CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
LS483415	Streptococcus pyogenes strain NCTC8304 genome assembly, chromosome: 1	1 crisprs	DinG,csm6,cas3,DEDDh,csa3	1	5	10	1

1. LS483415

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: LS483415_1

• CRISPR_ID: LS483415_1
• CRISPR_location: 779647-780012
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: II-A
• Spacer_info: 5 spacers

Consensus repeat of LS483415_1

Consensus_repeat	Method
GTTTTAGAGCTATGNTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC	CRT
GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC	PILER-CR

spacers of LS483415_1

>1.1|779683|30|LS483415|CRT
CTTACGAGCTGAGTTTACTCGTAGTAATCA
>1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR
CACTGATTGGACAAAGAATGCTCCAGTCCG
>1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR
GATTAGCTCAAGCATGCCTTTATAAATGTT
>1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR
CAGCTTGGATTTAATAGCAGACCATGTTTT
>1.5|779947|30|LS483415|CRT
GCACGAGTTTAACTCCCTTATTATTAGCTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483415_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LS483415_1

>merge|LS483415|1|779647-780012|CRT,PILER-CR
TTTAACTTGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACCTTACGAGCTGAGTTTACTCGTAGTAATCAGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACCACTGATTGGACAAAGAATGCTCCAGTCCGGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACGATTAGCTCAAGCATGCCTTTATAAATGTTGTTTTAGAGCTATGTTGTGTTGAATGGTCCCAAAACCAGCTTGGATTTAATAGCAGACCATGTTTTGTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGGATGGTCCCAAAACGCACGAGTTTAACTCCCTTATTATTAGCTTGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCTCCATTC

>LS483415|1|1|779647-780012|CRT
TTTAACTTGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC	CTTACGAGCTGAGTTTACTCGTAGTAATCA
GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC	CACTGATTGGACAAAGAATGCTCCAGTCCG
GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC	GATTAGCTCAAGCATGCCTTTATAAATGTT
GTTTTAGAGCTATGTTGTGTTGAATGGTCCCAAAAC	CAGCTTGGATTTAATAGCAGACCATGTTTT
GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGGATGGTCCCAAAAC	GCACGAGTTTAACTCCCTTATTATTAGCTT
GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCTCCATTC

>LS483415|1|1|779713-779946|PILER-CR
GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC	CACTGATTGGACAAAGAATGCTCCAGTCCG
GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC	GATTAGCTCAAGCATGCCTTTATAAATGTT
GTTTTAGAGCTATGTTGTGTTGAATGGTCCCAAAAC	CAGCTTGGATTTAATAGCAGACCATGTTTT
GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGGATGGTCCCAAAAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LS483415.1|SQG96671.1|777345_778098_+|oleoyl-[acyl-carrier-protein]-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|226401
LS483415.1|SQG96683.1|789899_790688_+|response-regulator	unknown	unknown	gnl|CDD|227095
LS483415.1|SQG96667.1|773012_773969_+|hypothetical-membrane-associated-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|227193
LS483415.1|SQG96672.1|778097_778862_+|haloacid-dehalogenase-like-hydrolase	unknown	unknown	gnl|CDD|319832
LS483415.1|SQG96677.1|784299_785319_+|hypothetical-membrane-spanning-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225411
LS483415.1|SQG96668.1|774022_775378_+|phosphoglucosamine-mutase	unknown	unknown	gnl|CDD|237670
LS483415.1|SQG96674.1|780654_782487_+|GTP-binding-protein-LepA	unknown	unknown	gnl|CDD|235462
LS483415.1|SQG96678.1|785525_785951_+|PTS-system-mannose-specific-transporter-subunit-IIA	unknown	unknown	gnl|CDD|225446
LS483415.1|SQG96675.1|782815_783547_+|SclB-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|366278
LS483415.1|SQG96664.1|769928_770720_-|cobyric-acid-synthase	unknown	unknown	gnl|CDD|225974
LS483415.1|SQG96669.1|775501_776143_+|acetyltransferase-GNAT-Family	unknown	unknown	unknown
LS483415.1|SQG96665.1|770719_772057_-|UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate-2,-6-diaminopimelate-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|223840
LS483415.1|SQG96679.1|785969_786461_+|PTS-system-mannose/fructose-family-transporter-subunit-IIB	unknown	unknown	gnl|CDD|225976
LS483415.1|SQG96673.1|778861_779494_+|membrane-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226884
LS483415.1|SQG96682.1|788246_789896_+|two-component-sensor-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|225519
LS483415.1|SQG96670.1|776139_777336_+|coproporphyrinogen-III-oxidase	unknown	unknown	gnl|CDD|236309
LS483415.1|SQG96676.1|783732_784170_+|methionine-sulfoxide-reductase-B	unknown	unknown	gnl|CDD|234692
LS483415.1|SQG96666.1|772164_773016_+|disA-bacterial-checkpoint-controller-nucleotide-binding-family-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224539
LS483415.1|SQG96680.1|786477_787287_+|PTS-system,-mannose-specific-IIC-component	unknown	unknown	gnl|CDD|226238
LS483415.1|SQG96681.1|787283_788111_+|phospotransferase-system-(PTS),-enzyme-II-component-D	unknown	unknown	gnl|CDD|226239

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LS483415.1|SQG96671.1|777345_778098_+|oleoyl-[acyl-carrier-protein]-hydrolase	gnl|CDD|226401	COG3884, FatA, Acyl-ACP thioesterase [Lipid metabolism].	1.32711e-106
LS483415.1|SQG96683.1|789899_790688_+|response-regulator	gnl|CDD|227095	COG4753, COG4753, Response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain [Signal transduction mechanisms].	5.79862e-82
LS483415.1|SQG96681.1|787283_788111_+|phospotransferase-system-(PTS),-enzyme-II-component-D	gnl|CDD|226239	COG3716, ManZ, Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IID [Carbohydrate transport and metabolism].	1.55707e-109
LS483415.1|SQG96679.1|785969_786461_+|PTS-system-mannose/fructose-family-transporter-subunit-IIB	gnl|CDD|225976	COG3444, COG3444, Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIB [Carbohydrate transport and metabolism].	8.80769e-55
LS483415.1|SQG96672.1|778097_778862_+|haloacid-dehalogenase-like-hydrolase	gnl|CDD|319832	cd07530, HAD_Pase_UmpH-like, UmpH/NagD family phosphatase, similar to Escherichia coli UmpH UMP phosphatase/NagD nucleotide phosphatase and Mycobacterium tuberculosis Rv1692 glycerol 3-phosphate phosphatase. Escherichia coli UmpH/NagD is a ribonucleoside tri-, di-, and monophosphatase with a preference for purines, it shows peak activity with UMP and functions in UMP-degradation. It is also an effective phosphatase with AMP, GMP and CMP. Mycobacterium tuberculosis phosphatase, Rv1692 is a glycerol 3-phosphate phosphatase. Rv1692 is the final enzyme involved in glycerophospholipid recycling/catabolism. This subfamily belongs to the UmpH/NagD phosphatase family, and to the haloacid dehalogenase-like (HAD) hydrolases, a large superfamily of diverse enzymes that catalyze carbon or phosphoryl group transfer reactions on a range of substrates, using an active site aspartate in nucleophilic catalysis. Members of this superfamily include 2-L-haloalkanoic acid dehalogenase, azetidine hydrolase, phosphonoacetaldehyde hydrolase, phosphoserine phosphatase, phosphomannomutase, P-type ATPases and many others. HAD hydrolases are found in all three kingdoms of life, and most genomes are predicted to contain multiple HAD-like proteins. Members possess a highly conserved alpha/beta core domain, and many also possess a small cap domain, the fold and function of which is variable. HAD hydrolases are sometimes referred to as belonging to the DDDD superfamily of phosphohydrolases.	1.59897e-126
LS483415.1|SQG96673.1|778861_779494_+|membrane-protein	gnl|CDD|226884	COG4478, COG4478, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.90272e-87
LS483415.1|SQG96668.1|774022_775378_+|phosphoglucosamine-mutase	gnl|CDD|237670	PRK14316, glmM, phosphoglucosamine mutase; Provisional.	0
LS483415.1|SQG96667.1|773012_773969_+|hypothetical-membrane-associated-protein	gnl|CDD|227193	COG4856, COG4856, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	3.12847e-114
LS483415.1|SQG96675.1|782815_783547_+|SclB-protein	gnl|CDD|366278	pfam00746, Gram_pos_anchor, LPXTG cell wall anchor motif.	3.5108e-09
LS483415.1|SQG96664.1|769928_770720_-|cobyric-acid-synthase	gnl|CDD|225974	COG3442, COG3442, Predicted glutamine amidotransferase [General function prediction only].	1.06082e-141
LS483415.1|SQG96678.1|785525_785951_+|PTS-system-mannose-specific-transporter-subunit-IIA	gnl|CDD|225446	COG2893, ManX, Phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA [Carbohydrate transport and metabolism].	3.64459e-31
LS483415.1|SQG96665.1|770719_772057_-|UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate-2,-6-diaminopimelate-ligase	gnl|CDD|223840	COG0769, MurE, UDP-N-acetylmuramyl tripeptide synthase [Cell envelope biogenesis, outer membrane].	1.3453e-108
LS483415.1|SQG96677.1|784299_785319_+|hypothetical-membrane-spanning-protein	gnl|CDD|225411	COG2855, COG2855, Predicted membrane protein [Function unknown].	1.34952e-103
LS483415.1|SQG96674.1|780654_782487_+|GTP-binding-protein-LepA	gnl|CDD|235462	PRK05433, PRK05433, GTP-binding protein LepA; Provisional.	0
LS483415.1|SQG96682.1|788246_789896_+|two-component-sensor-kinase	gnl|CDD|225519	COG2972, COG2972, Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain [Signal transduction mechanisms].	1.38139e-77
LS483415.1|SQG96670.1|776139_777336_+|coproporphyrinogen-III-oxidase	gnl|CDD|236309	PRK08599, PRK08599, oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase.	0
LS483415.1|SQG96676.1|783732_784170_+|methionine-sulfoxide-reductase-B	gnl|CDD|234692	PRK00222, PRK00222, peptide-methionine (R)-S-oxide reductase MsrB.	1.80871e-84
LS483415.1|SQG96666.1|772164_773016_+|disA-bacterial-checkpoint-controller-nucleotide-binding-family-protein	gnl|CDD|224539	COG1624, COG1624, Uncharacterized conserved protein [Function unknown].	2.09715e-101
LS483415.1|SQG96680.1|786477_787287_+|PTS-system,-mannose-specific-IIC-component	gnl|CDD|226238	COG3715, ManY, Phosphotransferase system, mannose/fructose/N-acetylgalactosamine-specific component IIC [Carbohydrate transport and metabolism].	3.81104e-76

