Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483391 | Streptococcus pyogenes strain NCTC8320 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DinG,csm6,cas3,DEDDh,csa3 | 0 | 0 | 8 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483391_2 | 997183-997284 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483391_2
|
1 spacers
spacers of LS483391_2
>2.1|997207|54|LS483391|CRISPRCasFinder CCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483391_2
The CRISPR arrays of LS483391_2 >merge|LS483391|2|997183-997284|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATACCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACATAAAATTGGTATAGTCTAATTATA >LS483391|2|2|997183-997284|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATA CCGATAAAAACATTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA TAAAATTGGTATAGTCTAATTATA
>LS483391.1|SQG43310.1|995317_997132_-|glucosamine-fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKALSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSRESTYTMLIHAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLATTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >LS483391.1|SQG43308.1|994786_995122_-|phosphonoacetate-hydrolase MSLPNCLQCQSEYVYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVLDSNGVRLSDGDTITVIKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >LS483391.1|SQG43307.1|994038_994680_-|histidine-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKVPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTAANRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >LS483391.1|SQG43305.1|993399_994029_-|histidine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKADAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >LS483391.1|SQG43303.1|992547_993384_-|polar-amino-acid-ABC-uptake-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKSLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGKCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKERQNKVAFTDSYMRNEQIIVVTKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVVTANIKS >LS483391.1|SQG43301.1|991405_992179_-|protein-B MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANLQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIEATVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDTGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKSFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQNALETALKS >LS483391.1|SQG43299.1|989800_991036_+|cation-diffusion-facilitator-transporter-family-protein MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLLLSAAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVAVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMILEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLVDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQHTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKRQLHHTHYRIVKM >LS483391.1|SQG43297.1|988358_989681_+|amino-acid-symporter MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGVYLTSRLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYAEGVLAIKYRTKDASGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFASSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQMVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLTVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNEPVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFVLMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >LS483391.1|SQG43295.1|985509_987828_-|DNA-helicase-II-/-ATP-dependent-DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALALNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLVKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANILGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTGYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEASEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPLGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >LS483391.1|SQG43293.1|984898_985147_-|transglycosylase-associated-family-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN >LS483391.1|SQG43312.1|997307_997865_-|signal-peptidase-I MVKRDFIRNILLLLIVIIGAILLRIFVFSTFKVSPETANTYLKSGDLVTIKKNIQPKYKDFVVYRVGKKDYVSRVIAVEGDSVTYMDDIFYLNNMVESQAYLEKMKAHYLNHAPFGTLYTDDFTVATITADKYQKVPKGKYLLLNDNRKNTNDSRRFGLINASQIKGLVTFRVLPLSDFGFVEVE >LS483391.1|SQG43314.1|998082_999585_-|pyruvate-kinase MNKRVKIVATLGPAVEIRGGKKYGEDGYWAGQLDVEESAKKIAELIEAGANVFRFNFSHGDHKEQGDRMATVRLAEEIARQKVGFLLDTKGPEMRTELFADDAKEFSYVTGEKIRVATTQGIQSTRDVIALNVAGSLDIYDEVEVGHTILIDDGKLGLKVIDKDIATRQFIVEVENDGIIAKQKGVNIPNTKIPFPALAERDNADIRFGLEQGLNFIAISFVRTAKDVEEVREICRETGNDHVQLFAKIENQQGIDNLDEIIEAADGIMIARGDMGIEVPFEMVPVFQKMIITKVNAAGKAVITATNMLETMTEKPRATRSEVSDVFNAVIDGTDATMLSGESANGKYPVESVRTMATIDRNAQTLLNEYGRLDSSAFPRTNKTDVIASAVKDATHSMDIKLVVTITETGNTARAISKFRPDADILAVTFDEKVQRALMINWGVIPVLAEKPASTDDMFEVAERVAVEAGLVQSGDNIVIVAGVPVGTGGTNTMRVRTVK >LS483391.1|SQG43317.1|999647_1000661_-|6-phosphofructokinase MKRIAVLTSGGDAPGMNAAIRAVVRKAISEGMEVYGINRGYAGMVDGDIFPLGSKEVGDKISRGGTFLYSARYPEFAQLEGQLAGIEQLKKHGIEGVVVIGGDGSYHGAMRLTEHGFPAVGIPGTIDNDIAGTDYTIGFDTAVNTAVEAIDKLRDTSSSHGRTFVVEVMGRNAGDIALWAGIASGADQIIVPEEEFDIEKVASTIQYDFEHKGKNHHIIVLAEGVMSGEAFAQKLKEAGDKSDLRVTNLGHILRGGSPTARDRVIASWMGSHAVELLKEGKGGLAVGIHNEELVESPILGTAEEGALFSLTEEGKIIVNNPHKARLDFAALNRSLSQ >LS483391.1|SQG43318.1|1000740_1003851_-|DNA-polymerase-III-subunit-alpha MFAQLDTKTVYSFMDSLIDLNHYFERAKQFGYHTIGIMDKDNLYGAYHFIKGCQKNGLQPVLGLEVEILYQERQVLLNLIAQNTQGYHQLLKISTAKMSGKLHMDYLCQHLEGIAVIIPSKGWSDTLVVPFDYYIGVDQYTDLSHMDSKRQLIPLRTVRYFAQDDMETLHMLHAIRDNLSLAETPVVESDQELADCQQLTTFYQTHCPQALQNLEDLVSGIYYDFDTNLKLPHFNRDKSAKQELQDLTEAGLKEKGLWKEPYQSRLLHELVIISDMGFDDYFLIVWDLLRFGRSKGYYMGMGRGSAAGSLVAYALDITGIDPVQHDLLFERFLNKERYSMPDIDIDLPDIYRSEFLRYVRNRYGSDHSAQIVTFSTFGPKQAIRDVFKRFGVPEYELTNLTKKIGFKDSLATVYEKSISFRQVINSRTEFQKAFAIAKRIEGNPRQTSIHAAGIVMSDDTLTNHIPLKSGDDMMITQYDAHAVEANGLLKMDFLGLRNLTFVQKMQEKVAKDYGCQIDIAAIDLEDPQTLALFAKGDTKGIFQFEQNGAINLLKRIKPQRFEEIVATTSLNRPGASDYTTNFIKRREGQEKIDLIDPVIAPILEPTYGIMLYQEQVMQIAQVYAGFTLGKADLLRRAMSKKNLQEMQKMEEDFIASAKHLGRAEETARGLFKRMEKFAGYGFNRSHAFAYSALAFQLAYFKAHYPAVFYDIMMNYSSSDYITDALESDFQVAQVTINSIPYTDKIEASKIYMGLKNIKGLPRDFAYWIIEQRPFNSVEDFLTRTPEKYQKKVFLEPLIKIGLFDYFEPNRKKILDNLDGLLVFVNELGSLFSDSSFSWVDTKDYSATEKYSLEQEIVGVGMSKHPLIDIAEKSTQTFTPISQLVKESEAVVLIQIDSIRIIRTKTSGQQMAFLSVNDTKKKLDVTLFPQEYAIYKDQLKEGEFYYLKGRIKERDHRLQMVCQQVQMAISQKYWLLVENHQFDSQISEILGAFPGTTPVVIHYQKNKETIALTKIQVHVTENLKEKLRPFVLKTVFR >LS483391.1|SQG43320.1|1004035_1004407_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSWKFDEKSPIYAQIAQHVMMQIISQEIKSGDQLPTVREYAEIAGVNPNTMQRAFTELEREGMVYSQRTAGRFVTDDQKLIARKRRELAISELESFITNMTKMGFSHTEIIPVLTSFLKEDSQ >LS483391.1|SQG43321.1|1004406_1005105_+|ABC-transporter-family-protein MAHLLQLHHVSKSYREKKAIDDLTITIPNGKIIGLLGPNGSGKTTLIKLINGLLQPNKGEIVIDGYRPCVETKKIISYLPDTTYLNENMRIKDMLEFFSDFYSDFDKSKATSLLRDLELDPEDRFKTLSKGNKEKVQLILVMSRKARLYVLDEPIGGVDPAARDYILKTIINSYCENASVIISTHLISDIEPILDEVIFLKQGRLFLSGNADDLRQEYQQSIDSLFRETYKV >LS483391.1|SQG43322.1|1005114_1005900_+|ABC-transporter-permease-protein MFGKLLKYEFRSIGKWYFALNAFVIAIAAILSFTIKLFAQSNSDGLFGVLTNKMLPLTLGLTFGSLIAGSLLSTLLIIIKRFSKSVFGREGYLTLTLPVNSHQIILSKLLASFICSVFNTIILAFAIAIVIVPMFNVNELLEGFFNSFKMDYFINMLTVLAYVLLSTFTSILLIYLSISIGQLFSNRRGLMAFIAYFILVILISVAATYVHNHIFNINTSADSFPFTEQKTTYLLILEQFIEMIMFYLATNFIIKNKLNLQ >LS483391.1|SQG43323.1|1006026_1006641_-|membrane-protein MTKRNSKAYILWQKIIKILGIIALIGTFFLAFWLYRLGILNDSNALKDLVQRYRLWGPFVFIVVQIIQIVFPVIPGGLTTVAGFLIFGPVTGFIYNYVGIIIGSIVLFLLVKTYGRKFILLFVNDKTFYKYERRLETPGYEKLFIFCMASPVSPADIMVMITGLTDMSLKRFVTILLITKPISIIGYSYLFIFGKDVISWFLQH >LS483391.1|SQG43324.1|1007199_1007421_-|phage-protein MLTYDEFKQAIDDGYIVGDTVMIVRKNGQIFDYVLPHEEARNGEVVTEEKVEEVMVELDYIIMKKTLSRQKNN >LS483391.1|SQG43325.1|1007535_1008324_-|exotoxin-M-precursor MRIFLHQNCRLVNMSTTFFIVVLSLMVFSVRMVSAEETINIKDIYSPRWDVDKTLSPTTLREIYNRDTIKKVNKPITGKRGTQVIMDAQHKTKVWEFDDYNFIISSNLHPSVEGKFNVGDNVDVFGLALSAEVFSKDQIHSINGGLVKVNERKGAGKTIYMNVFIDGHKKDDTSKYKITFEKSPVTFQEVDVRLRKSFMLNDEIKLYQYDSKVLSGNWEFHGSGEKEEGADLFKYPDYRYNNLIDIDKKSHIDVYLFTNKEN |
You can click texts colored in the table to view more detailed information
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
36584 : 48947
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483391|36584:48947|DBSCAN-SWA GATGTCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGATTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGCCTTGTGAAAGAGTTGACACATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGACTTGCGTATTGTGCAGGTTTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTACTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACCGTCTTTTGACGGAAGCTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTATTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCTGAGCTATACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAACCCTGTTGATTCACGTTTCAAGGACATTACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTATCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAAATTATAAAGCTGACGATTTTGCGGCCTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGACCTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGACGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAATTGAAGAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGACAACTTATGACAAATATATCGCCATGCGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAAACACTTATGGATATGGCGACTATTTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAACGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTGAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACACACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTCGGTGGAGCGGCGACTTGTATCGGTGGTGCTATTCGTGACCCATTGTCAGGACGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATCACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTGCCACAACAGGTTATTTCTAAGACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGACTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGCATGGAGCTTGGAGCTGTGGTCGGAGCGGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGTGATGTGGTAATCTTGCTTGGTGGTAAAACAGGGCGTGACGGTGTCGGCGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAGTCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATCGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTCTTCCGTGATGGTGAAGTGACTCGTCTCATCAAAAAATCAAACGACTTTGGTGCTGGTGGTGTCTGTGTTGCTATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTCCCACTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCAAGTGATGTGGATGCCTTCATCGCAGCTTGCAACAAGGAAAATATCGATGCCGTTGTAGTTGCGACAGTTACCGAGAAACCAAATCTTGTCATGACTTGGAATGGTGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTATTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCACGCTAGTCAAAAAGGTCTTCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGCTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGTTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGTATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTACTTTGAGCGTATGGATAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGTTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGGCTTGACAGTACCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGTGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGATTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGCGAAAACATTTACTATATCCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGATCTTATCAAGGCTAACTTTAGCCAGTTTGAGGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACAGCTGCCTCAGCCGCTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGTTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACGCGGTAAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGCGCTAGCCTTCTAGCAGCTTTCGAAGGCAAATTTGAAGAGGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCTGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAGTATGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGATTGCTATTGCTGAGTCAGTTGACACTATGGTTGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGCTTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACGAGAAGGTCCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATTGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCGAACCAACACGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATGCCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCACGCCATTCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGACACTCAGAACGCTGGGAAGACGGACTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAACCCTCTTTGCAAGTGCTGTAAAATACTTTACAGGGAAGTAAAAAGGTTCAGTGAACCTTTTTAGCCTTCGCCTTGAAGTAGTGAAGGGCGAGGTTAGAAAGAATCTCGCTTGATTTTTGAGAAATAGTAAACACGGGCGATAAGTTGTGCGAAAAACTTTCTATTTTCGCTTTACTTGACAGCCTTTGTATCGAGGTAAAAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGGCATCCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGAGCTGGTATTGTTTCAAATGACAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGGCTTCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCCTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTAATGCATTTGATTCGTCGAAGCCATAACTCAAATTTCATGGGAAAGGTAAAAGAAGCTCTAAATACAGTAAAGGGTGGCTTTGCCTATCTACTGATGACAGAAAATAAATTAATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTATTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGAATTAAGGGAACAAGGTGTTCGAATGAAACTATCAGCGGTATCTGGTGTTGTCAAAGGAAAGCGCGTTGTTATG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ATGGCATAGTAGGTACTAGACCATTAAAACCTAAAAGGATTACTCCTGAGACCAAAAAACGATGAAATTTTTTCATTAATTACCTCCTGTAACTTATTATTCGAAAGCAAGAAACAAAAAATGTTATTTTTAGATGATTATTTTGAAAATTGGCTTTACTTGATATTAAATAACTATTTGATTGGCTAATAGAGTGTTCCTTATTTCAAGAATTGTGGTCTACTATCACATTTTTACAATGTTTCAATTATTGATAATTAATACATTGTATCAAAAGGCGAACGTTTATGATATAATATCTAATTATAATACGAAAGAGGTGGGTGTTTTGAAATTACTTGTTGTTGGTTCAGGTGGTCGTGAACATGCGATTGCTAAGAAGTTGTTAGCGTCTAAGGGTGTGGATCAGGTTTTTGTGGCACCTGGTAATGATGGTATGACCTTGGATGGTCTGGACTTGGTGAATATAGTAGTTTCCGAACATTCCAGGTTGATTGCCTTTGCGAAGGAGAATGAGATTTCTTGGGCCTTTATTGGTCCTGATGATGCGCTAGCAGCTGGTATCGTTGATGATTTCAACAGTGCTGGACTCAGAGCTTTTGGTCCAACAAAGGCAGCAGCGGAGCTAGAGTGGTCAAAAGACTTTGCCAAGGAAATCATGGTCAAATACAATGTCCCAACAGCAGCCTATGGCACATTTTCAGACTTTGAAAAAGCCAAAGCCTACATCGAAGAGCAGGGCGCACCTATCGTGGTCAAGGCTGATGGCTTGGCGCTAGGTAAGGGTGTGGTCGTGGCTGAAACCGTTGAGCAGGCGGTAGAGGCGGCGCAAGAGATGCTTCTGGACAATAAGTTTGGCGACTCAGGAGCGCGTGTGGTTATCGAGGAATTCTTGGATGGCGAGGAGTTTTCCCTCTTTGCCTTTGTTAATGGTGATAAGTTCTACATCATGCCGACAGCTCAGGATCACAAGCGTGCCTTTGACGGAGACAAGGGGCCAAACACTGGTGGTATGGGTGCCTATGCGCCAGTTCCTCATCTACCTCAGAGCGTGGTAGACACAGCGGTTGAGACGATCGTTAGGCCTGTCCTTGAGGGCATGGTTGCCGAAGGGCGTCCTTATCTAGGTGTCCTTTATGTGGGGCTTATCCTGACAGCTGATGGACCTAAGGTTATCGAGTTCAACTCACGTTTCGGTGACCCTGAAACTCAGATTATCCTCCCTCGTCTGACTTCCGATTTCGCTCAGAATATTGACGATATCATGATGGGCATTGAGCCTTACATCACTTGGCAGAATGACGGTGTGACTTTGGGTGTTGTCGTTGCCTCAGAAGGCTATCCACTCGATTATGAGAAAGGTGTGCCACTGCCTGAAAAGACCGACGGCGATATCATCACCTACTATGCCGGAGCTAAGTTTGCAGAAAATAGCAAAGCGCTACTCTCAAACGGAGGACGCGTCTATATGCTTGTCACCACAGAAGACAGCGTCAAAGCAGGGCAGGACAAAATCTATACCCAACTGGCCCAACAAGACACAACAGGTCTCTTCTACCGAAATGACATCGGAAGCAAAGCTATAAGAGAATAAGACTAACCATTCAAATATTAGCGTCAGCAATCAGCGACCGAAGGTCGCTCCAAAAAGAAAGAAGAAAGGAACTGAACACGGGACTAATTTCCTAGGAAAAAAGATAAAACTACCTGGACGTAAGCGTCATCGTTAGTTTTCTGCGTCGTAGGCGTCTGATGCTAAAGCACCTAGTCGCCCTGACGTGGGTTCATCTTCGAAATCAAAGATTTCGGACTTACCGCATATTTTTCTACGGAAAGTTTCGACAAGTCGAAACGCCCCTTTATATCTTAATTATGAAAACTCCAATTATTTCTATTATCATGGGCTCCAAATCTGACTGGGCAACCATGCAAAAAACGGCTGAAGTTCTAGACAACTTTGGCATTGCTTACGAGAAGAAAGTCGTCTCTGCTCACCGCACGCCCGACCTCATGTTCAAGCATGCTGAGGAAGCACGTGGTCGTGGCATCAAAATCATCATCGCAGGAGCAGGTGGAGCAGCTCACTTGCCTGGTATGGTAGCAGCTAAAACAACGCTGCCTGTTATCGGTGTGCCTGTCAAATCACGTGCCCTTTTAGGTTTGGATTCACTCTATTCGATTGTGCAGATGCCTGGCGGTGTGCCTGTGGCAACCATGGCTATCGGAGAAGCGGGAGCGACTAACGCTGCCCTGACGGCCCTCCGTATTCTCTCCATCGAGGATCAAAATCTGGCTGATGCGCTAGCTCATTTCCATGAGGAACAAGGAAAAATCGCAGAGGAGTCAAGTGGTGAACTCATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483391|36584:48947|46911_48177_+|SQG41866.1|DBSCAN-SWA MKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFVNGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVETIVRPVLEGMVAEGRPYLGVLYVGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQNDGVTLGVVVASEGYPLDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGAKFAENSKALLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDTTGLFYRNDIGSKAIRE >LS483391|36584:48947|43928_45476_+|SQG41864.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIIDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDNAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDVDSHLQAAKDNNIELIDLVVINLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKDRPTVIALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEVAAAGVKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >LS483391|36584:48947|40518_41973_+|SQG41861.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSNFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTENKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGIQCDRYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >LS483391|36584:48947|42000_43023_+|SQG41862.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGVLGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYVATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGEDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVNGIGHITGGGFIENIPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADDSVVIK >LS483391|36584:48947|36584_40358_+|SQG41860.1|DBSCAN-SWA MSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDRLLTEAEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAELYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKAEQGLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGEVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPSDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVIDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTVSVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEGLTVPPTLVAFGVTTADSRKILSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKFEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEIAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANANSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK >LS483391|36584:48947|45534_46659_-|SQG41865.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGNQILRVGEYFTVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL >LS483391|36584:48947|48335_48947_+|SQG41867.1|DBSCAN-SWA MLKHLVALTWVHLRNQRFRTYRIFFYGKFRQVETPLYILIMKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKHAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVIGVPVKSRALLGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >LS483391|36584:48947|43190_43745_+|SQG41863.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
