Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483361 | Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis strain NCTC6179 genome assembly, chromosome: 1 | 2 crisprs | DEDDh,csa3,DinG,csm6,csn2,cas2,cas1,cas9,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 | 0 | 9 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483361_2 | 1234708-1235272 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of LS483361_2
|
8 spacers
spacers of LS483361_2
>2.1|1234744|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT CTAAAACGGCCAAGTTCATTGAGCTTCCTA >2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGTGGTTGCCTTGGCTCAAATGAGTAAGTA >2.3|1234876|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGAAGCGAAGTGTTTATCGAGAAAGGATAC >2.4|1234942|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TTTGCGAAAGTTACTCTATCATATTGTCGA >2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATGCACGCTAACTGCCGCAGCACATTTGCT >2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TGCTTGCCATCTGAGCCTTTATCGCCGTAA >2.7|1235140|31|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CACTCTCGGTGTCGTCATCAAGATAGACGGT >2.8|1235207|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ACACTCGATGCTTCACCCTACCGTGCAACC |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483361_2
The CRISPR arrays of LS483361_2 >merge|LS483361|2|1234708-1235272|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAATTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAACCTAAAACGGCCAAGTTCATTGAGCTTCCTAGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAACTGTGGTTGCCTTGGCTCAAATGAGTAAGTAGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAACTGAAGCGAAGTGTTTATCGAGAAAGGATACGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAACTTTGCGAAAGTTACTCTATCATATTGTCGAGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAACATGCACGCTAACTGCCGCAGCACATTTGCTGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAACTGCTTGCCATCTGAGCCTTTATCGCCGTAAGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAACCACTCTCGGTGTCGTCATCAAGATAGACGGTGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAACACACTCGATGCTTCACCCTACCGTGCAACCGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC >LS483361|2|2|1234708-1235272|CRISPRCasFinder GAATTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC CTAAAACGGCCAAGTTCATTGAGCTTCCTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TGTGGTTGCCTTGGCTCAAATGAGTAAGTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TGAAGCGAAGTGTTTATCGAGAAAGGATAC GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TTTGCGAAAGTTACTCTATCATATTGTCGA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC ATGCACGCTAACTGCCGCAGCACATTTGCT GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TGCTTGCCATCTGAGCCTTTATCGCCGTAA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC CACTCTCGGTGTCGTCATCAAGATAGACGGT GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC ACACTCGATGCTTCACCCTACCGTGCAACC GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC >LS483361|2|1|1234708-1235272|CRT GAATTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC CTAAAACGGCCAAGTTCATTGAGCTTCCTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TGTGGTTGCCTTGGCTCAAATGAGTAAGTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TGAAGCGAAGTGTTTATCGAGAAAGGATAC GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TTTGCGAAAGTTACTCTATCATATTGTCGA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC ATGCACGCTAACTGCCGCAGCACATTTGCT GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TGCTTGCCATCTGAGCCTTTATCGCCGTAA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC CACTCTCGGTGTCGTCATCAAGATAGACGGT GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC ACACTCGATGCTTCACCCTACCGTGCAACC GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC >LS483361|2|1|1234774-1235272|PILER-CR GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TGTGGTTGCCTTGGCTCAAATGAGTAAGTA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TGAAGCGAAGTGTTTATCGAGAAAGGATAC GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TTTGCGAAAGTTACTCTATCATATTGTCGA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC ATGCACGCTAACTGCCGCAGCACATTTGCT GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC TGCTTGCCATCTGAGCCTTTATCGCCGTAA GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC CACTCTCGGTGTCGTCATCAAGATAGACGGT GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC ACACTCGATGCTTCACCCTACCGTGCAACC GTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTAAAAC
>LS483361.1|SQF67113.1|1234132_1234591_-|nucleoside-diphosphate-kinase MEQTFFMIKPDGVKRGLVGEVLRRIERRGFTFDRLELRQASPELLAKHYEALVTKPFYPELEAYMTSGPVLIGVLSGNRVISSWRTMMGVTNPKDALPGTIRGDFAQAPGDDGGIFNVVHGSDSRDSARREIALWFNQAELDSSAIFPKDNQ >LS483361.1|SQF67112.1|1232230_1234063_-|GTP-binding-protein-LepA MNSQDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRHEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGDVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGIVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYVAASIKTVADTRVGDTVTLANNPAKEALHGYKQMNPMVFAGIYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVHTTDGDMIEVSNPSEFPDPTRVASIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELSQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYEISEYRKSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKIIVEKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKSIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDAKK >LS483361.1|SQF67111.1|1231618_1232056_-|methionine-sulfoxide-reductase-B METKDDLKKRIGDLSYEVTQHAATERPFTGKYDDFFEKGIYVDIVSGEVLFSSLDKFNSGCGWPAFSKPIENRMVTNHDDSSYGMRRVEVKSREAGSHLGHVFSDGPQEAGGLRYCINSAALKFIPYEQMEKEGYAQWLTLFDEK >LS483361.1|SQF67110.1|1230955_1231606_-|metal-dependent-phosphohydrolase MTEKEAQLLAQAEAWVKEKLAADASGHDFWHVNRVCRLAKIIAQEEEGDVFICQLAALLHDMADDKLNADPKKARQDILTWLAGHDVSQKQSDQVMTIIDTISFKGGHGKPLTNLEAKIVQDADRLDAIGAIGIARCMAYSGHTGRLIHDPDRLPRETMTVEEYRKDGTAIMHFHEKLLTLKERMNTAYGRQLAEHRHQVLVSYLDEFYAEWDGLR >LS483361.1|SQF67109.1|1230422_1230719_-|putative-sakacin-P-immunity-protein MSRLNWFSGANERQQQASLLIKDLVADLKQSGGKEPLQKVLLSFDEELKRGESSIPFILSRMTVAVSTVLKEHQITLSAKESAQLDDLYALLQIRYGY >LS483361.1|SQF67108.1|1229063_1230233_-|Predicted-lipase MATLLDYIKTNGNRDYHSLALNELDVAVINEIGYLAFDELVADDNHLEATIKLSQLPLLQTREIKGAPYDFLNTKERLDLFQMMCQSKRFSELTLSHYINDINTEFEKQFAAMVFRLPSIDYTQLVFRGTDDSLIGWKEDFKLTYMREIPAHRSAIDYLKSYHTYYPNQKLVLSGHSKGGNLALYAASFVPKNVQASLKDIYLFDSPGLIKEFLTHPGYQAIRRRLVVIKPQDAIIGVMLYCDVPEKIVQSQSYGLFQHQMVNWQITPNAQFKRVPKRSALSYDLEETFKDWTNQLSKQDLKLLCDTFFDCLASTGITSLNAFSIDDKAFLTLMRVISSLQSIDHEKKKVMVKSLDQLMVTYGSYRRRDISENIHNHLQQLLALTKGIK >LS483361.1|SQF67107.1|1227934_1228954_-|hypothetical-membrane-spanning-protein MSTYLRKLPGLLLCLLLALPAWYLGRLFPIIGAPVFAILLGMLLALFYHNSDKTKEGISFTSKYILQTAVVLLGFGLNLTQVMAVGMQSLPIIVSTIATALLVAYGLQKWLGLDVNTATLVGVGSSICGGSAIAATAPVIKAKDDEIAKAISVIFLFNILAALLFPSLGQLLGLSNEGFAIFAGTAVNDTSSVTATATAWDAIHHSNTLDGATIVKLTRTLAIIPITLGLSLYRAKKEHEIVTEEGFSLSKSFPPFILFFLLASLITTLMTSFGVSADVFHSLKELSKFFIVMAMAAIGLNTNLVKLIKTGGQAILLGAICWVAITLVSLGMQFALGIW >LS483361.1|SQF67106.1|1227302_1227728_-|PTS-system-mannose-specific-transporter-subunit-IIA MKRKFLIGSHGRLASGLQSSIDILAGMGQSLEIIDAYVDDSDYTSQIDDFIAGVAADEQGLIFTDLLGGSVNQKMVTAVMASGKDNIFLITNSNLATLLSVMFLNPDEALTKDEIVTVINESQVQLVDLSPATDSEDDFFD >LS483361.1|SQF67105.1|1226792_1227284_-|PTS-system-mannose/fructose-family-transporter-subunit-IIB MITQIRVDDRLIHGQVAVVWTKELNAPLLVVANDEAAKNEITQMTLKMAVPNGMKLLIRSVEESIKLFNDPRAKDKRIFVIVNSVKDACAIAKEVPDLEAVNVANVGRFDKSDPASKVKVTPSLLLNPEEMAAAKELASLPNLDVFNQVLPSNTKVHLSQLVN >LS483361.1|SQF67104.1|1225967_1226777_-|PTS-system,-mannose-specific-IIC-component MLVPATMAALAVLICFGGNYLTGQSMMERPLVVGLVTGLLLGDMKVGILMGASLEALFLGNVNIGGVIAAEPVTATAMATTFTIISHIDQKAAMTLAVPIGMLAAFVVMFLKNVFMNIFAPMVDKAAEANHQGQLVMLHYGTWIIYYLIIASISFIGILVGSGPVNAFVEHIPQNLMNGLSAAGGLLPAVGFAMLMKLLWTNKLAVFYLLGFVLTAYLKLPAVAVAALGAVICVISSQRDLELDAITKGAFSNQTSFDSKESEEEDFFA >LS483361.1|SQF67114.1|1235373_1236036_-|CRISPR-associated-family-protein MNLNFPLLDEPIPLRGGTILVLEDVCVFSKIVQHCYQYEEDSELKFFDHKMKAIKESEIMLVTDILGFDVNSSTILKLIHADLESQFNEKPEVKSMIDKLVATITELIVFECLENELDLEYDEITILELIKSLGVKVETQSDTIFEKCLEILQIFKYLTKKKLLIFVNSGAFLTKDEVASLQEYISLTNLTVLFLEPRELYDFPQYILDEEYFLITKNMV >LS483361.1|SQF67115.1|1236025_1236337_-|CRISPR-associated-Cas2-family-protein MFDMPTDTAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSIYSKLLLNNTANNAMIGRLREHNPHKGNITLLTVTEKQFARMIYLHGERNNCIANSDERLVFLGEAFDES >LS483361.1|SQF67116.1|1236363_1236729_-|cytoplasmic-protein MEHPINAGLDYGYTLLLSMFAREVVVSGCMTQFGLKHANQFNQFNFASDIMEPFRPLVDKIVYENRNQPFPKIKRELFTLFSDTFVYNGKEMYLTNIVSDYTKKVVKALNNEGKGVPEFRI >LS483361.1|SQF67117.1|1236735_1237233_-|cytoplasmic-protein MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDAYKTELIHLSEIDILLLETTDIVLSTMLVKRLVDENVLVIFCDDKRLPTAMLMPFYGRHDSSLQLGKQMSWPEAVKSEVWTTIIAQKILNQSCYLGACSYFEKSQSIMDLYHGLENFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDF >LS483361.1|SQF67118.1|1237232_1241348_-|CRISPR-associated-protein MDKKYSIGLDIGTNSVGWSVITDDYKVPSKKMKVLGNTGKQTIKKNLLGALLFDSGETAEATRLKRTARRRYTRRKNRIRYLQEIFANEMAKVDDSFFHRLEESFLVEEDKKHERHPIFGNIADEVAYHEKYPTIYHLRKKLADSTDKADLHLIYLALAHMIKFRGHFLIEGDLNPDNSDVDKLFIQLVQTYNQLFEENPINKSGVDAKAILSARLSKSRRLENLIAQLPGEKRNGLFGNLIALSLGLTPNFKSNFDLAEDAKLQLSKDTYDDDLDNLLAQIGDQYADLFLAAKNLSDAILLSDILRVNSEITKAPLSASMIKRYDEHHQDLTLLKALVRQQLPEKYKEIFSDQSKNGYAGYIDGGASQEEFYKFIKPILEKMDGTEELLTKLNREDLLRKQRTFDNGSIPHQIHLGELHAILRRQEEFYPFLKENREKIEKILTFRIPYYVGPLARGDSRFAWMTRKSDEAITPWNFEEVVDKGASAEAFIKKMTNFDEYLPTEKVLPKHSLLYEYFTVYNELTKVKYVTEGMRKPEFLSGKQKEAIVDLLFKTNRKVTVKQLKEDYFKKIECFDSVEISGVEDRFNASLGTYHDLLKIIKDKDFLDNEENEDILEDIVLTLTLFEDKEMIEERLKKYANLFDDKVMKQLKRRHYTGWGRLSRKLINGIRDKQSGKTILDFLKSDGFANRNFMQLINDDSLTFKEAIQKAQVSGQGHSLHEQIANLAGSPAIKKGILQTVKIVDELVKVMGHKPENIVIEMARENQTTQKGQKNSRERMKRIEEGIKELGSQILKEHPVENTQLQNEKLYLYYLQNGRDMYVDQELDINRLSDYDVDHIVPQSFIKDDSIDNKVLTRSDKNRGKSDNVPSEEVVKKMKNYWRQLLNVKLITQRKFDNLTKAERGGLSELDKAGFIKRQLVETRQITKHVAQILDSRMNTERDENHKTIREVKVITLKSKLVSDFRKDFQFYKVREINNYHHAHDAYLNAVVGSALIKKYPKLESEFVYGDYKVYDVRKMIAKSEQEIGKATAKRFFYSNIMNFFKIEITLANGEIRKRPLIEVNEETGEIVWNKEKDFATIRKVLSMPQVNIVKKTEVQTGALTNESIYARGSFDKLISRKHRFESSKYGGFGSPTVTYSVLVVAKSKVQDGKVKKIKTGKELIGITLLDKLVFEKNPLKFIEDKGYGNVQIDKCIKLPKYSLFEFENGTRRMLASVMANNNSRGDLQKANEMFLPAKLVTLLYHAHKIESSKELEHEAYILDHYNDLYQLLSYIERFASLYVDVEKNISKVKELFSNIESYSISEICTSVIDLLTLTATGAPADFKFLGTTIPRKRYGSPQSILSSTLIHQSITGLYETRIDLSQLGGD >LS483361.1|SQF67119.1|1241800_1241971_-|degenerate-transposase MSVQKSDFDTEFGHLEGDTIVGKHHKRAVVTLVEKQSKAIITLQTNGRKATTLSSH >LS483361.1|SQF67120.1|1241951_1242410_-|putative-transposase MTYTHLTTTELVMIEAYYKEGITVSNICQSLKRSRQTIYKVIAYLKAGHTAYDYYKDYKANKKRCGRRQTQITQSEQDFIQRHLELNSSLDVVKGTYPDKIPCSMRTLYRLADRGIFKKEDLPWKGKHQPNGMAEKRGKQAFRRDIRERSEI >LS483361.1|SQF67121.1|1242798_1244271_-|Phage-associated-cell-wall-hydrolase MLHKEKPDYNRNQYGFYTLDQLVPDEHFLRQVEAVIDFNFIYDLVEDTYSSDNGRPSLDPVILVKIPLIQCFYGIRSMRQTIKDIEVNTAYRWFLGLTLDDKVPHFTTYGKNYSRRFQEKGLIESIFTHILGLCINTGLIDPTEIFIDGTHIKAAANNRKFINREVEKQAKFMSEQLEIEINRDREKHGKKPLGPAKELGPVAKKISTTDPESGWFHKGDHKEVFAYSAQVACDKYGWALAYSVEAGNIHDSQAFPALFAKLEPLKPQFIIADSGYKIPSIAKFLIDKEITPVLPYIRPRGKKDLLRPKEFIYDEHFDCVICPEHQALTYRTTTREGYREYKSDPVICANCPLLSVCTTSKNHQKVVTRHIWKDYLEQCEDIRHQRGMKELYQHRKETIERLFGTAKEYHNLRYTREKGKSKMEDKVGLTLACLNLKKLVKRMAGEPFYFVQMRWFKRGNSHFYLKTLKKTNTKSMFVFNLNKRFENACF >LS483361.1|SQF67122.1|1244432_1245062_-|hypothetical-membrane-spanning-protein MVENIKLFCSWLWLLALAILMTIYSAWLWYPLEVEYLKLEQVVFMSKDAILHNYNGLLNYLTNPFETSLTFASFRSSTDGLKHFADVKWLFHLTQVIFLGLLYTTVKDFKQRFKTKSFWSIQRPLMIAALFPLMIGLMASVIGFENFFILFHKVLFVRDSNWLFDPLKDPVIWILPEVFFLHCFLFFMTVYEIILWSLVGLARWQRPKI >LS483361.1|SQF67123.1|1245061_1245826_-|haloacid-dehalogenase-like-hydrolase MPYKGYLIDLDGTIYQGKNRIPAGERFIKRLQEKGLPYLLVTNNTTRTPEMVQDMLSKQFNVETGIETIYTATMATVDYMNDMNRGKTAYVIGETGLKSAIAAAGYVEELENPAYVVVGLDSQVTYDMLATATLAIQKGALFIGTNPDLNIPTERGLMPGAGALNALLEAATRVKPIFIGKPNAIIMNKSLEVLGVKRSEAVMVGDNYLTDIMAGIQNDIATILVTTGFTRPEEVPTLPVQPDHVLSSLDEWEL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483361_3 | 1565020-1565192 | TypeI |
I-C
Consensus repeat of LS483361_3
|
2 spacers
spacers of LS483361_3
>3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder GATGGACTACATCGAGACGGAATTTGATGTAAAA >3.2|1565124|33|LS483361|CRISPRCasFinder ACTGCAATCACTTTTTGGCATTCCCAAAGTAAC >3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR GATGGACTACATCGAGACGGAATTTGATGT >3.4|1565137|30|LS483361|PILER-CR ACTGCAATCACTTTTTGGCATTCCCAAAGT |
cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483361_3
The CRISPR arrays of LS483361_3 >merge|LS483361|3|1565020-1565192|CRISPRCasFinder,PILER-CR TAGGATGCAATCCACTCACCCGCGAAGGGTGAGACGATGGACTACATCGAGACGGAATTTGATGTAAAACCTATTTCAATCCACTCACCCGTGAAGGGTGAGACACTGCAATCACTTTTTGGCATTCCCAAAGTAACCCTATTTCAATCCACTCACCCGTGAAGGGTGAGACT >LS483361|3|3|1565020-1565191|CRISPRCasFinder TAGGATGCAATCCACTCACCCGCGAAGGGTGAGAC GATGGACTACATCGAGACGGAATTTGATGTAAAA CCTATTTCAATCCACTCACCCGTGAAGGGTGAGAC ACTGCAATCACTTTTTGGCATTCCCAAAGTAAC CCTATTTCAATCCACTCACCCGTGAAGGGTGAGAC >LS483361|3|2|1565027-1565192|PILER-CR CAATCCACTCACCCGCGAAGGGTGAGACGATGGACTACAT CGAGACGGAATTTGATGTAAAACCTATTTC AATCCACTCACCCGTGAAGGGTGAGACACTGCAATCACTT TTTGGCATTCCCAAAGTAACCCTATTTCAA TCCACTCACCCGTGAAGGGTGAGACT
>LS483361.1|SQF67427.1|1563937_1564897_-|oxidoreductase MAKVRYGIVSTAQVAPRFIEGVRLAGNGEVVAVSSRSLDKAKAFATAHQLPKAYGSLDDMLLDVSIDAIYVASINQDHFPAAKKALLAGKHVLVEKPFTLTAAQAEELFALAQERGLFLMEAQKAVFIPMTQRLKGLIAAGELGDIVSVSSTTAYPNIDHVTWFRDLEKGGGTVHFMAPYALSYLPYLFDADIVSASGVAHFPKGQSDSQSKLILALSNGVLVDIFLTTHLSLPHELVIYGTKGRLEIPHFWKTTHATLVRPDGSRSVIEATMSSDFEAEAHHVSQMILEGQLTSPVMTKSLTLSGVGLIEKLYRSWGK >LS483361.1|SQF67426.1|1562913_1563846_-|magnesium-and-cobalt-transport-protein MPILPKASSAITLINLDQLTEHDQEALVSEGLIDAEVFDYAKDKNETSFMEENKEKLTIVFQILDRQEEAYHPNHIPRVIPITLFLNDQSLYILGHDHSLALIEEVFPDLDESRSPRHLVFQLLTAFTKQYVPLMDEIAQQRDKLIEALRQKANKTNLESLANLQSGTVYILMGSKQNEQMLAELKNMPGQQDLEEDEAEQLRDTIIEARQLSNMCDLNTRVLKEISSSYNNVLSNNLNNNVTSLTIFSIGISIIAMVTSFYGMNVKLPFAKVDSVWFWIVLTTSLVALLIMVVMYWYVHKRNRNASKRI >LS483361.1|SQF67425.1|1561983_1562694_-|cytochrome-c-type-biogenesis-protein MTLSIVLIASVFAAGLLSFFSPCIFPVLPVYLGILLDADDSRTMTIFGKKLYWYGIVKTLAFIFGLSTIFVILGYGAGFLGNILYAVWFRYLLGALVIILGIHQVGLITIKRLQFQKSLTFHNDKNRNGLLNVFILGLTFSFGWTPCVGPVLSSVLALVASGGSGAWQGGLLMIVYTLGLGIPFLLLSFASGFVLKHFNKLKPHMLLLKKVGGVLIIIMGILLMTGTLNNLAQLFG >LS483361.1|SQF67424.1|1561347_1561971_-|disulfide-interchange-protein MKKGLLVTTGLACLGLLTACSAQDNMAKKEMTQDKMSVATKTNDKMSTSKDKSMMTDKSSDKKMTNEGPRAPDFELKSVDGKTYRLSDLKGKKVYLKFWASWCSICLSTLADTEDLAKMSDKDYVVLTVVSPGHQGEKSEADFKKWFQGTDYRDLPVLLDPDGKLLEAYGVRSYPTEVFIGSDGVLAKKHIGYAKKADIQKNLKAIH >LS483361.1|SQF67423.1|1560201_1561308_-|bifunctional-methionine-sulfoxide-reductase-A/B MEHKWKLLLFIVGVVVLIGGASILIQRGQAKAFSQGKPQLPAKKVKSTKLDPNVPVDQKVIYLAGGCFWGVEEYFSQVDGVLDAVSGYANGRGDTTNYQLIHQTGHAETVEVTYDANRVSLKELLLHFFRIIDPTSVNKQGNDRGSQYRTGIYYTDKADLAVIDEVFKEKAKDYKKKIVVEKAPLKHFIKAEEYHQDYLKKNPNGYCHIDINQATYPVIDESKYPKPSAAEIKAKLSADEYRVTQKNETERAFSNRYWDSFEAGIYVDVVTGEPLFSSKDKFESGCGWPSFSRPISPDVIRYKEDKSFNMTRTEVRSRSGNSHLGHVFTDGPKDQGGLRYCINSLAITFIPKADMEAKGYGYLLSSVE >LS483361.1|SQF67422.1|1559373_1560114_-|two-component-response-regulator MYSLLIVEDEYLVRQGIRSLVDFSQFKIDRVNEAENGQLAWDLFQKEPYDIVLTDINMPKLNGIQLAELIKQESPQTHLVFLTGYDDFNYALSALKLGADDYLLKPFSKADVEDMLGKLQQKLDLSKKTETIQELVEQSPKEVSELAMAIQGQLADSRLTLKSLAHQLGFSPNYLSVLIKKELGLPFQDYLVQERLKKAKLLLLTSDLKIYEIAEQVGFEDMNYFSQRFKQLVGMTPSQYKKGGRA >LS483361.1|SQF67421.1|1557643_1559377_-|two-component-sensor-kinase MRRYPLLVQLISYVFVMVLALITTLGLLYYQTSSRNIRQLIERDTRQSIRQSSQFIDAYIKPLKETTSVLAKNSEIQDFASQIHQEDDKQVLQLMEMVLATNSDLQAAVLVTKDGRTVSTNPQLTMKTSSDMMAETWYKAAIDRQAMPVLTPARQLSLSSKKEWVVSVTQEVVDRAGHNLGVLRLDIAYPTIKASLDQLQLGRQGFAFIVNDKHEFVYHPKKSVYSSSREMAAMKPYLAIKNGYAKDKSSFVYQRVIPNSQWTLIGVASLDQLHRVQRQIFWSFLGMGLLACLICGLTTILVLRKWIRPIQQLQQVILAIQKGNRQLRAQETGSPELTDLAHQFNALLDQIDSLMVAVADKEKAIGQYRLQALASQINPHFLYNTLDTIIWMAEFNDSKRVVEVTKSLAKYFRLALNQGNDYIRLADELDHVSQYLFIQKQRYGDKLTYDVQGLDAYADFVIPKLILQPLVENAIYHGIKEVDRKGMIKVTVSETAQHLILTVWDNGKGIEASALTNSQSLLTRGGVGLKNVDQRLKLQYGEAYQMIIQSQSDQFTEIQLSLPKRHELMADDTQENE >LS483361.1|SQF67420.1|1556491_1557571_-|cytoplasmic-protein MSLATDYFSRQTPIVEKLMAYGFEKRDNGYFYNERFMEEEFEAQLRIDKAGNIWDRVIDCDLEEDYLPLQQAAWQGTYSGQVRAAYLELLERLSVACFEATPFQSMQANRLAKRITKEWSDPMDYPFEKHPDLATYRVGGKWYAMIFSLLADKLDQIPERLVGQTCEVMTVKVNPKDLHQLLQQEGIYPAYHMSKNNWVSVVLDDKVTDDQLLGLVIQSRQLVNPNGLSNPNGPDYWVIPANLKYYDIDAEFAANDVILWTQKAGIAVGDYVLIYMTAPVKSIRYACQVLETNIPNQGYRKNPNIDKLMRLRKCQQYEDGLLSFDLMKEHGVAAVRGPRRLSPQLIAFLKEKEYLKGNN >LS483361.1|SQF67419.1|1555752_1556469_-|B3/4-domain-containing-protein MVQFVADQSFWELFPDAKLGVILLKDVQNQGESPEDVKQLLADSHELAKAYLTADNFSDNQVVQVYRKAYQQFKTKKGARSSIEALLKRVANGQTIPSINPLVDIYNAASLRFGLPVGAEDSDSFTGDLRLTVTDGGDDFYLIGDADNNPTLPNELCYKDDIGAVCRCLNWRDGERTMVTEHTKNAFLIIEALDQEGQNRLQHALDFIEGSAKMYLHAITSLHVLDKDNPHVPLFTEN >LS483361.1|SQF67418.1|1555116_1555590_+|arginine-repressor MNKKETRHQLIRSLISETTIHTQQELQERLRKNGITITQATLSRDMKELNLVKVTSGNDTHYEALAISQTRWEHRLRFYMEDALVMLKVVQNQIILKTLPGLAQSFGSILDAMQIPEIVATVCGDDTCLIVCEDNEQAKACYETLSHYTPPFFFSNK >LS483361.1|SQF67428.1|1565339_1565633_-|hypothetical-cytosolic-protein MMVLVTYDVNTETSAGRKRLRHVAKLCVDYGQRVQNSVFECSVTPAEFVDIKHRLTQIIDGETDSIRFYLLGKNWQRRVETLGRSDSYDPDKGVLLL >LS483361.1|SQF67429.1|1565643_1566669_-|DNA-polymerase MKKLLNTLYLTQEDFYVTKEGDNIVIKQEGKVLKRFPFRIIDGIVCFSYLGVSPALVKLCTENQINLSFHTPQGRFCGRYIGSTNGNVLLRREHYRLSDREESLEYAKRFILAKISNSRKYLLRFKRDHRQQIDTRLFEAVNEELLWALEMVQAADNKDSLRGIEGQAANQYFRIFNDLVLTDKKTFQFQGRSKRPPLDCVNTLLSFGYSLLTFECQSALEAVGLDSYVGFFHTDRPGRASLALDLVEEFRSYIVDRFVFSLINKGQLQKKHFEVKENGSILLTENGRAIFIDLWQKRKHTEVEHPFTKEKVKLMLLPYVQAQLLAKAIRGDLESYPPFMV >LS483361.1|SQF67430.1|1566665_1567340_-|RecB-family-exonuclease MVYAEDDYLMLSGIQHFQFCKRQWALIHIEQQWLDNEATAHGEILHTKADNPYIKEKRKDLLVSRAMSISSGELGLSGIMDVVEFYKDDQGVSLRGKRGKWLPKVVEYKRGKPKKDTRDIVQLVAQTMCLEETLGCHINEGCLYYHSVNQRVTVEMTSALRQEVRELATEMHEVYQSQMLPKAEYFKNCQLCSLVDICKPRLSKKTRSVSRYINEAMISEEMTL >LS483361.1|SQF67431.1|1567341_1568190_-|putative-cytoplasmic-protein MLEHKIDFMVTLEVKEANANGDPLNGNMPRTDAKGYGVMSDVSIKRKIRNRLQDMGKPIFVQANERIEDDFRSLEKRFSQHFTAKTPDTEIEEKANALWFDVRAFGQVFTYLKKSIGVRGPVSISMAKSLEPIVISSLQITRSTNGMEAKNESGRSSDTMGTKHFVDYGVYVLKGSINAYFAEKTGFSQEDADAIKEVLVSLFENDASSARPEGSMRVREVFWFTHSSKLGNISSARVFDLLEYHQSIEEKSTYDAYQIHLNQEKLAKYEAKGLTVEILEGL >LS483361.1|SQF67432.1|1568194_1570087_-|CRISPR-associated-protein,-Csd1-family MDFFTSLLKTYEKAELADLVDHQKRDNEPVLLPIYHTSLKSNGKNIISVKLDKDGQFHKAEFMADKQMIIFPVTADSVARSGSNPAPHPLVDKFAYYSAEVDQSQYDSFHKQLNNWIDYCEEGDVKRFLTIVQQFILKPEFLTSILDSLIGPDYQNNQLKITFCDVTGKEKLIDLSACFLEFSIDQFQGFKNESISTFKALHQSYISFVEANRENLGICNISGREEQLTDKHRGLMGNAKVISVSNKREAYKGRFREREDVFSVGYETSEKIHLMIKYLLENKNTSTWLGSSQYLINWFSDDLTNDSRLDIVSPTFDDGLEEDDDDTSPVIALASEDNKRIGKSFIKGQKLFANDATYYVAILNKTSNGRIALKYFRQLQASQLLTNLDKWQEKYSWESRSKFGKSRLRTPTFHDILNVSYGVDRDRFLELDNDNFKSDQVQKLVTSLIDGKPMPQSIVKKLGSNIKERHRYRKHWYQVEQVCLAILHKQNGEEFSPMLDHTNQNRSYLFGRLLAIFELIETLRYGLDGTDSDRITNAERYWTAYTGQPTKLMMLLENKIKPYEEPLKLNRRGSWKKLEKEKEEILELLNPLLETETMEKPLDYRFIFGYYAEKNYYYTKQNTEVTESEE >LS483361.1|SQF67433.1|1570086_1570815_-|CRISPR-associated-protein-cas5 MYRSRDFYVRVSGQRALFTNPATKGGSERASYSVPTRQALNGIVDAIYYKPTFTNIVTEVKIINQIQTELQGVRALLHDYSADLSYVSYLSDVVYLIKFHFVWNEDRKDLNSDRLPAKHEAIMGRSICKGGRRDVFLGTRECVGLVDDISQEEYEAAVSYYNGVNIDLGIMFHSFAYPKDKKTPLKSYFTKTVMKNGVIMFKAQSECDIVNTLSSYAFKAPEEIKSVNDEYMEYDAMEKGEN >LS483361.1|SQF67434.1|1570946_1573373_-|CRISPR-associated-helicase-Cas3 