CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
LS483302	Staphylococcus aureus strain NCTC8726 genome assembly, chromosome: 1	5 crisprs	cas3,casR,DEDDh,DinG,csa3,WYL	4	1	11	0

1. LS483302

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: LS483302_1

• CRISPR_ID: LS483302_1
• CRISPR_location: 230045-230129
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of LS483302_1

Consensus_repeat	Method
TTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTG	CRISPRCasFinder

spacers of LS483302_1

>1.1|230071|33|LS483302|CRISPRCasFinder
TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483302_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LS483302_1

>merge|LS483302|1|230045-230129|CRISPRCasFinder
TTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCGAGTTGGGGTG

>LS483302|1|1|230045-230129|CRISPRCasFinder
TTCTACAGGCAATGCGAGTTGGGGTG	TGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT
TTCTACAGACAATGCGAGTTGGGGTG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LS483302.1|SQE39712.1|224314_225820_-|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|223395
LS483302.1|SQE39713.1|225845_227408_-|acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA-transferase-subunit-alpha	unknown	unknown	gnl|CDD|227016
LS483302.1|SQE39724.1|238294_239824_-|PTS-system-glucose-specific-transporter-subunit-IIBC	unknown	unknown	gnl|CDD|273923
LS483302.1|SQE39722.1|235302_236448_-|Flavohemoprotein-(Hemoglobin-like-protein)-(Flavohemoglobin)-(Nitric-oxide-dioxygenase)	unknown	unknown	gnl|CDD|237337
LS483302.1|SQE39710.1|220543_222805_-|Enoyl-CoA-hydratase-/-Enoyl-CoA-hydratase-[valine-degradation]-/-3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|224170
LS483302.1|SQE39711.1|222991_224203_-|glutaryl-CoA-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|173840
LS483302.1|SQE39725.1|240186_241122_+|Inosine-uridine-preferring-nucleoside-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|239117
LS483302.1|SQE39707.1|216325_216670_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|371594
LS483302.1|SQE39714.1|227781_228453_+|glutamine-amidotransferase-class-I	unknown	unknown	gnl|CDD|153212
LS483302.1|SQE39719.1|232917_234393_-|ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|173855
LS483302.1|SQE39723.1|237020_237974_+|L-lactate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|178836
LS483302.1|SQE39721.1|235103_235277_-|membrane-protein	unknown	unknown	unknown
LS483302.1|SQE39716.1|230310_230862_-|bacterial-regulatory-s,-tetR-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224228
LS483302.1|SQE39706.1|214398_216162_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|227120
LS483302.1|SQE39718.1|231672_232575_+|alpha/beta-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|223999
LS483302.1|SQE39708.1|216859_218743_+|staphylocoagulase-precursor	unknown	unknown	gnl|CDD|312335
LS483302.1|SQE39720.1|234590_234947_-|Putative-cytosolic-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225730
LS483302.1|SQE39709.1|219329_220514_-|3-ketoacyl-CoA-thiolase	unknown	unknown	gnl|CDD|238383
LS483302.1|SQE39715.1|228587_229826_+|membrane-spanning-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225217
LS483302.1|SQE39717.1|231015_231660_+|saccharopine-dehydrogenase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|187577

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LS483302.1|SQE39712.1|224314_225820_-|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase	gnl|CDD|223395	COG0318, CaiC, Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II [Lipid metabolism / Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	7.37356e-152
LS483302.1|SQE39713.1|225845_227408_-|acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA-transferase-subunit-alpha	gnl|CDD|227016	COG4670, COG4670, Acyl CoA:acetate/3-ketoacid CoA transferase [Lipid metabolism].	0
LS483302.1|SQE39724.1|238294_239824_-|PTS-system-glucose-specific-transporter-subunit-IIBC	gnl|CDD|273923	TIGR02002, PTS_system_glucose-specific_IIABC_component, PTS system, glucose-specific IIBC component. This model represents the combined B and C domains of the PTS transport system enzyme II specific for glucose transport. Many of the genes in this family also include an A domain as part of the same polypeptide and thus should be given the name "PTS system, glucose-specific IIABC component" while the B. subtilus enzyme also contains an enzyme III domain which appears to act independently of the enzyme II domains. This family is most closely related to the N-acetylglucosamine-specific PTS enzymes (TIGR01998). [Transport and binding proteins, Carbohydrates, organic alcohols, and acids].	1.23631e-175
LS483302.1|SQE39722.1|235302_236448_-|Flavohemoprotein-(Hemoglobin-like-protein)-(Flavohemoglobin)-(Nitric-oxide-dioxygenase)	gnl|CDD|237337	PRK13289, PRK13289, NO-inducible flavohemoprotein.	4.53176e-124
LS483302.1|SQE39710.1|220543_222805_-|Enoyl-CoA-hydratase-/-Enoyl-CoA-hydratase-[valine-degradation]-/-3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase	gnl|CDD|224170	COG1250, FadB, 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase [Lipid metabolism].	1.80826e-91
LS483302.1|SQE39711.1|222991_224203_-|glutaryl-CoA-dehydrogenase	gnl|CDD|173840	cd01151, GCD, Glutaryl-CoA dehydrogenase. Glutaryl-CoA dehydrogenase (GCD). GCD is an acyl-CoA dehydrogenase, which catalyzes the oxidative decarboxylation of glutaryl-CoA to crotonyl-CoA and carbon dioxide in the catabolism of lysine, hydroxylysine, and tryptophan. It uses electron transfer flavoprotein (ETF) as an electron acceptor. GCD is a homotetramer. GCD deficiency leads to a severe neurological disorder in humans.	1.31499e-95
LS483302.1|SQE39725.1|240186_241122_+|Inosine-uridine-preferring-nucleoside-hydrolase	gnl|CDD|239117	cd02651, nuc_hydro_IU_UC_XIUA, nuc_hydro_IU_UC_XIUA: inosine-uridine preferring, xanthosine-inosine-uridine-adenosine-preferring and, uridine-cytidine preferring nucleoside hydrolases. Nucleoside hydrolases cleave the N-glycosidic bond in nucleosides generating ribose and the respective base. These enzymes vary in their substrate specificity. This group contains proteins similar to nucleoside hydrolases which hydrolyze both pyrimidine and purine ribonucleosides: the inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase from Crithidia fasciculata, the inosine-uridine-xanthosine preferring nucleoside hydrolase RihC from Escherichia coli and the xanthosine-inosine-uridine-adenosine-preferring nucleoside hydrolase RihC from Salmonella enterica serovar Typhimurium. This group also contains proteins similar to the pyrimidine-specific uridine-cytidine preferring nucleoside hydrolases URH1 from Saccharomyces cerevisiae, E. coli RihA and E. coli RihB. E. coli RihA is equally efficient with uridine and cytidine, E. coli RihB prefers cytidine over uridine. S. cerevisiae URH1 prefers uridine over cytidine. .	1.20472e-149
LS483302.1|SQE39707.1|216325_216670_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein	gnl|CDD|371594	pfam11546, CompInhib_SCIN, Staphylococcal complement inhibitor SCIN. SCIN is released by Staphylococcus aureus to counteract the host immune defense. The protein binds to and inhibits C3 convertases on the bacterial surface, reducing phagocytosis and blocking downstream effector functions by C3b deposition on its surface. An 18 residue stretch 31-48 is crucial for SCIN activity.	1.06352e-41
LS483302.1|SQE39714.1|227781_228453_+|glutamine-amidotransferase-class-I	gnl|CDD|153212	cd01741, GATase1_1, Subgroup of proteins having the Type 1 glutamine amidotransferase (GATase1) domain. This group contains a subgroup of proteins having the Type 1 glutamine amidotransferase (GATase1) domain. GATase activity catalyses the transfer of ammonia from the amide side chain of glutamine to an acceptor substrate. Glutamine amidotransferases (GATase) includes the triad family of amidotransferases which have a conserved Cys-His-Glu catalytic triad in the glutaminase active site. In this subgroup this triad is conserved. GATase activity can be found in a range of biosynthetic enzymes, including: glutamine amidotransferase, formylglycinamide ribonucleotide, GMP synthetase , anthranilate synthase component II, glutamine-dependent carbamoyl phosphate synthase, cytidine triphosphate synthetase, gamma-glutamyl hydrolase, imidazole glycerol phosphate synthase and, cobyric acid synthase. Glutamine amidotransferase (GATase) domains can occur either as single polypeptides, as in glutamine amidotransferases, or as domains in a much larger multifunctional synthase protein, such as CPSase.	5.49795e-51
LS483302.1|SQE39719.1|232917_234393_-|ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-binding-protein	gnl|CDD|173855	cd08490, PBP2_NikA_DppA_OppA_like_3, The substrate-binding component of an uncharacterized ABC-type nickel/dipeptide/oligopeptide-like import system contains the type 2 periplasmic binding fold. This CD represents the substrate-binding domain of an uncharacterized ATP-binding cassette (ABC) type nickel/dipeptide/oligopeptide-like transporter. The oligopeptide-binding protein OppA and the dipeptide-binding protein DppA show significant sequence similarity to NikA, the initial nickel receptor. The DppA binds dipeptides and some tripeptides and is involved in chemotaxis toward dipeptides, whereas the OppA binds peptides of a wide range of lengths (2-35 amino acid residues) and plays a role in recycling of cell wall peptides, which precludes any involvement in chemotaxis. Most of other periplasmic binding proteins are comprised of only two globular subdomains corresponding to domains I and III of the dipeptide/oligopeptide binding proteins. The structural topology of these domains is most similar to that of the type 2 periplasmic binding proteins (PBP2), which are responsible for the uptake of a variety of substrates such as phosphate, sulfate, polysaccharides, lysine/arginine/ornithine, and histidine. The PBP2 bind their ligand in the cleft between these domains in a manner resembling a Venus flytrap. After binding their specific ligand with high affinity, they can interact with a cognate membrane transport complex comprised of two integral membrane domains and two cytoplasmically located ATPase domains. This interaction triggers the ligand translocation across the cytoplasmic membrane energized by ATP hydrolysis. Besides transport proteins, the PBP2 superfamily includes the ligand-binding domains from ionotropic glutamate receptors, LysR-type transcriptional regulators, and unorthodox sensor proteins involved in signal transduction.	3.28734e-173
LS483302.1|SQE39723.1|237020_237974_+|L-lactate-dehydrogenase	gnl|CDD|178836	PRK00066, ldh, L-lactate dehydrogenase; Reviewed.	0
LS483302.1|SQE39716.1|230310_230862_-|bacterial-regulatory-s,-tetR-family-protein	gnl|CDD|224228	COG1309, AcrR, Transcriptional regulator [Transcription].	1.26799e-09
LS483302.1|SQE39706.1|214398_216162_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase	gnl|CDD|227120	COG4781, COG4781, Membrane domain of membrane-anchored glycerophosphoryl diester phosphodiesterase [Energy production and conversion].	3.1133e-131
LS483302.1|SQE39718.1|231672_232575_+|alpha/beta-hydrolase	gnl|CDD|223999	COG1073, COG1073, Hydrolases of the alpha/beta superfamily [General function prediction only].	1.11198e-31
LS483302.1|SQE39708.1|216859_218743_+|staphylocoagulase-precursor	gnl|CDD|312335	pfam08764, Coagulase, Staphylococcus aureus coagulase. Staphylococcus aureus secretes a cofactor called coagulase. Coagulase is an extracellular protein that forms a complex with human prothrombin, and activates it without the usual proteolytic cleavages. The resulting complex directly initiates blood clotting.	3.38732e-154
LS483302.1|SQE39720.1|234590_234947_-|Putative-cytosolic-protein	gnl|CDD|225730	COG3189, COG3189, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	9.1054e-56
LS483302.1|SQE39709.1|219329_220514_-|3-ketoacyl-CoA-thiolase	gnl|CDD|238383	cd00751, thiolase, Thiolase are ubiquitous enzymes that catalyze the reversible thiolytic cleavage of 3-ketoacyl-CoA into acyl-CoA and acetyl-CoA, a 2-step reaction involving a covalent intermediate formed with a catalytic cysteine. They are found in prokaryotes and eukaryotes (cytosol, microbodies and mitochondria). There are 2 functional different classes: thiolase-I (3-ketoacyl-CoA thiolase) and thiolase-II (acetoacetyl-CoA thiolase). Thiolase-I can cleave longer fatty acid molecules and plays an important role in the beta-oxidative degradation of fatty acids. Thiolase-II has a high substrate specificity. Although it can cleave acetoacyl-CoA, its main function is the synthesis of acetoacyl-CoA from two molecules of acetyl-CoA, which gives it importance in several biosynthetic pathways.	1.67511e-180
LS483302.1|SQE39715.1|228587_229826_+|membrane-spanning-protein	gnl|CDD|225217	COG2339, prsW, Membrane proteinase, regulator of anti-sigma factor [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	2.04226e-74
LS483302.1|SQE39717.1|231015_231660_+|saccharopine-dehydrogenase-family-protein	gnl|CDD|187577	cd05267, SDR_a6, atypical (a) SDRs, subgroup 6. These atypical SDR family members of unknown function have only a partial match to a prototypical glycine-rich NAD(P)-binding motif consensus, GXXG, which conserves part of the motif of extended SDR. Furthermore, they lack the characteristic active site residues of the SDRs. This subgroup is related to phenylcoumaran benzylic ether reductase, an NADPH-dependent aromatic alcohol reductase. One member is identified as a putative NAD-dependent epimerase/dehydratase. Atypical SDRs generally lack the catalytic residues characteristic of the SDRs, and their glycine-rich NAD(P)-binding motif is often different from the forms normally seen in classical or extended SDRs. Atypical SDRs include biliverdin IX beta reductase (BVR-B,aka flavin reductase), NMRa (a negative transcriptional regulator of various fungi), progesterone 5-beta-reductase like proteins, phenylcoumaran benzylic ether and pinoresinol-lariciresinol reductases, phenylpropene synthases, eugenol synthase, triphenylmethane reductase, isoflavone reductases, and others. SDRs are a functionally diverse family of oxidoreductases that have a single domain with a structurally conserved Rossmann fold, an NAD(P)(H)-binding region, and a structurally diverse C-terminal region. Sequence identity between different SDR enzymes is typically in the 15-30% range; they catalyze a wide range of activities including the metabolism of steroids, cofactors, carbohydrates, lipids, aromatic compounds, and amino acids, and act in redox sensing. Classical SDRs have an TGXXX[AG]XG cofactor binding motif and a YXXXK active site motif, with the Tyr residue of the active site motif serving as a critical catalytic residue (Tyr-151, human 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase numbering). In addition to the Tyr and Lys, there is often an upstream Ser and/or an Asn, contributing to the active site; while substrate binding is in the C-terminal region, which determines specificity. The standard reaction mechanism is a 4-pro-S hydride transfer and proton relay involving the conserved Tyr and Lys, a water molecule stabilized by Asn, and nicotinamide. In addition to the Rossmann fold core region typical of all SDRs, extended SDRs have a less conserved C-terminal extension of approximately 100 amino acids, and typically have a TGXXGXXG cofactor binding motif. Complex (multidomain) SDRs such as ketoreductase domains of fatty acid synthase have a GGXGXXG NAD(P)-binding motif and an altered active site motif (YXXXN). Fungal type ketoacyl reductases have a TGXXXGX(1-2)G NAD(P)-binding motif.	1.29971e-91

Protein sequences

>LS483302.1|SQE39715.1|228587_229826_+|membrane-spanning-protein
MESLNHRRDEEKESATQTQSVANTTKEDSIALESKQSVNQSTASNIHNESIDKQMDDKAYETAQNTDLKHEARSLFDNATKSIGRLAGNDESLNLNLKDMFSEVFKPHTKNEADEIFIAGTAKTTPAICDISEEWGKPWLFSRVFIAFTVTFIGLWVMAAFFNNTNAIPGLIFIGALTVPLSGLFFFYESNAFKNISIFEVIIMFFIGGVFSLLSTMVLYRFVVFSDQFERFGSLTFFDAFLVGLVEETGKALIIVYFVNKLKTNKILNGLLIGAAIGAGFAVFESAGYILNFALGENVPLLDIVFTRAWTAIGGHLVWSAIVGAAIVIAKEQHGFEFKDILDKRFLIFFLSAVGLHGIWDTSLTILGSDTLKIFILIVVVWILVFILMGAGLKQVNTLQKEFKEQQNKVVE
>LS483302.1|SQE39714.1|227781_228453_+|glutamine-amidotransferase-class-I
MRVNVLQHTPNEGVGYIGEWAKESGHEVYIYHPYMNDGVLPLAEETDMLVILGGPMNPDDEMPWIQSERELILVLMAQNKPIYGACFGAQQISKALGYAVLKSPVKEVGWDDVYLESEIIPNIPSRLKALHWHEDMFQIPQQAELLFSGNHIRNQGFIINHHVIGLQFHFEPGPDDVREMVLNDAQYINHSILEQSAEDILAFEVPKQNRQAIFRILDFITQA
>LS483302.1|SQE39713.1|225845_227408_-|acetyl-CoA:acetoacetyl-CoA-transferase-subunit-alpha
MKQITWHDLQHIIKDGDVIGLPALAVANLPAEVLRAVLAQHDTYHTPNDLTFILANDIHSLGVAPDLDDFIERRMIKRVIMSILTASSKTAQAIKNNDIEAYFLPQGIITTHYRQSNQLLPGVITKIGLNTAVDPRYGGGKVNTRTTDDLVSLVTIDDETYLHYTFPSVDVALLRGTYADQQSNIYLTQEAYLSECYHVALNTKANHGKVIVQVKALVDDYQLKPNEVVIPGNLVDYVYVTEDEKNHRQVIQSHYLPALSGEERIDGIPEPALPFNSRKLILRRAAQFLTYGDTISIGYGINNELSNLLHEECVEHDVQPILDIGIFGGFVGSREHFGMNYNADVRMPHDRAWDFIYNNGVSVAYLSFAEVDQYGNVNVSYFNGRLNGCGGFIDITQSVNKIIFSGTFVAGSHVSCHNQRLSIETEGQNQKFVSDVSHIDFNAQYSQSLEQEVYFVTDRAVFELTNQGLKLIEIAPGLDLHKDILNQMAFKPIIADHLKLIDTSIYKEKWGELKQSIHKV
>LS483302.1|SQE39712.1|224314_225820_-|long-chain-fatty-acid--CoA-ligase
MNFDWIKTRSDFDDDKPAVIDHAKQTSWTYQQLNARADNMAHYLTSQGVKKGDVIGIFAPNDIAILDLLFACFKTGAVFLPLNWRLNPKEIAAIVEDAQLKLLFYAEKHLSSLTDIDQNLLHMDIDVAQYDEIVNPDYHQPFQATPVEPQDLAALIYTSGTTGSPKGVMFSYESFVHNGANLELTYKFNSNYITIVSTPMFHVLGFNDTVLPVLMSGGTLILQRYFNGEELNDMIAQYHPTFIIMIPTMYYSTLRASNFNPENFKAMDYIIQGGSQPLPSIQAAFKQYGINIINGYGLTEAPLVLVNTPENSKRKPMSIGKAVMFVDARILDDNGEEVPSGEIGELAIKAKNVTPGYWNKPAETAKAFHGRYLLTGDLAKMDDDGDIFIIDRKKELIITGGENVLPSEVENALAEHPLVDRCVVVGYDHPKYGESIAAAIILREDEPHYAEILDQHMRSRLAGYKVPRMYVPVTHMPLNSTQKPDKLAIRQMMNDKVSQTL
>LS483302.1|SQE39711.1|222991_224203_-|glutaryl-CoA-dehydrogenase
MTFEKETVLKTLFPEDVLSIAKGLTDGEVEFLQQVDSLLESKYRENINQHWIDATVPEDYFKDLGELNYFNNPLLYKDRPNAKMPSQLFQFFMSYLLARFDISLATLLGVHQGLGHNTFYFGGSKEQIAKYVPKLQSHELRTCFALTEPEHGSDVAGGLETVAERQGDTWVINGEKKWIGGAHVSDVIPVFAVNKETGKPHCFVVRPEQDGVDIEVIDNKIALRIVPNALIKLTNVKVDEADRLQNITSFKDIAKILYSTRAGVAYMATGGMAGALRATLDYVTERKQFGKPISKYQLIQEKLAMMQGNLAQAMATCAQLANMQAHGEYDEVATSTAKMMNALRLRETVAMGRGITGGNGILADDYDIARFFSDAEAIYTYEGTHEINALVIGRALTGDSAFV
>LS483302.1|SQE39710.1|220543_222805_-|Enoyl-CoA-hydratase-/-Enoyl-CoA-hydratase-[valine-degradation]-/-3-hydroxyacyl-CoA-dehydrogenase
MTINKVTVLGAGTMGAQLAALFVNAGLKVKLLDIVVDKNDPNLIAKKSYDKVTDKKRPLLFDLNLASHLTYGNFDDDLVNDDADLYIEAVKEDIEIKHAVWQQVLQHAKEDALFATNTSGIPINAIAKAFNEKDQERFFGLHFFNPPRIMKLVELIPTSHTKESIILDVKNFAQNVLGKGVIVVNDVPGFVANRVGTQTMNDIMYRAEQHKLSIVDVDALTGQAIGRPKTGTYALSDLVGLDIAVSVIEGMQQVPEETPYFHDVKIVNTLFENGALGRKTKQGFYKKDKETKARLVYDVEKQDYVPVSQPQLPILNEFNKDLVHNLDVIFNAQDEAGLFLWETLRNNFYYSAINVPKATDDFRDIDRALVWGFNWKLGPFQLWDAMGYERVKTRMEDELGDLPQWISDLDGGFYKQDETIEYATPVSHFVKDELWDKGDAKLSVTHDDQLLLKLQSKNNVITDEFNDALVDAIDLLENEHYTSMVIYADGNNFSVGANLFLMKKAHEDGLVDDVVAQSIDKLHYSFNRLKYSLKPVVTAVQGRALGGGCELVLYSPIVVAASETYIGLVEAGVGLLPSGGGLAEMADRILRTSHKFDDKQASMTKVLTNIAFAKVSTNAFEARRYGYLRDTDTIIFNTTQRVEVALKRAKYEAETNYIPNTRHQYIALGEDFKALIQGQLDAQRRGHFISDHDYHIALNIATILAGGDLPRNTFINQRYIQSLEKIGFIDLLKSKKSYERIAHMLKTGKPLRN
>LS483302.1|SQE39709.1|219329_220514_-|3-ketoacyl-CoA-thiolase
MQEAYIVAYGRSAAAKAKQGALFHERPDDVAAKVLQGVLKRIDGKFNKNMIEDVIVGTAFPEGLQGQNIARTIALRTGLSDTVPGQTVNRYCSSGLQTIAIAANQIMAGQGDILVAGGVELMSAVPMGGNEPTNNPTLQYDDIGASYPMGLTAENVASQFDVSREDQDAYAVRSHQRAYDAQRDGRFKDEIIPIQVNSVEYTNAGPKVHTNIFDQDEFIRPDTTMEALAKLRTVFKADGTVTAGTSAPLSDGAGFVVLMSGDKVKELGVTPIARFVGYKAVGVDPKIMGIGPAYAIPEVLSLSNLSVEDIDLIELNEAFASQTIASIKEVGLDISRTNVNGGAIALGHPLGATGAMLTARLLNEMGRCPDSRYGMVTMCIGVGMGAAAIFEYVR
>LS483302.1|SQE39708.1|216859_218743_+|staphylocoagulase-precursor
MKKQIISLGALAVASSLFTWDNKADAIVTKDYSGKSQVNAGSKNGTLIDSRYLNSALYYLEDYIIYAIGLTNKYEYGDNIYKEAKDRLLEKVLREDQYLLERKKSQYEDYKQWYANYKKENPRTDLKMANFHKYNLEELSMKEYNELQDALKGALDDFHREVKDIKDKNSDLKTFNAAEEDKATKEVYDLVSEVDTLVVSYYGDKDYGEHAKELRAKLDLILGDTDNPHKITNERIKKEMIDDVNSIIDDFFMETKQNRPKSITKYNPTTHNYKTNSDNKPNFDKLVEETKKAVKEADESWKNKTVKKYGETETKAHVVKEEKKVEEPQSPKVSEKVDVQETVGTTEEAPLPIAQPLVKLPQIGSQGKIVEGPKYPTMEQHTIYGEIVKGPEYPTMENKTLQGEIVQGPGFLTMEQSGPSLSNNYTNPPLTNPILKGIEGNSTKLEIKPQGTESTLKGIQGESSDIEVKPQASETTEASHYPARPQFNKTPKYVKYRDAGTGIREYNDGTFGYEARPRFNKPLETNAYNVTTNQDGTVSYGARPTQNKPSKTNAYNVTTHANGQVSYGARPTQNKSSETNAYNVTTHANGQVSYGARPTYNKPSETNAYNVTTHADGTATYGPRVTK
>LS483302.1|SQE39707.1|216325_216670_-|complement-inhibitor-SCIN-family-protein
MTTQMKIKTYLVAGIKAALLDTTGIKLASKSETTSHTYQHQALVDQLHELIVNTDLNKLSYLNLDAYQKRDILAAHYIAKSAIRTKNLDQMTKAKHRLESIYDSISNPLHSQNN
>LS483302.1|SQE39706.1|214398_216162_+|glycerophosphodiester-phosphodiesterase
MKRISKDIWAVFKLLYQNKGRFSINALLLQLIMIFISSTYLILLFNMMLKVAGQSQLTINNWMEIVSHPASVILLIIFILSVAFLIYVEFSLLVYMVYAGFDRQIITFKSIFKNAFVNVRKLIGVPVIFFVIYLMLMIPIANLGLSSVLTKNIYIPKFLTEELMKTTKGIIIYGTFMIAVFILNFKLIFTLPLTILNRQSLFKNMRLSWQITKRNKFRLVIEIVILELIIGAILTLIISGATYLAICVDEEGDKFLVSSILFVVLKSSLFFYYLFTKLSLISVLVLHLKQENVLDQPGLEFKYPKPKRKSRFFIISMVLAVTCFIGYNMYLLYNNTINTNISIIGHRGFEDKGVENSIPSLKAAAKANVEYVELDTIMTKDKQFVVSHDNNLKRLTGVNKNISESNFKDVVGLKMRQNGHEAKLVSLDEFIETAKQSNVKLLVELKPHGKEPADYTQRVIDILKKHGVEHQYRVMSLDYDVMTKLKKEAPYLKCGYIIPLQFGHFKETSLDFFVIEDFSYSPRLVNQAHLENKEVYTWTINGEEDLTKYLQTNVDGIITDDPALADQIKEEKKDETYFDRSIRILFE
>LS483302.1|SQE39716.1|230310_230862_-|bacterial-regulatory-s,-tetR-family-protein
MDKRIKKTQRTLKQTMITLLKEQHIEDITVTDICDKSDIVRRTFYAHFNDKYDLVERIMSDYISDFVEICHFKEQINFKLGNIKWFEYLYNNKDIFSVLFKSSISALFSKKLETVIYKQLENKISKSVINEGISKSTLLCFLTSAVLGVMVNFALNGDSDYQNKADETLILLKPYLKNDILNS
>LS483302.1|SQE39717.1|231015_231660_+|saccharopine-dehydrogenase-family-protein
MEKKNILIIGASGQISQELIDLLLDKTEHHLTLYLRNKAKLMNIEDGNRVTLIEADATDEAALENALDQIDVVFASLAGNIDEQAQAIVSAMEKKNVQRLIFVTALGIYDEVPGAFGKWNNDNIGPYLPPYKKAADIIEASSLDYTVLRPAWLTNNDEIEYETTVKGENFKGTEVSRKSVAALGLEIIENPSIHVKESLGVNKPNTDGDKPHWL
>LS483302.1|SQE39718.1|231672_232575_+|alpha/beta-hydrolase
MKKVNFKSNNLNVVANMYFPENFDENNQYPAIVVNHPAGGVKEQTAGLYAERLATLGYVTMAYDASYQGESEGQPHNLENPSSRVEDVRAAVDYFNTLDFIDDSRIGALGICAGGGYTIKAAQTEKRIKAVVGISAADIGQNFRKGWTGNQDEKDINPLLEQVAEQRKAEANGAPQKLVGFVPEEPTEDMDQETKDGWEYYRTPRAQHERSINQFPFISFDRIIEFTAFDLVDKLLTQPVLFIAGSEAGTLWQSENAYERALEPKDIHIVEGANHFDMYDKEPFVTEAVEKMNSFYGQYL
>LS483302.1|SQE39719.1|232917_234393_-|ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-binding-protein
MKFKRLATIFSAVLVLSGCGSMHSSGKDLNISLPLKTKSIAPYETDVPVKIGAAESLFKTNDQGKIEKVLVKSYHQPNDTTLDIELKDNVKFQNGQKLTAKKVKSSLENSMKKSDLVKYSLPISSITAKGQKLTIKTNSAYPELVSELANPFMAIYDTDAKSDVNQTPVGTGPYQIKNYKQSRKISLSNFKDYWQGKPKLDHITVTYQEDGNNRVRNLESQKDDLITDVPVNKVQDIENNQNLKVSKESGFRTSLLMYNHTNKKMTKSVREALDHIIDRQGIADHIYQGYAKPATSPFNDKIPYIKEPKLTKQNIEQAKTLLAKDGYTKEHPLKIKLITYDGRPELSKIAQVLQSDAKKANIEIDIKSVDDIEGYLKDRSAWDATMYSFGTIPRGDTGYFFNQAYKKDGAINKGDYNNNNVDALINQLNHTVDVKERHNISNDIIKLSSRDVPNSYIAYNDQIVAANSKVKNYKVTPEGIYLIDYRTTIER
>LS483302.1|SQE39720.1|234590_234947_-|Putative-cytosolic-protein
MTVDIGRIYDNKDNTDAIRILVDRVWPRGISKRTANLDYWLKDIAPSTELRQWFQHDPKLFGAFKEKYEKELRDNETQKDAFEKLKDIVNQHNHVLLLYAAKDTEHNQAVVLQQLLNT
>LS483302.1|SQE39721.1|235103_235277_-|membrane-protein
MKLNQRYVKVFALYFVSIVTANIIVKNNNLIKTLIQTIAGYTVFALGLKYLTKRKNK
>LS483302.1|SQE39722.1|235302_236448_-|Flavohemoprotein-(Hemoglobin-like-protein)-(Flavohemoglobin)-(Nitric-oxide-dioxygenase)
MLTEQEKDIIKQTVPLLKEKGTEITSTFYPKMFKAHPELLNMFNQTNQKRGMQSSALAQAVMAAAVNIDNLSIIKPVIMPVAYKHCALQVYAEHYPIVGENLLKAIQDVTGLEEDDPVIQAWAKAYGVIADVFIQIEKEIYDQMMWIGFKPFKITNIKQESEDIKSFTVETEEYDFSEFTPGQYITVDVSSDKLPYRAKRHYSIVSGDKNHLTFGVKRDVTTEHEGEVSTILHDEIKEGDMINLAAPVGGFVLENTTEPQLFLGSGIGVTPLVAMYETASAKGLDTQMVQVAENEQHLPFKDNFNSIASHHDNAKLYTHLKDKQGYIGAEELQVFLANKPEIYICGGTKFLQSMIEALKSLNYDMDRVHYETFIPRLSVAV
>LS483302.1|SQE39723.1|237020_237974_+|L-lactate-dehydrogenase
MNKFKGNKVVLIGNGAVGSSYAFSLVNQSIVDELVIIDLDTEKVRGDVMDLKHATPYSPTTVRVKAGEYSDCHDADLVVICAGAAQKPGETRLDLVSKNLKIFKSIVGEVMASKFDGIFLVATNPVDILAYATWKFSGLPKERVIGSGTILDSARFRLLLSEAFDVAPRSVDALIIGEHGDTELPVWSHANIAGQPLKTLLEQRPEGKAQIEQIFVQTRDAAYDIIQAKGATYYGVAMGLARITEAIFRNEDAVLTVSALLEGEYDEEDVYIGVPAVINRNGIRNVVEIPLNDEEQSKFAHSAKTLKDIMAEAEELK
>LS483302.1|SQE39724.1|238294_239824_-|PTS-system-glucose-specific-transporter-subunit-IIBC
MKSLFEKAQQFGKSFMLPIAILPAAGLLLGIGGALSNPNTVKAYPILDITLLQNIFTLMSAAGSIVFQNLPVIFAIGVAIGLSRSDKGTAGLAALLGFLIMNATMNGLLTITGTLAKDQLAQNGQGMVLGIQTVETSVFGGIITGIMTAILHNKYHKVVLPPYLGFFGGSRFVPIVTAFAAIFLGVLMFFIWPSIQAGIYHVGGFVTKTGAIGTFVYGFILRLLGPLGLHHIFYLPFWQTALGGTLEVKGHLVQGTQNIFFAQLGDPDVTKYYSGVSRFMSGRFITMMFGLCGAALAIYHTAKPEHKKVVGGLMLSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPILYVIHAFFDGLAFMMADIFNITIGQTFSGGFIDFLLFGVLQGNSKTNYLYVIPIGIVWFCLYYIVFRFLITKFNFKTPGREDKVAAQQVEATERAQTIVAGLGGEDNIEIVDCCATRLRVTLHQNDKVDKVLLESTGAKGVIQQGTGVQVIYGPHVTVIKNEIEELLGD
>LS483302.1|SQE39725.1|240186_241122_+|Inosine-uridine-preferring-nucleoside-hydrolase
MKRKIIMDCDPGHDDAIALILAGAIDSPLEILAVTTVAGNQSVDKNTTNALNVLDIMGRQDIAVAKGADRPLIKPAAFASEIHGESGLDGPKLPATPSRQAVAMPASDVIINKVMTSDTPVTIVATGPLTNVATALIREPRIAEHIESITLMGGGTFGNWTPTAEFNIWVDAEAAKRVFESGITINVFGLDVTHQVLADDHVIERFESINNPVAQFVVELLQFFKKTYKTHFNMDGGPIHDACTILYLLQPELFTMVPVNIDIEHQSPLTYGTMAVDLNHVTGKPTNAYFATTVDVEEVWNLIDHKLRTYE

