Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483318 | Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis strain NCTC5370 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,csm6,cas3 | 0 | 0 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483318_2 | 1699520-1699597 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483318_2
|
1 spacers
spacers of LS483318_2
>2.1|1699546|26|LS483318|CRISPRCasFinder ATAGGCTAAAAACGTTCACTGAACGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483318_2
The CRISPR arrays of LS483318_2 >merge|LS483318|2|1699520-1699597|CRISPRCasFinder ACCACTCGCTCTTTGTCTCTAGGCTCATAGGCTAAAAACGTTCACTGAACGTACCACTCGCTCTTTGTCGCTAGGCTC >LS483318|2|2|1699520-1699597|CRISPRCasFinder ACCACTCGCTCTTTGTCTCTAGGCTC ATAGGCTAAAAACGTTCACTGAACGT ACCACTCGCTCTTTGTCGCTAGGCTC
>LS483318.1|SQE86607.1|1699142_1699358_-|DJ-1/PfpI-family-protein MKKVACLIYPYFSLYEVTALTSTLVLSFGVDIDYIATSKASLFQRTGSLVRLQKLLSRFPLMIILASSYQE >LS483318.1|SQE86606.1|1698717_1699146_-|4-methyl-5(beta-hydroxyethyl)-thiazole-monophosphate-synthesis-protein MIDFKLVLRDKELLTFLAGLNEESILIAAISSAPILLAKAGLLKDKTFTGGIWQNFFDYFDFIPKENFKPLSVLKDQNIVTAIGFAHQEFARTVLTSLNLTEDANKFFREEATYAEEDLVFNLSEEEFENFKSDFDAHLISK >LS483318.1|SQE86605.1|1697347_1698484_-|chaperone-protein-DnaJ MNNTEYYDRLGVSKDASQDDIKKAYRKMSKKYHPDINKEAGAEQKYKDVQEAYETLSDSQKRAAYDQYGAAGANGGFGGGAGGFGGFDGGGFGGFEDIFSSFFGGGGMRNPNAPRQGDDLQYRVNLSFEEAVFGVEKEVSYNREATCGTCSGSGAKPGTSPVTCHKCHGSGVMTVDTQTPLGMMRRQVTCDVCHGTGQEIKEPCPTCHGTGHEKKVHKVSVKIPAGVETGQQIRLQGQGEAGFNGGPYGDLFVILNVLPSKKFERNGSTIYYSLDISFTQAALGDTVDIPTVHGDVEMAIPAGTQTGKTFRLKGKGAPKLRGGGQGDQHVTVNIVTPTKLNDAQKEALKAFAEASGEQPLHPKKKGFFDKVKDALEDI >LS483318.1|SQE86604.1|1696334_1697126_-|enoyl-CoA-hydratase MPFNYIIFDIQDDLATLTLNRPEVSNGFNIPTCQEILQALTKVKENPSVRFLMIKAVGKVFSVGGDLVEMQTAVEKDDVQSLVKIAELVQEISFAIKQLPKPVILCADGAVAGAAFNIALAADFCIASTQTKFIQAFVNVGLAPDAGGLFLLTRAVGLNRATYLVMTGEGVTAEKGLDYGFVYRAAESDKLDKVCLQLLKRLRRGSSNSYAGMKTLVWQSFFIGWEEYAKKELDIQEELAFKEDFKEGVRAYGERRRPNFQGK >LS483318.1|SQE86603.1|1695823_1696258_-|transcriptional-regulator,-MarR-family MEYDKINQYLVDIFNRILVIEEMSLKTSQFSDVSLKEMHTIEIIGKYDQVTPSDIARELMVTLGTVTTSLNKLEAKGYIERTRSSSDRRVVYLSLTKKGRLLDRLHAKFHKNMVGHVIADMSDEEMQALMRGLGNLHQFLEDLV >LS483318.1|SQE86602.1|1694848_1695823_-|3-oxoacyl-ACP-synthase MVFSKISQVAHYAPKQLVTNDDLANIMDTSHEWIFSRTGIAQRHIVREELTSDLASRVAEQLLTKSGLAADAIDFIIVATISPDGTMPSTAAIVQATIGATRAFAFDLTAACSGFVFALAMADKLIASGAYQNGMVIGAETLSKLVNWQDRATAVLFGDGAGGVLLEASQDQHLLAESLHTDGARGQHLTSGQTGLSSPFSLSQEVTHTIQMDGRAIFDFAIRDVSKNISGILEQSGLTNDDLDYLLLHQANRRILDKMARKIDFPREKFLENMEHYGNTSAASIPILLSEAVQNGQIRLDGTQKVLLSGFGGGLTWGSLIVKI >LS483318.1|SQE86601.1|1694563_1694788_-|Acyl-carrier-protein MAVFEKVQEIIVEELGKETEEVTLETTFDDLDADSLDVFQVISEIEDAFDIQIETEEGLNTVGDLVAYVEEKTK >LS483318.1|SQE86600.1|1693393_1694365_-|enoyl-ACP-reductase MKTHITELLNIDYPIFQGGMAWVADGDLAGAVSNAGGLGIIGGGNAPKEVVKANIDRVKAITDKPFGVNIMLLSPFADDIVDLVIEEGVKVVTTGAGNPGKYMERLHQAGIIVIPVVPSVALAKRMEKLGVDAVIAEGMEAGGHIGKLTTMTLVRQVVEAVSIPVIAAGGIADGRGAAAAFMLGAEAVQVGTRFVVAKESNAHQNFKDKILKAKDIDTVISAQVVGHPVRSIKNKLTSAYAKAEKEFLTNQKTADDIEEMGAGSLRNAVVDGDVVNGSVMAGQIAGLVKEEESCEAILKDIYYGAASVIQEESKRWQAVSLDN >LS483318.1|SQE86599.1|1692448_1693369_-|ACP-S-malonyltransferase MTKTAFLFAGQGAQKLGMARDFYDHFAIVRETFDQASQVLGYDLRRLIDSDQEKLNQTSYTQPAILTSSIAIYRVLGLHHIKPDMVAGLSLGEYSALVASGALSFEDTLALVAKRGRLMEEAAPSGSGKMVAVMNTDVQIIEEACQLAAVHGVVSPANYNTPSQIVIGGQAEAVNVAVELLKEKGVKRLIPLNVSGPFHTALLKPASRLLARELEHYTFNDFNIPLVGNTEASIMEKDRIPELLARQVMEPVRFYDSIATLTENGVTQAIEIGPGKVLTGFVKKINKQLPCSSIEDMVSLRSFLDR >LS483318.1|SQE86598.1|1691702_1692437_-|3-ketoacyl-ACP-reductase MEIKGKNIFITGSTRGIGLAMAHQFASLEANIVLNGRSAISDDLVASFADYGVTVVAISGDVSEASDAKRMVSEAIEHLGSVDVLVNNAGITNDKLMLKMTEEDFERVLKINLTGAFNMTQAVLKPMSKARQGAIINVSSVVGLTGNIGQANYAASKAGLIGFTKSVAREVAARNVRVNAIAPGFIESDMTDVLSEKMQEQILGQIPMKRIGKAQEVAQLASFLAGQDYITGQVIAIDGGMTMQ >LS483318.1|SQE86608.1|1699625_1701452_-|molecular-chaperone-DnaK MSKIIGIDLGTTNSAVAVLEGTESKIIANPEGNRTTPSVVSFKNGEIIVGDAAKRQAVTNPETIISIKSKMGTSEKVAANGKEYTPQEISAMILQYLKGYAEDYLGEKVTKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLEVERIVNEPTAAALAYGLDKTDKEEKILVFDLGGGTFDVSILELGDGVFDVLATAGDNKLGGDDFDQKIIDFLVEEFKKENGIDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVTQTQISLPFITAGAAGPLHLEMSLSRAKFDDLTRDLVERTKTPVRQALSDAGLSLSEIDEVILVGGSTRIPAVVEAVKAETGKEPNKSVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIDRNTTIPTSKSQVFSTAADNQPAVDIHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPAAPRGIPQIEVTFDIDKNGIVSVKAKDLGTQKEQHIVIKSNDGLSEEEIDRMMKDAEANAEADAKRKEEVDLKNEVDQAIFATEKTIKETEGKGFDAERDQAQSALDELKAAQESGNLEDMKAKLEALNEKAQALAVKMYEQAAAAQQAAQGAEGAQTSDSSNDDGVVDGEFTEK >LS483318.1|SQE86609.1|1701569_1702112_-|heat-shock-protein MSKKAKEEQVKEESLDQTVEVEEVSTEEVVEETPEKTDLELANERAEEFENKYLRAHAEMQNIQRRANEERQNLQRYRSQDLAKKILPSLDNLERALAVEGLTDDVKKGLEMVQESLVQALKEEGIEEVAVESFDHNLHMAVQTLPADDEHPADSIAEVFQKGYKLHERLLRPAMVVVYN >LS483318.1|SQE86610.1|1702153_1703188_-|heat-inducible-transcription-repressor MITERQNDILNLIVELFTQTHEPVGSKALQSAIDSSSATIRNDMAKLERLGLLEKAHTSSGRMPSAAGFKYFVEHSLSLDSIDEQDVYQLVKAFDFEAFRLEDLLAKASQILADITGYTAVILDVEPARQKLTAFDIVQLSNHDALAVLTLDESKPITVQFAIPKNFLSKDLLVLKEIVDERLLGRDVMDVHYKLRTEIPQIVQKYFTVTDNVLDLFDYIFEGLFQETVFVSGKVAALDYAGLATYQFLDHEQRLALSIRQSMAEDDMAMVRVADSKEAALANVTLLTYKFLIPYRGFGLLSLIGPIDMDYRRSVSLINVIGRILAVKLRDYYRYLNSNHYEVN >LS483318.1|SQE86611.1|1703322_1703892_-|N-acetyl-muramidase MRSRLKFPYFITLLLFFLVLIIGPLLFNGRMASATKEVNVGYSQDQFIKTLVPEVKPLAEHYGIRPSILIGQILLETDNGRTLLAAKYHNLFSKEADLGQSGIRLKDSLKSGQVFRYAVYKDRESSIRDYLSMLSQGQQIDKRLYRSLATEKGYKAPAQSLQDYRYSEDTTYAKRLIKVIEEKDLTSYD >LS483318.1|SQE86612.1|1703888_1704632_-|D,D-carboxypeptidase MKHNHFKLLLQTLVVLLFVGGIYLFIKPEKQATKTPSSQQASSQKVVKNSKESTGLPKVSPKDWELILVNRDHITEELSPELVDVNGVSVDKRIEQATADFLAAAQAIDPQEHLISGYRSVAYQAELYQSYIDQEMANDPSLTQEAAEALVQTYSQPAGASEHQTGLAIDMSTVDSLNASDPQVAQAVQKIAPEYGFVLRFPDGKTKSTGVGYEDWHYRYVGKASARYMTKHRLTLEEYISALKEKQ >LS483318.1|SQE86613.1|1704621_1705329_-|phosphoglycerate-mutase MTKTRLYIARHGKTMFNTIGRAQGWSDTPLTKKGEEGIRELGLGLKDSGIPFKAAFSSDSGRTMQTMEIILRESENEFLPYTRDKRIREWCFGSLDGAYDSELFLGVLPRTKAFENRDNLRDVPYSELAESIVEVDTANWAEPWEVLRKRIWDGFEAIALSIQNAGGGNALVVSHGMTIGTFMWLIDPDREKQYIDNGSVTVVEFEDGQFTIKTIGDMSYRYRGREIIEAKSDEA >LS483318.1|SQE86614.1|1705635_1705872_-|membrane-protein MIWSLIVGAFIGMIAGKITEKSQSMGCFTNIAAGLIGSAVGQRLFGDWGIQLAGMAVFPSILGAAIVIVLVSAIFGKR >LS483318.1|SQE86615.1|1705942_1706917_-|drug/metabolite-transporter-superfamily-protein MVGDEAEKGDSMSKTVKGSLMVLLAGLAWGISGAFGQYLMAHGTDVHLLTSLRLMISGVVLTALVLWRHKEKVIALVTTKKHFKELLIYSLLGLGLNQYAYLMAIRYSNAGTATVLQYLSPILVLIFVSATAKRLPTITESLAILLAILGTVIMACHGDLSHLAISPIGLFWGVFSALTYAYCVIKPVNMIKTWGSLIVIGLAMLMGGVVFPIVTRAWRYPLMLTAGNLVALIGIIGIGTIFAYTFFLKGASLIGPVKATLLASIEPVASFFFAIVLMKELFYVIDLLGMALILVAVLLISFRDLLLYQRERWLLKAVKRQKRF >LS483318.1|SQE86616.1|1707107_1708547_-|aspartyl/glutamyl-tRNA-amidotransferase-subunit-B MNFETIIGLEVHVELNTNSKIFSPSSAHFGEDPNANTNVIDWSFPGVLPVMNKGVIDAGIKAALALNMDIHKEMHFDRKNYFYPDNPKAYQISQFDEPIGYNGWIDIKLEDGSTKKIRIERAHLEEDAGKNTHGTDGYSYVDLNRQGVPLIEIVSEADMRSPEEAYAYLTALKEIIQYTGISDVKMEEGSMRVDANISLRPYGQEQFGTKTELKNLNSFSNVRKGLEFEVERQAKLLRSGGVIRQETRRYDEANKGTILMRVKEGAADYRYFPEPDLPLYEIDDAWIDEMRAQLPQFPAQRRAKYEEELGLSAYDASQLTATKALSDSFETAVSLGGDAKQVSNWLQGEVAQFLNAEGKTIEEIALTPENLVEMIAIIADGTISSKMAKKVFVHLAKNGGSARAYVEKAGLVQISDPAVLVPIIHQVFADNEAAVADFKSGKRNADKAFTGFLMKATKGQANPQVAQQLLAQELQKLLD >LS483318.1|SQE86617.1|1708546_1710013_-|aspartyl/glutamyl-tRNA-amidotransferase-subunit-A MSFNHKTIEELHDLLVAKEISATELTQKTLEDIKSREEAVGSFITVSEEAALKQAAAIDAKGIDADNLMSGIPLAVKDNISTKGILTTAASKMLYNYEPIFDATSVANAYAKDMIVIGKTNMDEFAMGGSTETSYFKKTKNAWDHTKVPGGSSGGSATAVASGQVRLSLGSDTGGSIRQPAAFSGVVGLKPTYGTVSRYGLIAFGSSLDQIGPFAPTVKENAQLLNVIASSDVKDATSAPVRIADYTSKIGRDIKGMKIALPKEYLGEGIDPEIKETVLAAAKQFEALGATVEEVSLPHSKYGVAVYYIIASSEASSNLQRFDGIRYGFRADDAKNLDEIYVNTRSQGFGDEVKRRIMLGTFSLSSGYYDAYFKKAGQVRTLIIQDFDKVFADYDLILGPTTPTVAFGLDTLNHDPVAMYLADLLTIPVNLAGLPGISIPAGFVDGLPVGLQLIGPKYAEETIYQAAAAFEAVTDYHKQQPIIFGGDK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
38503 : 48916
