQE34166.1|1898446_1899424_+|membrane-bound-metal-dependent-hydrolase MDTATHIAIGVGLTALATQDPAMASTFGATATTLIVGSLIPDGDTVLKLKDNATYISHHRGITHSIPFTILWPILITFLIFTFFSGTNPFHVWMWAQLAVFLHVFVDIFNSYGTQALRPITNKWIQLSVINTFDPIIFTVLCIGIVLWVIGLHPFAVFFPIIALLIIYYMIRFKMRAVIKQQALKAIQQEHHPVKVFVAPTIKFMEWRVAIQTDAHDYVGKAYGMNVVFSDKVERQTLSTDSILWKVKGNKDIRTFLNFSSIYRWQTTTLADGSTEIRLIDLRYLKNDHYSFVAIAHVTNDNLIDHSYIGWVFTEDKLQRKLYAK >LS483300.1|SQE34167.1|1899684_1900521_-|Teichoic-acid-translocation-permease-protein-TagG MLDNIILYFKNLPHTKRYVTERLKQSWKSFLIVLAVCLILIIASETLFSFSHLTDVKEVRWLFRIIALIVFAVLMFTIYISYHHYMNDFLVTKLFNISAATPVVIMSILSFIMLVILTMISALVKPVNFETSYIALFYFIVMATIFVGLISVTFGLIRLLTEKINIIFYGICVLCFLVLPIIFIPNPNHVFINHILMLNPMYYIVNGIAQSIIFGISSMENIPYHFYFILFLCLIAAVNFVLARYTTHAIYNKTSKVTQTDNQQDVSNDSTDEEDTSS |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483300_6 | 2124305-2124398 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483300_6
|
1 spacers
spacers of LS483300_6
>6.1|2124332|40|LS483300|CRISPRCasFinder ACTTTAGTTGTTAGGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGTAG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483300_6
The CRISPR arrays of LS483300_6 >merge|LS483300|6|2124305-2124398|CRISPRCasFinder CATCCAACTGTGTTCCTCTATCTTACAACTTTAGTTGTTAGGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGTAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTACA >LS483300|6|5|2124305-2124398|CRISPRCasFinder CATCCAACTGTGTTCCTCTATCTTACA ACTTTAGTTGTTAGGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGTAG CATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTACA
>LS483300.1|SQE34387.1|2123156_2124212_+|Lytic-regulatory-protein MFTYFKSALKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQNIAIYSQFGQKPPGDEYLKVIAVLLIAAIVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGIYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIFVVLLIKAIITWLLVIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFIVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENDKVTTSVETKTEKAQDSLNDNTTKQ >LS483300.1|SQE34386.1|2121911_2122892_+|Cobalt-zinc-cadmium-resistance-protein MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALIAFIYAEKNAIATKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESMICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >LS483300.1|SQE34385.1|2121589_2121910_+|Zn(II)-or-Co(II)-specific-transcriptional-repressor-protein MSEQYSEINTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >LS483300.1|SQE34384.1|2120772_2121438_-|oxidoreductase-ylbE MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVAFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFEGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNHQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >LS483300.1|SQE34383.1|2119398_2120337_-|mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSVFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIIIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >LS483300.1|SQE34382.1|2119137_2119368_-|membrane-protein MKQFLYIVLVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >LS483300.1|SQE34381.1|2117090_2118464_-|EVE-domain-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >LS483300.1|SQE34380.1|2116219_2116633_-|thiol-disulfide-oxidoreductase MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYQFATLKGEVEQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >LS483300.1|SQE34379.1|2115576_2116020_-|Non-specific-DNA-binding-protein-Dps-/-Iron-binding-ferritin-like-antioxidant-protein-/-Ferroxidase MSNQQDVIKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >LS483300.1|SQE34378.1|2114745_2115456_+|Purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGTYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNDAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >LS483300.1|SQE34388.1|2124762_2125620_-|Putative-cytosolic-protein MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPEDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLDQVKQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMREMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVNEFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIEHFGINQEETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >LS483300.1|SQE34389.1|2125687_2126470_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQVGRMKQGKTILKNISWQINGGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATNGGVNLFGKMPSKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQEGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGMSAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPVAGLDFIARESLLSILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSHFFRKKVAVQRWNNRFSMAMLE >LS483300.1|SQE34390.1|2126701_2128507_-|glucosamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSGDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEEGTPVVGLATQEKVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVTLQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >LS483300.1|SQE34391.1|2129187_2130726_+|PTS-system,-mannitol-specific-IIBC-component MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIVGFKVLAPVMKFIMYILSVAVESLVHAHLLPVVSILVEPAKILFLNNAINHGVFTPLGTDQAAKVGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFFGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKTPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLSTLVSFVVAALIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >LS483300.1|SQE34392.1|2130760_2132893_+|PTS-system-mannitol-(Cryptic)-specific-transporter-subunit-IIA MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVEAYLTSFSLTLERANKKGLRIAGENSDLNDLKQSIAQHQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELYLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLGQIYDVTFNQAEIDFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVKKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDSPYLTVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMIDKDDVHVETKDIDGNTSFENEQTSNLTSVFEKHLSDEKSEQLMHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDAIKDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLALPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMKNPQELETLLRNKFLERIKKQFI >LS483300.1|SQE34393.1|2132904_2133339_+|PTS-system-mannitol-specific-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >LS483300.1|SQE34394.1|2133338_2134445_+|Mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEGDIITTAVGVNILPIIAKSFAPFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFADKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTADQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >LS483300.1|SQE34395.1|2134763_2140697_-|truncated-methicillin-resistance-related-surface-protein MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISTNPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADVNTQPNANAGAQANPTAQPAAPANQGQPAAQPANQGGQANPAGGAAQPNTQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQAAPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPANAPAAAQPAAPVAANAQTQDPNASNTREGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQARGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGISKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEFTINTEVGNNGNFGASLKADQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQTANTNSDVTTAKDNGIAAINQVQAVTTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTTEEQQAAKDKVDQAVVTANTDIDNAAANTDVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPTAKQAIADKVQAQETAIDANNGATTEEKATAKQQVQTEKTTADTAIDGAHSNAEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDDAKQAITTKANERKTAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVTQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITTILNNKLQEIQATPDVTDEEKQTADAEANTENGKANQAISAATTNAQVDEAKANAEAAINAVTSKVVKKQAAKDEIDQLQVAQTSVINNDQNATTEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAATDDNGVDTAKDAGKNSIQSTQPATAVKSNAKNEVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVLKVKEKAYQDILNAQTTNDVTQIKDQAVADVQGITADTTIKDVARDELATKANEQKALIAQTADATTEEKEQENQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKDNAIQAIDPIQASTDVKTNARAELLTEMQNKITEILSDNTTTNEEKGKDIEPVRATYEEGLNNINTANTTGDVTTAKDTAVQKVQQLHANPVKKPAGKTALDQAAADRKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDAVLNQAKTNVDQSSTNEYVDNAVKEGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIADAYNAKVNEEDNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKETATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALESINNGVDNSDVDDALTQGKAAIDTIQVDATVKPKANQAIEAKAEDTKESIDHSDQLTAEEKTEALAMIKQITDQAKKGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELEAALDQIEAGVNVDADATTEEKEAFTNALEDILSKATEDISDQTTNAEIATIKNSALEQLKAQRINPVVKKNTLEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADKLDKTQTNTEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPNANDTNNGTDNNDATANSNANATPENTGQPNVTESTDNANADTSSTTTNNQNDTTTGETTATSANSSATNDANNKPTANNNSSVDASTDNSATGNGTTDKPEVESTNNGTTDKPATETDNATPAESTTNNNSTTTATNENVPTGSTATAPTTASTEATSSADSKDNASVNDSKQNAEVNNSAESQSTNGKVAQPKSENKAKAEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPKVSSNTSKDKEESTTNQTDAEQHNSDTNVTSNEVVKSPSKADTDVSNKPSTSASSEAKDKMTSTNVSQTDDTATADTNDTQKSVGSAANNKAKDMQTNDMKAPLATVSKGSNSANQDMLNVTKTKENKANAKSVQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDHQTEE >LS483300.1|SQE34396.1|2140974_2142330_-|Phosphoglucosamine-mutase-/-FemD,-factor-involved-in-methicillin-resistance MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFGSDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERYAQQIADVVQDKMGLDK >LS483300.1|SQE34397.1|2142356_2143289_-|ybbR-like-family-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSKSDIDPLFKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVKPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483300_4 | 4.1|1197768|26|LS483300|CRISPRCasFinder | 1197768-1197793 | 26 | LS483300.1 | 24157-24182 | 0 | 1.0 |
| LS483300_4 | 4.1|1197768|26|LS483300|CRISPRCasFinder | 1197768-1197793 | 26 | LS483300.1 | 755281-755306 | 0 | 1.0 |
| LS483300_4 | 4.1|1197768|26|LS483300|CRISPRCasFinder | 1197768-1197793 | 26 | LS483300.1 | 1248125-1248150 | 0 | 1.0 |
| LS483300_4 | 4.1|1197768|26|LS483300|CRISPRCasFinder | 1197768-1197793 | 26 | LS483300.1 | 2272981-2273006 | 0 | 1.0 |
| LS483300_3 | 3.2|915944|19|LS483300|PILER-CR | 915944-915962 | 19 | LS483300.1 | 1113657-1113675 | 1 | 0.947 |
| LS483300_3 | 3.2|915944|19|LS483300|PILER-CR | 915944-915962 | 19 | LS483300.1 | 37826-37844 | 2 | 0.895 |