Crispr_ID: LS483302_2

• CRISPR_ID: LS483302_2
• CRISPR_location: 923336-923416
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of LS483302_2

Consensus_repeat	Method
CAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG	CRISPRCasFinder

spacers of LS483302_2

>2.1|923361|31|LS483302|CRISPRCasFinder
CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGGAAAGT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483302_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LS483302_2

>merge|LS483302|2|923336-923416|CRISPRCasFinder
CAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGGAAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG

>LS483302|2|2|923336-923416|CRISPRCasFinder
CAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG	CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGGAAAGT
CAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LS483302.1|SQE40385.1|926114_927320_-|argininosuccinate-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|234785
LS483302.1|SQE40382.1|921934_923179_+|NAD-specific-glutamate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|223411
LS483302.1|SQE40391.1|935258_938912_+|ATP-dependent-nuclease,-subunit-A	unknown	unknown	gnl|CDD|274299
LS483302.1|SQE40375.1|914048_914477_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-B	unknown	unknown	gnl|CDD|183602
LS483302.1|SQE40383.1|923574_924504_-|putative-glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase	unknown	unknown	gnl|CDD|176543
LS483302.1|SQE40379.1|918461_918839_+|general-stress-protein-13	unknown	unknown	gnl|CDD|224023
LS483302.1|SQE40373.1|912218_913715_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-D	unknown	unknown	gnl|CDD|181085
LS483302.1|SQE40378.1|917452_918046_+|Peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|238908
LS483302.1|SQE40389.1|931046_931622_+|Signal-peptidase-I	unknown	unknown	gnl|CDD|274044
LS483302.1|SQE40376.1|914469_916875_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-A	unknown	unknown	gnl|CDD|237155
LS483302.1|SQE40374.1|913707_914049_-|Na+/H+-antiporter-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|181497
LS483302.1|SQE40387.1|929926_930502_+|SNARE-associated-Golgi-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223475
LS483302.1|SQE40381.1|920635_921826_+|Ornithine-aminotransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|179736
LS483302.1|SQE40392.1|939077_939980_+|Fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223257
LS483302.1|SQE40377.1|917005_917389_-|kinase-associated-B-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|378054
LS483302.1|SQE40384.1|924745_926125_-|Argininosuccinate-lyase	unknown	unknown	gnl|CDD|179143
LS483302.1|SQE40380.1|919200_920328_+|Putative-NADH-dependent-flavin-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|240086
LS483302.1|SQE40390.1|931781_935258_+|helicase-exonuclease-AddAB,-AddB-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|213736
LS483302.1|SQE40388.1|930506_931031_+|Signal-peptidase-I	unknown	unknown	gnl|CDD|274044
LS483302.1|SQE40386.1|927670_929002_+|Glucose-6-phosphate-isomerase	unknown	unknown	gnl|CDD|184504

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LS483302.1|SQE40385.1|926114_927320_-|argininosuccinate-synthase	gnl|CDD|234785	PRK00509, PRK00509, argininosuccinate synthase; Provisional.	0
LS483302.1|SQE40382.1|921934_923179_+|NAD-specific-glutamate-dehydrogenase	gnl|CDD|223411	COG0334, GdhA, Glutamate dehydrogenase/leucine dehydrogenase [Amino acid transport and metabolism].	0
LS483302.1|SQE40391.1|935258_938912_+|ATP-dependent-nuclease,-subunit-A	gnl|CDD|274299	TIGR02785, ATP-dependent_helicase/nuclease_subunit_A, helicase-exonuclease AddAB, AddA subunit, Firmicutes type. AddAB, also called RexAB, substitutes for RecBCD in several bacterial lineages. These DNA recombination proteins act before synapse and are particularly important for DNA repair of double-stranded breaks by homologous recombination. The term AddAB is used broadly, with AddA homologous between the Firmicutes (as modeled here) and the alphaproteobacteria, while the partner AddB proteins show no strong homology across the two groups of species. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0
LS483302.1|SQE40375.1|914048_914477_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-B	gnl|CDD|183602	PRK12573, PRK12573, Na(+)/H(+) antiporter subunit B.	9.17513e-61
LS483302.1|SQE40383.1|923574_924504_-|putative-glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase	gnl|CDD|176543	cd08601, GDPD_SaGlpQ_like, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain of Staphylococcus aureus and similar proteins. This subfamily corresponds to the glycerophosphodiester phosphodiesterase domain (GDPD) present in uncharacterized glycerophosphodiester phosphodiesterase (GP-GDE, EC 3.1.4.46) from Staphylococcus aureus, Bacillus subtilis and similar proteins. Members in this family show very high sequence similarity to Escherichia coli periplasmic phosphodiesterase GlpQ, which catalyzes the Ca2+-dependent degradation of periplasmic glycerophosphodiesters to produce sn-glycerol-3-phosphate (G3P) and the corresponding alcohols.	5.11302e-151
LS483302.1|SQE40379.1|918461_918839_+|general-stress-protein-13	gnl|CDD|224023	COG1098, VacB, Predicted RNA binding protein (contains ribosomal protein S1 domain) [Translation, ribosomal structure and biogenesis].	3.22125e-44
LS483302.1|SQE40373.1|912218_913715_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-D	gnl|CDD|181085	PRK07691, PRK07691, putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D; Reviewed.	0
LS483302.1|SQE40378.1|917452_918046_+|Peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase	gnl|CDD|238908	cd01927, cyclophilin_WD40, cyclophilin_WD40: cyclophilin-type peptidylprolyl cis- trans isomerases (cyclophilins) having a WD40 domain. This group consists of several hypothetical and putative eukaryotic and bacterial proteins which have a cyclophilin domain and a WD40 domain. Function of the protein is not known.	2.08824e-65
LS483302.1|SQE40389.1|931046_931622_+|Signal-peptidase-I	gnl|CDD|274044	TIGR02227, Inactive_signal_peptidase_IA., signal peptidase I, bacterial type. This model represents signal peptidase I from most bacteria. Eukaryotic sequences are likely organellar. Several bacteria have multiple paralogs, but these represent isozymes of signal peptidase I. Virtually all known bacteria may be presumed to A related model finds a simlar protein in many archaea and a few bacteria, as well as a microsomal (endoplasmic reticulum) protein in eukaryotes. [Protein fate, Protein and peptide secretion and trafficking].	7.44791e-54
LS483302.1|SQE40376.1|914469_916875_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-A	gnl|CDD|237155	PRK12645, PRK12645, monovalent cation/H+ antiporter subunit A; Reviewed.	0
LS483302.1|SQE40374.1|913707_914049_-|Na+/H+-antiporter-subunit	gnl|CDD|181497	PRK08600, PRK08600, putative monovalent cation/H+ antiporter subunit C; Reviewed.	9.82501e-64
LS483302.1|SQE40387.1|929926_930502_+|SNARE-associated-Golgi-family-protein	gnl|CDD|223475	COG0398, COG0398, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	7.69006e-41
LS483302.1|SQE40381.1|920635_921826_+|Ornithine-aminotransferase	gnl|CDD|179736	PRK04073, rocD, ornithine--oxo-acid transaminase; Provisional.	0
LS483302.1|SQE40392.1|939077_939980_+|Fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein	gnl|CDD|223257	COG0179, MhpD, 2-keto-4-pentenoate hydratase/2-oxohepta-3-ene-1,7-dioic acid hydratase (catechol pathway) [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	1.0042e-87
LS483302.1|SQE40377.1|917005_917389_-|kinase-associated-B-family-protein	gnl|CDD|378054	pfam08810, KapB, Kinase associated protein B. This bacterial protein forms an anti-parallel beta sheet with an extending alpha helical region.	8.96507e-53
LS483302.1|SQE40384.1|924745_926125_-|Argininosuccinate-lyase	gnl|CDD|179143	PRK00855, PRK00855, argininosuccinate lyase; Provisional.	0
LS483302.1|SQE40380.1|919200_920328_+|Putative-NADH-dependent-flavin-oxidoreductase	gnl|CDD|240086	cd04735, OYE_like_4_FMN, Old yellow enzyme (OYE)-related FMN binding domain, group 4. Each monomer of OYE contains FMN as a non-covalently bound cofactor, uses NADPH as a reducing agent with oxygens, quinones, and alpha,beta-unsaturated aldehydes and ketones, and can act as electron acceptors in the catalytic reaction. Other members of OYE family include trimethylamine dehydrogenase, 2,4-dienoyl-CoA reductase, enoate reductase, pentaerythriol tetranitrate reductase, xenobiotic reductase, and morphinone reductase.	0
LS483302.1|SQE40390.1|931781_935258_+|helicase-exonuclease-AddAB,-AddB-subunit	gnl|CDD|213736	TIGR02773, ATP-dependent_helicase/deoxyribonuclease_subunit_B, helicase-exonuclease AddAB, AddB subunit. DNA repair is accomplished by several different systems in prokaryotes. Recombinational repair of double-stranded DNA breaks involves the RecBCD pathway in some lineages, and AddAB (also called RexAB) in other. The AddA protein is conserved between the firmicutes and the alphaproteobacteria, while the partner protein is not. Nevertheless, the partner is designated AddB in both systems. This model describes the AddB protein as found Bacillus subtilis and related species. Although the RexB protein of Streptococcus and Lactococcus is considered to be orthologous, functionally equivalent, and merely named differently, all members of this protein family have a P-loop nucleotide binding motif GxxGxGK[ST] at the N-terminus, unlike RexB proteins, and a CxxCxxxxxC motif at the C-terminus, both of which may be relevant to function. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	0
LS483302.1|SQE40388.1|930506_931031_+|Signal-peptidase-I	gnl|CDD|274044	TIGR02227, Inactive_signal_peptidase_IA., signal peptidase I, bacterial type. This model represents signal peptidase I from most bacteria. Eukaryotic sequences are likely organellar. Several bacteria have multiple paralogs, but these represent isozymes of signal peptidase I. Virtually all known bacteria may be presumed to A related model finds a simlar protein in many archaea and a few bacteria, as well as a microsomal (endoplasmic reticulum) protein in eukaryotes. [Protein fate, Protein and peptide secretion and trafficking].	1.81012e-49
LS483302.1|SQE40386.1|927670_929002_+|Glucose-6-phosphate-isomerase	gnl|CDD|184504	PRK14097, pgi, glucose-6-phosphate isomerase; Provisional.	0

Protein sequences

>LS483302.1|SQE40382.1|921934_923179_+|NAD-specific-glutamate-dehydrogenase
MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA
>LS483302.1|SQE40381.1|920635_921826_+|Ornithine-aminotransferase
MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINENTAAILVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFATDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ
>LS483302.1|SQE40380.1|919200_920328_+|Putative-NADH-dependent-flavin-oxidoreductase
MKSKYEPLFDKVELPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDVELPYIEKRSQDVGITINAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTAQEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPIAVIEEVLKAKEMYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATTREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADEALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK
>LS483302.1|SQE40379.1|918461_918839_+|general-stress-protein-13
MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND
>LS483302.1|SQE40378.1|917452_918046_+|Peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase
MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYNGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE
>LS483302.1|SQE40377.1|917005_917389_-|kinase-associated-B-family-protein
MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKAQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK
>LS483302.1|SQE40376.1|914469_916875_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-A
MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLALPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWIWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASQANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTVFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE
>LS483302.1|SQE40375.1|914048_914477_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-B
MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE
>LS483302.1|SQE40374.1|913707_914049_-|Na+/H+-antiporter-subunit
MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD
>LS483302.1|SQE40373.1|912218_913715_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-D
MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPIRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAIARTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQSKGYDLNKKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK
>LS483302.1|SQE40383.1|923574_924504_-|putative-glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase
MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNQIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDETVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNNNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK
>LS483302.1|SQE40384.1|924745_926125_-|Argininosuccinate-lyase
MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLATYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ
>LS483302.1|SQE40385.1|926114_927320_-|argininosuccinate-synthase
MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMGAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDTADEIILTFVKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ
>LS483302.1|SQE40386.1|927670_929002_+|Glucose-6-phosphate-isomerase
MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKKIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL
>LS483302.1|SQE40387.1|929926_930502_+|SNARE-associated-Golgi-family-protein
MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVNTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGVLMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE
>LS483302.1|SQE40388.1|930506_931031_+|Signal-peptidase-I
MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKELDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS
>LS483302.1|SQE40389.1|931046_931622_+|Signal-peptidase-I
MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKHNFNPENTKN
>LS483302.1|SQE40390.1|931781_935258_+|helicase-exonuclease-AddAB,-AddB-subunit
MTLNAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKELIKYAKSVTIILTTDGNNDQFSLFRKPSEVLQHIEEIANELNISIERQYFNQFYRFNNQDLKHLEQEFDAFQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILYFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMDRFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLTQIQALFNRLEITNIPRYHEVAPLSLMQHVKQTKIALFEALRSWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVQLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSAILDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQAVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ
>LS483302.1|SQE40391.1|935258_938912_+|ATP-dependent-nuclease,-subunit-A
MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPDPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLATTNYIFKHMMDEQVGEVNYDESAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVYDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELALIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISILYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYRYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSKQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL
>LS483302.1|SQE40392.1|939077_939980_+|Fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein
MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK

Crispr_ID: LS483302_3

• CRISPR_ID: LS483302_3
• CRISPR_location: 1731337-1731417
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of LS483302_3

Consensus_repeat	Method
TTCTACAAACAATGCAAGTTGGG	CRISPRCasFinder

spacers of LS483302_3

>3.1|1731360|35|LS483302|CRISPRCasFinder
GTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGACCCCCAAT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483302_3

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LS483302_3

>merge|LS483302|3|1731337-1731417|CRISPRCasFinder
TTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGACCCCCAATTTCTACAAACAATGCAAGTTGGG

>LS483302|3|3|1731337-1731417|CRISPRCasFinder
TTCTACAAACAATGCAAGTTGGG	GTGGGGCCCCAACATAGAGAAATTGGACCCCCAAT
TTCTACAAACAATGCAAGTTGGG

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LS483302.1|SQE41089.1|1723325_1724270_-|Acetyl-coenzyme-A-carboxyl-transferase-alpha-chain	unknown	unknown	gnl|CDD|235580
LS483302.1|SQE41093.1|1730218_1731160_-|Bifunctional-oligoribonuclease-and-PAP-phosphatase-nrnA	unknown	unknown	gnl|CDD|223691
LS483302.1|SQE41097.1|1734579_1735635_+|Proline-dipeptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|223085
LS483302.1|SQE41099.1|1737203_1737704_+|universal-stress-protein-family	unknown	unknown	gnl|CDD|366180
LS483302.1|SQE41090.1|1724269_1725127_-|acetyl-CoA-carboxylase-subunit-beta	unknown	unknown	gnl|CDD|235547
LS483302.1|SQE41091.1|1725321_1726551_-|NADP-dependent-malic-enzyme	unknown	unknown	gnl|CDD|235976
LS483302.1|SQE41087.1|1720309_1722067_-|Pyruvate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|235784
LS483302.1|SQE41086.1|1718600_1719962_+|D-serine/D-alanine/glycine-transporter	unknown	unknown	gnl|CDD|224038
LS483302.1|SQE41084.1|1715814_1717083_-|isocitrate-dehydrogenase	unknown	unknown	gnl|CDD|180792
LS483302.1|SQE41103.1|1740899_1741670_-|membrane-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|182593
LS483302.1|SQE41096.1|1733715_1734405_-|metal-dependent-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|234811
LS483302.1|SQE41095.1|1732971_1733385_+|transcription-factor	unknown	unknown	gnl|CDD|366180
LS483302.1|SQE41088.1|1722088_1723057_-|6-phosphofructokinase	unknown	unknown	gnl|CDD|235111
LS483302.1|SQE41101.1|1739238_1740186_-|adenine-specific-methyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|223897
LS483302.1|SQE41085.1|1717131_1718253_-|Citrate-synthase-(si)	unknown	unknown	gnl|CDD|184468
LS483302.1|SQE41102.1|1740308_1740803_-|Thioredoxin-peroxidase	unknown	unknown	gnl|CDD|179055
LS483302.1|SQE41100.1|1737948_1739151_-|Acetate-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|234680
LS483302.1|SQE41092.1|1727000_1730198_-|DNA-polymerase-III-alpha-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|223660
LS483302.1|SQE41098.1|1735944_1737063_-|alanine-dehydrogenase-2	unknown	unknown	gnl|CDD|240630
LS483302.1|SQE41094.1|1731468_1732767_-|Cytosolic-protein-containing-multiple-CBS-domains	unknown	unknown	gnl|CDD|226594

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LS483302.1|SQE41089.1|1723325_1724270_-|Acetyl-coenzyme-A-carboxyl-transferase-alpha-chain	gnl|CDD|235580	PRK05724, PRK05724, acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha; Validated.	0
LS483302.1|SQE41093.1|1730218_1731160_-|Bifunctional-oligoribonuclease-and-PAP-phosphatase-nrnA	gnl|CDD|223691	COG0618, COG0618, Exopolyphosphatase-related proteins [General function prediction only].	2.11244e-98
LS483302.1|SQE41097.1|1734579_1735635_+|Proline-dipeptidase	gnl|CDD|223085	COG0006, PepP, Xaa-Pro aminopeptidase [Amino acid transport and metabolism].	1.16164e-126
LS483302.1|SQE41099.1|1737203_1737704_+|universal-stress-protein-family	gnl|CDD|366180	pfam00582, Usp, Universal stress protein family. The universal stress protein UspA is a small cytoplasmic bacterial protein whose expression is enhanced when the cell is exposed to stress agents. UspA enhances the rate of cell survival during prolonged exposure to such conditions, and may provide a general "stress endurance" activity. The crystal structure of Haemophilus influenzae UspA reveals an alpha/beta fold similar to that of the Methanococcus jannaschii MJ0577 protein, which binds ATP, though UspA lacks ATP-binding activity.	9.27306e-36
LS483302.1|SQE41090.1|1724269_1725127_-|acetyl-CoA-carboxylase-subunit-beta	gnl|CDD|235547	PRK05654, PRK05654, acetyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta.	0
LS483302.1|SQE41091.1|1725321_1726551_-|NADP-dependent-malic-enzyme	gnl|CDD|235976	PRK07232, PRK07232, bifunctional malic enzyme oxidoreductase/phosphotransacetylase; Reviewed.	0
LS483302.1|SQE41087.1|1720309_1722067_-|Pyruvate-kinase	gnl|CDD|235784	PRK06354, PRK06354, pyruvate kinase; Provisional.	0
LS483302.1|SQE41086.1|1718600_1719962_+|D-serine/D-alanine/glycine-transporter	gnl|CDD|224038	COG1113, AnsP, Gamma-aminobutyrate permease and related permeases [Amino acid transport and metabolism].	0
LS483302.1|SQE41084.1|1715814_1717083_-|isocitrate-dehydrogenase	gnl|CDD|180792	PRK07006, PRK07006, isocitrate dehydrogenase; Reviewed.	0
LS483302.1|SQE41103.1|1740899_1741670_-|membrane-protein	gnl|CDD|182593	PRK10621, PRK10621, hypothetical protein; Provisional.	6.58532e-39
LS483302.1|SQE41096.1|1733715_1734405_-|metal-dependent-hydrolase	gnl|CDD|234811	PRK00685, PRK00685, metal-dependent hydrolase; Provisional.	3.09103e-133
LS483302.1|SQE41095.1|1732971_1733385_+|transcription-factor	gnl|CDD|366180	pfam00582, Usp, Universal stress protein family. The universal stress protein UspA is a small cytoplasmic bacterial protein whose expression is enhanced when the cell is exposed to stress agents. UspA enhances the rate of cell survival during prolonged exposure to such conditions, and may provide a general "stress endurance" activity. The crystal structure of Haemophilus influenzae UspA reveals an alpha/beta fold similar to that of the Methanococcus jannaschii MJ0577 protein, which binds ATP, though UspA lacks ATP-binding activity.	6.00154e-19
LS483302.1|SQE41088.1|1722088_1723057_-|6-phosphofructokinase	gnl|CDD|235111	PRK03202, PRK03202, ATP-dependent 6-phosphofructokinase.	0
LS483302.1|SQE41101.1|1739238_1740186_-|adenine-specific-methyltransferase	gnl|CDD|223897	COG0827, COG0827, Adenine-specific DNA methylase [DNA replication, recombination, and repair].	2.48246e-57
LS483302.1|SQE41085.1|1717131_1718253_-|Citrate-synthase-(si)	gnl|CDD|184468	PRK14035, PRK14035, citrate synthase; Provisional.	0
LS483302.1|SQE41102.1|1740308_1740803_-|Thioredoxin-peroxidase	gnl|CDD|179055	PRK00522, tpx, thiol peroxidase.	5.93419e-100
LS483302.1|SQE41100.1|1737948_1739151_-|Acetate-kinase	gnl|CDD|234680	PRK00180, PRK00180, acetate kinase A/propionate kinase 2; Reviewed.	0
LS483302.1|SQE41092.1|1727000_1730198_-|DNA-polymerase-III-alpha-subunit	gnl|CDD|223660	COG0587, DnaE, DNA polymerase III, alpha subunit [DNA replication, recombination, and repair].	0
LS483302.1|SQE41098.1|1735944_1737063_-|alanine-dehydrogenase-2	gnl|CDD|240630	cd05305, L-AlaDH, Alanine dehydrogenase NAD-binding and catalytic domains. Alanine dehydrogenase (L-AlaDH) catalyzes the NAD-dependent conversion of pyruvate to L-alanine via reductive amination. Like formate dehydrogenase and related enzymes, L-AlaDH is comprised of 2 domains connected by a long alpha helical stretch, each resembling a Rossmann fold NAD-binding domain. The NAD-binding domain is inserted within the linear sequence of the more divergent catalytic domain. Ligand binding and active site residues are found in the cleft between the subdomains. L-AlaDH is typically hexameric and is critical in carbon and nitrogen metabolism in micro-organisms.	0
LS483302.1|SQE41094.1|1731468_1732767_-|Cytosolic-protein-containing-multiple-CBS-domains	gnl|CDD|226594	COG4109, COG4109, Predicted transcriptional regulator containing CBS domains [Transcription].	0

