Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483374 | Streptococcus pneumoniae strain NCTC7466 genome assembly, chromosome: 1 | 2 crisprs | DEDDh,PrimPol,cas3,DinG,RT | 1 | 1 | 17 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483374_1 | 97129-97224 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483374_1
|
1 spacers
spacers of LS483374_1
>1.1|97153|48|LS483374|CRISPRCasFinder TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483374_1
The CRISPR arrays of LS483374_1 >merge|LS483374|1|97129-97224|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAATTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGAAATGTGTAAAATTTTTATATATAA >LS483374|1|1|97129-97224|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAA TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA AATGTGTAAAATTTTTATATATAA
>LS483374.1|SQG01155.1|96784_97111_-|transcriptional-regulator MYFPTSSALIEFLILAVLEQGDSYGYEISQTIKLIANIKESTLYPILKKLEGNSFLTTYSREFQGRMRKYYSLTNGGIEQLLTLKDEWTLYTDTINGIIEGSIRHDKN >LS483374.1|SQG01154.1|96204_96798_-|membrane-protein MTRTEYLTQLELYLKKLPEADRIEAMDYFRELFDDAGIEGEEELIASLGTPKEAAHEVLSNLLDKKINEAPAQKNNRQILHIALLALLAAPIGIPLGIAILVTLFAILVAALTVILAFFAVSILGIIGGFLFLVESFTVLAQAKSAFILIFGSGLLAIGASSLVLLGISYVARFFGLLIVRLVQFVLKKGKRGNQHA >LS483374.1|SQG01153.1|95300_96212_-|Uncharacterised-protein MRKWTKGFLIFGVVTTVIGFILLFVGIQSDGIKSLLSMSKEPVYDSRTEKLTFGKEVENLEITLHQHTLTITDSFDDQIHISYHPSLSAHHDLITNQNDRTLSLTDKKLSETPFLSSGIGGILHIASSYSSRFEEVILRLPKGRTLKGINISANRGQTTIINASLENATLNTNSYILRIEGSRIKNSKLTTPNIVNIFDTVLTDSQLESTENHFHAENIQVHGKVELTAKDYLRIILDQKESQRINWDISSNYGSIFQFTREKPESRGTELSNPYKTEKTDVKDQLIARSDDNIDLISTPSRR >LS483374.1|SQG01152.1|94173_95238_-|Uncharacterised-protein MKQEWFESNDFVKTTSKNKPEEQAQEVADKAEETIADLDTPIEKNTQLEEEVSQAEVELESQQEEKIETPEDSEARTKIEEKKASNSTEEEPDLSKETEKVTIAEESQEALPQQKATTKEPLLISKSLESPYIPDQAPKSRDKWKEQVLDFWSWLVEAIKSPTSKLETSITHSYTAFLLLILFSASSFFFSIYHIKHAYYGHIASINSRFPEQLAPLTLFSIVSILVATTLFFFSFLLGSFVVRRFIHQEKDWTLDKVLQQYSQLLAIPIFLTAIASFFAFFDSLRFTALLCVISIGIILLASLHIITRPSQASETDSFYQLFLSVLVNGVIILLFFVAEVALIGDYLRILAFL >LS483374.1|SQG01151.1|93241_94102_+|Uncharacterised-protein MAKTFFIPNKQSILGEQEILNAKSILALLDGLESHSYDVVYLRQPLNRLEYIECAIVGQSQFLFKVSYADGQKAYRVDLPDLLTKTDWQIIKSFLDALLAYTGTDIEGLDGFDFEAYFQASIQAYLADPVARFTICQGIFNPIFFSRENLKSFLEADGLAQFEARVRAVQETDAYFARVSFYQDGEGKVHGVYHLAQGVKTVLPREPFVPAAYIEQLVDKEVQWEIDLVQITGDGSKPEDYEAIARLDYAKFLEVLPPSFYHQLDANQIEIQPILGQDFKTLAQEK >LS483374.1|SQG01150.1|92133_93120_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MAKDIRVLLYYLYTPIENAEQFAADHLAFCKSIGLKGRILVADEGINGTVSGDYETTQKYMDYVHSLPGMEELWFKIDEENEQAFKKMFVRYKKEIVHLGLEDNDFDNDINPLETTGAYLSPKEFKEALLDKDTVVLDTRNDYEYDLGHFRGAIRPDIRNFRELPQWVRDNKEKFMDKRVVVYCTGGVRCEKFSGWMVREGYKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGELWDGKMYVFDERIAVDVNHVNPTIVGKDWFDGTPCERYVNCGNPFCNRRILTSEENEDKYLRGCSHECRVHPRNRYVSKNELTQAEVIERLAAIGESLDQAATV >LS483374.1|SQG01149.1|90386_91862_+|extracellular-solute-binding-protein MKNWKKYAFASASVVALAAGLAACGNLTGNSKKAADSGDKPVIKMYQIGDKPDNLDELLANANKIIEEKVGAKLDIQYLGWGDYGKKMSVITSSGENYDIAFADNYIVNAQKGAYADLTELYKKEGKDLYKALDPAYIKGNTVNGKIYAVPVAANVASSQNFAFNGTLLAKYGIDISGVTSYETLEPVLKQIKEKAPDVVPFAIGKVFIPSDNFDYPVANGLPFVIDLEGDTTKVVNRYEVPRFKEHLKTLHKFYEAGYIPKDVATSDTSFDLQQDTWFVREETVGPADYGNSLLSRVANKDIQIKPITNFIKKNQTTQVANFVISNNSKNKEKSMEILNLLNTNPELLNGLVYGPEGKNWEKIEGKENRVRVLDGYKGNTHMGGWNTGNNWILYINENVTDQQIENSKKELAEAKESPALGFIFNTDNVKSEISAIANTMQQFDTAINTGTVDPDKAIPELMEKLKSEGAYEKVLNEMQKQYDEFLKNKK >LS483374.1|SQG01148.1|89205_90129_+|ABC-transporter-permease MAKKKIKKEKIDNVGIHSFSKKADIFFSIISGLIALSCILPFVFVIIISVTDEKSLLQYGYSFFPSQFGLDGFEFLAQFKDKILQALFISVFVTVVGTLTNVFITTTYAYAISRTTFKYRRFFTIFVLLSMLFNAGLVPGYIMVTRVLQLGDTVWALIVPMLLSPFNIILMRSFFKKTIPEAILESARIDGASEARIFFQICLPLSLPGIATITLLTALGFWNDWFNALLYIKSDNLYPLQYLLMQIQQNMDYIAKAVGLTGQLGVALPKETGRMAMVVVATLPIAILYPFFQRYFVKGLTIGGVKE >LS483374.1|SQG01147.1|88262_89192_+|ABC-transporter-permease MKKFSKTLRDNWIFLLMVLPGALWLILFFYIPVFGNVVAFKDYHMTSNGFIDSIINSKWVGLDNFRFLFSSRDAFIITRNTVLYNLGFIFLGLVVSVGIAIILSELRSKRMVKIFQTSMLFPYFLSWVIISFFTDAFLNIDKGVFNHLLESLGLKEVNFYADLGIWPYLLLFLGIWKGFGYSSVMYYATIMGIDPTYYEAATVDGASKWQRIRNVTIPQLTPLVTVLTILAVGNIFRADFGLFYQIPHNAGQLYNVTNVLDVYVFNGLTQTADIGMAAAAGLYQSVVGLILVILSNLLARRVDPNSALF >LS483374.1|SQG01146.1|87722_87944_+|surface-anchored-protein MSLQIKLKKLAKELSKLLKDSNLETVDKDVLENSQKELQKAVLFLADEKGSEHTEAEVIDNLKEVIAKLKANA >LS483374.1|SQG01156.1|97249_98416_-|cyanate-permease MKKQSLFFVPGIILIGVSLRTPFTVLPIILGNISQGLEVEVSSLGVLTSLPLLMFTLFSPFSTQLAQKIGLEHLFTYSLFFLTIGSLIRLINLPLLYLGTLMVGASVAVINVLLPSLIQANQPKKIGFLTTLYVTSMGIATALASYLAVPITQASSWKGLILLLTLLCLATFLVWLPNHRYNHRLAPQTKQKSQIKVMRNKQVWAIIIFSGFQSLIFYTVMTWLPTMSIHAGLSSHEAGLLTSILSLISIPFSMTIPSLTTSLSTRNRQLMLTLVSLAGVIGISMLFFPINNFIYWLAIHLLIGTATSALFPYLMVNFSLKTSAPEKTAQLSGLSQTGGYILAAFGPTLFGYSFDLFHSWVPSVAALLLIDILMTVALFTVDRADKIL >LS483374.1|SQG01157.1|98566_99631_+|glycosyl-transferase MTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTYPKEDIEILFINAMSTDGTTAIIQQFIKEDTEFNSIRLYNNPKKNQASGFNLGVKHSVGDLILKIDAHSKVTESFVMNNVAIIQQGEFVCGGPRPTIVEGKGKWAETLHLVEENMFGSSIANYRNSSEDRYVSSIFHGMYKREVFQKVGLVNEQLGRTEDNDIHYRIREHGYKIRYSPSILSYQYIRPTFKKMLHQKYSNGLWIGLTSHVQFKCLSLFHYVPCLFVLSLVFSLALLPITFVFITLLLGAYFLLLSLLTLLTLLKHKNGFLIVMPFLLFSIHFAYGLGTIVGLIRGFKWKKEYKGTIIYLDKISQINKNML >LS483374.1|SQG01158.1|99672_101523_+|nucleoside-diphosphate-sugar-isomerase MNKKLTDYVIDLVEILNKQQKQVFWGIFDIFSMVVSIIVSYILFYGLINPAPVDYIIYTSLAFLFYQLMIGFWGLNASISRYSKITDFMKIFFGVTASSVLSYSICYAFLPLFSIRFIILFILLSTFLILLPRITWQLIYSRRKKGSGDGEHRRTFLIGAGDGGALFMDSYQHPTSELELVGILDKDSKKKGQKLGGIPVLGSYDNLPELAKRHQIERVIVAIPSLDPSEYERILQMCNKLGVKCYKMPKVETVVQGLHQAGTGFQKIDITDLLGRQEIRLDESRLGAELTGKTILVTGAGGSIGSEICRQVSRFNPERIVLLGHGENSIYLVYHELIRKFQGIDYVPVIADIQDYDRLLQVFEQYKPAIVYHAAAHKHVPMMERNPKEAFKNNIRGTYNVAKAVDEAKVSKMVMISTDKAVNPPNVMGATKRVAELIVTGFNQRSQSTYCAVRFGNVLGSRGSVIPVFERQIAEGGPVTVTDFRMTRYFMTIPEASRLVIHAGAYAKDGEVFILDMGKPVKIYDLAKKMVLLSGHTESEIPIVEVGIRPGEKLYEELLVSTELVDNQVMDKIFVGKVNVMPLESINQKIREFRTLSGDELKQAIIAFANQTTHIE >LS483374.1|SQG01159.1|101608_101869_-|chlorohydrolase MKIKEQTRKLAAGCSKHCFKVVDGTDEVSSKHCFKVVDGTDEVSSKHCFKVVDGTDEVSSKHCFKVADRTDEISNIYIRQGDVDVV >LS483374.1|SQG01160.1|101918_102551_-|phosphatase MTSITAIFFDLDGTLVDSSIGIHNAFTYTFKELGVPSPDAKTIRGFMGPPLESSFATCLSKDQISEAVQIYRSYYKAKGIYEAQLFPQIIDLLEELSSSYPLYITTTKNTSTAQDMAKNLEIHHFFDGIYGSSPEAPHKADVIHQALQTHQLVPQQAIIIGDTKFDMLGARETGIQKLAVTWGFGEQADLLNYQPDYIAHKPLEVLAYFQ >LS483374.1|SQG01161.1|102572_103445_-|L-serine-dehydratase,-alpha-subunit MFYSIKELVEQADLDFQGNVAELMITTEFELTGREREEVFLLMERNLEVMKASVQLGLNENKSRSGLTGGDAAKLDHYIENGKTLSDYTILSAARNAIAVNEHNAKMGLVCATPTAGSAGCLPSVLTAAIEKLDLSHEQQLDFLFAAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMSAAALTLAAGGTPYQASQAIAFVIKNMLGLICDPVAGLVEVPCVKRNAMGASFAFIAADMALAGIESKIPVDEVIDAMYQVGASMPTAFRETAEGGLATTPTGRRLQKEIFGE >LS483374.1|SQG01162.1|103453_104125_-|putative-L-serine-dehydratase-beta-subunit MKSLRFQSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAVRIGKIVSSIFDDTPTEVEFQLFNSFAKTYRGHGTDLALVAGILGMDTDDPEIPNSLEIAHKRGIKIVWTIQKDSNAPHPNTTKITVKNAHKTISVTGISIGGGNIQVTELNGFAVSLNMNTPTIIIVHQDIPGMIALVTEALSRYGINIAQMNVTREKAGEKAIMIIEVDSRNCDEAIEEIRKIPHLHNVNFFK >LS483374.1|SQG01163.1|104366_104870_+|LysM-domain-containing-protein MKSITKKIKATLAGVAALFAVFAPSFVSAQESSTYTVKEGDTLSEIAETHNTTVEKLAENNHIDNIHLIYVDQELVIDGPVAPVATPAPATYAAPAAQDETVSAPVAETPVVSETVVSTVSGSEAEAKEWIAQKESGGSYTATNGRYIGRYGSWTAAKNFWLNNGWY >LS483374.1|SQG01164.1|105697_105946_+|bacteriocin MVCSILASTSVLAVWVDGGQWNYGVGWSGNFGYSDYLHSTRSHTATVKDGNKFSKDRAEAEAWARASIFKFPPTGMEYFYGF >LS483374.1|SQG01165.1|106000_108109_+|bacteriocin-immunity-protein MKKISHLCMLLLLLCTTFFVFNVNYTREVVRIQEMGKTVDSLDLYLKDINEPAASVLRFFEDVSKEYKVSIIKTDSGDEVVKSGVFDKDTFPYQEFGISSLDFTTDGEGVYSNKEISNKLGTIPTFLKAKPIQLMTFQTYIKDTSRSLNGRYTITSTQEMDKDRIVQKWSDFFKIDQATLLEPTYKSAVEVINRDLLLSAIVFVLAILLLVLVTVYQPMMEMKRVGVQKLLGFQDRAVLADVVKGNLYLLLGGALVINLGVFFLLDYKPKDLFPMLWLSHFLLLQLYLFISWLTYLLIQKMTISSLLKGFSSFKFGLIFNYVMKIGTTILLTALLIGVGRSLEQENKELAYQQQWVSQGNYLTLETFKLNDNLWQEELAGSGKSTDYFYRFYQDLVEKTQAGYVQSSSLPVKNFVQSEQIQQYQLTDTVDVYYANRNFLKSKGFKLPDTGIKKVILMPASTKGEEDKNQLLGKLIAFHSMKYEEQQKRTIEEMDVEIAYYEGDWSFFPYSDKRKENLSNPIISLVNDSDMMWDEKASLSTTGLNNPIKIENTVQHQKEITELVEKLSDGNYLKFSSIQAIQQEKVDSYRDAVRNFNLLFALFGLLSMMISYFLLVTTFLLKRRDIITKKFMGWKLVDRYRPLLVLLLLGYSFPLLVLIFFAHAFLPLLLFAGFTCLDILFVLGLASRMEKRSLVELLKGGIL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483374_3 | 1698526-1698643 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483374_3
|
1 spacers
spacers of LS483374_3
>3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder TTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483374_3
The CRISPR arrays of LS483374_3 >merge|LS483374|3|1698526-1698643|CRISPRCasFinder CAAAAAAGAAAGGACAAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTTTTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCCAAAAAAGAAAGGACGAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTT >LS483374|3|3|1698526-1698643|CRISPRCasFinder CAAAAAAGAAAGGACAAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTT TTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGC CAAAAAAGAAAGGACGAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTT
>LS483374.1|SQG02741.1|1696984_1697920_+|bifunctional-protein,-biotin-operon-repressor;-biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-synthetase MKSYQAVYQILSKETDYISGEKIAEKLSLSRTSIWKAIKRLEQEGIEINSIKNRGYKLMNGDLILPEILEENLPIKVSFKPETKSTQLDAKEAIDLGHEANTLYLASYQTAGRGRFQRSFYSPQGGIYMTLHLKPNLPYDKLPSYTLLVAGAVYKAIKNLTLIDVDIKWVNDIYLNNHKIGGILTEAMTSVETGLVTDIIIGVGINFTIKDFPQELKEKAASLFKATAPITRNELIIEIWRAFFETPAEELLYLYKKQSFILGKEVTFTLEQKDYKGLAKDISENGKLLVQCDNGKEIWLNSGEISLNSWK >LS483374.1|SQG02740.1|1696127_1696988_+|Msm-operon-regulatory-protein MLVFSEYQTGTIDLALSFYGYEECTPNYSFGPAIRDTYVLHYISKGQGKFHYKGKIVDLKEGDFFLLKPEELTFYQADSKEPWAYYWLGITGGKSPDYFALSQISDQSYLIQSETCHTQTTAKLISDIVRFAQITKSSELAQLHIMGQLHELMFHLGTIAPNQKKKNISSTHQLYLECKRLIDSHYPQSLTIQDLAKELSVHRSYLSSVFKEFNTLSPKEYLLYVRMHRARQLLENTQESIKVIAYSVGFSDPLHFSKAYKQYFNQSPSHTRKEYSQYQLVRKATL >LS483374.1|SQG02739.1|1693857_1696020_-|alpha-galactosidase MGVRIENNLFYVESKNLSLIIENRNGYLLLKHLGKTIKNYKGSNSVYERDHAFSGNPTATNRTFSLDTQRQIFGQHGLGDFRKPTIQVQHSVTEVTDFRFVEAKILKGQNGPQGLPSPHSMDDTETLVLMLEDSKAQLSLTLYYTTFNNDATIASYSKLDNNSNQEVVIHKDFSFMADFPAADYEIVTLQGAYAREKTVRRQQVEQGIFSISSNRGASGHAQTPALLLCEQGVTEDAGNVFAIQLMYSGNFEAFVQKNQLNEVRVAIGINPENFSWKLAPEEYFETPVALVTHSDQGLTGISHESQNFVLKHIILSEFSKKERPILINNWEATYFDFQREKLLELADEAKKVGIELFVLDDGWFGNRFDDNRALGDWVVNEEKLGGSLESLISAIHERGLQFGLWLEPEMISVDSDLYRQHPDWAIQVPDYEHTYSRNQLVLNLANPQVVEYLKSVLDQLLSYHEIDYIKWDMNRNITKLGNGLTYLETQMQSHQYMLGLYELVSYLTEKHSHILFESCSGGGGRNDLGMIRYFPQVWASDNTDAIARLPIQYGSSYLYPTISMGAHVSAVPNHQMGRMTPLETRGHVAMMGNLGYELDLTNLSDEEKATIANQVNLYKELRPVVQLGQQYRLINPDTASNEAAVQFNYGNQTIVTYVRVLSVVETMETTLKLKDLDEEGLYKLQENGEVYSGAELMYAGLTVILSQGDFLSRQYIFRKL >LS483374.1|SQG02738.1|1692506_1693766_-|sugar-ABC-transporter-binding-protein MEWYKKIGLLATTGLALFGLGACSNYGKSADGTVTIEYFNQKKEMTKTLEEITRDFEKENPKIKVKVVNVPNAGEVLKTRVLAGDVPDVVNIYPQSIELQEWAKAGVFEDLSNKDYLKRVKNGYAEKYAVNEKVYNVPFTANAYGIYYNKDKFEELGLKVPETWDEFEQLVKDIVAKGQTPFGIAGADAWTLNGYNQLAFATATGGGKEANQYLRYSQPNAIKLSDPIMKDDIKVMDILRINGSKQKNWEGAGYTDVIGAFARGDVLMTPNGSWAITAINEQKPNFKIGTFMIPGKEKGQSLTVGAGDLAWSISATTKHPKEANAFVEYMTRPEVMQKYYDVDGSPTAIEGVKQAGEDSPLAGMTEYAFTDRHLVWLQQYWTSEADFHTLTMNYVLTGDKEGMVNDLNAFFNPMKADVD >LS483374.1|SQG02737.1|1691626_1692493_-|sugar-ABC-transporter-permease MKKVLQKYWAWAFVVIPLLLQAIFFYVPMFQGAFYSFTNWTGLTYNYKFVGLNNFKLLFMDPKFMNAIGFTAIITIAMVVGEIALGIFIARVLNSKIKGQTFFRSWFFFPAVLSGLTVALIFKQVFNYGLPAIGNALHIEFLQTSLLGTKWGAIFAAVFVLLWQGVAMPIIIFLAGLQSIPTEITEAARIDGATSKQVFWNIELPYLLPSVSIVFILALKGGLTAFDQVFAMTGGGPNNATTSLGLLVYNYAFKNNQFGYANAIAVILFFLIVVISIIQLRVSKKFEI >LS483374.1|SQG02736.1|1690779_1691613_-|sugar-ABC-transporter-permease MKQDERKALIGKYILLILGSVLILVPLLATLFSSFKPTKDIVDNFFGFPTNFTWDNFSRLLADGIGGYYWNSVVITVLSLLAVMIFIPMAAYSIARNMSKRKAFTIMYTLLILGIFVPFQVIMIPITVMMSKLGLANTFGLILLYLTYAIPQTLFLYVGYIKISIPESLDEAAEIDGANQFTTYFRIIFPMMKPMHATTMIINALWFWNDFMLPLLVLNRDSKMWTLPLFQYNYAGQYFNDYGPSFASYVVGIISITIVYLFFQRHIISGMSNGAVK >LS483374.1|SQG02735.1|1688979_1690422_-|sucrose-phosphorylase MPIQNKTMLITYSDSLGNNLKDLYDNLEEHFGDAIGGVHLLPFFPSTGDRGFAPVDYDEVDSAFGDWEDVKRLGERYYLMFDFMINHISRQSKYYKDYQEKHEASEFKALFLNWDKFWPENRPTQSDVDLIYKRKDRAPKQEIVFEDGSVEHLWNTFGEEQIDLDVTKEVTMEFIRKTIQHLASNGCDLIRLDAFAYAVKKLDTNDFFVEPDIWDLLDKVRDIAAEYGTELLPEIHEHYSIQFKIADHDYYVYDFALPMVTLYTLYSSRTERLAKWLKMSPMKQFTTLDTHDGIGVVDVKDILTDEEIDYASNELYKVGANVKRKYSSAEYNNLDIYQINSTYYSALGDDDVKYFLARLIQAFAPGIPQVYYVGLLAGKNDLKLLEETKEGRNINRHYYSNEEIAKEVQRPVVKALLNLFSFRNRSEAFDLEGTTEIETPTAHSIVIKRQNKDKSVTAVVEIDLQNQTYRVIENGVEVTF >LS483374.1|SQG02734.1|1687648_1688842_-|O-Antigen-Polymerase-family MKSIGFIEKLKGLSSKELILLGIILSIFLPFYLFVVVLCLYIISLIFTGDMKSILQKMGEHPMLLLFLSYSTVISILAQNWMGLVASVGMFLFTIFFLHYQSILSHKFFRLILQFVLFGSVLSAAFASLEHFQIVKKFNYAFLSPNMQVWHQNRAEVTFFNPNYYGIICCFCIMIAFYLFTTTKLNWLKVFCVIAGFVNLFGLNFTQNRTAFPAIIAGAIIYLFTTIKNWKAFWLSIGVFAIGLSFLFSSDLGVRMGTLDSSMEERISIWDAGMALFKQNPFWGEGPLTYMHSYPRIHAPYHEHAHSLYIDTILSYGIVGTILLVLSSVAPVRLMMDMSQESGKRPIIGLYLSFLTVVAVHGIFDLALFWIQSGFIFLLVMCSIPLEHRMLVSDMTD >LS483374.1|SQG02733.1|1684982_1686962_-|oligopeptide-binding-protein-AmiA MKKNRVFATAGLVLLAAGVLAACSSSKSSDSSAPKAYGYVYTADPETLDYLISSKNSTTVVTSNGIDGLFTNDNYGNLAPAVAEDWEVSKDGLTYTYKIRKGVKWFTSDGEEYAEVTAKDFVNGLKHAADKKSEAMYLAENSVKGLADYLSGTSTDFSTVGVKAVDDYTLQYTLNQPEPFWNSKLTYSIFWPLNEEFETSKGSDFAKPTDPTSLLYNGPFLLKGLTAKSSVEFVKNEQYWDKENVHLDTINLAYYDGSDQESLERNFTSGAYSYARLYPTSSNYSKVAEEYKDNIYYTQSGSGIAGLGVNIDRQSYNYTSKTTDSEKVATKKALLNKDFRQALNFALDRSAYSAQINGKDGAALAVRNLFVKPDFVSAGEKTFGDLVAAQLPAYGDEWKGVNLADGQDGLFNADKAKAEFAKAKKALEADGVQFPIHLDVPVDQASKNYISRIQSFKQSVETVLGVENVVVDIQQMTSDEFLNITYYAANASSEDWDVSGGVSWGPDYQDPSTYLDILKTTSSETTKTYLGFDNPNSPSVVQVGLKEYDKLVDEAAKETSDLNVRYEKYAAAQAWLTDSSLFIPAMASSGAAPVLSRIVPFTGASAQTGSKGSDVYFKYLKLQDKAVTKEEYEKAREKWLKEKAESNEKAQKELASHVK >LS483374.1|SQG02732.1|1683419_1684916_-|peptide-ABC-transporter-permease MKKYIFMRVLRSLVSIFLVTTLTYTIIYTLVPRKLIFKQDPNYNKIATTADKRDNYENTVFERMGYIEYYDTKELQEKASSMDSSVTVEANATNKAIYEKYINQLGHGWTLGEFTESGQFYATREIPIFERVFHFYANLIDIDHTNKIQDPENPDLKRYLRFENDPAIGWSLVGSGTKHKYLLYFNSQFPFVHQNFVNLNLGDSYPTYANTPVLQVITQGQGQTKTAQVQFPTGKKTSSVNIYSRTYKSPSQADSREVASYGKDDPYTATESNYQYPSMIVSSAITGLIGLVLAYALAVPLGSAMARFKNTWIDSLSTGALTFLLALPTIALVYIVRLIGSSIALPDSFPILGAGDWRSYVLPAVILGLLGAPGTAIWIRRYMIDLQSQDFVRFARAKGLSEKEISNKHIFKNAMVPLVSGIPAAIIGVIGGATLTETVFAFPGMGKMLIDSVKASNNSMVVGLVFIFTCISIFSRLLGDIWMTIIDPRIKLTEKGGK >LS483374.1|SQG02743.1|1705552_1706908_-|RNA-methyltransferase MNLKVKQKIPLKIKRMGINGEGIGFYQKTLVFVPGALKGEDIYCQITSIRRNFVEAKLLKVNKKSKFRIVPSCTIYNECGGCQIMHLHYDKQLEFKTDLLHQALKKFAPAGYENYEIRPTIGMQEPKYYRAKLQFQTRKFKNQVKAGLYAQNSHYLVELKDCLVQDKETQVIANRLAELLTYHQIPITDERKVLGVRTIMVRRARKTGQVQIIIVTNRQLNLTQLVKELVKDFPEVVTVAVNTNTAKTSEIYGEKTEIIWGQESIQEGVLNYEFSLSPRAFYQLNPEQTEVLYSEAVKALDVDKEDHLIDAYCGVGTIGFAFAKKVKTLRGMDIIPEAIEDAKRNAKRMGFDNTHYEAGTAEEIIPRWYKEGYRADALIVDPPRTGLDDKLLDTILTYVPEKMVYISCNVSTLARDLVRLVEVYDLHYIQSVDMFPHTARTEAVVKLIKKV >LS483374.1|SQG02744.1|1706945_1707722_+|regulatory-protein-RecX MKITKLEKKKRLYLMELDNGDKCYITEDTIVRFMLSRDKVISEEELKEIQDFAQFSYGKNLALYHLSFKARTEKEVREYLKKYDIDKNIVSQVIANLKEDKWINDGQYAYAIINTNQLSGDKGPYVLTQKLAQKGISKSTIEENLKEFDFSEVAQRVANKLLKKYEGKLPARALQDKIIQNLTNKGFSYSDAKIAFDDLDSQVDQETTQELIFKELDKQYTKYARKYEGYELKQRLTQVLARKGYDFSDIASALREYL >LS483374.1|SQG02745.1|1707810_1708344_+|UPF0374-protein-SSU05 MKLPKEGDFITIQSYKHDGSLHRTWRDTMVLKTTENAIIGVNDHTLVTESDGRRWVTREPAIVYFHKKYWFNIIAMIRDNGTSYYCNMASPYYLDEEALKYIDYDLDVKIFTDGEKRLLDVEEYERHKRKMNYSDDLDYILKEHVKILVDWINNGRGPFSEAYVNIWYKRYVELKNR >LS483374.1|SQG02746.1|1708697_1708904_-|putative-transcriptional-regulator MKLQKLLKDDTKVFEKSTFKFVEGYKIYLTESKESGIKQMDNVIKYFEFIESKSIALYFQKRLNELID >LS483374.1|SQG02747.1|1709063_1710293_+|transposase MEQLHFITKLLDIKDPNIQILDIINKDTHKEIIAKLDYDAPSCPECGSQMKKYDFQKPSKIPYLETTGMPTRILLRKRRFKCYHCSKMMVAETSIVKKNHQIPRIINQKIAQKLIEKISMTDIAHQLSISTSTVIRKLNDFHFKHDFSCLPEIMSWDEYAFTKGKMSFIAQDFNNLNIITVLEGRTQAVIRDHFLKYDRAVRCRVKIITMDMFSPYYGLAKQLRFHIVQHLSRAMSRVRVQIMNQFHRKSHEYKAIKRYWKLIQQDSRKLSDKQFYRPTFRMHLTNKEILNKLLSYSEDLKHHYQLYQLLLFHFQNKEPEKFFGLIEDNLKQVHPIFQTVFKTFLKDKEKIVNALQLHYSNAKPEATNNLIKLIKRNAFGFRNFENFKKRIFIALNIKKERTKFVLSRA >LS483374.1|SQG02748.1|1710391_1712014_-|chaperone-GroEL MSKEIKFSSDARSAMVRGVDILADTVKVTLGPKGRNVVLEKSFGSPLITNDGVTIAKEIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVREGIKNVTAGANPIGIRRGIETAVAAAVEALKNNAIPVANKEAIAQVAAVSSRSEKVGEYISEAMEKVGKDGVITIEESRGMETELEVVEGMQFDRGYLSQYMVTDSEKMVADLENPYILITDKKISNIQEILPLLESILQSNRPLLIIADDVDGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGTVITEDLGLELKDATIEALGQAARVTVDKDSTVIVEGAGNPEAISHRVAVIKSQIETTTSEFDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETELKEMKLRIEDALNATRAAVEEGIVAGGGTALANVIPAVATLELTGDEATGRNIVLRALEEPVRQIAHNAGFEGSIVIDRLKNAELGIGFNAATGEWVNMIDQGIIDPVKVSRSALQNAASVASLILTTEAVVANKPEPVAPAPAMDPSMMGGMM >LS483374.1|SQG02749.1|1712029_1712314_-|CH10_SMI-10-kDa-chaperonin-(protein-Cpn10) MLKPLGDRVLLKIEEKEQTVGGFVLAGSAQEKTKTAQVVATGQGVRTLNGDLVAPSVKTGDRVLVEAHAGLDVKDGDEKYIIVGEANILAIIEE >LS483374.1|SQG02750.1|1712469_1712865_-|single-strand-DNA-binding-protein-B MYNKVIMIGRLTSTPELHKTNNDKSVARATIAVNRRYKDQNGEREADFVNMVLWGRLAETLASYATKGSLISVDGELRTRRFEKNGQMNYVTEVLVTGFQLLESRAQRAMRENNAGQDLADLVLEEEELPF >LS483374.1|SQG02751.1|1712942_1713704_-|3-oxoacyl-ACP-reductase MAKNVVITGATSGIGEAIARAYLEQGEDVVLTGRRIDRLEILKSEFAVSFPNQTVWTFPLDVTDMVMVKTVCSDILETIGRIDILVNNAGLALDLAPYQDYEELDMLTMLDTNVKGLMAVTHCFLPAMIKVNQGHIINMGSTAGIYAYAGAAVYSATKAAVKTFSDGLRIDTIATDIKVTTIQPGIVETDFSTVRFHGDKERAASVYQGIEALQAQDIADTVVYVTSQPRRVQITDMTIMANQQATGFMIHKK >LS483374.1|SQG02752.1|1713736_1714363_-|phenylalanyl-tRNA-synthetase,-beta-subunit MIFTYNKEHVGDVLMVIVKNSGDAKLNVERKGKVARVFLKENGETVAWNIFEVSSLFEIAERGQVFLSDEQVARLNQELQAEGFTEEIVNDKEPKFVVGEIVEMVAHPDSDHLNICQVAVASDKIVQIVAGAPNARVGLKTIVALPGAMMPKGNFIFPGELRGEKSFGMMCSPRELHLPNAPQKRGVLELSEDQVVGTPFDPAKHWTA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | LS483374.1 | 40191-40218 | 0 | 1.0 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | LS483374.1 | 966395-966422 | 0 | 1.0 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | LS483374.1 | 1656868-1656895 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to position: 40191-40218, mismatch: 0, identity: 1.0
tttcaacccactacagttgacaaagagc CRISPR spacer tttcaacccactacagttgacaaagagc Protospacer ****************************
2. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to position: 966395-966422, mismatch: 0, identity: 1.0
tttcaacccactacagttgacaaagagc CRISPR spacer tttcaacccactacagttgacaaagagc Protospacer ****************************
3. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to position: 1656868-1656895, mismatch: 0, identity: 1.0
