Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483407 | Streptococcus pyogenes strain NCTC13744 genome assembly, chromosome: 1 | 2 crisprs | DinG,csm6,cas9,cas1,cas2,csn2,cas3,DEDDh,csa3 | 0 | 5 | 8 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483407_2 | 781240-781605 | TypeII |
II-A
Consensus repeat of LS483407_2
|
5 spacers
spacers of LS483407_2
>2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GCTTACAAAAGCAAGTACAGTCTGCAATAG >2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTAAAACATGGTCTGCTATTAAATCCAAGC >2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT TTATAGAAAGAGAAAGTAACAGTAAAACAG >2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CTATCTAGTAAGTCAATCGCATTTCCCCAA >2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT CTGTTCGATAAATAGAAGTGTCCCAGAATG |
csn2,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483407_2
The CRISPR arrays of LS483407_2 >merge|LS483407|2|781240-781605|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACGCTTACAAAAGCAAGTACAGTCTGCAATAGGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACCTAAAACATGGTCTGCTATTAAATCCAAGCGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACTTATAGAAAGAGAAAGTAACAGTAAAACAGGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACCTATCTAGTAAGTCAATCGCATTTCCCCAAGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACCTGTTCGATAAATAGAAGTGTCCCAGAATGGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCTCCATTC >LS483407|2|1|781240-781539|PILER-CR GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC GCTTACAAAAGCAAGTACAGTCTGCAATAG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CTAAAACATGGTCTGCTATTAAATCCAAGC GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC TTATAGAAAGAGAAAGTAACAGTAAAACAG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CTATCTAGTAAGTCAATCGCATTTCCCCAA GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC >LS483407|2|2|781240-781605|CRISPRCasFinder GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC GCTTACAAAAGCAAGTACAGTCTGCAATAG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CTAAAACATGGTCTGCTATTAAATCCAAGC GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC TTATAGAAAGAGAAAGTAACAGTAAAACAG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CTATCTAGTAAGTCAATCGCATTTCCCCAA GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CTGTTCGATAAATAGAAGTGTCCCAGAATG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCTCCATTC >LS483407|2|1|781240-781605|CRT GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC GCTTACAAAAGCAAGTACAGTCTGCAATAG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CTAAAACATGGTCTGCTATTAAATCCAAGC GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC TTATAGAAAGAGAAAGTAACAGTAAAACAG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CTATCTAGTAAGTCAATCGCATTTCCCCAA GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CTGTTCGATAAATAGAAGTGTCCCAGAATG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCTCCATTC
>LS483407.1|SQG73015.1|780474_781137_+|CRISPR-associated-family-protein MNLNFSLLDEPIPLRGGTILVLEDVCVFSKIVQYCYKYEEDSELKFFDRKMKTIKESEIMLVTDILGFDVNSSTILKLIHADLESQFNEKPEVKSMIDKLVATITELIVFECLENELDLEYDEITILELIKSLGVKVETQSDTIFEKCLEILQIFKYLTKKKLLIFVNSGAFLTKDEVASLQEYISLTNLTVLFLEPRELYDFPQYILDEDYFLITKNMV >LS483407.1|SQG73014.1|780173_780485_+|CRISPR-associated-Cas2-family-protein MFDMPTDTAEERKAYRKFRKFLLSEGFIMHQFSIYSKLLLNNTANNAMIGRLREHNPNKGNITLLTVTEKQFARMIYLHGERNNCIANSDERLVFLGEAFDES >LS483407.1|SQG73013.1|779277_780147_+|cytoplasmic-protein MAGWRTVVVNTHSKLSYKNNHLIFKDAYKTELIHLSEIDILLLETTDIVLSTMLVKRLVDENVLVIFCDDKRLPTAMLMPFYGRHDSSLQLGKQMSWSETVKSQVWTTIIAQKILNQSCYLGACSYFEKSQSIMDLYHGLENFDPSNREGHAARIYFNTLFGNDFSRDLEHPINAGLDYGYTLLLSMFAREVVVSGCMTQFGLKHANQFNQFNFASDIMEPFRPLVDKIVYENRNQPFPKIKRELFTLFSDTFVYNGKEMYLTNIVSDYTKKVVKALNNEGKGVPEFRI >LS483407.1|SQG73012.1|775171_779278_+|CRISPR-associated-protein,-Csn1-family MDKKYSIGLDIGTNSVGWAVITDDYKVPSKKLKVLGNTDRHGIKKNLIGALLFDSGETAEATRLKRTARRRYTRRKNRICYLQEIFSNEMAKVDDSFFHRLEESFLVEEDKKHERHPIFGNIVDEVAYHEKYPTIYHLRKKLADSTDKVDLRLIYLALAHMIKFRGHFLIEGDLNPDNSDVDKLFIQLVQTYNQLFEENPINASRVDAKAILSARLSKSRRLENLIAQLPGEKKNGLFGNLIALSLGLTPNFKSNFDLAEDAKLQLSKDTYDDDLDNLLAQIGDQYADLFLAAKNLSDATLLSDILRVNSEITKAPLSASMIKRYDEHHQDLTLLKALVRQQLPEKYKEIFFDQSKNGYAGYIDGGASQEEFYKFIKPILEKMDGTEELLAKLNREDLLRKQRTFDNGSIPYQIHLGELHAILRRQEDFYPFLKDNREKIEKILTFRIPYYVGPLARGNSRFAWMTRKSEETITPWNFEEVVDKGASAQSFIERMTNFDKNLPNEKVLPKHSLLYEYFTVYNELTKVKYVTEGMRKPAFLSGEQKKAIVDLLFKTNRKVTVKQLKEDYFKKIECFDSVEISGVEDRFNASLGTYHDLLKIIKDKDFLDNEENEDILEDIVLTLTLFEDREMIEERLKTYAHLFDDKVMKQLKRRRYTGWGRLSRKLINGIRDKQSGKTILDFLKSDGFANRNFMQLIHDDSLTFKEDIQKAQVSGQGDSLHEHIANLAGSPAIKKGILQTVKVVDELVKVMGRHKPENIVIEMARENQTTQKGQKNSRERMKRIEEGIKELGSDILKEYPVENTQLQNEKLYLYYLQNGRDMYVDQELDINRLSDYDVDHIVPQSFLKDDSIDNKVLTRSDKNRGKSDNVPSEEVVKKMKNYWRQLLNAKLITQRKFDNLTKAERGGLSELDKVGFIKRQLVETRQITKHVAQILDSRMNTKYDENDKLIREVRVITLKSKLVSDFRKDFQFYKVREINNYHHAHDAYLNAVVGTALIKKYPKLESEFVYGDYKVYDVRKMIAKSEQEIGKATAKYFFYSNIMNFFKTEITLANGEIRKRPLIETNGETGEIVWDKGRDFATVRKVLSMPQVNIVKKTEVQTGGFSKESILPKRNSDKLIARKKDWDPKKYGGFDSPTVAYSVLVVAKVEKGKSKKLKSVKELLGITIMERSSFEKDPIDFLEAKGYKEVRKDLIIKLPKYSLFELENGRKRMLASAGELQKGNELALPSKYVNFLYLASHYEKLKGSPEDNEQKQLFVEQHKHYLDEIIEQISEFSKRVILADANLDKVLSAYNKHRDKPIREQAENIIHLFTLTNLGAPAAFKYFDTTIDRKRYTSTKEVLDATLIHQSITGLYETRIDLSQLGGD >LS483407.1|SQG73011.1|774060_774693_+|membrane-protein MVENTKLLCSWVWLLALAILITIYSTWLWYPLEVDHLKLEQVVFMSKDAILHNYNGLLNYLTNPFVTRLEFANFHSSADGLKHFADVKWLFHLTQVVFLGLLYPTLKTFTQRLKTKRFWLLQKPLILAALFPLMIGLMASFIGFEHFFTLFHQVLFVGDSSWLFDPLKDPVIWILPEVFFLHCFLFFMIVYEIILWSLVGLARWQRLNVE >LS483407.1|SQG73010.1|773296_774061_+|haloacid-dehalogenase-like-hydrolase MPYKGYLIDLDGTIYQGENRIPAGERFIKRLQERGIPYLLVTNNTTRTPEMVQSMLANQFNVETGIETIYTATMATVDYMNDMNRGKTAYVIGETGLKSAIAAAGYVEELENPAYVVVGLDSQVTYETLAIATLAIQKGALFIGTNPDLNIPTERGLMPGAGALNALLEAATRVKPVFIGKPNAIIMNKSLEVLGIQRSEAVMVGDNYLTDIMAGIQNDIATILVTTGFTRPEEVPTLPIQPDHVLSSLDEWRL >LS483407.1|SQG73009.1|772544_773297_+|oleoyl-[acyl-carrier-protein]-hydrolase MGLSYQEELTLPFELCDVKSDIKLPLLLDYCLMVSGRQSAQLGRSNNNLLVDYKLVWIVTDYEITIHRLPHFQETITIETKALSYNKFFCYRQFYIYDQEGDLLVDILAYFALLNPDTRKVATIPEDLVAPFETDFVKKLHRVPKMPLLEQSIDRDYYVRYFDIDMNGHVNNSKYLDWMYDVLGCAFLKTHQPLKMTLKYVKEVSPGGQITSSYHLDQLTSYHQIISDGQLNAQAMIEWRAIKQTESETD >LS483407.1|SQG73008.1|771338_772535_+|coproporphyrinogen-III-oxidase MKNQGKWFIHRNILSSKWYNKTMSKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIQNQPVDAYLRALIQEFDSYGIRDLKTLYIGGGTPTAITAKQLEYLLNHLERNLNLDDLEEFTIEANPGDLTPEKIAVLQRSAVNRISLGVQTFNNKQLKQIGRSHNEEQIYSTIANLKAAGFHNISIDLIYALPGQTLDQVKENVAKALALDIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLNLPTEDLEAEMFEYIISEMEANGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYFGCGAGASGYLNGIRYQNRVPIQHYLKAVEAGNARLNEEVLRKEEMMEEELFLGLRKKTGVSIQRFQEKFGISFEERYGNIVRELQNQGLLVKDDAFVRMTKKGLFLGDSVAERFILD >LS483407.1|SQG73007.1|770700_771342_+|acetyltransferase-GNAT-Family MTKQQIEKLADLLPPFAATLYLDMIPEFQEGYASYVYQTPKQDIQKRRIKQLTKNFERLLDTPSFYVMPVTRKTAEQLLADKGLAYHLLSTVAANQVFAAAVNEDQTLFQVLRNGARVAFVILQEKGEFLEMTLGILETVTENEVPAAIVEAVQTYLLTDMQEKLPSLSIMVSQESSKLFYQEQGFVLLAKGCKPGNENDSDVCQLVKYFSKP >LS483407.1|SQG73006.1|769221_770577_+|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGEANVELTPELAFKLGRFGGYVLSQHETERPKVFVARDTRISGEMLESALIAGLLSVGIEVYKLGVLATPGVSYLVRTEKASAGVMISASHNPALDNGIKFFGNDGFKLADDQELEIEALLDAPEDTLPRPSAEGLGTLVDYPEGLRKYEKFLVTTGTDLSGMTVALDTANGAASVSARDVFLDLNAEIAVIGEKPNGLNINDGVGSTHPEQLQELVKETGADLGLAFDGDSDRLIAVDETGEIVDGDRIMFIIGKYLSEKGLLAHNTIVTTVMSNLGFHKALDKQGINKAITAVGDRYVVEEMRSSGYNLGGEQSGHVIIMDYNTTGDGQLTAIQLAKVMKETGKSLSELAAEVTIYPQKLVNIRVENSMKERAMEVPAIANIIAKMEDEMAGNGRILVRPSGTEPLLRVMAEAPTDAEVDYYVDTIADVVRTEIGCDN >LS483407.1|SQG73016.1|781717_781915_+|nucleoside-diphosphate-kinase-protein-Ndk MEQTFFMIKPDGVKQGEVVGEVLRWNERLRLTFERLELRQASQELLAKHDEALVINLLILNLKLT >LS483407.1|SQG73017.1|782248_784081_+|GTP-binding-protein-LepA MNSQDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRHEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGDVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGIVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYVAASIKTVADTRVGDTVTLANNPAKEALHGYKQMNPMVFAGIYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVHTTDEDMIEVSNPSEFPDPTRVAFIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELSQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYDMSEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKIIVEKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDTKK >LS483407.1|SQG73018.1|784269_785742_+|Collagen-like-surface-protein MNKTKQNKTKQNKTKQNKTKHSLLCRYGLTSAAALLLTFGGVSAVKADEQSNIEALQSQLQALRENLPKVGDNIPKHDVFRQHVFYKHLEEFEARLDFYLKTLDGSLSQLQGPRGEQGLRGEAGPEGPQGKTGPAGPVGPAGPRGAQGLRGEAGPAGPVGPAGPRGAQGLRGEAGPEGPQGPAGKDGEDGAKGETGPAGPAGPRGEQGLRGETGPEGPQGPAGKDGEDGAKGETGPAGPAGPRGEQGLRGETGPEGPQGKTGPAGPAGPRGEQGLQGDRGETGAKGDRGETGPAGPAGKDGEAGAQGPMGPAGQNGKDGLPGKDGKDGQDGKDGQNGKDGLPGKDGKDGQNGKDGLPGKDGKDGQDGKDGLPGKDGKDGQDGKDGQPGKPAPKTPEVPQKPDTAPHTPKTPQIPGQSKDVTPAPQNPSNRGLDKPQTQGGNQLAKTLAAHDTHRQLPATGETTNPFFTAAAVAIMTTAGVVAVAKRQENN >LS483407.1|SQG73019.1|785927_786365_+|methionine-sulfoxide-reductase-B MEISDELKQRIGDLSYEVTQHAATESPFTGEYDDFFEKGIYVDIVSGEVLFSSLDKFNSGCGWPAFSKPIENRMVTNHDDSSYGMRRVEVKSREAGSHLGHVFSDGPKEAGGLRYCINSAALKFIPYEQMEKEGYAQWLTLFDET >LS483407.1|SQG73020.1|786494_787514_+|hypothetical-membrane-spanning-protein MSTHLRKLPGLLLCLLLALPAWYLGRLFPIIGAPVFAILLGMLLALFYEHRDKTKEGISFTSKYILQTAVVLLGFGLNLTQVMAVGMQSLPIIISTIATALLVAYGSQKWLRLDFNTATLVGVGSSICGGSAIAATAPVIKAKDDEVAKAISVIFLFNMLAALLFPSLGQLLGLSNEGFAIFAGTAVNDTSSVTATATAWDALHHSNTLDGATIVKLTRTLAILPITLGLSLYRAKKEHDIVTEENFSLRKSFPRFILFFLLASLITTLMTSFGVSADVFHSLKTLSKFFIVMAMAAIGLNTNLVKLIKTGGQAILLGAICWVAITLVSLAMQLSLGIW >LS483407.1|SQG73021.1|787720_788146_+|PTS-system-mannose-specific-transporter-subunit-IIA MKRKFLIGSHGRLASGLQSSIDILAGMGQALETIDAYVDDSDYTSQIDDFIAGVAADEQGLIFTDLLGGSVNQKMVTAVMNSGKDNIFLITNSNLATLLSLVFLKPGEALTKDEIVTVINESQVQLVDLVPETNSEDDFFD >LS483407.1|SQG73022.1|788164_788656_+|PTS-system-mannose/fructose-family-transporter-subunit-IIB MITQIRVDDRLIHGQVAVVWTKELNAPLLVVANDEAAKNEITQMTLKMAVPNGMKLLIRSVEDSIKLFNDPRATDKRIFVIVNSVKDACAIAKEVPDLEAVNVANVGRFDKSDPASKVKVTPSLLLNPEEMAAAKELVSLPELDVFNQVLPSNTKVHLSQLVN >LS483407.1|SQG73023.1|788672_789482_+|PTS-system,-mannose-specific-IIC-component MLVPATMAALAVLICFGGNYLTGQSMMERPLVVGLVTGLLLGDMKVGILMGASLEALFLGNVNIGGVIAAEPVTATAMATTFTIISHIDQKAAMTLAVPIGMLAAFVVMFLKNVFMNIFAPMVDKAAAANHQGKLVMLHYGTWIIYYLIIASISFIGILVGSGPVNAFVEHIPQNLMNGLSAAGGLLPAVGFAMLMKLLWTNKLAVFYLLGFVLTAYLKLPAVAVAALGAVICVISSQRDLELDAITRGAISKQTTFDSKESEEEDFFA >LS483407.1|SQG73024.1|789478_790306_+|phospotransferase-system-(PTS),-enzyme-II-component-D MTSQDNLTKEDRKMLRSVFWRSWTMNASRTGATQYHAVGVIYTLLPVINRFYKTDKDKAEALVRHTTWFNATMHINNFIMGLVASMEKKNSEDPDFDASAITAVKASLMGPISGVGDSFFWGILRVIAAGIGISLASAGSAMGAVVFLLLYNIPAFIIHYYSLYGGYSVGAGFIKKLYESGGIKIVTKTSSMLGLMMVGSMTASNVKFKTILTVAAKGAKEAASIQDYLDQLFIGIVPLLVTLAAFWLLRKKVNINWIMFGIMFLGIILGLLGIC >LS483407.1|SQG73025.1|790441_792091_+|two-component-sensor-kinase MRGEQVEEHFKKQLQDDISRHFSYQSLMLSLLLIGLFIIFSLAPQQLGLYRDINATATRYHRLISKQEALLDDLGKNSLLPFLNKNLSTADLSKHYFHLRHSSQTSPELLLFSSNQGLLFASNPHLGNAFSKSVYIQEVLRAAHPPKTLFKVAMDSEDGHYLMIIKPMIDQNQLKGYAFLVMSGKDFLHPTKTLTSELVIADKLDNTFTFSNREFIASSLDKINSQYLHHYFVFQDNRAFITRKVALQGGLWLYMYRPLIPMVSVMLFSLISSAVIFVILQRKSSGLANRIAAKNSRAINQMVRDMSAISRQEKRRIDLESQDEFQYLSDQINQMVERLQQLHDKTLDLETQKLLFEKRMLEAQFNPHFLYNTLETILITSHYDSALTEKIVIQLTKLLRYSLTDSSKPVLLKDDLSVIESYLVINQVRFEELQYSINLSPDLDSLAVPKLFLLPLIENAIKYGLKERHDVKINIACYYQDDHIIFSVRDNGSGIDAHHQKVIREQLEAGESHHGLINSYRRLKYHFSEVSLVFDQGDKQFNVSYHVKE |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483407_3 | 960201-960302 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483407_3
|
1 spacers
spacers of LS483407_3
>3.1|960225|54|LS483407|CRISPRCasFinder CCGATAAAAACAGTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483407_3
The CRISPR arrays of LS483407_3 >merge|LS483407|3|960201-960302|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATACCGATAAAAACAGTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACATAAAATTGGTATAGTCTAATTATA >LS483407|3|3|960201-960302|CRISPRCasFinder AATAATTGGTATAGTCTAATTATA CCGATAAAAACAGTATGTTTACAGTATATAATATCCACAATGTCTTGTCAAACA TAAAATTGGTATAGTCTAATTATA