Protein sequences

>LS483302.1|SQE41093.1|1730218_1731160_-|Bifunctional-oligoribonuclease-and-PAP-phosphatase-nrnA
MISTLNEIMKCIEDNDTIIIHRHVRPDPDAYGSQLGLKYYIQQKFPQKQVFAVGEAESSLSFIGELDNIDDKTYQDALVIVCDTANAPRIDDERYSTGSKLIKIDHHPAVDQYGDINLVNTNASSTSEIIYDIISHFNDEAIVNKDIASVLYLGIVGDTGRFLFNNTSEHTMEIAGKLIGHDIDHNALLNKMMEKDPKMLPFQGYVLQHFELMDDGFCQVKITEDVLEQFGIQPNEASQFVNTIADIKGLKIWVFAVDEGSEIRCRLRSKGQLIINDIAQDFGGGGHPNASGVSVNSWDEFEQLATALRTKLN
>LS483302.1|SQE41092.1|1727000_1730198_-|DNA-polymerase-III-alpha-subunit
MVAYLNIHTAYDLLNSSLKIEDAVRLAVSENVDALAITDTNVLYGLPKFYDACLANNIKPIFGMTIYVTNGLNTVETVVLAKNNDGLKDLYQLSSKIKMNSMENVSFELLQQFSSNLIIIFKNVADEHRDIVQVFDSHEDTYLDHRSVLVQGIKHVWIQDVCYQTRQDADTISALAAIRDNTKLDLIHDQEDFGAHFLTEKEIKQLDINQEYLTQVDVIAQKCNAELKYHQSLLPQYQTPNDESAKKYLWRVLVTQLKKLELNYDVYLERLKYEYKVITNMGFEDYFLIVSDLIHYAKTNDVMVGPGRGSSAGSLVSYLLGITTIDPIKFNLLFERFLNPERVTMPDIDIDFEDTRREKVIQYVQEKYGELHVSGIVTFGHLLARAVARDVGRIMGFDEVTLNEISSLIPHKLGITLDEAYQIDDFKKFVHRNHRHERWFSICKKLEGLPRHTSTHAAGIIINDHPLYEYAPLTKGDTGLLTQWTMTEAERIGLLKIDFLGLRNLSIIHQILTQVKKDLGINIDIEKIPFDDQKVFELLSQGDTTGIFQLESDGVRSVLKKLKPEHFEDIVAVTSLYRPGPMEEIPTYITRRHDPSKVQYLHPHLEPILKNTYGVIIYQEQIMQIASTFANFSYGEADILRRAMSKKNRAVLESERQHFIEGAKQNGYHEGISKQIFDLILKFADYGFPRAHAVSYSKIAYIMSFLKVHYPNYFYANILSNVIGSEKKTAQMIEEAKKQGITILPPNINESHWFYKPSQEGIYLSIGTIKGVGYQSVKVIVDERYQNGKFKDFFDFARRIPKRVKTRKLLEALILVGAFDAFGKTRSTLLQAIDQVLDGDLNIEQDGFLFDILTPKQMYEDKEELPDALISQYEKEYLGFYVSQHPVDKMFVAKQYLTIFKLSNAQKNKPILVQFDKVKQIRTKNGQNMAFVTLNDGIETLDGVIFPNQFKKYEELLSHNDLFIVSGKFDFRKQQRQLIINEIQTLATFEEQKLAFAKQIIIRNKSHIDTFEEMIKATKENANDVVLSFYDETIKQMTTLGYINQKDSMFNNFIQSFNPSDIRLI
>LS483302.1|SQE41091.1|1725321_1726551_-|NADP-dependent-malic-enzyme
MSLRDEALEMHKRNQGKLEVKPNVKVTNKEELSLAYSPGVAEPCKDIYEDKRKVYDYTIKGNTVAVITDGTAVLGLGNIGPEASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALNTTDTEEIIKTVKLLEPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTMAGLVNALRVVNKDIAKIKVVLNGAGAAGIAIVKLLYAYGVRNMVMCDSRGAIFEGRSYGMNPTKDVVAKWTNKDKIEGSLEEVVKDADVFIGVSVANALSQDMVKSMADNPIIFAMANPNPEIIPDDAKAAGARVVGTGRSDYPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIADLIDSSELNEDYCIPGPFDKRVAPSVARNVAKAAMESGVARIEVDPQDVYDKTMKLTDLQ
>LS483302.1|SQE41090.1|1724269_1725127_-|acetyl-CoA-carboxylase-subunit-beta
MFKDFFNRTKKKKYLTVQDSKNNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAISDEGSFTEFDKGMTSANPLDFPSYLEKIEKDQQKTGLKEAVVTGTAQLDGMKFGVAVMDSRFRMGSMGSVIGEKICRIIDYCTENRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPDDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRNDMRQTLSEILKIHQEVTK
>LS483302.1|SQE41089.1|1723325_1724270_-|Acetyl-coenzyme-A-carboxyl-transferase-alpha-chain
MLDFEKPLFEIRNKIESLKESQDKNDVDLQEEIDMLEASLERETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTTLDYIPYIFDSFMELHGDRNFRDDPAMIGGIGFLNGRAVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIATNLIEMASLKVPVIAIVIGEGGSGGALGIGIANKVLMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSNLAKIAAETMKITAHDIKQLGIIDDVISEPLGGAHKDIEQQALAIKSAFVEQLDSLESLSRDEIANDRFEKFRNIGSYIE
>LS483302.1|SQE41088.1|1722088_1723057_-|6-phosphofructokinase
MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNEIEVYGVYHGYQGLLNDDIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPEFKEQEVRKVAIENLRKRGIEGLVVIGGDGSYRGAQRISEECKEIQTIGIPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIGLVDKIRDTASSHARTFIIEAMGRDCGDLALWAGLSVGAETIVVPEVKTDIKEIADKIEQGIKRGKKHSIVLVAEGCMTAQDCQKELSQYINVDNRVSVLGHVQRGGSPTGADRVLASRLGGYAVDLLMQGETAKGVGIKNNKIVATSFDEIFDGKDHKFDYSLYELANKLSI
>LS483302.1|SQE41087.1|1720309_1722067_-|Pyruvate-kinase
MRKTKIVCTIGPASESEEMIEKLINAGMNVARLNFSHGSHEEHKGRIDTIRKVAKRLDKIVAILLDTKGPEIRTHNMKDGIIELERGNEVIVSMNEVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLIELQVKDIDHAKKEVKCDILNSGELKNKKGVNLPGVRVSLPGITEKDAEDIRFGIKENVDFIAASFVRRPSDVLEIREILEEQKANISVFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPEKVPMVQKDLIRQCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSLVNAIGISVAHTALNLNVKAIVAATESGSTARTISKYRPHSDIIAVTPSEETARQCSIVWGVQPVVKKGRKSTDALLNNAVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGETGTTNMMKIHLVGDEIANGQGIGRGSVVGTTLVAETVKDLEGKDLSDKVIVTNSIDETFVPYVEKALGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTVVGVEKAVKNISNNVLVTIDAAQGKIFEGYANVL
>LS483302.1|SQE41086.1|1718600_1719962_+|D-serine/D-alanine/glycine-transporter
MAEKLQRELSNRHIQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIALTGPSILLTYIIIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNTYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPEIPNWISALFCVLLLMSFNLLSARLFGELEFWFSIIKIATIIGLIVVGFVMILFAYKTQFGHASFTNLYEHGVFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPVKTIPKAINSVPIRILIFYVGALAVIMSIIPWQQVDPDNSPFVKLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLSSQQQAPPNFSKTNKYGVPHVAIFASSALLLVAALLNYIFPDATKVFTYVTTISTVLFLVVWGLIIIAYINYSRKNPDLHKKATYKLFGGKYMGYLIFVFFIFVFGLLFINVETRRAIYFIPIWFILLGFMYLRYKRIAAKSNN
>LS483302.1|SQE41085.1|1717131_1718253_-|Citrate-synthase-(si)
MAELQRGLEGVIAAETKISSIIESQLTYAGYDIDDLAENAQFEEVIFLLWNYRLPNEEELAHLKGKLNQYMTLNPRVYTHFEEYVTDHVHPMTALRTSLSYIAHFDPDAENESDENRYERAMRIQAKVASLVTAFARVRQDKEPLKPNPDLSYAANFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALILHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANEQVMTMLSEIGSIENVDAYLDEKFANKDKVMGFGHRVYKDGDPRAKYLREMSRQITKDAGREELFEMSVKMEKRMAEEKGLIPNVDFYSASVYHCMEIPHDLFTPIFAVSRSAGWIAHILEQYKDNRIMRPRAKYIGETNRKYIPLEERK
>LS483302.1|SQE41084.1|1715814_1717083_-|isocitrate-dehydrogenase
MTAEKITQGTEGLNVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKRIEWKEVLAGQKAFDTTGEWLPQETLDTIKEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQELDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTTEVKKVIDFLQNEMGATNIRFPETSGIGIKLVSKEGTERLVRAAIQYAIDNNRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLALTEFGDQVFTWQQYDEIVEKEGRDAANAAQEKAEKEGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSVILSSVLMLEHLGWQEAADKITDSIEDTIASKVVTYDFARLMDGAEEVSTSAFADELIKNLK
>LS483302.1|SQE41094.1|1731468_1732767_-|Cytosolic-protein-containing-multiple-CBS-domains
MTKHEQILDYIESLSIGSKISVRKIAKFLNVSEGTAYRAIKDADKMGMVATIDRVGTVRIEKRNRNEIEHLTFNEIVNIIDGQVLGGNKGITKMVSKFAIGAMELKDILKYIGPKTLLIVGNREDVQIEALKRGTAILITGGFKPSNKVINFANEHDLPVLSSSYDTFLVANIINKALFNQKIRKDILIVQDIMTPLDDLSVLFDTMKIADYKRMANRTGHTRFPVVNESYKLVGIVTSREMINTKDDDEIDKVMTRNPIYVNAMSTVASCAHMMIWEGIELIPVVSSNKKTVGVINRQDVLKSMQLLGRQPQMGETINDQIAKYITMNQDGITVEVSPLLINHYGTVSKAAFVSIIEETIQYEMRKFKKGNVMIENLNIVYIKTVPIESHITVRFGILDVGRNFAKIEVNMHSQNDKVASALVICQMFDEV
>LS483302.1|SQE41095.1|1732971_1733385_+|transcription-factor
MYKNILLGVDTQLKNEKALKEVSKLAGEGTVVTVLNAISEQDAQASIKAGVHLNKLTEERSKRLEKTRKALEDYGIDYDQIIVRGNAKEELLKHANSGKYEIVVLSNRKAEDKKKFVLGSVSHKVAKRATIPVLIVK
>LS483302.1|SQE41096.1|1733715_1734405_-|metal-dependent-hydrolase
MKLSFHGQSTIYLEGNNKKVIVDPFISNNPKCDLNIETVQVDYIVLTHGHFDHFGDVVELAKKTGATVIGSAEMADYLSSYHGVENVHGMNIGGKANFDFGSVKFVQAFHSSSFTHENGIPVYLGMPMGIVFEVEGKTIYHTGDTGLFSDMSLIAKRHPVDVCFVPIGDNFTMGIDDASYAINEFIKPKISVPIHYDTFPLIEQDPQQFKDAVNVGDVQILKPGESVQF
>LS483302.1|SQE41097.1|1734579_1735635_+|Proline-dipeptidase
MTKISKIIDELNNQQADAAWITTPLNVYYFTGYRSEPHERLFALLIKKDGKQVLFCPKMEVEEVKASPFTGEIVGYLDTENPFSLYPQTINKLLIESEHLTVARQKQLISGFNVNSFGDVDLTIKQLRNIKSEDEINKIRKAAELADKCIEIGVSYLKEGVTEREVVNHIEQTIKQYGVNEMSFDTMVLFGDHAASPHGTPGDRRLKSNEYVLFDLGVIYEHYCSDMTRTIKFGEPSQEAQEIYNIVLEAETSAIQAIKPGIPLKDIDHIARNIISEKGYGEYFPHRLGHGLGLQEHEYQDVSSTNSNLLEAGMVITIEPGIYVPGVAGVRIEDDILVTNEGYEVLTHYEK
>LS483302.1|SQE41098.1|1735944_1737063_-|alanine-dehydrogenase-2
MKIGIPREIKNNENRVGLSPSGVHALVESGHTVLVETNAGAGSFFEDVDYKEAGAEIVAEQAKVWDVDMVIKVKEPLESEYPYFKEGLVLFTYLHLANEEKLTQALIDKKVISIAYETVQLPDRSLPLLSPMSEVAGRMSAQVGAEFLQKLNGGMGILLGGVPGVPKGKVTIIGGGQAGTNAAKIALGLGADVTILDVNPKRLQQLDDLFGGRVHTIMSNPLNIELYVKQSDLVIGAVLIPGAKAPRLVTEDMIKQMKNGSVIIDIAIDQGGIFETTDKITTHDDPTYIKHGVVHYAVANMPGAVPRTSTLALNNATLPYALMLANKGYREAFKSNQPLSLGLNTYKGHVTNKGVAEAFEMEYKSVEEALHL
>LS483302.1|SQE41099.1|1737203_1737704_+|universal-stress-protein-family
MITYKNILIAVDGSHEAEWAFNRAVGVAKRNDAKLTIVNVIDSRTYSSYEVYDAQFTEKSKHFAEELLNGYKEVATNAGVKDVETRLEFGSPKSIIPKKLAHEINADLIMSGTSGLNAVERFIVGSVSESIVRHAPCDVLVVRTEELPADFQPQVATTQLREKYQN
>LS483302.1|SQE41100.1|1737948_1739151_-|Acetate-kinase
MSKLILAINAGSSSLKFQLIRMPEEELVTKGLVERIGLKDSIFTIEVDGEKVKTVQDIKDHVEAVDIMLDAFKAHNIINDINDIDGTGHRVVHGGEKFPESVAITDEVEKEIEELSELAPLHNPANLMGIRAFRKLLPNIPHVAIFDTAFHQTMPEKAYLYSLPYHYYKDYGIRKYGFHGTSHKFVSQRAAEMLDKPIEDLRIISCHIGNGASIAAIDGGKSIDTSMGFTPLAGVTMGTRSGNIDPALIPFIMEKTGKTAEQVLEILNKESGLLGLSGTSSDLRDLSEEAESGKARSQMALDVFASKIHKYIGSYAARMHGVDVIVFTAGIGENSVEIRAKVLEGLEFMGVYWDPKKNENLLRGKEGFINYPHSPVKVVVIPTDEESMIARDVMTFGGLK
>LS483302.1|SQE41101.1|1739238_1740186_-|adenine-specific-methyltransferase
MAEQQTIMERLFHTLDEKAKTLNNENGQSFIENLGLAMEQVYTNERGLLEQSTLQDRRKAFQFAYLSLMQEEKIQANHQITPDSIGLILGFLVERFMNNQEELHIVDIASGAGHLSATVKEVLPEIAVMHHLIEVDPVLSRVSVHLANFLEIPFDVYPQDAIMPLPLEEADIVIGDFPVGYYPIDERSKEFKLGFEEGHSYSHYLLIEQAINALKDAGYAFLVAPSNIFTGEHVKQLEKYIATETEMQAFLNLPPTLFKNEKARKSILILQKKKSGETKPVEVLLANIPDFKNPSQFQGFMTELNQWMDTNRPKK
>LS483302.1|SQE41102.1|1740308_1740803_-|Thioredoxin-peroxidase
MTEITFKGGPIHLKGQQINEGDFAPDFTVLDNDLNQVTLADYAGKKKLISVVPSIDTGVCDQQTRKFNSEASKEEGIVLTISADLPFAQKRWCASAGLDNVITLSDHRDLSFGENYGVVMEELRLLARAVFVLDADNKVVYKEIVSEGTDFPDFDAALAAYKNI
>LS483302.1|SQE41103.1|1740899_1741670_-|membrane-protein
MDLNLTMIIIIILFGFIAAFIDSVVGGGGLISTPALLAIGLPPSVALGTNKLASSFGSLTSAIKFIRSGKVDLYVVAKLFGFVFLASACGAYIATMVPSQILKPLIIIALSSVFIFTLLKKDWGNTRTFTQFTFKKALLFAALFILIGFYDGFVGGGTGSFMLFVLLIFGFDFLSAAGNAKVLNFASNIGALVLFMVLGQVDYVIGLVMAASMIVGSYAGAHFAIKQGVGYVKVLFIIITAILILKNAFDYIQQFV

Crispr_ID: LS483302_4

• CRISPR_ID: LS483302_4
• CRISPR_location: 1821897-1821985
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers
• Cas_protein_info: csa3

Consensus repeat of LS483302_4

Consensus_repeat	Method
CAATGCGCGTTGGGGTACGGGGCCCCAACA	CRISPRCasFinder

spacers of LS483302_4

>4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder
CAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAGA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483302_4

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LS483302_4

>merge|LS483302|4|1821897-1821985|CRISPRCasFinder
CAATGCGCGTTGGGGTACGGGGCCCCAACACAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAGACAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACAT

>LS483302|4|4|1821897-1821985|CRISPRCasFinder
CAATGCGCGTTGGGGTACGGGGCCCCAACA	CAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAGA
CAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACAT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LS483302.1|SQE41176.1|1830922_1831402_-|phosphohydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|131752
LS483302.1|SQE41170.1|1824040_1824394_+|CrcB-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223317
LS483302.1|SQE41169.1|1823678_1824044_+|CrcB-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|184566
LS483302.1|SQE41165.1|1820167_1820803_+|CAAX-amino-terminal-protease-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376806
LS483302.1|SQE41167.1|1822149_1822863_-|Transaldolase	unknown	unknown	gnl|CDD|183481
LS483302.1|SQE41158.1|1815168_1815483_+|arsenical-resistance-operon-repressor-2	csa3	COG0640_csa3_CAS-I-A	gnl|CDD|238042
LS483302.1|SQE41175.1|1830171_1830942_-|Dipeptidyl-aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase	unknown	unknown	gnl|CDD|224423
LS483302.1|SQE41174.1|1828284_1829877_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase	unknown	unknown	gnl|CDD|238270
LS483302.1|SQE41164.1|1819427_1819871_-|membrane-protein	unknown	unknown	unknown
LS483302.1|SQE41166.1|1820969_1821590_+|membrane-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|376806
LS483302.1|SQE41171.1|1824642_1825476_-|aldo/keto-reductase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223729
LS483302.1|SQE41159.1|1815482_1816775_+|arsenical-pump-membrane-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|185342
LS483302.1|SQE41161.1|1817991_1818216_-|putative-staphylococcal-protein	unknown	unknown	unknown
LS483302.1|SQE41172.1|1825687_1826596_-|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|377990
LS483302.1|SQE41162.1|1818414_1818885_+|DNA-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224511
LS483302.1|SQE41168.1|1823121_1823424_+|membrane-protein	unknown	unknown	unknown
LS483302.1|SQE41173.1|1826720_1827914_-|S-adenosylmethionine-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|235374
LS483302.1|SQE41160.1|1816861_1817716_-|peptidoglycan-endo-beta-N-acetylglucosaminidase	unknown	unknown	gnl|CDD|226656
LS483302.1|SQE41163.1|1818997_1819441_+|comK-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|368849
LS483302.1|SQE41157.1|1813022_1814525_-|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226906

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
LS483302.1|SQE41158.1|1815168_1815483_+|arsenical-resistance-operon-repressor-2	csa3	COG0640_csa3_CAS-I-A	6e-16	53.6	0.0

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LS483302.1|SQE41176.1|1830922_1831402_-|phosphohydrolase	gnl|CDD|131752	TIGR02705, conserved_hypothetical_protein, nucleoside triphosphatase YtkD. The functional assignment to the proteins of this family is contentious, with papers disagreeing in both interpretation and enzyme assay results. This protein belongs to the nudix family and shares some sequence identity with E. coli MutT but appears not to be functionally interchangeable with it. [DNA metabolism, DNA replication, recombination, and repair].	5.74138e-85
LS483302.1|SQE41170.1|1824040_1824394_+|CrcB-family-protein	gnl|CDD|223317	COG0239, CrcB, Integral membrane protein possibly involved in chromosome condensation [Cell division and chromosome partitioning].	2.95868e-24
LS483302.1|SQE41169.1|1823678_1824044_+|CrcB-family-protein	gnl|CDD|184566	PRK14201, PRK14201, fluoride efflux transporter CrcB.	5.04603e-56
LS483302.1|SQE41165.1|1820167_1820803_+|CAAX-amino-terminal-protease-family-protein	gnl|CDD|376806	pfam02517, Abi, CAAX protease self-immunity. Members of this family are probably proteases (after a isoprenyl group is attached to the Cys residue in the C-terminal CAAX motif of a protein to attach it to the membrane, the AAX tripeptide being removed by one of the CAAX prenyl proteases). The family contains the CAAX prenyl protease. The proteins contain a highly conserved Glu-Glu motif at the amino end of the alignment. The alignment also contains two histidine residues that may be involved in zinc binding. While they are involved in membrane anchoring of proteins in eukaryotes, little is known about their function in prokaryotes. In some known bacteriocin loci, Abi genes have been found downstream of bacteriocin structural genes where they are probably involved in self-immunity. Investigation of the bacteriocin-like loci in the Gram positive bacteria locus from Lactobacillus sakei 23K confirmed that the bacteriocin-like genes (sak23Kalphabeta) exhibited antimicrobial activity when expressed in a heterologous host and that the associated Abi gene (sak23Ki) conferred immunity against the cognate bacteriocin. Interestingly, the immunity genes from three similar systems conferred a high degree of cross-immunity against each other's bacteriocins, suggesting the recognition of a common receptor. Site-directed mutagenesis demonstrated that the conserved motifs constituting the putative proteolytic active site of the Abi proteins are essential for the immunity function of Sak23Ki - thus a new concept in self-immunity.	5.76782e-13
LS483302.1|SQE41167.1|1822149_1822863_-|Transaldolase	gnl|CDD|183481	PRK12376, PRK12376, putative translaldolase; Provisional.	1.22733e-152
LS483302.1|SQE41158.1|1815168_1815483_+|arsenical-resistance-operon-repressor-2	gnl|CDD|238042	cd00090, HTH_ARSR, Arsenical Resistance Operon Repressor and similar prokaryotic, metal regulated homodimeric repressors. ARSR subfamily of helix-turn-helix bacterial transcription regulatory proteins (winged helix topology). Includes several proteins that appear to dissociate from DNA in the presence of metal ions.	3.46552e-20
LS483302.1|SQE41175.1|1830171_1830942_-|Dipeptidyl-aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase	gnl|CDD|224423	COG1506, DAP2, Dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases [Amino acid transport and metabolism].	4.86928e-50
LS483302.1|SQE41166.1|1820969_1821590_+|membrane-protein	gnl|CDD|376806	pfam02517, Abi, CAAX protease self-immunity. Members of this family are probably proteases (after a isoprenyl group is attached to the Cys residue in the C-terminal CAAX motif of a protein to attach it to the membrane, the AAX tripeptide being removed by one of the CAAX prenyl proteases). The family contains the CAAX prenyl protease. The proteins contain a highly conserved Glu-Glu motif at the amino end of the alignment. The alignment also contains two histidine residues that may be involved in zinc binding. While they are involved in membrane anchoring of proteins in eukaryotes, little is known about their function in prokaryotes. In some known bacteriocin loci, Abi genes have been found downstream of bacteriocin structural genes where they are probably involved in self-immunity. Investigation of the bacteriocin-like loci in the Gram positive bacteria locus from Lactobacillus sakei 23K confirmed that the bacteriocin-like genes (sak23Kalphabeta) exhibited antimicrobial activity when expressed in a heterologous host and that the associated Abi gene (sak23Ki) conferred immunity against the cognate bacteriocin. Interestingly, the immunity genes from three similar systems conferred a high degree of cross-immunity against each other's bacteriocins, suggesting the recognition of a common receptor. Site-directed mutagenesis demonstrated that the conserved motifs constituting the putative proteolytic active site of the Abi proteins are essential for the immunity function of Sak23Ki - thus a new concept in self-immunity.	1.76569e-14
LS483302.1|SQE41171.1|1824642_1825476_-|aldo/keto-reductase-family-protein	gnl|CDD|223729	COG0656, ARA1, Aldo/keto reductases, related to diketogulonate reductase [General function prediction only].	3.73746e-137
LS483302.1|SQE41159.1|1815482_1816775_+|arsenical-pump-membrane-protein	gnl|CDD|185342	PRK15445, PRK15445, arsenical efflux pump membrane protein ArsB.	0
LS483302.1|SQE41174.1|1828284_1829877_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase	gnl|CDD|238270	cd00484, PEPCK_ATP, Phosphoenolpyruvate carboxykinase (PEPCK), a critical gluconeogenic enzyme, catalyzes the first committed step in the diversion of tricarboxylic acid cycle intermediates toward gluconeogenesis. It catalyzes the reversible decarboxylation and phosphorylation of oxaloacetate to yield phosphoenolpyruvate and carbon dioxide, using a nucleotide molecule (ATP) for the phosphoryl transfer, and has a strict requirement for divalent metal ions for activity. PEPCK's separate into two phylogenetic groups based on their nucleotide substrate specificity, this model describes the ATP-dependent groups.	0
LS483302.1|SQE41172.1|1825687_1826596_-|Uncharacterised-protein	gnl|CDD|377990	pfam08378, NERD, Nuclease-related domain. The nuclease-related domain (NERD) is found in a range of bacterial as well as archaeal and plant proteins. It has distant similarity to endonucleases (hence its name) and its predicted secondary structure is helix - sheet - sheet - sheet - sheet - weak sheet/long loop - helix - sheet - sheet. The majority of NERD-containing proteins are single-domain, but in several cases proteins containing NERD have additional domains which in 75% of cases are involved in DNA processing.	0.00931512
LS483302.1|SQE41162.1|1818414_1818885_+|DNA-binding-protein	gnl|CDD|224511	COG1595, RpoE, DNA-directed RNA polymerase specialized sigma subunit, sigma24 homolog [Transcription].	5.008e-16
LS483302.1|SQE41173.1|1826720_1827914_-|S-adenosylmethionine-synthase	gnl|CDD|235374	PRK05250, PRK05250, S-adenosylmethionine synthetase; Validated.	0
LS483302.1|SQE41160.1|1816861_1817716_-|peptidoglycan-endo-beta-N-acetylglucosaminidase	gnl|CDD|226656	COG4193, LytD, Beta- N-acetylglucosaminidase [Carbohydrate transport and metabolism].	2.92628e-119
LS483302.1|SQE41163.1|1818997_1819441_+|comK-family-protein	gnl|CDD|368849	pfam06338, ComK, ComK protein. This family consists of several bacterial ComK proteins. The ComK protein of Bacillus subtilis positively regulates the transcription of several late competence genes as well as comK itself. It has been found that ClpX plays an important role in the regulation of ComK at the post-transcriptional level.	4.98416e-05
LS483302.1|SQE41157.1|1813022_1814525_-|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase-family-protein	gnl|CDD|226906	COG4529, COG4529, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	1.40031e-168

Protein sequences

>LS483302.1|SQE41166.1|1820969_1821590_+|membrane-protein
MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKVLNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDMFAPPTLNEILIDEESEDAPYHLALLSNAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFYSGLIFGYTYLKTKRLEVPILIHFINNLLAM
>LS483302.1|SQE41165.1|1820167_1820803_+|CAAX-amino-terminal-protease-family-protein
MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFFITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTLSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHTPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILIWG
>LS483302.1|SQE41164.1|1819427_1819871_-|membrane-protein
MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANGYLRENVFRSKETKSYSVFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFINPKVELSTTVVILTIIGAILLMLVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH
>LS483302.1|SQE41163.1|1818997_1819441_+|comK-family-protein
MQDISTKHLLYIQTATSNHLETKCVFLYHEYNLEFPITKAIPYFAKLHFTSASILIDAAKSILNINKLVPIYLNPKTILFPIKQKRAPIQTYINAHYIIGMTEMGNSTMLHFKNGKTLEVDEPMSLISKKCYESLALKHFIENTNDH
>LS483302.1|SQE41162.1|1818414_1818885_+|DNA-binding-protein
MKFNDVYNKHHKIIHHLLKKYNISYNYDEYYQLLLIKMWQLSQIYKPSSNQSLSSFLFMRLNFYLIDLFRQQKRLNDIILCENHSPILTEQPTYFNEYDLRLQDVCALLNHRERQWLMLYLEGYKQYEIADSMSLSTSTIKLIKASVKRKCQRFFE
>LS483302.1|SQE41161.1|1817991_1818216_-|putative-staphylococcal-protein
MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK
>LS483302.1|SQE41160.1|1816861_1817716_-|peptidoglycan-endo-beta-N-acetylglucosaminidase
MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEINGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLNK
>LS483302.1|SQE41159.1|1815482_1816775_+|arsenical-pump-membrane-protein
MMTTLATFIFLVTLLFVLWQPKGLDIGFTALAGAIVAMITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKTFEDNKIKRPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVVFGIRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNIHGLLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGIIITIPVLFFTLLGLYLTLILF
>LS483302.1|SQE41158.1|1815168_1815483_+|arsenical-resistance-operon-repressor-2
MTYKELATYLKVLSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNLVTTRKIGNKHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC
>LS483302.1|SQE41157.1|1813022_1814525_-|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase-family-protein
MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTIYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNEQDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVSFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFKKLVHRRTGNHIADLKYDLARPTEMGIFQSMIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSKMIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYNVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQQQRSDNQ
>LS483302.1|SQE41167.1|1822149_1822863_-|Transaldolase
MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL
>LS483302.1|SQE41168.1|1823121_1823424_+|membrane-protein
MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI
>LS483302.1|SQE41169.1|1823678_1824044_+|CrcB-family-protein
MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIAFFSNHPSLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDHQQFITLLLYAITSYVFGILLCYVGIKLGGGLS
>LS483302.1|SQE41170.1|1824040_1824394_+|CrcB-family-protein
MISIILVMIGGGFGAIARSAVTDYFNHIFTSKLPIATLIVNLIGSFLIGLTIGLSISTSWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFNINLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI
>LS483302.1|SQE41171.1|1824642_1825476_-|aldo/keto-reductase-family-protein
MEVKTFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVKYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGTGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAVMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFQIFDFELSDEQMTRIDGLNQDKRIGPDPKTFEG
>LS483302.1|SQE41172.1|1825687_1826596_-|Uncharacterised-protein
MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMVSTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN
>LS483302.1|SQE41173.1|1826720_1827914_-|S-adenosylmethionine-synthase
MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINDQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKGAVK
>LS483302.1|SQE41174.1|1828284_1829877_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase
MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVAEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAEYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGKKVEHIAEKGSFNK
>LS483302.1|SQE41175.1|1830171_1830942_-|Dipeptidyl-aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase
MDFIKRKRMPIESVTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPLHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTELLRLLHDKYPQAFIHMVGFSRGGLQGLLTFQDLPVNSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGVMHETFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHS
>LS483302.1|SQE41176.1|1830922_1831402_-|phosphohydrolase
MRVKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPTFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNDYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT

Crispr_ID: LS483302_5

• CRISPR_ID: LS483302_5
• CRISPR_location: 2238081-2238219
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of LS483302_5

Consensus_repeat	Method
TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA	CRISPRCasFinder

spacers of LS483302_5

>5.1|2238132|37|LS483302|CRISPRCasFinder
AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483302_5

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LS483302_5

>merge|LS483302|5|2238081-2238219|CRISPRCasFinder
TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGATTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA

>LS483302|5|5|2238081-2238219|CRISPRCasFinder
TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA	AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA
TTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LS483302.1|SQE41557.1|2234827_2236492_-|Acetolactate-synthase,-catabolic	unknown	unknown	gnl|CDD|236312
LS483302.1|SQE41560.1|2240408_2240846_-|50S-ribosomal-protein-L13	unknown	unknown	gnl|CDD|181703
LS483302.1|SQE41564.1|2243546_2244356_-|cobalt-import-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|184207
LS483302.1|SQE41563.1|2242689_2243550_-|ATPase-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters	unknown	unknown	gnl|CDD|184205
LS483302.1|SQE41551.1|2228396_2229251_-|Peptidase,-M23/M37-family	unknown	unknown	gnl|CDD|223810
LS483302.1|SQE41552.1|2230122_2230401_+|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	unknown
LS483302.1|SQE41566.1|2245278_2246223_-|DNA-directed-RNA-polymerase-alpha-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|235359
LS483302.1|SQE41555.1|2233269_2233695_+|Truncated-cell-surface-protein-map-w	unknown	unknown	gnl|CDD|367591
LS483302.1|SQE41550.1|2225777_2228198_+|polysaccharide-lyase-family-8,-super-sandwich-domain-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|238517
LS483302.1|SQE41556.1|2234086_2234791_-|alpha-acetolactate-decarboxylase	unknown	unknown	gnl|CDD|226058
LS483302.1|SQE41561.1|2241085_2241889_-|tRNA-pseudouridine-synthase-A	unknown	unknown	gnl|CDD|234577
LS483302.1|SQE41549.1|2224954_2225371_-|transcriptional-regulator,-MerR-family	unknown	unknown	gnl|CDD|133384
LS483302.1|SQE41559.1|2239996_2240395_-|30S-ribosomal-protein-S9	unknown	unknown	gnl|CDD|178888
LS483302.1|SQE41565.1|2244893_2245262_-|50S-ribosomal-protein-L17	unknown	unknown	gnl|CDD|235522
LS483302.1|SQE41568.1|2246710_2247076_-|30S-ribosomal-protein-S13	unknown	unknown	gnl|CDD|235358
LS483302.1|SQE41548.1|2224036_2224885_-|oxidoreductase,-aldo/keto-reductase-family	unknown	unknown	gnl|CDD|381359
LS483302.1|SQE41553.1|2230410_2231928_+|glycosyl-transferases-group-1-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|340855
LS483302.1|SQE41562.1|2241893_2242700_-|Transmembrane-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters	unknown	unknown	gnl|CDD|223692
LS483302.1|SQE41554.1|2232159_2232975_-|hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|319792
LS483302.1|SQE41567.1|2246297_2246687_-|30S-ribosomal-protein-S11	unknown	unknown	gnl|CDD|180007