| LS483300_3 | 3.2|915944|19|LS483300|PILER-CR | 915944-915962 | 19 | LS483300.1 | 793959-793977 | 2 | 0.895 |
| LS483300_3 | 3.2|915944|19|LS483300|PILER-CR | 915944-915962 | 19 | LS483300.1 | 1013301-1013319 | 2 | 0.895 |
| LS483300_3 | 3.2|915944|19|LS483300|PILER-CR | 915944-915962 | 19 | LS483300.1 | 1322763-1322781 | 2 | 0.895 |
| LS483300_3 | 3.2|915944|19|LS483300|PILER-CR | 915944-915962 | 19 | LS483300.1 | 1577808-1577826 | 2 | 0.895 |
| LS483300_3 | 3.2|915944|19|LS483300|PILER-CR | 915944-915962 | 19 | LS483300.1 | 1699259-1699277 | 2 | 0.895 |
| LS483300_3 | 3.2|915944|19|LS483300|PILER-CR | 915944-915962 | 19 | LS483300.1 | 1916858-1916876 | 2 | 0.895 |
| LS483300_4 | 4.1|1197768|26|LS483300|CRISPRCasFinder | 1197768-1197793 | 26 | LS483300.1 | 755225-755250 | 2 | 0.923 |
| LS483300_4 | 4.1|1197768|26|LS483300|CRISPRCasFinder | 1197768-1197793 | 26 | LS483300.1 | 793722-793747 | 2 | 0.923 |
| LS483300_4 | 4.1|1197768|26|LS483300|CRISPRCasFinder | 1197768-1197793 | 26 | LS483300.1 | 2079812-2079837 | 2 | 0.923 |
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cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggcctcaacacagaagctggcgg Protospacer *******.*****.************
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cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacacaaaagctggcgg Protospacer *************.*.**********
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cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccgacacagaagctggcgg Protospacer *********.***.************
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
311428 : 322179
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483300|311428:322179|DBSCAN-SWA 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TTCGGTATTTAAAGGAGGTGAGTACCATGCTTAAAGGGATTTTAGGTTATAGTTTTTGGGCTTGTTTTTGGTTTGGTAAATGTAAGTAATTTTTAAAGGTCAGTGCTTTGACACTGGCTTTTTATTATTGTTGTGATTATGGTAATATACAAAAGTGAGCAAGTTGGATAGATGGTGGCTATCTGAGTATAAGGAGGTGGTGCCTATGGTGGCATTACTGAAATCTTTAGAAAGGAGACGCCTTTGTGGTATCTGTTGTTGATGCGCTAAATTTAATGTTTAGTTTCGGTATGTTTATCGTTACTTTACTTGGTTTAGTCATCGCAATCGTTAAATTAAACCATAAAAAATAACCATCGCTAACTTTGACGAGTACGATGGTTAGAGGATTATATAAATTCATTTAACTACAGAGGTCACCGTCTTTTTAACGGGCTCACTAGGGTAACATGTTTCCGCATGTTGCCCTTTTTCTATTTATAAATTAACACACTGTAATATAAATATCAAACATGTTAATATATTTTGGTAAGTAAACGTGACTACACATCTTAGTTTTAATTTGATGTTGCGTCACATGATACTAATAAGAGGTGTGTGGCGTAATGAGTAATACCCAAAAGAAAAATGTGCCAGAGTTGAGATTCCCGGGGTTTGAAGGCGAATGGGAAGAGAAGAAGTTAGGGGATGTAGCAACTTTTGCCAAAGGTAAGTTAGGCGCTAAGAAAGATGTGAGTCAAAATGGTGTGCCAATAATATTGTATGGAGAATTATATACAAAGTATGGTGCTATTGTTAGCAAGATTTTTAGTAAAACAGATATTCCCGAAAACAAATTAAAGATAGCTAAAAAAAATGACGTTCTTATTCCATCATCTGGGGAAACAGCAATTGATATAGCAACTGCATCGTGCATTTATTTAAATAAAGGCGTTGCAGTTGGTGGAGACATTAATATTTTAACACCTCAAAAGCAAGACGATAGGTTTATTTCATTGTCAATTAATGGAATAAATAAAAATGAATTATCTAAATATGCACAAGGGAAGACAGTAGTTCATTTATATAATAATGATATTAAAAATTTGAAAATAGTATTTCCAAGCGAATTTGAAGAACAAGTAAGAATAGGTGACTTCTTCAGCAAACTCGATCGACAAATTGAATTAGAAGAACAAAAACTTGAATTACTTCAACAACAGAAAAAAGGCTATATGCAGAAAATCTTCTCACAGGAATTGCGATTCAAAGATGAGAATGGTGAAGAATATCCAGAGTGGGAAGAGAAGCAATTAGGGGAAGTAGCCGAAATAATAGGGGGAGGACCTCCAAGTACAAAAAACAAATTATATTGGAATGGTGAAATAAATTGGTTTTCACCGATTGAAATAGGTAACAAAACATATGTCTATAGTAGTCAAAAGAAAATAACAGAGGAAGGGCTACGAAAAAGTTCTGCTAAAATTTTGCCTGTGGGCACTATACTATTTACCTCAAGAGCTGGAATAGGAAAAACAGCTATCTTAGCTAAAGAATCTACAACGAATCAGGGATTTCAATCAATAGTACCTCGAAAAGGTGTGTTAGATTCGTATTATGTATATACTATTTCAAATATATTGAAAATATTAGCAGAAAAAGTTAGTGCAGGGTCAACATTTTCAGAAATATCAAAAAAGCAAATGGAGCAATTGAATTTAAATATACCGATGATAAAGGAACAAAAAAATATAAGTAAATTCTTTAGCAAATTTGATAACTTAATAGAAATACAGGAACGAAAACTCAAACTATTAAAACAACAGAAACAAGGTTTACTACAAAAAATGTTTATATAGAACAGACGGCTTATTGGTCGTCTTTTTATTTTGGATAAAAGGAGCAAACAAATGGAAACAAAAGTAATAACAAGATATATTGTATTAATTTTAGCATTAGTCAATCAGTTTTTAGCGAACAAAGGTATAAGCCCGATACCAGTAGATGAAGAGAGTATTTCATCGATTATCTTAACAGTCATTGCTTTATACACCGCTTATAAAGACAATCCAACATCACAAGAAGGACGATGGGCGAATCAAAAACTAAAGAAATATAAAGCTGAAAATAAGTATAGAAAAGCAACAGGACAAGCGCCAATTAAAGAAGTAATGACACCTACAAATATGAATGACACAAATGATTTAGGGTAGGTGATTGATATATGTTAATGACAAGAAATCAAGCAGAAAAATGGTTTGATAACTCATTAGGAAAACAATTTAATCCAGATGTTGGTATGGGTTTCAATGTTACGATTATGCAAATATGTTCTTTATGTTAGCAACAGGAGAAAGGTTACAAGGTTTATACGCTTATAATATCCCATTTGATAATAAAGCGAAAATTGAAAAATATGGTCAAATAATTAAAAACTATGACAGCTTTTTACCACAAAAGTTGGACATTGTCGTCTTCCCATCGAAGTATGGTGGTGGAGCGGGTCATGTTGAAATTGTTGAGAGTGCAAATTTAAACACTTTCACATCATTTGGTCAAAACTGGAATGGGAAAGGATGGACTAATGGCGTTGCGCAACCTGGCTGGGGTCCTGAAACTGTTACAAGACATGTCCATTATTATGACAATCCAATGTATTTTATTAGATTAAATTTCCCTGATAGCATAAGTGTTAAGGATAAGGCTAAAGGTATTATTAAGCAAGCAACTGCAAAAAAGAGGCAGTAATTAAACCTAAAAGGATTATGCTTGTGGCTGGTCATGGATATAATGATCCAGGCGCAGTTGGTAATGGAACAAACGAACGTGATTTCATCCGTAAATATATAACGCCCAATATCGCTAAGTATCTAAGACATGCGGGACATGAAGTTGCTTTATATGGCGGCTCCAGTCAATCACAAGACATGTATCAAGATACTGCATACGGTGTTAATGTAGGAAATAAAAAAGACTATGGCTTATATTGGGTTAAATCACAGGGGTATGACATTGTTTTAGAGATACATTTAGATGCAGCAGGAGAAAGCGCAAGTGGCGGTCATGTTATTATCTCAAGTCAATTCAATGCAGATACTATTGATAAAAGTATACAAGATGTTATTAAAAATAACTTGGGACAAATAAGAGGTATAACACCTCGTAATGATTTGCTAAATGTTAATGTATCAGCTGAAATAAATATTAATTACCGCTTATCTGAATTAGGTTTTATTACTAATAAAAATGATATGGATTGGATTAAGAAAAATTACGACTTGTACTCTAAACTAATAGCTGGTGCGATTCATGGTAAGCCTATAGGTGGTTTGGTAGCTAGTGAGGTTAAAGCGCCAGTTAAAAACGAAAAGAATCCACCAGTACCAGCAGGTTATACCTTAGATAGTAAAGGGGTACCCTATAAAAAAGAACAAGGCAATTACACAGTAGCTAATGTTAAAGGTAATAATGTAAGAGACGGTTATTCAACTAATTCAAGAATCACTGGGGTGTTACCTAACAACACAACAATCACATATGACGGCGCCTATTGTATCAATGGTTATAGATGGATCACTTATATTGCTAATAGTGGACAACGTCGTTATATTGCGACAGGAGAGATAGACAAGGCAGGTAATCGAATAAGTAGTTTCGGTAAGTTTAGTGCAATATAATATTTGCTTAAAAGCTCACGATTTGTTATCCTTTAAAAAGAATGTTTTACAGTTTTCAAATTATTGTGTGGATACAAGGAAGTTATTTTATTTGAAGCTGTTACATTTAATTATAAATTTGGATGTAATGTTCGATCCTTTGCGACTTAATCTATTTACTAATAAATAGAAATATTTTATAATTAGAAAGTCATGTCTTTTTAAGCAGGTGCGTTACACACCTGCTTTTTTTATTTGCATTTAAAGATAAGATGTGATAAATTTCATTGGAACATTGTGCAGCATTTCTCTCAAGTTTATATTGTGGCTAGCCTTCGGACTGATTTTTTGTTATTATTTAAAGACATGCATCAACTATTTACATCATCCTTGTTAGCCCAAGCATGTCACTGGGCGTGTTTTCGTTTTATGATAGAGAGCAAAGTTCTTGCTATCCCCCCGTAGTATAGAAGCAGCTTTAACACACCCGCATAATAGTTTGCGGGGTGTTTTTTGTTTGGAATACATGTTTATTTGCTCTTAACTGCATATTAGGTGACTTATAGGACGGAATATGATACAGTTATTTAGCAGACAGTTATCAAAGCGATTGCATTACGCAATCGCTTTTTTCTTTTTCAATAGTTTAGCTTATGTTATAATTATATTAGAAAGCCTTCTTATACAAAATACATGCGATACAGAAAGATAAGCACTTTGGTGTTTGTCTTTTTATTTGAATAAAATAAAAGGTTTATGTTATTATATTATTAGAAATTTATCCAGAGTTTCTCTCTAAGCTAAAATTATCATTTTCGGGCAGGTACTTCGGTACTTGCCTATTTTTTATGTTATAATGTAATTACATTACCAGTAACCAATCTGGCTTAAAACCACATTTCCGGTAGCCAATCCGGCTATGCAGAGGACTTACTTGCGTAAAGCAGTAAGAAGCTGACTGCATATTTAAACCACCCATACTAGTTGCTGGGTGGTTTTTTGGAACAAAAAAAATAGTTTACAATCATTATTAGTAAGTATATAATTTTCTAGATCGATAATTTAGGAGAAATTTATATGGAAACTAAAGATTTATCATTAAAAATAGATGCAACAAAAATAGAAGTTGCAGGAATTAAAAATAAATTCACAGCTCAATGTAAACTTGCATATTCATTTATAGCTACGATAGCAACTATATTTGCAACTATATATTCAGATGGGAAACAATTAGTTATTTTTTCTATGTTACTTTTCGTCTTTCCAAGTTTCATTGAATCATTCGGAATTGCCAATGAAAATAAGGTTATAACTGCAATAGTTAAAATCTATAAATATATATTTTTTATTGTTTCTTTATTTCTATTCATTATTTTTGTTTGGTATTTTTACGATAAGCAAGATGCGTATAATTATACAAAAGTTATAGGCGATATATTATTGATAGTCAGTATTTTTATTAATTTAGTGTATTCTTTGATTTCTTATTTGAACTTACGCTACAATATAAATGAACATATTGCTTTAGCTGCAATAGAGCAAAGTACGTTAGAAAAACAAAAAGAAAGATTGCACTTTCAAGATAACATTAAAAAAGCACATAAAAAAGTATATCGTGAATTTGTTAGTAAACAAAATAAAGATAAAAAGGGGAAGGATAAATGATGTTTATAACTGGAATAGTGATATCGTTAGTTGTAATCTTGATAGCTTCATATTTTTCCTTTGTTTTAACAACATTAATTATAAGCGAAGATTTTAGTGACCGAGTTACTTTAAAAGTAGCATTTATCTTACCAATAATATTAATATCCCTATCCATTCGTGCATGTTTAGAAAACCTAAGGAGTAATAAACAACTTGCTAAAACAGCATTTAAAATGGCTACTACACAATATCCTTCAGTGGTAACAATGTTCATAGGTATGGTTAAAGACCATCAAGCACAAGTCCACTGTTTTGGTGAATCTACCTATACCTATAACCAAAATAAAGAAAACCTAATATTAAAAAAAGACATAAATAAGTCATGGTTAAATTCATTAAAGAATTTGAAGTCACTTATTAAATCAGAAGGATTTAAAAAGAATTTTTTAAATAACTTAGCTGAAGCTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483300|311428:322179|315548_315938_+|SQE32699.1|DBSCAN-SWA MQILVNKRNEIISYAVIGGFEEGIDIENLPKNFSQVFRPKAFKYSNGEIVFNEDYSEEKDDTHQQIDNEENSTGASDDILRKMVASMQKQVVQSTKLLMQDNKQNALMAKQIVAFNKKLEEIKGETENA >LS483300|311428:322179|315930_316095_+|SQE32700.1|DBSCAN-SWA MLKLISLTFEDVKTWYQLKEYTKEDIAWYVDMDVIDKEEYAIITGEKYPENLES >LS483300|311428:322179|318743_319154_+|SQE32705.1|DBSCAN-SWA MLATGERLQGLYAYNIPFDNKAKIEKYGQIIKNYDSFLPQKLDIVVFPSKYGGGAGHVEIVESANLNTFTSFGQNWNGKGWTNGVAQPGWGPETVTRHVHYYDNPMYFIRLNFPDSISVKDKAKGIIKQATAKKRQ >LS483300|311428:322179|313828_314083_+|SQE32697.1|DBSCAN-SWA MSDINIVGMSFYLTTDDTKRFTDFPTERKGVAGWNLYVEASNTGGFVHRLVRNSVTASAEILLKNYDSKTSSGPWTLHEGRIIS >LS483300|311428:322179|317032_318265_+|SQE32702.1|DBSCAN-SWA MSNTQKKNVPELRFPGFEGEWEEKKLGDVATFAKGKLGAKKDVSQNGVPIILYGELYTKYGAIVSKIFSKTDIPENKLKIAKKNDVLIPSSGETAIDIATASCIYLNKGVAVGGDINILTPQKQDDRFISLSINGINKNELSKYAQGKTVVHLYNNDIKNLKIVFPSEFEEQVRIGDFFSKLDRQIELEEQKLELLQQQKKGYMQKIFSQELRFKDENGEEYPEWEEKQLGEVAEIIGGGPPSTKNKLYWNGEINWFSPIEIGNKTYVYSSQKKITEEGLRKSSAKILPVGTILFTSRAGIGKTAILAKESTTNQGFQSIVPRKGVLDSYYVYTISNILKILAEKVSAGSTFSEISKKQMEQLNLNIPMIKEQKNISKFFSKFDNLIEIQERKLKLLKQQKQGLLQKMFI >LS483300|311428:322179|311428_312634_-|SQE32695.1|integrase|DBSCAN-SWA MWMEKFKNKNNETSYRYYEKYKDPYTDKWKRVSVALNKNTKQAQKEAMFRLEEKIKEKLHDKSSSILKTLTFHSLLDEWLEYHIKTSGFKVTMLDNLKTRIKNIKKNSSQNLLLNKIDTKYMQTFINELSNVYSANQVKRQLGHMKEAIKYAVKFYNYPNEHILNSVTLPKKSKTIEDIEKEEAKMYNYLEMEQGIQIRDFILNDNNMQYRARILVAGAVEVQALTGMRIGELLALQVKDVDLKNKTIDINGTIHRIKCNAGFGHKDTTKTAGSKRKIAINSRIANVLKKIMLENKKMQQWEPSYVDRGFIFTTCQGNPMQGSRINKRLSSAAESLNINKKVTTHTLRHTHISLLAEMNISLKAIMKRVGHTDEKTTIKVYTHVTEKMDRELEQKLEKLVY >LS483300|311428:322179|316140_316380_+|SQE32701.1|DBSCAN-SWA MFGFTKRHEQDWRLTRLEENDKTMFEKFDRIEDSLRAQEKIYDKLDRNFEELKHDKEEDEKNKEKMPKILEISRCGFLD >LS483300|311428:322179|321726_322179_+|SQE32708.1|DBSCAN-SWA MFITGIVISLVVILIASYFSFVLTTLIISEDFSDRVTLKVAFILPIILISLSIRACLENLRSNKQLAKTAFKMATTQYPSVVTMFIGMVKDHQAQVHCFGESTYTYNQNKENLILKKDINKSWLNSLKNLKSLIKSEGFKKNFLNNLAEA >LS483300|311428:322179|319177_320083_+|SQE32706.1|DBSCAN-SWA MAGHGYNDPGAVGNGTNERDFIRKYITPNIAKYLRHAGHEVALYGGSSQSQDMYQDTAYGVNVGNKKDYGLYWVKSQGYDIVLEIHLDAAGESASGGHVIISSQFNADTIDKSIQDVIKNNLGQIRGITPRNDLLNVNVSAEININYRLSELGFITNKNDMDWIKKNYDLYSKLIAGAIHGKPIGGLVASEVKAPVKNEKNPPVPAGYTLDSKGVPYKKEQGNYTVANVKGNNVRDGYSTNSRITGVLPNNTTITYDGAYCINGYRWITYIANSGQRRYIATGEIDKAGNRISSFGKFSAI >LS483300|311428:322179|314082_315549_+|SQE32698.1|tail|DBSCAN-SWA MSNLEKSVNINLENTAHYENISNLDITFRTGESDSSVLLFNITKNNQPLFLSEENIKARIVIRGKGVMVVAPLEILDPFKGALKFQLPNDVIKRDGSYQAQVSVAELGNSDVVVVERTITFNVEKSLFSMIPSETKLHYIVEFQELEKTIMDRAKAMDEAIKNGEDYASLIEKAKEKGLSDIQIAKSSSIDELKQLANSRITDLENKAQTYSRAFDEQKRYMDEKHEAFKQSVNSGGLVTSGSTSNWQKSKITKDDGKITQITGFDFNNPEQRVGDTTQFIYVSQAINYPRGVSTNGTVEYLVVTSDYKRMTYRPNGTNKVFVKRKEAGSWSDWSELAINDYNMPFETVQNAQSKANTAESNAKLYTDDKFNKRYSVIFDGTANGVGSTLNLNESLDQFILLIFYGTFPGGDFTEFGNPFGGGKISLNPSNLPDGDGNGGGVYEFGLTKSSRTSLTISNDVYFDLGSQRGSGANANRGTINKIIGVRR >LS483300|311428:322179|318316_318619_+|SQE32703.1|holin|DBSCAN-SWA METKVITRYIVLILALVNQFLANKGISPIPVDEESISSIILTVIALYTAYKDNPTSQEGRWANQKLKKYKAENKYRKATGQAPIKEVMTPTNMNDTNDLG >LS483300|311428:322179|318630_318750_+|SQE32704.1|DBSCAN-SWA MLMTRNQAEKWFDNSLGKQFNPDVGMGFNVTIMQICSLC >LS483300|311428:322179|312733_313387_-|SQE32696.1|protease|DBSCAN-SWA MDYLKNIFHDDLSVNNQNYFKAILKSLLLIVLFFIAFFSSDYVTKGWQYGFISLSLLCLCLFFSKLLKFNFFNLKLINYKEILIIFMSLVLIKVLDYILSFWQSDVSPNDESIIQHFSGTPFLLLAISIAIVPAIVEELIFRGFLLRVFFRKHLFIGTLVSSFLFAIFHDGSTVLDYIPYFYFGVILSVSYLITKRIEVPILIHFLNNFLALFYVFS >LS483300|311428:322179|321139_321727_+|SQE32707.1|DBSCAN-SWA METKDLSLKIDATKIEVAGIKNKFTAQCKLAYSFIATIATIFATIYSDGKQLVIFSMLLFVFPSFIESFGIANENKVITAIVKIYKYIFFIVSLFLFIIFVWYFYDKQDAYNYTKVIGDILLIVSIFINLVYSLISYLNLRYNINEHIALAAIEQSTLEKQKERLHFQDNIKKAHKKVYREFVSKQNKDKKGKDK |
