Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483390 | Streptococcus pneumoniae strain NCTC13276 genome assembly, chromosome: 1 | 2 crisprs | DEDDh,PrimPol,cas3,DinG,RT | 1 | 1 | 16 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483390_1 | 98041-98136 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483390_1
|
1 spacers
spacers of LS483390_1
>1.1|98065|48|LS483390|CRISPRCasFinder TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483390_1
The CRISPR arrays of LS483390_1 >merge|LS483390|1|98041-98136|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAATTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGAAATGTGTAAAATTTTTATATATAA >LS483390|1|1|98041-98136|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAA TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA AATGTGTAAAATTTTTATATATAA
>LS483390.1|SQG33378.1|97696_98023_-|transcriptional-regulator MYFPTSSALIEFLILAVLEQGDSYGYEISQTIKLIANIKESTLYPILKKLEGNSFLTTYSREFQGRMRKYYSLTNGGIEQLLTLKDEWTLYTDTINGIIEGSIRHDKN >LS483390.1|SQG33377.1|97116_97710_-|membrane-protein MTRTEYLTQLELYLKKLPEADRIEAMDYFRELFDDAGIEGEEELIASLGTPKEAAHEVLSNLLDKKINEAPAQKNNRQILHIALLALLAAPIGIPLGIAILVTLFAILVAALTVILAFFAVSILGIIGGFLFLVESFTVLAQAKSAFILIFGSGLLAIGASSLVLLGISYVARFFGLLIVRLVQFVLKKGKRGNQHA >LS483390.1|SQG33376.1|96212_97124_-|Uncharacterised-protein MRKWTKGFLIFGVVTTVIGFILLFVGIQSDGIKSLLSMSKEPVYDSRTEKLTFGKEVENLEITLHQHTLTITDSFDDQIHISYHPSLSAHHDLITNQNDRTLSLTDKKLSETPFLSSGIGGILHIASSYSSRFEEVILRLPKGRTLKGINISANRGQTTIINASLENATLNTNSYILRIEGSRIKNSKLTTPNIVNIFDTVLTDSQLESTENHFHAENIQVHGKVELTAKDYLRIILDQKESQRINWDISSNYGSIFQFTREKPESRGTELSNPYKTEKTDVKDQLIARSDDNIDLISTPSRR >LS483390.1|SQG33375.1|95085_96150_-|Uncharacterised-protein MKQEWFESNDFVKTTSKNKPEEQAQEVADKAEETIADLDTPIEKNTQLEEEVSQAEVELESQQEEKIETPEDSEARTKIEEKKASNSTEEEPDLSKETEKVTIAEESQEALPQQKATTKEPLLISKSLESPYIPDQAPKSRDKWKEQVLDFWSWLVEAIKSPTSKLETSITHSYTAFLLLILFSASSFFFSIYHIKHAYYGHIASINSRFPEQLAPLTLFSIVSILVATTLFFFSFLLGSFVVRRFIHQEKDWTLDKVLQQYSQLLAIPIFLTAIASFFAFFDSLRFTALLCVISIGIILLASLHIITRPSQASETDSFYQLFLSVLVNGVIILLFFVAEVALIGDYLRILAFL >LS483390.1|SQG33374.1|94153_95014_+|Uncharacterised-protein MAKTFFIPNKQSILGEQEILNAKSILALLDGLESHSYDVVYLRQPLNRLEYIECAIVGQSQFLFKVSYADGQKAYRVDLPDLLTKTDWQIIKSFLDALLAYTGTDIEGLDGFDFEAYFQASIQAYLADPVARFTICQGIFNPIFFSRENLKSFLEADGLAQFEARVRAVQETDAYFARVSFYQDGEGKVHGVYHLAQGVKTVLPREPFVPAAYIEQLVDKEVQWEIDLVQITGDGSKPEDYEAIARLDYAKFLEVLPPSFYHQLDANQIEIQPILGQDFKTLAQEK >LS483390.1|SQG33373.1|93045_94032_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MAKDIRVLLYYLYTPIENAEQFAADHLAFCKSIGLKGRILVADEGINGTVSGDYETTQKYMDYVHSLPGMEELWFKIDEENEQAFKKMFVRYKKEIVHLGLEDNDFDNDINPLETTGAYLSPKEFKEALLDKDTVVLDTRNDYEYDLGHFRGAIRPDIRNFRELPQWVRDNKEKFMDKRVVVYCTGGVRCEKFSGWMVREGYKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGELWDGKMYVFDERIAVDVNHVNPTIVGKDWFDGTPCERYVNCGNPFCNRRILTSEENEDKYLRGCSHECRVHPRNRYVSKNELTQAEVIERLAAIGESLDQAATV >LS483390.1|SQG33372.1|91298_92774_+|extracellular-solute-binding-protein MKNWKKYAFASASVVALAAGLAACGNLTGNSKKAADSGDKPVIKMYQIGDKPDNLDELLANANKIIEEKVGAKLDIQYLGWGDYGKKMSVITSSGENYDIAFADNYIVNAQKGAYADLTELYKKEGKDLYKALDPAYIKGNTVNGKIYAVPVAANVASSQNFAFNGTLLAKYGIDISGVTSYETLEPVLKQIKEKAPDVVPFAIGKVFIPSDNFDYPVANGLPFVIDLEGDTTKVVNRYEVPRFKEHLKTLHKFYEAGYIPKDVATSDTSFDLQQDTWFVREETVGPADYGNSLLSRVANKDIQIKPITNFIKKNQTTQVANFVISNNSKNKEKSMEILNLLNTNPELLNGLVYGPEGKNWEKIEGKENRVRVLDGYKGNTHMGGWNTGNNWILYINENVTDQQIENSKKELAEAKESPALGFIFNTDNVKSEISAIANTMQQFDTAINTGTVDPDKAIPELMEKLKSEGAYEKVLNEMQKQYDEFLKNKK >LS483390.1|SQG33371.1|90117_91041_+|ABC-transporter-permease MAKKKIKKEKIDNVGIHSFSKKADIFFSIISGLIALSCILPFVFVIIISVTDEKSLLQYGYSFFPSQFGLDGFEFLAQFKDKILQALFISVFVTVVGTLTNVFITTTYAYAISRTTFKYRRFFTIFVLLSMLFNAGLVPGYIMVTRVLQLGDTVWALIVPMLLSPFNIILMRSFFKKTIPEAILESARIDGASEARIFFQICLPLSLPGIATITLLTALGFWNDWFNALLYIKSDNLYPLQYLLMQIQQNMDYIAKAVGLTGQLGVALPKETGRMAMVVVATLPIAILYPFFQRYFVKGLTIGGVKE >LS483390.1|SQG33370.1|89174_90104_+|ABC-transporter-permease MKKFSKTLRDNWIFLLMVLPGALWLILFFYIPVFGNVVAFKDYHMTSNGFIDSIINSKWVGLDNFRFLFSSRDAFIITRNTVLYNLGFIFLGLVVSVGIAIILSELRSKRMVKIFQTSMLFPYFLSWVIISFFTDAFLNIDKGVFNHLLESLGLKEVNFYADLGIWPYLLLFLGIWKGFGYSSVMYYATIMGIDPTYYEAATVDGASKWQRIRNVTIPQLTPLVTVLTILAVGNIFRADFGLFYQIPHNAGQLYNVTNVLDVYVFNGLTQTADIGMAAAAGLYQSVVGLILVILSNLLARRVDPNSALF >LS483390.1|SQG33369.1|88634_88856_+|surface-anchored-protein MSLQIKLKKLAKELSKLLKDSNLETVDKDVLENSQKELQKAVLFLADEKGSEHTEAEVIDNLKEVIAKLKANA >LS483390.1|SQG33379.1|98161_99328_-|cyanate-permease MKKQSLFFVPGIILIGVSLRTPFTVLPIILGNISQGLEVEVSSLGVLTSLPLLMFTLFSPFSTQLAQKIGLEHLFTYSLFFLTIGSLIRLINLPLLYLGTLMVGASVAVINVLLPSLIQANQPKKIGFLTTLYVTSMGIATALASYLAVPITQASSWKGLILLLTLLCLATFLVWLPNHRYNHRLAPQTKQKSQIKVMRNKQVWAIIIFSGFQSLIFYTVMTWLPTMSIHAGLSSHEAGLLTSILSLISIPFSMTIPSLTTSLSTRNRQLMLTLVSLAGVIGISMLFFPINNFIYWLAIHLLIGTATSALFPYLMVNFSLKTSAPEKTAQLSGLSQTGGYILAAFGPTLFGYSFDLFHSWVPSVAALLLIDILMTVALFTVDRADKIL >LS483390.1|SQG33380.1|99478_100543_+|glycosyl-transferase MTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTYPKEDIEILFINAMSTDGTTAIIQQFIKEDTEFNSIRLYNNPKKNQASGFNLGVKHSVGDLILKIDAHSKVTESFVMNNVAIIQQGEFVCGGPRPTIVEGKGKWAETLHLVEENMFGSSIANYRNSSEDRYVSSIFHGMYKREVFQKVGLVNEQLGRTEDNDIHYRIREHGYKIRYSPSILSYQYIRPTFKKMLHQKYSNGLWIGLTSHVQFKCLSLFHYVPCLFVLSLVFSLALLPITFVFITLLLGAYFLLLSLLTLLTLLKHKNGFLIVMPFLLFSIHFAYGLGTIVGLIRGFKWKKEYKGTIIYLDKISQINKNML >LS483390.1|SQG33381.1|100584_102435_+|nucleoside-diphosphate-sugar-isomerase MNKKLTDYVIDLVEILNKQQKQVFWGIFDIFSMVVSIIVSYILFYGLINPAPVDYIIYTSLAFLFYQLMIGFWGLNASISRYSKITDFMKIFFGVTASSVLSYSICYAFLPLFSIRFIILFILLSTFLILLPRITWQLIYSRRKKGSGDGEHRRTFLIGAGDGGALFMDSYQHPTSELELVGILDKDSKKKGQKLGGIPVLGSYDNLPELAKRHQIERVIVAIPSLDPSEYERILQMCNKLGVKCYKMPKVETVVQGLHQAGTGFQKIDITDLLGRQEIRLDESRLGAELTGKTILVTGAGGSIGSEICRQVSRFNPERIVLLGHGENSIYLVYHELIRKFQGIDYVPVIADIQDYDRLLQVFEQYKPAIVYHAAAHKHVPMMERNPKEAFKNNIRGTYNVAKAVDEAKVSKMVMISTDKAVNPPNVMGATKRVAELIVTGFNQRSQSTYCAVRFGNVLGSRGSVIPVFERQIAEGGPVTVTDFRMTRYFMTIPEASRLVIHAGAYAKDGEVFILDMGKPVKIYDLAKKMVLLSGHTESEIPIVEVGIRPGEKLYEELLVSTELVDNQVMDKIFVGKVNVMPLESINQKIREFRTLSGDELKQAIIAFANQTTHIE >LS483390.1|SQG33382.1|102520_102781_-|chlorohydrolase MKIKEQTRKLAAGCSKHCFKVVDGTDEVSSKHCFKVVDGTDEVSSKHCFKVVDGTDEVSSKHCFKVADRTDEISNIYIRQGDVDVV >LS483390.1|SQG33383.1|102830_103463_-|phosphatase MTSITAIFFDLDGTLVDSSIGIHNAFTYTFKELGVPSPDAKTIRGFMGPPLESSFATCLSKDQISEAVQIYRSYYKAKGIYEAQLFPQIIDLLEELSSSYPLYITTTKNTSTAQDMAKNLEIHHFFDGIYGSSPEAPHKADVIHQALQTHQLVPQQAIIIGDTKFDMLGARETGIQKLAVTWGFGEQADLLNYQPDYIAHKPLEVLAYFQ >LS483390.1|SQG33384.1|103484_104357_-|L-serine-dehydratase,-alpha-subunit MFYSIKELVEQADLDFQGNVAELMITTEFELTGREREEVFLLMERNLEVMKASVQLGLNENKSRSGLTGGDAAKLDHYIENGKTLSDYTILSAARNAIAVNEHNAKMGLVCATPTAGSAGCLPSVLTAAIEKLDLSHEQQLDFLFAAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMSAAALTLAAGGTPYQASQAIAFVIKNMLGLICDPVAGLVEVPCVKRNAMGASFAFIAADMALAGIESKIPVDEVIDAMYQVGASMPTAFRETAEGGLATTPTGRRLQKEIFGE >LS483390.1|SQG33385.1|104365_105037_-|putative-L-serine-dehydratase-beta-subunit MKSLRFQSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAVRIGKIVSSIFDDTPTEVEFQLFNSFAKTYRGHGTDLALVAGILGMDTDDPEIPNSLEIAHKRGIKIVWTIQKDSNAPHPNTTKITVKNAHKTISVTGISIGGGNIQVTELNGFAVSLNMNTPTIIIVHQDIPGMIALVTEALSRYGINIAQMNVTREKAGEKAIMIIEVDSRNCDEAIEEIRKIPHLHNVNFFK >LS483390.1|SQG33386.1|105278_105782_+|LysM-domain-containing-protein MKSITKKIKATLAGVAALFAVFAPSFVSAQESSTYTVKEGDTLSEIAETHNTTVEKLAENNHIDNIHLIYVDQELVIDGPVAPVATPAPATYAAPAAQDETVSAPVAETPVVSETVVSTVSGSEAEAKEWIAQKESGGSYTATNGRYIGRYGSWTAAKNFWLNNGWY >LS483390.1|SQG33387.1|106609_106858_+|bacteriocin MVCSILASTSVLAVWVDGGQWNYGVGWSGNFGYSDYLHSTRSHTATVKDGNKFSKDRAEAEAWARASIFKFPPTGMEYFYGF >LS483390.1|SQG33388.1|106912_109021_+|bacteriocin-immunity-protein MKKISHLCMLLLLLCTTFFVFNVNYTREVVRIQEMGKTVDSLDLYLKDINEPAASVLRFFEDVSKEYKVSIIKTDSGDEVVKSGVFDKDTFPYQEFGISSLDFTTDGEGVYSNKEISNKLGTIPTFLKAKPIQLMTFQTYIKDTSRSLNGRYTITSTQEMDKDRIVQKWSDFFKIDQATLLEPTYKSAVEVINRDLLLSAIVFVLAILLLVLVTVYQPMMEMKRVGVQKLLGFQDRAVLADVVKGNLYLLLGGALVINLGVFFLLDYKPKDLFPMLWLSHFLLLQLYLFISWLTYLLIQKMTISSLLKGFSSFKFGLIFNYVMKIGTTILLTALLIGVGRSLEQENKELAYQQQWVSQGNYLTLETFKLNDNLWQEELAGSGKSTDYFYRFYQDLVEKTQAGYVQSSSLPVKNFVQSEQIQQYQLTDTVDVYYANRNFLKSKGFKLPDTGIKKVILMPASTKGEEDKNQLLGKLIAFHSMKYEEQQKRTIEEMDVEIAYYEGDWSFFPYSDKRKENLSNPIISLVNDSDMMWDEKASLSTTGLNNPIKIENTVQHQKEITELVEKLSDGNYLKFSSIQAIQQEKVDSYRDAVRNFNLLFALFGLLSMMISYFLLVTTFLLKRRDIITKKFMGWKLVDRYRPLLVLLLLGYSFPLLVLIFFAHAFLPLLLFAGFTCLDILFVLGLASRMEKRSLVELLKGGIL |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483390_3 | 1691905-1692022 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483390_3
|
1 spacers
spacers of LS483390_3
>3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder TTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483390_3
The CRISPR arrays of LS483390_3 >merge|LS483390|3|1691905-1692022|CRISPRCasFinder CAAAAAAGAAAGGACAAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTTTTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCCAAAAAAGAAAGGACGAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTT >LS483390|3|3|1691905-1692022|CRISPRCasFinder CAAAAAAGAAAGGACAAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTT TTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGC CAAAAAAGAAAGGACGAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTT
