Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483378 | Streptococcus sobrinus strain NCTC12279 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DEDDh,cas3,csa3,RT,DinG | 0 | 1 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483378_1 | 171973-172043 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483378_1
|
1 spacers
spacers of LS483378_1
>1.1|171996|25|LS483378|CRISPRCasFinder GAGCTTGAAAACTGGGAAGCGAGGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483378_1
The CRISPR arrays of LS483378_1 >merge|LS483378|1|171973-172043|CRISPRCasFinder GGTTCGGGGAACCTTTTTATCCCGAGCTTGAAAACTGGGAAGCGAGGCGGTTTGGGGAACCTTTTTATCCC >LS483378|1|1|171973-172043|CRISPRCasFinder GGTTCGGGGAACCTTTTTATCCC GAGCTTGAAAACTGGGAAGCGAGGC GGTTTGGGGAACCTTTTTATCCC
>LS483378.1|SQG12726.1|170079_171969_+|molecular-chaperone-DnaK MPVSYFSVVFSAFLVSYIMSKIIGIDLGTTNSAVAVLEGTESKIIANPEGNRTTPSVVSFKNGEIIVGDAAKRQAVTNPDTVISIKSKMGTSEKVSANGKEYTPQEISAMILQYLKGYAEDYLGEKVEKAVITVPAYFNDAQRQATKDAGKIAGLEVERIVNEPTAAALAYGLDKTEKDEKILVFDLGGGTFDVSILELGDGVFDVLATAGDNKLGGDDFDQKIIDYLVDEFKKENGIDLSTDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVTQTQISLPFITAGDAGPLHLEVSLTRAKFDDLTRDLVDRTKTPVRRALSDAGLSLSEIDEVILVGGSTRIPAVVEVVKAETGKEPNKSVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIETMGGVFTKLIDRNTTIPTSKSQVFSTAADNQPAVDIHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPAAPRGVPQIEVTFDIDKNGIVSVKAKDLGTQKEQHIVIKSNDGLSEDEIERMMKDAEANADADAKRKEEVDLKNEVDQAIFATEKTIKETEGKGFDTERDAAKTALDDLKKAQESGNTDDMKAKLETLNEKAQALAVKLYEQAAAAQQAAGGDQAADANDAGSKDSGDDVVDGEFTEK >LS483378.1|SQG12725.1|169325_169877_+|heat-shock-protein-GrpE MSEDIKKEKEEDVTQEAPSSEAEEKQQAQEATPEEATEKTELAAALEKVEDFENKFLRAHAEMQNIQRRANEERQQLQKYRSQDLAKGVLPSLDNLERALAVEGLSDDVKKGIEMVQESLLQALKEEGVEEVPVDSFDHNFHMAVQTLPADDDHPADSIAQVLQKGYQLHDRLLRPAMVVVYN >LS483378.1|SQG12724.1|168271_169306_+|heat-inducible-transcriptional-repressor MITQRQNDILSIIVELFTQTHEPVGSKALQAYISTSSATIRNDMAILEKIGLLEKAHTSSGRLPSRQGFQYYVSHLLNLESVDEEDAYQVIKAFDFEFFKLEDVLKKAGDVLADLTECTAITLDVEPSNQRLSAFDIVKLSHHDALAVMTFDDSNTVTSQFAIPKNFLDEDLLVVSQLVRERFLGQTVMEIHYRIRTEIPQIVQRYFKITDNVLELFEHIFKEMFVEKLFLSGKENLLKYSDDQTYRLLDNTQELALTIRRQFQEEQAYVIRLADENKQGLEALSQLSYKFLIPYRGFGNLTLLGPVTIDYRRSMGLLNVVSRVLTMKLADFYRYLSSNHYEVH >LS483378.1|SQG12723.1|167520_168105_+|N-acetyl-muramidase MQSRLKFRPFMIVFGLVLALVLLPLLLNMRTKAANTKVTSTYSQASFIKEVAPVAQKLSKAYGVKASVLIAQVAQSTDYGSNLLAVRYHNYLGVLAQPGDARIVLTTQSYEKGKWETVKQPYKIYENWQDSLYDYMEEISAGMWGKQLYTTLATTEEYTTAARALQKAGVDTDPEYANKLIAIIQGKNLTQYDK >LS483378.1|SQG12722.1|166588_167356_+|D-alanyl-D-alanine-carboxypeptidase MNKRSRQFLMIFFAVLVIIFGFAYFHDRKASQQSKGTSSQTTKTKQVTRAAGSSSDNNSSASGSDLPDVSADDWQLIVVNRDNITKELNPDLTTIDNIKVDSRIADNVKEFLAAAQKIDSKEHLISGYRSVAYQKELFDSYVKQEMSNDPSLSESQAEDKVKTYSQPAGASEHQTGLAIDMSTVDSLNESDPTVVEQLKKIAPDYGFVLRFEQGKSDSTGVDYEDWHFRYVGKASAKYMTEHNLSLEEYVAQLKK >LS483378.1|SQG12721.1|165900_166602_+|phosphoglycerate-mutase MAKTRLFIARHGKTMFNTIGRAQGWSDTPLTKEGERGIQELGLGLKEAGLHFVAAYSSDSGRTLQTMEIILRELGQETIPYKRDKRIREWCFGSLDGGYDAELFNGVIPRVFDKPVEEMTYQDMANAIMAVDTAGWAEPWEALKNRIITGFSDIAKEVQAKGGGDAIVVSHGMTIATLIGLIDPSQPRSLALDNGSICQLTYEDGDLHIEAIGDMSYRQKGREILEKEANEQA >LS483378.1|SQG12720.1|165330_165762_-|putative-transcriptional-regulator MDLNQSLGFLLNSGAKLMKRQLDSKLRAYQITSSQWAVLKLLSQNDKLSQVEIAQAIKTDKATCGAIIDKLIKKEFVKRTISQQDQRARIIEISPLALSVTDELTSLDEETNTEALMGIKQKEQEIFIKTLEQLIINLENKEI >LS483378.1|SQG12719.1|164204_165140_-|putative-integrase-protein MSYSHLTITDRIKIETYLELGLKPCQIANKLGVHKSTISRELRRCQNGYSAALAQEQYDHRAKQKGRKSRLTPKLKKEIEDGLKSSWSPEQICGRYQLEQKPMVAFKTIYNWLYAALIDLDLSVLRRKGKTRQPKETRGTFRIGTSIAKRPKEVRNRETFGHWELDTVVSSRGKSKGCLATFLERKTRFYLAFKIPDRTAKSMFSAIEQLCKLFPKEALKTFTSDRGKEFACYPLVENLGISFFFADAYSSWQRGSNENANGLLREYFPKKTDLAAISDEVLNKALYDINHRPRKCLAYRTASEALEDEFK >LS483378.1|SQG12718.1|162299_163637_+|putative-glycerol-3-phosphate-dehydrogenaseglycerol-3-phosphate-dehydrogenase MDIQQVTETIAMIEEQNFDVRTITMGISLLDCIDPDINRAADKVYRKIVDKAANLVAVGDEISAELGIPIVNKRVSVTPISIIGAATDATDYVPLAKAMDKAAKEIGINFIGGFSALVQKGYQKGDEILIESIPRALAETDFVCSSVNIGSTKSGINMTAVRDMGQIIKETAQLSEMGPAKLVVFANAVEDNPFMAGAFHGVGEADVVINVGVSGPGVVKRALEKVKGQSFDVVAETVKKTAFKITRIGQLVGSLASERLGVKFGIVDLSLAPTPAVGDSVARVLEEMGLETVGTHGTTAALALLNDQVKKGGVMACNQVGGLSGAFIPVSEDEGMIAAVEAGSLNLEKLEAMTAICSVGLDMIAIPEDTPAETIAAMIADEAAIGVINMKTTAVRLIPRGREGDTIEFGGLLGSAPVMSVNKNSSADFIARGGQIPAPIHSFKN >LS483378.1|SQG12717.1|162021_162288_+|ACT-domain-containing-protein