Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483522 | Streptococcus pyogenes strain NCTC8224 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DEDDh,cas3,csm6,DinG,csa3 | 0 | 0 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483522_1 | 811246-811346 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483522_1
|
1 spacers
spacers of LS483522_1
>1.1|811269|55|LS483522|CRISPRCasFinder ATGTTTGACAAGACATTGTGGATATTATATACTGTAAACATACTGTTTTTATCGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483522_1
The CRISPR arrays of LS483522_1 >merge|LS483522|1|811246-811346|CRISPRCasFinder TATAATTAGACTATACCAATTTTATGTTTGACAAGACATTGTGGATATTATATACTGTAAACATACTGTTTTTATCGGTATAATTAGACTATACCAATTAT >LS483522|1|1|811246-811346|CRISPRCasFinder TATAATTAGACTATACCAATTTT ATGTTTGACAAGACATTGTGGATATTATATACTGTAAACATACTGTTTTTATCGG TATAATTAGACTATACCAATTAT
>LS483522.1|SRX90825.1|810664_811222_+|signal-peptidase-I MVKRDFIRNILLLLIVIIGAILLRIFVFSTFKVSPETANTYLKSGDLVTIKKNIQPKYKDFVVYRVGKKDYVSRVIAVEGDSVTYMDDIFYLNNMVESQAYLEKMKAHYLNHAPFGTLYTDDFTVATITADKYQKVPKGKYLLLNDNRKNTNDSRRFGLINASQIKGLVTFRVLPLSDFGFVEVE >LS483522.1|SRX90824.1|808944_810447_+|pyruvate-kinase MNKRVKIVATLGPAVEIRGGKKYGEDGYWAGQLDVEESAKKIAELIEAGANVFRFNFSHGDHKEQGDRMATVRLAEEIARQKVGFLLDTKGPEMRTELFADDAKEFSYVTGEKIRVATTQGIQSTRDVIALNVAGSLDIYDEVEVGHTILIDDGKLGLKVIDKDIATRQFIVEVENDGIIAKQKGVNIPNTKIPFPALAERDNADIRFGLEQGLNFIAISFVRTAKDVEEVREICRETGNDHVQLFAKIENQQGIDNLDEIIEAADGIMIARGDMGIEVPFEMVPVFQKMIITKVNAAGKAVITATNMLETMTEKPRATRSEVSDVFNAVIDGTDATMLSGESANGKYPVESVRTMATIDRNAQTLLNEYGRLDSSAFPRTNKTDVIASAVKDATHSMDIKLVVTITETGNTARAISKFRPDADILAVTFDEKVQRALMINWGVIPVLAEKPASTDDMFEVAERVAVEAGLVQSGDNIVIVAGVPVGTGGTNTMRVRTVK >LS483522.1|SRX90823.1|807868_808882_+|6-phosphofructokinase MKRIAVLTSGGDAPGMNAAIRAVVRKAISEGMEVYGINRGYAGMVDGDIFPLGSKEVGDKISRGGTFLYSARYPEFAQLEGQLAGIEQLKKHGIEGVVVIGGDGSYHGAMRLTEHGFPAVGIPGTIDNDIAGTDYTIGFDTAVNTAVEAIDKLRDTSSSHGRTFVVEVMGRNAGDIALWAGIASGADQIIVPEEEFDIEKVASTIQYDFEHKGKNHHIIVLAEGVMSGEAFAQKLKEAGDKSDLRVTNLGHILRGGSPTARDRVIASWMGSHAVELLKEGKGGLAVGIHNEELVESPILGTAEEGALFSLTEEGKIIVNNPHKARLDFAALNRSLSQ >LS483522.1|SRX90822.1|804678_807789_+|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MFAQLDTKTVYSFMDSLIDLNHYFERAKQFGYHTIGIMDKDNLYGAYHFIKGCQKNGLQPVLGLEVEILYQERQVLLNLIAQNTQGYHQLLKISTAKMSGKLHMDYLCQHLEGIAVIIPSKGWSDTLVVPFDYYIGVDQYTDLSHMDSKRQLIPLRTVRYFAQDDMETLHMLHAIRDNLSLAETPVVESDQELTDCQQLTTFYQTHCPQALQNLEDLVSGIYYDFDTNLKLPHFNRDKSAKQELQELTEAGLKEKGLWKEPYQSRLLHELVIISDMGFDDYFLIVWDLLRFGRSKGYYMGMGRGSAAGSLVAYALNITGIDPVQHDLLFERFLNKERYSMPDIDIDLPDIYRSEFLRYVRNRYGSDHSAQIVTFSTFGPKQAIRDVFKRFGVPEYELTNLTKKIGFKDSLATVYEKSISFRQVINSRTEFQKAFAIAKRIEGNPRQTSIHAAGIVMSDDTLTNHIPLKSGDDMMITQYDAHAVEANGLLKMDFLGLRNLTFVQKMQEKVAKDYGCQIDIAAIDLEDPQTLALFAKGDTKGIFQFEQNGAINLLKRIKPQRFEEIVATTSLNRPGASDYTTNFIKRREGQEKIDLIDPVIAPILEPTYGIMLYQEQVMQIAQVYAGFTLGKADLLRRAMSKKNLQEMQKMEEDFIASAKHLGRAEETARGLFKRMEKFAGYGFNRSHAFAYSALAFQLAYFKAHYPAVFYDIMMNYSSSDYITDALESDFQVAQVTINSIPYTDKIEASKIYMGLKNIKGLPRDFAYWIIEQRPFNSVEDFLTRTPEKYQKKVFLEPLIKIGLFDCFEPNRKKILDNLDGLLVFVNELGSLFSDSSFSWVDAKDYSATEKYSLEQEIVGVGMSKHPLIDIAEKSTQTFTPISQLVKESEAVVLIQIDSIRIIRTKTSGQQMAFLSVNDTKKKLDVTLFPQEYAIYKDQLKEGEFYYLKGRIKERDHRLQMVCQQVQMAISQKYWLLVENHQFDSQISEILGAFPGTTPVVIHYQKNKETIVLTKIQVHVTENLKEKLRPFVLKTVFR >LS483522.1|SRX90821.1|804122_804494_-|GntR-family-transcriptional-regulator MSWKFDEKSPIYAQIAQHVMMQIISQEIKSGDQLPTVREYAEIAGVNPNTMQRAFTELEREGMVYSQRTAGRFVTDDQKLIARKRRELAISELESFITNMTKMGFSHTEIIPVLTSFLKEDSQ >LS483522.1|SRX90820.1|803424_804123_-|ABC-transporter-family-protein MAHLLQLHHVSKSYREKKAIDDLTITIPNGKIIGLLGPNGSGKTTLIKLINGLLQPNKGEIVIDGYRPCVETKKIISYLPDTTYLNENMRIKDMLEFFSDFYSDFDNSKATSLLRDLELDPEDRFKTLSKGNKEKVQLILVMSRKARLYVLDEPIGGVDPAARDYILKTIINSYCENASVIISTHLISDIEPILDEVIFLKQGRLFLSGNADDLRQEYQQSIDSLFRETYKV >LS483522.1|SRX90819.1|802629_803415_-|ABC-transporter-permease-protein MFGKLLKYEFRSIGKWYFALNAFVIAIAAILSFTIKLFAQSNSDGLFGVLTNKMLPLTLGLTFGSLIAGSLLSTLLIIIKRFSKSVFGREGYLTLTLPVNSHQIILSKLLASFICSVFNTIILAFAIAIVIVPMFNINELLEGFFNSFKMDYFINMLTVLAYVLLSTFTSILLIYLSISIGQLFSNRRGLMAFIAYFILVILISVAATYVHSHIFNINTSADSFPFTEQKTIYLLILEQFIEMIMFYLATNFIIKNKLNLQ >LS483522.1|SRX90818.1|801884_802499_+|membrane-protein MTKRNSKAYILWQKIIKILGIIALIGTFFLAFWLYRLGILNDSNALKDLVQRYRLWGPFVFIVVQIIQIVFPVIPGGLTTVAGFLIFGPVTGFIYNYVGIIIGSIVLFLLVKTYGRKFILLFVNDKTFYKYERRLETPGYEKLFIFCMASPVSPADIMVMITGLTDMSLKRFVTILLITKPISIIGYSYLFIFGKDVISWFLQH >LS483522.1|SRX90817.1|800522_801143_-|phage-protein MTKKHLLTLLLISFFTSFLVACSTTKDKEPQPSDSEIITPRLHQAAHQDKRANFEKIKLATVDSSFTGGTSLEELISLFGEPSQHDPKTAGEVTIDAYTWQFDQVTLTVNLYQNSSIVKTISNFTFARELGLSQKEYQQLQKGMSYEDVKKILTEPDNYSQASSSDHQTLQAIWVSGLKTDTSGANISLVFENNQLTEMSQVGLEE >LS483522.1|SRX90816.1|798001_800266_+|glycogen-phosphorylase MTRFTEYVETKLGKSLTQASNEEIYLSLLNFVKEEASHKAKNSAKRKVYYISAEFLIGKLLSNNLINLGIYKDIKEELAAAGKSIAEVEDVELEPSLGNGGLGRLASCFIDSISSLGINGEGVGLNYHCGLFKQVFKHNEQEAEPNYWIEDDSWLVPTDISYDVPFKNFTLKSRLDRIDVLGYRRDTKNYLNLFDIEGVDYGLIKDGISFDKTQIAKNLTLFLYPDDSDKNGELLRIYQQYFMVSNAAQLIIDEAIERGSNLHDLADYAYVQINDTHPSMVIPELIRLLTEKHGFDFDEAVAVVKNMVGYTNHTILAEALEKWPTAYLNEVVPHLVTIIEKLDALVRSEVSDPAVQIIDESGRVHMAHMDIHFATSVNGVAALHTEILKNSELKAFYDLYPEKFNNKTNGITFRRWLEFANQDLADYIKELIGDEYLTDATKLEKLMAFADDKAVHAKLAEIKFNNKLALKRYLKDNKDIELDEHSIIDTQIKRFHEYKRQQMNALYVIHKYLEIKKGNLPKRKITVIFGGKAAPAYIIAQDIIHLILCLSELINNDPEVSPYLNVHLVENYNVTVAEHLIPATDISEQISLASKEASGTGNMKFMLNGALTLGTMDGANVEIAELAGMENIYTFGKDSDTIINLYATASYVAKDYYDNHPAIKAAVNFIISPELLAFGNEERLDRLYKELISKDWFMTLIDLEEYIEVKEKMLADYEDQDLWMTKVVHNIAKAGFFSSDRTIEQYNEDIWHSR >LS483522.1|SRX90826.1|811397_813212_+|glucosamine-fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKALSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSRESTYTMLIHAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLTTTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >LS483522.1|SRX90827.1|813407_813743_+|phosphonoacetate-hydrolase MSLPNCLQCQSEYVYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVLDSNGVRLSDGDTITVVKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >LS483522.1|SRX90828.1|813849_814491_+|histidine-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKIPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTAANRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >LS483522.1|SRX90829.1|814500_815130_+|histidine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKADAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >LS483522.1|SRX90830.1|815145_815982_+|polar-amino-acid-ABC-uptake-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKSLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGKCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKERQDKVAFTDSYMRNEQIIVVKKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVATANIKS >LS483522.1|SRX90831.1|816353_817127_+|protein-B MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANFQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIEATVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDMGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKPFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQNALETALKS >LS483522.1|SRX90832.1|817496_818732_-|cation-diffusion-facilitator-transporter-family-protein MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLLLSVAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVAVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMIPEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLIDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQRTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKRQLHHTHYRIVKM >LS483522.1|SRX90833.1|818851_820174_-|amino-acid-symporter MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGIYLTSRLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYAEGVLAIKYRTKDANGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFAGSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQMVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLAVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNEPVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFVLMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >LS483522.1|SRX90834.1|820703_823022_+|DNA-helicase-II-/-ATP-dependent-DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALALNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLIKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANILGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTGYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEAAEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPFGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >LS483522.1|SRX90835.1|823384_823633_+|transglycosylase-associated-family-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
36588 : 48950
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483522|36588:48950|DBSCAN-SWA GATGTCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGATTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGCCTTGTGAAAGAGTTGACACATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGACTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTACTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACCATCTTTTGACGGAAGCTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTATTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAACCCTGTTGATTCGCGTTTCAAGGACATTACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTATCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAAATTATAAAGCTGACGATTTTGCGGCCTATAAGGCAGATCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGACCTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGACGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAATTGGAGAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGACAACTTATGACAAATATATCGCCATGCGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAAACACTTATGGATATGGCGACTATTTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAACGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGATGTGAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAACGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTCGGTGGAGCGGCGACTTGTATCGGTGGTGCTATTCGTGACCCATTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATCACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTTCCACAACAAGTTATTTCTAAAACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGTGATGTGGTCATCTTGCTTGGTGGTAAAACAGGGCGTGATGGTGTCGGCGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCAGGAGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATCGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTGATCAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCTCTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCAAGTGATGTGGATGCCTTCATCGCAGCTTGCAACAAGGAAAATATCGATGCCGTTGTAGTTGCGACAGTTACCGAGAAACCAAATCTTGTCATGACTTGGAATGGTGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCACGCTAGTCAAAAAGGTCTTCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGCTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGTTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGCATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTACTTTGAGCGTATGGATAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGTTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGACTTGACAGTACCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGCGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGCGAAAACATTTACTATATCCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGATAACTTTAGCCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACAGCTGCCTCAGCCGCTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGTTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACGCGGTGAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGCGCTAGCCTTCTAGCAGCCTTCGAAGGCAAATTGGAAGAGGTTTACCCAACAGAATTTGAACAGACAGATGTTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAATACGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGTTGCTATTGCTGAGTCAGTTGACACTATGGTTGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGTTTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACGAGAAGGTCCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCTAATCAGCATGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATTCCAGTTTCACATGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGACACTCAGAACGCTGGGAAGACGGACTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAACCCTCTTTGCAAGTGCTGTAAAATACTTTACAGGGAAGTAAAAAGGTTCAGTGAACCTTTTTAGCCCTCGCCTTGAATTAGTGAAGGGCGAGGTTAGAAAGAATCTCGCTTAATTTTTGAGAAATAGTAAACACGGGCGATAAGTTGTGCGAAAAACTTTCTATTTTCGCTTTACTTGACAGCCTTTGTATCGAGGTAAAAATGATATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGACATCCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGAGCTGGTATTGTTTCAAATGACAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGGCTTCTTTCTGAAGTTTTTAAAAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCCTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCGATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCATTTGATTCGTCGAAGCCATAACTCAAGTTTCATGGGAAAGGTAAAAGAAGCTCTAAATACAGTAAAGGGTGGCTTTGCCTATCTACTGATGACAGAAGATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTATTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGAATTAAGGGAACAAGGTGTTCGAATGAAACTATCAGCGGTATCCGGTGTTGTCAAAGGAAAGCGCGTTGTTATG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483522|36588:48950|43932_45480_+|SRX90081.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTNVALDDAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPIDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDSPTVVVLKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >LS483522|36588:48950|42004_43027_+|SRX90079.