>LS483407.1|SQG73189.1|958335_960150_-|glucosamine-fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGVVGNRNATDILMQGLEKLEYRGYDSAGIFVANANQTNLIKSVGRIADLRAKIGIDVAGSTGIGHTRWATHGQSTEDNAHPHTSQTGRFVLVHNGVIENYLHIKTEFLAGHDFKGQTDTEIAVHLIGKFVEEDKLSVLEAFKKALSIIEGSYAFALMDSQATDTIYVAKNKSPLLIGLGEGYNMVCSDAMAMIRETSEFMEIHDKELVILTKDKVTVTDYDGKELIRDSYTAELDLSDIGKGTYPFYMLKEIDEQPTVMRQLISTYADETGNVQVDPAIITSIQEADRLYILAAGTSYHAGFATKNMLEQLTDTPVELGVASEWGYHMPLLSKKPMFILLSQSGETADSRQVLVKANAMGIPSLTVTNVPGSTLSREATYTMLIYAGPEIAVASTKAYTAQIAALAFLAKAVGEANGKQEALDFNLVHELSLVAQSIEATLSEKDLVAEKVQALLTTTRNAFYIGRGNDYYVAMEAALKLKEISYIQCEGFAAGELKHGTISLIEEDTPVIALISSSQLVASHTRGNIQEVAARGAHVLTVVEEGLDREGDDIIVNKVHPFLAPIAMVIPTQLIAYYASLQRGLDVDKPRNLAKAVTVE >LS483407.1|SQG73188.1|957804_958140_-|phosphonoacetate-hydrolase MSLPNCLQCQSEYVYEDGLLLICPMCAFEWTPGEEATEEEGLVVLDSNGVRLSDGDTITVVKDLKVKGAPKDLKQGTRVKNIRLVEGDHNIDCKIDGFGAMKLKSEFVKKI >LS483407.1|SQG73187.1|957056_957698_-|histidine-transporter-permease MTYIQQVLPSLLDGALVTLQVFFIVIILSIPLGAILAFLMKIPFKPLQWFLTLYVWMMRGTPLLLQLIFFYYVLPSVGISFDRMPAAILAFTLNYAAYFAEIFRGGIEAIPKGQYEAAKVLKLKPLQTIRYIILPQVFKIVLPSVFNEVINLVKDSSLVYVLGVGDLLLASKTAANRDATLAPMFIAGLIYLLLIGLVTIISKQVEKRFNYYQ >LS483407.1|SQG73186.1|956417_957047_-|histidine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MLELKNISKQFGQKTIFDGFNLTVQDGEVLSLVGPSGGGKTTLLRMLAGLESIDSGQVFYNGEDVGIDHLENRNLLGFVFQDFQLFPHLTVLDNLTLSPTITMGKQKSDAKEKALDLLARLGLKEHAQVYPYSLSGGQKQRVALARAMMIDPQIIGYDEPTSALDPELRQTVEALIVQNREMGITQIVVTHDLVFAEAISDRIIRVNPK >LS483407.1|SQG73185.1|955565_956402_-|polar-amino-acid-ABC-uptake-transporter-substrate-binding-protein MIIKKRTVAILAIASSFFLVACQATKGLKSGDAWGVYQKQKSITVGFDNTFVPMGYKDESGKCKGFDIDLAKEVFHQYGLKVNFQAINWDMKEAELNNGKIDVIWNGYSITKERQEKVAFTDSYMRNEQIIVVKKRSDIKTISDMKHKVLGAQSASSGYDSLLRTPKLLKDFIKNKDANQYETFTQAFIDLKSDRIDGILIDKVYANYYLAKEGQLENYRMIPTTFENEAFSVGLRKEDKTLQAKINRAFRVLYQNGKFQAISEKWFGDDVATANIKS >LS483407.1|SQG73184.1|954423_955197_-|protein-B MKPKHLLCLSTVVAGLALFSTMTHSVLADDASNPDTILMNNNQANLQRDALVQKLDEGHQQLEAIKHEAKGTDIEATVNKAIDAVDHMKSSIRFNTETIYDFSSIGARVEALSDAIKAIVFSTTQLTHKVEKAHTDMGFAITKLVIRIIDPFASVDAIKAQVQEIKALEEKVINYPDLQPTDRATIYTKAKLNKAIWNTRLERDKKVLGIKPFDVYNRLNKAITHAVGVQLNPTTTVQQVDDEVIAVQNALETALKS >LS483407.1|SQG73183.1|952818_954054_+|cation-diffusion-facilitator-transporter-family-protein MTQDPIANLKLARKGPIVSIIVYLLLSVAKLLAGYLLNASSLIADGFNNLSDIVGNVALLIGLHLASQPADANHKFGHWKIEDLSSLVTSFIMFLVGFQVLIHTIKSIFSGQQVDIDPLGAIVGIVSAFVMLGVYVFNKRLSKRVKSSALVAASKDNLADAVTSIGTSIAIIAASLHLPVIDHIAAMIITFFILKTAFDIFMESSFSLSDGFDSRHLKKYEKAILEIPKIVSVKSQRARTYGSNVYLDIVLEMNPDLSVYESHSITEKVEQLLSDQFSIYDIDIHVEPAMIPEEEIFDNVAKKLYRYEKLILSKVPDYDHYIAKSFQLIDANGQTVNYEQFLNQEIYYPSNFNHFQIESISQKTMLVTYQLNGNQRTSIWRRHESWSLLFHQITPIAKKQLHHTHYRIVKM >LS483407.1|SQG73182.1|951376_952699_+|amino-acid-symporter MIALVKLIDNLVWGPPLLILLVGTGIYLTSRLGLIQILKLPRAFKLIFSDDEGHGDISSFAALATALAATVGTGNIVGVATAIKSGGPGALFWMWVAAFFGMATKYTEGVLAIKYRTKDANGHISGGPMYYIVNGMGTKWKPLAILFAGSGILVALFGIGTFAQVNSITSSLGHSFGLSPQMVSIVLAIFVAAIIFGGIHSISKVAEKVVPFMAIFYILSSLAVIFSHYQQLLPVIRLVFQSAFTPTAAIGGFAGSLMKDAIQKGIARGVFSNESGLGSAPIAAAAAKTNEPVEQGLISMTGTFIDTIIICTLTGLSILVTGQWTGQLEGAPLTQSAFATVFGNLGTFGLTFSLVLFAFTTILGWSYYGERCFEFLFGITHLTYFRIVFVLMVGLGGFLKLELIWVLADIVNGLMALPNLIALLALSPVVILETKHYFIK >LS483407.1|SQG73181.1|948529_950848_-|DNA-helicase-II-/-ATP-dependent-DNA-helicase-PcrA MNPLLNGMNDRQAQAVQTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLIDEKFVNPWNILAITFTNKAAREMKERALALNPATKDTLIATFHSMCVRILRREADHIGYNRNFTIVDPGEQRTLMKRILKQLNIDPKKWNERSILGTISNAKNDLLDEKGYEAQAADMYSQIVARCYKAYQEELRRSEALDFDDLIMMTLRLFDANPDVLAYYQQRYQYIHVDEYQDTNHAQYQLIKLLASRFKNICVVGDADQSIYGWRGADMQNILDFEKDYPDAKVVLLEENYRSTKKILQAANDVINNNRNRRPKKLWTQNADGEQLVYYRANDERDEAVFVASTISNMSQELGKNFKDFAVLYRTNAQSRTIEEALLKSNIPYTMVGGTKFYSRKEIRDLIAYLTIVANPADNISFERIVNEPKRGVGPGTLDKLRQFAYESDQSLLEAASNLLMSPLKGKAAQAIMDLANILGQLRQDLDQMSITDLAEALLEKTDYLDSLRLQNTLESQARIENIEEFLSVTKNFDESSASQEEDETGVDRLGRFLNDLALIADTDDSQAEAAEVTLMTLHAAKGLEFPVVFLIGMEEGVFPLSRASEDPDELEEERRLAYVGITRAEEVLFMTNANTRTLFGKSSYNRPTRFLKEISEELLSYKGLARPAQSSFGVRFSTETHTQFGQGMSLSEALQARKAQAQVRQSAQPMQAHTIPSASTSSVLPFGSNSSVEEVTWQIGDIAHHKKWGDGTVLEVSGSGKTMELKIKFPEVGLKKLLASVAPIEKK >LS483407.1|SQG73180.1|947918_948167_-|transglycosylase-associated-family-protein MGLIWTLIVGALIGVIAGALTKKGGSMGWIANIAAGLVGSSVGQALLGSWGPSLAGMSLIPSVIGAVIVVMITSFVLNKTNN >LS483407.1|SQG73190.1|960325_960883_-|signal-peptidase-I 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>LS483407.1|SQG73194.1|967053_967425_+|GntR-family-transcriptional-regulator MSWKFDEKSPIYAQIAQHVMMQIISQEIKSGDQLPTVREYAEIAGVNPNTMQRAFTELEREGMVYSQRTAGRFVTDAQKLIARKRRELAISELESFITNMTKMGFSHTEIIPVLTSFLKEDSQ >LS483407.1|SQG73195.1|967424_968123_+|ABC-transporter-family-protein MAHLLQLHHVSKSYREKKAIDDLTITIPNGKIIGLLGPNGSGKTTLIKLINGLLQPNKGEIVIDGYRPCVETKKIISYLPDTTYLNENMRIKDMLEFFSDFYSDFDKSKATSLLRDLELDPEDRFKTLSKGNKEKVQLILVMSRKARLYVLDEPIGGVDPAARDYILKTIINSYCENASVIISTHLISDIEPILDEVIFLKQGRLFLSGNADDLRQEYQQSIDSLFRETYKV >LS483407.1|SQG73196.1|968132_968918_+|ABC-transporter-permease-protein MFGKLLKYEFRSIGKWYFALNAFVIAIAAILSFTIKLFAQSNSDGLFGVLTNKMLPLTLGLTFGSLIAGSLLSTLLIIIKRFSKSVFGREGYLTLTLPVNSHQIILSKLLASFICSVFNTIILAFAIAIVIVPMFNINELLEGFFNSFKVDYFINMLTVLAYVLLSTFTSILLIYLSISIGQLFSNRRGLMAFIAYFILVILISVAATYVHSHIFNINTSADSFPFTEQKTIYLLILEQFIEMIMFYLATNFIIKNKLNLQ >LS483407.1|SQG73197.1|969048_969663_-|membrane-protein 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MTRFTEYVEIKLGKSLTQASNEEIYLSLLNFVKEEASHKAKNSAKRKVYYISAEFLIGKLLSNNLINLGIYKDIKEELTAAGKSIAEVEDVELEPSLGNGGLGRLASCFIDSIASLGINGEGVGLNYHCGLFKQVFKHNEQEAEPNFWIEDDSWLVPTDISYDVPFKNFTLKSRLDRIDVLGYKRDTKNYLNLFDIEGVDYGLIKDGISFDKTEIAKNLTLFLYPDDSDKNGELLRIYQQYFMVSNAAQLIIDEAIERGSNLHDLADYAYVQINDTHPSMVIPELIRLLTEKHGFDFDEAVAVVKNMVGYTNHTILAEALEKWPTAYLNEVVPHLVTIIEKLDALVRSEVSDPAVQIIDESGRVHMAHMDIHFATSVNGVAALHTEILKNSELKAFYDLYPEKFNNKTNGITFRRWLEFANQDLADYIKELIGDEYLTDATKLEKLMAFADDKAVHAKLAEIKFNNKLALKRYLKDNKDIELDEHSIIDTQIKRFHEYKRQQMNALYVIHKYLEIKKGNLPKRKITVIFGGKAAPAYIIAQDIIHLILCLSELINNDPEVSPYLNVHLVENYNVTVAEHLIPATDISEQISLASKEASGTGNMKFMLNGALTLGTMDGANVEIAELAGMENIYTFGKDSDTIINLYATASYVAKDYYDNHPAIKAAVNFIISPELLAFGNEERLDRLYKELISKDWFMTLIDLEEYIEVKEKMLADYEDQDLWMTKVVHNIAKAGFFSSDRTIEQYNEDIWHSR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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LS483407_2 | 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781276-781305 | 30 | NC_028700 | Streptococcus phage T12, complete genome | 30053-30082 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781276-781305 | 30 | MK448790 | Streptococcus phage Javan515, complete genome | 29969-29998 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781276-781305 | 30 | MK448783 | Streptococcus phage Javan503, complete genome | 29115-29144 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781276-781305 | 30 | MK448967 | Streptococcus phage Javan510, complete genome | 30201-30230 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781276-781305 | 30 | MK448683 | Streptococcus phage Javan149, complete genome | 32623-32652 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781276-781305 | 30 | NC_004588 | Streptococcus prophage 315.5, complete genome | 30350-30379 | 0 | 1.0 |
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LS483407_2 | 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781342-781371 | 30 | NC_004585 | Streptococcus prophage 315.2, complete genome | 10894-10923 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781342-781371 | 30 | MK448955 | Streptococcus phage Javan478, complete genome | 9990-10019 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781342-781371 | 30 | MK448966 | Streptococcus phage Javan508, complete genome | 10749-10778 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781342-781371 | 30 | KT388093 | Streptococcus phage A25, complete genome | 5353-5382 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781342-781371 | 30 | MK448772 | Streptococcus phage Javan483, complete genome | 10764-10793 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781342-781371 | 30 | MK448783 | Streptococcus phage Javan503, complete genome | 8311-8340 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781342-781371 | 30 | MK448967 | Streptococcus phage Javan510, complete genome | 8397-8426 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781342-781371 | 30 | KY349816 | Streptococcus phage Str01, complete genome | 30556-30585 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781342-781371 | 30 | NC_004588 | Streptococcus prophage 315.5, complete genome | 8546-8575 | 0 | 1.0 |
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LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | MK448942 | Streptococcus phage Javan448, complete genome | 25439-25468 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | MK448965 | Streptococcus phage Javan506, complete genome | 40859-40888 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | MK448970 | Streptococcus phage Javan516, complete genome | 45466-45495 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | MK448959 | Streptococcus phage Javan488, complete genome | 40461-40490 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | MK448778 | Streptococcus phage Javan493, complete genome | 40250-40279 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | MK448963 | Streptococcus phage Javan498, complete genome | 31137-31166 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | MK448949 | Streptococcus phage Javan460, complete genome | 41257-41286 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | MK448975 | Streptococcus phage Javan526, complete genome | 41041-41070 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | MK448782 | Streptococcus phage Javan501, complete genome | 43391-43420 | 0 | 1.0 |
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LS483407_2 | 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781474-781503 | 30 | MK448973 | Streptococcus phage Javan522, complete genome | 38435-38464 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781474-781503 | 30 | MK448762 | Streptococcus phage Javan447, complete genome | 37125-37154 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781474-781503 | 30 | MK448969 | Streptococcus phage Javan514, complete genome | 30533-30562 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781474-781503 | 30 | NC_004585 | Streptococcus prophage 315.2, complete genome | 37750-37779 | 0 | 1.0 |
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LS483407_2 | 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781474-781503 | 30 | MK448972 | Streptococcus phage Javan520, complete genome | 32468-32497 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781474-781503 | 30 | MK448795 | Streptococcus phage Javan527, complete genome | 43205-43234 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781474-781503 | 30 | MK448790 | Streptococcus phage Javan515, complete genome | 33547-33576 | 0 | 1.0 |
LS483407_2 | 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781474-781503 | 30 | NC_004584 | Streptococcus prophage 315.1, complete genome | 36541-36570 | 0 | 1.0 |
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LS483407_2 | 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 781408-781437 | 30 | CP041516 | Bacillus aryabhattai strain KNU10 plasmid unnamed, complete sequence | 44015-44044 | 9 | 0.7 |
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1. spacer 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448798 (Streptococcus phage Javan533, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448790 (Streptococcus phage Javan515, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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4. spacer 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448783 (Streptococcus phage Javan503, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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5. spacer 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448967 (Streptococcus phage Javan510, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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6. spacer 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448683 (Streptococcus phage Javan149, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcttacaaaagcaagtacagtctgcaatag CRISPR spacer gcttacaaaagcaagtacagtctgcaatag Protospacer ******************************