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483318|38503:48916|DBSCAN-SWA TATGGACAAACGTATTTTCGTTGAGAAGAAGGCTAATTTTCAGATTAAGGCTGAGTCGTTGGTAAAGGAACTGACGCATAATTTGCAGTTATCGACGTTGAAAACACTTCGTATGATTCAAGTTTATGATGTGTTTGGATTAACCGCTGCTTTGTTTCCACGTGCAGAGAAACACATCTTTTCTGAACAGGTTACCGATTGTATCTTGCCTGAGGAAACTATTAACACAGAGCTGACTAATGCCGCTTTTTTTGCAATTGAGAGTTTGCCAGGACAGTTTGATCAAAGAGCAGCATCTGCTCAAGAAGCTTTATTATTGTTAGGGGTTCCCAATGATGTGATGGTTAACACGGCTCAACTATATTTGGTCAATAAAGACATTTTAGAAACAGAGCTTGAAGCTATAAAACGTTATCTTCTCAATCCAGTTGATTCTCGATTTAAAGATATAACAAGAGGCATTGAGCGACATGACTTTTCTGAGTCGGACAAGGTTATCCCAACCTTGGATTTCTTTGAGACTTACACGTCAAATGAGTTTAAGATTTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCAATGGAGGTTGATGACCTTGTTTTCATTCAAGAGTACTTTAAATCAATTGGCCGTGTACCGACAGAAACAGAGTTAAGAGTTTTGGACACTTATTGGTCCGACCACTGTCGTCATACCACTTTTGAAACAGAATTAAAACATATTGATTTTTCCGCTTCTAAATTTCAAAAACAACTACAAGCGACTTATGATAAATATATCGCTATGCGTGAAGAATTGGGACGTTCTGATAAGCCACAGACGCTTATGGATATGGCGACAATTTTCGGTCGCTATGAGCGTGCGAATGGGCGTTTGGATGATATGGAAGTGTCTGATGAAATCAATGCTTGTTCCGTTGAGATTGACGTGGATGTTGATGGTGTTAAAGAGCCATGGCTCTTGATGTTTAAAAATGAGACACACAATCATCCAACAGAAATCGAACCTTTTGGTGGAGCAGCGACTTGTATTGGTGGAGCCATTCGTGATCCATTATCAGGGCGATCATACGTTTATCAAGCGATGCGTATTTCAGGTGCTGGAGACATTACAACACCTATTTCTGATACTCGCGCTGGAAAACTCCCTCAGCAAGTCATTTCAAAAACAGCAGCGCACGGCTATTCTTCATACGGAAACCAAATCGGTCTTGCTACAACTTATGTTAAGGAATACTTCCACCCAGGATTTGTCGCAAAACGTATGGAATTGGGAGCCGTTGTTGGTGCAGCACCTAAAGGAAATGTGATTCGTGAAAAACCAGAAGCTGGTGATGTTGTTATTCTTCTAGGTGGGAAAACAGGTCGTGATGGTATCGGTGGAGCAACGGGTTCCTCTAAAGTACAGACCGTTGAGTCTGTGGAAACGGCTGGTGCTGAAGTCCAAAAAGGGAATGCTATCGAAGAACGGAAAATTCAGCGTCTCTTCCGTAATGGTGAAGTAACACGCCTGATTAAGAAATCAAATGACTTTGGCGCAGGTGGTGTTTGTGTAGCTATTGGGGAATTGGCTGATGGTTTAGTAATTGATTTAAACAAAGTACCACTCAAATACCAAGGGTTAAATGGAACAGAGATTGCTATTTCAGAGTCCCAAGAGCGGATGGCGGTTGTCGTTCGTTCTAAAGATGCTGAGGAGTTTATTACTAAGTGTTCCAAAGAAAATATTAAGGCTGTTACTGTAGCAACGGTTACTGAAAAGCCAAATCTAGTCATGACTTGGAATGGCCAAACTATCGTTGACATTGAACGTTCTTTCCTAGATACCAATGGTGTTCGTGTCGTTGTTGATGCAAAGGTAGTTGACAAGGCTGTCAACTTGCCTGAAAGTCGCATAACATCGGTAGCAACGCTTGAACAAGATACACTTACTGTGCTTTCAAATCTTAATCATGCTTCTCAGAAAGGTCTTCAAACCCTTTTTGATTCTTCTGTTGGTCGTTCAACAGTTAATCATCCCATCGGGGGTCGTTACCAACTTACCCCAAGCGAGGCTTCTGTCCAAAAACTACCTGTTCAAAATGGTGTCACCACAACAGCCTCAGTTATCGCTCAAGGGTACAATCCCTACATTGCTGAGTGGTCACCATATCATGGTGCAGCTTATGCTGTAATTGAGGCCACAGCACGATTGGTGGCATCTGGTGCTAACTGGTCTAAAGCACGTTTCTCTTATCAAGAGTATTTCGAGCGCATGGATAAACAGGCAGAGCGCTTTGGCCAACCCGTTTCAGCACTACTTGGTTCTATTGAAGCCCAAATTCAACTTGGTCTACCATCCATTGGTGGCAAGGATTCCATGTCTGGAACATTTGAGGAATTGACAGTACCACCAACCTTGGTTGCTTTTGGTGTTACAACTGCACACACACAAGACGTTTTATCTCCGGAATTTAAAGTCGCAGGTGAGACTATTTACTATCTTCCTGGTCAAACTATTTCTGAAGAGATTGATTTTGACCTCATAAAAGCCAATTTTAGTAACTTTGAAAGTATTCAAGCTAACCATACGATTAGTTCTGCATCAGCTATAAAATATGGGGGTATTATAGAGAGTTTGGCTCTAGCTAGTTTTGGTAATCATATTGGAGCATCTGTAACCTTGACAGAGCTTGACAATAGATTGACAGGACAACTTGGTGGCTTTATATTTACTTCAGCTGAAGAAATCTCAGGTGTAACCAAAATTGGAAAAACACATGCGGACTTTACAGTTACTGTCAACGGAGTTATTCTTTCGGGTGCCAAGTTGCTGACAGCTTTTGAAGGCAAATTGGAAGATATTTATCCAACTACTTTTAGTCAAAGTCAAGATATAGAAGACGTTCCTGTTGTCGTTTCTGATGCAGTTATCACGACTCAAAAAATAATTGACAAACCATTGGTTTATATTCCGGTGTTTCCTGGTACAAACTCTGAATATGACTCAGCTAAGGCTTTTGAACAGGCGGGAGCAGAGGTTCATTTGGTCCCGTTTGTGACCTTGAATGAAGTGGCTATTGCACAGTCGGTTGACACAATGGTTGACAATATCAGTAAGGCCAATATTATCTTCTTTGCTGGTGGATTTTCAGCAGCGGATGAGCCAGATGGTTCTGCCAAATTCATCGTCAACATCCTACTCAATCAAAAGGTCCGCTCTGCTATTGATAATTTTATTGAAAAAGGTGGACTTATCATAGGTATCTGTAATGGTTTTCAAGCTCTTGTTAAATCTGGACTCTTACCTTATGGCAATTTTGAAAATGTCAAGGAGAGTTCTCCAACTCTCTTCTACAATGATGCTAACCAGCATGTGGCTAAGATGGTCGAGACGCGCATTGCAAATACTAATTCACCATGGCTTTCGGGTGTGGAAGTTGGCGATGTGCATGTGATTCCAGTTTCACATGGTGAAGGGAAGTTTGTTGTCTCTGCAGAGGAATTCGCAGAGTTGCGCGATAATGGTCAAATTTTTAGTCAATACGTAGATTTTGATAGTCATCCAAGTATGGATAGTCGCTACAATCCAAATGGATCGGTTAATGCTATCGAAGGAATTACCAGCAAAAATGGTCAAATTATTGGTAAGATGGGGCACTCAGAACGTTGGGAAGAAGGCCTTTTTCAAAATATTCCAGGGAATAAAGACCAAAAACTCTTTGAATCCGCAGTCCGTTATTTTACTGGTAAGTAAGGTTGCGAACAAGGAGAGCGCGATTCACGGGTGTCATTCTCAAATCATGGTGTTTTAAAAAAGAGCAATAGTGACTTTGGATTTAAAGAGAATTGCTAAAAGAAAATAGGAAAAACAAATGTACGAAGTAAAATCTCTTAATGAAGAATGTGGTGTCTTCGGAATATGGGGACATCCTCAAGCAGCTCAGATAACCTATTTTGGGCTTCATAGTCTTCAGCATCGAGGTCAAGAAGGTGCCGGTATTATCTCAAATGATGAAGGTAACCTACATCAACACCGAGCCACTGGTCTTTTATCGGATGTTTTTAAAAATCAGAATGACTTGACTAAGTTGACAGGTCATGCAGCAATTGGGCATGTTCGTTATGCCACGGCAGGATCTGCTTCTATTAATAATATTCAACCCTTCTTGTACCAGTTTACAGATGCTCAATTTGGGTTATGTCACAATGGTAATTTAACCAATGCGATTTCCTTAAAGAAAGAACTAGAGAGAGAAGGAGCTATTTTCAATGCTTCGTCAGACACTGAAATTCTGATGCATTTGGTCCGCCGTAGCCACCAGTCTGACTTTATTGGAAAAGTTAAAGAAGCTCTTAATACGGTAAAAGGTGGTTTTGCCTACCTACTTATGACAGAAAAGCAATTAATTGCTGCCCTCGATCCAAATGGTTTTAGACCGCTGTCTATTGGTAAAATGAAAAATGGGGCTTGGGTAGTTTCCTCGGAAACCTGTGCTTTTGAAGTGATTGGAGCTGAATGGATTCGAGATGTGAAGCCGGGAGAATTGATTGTCATTGATGATTCGGGCATTACCTACCATCAGTATACGACGGATACTCAACTAGCCATTTGTTCCATGGAATATGTTTATTTTGCACGTCCAGATTCTACTATTTATGGTGTCAATGTTCATACGGCGCGTAAGGAGATGGGAAAAAGGCTAGCGCAGGAATTTCAACATGAAGCTGATATAGTGGTTGGAGTGCCCAACTCATCACTATCAGCGGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCTGGGTTGCCAAATGAAATGGGTTTGGTCAAAAATCAATACACCCAACGAACCTTCATTCAACCGACACAGGACTTGCGAGAACAGGGTGTTCGCATGAAGTTATCAGCAGTGTCAGGTGTGGTAAAAGGAAAACGTGTGGTAATGGTGGATGATTCTATTGTCAGAGGAACAACGTCACGCCGTATTGTTAGTTTGCTCCGTGAAGCGGGAGCCACTGAAGTTCATGTGGCAATTGGT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AGAATCTCCACGTACTTCGGCTACCCAGGCCACATGGCCATACGTTGCATGAGATTGGAAAGCGTTAGTATCAAACCACGCTACTGCCCCGACTTTAGGGGTCTTATTGACAGTATAACCTTGTTTTTTTGCAATATGTCCCCAAGTGCAGGCATTCCCATAGCCTTTGGGCAACTGAAAACCATTTGCTGAACTCAGACGGAAAGCGACAAATGATGTGCACTGACGAACATACATATTCCAGGAATCAATTCCAGATCCCTTTTTCCATTTGCTAGGATAATTATCCCCAAGGACAGCTGCATGAACAACTCCTGTATGTTCTGCATTCAAAGTGGATGCAACTGAAGATACAGCACCATTAACACTCAAAAGGATTGCTCCTGACACTAACAATTGATGAATTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483318|38503:48916|38503_42229_+|SQE84889.1|DBSCAN-SWA MDKRIFVEKKANFQIKAESLVKELTHNLQLSTLKTLRMIQVYDVFGLTAALFPRAEKHIFSEQVTDCILPEETINTELTNAAFFAIESLPGQFDQRAASAQEALLLLGVPNDVMVNTAQLYLVNKDILETELEAIKRYLLNPVDSRFKDITRGIERHDFSESDKVIPTLDFFETYTSNEFKIYKAEQGLAMEVDDLVFIQEYFKSIGRVPTETELRVLDTYWSDHCRHTTFETELKHIDFSASKFQKQLQATYDKYIAMREELGRSDKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIDVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPISDTRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVKEYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKGNVIREKPEAGDVVILLGGKTGRDGIGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRNGEVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLVIDLNKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMAVVVRSKDAEEFITKCSKENIKAVTVATVTEKPNLVMTWNGQTIVDIERSFLDTNGVRVVVDAKVVDKAVNLPESRITSVATLEQDTLTVLSNLNHASQKGLQTLFDSSVGRSTVNHPIGGRYQLTPSEASVQKLPVQNGVTTTASVIAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVASGANWSKARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTAHTQDVLSPEFKVAGETIYYLPGQTISEEIDFDLIKANFSNFESIQANHTISSASAIKYGGIIESLALASFGNHIGASVTLTELDNRLTGQLGGFIFTSAEEISGVTKIGKTHADFTVTVNGVILSGAKLLTAFEGKLEDIYPTTFSQSQDIEDVPVVVSDAVITTQKIIDKPLVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQAGAEVHLVPFVTLNEVAIAQSVDTMVDNISKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNQKVRSAIDNFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFENVKESSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLSGVEVGDVHVIPVSHGEGKFVVSAEEFAELRDNGQIFSQYVDFDSHPSMDSRYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEEGLFQNIPGNKDQKLFESAVRYFTGK >LS483318|38503:48916|43951_44980_+|SQE84891.1|DBSCAN-SWA MIEKNAYAQSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERLGVMGALGGFGGMFDLSQTAIKEPVLISGTDGVGTKLMLAIQYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNEPAKLEQVVAGVAEGCVQAGCALIGGETAEMPGMYGEEDYDLAGFTVGIAEKSQILDGSKVAEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGDEVLPELEGQKLKDVLLEPTRIYVKAVLPLIKEGLVNGIAHITGGGFTENIPRMFADDLAAEIDENKVPVLPIFKALEKYGQIKHEEMFDIFNMGIGLVLAVTPENVDRVKKLLNEPVYDIGHIVTKRDASVVISNG >LS483318|38503:48916|45633_46146_+|SQE84893.1|DBSCAN-SWA MLKSKKLTFILFYLYLFLLSWCILFKFETQLQFINCFQQERVVNWVPFTQPVIVNGDIVFAEMGFNLLFFIPFGVCLPILAPNWTYKKIVSLGLLLSLLYETLQFILAIGISDVTDLLFNTLGVCCGILLYQLINNLFNNRITVLINTIGILFVAIPTIGLLALVILGLK >LS483318|38503:48916|44972_45527_+|SQE84892.1|DBSCAN-SWA MAKKIAVFASGNGSNFQVIAEQFKVELVFSDRRDAYVLERAQKLGVRAVTFELKEFETKAAYEKEIVQFLDKHDIDLICLAGYMKIVGPTLLDAYEGRMINIHPAYLPEFPGAHGISDAWQAGVDQSGVTVHWVDSGVDTGDIIQQMRVSRLASDTIEDFETRIHKAEYQLYPEVLDRLGVDRK >LS483318|38503:48916|47788_48916_-|SQE84895.1|DBSCAN-SWA MKKIHQLLVSGAILLSVNGAVSSVASTLNAEHTGVVHAAVLGDNYPSKWKKGSGIDSWNMYVRQCTSFVAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKKQGYTVNKTPKVGAVAWFDTNAFQSHATYGHVAWVAEVRGDSVVIEEYNYNAGQGPEKYHKRQIPKNHVSGYIHFKDLPSGEASKSQTKEQQVSKEAVKQGGTYHFTERTPVKAQAQLTSPDLAYYNPGQSVHYDQAMTVDGHEWISYLSFSGNRRYIPIKKIEQKTQQVSETTSPINIGDRVTFPGVFRVDRIVNNLLVSEELAGGGATSLNWIDPSPLDETDRKGVKAGNQILQAGEFFVIPGNYRVLKVDRPSNGIYVKIGSRGTWLTADKASKLP >LS483318|38503:48916|46164_47709_+|SQE84894.1|DBSCAN-SWA MKRALISVSDKAGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTKTALDAAGLETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDRDSHLQSARENNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENVDIGGPSMLRSAAKNHASVTVIVDPSDYPLVLAELTETGNTTYEMRQRLAAKVFRHTAAYDALIADYFTTQVGENKPEKLTLTYDLKQAMRYGENPQQAADFYQNAIPTEYAIASAKQLNGKELSFNNVRDADAAIRIIRDFKDQPTVVALKHMNPCGIGQADTIETAWDYCYEADPVSIFGGIVVLNREVDAMTAQKMHPVFLEIIIAPSYTEEALAILTHKKKNLRLLELPFGAQDASELEKEYTGVVGGMLVQNQDVVSESPADWQIVTERQPSEQEMTALEFAWKAIKYVKSNGILIANDHMTLGVGPGQTNRVASVRIAVEQAKKHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAASGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMVFTGVRHFRH >LS483318|38503:48916|42347_43799_+|SQE84890.1|DBSCAN-SWA MYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQITYFGLHSLQHRGQEGAGIISNDEGNLHQHRATGLLSDVFKNQNDLTKLTGHAAIGHVRYATAGSASINNIQPFLYQFTDAQFGLCHNGNLTNAISLKKELEREGAIFNASSDTEILMHLVRRSHQSDFIGKVKEALNTVKGGFAYLLMTEKQLIAALDPNGFRPLSIGKMKNGAWVVSSETCAFEVIGAEWIRDVKPGELIVIDDSGITYHQYTTDTQLAICSMEYVYFARPDSTIYGVNVHTARKEMGKRLAQEFQHEADIVVGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQDLREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVSLLREAGATEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTVEEVCDIIGADSLTYLSLDAMIDAIGLETDAPKGGLCVAYFDGEYPTPLYDYEDEYLRSLEEQTSFYIEKVK |