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGVLGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAVGAEPLYFLDYVATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVQAALPLIKEELVNGIGHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADASVVIK >LS483522|36588:48950|36588_40362_+|SRX90077.1|DBSCAN-SWA MSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDHLLTEAEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKADQGLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELENIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDDVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKFPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPSDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEDLTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKDNFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKLEEVYPTEFEQTDVLEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEVAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK >LS483522|36588:48950|46915_48181_+|SRX90083.1|DBSCAN-SWA MKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSERSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFVNGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVETIVKPVLEGMIAEGRPYLGVLYAGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQKDGVTLGVVVASEGYPFDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGVKFSENSELLLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDPTGLFYRNDIGSKAIRE >LS483522|36588:48950|45538_46663_-|SRX90082.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGDQILRVGEYFTVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL >LS483522|36588:48950|40522_41977_+|SRX90078.1|DBSCAN-SWA MIYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSSFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTEDKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTVDEVCEIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >LS483522|36588:48950|48338_48950_+|SRX90084.1|DBSCAN-SWA MLKHLVALTWVRLRNQRFRTYRIFFYGRFRQIETPLYILIMKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKHAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGIVAAKTTLPVIGVPVKSRALSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >LS483522|36588:48950|43194_43749_+|SRX90080.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKVAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
486063 : 549946
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483522|486063:549946|DBSCAN-SWA CATGATAAAATTATTATTTATGGGAACTCCCCAATTTTCAGCAACTGTATTGAAGGGCTTGCTAGATAATCCTGCCTATGAGATTTTAGGAGTGGTTACTCAGCCTGATCGAGCTGTTGGACGCAAAAAAGATATTAAGGTAACACCTGTAAAGCAATTAGCTCTTGAGCATGGAATATCAATCTATCAGCCGGAAAAATTATCAGGCTCTCAAGAACTCATTGAGATTATGGGACTTGGTGCAGATGGTATTATTACAGCAGCATTTGGCCAATTTTTACCAACAATATTACTTGATTCAGTTTCATTTGCTATTAATGTACATGCATCATTGTTACCTAAATATCGAGGTGGAGCACCTATCCATTATGCTATTATGAATGGAGATAAAGAGGCCGGCGTTACTATTATGGAAATGATTAAAGAAATGGATGCAGGTGACATGGTCGCTAAAGCAAGCACTCCAATTCTTGAAACCGATAATGTAGGTACTCTTTTTGAGAAATTAGCCATCATTGGTCGAGACTTACTTTTGGATAGTTTGTCAGCTTATCTTTCTGGAGAATTAAAACCTATTCCTCAAGATCACAGCCAAGCTACTTTTTCACCTAATATCTCTCCAGAACATGAAAAATTAGATTGGACAATGTCTAATCAAGAAGTGTTCAATCATATTCGAGGTATGAACCCTTGGCCGGTAGCGCATACGTTTTTAGAGGGGCAACGTTTAAAAATTTACGAAGCTCAACTAGCTGAAGGAGAGGGATTACCTGGACAAGTTGTTGTCAAAACCAAAAAATCTTTGGTAATAGCTACTGGACAAGGTGCTTTGTCCTTGATCGTTGTGCAACCGGCTGGTAAACCTAAAATGTCAATAATAGACTTTTTAAACGGCATTGGTAGAAAACTTGAAGTAGGGGACATCATTGGCAGATAATTGGAAAAAAAGTACGCGAGGCAAAGCCCTCCTTGTCATTGAAGCTATTTTTGATCAGGGGGCTTACACAAACATAGCGCTTAATCAGCAACTAAGCAATAAAGCTTTATCTGCTAAGGACAGAGCTCTATTAACTGAGATTGTATATGGTACCGTTTCACGTAAAATTAGCTTGGAATGGTATTTAGCCCATTATGTCAAAGACCGAGATAAATTGGACAAATGGGTTTATTATCTCCTTATGCTCAGTCTTTATCAACTGACTTATTTAGATAAGTTACCAGCGCATGCCATTGTTAACGATGCGGTTGGTATTGCCAAAAATCGTGGCAATAAAAAAGGTGCAGAGAAGTTTGTCAATGCTATTTTACGTCAATTCACCAGCCATCCTCTCCCAGATATGGAAACAATTAAGCGTCGAAATAAGTATTATTCGGTCAAGTATTCACTGCCTGTTTGGTTGGTTAAAAAGTTAGAAGACCAATTTGGTTCTGACAGATCAGTGGCCATCATGGAAAGTTTATTTGTGCGTAGTAAGGCTAGTATTCGCGTGACAGACCCTTTGAAGCTAGAGGAAGTTGCTGAGGCTTTAGATGCAGAACGTTCCCTTTTATCAGCAACTGGTTTAACCAAAGCGTCAGGTCATTTTGCAGCCAGTGATTATTTCACAAATGGGGACATCACTATTCAAGATGAAAGCAGTCAGCTTGTAGCTCCTACTTTAAACATTGACGGTGACGACATAATTCTTGATGCGTGTAGCGCTCCAGGGGGCAAGACCTCTCATATAGCATCTTACTTAAAAACAGGTAAAGTTATTGCCTTAGATCTCTATGATCATAAACTAGAGTTGGTGAAGGAAAATGCTAACCGCTTAGGAGTTGCTGATAACATTGAGACAAGAAAACTAGATGCCAGAGAGGTTCATCGTCATTTTGAAAAGGATAGCTTTGATAAGATTTTGGTGGATGCTCCTTGCTCAGGAATTGGTTTGATTCGTCGAAAACCCGATATCAAATATAATAAAGAAAGTCAAGATTTCAATGCTCTGCAAGCTATCCAGCTAGAGATATTGTCTAGTGTTTGTCAAACCTTGCGTAAAGGTGGTATAATAACATACAGTACTTGCACTATTTTTGATGAGGAGAATCGTCAAGTCATCGAAGCATTTTTACAAAGTCATCCTAATTTTGAACAAGTAAAACTGAACCATACACAAGCAGATATTGTCAAGGATGGTTATCTTATTATCACACCAGAACAATACCAGACTGATGGCTTCTTTATTGGACAAGTCAGACGAGTCTTGTAGTATTTTAGGAGGAAACTGACTGAGTCAGAAAAAACGTATGAAGATTTCATTAAAAACAGACATTGGGCAAAAACGCTCAAACAATCAAGATTTTATCAATAAGTTTGATAATAAAAAAGGCATCACTTTAGTGATTTTAGCAGACGGTATGGGTGGCCACAGAGCTGGAAATATTGCTAGTGAGATGACAGTCACAGACCTGGGAAGAGAATGGGTAAAAACAGACTTCACAGAGTTAAGTCAGATTAGAGATTGGTTATTTGAAACTATCCAGTCAGAAAATCAACGGATTTATGATCTAGGCCAATCAGAAGACTTTAAAGGAATGGGAACGACTGTTGAAGCAGTAGCTTTAGTTGAATCTAGCGCCATTTATGCTCATATTGGTGATTCACGGATTGGACTTGTCCATGATGGGCATTATACCTTATTGACCAGTGATCATTCTTTAGTGAATGAGTTGGTTAAGGCAGGACAGATCACAGAAGAAGAAGCTGCTAGCCATCCACAAAGAAATATTATCACTCAATCTATTGGTCAAGCTTCCCCAGTAGAGCCTGATTTAGGAGTGAGGGTTTTGGAGCCAGGGGATTATCTTGTCATTAACAGTGATGGTCTAACCAATATGATTTCAAATGATGAAATTGTGACTATCTTGGGCAGTAAGGTTAGTCTTGATGAAAAAAACCAAGAAATGATTGACTTAGCTAACCTAAGAGGAGGCCTAGATAATATTACAATCGCTTTGGTTCACAACGAAAGTGAGGACGTCGAATGATTCAGATTGGCAAATTATTTGCTGGTCGTTATCGCATTCTGAAATCTATTGGCCGCGGTGGTATGGCGGATGTTTATTTAGCAAATGATTTGATCTTGGATAATGAAGACGTTGCAATCAAGGTCTTGCGTACCAATTATCAAACAGATCAGGTAGCAGTTGCGCGTTTCCAACGAGAAGCGCGAGCCATGGCTGAATTGAACCATCCCAATATTGTTGCCATCCGGGATATAGGTGAAGAAGACGGACAGCAATTTTTAGTAATGGAATATGTGGATGGTGCTGATCTAAAGAGATACATTCAAAATCATGCTCCATTATCTAATAATGAAGTGGTTAGAATTATGGAAGAAGTCCTTTCTGCTATGACTTTAGCCCACCAAAAAGGAATTGTACACAGAGATTTAAAACCTCAAAATATCCTACTAACTAAGGAGGGTGTTGTCAAAGTAACTGATTTCGGCATCGCAGTAGCCTTTGCAGAAACAAGCTTGACACAAACTAATTCGATGTTAGGCAGTGTTCATTACTTGTCTCCAGAACAGGCTCGCGGCTCCAAAGCTACGATTCAAAGTGATATTTATGCGATGGGGATTATGCTCTTTGAGATGTTGACAGGCCATATCCCTTATGATGGCGATAGTGCTGTTACGATTGCCTTGCAACATTTTCAAAAGCCTCTTCCATCTATTATCGAGGAGAACCACAATGTGCCACAAGCTTTGGAGAATGTTGTTATTCGAGCAACAGCCAAGAAATTAAGTGATCGTTACGGATCAACCTTTGAAATGAGTCGTGACTTAATGACGGCGCTTAGTTATAATCGTAGTCGGGAGCGTAAGATTGTCTTTGAGGATGTTGAAAGTACCAAACCCCTCCCCAAAGTGGCCTCAGGTCCCACCGCTTCTGTAAAATTGTCTCCCCCTACCCCAACAGTGTTAACACAGGAAAGTCGATTGGATCAAACTAATCAAACAGATGCTTTACAGCCCCCCACCAAAAAGAAAAAAAGTGGTCGTTTTTTAGGTACTTTATTCAAAATTCTTTTTTCTTTCTTTATTGTAGGTGTAGCACTCTTTACTTATCTTATACTAACTAAACCAACTTCTGTGAAAGTGCCTAATGTAGCAGGCACTAGTCTTAAAGTTGCCAAACAAGAACTGTATGATGTTGGGCTAAAAGTGGGTAAAATCAGGCAAATTGAGAGTGATACGGTTGCTGAGGGAAATGTAGTTAGAACAGATCCTAAAGCAGGAACAGCTAAGAGGCAAGGCTCAAGCATTACGCTTTATGTGTCAATTGGAAACAAAGGTTTTGACATGGAAAACTACAAAGGACTAGATTATCAAGAAGCTATGAATAGTTTGATAGAAACTTATGGTGTTCCAAAATCAAAAATCAAAATTGAGCGCATTGTAACTAATGAATATCCTGAAAATACAGTCATCAGTCAATCGCCAAGTGCGGGTGATAAATTTAATCCAAACGGAAAGTCTAAAATTACGCTCAGTGTTGCTGTTAGTGATACGATCACTATGCCTATGGTAACAGAATATAGTTATGCAGATGCAGTCAATACCTTAACAGCTTTAGGTATAGATGCATCTAGAATAAAAGCTTATGTGCCAAGCTCTAGCTCAGCAACGGGCTTTGTGCCAATTCATTCTCCTAGTTCTAAAGCTATTGTCAGTGGTCAATCTCCTTACTATGGAACGTCTTTGAGTCTGTCTGATAAAGGAGAGATTAGTCTTTACCTTTATCCAGAAGAAACACACTCTTCTAGTAGCTCATCGAGTTCAACGTCAAGTTCAAACAGTTCTTCAACAAATGATAGTACTGCACCAGGTAGCAACACTGAATTAAGCCCATCAGAAACTACTGCTCAAACACCTTAACAAAGAATAGTTAGTCTCATGTTTTACTGGCATGCCACTAACTATTCTTTTTAACTACTCGTCATATAAAGATGCAAT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76 | Temperate_phage(43.55%) | tail,tRNA,holin,terminase,integrase,head,capsid | attL 482487:482503|attR 532606:532622 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