tttcaacccactacagttgacaaagagc CRISPR spacer tttcaacccactacagttgacaaagagc Protospacer ****************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | KY065475 | Streptococcus phage IPP35, complete genome | 21704-21731 | 0 | 1.0 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | MK448817 | Streptococcus phage Javan59, complete genome | 41452-41479 | 2 | 0.929 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | MK448405 | Streptococcus satellite phage Javan293, complete genome | 10770-10797 | 3 | 0.893 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | MH937476 | Streptococcus phage CHPC933, partial genome | 26091-26118 | 3 | 0.893 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NC_012642 | Streptococcus parasanguinis plasmid pFW213, complete sequence | 1560-1587 | 3 | 0.893 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP015284 | Streptococcus salivarius strain ATCC 25975 plasmid, complete sequence | 83115-83142 | 4 | 0.857 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP016699 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain 275 plasmid p275A, complete sequence | 36883-36910 | 4 | 0.857 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP015284 | Streptococcus salivarius strain ATCC 25975 plasmid, complete sequence | 55243-55270 | 5 | 0.821 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | MN480762 | Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence | 10598-10625 | 5 | 0.821 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | MN480762 | Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence | 168253-168280 | 5 | 0.821 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP020429 | Streptococcus sp. FDAARGOS_192 plasmid unnamed1, complete sequence | 118713-118740 | 5 | 0.821 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP020429 | Streptococcus sp. FDAARGOS_192 plasmid unnamed1, complete sequence | 98135-98162 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NC_019430 | Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8, complete sequence | 14620-14647 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP018832 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence | 180660-180687 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP040906 | Enterococcus faecium strain FB-1 plasmid punnamed, complete sequence | 113824-113851 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP027518 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence | 150478-150505 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP027498 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence | 174624-174651 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP016744 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM2 plasmid pJM2C, complete sequence | 19046-19073 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | MT074686 | Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence | 73336-73363 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP025756 | Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence | 63468-63495 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP031539 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 3107 plasmid p3107A, complete sequence | 22007-22034 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_LR135476 | Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 2 | 151354-151381 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP016738 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3B, complete sequence | 19022-19049 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NC_017493 | Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549, complete sequence | 16777-16804 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NC_021987 | Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence | 76654-76681 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_LR135358 | Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2 | 169632-169659 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP044265 | Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence | 110148-110175 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP016708 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain UC109 plasmid pUC109B, complete sequence | 14623-14650 | 6 | 0.786 |
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LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP041262 | Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence | 55029-55056 | 6 | 0.786 |
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LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP014450 | Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence | 29008-29035 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP027502 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence | 55406-55433 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP016715 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC063 plasmid pUC063A, complete sequence | 20508-20535 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP040803 | Streptococcus salivarius strain LAB813 plasmid pSAL813, complete sequence | 65781-65808 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_LR135279 | Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2 | 44791-44818 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_LR135236 | Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2 | 36603-36630 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_AP018502 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain C4 plasmid pC43, complete sequence | 13248-13275 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP041256 | Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence | 10619-10646 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_LR135220 | Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2 | 36627-36654 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_LR134106 | Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2 | 36627-36654 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP023514 | Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence | 139819-139846 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP040876 | Enterococcus faecium strain DB-1 plasmid punnamed2 | 74007-74034 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP019993 | Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence | 46625-46652 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP035655 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence | 78878-78905 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP035661 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence | 72511-72538 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP035667 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence | 72513-72540 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP035649 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence | 78881-78908 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP051519 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain F plasmid pScrF52, complete sequence | 39090-39117 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP041271 | Enterococcus faecium strain VVEswe-S plasmid pVVEswe-S1, complete sequence | 55028-55055 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP040237 | Enterococcus faecium strain VB3025 plasmid unnamed1, complete sequence | 55030-55057 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NC_020208 | Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence | 121228-121255 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP034948 | Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence | 64834-64861 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP012461 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence | 55439-55466 | 6 | 0.786 |
LS483374_3 | 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder | 1698571-1698598 | 28 | NZ_CP016687 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 158 plasmid p158C, complete sequence | 17331-17358 | 6 | 0.786 |
1. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to KY065475 (Streptococcus phage IPP35, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to MK448817 (Streptococcus phage Javan59, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.929
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3. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to MK448405 (Streptococcus satellite phage Javan293, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
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4. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to MH937476 (Streptococcus phage CHPC933, partial genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
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5. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NC_012642 (Streptococcus parasanguinis plasmid pFW213, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
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6. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015284 (Streptococcus salivarius strain ATCC 25975 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
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7. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016699 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain 275 plasmid p275A, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
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8. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015284 (Streptococcus salivarius strain ATCC 25975 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