7 | Microbacterium_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
206869 : 263995
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483318|206869:263995|DBSCAN-SWA GATGAAAATTGTGATGCAACGGGTCAAAGAAGCCTCTGTTTCTATTGATGGGAAAATTGCTGGCGCTATCAATCAAGGGTTATTGTTGTTAGTAGGCGTAGGCCCAGATGATGCTGCAGAAGATTTGCTTACGCTGTGCGAAAAATAGTCAACATGCGCATTTTTTCAGATGCTGATGGCAAGATGAATCAGTCTATCCAAGACATCAAGGGTAGTATCTTATCTGTGTCGCAATTTACCCTTTATGCTGACACCAAAAAGGGAAATCGCCCAGCCTTTACAGGAGCTGCAAAGCCTGATATGGCTAGCCAGTTTTATGATCGCTTTAATGAACAATTGGCAGATTTTGTGCCAGTTGAGCGTGGCGTTTTTGGGGCAGATATGCAGGTTAGTCTCATCAATGATGGACCAGTTACGATTATTTTAGACACGAAATGTCACTAGTCTCTACAACTAAGAGGTTAGAAAAAAGCAAGCAACTGTTGATAGCATGTTGCTTGCTTTTTTTGTCAGTTAATCTCATCGTTTCAGAAAATCGTGGTTATTTGTCGTTAGGGTTATCAGGTATAGGTGTCCCTGTATAACGCAGGTAGCTGTAAACTTCTCGTTCTTCTTCGGTATAACGATCTTTATCATAGGCTAAATGATAGCTAGCATTCTCTCCTTCGGGTCGCTTGCCCATATAAACGGTTATGATACGGTTGGTGTCATCGTGATTATCCTCTACTTTTCCAGTTAAGGTATAGTCCATAATACCAAAAGCATCGAGATTGTTGTAGAGTAGTTTAGCCTTATCACGAGGATCGTATAAATCTCTGAAGTCTAAGTTACGTTCGCTAGCTGTTAAGAGCTGCTCGCTTTTTAGCAATTCGTTGGTGTTGACATCAACGTATTTGATGGTGAACAGTTTCAAGTGACTGCGATCAAAGGGATCATACGGCTTTTCCCCTTTTTTAAGGACGTAATATTTCTCAGAGATCAGGTCAGTGTTGTTTATTTCTTCATTCAGACCAGATTTTTTATTGATCCTATAAGCTTGTTCCCGATTTTTAACACGGTAAGTAAACTCTTGATCCATTGGTAAAATCGTACGGAAAATATCCTTGTCATGAGTGACGATTGAGGAATCACGTTCATAAATCGTATAATCTGGATGGCTTTCGTTTAAAATGCTTTGTGCTTGAGCTAGTAATTCTTGAGATGTGACGGTGTCACCGATAGCTAGTGTTTTCAATAGCTTAGTATCTTTGAGACCTGGTCTGAAATCGTCATCAGGGTTTAAGGGAGTAAACTGTACAGTATATTCCACATCAACAGATTTCGCTTGGTTTTGTATTGGTTTTTCTTTATATGGTCTAACGCGCACATGTCCGCTTAGCAAAAATTCTTGGACAGGTTGGGTCGGCAAGGTTACCGAACCATCTTTGTCAGCAAAGTAGACCTTGCCGTTTCGATCAGTAATGGTTGCATTGCTTGCAAAATCAATGACCTCAAAGTAGTCGTCGTTACTGTGGACGTTAGCGATCAATTGTTCTTGGATAGCCTTTAGTAAGTCAGCTTTTTCAAGTTTATGTGGCATCGCGCCACTATCAGTAGCAAATGGTTTTGATTTTGGACTTAAGCCTTGCTCTGTCTTTCCTCCGTGATCAGGTCGTGATGTTAGATCGATTTCAAAAAATTTAAGACTAATGTCTTGATTCGTCCCCTCAACAGTACCAGCAACGCTAACAACTAATTGGCTGTTGTTGACAGATGGACGGTCTAGCAGCCACTCAGGTCCAGCAATAGCTTGGACAGAATTGACTGTTCCAAATGTTAGTGCAAACAGCAGTGCAAACATCCCAAAAGATAAGTAATTTTTCATAGAAACCTCCTAAAAGTTAAGTTTCAATCCCCATTATTAGAATAACATAATGGTTTTAAAGACACAAATAAAAACCTAATGATTTTTTTAAAATGATATTTTAATGACAATGAAAAAAGGTAAATAATACCTTTTTTAGCATAAACATAAATTAATCTTCCGATAAATAGCTATTTAATTGAATGTTCTTGCCAAAAATGAATAACCCTTATTTAGCTTTAATGATTAAAGAGGCAGAAAATACAAAATCGTGCTGACAACAAACCGAACTGTGCGATAAAGAGTCATGTGTTATAATGGTTTAAAGACCGTCATGAAAGGAATGGCTATGGAGCTAAAAGACTATTTTCCAGAGATGCAAGTAGGCCCTCATCAGTTAGGAGATAAAGAGTGGGTGAGTGTCAAAGAAGGGGACCAATATGTGCATTTTCCCAAATCATGTTTATCCGAAAAAGAGCGCTTATTACTTGAGGTGGGGCTGGGTCAGTGTGAGGACTTGCAGCCGCTAGGGTCACCTTGGCAGCGGTATTTGCTTGATCATCAGGGCAATCCCCCTCAGCTGTTTGAGACTTCTCAGTTTATTTACCTCAATCATCAGCAGGCTTTACCAGATGACTTAGTTGAGTTGCTCCAGCAGATGATTGCAGGGCTTGAGGTCATTTTGCCTATCAGTGCAACCCAAACGGCATTTTTATGTCGACAAGCAACTTCAATAAAGGTCTTGCGCTCGCTTGAAGGTCTCTTGCCAACGCTAGAAAGTGATTTTGGTTTGGCCTTAACCATGTTTGTTGGAAATGCCTGGTATCAGGTAGCTGCAGGCACATTGAGAGAGTGTTTTGAGGAGGAATGTCAGCTACTCACGGCTTATTTAAAGCAAAAGTCTGGAGGAAAACTGTTAACCTTTGCAGAAGTGATGCTCTGGTCCATTTTGTCTCATCAATCTTTCCCAGCTTTAACGCGTCAGTTTCACCAATTCCTAAATCCTCAAAGTGATATGGCCGATGTGGTTCACGCGCTATGGTCAGAACACGGCAATCTGGTGCAGACAGCGCAGCGCCTCTACATTCATCGCAATTCGTTGCAGTATAAGCTTGATAAATTTGCTCAGCAATCTGGTCTTCATCTCAAGCAATTGGATGATTTGGCTTTTGCTTATCTTTTTCTGTTGAAATATTAGGAAAGCCACAGGGCTTTCTTTTTTTGATGCCTTGACTGAAGCTGATAAGGAGAACAATAAACAGTGAAGCTTGTTTTATTTCCTGTGAATGGGCTGTGTTTCGACATGATTTTCTTGTTTTATTATCCCTCACGACTGGACTAGCCCTACTATTGTGCAAGGTGCCCAAAGAAGTTTGGTCGCTTTGTCTCTGTTTTGAAAGCGCTGTTTTTGGTACAATAAAAGCATCAAAAAAATGTCAGCGGTGTCTAGCCTTGCAGTCAGCTAGAAAGCTTGCTGGCCCAATAGGAGTTACACATGGTTGAATTAAATCTAAATCACATCTATAAAAAATACCCAAACACAACGCATTATGCCGTTGAGGACTTTGACTTGGATATTAAAGACAAAGAATTTATCGTCTTTGTTGGGCCTTCAGGATGTGGTAAATCAACAACGCTTCGTATGATCGCTGGTCTTGAAGATATTTCTGAAGGGGAATTGAAAATTGATGGCGAAGTGGTGAATGACAAGTCTCCTAAAGACCGTGACATTGCCATGGTATTCCAAAACTACGCTCTTTACCCACACATGACCGTGTATGATAACATGGCTTTCGGTCTTAAACTACGTAAATATAAAAAAGATGACATTGACCGTCGTGTGAAAGAAGCTGCGGAAATTCTTGGGTTGACTGAATTCTTGGAACGTAAACCGGCTGACCTTTCTGGTGGACAACGCCAACGTGTTGCCATGGGGCGTGCTATTGTCCGTGATGCTAAAGTGTTCTTGATGGACGAGCCTTTGTCAAACTTGGATGCGAAGCTTCGTGTGTCCATGCGTGCTGAAATTGCTAAAATTCACCGTCGTATCGGCTCAACGACTATTTATGTTACCCACGACCAGACTGAAGCCATGACTTTGGCAGACCGTATCGTTATCATGAGTGCTACTAAAAACCCTCAAGGAAACGGAACCATCGGTAAAATTGAACAAGTGGGTTCACCACAAGAATTGTACAACCTTCCAGCTAATAAATTCGTTGCCGGCTTTATCGGAAGCCCTGCCATGAATTTCTTTGAAGTGGAAGTTAAAGACGGTCGTATTGTGAGTGAAGATGGCCTTGATATTGCTATTCCAGAAGGACAAGCTAAAATGCTTGAAACAGCTGGTTACAAAGGTAAAAAAGTCACTTTTGGTATTCGTCCAGAAGATATTTCAAGCAACCAAATCGTGCATGACACTTATCCAAATGCGAATGTGACTGCAGAAGTCTTGGTATCTGAGTTGCTTGGTTCTGAAACCATGCTTTACGTTAAACTTGGCCAAACAGAGTTCGCTTCTCGTGTAGATGCGCGTGATTTCCATAGCCCAGGTGAGCAAGTTAGCTTGACCTTCAATGTGGCAAAAGGTCATTTCTTTGACCTTGATACAGAACAAGCTATTCGTTAAATAGACCTCCTAGAATATAGCAAAATCCTCAAAGGTCTTTTGAGGATTTTGTGTTCTTACTGATTAGAAAAGAGAATGACAATGCAAAAACAATGGTGGCATAAGGCAACAATTTATCAAATTTACCCAAGATCGTTTAAAGACACTAGTGGCAATGGGATTGGCGATTTGAAAGGTATTACCAGTCAGTTGGATTACCTGCAAAAACTTGGCATTACAGCCATTTGGTTATCACCAGTTTACCAATCACCCATGGATGACAATGGCTACGACATCTCTGACTATGAAGCCATTGCAGAAGTTTTTGGGAACATGGACGACATGGATGACCTCTTAGCAGCAGCTAATGAGCGCGGCATTAAGATTATCATGGACTTGGTGGTCAACCACACCTCTGACGAGCATGCCTGGTTTGTTGAAGCTAGAGAAAATCCCAATAGTCCTGAGCGTGATTACTATATTTGGCGTGACGAGCCAAACAACCTCATGTCTATTTTTTCAGGCTCTGCTTGGGAATTAGACGAGGCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483318|206869:263995|230763_231429_-|SQE85068.1|DBSCAN-SWA MKTISDTKLLAYYLTKHRLEEFFPKNSHPHLQLTHYLKGEAICVQDQELKALYYLVQGNIKIVRRLFNGKEHILETHNGPILIGDIELMTDQKAVTSVIVLDEAYVVQLSLTHKESLLTDADFLYHIGRGLAQNFYKQNITSTTNITYTVKERLASYLIAHENQQKVHLNLTLLADRFGTSYRHLHRVVHQLILQGMIERTSFKTYRIIDQQGLLQLSAND >LS483318|206869:263995|224153_228551_+|SQE85064.1|DBSCAN-SWA 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>LS483318|206869:263995|259430_259589_-|SQE85100.1|DBSCAN-SWA MVHFYKFINELYILFNQLLTIFINKHFINLYFLILIYFSYIFYMNLILIHFK >LS483318|206869:263995|260400_260739_+|SQE85102.1|DBSCAN-SWA MKKDSICQVDVINQQNVTTATNYLEKEKVQKSLRILSKFTDNKQINIIFYLLAVEELCVCDIACLLNLSMASTSHHLRKLANQNILDTRREGKIIYYFIKDEEIRDFFNQLG >LS483318|206869:263995|228716_229145_+|SQE85065.1|DBSCAN-SWA MSNLDKNSALKAMVVFRKAQRTLDAFGSDVFKNANLTPTQFSVLEVLHTKGSMRINNLIDSLLATSGNMTVVLRNMERNGWISRCKDDKDKRAYLVELTDQGRALIEDALPKHIKRVEQAFSVLTEAEQKELITLLKKFKNL >LS483318|206869:263995|241120_241705_+|SQE85076.1|DBSCAN-SWA MGWWKESIAIVKALDPAARSSLEVILTYPGIKALAAHRLSHFLWQHHFKLLARMHSQFWRFWTQIEIHPGAQIAPGVFIDHGAGLVIGETAIVEKGVMLYHGVTLGGTGKDRGKRHPTVRQGALVSAHAQVIGPIEIGANAKVGAAAVVLSDVPEDVTVVGVPAKIVRVHGQKDSLQIQSLQEQRETSYYSSKL >LS483318|206869:263995|221585_223427_+|SQE85062.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLIPTLREMPSDAQVISHALMVRAGYVRQVSAGIYAYLPLANRTIEKFKTIMREEFEKIGAVEMLAPALLTADLWRESGRYETYGDDLYKLKNRDKSDFILGPTHEETFTTLVRDAVKSYKQLPLNLYQIQAKYRDEKRPRNGLLRTREFIMKDGYSFHPNYDDLDVTYEDYRQAYEAIFTRAGLDFKGIIGDGGAMGGKDSQEFMAITPERTDLDRWVVLDKSIPSLADIPEEVLEEIKAELTAWMISGEDTIAYSSESSYAANLEMATNEYKPSSKVAAEDALTEVETPNCKTIDEVADFLSVDETQTIKTLLFMADNEPVVALLVGNDQVNDVKLKNYLGADFLEPASEDDARAFFGAGFGSLGPVNLAEGSRIVADRKVQDLANAVAGANKDGFHLTGVNPGRDFQAEYVDIREVKEGEMSPDGHGILQFARGIEVGHIFKLGTRYSDSMGATILDENGRAVPIVMGCYGIGVSRILSAVIEQHARLFVNKTPKGDYRYAWGINFPKELAPFDVHLITVNVKDQAAQDLTATLEADLMAKGYEVLTDDRNERVGSKFSDSDLIGLPIRVTVGKKAADGIVEIKIKATGDSIEVTADNLIETLEILTKEQ >LS483318|206869:263995|255046_255346_+|SQE85095.1|DBSCAN-SWA MNNLIEMTNHLSFSSYARKMLFKSSPIYLQFDFESYHDFIFQVRRIINNLRQLEKIAEQSEDLDNVRIFHYCVELMIEYEKKTSKQVKELVKRLNKKTR >LS483318|206869:263995|256376_256826_+|SQE85098.1|DBSCAN-SWA MSTIELNTYITDAEWEVMRVVWANDRVTSKKVISVLQEKMDWTQSTIKTILGRLVGKGVLNTEQEGRKFIYTANIEEKEAVRNYAEDIFNRICNKKVGNVIGSIIEDYVLSFDDIERLEKILEMKKSFAVEEVDCNCPEEQCKCHLHHH >LS483318|206869:263995|251992_253147_-|SQE85091.1|integrase|DBSCAN-SWA MSIHKYKTKKGILYYVSFYIGLDAYGKKKRHLKRGFKTKKEAKLYEARLEAGVVAPTVNTDKPNPKVTYKELYQEWFKAYVGTVEETTSSQTKNIYRIHILPIFGDKFIDQISPLDCQNFITQKSQTFKNIKQIKSYTSKIFDFAINMNYIDRNPMKNVIMPKIKKTRSDNFWSLEELHHFLDIVKETEPFKHFALFRLLAFSGLRKGELYALKWADINFDSNLLNIDKSLGRIDGKAIEKSTKNESSVRTIYLDDETIDIIKQWRNFYLKEQSQFPLTKLNISNEYMFSYISSNDKIEPLHADYINNVLNRIIKKHKLKPISPHGFRHTHATLMSEIGIDPSNTSKRLGHASSQMTLDVYTHTTKTGEKNSIDKFADYLNKAK >LS483318|206869:263995|235523_235808_+|SQE85072.1|DBSCAN-SWA MIKIVTVCGNGIGSSLLLRMKVEAIASSLGIDVDAESCDSNAAVGKGADLFVTVKEFKDIFPEDAKVCIVKSYTNRKKIEEDLVPVLKEMSGKE >LS483318|206869:263995|207409_208732_-|SQE85051.1|DBSCAN-SWA 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>LS483318|206869:263995|253198_253717_-|SQE85092.1|DBSCAN-SWA MSNHITKLIEDSGKKLTEISEATDIAYPTLSGYNQGIRKPKKDNAEKLAKYFNVSVAYIMGLDSNPHAPSNLKIVTDSFKTSKIGSVTPFKSDMEKLKRNIEFGERALTLPLDDSFSDEFRHIFSKYLAEKNKRFMSEFIDYMNHQNKDSKIWQSWIKTDEYAIRQEDRKNR >LS483318|206869:263995|229230_229782_+|SQE85066.1|DBSCAN-SWA MSKKVLFIVGSLRQNSFNKQMAQIAEEMIGDRAEVSYLDYADLPLFNEELEAQGVPAMDRIRKELEAADLVWIFSPVYNWAIPGTVKNLLDWASRSLDPSDHAAASSIHDKFFTVSSLANGESPKAVFKHYRELLPFIRTNVIGEFAGGPINPEAWATGKITLSESLHEKLANQVEEVLQELR >LS483318|206869:263995|240359_241112_+|SQE85075.1|DBSCAN-SWA MTKSNELDIRLRAFINAPDNFLDSVALVNAFHNFPVWAAKEPYVIEVEGVKVTPVFTDKEDMALFKEEQKSAQGQYWLERSALAVLEEVITSGAAGLAFNLKKKGDFGNSTIFKSSDMIQFMNHYTTVLNALMSDDNVAADTMDKVYLVPAFVYPKDDNHYDRLFPTMSTPEGKSYVPAFSNLQSFAKWYNQDDFGGLFRKAEGVILTWTIDDIYQPRNGENELDETFGVAINPFDDQQILVDWSDLDQA >LS483318|206869:263995|249736_250711_+|SQE85088.1|transposase|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(21.43%) | protease,integrase,transposase,tRNA | attL 257938:257952|attR 263818:263832 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
346196 : 395420
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483318|346196:395420|DBSCAN-SWA TATGAGTGAGAAAATTTATGAATACAAAGACGAGACCAATTGGTTTATCGGAAAGATGACCGGTCATAATATGATTACGGGGTGGGGAATAGATTGTGAGAACATTAAAAGAATAGATGATCTTTTAGATGGTATTGCCGCAACGTTAGACTGGGAAAATCCTAAAGGTTATGATGTTTCAGTGGTGCGGTACCAGTCTCCTTTGTCTCTCATCACCTTTATTATCGATATGATTAACCAAGAAACCCGGCGTGAGATTAAGGTGATTCCCCATGCAGGTACGATTTTGTTAATGGAAAATGGGCAACTACTTGCTGTTTATCTCCCAGAGGGTGGTGTATCAACAGATGCGTTTTTTGCTTCCAGTACGGATGGTTTTGGGGACACTCTTTTAATTGCCACCAGAAATGAGGGGAAAACCAAAGAATTTCGTCGTTTGTTTGGAGACCTGGGGTATCGTGTAGAAAATCTCAACGATTATCCTGAATTGCAAGATGTGGCAGAAACGGGTGTCACTTTTGAAGAAAATGCCCGCTTGAAGGCGGAAACCATTTCACGCTTAACAGGGAAGATGGTTTTGGCAGATGATTCGGGATTAAAAGTAGATGCTTTGGGTGGCTTACCTGGGGTTTGGTCTGCGCGTTTCTCAGGACCAGATGCCACTGATGATAGCAACAATGCTAAATTATTACACGAGTTAGCAATGGTCTTTGATCAAAAGGACCGTTCAGCACAATTCCATACAACGTTGGTAGTAGCTGCTCCCGATAAAGATAGCTTGGTTGTTGAAGCTGAATGGCCAGGCTACATTGCTACACAACCTAAGGGAGACAACGGCTTTGGCTATGATCCTCTCTTTATTGTAGGAGAGACAGGACGTCATGCAGCAGAATTAGAGGCTGATGAAAAGAATCACCTGTCTCATCGAGGTCAAGCTGTTCGAAAATTAATGGAGGTCTTTCCAATATGGCAAGCAAAACAATCATAGTAATGAGTGATTCTCACGGCGATCGAGACATCGTTCAAGCCATTAAAGATAAGTATCTTGGTCAAGTTGATGCTATTTTCCATAATGGGGATTCTGAATTGAAAAGTTCGGACCCTATTTGGGATGGGATTTATGTGGTTGGAGGAAACTGTGATTACGACGCTGGTTACCCAGATGATCTCGTCACACAACTAGATAATCTTACCATTGCTCAGACACACGGACATTTGTACCACATTAATTTTACGTGGGATAAATTGGACTATTTTGCTCAAGAAGCAGAGGCAGACCTCTGCATATATGGTCACCTACACCGTCCAGCAGCCTGGCAAGTTGAGAAAACGATTTTTGTTAACCCTGGATCTGTTTCACAACCTCGTGGTGAGGTCAATGAAAAACTCTATGCCCGTATTGACGTGACAGATACTACTATTAGGGTCAACTATTTTACCCGACAACATGAGCTTTACCCATTACTATCTAAGGAATTTAAACGATGATCGCAAAAGAATTTGAAACGTTTTTAATGAGTCATTTGGATAGCTACCTCATTCCAGCGGAAGATTTAGCCATTTTTATTAACACGCATAATGCAGACCATGTGATGCTACTCTTAGTTAGCAACGGGTTTTCAAGAGTTCCGGTGATTACGCGGGAGAAAAAATATGTGGGCACCATCAGCATCTCTGATATCATGACTTATCAAGCTCAAGGACAGTTGACTGACTGGGAGATGCGTCAAACGGATATCGGAGAGATGGTTAATACCAAAATCGAAACCATTAGTATTACTTCTAGTTTAACAGAAATCATGCATAAGTTAGTTGATTATCCTTTCTTGCCAGTTGTGGATCAAGAAGAGCGCTTTGTCGGTATTATCACTCGAAAATCGATTTTAAAAGCAGTCAACAGCCTTCTGCATGATTTTACAGACGATTATACCATTACTAAAAAATGATAACCTATATTGAAGCTTTTATTGCGAGTAAAACCTTATCTTTAAATAGTCAAAAGGCTTACCAATACGATTTGCAGCAGTTTTCTCAAGTAGTTGGGGAACGTATTAGTCAGGACAAATTGTCCCTTTATCAAAACAGTTTATCGGCAATTAGCCCATCCGCTAAAAAACGAAAGATATCTACGGTTAATCAGTTTTTGTATTACTTGTATCAGGAAAATCATTTGAGCTATTATTTTAGAATAACGGACCGAACAAAGATTCCGACAGCTAACAAACAAGACCTTGCTCTAATTGATCGGGACTGTTTTTACCAAGATACTCCTTTGGCGGCGGGCCAGTTAATCGCTTTGTTGATGCTAGAACTAGGATTGACGCCGAGTGATTTAGCCTGTATTGAGGTGGCGAATCTCGATTTAACCTTCCAAGTGTTGAGGTTACAGACAGCAAAAGGTGTTCGTGTATTGCCGTTATCTCACCAGCTTATCCCGTTCTTAGAAAGACAACGAAATGGTAAAAAGAGATACCTCTTTGAACACCAAGGTCAAGCTTTTTCAAGGCAGTGGTTTTTTAACCAACTAAAAGGATTTCTCGAAAGCATAGGGTATAAGGAATTAACCGCACAAAAATTACGGGAGCAGTTTATTTTGAAGGAAAAGTCGAGAGGAAAATCAATCATGGAGCTTAGTCAGTTTCTAGGATTGAAAAGCCCAGCGACTTTAGAAAAATATTACAAATCATAATGGATATAAAAGTTAAAGATTTTGAAGGACCTCTAGATTTACTGCTGCATTTGGTGTCCAAGTACAAGGTTGATATTTACGAGGTACCGATTGTAGAAGTCATTGAACAGTACCTTGCCTACGTTGAAACCTTGCAGGCTATGAAATTAGAGGTTGCTGGCGAATACATGCTGATGGCAAGCCAATTAATGCTCATTAAAAGCAGACGTCTTCTTCCCAAAATTGTCGAAGAACCTCAAGACGATGACAATCTAGAGCAAGACTTGCTGGATAAAATTGAAGAATATAGTCGTTTTAAAGCTCTTAGCCAGGAATTAGCTGAGCAGCACAATCGTCGGGCCAAATATTATTCAAAGCCCAAGCAAGAATTGATTTTTGAAGATGCTGTTTTGCAAGAAGACAAAACCGTGATGGATTTATTTCTTGCTTTTTCCAAAATCATGACGGCTAAACGAGAAGCCTTTAAAAATAACCATACGGTGATTGAACGTGATGATTATCGAATTGAGGACATGATGGTGTCGATTGAAAAACGGCTGGAGAAGGATAAGGTGGTTAGCCTATCTGCTATCTTTGACGATTGCCAGTCCTTAAACGAAGTGATTACCTTATTTCTAGCCAGCTTGGAATTAATCAAGATGCACTTAGTTATTGTAGAACAAGCCACAAATTTTGGTCAGATTATTTTGAGAAAGGAGATGCCATGAAGAGCTATTTGTCACAGATAGAAGCATTGCTATTTGTTGCAGGTGAAGAAGGATTGAGCCTAAGGCAGTTAGCAACCATGCTCTCTTTGCCTCCAACAGCTTTACAACAACAATTGGAAAAGCTCTCTCAAAAATATGAATCTGATTTAGACTCTAGCCTTTGCTTAATGGAATCATCAAATACTTATAAATTGGTGACCAAGGAAATTTTTGCTGATCTTTTACGAGATTATGCTAAGGCTCCTATCAATCAAAGTTTATCTCGTGCCAGTTTAGAAGTATTATCTATCATTGCTTACAAGCAACCTATTACTCGGATAGAAATTGATGATATTCGAGGGGTCAATTCAAGTGGTGCCTTAACCAAGTTATTAGCTTTTGAACTCATAAAAGAAGCTGGAAAGAAAGAAGTGATTGGCCGTCCTCGCTTGTATGCCACGACAGATTATTTTCTTGATTATATGGGAATTAATCATCTGGATCAGTTAGTGGATGTGTCAGCTATCGAATTAGCCGATGAAGAAAGTGCTCTTTTCAAACAGGAGACTGAGAATGACTAGGTCTCACTCGAGTTCCTTGGCATTTAAAAAGAGGGATATGACTTTGGCTTACCCAAGTTGACTGGTAATATCGTGACGACCAGTTGCCCAAAAGAAAGAAGAAAAAGAATGAGAATTAATAAATACATTGCCCATGCGGGTGTTGCCAGTCGTCGTAAGGCTGAAGAACTGATTAAGCAAGGCCTAGTCACCTTAAATGGTCAGATTATTACGGATTTAGCAACCACTGTTAAATCGGGAGACGTGGTTGAAATAGAAGGAAGTCCTATTTACAACGAGGAAAAGGTTTACTATTTGCTTAATAAGCCACGCGGTGTTATTTCCAGTGTGTCAGATGACAAAGGCCGTAAAACGGTACTGGATTTACTGCCTCAGGTTAAAGAACGGATTTACCCTGTTGGACGTTTAGACTGGGATACATCAGGTGTTCTTATTCTAACCAATGATGGTGATTTTACTGATACCATGATTCACCCAAGAAATGAGATTGATAAGGTTTATTTAGCGCGTGTCAAAGGGATTGCAACGAAAGAGAATCTTCGTCCGCTAACGCGAGGAGTGGTGATTGATGGGAAGAAAACGAAGCCGGCTCGTTATAATATTATCCGTGTAGAAGCTGATAAGAATCGTTCCATTGTCGAACTGACAATTCATGAGGGACGAAATCATCAGGTTAAAAAAATGTTTGAATCTGTGGGGCTATTGGTAGATAAATTGTCCCGTACACGTTTTGGAACTCTTGAGTTGACTGGTTTAAGACCAGGTGAATCAAGACGATTAAATAAGAAAGAAATTAGCCAACTGCATAATTTGGCCAATACCAAAAAATGATCACAACATTATTAGTAGCACCTGTTAAAGCTTATCAACGTTACATTTCCCCTTTATTTCCGCCAACATGTCGTTACCGACCAACGTGTTCAGCTTATATGATCACTGCTATTGAAAAGCATGGAGCTAAAGGGGTATTAATGGGATTAGCAAGAATATTGAGGTGCCATCCCTTTGTTGCTGGTGGTGACGACTCTGTTCCTGATCATTTCA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483318|346196:395420|386541_386931_-|SQE85239.1|DBSCAN-SWA MITKSTTMLYVADTEAALQFWTEQVGFVLVDQAQQERTSSYEIAPNKESAISFGLHNKEIVAAANPGMDLGFPSLLFETDHLQAEYERLTAAGVTTNPIMEYQGMIHFTFSDNEGHYIAVRQSTSPKGA >LS483318|346196:395420|368832_369918_-|SQE85215.1|transposase|DBSCAN-SWA MQDYYTPKGKQLTIHERRQIQRWKLEGRSNREIARLLGKAPQTIHNEIKRGLVRQQVRKGKFEAVYSAQHAQLVYQENRKRSVRPIRQRKQDREAIEHYMRQNYSPEMMVKAKGVQVPVSTIYYWIHHGKLSLGKEAMLYPRKAKQARKQASPYFKPAGKSIEQRPDSINQRLEAGHYEIDTVILTRAKNQCLLTLTDRKTRHQLIRLIPDKSAQAVNKALTGILKDYTVNSITADNGTEFSRLSDVFPASAIYYAHPYASWERGTNENHNRLIRRWLPKGTKTTTPKEVAAIEHWINHYPKRLFNYKSPVEMLKLANFNLKFGLLFFILLISLPINGKKETTPQSVHHEIVSLDNSLVPT >LS483318|346196:395420|363685_364624_-|SQE85211.1|DBSCAN-SWA 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MDIKVKDFEGPLDLLLHLVSKYKVDIYEVPIVEVIEQYLAYVETLQAMKLEVAGEYMLMASQLMLIKSRRLLPKIVEEPQDDDNLEQDLLDKIEEYSRFKALSQELAEQHNRRAKYYSKPKQELIFEDAVLQEDKTVMDLFLAFSKIMTAKREAFKNNHTVIERDDYRIEDMMVSIEKRLEKDKVVSLSAIFDDCQSLNEVITLFLASLELIKMHLVIVEQATNFGQIILRKEMP |
58 | Streptococcus_phage(41.67%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
410858 : 491678