645104 : 685297
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483522|645104:685297|DBSCAN-SWA 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MEQIKITGTGTALILDRVNRIFAISGSLTMQWDFISDFKKIDDEPSLDEDGELFETAYDLILEAKPKTKINLTSSYFAKEHKKDTDEIIKVFSFIEDNKRNIFETLGIRGVLE |
57 | Streptococcus_phage(59.18%) | tail,holin,terminase,integrase,head | attL 647701:647720|attR 681839:681858 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
708587 : 767861
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483522|708587:767861|DBSCAN-SWA 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56 | Enterococcus_phage(17.65%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1014594 : 1067703
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483522|1014594:1067703|DBSCAN-SWA CCTAGTTTCCAAAAGAAATCGAACTCTTTTTAAGTCGTTGATTACCTTCTTTAGCGCTAACAAGGAAAGTGGAATGACTATTACCACTCCCATGACGCATCTTTGCAGATGGCTTTTGTGTTAAGATATCAAAAATTTGCACCACTTGCTCAGTAACTATCGAGATCTTATTGGCTAAAACGGAATCACTGTGATTAGAATAGTACATCAGCCCTATAATAATAATCGTTACTAATAAGATAGTTTGTAAAAACCCTTTGATAAGATGCCAAAACATTTTCACTATTAGCTTAGGCAGCCACAAAATGATCGCCAGTAATTGTTTCATTCATCACCTCATGTTGTACTAGGAAATGGTTAAGATAACCTTTCTTCTTTTTGGTAGTTTATCGGTAACCACTCTAACAGAACTTCTAATTGTTGGTTCCAATAGTACCACTCATGTTTACCATGACCTTTATGATAGTCAATGTCAAGGCCTTGAACTCGAAAATCAGCAATAGCTTTTTCATTAGTGGCAAAAAGAAAATCCTCATAGCCACACCAAGCATAAAATTTGGTTTTTCCATCACTTTCTGCCACCATATTTTTAAGGTAATGCTTATCAAGGTCAGGGTCATCAAACTGGCCAAAAACGCCCTGCCAATAGGCTAATTCTCCCAGGTTTCCCTCAAGCAAGGTCTCAGGAGAAAAATCCAAAGCGCCTGAAAACGATGCCGCATAAGAAAACCGATTGCTTTTAAGTGCCCACTTAAAGGCACCATAGCCACCCATAGAGAGCCCAGCAACAAAGGTTTTTTCTCGTTTCTGGGTCATATTAGGAAAGAAAGCTGCTAAGACCTGCGGTAACTCTTGTGACAACGCCCGATAATAGTTAAGTCCATAAGCCGTGTCTGTATACCAACCTAGGTCTGTCGAAGGCATAACGACTATCAAATTGGTATGCCGCAACAAGCGTTCAATAGCTGTTCGTTTTTGCCAAGAGTTTTCATTGCCTCCCATACCATGTAACAAATATAAAACAGGAATATCCTTATCCCCTTGATCTTTTTTAGGGATTTCAGACTGGTCAGGATAAATCACATTTACCTTACGCTCCATTCCTAAAACTACCGAATGGTATTCAATTGCAATATTTGCCATTCATTACACTCCTTTATACCAAAATAATCCTATCACGTAAATCTACTGTATTTGTGGGTGAACAGTTTCCTGGTCTACCAGTTGTTAAAATCAAAGAAGGTAGGCAGTTTTTGCCTAACCTTCCTATTTTCACTAACGAACTTCCATTACAACCGGCAGAATCGCTGGGCGCCTTTTGGTTTGTTCAAATAAGAATTTAGACAAATCATCTCTGACATTCCCTTTTAATTCGCCCCAGTCAAAGGTATCTTTTTTTAAGTAATTGCCAACAGTTGTATTAACTAATTCTGCACTTTCTCTTAAAATATCATGACTTTTCTTGACATACACAAATCCACGCGTATTAACTTTAGCCTTAGAAATAATGCGTTTTTCTTTTTTAGAAACAGTAATAGCAACAATGAAAATACCATCTTCTGACAAGACTTTACGGTCTCGTAAAACGATATTACCCACATCACCGATAGCATTACCGTCAATCATGACATCACTGGCAGGTACACCTCCTTCATGGAGAAAACCTTCGTCATTAAGCACCATGATATCGCCACGCTTCAGAATATGAATATTCTCTGGAAAAATACCAACTTCTTCAGCTAGCTTTGCATGGGCAGCTAAATCACGATATTCTCCTTGTACTGGAAAAAGATACTGGGGTTTTAACAAATTCATCAATAGTTGCAAATCACGCCCATTAGCATGGCCTGAAACGCGTAAGTTTTGAGTGATTAATTTAACAGAACCACCGGCCTTGTAAATCAAGTTTTCAACACGCGCCACCATAGCTTCTTTAGCCGTACTTGGTGTTGTTACAATATAAACAAGGTCTCCTTCTTTGATTTGAACATAACGGTGACGTCCCGCTGCCATTTTTTGTAAGCTATTAATTGGCTCACCCATACGACCAGCTTCAAGGATGATTAATTCATGGTCTTCGAATTTAGACATATCCTTAGGTTTAATTAAAAGACGCTCATCCGTAATCATTAATTTTTCTAGACGTAAAGCTGTTCTGACAATATTTTCTGCATCTGTTCCGGTTAAAACAACACGACGCCCATGGGCAGTGGCGGAATCAAATACTTGTTGAATCCGAACAAGATTTGAGGCTACTGCAGCTACAATGACACGGCCATCAGCATCAGAGATAACACTGTCCATTTCTTCACCAACTTCAGATTCGCTAGCAATCTGATCGTTGCTTGTCGCATTGACTGAATCTGATAAAAGAGCTAGAACCCCTTCTTTCCCAATCTCAGCTAAACGTAGCAAATCCGTCTGATAACCTTCTCTTGCTGCTTGATCAAATTTGAAGTCACCGGTATAAACAATGTTTCCTTTATCTGTTCCAATAACAATACCCATACTTTCTGGGATTGAATGCGTTGTTCTAAAGAACGAAACTAGGCCATCTTTAAATTCAATTTCAGTATCACTGTCTACCACATGAAAATTATTAAATTTCTTAGTGCTGTTATTACTTTTCACAAATAGCTTGGCTAATTCAATAGTCAATTCAGATCCAAATACAGGAGCTGATACTTCAGCTAACAAATAAGGAAGAGCTCCAATGGCGTCAGCATGGCCATGACTCAAGAAAATCCCTTGTACCTTATCTTTGTTTTCAATTACATAATCTAAATTGGGGATGACTAAATCTACCCCAAGTTGCTCATTTTCAGGGTACTTGAGCCCTGCGTCTAAAATAAACATAGAATCGTTAATTTCTACCAAATAGAAGTTTTTTCCGTATTCACGGACCCCTCCCAAGGCAATCATTTTAATATCAGTCATGATACTCCTTTAAATATTTTATTATTACAAACGGTCCTTACAACGTAAGTCGAATTACTGTTATGTAGCTATGCTACTATCTTCTATAGTATATCATATTTGAGGCGTTTTTTCTCTAAATAGCCTTGATACTTTCAGATTATTTTCAGTACGGAAATCAAAAAATCACTGACTTATTATTCGTCAATGATTTAGATCGTTGATTAATCAAATAGTTGGTAATAGTCAGTAATCGTCAGTTGTTCTTTTTCCATTTGATTTAAATCTTTAATAATGTTTCCATCTTTCATTACAATCAGACGATTCCCATAAGTTAATGCATCTTCCATATGGTGGGTAATCATCAAAGCTGTTAAGCCATCTTTTGTCACAAACTCATCTGTCAATTGCATTAAAGAGTGACTCGTCTTAGGGTCAAGGGCAGCCGTATGCTCATCTAATAATAAGAGAGCTGGCTTTTTCAACGTTGCCATTAATAAACTTAAAGCCTGTCTTTGTCCACCAGACAAAAGACCTGCTGGTGTTTCTAAATGTTTTTCTAGGCCATTTCCTGTTCGTTTAATCAAATCCTCAAAACTAGCTAAGTGCTCTGTTATTTTTCGAGAAGCCAAGGAGCGTTTTTCTCCTCTTTGACGTGCGATTAAGAGATTTTCAGCCACTGTCATCCGAGGGGCTGTTCCCATTTTGGGATCTTGAAAGACTCGCGATAGGTAAAGAGCTCTTTTTTCTGCTGGCCAATGCGTCACATCCTGACCAAGAATCCTAATTTGCCCCCGTGTCAAACTTAGCGTTCCTGCAATTACATTAAAAAGGGTTGATTTTCCAGCTCCATTTCCTCCTAAAATAGTTAAAAAATCATGTTCATAGATAGTTAGTGTCACATTGTCCAATATTGTTTTAGCATCTTCAAAACCATTATCTACGTCAACTGTTGCATTGATCAATTCAATAATTTTTGTCATCGTGTTAACCTCACTCCCTTAAAGAAGCGCTCTTTTACCACTGGTATCATGAGGCACAGTGCTAAAACAAGAGCACTAATTAATTTCAAATAACTTGTATTAAAACCTAGCGTAATAACTACTGAAATTAAAAATTGATAAAGAATCGAGCCTATTACAATAGCAATCAAACGTTCTAAAAGAGTCAGTCCAGTTGAGTATAGTACTTCACCAACAATTATGCTCGCCAAACCAATAACAATAACTCCAATCCCTTTTGAGACATCTGCATAGCCATCTTGTTGACTCACTAGAGCACCTGATAAAGCTATTAAACTATTAGAAACCACAAGTCCCATAACTTCCATCCAATCCGTGTTAATACCAAAACTCTTAGCCATATCTTTATTGTCTCCCGTAGCGATATAAGCTTGACCTAGATTAGTGTAAAGGAAATAGATCAAAACGCTAATAACAATCACAACAGTTATCAGACCTGTTAAAAGGCTATTTAAATCAATTGAAAAAGGTAAACAATCCTGAATACGTTTATGATCATGTAAACCCAAGTTTGCTCTTCCCATTACCATTAGCATAATGGAGTTACATGACGTCATCACCAAAATTCCAGCTAAAAGTGTTGGCATTTTTCCTTTCGTATACAACAGCCCTGTTAAAAAACCTGCTAAAGCACCTGATAACATACCAAGTAAGGTTGATAGAAATGGATTCCACCCTAAGCTAATAGCGGTGACCGCAACAGCTCCTCCTAAAGGAAAAGAACCTTCTGTAGTCATGTCAGGGAAGTTTAAAATCCTAAAGGTCAGGTAGATTCCTAATCCTAAAACTCCCCATATAAGACCTTGTGAAACTGATGAAATAATCATATTTTTCCTCATATTTATATTAGCGGGTAACGCTCGCCAGTATAAACCCTTTCTTTACATTAATTTTTAGATTTGTTTTATACTTAGTTCAGCACCGTGGCTTAGTCTTTTTTTCAATCACTTTGACGAAACTAAGACAGAAAACAAAAAAGTCGAGAATCATGTTTAAACTTACTCAAAAGGCAAGATTTTTTACGTGTCTAAAATAGAGCATTTTAAAACTAAAAATGATAAA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63 | Streptococcus_phage(79.17%) | tail,holin,terminase,integrase,portal,protease | attL 1025913:1025961|attR 1064931:1064979 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1078382 : 1133355