Protein sequences

>LS483415.1|SQG96673.1|778861_779494_+|membrane-protein
MVENTKLLCSWVWLLALAILITIYSTWLWYPLEVDHLKLEQVVFMSKDAILHNYNGLLNYLTNPFVTRLEFANFHSSADGLKHFADVKWLFHLTQVVFLGLLYPTLKTFTQRLKTKRFWLLQKPLILAALFPLMIGLMASFIGFEHFFTLFHKVLFVGDSSWLFDPLKDPVIWILPEVFFLHCFLFFMIVYEIILWSLVGLARWQRLNVE
>LS483415.1|SQG96672.1|778097_778862_+|haloacid-dehalogenase-like-hydrolase
MPYKGYLIDLDGTIYQGKNRIPAGERFIKRLQEKGIPYLLVTNNTTRTPAMVQSMLANQFNVETGIETIYTATMATVDYMNDMNRGKTAYVIGETGLKSAIAAAGYVEELENPAYVVVGLDSQVTYEMLAIATLAIQKGALFIGTNPDLNIPTERGLMPGAGALNALLEAATRVKPVFIGKPNAIIMNKSLEVLGIQRSEAVMVGDNYLTDIMAGIQNDIATILVTTGFTRPEEVPTLPIQPDHVLSSLDEWRL
>LS483415.1|SQG96671.1|777345_778098_+|oleoyl-[acyl-carrier-protein]-hydrolase
MGLSYQEELTLPFELCDVKSDIKLPLLLDYCLMVSGRQSAQLGRSNNNLLVDYKLVWIVTDYEITIHRLPHFQETITIETKALSYNKFFCYRQFYIYDQEGGLLVDILAYFALLNPDTRKVATIPEDLVAPFKTDFVKKLYRVPKMPLLEQSIDRDYYVRYFDIDMNGHVNNSKYLDWMYDVLGCAFLKTHQPLKMTLKYVKEVSPGGQITSSYHLDQLNSYHQITSDGQLNAQAMIEWRAIKQTESEID
>LS483415.1|SQG96670.1|776139_777336_+|coproporphyrinogen-III-oxidase
MKNQEKWFIHRNILSSKWYNKTMSKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIQNQPVDAYLRALIQEFDSYGIRDLKTLYIGGGTPTAITAKQLEYLLNHLERNLNLDDLEEFTIEANPGDLTLEKITVLQRSAVNRISLGVQTFNNKQLKQIGRSHNEEQIYSTIANLKAAGFHNISIDLIYALPGQTLDQVKENVAKALALDIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLNLPTEDLEAEMFEYIISEMEANGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYFGCGAGASGYLNGIRYQNRVPIQHYLKAVEAGNARLNEEVLRKEEMMEEELFLGLRKKTGVSIQRFQEKFGVSFEERYGNIARELQNQGLLVKDDAFVRMTKKGLFLGDSVAERFILD
>LS483415.1|SQG96669.1|775501_776143_+|acetyltransferase-GNAT-Family
MTKQQIEKLADLLPPFAATLYLDMIPEFQEGYASYVYQTQKEDTQNRRIKQLTKNFERLLDTPSFYVMPVTRKTAEQLLADKGLAYHLLSTVAANQVFAAAVNEDQTLFQVLRNGARVAFVILQEKGEFLEMTLGILETVTENEVPAAIVEAVQTYLLTDMQEKLPSLSIMVSQESSKLFYQEQGFVLLAKGCKPGNENDSDVCQLVKYFSKP
>LS483415.1|SQG96668.1|774022_775378_+|phosphoglucosamine-mutase
MGKYFGTDGVRGEANVELTPELAFKLGRFGGYVLSQHETERPKVFVARDTRISGEMLESALIAGLLSVGIEVYKLGVLATPGVSYLVRTEKASAGVMISASHNPALDNGIKFFGNDGFKLADDQELEIEALLDAPEDTLPRPSAEGLGTLVDYPEGLRKYEKFLVTTGTDLSGMTVALDTANGAASVSARDVFLDLNAEIAVIGEKPNGLNINDGVGSTHPEQLQELVKETGADLGLAFDGDSDRLIAVDETGEIVDGDRIMFIIGKYLSEKGLLAHNTIVTTVMSNLGFHKALDKQGINKAITAVGDRYVVEEMRSSGYNLGGEQSGHVIIMDYNTTGDGQLTAIQLAKVMKETGKSLSELAAEVTIYPQKLVNIRVENSMKDRAMEVPAIANIIAKMEDEMAGNGRILVRPSGTEPLLRVMAEAPTDAEVDYYVDTIADVVRTEIGCDN
>LS483415.1|SQG96667.1|773012_773969_+|hypothetical-membrane-associated-protein
MKRFLNSRPWLGMVSVFFAILLFLTAASSNHNNSSSQIYSPIETYTHSLKDVPIDMKYDSDKYFISGYSYGAEVYLTSTNRIKLDSEVNNDTRNFKIVADLTHSHPGTVSVNLRVENLPSGVTATVSPDKISVTIGKKESKVFPVRGSVDAKQIANGYEISKIETGVNKVEVTSDESTIALIDHVVAKLPDDQVLDRNYSSRVTLQAVSADGTILASAIDPAKTNLSVAVKKITKSVPIRVEAVGMMDDSLSDIQYKLSKQTAVISGSREVLEDIDEIIAEVNISDVTKNTSKTVSLSSSQVSIEPSVVTVQLTTTKK
>LS483415.1|SQG96666.1|772164_773016_+|disA-bacterial-checkpoint-controller-nucleotide-binding-family-protein
MNNLSSIDIKFLLSLFADPWLLAVHLLDILIVAYLIYRFIKALTGTKIMSLVQGVIFFLVLRFIAEWIGFTTITYLMNQVITYGVIAGVVIFTPEIRAGLEKFGRSTQVFLQKQYVSSESALVDALIKSVAYMGPRKIGALIAIEQTQTLQEYIATGIPLNADISSQLLINIFIPNTPLHDGAVIVGQNKIVAACAYLPLSESKAISKEFGTRHRAAIGLSENSDALTIIVSEETGAISVTRKGQFLHDLSTDEFETVLRTYLMSDSNVTLPWYKKILGGKSK
>LS483415.1|SQG96665.1|770719_772057_-|UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate-2,-6-diaminopimelate-ligase
MKTLLGIIAGKAAQSILTKLGRGSTYPGRLALACNKDILKDLSKDYDIVVVTGTNGKTLTTALTVGILKEAFGEIITNPSGANMITGITSTFLAAKKGKSGRQIAVLEIDEASLPRITTYLKPSLFVYTNIFRDQMDRYGEIYTTYQMIVDGARNAPKATILANGDSPIFSSKDIVNPVQYYGFDTAKHAPQLAHYNTEGILCPKCEHILQYRLNTYANLGDFICLNCGFKRPQLDYRLTELTTITNHSSEFIIDDQDYKINVGGLYNIYNALAAVSVAEFFGVSPEKIKAGFNKSKAVFGRQETFTIGDKSCTLILIKNPVGASQALEMIQLADYPFSLSVLLNANYADGIDTSWIWDANFELITQMPITEINAGGVRHSEIARRLRVTGFDDTKIKQAEKLEQIIETIEKQEAKHAYLLATYTAMLEFRSLLADRHVVEKEMI
>LS483415.1|SQG96664.1|769928_770720_-|cobyric-acid-synthase
MTYTSLKSPENQDYIYDLNIAHLYGNLMNTYGDNGNILMLKYVAEKLEARVTVDIVSINDTFEQDDYDIVFFGGGQDYEQSIVAKDLPSKKAALADYIANNKVVLAICGGFQLLGQYYVQANGVKIDGLGIMGHYTLNQHQNRFIGDIKIHNDEFNETYYGFENHQGRTFLSGDEKPLGRVVYGNGNNKEDQTEGVHYKNVYGSYFHGPILSRNVNLAYRLVTTALKKKYGSAISLPSYDDILKQEITEEYADLKSKASFNKV
>LS483415.1|SQG96674.1|780654_782487_+|GTP-binding-protein-LepA
MNSQDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRHEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGDVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGIVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYVAASIKTVADTRVGDTVTLANNPAKEALHGYKQMNPMVFAGIYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVHTTDEDMIEVSNPSEFPDPTRVAFIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELSQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYDMSEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKIIVEKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDTKK
>LS483415.1|SQG96675.1|782815_783547_+|SclB-protein
MIQNLHQQIDNNSKLNVPQVPSSTYTTPSPDTSDLEGDISGIRQYLAQMNEYIKQHKEHDQEWKRELTRGIQQKLLDGKDGRDGAQGLAGERGATGPVGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGKDGKDGQPGKPAPKTPEVPQKPDTAPHTPKTPQIPDHSKDVTPAPQNPSNRGLNKPQTQGGNQFAKTPAAHDTHRQLPATGETTNPFFTAAAVAIMTTAGVVAVAKRQENN
>LS483415.1|SQG96676.1|783732_784170_+|methionine-sulfoxide-reductase-B
METSEELKQRIGDLSYEVTQHAATESPFTGEYDHFFEKGIYVDIVSGEVLFSSLDKFNSGCGWPAFSKPIENRMVTNHDDSSYGMRRVEVKSREAGSHLGHVFSDGPKEAGGLRYCINSAALKFIPYDQMEKEGYAQWLTLFDET
>LS483415.1|SQG96677.1|784299_785319_+|hypothetical-membrane-spanning-protein
MSTHLRKLPGLLLCLLLALPAWCLGRLFLIIGAPVFAILLGMLLALFYEHRDKTKEGISFTSKYILQTAVVLLGFGLNLTQVMAVGMQSLPIIVSTIATALLVAYGSQKWLRLDVNTATLVGVGSSICGGSAIAATAPVIKAKDDEVAKAISVIFLFNMLAALLFPSLGQLLGLSNEGFAIFAGTAVNDTSSVTATATAWDAIHHSNTLDGATIVKLTRTLAILPITLGLSLYRAKKEHDIVTEENFSLRKSFPRFILFFLLASLITTLMTSLGVSADSFHSLKTLSKFFIVMAMAAIGLNTNLVKLIKTGGQAILLGAICWVAITLVSLAMQLSLGIW
>LS483415.1|SQG96678.1|785525_785951_+|PTS-system-mannose-specific-transporter-subunit-IIA
MKRKFLIGSHGRLASGLQSSIDILAGMGQALETIDAYVDDSDYTSQIDDFIAGVAADEQGLIFTDLLGGSVNQKMVTAVMNSGKDNIFLITNSNLATLLSLVFLKPGEALTKDEIVTVINESQVQLVDLVPETNSEDDFFD
>LS483415.1|SQG96679.1|785969_786461_+|PTS-system-mannose/fructose-family-transporter-subunit-IIB
MITQIRVDDRLIHGQVAVVWTKELNAPLLVVANDEAAKNEITQMTLKMAVPNGMKLLIRSVEDSIKLFNDPRATDKRIFVIVNSVKDACAIAKEVPDLEAVNVANVGRFDKSDPASKVKVTPSLLLNPEEMAAAKELVSLPELDVFNQVLPSNTKVHLSQLVN
>LS483415.1|SQG96680.1|786477_787287_+|PTS-system,-mannose-specific-IIC-component
MLVPATMAALAVLICFGGNYLTGQSMMERPLVVGLVTGLLLGDMKVGILMGASLEALFLGNVNIGGVIAAEPVTATAMATTFTIISHIDQKAAMTLAVPIGMLAAFVVMFLKNVFMNIFAPMVDKAAAANHQGKLVMLHYGTWIIYYLIIASISFIGILVGSGPVNAFVEHIPQNLMNGLSAAGGLLPAVGFAMLMKLLWTNKLAVFYLLGFVLTAYLKLPAVAVAALGAVICVISSQRDLELDAITRGAISKQTTFDSKESEEEDFFA
>LS483415.1|SQG96681.1|787283_788111_+|phospotransferase-system-(PTS),-enzyme-II-component-D
MTSQDNLTKEDRKMLRSVFWRSWTMNASRTGATQYHAVGVIYTLLPVINRFYKTDKDKAEALVRHTTWFNATMHINNFIMGLVASMEKKNSEDPDFDASAITAVKASLMGPISGVGDSFFWGILRVIAAGIGISLASAGSAMGAVVFLLLYNIPAFIIHYYSLYGGYSVGAGFIKKLYESGGIKIVTKTSSMLGLMMVGSMTASNVKFKTILTVAAKGAKEAASIQDYLDQLFIGIVPLMVTLAAFWLLRKKVNINWIMFGIMFLGIILGLLGIC
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Self-targeting detection