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LS483302.1|SQE41557.1|2234827_2236492_-|Acetolactate-synthase,-catabolic	gnl|CDD|236312	PRK08617, PRK08617, acetolactate synthase AlsS.	0
LS483302.1|SQE41560.1|2240408_2240846_-|50S-ribosomal-protein-L13	gnl|CDD|181703	PRK09216, rplM, 50S ribosomal protein L13; Reviewed.	4.91074e-100
LS483302.1|SQE41564.1|2243546_2244356_-|cobalt-import-ATP-binding-protein	gnl|CDD|184207	PRK13648, cbiO, cobalt transporter ATP-binding subunit; Provisional.	0
LS483302.1|SQE41563.1|2242689_2243550_-|ATPase-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters	gnl|CDD|184205	PRK13646, cbiO, energy-coupling factor transporter ATPase.	0
LS483302.1|SQE41551.1|2228396_2229251_-|Peptidase,-M23/M37-family	gnl|CDD|223810	COG0739, NlpD, Membrane proteins related to metalloendopeptidases [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	1.54609e-24
LS483302.1|SQE41565.1|2244893_2245262_-|50S-ribosomal-protein-L17	gnl|CDD|235522	PRK05591, rplQ, 50S ribosomal protein L17; Validated.	2.70058e-62
LS483302.1|SQE41566.1|2245278_2246223_-|DNA-directed-RNA-polymerase-alpha-subunit	gnl|CDD|235359	PRK05182, PRK05182, DNA-directed RNA polymerase subunit alpha; Provisional.	1.89947e-175
LS483302.1|SQE41555.1|2233269_2233695_+|Truncated-cell-surface-protein-map-w	gnl|CDD|367591	pfam03642, MAP, MAP domain. This presumed 110 amino acid residue domain is found in multiple copies in MAP (MHC class II analogue protein). The protein has been found in a wide range of extracellular matrix proteins.	2.66977e-34
LS483302.1|SQE41550.1|2225777_2228198_+|polysaccharide-lyase-family-8,-super-sandwich-domain-protein	gnl|CDD|238517	cd01083, GAG_Lyase, Glycosaminoglycan (GAG) polysaccharide lyase family. This family consists of a group of secreted bacterial lyase enzymes capable of acting on glycosaminoglycans, such as hyaluronan and chondroitin, in the extracellular matrix of host tissues, contributing to the invasive capacity of the pathogen. These are broad-specificity glycosaminoglycan lyases which recognize uronyl residues in polysaccharides and cleave their glycosidic bonds via a beta-elimination reaction to form a double bond between C-4 and C-5 of the non-reducing terminal uronyl residues of released products. Substrates include chondroitin, chondroitin 4-sulfate, chondroitin 6-sulfate, and hyaluronic acid. Family members include chondroitin AC lyase, chondroitin abc lyase, xanthan lyase, and hyalurate lyase.	0
LS483302.1|SQE41556.1|2234086_2234791_-|alpha-acetolactate-decarboxylase	gnl|CDD|226058	COG3527, AlsD, Alpha-acetolactate decarboxylase [Secondary metabolites biosynthesis, transport, and catabolism].	2.30289e-119
LS483302.1|SQE41561.1|2241085_2241889_-|tRNA-pseudouridine-synthase-A	gnl|CDD|234577	PRK00021, truA, tRNA pseudouridine(38-40) synthase TruA.	3.67513e-120
LS483302.1|SQE41549.1|2224954_2225371_-|transcriptional-regulator,-MerR-family	gnl|CDD|133384	cd01109, HTH_YyaN, Helix-Turn-Helix DNA binding domain of the MerR-like transcription regulators YyaN and YraB. Putative helix-turn-helix (HTH) MerR-like transcription regulators of Bacillus subtilis, YyaN and YraB, and related proteins; N-terminal domain. Based on sequence similarity, these proteins are predicted to function as transcription regulators that mediate responses to stress in eubacteria. They belong to the MerR superfamily of transcription regulators that promote transcription of various stress regulons by reconfiguring the operator sequence located between the -35 and -10 promoter elements. A typical MerR regulator is comprised of distinct domains that harbor the regulatory (effector-binding) site and the active (DNA-binding) site. Their N-terminal domains are homologous and contain a DNA-binding winged HTH motif, while the C-terminal domains are often dissimilar and bind specific coactivator molecules such as metal ions, drugs, and organic substrates.	3.56048e-41
LS483302.1|SQE41559.1|2239996_2240395_-|30S-ribosomal-protein-S9	gnl|CDD|178888	PRK00132, rpsI, 30S ribosomal protein S9; Reviewed.	2.2295e-82
LS483302.1|SQE41568.1|2246710_2247076_-|30S-ribosomal-protein-S13	gnl|CDD|235358	PRK05179, rpsM, 30S ribosomal protein S13; Validated.	2.16257e-78
LS483302.1|SQE41548.1|2224036_2224885_-|oxidoreductase,-aldo/keto-reductase-family	gnl|CDD|381359	cd19133, AKR_AKR5F1, the AKR5F family of aldo-keto reductase (AKR). Klebsiella sp. 2,5-diketo-D-gluconic acid reductase (2,5-DKG reductase) is a founding member of aldo-keto reductase family 5 member F1 (AKR5F1). It catalyzes the reduction of 2,5-diketo-D-gluconic acid (25DKG) to 2-keto-L-gulonic acid (2KLG).	1.16299e-148
LS483302.1|SQE41553.1|2230410_2231928_+|glycosyl-transferases-group-1-family-protein	gnl|CDD|340855	cd04949, GT4_GtfA-like, accessory Sec system glycosyltransferase GtfA and similar proteins. This family is most closely related to the GT4 family of glycosyltransferases and is named after gtfA in Streptococcus gordonii, where it plays a role in the O-linked glycosylation of GspB, a cell surface glycoprotein involved in platelet binding. In general glycosyltransferases catalyze the transfer of sugar moieties from activated donor molecules to specific acceptor molecules, forming glycosidic bonds. The acceptor molecule can be a lipid, a protein, a heterocyclic compound, or another carbohydrate residue. This group of glycosyltransferases is most closely related to the previously defined glycosyltransferase family 1 (GT1). The members of this family may transfer UDP, ADP, GDP, or CMP linked sugars. The diverse enzymatic activities among members of this family reflect a wide range of biological functions. The protein structure available for this family has the GTB topology, one of the two protein topologies observed for nucleotide-sugar-dependent glycosyltransferases. GTB proteins have distinct N- and C- terminal domains each containing a typical Rossmann fold. The two domains have high structural homology despite minimal sequence homology. The large cleft that separates the two domains includes the catalytic center and permits a high degree of flexibility. The members of this family are found in bacteria.	2.16153e-60
LS483302.1|SQE41562.1|2241893_2242700_-|Transmembrane-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters	gnl|CDD|223692	COG0619, CbiQ, ABC-type cobalt transport system, permease component CbiQ and related transporters [Inorganic ion transport and metabolism].	1.11823e-48
LS483302.1|SQE41554.1|2232159_2232975_-|hydrolase	gnl|CDD|319792	cd02605, HAD_SPP, sucrose-phosphatase, similar to Synechocystis sp PCC 6803 SPP. Sucrose-phosphatase (SPP; EC 3.1.3.24) catalyzes the dephosphorylation of sucrose-6(F)-phosphate (Suc6P)-the final step in the pathway of sucrose biosynthesis in plants and cyanobacteria. This family belongs to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	5.61177e-99
LS483302.1|SQE41567.1|2246297_2246687_-|30S-ribosomal-protein-S11	gnl|CDD|180007	PRK05309, PRK05309, 30S ribosomal protein S11; Validated.	2.01588e-89

Protein sequences

>LS483302.1|SQE41557.1|2234827_2236492_-|Acetolactate-synthase,-catabolic
MTDKKYTAADMVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGVVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPVESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGVISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELETQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISEKVDEPFINQQHLDELEQLRTHIDEETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDDTTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN
>LS483302.1|SQE41556.1|2234086_2234791_-|alpha-acetolactate-decarboxylase
MTNVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHVRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFTNANIDYKDISDEIREAE
>LS483302.1|SQE41555.1|2233269_2233695_+|Truncated-cell-surface-protein-map-w
MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNSIDPSTIKQIQIVVK
>LS483302.1|SQE41554.1|2232159_2232975_-|hydrolase
MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVMTAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSTGNHNKDRRILESLVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY
>LS483302.1|SQE41553.1|2230410_2231928_+|glycosyl-transferases-group-1-family-protein
MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKEVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNNYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRIKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKMFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYPKVENMQNNDVKKIFTIHTNHFLSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAVSFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRGLYTKASLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSK
>LS483302.1|SQE41552.1|2230122_2230401_+|Uncharacterised-protein
MTFNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIVFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLETFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK
>LS483302.1|SQE41551.1|2228396_2229251_-|Peptidase,-M23/M37-family
MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKRAFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTMEQIWIDKANQFGVAVIWKNNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTHKNQGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVNGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFLNNRELIKGDVVCGLQGE
>LS483302.1|SQE41550.1|2225777_2228198_+|polysaccharide-lyase-family-8,-super-sandwich-domain-protein
MTYKMKKWQKLSTITLLMAGVITLNGGEFRSIDKHQIAVADTNIQTPDYEKLKNTWLDVNYGYDKYDENNEAMKKKFEVTEKEAEKLLKEMKTESGRKYLWDNSKDLDTKSADMTRTYRNIEKIAEAMKHPKTTLKNDENKKKLKDALEWLHKNAYGKDPDKKVADLKTNFSKSAPQKNTNLNWWDYEIGTPKSLTNTLILLNGDISSDEKKKYTAPIKTFAPKSDEILSSVGKAEPAKGGNLVDIAKVKLLESIIEEDKDMTKNSIDSFNKVFTYVQSNSTGKERNGFYKDGSYIDHQDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETPFKETSQNDTILKSWIDDGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHSASVTVMKSLLRLSDAMDESTKAKYKKIVKTSVKSDSSYKQNDYLSSYSDISKMKALMEDSTLSTNDLTQQLKIYNDMDRVTYHNKDLDFAFGLSMTSKNVARYESINGENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATADMKRLAGTTILENEEPKENKNSDKTFVGGTKFDDQHASIGMEFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKNTDSSKNPVTTIENRKANGYTLYTNDKQTTNSDNQETNSVFLESTDTKKNIGYHFLNKSKINVKKESHTGKWSDINKSQKDTQKADEYYEVTQKHSNSDNKYGYVLYPGLSKDVFKSKASQVTVVKQDDDFHVVKDNESVWAGVNYSNSTQTFEINGTKVEVKAKGMFILKKKDDNTYECSFYNPESTNTASDIESKISMTGYSITNKNTSTSNESGVRFELTK
>LS483302.1|SQE41549.1|2224954_2225371_-|transcriptional-regulator,-MerR-family
MKTKEVVALMNISQDTLRYYEKVGVIPPVNRDENGYRIYNDSDLNWIYLVKNLRNAGVSIESLIEFCRLAQLPKNENIQAQQKQILNKQLEELNENLKTIHDARDLLQYKIDNYDNHIAKINASDNHDANVERIWERK
>LS483302.1|SQE41548.1|2224036_2224885_-|oxidoreductase,-aldo/keto-reductase-family
MNHIEISKDVKIPVLGFGVFQIPQEQTAEAVKEAIKAGYRHIDTAQSYLNETEVGQGIEASGIDRSELFITTKVWIENVTYEDTIKSIERSLQRLNLDYLDLVLIHQPYNDIYGSWRALEELKETGKIKAIGVSNFGVDRIVDLGIHNQIQPQVNQIEINPFHQQEEQVVALQQENVVVEAWAPFAEGKNQLFQNQLLQAIADKYNKSIAQVILRWLVERDIVVLAKSVNPERMAQNLDIFDFELTEEDKQQIATLEESNSQFFSHADPEMIKVLTSRELDV
>LS483302.1|SQE41559.1|2239996_2240395_-|30S-ribosomal-protein-S9
MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR
>LS483302.1|SQE41560.1|2240408_2240846_-|50S-ribosomal-protein-L13
MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG
>LS483302.1|SQE41561.1|2241085_2241889_-|tRNA-pseudouridine-synthase-A
MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNKAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKSDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEISDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND
>LS483302.1|SQE41562.1|2241893_2242700_-|Transmembrane-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters
MKNKLIIGRYLPINSFVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFFCHSPLTYLWVFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGIYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPIAIILFVLKYSGV
>LS483302.1|SQE41563.1|2242689_2243550_-|ATPase-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters
MSIRFNDVSYTYQQGTPYEHQAIHDINTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALIKPTSGTVTIDDVTVTHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMDLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSVLAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKAIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKDKEKLADWHIGLPEIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK
>LS483302.1|SQE41564.1|2243546_2244356_-|cobalt-import-ATP-binding-protein
MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIENVKSGEIFYNNQTITDDNFEKLRKNIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRKVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGHQTSFLTYEGLVNQL
>LS483302.1|SQE41565.1|2244893_2245262_-|50S-ribosomal-protein-L17
MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV
>LS483302.1|SQE41566.1|2245278_2246223_-|DNA-directed-RNA-polymerase-alpha-subunit
MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED
>LS483302.1|SQE41567.1|2246297_2246687_-|30S-ribosomal-protein-S11
MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV
>LS483302.1|SQE41568.1|2246710_2247076_-|30S-ribosomal-protein-S13
MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK

Self-targeting detection

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_ID	Protospacer_location	Mismatch	Identity
LS483302_1	1.1|230071|33|LS483302|CRISPRCasFinder	230071-230103	33	LS483302.1	2310926-2310958	0	1.0
LS483302_2	2.1|923361|31|LS483302|CRISPRCasFinder	923361-923391	31	LS483302.1	784607-784637	2	0.935
LS483302_2	2.1|923361|31|LS483302|CRISPRCasFinder	923361-923391	31	LS483302.1	1625827-1625857	2	0.935
LS483302_2	2.1|923361|31|LS483302|CRISPRCasFinder	923361-923391	31	LS483302.1	2052019-2052049	2	0.935
LS483302_2	2.1|923361|31|LS483302|CRISPRCasFinder	923361-923391	31	LS483302.1	2310981-2311011	2	0.935
LS483302_4	4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder	1821927-1821955	29	LS483302.1	1422087-1422115	2	0.931
LS483302_5	5.1|2238132|37|LS483302|CRISPRCasFinder	2238132-2238168	37	LS483302.1	2238043-2238079	2	0.946

1. spacer 1.1|230071|33|LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 2310926-2310958, mismatch: 0, identity: 1.0

tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat	CRISPR spacer
tgggccccaacaaagagaaattggattcccaat	Protospacer
*********************************

2. spacer 2.1|923361|31|LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 784607-784637, mismatch: 2, identity: 0.935

cggggccccaacacagaagctggtggaaagt	CRISPR spacer
cggggccccaacatagaagctggcggaaagt	Protospacer
*************.*********.*******

3. spacer 2.1|923361|31|LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 1625827-1625857, mismatch: 2, identity: 0.935

cggggccccaacacagaagctggtggaaagt	CRISPR spacer
cggggccccaacatagaagctggcggaaagt	Protospacer
*************.*********.*******

4. spacer 2.1|923361|31|LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 2052019-2052049, mismatch: 2, identity: 0.935

cggggccccaacacagaagctggtggaaagt	CRISPR spacer
cggggccccaacagagaagctggcggaaagt	Protospacer
************* *********.*******

5. spacer 2.1|923361|31|LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 2310981-2311011, mismatch: 2, identity: 0.935

cggggccccaacacagaagctggtggaaagt	CRISPR spacer
cggggccccaacatagaagctggcggaaagt	Protospacer
*************.*********.*******

6. spacer 4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 1422087-1422115, mismatch: 2, identity: 0.931

cagagaatttcaacaagaaattctacaga	CRISPR spacer
cagagaatttcgaaaagaaattctacaga	Protospacer
***********.* ***************

7. spacer 5.1|2238132|37|LS483302|CRISPRCasFinder matches to position: 2238043-2238079, mismatch: 2, identity: 0.946

agctcacaaaacccttgatatcattggtttcccatga	CRISPR spacer
agctcacaaaacccttgatatcactggtttctcatga	Protospacer
***********************.*******.*****

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
LS483302_4	4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder	1821927-1821955	29	MN693250	Marine virus AFVG_25M507, complete genome	24474-24502	5	0.828
LS483302_4	4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder	1821927-1821955	29	NZ_LR134403	Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence	202405-202433	6	0.793
LS483302_4	4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder	1821927-1821955	29	NC_021539	Listeria phage LP-030-2, complete genome	30990-31018	6	0.793
LS483302_4	4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder	1821927-1821955	29	MN693116	Marine virus AFVG_25M217, complete genome	37740-37768	6	0.793
LS483302_4	4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder	1821927-1821955	29	KJ094023	Listeria phage LP-101, complete genome	36648-36676	6	0.793
LS483302_4	4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder	1821927-1821955	29	NC_009928	Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3, complete sequence	24267-24295	7	0.759
LS483302_4	4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder	1821927-1821955	29	NZ_CP039965	Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence	1307898-1307926	7	0.759
LS483302_4	4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder	1821927-1821955	29	HM452126	Aeromonas phage phiAS5, complete genome	16082-16110	8	0.724

1. spacer 4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder matches to MN693250 (Marine virus AFVG_25M507, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828

cagagaatttcaacaagaaattctacaga	CRISPR spacer
aagagaattgcaacaagaaattctaatgc	Protospacer
 ******** ***************  * 

2. spacer 4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

cagagaatttcaacaagaaattctacaga	CRISPR spacer
tagagaatatcaacaagaaattataaatg	Protospacer
.******* ************* ** * .

3. spacer 4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder matches to NC_021539 (Listeria phage LP-030-2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

cagagaatttcaacaagaaattctacaga	CRISPR spacer
tagagaatatcaacaagaaattataaatg	Protospacer
.******* ************* ** * .

4. spacer 4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder matches to MN693116 (Marine virus AFVG_25M217, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

cagagaatttcaacaagaaattctacaga	CRISPR spacer
agcaaaatttcaacaagagattctacaaa	Protospacer
 . *.*************.********.*

5. spacer 4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793

cagagaatttcaacaagaaattctacaga	CRISPR spacer
tagagaatatcaacaagaaattataaatg	Protospacer
.******* ************* ** * .

6. spacer 4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder matches to NC_009928 (Acaryochloris marina MBIC11017 plasmid pREB3, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

----cagagaatttcaacaagaaattctacaga	CRISPR spacer
gctgttga----ttcaacaagaaattctccaga	Protospacer
    . **    **************** ****

7. spacer 4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039965 (Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759

cagagaatttcaacaagaaattctacaga	CRISPR spacer
atgagaatttcaccaagaaattcggcatc	Protospacer
  ********** ********** .**  

8. spacer 4.1|1821927|29|LS483302|CRISPRCasFinder matches to HM452126 (Aeromonas phage phiAS5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.724

cagagaatttcaacaagaaattctacaga	CRISPR spacer
ccccagtcttcaacaagcaattctacaga	Protospacer
*   .. .********* ***********

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	259161 : 297388	33	Staphylococcus_virus(25.0%)	transposase,lysis,holin	NA
DBSCAN-SWA_2	710456 : 718275	10	Hokovirus(16.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_3	730251 : 744529	13	uncultured_Caudovirales_phage(50.0%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_4	840980 : 885480	64	Staphylococcus_phage(88.52%)	holin,head,terminase,tRNA,capsid,portal,tail	NA
DBSCAN-SWA_5	1039704 : 1048177	9	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_6	1237910 : 1309325	60	Cafeteria_roenbergensis_virus(12.5%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_7	1582957 : 1591269	7	Staphylococcus_phage(16.67%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_8	1660761 : 1669802	7	uncultured_Mediterranean_phage(50.0%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_9	1793200 : 1855350	60	Staphylococcus_phage(93.75%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_10	1937240 : 2026159	106	Staphylococcus_phage(88.31%)	holin,head,terminase,protease,tRNA,capsid,tail	NA
DBSCAN-SWA_11	2464641 : 2475079	8	Mycoplasma_phage(33.33%)	holin,transposase	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>LS483302|259161:297388|DBSCAN-SWA
TTTAGGCAATGTAAAAAAGCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGCTTTTTTGATATGCATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTATATTAAGTGCCATTAATACAAAACCTATGGCACTAGCTTCTACTTTTGTACCATCAATAAAAATTGAATTATCATCAATAAGATTTTGCTTTAAACATTGGCTATGGAACTGAATAAATAAAGATTCAATTAACGCATCAGTGTTAGGATTCACTCTAAAACGATTAATAGTTTTATAAGAAGGTGTTTGATTTTGAGCTAACCACATCATTCGAATACTGTCATGAAGTAATTTTTCTATTCTACGACCAGAAAATACAGATTGAGTATATGCATATAAGATAATTTTTAACATCATTTTTGGATGATAGGATGTTGCGCCACGATGATGTCTGAATTCATCAAATTCACTATCAGGTATCGTTTCAACAATTTCATTAACATATCGCGAAATATCATTTTGAGGAATTCTAACAGAAGTTTCTATTGGTAGTGTAAGTTGGGCAAAGTGTCTTATTTTTTTAAGTATTTCAAAGTAAAATTACATGTTAATACGTAGTATTAATGGCGAGACTCCTGAGGGAGCAGTGCCAGTCGAAGACCGAGGCTGAGACGGCACCCTAGGAAAGCGAAGCCATTCAATACGAAGTATTGTATAAATAGAGAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTTTTTAGGGATTTATATCCCAGCCTCGTTTTATTTTGCTATTTATGAAATGATTATGACATTTCCCTGATTTTCATTTTCATATACATTAAATTGTATACACTGAAAATGAGGAGGTCGTCTATAATGATAAATAAAAATGACATAGTAGCAGATGTAGTAACAGATTATCCGAAAGCAGCAGATATTTTTAGAAGCGTAGGTATAGACTTTTGTTGCGGTGGACAAGTAAGTATAGAAGCAGCATCCTTAGAAAAGAAAAATGTAGATTTGAACGAATTATTACAGCGTCTCAACGACGTTGAACAAACGAATACACCAGGTTCGCTTAACCCTAAATTTTTAAATGTTTCGTCACTTATTCAATATATTCAAGCAGCATATCATGAACCTCTTAGAGAAGAATTTAAAAATTTAACACCTTATGTGACGAAATTATCAAAAGTACATGGACCTAATCATCCATATTTAGTCGAGTTAAAAGAAACATATGATACATTTAAAAATGGCATGTTAGAGCATATGCAAAAAGAAGATGATGTTGATTTTCCAAAACTAATTAAATATGAACAAGGTGAAGTAGTAGACGATATTAATACAGTGATTGATGATTTAGTATCTGATCACATTGCAACTGGACAATTGTTAGTAAAAATGAGCGATTTAACATCAAGCTATGAACCACCGATAGAAGCGTGTGGTACTTGGCGACTCGTTTATCAGAGATTAAAAGCACTTGAAGTGTTAACACATGAGCATGTTCATTTAGAGAATCATGTTTTATTTAAAAAAGTATCATAGATAAAGCGATTAGAAACTGTTGGCAAAGTAATGTCAGCAGTTTTTCGCTATACTTAACAGAAATTTAGTGACATGATAGTCATTATTTTGAAAAGGAAAATTGCCAACTTAGCATAAAAATTGATATAAAATTTTAATGGTATAGGTAATTAAATAGTAGCGTGATTTTTTAATAATTTATTCATGAATTTTACATGCACTATTATGATAAAATAAACATAATTATAATTCACTGAGGTGCTATCGTGCTATCGCTAACAATGTTATTACTTGAGCGTGTAGGTTTAATTATTATTTTGTCCTATGTGTTGATGAATATTCCATATTTTAAAAACTTAATGAATCGTCGACGTACATGGAAAGCACGTTGGCAATTATGTATTATTTTCAGTTTGTTTGCCTTAATGTCAAATTTAACTGGTATCGTCATTGATCATCAACACAGTTTGTCAGGAAGTGTGTACTTCCGTTTAGATGATGATGTATCTTTAGCTAACACACGTGTATTAACGATAGGTGTCGCAGGATTAGTTGGTGGCCCTTTTGTAGGTCTATTTGTTGGCGTTATTTCAGGTATTTTCAGAGTGTATATGGGTGGGGCGGATGCACAAGTTTATCTTATCTCATCTATATTTATCGGTATAATTGCTGGTTATTTTGGCTTACAAGCTCAAAGACGCAAGCGTTACCCGAGTATTGCGAAAAGTGCCATGATTGGAATTGTTATGGAAATGATTCAAATGTTGAGCATTTTAACATTTTCCCACGACAAAGCATATGCGGTTGACCTCATATCATTAATTGCACTACCAATGATTATTGTTAATAGCGTTGGTACGGCGATTTTTATGTCTATTATCATTTCAACATTAAAGCAAGAGGAGCAAATGAAGGCTGTTCAAACACATGATGTACTGCAATTGATGAACCAGACATTGCCGTATTTTAAAGAAGGATTGAATAGAGAATCGGCACAGCAAATTGCGATGATTATTAAAAATTTAATGAAAGTATCTGCCGTAGCAATTACAAGCAAAAATGAAATCTTATCGCATGTAGGTGCAGGTAGTGATCATCACATACCAACAAATGAAATATTAACAAGTCTGTCTAAAGATGTATTGAAATCAGGAAAGTTGAAAGAAGTTCATACTAAAGAAGAAATTGGTTGTAGTCATCCGAATTGCCCGCTTAGAGCAGCTATCGTGATACCACTTGAGATGCATGGTTCTATCGTCGGTACATTGAAGATGTATTTTACAAACCCTAATGATTTAACTTTTGTGGAACGTCAACTTGCAGAAGGATTGGCAAATATTTTTAGTAGCCAAATTGAACTTGGTGAAGCCGAAACGCAAAGTAAGTTATTGAAAGATGCTGAAATTAAGTCATTACAGGCACAAGTGAGTCCACATTTTTTCTTCAATTCAATTAACACGATTTCAGCTTTAGTTAGAATAAATAGCGAAAAGGCACGAGAGTTACTATTAGAATTGAGTTATTTTTTCAGAGCGAATTTACAAGGCTCTAAGCAACATACGATTACTTTAGATAAAGAGTTAAGTCAAGTGCGTGCATACTTATCACTTGAACAAGCACGTTATCCAGGAAGATTTAATATCAATATTAATGTTGAAGACAAATATCGCGATGTGCTTGTACCACCATTTTTAATTCAAATTTTAGTTGAAAATGCCATCAAACATGCGTTTACGAATCGAAAGCAAGGTAACGATATTGACGTGTCAGTGATTAAAGAAACTGCAACACATGTACGTATTATTGTACAAGATAATGGTCAGGGTATTTCTAAAGATAAAATGCATTTGTTGGGAGAAACATCTGTAGAATCAGAATCTGGAACTGGTAGTGCTTTAGAAAATTTAAACTTACGCCTAAAAGGATTATTTGGAAAATCCGCAGCATTACAATTTGAATCGACATCGAGCGGTACCACTTTTTGGTGTGTACTTCCTTATGAAAGACAAGAGGAGGAATAAATATGAAAGCATTAATCATAGATGATGAGCCATTAGCACGTAATGAATTAACATATTTATTAAATGAAATTGGTGGTTTTGAAGAAATTAATGAGGCAGAAAATGTAAAAGAAACATTGGAAGCACTACTGATAAATCAATATGACATTATATTTTTAGATGTCAATTTAATGGATGAAAATGGTATCGAATTAGGAGCTAAAATTCAAAAGATGAAAGAGCCACCTGCGATTATTTTTGCAACTGCACATGACCAATACGCAGTACAGGCATTTGAATTAAATGCGACAGACTATATTTTGAAACCGTTTGGTCAAAAACGTATTGAACAAGCAGTCAATAAAGTTCGTGCGACTAAAGCCAAAGATGATAATAGCGCAAATGCAATTGCGAATGATATGTCGGCGAATTTTGATCAAAGTTTACCTGTTGAAATTGACGATAAAATTCACATGTTAAAGCAACAAAATATTATTGGGATTGGCACACATAATGGTATTACAACCATACATACAACGAATCATAAATATGAAACAACAGAGCCATTGAATCGTTATGAAAAACGATTGAATCCCGCTTATTTCATACGTATTCATCGTTCATATATTATTAATACGAAACACATTAAAGAAGTGCAACAATGGTTTAACTACACTTATATGGTAATATTGACAAATGGTGTCAAGATGCAAGTTGGACGTTCATTTATGAAAGATTTTAAAGCGTCGATAGGATTACTTTAACAGTAATCCTTTTTTTTATGCATTTTACCTATGATATTTTGTATTTCGGACTAAAATTCACGCAAATCGAAGTGAGCCATCTATACTTTAGTTAAATCAAACGTAGGAGGCAATGGTCGTGAAACAACAAAAAGACGCATCAAAACCAGCACACTTTTTTCACCAAGTCATTGTAATTGCTTTAGTACTCTTTGTATCGAAAATAATTGAATCATTTATGCCAATTCCTATGCCTGCATCAGTAATCGGTTTAGTATTATTATTTGTATTATTATGTACTGGTGCTGTTAAGTTAGGCGAAGTCGAAAAAGTAGGAACGACACTAACAAATAACATTGGCTTACTCTTCGTACCAGCCGGTATCTCAGTTGTTAACTCTTTAGGTGTCATTAGCCAAGCACCATTTTTAATCATTGGACTAATAATCGTCTCAACAATACTATTACTTATTTGTACTGGCTATGTCACACAAATTATTATGAAAGTTACTTCGAGATCTAAAGGTGACAAAGTCACAAAAAAGATCAAAATAGAGGAGGCACAAGCTCATGATTAACCACTTAGCACTAAACACACCTTACTTCGGAATACTGTTATCCGTTATACCATTTTTCTTAGCGACCATATTATTTGAAAAAACAAATCGTTTCTTCTTATTCGCACCGCTATTTGTCAGTATGGTATTTGGTGTGGCCTTCCTCT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MSNKGEIRRQIANKEREKASKEAQLTDLKEDLRRLKDASKKLDTAGEDFNKGQSSYNKVEISTSDWKGERRTKSDSKKKDVDSELKKVEQDFDDAKKAIKKDIQDKEEEIKGVEGEISTINAAIDALKSKL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE39741.1|259161_259563_-|transposase	putative transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	2.2e-12	83.7
SQE39742.1|260040_260715_+	DnrN	NA	NA	NA	NA
SQE39743.1|260960_262715_+|lysis	Autolysis histidine kinase LytS	Q9EYF3	Enterobacteria_phage	1.5e-62	31.3
SQE39744.1|262717_263458_+|lysis	Autolysis response regulater LytR	NA	NA	NA	NA
SQE39745.1|263576_264014_+|holin	holin-like protein	NA	NA	NA	NA
SQE39746.1|264006_264708_+	LrgA-associated membrane protein LrgB	NA	NA	NA	NA
SQE39747.1|264814_265519_-	Transcriptional regulator, GntR family	NA	NA	NA	NA
SQE39748.1|265665_266457_+	PTS family glucose/glucoside (glc) porter component IIABC	NA	NA	NA	NA
SQE39749.1|266472_267909_+	6-phospho-beta-glucosidase	A0A0B5JD41	Pandoravirus	4.8e-30	25.2
SQE39750.1|268481_269243_-	SAM-dependent methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SQE39751.1|269492_270407_-	Ribokinase	NA	NA	NA	NA
SQE39752.1|270434_270839_-	Ribose ABC transport system, high affinity permease RbsD	NA	NA	NA	NA
SQE39753.1|270853_271735_-	sugar transport protein	NA	NA	NA	NA
SQE39754.1|271966_272965_-	ribose operon repressor, putative	NA	NA	NA	NA
SQE39755.1|273448_274825_-	multidrug resistance protein B	NA	NA	NA	NA
SQE39756.1|275058_276051_+	choloylglycine hydrolase	M1H9I8	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	1.3e-21	25.5
SQE39757.1|276376_277327_+	peptidoglycan hydrolase	V5R8R0	Arthrobacter_phage	1.2e-16	42.7
SQE39758.1|277378_278038_-	ABC transporter ATP-binding protein	Q9EMR9	Amsacta_moorei_entomopoxvirus	4.9e-22	36.1
SQE39759.1|278051_278972_-	ABC-2 family transporter protein	NA	NA	NA	NA
SQE39760.1|278968_280135_-	ABC-2 transporter family protein	NA	NA	NA	NA
SQE39761.1|280202_281726_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQE39762.1|282056_282959_-	staphyloxanthin biosynthesis protein, putative	NA	NA	NA	NA
SQE39763.1|283197_283491_+	Virulence factor esxA	NA	NA	NA	NA
SQE39764.1|283525_285172_-|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	3.9e-294	99.8
SQE39765.1|285489_288519_+	Putative secretion accessory protein EsaA/YueB	NA	NA	NA	NA
SQE39766.1|288518_288977_+	Putative secretion system component EssA	NA	NA	NA	NA
SQE39767.1|288948_289191_+	Putative secretion accessory protein EsaB/YukD	NA	NA	NA	NA
SQE39768.1|289203_290538_+	essB	NA	NA	NA	NA
SQE39769.1|290559_292635_+	FtsK/SpoIIIE family protein, putative secretion system component EssC/YukA	NA	NA	NA	NA
SQE39770.1|292687_295009_+	essC	V5UPA0	Mycobacterium_phage	1.6e-19	22.3
SQE39771.1|295011_295278_+	type VII secretion effector	NA	NA	NA	NA
SQE39772.1|295300_295696_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQE39773.1|295717_297388_+|transposase	putative transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>LS483302|710456:718275|DBSCAN-SWA
ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTTCGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTATTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTACGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCGTATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCATGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAATGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAATAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTTAGCAACATAATGTGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCAGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTTTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAGCAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACGCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTGAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACAAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACCTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGACTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGCTGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATAACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAAAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGGTGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGTCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCCTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCACCAGGGCCGGGTAATCCTGATGATTATCCAATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGGTTACAGCAAAAAACGATGAAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTACATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAGGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTATTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATCTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCCACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTTTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTAAAAAAGCGGAAAACATAAATTCAATATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAACATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTTGAAGGCGAAACGTATCAGGTGAACTATACGGCGCGCTTAACGGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACTGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGTAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTCATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAACTAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATTACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGAATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCGATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