14 | Staphylococcus_phage(61.54%) | holin,protease,integrase,tail | attL 311318:311335|attR 322404:322421 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
385186 : 403829
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483300|385186:403829|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483300|385186:403829|402139_402940_+|SQE32797.1|DBSCAN-SWA MNKSRFISCVILIFALILVLFTPNVLAESQPDPTPDELHKASKFTGLMENMKVLYDDRYVSATKVKSVDKFLAHDLIYNISDKKLKNYDKVKTELLNEDLAKKYKDEVVDVYGSNYYVNCYFSSKDNVGKVTGGKTCMYGGITKHEGNHFDNGKLQNVLIRVYENKRNTISFEVQTDKKSVTAQELDIKARNFLINKKNLYEFNSSPYETGYIKFIENNGNTFWYDMMPAPGDKFDQSKYLMMYNDNKTVDSKSVKIEVHLTTKNG >LS483300|385186:403829|398498_399068_+|SQE32793.1|terminase|DBSCAN-SWA MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQNGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGNVPMFINIGEWDGDDEELDKAVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED >LS483300|385186:403829|392124_392994_+|SQE32784.1|DBSCAN-SWA MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWSKLINKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKNGANDHGEIIKKHRNDVNVVYRDVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSFSHTTEQARIRLYIPLNERISANDYRNYTKVLANKIGRKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWLKEYEQSNASPNVIAYTRRDSKYWRELCFGTTEGNRNNALASLVGHLLRCHVNDYIVYSFALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN >LS483300|385186:403829|388312_389449_-|SQE32776.1|DBSCAN-SWA MIKKYKKKDGSTAYMFVAYLGTDPITGKQKRTTRRGFKTEREAKIAEAKLQTEVSQNGFLNNDITTFKEVYELWLEQYQNTVRESTYQRVLTLFDTAILEHFQDVPIKKITVPYCQKVINKWNKKYSDIKAIRIYTSNVFKYAVSLKIIVDNPFAHTKAPRKKEAQQDASTKYYSSDELKQFLTFVEDDPLYYAIFRTLAFTGFRRGELMALTWNDIDFTKQTISINKTCARGANYKLVIQEPKTKSSHRTISIDDKTASVLKSWRTHQRVESLKYGHNTSDKHQHVFTTVRDNKPLYPEHCNKALDLICEKNSFKRIKVHGFRHTHCSLLFEAGLSIQEVQDRLGHGDIKTTMDIYAHVTEKQRDQVADKFAKYINF >LS483300|385186:403829|398160_398502_+|SQE32792.1|transposase|DBSCAN-SWA MDKQQIKDFVCDYHERTRSDVLIDDDINTDEFFSIADENSNEWMADDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSYQDISGVLDCSEQSVRFWYETLLDKIVEVIE >LS483300|385186:403829|397582_398158_+|SQE32791.1|DBSCAN-SWA MIAYPIRVGSVYRGEQMKLLKTKNCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPTFINKKIRMCEFQIESMYHMSASTTTCDEMMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKARLQNYKNRSISNMVLLKTVLNHYTEKEQKKVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNIAIENSKIARVNAYHQSSYVKVV >LS483300|385186:403829|391154_391358_+|SQE32781.1|DBSCAN-SWA 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MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >LS483300|385186:403829|396765_397344_+|SQE32789.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTESYFKEYNQFVLDQHKAIQELEQERNALESKIKLDKSTYKQLIMDGQDDKADNLYQATDADEKKLKALNKRLETKKSVSKEVKYQKTIELLKHQSELSSLYESEKQSAIEKLKKAVDAYNEIIDEIEDINDRYEDEHQQYASVYSQEQLYDDKEARKALNGHFKENIFTSFINGNDLPYEHNNKLFLKC >LS483300|385186:403829|403106_403829_-|SQE32798.1|DBSCAN-SWA 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MKLNLLFITLTSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENK >LS483300|385186:403829|395047_395428_+|SQE32786.1|DBSCAN-SWA MDKEQLKKYIYDYVKEYKEIPIYQLEDLFKEMNHDYIGRTSITHDKDENVVFWSGWNKITMFALIELVKSEQLDLVYRGSFVMRYLLDGRVPNLPLAICYPEDGQQTDVPSWVPMVLRINKEEKIK >LS483300|385186:403829|391359_391743_+|SQE32782.1|DBSCAN-SWA MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKFQSDKDYHYQDKAFYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEAFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIVGNIEVEEL >LS483300|385186:403829|399222_399927_-|SQE32794.1|DBSCAN-SWA MNKKLLMKFFIVSPLLLATIATGFTPVPLSSNQIIKTAKASTNDNIKDLLDWYSSGSDAFTNSEVLDNSLGSMRIKNTDGSISLIIFPSPYYSPTFSKGEKVDLNTKRTKKSQHTSEGTWIHFQISGVTNTEKLPTPIELPLKVKVHGKDSPLKYWPKFDKKQLAISTLDFEIRHQLTQIHGLYRSSDKTGGYWKITMNDGSTYQSDLSKKFEYNTEKPPINIDEIKTIEAEIN |
25 | Staphylococcus_phage(65.0%) | transposase,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
724117 : 731937
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483300|724117:731937|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTTTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTATAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATTTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAATTAATACAGAGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTTAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGACGGTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCGCTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGGCTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTGTGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTACCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCAACTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483300|724117:731937|730208_730802_+|SQE33093.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPNAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >LS483300|724117:731937|727368_727953_-|SQE33089.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >LS483300|724117:731937|725172_725859_-|SQE33086.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >LS483300|724117:731937|729189_729858_-|SQE33092.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >LS483300|724117:731937|728768_729188_-|SQE33091.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKLIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >LS483300|724117:731937|726648_727089_-|SQE33088.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVASVLILGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >LS483300|724117:731937|728051_728765_-|SQE33090.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >LS483300|724117:731937|725833_726307_-|SQE33087.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >LS483300|724117:731937|730785_731937_+|SQE33094.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTYYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLKDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >LS483300|724117:731937|724117_725173_-|SQE33085.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
743908 : 758366
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483300|743908:758366|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACACCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAACAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCATTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCCGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGCGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTAAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGTTGTCACATTGTATAAAAATGTGACTAAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTAGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTGAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTTTTAGATCCTCAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAAATATATCACTTGAAGCATTTCATGTAGCAAATAAAATGCATATACTGGGGCCCCAACAAAGAAGCTGACGAAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCGAGTTGGGGGCCCCCAACACAGAGAAATTGGAACGCCAATTTCTACAAACAATGCGAGTTGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTGTAACTCATGCAATCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAATCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCGTCTTACTCTCAATAAATGTAAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGGTAATCTATGTCAGATTACATGTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGACGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAATATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGAGTAATAGCTTAAAGCTAATAACAACGAATATAATGTACGTTGAATCTTATGATTACACTTTAAACCTAATATAATATCCCGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGATAGTATCATGCTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATTCCAATAGGGAGTTGAAGGTCATTTGTCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGTCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATTTATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTAACATTGATGTCTATAGTGGAATGTGAAAATATAATTACTAATTAGATTGTTTAGTTGTCTATAACGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTAATAGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGTCAACAATATTAACGTATACCTTTCATCGCTTTGATGATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAGGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAAAGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCAAAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAAATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATAAATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGGATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACGCGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAAAGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAAACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCGGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCAATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAATACGGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTGCCCGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACGCCTAGTCCTC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483300|743908:758366|755651_756665_+|SQE33112.1|DBSCAN-SWA MIMIIINLKGEKFVMKYLLKGNILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDLLHLTESQRNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSICGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFTNHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >LS483300|743908:758366|757604_758366_+|SQE33114.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILEDISIDIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDNGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHDIVNDALDLLQLQDIRNRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVALKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >LS483300|743908:758366|745124_745667_+|SQE33104.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >LS483300|743908:758366|756651_757608_+|SQE33113.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTLLISVLYLFVGIDFEIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVILLAITILLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSVQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >LS483300|743908:758366|751864_753970_+|SQE33110.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIQRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >LS483300|743908:758366|743908_744967_+|SQE33103.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKQVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSKHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKYE >LS483300|743908:758366|751503_751902_+|SQE33109.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >LS483300|743908:758366|754087_755059_+|SQE33111.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >LS483300|743908:758366|746272_747190_-|SQE33105.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTNDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETSMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >LS483300|743908:758366|749316_749817_-|SQE33107.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >LS483300|743908:758366|747471_748977_-|SQE33106.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >LS483300|743908:758366|749836_750703_-|SQE33108.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGRLSSQPLLITRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK |
12 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
848504 : 856292
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483300|848504:856292|DBSCAN-SWA AGTGGCCGAACACTCATTTGACGTTAATGAAGTAATCAAGGATTTTCCGATATTAGATCAAAAAGTCAATGGCAAACGTTTAGCATATCTTGATTCAACAGCGACAAGTCAAACGCCTGTGCAAGTGTTAAATGTTTTAGAGGATTACTACAAGCGTTATAATTCAAACGTTCATCGTGGTGTTCATACATTAGGATCATTGGCAACTGATGGTTATGAAAATGCTCGTGAAACCGTTCGTCGTTTTATTAATGCGAAGTATTTTGAAGAAATCATTTTCACACGCGGAACAACTGCATCGATTAACCTTGTAGCACATAGCTATGGTGATGCAAATGTTGAAGAGGGCGATGAAATTGTTGTCACTGAAATGGAACATCATGCCAATATTGTTCCTTGGCAACAGTTAGCAAAGCGTAAAAATGCGACATTGAAATTTATACCAATGACAGCTGACGGGGAATTAAACATCGAAGATATTAAGCAAACGATTAATGATAAAACAAAGATCGTTGCTATTGCACATATTTCTAATGTACTCGGTACAATTAATGATGTTAAAACCATTGCAGAAATAGCTCATCAACATGGTGCAATTATCAGTGTTGATGGGGCGCAAGCAGCACCACATATGAAACTTGATATGCAAGAAATGAATGCTGATTTTTATAGTTTTAGTGGACATAAAATGCTTGGACCAACAGGTATTGGCGTATTATTTGGTAAACGTGAGTTACTACAAAAAATGGAACCGATTGAGTTCGGTGGCGACATGATTGATTTTGTAAGTAAGTATGATGCAACATGGGCTGATTTACCTACTAAATTTGAGGCGGGTACTCCATTAATTGCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGATATTTAGAACGCATAGGTTTTGAGGCAATTCATAAATATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTACATCCACACGATGTTGCTACAGCCGTAGATACAGAAGGTGTAGCGGTTAGAGCTGGGCATCATTGTGCGCAACCGTTAATGAAATGGTTAAATGTGTCTTCAACAGCTAGAGCGAGTTTTTATATATACAACACGAAAGAAGACATTGATCAGTTAATAAATGCCTTGAAACAAACGAAGGAGTTTTTCTCTTATGAATTTTAATAATCTAGATCAATTATATAGATCTGTCATTATGGATCATTATAAAAATCCTAGAAATAAAGGTGTATTAGATAACGGGTCTATGACAGTAGATATGAATAACCCGACATGCGGTGACCGTATACGACTAACATTTGATATAGAAGACGGCATTATAAAAGATGCTAAGTTTGAAGGTGAAGGTTGTTCGATTTCAATGGCAAGTGCATCGATGATGACACAAGCTGTTAAAGGTCATTCACTTGGAGAAGCAATGCAAATGAGCCAAGAATTTACGAAAATGATGCTTGGTGAAGACTATGTGATTACAGAAGAAATGGGAGATATTGAAGCATTGCAAGGTGTATCTCAATTCCCAGCTCGTATTAAATGTGCCACATTAGCTTGGAAAGCATTGGAAAAAGGTACTGTTGCTAAAGAAGGTAAAGCAGAAGGTACGACTGAAGAAGAATAGAATGCTGTTAATCATAGATGATTTTGATATTAGACATATAAAAGTATAAAATTTTTTATAAGATGTCATGTCATTGTTATAATATGGTTTACATCATGAATTAAAAACTTACGCACGCCGTTGTAAATATATTTTTAAGGAGTGATTGAAATGGCTAAAAAAGCACCTGATGTTGGGGATTATAAATATGGATTCCACGACGATGATGTGTCCATTTTCAGATCAGAACGTGGTTTAACTGAGAATATCGTTAGAGAAATTTCTAACATGAAAAATGAGCCGGAATGGATGTTAGATTTCCGTCTTAAATCATTAAAATTGTTTTATAAAATGCCAATGCCTCAATGGGGTGGCAACTTATCAGAATTGAATTTCGATGACATTACTTACTATGTAAAGCCTTCAGAACAAGCTGAACGTTCATGGGATGAAGTGCCAGAAGAAATTAAAAGAACTTTCGATAAATTAGGAATTCCTGAAGCTGAACAAAAATATTTAGCTGGCGTTTCTGCTCAATATGAATCTGAAGTTGTTTACCATAATATGGAAAAAGAACTTGAAGAAAAAGGTATTATCTTTAAAGATACAGATAGTGCTTTACAAGAAAATGAAGAATTATTCAAAAAATACTTTGCTTCTGTAGTACCTGCAGCAGATAACAAATTTGCGGCGTTAAACTCAGCAGTATGGTCAGGTGGTTCGTTCATTTATGTACCTAAAAATATCAAACTAGATACGCCACTACAAGCTTATTTCCGTATTAACTCTGAGAACATGGGTCAATTTGAACGTACATTAATCATTGCTGATGAAGGTGCTTCTGTACATTACGTAGAAGGTTGTACTGCACCAGTTTATACAACTAGTTCTTTACACTCTGCTGTTGTGGAAATCATTGTGCATAAAGATGCGCACGTTCGTTATACAACGATTCAAAACTGGGCGAACAATGTATACAATTTAGTTACAAAACGTACTTTTGTTTATGAAAACGGAAATATGGAATGGGTAGATGGTAACTTAGGTTCTAAGTTAACGATGAAATATCCAAACTGCGTTCTTTTAGGTGAAGGTGCAAAAGGTAGTACATTATCTATTGCATTTGCTGGTAAAGGACAAGTTCAAGATGCCGGTGCTAAAATGATTCATAAAGCGCCAAATACATCTTCAACAATTGTTTCTAAATCTATTTCTAAAAATGGTGGTAAAGTTATTTATCGTGGTATTGTACATTTTGGACGTAAAGCAAAAGGCGCTCGTTCAAATATTGAGTGTGATACATTAATCTTAGATAACGAATCAACATCAGATACAATTCCATATAACGAAGTATTCAACGATCAAATATCATTAGAACATGAAGCGAAGGTTTCAAAAGTTTCTGAAGAACAATTATTCTATCTAATGAGTCGTGGTATTTCTGAAGAAGAAGCGACAGAAATGATTGTTATGGGATTCATCGAACCATTCACAAAAGAACTTCCAATGGAATACGCAGTCGAAATGAACCGTTTAATCAAGTTCGAAATGGAAGATAGCATTGGATAGCTTTAAACCGCGTTGTTAAGCCATTCTTGACTTCCGGAAATGGCTATTGATACCATTTTGATACCATTTACTTGTCAAAAATGGCTATTGCATCGTGTTTTTTCTGAGTATATAAATGGCTGTAAGTGCCCATCGTTTCAGTGATTTGAGCATGTCTCATGAGTGACTGTAAAACGAAAATATCTACACCATTATTTGCAAGATAAGATGCATAAGAATGTCTTAACGCATGAATGTTATAATGAGGGAAAGCTTTTTGGAATTTCTTTTGAACATGACTGTAATGTTTGGGAGCCATTCCTCCGAAAATAAAATAACTACGTTCATCAAAATATTTGTTTAACTCTTTTTCGCGTTGGTGTCGTTCAGTTAACATTTTATTGATGAATTTAGGTAAAGGAACAATATCCTCTGAACTATCTGTTTTTGGTCTCGGATATATAGTTCTATTAGAGGTGTCCATTGTTTTATTTATGGATATCTCTTTTTTGTATTTATTGTAGTCTGTCCAAACAAGCGCCATAGCTTCGCCAATCCTCAAACCTGTATAAAACATTAATGTAAATAACTCTCTGTAATCTTGCTCTTCAATGTTTTTGATTCTTTCTTCAAATTCTTCACGCATCATAAACTTAGGTTTTGGTTTTACACGCGGAATAGGTTTGGTTTAGTTGGGACAATATTTGGGTCGCTAATTATAGCATTATTACGTATGCTTATGGGTATATAAGAGAGGTGTTTACTATGCTTAAAGGAATTTTAGGTTACAGTTTCTGGACGTGTTTTTGGTTTGGTAAATGTAAGTAATTTTTAAAGGTCAGTGCTTTGACACTGGCTTTTTATTATTGTTGTGGTTATGGTAATATACAAAAGTGAGCAAGTTGGATAGATGGTGGCTATTTGAGTATAAGGAGGTGGTGCCTATGGTGGCATTACTGAAATCTTTAGAAAGGAGACGCCTTTGTGGTATCTGTTGTTGATGCACTAAATTTAATATTTAGTTTCGGTATGTTTATCGTTATTTTACTTGGTTTAGTCATCACAATCGTTAAATTAAACCATAAAAAATAACCATCACAACTTTGGACGGTTAATGGTTATTTTATAATAATTTCAAAACTGAGCCACCGTCTTTTTAACGGGCTCATTAGGGTAACATGTTTGCGCATGTTGCCTTTTTCTATATATAAATTAACACACCATAATATAAATATCAAATAGACGGCTTATTAGTCGTATTTTTATTTTGGATAAAAGGAGATAAGAATATGATTAATTGAAAAATTAGAATGAAACAAAAATCATTTTGGGTAGCGATATTGTCAGCTATCTTTTTATTTGCTCAAAACATTGCAAAAGCTATTGGGTATGATATTCAAGTTTATACAGAGCAATTAACAGACGGTTTAAACGCTATATTAGGGTTTTTAGTATTAACTGGTGTGATTCAAGACCCGACTACTAAAGGTATAGGTGATAGCCACCAAGCTTTAGAATATGAAGAACCAAGTAGAAAATACTAGGAGGTAAAATAATGAAAACATACAGTGAAGCAAGAGCAAGGTTACGTTGGTATCAAGGTAGGTATATTGATTTTGACGGTTGGTATGGTTATCAATGTGCAGATTTAGCAGTTGATTACATTTATTGGTTGTTAGAAATTAGAATGTGGGGAAATGCAAAAGATGCAATCAATAACGATTTTAAAAACATGGCAACAGTATATGAAAACACACCATCGTTTGTTCCACAAAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483300|848504:856292|855323_856292_+|SQE33210.1|DBSCAN-SWA MKIKNIVKSSVATSITFIMLSNTVDAAQHITPVSEKKVDDKITLYKTTATSDSDKLKISQILTFNFIKDKSYDKDTLILKAAGNIYSGYTQPTSDSSINSQFYWGAKYNVFVSSESKDSVNIVDYAPKNQNEEFQVQQTLGYSYGGDINIINGLTGGLNGSKSFSETINYKQESYRTTIDRKINHKLIGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSSDSLYGNELFLGGRQSSSNANQNFLPTHQMPILARGNFNPEFISVLSHKQKDVKKSKIKVTYQRQMDRYENFWNNLHWIGYNIKNQKRATHTSIYEIDWEKHTVKLVASQSSE >LS483300|848504:856292|849735_850200_+|SQE33204.1|DBSCAN-SWA MNFNNLDQLYRSVIMDHYKNPRNKGVLDNGSMTVDMNNPTCGDRIRLTFDIEDGIIKDAKFEGEGCSISMASASMMTQAVKGHSLGEAMQMSQEFTKMMLGEDYVITEEMGDIEALQGVSQFPARIKCATLAWKALEKGTVAKEGKAEGTTEEE >LS483300|848504:856292|853037_853271_+|SQE33207.1|holin|DBSCAN-SWA MKQKSFWVAILSAIFLFAQNIAKAIGYDIQVYTEQLTDGLNAILGFLVLTGVIQDPTTKGIGDSHQALEYEEPSRKY >LS483300|848504:856292|850350_851748_+|SQE33205.1|DBSCAN-SWA MAKKAPDVGDYKYGFHDDDVSIFRSERGLTENIVREISNMKNEPEWMLDFRLKSLKLFYKMPMPQWGGNLSELNFDDITYYVKPSEQAERSWDEVPEEIKRTFDKLGIPEAEQKYLAGVSAQYESEVVYHNMEKELEEKGIIFKDTDSALQENEELFKKYFASVVPAADNKFAALNSAVWSGGSFIYVPKNIKLDTPLQAYFRINSENMGQFERTLIIADEGASVHYVEGCTAPVYTTSSLHSAVVEIIVHKDAHVRYTTIQNWANNVYNLVTKRTFVYENGNMEWVDGNLGSKLTMKYPNCVLLGEGAKGSTLSIAFAGKGQVQDAGAKMIHKAPNTSSTIVSKSISKNGGKVIYRGIVHFGRKAKGARSNIECDTLILDNESTSDTIPYNEVFNDQISLEHEAKVSKVSEEQLFYLMSRGISEEEATEMIVMGFIEPFTKELPMEYAVEMNRLIKFEMEDSIG >LS483300|848504:856292|853282_854038_+|SQE33208.1|DBSCAN-SWA MKTYSEARARLRWYQGRYIDFDGWYGYQCADLAVDYIYWLLEIRMWGNAKDAINNDFKNMATVYENTPSFVPQIGDVAVFTKGIYKQYGHIGLVFNGGNTNQFLILEQNYDGNANTPAKLRWDNYYGCTHFIRPKYKSEGLMNKITNKVKPPAQKAVGKSASKITVGSKAPYNLKWSKGAYFNAKIDGLGATSATRYGDNRTNYRFDVGQAIYAPGTLIYVFEIIDGWCRIYWNNHNEWVWHERLIVKEVY >LS483300|848504:856292|854395_855322_+|SQE33209.1|DBSCAN-SWA MFKRKLLVTTLSLGLIVPIATPFQGSKATTNAEDIGDDAEVIKRTEDVSSRKWGVTQNVQFDFVKDKKYNKDALIIKMQGFINSRTTFNDVKQNRANKRMVWPFQYNIGLTSKDQNTSLINYLPKNKIETVDVGQTLGYNIGGKFQSAPSIGGNGSFNYSKSIKYSQKSYVSEVEQQSSKTIKWGVKANSFVIAGHRWSAYDELLFIRNTTRGPNARDYFVDDNELPPLITSGFNPSFIATVSHEKDSGDTSEFEITYGRNMDVTYATYLPKQGLYPERKHNEFVNRNFVVKYEVNWKTHEIKVKGHN >LS483300|848504:856292|851815_852376_-|SQE33206.1|integrase|DBSCAN-SWA MMREEFEERIKNIEEQDYRELFTLMFYTGLRIGEAMALVWTDYNKYKKEISINKTMDTSNRTIYPRPKTDSSEDIVPLPKFINKMLTERHQREKELNKYFDERSYFIFGGMAPKHYSHVQKKFQKAFPHYNIHALRHSYASYLANNGVDIFVLQSLMRHAQITETMGTYSHLYTQKKHDAIAIFDK >LS483300|848504:856292|848504_849746_+|SQE33203.1|DBSCAN-SWA MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFEAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDIDQLINALKQTKEFFSYEF |
8 | Staphylococcus_prophage(66.67%) | holin,integrase | attL 843516:843531|attR 863319:863334 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1014695 : 1023168