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MGE targeting detection<

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LS483415_1	1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR	779815-779844	30	NZ_CP016080	Mesorhizobium loti NZP2037 plasmid pML2037, complete sequence	380602-380631	9	0.7

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27. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgtgctgagtttactcgtagtaatca	Protospacer
****** ***********************

28. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctccagtccg	Protospacer
***************.**************

29. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448852 (Streptococcus phage Javan140, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

30. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448771 (Streptococcus phage Javan481, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

31. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

32. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448860 (Streptococcus phage Javan172, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

33. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448779 (Streptococcus phage Javan497, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

34. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

35. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

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gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

36. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448976 (Streptococcus phage Javan528, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
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*****************************.

37. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
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*****************************.

38. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448970 (Streptococcus phage Javan516, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

39. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448972 (Streptococcus phage Javan520, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

40. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

41. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448944 (Streptococcus phage Javan452, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

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gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

42. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448959 (Streptococcus phage Javan488, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
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*****************************.

43. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448945 (Streptococcus phage Javan454, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

44. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448774 (Streptococcus phage Javan487, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

45. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448772 (Streptococcus phage Javan483, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

46. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448766 (Streptococcus phage Javan465, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

47. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

48. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

49. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448797 (Streptococcus phage Javan531, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

50. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448949 (Streptococcus phage Javan460, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

51. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

52. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

53. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

54. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
*****************************.

55. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448952 (Streptococcus phage Javan472, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
tttacgtgctgagtttactcgtagtaatca	Protospacer
.***** ***********************

56. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448794 (Streptococcus phage Javan525, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
tttacgtgctgagtttactcgtagtaatca	Protospacer
.***** ***********************

57. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
tttacgtgctgagtttactcgtagtaatca	Protospacer
.***** ***********************

58. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448765 (Streptococcus phage Javan459, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
tttacgtgctgagtttactcgtagtaatca	Protospacer
.***** ***********************

59. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448784 (Streptococcus phage Javan505, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

60. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448947 (Streptococcus phage Javan458, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

61. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448965 (Streptococcus phage Javan506, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

62. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

63. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448689 (Streptococcus phage Javan163, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

64. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448974 (Streptococcus phage Javan524, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

65. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

66. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

67. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448789 (Streptococcus phage Javan513, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

68. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448678 (Streptococcus phage Javan135, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgagctgagtttactcgtagccatca	Protospacer
************************. ****

69. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448860 (Streptococcus phage Javan172, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaacgctccagtccg	Protospacer
***************.**.***********

70. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctccagtctg	Protospacer
***************.************.*

71. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448972 (Streptococcus phage Javan520, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctccagtctg	Protospacer
***************.************.*

72. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448774 (Streptococcus phage Javan487, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctccagtctg	Protospacer
***************.************.*

73. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctccagtctg	Protospacer
***************.************.*

74. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctccagtctg	Protospacer
***************.************.*

75. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448968 (Streptococcus phage Javan512, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataagtgtc	Protospacer
*************************.***.

76. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_009819 (Streptococcus phage P9, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagttcaagcatgcctttataaatgtc	Protospacer
******.**********************.

77. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_004589 (Streptococcus prophage 315.6, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattagctcaagcatgcctttataagtgtc	Protospacer
*************************.***.

78. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448871 (Streptococcus phage Javan196, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

79. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

80. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448697 (Streptococcus phage Javan185, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

81. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448693 (Streptococcus phage Javan177, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

82. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448696 (Streptococcus phage Javan183, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

83. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to NC_009819 (Streptococcus phage P9, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

84. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448868 (Streptococcus phage Javan188, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

85. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448866 (Streptococcus phage Javan184, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

86. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448699 (Streptococcus phage Javan189, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

87. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448867 (Streptococcus phage Javan186, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

88. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448698 (Streptococcus phage Javan187, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagctt	Protospacer
*.** *************************

89. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448796 (Streptococcus phage Javan53, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
attacgtgctgagtttactcgtagttatca	Protospacer
 ***** ****************** ****

90. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448951 (Streptococcus phage Javan470, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttgcgtgctgagtttactcgtagtaatga	Protospacer
***.** ********************* *

91. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448946 (Streptococcus phage Javan456, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaagaatgctcctgctcg	Protospacer
************************ *..**

92. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag	Protospacer
***************.******** *** *

93. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag	Protospacer
***************.******** *** *

94. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag	Protospacer
***************.******** *** *

95. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag	Protospacer
***************.******** *** *

96. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_004584 (Streptococcus prophage 315.1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag	Protospacer
***************.******** *** *

97. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

cactgattggacaaagaatgctccagtccg	CRISPR spacer
cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag	Protospacer
***************.******** *** *

98. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448978 (Streptococcus phage Javan532, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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***************.******** *** *

99. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448785 (Streptococcus phage Javan507, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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***************.******** *** *

100. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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***************.******** *** *

101. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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***************.******** *** *

102. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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***************.******** *** *

103. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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.** *************************.

104. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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.** *************************.

105. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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.** *************************.

106. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448680 (Streptococcus phage Javan139, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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.** *************************.

107. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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.** *************************.

108. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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.** *************************.

109. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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*********************.*****.*.

110. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448854 (Streptococcus phage Javan146, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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*********************.*****.*.

111. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to JX409895 (Streptococcus phage JX01, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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**..********.*****************

112. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448858 (Streptococcus phage Javan166, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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**..********.*****************

113. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448763 (Streptococcus phage Javan451, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

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*.** ***********************.*

114. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448941 (Streptococcus phage Javan446, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9

gcacgagtttaactcccttattattagctt	CRISPR spacer
gtaccagtttaactcccttattattagcct	Protospacer
*.** ***********************.*

115. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448679 (Streptococcus phage Javan137, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867

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********* *.***************.*.

116. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448690 (Streptococcus phage Javan169, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867

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********* *.***************.*.

117. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448682 (Streptococcus phage Javan143, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867

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********* *.***************.*.

118. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867

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**..********.*************** *

119. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867

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**..********.*************** *

120. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448701 (Streptococcus phage Javan197, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

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.** ********************.**.*.

121. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448869 (Streptococcus phage Javan190, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

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.** ********************.**.*.

122. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448864 (Streptococcus phage Javan180, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

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.** ********************.**.*.

123. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448694 (Streptococcus phage Javan179, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

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.** *****************.*****.*.

124. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448870 (Streptococcus phage Javan192, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833

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.** ********************.**.*.

125. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8

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****** **************.  . ****

126. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MN830258 (Lactobacillus phage JNU_P9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733

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.*.  . ********* *********.***

127. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033508 (Mesorhizobium jarvisii strain ATCC 700743 plasmid pMJ700743a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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***** *************** ... *   

128. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033369 (Mesorhizobium loti strain SU343 plasmid pMLSU343a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

gattagctcaagcatgcctttataaatgtt	CRISPR spacer
gattacctcaagcatgcctttccggttcaa	Protospacer
***** *************** ... *   

129. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016080 (Mesorhizobium loti NZP2037 plasmid pML2037, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7

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***** *************** ... *   

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	37915 : 50350	8	Synechococcus_phage(28.57%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_2	335493 : 390649	58	Streptococcus_phage(33.33%)	protease,transposase,bacteriocin,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_3	513315 : 525559	11	Streptococcus_phage(55.56%)	tRNA	NA
DBSCAN-SWA_4	609821 : 617221	6	Streptococcus_phage(66.67%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_5	622998 : 667067	45	unidentified_phage(15.38%)	head,tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_6	683811 : 723791	39	Streptococcus_phage(30.77%)	protease,transposase	NA
DBSCAN-SWA_7	929294 : 1021352	114	Streptococcus_phage(45.71%)	integrase,tRNA,head,terminase,capsid,transposase,portal,tail,holin	attL 1007307:1007322|attR 1011495:1011510
DBSCAN-SWA_8	1035496 : 1086349	50	Bacillus_phage(18.75%)	tRNA,transposase,protease	NA
DBSCAN-SWA_9	1299361 : 1370973	89	Streptococcus_phage(61.02%)	integrase,head,tRNA,terminase,portal,tail,holin	attL 1325946:1325962|attR 1371019:1371035
DBSCAN-SWA_10	1714595 : 1730328	22	Streptococcus_phage(61.54%)	tRNA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>LS483415|37915:50350|DBSCAN-SWA
GATGTCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGATTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGCCTTGTGAAAGAGTTGACACATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGACTTGCGTATTGTGCAGGTTTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTACTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACCGTCTTTTGACGGAAGCTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTATTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCTGAGCTATACTTGATCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAACCCTGTTGATTCGCGTTTCAAGGACATTACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTATCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAAATTATAAAGCTGACGATTTTGCGGCCTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGACCTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGACGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAATTGAAGAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGACAACTTATGATAAATATATCGCCATGCGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAAACACTTATGGATATGGCGACTATTTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAACGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTGAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTCGGTGGAGCGGCGACTTGTATCGGTGGTGCTATTCGTGACCCATTGTCAGGGCGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATCACGACTCCGATTGCGGAAACACGTACTGGTAAATTGCCACAACAGGTTATTTCTAAGACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGACTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGCATGGAGCTTGGAGCTGTGGTCGGAGCGGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGTGATGTGGTAATCTTGCTTGGTGGTAAAACAGGGCGTGACGGTGTCGGCGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAGTCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATCGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTCTTCCGTGATGGTGAAGTGACTCGTCTCATCAAAAAATCAAACGACTTTGGTGCGGGTGGTGTCTGTGTTGCTATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTCCCACTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCAAGTGATGTGGATGCCTTCATCGCAGCTTGCAACAAGGAAAATATCGATGCCGTTGTAGTTGCGACAGTTACCGAGAAACCAAATCTTGTCATGACTTGGAATGGTGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGTTAAATTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGATCTCAACCATGCTAGTCAAAAAGGTCTTCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGCTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGTTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGCATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTACTTTGAGCGTATAGATAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGTTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGACTTGACAGTACCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGCGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGCGAAAACATTTACTATATCCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAGCCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACAGCTGCCTCAGCCGCTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGTTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACGCGGTGAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGCGCTAGCCTTCTAGCAGCCTTCGAAGGCAAATTGGAAGAGGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCTGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAATATGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGTTGCTATTGCTGAGTCAGTTGACACTATGGTTGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGCTTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACGAGAAGGTCCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAAGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCCAACCAACACGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATCCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGACACTCAGAACGCTGGGAAGACGGACTCTTCCAAAATATTCCTGGTAACAAAGACCAAACCTTGTTTGCTAGTGCAGTAAAATATTTTACAGGAAAATAATTTTTTCAAATTTTTTCATAAAACAGATAAGGAAACAAGAGCGAAGCGAGCTTAACTGTATCTTTCTGTCGTAGTGGTATTTGGGAGCCGTTGAGGCTAAGACTCAATGATTAGCTTGAAAATAGCTTGATAGATTTTCTATTTTGATGTTGGCATTGGTGACGATAGATCCAAAATTGAGAAAATCATCAAAGCTACTTAAGAAGAGATACAAAAAGAATTAGGAAAAAAGAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGGCATCCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGAGCTGGTATTGTTTCAAATGACAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGGCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCCTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACTCAAGTTTCATGGGAAAGGTAAAAGAAGCTCTAAATACAGTAAAGGGTGGCTTTGCCTATCTACTGATGACAGAAAATAAACTCATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATCGTGGTATTCAATGTGATTGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGATGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGA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TCCACTTACTCGGATAGTTATCGCCTAAAACAGCTGCATGAACAAGATTTTCCTGTTGCGAAATAAGTGTAGATGGCATAGTAGGTACTAGACCATTAAAACCTAAAAGGATTACTCCTGAGACCAAAAAACGATGAAATTTTTTCATTAATTACCTCCTGTAACTTATTATTCGAAAGCAAGAAACAAAAAATGTTATTTTTAGATGATTATTTTGAAAATTGGCTTTACTTGATATTAAATAACTATTTGATTGGCTAATAGAGTGTTCCTTATTTCAAGAATTGTGGTCTACTATCACATTTTTACAATGTTTCAATTATTGATAATTAATACATTGTATCAAAAGGCGAACGTTTATGATATAATATCTAATTATAATACGAAAGAGGTGGATGTTTTGAAATTACTTGTTGTTGGTTCAGGTGGTCGTGAACATGCGATTGCTAAGAAATTGTTAGCGTCTAAGGGTGTGGATCAGGTTTTTGTGGCACCTGGTAATGATGGTATGACCTTGGATGGTCTGGACTTGGTGAATATAGTAGTTTCCGAACATTCCAGGTTGATTGCCTTTGCGAAGGAGAATGAGATTTCTTGGGCCTTTATTGGTCCTGATGATGCGCTAGCAGCTGGTATCGTTGATGATTTCAACAGTGCTGGACTCAGAGCTTTTGGTCCAACAAAGGCAGCAGCGGAGCTAGAGTGGTCAAAAGACTTTGCCAAGGAAATCATGGTCAAATACAATGTCCCAACAGCAGCCTATGGCACATTTTCAGACTTTGAAAAAGCCAAAGCCTACATCGAAGAGCAGGGCGCACCTATCGTGGTCAAGGCTGATGGCTTGGCGCTAGGTAAGGGTGTGGTCGTGGCTGAAACCGTTGAGCAGGCGGTAGAGGCGGCGCAAGAGATGCTTCTGGACAATAAGTTTGGCGATTCAGGAGCGCGTGTGGTTATCGAGGAATCCTTGGATGGCGAGGAGTTTTCCCTCTTTGCCTTTGTTAATGGTGATAAGTTCTACATCATGCCGACAGCTCAGGATCACAAGCGTGCCTTTGACGGAGACAAGGGGCCAAACACTGGTGGTATGGGTGCCTATGCGCCAGTTCCTCATCTACCTCAGAGCGTGGTGGATACAGCGGTTGAGACGATCGTTAGGCCTGTCCTTGAGGGTATGATTGCCGAAGGGCGTCCTTATCTAGGCGTCCTCTATGCGGGGCTTATCCTGACGGCTGATGGTCCTAAGGTTATCGAGTTCAACTCACGTTTCGGTGACCCTGAAACTCAGATTATCCTCCCTCGCCTGACTTCCGATTTCGCTCAGAATATTGACGATATCATGATGGGCATTGAGCCTTACATCACTTGGCAGAATGACGGTGTGACTTTGGGTGTTGTCGTTGCCTCAGAAGGCTATCCGCTCGATTACGAGAAAGGTGTGCCACTGCCTGAGAAGACCGACGGCGATATCATCACCTACTATGCCGGAGCTAAGTTTGCGGAAAATAGCGAGCTACTTCTCTCAAACGGAGGACGTGTCTATATGCTCGTCACCACAGAAGACAGCGTCAAAGCAGGGCAGGACAAAATCTATACCCAACTGGCCCAACAAGACACAACAGGTCTCTTCTACCGAAATGACATCGGAAGCAAAGCTATAAGAGAATAAGACTAATCATTCAAATATTAGCGTCAGCAATCAGCGACCGAAGGTCGCTCCAAAAAGAAAGAAGAAAGGAACTGAACACGGGACTAATTTCCTAGGAAAAAAGATAAAACTACCTGGACGCAAGCGTCATCGTTAGTTTTCTGCGTCGTAGGCGTCTGATGCTAAAGCACCTAGTCGCCCTGACGTAGGTTCGTCTTCGAAATCAAAGATTTCGGACTTACCGCATATTTTTCTACGGAAAGTTTCGACAAGTCGAAACGCCCCTTTGTATCTTAATTATGAAAACTCCAATTATTTCTATTATCATGGGCTCCAAATCTGACTGGGCAACCATGCAAAAAACGGCTGAAGTTCTAGACAACTTTGGCATTGCTTACGAGAAGAAAGTCGTCTCTGCTCACCGCACGCCCGACCTCATGTTCAAGTATGCTGAGGAAGCACGTGGTCGTGGCATCAAAATCATCATCGCAGGAGCAGGTGGGGCAGCTCACTTGCCTGGTATAGTGGCAGCTAAAACAACGCTGCCTGTTATCGGTGTGCCTGTCAAATCACGTGCCCTTTCAGGTTTGGATTCACTCTATTCGATTGTGCAGATGCCTGGCGGTGTGCCTGTGGCAACCATGGCTATCGGAGAAGCGGGAGCGACTAACGCTGCCCTGACAGCCCTCCGTATTCTCTCCATCGAGGATCAAAATCTGGCTGATGCGCTAGCTCACTTCCATGAGGAACAAGGAAAAATCGCAGAGGAGTCAAGTGGTGAACTCATTTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_1

