Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483373 | Bartonella quintana strain NCTC12899 genome assembly, chromosome: 1 | 0 crisprs | NA | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. LS483373
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
438681 : 448198
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483373|438681:448198|DBSCAN-SWA ATCAGCGTAGCAAAATTTCTTGTAGAAATTTTCCGGTGTAGGAAGCGGGAACATTAATAATATCTTCAGGTCGTCCAACTGCCACAATTTCACCGCCGCGATATCCACCTTCTGGTCCTAAGTCAATAATCCAGTCGGCTGTCTTTATAACTTCAAGATTATGCTCAATGACTGCGACTGTATTCCCTTGCTCAACGAGTTCATGCAGTACTTCGAGGAGTTTAGAGATATCGTGAAAATGCAACCCCGTTGTTGGTTCGTCCAAAATGTAGAGTGTACGACCTGTTGTTTTGCGTGAAAGTTCTTTGGCAAGTTTCACGCGTTGGGCTTCACCACCGGAAAGTGTCGTGGCTTGTTGTCCTACTTTGATATAGCCGAGGCCGACTTTGATGAGGGTCTTCATTTTGTTGTGAATGGTGGGAACAGCTTGGAAAAATTCCTCTGCTTTTTCGATTGTCATATCCAAGACATCGGCGATCGACTTTCCTTTAAATTTCACTTCCAGTGTTTCTCGATTATAGCGTTTTCCTTGGCACACATCACAAGTAACGTAGACATCGGGCAAAAAGTGCATTTCAATTTTGATAACCCCATCACCTTGACATGCTTCGCAGCGTCCTCCCTTAACATTGAATGAAAAACATCCTGCTTGATAACCACGCGCTTTTGATTCTGGAAGTTCGGCAAACCACTCACGAATCGGGGTAAAAGCACCCGTATAGGTTGCTGGATTAGAACGTGGGGTACGTCCAATAGGAGATTGATTGATATCGATGACTTTATCGAGAAATTCTAATCCTTCAATTTTATCGTAGCTTTCTGGGCTGTGATGGCTTCCCATGATATAACATGATGCGGCTTTGAAAAGGGTTTCAATGAGGAGTGTTGATTTTCCTCCACCTGAAACGCCAGTTATACAGGTAAAGGTTCCAAGAGGAATTTCAGCATTGATATTTTTGAGATTATTGCCTCGAGCACCGATGATTTTCAGTGTTTTTGTCTTTGATATTTTACGTCGTTGAGCAGGGATGGTAATTGCCATTCTTCCTGAAAGATATTGGCCTGTGAGAGAAGAAGGATTTTCTATAATTTCTTGCGGTGTGCCTTGTGCCATAATTTTTCCACCATGAACGCCTGCTGCTGGTCCCATATCAACGACATGGTCTGCAGTAAGAATGGCATCTTCATCATGTTCAACAACAATAACTGTGTTGCCGAGATCGCGCAGATGATGCAGCATCCTTAGAAGGCGTGCATTATCACGTTGGTGTAAACCGATAGATGGTTCATCTAAAATATAAAGGACGCCTGTAAGACCAGAGCCAATCTGGGATGCTAACCGAATACGTTGACTTTCTCCACCTGAAAGTGTGCCTGAATTTCGAGATAAGGTAAGATATTCAAGTCCTACATGATTTAAAAAAGCTAAGCGTTCACGAATTTCTTTTAAAATGCGTACAGCTATATTACGTTGTTTTTCAGTCAGATATTGATCAATGTTGGCAAACCAATCATCTGCTTTTAAGATAGAAAGTTCTGATATTTGTCCAATATGCATCCCGTGGATTTTAATAGCGAGTGCTTCTGGTTTTAAACGATAACCATGACAGGCTGGACAGAGCGAAGAAGACATATAACGCTCGATTTCTTCACGTGACCACGCAGAATCTGTTTCTTTCCATTGTTTTTCCATATTCGGGATAACACCTTCAAAATGTTGGATCATTTTATGTGAACCTGAATCACTTTTATGGTCAAAGGAAATTGTCTTTCTTTTTGTGCCATAGAGAATAGCCTGCTGCGCTTCATCTGAGAGTGCACTCCATTTATCCGTGAGTTTAAATCCATAAATTTTACCCAATGCCTCTAAGATTTGGTTAGAAAAGGGTGAGGATGATTTAGACCAAGGGGCAATTGCTCCAGATTCTAAGGTGAGATTTTCATTTGGTACGATTTTTTTAGGGCCGATTGCCTTTTTTGTGCCAAGTCCGTCGCAAGTAGGGCAAGCGCCAAAAGGGTTATTGAATGAAAAGAGCCGTGGTTCAATTTCAGGGATAGAAAATCCAGATATGGGGCAGGAAAACTTTTCTGAAAAAATAAGCCGTTTGTGCGTTTCATTTTTTGATTTATTGGCAGATTCCTTTGAGGTTTCTTTTTGGGCTAAAGGTTGATCTGCCATTTCAACTACTGCAATCCCATCTGCTAGCTGCAAACAGGTTTTTATACTGTCAGCTAGGCGAGAGGCCATGTCATTATGCACAACAATGCGGTCTACCACAACATCTATGTCATGTTTATATTTTTTATCAAGAGGAGGAATATCAGGAATTTCATAGAATTTTCCATCAACTTTAGCGCGCTGAAATCCTTTTTTTAAAAGTTCCATTAACTCTTTTTTATATTCTCCCTTTCGTCCTCGCACTAAGGGCGCCATAATAAAAATCCGCGTACCTTCTGATAAGGCCATAATTTGATCGACCATTTGGCTTACTGTTTGGCTTTCGATAGGCAGTCCCGTCGTAGGGGAATGAGGAACACCGATACGTGCAAAGAGAAGGCGCATATAGTCGTGAATTTCAGTAACAGTACCCACTGTTGAACGGGGGTTACGGCTGGTTGTTTTTTGTTCAATGGAGATGGCGGGGGAAAGACCATCTATTCGGTCGACATCTGGTTTTTGCATCATTTCCAGAAATTGGCGTGCATACGCAGAAAGGCTTTCAACATAGCGGCGTTGACCTTCGGCGTAAATTGTATCAAAAGCTAAGGATGATTTACCTGATCCAGAAAGCCCTGTTATGACGATTAGTTTGTCACGAGGGAGGTCTATATCAAGATTTTTAAGATTATGCTCACGTGCGCCGCGAATGGAGATGTATTTTTGATGAGCCATATTTTATCCTTGGCATGTTTGACCAAAATTAAGCATCTAAAGTGGAATAAAACTTTCCCTTTAGAATTACAACGTGGTTAATTGCTTTAAGGTGGAAAAAGAATACAAGTTCTGTGGAAAGAAAGATCCAGAAAGCAGCTTTTTATTCTCTGGTGATGGAATAAACTATGCGTTGTTATCATCTTTTGCTATAATCACATGATGTAATGTTTAATTAAGGGTAGGCAAGATCCACATTGAGGTCAATTGCAGAGGTAAATGCGCAAATGGTAAGATCAAAATGGTAATTGACTGCATAAAGAGAGTGTTTTGCAAATTAAGACTTTGGAGTTTATGAGATGGCTGGTAGCCTTAATAAAGTTATTTTGATTGGTAATCTTGGTGCCGATCCTGAAATCCGCCGTTTGAATTCTGGTGATCAAGTTGCAAATCTGCGTATTGCGACTTCAGAAAGTTGGCGCGATCGTAATACAAATGAACGTAAAGAACGCACGGAGTGGCATAATATCGTTATTTTTAACGAAAACCTTGTCAAAGTTGTAGAGCAATATTTAAAAAAAGGCAGTAAGATCTATATTGAAGGTCAGTTGCAAACGCGCAAATGGCAAGATCAAAATGGTAATGACCGTTATACAACAGAAATTGTTTTGCAAAAATACCGGGGTGAATTACAAATGCTTGATGGGCGTGGAGTAACTGGGGGAGAGCAAATGCAAGGAGCAAACCAGTCGAGCGGCGGTTATGTCAATAGTGGTTTTGGAGACAGTGGCGTAAATCAGAGAAATGTTTTTGGTCAAAACAATAGCCAATCGGAAGAAAGCTTTTCACACAAATTAGATGATGATGTACCTTTTTGATGATACTTAAGGCGTATTGCTATTGCTTTTTGTATTTTTTGGTTGTTCGTTTCAGGTTTTTAAAGTTCAAAAAAACAGGTCTTGTTGATTTTGTCCGCCGTTTTTAACATAAATAAATAACATATTGAAAATTATTATTAAATTTCTTCTCTGATGTAGGGGAGAAATTGGCATCTTAATGTATTTTTCGATATATAAAAAGTAGAGTGATTCTTTTTGAAAGTCTTAAAGCTGTGACCGATTTTAATCCACTACCAGAACGTGATGTGCTGACCGGTATTGAACCAATCAGTATTATTGATGAAATGCAACGCTCCTATCTCGATTATGCAATGAGCGTGATTGTTTCACGTGCCCTTCCTGATGTACGTGATGGTCTTAAACCTGTTCATCGGCGTATTCTTCATGCCATGAATGAAATGGGGCTTGCTTTCAATAAGCCGTATCGTAAGTCTGCGGGTGTTGTTGGTGAGGTTATGGGAAAATTCCATCCTCATGGAGATGCTTCAATTTACGATGCTTTGGTTCGTATGGCTCAGGATTTCTCTTTACGAAATCCATTGATTGATGGTCAAGGGAATTTTGGTTCTGTTGATGGCGATCCGCCTGCGGCGATGCGTTATACAGAATGTCGTTTGGAAAAAGTTTCAGAAGAGCTTTTAGCGGATATTGATAAAGATACTGTTGATTTTCAAGATAATTATGATGGACGTGATCGTGAACCCGTAGTCTTACCAGCACGTTTCCCTAATCTTTTGGTCAATGGATCAGGTGGTATTGCCGTGGGAATGGCAACTAATATTCCTCCTCATAATCTTGGTGAAGTCGTTGATGCTTGTATCGCCTTGATTGATGATCCCAATATAGCACTTGATAAAATAATTGAAATTATTCCTGGTCCTGATTTTCCCACTGGTGGTATTATCCTTGGTCATTCCGGTATCCGTTCGGCTTATGAAACGGGACGTGGTTCAATTATTATGCGTGCTAAAGTTGATATTGAGGAAATGCACAATGGTCGACAGGCAATCATTGTAAGCGAAATACCTTACCAAGTTAATAAAGCAACGATGATTGAGAAAATGGCCGAATTGGTGCGTGATAAACGCATCGAAGGAATCTCTGATTTGCGTGATGAATCTGATCGTGATGGGTATCGGGTCGTTATTGAGCTTAAGAAAGATGTTATTGCAGAAGTTGTTTTGAACCAATTGTATCGTTATACGCTGCTACAAACTTCCTTTGGTTGTAATATGGTGGCGTTAAACGGAGGAAAACCTGAACAGATGACGTTGCTTGATATGCTTCGTGCATTTGTTTCTTTCCGGGAAGAAGTTGTTAGTCGGCGAACAAAATATCTTTTGCGTAAAGCACGCGAAAGGGCGCATGTTTTGGTCGGTCTTGCACTTGCTGTTGCCAATATTGATGAAATTATAGCGCTCATTCGCAAAGCATCTGATCCACAGATAGCGCGTTCACAGTTAATGGAGCGGCGCTGGCTGGCTGCTGATGTGGCGTCTTTGATTAAACTTATTGATGATCCTCGTCATATTATCTATGGGGATAATACTTATAATTTATCTGAAGAACAGGCACGCGCTATTCTGGAATTGCGCTTGCAAAGGTTAACGGCGCTTGGACGTGATGAAATTGCTGATGAATTGAATAAAATTGGAGTGGATATTGCGGATTATCTTCATATTTTGGCATCACGTTCACGGATTATGAGCATTGTTAAAGATGAACTAAATGTTCTTCGCGAAGCCTTTGCAACTCCTCGACGCACTATATTTGGTTTTGGTAGCGCTGAGATGGATTGTGAAGATCTGATTGCACCGGAAGATATGGTGGTAACGGTGAGTCATAGTGGCTATATTAAACGGGTTCCTCTCAATACATACCGTGCGCAGCGCCGCGGTGGTAAGGGGCGTTCTGGTATGTCTACGAAGGATGAGGATTTTGTAACACATTTGTTTGTGGTTAATACCCATACACCGGTTCTTTTCTTTTCAACGCGTGGAATCGTTTATAAGGAAAAAGTTTGGCGTTTGCCTATTGGTACACCGCAATCGCGCGGGCGGGCTCTGATCAATATGCTTCCCTTACAGCAAGGTGAGCGTATAACAACTATTATGCCCTTGCCAGAAGATGAAGCGAGTTGGAGCGCATTGGATGTGATGTTCGCAACTACGCGTGGAACTGTGCGTCGTAATAAATTATCAGATTTCGTTCAGGTTAATCGCAATGGCAAAATTGCAATGAAACTTGATGAGGAAGATGAAATTCTTTCTGTAGAAACTTGTACGGAACATGATGACGTTGTTCTAACAACCGCTAATGGACAATGTATTCGTTTTCCAGTCGTTGAGGTTCGTATTTTTGCAGGTCGTAATTCGGTGGGGGTGCGTGGTATTAATTTGACTAACGGTGATAAAGTCATTTCGATGACTCTCTTAGAGCATGTTGAGGCGACGTCGGTTGAGCGTTCTGCTTATATTAAACGTGTGATTCATGAACGGCGTGCCGCTGGTGCAGACGCTGAAGATATTTTAGTTCTTGATGAAAATGACGTGGGAACCGAAACAGAGTTGACAGATGAGCGCTATGCAGAGCTTAATGCTCGTGAGCAAATGCTTTTAACATTGAGTGAATTTGGTTATGGAAAACGGTCTTCCTCATATGAGTTCCGGATTTCTGGACGTGGTGGAAAAGGGATTCGTGCAACAGATCCATCTAAGACGGCTGAAATTGGTAAATTAGTAGCGGCTTTTCCGGTGAAGGCACAAGATCAAATTATGTTGGTGTCAGATGGGGGGCAGCTTATTCGCGTCCCTGTGGATGGTATTCGTATAGGTGGTCGTTCGACGAAGGGGGTGAAAATTTTCAATACAGCTGAGGGTAAAAAAGTTGTATCAGTTGAGCGTATTTCTGAATCTGAAGATGATGTTAGCCAATTAGATGATGAAGCTGGAAAGCATTCTGATACGGTTGATGTGAGCGAAGAAAAATAATTCTGAAGGGGCCGAGGAAAATAATGAAAATTGCTCTTTATGCGGGTTCCTTCGATCCTCTTACAAATGGTCATATTGCTATTTTGCAAGGCAGTTTTGTTTTGGCTGATAAGGTGGTTGTGGCTATAGGCATACAGGCTAAAAAAAAATCACTTTTTAGTTTTGAAGAGCGTGTTGATTTAATTACCCAGGTAGGGAAAGATTTGTTAAGTATAGGTCCTGATCGGTTACAGGTTATTTCGTTTGATACTCTTTTGATTGATAAAGCGCGTGAAATTGGTGCTTCATTTCTTATTCGTGGGTTACGTGATGGCACTGACCTTGACTATGAAATGCAAATGGCGGGGATGAATGGTGTTATGGCTCCTGAATTACAAACTGTTTTTTTGCCGGCGAGTGTTTCAGGGCGTGCGATAACTTCTACCTTGGTGCGCCAGATTGCCTCTATGGGAGGTGATGTATCAGCCTTTGTACCTCCCAATGTTGAACGAGCTTTGCACTTAAAATTTCAATCTTCAAGGGAAAATGGTTGTGTCTCTTAAACTTTTTGCTGTTTTGACATGTATTTTTTGCTTTTTTTCATTGAGTGCTGTGGCCGATGATTCTAAGGCAGCTGATAATTCTAATATTCTTGTTTTATCTCTCAAAAATGGTGAAGTGGTTATTCGCTTTCGGCCTGATTTAGCACCAAAACATGTTGCACAAATCAAGAGGTTAACAAAGGAAGGTGCATACAACAATGTTGTATTTCACCGTGTTATTCCCGGTTTTATGGCACAGACTGGTGATGTGCAGTTTGGGAAGAAGGGCAGTGCGAATTTTGATCTTAAACGTGTTGGTACGGGTGGTTCCAACTATCCCAATATACCAGCAGAGTTTTCAGAGCAGCCATTTAAGCGTGGTACTGTTGGGATGGCACGTTCACAAAATCCTGATTCAGCTAATTCTCAGTTTTTCATTTGTTTTAATGATGCTGTTTTTTTAAATGGTCAGTATACTGTTGTTGGAGAAGTCATAAAGGGAATGGATGTTGTTGATAAAATTAAAAAAGGCACCACAAGTAATAATGGATCTGTAAAAGATCCTGATATTATTAATGCTGCTACTTTACAAGCTGAGTAAATAAGTCAAAGGGAGTTAGCCGTATGTCCGAGATTAAAGATTTAGAGAATACTTTAATTCTTGAAACAACGAAGGGCAGAGTTGTTATTGAACTTTTTGCTGATTTAGCACCTAGGCATGTTGCACAAATCAGGAGGTTAACAAAGGAAGGGGCATACAACAATGTTGTATTTCACCGTGTTATTTCTGGTTTTATGGCACAGACTGGTGATGTGCAGTTTGGGAAGAAGGACAGTGCGAATTTTGATCCTAAACGTGTTGGTACGGGTGGTTCCAATTATCCCAATATACCAGCAGAGTTTTCTAATCTTTCGCATAAGCGTGGTACGGTTTCTATGGCACGTAGTCAGAATCCAAATTCTGCTAATTCGCAGTTTTTTATCTGTTTTGCCGATGCTCCTTGGCTTGATCGTCAATATTCTATATGGGGGCAAGTTATTGAAGGTATGGAAAATGTCGATAAAATTAAGCATGGTGAACCTGTTGTAGATCCCGATGCAATTATTAAGGCCACAGTTGCTGCGGATACGAAATAGTATACCTGTATTGGTTTCAACTGTAAGATCGGCAAGTGAAGATATTTACGTTTGATTGTTGTTTTGAATATGGTAAAGATAAAGCGTTGCGATTTTTATCTCTATAAGAGTTTCCGACTGCTCTATATTTGCTCTTTTGCTGTCCATATCAAGTTTTATTGTCTTGAGGCGCAGTGAAAACTGGTAGCATGCTGTTTGTTATTGTTGTCAACCGCATATCCTATATGCTCAATGTGATTTGGCGCCATGTTTTGTATTGATGAGAAGAGATGAGATAGGGATATGCTGTAATTCATTGTTTTTATGAGTTTTTTCTGCCATTAATGAGTATTGTATCAAATTAGATTTTGACAGAAAAAAAGAGGAAGAAGGGTTTGAAAGGTATTTCAAGAATCCTCGAGAGCTCTTTTAAAAAATGAATTTGTGCAAAATCTAGTGTCAAATTATACAAAGTCCGCTGACAAGCAACACCAAAACTTGAGTGCTTATTATCTACTACTCTTGTAATCTGAGCACGATTAGCTAATTCAAAACCACTCAGTTTTACAGGATTAATTGCTTCTTATCATTGTTTTGCATTTATCCAGATGCAGCTAGATCAATGTATAGCATTACCTGTAAGTGAAAAAGAAATGAAGTCTGCTATGGAGCTTTCATTGCGGTGGGCACAGCGTTGTAAAACAGCTTTTGGTGATCAGCCAAACAAAGCGTTGTTTGGTATTGTTCAAGGCGGTGAAAATATGAAAATACGTGAACGTTCTGCCCAAGCATTAAAAGAAATGAATTTGAAAGGTATGCTATTGGAGGGCTTGCAGTTGGTGAACCGCAAAGTGCTATGATAGCTGTTTTGGATTCTATTTGTCCGATTTTGCCAGGGGATAAGCTACGCTATCTCATGAGGGTGGGAACGCTTGATGATATTTTACAAAGTGTTGCTTGTGGTATTGATATGTTTGATTGTGTTATGCCGATGCGTGCGGGATACCATGGTTTAGCTTTTACGCGCTTTGGTAGAATTAATTTGTGCAATGCGCGTTATGTAGAGGATCCATATCCTCTTGATCCACAGTCACTTTGTTCTGCTGCATGTGATTTATAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483373|438681:448198|447934_448198_+|SQF95499.1|tRNA|DBSCAN-SWA MIAVLDSICPILPGDKLRYLMRVGTLDDILQSVACGIDMFDCVMPMRAGYHGLAFTRFGRINLCNARYVEDPYPLDPQSLCSAACDL >LS483373|438681:448198|445972_446563_+|SQF95493.1|DBSCAN-SWA MSLKLFAVLTCIFCFFSLSAVADDSKAADNSNILVLSLKNGEVVIRFRPDLAPKHVAQIKRLTKEGAYNNVVFHRVIPGFMAQTGDVQFGKKGSANFDLKRVGTGGSNYPNIPAEFSEQPFKRGTVGMARSQNPDSANSQFFICFNDAVFLNGQYTVVGEVIKGMDVVDKIKKGTTSNNGSVKDPDIINAATLQAE >LS483373|438681:448198|445464_445983_+|SQF95491.1|DBSCAN-SWA MKIALYAGSFDPLTNGHIAILQGSFVLADKVVVAIGIQAKKKSLFSFEERVDLITQVGKDLLSIGPDRLQVISFDTLLIDKAREIGASFLIRGLRDGTDLDYEMQMAGMNGVMAPELQTVFLPASVSGRAITSTLVRQIASMGGDVSAFVPPNVERALHLKFQSSRENGCVS >LS483373|438681:448198|438681_441573_-|SQF95488.1|DBSCAN-SWA