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483300|1014695:1023168|DBSCAN-SWA AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAGACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCAATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCTGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAACGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAATCCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAGTATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGCTGTTTTGGATCCTGCTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTTTACAAGCCAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAGGTTGTCCCATTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATGGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTAAAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATTAAGAAAGAAGTATCACTTACTGTTACAAGAGGAAACAACAATCAAATCACTTATTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAAGCATGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAGCAGAAAAATGGGGCATATGACTGTACTAACGAATGATGTATACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGGGCTAAGAAAGACACGATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAGCAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTTCGTAATATTGCTAGTGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAAGCACTTGTGGAATTTTTCTATAAAAATGATGCATTAAATGATCCGTTGATAACGGATGATCACATCAAATTACTGAATATTGCGACAGATAAAGATATTGAAACATTAAAAACGAAAGCGCTAGAAATTAATCAAGTATTAAAAAAATTAATGGATGCTATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGGTCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGCCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGATTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTGTTAGATGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCTGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGATTTCAAATTTTAACTGAAATAGGTTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCATACGGCATTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGTGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAGCTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGCTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGGCCAGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATAGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAGTCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATATCAAGGGGCTGCTACAGGCGTTGGCGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAACAAAACCAAAGATTACTTAAAGGGGTTGTAAAGGGTATCGGAGGTTATGGTAACTGCATTGGTATTCCAACAACTGCCGGTGAAATCGAATTTGATGAACGTTATGATGGCAATCCACTTGTTAATGCAATGTGTGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCTTCTGAAATGGCTGCAAAAGGTGGTAGTGGTTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTATGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTTACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGATGACGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATTTATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAAATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAGCATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGACCAACAAGTTGGTGCCAATACGATAATTAAGCCTGGACTTCAAGCATCGGTAGTACGTGTGGAAGGTACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGAAATTTAATTGCCGTGGGTGCAACACCATTAGCAATGACAGATTGTTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATCTATCAACAGTTGATAGATTCAACGAAAGGTATGGCAGAAGCATGCGACATTCTTAAGACACCAGTAGTTTCTGGTAATGTATCTTTATATAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCAACACCAGTTGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTGAACCTCAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGAAAAGTTAATTTATGGCAAAGTTAATCATGAATTTGAGTCATTAGATTTGAGTTCAGAAGTTGAAAAAGGTGAATCAATCAAGACAGCTATTCGTGAAGGGGTATTATCACATGTTCAAACGGTTGGTAAAGGTGGCTTACTGATTACCTTAGCTAAACTAAGTGCGCATTACGGTTTAGGATTAAAGTCTTCAATAGATATAACAAATACACAATTGTTTAGTGAGACACAAGGCCGATATGTTGTTTCTGTTAAATCAGGTAAAACTTTAAATATTGATAATGCAATAGAAATTGGACTTTTAACAGATAGTGATAATTTCAAAGTAACAACACCATATACAGAGATTAGTGAAAATGTTTCAGATATTAAACAAATATGGGAAGGGGCAATTGCTCAATGTTTAACTACTCAGGATTAAACGAAGAATGTGGCGTGTTTGGTATTTGGAATCATCCTGAAGCAGCGCAACTAACATATATGGGACTTCATAGTTTGCAACATCGTGGTCAAGAAGGTGCAGGTATAGTTGTTTCTAATCAAAATGAATTAAAAGGCGAGCGAGGATTAGGCTTACTAACTGAAGCGATTAAAGATGACCAAATGGAACGATTAAAAGGATATCAACATGCAATTGGTCACGTCCGTTATGCTACTTCAGGTAATAAAGGTATTGAAAATATTCAACCGTTTCTGTATCACTTTTATGATATGAGTGTAGGTATTTGTCATAATGGTAACCTCATTAATGCTAAATCATTGCGTCAGAATTTAGAAAAACAAGGTGCTATCTTCCATTCGTCTTCTGATACTGAAGTCATTATGCATTTGATACGTCGAAGTAAAGCTCCTACTTTTGAGGAAGCGTTGAAAGAAAGTTTGCGAAAAGTTAAAGGGGGTTTTACATTTGCGATTTTAACTAAAGATGCGTTATATGGCGCAGTAGATCCAAATGCTATCAGACCTCTTGTTGTAGGTAAAATGAAAGATGGTAAATACATCCTTGCAAGTGAAACATGTGCAATAGATGTGTTAGGTGCAGCATTTGTTCAAGATATTCATGCAGGTGAATATGTCGTGATTAACGATAAAGGTATTACAGTTAAATCTTATACACATCATACGACAACTGCAATTTCTGCGATGGAATATATTTATTTTGCTAGACCAGATTCAACAATAGCTGGTAAAAATGTCCATGCAGTACGTAAAGCTTCTGGTAAAAAATTAGCCCAAGAAAGCCCTGTAAATGCTGATATGGTCATCGGTGTACCCAATTCATCGCTATCAGCTGCGAGTGGTTATGCTGAAGAAATAGGTTTGCCATATGAAATGGGACTAGTTAAAAATCAATATGTTGCAAGAACATTTATTCAACCAACTCAAGAATTACGTGAGCAAGGTGTGAGAGTGAAGTTATCTGCGGTAAAAGATATAGTAGATGGGAAAAATATCATTCTTGTTGATGATTCCATTGTTCGCGGTACGACAATTCGACGCATTGTGAAAATGTTAAAAGATTCTGGTGCAAATAAAGTGCATGTGCGTATAGCATCACCGGAATTTATGTTCCCAAGTTTTTATGGAATCGATGTTTCAACTACGGCAGAATTAATTTCTGCAAGCAAATCACCTGAAGAAATTAAAGATTATATTGGCGCTGATTCATTAGCATATCTATCTGTAGATGGGTTAATTGAATCAATTGGTTTAGATTATGACGCGCCATATAGTGGCTTATGTGTAGAAAGTTTCACTGGAGATTATCCTGCAGGGTTATATGATTATGAAGCAAATTATAAAGCACATTTAAGTCATCGACAAAAGCAATATATTTCTAAAAACAAACACTTTTTTGATAGCGAGGGAAATTTAAATGTCTAAAGCATATGAACAATCTGGTGTAAATATTCATGCTGGTTATGAAGCTGTAGAAAGAATGTCTAGTCATGTTAAACGTACGATGCGTAAAGAAGTTATCGGTGGTTTAGGTGGATTCGGTGCTACATTTGATTTATCACAATTAAATATGACAGCACCAGTTTTAGTTTCTGGAACAGACGGAGTAGGAACGAAATTAAAACTAGCTATCGACTATGGTAAACATGATTCGATAGGTATCGATGCAGTTGCAATGTGTGTTAATGATATTTTAACGACAGGTGCAGAACCATTATATTTTTTAGATTACATCGCTACAAACAAAGTTGTTCCTGAAGTTATTGAACAAATTGTTAAAGGTATTAGTGATGCATGCGTTGAAACGAATACTGCACTTATCGGTGGAGAGACTGCTGAAATGGGTGAAATGTATCACGAAGGCGAATATGATGTAGCCGGATTTGCTGTTGGAGCAGTTGAAAAGGATGACTATGTAGATGGTTCAGAAGTGAAAGAGGGACAAGTTGTTATAGGACTTGCGTCAAGTGGCATTCATTCAAATGGATACAGTTTAGTGCGCAAATTAATTAATGAATCAGACATTGATTTGGCATCAAACTTCGATAATCGTCCATTTATAGATGTCTTTTTAGAGCCAACTAAATTATATGTCAAACCTGTACTTGCTCTGAAAAAAGAAGTTTCTATTAAGGCAATGAATCATATTACTGGTGGAGGTTTTTATGAAAATATTCCACGTGCATTGCCAGCCGGATATGCTGCTAGAATTGATACTACATCATTTCCAACGCCAAAAATATTTGATTGGTTACAACAACAAGGCAATATAGACACAAATGAAATGTATAACATTTTTAATATGGGTATTGGCTATACGGTTATCGTTGATGAAAAAGATGTATCACGCGCTTTGAAGATTTTAGCAGAACAAAATGTGGAAGCCTATCAAATTGGTCATATTGTGAAAAATGAGTCAACTGCAATCGAATTGTTGGGGGTATAACAATGGTTAAAATTGCGATTTTTGCATCAGGTTCAGGAAGTAACTTTGAAAATATAGTTGAGCATGTTGAATCAGGAAAACTTGAAAATATTGAAGTTACGTCGCTATATACGGATCATCAAAATGCGTTTTGTATAGATAGAGCAAAAAAGCATGATATTCCTGTTTATATTAATGAACCAAAAAAATTTGATTCAAAAGCAGCGTATGAACAACATTTAGTAACATTATTAAATGAAGATAAGGTAGAGTGGATTATTTTAGCTGGCTACATGCGTCTAATTGGTCCAGACTTATTAGCTTCATTTGAAGGTAAAATATTGAATATACATCCATCTCTATTGCCGAAATATAAGGGGATTGACGCAATAGGCCAAGCATATCATAGTGGCGATACTATTACTGGTTCGACAGTACATTATGTTGATAGTGGTATGGATACGGGAGAAATTATTGAACAGAGACAATGTGATATTAGACCGGACGATTCAAAAGAACAATTAGAAGAGAAAGTAAAAAAATTGGAATATGAGTTATATCCAAGTGTTATTGCTAAAATTGTAAAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483300|1014695:1023168|1015164_1016289_+|SQE33361.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFLQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDMDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLKEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVYQTEQDMYAKFEGSN >LS483300|1014695:1023168|1022601_1023168_+|SQE33368.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTSLYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKKFDSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >LS483300|1014695:1023168|1014695_1015178_+|SQE33360.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >LS483300|1014695:1023168|1016996_1017260_+|SQE33363.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >LS483300|1014695:1023168|1021570_1022599_+|SQE33367.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESDIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDVSRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >LS483300|1014695:1023168|1016292_1016997_+|SQE33362.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREALVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKKLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >LS483300|1014695:1023168|1020093_1021578_+|SQE33366.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSNQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGKYILASETCAIDVLGAAFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >LS483300|1014695:1023168|1017925_1020115_+|SQE33365.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVFILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNTQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >LS483300|1014695:1023168|1017261_1017933_+|SQE33364.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNHTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1219521 : 1286502
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483300|1219521:1286502|DBSCAN-SWA AGTGAGCTATTTAGTTACAATAATTGCATTTATTATTGTTTTTGGTGTACTAGTAACTGTTCATGAATATGGCCATATGTTTTTTGCGAAAAGAGCAGGCATTATGTGTCCAGAATTTGCGATCGGTATGGGGCCAAAAATTTTTAGTTTTAGAAAAAATGAAACACTTTACACTATTAGGTTATTGCCTGTTGGTGGATATGTTCGTATGGCAGGAGATGGCTTAGAAGAGCCACCAGTCGAGCCTGGTATGAACGTTAAAATTAAACTGAATGAAGAAAATGAAATAACACATATCATATTAGATGATCATCATAAGTTTCAACAAATTGAAGCGATCGAAGTTAAAAAATGTGATTTTAAAGATGACTTATTCATAGAAGGTATTACTGCTTATGATAACGAAAGACATCATTTTAAAATTGCTAGAAAGTCTTTTTTTGTTGAAAATGGTAGCTTAGTTCAAATTGCTCCGAGAGACAGACAATTTGCACATAAAAAGCCATGGCCGAAATTTTTAACATTATTTGCGGGACCGTTATTTAACTTTATATTAGCTTTAGTCCTATTTATTGGTCTTGCATATTATCAAGGTACACCTACGTCTACTGTAGAACAAGTCGCAGATAAGTATCCAGCTCAACAAGCAGGCTTACAAAAAGGCGATAAAATTGTCCAAATTGGCAAATATAAAATATTTGAATTTGATGATGTTGATAAGGCGTTAGATAAAGTTAAAGATAATAAGACAACTGTTAAATTTGAACGTGATGGTAAAACAAAGTCAGTTGAATTAACACCTAAAAAGACTGAAAGAAAACTGACTAAAGTAAGTTCAGAAACGAAGTATGTTCTCGGATTCCAACCAGCGAGTGAACATACACTCTTCAAACCAATTGTATATGGATTTAAAAACTTTTTAATCGGTAGTACTTATATTTTTTCAGCTGTAGTAGGTATGTTGGCTAGTATATTTACGGGCGGATTCTCATTTGATATGTTAAATGGTCCGGTTGGTATTTATCATAACGTAGACTCAGTTGTTAAAGCGGGTATCATTAGCTTAATTGGATACACTGCGTTATTAAGTGTAAACTTAGGTATTATGAATTTAATTCCTATTCCTGCACTAGACGGTGGTCGTATTTTATTTGTTATATATGAAGCGATTTTCAGAAAACCAGTTAATAAAAAAGCGGAAACAACTATTATTGCTATTGGTGCCATTTTCATGGTCGTTATTATGATATTAGTAACGTGGAATGATATTCGACGATATTTCTTATAATTTAGGAGGATAAATAATTATGAAGCAATCCAAAGTTTTTATACCAACGATGCGTGACGTGCCATCAGAAGCAGAAGCACAAAGTCATCGTTTATTATTGAAATCGGGTTTGATAAAACAAAGTACAAGTGGGATTTATAGTTATTTACCGCTAGCAACACGTGTGTTAAATAATATTACTGCAATTGTGCGACAAGAAATGGAACGTATCGATTCTGTTGAAATTTTAATGCCAGCGTTACAACAAGCTGAATTATGGGAAGAATCAGGACGTTGGGGTGCATATGGTACAGAATTAATGCGTTTACAAGATAGACATGGAAGACAATTTGCATTAGGTCCAACACATGAAGAATTAGTTACATCAATAGTAAGAAATGAATTGAAATCATACAAACAATTACCGATGACATTATTCCAAATTCAATCTAAATTCCGTGATGAAAAGAGACCACGTTTTGGTTTACTTCGTGGTCGTGAATTTATTATGAAAGATGCGTATTCATTCCATGCTGACGAGGCATCATTAGATCAAACGTATCAAGATATGTATCAAGCGTATAGCCGTATTTTTGAGAGAGTTGGCATTAACGCAAGACCAGTAGTTGCAGATTCAGGTGCTATTGGCGGTAGCCATACACATGAATTTATGGCATTAAGTGCTATCGGTGAGGATACAATCGTTTACAGTAAAGAAAGTGACTATGCTGCTAATATCGAAAAAGCAGAAGTCGTTTACGAACCAAATCATAAGCATACTACTGTGCAATCTTTAGAAAAAATTGAAACACCAAATGTTAAGACTGCGCAAGAATTGGCAGACTTCTTAGGTAGACCAGTAGATGAAATCGTTAAAACGATGATTTTCAAAGTTGATGGCGAATATATTATGGTTTTAGTGCGTGGACATCATGAAATTAATGACATTAAATTAAAATCTTATTTCGGCACAGATAATATTGAATTAGCAACACAAGACGAAATTGTTAATTTAGTTGGTGCAAATCCTGGTTCACTAGGTCCTGTAATTGATAAAGAGATCAAAATTTATGCAGATAATTTTGTGCAAGATTTAAATAATTTAGTTGTCGGGGCTAACGAAGATGGTTATCACTTAATTAATGTAAATGTAGGTAGAGACTTCAACGTTGATGAATATGGCGATTTCCGTTTTATTTTAGAAGGCGAAAAGTTAAGTGATAGTTCAGGCGTTGCACATTTTGCTGAAGGTATTGAAGTTGGTCAAGTATTCAAATTGGGTACTAAGTATTCAGAATCAATGAATGCTACATTCTTAGATAACCAAGGAAAAGCCCAACCTTTAATTATGGGTTGTTACGGAATTGGAATTTCTAGAACGCTAAGTGCGATTGTTGAACAAAATCACGATGATAATGGAATTGTTTGGCCTAAATCAGTTACTCCGTTTGATTTACATTTAATTTCTATTAATCCTAAGAAAGATGATCAACGAGAACTAGCGGATGCACTATATGCTGAATTTAATACTAAATTTGATGTGTTGTACGATGATCGTCAGGAACGTGCTGGTGTCAAATTTAATGATGCCGATTTAATTGGTTTACCACTGCGAATTGTTGTTGGTAAACGTGCATCGGAAGGTATTGTAGAAGTTAAAGAACGTTTAACAGGTGATAGCGAAGAAGTCCACATTGCTGACTTAATGACTGTCATTACAAATAAATATGATAACTTAAAATAATTAAGATCGAATGAATTATAAGAGTATGAAAAAGCAGAAAGAAATCTGATGCTTATGTCCTGCTCTTATTATTTTTGATATAATGATTATTCGATGAAAAATGACTGAAGACATAGTATAATTAAAGATAAATTTGTTTTAACAATATTATGATTAGCCAAATATAAAGCATTTAATTTTCTATCATTACTATGCATACATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTCATATTACATTACCACAATTCTTAGCTCATGAAGATTATTTATTATTTATACATGCAATAGAGCAAGAGTTTAAAGATATCGCCAACGTTACATGTCGTTTTACGGTAACAAATGGCACGAATCAAGATGAACATGCAATTAAATACTTTGGGCACTGTATTGACCAAACAGCTTTATCTCCAAAAGTTAAAGGTCAATTGAAACAGAAAAAGCTTATTATGTCTGGAAAAGTATTAAAAGTAATGGTATCAAATGACATTGAACGTAATCATTTTGACAAGGCTTGCAATGGAAGTCTTATCAAAGCGTTTAGAAATTGTGGTTTTGATATCGATAAAATCATATTCGAAACAAATGATAATGATCAAGAACAAAACTTAGCTTCTTTAGAAGCACATATTCAAGAAGAAGACGAACAAAGTGCACGATTGGCAACAGAGAAACTTGAAAAAATGAAAGCTGAAAAAGCGAAACAACAAGATAACAACGAAAGTGCTGTCGATAAGTGTCAAATTGGTAAGCCGATTCAAATTGAAAATATTAAACCAATTGAATCTATTATTGAGGAAGAGTTTAAAGTTGCAATAGAGGGTGTCATTTTTGATATTAACTTAAAAGAACTTAAAAGTGGTCGCCATATCGTAGAAATTAAAGTGACTGACTATACGGACTCTTTAGTTTTAAAAATGTTTACTCGTAAAAACAAAGATGATTTAGAACATTTTAAAGCGCTAAGTGTTGGTAAATGGGTTAGGGCTCAAGGTCGTATTGAAGAAGATACATTTATTAGAGATTTAGTTATGATGATGTCTGATATTGAAGAGATTAAAAAAGCGACAAAAAAAGATAAGGCTGAAGAAAAGCGTGTAGAATTCCACTTGCACACTGCAATGAGTCAAATGGATGGTATACCAAATATTGGTGCGTATGTTAAACAGGCAGCAGACTGGGGACATCCAGCCATTGCGGTTACAGACCATAATGTTGTGCAAGCATTTCCAGATGCTCACGCAGCAGCGGAAAAACATGGTATTAAAATGATATACGGTATGGAAGGTATGTTAGTTGATGATGGTGCTCCGATTGCATACAAACCACAAGATGTCGTATTAAAAGATGCTACTTATGTTGTATTCGACGTTGAGACAACTGGTTTATCAAATCAGTATAATAAAATTATCGAGCTTGCAGCTGTGAAAGTTCATAACGGCGAAATCATCGATAAGTTTGAAAGGTTTAGTAATCCGCATGAACGATTATCGGAAACGATTATCAATTTGACACATATTACTGATGATATGTTAGTAGATGCCCCTGAGATTGAAGAAGTACTTACAGAATTTAAAGAATGGGTTGGCGATGCGATATTCGTAGCACATAATGCTTCGTTTGATATGGGCTTCATCGACACGGGATACGAACGTCTTGGATTTGGACCATCTACGAATGGTGTTATCGATACATTAGAATTATCTCGTACGATTAATACTGAATATGGTAAACATGGTTTAAATTTCTTAGCTAAAAAATACGGTGTAGAATTAACGCAACATCACCGTGCCATTTATGATACAGAGGCAACAGCTTACATTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483300|1219521:1286502|1219521_1220808_+|SQE33553.1|protease|DBSCAN-SWA MSYLVTIIAFIIVFGVLVTVHEYGHMFFAKRAGIMCPEFAIGMGPKIFSFRKNETLYTIRLLPVGGYVRMAGDGLEEPPVEPGMNVKIKLNEENEITHIILDDHHKFQQIEAIEVKKCDFKDDLFIEGITAYDNERHHFKIARKSFFVENGSLVQIAPRDRQFAHKKPWPKFLTLFAGPLFNFILALVLFIGLAYYQGTPTSTVEQVADKYPAQQAGLQKGDKIVQIGKYKIFEFDDVDKALDKVKDNKTTVKFERDGKTKSVELTPKKTERKLTKVSSETKYVLGFQPASEHTLFKPIVYGFKNFLIGSTYIFSAVVGMLASIFTGGFSFDMLNGPVGIYHNVDSVVKAGIISLIGYTALLSVNLGIMNLIPIPALDGGRILFVIYEAIFRKPVNKKAETTIIAIGAIFMVVIMILVTWNDIRRYFL >LS483300|1219521:1286502|1264854_1265388_+|SQE33587.1|DBSCAN-SWA MNNNILPAIRNIKDLEKLIKTDYKMCVLLDMHIGHIKSIMELLKQNHIECFIHIDLIKGLSHDEFASEFIIQQYKPKGIVSTKSKVIKKAKSLNTLTIFRVFIIDSQALKRSIDLIKKVEPDFVEVLPGVASKAIHHIQKETNTQVIAGGLINTIDEVNEAVKNGAKYVTTSYDKLW >LS483300|1219521:1286502|1257041_1257335_+|SQE33581.1|DBSCAN-SWA MKDTLMSIQIIPKTPNNDNVIPYVDEAIKIIDESGLHFRVGPLETTVQGNMNECLILIQSLNERMVELECPSIISQVKFYHVPDGITIETLTEKYDE 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MKPQLSWKVGGQQGEGIESTGEIFATAMNRKGYYLYGYRHFSSRIKGGHTNNKIRVSTTPVHAISDDLDILIAFDQETIDVNHHEMREDSIILADAKAKPVKPEGCHAQLIELPFTATAKELGTALMKNMVAIGATSALMNLNTNTFEELITNMFSKKGDKVVEVNIQALNEGYQLMQSRLPEIDGDFELESTDALPHLYMIGNDAIGLGAIAAGSQFMAAYPITPASEVMEYMIANISKVNGAVIQTEDEIAAVTMAIGANYGGVRAFTASAGPGLSLMMEAIGLSGMTETPLVIINTQRGGPSTGLPTKQEQSDLMQMIYGTHGDIPKIVVAPTDAEDAFYLTMEAFNLAEQYQCPVIVLSDLQLSLGKQTVEKLDYNRIEIKRGEIIQSDIEREEDDKGYFKRYALTSNGVSPRPIPGVKGGIHHITGVEHNEEGKPSESASNRQQQMEKRMRKIEQLVIESPVEANLQHEDADILYIGFISTKGAIQEGSNRLNQQGIKVNTIQIRQLHPFPTSVIQDAVNKAKKVVVVEHNYLGQLASIIKMNVNIHDKIENYTKYDGTPFLPHEIEEKGKIIATEIKEMV >LS483300|1219521:1286502|1232705_1233623_+|SQE33562.1|tRNA|DBSCAN-SWA MYNGILPVYKERGLTSHDVVFKLRKILKTKKIGHTGTLDPEVAGVLPVCIGNATRVSDYVMDMGKAYEANVSIGRSTTTEDQTGDTLEMKGVHSADFNNDDIDRLLENFKGVIEQIPPMYSSVKVNGKKLYEYARNNETVERPKRKVNIKDIGRISELDFKENECHFKIRVICGKGTYIRTLATDIGVKLGFPAHMSKLTRIESGGFVLKDSLTLEQIKELHEQDSLQNKLFPLEYGLKGLPSIKIKDSHIKKRILNGQKFNKNEFDNKIKDQIVFIDDDSEKVLAIYMVHPTKESEIKPKKVFN >LS483300|1219521:1286502|1241998_1242712_+|SQE33567.1|DBSCAN-SWA MSEMNAVYNVKQYILNLIKQNKLEYGDQLPSNLSIARELNVKTDDVYEATQALITEQVIKDNFEEGTSVKSLPPFYYPLNELISIGQMIKNAGFECGTEYLNFDEQPATMLDANLLSVEEGYPVTIIERLRTADGEPVVYCLDKIAKKELTCTEYQMSNGSILSAIKEQSNHNICYADTEIEAVNYEPRISEVLNASPHEGLILLKITHYNESDEPILYSLNYMKNSLVQFKITRKI >LS483300|1219521:1286502|1272169_1272403_+|SQE33593.1|DBSCAN-SWA MIANENIQDKALENFKANQTEVTVFFLNGFQMKGVIEEYDKYVVSLNSQGKQHLIYKHAISTYTVETEGQESTESEE >LS483300|1219521:1286502|1245293_1245998_+|SQE33570.1|DBSCAN-SWA MKALVLGGSGSIGSEIVKQLLTDGFEVYVQYYRTDINELTSKFNDDKVHFIQADLSQIIDIDKTFGDIKSLDCLIYASGQSLYGVLQDMKDHDINACYQLNVLQLIRLCRYFVDVLRQSDNGRIIVISSIWGETGASMETIYSTMKSAQLGFVKALSQELALTSVTVNAIAPGFVAGNMASEWQEDELQAMITELPQQRLVLPSEVAHTCAYLYHPNARSVTGTIQKVNGAWYI >LS483300|1219521:1286502|1233637_1234609_+|SQE33563.1|DBSCAN-SWA 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MDNDRQKALDTVIKNMEKSFGKGAVMKLGDNIGRRVSTTSTGSVTLDNALGVGGYPKGRIIEIYGPESSGKTTVALHAIAEVQSNGGVAAFIDAEHALDPEYAQALGVDIDNLYLSQPDHGEQGLEIAEAFVRSGAVDIVVVDSVAALTPKAEIEGEMGDTHVGLQARLMSQALRKLSGAISKSNTTAIFINQIREKVGVMFGNPETTPGGRALKFYSSVRLEVRRAEQLKQGQEIVGNRTKIKVVKNKVAPPFRVAEVDIMYGQGISKEGELIDLGVENDIVDKSGAWYSYNGERMGQGKENVKMYLKENPQIKEEIDRKLREKLGISDGDVEETEDAPKSLFDEE >LS483300|1219521:1286502|1286022_1286145_+|SQE33605.1|DBSCAN-SWA MYFAQLDGEITNKQSQELLDKEYEKAIELENKNKEQKLEK |
54 | Staphylococcus_phage(20.0%) | transposase,tRNA,protease,head,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1549403 : 1557715
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483300|1549403:1557715|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTATACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCGTTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGAATTTGCTTTTTGTGAGACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCTATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCTCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATAAGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTCAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCACCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAGCATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGTGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATGAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCTATAACGTATTGGACTTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCGTTATCTCTACTATTACAGAAAACAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCGATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGGTCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAATCATTAATTCTAGTAGGGGTACCTATAATCAATTGAGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGGTCGCTGCATCATATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTTTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACCATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCACCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCTATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAAAATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTCGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATTGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAGCCTTTTTCGATCGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAACAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAACTTTCGGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTTTTTCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATTACTTCTCCTGCAATACCGTAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTGCCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATAGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAACTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACGTATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTTGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAATTATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAAAATCACATGCTACATGCGTTCCTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATTGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCATCATTCAAACTATATTGTTCTAAGCTAATTAGTGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGCACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCCGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATGTAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAGTGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGCCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGTGCTTTATCTAAGTTATATAACAACTTTCTTTTTTGAAATATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTAGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAATTTTCTTCGTTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAAGCGCATCTGTAAAACCACGTTCTTGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAATAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCAATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCGCCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAGATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGGGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483300|1549403:1557715|1551214_1552561_-|SQE33855.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKKTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAATHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIVFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEVQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >LS483300|1549403:1557715|1549403_1550189_-|SQE33853.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANSFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRIMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >LS483300|1549403:1557715|1555915_1557715_-|SQE33859.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNGKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >LS483300|1549403:1557715|1550314_1551205_-|SQE33854.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >LS483300|1549403:1557715|1552674_1553775_-|SQE33856.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKRTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADFKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >LS483300|1549403:1557715|1553777_1554455_-|SQE33857.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDYGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVEKIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTESLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >LS483300|1549403:1557715|1554585_1555692_-|SQE33858.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1626816 : 1635859