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>LS483415|37915:50350|43404_44427_+|SQG95969.1|DBSCAN-SWA
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MSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDRLLTEAEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAELYLINKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKAEQGLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRTGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGEVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPSDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDVKFVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERIDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEDLTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKLEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEVAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK
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MKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKYAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGIVAAKTTLPVIGVPVKSRALSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI
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MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI
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MFQLLIINTLYQKANVYDIISNYNTKEVDVLKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEESLDGEEFSLFAFVNGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVETIVRPVLEGMIAEGRPYLGVLYAGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQNDGVTLGVVVASEGYPLDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGAKFAENSELLLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDTTGLFYRNDIGSKAIRE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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SQG95969.1|43404_44427_+	phosphoribosylaminoimidazole synthetase	A0A0E3FGG1	Synechococcus_phage	4.0e-63	41.7
SQG95970.1|44594_45149_+	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	2.4e-25	36.1
SQG95971.1|45332_46880_+	IMP cyclohydrolase / Phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase	E3SNU8	Prochlorococcus_phage	5.7e-45	52.4
SQG95972.1|46937_48062_-	bacterial SH3 domain protein	F8HGP2	Streptococcus_phage	7.7e-07	28.6
SQG95973.1|48224_49580_+	phosphoribosylamine--glycine ligase	NA	NA	NA	NA
SQG95974.1|49858_50350_+	phosphoribosyl carboxyaminoimidazole mutase	A0A2P0VNU7	Tetraselmis_virus	1.4e-18	42.3

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>LS483415|335493:390649|DBSCAN-SWA
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>LS483415|335493:390649|384150_385203_+|SQG96294.1|DBSCAN-SWA
MQEYSIDITLTHPDDVLALFGSNERHLKLIEAHLGVIVHARTERVQVIGEDEEAVELARLTIKALLVLVGRGMVVNTSDVVTALSMAESHQIDQFMALYEEEIIKDNYGKAIRVKTLGQKTYVDSVKRHDVVFGVGPAGTGKTFLAVTLAVTALKRGQVKRIILTRPAVEAGESLGFLPGDLKEKVDPYLRPVYDALYHILGKEQTTRLMERDVIEIAPLAYMRGRTLDDAFVILDEAQNTTIMQMKMFLTRLGFNSKMIVNGDTSQIDLPRNVKSGLIDATQKLQGIKQIDFVYFSAKDVVRHPVVADIIKAYETSSEETKDLLKPKASDVEAGYQPGLTKYPVIGQEH
>LS483415|335493:390649|386460_386868_+|SQG96297.1|DBSCAN-SWA
MALHDNNTTKRKWKNRTITSSLEFALTGVFTAFKEERNLRSHLLSACLACVAGLFFSISAIEWLFLLLAIFLVITLEIVNSAIENVVDLASDYHFSMLAKNAKDMAAGAVLMISGYAVLTGLIIFIPKIWNIFVH
>LS483415|335493:390649|389338_389473_+|SQG96301.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA
MIKFAEEIQKEELFHIIGGYSATDCKSHLIGGITSGAIAGGWLL
>LS483415|335493:390649|385248_385824_+|SQG96295.1|DBSCAN-SWA
MDDLTKAIMADEANLSYTERDIFPLYDAPQTARIIIVGQAPGIVAQETKLYWNDRSGIRLRDWLGVDNDTFYHSGLFGIIPMDFYYPGKGKSGDLPPREGFAAKWHPPLRALMPEVELTILVGRYAQDFYLGNKAYKTLTETVRHFEDYLPDYFPLVHPSPRNQLWLAKNLWFEQDLLPILQKRVEAILTK
>LS483415|335493:390649|378250_378808_+|SQG96288.1|DBSCAN-SWA
MANAIIETAKERFAQSHQSLSREYSSIRAGRANASLLDRIQVDYYGAPTPLNQLASITVPEARVLLISPFDKSSIKDIERALNASDLGITPANDGSVIRLVIPALTEETRKELAKEVKKVGENAKIAIRNIRRDAMDDAKKQEKAKEITEDELKTLEKDIQKATDDAIKEIDRMTAEKEKELLSV
>LS483415|335493:390649|359040_359391_+|SQG96266.1|DBSCAN-SWA
MKTRSKRFLNLATLCLALLGTILLMEQPVKAEAIRTDGQTEHISQSTDGQSTDRQKDRDAGYEAGLRDGRRDAQTLSEPREPDQDQGDFKSLDYCDGYFIGYYRGWDEVRYPVQTF
>LS483415|335493:390649|386987_387884_+|SQG96298.1|DBSCAN-SWA
MFKSGFVAILGRPNVGKSTFLNHVMGQKIAIMSDKAQTTRNKIMGIYTTETEQIVFIDTPGIHKPKTALGDFMVESAYSTLREVETVLFMVPADEKRGKGDDMIIERLKAAKIPVILVINKIDKVHPDQLLEQIDDFRSQMDFKEVVPISALEGNNVPTLIKLLTDNLEEGFQYFPEDQITDHPERFLVSEMVREKVLHLTQQEVPHSVAVVVESMKRDEETGKVHIRATIMVERDSQKGIIIGKQGAMLKKIGKMARRDIELMLGDKVYLETWVKVKKNWRDKKLDLADFGYNEKEY