MAHQKYISIRGAREHNLKNLDIDLPRDKLIVITGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLEMMQKPDVDRIDGLSPAISIEQKTTSRNPRSTVGTVTEIHDYMRLLFARIGVPHSPTTGLPIESQTVSQMVDQIMALSEGTRIFIMAPLVRGRKGEYKKELMELLKKGFQRAKVDGKFYEIPDIPPLDKKYKHDIDVVVDRIVVHNDMASRLADSIKTCLQLADGIAVVEMADQPLAQKETSKESANKSKNETHKRLIFSEKFSCPISGFSIPEIEPRLFSFNNPFGACPTCDGLGTKKAIGPKKIVPNENLTLESGAIAPWSKSSSPFSNQILEALGKIYGFKLTDKWSALSDEAQQAILYGTKRKTISFDHKSDSGSHKMIQHFEGVIPNMEKQWKETDSAWSREEIERYMSSSLCPACHGYRLKPEALAIKIHGMHIGQISELSILKADDWFANIDQYLTEKQRNIAVRILKEIRERLAFLNHVGLEYLTLSRNSGTLSGGESQRIRLASQIGSGLTGVLYILDEPSIGLHQRDNARLLRMLHHLRDLGNTVIVVEHDEDAILTADHVVDMGPAAGVHGGKIMAQGTPQEIIENPSSLTGQYLSGRMAITIPAQRRKISKTKTLKIIGARGNNLKNINAEIPLGTFTCITGVSGGGKSTLLIETLFKAASCYIMGSHHSPESYDKIEGLEFLDKVIDINQSPIGRTPRSNPATYTGAFTPIREWFAELPESKARGYQAGCFSFNVKGGRCEACQGDGVIKIEMHFLPDVYVTCDVCQGKRYNRETLEVKFKGKSIADVLDMTIEKAEEFFQAVPTIHNKMKTLIKVGLGYIKVGQQATTLSGGEAQRVKLAKELSRKTTGRTLYILDEPTTGLHFHDISKLLEVLHELVEQGNTVAVIEHNLEVIKTADWIIDLGPEGGYRGGEIVAVGRPEDIINVPASYTGKFLQEILLR >LS483373|438681:448198|447686_447938_+|SQF95497.1|tRNA|DBSCAN-SWA MQLDQCIALPVSEKEMKSAMELSLRWAQRCKTAFGDQPNKALFGIVQGGENMKIRERSAQALKEMNLKGMLLEGLQLVNRKVL >LS483373|438681:448198|446586_447099_+|SQF95495.1|DBSCAN-SWA MSEIKDLENTLILETTKGRVVIELFADLAPRHVAQIRRLTKEGAYNNVVFHRVISGFMAQTGDVQFGKKDSANFDPKRVGTGGSNYPNIPAEFSNLSHKRGTVSMARSQNPNSANSQFFICFADAPWLDRQYSIWGQVIEGMENVDKIKHGEPVVDPDAIIKATVAADTK >LS483373|438681:448198|442636_445441_+|SQF95490.1|DBSCAN-SWA MILFESLKAVTDFNPLPERDVLTGIEPISIIDEMQRSYLDYAMSVIVSRALPDVRDGLKPVHRRILHAMNEMGLAFNKPYRKSAGVVGEVMGKFHPHGDASIYDALVRMAQDFSLRNPLIDGQGNFGSVDGDPPAAMRYTECRLEKVSEELLADIDKDTVDFQDNYDGRDREPVVLPARFPNLLVNGSGGIAVGMATNIPPHNLGEVVDACIALIDDPNIALDKIIEIIPGPDFPTGGIILGHSGIRSAYETGRGSIIMRAKVDIEEMHNGRQAIIVSEIPYQVNKATMIEKMAELVRDKRIEGISDLRDESDRDGYRVVIELKKDVIAEVVLNQLYRYTLLQTSFGCNMVALNGGKPEQMTLLDMLRAFVSFREEVVSRRTKYLLRKARERAHVLVGLALAVANIDEIIALIRKASDPQIARSQLMERRWLAADVASLIKLIDDPRHIIYGDNTYNLSEEQARAILELRLQRLTALGRDEIADELNKIGVDIADYLHILASRSRIMSIVKDELNVLREAFATPRRTIFGFGSAEMDCEDLIAPEDMVVTVSHSGYIKRVPLNTYRAQRRGGKGRSGMSTKDEDFVTHLFVVNTHTPVLFFSTRGIVYKEKVWRLPIGTPQSRGRALINMLPLQQGERITTIMPLPEDEASWSALDVMFATTRGTVRRNKLSDFVQVNRNGKIAMKLDEEDEILSVETCTEHDDVVLTTANGQCIRFPVVEVRIFAGRNSVGVRGINLTNGDKVISMTLLEHVEATSVERSAYIKRVIHERRAAGADAEDILVLDENDVGTETELTDERYAELNAREQMLLTLSEFGYGKRSSSYEFRISGRGGKGIRATDPSKTAEIGKLVAAFPVKAQDQIMLVSDGGQLIRVPVDGIRIGGRSTKGVKIFNTAEGKKVVSVERISESEDDVSQLDDEAGKHSDTVDVSEEK >LS483373|438681:448198|441911_442430_+|SQF95489.1|DBSCAN-SWA MAGSLNKVILIGNLGADPEIRRLNSGDQVANLRIATSESWRDRNTNERKERTEWHNIVIFNENLVKVVEQYLKKGSKIYIEGQLQTRKWQDQNGNDRYTTEIVLQKYRGELQMLDGRGVTGGEQMQGANQSSGGYVNSGFGDSGVNQRNVFGQNNSQSEESFSHKLDDDVPF |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(75.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
789290 : 795209
