Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483325 | Streptococcus equi subsp. zooepidemicus strain NCTC7022 genome assembly, chromosome: 1 | 0 crisprs | DEDDh,cas3,RT,WYL,DinG,csm6 | 0 | 0 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
32033 : 42233
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483325|32033:42233|DBSCAN-SWA TATGTTAACTATGAATAAACGAATTTTTGTTGAAAAAAAGGCTGATTTTCAGATTAAGGCCCAGGCCTTGTTAAAGGAATTGAGACATCAGCTGCAGTTAAAGACACTAGTTGAGTTGCGTATTGTGCAGGTTTATGATGTGTTTCATTTGGATCAGGAGCTGCTTTTAGCAGCTATAAAGCATGTTTTCTCTGAGCAGGTAACTGATCAGGTATTATCAGAAGAAGCCTTACAAGCAGATTTAAAAAGGTATGCTTTTTTTGCGATCGAATCCCTGCCTGGACAGTTTGATCAGCGTGCGGCAAGCTCTCAGGAAGCCTTATTGTTATTAGGAGCTTCAACTGACGTGACTGTGTTGACCTCACAGCTTTATTTGGTCAATCAAGACATTGCTGCTGAAGAATTAGAAGCCTTAAAGCAGTACTTGTTAAATCCAGTGGATTCTAGGTTTAAGGACATATCAGCTGGTATTGACTACCGGGATTTTTCAGTAGCAGATAAAGTGATTCCAGCGCTTGATTTTTTTAGTGATTATACAGCAGAAGACTTTGCTCGTTACAGGTCTGAGCAGGGCCTAGCAATGGAGGTGGAGGATCTGCTGTTTATTCAGGATTATTTCAGGTCAAAAGGGCGAGTGCCAACAGAGACTGAATTAAGGGTTTTAGACACGTATTGGTCCGATCATTGTCGCCACACAACCTTTGAAACTGAGCTAAAAAGGCTTGATTTTTCAGCTTCTCAGTTTGAAAAGCAGCTTCAAGCTACCTACGAGACCTACCTTGCTATGCGTGATGAGTTAGGGCGGTCTGAGAAGCCTCAAACGCTTATGGATATGGCAACCATTTTTGGGCGTTATGAAAGGGCTAATGGCCGTCTCGAGGATTTGGAGGTTTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTGGCAATTGAGGTAGATGTTGATGGTGTCAAGGAGCCTTGGCTGCTCATGTTTAAAAATGAAACACATAATCACCCAACGGAAATTGAGCCCTTTGGCGGTGCTGCCACCTGTATTGGTGGAGCTATTCGTGATCCTCTGTCAGGCCGTTCCTACGTTTATCAAGCCATGCGGCTTTCTGGTGCAGGGGACATTACAAGCCCTCTGTCAGAGACTCGTAAGGGCAAATTACCACAGCAGGTTATTTCAAGGCGAGCAGCACATGGTTACTCGTCATATGGTAATCAAATTGGACTTGCGACGACCTATGTTCGTGAATATTTTCACCCAGGCTTTGTTGCAAAGCGTATGGAGCTTGGTGCTGTGGTTGGTGCTGCTCCCAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAAGGGCAGGTGACGTGGTTGTTTTGCTTGGTGGGAAAACAGGACGTGATGGTATAGGTGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAGACAGTTGAGTCCGTAGAAACAGCTGGTGCAGAGGTCCAAAAAGGAAATGCTATTGAAGAACGTAAAATCCAACGTCTTTTTCGTCGTGGTGATGTGACACGCCTCATCAAGAAGTCAAATGATTTTGGTGCTGGCGGTGTCTGTGTGGCTATTGGTGAGCTTGCTGCTGGTCTTAACATTAACTTAGATAAGATTCCTTTAAAATATGCTGGGCTAAATGGAACAGAAATTGCCATTTCAGAATCCCAAGAGCGTATGGCTGTCGTGATTTGTCCAAAGGATCTAGAGGCCTTTATGAGCGCCTGCCATAAGGAAAATATCCATGCTGCTGTTGTGGCAACTGTGACAGAAAAACCGAATCTTGTCATGACCTGGAATGGGCAAACGATTGTTGATATTGAACGCTCATTTTTAGAGACAAATGGTGTGCGCGTGTCTGTTGCTGCTAAGGTTGTTGACAGTGGTGCGCCAATACCAGAAGCCCGTCAAACTACTGCTGAGACACTTGAAGCAGATACCATTGCTGTCTTATCAGACCTGAACCATGCTAGTCAAAAGGGCTTGCAAACACTTTTTGATAGCTCAGTGGGTCGCTCCACAGTAATACACCCGCTTGGTGGGCGCTATCAAATGACGCCTGTTGAAGGCTCTGTTCAGAAATTACCAGTTCAACATGGAGTGACAAAGACAGTCTCTGTCATCGCTCAAGGCTATCACCCTTATATAACCGAATGGTCACCTTATCATGGTGCCGCTTATGCTGTGATTGAAGCAACTGCTCGTCTGGTTGCAATAGGTAGCCATTGGCATAAGGCACGCTTTTCATATCAGGAATACTTCCAAAGAATGGATAAGCAGGCAGAACGCTTTGGTCAGCCGGTGGCAGCCTTGCTTGGGGCAATTGAAGCACAGGTGCAGCTTGGCTTGCCTTCTATTGGAGGTAAGGATTCGATGTCTGGTAGCTTTGAGGAATTGATAGTGCCGCCGACCTTGGTTGCCTTTGGTGTGACGACTGCTCATGTAGATCATATCCTCTCACCAGAATTTAAAGCTGCTGGCGAGTATATTTACTATATTCCAGGACAGGCTATTTCAGAAGTGATTGATTTTGAGATGATCAAATCCAACTTTAGAAGCTTTGCAGCCATTCAGGCAAGGCATAAGATTAGCTCGGCTTCGGCTGTTAAATACGGTGGTATTATTGAAACACTTGCTCTTGCAGCCTTTGGTAATCAGTTAGGGGCTTGTGTGACCTTGGCGGAGCTTGACAGGAGCTTAACAGCTCAGCTTGGCGGCTTTGTCTTTACGTCAAAAGAGGAGATTGCAGGTGCTATCAGGCTTGGTCAGACCACTAGTGACTTTACATTGATGGTCAATGATGTCAAGCTATCTGGAGATCGTCTCTTAAAGGCTTTTGAGGGGAGCCTGGAGCAGGTTTACCCAACGGTATTTCAGCAGACAGGTGACTTGCAGCCTGTTCCTGTAGTGACAACAGCACTTGCTACTCAGTTTAAGGAAAAAATAGCTCAGCCAGTTGTCTATATTCCAGTTTTTCCAGGAACTAACTCAGAATATGATTCGGCTAAGGCCTTTGAAAGAGAGGGCGCAAGGGTGAACTTGGTGCCTTTTGTTACCTTGAATGAGGCAGCTATTGACGCTTCAGTTGACACGATGGTTGACCATATTCACCAAGCTCATATTATCTTCCTTGCAGGTGGTTTTTCAGCGGCAGATGAGCCAGATGGTTCAGCTAAATTTATTGTTAATATCCTGCTGAATGAGAAGGTTCGAGCGGCGATTGCTGCCTTTATTGAAAAGGGTGGTCTGATTATCGGTATTTGTAATGGCTTTCAAGCTCTGGTCAAATCAGGGCTGCTGCCATATGGACGTTTTGAGGCGGTACATGAGGCTAGTCCAACTCTGTTTTATAATGATGCCAATCAGCATGTGGCTAAAATGGTAGAAACGCGTATTGCCAATACCAATTCTCCTTGGCTAGCAGGTGTCAAGGTGGGGGATATTCATGCTGTTGCAGTGTCGCATGGAGAGGGCAAGCTTGTGGTAACAGAAAGAGAATTAGCAGAGCTTTGTGAAAATGGTCAGATTTTCAGCCAGTATGTTGACCTTGATGGCAAACCAAGCATGGATAGCAGGTATAATCCAAATGGCTCTGTCAATGCTATTGAAGGTCTTACCAGTAAAAATGGTCAGATTATCGGTAAGATGGGCCATTCAGAGCGCTTTGAAGAGGGACTTTTCCAAAATATTCCAGGCAATAAGGATCAATGGTTATTCCGAAGTGCGGTGCATTATTTTAGGGGAGACCATGCGGACATTAACTGATCTTGGATATAGCCTTGTAATAGCTAAGATAGCTGGTATTATTGCTCAGCCTAGCTACTGATCCTAGCTTAGTTAATGACATAATCATAATTAAAGGGGCATTGACCCAGAGGTAAAGATGATATATGACGTAAAATCTCTTAATGAGGAGTGTGGTGTTTTTGGGATTTGGGGGCACCCACATGCCGCTCAAGTGACTTATTTTGGGCTTCATAGCCTACAGCATCGCGGCCAAGAGGGAGCAGGTATTATTTCAAATGATAATGGGGAGCTTCATCAGCATCGTGATGTAGGTCTCTTGTCAGAGGTGTTTAAGGATTCATCTGATCTGGACAAGCTAAAGGGACATGCTGCCATTGGTCATGTGCGGTATGCGACTGCTGGGACGGCTTTCATTAATAATATTCAGCCCTTTTTATACCGCTTTACAGACGCTCAATTTGGCTTGTGCCACAATGGTAATTTGACCAACGCTATGTCATTGAAAAAAGCGTTAGAGAGTGAGGGAGCTATTTTTAATGCCTCTTCTGATACAGAAATTCTAATGCATTTGATTCGTCGTAGTCATCACCCAGAATTTTTAGGAAAGGTAAAAGAGGCACTCAATACTGTTAAAGGTGGCTTTGCTTATCTGCTGATGACAGAGCACCAGCTGATAGCAGCACTTGATCCAAATGGCTTTAGGCCATTATCTATAGGCCGTATGAAAAATGGGGCTTGGGTCGTCTCAAGTGAAACCTGTGCCTTTGAAGTGGTTGGTGCTGAGTGGGTTCGCGATGTGATGCCAGGTGAGGTCATTATCATTGATGATCAGGGGATCACCTATGACTGCTATACGACTACTACGCAGCTGGCTATCTGCTCTATGGAATATATTTACTTTGCGCGTCCTGATTCAACCATTGCTGGAGTCAATGTTCACACCGCTCGCAAGCGAATGGGAAAGAGATTGGCTCAGGAATTTCAGCATGAGGCTGATATTGTGGTTGGTGTGCCAAATTCCTCATTATCAGCGGCAATGGGCTTTGCAGAAGCATCAGGTCTGCCAAATGAAATGGGATTGGTCAAGAATCAATATACCCAGCGAACCTTTATCCAACCAACTCAAGAGCTTCGTGAGCAGGGAGTTCGAATGAAGCTTTCAGCTGTTTCAGGTGTTGTTAAGGGTAAAAGAGTTGTGATGGTAGATGATTCCATCGTCAGAGGGACAACCTCACGACGCATTGTTAATTTGCTGCGTGAAGCAGGA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GGAAGTGCATTGACGTAAGTACATGTTCCAAGGATCAGCTCCGAAGCCCTGTTTCCACTTACTTGGATAGTTGTCTCCTAAAACAGCAGCGTGCACGATACCCGACTGGCCTTGTGAAATCGCTGTTGTGGTAGAGGATATTGCACCATTAACACCTAAAAGGATTGCTCCTGAAGTTAACAATTGATAGACTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483325|32033:42233|39139_40687_+|SQE94966.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKRGIVDLAKELKHLGWDIISTGGTRLALEEAGVATVAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPRIHGGLLARRDTEHHLQAAKQNRIDLIDLVVVNLYPFKESICRSDITYDVAVDMVDIGGPSLLRSAAKNHASVTVVVDPTDYPLVLGELASTDNTSYQTRQSLAAKAFRHTAAYDAVIADYFTRQAGETRPEKLTLTYDLKQSMRYGENPQQAADFYQGALPTAYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKERPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDFAYAADPVSIFGGIVVLNRKVDLATAEKLHAIFLELIIAPGYSKEALAVLTHKKKHLRILELPFAAQETSKIEAEYTGVLGGLLVQNQDVVTESPADWIVVTKRQPNEQEMAALSFAWKTIKYVKSNAIVIANDHMTLGVGPGQTNRIASVRIAIEQAKGQLEGAALASDAFFPFADSVEEIAAAGIKAIIQPGGSIRDSESIVAADQHGIAMIFTGVRHFRH >LS483325|32033:42233|37415_38438_+|SQE94964.1|DBSCAN-SWA MSKNAYAQSGVDVEAGYELVERIKKHAERTKRLGVMGGLGGFGGLFDLSKTGIKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIQYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYLAAGKNEPAKLEQVVAGIAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGQKDYDLAGFAVGIAEKSQLIDGSRVAEGDHLLGLASSGIHSNGYSLVRRIFADYTGDEVLPELEGKKLKEVLLEPTRIYVKAVLPLIKSGLVAGIAHITGGGFVENIPRMFSRELAAEINEASLPVLPIFKVLETYGRINHEEMFDIFNMGIGLVLAVKPEHVEQVKACLDEPVYDIGRVVTRTAASVVIKP >LS483325|32033:42233|41078_42233_-|SQE94967.1|DBSCAN-SWA MKKVYQLLTSGAILLGVNGAISSTTTAISQGQSGIVHAAVLGDNYPSKWKQGFGADPWNMYLRQCTSFVAFRLHSANGFSLPRGYGNAESWGHIAKHQGYLVDHTPRVGAVAWWDKGFNQSHTLYGHVAWVAEVNGDTVVIEEYNYNAGQGPEKYHKRQIHKHQVSGYIHFKDLDHNSTSHMQMSHASQAGPASLAKTGTYYFSSQSPIKAEATLASPDLAYYHTGQLVHYDQTLVADGYEWLSYIGHSGNRRYIPIHKLPVQPQQHSQGAIDKPKPVATTPIKVGDTVAFPGVFRVDQVAQNMIASSELAGGEPTSLNWIDPAPLHETDHKGRIAGNQILQVGDYFVVSGTYKVLKVDQPSKGIYVQMGSRGTWLTIDKAKKV >LS483325|32033:42233|35901_37359_+|SQE94963.1|DBSCAN-SWA MIYDVKSLNEECGVFGIWGHPHAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIISNDNGELHQHRDVGLLSEVFKDSSDLDKLKGHAAIGHVRYATAGTAFINNIQPFLYRFTDAQFGLCHNGNLTNAMSLKKALESEGAIFNASSDTEILMHLIRRSHHPEFLGKVKEALNTVKGGFAYLLMTEHQLIAALDPNGFRPLSIGRMKNGAWVVSSETCAFEVVGAEWVRDVMPGEVIIIDDQGITYDCYTTTTQLAICSMEYIYFARPDSTIAGVNVHTARKRMGKRLAQEFQHEADIVVGVPNSSLSAAMGFAEASGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVNLLREAGATEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTAAEVCDIIGADSLTYLSLDGLIEAIGLDTKSPNGGLCVAYFDGQYPTPLYDYEEAYLKSLEEKVSFHIDQVTK >LS483325|32033:42233|38434_38992_+|SQE94965.1|DBSCAN-SWA MTKIAVFASGNGSNFQTIAEQFPVAFVFSDHRAAHVLNRACALGIVAYSFELRDFESKQAYEQALVALLQQHQIDLIVLAGYMKIVSTTLLAAYEGKIINIHPAYLPEFPGAHGIVEAWQAGVSQSGVTVHWVDSGIDTGKIIKQVRVPRLSDDTLESFEARIHEAEYQLYPEVLDSLGVERLNR >LS483325|32033:42233|32033_35783_+|SQE94962.1|DBSCAN-SWA MLTMNKRIFVEKKADFQIKAQALLKELRHQLQLKTLVELRIVQVYDVFHLDQELLLAAIKHVFSEQVTDQVLSEEALQADLKRYAFFAIESLPGQFDQRAASSQEALLLLGASTDVTVLTSQLYLVNQDIAAEELEALKQYLLNPVDSRFKDISAGIDYRDFSVADKVIPALDFFSDYTAEDFARYRSEQGLAMEVEDLLFIQDYFRSKGRVPTETELRVLDTYWSDHCRHTTFETELKRLDFSASQFEKQLQATYETYLAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLEDLEVSDEINACSVAIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRLSGAGDITSPLSETRKGKLPQQVISRRAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPRAGDVVVLLGGKTGRDGIGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRRGDVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELAAGLNINLDKIPLKYAGLNGTEIAISESQERMAVVICPKDLEAFMSACHKENIHAAVVATVTEKPNLVMTWNGQTIVDIERSFLETNGVRVSVAAKVVDSGAPIPEARQTTAETLEADTIAVLSDLNHASQKGLQTLFDSSVGRSTVIHPLGGRYQMTPVEGSVQKLPVQHGVTKTVSVIAQGYHPYITEWSPYHGAAYAVIEATARLVAIGSHWHKARFSYQEYFQRMDKQAERFGQPVAALLGAIEAQVQLGLPSIGGKDSMSGSFEELIVPPTLVAFGVTTAHVDHILSPEFKAAGEYIYYIPGQAISEVIDFEMIKSNFRSFAAIQARHKISSASAVKYGGIIETLALAAFGNQLGACVTLAELDRSLTAQLGGFVFTSKEEIAGAIRLGQTTSDFTLMVNDVKLSGDRLLKAFEGSLEQVYPTVFQQTGDLQPVPVVTTALATQFKEKIAQPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEREGARVNLVPFVTLNEAAIDASVDTMVDHIHQAHIIFLAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIAAFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGRFEAVHEASPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVKVGDIHAVAVSHGEGKLVVTERELAELCENGQIFSQYVDLDGKPSMDSRYNPNGSVNAIEGLTSKNGQIIGKMGHSERFEEGLFQNIPGNKDQWLFRSAVHYFRGDHADIN |
6 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
92969 : 142226
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483325|92969:142226|DBSCAN-SWA 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>LS483325|92969:142226|101758_102202_+|SQE95027.1|DBSCAN-SWA MTILEKKLDSLVNRILLKAENQHELLFGACQSDVKLTNTQEHILMLLSQEKLTNTDLAKRLNISQAAVTKAIKGLIKQEMLAGTKDTVDARVTYFELTDLARPIAKEHTHHHDKTLAVYHRLLAHFSAEEQVIVEKFITVFSEELEG |
39 | Streptococcus_phage(30.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
931718 : 972097
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483325|931718:972097|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(70.83%) | integrase,tail,holin,terminase | attL 929110:929124|attR 938013:938027 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1252717 : 1308106