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQG96247.1|335493_336084_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	7.5e-54	55.2
SQG96248.1|336578_336854_+	hypothetical cytosolic protein	NA	NA	NA	NA
SQG96249.1|337102_337738_+	thymidylate kinase	M1PSC7	Streptococcus_phage	1.2e-65	63.4
SQG96250.1|337755_338631_+	DNA polymerase III subunit delta	M1NSC1	Streptococcus_phage	2.0e-55	41.4
SQG96251.1|338649_338889_+	Tpl protein	NA	NA	NA	NA
SQG96252.1|339293_339617_+	DNA replication initiation control protein	M1PFV3	Streptococcus_phage	1.3e-28	59.4
SQG96253.1|339621_340485_+	corrin/porphyrin methyltransferase	M1PLC5	Streptococcus_phage	3.6e-113	73.6
SQG96254.1|340511_340904_+	hypothetical membrane associated protein	NA	NA	NA	NA
SQG96255.1|340950_341580_-	copper homeostasis protein	NA	NA	NA	NA
SQG96256.1|341879_342236_+	arsenate reductase	M1PLC0	Streptococcus_phage	1.1e-39	65.0
SQG96257.1|342309_343137_-	3'-exo-deoxyribonuclease	M1PSC0	Streptococcus_phage	8.4e-128	79.1
SQG96258.1|343370_344552_+	L-lactate oxidase	NA	NA	NA	NA
SQG96259.1|344817_349761_+	LPXTG-motif cell wall anchor domain protein	NA	NA	NA	NA
SQG96260.1|350530_351238_+	permease	NA	NA	NA	NA
SQG96261.1|351480_353478_+|tRNA	methionyl-tRNA synthetase	A0A1V0SHR2	Klosneuvirus	1.3e-86	35.0
SQG96262.1|353972_354986_+	ribonucleotide-diphosphate reductase subunit beta	R4TBI6	Mycobacterium_phage	4.2e-97	53.0
SQG96263.1|354989_355478_+	nrdI protein	R4JF54	Bacillus_phage	1.3e-11	37.5
SQG96264.1|355444_357625_+	ribonucleoside-diphosphate reductase subunit alpha	A8E2R1	Enterococcus_phage	1.4e-169	43.1
SQG96265.1|357830_358583_-	ADP-ribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96266.1|359040_359391_+	hypothetical membrane associated protein	NA	NA	NA	NA
SQG96267.1|359805_360057_+	hypothetical membrane spanning protein	NA	NA	NA	NA
SQG96268.1|360151_360652_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG96269.1|361012_361249_+	Protein of uncharacterised function (DUF2829)	NA	NA	NA	NA
SQG96270.1|361241_361940_+	3-ketoacyl-ACP reductase	A0A0N9R355	Chrysochromulina_ericina_virus	3.5e-10	25.2
SQG96271.1|362015_362975_+	NAD(P)-dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
SQG96272.1|363307_364645_+	phosphoglycerate transporter protein	NA	NA	NA	NA
SQG96273.1|364818_366201_+	bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase	A0A2K9L4K9	Tupanvirus	2.2e-32	36.4
SQG96274.1|366231_366786_+	ADP-ribose pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
SQG96275.1|366785_367037_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQG96276.1|367056_367752_+	MTA/SAH nucleosidase	NA	NA	NA	NA
SQG96277.1|367902_368244_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96278.1|368340_368988_-	metalloregulator ScaR	NA	NA	NA	NA
SQG96279.1|369133_370066_+	manganese-binding protein	NA	NA	NA	NA
SQG96280.1|370129_370855_+	manganese transporter ATP-binding protein	A0A1V0SE00	Indivirus	1.4e-17	32.6
SQG96281.1|370855_371710_+	ABC 3 transport family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96282.1|371856_372663_-	cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase	A0A2H4UTF4	Bodo_saltans_virus	1.5e-20	36.6
SQG96283.1|372879_375285_+	cell division protein FtsK	S5VNE3	Mycobacterium_phage	3.8e-88	51.7
SQG96284.1|375354_375708_-	integral membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQG96285.1|375951_376377_+	50S ribosomal protein L11	NA	NA	NA	NA
SQG96286.1|376482_377172_+	50S ribosomal protein L1	NA	NA	NA	NA
SQG96287.1|377493_378222_+	uridylate kinase	NA	NA	NA	NA
SQG96288.1|378250_378808_+	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
SQG96289.1|378916_379774_+	s1 RNA binding domain	NA	NA	NA	NA
SQG96290.1|379846_380356_+	methionine sulfoxide reductase A	NA	NA	NA	NA
SQG96291.1|380352_380568_+	hypothetical cytosolic protein	NA	NA	NA	NA
SQG96292.1|380723_381905_+	lysM domain protein	A0A0E3XB61	Gordonia_phage	2.1e-15	39.6
SQG96293.1|382219_383992_+	myosin-cross-reactive antigen	NA	NA	NA	NA
SQG96294.1|384150_385203_+	phosphate starvation-induced protein	W8D063	Erwinia_phage	1.2e-46	50.0
SQG96295.1|385248_385824_+	uracil DNA glycosylase superfamily protein	NA	NA	NA	NA
SQG96296.1|385982_386480_+|protease	metalloprotease	NA	NA	NA	NA
SQG96297.1|386460_386868_+	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
SQG96298.1|386987_387884_+	GTP-binding protein Era	NA	NA	NA	NA
SQG96299.1|387904_388381_+	phosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
SQG96300.1|388686_388941_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96301.1|389338_389473_+|bacteriocin	bacteriocin class II with double-glycine leader peptide family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96302.1|389560_389743_+|bacteriocin	bacteriocin class II with double-glycine leader peptide family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96303.1|390080_390230_-|transposase	IS1191 transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96304.1|390226_390649_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>LS483415|513315:525559|DBSCAN-SWA
CATGGCACTAATAGAAATGTCTGGTGTTACTAAAAAATACCGCCGCTCAACGACCGCCCTCAGAGACGTCAATGTTTCTGTTAACCAAGGTGAGTTTGTTTATCTCGTAGGCCCATCAGGTGCTGGTAAATCAACTTTTATCAAACTCCTTTACCGTGAAGAACAACTGACAACTGGTAAGCTATATGTGGGTGAATTCAATTTAACTAAGCTAAAAGCACGTGATGTTCCGATTCTTCGTCGTCACATCGGAGTAGTTTTTCAAGATTACAAACTGCTACCAAGAAAAACAGTCTTTGAAAATGTAGCTTACGCCATGGAAGTTATTGGTGAAAAGCGCCGCCACATTAAAAAACGCGTGCCAGAGGTACTCGATTTAGTTGGCTTGAAACATAAGATGCGTTCTTTTCCAAGTCAGCTATCAGGAGGGGAGCAGCAACGTGTGGCCATTGCGCGTGCGATTGTTAACAACCCTAAATTATTGATTGCAGATGAACCGACAGGGAATTTAGATCCTGAGATTTCATGGGAAATTATGCAGTTACTTGAACGTATTAATGTTCAGGGAACAACTATCTTAATGGCGACACACAACAGTCATATTGTGAATACATTTCGTCATCGTGTTGTTGCTATTGAAGATGGTCGCATAGTACGTGATGAAGAAAAAGGAGATTATGGTTACGATGATTAGATACTTTTTCCGTCATATTTGGGAATCCATTAAAAATCTTAAACGCAACTTTTGGATGACATTTGCTTCAGTTAGTATGGTGGCTGTTACATTGACTTTAGTTGGTGTTTTTGCGGCGACATTGTTGAATATACAGCGTGTTGCTTCGGGTGTTGAAAATAATGTCCATATCAATACCTACTTACAAGTTGATTCAACTGATGCTGCAAAAGTTATTCAAAATACTGCCGGTGAACCTGTTAATAACGATAACTACCACAGTGTTTACGACAAAATTGCTCAGATAAAAGGTGTCAAAAAGATTACATTTTCTAGCAAGGATGAACAATTGAAAAAATTGCAAGAAACCTTAGGTGATGTTTGGAATATGTATGACCAAGACACTAATCCGCTCCAAGATATCTATCTTATTGAGACCCAGACGCCTAAACAAGTTAAGGCGATCACTAAAAAGATCAGAACGATTGAAGGCGTAGAAGCCGCAGATTATGGAGGGATTAACTCCGATAAACTATTTAAGTTTTCAACATTAATTCAAACTTGGGGGCTGATCGGAACAGCAATGCTATTATTTGTAGCTGTCTTTCTCATTTCAAACACTATTCGTATGACTATTATGTCTCGTAAACGCGACATTGAAATTATGCGGTTAGTTGGTGCTAAAAATTCTTATATTCGAGGGCCTTTCTTTTTTGAAGGGGCTTGGGTTGGCTTGTTAGGAGCTGTTTTACCATCTCTTCTGATTTATTATGGATATGATCTTGTTTATAAGCATTTTGCACAAGAATTACAACGTAATAATCTCTCGATGTATCCGCTTGATCCTTATGTATATTACCTGATTGGTGCTTTGTTTGTCATAGGTATTATGATTGGTTCGCTTGGTTCAGTGCTTTCTATGAGACGTTATTTAAAATTCTAAAAAAAGCGCTGCTGACGAAACGTAGCGACCCCCAAAAGTTGGACCTCTTATGTTATTCCAAGGACTTCGTTTTGTATTGCACAGGACTGGTCCTTTTCATTTTGTTTTGATTCATTTGTTTATTTGTAATAGGCAATATAGTTTAAAATAGCAGTTTCTAAGGTTTCAAGAGAAGAAAAGCACCCCAAAAGTTAGATGTTTGATGTATCTAACTTTTGGGGTGTCATTCAAAATTTAGTGGCTCTTTTTTAGTAAAATACTATGATTTCAGTTTTAGGATAACCTCAAACAGTATCTAAAATAGCTATGTCAATGAAAAAAGGGGTTAGCATTTTTTTCGTGACAAATGGTAGTAGAAGGACCATGCCCAGGATAAACTCGGTAATGATTAGGTAAGGTGAATAGTTCTTGGCGAATACCAGTAATGAGGTCCTCAAAGTTACTGGTAGGTAAGTCAGTACGACCGATAGTTTCACGAAATAGAGCATCGCCAGTAACGACTAATTCATCTGAGTGGAAAACAAATGAGACTCCTCCCCAAGAATGACCAGGTGTTGGTAAAACTGTGAATTCAAAACCATTTAGTTGATAGGGTTGCTTTAATTTAAAAAAGTTCTCTGCCGGTCTTGCTATAACATTAATGATATCATCATGACGGCCTAAGCCAGATAAATTATCATCTGGGGAAGATAGCCAAGCGGCTTCTTTTTCTGAAACATAAACAGGTGGATGATCAAAAGCATCTCTGACCAAATCTAAACTAAAAATATGATCATAGTGAGTATGCGTTAAGAGGATAGCCACTAAAGGTTTTTCAAAGGATTTAATTTTAGAAATGATTTCTTGGCCGTTACTTCCTGGATCAATGAGGATAACAGCTTGATCATTAACGAGGTAATAAGTATTTTCACCAGCAATGTGGTTTATTGTTTTATAGATTTTCATAAGGATAGTGTACCAAAAAATCAAGGCTTTGTTAAAAAAAGAGTGGCGGAAAATAAATGGCAATTAGTTTCAGAAAATATGAGATCTCACAGCAATTTCTTGACACCGTTTTCATAAAGGTGTATCATAAAAGTAATCAATAAGCCAAGCCTAAAGCTGAACTTAGTTTAAGAACACTGACTTTTTGAGAGCAACCTAATCGGTTGACTAAAAAATATGAGGTGGAAGATATGTCAAAAGTTGCTATTGTTACTGGTGCTGGTCAAGGAATTGGATTTGCTATCGCGAAACGTCTTCATGCAGACGGCTTTAAAATAGGCATTTTAGACTATAATGAAGAGACTGCTCAGGCTGCGGTTGATAAACTATCACCTGAGGATGCTGTTGCAGTTGTAGCAGATGTTTCAAAACGTGACCAAGTTTTTGATGCTTTCCAAAAAGTTGTAGATACTTTTGGTGATTTGAATGTTGTTGTTAACAATGCAGGTGTTGCCCCAACAACCCCTCTTGACACGATTACTGAAGAGCAGTTTGAAAAGGCTTTTGCAATCAATGTCGGAGGAACGATTTGGGGAAGCCAAGCAGCTCAAAAACATTTTAGAGAATTAGGTCATGGCGGAAAAATTATAAATGCAACATCACAAGCAGGGTGTGAAGGGAATCCTAATTTGACTGTTTATGGTGGTACAAAATTTGCAGTTCGTGGTATTACACAGACTTTGGCAAAGGATTTGGCATCAGAAGGAATCACAGTCAATGCTTACGCACCAGGTATTGTTAAAACACCTATGATGTTTGCTATTGCCCATGAAGTTGGTAAAAATGCAGGCAAAGATGATGAATGGGGTATGGAGCAATTTGCAAAAGATATCACTTTGAAACGCTTGTCTGAACCAGAAGATGTTGCTAATGCAGTAGGCTTCCTAGCGGGAGATGATTCAAATTATATCACTGGACAAACAATAGTTGTCGATGGTGGTATGGTATTCCATTAAAAATGATTAATACTGACACTGTGAGTGAAACTCACAGTGTTTTTTATACTTCTTAAAAAATTATCCTATCTTGGTTATTGGAGTGATGGCACCTTTGAGGTATAGTCATGTTTTGTTTTATAGATATAGCGTGCTATAATAGACTTACTATGACCCAGAAAAAACTTAGAAAATATGCAGTAGTGGACTTGGAGGCTACTGGAGCAGGTCCCAATGCTTCTATTATTCAGGTTGGGATTGTTATTATCCAAGGAAATAAAATTATTGATAGTTATGAAACAGATGTTAATCCTCATGAATCTTTAGATGAGCATATTGTTCATTTGACAGGTATTACGGATAAGCAGTTGGCTAAAGCTCCGGATTTTGGTCAAGTGGCGCATCACATTTATCAATTGATTGAAGATTGTATTTTTGTTGCCCACAATGTAAAGTTCGATGCAAATTTATTGGCAGAAGCTCTTTTTTTGGAAGGATATGAGTTAACAATACCACGTGTTGATACTGTTGAATTAGCCCAACTATTTTTCCCTCGCTTTGAAAAGTATAACCTTGGTCACCTATCTAGGCAGCTCAATATTGATTTGGCAGAAGCTCATACTGCTATTGCAGATGCAAGAGCTACAGCTATACTGTTTTTAAGACTTTTACAAAAAATTGAGAGCCTTCCAATTGAGTGCTTAGAAAGCTTATTAGTCTATTCAGATAGCCTGCTATTTGAAACAGCAATGGTCATTCAAGAAGGATTAGCCAAAGCCAAACCTTATGATCCCAACAAATACATTAAAATCAGACAGATTCTCTTACCAAAGGGCCCAAAAGCTCCCAAGCCTTATCAAATATCAAAAAGCTTCCCTATTAATATGGCACTATTAGGTCTGGAAGAAAGGCCTAAACAGACTCAATTTGCTCAGTTAATTGACGAAGATTACCATCAGGGAGTAGCTAGTTTTATTGAAGCTCAGACAGGTATTGGAAAAACCTACGGCTACCTGCTACCCCTTTTGGCAAAAGAAGATCAAAACCAAATCATTGTCAGTGTGCCAACCAAACTTCTTCAAGACCAATTAATGGCTGGTGAAGTAGCTGCTATTCAAGAACAATTTCACATCGCCTGCCATAGTTTAAAAGGACCCGCCAATTACCTAAAGCTAGATAGCTTTGCAGATAGTTTGGACCAAAATGACCAGAACCGTTTGGTGAATCGTTATAAAATGCAATTATTGGTTTGGCTCTTAGAAACTAAGACAGGAGACCTTGACGAAATCAAACAAAAGCAGCGCTTTGCCGCTTATTTTGAGCAGCTTAAGCACGATGGAGACATTAAGCAGTCTTCTGAATTTTACAATTATGATTTTTGGAGAGTTAATTATGAAAAAGCCAAAACAGCCCGTCTCCTGATTACCAACCATGCTTATTTTTTACACCGTGTTCAAGATGACAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3