7. spacer 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004588 (Streptococcus prophage 315.5, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gcttacaaaagcaagtacagtctgcaatag CRISPR spacer gcttacaaaagcaagtacagtctgcaatag Protospacer ******************************
8. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448798 (Streptococcus phage Javan533, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc Protospacer ******************************
9. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc Protospacer ******************************
10. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc Protospacer ******************************
11. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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12. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KT388093 (Streptococcus phage A25, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc Protospacer ******************************
13. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448772 (Streptococcus phage Javan483, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc Protospacer ******************************
14. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448783 (Streptococcus phage Javan503, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc Protospacer ******************************
15. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448967 (Streptococcus phage Javan510, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc Protospacer ******************************
16. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KY349816 (Streptococcus phage Str01, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc Protospacer ******************************
17. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004588 (Streptococcus prophage 315.5, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc Protospacer ******************************
18. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag Protospacer ******************************
19. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448942 (Streptococcus phage Javan448, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag Protospacer ******************************
20. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448965 (Streptococcus phage Javan506, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag Protospacer ******************************
21. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448970 (Streptococcus phage Javan516, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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22. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448959 (Streptococcus phage Javan488, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag Protospacer ******************************
23. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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24. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448963 (Streptococcus phage Javan498, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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25. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448949 (Streptococcus phage Javan460, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag Protospacer ******************************
26. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag Protospacer ******************************
27. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag Protospacer ******************************
28. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448960 (Streptococcus phage Javan492, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
29. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
30. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448762 (Streptococcus phage Javan447, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
31. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
32. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
33. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
34. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448972 (Streptococcus phage Javan520, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
35. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
36. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448790 (Streptococcus phage Javan515, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
37. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004584 (Streptococcus prophage 315.1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
38. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448774 (Streptococcus phage Javan487, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
39. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448772 (Streptococcus phage Javan483, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
40. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
41. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
42. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448978 (Streptococcus phage Javan532, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
43. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448785 (Streptococcus phage Javan507, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
44. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
45. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
46. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer ******************************
47. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
48. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448960 (Streptococcus phage Javan492, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
49. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448762 (Streptococcus phage Javan447, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
50. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
51. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
52. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
53. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
54. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
55. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
56. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
57. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448854 (Streptococcus phage Javan146, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
58. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
59. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
60. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448954 (Streptococcus phage Javan476, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
61. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
62. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer ******************************
63. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
64. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448848 (Streptococcus phage Javan126, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
65. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448857 (Streptococcus phage Javan164, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
66. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448677 (Streptococcus phage Javan133, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
67. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_009018 (Streptococcus phage phi3396, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
68. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
69. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctgtctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer **.***************************
70. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448849 (Streptococcus phage Javan128, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctgtctagtaagtcaatcgcatttccccaa Protospacer **.***************************
71. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448682 (Streptococcus phage Javan143, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
72. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448854 (Streptococcus phage Javan146, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
73. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448680 (Streptococcus phage Javan139, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
74. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatcgcattttcccaa Protospacer ************************.*****
75. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
76. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcatttccccaa Protospacer ***************** ************
77. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
78. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448858 (Streptococcus phage Javan166, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
79. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448798 (Streptococcus phage Javan533, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
80. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028700 (Streptococcus phage T12, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
81. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448790 (Streptococcus phage Javan515, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
82. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
83. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
84. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448967 (Streptococcus phage Javan510, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
85. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
86. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
87. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004588 (Streptococcus prophage 315.5, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer *****.************************
88. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448976 (Streptococcus phage Javan528, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcattgccccaa Protospacer ***************** ***** ******
89. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448681 (Streptococcus phage Javan141, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctgtctagtaagtcaatcgcgtttccccaa Protospacer **.*****************.*********
90. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcattgccccaa Protospacer ***************** ***** ******
91. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448963 (Streptococcus phage Javan498, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtcaatagcattgccccaa Protospacer ***************** ***** ******
92. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448683 (Streptococcus phage Javan149, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaggtcaatagcatttccccaa Protospacer **********.****** ************
93. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccaaaatg Protospacer *****.*******************.****
94. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccaaaatg Protospacer *****.*******************.****
95. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448683 (Streptococcus phage Javan149, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctgtttgataaatagaagtgtcccaaaatg Protospacer *****.*******************.****
96. spacer 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK449010 (Streptococcus phage Javan90, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gcttacaaaagcaagtacagtctgcaatag CRISPR spacer gcttacaaaagcagatacagtctgcaattg Protospacer *************..************* *
97. spacer 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448833 (Streptococcus phage Javan87, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gcttacaaaagcaagtacagtctgcaatag CRISPR spacer gcttacaaaagcagatacagtctgcaattg Protospacer *************..************* *
98. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to JX409895 (Streptococcus phage JX01, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ctaaaacatggtctgctatcaaatccaaat Protospacer *******************.********..
99. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448900 (Streptococcus phage Javan290, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaggtcaatcgcattgccccac Protospacer **********.************ *****
100. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448727 (Streptococcus phage Javan291, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaggtcaatcgcattgccccac Protospacer **********.************ *****
101. spacer 2.4|781474|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ctatctagtaagtcaatcgcatttccccaa CRISPR spacer ctatctagtaagtctatggcatttccccag Protospacer ************** ** ***********.
102. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_028666 (Streptococcus phage Str-PAP-1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ctgttcgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer ctataagataaatagaagtgtcccagaatg Protospacer **.* ************************
103. spacer 2.1|781276|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448856 (Streptococcus phage Javan158, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
gcttacaaaagcaagtacagtctgcaatag CRISPR spacer gcttacaaaaacaaatacagtctgcactgg Protospacer **********.***.*********** *.*
104. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448858 (Streptococcus phage Javan166, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ccaaaacatggtctgctatcaaatccaaat Protospacer *.*****************.********..
105. spacer 2.5|781540|30|LS483407|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448956 (Streptococcus phage Javan48, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
ctgtt-cgataaatagaagtgtcccagaatg CRISPR spacer -tgttatgataaacagaagcgtcccagaatg Protospacer **** .******.*****.***********
106. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ccacaacatggtctgctatcaaatccaaat Protospacer *.* ***************.********..
107. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer ccacaacatggtctgctatcaaatccaaat Protospacer *.* ***************.********..
108. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011738 (Gloeothece citriformis PCC 7424 plasmid pP742401, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer cttcacaaagagaaggtaacactaaaacat Protospacer .* .* ********.****** *******
109. spacer 2.2|781342|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN830258 (Lactobacillus phage JNU_P9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ctaaaacatggtctgctattaaatccaagc CRISPR spacer gtaaagcatggtctgatattaaatcggctt Protospacer ****.********* ********* . .
110. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC292027 (Halovirus HCTV-5, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer agaatgaaagagaaagtcacagtcaaactc Protospacer * ************ ***** ****
111. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to KC117377 (Halovirus HVTV-1, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer agaatgaaagagaaagtcacagtcaaactc Protospacer * ************ ***** ****
112. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP041516 (Bacillus aryabhattai strain KNU10 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer atgaagaaaaagaaagtaacagtaagtatc Protospacer *. *****.***************.
113. spacer 2.3|781408|30|LS483407|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041068 (Bacillus megaterium strain KNU-01 plasmid pKNU_01_4, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
ttatagaaagagaaagtaacagtaaaacag CRISPR spacer atgaagaaaaagaaagtaacagtaagtatc Protospacer *. *****.***************.
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
36589 : 48950
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483407|36589:48950|DBSCAN-SWA GATGTCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGACTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGCCTTGTGAAAGAGTTGACACATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGACTTGCGTATTGTGCAGGTCTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTACTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACCGTCTTTTGACGGAAGCTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCTTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTATTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCCCAGCTTTACTTGGTCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAACCCTGTTGATTCGCGTTTCAAGGACATTACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTATCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAAATTATAAAGCTGACGATTTTGCGGCCTATAAGGCAGATCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGACCTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGACGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAATTGAAGAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGACAACTTATGACAAATATATCGCCATGCGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAAACACTTATGGATATGGCGACTATTTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAACGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTGAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAACGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTCGGTGGAGCGGCGACTTGTATCGGTGGTGCTATTCGTGACCCATTGTCAGGGCGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATCACGACTCCGATTGCGGAAACACGTGCTGGTAAATTTCCACAACAAGTTATTTCTAAAACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGGCTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGTATGGAGCTTGGAGCTGTGGTTGGTGCTGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGTGATGTGGTCATCTTGCTTGGTGGTAAAACAGGGCGTGATGGTGTCGGCGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAATCTGTGGAAACAGCAGGAGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATCGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTTTTCCGTGATGGCAATGTCACTCGTCTGATCAAGAAATCAAATGACTTCGGTGCAGGTGGTGTCTGTGTTGCCATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTGCCTCTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCAAGTGATGTGGATGCCTTCATCGCAGCTTGCAACAAGGAAAATATCGATGCCGTTGTAGTTGCGACAGTTACCGAGAAACCAAATCTTGTCATGACTTGGAATGGTGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGCTAAAGTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGACCTCAACCACGCTAGTCAAAAAGGTCTTCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGCTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGTTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGCATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTACTTTGAGCGTATGGATAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGTTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGTCTTGACAGTACCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGCGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGCGAAAACATTTACTATATCCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAGCCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACAGCTGCCTCAGCCGCTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGTTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACGCGGTGAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGCGCTAGCCTTCTAGCAGCCTTCGAAGGCAAATTGGAAGAGGTTTACCCAACAGAATTTGAACAGACAGATGTTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCAGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAATACGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGTTGCTATTGCTGAGTCAGTTGACACTATGGTTGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGTTTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACGAGAAGGTCCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAGGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCTAATCAGCATGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATTCCAGTTTCACATGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGACACTCAGAACGCTGGGAAGACGGACTCTTCCAAAATATCCCTGGTAACAAAGACCAAACCCTCTTTGCAAGTGCTGTAAAATACTTTACAGGGAAGTAAAAAGGTTCAGTGAACCTTTTTAGCCCTCGCCTTGAATTAGTGAAGGGCGAGGTTAGAAAGAATCTCGCTTAATTTTTGAGAAATAGTAAACACGGGCGATAAGTTGTGCGAAAAACTTTCTATTTTCGCTTTACTTGACAGCCTTTGTATCGAGGTAAAAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGACATCCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGAGCTGGTATTGTTTCAAATGACAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGGCTTCTTTCTGAAGTTTTTAAAAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCCTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCGATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCATTTGATTCGTCGAAGCCATAACTCAAGTTTCATGGGAAAGGTAAAAGAAGCTCTAAATACAGTAAAGGGTGGCTTTGCCTATCTACTGATGACAGAAGATAAACTCATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATAGTGGTATTCAATGTGATCGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATATCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGGTGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGGATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGAATTAAGGGAACAAGGTGTTCGAATGAAACTATCAGCGGTATCCGGTGTTGTCAAAGGAAAGCGCGTTGTTATG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483407|36589:48950|43933_45481_+|SQG72321.