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483522|1078382:1133355|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_virus(23.08%) | transposase,tRNA,protease,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1169747 : 1180351
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483522|1169747:1180351|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483522|1169747:1180351|1172951_1174304_-|SRX91181.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANSAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHASYERGFEQNGVDRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIVGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKAIVDVLVEEMAVGGPCLHPHSEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFGLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNNKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKKYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >LS483522|1169747:1180351|1174524_1174866_-|SRX91182.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAVQADASASQLFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK >LS483522|1169747:1180351|1176869_1178033_-|SRX91185.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >LS483522|1169747:1180351|1169747_1170890_-|SRX91178.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTIPYGEALKTYQEVATKIYGNPSSLHQLGTNASRILEASRKQIAGLLGVKSEEIFFTSGGTESANWAIKGIAFEKTAFGKHIIISAIEHPAVSESVKWLLTQGFEVSYAPVTTQGVVDVNALAELIRPDTILISIMAVNNEMGAIQPIRAISNLLANQPTITFHVDAVQAIGKIPLCDYMTNRVDLASFSGHKFHSVRGVGFLYKKAGKRLNPLLSGGGQEQELRSTTENVAGIASMAKALRIVTEKQVSVLPKLTAMRDVIYKALSAYPDVTVFSAQEGFVPNILTFGIRGVRGEVIVHAFEKYEIYISTTSACSSKAGKPAGSLVAMGIPVKTAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYDKTQKVR >LS483522|1169747:1180351|1176186_1176873_-|SRX91184.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >LS483522|1169747:1180351|1171594_1172872_+|SRX91180.1|DBSCAN-SWA MTTYDSISWIHTFKANGRKTDLARMAWLLEALGRPQDKFPAIHVVGTNGKGSVTAYLQHILSTSGYQVGTFTSPFIISFHDRICLNGQPISDLELAQCVSVIRPILTKMSLETNWDRPTEFELVTLIMFCYFANLKPVDIAIIEAGIGGKTDATNVFHALAVVCPSISFDHQERLGYSLAEIAHQKAEVIKAKEPVIIGQLEQEASQVFQQVTQKAGSRLYQLGKDFLLNPSEKTFSFQHDNLNLTKLRLKLLGQHQKANACLAIMTAQLLRKSFPKISPKTIQKGIEATTWPGRSEFIQPNLLLDGAHNPDSIAKLKSLLQEEFPKRPIHILFAGLKRKPLADLLAQLDTFEVSVTTFDFPEANLLEDYPDKYPQVKDYRDWLQGSVTSDELFVVTGSLYFISEVRQYCLSNANIFKNIFPLIT >LS483522|1169747:1180351|1174926_1176093_-|SRX91183.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGPSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEEEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >LS483522|1169747:1180351|1178140_1180351_+|SRX91186.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFILYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYDNSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNTKNRE >LS483522|1169747:1180351|1171124_1171565_+|SRX91179.1|DBSCAN-SWA MSSRYSRQQKPRKSGGVPTEHIKTGFTAFQKSIALIGSILSIIVATITITRALQPVPDKTSNDTPKESSNTIVKIIEKESSQGNQNHTGTSETTDDNKTTLPSSSTTPSHNETTPTAPETPSATEGTQLPNATGAEDANTGLPTNS |
9 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1369565 : 1398840
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483522|1369565:1398840|DBSCAN-SWA ATTAAGCTTGTGCATCTGGACGTGACTTGCGAGCAATGTCTGCCAAGATGTTTTCCACAAATTCTTCCACAGATTCAGTGTGAGTCGCCTTACTACCATAGCGGCGAACATTGACTGATTTGTCTTCCATTTCTTTGTCCCCAACAATTAATTGGTAAGGAATTTTGCTGGTTTGAGACGCACGAATCTTGTACTGCATTTTTTCATTGCGGTCATCGACATCTGCACGAACACCACGGTCACGAAGGGTTTTTGCTACTTCCCAAGCATAGTCAATGTGGGCTTCATTTGAAATTGGAATCACGGTTACTTGGTGAGGTGCCAACCAAGTTGGGAAAGCACCCTTGTAAGTTTCAATAAGGATAGCAGTGAAACGTTCCATAGTTGAGATAACACCACGATGAATCATGACTGGGCGGTGTTCTTCGCCATCTGCACCAATGTATTTAAGGTCAAAACGTTCTGGCAACAAGAAGTCCAACTGAATGGTTGATAGAGTTTCTTCGTTACCAAGAGCTGTTTTCACCTGAATATCAAGCTTAGGCCCATAAAAGGCTGCTTCACCTTCTGCTTCAAAGTAATCTACACCCATCTCATCAAGTGCAGCTTTAAGCATACTTTGAGCATTTTCCCACATCTCATCATTGTCATAATATTTATGAGTATCGTTAGGGTCTCGGTATGACAAACGAAAACGATAATCAGTCAAGTTGAAGTCAGCATAAACATCAATGATTAATTGAAGGGCACGTTGAAATTCTTCCTGGATTTGCTCTGGTGTTACGAAAATGTGGCCATCATTCAAGGTCATTTCACGTACCCGTTGAAGTCCTGATAGGGCACCTGATTTTTCGTAACGGTGCATCATGCCAAGCTCGGCAATACGAATAGGCAATTCACGATAAGAACGCACATGATTTTTATACACTTGAATGTGGTGTGGGCAGTTCATTGGACGAAGAACAAACTCCTCACCATCTCCCATATCCATTACAGGGAACATATCTTCTTGATAATGATCCCAATGACCTGATGTCTTGTACAATTCTACAGAAGCAAGTGGTGGTGTGTAAACGTGTTGGTAGCCTGATGCTAATTCTTTATCTGTGATGTAGCGCTCAAGTGTACGACGAATAGTCGCTCCATCTGGTAACCAAAATGGCAAGCCTTGACCAACTTCTTGACTAATCATGAACAAGTCAAGCTCTTTACCAAGCTTACGGTGATCACGTTCTTTGGCTTCTTCTAGACGAGTCAAGTAAGCTTTGAGGTCTTTTTTATCAAACCAAGCTGTTCCATAGATACGTTGCATCATGTTATTGTCGCTGTTACCACGCCAGTAAGCACCCGCCACATTGAGCAAGTGGAAGACTTGGATACGGCCTGTTGATGGCACATGAGGGCCACGGCAAAGATCCACAAATTCACCTTGACGGTAAACCGTCAAGCCAGCACCAGCATGCTCATTAATCAATTCTACCTTGTAAGGATCATCTTTGAACAATTCCAAAGCTTCTTCTTTAGTCACTTCTTCACGGATACATGGGTAATTTTCTGTCACGATTTTTTGCATTTCAGCTTCGATACGTGGCAAATCTTCGTTTGAAATTTGGCCTTCAGCATTATCTGTATCATAGTAAAAGCCTTCTGCAATGGCAGGGCCCACACCCAAATGAAGATTTGGGAACAAGCGTTTTGCAGCTTGGGCAAATAAATGGGCTGCAGAGTGACGAAGCACCTCATAAGCATCTTTGTGATCAGGTGTCACGATTTCAATACTGCCATCTTCTTCAATGGCACGAGTGGTGTCAATGAGTTGATCATTGAACTTACCAGCTAAAGCTTTTTTAGCCAATGATTTGCTGATGGACTCAGCAATGTCAAACGTTGTTACGCCAGATTCAAATTCACGCACGGCGCCATCTGGAAAAGTAATCTTAATCATTTGCTTTCTCCTTTAAGTCAGTTAAGATTTCCACTAAAACATGGATAGTAAGACAAAATAGGGACAAGAGGTTAGTGAATAGCTCAATACCACCACGTAGAAGAACAATACCTTATTCACGAATCTACCCTCCCTAGTCCTTAAAAACAAGGCTAATCCCCTCCAAAACAAAAAAACTGACCGCATCCCAAAGGACGCAATCAGCGTGGTTCCACCTTAATTTATGCAGGACAAAAAACATGCCTTGCACCTCTAGTGGCGATAAGGGGGCCACCCTTTTATGTTTGCATAAAAACCAGGAAGGAGTATCAGATTAGCTATCCTTGTGCTCTTTCCACCAACCAGCACTCGCTTAAAAGATTCTGTCCAATCTAACTTGTCTTCAAGATTATTATAGCAAGTTTTCAAAAATTTACAAGCCTTAATCCAGAAAATCTTTGATAGCATGGACCAGCTTGATAGGAGTCTTGACTACTTTTACTGAGGTGATAGCTGTGACCTTAGCAGCACGTTTAGGCAAGTGAATAGCACCTTGCACTAATTTTAGAGAACTACTTTTACCAGAATGATTAAGATAAAGACTCAGCTTTTGAGCTTCTTTGCTATTTCTAGCAATTAACGTATCTAAATAGAACGTGTAAATAGATTTTCCAAAGTGCTGTGCTGAGATTTCATAACGTTTTTTTGCTAATAACCGTTTATCCATAACTGGTGTTTTTAGTATGGCATCAATAATAGCATCAGTTAAATCTGTTTCAGCGTAATAAAGAGTGCCAAACATTTTATCAGTCACCACATCATCTAAATAAGGATTGCCATGAGCAATAATAGGAGTGCCACTAGCCAAACTTTCAATATAGGTCAAGCCCTGAGTCTCACTGGTCGATGCTGAGATAAAGAAATCACAAGCCTTATAGTACAGAGCAACCTTATCATGAGGCACCATGCCTGTAAAGGTCACGTGTTTGTCAACCTCTAACTGCATCGCCAAGTGTTTCAAATCTTGCAAATAGGGGCCATTTCCTACAATAATAAGCTTTATCTTGGCATTTTCAGCCAAAATAGCTGGCATCTGATTGATGATAGCTTGAATATTTTTTTCATAAGAAATCCGTGACAAACTCAATAACATGGTTTCATCACCAGCAATGCCCAATTCTGCTTTTAAGTTGGTTACTTCTTCTGCTGTGATGTCATCACGAATATATTTTTCCAAAGGAATGCCTGTTGGGATAACCCGCTTAGGGATAGTCACTTCGTAACCTTCTAGAAGATTGAGGACAATCCTACTTGGGCAGATAACCCCATCTAAATCCTTCAAATAGCCCCTAAGAAGAGGTTTGACCATACTTGGTCGAATGATTTTTCCGTTGGCAATATAACTCACGTAGTCCTCATATTGGGTATGATAAGTATGGACAACAGGAATTCGCAAAGCTTTGCCTATCATTTTCCCTAATAAGCCTAAGCTAAACTCAGTTTGCGTATGAATAATATCAAGATTATAGTGTTTTGCAATTTTGTATGACGAAATGAGGCCACGATAAACCACACGTCTATCCGTAAATGACACAAAAGGAACACTTGGCAGTCGAATAATGGTCGGGTCTTCAAAGCGTTTGACATCTCTATCAGTAGTGGTGAAAATATAAACTTCGTGACCTTCTTTTTCTAGCTCTTCTTTTAACGTACGAATACTAGTAGCGACTCCTGAAACTTGTGGAAAATAGGTATCTGTGAATAGACCTATACGCATCTTATAACTCCATTACTTTTTTATAGACATCTACTAAGGCATGGCCAACCGTTTCTAGGCGACGACTCTGGGCAACCTTGTAACCAGCTTCAACTTTGTTGCTGGCACCAGAAAAGACTTTTTTCAGAGCTTCTATAAAACCTGGTATATCGGTTGCTAATTCCGCACTACTTTGATCAACCCATCCGTAGTAAACTGGTATATCACGTAAAACAAGGTGCTGGCGACTGGCCAAGGCTTCTAAGACAACAATGCCTTCTGTTTCTTCACGACTTGGAAAGAAAAAGACATCTGCACCAGTCATGGCACCTTCATAAACATCCCCTTTAATGTATCCTGGGAAAATAAGATTTTTCGGGTGGTTACCATTGACCATTTGGCGAACTTGAGCAGGAATGACCCATTTGTTGGTCTCGCCAAACCAGATAAAACGAACATCTGGCATAGCTTGGGCAACTTTGACAAAGTCATCAATTCCTTTCCTCAGAAAAAATAATCCTGCTCCCATAACCACTTTTTCGCCCTCTTTAATGTCAAAGTAGCGACGAAAAGCTGCTTCCTTTTTAGGATCTGCTCCGTACTGCTCCAAATCAATCCCATTTGACACTGCAAAAATAGGTGACTTCACTCCATAACTCTCAATCAAAGACTTAGAATATAGGGTAGGGGTAATGATAGCATCTGCCTTATTGTAAAAGTGACAAAGGTATTTTTTAAACCAAGGAGATAATAGATTTGAAAAAATAAAAGAATTTCTAAAATCTTCTTCTGTAGAATGCCCATGCATGATAACCTTCTTACCAGCTTTTTGTGCTTTTATCATCAGCAGCCAACTTTTTAAACCATAGGTATTGAGATGAACCAAATCATAAGTTTCTCTTGGATTAGTCGTAAAATGTTGACCAACAAGTGACAAGGCTTTAGCCTGATGCTTAATCGCTCGACCAATTCCTGATTTTCTTAGATAATTTTCTGCTTCTAAATACAATAAGACTTTCATAAGTTCTATTATAGCTCATTTTATAGTATTTTTCACTAAGACATGCAAAAATCAGCCCTAAGGCTGATTTTAGTATTGAAGAAACAGTCTATTGTGATACTTTTTGTTAGATGGTGCTCATAAGTCACAGTTACTTAGTTGTCCCACGTTTTTTAATACCATGATTCAAAAGAATTTCTTTTTCTTCCAACTCTTCTTTGTTCATGATTTTAGTCAACATCCGCATGCTAACAGCACCTAAGTCATAAACAGGTTGACTGATAGAACTCAAATTGGGACGAGTGTATTGAACCACTGGT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34 | Tupanvirus(14.29%) | bacteriocin,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1404504 : 1416167
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483522|1404504:1416167|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483522|1404504:1416167|1415669_1416167_-|SRX91416.1|protease|DBSCAN-SWA MYIEMIDETGQVSQEIMEQTLDLLNFAAQKTGKEEKEMSVTFVTNERSHELNLEYRDTDRPTDVISLEYKPETPILFSQEDLAADPSLAEMMAEFDAYIGELFISIDKAREQSQEYGHSFEREMGFLAVHGFLHINGYDHYTLEEEKEMFTLQEEILTAYGLTRQ >LS483522|1404504:1416167|1404504_1405254_-|SRX91398.1|DBSCAN-SWA MNIFVLEDDFLHQTRIEKIIYKILTDNKLEVNHLEVYGKPNQLLEDISERGRHQLFFLDIDIKGEDKKGMEIAVEIRNRDPHAVIVFVTTHSEFMPVSFQYQVSALDFIDKELPEELFSHRIEKAITYVQDNQGKTLAEDSFVFINVKSQIQVPFSDLLYIETSLIPHKLILYSTKQRVEFYGQLSEIVEQDDRLFQCHRSFVVNPYNISSIDRSERLVYLKGGLSCIVSRLKIRSLIKVVEELHTKEK >LS483522|1404504:1416167|1414265_1415162_-|SRX91414.1|DBSCAN-SWA MFKSGFVAILGRPNVGKSTFLNHVMGQKIAIMSDKAQTTRNKIMGIYTTETEQIVFIDTPGIHKPKTALGDFMVESAYSTLREVETVLFMVPADEKRGKGDDMIIERLKAAKIPVILVINKIDKVHPDQLLEQIDDFRSQMDFKEVVPISALEGNNVPTLIKLLTDNLEEGFQYFPEDQITDHPERFLVSEMVREKVLHLTQQEVPHSVAVVVESMKRDEETDKVHIRATIMVERDSQKGIIIGKQGAMLKKIGKMARRDIELMLGDKVYLETWVKVKKNWRDKKLDLADFGYNEKEY >LS483522|1404504:1416167|1410364_1410589_-|SRX91408.1|DBSCAN-SWA MNTTIKQFEIMDEAMLTGIEGGCSWHGLAQAAVFTGAGNGFRLGVKTRTWQGAAAGAAGGLVIGGVGYGATCWW >LS483522|1404504:1416167|1407196_1407412_-|SRX91401.1|DBSCAN-SWA MSPKGNPYDNALMEAFYKTLKRELVNDAHFATIEQAQLEIFKYSETYYNPKRLHSALGYLSPVEFEKIVTH >LS483522|1404504:1416167|1413768_1414245_-|SRX91413.1|DBSCAN-SWA MPQDYISYIRSKVGHDKIILNFAGGILTNDDGKVLMQLRGDKKTWTIPGGTMELGESSLETCKREFLEETGIEVEAVRLLNIYTHFEEVYPNGDAVQTIVFIYELTAVSDMAIDNFHNEETLKLQFFSHEEIAELESVSAKHRLMLEKYFSDSFAMGH >LS483522|1404504:1416167|1408766_1408997_-|SRX91405.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MMNTKTMEQFEVMNSEMLAGVEGGWGGWGEAIAGLLGGFAPSPTLDQLNGKWPIRKPSKPCSPYGTGGTPNACNGL >LS483522|1404504:1416167|1413077_1413272_+|SRX91412.1|DBSCAN-SWA MIVIQVLHRSLLGYMISIYINYYLKRYFLKTQIISGKNLDYKYKCQVYFIINHTFLNLSKYMTF >LS483522|1404504:1416167|1408400_1408718_-|SRX91404.1|DBSCAN-SWA MLTLYKRQIAEVWEIGRETPQPEWVRDAFRKNYICWLDEHVRILMTGLNPSLTTNLKIGATGTVGGGFAGYGMYVLGYPGDFLDVTNHRVISAKKFHKEYQIIDG >LS483522|1404504:1416167|1405488_1406421_-|SRX91399.1|transposase|DBSCAN-SWA MEKKPLGPAKELEPVAKKISTTDPESGWFHKGDHKEVFAYSAQVACDKYGWALAYSVEAGNIHDSQAFPELFAKLEPLKPQFIIADSGYKIPSIAKFLIDKEITPVLPYTRPRGKKDLLRPKEFIYDEHFDCVICPEHQALTYRTTTREGSREYKSDPAICANCPLLSVCPTSKNHQKVVTRHIWKDYLEQCEDIRHQRGMKELYQHRKETIERLFGTAKEYHNLRYTREKGKSKMEDKVGLTLACLNLKKRVKRMAGEPFYFVQMRWFKHGNSHFYLKTLKKTNTKSMFVFNLKPPVFTGGFYLYKAIR >LS483522|1404504:1416167|1410210_1410387_-|SRX91407.1|DBSCAN-SWA MGRLVGGNNHGYQKFFAWFSYWFTLPNFRQYIIEYPEKLEKPIEDTKMGLYSVYIGDL >LS483522|1404504:1416167|1407724_1408021_-|SRX91403.1|DBSCAN-SWA MNSHHTCQTLQVSRSGFYAYLKRRLSSKHVENEALKEMIKAIFYEHKERYGSVRITQELCRRGIHVNHKRVGRLLHQPGLYAKGSRYQYKYYNRRRSS >LS483522|1404504:1416167|1411227_1411938_+|SRX91410.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MSFLPLIFKQESLIFYIVLASLLVTLINIGGSYYLQGIWDEYIPNQMKPTLGIISIGLIVTYILQQMMSFSRDYLLTVLSQRLSIDVILSYIRHIFELPMSFFVTRRTGEIISRFTDANAIIDTLASTILSLFLDVSILSIVGGVLLVQNTNLFLLSLISIPIYIIIIFTFMKPFEKMNNNVMQSNSMASSAIIEDINGIETIKSLTSEEIRYQKIDSEFVDYLDKSFKLSKYSTK >LS483522|1404504:1416167|1409897_1410125_-|SRX91406.1|DBSCAN-SWA MSGVFKKCLTFIMSIIFSIFMTIFVQTPVVATFNNERINLRQGINGDFLRVIICIIFIILCFYFLSLLAKCLISQ >LS483522|1404504:1416167|1412433_1412664_-|SRX91411.1|DBSCAN-SWA MSSIFFLALTFTHVIILIILHAKVYVYKVTVKNLSLYTLFFFYILPSLEIGIEFQDMNIVSDIYQNVLLTSGVIST >LS483522|1404504:1416167|1415281_1415689_-|SRX91415.1|DBSCAN-SWA MALHDNNTTKRKWKNRTITSSLEFALTGVFTAFKEERNLRSHLLSACLACVAGLFFSISAIEWLFLLLAIFLVITLEIVNSAIENVVDLASDYHFSMLAKNAKDMAAGAVLMISGYAVLTGLIIFIPKIWNIFVH >LS483522|1404504:1416167|1407451_1407622_-|SRX91402.1|integrase|DBSCAN-SWA MSVLIDVYSRKIVGWAMGRRMQDKLVTEAFNQAYNREKPKEGVIVHTDQGSQYTGA >LS483522|1404504:1416167|1406371_1406983_-|SRX91400.1|transposase|DBSCAN-SWA MLHKEKPDYNRNQYGFYTLDQIVPDEHFLRQVEAVIDFDFIYDLVEDTYSSDNGRPSLDPVMLVKIPLIQCFYGIRSMRQTIKDIEVNTAYRWFLGLTLDDKVPHFTTYGKNYSRRFQEKGLIESIFTHILGLCINTGLIDPTEIFIDGTHIKAAANNRKFINREVEKQAKFMSEQLEIEINRDREKHGKKAARARQRARARR >LS483522|1404504:1416167|1410886_1411123_+|SRX91409.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MTSCKRTFVPQIDARDCGIAALASIAKFYGSDYSLTHLRELAKTNKEGTTTLGIVKAAKEMGFEKNISSLEIQIPPLK |
19 | Streptococcus_phage(33.33%) | protease,bacteriocin,integrase,transposase | attL 1399112:1399129|attR 1410695:1410712 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1461884 : 1467919