>LS483390.1|SQG34956.1|1690363_1691299_+|bifunctional-protein,-biotin-operon-repressor;-biotin--[acetyl-CoA-carboxylase]-synthetase MKSYQAVYQILSKETDYISGEKIAEKLSLSRTSIWKAIKRLEQEGIEINSIKNRGYKLMNGDLILPEILEENLPIKVSFKPETKSTQLDAKEAIDLGHEANTLYLASYQTAGRGRFQRSFYSPQGGIYMTLHLKPNLPYDKLPSYTLLVAGAVYKAIKNLTLIDVDIKWVNDIYLNNHKIGGILTEAMTSVETGLVTDIIIGVGINFTIKDFPQELKEKAASLFKATAPITRNELIIEIWRAFFETPAEELLYLYKKQSFILGKEVTFTLEQKDYKGLAKDISENGKLLVQCDNGKEIWLNSGEISLNSWK >LS483390.1|SQG34955.1|1689506_1690367_+|Msm-operon-regulatory-protein MLVFSEYQTGTIDLALSFYGYEECTPNYSFGPAIRDTYVLHYISKGQGKFHYKGKIVDLKEGDFFLLKPEELTFYQADSKEPWAYYWLGITGGKSPDYFALSQISDQSYLIQSETCHTQTTAKLISDIVRFAQITKSSELAQLHIMGQLHELMFHLGTIAPNQKKKNISSTHQLYLECKRLIDSHYPQSLTIQDLAKELSVHRSYLSSVFKEFNTLSPKEYLLYVRMHRARQLLENTQESIKVIAYSVGFSDPLHFSKAYKQYFNQSPSHTRKEYSQYQLVRKATL >LS483390.1|SQG34954.1|1687236_1689399_-|alpha-galactosidase MGVRIENNLFYVESKNLSLIIENRNGYLLLKHLGKTIKNYKGSNSVYERDHAFSGNPTATNRTFSLDTQRQIFGQHGLGDFRKPTIQVQHSVTEVTDFRFVEAKILKGQNGPQGLPSPHSMDDTETLVLMLEDSKAQLSLTLYYTTFNNDATIASYSKLDNNSNQEVVIHKDFSFMADFPAADYEIVTLQGAYAREKTVRRQQVEQGIFSISSNRGASGHAQTPALLLCEQGVTEDAGNVFAIQLMYSGNFEAFVQKNQLNEVRVAIGINPENFSWKLAPEEYFETPVALVTHSDQGLTGISHESQNFVLKHIILSEFSKKERPILINNWEATYFDFQREKLLELADEAKKVGIELFVLDDGWFGNRFDDNRALGDWVVNEEKLGGSLESLISAIHERGLQFGLWLEPEMISVDSDLYRQHPDWAIQVPDYEHTYSRNQLVLNLANPQVVEYLKSVLDQLLSYHEIDYIKWDMNRNITKLGNGLTYLETQMQSHQYMLGLYELVSYLTEKHSHILFESCSGGGGRNDLGMIRYFPQVWASDNTDAIARLPIQYGSSYLYPTISMGAHVSAVPNHQMGRMTPLETRGHVAMMGNLGYELDLTNLSDEEKATIANQVNLYKELRPVVQLGQQYRLINPDTASNEAAVQFNYGNQTIVTYVRVLSVVETMETTLKLKDLDEEGLYKLQENGEVYSGAELMYAGLTVILSQGDFLSRQYIFRKL >LS483390.1|SQG34953.1|1685885_1687145_-|sugar-ABC-transporter-binding-protein MEWYKKIGLLATTGLALFGLGACSNYGKSADGTVTIEYFNQKKEMTKTLEEITRDFEKENPKIKVKVVNVPNAGEVLKTRVLAGDVPDVVNIYPQSIELQEWAKAGVFEDLSNKDYLKRVKNGYAEKYAVNEKVYNVPFTANAYGIYYNKDKFEELGLKVPETWDEFEQLVKDIVAKGQTPFGIAGADAWTLNGYNQLAFATATGGGKEANQYLRYSQPNAIKLSDPIMKDDIKVMDILRINGSKQKNWEGAGYTDVIGAFARGDVLMTPNGSWAITAINEQKPNFKIGTFMIPGKEKGQSLTVGAGDLAWSISATTKHPKEANAFVEYMTRPEVMQKYYDVDGSPTAIEGVKQAGEDSPLAGMTEYAFTDRHLVWLQQYWTSEADFHTLTMNYVLTGDKEGMVNDLNAFFNPMKADVD >LS483390.1|SQG34952.1|1685005_1685872_-|sugar-ABC-transporter-permease MKKVLQKYWAWAFVVIPLLLQAIFFYVPMFQGAFYSFTNWTGLTYNYKFVGLNNFKLLFMDPKFMNAIGFTAIITIAMVVGEIALGIFIARVLNSKIKGQTFFRSWFFFPAVLSGLTVALIFKQVFNYGLPAIGNALHIEFLQTSLLGTKWGAIFAAVFVLLWQGVAMPIIIFLAGLQSIPTEITEAARIDGATSKQVFWNIELPYLLPSVSIVFILALKGGLTAFDQVFAMTGGGPNNATTSLGLLVYNYAFKNNQFGYANAIAVILFFLIVVISIIQLRVSKKFEI >LS483390.1|SQG34951.1|1684158_1684992_-|sugar-ABC-transporter-permease MKQDERKALIGKYILLILGSVLILVPLLATLFSSFKPTKDIVDNFFGFPTNFTWDNFSRLLADGIGGYYWNSVVITVLSLLAVMIFIPMAAYSIARNMSKRKAFTIMYTLLILGIFVPFQVIMIPITVMMSKLGLANTFGLILLYLTYAIPQTLFLYVGYIKISIPESLDEAAEIDGANQFTTYFRIIFPMMKPMHATTMIINALWFWNDFMLPLLVLNRDSKMWTLPLFQYNYAGQYFNDYGPSFASYVVGIISITIVYLFFQRHIISGMSNGAVK >LS483390.1|SQG34950.1|1682358_1683801_-|sucrose-phosphorylase MPIQNKTMLITYSDSLGNNLKDLYDNLEEHFGDAIGGVHLLPFFPSTGDRGFAPVDYDEVDSAFGDWEDVKRLGERYYLMFDFMINHISRQSKYYKDYQEKHEASEFKALFLNWDKFWPENRPTQSDVDLIYKRKDRAPKQEIVFEDGSVEHLWNTFGEEQIDLDVTKEVTMEFIRKTIQHLASNGCDLIRLDAFAYAVKKLDTNDFFVEPDIWDLLDKVRDIAAEYGTELLPEIHEHYSIQFKIADHDYYVYDFALPMVTLYTLYSSRTERLAKWLKMSPMKQFTTLDTHDGIGVVDVKDILTDEEIDYASNELYKVGANVKRKYSSAEYNNLDIYQINSTYYSALGDDDVKYFLARLIQAFAPGIPQVYYVGLLAGKNDLKLLEETKEGRNINRHYYSNEEIAKEVQRPVVKALLNLFSFRNRSEAFDLEGTTEIETPTAHSIVIKRQNKDKSVTAVVEIDLQNQTYRVIENGVEVTF >LS483390.1|SQG34949.1|1681027_1682221_-|O-Antigen-Polymerase-family MKSIGFIEKLKGLSSKELILLGIILSIFLPFYLFVVVLCLYIISLIFTGDMKSILQKMGEHPMLLLFLSYSTVISILAQNWMGLVASVGMFLFTIFFLHYQSILSHKFFRLILQFVLFGSVLSAAFASLEHFQIVKKFNYAFLSPNMQVWHQNRAEVTFFNPNYYGIICCFCIMIAFYLFTTTKLNWLKVFCVIAGFVNLFGLNFTQNRTAFPAIIAGAIIYLFTTIKNWKAFWLSIGVFAIGLSFLFSSDLGVRMGTLDSSMEERISIWDAGMALFKQNPFWGEGPLTYMHSYPRIHAPYHEHAHSLYIDTILSYGIVGTILLVLSSVAPVRLMMDMSQESGKRPIIGLYLSFLTVVAVHGIFDLALFWIQSGFIFLLVMCSIPLEHRMLVSDMTD >LS483390.1|SQG34948.1|1678361_1680341_-|oligopeptide-binding-protein-AmiA MKKNRVFATAGLVLLAAGVLAACSSSKSSDSSAPKAYGYVYTADPETLDYLISRKNSTTVVTSNGIDGLFTNDNYGNLAPAVAEDWEVSKDGLTYTYKIRKGVKWFTSDGEEYAEVTAKDFVNGLKHAADKKSEAMYLAENSVKGLADYLSGTSTDFSTVGVKAVDDYTLQYTLNQPEPFWNSKLTYSIFWPLNEEFETSKGSDFAKPTDPTSLLYNGPFLLKGLTAKSSVEFVKNEQYWDKENVHLDTINLAYYDGSDQESLERNFTSGAYSYARLYPTSSNYSKVAEEYKDNIYYTQSGSGIAGLGVNIDRQSYNYTSKTTDSEKVATKKALLNKDFRQALNFALDRSAYSAQINGKDGAALAVRNLFVKPDFVSAGEKTFGDLVAAQLPAYGDEWKGVNLADGQDGLFNADKAKAEFAKAKKALEADGVQFPIHLDVPVDQASKNYISRIQSFKQSVETVLGVENVVVDIQQMTSDEFLNITYYAANASSEDWDVSGGVSWGPDYQDPSTYLDILKTTSSETTKTYLGFDNPNSPSVVQVGLKEYDKLVDEAAKETSDLNVRYEKYAAAQAWLTDSSLFIPAMASSGAAPVLSRIVPFTGASAQTGSKGSDVYFKYLKLQDKAVTKEEYEKAREKWLKEKAESNEKAQKELASHVK >LS483390.1|SQG34947.1|1676798_1678295_-|peptide-ABC-transporter-permease MKKYIFMRVLRSLVSIFLVTTLTYTIIYTLVPRKLIFKQDPNYNKIATTADKRDNYENTVFERMGYIEYYDTKELQEKASSMDSSVTVEANATNKAIYEKYINQLGHGWTLGEFTESGQFYATREIPIFERVFHFYANLIDIDHTNKIQDPENPDLKRYLRFENDPAIGWSLVGSGTKHKYLLYFNSQFPFVHQNFVNLNLGDSYPTYANTPVLQVITQGQGQTKTAQVQFPTGKKTSSVNIYSRTYKSPSQADSREVASYGKDDPYTATESNYQYPSMIVSSAITGLIGLVLAYALAVPLGSAMARFKNTWIDSLSTGALTFLLALPTIALVYIVRLIGSSIALPDSFPILGAGDWRSYVLPAVILGLLGAPGTAIWIRRYMIDLQSQDFVRFARAKGLSEKEISNKHIFKNAMVPLVSGIPAAIIGVIGGATLTETVFAFPGMGKMLIDSVKASNNSMVVGLVFIFTCISIFSRLLGDIWMTIIDPRIKLTEKGGK >LS483390.1|SQG34958.1|1698931_1700287_-|RNA-methyltransferase MNLKVKQKIPLKIKRMGINGEGIGFYQKTLVFVPGALKGEDIYCQITSIRRNFVEAKLLKVNKKSKFRIVPSCTIYNECGGCQIMHLHYDKQLEFKTDLLHQALKKFAPAGYENYEIRPTIGMQEPKYYRAKLQFQTRKFKNQVKAGLYAQNSHYLVELKDCLVQDKETQVIANRLAELLTYHQIPITDERKVLGVRTIMVRRARKTGQVQIIIVTNRQLNLTQLVKELVKDFPEVVTVAVNTNTAKTSEIYGEKTEIIWGQESIQEGVLNYEFSLSPRAFYQLNPEQTEVLYSEAVKALDVDKEDHLIDAYCGVGTIGFAFAKKVKTLRGMDIIPEAIEDAKRNAKRMGFDNTHYEAGTAEEIIPRWYKEGYRADALIVDPPRTGLDDKLLDTILTYVPEKMVYISCNVSTLARDLVRLVEVYDLHYIQSVDMFPHTARTEAVVKLIKKV >LS483390.1|SQG34959.1|1700324_1701101_+|regulatory-protein-RecX MKITKLEKKKRLYLMELDNGDKCYITEDTIVRFMLSRDKVISEEELKEIQDFAQFSYGKNLALYHLSFKARTEKEVREYLKKYDIDKNIVSQVIANLKEDKWINDGQYAYAIINTNQLSGDKGPYVLTQKLAQKGISKSTIEENLKEFDFSEVAQRVANKLLKKYEGKLPARALQDKIIQNLTNKGFSYSDAKIAFDDLDSQVDQETTQELIFKELDKQYTKYARKYEGYELKQRLTQVLARKGYDFSDIASALREYL >LS483390.1|SQG34960.1|1701189_1701723_+|UPF0374-protein-SSU05 MKLPKEGDFITIQSYKHDGSLHRTWRDTMVLKTTENAIIGVNDHTLVTESDGRRWVTREPAIVYFHKKYWFNIIAMIRDNGTSYYCNMASPYYLDEEALKYIDYDLDVKIFTDGEKRLLDVEEYERHKRKMNYSDDLDYILKEHVKILVDWINNGRGPFSEAYVNIWYKRYVELKNR >LS483390.1|SQG34961.1|1702076_1702283_-|putative-transcriptional-regulator MKLQKLLKDDTKVFEKSTFKFVEGYKIYLTESKESGIKQMDNVIKYFEFIESKSIALYFQKRLNELID >LS483390.1|SQG34962.1|1702442_1703672_+|transposase MEQLHFITKLLDIKDPNIQILDIINKDTHKEIIAKLDYDAPSCPECGSQMKKYDFQKPSKIPYLETTGMPTRILLRKRRFKCYHCSKMMVAETSIVKKNHQIPRIINQKIAQKLIEKISMTDIAHQLSISTSTVIRKLNDFHFKHDFSCLPEIMSWDEYAFTKGKMSFIAQDFNNLNIITVLEGRTQAVIRDHFLKYDRAVRCRVKIITMDMFSPYYGLAKQLRFHIVQHLSRAMSRVRVQIMNQFHRKSHEYKAIKRYWKLIQQDSRKLSDKQFYRPTFRMHLTNKEILNKLLSYSEDLKHHYQLYQLLLFHFQNKEPEKFFGLIEDNLKQVHPIFQTVFKTFLKDKEKIVNALQLHYSNAKPEATNNLIKLIKRNAFGFRNFENFKKRIFIALNIKKERTKFVLSRA >LS483390.1|SQG34963.1|1703770_1705393_-|chaperone-GroEL MSKEIKFSSDARSAMVRGVDILADTVKVTLGPKGRNVVLEKSFGSPLITNDGVTIAKEIELEDHFENMGAKLVSEVASKTNDIAGDGTTTATVLTQAIVREGIKNVTAGANPIGIRRGIETAVAAAVEALKNNAIPVANKEAIAQVAAVSSRSEKVGEYISEAMEKVGKDGVITIEESRGMETELEVVEGMQFDRGYLSQYMVTDSEKMVADLENPYILITDKKISNIQEILPLLESILQSNRPLLIIADDVDGEALPTLVLNKIRGTFNVVAVKAPGFGDRRKAMLEDIAILTGGTVITEDLGLELKDATIEALGQAARVTVDKDSTVIVEGAGNPEAISHRVAVIKSQIETTTSEFDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETELKEMKLRIEDALNATRAAVEEGIVAGGGTALANVIPAVATLELTGDEATGRNIVLRALEEPVRQIAHNAGFEGSIVIDRLKNAELGIGFNAATGEWVNMIDQGIIDPVKVSRSALQNAASVASLILTTEAVVANKPEPVAPAPAMDPSMMGGMM >LS483390.1|SQG34964.1|1705408_1705693_-|CH10_SMI-10-kDa-chaperonin-(protein-Cpn10) MLKPLGDRVLLKIEEKEQTVGGFVLAGSAQEKTKTAQVVATGQGVRTLNGDLVAPSVKTGDRVLVEAHAGLDVKDGDEKYIIVGEANILAIIEE >LS483390.1|SQG34965.1|1705848_1706244_-|single-strand-DNA-binding-protein-B MYNKVIMIGRLTSTPELHKTNNDKSVARATIAVNRRYKDQNGEREADFVNMVLWGRLAETLASYATKGSLISVDGELRTRRFEKNGQMNYVTEVLVTGFQLLESRAQRAMRENNAGQDLADLVLEEEELPF >LS483390.1|SQG34966.1|1706321_1707083_-|3-oxoacyl-ACP-reductase MAKNVVITGATSGIGEAIARAYLEQGEDVVLTGRRIDRLEILKSEFAVSFPNQTVWTFPLDVTDMVMVKTVCSDILETIGRIDILVNNAGLALDLAPYQDYEELDMLTMLDTNVKGLMAVTHCFLPAMIKVNQGHIINMGSTAGIYAYAGAAVYSATKAAVKTFSDGLRIDTIATDIKVTTIQPGIVETDFSTVRFHGDKERAASVYQGIEALQAQDIADTVVYVTSQPRRVQITDMTIMANQQATGFMIHKK >LS483390.1|SQG34967.1|1707115_1707742_-|phenylalanyl-tRNA-synthetase,-beta-subunit MIFTYNKEHVGDVLMVIVKNSGDAKLNVERKGKVARVFLKENGETVAWNIFEVSSLFEIAERGQVFLSDEQVARLNQELQAEGFTEEIVNDKEPKFVVGEIVEMVAHPDSDHLNICQVAVASDKIVQIVAGAPNARVGLKTIVALPGAMMPKGNFIFPGELRGEKSFGMMCSPRELHLPNAPQKRGVLELSEDQVVGTPFDPAKHWTA |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | LS483390.1 | 40191-40218 | 0 | 1.0 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | LS483390.1 | 992036-992063 | 0 | 1.0 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | LS483390.1 | 1650247-1650274 | 0 | 1.0 |
1. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to position: 40191-40218, mismatch: 0, identity: 1.0
tttcaacccactacagttgacaaagagc CRISPR spacer tttcaacccactacagttgacaaagagc Protospacer ****************************
2. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to position: 992036-992063, mismatch: 0, identity: 1.0
tttcaacccactacagttgacaaagagc CRISPR spacer tttcaacccactacagttgacaaagagc Protospacer ****************************
3. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to position: 1650247-1650274, mismatch: 0, identity: 1.0