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIVDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDDAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDADSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDITYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTFETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTTQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDVDAAIRIIRDFKDRPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMMLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEIAAAGIKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >LS483407|36589:48950|43195_43750_+|SQG72320.1|DBSCAN-SWA MKIAIFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI >LS483407|36589:48950|40523_41978_+|SQG72318.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSSFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTEDKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDSGIQCDRYTDETQLAICSMEYIYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIGVPNSSLSAAMGFAEGSGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTVDEVCEIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >LS483407|36589:48950|42005_43028_+|SQG72319.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGALGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGQDDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVNGIGHITGGGFIENIPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHDEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKELLDEPVYEIGRIIKKADDSVVIK >LS483407|36589:48950|48338_48950_+|SQG72324.1|DBSCAN-SWA MLKHLVALTWVCLRNQRFRTYRIFFYGKFRQVETPLYILIMKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKHAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGMVAAKTTLPVIGVPVKSRALSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >LS483407|36589:48950|45538_46663_-|SQG72322.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTNIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGDQILRVGEYFIVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL >LS483407|36589:48950|36589_40363_+|SQG72317.1|DBSCAN-SWA MSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDRLLTEAEITAELDKVAFFAIEALLGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAQLYLVNKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKADQGLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRAGKFPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGNVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPSDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDAKVVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERMDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEVLTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKLEEVYPTEFEQTDVLEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEVAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK >LS483407|36589:48950|46825_48181_+|SQG72323.1|DBSCAN-SWA MFQLVIINTLYQKSNIYDIISNYNTKEVDVLKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEEFLDGEEFSLFAFVNGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVEMIVRPVLEGMVAEGRPYLGVLYVGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQKDGVTLGVVVASEGYPFDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGVKFSENSELLLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDPTGLFYRNDIGSKAIRE |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
334679 : 340712
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483407|334679:340712|DBSCAN-SWA GATGATCACAGGAAAACTCATAACCGTTGAAGGTCCAGATGGCGCAGGGAAAACGACTGTTTTAGAGCAACTCATTCCACTGTTAAAACAAAAAGTGGCTCAGGATATCTTGACAACAAGAGAGCCTGGAGGTGTTGCCATTTCAGAACACATTAGAGAACTTATTTTAGACATCAACCATACTGCTATGGACCCTAAAACAGAACTCTTACTTTATATTGCGGCTCGAAGGCAGCATTTGGTGGAAAAGGTACTACCAGCTCTTGAAGCAGGCCAGTTGGTTTTTATTGATCGTTTCATCGATAGTTCAGTAGCTTATCAAGGTGCGGGACGCGGTTTGATCAAAGCAGACATTCAGTGGCTCAACGAGTTCGCAACAGATGGTTTAGAGCCTGACTTGACCCTTTATTTTGATGTTCCTTCTGAAATTGGTTTAGCACGGATTAACGCGAACCAACAAAGAGAAGTCAATCGTTTAGATTTGGAAACAATAGAGATACATCAACGAGTACGAAAAGGATACCTAGCCTTAGCTAAGGAGCATCCAAAACGTATTGTCACAATTGATGCGACTAAACCATTGAAAGAAGTTGTCTCTGTCGCTTTGGAACATGTCTTAGCCTTGCTTTTAGCCTAGAATAAGGGAGGGTAGGAATGGATTTAGCGCAAAAAGCTCCTAACGTTTATCAAGCTTTTCAGACGATTTTAAAGAAAGACCGTCTGAATCATGCTTATCTTTTTTCGGGTGATTTTGCTAATGAAGAAATGGCTCTTTTTTTAGCTAAGGTCATCTTTTGTGAACAGAAAAAGGATCAGACGCCCTGCGAGCATTGTCGCTCTTGTCAATTGATTGAACAAGGAGATTTTGCCGATGTGACGGTATTGGAACCAACAGGGCAAGTGATTAAAACGGATGTGGTCAAAGAAATGATGGCTAACTTTTCTCAGACAGGATATGAAAACAAACGACAAGTTTTTATTATCAAAGATTGTGACAAAATGCATATCAATGCCGCTAATAGCTTGCTAAAATACATTGAGGAGCCTCAGGGAGAAGCTTACATATTTTTATTGACCAATGATGATAACAAAGTGCTTCCGACCATTAAAAGTCGGACACAGGTTTTTCAGTTTCCTAAAAACGAAGCCTATCTTTACCAATTGGCACAAGAAAAGGGATTATTAAACCATCAGGCTAAGCTAGTAGCCAAACTTGCCACAAATACCAGTCATCTAGAACGTCTGTTGCAAACGAGCAAGCTTTTAGAACTGATAACTCAAGCAGAGCGTTTTGTATCTATTTGGCTGAAAGATCAGTTGCAGGCATATTTAGCGTTGAACCGTCTGGTACAGTTAGCAACTGAAAAAGAAGAACAAGATTTAGTTTTGACCCTTTTGACCTTGCTCTTGGCAAGAGAGCGTGCGCAAACGCCTTTGACACAATTGGAGGCTGTTTATCAGGCTAGGCTCATGTGGCAGAGCAATGTTAATTTCCAAAACACATTAGAATATATGGTGATGTCAGAATAAGTGCAATTGGAATTCGTTATGGGGAAACGAAGCTTGTCAAAAAACTTGCCCTTAGCGACCAAAGTAGCGGCGCATAGGGGCAAAACAAGCTTTTGAAGAAAATACTGCCTTTGCAACAGATTTGATGAAAGAAGTATCACGATTAATAACACAAAATCAACTTGAAATGACGTTTATTAATAGTGTCTTTCCCTTAGATCAGCATGTTGTCCTAATTCCCTTTTCAGCAGAAGAGCACATGGATTTTTACAACTGTTAAAAGATTTAGCGGCCGATTTTAGGTCAAGAAGTGAGCTGCCCCAGATTAACAGCCAAGAAGAAACCAAGATTTATGGGCGCTTAGGACCGTGTGGCAGACCACTGTGCTGCTTTCGTTTTTGGGAAAATTTCTGACAGTATCTATTAAAATACTAAAAAATCAAAGGTTATCATTGACTTTGGGTAAAGCAACAAGCCCTTATGGCCGTTTGCTTTGCTGTCTCTATGATGAAGGTGGCTTTTACCAATAAAGCAAGAAAAAATTCCCTGAATATGGTACCATAGTAGAGACAAGTGATGGCCCTGCAACAGTAGCAGCCTTGATATATTTACAGATCCCATTAAGGTGCGGTTAAAAGACCAGTTGACCTTAGTCACTTATGCTTTAGAGGAGGTTAAAGTAGGTGAATAAAAAAGAATTATTCGACGCTTTTGATGGATTTTCCCAAAATTTAATGGTTACTTTAGCTGAAATTGAAGCCATGAAAAAACAAGTCCAATCACTAGTAGAAGAAAACACGATTCTTCGCCTAGAAAATACAAAACTACGGGAACGTTTGAGTCACCTAGAACATGAAACGGTAGCTAAAAATCCTTCCAAACAAAGGAAGGATCACTTAGAGGGAATTTATGATGAAGGGTTTCATATCTGCAATTTTTTCTATGGACAACGTCGTGAAAATGATGAAGAATGTATGTTTTGCAGAGAATTATTAGATAGAAAGTAAGGGCATGCAGGTTCAAAAAAGTTTTAAAGACAAAAAAACAAGCGGAACCTTGTATTTGGTTCCAACCCCAATTGGCAATCTGCAGGACATGACCTTTAGAGCAGTGGCAACGTTAAAAGAGGTTGATTTTATTTGTGCAGAAGACACAAGAAATACAGGTCTTTTGCTAAAACACTTTGACATTGCTACCAAGCAAATCAGCTTTCATGAGCACAACGCCTATGAGAAGATTCCTGATTTAATTGATTTATTAATATCAGGACGGTCACTAGCTCAGGTGTCTGATGCAGGAATGCCATCGATTTCTGATCCTGGGCATGATTTGGTCAAGGCTGCTATTGATAGTGATATCGCAGTCGTTGCTTTACCAGGTGCCTCAGCTGGGATTACAGCTTTGATTGCTAGTGGACTGGCTCCTCAACCCCATGTTTTTTATGGGTTTTTACCCAGAAAAGCAGGGCAACAAAAGGCTTTCTTTGAGGACAAACACCATTACCCAGAGACACAAATGTTTTATGAATCGCCCTATCGCATCAAAGATACCCTGACCAATATGTTGGCTTGTTATGGTGATCGTCAAGTGGTGCTTGTCAGAGAATTAACCAAGCTTTTTGAGGAGTACCAACGGGGGGCGATTTCAGAAATCTTGTCCTACCTTGAGGAAACACCCCTAAAAGGGGAGTGTCTGCTGATTGTGGCTGGAGCTCAAGTAGACAGTGAGGTTGAGCTGACAGCTGATGTTGACTTAGTGTCTCTAGTGCAAAAAGAAATCCAATCAGGAGCCAAGCCAAATCAGGCTATTAAAACAATTGCTAAAGCTTACCAGGTAAATCGCCAAGAGCTTTACCAACAATTTCATGACTTATAAGTCATCGTAGATTAGGAGAAAAACAAATGACAGAAGATCAAGCAACTATCCTTATTTTAGGAGTATACGGAATCATATTGGCTGTATTCTTATTATCAGCTTTATTATGCCTTATCGCTAACTGGCGACTCTTTAAAAGAGCAGGTTACAAAGGATGGTATAGTCTCATTCCTTTCTATGCAGGTTTTGTCAAACACAAAATCACTTTTGGAGAAGATAATAAATGGTTTTACTTTATTGGTTGGGTCATTGCTATTTATTATTACTATGTGCACTTTTGCTATGTCCGTGCTTTTGGTGGATCAAAGGGCCTAGCAGTATTTGGCTTGTTTTTCCCAGGCATTGCTTCTTTGATAGTGGCTTTTGGAAAAACTTATACCACACAAGAATGCCACCCTGTGCCACATCTTTTAAACTAAGAGAGAAAAGACCATCAATTGGATTTATTGATGGTCTTTTAGGTGTTTAAATGATTTTAGTCCCGTGAACAATGGCCGTTCCAGTGAGTTGACTCAAGCTTTGGCAATTCTCAGCAGTGACGCCTCCTCCAATCATGATTTCAATGCGTTTATTGGCATAGGTCACAAGACTTTTAAGCTGTTCCACATTGTCTGTAATAGGAGTAGCTTCAGGTGAGCCATGAGTTAGCACACGCACAAAGCCATAATCAATCAGTTGATCAAGCGCTTGGTGCTGGTGATCAGTCGGAATATGGTCAAAAGCCATGTGGAAAACCAAAGGCAAGCCTTGTGTAGCAGGCAGTAATTGCTCGATAGCGTCGGTATCCAGTTGATTTTCTGTGGTCAGCAAGCCTAAGACTAGCGCATCTGAGCCAGCTTCAACAGCTTTTAAGATATCTTCTTCCATAGCTTTTAGTTCGAGGTCGTTATAGACAAAATCGCCACCGCGAGGTCGAATCATGGTCGCTACGCTAATCTTTTTATCGTGTAAGAGCTGACAGGCTTCTTTGATGACGCCATAAGATGGCGTGGTCCCTCCGACAGCTAGGTTATTACAGAGTTCCACACGACTGACTTGACCAGCATCAAGGGTTGGCAGTAGTGTGAGGTTCTCAGCACAAAATTCTTTAATCATTTTTAGTTCTCCTTTATCACTAATATTATAGCACGAATGAAGCTAGTCATCAGGAAACATTTTTGTCAAATCATGGACATTATGCTATACTCACTAGTATTAAAAGTAGGCCAAAACAGCAGCAAATACTTTGAAAAAAGCTTGCTATGTTCTACGGCAATATCAGTCTTTACCAACGAACTCTCAAGAAGAAAAGAAAGACAAAGCTTAGCATTTTAAAAAAGCCCCCTTTTTTTGTGAAATGATGACCAAAAACGGGCGCCTCACGCCTAAAACAGTTACCCTAAAGGAGAACAAATGATTACGATTTACCAATACCCAAAATGTAGCACCTGCCAAAGAGCCATGGCTGAATTAAAGCAACTGGTTAGTGACTTTGAAGCCATTGACATCAAAGCTAATCCACCCAAAGCTCAGGACCTCAAACATTGGATGGAAACATCTGGTTATACCATCAAAAATTTCTTTAATACCAGTGGTAACAGCTACCGCGAATTGGGACTTAAAGATAAAATAGACCAGCTTAGCCTTGATAAAGCTGCTGAACTCTTAGCCACAGATGGTATGCTGATTAAACGGCCTATTCTGATTAAGGATGGTAACGTCTTACAAGTTGGCTATCGCAAGCCATATCAAGAGTTGGATTTAGGATAATGCGACAAAGTTTCAAAAAAGGACAAGGCAACATTATAACGCCTTGTCCTTTTTTGGGATCTGTTTTTAGACATTAGAGATCAATATCTAGAAAAATTGGCGTATGGTCTTGGCGTTCCCCAGAAGAAATCATTTCAGAACGCTTAACCTTATCCACAAGTCGGTTTGAAGCTAGCCAATAGTCAATTCTCCAACCAGTATTATTGATTTTGCTGGTTTTGCTACGTTGTGCCCACCAGGTATAAACATGAGGAATATCGCCGTGCAAGTGACGAAAAGTATCTGTAAAGCCTCTTGCTAATAGGTTAGTAAAGCCTTGACGTTCTTCGTCGGTAAAACCAGGGGAACGTCGATTGCTGCTTGGATTTGCCAAATCAATCTCTTTGTGGGCAACGTTGTAATCTCCCGTAGCCAAAACAGGCTTTTGAGCATCCAGTTCAGTCAAGTAATCAGCGTATTTGTGGTCCCAGATTTGACGGTCATCTAACCGTCTAAGGCCATCGCCGGCATTAGGCGTGTAAACCTGTGTGACGAAAAAGTCTTCAAATTCTAGGGTAATGATACGGCCCTCAGCATCCATTGTTGTTGGGGCACCAATTTCTGGAAAAGTAATGACAGGGTTTAGCGTGTTTTTGTAAAGGAACATGGTGCCAGCATAGCCTTTCCTAGCAGGCTCAACTGAAGAACGCCACACATGCAAATAGTTTGGAAAGTAACTAAGTAAGGCCTCGATATGTTTTTTGGTAGGCCCCTTAGCAGATAATTTGGTTTCTTGAATGGCAATAATATCCGCATCTTGAGCGACTAAAGTGTCTAAAACAGCGCGTGATAAAAGCGCACGAGGGGACTCTCCTGTGAGAGCAGCATTTAAGGAATCAATGTTCCATGAAATCAGTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483407|334679:340712|335332_336208_+|SQG72596.1|DBSCAN-SWA MDLAQKAPNVYQAFQTILKKDRLNHAYLFSGDFANEEMALFLAKVIFCEQKKDQTPCEHCRSCQLIEQGDFADVTVLEPTGQVIKTDVVKEMMANFSQTGYENKRQVFIIKDCDKMHINAANSLLKYIEEPQGEAYIFLLTNDDNKVLPTIKSRTQVFQFPKNEAYLYQLAQEKGLLNHQAKLVAKLATNTSHLERLLQTSKLLELITQAERFVSIWLKDQLQAYLALNRLVQLATEKEEQDLVLTLLTLLLARERAQTPLTQLEAVYQARLMWQSNVNFQNTLEYMVMSE >LS483407|334679:340712|338088_338481_+|SQG72599.1|DBSCAN-SWA MTEDQATILILGVYGIILAVFLLSALLCLIANWRLFKRAGYKGWYSLIPFYAGFVKHKITFGEDNKWFYFIGWVIAIYYYYVHFCYVRAFGGSKGLAVFGLFFPGIASLIVAFGKTYTTQECHPVPHLLN >LS483407|334679:340712|339454_339811_+|SQG72601.1|DBSCAN-SWA MITIYQYPKCSTCQRAMAELKQLVSDFEAIDIKANPPKAQDLKHWMETSGYTIKNFFNTSGNSYRELGLKDKIDQLSLDKAAELLATDGMLIKRPILIKDGNVLQVGYRKPYQELDLG >LS483407|334679:340712|337198_338062_+|SQG72598.1|DBSCAN-SWA MQVQKSFKDKKTSGTLYLVPTPIGNLQDMTFRAVATLKEVDFICAEDTRNTGLLLKHFDIATKQISFHEHNAYEKIPDLIDLLISGRSLAQVSDAGMPSISDPGHDLVKAAIDSDIAVVALPGASAGITALIASGLAPQPHVFYGFLPRKAGQQKAFFEDKHHYPETQMFYESPYRIKDTLTNMLACYGDRQVVLVRELTKLFEEYQRGAISEILSYLEETPLKGECLLIVAGAQVDSEVELTADVDLVSLVQKEIQSGAKPNQAIKTIAKAYQVNRQELYQQFHDL >LS483407|334679:340712|336870_337194_+|SQG72597.1|DBSCAN-SWA MNKKELFDAFDGFSQNLMVTLAEIEAMKKQVQSLVEENTILRLENTKLRERLSHLEHETVAKNPSKQRKDHLEGIYDEGFHICNFFYGQRRENDEECMFCRELLDRK >LS483407|334679:340712|334679_335315_+|SQG72595.1|DBSCAN-SWA MITGKLITVEGPDGAGKTTVLEQLIPLLKQKVAQDILTTREPGGVAISEHIRELILDINHTAMDPKTELLLYIAARRQHLVEKVLPALEAGQLVFIDRFIDSSVAYQGAGRGLIKADIQWLNEFATDGLEPDLTLYFDVPSEIGLARINANQQREVNRLDLETIEIHQRVRKGYLALAKEHPKRIVTIDATKPLKEVVSVALEHVLALLLA >LS483407|334679:340712|339884_340712_-|SQG72602.1|DBSCAN-SWA MKLISWNIDSLNAALTGESPRALLSRAVLDTLVAQDADIIAIQETKLSAKGPTKKHIEALLSYFPNYLHVWRSSVEPARKGYAGTMFLYKNTLNPVITFPEIGAPTTMDAEGRIITLEFEDFFVTQVYTPNAGDGLRRLDDRQIWDHKYADYLTELDAQKPVLATGDYNVAHKEIDLANPSSNRRSPGFTDEERQGFTNLLARGFTDTFRHLHGDIPHVYTWWAQRSKTSKINNTGWRIDYWLASNRLVDKVKRSEMISSGERQDHTPIFLDIDL >LS483407|334679:340712|338527_339157_-|SQG72600.1|DBSCAN-SWA MIKEFCAENLTLLPTLDAGQVSRVELCNNLAVGGTTPSYGVIKEACQLLHDKKISVATMIRPRGGDFVYNDLELKAMEEDILKAVEAGSDALVLGLLTTENQLDTDAIEQLLPATQGLPLVFHMAFDHIPTDHQHQALDQLIDYGFVRVLTHGSPEATPITDNVEQLKSLVTYANKRIEIMIGGGVTAENCQSLSQLTGTAIVHGTKII |
8 | Streptococcus_phage(100.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
349055 : 397643
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483407|349055:397643|DBSCAN-SWA GATGAAAAAACCATTTTACATTACGACACCCATTTATTACCCATCTGGGAAATTACACATTGGTTCTGCTTATACAACTATTGCTTGTGATGTCTTGGCACGCTACAAGCGCTTGATGGGCCATGAGGTCTTTTACCTCACAGGACTTGATGAGCACGGACAAAAGATTCAAACCAAGGCAAAAGAAGCTGGTATTACACCTCAAACCTATGTTGATAACATGGCAAAGGATGTCAAAGCCCTTTGGCAATTGCTAGATATTTCCTATGACACATTTATCCGGACAACGGACGATTACCACGAAGAGGTCGTTGCTGCTGTCTTTGAAAAATTGCTGGCGCAAGACGACATTTACCTTGGCGAATACTCTGGTTGGTATTCTGTCTCTGATGAGGAATTTTTCACTGAAAGCCAATTAAAAGAAGTCTTTAGAGATGAAGACGGTCAGGTTATTGGAGGGATTGCCCCATCAGGTCATGAGGTCGAGTGGGTCTCTGAAGAATCCTACTTCCTACGCCTTAGCAAATACGCTGATCGTCTTGTGGCCTTCTTTAAAGAGCGACCTGACTTTATCCAACCAGACGGTCGTATGAATGAAATGGTGAAAAACTTTATCGAGCCAGGTCTAGAAGATTTGGCTGTTAGCCGTACTACCTTTACATGGGGTGTACCTGTTCCATCAGACCCAAAACACGTGGTTTATGTGTGGATTGATGCCCTCTTAAACTACGCGACAGCTCTTGGTTATGGTCAAGCTAATCACGCTAACTTTGATAAATTCTGGAATGGAACGGTTTTCCACATGGTTGGAAAAGATATCTTGCGTTTCCACAGTATCTACTGGCCGATCTTACTCATGATGCTTGATTTACCAATGCCAGACCGCTTAATTGCCCATGGTTGGTTTGTCATGAAAGACGGTAAAATGTCTAAATCAAAAGGCAATGTGGTCTATCCAGAAATGTTAGTGGAGCGCTTTGGACTTGATCCTCTTCGTTATTACCTCATGCGTTCTTTGCCAGTGGGTTCAGACGGGACCTTTACCCCTGAAGATTATGTGGGTCGTATCAACTATGAATTGGCCAACGATCTTGGCAATTTATTAAACCGTACCGTTGCGATGATCAACAAGTATTTTGACGGCACGGTGCCAGCTTATGTTGACAATGGAACTGCCTTTGATGCTGACTTAAGTCAACTGATTGATGCTCAGCTAGCAGACTACCATAAGTACATGGAAGCGGTGGATTACCCACGCGCCTTGGAGGCTGTTTGGACCATCATTGCTCGTACCAACAAATACATCGATGAAACCGCTCCTTGGGTGCTCGCTAAAGAAGATGGAGACAAAGCTCAACTAGCCAGTGTCATGGCACACTTGGCAGCTAGCTTGCGCGTGGTCGCTCATGTGATCCAACCCTTTATGATGGAAACATCAGCTGCTATCATGGCCCAGCTTGGCTTAGCGCCTGTTTCTGACTTGTCAACACTTGCTCTAGCAGCTTTTCCTGCCAATACAAAGGTCGTTGCCAAAGGCACACCGATTTTCCCACGTCTTGACATGGAAGCTGAGATTGACTACATCAAAGCTCAAATGGGTGACAGCTCAGCTATTTCCCAAGAAAAAGAATGGGTCCCTGAAGAGGTTGCGCTCAAATCTGAAAAAGACGTCATCACATTTGAAACCTTTGATGCTGTGGAAATCCGTGTGGCAGAAGTCAAGGAAGTGTCAAAAGTGGAAGGTTCAGAAAAATTGCTGCGCTTTAGAGTAGATGCAGGAGACGGGCAAGACCGTCAAATCTTGTCAGGTATTGCCAAATTTTACCCCAACGAACAAGAATTAGTGGGTAAAAAACTACAAATTGTTGCTAACCTGAAACCGCGTAAAATGATGAAACAATACATCAGTCAAGGGATGATTCTATCAGCAGAGCATGGAGATCAGCTAACGGTCTTAACCGTTGATTCCTCTGTTCCAAATGGAAGTATCATTGGCTGATGCTGACCTATTATTCAAAAAACCTAAGCAAGAATATGTGCTTAGGTTTTTTTGATTGCCTTCAAGAAAGACGAATAACGAGATGGGTGATATGGCATCAAAAGCATAACTATCCTAGGACCTGTCCTAGTAAGATTGCTGTGCTTTTGACAAGTGAACAGAGAGGTCTTAAAACTATATCTTGTCATAAAAAAGATTGCAAAACACTATATCTTGTGTTATTATGGTTTTTATAAAAGTTAAGCATGCTTAACTTTAGCCAAACAAAAGAGGACACTAGAGCGTGTCCCACAAGACAGTTGAGCCCTTCGCTTTTTTAGTAGAGTAGGAGTGCTCAAGTCAAAAAGAGACATCCCATCAAACCATTGCTGTTTAGCAGGTCTTTTTGTGTTGCTCAAAAAAACAATTCCTGTCTGTTTGGCGTCTAGTGATGACTTAGGCTTAGCGCTACTAGACTTTTGTTTGAAAAATACCTCAAGCCTTGAAGGAGACAAATGACCCAACATTATTATGAACGTTCGCAATCCCCAATTGAATACGCCCTATCTAAAACACAAAAACAGTTGCGCTCCATCAATTGGAATTACCTTAATGATGACAAAGATTTGGAAGTGTGGAACCGTGTCACTCAAAATTTTTGGTTGCCTGAAAAGGTTCCTGTTTCTAATGATTTAAATTCTTGGCGCTCCTTGGGTGAGGAGTGGCAACAGCTCATCACAAGGACCTACACTGGGTTGACTTTACTAGATACAGTACAAGCAACGGTTGGTGATGTGGCACAAATTCAGCATTCACAAACCGACCACGAACAAGTCATCTATACGAACTTTGCCTTTATGGTGGGGATTCATGCCCGCTCTTACGGGACGATTTTTTCGACCCTTTGCAGCAGCGAGCAAATCGAAGAAGCACATGAATGGGTGGTCTCAACACAGAGCTTGCAAGACCGTGCCCGTGTCTTGATTCCTTACTATACGGGTGATGACCCTTTGAAATCAAAAGTAGCAGCAGCTATGATGCCAGGATTTTTGCTGTATGGCGGCTTTTACCTTCCTTTTTACCTATCAGCACGTGGTAAAATGCCAAACACATCTGATATCATCCGCCTGATTTTACGCGATAAAGTTATTCACAACTATTACAGCGGTTACAAATACCAACAAAAAGTAGCACGTCTTAGCCCAGAAAAACAGGCTGAAATGAAGGCCTTTGTCTTTGACTTGCTCTATGAACTCATCGACCTTGAAAAAGCTTACTTGAGAGAACTCTATGCAGGCTTTGATTTGGCAGAAGATGCTATCCGCTTTAGCCTTTATAACGCTGGAAAATTCCTTCAAAATTTGGGATATGAGTCGCCCTTCACAGATGAAGAAACGCGCGTTTCACCAGAAGTATTTGCTCAGCTATCAGCGCGTGCAGACGAAAACCATGACTTTTTTTCAGGCAATGGCTCATCTTATGTGATGGGGATCACCGAAGAAACCACAGATGACGATTGGGAGTTTTAAGAAATGGCAGAGCTGATTATTGTGTATTTTTCATCTAAGTCCAATAACACCCATCGCTTCGTCCAAAAATTAGGCCTGCCTGCTCAGCGCATACCAGTAGATAATAGGCCACTTGAAGTTTCAACCCATTACCTTTTGATTGTGCCTACCTATGCAGCTGGTGGCTCAGATGCCAAAGGAGCCGTTCCTAAACAAGTGATTCGTTTTTTGAATAATCCTAACAATCGTAAACATTGTAAGGGAGTGATCTCTTCAGGAAATACCAATTTTGGCGATACCTTTGCCTTAGCAGGCCCTATCATTTCTCAAAAATTGCAGGTCCCCTTATTACACCAATTTGAACTATTAGGCACTGCTACAGATGTCAAAAAGGTACAGGCGATTTTTGCCCGCTTAAAGCATCACACACACGACAAGCAAAAACAAACCAACAACCTGATTACAGAAAGGACACACCCATGTCACAAACCAATGCGTCATACCTCTCATTAAATGCACTGACCCGTTTTAAAAAACCAGACGGCAGCTACCATTTTGATAGCGATAAAGAAGCTGTTAGGCGCTACCTGGAAGAACATGTCTCTCCCAATCAAATGGCTTTTAACTCACTAGAAGATAAGCTAGCTTACCTCATCAATGAAGGGTATTATGAGCAGGCCATTTTTGATGCCTATCCTAATGACCTTATCAAGGAGGCCTTTCATTATGCCTATCAACAAGGCTATCGCTTTTTAAATCTCATGGGCGCTATGAAATTTTACCAGTCCTATGCCTTAAAAACCTTGGACGGTAAGCAGTATCTAGAAACATTTGAAGACCGTACTGTGATGAATGCACTCTTTTTAGCTGATGGAGATCAAACCTTTGTCTTTGACGTGATTGATGCCATCTTGCACCGACGCTTTCAACCAGCTACCCCAACCTTTTTAAATGCCGGAAAAAAACGCCGTGGCGAATACATTTCGTGCTATCTTCTTCGTGTCGAAGACAATATGGAATCTATCTCTCGCGCCATTAGCACCAGCCTACAACTCTCAAAAAGAGGAGGAGGAGTCGCCTTGTGCCTCACCAACCTCAGAGAAATCGGAGCACCGATAAAAGGGATTGAAAATCAGGCAACAGGCATCGTTCCTGTCATGAAACTACTAGAGGACTCTTTTTCCTATGCCAATCAACTAGGTCAGCGCCAAGGAGCAGGTGCGGTTTACCTTCATGCCCATCACCCTGAGGTCCTGACCTTTTTAGACACCAAACGTGAAAATGCCGATGAGAAAATTCGCATTAAGTCCCTAGCATTGGGACTTGTGATCCCAGATATTACCTTCCAGTTAGCCAAAGAAAACAAAGACATGGCACTCTTTTCACCCTATGATATCAAGCGTGCCTATGGCAAGGACATGTCAGACATCTCCATCACAGAGGAATACGATAAACTGCTAGCCAATCCAGCCATCAAAAAGACCTACATCAGTGCTAGAAAGTTCTTTCAGTTA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55 | Mycobacterium_phage(14.29%) | protease,tRNA,transposase,bacteriocin,integrase | attL 392710:392727|attR 404209:404226 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