>LS483302|710456:718275|713706_714291_-|SQE40158.1|DBSCAN-SWA
MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF
>LS483302|710456:718275|715106_715526_-|SQE40160.1|DBSCAN-SWA
MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV
>LS483302|710456:718275|715527_716196_-|SQE40161.1|DBSCAN-SWA
MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL
>LS483302|710456:718275|714389_715103_-|SQE40159.1|DBSCAN-SWA
MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV
>LS483302|710456:718275|711511_712198_-|SQE40155.1|DBSCAN-SWA
MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR
>LS483302|710456:718275|716546_717140_+|SQE40162.1|DBSCAN-SWA
MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKVTAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI
>LS483302|710456:718275|710456_711512_-|SQE40154.1|DBSCAN-SWA
MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITS
>LS483302|710456:718275|717123_718275_+|SQE40163.1|DBSCAN-SWA
MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFKKAENINSIYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML
>LS483302|710456:718275|712986_713427_-|SQE40157.1|DBSCAN-SWA
MNTKYFLAVGAAAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKKKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK
>LS483302|710456:718275|712172_712646_-|SQE40156.1|DBSCAN-SWA
MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE40154.1|710456_711512_-	Sensor histidine protein kinase SaeS (exoprotein expression protein S)	A0A1V0SGX0	Hokovirus	3.6e-14	29.8
SQE40155.1|711511_712198_-	Response regulator SaeR	NA	NA	NA	NA
SQE40156.1|712172_712646_-	DoxX family protein	NA	NA	NA	NA
SQE40157.1|712986_713427_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
SQE40158.1|713706_714291_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQE40159.1|714389_715103_-	Queuosine Biosynthesis QueE Radical SAM	A0A1U9WRB6	Streptococcus_virus	6.5e-52	43.5
SQE40160.1|715106_715526_-	6-pyruvoyl-tetrahydropterin synthase	S4U060	uncultured_phage	6.3e-07	28.7
SQE40161.1|715527_716196_-	Queuosine Biosynthesis QueC ATPase	A0A2H4J8Q7	uncultured_Caudovirales_phage	9.6e-66	57.5
SQE40162.1|716546_717140_+	Para-aminobenzoate synthase, amidotransferase component PabAb	A0A0P0IKJ1	Acinetobacter_phage	8.9e-39	44.0
SQE40163.1|717123_718275_+	Para-aminobenzoate synthetase component I	S4VNU7	Pandoravirus	2.1e-23	36.1

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>LS483302|730251:744529|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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MTQQNSHGNHIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGTSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE40172.1|730251_731310_+	histidinol-phosphate aminotransferase	A0A0H3TLT9	Faustovirus	2.6e-20	26.9
SQE40173.1|731467_732010_+	5'-3'-deoxyribonucleotidase, putative	NA	NA	NA	NA
SQE40174.1|732180_732330_+	Protein of uncharacterised function (DUF3125)	NA	NA	NA	NA
SQE40175.1|732705_733623_-	Transcription regulator (contains diacylglycerol kinase catalytic domain)	A0A1V0SBJ0	Catovirus	2.1e-07	22.4
SQE40176.1|733892_735398_-	Di/tripeptide permease YjdL	A0A0P0IY73	Acinetobacter_phage	3.4e-58	32.2
SQE40177.1|735738_736239_-	NADPH dependent preQ0 reductase	E7DN65	Pneumococcus_phage	5.9e-52	71.5
SQE40178.1|736258_737125_-	Integral membrane domain protein	NA	NA	NA	NA
SQE40179.1|737926_738325_+	Nrdi	A0A2H4J545	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-52	72.0
SQE40180.1|738287_740393_+	ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha	A0A2H4J2N6	uncultured_Caudovirales_phage	0.0e+00	91.7
SQE40181.1|740510_741482_+	ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A2H4J4P3	uncultured_Caudovirales_phage	4.2e-171	91.3
SQE40182.1|741856_742828_+	FatD	A0A2H4IY97	uncultured_Caudovirales_phage	1.0e-140	79.9
SQE40183.1|742814_743771_+	Iron compound ABC uptake transporter permease protein	A0A2H4J116	uncultured_Caudovirales_phage	1.2e-05	57.8
SQE40184.1|743767_744529_+	Iron compound ABC uptake transporter ATP-binding protein	Q9EMR9	Amsacta_moorei_entomopoxvirus	3.6e-16	30.6

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>LS483302|840980:885480|DBSCAN-SWA
AGTGGCCGAACACTCATTTGACGTTAATGAAGTAATCAAGGATTTTCCGATATTAGATCAAAAAGTCAATGGCAAACGTTTAGCATATCTTGATTCAACAGCGACAAGTCAAACGCCTGTGCAAGTGTTAAATGTTTTAGAAGATTACTACAAGCGTTATAATTCAAACGTTCATCGTGGTGTTCATACATTAGGATCATTGGCAACTGATGGTTATGAAAATGCCCGTGAAACCGTTCGTCGTTTTATTAATGCGAAGTATTTTGAAGAAATCATTTTTACACGCGGAACAACTGCGTCGATTAACCTTGTAGCACATAGCTATGGTGATGCAAATGTTGAAGAGGGCGATGAAATTGTTGTCACTGAAATGGAACATCATGCCAATATTGTTCCTTGGCAACAGTTAGCAAAGCGTAAAAATGCGACATTGAAATTTATACCAATGACAGCTGACGGTGAATTAAACATCAAGGATATTAAGCAAACGATTAATGATAAAACAAAGATCGTTGCTATTGCACATATTTCTAATGTGCTCGGTACAATTAATGATGTTAAAACCATTGCAGAAATAGCTCATCAACATGGTGCAATTATCAGTGTTGATGGGGCGCAAGCAGCACCACATATGAAACTTGATATGCAAGAAATGAATGCTGATTTTTATAGTTTTAGTGGTCATAAAATGCTTGGACCAACAGGTATTGGCGTATTATTTGGTAAACGTGAGTTACTACAAAAAATGGAACCGATTGAGTTCGGTGGCGACATGATTGATTTTGTAAGTAAGTATGATGCAACATGGGCTGATTTACCTACTAAATTTGAGGCGGGTACGCCATTAATTGCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAATTATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGGATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTACATCCACACGATGTTGCTACAGCCGTAGATACAGAAGGTGTAGCAGTTAGAGCTGGGCATCATTGTGCGCAACCGTTAATGAAATGGTTAAATGTGTCTTCAACAGCTAGAGCGAGTTTTTATATATACAACACGAAAGAAGACATTGATCAGTTAATAAATGCCTTGAAACAAACGAAGGAGTTTTTCTCTTATGAATTTTAATAATCTAGATCAATTATATAGATCTGTCATTATGGATCATTATAAAAATCCTAGAAATAAAGGTGTATTAGATAACGGGTCTATGACAGTAGATATGAATAACCCGACATGCGGTGACCGTATACGACTAACATTTGATATAGAAGATGGCATTATAAAAGATGCTAAGTTTGAAGGTGAAGGTTGTTCGATTTCAATGGCAAGTGCATCGATGATGACACAAGCTGTTAAAGGTCATTCACTTGGAGAAGCAATGCAAATGAGCCAAGAATTTACGAAAATGATGCTTGGTGAAGATTATGTGATTACAGAAGAAATGGGAGATATTGAAGCATTGCAAGGTGTATCTCAATTCCCAGCTCGTATTAAATGTGCCACATTAGCTTGGAAAGCATTGGAAAAAGGTACTGTTGCTAAAGAAGGTAAAGCAGAAGGTACGACTGAAGAAGAATAGAATGCTGTTAATCATAGATGATTTTGATATTAGACATATAAAAGTATAAAAATTTTTATAAGATGTCATGTCATTGTTATAATATGGTTTACATCATGAATTAAAAACTTACGCACGCCGTTGTAAATATATTTTTAAGGAGTGATTGAAATGGCTAAAAAAGCACCTGATGTTGGGGATTATAAATATGGATTCCACGACGATGATGTGTCCATTTTCAGATCAGAACGTGGTTTAACTGAGAATATCGTTAGAGAAATTTCTAACATGAAAAATGAGCCGGAATGGATGTTAGATTTCCGTCTTAAATCATTAAAATTGTTTTATAAAATGCCAATGCCTCAATGGGGTGGCGACTTATCAGAATTGAATTTCGATGACATTACTTACTATGTAAAGCCTTCAGAACAAGCTGAACGTTCATGGGATGAAGTGCCAGAAGAAATTAAAAGAACTTTCGATAAATTAGGAATTCCTGAAGCTGAACAAAAATATTTAGCTGGCGTTTCTGCTCAATATGAATCTGAAGTTGTTTACCATAATATGGAAAAAGAACTTGAAGAAAAAGGTATTATCTTTAAAGATACAGATAGTGCTTTACAAGAAAATGAAGAATTATTCAAAAAATACTTTGCTTCTGTAGTACCTGCAGCAGATAACAAATTTGCGGCGTTAAACTCAGCAGTATGGTCAGGTGGTTCGTTCATTTATGTACCTAAAAATATCAAACTAGATACGCCACTACAAGCTTATTTCCGTATTAACTCTGAGAACATGGGTCAATTTGAACGTACATTAATCATTGCTGATGAAGGTGCTTCTGTACATTACGTAGAAGGCTGTACTGCACCAGTTTATACAACTAGTTCTTTACACTCTGCTGTTGTGGAAATCATTGTGCATAAAGATGCGCACGTTCGTTATACTACGATTCAAAACTGGGCGAACAATGTATACAACTTAGTTACGAAACGTACTTTTGTTTATGAAAACGGAAATATGGAATGGGTAGATGGTAACTTAGGTTCTAAGTTAACGATGAAATATCCAAACTGTGTTCTTTTAGGTGAAGGTGCAAAAGGTAGTACATTATCTATTGCATTTGCTGGTAAAGGACAAGTTCAAGATGCCGGTGCTAAAATGATTCATAAAGCGCCAAATACATCTTCAACGATTGTTTCTAAATCTATTTCTAAAAATGGTGGTAAAGTTATTTATCGTGGTATTGTACATTTTGGACGTAAAGCAAAAGGTGCTCGTTCGAACATTGAATGTGATACTTTAATTTTAGATAACGAATCAACATCAGATACAATTCCATATAATGAAGTATTCAATGATCAAATTTCATTAGAACACGAAGCGAAGGTTTCAAAAGTTTCTGAAGAGCAATTATTCTATCTAATGAGTCGTGGTATTTCTGAAGAAGAAGCGACAGAAATGATTGTTATGGGATTCATCGAACCATTTACAAAAGAACTTCCAATGGAATACGCGGTCGAAATGAACCGTTTAATCAAGTTCGAAATGGAAGGTAGCATTGGATAGCTTTAAACCGCGTTGTTAAGCCATTCTTGACTTCCGAAAATGGCTATTGATACCATTTTGATACCATTTACTTGTCAAAAATGGCTATTGCATCGTGTTTTTTCTGAGTATATAAATGGCTGTAAGTGCCCATCGTTTCAGTGATTTGAGCGTGTCTCATAAGTGACTGTAAAACGAAAATATCTACACCATTATTTGCAAGATAAGATGCATAAGAATGTCTTAACGCGTGAATGTTATAATGGGGGAAAGCTTTTTGGAATTTCTTTTGAACATGACTGTAATGTTTGGGAGCCATTCCTCCGAAAATAAAATAACTACGTTCATCAAAATATTTGTTTAACTCTTTTTCACGTTGGTGTCGTTCAGTTAACATTGTATTGATGAATTTAGGTAAAGGAACAATATCCTCTGAACTATCTGTTTTTGGTCTCGGATATATAGTTCTATTAGAGATGTCCATTGTTTTATTTATGGATATCTCTTTTTTATATTTATTGTAGTCTGTCCAAACAAGCGCCATAGCTTCGCCAATCCTCAAACCTGTATAAAACATTAATGTAAATAACTCTCTGTAATCTTGCTCTTCAATGTCTTTGATTCTTTCTTCAAATTCTTCACGCATCATAAACTTAGGTTTTGATTTTACACGCGGAATAGGTTTAATTGATATTGTTGGATCTGTACGTAATCCAAAGTATTTTTTGGCATAATTAATTACAACTTTAAAACCTGACCAAATTGTACGAGCAGAATTTGTTGATGCTACATTCTCTATTAGATATTTACGAAACTCTTGGCATTGATTTTGCGTTATCTTATTCATTTTTATGTGCCCGAACTTAGCTTTAAAATGTTTATGATATTCATTTTGTTTGCGTCGTTTTGTTTTAGGTCTCAAATCGCTATTTTCTAAATAGTGATGAAAAACATAATCAAATGTTTTTGAATCGCTATATCCTTCGTTTACATCATTCAAAAAAATAGCCTCTGCACTCTTAGCTTCACGCTTAGTTGAAAAACCGCGTTGCATCTTACGTTTGTTATTACCGTATACATCTTTATATCTAATGGAAAAATACCATTTACCTGTATTATCATCCTTATATACTGGCATTTTGCTTCTCCCTCCTCAAAATTGGCAAAAAATAATAAGGGTAGGCGGGCTACCCGAAATTTTATTGTGAAGTTAAATAGTAACCTCTAATTGCTGGTAATTCGTTTATAGAAATATTTGAATTTTCATTTACATGTGCAATTAATATTTCACAAAAATCATTACAAATTTTTTCACTTACAGAAACGAATGAAGAAACATCAGCAAAGAATATTTTCTTCAATACACTTAAGTTAATATCTTCAACCAAAAGTAAATCTTCGTAATATTCGAGACTTTCGGAGTCAATATAAAATATGTCTAAGATTTTTCTTTCTACAAACCCGTTTCTTATGTTAAATTTTAAATGTTCTAAGCTTTGAACAAATCCTAAATAAATTCCGTAATTTGTATACTTACGTACTATCAATTTATCTTTCTTAATTGATTTATAATAGTGTGTTAGATTATGAACTATATTTTTTGTTTCATGTATATTCTTTTCGTTGTTTTCAATTAATTTCAAATATATGAACTCTATTTTGTCAGTAATATTATATTGATTTTCAACTAATTTATGTGCAACTGCTAAATTTACTATATAAGGTCTATAGAAAAAATGGGGCACGTAATTAGTATCTTCTATAAGTTTTTCACCC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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE40279.1|840980_842222_+	Selenocysteine lyase	Q2XUY6	environmental_halophage	1.1e-110	44.8
SQE40280.1|842211_842676_+	Iron-sulfur cluster assembly scaffold protein IscU	NA	NA	NA	NA
SQE40281.1|842826_844224_+	Scaffold protein sufB	NA	NA	NA	NA
SQE40282.1|844291_845341_-	Integrase	A0A0H4ISP4	Staphylococcus_phage	1.7e-202	99.7
SQE40283.1|845402_846644_-	SAP domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
SQE40284.1|846688_847363_-	phage protein	A0A0F6N3H6	Staphylococcus_phage	2.9e-118	92.4
SQE40285.1|847379_847712_-	Transcriptional regulator, Cro/CI family helix-turn-helix domain protein	R4IH08	Staphylococcus_phage	2.0e-56	98.2
SQE40286.1|847973_848168_+	helix-turn-helix domain protein	A0A0F6N3M9	Staphylococcus_phage	7.7e-24	93.8
SQE40287.1|848167_848941_+	anti-repressor	Q4ZCB0	Staphylococcus_virus	1.3e-125	87.9
SQE40288.1|848941_849166_+	phage protein	A0A0F6N4M2	Staphylococcus_phage	3.2e-34	100.0
SQE40289.1|849205_849655_+	phi PV83 orf 10-like protein	A0A0H3U2S4	Staphylococcus_phage	2.3e-79	100.0
SQE40290.1|849671_849890_+	phage protein	A0A0F6N3I2	Staphylococcus_phage	9.5e-31	98.6
SQE40291.1|849882_850044_+	phage protein	A0A1P8L6G0	Staphylococcus_phage	1.9e-20	100.0
SQE40292.1|850136_850397_+	putative phi PVL-like protein	A0A2I6PDH1	Staphylococcus_phage	2.6e-43	100.0
SQE40293.1|850405_850669_+	phage protein	A0A2I6PDG2	Staphylococcus_phage	7.7e-43	100.0
SQE40294.1|850671_852621_+	Uncharacterized conserved protein	R9QT82	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.2
SQE40295.1|852622_853543_+	recombinase, phage RecT family protein	A0A2I6PDH5	Staphylococcus_phage	2.3e-166	100.0
SQE40296.1|853755_854241_+	Metallo-beta-lactamase superfamily domain protein in prophage	A0A1P8L6F7	Staphylococcus_phage	2.7e-86	99.4
SQE40297.1|854241_854712_+	Single-stranded DNA-binding protein, phage associated	I1W659	Staphylococcus_phage	5.3e-79	97.4
SQE40298.1|854741_855626_+	Phage protein	S4V6D4	Staphylococcus_phage	6.2e-137	96.3
SQE40299.1|855632_855851_+	phage protein	A0A2I6PDG4	Staphylococcus_phage	1.0e-37	100.0
SQE40300.1|855859_856264_+	endodeoxyribonuclease RusA family protein	O80087	Staphylococcus_phage	1.4e-72	99.3
SQE40301.1|856276_856648_+	PVL ORF-50-like family protein	A7TWA7	Staphylococcus_phage	1.3e-56	99.2
SQE40302.1|856648_856897_+	phage family protein	W5R983	Staphylococcus_phage	1.5e-40	97.6
SQE40303.1|856937_857186_+	Phage protein	A0A2H4PQK1	Staphylococcus_phage	4.5e-37	95.1
SQE40304.1|857178_857688_+	dUTP pyrophosphatase	A0A1X9H051	Staphylococcus_phage	2.5e-90	99.4
SQE40305.1|857724_857970_+	phage protein	A0A2I6PDW7	Staphylococcus_phage	5.0e-36	100.0
SQE40306.1|857966_858155_+	phage protein	A0A2I6PDV0	Staphylococcus_phage	2.1e-26	100.0
SQE40307.1|858129_858330_+	phage protein	A0A2I6PF22	Staphylococcus_phage	1.8e-28	100.0
SQE40308.1|858329_858506_+	transcriptional activator rinb-like protein	A0A0E3TAH3	Staphylococcus_phage	1.1e-21	94.7
SQE40309.1|858506_858872_+	phage protein	I1W652	Staphylococcus_phage	2.8e-59	99.2
SQE40310.1|858872_859019_+	phage protein	B2ZYX7	Staphylococcus_phage	2.2e-15	100.0
SQE40311.1|859042_859465_+	phage transcriptional activator RinA	A0A0F6N3E5	Staphylococcus_phage	1.2e-74	100.0
SQE40312.1|859795_860290_+	phage protein	A0A0N9BAX3	Staphylococcus_phage	3.4e-84	100.0
SQE40313.1|860282_861506_+|terminase	phage terminase, large subunit, PBSX family	A0A0N9BAX9	Staphylococcus_phage	7.5e-242	100.0
SQE40314.1|861502_862927_+|portal	phage portal protein, SPP1 family	Q4ZBZ7	Staphylococcus_virus	1.2e-270	99.6
SQE40315.1|862895_863849_+|head	phage minor head protein	A0A0N7E0U6	Staphylococcus_phage	7.3e-176	99.1
SQE40316.1|863850_864057_+|tRNA	putative seryl-tRNA synthetase	A0A2H4JAK3	uncultured_Caudovirales_phage	1.4e-28	100.0
SQE40317.1|864159_864744_+	phage protein	A0A0N7E0U8	Staphylococcus_phage	1.4e-73	96.4
SQE40318.1|864760_865675_+|capsid	phage major capsid protein, HK97 family	A0A0H3U2U7	Staphylococcus_phage	1.2e-170	100.0
SQE40319.1|865686_865830_+	phage protein	A0A0E3XC49	Staphylococcus_phage	4.6e-18	100.0
SQE40320.1|865835_866186_+|head,tail	phage gp6-like head-tail connector family protein	A0A0H3U2R5	Staphylococcus_phage	1.9e-60	100.0
SQE40321.1|866197_866533_+|head,tail	putative head-tail adaptor	A0A0E3TAH8	Staphylococcus_phage	8.8e-60	100.0
SQE40322.1|866519_866927_+	phage protein	A0A0E3T8J0	Staphylococcus_phage	1.7e-73	99.3
SQE40323.1|866939_867365_+	phage protein	A0A0E3XBP2	Staphylococcus_phage	1.2e-74	100.0
SQE40324.1|867365_867923_+|tail	putative tail protein	Q4ZBQ8	Staphylococcus_phage	8.2e-103	100.0
SQE40325.1|867989_868496_+	phage family protein	Q4ZBQ7	Staphylococcus_phage	2.7e-92	100.0
SQE40326.1|868540_868825_+	phage protein	A0A0N7E0V9	Staphylococcus_phage	8.8e-45	100.0
SQE40327.1|868828_871714_+	phage tape measure protein	A1KXA6	Staphylococcus_virus	0.0e+00	99.6
SQE40328.1|871728_872670_+|tail	phage tail family protein	A1KXA7	Staphylococcus_virus	4.8e-180	99.4
SQE40329.1|872680_874567_+	GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein	A0A0H3U2R3	Staphylococcus_phage	0.0e+00	100.0
SQE40330.1|874579_876478_+	phage protein	A0A0H3U448	Staphylococcus_phage	0.0e+00	98.4
SQE40331.1|876477_878301_+	phiETA ORF57-like protein	A0A0E3XBS0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	98.8
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SQE40333.1|878678_878861_+	phage protein	A0A2H4PQV2	Staphylococcus_phage	1.9e-29	100.0
SQE40334.1|878901_879201_+	hypothetical phage-related protein	A0A2I6PER2	Staphylococcus_phage	2.0e-31	100.0
SQE40335.1|879337_881212_+	mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase	A0A2I6PCX0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.0
SQE40336.1|881224_882397_+|tail	phage tail fiber protein	B2ZZ03	Staphylococcus_phage	1.9e-197	99.7
SQE40337.1|882402_882798_+	phi ETA orf 63-like protein	A0A2H4PQP8	Staphylococcus_phage	2.1e-68	100.0
SQE40338.1|882853_883291_+|holin	holin, phage phi LC3 family	A0A2H4PQP0	Staphylococcus_phage	1.5e-72	99.3
SQE40339.1|883271_884717_+	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase family protein	Q4ZB16	Staphylococcus_virus	9.1e-295	99.6
SQE40340.1|884983_885112_+	Uncharacterised protein	A0A0F6N3H2	Staphylococcus_phage	1.1e-15	100.0
SQE40341.1|885182_885293_+	Uncharacterised protein	W5R8J7	Staphylococcus_phage	3.8e-12	97.2
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Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>LS483302|1039704:1048177|DBSCAN-SWA
AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAGACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACAACGCTACCAGTTATTGGAGTACCAATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTCTAGATTCTTTATTATCTATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAATGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAAGTCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAGTATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGCTGTATTGGATCCTGCTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCTAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAAGTTGTCCCATTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATCAAGAAAGAAGTATCACTTACTGTTACAAGAGGAGACAACAATCAAATCACTTATTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAAGCGTGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAAGCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAACAGAAAAATGGGTCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGTGCTAAGAAAGACACAATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAGCAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTTCGTAATATTGCTAGCGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTGGAATTTTTCTATAAAAATGATGCATTAAATGATCCTTTGATTACAGATGATCACATCAAATTACTGAATATTGCGACAGATAAAGATATTGAAACATTAAAAACGAAAGCGCTAGAAATTAATCAAGTATTAAAACAATTAATGGATGCGATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGGTCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGATTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTGTTAGATGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCTGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATTGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCATTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGTGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAGCTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAACCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTGTGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGTTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGTCCAGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATCGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAATCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATACCAAGGGGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAGCAAAACCAACGATTACTTAAAGGTGTTGTTAAAGGGATTGGTGGCTACGGTAACTGTATTGGTATACCAACAACAGCTGGTGAAATTGAATTTGATGAACGATACGATGGCAATCCACTAGTTAATGCAATGTGCGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCTTCTGAAATGGCAGCAAAAGGTGGCAGTGGTTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTACGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTTACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGAAGACGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAAATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAACATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGACCAACAAGTTGGTGCTAATACGATAATTAAGCCAGGACTTCAAGCATCGGTAGTTCGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGTAATTTAATTGCGGTTGGAGCTACACCATTAGCAATGACTGACTGCTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATTTATCAACAGCTGATAGATTCAACGAAGGGTATGGCAGAAGCATGCGAAATTCTTAAGACACCAGTAGTTTCTGGTAATGTATCTTTATATAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCAACACCAGTTGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTGAACCTCAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGAAAAGTTAATTTATGGCAAAGTTAATCATGAATATGAGTCATTAGATTTGAGTTCAGAAGTTGAAAAAGGTGAATCAATCAAGACCGCTATTCGTGAAGGACTATTATCACATGTTCAAACAGTTGGTAAAGGTGGCTTACTGATTACCTTAGCTAAACTAAGTGCGCATTACGGTTTAGGATTAAAGTCTTCAATAGATATAACAAATGCACAATTGTTTAGTGAGACACAAGGCCGATATGTTGTTTCTGTTAAATCAGGTAAAACTTTAAATATTGATAATGCAATAGAAATTGGACTTTTAACAGATAGTGATAATTTCAAAGTAACAACACCATATACAGAGATTAGTGAAAATGTTTCAGATATTAAACAAATATGGGAAGGGGCAATTGCTCAATGTTTAACTACTCAGGATTAAACGAAGAATGTGGCGTGTTTGGTATTTGGAATCATCCTGAAGCAGCGCAACTAACATATATGGGACTTCATAGTTTGCAACATCGTGGTCAAGAAGGTGCAGGTATAGTTGTTTCTGATCAAAATGAATTAAAAGGCGAGCGAGGATTAGGCTTACTAACTGAAGCGATTAAAGATGACCAAATGGAACGATTAAAAGGATATCAACATGCAATTGGTCACGTCCGTTATGCTACTTCAGGTAATAAAGGTATTGAAAATATTCAACCGTTTCTGTATCACTTTTATGATATGAGTGTAGGTATTTGTCATAATGGTAACCTCATTAATGCTAAATCATTACGTCAGAATTTAGAAAAACAAGGTGCTATCTTCCATTCGTCTTCTGATACTGAAGTCATTATGCATTTGATACGTCGAAGTAAAGCTCCTACTTTTGAGGAAGCGTTGAAAGAAAGTTTGCGAAAAGTTAAAGGCGGTTTTACATTTGCGATTTTAACTAAAGATGCGTTATATGGCGCAGTAGATCCAAATGCTATCAGACCTCTTGTTGTAGGTAAAATGAAAGATGGTACATACATCCTTGCAAGTGAAACATGTGCAATAGATGTGTTAGGTGCAGAATTTGTTCAAGATATTCATGCAGGTGAATATGTCGTGATTAACGATAAAGGTATTACAGTTAAATCCTATACACATCATACGACAACTGCAATTTCTGCGATGGAATATATTTATTTTGCGAGACCAGACTCAACAATAGCTGGTAAAAATGTCCATGCAGTACGTAAAGCTTCTGGTAAAAAATTAGCCCAAGAAAGCCCTGTAAACGCTGATATGGTCATCGGTGTACCCAATTCATCGCTATCAGCGGCGAGTGGTTATGCTGAAGAAATAGGTTTGCCATATGAAATGGGACTAGTTAAAAATCAATATGTTGCAAGAACATTTATTCAACCAACTCAAGAATTACGTGAGCAAGGTGTGAGGGTGAAGTTATCTGCGGTAAAAGATATAGTAGATGGGAAAAATATCATTCTTGTTGATGATTCCATTGTTCGCGGTACGACAATTCGACGCATTGTGAAAATGTTAAAAGATTCTGGTGCAAATAAAGTGCATGTGCGTATAGCATCACCGGAATTTATGTTCCCAAGTTTTTATGGAATCGATGTTTCAACTACGGCAGAATTAATTTCTGCAAGCAAATCACCTGAAGAAATTAAAGATTATATTGGCGCTGATTCATTAGCATATCTATCTGTAGATGGGTTAATTGAATCAATTGGTTTAGATTATGACGCGCCATATAGTGGTTTATGTGTAGAAAGTTTCACTGGAGATTATCCTGCAGGATTATATGATTATGAAGCAAATTATAAAGCACATTTAAGTCATCGACAAAAGCAATATATTTCTAAAAACAAACACTTTTTTGATAGCGAGGGAAATTTAAATGTCTAAAGCATATGAACAATCTGGTGTAAATATTCATGCTGGTTATGAAGCTGTAGAAAGAATGTCTAGTCATGTTAAACGTACGATGCGTAAAGAAGTTATTGGTGGTTTAGGTGGATTCGGTGCTACATTTGATTTATCACAATTAAATATGACAGCGCCAGTTTTAGTTTCTGGAACAGACGGAGTAGGTACGAAATTAAAACTAGCTATCGACTATGGTAAACATGATTCGATAGGTATCGATGCAGTTGCAATGTGTGTTAATGATATTTTAACGACAGGTGCAGAACCATTGTATTTTTTAGATTATATCGCTACAAACAAAGTTGTTCCTGAAGTTATTGAACAAATTGTTAAAGGTATTAGTGATGCATGCGTTGAAACGAATACTGCACTTATCGGTGGAGAGACTGCTGAAATGGGTGAAATGTATCACGAAGGCGAATATGATGTAGCCGGATTTGCTGTTGGAGTAGTTGAAAAGGATGACTATGTAGATGGTTCAGAAGTAAAAGAGGGACAAGTTGTTATAGGGCTTGCGTCAAGTGGCATTCATTCAAACGGATACAGTTTAGTGCGTAAATTAATTAATGAATCAGGCATTGATTTGGCATCAAACTTCGATAATCGTCCATTTATAGATGTCTTTTTAGAACCAACTAAATTATATGTCAAACCTGTACTTGCTTTGAAAAAAGAAGTTTCTATTAAGGCAATGAATCATATTACTGGTGGAGGTTTTTATGAAAATATTCCACGTGCATTGCCAGCCGGATATGCTGCTAGAATTGATACTACATCATTTCCAACGCCAAAAATATTTGATTGGTTACAACAGCAAGGCAATATTGACACAAATGAAATGTATAACATTTTTAATATGGGTATTGGCTATACAGTTATCGTTGATGAAAAAGATGCATCACGCGCATTGAAGATTTTAGCCGAACAAGATGTGGAAGCCTATCAGATTGGTCATATTGTGAAAAATGAGTCAACTGCAATTGAATTGTTGGGGGTATAACAATGGTTAAAATTGCGATTTTTGCATCTGGTTCAGGAAGTAACTTTGAAAATATAGTTGATCATGTTGAATCAGGAAAACTTGAAAATATTGAAGTTACGGCGCTATATACGGATCATCAAAATGCGTTTTGTATAGATAGAGCAAAAAAGCACGATATACCTGTGTATATTAATGAACCAAAACAATTTGATTCAAAAGCAGCGTATGAACAACATTTAGTAACTTTATTAAATAAAGATAAGGTAGAGTGGATTATTTTAGCTGGCTACATGCGTCTAATTGGTCCAGACTTATTAGCTTCATTTGAAGGTAAAATATTGAATATACATCCATCTCTATTGCCGAAATATAAGGGGATTGACGCAATAGGCCAAGCATATCATAGTAGCGATACTATTACTGGTTCGACAGTACATTATGTTGATAGTGGTATGGATACGGGAGAAATTATTGAACAGAGACAATGTGATATTAGACCGGACGATTCAAAAGAACAATTAGAAGAGAAAGTAAAAAAATTGGAATATGAGTTATATCCAAGTGTTATTGCTAAAATTGTAAAATAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_5