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483522|1461884:1467919|DBSCAN-SWA AATGAAACTGATTTCATGGAACATTGATTCCTTAAATGCTGCTCTCACAGGAGAGTCCCCTCGTGCGCTTTTATCACGCGCTGTTTTAGACACTTTAGTCGCTCAAGATGCGGATATTATTGCCATCCAAGAAACAAAATTATCTGCTAAGGGGCCTACCAAAAAACATATCGAGACCCTACTTAGTTACTTTCCAAACTATTTGCATGTGTGGCGTTCTTCAGTTGAGCCTGCTAGGAAAGGCTATGCTGGCACCATGTTCCTGTACAAAAACACGTTAAACCCTGTCATTACTTTTCCAGAAATTGGTGCCCCAACAACAATGGATGCTGAGGGCCGTATCATTACCCTAGAATTTGAAGACTTTTTCGTCACACAGGTTTACACGCCTAATGCTGGTGATGGTCTAAGACGGTTAGATGACCGTCAAATCTGGGACCACAAATACGCTGATTACTTGACTGAACTTGATACTCAAAAGCCTGTTTTGGCTACGGGAGATTACAACGTTGCCCACAAAGAGATTGATTTGGCAAATCCAAGCAGCAATCGACGTTCCCCTGGTTTTACCGACGAAGAACGTCAAGGCTTTACTAACCTATTAGCAAGAGGCTTTACAGATACTTTTCGTCACTTGCACGGCGATATTCCTCATGTTTATACCTGGTGGGCACAACGTAGCAAAACCAGCAAAATCAATAATACCGGTTGGAGAATTGACTATTGCCTAGCTTCAAACCGAATCGTGGATAAGGTTAAGCGTTCTGAAATGATTTCTTCTGGGGAACGCCAAGACCATACGCCAATTTTACTAGATATTGATCTCTAATGTCTAAAAACAGATCCCAAAAAAGGACAAGGCGTTATAATGTTGCCTTGTCCTTTTTTGAGACTTTGTCGCATTATCCTAAATCCAACTCTTGATATGGCTTGCGATAGCCAACTTGTAGGACTTTACCGTCCTTAATCAGAATAGGCCGTTTAATCAGCATACCATCTGTGGCTAAGAGTTCAGCAGCTTTATCAAGGCTAAGCTGGTCTATTTTATCTTTAAGTCCCAATTCGCGGTAGCTGTTACCACTGGTATTAAAGAAATTTTTGATGGTATAACCAGATGTTTCCATCCAATGTTTGAGGTCCTGAGCTTTGGGTGGATTAGCTTTGATGTCAATGGCTTCAAAGTCACTAACCAGTTGCTTTAATTCAGCCATGGCTCTTTGGCAGGTGCTACATTTTGGGTATTGGTAAATCGTAATCATTTTTTCTCCTTTAGGGTAACTGTTTTAGGCGTGAGGCGCCTGTTTTTGGTCATCATTTCACAAAAAAAGGGGAGGCTTTTTTAAAATGCTAAGCTTTGTCTTTCTTTTCTTCTTGAGAGTTCGTTGGTAAAGACTGATATTGCCGTAGAACATAGCAAGCTTTTTTCAAAGTATTTGCTGCTGTTTTGGCCTACTTTTAATACTAGTGAGTATAGCATAATGTCCATGATTTGACAAAAATGTTTCCTGATGACTAGCTTCATTCGTGCTATAATATTAGTGATAAAGGAGAACTAAAAATGATTAAAGAATTTTGTGCTGAGAACCTCACACTACTGCCAACCCTTGATGCTGGTCAAGTCAGTCGTGTGGAACTCTGTGATAACCTAGCTGTCGGAGGGACCACGCCATCTTATGGCGTCATCAAAGAAGCCTGTCAGCTCTTACACGATAAAAAGATTAGCGTAGCGACCATGATTCGACCTCGCGGTGGCGATTTTGTCTATAACGACCTCGAATTAAAAGCTATGGAAGAAGATATCTTAAAAGCTGTTGAAGCTGGCTCAGATGCGCTAGTCTTAGGCTTGCTGACCACAGAAAATCAACTGGATACCGACGCTATCGAGCAATTACTGCCTGCTACACAAGGCTTGCCACTGGTTTTCCACATGGCTTTTGACCATATTCCGACTGATCACCAGCACCAAGCGCTTGATCAACTGATTGATTATGGCTTTGTGCGTGTGCTAACTCATGGCTCCCCTGAAGCTACTCCTATTACAGACAATGTGGAACAACTTAAAAGTCTTGTGACCTATGCCAATAAACGCATTGAAATCATGATTGGAGGAGGCGTCACTGCTGAGAATTGCCAAAGCTTGAGTCAACTCACTGGAACGGCCATTGTTCACGGGACTAAAATCATTTAAACACCTAAAAGACCATCAATAAATCCAATTGATGGTCTTTTTTCTCTTAGTTTAAAAGATGTGGCACAGGGTGGCATTCTTGTGTGGTATAAGTTTTTCCAAAAGCCACTATCAAAGAAGCAATGCCTGGGAAAAACAAGCCAAATACTGCTAGACCCTTTGATCCACCAAAAGCACGGACATAGCAAAAGTGCACATAGTAATAATAAATAGCAATGACCCAACCAATAAAGTAAAACCATTTATTATCTTCTCCAAAAGTGATTTTGTGTTTGACAAAACCTGCATAGAAAGGAATGAGACTATACCATCCTTTGTAACCTGCTCTTTTAAAGAGTCGCCAGTTAGCGATAAGGCATAATAAAGCTGATAATAAGAATACAGCCAATATGATTCCGTATACTCCTAAAATAAGGATAGTTGCTTGATCTTCTGTCATTTGTTTTTCTCCTAATCTACGATGACTTATAAGTCATGAAATTGTTGGTAAAGCTCTTGGCGATTTACCTGGTAAGCTTTAGCAATTGTTTTAATAGCCTGATTTGGCTTGGCTCCTGCTTGGATTTCTTTTTGCACTAGAGACACTAAGTCAACATCAGCTGTCAGCTCAACCTCACTGTCTACTTGGGCTCCAGCCACAATCAGCAGACACTCCCCTTTTAGGGGTGTTTCCTCAAGGTATGACAAGATTTCTGAAATCGCCCCCCGTTGGTACTCCTCAAAAAGCTTGGTTAATTCTCTGACAAGCACCACTTGACGATCACCATAACAAGCCAACATATTGGTCAGGGTATCTTTGATGCGATAGGGTGATTCATAAAACATTTGTGTCTCTGGGTAATGGTGTTTGTCCTCAAAGAAAGCCTTTTGTTGCCCTGCTTTTCTGGGTAAAAACCCATAAAAAACATGGGGTTGAGGAGCCAGTCCACTAGCAATCAAAGCTGTAATCCCAGCTGAGGCACCTGGTAAAGCAACGACTGCGATATCACTATCAATAGCAGCCTTGACCAAATCATGCCCAGGATCAGAAATCGATGGCATTCCTGCATCAGACACCTGAGCTAATGACCGTCCTGATATTAATAAATCAATTAAATCAGGAATCTTCTCATAGGCGTTGTGCTCATGAAAGCTGATTTGCTTGGTAGCAATGTCAAAGTGTTTTAGCAAAAGACCTGTGTTTCTTGTGTCTTCTGCACAAATAAAATCAACCTCTTTTAACGTTGCCACTGCTCTAAAGGTCATGTCCTGCAGATTGCCAATCGGGGTTGGAACCAAATACAAGGTTCCGCTTGTTTTTTTGTCTTTAAAACTTTTTTGAACCTGCATGCCCTTACTTTCTATCTAATAATTCTCTGCAAAACATACATTCTTCATCATTTTCACGACGTTGTCCATAGAAAAAATTGCAGATATGAAACCCTTCATCATAAATTCCCTCTAAGTGATCCTTCCTTTGTTTGGAAGGATTTTTAGCTACCGTTTCATGTTCTAGGTGACTCAAACGTTCCCGTAGTTTTGTATTTTCTAGGCGAAGAATCGTGTTTTCTTCTACTAGTGATTGGACTTGTTTTTTCATGGCTTCAATTTCAGCTAAAGTAACCATTAAATTTTGGGAAAATCCATCAAAAGCATCGAATAATTCTTTTTTATTCACCTACTTTAACCTCCTCTAAAGCATAAGTGACTAAGGTCAACTGGTCTTTTAACCGCACCTTAATGGGATCTGTAAATATATCAAGGCTGCTACTGTTGCAGGGCCATCACTTGTCTCTACTATGGTACCATATTCAGGGAATTTTTTCTTGCTTTATTGGTAAAAGCCACCTTCATCATAGAGACAGCAAAGCAAACGGCCATAAGGGCTTGTTGCTTTACCCAAAGTCAATGATAACCTTTGATTTTTTAGTATTTTAATAGATACTGTCAGAAATTTTCCCAAAAACGAAAGCAGCACAGTGGTCTGCCACACGGTCCTAAGCGCCCATAAATCTTGGTTTCTTCTTGGCTGTTAATCTGGGGCAGCTCACTTCTTGACCTAAAATCGGCCGCTAAATCTTTTAACAGTTGTAAAAATCCATGTGCTCTTCTGCTGAAAAGGGAATTAGGACAACATGCTGATCTAAGGGAAAGACACTATTAATAAACGTCATTTCAAGTTGATTTTGTGTTATTAATCGTGATACTTCTTTCATCAAATCTGTTGCAAAGGCAGTATTTTCTTCAAAAGCTTGTTTTGCCCCTATGCGCCGCTACTTTGGTCGCTAAGGGCAAGTCTTTTGACAAGCTTCGTTTCCCCATAACGAATTCCAATTGCACTTATTCTGACATCACCATATATTCTAATGTGTTTTGAAAATTAACATTGCTCTGCCACATGAGCCTAGCCTGATAAACAGCCTCCAATTGTGTCAAAGGCGTTTGCGCACGCTCTCTTGCCAAGAGCAAGGTCAAAAGGGTCAAAACTAAATCTTGTTCTTCTTTTTCAGTTGCTAACTGTACCAGACGGTTCAACGCTAAATATGCCTGCAACTGATCTTTCAGCCAAATAGATACAAAACGCTCTGCTTGAGTTATCAGTTCTAAAAGCTTGCTCGTTTGCAACAGACGTTCTAGATGACTGGTGTTTGTGGCAAGTTTGGCTACTAGCTTAGCCTGATGGTTTAATAATCCCTTTTCTTGTGCCAATTGGTAAAGATAGGCTTCGTTTTTAGGAAACTGAAAAACCTGTGTCCGACTTTTAATGGTCGGAAGCACTTTGTTATCATCATTGGTCAGCAAAAACATGTAAGCTTCTCCCTGAGGCTCCTCAATATACTTTAGCAAGCTATTAGCGGCATTGGTATGCATTTTGTCACAATCTTTGATAATAAAAACTTGTCGTTTGTTTTCATATCCTGTCTGAGAAAAGTTAGCCATCATTTCTTTGACCACATCCGTTTTAATCACTTGCCCTGTTGGTTCCAATACCGTCACATCGGCAAAATCTCCTTGTTCAATCAATTGACAAGAGCGACAATGCCCGCAGGGCGTCTGATCCTTTTTCTGTTCACAAAAGATGACCTTAGCTAAAAAAAGAGCCATTTCTTCATTAGCAAAATCACCCGAAAAAAGATAAGCATGATTCAGACGGTCTTTCTTTAAAATCGTCTGAAAAGCTTGATAAACGTTAGGAGCTTTTTGCGCTAAATCCATTCCTACCCTCCCTTATCCTAGGCTAAAAGCAAGGCTAAGACATGTTCCAAAGCGACAGAGACAACTTCTTTCAATGGTTTAGTCGCATCAATTGTGACAATACGTTTTGGATGCTCCTTAGCTAAGGCTAGGTATCCTTTTCGTACTCGTTGATGTATCTCTATTGTTTCCAAATCTAAACGATTGACTTCTCTTTGTTGGTTCGCGTTAATCCGTGCTAAACCAATTTCAGAAGGAACATCAAAATAAAGGGTCAAGTCAGGCTCTAAACCATCTGTTGCGAACTCGTTGAGCCACTGAATGTCTGCTTTGGTCAAACCGCGTCCCGCACCTTGATAAGCTACTGAACTATCGATGAAACGATCAATAAAAACCAACTGGCCTGCTTCAAGAGCTGGTAGTACCTTTTCCACCAAATGCTGCCTTCGAGCCGCAATATAAAGTAAGAGTTCTGTTTTAGGGTCCATAGTAGTATGGTTGATGTCTAAAATAAGTTCTCTAATGTATTCTGAAATGGCAACACCTCCAGGCTCTCTTGTTGTCAAGATCTCCTGAGCCACTTTTTGTTTTAACAGTGGAATGAGTTGCTCTAAAACAGTCGTTTTCCCTGCGCCATCTGGACCTTCAACGGTTATGAGTTTTCCTGTGATCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483522|1461884:1467919|1464536_1465400_-|SRX91462.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKHFDIATKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLISGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDSDIAVVALPGASAGITALIASGLAPQPHVFYGFLPRKAGQQKAFFEDKHHYPETQMFYESPYRIKDTLTNMLACYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGAISEILSYLEETPLKGECLLIVAGAQVDSEVELTADVDLVSLVQKEIQAGAKPNQAIKTIAKAYQVNRQELYQQFHDL >LS483522|1461884:1467919|1465404_1465728_-|SRX91463.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSHLEHETVAKNPSKQRKDHLEGIYDEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK >LS483522|1461884:1467919|1467283_1467919_-|SRX91465.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQLIPLLKQKVAQEILTTREPGGVAISEYIRELILDINHTTMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGQLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLTKADIQWLNEFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARINANQQREVNRLDLETIEIHQRVRKGYLALAKEHPKRIVTIDATKPLKEVVSVALEHVLALLLA >LS483522|1461884:1467919|1466390_1467266_-|SRX91464.