626027 : 636631
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483407|626027:636631|DBSCAN-SWA ATTATTCTCTATTTTTGGTGTTATCCTCTTTTAGTTCAGAAGTTGCCGCGTCAGCTTCTACGGGATTTAGTTCTAAGTAAGATGGTGCTTTAAAAAGTTTCTGAGTTGATTTATGACCATTTTTACTGTATAAACTTGTTGACTCTGATCCGAGTTTTGCTGAAATATCTTTCAGTTGTTTTAACTGCTTAGTGTAGATAAACTGGTTAGGATCAATAGCTTTTAGACCATTTTGAGTATCAAAGCGCAGGAGATCACCCGTTTGAATAGCGTCGCTAGCTGCTAGTTGTTGAGCAACAGCAGAGCGAATTTCCTTAGTTTTGGCTATAGTCATTTCATCGGGATTAGTGATTTCTAAACCTGTTTGCGTGTTGTACAGACGTCCACTATAGTTAGTGTATTCAGGAGTCATATAAGTCCCAGATGTTCGTTGTGCCACAATCTGGCTATTTTGAGGTGATAATAAATCTTGTCCTAATTGAACAAACTGACTAGTGTCAATACCAAGTATGTGGAGTAAAGTAGGAAGAGCATCGATTTCACCGCCAAAGGTTTCTTTGATACTACCATTCGTATAACCTGGAATATGGATCATATACGGGACTCGTTGTAGCATAGCATTATCATATTCAGACCAAGTTTCAGAATCTTTACCAAGAAGTGGAGCAAGACTAGAATTACGAGAATTTGAAATACCATAATGGTCACCATATAAAACAAAAATAGAATTGTCGTACAAACCAGTGGCTTTCAAGTAATCAAAAAAAGATTTAAGGGCAGCGTCTAAATAATTGGCAGTAGCAAAGTAACCATTGATCGTTTCATCGTCTGTTTTGGCTAAAGGAAAACCTTCTTCACTACTTTCGCCTTTTAGACTAGTATAAGGATAGTGATTACTCACAGTGATAAACTTGGTATAAAAAGGTTGTTGCATCTGTTCAAGATATTTTATGGAATCCTTAAACATGTACTTATCATTTAACCCATATTGAAAAGAGTTCTTACTATTTTGTTTAGAGAAGTAGCTAGAATCAAAAAAATAATTATAGCCCCATTGTTTATAAGCATTATTGCGATTCCAGAAAGTTCCAACGTTACCATGAAAGACAGCGCTGGTATAGCCACCTTTTTGGGCTAAAATACTTGGAGTAGCAAATTGTGTATTTTCACCACCGTAGTTCACCATAAAAGAACCACTATTTAAACCAAATAAGGAATTCTCCATCATGGTTTCAGCATCAGAAGTTTTACCTGCTTTAACCTGATGAAAAAAGTTAGGGAATGCTAAGGTAGCATTTGAGTGATAAAGCGAGTTGATAAAAGGCGTTACCTCATATTCTTTATCTCCTTCTTTTAGTTTATAATCTATTAAGAATTGTTGAAAGCTTTCTAAATGAAGAACAATAATATTTTTGCCTTTTCCAATTCCAAAATACTGGGGATCAGGTGCTGCATAATGTCCTTTGACATAAGTTTTAACATCAATTAATTCTTCTGCAGTAGCTCCATTTCGTTCTTTTTGAGCTTGATAGGTTTGATTGCCGCTATAGAGGGTAAACGCTGGTAATCCTAAAGCTCTCACAATATAAGTATTTGAAAAGCCACGTGTTAATAGTTCCGGACGATCAATTTCTGCTAAAAAAAGATTAATAGAAAGCAATAGACTAGATAAAGCGGTGATGGCAAATGCTGCGCGCTTGTTAAAAGGACGTTGATCATTTTTGATTTTTTTAGTGATAGATAAACTAATTAGAATAATAAAATCAAGAATATAGATAATATCCCAGATGCGTAAAAGGTTTAAAGCAGAGTCCCCTAATCCAGCGGAGACTTTACTGCTAGCTAGCATGGCACTCACTGTAATAAAGTCTGAAAATTCTCGGTAATATATAGAATTTGATATCAAGAGAATGTTAAGGATAATATAAACCACCCAAGAACAGATATAAAAGGCTCGGGTATTCTTAACGTAAAGAGCGACCCCAAAAAGTAAAAAAGCTAGTGGGATTGGATTGATAATTGTTAGAAAGACTTGGTATATATTTCCCAAATCTAGTGAAAAGTCTGTATGATATGCCCACAGAGTCTTTATCCAGTAACAAAAGAGTAGAGTAATTATAAAACCCAATCTTGTGTTGATAAAACCTGTGATAAGTGTTTTAAATTTCTTCACAGTAGCAACTTCCTTATCGTTTTTTCCTAAAGATGTCATCTCCAAATAAAATCTCAGATTAAATTATACCAAAAATGTGAAGCTAATGCTTGTTGTAAGTTCAAATTTAGTAGGATTTTTTATCAGATTTTGTTATAATAAAAACTATGAATAAACTCTATATTGATTCTTTTGTCGAAAAGAAGCTGACAGCAGGGGTACAATTATTAGATGAAAAAGATTTTTCTAATATAAAGGAAAAAAATCAGTTGGTTCAACTGGTGACCAAGTCCAATCGTCCCATTGGAACAGCATATATCTCTAAGCAAAATAAAGGAATTGGTTGGTATCTAGGACCAGAAAAAATCGACTTGTCTATCTCTTATTTTGTTAGTCTATTTTCAGTTGCTAAAGCCAAAAGACAAGATTTTGCTCAATCGGACGAGACCAATGCTTATCGCCTTTTTAATCAAGAAGGAGACGGTTTTGGTGGAGTAACAATTGATCTTTATAAAGATTTTGCAGTCTTTTCATGGTACAATGCCTTTGTCTATGACAAAAAAGAAATGATTATGGAGGCTTTTCAACAGGTTTTTCCTGAAGTCAAAGGAGCTTATGAAAAGTGTCGCTTTAAAGGTCCAGATACTGAAACTGCTCATCTGTATGGTGAGCTGGCACAAGAAACCTTTTCGATTTTAGAAAATGGCATAGCCTATCAAGTCTTCTTGAATGAGGGCTTAATGACAGGTATTTTTCTAGACCAGCATGATGTTAGAAGAGCACTAGTAGATGGTTTAGCTATGGGCAAGTCCCTTCTTAACCTATTTTCCTATACAGCTGCCTTTTCTGTAGCAGCTGCTATGGGTGGTGCTATCGAGACCACTTCTGTGGACTTGGCTAAACGATCGAGAGAATTATCACTAGCTCATTTTGAGCATAACCAGTTAAACTTAGCCTCACATCATTTTGTGGTGATGGATGTTTTTGAATACTTCAAATATGCCAAACGGAAAAAATTAATTTTTGATGTGATTGTGATTGACCCACCAAGCTTTGCTAGAAATAAAAAACAAACTTTCTCTGTGAGCAGGGACTACCACAAATTAATCACAGAGGCCTTGGACATATTGAGTCCTAAGGGAACTATTATAGCTTCAACAAATGCTGCTAATATGACTGTTAGCCAGTTCAAAAAGCAAATTATCAAAGGATTTGGAAGTCGTCGTCCTGAGTCTATGACTCTCCAGCAGCTTCCGAGTGACTTTACTATCAATAAAGCAGATGAAAGAAGTAACTATTTAAAGGTATTTACTATAAAGGTACGAGAATGAGAATTGTAGCACCAGTCATGCCAAGACATTTTGACGAGGCTCAAGCCATTGATATTTCTAAATATGAAGATGTTAATTTAATTGAATGGCGAGCAGACTTTCTTCCCAAGGATGAGATTGTCGCAGTAGCACCAGCTATTTTTGAAAAATTTGCCGGAAAAGAAATTATCTTTACCCTTCGGACTGTTCAAGAAGGGGGGAATATTACCCTTTCAAGTCAGGAGTATGTTGATATTATCAAAGAAATCAATGCTATTTATAATCCAGACTATATTGACTTTGAGTATTTTACGCACAAGTCAGTATTTCAAGAAATGCTTGATTTTCCAAATCTTATTTTGTCTTATCACAACTTTGAAGAGACTCCTGAAAATTTAATGGAAGCTTTTTCAGAAATGACCAAGTTGGCACCGCGTGTGGTTAAAATTGCTGTGATGCCCCAGAGTGAACAAGATGTTCTAGATTTGATGAACTATACCAGAGGCTTTAAGACGCTCAATCCTGAGCAAGAATTTGCAACTATATCTATGGGGAAATTAGGAAGATTGTCTCGTTTTGCGGGAGATGTCATTGGCTCTTCCTGGACATACGTTTCATTAGATCATGTTAGCGGTCCAGGTCAAGTGACTCTCAATGATATGAAACGTATTATTGAGGTCTTAGAAATGGATATATCTAACTAGTGAATGGTCTAAAAATATTATTTCTACAATAGTTAAGAAATGATGTTTTTAGATTAATGTTTTTAAAATAAGTGGAACCAAAAAGGAGAAAAATTGCGTTATTTAACAGCAGGAGAATCTCATGGGCCATCCTTAACAGCTATTATTGAAGGTATACCAGCAGGATTAACTCTTCATCCAGCGGATATTGATCACGAATTACAGCGACGTCAAGGAGGTTATGGCCGTGGTGCCAGAATGTCTATTGAGACTGATCGGGTTCAAATATCCTCAGGAGTTCGTCATGGCAAAACAACAGGGGCCCCCATTACCTTAACGGTAATTAATAAGGATCACCAAAAATGGCTAGATGTCATGGCTGTAGGAGACATTGAAGAGACTCTCAAGTTAAAGCGTCGTGTTAAGCATCCTAGACCAGGACATGCGGATTTGGTAGGAGGTATTAAATATCATTTTAACGATTTAAGAGATGCCTTAGAGCGTTCCTCGGCTAGAGAAACAACGATGAGAGTGGCTGTAGGCGCTGTTGCTAAACGTATCTTAGCTGAACTTGGAATTGATATGTTACATCATATCTTAATATTTGGTGGTATAACGATCACAATACCTTCTAAGCTCTCTTTTAGAGAGCTGCAAGAAAGGGCTCTCCATTCAGAATTATCTATTGTTAATCCAAAGCAAGAAAAAGAAATTAAAACGTATATTGATAAGATAAAAAAAGAAGGGGATACCATTGGTGGTATTATTGAAACGATAGTTCAAGGGGTGCCAGCAGGTCTTGGATCTTATGTCCAATGGGATAAAAAATTAGATGCCAAGCTGGCTCAAGCAGTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483407|626027:636631|633506_634784_-|SQG72882.1|DBSCAN-SWA MTTYDSISWIHTFKANGRKTDLARMAWLLEALGRPQDKFPAIHVVGTNGKGSVTAYLQHILSTSGYQVGTFTSPFIISFHDRICLNGQPISDLELAQCVSVIRPILTKMSLETNWDRPTEFELVTLIMFCYFANLKPVDIAIIEAGIGGKTDATNVFHALAVVCPSISFDHQERLGYSLAEIAHQKAEVIKAKEPVIIGQLEQEASQVFQQVTQKAGSRLYQLGKDFLLNPSEKTFSFQHDNLNLTKLRLKLLGQHQKANACLAIMTAQLLRKSFPKISPKTIQKGIEATTWPGRSEFIQPNLLLDGAHNPDSIAKLKSLLQEEFPKRPIHILFAGLKRKPLADLLAQLDTFEVSVTTFDFPEANLLEDYPDKYPQVKDYRDWLQGSVTSDELFVVTGSLYFISEVRQYCLSNANIFKNIFPLIT >LS483407|626027:636631|634813_635254_-|SQG72883.1|DBSCAN-SWA MSSHYSRQQKPRKSGGVPTEHIKTGFTAFQKSIALIGSILSIIVATITITRALQPVPDKTSNDTPKESSNTIVKIIEKESSQGNQNHTGTSETTDDNKTTLPSSSTTPSHNETTPTAPETPSTTEGTQLPNATGAEDANTGLPTNP >LS483407|626027:636631|635488_636631_+|SQG72884.1|DBSCAN-SWA MIYFDNAATTIPYGEALKTYQEVATKIYGNPSSLHQLGTNASRILEASRKQIAGLLGVKSEEIFFTSGGTESANWAIKGIAFEKTAFGKHIIISAIEHPAVSESVKWLLTQGFEVSYAPVTTQGVVDVNALAELIRPDTILISIMAVNNEMGAIQPIRAISNLLANQPTITFHVDAVQAIGKIPLCDYMTNRVDLASFSGHKFHSVRGVGFLYKKAGKRLNPLLSGGGQEQELRSTTENVAGIASMAKALRIVTEKQVSVLPKLTAMRDVIYKALSAYPDVTVFSAQEGFVPNILTFGIRGVRGEVIVHAFEKYEIYISTTSACSSKAGKPAGSLVAMGIPVKTAQTAVRISLDDDNDMGQVEQFLTIFKQIYDKTQKVR >LS483407|626027:636631|630285_631452_+|SQG72879.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGPSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEKEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >LS483407|626027:636631|628345_629509_+|SQG72877.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >LS483407|626027:636631|629505_630192_+|SQG72878.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN >LS483407|626027:636631|632074_633427_+|SQG72881.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHVSYERGFEQNGVNRIYDYAVFKDAHTVEIAGQLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSKTDLFIRHDRPLRSFDKAIVDVLVEEMAVGGPCLHPHSEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFGLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNGKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >LS483407|626027:636631|626027_628238_-|SQG72876.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLFGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYDNSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNTKNRE >LS483407|626027:636631|631512_631854_+|SQG72880.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADASTSQLFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKDLVK |
9 | Streptococcus_phage(57.14%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
663574 : 699922
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483407|663574:699922|DBSCAN-SWA 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34 | Bacillus_phage(23.08%) | head,protease,tRNA,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
1002932 : 1134210
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483407|1002932:1134210|DBSCAN-SWA 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144 | Streptococcus_phage(38.16%) | protease,tRNA,transposase,capsid,head,integrase,tail,terminase | attL 1013599:1013614|attR 1131595:1131614 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
1417365 : 1468263
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483407|1417365:1468263|DBSCAN-SWA 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>LS483407|1417365:1468263|1425487_1425784_-|SQG73635.1|DBSCAN-SWA MIDFVQIGAFCGAALSILGVWGFIVNPFKKAMEANEFAMAQLKDSIKELAYELKNLDREREITKKIIDRHEERLGRVEDEVIINKERIVTLFKKGEEK >LS483407|1417365:1468263|1439621_1440704_-|SQG73651.1|DBSCAN-SWA MALIHEIITSENIKGFYNAKNKNVENTLGENAFPPKQQLGLKLSFIKGAAGKPVTLKAAAFDTKVPLRDRMTVELLDEEMPFFKEAMVVKEADRQQLSLLAQTKNQELIDTALAAIYNDKVTLIAGAKARLEAMRMEVLSKGKIHVASNGVMKDFDYGLDSSQTTKSDTKWEQVDTATPLKDIEKAIEVMAERGFVPEAIIMNSKTLSLIKNASNTLDVVKPMAPDGAAVTKGDLETYIADELGLKILLKDGMFVGDDGKAKKYFPDGFATLVPNGNLGYTVFGTTPEQSDLLGGEATDAEVSIVETGIAITTTKTTDPVNVQTKVSMIALPSFERLEEVQIINATESEEETKKENSFEM >LS483407|1417365:1468263|1425191_1425302_-|SQG73633.1|DBSCAN-SWA MRAITRLALVIAIAILYVPLSVVALIFYPFLDKEDR >LS483407|1417365:1468263|1444158_1445661_-|SQG73658.1|portal|DBSCAN-SWA 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>LS483407|1417365:1468263|1456008_1456812_-|SQG73680.1|DBSCAN-SWA MAQKSKTKIYYWLKFDKHFFDNLFIKRLLRNFPGGSEMIVIYIRLMLEAIENDCIIDYEGTFDNYAEELALRLETSEEQINMALAYFVKCGVIQVDDGGNTHYPQAKALLGQETNWNRYKKKQAELEKFQLLSNQVPTEIEKDKKIDINIDIKSEVEEEIKDSSSAANVNNLKIISDYFQQEIGILSPNQFEQLSDYITITKMEVDVVKEAITRAADNSKRSFGYVNSILRNWRQNGILTMVKVEEEQRQFQYRKSKQEEVSEYDTW >LS483407|1417365:1468263|1454006_1454489_-|SQG73675.1|DBSCAN-SWA MAYLYELEGIAAYLESLDLDDETFQNTLDSIDFQSDLENTIEYFVKMLKNAQADVEMYKDEKEAFYKKQKQAEAKVEKYKETIRRAMELSQKKKVDAGMFKVSLRKSKKVEILDETKIPLDYMQEKIEYKPMKSEISKALKSGIDISGVELIETESLQVK |
79 | Streptococcus_phage(39.34%) | portal,tail,terminase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1533170 : 1557650
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483407|1533170:1557650|DBSCAN-SWA AATGGGAAATCAAACTAAAACAGAACTTGAACTTGAAAAAGAGTTGATCCATCTCTTAGAAACAGGTGAAAGTCAATGGACATATCGTAAAGAATTAAAAACTGAAGATGCTTTATGGGATAATTTCTTTAAGATCTTAGCGCAAAATAACACGCAATATCTGAACGAGGAGCCTTTAACAGCTAGTGAAAAAGAGCAGATTAAGAATCAACTTAACTTTGTCAATTACTATGAAGCGGCTAAATGGTTAGCTGGTGAAAACGGCATTGCTAAAGTACAAGTGCAACGCGAAGATGCAAAACTAGGAACGATTCGTTTAGAAGTCGTTAAAGCAGACAATGTGGCTGGTGGAACTTCTGTTTATGAGATTGCCAATCAAGTTGCTTTCTCTGGTTCTCGTGATAGACGAGGTGATGTGACACTTCTCATCAATGGCTTACCTATGATCCAAATTGAATTAAAATCTCAGAATCATCAATGCATTGAAGCTTTTAACCAGGTCAAAAAGTATGATAAAGAAGGCCAGTTTAGAGGTATCTTTTCAACCTTACAAATGTTTGTGGTCTCAAATAAAACAGATACAAGGTATATCGCTGCAGCTAAAGAAAATAAATTAAACCCTAACTTCTTGACCCAATGGGTAGATCAAAACAACAAACCACAAAAAGATCTCTTTGCCTTTGCCAAAGAAGTCCTATCTATCCCTCGTGCTCACCAAATGGTCATGACTTACTCTGTCATTGATAATGATAAAAAAGCACTAATTCTCCTTCGTCCTTATCAGATTCATGCAATCGAAGCCGTCGCTGAAGCGAGTCGTCACCGCAAGTCTGGCTATATCTGGCACACAACAGGTTCTGGAAAAACCTTAACTTCCTATAAAGTGGCTCGCAATATCCTTCAAATACCGGCCGTTGAAAAATCCATCTTTGTCATTGACCGAAAGGATTTAGATAATCAGACCACTTCTGCTTTTCAATCTTATGCGCAAAATGATATCTTTGATGTCGATGAGACAGAAGATACGAGACAACTCATCAAAAATTTAGAATCCAGTGATCGTCGTGTTGTGGTCACCACCATTCAAAAACTCAATGCCATGATCAGTCAGATGGAAAGTTATGACACTCCAAAATTCAAGAAACTTAAAGACCGTCTTGCACACTTAAATGTTGTCTTTGTTGTGGACGAATGCCACCGTGCTGTCACACCGGAACGTCAACGTTATCTCACGAATACTTTTCGTAACAGTCTCTGGTATGGCTTTACCGGCACTCCTATCTTTGTGGAAAATAAGCGTGCTCAATTAGGTGATTTAGCCCAAACAACGGAACAGCAATACGGCAAATGTCTCCATCAATACACCGTTAAAGAAGCCATTCATGATAAAGCGGTTCTAGGCTTTCAAGTTGAGTATAAGACAACCATTCCTGATATGCCTGAAGACAGTATTCCGGAAGAAGCTTATGATCATGAAGAACATATGTTAGCTGTCTTAGATAGTATCATTAATCAATCACGCAAGAAACTTGGTTTTAATAATGGAATTGGTCAGACATTCGAAGGTTTACTAACCGTTAAGAGTATTGCTCGTGCCCAAGCCTATTATGATCTGATGAAGAAAGTTAAGGCTGGTGAAACGGATTTAGTCATTTCTAAGAAGGTCAAAGAAAAACTACCAGACTTTCCAAAGGTAGCTATTACTTATTCTATCACTGAAAATGACAATGCGTCTATCAGCCGACAAGATAAAATGACCAAAAATCTAGAAGACTATAATCACCTCTTTGGCACTAACTTTACCATCGATAACTTACAAGGCTATAACAGAGATTTAAATGATCGCTTAGCCCGTAAAAGAGATAAATTCAAAGATCGTCATGAACAATTAGACCTCGTGATTGTGGTTGACCGTCTCTTAACAGGCTTTGATGCGCCTTGTTTATCAACCATCTTCATCGATCGCCAGCCTATGAAACCTCAGCACATTATTCAAGCTTTCTCACGAACCAACCGTATCTTTGAAAGTAGAAAACATTACGGTCAGGTTGTGACTTTCCAAACACCACTTCGTTTTAAAGAAGCTGTCGACAAAGCGCTTAGCCTCTACTCTAATGGGGGTGAAAACGACGTTTTGGCCCCTTCTTGGGAAGAAGAAAAAGCAAGATTCCTTGAAAACGTAACAGTATTAAAAAATATAGTTCCTGATCCAGACGCTTTCCCAACTATTGAGAGCGCACAGACAGCTTTTCTCAAACAATACGCCAAAGCCTTTCAAGCGTTTGATAAACTCTTTGCATCTGTACAGGTCTATAGTGACTTTAATGAAACACTGTTGAGTGAGGTTGGGTTATCAGATGAAGTGATTGATACTTATAAAGGCACTTACCAAAATGTCATTGCAGAAATACGAAAACGAAGAGAAGATGACGAAGCCATCCCAGAGATCAATATCGACTATGAGCTAGAAAGTGTTCAGATGGATGATATCAACTATCACTATATCCTGACCTTGATCCAAGCCTTTGTTGATCAAGAACAAGAAGCTCTTCAAGAAAGGCTCAATGACAATCCCATGGATCAATACATCCAGGATTTAGCAAAATCAAACCCTGCTATGGCTAACCCACTAGCTGAGTTATGGCAAGATATTCAAAAAGACCCTAAAGCATATGAAGGGAAAAGCATTGCTTATGAGTTGGATAACCTCATTGGTGATAAGATCCAAAGGGCCATCAAATACTTTGCGGACCAGTGGAAGGCAGATCCTGACAAATTAGCCTTTGTGGCGACAAATTATCATAGTGCAAACACTACCAAGCAAGTGGGCATGTCAACCTTAAAAGAATCCCTAGACTATCAAGCTTATAAAGAAAAACAAGGTGATTCTGCCATGAATAAACTCAAATACAAGAGCCAATTTGAACGGGAGTTAGTTCAATTCATTAGAGATCAAATCCAACCCTTAAAAGGGCACTAGGAAAGGAAAGAGATGACAAAATCTAAACAGCCTCAATATCGCTTTGACAGTTTTGAAGGGGAGTGGGAAGAGAAACGAATTTCTGATATTGCGAATGTGTTTACTGGAGGTGGCACACCTAGTACTCAAAACGATCAATACTGGACTGGCAATATCCCCTGGATACAATCATCTGATTTATCCAAAGATGAAATATTAGATGTAAACCCCAAAAAATTTATTACAAAATTGGGCCTTTCTAACTCTGCTGCAAAATTAATACCAAAAAATTCTATTGCTATTGTTACACGAGTTGGTGTAGGAAAACTTTCAATCATCAATAAGGAATACACAACCAGCCAAGATTTTTTATCTATCTCAGATCTTAAAGAGAACTTGAAATTTACTGTATATTCGCTATATAGACTCTTACAAAAGGAACTAAATCAATTACAAGGAACGTCAATTAAAGGTATCACAAAAGGGTATCTCCTTTCTAAAACGATACTTATCCCCTCTCTCCCCGAACAAGAAGCCATTGGCGAACTCTTCCAAACGGTTGATCAACTGCTTCAGTTACAGGATCAAAAGCTAGCAACTCTAAAAGAACAAAAGCAAACCTTCCTCAGAAAGATGTTCCCACCTCAAGGACAAAAAGTCCCTGAAATCCGTTTACAAGGTTTTGATGGTGAGTGGGAAGAGAATAAACTGGGGGAAGTTTCTCCATTAAGGGGTGGATACGCATTTGAAAGTGATAAATTTCAATCTGATGGAATTAAAATCATAAGGATTTCTAATATTTTATCTTCAGGAATTATTGGTGGAGAATTTGCTCACTACCACCAAATTAATAATGATGATAAGTATTTACTTACTGGGGGATCTGCACTAATAGCAATGTCAGGAGCCACAACAGGAAAAGTTTCTATATTAAATACTGAGGAAAAATACTATCAAAACCAACGGGTAGGATATTTTATGGATTTAAATAAAATTCACTATAACTTTATTATAGCTTTTCTAAAATCATTAAATTTTAACAAACAAATTCAAAGTGTATTAGTTGCGGGTGCACAACCAAACATTTCTTCAAAAGAGATAGATAATTTCCAAATTTTATATCCTCGTCATAATGTTGAACAAGAAGCCATTGGTAATTTCTTCCAAACTTTAGACCAACAAATTGCTCAATCTGAAGAAAAACTAACAGAACTCAAAGCACTCAAGCAAACATTACTCAATCGTTTATTCGTATAAGAAAGGACTCACATGGCAGAGAAAACAACTTCACTCCGTCAAGCACTATGGCATTCGGCCGACCAATTACGTGGCCAAATGGATGCCAATGACTATAAAAACTATCTTCTTGGACTTATTTTTTACAAACACTTATCTGATAAATTACTCTTGGCTGTTTGTGATAATCTAGAAAAACACTTCAATACCTTTACAGAGGCTCAAAAAATCTTTGAAGATGCTTATCAAGATGAAGGCCTAAAAGATGACCTCATTTCTGTTGTTACTGGTGATTTAGGTTACTTTATCGAACCGAGACTGACCTTTGAAAAACTCATCCAAGATGTTTATCACAATACTTTCCAATTAGAATCATTAGCTCAAGGTTTTCGCGATATTGAACAAAGTGGTGAAGACTTTGAAAACTTATTTGAAGATATTGACCTCTACTCTAAAAAATTAGGCTCTACTCCTCAAAAACAAAATCAAACCATTTCTAATGTCATGAAAACATTAAATGAAATTGACTTTGAGGCAGTAGATGGGGATACTTTAGGTGATGCTTATGAGTACTTGATTGGTGAATTTGCCAGTGAGTCAGGAAAAAAAGCAGGTGAGTTCTATACCCCACAAGCTGTCTCTCACTTGATGACTCAGATTGTCTTTTTAGGTCGTGAAGATCAAAAAGGAATGACCCTCTATGACCCTGCTATGGGATCTGGATCACTCCTTTTAAATGCTAAGAAATATAGTAACCAATCCGATACCGTTTCTTACTATGGTCAAGAAATCAATACTTCTACTT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MKPSSFQTTIENQFDYICKRAMEDERKNYMLYLSRIAKREVSFSDVGDYLVSQFATTDNYSTDFQIFTLNGLSVGVENDLLSEALRELPDKKREILLLFYFMDMSDSEIADLLKLNRSTVYRHRTSGLALIKKFMEEFEE |
20 | Streptococcus_phage(85.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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