Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312 | Staphylococcus lugdunensis strain NCTC7990 genome assembly, chromosome: 1 | 8 crisprs | cas1,cas2,csa3,WYL,DEDDh,cas3,DinG | 7 | 6 | 7 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312_1 | 156502-156669 | TypeII |
NA
Consensus repeat of LS483312_1
|
2 spacers
spacers of LS483312_1
>1.1|156538|30|LS483312|CRISPRCasFinder CACCTATTAGATTACCGTTCTCATCTCTAT >1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder GATAAGGGATTGCTTTGTTGGGCATGGTTT |
cas9,cas1,cas2 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483312_1
The CRISPR arrays of LS483312_1 >merge|LS483312|1|156502-156669|CRISPRCasFinder GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAGTGATACCACCTATTAGATTACCGTTCTCATCTCTATGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAGTGATACGATAAGGGATTGCTTTGTTGGGCATGGTTTGTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAATGATAC >LS483312|1|1|156502-156669|CRISPRCasFinder GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAGTGATAC CACCTATTAGATTACCGTTCTCATCTCTAT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAGTGATAC GATAAGGGATTGCTTTGTTGGGCATGGTTT GTTTTAGTACTCTGTAATTTTAGGTATAAATGATAC
>LS483312.1|SQE70554.1|154827_156186_+|transporter MEIVKSKEDLFRIIDHADEQYTSKMLLFMILGTIFLDAYDITILGTMTDQLTQQFHLSPTMLSTVMTSLPIGALIGAIFGGVFAHRFGRKRILSISLLALVITSLGAALSPNLTILLLCRFLMGMAIGMDSPVAFTFIAEISNRAQKGRNVNYWQVVWYVAIVTSSLCVIAFFLMGTGSHLWRVAVGFGAIIALVLYLLRLKFLHESPTWMINHYSLGQAADYIRQKYHVDIQLAANQTNDVSSQERQPSARALFQPKYGKRLLLATAISTLQGMQYYAVGLYIPIIATYIISKEKLGVLLGTAIVNIAGIVGAYFGAQLTYRLGTRKLTIIGFALVLIAMVMTGVFYHLLPMILNTFLIALFLFGHSGGPGTQGKTIGALSFPTYLRSQATGFVEAVSRTGSIIGTFIFPIILAAVGLTNTMLILSIVPLVGLIITSAIKWEPVGKNVEVE >LS483312.1|SQE70553.1|153897_154698_+|hydrolase MFKLVVTDMDGTFLNAQGTFNKAHFQALLAPMKARGIRFAFCTGKQVERVEAVVGDLSQDLFIIGDSATRIQLNGENIYTKTLDSAVGQQLINKIKKIDPELTIIVCTPETAYVENSVRDQDKSMVFGSYEQVTFVDDLANLTAPILKITIYDHKAQCFNHVNDLAEFQDDLYIVAAEESWIDITDKAVDKGTTIQFLQSLLNIPADETIVFGDGYNDMPLFENAAYKVAMDNAYPELKEKANLIALNHNQDGVVTTLNVLLKLAR >LS483312.1|SQE70552.1|151208_153821_+|sporulation-protein-K-like-protein MKKPILVGKGFRRISFEKLVLETPIPDDSTIVFESLGDQKHYFNQGMQFQNMRFKLRGNSLPEDTVIDSWFYIENCNAVIENLTIDNSQPNDHALNIHNSHVTINNVILKGKQAIALYIDQNSSVSINEVTVDTHAEEEISGIFVDNGSRAQINQSLMNGLTANQDAYIEVNHSLSTETVCAQQEGRINANDLYIDKTEETIDIMLFSHGQMYIDGLTIVSGSSEAYLEEGYLSLQHVNTENTNGFLVNIDNFSDAEGEGFEVINRDEYQRQLNDQGAYAQNVDDNIGQEDVDTQFDEFYEDDTVNESENDSYEDTMDAFDEEAMPEEKSALDAIHELIGLDGVKKAVEKFINISKINKIKQQKGLQPNMPAMHSLFIGNPGTGKTTVARLMAQALYEEQVIKENNFVEVSRQDLVSEYIGRTATQTLEMLESAKNGVLFIDEAYTLVSEGDKGFGQEAIDTILKYMEDHREEIMIIFAGYTNEMITFKNSNPGLASRIPHTFDFEDYKLPQLVQIGEADLINKGYVFDADYYQKALANEYRHNFDNSNGRWVRNFNEKLTSEQIQRISESGEYIDDEALMTITDKDFSIFSSQDDRSDETLHDLLEELHQLIGLANVKQHVDKIINEVKFNKLLEEQGKVTTHSNYHMIFTGAPGTGKTTVARLLAQIFKHLGLLSKGHLIETERSKLIGNYIGQTEKNTKQAVEQAMGGVLFIDEAYQLTPKGQSDNDFGSQAIETLITELENNRNKFIAIFAGYNDDMQRFLESNEGLKSRVPYQLHFEDYSPEEVADIVVMTLIKEDWQFDETLLREIVEELYANIEESQKSNGRWARNFVQELLVRHKNKVIQTATPDADLTTISNETILEMQEV >LS483312.1|SQE70551.1|150466_151195_+|membrane-protein MKCKQCGTEFNHFQQHCPTCGEPIQVDTTSNQQQTSKQSQKRDIRSQFGAGAQQHKKRPDQQQEASHDSDVKEQVGASSTTDEANTHSTESQEQFGAHSGDHASHVSKNDFGASSTDSVSTGFLAVVKNIFKLDDTAAWAKRIIISIAFFVFYVFFIHITYNMIIFILNVLLFPFVMCVVDHVLSKVFKKSSYAYDIQQHGFDIATGKVALKYIFLLFIWNFSWILGILSFIYLYSLAKKLG >LS483312.1|SQE70550.1|149994_150153_-|Uncharacterised-protein MKINNHNSFFIPCGLFLGLGLGLIFKEIVAGAFLGLALGFLLYIIFNKRDNK >LS483312.1|SQE70549.1|148491_149850_+|branched-chain-amino-acid-transport-system-carrier-protein MKNHTLTLKQNIFIGSMLFGLFFGAGNLIFPIHLGQTAGANVWLANLGFLITAIGLPFLGIIAIGVSKTNGVFEIASRVSTSYAYIFTIGLYLVIGPFFALPRLATTSFEIAFSPFISPSTAKILLPIFSIVFFVLAWLFARKPSKILDYIGKFLNPIFLILLGIVVILAFIHPMGSINHASISPDYKHGTVLKGFIDGYNTLDALASLAFGIIIVSTIKKLGISNPNTIAKETFKSGTISIVAMGVIYTLLAVMGTMSLGHFKVSENGGIALAQIAQYYLGDYGIIILSLIIIVACLKTAIGLITAFSETFTELFPKQNYLAIATIVSVLACIFANVGLTKIIMYSIPVLMFIYPLAITLILLTLISPLFNHSTTVYRFTTFFTMIAALIDGIKASPEFFVNTSFAQWLIALGEHYLPLFDIGMGWMLPALIGFIIGLIVYKIRLPRQPQT >LS483312.1|SQE70548.1|146676_148179_-|monooxygenase,-FAD-binding-protein MSNDVLIVGAGPSGLALTIALSAQGISYKLIDKNKGPGTASRAMVVQSRVLEFYRQYDFDDKIVEAGIPIQHFNVYKDKRLVGKLPIAKKGKDVSPYPYVLTLPQDIHEQILVEELEKVGGQVCWEHELISFDDNETFISATFQQPNGEEVTETFNYICGCDGASSTVRKRLDIGFPGGTYTQLFYVADVETNTQLDGASMGFHGNHFCVGFPIRTTEQLRLIGIIPEEVKTNGEPPESFKPLIPFAENILPIHIKNINWYSSYRSHHRVAEHFRVNRAFICGDAGHIHSPAGGQGMNTGISDAFNLAWKLSNVIQGKADKSILDTYEPERIEFAKKLVNTTDTGFKFMANSQVVKDWIIPYIFPTLLHLDILKKKLYKTISQTAIHYKHSDLSIGNYGNIAGGDRLPWIHIDSIDNFEPLKSRTWQIHIYGKLTQELKQFAYDSQLPIYHIPWVTQMSQKDIQRDAVFLVRPDGYISVATNSYDVEPLKQMIEKYHIKP >LS483312.1|SQE70547.1|144561_146478_+|threonyl-tRNA-synthetase MSNQRINIQFPDGSQKAYEQGVLARDVAKSISTSLFKAAVVCRVNGTLVDLTYPLQEDCELTFYTLEDAEGIEAMRHTAAHVLAQALTRLYPQVLLTIGPVIDNGFYYDIDLDESISEVDLNKIEKEMKKIQSENLDIVKENVSYDEAKALFKDNPYKLEIIEQYQGEQLSVYRQGEFLDLCVGPHVPNTKFVKHVKLTKVSGAYWRGDSDNKMLQRIYGVAFQSQAQLDDYFEFLREAEARNHRKLGKQLKLFMFSEEAPGMPFYLSNGQFVRNQMENFLREIQLKNDYDEVRTPLMMNQKLWEESGHWDHYHENMYFTKVDENDYALKPMNCPGHMLIFKNELRSYKDLPLRMAEFGQVHRHEFSGALNGLLRVRTFCQDDAHIFIMKSQIKSEVEDILKLIDYIYSVFGFTYSIELSTRPEDYLGELKLWNEAEQSLANVLDELGLKYTINEGDGAFYGPKIDVHIKDALNRSHQCATVQLDFQMPEKFDLTYINEQNEKERPVVLHRAIFGSLDRFFGILIEHFKGAFPLWMAPVQVNIIGVSDNNTAYVNKVFEALQNNNIRVVIDDRDEKLGKKIRESQMKKIPYTLVLGDHEQENNVVSARKYSHEDNEVMDIQDFIAQLQEEVESKALLV >LS483312.1|SQE70546.1|143578_143992_-|transcriptional-regulator,-MarR-family-protein MTINDVAAHLNMSKSQIRYYEKVGLITVPRNDSGYRIFDEDTMFKLKLINDLKDLDLDLQNINHIIQLYDQPISDTCNKQSNKFIENLITKIEQRLKQQQLILQKIKTLHQLSKDGQYEQNQHKIFAELAKEVSMND >LS483312.1|SQE70545.1|143019_143586_-|flavodoxin-like-fold-domain-protein MISIIYGGNTSGTCYELYQHILHQIPKQQRYDVFLQQSNIGFLLTTGYHAPLSSQQQIWINQLEASSTLIFIYPLYWFNVTPILKSFIDQTFWPEHAFSFKNKQYFRNGLWKGKKAIIIYTQGGPEILHRFKGRLGYKVMKYPLNLSGIYDISVLHLDNLNRSATDNKKVVASMANIAQKVKQLIRNK >LS483312.1|SQE70555.1|156979_160144_+|CRISPR-associated-protein,-Csn1-family MNQKFILGLDIGITSVGYGLIDYETKNIIDAGVRLFPEANVENNEGRRSKRGSRRLKRRRIHRLERVKKLLEDYNLLDQSQIPQSTNPYAIRVKGLSEALSKDELVIALLHIAKRRGIHKIDVIDSNDDVGNELSTKEQLNKNSKLLKDKFVCQIQLERMNEGQVRGEKNRFKTADIIKEIIQLLNVQKNFHQLDENFINKYIELVEMRREYFEGPGKGSPYGWEGDPKAWYETLMGHCTYFPDELRSVKYAYSADLFNALNDLNNLVIQRDGLSKLEYHEKYHIIENVFKQKKKPTLKQIANEINVNPEDIKGYRITKSGKPQFTEFKLYHDLKSVLFDQSILENEDVLDQIAEILTIYQDKDSIKSKLTELDILLNEEDKENIAQLTGYTGTHRLSLKCIRLVLEEQWYSSRNQMEIFTHLNIKPKKINLTAANKIPKAMIDEFILSPVVKRTFGQAINLINKIIEKYGVPEDIIIELARENNSKDKQKFINEMQKKNENTRKRINEIIGKYGNQNAKRLVEKIRLHDEQEGKCLYSLESIPLEDLLNNPNHYEVDHIIPRSVSFDNSYHNKVLVKQSENSKKSNLTPYQYFNSGKSKLSYNQFKQHILNLSKSQDRISKKKKEYLLEERDINKFEVQKEFINRNLVDTRYATRELTNYLKAYFSANNMNVKVKTINGSFTDYLRKVWKFKKERNHGYKHHAEDALIIANADFLFKENKKLKAVNSVLEKPEIESKQLDIQVDSEDNYSEMFIIPKQVQDIKDFRNFKYSHRVDKKPNRQLINDTLYSTRKKDNSTYIVQTIKDIYAKDNTTLKKQFDKSPEKFLMYQHDPRTFEKLEVIMKQYANEKNPLAKYHEETGEYLTKYSKKNNGPIVKSLKYIGNKLGSHLDVTHQFKSSTKKLVKLSIKPYRFDVYLTDKGYKFITISYLDVLKKDNYYYIPEQKYDKLKLGKAIDKNAKFIASFYKNDLIKLDGEIYKIIGVNSDTRNMIELDLPDIRYKEYCELNNIKGEPRIKKTIGKKVNSIEKLTTDVLGNVFTNTQYTKPQLLFKRGN >LS483312.1|SQE70556.1|160146_161049_+|CRISPR-associated-protein-Cas1 MSWRIVYVSDVNHMSLNLNSLKIKKGDLETKIPLADIFALVIEDLTVTITSRLLVELSNYNILVIFCNQKHLPECSLQPISGHFNQYIQMKEQLKWDEARKNELWSAIVKRKIHNQIECMKYLDIDQLRINKMTDLYHSVALFDRNNIEGQAAKYYFNSFFKDFIRDNDELIENAVLNYGYTIFNAAIARTIVAKGLIPAIGIHHIGGRNHFNLASDLIEPFRPIVDLFLLKYPPEDFLTKDYRVKLINLLHARIEIDGKMQTIIRAIEIMIQSIIEYFKNGHLDIVKFPNLRKYQFYEL >LS483312.1|SQE70557.1|161053_161362_+|CRISPR-associated-protein-Cas2 MRVLLMFDLPVETKKQRRIYSKFRKHLIEDGFLMMQYSIYIKSVINKDAANLTIRRVNNFLPSEGHVRALIITEKQYEHMQILLGEENQNIEILGDHRTIIF >LS483312.1|SQE70558.1|161374_162376_+|Uncharacterised-protein MTNLVWQIKYESLPNIELNIGKYTAIYNEYETIEEDLLTIVDGYFKRRNSNSKEVSIIDTLNQELVSHHLFESVIIDNNLIENEHLLGASSILNKKIQRDFVNNLESNGYLQSINSLLEDLLELLNYTDLPLRTKQFDIKQFVKMLKFEYDLKDDYTRLIVRIEQVLPLVIEELKKQHNNQLLLIYLYPEANLSPKEQIRLKQLLISLDVNIIVLTGSMHFLAQQWKNNNYIRYDKQKLTSNFIDRLVWDAPLNFEQLEIENSLNQFTLTYQDKIEVHPTISNYQIAPIMLFNAIDLYVGINYMQHCQHQFNFDIDETLLPKTMFKYFSSYLK >LS483312.1|SQE70559.1|162389_163094_+|Uncharacterised-protein MKISTLLVLIVVLLVIFIVINAIRKKSQQTYSEDKLDAINHSQYDDGEYFYQSPGMLVDKQYIPIYASYKLCHIPYYKDSSQKWRSIFGLKPLHGTEVRSNAHKVIIERIEGMTNQSQYKVFLDDLHIGTFKKDKLFKENGKSRLYPYSFINKLDESFIFENPDRFHTTVIKDSQGNTILSAERTALDYKKNSTTNKRGEQHQIKIINNSQYPDELWLALYIQAGITYQTLDKS >LS483312.1|SQE70560.1|163308_163530_+|putative-DUF1447-containing-protein MKFYRLDYQHHKDIVDENILTVFVVAQNKGEVEQLAKKLRYAVENITKLTEKEFKKEKETNEHFRLEYAENYL >LS483312.1|SQE70561.1|164043_165645_+|substrate-binding-domain-containing-oligopeptide-transporter MNKLSKITVTLLASGMILAGCSDNKALENKKSEKTLSYTTVKDIGDMNPHVYGGSMSAESMLYEPLVRNTKDGIKPLLAKKWDISADGKTYTFHLRDDVKFHDGTKFDAEAVKKNIDAVQQNKKLHAWLKLSTLIDDVKVKDTYTVQLHLKEAYQPALAELAMPRPYVFVSPKDFKNGTTKDGVKAFDGTGPFKMGKHKKDEQANFNKNNDYWGTKPKLNQVQAKVMPAGETAFLSMKKGETNFAFTDDRGTDSLDKDSLKQLKDTGNYQVKRSQAMNTKMLVVNSGSKDSAVKDKTVRQALGHLVNRNKIATDILDKQEKPATQLFAKNVTDINFNMPTRQFDTHKAQQLLDKAGWKASSKEGSIREKEGKALELALYYDKGSSSQKEQAEFLQAEFKKVGIKLNINGETSDKVAERRTSGDYDLMFNQTWGLLYDPQSTIAAFKAKNGYESATSGIAHKDALYRDIDAAFKMQNDKQRSAKYQHILKQMDDEGIFIPISHGRMTVVAPKDLEKVSFTQSQYELPFNEMQYK >LS483312.1|SQE70562.1|165657_166599_+|membrane-permease-domain-containing-oligopeptide-transporter MVKFIIKRIALMVPLMLVVSFLTFLLTYLTDENPAVTILHAQGVPHVTPQLIAETKAKYGLDQPLLIQYKNWLIQALQLNFGTSYITGDPVASRITPAFINTLKLTLISSVMVIMTSIIFGVISALTRGTLIDRSIRSMAFVLTALPSYWIASIFVIYISVKLNLLPTSGLTGPESYVLPVLVITIAYAGIYFRNVRRSMIEQLNEDYVLYLRACGISTKKLICHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIEYIFAWPGLGQLSLKAILEHDFPIIQAYVLIVAILFIVFNTLADIINALLNPRLREDISCS >LS483312.1|SQE70563.1|166589_167459_+|membrane-permease-domain-containing-oligopeptide-transporter MLVMKRLLHDKGAVLALVIILGYVLLGVLAPLVTWYDPNHIDTAHKYASISWQHLLGTDHLGRDILTRLIYAIRPSLLYVFVALICSVVIGAVLGFIAGYFRGYIDALIMRLCDVMLAFPSYVVTLALIAMFGMGTENIILAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTTAHHVQFAKTIGMSHFKIIHKHIMPLTLADIAIISSSSMCSMILQISGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMFAPAIAIVIIVMAFNFLSDAIQLAIDPRLSMVERRQAVKKGGIRI >LS483312.1|SQE70564.1|167455_168271_+|peptide-ABC-transporter-ATPase MTRLNVHHLNIIDSWTGQALVSDVNFNVNSGETLGIIGESGSGKSITCKAIVGLNDDRLKVQGQINFESVDMLKLHDKQLKQYRGKEIAMIMQQGSRAFDPSSPVGKQMMETMQAHTSLGRQQVIDILVERMLYMKLQNPKQVLSMYPHMLSGGMLQRLMIALALALQPKLIIADEPTTALDTITQYEVLEAFNDMKQQMGCAMIFISHDLTVVNHVADHVAVMRAGRLVEQGTREAVLYHPQHAYTSYLLATKKKISDHFQRVMRGECNA |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312_2 | 227587-227733 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483312_2
|
2 spacers
spacers of LS483312_2
>2.1|227637|23|LS483312|PILER-CR TCCGATGGCTTTCTTTTCGAAAG >2.2|227710|7|LS483312|PILER-CR CGCATTT >2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder CTTGCTTGGCTAAATGCTTTTCGCATTTCTCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483312_2
The CRISPR arrays of LS483312_2 >merge|LS483312|2|227587-227733|PILER-CR,CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCTTTGTCCGATGGCTTTCTTTTCGAAAGCCTATCTGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCCTTGCTTGGCTAAATGCTTTTCGCATTTCTCTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCTTTGCTTGACGAAATGCTTTT >LS483312|2|1|227587-227733|PILER-CR CACCCCAACTTGCTTTGTCCGATGGCTTTCTTTTCGAAAGCCTATCTGTT GGGGCCCACCCCAACTTGCCTTG CTTGGCTAAATGCTTTTCGCATTTCTCTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACT TGCTTTG CTTGACGAAATGCTTTT >LS483312|2|2|227633-227711|CRISPRCasFinder TGTTGGGGCCCACCCCAACTTGC CTTGCTTGGCTAAATGCTTTTCGCATTTCTCTT TGTTGGGGCCCCACCCCAACTTG
>LS483312.1|SQE70617.1|226599_227115_-|YceI-like-domain-containing-protein MTQFNFDKVHSSIEFQIKHLMVSKVKGTFNDIDVTVEGDINNLSSLKATAIIDPKSIDTKNEDRDNHLRSGDFFATDEYDKITFVTKEVKDDKVVGDLTIKGETHEETFDLEFNGVSKNPMNGEQVTGFVVSGKIDREKYGVSFNQALETGGVMLGKEVKFEASAEFSIQE >LS483312.1|SQE70616.1|225643_226411_+|membrane-spanning-protein MGSLIKQECFKLSKKKSTWIWPIVIIAIMITLLFISQNSDIMSSEGLIQGGFSGFYWVVILMIVQASTIISMEFHYETIKNVLYRNYSRTSIVISKVITLVIYSLICFIGVIAVTLLLYAISFNDIDLLAPHGSQPPLLNEMLLLAVADFVTMWLVLSLTLLISCAMKGPTLSITIGIFFYFVMSFVAALLTYFNGKWEWFKWNPLNMIMLPQQIVDNDFKEMSHLELHELFIGNIVYIVIFLVLLVFVFKKKNV >LS483312.1|SQE70615.1|224946_225642_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSVLTVDNISKKINSKTILQDVSFNLEKGEIVGLVGANGAGKTSLMKVILGYSNYQKGHYKVVDSGSKRSSIGALIESPGVYPFMSGYDNLKLLNESKDNSDIDDIVTKLKMKDYIHNKAKTYSLGMKQKLGIAIAFLNDPKLIILDEPMNGLDPRAVRDVRNLILDKAQQGITFLISSHMLSELVKITDAILIIDEGKIVKETTREEIEQHDAENFETVLLDIIDKEGDA >LS483312.1|SQE70614.1|224146_224668_-|immunodominant-antigen-B MNKMTKLVLSSTLVFGSVLGVNAISTNAQHVSHAAITPYYTYHGYAGYNPSFLLTHEFKNGIKYKNITFNGKKIVPTKGTKTVKLYDQTFSGVTKSGKSASTVSFDVTGKLTTAQLKNAYGKALKKVGPPKPSKKVKAVYDYRPSLETPRVLFTVNHNNRVTHVDITYGSIGY >LS483312.1|SQE70613.1|223469_223949_+|transcriptional-regulator,-MarR-family MTLFYFIESDVKMMNKNDYEHMLFYFAYKTFTLTANEIIEQYGMSRQHHRFLFFINKLPGITIKELLQTLEISKQGSHATLKKLKDKQLIFEQPSKHDRRVKQLYTTEEGEALIATLNKAQDELIQQTIKKVGTDWYAIMEELASYRQGFKNVKHLKDE >LS483312.1|SQE70612.1|221700_223341_-|pyruvate-decarboxylase;-Alpha-keto-acid-decarboxylase MKQRVGQYLMDAIYQAGADRVFGVPGDFNLAFLDDIVAHEHLQWVGNTNELNASYAADGYARLKGVSALVTTFGVGELSAVNGIAGSYAERVPVIAITGAPTRAVEQAKKYVHHSLGEGTFDDYQKMFSHITTAQGYITPENATTEIPRLINASLQERRPVHIHLPIDVAMTEIEVTEPFKLQNPKQHDVSEYIKLIQQKLQSASNPVIIAGHEINSFHLHDALEQLVNQTNIPVAQLSLGKGAFNEENPHYLGIFDGKFAEDNVRDYVNNSDAILNIGAKLTDSATGGFSYDFDIEDVVMINHHNFKLGDTQNNEVSLPDMLHGLLEMDYHNKGTYSSYVRPKAHSYTLSDEPLTQETYFNMIQDFLQPDDVLLAEQGTSFFGAYDLALYKNVDFIGQPLWGSIGYTLPATIGSQMADTTRRNILLIGDGSLQLTVQGLSTMIRNQLKPIIFVINNDGYTVERLIHGMKAPYNDIHMWDYKALPAVFGGDNVAIHDVHTSNDLKRTFDEINAESDVMHYVEVTMAAEDAPEKLANIAEAFASQNK >LS483312.1|SQE70611.1|220887_221511_+|Nickel-transport-ATP-binding-protein-nikE MLQVDHINKTIQGRIILEDISFDLAQGNLIISGPSGCGKSTLAHIIAGLDKQYTGSLRLDGRLMHDYKTKQWMRDIQYVPQYQRTSMDPRQTVEAVLTEPLKRFGIPKTLHASRVDNVLSQCQLSSQLLQQRVSTLSGGQFQRVWIAKALIIQPKLLILDEATTNLDVVNEDLILQMLQSLTDIQLLIISHDPYVIQQFEAQHLSLT >LS483312.1|SQE70610.1|220184_220901_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSIYHKDKTLISSLSLEVERYSFHCIVGESGSGKSLLVRSILHMTDDQLTYQGNVDIDLLHADAMFQDANSNLFQNITIKQHIAMLYDAKKSTLSRAEQYKEVKTMMTRLGLEQPEQLLQYYPFELSGGMAQRVAFILSLIRNPQCLILDEPTSALDVQNRTKFMQQLMHIISERKMTVIFVTHDLSLVKDYATHVSIMQHGQIIESGQAQQVMHHPERHYTQTLIRTAERREAYATG >LS483312.1|SQE70609.1|219390_220161_+|oligopeptide-permease MKYLHVNWQWRIIGVSLIGALYIAVIGWNSKPSEHLAPPSLQHLLGTDQLGRDMFTRMIIGSGVTLGLTVVVVVLSVSIGLIFGMMAGLMGRWLDKLCMFVADLLLAIPSFIIALVILGLVSDSMIGLLCALVIGWLGRYLRYFRNLTRDIQKEPFIQYAVLSGNSNVQTLYAHMLPHLLSKIMALVTADFGKIMLSISGLAFLGLGVKPPIPELGTILFDGKSYLTIAPWLFFFPGILLGGYALLFQIINNKIIK >LS483312.1|SQE70608.1|218443_219394_+|peptide-ABC-transporter-permease MWQRTYKLFGYLIVSSLIIFILVEQTAGNPAILYLQRHGYTQMTQQQIDMAQHHLGLGRHILLRYLDWLGHALIGDLGYSFSTQEPVMNLIANALKPTWILMSWATVLMLPLGVGLGYCVGMLPHARIAQSLRYISQVITSMPEYWIAIVAIYYMGVKWQLLPFVGSASWQNYLLPVGIMIIVEGSHLLLMTAHLIAQTRQDDTYQLIKLRQATWKARIYCQFKVIFAPLMTIVVNSIIHLFSRAVILEVIFSMSGLGKLLITAINQRDYPLIQGIIMLIIVVIMLLNYLGDILILKSDPRIQRLRANKSKVRGAR >LS483312.1|SQE70618.1|228134_229541_+|short-chain-fatty-acids-transporter MARGHNKRPKRKLKFKTPHTYALLMIIITIAWIMTFIIPSGEYERHKKGGQTLVVDGTYHHVPHAATSFLDIFRAIPEGLVSGAEIVFYIFLVGGAFGIVHKTGSFENGVNKAMRALGNAKILMIPLTMTIFSILGFSIGLAEETIIFVPLGILIARTLGYDAMTGAAMVILGAASGFIGGMLNPFTVGVAQTVAELPMFSGWGLRSIIYIFILIAAITTVMLYARKVKRDHTKSLVYELEQQEGTMNEDIQYQHFTPRQVISLALMLGAIILNVVGIFKFEWTFGEMSANFLLAGILAGLISGLGLNGTFDALIEGMQSILFGALVVGFAKGIVVILENGKIIDTIVHGMTSLLADVPASFVIIAMFILQFMLNFFIPSGSGQALTTMPLMVPISDLLHINRQLTVLAFQYGDAISNVLFPTSAILMGALAVGRISYGQWIKFAWKLIVIWVLICAIAMSIALFVGY >LS483312.1|SQE70619.1|229583_230105_+|membrane-protein MEFNHAIHQDNTHAKVTIIDNEILKYTSNIIFPFIVGVILFICGLVVFIVIFGFLSAIITGQYSFVASGGIALVVSYSLFKGLHNKIFEKEVTLYQYGHERYEFIIGNQQYTGYYKHVDKVRLRRYFGDTTLFAPDISLTLVTLNGTFKFATTRIGAQEAIGKMEAHFKRLSQ >LS483312.1|SQE70620.1|230220_231564_+|bicyclomycin-resistance-protein-TcaB MNIKKYLIFIIGALGGLLYGYDNGIISGALTYIPKDIPLTSFQSGLVVSSMLFGAVIGAGSSGPLSDKIGRRRLVLFIAIIFALGAFILAIAPNVTILVLGRIVIGLAVGGSMATVPVYLSELAPTELRGSLGSLNQLMITIGILAAYLVSYGFADMGAWRWMLGLAVVPSIILLIGIAFMPESPRWLLENKTEKAARHVMQITYSDEEIDREIKEMKELAEKTESSWSVLKSKWLRPTLIIGCTFAILQQFIGINAVIFYASPILTKAGFGESASILGSVGIGVVNVLVTVLALFIVDKIDRKKLLVVGNIGMVASLVIMAILIWTLGIQSSAWIIIVCLSLFIVFFGASWGPVLWVMLPELFPTRARGAATGIATLVLNIGTLIVAQLFPMINAALDVEWVFLIFAAIGVVALIFVIKFLPETRGRSLEEIEIELRQRAGVKTEQ >LS483312.1|SQE70621.1|231582_231903_+|membrane-protein MVNHCSDVKNILRKGDIIFNKEQHPKLLTVLHIIMIVFVGLAVLTLLISIIAHFIVGGRPFYHFAYVLFIIGMLAEVSINIIQRQTQAVVLSIIMIVLAIIIIFAD >LS483312.1|SQE70622.1|231966_232236_+|membrane-protein MSERRRSIISSLLLILAVIIISAVVLCDIINFIAGISVNHHIINTQYNMYFVFVSMLLWIISEVFDKQYVKAVIIALVVGVLTIIALII >LS483312.1|SQE70623.1|232609_233407_-|N-hydroxyarylamine-O-acetyltransferase MMNIRAFEHYMSIDSERYSEPSLEALNDYATRFMYTVPFENINVQNGIPISVDINDLYHKIVDNHRGGFCYELNTLFQAYLKAKGFDAQMMSATVHTANGGHRLEGSHVSLVVPLQGTYYVTDVGFGDLPLHAMPITLEQDSQPVQDISGTFRAIFENENKTRFFVQKWESDTWKTKYDAILKASSIDAFKDKINYNETHPDSIFVQNLLITQPKSYGRVTMSQQHLTVTKQNRKVQYDVTPQNYRQLLQDYFNLNVTIDRLELS >LS483312.1|SQE70624.1|233544_234300_-|short-chain-dehydrogenase/reductase MFKLTNQIALVTGGANGIGKGIAAALAQAGAKVIIGDIDDTRGKETARELNGDFIELDVTQHDQVKDVVDQIVAKYERIDILASNTGVYPQIDIESLTEADWDYIQNINLKGMFFVTQAVLKVMKAQRYGRVIITSSVTGPITGYPGWAHYGASKAGQLGFMRSAALEYAKYGITVNAVQPGNVLTDGLKAQGEAYLEGTRKIIPTHELGEPLDIGYAVTFFASQEAKFITGQSLVIDGGQLLPEEPDGVL >LS483312.1|SQE70625.1|234403_234982_-|membrane-protein MEEVLTNDSFSNLTYTKLKRFNKDYWKFVLIMFPTIPISAILPYLGNIYLKNNKDNIFVHGTIFPDNWTIIAGLIFALLFFYLIVLSPLLSFKNDVQTEIDIVNSVLINNQGELHSFIHLIRCDHFETEYYEHLITFISREYTRVTKQDLSHEQQTRYDEVQPHLSLDEAHRYVRELYLTLEKRYNNINLPE >LS483312.1|SQE70626.1|235229_236765_+|PTS-system-glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific-transporter-subunit-IIC MNKVFEKAQQFGKSFMLPIAILPAVGLLLGIGGALSNPNTVKAYPVLDVAILQNIFTLMSSAGNIVFQNLPVIFAIGVAIGLARSDKGTAGLAALIGFLIMNATMNGMLVITDGLSKTTELAKHGQSMVLGIQTIETGVFGGIVTGILTAYLHNKYNKITLPAYLGFFSGSRFVPIVTAISAIFLGVILFYIWPTVQSGIFNAGGLGEKTGVIGTFFFGFILRLLGPFGLHHIFYLPFWQTGLGGSLEVGGHMVRGTQNIFLAQLGDPHVTHYFSGISRYMSGRFITMMFGLCGAALAIYHTAKPQHKKVVGGLMLSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPVLYLIHAFLDGLAFMMADIFNITVGQTFSGGFIDYILFGVLQGNDKTNYLWVIPIGIVWFVLYYVIFRTLITVFNFKTPGREDKEAQHTVAATERAETIVQGLGGKENIEVVDCCATRLRVTLKDGDLLDKSTLLKTDAKGVIVRGNGAQIVYGPHVTTIKNEVEELLEQS >LS483312.1|SQE70627.1|236970_237738_-|3-oxoacyl-ACP-reductase MTTLQDQVILITGASRGIGSAIAEACAQSGAHVIINYKSNTQAAQKTVSRCQAHGGIAEAIQADINQRQQVDEMMHYIQNNYGKLSCVVNNAFRPFEFNAETRQVADEMNWQDYATQFEGALLYTHNVIQAALPYLKQQQAASIINMTTNLIKRPIVPYHSYNVAKSALEAYTKNLAIDLGKYGIRVNCVAPGLVYPTNNTLATKEQLKQQLIQQTPLGRYTVPDDIAGPVMFLASDWSRFMTGQVLYVDGGLTI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312_3 | 241652-241736 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483312_3