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483325|1252717:1308106|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_phage(30.0%) | transposase,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1663560 : 1672394
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483325|1663560:1672394|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483325|1663560:1672394|1666284_1666482_+|SQE96485.1|DBSCAN-SWA MTVQELNLTPTQTLILFIVLGLVGLLLSLSKPLIEIDLPEDTQVPKPPQNANYGAYIQSQNHYYN >LS483325|1663560:1672394|1664613_1665234_+|SQE96481.1|DBSCAN-SWA MRTETWNGYTIRFVEHQGEWWAVLADIAKALDLKPKFIKQRLGDEVVSNNHVADSLGRQQEMLIVNEFGIYETIFSSRKKEAKTFKLWVFETIKQLRQSTGLEGFQVFRMLDKEHQKKAMNRLVDGLQNATRKDLIKANTIANKAVSDLYGYPKMVSKNEMTENMLRDREPILDETVELIKVKEKYGLNFSVSEAIYNQNTIKKAQ >LS483325|1663560:1672394|1665259_1665592_+|SQE96482.1|DBSCAN-SWA MNLVYMDGKKEPYTTSDIIAEVTQVQPLSVVKLIDNNADRFLNLGHLQRKKQSKRVGRPRKVYRLNEAQTYLAISLQRNLTRNSEVVGDHKEMFSKAYQIIKTMKQKTHQ >LS483325|1663560:1672394|1666493_1666823_+|SQE96486.1|DBSCAN-SWA MTLPENYRRVLKLIKVGADNPITGAEISLILKLEERSVQSIISSLITRYNVPIIGIRHGFNRGYFIPANKEELLDGAKAFYNQVQKEQEHLSVLLNADLTNYKELLKGG >LS483325|1663560:1672394|1671673_1672036_+|SQE96494.1|DBSCAN-SWA MNAKEQLKELKPLFALMTLFEEQRDKDIKLMNAFRNPELLNGIEKGTAKQLLYLAKERDKRLAMIATLQDERQIAVIKARYVDDLSWDEIPDKLGYSRNTVFKLHREALEVLDEQEERYS >LS483325|1663560:1672394|1664402_1664600_+|SQE96480.1|DBSCAN-SWA MKNNLRIILAKQRKKISDLHEDTGISKTTLTSLYYERTKNPESETLLKVANSLGVTIDELLTVED >LS483325|1663560:1672394|1667247_1668114_+|SQE96489.1|DBSCAN-SWA MAIYEARGFNSYLYPYKGQLEPFDYIAQFKPLKPPEGMAINEYKGTQAPYCLSGKVTAEKNGSYKRNNASLVYRDLIFLDYDEIETGVNLPKIVSETLGEYNYIIYPTIKHTPEKPRYRLVVKPSDVMTEATYQQVVKEIADKIGLPFDLASLTWSQLQGLPVTTGDPEDYQRYVNRGLDYPVPKNGSTPNRRITTTYTPRPRSQRSITMRVIDTLFNGFGDEGGRNVALTRFIGLLFNKWVDCDLETAYELVQIANSVTAKPLPIDEIDTTFRSILDKELRKRGIKP >LS483325|1663560:1672394|1663560_1664241_-|SQE96479.1|DBSCAN-SWA MIKTNFAVLMAERGLKIADVYEDTGISKTTLMALSENTGKGVQFDTVDKLCNYLGIELKDFFVYSPYIWKIYSKENYEYKEDGEQVIAINLKSPHSERVYIAKLFFFSPKHIDSPIDDDSIKLWVRLSLDEESGNFGYKEFYNFISSLPVGFQTLFYNDVIEVIKNHYLNSETMISAYRYDFHPTKEYLTKISLNKNDKVFISFFDNYGSYRAPKEVQADKTIKID >LS483325|1663560:1672394|1665834_1666167_+|SQE96483.1|DBSCAN-SWA MKYRVETNPFSKDRYTPEQREMFKNRQLSKDKAEAYFTRLYNQHIAWVIIANVMSEYVNKFRKSATSFEEAWEALDYQQTTEIVFRAVNGLPCSEKDTGELEIYLSEVSA >LS483325|1663560:1672394|1667093_1667246_+|SQE96488.1|DBSCAN-SWA MAGSFRQHHPAFDNMLLADDRIYKNRRPTVEQNKEQQHLKKLKKKRRKGR >LS483325|1663560:1672394|1666163_1666304_+|SQE96484.1|DBSCAN-SWA MRSIEELKAIAEYILEHMTDSEKAHFPNMTREEIKGLIIKYDSSRT >LS483325|1663560:1672394|1669813_1669987_+|SQE96491.1|DBSCAN-SWA MKIKLFYQKHNESLDDFEYRVNQFTLSVSVIDIKLSEATYGNYEDMSTTTSLLVLYR >LS483325|1663560:1672394|1666825_1667104_+|SQE96487.1|DBSCAN-SWA MNLFSQDYEAKLLEQNLTAFNRFLEDYQKPKPRVLGLITAEQVKEELNIKGKTLKRWEKAGLRRYQPPLEYTRKHYYKVSDILVFLGVENGR >LS483325|1663560:1672394|1672010_1672394_+|SQE96495.1|DBSCAN-SWA MSKKNAIRKLKEFHRWQRIANSLNLTYNERYQFDIDYHPTRRKHLEISRECALEELDAIKHAVNQLSKIEYRKILIECYLFGEKKSQQDIIAELNRSQSWYYETKKRALLEFTEPYRGRGVQQHILN >LS483325|1663560:1672394|1668125_1669520_+|SQE96490.1|DBSCAN-SWA MKDYQNKLSQTTQPTFAPAFRTRKGRGDKEYVISSPYNVGKVFEFYENIFTGIKYNEFEKTIEITKAVPWSKEKGLWTNEQTSLCIAFIDEKYRFTPRKEHIEVAITALAKKNTYHPIKQRIESQKWDGKARGERYFIDLLGCADNSYNREIAKVWLTGLMARIYLRKVKFEVVPILIDKRQGTGKSTVTKRLLPNYHTDSEIKFGKNDSDYQKIQANAIIELGELKGMSKTEIETVKSFISSDSDTYREPYERKATPHPRHCVFIGTANKKSFLKDSGTERRFFPIECGVNDVEKHPMEVEEDYFLQVLAEAKVWFNNYEPLTPSKELMNQLADIQEDYKVEDVDKEIIDQLLNEFQIVEGWDGLSQYEQRQYVLKQLGEPLDNAQSYSDYPSTQTDCLLQVTSPNHIAYLGFNQKPTQGGKALISQKIRDHLDNDDGWKKGENPSRKRLFKGGTPVSYYERV >LS483325|1663560:1672394|1670786_1671275_+|SQE96493.1|DBSCAN-SWA MLELAIESIIKPMKAQGKTRVTGTIGDQPITIDLDNLVIHYNHQDLLLETIPGTYGGKRYFFFCPDCERRCRKLFKISHDFACGSCQKVHQATLNRSKTDCQYYWRLAFRECLKVDPKARHKHGYYSHDDFPKRPKYMRIAKYLYHWKRFHYYMDKGDRYWL >LS483325|1663560:1672394|1670167_1670713_+|SQE96492.1|DBSCAN-SWA MRTFSDTPKTFTFHYTFKDFDTAQVACHAILGYMTGTYKQPVIDATYHNDNQGGHANQLVLEYAEDRKLNKVFKRICDSFKDYYNQPEDMTDEELDAMVQENEVEELEHQRVVPLSEITQEEANEQHTLMAFISYHDQLAEHLSMNYQEMSQDDLGAILETISQAFNHLYDMVVEGQLLVK |
17 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1678956 : 1727046
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483325|1678956:1727046|DBSCAN-SWA 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40 | Catovirus(20.0%) | bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1911618 : 1978640
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483325|1911618:1978640|DBSCAN-SWA 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>LS483325|1911618:1978640|1977419_1978640_+|SQE96761.1|integrase|DBSCAN-SWA MTVTKTSSNTYNLKVYIPKEIRPKMGIRGSHFVKRYKTRKEAKEAELDILTKIHQLENGESLIFSKDGDILFSDFYKLVWWDSYKAGQTTSTTKPPTQVTIDNTETVFRKHILPMFANFSIDFLNQNKQVVLNLMTAKAEEYANFKVIRSYVNSIFDWAEELEYIESNRLSKTIKRIKATKKIKLQEAKNEEDLYLSSEELQDWFNAFREDLENNKLSLKDYVLFFTTFILSDRKSESYALHWKNIDLIKAQIDLRHALDKYKNVKSTKGNKKTIFSIPNYLVTLLSEWKTQQKQELAKFGIMQTPDQLVFTYIDTKGNVNSPLHVDYLNNKMNSVRRRHPRLKHATPHKLRHTGATLAKKAGMSLEAISEALTHSDTLTTKTYVNTSNIVPLSAGHVAYQHLKNE >LS483325|1911618:1978640|1976306_1977101_+|SQE96759.1|DBSCAN-SWA MSYNRKIIRTSSYLEIWEYETPIFSSDNTEIEENRTSLKEKTKRKTFDELTSDEQEERIKRISKTRKNTKWKLQRLIDTNFDDKTSFLTLTTKENIQDRQYFNILFDKFIKRLNYHIYHSKKRLIKYIAVLERQKRGAWHAHILLFSFPFVPHKDLLAIWRLGAVRINKLDSLDDSSNAGRYVSKYMEKGIGQELLESLGKKAFYSSRNLQKPEEIKLLTNENIEDLVQADDILYESTYNSKVFRKGHLVNNEVKYRKIKIDKE >LS483325|1911618:1978640|1930780_1931260_-|SQE96728.1|DBSCAN-SWA 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51 | Liberibacter_phage(25.0%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 1954681:1954698|attR 1981740:1981757 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
2100780 : 2112341
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483325|2100780:2112341|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483325|2100780:2112341|2103322_2103670_-|SQE96877.1|DBSCAN-SWA MPYRESLHQLIAALEKHSSIIAYKEAQQLLQRTDYNQKAYQMKRHQQDTYLFRQIAKDKAAEESAFKAQQLRDDLDHQPLIDDYRDKMQNASDLVRYITGTIEDELNKEFNDGKD >LS483325|2100780:2112341|2106131_2106926_-|SQE96880.1|DBSCAN-SWA MAVKKKSVSRSDWKTNSFAGSYDSQAKAMAKAAKAMENRLTRMKEVNRPHKKAWAKLKKDPNEGALPNTLLHLQEGTLTRDYQLLFDYPDIVIRSHSRIAIIGRNKTGKSSFLDQLAAQALSGFYVQNLRITYFKQDQADLEPDQTAVELISRQSNQDRVTILNYLAMMGIDYDKANQKVAILSGGERVRLALVAALLTDHQLLILDEPTTYLDLVAIEALESCLIDYPAALLLVSHDLAFVNKVATEIYEVKDHHLIAYHFED >LS483325|2100780:2112341|2104392_2106084_+|SQE96879.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDTKTLIAAEIAKVVPELEQAAIFNLLETPKNSDMGDLAFPAFSLANVLRKAPQAIASDLAERIDASQFERVAAVGPYVNFFLDKASISAQVLTQVITDGADYGQQDEGQGRHIAIDMSSPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSLAHIFAKMGYKPVKINHLGDWGKQFGMLIVAYKKWGNEAAVQAHPIDELLKLYVKINAEAEADPSLDEEAREWFRRLEEGDQEATELWQWFRDESLIEFNRLYDQLGVSFDSYNGEAFYNDKMDEVLELLEGKGLLVESKGAKVVNLEKYGIEHPALIKKSDGATLYITRDLAAALYRKRTYDFAKSVYVVGNEQAAHFKQLKAVLKEMGYDWSDDMTHVAFGLVTKGGAKLSTRKGNVILLEPTVAEAISRAANQIEAKNPKLANKEAVAHAVGVGAIKFYDLKTDRMNGYDFDLEAMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKASFTPAVDTSYSLNDSESWEIIKLIQDFPRIIKRAFDNFEPSIMAKFAIHLAQSFNKYYAHTRILEDDPERDNRLALCYATAIVLKEALRLLGVEAPNEM >LS483325|2100780:2112341|2100780_2103336_-|SQE96876.1|DBSCAN-SWA MAKTNVSPGMQQYLDIKKNYPDAFLLFRMGDFYELFYEDAVKAAQILEIGLTSRNKNADNPIPMAGVPYHSVQQYIDVLIDLGHKVAIAEQMEDPKQAIGVVKREVVQVITPGTAVDSSRPDSPNNFLVAVDFDGKAYGLSYMDVSTGEFFATDLADFASVKSEIQNLKAREVLLGFELSEEEQAILVKQMNLLLSFETTALEDSPLIDHQLTAVELSAAGKLLHYVHQTQLRELSHLQTLVHYDIKDHLQMSYATKSSLDLLENARTGKKHGSLYWLLNETKTAMGMRLLRAWIDRPLVTSEAILERQEIIQVFLNAFIERTDLSDSLKGVYDIERLSSRVSFGKANPKDLLQLGHTLAKVPYIKAVLEAFNSPYLDKLVNQIDTLPELEHLIRSAIDPDAPATINEGNIIRTGFDERLDHYRKVMREGTGWIADIETKERQASGITNLKIDYNKKDGYYFHVTNSNLGMVPDHFFRKATLKNSERYGTAELAKIEGQMLEAREESSSLEYDIFMCIRAQVETYIDRLQQLAKALATVDVLQSLAVVAEKNHYVRPLFNQESRIAIDNGRHAVVEKVLGVQEYIPNSISFGPQTSIQLITGPNMSGKSTYMRQLALTVIMAQIGSFVAAESASLPLFDAIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMMEANHAIKRATPHSLILFDELGRGTATYDGMALAQSIIEYIHDRVGAKTMFATHYHELTELSTKLTKLVNVHVATLEKDGNVTFLHKIAEGPADKSYGIHVARIAGLPEDLLARADAVLTKLEAQSQARESVLSTTEVRETQQLANQQLSLFTDDGSSSEIIKRLESVDVMNLTPIQAMTVLYELKKLL >LS483325|2100780:2112341|2109652_2110600_-|SQE96884.1|DBSCAN-SWA MIKKTTYRKRVKYLINRGAKKIGLLHAVKSISKEKYTEKISASLLYGILSSIAVNFFFQPGHVYSSGATGLAQVLSAISHRLWGYELPVALAFYVINIPLLILAWYKIGHKFTIFTFITVSMSSFFIQIMPQVTLTTDPLINAIFGGLVMGMGIGTGFKSRISSGGTDIISLTLRKKTGRDVGNLSLMINGVIMVFAGLLFGWQYALYSMVTIFVSSRVTDAIFTKQKKMQATIVTSCPDKVIHMIHKKLHRGVTSINDAEGTYRHEHKAVLITILTREEYSEFKWLMLKTDPNAFVSVAENVRIIGRFVESDED >LS483325|2100780:2112341|2106916_2107525_-|SQE96881.1|DBSCAN-SWA MEALNIQHYALDTAEKNLLTIDSLMLNQGERVFIIGDNGAGKTSFLKTIIGESPDYSGFLQVHGDIAYVPQIKSASPQSGGERAMSYLKEAFQARPSLLILDEPSSYLDHANRDWLINQLKRYRGTLLVVSHDRYLINQLSQKIWLLEHQMIKIYHGNYDDYQRSRQLEEDKQLRAFLEYRRKTNQLKKSLTRKKCRPTKWL >LS483325|2100780:2112341|2107696_2108611_-|SQE96882.1|DBSCAN-SWA MTNHDKRHRVRELLLIAVGVAIYTFGFVNFNMANELAEGGVAGITLILHAHFGINPAYSSLLFNLPLFMLGAKIFGRRSLALTIYGTVLMSVFIWLWQKVPMELGLENDMMLVAVVAGLFAGIGSGLVFRYGATTGGTDIIARIAEEKFGAKLGQTLLFVDALVLTASLTYVDLKHMLYTLVASFVFSQMISVVQNGGYTIRGMIIITKQSQAAAQAILTEINRGVTYLKGQGAYSGNDYNIMYVTLNPTEVREVKRILAELDPDAFISIIDVDEVISSDFKIRRKNFDKPIEKALQKKSNMLK >LS483325|2100780:2112341|2110592_2112341_-|SQE96885.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKRSMYAGHVREEHIGRTIVLKGWVSRRRDLGGLIFIDLRDREGVMQLVINPEDVSGDVMATAERLRSEYVIEVEGSVEARQQANDKLATGAVELKVSGLTILNTAKTTPFEIKDGVEVSDDTRLRYRYLDLRRPEMLESFKLRAKTTHVIRNYLDNLGFIDVETPMLTKSTPEGARDYLVPSRISQGHFYALPQSPQITKQLLMNAGFDRYYQIVKCFRDEDLRGDRQPEFTQVDLETSFLSEQEIQDIVEGMIAKVMKDTKGIEVKLPFPRMAYDDAMNHYGSDKPDTRFDMLLQDLTDLVKEIDFKVFSEAQAVKAIVVKGHADDYSRKDIDKLTEFAKQFGAKGLAWLKVVDGAFTGPIAKFLTGLESKLTEALHLEHNDLILFVADTLEVANNTLGTLRTRIAKELDMIDMSQFHFLWVVDWPMFEWSEEEERYMSAHHPFTLPTQESAHELEGDLAKVRAVAYDIVLNGYELGGGSLRINQKDMQERMFKALGFTKEEASDQFGFLLEAMEYGFPPHGGLAIGLDRLVMLLAGKDNIREVIAFPKNNKASDPMTQAPSLVSEKQLEELQLQIECHD >LS483325|2100780:2112341|2108754_2109696_-|SQE96883.1|DBSCAN-SWA MLESLVALSNQMKTKEIGINMPANKSLKLKNCCFIILGSAIYAFAFVYFYMANRIAANGLAGLTQVANALFQINPSITGYLINLPLVLLGARLFGRRAMVYTVTGILSLYWFVWLFQQLPLFIDLNHDNLVVSLLAGILGGLGGGIVFRNGGTIGGSDIIAKLIEDRFGLQLNQALLGIDIFVMVVSLTYISIPQMMYALIASFMYSRIVHLVQNGGYSARGTFIISDYSQAISEFIMEELGRGVTYLHGEGAYSGREKRVIYVALGRSDVRELKAFIAQVDPNAFVSFFDVNEVNSPEFIATKSKYHKTKKR >LS483325|2100780:2112341|2103671_2104109_-|SQE96878.1|DBSCAN-SWA MNKIERQQQIKQLIQAEHIGTQEEIRRLLQKDGIVVTQATLSRDLREIGLLKLRDDRGKLYYSLSEPVATPFSPDVRFYVLKVDRAGFMLVLHTNLGEADVLANLIDNDAIEDVLGTIAGADTLLVICRDEEIAKRFEKDLAAGL |
10 | Streptococcus_phage(42.86%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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