MKAIITVVGKDSQGIVAGVSAKIADLRLNIDDITQTILDEYFTMMAVVSSPEKKDFSLLRLELEKLGEQLGVKINIQSSAIFDAMHKL >LS483378.1|SQG12727.1|172517_173672_+|chaperone-protein-DnaJ MGLVSYMNNQEYYDRLGVSKDASQDEIKKAYRKMSKKYHPDINKEPGAEEKYKDIQEAYETLGDEQKRAAYDQYGPDGANFGGGGAGGFSGFDGAGFGGFEDIFSSFFGGGGASRNPSAPRQGDDLQYRLNLEFEEAIFGADKDVTYNREAECETCHGSGAKPGTSPITCSRCHGQGVINVDTQTPLGMMRRQVTCDVCHGTGKEIKEPCDTCHGTGHEKKAHKVSVKVPAGVETGQQIRLSGQGEAGFNGGPYGDLFVIINVLPSKKFERDGSTIYYTLNISFAQAALGDTVEVPTVHGYVEMTIPEGTQTGKTFRLKGKGAPRLRGGSQGDQHVTINVVTPTKLNEAQKEALLALAAASGETSIRPKKKGFFDKVKDAFDGE >LS483378.1|SQG12728.1|174071_174845_+|tRNA-pseudouridine-synthase-A MVRYKAVISYDGTLFAGFQHQTKERSVQEELEKTLERLNSGQPVKVHGAGRTDSGVHAYGQVIHFDLPQARDEEKLRFGLDTQSPEDIDVVSIQQVPDDFHARYNPHSKTYEFLVDTGRPKNPMMRAYATHFPYTVDLAAMQDAIADLIGTHDFTGFTASGTSVQNKVRTITEAKVERDPKTGFLVFTFSGNGFLYKQVRNMVGTLLKIGNGRMPVGQVKTILAAKDRNLAGPTAAGNGLYLKEITYESKNSSDFRQ >LS483378.1|SQG12729.1|174810_175572_+|phosphomethylpyrimidine-kinase MSQKILAISGNDVFSGGGLYADLTTYTLNGLRGFLAVTCLTAMTEQGFQVFATDAKVFRAQLASLQKVDFAGVKLGLLPNVEVAEAALNFVRSRKDLPIVLDPVLVCKEKHDVAVSALRDELLQFLPYVSILTPNLAEAEILTGLSIKNLEDMKQAAQKLQAMGAKAVVVKGGNRLDSDQALDVYCDEKGLEVLSGPLSDKNNVGAGCTFASSIASQLVLGKEPLEAVKLAKEFVYQAILHSDDYGVVQAYDK >LS483378.1|SQG12730.1|175561_176032_+|membrane-protein MTSKKTRELTLLAILTALSLALGFIHIPSPTGFLTLIDTGIFFTAFYLGSKSGAVVGGLSAFLLDFLLAYPQYMFFSLFAHGLQGYFAGWTGVRRYLGLLLASLAMVGIYILAALVLGFGWGAALAGIWGNLSQNVLGLVVGAALYRAFSKAFPRK >LS483378.1|SQG12731.1|176040_176604_+|TIGR01440-family-protein MDLQNLEKETRAIVRDILERSAIKQGQIFVLGLSSSEVAGGRIGQNSSLEIGQVIVKTILEETKLKGVHLAVQGCEHLNRALVVEEAVAESKGLEIVNVLPGLHAGGSGQLAALDYMENPVEVEAVVAHAGLDIGDTFIGMHVKRVQVPLIPLQRELGGAHVTALASRPKLIGGARAKYKADPIRKN >LS483378.1|SQG12732.1|176752_177601_-|mechanosensitive-ion-channel-protein MSIFIKYWESLHFEDLAVNLLAKAIELALLVFAFIIGKQIANWAFDKFFSHSPRLLGQTEGRRKTLIKLFHNVMNYFLYFLLIYWILAILGLPVSSLLAGAGIAGLAIGLGAQGFLSDLVNGFFILIERQFDVGDSVTVDQVSGIVSSVGIRTTEIRDFDGTLHFIPNREILLVSNKSRGDMRAQIDIPIYASTNLDRVTQIIKEVNEIEVPNSPEIVGVPNVLGPRTASNGQFIFRVDIFVQNGQQAEIYSKFYRLYQEALLKDDISLPTPNTHIQPSQKS >LS483378.1|SQG12733.1|177843_179127_+|trigger-factor MSVSFENTATNRGVLTFTISQEQIQPALDTAFNKVKKNLNVPGFRKGHMPRAVFNQKFGEEALYEDALNAILPTAYEAAVAESGLDVVAQPKIDVDSMEKGQDWSIKAEVVTKPEVKLGDYKNLEVSVEESKEVSDQDVNDKIERERKNLAELTIKDAAAENGDTVVIDFVGTVDGVEFDGGKGDNFSLELGSGQFIPGFEDQLVGAKAGDDVEVKVTFPADYQAEDLAGKDAVFATKVHEVKSKEVPELDDELAKDIDEEVETLDELKAKYRKELEAAKEIAYDDAVEGAAIEKAVENAEIVELPEEMVHDEVHRAMNEFLSNMQRQGISPEMYYQLTGTTEEDLHKQYEADADKRVRTNLVIEAIAAAEGFDATDEEIEKEITDLAAEYNMPADQVRSLLSADMLKHDITMKKAIEAITSSAKVK >LS483378.1|SQG12734.1|179320_179959_+|haloacid-dehalogenase MGLLVDTEYLDFQLQSGYLRSIASPSVTLGVKDFSSLVGRSGQDLLMQVRNLTQTEKTFAEITAGLKKIEAKKYHPDNYLPLFRQDIVPLLQYAKEQRLLLAVASSTALNYLLDILDNCGIRNYFDLIVSGEDFESSKPHPEIYLSVLKALHVAPEEAIAIEDSSAGIAAAKAAGMDVIAYEEKRFLIDQTQANLICKNMRAIFCHIKSLRK >LS483378.1|SQG12735.1|180049_180631_+|DNA-directed-RNA-polymerase-subunit-delta MELKVFAGQEKSELSMIEVARAILESRGRDHEMYFSDLVNEIQNYLEKSDADIRQALPFFYSDLNTDGSFIPLGENRWGLRTWYAIDEIDEEVITLEENGENAPKRKRKRVNAFMDGDEDAIDYNDDDPEDEDNFTPTDVEYDDENPDDEKSEVESYDSEINEIIPDEEVSDDEDDVDLNESDDEDDDEAEND >LS483378.1|SQG12736.1|180923_182528_+|CTP-synthase MTKYIFVTGGVVSSIGKGIVAASLGRLLKNRGLKVTIQKFDPYINIDPGTMSPYQHGEVYVTDDGAETDLDLGHYERFIDINLNKYSNVTTGKIYSEVLRKERKGEYLGATVQVIPHITDALKEKIKRAATTTDSDVIITEVGGTVGDIESLPFLEALRQMKADVGSDNVMYIHTTLLPYLKAAGEMKTKPTQHSVKELRGLGIQPNMLVIRTEQPATQGVKNKLAQFCDVAPEAVIESLDVDHIYQVPLNMQAQGMDQIVCDHLKLDVPKADMTEWSAMVDRVLNLKKSTRIALVGKYVELPDAYLSVVEALKHSGYVNDSAIDLKWVNANDVTAENVADLLGDVDGIIVPGGFGHRGTEGKIQTIRYARENDVPMLGICLGMQLTCVEFARHVLNMQGANSSELDPDTSYPVIDLMRDQVDVEDMGGTLRLGLYPCKLKPGSKAAAAYNNQEVVQRRHRHRYEFNTKYREVFEAAGFVFSGVSPDNRLMEVVELPDKKFFVAAQYHPELQSRPNRAEELYTAFVTAAVENAK |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483378_1 | 1.1|171996|25|LS483378|CRISPRCasFinder | 171996-172020 | 25 | MH648987 | Siphoviridae sp. isolate ctcj11, complete genome | 23844-23868 | 3 | 0.88 |
1. spacer 1.1|171996|25|LS483378|CRISPRCasFinder matches to MH648987 (Siphoviridae sp. isolate ctcj11, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.88
gagcttgaaaactgggaagcgaggc CRISPR spacer gagcttgataactgggaagcgatac Protospacer ******** ************* .*
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
184330 : 260664