|
1 spacers
spacers of LS483312_3
>3.1|241679|31|LS483312|CRISPRCasFinder CGCCCCCAACTTGCTTTGCTTGATGAATTTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483312_3
The CRISPR arrays of LS483312_3 >merge|LS483312|3|241652-241736|CRISPRCasFinder TTTTAGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCGCCCCCAACTTGCTTTGCTTGATGAATTTCTTTTTGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCC >LS483312|3|3|241652-241736|CRISPRCasFinder TTTTAGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCC CGCCCCCAACTTGCTTTGCTTGATGAATTTC TTTTTGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCC
>LS483312.1|SQE70630.1|240776_241349_+|substrate-specific-component-YkoE-of-thiamin-regulated-ECF-transporter-for-hydroxymethylPyrimidine MKRLTLADILVTVLISFIFGIIYKMVGLTVAALKPLGLHLDQIAYGLWFIAAIVAFLIIRKPGVAILAELAAGAGETILSGELNMSIIMHSLAQGLACELIFLIFKYKSTKASVAMLAGATAGIFTVPVDWFFNYLGNMPWWNVILLYVIRILSGTILSGLFGYYIVLSLEKTGVTRLYQSSTKKDIDSL >LS483312.1|SQE70629.1|239207_240275_-|Long-chain-fatty-acid--luciferin-component-ligase MDITQIKQQMTNFITDGKSEDFPQMALTLFNFQFNHNLDYQKFCIAQGKTPQTVRQWQDIPAVPIDAFKQATFSAIPPEDAAYVFMTSGTTRGIKGKNYHLDLDVYDLAMTKFFKQKVMPQIERIDMGILFPSPNDMPHSSLAHYLEVVKQQFGTSLSDTFINQQGIQFESVVQSLRHAEAQGTPYALLGASYSLVHFLDYLADHGLYFKLPKDSFIFDTGGYKNQSRDVPQSEFYSTLEKRFGVPKDKCINMYGVTELSTQFYDDGNAVSPSIKHGPHWCRSRIVNPLTLEPVPNGEKGVLIHYDLANYNSVAAIMMEDIGEARNDGFILHGRTEGALAKGCSLAVESFLNTMK >LS483312.1|SQE70628.1|237761_239195_-|acyl-CoA-reductase MTIQLGYVPFLKAEDIHYQTIQVGNYTVKVPDLTQSQLTNVCHQIKSARYHLQAYTINDIIDVIDHAIQILLDRTSKWRQLAEEILPQSTGYPFDIIKVGLTRYLMTFRKHQLHRFIAEDLPNPQILNQFIPNHKGGYTKAVSPALITHLWSGNIPGLPLWSFISSLLVKSGSICKLPHAEPFLASWFAEIIAEIDPVIAQCFAVIYWPGGETQLESIAIEQSDVILGYGNNDVLSAIAQRIPVTKRFLAYGEKVSLALIGNETLSPNKVEQVTRNIAREIANYDQQGCYSPQMFFIQQGGNYHPLQVAQMIAHQLQQLEQLFPVQSFNLQDSMTRSHWLQQAETQALLTDDIHVFKGAHASWIVTFHKQLTFLPSPLNRFVRIMPFTNITQLIQLLTPYRSYLQTVGIAAATEKMFQWSEALAQVGVCRFSSLETMTLPEAGWHHDGGFNLRDLLSFVDIEQPLLSSSEHFVDYEI >LS483312.1|SQE70627.1|236970_237738_-|3-oxoacyl-ACP-reductase MTTLQDQVILITGASRGIGSAIAEACAQSGAHVIINYKSNTQAAQKTVSRCQAHGGIAEAIQADINQRQQVDEMMHYIQNNYGKLSCVVNNAFRPFEFNAETRQVADEMNWQDYATQFEGALLYTHNVIQAALPYLKQQQAASIINMTTNLIKRPIVPYHSYNVAKSALEAYTKNLAIDLGKYGIRVNCVAPGLVYPTNNTLATKEQLKQQLIQQTPLGRYTVPDDIAGPVMFLASDWSRFMTGQVLYVDGGLTI >LS483312.1|SQE70626.1|235229_236765_+|PTS-system-glucose/maltose/N-acetylglucosamine-specific-transporter-subunit-IIC MNKVFEKAQQFGKSFMLPIAILPAVGLLLGIGGALSNPNTVKAYPVLDVAILQNIFTLMSSAGNIVFQNLPVIFAIGVAIGLARSDKGTAGLAALIGFLIMNATMNGMLVITDGLSKTTELAKHGQSMVLGIQTIETGVFGGIVTGILTAYLHNKYNKITLPAYLGFFSGSRFVPIVTAISAIFLGVILFYIWPTVQSGIFNAGGLGEKTGVIGTFFFGFILRLLGPFGLHHIFYLPFWQTGLGGSLEVGGHMVRGTQNIFLAQLGDPHVTHYFSGISRYMSGRFITMMFGLCGAALAIYHTAKPQHKKVVGGLMLSAALTSFLTGITEPLEFSFLFVAPVLYLIHAFLDGLAFMMADIFNITVGQTFSGGFIDYILFGVLQGNDKTNYLWVIPIGIVWFVLYYVIFRTLITVFNFKTPGREDKEAQHTVAATERAETIVQGLGGKENIEVVDCCATRLRVTLKDGDLLDKSTLLKTDAKGVIVRGNGAQIVYGPHVTTIKNEVEELLEQS >LS483312.1|SQE70625.1|234403_234982_-|membrane-protein MEEVLTNDSFSNLTYTKLKRFNKDYWKFVLIMFPTIPISAILPYLGNIYLKNNKDNIFVHGTIFPDNWTIIAGLIFALLFFYLIVLSPLLSFKNDVQTEIDIVNSVLINNQGELHSFIHLIRCDHFETEYYEHLITFISREYTRVTKQDLSHEQQTRYDEVQPHLSLDEAHRYVRELYLTLEKRYNNINLPE >LS483312.1|SQE70624.1|233544_234300_-|short-chain-dehydrogenase/reductase MFKLTNQIALVTGGANGIGKGIAAALAQAGAKVIIGDIDDTRGKETARELNGDFIELDVTQHDQVKDVVDQIVAKYERIDILASNTGVYPQIDIESLTEADWDYIQNINLKGMFFVTQAVLKVMKAQRYGRVIITSSVTGPITGYPGWAHYGASKAGQLGFMRSAALEYAKYGITVNAVQPGNVLTDGLKAQGEAYLEGTRKIIPTHELGEPLDIGYAVTFFASQEAKFITGQSLVIDGGQLLPEEPDGVL >LS483312.1|SQE70623.1|232609_233407_-|N-hydroxyarylamine-O-acetyltransferase MMNIRAFEHYMSIDSERYSEPSLEALNDYATRFMYTVPFENINVQNGIPISVDINDLYHKIVDNHRGGFCYELNTLFQAYLKAKGFDAQMMSATVHTANGGHRLEGSHVSLVVPLQGTYYVTDVGFGDLPLHAMPITLEQDSQPVQDISGTFRAIFENENKTRFFVQKWESDTWKTKYDAILKASSIDAFKDKINYNETHPDSIFVQNLLITQPKSYGRVTMSQQHLTVTKQNRKVQYDVTPQNYRQLLQDYFNLNVTIDRLELS >LS483312.1|SQE70622.1|231966_232236_+|membrane-protein MSERRRSIISSLLLILAVIIISAVVLCDIINFIAGISVNHHIINTQYNMYFVFVSMLLWIISEVFDKQYVKAVIIALVVGVLTIIALII >LS483312.1|SQE70621.1|231582_231903_+|membrane-protein MVNHCSDVKNILRKGDIIFNKEQHPKLLTVLHIIMIVFVGLAVLTLLISIIAHFIVGGRPFYHFAYVLFIIGMLAEVSINIIQRQTQAVVLSIIMIVLAIIIIFAD >LS483312.1|SQE70631.1|241780_243163_-|major-facilitator-superfamily-protein MSMSNSYQKGKQLIIGIILGILTYWLFAQSLLNIAPHVQHDYKIDMSVVNIAVSLTSLLTGVFIVVAGGLSDKLGRVKMTNIGLILSIIGSLALIVSNMPILLLTGRVLQGLSAACLLPSTIALINQFFTGEERQKALSFWSFGSYGGTGLASLFAGTIATYVGWRWIFILSIIFACIAIILLRGTPESKDRSSDGKRFDVIGIIVFVIMMVSVNVVITQGSKIGWLSPIILTLMIIFVLTLFIFYFYEQRQRHPFIDFSLFSNKVYIGTTIANLLVNTVIGSLALFNIFAQAGLGLTGAQAGLITIPYMLGSLLMIRIGERFMQKKGPQIPLMAGPISISVGILLLALNFLPHILYYIIALIGFSFIGLGLGFFATPALSTAVSNAPESKVGMASGIIKMTSTLGAAFGIAVVTTVYSTLEINHTPHMAATIALIVGACMVISAFIVAFLVIPKQHVKA >LS483312.1|SQE70632.1|243169_246202_-|NADH-dependent-flavin-oxidoreductase 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>LS483312.1|SQE70633.1|246279_247200_-|thiamin-biosynthesis-lipoprotein-ApbE MNKRQIKAMGTLIQLSINHDDAEYLFDLAEAKIRAWEQRFSANNTQSELMAINQQAGIRPVQVHPELFHLIKKAHQASMSSNLKLNILIGPLVKLWRIGFEDAQLPTNTEIQQRLRRIQPHHLYLNDAKHEIFLAQHGMEIDLGAIAKGYFADELQAFFLQNGVTSGIINLGGNVITIGSPATHKTWHVGIRDPFHHDGLPLLTVEIQQQSVVTSGIYERYFYQDGQLYHHILDSTTGYPVNNDIASVTIISNHSIDGEIWSTLCSFGYAQQNIDLLNQIDGVEGVIIRKNHDILFTHQLRTKLHL >LS483312.1|SQE70634.1|247495_248008_+|membrane-spanning-protein MMRNQNDKLKWSSLIMGTLLLITAIIIFSHPVKNFYALTWLIGVFIVINGILGLFFRRAAKAMTGSGTLTTFMAVIDIIFGLLVMFNVGVGSAFFIYMFAVWFVISSVIGLMTLSGQGRFKGLSILINMLGLLFGIILLFNPMMGMVIVSMMIGISFTIIGVMYIVDGLA >LS483312.1|SQE70635.1|248520_249714_+|aminotransferase MTYNFDEIIDRRSTNAMNVEGYLPYLFGNADVSDLQHTDDLIRLWIADMDFATPDVVLNAIRRRLDQKNLGYTQVFHVDYYNAFVKWTQSRYGYHFPQEQLVFSHGIVAGLIELVSYICNNEDHALILTPSYGPFKMACDENQVEVHYSPLINEEEYYRIDFDDVERQIVQHKLCIFCNPHNPSGRVWSREELERFGNIMKAHDVWLISDEIHCDIMRKGMQHLPFATVLSDYDKVITAMSQSKAFNIAGLMFSNLIIRHKGLLNTWKQQHFGSENPLSIAATQAAYEQGEDWLQAMNTYLDGNFEWLKQFLQQELPNAKFKIPEATYLAWVDLSDYITQQHISEPMAKYFIKRAGVIIEGQEQFVHNADGHIRINLAVPRTVLQQGLTKIKAALMS >LS483312.1|SQE70636.1|250217_250499_+|membrane-protein MLGTFMEILKIITPVLLASAVIATQYLLSRTGKKRFGLIIPIITLAVIVYMHITGILGLKLIGTILLTIIAELFLLGQWVSAQEDRKKKHAEK >LS483312.1|SQE70637.1|251024_252377_+|dihydrolipoamide-dehydrogenase-of-acetoin-dehydrogenase MTEKYDVIIIGAGPGGYVSAIRAAQLGKTVAIIEKNNAGGTCLNVGCIPSKTLLEHGKKVHDIQSADEWGIHTSNLTIDAAQLTSRKVQVVQTLTSGVTHLLKKNKVSYYKGEAKINSDLTVTVNDETLSSQDVVLATGSRPFVPPIPGLENVDYETTDTFFDMEALPKSLVVIGGGVIATELASSMADLGVKVNIVEVADDILLTEIDEVRALLREHLESQGIEIITSADIEKVEKKSLHLKGQDTISFDRLLVATGRQPNIEIVNDLELSRDGKYLQVDVHYQTSKAHLYAIGDLTSGYQLAHAASAHGIHVAEHLAGMQPKTIKQEDITRCIYTRLEAASVGLSAEQAEALGYEVKVTTSGFQGNAKAIIKGEGQGFVQLVTDEKYKEILGAFIVGPHATDLIGELLGVKASEGTIAELSEIIQPHPALLEAIGEGADAYYNQAIHM >LS483312.1|SQE70638.1|252465_253413_+|acetoin-dehydrogenase-E1-component-subunit-alpha MEKEQARWIYKTMNEIRYFEEKVHKIFSDGKIPGFVHLYVGEEAVATGVMSQLEDDDYITSTHRGHGHAIAKGCDLNGMMAEIMGKKTGLGHGKGGSMHVAEIDKGMLGANGIVSGGFGLAIGAGISIRNQQKENVAVCFFGDGAANEGNFHEGLNFASILNLPVIFVCENNQFGEGTTHDYASASETIAERASAYNMPGVRVDGMDVMAVLEATEEAVARAKKGEGPTLIECDTYRKYGHFEGDEQKVKSPDDRNADKNATEEFRKQVIEEGWLTEDEADDIEKAAEQAVEDAVKYADDSDLPDVESLYKDVFA >LS483312.1|SQE70639.1|253428_254469_+|acetoin-dehydrogenase-E1-component-beta-subunit MTETRKLTFMGAINEAIDQSMEQDENVILIGTDVSGGAGVKHIKDDDTFGGVFGVTKGLAKKYSRNRVIDTPIAEHITLSAGVGAAATGLRPIAELMFNDFLGFGLDPILNQGAKMRYMFGGKAKIPLVVRTVHGAGAGAAAQHSQSLYNVFAAIPGVKVVVPSNPYDAKGLLIAAVQDDNLVVFSEDKTLLGQKGNVPEEPYTVDIGKARVVREGEDLSIVAIGKMVAVAEETADRLKDDNISVEVIDLRTVSPWDEETVLTSVKKTGRLIVIDESNPQCNVAGDIASVMGDRAFDYLDGPIKKVTAPDTPVPFAANLEQAYIPNADKVLDVAAELVDDLRKVKS >LS483312.1|SQE70640.1|254486_255779_+|dihydrolipoamide-acetyltransferase-component-(E2)-of-acetoin-dehydrogenase-complex MSQNIIMPKLGMTMTEGTVEEWFVAEGDDVNEGDSIATISSEKLTQDIEAPATGTLLKIEVQAGEDAKVKGVLGIIGDADEATDNSSSSTESTNETADTSEHDQHETSTETAKDDAQSYSTEKSTADVEKSPQRHTRIFISPLARNMAEDKALDINRIKGTGGNARITKLDIQRVEAQGYDYDDSKATETSVQTSKNVDVTNIGEGLNPMRKRIAQNMRESLANTAQLTLHRKVDADRLLDFKDKLTVELNQADKDVKLTVTALLAKAVVLALKDYGAMNARYDNGELLEYEDVHLGIATSLEEGLMVPVINEADTKSIGALAEEIKKTSQAVRDGHTDDVQLSGATFTITNMGTSGIEYFTPILNLGETGILGVGALMKEVTLDGDSLRQVSRIPLSLTFDHQILDGAGAAEFLKVLAKYIENPYLLIL |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312_4 | 680913-681000 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483312_4
|
1 spacers
spacers of LS483312_4
>4.1|680944|26|LS483312|CRISPRCasFinder CTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483312_4
The CRISPR arrays of LS483312_4 >merge|LS483312|4|680913-681000|CRISPRCasFinder CTGTGCTTGTGGAATTTCTTATCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCTGTGCTTGTGGAATTTCTTATTGAAATTCT >LS483312|4|4|680913-681000|CRISPRCasFinder CTGTGCTTGTGGAATTTCTTATCGAAATTCT CTTTGTTGGGGCCCCACCCCAACTTG CTGTGCTTGTGGAATTTCTTATTGAAATTCT
>LS483312.1|SQE71022.1|679003_680740_+|thiamin-biosynthesis-protein-ThiC MKQEMIRFKKNFPASKRIFKKGSDDDIAVPFRQIELSDTQLENDAFHNDPITVYDTAGPYHDDNYDVNIDSGIPQLRKSWIDARQDVESYKGRKIQSIDNGFKKEGHKNYVAHPFQYQPKRAKQGGNVTQMHYAKQGIITKEMKFVAVREQVEPEFVRDEIARGRAIIPNNVNHPESEPMIIGKNFAVKVNANIGNSVVSSSIEAEIEKLVWAIHWGTDTMMDLSTGKNIHSTREYLIRNSPVPVGTVPIYQALEKVNGVAEDLTWEVYRDTLIEQAEQGVDYFTIHAGLLLHYIPLTVDRLTGIVSRGGSIIAQWCLAHHEESFLYTHFEDICKILNQYDVAISLGDGLRPGSIYDANDESQISELKTLGELTEIAWKHDVQVMIEGPGHIPMHKIKENQDLADFYCKEAPFYTLGPLVTDIAPAYDHITSAIGAAQIASHGTAMLCYVTPKEHLGLPNKDDVRDGVVTYKIAAHAADLAKGLPGATVRDDAISKARFEFRWIDQFNLSLDPDRAREFHDETLPSESAKIAHFCSMCGPKFCSMKLSHDIRDSYKEQLAGMKEKAKEFQAAGNKIYH >LS483312.1|SQE71021.1|676508_678284_+|putative-myosin-crossreactive-antigen MYYSNGNYEAFARPKKPENVEQKSAYLIGSGLASLAAACFLVRDGQMDGAKIHVLEELAKPGGSLDGDELPMKGYVVRGGREMENHFECLWDLFRSIPSLEVEGASVLDEFYWLNKEDPNYSRCRVIEKRGHQLPTDGDFTLTKQAIKEMIDLCLMTEEDLNDVMISEVFSKDFMNSNFWIYWKTMFAFEPWHSAMEMRRYLMRFVHHIGGLADFSALKFTKYNQYESLVLPMIAYLESHGVQFEYDVQVLDIKVDVTTTEKVAREMKLKRQGKEETMLLTPNDLVFVTNGSITESSTYGDNETPAPPTKVTGGSWNLWRNLAKQSPEFGHPEKFYQDLPEKSWFVSATATTNNKRIIDTIESICKRDPLAGKTVTGGIITVNDSAWQMSFTVNRQQQFKAQPKDEVSVWIYALYSNVKGDYINKPIVECSGNEICQEWLYHMGVPTNQIKDLAQNQCNSIPVYMPYICSYFMPRAIGDRPLVVPHQSRNLAFIGNFAETERDTVFTTEYSVRTAMEAVYQLLNIDRGVPEVVATEFDLRVLMDAMYELNDGKGLVELVEQKKLKQVALNAFLKKIKGTYIEQLLKQHKLL >LS483312.1|SQE71020.1|675717_676305_-|TetR-family-transcriptional-regulator MNKQDLRVQKTHQALMTAFHQLLKTKTFEQITIQDLCHKANIRRSTFYRHFNDKYHLLNHVVGILIDHFRELYLPEINPDNPRQFFEKLMTDILTFIHHHKNTVRSVITLNFYGEVYNIFYDQIYAAVKKQIDFDKQNGQFYVDVTIYSEFLTGGILSVITNWIQHGQQQPIDKVVNEIVTIICGAREIHLKKLK >LS483312.1|SQE71019.1|674606_675503_+|urea-transporter MEKIDVFLKNIAQVVLINSKWTGLFILIGLFVADWELGLAAALGSALSVLLAPYFNYSAEEIHNGLAGYNSVLTAIGLALFLQSTTIAWIVLVISVILTLPVGAATREFLKSYGVPMLTFPFVLMTWLILAMTTQFSTLSVTVDILPLHVKHPVISHHHISWLSGITTNFSEIFLVTSIGGSVLILIGIFLGSIKGGVYALISSIFAVACIALLGGDYPTIANGLYGYNAVLTGIALGATFMTKLNKYIAVITGLLLTIVMHGALATLLTPVGLPILTAPFIFATWLVLFAGKMSNEN >LS483312.1|SQE71018.1|674095_674398_-|urease-subunit-gamma MHFTQREQDKLMIVVAAEVARRRKARGLKLNHPEALALISDELLEGARNGKTVAELMSYGKTILNEEDVMDGVASMITELEIEATFPDGTKLITVHHPIV >LS483312.1|SQE71017.1|673675_674083_-|urease-beta-subunit MIPGEIKVKNTDIEINQGHPETVLTVKNTGDRPIQVGSHFHFYEANKALKFEREKTYGKHLDIPAGAAVRFEPGDEKKVQLVEYAGHRNIYGFRGMVNGKIDETRVYRPTGEHDSYAGVFNDQGEENLNKKGGQD >LS483312.1|SQE71016.1|671960_673676_-|urease-alpha-subunit MSFKMTQSQYTSLYGPTVGDSVRLGDTNLFAQVEKDYANYGDEATFGGGKSIRDGMAQNPNVTRDDRKVADLVLTNALIIDYDKVVKADIGVKNGYIMGIGKAGNPDIMDNVDIIIGATTDIIAAEGKIVTAGGIDTHVHFINPEQAEVALESGITTHIGGGTGASEGTKATTVTPGPWHIHRMLEVAEALPINVGFTGKGQAVNHTALIEQIHAGAIGLKVHEDWGATPSALRHALDVADEFDVQIALHADTLNEAGFMEDTMAAVKDRVLHMYHTEGAGGGHAPDLIKSASYPNILPSSTNPTLPYTQNTVDEHLDMVMITHHLNASIPEDIAFADSRIRKETIAAEDVLQDMGVFSMISSDSQAMGRVGEVIIRTWQVAHRMKEQRGVLEGDTEYNDNHRIKRYIAKYTINPAITHGISDYVGSIESGKLADLVMWDPIFFGVKPELVIKGGLINSAVNGDANGSIPTSEPQKYRKMYGQYGTNIQHTAITFVSTTAYENGIYNLLNLKRMVRPVHGIRNLSKKDMKHNHATPKLDVDPQTYEVFVDGEKITSEAATELPLTQRYFLF >LS483312.1|SQE71015.1|671495_671948_-|urease-accessory-protein-UreE MIIEEIQGNIANLTAEEKSKHIEKVYLENSDLVKRIQRVTTDHGTELGIRLRQPIDLQYGDILYQDETNMIVVDVNSEDLLVIQPRTLQEMGDIAHQLGNRHLPAQFTETEMLVQYDYLVEDLLKTLGIPYSHEDRKVNKAFRHIGHSHD >LS483312.1|SQE71014.1|670813_671503_-|urease-accessory-protein-UreF MIDHSHLRLFQFCDSQFPTGAFSHSFGLETYIQRDAVKDAATFKAWLQLFLDEQLTYSDGLAMRLVYQALEDGDTEKLLKVDRLIFVQSLPRETRVGAKQMGTRMAKLANELYDSEWMAWYLKQMAEKQAKLHPAICFTILGHYLGINIETIIDYYLYQNVSSLTQNAVRAIPLGQTTGQQVVKDLIPYIEHTRQHIFTLNEEDFGITAPGLELNQMEHENVNVRIFIS >LS483312.1|SQE71013.1|670185_670800_-|urease-accessory-protein-UreG MANPIKIGIGGPVGAGKTQLVEKIVRRLSKDLSIGVITNDIYTKEDQKILVNTGVLAEDRIIGVETGGCPHTAIREDASMNFAAIDELLERNEDIELIFIESGGDNLAATFSPELVDFSIYIIDVAQGEKIPRKGGQGMIKSDYFVINKTDLAEFVGASLDQMAEDTKTFRGNRPFTFTNLKTDDGLDDVIEWIERDVLLKGLA >LS483312.1|SQE71023.1|681240_682146_+|RarD-protein MNSNIEFKKGVLFALGAHLLWGILPIYWRLIGNISAFEILAYRIILSMIFMIIMIYILKQSTAFKRDLTHLFATPIQLIAIIVAGYVITLNWGTFIWAVSNGHVLQTSLGYYINPLVSILLAFIFLKERFNKFESLAIVFAAIGVLYMTIRVGEFPMISLMLAFSFGIYGLLKKLVRVDAMTGIAIECIVTAPAGLIYIIYLWQIHHTSVGINMASFWLLFSGAVTAVPLILFSAGARRIPLSLTGFIQYVSPTIIFLLGIFVFKEPFDIHQFITFIFIWIGIALYSISQYVKMKRNVRPE >LS483312.1|SQE71024.1|682376_682670_+|tandem-five-TM-protein MRHVTIDSIKNNSKYKIIHDGEKHYVIDLNRNKLTYIFPLLNYLLPHRLMEISDDAYFSLTTVQQSVESKVKNMMITLIGIVILFIYYRANVVDNFF >LS483312.1|SQE71025.1|682702_683020_+|tandem-five-TM-protein MVLIFIIKWLIDKRKRQRLNIEQIETEKRAYIFPEIFTMVISIILYVIAVMSFVFLSFKIFGSMGEPHLNSNVLIIMLAIILSFDQLLYSNSETSGKMSHIKVKA >LS483312.1|SQE71026.1|683370_684003_+|membrane-protein MINMGGDVLIKSIDKNVYKHALKVFALATIILMITTVITYFCHPAINDVKHLGNSSTNISSNPQGLSKVWHFIVNNGCFVPVQMFILALIPIPFLYMLNIVISVIIPGIMFGIFLNFDLHKAFTAIIAYIPHYTLEIMAYCILASGLYMLNKAIVRKVTNLFRKKKKDNYPFKKSLFKVIKIYFIFTLPLIILAAFTETYVADWIYQLMN >LS483312.1|SQE71027.1|684330_685944_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNILNASNISKKYTEDILFDHIKITLNSGDTVGLVGRNGEGKTTLLKLLSGMERPSTGVISWKKDIKIGYLNQIPDYEKSESVYQCIKSVFKELDTISKQLETIETKMIEERENINSLVARYGELQTYYEENGGYEIDAKIRKVTHGLNIAHLLKAKWGDLSGGERTKVGIAQMLIKPTDLLLLDEPTNHLDVKSIEWLASYIKNNDSATVIVSHDRYFLDETVNQIIEIDQKKLHFYNGNYSYFVEERDKRLLIEFEAYKTQQKKIKKMKESIKQLRTWASQAKPPNAAMFRRAKSMEKALNRIQRLEKPLLDSKKMHITLEEGMNVSNRVIEMENVTKAYDDVLFRNVNMLIRRGEHVAIIGDNGTGKTTLLKIILGLTSIDKGSIKTASNLKIGYLSQHEFERDGNDTLLHTFRKKVNVSEDQARHILAHFMFYGKDVFKKVNELSGGEKIRLRWAQLVNTDYNLLVLDEPTNHLDIDAKEIVEDALLDFNGTIITVSHDRYFLNKLFNTTYLLKNKTLEKFEGNYDYIKEKML >LS483312.1|SQE71028.1|686144_686522_-|membrane-protein MKKRIFLCLIFLLPIDFITIALDYHFQVGLLYVYIPALILPVILTFCFKWGKDFWLILSMKVCRFIISWGLAKIFIDFMKSAEYYEMFDGAGAIISLVIGEEIIFIIAITVFLLSKEIKKLFITQ >LS483312.1|SQE71029.1|686539_686752_-|membrane-protein MSSNFVVVIITILMIVCIDAIFYYVSKIKHAPKKILITMVAFFVSIFLVFLFIIAILEIGAMVDTGQLFV >LS483312.1|SQE71030.1|687731_688364_+|tandem-five-TM-family-protein MENVYTIYKNPRYKIIQKDNRYLIVDLEQNWYSYLCPMLNWFIPIKYTELSYKEFNNLNIFNNQNQSNQGLIAAGIGVTISVLLRSFIGLMNINISQIWMFVLFLIGFVAVITLRLSIRNKMNHPVFNKKSKQKVMLIPSFKNMVLVVFCYLMFLFLSIAPIQMIFDDNQNIFGYVGWLVTLLMFTIMNIASISDRKVHAKIKNIERQVK >LS483312.1|SQE71031.1|688571_689717_-|major-facilitator-superfamily-protein MKKVWVLTIGMFALGMDAYIVAGLIPAIGDNFNKNSAEVGQGVTVFTLFFAISAPIFSTLLAKNEVKNILILAISVFSLANLITALAPNYAIYIISRAIAGLGAGIFSPIAVSSSSHLVSKKHKGKAIAFTVGGMSVGTVVGVPLGLEVSKYTNWRFSILIIVLIGLIGLMSILKYLPRFKVQAPPNLKSRFKLFLDKHVLSVVFVTLCAAIASLGLYTYLADIIKESGNTEYLTCYLTAWGVGGLIGSFGIGFLIDKFKNPAVLMLIILFALALSFALLNVTIQVPFLNFIPFILWGAMGWATQAPQQHILLQNHANHGGAAVALNSSINYLGSALGSALGGIILLKFINTNMLIYSAIIITVIGIMLQIMNITIDRKNN >LS483312.1|SQE71032.1|689859_690711_+|LysR-family-transcriptional-regulator MNFEYMQDFIRVAEYNSINKASQELNISTPALSKRIKSVEAYFNCHLFYRTSKGIFLNEEGKLVFNTFREMQHSIADLKKQLNISFDSKWEIGVIPSFSLTNKYKNRGFDEIANLIIEDSTSILIEELSKGNIDLLIGDVSKLNNRDIYRKRLYSENFMVIYNDDNKFTESSKIEINELLSEKIYIQNPPCDTYDFIKNRSMEDKLNLNYNKHFESVIANIKAGNGITLMPVSLTSRISNMNLFQKALSGYKRDIGIASYDQRKIIKIYDFLLKNLEEERNQK |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483312_5 | 1017204-1017290 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483312_5