329359 : 335393
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483391|329359:335393|DBSCAN-SWA GATGATCACAGGAAAACTCATAACCGTTGAAGGTCCAGATGGTGCAGGGAAAACGACTGTTTTAGAGCAACTCATTCCACCGTTAAAACAAAAAGTGGCTCAGGAGATCTTGACAACAAGAGAGCCTGGAGGTGTTGCCATTTCAGAATACATTAGAGAACTTATTTTAGACATCAACCATACTACTATGGACCCTAAAACAGAACTCTTACTTTATATTGCGGCTCGAAGGCAGCATTTGGTAGAAAAGGTACTACCAGCTCTTGAAGCAGGCCAGTTGGTTTTTATTGATCGTTTCATCGATAGTTCAGTAGCTTATCAAGGTGCGGGACGCGGTTTGATCAAAGCAGACATTCAGTGGCTCAACGAGTTCGCAACAGATGGTTTAGAGCCTGACTTGACCCTTTATTTTGATGTTCCTTCTGAAATTGGTTTAGCACGGATTAACGCGAACCAACAAAGAGAAGTCAATCGTTTAGATTTGGAAACAATAGAGATACATCAACGAGTACGAAAAGGATACCTAGCCTTAGCTAAGGAGCATCCAAAACGTATTGTCACAATTGATGCGACTAAACCATTGAAAGAAGTTGTCTCTGTCGCTTTGGAACATGTCTTAGCCTTGCTTTTAGCCTAGGATAAGGGAGGGTAGGAATGGATTTAGCGCAAAAAGCTCCTAACGTTTATCAAGCTTTTCAGACGATTTTAAAGAAAGACCGTCTGAATCATGCTTATCTTTTTTCGGGTGATTTTGCTAATGAAGAAATGGCTCTTTTTTTAGCTAAGGTCATCTTTTGTGAACAGAAAAAGGATCAGACGCCCTGCGGGCATTGTCGCTCTTGTCAATTGATTGAACAAGGAGATTTTGCCGATGTGACGGTATTGGAACCAACAGGGCAAGTGATTAAAACGGATGTGGTCAAAGAAATGATGGCTAACTTTTCTCAGACAGGATATGAAGGAAAACGACAAGTTTTTATTATCAAAGATTGTGAAAAAATGCATGTAAATGCCGCTAATAGCTTGCTAAAATACATTGAGGAGCCTCAGGGAGAAGCTTACATGTTTTTGCTGACCAATGATGATAACAAAGTGCTTCCGACCATTAAAAGTCGGACACAGGTTTTTCAGTTTCCTAAAAACGAAGCCTATCTCTTCCAGTTAGCCCAAGAGCGAGGTTTATTAAGAAGTCAAGCTGATTTAGTGGCCAAACTGGCTAAAAATGTTGACCAATTAGAAGATTTGGCACAAAATAGTCATTTTTTAGAAGTGATGGCTCAGACTGAACGTTTTGTTTCAATCTGGTTAAAAGATCAGCTGCAAGCTTATTTAGCGTTGAATCGTCTGGTACAGTTAGCAACTGAAAAAGAAGAACAAGATTTAGTTTTGACCCTTTTGACCTTGCTCTTGGCAAGAGAGCGTGCGCAAACGCCTTTGACACAATTGGAGGCTGTTTATCAGGCTAGGCTCATGTGGCAGAGCAATGTCAATTTTCAAAACACATTAGAATATATGGTGATGTCAGAATAAGTGCAATTGGAATTCGTTATGGGGAAACGAAGCTTGTCAAAAGACTTGCCCGTAGCGACCAAAGTAGCGGCGCATAGGGGCAAAAAAGCTTTTGAAGAAAATACTGCCCTTGCAACAGATTTGATGAAAGAAGTATCACGATTAATGATACAAAATCAACTTGAAATGACGTTTATTAATAGTGTCTTTCCCTTAGATCAGCATGTTGTCCTAATTCCCTTTTCAGCAGAAGAGCACATGGATTTTTACAACTGTTAAAAGATTTAGCGGCCGATTTTAGGTCAAGAAGTGAGCTGCCCCAGATTAACAGCCAAGAAGAAACCAAGATTTATGGGCGCTTAGGACCGTGTGGCAGGCCACTGTGCTGCTTTCGTTTTTGGGAAAATTTCTGACAGTATCTATTAAAATACTAAAAAATCAAAGGTTATCATTGACTTTGGGTAAAGCAACAAGCCCTTATGGCCGTTTGCTTTGCTGTCTCTATGATGAAGGTGGCTTTTACCAATAAAGCAAGAAAAAATTCCCTGAATATGGTACCATAGTAGAGACAAGTGATGGCCCTGCAACAGTAGCAGCCGTTGATATATTTACAGATCCCATTAAGGTGCGGTTAAAAGACCAGTTGACCTTAGTCACTTATGCTTTAGAGGAGGTTAAAGTAGGTGAATAAAAAAGAATTATTCGATGCTTTTGATGGATTTTCCCAAAATTTAATGGTTACTTTAGCTGAAATTGAAGCCATGAAAAAACAAGTCCAATCACTAGTAGAAGAAAACACGATTCTTCGCCTAGAAAATACAAAACTACGGGAACGTTTGAGTCACCTAGAACATGAAACGGTAGCTAAAAATCCTTTCAAACAAAGGAAGGATCACTTAGAGGGAATTTATGATGAAGGGTTTCATATCTGCAATTTTTTCTATGGACAACGTCGTGAAAATGATGAAGAATGTATGTTTTGCAGAGAATTATTAGATAGAAAGTAAGGGCATGCAGGTTCAAAAAAGTTTTAAAGACAAAAAAACAAGCGGAACCTTGTATTTGGTTCCAACCCCAATTGGCAATCTGCAGGACATGACCTTTAGAGCAGTGGCAACGTTAAAAGAAGTTGATTTTATTTGTGCAGAAGACACAAGAAACACAGGTCTTTTGCTAAAACACTTTGACATTGCTACCAAGCAAATCAGCTTTCATGAGCACAACGCCTATGAGAAGATTCCTGATTTAATTGATTTATTAATATCAGGACGGTCACTAGCTCAGGTGTCTGATGCAGGAATGCCATCGATTTCTGATCCTGGGCATGATTTGGTCAAGGCTGCTATTGATAGTGATATCGCAGTCGTTGCTTTACCAGGTGCCTCAGCAGGGATTACAGCTTTGATTGCTAGTGGACTGGCTCCTCAACCCCATGTTTTTTATGGGTTTTTATCCAGAAAAGCAGGACAACAAAAGGCTTTCTTTGAGGACAAACACCATTACCCAGAGACACAAATGTTTTATGAATCGCCCTATCGCATCAAAGATACCCTGACCAATATGTTGGCTTGTTATGGTGATCGTCAAGTGGTGCTTGTCAGAGAATTAACCAAGCTTTTTGAGGAGTACCAACGGGGGTCGATTTCAGAAATCTTGTCCTACCTTGAGGAAACATCCCTAAAAGGGGAGTGTCTGCTGATTGTGGCTGGAGCCCAAGTAGACAGTGAGGTTGAGCTGACAGCTGATGTTGACTTAGTGTCTCTAGTGCAAAAAGAAATCCAAGCAGGAGCCAAGCCAAATCAGGCTATTAAAACAATTGCTAAAGCTTACCAGGTAAATCGCCAAGAGCTTTACCAACAATTTCATGACTTATAAGTCATCGTAGATTAGGAGAAAAACAAATGACAGAAGATCAAGCAACTATCCTTATTTTAGGAGTATACGGAATCATATTGGCTGTATTCTTATTATCAGCTTTATTATGCCTTATCGCTAACTGGCGACTCTTTAAAAGAGCAGGTTACAAAGGATGGCATAGTCTCATTCCTTTCTATGCAGGTTTTGTCAAACACAAAATCACTTTTGGAGAAGATAATAAATGGTTTTACTTTATTGGTTGGGTCATTGCTATTTATTATTACTATGTGCACTTTTGCTATGTCCGTGCTTTTGGTGGATCAAAGGGTCTAGCAGTATTTGGCTTGTTTTTCCCAGGCATTGCTTCTTTGATAGTGGCTTTTGGAAAAACTTATACCACACAAGAATGCCACCCTGTGCCACATCTTTTAAACTAAGAGAGAAAAGACCATCAATTGGATTTATTGATGGTCTTTTAGGTGTTTAAATGATTTTAGTCCCGTGAACAATGGCCGTTCCAGTGAGTTGACTCAAGTTTTGGCAATTCTCAGCAGTGACGCCTCCTCCAATCATGATTTCAATGCGTTTATTGGCATAGGTCACAAGACTTTTAAGCTGTTCCACATTATCTGTAATAGGAGTAGCTTCAGGGGAGCCATGAGTTAGCACACGCACAAAGCCATAATCAATCAGTTGATCAAGCGCTTGGTGCTGGTGGTCAGTCGGAATATGGTCAAAAGCCATGTGGAAAACCAGTGGCAAGCCTTGTGTAGCAGGCAGTAATTGCTCGATAGCGTCGGTATCCAGTTGATTTTCTGTGGTCAGCAAGCCTAAGACTAGCGCATCTGAGCCAGCTTCAACAGCTTTTAAGATATCTTCTTCCATAGCTTTTAGTTCGAGGTCGTTATAGACAAAATCGCCACCGCGAGGTCGAATCATGGTCGCTACGCTAATCTTTTTATCGTGTAAGAGCTGACAGGCTTCTTTGATGACGCCATAAGATGGTGTTGTTCCCCCGACAGCTAGGTTATCACAGAGTTCCACACGACTGACTTGACCAGCATCAAGGGTTGGCAGTAGTGTGAGGTTCTCAGCACAAAATTCTTTAATCATTTTTAGATCTCCTTTATCACTAATATTATAGCACGAATGAAGCTAGTCATCAGGAAACATTTTTGTCAAATCATGGACATTATGTTATACTCACTAGTATTAAAAGTAGGCCAAAACAGCAGCAAATACTTTGAAAAAAGATTGCTATGTTCTACGGCAATATCAGTCTTTACCAACGAACTCTCAAGAAGAAAAGAAAGACAAAGCTTAGCATTTTAAAAAAGCCCCCCTTTTTTTGTGAAATGATGACCAAAAACAGGCGCCTCACGCCTAAAACAGTTACCCTAAAGGAGAACAAATGATTACGATTTACCAATACCCAAAATGTAGTACCTGTCAAAGAGCCATGGCTGAACTAAAGCAACTGGTTAGTGACTTTGAAGTCATTGACATCAAAGCTAATCCACCCAAAGCTCAGGACCTCAAACATTGGATGGAAACATCTGGTTATACCATCAAAAATTTCTTTAATACCAGTGGTAACAGCTACCGCGAATTGGGACTTAAAGATAAAATAGACCAGCTTAGCCTTGATAAAGCTGCTGAACTCTTAGCCACAGATGGTATGCTGATTAAACGGCCTATTCTGATTAAGGACGGTAGAGTCCTACAAGTTGGCTATCGCAAGCCATATCAAGAGTTGGATTTAGGATAATGCGACAAAGTCTCAAAAAAGGACAAGGCAACATTATAACGCCTTGTCCTTTTTTGGGATCTGTTTTTAGAAATTAGAGATCAATATCTAGTAAAATTGGCGTATGGTCTTGGCGTTCCCCAGAAGAAATCATTTCAGAACGCTTAACCTTATCCACAAGTCGGTTTGAAGCTAGCCAATAGTCAATTCTCCAACCGGTATTATTGATTTTGCTGGTTTTGCTACGTTGTGCCCACCAGGTATAAACATGAGGAATATCGCCGTGCAAGTGACGAAAAGTATCTGTAAAGCCTCTTGCTAATAGGTTAGTAAAGCTTTGACGTTCTTCGTCGGTAAAACCAGGGGAACGTCGATTGCTGCTTGGATTTGCCAAATCAATCTCTTTGTGGGCAACGTTGTAATCTCCCGCAGCCAAAACAGGCTTTTGAGCATCCAGTTCAGTCAAGTAATCAGCGTATTTGTGGTCCCAAATTTGACGGTCATCTAAACGTCTAAGGCCATCACCAGCATTAGGCGTGTAAACCTGTGTGACGAAAAAGTCTTCAAATTCTAGGGTAATGATACGGCCCTCAGCATCCATTGTTGTTGGGGCACCAATTTCTGGAAAAGTAATGACAGGGTTTAGCGTGTTTTTGTACAGGAACATGGTGCCAGCATAGCCTTTCCTAGCAGGCTCAACTGAAGAACGCCACACATGCAAATAGTTTGGAAAGTAACTAAGTAAGGCCTCGATATGTTTTTTGGTAGGCCCCTTAGCAGATAATTTGGTTTCTTGAATGGCAATAATATCCGCATCTTGAGCGACTAAAGTGTCTAAAACAGCGCGTGATAAAAGCGCACGAGGGGACTCTCCTGTGAGAGCAGCATTTAAGGAATCAATGTTCCATGAAATCAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483391|329359:335393|333207_333837_-|SQG42146.