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483373|789290:795209|DBSCAN-SWA TTTAAGCTTTTCCTTCCTTTGACACAGCTTTCTTCTCTTTAGATGCGCCCACACGTTCCTTCTTTACAATTTTAGCTTCAGATTTTTTTTGTGTTTTTACTTTAGCATTAAGTTTTGATTTTTCTTCCGAAATGGGTTCTCCTTTAACGCGAACATCTGACAATGTTAAACGAATAACGCGAACACGCATACCGTCACAAATTTCAACCTCTAATTCACCACTCTCATCATAAACTTTCGTAACCTTGCCAATAATACCACCACCCGTTACAACGGTATCACCACGACGCACAGAATCAAGCATTTCCTTGCGTTTTTTCATTTGCGCACGTTGAGGGCGAATCATAAAAAAATACATAATTCCAAAAATCAAAATGAATGGGACAAAAGTAACAAGTGAAGGCCCATTGGAAACATCCCCTGCAACTTGAGCATAAGCATTAGTAATAAACATTTTTATCTCCTATAGATTAAACTCCAGGTACTTGCCACTCTCCTAAAACAAGGCTTTTGGCTGAAAAAAAGCTTTCTAAAGGATCTATCGAGCGATAATTACACAATGTACTCACAGCTTTATCGAAAGGCAATAAATCCTTAAGAGATAGAAGGCAACGAGAAAAAATTTTAAAAAACAGATTTATTTCTCTCGTTTTGTATATCATGAATATAAGCATCTTCACTAACTGGAAAAACAAATGATGTAAAACAATTTTCTTCCTTTCCAATGAGCACAACTGATCGCTCTCCTAAAATGTGTGAATTTTTTTGCTGAAATACCATTAATTAATCACATTGCTTGTTTTGTTCGAAAACCATATGAATTATAAATTTCTAAAATAAAGCCATCATGAATTAGTTTTCTAAATACTCGATAGGATCAACAGGTAAAGAATTCTTACGTACTTCAAAATAAACACGTGGAGTTTTAACATCTCCTGAAACACCAGACTTAGCAATCTCATCACCACGCCGTATCCTTTGCCCCCTATTAACAACAAGCTTGCTATTATATCCATAAATAGTGATAATATCATTTTCATGTCGAATCATAACAACATTGCCGAGTTCTTTTAACCCATCACTTGCATAAATAACGATACCATTTTCCGCTGCCTTTACCGATGAGCCTTCAGGTACAGCAATATCTATTCCTCGACTCGTTGCCGTCCCTTTCTTTTGACCAAACTGGCTCAATAAACGCCCTCGTACCGGCCAACGCATCTTAGAAATTCCCGTAGCTTGTGGGGTCACACCACCATCCGTATTCATTACAGTGTCCAAAACATCCGTTTTATAATTCGATGAAGGCATCTGTGTGGAAGAATCCTGCTCAGCATTTGACCTGTTTATCTTTGAAGAAGGCATGGCTGTTATAGGAGCTTTATCTGTAGATGGAGCTTTCTGGTATCGTATAGAAGACCTGACTTGAGATTGGGATGAAGGTTCTGTTGATGTAACCCTATCATCATTTTGAGCATTCGAAGTTGCGACCGTACGCCTGCCTGGGATCATAAGCACCTGACCGATATAAATAGAATTATTACTACTTATGCCATTTGCTAATTTTAATGCCTCAACACTGATCCCTATTTGCCGTGCAATGCTTAATAATGTATCCCCACTTTGAACGATATAAGAGTTTCGCCGAAAAAGAGGAGTATTATTCATTTGTGAACGAGAAATTGTTCCAAGATTGCGTGGCGGCGTCCCTATAATTCGACCATCAGGAGAAAGCGTCCCGTCTTGTCGTGGAGAATTATATGGAGCACTGTCATCAGCCCATGAATCATTACTTGGCTCCACAGGTGGCAATTCAGTGCTTTGTATTACACCGCCACCGTACGATAGCATTCCCGGATCTGTAGGGATCGTTGTAGACATATTAGACCGATTAGAAACCGTATGATGAGAGAAAATATTAGCGAAACGCTGTGTACCGGAACTACACCCCGCAAGAATCGTTATCATCGCTAAAAGGGTTATCCCTTGATTACACCGGAAAATCTTACCCAAAACTTTTAAATACATAGTTTTGCTCACTCGCCAATACTCAAATTACTCTATTAGAACTTTTTAATATTACCTAAGAGTTAAAACTAAGATATTTGATTCAGAAATATCTTTACGGTAAAATCAGACTGAATTTGCTATAAAGCAAAAGATGAAATGCTTGAGGGAGTACCTACACTCTGAAAATCAAAGTGTTTCCGCAATACCTTCAATAAAGGGTTGATAGCGCACTTGAAACATTTCTAAGCACTCAAATCGGCTACCAATTTTTGTATAACGCGTAATCGTTTGTACCCCTTCATCGGGTCCTATGGCTTGAATGAGAATGCCATTTTCAGTTAAAAGTTCTAAAAATTCCTTTGGTTCATCAGAGCGTGATGGCCAAATAAGAATACGATCAAACGATCCAAAACCTGTAACAGTACGGCTTCCATCAACCTGTCGTAAAACAATATTCTCAATTCCCAAAGTTTGAAATTTTTGACGCGCCAAATCAATAAGTGTTTTATAGCGATCAATTGTTATTACACGTTCACTAAGACATGCCATAAGGGCAGTACAAAAACCAGAACCCGTACCAATTTCTAAGATGCGATGTTTCTTTTTCAACGATAAAGCAAAAAGGATCAAAAGCTGCTCTTCCAAACGCTCAATATATTCACCACACTCAATTGGGATAACTTTATTATCATATGCGCTGTTACACCAAGGAGAAGCCACAAACTGCTGCCGCGGAACTTTCTCCAATGCTGCAAAAAAGCGAACATCATCAATTCCTTTGCTGCGCATTTTCAGCACAAGACCGGCCAACTCCTCATGAAATCGTAAAATACCCTTTTGATTCATAGTATCATCCGATCTCCAACAAAGGAGTTACATGATTACACGCTCCCATTATCTCATTTAAAATGGCAAAACTTTGTGTTCGCATGCCATCATTTTCTAGCAATAAACTTATATCGTTTTTCCTTTTGCAAAATTAAGCAGTAATACAACGCATACCCTTTACATAAGGTTGTAAAACATCTGGTATAATAATCGACCCATCAGCCTGCTGATAATTCTCAAGAATGGCAATAAGACAACGACCAACAGCTGTACCAGAACCATTAAGACTATGAACGAATTTTAATGTTTTATCACCTTCTTTACGATACCGAGCATTCATGCGCCGCCCTTGAAAATCTCCACAAACTGAACAACTGGAAATTTCACGATAACATCCTTGGCCAGGAAGCCACACCTCAATATCATAAGTCTTACGGGCAGCAAATCCCATATCACCAGTAGAAAGAACCACTGTACGAAAAGGCAAACCAAGCCGTTTTAACACATCTTCTGCACATTCCGTCATACGTTCTAGTTCCATTAAAGACTGCTCTTCAGTAGTAATTGATACCATTTCTACCTTCCAAAACTGGTGTTGACGCAACATACCACGTGTATCACGGCCTGCAGATCCAGCTTCTGAGCGAAAACAGGGAGTCAAAGAAGAAAAGCGCAGTGGCAAATCTGATATCTCAAGAATTTCATTGTTTACCAAATTGGTTAACGGTACTTCTGCTGTAGAAATAAGCCACCGACCATCTGTCGTCCGAAAAAGATCGTCAGCAAATTTCGGCAACTGAGCTGCTCCATAAACAATCTCATCACGAACAAGAAGAGGTACAGAAACTTCTGTATAACCATGTTCATCAACATGCACATCAAGCATAAATTGACCCAATGCGCGTTCAAGCCGGGCCAATGCCCCTGAAAGCACTGTGAAACGTGTACCCGACAAACGGCTTGCCCGCTCAAAATCCATCTGCTTGAGATTTTGACCAAGATCAAAGTGTTCCTTTGGTGTAAAATCAAACATCGCAGGTGTACCAAAATGTCGAATAACAACATTATCACTTCCATCTTTACCCACTGAAACATCATCCAATGGAATATTCGGGAGTGTTGAAAGAGCTCTCTCAAAGTTCTCTGTCAATCGCTTTTCTTCTGTTGTAGCAGAAGAAAGAAAGACTTTAATCTCTTCAACCTCAGCTCTAAGATGCTCAGCCATTGTCTGATCACACGCAGCTAAAGCCTGTCCTATTTCCTTTGAAGCCGCATTGCGACGCTCCTGTGCGGATTGCACTTTAGCAACATGTGACCGCCGCTCAAGATCAAGTTTTATTAACCTTTCAGCTTGTGGCTCAATGCCTCTCTTTGCCAACGCTTCATCTAATTTTTCAGGGTATTCACGAATCCACTTAATATCAAGCATCCAAATTCCTCATTTGCATCGTTTCTATTCGTTTCTTATCGCACAAGTTATAAACTTCTCTTAAGAGGATTTTTTCTCTTTTCTATCCAGTAGGCAATTAAAATTGAAATCTCATAAAGAGCAATCGTTGGTAAAGCCACTGCAAACATAGTAAAAAAATCCGATGGAGTTACTATCGCCGCAATTATAAAAGAGACGAGGATAGCCCACTTTCGTTTAGATACCAAACCATGAGAAGTTAAAAGTCCAACGTTCGTTAAAAGACTGGTGACAAGAGGTAATTGAAAAATCAAACCAAAAATCAGCATAAACGATGTCATAAAGCTCAAATAATCGGAGATACGGACTATAAACTCTATTCTTAAATGAACACCTGGAAGAAATTGCTGAGAAAGACTAAACCAAAGCATTATCGGCGCTAATAGAGCATAAACAAATGCTCCCCCAATACAAAATAAGATCGGGCTACTAATGAGAAATGGTAAAAAAGCCATACGTTCATTTTTATAAAGACCTGGTGCGATAAAGCTATAAAACTGAAAAGCCGTACAGGGAAATGACAAAATAGCGGCCCCAAAAGCAGCAAGTTTCATTTTCGTTAAAAAAGTTTCCCATACTTGTGTTGATTGCAGACGAATACTTTCAGGATTACCACCCGACATTTTCATTGCCCACTGATAAGGCCATATCAAAAAATTTAAGATATAGTCTTTGACGAGAAAACACATCATAAAAGCTATTAAAAATGCGATCAGAGCAACAATAATTCGCTGACGAAGTTCAATCAAATGTTCTAAAAGTGGTGCCATATTGGCATCAACTTCATCTCTCTCATTCATGATGCATCTTCTTTATCTTTAGAAATTACAGAAATACTTCCAGAACTTTGAGAATCAACAGATACTGTTACCTCTTCATTGGTTTTGTTCTGATCATATCCAACAATTTCTTTATTTTTTTCTGATTTATGGTGCATTGTATTTACATCAAAATTATTGCAGACATCCCCTACTGCATCATGAATGGGATTGAAAATTTCCATCAACTTCTTGTTTGGATTAAGGTCATTAATATCCGATAATGTTTTTTGCAAATCATCGAGCTCGATTTGTTTCATTGCATCATCAAACTGATGACGAAATTCATTCGCTGTTGAACGTACATAAGCTATTGCTTTTGCCATTGTCCTTAGCATTTTCGGTAAATCTCTTGATCGAACTACGATGATGAGAACAAATAAGATCACAAGAAACTCTGGCCCATCAATCCCAAACATCACTTATACTCGACTTCCTTATTAAAAAATAATGCATAATTATTGAGTGTGTAATTGCGTCTTTATTACTTTCCACGCTGTTTTTTAGCAACAGACGCCTTGCCTTCTTTAAAGGAAGAAGAACCTTTTCTGCGTTCTGCTGCACGCTTCACCGATAATGGCTGAGATTGTTGAGGTCTAACATCAGTTGTTTTGGAATAGTCGGACATTTCAAGTTTATCCTCGAGAAGTTCTCCTTCTTCCTTCATATTCTTTTTAAAAGCTTTAATCCCCTTAGCCACATCGCCCATTAATTCAGAAACCTTACCGCGTCCGAAAAGCACAAGGACAATCAGTAAAATCACAATTAAATGTGTTGGTGAAAAAATATTACCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483373|789290:795209|792278_793556_-|SQF96041.1|tRNA|DBSCAN-SWA MLDIKWIREYPEKLDEALAKRGIEPQAERLIKLDLERRSHVAKVQSAQERRNAASKEIGQALAACDQTMAEHLRAEVEEIKVFLSSATTEEKRLTENFERALSTLPNIPLDDVSVGKDGSDNVVIRHFGTPAMFDFTPKEHFDLGQNLKQMDFERASRLSGTRFTVLSGALARLERALGQFMLDVHVDEHGYTEVSVPLLVRDEIVYGAAQLPKFADDLFRTTDGRWLISTAEVPLTNLVNNEILEISDLPLRFSSLTPCFRSEAGSAGRDTRGMLRQHQFWKVEMVSITTEEQSLMELERMTECAEDVLKRLGLPFRTVVLSTGDMGFAARKTYDIEVWLPGQGCYREISSCSVCGDFQGRRMNARYRKEGDKTLKFVHSLNGSGTAVGRCLIAILENYQQADGSIIIPDVLQPYVKGMRCITA >LS483373|789290:795209|791485_792145_-|SQF96039.1|DBSCAN-SWA MNQKGILRFHEELAGLVLKMRSKGIDDVRFFAALEKVPRQQFVASPWCNSAYDNKVIPIECGEYIERLEEQLLILFALSLKKKHRILEIGTGSGFCTALMACLSERVITIDRYKTLIDLARQKFQTLGIENIVLRQVDGSRTVTGFGSFDRILIWPSRSDEPKEFLELLTENGILIQAIGPDEGVQTITRYTKIGSRFECLEMFQVRYQPFIEGIAETL >LS483373|789290:795209|789290_789743_-|SQF96035.1|DBSCAN-SWA MFITNAYAQVAGDVSNGPSLVTFVPFILIFGIMYFFMIRPQRAQMKKRKEMLDSVRRGDTVVTGGGIIGKVTKVYDESGELEVEICDGMRVRVIRLTLSDVRVKGEPISEEKSKLNAKVKTQKKSEAKIVKKERVGASKEKKAVSKEGKA >LS483373|789290:795209|794897_795209_-|SQF96047.1|DBSCAN-SWA MGNIFSPTHLIVILLIVLVLFGRGKVSELMGDVAKGIKAFKKNMKEEGELLEDKLEMSDYSKTTDVRPQQSQPLSVKRAAERRKGSSSFKEGKASVAKKQRGK >LS483373|789290:795209|793603_794395_-|SQF96043.1|DBSCAN-SWA MNERDEVDANMAPLLEHLIELRQRIIVALIAFLIAFMMCFLVKDYILNFLIWPYQWAMKMSGGNPESIRLQSTQVWETFLTKMKLAAFGAAILSFPCTAFQFYSFIAPGLYKNERMAFLPFLISSPILFCIGGAFVYALLAPIMLWFSLSQQFLPGVHLRIEFIVRISDYLSFMTSFMLIFGLIFQLPLVTSLLTNVGLLTSHGLVSKRKWAILVSFIIAAIVTPSDFFTMFAVALPTIALYEISILIAYWIEKRKNPLKRSL >LS483373|789290:795209|790141_791317_-|SQF96036.1|DBSCAN-SWA MYLKVLGKIFRCNQGITLLAMITILAGCSSGTQRFANIFSHHTVSNRSNMSTTIPTDPGMLSYGGGVIQSTELPPVEPSNDSWADDSAPYNSPRQDGTLSPDGRIIGTPPRNLGTISRSQMNNTPLFRRNSYIVQSGDTLLSIARQIGISVEALKLANGISSNNSIYIGQVLMIPGRRTVATSNAQNDDRVTSTEPSSQSQVRSSIRYQKAPSTDKAPITAMPSSKINRSNAEQDSSTQMPSSNYKTDVLDTVMNTDGGVTPQATGISKMRWPVRGRLLSQFGQKKGTATSRGIDIAVPEGSSVKAAENGIVIYASDGLKELGNVVMIRHENDIITIYGYNSKLVVNRGQRIRRGDEIAKSGVSGDVKTPRVYFEVRKNSLPVDPIEYLEN >LS483373|789290:795209|794391_794832_-|SQF96045.1|DBSCAN-SWA MFGIDGPEFLVILFVLIIVVRSRDLPKMLRTMAKAIAYVRSTANEFRHQFDDAMKQIELDDLQKTLSDINDLNPNKKLMEIFNPIHDAVGDVCNNFDVNTMHHKSEKNKEIVGYDQNKTNEEVTVSVDSQSSGSISVISKDKEDAS |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(83.33%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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