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9. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to MN480762 (Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
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10. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to MN480762 (Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
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11. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020429 (Streptococcus sp. FDAARGOS_192 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
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12. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020429 (Streptococcus sp. FDAARGOS_192 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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13. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NC_019430 (Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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14. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018832 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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15. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040906 (Enterococcus faecium strain FB-1 plasmid punnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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16. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027518 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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17. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027498 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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18. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016744 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM2 plasmid pJM2C, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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19. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to MT074686 (Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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20. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025756 (Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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21. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031539 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 3107 plasmid p3107A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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22. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135476 (Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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23. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016738 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3B, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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24. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NC_017493 (Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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25. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NC_021987 (Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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26. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135358 (Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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27. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044265 (Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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28. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016708 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain UC109 plasmid pUC109B, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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29. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NC_017478 (Lactococcus lactis plasmid pSK11L, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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30. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020439 (Streptococcus equinus strain FDAARGOS_251 plasmid unamed1 sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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31. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018188 (Streptococcus salivarius strain ICDC2 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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32. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022342 (Enterococcus faecium strain KUHS13 plasmid pKO1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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33. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NC_008506 (Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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34. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016733 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM4 plasmid pJM4E, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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35. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135308 (Enterococcus faecium isolate E7240 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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36. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018827 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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37. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF150536 (Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain FM03P plasmid pLd8, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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38. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041262 (Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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39. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043524 (Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain SD96 plasmid pSD96_05, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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40. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013995 (Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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41. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014450 (Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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42. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027502 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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43. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016715 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC063 plasmid pUC063A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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44. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040803 (Streptococcus salivarius strain LAB813 plasmid pSAL813, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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45. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135279 (Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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46. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135236 (Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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47. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP018502 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain C4 plasmid pC43, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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48. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041256 (Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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49. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135220 (Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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50. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134106 (Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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51. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023514 (Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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52. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040876 (Enterococcus faecium strain DB-1 plasmid punnamed2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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53. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019993 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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54. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035655 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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55. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035661 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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56. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035667 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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57. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035649 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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58. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP051519 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain F plasmid pScrF52, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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59. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041271 (Enterococcus faecium strain VVEswe-S plasmid pVVEswe-S1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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60. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040237 (Enterococcus faecium strain VB3025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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61. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NC_020208 (Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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62. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034948 (Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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63. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012461 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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64. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016687 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 158 plasmid p158C, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4185 : 53357
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483374|4185:53357|DBSCAN-SWA 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44 | Streptococcus_phage(22.22%) | bacteriocin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
105697 : 141345
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483374|105697:141345|DBSCAN-SWA 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37 | Streptococcus_phage(60.0%) | bacteriocin,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
289398 : 332895
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483374|289398:332895|DBSCAN-SWA 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46 | Streptococcus_phage(33.33%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
347718 : 381471
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483374|347718:381471|DBSCAN-SWA 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33 | Macacine_betaherpesvirus(33.33%) | transposase,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
424232 : 485904
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483374|424232:485904|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_phage(20.0%) | bacteriocin,protease,transposase,integrase | attL 448628:448644|attR 479760:479776 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
570404 : 620520
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483374|570404:620520|DBSCAN-SWA AATGAAAAAAAGCACAGTATTGTCACTAACTACAGCTGCAGTTATTTTAGCAGCCTATGCCCCTAATGAGGTAGTCTTAGCAGACACATCTAGCTCTGAAGATGCTTTAAGCATCTCTGATAAAGAAAAAGTAGTAGTAGATAAGGAAACAGAAAATAAAGAGAAACATAAAGATATTCATAATGCTATAGAAACTTCAAAGGATACTGAAGAAAAGAAAACAACAATTATTGAGGAAAAAGAAGTTGTTAGTAAAAATCCTGTAATAGACACTAAAACTAGCAATGAAGAAGCAAAAATCAAAGAAGAAAATTCCAATCAATCCCAAGGAGATCATACGGACTCATTTGTGAATAAAAACACAGAAAATCCCAAAAAAGAAGATAAAGTTGTCTATATTGCTGAATTTAAAGATAAAGAATCTGGAGAAAAAGCAATCAAGGGACTATCAAATCTTAAGAATACAAAAGTTTTATATACTTATGATAGAATTTTTAACGGTAGTGCCATAGAAACAACTCCAGATAACTTGGACAAAATTAAACAAATAGAAGGTATTTCATCGATTGAAAGGGCACAAAAAGTCCAACCCATGATGAATCATGCCAGAAAGGAAATTGGAGTTGAGGAAGCTATTGATTACCTAAAGTCTATCAATGCTCCGTTTGGGAAAAATTTTGATGGTAGAGGTATGGTCATTTCAAATATCGATACTGGAACAGATTATAGACATAAGGCTATGAGAATCGATGATGATGCCAAAGCCTCAATGAGATTTAAAAAAGAAGACTTAAAAGGAACTGATAAAAATTATTGGTTGAGTGATAAAATCCCTCATGCGTTCAATTATTATAATGGTGGCAAAATCACTGTAGAAAAATATGATGATGGAAGGGATTATTTTGACCCACATGGGATGCATATTGCAGGGATTCTTGCTGGAAATGATACTGAACAAGATATCAAAAACTTTAACGGCATAGATGGAATTGCACCTAATGCACAAATTTTCTCTTACAAAATGTATTCTGACGCAGGATCTGGGTTTGCGGGTGATGAAACAATGTTTCATGCTATTGAAGATTCTATCAAACACAACGTTGATGTTGTTTCGGTATCATCTGGTTTTACAGGAACAGGTCTTGTAGGTGAGAAATATTGGCAAGCTATTCGGGCATTAAGAAAAGCAGGCATTCCAATGGTTGTCGCTACGGGTAACTATGCGACTTCTGCTTCAAGTTCTTCATGGGATTTAGTAGCAAATAATCATCTGAAAATGACCGACACTGGAAATGTAACACGAACTGCAGCACATGAGGATGCGATAGCGGTCGCTTCTGCTAAAAATCAAACAGTTGAGTTTGATAAAGTTAACATAGGTGGAGAAAGTTTTAAATACAGAAATATAGGGGCCTTTTTCGATAAGAATAAAATCACAACAAATGAAGATGGAACAAAAGCTCCTAGTAAATTAAAATTTGTATATATAGGCAAGGGGCAAGACCAAGATTTGATAGGTTTGGATCTTAGGGGCAAAATTGCAGTAATGGATAGAATTTATACAAAGGATTTAAAAAATGCTTTTAAAAAAGCTATGGATAAGGGTGCACGCGCCATTATGGTTGTAAATACTGTAAATTACTACAATAGAGATAATTGGACAGAGCTTCCAGCTATGGGATATGAAGCGGATGAAGGTACTAAAAGTCAAGTGTTTTCAATTTCAGGAGATGATGGTGTAAAGCTATGGAACATGATTAATCCTGATAAAAAAACTGAAGTCAAAAGAAATAATAAAGAAGATTTTAAAGATAAATTGGAGCAATACTATCCAATTGATATGGAAAGTTTTAATTCCAACAAACCGAATGTAGGTGACGAAAAAGAGATTGACTTTAAGTTTGCACCTGACACAGACAAAGAACTCTATAAAGAAGATATCATCGTTCCAGCAGGATCCACATCTTGGGGGCCAAGAATAGATTTACTTTTAAAACCCGATGTTTCAGCACCTGGTAAAAATATTAAATCTACGCTTAATGTTATTAATGGCAAATCAACTTATGGCTATATGTCAGGAACTAGTATGGCGACTCCAATCGTGGCAGCTTCTACTGTTTTGATTAGACCGAAATTAAAGGAAATGCTTGAAAGACCTGTATTGAAAAATCTTAAGGGAGATGACAAAATAGATCTTACAAGTCTTACAAAAATTGCCCTACAAAATACTGCTCGACCTATGATGGATGCAACTTCTTGGAAAGAAAAAAGTCAATACTTTGCATCACCTAGACAACAGGGAGCAGGCCTAATTAATGTGGCCAATGCTTTGAGAAATGAAGTTGTAGCAACTTTCAAAAACACTGATTCTAAAGGTTTGGTAAACTCATATGGTTCCATTTCTCTTAAAGAAATAAAAGGTGATAAAAAATACTTTACAATCAAGCTTCACAATACATCAAACAGACCTTTGACTTTTAAAGTTTCAGCATCAGCGATAACTACAGATTCTCTAACTGACAGATTAAAACTTGATGAAACATATAAAGATGAAAAATCTCCAGATGGTAAGCAAATTGTTCCAGAAATTCACCCAGAAAAAGTCAAAGGAGCAAATATCACATTTGAGCATGGTACTTTCACTATAGGCGCAAATTCTAGCTTTGATTTGAATGCGGTTATAAATGTTGGAGAGGCCAAAAACAAAAATAAATTTGTAGAATCATTTATTCATTTTGAGTCAGTGGAAGAAATGGAAGCTCTAAACTCCAACGGGAAGAAAATAAACTTCCAACCTTCTTTGTCGATGCCTCTAATGGGATTTGCTGGGAATTGGAACCACGAACCAATCCTTGATAAATGGGCTTGGGAAGAAGGGTCAAGATCAAAAACACTGGGAGGTTATGATGATGATGGTAAACCGAAAATTCCAGGAACCTTAAATAAGGGAATTGGTGGAGAACATGGTATAGATAAATTTAATCCAGCAGGAGTTATACAAAATAGAAAAGATAAAAATACAACATCCCTGGATCAAAATCCAGAATTATTTGCTTTCAATAACCAAGGGATCAACGCTCCATCATCAAGTGGTTCTAAGATTGCTAACATTTATCCTTTAGATTCAAATGGAAATCCTCAAGATGCTCAACTTGAAAGAGGATTAACACCTTCTCCACTTGTATTAAGAAGTGCAGAAGAAGGATTGATTTCAATAGTAAATACAAATAAAGAGGGAGAAAATCAAAGAGACTTAAAAGTCATTTCGAGAGAACACTTTATTAGAGGAATTTTAAATTCTAAAAGCAATGATGCAAAGGGAATCAAATCATCTAAACTAAAAGTTTGGGGTGACTTGAAGTGGGATGGACTCATCTATAATCCTAGAGGTAGAGAAGAAAATGCACCAGAAAGTAAGGATAATCAAGATCCTGCTACTAAGATAAGAGGTCAATTTGAACCGATTGCGGAAGGTCAATATTTCTATAAATTTAAATATAGATTAACTAAAGATTACCCATGGCAGGTTTCCTATATTCCTGTAAAAATTGATAACACCGCCCCTAAGATTGTTTCGGTTGATTTTTCAAATCCTGAAAAAATTAAGTTGATTACAAAGGATACTTATCATAAGGTAAAAGATCAGTATAAGAATGAAACGCTATTTGCGAGAGATCAAAAAGAACATCCTGAAAAATTTGACGAGATTGCGAACGAAGTTTGGTATGCTGGCGCCGCTCTTGTTAATGAAGATGGAGAGGTTGAAAAAAATCTTGAAGTAACTTACGCAGGTGAGGGTCAAGGAAGAAATAGAAAACTTGACAAAGACGGAAATACCATTTATGAAATTAAAGGTGCAGGAGATTTAAGAGGAAAAATCATTGAAGTCATTGCATTAGATGGTTCTAGCAATTTCACAAAGATTCATAGAATTAAATTTGCTGATCAGGCTGATGAAAAGGGGATGATTTCTTATTACCTAGTAGATCCTGACAAAGATGCTTCTAAATATGAAAAACTTGGTGAAATTTCTGAAGATAAACTCAAAAATGCAAAGAGCCCAGAGGAAAATACCAATAATAATCAAGCTAAGGATGAAGATTCAAAACCAGATGAAAAAAGTTCAGTTGAGGGAGAAGCTAGCCTTGAAATAAATAAAACTATTTCAACAATTAGAGAGTTTGAAAATAAAGACCTAAAGAAACTCATTAAAAAGAAATTTAGAGAAGTTAATGATTTTACAAGTGAAACTGGTAAGAGAATAGAGGAATACGATTATAAATACGATGATAAGGGAAATATTATTGCTTATGACGATGGTAGTGCCTTACAATATGAAACTGAAAAATTTGACGAAATAAAATCAAAAATTTATGGTGTTCTAAGCCCATCTAAAGATGGACACTTTGAAATTCTTGGAAAGATAAGCAATGTTTCTAAAAATGCCAAGGTATATTATGGAAATAGCTATAAATCGATAGAAATCAAAGCGACTAAGTATGATTCACATTCAAAAACGATGATATTTGATTTATACGCTAATATTAATGATATTGTAGATGGATTAGCTTTTGCTGGAGATATGAGATTATTTGTTAAAGATGACAATCAAATAAAAGCTGAAACTAAGATTAGAATGCCTGAAAAAAATAAGGAAACTAAAGCAGAATATCCCTATGTATCAAGTTATGGGAATGTAATCGAATTAGGAGAAGGAGATCTTTCAAAGAACAAACCAGACAATTTAACTAAAATGGAATCTGGTAAAATCTATTCTGATTCAGAAAAACAACAATATCTGTTAAAGGATAACATCATTCTAAGAAAAGGCTATGCACTAAAAGTGACTACCTATAATCCTGGAAAAACGGATATGTTAGAAGGAAATGGAGTCTATAGCAAGGAAGATATAGCAAAAATACAAAAGGCCAATCCTAATCTAAGAGTCCTTTCAGAAACAACAATTTATGCTGATAGTAGAAATGTTGAAGATGGAAGAA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39 | Staphylococcus_phage(28.57%) | holin,bacteriocin,protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
698422 : 812905
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483374|698422:812905|DBSCAN-SWA 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108 | Streptococcus_phage(12.9%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
825068 : 871442