tttcaacccactacagttgacaaagagc CRISPR spacer tttcaacccactacagttgacaaagagc Protospacer ****************************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | KY065475 | Streptococcus phage IPP35, complete genome | 21704-21731 | 0 | 1.0 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | MK448817 | Streptococcus phage Javan59, complete genome | 41452-41479 | 2 | 0.929 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | MK448405 | Streptococcus satellite phage Javan293, complete genome | 10770-10797 | 3 | 0.893 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | MH937476 | Streptococcus phage CHPC933, partial genome | 26091-26118 | 3 | 0.893 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NC_012642 | Streptococcus parasanguinis plasmid pFW213, complete sequence | 1560-1587 | 3 | 0.893 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP015284 | Streptococcus salivarius strain ATCC 25975 plasmid, complete sequence | 83115-83142 | 4 | 0.857 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP016699 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain 275 plasmid p275A, complete sequence | 36883-36910 | 4 | 0.857 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP015284 | Streptococcus salivarius strain ATCC 25975 plasmid, complete sequence | 55243-55270 | 5 | 0.821 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | MN480762 | Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence | 10598-10625 | 5 | 0.821 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | MN480762 | Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence | 168253-168280 | 5 | 0.821 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP020429 | Streptococcus sp. FDAARGOS_192 plasmid unnamed1, complete sequence | 118713-118740 | 5 | 0.821 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP020429 | Streptococcus sp. FDAARGOS_192 plasmid unnamed1, complete sequence | 98135-98162 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NC_019430 | Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8, complete sequence | 14620-14647 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP018832 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence | 180660-180687 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP040906 | Enterococcus faecium strain FB-1 plasmid punnamed, complete sequence | 113824-113851 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP027518 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence | 150478-150505 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP027498 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence | 174624-174651 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP016744 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM2 plasmid pJM2C, complete sequence | 19046-19073 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | MT074686 | Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence | 73336-73363 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP025756 | Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence | 63468-63495 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP031539 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 3107 plasmid p3107A, complete sequence | 22007-22034 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_LR135476 | Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 2 | 151354-151381 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP016738 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3B, complete sequence | 19022-19049 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NC_017493 | Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549, complete sequence | 16777-16804 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NC_021987 | Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence | 76654-76681 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_LR135358 | Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2 | 169632-169659 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP044265 | Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence | 110148-110175 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP016708 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain UC109 plasmid pUC109B, complete sequence | 14623-14650 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NC_017478 | Lactococcus lactis plasmid pSK11L, complete sequence | 19224-19251 | 6 | 0.786 |
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LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_AP022342 | Enterococcus faecium strain KUHS13 plasmid pKO1, complete sequence | 223062-223089 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NC_008506 | Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4, complete sequence | 44473-44500 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP016733 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM4 plasmid pJM4E, complete sequence | 19069-19096 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_LR135308 | Enterococcus faecium isolate E7240 plasmid 2 | 140234-140261 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP018827 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence | 180660-180687 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_MF150536 | Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain FM03P plasmid pLd8, complete sequence | 19158-19185 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP041262 | Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence | 55029-55056 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP043524 | Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain SD96 plasmid pSD96_05, complete sequence | 28578-28605 | 6 | 0.786 |
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LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP014450 | Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence | 29008-29035 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP027502 | Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence | 55406-55433 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP016715 | Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC063 plasmid pUC063A, complete sequence | 20508-20535 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP040803 | Streptococcus salivarius strain LAB813 plasmid pSAL813, complete sequence | 65781-65808 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_LR135279 | Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2 | 44791-44818 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_LR135236 | Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2 | 36603-36630 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_AP018502 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain C4 plasmid pC43, complete sequence | 13248-13275 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP041256 | Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence | 10619-10646 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_LR135220 | Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2 | 36627-36654 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_LR134106 | Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2 | 36627-36654 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP023514 | Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence | 139819-139846 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP040876 | Enterococcus faecium strain DB-1 plasmid punnamed2 | 74007-74034 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP019993 | Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence | 46625-46652 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP035655 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence | 78878-78905 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP035661 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence | 72511-72538 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP035667 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence | 72513-72540 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP035649 | Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence | 78881-78908 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP051519 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain F plasmid pScrF52, complete sequence | 39090-39117 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP041271 | Enterococcus faecium strain VVEswe-S plasmid pVVEswe-S1, complete sequence | 55028-55055 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP040237 | Enterococcus faecium strain VB3025 plasmid unnamed1, complete sequence | 55030-55057 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NC_020208 | Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence | 121228-121255 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP034948 | Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence | 64834-64861 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP012461 | Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence | 55439-55466 | 6 | 0.786 |
LS483390_3 | 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder | 1691950-1691977 | 28 | NZ_CP016687 | Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 158 plasmid p158C, complete sequence | 17331-17358 | 6 | 0.786 |
1. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to KY065475 (Streptococcus phage IPP35, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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2. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to MK448817 (Streptococcus phage Javan59, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.929
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3. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to MK448405 (Streptococcus satellite phage Javan293, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
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4. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to MH937476 (Streptococcus phage CHPC933, partial genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
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5. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NC_012642 (Streptococcus parasanguinis plasmid pFW213, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.893
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6. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015284 (Streptococcus salivarius strain ATCC 25975 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
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7. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016699 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain 275 plasmid p275A, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.857
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8. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP015284 (Streptococcus salivarius strain ATCC 25975 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
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9. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to MN480762 (Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
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10. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to MN480762 (Streptococcus salivarius strain NU10 plasmid pSsal-NU10, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
tttcaacccactacagttgacaaagagc CRISPR spacer tcgtcacccactacagttgacagagagc Protospacer *. . *****************.*****
11. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020429 (Streptococcus sp. FDAARGOS_192 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.821
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12. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020429 (Streptococcus sp. FDAARGOS_192 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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13. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NC_019430 (Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9 plasmid pCIS8, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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14. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018832 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_9 plasmid p1_ISMMS_VRE9, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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15. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040906 (Enterococcus faecium strain FB-1 plasmid punnamed, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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16. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027518 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004024 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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17. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027498 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004167 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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18. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016744 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM2 plasmid pJM2C, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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19. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to MT074686 (Enterococcus faecium strain E1077 plasmid pE1077-217, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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20. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP025756 (Enterococcus faecium strain AALTL plasmid pEFA-99d7, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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21. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP031539 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 3107 plasmid p3107A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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22. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135476 (Enterococcus faecium isolate E8423 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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23. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016738 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM3 plasmid pJM3B, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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24. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NC_017493 (Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA549, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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25. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NC_021987 (Enterococcus faecium Aus0085 plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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26. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135358 (Enterococcus faecium isolate E7948 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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27. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP044265 (Enterococcus faecium strain V1836 plasmid pHVH-V1836-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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28. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016708 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain UC109 plasmid pUC109B, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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29. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NC_017478 (Lactococcus lactis plasmid pSK11L, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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30. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP020439 (Streptococcus equinus strain FDAARGOS_251 plasmid unamed1 sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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31. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018188 (Streptococcus salivarius strain ICDC2 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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32. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP022342 (Enterococcus faecium strain KUHS13 plasmid pKO1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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33. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NC_008506 (Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11 plasmid 4, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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34. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016733 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain JM4 plasmid pJM4E, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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35. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135308 (Enterococcus faecium isolate E7240 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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36. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP018827 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_12 plasmid p1_ISMMS_VRE12, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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37. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_MF150536 (Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain FM03P plasmid pLd8, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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38. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041262 (Enterococcus faecium strain VVEswe-R plasmid pVVEswe-R1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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39. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP043524 (Lactococcus lactis subsp. lactis bv. diacetylactis strain SD96 plasmid pSD96_05, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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40. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP013995 (Enterococcus faecium strain 6E6 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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41. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP014450 (Enterococcus faecium strain ATCC 700221 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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42. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP027502 (Enterococcus faecium strain AUSMDU00004142 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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43. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016715 (Lactococcus lactis subsp. lactis strain UC063 plasmid pUC063A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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44. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040803 (Streptococcus salivarius strain LAB813 plasmid pSAL813, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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45. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135279 (Enterococcus faecium isolate E6975 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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46. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135236 (Enterococcus faecium isolate E7067 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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47. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_AP018502 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain C4 plasmid pC43, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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48. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041256 (Enterococcus faecium strain 515 plasmid p26, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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49. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR135220 (Enterococcus faecium isolate E7040 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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50. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134106 (Enterococcus faecium isolate E6043 plasmid 2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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51. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP023514 (Enterococcus sp. FDAARGOS_375 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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52. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040876 (Enterococcus faecium strain DB-1 plasmid punnamed2) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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53. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP019993 (Enterococcus faecium isolate 2014-VREF-268 plasmid p268-1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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54. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035655 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_08 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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55. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035661 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_09 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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56. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035667 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_20 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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57. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP035649 (Enterococcus faecium strain UAMSEF_01 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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58. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP051519 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain F plasmid pScrF52, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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59. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP041271 (Enterococcus faecium strain VVEswe-S plasmid pVVEswe-S1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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60. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP040237 (Enterococcus faecium strain VB3025 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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61. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NC_020208 (Enterococcus faecium ATCC 8459 = NRRL B-2354 plasmid pNB2354_1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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62. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP034948 (Enterococcus faecium strain NM213 plasmid unnamed5, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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63. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP012461 (Enterococcus faecium strain ISMMS_VRE_7 plasmid ISMMS_VRE7_p1, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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64. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016687 (Lactococcus lactis subsp. cremoris strain 158 plasmid p158C, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.786
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
4185 : 53357
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483390|4185:53357|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483390|4185:53357|31269_33939_+|SQG33321.1|DBSCAN-SWA MVFFDSFLYNGCMDKKKLLLIDGSSVAFRAFFALYQQLDRFKNAAGLHTNAIYGFQLMLSHLLERVEPSHILVAFDAGKTTFRTEMYADYKGGRAKTPDEFREQFPFIRELLDHMGIRHYELAQYEADDIIGTLDKLAEQDGFDITIVSGDKDLIQLTDEHTVVEISKKGVAEFEAFTPDYLMEEMGLTPAQFIDLKALMGDKSDNIPGVTKVGEKTGIKLLLEHGSLEGIYENIDGMKTSKMKENLINDKEQAFLSKTLATIDTKAPIAIGLEDLVYSGPDVENLGKFYDEMGFKQLKQALNMSSADVAEGLDFTIVDQISQDMLSEESIFHFELFGENYHTDNLVGFAWSCGDQLYATDKLELLQDPIFKDFLEKTSLRVYDFKKVKVLLQRFGVDLQAPAFDIRLAKYLLSTVEDNEIATIASLYGQTYLVDDETFYGKGVKKAIPEREKFLEHLACKLAVLVETEPILLEKLSENGQLELLYDMEQPLAFVLAKMEIAGIVVKKETLLEMQAENELVIEKLTQEIYELAGEEFNVNSPKQLGVLLFEKLGLPLEYTKKTKTGYSTAVDVLERLAPIAPIVKKILDYRQIAKIQSTYVIGLQDWILADGKIHTRYVQDLTQTGRLSSVDPNLQNIPARLEQGRLIRKAFVPEWEDSVLLSSDYSQIELRVLAHISKDEHLIKAFQEGADIHTSTAMRVFGIERPDNVTANDRRNAKAVNFGVVYGISDFGLSNNLGISRKEAKAYIDTYFERFPGIKNYMDEVVREARDKGYVETLFKRRRELPDINSRNFNIRGFAERTAINSPIQGSAADILKIAMIQLDKALVAGGYQTKMLLQVHDEIVLEVPKSELVEMKKLVKQTMEEAIQLSVPLIADENEGATWYEAK 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44 | Streptococcus_phage(22.22%) | tRNA,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
106609 : 142257
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483390|106609:142257|DBSCAN-SWA AATGGTATGTAGTATACTTGCTTCTACAAGTGTTTTGGCAGTATGGGTTGATGGTGGTCAATGGAACTATGGAGTAGGATGGTCAGGAAATTTTGGTTATTCTGATTATTTACATTCTACTCGCTCTCATACAGCAACTGTTAAAGATGGAAATAAATTCTCTAAGGATCGTGCAGAAGCTGAGGCATGGGCTCGGGCTTCAATCTTCAAATTCCCACCAACGGGAATGGAATATTTCTATGGATTTTAATTAAAATTCTCCCTCCCCTTTTGGAGAGGGAGTTTCTTCACGGGAGGTATCTCTATGAAAAAAATCAGTCATCTTTGTATGTTACTCCTGCTTCTGTGTACCACTTTTTTTGTTTTTAATGTAAACTATACACGAGAAGTGGTTCGGATTCAAGAAATGGGAAAGACTGTAGATTCTTTGGATTTGTATTTGAAAGATATTAACGAACCTGCAGCGTCTGTTCTTCGATTTTTTGAGGATGTATCAAAGGAGTATAAAGTCTCCATCATCAAAACAGACAGTGGTGATGAGGTGGTCAAGTCTGGTGTTTTTGATAAAGATACCTTCCCCTACCAAGAGTTTGGGATTTCTTCTCTTGATTTTACCACAGATGGTGAAGGAGTCTATAGTAATAAAGAAATTTCCAATAAACTTGGTACGATTCCGACCTTTCTAAAAGCCAAACCTATTCAGCTTATGACTTTTCAAACCTATATCAAGGATACATCTCGTAGTTTAAATGGTCGCTATACGATAACTTCTACACAAGAGATGGACAAGGATAGGATTGTACAGAAATGGAGCGATTTTTTCAAGATAGACCAGGCTACCTTGCTAGAGCCGACCTACAAAAGTGCAGTGGAAGTCATAAATCGAGATTTGCTTTTATCTGCCATTGTTTTTGTCTTGGCTATTTTGCTTCTTGTGTTAGTGACAGTGTATCAACCGATGATGGAGATGAAAAGAGTTGGGGTACAAAAATTACTTGGTTTTCAAGATAGGGCTGTTTTAGCTGATGTTGTAAAAGGCAACCTTTACCTCCTCCTAGGTGGGGCTCTTGTGATCAATCTAGGCGTGTTTTTCTTGCTTGATTATAAGCCAAAAGATTTGTTTCCTATGCTGTGGTTGTCTCATTTTTTGCTGTTGCAGCTTTATCTCTTTATCAGTTGGTTGACTTACCTCTTAATCCAAAAAATGACAATCAGCTCTCTGCTGAAAGGTTTTTCATCTTTCAAATTTGGTCTTATCTTCAATTATGTGATGAAAATAGGGACAACTATTTTACTGACGGCCTTACTGATTGGGGTGGGCAGAAGTTTAGAACAAGAAAACAAAGAACTTGCTTATCAGCAACAGTGGGTAAGTCAAGGTAATTACCTGACCTTAGAAACCTTCAAACTCAATGATAATCTGTGGCAAGAAGAGCTAGCAGGGTCAGGGAAATCTACAGATTATTTCTATCGATTTTATCAGGATTTGGTAGAAAAAACGCAGGCGGGCTATGTGCAGAGTAGCAGTCTTCCTGTAAAAAATTTTGTCCAATCAGAACAGATTCAGCAATATCAGTTAACAGATACGGTGGATGTTTACTATGCCAATCGCAATTTTCTAAAGAGCAAGGGATTCAAGCTACCAGATACCGGTATTAAAAAAGTTATTTTGATGCCAGCAAGTACGAAAGGTGAAGAAGATAAAAATCAGCTCTTGGGGAAGTTAATTGCCTTTCATTCGATGAAGTATGAAGAGCAGCAAAAACGAACGATAGAGGAGATGGATGTCGAGATTGCCTATTATGAAGGAGATTGGTCATTTTTCCCATATAGTGATAAGCGAAAGGAAAATCTCTCCAATCCAATTATTAGCTTGGTCAATGATTCTGATATGATGTGGGATGAGAAAGCCTCCCTGTCAACAACTGGCTTAAATAATCCGATTAAAATTGAAAATACGGTTCAACATCAAAAAGAGATTACAGAGTTAGTTGAGAAATTGTCAGATGGAAATTATTTAAAATTTTCATCTATTCAAGCCATTCAACAAGAGAAAGTGGATTCTTATCGAGATGCTGTTCGGAATTTTAACCTACTCTTTGCTTTGTTTGGTCTCCTTAGCATGATGATTTCCTACTTCTTACTAGTAACAACTTTCTTATTGAAGCGCAGGGATATCATTACCAAGAAGTTTATGGGGTGGAAACTGGTCGATCGCTACCGTCCTCTCCTCGTTCTGCTCTTGCTGGGCTATAGTTTCCCTCTTCTAGTCTTGATTTTCTTTGCCCATGCGTTCTTACCACTTCTACTGTTTGCAGGTTTTACATGTCTGGATATACTATTTGTGCTAGGCTTAGCTTCTAGGATGGAGAAAAGAAGTCTAGTAGAGTTATTGAAAGGGGGCATCTTATGATTGAGTTGAAAAATATTACCAAAACCATTGGGGGAAAAGTGATTTTGGATAACTTATCTCTCAGGATTGATCAGGGGGATTTGGTAGCTATTGTTGGTAAGAGTGGTAGTGGGAAGTCGACCTTGTTAAATTTATTGGGTTTGATAGATGGTGATTATAGCGGACGGTATGAGATTTTTGGTCAGACAAATCTAGCGGTTAATTCTGCTAAGTCGCAAACAATAATCCGTGAACATATCTCTTATCTGTTTCAAAATTTTGCCCTGATTGATGATGAAACGGTCGAGTACAATCTCATGCTGGCGCTGAAATATGTGAAATTGCCTAAGAAAGACAAGCTCAAAAAGGTGGAAGAGATTTTAGAGAGAGTAGGTTTGTCAGCTACTTTGCATCAAAGGGTCTCCGAGTTGTCTGGGGGCGAACAACAACGAATTGCAGTTGCTAGAGCCATCTTAAAACCCAGCCAGCTGATTTTAGCCGATGAACCTACAGGTTCGCTGGATCCTGAAAATAGAGATTTGGTCTTGAAGTTTCTCTTAGAGATGAATCGAGAAGGGAAAACAGTCATTATTGTGACCCACGATGCTTATGTAGCCCAACAATGTCATCGTGTCATTGAATTGGGCGAGGGAAAATGAGTTCATTCAGCTCCTTTTGACTGGCTGAATACTCATGTTTTCCAGAGAAAAATAGCATAAATACGCCTAGGAATGACATTTTATGTAGCATTTCTAGGTTTTTTTGTTTCAAATTGAAAATTTTTTCAATTTAGGCTTGACAAAGGATGAGTATAGGAGTATTATTTATACAATAAAAAAGAATAAACATAAAGAAGGCTTTGTTATGAATAAGATGAAGAAGGTGTTGATGACGATGTTTGGTTTAGTGATGCTCCCCCTACTATTTGCTTGTAGTAACAATCAATCGGCTGGAATTGAAGCCATCAAGTCCAAAGGAAAATTGGTTGTAGCCCTCAATCCAGATTTTGCTCCATTTGAATATCAAAAAGTGGTTGATGGGAAAAATCAGATTGTGGGTTCAGATATCGAATTAGCCAAGGCTATCGCAACAGAACTAGGTGTCGAATTGGAACTATCTCCTATGAGTTTTGACAATGTACTGGCTAGCGTTCAATCAGGAAAAGCTGACCTTGCCATATCAGGTGTTTCTAAGACAGATGAACGGAGCAAGGTGTTTGATTTTTCAACTCCCTACTATACTGCAAAAAATAAACTCATTGTCAAAAAATCTGATTTAGCCACTTATCAGTCTGTCAACGATTTGGCGCAGAAAAAGGTCGGAGCGCAGAAAGGTTCGATTCAAGAGACGATGGCGAAAGATTTGCTACAAAATTCTTCCCTCGTATCTCTGCCTAAAAATGGGAATTTAATCACAGATTTAAAATCAGGGCAAGTGGATGCCGTTATTTTTGAAGAACCCGTTGCCAAGGGATTTGTGGAAAATAATCCTGATTTAGCAATCGCAGACCTCAATTTTGAAAAAGAGCAAGATGATTCCTATGCGGTAGCCATGAAAAAAGATAGCAAGGAATTGAAAGAGGCAGTCGATAAAACCATTCAAAAGTTGAAGGAGTCTGGGGAATTAGACAAACTCATTGAGGATGCCTTTAAAGCGTCCATTGAAAAATAGAAAGAAGGAAAAGAACATGAGTAAAGAAAAAGTAATTTTGGCCTATTCTGGCGGTTTAGACACATCAGTTGCTATTACCTGGCTGAAGAAAGACTATGATGTTGTTGCAGTTTGTATGGATGTGGGTGAAGGGAAAGACTTAGATTTCATCCATGATAAGGCTCTTAAGGTTGGGGCAGTCGAATCTTATGTCATTGATGTTAAGGACGAATTTGCTACAGATTATGTGCTAGTGGCTCATCAGTCACATGCCTATTATGAACAAAAGTATCCCTTGGTATCTGCCTTGAGCCGCCCTCTGATTTCTAAAAAATTGGTTGAAATAGCGCATCAGATAGGAGCGACTACAATTGCTCATGGTTGTACCGGTAAGGGGAATGACCAAGTACGTTTTGAAGTATCGATTGCAGCCTTGGATCTCAATTTAAAAGTGATTGCTCCAGTTCGTGAATGGAAATGGTCTCGGGAGGAAGAAATTTATTATGCCAAGGAAAATGGGGTGCCTGTTCCTGCTGACCTTGACAATCCCTACTCTGTCGACCAAAATCTTTGGGGACGTGCCAATGAGTGTGGTATTTTGGAAAATCCATGGAATCAGGCTCCAGAAGAAGCCTTTGGCATCACAACTTCTCCAGAGCAAGCTCCAGATATGCCAGAATACATTGAGATTGAGTTTAGTGAAGGTGTTCCAGTTTCCCTCAATGGAGAAGTGTTAAAATTGGCAGATTTGATTCAAAAACTCAATGAAATAGCTGGAAAACATGGGGTTGGACGGATTGACCACGTGGAAAATCGCTTGGTTGGGATTAAATCAAGAGAAATCTATGAGTGTCCAGGTGCAGTGACCCTGCTGACAGCTCATAAGGAAATTGAGGACTTGACGCTTGTGAGAGAAGTGGCTCATTTTAAACCAATCATAGAAAATGAATTATCAAAT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37 | Streptococcus_phage(60.0%) | tRNA,bacteriocin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
268557 : 374853
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483390|268557:374853|DBSCAN-SWA 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MPDHVHMLVSIPLRLSVSSFMGYLKGKSALMMFDKHANLKYKFGNRHFWVEGYYVSTVGLNKATIKKYSQD >LS483390|268557:374853|349035_350031_+|SQG33632.1|DBSCAN-SWA MKKQAYVIIALTSFLFVFFFSHSLLEILDFDWSIFLHDVEKTEKFVFLLLVFSMSITCLLALFWRGIEELSLRKMQANLKRLLAGQEVVQVVDPDLDASFKSLSGKLNLLTEALQKAENQSLAQEEEIIEKERKRIARDLHDTVSQELFAAHMILSGISQQALKLDREKMQTQLQSVTAILETAQKDLRVLLLHLRPVELEQKSLIEGIQILLKELEDKSDLRVSLKQNMTKLPKKIEEHIFRILQELISNTLRHAQASCLDVYLYQTDVELQLKVVDNGIGFQLGSLDDLSYGLRNIKERVEDMAGTVQLLTAPKQGLAVDIRIPLLDKE >LS483390|268557:374853|303628_305881_+|SQG33595.1|DBSCAN-SWA MKWTKRVIRYATKNRKSPAENRRRVGKSLSLLSVFVFAIFLVNFAVIIGTGTRFGTDLAKEAKKVHQTTRTVPAKRGTIYDRNGVPIAEDATSYNVYAVIDENYKSATGKILYVEKTQFNKVAEVFHKYLDMEESYVREQLSQPNLKQVSFGAKGNGITYANMMSIKKELEAAEVKGIDFTTSPNRSYPNGQFASSFIGLAQLHENEDGSKSLLGTSGMESSLNSILAGTDGIITYEKDRLGNIVPGTEQVSQRTMDGKDVYTTISSPLQSFMETQMDAFQEKVKGKYMTATLVSAKTGEILATTQRPTFDADTKEGITEDFVWRDILYQSNYEPGSTMKVMMLAAAIDNNTFPGGEVFNSSELKIADATIRDWDVNEGLTGGRMMTFSQGFAHSSNVGMTLLEQKMGDATWLDYLNRFKFGVPTRFGLTDEYAGQLPADNIVNIAQSSFGQGISVTQTQMIRAFTAIANDGVMLEPKFISAIYDPNDQTARKSQKEIVGNPVSKDAASLTRTNMVLVGTDPVYGTMYNHSTGKPTVTVPGQNVALKSGTAQIADEKNGGYLVGLTDYIFSAVSMSPAENPDFILYVTVQQPEHYSGIQLGEFANPILERASAMKDSLNLQTTAKALEQVSQQSPYPMPSVKDISPGDLAEELRRNLVQPIVVGTGTKIKNSSAEEGKNLAPNQQVLILSDKAEEVPDMYGWTKETAETLAKWLNIELEFQGSGSTVQKQDVRANTAIKDIKKITLTLGD >LS483390|268557:374853|365868_366741_-|SQG33649.1|DBSCAN-SWA 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>LS483390|268557:374853|319681_320920_+|SQG33607.1|DBSCAN-SWA MKIAVAGTGYVGLSIAVLLSQQHQVMAVDIIPEKVELINQRKSPIQDDYIEKYLAKKDLNLVATLDAKEAYQDADFVVIAAPTNYDPKKNFFDTSAVESVIETALKYNPDAIMVIKSTVPVGYTESARKKFQTENILFSPEFLRESKALYDNLYPSRIILGTDKNNERLVSAAETFARLLQEGALKENIDTLYMGFTEAEAVKLFANTYLALRVSYFNELDTYSEMKGLDTQAIIDGVGLDPRIGSHYNNPSFGYGGYCLPKDTKQLLANYEDIPEELIGAIVRSNSTRKDFIADQVLKMVDYYDYSAHNIFDERVEKDIIIGIYRLTMKSNSDNFRQSSIQGIMKRIKAKGVRVVIYEPTLESGSTFFGSSVINDLEEFKRLSNAIVANRYDNSLEDVKEKVYTRDIFERD >LS483390|268557:374853|313800_313974_+|SQG33601.1|DBSCAN-SWA MNIKKRVLSAGLTFASALLLAACGQSGSDTKTYSSTFSGNPTTFNYLLDYYADNIVN >LS483390|268557:374853|317082_318240_+|SQG33605.1|DBSCAN-SWA 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101 | Enterobacteria_phage(10.53%) | tRNA,protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
417614 : 479286
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483390|417614:479286|DBSCAN-SWA 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58 | Bacillus_phage(20.0%) | integrase,protease,transposase,bacteriocin | attL 442010:442026|attR 473142:473158 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
563786 : 613901
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483390|563786:613901|DBSCAN-SWA 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39 | Staphylococcus_phage(28.57%) | tRNA,transposase,holin,bacteriocin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
691803 : 806286
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483390|691803:806286|DBSCAN-SWA 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MKENNMLVNWKLESDVNDYVKKQFENLGLKKLQDY >LS483390|691803:806286|759690_760335_+|SQG34042.1|DBSCAN-SWA MKILVTGFNPFGGEKINPALEAVKLLPSEINGAEVRWVEIPTVFYKSSEVLEAEILRYQPDAVLCIGQAGGRTGLTPERVAINQDDARIPDNEGNQPIDTPIRIDGASAYFSSLPIKAMVQAIKKQGLPAVVSNSAGTFVCNHLMYQALYLVDKKFPNMRAGFMHIPYMMEQVVNKPNTAGMSLCDIVRGIEVAIEAIVDYKDKDLQLVGGETH |
108 | Streptococcus_phage(12.9%) | tRNA,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
818449 : 864823
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483390|818449:864823|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483390|818449:864823|837631_838270_+|SQG34113.1|DBSCAN-SWA MSKGFLVSLEGPEGAGKTSVLEALLPILEEKGVEVLTTREPGGVLIGEKIREVILDPSHTQMDAKTELLLYIASRRQHLVEKVLPALEAGKLVIMDRFIDSSVAYQGFGRGLDIEAIDWLNQFATDGLKPDLTLYFDIEVEEGLARIAANSDREVNRLDLEGLDLHKKVRQGYLSLLDKEGNRIVKIDASLPLEQVVETTNAVLFDGMGLAK >LS483390|818449:864823|857501_857861_+|SQG34137.1|DBSCAN-SWA MARVKGGVVSRKRRKRILKLAKGYYGAKHILFRTAKEQVMNSYYYAYRDRRQKKRDFRKLWITRINAAARMNGLSYSQLMHGLKLAEIEVNRKMLADLAVNDAVAFTALADAAKAKLGK >LS483390|818449:864823|825683_826769_+|SQG34101.1|DBSCAN-SWA MMDSPKKLGYHMPAEYEPHHGTLMIWPIRPGSWPFQGKAAKRAFTQIIETIAEGERVYLLVEQAYLSEAQSYLGDKVVYLDIPTNDAWARDTGPTILVNDKGKKLAVDWAFNAWGGTYDGLYQDYEEDDQVASRFAEALERPVYDAKPFVLEGGAIHSDGQGTILVTESCLLSPGRNPNLTKEEIENTLLESLGAEKVIWLPYGIYQDETNEHVDNVVAFVGPAEVVLAWTDDENDPQYAMSKADLELLEQETDAKGCHFTIHKLPIPAVRQVVTEEDLPGYIYEEGEEERYAGERLAASYVNFYIANKAVLVPQFEDVNDQVALDILSKCFPDRKVVGIPARDILLGGGNIHCITQQIPE >LS483390|818449:864823|854607_855084_+|SQG34134.1|DBSCAN-SWA 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49 | Streptococcus_phage(50.0%) | tRNA,protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
950329 : 992587
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483390|950329:992587|DBSCAN-SWA 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43 | Streptococcus_phage(36.36%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1021975 : 1087946
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483390|1021975:1087946|DBSCAN-SWA 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56 | Enterococcus_phage(18.18%) | protease,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1148206 : 1195872
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483390|1148206:1195872|DBSCAN-SWA 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52 | Bacillus_phage(16.67%) | transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1292498 : 1327294
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483390|1292498:1327294|DBSCAN-SWA 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MDNLYLVKDDSQLATFRDFVVRNTEKLKDYQSFLKNELAVCDLPQAVIWSDFNAATQIIRESAVPTYTNNRRVVMTPDLAVWKELYLYQLMDYECSEQTQAIESHYHSLSENFLLQIVGHELAHWSDIF |
42 | Streptococcus_phage(20.0%) | tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1407981 : 1414735
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS483390|1407981:1414735|DBSCAN-SWA TATGTCTCAACTCTATGATATTACCATTGTGGGTGGTGGTCCTGTCGGGCTTTTTGCAGCCTTTTATGCCCACCTACGCCAAGCCAAGGTTCAAATCATCGACTCTCTTCCCCAGCTAGGTGGACAACCTGCTATTCTCTACCCTGAAAAGGAAATCCTAGACGTACCAGGCTTCCCAAACCTGACTGGAGAAGAGTTGACTAACCGCTTGATTGAACAGCTAAATGGATTTGATACCCCTATTCATCTCAATGAAACGGTTCTTGAGATTGACAAACAAGAAGAAGAATTTGCCATCACAACTTCCAAAGGAAGTCACCTGACTAAAACAGTTATCATCGCTATGGGTGGCGGTGCCTTCAAACCACGTCCGCTGGAACTTGAAGGGGTTGAGGACTATGAAAATATCCACTACCACGTTTCTAACATTCAGCAATACGCTGGTAAGAAAGTGACGATTCTTGGTGGGGGAGACTCGGCTGTGGATTGGGCTTTGGCTTTTGAAAAAATCGCACCAACTACCCTTGTTCACCGCAGAGATAATTTCCGTGCCTTGGAACACAGTGTTCAAGCCTTGCAAGAATCATCTGTAACCATCAAGACACCATTCGCCCCTAGCCAACTCCTTGGAGATGGAAAAACGCTTGATAAACTTGAAATCACAAAAGTCAAATCTGATGAAACTGAAACCATTGACCTAGACCACCTCTTTGTCAACTATGGTTTCAAATCTTCTGTCGGTAACCTTAAAAACTGGGGGCTCGACCTCAACCGTCACAAGATTATCGTCAACAGCAAACAAGAATCCAGCCAAGCAGGTATCTATGCTATCGGTGACTGCTGCTACTATGACGGAAAAATTGATCTGATTGCGACAGGTCTAGGGGAAGCTCCAACTGCTGTCAACAACGCTATCAACTACATTGACCCTGAACAAAAAGTACAACCAAAACACTCTACCAGTTTATAAAAAAGAACCACGAGTCACATAGGATTCGTGGTTTTATAATTCATCCGCTATCTTATTGATTTTTCTGAGTCTGTGATTGACACCACTTTTGGTCAGAGGGGTGCTGAGACTATCTGCTAACTGCTGGATAGAGTAGTCTGGGTGCTGAATCCTCAGTTGCGCCACTTCCTGCAAATCTACTGGCAAATTTTCTAAGCCCATGATATCTTTGATTTTACTGATATTGTTAATGGTCTTCATGCTGGCAGAAACTGTCCGAGCGATATTAGCTGTCTCGGCATTATTAGCTCGATTGAGGTCGTTACGGGTTTCTCGCAAAATCTTAACCCGCTCAAAATCATCACGTGCCTGCATGGCTCCTATTACTATCAAGAAGTCCATAATGTCTTCTGCTCGCTGGAGATAGGTCACAGCCCCCTTCTTGCGCTCAAGCACCTTGGCATCCAGTAAAAACTGTTGGAGAAGGGAGGCAATTCCTTGCGCGTGGTCCAGATAAACAGAACTGATTTCCAACTGGTACTTGCCTGACTCAGGGTCACGAATGCTCCCATTTGCCAAGAAAGCGCCACAGAGATAGGCACGACCTGCTTCCTCATCCGATAAAATCGCCTCATCAATACCTGTTTCCAGGCCAAAGAAAGAGTCTGCCAAGTGCAAATCACTTAACAAATCCTGCACCTTTTCATCTGTAAAAACGGTATAGACGCGATTCTTGCGAAGATTGCTCCGTTGGTGGTGACGAATTTCAGATTTGATTTCATAGAAATGGAGAAAGGACTCATAGAGGTGACGGGCCAGTTTGGCATTTTCTGTCACAACTGACAAAGTCAAGCCCGAAGTCGAGAGACCGATGCTACCAGACATTTTGATAATGGCAGATAATTCATGCCAGCTCAGATGGTGTTGGCCCAGGATTTCTTCTTTTACTGCTACTGTGAAACTCATTTTTTCACCTGTATAATGCGCATCAACTCGTCCACAATCAAATCTCCATCGTGGAAGGCACCGCCATTTTCCAGACGAAGGAAGTTAGATGAAATCACGCGCGAAACTTGCTTACAAAGACCTACAAAATCGTGTTCCACTTGCACCAAGTATTCATCAAAACGGTTGGAATTCATGTATTCCTGAGGCACTTTTTCAATATTCACCAAGACAGTGTCGATAAAAGGGCGACCAAGGTGACGATGCAAGACTTCCACGTGGTTGCTATCTGTAAAGTGTTCCGTCTCCCCACGTTGGGTCATGATATTGCAGACATAGGCAATTTCTGCCTTGGTTTCCAAAAGAGCCCGCCCAATTTCCTTAATCACGATATTGGGCAAAATAGAGGTAAAGAGGGAACCTGGCCCTAGGACAATCATGTCACTTTCAAGGATGGTCTGCACTACTCGACGGCTGGCCAGAGGCGTATCATCGTTTAGGGCATTGGTCACATAGACATTGTCAATTATGCCTCGATGGTCTACAATATGACTCTCTCCAGCCACTTCTGTCCCATCCTGAAAGACTGCATGAAGGGTCAAAGGATGGTCACTGGAAGGATAAATTTTCCCTGTTGTATGGAAAAATTTGCTCAATAACTGCATGGCATTATAGGTTGAACCCTGCATTTCTGACAAGCCAGCAATGATGAGATTTCCCAATGGATGGCCAGCAAAGGCTCCGGCATCCTCAGAGAACCGATACTGAAAGACCTTCTCATAAAACTTAGGCATATCCGACATGGCCACAAGGACATTACGAAGATCACCTGGCGGTGTCAACTGTTGCATATTTTTTCGGAGTTCACCTGAAGAACCACCATCATCTGCCACCGTCACGATAGCTGCGATTTCCACATCTTTTTCCCGCAGACTTTTTAGAATGACGGGAATTCCAGTCCCTCCACCAATCACCGTTATCTTTGGTTTTCTCATGAACGGTTTACCGTTTCCTTTCTGCGGTCTTTGTCGCGATGCCCTTCATTAACAGACCAATTCTTGGATAAGTCCTGCACCAAGCGTTTAGCAAATGCCACACTACGGTGTTGTCCACCCGTACATCCCATGGCAATGGTCAAAACGGACTTACCTTCCTTTTGGTAACTTGGCAGAATCGGCTCAATCAAGGCCAATAAATGTTGATAAAAGTCTTCTGACTCAGGATGGTTCATGACATAATCATAAACAGGTTCATCCACACCCGTTTGGTTTCTCAGTTCTGGTAAATAATAGGGATTTGGCAAGAAACGGACATCAAAGACCAAGTCCGCATCAATCGGGATTCCATACTTAAATCCGAAAGACATGACTTCGATACGGAAAGACTGAGCTTGTTCTTGGTCTGAAAACTGCTCTGCAAGGGTTTTGCGCAGCTCACGTGGAGTGAGTTCAGTCGTATCCACCACATTTTGGCTCATATTTTTCAAAGGTGCCAAGAGTTCACGTTCCAACTTGATTCCATCTAAAATACGACCGTCTGCTGCTAGTGGGTGACTCCGTCTGGTTTCCTTGTAACGAGCGACCAATTCCTTATCAGCCGCATCCAAAAAGAGGATTTTGAAATCCAAACCATCTTGATTTTCCAACTCATCCAAAACAGCTTGAATCTCTGAAAAGAAAGAACGACTACGCATATCCACTACCAAGGCCAACTTAGGATTGTCTTCCTTAATTTCAACCAGCTGCAAAAACTTAGGCAAGAGAGCTGGCGGCATATTATCAATGGTGAAATAACCTAGATCCTCGAAGGACTGAATGGCTACAGTTTTCCCTGCGCCACCCATCCCTGTCACAATCACCAAGTGAAGTTGTTTCTTTGTCATCTTTTTCTCCTTATATCAAAAGAAGTTTGGCAACACCAAACTTCAACTAGCTTATCCAATCTCTGCGATGACTTCAATTTCGACTTTTACATCACGAGGAAGACGAGCTACCTCCACAGCTGAACGAGCTGGGAATTCCTCTTTGAAGGCCGTTTGGTAAACCTCATTAAAAGGAACAAAGTCGTTCATATCGCTCAAGAAGCAAGTTGTTTTGACAACATGGTCAAAGTCTGTTCCTGCTTCTGCCAAAATAGCACCGATGTTTTTCAAGACTTGCTCTGTCTGTTCTTGGATATTCTCTCCTACAATTTCCCCAGTTTCAGGGGATAGGGGAACTTGACCGCTAGCAAACAAAAGGTTGCCAACGATTTTTCCTTGAACATAGGGCCCGATAGCCTTTGGGGCCTTATCTGTATGAATTGTTTTTGCCATTTTCTTTTCCTCACAATTTTTCTAAGATTGCATCCCAAGCCTCATCCATCCCTGCCTTGCTGACAGATGAAAAGAGGATGAAATCGTCACTTGGGTCAAAGTTTAATTTCTTTTTGATTGCTGATTCATGCTTGTTCCATTTACCACGAGGAATCTTGTCCGCCTTGGTCGCCACAATGATGACTGGAATCTCATAATACTTGAGAAATTCGTACATCTGCACATCATCTGCTGACGGGTCATGACGAAGGTCAACTAGACTGACAACCGCACGGAGATTTTCCCGAGTCGTTAAGTACTCCTCAATCATGCACCCCCACTTTTCACGTTCCTTTTTAGAAACACGAGCATAGCCATAACCAGGCACATCCACAAAGCGCATCTTGTCATCAATGTTAAAAAAGTTCAGGAGCTGGGTTTTACCAGGTTTTCCTGATGTACGGGCGAGATTCTTACGGTTCAACATAGTGTTGATAAAGCTGGATTTACCAACATTTGAACGCCCTGCTAGGGCAATCTCTGGCAGTTCATCCTGCGGATAGTGGGACTTATTAGCTGCACTGAGCAAGATTTCAGCATTGTGTGTGTTAAGTTCCATAGTCACCTCTAGGCTGTTTCTAGGATCGGTTTATCCGTTCCATCGACAGTTTCTTTAGTGATGCGAACCAATTTCACATTTTCCTGACTCGGCACCTCAAACATAACATCTAGCATGGTTTCTTCGATGATGGAGCGAAGTCCACGCGCCCCTGTCTTCCGTTCGATTGCTTTATTAGCAATCTCTTGAAGGGCTTCGTCGTCAAATTCCAACTCAACATCATCATAAGAAAGCAAGGTTTGGTACTGTTTCACCAAGGCATTTCTTGGCTCTTTCAAGATGCGAACCAAGTCATCAACGGTCAATTGCTCAAGAGCCGCAAAAACAGGCAAGCGTCCAATCAACTCAGGGATAATACCAAATTTTTGAATGTCTTCAGCGATGATTTCTTGCATGTATGAGCTGTTTTCGTCAATCGCCTTATTGTTTTGACCAAATCCGATGACTTTTTCACCCAGACGTTGTTTGACAATTTCTTCAATACCATCAAAAGCACCACCCACGATGAAGAGGATATTTTTTGTATCCACTTGAATCATCTCTTGTTGTGGATGTTTGCGTCCACCTTGAGGCGGTACGCTAGCAACAGTTCCCTCGATAATCTTGAGAAGGGCTTGTTGCACCCCTTCACCAGAAACATCACGTGTGATAGACACATTCTCACTCTTCTTGGCAATCTTGTCAATTTCATCCACATAGATAATGCCACGCTCTGCACGTTCGATGTTAAAGTCAGCAACCTGCAAGAGTTTGAGGAGGATATTTTCCACGTCCTCACCCACATAACCAGCCTCCGTCAGAGCTGTCGCATCCGCAATAGCAAAAGGCACATTCAAGCTCTTAGCCAAGGTCTGGGCAAGGAAAGTTTTCCCTGAACCAGTTGGGCCAATCATCAAAATGTTTGACTTCTGCAAATCCACATCTTCTGACTCTTCGCGTGTATCGTGGAAATTGATGCGTTTGTAGTGGTTATAAACCGCCACTGCCAAGGCACGCTTGGCACGATCTTGACCAATTACATAGTGGTTCAAGATATGGAGGAGTTCAATTGGTTTTGGCACCTCAGACAAGTCTGCCAAGACTTCCTCAACCAATTCTTCTCGAATGATTTCCTGAGCTAACTCCACGCATTCATTACAAATAAAAGCATTGTTGCCAGCAATTATTTTTTGTACTTCTTCTTGGTTTTTGCCACAAAATGAGCAATAAACCATCATATCATTTTTTCTATTTGTAGACATGATTTCCTTCCATTCTATACTGTCATTCTATCTAAAATAAGGTCATGTAAAAAGCATGAATACTATTGACCAGATTGGTAAAGGCATTTAACCAAAGGAGGATAGAAAGCCCGTAACGCTTTTTACGAAAAGCCTGTGCTCCTGCCAGAAAGCAGATGAAACACAGAAAAGCCGTGAATAGACCAAATAAACTCCGTTCCATTAGACTTCCTTTCTCTTGCGGTATTGGATGGTAAAATCATAAGGATTCTTCTCATCTTTGGCGTAAAATTTGCTTGAAACTGTCTCAAAAAGAGACAAGTCAAGCTCTTCAGGGAAATAGGTATCTCCTTCCACCCGAGCATGAATGTGAGTGACAATCACTTCATCAAGGTAAGGTTCAAAAGCCTGAAAAATTTGCTTCCCACCGATAATGTAGAGATTCTTTTCTTGATCCTGATACCAGTCAAGAACAGACTGGACGTCCTGAAAAGTAGCAACCCCATCTATCTTTTCTTCCGGATTACGCGTCAAAATCAGGGTTTCCCGTTTTGGAAGCAAGCGACGCCCCATCCCATCAAAGGTCACACGCCCCATCAAGATAGCATGATTCAGAGTTGTTTCTTTAAAGTGCTGCAATTCTGCTGGCAAATGCCAAGGCAGACGATTTTCCTTACCAATCAAACCCTCTTCATCCTGGGCCCAAATAGCTACGATTTTCTTAGTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >LS483390|1407981:1414735|1412198_1412786_-|SQG34677.1|DBSCAN-SWA MELNTHNAEILLSAANKSHYPQDELPEIALAGRSNVGKSSFINTMLNRKNLARTSGKPGKTQLLNFFNIDDKMRFVDVPGYGYARVSKKEREKWGCMIEEYLTTRENLRAVVSLVDLRHDPSADDVQMYEFLKYYEIPVIIVATKADKIPRGKWNKHESAIKKKLNFDPSDDFILFSSVSKAGMDEAWDAILEKL >LS483390|1407981:1414735|1408983_1409895_-|SQG34673.1|DBSCAN-SWA MSFTVAVKEEILGQHHLSWHELSAIIKMSGSIGLSTSGLTLSVVTENAKLARHLYESFLHFYEIKSEIRHHQRSNLRKNRVYTVFTDEKVQDLLSDLHLADSFFGLETGIDEAILSDEEAGRAYLCGAFLANGSIRDPESGKYQLEISSVYLDHAQGIASLLQQFLLDAKVLERKKGAVTYLQRAEDIMDFLIVIGAMQARDDFERVKILRETRNDLNRANNAETANIARTVSASMKTINNISKIKDIMGLENLPVDLQEVAQLRIQHPDYSIQQLADSLSTPLTKSGVNHRLRKINKIADEL >LS483390|1407981:1414735|1414058_1414229_-|SQG34679.1|DBSCAN-SWA MERSLFGLFTAFLCFICFLAGAQAFRKKRYGLSILLWLNAFTNLVNSIHAFYMTLF >LS483390|1407981:1414735|1409891_1410869_-|SQG34674.1|DBSCAN-SWA MRKPKITVIGGGTGIPVILKSLREKDVEIAAIVTVADDGGSSGELRKNMQQLTPPGDLRNVLVAMSDMPKFYEKVFQYRFSEDAGAFAGHPLGNLIIAGLSEMQGSTYNAMQLLSKFFHTTGKIYPSSDHPLTLHAVFQDGTEVAGESHIVDHRGIIDNVYVTNALNDDTPLASRRVVQTILESDMIVLGPGSLFTSILPNIVIKEIGRALLETKAEIAYVCNIMTQRGETEHFTDSNHVEVLHRHLGRPFIDTVLVNIEKVPQEYMNSNRFDEYLVQVEHDFVGLCKQVSRVISSNFLRLENGGAFHDGDLIVDELMRIIQVKK >LS483390|1407981:1414735|1414228_1414735_-|SQG34680.1|DBSCAN-SWA MTKKIVAIWAQDEEGLIGKENRLPWHLPAELQHFKETTLNHAILMGRVTFDGMGRRLLPKRETLILTRNPEEKIDGVATFQDVQSVLDWYQDQEKNLYIIGGKQIFQAFEPYLDEVIVTHIHARVEGDTYFPEELDLSLFETVSSKFYAKDEKNPYDFTIQYRKRKEV >LS483390|1407981:1414735|1412794_1414027_-|SQG34678.1|protease|DBSCAN-SWA MSTNRKNDMMVYCSFCGKNQEEVQKIIAGNNAFICNECVELAQEIIREELVEEVLADLSEVPKPIELLHILNHYVIGQDRAKRALAVAVYNHYKRINFHDTREESEDVDLQKSNILMIGPTGSGKTFLAQTLAKSLNVPFAIADATALTEAGYVGEDVENILLKLLQVADFNIERAERGIIYVDEIDKIAKKSENVSITRDVSGEGVQQALLKIIEGTVASVPPQGGRKHPQQEMIQVDTKNILFIVGGAFDGIEEIVKQRLGEKVIGFGQNNKAIDENSSYMQEIIAEDIQKFGIIPELIGRLPVFAALEQLTVDDLVRILKEPRNALVKQYQTLLSYDDVELEFDDEALQEIANKAIERKTGARGLRSIIEETMLDVMFEVPSQENVKLVRITKETVDGTDKPILETA >LS483390|1407981:1414735|1410865_1411756_-|SQG34675.1|DBSCAN-SWA MTKKQLHLVIVTGMGGAGKTVAIQSFEDLGYFTIDNMPPALLPKFLQLVEIKEDNPKLALVVDMRSRSFFSEIQAVLDELENQDGLDFKILFLDAADKELVARYKETRRSHPLAADGRILDGIKLERELLAPLKNMSQNVVDTTELTPRELRKTLAEQFSDQEQAQSFRIEVMSFGFKYGIPIDADLVFDVRFLPNPYYLPELRNQTGVDEPVYDYVMNHPESEDFYQHLLALIEPILPSYQKEGKSVLTIAMGCTGGQHRSVAFAKRLVQDLSKNWSVNEGHRDKDRRKETVNRS >LS483390|1407981:1414735|1407981_1408950_+|SQG34672.1|DBSCAN-SWA MSQLYDITIVGGGPVGLFAAFYAHLRQAKVQIIDSLPQLGGQPAILYPEKEILDVPGFPNLTGEELTNRLIEQLNGFDTPIHLNETVLEIDKQEEEFAITTSKGSHLTKTVIIAMGGGAFKPRPLELEGVEDYENIHYHVSNIQQYAGKKVTILGGGDSAVDWALAFEKIAPTTLVHRRDNFRALEHSVQALQESSVTIKTPFAPSQLLGDGKTLDKLEITKVKSDETETIDLDHLFVNYGFKSSVGNLKNWGLDLNRHKIIVNSKQESSQAGIYAIGDCCYYDGKIDLIATGLGEAPTAVNNAINYIDPEQKVQPKHSTSL >LS483390|1407981:1414735|1411807_1412188_-|SQG34676.1|DBSCAN-SWA MAKTIHTDKAPKAIGPYVQGKIVGNLLFASGQVPLSPETGEIVGENIQEQTEQVLKNIGAILAEAGTDFDHVVKTTCFLSDMNDFVPFNEVYQTAFKEEFPARSAVEVARLPRDVKVEIEVIAEIG |
9 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1648923 : 1673261