|
1 spacers
spacers of LS483312_5
>5.1|1017234|27|LS483312|CRISPRCasFinder CAAAGACTTTCCAAAAGAAAGTCCACG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483312_5
The CRISPR arrays of LS483312_5 >merge|LS483312|5|1017204-1017290|CRISPRCasFinder AACAACGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACACAAAGACTTTCCAAAAGAAAGTCCACGAACAACGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACAG >LS483312|5|5|1017204-1017290|CRISPRCasFinder AACAACGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCAACA CAAAGACTTTCCAAAAGAAAGTCCACG AACAACGCAAGTTGGGGTGGGCCCCAACAG
>LS483312.1|SQE71350.1|1015480_1017037_+|membrane-anchored-protein MTRKKTKIKYLSASFAIAVSTQVISPHITHAQDNTLYNEVTNEKSPAHSDNLSQNNSNQNDSDNTNQLSNSSNSANNEGKDNRPNKPSDGTDNEGKDNKPNKPSDGTNNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPNKPSDGTDNGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPNKPSDGTDHGGKDNKPSDGKDNGGTPSHPQPPTQNGGHGHKPTNQPNNKDNNNGQNNGNGNQGWNTSNGQQYPQNGEKTDHNVSDDFINQINGRGHDSGRNSSSYFPRNHYDEGPVANNQRQSIMKRFKSLAIGSFKYNPFIIEQVNKLGESGNQVSDQDLYALFRKQNFSGNSYLNSLQRGSNYFRFEYFNPTNSSKYYKNLDEQVLALITGEIGSMPDLKKPVDKKGEDNHTQRSEDKIISAEGEDHKQGMTDVKFNRLNITLIGSMCVIFVAVMVYWFINRQKEKEQ >LS483312.1|SQE71349.1|1014663_1015287_-|nitroreductase MGLFSKNSEKSFLNAIEGRRTVYNLKESISISDEELEQIMTQAIKHVPSAFNSQSTRIVLLLNNKNKQFWDNTKAVLKEKMGADRDFTATEQKIDNFKHSYGTILYFEDQSVVKGLQEQMPSYAENFAIWSTQANAMHQFAIWTALSTKGIGASLQHYNPLVDAVTHQDFDIPETWELMAQMPFGDVREEPNEKEIQPVDARFLVRK >LS483312.1|SQE71348.1|1013743_1014529_-|aliphatic-amidase MKLQLLQFNVAYADVNANEHKIKTWFSNSLQQDTDVVILPEMWNNGYALEQLEEKADFDLERSTDFIKNLALQYQVDIIAGSVSNKHHDHIFNTAFAIDKTGKVINQYDKMHLVPMLDEPAFLTAGKNVPETFKLSNGVKVTQMICYDLRFPELLRYPARSGATIAFYVAQWPSARLNHWQVLLKARAIENNMYVIGCNGCGYDGKTQYAGHSVVINPNGEIIQELSTIEKELTVTIDIDAVEQQRKAIPVFDSLVPHLYK >LS483312.1|SQE71347.1|1012549_1013116_-|accessory-gene-regulator-B-(AgrB) MKAIDKKIERFARYLQRQNNLDHIQFLKIRLGIQVALGNFFKTIVTYGVALLFHTFLYTLITHLTYFFVRRFAHGAHARSSLLCHIQNLVLFVALPWSIVHFQVSWTFMILLAFIAFIIIICYAPAATKKQPILPHLRKKKKRNAILISICFLVLMLFVSEPYMQLIALGMCLEAITLLPIFFSKEET >LS483312.1|SQE71346.1|1012403_1012547_-|AgrD MNLLSGLFTKGISVIFEFIGNFSVQDMCNGYFDEPEVPQELIDLHRN >LS483312.1|SQE71345.1|1011093_1012383_-|histidine-kinase-of-the-competence-regulon-ComD MEYLNSIFISIFQAVMLIIVAKIIANVKFYLRDYLAVAGIIVPSAVLFVVFGRQSIIFLLIICLIYFYVKIGFYSIIAILGSALIMYISNFFSVSLIILIGNFIKFRIIYVIISLSSYILIGVLCAFMTKYLINKLKKTYLFFNKVYIIVISTFLTFTIAIFYLYSLKFQQTYQEWKLFALLFIGILIFLAIFIIVITFSVHREMQYKRNLKEIETYYEYTLQIESINNEMRKFRHDYVNILSTMSEYIREDDMPGLREYFNNNIVSMKDNLQMNSIKINGTDKLKVRAIKGLVTTKILQAQEKNIPISIEVPELIEHIEMNTVDLSRVIGIIIDNAIEASESLEDALIRIAFIKNEDSVLFIVMNKCSDTTPKIHELFQENFSTKGKNRGLGLSNLKEIIDATPNTLLDTTIDNGYFIQKVEILNNIP >LS483312.1|SQE71344.1|1010364_1011081_-|Accessory-gene-regulator-A MKIYICEDDVKQRENMVEIINNYIMIEEKPMEIALATDNPYEILKMSKENEDVGCYFLDIQLEADINGIKLGSEIRKYDPIGNIIFVTSHSELTYLTFVYKVSAMDFIFKDDPAELKTRIIDCLETAHTRLKLLSKERTVETIELKRGSNSVYVQYDEVMFFESSTNSHRLIAHLDNRQIEFYGNLKQISQIDDRFFRCHNSFVVNRHNISSINSKERVVYFKNGEHCYASVRNVKKI >LS483312.1|SQE71343.1|1009298_1010273_+|Fructokinase MRTLYAIGEALIDFIPNVVNSELKDVTGFTRQVGGAPANVASTVARLGGQAHMITQLGQDAFGDIIVETLQQIGVGTSHIKRTDVANTALAFVSLKEDGQRDFSFYRKPSADMLYHPDNVEEIDVSSEDIMHFCSVDLIDSDMKQAHYKLIEKFEAQRGTIIFDPNVRLPLWKNAADCKKAINEFIPKANIVKVSDEELEFITGESSLEAGIQALFKGHVEAVIYTAGSNGASIYLKNGKHIYHEGFTVKAIDTTGAGDAFIGAVISRLLLDEDTPVTQQLEQDGAEILEFSNCVASTVTTKYGAIESIPTLEEVKQQLNKKTS >LS483312.1|SQE71342.1|1007813_1009298_+|sucrose-6-phosphate-hydrolase MSEWTREQRYQGIDDVPQSQLIELKQKVDASHYRQTYHIQPETGLLNDPNGLIFYNGTYYVSHQWFPLGAVHGLKYWFNYTSKDLVSFTPHGPILEPDTAYDSHGVYSGSAFEYNGQLYYMYTGNHRDSEWNRHSSQMLAKVDEYGDAVKFEKPVIPAPPTGYTQHFRDPNVFQKDGQYFMIIAAQNEQENACLLLYKMEEQVNEWAFVGEIATQLSNFGYMWECPDFFNLNQTDVLLFCPQGISPEGERFNNIYQSGYLLGTLDIQKPAFEHQDFKELDYGFDFYAPQTFLDKQGNRILIGWMGMPDTHYPTDDEGWAHCLTLPRVLTVEHGKLIQRPLPALQKLRHNEETAEGYANKFTTKLHPYEGLHYELIIDILENEASEVYFELRTSKQHSTLITYNKQSQRLTLDRSDSGALPEPVKGTTRSTILYTPLFQLQIFVDTSSIEIFCNNGERVLTSRIFPDEQATGIKTSTESGQVYLKFTKYELKDEK >LS483312.1|SQE71341.1|1006763_1007714_+|LacI-family-transcriptinal-regulator MKNIADIARLAGVSKSTVSRYLNNGSVSTKTKEKLSKIIKEQDYQPNQFAQSLRARHTKMIGAIIPRMNSHAVDETIKGVAHVCKELEYQLLLNYTGLDLSEEIIALETLSRSKVDGIILMATRITPQHLDVINKINVPVILVGQEHSGVNSIIHDDYLAGSYVGRQIVEANYKQVYFFGVTEEDKAVGQQRKNGVLDILALNHIDVQVFKTSFQFMEAKNDVKLHLQSVHTADAIIGATDTIALAIHSYCSQPHHKLIPHKIYGFGGDPITQIVTPQINTVMYHYFKAGQQALSQLHRLINHHDAQLLTVIPVEL >LS483312.1|SQE71351.1|1017579_1018320_-|abortive-infection-protein MSRIWISFLTIVIYALAQYLPVFIIKLTSFQIKSPTQLLHVAIYIQVILFIIAAIIIILLQKVIKNPTKLESDYKEPKRYLVQYALLGFIVVMIYQMFAGLINTWIFGELKASPNTERLMDIARQAPIFIILISIVGPILEEYVFRKVIFGEILDRLKGNIVMRFLIASVVSSLLFALAHNDITFIIVYFGMGMIFSLAYVLTKRIAVSIMIHMMQNGFVVIMQVCFGDVLKHLQTQANAIFHLFF >LS483312.1|SQE71352.1|1018500_1018785_+|molecular-chaperone-GroES MLKPIGNRVVIEKKEQEQTTKSGIVLTDSAKEKSNEGVVIAVGLGRQLENGQRITPDVNEGDRVVFQEYAGTEIKQGNDTYLILNADDILAIIE >LS483312.1|SQE71353.1|1018844_1020467_+|molecular-chaperone-GroEL MAKDLKFSEDARQAMLRGVDKLANAVKVTIGPKGRNVVLDKEYAAPLITNDGVTIAKEIELEDPYENMGAKLVQEVANKTNEIAGDGTTTATVLAQAMIQEGLKNVTSGANPVGLRQGIDKAVKVAIEALHDISQKVENKNEIAQVGAISAADEEIGQYISEAMDKVGNDGVITIEESSGFNTELEVVEGMQFDRGYQSPYMVTDSDKMTAELERPYILVTDKKISSFQDILPLLEQVVQSSRPILIVADEVEGDALTNIVLNRMRGTFTAVAVKAPGFGDRRKAMLEDLAILTGAQVITDDLGLELKDATMDMLGSANKVEVTKDNTTIVDGDGDNNNIDARVSQIKAQIEETDSDFDKEKLQERLAKLAGGVAVIKVGAASETELKERKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVNIYKKVSDIQAEGDVETGINIVLKALTAPVRQIAENAGLEGSIIVERLKHADSGVGFNAATNEWVNMLEAGIVDPTKVTRSALQHAASVAAMFLTTEAVVANIPEPESNNQPPMGGGMPGMM >LS483312.1|SQE71354.1|1021009_1022296_-|aspartate-aminotransferase MNPLAQNLNNELYQYNPEVLSMLSQLGKEMFYPKGILSQSADAKSTKYNATIGMATDKDGKMYANELYGVFNHLSPDEIFPYAPPQGIEGLRTLWQEKILKENPDLKSHMISKPIVTNALTHGLSLIGDLFVDTNDTILLPSHNWGNYKLIFNTRHQANINTYDIFDNNGHYTTDALVSTLEHYTSDKVIMILNYPNNPTGYTPTKQEVKTIVEAIEALANKGTKVIAVVDDAYYGLFYEDVYTQSIFTALTTLNHKNILPVRLDGATKEFFAWGLRVGFMTFGIHNDTAQQVLEAKVKGLIRSNISSGPMPSQSAIKYVLEHHEQFNKEIQTNINTLQERYAVTKEVVYDKQYQRHWQAYDFNSGYFMALKVNGVDPEELRVHLINKYSIGIIALNDTDIRVAFSCVEKDDIPHVFNSIAQAIEDLK >LS483312.1|SQE71355.1|1022769_1022949_+|membrane-protein MKHLTKIFAILAIILFVLGYYLQATNHESSGIKILTAAILFIICAFISRNNDRRKQNRK >LS483312.1|SQE71356.1|1023174_1023555_+|GntR-family-transcriptional-regulator MKILIKNTSNQPIYEQIKQQIKENILTGQIDAGSHLPSMRELAKDLQVSLITTKRAYEDLEKDGFVTTIRGKGTFVKEQDQSILKEKQFIVIEQLAHSLCKEAKTIGMPLAEIKEIISLIYEEDEV >LS483312.1|SQE71357.1|1023551_1024439_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MNVVELNNVNYKNPSIELKNISFNIPRGFVTGFIGANGSGKTTIIRLIMGLLEASSGTIQLFNRTMDDAPQYIKDKIGFVYSDIYANPDWTIDKLEYYTAPFYNQWDTKCFNDYLRQFHLNKQQKIKMLSSGMKMKLSLALALSHHAELFVFDEPTSGLDPVARNEVLTLIQHELLDEQKTVLMSTHIMSDLEKIADYLVYLKHGEILLTGECDALLAKYDIVKGDAAQLDSELDDLLDYKEIRHTGYLGLTSHGNTFKELFGHDVEVYSPTIEELMIYLDKGQKNNLSVREDSQ >LS483312.1|SQE71358.1|1024435_1025101_+|membrane-protein MKSLLMRNFKLRQWTLYIYLGLLVFFPIYIIITVNTDFGFIIFIPIGIILMIISIFDAGHMFRVHKRLGGQQAYIYFASLPVSKKDMLRANYLTCLLLTLFGALVIGLYDSQTIDNELMNRLHISTAYSFLIVNFLSIPIAFPKYTEYKRKGVSYVGYLIFMLIVIPVMYSFFFTVLNHALFNNQLSKNEVAYFLNNGLLVIAILIFIINYFIQLKYIKRL >LS483312.1|SQE71359.1|1025119_1025992_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQLKKITKTYKDNVVLDQIDFDFKESQIVGLIGKNGVGKTTLMKVMNNNIINYQGEVAVNREDNIGYLIEHPKLYDNKSGLDNLKLFAQVLGNGFDKSYSDKIIDAFGMRSYINKKVKKYSMGMKQKLAIAVSLMNKPKYLILDEPTNGMDPDGSIDVLETIKSLVEELQMKILISSHKLEDIELICDRAIFLRNGKFVQDVDMTKGSIDDATIIKVKVEQFDEAKEVLENHFNVLESHAELGELHIKIQQDYSQLLKLLAQRHVYPTFIESRKNSLRDTYFNINQRGDK >LS483312.1|SQE71360.1|1025991_1026720_+|ABC-2-transporter-family-protein MRSLQLVKYDLISIIKSYLTYVAIALVGGLFGLVSYLFMKNAHKVHYESLIPMINWALLFVGTLFVIKTITRDYSQGTIQLYMNRVSSRIGYVMAKVISIILIALIFAGVAYISMLLIQAFTKGDKLDGDIFLKNIWFYVIFLLFYGLVLFLLTLIVQKPAVIFTIGIFLIFIVPFIDPFLGLIPEWGEHIQDAMKYIPFSYLTKKELNSNIEFTNWQWFISIASIVVLFVTTLFYATKRDI |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483312_6 | 1244150-1244240 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483312_6
|
1 spacers
spacers of LS483312_6
>6.1|1244174|43|LS483312|CRISPRCasFinder AATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483312_6
The CRISPR arrays of LS483312_6 >merge|LS483312|6|1244150-1244240|CRISPRCasFinder AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGCAATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACTAAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC >LS483312|6|6|1244150-1244240|CRISPRCasFinder AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC AATAAAGGAATACCTGAGCTGAAGCTCATGCATAAGAAGCACT AAACTCGCCATGCTCGTTAAGTGC
>LS483312.1|SQE71555.1|1242252_1243962_+|phosphate-regulon-sensor-protein-PhoR MLKFHQRLLLLLCTITIISFIGLGAIMHHSIYQTLTDKKVADLTKKTENYSKLEEQGKTEEIKNIAKNENISVKITEGNKIIFETKSHYDINPAIDNAANPSNIIYDRADEGYHYTFKNKFSNEAIYISGIDDEMVNLQKELWKYIALIGVVVLIAIYLAVRSIKRTYIRPINEVTYATSLLADGYYHVRVPESNVKETKALFVTTNELARRLQKLNNKQKIQSNRLKTTLENIPSSVLMIDKYGEIVVANHSYYEVFGLEEKVENKDYNDFIDDKIKQLILEAFKTEKSMYNQVEVNINNVHHKYFDVSCVPILSKSKKHLQGMVVVLHDITNLKKLENLRREFVANVSHELKTPITSIKGFAETLIEGAKDDVASLDMFLNIILKESNRIESLVMDLLDLSHIEQQRELETAYVNLSELAHNTVDNLQNQAKDKNIEIIDEISPDIIFKANKNKIAQVITNLLSNAINYSLENNRVIVRVYRQQSKVYLEIQDFGIGISKEEQKHIFERFYRVDKARSRDSGGTGLGLSITKHIVEAHHGVISVKSEPNKGSTFKVTFTDNYSNNEV >LS483312.1|SQE71554.1|1241542_1242253_+|alkaline-phosphatase-synthesis-transcriptional-regulatory-protein MSQKILVVDDEQSIVTLLKYNLETAGYIVEVAYDGEEALEKVEKVQPDLIVLDVMLPKKDGIEVCKTIRSDKNLVPILMLTAKDDEFDRVLGLELGADDYMTKPFSPREVVARVKAILRRSQFVNEAANDAANEEDILIENIRIRPEFFEVYKDDELLELTPKEFELLLYLIERQGRVITREHMLNSVWNYEFAGDSRIVDVHISHLRDKLEENPKQPKLIKTVRGLGYKLERPKA >LS483312.1|SQE71553.1|1240070_1241339_+|isocitrate-dehydrogenase MSAEKIVKTQDGLQVPNEPIIPFIIGDGIGPDIWKAASRVIDAAVEKAYNGEKQIVWKEVLAGQKAYDETGEWLPSETLKTIEEYLIAVKGPLTTPIGGGIRSLNVALRQQLDLFTCLRPVRWFKGVPSPVKRPQDVDMVIFRENTEDIYAGIEFKEGTEEVKKVIDFLQNEMGASNIRFPETSGIGIKPVSKEGTERLVRAAIQYAIDNGRKSVTLVHKGNIMKFTEGSFKQWGYDLAHNEFADKVFTWQQYDEIVENDGKEAANKAQERAEQQGKIIIKDSIADIFLQQILTRPAEHDVVATMNLNGDYISDALAAQVGGIGIAPGANINYETGHAIFEATHGTAPKYAGLNKVNPSSELLSSVLMLEHLGWQEAADKITDAIESTIASKIVTYDFARLMDGATEVLTSEFADELIKNLK >LS483312.1|SQE71552.1|1238904_1240023_+|Citrate-synthase-(si) MAELKKGLEGVIAAETKISSIIGSQLTYAGYDIDDLAENAEFEEIVFLLKNYRLPTEEELADLKKKLNYYMTLNPRVYKHFEEYVTDNVHPMTALRTSVSYIAHFDPNAEGESEEKILERSIRIQAKVASLVTAFARVRDGKEPLKPKAELNYAGNFLYMLRGELPTDIEVEAFNKALVLHADHELNASAFTARCAVSSLSDMYSGIVAAVGSLKGPLHGGANERVMNMLSEVKSVDQVDDYLDEKFANKEKIMGFGHRVYKEGDPRAKYLREMSRKITSETGRSELYDISIAIEKRMKEEKGLIPNVDFFSATVYHSMDIPHDLFTPIFAVSRTAGWTAHILEQYRDNRIMRPRAKYIGEKDRKYIPIEER >LS483312.1|SQE71551.1|1237199_1238558_-|D-serine/D-alanine/glycine-transporter MEDKLQRELSNRHVQLIAIGGAIGTGLFLGAGQTIAMTGPSILLTYILIGFMLFMFMRGLGEIIIQNTEFKSFADVTNKYIGPFAGFVTGWTYWFCWIITGMAEVTAVAKYVSFWFPQIPNWVSALFCVLILMTFNLLSARLFGELEFWFAIIKIATIVGLIVVGLVMILMAYKTQFGSASFANLYQNGIFPKGASGFFMSFQMALFSFVGIEMIGVTAGETKDPQKTIPKAINSVPLRILVFYVGALAVIMSIIPWDKVSPDDSPFVRLFALIGIPFAAGLINFVVLTAAASSCNSGIFSNSRMLFGLADQQQAPPIFRSTNKQGVPHIAIIGSSVFLLVAALLNYIFPDATLVFTYVTTISTVLFLVVWGLILWAYINYSRRNPELHKQSTYKLPGGKYMGYIILLFFVFVFALLFVNVETRRAIYFTPVWFIILGLMYYRYKQMAKKTK >LS483312.1|SQE71550.1|1234888_1236649_+|pyruvate-kinase MRKTKIVCTIGPASESEEMLEKLMKAGMNVARLNFSHGSHEEHKARIDTIRKVAKKLGKTIGILLDTKGPEIRTHDMKDGLIMLEKGKEVIVSMTQVEGTPEKFSVTYENLINDVQVGSYILLDDGLVELEVKEIDKANGEVRCEILNTGELKNKKGVNLPGVRVNLPGITDKDADDILFGIKEDVDYIAASFVRRPSDVLDIREILERENNHNITIFPKIENQEGIDNIEEILEVSDGLMVARGDMGVEIPPESVPIVQKDLIRKCNKLGKPVITATQMLDSMQRNPRATRAEASDVANAIYDGTDAVMLSGETAAGLYPEEAVKTMRNIAVSAEAAQDYKKLLSDRTKLVETSFVNAIGVSVAHTALNLNVKAIVAATESGSTAVTISKYRPHSDIIAVTPSAHTARQLALVWGAYPVIKKGRKTTDDLLNNSVATAVETGRVTNGDLIIITAGVPTGEKGTTNMMKLHLVGDEIAKGQGVGRESVVGQSVVADDASDLEGKDLSNSIIITTSVDETLVPYIEKAAGLITEENGITSPSAIVGLEKGIPTIVGVEHATKEIKDGILITIDASQGKIFEGYANVL >LS483312.1|SQE71549.1|1233902_1234871_+|6-phosphofructokinase MKKIAVLTSGGDSPGMNAAVRAVVRTAIYNNIEVYGIYQGYQGLLDDNIHKLELGSVGDTIQRGGTFLYSARCPQFKEAEHRKVGIDNLRKRGIEGLVVVGGDGSYRGAQRISEECPEIQTIGVPGTIDNDINGTDFTIGFDTALNTIIECVDKIRDTASSHARTFIVEVMGRDCGDLALWAGLSVGAETIMVPEVKTEIKDVAEKIESGIKRGKKHSIVMVAEGCMSGQECADELMKYINVDTRVSVLGHIQRGGSPSGTDRVLASRLGGHAVDLLIQGKSGLGVGITHNQLTATPFDEIFKISDHKFNNDIYELAKKLSI >LS483312.1|SQE71548.1|1232795_1233740_+|acetyl-coenzyme-A-carboxyl-transferase-subunit-alpha MLDFEKPLYDIKNKIESLKESQQKNDVDLQDEIDLLEASLKRETKKIYTNLKPWDRVQIARLQERPTLLDYIPHIFDAFIEFHGDRNFRDDPAMVGGIAYLNEMPVTVIGQQRGKDTKDNIYRNFGMAHPEGYRKALRLMKQAEKFNRPIFTFIDTKGAYPGKAAEERGQSESIAKNLIEMASLSVPVIAIVIGEGGSGGALGIGVANRILMLENSTYSVISPEGAAALLWKDSSLAKMAAETMKITANDLLQLKIIDNVIEEPLGGAHRDIEIQAQHIKAAFEKELAELSKLNKKQLAEDRYNKFRHIGSFVD >LS483312.1|SQE71547.1|1231936_1232794_+|acetyl-CoA-carboxylase-subunit-beta MFKDFFNRSSKKKKYLTVQDSKQNDVPAGIMTKCPKCKKIMYTKELAENLNVCFNCDHHIALTAYKRIEAVSDEGSFQEFDKGMTSANPLDFPGYEEKIEKDQQKTDLQEAVVTGIATLENLPFGIAVMDSRFRMGSMGSVVGEKICRIIDYCTEHRLPFILFSASGGARMQEGIISLMQMGKTSVSLKRHSDAGLLYISYLTHPTTGGVSASFASVGDINLSEPKALIGFAGRRVIEQTINEKLPEDFQTAEFLLEHGQLDKVVHRKDMKETLAQILKMHQEVN >LS483312.1|SQE71546.1|1230618_1231848_+|NADP-dependent-malic-enzyme MSLRDDALQMHKENQGKLQVTPNVKVTNKKELSLAYSPGVAEPCKEIHEDPRTVYDYTIKRNTVAVVTDGTAVLGLGNIGAAASIPVMEGKAVLFKSFAGINGVPIALDTTDTEEIIQTVKLISPNYGGINLEDISAPRCFEIEERLKKETNIPVFHDDQHGTAIVTLAGLINALRIVDKPLSDIKIVLNGAGAAGIAICKLLDAYGVRHMIMCDSKGAIYEDRPYGMNETKSFVAKFTNKDKIEGSLQDVIKEADVFIGVSIADLLTKEMVQSMSKDAIIFAMANPNPEIKPEDAKEAGAKVIGTGRSDFPNQINNVLAFPGIFRGALEVEATHINEEMKKAAVEAIANLIQPDELRPDYCIPDPFDKRVAPSVAREVARAAMETGVARIEVEPQAIYDKTMKLTDIQ >LS483312.1|SQE71556.1|1244287_1246921_+|DNA-polymerase-I MDKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAIYGFAMLLEKILKEEQPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQSTPPELSEQFPYIRQLLDAYHIKYYELENYEADDIIGTLSKQAEASGLETIIITGDRDLTQLATDHVTIYYTKKGVTDVDHYTPEFIAEKYNGLLPKQIIDMKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFHSVEGVYNHLDEVSGKKLKENLENSKADAFMSKDLATINCDSPIKVNLKDTIMGDLNDNKDKIELFQKLEFKQLLNDIDSSASENNSETEQNFEVIHHFDNINFKKLDNAIIHFEIDGSNYLKDKILKFGLYAQNQYIVISAEDIHQYTELIEWLENDHNNKIVFDAKKTYVAAHRLEINLQHIDFDVMLASYIINPSRTIEDVQSVVSYYNQNFVKSDIAVYGKGKKRQVPLDDVLEVHIAAIMQAIYNCKPLMSDILSDHNQMDLLNNLELPLARILADMEETGIYTDVNDLKEMQNELQEKLDNLVSEIYEAAGESFNINSPKQLGIVLFETLKLPIIKKTKTGYSTAVDVLEQLQGKHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSIDPNLQNIPIRLEEGRKIRKAFKPTSDDYVILSADYSQIELRVLAHMTQDESLKEAFIYGDDIHAATAMKVFGVEKDQVNDLMRRQAKAVNFGIVYGISDYGLSQNLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMTDIVKDAKANGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRSFAERTAMNTPIQGSAADIIKLAMVQFDKNVRETNYHAKLLLQVHDELIFEVPKSEVQDFSEFVEEIMDNALTLAVPLLVDSSYGATWYDAK >LS483312.1|SQE71557.1|1246937_1247810_+|formamidopyrimidine-DNA-glycosylase MPELPEVEHVKRGIEPFIINTIIKSVTFSSKVIDGKSDGKETIIKGINLDGFRQFTEGYKIYKVERCSKYINIYIEKNQERRVLISHLGMAGGFFIVNHLDEIYAPNYRKHWHVIFHLSNGKLLVYSDIRRFGEIRNVQALNNYASFKNMAPEPFDESALDHYLTYLNQTKVKHKPIKQLILDHKVIAGCGNIYACEALYRAAIHPATEVQSLNQQARQNLFLEVQAVLNEGIKYGGTSISDYRHADGKTGTMQLRLNVYKQQQCKKCGHKIEQQVIATRNSHFCPVCQK >LS483312.1|SQE71558.1|1247825_1248431_+|Dephospho-CoA-kinase MPKVIGLTGGIATGKSTVSELLTAYGFKVVDADIAAREAVKKGSAGLEQVRQTFGNEAINDDGEMNRQYMGQLVFNHPDKRTELNEIVHPIVHQLMDKEKSRYLNQGYNVVMDIPLLFENELEDTVDEVWLVYTSESIQIERLMERNNLSLEEAKARVYSQISIDKKSRMADIVIDNLGDKLELKQNVERILTDQGYINQE >LS483312.1|SQE71559.1|1248577_1249579_+|NADPH-dependent-glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MSTNIAINGMGRIGRMVLRIALKNEALNVVAINASYPPETIAHLINYDTTHGRYDKRVEPIESGIRVEGHDIKLVSDRNPENLPWKDLEIDIVIEATGKFNHGDKAKAHIQAGAKKVLLTGPSKGGKVQMVVKGVNDQDLDTDTYDIFSNASCTTNCIGPVAKVLNDSFGIENGLMTTVHAITNDQNNIDNPHKDLRRARSCGESIIPTSTGAAKALKEVMPELNGKLHGIALRVPTQNVSLVDLVVDLKQKVTVDEVNHAFRDANLQGIIDVEEAPLVSKDYNTNPHSAVIDAKNTMVMGDNKVKVIAWYDNEWGYSNRVVEVANQLGELIK >LS483312.1|SQE71560.1|1249751_1250759_+|Biotin-synthase MNLANQIINGKYLTQAECLKIYRDASLATLDLVHEAYLIRRHYFGHKVKLNMILNAKSGICSEDCGYCGQSREMKHKQRYALVSNETICKGADVASNNKIGTYCIVMSGRGPSDKEVEHITKTVKDIKKDHPQLKICACLGLANEEQAEKLKAAGVDRYNHNINTSESYHGQVVSTHTYDERIQTLSYMKEHHISPCSGVICGMGESDEDIIDMAFALKKIDADSIPVNFLHPIQGTKFGSMDDLKPMKCLRILSIFRLINPTKEIRVAGGREVNLRSLQPLALQIANSIFVGDYLITGGQPNELDYQMLEDLGFEIDYGNDDEITFSHPQFKSK >LS483312.1|SQE71561.1|1251075_1251546_+|NrdR-family-transcriptional-regulator MKCPKCSSTHSKVVDSRHADEANAIRRRRECEKCGTRFTTFEHIEVSPLIVVKKDGTREQFLREKILNGLVRSCEKRPVRYQQLEDITNKVEWQLRDEGHTEISSRDIGEHVMNLLMHVDQVSYVRFASVYKEFKDVDQLLASMQGILNDNKRSDS >LS483312.1|SQE71562.1|1251546_1252923_+|Helicase-loader-DnaB MTMQAYQFDLRPRDSFEVIRHFELSQAHLEILNRLYAPLIGTHAIGLYHYLNQFVSENNQELLTHYTIMNELKVNLLDFRKTMDYLEGIGLLKSFVRHQSDNSNFIYELIQPPTAYQFFNDPMLSVFLFSEVDKKRFVQLKQYFEQDRKDLTNYQNITHKFTEVFKMPNKDIKIDSQNIKSSQYYKGLDLSNEHFDFELLKELLQHHFISSEIVTDEAKALILQLATLYGLTVEAMKRMILNSITSAQTLSFEELRKQARSYYLIEHEQQLPKLAINADKYYDSESQHTRDNSTNTKQDEWLSSLDNISPVDMLSSWSGSEPTHQQKLMIEELVSREKLPLGVINILLQFVMLKNEMMLPKKYIFEVASNWKKLGISNAKEAYERALKMNEPKQVEQKPQNAKNRYYGKQIVSREKTPKWLENRDTAKRQEKIKKKDDNLEKDRQQFLEQLKKDWGDD >LS483312.1|SQE71563.1|1252922_1253843_+|Helicase-loader-DnaI MKSFKNIMGSDSNLEQRISQIKQQVINDPDVKQFLTMHQSELTNAMIDRDLNVLQEFKDQQKHYDGHDYHSCPNFVKGHIPELYVEDERIKIKYLPCPCKIKYDEARFDSQLVTSHHMQRDTLNAKLNDIFTEDRDRLEIAIKANHICKSIINGESVKGLYIYGPFGTGKSFILGAMANQLKSQKVASTIVYLPEYIRSLKNGFKDGSYEQRLARIREAGILMLDDIGAEEVTPWVRDEIIGPLLHYRMVQELPTFFSSNLSFEELEHHLSITREGAEKTKAARIIERIKSLADDVYLEGKNYRNN >LS483312.1|SQE71564.1|1254202_1256140_+|Threonyl-tRNA-synthetase MTKINIQFPDGNKKAFDKGITTEEIAQSISPGLRKKAVAGKFNQQLIDLARPLEEDGEIEIVTPGSEEALEVLRHSTAHLMANALKRLYGNVQFGVGPVIEGGFYYDFDMENKISSDDFEKIEKMMKQIVNENHKIERKVVSREEAKEFFKDDPYKLELIDAIPQDEMVTLYSQGDFTDLCRGVHVPSTAKIKEFKLLSTAGAYWRGDSNNKMLQRIYGTAFFDKKDLKAHLQLLEERRERDHRKIGKDLELFTNNQLVGAGLPLWLPNGATIRREIERYIVDKEVSMGYDHVYTPVLANVDLYRTSGHWAHYRDDMFPPMKLDENEEMVLRPMNCPHHMMIYKNKPHSYRELPIRLAELGTMHRYEASGAVSGLQRVRGMTLNDSHIFVRPDQIKDEFKRVVHMIQDVYKDFGFEDYTFRLSYRDPEDKEKYMDDDDMWNKAESMLKEAVDELGLPYVEAIGEAAFYGPKLDVQVKTAMGKEETLSTAQLDFLLPERFELTYIGSDGEYHRPVVIHRGVVSTMERFVAFLTEETKGAFPTWLAPKQVEIIPVNVDLHYDYARNLQDELKSQGVRVEIDDRNEKMGYKIREAQMQKIPYQIVVGDKEVENNQVNVRQYGSQDQQTLERDEFIWNLVDEIRLKKHR >LS483312.1|SQE71565.1|1256603_1258097_+|lysine-specific-permease MSKIESQNGGIIRGLKDRHISMIAMGGCIGTGLFMTSGGAIHDAGALGALIAYAIIGIMVFFLMTSLGEMATYLPVSGSFSTYATRFVDPSLGFALGWNYWFNWVITVAADVTIAAQVIQYWTPMAGIPAWLWSCIFLVIIFSLNSLSVRIYGESEYWFALIKVVTVIIFIAIGLLTIIGIMGGKFVGFETFTKGEGPILGGNFGGSLLSILGVFLVAGFSFQGTELIGITAGESENPERAVPKAIKQVFWRILLFYILAIFVIGMLIPYDSNALMGGDNSIATSPFTLVFKNAGLAFAASFMNAVILTSVLSAGNSGMYASTRMLYSMSKDKLAFPIFGKTNKYGVPYLSLLLTAILVIIIFLVQKVSGNAYEYIVAASGMTGFIAWVGIAVSHYRFRRAFQRQHHNKKELKYKAKWFPFGPIFAGILCVIVIIGQDVDFIKTGEFDLNRFVITYMGIPVFLVFFIYHKLRYKTKKIPLEEVDLRQDVHMNEIKHH |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312_8 | 1673458-1673545 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483312_8