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483374|825068:871442|DBSCAN-SWA 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>LS483374|825068:871442|846135_847005_+|SQG01901.1|DBSCAN-SWA MQIQKSFKGQSPYGKLYLVATPIGNLDDMTFRAIQTLKEVDWIAAEDTRNTGLLLKHFDISTKQISFHEHNAKEKIPDLIGFLKAGQSIAQVSDAGLPSISDPGHDLVKAAIEEEIAVVTVPGASAGISALIASGLAPQPHIFYGFLPRKSGQQKQFFGLKKDYPETQIFYESPHRVADTLENMLEVYGDRSVVLVRELTKIYEEYQRGTISELLESIAETPLKGECLLIVEGASQGVEEKDEEDLFVEIQTRIQQGVKKNQAIKEVAKIYQWNKSQLYAAYHDWEEKQ >LS483374|825068:871442|856028_856304_-|SQG01914.1|DBSCAN-SWA MTTHDEPVYEKHGVLHYAVANIPGAVARTSTIALTNVTLPYIEALAGKGFAQAISEDEGLRQGVTTYQGYLTSLPVAQGLNRDYTDINDLV >LS483374|825068:871442|851210_851948_+|SQG01907.1|DBSCAN-SWA MANPKYKRILIKLSGEALAGERGVGIDIQTVQTIAKEIQEVHSLGIEIALVIGGGNLWRGEPAAEAGMDRVQADYTGMLGTVMNALVMADSLQQVGVDTRVQTAIAMQQVAEPYVRGRALRHLEKGRIVIFGAGIGSPYFSTDTTAALRAAEIEADAILMAKNGVDGVYNADPKKDKTAVKFEELTHRDVINKGLRIMDSTASTLSMDNDIDLVVFNMNQSGNIKRVVFGENIGTTVSNNIEEKE >LS483374|825068:871442|845815_846133_+|SQG01900.1|DBSCAN-SWA MDKKELFDALDDFSQQLLVTLADVEAIKKNLKSLVEENTALRLENSKLRERLGEVEADAPVKAKHVRESVRRIYRDGFHVCNDFYGQRREQDEECMFCDELLYRE >LS483374|825068:871442|838968_840852_+|SQG01894.1|holin|DBSCAN-SWA MKKKLTSLALVGAFLGLSWYGNVQAQESSGNKIHFINVQEGGSDAIILESNGHFAMVDTGEDYDFPDGSDSRYPWREGIETSYKHVLTDRVFRRLKELSVQKLDFILVTHTHSDHIGNVDELLSTYPVDRVYLKKYSDSRITNSERLWDNLYGYDKVLQTATETGVSVIQNITQGDAHFQFGDMDIQLYNYENETDSSGELKKIWDDNSNSLISVVKVNGKKIYLGGDLDNVHGAEDKYGPLIGKVDLMKFNHHHDTNKSNTKDFIKNLSPSLIVQTSDSLPWKNGVDSEYVNWLKERGIERINAASKDYDATVFDIRKDGFVNISTSYKPIPSFQAGWHKSAYGNWWYQAPDSTGEYAVGWNEIEGEWYYFNQTGILLQNQWKKWNNHWFYLTDSGASAKNWKKIDGIWYYFNKENQMEIGWVQDKEQWYYLDVDGSMKTGWLQYMGQWYYFAPSGEMKMGWVKDKETWYYMDSTGVMKTGEIEVAGQHYYLEDSGAMKQGWHKKANDWYFYKTDGSRAVGWIKDKDKWYFLKENGQLLVNGKTPEGYTVDSSGAWLVDVSIEKSATIKTTSHSEIKESKEVVKKDLENKETSQHESVTNFSTSQDLTSSTSQSSETSVNKSESEQ >LS483374|825068:871442|857953_858604_+|SQG01917.1|DBSCAN-SWA MEAIIEKIKEYKIIVICTGLGLLVGGFFLLKPAPQTPVKETNLQAEVAAVSKDLVSEKEVNKEEKEEPLEQDLITVDVKGAVKSPGIYDLPVGSRVNDAVQKAGGLTEQADSKSLNLAQKVSDEALVYVPTKGEEAVSQQTGLGTASSISKEKKVNLNKASLEELKQVKGLGGKRAQDIIDHREANGKFKSVDELKKVSGIGGKTIEKLKDYVTVD 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49 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease,transposase,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
894547 : 966389
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483374|894547:966389|DBSCAN-SWA 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55 | Streptococcus_phage(46.15%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1094171 : 1161652
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483374|1094171:1161652|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(20.0%) | bacteriocin,protease,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1186506 : 1231450
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483374|1186506:1231450|DBSCAN-SWA 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47 | Bacillus_phage(62.5%) | bacteriocin,protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1299118 : 1333914
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS483374|1299118:1333914|DBSCAN-SWA 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42 | Streptococcus_phage(20.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1414602 : 1421356
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS483374|1414602:1421356|DBSCAN-SWA TATGTCTCAACTCTATGATATTACCATTGTGGGTGGTGGTCCTGTCGGGCTTTTTGCAGCCTTTTATGCCCACCTACGCCAAGCCAAGGTTCAAATCATCGACTCTCTTCCCCAGCTAGGTGGACAACCTGCTATTCTCTACCCTGAAAAGGAAATCCTAGACGTACCAGGCTTCCCAAACCTGACTGGAGAAGAGTTGACTAACCGCTTGATTGAACAGCTAAATGGATTTGATACCCCTATTCATCTCAATGAAACGGTTCTTGAGATTGACAAACAAGAAGAAGAATTTGCCATCACAACTTCCAAAGGAAGTCACCTGACTAAAACAGTTATCATCGCTATGGGTGGCGGTGCCTTCAAACCACGTCCGCTGGAACTTGAAGGGGTTGAGGACTATGAAAATATCCACTACCACGTTTCTAACATTCAGCAATACGCTGGTAAGAAAGTGACGATTCTTGGTGGGGGAGACTCGGCTGTGGATTGGGCTTTGGCTTTTGAAAAAATCGCACCAACTACCCTTGTTCACCGCAGAGATAATTTCCGTGCCTTGGAACACAGTGTTCAAGCCTTGCAAGAATCATCTGTAACCATCAAGACACCATTCGCCCCTAGCCAACTCCTTGGAGATGGAAAAACGCTTGATAAACTTGAAATCACAAAAGTCAAATCTGATGAAACTGAAACCATTGACCTAGACCACCTCTTTGTCAACTATGGTTTCAAATCTTCTGTCGGTAACCTTAAAAACTGGGGGCTCGACCTCAACCGTCACAAGATTATCGTCAACAGCAAACAAGAATCCAGCCAAGCAGGTATCTATGCTATCGGTGACTGCTGCTACTATGACGGAAAAATTGATCTGATTGCGACAGGTCTAGGGGAAGCTCCAACTGCTGTCAACAACGCTATCAACTACATTGACCCTGAACAAAAAGTACAACCAAAACACTCTACCAGTTTATAAAAAAGAACCACGAGTCACATAGGATTCGTGGTTTTATAATTCATCCGCTATCTTATTGATTTTTCTGAGTCTGTGATTGACACCACTTTTGGTCAGAGGGGTGCTGAGACTATCTGCTAACTGCTGGATAGAGTAGTCTGGGTGCTGAATCCTCAGTTGCGCCACTTCCTGCAAATCTACTGGCAAATTTTCTAAGCCCATGATATCTTTGATTTTACTGATATTGTTAATGGTCTTCATGCTGGCAGAAACTGTCCGAGCGATATTAGCTGTCTCGGCATTATTAGCTCGATTGAGGTCGTTACGGGTTTCTCGCAAAATCTTAACCCGCTCAAAATCATCACGTGCCTGCATGGCTCCTATTACTATCAAGAAGTCCATAATGTCTTCTGCTCGCTGGAGATAGGTCACAGCCCCCTTCTTGCGCTCAAGCACCTTGGCATCCAGTAAAAACTGTTGGAGAAGGGAGGCAATTCCTTGCGCGTGGTCCAGATAAACAGAACTGATTTCCAACTGGTACTTGCCTGACTCAGGGTCACGAATGCTCCCATTTGCCAAGAAAGCGCCACAGAGATAGGCACGACCTGCTTCCTCATCCGATAAAATCGCCTCATCAATACCTGTTTCCAGGCCAAAGAAAGAGTCTGCCAAGTGCAAATCACTTAACAAATCCTGCACCTTTTCATCTGTAAAAACGGTATAGACGCGATTCTTGCGAAGATTGCTCCGTTGGTGGTGACGAATTTCAGATTTGATTTCATAGAAATGGAGAAAGGACTCATAGAGGTGACGGGCCAGTTTGGCATTTTCTGTCACAACTGACAAAGTCAAGCCCGAAGTCGAGAGACCGATGCTACCAGACATTTTGATAATGGCAGATAATTCATGCCAGCTCAGATGGTGTTGGCCCAGGATTTCTTCTTTTACTGCTACTGTGAAACTCATTTTTTCACCTGTATAATGCGCATCAACTCGTCCACAATCAAATCTCCATCGTGGAAGGCACCGCCATTTTCCAGACGAAGGAAGTTAGATGAAATCACGCGCGAAACTTGCTTACAAAGACCTACAAAATCGTGTTCCACTTGCACCAAGTATTCATCAAAACGGTTGGAATTCATGTATTCCTGAGGCACTTTTTCAATATTCACCAAGACAGTGTCGATAAAAGGGCGACCAAGGTGACGATGCAAGACTTCCACGTGGTTGCTATCTGTAAAGTGTTCCGTCTCCCCACGTTGGGTCATGATATTGCAGACATAGGCAATTTCTGCCTTGGTTTCCAAAAGAGCCCGCCCAATTTCCTTAATCACGATATTGGGCAAAATAGAGGTAAAGAGGGAACCTGGCCCTAGGACAATCATGTCACTTTCAAGGATGGTCTGCACTACTCGACGGCTGGCCAGAGGCGTATCATCGTTTAGGGCATTGGTCACATAGACATTGTCAATTATGCCTCGATGGTCTACAATATGACTCTCTCCAGCCACTTCTGTCCCATCCTGAAAGACTGCATGAAGGGTCAAAGGATGGTCACTGGAAGGATAAATTTTCCCTGTTGTATGGAAAAATTTGCTCAATAACTGCATGGCATTATAGGTTGAACCCTGCATTTCTGACAAGCCAGCAATGATGAGATTTCCCAATGGATGGCCAGCAAAGGCTCCGGCATCCTCAGAGAACCGATACTGAAAGACCTTCTCATAAAACTTAGGCATATCCGACATGGCCACAAGGACATTACGAAGATCACCTGGCGGTGTCAACTGTTGCATATTTTTTCGGAGTTCACCTGAAGAACCACCATCATCTGCCACCGTCACGATAGCTGCGATTTCCACATCTTTTTCCCGCAGACTTTTTAGAATGACGGGAATTCCAGTCCCTCCACCAATCACCGTTATCTTTGGTTTTCTCATGAACGGTTTACCGTTTCCTTTCTGCGGTCTTTGTCGCGATGCCCTTCATTAACAGACCAATTCTTGGATAAGTCCTGCACCAAGCGTTTAGCAAATGCCACACTACGGTGTTGTCCACCCGTACATCCCATGGCAATGGTCAAAACGGACTTACCTTCCTTTTGGTAACTTGGCAGAATCGGCTCAATCAAGGCCAATAAATGTTGATAAAAGTCTTCTGACTCAGGATGGTTCATGACATAATCATAAACAGGTTCATCCACACCCGTTTGGTTTCTCAGTTCTGGTAAATAATAGGGATTTGGCAAGAAACGGACATCAAAGACCAAGTCCGCATCAATCGGGATTCCATACTTAAATCCGAAAGACATGACTTCGATACGGAAAGACTGAGCTTGTTCTTGGTCTGAAAACTGCTCTGCAAGGGTTTTGCGCAGCTCACGTGGAGTGAGTTCAGTCGTATCCACCACATTTTGGCTCATATTTTTCAAAGGTGCCAAGAGTTCACGTTCCAACTTGATTCCATCTAAAATACGACCGTCTGCTGCTAGTGGGTGACTCCGTCTGGTTTCCTTGTAACGAGCGACCAATTCCTTATCAGCCGCATCCAAAAAGAGGATTTTGAAATCCAAACCATCTTGATTTTCCAACTCATCCAAAACAGCTTGAATCTCTGAAAAGAAAGAACGACTACGCATATCCACTACCAAGGCCAACTTAGGATTGTCTTCCTTAATTTCAACCAGCTGCAAAAACTTAGGCAAGAGAGCTGGCGGCATATTATCAATGGTGAAATAACCTAGATCCTCGAAGGACTGAATGGCTACAGTTTTCCCTGCGCCACCCATCCCTGTCACAATCACCAAGTGAAGTTGTTTCTTTGTCATCTTTTTCTCCTTATATCAAAAGAAGTTTGGCAACACCAAACTTCAACTAGCTTATCCAATCTCTGCGATGACTTCAATTTCGACTTTTACATCACGAGGAAGACGAGCTACCTCCACAGCTGAACGAGCTGGGAATTCCTCTTTGAAGGCCGTTTGGTAAACCTCATTAAAAGGAACAAAGTCGTTCATATCGCTCAAGAAGCAAGTTGTTTTGACAACATGGTCAAAGTCTGTTCCTGCTTCTGCCAAAATAGCACCGATGTTTTTCAAGACTTGCTCTGTCTGTTCTTGGATATTCTCTCCTACAATTTCCCCAGTTTCAGGGGATAGGGGAACTTGACCGCTAGCAAACAAAAGGTTGCCAACGATTTTTCCTTGAACATAGGGCCCGATAGCCTTTGGGGCCTTATCTGTATGAATTGTTTTTGCCATTTTCTTTTCCTCACAATTTTTCTAAGATTGCATCCCAAGCCTCATCCATCCCTGCCTTGCTGACAGATGAAAAGAGGATGAAATCGTCACTTGGGTCAAAGTTTAATTTCTTTTTGATTGCTGATTCATGCTTGTTCCATTTACCACGAGGAATCTTGTCCGCCTTGGTCGCCACAATGATGACTGGAATCTCATAATACTTGAGAAATTCGTACATCTGCACATCATCTGCTGACGGGTCATGACGAAGGTCAACTAGACTGACAACCGCACGGAGATTTTCCCGAGTCGTTAAGTACTCCTCAATCATGCACCCCCACTTTTCACGTTCCTTTTTAGAAACACGAGCATAGCCATAACCAGGCACATCCACAAAGCGCATCTTGTCATCAATGTTAAAAAAGTTCAGGAGCTGGGTTTTACCAGGTTTTCCTGATGTACGGGCGAGATTCTTACGGTTCAACATAGTGTTGATAAAGCTGGATTTACCAACATTTGAACGCCCTGCTAGGGCAATCTCTGGCAGTTCATCCTGCGGATAGTGGGACTTATTAGCTGCACTGAGCAAGATTTCAGCATTGTGTGTGTTAAGTTCCATAGTCACCTCTAGGCTGTTTCTAGGATCGGTTTATCCGTTCCATCGACAGTTTCTTTAGTGATGCGAACCAATTTCACATTTTCCTGACTCGGCACCTCAAACATAACATCTAGCATGGTTTCTTCGATGATGGAGCGAAGTCCACGCGCCCCTGTCTTCCGTTCGATTGCTTTATTAGCAATCTCTTGAAGGGCTTCGTCGTCAAATTCCAACTCAACATCATCATAAGAAAGCAAGGTTTGGTACTGTTTCACCAAGGCATTTCTTGGCTCTTTCAAGATGCGAACCAAGTCATCAACGGTCAATTGCTCAAGAGCCGCAAAAACAGGCAAGCGTCCAATCAACTCAGGGATAATACCAAATTTTTGAATGTCTTCAGCGATGATTTCTTGCATGTATGAGCTGTTTTCGTCAATCGCCTTATTGTTTTGACCAAATCCGATGACTTTTTCACCCAGACGTTGTTTGACAATTTCTTCAATACCATCAAAAGCACCACCCACGATGAAGAGGATATTTTTTGTATCCACTTGAATCATCTCTTGTTGTGGATGTTTGCGTCCACCTTGAGGCGGTACGCTAGCAACAGTTCCCTCGATAATCTTGAGAAGGGCTTGTTGCACCCCTTCACCAGAAACATCACGTGTGATAGACACATTCTCACTCTTCTTGGCAATCTTGTCAATTTCATCCACATAGATAATGCCACGCTCTGCACGTTCGATGTTAAAGTCAGCAACCTGCAAGAGTTTGAGGAGGATATTTTCCACGTCCTCACCCACATAACCAGCCTCCGTCAGAGCTGTCGCATCCGCAATAGCAAAAGGCACATTCAAGCTCTTAGCCAAGGTCTGGGCAAGGAAAGTTTTCCCTGAACCAGTTGGGCCAATCATCAAAATGTTTGACTTCTGCAAATCCACATCTTCTGACTCTTCGCGTGTATCGTGGAAATTGATGCGTTTGTAGTGGTTATAAACCGCCACTGCCAAGGCACGCTTGGCACGATCTTGACCAATTACATAGTGGTTCAAGATATGGAGGAGTTCAATTGGTTTTGGCACCTCAGACAAGTCTGCCAAGACTTCCTCAACCAATTCTTCTCGAATGATTTCCTGAGCTAACTCCACGCATTCATTACAAATAAAAGCATTGTTGCCAGCAATTATTTTTTGTACTTCTTCTTGGTTTTTGCCACAAAATGAGCAATAAACCATCATATCATTTTTTCTATTTGTAGACATGATTTCCTTCCATTCTATACTGTCATTCTATCTAAAATAAGGTCATGTAAAAAGCATGAATACTATTGACCAGATTGGTAAAGGCATTTAACCAAAGGAGGATAGAAAGCCCGTAACGCTTTTTACGAAAAGCCTGTGCTCCTGCCAGAAAGCAGATGAAACACAGAAAAGCCGTGAATAGACCAAATAAACTCCGTTCCATTAGACTTCCTTTCTCTTGCGGTATTGGATGGTAAAATCATAAGGATTCTTCTCATCTTTGGCGTAAAATTTGCTTGAAACTGTCTCAAAAAGAGACAAGTCAAGCTCTTCAGGGAAATAGGTATCTCCTTCCACCCGAGCATGAATGTGAGTGACAATCACTTCATCAAGGTAAGGTTCAAAAGCCTGAAAAATTTGCTTCCCACCGATAATGTAGAGATTCTTTTCTTGATCCTGATACCAGTCAAGAACAGACTGGACGTCCTGAAAAGTAGCAACCCCATCTATCTTTTCTTCCGGATTACGCGTCAAAATCAGGGTTTCCCGTTTTGGAAGCAAGCGACGCCCCATCCCATCAAAGGTCACACGCCCCATCAAGATAGCATGATTCAGAGTTGTTTCTTTAAAGTGCTGCAATTCTGCTGGCAAATGCCAAGGCAGACGATTTTCCTTACCAATCAAACCCTCTTCATCCTGGGCCCAAATAGCTACGATTTTCTTAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS483374|1414602:1421356|1415604_1416516_-|SQG02458.1|DBSCAN-SWA