>LS483302|1039704:1048177|1045102_1046587_+|SQE40487.1|DBSCAN-SWA
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MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGDNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQALPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDNRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN
>LS483302|1039704:1048177|1047610_1048177_+|SQE40489.1|DBSCAN-SWA
MVKIAIFASGSGSNFENIVDHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSSDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK

Homologous phage analysis in the prophage region

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SQE40481.1|1039704_1040187_+	AIR carboxylase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	6.8e-21	44.0
SQE40482.1|1040173_1041298_+	phosphoribosylaminoimidazolesuccinocarboxamide synthase	NA	NA	NA	NA
SQE40483.1|1041301_1042006_+	Phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase	M4R1E8	Synechococcus_phage	3.6e-47	41.6
SQE40484.1|1042005_1042269_+	Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, PurS subunit	NA	NA	NA	NA
SQE40485.1|1042270_1042942_+	Phosphoribosylformylglycinamidine synthase	NA	NA	NA	NA
SQE40486.1|1042934_1045124_+	Phosphoribosylformylglycinamidine synthase, synthetase subunit	A6N228	Microbacterium_phage	3.5e-141	39.8
SQE40487.1|1045102_1046587_+	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	3.2e-45	31.7
SQE40488.1|1046579_1047608_+	Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase	Q58MH8	Prochlorococcus_phage	1.5e-62	41.7
SQE40489.1|1047610_1048177_+	Phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	4.0e-28	39.0

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>LS483302|1237910:1309325|DBSCAN-SWA
AATGACTCAAACTGTAAATGTAATAGGTGCTGGTCTTGCCGGTTCAGAAGCGGCATATCAATTAGCTGAAAGAGGAATTAAAGTTAATCTAATAGAGATGAGACCTGTTAAACAAACACCAGCGCACCATACTGATAAATTTGCGGAACTTGTATGTTCCAATTCATTACGTGGAAATGCTTTAACTAATGGTGTGGGTGTTTTAAAAGAAGAAATGAGAAGATTGAATTCTATAATTATTGAAGCGGCTGATAAGGCACGAGTTCCAGCTGGTGGTGCATTAGCAGTTGATAGACACGATTTTTCAGGTTATATTACTGAAACACTCAAAAATCATGAAAATATCACAGTTATTAATGAAGAAATTAATGCCATTCCAGATGGATACACAATTATCGCAACAGGACCACTTACTACAGAAACGCTTGCGCAAGAAATAGTGGACATTACTGGTAAAGATCAACTTTATTTCTATGATGCGGCTGCTCCAATTATTGAAAAAGAATCTATTGATATGGATAAAGTTTACTTAAAGTCCCGTTATGATAAAGGTGAAGCTGCATATTTAAACTGTCCTATGACTGAAGATGAATTTAATCGCTTTTATGATGCAGTATTAGAAGCTGAAGTTGCACCTGTAAATTCATTTGAAAAAGAAAAATATTTCGAGGGTTGTATGCCTTTTGAAGTAATGGCAGAACGCGGGCGCAAGACATTACTATTTGGACCAATGAAACCAGTAGGATTAGAAGATCCAAAGACTGGGAAACGTCCTTATGCAGTGGTTCAATTAAGACAAGATGACGCTGCTGGCACACTCTACAATATTGTCGGCTTCCAAACACATTTAAAATGGGGAGCTCAAAAAGAAGTTATTAAATTAATTCCAGGCTTAGAAAATGTTGATATTGTTAGATATGGTGTGATGCATAGAAATACCTTCATTAACTCACCGGACGTATTAAACGAGAAATATGAATTGATTTCACAACCAAACATACAGTTTGCAGGACAAATGACTGGTGTTGAAGGTTACGTAGAAAGCGCAGCTAGCGGCTTAGTTGCAGGCATCAATCTTGCGCATAAAATATTGGGCAAAGGTGAGGTAGTATTTCCGAGAGAAACTATGATTGGAAGTATGGCTTACTATATTTCTCATGCTAAAAATAATAAGAATTTCCAACCTATGAATGCTAACTTCGGGTTATTACCATCTTTAGAAACTAGAATTAAAGATAAAAAAGAACGCTATGAAGCACAAGCTAATAGAGCTTTGGATTACTTAGAAAATTTCAAAAAAACTTTATAAAATAGTTAGAAAGACTAGATATGCTATTCATTCTTAAGTCATCAACGAGTAAGTAATGACTTTCTAAATGGAAAATACTTATCCTAGTCTTTTTAATTTTGGAATTGTTACGTATTTCTGACAATTTAGAATTCGTATTCAAAAAAATATCTAAATAAATAACACGCAATAAGTTGATTGATGTAACATGTAAGAGAATGTTTTAAATAAACTTTATTTAAAAGACAATGAAATAATAAATGGCAAGGCTATTAATAAAGACTTTTAGTAATTAATTTAAAAAAGAGGTATTCTAATTAACAGGTTTTCCGATTAGTTACAATTATTTAATTCTCAAAAGATTTAGAATTGATTATCAAATTACTGTAAGCCCTTTGCTGTATATGCTACAATTCTTATTGATGGAGGGTAAATGTATTGAATCATATTCAAGAAGCGTTTTTAAATACATTGAAAGTTGAACGGAATTTTTCGGAACATACATTGAAATCATATCAAGATGACTTAATTCAGTTTAATCAATTTTTAGAACAAGAACATTTACAGTTGAATACTTTTGAATACAAAGATGCTAGAAATTATTTGAGCTATTTATATTCAAATCATTTGAAAAGAACATCTGTTTCTCGTAAAATCTCAACGTTAAGAACTTTCTATGAATATTGGATGACGCTTGATGAGAACATTATTAATCCATTTGTTCAATTAGTACATCCGAAAAAAGAAAAATATCTTCCGCAATTCTTTTACGAAGAAGAAATGGAAGCGTTATTTAAAACTGTAGAAGAGGACACTTCAAAAAGTTTACGGGATCGAGTTATTCTTGAATTGTTATATGCTACAGGTATCCGTGTTTCGGAATTAGTTAATATTAAAAAACAAGATATAGATTTTTACGCGAATGGTGTTACCGTATTAGGAAAAGGGAGCAAAGAGCGCTTTGTACCGTTTGGTGCTTATTGTAGACAAAGCATCGAAAATTATTTAGAACATTTCAAACCAATTCAGTCGTGCAATCATGATTTTCTTATTGTAAATATGAAGGGTGAAGCAATCACTGAACGCGGTGTACGATATGTTTTAAATGATATTGTTAAACGAACAGCAGGCGTAAGTGAGATTCATCCCCACAAGCTCAGACATACATTTGCAACGCATTTATTGAATCAAGGTGCAGACCTAAGAACAGTACAATCGTTATTAGGTCATGTTAATTTGTCAACAACTGGTAAATATACACACGTATCTAACCAACAATTAAGAAAAGTGTATCTAAATGCACATCCTCGAGCGAAAAAGGAGAATGAAACATGAGTAATACAACATTACATGCAACAACTATTTATGCTGTAAGACATAATGGGAAAGCAGCTATGGCTGGAGATGGTCAAGTAACGCTTGGTCAACAAGTCATCATGAAACAAACGGCAAGAAAAGTGCGACGTTTATATGAAGGTAAAGTGTTAGCTGGTTTCGCAGGTAGTGTAGCAGATGCGTTTACGTTATTTGAAAAATTCGAAACAAAATTACAGCAGTTTAGTGGTAACTTAGAAAGAGCTGCTGTTGAATTGGCACAAGAATGGCGAGGCGATAAACAATTACGTCAATTAGAAGCTATGCTAATTGTAATGGATAAAGATGCTATTTTAGTTGTCAGTGGAACTGGCGAAGTTATTGCCCCAGATGATGACCTTATCGCTATTGGATCAGGAGGCAACTACGCATTAAGCGCAGGACGTGCATTGAAGCGCCATGCATCGCATTTGTCTGCTGAAGAAATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATATGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGTAAAGTGGCAATTGCCCTACGTAATCGATACAGAAGAAGTTTATTAGATGAGGAATCAAAGCAAGAAATTTCACCTAAAAATATTTTGATGATTGGACCAACCGGCGTTGGTAAAACTGAAATTGCAAGAAGAATGGCCAAAGTTGTCGGCGCGCCATTTATAAAAGTAGAAGCTACTAAATTTACTGAGGTAGGTTATGTAGGACGAGATGTTGAAAGTATGGTTAGAGATCTTGTTGATGTTTCAGTAAGATTAGTCAAGGCGCAGAAAAAATCATTGGTACAAGATGAAGCAACAGCTAAGGCCAATGAAAAACTTGTTAAGTTATTAGTTCCAAGTATGAAAAAGAAAGCGTCTCAAACGAATAATCCTTTAGAGTCACTTTTCGGAGGTGCAATTCCAAATTTCGGACAAAATAATGAAGATGAAGAAGAACCACCTACTGAGGAAATTAAAACAAAACGTTCTGAAATTAAGAGACAGCTAGAAGAAGGCAAACTTGAAAAAGAAAAGGTAAGAATTAAAGTAGAACAAGATCCTGGTGCTTTAGGAATGCTAGGTACAAATCAAAATCAGCAAATGCAAGAGATGATGAATCAATTAATGCCTAAAAAGAAAGTTGAGCGAGAAGTTGCTGTTGAGACGGCAAGGAAAATCTTAGCTGATAGTTATGCGGATGAACTAATTGACCAAGAAAGCGCTAATCAAGAAGCGCTTGAATTAGCAGAACAAATGGGTATCATCTTTATAGATGAAATCGACAAAGTTGCGACGAATAATCATAATAGTGGTCAAGATGTCTCAAGACAAGGTGTTCAAAGAGATATTTTACCTATACTTGAAGGTAGCGTTATTCAAACCAAATATGGTACTGTGAATACTGAACATATGCTGTTTATAGGTGCTGGAGCTTTCCATGTATCTAAGCCGAGTGACTTGATACCAGAATTGCAAGGTCGTTTTCCGATTAGAGTTGAACTTGATAGTTTATCGGTAGAAGATTTTGTAAGAATTTTGACAGAACCAAAATTGTCATTAATTAAACAATATGAAGCATTGCTTCAAACAGAAGAAGTTACTGTAAACTTTACGGATGAAGCAATTACTCGCTTAGCTGAGATTGCTTATCAAGTAAATCAAGATACAGACAACATTGGTGCACGTCGACTTCATACAATTTTAGAAAAGATGCTAGAAGATTTATCATTCGAAGCACCAAGTATGCCGAATGCAGTTGTAGATATTACCCCACAATATGTTGATGATAAATTAAAATCAATTTCAACAAACAAAGATTTAAGTGCATTTATTCTATAAAAATATACAAAAGGAGAAAAATTCATGAGCTTATTATCTAAAACGAGAGAATTAAACACGTTACTTCAAAAACACAAAGGTATTGCGGTTGATTTTAAAGATGTAGCACAAACGATTAGTAGCGTAACTGTAACAAATGTATTTATTGTATCGCGTCGAGGTAAAATTTTAGGATCGAGTCTAAATGAATTATTAAAAAGTCAAAGAATTATTCAAATGTTGGAAGAAAGACATATTCCAAGTGAATATACAGAACGATTAATGGAAGTTAAACAAACAGAATCAAATATTGATATCGACAATGTATTAACGGTTTTCCCACCTGAAAACAGAGAATTATTCATAGATAGTCGTACAACTATCTTC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MFKKLINKKNTINNYNEELDSSNIPEHIAIIMDGNGRWAKKRKMPRIKGHYEGMQTIKKITRVASDIGVKYLTLYAFSTENWSRPESEVNYIMNLPVNFLKTFLPELIEKNVKVETIGFTDKLPKSTIEAINNAKEKTANNTGLKLIFAINYGGRAELVHSIKNMFDELHQQGLNSDIIDETYINNHLMTKDYPDPELLIRTSGEQRISNFLIWQVSYSEFIFNQKLWPDFDEDELIKCIKIYQSRQRRFGGLSEE
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MNIPNQITVFRVVLIPVFILFALVDFGFGNVSFLGGYEIRIELLISGFIFILASLSDFVDGYLARKWNLVTNMGKFLDPLADKLLVASALIVLVQLGLTNSVVAIIIIAREFAVTGLRLLQIEQGFVSAAGQLGKIKTAVTMVAITWLLLGDPLATLIGLSIGQILLYIGVIFTILSGIEYFYKGRDVFKQK
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MSLIKKKNKDIRIIPLGGVGEIAKNMYIVEVDDEMFMLDAGLMFPEDEMLGIDIVIPDISYVLENKDKLKGIFLTHGHEHAIGAVSYVLEQLDAPVYGSKLTIALIKENMKARNIDKKVRYYTVNNDSIMRFKNVNISFFNTTHSIPDSLGVCIHTSYGAIVYTGEFKFDQSLHGYYAPDIKRMAEIGEEGVFVLISDSTEAEKPGYNTPENVIEHHMYDAFAKVRGRLIVSCYASNFIRIQQVLNIASKLNRKVSFLGRSLESSFNIARKMGYFDIPKDLLIPITEVDNYPKNEVIIIATGMQGEPVEALSQMAQHKHKIMNIEEGDSVFLAITASANMEVIIANTLNELVRAGAHIIPNNKKIHASSHGCMEELKMMINIMKPEYFIPVQGEFKMQIAHAKLAAEAGVAPEKIFLVEKGDVINYNGKDMILNEKVNSGNILIDGIGIGDVGNIVLRDRHLLAEDGIFIAVVTLDPKNRRIAAGPEIQSRGFVYVRESEDLLREAEEKVREIVEAGLQEKRIEWSEIKQNMRDQISKLLFESTKRRPMIIPVISEI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE40666.1|1237910_1239218_+|tRNA	tRNA:m(5)U-54 MTase gid	NA	NA	NA	NA
SQE40667.1|1239635_1240532_+	Site-specific tyrosine recombinase	A0A0K2CP59	Brevibacillus_phage	4.6e-31	31.9
SQE40668.1|1240528_1241074_+|protease	ATP-dependent protease HslV	NA	NA	NA	NA
SQE40669.1|1241139_1242543_+	ATP-dependent endopeptidase hsl ATP-binding subunit	A0A1B2IDZ7	Erwinia_phage	4.9e-27	25.6
SQE40670.1|1242567_1243341_+	GTP-sensing transcriptional pleiotropic repressor codY	NA	NA	NA	NA
SQE40671.1|1243682_1244450_+	30S ribosomal protein S2	NA	NA	NA	NA
SQE40672.1|1244631_1245513_+	Translation elongation factor Ts	NA	NA	NA	NA
SQE40673.1|1245649_1246372_+	Uridylate kinase	NA	NA	NA	NA
SQE40674.1|1246390_1246945_+	Ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
SQE40675.1|1247317_1248088_+	Undecaprenyl pyrophosphate synthetase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	7.3e-25	41.5
SQE40676.1|1248094_1248877_+	Phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
SQE40677.1|1249088_1250375_+|protease	Membrane-associated zinc metalloprotease	NA	NA	NA	NA
SQE40678.1|1250394_1252098_+|tRNA	Prolyl-tRNA synthetase	NA	NA	NA	NA
SQE40679.1|1252355_1256672_+	DNA polymerase III subunit alpha	A0A0A8WJ41	Clostridium_phage	3.5e-23	41.2
SQE40680.1|1256961_1257429_+	Putative cytosolic protein	NA	NA	NA	NA
SQE40681.1|1257449_1258625_+	Transcription termination protein NusA	NA	NA	NA	NA
SQE40682.1|1258645_1258930_+	nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination	NA	NA	NA	NA
SQE40683.1|1258926_1259244_+	ribosomal protein L7Ae family protein	NA	NA	NA	NA
SQE40684.1|1259248_1261366_+	protein translation initiation factor 2 (IF-2)	E3T4N3	Cafeteria_roenbergensis_virus	2.4e-25	25.1
SQE40685.1|1261752_1262103_+	ribosome-binding factor A	NA	NA	NA	NA
SQE40686.1|1262272_1263190_+|tRNA	tRNA pseudouridine synthase B	NA	NA	NA	NA
SQE40687.1|1263204_1264176_+	Riboflavin kinase / FMN adenylyltransferase	A0A1V0SJE1	Klosneuvirus	1.7e-07	32.1
SQE40688.1|1264290_1264560_+	30S ribosomal protein S15	NA	NA	NA	NA
SQE40689.1|1267259_1268933_+	Zn-dependent hydrolase	NA	NA	NA	NA
SQE40690.1|1269187_1271557_+	DNA translocase FtsK	S5VNE3	Mycobacterium_phage	7.3e-84	47.7
SQE40691.1|1271561_1272275_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SQE40692.1|1272305_1273571_+|protease	Zinc protease	A0A1X9I714	Streptococcus_phage	2.0e-40	26.8
SQE40693.1|1273570_1274857_+	peptidase, M16 family	G3MBJ8	Bacillus_virus	6.7e-15	27.9
SQE40694.1|1274856_1275561_+	3-oxoacyl-[acyl-carrier protein] reductase	NA	NA	NA	NA
SQE40695.1|1275665_1276493_+	protein with ACT domain	NA	NA	NA	NA
SQE40696.1|1276511_1276904_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
SQE40697.1|1276937_1277516_+	CDP-diacylglycerol--glycerol-3-phosphate 3-phosphatidyltransferase	NA	NA	NA	NA
SQE40698.1|1277741_1278893_+	Competence/damage-inducible protein CinA	NA	NA	NA	NA
SQE40699.1|1279057_1280101_+	recombinase A	A0A0S2MVG1	Bacillus_phage	9.3e-124	69.2
SQE40700.1|1280454_1282014_+	Hydrolase (HAD superfamily)	NA	NA	NA	NA
SQE40701.1|1282311_1282527_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQE40702.1|1282700_1283498_+	Phosphoesterase family protein	NA	NA	NA	NA
SQE40703.1|1283637_1285398_+	2-oxoacid ferredoxin oxidoreductase subunit alpha	NA	NA	NA	NA
SQE40704.1|1285398_1286265_+	2-oxoglutarate oxidoreductase, beta subunit	NA	NA	NA	NA
SQE40705.1|1286357_1286651_+	Uncharacterized conserved protein	NA	NA	NA	NA
SQE40706.1|1286784_1288329_+|tRNA	tRNA-i(6)A37 methylthiotransferase	NA	NA	NA	NA
SQE40707.1|1288329_1288695_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQE40708.1|1288721_1289213_+	Substrate-specific component ThiWthiazole ECF transporter	NA	NA	NA	NA
SQE40709.1|1289515_1292134_+	DNA mismatch repair protein MutS	E3T5Q7	Cafeteria_roenbergensis_virus	3.8e-41	23.5
SQE40710.1|1292146_1294156_+	DNA mismatch repair protein MutL	A0A1B2LRQ5	Wolbachia_phage	3.1e-59	29.5
SQE40711.1|1294170_1294704_+	glycerol uptake operon antiterminator regulatory protein	NA	NA	NA	NA
SQE40712.1|1295178_1295997_+	Glycerol uptake facilitator protein	M1H4F4	Acanthocystis_turfacea_Chlorella_virus	3.1e-26	35.1
SQE40713.1|1296127_1297624_+	glycerol kinase	NA	NA	NA	NA
SQE40714.1|1297781_1299455_+	Glycerol-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
SQE40715.1|1299601_1300519_+	hydrolase	NA	NA	NA	NA
SQE40716.1|1300536_1301472_+|tRNA	tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase	NA	NA	NA	NA
SQE40717.1|1301486_1301720_+	RNA-binding protein Hfq	NA	NA	NA	NA
SQE40718.1|1301941_1302418_-	Glutathione peroxidase family protein	Q70H87	Fowlpox_virus	1.2e-22	38.0
SQE40719.1|1302529_1303768_+	GTP-binding protein	NA	NA	NA	NA
SQE40720.1|1303786_1305025_+	aluminum resistance protein, putative	NA	NA	NA	NA
SQE40721.1|1305268_1305637_+	FemC, factor involved in methicillin resistance / Glutamine synthetase repressor	NA	NA	NA	NA
SQE40722.1|1305655_1306996_+	glutamine synthetase	NA	NA	NA	NA
SQE40723.1|1308190_1308361_-|transposase	truncated transposase	NA	NA	NA	NA
SQE40724.1|1308357_1309002_-|transposase	transposase	A0A0C5AEB1	Paenibacillus_phage	4.5e-52	55.5
SQE40725.1|1309043_1309325_-|transposase	transposase	A0A0C5AJ30	Paenibacillus_phage	6.5e-24	64.5