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>LS483415|513315:525559|516977_518438_+|SQG96429.1|DBSCAN-SWA
MFCFIDIACYNRLTMTQKKLRKYAVVDLEATGAGPNASIIQVGIVIIQGNKIIDSYETDVNPHESLDEHIVHLTGITDKQLAKAPDFGQVAHHIYQLIEDCIFVAHNVKFDANLLAEALFLEGYELTIPRVDTVELAQLFFPRFEKYNLGHLSRQLNIDLAEAHTAIADARATAILFLRLLQKIESLPIECLESLLVYSDSLLFETAMVIQEGLAKAKPYDPNKYIKIRQILLPKGPKAPKPYQISKSFPINMALLGLEERPKQTQFAQLIDEDYHQGVASFIEAQTGIGKTYGYLLPLLAKEDQNQIIVSVPTKLLQDQLMAGEVAAIQEQFHIACHSLKGPANYLKLDSFADSLDQNDQNRLVNRYKMQLLVWLLETKTGDLDEIKQKQRFAAYFEQLKHDGDIKQSSEFYNYDFWRVNYEKAKTARLLITNHAYFLHRVQDDKDFARNKVLVFDEAQKLMLQLDQLSRHQLNLTFFYKQYRPS

Homologous phage analysis in the prophage region

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SQG96429.1|516977_518438_+	helicase DinG	A0A1X9I5C8	Streptococcus_phage	6.9e-133	53.9
SQG96430.1|518500_519478_+	helicase DinG	A0A1X9I5C8	Streptococcus_phage	1.1e-57	43.6
SQG96431.1|519812_521006_+	aspartate aminotransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96432.1|521026_522373_+|tRNA	asparaginyl-tRNA synthetase	A0A2P1EMB4	Moumouvirus	1.1e-55	30.8
SQG96433.1|522786_523677_+	P-loop ATPase protein family protein	A0A0R8VB27	Thermobifida_phage	8.8e-06	29.8
SQG96434.1|523673_524651_+	transporter	A1IMD5	Streptococcus_phage	1.2e-138	74.2
SQG96435.1|524647_525559_+	sporulation Regulator WhiA C terminal domain-containing protein	Q7AWZ3	Streptococcus_phage	2.9e-105	64.4