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS483390|1648923:1673261|DBSCAN-SWA TATGGAACAATTACATTTTATCACAAAATTACTAGACATTAAAGACCCTAATATCCAGATTTTAGACATCATCAATAAGGATACACACAAGGAAATCATCGCCAAACTGGACTACGACGCCCCATCTTGCCCTGAGTGCGGAAACCAATTGAAGAAATATGACTTTCAAAAACCGTCTAAGATCCCTTACCTCGAAACAACTGGTATGCCTTCTAGAATTCTCCTTAGAAAACGCCGTTTCAAGTGCTATCACTGTTCAAAAATGATGGTCGCTGAAACTTCTATCGTCAAGAAGAATCATCAAATTCCTCGTATTATCAACCAAAAAATTGCGCAAAAGTTGATTGAGAAGATTTCTATGACCGATATTGCTCATCAGCTGGCCATTTCAACTTCAACTGTCATTCGCAAGCTCAATGATTCTCACTTTGAGCATGATTTTTCGCGTCTTCCTGAGATTATGTCCTGGGACGTTGAAACAGTCCGGGGAGTGACTGTTTCAATCGGGAGATGGAGATGAGCTTTATTGCGCAAGATTTTAACAATCTCAATATCATCACTGTTCTTGAGGGAAGAACACAAGCTATCATTCGAAATCACTTTCTTCGCTACGATAGAGCCGTCCGATGTCGCGTCAAAATCATTACTATGGATATGTTTAGCCCTTACTATGGCTTGGCTAAACAGCTTCGCTTTCAAATTTCTAGGCTCAGGCTGAAACAGTCTCCCAGACTGTTTCACTCCCGAATGCTAAAATCGTTCTTGATCGCTTTCACATTGTACAACATCTTAGCCGTGCTATGAGTCGTGTGCATGTCCAAATCATGAATCAGTTTCATCGAAAATCCCATGAATACAAGGCTATCAAGCGCTACTGGAAACTCATTCAACAGGATAGCCGTAAACTGAGTGATAAACGTTTTTATCGTCCTACTTTTCGTATGCACTTAACCAATAAAGAGATTTTAAACAAGCTTTTGAGCTATTCACAAGACTTGAAACACCACTATCAGCTCTTGCTGTTTCACTTCCAGAATAAGGAACCAGAGAAATTTTTCGGGCTTATTGAGGACAATCTAAAGCAGGTTCATCCTCTTTTTCAGACTGTCTTTAAAACCTTTCTAAAGGACAAAGAGAAAATCGTCAACGCCCTTCAACTACCCTATTCAAACGCCAAATTGGAAGCGACCAATAATCTCATCAAACTTATCAAACGCAATGCCTTTGGTTTTCGAAACTTTGAAAACTTCAAAAAACGGATTTTTATCGCTCTGAATATCAAAAAAGAAAGGACAAAATTTGTCCTTTCTCGAGCTTAGCTTTTTTTCAACCCACTACAGTTGACAAAGAGCCGGAAATTGTCTGAGCATTCTTTTATCTAGTCGTTTAAGGAAGTTGAGTTCAGTATGTTTAAAGTCTCTGTCCCATCATTTCTTCAACAAACCTTGTTCTTGGAGAAACTCCTTGGCTACTTGCTTTGCTGACTTGCCTTCAACACCGACTTGGTAGTTGAGCTGGCTCATCTGGCTTTCTGTAATCTTACCAGCCAATGTATTAAGAACTCTTTCCAACTCTGGGTGTTTCTTGAGAAGAGCTTCTTTCATGAGTGGAGCCCCTTGATAAGGTGGGAAGAGTTGCTTGTCATCTTCCAAGACCTGTAAATCATAACGCTCCAATTCCGCATCAGTCGAATAGGCATCCGTGATTTGAATATCCCCTGAATGAATTGCCTGATAACGAAGAGCTGGCTGCATAGTCGCCACATTGAGATTGAGACCATACATTGATTGCAAGCCCTTATTTCCATCTTCACGGTCGTTAAACTCAAGCGTAAAGCCTGCCTTCAGCTGCCCTTCCACTTTTTTCAAATCCGAAATGGTCTTCAAGCCATATTCTTGAGCAATCTTTTTCGGAACAGCTACAGCATAGGTATTTTGATAAGACATAGGTTTGAGATAGGCTAGATGATCCTGCTTGGCAATGCCATCACGCGCCACTTGATAAACCTGCTCTGGCTCATGACTCACCTTGGGTGATGGTTGAAGCAAACTTTCAGTCACCGTACCGGTAAATTCAGGATAAATGTCAATATCACCTTTTTTCAGAGCTTCATAAAGGAAACTTGTCGTCCCAAAATTCGGTTTAACAGTCGCAGTCATGCTGGTATTTTCTTCAATCAGCAATTTATACATATTAGCCAAAATTTCTGGTTCTGGGCCTATTTTCCCAGCAATAATCAAGTTTTCCTTCTCTTTTTGAGCCAAAAGGGCTGGACTATAAGACAGACCCAGTAATAAAGCCATCAAGGCAAAACCAGAGAAAATCGTCCGCAATTTCGCTTTTTCCATTACTTTTAGTAGGAAGTTAAAGGCAATAGCTAGCACTGCAGAAGAAAGGGCCCCAATCAAAATCAAACTGGCATTATTACGGTCAATTCCCAACAGGATAAAGGAACCCAGTCCCCCTGCCCCAATCAAGGTCGCCAAGGTAGCCGTACCGATAATCAAGACCGCTGCCGTCCGAATTCCAGACATGATAACAGGCATGGCAAGTGGAATTTCAAACTTCTTGAGACGCTCCCATCTGGTCATCCCAAAGGCAATCCCAGCCTCTTGAAGACTCGGATCAATTCCCTTCAGCCCAGTAATAGTATTTTGTAAAATCGGAAAAATCGCATAAATCACTAGAGCTGTCAATGCCGGTAAAGTCCCAATTCCCATCAAGGGAATAAAGAGTCCCAACAAGGCCAGAGACGGGATGGTCTGGAAAATCCCTGCAATCTGTAAGACCCAATCCGCCAACTTCTCATGATAGCGAAGATAAACAGCCAAGGGAATCGCAAGCAAAATAGCTAGTAACAAGGTCAAAAGTGACAACTGCAAATGTTGAGATAGGGCTGTCAACCAATCACCAAAACGATCCTGAAAAGTTGCAATTAAATTAGTCATGAATACTACCTCCAAACAAGTCTGCAACAAAGTCTGTTGCAGGAGCTTTTAAAATAGTCTCAGGATTCGACACCTGACGAATCTCTCCATCCTGCAAGACAGCAATACGATCTGCCAACTTTAAGGCTTCATCCGTATCATGAGTCACAAAAATCGTTGTCATCCCAAACTCTTTATGTAATTCTTTTGTCAGAACCTGCAACTGCTTGCGAGAAATAGCATCCAAGGCTGAAAAGGGTTCATCCATGAGGAGAATCTTGGGCTGACCAATCATAGCTCGGACAATACCGACCCGTTGCTGTTCTCCACCAGATAGCTCACTTGGAAGTCGATGCCCATACTCAGCTACTGGTAAACCAACCTTAGCCAAAAGCTCTTCTGTTTTTTGAGCAATTTCTTCCTTAGTCCAACCCTTCATTTCAGGAATGAGAGCAATATTTTCCTCAACTGTTAGATTGGGAAAGAGAGCAATAGCCTGTAAAACATAACCAGTAGAAAGACGAAGTTCACGCTCATCATAGTCTTTGATGCGCTTCCCATCCATATAAATATTTCCATCAGTTGGTTCCAAAAGACGGTTAATCATCTTGAGCATGGTCGTCTTACCTGACCCAGAAGGCCCTACTAAAACCATAAATTCCCCATCCTCAATCTGTAAGTTGACATCTCTCAAGACATCCTTTTCTGTGTAGCGCAGTGCTACATTTTTGTATTCAATCATTCTTTGTCCTCAATTTAAAACTTCCCTCGATTAGTCAAGTCTTCTACCTTAGGCATGACTTCCTTATTATCCCAATGCTCCACAATTTTCCCGTTCTCTAAACGGAAGATATCGTACTGGGCATAAGCAACGCCATCAATCTGAGTCTGACCATAGCTAACCACATAGTTTCCTTGTCCTAAGAGTTGGAAAACAAAGTCAAAAGTGACACTATATTCAGCCACATAGTTTTTATAAGCAGCACTTCCTTGTCCAATCTCATGATTATGCTGAATCAAATCGTCTGCCACATAATCACTCCACTGCTCTAGCTCCCCATTTTGGAAAATTTCTGTCAAGAAACGGCGAACCAGCTTTTTATTTTCTGCTTTCTTATCCAAATCCTTGATTTCAAAATCTCCAAAAATTTGATCTAGTTGGTCATTTTCAGGTGTTCGATAGTAGTCAATGACATCCCAATGCTCAACAATACAACCATTCTCATCCTCACGGAAAGTATCCGTCGTCACCCATTGAGCTTCTCCACCATTCAGATATTGATGAACATGAACAAAGACCAGATTGCCATCCTCAATGGTGCGGACAATCTTAATCTGACGCTCTGGATGACGCTCAAAGAAATCTGCAAAGAAGGCTGCAAATCCTTCTTTCCCGTCAGGAACACCTGTCGAATGTTGGATATAGGTATCCCCTACAGACTGGGCTTGAGCCTCAGCAACTCGCCCGTCTTGAATGGCATGGATGTATAGGTTGTGAGCATTTTTCACTTGTTGTGACATATTCTAAACCTCATTTCCCTTCTCTTTCAGATTCGCCAAAATTCTTTCTTGAAAACCTTCAAATTGGTGAATTTCTTCCTCTGAAAATCCTTTGTAAAAGATAGTATCCAATTTCTGACTGACACGATGCCCCACTTCTTTCTGGGACTTGCCTAACTCCGTTAAAACTAAATACTTCTTACGCTTGTCTTTTCCACACGGACTAACAATTACAAGCTTTTGTTCCTCTAGCTTTTTTATCATAGTCGTCAGCGTATTATTCGCAAGTCCAGTCGCAAGCGCGATATCTGTCGCAGTTGCGCAGCCAGTTTCACTATTCCATAAAACCGCTAAAATCTTGCCCTGTTCACCCCTATAAAGAGCCTCAGGATCTTGACTCAGTAACTTTTGAAAAATCCGCCCATTCAACAAACGAATATGATGGGCTAGCAAATGACCATCTTTCATAACACCTCCAATTTATTTCGATATCGAAATGAATAAAACAATTGTAACACTCATCGTTCTAACTGTCAACTATTTCGATTTAGAAATAATTTTTGATAATTATCC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_13 >LS483390|1648923:1673261|1656281_1656983_+|SQG34924.1|DBSCAN-SWA MTKTILVTGGTSYIGSHTVKALLNAGYQVHILDNLSTGNRAAVDSRASFKELDVYDASALKAYLEENQIDAVLHYTGEIVVSESIENPSKYFTANVAGMNQVLKVLSEVGIQKIMFSSTASLYGNNCIDKPVTEDTLLDPVNPYAETKLMGERMIYWMANRYDWKYVIFRYFNVAGAEMDASNGLRVKNPTHIIPNINKTALGQNDSLKIFGDDYDTRDGSCIRDYIYVLDLA >LS483390|1648923:1673261|1667267_1667516_-|SQG34938.1|DBSCAN-SWA MDLLLAIVLIVLAFLGGALGGMYLVRKQIEKEFADNPRLNAEAVRTLLSANGQKPSEAKVQQVYHQIIRQQKAALANNKKKK >LS483390|1648923:1673261|1667657_1669283_-|SQG34939.1|DBSCAN-SWA 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28 | Streptococcus_phage(33.33%) | integrase,transposase,holin | attL 1656906:1656922|attR 1666131:1666147 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_14 |
1691506 : 1743575
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >LS483390|1691506:1743575|DBSCAN-SWA 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52 | Streptococcus_phage(45.45%) | tRNA,protease,transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_15 |
1870417 : 1930563
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >LS483390|1870417:1930563|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_phage(27.27%) | tRNA,protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_16 |
1988910 : 2026393
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >LS483390|1988910:2026393|DBSCAN-SWA 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MELVHGISTHFIQSKKFKTNKITVRFTAPLSLDTIAGHMLSASMLETANQMYPTSQDLRRHLASLYGTDMSTNCFRRGQSHIIELTFTYVRDEFLSRKNVLTSQILELVKETLFSPAVVDNGFDPALFEIEKKQLLASLAADMDDSFYFAHKELDKLFFHDERLQLEYSDLRNRILAETPQSSYSCFQEFLANDRIDFFFLGDFNEVEIQNVLESFGFKGRKGDVKVQYCQPYSNILQEGMVRKNVGQSILELGYHYRSKYGDEQHLPMIVMNGLLGGFAHSKLFTNVRENAGLAYTISSELDLFSGFLRMYAGINRENRNQARKMMNNQLLDLKKGYFTEFELNQTKEMIRWSLLLSQDNQSSLIERAYQNALFGKSSADFKSWIAKLEQIDKDAICRVANNVKLQAIYFMEGIE >LS483390|1988910:2026393|2007322_2008621_-|SQG35250.1|DBSCAN-SWA MKVNLDYLGRLFTENELTEEERQLAEKLPAMRKEKGKLFCQRCNSTILEEWYLPIGAYYCRECLLMKRVRSDQTLYYFPQEDFPKQDVLKWRGQLTPFQEKVSEGLLQAVDKQKPTLVHAVTGAGKTEMIYQVVAKVINAGGAVCLASPRIDVCLELYKRLQQDFSCGIALLHGESEPYFRTPLVVATTHQLLKFYQAFDLLIVDEVDAFPYVDNPMLYHAVKNSVKENGLRIFLTATSTNELDKKVRLGELKRLNLPRRFHGNPLIIPKPIWLSDFNRYLDKNRLSPKLKSYIEKQRKTAYPLLIFASEIKKGEQLAEILQEQFPNEKIGFVSSVTEDRLEQVQAFRDGELTILISTTILERGVTFPCVDVFVVEANHRLFTKSSLIQIGGRVGRSMDRPTGDLLFFHDGLNASIKKAIKEIQMMNKEAGL >LS483390|1988910:2026393|2000378_2001725_-|SQG35243.1|holin|DBSCAN-SWA MKILPFIARGTSYYLKMSVKKLVPFLVVGLMLAAGDSVYAYSRGNGSIARGDDYPAYYKNGSQEIDQWRMYSRQCTSFVAFRLSNVNGFEIPAAYGNANEWGHRARREGYRVDNTPTIGSITWSTAGTYGHVAWVSNVMGDQIEIEEYNYGYTESYNKRVIKANTMTGFIHFKDLDSGSVGNSQSSASTGGTHYFKTKSAIKTEPLVSATVIDYYYPGEKVHYDQILEKDGYKWLSYTAYNGSYRYVQLEAVNKNPLGNSVLSSTGGTHYFKIKSAIKTEPLVSATVIDYYYPGEKVHYDQILEKDGYKWLSYTAYNGSRRYIQLEGVTSSQNYQNQSGNISSYGSNNSSTVGWKKINGSWYHFKSNGSKSTGWLKDGSSWYYLKLSGEMQTGWLKENGSWYYLGSSGAMKTGWYQVSGEWYYSYSSGALAINTTVDGYRVNSDGERV >LS483390|1988910:2026393|1999111_1999870_-|SQG35241.1|DBSCAN-SWA MRNLKSILRRHISLLGFLGVLSIWQLAGFLKLLPKFILPTPLEILQPFVRDREFLWHHSWATLRVALLGLILGVLIACLMAVLMDSLTWLNDLIYPMMVVIQTIPTIAIAPILVLWLGYGILPKIVLIILTTTFPIIVSILDGFRHCDKDMLTLFSLMRANPWQILWHFKIPVSLPYFYAGLRVSVSYAFITTVVSEWLGGFEGLGVYMIQSKKLFQYDTMFAIIILVSIISLLGMKLVDISEKYVIKWKRT |
38 | Streptococcus_phage(50.0%) | protease,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483390.1|SQG34920.1|1652605_1653370_-|lipoprotein |
1652605_1653370_-
Protein sequences of LS483390.1|SQG34920.1|1652605_1653370_-|lipoprotein>LS483390.1|SQG34920.1|1652605_1653370_-|lipoprotein MSQQVKNAHNLYIHAIQDGRVAEAQAQSVGDTYIQHSTGVPDGKEGFAAFFADFFERHPERQIKIVRTIEDGNLVFVHVHQYLNGGEAQWVTTDTFREDENGCIVEHWDVIDYYRTPENDQLDQIFGDFEIKDLDKKAENKKLVRRFLTEIFQNGELEQWSDYVADDLIQHNHEIGQGSAAYKNYVAEYSVTFDFVFQLLGQGNYVVSYGQTQIDGVAYAQYDIFRLENGKIVEHWDNKEVMPKVEDLTNRGKF |
254 aa aa | NA | NA | NA | 1648923-1673261 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 3.1|1691950|28|LS483390|CRISPRCasFinder matches to LS483390 position: 1650247-1650274, mismatch: 0 tttcaacccactacagttgacaaagagc CRISPR spacer tttcaacccactacagttgacaaagagc Protospacer **************************** |