MMTKETLAHYQKKTEQESEKKQSLDEHLWHVACSSRQEASIIGQGDVLFLIGLYHDLGKSDRAFQDKLLNNPNRHVDHSYAGAKYLCSIIGPHLKNRGVDKNERMTFNEMVGYVISAHHGMYDLCYYSDDAEYYSFNKFKNRINRDLDGYHYHEDIKGYALKLEEKLCDYGYKDLRELIDKAFDNYRQAMSSLNWQDKSEWDYYQSCMVRLYLSLLKNADILDTVNAYGLKVSPMDKIERSFLKHSYLAAIEQKYASFGRPNNQLNIIRTEIAERVRERGKRDSKGIYRLDLPTGAGKTNLSMRYAFHQLVHQDKSRFFYITPFLSVLEQNASEIRKVTGDRGVLEHHSNVVKQANEDDDDKNNLLSAYLSDSWDSQVVLTSMVQFFQTLFKTKSANLRRFSSLINSVVILDEVQSLPIEVTSLFNLTMNFLNKVMNTTIVLCTATQPAYDSSEIDHRICYGGNLGESAEIVELTIEEKQIFSRTELRKFDDNNQKVHLTDVINLILGEENSVLTIFNTKKTVNSCYTMLKDMTDRPVYQLSTNMCAQHRLDLIAKIKTELQNNIPIICISTQLIEAGVDVDFHRVIRSYSGIDSIVQAAGRCNREGKRDKGQVTLVNLTNEEENISRLTEIKAKKEGTESILHKIGSPIDISTLNRDFFEYYYANNQGLMDYPLEDNISIYDYLSLNTYQTVNKKFKGKLKQAFKTAGAKMNLINNDMIGILVPYGVAKKKLAYLEELGAPHFLSVEDYQTIKSLLKELQPFTVNVRENDPLLEATKSYLNGQILVLTSEYYDTKRGVKYDSASFYF >LS483361.1|SQF67435.1|1573640_1576289_-|valyl-tRNA-synthetase MTELSPKYNPAEVEAGRYQKWLAADVFKPSGDQKAKPYSIVIPPPNVTGKLHLGHAWDTTLQDIIIRQKRMQGFDTLWLPGMDHAGIATQAKVEERLRGQGITRYDLGREKFLDKVWEWKDEYATTIKEQWGKMGLSVDYSRERFTLDEGLSKAVRKVFVDLYKKGWIYRGEFIINWDPAARTALSDIEVIHKDVEGAFYHMNYMLEDGSRALQVATTRPETMFGDVAVAVNPEDPRYKDLIGKHVILPIVNKLIPIVGDEHADPEFGTGVVKITPAHDPNDFEVGQRHNLPQVNVMNDDGTMNELAGDFAGMDRFEARKATVAKLEELGALVNIEKRVHSVGHSERSGAVVEPRLSTQWFVKMDELAKQAMDNQETDDRVDFYPPRFNDTFLQWMENVHDWVISRQLWWGHQIPAWYKAEGEIYVGEEAPEGDGWTQDEDVLDTWFSSALWPFSTMGWPDTDSEDFNRYFPTSTLVTGYDIIFFWVSRMIFQSLEFTGRQPFQNVLIHGLIRDEEGRKMSKSLGNGIDPMDVIEKYGADALRWFLSNGSAPGQDVRFSYEKMDASWNFINKIWNISRYILMNNEGLTLEEAESNVAKVAASEAGNVTDQWILHNLNETIAKVTENFDKFEFGVAGHILYNFIWEEFANWYVELTKEVLYSDNEAEKVITRSVLLYTFDKILRLLHPIMPFVTEEIYAQYAQGSIVTAAYPTVTPAFENEAAHKGVESLKDLIRAVRNARAEVNVAPSKPITILVKTADSELEDFFNSNINYIKRFTNPEKLEISSAIAAPELAMTSIITGAEIYLPLADLLNVEEELFRLDKELAKWQKELDMVGKKLGNERFVANAKPEVVQKEKDKQADYQAKYDATQERIVEMKKLVG >LS483361.1|SQF67436.1|1576290_1576854_-|shikimate-kinase MNLIIIGAQASGKMTIGQEIAKQTGMTLFHNHDSIDFVLRFMPWSQESTALIERLRFNFFETFAKNGQEMIFTIVIDFNDPNDVAFLEKIQAVFQSYDQEVLFVELETDVNERLKRNRTENRLKHKPLKRNIEWSEQDIQSTMAYAVFNPSEPPKTLTHYQKINNTHLTAAETAQLIIQKMTHIKEN >LS483361.1|SQF67437.1|1576850_1577441_-|GNAT-family-acetyltransferase MIVKMLEAYSGKALPKVETERLVLRQRKLEDAEDIFAFAKLAEVSYPAGFPPVKSLADEITYLQDIYPANLEKEGLPSGYGITLKGDDKVIGSIDFNHRRADDVFEIGYLLHPDYWGQGIVPEAAAALIEIGFTLIDLHKIELGCYDYNKQSQAVARKLGFTLEANVRDRKDVQGRRCGDMRFGLLRSEWEAWKRK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448824 | Streptococcus phage Javan637, complete genome | 15668-15697 | 0 | 1.0 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK449002 | Streptococcus phage Javan642, complete genome | 15623-15652 | 0 | 1.0 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK449003 | Streptococcus phage Javan648, complete genome | 15623-15652 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448960 | Streptococcus phage Javan492, complete genome | 7957-7986 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448762 | Streptococcus phage Javan447, complete genome | 8083-8112 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448795 | Streptococcus phage Javan527, complete genome | 13640-13669 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448791 | Streptococcus phage Javan517, complete genome | 7024-7053 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | NC_004587 | Streptococcus prophage 315.4, complete genome | 7119-7148 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | NC_003157 | Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome | 8389-8418 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448977 | Streptococcus phage Javan530, complete genome | 7024-7053 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448793 | Streptococcus phage Javan523, complete genome | 8244-8273 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448788 | Streptococcus phage Javan511, complete genome | 7024-7053 | 0 | 1.0 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448954 | Streptococcus phage Javan476, complete genome | 8038-8067 | 0 | 1.0 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448858 | Streptococcus phage Javan166, complete genome | 16919-16948 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448862 | Streptococcus phage Javan178, complete genome | 12156-12185 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448970 | Streptococcus phage Javan516, complete genome | 17188-17217 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448854 | Streptococcus phage Javan146, complete genome | 16404-16433 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448694 | Streptococcus phage Javan179, complete genome | 15361-15390 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448957 | Streptococcus phage Javan484, complete genome | 16608-16637 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235008-1235037 | 30 | MK448790 | Streptococcus phage Javan515, complete genome | 18535-18564 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235074-1235103 | 30 | MK448798 | Streptococcus phage Javan533, complete genome | 29976-30005 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235074-1235103 | 30 | NC_028700 | Streptococcus phage T12, complete genome | 29829-29858 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235074-1235103 | 30 | MK448790 | Streptococcus phage Javan515, complete genome | 29745-29774 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235074-1235103 | 30 | MK448783 | Streptococcus phage Javan503, complete genome | 28882-28911 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235074-1235103 | 30 | MK448967 | Streptococcus phage Javan510, complete genome | 29977-30006 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235074-1235103 | 30 | MK448856 | Streptococcus phage Javan158, complete genome | 8411-8440 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235074-1235103 | 30 | NC_004588 | Streptococcus prophage 315.5, complete genome | 30126-30155 | 1 | 0.967 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448790 | Streptococcus phage Javan515, complete genome | 8370-8399 | 1 | 0.967 |
LS483361_3 | 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR | 1565067-1565096 | 30 | MK448683 | Streptococcus phage Javan149, complete genome | 9848-9877 | 1 | 0.967 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | NC_004585 | Streptococcus prophage 315.2, complete genome | 15785-15814 | 2 | 0.933 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448965 | Streptococcus phage Javan506, complete genome | 14832-14861 | 2 | 0.933 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448955 | Streptococcus phage Javan478, complete genome | 15424-15453 | 2 | 0.933 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448966 | Streptococcus phage Javan508, complete genome | 15640-15669 | 2 | 0.933 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448795 | Streptococcus phage Javan527, complete genome | 19679-19708 | 2 | 0.933 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448791 | Streptococcus phage Javan517, complete genome | 12155-12184 | 2 | 0.933 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448959 | Streptococcus phage Javan488, complete genome | 14832-14861 | 2 | 0.933 |
LS483361_2 | 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234810-1234839 | 30 | MK448672 | Streptococcus phage Javan117, complete genome | 11557-11586 | 2 | 0.933 |
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LS483361_2 | 2.3|1234876|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1234876-1234905 | 30 | NZ_HG938356 | Neorhizobium galegae bv. officinalis bv. officinalis str. HAMBI 1141 plasmid pHAMBI1141a, complete sequence | 1262360-1262389 | 8 | 0.733 |
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LS483361_2 | 2.7|1235140|31|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235140-1235170 | 31 | NZ_CP015881 | Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAA, complete sequence | 786583-786613 | 9 | 0.71 |
LS483361_2 | 2.7|1235140|31|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1235140-1235170 | 31 | NZ_CP015882 | Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAB, complete sequence | 933163-933193 | 9 | 0.71 |
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LS483361_3 | 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder | 1565055-1565088 | 34 | NZ_CP049788 | Ralstonia solanacearum strain B2 plasmid unnamed, complete sequence | 748588-748621 | 10 | 0.706 |
LS483361_3 | 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder | 1565055-1565088 | 34 | NZ_CP052069 | Ralstonia solanacearum strain FJAT91.F50 plasmid Plas1, complete sequence | 823066-823099 | 10 | 0.706 |
LS483361_3 | 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder | 1565055-1565088 | 34 | NZ_CP022482 | Ralstonia solanacearum strain HA4-1 plasmid HA4-1MP, complete sequence | 246821-246854 | 10 | 0.706 |
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7. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgt Protospacer ******************************
8. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgt Protospacer ******************************
9. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgt Protospacer ******************************
10. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgt Protospacer ******************************
11. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgt Protospacer ******************************
12. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgt Protospacer ******************************
13. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448954 (Streptococcus phage Javan476, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgt Protospacer ******************************
14. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448858 (Streptococcus phage Javan166, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgccttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.***************************
15. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgaggttgccttggctcaaatgagtaagta Protospacer ** ***************************
16. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448970 (Streptococcus phage Javan516, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgccttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.***************************
17. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448854 (Streptococcus phage Javan146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgtggttgccttagctcaaatgagtaagta Protospacer ************.*****************
18. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448694 (Streptococcus phage Javan179, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgaggttgccttggctcaaatgagtaagta Protospacer ** ***************************
19. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgccttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.***************************
20. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448790 (Streptococcus phage Javan515, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atgcacgctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer atgcacgctaactgtcgcagcacatttgct Protospacer **************.***************
21. spacer 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448798 (Streptococcus phage Javan533, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgcttgccatctgagcctttatcgccgtaa CRISPR spacer tgcttgccatctgaacctttatcgccgtaa Protospacer **************.***************
22. spacer 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028700 (Streptococcus phage T12, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgcttgccatctgagcctttatcgccgtaa CRISPR spacer tgcttgccatctgaacctttatcgccgtaa Protospacer **************.***************
23. spacer 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448790 (Streptococcus phage Javan515, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgcttgccatctgagcctttatcgccgtaa CRISPR spacer tgcttgccatctgaacctttatcgccgtaa Protospacer **************.***************
24. spacer 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448783 (Streptococcus phage Javan503, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgcttgccatctgagcctttatcgccgtaa CRISPR spacer tgcttgccatctgaacctttatcgccgtaa Protospacer **************.***************
25. spacer 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448967 (Streptococcus phage Javan510, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgcttgccatctgagcctttatcgccgtaa CRISPR spacer tgcttgccatctgaacctttatcgccgtaa Protospacer **************.***************
26. spacer 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448856 (Streptococcus phage Javan158, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgcttgccatctgagcctttatcgccgtaa CRISPR spacer tgcttgccatctgaacctttatcgccgtaa Protospacer **************.***************
27. spacer 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_004588 (Streptococcus prophage 315.5, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
tgcttgccatctgagcctttatcgccgtaa CRISPR spacer tgcttgccatctgaacctttatcgccgtaa Protospacer **************.***************
28. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448790 (Streptococcus phage Javan515, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagacagaatttgatgt Protospacer ******************.***********
29. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448683 (Streptococcus phage Javan149, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactatatcgagacggaatttgatgt Protospacer *********.********************
30. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcagttgccttggctcaaatgagtaagta Protospacer **..**************************
31. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448965 (Streptococcus phage Javan506, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgtgattgccttggctcaaaggagtaagta Protospacer ****.*************** *********
32. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
33. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcagttgccttggctcaaatgagtaagta Protospacer **..**************************
34. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
35. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
36. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448959 (Streptococcus phage Javan488, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgtgattgccttggctcaaaggagtaagta Protospacer ****.*************** *********
37. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
38. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
39. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448945 (Streptococcus phage Javan454, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
40. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
41. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448849 (Streptococcus phage Javan128, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
42. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448772 (Streptococcus phage Javan483, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcagttgccttggctcaaatgagtaagta Protospacer **..**************************
43. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448962 (Streptococcus phage Javan496, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgtgattgccttggctcaaaggagtaagta Protospacer ****.*************** *********
44. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
45. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448949 (Streptococcus phage Javan460, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgtgattgccttggctcaaaggagtaagta Protospacer ****.*************** *********
46. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448783 (Streptococcus phage Javan503, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
47. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tgcggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer **.*****.*********************
48. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
atgcacgctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer atgcacgctaactgtcgcagcacgtttgct Protospacer **************.********.******
49. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448798 (Streptococcus phage Javan533, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
atgcacgctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer atgcacgctaactgtcgcagcacgtttgct Protospacer **************.********.******
50. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448681 (Streptococcus phage Javan141, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
atgcacgctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer atgcacgctaactgtcgcagcacgtttgct Protospacer **************.********.******
51. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_028700 (Streptococcus phage T12, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
atgcacgctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer atgcacgctaactgtcgcagcacgtttgct Protospacer **************.********.******
52. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448967 (Streptococcus phage Javan510, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
atgcacgctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer atgcacgctaactgtcgcagcacgtttgct Protospacer **************.********.******
53. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
atgcacgctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer atgcacgctaactgtcgcagcacgtttgct Protospacer **************.********.******
54. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448683 (Streptococcus phage Javan149, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
atgcacgctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer atgcacgctaactgtcgcagcacgtttgct Protospacer **************.********.******
55. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_004588 (Streptococcus prophage 315.5, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
atgcacgctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer atgcacgctaactgtcgcagcacgtttgct Protospacer **************.********.******
56. spacer 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgcttgccatctgagcctttatcgccgtaa CRISPR spacer tgcttaccatctgagcctttatccccgtaa Protospacer *****.***************** ******
57. spacer 2.6|1235074|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
tgcttgccatctgagcctttatcgccgtaa CRISPR spacer tgcttaccatctgagcctttatccccgtaa Protospacer *****.***************** ******
58. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to MK449012 (Streptococcus phage Javan94, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer aatggactacatcgagacagaatttgatgt Protospacer .*****************.***********
59. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tacggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer *..*****.*********************
60. spacer 2.2|1234810|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
tgtggttgccttggctcaaatgagtaagta CRISPR spacer tacggttgtcttggctcaaatgagtaagta Protospacer *..*****.*********************
61. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448960 (Streptococcus phage Javan492, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
62. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448762 (Streptococcus phage Javan447, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
63. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
64. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
65. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
66. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
67. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
68. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
69. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
70. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448954 (Streptococcus phage Javan476, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacggaatttgatgtatgg Protospacer ******************************* ..
71. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to JX409894 (Streptococcus phage LYGO9, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer aatggaatacatcgaaacggaatttgatgt Protospacer .***** ********.**************
72. spacer 3.4|1565137|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448860 (Streptococcus phage Javan172, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
actgcaatcactttttggcattcccaaagt CRISPR spacer gctgcaatcactttttggcattcccagagc Protospacer .*************************.**.
73. spacer 3.4|1565137|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
actgcaatcactttttggcattcccaaagt CRISPR spacer gctgcaatcactttttggcattcccagagc Protospacer .*************************.**.
74. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448790 (Streptococcus phage Javan515, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.882
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactacatcgagacagaatttgatgtatgg Protospacer ******************.************ ..
75. spacer 3.2|1565124|33|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448860 (Streptococcus phage Javan172, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879
actgcaatcactttttggcattcccaaagtaac CRISPR spacer gctgcaatcactttttggcattcccagagcaat Protospacer .*************************.**.**.
76. spacer 3.2|1565124|33|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879
actgcaatcactttttggcattcccaaagtaac CRISPR spacer gctgcaatcactttttggcattcccagagcaat Protospacer .*************************.**.**.
77. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK448683 (Streptococcus phage Javan149, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.853
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer gatggactatatcgagacggaatttgatgttttg Protospacer *********.******************** .
78. spacer 3.4|1565137|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actgcaatcactttttggcattcccaaagt CRISPR spacer gttgcaataactttttggcattcccagagc Protospacer ..****** *****************.**.
79. spacer 3.4|1565137|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448681 (Streptococcus phage Javan141, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actgcaatcactttttggcattcccaaagt CRISPR spacer gttgcaataactttttggcattcccagagc Protospacer ..****** *****************.**.
80. spacer 3.4|1565137|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
actgcaatcactttttggcattcccaaagt CRISPR spacer gttgcaataactttttggcattcccagagc Protospacer ..****** *****************.**.
81. spacer 2.3|1234876|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KY000033 (Agrobacterium rhizogenes strain 26-59 plasmid pRi_26-59, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
--tgaagcgaagtgtttatcgagaaaggatac CRISPR spacer gccgaggc--tgtgtttatcgaaaaaggatac Protospacer .**.** ***********.*********
82. spacer 2.3|1234876|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019703 (Agrobacterium rhizogenes strain K599 (NCPPB2659) plasmid pRi2659, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
--tgaagcgaagtgtttatcgagaaaggatac CRISPR spacer gccgaggc--tgtgtttatcgaaaaaggatac Protospacer .**.** ***********.*********
83. spacer 2.3|1234876|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_010841 (Agrobacterium rhizogenes plasmid pRi2659, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
--tgaagcgaagtgtttatcgagaaaggatac CRISPR spacer gccgaggc--tgtgtttatcgaaaaaggatac Protospacer .**.** ***********.*********
84. spacer 2.3|1234876|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_002575 (Agrobacterium rhizogenes plasmid pRi1724 DNA, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
--tgaagcgaagtgtttatcgagaaaggatac CRISPR spacer gccgaggc--tgtgtttatcgaaaaaggatac Protospacer .**.** ***********.*********
85. spacer 2.3|1234876|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_KY000038 (Agrobacterium rhizogenes strain 1724 plasmid pRi_1724, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
--tgaagcgaagtgtttatcgagaaaggatac CRISPR spacer gccgaggc--tgtgtttatcgaaaaaggatac Protospacer .**.** ***********.*********
86. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP030355 (Novosphingobium sp. P6W plasmid pP6W2, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
atgcacgctaactgccgcagcacat-ttgct CRISPR spacer cggaacgctaactgccgcaggacatagtgc- Protospacer * **************** **** ***
87. spacer 2.5|1235008|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017887 (Pseudomonas frederiksbergensis strain ERDD5:01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
atgcac-gctaactgccgcagcacatttgct CRISPR spacer -tgttctgctaactggcgcagcacaattgca Protospacer **. * ******** ********* ****
88. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to MK449012 (Streptococcus phage Javan94, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer aatggactacatcgagacagaatttgatgtgttg Protospacer .*****************.***********. .
89. spacer 2.3|1234876|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP010270 (Paenibacillus polymyxa strain Sb3-1 plasmid pSb31l, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
tgaagcgaagtgtttatcgagaaaggatac CRISPR spacer ttgaatgaaatgttgatcgagaaaggatat Protospacer * .*..***.**** **************.
90. spacer 2.7|1235140|31|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP011809 (Pandoraea faecigallinarum strain DSM 23572 plasmid pPF72-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.774
cactctcggtgtcgtcatcaagatagacggt CRISPR spacer cacggagcgtgttgtcatcaagatcgacggt Protospacer *** ****.*********** ******
91. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to MG602477 (Bacillus phage BCP01, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagaaggagcgagcttt Protospacer ***************** ***.. * * *
92. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to KX495186 (Bacillus phage PK16, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer gatggactacatcgagaaggagcgagcttt Protospacer ***************** ***.. * * *
93. spacer 3.4|1565137|30|LS483361|PILER-CR matches to MK448694 (Streptococcus phage Javan179, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
actgcaatcactttttggcattcccaaagt CRISPR spacer gccactataactttttggcattcccagagc Protospacer .*..* ** *****************.**.
94. spacer 2.3|1234876|30|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_HG938356 (Neorhizobium galegae bv. officinalis bv. officinalis str. HAMBI 1141 plasmid pHAMBI1141a, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
tgaagcgaagtgtttatcgagaaaggatac CRISPR spacer gcgcgcgaagtgtttatcgagcagggattt Protospacer . ***************** *.**** .
95. spacer 3.3|1565067|30|LS483361|PILER-CR matches to AP013460 (Uncultured Mediterranean phage uvMED DNA, complete genome, group G17, isolate: uvMED-CGR-U-MedDCM-OCT-S40-C18) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
gatggactacatcgagacggaatttgatgt CRISPR spacer tatggactaccacgagacggaattaagagc Protospacer ********* ************ .. *.
96. spacer 2.7|1235140|31|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP019033 (Lactobacillus fermentum strain SNUV175 plasmid pSNU175-4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
cactctcggtgtcgtcatcaagatagacggt CRISPR spacer tcgcctcggtttcgtcatctagatagacccg Protospacer . .****** ******** ********
97. spacer 2.7|1235140|31|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015881 (Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAA, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
cactctcggtgtcgtcatcaagatagacggt CRISPR spacer gcttgccggtggcgtcatcaatatagacgag Protospacer .* .***** ********* *******.
98. spacer 2.7|1235140|31|LS483361|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP015882 (Ensifer adhaerens strain Casida A plasmid pCasidaAB, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
cactctcggtgtcgtcatcaagatagacggt CRISPR spacer gcttgccggtggcgtcatcaatatagacgag Protospacer .* .***** ********* *******.
99. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016613 (Ralstonia solanacearum FJAT-91 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer agctgaggtgatccagacggaatttgatgcaaaa Protospacer ... ** *** ***************.****
100. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP049788 (Ralstonia solanacearum strain B2 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer agctgaggtgatccagacggaatttgatgcaaaa Protospacer ... ** *** ***************.****
101. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP052069 (Ralstonia solanacearum strain FJAT91.F50 plasmid Plas1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer agctgaggtgatccagacggaatttgatgcaaaa Protospacer ... ** *** ***************.****
102. spacer 3.1|1565055|34|LS483361|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP022482 (Ralstonia solanacearum strain HA4-1 plasmid HA4-1MP, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
gatggactacatcgagacggaatttgatgtaaaa CRISPR spacer agctgaggtgatccagacggaatttgatgcaaaa Protospacer ... ** *** ***************.****
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
40125 : 49951
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483361|40125:49951|DBSCAN-SWA TATGGACAAACGTATTTTCGTTGAGAAGAAGGCTGATTTTCAGATTAAGACTGAGTCGTTGGTAAAGGAACTGACGCATAATTTGCAGTTATCGACGTTGAAAACACTTCGTATGATTCAAGTTTATGATGTATTTGGATTAACCGCTGCTTTGTTTCCACGTGCAGAGAAACACATCTTTTCTGAACAGGTTACAGATTGTATCTTACCTGAGGAAACTATTAAAACAGAGCTGACTAATGCTGCTTTTTTTGCAATTGAGAGTTTGCCAGGACAGTTTGATCAAAGAGCAGCATCTGCTCAAGAAGCTTTATTATTGTTAGGAGCTCCCAATGATGTGATGGTTAACACGGCTCAACTATATTTGGTCAATAAAGACATTTTAAAAACAGAGCTTGAAGCTATAAAACGTTATCTTCTCAATCCAGTTGATTCTCGATTTAAAGATATAACAAGAGACATTGAGCGGCATCACTTTTCTGAGTCGGACAAGGTTATCCCAACCTTGGATTTCTTTGAGACTTACACGTCAAATGAGTTTAAGATTTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCAATGGAGGTTGATGACCTTGTTTTCATTCAAGAGTACTTTAAATCAATTGGCCGTGTACCGACAGAAACAGAGTTAAGAGTTTTGGACACTTATTGGTCCGATCACTGTCGTCATACCACTTTTGAAACAGAATTAAAACATATTGATTTTTCCGCTTCTAAATTTCAAAAACAACTACAAGCGACTTACGATAAATATATCGCTATGCGTGAAGAATTGGGACGTTCTGATAAGCCACAGACGCTTATGGATATGGCGACAATTTTCGGTCGCTATGAGCGTGCGAATGGGCGTTTGGATGATATGGAAGTGTCTGATGAAATCAATGCTTGTTCCGTTGAGATTGACGTGGATGTTGATGGTGTTAAAGAGCCATGGCTCTTGATGTTTAAAAATGAGACACACAATCATCCAACAGAAATCGAACCTTTTGGTGGAGCAGCGACTTGTATTGGTGGAGCCATTCGTGATCCATTATCAGGGCGATCGTACGTTTATCAAGCGATGCGTATTTCAGGTGCTGGAGACATTACAACGCCTGTTTCTGATACTCGCGCTGGAAAACTCCCTCAGCAAGTCATTTCAAAAACAGCAGCGCACGGCTATTCCTCATACGGAAACCAAATCGGTCTTGCTACAACTTATGTTAAGGAATACTTCCACCCAGGATTTGTCGCAAAACGTATGGAATTGGGAGCCGTTGTTGGTGCAGCACCTAAAGGAAATGTGATCCGTGAAAAACCAGAAGCTGGTGATGTTGTTATTCTTCTAGGTGGGAAAACAGGTCGTGATGGTATCGGTGGAGCAACGGGTTCCTCTAAGGTACAGACCGCTGAGTCTGTGGAGACGGCTGGTGCTGAAGTCCAAAAAGGGAATGCTATCGAAGAACGGAAAATTCAGCGTCTCTTCCGTAATGGTGAAGTAACACGCCTGATTAAGAAATCAAATGACTTTGGCGCAGGTGGTGTTTGTGTAGCTATTGGGGAATTGGCTGATGGTTTAGTAATTGATTTAAACAAAGTACCACTCAAATACCAAGGGTTAAATGGAACAGAGATTGCTATTTCAGAGTCCCAAGAGCGGATGGCGGTTGTCGTTCGTTCTAAAGATGCTGAGGAGTTTATTACTAAGTGTTCCAAAGAAAATATTAAGGCTGTTACTATAGCAACGGTTACTGAAGAGCCAAATCTAGTCATGACTTGGAATGGCCAAACTATCGTTGACATTGAACGTTCTTTCCTAGATACCAATGGTGTTCGTGTCGTTGTTGATGCAAAGGTAGTTGACAAGGCTGTCAACTTGCCTGAAAGTCGCATAACATCAGTAGCAACGCTTGAAAAAGATACACTTACTGTGCTTTCAAATCTTAATCATGCTTCTCAGAAAGGTCTTCAAACCCTTTTTGATTCTTCTGTTGGTCGTTCAACAGTTAATCATCCCATCGGGGGTCGTTACCAACTTACCCCAAGCGAGGCTTCTGTCCAAAAACTACCTGTTCAAAATGGTGTCACCACAACAGCCTCAGTTATCGCTCAAGGGTACAATGCCTACATTGCTGAGTGGTCACCATATCATGGTGCAGCTTATGCTGTAATTGAGGCCACAGCACGATTGGTGGCATCTGGTGCTAACTGGTCTAAAGCACGTTTCTCTTATCAAGAGTATTTCGAGCGCATGGATAAACAGGCAGAGCGCTTTGGCCAACCCGTTTCAGCACTACTTGGTTCTATTGAAGCTCAAATTCAACTTGGCCTACCATCCATTGGTGGCAAGGATTCCATGTCTGGAACATTTGAGGAATTGACAGTACCACCAACCTTGGTTGCTTTTGGTGTTACAACTGCACACACACAAGACGTTTTATCTCCGGAATTTAAAGCCGCAGGTGAGACTATTTACTATCTTCCTGGTCAAACTATTTCTGAAGAGATTGATTTTGACCTCATAAAAGCCAATTTTAGTAACTTTGAAAGTATTCAAGCTAACCATACGATTAGTTCTGCATCAGCTATAAAATATGGGGGGATTATAGAGAGCTTGGCCCTAGCTAGTTTTGGTAATCATATTGGAGTATCTGTAACCTTGACAGAGCTTGACAATAGCTTGACAGGACAACTTGGTGGCTTTATATTTACTTCAGCTGAAGAAATCTCAGGTGTAACCAAAATTGGAAAAACACATGCGGACTTTACAGTTACTGTCAACGGAGTTATTCTTTCGGGTGCCAAGTTGCTGACAGCTTTTGAAGGAAAATTGGAAGATATTTATCCAACTACTTTTAGTCAAAGTCAAGATATAGAAGACGTTCCTGTTGTCGTCTCTGATGCAGTTATCACGACTCAAAAAATAATTGACAAACCATTGGTTTATATTCCGGTGTTTCCTGGTACAAACTCTGAATATGACTCAGCTAAGGCTTTTGAACAGGCGGGAGCAGAGGTTCATTTGGTCCCGTTTGTGACCTTGAATGAAGTGGCTATTGCACAGTCAGTTGACACAATGGTTGACAATATCAGTAAGGCCAATATTATTTTCTTTGCTGGTGGATTTTCAGCAGCGGATGAGCCAGATGGTTCTGCCAAATTCATCGTCAACATCCTACTCAATCAAAAGGTCCGCTCTGCTATTGATAATTTTATTGAAAAAGGTGGACTTATCATAGGTATCTGTAATGGTTTTCAAGCTCTTGTTAAATCTGGACTCTTACCTTATGGCAATTTTGAAAATGTCAAGGAGAGTTCTCCAACTCTCTTCTACAATGATGCTAATCAGCATGTGGCTAAGATGGTCGAGACGCGCATTGCAAATACTAATTCACCATGGCTTTCAGGTGTGGAAGTTGGTGATGTGCATGTGATTCCAGTTTCACATGGTGAAGGGAAGTTTGTTGTCTCTGCAGAGGAATTCGCAGAGTTGCGCGATAATGGTCAAATTTTTAGTCAATACGTAGATTTTGATAGTCATCCAAGTATGGATAGTCGCTACAATCCAAATGGATCGGTCAATGCTATCGAAGGAATTACCAGCAAAAATGGTCAAATTATTGGTAAGATGGGGCACTCAGAACGTTGGGAAGAAGGCCTTTTCCAAAATATTCCAGGGAATAAAGATCAAAAACTCTTTGAATCCGCAGTCCGTTATTTTACTGGTAAGTAAGGTTGCCAACAAGGAGAGCGCGATTCACGGGTGTCATTCTCAAATCATGGTGTTTTAAAAAAGAGCAATAGTGACTTTGGATTTAAAGAGCATTGCTAAAAGAAATTAGGAAAAACAAATGTACGAAGTAAAATCTCTTAATGAAGAATGTGGTGTCTTCGGAATATGGGGACATCCTCAAGCAGCTCAGGTAACCTATTTTGGGCTTCATAGTCTTCAGCATCGAGGTCAAGAAGGTGCCGGTATTATCTCAAATGATGAAGGTAACCTACATCAACACCGAGCCACTGGCCTTTTATCAGATGTTTTTAAAAATCAGAATGACTTGACTAAGTTGACAGGTCATGCAGCAATTGGGCATGTTCGTTATGCCACGGCAGGATCTGCTTCTATTAATAATATTCAACCCTTCTTGTACCAGTTTACAGATGCTCAATTTGGGTTATGTCACAATGGTAATTTAACCAATGCGATTTCCTTAAAGAAAGAACTAGAGAGAGAAGGAGCTATTTTCAATGCTTCGTCAGACACTGAAATTCTGATGCATTTGGTCCGCCGTAGCCACCAGTCTGACTTTATTGGAAAAGTTAAAGAAGCTCTTAATAGGGTAAAAGGTGGTTTTGCCTACCTACTTATGACAGAAAAGCAATTAATTGCTGCCCTCGATCCAAATGGTTTTAGACCGCTGTCTATTGGTAAAATGAAAAATGGGGCTTGGGTAGTTTCCTCGGAAACCTGTGCTTTTGAAGTGATTGGAGCTGAATGGATTCGAGATGTGAAGCCAGGAGAATTGATTGTCATTGATGATTCGGGCATTACCTACCATCAGTATAAGACGGATACTCAACTAGCCATTTGTTCCATGGAATATGTTTATTTTGCACGTCCAGATTCTACTATTTATGGTGTAAATGTTCATACGGCGCGTAAGGAGATGGGAAAAAGGCTAGCGCAGGAATTTCAACATGAAGCTGATATAGTGGTTGGAGTGCCCAACTCATCACTATCAGCGGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCTGGGTTGCCAAATGAAATGGGTTTGGTCAAAAATCAATACACCCAACGAACCTTCATTCAACCGACACAGGACTTGCGAGAACAGGGTGTTCGCATGAAGTTATCAGCAGTGTCAGGTGTGGTAAAAGGAAAACGTGTGGTAATGGTGGATGATTCTATTGTCAGAGGAACAACGTCACGCCGTATTGTTAGTTTGCTCCGTGAAGCGGGAGCCACTGAAGTTCATGTGGCAATTGGTAGTCCCGAACTGAAATATCCTTGTTTTTATGGTATTGACATCCAAACAAGAAGGGAATTAATTTCTGCTAATCATACAGTCGAAGAAGTATGTGACATTATTGGAGCAGATAGTTTAACCTATCTTTCTCTAGATGCCATGATTGACGCTATAGGCCTTGAAACGGATGCTCCTAAAGGTGGGCTCTGTGTGGCTTATTTTGATGGGGAATACCCAACACCTTTGTATGATTATGAAGACGAGTATTTACGAAGTTTAGAAGAACAAACTAGTTTTTATATTGAGAAAGTGAAATAACTGTATACAGGAGTAGATTTCAACAGTTAATCAGTAAGTTTGTTAATGACAATAGTTGCTTCCTAAGCCATATAAGAAATGACGATTAGTAGCAGGACCTGCCTAGGACTGTACCACTTTAGTTGAGTTTTAATCAAAAAAAGGAAAAAATGATGATAGAAAAAAACGCTTATGCCCAATCTGGAGTAGATGTTGAGGCGGGATATGAAGTTGTGGAACGTATAAAAAAACACGTGGCTCGTACAGAGCGATTAGGAGTTATGGGAGCTCTAGGTGGTTTTGGTGGTATGTTTGATTTGTCCCAGACAGGTATTAAAGAACCAGTTCTTATTTCTGGAACAGACGGTGTGGGTACCAAACTCATGCTGGCGATCCAGTATGATAAACATGATACGATTGGTCAGGATTGTGTAGCCATGTGCGTTAATGATATTATTGCCGCAGGTGCAGAGCCTCTCTATTTCCTTGATTATATTGCAACTGGTAAAAATGAACCTGCTAAGTTGGAACAAGTTGTTGCAGGTGTGGCAGAAGGTTGTGTACAGGCTGGCTGTGCCCTTATCGGAGGTGAAACAGCAGAAATGCCAGGCATGTACGGCGAAGAGGATTATGACTTGGCTGGTTTTACAGTTGGTATTGCTGAAAAGTCTCAGATTTTGGATGGGTCAAAAGTTGCCGAAGGTGATATTCTTCTAGGCCTTGCTTCAAGTGGCATCCACTCGAATGGTTATTCACTTGTTCGTCGTGTCTTTGCTGATTATACAGGAGATGAGGTTTTGCCTGAACTGGAGGGTCAAAAACTTAAAGATGTTCTTCTTGAGCCAACTCGTATTTATGTGAAAGCTGTGCTTCCTCTTATCAAGGAAGGGTTGGTTAATGGCATTGCCCATATCACTGGTGGTGGTTTTACAGAGAATATTCCTCGTATGTTTGCAGATGATTTAGCTGCTGAAATTGACGAAAATAAGTTGCCTGTTCTTCCAATTTTTAAAGCTCTTGAGAAGTATGGGCAGATTAAGCATGAGGAAATGTTTGATATTTTCAATATGGGGATTGGCCTGGTTCTAGCAGTTACACCGGAAAATGTGGATCGTGTCAAGAAACTCCTTAACGAACCAGTCTATGATATCGGTCATATCGTGACCAAAAGGGATGCTAGTGTGGTGATTTCAAATGGCTAAAAAAATAGCCGTCTTTGCATCTGGCAATGGATCAAATTTTCAAGTGATTGCAGAGCAATTCCAGGTTGAACTGGTCTTTTCAGATCGACGAGATGCTTATGTTTTAGAACGTGCCCAAAAACTTGGGGTTAGGGCAGTTACATTTGAACTCAAGGAATTTGAAACTAAGGCTGCCTATGAAAAAGAAATTGTCCAGTTTCTTGACAAACATGACATTGATTTGATTTGTTTAGCAGGCTATATGAAAATTGTAGGGCCTACTCTTCTGGATGCTTATGAGGGCCGAATGATTAATATTCATCCAGCTTATTTACCAGAATTTCCAGGAGCTCATGGGATTTCAGATGCCTGGCAAGCAGGCGTAGACCAGTCAGGCGTAACTGTGCATTGGGTTGACAGCGGAGTTGATACGGGTGACATCATACAGCAGGTGCGCGTGTCACGGTTGGCTAGTGATACCATTGAAGATTTTGAAACAAGGATTCATAAAGCGGAGTATCAGCTTTATCCAGAAGTATTGGATCGTTTAGGCGTTGACAGGAAATAGATAACAGTTAAATAAAAAACGTCCTAGTGACACTTATTAAGGAGAATAGAATGAAACGTGCACTCATTAGTGTTTCAGATAAAGCGGGCATTGTAGAGTTTGCTCAGGAATTAAAAAATCTTGGTTGGGATATTATTTCAACTGGTGGGACTAAGACGGCACTTGATGCAGCAGGTCTTGAGACCATTGCTATTGATGATGTGACAGGATTTCCAGAAATGATGGATGGTCGTGTTAAGACCCTTCATCCCAATATTCACGGGGGGCTTTTAGCTCGTCGTGATAGAGATAGTCACTTGCAGTCTGCTCGCGAGAATAATATAGAGCTTATTGATCTTGTAGTGGTCAATCTTTACCCTTTTAAGGAAACTATTTTGCGTCCAGATGTGACGTATGATTTAGCAGTGGAGAATGTTGATATTGGTGGTCCCTCAATGCTGCGCTCTGCAGCAAAAAATCATGCCAGTGTGACTGTTATAGTTGATCCGAGTGATTACCCTCTTGTCTTGGCAGAACTGACTGAAACCGGGAATACAACATATGAGACGCGTCAGCGTCTGGCTGCTAAAGTTTTTCGTCATACCGCTGCCTATGACGCTTTGATTGCAGATTATTTCACGACTCAAGTTGGTGAAAATAAGCCAGAAAAACTGACTTTGACTTATGATTTGAAACAATCTATGCGTTACGGAGAAAATCCCCAACAAGCTGCTAATTTTTATCAAAATGCTATTCCAACGGAATATGCCATTGCTTCTGTCAAACAACTTAATGGAAAGGAATTGTCTTTTAACAACGTTCGAGATGCAGATGCGGCAATCCGAATTATTCGCGATTTTAAAGATCAACCAACAGTTGTGGCTCTTAAGCATATGAATCCATGTGGCATTGGGCAGGCAGATACTATTGAAACAGCGTGGGATTACTGCTATGAGGCCGATCCGGTATCTATATTTGGTGGGATTGTGGTTCTCAACCGTGAAGTTGATGCCATGACAGCTCAGAAGATGCATCCTGTTTTTCTTGAAATCATTATTGCGCCATCTTACACGGAAGAAGCGCTCGCCATTCTAACCCATAAAAAGAAAAATTTGCGTCTCCTTGAATTACCTTTTGGTGCTCAAGATGCCAGCGAACTGGAAAAGGAGTATACCGGTGTAGTTGGTGGAATGCTCGTCCAAAATCAGGATGTTGTTTCAGAGAGTCCGGCGGATTGGCAAATAGTTACGGAACGACAACCATCAGAGCAGGAAATGACTGCTTTGGAGTTTGCTTGGAAAGCCATCAAATATGTTAAATCAAATGGGATTCTTATCGCGAATGACCATATGACTTTAGGTGTAGGTCCAGGACAAACCAATCGTGTGGCTTCTGTTCGTATTGCTATTGAGCAAGCTAAGAAGCATCTTGATGGAGCAGTATTAGCTTCCGATGCTTTCTTTCCTTTTGCTGATAATATTGAAGAAATTGCGGCTTCAGGGATTAAAGCCATTATTCAGCCAGGTGGTTCAGTTAGAGATCAAGATTCTATTGACGCTGCCAATAAACATGGCCTGACTATGGTATTTACAGGTGTCAGACATTTTAGACATTAAAAACTAAAAGAGATGTGGTCGTCTAGGACACATCTCTTTTAGTATAATATTGAGAGAAAACGAAGAAGAGGAAAAGGGGTTATGGCAATTTAGAGGCTTTATCAGCAGTTAACCATGTTCCACGTGATCCAATCTTGACATAAATCCCATTGCTTGGTCGGTCGACTTTCAGTACCCTATAGTTACCTGGGATAACAAAAAACTCACCGGCCTGTAAAATTTGATTTCCTGCTTTTACTCCTTTACGATCTGTTTCATCCAAAGGTGAGGGATCAATCCAGTTAAGAGAAGTAGCGCCCCCACCAGCTAGTTCCTCGCTAACTAATAGATTGTTTACAATACGATCCACACGGAAAACGCCAGGGAAAGTCACTCTATCGCCAATATTGATAGGCGATGTTGTCTCAGAGACTTGTTGTGTTTTTTGCTCTATCTTTTTAATTGGGATATAACGTCGACTTCCTGAAAAACTGAGATAGCTAATCCATTCATGACCGTCAACGGTCATAGCTTGATCGTAATGAACAGATTGTCCAGGATTATAATAAGCTAAGTCAGGGCTAGTGAGTTGAGCCTGTGCTTTAACAGGAGTACGCTCAGTAAAATGGTAAGTTCCTCCTTGTTTTACTGCTTCTTTAGAAACCTGTTGTTCTTTTGTTTGAGACTTACTTGCTTCACCACTAGGCAAATCTTTAAAATGAATATAACCGCTCACATGGTTTTTGGGGATTTGACGCTTATGGTATTTCTCAGGTCCTTGACCAGCATTGTAATTATATTCCTCAATCACAACAGAATCTCCACGTATTTCGGCTACCCAAGCCACATGACCATACGTTGCATGAGATTGGAAAGCGTTAGTATCAAACCACGCTACTGCCCCGACTTTAGGGGTCTTATTGACAGTATAGCCTTGTTTTTTTGCAATATGTCCCCAAGTGCAGGCATTCCCATAGCCTTTGGGCAACTGAAAACCATTTGCTGAACTCAGACGGAAAGCGACAAATGATGTGCACTGACGAACATACATATTCCAAGAATCAATTCCAGATCCCTTTTTCCATTTGCTAGGATAATTATCCCCAAGGACAGCTGCATGAACAACTCCTGTATGCTCTGCATTCAAAGTGGATGCAACTGAAGATACAGCACCATTAACACTCAAAAGGATTGCTCCTGACACTAACAATTGATGAATTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483361|40125:49951|43969_45421_+|SQF65938.1|DBSCAN-SWA MYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIISNDEGNLHQHRATGLLSDVFKNQNDLTKLTGHAAIGHVRYATAGSASINNIQPFLYQFTDAQFGLCHNGNLTNAISLKKELEREGAIFNASSDTEILMHLVRRSHQSDFIGKVKEALNRVKGGFAYLLMTEKQLIAALDPNGFRPLSIGKMKNGAWVVSSETCAFEVIGAEWIRDVKPGELIVIDDSGITYHQYKTDTQLAICSMEYVYFARPDSTIYGVNVHTARKEMGKRLAQEFQHEADIVVGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQDLREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVSLLREAGATEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTVEEVCDIIGADSLTYLSLDAMIDAIGLETDAPKGGLCVAYFDGEYPTPLYDYEDEYLRSLEEQTSFYIEKVK >LS483361|40125:49951|48823_49951_-|SQF65942.1|DBSCAN-SWA MKKIHQLLVSGAILLSVNGAVSSVASTLNAEHTGVVHAAVLGDNYPSKWKKGSGIDSWNMYVRQCTSFVAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKKQGYTVNKTPKVGAVAWFDTNAFQSHATYGHVAWVAEIRGDSVVIEEYNYNAGQGPEKYHKRQIPKNHVSGYIHFKDLPSGEASKSQTKEQQVSKEAVKQGGTYHFTERTPVKAQAQLTSPDLAYYNPGQSVHYDQAMTVDGHEWISYLSFSGSRRYIPIKKIEQKTQQVSETTSPINIGDRVTFPGVFRVDRIVNNLLVSEELAGGGATSLNWIDPSPLDETDRKGVKAGNQILQAGEFFVIPGNYRVLKVDRPSNGIYVKIGSRGTWLTADKASKLP >LS483361|40125:49951|45573_46602_+|SQF65939.1|DBSCAN-SWA MIEKNAYAQSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERLGVMGALGGFGGMFDLSQTGIKEPVLISGTDGVGTKLMLAIQYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNEPAKLEQVVAGVAEGCVQAGCALIGGETAEMPGMYGEEDYDLAGFTVGIAEKSQILDGSKVAEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGDEVLPELEGQKLKDVLLEPTRIYVKAVLPLIKEGLVNGIAHITGGGFTENIPRMFADDLAAEIDENKLPVLPIFKALEKYGQIKHEEMFDIFNMGIGLVLAVTPENVDRVKKLLNEPVYDIGHIVTKRDASVVISNG >LS483361|40125:49951|47199_48744_+|SQF65941.1|DBSCAN-SWA MKRALISVSDKAGIVEFAQELKNLGWDIISTGGTKTALDAAGLETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDRDSHLQSARENNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENVDIGGPSMLRSAAKNHASVTVIVDPSDYPLVLAELTETGNTTYETRQRLAAKVFRHTAAYDALIADYFTTQVGENKPEKLTLTYDLKQSMRYGENPQQAANFYQNAIPTEYAIASVKQLNGKELSFNNVRDADAAIRIIRDFKDQPTVVALKHMNPCGIGQADTIETAWDYCYEADPVSIFGGIVVLNREVDAMTAQKMHPVFLEIIIAPSYTEEALAILTHKKKNLRLLELPFGAQDASELEKEYTGVVGGMLVQNQDVVSESPADWQIVTERQPSEQEMTALEFAWKAIKYVKSNGILIANDHMTLGVGPGQTNRVASVRIAIEQAKKHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAASGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMVFTGVRHFRH >LS483361|40125:49951|40125_43851_+|SQF65937.1|DBSCAN-SWA MDKRIFVEKKADFQIKTESLVKELTHNLQLSTLKTLRMIQVYDVFGLTAALFPRAEKHIFSEQVTDCILPEETIKTELTNAAFFAIESLPGQFDQRAASAQEALLLLGAPNDVMVNTAQLYLVNKDILKTELEAIKRYLLNPVDSRFKDITRDIERHHFSESDKVIPTLDFFETYTSNEFKIYKAEQGLAMEVDDLVFIQEYFKSIGRVPTETELRVLDTYWSDHCRHTTFETELKHIDFSASKFQKQLQATYDKYIAMREELGRSDKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIDVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPVSDTRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVKEYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKGNVIREKPEAGDVVILLGGKTGRDGIGGATGSSKVQTAESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRNGEVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLVIDLNKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMAVVVRSKDAEEFITKCSKENIKAVTIATVTEEPNLVMTWNGQTIVDIERSFLDTNGVRVVVDAKVVDKAVNLPESRITSVATLEKDTLTVLSNLNHASQKGLQTLFDSSVGRSTVNHPIGGRYQLTPSEASVQKLPVQNGVTTTASVIAQGYNAYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVASGANWSKARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEELTVPPTLVAFGVTTAHTQDVLSPEFKAAGETIYYLPGQTISEEIDFDLIKANFSNFESIQANHTISSASAIKYGGIIESLALASFGNHIGVSVTLTELDNSLTGQLGGFIFTSAEEISGVTKIGKTHADFTVTVNGVILSGAKLLTAFEGKLEDIYPTTFSQSQDIEDVPVVVSDAVITTQKIIDKPLVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQAGAEVHLVPFVTLNEVAIAQSVDTMVDNISKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNQKVRSAIDNFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFENVKESSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLSGVEVGDVHVIPVSHGEGKFVVSAEEFAELRDNGQIFSQYVDFDSHPSMDSRYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEEGLFQNIPGNKDQKLFESAVRYFTGK >LS483361|40125:49951|46594_47149_+|SQF65940.1|DBSCAN-SWA MAKKIAVFASGNGSNFQVIAEQFQVELVFSDRRDAYVLERAQKLGVRAVTFELKEFETKAAYEKEIVQFLDKHDIDLICLAGYMKIVGPTLLDAYEGRMINIHPAYLPEFPGAHGISDAWQAGVDQSGVTVHWVDSGVDTGDIIQQVRVSRLASDTIEDFETRIHKAEYQLYPEVLDRLGVDRK |
6 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
186519 : 274703
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483361|186519:274703|DBSCAN-SWA 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90 | Staphylococcus_phage(13.64%) | bacteriocin,integrase,protease,transposase,tRNA | attL 177323:177339|attR 283705:283720 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