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPNVYQAFQTILKKDRLNHAYLFSGDFANEEMALFLAKVIFCEQKKDQTPCGHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYENKRQVFIIKDCDKMHTNAANSLLKYIEEPQGEAYMFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLYQLAQEKGLLNHQAKLVAKLATNTSHLERLLQTSKLLELITQAERFVSIWLKDQLQAYLALNRLVQLATEKEEQDLVLTLLTLLLARERAQTPLTQLEAVYQARLMWQSNVNFQNTLEYMVMSE >LS483522|1461884:1467919|1464117_1464510_-|SRX91461.1|DBSCAN-SWA MTEDQATILILGVYGIILAVFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWYSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIASLIVAFGKTYTTQECHPVPHLLN >LS483522|1461884:1467919|1461884_1462712_+|SRX91458.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTGESPRALLSRAVLDTLVAQDADIIAIQETKLSAKGPTKKHIETLLSYFPNYLHVWRSSVEPARKGYAGTMFLYKNTLNPVITFPEIGAPTTMDAEGRIITLEFEDFFVTQVYTPNAGDGLRRLDDRQIWDHKYADYLTELDTQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSPGFTDEERQGFTNLLARGFTDTFRHLHGDIPHVYTWWAQRSKTSKINNTGWRIDYCLASNRIVDKVKRSEMISSGERQDHTPILLDIDL >LS483522|1461884:1467919|1463441_1464071_+|SRX91460.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQVSRVELCDNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKKISVATMIRPRGGDFVYNDLELKAMEEDILKAVEAGSDALVLGLLTTENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDHIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKSLVTYANKRIEIMIGGGVTAENCQSLSQLTGTAIVHGTKII >LS483522|1461884:1467919|1462785_1463142_-|SRX91459.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMAELKQLVSDFEAIDIKANPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRELGLKDKIDQLSLDKAAELLATDGMLIKRPILIKDGKVLQVGYRKPYQELDLG |
8 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1728689 : 1749262
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483522|1728689:1749262|DBSCAN-SWA ATTACACCTTTTTCATTTTTGCAGAAACAACCGTAAAATAAATCCCTAGCAAAGCAATGACTACAAATAAGCATTGCACGCCTAAAGGACCTGTAAAATGGCTGACAGATACTAGGAGACTAGCCAAAATAGCACCTAGGGGTTGTGCCATTGACACAAAACCTGTATAAGATCCTATTTGGGAATGATCCATCATATCAGCACGTAGGACTTGACTAGCAGGAACATTTATCATTTCCCCAAAAGTTAACAAAACAACTGATAACCAGATAGCATAGAACTGCGTAAAGGTAAATGCCAAGAGCATCCCTAGAGTAAATAGTAAAGAACCAACCACAAGCTGAGGTAATAGTTTCCATTTTTCCGTTAATTTATTTACTACTGTCATGAAAAGGACAATCAGCAATGTATTAGTTAAAACCATTAATGATAACATTTTAGAACTAGTTACTTGGAAACCTAACACAGCCGTTGGCTGAAAATACAGTTTCAAATGGACTGGCACATAGTTATCCATCTGCATCCAGATACTACCAGAAAAGATGGCACCTAAGGTAAACAAGACAAAGGCACGATCATGAAACACCTGACGATAATTTCGAAAACTATCCAGCAAGCCTTTTCCATGATCAAAAGCATGTGTCTCTGGTCTAGTCTCATCAAAATAGTAGTAAGCAACGCCAAAACAAAGTACATTGACGAGTAATAAGGCTACTAACAAGGCTAAAAAATGATGATCATAAAAAAGCCCAGATAGCCCTGCACCAAACATGACGGCAATATTGATAAACCAATAATTGATGGTGTAAACAAATCGACGATTACTCTCATCAGTCAAATCAATCAACATAGCTTCATAGGCAGGACCATAAAAACTAGAAGCAATCTCTACCAATAAAATACCCGCAAAGGTTAACCAAGGAATAGCCGCATTAGGCAAATTAGCTAAAATAGTCAAAAACCAGCCTAGCGTTGTTCCTACTGACCCAATCATAATGACTTTTTTGCGACCAAGAGCATCTGACAAATGCCCACCGTATAAAGTTCCAACAAATCCCATCAAACTGGTAATCATCATTAAGAGGCCTGTCCAAAACGTACCAAAGTAAGTCGTATAATACATGGCCATAAAGGGAAAGATACTACTGCCTAAGGTAATGGTCACAAAGCGTACCAGTTGCCTCAGCTGAATCTGCTTAGGAAGGTTTAAAAACTCTTGCATCTCATCCTCTCTAATATTTTCCTAGCTCTCGCAGGCTAGTGTGATTTTCTTGAATTCGACGGAACATTTTTTCCATATCTGCCTTACTAAAATTAATCAATACGGGTCTACCATGAGGGCAGTTATAAGGATTTTGACATTGGGCCAATTGCAGTAGCAGATTTCTTGCTGAATAATCATCCAAGCTATGATTTGCCTTGATAGATCGTTTACAACTCATCATAATAGCTAACTCTGCTCGGTAAGTTTTAATAGATACCTCATTGGTTAGAAGTAACATGTCACACATTTCATAGACACCAGATGCAATCTCTTCTTCTTTCATCCAGATAGGATGCTCCCTCAAAATGAAAGTATTGTGCCCATAAACTTCTAAGAAGATACCAACTTCATTTAAGAGTGCCATTTTCTCCTGTAAGTTAATGAAATCAGAACCAGAAAACTCAAACAAATAGGGCACCAACAATTGCTGTAAACTACTGTCAACCTCACCAATCTTATCACGATAATATTCGTATTTAACCCGCTCCTGGGCAGCGTGTTGGTCAATTATAAATAAACCATCTTTTCCCTGAGCAAAGAGATAAGTTCCGTGCATCTGACCAAAATAATCCAATTCGGGAAACACTGATTGCTCTTCATTTTCCAAACGGGTTAGCATTTGAGATAACTTTTGTCTGTTTTTTAAGTCAAGATTAGGATGATCAGTCTCGGTAAAGGTATTCTGGGGACGACTTGCGTGTTTAACCGAAGAAGGTCCTATAACTTCTTCTGAGTGGGGTAACAGCTCTGCTTTTTCAACCTTTACACTGTTGTCAACAGTGCCGAAATAAAAATCAGTTTCAGGTATTTTTTCCGAGACAGCCGACTCTTTGACAAAAAAGTCATTCTTTTGAGGATCATAATAAAGTCCCCTAGACTGTAAAGGAAGTTGTGTTTGCTCTGGTTTAGAGAAATGTCGTGTGCTTGATTTGGCTAAGTTTTCCAGAGCATCTGGAATCAAATCTTGTTCCTTAAGACTTTCAGAAATCGCCGTACTAATTAAAGCCATCAACTCACGCTCTTTTGAAATACGAACCTCTTGTTTTGTGGGATGAACATTGACATCGGCCAAATAGGGATCAATCTGAATATCAATCACAACAATTGGGAAACGTCCAACCATGAGCTTAGAACCGTAACCATCAAGAATTGCTCGATTAAGCAAGAAATTCTTGATATAACGCCCATTAACCAAAATCGTCATGTAATTACGGTTGGCGCGTGTCAACTCTGGCAAGCTAACATAGCCGGAAACTTCAAAATCCAAATCAGCATTAGAGATAGCCAGCATTTTTTTGGTAGTATTCAAACCATAAATCCCTGCAATTGCTTGGCGTAAATCGCCAGTTCCTGATGTCTGAGTTAATTGGCGACCATCACTAATCAGTGTGAAAGCAACTTCTGGATGTGCCAAACTCAACCGGTTGACCACATCTACAATGTGAGCTAATTCTGCCTGTAAACTTTTCATGTATTTGAGACGAGCAGGCGTGTTGTAAAAAAGGTTTTCAACCTTAATTTTGGTTCCAGTAGGAGTTGAGATCGCTTCAAGTGTCTCAATTTCCCCACCAGTAGCTATAAGAAGAGAACCGTGAGTGACTTCTTTTGTTGCTGTTTTTATCGTGATTTTACTGATAGAGGCAACAGACGGTAAAGCCTCTCCACGGAAGCCAAGTGTTCTAATTCTAAACAAATCACTCTGACTCTTAATTTTACTAGTAGCGTGGCGACGCAGACTTAAAGGTAAATCTTCATGAGACATTCCCTCACCGTTGTCTGTAACCTGTATCATCTTAAGGCCAGACTCTTCAATTTCAACGGTAATCTGGCTACTTTTAGCATCAATAGCATTCTCAACCAATTCCTTGACAACACTCGCTGGCCTTTCTACAACTTCACCAGCTGCAATTTGGTTGGCGAGAACTTCCGGTAATTCAATAATGTTTGTCATAATTTTGTTTTTAACACTTTCTAAACGTTGATATAACAAGGTTTCATTAGGTTTACACCTCTCAAAATATTAATTTGTGGACTTTTTTGTGGACTTATAAATTATTCATAGCCTTTTCATAATATAAAACAGCTTCTTTTTCTTTGTCCTTAGAAAGATGGCCATAGGTATCCAAAGTCATGCTGATATTCGCATGTCCTAGACGGTACTGAAGTTCCTTATAACTAATACCAGCGTTCAGCAATAAACTAGCGTGAGTGTGTCTAAAAGCGTGAAAGGTAAAGCGTTCAATCCCTGCTTCCTTACACCTAGTATCTAAAGCGCTTTGTCTAACCGAAGCATTAAAATACTTTCGTGTTGGTGTGGCAAACACTACCTCCGACACACGCGCACCAACCTCATTAAATAATTGTCGCTGTCTCATTTGATAGAGCTTTAGGCTTCTAAGGGTCTTTTTATCAACACTAATCACTCTATTGCCTGACTGGGTTTTAGCTGTACTCAAAAACTTCAAATTTTTATTGTAAGTCTTATTAATGGCTATTGTACCATTTTCTAGGTCAATATCTCCCCACTCTAATGCACAGGCTTCGCCTATCCTCAAGCCAGTGGATAATAAAAGTTGGTAGAGAACTGCATCAAAGTAAAGGTTATAGCGTTTGTGTTGACTAGTTTCTAAATGTTCTAAAAAAGATTTCAAATCAGACGGATCAATAAACTTAACTTTTTTCTTAGCGTTTGGCTGCTTCCTTGGAAGGATAATATCTCTTGCTGAGTTATAATCTATTAACCCTAGCAATACTCCTTGTTGGAGAACTTTTCGGATGACTGAACGTACCGCAGTATAATTGACATAATATTTAGATAATCTATTAATCAGCATTTGAATATCACTAGCGGTTATCTTATCAACCTTCATATTGCCCAGAGTTGGCATAATATGTCGATTAAGTCTAGTAACAGTAGCATCATAAGTTTGAGGCTTCACTGTTAACTTATAGGTTTCAAGCCATAAATGACTAAGTTCTTTAAATGTTTTAATCACAACTTTTCTTTTAATTGTAGATCCATTAGATAGGAAGTCAAGCTGCGCATGCTTGGCTTTTTGATTAACTTCTTTTCTTGTTCTTCCTGTGATGCTTGTTTTTACTCTCTTACCTGTCATTTGGTCAATGCCTAGATAAATACTAGCACGATAAACGATTGTACCGTTTTTCTTCTTATGTTCTGTTATTTTCATGATTATAAACCTTTCCATCAGCAGGCAAGCTATTATTAAAAGGGTTTTAGATTAGTTCATATCATGGTATAATATTAGTCTTTTTAAGACCTTGCGAGCGTGGAAAACTTGCGGGGTCTTTTTTGTTTGGTTTTGTAAGGTATAGAGAGTTTCAGAAGAAGTTTTGCATGTCTAAAAACTAGGTCAAGGTAGTCGTAGCCTTATGTCTGGAGGTGGTGCTTATGTATGTAAGTCACAGAAACCAAAAGAAAGGAGACGACAAGGTTTGTCAGTTTATGAAACGCTTACTTTGATGATTGCCTTTGGTACTCTGATAGTAGCTATCATGAATAACAAGAACAAATAGAAAAACCGTCCCACACTTTAGCCAATCGTGGACGGTTTATAGAAAATATAAACAAATACGGTAAGGCTGCCGTCTTAAACGGTGTTACCACAGGAGATTGTTTGCGCAATCTCCTTTTTCTATGTCCATTATAGCTTTGTTTGATAAAGAAGTCAAAGGGTATAGTTAGAAAGTATAGTCTTTAGCGCTCTTAACATTC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25 | Streptococcus_phage(52.94%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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