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483318|410858:491678|DBSCAN-SWA CATGATATTTGAAGAGATTTTACCAGGCCTCAAAGCAAAGAGAAAATATGTTCGGACAGGCTGGGGAGGTGCTGAAAACTATGTCCAACTCTTTGATAGCATCGAACAAAATGGCCAAGCACTTGAAGTAACGCCTTACTTCTTGATTAATGTGTCTGGCGAGGGAGAGGGCTTCTCCATGTGGGCACCAACCCCATGTGATGTGCTAGCCACCGATTGGGTAGAAGTTCATGACTAAACGCGTCCTCATCACAGGAGTATCATCAGGCATCGGCTTAGCGCAGGCTCGTCTTTTTTTGGAGAATGGCTACGCAGTCTATGGCGTTGACAAGTCGGCTAAGCCTGACTTGCCCGGTAACTTTCAGTTTTTACAACTGGACCTTAGCGGCGATTTAGCTGCGCTTCACGACTTTGCACCACATGTGGACATCATATGCCATACCGCAGGAATCCTCGACGACTATAAGCCCTTACTTGATATTAGTGATGCCGATATTGACAAAATTTTTCAGGTCAACCTTTTTGCTACTATCCGAATCACTCGCCATTACTTACCCCAAATGGTTGCTAATGGTTCTGGCATTATCATCAACATGTGTTCTATTGCTAGTTTTTTAGCAGGAGGTGGCGGAGTAGCTTATACAGCTAGCAAGCACGCCTTGGCAGGTTTTACCCGTCAGTTAGCTCTTGATTATGCCAAGTCTGGTATTCAGGTTTTTGGCATTGCACCAGGCGCCGTTAAAACGGCCATGACACAAGCGGATTTTGAACCTGGAGGCTTGGCTCAATGGGTGGCCGATGAAACTCCGATTGGGCGCTGGTTAGATCCAGCAGAAATTGCTGAGCTTACCCTCTACTTAGCTTCAGGAAAAGCAGGAGCGATGCAGGGAGAAATCCTTAAAGTTGATGGTGGCTGGAGTTTGAAGTGACCAAGTATATTGAGATTGGCTTGGGCAATTCTTGGTTGGTTCGTACAGAATACGAAAAAGATGATGGAACGGAAGTTGAGGTTAGAGGTATTTCAGGAGCTGTTCATCCGAGGTCTATTTATCTTAGAATTTGGCTGGGTTATACCGTTTGGATTTTGGATTTCAAAGAAGGGTTTAAACAGCAAACCAAGTCTCGTAAGTCCTTCAAATGTGTTGTTGGCATTGTATCAGAGCTTTGATAAATAAAGGAGAAAAAATGACAGCAGAAGAATTATGGCAGGCCTATCGAAAGATTAATCCTGGTATTGGTGATGAGATTGACGCTTGGGCCTTTGGGGCTCAACCGGATTTATTGGCACAGCTCGTCCTAAAAGGAATTAAAACAGCAACGGCTTCTGCTTATGATTTGTATGAATTGGATCAGGAACCTCTGCCACAGGTCGGAACTTATGATGTGGTGTTAGATGGACAAGGACAGGCAGTTTGTATTGTTCACATTACTAAGGTTGAGGTGCTTCCTTTTGATCAGGTATCAGCAGAACATGCTTACAAAGAAGGAGAAGGGGATAGGAGTTTGGCTTGGTGGCGACAGGCTCATCAGGACTTTTTTCAACCTTATTTTGAAGAGGCAGGGCTTGTTTTTTCTGAACAAAGTCCCATTGTTTTAGAAGAATTTCAAGTGGTTTACCCACAGTTAGGAGATTAAGATGAAATTAGCCATTTTAGGGACCGGTATGATTGTCAAAGATCTTTTACCTGTCCTACAAGAAATTAAGGGTATTGACCTTAACGCTATTGTTTCCACGCCTCGTAGTGTAGATGTGGCTAGAGAATTAGCAAAAAGCTTTGCTATTCCAACAGCTACAAGTGATTTTGACAGTGTTCTTGCCTCAGAAGATGTGGACACCGTTTATATCGCAACCCCTAATCATTTGCATTATGAGGGGGCGAAAAAGGCTCTTCTAGCCGGCAAACATGTCATCTGTGAAAAACCTTTTACCCTGACAGCAGGGGAATTAGATGAACTAGTGGTGATCGCTAAAGAACGAAAGCTCATTTTGTTAGAAGCGATTACTAATCAGTATCTGAGCAACATGACCTTTATTAAAGAGCACCTTGACCAACTCGGTGATATTAAAATTGTAGAGTGCAACTATTCTCAGTATTCGTCTCGTTATGATGCCTTTAAACAAGGTGACATAGCACCAGCCTTTGACCCTCAAAAAGGTGGCGGAGCCTTACGCGATTTAAATATCTATAATATTCATTTTGTGGTAGGCCTATTTGGCAGTCCCAAAAAGGTTCAATATTTAGCCAATATGGACAAGGGCATTGATACGTCAGGCATGCTTGTCATGGACTATGAGCAGTTTAAAGTGGTTTGTATTGGGGCGAAGGATTGCACGGCAGAAATCAAGTCCACTATTCAAGGTAACAAAGGCTCACTTGCAGTGCTTGGAGCAACGAATACCCTCCCTCAAGTTCAGTTAAGTCTACACGGTCACGAAGCAGAAGTGGCTAATCTTAACAAACATGAACACCGCATGTATGAAGAATTCCTTGCTTTTAGGGATATGATTGACCAAAGAGACTTTGAGAAAGTGAATCAGGCTTTGGAACATAGCAGAGCAGTTATGGCTGTGTTGGAGCGAGCTGTTCATTCGTGATGGTAATCTGGTAGCCATTGCCTTTTGTGCAGGTGCTATGGTAATGGTTGAAAGACGTGTTTTCACGAGGGTTAACCCCCTCGTGCTTTTTTGGCAAAAATAACTTGTTCAGGATTTGGGCTTTCTTTGTGAGATGAGAGATGCCTGACGAATTGATTTGATTAAAATAATGATAAAGCCAAACGATTTAAGAAATGACCGTTCGGAAATTCTGCCCCCAAAAGGTCTCTAGAAGCAGTGAAACTAAATTTGTAAGCGTTGACACTGCTGCATAACTCTGTTACACTAAAAGAATGTCATGACAAAAATTACAGTGTAGGAGTTTCATTGTTTATGGAAGAGGATTATAACAAAAGAGAACCTGAGAAGTTTACGCAATTTCTGCGCCGTCAAAAGGTCGTCTTTTTTGTCGCATTTTTTGGTTATGTGTGTGCCTACTTGGTACGCAACAATTTCAAACTAATGTCAAACACTATTATGGTCCAAAACGGTTGGGACAAGGCTCAAATTGCGACCTTGTTATCGTGTTTGACCGTTTCTTATGGTTTAGCAAAATTCTATATGGGGGCCTTAGGGGATCGTGTTAGCTTGAGGAAGCTCTTTTCAATCAGCTTGGGTGCAAGCGCTTTGATTTGTATTTTAATCGGTTTTTACAATAGTTCAATGGTGGTATTAGGAATACTGCTAGTCTTGTGTGGTGTCGTACAAGGTGCCTTGGCACCTGCCTCACAAGCCATGATTGCCAATTATTTTCCAAATAAAACACGCGGCGGAGCTATCGCTGGATGGAACATTTCTCAAAACATGGGATCAGCCCTCTTGCCATTAACCATCGCCTTGCTGACCAGTATGGGCTTGGTGGTACCAGCTAATGGCAATATTTTACTTGCCTTTTTAATCCCTGGTATTTTAGTGCTCTTGTTTGCTTTGTGCTGCTGGAAACTTGGCGGTGATAACCCTGAGTTTGAGGGCCTTGACTCTCTTCGAACGATGTATGGTGATGCGGGCGAATCAGCTGTTGCCAGTGAAGAAGAAAAGCATAATCTGTCTTATTGGCAACTCATCTGGAAATACGTTTTTTGTAACCCGTCGCTCTTACTTGTTGCTGCTGTCAATGTGGCCCTTTATTTTGTTCGTTTTGGGATTGAAGACTGGATGCCGATCTACTTGTCACAAGTAGCCAGTATGTCAGAGGCCCATATTCATTTTGCGATTTCAATGTTAGAGTGGGTAGCTATTCCAGGCTCGCTGGTATTTGCGTGGTTAGCGGTTCGTTATCCTAATAAAATGGCCAAGATTGGGGCTATTGGGCTTTTTGTGTTAGCGGCTATTGTGTTTGTCTATGAACGCTTGACTGCCACAGGTTCTCCAAACTATTTCTTGTTGCTTGTTATTGCAGGTATTTTAGGGTCATTGATTTATGGCCCACAGTTGATCGTGAATATTTTAACAATTAACTTTGTTCCTTTAAATGTTGCAGGAACAGCGATTGGTTTTGTAGGAGTCACAGCTTATCTCATCGGCAATATGGGAGCAAACTGGCTGATGCCGATTTTGGCAGATGGTTTTGGCTGGTTTTGGTCATATATTGTCGTTGCAGCCTTATCTGCTTTTTCAGCAGTTGGTTATTTGATTTTAGCCAAACGCGAAGAAGAAATCATCAAAGATTAGCTAGGCAAATGCCTAAAAAAGACAGACTTATTGCTGAAGTCCTGTCTTTTTTAGTCATAACAAGCCTCAAGTGACACTATAAAAGATAAGAGAATGCTAGGATGTTTCAGGAAAAAATGAGAAAATATGCTATAATGGGAAGGTATTTATCACATTATTAAGGAAAAACGTATGACAAATTATGCAATTATTCTAGCTGCGGGTAAGGGCACCCGCATGAAATCAGACCTTCCTAAAGTGCTTCACCATGTTTCTGGCTTAACCATGTTAGAACACGTTTTTCGCAGCGTAGCAGCGATTGAACCTGAGCAAAATGTGACCGTTATTGGCCACAAAGCAGATATGGTACGTGCCGTATTAGCAGACCAATCCGAGTTTGTGTTACAAACAGAACAGCTAGGCACAGGACATGCTGTTATGATGGCCGAAGAAAAGTTAGCAGGACTAGAAGGTCATACCTTGGTGATTGCAGGCGACACCCCTTTAATCACCGGTCAAAGCCTCAAGAGTCTGATTGATTTTCACGTTAACCATAAAAATGTTGCTACGATCTTGACTGCCACAGCGCAGGATCCCTTTGGCTATGGTCGTATTATCCGTAACAAGGATGGTGAAGTGATTAAAATTGTTGAGCAAAAAGATGCCAGCGATTTTGAACAACAAATCAAAGAGATTAACACAGGAACTTATGTCTTTGACAATAAGCGTTTGTTTGAAGCCCTTAAAAACATTA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MQENAFEQLIDDSGIKKKVIATKMGFTRSGFYQKRKKPKKSFDASEVAMLADILGVDPGKVLEAILIS >LS483318|410858:491678|451824_452541_+|SQE85321.1|DBSCAN-SWA MTAFIKFDGKKSSDFDLRIINDVEHDSTFYDVDQIKVPGRDGVVLKDNQRLEAVERSYPLRLYSKRRLTEVETDISDWLNVKGWKDLELSWEPDYIYKATHTTPFSIKEVLRNFGSLRANFLIHPIKYLKTGKQEMPLVNGGTLQNPGNVRAKPILKIKGTGNGVLTINDFETGLENVQGGLVIDMERHLVYKDVLSAWDNIVRTERHRMPLFDIGQNKISWTGNFTITAVPNWGVKV >LS483318|410858:491678|426399_426537_+|SQE85277.1|DBSCAN-SWA MDEIKIRNDGIYLNDKKIKSAQAYRVKSDKNGYAEVFIKLFVKLT >LS483318|410858:491678|480092_480446_+|SQE85353.1|DBSCAN-SWA MTQDYVSYIRSKVGHATIIMTFTGGILADEEGRVLLQLRGDKKTWAIPGGAQELYESTYETCRREFLEETGVAVTPVRLLNTYTNFQETYSNGDQVQTVAFVLQKVQHHQKVPYDSP >LS483318|410858:491678|443639_443771_+|SQE85310.1|DBSCAN-SWA MNKRIKKKRKLETAIVLLIAENAMQAEAIKNQNRQIAELRAIV >LS483318|410858:491678|410858_411095_+|SQE85258.1|tRNA|DBSCAN-SWA MIFEEILPGLKAKRKYVRTGWGGAENYVQLFDSIEQNGQALEVTPYFLINVSGEGEGFSMWAPTPCDVLATDWVEVHD >LS483318|410858:491678|484501_485251_+|SQE85361.1|DBSCAN-SWA MNIFVLEDDFLHQTRIEKIIYKILTDNKLEVNHLEVYGKPNQLLEDISERGRHQLFFLDIDIKGEDKKGMEIAVEIRNRDPHAVIVFVTTHSEFMPVSFQYQVSALDFIDKELPEELFSHRIEKAITYVQDNQGKTLAEDSFVFINVKSQIQVPFSDLLYIETSLIPHKLILYSTKQRVEFYGQLSEIVEQDDRLFQCHRSFVVNPYNISSIDRSERLVYLKGGLSCIVSRLKIRSLIKVVEELHTKEK >LS483318|410858:491678|467350_467776_+|SQE85338.1|DBSCAN-SWA MAKKVEKLVKLQIPAGKATPAPPVGPALGQAGINIMGFTKEFNARTADQAGMIIPVVISVYEDKSFDFITKTPPAAVLLKKAAGVEKGSGTPNKTKVATVTRAQVQEIAETKMPDLNAANIEAAMRMIEGTARSMGFTVTD |
114 | Streptococcus_phage(36.67%) | protease,terminase,integrase,bacteriocin,head,tRNA,tail,capsid | attL 412184:412200|attR 441578:441594 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
544505 : 601779
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483318|544505:601779|DBSCAN-SWA TATGAACACAAAACAACGTTTTTCTCTCCGTAAATATAAAATAGGCGCTGTGTCTGTTTTGTTGGGAACCCTACTTTTCATGGGTGGCGTTACAACTACCTCAGCAGATGCCGTTACAAACGACAGTTCAGTCGCAAGCCTTGTTCAGTCAGCTTCTGCCCAAGAAGCCCCCTCCTCTCCCATTGCAGCAATTGTTAAAGAAGAAGCCTCCGTTGCAACCGTTCAAGCTATGCCTTCTAGCACTGATACAGACGCTCAGGGAGGGGTGACGTCTACCACTAGTAACATGGCAGAAACTCCTAGCTCCAGTGAGCCTTTGGCAGAAGAAGTAAATCGTCTGGCCGTTGGTGAAAAAGAGGCTACTCCTCAAAACATCGACAGTAATGAGATTATTAGCATTCCTCACGTTTGGGATAGTGGTTATAAAGGTCAAGGAACTGTTGTGGCTGTGATTGATTCAGGGCTTGATAGTCAGCATGACGTGCTTCAATTGTCAGACGTTAGTCAAGCAAAGTATCACTCTCAAGAAGAATTAGAAGCAGCTAAGCAAAAAGCAGGGATTACTTATGGCCAATGGTATAACAATAAGGTTATTTTTGGGTATAACTACGTGGATGTCAATACAGACCTAAAAGAAGCTGTGGACTAATGTCAAATAAGTAGACAGAAAACCGTGTTATTTTATTGCGTTAAACTAATTTTCTTCTTTCTGATTAGGGGTTAGTCCTAGATTAGCCGTATGTGGGTTGTAATTGTTATAAAAATTCTCAATGTATTCAAAGCAGTCTAATTGAACCTGTTTGATATTTTGATACTTTTTTCGGTTGATTTGTCTATGCTTTAAATACTTGAAAAATGCTTCCGTTACGGCATTATCATAAGGATTGGATGTCTACTTTTATAGTATACATCCAGGTCATTGATCAAGCTGTTGCGACGTTAGTAAAAGCTCGTCAAGCCCTAAATGGCAAAGTAACAGATCTAACTGCCTTGAGTAATGAAATTCTTGAAGAAGCTAATGTGATAGCCAGCCAATCCTTTACAAATGCTAATCCATTGAACAGGGAAACCTATCAAAACCAACTGGCAGTTGCTAAAGCATTACTTCAAAAAGCCAAGGTGAGTCAGGAAGAAGTGGAACAGGCTCTGGCAGCTCTGCTCACTGCCAAAGAGCATGTGTTAGGGCATCAGACAGATTACACTGCCCTCCGTCAAATGGTGACCAAAGCATCGGTTCTCAAACAAACCGCAGCCAAGTATCAAATGGCAAGCCAGTCTAGCAAAGAAGCTTACGACAACTTGTTGACAGCTGCTCAAAACCTCTTGGAAACTCAAGGAGCTACTCAAGCAGAAGTGGATGCCCTTCTGGCTCAAATTAAGGCAGCAGAGAAAGCTTTAGATGGGCAAGGAAATCTGTCTTCTCAAGAAAACACTCATTCCCCACAAGAACAGCTGTTACCAGAAGAATCACAAGAAGCCCCACCTCATTCTATGTTGCTGGGTCAAAAAGACTTACGAGAAAGCGAGGTTGCTCAGAAGCGTGCCCAAAGGGTCTTTGCCTTGCTCAACGAGCCTCAAACGCCACTCGCTCGAGCTGTGGCAAATAGCAACAAGAAGCTAGAACACTTACCACAGACAGGTGATAAATCTCCTCAATTATTACTGATTAGTTTAGGTTTTGCCAGCCTGTTAATGGTTATCCCACTAGCTTACATACGCTCTAAGAACTAATACAAACGCTTGGTTTATCTCAGTTAAGTCACTTAAAAAGCATGGCTTCGTTTTCCGTTGAGGAAAGCGAACTCATGCTTTTTTGAGTTAGTTCTGGTTACTCTTTTCGACAAGATGGTAGCTCAGACAATATCAAAAAAGAAGTGGTTTAAGGCCTGTCTTAGCCCCTAGTTGCCCTATTTTTAGTCTTCTATGTTATAATAAAAGGACATGACTCAAAAGAAATAGTAGGAAATAACATGATTAAATTAATAGCAACAGATATGGATGGTACCTTCTTAGCTGAAGATGGGACATACGATCAAGCGAGATTAGCTGCGCTATTACCAAAACTAACAGAAAAAGGAATAGTCTTTACCGTTTCGAGTGGCCGCTCGCTCTTGGCCATTGATCAGCTGTTTGAACCTTTTTTGGATCAGATTGCTGTGATAGCTGAAAATGGCTCTGTTGTTCAGTACCAAGGCGAGGTGCTCTTTGCAGATGTGATGACCCAAGAGCAGTATGCAGAAGTTGCAGAAAAGATTTTGGCTAATCCACATTATCTTGAAACAGGTATGGTCTTTTCTGGGCAGAAGGCAGCCTATGTTTTAAAGGGAGCAAGCCAAGAGTACATTCAAAAAACTAAACACTACTACGCCAATGTTAAAGTTGTTGATGGCTTTGAAGATATGGAAAATGATACCATTTTTAAAGTTTCTACCAACTTTACAGGCGATACGGTCTTGGAAGGTAGTGATTGGTTAAATCAGGCCTTGCCTTATGCTACTGCAGTGACAACAGGCTTTGATTCTATTGATATCATCTTAAAAGAGGTTAATAAAGGTTTCGGAATGGATCACCTTTGCCTAGCTTTAGGGATTGAGCCTTCAGAAACCATTGCTTTTGGAGATAATTTTAACGATTATCAAATGTTGGAATTTGCTGGTAAAGCTATTGCTACGGAGAATGCAAGACCCGAAATTAAAGCGATTTCAGATCAAGTCATTGGACACTGCAATGACGGAGCAGTATTAACGTATTTAGAAGGATTAGTGTAAAGCATGGATATTAAGATTTTGGCGCTTGATTTAGATGGCACTCTATACAACACGGAAAAAATTGTGACGGATGCTAATAAAGAAGCACTTGCCGCTGCTAGAGAAAAAGGGGTTAAGGTAGTTATTACAACAGGTCGTCCCCTTAGGGCCATTGGTAATCTTTTAGAAGAATTAAATCTCCTAGATGAAGAGGATTACAGTATCACCTTTAATGGTGGACTGATTCAGCGTAACACAGGGGAAATTTTGAATAAACGTTCTCTTAATTTTGATCAGATTTACCAGATTCAAAAGGCTCTGGAGGCGGTTGGATTACCAACCGATATTATCAGTGATGGAGATGTGTATAGCATTCCTAGTAAAGATGGTCGGCATTCTCAATACCGCTTAGCTAATCCTATGTTAAATTTTATTGAGGTAAGTTCTGTTGACGACTTGCCAACAGATATTTCTTATAATAAGATTGTAACAGTAACAGATCCAGACTTTTTGGATCAGCAGATTGCCAAATTGTCACCACGTTTATTTGAAGATTTTGAAGCTTTTAAATCACGAGATATTATTTTTGAAATCATGCCAAACGGTATTGACAAGGCATTTGGATTAAAGTTGCTTTGTGAACATCTCGGACTTGACGCTAAACACGTTATGGCCATGGGAGATGAAGCGAATGATTTTAGCATGTTGGAATGGGCAGGCCTTGGAGTGGCTATGGCCAACGGCGTTTCAGGAGCTAAAGCAGCTGCTGATGCGGTGACAACCTTGACCAATGATGAGTCTGGTGTCGCAGAAGCTGTCAAAAGATTTATTTTAGATGAGGAGAACTAATGGGATTATTTGATCGTTTATTTGGGAAAAAAGAAACCCAACAAGTGACCGAAACCAAACCAGAAGAAGAACTTTTGGAAACATCAGCTAAAGAAGAGGCTGTTTCGACAACCAGTGAGCAAGATCAGCCAGACCTCACGCTGTCACAAGACGACGCTCCGGCAGTTTTTACTCTAGAAGAACAAGCTTCCAAAGACAGTTTAGAAGCATCGCAACAGCGTGAAGAAAAACTTGTTGAAAGCACAGCAGTTTCTCCAGCAGATTCTGCTAGCATGGTCGGTGACAAAGATGCCCTTACGTCAAGTCCATTCGGTCAAGCTACTGTATCAGATACAGAAGAAATCAAGGAACAGCCGATTGTAGACCAATTTCCAGTGGAACAAACTCAAGATGCTGAGTCAGCTAATTTCACGGAAGAGGATGAAACAAGTGTTTCAGAAGAACCAACCAGTAGCCAACAATTTATGGAGGACTATTACCGTCGTAAGGCTGCTCTTGAAAAAAGTCTTCAAGAAGCAGCTGCAGCAACTGTCCCATTGATGCCAGAGGAACCGGTTGAGGTATCTGTAGGGTCCGATATGTCAGAAGAGGTTGCACAAGACGACTCTTTGACTGAGGTGACGGAAACGGATGAGGAAAAATACAAGCGTAGTTTGAAAAAAACACGAATAGGTTTTTCAGCTCGCTTAAACAGTTTCTTTGCCAATTTTAGGCGCGTGGATGAGGAATTCTTTGAAGAACTAGAAGAAATGTTGATTCTATCAGATGTCGGTGTACATGTGGCGACAACTTTGACAGAGGAGTTGCGTTATGAAGCTAAACTGGAAAATGCTAAAAAACCAGATGCCTTGAAACGCGTGATTGTGGAAAAATTGGTGGACATCTATGAGAAAGATGGACAATATAATGAAGCTATTAATTATCAAGATGGCCTGACCGTCATGTTGTTTGTAGGGGTTAACGGGGTTGGTAAAACCACTTCGATTGGGAAGCTGGCTTACCGCTATAAGCAAGAAGGAAAAAAAGTCATGTTAGTGGCAGCTGATACCTTCCGTGCCGGCGCTGTTGCTCAGCTAGTCGAATGGGGACGCCGAGTAGATGTTCCAGTGATTACGGGTCCTGAAAAGGCTGATCCAGCGTCTGTTGTTTTTGATGGGGTAGAAAAAGCTGTGGCAGAAGGTGCAGATATTCTTCTGATTGACACGGCTGGTCGTTTGCAAAACAAAGAAAATCTCATGGCAGAGCTGGAAAAAATGGGTCGTATCATTAAGCGCGTGATACCAGATGCCCCTCATGAAACGCTCTTGGCCTTAGATGCTTCAACAGGTCAAAATGCGCTTAGCCAAGCCAAGGAATTTTCAAAAATAACACCTTTAACAGGTTTGATTCTAACGAAAATTGATG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60 | Bacillus_phage(15.38%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
761934 : 858323
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483318|761934:858323|DBSCAN-SWA 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99 | unidentified_phage(13.33%) | transposase,integrase,protease,tRNA | attL 847194:847209|attR 862046:862061 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
919914 : 950857
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483318|919914:950857|DBSCAN-SWA TCTAGGCAATTAATCTTTTAGTCATTGGTGTTTGGTAGTTGAGACTACCATGAATGCGGTGGTAATTCCACCAATGAACATAGTCTTTAGTCTTAAGAGCTAGTTCTTCCAGCGATTGAAAAGTTTCTTGATAAACAAATTCAATTTTGAAAGCACGATACGTACTTTCAGCTACGGCATTGTCATAAGGACAACCAGCCTGACTAAGCGAACGTGTGATTCCAAAGGCTTCCAATATTTCATCAATTAACTGATTATCAAACTCTTTGCCACGATCTGAATGGAACATCTTGACTTTGGTCAGGGCGTAAAGGATGCTTTGTATGGCTTGCTTAACGAGTTCAGCGGTCTTGTGCCAACCAAGAGACAGGCCGATTGATTTCACGGTTGTATAGGTCAATGATGAGGCAAACATAAGCCCAACGATTGCCTACACGAACATAGGTTAAGTCAGTGACTAAGGCTTGTAGTGGTCTTTCTTGCTTAAATTGCCTGTCTAAGTGGTTGGGAATAGGGGCTTCATTCTTGCCTCTGGAATGTGGTTTGAAGGTGGCTTTCTGATAAACAGAAACCAAATTGAGTCGCTTCATAATGCGTCGAATCCGACGACGTGAACGTGTGATACCTTCGTTATTCAAGCATATTTTGATTTTTCTGGATCCGTATCTGGACTCGCTCTCGAGGAAAATTCTTTTAATAGTTTCTTCAAACTCCATTTCAGATACTGACTCCACGGCTTGATAGTAATAACTTGAGCGTGGCATATTCAGCCAGCGACACATCTTTGAAATGCTGTATTTATCCTTATTAGCAGTGATTATTTCCCTTTTTGTGCCATAATCACCGCTGCTTGCTTTAGGATATCTAATTGCATTTCGAGTTCTTTATTGTGTTTCCTGAGTTCAATTAGCTCCCGCTGTTCATCTGTCAGATTATCAACAGACTTGAATGAACCAGTTGTTTTGGCTTGTCTAACCCACTTATCGAAGGTGGAAGGGATTAGCTCATATTCCTTGATGAGACTGCTACGCTTTCTACCAACATTGTAAAGGTCAACAATTTGTTGCTTAAAATCATCGGTGAAGTGACGACGTACTTTTCTAGACATGGTTTTTCTCCCCTTTTTCTTAAGTGTAGAACACTTTATAAGACTGTCTAGTTTAGTGTAACCTATTCAATAGGTTGTCCTTTCGTTTTTGTGTCTTTTAAAACAGATTGTAACACACAAAGTTTTGTCTACTTTTATAGGATACATCCATTAAAAAATTGAAATGGATTTTTGATACTGACAAAAAAACAGATAAAAAATAGATTATCGTTAGAAAAAGAGTAGATGCATTTGCTAGAATAAAGATATCAAAAAAAAGGAGCATTTCACTATGAAATTAAAAAAAGTTTTCGTTCTTCCCGTCTTAGCATTAGCAGCAACATGTTTTTTAACAGCTTGTGGTACAAAAAAAGATTCTAAAAAAGAAGAAGTCAAAGAAATAAAAATGTCTGATATTAAAGACGATGCGGTTAGCAAAAAAACAAAAGTGGTTGATGGAGAGGAAGTTACGGAGTACACAACAAAAGATGGAAATGTGATTCAAATTCCTACAGGAAATGAAGAAGACATAGAGTCAAAAGATAGTGGTGGAGCAGATACTTCTGCCAAAAACTAAGGGTTACGATGAATAGCATAAGGTGACTCGCAAACGTTAACCATAACCTCGGGTAGTTTGCCTAGGGTGGTAACTAACTTATCATAATGCTTAAATAGCCAAACACACTAACTCGCAAATGTACAAAATCATATATCCGTGCTTATGTGAGCGAACGGTTATATGATTTTTGTTTTTAAAAAAAGAACGCTGAAGTAGCTAGTTTGTTGTGTTCAAGGTGTTAAGAAGGAAGTGTTAGAATGAAAAAAAGATTAATTGTACCTGTCATCATACTATTTGTAATCGGATTAATCGTTGGTGTTAAACATCATCGTGACTAGTAGGTCTTGCTAGTGACCGTTCAAAATGGATAAAGTTGGTATGGTATAACTATAAAATAGTATAAAAAGAAAAAATAGTTATTGAGGAGAAAGTATGTTTCAGTTAAGAAGAAAAATGACGCGCAAACAATTAGCCTTGTTGAGTGCTGGAGTATTGACCTGTGTGGTTGGTGGTAGTTACTTGATAATGAACCATCAACAACAAGAAATTGTCTCTAGTGTCAACAAAGTAAAAGCCTTAACCATAAAAGAAGCTATGGAACAAGGAAAAGATATCAGCTTGACCTTAGCTGGCGAAGTAACAGCTAACAACAGCAGCAAAGTTAAAATCGACTCAAGTAAAGGAGAAGTCAAAGATGTCTTTGTCAAAAAAGGCGATGTTGTCAAAGTAGGACAACCCTTGTTTAGCTATGAAACGTCACAACGGTTAACGGCTCAAAGTTCAGAATTTGATGTTCAAACCAAAGCTAATCAACTCCAAGTTGCTAAAAGTAATGCAGCATTGAAGTGGGAAACCTATAATCGCAAGGTCAATGAAATCAACACCCTAAAATCACGCTACAACACCGCACCAGATGAGAGCTTACTAGAACAAATTCGCAGCGCAGAAGATAGTGTCTCTCAAGCACTAAGTGATGCCAAAACAGCAGATAGTGAGATTAAAACCGCTCAAATCGAACTAGATAAAGCTAATGTCACTGCCGCAACCGAAAAAGATAGACTAGAGTATGACACCATTAAGTCAGACACTGCGGGGACAATTGTCAGTCTAAATGCTGATTTGCCAAATCAATCAAAATCTAAAAAAGAAAGTGAAACTTTTATGGAAATTATTGACAAATCAAAAATGTTAGTCAAAGGTAACATCAGTGAATTTGATCGTGACAAGTTAAAAATCGGTCAAAAAGTCGAAGTGATTGACCGCAAAGACAACTCTAAAAAATGGACTGGAAAAGTGACCCAAGTTGGCAACCTCAAAGCCGAGGCGACAGATCAAGGTCAAGGTGGCAATGACCAACAAGACAATCCAAACCAAGCAAAATTCCCTTATGTTATCGAACTTGACCAATCAGACAAGCAGCCACTCATTGGTTCACACACCTATATCAATGTGCTCAACAATGCTCCAGAAGCTGGCAAGATCGTATTGAAAGAAACCTTTACAATGGCAGAAAATGGAAAAACCTATGTGTGGAAAGTTGATAAAAACAAGGTCAAAAAACAAGAAATCAAGACTAAGCCCTTCTCAAAAGGTTATGTTGAGGTGACAAGTGGCTTGACCATGCAAGATAAGATTGCTCAGCCGCTTCCTGGCATGAAAGACGGTATGGAGGTAGGAAGTATTGTTAAACCTTAAAGATATTCGAAAAAGCTATCATCTTGGGACTGAAGAATTTGCGATTTTAAAAGGAATCGATTTAGAAGTTAACGAGGGTGACTTTTTAGCCATCATGGGACCATCAGGTTCAGGAAAGTCAACATTGATGAATATCATTGGGTGCTTAGATAAGCCTGGCTCTGGCTCATATGCCATTGAAGGCAGAGACGTGTCGTCCTTATCTGATAATGAACTTGCTGATTTGCGTAATCAAAAAATCGGCTTTGTTTTTCAAAATTTTAACCTGATGCCCAAGCTAACAGCTTGCCAAAATGTCGAATTGCCCTTGACTTATATGAATGTTCCTAAAAAAGAGCGTCGCAAACGAGCCCTAGAGATGTTAAAGCTAGTAGGACTAGAAGAACGTAGTGAATTTAAACCGATGGAGCTATCTGGTGGGCAAAAACAGCGTGTAGCGATTGCAAGAGCTTTAGTCACTAACCCGAGTTTTATCCTTGGTGATGAGCCAACAGGTGCACTAGACACAAAAACCAGCGTCCAAATCATGGACCTATTTAAACAATTCAATGATAACGGCAAAACGATTATTATCATCACACACGAGCCTGAAGTAGCTGCCCTATGCAAAAAGACGGTGATCCTAAGAGATGGTAATATAGAACATTCCGATATAGAGTAAAGGGGGAGAATAATGGAAGATATTATTGCAGCTTTAAGCTCTATATTATCACACAAGATGCGGTCAATTTTGACAATGCTAGGGATTATTATCGGTATTGGTGCCATTATCGCAATCTTTTCAATCATCGAAGGTAATACCGAAAATACCAAAAGACAGTTGATTGGTGGCAGCAATAACACTATTAACATTGTGTTTAACAAAAAAAGTAGTATTGACCCTAAATTTCCAGACAAGTCAAATGCTAAAAAACCAGACTATCTTCCTTTTATGGCTGAAGAAGAGCTTAGCAAAATACAGCAAGTCAAAGGCGTCAAAAACGCCCTGATTTCATATGGTATTGATGACAAAGTCTACCATCTAGGCCAAAAATCATCTGCAAAGATTTCTGCCATCACAAAAAACGTAGCTGAAGTGAGACGCATGACATTTATTAAAGGCAGTGACTTTTCAGACAAAGACTTTATTGACCAAAAACAGGTGATTTACCTTGAAAAAAGCTTGTATGAGTCACTATTTCCAAAAGACGATGGCCTTGGAAAATTTGTCGAAGTGATGGGAAATCCCTTCAGGGTCATTGGGGTGTTTGAATCAAAAGAACAAAGTGGCCTCACAAGTGGGACTGAGAAAATTGCTTATATTCCGCTACATCAGTGGTATAATATTAATAGTGTAGTGGATGCGACACCTGAGATCACGATCCAAACCTATCGCGCAGATGATCTCAAACCTGTAGCAAAGCGTGTCAGTGATATGCTCAATCAAACGATCCCTAAATCAGATTATATGTTTGGTGTCATGAACCTTAAAGAATTTGAACGCCAACTAGACAACCTAAACAAATCTAATTTTGTATTATTAGCAGGTATTGCTAGCATCTCTCTTATCGTAGGTGGTATTGGTGTGATGAACATTATGCTAGTATCAGTTACCGAAAGAACGAGAGAAATTGGGATCAAAAAAGCGCTTGGCGCTAGACGTAAGCTTATTTTAAAACA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28 | Streptococcus_phage(26.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1009793 : 1114315
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483318|1009793:1114315|DBSCAN-SWA 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104 | Bacillus_phage(18.18%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1134996 : 1178774