293529 : 341890
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483361|293529:341890|DBSCAN-SWA CATGATCAAAATTTATGATACCATGACCCGTTCGCTCCGCGAGTTTGTGCCCTTGACTGAAAAGACAGTCAATATGTACGTTTGTGGACCAACAGTCTATAATTATATTCATATTGGAAATGCTAGATCAGCGGTCGCTTTTGACACAATTCGACGTTATTTTGAATACGCCGGTTATCGGGTCAATTACATTTCCAATTTTACGGATGTGGATGATAAAATCATCAAAGCAGCTGCACAAGCAGGTGTTTCTCCAAAAGAGTTGTCAGATCGCTTTATTGCAGCTTTTATGGAAGATACCAAGGCGCTTGGTGTTAAACCAGCTACGCAAAATCCGCGTGTTATGGATTATATGACTGAAATCATTTCATTTGTCCAAGTACTTATCGAAAAAGGCTTTGCTTACGAAGTAGCTGGTGATGTGTATTTTCGGGTGGAAAAGTCAGAGCATTATGCCCAACTAGCTAATAAAACCCTCTCAGAACTGGAAGTTGGAGCAAGCGGTCGGACAGATGCTGAGACAAGTTTGAAAGAAAACCCATTAGATTTTGCCCTCTGGAAATCAGCCAAGACAGGTGAGGTTTCATGGGATAGCCCCTGGGGATCTGGTCGTCCAGGCTGGCATATTGAATGTTCTGTGATGGCTACTGAAATTCTTGGTGACACCATCGATATTCATGGTGGTGGCGCTGATTTGGAATTTCCTCATCATACCAATGAAATTGCTCAATCTGAGGCCAAAACAGGCAAGACTTTTGCTAACTATTGGATGCATAACGGGTTTGTCAATGTCGATAATGAAAAAATGTCCAAGTCACTAGGTAATTTTGTGACCGTTCATGACATGTTACAAACCGTTGATGGTCAGGTTTTACGCTTTTTCCTTGCCACACAACAGTACCGAAAACCAATTAATTTCACAGATAAGGCTATTCGTGATGCGGAAGTCAATCTCAAATACCTCAAAAACACTTTCCAACAGCCTCTGACAGAAACGGCAGATGAGCAAGAGCTAAAACGCTTTGTCACAGCTTTCCAAGACGCTATGGACGATGATTTTAACACAGCAAATGGTATTACCGTAGTGTTTGACATGGCTAAGTGGATTAATTCTGGTTCTTACACTGGAATGGTTAAAGAAGCGTTTGAAAAAATCTTAGCCGTATTTGGGATTGTTTTTGAAGAGGAAGTTCTGGATGCGGATATTGAAGCTTTGATAGCCAAGCGACAAGAAGCCCGCACAAACCGTGATTTTGCCACAGCTGATGCTATCCGAGATCAGTTAGCAGCTCAAGGCATCAAGTTGCTAGATACCAAAGATGGTGTGAGGTGGACACGTGACTAATCCAGTTGATGTGAATTTGATCAATGGCATTGCCCTAGCCTTTGAGGGGGATGCGGTTTATTCCTACTATATTCGCCGCCATTTGATTTTTCAAGGCAAAACGAAACCTAGCCAGCTGCACCATTTAGCGACGAGATACGTTTCTGCAAAGGCACAAGCTAATCTGATTCAGGCTATGTTAGAAGCGCAGCTATTGACCGAAAAAGAAGAAGACATTTACAGACGTGGTCGCAACACCAACAGTCACACCAAAGCTAAAAATGCGGACGTGGTGACTTATCGGATGTCAACAGGATTTGAGGCCGTCATGGGCTATCTTGATATGACTGACCAAAAGGCTCGTTTAGAAGAATTGATTACATGGTGTATCACCTATGTGGAAAAGAATGCATAACCATGCGCGAGAGTTCTCCTAGGAGGCTCTCTTTCATTGTTTCAAAATAATCGTGTATGCCATTTTTGCTAGTGGCATAGAACTAATGATGATGACATAATATTGAGGAGGATTTAATGCAAGCTAGCTATTTAAAACCAATAGGAGCAGCCCTGTCAACAGGAATTGTCATGATGATTGCTGTGCTGATACATAATTTAACGCTAGGGACATTAGGAGTACTGGGAGCTTTTGCCTTTTTAGCTTTTCAAGACCGCTCGGTTTACTATAATGTCAAAGCTATTTCCTTACATGGATTGGCTTTATTAATAGCGTTTCTCTTAGGAGCAAGTACAGCTTATTCCCCATGGTTACTGCCTTTTGTCACAGCTAGTTTGTCATTTGGGGCTTTTTTAATCACTAAACTTTACCGGATTCCTAAGCCAGATTATTTTTTTGTGTTAATGGTTTTTACTACGGATTACAATTTTCAAAAACCTCTTCATGAGATTTTAACCTATCATGTTTGGGGACTTCTTCTGGGAGTAGTGGTTTCCGTTATAGTAGGTGTTGAAATTTCACGACTGTTAAACTTACCATTTTCCTTGTGGCCTTACGTCCCAAAAAACCTAACGTTAAATCAGCGCTACCAATTCATGTTAACCAAGGACCCCACAGTTTTAGTAAAGGCTAGTCATTTTTCCAGCATCTTATTTGTCACCAGTTATATTGCCTACCTGTTAATTGATAAAGGAGGTTATTGGGTCTTAATTTCTTCAGCAGCTGTCTTGTCTGGTGAACATCTAGAACACATCAAAAAAGAACAATCGGACGTGTTCTAGGAACGATAGTCGGTATTGTGATTGGACTAGGTATTATCCAGCTTCATGTCAGTGTTACTTATCTGATTTTACTGCTAGTCCTCTTTAATTTTTTAACCGAATACTATATGCCCAGACAGTATACGATTGCTAATTTCTTTACCAATCCTCAAGTGATTATTTTAATGGCGCTGTCGAATTATTTTAGACATTCTGTCTTAACCATTCGCTTTTTAGGTGTGTTCATAGGCAGTTTACTGACGCTTTTCATTATTCTTATTTTGGAATACGCCCTTCAAAGCATGACTGACCACAAAGCAACCATTAAAGAATGGGTTGACGACTAAAGAAAAGCTCTTTAAAGGAGATTCAGACTGAAGAAAAAGTCTACTCTCTTCAAAGTTATTATTTTTTATGATACTTGACTTAGGTAGCACGGACGGTAGCAACGCCTTACTAGATTTTTAACCTAGGTCTTAAAATTTCCGAATGCCAGAAATGTCATGTTTCTGGCGTTTTTGATTGGGCGTAACGTATGAGTTTGGATCCGCTTATGCCTCATAGGATGCAAACAGTGATACTATTTTTTGAGGAAATGATAGACAAATTCTCTTAGAGGAACTTGCTGACTTTTTAAAGAAATAATTGTAATATATTTGAAATATTTTTAACAAAAAAGACACAAAACTATTGCAAAAATTTTCGAATAGATTATAATGAAAGAGTAAAAAAACGAAACACAGAGGAGGTCCCTGTTATGACATCTATAAAAAAATCACTTGGATTAATCTCAACCACTTTACTTATAGCTTCTGTTTTATCTGTGAGCTCGCCTTATGCTGTCCATGCAGAGGACAGTCAACCAGACAAGGTGACCGCAGAAACCAAAACTAATCAGGTTAATGTGGACGCAAGTATGCGTGGAAATGAACCGTATATTGACGCAACTATTGCGACCGAGCAACCGGTTAGTCAATCTGCTCAAGCAACTGTTATGCTTCAAGATGCCAATGGCAATACCATTACCAGCTGGGTTTATACCATGACACCAGGACAACGTCGATTTACAGCTTGGTTTGATTTAACTGGTCTAAAAAGCAATGATTACCGTGTTGCGGTGAGTGTTCAGGACAAGGAAGCGGTGGCTAGTGGTCAATCGACAGCTGTTCATTTTGATCAGACTAAAGCTAAAAAATCCCCAACAAGTAATGACAAAAAGACCACAACACCCAACCAAAACAGCCAGTCTACTGCTAGCACTACAACTGATGGCCAGCAGTCAAACTTGGCTTCAGGGACAAATGGCAATGCTAACCAGCAAATAACAAGAACAACCCAAGGGAATACTTCTCAAAAAACAGCATCTGCTAAGGTTACTTCAGGTGCTCACGAAGATAAAAACCAAGGCACTAAAATGTTAGCAGACCGAGAAGAAGAGAAGACGGAACCTAAAAAAGGATTTCCTTGGCTTTTATCAGGTTTAGTGGCAGTCGTTGCTTTGAGCTTGTTTCTTGTTATCCAAAAAGTCGCTAAGCGAAAATAAATGAGCTGACACATCTATTTTGAGGCATCCGTGGTATAATAAGAACTATGAAAGATAAAGATACTATTGAAACAAACGACATCGTTTATGGTGTCCATGCTGTGACGGAAAGTCTCCATGCTAATACAGGAAACAAACTCTATATCCAAGAGGATTTAAGAGGAAAAAACGTTGATAACATCAAGCGTTTAGCCACTGAGAAGAAGGTGTCTATTTCCTGGACCCCTAAGAAAACCTTATCAGAAATGACAGAAGGAGCAGTTCATCAAGGTTTTGTTCTTAGAGTATCAGCCTTTGCTTATACCGAGTTGGATGTGATTTTAGAAAAAGCAGAGCAAGAAGACAACCCTTTGATTTTGATTTTAGATGGTTTGACAGACCCTCATAATTTAGGGTCTATTCTGCGAACAGCTGACGCGACCAATGTGTGTGGGGTGATTATACCTAAACATCGTGCCGTCGGCGTCACACCGGTTGTTTCAAAAACGTCAACAGGAGCTGTCGAGCATGTTCCGATTGCCCGTGTAACTAATCTCAGTCAAACGCTGGATAAGCTGAAAGCAAAAGGATTCTGGACATTTGGTACAGACATGAATGGAACACCCTCGCATCGTTGGAATACCAGCGGGAAGTTAGCCCTGATTATTGGAAATGAAGGGAAAGGGATTTCGGCCAACATTAAAAAACAGGTTGATGAGATGATTACGATTCCGATGAACGGTCATGTACAAAGCCTAAATGCTAGTGTCGCGGCAGCTATTTTGATGTATGAAGTTTTCCGTAATAGACTATAACTAATGAAAAAACGTATTTTGTTAGTTGATGGTTATAATATGATTGCTTTTTGGCAATCTACACGTCAACTATTTAAAACCAATCAGCTAGATCAGGCACGTAACATACTTTTAACAAAACTTA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MVAQKRKGLFTKLSIAGLIFGLSNTSLVPLISTQVVSAESNQIAMKDGAILHAWCWSFNTIKQNMKAIKDAGYTSIQTSPINAVIPGDNGSKDLKNWYFHYQPTDYTIGNYQLGTEDEFKAMAAEADKYGINIIVDAVLNHTTTDINAVSEKIKAIPDWTHGNQGIENYNDRFQLTQHALLGLYDLNTQNKAVQEYLLNYLKQAVADGADGFRFDAAKHIELPGEFNSDFWTNILANSGAKFQYGEVLQGGASNEAGYGQIMSVTASNYGKFIREVLKRRYVENDHLINFQMGNVPDDKLVTWVESHDTYANKEEESTKLSDEDIKLGWGIVAARNEGAPLFFSRPVGGGGQHGRFPGTTKIGDAGSDLFKDPTIVAINKFRNAMNGQSEYIRNPNMDQGLVMIERGGKGAVITNLTSEEKGIHSETTLADGQYKDIITGHIFEVSNKQISGKMAPRIVAVLYPITQ >LS483361|293529:341890|326929_327403_+|SQF66212.1|DBSCAN-SWA MQKSKTRQMSLLAVLTALTIVLGRFVMVPTPTGFLTLLDAGIYFTSFYLGATQGAIVGGLSGFLIDLIAGYPQWMIHSLIAHGAQGYFAGWTGYKRWLGILLGSVIMVVWYFLGSLMLGYGLAGSLAGILGNVMQNTFGLLVGYLIFRAMIAFQKNK >LS483361|293529:341890|314259_314544_+|SQF66203.1|DBSCAN-SWA MKKLLVMCGSGIATSTVVMGKVKAWVAENGYTDKVQLFQSKIAEEINHIDDYDVVISTTVVPDSVKDKVIMGLPLLTGIGTDQLWEEVKKEIEA >LS483361|293529:341890|295383_296088_+|SQF66178.1|DBSCAN-SWA MQASYLKPIGAALSTGIVMMIAVLIHNLTLGTLGVLGAFAFLAFQDRSVYYNVKAISLHGLALLIAFLLGASTAYSPWLLPFVTASLSFGAFLITKLYRIPKPDYFFVLMVFTTDYNFQKPLHEILTYHVWGLLLGVVVSVIVGVEISRLLNLPFSLWPYVPKNLTLNQRYQFMLTKDPTVLVKASHFSSILFVTSYIAYLLIDKGGYWVLISSAAVLSGEHLEHIKKEQSDVF >LS483361|293529:341890|314545_315385_+|SQF66204.1|DBSCAN-SWA MKADMSQVLQAAKACHYAVPAMNYIDFASAKAYASVSEKRKLPLILAFAQSHSQWLSLEEAALIGRYFQQTLSTPVVLHLDHGQDSAFIKKAIDLGFNSVMIDASLDSFDENVKKTREIVDYARARGVAVEAEIGFVGANANQENHRETESIYTSLEDAKLFYEQTLVDALAISIGTAHGIYRGQPKLNFERLTEIAAALPIPLVLHGGSSSGDDNLARCAREGIAKINIFSDMIAAAYQHRLDSKITDYPSLMSTMQVAMEKVLDHYYDVFGTTRGGS >LS483361|293529:341890|330930_332304_+|SQF66216.1|DBSCAN-SWA MVSSRRKKITVASLVTGVMLGTAGLGWFWSQHTQKVEMKDGAILHAWCWSFDTIKDNLPAIKKAGYTSIQTSPINQVVEGEDGSKALTNWYYHYQPTDYTIGNYQLGTEADFKALTKEADKYGLHIIVDAVVNHTTSDVAAVSPKIKALGKWTHGNEGIKDFGDRYQLTQKSLLGLYDLNTQNKAVQEYLLAYLKRAVADGADGFRYDAAKHIELPKEYGSDFWSVILNNGAQFQYGEILQGSTSKEADYAKLMGVTASDYGEFIRNSLRQEEVYAEDLMDFQAPGVPEDRLVTWVETHDTYANDNGESTNLTDQDIILGWSLIASRKEGAPLFYSRPVGGGGQNDRFPGQSEIGDAGSDLFKNKTIVAINHFRNTMNGRDEYLHNISDDQGLVMIERGGKGAIITNLASENKTFSTSTKLADGSYKDAVSGKVYKVSGKTLKGKLPKKSVLVLLPA >LS483361|293529:341890|323228_323711_+|SQF66208.1|DBSCAN-SWA MSLETGEVFEKVKPIILKLKRHYYLQLWETDDWLQEGHLVLVKLLERHPELVGDEARLYRYFKTKFSSYLKDVLRRQESQKRQFDKMAYEEIGDVAHAIPAGGLWLDDYVAYREVLVQVEEALSEADRKQFQALVRGERFKGRQALLRKVRPYFSGFDQG >LS483361|293529:341890|334008_334575_+|SQF66218.1|DBSCAN-SWA MKLDVFAGQEKSELSMIEVARAILEERGRDHEMYFSDLVNEIQNYLGKSDADIRHALPFFYTDLNTDGSFIPLGDNKWGLRSWYAIDEIDEEIITLEDDEDGAQKRKKKRVNAFMDGDEDAIDYSDDDPEDEDFTEESADIEYDEEDPDDEKSEVESYDSELNEIIPEDDFEEVDINEEDEEEEEDEE |
49 | Streptococcus_phage(30.0%) | tRNA,integrase,transposase,holin | attL 285897:285913|attR 310775:310791 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
412838 : 466623
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483361|412838:466623|DBSCAN-SWA CATGGCAAAATTGGGTCAAAACAGTCGTGTTAATAGCGATCAATTGATTCAGACCATTTTGGCAGATCCTGAAGTGGCTGATTTTATCAGCCGACACCATCTGTCACAAGAACAAATTAATCTGAGTTTGTCTAAATTTAATCAATTTTTGGTAGAACGTCAGAAATATCAGCTCAAGGATGATTCTTATATTGCTAAGGGATACCAACCTATTCTAGCCATGAATGAAGGTTATGCTGATGTCTCTTATTTGGAAACCAAAGAATTGGTAGAGGCTCAAAAACAGGCCGCTATCTCAGAACGGATTCAACTGGTCAGTTTGCCAAAGTCTTATCGCCATATTCATTTGTCGGATATTGACGTTAATAACGCTAGTCGTATGGAAGCCTTCTCGGCTATTTTGGATTTTGTGGAACAATACCCATCATTAGAGCAAAAAGGATTGTACCTATATGGGGACATGGGGATTGGCAAGTCCTACTTGTTGGCTGCTATGGCTCATGAATTGTCTGAGAAAAAAGGTGTCTCAACCACTCTTTTGCATTTTCCGAGCTTTGCCATTGATGTTAAAAATGCCATTTCAAATGGCTCTGTTAAAGAAGAAATTGATGCGGTGAAGAATGTGCCGGTGCTCATTTTAGATGATATTGGTGCAGAGCAAGCCACTTCTTGGGTCCGTGATGAGGTGTTGCAGGTGATTTTGCAGTACCGCATGTTAGAAGATTTACCGACTTTCTTTACGTCCAATTATAGCTTTGCAGATTTGGAGCGTAAATGGGCGACTATTAAAGGAAACGACGAGACTTGGCAAGCTAAACGGGTGATGGAACGTGTCCGCTATTTGGCTAGGGAGTTTCATTTAGAAGGAGTTAATCGCCGTTAAGTTTGGGATAACAATCAAGAAGAATAGACAAGTGTATTAGTGAGAGAAAGAAAAGGAGAATCATGGTTTTACCTACCGTTGCCATTGTGGGCCGTCCAAATGTGGGCAAGTCCACCTTATTTAACCGAATTGCTGGAGAGCGTATTTCAATTGTGGAAGATGTCGAAGGCGTTACTCGAGATCGTATTTATGCTACTGGAGAATGGCTTAATCGCCAGTTCTCATTGATTGATACAGGTGGTATTGATGATGTTGATGCCCCGTTTATGGAACAAATCAAGCACCAGGCTCAAATTGCTATGGAGGAAGCGGACGTTATTGTCTTTGTCGTTTCTGGTAAAGAAGGGGTGACCGACGCTGACGAATATGTGTCTAAAATTCTGTATCGAACCAATACCCCAGTCATTTTAGCCGTTAATAAGGTTGATAATCCTGAAATGCGTAATGATATTTATGATTTTTATTCACTTGGTTTGGGTGATCCTTATCCAGTTTCTTCTGTTCACGGGATCGGAACAGGGGATGTCTTGGATGCCATCGTTGAAAACTTACCAGTAGAAGAAGTCGAAGAAAATGATGATATTATCCGCTTCAGTTTAATCGGTCGTCCTAATGTTGGGAAATCTAGCTTGATTAATGCTATTTTAGGTGAGGATCGCGTTATTGCTAGTCCTGTCGCAGGGACAACACGTGATGCCATTGACACGCATTTTACTGATGCTGACGGTCAAAAATTCACCATGATCGATACTGCTGGAATGCGCAAATCTGGCAAGATTTACGAAAATACAGAGAAATATTCTGTCATGCGAGCGATGCGTGCCATTGACCGCTCTGATGTGGTCTTGATGGTTATCAATGCTGAAGAGGGAATCCGTGAATACGATAAGCGAATTGCTGGTTTTGCACACGAAGCTGGTAAAGGAATGATTATTGTCGTTAACAAATGGGATACCATTGACAAAGATAACCACACGGTTGCTCAATGGGAAGCGGATATTCGGGATCAATTCCAATTTTTGGCTTATGCTCCAATCACTTTTGTGTCAGCTTTGACAAAGCAGCGCTTGAATAAACTACCAGAATTGATTAAGCGTATTAGTGACAGTCAGAATAAACGTATCCCATCTGCTGTCCTTAATGACGTTATTATGGACGCTATTGCTATTAATCCAACGCCAACCGATAAAGGGAAACGCTTGAAGATTTTCTATGCGACACAAGTTGCGGTCAAGCCGCCAACATTTGTGATTTTTGTTAATGAGGAAGAATTGATGCACTTCTCTTACCTACGTTTCTTGGAAAATCAAATTCGTGCAGCCTTTACCTTCGAGGGAACACCGATTCATCTGATTGCACGCAAACGGAAATAAGGAACGGTCCTCTGTTAAAATAGTAATTTTAAAAAGACATTATCAGTCACTGATAAGGATTGTCTTCTGTATGTCACAGGAGGCAATCCTTTTTATGATGCTTTTTAGAGGTAGGGAAAGAGTCTTTAGCTTCAAACAAAGAAAACAAGAAAAAGGATTTTTCCAAGAAATCTCATTTGATTTTTGTTATAATGAAAAGATGGATATTTAAAACTTACGAATAGATAGTTTCATCTAAAACGCTGTAATATCAACGTTTTAGTTTTTTTGTTTAGCCATAAAAAGTAACAAAAACCATAAAAAGTAATATTTTGTCGGGGACTATGTCGGGGGATTTTTAGTTGATACTGCTCATAAAAGTCGCCGTGACATTTTCTCCTACCTCATCTTTAATGTGGGTGTATTTGCTTGTCATGTAATTAGTCGAATGGCCAAGTGCTGCTGCCATATGCTCGATTGGCACACCCGCTATTTGTCCTTGTGTAGCGAAAAAATGCCTCATCATGTGTGGAGTAAAAATAACGTCGCAATTTTTATTAACTTTTTTAAATAAGCAGTAGATGTAATGACTACCAATTGGCTTGCCTACAAAAGATGTTTTTACTTTTTCGTCGTCTCCTAAAAATAAAAAGTCAGTCTTGTTCAGGATGCGATTGGTGCGCAAGGATATTTTGATAGATGTATCGATGGCTTTTTTCAGTAGTTGTGATGTCTCGAAATCTAAATACACATATCGCTCTGAAGATGCCGTTTTTAGGGCCCCACCGTCTTTTCTGCCTCTCGTCCTTGATTCGTCTATCTTTACGACTGCACAATCTTTATCATTAAAAGTTATATTTCCTAATTTTATGCCAGCCACCTCACTTCTACGCAATCCAAGATATGTTATCCTAACCATTGCGTAGTCATAATCATCAAGCGTTAGCCTAGCAACTTTATCCCAAGCTTTAAAATCCTGCATTGATCTATGTTTATTAACAGCTTTTTTCTTGCTAGGGCCTATGTCGATAAATTTAATGATATTATCGTCTAACATTTTATTTCTGACAGCATGGTTTAACATAACACTAAAAACAGCATGTAAGTGTTTTACGGTACTTCTTGCATGCGTGTTTAGTAATTCGTTGATGTAATTTTCGTATTCTAAACGACTAATACCATTCATTTTTTTGTTGCCGAATTTTGGGCTAATGTGATTTTTAAAGTTACTGATACGCTCCTCATGGGTATCAGGAGACCACGCTCCAGCCTTTAATCTATTATCAACGTATATATCCCAGTATTCATTAACAGTTAAGTTTTTATTATAAGCAAATTCATTATTTTCTATTTTTCGCTCAATCTCGGCAAGTGCGGCTCTAGCTTCTTGTAGCGTTTTAACGTTGCTTTTATTAGCCTCCTTCTTTTTTCCTTTTAAGTAATAGCCCCTACGTACGTAGTAGCGTTTACCTTTCTGAGTTTCGTACCAGAATATGTTTGGGTATTTTGTTTTGTTGTATTTCATTCTTAAATCCTTTCATGTGTTTGACTTTTGGACGAGGTCGTTTGAAAGGATATTGGCATCACCACCTTTGTATGTTATAATTTAGAATATAAGAAAACGAGCTGTTTAAAGCTTACTTCTTATTGATTGCATATTGCCTCACGCTCTCCTCGCCAAATTTGAGCGTGGGGCTTTTTTTATTTGTCTTCATCAAATTCTAAATCTAATTCAATTATACCGTCTTCTCTAGATGTCATAACATTAAATTTCTCTTTGAAATCTTTCCAGTTAGATGAAATTCTCATAATCCCAAGAACTTTATAAATTTGAGCGTTTAAATCAGGATGTCCTATATCTGGTGTTAAAGTTTGGAAAAATCTAGCTTTATATTGACCTTTCTTTGTTTTTGGAGTTCTTCTTTTTAATTCTTCTAACACTCCATCAGGCAGTCTTTTATAAATCAATTCATTTGTCCATTTACCAACAACACCTGGACGCCTTTTAATTGATTGAACATCGTAGCTCCACCCGTTCAATCTAAAAATTTCCATATAAAAATCATCTGGAAACATCTTTTGCCATTTTAGCAATTCTTCACTAATATATGCTTTAAATATTTTTTGAAGCTCAAAACGTTCTCTCTCATATTGATAACCAGTAGCTTCATCTACTAAAGCAGTAACACCAACTTTCGCAAGTGAGCGAACTAACATTTCCGCTTTTTGTGCAGTTCTCATCTGAGCTTCTGATTTGATAGCTCCAATTTCTCTAGCTTTTAAATATAAATCTGATACTAGCGGTAAAATGTTAGCATCAAAACCTAATTGAATCCTACCATTTAAATCCATATATTCAATTTTGTTGATCACACCCCTTAAATCCTTTGATATCAATGGTTGAAGGTTTTTTGCATCCATAAAAGTAGGTATTCCGATCACACGGGTATTGCCTCTACTAGGTCTGTCCAATGCTTTAAAAACACCAGCTTGGGTGATGATTCGCTGACCGTTATTTAAAACTGCTACATCAAGAGTTGTATTATCTAAGACTAATTTACCCTCGTGAGTTGCATGTAAAACTTCATTTTCCATATTTTCTCCTAAACTCATTCACAACCGTAGCTTCGTTAGCTATGATTTTCCGAATAACTCCCCACAACCTCACCAATAATTCTAAAGTCGCTATCTGCGTCTATCGGAATGTCATCGTACTTGCTATTTAAACTGTGCAGAAATGCCCCCTCGGCGTTTATAAGCAACTG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483361|412838:466623|448265_452285_+|SQF66355.1|DBSCAN-SWA 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80 | Streptococcus_phage(55.38%) | integrase,portal,terminase,capsid,tail | attL 415272:415294|attR 463487:463509 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