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQVSRVELCDNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKKISVATMIRPRGGDFVYNDLELKAMEEDILKAVEAGSDALVLGLLTTENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDHIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKSLVTYANKRIEIMIGGGVTAENCQNLSQLTGTAIVHGTKII >LS483391|329359:335393|334135_334492_+|SQG42147.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMAELKQLVSDFEVIDIKANPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRELGLKDKIDQLSLDKAAELLATDGMLIKRPILIKDGRVLQVGYRKPYQELDLG >LS483391|329359:335393|330906_331146_+|SQG42142.1|DBSCAN-SWA MGKRSLSKDLPVATKVAAHRGKKAFEENTALATDLMKEVSRLMIQNQLEMTFINSVFPLDQHVVLIPFSAEEHMDFYNC >LS483391|329359:335393|331878_332742_+|SQG42144.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKHFDIATKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLISGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDSDIAVVALPGASAGITALIASGLAPQPHVFYGFLSRKAGQQKAFFEDKHHYPETQMFYESPYRIKDTLTNMLACYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGSISEILSYLEETSLKGECLLIVAGAQVDSEVELTADVDLVSLVQKEIQAGAKPNQAIKTIAKAYQVNRQELYQQFHDL >LS483391|329359:335393|329359_329995_+|SQG42140.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQLIPPLKQKVAQEILTTREPGGVAISEYIRELILDINHTTMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGQLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLIKADIQWLNEFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARINANQQREVNRLDLETIEIHQRVRKGYLALAKEHPKRIVTIDATKPLKEVVSVALEHVLALLLA >LS483391|329359:335393|330012_330888_+|SQG42141.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPNVYQAFQTILKKDRLNHAYLFSGDFANEEMALFLAKVIFCEQKKDQTPCGHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYEGKRQVFIIKDCEKMHVNAANSLLKYIEEPQGEAYMFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLFQLAQERGLLRSQADLVAKLAKNVDQLEDLAQNSHFLEVMAQTERFVSIWLKDQLQAYLALNRLVQLATEKEEQDLVLTLLTLLLARERAQTPLTQLEAVYQARLMWQSNVNFQNTLEYMVMSE >LS483391|329359:335393|334565_335393_-|SQG42148.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTGESPRALLSRAVLDTLVAQDADIIAIQETKLSAKGPTKKHIEALLSYFPNYLHVWRSSVEPARKGYAGTMFLYKNTLNPVITFPEIGAPTTMDAEGRIITLEFEDFFVTQVYTPNAGDGLRRLDDRQIWDHKYADYLTELDAQKPVLAAGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSPGFTDEERQSFTNLLARGFTDTFRHLHGDIPHVYTWWAQRSKTSKINNTGWRIDYWLASNRLVDKVKRSEMISSGERQDHTPILLDIDL >LS483391|329359:335393|332768_333161_+|SQG42145.1|DBSCAN-SWA MTEDQATILILGVYGIILAVFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWHSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIASLIVAFGKTYTTQECHPVPHLLN >LS483391|329359:335393|331550_331874_+|SQG42143.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSHLEHETVAKNPFKQRKDHLEGIYDEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK |
9 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
343737 : 386951
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483391|343737:386951|DBSCAN-SWA GATGAAAAAACCATTTTACATTACGACACCCATTTATTACCCATCTGGGAAATTACACATTGGTTCTGCCTATACTACCATTGCCTGTGATGTTTTGGCACGCTACAAGCGCCTGATGGGCCATGAGGTCTTTTACCTCACAGGACTAGATGAACATGGACAAAAGATTCAAACCAAGGCAAAAGAAGCAGGCATTAGCCCTCAAACCTATGTTGATAACATGGCAAAGGATGTCAAAGCCCTTTGGCAATTGCTAGATATTTCCTATGACACATTTATCCGGACAACGGACGATTACCACGAAGAGGTCGTTGCTGCTGTCTTTGAAAAATTGCTGGCGCAAGATGACATTTACCTTGGCGAATACTCTGGTTGGTATTCTGTCTCTGATGAGGAATTTTTCACTGAAAGCCAATTAAAAGAAGTCTTTAGAGATGAAGACGGTCAGGTTATTGGAGGGATTGCCCCATCAGGTCATGAGGTCGAGTGGGTCTCTGAAGAATCCTATTTCCTACGCCTTAGCAAATACGCTGATCGTCTTGTGGCCTTCTTTAAAGAGCGACCTGACTTTATCCAACCAGACGGTCGTATGAATGAAATGGTGAAAAACTTTATCGAGCCAGGTCTAGAAGATTTGGCTGTTAGCCGTACTACCTTTACATGGGGTGTACCTGTTCCATCAGACCCAAAACACGTGGTTTATGTGTGGATTGATGCCCTCTTAAACTACGCGACAGCTCTTGGTTATGGTCAAGCTAATCACGCTAACTTTGATAAATTCTGGAATGGAACGGTTTTCCACATGGTTGGAAAAGATATCTTGCGTTTCCACAGTATCTACTGGCCGATCTTACTCATGATGCTTGATTTACCAATGCCAGACCGCTTAATTGCTCATGGTTGGTTTGTCATGAAAGACGGTAAAATGTCTAAATCAAAAGGCAATGTGGTCTATCCAGAAATGTTAGTGGAGCGCTTTGGACTGGATCCTCTTCGTTATTACCTCATGCGTTCTTTGCCAGTGGGTTCAGACGGGACCTTTACCCCTGAAGATTATGTGGGTCGTATCAACTATGAGTTAGCCAACGACCTTGGCAATTTATTGAACCGTACCGTTGCCATGATCAATAAGTATTTTGACGGCACGGTGCCAGCTTATGTTGACAATGGAACTGCCTTTGATGCTGACTTAAGTCAACTGATTGATGCTCAGCTAGCAGACTACCATAAGCACATGGAAGCTGTAGACTACCCACGCGCCTTGGAGGCTGTTTGGACCATCATCGCTCGTACCAACAAATACATCGATGAAACCGCTCCTTGGGTGCTCGCTAAAGAAGATGGTGACAAAGCTCAACTAGCCAGTGTCATGGCACACTTGGCAGCTAGCTTGCGCGTGGTCGCTCATGTGATCCAACCCTTTATGATGGAAACATCAGCTGCTATCATGGCCCAGCTTGGCTTAGCGCCTGTTTCTGACTTGTCAACACTTGCTCTAGCAGATTTTCCTGCCAATACAAAGGTCGTTGCCAAAGGCACACCGATTTTCCCACGTCTTGACATGGAAGCTGAGATTGACTACATCAAAGCCCAAATGGGTGACAGCTCAGCTATTTCCCAAGAAAAAGAATGGGTCCCTGAAGAGGTTGCGCTCAAATCTGAAAAAGACGTCATCACATTTGAAACCTTTGATGCTGTGGAAATCCGTGTGGCAGAAGTCAAGGAAGTGTCAAAAGTGGAAGGTTCAGAAAAATTGCTGCGCTTTAGAGTAGATGCAGGAGACGGGCAAGACCGTCAAATCTTGTCAGGTATTGCCAAATTTTACCCCAACGAACAAGAATTAGTTGGCAAAAAACTACAAATTGTTGCTAACCTTAAACCTCGTAAAATGGTGAAAAAATACATCAGCCAAGGCATGATTTTATCAGCAGAGCATGGAGATCAGCTAACGGTCTTAACCGTTGATTCCTCTGTTCCAAATGGAAGTATCATTGGCTGATGCTGACCTATTATTCAAAAAACCTAAGCAAGAATATGTGCTTAGGTTTTTTTGATTGCCTTTAAGAAAGACGAATAACGAGATGGGTGATATGGCATCAAAAGCATAACTATCCTAGGACCTGTCCTAGTAAGATTGCTGTGCTTTTGACAAGTGAACAGAGAGGTCTTAAACTATATCTTGTCATAAAAAAGATTGCAAAACACTATATCTTGTGTTATTATGGTTTTTATAAAAGTTAAGCATGCTTAACTTTAGCCAAACAAAAGAGGACACTAGAACGTGTCCCACAAGACAGTTGAGCCCTTCGCTTTTTTAGTAGAGTAGGAGTGCTCAAGTCAAAAAGAGACATCCCATCAAACCATTGCTGTTTAGCAGGTCTTTTTGTGTTGCTCAAAAAGACAATTCCTGTCTGTTTGGCGTCTAGTGATGACTTAGGCTTAGCGCTACTAGACTTTTGTTTGAAAAATACCTCAAGCCTTGAAGGAGACAAATGACCCAACATTATTATGAACGTTCGCAATCCCCAATTGAATACGCCCTATCTGAAACACAAAAACAGTTGCGCTCCATCAATTGGAATTACCTTAATGATGACAAAGATTTGGAAGTGTGGAACCGTGTCACTCAAAATTTTTGGTTGCCTGAAAAGGTTCCTGTTTCTAATGATTTAAATTCTTGGCGCTCCTTGGGTGAGGATTGGCAACAGCTCATCACAAGGACCTACACTGGGTTGACTTTACTAGATACAGTACAAGCAACGGTTGGTGATGTGGCACAAATTCAGCATTCACAAACCGACCACGAACAAGTCATCTATACGAACTTTGCCTTTATGGTGGGGATCCATGCCCGCTCTTACGGGACGATTTTTTCGACCCTTTGCAGTAGCGAGCAAATCGAAGAAGCACATGAATGGGTGGTCTCAACACAGAGCTTGCAAGACCGTTCCCGTGTCTTGATTCCTTACTATACGGGTGATGACCCTTTGAAATCAAAAGTAGCAGCAGCTATGATGCCAGGATTTTTGCTGTATGGCGGCTTTTACCTTCCTTTTTACCTATCAGCACGTGGTAAAATGCCAAACACATCTGATATCATCCGCCTGATTTTACGCGACAAAGTTATTCACAACTATTACAGCGGTTACAAATACCAACAAAAAGTAGCACGTCTTAGCCCAGAAAAACAGGCTGAAATGAAGGCCTTTGTCTTTGACTTGCTCTATGAACTCATCGACCTTGAAAAAGCTTACTTGAGAGAACTGTATGCAGGCTTTGATTTGGCAGAAGATGCTATCCGCTTTAGCCTTTATAACGCTGGAAAATTCCTTCAAAATTTAGGCTATGATTCGCCCTTCACAGAAGAAGAGACCCGTATCTCACCTGAAGTATTTGCTCAGCTATCAGCGCGTGCAGACGAAAACCATGACTTTTTCTCAGGCAATGGCTCATCTTATGTGATGGGGATCACCGAAGAAACCACAGATGACGATTGGGAGTTTTAAGAAATGGCAGAGCTGATTATTGTGTATTTTTCATCTAAGTCCAATAACACCCATCGCTTCGTCCAAAAATTAGGCCTGCCTGCTCAGCGCATACCAGTAGATAATAGGCCACTTGAAGTTTCAACCCATTACCTTTTGATTGTGCCTACCTATGCAGCTGGTGGCTCAGATGCCAAAGGAGCCGTCCCTAAACAAGTGATTCGTTTTTTGAATAATCCTAACAATCGTAAACATTGTAAGGGAGTGATCTCTTCAGGAAATACCAATTTTGGCGATACCTTTGCCTTAGCAGGCCCTATCATTTCTCAAAAATTGCAGGTCCCCCTATTACACCAATTTGAACTATTAGGCACTGCTACAGATGTCAAAAAGGTACAGGCGATTTTTGCCCGCTTAAAGCATCACACACACGACAAGCAAAAACAAACCAACAACCTGATTACAGAAAGGACACACCCATGTCACAAACCAATGCGTCATACCTCTCATTAAATGCACTGACTCGTTTTAAAAAACCAGACGGCAGCTACCATTTTGATAGCGATAAAGAAGCTGTTAGGCGCTACCTGGAAGAACATGTCTCACCCGATCAAATGGCTTTTAACTCACTAGAAGATAAGCTAGCTTACCTCATCAATGAAGGGTATTATGAGCAGGCCATTTTTGATGCCTACCCTAACGACCTTATCAAGGAGGCTTTTCATTATGCCTATCAACAAGGCTATCGCTTTTTAAATCTCATGGGCGCTATGAAATTTTACCAGTCCTATGCCTTAAAAACCTTGGACGGTAAGCAGTATCTAGAAACATTTGAAGACCGTGCTGTGATGAATGCACTCTTTTTAGCTGATGGAGATCAAACCTTTGTCTTTGACGTGATTGATGCCATCTTGCACCGACGCTTTCAACCAGCTACCCCAACGTTTTTAAATGCCGGAAAAAAACGCCGTGGCGAATACATTTCGTGCTACCTTCTTCGTGTCGAAGACAATATGGAATCTATCTCTCGCGCCATTAGCACCAGCTTGCAACTCTCAAAAAGAGGAGGCGGAGTCGCCTTGTGCCTCACCAACCTCAGAGAAATTGGAGCACCGATAAAAGGGATTGAAAATCAGGCAACAGGCATTGTTCCTGTCATGAAACTACTAGAGGACTCTTTTTCCTATGCCAATCAACTAGGTCAGCGCCAAGGAGCAGGTGCGGTTTACCTTCATGCCCATCACCCCGAGGTCCTGACCTTTTTAGACACCAAACGTGAAAATGCCGATGAGAAAATTCGCATTAAGTCCCTAGCATTGGGACTTGTGATCCCAGATATTACCTTCCAGTTAGCCAAAGAAAACAAAGACATGGCACTCTTTTCACCCTATGATATCAAGCGTGCCTATGGCAAGGACATGTCAGACATCTCCATCACAGAGGAATACGATAAACTGCTAGCCAATCCAGCCATCAAAAAGACCTACATCAGTGCTAGAAAGTTCTTTCAGTTAA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50 | Bacillus_phage(23.08%) | protease,tRNA,transposase,bacteriocin,integrase | attL 333064:333078|attR 387917:387931 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
534185 : 603452
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483391|534185:603452|DBSCAN-SWA 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88 | Streptococcus_phage(58.06%) | tail,capsid,holin,protease,tRNA,terminase,transposase,portal,bacteriocin,integrase | attL 538855:538873|attR 579907:579925 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
663699 : 717011
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483391|663699:717011|DBSCAN-SWA ATTATTCTCTATTTTTGGTGTTATCCTCTTTTAGTTCAGAAGTTGCCGCGTCAGCTTCTACGGGATTTAGTTCTAAGTAAGATGGTGCTTTAAAAAGTTTCTGAGTTGATTTATGACCATTTTTACTGTATAAACTTGTTGACTCTGATCCGAGTTTTGCTGAAATATCTTTCAGTTGTTTTAACTGCTTAGTGTAGATAAACTGGTTAGGATCAATAGCTTTTAGACCATTTTGAGTATCAAAGCGCAGGAGATCACCCGTTTGAATAGCGTCGCTAGCTGCTAGTTGTTGAGCAACAGCAGAGCGAATTTCCTTAGTTTTGGCTATAGTCATTTCATCGGGATTAGTGATTTCTAAACCTGTTTGCGTGTTGTACAGACGTCCACTATAGTTAGTGTATTCAGGAGTCATATAAGTCCCAGATGTTCGTTGTGCCACAATCTGGCTATTTTGAGGTGATAATAAATCTTGTCCTAATTGAACAAACTGACTAGTGTCAATACCAAGTATGTGGAGTAAAGTAGGAAGAGCATCGATTTCACCGCCAAAGGTTTCTTTGATACTACCATTCGTATAACCTGGAATATGGATCATATACGGGACTCGTTGTAGCATAGCATTATCATATTCAGACCAAGTTTCAGAATCTTTACCAAGAAGTGGAGCAAGACTAGAATTACGAGAATTTGAAATACCATAATGGTCACCATATAAAACAAAAATAGAATTCTCGTACAAACCAGTGGCTTTCAAGTAATCAAAAAAAGATTTAAGGGCAGCGTCTAAATAATTGGCAGTAGCAAAGTAACCATTGATCGTTTCATCGTCTGTTTTGGCCAAAGGAAAACCTTCTTCACTACTTTCGCCTTTTAGACTAGTATAAGGATAGTGATTACTCACAGTGATAAACTTGGTATAAAAAGGTTGCTGCATCTGTTCAAGATATTTTATGGAATCTTTAAACATGTACTTATCATTTAACCCATATTGAAAAGAGTTCTTACTATTTTGTTTAGAGAAGTAGCTAGAATCAAAAAAATAATTATAGCCCCATTGTTTATAAGCATTATTGCGATTCCAGAAAGTTCCAACGTTACCATGAAAGACAGCGCTGGTATAGCCACCTTTTTGGGCTAAAATACTTGGAGTAGCAAATTGTGTATTTTCACCACCGTAGTTCACCATAAAAGAACCACTATTTAAACCAAATAAGGAATTCTCCATCATGGTTTCAGCATCAGAAGTTTTACCTGCTTTAACCTGATGAAAAAAGTTAGGGAATGCTAAGGTAGCATTTGAGTGATAAAGCGAGTTGATAAAAGGCGTTACCTCATATTCTTTATCTCCTTCTTTTAGTTTATAATCTATTAAGAATTGTTGAAAGCTTTCTAAATGAAGAACAATAATATTTTTGCCTTTTCCAATTCCAAAATACTGGGGATCAGGTGCTGCATAATGTCCTTTGACATAAGTTTTAACATCGATTAATTCTTCTGCAGTAGCTCCATTTCGTTCTTTTTGAGCTTGATAGGTTTGATTGCCGCTATAGAGGGTAAACGCTGGTAATCCTAAAGCTCTCACAATATAAGTATTTGAAAAGCCACGTGTTAATAGTTCAGGACGATCAATTTCTGCTAAAAAAAGATTAATAGAAAGCAATAGACTAGATAAAGCGGTGATGGCAGATGCTGCGCGCTTGTTAAAAGGACGTTGATCATTTTTGATTTTTTTAGTGATAGATAAACTAATTAGAATAATAAAATCAAGAATATAGATAATATCCCAGATGCGTAAAAGGTTTAAAGCAGAGTCCCCTAATCCAGCGGAGACTTTACTGCTAGCTAGCATGGCACTCACTGTAATAAAGTCTGAAAATTCTCGGTAATATATAGAATTTGATATCAAGAGAATGTTAAGGATAATATAAACCACCCAAGAACAGATATAAAAGGCTCGGGTATTCTTAACGTAAAGAGCGACCCCCAAAAGTAAAAAAGCTAGTGGGATTGGATTGATAATTGTTAGAAAGACTTGGTATATATTTCCCAAATCTAGTGAAAAGTCTGTATGATATGCCCACAGAGTCTTTATCCAGTAACAAAAGAGTAGAGTGATTATAAAACCCAATCTTGTGTTGATAAAACCTGTGATAAGTGTTTTAAATTTCTTCACAGTAGCAACTTCCTTATCGTTTTTTCCTAAAGATGTCATCTCCAAATAAAATCTCAGATTAAATTATACCAAAAATGTGAAGCTAATGCTTGTTGTAAGTTCAAATTTAGTAGGATTTTTTATCAGATTTTGTTATAATAAAAACTATGAATAAACTCTATATTGATTCTTTTGTCGAAAAGAAGCTGACAGCAGGGGTACAATTATTAGATGAAAAAGATTTTTCTAATATAAAGGAAAAAAATCAGTTGGTTCAACTGGTGACCAAGTCCAATCGTCCCATTGGAACAGCATATATCTCTAAGCAAAATAAAGGAATTGGTTGGTATCTAGGACCAGAAAAAATCGACTTGTCTATCTCTTATTTTGTTAGTCTATTTTCAGTTGCTAAAGCCAAAAGACAAGATTTTGCTCAATCGGACGAGACCAATGCTTATCGCCTTTTTAATCAAGAAGGAGACGGTTTTGGTGGAGTAACAATTGATCTTTATAAAGATTTTGCAGTCTTTTCATGGTACAATGCCTTTGTCTATGACAAAAAAGAAATGATTATGGAGGCTTTTCAACAGGTTTTTCCTGAAGTCAAAGGAGCTTATGAAAAGTGTCGCTTTAAAGGTCCAGATACTGAAACTGCTCATCTGTATGGTGAGCTGGCACAAGAAACCTTTTCGATTTTAGAAAATGGCATAGCCTATCAAGTCTTCTTGAATGAGGGCTTAATGACAGGTATTTTTCTAGACCAGCATGATGTTAGAAGAGCACTAGTAGATGGTTTAGCTATGGGCAAGTCCCTTCTTAACCTATTTTCCTATACAGCTGCCTTTTCTGTAGCAGCTGCTATGGGTGGTGCTATCGAGACCACTTCTGTGGACTTGGCTAAACGATCGAGAGAATTATCACTAGCTCATTTTGAGCATAACCAGTTAAACTTAGCCTCACATCATTTTGTGGTGATGGATGTTTTTGAATACTTCAAATATGCCAAACGGAAAAAATTAATCTTTGATGTGATTGTGATTGACCCACCAAGCTTTGCTAGAAATAAAAAACAAACTTTCTCTGTGAGCAGGGACTACCACAAATTAATCACAGAGGCCTTGGACATATTGAGTCCTAAGGGAACTATTATAGCTTCAACAAATGCTGCTAATATGACTGTTAGCCAGTTCAAAAAGCAAATTATCAAAGGATTTGGAAGTCGTCGTCCTGAGTCTATGACTCTCCAGCAGCTTCCGAGTGACTTTACTATCAATAAAGCAGATGAAAGAAGTAACTATTTAAAGGTATTTACTATAAAGGTACGAGAATGAGAATTGTAGCACCAGTCATGCCAAGACATTTTGACGAGGCTCAAGCCATTGATATTTCTAAATATGAAGATGTTAATTTAATTGAATGGCGAGCAGACTTTCTTCCCAAGGATGAGATTGTCGCAGTAGCACCAGCTATTTTTGAAAAATTTGCCGGAAAAGAAATTATCTTTACCCTTCGGACCGTTCAAGAAGGGGGGAATATTACCCTTTCAAGTCAGGAGTATGTTGATATTATCAAAGAAATCAATGCTATTTATAATCCAGACTATATTGACTTTGAGTATTTTACGCACAAGTCAGTATTTCAAGAAATGCTTGATTTTCCAAATCTTATTTTGTCTTATCACAACTTTGAAGAGACTCCTGAAAATTTAATGGAAGCTTTTTCAGAAATGACCAAGTTGGCACCGCGTGTGGTTAAAATTGCTGTGATGCCCCAGAGTGAACAAGATGTTCTAGATTTGATGAACTATACCAGAGGCTTTAAGACGCTCAATCCTGAGCAAGAATTTGCAACTATATCTATGGGGAAATTAGGAAGATTGTCTCGTTTTGCGGGAGATGTCATTGGCTCTTCCTGGACATACGTTTCATTAGATCATGTTAGCGGTCCAGGTCAAGTGACTCTCAATGATATGAAACGTATTATTGAGGTCTTAGAAATGGATATCTCTAACTAGTGAATGGTCTAAAAATATTATTTCTACAATAGTTAAGAAATGATGTTTTTAGATTAATGTTTTTAAAATAAGTGGAACCAAAAAGGAGAAAAATTGCGTTATTTAACAGCAGGAGAATCTCATGGGCTATCCTTAACAGCTATTATTGAAGGTATACCAGCAGGATTAACTCTTCATCCAGCGGATATTGATCACGAATTACAGCGACGTCAAGGAGGTTATGGCCGTGGTGCCAGAATGTCTATTGAGACTGATCGGGTTCAAATATCCTCAGGAGTTCGTCATGGCAAAACAACAGGGGCCCCCATTACCTTAACGGTAATTAATAAGGACCACCAAAAATGGCTAGATGTCATGGCTGTAGGAGACATTGAAGAGACTCTCAAGTTAAAGCGTCGTGTTAAGCATCCTAGACCAGGACATGCGGATTTGGTAGGAGGTATTAAATATCATTTTAACGATTTAAGAGATGCCTTAGAGCGTTCCTCGGCTAGAGAAACAACGATGAGAGTGGCTGTAGGCGCTGTTGCTAAACGTATCTTAGCTGAACTTGGAATTGATATGTTACATCATATCTTAATATTTGGTGGTATAACGATCACAATACCTTCTAAGCTCTCTTTTAGAGAGCTGCAAGAAAGGGCTCTCCATTCAGAATTATCTATTGTTAATCCAAAGCAAGAAGAAGAAATTAAAACGTATATTGATAAGATAAAAAAAGAAGGGGATACCATTGGTGGTATTATCGAAACGATAGTTCAAGGGGTGCCAGCAGGTCTTGGATCTTATGTCCAATGGGATAAAAAATTAGATGCCAAGCTGGCTCAAGCAGTT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50 | Streptococcus_phage(25.0%) | head,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1000740 : 1064748
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483391|1000740:1064748|DBSCAN-SWA 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MKLGEIIKNFREEKKLSMDRFAEKSGLTKGYISMLEKNEHPKSKKPIIPTEETLLKVAKGMGVDIDFVLSKLDSDQEIQINISPKNMLNMDNPSTPTTPKVELIPSTLQKINSTSSQLEHSRQIIVLDTAETLLEQQKEIKNNEDTIAELFSYNYYDHAASAGTGQYLNDVQVEKIELPVDYDADFVIPVYGDSMEPKYHSGDYVFVKLSVELTDGDIGVFEYYGDAYIKQLLINAEGAFLHSLNQCGDYPDIPIDRDSDFRIIGEVMGSYRER >LS483391|1000740:1064748|1007199_1007421_-|SQG43324.1|DBSCAN-SWA MLTYDEFKQAIDDGYIVGDTVMIVRKNGQIFDYVLPHEEARNGEVVTEEKVEEVMVELDYIIMKKTLSRQKNN >LS483391|1000740:1064748|1014007_1014619_-|SQG43344.1|DBSCAN-SWA MRNWKVTGKYPQYDSTGAVASTHIIITAEDGSVISQPIKQDLTSTNDTEIIKATLEEFKKSEYVEIAMGEAVQKVDDLEKISQETANTAKTAQTAAGLAKVSAERTQRMINLQTIHMLTSDGKIDSDIYKGMLELIESAQKGEYQAYDVFTVVDDKHEEQAGEGNLVFVHVNEPFTYDKQTLKELEEEDKVTVIKYADLVKQD >LS483391|1000740:1064748|1015463_1016696_-|SQG43349.1|DBSCAN-SWA MSRDPTLTLDESKLVIGPDGRMHYTFTAQDDNQKVRLVSNCLGTAHFNQVMIERGDKATSYVAPAVVEGSGKSTGVFKSFEEMLSSLKSINLELTDTKNSKLWSKIKLTNHGMIQEYYDGKIKTEIVNSAQGVATRITEDTGKKLALINDTINGIKREYQNADKKLSASYQLGIDGLKATMRSDKIGLQAEIQTTAQGLYQRYDNEIRKLSAKITTTSSGTTEAYESKLDGLRAEFTHSNQGMRVELESKISGLQSTQQATARQISQEISNREGAVSRVQQGLDSYQRRLQSAEGNYNSLRETVAGYERRISNQDNTISSNFTQLKSLINQSVTLGKIQSLLRQSGDSIMLAIKDKIPQSKMSGSDIISAINLNSRGVQIAGKNIALDGNTTVNGAFGAKLGEFIKLRAD |
89 | Streptococcus_phage(38.24%) | tail,holin,terminase,transposase,portal,head,integrase | attL 1007062:1007121|attR 1053701:1053799 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1130695 : 1210680
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483391|1130695:1210680|DBSCAN-SWA CTTGAATAGTCATCACGCCTGTCAAACTCTTCAAGTCTCCCGTTCAGGTTTCTATGCTTATTTAAAACGTCGTCCCTCTTCAAGGCATGTTGAGAATGAAGCTTTGAAGGAAATGATTAAAGACATTTTCTATGAACATAAAGAGCGTTACGGAAGTGTACGAATTACCCAAGAACTTTGTAGACGTGGCATCCATGTCAATCATAAACGTGTTGGTAGACTCCTTCATCAGCTAGGTCTCTATGCTAAAGGAAGTCGATATCAATATAAATACTATAACCGTCGACGTTCTTCATTAACTCGTCCCAATCTTGTTAATCAATGTTTCCAAGCGACTGGTAAGAATAAATTATGGCTAGGAGACTTAACCTACATTCCTACACAAGAAGGAATACTTTATGTGTCTGCCTTGATAGACGTTTATAGTAGAAAGATTGTTGGTTGGGCAATGGGCCGATGTATGCAAGACAAGTTGGTAACAGAAGCTTTCAATCAAGCTTATAATAGAGAAAAGCCTAAAGAAGGGGTAATCGTCCATACAGATCAGGCTTCTCAATATACCGGAGCATGATTTCAGGACCTACTTAGACGAAAAAAATGTAAGTCCAGGATGAGTCGAAAAGGTAATCCATACGATAATGCACTCATGGAAGCCTTTTATAAAACATTAAAAAGAGAGCTTGTCAATGATGCTCATTTCGCAACTATTGAGCAAGCTCAGCTTGAGATTTTTAAATATAGTGAGACTTACTATAACCCTAAACATCTGCCTTCAGCTTTAGGGTATCTCTCACCTGTAGAATTTGAAAAAATAGTTACTCATTAGCTTAACTTTATGTCTATTTTTCTTGACAAGTCCAACCAAATGTTAGATTTTTTTGTCCAACTTTTGGGGTGCAGTTCATTCATCCGAAGCTTTTTATTATATGACTCCTAAGCCTATTGACATTAACAAAATGACTTCAATCAAGTTATTAAAAATATGTAACAAGATAGCGTCTTTTAAGTTTCCTCGTCTTTGATAGGCAACAAAGAGAAAAATGCCCATACAGCTGTACATGATAAATTCAACACTATTGGTGGCATGTGGTAAAGCAAAAACAAGAGAGGTCACTAAACCTGCCACCTTAAGTGATTTTCCTTTGAAGAGATCAATCATAGGAAATCCTCTAAAGACTAATTCTTCCATAATAGGAGCGATAAAAGCTATCACAAGTACAAATAGGGCAGTATAAAGCGGGAAACCACCTTTGATAAGTCTAGCTAAGGTATGTATTGCAGCATCATTAGCACTCACTTGTTGACCAGACCATAGCTGGTTAACAAGGGTACCTACAATAGCTATCACACGGATGATTAACCAAAATAATGCTAAATAACCCCAGTCAACCAATCTCATTTTTTGCTGTTTAATAGGGGTGTCTTGCTTAGCTTGATAAAGACGCCATAATACAATAAGGACACTTCCAACAATAACCAAGTAGAAAATACCAATTCCCCAATTAAGCGCCATAGGAATATCGTGTTGCTTTTGCAATAAAATCATCGGAAGGACATTGAAAACCATAGCCAGAATAATGAGCACTGCTATTTTTAAATAATTAATGAATCCTTTCATAAATAGTCTCCTTTTAGGCTAACGGTAAAATTGTCTGGTCATTGTTGCACTCTTAACGAGTAAATAGAGCTGAATTAACACTAAAACTAGGATAGCTGTCAATTCCACTTGACCAGTGAATAGATAGATAAAAAATAAAATCACATACAAGGAAGGGATGATGACTCCATTTAATGACAACACACTTTCAAACGATGTCTTATGATAGGCTTGTAACTCTGCCTCATCTAGAGCCATGATATTATGTTTTAATTCTTTCAAATTTGGAAAATAAGGAACATCGGTTCCCCGAATGGCATTGTAACGTTTCATGGCTAAAGCTTGAAAAGGAATGACCATTAATAATAAAAGGATATCCAGAAGCGGAATGGCCAACATGGCATGCTGTGAATCATTTGTTAAGGTCAGACCAAGCAGTACATTACACATGGATAAAATAGAAGCTACGGCAATCAATAACATGGTATAAGCATGCTTTTTATTCAGCTGACGGTAACCTTTTTCAGAATAATCATCCTCTTCAACTGTGTTATAAACAGCTGTCTCTTTTTTCAGTTGCGTTAAAAAAACAAAAGAGAGTGTGAGTCCTGTGACAACTACCAGACGATTTAATAAGATAATCAGGTTAATCACATCGTCTTTTAGGAATGTGAGATGATCTAATCTCCCTCCATGGTAACCTAAAAAGGCTCCAACCATGCCACCTATAATCCCTCCCGCCAAACTTGATAGTAATAACATTTTTAACAAGCGTAAAAAACTATTCTTCTTCTTTTTCATTCCTCGACCTCCACTAGATGAAACACCTCTTCAACTGGTTCCTGAAATACCTTTGCAATTTTCATGGCAATTATAACTGATGGGGTGTACTCGTTACGCTCAATGAGACTGATGGTCTGCCTCGATACTCCTGCCAGTTTAGCCATTTCCGTTTGATTAATTCCATCTCTGGCTCGTAATTCTTTGAGCCGATTTTTAAGAATAACCTCCATTGCCATCTCCTTCATTCTCCTTTAACTTATAACTTACTTTCTAAAATAAGAAAAAGTATTCAACAGCAAGGCTAGTCCTGTAAAGCCCAAAACCAGATAACTCAAGGGTACTCCAAACCAGATTACCCTGATAAGATGATAACTTAAAATGAAAAGAGTCAGGATACTTGCCCATAAGTAAATCTGCCTCTTAAGTTTGATACCATGTGTCATTTTCTCTAACACCTCCTCATGTCTATTTGTTACTATCATTGTAACATATCTTTTTCTTTTTGACAATGATAATAGTCAAAAAGGTTATGATGATAGTCATTTCAAATATAAAAAACCAAGTTCTAAATAACTTGGTTTTTATGGATTTACACTGTTTCAGCAACTGCTGCTAGCAGCTCTGCAATTTTACTTGCATCGCTACCACCTGCCATAGCCATGTCTGGTTTACCTCCACCACGACCTGCTACAATTGGTGCCAATTCTTTAATCATGTTACCAGCGTGGACATCTTTAGTTTTACTTGCAACAAGGACATTAACCTTCTCACCGATAGCTGCTACGAGAACAAGCACATCAGAGTAGTCTTTTTGTTTCCAGTTATCAGCAAATGTACGAAGTGCCCCTGCATCTGCAACATCAACTTGACTAGCAATGAAGCGCACGCCCTTAGCTTCTTGAACATCTTTAAAGACATCACCAGCTGCTGCAGCTGCTGCTTTTTCTTTAAGCTCTGCATTTTCTTTTTGAAAATCACGAAGTGAGTCGCTAAGAGCTTGTACTTTAGCTGCTGCATCTTTCAATTGCGGAGCTTTTACAGTAGCAGCGATCTCTTTTAGGGCATCCTCTTGGTTACGATAAGCTTCAAAAGCTTGTCTACCAGTAACTGCAATAATACGACGAGTGCCTGAACCAATACCTTCTTCTTTGACAATCTTGAAGAGACCGATTTCTGAAGAATTATTTAAGTGAGTTCCACCACAAAGTTCAACAGAATAATTACCAATTTGAACCACACGAACCACTTTACCATATTTCTCACCAAAAAGCGCCATTGCTCCCCTCTCTTTTGCGGTTTCAACGTCAGTTTCAGTCGTTGTGATTGTAAGAGCGTTCCAAATTTGCTCATTAACTTCTTGTTCAATGTGACGAAGTTCCTCATTGCTTACTGCTTCAAAGTGAGTAAAATCAAAGCGCAAGAATTCTTCTTCGTTCAATGAACCAGCCTGAGTTGCGTGTTCACCGATAACATTGTGAAGGGCTGCATGGAGCAAGTGAGTTGCTGTGTGGTTTTTCTCAACAGCCAAACGACGCTCTTTGTTGATTTCAAGTGTGTAGTTTGTTCCAACTGAAAGTGATGCTAAAACGTTTACAGTGTGTAGAGGTTGACCATTTGGTGCTTTTTGAACATCAACAACCTCAGCAACTGTGTCACCCTTATCATTTTTGATTCTACCTGTGTCAGCAACCTGTCCACCCATTTCAGCATAGAATGGTGTTTGAGCAAAGACAAGAAGGGCTTGACCTTCTGAAACAGCTTCGGTACGTTCATTATCAGCGATGATGACTGAAAGACTTGATTCAAGACTATATGTGTCGTATTCGAATCGTGATTCTTCAACAATACCAGCTAGGGTTTCATTTTGCATCCCCATTGAACCACCCTTAACAACAGCTGCACGCGCACGGTCTTGTTGTTCTTTCATGGCTGACTTAAAGCCTTCGTGGTCAATCTTGTATCCTGCATCTTCTGCCAATTCCTCTGTCAATTCAACCGGGAATCCATAAGTATCATAAAGTTTGAAGATATCTTTACCTTCAAGTGTATCTTTACCTTCAGCTTTAAGCTGCGCAAGCAATGAATCCAAGTGACCGCTACCTGCATCGATAGTACGAGCAAATGTTTCTTCCTCACGTTTAACGATTTTCTCGATAAAATCACGTTTTTCAAGCACTTCTGGGTAGTAGCTTTCCATGATTTGTCCAACAGTTAGAACCAATTTGTAAAGGAAAGTTTCGTTGATGCCAAGACGGCGGCCATGCATAACCGCACGACGGAGAAGACGACGAAGAACGTAACCACGACCTTCATTTCCAGGAAGCGCACCATCACCGATAGCAAATAAAAGCGCACGGATGTGGTCAGCGATAACCTTGAAACTCATGTTGTCGCCATCTGGATCGTAAGTTTTACCTGACAATTTTTCTACTTCACGGATGATAGGCATGAAAAGGTCAGTTTCAAAGTTTGTTTTTGCCCCTTGCATAACAGCTGCAAGACGTTCAAGACCAGCACCCGTATCAATGTTTTTGTTTGGTAATTCTTTGTATTCTGAACGTGGCACAGCAGGATCAGCATTGAATTGTGAGAGAACGATGTTCCAGATTTCGATGTAACG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103 | Streptococcus_phage(58.46%) | tail,protease,tRNA,terminase,holin,head,integrase | attL 1172082:1172101|attR 1208065:1208084 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1409984 : 1459928
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483391|1409984:1459928|DBSCAN-SWA 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>LS483391|1409984:1459928|1418397_1418580_-|SQG44303.1|DBSCAN-SWA MLTYDEFKQAIDNGYITADTVMIVRKNGQIFDYVLPHEEARNGEVVTEEVVEEVMVELDK >LS483391|1409984:1459928|1434050_1434512_-|SQG44337.1|tail|DBSCAN-SWA MARQKNALRGHFIAPYNAGVEPEAKGSEWMEIAKWIKDISDDTDEKTEDEAYYDGDGTEETTVVGVKGAYTFEGTYDPEDKAQKHIADMKYKTGEGRKVWHKVVASDNKKQWIGLSTVSEIIAGSGAAADFEAFSCKITYNSLPKESVPSEVL >LS483391|1409984:1459928|1449341_1449782_-|SQG44390.1|DBSCAN-SWA MVKFIIPIEPKPQKRPRFSRWSGAYEDGDMMAWRKQVTDYVKNNYEGPYFDDGLKVDVTFYLKAPELVSKKPSERARDKTKQKYQDYINELLYVPKKPDLDNLEKAVYDSISKSEVVWTDDNIIVEHTTRKLYSPNPRIEVKINEL >LS483391|1409984:1459928|1450402_1451077_-|SQG44395.1|DBSCAN-SWA MRKSESITEYAKAFCKAQLEVKQPLKDKDNPFFKSKYVPLENVTEAITKAFANNGISFSQDPTTNTENGYIDVATLVMHTSGEWVEYGPLSVKPTKNDVQGAGSAITYAKRYALSAIFGITSDQDDDGNEASKPNKTNQSQKPTNKTSKGASFQTPKISNIQVETYKSDLSDIAKATNQNVEELTKWLTDTLKVKTLEDLRTEQIVSTDNLINKLKKKAEQKND >LS483391|1409984:1459928|1436876_1437485_-|SQG44348.1|DBSCAN-SWA MENVTNENVDQETTDLENNQQEDKAFTQDDLNRVGTKEHSKGYNKAVKDLGFDDVESAKDALKAFQEWQESQRSESEKQTEILNAKDKELEEARANNKALNAKLAAMSLGVNAESIDDVIALSERLVTDETSIEDAIKTVLGKYPHFGQTKDKAPKITVAGNPSADNGQGSVSKEDFAKMSYQEKLDLKLKNKNLYDQLKGN >LS483391|1409984:1459928|1446210_1446477_-|SQG44371.1|DBSCAN-SWA MKEKTIFISKKYANDFNNDKYNLSSGYYFKNGEQHDIAIVKYGEQDYLKNTDLAYVVCDKIVDGESIGFVYHGEYETWRFKLLNTEAN >LS483391|1409984:1459928|1423303_1423732_-|SQG44319.1|DBSCAN-SWA MDLTLKNKDLNTFYSVLDKIKITNMRANRGRAKLLAKVVDKINEYAKDEADIIDLYALKNKDGKFVIDEHKNIKIEDPKKIDELNDLLTELGNEDITIKGHEYSKRFIDFLEYLAESEDEFTSEEIVLIDNILEQFEESKGE |
73 | Temperate_phage(56.67%) | tail,capsid,tRNA,terminase,head,integrase | attL 1448628:1448643|attR 1468245:1468260 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||
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LS483391.1|SQG44306.1|1419958_1420552_-|phage-protein |
1419958_1420552_-
Protein sequences of LS483391.1|SQG44306.1|1419958_1420552_-|phage-protein>LS483391.1|SQG44306.1|1419958_1420552_-|phage-protein MNYRTISLDEIMKYLEKEEIQQLLKSFKGFNDGTSTPHDVEVFLHQKAVEFERSAIASTYLVFSTDSRELVGFFSLANRPLYFSKQNYQTLTKSQRKKISRSGRTLKGSGSFLMNSFLIGQLGKNYKSNTSISGKELLTLACDKVKKASKIINTKYIWLECDNNPKLIQFYQNFGFTPIDNFESENGLKVFVMKIQK |
197 aa aa |
89
gnl|BL_ORD_ID|89 information
|
NA | NA | 1409984-1459928 | NA |