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483318|1134996:1178774|DBSCAN-SWA ATTAAAGCGCTCCTCCAGAATGCCAACCAGCATTTCCGCCAGTGAGGACATTCATTACTGAATTATTTGCAATAGTAGTCCACGTTTCAGCCCAATTCACCCAGCACTTCACTTTATTACAATATAATCCATTACCTTGATAAACCGTCTTACCACTGCCTGCACCACCATCAATATATGCAAGCTTTTCATTATCCATAAAATCAAATTTTTCAAAAATCTTTGTATTCACGTTGAATATCTCCTGTATCTGTTTGTTTTGTCTGTTGCAACTCGACAATCCTATACTACCTTTTTTTCAACTCATTTTGATGTCCAAATCATCAACGGTCTTTTTATGGTCATGAACTGTTTTGATTATTCAAACTAATTCTATGACACACCTCAGAATAACTCGATATAACCCATACGTGTCTTTTAAAATATACCAGTTGATTTCTTAACGCAAGCCATCCCATTCAGCATAAAATTCATCTAAATAAGATACCAAAACCTGATGCCGATGCTCCGCAAGCTGACGACCGTAAGCGGTATTCATGCGCTCTTTCAAGGTCAGTAATTTCTCATAAAAATGCATGATGGCTGTACCATCCTTACGATATTCCTCAACAGTCATGGTCTCTCGCGGTAGTCTATCAGGATCATGAATCAGTCGACCGGTGTGACCTGAGTAAACCATACAACGGGCAATGCCAATGGCACCAATAGCATCGAGTCGATCAGCATCTTGAACAATCTTAGCCTCCAAATTCGTCAATGGTTTCCCGTGACCGCCTTTAAAAGAGATCGTATCAATAATCATCATGACCTGATCAGACTGCTTCTGCGATACGTCATGACCAGCTAACCAAGCCAGAATATCTTGGCGAGCTTTCTTTGGATCAGCATTGAGTTTGTCATCAGCCATATCATGCAAGAGAGCTGCCAACTGACAGATGAAAACATCTCCCTCTTCCTCTTGGGCGATAATCTTAGCCAAGCGACAAACACGAATCACATGCCAAAAATCATGACCACTAGCATCCGCTGCCAGTTTTTCCTTGACCCAGGCTTCTGCTTGGGCTAATAGCTGCGCTTCTTTTTCAGTCATTTTGAAACCCTATTATTTCTCATCAAACAATGTGAGCCATTGGGCATAGCCTTCTTTTTCCATCTGGTCATAAGGAATGAATTTAAGAGCTGCTGAATTGATACAGTAACGCAAGCCTCCAGCTTCTTGAGGGCCGTCACTAAAGACATGCCCCAAATGCGATCCCGCTTCCCGACTTTTGACTTCAACCCGTCTCATTCCATAAGAAGAGTCATCGTGGTTCGTGACCATGCGATTTTCAATAGGTTTTGAGAAGGCAGGCCAACCACAGCCAGAATTAAATTTATCCAGTGATGAAAACAAGACCTCTCCACTAACAATATCGACATAGATCCCCTTCTCAAAAAAATCATCATATTTCCCTGTAAAAGGACGTTCTGTCGCCGCATGTTGGGTAACCTCGTAAGAAAGGTCGCCAATCCGTTTTTTCAAGTCATCTTTTGTCTCCATGAGAAACTCCTTTCAGGTGTGTTAATGCTTTCATTCTACCAAAAAAACGACAATCTTTTGAACCATTTGTTTAGAATCTGTTCTAAACTGCTCTTGATTAGCCAATTCTTACGCCTCTAAGAGATTCCAATTGACCAAAAAAGCCAGATAAGTAATCTGACTTTTTCAAAAATCATTATTTTTTGGCATCCTCATCCATTGAGAGAACACTCAAGAAAGCTTCTTGAGGGACTTCTACCGAACCAATCGATTTCATTCGTTTTTTACCGGCTTTTTGTTTTTCGAGCAATTTACGTTTACGAGACACGTCACCACCATAACACTTAGCCAAAACGTTTTTACGAAGGGCCTTGATGTCTGAACGAGCAACAATTTTTTGACCGATAGCCGCTTGAATAGGCACTTCAAATTGTTGACGTGGAATGATTTTTTTCAATTTCTCAACAATAATTTTCCCACGTTCATAAGCAAATTCTTTATGGACAATAAAGCTGAGCGCATCAACCTTATCCCCATTCAGCAGAATATCCATTTTCACCAGTTGTGACTTGCGGTATTCAGAAATTTCATAATCAAAACTCGCATAGCCTCGCGTTGAGGATTTCAATTTATCAAAGAAATCAAAGACAATTTCAGCCAGCGGGATTTGGTAAATCACATTGACACGATTATCATCAATGTAATCCATGGTTACAAAATCACCACGCTTGCGCTGCGACAATTCCATAACAGCCCCAACGAACTCTTGTGGCACCATGATTTGCGCTTTAACATAAGGCTCTTCAATAGAAGCCACCCGCGTTGGATCAGGAAATTCTGAGGGGTTAGACACTTCAATCATATCCCCATCAGTTGTGTGAACGTGATACACCACGGACGGTGCTGTCATGATCAAATCAATGTTAAACTCACGCTCTAAACGTTCTTGAATCACGTCCATATGAAGCAAACCTAAAAATCCACAACGGAAACCAAAGCCAAGAGCTTGTGACGTTTCTGGTTCAAACTGTAAACTGGCATCATTCAGTTGTAATTTTTCAAGCGCTTCACGCAAGTCATTGTATTTATTTGATTCAATCGGATAAATCCCTGCAAAGACCATTGGATTCATTTGTTTGTAGCCATGCAAGGCTTCCTTAGCAGGGTTATTAGCTAAAGTCACCGTATCGCCCACACGGGTATCTGCTACCGTTTTGATAGAAGCCGCAACATAACCAACATCTCCCGTCGCAAGGAAATCTCGTCCAACTGCCTTAGGAGTGAAAATCCCAACTTCTGTGACATCAAAGGTTTTTCCATTAGACATCATTTGAATTTTATCGCCAGGTTTGACAATACCATTCACAATCCGAACCTGCAGAATAACGCCTCGATAAGCATCGTAAACAGAGTCAAAAATCAAGGCTTGTAAAGGCGCATCCACATCACCCGTAGGAGCAGGAACCTTCTCAACAATTTGTTCAAGAATCTCTTCAATCCCGATACCAGCCTTGGCTGACGCCAGAACAGCCTCAGAAGCATCAAGCCCAATTACATCTTCCACTTCATGACGAACCCGTTCAGGATCAGCAGCCGGCAAGTCAATTTTATTGATAACAGGTAAAATTTCCAAATCATTGTCGAGGGCTAGGTAAACATTAGCCAATGTCTGCGCTTCAATTCCCTGCGCTGCATCAACAACTAGAATGGCCCCCTCGCAGGCTGCCAACGAACGAGATACTTCATAAGTAAAGTCCACATGCCCTGGGGTATCAATAAGGTGGAAAATGTACGTTTCCCCATCCTTAGCCGTATAATTAAGCTCAATAGCGTTTAACTTGATGGTAATCCCACGCTCACGCTCCAAATCCATGGAGTCCAGTAACTGGGCCTGCATTTCGCGAGAGGAAACGGTCTCTGTCTTTTCCAAAATGCGATCAGCGAGAGTAGATTTGCCATGGTCAATATGTGCAATAATGGAGAAATTACGAATCTTCTCCTGACGTTTCTTTAAATCTTGACTGTTCATTCTATTTTCCTATACATTTAGTCTTTCCCTCTATTATAACAAAAAAGACAGGCCTTTGCCTATCTTTTCTTACTGATTATCTTTCGGAAAAATAGCAGAGCTATCAAGTTCAGCTTGATTAAACCAAAGGGCAATCTCACGCCTAGCAGAGTCTCTTGAATCAGACCCATGCACCACGTTAAAAATACCTCCATCATCACCAGGAGCTTGGGCAAAATCACCACGAATGGTCCCGGGAAGAGCATCCTTAGGATTAGTTACCCCCATCATGGTTCGCCAAGAGGAAATCACCCGATTTCCCGACAGCACCCCAATTAAAACAGGACCACTTGTCATGTAAGCTTCAAGCTCAGGATAAAATGGTTTAGTTACCAAGGCTTCGTAGTGCTTAGCCAAGAGTTCCGGACTAGCTTGCCGCAACTCCAAGCGTTCAAATGTAAACCCTCGACGCTCAATCCGCCGCAAAACCTCTCCAACTAACCCTCGCTCAACCCCATCCGGCTTAATCATAAAAAATGTTTGTTCCATCGCTCCACCCTCCTTCTCCTTTTGACTATTATAACATGAAAACGTTTTAATAGAAAGAATGGGAAGGCATAAGGATATTGTATTTATCCCTCTCTCAAGTCATATTGACGATATTGAATTGGGACCATTCAAAACAACATAGCTCTAAAACTTAGGAAGCTCTATTGTCATATTGACATATATTTTGGGACCATTCAAAACAACGTAGCAAGTTAAAATAAGGCTAGTCCGTTATCAACTTGAAAAAGTGGCACCGAGTCGGTGCTTTTTGTATCTTTATTTTACCTTGTCGATAAACTAAAAACAAGCGTTTTCAAAGCGCTTGTTTTTTATTTTTTGAAAAATGAATTCCTAACTTTTAGTTGTTACTATATCTTTGGTCGCTGCCATCTTGCTAAACCTACTAAGCTCCACAAGATGATTTCGTAAACGATCATAAAGAAAAGGAAACAGTGCAAGAAAAAGACTTCTGGAAGGATCCAGATCACAGGATCTTTCAAGGGGTCAAAGAGCCAATTACTATCTCCTACAAAAAGCACCTTATGAAAAAGAGTAAAAAAGTTTTCAAATCCAATAACACTAGCCATCAACCCAATCATAAGAGGAAACAAAGCTGCTATCATTAAAGGCCTTTGAATGGACCAGAAACTTTTAGTTTTGAATCTTTGCTTAAAATCCTTAACCGTTGGGTAAAGGAAACCTAGGAAGATGACTTGTGTGAGGTGAAAAAGCCACTTGACGTCTGCAAAATGCTTGAGCCCATCTGTCGACGATCTAAAACTAGCAAACGTCAAACTTGTCTCAAAGGGATTAGTGAGGTAATTGAGCAGTCCGTTATAGTTATGCAAGATAGCATCCTTGCTCATAAAAACAACTTGTTCTAATTTTAGGTACTCCACCTCAAGAGGATACCATAGCCAAGCT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46 | Tupanvirus(20.0%) | protease,tRNA,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1204617 : 1256752
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483318|1204617:1256752|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_phage(15.38%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1876002 : 1933637
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483318|1876002:1933637|DBSCAN-SWA 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60 | unidentified_phage(16.67%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2007627 : 2019128
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS483318|2007627:2019128|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS483318|2007627:2019128|2010169_2010523_-|SQE87094.1|DBSCAN-SWA MTSYQNALKDLIVAINAHPSIIAYKEAKQQLSQLDQFEDQAYQMKRYQQEAELFQKIAKNQAAAVSSNKAKELEHHLNHQPVIDDYREKMQDASDVIQYITKRIEEQLNEELTNGKS >LS483318|2007627:2019128|2007627_2010183_-|SQE87093.1|DBSCAN-SWA MAKANISPGMQQYLDIKKDYPDAFLLFRMGDFYELFYDDAVKAAQLLEIGLTSRNKNAENPIPMAGVPHHSAQQYIDVLIELGYKVAIAEQMEDPKQAVGVVKREVVQVITPGTVVDSAKPDSANNFLVAVDFDGCRYGLAYMDVSTGEFCVTDLADFTSVRSEIQNLKAKEVLLGFDLSEEEQTILVKQMNLLLSYEETVYEDKSLIDGQLTTVELTAAGKLLQYVHKTQMRELSHLQALVHYEIKDYLQMSYATKSSLDLVENARTNKKHGSLYWLLDETKTAMGMRLLRSWIDRPLVSKKAILERQEIIQVFLNAFIERTDLSNSLKGVYDIERLSSRVSFGKANPKDLLQLGHTLAQVPYIKAILESFNSPFVDKLVNDIDSLPELEYLIRTAIDPDAPATISEGSIIRNGFDERLDHYRKVMREGTGWIADIEAKERQASGINNLKIDYNKKDGYYFHVTNSNLSLVPDHFFRKATLKNSERYGTAELAKIEGQMLEAREESSSLEYDIFMCIRAQVETYINRLQKLAKTLATVDVLQSLAAVAETNHYIRPQFNDNHVIKIQEGRHAVVEKVMGVQEYIPNSISFNQETSIQLITGPNMSGKSTYMRQLALTVIMAQMGSFVAADHVDLPLFDAIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMMEANQAIKRASDNSLILFDELGRGTATYDGMALAQAIIEYIHDRVGAKTMFATHYHELTDLSTKLTSLVNVHVATLEKDGDVTFLHKIAEGPADKSYGIHVAKIAGLPEALLSRADEVLTRLEAQAQSAEIISVPSKVEPSSAAREGQLSLFPDEDKSQEIIHTLEAIDVMNMTPLQAMTTLYELKKLL >LS483318|2007627:2019128|2013742_2014405_-|SQE87098.1|DBSCAN-SWA MEILTLSHYQLEVGGNLLLSINQLHLHQGDKVFLIGDNGSGKTSFLQTLIGERRSYQGQLSLHSDVAYLPQLQAAQNQSGGEKVMASLKVLFQKNASLLILDEPSSHLDKANQKWLIHQLKRYRGTLLVVSHDRYLMNQIAQQIWAIEKQDIKVYQGNYDAYRQVKELEMQKQAIEKANYQRQVTKLTKQIQAKKERANQMVKPKKKHLTFRLESECFCR >LS483318|2007627:2019128|2016445_2017387_-|SQE87101.1|DBSCAN-SWA MIKKTTYKKKVKYVISRGAKKVGLLHALRSISREKYAEKISASLLYGILSSIAVNFFFQPGHVYSSGATGLAQVFSALSHRLLGYDFPIALAFYLINIPLLILAWYKIGHQFTIFTFITVSMSSFFIQIMPQVTLTTDPLINAIFGGLVMGMGIGTGFKSRISSGGTDIISLTLRKRTGKDVGSLSLMVNGAILTFAGILFGWQYALYSMVSIFVSSRVTDAIFTKQKKMQATIITSHPERVIQMIHKRLHRGVTSINDAEGTYKHEQKAVLITILTREEYTEFKWLMLKADPQAFVSVAENVRIIGRFVEED >LS483318|2007627:2019128|2010519_2010957_-|SQE87095.1|DBSCAN-SWA MNKIERQHQIKQIIQAEHIGTQEDIKKALQKEGIVVTQATLSRDLREIGLLKLRDEQGKLYYSLSEPVATPFSPEVRFYVLSVDRAGFMLVLHTNLGEADVLANLIDNDDIEDILGTIAGADTLLVICRDEEIAKRFEKDLAAGL >LS483318|2007627:2019128|2011245_2012937_+|SQE87096.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDTKTLIASEIAKVVPELEQDAIFNLLETPKNSDMGDLAFPAFSLAKVLRKAPQMIAGELAEQIDGSQFEKVVAVGPYINFFLDKAKISSQVLEQVITAGSDYAQQDEGQGRNVAIDMSSPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSLANIFAKMGYQPVKINHLGDWGKQFGMLIVAYKKWGDEAAVQAHPIDELLKLYVRINAEAETDPTVDEEAREWFRKLEDGDKEATELWQWFRDESLLEFNRLYNQLNVTFDSYNGEAFYNDKMDEVLELLEAKNLLVESKGAQVVNLEKYGIEHPALIKKSDGATLYITRDLAAALYRKRTYDFAKSVYVVGNEQAAHFKQLKAVLKEMGYDWSDDMTHVAFGLVTKGGAKLSTRKGNVILLEPTVAEAINRAASQIEAKNPNLADKEAVAHAVGVGAIKFYDLKTDRMNGYDFDLEAMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKADFTPSTTTTYSLADAESWEIIKLIQDFPRIIKRTSDNFEPSIMAKFAINLAQSFNKYYAHTRILDDNSERDSRLALCYATATVLKEALRLLGVEAPNEM >LS483318|2007627:2019128|2013006_2013762_-|SQE87097.1|DBSCAN-SWA MNAFAGSYDSQAKRIAKSAKAMENRLAKLTPNRQESKEIWAKLKFNPQEKKIPHTLIHLREGNLSRNKQILFTYPDIAIRADSKLAIIGRNKAGKSTFLESLANQDLPGFYSDHLKLTFFKQDQVQLDSQLTAFEFVQEQSNQDSRLILNYLAMMGISYQKAHQKIASLSGGERVRLALVGAMLGDHQLLILDEPTNYLDLVAMEALERCLKQYPYPFVLVSHDQQFVSSVVNRCYVIRDGQLEEIDKDHF >LS483318|2007627:2019128|2015525_2016425_-|SQE87100.1|DBSCAN-SWA MTVDQRLQLKNFCFIILGAAIYAFAFVYFYMANRIAANGLAGLTLVGKALFDIDPSLTGYLINLPLVLLGAKLFGKRAMVYTVTGIFSLYFFVWVFQQLPLVVDLDHDNLVVSLMAGIIGGLGGGLVFRNGGTIGGADIIAKLFEDKLGLQLNQALLGIDIFVMIVSLTYISLPQMMYALIASFMYGQIVRLVQQGGYTARGTLIISDQSETIARFIMEELGRGVTYLHGEGAYSGRDKKVIYVALGRTDIRELKAFLAQIDPDAFVSYFDVDEVNSPEFVATKSKYHKKKSRSNVSKR >LS483318|2007627:2019128|2014581_2015496_-|SQE87099.1|DBSCAN-SWA MTRHDKLTKLIELLLIALGVAIYTFGFVNFNMANALAEGGVAGITLILHAHFGINPAYSSLLFNLPLFILGAKIFGKRSLALTIYGTVLMSVFIWMWQKVPMELGLENDMMLVAVVAGLFSGIGSGLVFRYGATTGGTDIIGRIAEEKFGAKLGQTLLLVDALVLTASLTYVDLKHMLYTLVASFVFSQMISVVQNGGYTIRGMIIITKHSEAAAQAILNEINRGVTYLKGQGAYSGNDYNIMYVTLNPTEVREVKRILAELDPDAFISILDVDEVISSDFKIRRKNFDKPIEKALQKKPKLLK >LS483318|2007627:2019128|2017379_2019128_-|SQE87102.