504306 : 515731
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483361|504306:515731|DBSCAN-SWA GATGGCATTACTTGAAGTTAAACAGCTGAGTAAACACTTTGGTGGCCTAACGGCTGTTGGAGATGTCACCATGGCTTTGGAAATGGGTGAATTAGTAGGGCTGATTGGACCTAATGGAGCTGGAAAAACCACCCTCTTTAATCTCTTGACTGGGGTGTATGAACCTAGCGAGGGAACGATTGCCCTAAATGGTCAACTGTTGAATGGCAAGTCTCCTGATAAGATTGCCTCACTAGGCCTATCACGAACCTTTCAAAATATCCGCTTGTTTAAAAACATGACCGTTTTGGAAAATGTTTTGATTGGTTTGGCCAACCAGGGCAAATCCCATTTCTGGTCCAGCCTCCTGCGTTTGCCTAAATTTTATCAGACAGAAGCAGCCTTAAAGGAAGAAGCGCTATCCTTATTGGCTAGATTTCAGTTAGAGGGAGAGGCAGAAACCTTGGCTAAAAACTTACCCTATGGGCAACAACGTCGTCTGGAAATTGTGCGCGCTTTGGCAACCAAACCTAAAATCCTCTTTTTAGATGAGCCAGCTGCAGGCATGAACCCTCAAGAAACGGCTGAATTGACGGCTCTTATTCGCCAGTTGAAAACAGATTTTGGTATAACCATTATTTTGATCGAACATGATATGAGTCTGGTTATGGAAGTGACCGAACGAATTTATGTGTTAGAGTATGGTCGCTTGATTGCCCACGGTAGTCCACAAGACATCAAAAACAATCCACGTGTTATTGAAGCGTATTTAGGAGGTGACCTCTGATGGCCATGTTATCAGTGAAACAGTTATCGGTGAATTATGGAGCCATTGAGGCTGTTAAAGATGTTTCTTTTGAGGTTCACGAGGGAGAAGTTGTCACCTTAATAGGGGCTAATGGAGCCGGAAAAACCTCCATTTTAAGAACCATTTCAGGTTTGGTTAAGCCAAAATCAGGTAGTATTTCCTTTTTAGGACAAGACCTCTTAAAACAACCAGCCCGCAAAATTGTAGCTGCTGGGCTCTCACAAGTTCCTGAAGGCCGTCACGTCTTTGCTGGTTTGACTGTTATGGAAAATCTAGAAATGGGGGCTTTTCTTAGTCGGAATCGTGAGCAAAATCAGAAGAACCTCCGCCTTATTTTTGATCGTTTTCCAAGACTAGAAGAACGCAAGCATCAAGATGCGGCGACCTTGTCAGGTGGTGAGCAACAAATGCTAGCGATGGGACGAGCTTTAATGAGTCAACCCAAGTTGCTTTTACTAGATGAGCCATCTATGGGTCTTGCCCCCTTATTTATCAAGGAAATCTTTGATATTATTCAGGCGATTCAAAGGCAAGGGACAACGGTGCTACTCATTGAGCAAAATGCTAACAAGGCCTTAGCCATTGCGAATCGTGCCTATGTGTTAGAAACTGGTCAACTCGTTCTTTCAGGAACTGGTCAGGAATTATTAACTTCTGAAGCAGTTAAAAAAGCTTATCTTGGTGGTTAAACCACTTACTCAGGACATTTGAAATCAAAGAAAAAGGAGAAGTCATGTCAGTTAAAGATTATATGACGAAGGAAGTCATCAGCATTTCACCCGAGGAAAGTGTTGCCCATGCAGCTGATCTGATGCGCGACAAGGGATTGAGACGCTTGCCTGTTATCGAAAAGGGGCAGCTAGTTGGTCTTGTGACCGAGGGGACTATGGCAGATGCAAGCCCGTCAAAGGCAACCAGTTTATCTATCTATGAGATGAATTATTTGCTTAATAAAACTAAAATCCGAGACATCATGATTCGTCAGGTCGTGACCGTAGAACCAGACGCTAGCTTGGAAGATGCCATTTATGAAATGATGACCTACAAAGTAGGTGTCTTACCTGTTGTCCAAAACAATCAAGTGGTTGGTATTATTACAGATCGTGATGTCTTTAAAGCTTTTTTAGAGGTCTCTGGATATGGAGTGGAGGGCATTCGTGTGGTTTTGTTAGCGGATAATGCCGTTGGCGTTCTCGCCAAAATTGCGGACTGCTTGTCACAAGAAAACCTGAACATCCGGCGTACCGTTGTTGCCAATCGTTCCAATGGGAAAACAGTTATTGAGATGCAATTAGATGGAACGACAGCTCCACAATGGTTATCTGAACGGTTAGCAGCAGCAGGAATTACCGTGGAATCTGTTCTTAAAACACTTGCTAAGCCTGATCTATCCTAAAAATTGAACGCTGCCAAGAGAATTGGCAGTGTTTTTTTGAGCAATTTTTTGGTAAAATAGAACTAATATAGAACGAAGGAAGTCAAATGATTACAGGAAAACTTATCACAGTCGAAGGGCCAGATGGCGCAGGAAAAACTACTGTTTTGGAACAAGTCGTTCCTTTGTTAAAAGAGCGTCTTAGCCAAGAGATTGTGACCACAAGAGAACCGGGTGGTGTTGCGATTTCAGAGCACATTCGGGAGCTTATTTTGGATGTCAATCACACGACGATGGATCCCAAAACCGAACTCTTACTTTACATTGCAGCTCGCCGGCAGCATTTGGTGGAAAAGGTGCTACCAGCTCTTGAAGCAGGTCAGTTGGTTTTTATTGATCGTTTCATTGATAGTTCGGTAGCTTATCAAGGTGCGGGACGAGGGTTGTCAAAGACTGACATTCAATGGCTCAACAGATTTGCGACAGATGGTCTAGAACCTGATTTGACCCTTTATTTTGATGTACCTTCCGAAATTGGTTTGGCTCGTATTGCTGCCAATAAAAATCGTGAAGTGAATCGTTTGGATCTTGAAGCAGTTGATATGCATCAGCGGGTACGCGAAGGGTATTTGGTTTTGGCTCAAGAACAACCTAATCGCATTGTAACCATTGATGCCTCAAAACCTTTAGAAGATGTCGTTGGTGTTGCTTTAGCACATATTTTGGCTCTCATGGAAGCCTAGAAAAGGAGGATGGGAATGGATTTAGCACAGAAGGCCCCTAAAGTCTATCAAGCATTTCAGGATATTTTAAAGAAGGACCGTCTAAACCATGCCTATCTTTTTTCTGGTGATTTTGCCAATGCCGAGATGGCTCTTTTTTTAGCTAAGGTCATCTTTTGTGAACAGAAAAAGGATCAGACACCCTGCGGGCACTGTCGATCTTGTCAATTGATTGAACAGGGAGATTTTGCTGATGTGACGGTATTGGAACCAACAGGGCAAGTGATTAAAACGGATGTGGTCAAAGAAATGATGGCTAACTTTTCACAGACAGGATATGAAGGAAAACGACAAGTTTTTATTATCAAAGATTGTGAAAAAATGCATGTCAATGCCGCTAATAGCTTGCTAAAATACATTGAGGAACCTCAAGGGCAAGCTTACATGTTTTTGCTGACCAATGATGATAACAAAGTGCTTCCGACCATTAAAAGTCGCACACAGGTGTTTCAATTTCCGAAAAATGAAGCCTATCTCTTCCAGTTAGCCCAAGAGCGAGGTTTATTAAGAAGTCAAGCTGATTTAGTGGCCAAACTGGCTAAAAATGTTGACCAATTAGAAGATTTGGCACAAAGTAGTCATTTTTTAGAAGTGATGACTCAGACTGAACGTTTTGTTTCAATCTGGTTAAAAGACCAGCTGCAAGCTTATTTAGCCTTGAATCGCCTGGTACTGTTGGCAACCGAAAAAGAAGAGCAAGAGTTAGTTTTGACCCTTTTGACACTACTCTTGGCAAGAGAGCAATCACAAACGCCCTTTAAACAATTGGAGGCTGTCTATCAGGCTAGGCTCATGTGGCAGAGCAATGTCAATTTTCAAAACACATTAGAATATATGGTGATGTCATGATAGGTGCAATTGGAATTCGTTATGGGGAAACGGAGCTTGTCAAATACGCTCAGACAGATCAGGAGTTTCCTAAAGGGACCTTGTTAGTGGTCAAAGATGATAAAGGAAGCCATCTGGCAAAGGTCTGCCAAGTGAAAAAGACCTTTTCTGAGAGTAGTCTCCCAAAGGGATTGCCAACCGTTGTAAGACTTGCTACGGCAATGGATAAAAAGGCTTTTGAGGATAATGCCAAGTTTGCAGCAGCATCAAAGGCAGAAGTAGTGGCTTTGATTGCCAAAAATGGGCTAGACATGAAACTTATCGATATTGTCTTTCCTTTAGATCGGCATTATGTCCTAATTACCTTTTCAGCAGAAGAGCGCGTGGATTTTCGGCAACTATTAAAAGATTTAGCGGCTTATTTTAAGACTAGAATCGAACTGCACCAGATTAACAGTCGAGAAGAAGCCAAGATTTATGGGGGCTTAGGACCTTGTGGACGTCCTCTATGCTGCTCGAGCTTTTTAGGAGAATTTCCAGCTGTCTCTATCAAGATGTTGAAAAATCAAGGTTTGTCTTTGAATTCTGGTAAGTTAACGGGCTACTGTGGACGTTTACTCTGTTGTCTCCAGTATGAAGAAAGCTTTTATCAGGAAAGCAAGAAAAAATTCCCTGATTATGGTACCATAGTAGAGACAAGTGATGGTCCTGCGACGGTAGCGGCTATTGATATTTTTACAGATACCGTTAAGGTACGGTTGAAAGACCAGTTGACCTTGGTCACTTATGCTTTAGAGGAGGTTAAAGTAGGTGAATAAAAAAGAATTATTCGATGCTTTTGATGGGTTTTCACAAAATTTAATGGTTACTTTAGCTGAAATTGAAGCCATGAAAAAACAAGTGCAATCACTAGTAGAAGAAAACACTATTCTTCGCCTTGAAAATACAAAACTACGAGAACGTTTGAGCCAGTTGGAACATGAAACGGTAGCTAAAAATCCTTCCAAACAAGGAAAGGACCATTTAGAAGGTATTTACGAAGAAGGGTTTCATATCTGTAATTTTTTCTACGGTCAGCGTCGTGAAAATGATGAAGAATGTATGTTTTGTAGGGAATTATTAGATAGAAAGTAAGGGCATGCAGGTTCAAAAAAGTTTTAAAGACAAGAAAACAAGCGGGACCTTGTATTTGGTTCCAACTCCGATTGGCAATCTGCAGGACATGACC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GACCGTTACCATCAGTAACGAGATAAACATTAATGGCAGTAACCATACTAAGCTCCTTTAGGTGATGTTGATTGACGAACAGCGATGTAATGACCTTCATTATCAGAGAAGGTGAAATGAATCATGCCTTGGTATTCCATAATAGGATTGGTTGCGACACCAGCGGCCGTTAGACGTTCGTAATCTGCCTGAAGATGATCCGTTTCAAATAAAAGAGATGGAAAACCTAGATCCATACCAGGATTAGCAGCAGCCACGATTTCCTTGTTGTGTAGGTAAAAGCTTATAGCTGATTCCTTATTTGGGGCAATCTCATAGGAGGAAGTCCCTTCTTGTTGCGCTTGATCAATTAAGACAAAGCCCACTTGCTCAGACCAAAATTGTAGAGCGGCCTCTGTATCTGCGACATAAAGCATTGTTGTTGATTTTGTAATCATTTCTCTCTCCATTACTAATATTTAGTGATAAATAATTATACCTTTCCTATTGTTAAAGAGCAATTTAAAAGTATTCGAAATGGGATGTATATGCTATTGAGACATAAAAAAAGAAGGGTTCCCTTCTTTTTCTTTAGTCGAGTTGTCAGGCTACTTGGACATTATAAGTCAATATCCAAGAGGATTGGCGTATGGTCTTGGCGTTCCCCAGAAGAAATCATCTCAGAGCGGTTAATCTTATCCACAAGTCGGTTTGACGTTAACCAATAGTCAATTCTCCAACCGGTATTGTTGATTTTGCTGGTTTTGCTACGTTGTGCCCACCAGGTATAAACATTGGGAATATCTCCGTGCAAGTAACGGAAGGTATCTGTAAAGCCTCTTGCCAATAGGTTAGTAAAACCTTGACGCTCTTCGTCGGTAAAACCGGGTGAACGACGATTGCTACCTGGATTTGCCAAATCAATTTCTTTGTGGGCAACGTTGTAATCTCCCGTAGCCAAAACAGGCTTTTGAGCATCAAGTTCAACCAAGTAATCAGCGTATTTTTGATCCCAAATTTGACGGTCTTCTAAACGTCTAAGGCCATCGCCGGCATTAGGGGTGTAAACCTGTGTGACAAAAAAGTCTTCAAATTCTAGAGTAATCATACGGCCCTCGGCATCCATCGTTGTGGGGGCACCAATTTCTGGAAAGGTAATGACAGGGTTTAGTGTGTTTTTGTAAAGGAACATGGTTCCTGCGTAGCCTTTTCGAGCAGGCTCTACTGAAGAACGCCAAACATGCAAATAGTACGGAAAATAACTAAGCAGGGTCTCAACATGTTTCTTGGTAGGGCCCTTAGCAGATAATTTGGTTTCTTGAATGGCAATAATATCCGCATCTTGAGCGACTAAAGTGTCTAAAACAGCGCGTGATAGAAGGGCACGAGGAGATTCTCCTGTGAGGGCAGCATTTAAGGAATCGATGTTCCATGAGATAAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483361|504306:515731|509215_510079_+|SQF66421.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKHFEIDTKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLTSGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDNDIAVVALPGASAGITALIASGLAPQPHIFYGFLPRKAGQQKSFFESKSPYPETQIFYESPYRVKDTLANMLTCYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGSISEILSYLEETPLKGECLLIVSGSQVDSEVELTAEVDLVSLVQKEIQAGAKPNQAIKTVAKAYQVNRQELYQQFHDL >LS483361|504306:515731|514352_514742_-|SQF66429.1|DBSCAN-SWA MITKSTTMLYVADTEAALQFWSEQVGFVLIDQAQQEGTSSYEIAPNKESAISFYLHNKEIVAAANPGMDLGFPSLLFETDHLQADYERLTAAGVATNPIMEYQGMIHFTFSDNEGHYIAVRQSTSPKGA >LS483361|504306:515731|513027_513525_+|SQF66426.1|DBSCAN-SWA MTLTESYYDSPLGKISLVATDHALLGAWFLGQAYFQAGLDRLPQRGTNAILQAAASWLDTYFEGNPTAISINLAPKGTPFQQNVWEALRQIPYGETITYGQLATQVACQSAQAAGAAIGRNPLSLFIPCHRVIAAYGQLRGYAGGLDKKAWLLKHERSLITKEKK >LS483361|504306:515731|504306_505071_+|SQF66414.1|DBSCAN-SWA MALLEVKQLSKHFGGLTAVGDVTMALEMGELVGLIGPNGAGKTTLFNLLTGVYEPSEGTIALNGQLLNGKSPDKIASLGLSRTFQNIRLFKNMTVLENVLIGLANQGKSHFWSSLLRLPKFYQTEAALKEEALSLLARFQLEGEAETLAKNLPYGQQRRLEIVRALATKPKILFLDEPAAGMNPQETAELTALIRQLKTDFGITIILIEHDMSLVMEVTERIYVLEYGRLIAHGSPQDIKNNPRVIEAYLGGDL >LS483361|504306:515731|512407_512959_+|SQF66425.1|DBSCAN-SWA MEIRLAFPNEVAQVMTVIEDAKAVIAAYGSDQWQNGYPNEEVIIDDILKGHAYVALNDESSIVAYAAAIYGNEEAYNAIYDGQWRTPNQDYVTFHRIAVSKDHQGQGVAQTFLQGLIEGFDQKDFRCDTHEKNNVMQHLLTKLGYVYCGKVPLDGVRLAYQKLKESYEQADYQEIDEDSRYGL >LS483361|504306:515731|508887_509211_+|SQF66420.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSQLEHETVAKNPSKQGKDHLEGIYEEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK >LS483361|504306:515731|513521_513878_+|SQF66427.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMTELKQLVSDFEVIDVKANPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRDLGLKDKIDHLSLDEAAELLATDGMLIKRPILIKDGNVLQVGYRKPYQDLNLS >LS483361|504306:515731|506574_507210_+|SQF66417.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQVVPLLKERLSQEIVTTREPGGVAISEHIRELILDVNHTTMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGQLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLSKTDIQWLNRFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARIAANKNREVNRLDLEAVDMHQRVREGYLVLAQEQPNRIVTIDASKPLEDVVGVALAHILALMEA >LS483361|504306:515731|513928_514351_-|SQF66428.1|DBSCAN-SWA MVTAINVYLVTDGNGQEAVAFYQEVFQAKVVNLFLWKDGVPDCPKTHEHLVLNAQLDIDGIRLDLSDENPDVGYQTGVNMTASIMVDSIEEAQRIYDKLITNAKAINLPFQKTFWSPAYANITDQFGMMWQLNTELKAEH >LS483361|504306:515731|508094_508895_+|SQF66419.1|DBSCAN-SWA MIGAIGIRYGETELVKYAQTDQEFPKGTLLVVKDDKGSHLAKVCQVKKTFSESSLPKGLPTVVRLATAMDKKAFEDNAKFAAASKAEVVALIAKNGLDMKLIDIVFPLDRHYVLITFSAEERVDFRQLLKDLAAYFKTRIELHQINSREEAKIYGGLGPCGRPLCCSSFLGEFPAVSIKMLKNQGLSLNSGKLTGYCGRLLCCLQYEESFYQESKKKFPDYGTIVETSDGPATVAAIDIFTDTVKVRLKDQLTLVTYALEEVKVGE >LS483361|504306:515731|511290_512382_+|SQF66424.1|DBSCAN-SWA MSQYYFSAGPAVLSRSVLKQAQASLLDIDGRGTSILELSHRSQRFEDIIQTAEELLRELMAIPDNYRVLFLQGGASTQFSMLPLNVARGKTAYYQVAGHWGKKAYLEALTLAREIEVKPILLASSEADAFEYIPTFDPKILDAEAAYVHITTNNTIEGTALYDLPQTNGIPLVADMSSNILTYPYQVEDFAMIYASAQKNMGPAGVTVVIIDEDFLNQEPTLSSMWDYRVQAEAHSLYNTPPTFSIYVLSLVLDWLKGMGGVAKMTKRNQEKAQLLYDYLDQSRFYHNPVRYANQRSLVNVPFTCPNPALDALFIQEAEARGLYGLQGHSSVGGMRASLYNAFPKEGVLALIEMMAAFEAKYQ >LS483361|504306:515731|505070_505781_+|SQF66415.1|DBSCAN-SWA MAMLSVKQLSVNYGAIEAVKDVSFEVHEGEVVTLIGANGAGKTSILRTISGLVKPKSGSISFLGQDLLKQPARKIVAAGLSQVPEGRHVFAGLTVMENLEMGAFLSRNREQNQKNLRLIFDRFPRLEERKHQDAATLSGGEQQMLAMGRALMSQPKLLLLDEPSMGLAPLFIKEIFDIIQAIQRQGTTVLLIEQNANKALAIANRAYVLETGQLVLSGTGQELLTSEAVKKAYLGG >LS483361|504306:515731|510544_511174_-|SQF66423.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQVTRVELCDNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKNISVATMIRPRGGDFVYNDLELKAMEEDILKAIEAGSDALVLGLLTSENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDQIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKDLITYANKRIEIMIGGGVTAENCQSLSQLTGTAIVHGTKII >LS483361|504306:515731|510105_510498_+|SQF66422.1|DBSCAN-SWA MTEDQTTVLILGIYGIILAIFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWYSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIATLIIAFGKAYTAEEYHPVPHLLN >LS483361|504306:515731|507225_508098_+|SQF66418.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPKVYQAFQDILKKDRLNHAYLFSGDFANAEMALFLAKVIFCEQKKDQTPCGHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYEGKRQVFIIKDCEKMHVNAANSLLKYIEEPQGQAYMFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLFQLAQERGLLRSQADLVAKLAKNVDQLEDLAQSSHFLEVMTQTERFVSIWLKDQLQAYLALNRLVLLATEKEEQELVLTLLTLLLAREQSQTPFKQLEAVYQARLMWQSNVNFQNTLEYMVMS >LS483361|504306:515731|505825_506488_+|SQF66416.1|DBSCAN-SWA MSVKDYMTKEVISISPEESVAHAADLMRDKGLRRLPVIEKGQLVGLVTEGTMADASPSKATSLSIYEMNYLLNKTKIRDIMIRQVVTVEPDASLEDAIYEMMTYKVGVLPVVQNNQVVGIITDRDVFKAFLEVSGYGVEGIRVVLLADNAVGVLAKIADCLSQENLNIRRTVVANRSNGKTVIEMQLDGTTAPQWLSERLAAAGITVESVLKTLAKPDLS >LS483361|504306:515731|514903_515731_-|SQF66430.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTGESPRALLSRAVLDTLVAQDADIIAIQETKLSAKGPTKKHVETLLSYFPYYLHVWRSSVEPARKGYAGTMFLYKNTLNPVITFPEIGAPTTMDAEGRMITLEFEDFFVTQVYTPNAGDGLRRLEDRQIWDQKYADYLVELDAQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPGSNRRSPGFTDEERQGFTNLLARGFTDTFRYLHGDIPNVYTWWAQRSKTSKINNTGWRIDYWLTSNRLVDKINRSEMISSGERQDHTPILLDIDL |