|
1 spacers
spacers of LS483312_8
>8.1|1673489|26|LS483312|CRISPRCasFinder GGGTCCCCAACAGAGAGAATTTCGAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483312_8
The CRISPR arrays of LS483312_8 >merge|LS483312|8|1673458-1673545|CRISPRCasFinder AAGAAATTCGACAAACAAAGCAGGTTGGGGTGGGTCCCCAACAGAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGT >LS483312|8|8|1673458-1673545|CRISPRCasFinder AAGAAATTCGACAAACAAAGCAGGTTGGGGT GGGTCCCCAACAGAGAGAATTTCGAA AAGAAATTCGACAAACAAAGCAAGTTGGGGT
>LS483312.1|SQE71960.1|1672183_1673098_-|SMF-family-protein MHWQVIMSKKGSGLVDDIVLLKLRYSGIQAPQFQRLIHAYPNFLSLSEDDLLNLLSKTEIKKWFGDIAAQYKRISEDYILTSLYDASVKFITINSQCYSTLLKEIYDFPPILFYRGDISLLNSNTTLAVVGSRKATSYSYKALDFLFSEFNRRFTIVSGLAKGADSMAHELAIQHHHATIAVLGFGHLTHYPKETYILRQKIEAHHLSISEYLPFEPVTKYHFPQRNRLISGISKGVLITEAEKRSGSQITIAHALDQNRNVYVLPGDLFNPLTQGNLYRAREGACIVTGAEDILMDYDINKVF >LS483312.1|SQE71959.1|1669942_1672012_-|DNA-topoisomerase-I MADNLVIVESPAKAKTIEKYLGKKYKVIASMGHVRDLPRSQMGVDVDDNFEPKYITIRGKGPVVKELKKYAKKAKKVFLASDPDREGEAIAWHLSNILELEDSKENRVVFNEITKDAVKESFKHPRDIEMDLVDAQQARRILDRLVGYNISPVLWKKVKKGLSAGRVQSVALRLVIDRENEIRNFKPEEYWTIEGEFRYQKSKFTAKFLHYKNKPFKLQNKDDVNKVTAKLDGDQFEITNVNKKEKTRNPAQPFTTSTLQQEAARKLNFKARKTMMIAQQLYEGIDLKRQGTVGLITYMRTDSTRISDAAKNEAKSYITENYGSNYVSKRQAKGKQGDQDAHEAIRPTSAMRTPNEMKSYLSRDQHRLYKLIWERFVASQMAPAILDTVALDVTQNDIKFRANGQTIKFKGFMTLYVEAKDDKENDKENKLPNLKEGDKVTATQIEPAQHFTQPPPRYTEARLVKTLEELKIGRPSTYAPTIDTIQKRNYVKLDSKRFVPTELGEIVYEQVKEYFPEIIDVEFTVNMETLLDKIAEGDMKWRKVIDDFYNSFKLDVARAEKEMEKIEIKDEPAGEDCEVCGSPMVIKMGRYGKFMACSNFPDCRNTKAIVKTIGVTCPTCKKGDVVERKSKKNRIFYGCSNYPECDFISWDKPIGRDCPKCEHYLVEKKKGRSSQVVCSNCDYQEEAQK >LS483312.1|SQE71958.1|1668583_1669891_-|tRNA:m(5)U-54-MTase-gid MTQTVNVIGAGLAGSEAAYQLAQRGINVNLIEMRPVKQTPAHHTDKFAELVCSNSLRGNALTNAVGVLKEEMRRLDSLIIKAADQAKVPAGGALAVDRHDFAGYVTDALRSHPNVTVLNEEITQIPDGHSIIATGPLTTSSLAQEIVNITGKDQLYFYDAAAPIIEKDSIDMDKVYLKSRYDKGEAAYLNCPMTEEEFNRFYDAVLAAEVAPVNEFEKEKYFEGCMPFEVMAERGRKTLLFGPMKPVGLEDPKTGKRPFAVVQLRQDDAAGTLYNIVGFQTHLKWGAQKEVIQLIPGLENVEIVRYGVMHRNTFINSPDVLNEKYELIGNEHIQFAGQMTGVEGYVESAASGLVAGVNLAHKLLAKGEVIFPRETMIGSMAYYISHAKNDKNFQPMNANFGLLPVLEKRIKDKKERYETLANRALEYLEKYKKTL >LS483312.1|SQE71957.1|1667558_1668452_-|Site-specific-tyrosine-recombinase MNEIQKAFLYMLKVERNFSDHTIKSYHDDLMQFNEFLAQEMLTLSTFEYKDARNYLSYLYNKNLKRTTVSRKISTLRSFYEYWMTQDETVINPFVQLVHPKKEQYLPQFFYEAEMDALFETVLHDAKKGLRDRVILELLYSTGMRVSELVHIKKMDIDLTLPGVKVLGKGSKERFLPFGEFCKQSIEQYLLEFGPVKQNDHPFLLVNMNGQPITERGVRYVLNDIVKRTAGVTDIHPHKLRHTFATHLLNQGADLRTVQSLLGHVNLSTTGRYTHVSKDQLRKVYLNAHPRAKKERN >LS483312.1|SQE71956.1|1667015_1667558_-|ATP-dependent-protease-HslV MSTSIHATTIYAVRHNGEAAMAGDGQVTLGQQVIMKQTARKVRRLYDDKVLAGFAGSVADAFTLFEKFETKLQQFSGNLERAAVELAQEWRGDKQLRQLEAMLIVMDKSGILVVSGTGEVIAPDDDIIAIGSGGNYALSAGRALKRHAAHLSAKEMAYESLKVASDICVFTNDNIIVETL >LS483312.1|SQE71955.1|1665565_1666969_-|ATP-dependent-protease-ATP-binding-subunit-HslU MDTNGIKLTPKDIVSQLNEYIVGQDDAKRKVAIALRNRYRRSLLDEETKQEIAPKNILMIGPTGVGKTEIARRMAKIVGAPFIKVEATKFTEVGYVGRDVESMVRDLVDVAVRLVKNQKKAMVKDEAVAKANDKLVKLLVPSMKKKAAQGNNPLENLFGGAIPNFGNNQEDEEEPPTEEIKTKRSEIRQQLLAGKLEDEKVRIKVEQDPGALGMLGTNQNQQMQDMMNQLMPKKKVEREVPVKAARNILADDFADELIDQETANQEAIELAEQMGIIFIDEIDKVATNNQSSGQDVSRQGVQRDILPILEGSMIQTKYGTVNTEHMLFIGAGAFHVSKPSDLIPELQGRFPIRVELESLTVNDFYRILTEPKLSLVKQYEALLKTEEVTVNFTDGAITKLAEIAYQVNQDTDNIGARRLHTILEKMLEDLSFEAPNMPNAVVDITPQYVDEKLKSISTNKDLSAFIL >LS483312.1|SQE71954.1|1664770_1665544_-|GTP-sensing-transcriptional-pleiotropic-repressor-codY MSLLSKTRELNTLLQKHKGIAVDFKDVAQTISNVTVTNVFIVSRRGKILGSSLNELLKSERINQMLESKHIPEEYTEQLMEVKQTQSNIDIDNVLTVFPPEDRETFINSRTTVFPILGGGERFGTLVLGRVKDDFNENDLVLGEYAATVIGMEILREKHNEVEKEARDKAAINMAINSLSYSEKEAIEHIFEELGGNEGLLIASKVADRVGITRSVIVNALRKLESAGVIESRSLGMKGTFIKVKKEKFLDELERNK >LS483312.1|SQE71953.1|1663763_1664552_-|30S-ribosomal-protein-S2 MAVISMKQLLEAGVHFGHQTRRWNPKMKKYIFTERNGIYIIDLQKTVKKVEEAYNFIKQVSEDGGKVLFVGTKKQAQESVKAEAERAGQFYVNQRWLGGILTNYKTISKRIKRISEIEKMEEDGLFDVLPKKEVVELKKEYDRLIKFLGGIRDMKSMPQALFVVDPRKERNAIAEARKLNIPIVGIVDTNCDPDEIDYVIPANDDAIRAVKLLTGKMADAVLEGQQGVSNEEVAAEQNIDLDEKEEAKDAETTEENTSVESN >LS483312.1|SQE71952.1|1662701_1663580_-|Translation-elongation-factor-Ts MAISAKLVKQLRERTGAGMMDCKKALTETDGDIDKAIDYLREKGIAKAAKKADRIAAEGLVHVEVKGNEAAIVEINSETDFVARNEGFQELVKEIANQILDTKPESVDALMETKLPNGQSVDEKMKEAISTIGEKLSIRRFAVKSKSDNDAFGAYLHMGGRIGVLSVVEGSTDEEAAKDVAMHIAAINPKYVSSEQVSEDEINHEREVLKQQALNEGKPANIVEKMVEGRLRKYLQEICAVDQNFVKDPDQTVEAFLKSKGGKLVDFVRYEVGEGMEKREENFADEVKGQMK >LS483312.1|SQE71951.1|1661842_1662565_-|Uridylate-kinase MTQTSKYKRVVLKLSGEALAGEKGFGINPIIIKSVAEQVAEVAKMDCEIAVIVGGGNIWRGKTGSDLGMDRGTADYMGMLATVMNALALQDSLEQLDCDTRVLTSIEMKQVAEPYIRRRAIRHLEKKRVVIFAAGIGNPYFSTDTTAALRAAEVEADVILMGKNNVDGVYSADPKVDPNAVKYEHLTHIQMLQEGLQVMDSTASSFCMDNNIPLNVFSIMEEGNIKRAVMGEKIGTLITK >LS483312.1|SQE71961.1|1673714_1674950_-|FmhA-protein-of-FemAB-family MNFTTLTCEEFNTYVSKHFSHYTQSIQLYEYRKQQHKGVHLVGVKNIYGEVIAACLLTEARVLKIFKYFYSHRGPVMDYNDLSLVKFFFKHLTRYLKKQRGLFVLIDPYILENIRNAEGEIIHTYNNEKLIDTMHRLGYEHQGFSVGYSDMSQIRWHSVLNLQQKSEDQLLKEMSYQTRRNINKTFEMGVEVITLPIEETDRFYRLFKMAEEKHGFNFREKSYFEEMQKIYHDNGCIKLAYINLADYLTRLEKQRQKLIVLLNDVKETLEINPNSKKSKTKYQQLTQQLASIDKNIAKTQDLQQEDGNILDLAAALYVYNNHEMYYLSSGSNPKYNQYMGAYRLQWDMICFAKSHHIHRYNFYGITGDFSSQAEDYGVQQFKKGFNAFVEEYIGDFIKPLRPWLYKFYSRK >LS483312.1|SQE71962.1|1675104_1676013_-|Succinyl-CoA-ligase-[ADP-forming]-alpha-chain MSVFIDKNTKVMVQGITGSTALFHTKQMLDYGTQIVAGVTPGKGGQVVEGVPVYNTVAEAKQETGANVSVVYVPAPFAADSILEAADADLDMVICITEHIPVVDMVKVKRYLEGRKTRLVGPNCPGVITADECKIGIMPGYIHKKGHVGVVSRSGTLTYEAVHQLTEEGIGQTTAVGIGGDPVNGTNFIDVLKAFNNDEETKAVVMIGEIGGTAEEEAAEWIKANMTKPVVGFVGGQTAPPGKRMGHAGAIISGGKGTAAEKIKTLNSCGVKTADTPSEIGTTLIAAAKEAGIYEQLLTIDK >LS483312.1|SQE71963.1|1676034_1677201_-|Succinyl-CoA-ligase-[ADP-forming]-beta-chain MNIHEYQGKEIFRSMGVAVPEGRVAFTAKEAVEKAKELNSDVYVVKAQIHAGGRGKAGGVKIAKSLSEVETYANELLGKQLVTHQTGPEGKEVKRLYIERGCDIQKEYYVGFVIDRATDRITLMASEEGGTEIEEVAAKTPGKIFKETIDPVVGLSPYQARRIAFNINIPKESINKAAKFLISLYNVFIEKDCSIVEINPLVTTGDGEVLALDAKINFDDNALFRHKDIQELRDLEEEDPKEIEASKYDLSYIALDGDIGCMVNGAGLAMATMDTINHFGGNPANFLDVGGGATKEKVTEAFKIILGDDNVKGIFVNIFGGIMKCDVIAEGIVAAVKEVELTLPLVVRLEGTNVKRGKEILNDSGLAIEPAATMAEGAQKIVKLVKEA >LS483312.1|SQE71964.1|1677311_1678079_-|ribonuclease-HII MKITIKEAKAQLNKVTTLEALSNHALHLDERKGIQQAIRVRQRQLEKELKLEQDYQRMMKYEQEILQQQPDAIICGIDEVGRGPLAGPVVACAVILNANHHYLGLNDSKKVSAVNRAQLNQDLMDNVRGYAYGIASAAEIDQLNIYRATQVAMQRAINQLQVRPTHLLIDAMSIDSTISQTAIIKGDAKSVSIAAASIMAKEYRDHLMRDYAQVYPHYGFDKNVGYGTKAHLAGLEQYGVTPIHRRTFEPVKSML >LS483312.1|SQE71965.1|1678062_1678947_-|50S-ribosomal-subunit-maturation-GTPase-RbgA MAIQWYPGHMAKAKRKVTEQLKKVDVVFELVDARIPYSSRNPMIDDVIKQKPRVVILNKKDMTNLKEMSKWEHYFVEQGFYPVAVDAKHGKNLKGVEAAAIEATKDKFAKEQAKGLKPRAIRAMIVGIPNVGKSTLINKLARKNIAQTGNKPGVTKQQQWIKVGKVLQLLDTPGILWPKFEDELVGKKLSLTGAIKDSIVHLDDVAIFGLNFLIQHDIETLRQHYHISVEEDAAILEWFDAIGRRRGLLQKGNEVDYEAVIELLINDLRNAKMGTYCFDLYSEMKRDIAHENND >LS483312.1|SQE71966.1|1679203_1681795_+|membrane-protein MTKKLLMIMLFLTLAIIGHTYILYRFIHVGILFTGPNDGIEQMIPMQMYLYDKWSQGQFFYATDFGLGGDFFSDLSYYFSTNLLFIINAIIIYITNLIVSLPTGNVTFWTINAIVISIVKATIAMLVTYLFSMRIVKHRVNSSLIAFLFVMSPLYYRFTVYWPFFSDVFIGLPLLLYAIEHMLQQKKIGLLILAITIIMINNFYFAYYFLLIGAGYLLIRITFPHKDDRMKRITALWLSVLCAFLGLANALFMFYYSAQSYINNRRIPYKDHVPVFESLNINNNIFIDNYLIILLFITIQALLTFKLYKHYYFRLFAFLTCITILFNFMPIVDQIFNGFSAPQKRWHFLLAFNSAMVIGLFIKYFSTIRIKTYIWTNIVAQLAVFISVIVYHQYVPWLVLVPIVSLIGLFTLIIKDATSRLIIKQIYVFSIISLSILVSAVFIKNQIYFKDHEQRANNMYIHSSLYNSELQRQLLSYMTHTKEPWERIDWRVNEQDNTPMYQKFKGLSLYSSIFHHNILDLYYDDLKINLAEESLSRYQSTNGRQNIASLFSVRYMMLKDYQNNLPAYFQKIKSSGQYAIYENKLNLPAVKVTNHLYNDQSIKTSIDREHAMLDGVIVHNGGNNYRKHSKNLLNKVSQSSQHIQCLSNKHIKVNSQQGGMIKLHVPKSIRQHYTDFYLTMYIKRGQPDSNYSVAINGYVNHRLYNQSTYRTGVNTQLYRTQPDENGNISIQLTPSGTFDMKLISLHGENYHKLVQTHRQANFDHRYQDIQDGVRITLAPHSQGMAVVNIPYRKGMMAYVDGKRINPIRVNTMMTGIPVKKSTTSIIIKYLPPHWIVMLLLSSISILCSIMITRIFTKKRKDEE >LS483312.1|SQE71967.1|1681799_1684406_+|integral-membrane-protein MQKRTVQAMKTFVMITLISFIATLIIYFPFIKDWISKGYVFSGVGDGFRQMMPFQMYLYEHYTQLKGFYDHSFGLGGDYVKSLAYYYSLSPTMWCNFIMIWLGERLLHWNPHVIGFWPFNQLIVALGRSLLTFICAFYYFRYLKLKQAPLMIATILYGASTVGLYYNFTWSFYGDLLIFLPLSLWGMERFYQRGKIGVFIVAIAITLFSNFYFSYYQAIVLGIYFLLRIIFEYRYDIVTRWQKFYLLMFGTILALFSSIIGFYTGVSSFLNNDRQQNSDFKISLFTDLTQDNYYIFSNGFYITISIIALVALLSFKLYKHYYYKLFAIITWFLLIGSLTQYFDSAFNGFSLPQRRWVYFLVLSTSALMALYIQHISELSIKQYCFTAIPVFIFGLCRYLFAEHFVNWMLISLILIIILALLVWRKKWLHHPLVLLGIIVIFFVQQVVMTIESSKRTIGPYSTTMSTITDPSYYNTKLAKVIQQINHKNNNPLHRIDYMSFYALNSPFIYHYNGISLYSSIFDGSILNYYDHLMQINMPVDKNSTYRYLSNRANLEALWNVQDRFRHPNDLNIPYGFKKIDTIKYGNDTLIHSKNTINYPAAHVTNKVFNASDLKSPLDREQAMLQGIVPSDASIKANTAFKANQNLIDEAKRSTHNATWQNHSHLKVDKNNGGVTYTLPKNVAKKYKDLYVEMDVELLTPDKNHEVGVNEYAQDRNELTYKYRRFVTPVTMRVKASDKLNIHLSQGTYRLSVKGIYGEDYSSLQQSAKDLKAVSVKENKNGYTISKSKSISGYVVLPMVYADGMKATVNGRHEDVKKVNGIMTAIPVNKGDTHIRLTYTPPHWHLLFIMSILGIFLSIAFRFWVKRKV >LS483312.1|SQE71968.1|1684652_1685003_-|50S-ribosomal-protein-L19 MSNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRTGDTLRVHVRIIEGSRERIQVFEGVVIKRRGGGISETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRNLRGKAARIQEIR >LS483312.1|SQE71969.1|1685108_1685846_-|tRNA-(guanine37-N1)--methyltransferase MKIDYLTLFPEMFEGVLNHSILKRAQDKGIINVNTINFRDYAVNKHNQVDDYPFGGGQGMVLKPEPVFNAMKDIQHNDETRVILMCPQGRPFTQKIAQELSSTEHIVFICGHYEGYDERIREHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNQQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFQGMTVPDVLLSGNHAHIEKWRHKQKLIRTYLKRPDLLMAYPLSEQDKEIIESFKKQLKKG >LS483312.1|SQE71970.1|1685845_1686346_-|16S-rRNA-processing-protein-RimM MQVEVGQIVNTHGIKGEVKVKSHSDFTDTRFQPGEVLTLKHNNDNVELTVTSYRIHKGFHMLKFEGFDNINDVESFKGDYLYQERDHEGIELAEHEFYYSDIIGCTVFNGEIPIGRVINIIETGANDVWVVKGDKEYMIPYIADVVKDVDIENKMIMITPLEGLLD |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312_9 | 1788317-1788401 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483312_9
|
1 spacers
spacers of LS483312_9
>9.1|1788345|29|LS483312|CRISPRCasFinder AAGAGAAATGCGAAAAGCATTTCACCAAG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483312_9
The CRISPR arrays of LS483312_9 >merge|LS483312|9|1788317-1788401|CRISPRCasFinder CAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCGACAAAGAGAAATGCGAAAAGCATTTCACCAAGCAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCGACA >LS483312|9|9|1788317-1788401|CRISPRCasFinder CAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCGACA AAGAGAAATGCGAAAAGCATTTCACCAAG CAAAGCAAGTTGGGGTGGGGCCCCGACA
>LS483312.1|SQE72065.1|1786904_1787834_+|putative-heme-A-synthase MMGCIKLFKQKNLKWLSVLAAIIMGFVQLGGALVTKTGSEDGCGASWPLCHGALLPENLPIATIIELSHRAMSGLSLIIVLWLVITAWKNIGYIKEVKPLCIISVAFLLVQALVGAAAVIWQQNSYVLALHFGISLISFSSVFVLMLIVFEVDQKYEADELYIKKPLRTLTWIMTIIVYLTIYTGALVRHTKASLAYGAWPVPFDHIMPHGEQEWVQFVHRGMALIAFTWILITFIHAVKNYSENRTVRYGYSAAFILIILQVVTGALSIITHVNLIIALFHALFITILFGMIAYFIMLMLRTIRSSHL >LS483312.1|SQE72064.1|1785775_1786687_-|heme-O-synthase,-protoheme-IX-farnesyltransferase-COX10-CtaB MNKEQTLSHTSSRVSFKELQQIIKMGLVQGNLIPAFAGAWLAVVMTSHSFLSSIPQIILMIIGSTLIMGGACAINNYYDQDIDRIMPSKQNRPTVNDRISDRNLMLLSFGMMLVGEACLFLLNIPTGVLGLVGIVGYVSFYSIWSKRHTTWNTVVGSFPGAVPPLIGWAAIDGQLSLAAFGLFLVVFCWQPIHFYALAIKRKDEYALANIPMLPSVKGIKRTRVSMFFWLVCLLPLPFFFTNLGTTFIVLATLLNLGWLFIGLTTFKKDTDQTKWATKMFIYSLNYLVVFFVMVVVVSLIKMI >LS483312.1|SQE72063.1|1785288_1785750_-|heme-biosynthesis-related-protein MNVPILPTISTSCIVISAILIAIGWWQIWHRHVNAHKKTMLWAAVFALTFFIIYATRTVFIGNTDFGGPDSLRPFYKGFLFFHINLATLGGIGGLVQIITAFKDKFNIHRKIGPTASVIWFLTAITGVTVYILLYVLYPGGETTSVIKATLGL >LS483312.1|SQE72062.1|1784046_1785087_-|Allergen-V5/Tpx-1-related-protein MKILGVVLLVTFLIYLFYSPRLQFDVLENPNKSTNTSRSDQSAHQNNQKDDGNPKPKEGIGTWIGKDISYLTKKFGQADRSYRYSDHYKNYVFKQQDAYYVVLVRDKRIKSVYATGENANVAPLKINDSAARIFENTSINPDPTFKVNNRTYHFELSDEDLKTQTLIKYGENYAQVYVDQQTNDIMGIRYLDKEALALFKPYRLEDDEQSSKSRIKHSADIPFEQNPNQLMTLYEITNEIRKLKGIKPMRVNSDIAHIAAINLYDATDSDSVAFTEDTLRNQLENQNIEFKTTSQNVGYDFDDVPTLIHSWMNSDIHRSRLLNKKYNEMGGEVMKNYYSLIFVEDK >LS483312.1|SQE72061.1|1783595_1784030_-|putative-DUF964-containing-protein MYTEEMGYILDEIEKLSDMVTDSEIYYQFKEAQLKLNRDDEAHLMYEAFLKHKHMYDEVIRFGRYHPDYQTIMLETRRRKRAYEMLPVVMDYKVKEVKLQNLIDELISKIAHAVSANVKIEAGNPFFQTDEHGCASGGSCKCSL >LS483312.1|SQE72060.1|1782581_1783508_+|glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MSIKNKRLINWGLAGIGIMSGLLFYKRQQSQQQPKTIPPFFQGRSPYIFAHRGGMAVRPEQTQLAFDHAVSFDVDGFETDVRLTKDEKLIVFHDATVDRTTNGSGKVSEHTVAELKKLDAGYHFTDINGTTPYRGHEKTAILTFDELLKLYPNMRINVDLKDHPGSYEGSIAPQKMFDDILNNQAQDRVLVTSFYSEQIDRFNKIAQNSVAIGASQKEVAEGFLKFFSGTARSFHPQANTFQMPTHFKGIPLTSRRFIQWLNTLNIVPGYYGINSIDMMHDLYLKGAHTLVTDRPDLGKQFKDSLTMK >LS483312.1|SQE72059.1|1782171_1782423_-|putative-DUF2129-containing-protein MNLIPRTSLTVYLKHIKHERQLRKYGHIVHTNKQERYVIIYINEVDADVIVHKLMQMKYVRHIDASPYKYLKKTYEKEKHETL >LS483312.1|SQE72058.1|1781765_1782155_+|Uncharacterised-protein MKQSFIVLGEGLTDLFEFLTLIDYDHARVDKIMYFHTPESEKQQSSVALVMQPTEGHHFQAMYIMLNAMSYPYPESNKKFQMINEKAEQYNIQTIGVDVQPIEAFHDLDLYFKYLISILRLQNWIPPLQ >LS483312.1|SQE72057.1|1781145_1781697_-|ribosomal-RNA-small-subunit-methyltransferase-D MRVIAGKHKSKALESLEGRNTRPTMDKVKEGIFNSLHNVSGLGLDLFAGSGALGIEGLSRGMDKVIFVDQNFKAIKVIQANLQQLDLTEQAEVYKNNADRALKALNKRDIQFDYIFLDPPYNKGLIDKALIQIETFNLLKESGIIICEFSHQEDIAIQSFKELKRYHYGLTDTLLLEKGDKNG >LS483312.1|SQE72056.1|1780670_1781153_-|phosphopantetheine-adenylyltransferase MGKTKAVIPGSFDPITYGHLDIIERSAGRFDELHVCVLKNSNKAGTFTVNERIELIEESVKHLSNVQVHHFYGLLVDFCDQIGAKTIIRGLRAVSDFEYELRLTSMNKKLNSDVETMYMMTSTNYSFISSSVVKEVAQYKANISDFVPPNVATALKEKFK >LS483312.1|SQE72066.1|1788598_1792045_-|pyruvate-carboxyl-transferase MKHIKKLLVANRGEIAIRIFRAATELNIKTVAIYSNEDKSSLHRYKADESYLVGKDLGPAESYLNIERIIAVAKEAGADAIHPGYGFLSENEHFAHRCHEEGIKFIGPHLDHLDMFGDKVKARTTAINADLPVIPGTDGPIENFESARAFADEAGYPLMIKATSGGGGKGMRIVREANELEDAFHRAKSEAEKSFGNSEVYIERYIDNPKHIEVQVIGDEFGNIVHLYERDCSVQRRHQKVVEVAPSVGLSKELREKICNAALQLMTKIKYVNAGTVEFLVSGEDFYFIEVNPRVQVEHTITEMITGIDIVKTQILVADGASLFGEEIGLPQQQDIHTLGYAIQCRITTEDPTNDFMPDSGTIIAYRSSGGFGVRLDAGDGFQGAEISPYYDSLLVKLSTHAVTFKQAEEKMERSLREMRIRGVKTNIPFLINVMRNEKFRSGDYTTKFIEETPELFDIQPTLDRGTKTLEYIGNVTINGFPNVQQRPKPDYETTSIPRIAKKQINSLSGTKQLLDQHGPNHVAQWVRQQDDVLITDTTFRDAHQSLLATRVRTKDLMNIASKTAEVFKDSFSLEMWGGATFDVAYNFLKENPWERLERLREAIPNVLFQMLLRASNAVGYKNYPDNVIKKFVAESAKAGVDVFRIFDSLNWVDQMKVANEAVQEAGKISEGTICYTGDILNPERSNVFTLEYYVNLAKQLEREGFHILAIKDMAGLLKPKAAYELIGELRAAVDMPIHLHTHDTSGNGLLTYKEAIDAGVDIIDTAVASMSGLTSQPSANSLYYALNGFDRNMRTDIAGLETLSHYWGHVRDYYIDFESDIKSPNTEIYQHEMPGGQYSNLSQQAKSLGLGERFDEVKDMYRRVNFLFGDIVKVTPSSKVVGDMALYMVQNDLDEESVIRDGHKLDFPESVVSYFKGEIGQPVNGFNKQLQDVILKGQQPLTARPGEYLDDVNFDAVRKELANKQQEEVTDQDLISYVLYPKVYEQYIATKEQYGNLSLLDTPTFFFGMRHGETVEIEIDTGKRLIIKLETISEPDENGNRTIYFVMNGQARRIYIKDENVKTNVNVKPKADKTNPSHIGAQMPGSVTEVKVAVGDEVSVNQPLLITEAMKMETTIQAPFNGIIKQVTVANGDAIATGDLLIEIEKI >LS483312.1|SQE72067.1|1792709_1793948_-|cell-division-protein-FtsW MNNFKNLMRKIGKTSKFIDYPLLIAYVILCLIGLVMVYSASMVAATKGTLTGGVEVAGTYFYDRQLLYVILSFAIVFVIAFLLNGKILKNPQVQVGIMGTIILLLLLTLIIGKNINGSKSWINLGFMNLQASELLKIAIIMYIPFIIDRKMPRVKKDFTLIFAPVGLVLFCLALVFLQRDVGQTLLIIIIFGSILLYSGLGFEKFFKGKFFIILTAIAAAFFIVLLIVALSGHLPGYLQARFSTLVDPFASSAGTGYHISNSLIAIGNGGLFGRGLGNSVMKLGYLPEPHTDFIFAIICEELGLVGGLFVIGLLFFIVYRAFILANKTTSYFNKLVCVGVASYIGSQTFVNLGGISATIPLTGVPLPFISFGGSSMISLSIALGLLLMIGKQIKKEDKLRKQRQKSMPKRIM >LS483312.1|SQE72068.1|1794248_1794527_-|Uncharacterized-protein-conserved-in-bacteria MANQTNLKSVAYEQLNKDADRILQLIKVQIDNLTLPSCPLYEEVLDTQMFGLQKEVDFAVQLGLVDKEDGKDLMLRLEKELSKLHEAFTDVK >LS483312.1|SQE72069.1|1794670_1795156_+|Uncharacterised-protein MIQITGEVKYPITLDSTTWIFDDRKVSISDLEQGVFDGSKPIEFDDNREWNRAILEGQTNPPTLNSEIKYKKRAVLEDSFVINMTPFFKNAEPHNNATMIRLIDKNQDAIDVPLDLLPYLFFQFAKDGKRLYEDNAVDSFVYIQNKGYDYQFKHITHIEVI >LS483312.1|SQE72070.1|1795157_1795412_+|putative-DUF2197-containing-protein MREVQCIICDRKVFIDEATVEAKRLQNNPIRTFMCDDCKSRLDKPKQRPYTQETQRNATDKRCHKQPKKSLKKNKKTAKTKKTD >LS483312.1|SQE72071.1|1795457_1797305_-|GTP-binding-protein-TypA/BipA MTNRREDVRNIAIIAHVDHGKTTLVDELLKQSGIFRENEHVDERAMDSNDLERERGITILAKNTAVDYKGTRINILDTPGHADFGGEVERIMKMVDGVVLVVDAYEGTMPQTRFVLKKALEQNLKPVVVVNKIDKPSARPEGVVDEVLDLFIELEANDEQLDFPVVYASAVNGTASLDAEKQDENMQSLYETIIDYVPAPIDNSDEPLQFQVALLDYNDYVGRIGIGRVFRGKMHVGDNVSLIKLDGSVKNFRVTKIFGYFGLKREEIEEAQAGDLIAVSGMEDINVGETVTPTDNQEALPVLRIDEPTLEMTFKVNNSPFAGREGDFVTARQIQERLEQQLETDVSLKVSPTDSPDTWIVAGRGELHLSILIENMRREGFELQVSKPQVILREIDGVLSEPFERVQCEVPSENAGAVIESLGARKGEMVDMTTTDNGLTRLIFMVPARGMIGYTTEFMSMTRGYGIINHTFEEFRPRVKAQIGGRRNGALISMDQGQATAYAIIGLEDRGVNFMEPGTEVYEGMIVGEHNRENDLTVNITKAKHQTNVRSATKDQTQTMNRPRILTLEEALEYINDDELVEVTPQSIRLRKKILNKAAREKEAKRVKQMMQDNE >LS483312.1|SQE72072.1|1797403_1797601_+|Uncharacterised-protein MQNQKQKSKSIFWILSILAVIFLVLFSFSVGAGSVPMMILTLILLIAIFGIGFTLKKKYRNNHWL >LS483312.1|SQE72073.1|1797774_1798590_-|inositol-monophosphatase MALYDFAKSLILEAGNNVRLMMKEKLSIETKSNPNDLVTNVDKATETYIYEAIHSNYPEHKVIGEEGHGHNIRNIDGVVWVVDPIDGTLNFVHQRENFAISIGIYYNGEAYAGFVYDVMKDALYHAKVHEGAFENNHRLEAIGTSELKSSLIGINPNWVTKPIIGPIFQPVVNRARSSRAYGSAALEIIAVAKGQLAAYITPRLQPWDFAGGLIILNEVGGKGSNLLGETLEITHPDSVLMANQTVHEELLQQFFLPHQQTLTELHAKYYK >LS483312.1|SQE72074.1|1798772_1799384_+|putative-DUF1054-containing-protein MTKYTFKQKDFKAFDVDGLDARMEALEVHVRPQLRALGDYFADYFTSQTGETFYSHVAKHARRSVNPPKDTWVAFATNKRGYKMLPHFQIGLFKDHLFIMYGVMHETKDKAQRVKTFDKHFDTLTHLPEDYRICLDHMKPDKPLIKDLSVDELHEAIDRVKNVKKGEFFVARTLAPNDKRLKSDRAFLNFVEETFNEFIKFYA >LS483312.1|SQE72075.1|1799645_1800998_+|manganese-transport-protein-MntH MNKRDTTHQPKHLSLDEINNTIKFDSNGTSSQKFLAFLGPGLLVAVGYMDPGNWITSMQGGAQFGYTLLFIILISSLSAMLLQSMTLRLGIATSHDLAQMTKHYLSKPVAIIFWIIAELAIIATDIAEVIGSAIALNLLLGIPLIVGAIITVCDVFLLLFIMKFGFRKIEAIVGTLIFTVLAIFVFEVFISSPSTTAILEGFVPHKEIITNHGILYIALGIVGATIMPHNLYLHSSIVQSRQYDRHSIKEKAQAIKYATIDSNLQLSVAFVVNCLLLVLGASLFYGVNQDQLGGFYDLYHALRTQPILGAALGAIMSTLFAVALLASGQNSTITGTLAGQIVMEGFLNISLPNWLRRLVTRAIAVIPVIICLIIFKGNEEKIEQLLVFSQVFLSIALPFSLIPLQLSTSNKQLMGPFVNKSWVNYCSWILIIVLSVLNVYLIIETFKEFI |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312_2 | 2.1|227637|23|LS483312|PILER-CR | 227637-227659 | 23 | LS483312.1 | 1200472-1200494 | 0 | 1.0 |
LS483312_2 | 2.1|227637|23|LS483312|PILER-CR | 227637-227659 | 23 | LS483312.1 | 1503228-1503250 | 0 | 1.0 |
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LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | LS483312.1 | 950879-950907 | 2 | 0.931 |
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ctttgttggggccccaccccaacttg CRISPR spacer ctttgtttgggccccaccccaacttg Protospacer ******* ******************
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ctttgttggggccccaccccaacttg CRISPR spacer ctttgttggggccccacccctacttg Protospacer ******************** *****
25. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 1017290-1017318, mismatch: 1, identity: 0.966
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cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer cttgatgaatttcttctcgaaattctctc Protospacer **** ************************
27. spacer 9.1|1788345|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 1416137-1416165, mismatch: 1, identity: 0.966
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28. spacer 9.1|1788345|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 2125104-2125132, mismatch: 1, identity: 0.966
aagagaaatgcgaaaagcatttcaccaag CRISPR spacer aagagaaatgcgaaaagcatttcgccaag Protospacer ***********************.*****
29. spacer 2.1|227637|23|LS483312|PILER-CR matches to position: 595033-595055, mismatch: 2, identity: 0.913
tccgatggctttcttttcgaaag CRISPR spacer tccgtcggctttcttttcgaaag Protospacer **** .*****************
30. spacer 3.1|241679|31|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 386289-386319, mismatch: 2, identity: 0.935
cgcccccaacttgctttgcttgatgaatttc CRISPR spacer cgaccccaacttgctttgcttggtgaatttc Protospacer ** *******************.********
31. spacer 4.1|680944|26|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 2448388-2448413, mismatch: 2, identity: 0.923
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32. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 115796-115824, mismatch: 2, identity: 0.931
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer cttgtggaatttcttgtcgaaattctctc Protospacer ***** ********* *************
33. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 950879-950907, mismatch: 2, identity: 0.931
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer cttggtgaatttcttttcgaaattctctc Protospacer **** **********.*************
34. spacer 8.1|1673489|26|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 458017-458042, mismatch: 2, identity: 0.923
gggtccccaacagagagaatttcgaa CRISPR spacer ggggccccaacaaagagaatttcgaa Protospacer *** ********.*************
35. spacer 9.1|1788345|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 227717-227745, mismatch: 2, identity: 0.931
aagagaaatgcgaaaagcatttcaccaag CRISPR spacer aagagaaatgcgaaaagcatttcgtcaag Protospacer ***********************..****
36. spacer 9.1|1788345|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 1039209-1039237, mismatch: 2, identity: 0.931
aagagaaatgcgaaaagcatttcaccaag CRISPR spacer aagagaaatgcgaaaagcatttcgtcaag Protospacer ***********************..****
37. spacer 9.1|1788345|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to position: 1190367-1190395, mismatch: 2, identity: 0.931
aagagaaatgcgaaaagcatttcaccaag CRISPR spacer aagagaaatacgaaaagcatttcgccaag Protospacer *********.*************.*****
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312_2 | 2.1|227637|23|LS483312|PILER-CR | 227637-227659 | 23 | NC_015057 | Granulicella tundricola MP5ACTX9 plasmid pACIX901, complete sequence | 152437-152459 | 3 | 0.87 |
LS483312_1 | 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder | 156604-156633 | 30 | MK448946 | Streptococcus phage Javan456, complete genome | 19599-19628 | 5 | 0.833 |
LS483312_5 | 5.1|1017234|27|LS483312|CRISPRCasFinder | 1017234-1017260 | 27 | NC_018265 | Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1, complete sequence | 120057-120083 | 5 | 0.815 |
LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | KU160494 | Vibrio phage vB_VmeM-32, complete genome | 52113-52141 | 5 | 0.828 |
LS483312_1 | 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder | 156604-156633 | 30 | MK448970 | Streptococcus phage Javan516, complete genome | 21128-21157 | 6 | 0.8 |
LS483312_1 | 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder | 156604-156633 | 30 | MK448795 | Streptococcus phage Javan527, complete genome | 21667-21696 | 6 | 0.8 |
LS483312_1 | 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder | 156604-156633 | 30 | MK448957 | Streptococcus phage Javan484, complete genome | 20548-20577 | 6 | 0.8 |
LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | NZ_AP017631 | Clostridium perfringens strain CBA7123 plasmid pCBA7123-01, complete sequence | 960-988 | 6 | 0.793 |
LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | MN692994 | Marine virus AFVG_117M61, complete genome | 53082-53110 | 6 | 0.793 |
LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | MN694296 | Marine virus AFVG_250M539, complete genome | 12053-12081 | 6 | 0.793 |
LS483312_1 | 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder | 156604-156633 | 30 | NZ_CP020895 | Legionella longbeachae strain F1157CHC plasmid pLLO-F1157CHC, complete sequence | 9591-9620 | 7 | 0.767 |
LS483312_5 | 5.1|1017234|27|LS483312|CRISPRCasFinder | 1017234-1017260 | 27 | MT774376 | CrAssphage cr55_1, complete genome | 42412-42438 | 7 | 0.741 |
LS483312_5 | 5.1|1017234|27|LS483312|CRISPRCasFinder | 1017234-1017260 | 27 | MT774380 | CrAssphage cr1_1, complete genome | 46180-46206 | 7 | 0.741 |
LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | MN693786 | Marine virus AFVG_250M1027, complete genome | 11513-11541 | 7 | 0.759 |
LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | MN693872 | Marine virus AFVG_250M911, complete genome | 56145-56173 | 7 | 0.759 |
LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | MN694696 | Marine virus AFVG_250M540, complete genome | 62218-62246 | 7 | 0.759 |
LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | MN693811 | Marine virus AFVG_250M463, complete genome | 12722-12750 | 7 | 0.759 |
LS483312_7 | 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1520534-1520562 | 29 | NC_015727 | Cupriavidus necator N-1 plasmid pBB1, complete sequence | 1387688-1387716 | 8 | 0.724 |
LS483312_9 | 9.1|1788345|29|LS483312|CRISPRCasFinder | 1788345-1788373 | 29 | NZ_LR134421 | Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 12 | 28194-28222 | 8 | 0.724 |
LS483312_2 | 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder | 227656-227688 | 33 | NC_028926 | Bacillus phage Palmer, complete genome | 5087-5119 | 11 | 0.667 |
LS483312_2 | 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder | 227656-227688 | 33 | NC_028782 | Bacillus phage Pavlov, complete genome | 5050-5082 | 11 | 0.667 |
LS483312_2 | 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder | 227656-227688 | 33 | NC_022770 | Bacillus phage Pony, complete genome | 5051-5083 | 11 | 0.667 |
LS483312_2 | 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder | 227656-227688 | 33 | KM236248 | Bacillus phage Pookie, complete genome | 5050-5082 | 11 | 0.667 |
LS483312_2 | 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder | 227656-227688 | 33 | KF669655 | Bacillus phage Page, complete genome | 5042-5074 | 11 | 0.667 |
LS483312_2 | 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder | 227656-227688 | 33 | KF669657 | Bacillus phage poppyseed, complete genome | 5042-5074 | 11 | 0.667 |
1. spacer 2.1|227637|23|LS483312|PILER-CR matches to NC_015057 (Granulicella tundricola MP5ACTX9 plasmid pACIX901, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.87
tccgatggctttcttttcgaaag CRISPR spacer tccgatggctttctttccgaaga Protospacer ****************.****..
2. spacer 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MK448946 (Streptococcus phage Javan456, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gataagggattgctttgttgggcatggttt CRISPR spacer gatgtcggtttgctttgttgggcatggttc Protospacer ***. ** ********************.
3. spacer 5.1|1017234|27|LS483312|CRISPRCasFinder matches to NC_018265 (Melissococcus plutonius DAT561 plasmid 1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
caaagactttccaaaagaaagtccacg CRISPR spacer aaaagactttccataagaaagtctaaa Protospacer ************ *********.* .
4. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to KU160494 (Vibrio phage vB_VmeM-32, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer ctattggaatttcttctccaaattctctt Protospacer ** * ************ *********.
5. spacer 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MK448970 (Streptococcus phage Javan516, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gataagggattgctttgttgggcatggttt CRISPR spacer gatgtcggtttgctctgttgggcatggttc Protospacer ***. ** *****.**************.
6. spacer 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gataagggattgctttgttgggcatggttt CRISPR spacer gatgtcggtttgctctgttgggcatggttc Protospacer ***. ** *****.**************.
7. spacer 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gataagggattgctttgttgggcatggttt CRISPR spacer gatgtcggtttgctctgttgggcatggttc Protospacer ***. ** *****.**************.
8. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP017631 (Clostridium perfringens strain CBA7123 plasmid pCBA7123-01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer cttgttgaatttcttctacaaattcatct Protospacer ***************** ****** ...
9. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MN692994 (Marine virus AFVG_117M61, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer tttgttgcatttcttctctaaattctaat Protospacer .****** ********** ******* .
10. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MN694296 (Marine virus AFVG_250M539, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer attgttgcatttcttctctaaattctagt Protospacer ****** ********** ******* .
11. spacer 1.2|156604|30|LS483312|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020895 (Legionella longbeachae strain F1157CHC plasmid pLLO-F1157CHC, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gataagggattgctttgttgggcatggttt CRISPR spacer atttaatgagtgctttgttggtcatggttt Protospacer . * *. ** *********** ********
12. spacer 5.1|1017234|27|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MT774376 (CrAssphage cr55_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
caaagactttccaaaagaaagtccacg CRISPR spacer taaagactttcctaaagaaagtattta Protospacer .*********** ********* . ..
13. spacer 5.1|1017234|27|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MT774380 (CrAssphage cr1_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.741
caaagactttccaaaagaaagtccacg CRISPR spacer taaagactttcctaaagaaagtattta Protospacer .*********** ********* . ..
14. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MN693786 (Marine virus AFVG_250M1027, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer tctgttgtatttcttctctaaattctagt Protospacer ..***** ********** ******* .
15. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MN693872 (Marine virus AFVG_250M911, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer tctgttgtatttcttctctaaattctagt Protospacer ..***** ********** ******* .
16. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MN694696 (Marine virus AFVG_250M540, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer tctgttgcatttcttctctaaattctagt Protospacer ..***** ********** ******* .
17. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to MN693811 (Marine virus AFVG_250M463, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer tttgttgcatttcttctctaaattcaagt Protospacer .****** ********** ****** .
18. spacer 7.1|1520534|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to NC_015727 (Cupriavidus necator N-1 plasmid pBB1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
cttgttgaatttcttctcgaaattctctc CRISPR spacer tcgcttgaattccttctcgaaatcctcga Protospacer .. *******.***********.***
19. spacer 9.1|1788345|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134421 (Legionella adelaidensis strain NCTC12735 genome assembly, plasmid: 12) position: , mismatch: 8, identity: 0.724
aagagaaatgcgaaaagcatttcaccaag CRISPR spacer tccgctaatgcgtaaagcatttccccaag Protospacer . ****** ********** *****
20. spacer 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder matches to NC_028926 (Bacillus phage Palmer, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
cttgcttggctaaatgcttttcgcatttctctt CRISPR spacer tcgtgttggcttaatgcttctcgcatttcctca Protospacer .. ****** *******.*********...
21. spacer 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder matches to NC_028782 (Bacillus phage Pavlov, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
cttgcttggctaaatgcttttcgcatttctctt CRISPR spacer tcgtgttggcttaatgcttctcgcatttcctca Protospacer .. ****** *******.*********...
22. spacer 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder matches to NC_022770 (Bacillus phage Pony, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
cttgcttggctaaatgcttttcgcatttctctt CRISPR spacer tcgtgttggcttaatgcttctcgcatttcctca Protospacer .. ****** *******.*********...
23. spacer 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder matches to KM236248 (Bacillus phage Pookie, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
cttgcttggctaaatgcttttcgcatttctctt CRISPR spacer tcgtgttggcttaatgcttctcgcatttcctca Protospacer .. ****** *******.*********...
24. spacer 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder matches to KF669655 (Bacillus phage Page, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
cttgcttggctaaatgcttttcgcatttctctt CRISPR spacer tcgtgttggcttaatgcttctcgcatttcctca Protospacer .. ****** *******.*********...
25. spacer 2.3|227656|33|LS483312|CRISPRCasFinder matches to KF669657 (Bacillus phage poppyseed, complete genome) position: , mismatch: 11, identity: 0.667
cttgcttggctaaatgcttttcgcatttctctt CRISPR spacer tcgtgttggcttaatgcttctcgcatttcctca Protospacer .. ****** *******.*********...