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKRSMYAGRVREEHIGTTITLKGWVGRRRDLGGLIFIDLRDREGVMQLVINPEDVSSDVMATAERLRSEYVIEVEGLVEARQQANDKLATGMIELKVSALTILNTAKTTPFEIKDDVEVSDDTRLRYRYLDLRRPEMLENFKLRAKVTHSIRNYLDDLEFIDVETPMLTKSTPEGARDYLVPSRVSQGHFYALPQSPQITKQLLMNAGFDRYYQIVKCFRDEDLRGDRQPEFTQVDLETSFLSEQEIQDIVEGMITKVMKETKGIDVTLPFPRMSYDVAMNSYGSDKPDTRFEMLLQDLTETVKGIDFKVFSEAPAVKAIVVKENADRYSRKDIDKLTEFAKQFGAKGLAWVKVTDGQLAGPVAKFLTAIETELSSQLKLAENDLVLFVADTLEVANNTLGALRTRIAKDLDMIDQSQFNFLWVVDWPMFEWSEEEGRYMSAHHPFTLPTSESAHELEGDLAKVRAIAYDIVLNGYELGGGSLRINQKEMQERMFKALGFTAEEANDQFGFLLEAMDYGFPPHGGLAIGLDRFVMLLAGKDNIREVIAFPKNNKASDPMTQAPSLVSEKQLEELSLQIESHD |
10 | Streptococcus_phage(57.14%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2029494 : 2042055
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS483318|2029494:2042055|DBSCAN-SWA 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GATATTCGGACTATCGAAAGACTGGTAGAAGCTCATAAAATAGAGCTTACTGAAAATGGTTACCACACTTTACGTGGGGAACAACTAGCTAATTTTAAAGAGAACGCTTTTGCTACCGACACAAATGTCGGTAGCAAAGTTACACAATTAAGTATCTCATCATTCAGAACGTTACTTAACTTTGCTATGTTGTTAACAAATAGTGACATAGCTAAGCAAGTAAGAAATACCTTACTTGATATTGTCATTAATGTCTTAACCGAGAAGACTGGTGGCCATGTAAAATTTATAAACCAACGTGACAAAAATTATCTGTCGACTGCATTAGAAGAAGATAATGCTAGAAAAATATTTACAAATGCTATTGATAAGTATGTTTCTGGAAGTAATTTTAAATATGGTCAATTAACAAATGAAATTTACAAAGCAATCTTTAAAGAAAGAGCCTCAGAATATAAGAAAATATTAAAATTGAACAAAAATGATAATGCCCGTGCAACAATGTATAGTGAGGTTCTCATAGTTATTGCTAGTTTCGAAAAGGGGGTCGCTTATGAGATTGAACAAAAGAGTAAGTCTTTAAATCAAAAAATAACTAATGCTGATGTAATTGAGATAATTCAGAAATTAGCAAGTCACCCAATGCAGGAGCCTCATCTAATGCATGCTAGAGAGAAAATGGCAAGTAGGGATCTATCTTTTAGAAATGCTCGACATGAGAAATTAGCACAATATATCCGTCCAATTTCTGAAGAAGACTTTGAACGGTTTATTGGCGAACAAAGTAAATCTCTCTCAGAACAAATTGATGAACATCGCCAAGTCTTTGAAAGATTGAGGGATAAATAATGGGTACAATCAATTATTTTTTTGCTGAAGAGGCTATTTTACTACATGACATTGAAGTAATTGAGAAGATCGGTGGTTTGCATGGTGTTAAAGATAAAGGGAGGGTATTTAGTGTATTTGAGCACTTACAAAATGACGATTACTATCCAGACTTTGAAACCAAACTTACAGTTCTAGTATTTAACACAGTTCAATTTCATATGTTTAACGATGGAAACAAAAGAAGTAGTATCGTCTTTGGCGTTAAATTTTTAACAATCAATCACTTTGATTATCTCATTCCCTTCTTTATCGAAACAATGGAAAATATTGTCCTATGGGTGGCAATGGGATTAATTGATTTCAAATTTTTAAAAGAAATTATTTCTTCAATTCTCTATTATGAGGAACTCACTGAACAAGTAAAAGAAAGACTTGTGCAGATAGCTTTAACCATAGAAAACTACAAATAAAAGACTTTCTCGTAACCCCTGGCATGATATAAACCTATAACATTATAAAACCCTTTTAATAACAGCTTGCCTGCTGATGGAAAGGTTTATGATCATGAAAATAACTGAAGTAAAAAAGAAAAACGGTGCTACTGTGTACCGCGCTAGTGTATATCTGGGAGTTGACCAGGTAACAGGTAAGAAGGTAAAGACCAAAGTAACGGGTCGGACACAAAAGGAGGTTAAGCAGAAAGCCAAACAAGAAAAAATAGCCTTCCAGCAAGACGGCTTTACCAGGTTTCAAGCTACGTCAATAGCAAGTTATCAGGAATTAGCTGAACTATGGTGGGAAAGCTACAAGCATACTGTCAAACCCAACACACAAGACAACGTTAAGAAGTTACTAGATAACCATGTTTTGCCACTCTTTGGGGTCTATAAGCTCGATAAGCTGACTACGCCACTCATTCAAAGCATAGTTAACAAACTGGCTGACAAGACAAACAAGGGGGAGCCTGGGGCTTATCTGCATTATGATAAGATCCACGCGCTGAACAAACGTATTTTACAGTATGGCATGACCATGCAAGCTATACCAGCGAACCCTGCGCGTGATGTCGTCCTACCTCGTAACACTCAAAAGGCTAAGAGAAAAAAGGTCAAGCATTTTGAAAATCAAGACCTAAAAAAGTTTCTCGACTACCTGGGAGGGCTGGACCTGTCCAAGTACAGAAATCTGTATGAAGCCACCCTATACAAGTTCTTGCTGGCCACTGGTTGCCGTATCAATGAAGCCCTAGCGCTTAGCTGGTCTGATATTGACCTGGAGAATGCAACCATCAGCATTACTAAGACACTAAACCATCTAGGGCAAATCAATAGCCCAAAATCAAAAGCAAGCTATCGGGATATAGATATAGACCAGGCGACTATTACCATGCTGAAAGCCTACCAGCTTAGACAAATTCAAGAAGCTTGGAAGTTAGGGCGAACTGAAACAGTTGTATTCTCTGACTTTATCCATGATTACCCAAGTAACAAAACCCTGGGTACACGTCTAAAAACTCGGTTTAAACGTGCTGGAGTTCCTAACATTGGCTTTCATGGTTTCCGCCATACCCACGCTAGTTTACTGCTTAACTCTGGAATACCTTACAAGGAACTACAATACCGCCTAGGTCATTCCACTCTATCCATGACCATGGATATTTATAGCCATCTCTCAAAAGAGAACGCAAAAAAAGCCGTCTCGTTTTACGAAACAGCACTAAAAGCCCTCTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS483318|2029494:2042055|2036545_2036827_-|SQE87121.1|DBSCAN-SWA MGLFSQDYEAKLLEQNLTAFNRFLEDYQKPKPRVLGLITAEQVKEELNIKGKTLKRWENAGLRRYQPPLEDTRKIFYRVSDVLIFLGVENGKI >LS483318|2029494:2042055|2037361_2037694_-|SQE87124.1|DBSCAN-SWA MKYRVETNPFSKDRYTPEQREMFKNRQLSKDKAEAYFTRLYNQHVAWVIIANVMTEYVIKFRKSATSFEEAWDALDYQRTTEIVFRAVNGLPCSEKDSGELETYLSEVSA >LS483318|2029494:2042055|2039337_2040342_+|SQE87127.1|DBSCAN-SWA MTDLTTSQIERQNILNNSLAIKQAEEILKVPGFYFEDSFYFTNSQIASFFDVDIRTIERLVEAHKIELTENGYHTLRGEQLANFKENAFATDTNVGSKVTQLSISSFRTLLNFAMLLTNSDIAKQVRNTLLDIVINVLTEKTGGHVKFINQRDKNYLSTALEEDNARKIFTNAIDKYVSGSNFKYGQLTNEIYKAIFKERASEYKKILKLNKNDNARATMYSEVLIVIASFEKGVAYEIEQKSKSLNQKITNADVIEIIQKLASHPMQEPHLMHAREKMASRDLSFRNARHEKLAQYIRPISEEDFERFIGEQSKSLSEQIDEHRQVFERLRDK >LS483318|2029494:2042055|2038342_2038963_+|SQE87126.1|DBSCAN-SWA MKIGDIVKEYRKRNKLTMQEFADKIGKTKGYISMLEKGENPQTHKPIAPTFETLREIAKAMGIELNTLIQKLDGDQVIKVNSTRYDWDDEEENLRNWGTYDWDGNFSPSLFHEDIFIGIKNTLSNIDEVTFTRSDIESFYSSCIIDNVRITDRKSLIEYLKKSIKGFNELVHGISDFDEQSLDSGLLSVLARDRNKYKFYLTQLEP >LS483318|2029494:2042055|2031432_2031864_-|SQE87115.1|DBSCAN-SWA MTIEELKQRLEGIRWIDKEISQLYLELQYLETGLFKQTTLTQARVQTSRVNSTENQLVAQLTLKEDITSRIDRLTQDRLELVSIIDKLEIPKYRLALNLYYVQHKLDIEASEIMGISRTTFFRYLRQGQAELVSLLTHAEKEN >LS483318|2029494:2042055|2036829_2037159_-|SQE87122.1|DBSCAN-SWA MTLPENYRRVLNLIKVGADNPITGAEIGLILKLEERSVQSIISSLITRYNVPIIGIRHGFNRGYFIPANKEELLDGAKAFYNQVQKEQERLSVLLNADLTSYKELLKGG >LS483318|2029494:2042055|2032959_2033490_-|SQE87117.1|DBSCAN-SWA MTLKTISDKPQTFTFTYDFEDIDTAKVASNAVFGYMFGTYHAPVIEATIKGKGQLVLEYAEDKKLSKIFKRICDGFKDYYTHQGQENEIKEDYKLERVQQLKQSEDFDSLLDKLVACELELMELADSVLDDDYPDTAVNGVHGNLKALDNQAMALLKNLDAEGEYKALWKYASREA >LS483318|2029494:2042055|2040882_2042055_+|SQE87129.1|DBSCAN-SWA MIMKITEVKKKNGATVYRASVYLGVDQVTGKKVKTKVTGRTQKEVKQKAKQEKIAFQQDGFTRFQATSIASYQELAELWWESYKHTVKPNTQDNVKKLLDNHVLPLFGVYKLDKLTTPLIQSIVNKLADKTNKGEPGAYLHYDKIHALNKRILQYGMTMQAIPANPARDVVLPRNTQKAKRKKVKHFENQDLKKFLDYLGGLDLSKYRNLYEATLYKFLLATGCRINEALALSWSDIDLENATISITKTLNHLGQINSPKSKASYRDIDIDQATITMLKAYQLRQIQEAWKLGRTETVVFSDFIHDYPSNKTLGTRLKTRFKRAGVPNIGFHGFRHTHASLLLNSGIPYKELQYRLGHSTLSMTMDIYSHLSKENAKKAVSFYETALKAL >LS483318|2029494:2042055|2029494_2030349_-|SQE87114.1|transposase|DBSCAN-SWA MLHKEKPDYNRNQYGFYTLDQLVPDEHFLRQVEAVIDFDFIYDLVEDTYSSDNGRPSLDPVILVKIPLIQCFYGIRSMRQTIKDIEVNTAYRWFLGLTLDDKVPHVTTYGKNYSRRFQEKGLIESIFTHILGLCINTDLIDPTEIFIDGTHMKAAANNRKFINREVEKQAKFMSEQLEIEINRDREKHGKKPLGPAKELEPVAKKISTTDPESGWFHKGDHKEVFAYSAQVACDKYGWALAYSVEAGNIHDSQAFPALFAKLEPLKPQFIIADSGYNIPSIASF >LS483318|2029494:2042055|2033510_2033684_-|SQE87118.1|DBSCAN-SWA MKIKLFYQKHKQSLEEFENQVNDFMAGVEVVDVKYTEATSGDYEAMTTTLGLLVLYK >LS483318|2029494:2042055|2034019_2035522_-|SQE87119.1|DBSCAN-SWA MKNLESEILEARENEQPPRTMKELENRIFQAGEQWREEHTETKINESTGDVTEKVAMPQVFTVAKMLSEIITFTFISKSNVPDYSLLYIYDLDEGIYTASNDLFNRFCKTFDVRIKPREWPQIKLMVRTLTRIKKPLESAYLIPVQNGIIDLRTKELLPFSPKYVITSKISTAYHAPKRIPTDREGKTFDDWLNSIACNDSELVILFWQIILEAINPNHTRNKFAIFYGDGNNGKGTFQRFLINLIGESNVSALKPVQFAEKHNLETLVGKVCNIGDEAPNEYLKNPSDLMSITSGDTVLVNPKGRPAFEATFKLFNIFSGNYIPNGGNKTKGWYRRIMIVPFNADFNGEKEKPWIKNDFLANKEVLEYALYKAINQKSFTHFIEPQAVKGLLEEYQEDNDYLLSWVKHEYMERGWHELDVVPVFIATRSLKHYAEDMGIPKPNVYGAGKETIRHLQQLTPNKYQLKKARVKVEDYDKLDPLEFERPKLGRVNHAITKKE >LS483318|2029494:2042055|2037964_2038153_-|SQE87125.1|DBSCAN-SWA MNGKKIAEIRKIQRLSQEELAEKAQVSRSIISFLETGKEKDVKLFTLTRIAKALNCKVEDFL >LS483318|2029494:2042055|2035541_2036411_-|SQE87120.1|DBSCAN-SWA MAIYEARGFQSNLVYLFDKMEPFQYIERFKPLVVPEGADLEEYKRTQAPYCLSGKITAEKTGSYKRNNISLVYRDLIFLDYDEIKGPAQGFIEAVSRALFGFSYILYPTIKHTPESPRFRLVVKPGGVMNEETYKQVVKEIADKIGLPFDMASLTWSQLQGLPVTTGDPADYQKIVEHGLDYPVPKSRQNRTSGQGVKPQTYTPRASGQRSITMRVIDTLFNGFGDEGGRNVALTRFVGLLFNKWVDCDIETAYELTKIANSVTANPLPERELDRTFESIARAEFRKRG >LS483318|2029494:2042055|2032362_2032830_-|SQE87116.1|DBSCAN-SWA MKKKGITQGKGELDDYSLTIDLDNLFIVMGKESFELARIPGTKGGYRYFFLCPDCGRRCRKLYKRYLFYACGNCQQIHKQTLNRSKTDCQYYWERALREARKVQPGWTPERGRYVFDGFPSRPKRMKRDRYYKHYQRFLNYVRKGDSYWLRGLSR >LS483318|2029494:2042055|2040341_2040794_+|SQE87128.1|DBSCAN-SWA MGTINYFFAEEAILLHDIEVIEKIGGLHGVKDKGRVFSVFEHLQNDDYYPDFETKLTVLVFNTVQFHMFNDGNKRSSIVFGVKFLTINHFDYLIPFFIETMENIVLWVAMGLIDFKFLKEIISSILYYEELTEQVKERLVQIALTIENYK >LS483318|2029494:2042055|2037170_2037362_-|SQE87123.1|DBSCAN-SWA MQELNLTPTQTLILFIVLSLLGLLLSRSKPLIEIDLPEDTQVPKPPKNADYGAYIQSQNHYYN |
16 | Streptococcus_phage(80.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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