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>LS483302|1582957:1591269|DBSCAN-SWA
ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATGGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTTGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGCTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAGCCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAGCATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGATCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAATCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAATGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCCTGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAGCCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAAAAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCTTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGCAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAACTTTCGGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCACCTGCAATACCGCAATCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTACCTTGTTTTAAAAATCGACTTACCGTCGTTAATCGGTTATTTAACGAAATCATTTTATTCTCCTTTATGAAAAAAGAGGTTGAACATTATTCAATGTACCAACCTCACTCAAGTTAAATCTTAATCTAAAAATAAATAAGCGCTTATTCATGTCTTGGTATCAATCATTAAAATTGATATAAATTAATCCATAAAGTCTTTCAAACGTTTACTACGACTTGGATGTCTTAATTTTCTAAGTGCTTTTGCTTCGATTTGTCGAATACGTTCACGTGTAACACCGAAAACTTTACCAACTTCTTCAAGTGTTCTTGTTCTACCGTCATCAAGACCAAATCTTAATCGTAATACATTTTCTTCTCTATCAGTTAATGTATCAAGCACATCTTCTAATTGCTCTTTTAATAATTCATAAGCAGCATGATCTGAAGGACTTTGTGCTTCCTGATCCTCAATAAAGTCTCCTAAATGACTATCATCTTCTTCACCAATTGGTGTTTCTAATGAAACAGGTTCTTGCGCAATTTTTAAAATTTCACGAACTTTTTCTGCTGGTAAATCCATTTCTTCACCAATTTCTTCTGGTGCTGGATCTCGACCTAAGTCCTGTAATAATTGACGTTGAACACGAATTAATTTATTAATTGTTTCTACCATATGCACAGGGATACGAATCGTACGTGCTTGGTCAGCAATTGCACGAGTGATTGCTTGTCTAATCCACCATGTTGCATATGTTGAAAATTTAAATCCTTTGTTAAAGTCAAATTTTTCAACAGCTTTAATAAGACCCATATTACCTTCTTGGATTAAATCAAGGAATAACATACCACGACCTACATATCTTTTAGCAATACTTACAACTAAACGTAAGTTCGCTTCTGCAAGTCTCGATTTTGCTACTTCATCACCTTGTTCAATACGTTTGGCTAATTCGATTTCTTCTTGTGCACTTAATAAGTTAACACGCCCAATTTCTTTAAGGTACATACGAACTGGGTCATTTATTTTAACACCTGGAGGGGCACTAAGATCACTTGGATTCAGTTTCTCGTCAGTATCTGAACTATCTTTTTCATTAACTAGTGAAATATCATTATCATTTAATTGATCAAAGAAATCATCCATTTGATCAGAGTCGATATCGAAATTCTGAAGTTTTTCAGCAATTTCTTCATGACTTAAATGACCCTCTTTTTTACCTTTTTCAATTAATTGCTTCTTAACATCTTCTAATGTTAATGTCGGATCAATTGTTTGTTTTTTAATTTTAACTGTGTTATCAGACATGAAACGGCCTCCCGATTTTAAATATGAACATTCGAAATTTATTCAATATTGCTATTTTAAACTAAATTCTTAATTAATTCATCCATATTTTTAATTTTATTTTACAAATAGGAACTAATCCCAATATTTATTTTTCAATAGTGTTGTTTAAATGCGGTAACTATCATTTACCCTTATACATTTTGACATAATCATTATTCGTATTATTCTTTAATACCACATGCTACATGCGTTCTTTATTCTTAGCAACAATTTGCTGTAAATAGTATTTCTGTAATTCTACATCGCCAATCCTTGTAGCTTCCCTTAATTTATGATTCAATGACTCAATGGTTTCTTGTCCGTTTTCATTAATAACATTGACATAATCATCAATTTCATTTTCATATGGTTCGTCATTCAAACTATATTGTTCTAGGCTAATTAATGTTTCTCTCAACTCATTTGAATTAACATACTGTACAGCATCACTGATATTATATTGATCATTTTCCGCATAAAAATCATGTAAGACTTCGAATACATATTTAAAATGCTGATTTGTGAAGTTATCCTTATCAACACTTTCATAATAATTTAAAAATGTATCTTTATCTCTCATTAAATGTTTTAAAAATGCTCGCTCTGCTTTTTCTTGACGGCTCAAATTGTCAAATTGTGCCATACCAATTGGCTCAGGTTCAATATAACCGCCATACTCATCTTCTGGATAATAATTGGCTGGTGCTTGATTGAATTGTATTTCGTTAGCTAATTGCTCAGGACTAACATTGAAAAATGGCGCAACATCATTTATAGCCTTTTGTTGTAGAATTGATGACTTCATAAATGAAATGTCATGACTCAGTTCTTTCAAATAACGTTCATATGAAAGGTCATTATGTGCAATTTCATCTTTTAATATACTCACTTTATAATGTGCAAATGACTTTTTGTCATTTTTTACAAAAGCAGTAAATGCGTCGTTGCCATACTTACCAATGTATTCATCAGGATCCATGCCAGATGGCAATTGTATAACAAATACATTTAGCCCTTGCTGTAACAAATGTTGACCTGTTTTAAGTGTTGCTTCACTACCCGCAAAATCCCCATCAAACATTAATGTTATATTTGATGTTAACTTTCGTATAAAGGTAATATGTTCATCTGACAACTGTGTACCCATTGTTGCAACAACGTTTTTCAAGCCAGCAGTATCAGATTTTATAACATCCATAAAACCTTCTAGTAATACAATTTCATCTAATTTTCTAATTGATTTACGCGCTTTATCTAAGTTGTATAACAACTTTCTTTTTTGAAAAATAGGTGTTTCAGGACTATTTAGGTATTTTGGTTCTTGACCGGTATATGTTCGACCTGAATATCCAACAATTCTTCCTTGCGCATTTTTCAAAGGAAACATAATACGATTTCGAAATCTATCGTAATAACTGAAGTTTTCTTCATTACGTGATAATAATCCGGCTTCATATGCTAATTCAATATCGTAACCCTTTTTTTGAAGAAAATCATGACAAAAATGTGAGCTATCGGGTGCAAAGCCAATGCCTCGCTCTTTAATAATCGCATCTGTAAAACCACGTTCTAGTAAGTATGTTAATGCTTGTTCGCCTTCGACTGTCTTTGTTAAAGCGTAATAGTAAAATTCTTGTATTAACTCATGCATTTCGATCATTTGTAAATCATCAGAAGCAATTTGAACATTTGAGTTAGATTGTGTTGCCTCAATATCTACAGCAACATTAACTCTATCACCTAATTCTTTAACCGCTTCAACAAATGATATGTCTTTAATTTCTTGAGTAAATTGAAAAACATTGCCACCTTTTTTACAACCAAAACAATGACAAATTTGTTTATCTTCAGAAACTGTAAATGAAGGTGTCTTTTCATCATGAAAAGGACACAAACCTATATAATTGCGTCCTCTCTTTTCTAATTTTACATATTCACTTACCAAGTCTAAAATGTCGGTTTTATCTTTTATTTCATTAATGATCGATTGATCTATTCGCAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

>LS483302|1582957:1591269|1587331_1588009_-|SQE40962.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCDCGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTESLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSAQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINEEIAVIERVL
>LS483302|1582957:1591269|1586228_1587329_-|SQE40961.1|DBSCAN-SWA
MKIADLMTFLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIQGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI
>LS483302|1582957:1591269|1583868_1584759_-|SQE40959.1|DBSCAN-SWA
MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ
>LS483302|1582957:1591269|1582957_1583743_-|SQE40958.1|DBSCAN-SWA
MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN
>LS483302|1582957:1591269|1584768_1586115_-|SQE40960.1|DBSCAN-SWA
MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG
>LS483302|1582957:1591269|1588139_1589246_-|SQE40963.1|DBSCAN-SWA
MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD
>LS483302|1582957:1591269|1589469_1591269_-|SQE40964.1|DBSCAN-SWA
MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLLERGFTDAIIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISFMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE40958.1|1582957_1583743_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	8.0e-19	28.3
SQE40959.1|1583868_1584759_-	endonuclease IV	A0A2H4UU70	Bodo_saltans_virus	2.0e-26	33.1
SQE40960.1|1584768_1586115_-	ATP-dependent RNA helicase YqfR	A0A1V0SIR5	Klosneuvirus	2.4e-55	34.0
SQE40961.1|1586228_1587329_-	NIF3 protein	A0A1S5V250	Saudi_moumouvirus	1.0e-08	30.6
SQE40962.1|1587331_1588009_-|tRNA	Putative tRNA-m1A22 methylase	NA	NA	NA	NA
SQE40963.1|1588139_1589246_-	RNA polymerase sigma factor RpoD	A0A2I7SAT0	Vibrio_phage	1.1e-37	38.1
SQE40964.1|1589469_1591269_-	DNA primase	A0A0K1LMQ9	Caulobacter_phage	1.3e-53	36.0

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>LS483302|1660761:1669802|DBSCAN-SWA
TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCACCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTTTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATTTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATTGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGTGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGTATATTTTTAATCGTTATGTCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTGTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGTCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCATTTCTGCCATTGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATTATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAGTCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAAATGTTGAAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAAGGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCGAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGCCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCTATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTTAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATCATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAAAGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCAGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTCGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAGTTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACTTTTCTTAGAGATTTCTTCTGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCTTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTATTACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATTGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAAAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCGTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCAGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGCGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATAATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATACGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATTAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCGGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCATAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATACGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATACATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTGCCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCATGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTTGCAACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATAGCACTTTCATCATCAATACCTGTGCCCAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGAGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTCGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

>LS483302|1660761:1669802|1666608_1667748_-|SQE41039.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF
>LS483302|1660761:1669802|1661301_1663575_-|SQE41036.1|DBSCAN-SWA
MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKAIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQHLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNNQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAEMKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIDNIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS
>LS483302|1660761:1669802|1663775_1666055_-|SQE41037.1|DBSCAN-SWA
MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKSDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGMMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV
>LS483302|1660761:1669802|1667770_1668796_-|SQE41040.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETANLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDYDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII
>LS483302|1660761:1669802|1666329_1666590_-|SQE41038.1|DBSCAN-SWA
MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS
>LS483302|1660761:1669802|1668797_1669802_-|SQE41041.1|DBSCAN-SWA
MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDDESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE
>LS483302|1660761:1669802|1660761_1661280_-|SQE41035.1|DBSCAN-SWA
MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATNKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLKMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE41035.1|1660761_1661280_-	Adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	1.2e-28	45.8
SQE41036.1|1661301_1663575_-	Single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ	A7KV88	Bacillus_phage	4.3e-65	29.7
SQE41037.1|1663775_1666055_-	Protein-export membrane protein secD / Protein-export membrane protein secF	A0A1B1IVP7	uncultured_Mediterranean_phage	1.8e-31	35.8
SQE41038.1|1666329_1666590_-	Preprotein translocase subunit YajC	A0A1B1IVR5	uncultured_Mediterranean_phage	8.2e-05	35.3
SQE41039.1|1666608_1667748_-|tRNA	queuine tRNA-ribosyltransferase	A0A1B1IVQ4	uncultured_Mediterranean_phage	5.4e-85	44.7
SQE41040.1|1667770_1668796_-|tRNA	S-adenosylmethionine--tRNA ribosyltransferase-isomerase	NA	NA	NA	NA
SQE41041.1|1668797_1669802_-	Holliday junction DNA helicase RuvB	B3GAM6	uncultured_virus	1.7e-05	29.1

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>LS483302|1793200:1855350|DBSCAN-SWA
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MQFDNIDSALMALKNGETIIVVDDENRENEGDLVAVTEWMNDNTINFMAKEARGLICAPVSKDIAQRLDLVQMVDDNSDIFGTQFTVSIDHVDTTTGISAYERTLTAKKLNDLSSEAKDFNRPGHLFPLVAQDKGVLARNGHTEAAVDLAKLTGAKPAGVICEIMNDDGTMAKGQDLQKFKEKHQLKMITIDDLIEYRKKLEPEIEFKAKVKMPTDFGTFDMYGFKATYTDEEIVVLTKGAIRQHENVRLHSACLTGDIFHSQRCDCGAQLESSMKYINEHGGMIIYLPQEGRGIGLLNKLRAYELIEQGYDTVTANLALGFDEDLRDYHIAAQILKYFNIEHINLLSNNPSKFEGLKQYGIDIAERIEVIVPETVHNHDYMETKKIKMGHLI

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE41144.1|1793200_1799749_-	putative surface anchored protein	A0A2H4PQU6	Staphylococcus_phage	2.9e-287	86.5
SQE41145.1|1800073_1800385_-	Rhodanese-like domain protein	A0A2H4PQR9	Staphylococcus_phage	6.9e-51	97.1
SQE41146.1|1800406_1802824_-|tRNA	Leucyl-tRNA synthetase	A0A2H4PQS0	Staphylococcus_phage	0.0e+00	98.7
SQE41147.1|1803111_1804293_-	Multidrug resistance protein	A0A2H4PQR6	Staphylococcus_phage	9.6e-218	99.7
SQE41148.1|1804402_1805356_+	Fe-S oxidoreductase	A0A2H4PQV5	Staphylococcus_phage	6.4e-79	99.3
SQE41149.1|1805352_1805916_+	SAM-dependent methyltransferase, MraW methylase family	A0A2H4PQV0	Staphylococcus_phage	4.1e-102	98.4
SQE41150.1|1806032_1806434_-	HTH-type transcriptional regulator rot	NA	NA	NA	NA
SQE41151.1|1807005_1807833_-	Lysophospholipase; Monoglyceride lipase; putative	NA	NA	NA	NA
SQE41152.1|1808066_1809068_+	Proline dehydrogenase (Proline oxidase)	A0A2H4PQT6	Staphylococcus_phage	9.0e-185	99.7
SQE41153.1|1809189_1809654_-	6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase	A0A2H4PQS3	Staphylococcus_phage	3.8e-69	98.1
SQE41154.1|1809666_1810848_-	3,4-dihydroxy-2-butanone-4-phosphate synthase	A0A2H4PQS2	Staphylococcus_phage	2.1e-225	99.5
SQE41155.1|1810858_1811491_-	Riboflavin synthase alpha chain	A0A2H4PQS5	Staphylococcus_phage	9.3e-111	98.1
SQE41156.1|1811497_1812541_-	5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil reductase	A0A2H4PQS8	Staphylococcus_phage	1.6e-195	98.5
SQE41157.1|1813022_1814525_-	pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein	A0A2H4PQX2	Staphylococcus_phage	2.3e-30	100.0
SQE41158.1|1815168_1815483_+	arsenical resistance operon repressor 2	A0A2H4PQT4	Staphylococcus_phage	1.3e-52	98.1
SQE41159.1|1815482_1816775_+	arsenical pump membrane protein	A0A2H4PQU3	Staphylococcus_phage	8.3e-215	93.5
SQE41160.1|1816861_1817716_-	peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase	Q4ZCC7	Staphylococcus_virus	9.8e-39	38.6
SQE41161.1|1817991_1818216_-	putative staphylococcal protein	NA	NA	NA	NA
SQE41162.1|1818414_1818885_+	DNA-binding protein	A0A2H4PQT5	Staphylococcus_phage	3.8e-69	85.2
SQE41163.1|1818997_1819441_+	comK family protein	NA	NA	NA	NA
SQE41164.1|1819427_1819871_-	membrane protein	A0A2H4PQT8	Staphylococcus_phage	8.4e-50	78.6
SQE41165.1|1820167_1820803_+|protease	CAAX amino terminal protease family protein	NA	NA	NA	NA
SQE41166.1|1820969_1821590_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQE41167.1|1822149_1822863_-	Transaldolase	M1PR54	Cyanophage	5.5e-19	35.3
SQE41168.1|1823121_1823424_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQE41169.1|1823678_1824044_+	CrcB family protein	A0A2H4PQR0	Staphylococcus_phage	1.4e-58	98.3
SQE41170.1|1824040_1824394_+	CrcB family protein	A0A2H4PQQ7	Staphylococcus_phage	1.4e-20	94.9
SQE41171.1|1824642_1825476_-	aldo/keto reductase family protein	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	1.6e-158	99.6
SQE41172.1|1825687_1826596_-	Uncharacterised protein	A0A2H4PQQ8	Staphylococcus_phage	9.8e-138	99.7
SQE41173.1|1826720_1827914_-	S-adenosylmethionine synthase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	2.2e-217	99.2
SQE41174.1|1828284_1829877_+	phosphoenolpyruvate carboxykinase	A0A2H4PQN1	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.8
SQE41175.1|1830171_1830942_-	Dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase	A0A2H4PQM6	Staphylococcus_phage	3.7e-138	96.4
SQE41176.1|1830922_1831402_-	phosphohydrolase	A0A2H4PQM4	Staphylococcus_phage	3.0e-85	99.4
SQE41177.1|1831461_1831719_+	Putative cytosolic protein	A0A2H4PQM5	Staphylococcus_phage	2.1e-45	98.8
SQE41178.1|1831715_1832717_-	O-succinylbenzoate synthase	A0A2H4PQM0	Staphylococcus_phage	5.9e-184	96.4
SQE41179.1|1832721_1834200_-	O-succinylbenzoic acid--CoA ligase	A0A2H4PQM9	Staphylococcus_phage	8.4e-280	95.9
SQE41180.1|1834358_1834841_-	putative lipoprotein	A0A2H4PQN7	Staphylococcus_phage	1.0e-77	95.9
SQE41181.1|1835152_1835767_+	endonuclease	A0A2H4PQM8	Staphylococcus_phage	8.7e-29	76.5
SQE41182.1|1835847_1836843_+	Telomeric repeat-binding factor 2	A0A2H4PQN2	Staphylococcus_phage	1.5e-70	95.6
SQE41183.1|1836918_1837542_+	lipoprotein	A0A2H4PQM7	Staphylococcus_phage	2.5e-76	82.7
SQE41184.1|1837582_1837924_+	Uncharacterised protein	A0A2H4PQN6	Staphylococcus_phage	1.3e-53	93.8
SQE41185.1|1838024_1838597_+	Uncharacterised protein	A0A2H4PQN4	Staphylococcus_phage	3.2e-25	94.8
SQE41186.1|1839116_1839293_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQE41187.1|1839303_1839687_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQE41188.1|1840076_1840370_-|transposase	transposase	A0A0C5AJ30	Paenibacillus_phage	3.3e-18	64.1
SQE41189.1|1841268_1842471_-	putative restriction and modification system specificity protein	A0A2H4PQP5	Staphylococcus_phage	3.0e-49	37.3
SQE41190.1|1842463_1844020_-	Type I restriction enzyme EcoprrI M protein	A0A2H4PQP4	Staphylococcus_phage	1.0e-283	98.1
SQE41191.1|1844110_1844215_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQE41192.1|1844372_1845092_-|protease	Serine protease splD	A0A2H4PQP1	Staphylococcus_phage	7.5e-125	94.6
SQE41193.1|1845257_1845737_-|protease	serine protease SplE	A0A2H4PQN5	Staphylococcus_phage	1.7e-85	96.2
SQE41194.1|1846139_1846856_-	serine proteinase	A0A2H4PQN5	Staphylococcus_phage	7.1e-83	62.2
SQE41195.1|1846979_1847699_-|protease	Serine protease splC	A0A2H4PQP7	Staphylococcus_phage	2.7e-122	92.9
SQE41196.1|1847756_1848479_-|protease	Serine protease splB	A0A2H4PQN0	Staphylococcus_phage	2.1e-119	90.4
SQE41197.1|1848597_1849305_-|protease	serine protease SplA	A0A2H4PQN3	Staphylococcus_phage	6.7e-126	95.3
SQE41198.1|1850271_1850841_+	beta-lactamase	A0A2H4PQH6	Staphylococcus_phage	1.7e-50	63.2
SQE41199.1|1851316_1851535_-	lantibiotic ABC transporter protein	A0A2H4PQH0	Staphylococcus_phage	1.4e-26	81.9
SQE41200.1|1851790_1852264_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQE41201.1|1852268_1853060_+	Domain of uncharacterised function DUF1828	NA	NA	NA	NA
SQE41202.1|1853429_1854413_-	Leukotoxin LukD	A0A2H4PQH7	Staphylococcus_phage	3.9e-180	95.4
SQE41203.1|1854414_1855350_-	Leukocidin S subunit lukE	A0A2H4PQI5	Staphylococcus_phage	2.0e-173	99.3

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

>LS483302|1937240:2026159|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10

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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE41272.1|1937240_1938668_-|tRNA	aspartyl/glutamyl-tRNA amidotransferase subunit B	NA	NA	NA	NA
SQE41273.1|1938680_1940138_-|tRNA	aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln) amidotransferase subunit A	NA	NA	NA	NA
SQE41274.1|1940139_1940442_-|tRNA	Aspartyl-tRNA(Asn) amidotransferase subunit C; Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C	NA	NA	NA	NA
SQE41275.1|1940808_1942347_+	Sodium/proline symporter	NA	NA	NA	NA
SQE41276.1|1942435_1943635_-	Lipoprotein (pheromone precursor)	NA	NA	NA	NA
SQE41277.1|1943647_1945651_-	DNA ligase	A0A0K2QQN8	Ralstonia_phage	4.4e-114	36.1
SQE41278.1|1945654_1947847_-	ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA	A7KV33	Bacillus_phage	1.0e-135	42.2
SQE41279.1|1947843_1948536_-	geranylgeranylglyceryl diphosphate synthase	NA	NA	NA	NA
SQE41280.1|1948707_1949010_-	His repressor	NA	NA	NA	NA
SQE41281.1|1949118_1950414_-	adenylosuccinate lyase	A0A1B3B081	Gordonia_phage	1.6e-16	32.9
SQE41282.1|1951260_1952427_+	Staphopain A precursor	NA	NA	NA	NA
SQE41283.1|1952457_1952784_+|protease	putative cysteine protease inhibitor (Staphostatin A)	NA	NA	NA	NA
SQE41284.1|1953074_1953248_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQE41285.1|1953228_1953831_-	Uncharacterized protein conserved in bacteria (DUF2179)	NA	NA	NA	NA
SQE41286.1|1954096_1954918_-	NH(3)-dependent NAD(+) synthetase	G3MA24	Bacillus_virus	8.8e-69	53.1
SQE41287.1|1954910_1956380_-	nicotinate phosphoribosyltransferase	G3MA18	Bacillus_virus	3.2e-106	44.3
SQE41288.1|1956563_1957640_+	nitric-oxide synthase	NA	NA	NA	NA
SQE41289.1|1957659_1958454_+	ACT domain protein	NA	NA	NA	NA
SQE41290.1|1958643_1960206_-	sodium-dependent dicarboxylate transporter sdcS	NA	NA	NA	NA
SQE41291.1|1960410_1961508_-	cell wall surface anchor family protein	U5PWM6	Bacillus_phage	4.3e-47	34.6
SQE41292.1|1961879_1962440_+	Nicotinamidase	G3MA16	Bacillus_virus	2.0e-32	41.2
SQE41293.1|1962492_1963422_+	inorganic pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
SQE41294.1|1963839_1965219_+	Aldehyde dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
SQE41295.1|1965337_1966366_-	6-phosphogluconolactonase	NA	NA	NA	NA
SQE41296.1|1966634_1967036_+	yolD-like family protein	U3PG23	Staphylococcus_phage	1.3e-22	42.9
SQE41297.1|1967092_1967266_-	exported protein	NA	NA	NA	NA
SQE41298.1|1967644_1968757_+	choloylglycine hydrolase	NA	NA	NA	NA
SQE41299.1|1968813_1969656_-	exported protein	NA	NA	NA	NA
SQE41300.1|1969652_1970210_-	Predicted membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQE41301.1|1970269_1970794_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQE41302.1|1970914_1971478_+	Thioredoxin	NA	NA	NA	NA
SQE41303.1|1971543_1972284_-	ABC-2 transporter family protein	NA	NA	NA	NA
SQE41304.1|1972283_1973156_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	6.1e-28	35.2
SQE41305.1|1973152_1973833_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQE41306.1|1973833_1974730_-	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.1e-16	30.2
SQE41307.1|1974726_1975107_-	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SQE41308.1|1975364_1975541_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQE41309.1|1976080_1977367_+	Aspartate aminotransferase	NA	NA	NA	NA
SQE41310.1|1977637_1979707_-	MHC class II antigen-like protein	NA	NA	NA	NA
SQE41311.1|1980092_1980293_+	phospholipase C	A0A1P8L6A7	Staphylococcus_phage	8.4e-26	93.8
SQE41312.1|1981467_1981818_-	Involved in expression of fibrinogen binding protein, phage associated	A7TWS0	Staphylococcus_phage	7.5e-54	100.0
SQE41313.1|1982329_1982629_-	amidase	A0A1P8L6B4	Staphylococcus_phage	2.8e-49	97.0
SQE41314.1|1983271_1983763_-	Staphylokinase	A7TWR8	Staphylococcus_phage	8.0e-86	100.0
SQE41315.1|1983953_1984709_-	Autolysin	D2JLG5	Staphylococcus_phage	3.4e-152	100.0
SQE41316.1|1984720_1984975_-|holin	Phage holin	D2JLG4	Staphylococcus_phage	4.1e-41	100.0
SQE41317.1|1985512_1985743_-	phage protein	D2JLG2	Staphylococcus_phage	1.2e-31	100.0
SQE41318.1|1985866_1986154_-	phage protein	D2JLG1	Staphylococcus_phage	1.3e-43	100.0
SQE41319.1|1986200_1986353_-	phage protein	D2JLG0	Staphylococcus_phage	5.2e-20	100.0
SQE41320.1|1986342_1990128_-	phage minor structural protein	C8CH32	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.6
SQE41321.1|1990143_1991628_-	bacteriophage protein	A0A2I6PDJ0	Staphylococcus_phage	7.6e-297	99.6
SQE41322.1|1991624_1996154_-|tail	TP901 family phage tail tape measure protein	A0EX03	Staphylococcus_phage	0.0e+00	98.3
SQE41323.1|1996210_1996348_-	phage protein	A0A2I6PDX7	Staphylococcus_phage	3.4e-18	100.0
SQE41324.1|1996398_1996749_-	phage protein	G4KNQ8	Staphylococcus_phage	7.8e-59	100.0
SQE41325.1|1997064_1997709_-|tail	phage major tail protein	W5R9H4	Staphylococcus_phage	6.5e-120	100.0
SQE41326.1|1997709_1998117_-	putative bacteriophage protein	G4KNQ6	Staphylococcus_phage	7.1e-72	100.0
SQE41327.1|1998113_1998518_-	phage protein	A0A1W6JPJ1	Staphylococcus_phage	2.5e-69	100.0
SQE41328.1|1998514_1998877_-|head,tail	phage head-tail adaptor	G4KNQ4	Staphylococcus_phage	4.4e-65	100.0
SQE41329.1|1998860_1999145_-	Gp6 protein	A0A2I6PDJ5	Staphylococcus_phage	2.3e-45	100.0
SQE41330.1|1999134_1999419_-|terminase	phage terminase small subunit	A0A1W6JPL8	Staphylococcus_phage	2.3e-45	100.0
SQE41331.1|1999438_2000659_-|capsid	Phage major capsid protein	A0A075LYD8	Staphylococcus_phage	2.6e-226	98.3
SQE41332.1|2000606_2001344_-	ATP-dependent endopeptidase clp proteolytic subunit	G4KNQ2	Staphylococcus_phage	5.2e-129	99.6
SQE41333.1|2001327_2002515_-	Portal protein, phage associated	A0A2I6PDI1	Staphylococcus_phage	1.0e-219	100.0
SQE41334.1|2002530_2004192_-|terminase	Phage terminase large subunit	A0A2I6PDJ8	Staphylococcus_phage	0.0e+00	100.0
SQE41335.1|2004188_2004533_-	phage protein	G4KNP9	Staphylococcus_phage	9.4e-57	100.0
SQE41336.1|2004663_2004960_-	phage-associated homing endonuclease	G4KNP8	Staphylococcus_phage	1.3e-51	100.0
SQE41337.1|2005194_2005611_-	phage transcriptional regulator	G4KNP7	Staphylococcus_phage	1.3e-76	100.0
SQE41338.1|2005638_2005842_-	phage protein	R9QT57	Staphylococcus_phage	6.3e-29	100.0
SQE41339.1|2005838_2006489_-	Uncharacterised protein	D2JLD8	Staphylococcus_phage	3.4e-116	99.5
SQE41340.1|2006495_2006648_-	Uncharacterised protein	A0A2I6PDV2	Staphylococcus_phage	5.4e-17	100.0
SQE41341.1|2006647_2006800_-	transcriptional activator RinB family protein	A0A1X9H063	Staphylococcus_phage	1.7e-18	100.0
SQE41342.1|2006799_2007000_-	phage protein	A0A2I6PF22	Staphylococcus_phage	1.8e-28	100.0
SQE41343.1|2006974_2007163_-	phage protein	A0A2I6PDV0	Staphylococcus_phage	2.1e-26	100.0
SQE41344.1|2007159_2007405_-	phage protein	A0A2I6PDW7	Staphylococcus_phage	5.0e-36	100.0
SQE41345.1|2007441_2007951_-	dUTP pyrophosphatase	A0A1X9H051	Staphylococcus_phage	2.5e-90	99.4
SQE41346.1|2007943_2008192_-	Phage protein	A0A2H4PQK1	Staphylococcus_phage	4.5e-37	95.1
SQE41347.1|2008232_2008481_-	phage family protein	W5R983	Staphylococcus_phage	1.5e-40	97.6
SQE41348.1|2008481_2008853_-	PVL ORF-50-like family protein	A7TWA7	Staphylococcus_phage	1.3e-56	99.2
SQE41349.1|2008865_2009270_-	endodeoxyribonuclease RusA family protein	O80087	Staphylococcus_phage	1.4e-72	99.3
SQE41350.1|2009278_2009497_-	phage protein	A0A2I6PDG4	Staphylococcus_phage	1.0e-37	100.0
SQE41351.1|2009503_2010388_-	Phage protein	S4V6D4	Staphylococcus_phage	6.2e-137	96.3
SQE41352.1|2010417_2010888_-	Single-stranded DNA-binding protein, phage associated	I1W659	Staphylococcus_phage	5.3e-79	97.4
SQE41353.1|2010888_2011374_-	Metallo-beta-lactamase superfamily domain protein in prophage	A0A1P8L6F7	Staphylococcus_phage	2.7e-86	99.4
SQE41354.1|2011586_2012507_-	recombinase, phage RecT family protein	A0A2I6PDH5	Staphylococcus_phage	2.3e-166	100.0
SQE41355.1|2012508_2014458_-	Uncharacterized conserved protein	R9QT82	Staphylococcus_phage	0.0e+00	99.2
SQE41356.1|2014460_2014724_-	phage protein	A0A2I6PDG2	Staphylococcus_phage	7.7e-43	100.0
SQE41357.1|2014732_2014993_-	putative phi PVL-like protein	A0A2I6PDH1	Staphylococcus_phage	2.6e-43	100.0
SQE41358.1|2015085_2015247_-	phage protein	Q4ZAZ7	Staphylococcus_virus	2.5e-20	100.0
SQE41359.1|2015243_2015564_-	Uncharacterized protein conserved in bacteria	A0A1W6JPI1	Staphylococcus_phage	7.4e-56	100.0
SQE41360.1|2015593_2015812_-	phi PV83 orf 10-like protein	A0A068A2A3	Staphylococcus_phage	8.6e-32	100.0
SQE41361.1|2015808_2016087_-	Uncharacterised protein	G4KNN2	Staphylococcus_phage	3.5e-46	100.0
SQE41362.1|2016369_2016630_-	putative phi PVL-like protein	A0A2I6PDT7	Staphylococcus_phage	3.5e-40	100.0
SQE41363.1|2016642_2017392_-	putative phage anti-repressor protein	Q8SDM9	Staphylococcus_phage	4.9e-135	99.2
SQE41364.1|2017448_2017658_+	Uncharacterised protein	A0A2I6PDR8	Staphylococcus_phage	9.1e-31	100.0
SQE41365.1|2017650_2017791_-	phage protein	A0A2I6PDT8	Staphylococcus_phage	1.9e-16	100.0
SQE41366.1|2017805_2018249_-	hypothetical phage-related protein	Q6R853	Staphylococcus_virus	4.9e-74	99.3
SQE41367.1|2018261_2018504_-	phage DNA-binding protein	A0A1X9H035	Staphylococcus_phage	1.6e-39	100.0
SQE41368.1|2018667_2019384_+	putative phage repressor protein	A0A1X9H038	Staphylococcus_phage	5.4e-131	100.0
SQE41369.1|2019395_2020250_+	HIRAN domain-containing protein	A0A1X9H037	Staphylococcus_phage	7.3e-151	100.0
SQE41370.1|2020323_2020470_+	phage protein	A0A1X9H032	Staphylococcus_phage	3.3e-19	100.0
SQE41371.1|2020466_2020652_+	phage protein	U5U7D6	Staphylococcus_phage	2.3e-25	100.0
SQE41372.1|2020722_2020905_+	Putative cytosolic protein	A0A2I6PDR4	Staphylococcus_phage	5.3e-27	100.0
SQE41373.1|2020982_2021696_+	phi77 ORF017-like protein	A0A1X9H026	Staphylococcus_phage	5.0e-129	100.0
SQE41374.1|2021887_2022925_+	DNA integration/recombination/inversion protein	A0A1X9H022	Staphylococcus_phage	2.6e-179	100.0
SQE41375.1|2022981_2023806_+	phospholipase C	A0A1P8L6H7	Staphylococcus_phage	6.3e-160	99.3
SQE41376.1|2024062_2025082_-	leukocidin-protein 1	A0A2I6PEU3	Staphylococcus_phage	2.6e-54	39.8
SQE41377.1|2025103_2026159_-	Leukocidin S subunit	A0A2I6PER8	Staphylococcus_phage	6.0e-38	34.6