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
571308 : 594426
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483312|571308:594426|DBSCAN-SWA TATGAAAATGATAAAAGTTGTAAGCTCTACCATAGTTGCCTCAGCATTAGCATTATCCATGTTTCCATCTACACAAGCAGCTGAAACGAATACAGCTTCACGCACAGTTCTATTTGATAATTCTCATGGACAAACTGCTGGCGCGGCTGATTGGGTTATTGATGGTGGTTTTTCTGATTATGCGGATTCAATGAAGAAACAAGGTTTTGCTGTTAAATCACTAGATGGGGAAGCAAATATTAGTCAAGAGTCATTAAAAAATAGTGATATTTTAGTTATACCAGAAGCGAATATTCCATTTAAGACGACTGAACAACAAGCCATTGTGAATTTTGTAAATCATGGTGGAAGTATCATTTTTATCTCAGACCATTACAATGCAGATAGAAATTTAAACCGCATTGATTCTTCTGAAGCTATGAATGGCTATCGTCGTGGTGCCTATGCGGATATGACCAAGGATATGGATCAAGGAGAGAAACAATCTAAAGCAATGGCAGGTGTTTCAAGCTCAGACTGGTTAGCCCAAAATTTTGGTGTGCGTTTCCGTTATAATGCTTTAGGGGATTTGAATACATCTAATCTTGTCTCAAGCGATGAAAGTTTTGGCATTACTAAAGGCGTTAAATCTGTGTCTATGCATGCTGGTTCAACACTTGCTATTACAGATCCTAAAAAAGCAAAAGGAATTGTATACACACCTGATCACTTAGGTAACAATGCGAAATGGAGTCATGCAGTTGACCAAGGTGTTTATAATGGTGGAGGTAAAGCTGAAGGTGCCTATATTGCTATTGCAAAGGTAGGTAAAGGAAAAGCTGCCTTTATTGGAGACTCCTCATTGGTAGAAGATAGTTCTCCAAAATATTTACGTGAAGACACGGGTAAAACAAAGAAAACGTATGATGGTTTTAAAGAAGAAGATAACGCACAATTGTTGAATAATTTAACTTCTTGGTTAAGTAAGAAAGAATCAACACCGAATTTAGCTAAAAGTGGTGTAAAATTAGATAAAGCGACTGTGTTACATGATTTTGAACAGCCACAAAATTCAACAGAACCGCAAAAAGAACCATGGTCACAACCACCTGAAGGTTATCATTGGTACGATCGATCAACGTTTGCGCCTGGTAGTTATGGCAGTACAAAATCTACTAAAGATGATGGTGATAAACAACCAGGAGACCAACCGGCTGTGCAAAATGTAGCCTTTGCCATTCCTAAAGATGTGCAAGCTAACACGCCATTTAACATCACGATCAATTTGTCACAATTACCGGCTAACCAATCATTAGATAATTTGAAATTAGGAATTTATCAAGATGGTGGTAAACAAATCGGTCAATTTTCAACGGATGGTAAATCATATAGTAATATCGGCTATGGTTCACTTCCAACCATTAAAGTCAATAAAGATGGCACAGCTTCAGTGACGATTTCAGCAAAGGTAACGGAGTCTTTAAAAGGGGCTAATATACGGTTAAAGCAAGGAGATAAAACCCTTAAAACTGAAAAATTGAAGTAATGGAGGACAACATGCGATGACACAACTTGCATTTTACATTTTAAGTGATATACATGGTTATATTTTCCCAACAGATTTTAAACAGACAAAAGGTTATAAACCGATGGGGCTATTATTGGCGAACCACATAATTGAACAAGATCGTCAGCGCTATGATGCTAGCTTTAAAATAGATAATGGTGATTTTTTACAAGGTTCACCTTTTTGTCATTACCTTGCTACACATATACATTCTAGCAAGCCATTGACGGATATCTATAATCGTATTGGTTTTGACTTTGGTACATTAGGAAACCATGAATTTAACTATGGTCTCAACTATTTAACTCAAAGTATCAATCGCTTAAATTATCCAATCCTTTGTGCCAATATTTTAAAAGATAATAAACCATTAACAGAACAAGGAATCATGTATATTAAGAAGCAAGGATACAATATTGGTATTATTGGTTTAACGACACAATATATTCCACATTGGGAACGACCAGAGTATATTCAACACTTAACATTTAATAGTGCAGTTCAAACGTTAGAGGACATATTACCTCAAGTACGTGAACAGGCTGATATCGTGGTTGTTAGTTATCATGGGGGCTTTGAACGTAACATTGACACGTATCAACCAACTGAAGTATTAACTGGAGAAAATGAAGCGTCTGAGATATTGCAGCGCTTTGGGTCGGACATTGACGTGCTTATTACGGGGCATCAACACCGTGAAATTGCTGCTATCAAGCACGATACAGTTATTCTACAACCAGGAACACGTGCGACACAAATTGGTAAAGTTACGCTAACATTCAATGATCGAAGACAATTGGTTCAGCGTACAAGTGAACTGTTGCCAGTGCACGATGACAGCGCTTTTAAATTAATCGATAAAGATAGTCAATTAATAAGTGATGTGGACACGTGGTTAGATACGCCGATTGCTGAAATTCAGCAGAATATGATTGTTGACGAGCCATTTACTGCAAGAATTGCACCGCACCCTTTTATTAATGTGTTACTACATGCATTATTACAAACAAGCGGCGCTCAAATAGCAAGTACGGCATTATTTGATTCTGCGACTGGCTTTGATAAGACCATTACAATGCGTGATATTATCAATAACTATCCGTTTCCAAATACGTTTAAAGTATTAGAGATGACGGGTAAGGGCATTCGTGAAGCATTAGAACAATCAGCACGCTATTTTGATCTTACGGACAGCGGGGATGTAGGTATTAATGACACGTTTTTAAATCCTAAACCGCAACATTATAACTATGACATATTTGGAGGCGTATCATATAATATTAAAGTGAGCGAGCCTATGGGGCATCGCGTGCATGATATTAAAGTGGAAGGACAGCCATTAGTCGAAGATAAGATCTATACCGTTTGTGTAAACAATTATCGTGCTGTAGGTGGCGGTGATTATAACATGTTTGCAGAAGCAAAGGTGGTTAAAGATATACAAGTGGAGGGTGCACAGCTATTAATCGATTATCTAACACACCACAATTTAAATAACATGCCACAAGTTGTGGATTTTAAAGTAGAAATATAATTCAGTAATAACTATGAGCCTGGGACATCATTATGTTTTAGGCTATGAACTCTATATTGGCAGTAGTTGACTGGATTGAAAATACGCGTATACCAAGCTTTTCCAATCCTAGTCAACCTTGCTGGGGCGGGACTACGAATTTATAATGAATTCTGTCCTGCTCCTTTATTTTTGGCTTTGTTTATATTTTATTGTGAGACTTACTAACGCTTATTACATGTTGTAAAAAGAAATGTTTAACGCTTCTTAACTTATGGCTCCAGAAGTTTAAGTTTGTATGTGTCTATGCTTTGTAACGTGCCATTTTGTTGTTGATGTATGATGTGTTGTGCTGTGATATTTGTTGGATTGTTAACACCAACTGCTGCTGCGATGTTGTATAAGCCTTCATGTAGACTTGTGATGTAATTGGTTACGCGAAATGTTTTTTCTTCTACAATGAGCGCTTTTTCCTTTTTAGGATCTGTCGTAGCAACACCTACTGGACATGTGTTGAGGTGACATTGTTGACTCATAATGCAGCCGACACTAATCATCATGCCTCGAGCAATATTAACTAAATCAGCGCCTAATCCGAGTGCAATGGCGATTTTGTCGGGTGTGATTAGCTTGCCTGAAGCAAAAATCTTAATTTTATTCCGTATACCATAGCGTTCAAGCATGCCAGACACAATAGGAAGTGCTGTAAATAATGGTAGGCCAACGCCATCTTGTAATTCTTGAAAAGTAGCGCCCGTACCACCTTCGCCACCATCAACAGTTATAAAACTAGGATACTTATCTAAACGTATCATTTCTTTCACTAATATTTCAATTTCATCAACATGACTCACTACAATTTTAAAGCCAACTGGTTTTTGTCCAAGCTGTTTAAGTTCATCAACAAAAGTGATTAATTCTGCTGCATTTGAAATAAAGTTAAAACGGTTTGGTGAATTAATTGTTTGAAACGGTTTGACATTGCGTATTTGTGCAATCTCTTCAGTCACTTTATTTCCTTCCATATGACCGCCACGGGTCTTGGCACCTTGTGCAAGTTTAAGCTCAAATGCTTTGATTGCCGATTGATTCACTAATTTTACAAATTCATCTTTACTAAAATTTCCCTCTTGATCACGGACACCAAAAAGGCCAGGTCCTATTTGAAAAATAATATCCCCACCACCGGACAAATGATAATCAGATAAGCCACCTTCACCTGTGTTCATCCATGTGCCAGCACGTGCTAACCCCTGAGATAGTGCTGTTATGGCACGTTGACCTAATGCACCATAACTCATGCCAGATTGTCCAACTAAACGTTTAACGATGAACGGATGTGCTAAATCATTGCCGATGACGACAGCATGCTGATCATCAAGTTGAAATGGTTTAATATCAGCTGGTTTGCGATGTTCGTCTCGTTTAAATAACCGCTCATTATCAACTTGATAAATAAATGTAGAAATCATATGTTGGTTATCAATAACTAGTTCAGTTGACTGTAATGGAAACATTGCATTTTGTATGTAAAACCCATGTTCATAGTGCTTCAACGTACCAAAACTGGTCATTCTTGAGTTATATTTTCCGGCAATAACAATATTTTTATAGTCGACACGTGAGAACGGCTTGCCTTCGGTATCATTAGCATATAAGTATTGACGCATTTCGGGACCAATTTTTTCTGAAAAATAACGAATTCTTCCTAATAAAGGGAAGTTCCTTAATACGCTATGTTGTTTCTGATGTTTGTCTTTAAAGAGTAACCACAGCCCTAATAAAACAACGAATAATAGACAGCTTACTATAATAACATTTACAATAAATTGCATTGTTGTTAATATCATTCTTTATCCCCCCGTTATCTCTGTAATGATTATTGTACATTATTTATATGGAAAAACAATGTAATGTTCCACTAATATAAGGATACAAGTT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MSNTAICLTALLLIIPIAISYKEGLHIIKDLVVASLRATIQLLILGFLLHYIFEIDAKWLLLLAVFIIIINASWNTLHRASKVMHHVFWISLIAIIIGTAIPLTAIILTGAIDFKPNEVIPISGMLANNGLIAINLAYQHLDRAFVKDVNDIESKLTLAASPKLASKDAVRDSIRLAIVPTIDSVKTYGLVSIPGMMTGLIIGGTPPLEAVKFQLLVVFVHTTSTVMSALIATYLSYGQFFNARHQLVARDNDIVDEA >LS483312|571308:594426|578202_578865_+|SQE70923.1|DBSCAN-SWA MLLEIKHLCYQATRRTILDNINFQLKKGETVAIVGPSGSGKSTLLKQIDNLISPTSGELLLNDKPFDAYEPEVLRSKISYLMQQSELFGQNIGDNMRFPAMAHSDEFDETKALQLLQHLNLGHYNLNTRIEHLSGGERQRITIARQLMYQPELLLLDEATSALDTANKRIVEQLVFDLAKTGVGVMWITHSDDQSMRHFDRRITIVDGQITKQEELKHNE >LS483312|571308:594426|574638_576216_-|SQE70920.1|DBSCAN-SWA MILTTMQFIVNVIIVSCLLFVVLLGLWLLFKDKHQKQHSVLRNFPLLGRIRYFSEKIGPEMRQYLYANDTEGKPFSRVDYKNIVIAGKYNSRMTSFGTLKHYEHGFYIQNAMFPLQSTELVIDNQHMISTFIYQVDNERLFKRDEHRKPADIKPFQLDDQHAVVIGNDLAHPFIVKRLVGQSGMSYGALGQRAITALSQGLARAGTWMNTGEGGLSDYHLSGGGDIIFQIGPGLFGVRDQEGNFSKDEFVKLVNQSAIKAFELKLAQGAKTRGGHMEGNKVTEEIAQIRNVKPFQTINSPNRFNFISNAAELITFVDELKQLGQKPVGFKIVVSHVDEIEILVKEMIRLDKYPSFITVDGGEGGTGATFQELQDGVGLPLFTALPIVSGMLERYGIRNKIKIFASGKLITPDKIAIALGLGADLVNIARGMMISVGCIMSQQCHLNTCPVGVATTDPKKEKALIVEEKTFRVTNYITSLHEGLYNIAAAVGVNNPTNITAQHIIHQQQNGTLQSIDTYKLKLLEP >LS483312|571308:594426|581581_582259_-|SQE70926.1|DBSCAN-SWA MTIDVLIVEDDKDINELMKLSLTTKGIKQIKVAYDIDHAKTLLHDFNFQVVLLDLNLHAEDGYQLLKYIDLSVTNVIVVTAKDTNLDVYKGFEKGAVDYIKKPFDPMELYYRVSLHLHSDACTTYHYDYLDIDFNSMDVQVNGHSVPLTAREYDLLIYFIRHKNQVLTKQQLYEHVWGYDTGVDDNTLMVHIRTLRKKIERQPNQPTFIQTVRGKGYIYKEDAYE >LS483312|571308:594426|572848_574387_+|SQE70919.1|DBSCAN-SWA MTQLAFYILSDIHGYIFPTDFKQTKGYKPMGLLLANHIIEQDRQRYDASFKIDNGDFLQGSPFCHYLATHIHSSKPLTDIYNRIGFDFGTLGNHEFNYGLNYLTQSINRLNYPILCANILKDNKPLTEQGIMYIKKQGYNIGIIGLTTQYIPHWERPEYIQHLTFNSAVQTLEDILPQVREQADIVVVSYHGGFERNIDTYQPTEVLTGENEASEILQRFGSDIDVLITGHQHREIAAIKHDTVILQPGTRATQIGKVTLTFNDRRQLVQRTSELLPVHDDSAFKLIDKDSQLISDVDTWLDTPIAEIQQNMIVDEPFTARIAPHPFINVLLHALLQTSGAQIASTALFDSATGFDKTITMRDIINNYPFPNTFKVLEMTGKGIREALEQSARYFDLTDSGDVGINDTFLNPKPQHYNYDIFGGVSYNIKVSEPMGHRVHDIKVEGQPLVEDKIYTVCVNNYRAVGGGDYNMFAEAKVVKDIQVEGAQLLIDYLTHHNLNNMPQVVDFKVEI >LS483312|571308:594426|592366_592678_+|SQE70937.1|DBSCAN-SWA MITIGSIVYLKGGSQKMMILNRGPIIEQDDKKVMFDYSACKYPLGLVENQIYYFNTENVDRVIFEGYSDDDEIRFQELYQEMLNELSDDITRGEVEEKQFGLE >LS483312|571308:594426|571308_572832_+|SQE70918.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKMIKVVSSTIVASALALSMFPSTQAAETNTASRTVLFDNSHGQTAGAADWVIDGGFSDYADSMKKQGFAVKSLDGEANISQESLKNSDILVIPEANIPFKTTEQQAIVNFVNHGGSIIFISDHYNADRNLNRIDSSEAMNGYRRGAYADMTKDMDQGEKQSKAMAGVSSSDWLAQNFGVRFRYNALGDLNTSNLVSSDESFGITKGVKSVSMHAGSTLAITDPKKAKGIVYTPDHLGNNAKWSHAVDQGVYNGGGKAEGAYIAIAKVGKGKAAFIGDSSLVEDSSPKYLREDTGKTKKTYDGFKEEDNAQLLNNLTSWLSKKESTPNLAKSGVKLDKATVLHDFEQPQNSTEPQKEPWSQPPEGYHWYDRSTFAPGSYGSTKSTKDDGDKQPGDQPAVQNVAFAIPKDVQANTPFNITINLSQLPANQSLDNLKLGIYQDGGKQIGQFSTDGKSYSNIGYGSLPTIKVNKDGTASVTISAKVTESLKGANIRLKQGDKTLKTEKLK >LS483312|571308:594426|582416_582644_+|SQE70927.1|DBSCAN-SWA MKIVAYTSGFIATVLFLFNILRFVFAWFEARFHLNFGIDLLLHNSYVIYGALIGFAIAMITMTITEDYLDESDRI >LS483312|571308:594426|587771_589022_+|SQE70932.1|holin|DBSCAN-SWA MLSIKNLTKIYSGNKKAVDRISLDIESGEFIAFIGTSGSGKTTALRMINRMIEPTEGQITINGKNIGDMNPVELRRSIGYVIQQIGLMPHMTIRENIVLVPKLLKWSKEKKDARAKELIKLVDLPEDYLDRYPAELSGGQQQRIGVVRALAADQDVILMDEPFGALDPITRDTLQDLVKTLQQKLGKTFIFVTHDMDEAIKLADRICIMSKGKIVQFDTPDNILRHPANDFVVDFIGQNRLIQDRPNMKTVEGAMITPVTVHADDSLNDAVNIMRERRVDTIFVVNNQNRLLGFLDIEDINQGLRRGEELIDMMQRDVYKVHIDTKLQDSVRTILKRNVRNVPVVDDDNTLIGLITRANLVDIVYDSLWGDENDDAAPLDSDNKDKQSTSQQDVPPREQDVMNGLDHKTNEMGDDR >LS483312|571308:594426|580125_581589_-|SQE70925.1|DBSCAN-SWA MNKRFNFKFSKYMTLFMLANIILGVVFVVYLLIETYDRIYSDINTIDPDYLIANDIVKEPNQHIKDLAAEHNVSLYFTDTAGNILYPHTKKGQNLKSRILKNLRYAHAVSNKKGTYMVYFYPNQSTTRVNNAHQIKTDQLLESIVSQDYNKWDYKLNQHHLSFIKNPNPKPILDDDELGKGFENSGKFYLTVLMIYVLLSIVLIVIATFFVTKRVTKPMSYYIHWINHLAHGKLYQPTTKSKLKRFINTYPELHHSLSHLTQQLLNDKFYHNQMTYYKSKWISQVSHDLKSPLTTIYGYAKLIHADSETQQYVNLITQKASFMTELLESLNQTFDIETNQIQYSKELFPVESTMNKVINVIGYDNIDVYFHTASHKTFYGNKLYFERLMINLINNSLEHNNENPHIQIQLKVYGTQLIIDYLDDGIGLPHTDFKSLVQETYTTKKDRESHGFGLSIINDAVNYHHGTIQLQPTAQGVHFHIMLQDKS >LS483312|571308:594426|593724_594426_-|SQE70939.1|holin|DBSCAN-SWA MIEHLGINTPYFGILVSLIPFVIAQYFYKKTNGFFLLAPLFVAMVAGIVFLKLTGISYAQYKVGGDIIYFFLEPATISFAIPLYKKRDVLKKYWLQIFGGITLGTLAALILIYLVSTLFQLGNTVSASMLPQAATTAIALPVSTGIGGVKELTSLAVILNAVVISALGTKIVKWFKISNPIARGLALGTSGHTLGVAAAKDLGETEESMGSIAVVIVGVIIVAIVPPLASILF >LS483312|571308:594426|589021_589657_+|SQE70933.1|holin|DBSCAN-SWA MREFLQEYGSQLVSKTIEHFQISIIALLLAIVIAVPLGILLSKTKKTANIVLTIAGVLQTIPTLAILALMIPIFGVGKTPAIVALFVYVLLPILNNTILGVKNIDKNVIQAGTSMGMTRLQLMKDVQLPLALPMIISGIRLSSVYVISWATLASYVGAGGLGDLVFNGLNLYQPPMIITAAILVTAIALIVDFLLSLVEKWVVPKGLKVSR >LS483312|571308:594426|577296_578076_+|SQE70922.1|protease|DBSCAN-SWA MNHRMTKNNRISSMTYHQNPWRQPQMVKRDFLLILVYVLGNMYLPFILADAINWLSFTLLHRPSGLTYTSQLYALLAQLSVVLIFWALHYRALLNTAIARVKQLQRYIYLMIIVLLVMYVANIVYANVMQFLPEHWQFHDTQNEQEIRKLFSNIKVWPLLFLNIVIITPIVEELLFRHLLIHELGKKLSYPVMSIISILLFAGIHVTDATSPFEIGPYLIMATSFVVAYNMSGRNLAVTIALHSFNNLLSFILTLLQFL >LS483312|571308:594426|585572_586169_+|SQE70930.1|DBSCAN-SWA 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22 | Bacillus_phage(40.0%) | protease,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1138604 : 1168858
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483312|1138604:1168858|DBSCAN-SWA 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32 | Staphylococcus_phage(96.15%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1420100 : 1428797
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483312|1420100:1428797|DBSCAN-SWA AATGTATGAAGTAAAATTAGACGCTTTTAGCGGTCCACTCGATTTATTGCTCCATTTAATTCAGAAATATGAAATAGATGTTTATGACATTCCAATGAAAACATTAACTGAGCAATATATGCAATATGTACATACGATGAAGCGTCTAGAAATTAATATTGCTAGTGAATATCTCGTTATGGCGTCTGAACTCTTAATGATTAAAAGTAAATTACTTCTACCTCAATCAGATGATCATGTAGAATTTGAAGAAGATCCACGTGAAGATTTAGTAGGTAGACTAATTGAATATCAAAACTATAAAGAATATACAGAAATACTTGATAGTATGAAAGCAGAACGAGATCTCTACTTTACAAAACATCCGACAGATTTATCTCATTTAGAAACTAATGAAAGTTGGGATAAATCAAACACCATTGATTTGACAGAACTGATTGTTGCTTATCAAAGAGTGAAAAATCGCGTTGAGTATCACACACCAAAAACTGTAGAAATCAGTAAAGAAACATTCACTATTGAAGAAGCAACAGAAATTGTAACGACAAGATTACGTACACAAACAGCGTTTAATTTTTTCAGCTTATTTACTTTTCATGAACCAATTGAACAAGTCGTTACGCATTTTCTTGCTATTTTAGAAATGTCTAAGGCTGGCATAATAAACATAAGTCAAAAGCAAAATTTTGATGATATTGATATTGTAAGGGGAGTGAATTATCAAGTTGGATAAACAAGCAATCTTAGAGGCATTATTATATACAGCTGGCGATGAAGGTATTGACACAAAACAATTGCTAGAGATACTGGACATTACTAAACCACAATTGATTGAATTAATCGATAATTATTCATCTCAAGGACTAGAAATTCATCACTACGGTCAAACTTATGTATTAACTACAAAAAAAGATGCTGCTAATTATATTGAAAAACTCGTTCAACAAAAGTCAAATATGAAATTATCACAAGCTGCAATGGAAACGTTATCAATCGTTGCTTATAATCAACCTATTACACGTAGTGATATTGAATTAATACGAGGTATTAATTCAGATGGTGCTGTTAGAACATTAGTTGCTCGTGGTATGATTGAAGCTAAAGATGTTGAACATTCAAGAAGCCATCACTTGTATACAACTGAATTATTTTTAAATGTATTTGGATTAGAAACAATAGAAGATTTACCGACTACCGAAGAAGATGATGAAGAAATGGAAGATTTCTTTAGTCAATTAGTTAATCAAAAGGGAGAATGATTATGAGCAAAGAACTAGAGCGATTGCAAAAAAGAATTGCTAATAGTGGTTATACGTCTAGAAGAAAAGCTGAAACATTGATTACTGAAGGTAAAGTCAAAGTGAATGGAGAAGTTGTCACTGAACTTGGCACAAAAGTAAAACCATCAGATCAAGTTGAAGTAGAAGGAATCAAAATGGAACAAGAAGATAAAATATATATTCTGTTTCATAAACCAGCGCAAGTCATTACTAGTGTATCAGATGACCATGGAAGAACAGTTGTGACTGACTATTTTAAAGACTTAGATACTAGAATATATCCTGTTGGTCGTTTAGATTACGATACATCCGGAGTATTACTACTAACAAATGATGGTGAGTTCACTAATCTTATGACCCATCCACGGTACCATATACCAAAAACATATGTTGCCAAACTCAAAGGTTACCTTATGCGCGAAGAAGTAAAAACACTTGAAGCAGGAATAGAACTTGAAGATGGTTTAACTCAACCCGCTACTGTTAAAATTAAACGCCAAGATAAAGACAAAAATACAACGTTAGTTGAGATTACCATTAGTGAAGGACGAAATCGACAAGTACGTCGTATGTTTGAGCATTTTGGCCATAGCGTTAATAAATTAACACGTATACAATTCGGTTCACTAAATTTAAAAGGTCTTAACGCTGGAGAAGGACGCGTATTAACACCTCATGAAGTAAAAGTATTACGTCATCAAGCAGAAAACGGCAATTAGTAAGCGGTTACATGTAGTTTGCTGAAGTTAATTTTATGGTTATAAAATCATTGCTAATTTTTTCACAATCAAATTTGAAATTAGAGATTTAACAATTACCATATGCTATAATAAACAAGAAAATAGCATGTGTAGGAGGTATATGAATTAATGAGTAAGGAAATACTTATCGTAGATGATGAAGACAGAATTAGAAGATTACTCAAATTATACTTAGAGAGAGAATCTTTTAACATTCATGAGGCTAGTGACGGCAAAGAAGCCTATGAATTAGCCATGGACCACAATTATGCATGCATACTTTTAGACTTAATGCTTCCTGAAATGGATGGAATCGAGGTCGCATCAAAACTACGGGAGCATAAAGATACACCTATCATTATGCTTACTGCTAAAGGCGAAGAAACTAACCGAGTTGAAGGATTCGAATCAGGTGCTGATGATTATATTGTTAAACCATTCTCTCCACGTGAAGTGGTCTTAAGAGTGAAAGCGCTATTAAGACGTACACAATCAACAAGCGCCGAACAAAGCGAGCCTCATGCGAGAGATATCATAGAATTTAATCATTTACTTATTGATAATGATGCGCATCGTGTATTAGCTGATAATCAACAAGTTAACTTAACACCCAAAGAATATGAACTACTAATATATTTAGCTAAAACACCAAACAAAGTATTTGATAGAGAACAATTACTTAAAGAAGTTTGGCATTATGAATTTTATGGTGACTTAAGAACTGTTGATACCCATGTTAAACGCTTAAGAGAAAAACTTAATCGTGTTTCAGAAGATGCAGCACAAATGATTCAAACAGTATGGGGTGTTGGCTACAAATTTGAAGTTAGAGCTAGCGATGAGCCGACTAAATAGTGTTGTAATAAAACTGTGGTTAACTATTATCTTTATAGTAACGACAGTTTTAATTTTATTAAGTGCTGCATTAATAACTTTTATTCAATACTATTATACTGAGCAAACAGAAAAATCAATTCGTGATGATGCCAAAAGAATCAGTCATGTTGTTGAAACATCTAAAAATAAAAAGTTAGCTATTGAACATAGCCAAAAACTGATTAGTGGTTCTGGTGGCGTTATTATTATGAAAGACAAGTCAACACATCATAATGCTAAAGAGTCACAATTAAATAATCAAATGTTGGCTGAGATTAATCAAAACGAACACTTTTCTCCAGTGTTTAATAAAGGTCAATCTGCAACTCAAAATGTAACATTAAAACATAATGACCATTCTCGTTCTTATATCTTACTGGGTTATCCTATGAAAGCTCAAAAGGGAAGTCACAGTCATTATAGTGGCGTCTTTATTTATCAGGATTTAAAATCCATAGAAGATACCAATAACGCTATTACGATTATTATTCTGATAACTGCAATTATTTTCCTAGGTATTTCAACTGTCTTCGCCTTTTTCCTATCTAATAGAATTACTAAACCACTTAGAAAGCTTAGAAATCAGGCTAAAAGTGTTTCTAAAGGGGATTATTCTCAAATTTCATCTGTAACAACTAAAGATGAAATTGGTGAACTATCTCGTGCATTAAACGACATGAGTTTCGAAATTCAGGAAAATGTTCAAGCACTATCAACATCAAAAAATATTCGTGATAGTTTAATTAATTCAATGGCTGAAGGTGTTGTAGGTATCAATGATCATCGCGACATTATATTATCAAATAAAATGGCAGATGAAATTTTACCAACTATTAATCAATCTATGTATGAACGAATTGAAGACCAAATCGAAGATACTTTTACAAGTGAAGGCACAGAATTTCGAGAATACGATTTTGACACACGCTATTATGTCTTCATTATGAGTTACATTCCTCAGATTCAAGAAGATGGTCGCAGTGGAATTGTCGTTATTATTCGTGATATGACTAATGAGCATAACTTAGATCAAATGAAAAAAGATTTCATTGCTATTGTTTCTCATGAATTGCGTACACCTATTTCATTATTACAAGGATATACAGAATCAATTGTTGACGGTATCGTTACAGAACCAGAAGAAATTAAAGAGTCATTATCAATTGTCTTAGATGAAACAAATAGGCTCAATCGTTTAGTTAATGAATTACTCAATGTTGCAAGAATGGATGCTGAAGGGTTATCTGTTAATAAAGAGATACAACCTATTGCACCATTATTAAACAAAATACAAACAAAGTATAGACAACAAGCTAGTGATTTATCATTAAATATGTACTTAACTCCAGAAACTAATGACGCATTGTGGTACTACGATTCTGATCGAATCGATCAAGTGCTCACAAATCTTATTGATAATGCTACAAGATATACTCAACCTGGTGATACAATTTCTATTACTAGCGAAGATACTGATAAGTACAATGTGCTTCACATAAATGATACAGGCAGTGGTATTGCTCCTGAACATTTAAATCTTGTTTTTGATCGCTTTTACAAGGTTGAAGCATCCAGAACACGTGGCAAACAAGGAACCGGCTTAGGATTATTCATTTGTAAAATGATTATAGAAGAACATGGAGGTACGATCACTGTATCAAGTGTCGTTGGAGAGGGAACAACATTTACAATCAAGTTACCGAAGCCTTAATCTTCAGGCTTATTTATAAAATTTATCAAAGATAATATCACTGAATTCAGACAGGGACATAAACCCGCAAATAATAGTACAAAGATGATTTAAAATTAAAAATCGTCTTTGTGCTTTTTATATTCAATACTTTGTATGATTGGCTCGCATGCTTAGGAGACTACTTCAGCTTGCTTTGTTAGAAAAAACTGGTTTAGTCAGTTTTTTCTGTACTGGACTTTGACTTAATATAAAAATAAGGACGAAGGCTATTTAAGCAGAGACGTTTATGAGCCGGCCTGACCTTATATATAGTTAATATCAGTTAAAACATATTGAGATTAACTATGCAAGATATATTGGCAGTAGTTGACTGGATTGAAAATATCCTTATACCAAGCTTTTTCAATCCTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483312|1420100:1428797|1422248_1422974_+|SQE71736.1|DBSCAN-SWA MSKEILIVDDEDRIRRLLKLYLERESFNIHEASDGKEAYELAMDHNYACILLDLMLPEMDGIEVASKLREHKDTPIIMLTAKGEETNRVEGFESGADDYIVKPFSPREVVLRVKALLRRTQSTSAEQSEPHARDIIEFNHLLIDNDAHRVLADNQQVNLTPKEYELLIYLAKTPNKVFDREQLLKEVWHYEFYGDLRTVDTHVKRLREKLNRVSEDAAQMIQTVWGVGYKFEVRASDEPTK >LS483312|1420100:1428797|1422957_1424706_+|SQE71737.1|DBSCAN-SWA MSRLNSVVIKLWLTIIFIVTTVLILLSAALITFIQYYYTEQTEKSIRDDAKRISHVVETSKNKKLAIEHSQKLISGSGGVIIMKDKSTHHNAKESQLNNQMLAEINQNEHFSPVFNKGQSATQNVTLKHNDHSRSYILLGYPMKAQKGSHSHYSGVFIYQDLKSIEDTNNAITIIILITAIIFLGISTVFAFFLSNRITKPLRKLRNQAKSVSKGDYSQISSVTTKDEIGELSRALNDMSFEIQENVQALSTSKNIRDSLINSMAEGVVGINDHRDIILSNKMADEILPTINQSMYERIEDQIEDTFTSEGTEFREYDFDTRYYVFIMSYIPQIQEDGRSGIVVIIRDMTNEHNLDQMKKDFIAIVSHELRTPISLLQGYTESIVDGIVTEPEEIKESLSIVLDETNRLNRLVNELLNVARMDAEGLSVNKEIQPIAPLLNKIQTKYRQQASDLSLNMYLTPETNDALWYYDSDRIDQVLTNLIDNATRYTQPGDTISITSEDTDKYNVLHINDTGSGIAPEHLNLVFDRFYKVEASRTRGKQGTGLGLFICKMIIEEHGGTITVSSVVGEGTTFTIKLPKP >LS483312|1420100:1428797|1427417_1428797_+|SQE71741.1|DBSCAN-SWA MLEDKLKSWFGFDNFKAGQKEIIKSVLDSNHTLGILPTGSGKSLCYQMATYELQQSTLIISPLISLMDDQVAQLKMSGEQSVAYIHSGMDDNEKNWNMKRLAKSRFIFLSPEFILQPQNFKLISTIDFGLIVLDEAHCISEWGYDFRPHYALISKITNYYKNATILALTATAPPHLEQDLNQLLNVSFHVIKTHMNRPNISFQHINFRNDQEKMNWLMHYIEQSGPTIIYVSSKKMCVELAKTIYKHGYLTGIYHGDLSYQERQTVQQQFINNDIPVIVATSAFGMGVNKKDIRTVIHFHLSTSPSSYLQEIGRAGRDQQPSQAISLFQPDDRYLLETILFADMILPYDIDCYELGANIEPLKQDILEILHSHFTYAQLKQIFQIAQERKQLALNRMLSYSQLDQCRRKYLLEFFGEVPDIPSICCDHDTDIKPLKIYNRKKVKRQMSYEDKLKNLFLS >LS483312|1420100:1428797|1426112_1426361_-|SQE71739.1|DBSCAN-SWA MAKYTIVDMDTCIACGACGAAAPDIYDYDDEGIAFVILDDNQGTAEVPEELYEDMEDALEGCPTDSIKIEEEPFDGDALKFE >LS483312|1420100:1428797|1421360_1422098_+|SQE71735.1|DBSCAN-SWA MSKELERLQKRIANSGYTSRRKAETLITEGKVKVNGEVVTELGTKVKPSDQVEVEGIKMEQEDKIYILFHKPAQVITSVSDDHGRTVVTDYFKDLDTRIYPVGRLDYDTSGVLLLTNDGEFTNLMTHPRYHIPKTYVAKLKGYLMREEVKTLEAGIELEDGLTQPATVKIKRQDKDKNTTLVEITISEGRNRQVRRMFEHFGHSVNKLTRIQFGSLNLKGLNAGEGRVLTPHEVKVLRHQAENGN >LS483312|1420100:1428797|1425428_1425971_+|SQE71738.1|DBSCAN-SWA MQQNKRLITISMLSAIGFVLTFLKFPLPFFPPYLTLDFSDVPTLLATFSMGPIAGIIVAFIKNLLNFFFNMGDPVGPVANFLAGISFLLTAYYVNKRGHVANKAMITALVMATLVMTIVLSILNYFVLLPLYGMIFNLVDIVQNIKIIIVSGIIPFNIIKGAIISIIFILLYRRIKSVLK >LS483312|1420100:1428797|1420824_1421358_+|SQE71734.1|DBSCAN-SWA MDKQAILEALLYTAGDEGIDTKQLLEILDITKPQLIELIDNYSSQGLEIHHYGQTYVLTTKKDAANYIEKLVQQKSNMKLSQAAMETLSIVAYNQPITRSDIELIRGINSDGAVRTLVARGMIEAKDVEHSRSHHLYTTELFLNVFGLETIEDLPTTEEDDEEMEDFFSQLVNQKGE >LS483312|1420100:1428797|1420100_1420832_+|SQE71733.1|DBSCAN-SWA MYEVKLDAFSGPLDLLLHLIQKYEIDVYDIPMKTLTEQYMQYVHTMKRLEINIASEYLVMASELLMIKSKLLLPQSDDHVEFEEDPREDLVGRLIEYQNYKEYTEILDSMKAERDLYFTKHPTDLSHLETNESWDKSNTIDLTELIVAYQRVKNRVEYHTPKTVEISKETFTIEEATEIVTTRLRTQTAFNFFSLFTFHEPIEQVVTHFLAILEMSKAGIINISQKQNFDDIDIVRGVNYQVG >LS483312|1420100:1428797|1426471_1427431_+|SQE71740.1|DBSCAN-SWA MKDIILYSKQHSFTYKTNKSIFNLLTGKKTHQTFFDACSQQLLSLYHSLPNLKYPSFERFMAQNVNNDMTIKVHPRYTYDSLVHTFNCIQLLIQTLSNTQQNVYSFIPISQHGLIQRKVKQIYYYIKKEDKDSAFITELNQLFKALYTNNNNYCCLHYYLQGYEEPMYTRQQISLIESIPEQHLFNLEMNELVTLMYELEIEYRYPILSQCIIKPSLLHKTHITQQQLKQRFSMTQIAQKQHVKLNTIEDHILELFIKGYITHYFDFISEDGFHQFNEFYNKHRGERLKAYKQAFPNLSYFEIKLMIVGIERGELIARG |
9 | uncultured_Mediterranean_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1832411 : 1840881
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483312|1832411:1840881|DBSCAN-SWA CTTATTTAATAACCTTAGCTATAACACTAGGATAAAGTTCATATTCTAATTGTTTGACTCGTTCTTCCAAATTTTCTTTGGTATCATCCGGTTTGATCTCGCATTGTCTTTGTTCAATAATTTCTCCCGTATCCATGCCACTATCAACATAATGAACTGTTGATCCTGTAACATTATCACCACTATTAAAAGCCTGACCAATAGCATCTTTCCCCTTATATTTTGGCAATAATGATGGATGAATATTTAAAATCTTACCTTCGTATGCATCTAACAAATCAGGACCAATTAGCCTCATATAACCTGCGAGAATAATCCATTCCACTTCTTCACGCTCTAGTAAACGAATCAAATGGTGTTCATAGGCCGATTTTGACTCAAAATCTTTTGGTTCGTTGATATTAACTGCTACCTTTAACTGTTTTGCGCGTTCAATACAATACGCATCGTGATGATCAGTATAAAGTGAAGTAATTTCTATATTGTTGAGTTCTCCTTTATCCACTTTTAAAACAATATTTTCGAAATTACTGCCCGATCCAGAGGCAAAAATAGCTACCTTAGTCACTATTCTACCCCCTTAAGATAAATAGGCACATGTGCATCTTCTATAACATTGCCTATGTGGTAAGCAGGGACATCGTGTTTTTTTAGAACATCTAGTGCTTTAGCAATGTCATCTTGACTAACGATGACCGTATACCCTATTCCCATATTAAAAATGTTATACATTTCATCCGTAGAAATTTGTCCTTGTTGTTGTAACCAGTCAAAAATAGGAGGTGTTGGGAATGTATTCACATCAATTTGCGCAGCTAAACCATCAGGTAACACTCTAGGAATATTTTCATAAAATCCACCACCAGTGATATGATTCATCCCCATGATTGTTACTTTATCTTTTAAATCAAGTATCGGTTTCACATAGAGTCGCGTAGGTGTTAAGAATGTATCTAAATATGTTTGACCATTGAAGTCATCGTATAAATCAATGTCAGTCTGTTTAATTAATTTACGTACTAAGCTATAACCATTTGAATGTATCCCACTAGAAGCTAAACCAATAATTGCATGATCTGCTTTTATATTTGAGCCATCAATGTATTCTGCTTTTTCAACAGCACCGACAGCAAAGCCAGCTAAGTCATACTCACCTTCATGATACATTTCTCCCATCTCCGCGGTTTCACCACCAATCAGTGCGGTATTTGTTTGTTGACATCCTTCGCTGACTCCTTTTACAATCTGCTCAATAACTTCTGGAACAACTTTATTTGCCGCAATATAATCTAAAAAATATAATGGTTCTGCTCCAGTTGTAAGAATGTCATTCACACACATGGCTACGGCATCAATTCCAATGGTGTCATGTCTGTCATGATCGATAGCTAACTTTAACTTTGTTCCTACACCGTCTGTACCTGACACAAGCATAGGCGCTGTCATCTGCAATTGTGATAAGTCAAATGTCGCACCAAAACCACCTAAGCCACCTAAGACTTCTTTTCGTAGTGTTCGCTTTACATGTGCTGACATTCTTTCTACTGCTTCATATCCTGCTTCTATATCTACTCCAGATTGTTCATAAGCTTTAGACATTTTTATTTCCCTCTCGATCATAATAGTGTTGATGATTCTCGATATATGCTTTTTGTCGTGGGCTCAAGTGCTTAAAATAATTTTCTTCATAATCATACAAACCAGCTGGATAATCACCTGTAAAACTTTCTAAACATAGACCACTATATGGCGCATCATAGTCTAAGCCAATAGCTTCTATTAAACCATCAACGCTTAAATAGGCTAATGAGTCGGCACCTATATGGTCACAAATTTCTTCAGGTGATTTACTCGCTGAAATCAACTCAGCAGTAGTTGAAACATCAATACCATAAAAGCTTGGAAACATAAATTCTGGTGATGCGATCCTTACATGTACTTCTTTAGCACCGGAATCTTTGAGCATTTTGACTATACGTTTAATAGTTGTGCCACGTACAATTGAGTCATCGACTAAAATAATTTTTTTACCTTCTACAATGTCTTTGACAGCTGATAGTTTGACACGTACCCCTTGTTCTCTCAATTCTTGAGTTGGTTGGATGAACGTTCTAGCGACATATTGATTTTTAACTAATCCCATTTCATAAGGCAGCTGGCTTTCTTCAGCATAGCCACTAGCTGCTGATAATGATGAATTAGGTACACCAATAACCATATCTGCTTCCACAGGATTTTCTTGAGCTAATTTCTTTCCAGAAGCTTTACGAACTGCATGCACATTCTTACCAGCTATTGTAGAGTCTGGACGCGCAAAATAAATATATTCCATTGCTGAAATCGCAGTACTTGTGTGTTTTGTATATGATTTTATTTTTATACCTTCGTCATTGATAACGACATATTCTCCTGCGTGAACATCTTGGATAAATTCTCCACCTAAAACATCAATAGCGCATGTTTCACTTGCTAATATATAAGTTCCATCTTGCATTTTTCCGACCGCTAATGGTCTAATGGCATTAGGATCAACTGCACCATATAAAGCATCCTTCGTCAAAATCGTAAAGGTAAAACCACCTTTAATTTGGCGTAGACTTTCCTTTAGTGCTTCTTCAAATGTTGGTGCTTTACTTCTACGAATTAAATGCATAATTACTTCAGTATCTGAAGACGAATGAAATATTGCCCCATGCTTTTCTAAGTATTGTCGTAATGATTGTGCGTTGATCAAATTTCCGTTATGACATACTGCAACGCTCATATCATAAAAATGATAGAGAAATGGTTGAATATTCTCGATACCTTTATTGCCTGATGTTGCATAACGTACATGACCTATAGCGTTACGACCTGTTTTTAATTGTTCCATTTGCACTTCTTTGATTGCTTCAGTTAACAGCCCTACACCACGTTCACCTTTTAATGTGTTACCATCTGTGACAACAATTCCAGCGCCTTCTTGACCGCGATGTTGTAAACTATGCAATCCCATATATGTCAATTGAGCTGCCTCTGCATGGTTCCAAATTCCAAATACGCCACACTCTTCGTTTAATCCACTGTAGTTAAACATTGCGCAATAGCTCCTTCCCATTGTGCTTTTATATCAGAAGCTCTCTTAGAAATTGATGTATGAGCAGCTGCAACATTAAATTCATCCGTATCTGTAAGTTGACCTATTTCAATTGCATGCTCAATATTTAATTCTTGTCCTGCTTTAACAGCAATCACATAACGTCCTTGCGTTTCACTGAATAACTGTGCATCTGAAAGATTTACTTTAGCTTTTAATCCAAGACTATAATGCGCACTGATTCTAGCGAGAGTAATTAACAATCCACCTTTGCCAACAGTCTGTACGTGTGAAGCCACACCATTTCTAATTGCCTTTTTAACGGCTTCACCCTTTGTCACTTCATCGCTTAAATCAATCGCTTCAAATTCATGATTCACTTTGCCGTATAACAATTTTTCAATTTGACTGCCACCGAAATCATCCCTAGTATCTCCAACTAAGTACAATTTATGTCCTGCTTGAGGATGGAAATCATTTAAATATTCGATATTTTCAATTAGCCCTACCATACCAACAACTGGTGTTGGAAAAATAGATGTACCACGTGTTTCGTTATAAAGCGAAACATTACCAGATACTACTGGTGTTTTTAAAATTTCACATGCTTCTGACATCCCTTTTGTTGAATCTATTAATTGTTGATAGATTTCTTTTTTCTCAGGAGAACCATAATTTAAGCAATCTGTCATTGCAAGTGGCGTGGCACCAACAGCAATTAAATTGCGATAGGCTTCTGCCACTACCATTTTTCCACCTTCATATGGTTGATTAAAGACATAACGTGCTTCGCCATCAATGGTAGAAGCAATCGCTTTTTGGGTACCTTCAACACGAACAACTGAAGCCTGTAAACCTGGTTTAATGATTGTATTGGCACCCACTTGTTGATCATATTGTTCATATAAATAATGTTTTGATGCAATTGTTGGATGTGTGAATAACTGGTCAAATACCTCTTGAACATTGATAGAATTATAATCATTTTTAGAAGTATTATATGCCTTTTCTTCGCCTTCAAGCACATAAACAGGTGCTTCATCAGCTAGTGATTGCACTGGAATATCTGCAAATACTTCATCCTCATATTTAAGTATAAAACGGTCTGTATTTGTTACTTCACCAATAACAGCACTATCTAATTCATGTTTATCAAATAAATCTAAGAATTTTTGTTCCGTACCCTTTTCAACAACAAGTAACATTCTTTCTTGTGTTTCAGAAAGCATCATTTCATAAGGAGATATGCCAGGTTCTCTAGTCGGCACTTGGTCTAAATTTAATATTAAGCCACTGCCACCTTTAGCTGCCATTTCAGACGATGACGATGTTAATCCGGCTGCTCCCATATCTTGAATACCTACGAGCTCTTTGTATGTAATTGCTTCTAGGGTAGCTTCCATTAATTTCTTACCTACAAAAGGGTCGCCAATTTGAACTGAAGGACGTTTACTTTCACTTTCTTCCGTCAATTCTTCAGACGCAAACGTTGCACCATGAATACCATCACGACCTGTTTTCAAACCAACATATATAACTGAATTTCCTTCGCCTTTAGCCGTCCCTTTTTGAATCATATCATGGTCAATAATACCTACACACATCGCATTAACTAATGGATTGCCATCATAACGATCATCAAATTCAATTTCACCTGCAGTAGTAGGAATACCGATACAGTTACCATAGCCACCTATACCGCGAACGACCCCTTTTAGTAGTCGTTGATTTTGTTTCACTGATAATTCACCAAAACGCAAACTGTTTAATAAATTAATAGGTCGTGCACCTATTGACACAATGTCACGAATAATCCCACCTACGCCAGTTGCTGCACCTTGATATGGTTCAATTGCTGAAGGGTGATTATGTGATTCAACTTTAAAAACGACCGCTTGGTTATCACCAATATCAACTACACCAGCACCTTCACCTGGTCCCATCAATATACGCTCACCTGTAGTGGGAAATTGTTTTAAAAATGGTTTAGAATGTTTATATGAACAATGTTCACTCCACATAACAGAAAATATACCTACTTCAGTAAAGTTTGGTTCTCTACCTAGAACATCACAAACTTTAGTGTACTCAGCATCACTTAAACCCATATCTTGATATAATTTTTCAACTTTAATTTCTTCAATACTAGGTTCAATAAACTTAGACATGTTGTTCCCTCCAACTATTAACCATTGCTTCGAATAATTTTACGCCACTATCAGTACCAAGAATTGTTTCAAGTGCACGTTCTGGATGAGGCATCATACCACACACATTCCCTTCTTTATTCACGATGCCAGCAATATCTTTATATGAGCCATTAGGATTGTCTTGATACGTTAATATGATTTGGTTATTGGTTACTAATTCTTCATATATGTCATCAGTGCAATAATAGTGCCCTTCACCATGTGCTACTGGATATACTACGAGATCATTGTTTTCATATAAGTTAGTAAAAGGCGTTTGATTATTAACAATTTTTAAGGTTTCATTTCTACTAATAAATAAATGGGAATCGTTATGAAGTAAAGCTCCTGGTAATAAGCCAATTTCAGTTAAAATTTGAAAACCATTGCATACACCTAATACTGGTTTACCTTCACTTGCTAAACGTTTAACTTCATCAATTACTGGGGCTACGCTAGCCATGGCGCCTGAGCGCAAATAATCTCCAAATGAAAATCCTCCTGGTATAAGTACACCATCAAAACCTTCAAGTGATGTCTCACGATAATCTACATATTCAGCTTCAGCACCTGTTTTAATCGCCGCGTTATACATATCTCTATCACAATTAGAACCAGGGAATACGAGAACTGCAAATTTCATATCATGCATTCTCCTTTTCATCAACGATTTTATAGCTGTATTCTTCAATGACTGTATTGGCAAATAACTTTTCACTAAGCGTTGTAATGATGTTATCAACTGCTTCATCCGTAGCTTCATCAACAGACATATATAATACTTTGCCGACGCGGATATCATTGACTTGCGTATAACCTAAGTCATGTACAGCACGATTTAATGCTTGCCCTTGAGTATCTAATACTTGTGGTTGTAAAGTAATATGAAGTTCAATCGTTTTCATTATTTAACTTCCTCCAATTTATTTAAAAATGTTTGATATGTGTCAATCAGTGAGCCTGTTTCATTTCTGTATACATCTTTGTCAAAATTCGTACCTGAATCCTTGTCCCATATACGACAAGTGTCTGGTGAAATTTCATCTGCTAATAAAATTTTTCCATCTTGTGTTTTTCCAAATTCTATTTTGAAATCCACAAGCTGTAAATCCATTTCATCCATAAGTTGTATCAGTACATGATTGATATCCTTAGCCATTTGTTTTAATGTTTGTATTTCTTCATCGTTGGCAATGTTTAATAGTTTGACATGGTCATCAGTAATTAGCGGATCATTTAAGTCATCATTTTTATAAAAAAATTCAACTAGTGGTTCGTTAAATTGATATCCTTTATCTAAACCTAAGCGTTTCGTGATGGAGCCCGCTGCAACGTTACGAACAACAACTTCTAATGGAATAATCTTTACTTCTTTAACTAATTGTTCTGTCTCAGATAATTGTTTAATAAAATGACTCTCTATACCTTTATGGCTTAAATAATCAAATATAATAGATGTAATTTGATTGTTTAAGCGACCTTTGCCTTTCATGGTATCTTTTTTTGCACCATTGCCAGCCGTTACTTCATCTTTATACTCAACACGCAATTGATTTTCTACTTCAGTAGAAAATACTCTTTTTGCTTTACCTTCATATAATAATGCCATTTATAACTCTCTCCCTTCGAATTGTTTAAGCATGGTAGCTTCAGTGGCATTTACATCATCTGTTAGTATCGTCATGTGGCCCATCTTGCGATCTGGTTTACGTTCAGCTTTGCCATAAATATGAACATGCCATTCTGGATGTTGACCAAAATCGTCTTCTAATAAATCTAAATCTCGACCAAGTAAATTCATCATAACGGCAGGCTTTAGCAATTCTATAGTCTGAGGTAATGTCTGACCAGTTACCGCAAGAATATGCGTATCGAATTGAGAATAATCACATGCTTCAATAGAATAGTGACCTGAATTATGTGGCCTTGGTGCAATTTCATTAACATATAATTGATTTTGTTTATCGATAAAGAATTCCACTGTAAACGTGCCAACAAAATGTACAGTATCGATGATTTTATTTACTTCTATTCTTGCTAGTTGTTCTTTGTCACTGCGTGCTGGAACAATTGTTTTAAATAATATTTGATTGCGATGTTCATTTTCTTGTAATGGGAAATACGTCGTTTGTTTTTGATTACCGATTGTGACAGTTAATGATACTTCGCGTTCAATGTCGAGGTATTGCTCAGCTACACATTCTTGTTGCGCAATAAGCTGTTTGGCTTCTTCTATCGCCGTATGATCTTTAACTAAAATTTGTCCTTTCCCGTCGTAACCACCAAATCGTGTTTTGATGATAAAAGGATAGCCTAACTCTTCTATGGCATTGTATAAATCATCTATATTGTTTATTGATAAAAATGGAACAATATGAGCCCCGGCTCGCTCTAATGTTTGTTTTTCGGTTAGTCGATCTTGAAGTAATTCTATTGCTTGGTAACCTTGAGGAATATTAAATTGTTCAGATAACGTCTTTAATTGTTGTGCTGAGATATTTTCAAATTCATACGTAATGACATCTGATTTTTCACCAAGTTCTTGTAAAGCTTGTGTATCATCATAGGCAGCAGTGATAAACTCATTAGCAATATGATGGCATGGGCAATCTGTATTTGGATCTAAACAAATAACTTTAAAACCCATTTTTTGAGCAGATTGGGTCATCATTTTTCCTAACTGTCCACCACCAATAATGCCTATAGTGTCGCCAAACTTTAACTTATTGAAGCTCATGCTGCATGTCCCCTACTTTCTTAACGAGTGTTTTTTCATAATTTTCTAACTTTTCAAGTACTGACTTGTGACTGATACTTAGAATTCTCGCAGCTAAAATACCCGCATTTTTAGCACCAGATTTCCCTATAGCTGTTGTAGCAACAGGAATACCTCCTGGCATTTGAACAATTGACAATAGCGAATCTAGTCCTTTTAAGCTTTTTGATTCGATTGGCACACCAATCACCGGTAAGGTTGTCATTGATGCTACCATACCCGGTAAATGCGCTGCACCACCAGCTCCCGCAATAATGATATCGTAATCATTAGCGCGCGCTTGGTTTGCGAAATCGTACATTAATTTTGGTGTACGATGTGCCGAAACAACTTTCTTATCAAACGGAATACCAAATTCTTCTAACATCGCACAACTTTCTTGCATAATCTTCCAATCTGAAGAACTACCCATAATGACTGCTACTTTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483312|1832411:1840881|1837646_1838318_-|SQE72111.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMYNAAIKTGAEAEYVDYRETSLEGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVIDEVKRLASEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNETLKIVNNQTPFTNLYENNDLVVYPVAHGEGHYYCTDDIYEELVTNNQIILTYQDNPNGSYKDIAGIVNKEGNVCGMMPHPERALETILGTDSGVKLFEAMVNSWREQHV >LS483312|1832411:1840881|1840398_1840881_-|SQE72115.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCAMLEEFGIPFDKKVVSAHRTPKLMYDFANQARANDYDIIIAGAGGAAHLPGMVASMTTLPVIGVPIESKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGKSGAKNAGILAARILSISHKSVLEKLENYEKTLVKKVGDMQHELQ >LS483312|1832411:1840881|1838579_1839284_-|SQE72113.1|DBSCAN-SWA MALLYEGKAKRVFSTEVENQLRVEYKDEVTAGNGAKKDTMKGKGRLNNQITSIIFDYLSHKGIESHFIKQLSETEQLVKEVKIIPLEVVVRNVAAGSITKRLGLDKGYQFNEPLVEFFYKNDDLNDPLITDDHVKLLNIANDEEIQTLKQMAKDINHVLIQLMDEMDLQLVDFKIEFGKTQDGKILLADEISPDTCRIWDKDSGTNFDKDVYRNETGSLIDTYQTFLNKLEEVK >LS483312|1832411:1840881|1835464_1837654_-|SQE72110.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSIEEIKVEKLYQDMGLSDAEYTKVCDVLGREPNFTEVGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTTGERILMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELSVKQNQRLLKGVVRGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDDRYDGNPLVNAMCVGIIDHDMIQKGTAKGEGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITYKELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLILNLDQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTNTDRFILKYEDEVFADIPVQSLADEAPVYVLEGEEKAYNTSKNDYNSINVQEVFDQLFTHPTIASKHYLYEQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTQKAIASTIDGEARYVFNQPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMSEACEILKTPVVSGNVSLYNETRGTSIFPTPVVGMVGLIENIEYLNDFHPQAGHKLYLVGDTRDDFGGSQIEKLLYGKVNHEFEAIDLSDEVTKGEAVKKAIRNGVASHVQTVGKGGLLITLARISAHYSLGLKAKVNLSDAQLFSETQGRYVIAVKAGQELNIEHAIEIGQLTDTDEFNVAAAHTSISKRASDIKAQWEGAIAQCLTTVD >LS483312|1832411:1840881|1839284_1840412_-|SQE72114.1|DBSCAN-SWA MSFNKLKFGDTIGIIGGGQLGKMMTQSAQKMGFKVICLDPNTDCPCHHIANEFITAAYDDTQALQELGEKSDVITYEFENISAQQLKTLSEQFNIPQGYQAIELLQDRLTEKQTLERAGAHIVPFLSINNIDDLYNAIEELGYPFIIKTRFGGYDGKGQILVKDHTAIEEAKQLIAQQECVAEQYLDIEREVSLTVTIGNQKQTTYFPLQENEHRNQILFKTIVPARSDKEQLARIEVNKIIDTVHFVGTFTVEFFIDKQNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQTLPQTIELLKPAVMMNLLGRDLDLLEDDFGQHPEWHVHIYGKAERKPDRKMGHMTILTDDVNATEATMLKQFEGREL >LS483312|1832411:1840881|1838319_1838580_-|SQE72112.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQALNRAVHDLGYTQVNDIRVGKVLYMSVDEATDEAVDNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKIVDEKENA >LS483312|1832411:1840881|1832411_1832978_-|SQE72107.1|DBSCAN-SWA MTKVAIFASGSGSNFENIVLKVDKGELNNIEITSLYTDHHDAYCIERAKQLKVAVNINEPKDFESKSAYEHHLIRLLEREEVEWIILAGYMRLIGPDLLDAYEGKILNIHPSLLPKYKGKDAIGQAFNSGDNVTGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCEIKPDDTKENLEERVKQLEYELYPSVIAKVIK >LS483312|1832411:1840881|1834001_1835486_-|SQE72109.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHAEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVTDGNTLKGERGVGLLTEAIKEVQMEQLKTGRNAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVAVCHNGNLINAQSLRQYLEKHGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRQIKGGFTFTILTKDALYGAVDPNAIRPLAVGKMQDGTYILASETCAIDVLGGEFIQDVHAGEYVVINDEGIKIKSYTKHTSTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQENPVEADMVIGVPNSSLSAASGYAEESQLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVEGKKIILVDDSIVRGTTIKRIVKMLKDSGAKEVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEICDHIGADSLAYLSVDGLIEAIGLDYDAPYSGLCLESFTGDYPAGLYDYEENYFKHLSPRQKAYIENHQHYYDREGNKNV >LS483312|1832411:1840881|1832977_1834009_-|SQE72108.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVDIEAGYEAVERMSAHVKRTLRKEVLGGLGGFGATFDLSQLQMTAPMLVSGTDGVGTKLKLAIDHDRHDTIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIAANKVVPEVIEQIVKGVSEGCQQTNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDLAGFAVGAVEKAEYIDGSNIKADHAIIGLASSGIHSNGYSLVRKLIKQTDIDLYDDFNGQTYLDTFLTPTRLYVKPILDLKDKVTIMGMNHITGGGFYENIPRVLPDGLAAQIDVNTFPTPPIFDWLQQQGQISTDEMYNIFNMGIGYTVIVSQDDIAKALDVLKKHDVPAYHIGNVIEDAHVPIYLKGVE |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2039655 : 2052661