MSFTVAVKEEILGQHHLSWHELSAIIKMSGSIGLSTSGLTLSVVTENAKLARHLYESFLHFYEIKSEIRHHQRSNLRKNRVYTVFTDEKVQDLLSDLHLADSFFGLETGIDEAILSDEEAGRAYLCGAFLANGSIRDPESGKYQLEISSVYLDHAQGIASLLQQFLLDAKVLERKKGAVTYLQRAEDIMDFLIVIGAMQARDDFERVKILRETRNDLNRANNAETANIARTVSASMKTINNISKIKDIMGLENLPVDLQEVAQLRIQHPDYSIQQLADSLSTPLTKSGVNHRLRKINKIADEL >LS483374|1414602:1421356|1417486_1418377_-|SQG02460.1|DBSCAN-SWA MTKKQLHLVIVTGMGGAGKTVAIQSFEDLGYFTIDNMPPALLPKFLQLVEIKEDNPKLALVVDMRSRSFFSEIQAVLDELENQDGLDFKILFLDAADKELVARYKETRRSHPLAADGRILDGIKLERELLAPLKNMSQNVVDTTELTPRELRKTLAEQFSDQEQAQSFRIEVMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPYYLPELRNQTGVDEPVYDYVMNHPESEDFYQHLLALIEPILPSYQKEGKSVLTIAMGCTGGQHRSVAFAKRLVQDLSKNWSVNEGHRDKDRRKETVNRS >LS483374|1414602:1421356|1420849_1421356_-|SQG02465.1|DBSCAN-SWA MTKKIVAIWAQDEEGLIGKENRLPWHLPAELQHFKETTLNHAILMGRVTFDGMGRRLLPKRETLILTRNPEEKIDGVATFQDVQSVLDWYQDQEKNLYIIGGKQIFQAFEPYLDEVIVTHIHARVEGDTYFPEELDLSLFETVSSKFYAKDEKNPYDFTIQYRKRKEV >LS483374|1414602:1421356|1419415_1420648_-|SQG02463.1|protease|DBSCAN-SWA MSTNRKNDMMVYCSFCGKNQEEVQKIIAGNNAFICNECVELAQEIIREELVEEVLADLSEVPKPIELLHILNHYVIGQDRAKRALAVAVYNHYKRINFHDTREESEDVDLQKSNILMIGPTGSGKTFLAQTLAKSLNVPFAIADATALTEAGYVGEDVENILLKLLQVADFNIERAERGIIYVDEIDKIAKKSENVSITRDVSGEGVQQALLKIIEGTVASVPPQGGRKHPQQEMIQVDTKNILFIVGGAFDGIEEIVKQRLGEKVIGFGQNNKAIDENSSYMQEIIAEDIQKFGIIPELIGRLPVFAALEQLTVDDLVRILKEPRNALVKQYQTLLSYDDVELEFDDEALQEIANKAIERKTGARGLRSIIEETMLDVMFEVPSQENVKLVRITKETVDGTDKPILETA >LS483374|1414602:1421356|1418819_1419407_-|SQG02462.1|DBSCAN-SWA MELNTHNAEILLSAANKSHYPQDELPEIALAGRSNVGKSSFINTMLNRKNLARTSGKPGKTQLLNFFNIDDKMRFVDVPGYGYARVSKKEREKWGCMIEEYLTTRENLRAVVSLVDLRHDPSADDVQMYEFLKYYEIPVIIVATKADKIPRGKWNKHESAIKKKLNFDPSDDFILFSSVSKAGMDEAWDAILEKL >LS483374|1414602:1421356|1420679_1420850_-|SQG02464.1|DBSCAN-SWA MERSLFGLFTAFLCFICFLAGAQAFRKKRYGLSILLWLNAFTNLVNSIHAFYMTLF >LS483374|1414602:1421356|1416512_1417490_-|SQG02459.1|DBSCAN-SWA MRKPKITVIGGGTGIPVILKSLREKDVEIAAIVTVADDGGSSGELRKNMQQLTPPGDLRNVLVAMSDMPKFYEKVFQYRFSEDAGAFAGHPLGNLIIAGLSEMQGSTYNAMQLLSKFFHTTGKIYPSSDHPLTLHAVFQDGTEVAGESHIVDHRGIIDNVYVTNALNDDTPLASRRVVQTILESDMIVLGPGSLFTSILPNIVIKEIGRALLETKAEIAYVCNIMTQRGETEHFTDSNHVEVLHRHLGRPFIDTVLVNIEKVPQEYMNSNRFDEYLVQVEHDFVGLCKQVSRVISSNFLRLENGGAFHDGDLIVDELMRIIQVKK >LS483374|1414602:1421356|1414602_1415571_+|SQG02457.1|DBSCAN-SWA MSQLYDITIVGGGPVGLFAAFYAHLRQAKVQIIDSLPQLGGQPAILYPEKEILDVPGFPNLTGEELTNRLIEQLNGFDTPIHLNETVLEIDKQEEEFAITTSKGSHLTKTVIIAMGGGAFKPRPLELEGVEDYENIHYHVSNIQQYAGKKVTILGGGDSAVDWALAFEKIAPTTLVHRRDNFRALEHSVQALQESSVTIKTPFAPSQLLGDGKTLDKLEITKVKSDETETIDLDHLFVNYGFKSSVGNLKNWGLDLNRHKIIVNSKQESSQAGIYAIGDCCYYDGKIDLIATGLGEAPTAVNNAINYIDPEQKVQPKHSTSL >LS483374|1414602:1421356|1418428_1418809_-|SQG02461.1|DBSCAN-SWA MAKTIHTDKAPKAIGPYVQGKIVGNLLFASGQVPLSPETGEIVGENIQEQTEQVLKNIGAILAEAGTDFDHVVKTTCFLSDMNDFVPFNEVYQTAFKEEFPARSAVEVARLPRDVKVEIEVIAEIG |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1655544 : 1679882
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >LS483374|1655544:1679882|DBSCAN-SWA TATGGAACAATTACATTTTATCACAAAATTACTAGACATTAAAGACCCTAATATCCAGATTTTAGACATCATCAATAAGGATACACACAAGGAAATCATCGCCAAACTGGACTACGACGCCCCATCTTGCCCTGAGTGCGGAAACCAATTGAAGAAATATGACTTTCAAAAACCGTCTAAGATCCCTTACCTCGAAACAACTGGTATGCCTTCTAGAATTCTCCTTAGAAAACGCCGTTTCAAGTGCTATCACTGTTCAAAAATGATGGTCGCTGAAACTTCTATCGTCAAGAAGAATCATCAAATTCCTCGTATTATCAACCAAAAAATTGCGCAAAAGTTGATTGAGAAGATTTCTATGACCGATATTGCTCATCAGCTGGCCATTTCAACTTCAACTGTCATTCGCAAGCTCAATGATTCTCACTTTGAGCATGATTTTTCGCGTCTTCCTGAGATTATGTCCTGGGACGTTGAAACAGTCCGGGGAGTGACTGTTTCAATCGGGAGATGGAGATGAGCTTTATTGCGCAAGATTTTAACAATCTCAATATCATCACTGTTCTTGAGGGAAGAACACAAGCTATCATTCGAAATCACTTTCTTCGCTACGATAGAGCCGTCCGATGTCGCGTCAAAATCATTACTATGGATATGTTTAGCCCTTACTATGGCTTGGCTAAACAGCTTCGCTTTCAAATTTCTAGGCTCAGGCTGAAACAGTCTCCCAGACTGTTTCACTCCCGAATGCTAAAATCGTTCTTGATCGCTTTCACATTGTACAACATCTTAGCCGTGCTATGAGTCGTGTGCATGTCCAAATCATGAATCAGTTTCATCGAAAATCCCATGAATACAAGGCTATCAAGCGCTACTGGAAACTCATTCAACAGGATAGCCGTAAACTGAGTGATAAACGTTTTTATCGTCCTACTTTTCGTATGCACTTAACCAATAAAGAGATTTTAAACAAGCTTTTGAGCTATTCACAAGACTTGAAACACCACTATCAGCTCTTGCTGTTTCACTTCCAGAATAAGGAACCAGAGAAATTTTTCGGGCTTATTGAGGACAATCTAAAGCAGGTTCATCCTCTTTTTCAGACTGTCTTTAAAACCTTTCTAAAGGACAAAGAGAAAATCGTCAACGCCCTTCAACTACCCTATTCAAACGCCAAATTGGAAGCGACCAATAATCTCATCAAACTTATCAAACGCAATGCCTTTGGTTTTCGAAACTTTGAAAACTTCAAAAAACGGATTTTTATCGCTCTGAATATCAAAAAAGAAAGGACAAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTTTTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCCGGAAATTGTCTGAGCATTCTTTTATCTAGTCGTTTAAGGAAGTTGAGTTCAGTATGTTTAAAGTCTCTGTCCCATCATTTCTTCAACAAACCTTGTTCTTGGAGAAACTCCTTGGCTACTTGCTTTGCTGACTTGCCTTCAACACCGACTTGGTAGTTGAGCTGGCTCATCTGGCTTTCTGTAATCTTACCAGCCAATGTATTAAGAACTCTTTCCAACTCTGGGTGTTTCTTGAGAAGAGCTTCTTTCATGAGTGGAGCCCCTTGATAAGGTGGGAAGAGTTGCTTGTCATCTTCCAAGACCTGTAAATCATAACGCTCCAATTCCGCATCAGTCGAATAGGCATCCGTGATTTGAATATCCCCTGAATGAATTGCCTGATAACGAAGAGCTGGCTGCATAGTCGCCACATTGAGATTGAGACCATACATTGATTGCAAGCCCTTATTTCCATCTTCACGGTCGTTAAACTCAAGCGTAAAGCCTGCCTTCAGCTGCCCTTCCACTTTTTTCAAATCCGAAATGGTCTTCAAGCCATATTCTTGAGCAATCTTTTTCGGAACAGCTACAGCATAGGTATTTTGATAAGACATAGGTTTGAGATAGGCTAGATGATCCTGCTTGGCAATGCCATCACGCGCCACTTGATAAACCTGCTCTGGCTCATGACTCACCTTGGGTGATGGTTGAAGCAAACTTTCAGTCACCGTACCGGTAAATTCAGGATAAATGTCAATATCACCTTTTTTCAGAGCTTCATAAAGGAAACTTGTCGTCCCAAAATTCGGTTTAACAGTCGCAGTCATGCTGGTATTTTCTTCAATCAGCAATTTATACATATTAGCCAAAATTTCTGGTTCTGGGCCTATTTTCCCAGCAATAATCAAGTTTTCCTTCTCTTTTTGAGCCAAAAGGGCTGGACTATAAGACAGACCCAGTAATAAAGCCATCAAGGCAAAACCAGAGAAAATCGTCCGCAATTTCGCTTTTTCCATTACTTTTAGTAGGAAGTTAAAGGCAATAGCTAGCACTGCAGAAGAAAGGGCCCCAATCAAAATCAAACTGGCATTATTACGGTCAATTCCCAACAGGATAAAGGAACCCAGTCCCCCTGCCCCAATCAAGGTCGCCAAGGTAGCCGTACCGATAATCAAGACCGCTGCCGTCCGAATTCCAGACATGATAACAGGCATGGCAAGTGGAATTTCAAACTTCTTGAGACGCTCCCATCTGGTCATCCCAAAGGCAATCCCAGCCTCTTGAAGACTCGGATCAATTCCCTTCAGCCCAGTAATAGTATTTTGTAAAATCGGAAAAATCGCATAAATCACTAGAGCTGTCAATGCCGGTAAAGTCCCAATTCCCATCAAGGGAATAAAGAGTCCCAACAAGGCCAGAGACGGGATGGTCTGGAAAATCCCTGCAATCTGTAAGACCCAATCCGCCAACTTCTCATGATAGCGAAGATAAACAGCCAAGGGAATCGCAAGCAAAATAGCTAGTAACAAGGTCAAAAGTGACAACTGCAAATGTTGAGATAGGGCTGTCAACCAATCACCAAAACGATCCTGAAAAGTTGCAATTAAATTAGTCATGAATACTACCTCCAAACAAGTCTGCAACAAAGTCTGTTGCAGGAGCTTTTAAAATAGTCTCAGGATTCGACACCTGACGAATCTCTCCATCCTGCAAGACAGCAATACGATCTGCCAACTTTAAGGCTTCATCCGTATCATGAGTCACAAAAATCGTTGTCATCCCAAACTCTTTATGTAATTCTTTTGTCAGAACCTGCAACTGCTTGCGAGAAATAGCATCCAAGGCTGAAAAGGGTTCATCCATGAGGAGAATCTTGGGCTGACCAATCATAGCTCGGACAATACCGACCCGTTGCTGTTCTCCACCAGATAGCTCACTTGGAAGTCGATGCCCATACTCAGCTACTGGTAAACCAACCTTAGCCAAAAGCTCTTCTGTTTTTTGAGCAATTTCTTCCTTAGTCCAACCCTTCATTTCAGGAATGAGAGCAATATTTTCCTCAACTGTTAGATTGGGAAAGAGAGCAATAGCCTGTAAAACATAACCAGTAGAAAGACGAAGTTCACGCTCATCATAGTCTTTGATGCGCTTCCCATCCATATAAATATTTCCATCAGTTGGTTCCAAAAGACGGTTAATCATCTTGAGCATGGTCGTCTTACCTGACCCAGAAGGCCCTACTAAAACCATAAATTCCCCATCCTCAATCTGTAAGTTGACATCTCTCAAGACATCCTTTTCTGTGTAGCGCAGTGCTACATTTTTGTATTCAATCATTCTTTGTCCTCAATTTAAAACTTCCCTCGATTAGTCAAGTCTTCTACCTTAGGCATGACTTCCTTATTATCCCAATGCTCCACAATTTTCCCGTTCTCTAAACGGAAGATATCGTACTGGGCATAAGCAACGCCATCAATCTGAGTCTGACCATAGCTAACCACATAGTTTCCTTGTCCTAAGAGTTGGAAAACAAAGTCAAAAGTGACACTATATTCAGCCACATAGTTTTTATAAGCAGCACTTCCTTGTCCAATCTCATGATTATGCTGAATCAAATCGTCTGCCACATAATCACTCCACTGCTCTAGCTCCCCATTTTGGAAAATTTCTGTCAAGAAACGGCGAACCAGCTTTTTATTTTCTGCTTTCTTATCCAAATCCTTGATTTCAAAATCTCCAAAAATTTGATCTAGTTGGTCATTTTCAGGTGTTCGATAGTAGTCAATGACATCCCAATGCTCAACAATACAACCATTCTCATCCTCACGGAAAGTATCCGTCGTCACCCATTGAGCTTCTCCACCATTCAGATATTGATGAACATGAACAAAGACCAGATTGCCATCCTCAATGGTGCGGACAATCTTAATCTGACGCTCTGGATGACGCTCAAAGAAATCTGCAAAGAAGGCTGCAAATCCTTCTTTCCCGTCAGGAACACCTGTCGAATGTTGGATATAGGTATCCCCTACAGACTGGGCTTGAGCCTCAGCAACTCGCCCGTCTTGAATGGCATGGATGTATAGGTTGTGAGCATTTTTCACTTGTTGTGACATATTCTAAACCTCATTTCCCTTCTCTTTCAGATTCGCCAAAATTCTTTCTTGAAAACCTTCAAATTGGTGAATTTCTTCCTCTGAAAATCCTTTGTAAAAGATAGTATCCAATTTCTGACTGACACGATGCCCCACTTCTTTCTGGGACTTGCCTAACTCCGTTAAAACTAAATACTTCTTACGCTTGTCTTTTCCACACGGACTAACAATTACAAGCTTTTGTTCCTCTAGCTTTTTTATCATAGTCGTCAGCGTATTATTCGCAAGTCCAGTCGCAAGCGCGATATCTGTCGCAGTTGCGCAGCCAGTTTCACTATTCCATAAAACCGCTAAAATCTTGCCCTGTTCACCCCTATAAAGAGCCTCAGGATCTTGACTCAGTAACTTTTGAAAAATCCGCCCATTCAACAAACGAATATGATGGGCTAGCAAATGACCATCTTTCATAACACCTCCAATTTATTTCGATATCGAAATGAATAAAACAATTGTAACACTCATCGTTCTAACTGTCAACTATTTCGATTTAGAAATAATTTTTGATAATTATCC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MAEPNLESLIKDLYNHARHDLSEDLVAALLETAKKLPTTNEQLQAVRLSGLVNRELLLNPKHPAPELLNLARFIKREEAKYRGTATSALMYEELFKML >LS483374|1655544:1679882|1656059_1656347_+|SQG02701.1|transposase|DBSCAN-SWA MSFIAQDFNNLNIITVLEGRTQAIIRNHFLRYDRAVRCRVKIITMDMFSPYYGLAKQLRFQISRLRLKQSPRLFHSRMLKSFLIAFTLYNILAVL >LS483374|1655544:1679882|1658483_1659212_-|SQG02704.1|DBSCAN-SWA MIEYKNVALRYTEKDVLRDVNLQIEDGEFMVLVGPSGSGKTTMLKMINRLLEPTDGNIYMDGKRIKDYDERELRLSTGYVLQAIALFPNLTVEENIALIPEMKGWTKEEIAQKTEELLAKVGLPVAEYGHRLPSELSGGEQQRVGIVRAMIGQPKILLMDEPFSALDAISRKQLQVLTKELHKEFGMTTIFVTHDTDEALKLADRIAVLQDGEIRQVSNPETILKAPATDFVADLFGGSIHD >LS483374|1655544:1679882|1659994_1660438_-|SQG02706.1|DBSCAN-SWA MKDGHLLAHHIRLLNGRIFQKLLSQDPEALYRGEQGKILAVLWNSETGCATATDIALATGLANNTLTTMIKKLEEQKLVIVSPCGKDKRKKYLVLTELGKSQKEVGHRVSQKLDTIFYKGFSEEEIHQFEGFQERILANLKEKGNEV >LS483374|1655544:1679882|1671919_1672891_-|SQG02721.1|DBSCAN-SWA MTNKIYEYKDDQNWYVGSYSIFGGVNSLSDYKADFPLFEFSKIFGDEEYGFPLSVTVLRYGSTYRLFSFVVDMLNQEMGRNLEVIQRHGALLLVENGQLLYVELPKEGVNVHDFFETSKVRETLLIATRNEGKTKEFRAIFDKLGYDVENLNDYPDLPEVAETGMTFEENARLKAETISQLTGKMVLADDSGLKVDVLGGLPGVWSARFAGVGATDRENNAKLLHELAMVFELKDRSAQFHTTLVVASPNKESLVVEADWSGYINFEPKGENGFGYDPLFLVGETGESSAELTLEEKNSQSHRALAVKKLLEVFPSWQSKPSL >LS483374|1655544:1679882|1670233_1670968_-|SQG02718.1|integrase|DBSCAN-SWA MRDRISAFLEEKQGLSVNSKQSYKYDLEQFLDMVGERISETSLKIYQAQLANLKISAQKRKISACNQFLYFLYQKGEVDSFYRLELAKQAEKKTEKPEILYLDSFWQESDHPEGRLLALLILEMGLLPSEILAIKVADINLDFQVLRISKASQQRIVTIPTALLSELEPLMGQTYLFERGEKPYSRQWAFRQLESFVKEKGFPSLSAQVLREQFILRQIENKVDLYEIAKKLGLKTVLTLEKYR >LS483374|1655544:1679882|1668917_1669487_-|SQG02716.1|DBSCAN-SWA MSTLAKIEALLFVAGEDGIRVRQLAELLSLPPTGIQQSLGKLAQKYEKDPDSSLALIETSGAYRLVTKPQFAEILKEYSKAPINQSLSRAALETLSIIAYKQPITRIEIDAIRGVNSSGALAKLQAFDLIKEDGKKEVLGRPNLYVTTDYFLDYMGINHLEELPVIDELEIQAQESQLFGERIEEDENQ |