Sequences of DBSCAN-SWA_11

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11

>LS483302|2464641:2475079|DBSCAN-SWA
ATTACATATTAATACTTTGCGGACGATGATTAGATTGATTTTTACGATGTCGTGTCGTTGGGTCTAATCGTTTTTCTAAAAATCTTAATAGTACATCAATGACGATTGCAATGATAGCAATCGGAATCGCACCTGCTAAAATAAACGTTGTGCCATCCGTCGCATTTGTACCACGAATCACAATGTCACCAAGCGTAGGTGCTCCTATAAATGATCCAACGGCAACAACACCTATCGCAACAACCAAGGCAATACGAATGCCACCGATAATAACCGAAACAGATAACGGTAATTCAATCATTCGTAGCACTTGATTGCGTGTCATTCCCATACCTTTGCCAGCATCCTTAATATTCGCATCAACACTAGCTATACCAGTATAAGTATTTTTTATAATTGGAAGTAACGCATATAAAAACACTGTTAAAACTACTGTTTCTGAGCCTAGGCCCATGACTAACATTAAAATAGCTAACATTGCAATGACTGGAACTGTTTGAATTATATTTGCAATTGTAATTACAAATCCAGAAAGTTTTGTGTATCTTGCAAGCAAGATTCCCAGTGGAATACCAATTAAAGCTGCAAACAGCACACCATAGACAGACATTAATAAGTGTTTGAAAAATAAATCCCATAGATAGCCAAAGTTCGTAACATAATAATTGAATAATTGCTGTAATAAATTACCTTCCATTACTTATGACCACCTTTCTGTTTATCAAAATAGTGGTGTTTTTTCAAAAATTCTTCTGCGACGACAGCAGGTTCTTTACCTTTACCATCCGCTTCATAATTCAAGCGCTGCATCTCTGAAGTTGAAATCTTTCCAGTCAACTTATTAATCGTCGTTGTAAGTTCTGGGTGTTGGCGTAATAATTCATTTGTTGCAACAGCACTCGCAGCATAAGGTGGGAAAAATTGTTTATCATCTTTAAGTACTTTCAAATCATACGCGGCAATTCGACCATCTGTAGAATAACCTAATGCAACGTCTAACTTCCCTGAGTTTAATGCGTCATAAACGAGACCTATTTGCATTGGTCGCACGGTACCAAAGTCGAAACCATACTCTTTTTTAAATCCTTCATAGCCATCGCCTTTACGATTCATCCATGAACTATCCATACCTAAACGTAAATCTTTACTATGCTTTGCTAAGTCTGAAACCGTCTCTAAATGATATTTTTTAGCAGTCTCTTTCGTTACCATAAAGGCATACGTATTCGCAAAACCATACGAATTGAAAAACGTTTGATCAAATTTCTTTTTAAATCCTTGTTGTGTGGCTATCATCGCTTTCTTAGGATCTTTAATTGGTGCTTCCTTCAAAACTCCCGTTAAATCTGTACCATTATATCTAACACCCGATATATTAGCATCCCCATTAATTAAGGCATTATGTTGAATCGTACTTGACCCTAAATTATTTACTAATGTTGGCTTTATCTTACCCTGCGTATCATGCTCTATTAATAACCGTAACATATGTGAAATAATTTGCGATTCGCTTGTTGATAATGCTGTAATTTTGACATCATTTTTCGTGCTCTTACTACCTAGTCCGGGCAAACTACATCCAGATAATACGGTAAGTGATAAGACAAGCACGACAACTATATATTTAATTTTCTTCATTATCTTAGCCTCCTAATTATCCAGATACTTTTAACCCTTTAGGAACTACCCATTTTTCAACTAAAGCTAATAAGGCATCAACACCTAATGCTAGTGCAGTAACGAGTACCGTTGCAGTTACAATCATCAGTGGATCATATAAATTTAAACCATTGAAAATGAAATCACCTAATCCACCCGCACCTACATAACTTGCAAGTGTAGCCCAACTAATTACATACACAGACGACAAGCGAATACCGCCTAGTATAAGCGGTAAGGCTAACGGCAATTCCACATCCTTCATCAATTGAAATTGCGTCATTCCCATACTTTTTCCAGCTTCTTTAATGTTGCTATCAATATTTTGAACGCCGAGTACCGTGTTATTTAAAATAGGTAATAATACATAAATAAATAGCGCTACAATTGCAGGCGTTTTACCAACACCAAAAATCGGTATCATAATAGCAAGTACAGCTAGTGTTGGAATAGTTTGTAACACACCTGCCACAGTTAATATAATATTGGCAGTTCGCTTTGTTTTTGATAATAAAATGCCTATAGGTACTGCAACAATGATGGCAAGTAATAATGCCACTATAGAAATATAGAAATGTTCCAGTGTTTTCGACATCAACTGTTCGCCATGTTCATGTAGGAACTCGATCATGATTTATCATCTCCTATGTCACGTACTTTGACATTAGTAGTGTGTTGCTCATGCACTTTTGAGGACGCAGTGTCTTTCCCCACATGTTCTGTTTGCACTGTATCCTCACTATCGCCCCAAATCGTGTCATATACAATATCAACAACATTGGCACGCGTAATCAGTCCTACTAAACGCTGTTGATCATCTACGACAGGTACATTCTTAACGTTTCTTTTTAAAATCGTACGTACAGAATCTTGTAACTTAGAATCAATTTGAACGGTATAAATATGTTGTTGCATGGTATCTCGTAAACTTTTGTGTCCACGTATACCCTGATTTATATCTTCAATATCTAAGAAGCCTAGTAAATGGTTATCCCTATCTACTACAAAAATAGTATCAACACGTTTTTGTCTCATAATATGAACGGCGTCATTCAGTGTTGCTTCTGCTTGTATCGTGATTGGTTTAATCATTACACTTTCTACAGTCTTGTCATTAGGACGGTCTTGAATCAGTCTATTTTGTCCTATAAAATCACGTACAAAATCATTTGCGGGATGTCTTAAAATATTGTCCGGTGTATCAAATTGCACTACTTTACCTTCTGACATAATACAAATTTTGTCTGCTAATTTAATCGCTTCATCCATATCATGTGTTACAAAGATAAACGTCTTGCCTAATTTTCGTTGTAACGTTTTAACTAAATCTTGTAACGTATCTCTCGTAATAGGATCCAATGCACCAAAAGGTTCATCCATTAAAATAATATCTTGTTCGGCCGCAAGTGCTCTTACGACACCGATACGTTGTTGTTGCCCACCTGATAGTTCAGCTGGATAACGCTCTAAAAATGACTCCGGTAAATCCACAAGTTTAATTAATTCCTTTGCACGCTTATCCTTTTCTTCTTTAGTCCATTTCAACAATTTGGGTACCAACACAATATTCTCTTTAATCGTCATATGAGGCATTAAGCCAATTTGTTGAATAACATAGCCAATATTTCTACGTAATTCAACAGGATTCATACTCCGAACATCTTTACCATCAATTTCAATTTGTCCTTCTGTCGCTTCAATCATACGGTTGATCATTCTTAAAGCAGTCGTTTTGCCACTCCCACTGGTTCCTATAAACGCGATAAATTCGCCTGATTGAATATCTAAAGAGATGTCATCTACTGCCTTTTTATTACCAGAATAAATTTTCGTTAAATGCTTAATACTTAACATAATCATTTCTCCTTCCTCATAAAAAATATGACGAATGATACGCATAAAATAAAAAGACCATCATCGCAATTGTTAAACAAATAGAGTCATAAGTTAAACAAGTACACATCATGGTCTTGATTATGTAGAATTTTAAATTTTTCATCTGTAATGTGAATACTTAACAGTAAACGGCGCTATGTATGTTGAATTTCTACCGATTACTTTGTTTGCACATTCGTATATTCGACATTTAAAACTAACATACTCTATATGATGTTATTAAACATTATCATTTTATCTTTTGCAACTAAATAGATAACTCATATTTTTCAAAAGCGAATTTATTATCGCTCAATTGGTTGTTTTATAGCAAAAAAGTGTCGAAAATGTGAAATATTATTACAAAAGTCGAATTTTTGTAATAATGCACACGCATCCATTGTTACAGGCGGATAAACGTCCATCCGCCACTCACAAAGTCATCCTTATATTTTAATATCTTCATCATTTATTGTAGACACCCTTGCCTTTTGCTAACAGTTCCTACTCCCAAGCCTGTAACGGCATTCCACCGTCAAAGTGTTGCCCATGACAGGCACACCTAAAAAACAACCAACAGCATGAGCCATTGGTTGTTTCGTGTCATCTTGTATGTTGTTGTATAACCGGTATGCTTTTACTCATTAATTACTTATCATGCATCCCTTTACCTTCTAGTATTTGGTTAATATACTTTTCAACACGCTTTTGTCTTGTTTCACTGCGTTTAGCTTGTCCAATATGATATATATATTGATGTTGTCTGCCTGGCGTTAATTTATAAAATGACGACTCTAGCTGTGGCATTTCTTCGAACTTAGCTTCTAACTCTTTAGGAATAACATATTCCTCTGTTTTCTTCATTTCAACTTTTTTACCAGCATTTTCAGCTTTAATTGCTTCAGCAATATAGTATTTAATTTCTTCTCTACGTGCCTGAATCTCTTCTAGATTTTCAAATCGTAACTGACGAGCTGCTTGCACCTTTTCAGTCTGTTGAATGAGTGTATGATATTTATCCTCCAAAATGGCACCTTTATGAAATAATAGTGCAACATAATTTTTGAAGCCATGGATAAGTACTACATTTTTATTATTCAACGTGTAACAAGGATGCATCCATTTATACGCTTCCTCTAATTCTGTTTCATTAAAGATTAACGTTCTCAAATATTTATATTCTTCTTGCCATTGACTCTCTTTATTTAAAAATGCCTCAACTTTTTCATTCGATTGTTTCTCACTCATAGTCATCACTTCCATTTTATTTTTCAATACACATTGTATTATATATCCTAATTTTATAAAAAACTAATTTTACAAATGCTTTTGCGTTCTTACAAAAAATAAATTTGACTATTATACTAATAAGCGTATAATTTTTCGCATACTATTTTTTGAATTTTCGGCAATAACGAAGGAGTATTTATGAATAAAGACAAGCAATTGCACAACGACAAAATCAATCTATCCCAATTAGTATTACTAGGGTTAGGTTCATTAATAGGATCTGGTTGGCTATTTGGTGCGTGGGAAGCATCATCAATAGCTGGACCAGCAGCAATCATATCATGGGTTCTTGGGTTCCTAGTTATTGGAACCATTGCCTATAACTACATTGAAATCGGCACAATGTTTCCTCAATCAGGTGGCATGAGTAACTATGCCCAGTATACACATGGCTCATTATTAGGCTTTATTGCTGCTTGGGCGAATTGGGTGTCTTTGGTGACAATAATACCTATCGAAGCTGTGTCAGCTGTTCAATATATGAGTTCTTGGCCGTGGCATTGGGCGAAACCAATGAAACATTTAATGGAAAATGGCTCTATTAGCACATACGGATTGCTAGCTGTATATCTCATCATTGTTATTTTTTCATTATTAAACTATTGGTCCGTAAAACTTTTAACATCATTTACGAGTTTAATTTCTGTATTTAAATTAGGCGTACCCATGTTAACCATCATCATGTTAATGTTATCAGGATTCGACACTTCAAATTACGGCCATTCGGCAAGCACATTTATGCCTTACGGAAGTGCACCGATTTTTGCTGCAACAACAGCATCAGGGATTATTTTTTCATTCAATTCATTCCAGACAATTATTAATATGGGTTCAGAAATTAAAAATCCTGAAAAAAATATCGCAAGAGGCATCGCTATTTCACTGTCAATCAGTGCAGTGTTGTACATCATTTTACAAAGTACGTTTATCACTTCTATGCCTCAATCAATGTTACAACATAGTGGATGGAATGGCATCAACTTCAATTCACCATTTGCTGATTTAGCTATCTTATTAGGAATTAATTGGCTCGCAATTATACTATATATTGAAGCTTTTGTATCACCATTCGGTACTGGCGTGTCATTTGTCGCCGTTACAGGTCGAGTTTTACGAGCAATGGAGAAAAATGGACATATCCCTAAATTTCTTGGGAAGATGAACGAAAAATATCATATTCCACGTGTAGCAATCATCTTTAATGCCATCATTAGTATGATTATGGTTACGTTATTTAGAGATTGGGGTACGCTAGCAGCAGTTATTTCTACTGCAACTTTAGTAGCATATTTAACTGGCCCAACGACAGTGATTGCATTAAGAAAAATGGGACCAACAATGACTCGTCCATTTAGAGCAAAAATTTTAAAAGTAATGGCACCATTATCATTTGTATTAGCTTCATTAGCTATATATTGGGCAATGTGGCCAACAACGGCTGAAGTAATTTTAATCATTATACTTGGCTTACCAATCTACTTCTTCTATGAATATCGTATGAATTGGCGTAATACAAAGAAACAAATTGGTGGTAGCTTATGGATTATTGTATATTTAATCGTGCTATCAATACTGTCATTTATAGGAAGCAAAGAATTTAAAGGCTTAAATATGATTCACTATCCATTTGACTTTATCGTTATTATTATTGTGGCGCTTATCTTCTATTACATCGGTACAACGAGTTCATTTGAAAGCGTCTATTTCCGTCGCGCAACACGAATCAATACAAAGATGCGCGAGTCACTAAATAATGAATCAAAGTCATCTCATTAAATATTTTAAAATGCAGTGCCATATATGATTTCAACACACACATTAACCAACCATTGATTTCAACATCTTGGTTGGTTTTTTATTTTGAAAATGGGTTATAAATAACTAACATAACAAGATGGTGAGGAGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTCAATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTTGGTCTTCGACTGGCACTGCTCCCTCAGGAGTCTCGCCATTAATACTACGTATTAACATGTAATTTTACTTTGAAATACTTTAAAAAAATAAGACACTTTCGTATAATTTAATAAATACCACTAAACTAAATTAACGAGGTGCCTTATGTATAAAAATTATAACATGACCCAACTTACACTACCAATAGAAACTTCTGTTAGAATTCCTCAAAATGATATTTCACGATATGTTAACGAAATTGTTGAAACGATACCTGATAGCGAATTCGATGAATTCAGACATCATCGTGGCGCAACATCCTATCATCCAAAAATGATGTTAAAAATTATCTTATATGCATACACTCAATCTGTATTTTCTGGTCGTAGAATAGAGAAATTACTTCATGACAGTATTCGAATGATGTGGTTAGCTCAAAATCAAACACCTTCTTATAAAACTATTAATCGTTTTAGAGTAAATCCTAATACTGATGCATTAATTGAATCTTTATTTATTCAGTTTCATAGTCAATGTTTAAAGCAAAATCTTATTGATGATAATTCAATTTTTATTGATGGTACAAAAGTAGAAGCTAATGCCAATAGGTATACATTTGTGTGGAAGAAAAGTATTCAAAATCACGAATCGAAATTGAACGAAAATTCAAAAGCATTATATCGTGACTTAGTTGAAGAAAAAATAATACCAGAGATAAAAGAAGATGGAGATAGCGATTTAACAATAGAAGAAATAGATTTAATTGGTAGTCATTTAGATAAAGAAATCGAAGATTTAAATCATTCTATTCAGAACGAAGATTGTACTCAAATTAGAAAACAGACCCGTAAAAAAAGAACTGAGATTAAGAAGTTCAAAAAGAAATTTGATGATTATTCCGAAAGAAAAAGTAAATATGAAGAACAAAAATCGATTCTTAAAGATAGAAATAGCTTTTCTAAAACTGATCATGATGCAACTTTTATGAGAATGAAGGAAGACCATATGAAAAATGGCCAACTTAAGCCAGGATACAATTTACAAATAGCGACAAATTCTCAATTTGTTTTATCCTATGACCTATTTCAAAACCCGACAGATACTAGAACTTTAATTCCATTTTTAACAATGATTCAAAATACCTTCGGTTATTTACCGGAGTATATTGTAGCTGATGCAGGTTATGGTAGTGAGCAAAACTATATGGCTATTATAGATGATTTTAATAAAACGCCACTTATTACGTATGGTATGTTTATTAAAGATAAAACGAGAAAGTTTAAAAGTGACATTTTTAACACTCAAAACTGGAAATATGACGAACTTAATGATGAATTTATATGTCCTAATAACAAAAGAATAGGTTTTAAAAGATATGCATACCGTAATGATAGATATGGTTTTAAACGTGACTTCAAACTATATGAATGCGATGACTGTTCAGCATGTTCTTTGAGGCAACAATGCATGAAGCCAAATTCGAAATCCAATAAGAAAATCATGAAGAATTATAATTGGGAATACTTTAAAGCCCAAATTAATCAAAAGCTTTCTGAACCAGAAACGAAAAAAATCTATAGTCAAAGAAAAATTGATGTAGAGCCTGTTTTTGGATTTATGAAGGCTATTTTGGGTTTCACTCGAATGTCAGTTCGAGGAATAAATAAAGTTAAACGAGAGCTAGGTTTTGTATTAATGGCACTTAATATAAGGAAAATAGTAGCTCGACGAGCTGTATATTATCAAATACGTTTAAAAAAAGCTGATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAACTTAATGTCCCAAGCTCGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTCGGTCTTCGACTGGCACTGCTCCCTCAGGAGTCTTGCCATTAATACTACGTATTAACATGTAATTTTACTTTGAAATACTTAAAAAAATAAGACACTTTGCCCAACTTACACTACCAATAGAAACTTCTGTTAGAATTCCTCAAAATGATATTTCGCGATATGTTAATGAAATTGTTGAAACGATACCTGATAGCGAATTCGATGAATTTAGACATCATCGTGGCCAACATCCTATCATCCAAAAATGATGTTAAAAATCATCTGATATGCATATACTCAATCTGTATTTTCTGGTCGTAGAATAGAGAAATTACTTCATGACAGTATTCGAATGATGTGGTTAGCTCAAGATCAAACACCTTCTTATAAAACTATTAATCGTTTTAGAGTGAATCTTAATACTGATGCGTTAATTGAATCTTTATTTATTCAGTTCCATAGTCAATGTTTAAAGCAAAATCTTATTGATGGTACAAAAGTAGAAGCTAGTGCCAATAGATATACATTTGTGTGGAAGAAAAGTATTCAAAATCACGAATCGAAATTGAACGAAAATTCAAAAGCATTATATCGTGACTTAGTCGAAGAAAAAATAATACCAGAGATTAAAGAAGATGGAGATTGCTATTTAACAACAGAAGAAATTGATTTAATTGGTAGTCATTTAGATAAAGAAATAGAAGATTTAAATCATTCTATTGAGAACGAAGATTGTGCTCAAATTAGAAAACAGACCCGTAAAAAAAGAACTAAGATTAAGAAGTTCAAAAATAAATTTGATGATTATTCTGAAAGAAAAAGTAAATATGAAGAGCAAAAATCGATTCTTAAAGATAGAAATAGCTTTTCTAAAACTGATCATGATGCAACTTTTATGAGAATGAAGGAAGACCATATGAAAAATGGCCAACTTAAGCCAGGATACAATTTACAAATAGCGACAAATTCTCAATTTGTTTTATCCTATGACCTATTTCAAAAACCAACAGATACTAGAACTTTAATTCCATTTTTAACAATGATTCAAAATACCTTCGGTTATTTACCAGAGTATATTGTAGCTGATGCAGGTTATGGTAGTGAGCAAAACTATATGGCTATTATAGATGATTTTAATAAAACGCCACTTATTACGTATGGTATGTTTATTAAAGATAAAACGAGAAAGTTTAAAAGTGACATTTTTAACACTCAAAACTGGAAATATGACGAACTTAATGATGAATTTATATGTCCTAATAACAAAAGAATAGGTTTTAAAAGATATGCATACCGTAATGATAGATATGGTTTTAAACGTGACTTCAAACTATATGAATGCGATGACTGTTCAGCATGTTCTTTGAGGCAACAATGCATGAAGCCAAATTCGAAATCCAATAAGAAAATCATGAAGAATTATAATTGGGAATACTTTAAAGCCCAAATTAATCAAAAGCTTTCTGAACCAGAAACGAAAAAAATCTATAGTCAAAGAAAAATTGATGTAGAGCCTGTTTTTGGATTTATGAAGGCTATTTTGGGTTTCACTCGAATGTCAGTTCGAGGAATAAATAAAGTTAAACGAGAGCTAGGTTTTGTATTAATGGCACTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTTTAAAATACATATCAAAAAAGCTGATTTCCACCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_11

>LS483302|2464641:2475079|2473711_2475079_+|SQE41795.1|transposase|DBSCAN-SWA
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MLSIKHLTKIYSGNKKAVDDISLDIQSGEFIAFIGTSGSGKTTALRMINRMIEATEGQIEIDGKDVRSMNPVELRRNIGYVIQQIGLMPHMTIKENIVLVPKLLKWTKEEKDKRAKELIKLVDLPESFLERYPAELSGGQQQRIGVVRALAAEQDIILMDEPFGALDPITRDTLQDLVKTLQRKLGKTFIFVTHDMDEAIKLADKICIMSEGKVVQFDTPDNILRHPANDFVRDFIGQNRLIQDRPNDKTVESVMIKPITIQAEATLNDAVHIMRQKRVDTIFVVDRDNHLLGFLDIEDINQGIRGHKSLRDTMQQHIYTVQIDSKLQDSVRTILKRNVKNVPVVDDQQRLVGLITRANVVDIVYDTIWGDSEDTVQTEHVGKDTASSKVHEQHTTNVKVRDIGDDKS
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>LS483302|2464641:2475079|2471645_2473292_+|SQE41794.1|transposase|DBSCAN-SWA
MYKNYNMTQLTLPIETSVRIPQNDISRYVNEIVETIPDSEFDEFRHHRGATSYHPKMMLKIILYAYTQSVFSGRRIEKLLHDSIRMMWLAQNQTPSYKTINRFRVNPNTDALIESLFIQFHSQCLKQNLIDDNSIFIDGTKVEANANRYTFVWKKSIQNHESKLNENSKALYRDLVEEKIIPEIKEDGDSDLTIEEIDLIGSHLDKEIEDLNHSIQNEDCTQIRKQTRKKRTEIKKFKKKFDDYSERKSKYEEQKSILKDRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMKNGQLKPGYNLQIATNSQFVLSYDLFQNPTDTRTLIPFLTMIQNTFGYLPEYIVADAGYGSEQNYMAIIDDFNKTPLITYGMFIKDKTRKFKSDIFNTQNWKYDELNDEFICPNNKRIGFKRYAYRNDRYGFKRDFKLYECDDCSACSLRQQCMKPNSKSNKKIMKNYNWEYFKAQINQKLSEPETKKIYSQRKIDVEPVFGFMKAILGFTRMSVRGINKVKRELGFVLMALNIRKIVARRAVYYQIRLKKADFYQIINRNQLFYIA
>LS483302|2464641:2475079|2464641_2465337_-|SQE41788.1|holin|DBSCAN-SWA
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MNKDKQLHNDKINLSQLVLLGLGSLIGSGWLFGAWEASSIAGPAAIISWVLGFLVIGTIAYNYIEIGTMFPQSGGMSNYAQYTHGSLLGFIAAWANWVSLVTIIPIEAVSAVQYMSSWPWHWAKPMKHLMENGSISTYGLLAVYLIIVIFSLLNYWSVKLLTSFTSLISVFKLGVPMLTIIMLMLSGFDTSNYGHSASTFMPYGSAPIFAATTASGIIFSFNSFQTIINMGSEIKNPEKNIARGIAISLSISAVLYIILQSTFITSMPQSMLQHSGWNGINFNSPFADLAILLGINWLAIILYIEAFVSPFGTGVSFVAVTGRVLRAMEKNGHIPKFLGKMNEKYHIPRVAIIFNAIISMIMVTLFRDWGTLAAVISTATLVAYLTGPTTVIALRKMGPTMTRPFRAKILKVMAPLSFVLASLAIYWAMWPTTAEVILIIILGLPIYFFYEYRMNWRNTKKQIGGSLWIIVYLIVLSILSFIGSKEFKGLNMIHYPFDFIVIIIVALIFYYIGTTSSFESVYFRRATRINTKMRESLNNESKSSH
>LS483302|2464641:2475079|2465336_2466278_-|SQE41789.1|holin|DBSCAN-SWA
MKKIKYIVVVLVLSLTVLSGCSLPGLGSKSTKNDVKITALSTSESQIISHMLRLLIEHDTQGKIKPTLVNNLGSSTIQHNALINGDANISGVRYNGTDLTGVLKEAPIKDPKKAMIATQQGFKKKFDQTFFNSYGFANTYAFMVTKETAKKYHLETVSDLAKHSKDLRLGMDSSWMNRKGDGYEGFKKEYGFDFGTVRPMQIGLVYDALNSGKLDVALGYSTDGRIAAYDLKVLKDDKQFFPPYAASAVATNELLRQHPELTTTINKLTGKISTSEMQRLNYEADGKGKEPAVVAEEFLKKHHYFDKQKGGHK
>LS483302|2464641:2475079|2468822_2469422_-|SQE41792.1|DBSCAN-SWA
MSEKQSNEKVEAFLNKESQWQEEYKYLRTLIFNETELEEAYKWMHPCYTLNNKNVVLIHGFKNYVALLFHKGAILEDKYHTLIQQTEKVQAARQLRFENLEEIQARREEIKYYIAEAIKAENAGKKVEMKKTEEYVIPKELEAKFEEMPQLESSFYKLTPGRQHQYIYHIGQAKRSETRQKRVEKYINQILEGKGMHDK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQE41788.1|2464641_2465337_-|holin	putative glycine betaine/carnitine/choline transport system permease protein	NA	NA	NA	NA
SQE41789.1|2465336_2466278_-|holin	Osmotically activated L-carnitine/choline ABC transporter, substrate-binding protein OpuCC	NA	NA	NA	NA
SQE41790.1|2466294_2466930_-|holin	Osmotically activated L-carnitine/choline ABC transporter, permease protein OpuCB	NA	NA	NA	NA
SQE41791.1|2466926_2468153_-|holin	glycine betaine/carnitine/choline ABC transporter, ATP-binding protein, putative	Q6GZ03	Mycoplasma_phage	8.6e-20	39.6
SQE41792.1|2468822_2469422_-	molecular chaperone GroEL	NA	NA	NA	NA
SQE41793.1|2469602_2471240_+	Amino acid permease	NA	NA	NA	NA
SQE41794.1|2471645_2473292_+|transposase	transposase	A0ZS58	Staphylococcus_virus	3.9e-294	99.8
SQE41795.1|2473711_2475079_+|transposase	IS1272 transposase, putative	A0A146ICT8	Staphylococcus_phage	1.4e-228	95.5