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483312|2039655:2052661|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483312|2039655:2052661|2051635_2052661_-|SQE72321.1|DBSCAN-SWA MIELKQVVKRYHTKKKDVLAVDHVDLNIPTGSVYGVIGFSGAGKSTLIRMFNQLESPTSGDIIIDGDNMSQLSKSELRLKRQKVSMVFQHFNLLWSRTVLNNIKFPLEIAGVPSGLAVKRALELVELVGLKGREHAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPDVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIKKSQSLTIVLITHEMHVIRRVCDQVAVMENGRVIEQGKVSDVFENPQHEVTRRFVKDDLNNDFEESLDQLEPLAHDAYVVRLNFNGDNTTQPIVSYITKTHNIDVNILEADIKNTRNGTIGFLVIHIPHISEVDFGHFTEGLHKKGVNVEVLRHG >LS483312|2039655:2052661|2045717_2046017_-|SQE72310.1|DBSCAN-SWA MNWEIKDVMCDIEVIKEKINDVAIKHGWFVEDKFVKNELETKREHIIFSASYLEHRIQNEHTVELLQVYLKEFDELIQKFHEIEKASSDVSLATESDDA >LS483312|2039655:2052661|2050947_2051643_-|SQE72320.1|DBSCAN-SWA MGKSYSEIFHEMVTMPNVQWPEVWTAIYETLYMTIISTIFAFIFGLILGVLLFLSAKSNSVGARIFYSIVSFVVNLFRAIPFIILILLLIPFTSIVLGTISGPTGALPALIIGASPFYARLVEIAFKEIDKGVIEASVSMGATTLTIVRKVLLPESMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWITNKLDKR >LS483312|2039655:2052661|2046757_2047030_-|SQE72314.1|DBSCAN-SWA 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21 | Staphylococcus_phage(86.67%) | transposase,terminase,integrase | attL 2035197:2035212|attR 2050110:2050125 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2132437 : 2150231
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483312|2132437:2150231|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483312|2132437:2150231|2137783_2138761_-|SQE72407.1|DBSCAN-SWA MKLLLKGYTLLICLVIMSIISLFVGVSQLSITDIFHLTKEQLNILLSSRIPRTVSILISGSTLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILISLVCFPQGHILLKLAFAVLCSLFGTFLFVKLIEMIRVKEVIFVPLLGIMLGGIVSSFTTFIALRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLIITYIFANHFTIAGMGKDFSHNLGVNYEQIVRIALFITASITALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKNALPHTMMLGACFVLFSDIIGRLIVYPFEINIGLTIGVFGTVIFLVLLMKGRKNYANDFE >LS483312|2132437:2150231|2134915_2135950_-|SQE72404.1|DBSCAN-SWA MKKTVLFLILSLVLVLAACGNQSKDSETKSGESKGTVKINNNFEAQGDKRDGSDAKKVKNTVKVPKNPKKAIVLDYGALDTLKEFGVEDQIKGLPKGENNASLPKFLDEFKSDKYENTGNLKEVNFDKIAAAKPDVIYISGRTASQKNLDEFKKAAPKAKVVYVGASEKNYVNDMKKVTTNLGKIYNKEDKAKDLNKKLDDKIADVKTKAKKVNKSTMYLLVNEGELSTFGPGGRFGGLVFDTLGFKPADKDVKPSPHGQNVNNEYITKKDPEIILAMDRGSVVGGKSTAKQVLGNDVIKDVKAVKEDNVFELDPKLWYFSSGSTSTTIKQIDELNKVLDKAQK >LS483312|2132437:2150231|2132437_2133391_-|SQE72402.1|DBSCAN-SWA 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>LS483312|2132437:2150231|2144559_2145060_+|SQE72412.1|DBSCAN-SWA MTQGRQEEEMKDITLLGNQNNHYQFDYRPDVLETFVNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPDTKYARMAEHRLMNHDMYPEKIDNR >LS483312|2132437:2150231|2145317_2146430_+|SQE72413.1|DBSCAN-SWA MKVQKGWDVMASHNSHELAVEKIPQKGFFGHPKGLGVLFFVEFWERFSYYGMRAMLIFYMYYAINQGGLGIDKATAMSIMSVYGALIYMSSIPGAWIADRITGTRGATLIGAVLIIIGHVCLSLPFQMFGLFASMFFIIVGSGLMKPNISNIVGRLYPENDVRIDAGFVIFYMSVNLGALISPIILQNFLDVNNFHGGFLIAAIGMALGLVWYILFNRKTLGQVGMQPTNPLTAEEKKKYTFIIVAIVAVITAVLVVTYLTNTLSFNLVSNTVLVLGIVLPIIYFATMIYSKDVDDTERSRVKAFIPLFILGMIFWSIQEQGSNVLNIYGLEKSDMHLNIFGWTTRFGEAWFQSINPLFILLFAPLISLM >LS483312|2132437:2150231|2148136_2148334_+|SQE72416.1|DBSCAN-SWA MLLRSIYGETPEEAVPVEDRGPNKEKCEKHFTKQSKLGWLRRHPRKAKPFNTKHCENREQQQDIF >LS483312|2132437:2150231|2133377_2134361_-|SQE72403.1|DBSCAN-SWA MKMKFLLKSYVLVTLVIILTIVSLFVGVSKLALTDIFHLSSEQINILISSRIPRTVSILISGSSIALAGLMMQHMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILISLTVFPESPIMLKLLFAVGCSLIGTALFVKLVSLIQVKEVIFIPLLGIMLGGIVSSFTTFIALRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEVLYLSIPLLIVTYAFAQYFTIVGMGKEFSHNLGVNYELMVNIALFITATMTALVVVTVGTLPFLGLIVPNIISIYRGDHLKNTLPHTMLLGACFVLISDIIGRLIVFPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYANELE >LS483312|2132437:2150231|2142405_2142804_-|SQE72410.1|DBSCAN-SWA MKVIYFSFSGNVQRFIKRTELSDVMEITEDNCQEEVNEPYILVTGTIGFGEVPQEVQQFLQVNHQHLQAVAASGNRNWVQNFAKAGQTISEQYNVPLLMKFEVQGSNSDVKEFKDKVGQFNENYEREKIQSY >LS483312|2132437:2150231|2149175_2150231_-|SQE72418.1|DBSCAN-SWA MKKQLDQLSAYQPGLSPRALKQQFGIEGELYKLASNENLYGPSPKVKQAITDHLDELYYYPETGSPSLRKAISAHLHIDESRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDKIVTSEATFGQYYHNAIVESADVVQVPLKNGGFDLEGILNEVDEQTALVWLCNPNNPTGTYFTHEKLHDFLSRVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLKLQEEFDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVIATNEAIDKWNIIRPPFNVTRISEYAAIAALEDQDYLHDITQKNAQERQKFYAIPQSKHFLPSQTNFIFVVTDKVQELYQQLLQVGCITRPFPTGVRITIGFPEQNDKMIEVLQQFDY >LS483312|2132437:2150231|2147176_2148091_+|SQE72415.1|DBSCAN-SWA MTDKYNHGVLFYHEHSGLKDIYNGLGEVTKVLSSICKQLSIQLSENEGDIIKYCQKIKQGDYGQKIDILFILGGDGTVNEMVNGVMKHQLDLPIGIIPGGTFNDFTKTLNIHPNFKQASEQLKYAQIGQYDVIQVNKEFALNFVGLGLIVQNAENVQNGAKDIFGKLSYIGSTVKTLMDPSNFDFTLTIDGEKTTGNTSMLLIANGPNIGGSRIPLTDLSPQDGKLNTFIFDEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIDHISGKDIRIDTKPIMKVDIDGEIRLETPLDIKVLPKALKLLTIPT >LS483312|2132437:2150231|2140337_2142443_-|SQE72409.1|DBSCAN-SWA MKIMNEKKYNHIELNNEVTKRKESGFFNLEKDQEALKVYLEEIHDKTIYFDDEIERLHYLVDHDFYFNVFDKYSEIDLREITDFAKSIEFNFASYMSASKFYKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVTIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPVAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKQEYGVTLDDIDLEQYYDDMVANPNIIKKKKDAREMLNTIAQTQLQSGYPYLMFKDNANKVHANSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIDDEIKRDISCNLGSLNIVNVMETGKFRDSVFTGMDALTVVSDEANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYFAKNKIGYESEEAKDFANVFFMMMNYYSLERSMQIAKERGQVYQDFEQSDYANGKYFSFYTAQDITPRFAKVQQLFEGIEIPTAEDWKALQQQVEAHGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPETMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELSRLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCAI >LS483312|2132437:2150231|2136064_2136829_-|SQE72405.1|DBSCAN-SWA MTQSIQGKAILKDISVDIQKGRLTSLIGPNGAGKSTLLSAISRIIEHDSGAIELEDIDIAAYRKNLLAQKLSILKQTNHTDMNITVEQLVNFGRFPYSKGRMKEADYEQVDYAINLLHLEDIRQRDLKTLSGGQRQRAYIAMTIAQNTDYILLDEPLNNLDMKHSVQIMQTLRRLCRELNKTIVIVLHDINFASCYSDDIIALKDGELVKADEKDAVIQKEVLQELYDMNVAIESIKGQRICLYFDEQLVEDVT |
17 | uncultured_Caudovirales_phage(58.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2164755 : 2171376
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483312|2164755:2171376|DBSCAN-SWA TTTATAGCATCTCCAAAATTTTAGCTTTATCACGAAATTCTTGCACTTCATTTTCAGGATCAGAATCAATAGTAATACCCGCGCCGACACCATATATCGCTTTATTATCACGATATTCAATTGTGCGAATAGGCACATTAAAAATCATCTTGTCATCTGGCATCAATATGCCAAGCGTACCACAGTAAATATAACGCGGTTGGTCTTCTAATTTGTGAATATATGACATCGTGTTTAATTTAGGTGCACCTGTTATGGAACCACAAGGAAATAGCGCATGAAATAACGTTGCTAATGGTAATGTAGCATTTGAGAGTTGACCTGCAACCATACTTGTCATTTGATATACAGTGGCATAAGTTTCAATAAAAAACGGACGATACACATGTACCGTACCTTTTCGTGCAATTCTAGCAATATCATTTCTCAATAAATCAACAATCATGACATTTTCTGCTCTATCCTTTAATGATTGTTGTAAATATTTATAGTTATATTGATCTTGCTGTTTGACATCTGACCTTGGCATGGTGCCTTTCATAGGCTTACTCACAACTACATTATCTTGACCATCAAATGGCCCTTTCTGAAAGAATAATTCGGGTGAAATAGAAGCGACTTGTACGTCTTCAGTATCCATTAACATGGTGTAATTGCCATTTTTAGTTTGCGTTAATTTATCATACAGGTCTTTAATTGGCATTTGTACTGGCGAACTCACTCTTGTTGTATAGTTTACCTGGTAAGTTTCGCCATCAATAATTGCTGCTTGTACTGCTTTGATATGTTGAATCATAGTTGCCTCTTTTACTTGAAAGGCAAACTGGTGTTGTGGCTTATTATTATAATGCTTTATTGACGTCTCTTGTTGTATGGGCTGTGCCGATTGATAACTATAAGCCGCTGCTAATATTGCATCGTCTGCAGTTGGATGCACAGCCATGTCAGGATTAAAGTATTGTGCCGCTTCATACGTCATATAAAGCGCCACATATTTCCCTTCTTTCTGCTGTTGTTCTGCAAAATTGATAACGTCTCCCACATCTTTCATCTCATATGCTAGATATTGCCCTAACCTTTCTGTGAGTTTAAGTTGGTGCGTTTCGTAGCGTGAATCGTCTAAATAATATCTATAATTAAATTGTATTGTCACACTGATTCACCCCCAAAGTTTTAATAAACAGCTCAATTTGTGCATGACCATGTTCACTGAGAATTGATTCAGGATGATATTGCACCGCATAAATAGGCCATTGTCGATGCTGAACTGCCATAATAATACCTTCATCATTTTCAGCACTAATTTCAAGTTGTGCCGGCAGTGATTGACGCTCTGCAATCAAAGAATGGTAACGCATCACTTCAAAATGTTGTGGCAGTTGAGCAAAAATCCCCTTATTATTATGATTAAGCTTTGTTGTGTGGCCGTGTACAGGTCGTTTACCATGAATAATACGGCCCCCAAAATAATCGTAAATGCATTGAAATCCTAAGCAAACACCTAATATGGGAATACGCTTTTTAAATGCTGCAATAATCTGTGCGATTATCGGATAATCACTAGGCTTACCCGGGCCTGGGGAAATAACTAGCGCTGACGGATTAAGCTGTTGTAATGATTGTATTGTGACTTGATTAATACGATAAACAATGATTTCTATATCAGTAACTGTTTTAAAGTAATCTATCAAGTTATATGTAAATGAGTCGTTATTATCTATGACTAATATCATTTTATGCTTACCTTCTTTAGTTTCATTCGTAAAAATTACCACTTTATTATAATATATATGTAAGGGGTTACGTTTCTATTATCCCAAAATATTTCTTGATTTTACATAGTTTCTGTATTATTCTAGCTAGCGTATTCAAAATAAATAATCAGAGGTTCCTAGCCGAAACCCTCTATAAAAAACTAGACACCGAATGTTTCAATCAATATTTAAAGTAACTTATCATCATATGCATTTACTTATTCTGTGGTCTATCTTTTTTATAGAGATAGCTTTTTTTATGTCTAAAAATAGGTTGCATTACCCTCAACGCACTTAAATTGGAGAGATGGACAATGACTGAAACAACTTTAAACAATAACAAAGCCATAGTCGTATTTAGCGGTGGTCAAGATAGTACTACATGCTTATTTTATGCTAAAAAGCACTTTGACGAAGTCGAACTTGTTACGTTCAATTATGGACAGCGTCATAATACTGAAATTGAAGTAGCCAAAAGCATAGCGCATGAACAAGGACTAGCACATCACATTCTTGATATGTCGCTATTATCACAATTAACGCCAAACGCATTAACGCAACACGATATGAAAATCGAAACCAACGATGACGGTATGCCTAATACATTCGTACCTGCACGTAATCTATTGTTTTTATCATTTGCAGGTGCCCTTGCTTACCAACTCAACGCCAAACATATTATCACTGGTGTATGTGAAACAGATTTCTCTGGCTACCCTGATTGCAGAGATAACTTTATTAAATCAATGAATGTGACACTAAGTTTAGCTATGGATAAAGATTTTGTTATTCATACACCTCTCATGTGGCTAAACAAAGCTCAAACATGGGCGCTAAGTGATGAACTTGGTGTCTTAGACTATATCCGTCATCAAACATTAACATGCTATAACGGCATCATTGGTGATGGCTGCGGAGAATGTCCAGCTTGTCACTTAAGAGCACGTGGTTTACAACAATATCTTAATTCTAAAGGAGCGAAATAATATGTTACAACAAATTTACCCGTCTGTCTCACATCCTTACCAATTCGAACTCAATAAAGACTTTAATTTTTCTGCAGCACATTTTATACCATGTAAAGATGCTGGAAAATGCGTACGCACTCATGGACATACGTATTTCGTAAATTTAACAATTGCGGGTGACACGCTTGATCATAATGGTTTCCTTATCAATTTCCAAGAGTTAAAAGCATTGATTCACGATCAATTTGATCATTATTTATTGAATGATTTGCCACACTTTAAAGATCAAAGTCCCTCTACTGAAATTGTGGCACAGACAATATATAACATGATTGAAAATCATCTGATGCAATATACAAATCGTCCACATTGTGTTCAAGTCTACTTAAGAGAAACACCAACAAGTTATGTTGTTTATCGTCCGAAGGTGCAACATTAATGGCTGCTAAAATACCTGTATTAGAAATTTTTGGCCCCACAATTCAAGGTGAAGGCCGTGTCATTGGACGTAAAACGATGTTTGTTCGAACTGCTGGATGTGATTATCGCTGTAGTTGGTGCGATTCCGCATTTACCTGGGATGGCAGTGCAAAAGATCAAATTCAATTAATGAGCGCAACAGAAATTTATGAAAAATTAATTGAAATTGGTGGCGATTGTTTTGATCATGTAACGATATCAGGAGGTAATCCTGCATTAATTAAAGGTATACAAGATCTTGTCGATTTATTTGAAACTGAGCATATCGCAACTGCTTTAGAAACACAAGGTAGTAAATTCCAACCTTGGATGACACAGATTAATGATTTGACGATAAGTCCTAAACCACCTAGCTCTTCAATGACACCTAATTTAGAAGTTTTAGATCAAGTCATTGCACAATGTGTGCCACAATCCTTAAATTTGAAAGTGGTTGTTTTTGATGATGAAGATTATGCTTTTGCCAAAATGATTCATCATCGTTATCCAGACATACCTTTCTATTTGCAAGTAGGCAACCCATACTTAGCAGATGACGTAGCAAATCACACTGAAAAACTATTGTCACGATATGAACAATTGGTTGAAAAAGTAATGCATAGCAATGATATGAATCGCGCTTATGTCTTACCACAACTTCATACATTATTATGGAGCAACAAAAAAGGTGTTTAAATTTATCGCTATAAAATGTTTTGTAAGTGTTATGAAATGATTAAGTTGTGTTAAATTGCTATAATATGGCAATGAAGTATTTGCGATAGGAGTTCATCATGATTATATACGTACTATTAAACATTGCTGTAGTTTTGGCTATCGTTGGGTTTGATTTATATAGGCAGCAATATAAACAACTTAAATTTAGTTCTCTACTATTAGCGATTGTCATTAACACAACAATAAATATGTTTATTATTCAAAAGTATAATTTTATTTCAACTTATACCACTGCATTACTAATCATATGGTTATTACTGCAACTGTATGTTAATTATAAGGTACATCCTTTTGTAATTAATAACCAAAAATTTCTTGCCAGCATATTTGCGATTATTTTAAGCTTATCAGCATTTATTATGGATATTTCGAGCGACCAATCTGTCTATATGTCCATTCCTTATCTGTCACCAGCTATTTTTCTAATTGGGGCAATCATTTTATTTACGGGTACATTTAAATCAACCGAACGCAATCGCTTGCCATTATTCAAACGAATACAAGCCCCTATCATGATAGGAACAATTATTATTGCATTATCATTTGTTGTTATGATGATGTTAACACCATTCTGGTACATATTTTTAGGAATCTATGTATTATTTATAGCATTTATTATTTGGCAAAAAGTATTTCAACATTATTAAAATAACCGGAACACACTTGTCGGCGTGTTTCGGTTATTTATTATATATGCTCTTTTTCTTTATCTTTCACGGTATGCTCATGGTTTATATTACATTGATATGCATTGGGACTATGACCATTTTCATAGGTTAAATTCGAAGCTTGTACAATGTACTTAGGTCTTTGCTTCACTTCATAATAAATCCGTCCGATATATTCTCCGACAACACCTATAGAGATAAGCTGAATACCACCAAGTAACAAAATAGCAGCTATCGTCGTGAAATAACCTGGATTACTAATGCCATTTACGATAATGCCTATAGACAAATAAATAATATAGATAAGGCTAATTGCAAAAATAAATAATCCAAAATAAATCATTGTCCGTAATGGCTTACTATTAAATGAAATTAAACCATCAATACCATAATTAAATAACTTTCTAAAATTCCACTTTGATTGTCCCGCTTCACGTTCTACATTTTTATATGAAAAGACTTTTGTATTATAACCAATCCAAGCAAATAATCCTTTTGAAAAACGATTGTTCTCTTGCAACTCAGCAATTGCACACACAGCTCGTTGACTCAACAATCTAAAATCTCCTACCCCATCGACAAACTGGACATCTTCAACAAATGCATTAATCAATTTATAATACATCTTTGTCACTATTTTACGTGATAGCTGTTCGCCTTCTCTATCACGTTGGGCAATGACTTGATCATAACCCTCTAGATAACCATCAATCATATTGGGTATAAATTCAGGAGGATGCTGTAAATCACCATCTATCATAATGACAGCGTCTACATCAACACTATGGTGAAAACCTGCAATCATCGCTGATTCTTTACCAAAATTCCTACTAAATGAAATAAACTTTACGTGTTTATCTTCTAACGACAATTGCTGTATGTGTTGAATCGTACTATCTTTGCTACCATCATCAATAAATAATAAATCATAGTCATAATTTTTTTCGTTACTGTCTTTCAACATAATTTCAGTCAATCGCTCATATGTTTTTAATACGACTTCTCCTTCGTTATAACAGGGGACAATGACTCTGATTTTCATCCGATTACTTCCTTTACTTATTTCTTAATACTATTTTATCAATTTATTCATAAAACGCGCTAGTATCGTTCTTTAATTTTACAAAAAATTAATAAAGTTGCAAGCGAACTAGTTTTTAAAGCTATTTTATTTTTTTAAGTAGGCTTATCATTTGTACTATTTTAAATCGCCAATGCTAACATCATCAGGATCTTTCCCTTGTCTTGCATTGCGATTCAAACTATCAATTTCTGCAATTTCAGCTAATTCCAAATTAAAATTAAATAAATCGAAATTTTCTTTAATTCGTGAAGGTGTCTGAGACTTAGGTATAATGATACGATTATGTGCTAAGTGCCAACGCAACACGATTTGAGCCGGTGTCTTGTCGTGTTGTTGGGCAATATGTTGAATTGTTGAATCATCTAATAATCCGCGATTGCGCATTAATGGCATCCATGCCGTTACAGTAATATCGTGTTTATCGCAAAAGTCTTGAACATCCTGTTGATTAAAGTAAGGATGCAATTCAATTTGGTTAATTTGTGGAACGATATTGGTTTCTTGCATTAATTTTTCCAAGTGATGAATTTTAAAGTTACATACGCCAATCGCTTTTACTTTACCTTCATGATATAAATCCTCTAGTGCTTTATATGTTTCAATATATCGTCCATTCTGTTCACATGGCCAATGAATCAAAAATAAATCAAAATAATCAAGGCCCATGTTATCTAAAGAACGTTGGAAATAGGCTTTCGTCTGTTCATAACCTTGATGATCATTCCATACCTTAGACGTGATAAACAATTCTTCACGTGGCACACCACTGTTCTTTAAAGCCTGTCCTAATGATGCCTCATTGCCATAAAAATATGCAGTATCAAATGCACGATAGCCGGTTTCTATAGCTTGTTGAATGACTTTCGGCATATCTTCATCAGTAATTTTATAAACACCAAAACCTACTTTGGGCATAGGATAGCCATTATTTAATAATTGCGTATCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483312|2164755:2171376|2166822_2167494_+|SQE72431.1|DBSCAN-SWA MTETTLNNNKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFDEVELVTFNYGQRHNTEIEVAKSIAHEQGLAHHILDMSLLSQLTPNALTQHDMKIETNDDGMPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQLNAKHIITGVCETDFSGYPDCRDNFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAQTWALSDELGVLDYIRHQTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRARGLQQYLNSKGAK >LS483312|2164755:2171376|2165890_2166487_-|SQE72430.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYFKTVTDIEIIVYRINQVTIQSLQQLNPSALVISPGPGKPSDYPIIAQIIAAFKKRIPILGVCLGFQCIYDYFGGRIIHGKRPVHGHTTKLNHNNKGIFAQLPQHFEVMRYHSLIAERQSLPAQLEISAENDEGIIMAVQHRQWPIYAVQYHPESILSEHGHAQIELFIKTLGVNQCDNTI >LS483312|2164755:2171376|2167914_2168631_+|SQE72433.1|DBSCAN-SWA MAAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKDQIQLMSATEIYEKLIEIGGDCFDHVTISGGNPALIKGIQDLVDLFETEHIATALETQGSKFQPWMTQINDLTISPKPPSSSMTPNLEVLDQVIAQCVPQSLNLKVVVFDDEDYAFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLADDVANHTEKLLSRYEQLVEKVMHSNDMNRAYVLPQLHTLLWSNKKGV >LS483312|2164755:2171376|2170539_2171376_-|SQE72436.1|DBSCAN-SWA MNDTQLLNNGYPMPKVGFGVYKITDEDMPKVIQQAIETGYRAFDTAYFYGNEASLGQALKNSGVPREELFITSKVWNDHQGYEQTKAYFQRSLDNMGLDYFDLFLIHWPCEQNGRYIETYKALEDLYHEGKVKAIGVCNFKIHHLEKLMQETNIVPQINQIELHPYFNQQDVQDFCDKHDITVTAWMPLMRNRGLLDDSTIQHIAQQHDKTPAQIVLRWHLAHNRIIIPKSQTPSRIKENFDLFNFNLELAEIAEIDSLNRNARQGKDPDDVSIGDLK >LS483312|2164755:2171376|2167495_2167915_+|SQE72432.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSVSHPYQFELNKDFNFSAAHFIPCKDAGKCVRTHGHTYFVNLTIAGDTLDHNGFLINFQELKALIHDQFDHYLLNDLPHFKDQSPSTEIVAQTIYNMIENHLMQYTNRPHCVQVYLRETPTSYVVYRPKVQH >LS483312|2164755:2171376|2164755_2165907_-|SQE72429.1|DBSCAN-SWA MTIQFNYRYYLDDSRYETHQLKLTERLGQYLAYEMKDVGDVINFAEQQQKEGKYVALYMTYEAAQYFNPDMAVHPTADDAILAAAYSYQSAQPIQQETSIKHYNNKPQHQFAFQVKEATMIQHIKAVQAAIIDGETYQVNYTTRVSSPVQMPIKDLYDKLTQTKNGNYTMLMDTEDVQVASISPELFFQKGPFDGQDNVVVSKPMKGTMPRSDVKQQDQYNYKYLQQSLKDRAENVMIVDLLRNDIARIARKGTVHVYRPFFIETYATVYQMTSMVAGQLSNATLPLATLFHALFPCGSITGAPKLNTMSYIHKLEDQPRYIYCGTLGILMPDDKMIFNVPIRTIEYRDNKAIYGVGAGITIDSDPENEVQEFRDKAKILEML >LS483312|2164755:2171376|2169360_2170383_-|SQE72435.1|DBSCAN-SWA MKIRVIVPCYNEGEVVLKTYERLTEIMLKDSNEKNYDYDLLFIDDGSKDSTIQHIQQLSLEDKHVKFISFSRNFGKESAMIAGFHHSVDVDAVIMIDGDLQHPPEFIPNMIDGYLEGYDQVIAQRDREGEQLSRKIVTKMYYKLINAFVEDVQFVDGVGDFRLLSQRAVCAIAELQENNRFSKGLFAWIGYNTKVFSYKNVEREAGQSKWNFRKLFNYGIDGLISFNSKPLRTMIYFGLFIFAISLIYIIYLSIGIIVNGISNPGYFTTIAAILLLGGIQLISIGVVGEYIGRIYYEVKQRPKYIVQASNLTYENGHSPNAYQCNINHEHTVKDKEKEHI >LS483312|2164755:2171376|2168729_2169320_+|SQE72434.1|DBSCAN-SWA MIIYVLLNIAVVLAIVGFDLYRQQYKQLKFSSLLLAIVINTTINMFIIQKYNFISTYTTALLIIWLLLQLYVNYKVHPFVINNQKFLASIFAIILSLSAFIMDISSDQSVYMSIPYLSPAIFLIGAIILFTGTFKSTERNRLPLFKRIQAPIMIGTIIIALSFVVMMMLTPFWYIFLGIYVLFIAFIIWQKVFQHY |
8 | Pandoravirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483312.1|SQE72416.1|2148136_2148334_+|Uncharacterised-protein |
2148136_2148334_+
Protein sequences of LS483312.1|SQE72416.1|2148136_2148334_+|Uncharacterised-protein>LS483312.1|SQE72416.1|2148136_2148334_+|Uncharacterised-protein MLLRSIYGETPEEAVPVEDRGPNKEKCEKHFTKQSKLGWLRRHPRKAKPFNTKHCENREQQQDIF |
65 aa aa | NA | NA | NA | 2132437-2150231 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 9.1|1788345|29|LS483312|CRISPRCasFinder matches to LS483312 position: 2148207-2148235, mismatch: 0 aagagaaatgcgaaaagcatttcaccaag CRISPR spacer aagagaaatgcgaaaagcatttcaccaag Protospacer ***************************** |