28 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,holin,integrase | attL 1663527:1663543|attR 1672752:1672768 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1698127 : 1750197
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >LS483374|1698127:1750197|DBSCAN-SWA TATGGAACAATTACATTTTATCACAAAACTGCTCGATATTAAAGACCCAAACATCAAGATTCTAGATATCATCAATATGGATACCCACAAAGAAATTATCGCTAAGCTGGATTATGAGGCTCCATCTTGCCCTGATTGTGGAAGTCTAATGAAGAATAAGGAACCAGAGAAATTTTTCGGGCTTATTGAGGACAATCTGAAGCAGGTTCATCCTATTTTTCAGACTGTCTTTAAAACCTTCCTCAAAGATAAAGAAAAGATTGTCAACGCCCTTCAACTACACTATTCTAACGCCAAACTGGAAGCGACAAATAATCTCATCAAACTTATCAAACGAAACGCCTTTGGATTTCGGAACTTTGAAAACTTCAAAAAAAGGATTTTTATCGCTTTGAACATCAAAAAAGAAAGGACAAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTTTTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCCAAAAAAGAAAGGACGAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTTCTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCCATAAAAATAACTTCAGATTAGTAATTCAATTAAGTTTTACGGATCTGAAGCTTTATTGTCTCTAAAAATAAAAAAGAGAGTTACAAACTCTCATTAAAACGGAGAATAAGGGATTCGAACCCTTGCGCCAGTTACCCGACCTAACGATTTAGCAAACCGTCCTCTTCAGCCTCTTGAGTAATTCTCCAATTAATGGGCACGAGTGGACTCGAACCACCGACCTCACGCTTATCAGGCGTGCGCTCTAACCACCTGAGCTACGCGCCCAAGTTAAAAAACTTGGTAATTTGAACAAAGTTCAAAGCGGGTGACGAGAATCGAACTCGCGACAACAGCTTGGAAGGCTGTAGTTTTACCACTAAACTACACCCGCATAAATACTATCAATAAAATGGCGCGAGACGGAATCGAACCGCCGACACATGGAGCTTCAATCCATTGCTCTACCAACTGAGCTACCGAGCCTTATTGCGGGAGCAGGATTTGAACCTACGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCGAGCTGCTCCATCCCGCGTTAATAATATAAAAGGAGGATGTGGGATTCGAACCCACGCACGCTTTTACACGCCTGACGGTTTTCAAGACCGTTCCCTTCAGCCGGACTTGGGTAATCCTCCAATATTCAAATGGACCTTGTAGGACTTGAACCTACGACCACTCGGTTATGAGCCGAGAGCTCTAACCAGCTGAGCTAAAGGTCCGACAAGATCATTATAGCGGCGAAGGGGATCGAACCCCCGACCTCCCGGGTATGAACCGGACGCTCTAGCCAGCTGAGCTACACCGCCATGAATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACACCTTGGTCCCAAACCAAGTACTCTACCAAGCTGAGCTACTTCCCGAGTTAAATAGAAAAATGCACCCTAGAGGAGTCGAACCTCTAACCGCCTGATTCGTAGTCAGGTACTCTATCCAGTTGAGCTAAGGGTGCTCCATATTATGCCGAGGACCGGAATCGAACCGGTACGATCGTTACCAATCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCCTCTCTAAGCGAACGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCCACCTTGGCAAGGTGGTGTTCTACCACTGAACTACGTTCGCACTGTTTTCTTCTATCTAAAAATGCCGGCTACATGACTTGAACACGCGACCCTCTGATTACAAATCAGATGCTCTACCAACTGAGCTAAGCCGGCTCATTTGTTATATCTTAATGCGGGTTAAGGGACTTGAACCCCCACGCCGTTAAGCGCCAGATCCTAAATCTGGTGCGTCTGCCAATTCCGCCAAACCCGCATATATGACCCGTACTGGGCTCGAACCAGTGACCCATTGATTAAAAGTCAATTGCTCTACCAACTGAGCTAACGAGTCTAAAATAACTTGCGTTATCTTAAACGGTCCCGACGGGAATCGAACCCGCGATCTTCGCCGTGACAGGGCGACGTGATAACCGCTACACTACGGGACCTTTGGGAGTTAACGGGATCGAACCGCTGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAAACTCCCTAGAGCTAAGCGACTTCCCTATCTCACAGGGGGCAACCCCCAACTACTTCCGGCGTTCTAGGGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGTACAGGTGTATCTCCTAGGCTATCGTCACTTAACTCTGAGTAATACCTACTCAAAATTGAATATCTATTCAACTTAAGAAAACCGTTCGCTTTCATATTCTCAGTTACTTTGGATAAGTCCTCGAGCTATTAGTATTAGTCCGCTACATGTGTCGCCACACTTCCACTTCTAACCTATCTACCTGATCATCTCTCAGGGCTCTTACTGATATATAATCATGGGAAATCTCATCTTGAGGTGGGTTTCACACTTAGATGCTTTCAGCGTTTATCCCTTCCCTACATAGCTACCCAGCGATGCCTTTGGCAAGACAACTGGTACACCAGCGGTAAGTCCACTCTGGTCCTCTCGTACTAGGAGCAGATCCTCTCAAATTTCCTACGCCCGCGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTGCCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCAACCCTTGGGACCGACTACAGCCCCAGGATGCGACGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACCTCCCCGTCGATGTGAACTCTTGGGGGAGATAAGCCTGTTATCCCCAGGGTAGCTTTTATCCGTTGAGCGATGGCCCTTCCATACGGAACCACCGGATCACTAAGCCCGACTTTCGTCCCTGCTCGAGTTGTAGCTCTCGCAGTCAAGCTCCCTTATACCTTTACACTCTGCGAATGATTTCCAACCATTCTGAGGGAACCTTTGGGCGCCTCCGTTACCTTTTAGGAGGCGACCGCCCCAGTCAAACTGCCCGTCAGACACTGTCTCCGATAGGGATCACCTATCTGGGTTAGAGTGGCCATAACACAAGGGTAGTATCCCAACAGCGTCTCCTTCGAAACTGGCGTCCCGATCTCTTAGACTCCTACCTATCCTGTACATGTGGTACAGACACTCAATATCAAACTGCAGTAAAGCTCCATGGGGTCTTTCCGTCCTGTCGCGGGTAACCTGCATCTTCACAGGTACTAAAATTTCACCGAGTCTCTCGTTGAGACAGTGCCCAAATCATTACGCCTTTCGTGCGGGTCGGAACTTACCCGACAAGGAATTTCGCTACCTTAGGACCGTTATAGTTACGGCCGCCGTTTACTGGGGCTTCAATTCATACCTTCGCTTACGCTAAGCACTCCTCTTAACCTTCCAGCACCGGGCAGGCGTCACCCCCTATACATCATCTTACGATTTAGCAGAGAGCTGTGTTTTTGATAAACAGTTGCTTGGGCCTATTCACTGCGGCTGACTTAAAGTCAGCACCCCTTCTCCCGAAGTTACGGGGTCATTTTGCCGAGTTCCTTAACGAGAGTTCTCTCGCTCACCTGAGGCTACTCGCCTCGACTACCTGTGTCGGTTTGCGGTACGGGTAGAGTATGGTTAAACGCTAGAAGCTTTTCTTGGCAGTGTGACGTCACTAACTTCGCTACTAAACTTCGCTCCCCATCACAGCTCAATGTTATAGAATTAAGCATTTGACTCAATTCACACCTCACTGCTTAGACAGACTCTTCCAATCGTCTGCTTTAGTTAGCCTACTGCGTCCCTCCATCACTACATACTCTAGTACAGGAATATCAACCTGTTGTCCATCGGATACACCTTTCGGTCTCTCCTTAGGTCCCGACTAACCCAGGGCGGACGAGCCTTCCCCTGGAAACCTTAGTCTTACGGTGGACAGGATTCTCACCTGTCTTTCGCTACTCATACCGGCATTCTCACTTCTATGCGTTCCAGCACTCCTCACGGTATACCTTCATCACACATAGAACGCTCTCCTACCATACCTATAAAGGTATCCACAGCTTCGGTAAATTGTTTTAGCCCCGGTACATTTTCGGCGCAGGGTCACTCGACTAGTGAGCTATTACGCACTCTTTGAATGAATAGCTGCTTCTAAGCTAACATCCTAGTTGTCTGTGCAACCCCACATCCTTTTCCACTTAACAATTATTTTGGGACCTTAGCTGGTGGTCTGGGCTGTTTCCCTTTCGACTACGGATCTTAGCACTCGCAGTCTGACTGCCGACCATAATTCATTGGCATTCGGAGTTTATCTGAGATTGGTAATCCGGGATGGACCCCTCACCCAAACAGTGCTCTACCTCCAAGAATCTCTAATGTCGACGCTAGCCCTAAAGCTATTTCGGAGAGAACCAGCTATCTCCAAGTTCGTTTGGAATTTCTCCGCTACCCACAAGTCATCCAAGCACTTTTCAACGTGCCCTGGTTCGGTCCTCCAGTGCGTCTTACCGCACCTTCAACCTGCTCATGGGTAGGTCACATGGTTTCGGGTCTACGTCATGATACTAAGGTGCCCTATTCAGACTCGGTTTCCCTACGGCTCCGTCTCTTCAACTTAACCTCGCATCATAACGTAACTCGCCGGTTCATTCTACAAAAGGCACGCTCTCACCCATTAACGGGCTCGAACTTGTTGTAGGCACACGGTTTCAGGTTCTATTTCACTCCCCTCCCGGGGTGCTTTTCACCTTTCCCTCACGGTACTGGTTCACTATCGGTCACTAGGGAGTATTTAGGGTTGGGAGATGGTCCTCCCAGATTCCGACGGGATTTCACGTGTCCCGCCGTACTCAGGATACTGCTAAGTACAAAGACTATTTTAAATACGAGGCTATTACTCTCTTTGGCTGATCTTCCCAAATCATTCTTCTATAATCTTTGAGTCCACATTGCAGTCCTACAACCCCGAAGAGTAAACTCTTCGGTTTGCCCTCCTGCCGTTTCGC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52 | Streptococcus_phage(45.45%) | bacteriocin,protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1877040 : 1937156
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >LS483374|1877040:1937156|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(27.27%) | protease,transposase,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_17 |
1995501 : 2032984
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >LS483374|1995501:2032984|DBSCAN-SWA 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MFASKSERKVHYSIRKFSIGVASVAVASLVMGSVVHATENEGSTQAATSSNMAKTEHRKAAKQVVDEYIEKMLREIQLDRRKHTQNVALNIKLSAIKTKYLRELNVLEEKSKDELPSEIKAKLDAAFEKFKKDTLKPGEKVAEAKKKVEEAKKKAEDQKEEDRRNYPTNTYKTLELEIAEFDVKVKEAELELVKEEAKESRNEGTIKQAKEKVESKKAEATRLENIKTDRKKAEEEAKRKADAKLKEANVATSDQGKPKGRAKRGVPGELATPDKKENDAKSSDSSVGEETLPSSSLKSGKKVAEAEKKVEEAEKKAKDQKEEDRRNYPTNTYKTLDLEIAESDVKVKEAELELVKEEAKEPRDEEKIKQAKAKVESKKAEATRLENIKTDRKKAEEEAKRKAAEEDKVKEKPAEQPQPAPATQPEKPAPKPEKPAEQPKAEKTDDQQAEEDYARRSEEEYNRLTQQQPPKTEKPAQPSTPKTGWKQENGMWYFYNTDGSMATGWLQNNGSWYYLNANGAMATGWLQNNGSWYYLNANGSMATGWLQNNGSWYYLNANGAMATGWLQYNGSWYYLNSNGAMATGWLQYNGSWYYLNANGDMATGWLQNNGSWYYLNANGDMATGWLQYNGSWYYLNANGDMATGWVKDGDTWYYLEASGAMKASQWFKVSDKWYYVNGSGALAVNTTVDGYGVNANGEWVN >LS483374|1995501:2032984|2020800_2021979_-|SQG03039.1|DBSCAN-SWA MKKKILASLLLSTVMVSQVAVLTTAHAETTDDKIAAQDNKISNLTAQQQEAQKQVDQIQEQVSAIQAEQSNLQAENDRLQAESKKLEGEITELSKNIVSRNQSLEKQARSAQTNGAVTSYINTIVNSKSITEAISRVAAMSEIVSANNKMLEQQKADKKAISEKQVANNDAINTVIANQQKLADDAQALTTKQAELKAAELSLAAEKATAEGEKASLLEQKAAAEAEARAAAVAEAAYKEKRASQQQSVLASANTNLTAQVQAVSESAAAPVRAKVRPTYSTNASSYPIGECTWGVKTLAPWAGDYWGNGAQWATSAAAAGFRTGSTPQVGAIACWNDGGYGHVAVVTAVESTTRIQVSESNYAGNRTIGNHRGWFNPTTTSEGFVTYIYAD >LS483374|1995501:2032984|2018691_2019732_-|SQG03037.1|DBSCAN-SWA MAEITAKLVKELREKSGAGVMDAKKALVETDGDIEKAIELLREKGMAKAAKKADRVAAEGLTGVYVNGNVAAVIEVNAETDFVAKNAQFVELVNTTAKVIAEGKPANNEEALALIMPSGETLEAAYVSATATIGEKISFRRFALIEKTDAQHFGAYQHNGGRIGVISVVEGGDEALAKQLSMHIAAMKPTVLSYKELDEQFVKDELAQLNHVIDQDNESRAMVNKPALPHLKYGSKAQLTDDVIAQAEADIKAELAAEGKPEKIWDKIIPGKMDRFMLDNTKVDQAYTLLAQVYIMDDSKTVEAYLESVNASVVEFARFEVGEGIEKAANDFEAEVAATMAAALNN |
36 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
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LS483374.1|SQG02705.1|1659226_1659991_-|lipoprotein |
1659226_1659991_-
Protein sequences of LS483374.1|SQG02705.1|1659226_1659991_-|lipoprotein>LS483374.1|SQG02705.1|1659226_1659991_-|lipoprotein MSQQVKNAHNLYIHAIQDGRVAEAQAQSVGDTYIQHSTGVPDGKEGFAAFFADFFERHPERQIKIVRTIEDGNLVFVHVHQYLNGGEAQWVTTDTFREDENGCIVEHWDVIDYYRTPENDQLDQIFGDFEIKDLDKKAENKKLVRRFLTEIFQNGELEQWSDYVADDLIQHNHEIGQGSAAYKNYVAEYSVTFDFVFQLLGQGNYVVSYGQTQIDGVAYAQYDIFRLENGKIVEHWDNKEVMPKVEDLTNRGKF |
254 aa aa | NA | NA | NA | 1655544-1679882 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|1698571|28|LS483374|CRISPRCasFinder matches to LS483374 position: 1656868-1656895, mismatch: 0 tttcaacccactacagttgacaaagagc CRISPR spacer tttcaacccactacagttgacaaagagc Protospacer **************************** |