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483300|1626816:1635859|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATGCCGCCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACGACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATTTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATACACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAAATTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATCGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGCAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGCGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACCGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCAACAATTTTCGAAGCTACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCCACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAACAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGTCCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCCGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTTGTCATATCGCTCAATTGCAATGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGTTGGTTTAATTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATCATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCATCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAACACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAAGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTAGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCAGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGAGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAAATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACATTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACATTTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCTTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATGTTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAATGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATACGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACAGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTAGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGGGTTAACATTAACATTTCAACTTTTCCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTCCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCGATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGTTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATAGCACTTTCATCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGCCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483300|1626816:1635859|1627356_1629630_-|SQE33931.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLIKPTEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLNFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >LS483300|1626816:1635859|1634854_1635859_-|SQE33936.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDDESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYGHFAKSNEERE >LS483300|1626816:1635859|1632665_1633805_-|SQE33934.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEHEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >LS483300|1626816:1635859|1632386_1632647_-|SQE33933.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >LS483300|1626816:1635859|1626816_1627335_-|SQE33930.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >LS483300|1626816:1635859|1633827_1634853_-|SQE33935.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGGKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >LS483300|1626816:1635859|1629832_1632112_-|SQE33932.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKNVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
1763340 : 1840313
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483300|1763340:1840313|DBSCAN-SWA CTTAATTTAAAGTATTAATCGCAGCATTTTTCTCATCATTCGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCCGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAACTCTTGATCCACTTGATTTAAAGCCACTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCATTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCGCCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTATCATTTACAGCATTGCGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGTAATTGTTGTGCTGCTTGTTGTTCTTCGAGCGTCGCATCATTATTATTAAAGATCGTATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTTATCGATGGCATTTTTTGCATCTGTTTTTACTTTTGTAGCTGGTGTAATTGCTTGTATTCCTTGAATCGCATTTGTCTTCACTTGTTCAACATTAGCATTGGTATTAGCGTTTAAAATGTTTGTGTTTGCTGCAGTTACAGCAGCATTCACTTTGTCAATTGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGATTAACTAAATCTTCCATTTGATCAGCTTTTTGGTTTACTGCATTTTCAGCATCAACACTTCGAATTAAAGTATGTTGCATCTGATTAGTTAATGTATCAATATCTGCTTGAGATACTCTTTTATTTAATGGTACATTGTTACGATTTTCAGCTAAAATTGTTTGTGCACGTCTTTTAAGATCATTAAAGATATCTAATGATGCAAATGTATAATCAGCTTGTTGAATACGTCTATCAACTTCACCTTGCAATGCGTCTTTATTCATTATGATATCGATTGTATACGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGTATACGTTTTATATGTTAATGTATCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTCGGTACATTATTAACACGCAACTTAAACTTTAAATCCAATATTTTATCAGGCATTAGTCGTGCCGGTGAATTCGTTGTGCCACCACCAGCGCTTTTAATTGTTATCACTCGATTCGTCGCATCATACGTGACATTCATATTATTAACATCAACGCCTGAATTGTTACTTGGAAAATCTTTAGTCAATGAGTTATTAACATATTCTACCCCTTCAGGTAATTGAATTTTATAAACAAATTCATCTGTATCTAGAGAAGCACCAGAATTACCATTATTTTTTAGTGATGTTGTAACTGTAAATTCTTTATTATTCGTTGCTGTGGGTTCCATTGTTCGTCTTTCAACATAGACATGCGAACCAGAATGAAGTCCGATTGAGTCAACAAAATCATAATATTTGTAACCATCTTTTAGTTGATAAATTCCTCGTGTATCTGTAATTGCATCATTTTTAGGCACAAATTGGATTTTAAGGTTATTTACATTATCTGGCACTTTGAATAATCGCAAAGTTGGTCCGTCTTCAATAGTCTTTTCAGCAATCGTATCGTTAGTAACACCATTTTTAATAATGACATTTGTTGCACCTTGACCATTTTTAGTTGGCATTGTATTAAATTCAAAGATTAATTCAGAATTTGGATTTACTGTTAAAGATTTTTCAATACCATTAAAATCTCCATGATTACTAGCGTCCGTCCCGCTTATACGTCCTAATGCAAGTACATTGCCTTGTGCCTGATAGGTTCTGTTGCTCCCAGCCTCAAACATACTTGTTCTAACCATCGCATGGCTTAACACACCTACTTTACCACCATTGATAAGTGTAAAGCCTGGTAAATTATCAACAACTGTTACTGATGGTACAGAACGGTTGGTACTTGGTCTAATACCATTGTCATCAAAAGACAGCACTTCGTTAGGTGCATTTTGTCCTGCATTATTGGCATTAGGATCTGTTGTCGGCGTGTATGGCGCTGTAATTGCAACTGGTGCACCACCGTTTCCTGCCGCTGCAGCCGCTGGATCTGCTGGTGTTGCATTAGGATCTGCTGGTGCCGCACGTCTACTTCTCTTTTTCGGTCTATTAGATGCCTGTTCAGCAATTGCAACTAGCTCTGGTTTATCTGAAGAATGACGAACATCTTCTTGAATTTCCTTTAAAGTTAGATGTCCTCCTGAACCATTTTCATTTGTTCTATTTGGTACATTTAATGTGGTATTATTCGACACTACATCATTATTATTAGCGTTTGACACTGTCTCTGTTGCTGTTGAATTAGCATCAGAATGATTATTATTTTGCGCAGGCGACGCGCTAGGCTGTATTGGAGCTGGCGTAGCTTGATTTGCTATACTACCATTATTATGATTAACCAATGCTTGATTCGTTGATTGATTAGGTGTTGCAGATTGATTAGGTGTATTCTGTGCACTATTTGCTAAACCTCTATTATTAGCAACATTTGTATCTTGTGAATTTACAGGTATTGCTTGATTAGTATCGCTTTGTACATTATTATCCGTAGTTAAGGCTTGTGCACCATTTGGGTTTGAAAGTAATAAAACTGTTCCGATTAAAGTAGAGAATATGCCTACTTTATACTTCCTAATACTATATTTATTTTTCTTTAACAAATTCATTTCATTTTCCTCCTGGTTGTCTGTTCTCTGCTGTGTTGTTTAGAATTATGCTAAAAATATACGCTCCCTCATATTATGTTTATAGCTATATTATTTTGTACAACATTTTAAGTTCACTCATTTTTATCATCATCATCATTTTATGAAATAAAGTTTTATTTTATTACAATTTAGTTTCCGTTTTGCAATTAAAATCTTAATAAAACATAACAAGAACGCTTTAGATTGTTTTGTAACAGAAAGCAATTCATACCAAAAAACACCAAGCAACCGAAAAGTTACTTGGTGTCATTACAAATGTAATATTATTTTAAATTATGTCACTACTTTAAATACTTTTTATTTCCAAACCTTCATCGCCCCATGCGTGCATGCCGCCTTCGACATTTACGGCATCAATGCCATTTGCCTCTAAATATTCTACAACTTTAGCGCTTCGAACTCCACCAGCACATACAATATAATATATTTCATTTTTATTAAATGAATTTAAATTATCCGGAATGGTATCCATTGGAATTAACTTTGCATTAGGAATATATCCCATTTCTGTTTCTTCATCAGTACGAACATCAACAATTTGAACTGGTTTAGATTCTAAAAGTTTGTTTTTTAATTCATCTGTAGTAATTGACTTCATTTTAAAGTCCTCCTTAAAACATTATTTAGCTACAATATTGACTAATTTTTGAGGAACAGCGATGACTTTCATGATGTCTTTACCTTCAATACTCGCTTTAACATTGTCATTAGATAAGGCAATTTCTTGCATTTCTTCTTTTGATGTATCTTTAGCAATTTTAATTTTAGCTCTCAATTTACCATTAACTTGAACAACGATTTCTACTTCATCATCTACAAGTAGTGCTTCGTCATAAGTTGGCCAAGGTTGGTACGTAATAGACTCTTCATGTCCTAATTTTGACCATAATTCTTCACCGATATGTGGTGCAATAGGTGCTAACATTTTAACGAAACCTTCAATGTAAGGTTTATAAACTTCATCAACTTTATAACACTCATTAATAAATACCATTAATTGACTAATAGCAGTATTAAATCCTAATGTTTCAAAGTCATCTGTTACCTTTTTAACAGTTTGGTTATAAACTTTATCTAAAGACTTATTATTTGTAGTTACAATTTTTGAACTCAATGTTCCATCTTCATTTACTATTAAACGCCATACGCGATCTAAGAATCGACGAGACCCATCTAATCCTTTTTCACTCCATGCAATTGCAGCATCTAAAGGCCCCATAAACATTTCGTAAAGTCGTAAAGTATCTGCACCATGAGACTGTACTATATCATCAGGATTGATTACATTTCCTTTAGATTTACTCATCTTCTCATTACCTTCTCCTAAAATCATACCTTGGTTAAATAATTTTTGGAAAGGTTCTTTAGTAGGTACGATGCCCAAATCATAAAGGACTTTATGCCAAAATCTTGCATATAATAAGTGAAGAACCGCATGTTCTACTCCACCGATATATAAATCAACAGGTAACCAATGTTTTAATTTTTCGGGATCTGCTAACATATTTTCATTTTTAGGATCGATGTAACGTAAATAATACCAACAACTACCTGCCCATTGTGGCATCGTATTTGTTTCACGACGTCCTTTCATACCTGTTTTTTCATCTACAACATTTACAAATGAATCAATATTAGCTAGTGGAGACTCACCAGTCCCTGATGGCTTGATTTCATCTGTTTCAGGTAACAACAATGGTAGCTCTTCTTCAGGAACAGTTGTCATTGTTCCATCTTCCCAATGAATGACAGGAATTGGTTCACCCCAATAACGCTGACGACTGAATAACCAATCTCTTAATTTGTAATTAACTTTCTTTTCGCCAGCACCTTTTTGCTCTAATAATTGAATAGCTTTAGTAATTGCCGCTTCATTTTCTAAACCATCAAGTTCACCAGAATTAATATGTTTACCTTCACCAGTGTATGCTGCTTCTTCAACATT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483300|1763340:1840313|1776277_1777459_-|SQE34055.1|DBSCAN-SWA MQFDNIDSALMALKNGEPIIVVDDENRENEGDLVAVTEWMNDNTINFMAKEARGLICAPVSKDIAQRLDLVQMVDDNSDIFGTQFTVSIDHVDTTTGISAYERTLTAKKLIDPSSEAKDFNRPGHLFPLVAQDKGVLARNGHTEVAVDLAKLTGAKPAGVICEIMNDDGTMAKGQDLQKFKEKHQLKMITIDDLIEYRKKLEPEIEFKAKVKMPTDFGTFDMYGFKATYTDEEIVVLTKGAIRQHENVRLHSACLTGDIFHSQRCDCGAQLESSMKYINEHGGMIIYLPQEGRGIGLLNKLRAYELIEQGYDTVTANLALGFDEDLRDYHIAAQILKYFNIEHINLLSNNPSKFEGLKQYGIDIAERIEVIVPETAHNHDYMETKKIKMGHLI >LS483300|1763340:1840313|1797755_1798013_+|SQE34078.1|DBSCAN-SWA MKKIFLAMIHFYQRFISPLTPPTCRFYPTCSEYTREAIQYHGAFKGLYLGIRRILKCHPLHKGGFDPVPLKKDKSASKHSHKHNH >LS483300|1763340:1840313|1785629_1786100_+|SQE34064.1|DBSCAN-SWA MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSKQSLSSFLFTRLNFYLIDLFRQQNQLKDVILCENNSPTLTEQPTYFNEHDLRLQDIFKFLNHRERLWLKLYLEGYKQFEIAEIMSLSLSTIKLIKTSVKRKCQHNFK >LS483300|1763340:1840313|1783280_1783676_+|SQE34061.1|DBSCAN-SWA 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>LS483300|1763340:1840313|1788442_1789156_-|SQE34068.1|DBSCAN-SWA MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEVAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >LS483300|1763340:1840313|1804320_1804893_+|SQE34086.1|DBSCAN-SWA MEKNEYTAKYNEYSQLLDATYSQAVAYLLNKYGAVTDDYYKEKSYTRFLNGEIKSISKGKYTRASEGLYCHHISEDKFQNLSDLRFISEFKYSYNYQKKENLVYCDLIEHLILHAIITKESHGQFGVAGLCQMIKPTVIDWYIGEYNPKPAWMQATKARAYLPGILVEKLLIKIDDMLKGIEIYDFLESR >LS483300|1763340:1840313|1778108_1779152_-|SQE34057.1|DBSCAN-SWA MSQFMDYAIQLANMVQGQTGVNPPVGAVVVKEGRIVGIGAHLRKGDKHAEVQALDMAQQNAEGATIYITLEPCSHFGSTPPCVNKIIDCKIAKVVYATKDNSLDTHGDDTLRDHGIEVECVDDERASQLYQDFFKAKAKQLPQITVKVSASLDGKQANDNGQSQWITNKEVKQDVYKLRHRHDAVLTGRRTVELDDPQYTTLIQDGKNPIKVILSKSGNIHFNQQIYQDESTPIWIYTENPNLTTNQTHIEIICLKSCDLTTILHNLYKRGVGTLLVEAGPTTTSEFLQSNYIDEFILYYAPKLIGGSGNYQFYQTNDVIEIPDANQFEIVHSELLNQNVKLTLRKK >LS483300|1763340:1840313|1796465_1797236_-|SQE34076.1|DBSCAN-SWA MDFIKRKRMPIESFTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPHHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTQLLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVNSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPSILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGATHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLAYIKEFMNQVELHS >LS483300|1763340:1840313|1834655_1835639_-|SQE34116.1|DBSCAN-SWA MKMKKLVKSSVASSIALLLLSNTVDAAQHITPVSEKKVDDKITLYKTTATSDNDKLNISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKAAGNINSGYKKPNPRDYDYSQFYWGGKYNVSVSSESNDAVNVVDYAPKNQNEEFQVQQTLGYSYGGDINISNGLSGGLNGSKSFSETINYKQESYRTTIDRKTNHKSIGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSYDPTYGNELFLGGRQSSSNAGQNFLPTHQMPLLARGNFNPEFISVLSHKQNDTKKSKIKVTYQREMDRYTNQWNRLHWIGNNYKNQNTVTFTSTYEVDWQNHTVKLIGTDSKETNPGV >LS483300|1763340:1840313|1781656_1781971_+|SQE34059.1|DBSCAN-SWA MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >LS483300|1763340:1840313|1803211_1803838_+|SQE34084.1|DBSCAN-SWA 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>LS483300|1763340:1840313|1827183_1828557_-|SQE34110.1|protease|DBSCAN-SWA MKTIKRVLNNLIILSLLISFTMSTASASEEQYYSVEYKNTATFNKLVKKNALNVVYNIPELHVAQIKMTKTHANALANYKNDIKYINATCSTCITSEKTIDRTSNESLFSRQWDMNKITKNGASYDDLPKHANTKIAIIDTGVMQTHDDLKNNFSTDSKNLVPLNGFRGTEPEETGDVRDVNDRKGHGTMVSGQTSANGRLIGVAPNNKFTMYRVFGSKKTELLWVSKAIVQAANDGNQVINISVGSYTVLDKNDHQTFRKDEKVEYDALQKAINYAKKKKSIVVAAAGNDGIDVNDKQKINLQREYQGNGEVKDVPASMDNVVTVGSTDQNSNLSEFSNFGMNYTDIVAPGGSFAYLNQFGVDKWMNEGYMHKENILTTANNGRYIYQAGTSLATPKVSGVLALIIDKYHLEKHPDKAIELLYQHGTSKNNKPFSRYGHGEIDVNKALNVTNQKAS >LS483300|1763340:1840313|1779632_1781135_-|SQE34058.1|DBSCAN-SWA 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75 | Staphylococcus_phage(95.0%) | protease,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1988599 : 2022546
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483300|1988599:2022546|DBSCAN-SWA 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MIAYPIRVGSVYRGEQMKLLKTKNCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPTFINKKIRMCEFQIESMYHMSASTTTCDEMMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKARLQNYKNRSISNMVLLKTVLNHYTEKEQKKVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNIAIENSKIARVNAYHQSSYVKVV |
38 | Staphylococcus_phage(60.87%) | transposase,protease,terminase,integrase | attL 1982728:1982747|attR 1999154:1999173 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
2421258 : 2455281
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS483300|2421258:2455281|DBSCAN-SWA ATTACATATTAATACTTTGCGGACGATGATTAGATTGATTTTTACGATGTCGTGTCGTTGGGTCTAATCGTTTTTCTAAAAATCTTAATAGTACATCAATGACGATTGCAATGATAGCAATCGGAATCGCACCTGCTAAAATAAACGTTGTGCCATCCGTCGCATTTGTACCACGAATCACAATGTCACCAAGCGTAGGTGCTCCTATAAATGATCCAACGGCAACAACACCTATCGCAACAACCAAGGCAATACGAATGCCACCGATAATAACTGAAACAGATAACGGTAATTCAATCATTCGTAGCACTTGATTGCGTGTCATTCCCATACCTTTGCCAGCATCCTTAATACTCGCATCAACACTAGCTATACCAGTATAAGTGTTTTTTATAATTGGAAGTAACGCATATAAAAACACTGTTAAAACTACTGTTTCTGAGCCTAAGCCCATGACTAACATTAAAATAGCTAACATTGCAATGACTGGAACTGTTTGAATTATATTTGCAATTGTAATTACGAATCCAGAAAGTTTTGTGTATCTTGCAAGCAAGATTCCCAATGGAATACCAATTAAAGCTGCAAAAAGTACACCATAGACAGACATTAATAAGTGTTTGAAAAATAAATCCCATAGATAGCCAAAGTTCGTAACATAATAATTGAATAATTGCTGTAATAAATTACCTTCCATTACTTATGACCACCTTTCTGTTTATCAAAATAGTGGTATTTTTTCAAAAATTCTTCTGCGACGACAGCAGGTTCTTTACCTTTACCATCTGCTTCATAATTCAAGCGCTGCATCTCTGAAGTTGAAATCTTTCCAGTCAACTTATTAATCGTCGTTTTAAGTTCTGGGTGTTGACGTAATAATTCATTTGTTGCAACAGCACTCGCAGCATAAGGTGGGAAAAATTGTTTATCATCTTTAAGTACTTTCAAATCATACGCGGCAATTCGACCATCTGTAGAATAACCTAATGCAACGTCTAACTTCTCTGAGTTTAATGCATCGTAGACTAGACCTATTTGCATTGGTCTCACTGTACCAAAGTCGAAACCATACTCTTTTTTAAACCCTTCATAGCCATCGCCTTTACGATTCATCCATGAACTATCCATACCTAAACGTAAATCTTTACTATGCTTTGCTAAATCTGAAACTGTCTCTAAATGATATTTTTTAGCAGTTTCCTTCGTTACCATGAATGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATCAAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTGGCTATCATTGCTTTCTTAGGATCTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAGCTCCCGTTAAATCTGTACCATTATATCTAACACCCGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTGTGTTGAATCGTACTTGACCCTAAATTATTTACTAATGTGGGCTTTATCTTACCATGTGTATCATGCTCTATTAACAACCGTAACATATGTGAAATAATTTGCGATTCGCTTGTTGATAATGCTGTAATTTTGACATCATTTTTCGTGCTCTTACTACCTAGTCCGGGCAAACTACATCCAGATAATACGGTAAGCGATAAGACAAGCACGACAAGTATATATTTAATTTCCTTCATTATCTTAGCCTCCTAATTATCCAGATACTTTTAAGCCTTTGGGAACTACCCATTTTTCAACTAAAGCTAATAAGGCATCAACACCTAATGCTAGTGCAGTAACGAGTACCGTTGCAGTTACAATCATCAGTGGATCATATAAATTTAAACCATTAAAAATGAAATCACCTAATCCACCCGCACCTACATAACTTGCAAGTGTAGCCCAACTAATTACATACACAGACGACAAGCGAATACCGCCTAGTATAAGCGGTAAGGCTAATGGCAATTCCACATCCTTCATCAATTGAAATTGCGTCATTCCCATACTTTTTCCAGCTTCTTTAATGTTGCTATCAATATTTTGAACACCGAGTACCGTGTTATTTAAAATAGGTAATAATACATAAATAAATAGCGCTACAATTGCAGGCGTTTTACCAACACCAAAAATCGGTATCATAATAGCAAGTACAGCTAGTGTTGGAATAGTTTGTAAGACACCTGCCACAGTTAATATAATATTGGCAGTTCGCTTTGTTTTTGATAATAAAATGCCTATAGGTACTGCAACAATGATGGCAAGTAATAATGCCACTATAGAAATATAGAAATGTTCCAGTGTTTTCGACATCAACTGTCCACCATGTTCATGTAGGAACTCGATCATGATTTATCATCTCCTATGTCACGTACTTTGACATTAGTAGTATTTTGCTCATGCACTTTTGAGGACGCAGTACCTTCCCCCACATGTTCTGTTTGCACTGTATCCTCACTATCGCCCCAAATCGTGTCATATACAATATCAACAACATTGGCACGCGTAATCAGTCCTACTAAACGTTGCTTATCATCTACGACAGGTACATTCCTAACGTTTCTTTTTAAAATCGTACGTACAGAATCTTGCAATTTAGAATCAATTTGAACGGTATAAATATGTTGTTGCATAGTATCTCGTAAACTTTTGTGTCCACGTATACCCTGATTTATATCTTCAATATCTAAGAATCCTAGTAAATGCTTATCCCTATCTACTACAAAAATAGTATCAACACGTTTTTGTCTCATAATATGAACGGCGTCATTCAGTGTTGCTTCTGCTTGTATAGTGATTGGTTTAATCATTACACCTTCTACAGTCTTGTCATTGGGACGGTCTTGAATCGGTCTATTTTGTCCTATAAAATCACGTACAAAATCATTTGCGGGATGTCTTAAAATATTGTCTGGTGTATCAAATTGCACCACCTTACCTTCTGACATAATACAAATTTTGTCTGCTAATTTAATCGCTTCATCCATATCATGTGTTACAAAGATAAACGTCTTACCTAATTTTCGTTGTAACGTTTTAACTAAATCTTGTAACGTATCTCTCGTAATAGGATCCAATGCACCAAAAGGTTCATCCATTAAAATAATATCTTGTTCGGCCGCAAGTGCTCTTACTACACCGATACGTTGTTGTTGCCCACCTGATAGTTCTGCTGGATAACGCTCTAAAAATGACTCCGGTAAATCCACAAGTTTAATTAATTCCTTTGCACGTTTATCCTTTTCTTCTTTAGTCCATTTCAACAATTTGGGTACCAACACAATATTCTCTTTAATCGTCATATGAGGCATTAAGCCAATTTGTTGAATAACATAGCCAATACTTCTACGTAATTCGACAGGATTCATACTCCGAACGTCTTTACCATCAATTTCAATTTGTCCTTCTGTCGCTTCAATCATACGGTTTATCATTCTTAAAGCAGTCGTTTTGCCACTTCCACTGGTTCCAATAAATGCGATAAATTCCCCAGATTGAATATCTAAAGAGATGTCATCTACTGCCTTTTTATTACCAGAATAGATTTTCGTTAAATGCTTAATACTTAACATAATCATTTCTCCTTCCTCATAAAAAATATGACGAATGATACGCATAAAATAAAAAGACCATCATCGCAATTGTTAAACAAATAGAGTCATAAGTTAAACAAGTACACATCATGGTCTTGATTATGTAGAATTTTATATTTTTCATCTGTAATGTGAATACTTAACAGTAAACGGCGCTATGTATGTTGAATTTCTACCGATTACTTTGTTTGCACATTCGTATATTCGACATTTAAAACTAACATACTCTATATGATGTTATTAAACATTATCATTTTATCTTTTGCAACTAAATAGATAACTCATATTTTTCAAAAGCGAATTTATTATCGCTCAATTGGTTGTTTTATAGTAAAAAAGTGTCGGAAATGTGAAATATTATTGTAAAAGTCGAATTTTTGTAATAATGCACACGCATCCATTGTTACAGGCGGACAAAAGCCCATCCGCCACCCACAAAGTCATCCTTATATTTTAATATCTTCATCATTCATTGTAGACACCCTTACCTTTTGCTAACAGTTCCTACTCCCAAGTCTGTAACGGAATTCCACCGTCAAAGTGTTGCCCATGACAGGCACACCTAAAAAACAACCAACAGCATGAGCCATTGGTTGTTTTGTGTCATCTTGTATGTTGTTGTATAACCGGTATGCTTTTACTCATTAATTACTTATCATGCATCCCTTTACCTTCTAGTATTTGGTTAATATACTTTTCAACACGCTTTTGTCTTGTTTCACTGCGTTTAGCTTGTCCAATATGATATATATATTGATGTTGTCTGCCTGGCGTTAATTTATAAAATGACGACTCTAGCTGTGGCATTTCTTCGAACTTAGCTTCTAACTCTTTAGGAATAACATATTCCTCTGTTTTCTTCATTTCAACTTTTTTACCAGCTTTTTCAGCTTTAATTGCTTCAGCAATATAGTATTTAATTTCTTCTCTACGTGCTTGAATCTCAGTTAAATTTTCAAATCGTAACTGACGAGCTGCTTGCACCTTTTCAGTCTGTTGAATGAGTGTATGATATTTATCCTCCAAAATGGCACCTTTATAAAATAATAGTGCAACATAATTTTTGAAACCATGGATAAGTACTACTTTTTATTATTCAGCGTGTAACAAGGATGCATCCATTTATACGCTTCCTCTAATTCTGTTTCATTAAAGATTAACGCTCTCAAATATTTATATTCTTCTTGCCATTGACTCTCTTTATTTAAAAATGACTCAACTTGTTCATTCGATTGTTTCTCACTCATAGTCATCACTTCCATTTTATTTTTCAATACACATTGTATTATATATCCTAATTTTATAAAAAACTAATTTTACAAATTCTTTTGCATTCTTACAAAAAATGCATTTGACTATTATTATAATAAGCGTATAATTGTCGCATATTATTTTTTGTATTTTTGGCAATAACGAAGGAGTATTTATGAATAAAGACAAGCAATTGCACAACGACAAAATCAATC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>LS483300|2421258:2455281|2439742_2440492_-|SQE34689.1|DBSCAN-SWA MIKIKDVEKSYQSAHVFKRRRTPIVKGVSFECPIGATIAIIGESGSGKSTLSRMILGIEKPDKGCVTLNDQPMHKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVREILFEVMCQCDGQPKDVMEVQAITLLEEVGLSKAYMDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPKYILFDEAISSLDMSIQTQILDLLIHLRETRQLSYIFITHDIQAATYLCDQLIIFKNGKIEEQIPTSALHKSDNAYTRELIEKQLSF >LS483300|2421258:2455281|2453606_2454302_-|SQE34702.1|DBSCAN-SWA MTVLTDKVAVVTGAGSGIGEAIATLLHEEGVKVILAGRHKDKLQNVANQLAQDRVKVVPTDVTKKEEVDELIKIAQQTFGGLDIVINSAGQMLSSKITDYQVDEWDSMIDVNIKGTLYTAQAALPTMLEQSSGHLINIASISGFEVTKSSTIYSATKAAVHTITQGLEKELAKTGVKVTSISPGMVDTAITAAYNPTDRKKLEPQDIAEAVLYALTQPKHVNVNEITVRPV |
33 | Bacillus_phage(28.57%) | transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Click the colored protein region to show detailed information
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483300.1|SQE33606.1|1286301_1286502_+|phage-capsid-and-scaffold-protein |
1286301_1286502_+
Protein sequences of LS483300.1|SQE33606.1|1286301_1286502_+|phage-capsid-and-scaffold-protein>LS483300.1|SQE33606.1|1286301_1286502_+|phage-capsid-and-scaffold-protein MENNEGNITDVTQNEEQLDNSDEQSQQNEKTFSQEEVSQLIKERIARERKKSDERIKDAKESNEVA |
66 aa aa | NA | NA | NA | 1219521-1286502 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 4.1|1197768|26|LS483300|CRISPRCasFinder matches to LS483300 position: 1248150-1248125, mismatch: 0 cggggccccaacatagaagctggcgg CRISPR spacer cggggccccaacatagaagctggcgg Protospacer ************************** |