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483378|184330:260664|DBSCAN-SWA AATGATTGAACGGTGGTTACGAGAAGGGCTCTCCCATCGTGAAGTGGCTAGGCGATTAGCCAAAGCTCCCCAAACCATTAACAACGAAGTCAAACGTGGACAAGTTAGCCAGCAGGTACGCAAAGGCAAGTTTGAAGGGGTTTACTCAGCTGACTTTGCTCAAAAAGTCTATGAAAACAACCGTAAGCACTCTGTTAAGCAGATTTCTCTAACCAAGGAGCTTAAAGAAAAGATTGTCCACTACATCAAACAGAAATACTCTCCGGAAATGATGGTTAAGGCAAAAGGTATCCCTGTTCCCATCTCAACCATCTACTACTGGCTTCACCACGGACACTTGGGGTTGACTAAGGCTGACAGGCTTTATCCTCGTAAAGAGAAGGCTAAAAGGAAGCAAGCTAGCCCAAACTTCAAGCCCGCTGGAAAATCCATTGAGGAACGTCCTGAAAGCATGAATAGGCGCGAGAATCTAGGTGATTTTGAAATGGATACGGTCATTCAGACACGGGCTAAAAACGAGTGTTTACGGATCTTAACCGACCGAAAGAGTCGCTATCAAATCATCCGTCTCATACCCGACAAGTCGGCAAGTTCAGTCAATCAGGCTTTGAGAGCAATTCTACAAGAGTACCAGATTAACTCCATCACAGCTGATAACGGGACAGAGTTTAGTCGCTTATCGGATGTTTTTGACCCTGAGCACATCTATTACGCCCACCCTTATGCTTCTTGGGAGCGGGGCACCAATGAGAATCACAATAGGCTCATCCGTCGTTGGTCACCCAAGGGAAGCAAAAATGCGACTCCACAAGAAGTCGCAGTCATTGACAATTGGATAAACAACTATCCGAAGAAAATACTGGATTACAAATCCCCCAGAGAAGTTTTATCTGCTGGCTAACTTGGACTTGAAATTTGGCTTTGACCGCCCCCTTGCAGCTTTTGCATTAAATTTTTCAAATAGCTTGCCAAGCCTACTGAATTCTGATAAACTACTAAGGTATGTGGTGCTAGCACATCCGTAAAAAAATAATATAGGAGGACGCAATTAAGATGGCAAAAGTATGTTATTTTACAGGCCGTAAAACAAAATCAGCCAATAACCGTTCACATGCGATGAACAAAACTAAACGTGCCGTTAAGCCAAACTTGCAAAAAGTTACTATCCTTGTTGATGGTAAGCCTAAAAAAGTTTGGGCTTCAGCTCGTGCCCTTAAATCAGGTAAGGTTGAACGCGTTTAATAAGTAAATGAGAGCCCTCGGGCTCTTTTTTTCGTATCTTGATAGAAGAGCAGGGACCAATTGTTTATTAACTTTGTCTGTGGTGATATGGAGCTTGACCGGCTGATAATGCTGGACAAACGGAGTTAGTCAGGGACAAGGAAAATTTTCCCTAGGAAATTTTGTAGTTGTCCTAAAGGTGAAAAGTAGAGCGACCTCGTCCGTGACGACATGAAGCTAAAGGAGGCGGTTATACTTCTTTTGCTGAATTAGTAAGGAAGATAGGTAGACCACCGCTAGTGGCTGCCGTGTGACAGTGCGTGCTTTAGCACTTAGGTGGAACTCCATGAGTATATTTTGCGACACGAAGATAAAGTAGTCGATAATACTACTTTATCGGAGTTAGTAAAGGCGGTAGGCAATCCACCGCTAGTGGTTGCCGTGAGAAACCAAGTGCTTTAGCACTTAGGGTGAACTCCGCCTTTGTACTTTAGCTGGGGTTTATGATAAAATAAAGTGATAAAAACTTGAGAGGTGCGAAATGACTGTAAAAATTAACACAAAGGATGGTCAGATTGAGCTATCTGATGACGTTATTGCAACAGTTGTCGGAGGTTCAGCGACAGAAATCTTTGGAGTGGTTGGCATGGCCAGTAAAAGTGCTATTAAGGATAATTTCCAAGCTCTTTTGCGTAAGGAAAACTATTCTAAGGGAGTCGTTGTTAAATCATTGGAAGATGGGATTACAGTTGATGTCTACACCGTCATGAGTTATGGTGTTAAAATCAGTGAAGTTTCCAAAAATATTCAGGAACGTGTGAAATTTAATCTTGAGAACCAACTTGGCATCCATGCCAATGTGGTTAATGTTTATATTCAAAATATCAAGGTTGTAGGAGAAGATTAGTGTCAAATATTACAACGAGCCTTTTTCAAGAGATGGTGCAGGCAGCTGCAACTCGTCTCGGTAATCAGGCAGAATATGTTAATTCTTTGAATGTTTTCCCAGTACCCGATGGTGATACAGGGACCAATATGGGGATGACTATTGAAAATGGGGCTAAGGCTGTTGCGGATCAAGCAGCGACTAGCGTTGGTCAAGTCGGTCAGATTCTCTCTAAGGGTCTCTTGATGGGAGCGCGGGGGAATTCGGGTGTTATCACATCGCAATTGTTCCGCGGATTTGGTCAAGCCATCAAAGACAAGGAAGAGTTAGATGGTAAAGCTCTGGCGGAAGCCTTCCAGTCAGGAGTAGAGGTTGCCTACAAGGCTGTCATGAAACCTGTTGAGGGGACCATTTTGACAGTCTCGCGTGGGGCAGCGACTGCAGCCCTCAAGAAGGTAGAAACAACCAACGATGCGGTTGAGGTTATGCAGGCGGCTCTTGATGGGGCCAAGGCAGCCTTGGCTAAGACACCAGAGATGCTACCAGTTCTGAAAGAAGTTGGCGTTGTTGACTCTGGTGGTCAAGGTCTGGTCTTTATTTATGAAGGCTTCTTATCTGCTTTGACAGGGGACTATATTGCTTCGGAAGAATTTCAAGCAACGCCAGCCAATATGAGCGAAATGATCAACGCCGAGCATCATAAGTCGGTTGCTGGTCATGTGGCTACTGAGGATATTAAGTTTGGCTACTGTACCGAAATCATGGTGGCTCTCCGCAAGGGACCCACCTACGTCAGGGACTTTGACTATGATGGTTTTCGTAACTACCTCAACGAACTTGGGGACTCCCTTCTCGTTGTTAATGATGATGAAATTGTCAAGGTTCATGTCCATACCGAAGATCCTGGTCTGGTCATGCAAGAAGGTCTCAAGTATGGTGCCTTGGTCAAGGTAAAGGTTGACAATATGCGGGGACAACACGAGGCCCAATTGGAAAAGGAAGCCGGTCAGGAAGCGGTGGCTCCAGCAACCCCAGCCAAGGACTTTGGCTTGATTGCTGTTGTGGCCGGTGATGGATTAGCAGAGATTTTCAAGTCCCAAGGTGTTGATGTTATCATCTCAGGTGGTCAAACCATGAACCCTTCAACTGAGGATATTGTTAAGGCTATTGACTCCCTCAATGCTAAGAATATCATCATCCTGCCTAACAATAAGAATATCTTTATGGCTGCCCAATCAGCAGCCGAGGTAGTTGATCTGCCGACGGCAGTTATTGAAAGTCGGACCATTCCTCAAGGCTTGACCAGCCTTCTGGCCTTCAACCCTGAGAATTCTCTAGAAGATAATGTTGCTGCTATGACGGCCAGTCTATCGGATGTTGTCAGCGGTAGTCTAACCCTAGCTGTTCGTGATACCAGTATTGATGGCCTAGAAATCCATAAGGATGACATTCTGGGGATGGTTGATGGTAAGATTCTTGTTTCTGACCCAGATATGGAATCTGCCCTGCTAGCGACTCTGGATAAGATGATTGATGAGGATAGTGAAATTGTCACCATCTATATCGGTCAAGATGGTCAAAAAGAGCTTGTTGAGAAATTGACAGCGACTTTGGAAGACAAATATGAGGAAATTGAGGTAGAAGTTCACCAAGGTGACCAACCGGTTTATCCATACTTGCTCAGTGTTGAATAATTTAATGATGGTTTTCCCAGCTCTCTAATGAGGGCTGGATTTTTTATCATTTCCTTTTTGAGATGGGCTGAGATCTGTTGCCATGTAAATGAAAACTTTGGACAAGAGTAATCTAGGAACTCACCCTGAATTGGTTTTAAACAGGTTTTCTTCCTTTCTTAAATTGCCTGATAAATTTTCTCATTTTGACTTGCATTATTTTCTGAAAATGTTATTATAGACACAAGATTTTTGAATTTTTAGAAAAATCCGTAAAATTCAGACAAAGGAGGTAATATGAACCAAATAACTTTAGAAAACCCAAAAACGGGTTCTGATTTACTTTTAGATACTCTGGTGAATTTGGGGATTAAGACCATTTTTGGCTATCCGGGTGGAGCCGTGCTTCCTTTGTACGATGCCATTTATCAACATAATGACATTCGGCATATTCTTGCCCGCCATGAGCAAGGAGCCCTGCATGAAGCAGAAGGTTTTGCCAAGTCAACAGGTCAGATTGGTGTGGCCGTTGTGACCAGTGGTCCTGGTGCGACCAATGCTATTACAGGAATTGCTGATGGCATGAGTGATAGTGTTCCTATGTTGATTTTCACAGGCCAAGTTGGCATGGCTGGTATCGGGAAGGATGCCTTCCAAGAAGCTGATATTGTCGGTATTACCATGCCCATTACCAAGTACAATTATCAGATTCGTGATGCTGCTGATATTCCACGGATTGTCACCGAAGCGATTCACATCGCGACAACTGGTCGGCCTGGACCAGTCGTCATTGATCTTCCTAAGGATATTGCGGCAGCTAGGGTGACTAGCTACAATGATCCTGGTTTGGATTTGCCTAGCTATCAACCTAGGGTTGAGCCTAATGGCTTGCAGATTAAAAAACTTCTCAACCAGCTTAAACGAGCTAAGAAACCTTTAATTATTGCCGGTGGCGGGGTTAACTACGCTGGGGCCTCCAAAGAGTTGATAGCTTTTGCAGAACGCTACAATATTCCAGTTGTTTCCACGCTCTTGAGTCTGGGAACAATTCCTGTATCTCATCCGCTGGCTCTGGGAATGGGAGGCATGCATGGCTCCTATGCCTCTAATATGGCTATGACCCAGTGTGATTTCATGATAAACTTTGGTTCACGTTTTGCTGATCGCTTGACAGGGAATCCTAAGACCTTTGCTAAGAATGCTGTTGTTGCCCATGTTGA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57 | Staphylococcus_phage(14.29%) | integrase,transposase,tRNA | attL 196761:196775|attR 252537:252551 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
315341 : 382470
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483378|315341:382470|DBSCAN-SWA 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59 | Streptococcus_phage(17.65%) | integrase,transposase | attL 311187:311205|attR 385604:385622 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
422368 : 480370
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483378|422368:480370|DBSCAN-SWA 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52 | Pandoravirus(15.38%) | integrase,protease,transposase,tRNA | attL 424390:424405|attR 479245:479260 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
500358 : 530995
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483378|500358:530995|DBSCAN-SWA 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MQTIWKSYHVFMWNYEVFDDFIRAFYKLLTKQQKENIFFIRYWKGGPHLRIRIKKENSEIVRSLIEDALQVISEQYPGLNNITLNKNDFYETTFMDGESFDLKNLPWFKNLSIVEIPYVREVERYGGTDLMAQTERIFCMSSIIVSHLIKRPLLLSQKIVILYRTVELVVENILTSQNDKIRYYSMSSRFWKSLERVESIDIETSEKIYQISHNLNLLSLLSEFISGLKAIYLEVLKQDQEYAMSVVMSHLHMFANRLGVSIDTELSCYNYFREKERYDAVG >LS483378|500358:530995|529251_529938_-|SQG13051.1|transposase|DBSCAN-SWA MSKRSPKSVEEKCDIVQLLIKGEQSVSQLAKQYRIAGTTVKRWRDKYQQYGIDGLKESHTWQSYTYELKQEAVEAYLDGKGALTEVCRMYDISDPYGLRSWIKRYTSGKEPKATSKGYSRMKQGRKTTFEERVEIVNYTIAHEKDYQAAIEKFGVSYQQVYSWVRKFEKHGSQGLIDRRGKGLESKPNLTEAEQLQLKIKQLEDRNRYLEMEVGLLKKLDTIRRQNRR >LS483378|500358:530995|515285_516221_+|SQG13036.1|integrase|DBSCAN-SWA MSYSHLTITDRIKIETYLELGLKPCQIANKLGVHKSTISRELRRCQNGYSAALAQEQYDHRAKQKGRKSRLTPKLKKEIEDGLKSSWSPEQICGRYQLEQKPMVAFKTIYNWLYAALIDLDLSVLRRKGKTRQPKETRGTFRIGTSIAKRPKEVRNRETFGHWELDTVVSSRGKSKGCLATFLERKTRFYLAFKIPDRTAKSMFSAIEQLCKLFPKEALKTFTSDRGKEFACYPLVENLGISFFFADAYSSWQRGSNENANGLLREYFPKKTDLAAISDEVLNKALYDINHRPRKCLAYRTASEALEDEFK >LS483378|500358:530995|510806_510977_+|SQG13031.1|DBSCAN-SWA MVSLTENEQNTLDELTQLDLTVLDLDESELVSAAAASSGSSSSCSISTCGSSSCCA |
32 | Streptococcus_phage(45.45%) | integrase,bacteriocin,transposase | attL 515192:515251|attR 531030:531123 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
683246 : 744765
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483378|683246:744765|DBSCAN-SWA 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54 | Tupanvirus(16.67%) | protease,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
917329 : 971906
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483378|917329:971906|DBSCAN-SWA 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51 | Streptococcus_phage(16.67%) | holin,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1265126 : 1272522
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483378|1265126:1272522|DBSCAN-SWA 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AAGATTTCTTCTCAAATTTAGACTTGACATGACGCAAAGCTTTTTCAGCTCAGCTGCTCAATCCGATTTTATTTTTATGGTAAACCTTATAGCTTTCAGAAATCTTAATTATTTTTGGTGAAGTCTCTCATTAGCTCAGGCTAGAATCTTAAAGCTACTTCTCCAACCTTAGTAGTCCGTAATTTCTGGGCGGTCATGAATGCGGGATTGTCTTCCCTGGCGGGCTTGAAGGACTACTTCGACATCCGCCAAGGACAGACCTGTTTCGACTAGGGTGACAGCTAGGTGATAGAGGAGGTCAGCTGTTTCGTTGGCGATTTCTTCCTTATTTCCATTCTTGGCGGCGATGACAACTTCGGTTGCTTCTTCTCCAACCTTCTTGAGAATCTTGTCCAGCCCCTTGTCAAAGAGATAATTGGTATAGGAGCCTTCCTTGGGATTGGCCTTGCGGTCCTGAGCTTCTTGGTAAAGTGTTTCTAACATAGCTTCCTCCTTATGAAATATAGCTGTCCTAATAAGTAGACCCTACCAAAGTTGATAAAAATGCTAAGCATGGGCCTAAGAATTTCTGCTGGACACCATTAATGGAATTTGTGACTTTATAAAATATCATTAAAAAAGCAAGAATAGGCACCGGTATGACAGGCGGCACCGATTTGCTCAACGGCTACTAGGAGCGTATCGCAATCACAGTCGGTCTTGATAGACTTGACCTTTTGGAAATGACCACTGGTCTCGCCCTTGTGCCAGATTTCCTGACGGGAGCGACTCCAATAGTGCATTTCTTTGGTTTTCAGGGTCAGGTCATAGCTCTCCTGGTTCATATAAGCCAACATGAGAACTTGCCCTGTTTGGTAATCGGTCACAATGACGGGAATGAGCCCGCCTTGCTTGGCAAAATCCAGCTTGATTTCTGTCATAGTCTGACCTCCAATCCAGCTTGAGCCATGACTTCCTTGGTCTCCGCAATAGAAATTTCCCCATAGTGGAAGATGGAGGCAGCCAAGGCTCCCGTTGCAGGGGTTTCCTCAAAAACCTGAACCATATCAGCTACAGACCCAGCACCACCTGAGGCAATAATGGGAACATTGACTAGGTTAGCTACAGCATTCAGCATGGACAAATCAAAGCCCGACTTGGTACCATCCTTATCCATAGAGGTCAGAAGGATTTCGCCTGCTCCTAGTTGCACGGCCTCCTGAACCCAATCCAACAAGTCACGGCCAGTATCCTTGCGACCCCCAGCCACGTAGACATGCCAGTTGCCGTCTTCCTGCTTCTTGGCATCAACAGCTAGGACCACGCACTGACTGCCGAATTTCTGGGAACAGGCCTTAATCAGCTGGGGATTAGCTAGAGCAGAGGAATTGACCGCCACCTTGTCGGCACCCGCCTTGAGCATGCGGTTCATGTCCTCAACTGAGCGAATGCCACCACCGACCGTAAAGGGGATAAAGACCTGATCTGCCACCCGCTTGACCATTTCCACGGTCGTATCGCGTTTTTCATGAGTGGCCGTAATGTCCAGAAAGACCAGCTCATCACAGCCAGCCTGATAATAGGCCTGGGCTGAGTCCACGGGATCACCGACATCGGTCAGATTGACAAAATTGACCCCTTTGACCACACGCCCGTCCTTGACATCCAGACAGGGAATAATTCTTTTTTTCAGCATAGCTAACCTCCGAAAGCTTTGAGCTCGGCTAGGCTAATATTGCCACTGTAGTAGGCCTTACCAACGATGGCAGCTGGCAGACCAATCTTGGCCAGCTCCTCCAAATCCGAGAGCTGGGCAATGCCACCAGAGGCAATAACTTGGGCTGATGTCAACTTGGTCATCAGGGCTTGATAGTGCTGGAGATTGGGACCAGCTAGAGTACCATCCCGATCAACATCGGTATAAACAAAGAGTCTAACGCCGATTTTTTCCATGGCCAGAGCTAGGTCCAGATAGTTGACCTGGCTGGTTTCCAACCAACCTTCGGTGGCCACCAAGCCTGACTTGGCATCAATCCCAACGACAATGCGGTCTGCTCCAAATTTTTCCAAAGCAGCTTGGACGAAATCGGGACTCTTAACTGCCATGGACCCGATAATCACACGGTCAATGCCTACTTCCAAATAATCCTCAATCTGTTCCAGAGTGCGAATGCCACCCCCGACCTCGACACCCAGACCAGTAGTCTCTTTTATCTGGGCGATCAGGTCACGATTGCTGGCCTTGCCCTCCAAGGCACCATCCAAATCTACCACATGGATAAAGCGGATGCCAGCTTCCTTGAAAAGTCGAGCCTGGCCAAGAACATCGGGATTGACCACCGTCTGCTGGGCAAAATCCCCTTTAAAAAGGCGGACGGCTTGACCATTCTTTATATCAATGGCGGGTAGAATTTGCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483378|1265126:1272522|1269507_1270125_-|SQG13741.1|protease|DBSCAN-SWA MLVINQLLSAFLQLGLVILLSLVWYFIRQHKIQGYFSWLGLKSSKSLPWKPMLGIFLAYFLLAFLPYLWFYQTGSLQLSDFRAQVFHQLGWSWQTVLVILVWSVFQTSLSEEIFFRGFLGKRLMARLGFVKGNSLQALLFGSLHTLALAKYNLLAAFLVFLLTAGMAYALGWLMAKKADGSIIYGWLIHALTNFFSSFLLLSLLF >LS483378|1265126:1272522|1267089_1269243_+|SQG13740.1|DBSCAN-SWA MKKYLSPLKKMGKIINTRLGFVLVLLFFYWIKSLWAYNIDFNLDLENTSQTIVAIFNPLPLGLLLLGLPLYFKKSKIFYPLEILIYLILNILIISNAIYFREFTDFITVNTLMASSKSAAGLGDTAGNLVELTDLFFLIDLLVFIPLLFFKKMKSDKRPFNKRASFAVTALSVLLFSANLFAAETIRPQLLTRGFANYYVVRGIGLPAFMTYSANQTYQAHRERSAATAGDLKKVDAYVKKNYAAPNSKYFGIAKGRNVIVIHLESFQQFLLDYKLKSDDKEYEVTPFLNSLYHSKSSIAFSNFFNQVKNGKTSDAETMMENSLYGLNNGSYMVNYGGDNTAYATPSILAQKGGYTSAVFHGNTGSFWNRNNTYKQWGYNYFFDSTYFEKQDDSNSFQYGLNDKYLFKDSIKYLEQMQQPFYAKFITVSNHYPYTSLNGDKKELGFPLADTKDDTVNGYFATANYLDSALKSFFDYLKATGLYDKSIIVLYGDHYGISNDRNTSLAPLLGKDAETWSDYDNAMMQKVPYIINIPGYTDGFISDTYGGEIDSLPTLLHLLGIDTKGYLQMGQDLLSPQNDNLVPLRTSGYFISPTYTSYGGKVYYTQTGQEITAPNAQTKADLDKLKDAAAAQLSNSDAIQTGDLLRFATIPGLSKTDSSQYNYNGALKQMEKISKNKGDKSTSLYHKKGDQSTEDLYQAKSYEEIHGSSDSSSSSSK >LS483378|1265126:1272522|1265126_1265783_-|SQG13738.1|DBSCAN-SWA MPRSLDEVNQLDVAKYDHADIIEWRADFLPKDDIINVAPAIFEKFPGREIIFTLRTQSEGGQISLSDEEYVSLIKEVSSLYHPDYIDFEYYSHQDIFSQMLDFPNLILSYHNFEETPDNLMGILSELTTLTPRVVKVAVMPQSEQDVLDLMNFTRGFKVLNPEQDYVTMAMGKLGQVSRLASDLMGSSWTFASVDEGSAPGQIGLADMFKVREILDAD >LS483378|1265126:1272522|1270724_1271045_-|SQG13743.1|DBSCAN-SWA MTEIKLDFAKQGGLIPVIVTDYQTGQVLMLAYMNQESYDLTLKTKEMHYWSRSRQEIWHKGETSGHFQKVKSIKTDCDCDTLLVAVEQIGAACHTGAYSCFFNDIL >LS483378|1265126:1272522|1270293_1270608_-|SQG13742.1|DBSCAN-SWA MLETLYQEAQDRKANPKEGSYTNYLFDKGLDKILKKVGEEATEVVIAAKNGNKEEIANETADLLYHLAVTLVETGLSLADVEVVLQARQGRQSRIHDRPEITDY >LS483378|1265126:1272522|1271041_1271800_-|SQG13744.1|DBSCAN-SWA MLKKRIIPCLDVKDGRVVKGVNFVNLTDVGDPVDSAQAYYQAGCDELVFLDITATHEKRDTTVEMVKRVADQVFIPFTVGGGIRSVEDMNRMLKAGADKVAVNSSALANPQLIKACSQKFGSQCVVLAVDAKKQEDGNWHVYVAGGRKDTGRDLLDWVQEAVQLGAGEILLTSMDKDGTKSGFDLSMLNAVANLVNVPIIASGGAGSVADMVQVFEETPATGALAASIFHYGEISIAETKEVMAQAGLEVRL >LS483378|1265126:1272522|1271802_1272522_-|SQG13745.1|DBSCAN-SWA MQILPAIDIKNGQAVRLFKGDFAQQTVVNPDVLGQARLFKEAGIRFIHVVDLDGALEGKASNRDLIAQIKETTGLGVEVGGGIRTLEQIEDYLEVGIDRVIIGSMAVKSPDFVQAALEKFGADRIVVGIDAKSGLVATEGWLETSQVNYLDLALAMEKIGVRLFVYTDVDRDGTLAGPNLQHYQALMTKLTSAQVIASGGIAQLSDLEELAKIGLPAAIVGKAYYSGNISLAELKAFGG >LS483378|1265126:1272522|1265811_1266981_-|SQG13739.1|DBSCAN-SWA MFSMNKLIVDALVEKKINRGIQLLQGQDFNDFSMSDQVLGLYNAKQKFLGTAYLSKQNKGIGWLVSRKSVQLDKPFFIDLFEKARVKRQTYENDDLTTAYRLFNQDGDGLGGLTIDRYGDYALFSWYNAYIYSLKDSIVAAFRLVYPELGGGYEKIRFKGLDYQSAHLYGQEAPETFTILENGVSYSVFLNDGLMTGIFLDQHEVRASLIDGLAMGKTVLNTFSYTAAFSLAAAMGGAFETTSVDLAKRSRELSQAHFLANGLSMDQHKLIVMDVFDYYKYAKRKGLTYDLIIIDPPSFARNKKQTFSVAKDYHKLVSQALEIINPGGHIIASTNASNLSVGQFKKQLEKGFAGYKHHYLNLKQLPADFAVNQADQSSNYLKVYTIKVE |