17 | Streptococcus_phage(83.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
519994 : 626113
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483361|519994:626113|DBSCAN-SWA AATGACCTATACTCATCTTACCACAACCGAGCTTGTAATGATAGAGGCTTATTACAAAGAAGGAATAACTGTTAGCCATATTTGTCAATCCCTCAAAAGATCAAGACAAACAATTTATAAGGTCATTGCTTATCTCAAGGCTGGTCACACTGCCTATGATTACTACAAAGACTACAAAGCTAACAAGAAGCGCTGTGGTCGTCTTAAGACCCAACTCACTCAAAGTGAACAAGATTTTATTCAAAGGCATTTAGAACTTAATTGGAGTTTGGATGTTGTCAAAGGAACTTATCCCGATAAAATCCCTTGTTCTATGAGAACTCTTTATCGCTTAGCTGACCGTGGTATCTTCAAGAAAGACGATTTACCATGGAAGGGAAAACGCAAACCAAATGGTATGGCCGAAAAACGTGGCAAACAAGCTTTTAGGAGGGATATCCGTGAGCGTTCAGAAATCTATCCAGATTTTGATACAGAATTTGGACATCTTGAAGGAGATACAATCGTTGGTAAACATCACAAAAGTGCTGTTGTCACCTTGGTAGAGAAGCAATCTAAAGCTATTATCACACTTCAAACCAATGGTCGAAAAGCTAGTGACATTGAGCAGTCACTAAATAGATGGCTGTCACAATTCCCAAAACATCTCTTTAAATCTGTCACTTTTGATTGTGGGAAAGAATTCTCTAATTGGAAGACAATAGCCAACCAACACGACATTGATATTTTCTTTGCGGATCCAGGTTGCCCTGGTCAACGTGGGTTAAATGAACATTCAAATGGTTTATTAAGACGTCATGGACTACCAAAGCAAATGGATTTCAATGGTATTCCTCAGAAATATTTATCAGCTATCGCTGATAAACGAAATAGAATTCCTAGGAAATCTTTAAATTATCGAACACCATATCAGGTTTTTCTGAGTTACGTAAAATGTCTAGCTTAATTTGACAATTTGGGAAATATTAAAAAGCAAAACTTCTTACATTATTACTATTTGGGATTTATTTTATTGGAAAAATATGGTTAAATACTCAAATATTATTAATGTGAAATGAGTTATTAATTAATTTTAAAAAAACTTCATTTTAGTCCAATTTAGGAGGAAGTTAAGTGGAGAAGAAACAACGTTTTTCCCTTCGAAAACACAAATTAGGGACGGTTTCAGTTTTAATTGGAAGTCTGTTATTCCTTGCAACAAGTAGCATATCAGCAGAGGAGGTAGCAACTCCCATCCTAACGGCTAACGGAAGTGTCACTCAGTTGCCAGCGCAAGAGCATCAGGCTAAAGAGTCTCCGGTTTTACCCGTGCCTGCAACAAAGGATTCAGACATGGCAGGGGAGGTTGGAGTTGACGTTGGTAAAGGTGCTCAACCACCAATAGAATCAGCCACACAAGAAGATAATGGAACAAATAAGGGTGGTGAGGCAACAGACCTTCATCAGACCTCGGAGTTGCCTCCAGTCAATAGGGATGTTCATGACTGGGTTAAGACAAAAGGAGCCTGGGATAGAGGATTCAAAGGTCAAGGCAAGGTGATTGCGATTATTGATACTGGCATTGATGCTAATCATCAAGCTATGCGCTTAACCGATGTGTCCACGGCAAAAGTAACTTCCAAAGCAGCTATGGAAGAACGTAAAAAAGCAGCTGGCATCCAGTATGGGGTGTGGTTAACTTATAAAGTGATCTTTGCTCATAATTATGTGGAAAATAATGACAAGGTCAAAGAAGTTAAGTTTGATTTGTTTGGAGAGGAAGAGTTGGAAGGCCTTGATATCAAGGTTGATGTTCAAAAAGTTAAGTCATCCAAGCATTATCGTCCACAAGCGGTTGAGCCTCCAAAAGAAACGGTTATTAAGATAGAGGATATTCAGGGATCACTTGAGATTGACTGGCCAGAAATAGATGATGACACCAAATACGAATCACATGGCATGCACGTTACGGGGATTGCCGCAGGAAATGGCATCGAAGCAGCAGCTACTGGAGAGGGCTTCTTAGGAATTGCTCCAGAAGCACAGGTCATGTTCATGCGTGTTTTTGCAAATGATGTCATGGGAACAGGGGACTCTCTTCATTAAGGCTATTGAAGACGCAGTGGCTCTAGGAGCTGATGCCATCAACCTTAGCCTTGGATCTGCCAACGGTTCCCAACTTAGTGGTAACCGAGCTCTTATGGAGGCTATTGAAAAGGCAAAACAAGCAGGCGTATCTGTGGTAGTTGCCGCAGGAAATGAGCGCGTGTTTGGTTCTGATCACGATGATCCTTTTGTGACTAATCCTGATTATGGCCTAGTGGGCTCTCCGTCGACAGGTCGTACGCCAACGTCTGTAGCGGCCATTAATAACAAATGGGTCATTGAACGCTTAATGACCGTTGAAGGGTTACAGGATCGTGCTGATCTTAACAATGGTAAAGCGATTTATGTAGAATCTGTTTATTTTAAAGATATCAAAAACAGCCTTGGTTATGACTTGTCCTATCCGTTTGTGTATATTGAGCAATTAACAGAAGCGGGTTACACAGCTAAGGATATTAAAGATAAAATCGTTTTAATTGAACGTGATCCAGAGAAAACCTATGATGACATGATTGCACAAGCCAAAGCCCATGGCGCCGTAGGTGTTGTCATGTTTAACAATGTCCCAGGTCAGGCTAATCGTTTGATACGTTTAAATCCTCATGGGATGGTGCTTCCACTTGCCTTTATATCTCATGAATTTGGTAAGGCTATGTCAACCTTAAATGGGAATGGGACAGGAAATTTAATGTTTGATAGCAGCCTATCAAAAGCGCCTAGTCAAAAGGGCAATGAGATGAACCATTTTTCAAATTGGGGACTGACTTCGGATGGCTATTTGAAACCTGATGTAACAGCACCCGGTGGGGATATTTACTCAACTTATAATGATAATCACTATGGTAGCCAAACGGGGACCAGTATGGCTGCTCCTCAAATTGCAGGAGCTAGCCTATTGATTAAACAATATCTTGAGCAAATTAAGCCTGATCTGCCAAAAGACCAAGTAGCAGATTTGGTTAAAAATATCATGATGAGTAATGCTCAGGTCCATGTGAATCCAGTGTCAAATGTAACAACATCCCCACGTCAGCAAGGAGCTGGCTTACTGAATCTTGAGGCGGCGGTAAGCAGTGGCCTTTATGTAACAGGAAAAGACAACTACGGCAGCATCTCTTTGGGGAATGTCACAGATAATTTTTCATTTGAGGTAACTGTTCATAATTTATCTCAAGAAGCTAAAAGCTTGCGCTATGAGACAGAGTTGTTAACAGATAAAGTCAATCCTGAAGAAGGGCGATTTACCCTGACCTCTCGCTTGCTAAAAATCTATCCGGGTGAAATCATTGAAGTTCCTGCTAATGGTCAAAAAACAATCACTATCACTCTGGATGCGTCAGCTTTCACAGAAGAGCTAAGTCAGCAAATGCCAAACGGTTATTATTTAGAAGGATTTGTGCGTTTTGTGGATAGTAACAATCAACAAAACAACCAGGTTACGATTCCTTTTGTAGGATTTAAAGGCGAGTTTGAAAACCTTGCAGTCGTCGAAGAATCAATTTACCAGCTAAAAGCTAAAGGAGAAAAAGGCTTTTATTTTGATGAGTCAGGCCCTAAAGATGATATCTATGTTGGTAAACATTTCACCGGCTTAGTGACATTAGGAACAGATACTAATGTCTCGACAGCGACTATCTCAGATAATGGCTTGCATACTCTTGGGACATTTAGAAATCAAGATGGTAAATTCATCTTAGGTCGAAATAATCAAGGACAGCCTGTCTTAGCGATTTCACCAAATGGAGATCATCATCAAGATTTTGCTGCTTTTACGGCAGTCTTTTTACGGAAATACCAAGGTCTAAAAGCCAGCGTTTATCAAGCCAGTGACAAGGAACATCAATCTCCTCTTTGGCTTAGCCCGAAAAGTTTTAAAGGGGATAAAAACTTTAACAGTGATATTCGTTTTGCGAAATCAACGACCCTATTAGAAACAGAATTTTCTGGCAAATCTTCAACAGGTGCTGATTTACCGGATGGTCATTACCATTATGTGGTATCTTATTACCCAGACGTGGTCGGTGCCAAGTGTCAGGAAATGACGTTTGAGTTAATTTTAGATCGTCAAAAACCTCTTTTAAATCAGGCAACATTTGATCCAAGGACCAATCAGTTCAGTCCCACGGCCATAGAAGATCTTGGTCCGTCAGGTGTTCTAAGAGATAGTGTCTTTTACTTGGAAACTAAAGATAACAAACCTTACACCATTAGCATTAACAATGGTTACAAATATGTTTCTGTAGCAGACAATAAACAATTTGTGGGTCGTCAAGCAGATGGTAGTTTCATCTTGCCGCTTGATAAGGCAGCACTAGGTAACTTTTATTATATGGTGGGAGACTTTGCAGGTAACATTGCCATTGCTAAATTAGGGGATCATTTACCAAAAACTATCGGCAATGACTTGGTGCATCTGACACTGACAGATGGTAATTATCAGAAAAAAGTTGGTTACGAGGATAATCTTGACATGGTAGCAACTGACACCGGATTGGTTACCAACCAAGCTCAGCTAGCCGTCAGCCACCGCAATCGTCCTCACAGTCAATTGGTGACACTAAAACAAGACTTCTTTATTTCACCAAATGACGATGGTAATAAAGACTTTGTAGCTTTCAAAGGATTGCCAAACAAGACCTATAATAACTTACAGGTCACGGTTTTTGCTGCAGAAGATCAACAACGTTTAACGCCTATTTGGTTCAGTCAACCAGATGCAGACCTATCAGATATTGAAAGTACTGCTTGGCGTGGAATCACTGCTGGAGGTGAGAAAGTTCTATCTGGCAGCTACCAATACGTTATCACCTATCATGATGCCAATAATCACGCGCAGGAGAAGGTTTTCAAAGTATCAGTGAATCATAACAAACCAATCCTGACGCAAGGGAGTTTCCGTAAGGATAATGACGTTG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107 | Staphylococcus_phage(16.13%) | bacteriocin,integrase,protease,transposase,tRNA | attL 570353:570412|attR 625225:626536 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
884049 : 953366
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483361|884049:953366|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(23.81%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
969522 : 1027226
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483361|969522:1027226|DBSCAN-SWA 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59 | Bacillus_phage(26.32%) | integrase,transposase | attL 970671:970710|attR 1024325:1024364 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1362418 : 1420966
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483361|1362418:1420966|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phi-m46.1-like_phage(22.22%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1503813 : 1548086
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483361|1503813:1548086|DBSCAN-SWA 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43 | Klosneuvirus(12.5%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1859882 : 1905032
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483361|1859882:1905032|DBSCAN-SWA 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45 | Bacillus_phage(15.38%) | tRNA,integrase,transposase,protease | attL 1880905:1880920|attR 1895769:1895784 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
2031376 : 2106894
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS483361|2031376:2106894|DBSCAN-SWA CTTAGCCTCTTTCTCCAAATAATTGGGCTAAATAATCTTTCAAATGGACAGAAATATACCGTTGTTTGCGACGATAACTGAGGTCTTTTTTAGGAAATACCATCACTTTGAGAAAATATAAGCACATTTTTCGGATAAGATTTAGGTTAAATGCGGCTCTTTTATCCAATGTCTGATGATGATCTTCATGATAAACAACGTCCAATAACCAGTGCATACTCTCTATCTGCCAATGACCTCGTACACAATTGGCAAATGTGAGGACATCCGGCTTAAAGCTAAAGATAAAATAACGATCCTCTTGACTCATCTGTCCATCCTTATCAATCGTGTTACGAGTCATCCCAATACCACGTAACTTATGCCATTTGGGATGATTTTGACACAACCATTTGATCTCGGAAGACACCCAGTATTCTCTAACTTCAATCTGTCCCCTAGATTTTTCAACAGTCTGATAATACTGTCCATTTTCTTGGAGTTCTTCCAATAAGTTGACATCACTAAAATAAAGAGCAATATCATCATAAAGTGTTTCTTGATTTCCTTTGACGGCTAAGCAATAGTCTGCTTTACCTTTAATAATCGTATCAACGATAGCCGTCTGCGTGCCCATTGCATCTATCGTTACAATGCTTTTACGGATATCAATCGTCCGCAATAACTGAGGAATGGCAACAATTTCATTACTTTTCTCCTCAACCGCTACCTGTCCCAAACTAAGATGATGACCCCCATCATAAGCCGTTACAATATGAACAGGCTTCTGATTGTTACCTCGATTGCCTCGAATCGTTTTACCGTCCACTGAAATCAGTTGATGAACGGCATCTAAGCTTGTCAATGATTGCTCAAATTGAACTTTAAGCTCTTTTAAACGGTCTGAATTAACAAGACTCATCACACGCTCTAAGGTATCATGAGACGGACAACCTTCACTCAAATCAACGTAGGTCGCAAACAATGGTTCATTCATTTCAATAAAATCTTCCATCTCCTTCCAGGTTTCAATGCCAGCTAACTGACAAACGAAGACAAGAAATAGAATGGTTGATAAGGGGTAGCGAATTTTCCAAGATTGACGACTATCCAATTCACCGGCGCAATCATCAATAGCAATAATAAAATCAATCATCGTAGTCACCTCATCTATAGTGTACTACTTTGATTGATTTTGTCATTATGAATCTAGTTTTCTGAAAACAAAAGTTTCTTCATGCGTTTGGCGTGGACGCGATGTGTTACTAATTTCAGATTTTTCAAAATATTTCACGGGGATTGGACATTCCTAAAAAGCAGGCAGCTGGAAAACTCCTCTGAAAACATCCAAATATCCCGACATAAGCTAAAAAACGAAACACAAAAGGGCTATCTGCCCTTTTTGGGAATTGGTTGGTGATGGAATTAGTCTTCTTTGCGTTTTGAAGAAACGGCAACCATACCTGCACTTGCCATAACTGCAAATGCTGCTGCTGTGAAGAATGGGTTAGCAGCTTCGCCTGTTGATGGAAGTTTTTTCTCATCTTTCTTAGCTTCTGCTGGTTTGTCTTCTTTCTTAGCAGGTTTGTTTTCTGGTTCAACTTCTGGTTTAACTTCAGGAGATTTTTGTTCTCTCAAGAAGTCTACAAGACCTTCTGTTGCGTTAGCAATGTTCTTAGCTTTATCTTCTTCAGAAGATACTTTCCCTGAACGCAAGTAGTCAGTTAGACCTTCTGTCGCAGTCGCCATATTTTGTCTCGTCTCTTCTTCAGCAGCAACTATGTTATTAATAGTATCTCGGAAATCTCTTAGTGTAACTACTTTATTTGCTTTTTCAATTAGTGAGGCTTTTTGACCTTTAGTCAATTCCTTGCTTTCAGTAATTCCTTTAACAAAAGTTTCTCGCACTTCTGTAATATTAGTATCAACCGCAACTCTAATTTGATTTTCTAACACTTCTAATTCGTCTAAACTCTTAGCTGCTTTAATTTTGTCATAAAAAATATTGATATCTTCAAGTGGTAAAATAGTCTGCTCACTAAGCCATGAATTTAAATTTTCTTTTACTGAAGCAACTTTTTCATCATTTGAACTCACTTCAGCAACTAATGTAGCAGTTATGTTTCTAATCACATATCCCTTATCCATATATGTATCATATTTTGATAAGAAATCTAGTCTTAACTGTTCTTTTCTTTCTACTGGAAGGCTTGATACTGCTAATTCATCTAAAATTTCTTTAAATTTTTGTCCATTCATAGCAGAATTAACGTCATGTCTAAGCTTAGTAATTATTTTATTAGGGTTATCTGAGTTATAGTTATTAGACATAAATTCGTCATATTTTGACAAAAGATTTTGCTTTAGCTGCTGTTTTCTATCTTGAGAAAGGCTTGAATCGTCTATACTATTTAAGATATTTCTGAATTCATACCCTCCTACAGCTCTTTTAGATCCTTTTAGAGCATCTATAGTTTCATGAGAAATGACTGCATTATCCACTAACTCAGTTGCTTTAGCTCGAGTTTCTGCATCAAAATTTGTATCTGCAATTTCTTGACGCGCCTCACTACTGAGTCGTTTGATGGTTTCTAAATTATTCCCATTATCCGCAGCTACTGTGCTACCTAAGATAAATACGGCTGATACTGAGGCTAACCCGAAGGCTGATTTTCTCAAGTAATACTTCATTTGTTTGTTTCTTTCATTCCTATTCCCCTTTAATGATGTGAAGAAAACGTTATCCTAATTATCATCATTTATAATCCTAATCTTAGTTGTAAATAGTCTTAAAGTTAATGTCGAGGTTAAAATAATATTTAGTTAACTTTCATCGTTTTACAAGGAATTTCATGATAAAATAGCAAATTGGCGCATTTTTTAATATTGAAATATTAAAAAATCGGACGATTATATTTTCTCATCCGATTCGTGTTTTTTAAAAGATTAAAACATTAAAATATATTAGAAATTTTAATGATTATAGTTCTGCGATTTGGTAAAGTTCAACTTCGGCTACTGTTTCTGATCCAAACATGTTCAACATCAGTTTCACCTTGTTATTTTCAATCTCAACCACACGGCCTTCTTGTCCCATAAAGGCACCGTCGATGATTTGAACCACATCGCCCTCTTTGATATTGGTATCAAAGACATCAATGGTTTGCCCCATAGATAATAGGATGGCACGGATTTCTTCTTCAAGTAGTGGCGTTGGTTTAGAACGGTTCCCGTGTGAACCCACGAACCCAGTAACGTTTGGCGTGTTACGCACCACGAACCAAGCTTCATCTGTCATGACCATTTCTACCAATACATACCCTGGGAAGCGGTTTTCTTCGATTTCTTTGGTTTGCCCATTTTTTTCCACGTTAACGGTTTGCGTTGGGATTTCCACGCGCAAAATATTGTCCAACATGTTGTAAGTCTGCGCACGTTGCAAGAGGTTTTCTTTCACCTTGTTTTCGTAGCCTGAGTAAGTTTGGAGGACGAACCAGCCCTTGTCAAAAGAATCTAACATGATGTTTCCTTTCATTATAAAAAAGCCTCTTTTGGCTTTTGCGATGTTTTCTATTACCCTCATTATAATAGAAGAACCCGTCACTGTCAATGAAAGACCTTCCTCTTGACACTTTCGAATCTCCTTTTCAACCTGAGCTATTAAGCACTCAAAAAGGCTGGGAATAATTCCCAGCCTGGCTTTTCCAAGCGATGTTTTCCAATTTCTTTTAGTTAACTTAGAAGAAATTGATCAATGATAATACGCCTTTTGACAACAACTGGTCAAAGATATAGATAATCACCGTAAAGAAAGCTGTGTACTCAAGAACTGAGATAAAATCTTTCCAACGTTGCTTACGGTCTGGCCATGTTGTGTCTTTTAAGACTTTAAAAATCCCACTAATGAATCCCATCAGGCTCTCCTCTTAACGTGTTTCCTTGTGTAAGGTATATTTTTTACAATACTTGCAAAATTTGTTGACTTCTAGACGTGTTGGTTTTGGGGTGCTGCTTACTCCGATAGAGTAGTTGCGGCTGCCACATTCGACACACGCTAGGCTTGCTTTTTTCTGTGCCATAACGCCTCCGTAGTCCATATTCTACCATGATTTTTAGAATTCCGCAAGCTATCTGAAATAGTCCACAATACCGTTCCAGATGGATTGGGCTTTATCACGCAAGCCGGATTGATCAACGGCATCAGATAAGGATTTTGAGGCTTCCTCAGCTGATTTTCTCAAGCCATCAATGATGGACTGGGAATCAATCCCTGCCTGGTTACCCGTTTCATTAATCCCATAGACAGCTGCAATGCCATTTTGAGCGTAAGCATTATCCACATGAAATTGGCTTCCTTTTGTGTAAGGGAGGATATAAGAAGCTTGGGTACTAAAAATCGTTGAGGCTGTTCCTGCACTGGAGTCGGTCAGGTAATGGTTTTCATCGGTCTGGTTAAAGCCCACCCACTGGCTGATGACCACATCTGGGGTGTAACCAATGACCCACTGGTCTCCTGCAACATCTGGGTTAAAGCTCGTTTCGGTGGTTCCTGTTTTTCCAGCCAAGGTGTAACCATAGACGTTAGCGTTAACGGCTGTTCCGTTTGAGAAAGTCCCTAACATCATACTTGTCATCTTGTCAGCAACAGATTGGCTAATCACGCGCTTAGCCTTATCGGTAAAGGCTTTGACCACCTCACCTCTGGCATTTTCAATGCGGGTGATGAGATGAGCAGGGTGAATCACCCCATTATTAGCAAAGGCAGCGTATGCCTGAGCCATTTCCAATGGATTGGTGGTCACACTACCGCCGAGAGCTACGCCCAACTCTTTTTTGGCAGAGGTCATGTCTAGACCGAACTTTTTCCCATAGGCAAAGGCCTTATCAATACCAATGTCATTTAAAGTCGAAACAGCTGGAATATTGTAAGAATTGGCTAGCGCTTGATACATGGGCACGTCTTCTGATTCGTAGTTGCCATAATTGTGAGGCTGATAGCCGTCAAAATCTTGAATCGTGTT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88 | Streptococcus_phage(53.45%) | integrase,head,terminase,transposase,capsid,tail | attL 2058778:2058798|attR 2104309:2104329 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
2152723 : 2164222
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS483361|2152723:2164222|DBSCAN-SWA GCTATAACAACTTTTTCAATTCGTAAAGGGTTGTCATTGCTTGAAGTGGAGTCATGTTCATCACATCAATAGCTTCTAACGTGTGAATAATCTCCTGAGACTTATCCTCATCAGGAAACAGCGATAACTGTCCCTCTCTAGCAGCGCTGCTTGGCTCAACTTGTGAAGGGACTGATATTATCTCAGCAGATTGTGCTTGCGCTTCTAAGCGCATAAGCACCTCATCTGCTCTGCTTAGCAGGGCCTCAGGAAGTCCTGCTATTTTTGCTACATGAATACCGTAAGATTTATCCGCCGGTCCTTCAGCAATCTTATGAAGGAAGGTTACATCGCCATCTTTTTCAAGCGTTGCTACATGAACATTGACTAGACTTGTCAACTTAGTTGACAAGTCTGTCAACTCATGATAGTGCGTTGCAAACATGGTCTTAGCACCAACTCTATCATGGATATACTCGATAATTGCCTGAGCCAGTGCCATACCATCATAAGTTGCCGTACCCCTCCCTAGTTCATCAAATAGAATAAGGGAATTGTCACTGGCGCGTTTGATTGCTTGGTTGGCTTCCATCATCTCCACCATAAAGGTTGATTGCCCAGAAATCAAATCATCAGCAGCCCCAATACGCGTAAAAATCGCATCAAATAGAGGCAAATCAACATGGTCAGCAGCCACAAATGAGCCCATCTGGGCCATGATAACCGTTAAGGCCAGCTGTCTCATATAAGTAGACTTACCGCTCATATTTGGACCTGTAATCAATTGAATGCTTGTCTCTTGGTTAAAAGAGATACTATTGGGAATGTATTCCTGCACTCCCATAACCTTTTCAACAACCGCGTGACGACCTTCTTGAATTGTAATCACATGATTATCATTGAACTGCGGCCGGATATAATGATTGGTTTCGGCAACGACTGCTAAACTTTGCAAAACATCCACCGTTGCCAAAGTTTTAGCCAGTTTCTGTAAACGATTAATATAGGTTTCAACTTGAGCTCGAATACACATAAAAATATCGTATTCTAAACTAGATGACTCTTCCCTAGCCTCTAACATCTGACCTTCAATCTTAGCCAATTCTGCTGTTCCATAACGTTCAGAATTTTTTAAAGTTGCCTTTCTGAAAAAATGCTCGGGAACTAAGCTAAGATTTGAATTCGTAACGTGAAAATAATAACCATCTTTTTTATTGTAATCAATTTTTAGGTTATTAATGCCACTTGCTTGACGCTCTTTGGCCTCAATATCCGCAATCCAGCCTGTCCCCTCTCGCATTACTTTACGATAATGGTCCAAGCGCTCATCAAAACCATTGCGGATAATACTTCCTTCACTAATAGTTGCTGGTGCATCTGGATCAATGGCTGTTCTAATCAAGTATTCCAACTCAGGCAAACTGTCAACATCATTGACAAGTTTGTCAACAAAAGGACTATTAAAAGACTCTAAGATAGCTTTGATATAAGGCACTTGGGCTAAGGTATGCCCCAATTGAAGTAAATCTTTCGGATTTGCCTTGCCAAAAGACACACGGCTAGATAAACGTTCGATATCGTAAACACCTTTTAAGCTATTGCTTAAATCTGTTCGCTCAATAAAAGAATTCAGAAAAACTTGAATAATTTCTTGACGCTCTAAAATAGCTTCTTTAGAAACCAAAGGTCGATCAATCCATGAGCGCAAAAGCCTCATCCCCATAGCTGTCTTGGTTTCATCTAAAAGCCAATACAGACTCCCATGTTTTTTATTCGTTCTAGCATTCTCTACCAAATCTAAACTTGACTTAGTGGCATACGACATCTGCAAATAATCCTTGATTTCATAGTGAACCAAGGCTTGCAAGTGGCTGAGTTCTCGCATTTGTGTTTTGTGAACGTATTGCAAGAGTTTTCCTGCCGCTGTCAGTTCTACCGTTGTCAATTGACCGTCAATTAAAGATTTATCTTCATAGACCGTTTCTTCATAAGAAAGCAGCAAATTCATCTGCTTGACCAAAATCGTCTGTTCTTCTTCAGATAAATCAAAACCTAGTAAGACTTCTTTTGCCTTGAGGTTTTGGATTTCGCTACGAACACTCGTAAAGTCCGCCAAATCTGTCACGCAAAATTCACCTGTGGATACATCCATATAAGCCAATCCATAACAGCAACCATCAAAGTCAACAGCTACCAAAAAGTTATTGGCGCTATCTGGCTTAGCTGAATCCACAACCGTTCCAGGAGTGATGACTTGAACGACCTCACGCTTCACCACTCCAACAGCTTGTTTGGGGTCCTCCATCTGTTCTGCAATAGCCACCTTGTAACCCAACTCAATTAACACATCAATGTATTGCTGGGCAGAATGATGTGGCACTCCTGCCATGGGAATTGGATTTTCCGCATTCTTGTTGCGACTGGTCAAACCAATCTCTAAAAGTTGCGCTGCCTTGACTGCATCATCATAAAATAATTCATAAAAGTCACCCATCCTGAAAAGCAAAAAAGCATCTGGATAATCTTTTTTGATGTCCAGATACTGTTGCATCCCAGGAGAAATGTTAGCTTTTGCCATTCGTTAGCTCCTCGTTTAATTGTTCTTCTATACGTTTGGTGATGTATTGAATCAAATCACTTGCATCTTGCATTTTCTCACGATAATCATCAATCACGGGTTGATGGTTGAGATGATGTTCTAATTCTTTGGCCTTGTTTGAAGACACAGCGGCAGCTTGAGTTTTCGCTATCTTTTGGAATAGCTCCGCCTCTTGCTGATAACGTTTCATCTGGTAAGCTTGGTCTTCAAACTGATCAAGCTGAGATAACTGCTGTTTGGCTGCTTTATAGGCAATAATGCTAGGGTGAGCATTGATAGCCACGATTAAATCCTTCAAGGCATTTTGATAGCTTGTCATAGGCCAGCTGCCAAATCTTTTTCAAAACGCTTGGCAATCTCTTCATCACGACAAATCACCAATAAAGTATCTGCTCCTGCAATAGTTCCTAAGATATCTTCAATGTCGTCATTGTCAATCAGATTAGCCAATACATCAGCCTCTCCTAAGTTAGTGTGGAGAACAAGCATAAAACCAGCGCGATCAACTGATAACACATAAAAACGCACCTCAGGGCTAAAGGGGGTCGCAACAGGTTCAGACAAACTATAATAGAGTTTGCCTTGCTCATCCCTTAATTTCAAGAGACCAATTTCCCTCAAATCACGCGATAAGGTGGCTTGAGTGACGACAATACCTTCTTTTTGAAGAGCTTTCTTAATATCTTCTTGTGTGCCAATATGCTCCGCTTGAATGATTTGTTTAATTTGATGTTGTCGCTCTATTTTATTCATGATAGATCACCCCAATTGTATAATTATCCTCTCAAATTATAACAAAAAAACTGTATTTTTTCATCTTTCCCCTGTTATTTACTCCATTTTTTAAGAATACGAAAAGGAAACGTCACTAAAAACGATTGACAGTGAACGGCGTTGATCTTTTGACAACTTCTCCTAAAGAAATTTTGTAAAGCAAGAAAGACCTTTGAATTTGACAGTATAAATTATCAATCCTCTCCTCGTTTATTTTAAAGAAATATGTTAGAATAGGGTGACAAACAATTTTTAGGAGACGCTGTATGGATACTAAAACTCTAATCGCAAGTGAAATAGCCAAAGTTGTTCCAGAGTTAGAACAAGATGCTATTTTTAACTTGCTTGAAACCCCAAAAAATTCTGACATGGGAGACCTTGCCTTTCCAGCCTTTAGTTTAGCAAAAGTCCTTCGCAAAGCCCCTCAAATGATCGCAGGCGAATTAGCTGAACAAATCGATGGGAGCCAATTTGAAAAAGTCGTAGCTGTCGGCCCTTACATCAACTTTTTCCTTGATAAAGCTAAGATTTCCTCACAGGTCCTTGAACAAGTGATTACAGCAGGTTCAGACTATGCTCAGCAAGATGAGGGTCAAGGGCGAAATGTTGTTATTGACATGTCAAGCCCAAACATTGCTAAACCATTTTCAATCGGTCACCTCCGCTCAACTGTTATTGGTGATAGCCTTGCTAATATCTTTGCTAAAATGGGTTATCAACCTGTAAAAATCAATCACCTTGGTGACTGGGGTAAACAATTTGGTATGCTAATTGTTGCCTACAAAAAATGGGGAGATGAAGCTGCTGTCCAAGCACATCCAATCGATGAACTCTTAAAACTTTACGTCCGTATCAATGCTGAAGCTGAAACTGATCCCACCGTTGATGAAGAAGCTCGTGAATGGTTCCGTAAATTGGAAGATGGCGACAAAGAAGCTACTGAATTATGGCAATGGTTCCGTGACGAGAGTTTGCTTGAGTTTAACCGTCTCTATGACCAACTTAATGTAACCTTCGATAGTTACAACGGTGAAGCCTTCTATAATGATAAAATGGATGAGGTTCTTGAGCTATTAGAAGTGAAAAACCTTCTTGTAGAATCTAAAGGTGCCCAAGTTGTTAATCTTGAAAAATATGGCATTGAACACCCTGCCTTGATCAAAAAATCAGATGGCGCTACTCTTTACATTACCCGTGACCTAGCTGCCGCACTTTACCGTAAACGTACTTATGACTTTGCTAAATCCGTTTATGTTGTTGGTAATGAGCAAGCTGCTCACTTCAAACAATTAAAAGCAGTGCTAAAAGAAATGGGTTACGATTGGTCAGATGATATGACACACGTTGCTTTTGGACTTGTCACAAAAGGCGGTGCTAAATTATCAACACGTAAAGGTAATGTTATTCTTCTTGAACCTACGGTTGCTGAAGCCATTAACCGTGCAGCTTCTCAAATTGAAGCGAAAAATCCAAACCTTGCTGACAAAGAAGCCGTTGCCCATGCCGTTGGTGTTGGTGCCATCAAGTTTTACGATCTCAAAACAGATCGTATGAATGGGTATGACTTTGACCTTGAAGCCATGGTTTCCTTTGAAGGAGAAACTGGACCTTACGTTCAATATGCTCATGCTCGTATCCAATCTATTCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS483361|2152723:2164222|2160619_2161519_-|SQF67983.1|DBSCAN-SWA MTVDQRLQLKNFCFIILGAAIYAFAFVYFYLANRIAANGLAGLTLVGKALFDIDPSLTGYLINLPLVLLGAKLFGKRAMVYTVTGIFSLYFFVWVFQQLPLVVDLDHDNLVVSLMAGIIGGLGGGLVFRNGGTIGGADIIAKLFEDKLGLQLNQALLGIDIFVMIVSLTYISLPQMMYALIASFMYGQIVRLVQQGGYTARGTLIISDQSETIARFIMEELGRGVTYLHGEGAYSGRDKKVIYVALGRTDIRELKAFLAQIDPNAFVSYFDVDEVNSPEFVATKSKYHKKKSRSNVSKR >LS483361|2152723:2164222|2158101_2159499_-|SQF67981.1|DBSCAN-SWA MEILTLSHYQLEVGGNLLLSINQLHLHQRDKVFLIGDNGSGKTSFLQTLIGERRSYQGQLSLHSDVAYLPQLQAAQNQSGGEKVMASLKLLFQKNASLLILDEPSSHLDKANQKWLIHQLKRYRGTLLVVSHDRYLMNQIAQQIWAIEKQDIKVYQGNYDAYRQAKELEMQKQAIEKANYQRQVTKLTKQIQAKKERANQMVKPKKNISRSDWKVNAFAGSYDSQAKRIAKSAKAMENRLAKLTPNRQESKEIWAKLKFNPQEKKIPHTLIHLREGNLSRNKQILFTYPDIAIRADSKLAISGRNKAGKSTFLESLANQDLPGFYSDHLKLTFFKQDQVQLDSQLTAFEFVQEQSNQDSRLILNYLAMMGIPYQKAHQKIASLSGGERVRLALVGAMLGDHQLLILDEPTNYLDLVAMEALERCLKQYPYPFVLVSHDQQFVSSVVNRCYVIRDGQLEEVDKDHF >LS483361|2152723:2164222|2152723_2155279_-|SQF67977.1|DBSCAN-SWA MAKANISPGMQQYLDIKKDYPDAFLLFRMGDFYELFYDDAVKAAQLLEIGLTSRNKNAENPIPMAGVPHHSAQQYIDVLIELGYKVAIAEQMEDPKQAVGVVKREVVQVITPGTVVDSAKPDSANNFLVAVDFDGCCYGLAYMDVSTGEFCVTDLADFTSVRSEIQNLKAKEVLLGFDLSEEEQTILVKQMNLLLSYEETVYEDKSLIDGQLTTVELTAAGKLLQYVHKTQMRELSHLQALVHYEIKDYLQMSYATKSSLDLVENARTNKKHGSLYWLLDETKTAMGMRLLRSWIDRPLVSKEAILERQEIIQVFLNSFIERTDLSNSLKGVYDIERLSSRVSFGKANPKDLLQLGHTLAQVPYIKAILESFNSPFVDKLVNDVDSLPELEYLIRTAIDPDAPATISEGSIIRNGFDERLDHYRKVMREGTGWIADIEAKERQASGINNLKIDYNKKDGYYFHVTNSNLSLVPEHFFRKATLKNSERYGTAELAKIEGQMLEAREESSSLEYDIFMCIRAQVETYINRLQKLAKTLATVDVLQSLAVVAETNHYIRPQFNDNHVITIQEGRHAVVEKVMGVQEYIPNSISFNQETSIQLITGPNMSGKSTYMRQLALTVIMAQMGSFVAADHVDLPLFDAIFTRIGAADDLISGQSTFMVEMMEANQAIKRASDNSLILFDELGRGTATYDGMALAQAIIEYIHDRVGAKTMFATHYHELTDLSTKLTSLVNVHVATLEKDGDVTFLHKIAEGPADKSYGIHVAKIAGLPEALLSRADEVLMRLEAQAQSAEIISVPSQVEPSSAAREGQLSLFPDEDKSQEIIHTLEAIDVMNMTPLQAMTTLYELKKLL >LS483361|2152723:2164222|2161539_2162481_-|SQF67984.1|DBSCAN-SWA MIKKTTYKKKVKYVISRGAKKVGLLHALRSISREKYAEKISASLLYGILSSIAVNFFFQPGHVYSSGATGLAQVFSALSHRLLGYDFPIALAFYLINIPLLILAWYKIGHQFTIFTFITVSMSSFFIQIMPQVTLTTDPLINAIFGGLVMGMGIGTGFKSRISSGGTDIISLTLRKRTGKDVGSLSLMVNGAILTFAGILFGWQYALYSMVSIFVSSRVTDAIFTKQKKMQATIITSHPERVIQMIHKRLHRGVTSINDAEGTYKHEQKAVLITILTREEYTEFKWLMLKADPQAFVSVAENVRIIGRFVEED >LS483361|2152723:2164222|2155615_2156053_-|SQF67979.1|DBSCAN-SWA MNKIERQHQIKQIIQAEHIGTQEDIKKALQKEGIVVTQATLSRDLREIGLLKLRDEQGKLYYSLSEPVATPFSPEVRFYVLSVDRAGFMLVLHTNLGEADVLANLIDNDDIEDILGTIAGADTLLVICRDEEIAKRFEKDLAAGL >LS483361|2152723:2164222|2155265_2155619_-|SQF67978.1|DBSCAN-SWA MTSYQNALKDLIVAINAHPSIIAYKAAKQQLSQLDQFEDQAYQMKRYQQEAELFQKIAKTQAAAVSSNKAKELEHHLNHQPVIDDYREKMQDASDLIQYITKRIEEQLNEELTNGKS >LS483361|2152723:2164222|2159675_2160590_-|SQF67982.1|DBSCAN-SWA MTRHDKLTKLIELLLIALGVGIYTFGFVNFNMANALAEGGVAGITLILHAHFGINPAYSSLLFNLPLFILGAKIFGKRSLALTIYGTVLMSVFIWMWQKIPMELGLENDMMLVAVVAGLFSGIGSGLVFRYGATTGGTDIIGRIAEEKFGAKLGQTLLLVDALVLTASLTYVDLKHMLYTLVASFVFSQMISVVQNGGYTIRGMIIITKHSEAAAQAILNEINRGVTYLKGQGAYSGNDYNIMYVTLNPTEVREVKRILAELDPDAFISILDVDEVISSDFKIRRKNFDKPIEKALQKKPKLLK >LS483361|2152723:2164222|2156340_2158032_+|SQF67980.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDTKTLIASEIAKVVPELEQDAIFNLLETPKNSDMGDLAFPAFSLAKVLRKAPQMIAGELAEQIDGSQFEKVVAVGPYINFFLDKAKISSQVLEQVITAGSDYAQQDEGQGRNVVIDMSSPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSLANIFAKMGYQPVKINHLGDWGKQFGMLIVAYKKWGDEAAVQAHPIDELLKLYVRINAEAETDPTVDEEAREWFRKLEDGDKEATELWQWFRDESLLEFNRLYDQLNVTFDSYNGEAFYNDKMDEVLELLEVKNLLVESKGAQVVNLEKYGIEHPALIKKSDGATLYITRDLAAALYRKRTYDFAKSVYVVGNEQAAHFKQLKAVLKEMGYDWSDDMTHVAFGLVTKGGAKLSTRKGNVILLEPTVAEAINRAASQIEAKNPNLADKEAVAHAVGVGAIKFYDLKTDRMNGYDFDLEAMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKADFTPSATTTYSLADAESWEIIKLIQDFPRIIKRTSDNFEPSIMAKFAINLAQSFNKYYAHTRILDANSERDSRLALCYATATVLKEALRLLGVEAPNEM >LS483361|2152723:2164222|2162473_2164222_-|SQF67985.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKRSMYAGRVREEHIGTTITLKGWVGRRRDLGGLIFIDLRDREGVMQLVINPEDVSSDVMATAERLRSEYVIEVAGLVEARQQPNDKLATGMVELKVSALTILNTAKTTPFEIKDDVEVSDDTRLRYRYLDLRRPEMLENFKLRAKVTHSIRNYLDDLEFIDVETPMLTKSTPEGARDYLVPSRVSQGHFYALPQSPQITKQLLMNAGFDRYYQIVKCFRDEDLRGDRQPEFTQVDLETSFLSEQEIQDIVEGMIAKVMKETKGIDVTLPFPRMSYDVAMNSYGSDKPDTRFEMLLQDLTETVKGIDFKVFSEAPAVKAIVVKENADRYSRKDIDKLTEFAKQFGAKGLAWVKVTDGQLAGPVAKFLTAIETELSSQLKLAENDLVLFVADTLEVANNTLGALRNRIAKNLDMIDQSQFNFLWVVDWPMFEWSEEEGRYMSAHHPFTLPTPESAHELEGDLAKVRAIAYDIVLNGYELGGGSLRINQKEMQERMFKALGFTAEEANDQFGFLLEAMDYGFPPHGGLAIGLDRFVMLLAGKDNIREVIAFPKNNKASDPMTQAPSLVSEKQLEELSLQIESHD |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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