8 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1606083 : 1616605
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483378|1606083:1616605|DBSCAN-SWA CTTAAAGCAGGTCTAATTTTTTCAATTCACAGTCGACCATATCAAAGACGGTTTGCAAGTCGTCTGAATTTTTGACGAAGTCCAGCTTGTTTCCGTCAACACGAATTTTAGGTGACACATCGTAGTTTGCATACCAGTCAGGATATTCTCCATGAACCTGTTGGTAGTATTCATAGAGTTCAGGATTATCAGCAATTTGCTCAAAGCTCCGACCCCTTTTGCCAATCCGCTCCAACATCTTGTCAAAGGAAACGTCAATATAAATCAGCAAATCGGGCTTTTTCTTGGGCATACCCTCCAACTCTTCCAGCATGTTGCCCAGGAGCTCCTTATAAATATCCAGCTCGGTCTTGGTGACATTGCCATTCTTATAATTGAGGGTCAAGAAAAGTTCATCCTCAAAAATTGAGCGGTCCAAGATATTGTTATCCGCCTTATAGGCTTCCTTGATAGACTGGAAGCGTTTATTCAAAAAGAAAATTTGCAGTAAAAAAGCGTATTTTTTGGGGTCCTTGTAATAGAGGTCCAAAACTGGATTATTATCAACCGCTTCATAGAAAACTTCCGTTCCCAAGTGCTCACCCAGGGCAGCTGCCAAAGAACTCTTACCAGCACCAATTGTGCCCGCTAAAACTATCAACATTATGCTCCTAACTCAAGATACCACAGATAAAGTCACTCTATCATTTCTATTTAGAGTGACTACGAAAACTACCAATTTGGTTTTCTATATCTCTGACTAACTTTGATAAAGTAGCTTTATCGGCTACTTTATCTCCGTGTCACAAAGGGCGTAAAAAAACCGTATGAAAATAGAGAAGGCGACACAGACGCACCTAAGCATCTGGGAGACTTCATCTTTTTCACTAGGCTTTTAGCCCGTGTTTAATTAACAAGATACTAAGCCGTCAAGCACTTCAAAGAAAATTAGGGAAGCTGACGAAGGTGAGAAAACACCTAGGAAGCTTTCTCTATTTTCACAGAAGTGTAGGCGTGTTCAATTGAGCAGTTTCACTAAGCATTAAAATGCTTGTTCAACTACGAGATTTTCTAGGAAAATCTCTAGCTCACTTACTAGTTTCTGTAGGTCGGTAGTATCGACCGACCTACAGAAACATCGCAATTAACAAAATACAAGGAGGTCCAGCCAAAAAATTATGTCGCTGGCTCCTTTTTAACTTTTCTATTTTATCGGATTTGATGGTCTAATTCAAGCACAAAAACTCTGAAAATGTCTTTCATCTTTCTTTTTATTTTTTGTTTAAGAGGGGAGCTGGTCTAAGCTCTGAAGAACTTGTCCGGCTGGGCCAGCCGCTACGCTGGCTACCCTCTCTTATTAACTCAACTGATACAACAGTGTTGTCCCTCTCCCCTTTTTATTGTAAGTTAGGGCAAAATTTCAATTCATTATTGGCAGGCAGGCAGACAGCTTGCCTAGAGGCCATAAACCAGATAACCAGCACAGCCTGCAAAGTCGCTAGCAAAAAAATCCGCAACCTTGGGTCACGAATCTTCACTTATTCTTTTTCTTCTTCAACTTCTTCAAGGGGACTGAGGATGACCTTGACCTTGATAACTCGGCCTTCCTTGACCTTGTCATTGATGATCTCTAGGTGGTGCTTGCCACTATCTACTTCAAAGCTTTCTTTTTCTTCCTGAGATGGGATATTCCCAACACCGGTCAAATAGTAGCCAGCGATGGTATCAACATCGTCGCTTTCCAATTCAGTTTCAAAGTGCTCGTTAAAATCATTGAGGGTCATGGTACCTAAGACGATATAGGTGTCCTTGTCAATTTCCCGCACTTCAACTTCCGCCTGGTCGGTTTCATCATCAATTTCTCCGACGATTTCTTCCAGCAGGTCTTCTAGGGTAACGAGACCGGAGACCCCACCATATTCATCTAAGAGAATGGCCATCTGATTTTGCGTCCGCCGCAGCTCCTTGAGCAAATCATCAACAAAAATGGTTTCCGGAACAAAGAGGGGCTCTTGTAAAATGCGACGAAGACTGATATTCTCAAAACCATTATTAAAGCCAACTTCCAGCAGCTTCTTGGTATGAATTAGACCAAGCACCTTATCCTTGTCATCATCATAGACGGGAATTCTTGAAAAATTCTTCTTGAGAATCTCCTTGATAATTTCTTGGGGATCATCATTGATGTCAACCATAAAGGCATCGGTCCGGTGAACCATGACTTCACGAGCCATCAATTCGTCCAGGGAGAAGACCCCTTGAAGCATTTCGATTTCATCTTGCTCCAGGGTTTCCTCGCTGTTGGTCAACATATATTCAATTTCATCTCGGGTCATCTTCTCATCAGCATCGTCAAAGGTCATGGGCGTCATCCGACTGAGGAGATTGGTCGAAGCCGACAGGAACCAGACAAAAGGACTGACAACCTTGCCCAGGCCAACAATGACCGGAGCCGAATAAATGGCGAAATTATCCTTTAGGTTCATGGCAATCCGCTTGGGATAGAGCTCACCGAGAACGATGGCAATATAGGTCAGAAAGATCAGGGAAATGATGCTACCAGCGGTTTGAGCGGTAGCCGAATTACCAAACCAAGAAGCAATCACCTTCCCCAGGGAAGCTGAAAGACTAGCCCCTTGTAAGAGGGAGATGAAGGTAATGCCAACCTGAATGGTCGATAGAAAGTTATTGGGTTTGTCCAGTACCTTGACCAGACGGATATATTTTTTATCGCCCTCTTCTGCCTTTTGTTCCACCCGTGCCCGATTGAGGGAGACCATGGACATTTCGGATGCCGCAAAAAAGGCATTCAAGCAAGTAAGGACGACTAGTAAAAGCATTTGAAAAAGCAAATTCTGACTGCTCGGGTCTTCCATTAAATTCTTTCTCCTAAAAATGTGGATTGCCTTCATTATAGCATATTTTCAAAAAGCGTGTTAAAAAGTCACTCCAGCCCTTAATTTTTCAGGCCAAGTCTGCTATAATGAAGCTAATTTTTCACGAGCGAAAGGGGAAACTGATGGCTATTATTTCTATGAAAAATGTCAACCTACGCAAGCAAGGCAAGGACCTGCTCAAAGATATTAACTGGATCGTTGAGAAGGGGCAGACCTGGGCCATTCTAGGCTTGAATGGAGCTGGGAAAACGACCCTTTTAAAATTGATTATGGCTGAACTTTACCCCAGCCAAGGGGAGATTAACATTTTAGGAACCCAGTTTGGTCAAGGCGACATTACCAAGCTCCGCAAGCGTATTGGCATTGTCTCAGGCTTTATCACGGACCGCCTATCGCTCCACCTCTTTGCCGAGCAGGCCGTCTTGACTGGTAAGTATAAGTCTTCCATTCTTTATAAGGATTATGGCAGCAAGGAGCTGACCGAGGCCCGTGACATGCTGACCAGCCTTGGGGGTCAGGCCTTGATTGGTCGCAGGCTCTACACCCTCTCACAAGGGGAACGTCAGCTGATTATGATTGCCCGCTGCTTGATGGAAGAGCCCGATATTATCATTCTTGACGAGGCAACTGTCGGTCTGGACCTCTTTGCCAGGGAAAAATTGTTGAAGCAGGTGGATCGTATCACCGAATTGCCCCACGCCCCTCATGTTCTTTACGTGACCCACCATGCTGAGGAAATCACCCAGAAAATGGATCACGTCCTGCTCCTCAAACAGGGACGAATCATTGCCCAGGGGAAGAAGGAAGACATCATCACGGTGCCGACCCTGACCGAATTCTTTGACAACAAGGTTTCCATCATTCCAATTGATGCCCACCGCTTCTTTATCAAGCCAGAACTTTAAAAACAAGCAAAACAAAATCGCCTGTCTCCTTGTCGGTTAGACTTTGGAAGCAGGCGATTTTTCTATAATACTTAACGAAGCGAGCTAGACGGGTTAAAACAGCATTTAGGGCTATTATCCAGTTCGAACCGAAGCAAAAACTAAGCTTCAGACTCATTACAAATTTCTAAGGAAGGCTAAAAAATTGGAGAATTGAGCCGAGCCCACTTTTTAGCTAAGTTTCTCCACCATGATTAAAAAAGGTGGCCTATGGATTTGATTGAGGGGCTGGTAGAGCATGGTCGCATAGGTCTCTTGGGGCAGAGCTTTGACAAAATCTAAAACGGCATCCTTCTCCAGATCCCCACCCTCATGGCCATAGTAGACCATAATCGACAGACGACCGCCTACCTCCAGTAGCTCCAAGACCTTTCTTAAGGCCTCCAGAGTTGTGTTAGGCTGGGTAATCAGGGACTTATCAGCCGTTGGCAAATAGCCCAGATTAAAAATCGCTGCCCTAAGAGCTTCCGTCACATACTTGTCCAGGTGCTCATGCCCGTCTAAAATCAGCTGGGCATTGATCAAGCCCTCCCTCTCCAATCTCTCTTTCGTCTTGGTCAGAGCTTGCTCCTGGACATCAAAGGCGTAGACTTTCTTGGCTAGCTTGGCCAAAAAGGCCGTATCGTTGCCCTTACCCATGGTGGCATCAAGAGCCAAGGAGTCTTTATCTAGCACTTCTGCTAGAAAATCATGAGAAGCCTGTAAGGGGCGTTTTATCATTGGGCCACCTCCAATTTACAACCTTGCCAGCTGTCGCGACGCTCCATTTCCTGATCAATGGCATTGAGAACCTCCCACTTGTTGAGACTCCACATGGGACCAATTAGCATGTCCCGAGGAGCATCCCCCGTAATCCGATGGATAACCATGTCTTTAGGGATAATCTCCAGCTGGTCACAGATGATGGAAACATACTCCTCTTGGCTGAGCAGTTGCAGACGACCCTCATGGTAGTCCCGCTGCATTCGCGTATTAGTCATGAGATGGAGGAGGTGAAGCTTGATCCCGTTGATATCATTATCTGTCACACAGCGACGAACATTCTCTACCATCATCTCATGGGTCTCCCCTGGCAGGCCGTTAATCAGGTGGGAAACAATTTCCACCTTGGGGGCTAATTCCCGTAACCGCTTGACAATATCAATGTAAAGTTGGTAACTATGAGCCCGGTTGATGAGCT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TCCACTCTTCCTGAAAATCTCGCTTAGACATGCGGGTGACCTTGACGGTAGGATCTGGGTCCCCAATAATCAGGCTATCACCAGCATTGGCATAGACGACATAATAGTGCTGGAGACGCTTATTCTTAACCACATGGACAATAAAAGGGTATGTTAAATCCGTATAGTCAAACAAAGTCATATCAGCCTTGATCGAGCGGGTTTCAAAGCCAATGGCCTTGGCAGCTTCTACTAAACCAAGAGCTGTCGTTCCCTGCTTGTCAGTCTTTGAAAGCTCTCGCAATCTAGCCAGAGAATAGTCCGAACCATAGTGCTTGGCTACTGAAGCCAGGGCTGCCGGACCGCAGTCTCTGGTATCCACTTGGGTCACTAGCTTATAGCGACCACCGAAGGACACCCGACCAGAAGCAGAGCCATTTGAAGCCGATGCCCCTCGTCGCATCACCCGCTTGATCACTTCAATCAGAATATTGACCAAAATCACCAAGCCTACTATGGCGGCAATATACAATGATTGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483378|1606083:1616605|1613791_1616605_-|SQG14052.1|DBSCAN-SWA MKQSLYIAAIVGLVILVNILIEVIKRVMRRGASASNGSASGRVSFGGRYKLVTQVDTRDCGPAALASVAKHYGSDYSLARLRELSKTDKQGTTALGLVEAAKAIGFETRSIKADMTLFDYTDLTYPFIVHVVKNKRLQHYYVVYANAGDSLIIGDPDPTVKVTRMSKRDFQEEWTGLAIFLAPTPNYKPKKDEKNGLMSFFPIILRQKALLTYIVLASLMVTLIDIVGSYYLQGMLDEYIPDQLISTLGIITIGLIITYIIQQMMSFAKEYLLNVLSLRLVIDVILSYIKHIFTLPMSFFATRRTGEITSRFSDANQIINAVASTIFSIFLDVTMLLIVGGVLLVQNSHLFLLTLLSIPIYAIIITAFLKPFEKMNHEVMEANAMVSSSIIEDINGMETIKSLTSESNRYQNIDGEFVDYLEKNFRLQKMNALQTSLKTGAKLILNVVILWYGARLVMDGKISVGQLITFNALLSYFQNPIENIISLQTKLQSARVANTRLNEVYLVESEFENDGELSEDSFLDGDISFEKLSYKYGYGRDTLSDINLTIAKGSKVSLVGPSGSGKTTLAKMMVNFYDPNRGIARINGYDLKVIDKTALRQHISYLPQQAYVFSGTIMDNLTLGAKEGTTQEDIIRACEIAEIRSDIEQMPLGYQTELSDGAGVSGGQKQRIALARALLTQAPVLILDEATSSLDVLTEKKIVDNLMAMTDKTIVFVAHRLSIAQSYGPDEYMERNRSRTYAGIKHMDGESPVTYKDKYYDLLRTPTAPNKRYTVQDVIGEQRNRFENLPEFLPDDTVEVGKDYDTNVYKYALGNENVIDAHIYQIKSDLPSEFGRVLWLGLAQSRNTPYVPFYGNVTDTYEAFKNRSEKYDGKSWYWSVWHIDQMVMKYPDIFDKSIQDKWKAKEEEWVKEESQDSNCLQVIANHDTAVEPGIIEF >LS483378|1606083:1616605|1606083_1606725_-|SQG14044.1|DBSCAN-SWA MLIVLAGTIGAGKSSLAAALGEHLGTEVFYEAVDNNPVLDLYYKDPKKYAFLLQIFFLNKRFQSIKEAYKADNNILDRSIFEDELFLTLNYKNGNVTKTELDIYKELLGNMLEELEGMPKKKPDLLIYIDVSFDKMLERIGKRGRSFEQIADNPELYEYYQQVHGEYPDWYANYDVSPKIRVDGNKLDFVKNSDDLQTVFDMVDCELKKLDLL >LS483378|1606083:1616605|1613118_1613688_-|SQG14051.1|DBSCAN-SWA MSTIQTIFIYLIFALIVLSEIYIKHHTKKNKAEHSADDGTRYVIIVSVVLSLLSVNLDNLAVFRVKLPSIFLFLGFALAIFAIALRLYAVNYLGKAFTLAVQTTDQQKLVDSGPYAIVRNPAYTGSILSLLGLSLITLNLYSFLLSLLVLVVGYVIRLRVEEKVLGEHFGQAYQDYCSKVKYRIFPFIW >LS483378|1606083:1616605|1610073_1610622_-|SQG14047.1|DBSCAN-SWA MIKRPLQASHDFLAEVLDKDSLALDATMGKGNDTAFLAKLAKKVYAFDVQEQALTKTKERLEREGLINAQLILDGHEHLDKYVTEALRAAIFNLGYLPTADKSLITQPNTTLEALRKVLELLEVGGRLSIMVYYGHEGGDLEKDAVLDFVKALPQETYATMLYQPLNQIHRPPFLIMVEKLS >LS483378|1606083:1616605|1609080_1609863_+|SQG14046.1|DBSCAN-SWA MAIISMKNVNLRKQGKDLLKDINWIVEKGQTWAILGLNGAGKTTLLKLIMAELYPSQGEINILGTQFGQGDITKLRKRIGIVSGFITDRLSLHLFAEQAVLTGKYKSSILYKDYGSKELTEARDMLTSLGGQALIGRRLYTLSQGERQLIMIARCLMEEPDIIILDEATVGLDLFAREKLLKQVDRITELPHAPHVLYVTHHAEEITQKMDHVLLLKQGRIIAQGKKEDIITVPTLTEFFDNKVSIIPIDAHRFFIKPEL >LS483378|1606083:1616605|1607599_1608937_-|SQG14045.1|DBSCAN-SWA MEDPSSQNLLFQMLLLVVLTCLNAFFAASEMSMVSLNRARVEQKAEEGDKKYIRLVKVLDKPNNFLSTIQVGITFISLLQGASLSASLGKVIASWFGNSATAQTAGSIISLIFLTYIAIVLGELYPKRIAMNLKDNFAIYSAPVIVGLGKVVSPFVWFLSASTNLLSRMTPMTFDDADEKMTRDEIEYMLTNSEETLEQDEIEMLQGVFSLDELMAREVMVHRTDAFMVDINDDPQEIIKEILKKNFSRIPVYDDDKDKVLGLIHTKKLLEVGFNNGFENISLRRILQEPLFVPETIFVDDLLKELRRTQNQMAILLDEYGGVSGLVTLEDLLEEIVGEIDDETDQAEVEVREIDKDTYIVLGTMTLNDFNEHFETELESDDVDTIAGYYLTGVGNIPSQEEKESFEVDSGKHHLEIINDKVKEGRVIKVKVILSPLEEVEEEKE >LS483378|1606083:1616605|1612367_1612997_+|SQG14050.1|transposase|DBSCAN-SWA MDMFSPYYDIARKFFPNAKIVLDRFHIVQHLSRAMNRVRIKIMNQFDRRSHEYKALKRYWKLIQQDNYTLSSKRFYRPTFRSHLTNKEILEKLLSYSQDLREHYELYQLLLFHFQEKHADYFFELITESISSVNPIFQTIFRTFLRDQDKIINALELPYSNAKLEATNNLIKVIKRNAFGFRNFENFKTRILIALNIKKERTNLVLSRL >LS483378|1606083:1616605|1611948_1612344_+|SQG14049.1|transposase|DBSCAN-SWA MEQLNVITNRLGMNDKNIIILDYLDAGTHKEVIAKLDYPASKCHNCQGQMAKYDFQIESKIPYLECAGYKTLIRKTNLNHLPEHLSWDEYSFKKGKMSFIAQDYDTRKILAILDGRTQQLFAIISFGILDR >LS483378|1606083:1616605|1610618_1611551_-|SQG14048.1|DBSCAN-SWA MEKRYNTLNNYYRKIFGQKIFKLPIDAGFDCPNRDGTVAHGGCTFCTVSGSGDAIVAPELPIREQFYKEIDFMHRKWPEVNKYLVYFQNFTNTHDKVEVIRERYEQAINEPGVVGINIGTRPDCLPDETLAYLAELSDRMHVTLELGLQTTYEATSKLINRAHSYQLYIDIVKRLRELAPKVEIVSHLINGLPGETHEMMVENVRRCVTDNDINGIKLHLLHLMTNTRMQRDYHEGRLQLLSQEEYVSIICDQLEIIPKDMVIHRITGDAPRDMLIGPMWSLNKWEVLNAIDQEMERRDSWQGCKLEVAQ |
9 | Staphylococcus_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1759915 : 1797956
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483378|1759915:1797956|DBSCAN-SWA 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39 | Staphylococcus_phage(30.77%) | integrase,protease,transposase | attL 1760546:1760561|attR 1800464:1800479 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1874052 : 1923737
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483378|1874052:1923737|DBSCAN-SWA 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53 | Staphylococcus_phage(27.27%) | integrase,protease,bacteriocin,tRNA | attL 1921979:1922003|attR 1924722:1924746 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
2132981 : 2151390
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483378|2132981:2151390|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483378|2132981:2151390|2140335_2140575_-|SQG14556.1|DBSCAN-SWA MISVLTIIMYSQGGIKLAMQTFAIYYFVIPLMSMYYADATSGIRKMYNLLRVSLYREMSSLLLSLAIIFCPKSSSVIYL >LS483378|2132981:2151390|2142504_2143122_-|SQG14559.1|DBSCAN-SWA MSSSKCCTYSCNLSNTITGLLSKDSGEITLNGSDFSSVYFKERIFLIPSDSLMPEYLTGKEYAEFILSRYPNSSRDMYNRLIDLLGMAEAQKEVIESYSFGMKKKIQIAIALSLNVDYLLADEVFSGLDFETVILVQEIIKLISKKQKIVLVSHEENIINCFSEEIYLMKNGKLRSYWGSAQQLSKLLIQEGRVHERVDTIKELI >LS483378|2132981:2151390|2143108_2144044_-|SQG14560.1|integrase|DBSCAN-SWA MSYSHLTITDRIKIETYLELGLKPCQIANKLGVHKSTISRELRRCQNGYSAALAQEQYDHRAKQKGRKSRLTPKLKKKIEDGLKSSWSPEQICGRYQLEQKPMVAFKTIYNWLYAALIDLDLSVLRRKGKTRQPKETRGTFRIGTSIAKRPKEVRNRETFGHWELDTVVSSRGKSKGCLATFLERKTRFYLAFKIPDRTAKSMFSAIEQLCKLFPKEALKTFTSDRGKEFACYPLVENLGISFFFADAYSSWQRGSNENANGLLREYFPKKTDLAAISDEVLNKALYDINHRPRKCLAYRTASEALEDEFK >LS483378|2132981:2151390|2145948_2146389_-|SQG14564.1|DBSCAN-SWA 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MKHKFFYISCFVMICSFIFGYFHFVLSNQTPSNINEKQYYYKTSPHEVISKLTDNKRGVYYFGFPSCPWCAEIRPVFNDVLKECTQKSYMVDTKSKELSSQDYKKLTNFYHKFYKDELTVPFIVSINSRGEVVTHVGTLEGHDARARKLTKKEVEKLHKLLVNLVKHTKN >LS483378|2132981:2151390|2149293_2149992_+|SQG14569.1|integrase|DBSCAN-SWA MKASPRVHSVESFVYAYKEEHPSETVPSTKTLYNYSHQGLLAIKAIDLPKAVRLRKKTKKRSSTQKHLGVSIEERPETINDRSVFGHWEIDSVLGTQKAGEPSILTLVERKTRYAITAYLAGKTAATVNEAVKELMGLYPIKSITADNGSEFAALNELEGVQIYYAHAYSSYERGTNENFNGLLREFVPKGKSLKTLTAEDLAKATLAINQRPRRLLNYQTAKTLFGLAQTA >LS483378|2132981:2151390|2145038_2145848_-|SQG14563.1|transposase|DBSCAN-SWA MSEIIEFLITVRDERDNWKIKHSLADIVLLIFFARLSGAEFWEEIEDFGNIYETSLRSVLTLENGIPSHDTLQRVFATLDAQVLVEVTLMWNDILREADLSAKTFPSFAKRLLAIDGKTIKGNSSQTQKALHIVSAYATDLGICYGQVATDDKSNEITVIPDLLDKISVKGCLISIDAMGTQTAIANKIIKKQADYCLAVKENQKGLLEDIQPFFNVGKRETDSYETVEKAHGQVETRRYEVINDTAWLRKERPNWGHIQCIGKSQYHD >LS483378|2132981:2151390|2146400_2147681_-|SQG14565.1|tRNA|DBSCAN-SWA MKLQKPKGTQDILPAESAKWQYVENVARETFKKYNYGEIRTPMFEHYEVISRSVGDTTDIVTKEMYDFHDKGDRHITLRPEGTAPVVRSFVENKLFAPEVQKPVKMYYIGSMFRYERPQAGRLREFHQVGVECFGSSNPATDVETIAMAYQLFHELGIKDVTLHLNSLGNTASRLAYRQALIDYLTPLKDSLSKDSQRRLEESPLRVLDSKEKEDQAAVEKAPSILDYLDEESQTHFDAVRQMLESLAIPYLIDTNMVRGLDYYNHTIFEFMAKVGNSDLTICAGGRYDGLVDYFDGPETPGFGFGLGLERLLLILDKQGIYLPVAESLDVYIAVLGQSANGKALELVQALRAQGFKAERDYLGRKIKAQFKSADAFKAKTVITLGESELESGQVIVKNNQTRQELETSLEAISQDFAGILEQLGY |
22 | Staphylococcus_phage(50.0%) | integrase,transposase,tRNA | attL 2139220:2139236|attR 2158776:2158792 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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