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>LS483415|609821:617221|DBSCAN-SWA
ATTATTCTCTATTTTTGGTGTTATCCTCTTTTAGTTCAGAAGTTGCCGCGTCAGCTTCTACGGGATTTAGTTCTAAGTAAGATGGTGCTTTAAAAAGTTTCTGAGTTGATTTATGACCATTTTTACTGTATAAACTTGTTGACTCTGATCCGAGTTTTGCTGAAATATCTTTCAGTTGTTTTAACTGCTTAGTGTAGATAAACTGGTTAGGATCAATAGCTTTTAGACCATTTTGAGTATCAAAGCGCAGGAGATCACCCGTTTGAATAGCGTCGCTAGCTGCTAGTTGTTGAGCAACAGCAGAGCGAATTTCCTTAGTTTTGGCTATAGTCATTTCATCGGGATTAGTGATTTCTAAACCTGTTTGCGTGTTGTACAGACGTCCACTATAGTTAGTGTATTCAGGAGTCATATAAGTCCCAGATGTTCGTTGTGCCACAATCTGGCTATTTTGAGGTGATAATAAATCTTGTCCTAATTGAACAAACTGACTAGTGTCAATACCAAGTATGTGGAGTAAAGTAGGAAGAGCATCGATTTCACCGCCAAAGGTTTCTTTGATACTACCATTCGTATAACCTGGAATATGGATCATATACGGGACTCGTTGTAGCATAGCATTATCATATTCAGACCAAGTTTCAGAATCTTTACCAAGAAGTGGAGCAAGACTAGAATTACGAGAATTTGAAATACCATAATGGTCACCATATAAAACAAAAATAGAATTCTCGTACAAACCAGTGGCTTTCAAGTAATCAAAAAAAGATTTAAGGGCAGCGTCTAAATAATTGGCAGTAGCAAAGTAACCATTGATCGTTTCATCGTCTGTTTTGGCTAAAGGAAAACCTTCTTCACTACTTTCGCCTTTTAGACTAGTATAAGGATAGTGATTACTCACAGTGATAAACTTGGTATAAAAAGGTTGTTGCATCTGTTCAAGATATTTTATGGAATCCTTAAACATGTACTTATCATTTAACCCATATTGAAAAGAGTTCTTACTATTTTGTTTAGAGAAGTAGCTAGAATCAAAAAAATAATTATAGCCCCATTGTTTATAAGCATTATTGCGATTCCAGAAAGTTCCAACGTTACCATGAAAGACAGCGCTGGTATAGCCACCTTTTTGGGCTAAAATACTTGGAGTAGCAAATTGTGTATTTTCACCACCGTAGTTCACCATAAAAGAACCACTATTTAAACCAAATAAGGAATTCTCCATCATGGTTTCAGCATCAGAAGTTTTACCTGCTTTAACCTGATGAAAAAAGTTAGGGAATGCTAAGGTAGCATTTGAGTGATAAAGCGAGTTGATAAAAGGCGTTACCTCATATTCTTTATCTCCTTCTTTTAGTTTATAATCTATTAAGAATTGTTGAAAGCTTTCTAAATGAAGAACAATAATATTTTTGCCTTTTCCAATTCCAAAATACTGAGGATCAGGTGCTGCATAATGTCCTTTGACATAAGTTTTAACATCAATTAATTCTTCTGCAGTAGCTCCATTTCGTTCTTTTTGAGCTTGATAGGTTTGATTGCCGCTATAGAGGGTAAACGCTGGTAATCCTAAAGCTCTCACAATATAAGTATTTGAAAAGCCACGTGTTAATAGTTCAGGACGATCAATTTCTGCTAAAAAAAGATTAATAGAAAGCAATAGACTAGATAAAGCGGTGATGGCAAATGCTGCGCGCTTGTTAAAAGGACGTTGATCATTTTTGATTTTTTTAGTGATAGATAAACTAATTAGAATAATAAAATCAAGAATATAGATAATATCCCAGATGCGTAAAAGGTTTAAAGCAGAGTCCCCTAATCCAGCGGAGACTTTACTACTAGCTAGCATGGCACTCACTGTAATAAAGTCTGAAAATTCTCGGTAATATATAGAATTTGATATCAAGAGAATGTTAAGGATAATATAAACCACCCAAGAACAGATATAAAAGGCTCGGGTATTCTTAACGTAAAGAGCAACCCCCAAAAGTAAAAAAGCTAGTGGGATTGGATTGATAATAGTTAGAAAGACTTGGTATATATTTCCCAAATCTAGTGAAAAGTCTGTATGATATGCCCACAGGGTCTTTATCCAGTAACAAAAGAGTAGAGTAATTATAAAACCCAATCTTGTGTTGATAAAACCTGTGATAAGTGTTTTAAATTTCTTCACAGTAGCAACTTCCTTATCGTTTTTTCCTAAAGATGTCATCTCCAAATAAAATCTCAGATTAAATTATACCAAAAATGTGAAGCTAATGCTTGTTGTAAGTTCAAATTTAGTAGGATTTTTTATCAGATTTTGTTATAATAAAAACTATGAATAAACTCTATATTGATTCTTTTGTCGAAAAGAAGCTGACAGCAGGGGTACAATTATTAGATGAAAAAGATTTTTCTAATATAAAGGAAAAAAATCAGTTGGTTCAACTGGTGACCAAGTCCAATCGTCCCATTGGAACAGCATATATCTCTAAGCAAAATAAAGGAATTGGTTGGTATCTAGGACCAGAAAAAATCGACTTGTCTATCTCTTATTTTGTTAGTCTATTTTCAGTTGCTAAGGCCAAAAGACAAGATTTTGCTCAATCGGACGAGACCAATGCTTATCGCCTTTTTAATCAAGAAGGAGACGGTTTTGGTGGAGTAACAATTGATCTTTATAAAGATTTTGCAGTCTTTTCATGGTACAATGCCTTTGTCTATGACAAAAAAGAAATGATTATGGAGGCTTTTCAACAGGTTTTTCCTGAAGTCAAAGGAGCTTATGAAAAGTGTCGCTTTAAAGGTCCAGATACTGAAACTGCTCATCTGTATGGTGAGCTGGCACAAGAAACCTTTTCGATTTTAGAAAATGGCATAGCCTATCAAGTCTTCTTGAATGAGGGCTTAATGACAGGTATTTTTCTAGACCAGCATGATGTTAGAAGAGCACTAGTAGATGGTTTAGCTATGGGCAAGTCCCTTCTTAACCTATTTTCCTATACAGCTGCCTTTTCTGTAGCAGCTGCTATGGGTGGTGCTATCGAGACCACTTCTGTGGACTTGGCTAAACGATCGAGAGAATTATCACTAGCTCATTTTGAGCATAACCAGTTAAACTTAGCCTCACATCATTTTGTGGTGATGGATGTTTTTGAATACTTCAAATATGCCAAACGGAAAAAATTAATCTTTGATGTGATTGTGATTGACCCACCAAGCTTTGCTAGAAATAAAAAACAAACTTTCTCTGTGAGCAGGGACTACCACAAATTAATCACAGAGGCCTTGGACATATTGAGTCCTAAGGGAACTATTATAGCTTCAACAAATGCTGCTAATATGACTGTTAGCCAGTTCAAAAAGCAAATTATCAAAGGATTTGGAAGTCGTCGTCCTGAGTCTATGACTCTCCAGCAGCTTCCGAGTGACTTTACTATCAATAAAGCAGATGAAAGAAGTAACTATTTAAAGGTATTTACTATAAAGGTACGAGAATGAGAATTGTAGCACCAGTCATGCCAAGACATTTTGACGAGGCTCAAGCCATTGATATTTCTAAATATGAAGATGTTAATTTAATTGAATGGCGAGCAGACTTTCTTCCCAAGGATGAGATTGTCGCAGTAGCACCAGCTATTTTTGAAAAATTTGCCGGAAAAGAAATTATCTTTACCCTTCGGACCGTTCAAGAAGGGGGGAATATTACCCTTTCAAGTCAGGAGTATGTTGATATTATCAAAGAAATCAATGCTATTTATAATCCAGACTATATTGACTTTGAGTATTTTACGCACAAGTCAGTATTTCAAGAAATGCTTGATTTTCCAAATCTTATTTTGTCTTATCACAACTTTGAAGAGACTCCTGAAAATTTAATGGAAGCTTTTTCAGAAATGACCAAGTTGGCACCGCGTGTGGTTAAAATTGCTGTGATGCCCCAGAGTGAACAAGATGTTCTAGATTTGATGAACTATACCAGAGGCTTTAAGACGCTCAATCCTGAGCAAGAATTTGCAACTATATCTATGGGGAAATTAGGAAGATTGTCTCGTTTTGCGGGAGATGTCATTGGCTCTTCCTGGACATACGTTTCATTAGATCATGTTAGCGGTCCAGGTCAAGTGACTCTCAATGATATGAAACGTATTATTGAGGTCTTAGAAATGGATATCTCTAACTAGTGAATGGTCTAAAAATATTATTTCTACAATAGTTAAGAAATGATGTTTTTAGATTAATGTTTTTAAAATAAGTGGAACCAAAAAGGAGAAAAATTGCGTTATTTAACAGCAGGAGAATCTCATGGGCTATCCTTAACAGCTATTATTGAAGGTATACCAGCAGGATTAACTCTTCATCCAGCGGATATTGATCACGAATTACAGCGACGTCAAGGAGGTTATGGCCGTGGTGCCAGAATGTCTATTGAGACTGATCGGGTTCAAATATCCTCAGGAGTTCGTCATGGCAAAACAACAGGGGCCCCCATTACCTTAACGGTAATTAATAAGGACCACCAAAAATGGCTAGATGTCATGGCTGTAGGAGACATTGAAGAGACTCTCAAGTTAAAGCGTCGTGTTAAGCATCCTAGACCAGGACATGCGGATTTGGTAGGAGGTATTAAATATCATTTTAACGATTTAAGAGATGCCTTAGAGCGTTCCTCGGCTAGAGAAACAACGATGAGAGTGGCTGTAGGCGCTGTTGCTAAACGTATCTTAGCTGAACTTGGAATTGATATGTTACATCATATCTTAATATTTGGTGGTATAACGATCACAATACCTTCTAAGCTCTCTTTTAGAGAGCTGCAAGAAAGGGCTCTCCATTCAGAATTATCTATTGTTAATCCAAAGCAAGAAGAAGAAATTAAAACGTATATTGATAAGATAAAAAAAGAAGGGGATACCATTGGTGGTATTATCGAAACGATAGTTCAAGGGGTGCCAGCAGGTCTTGGATCTTATGTCCAATGGGATAAAAAATTAGATGCCAAGCTGGCTCAAGCAGTTCTTTCCATTAATGCTTTTAAAGGGGTGGAATTTGGAGTTGGGTTTGATATGGGATTCCAAAAGGGCTCTCAGGTAATGGATGAAATCACCTGGACACCTACCCAGGGCTATGGTCGTCAAACAAACCACTTAGGTGGCTTTGAAGGTGGCATGACCACAGGACAACCTCTTGTTGTTAAAGGGGTTATGAAGCCCATTCCTACTTTGTATAAACCACTCATGTCGGTAGATATTGATAGTCATGAACCTTATAAAGCAACGGTGGAACGCTCTGATCCGACGGCCTTACCAGCTGCAGGGGTTATCATGGAAAATGTAGTGGCGACGGTGCTTGCCAAAGAGATTTTAGAGACCTTTTCTTCTACTACCATGTCTGAATTGCAAAAAGCTTTTTCGGACTATCGCGCCTACGTCAAGCAATTTTAGATAGCGAGATACTGGCTTTTATGGTATCATACAGGTATTAATGAACAAAAGGAGACTGTCATGTCACAGGAAATTTATGACTATGCTAATCAACTTGAAAGAGCAGTTCGTGCTCTGCCAGAATACCAAAAAGTGTTAGAAGTAAAAGAGGCCATTCAAGCAGACGCTAGTGCTAGCCAACTGTTTGATGAGTTTGTCGCTATGCAAGAAAAAATCCAAGGGATGATGCAATCAGGCCAAATGCCAACGGCTGAAGAACAAACAAGCATTCAAGAACTTAGCCAAAAGATTGAAGCTAATGACCAGCTAAAAGCTTATTTTGAAGCGCAGCAGGCCTTATCTGTTTACATGAGTGATATTGAGCGTATTGTATTTGCTCCGTTGAAAGTTTTAGTCAAGTAAGCCAATTAAGATAGGAAAAAAACAGATTGCTGGCAGCTCGTCAGGATCTGTTTTTTAGTGTTTATTTTCTTTGTATCAGAAAGTTGAGCCTCTTTCTTATTTGTGATATAGTCAAATAAAGTGACCAAAATAGCAGGCCAGTAGTGGCTTTAATGAAGGCAAGTTGTCTGCTAACTGGCTATGCTAAAACATCAGTATTAGAAAGTAAAAGGTGATAAAAATGGTTATTCCTTATGATTATATTGTTATTGGTGGAGGGAGTGCAGGTATTGCTTCTGCGAACAGGGCAGCCATGCATGGGGCCAAAGTATTGTTAGCTGAAGGTAAAGAGATTGGGGGAACCTGTGTTAACCTAGGCTGCGTTCCTAAAAAAGTCATGTGGTATGGCGCTCAAGTAGCAGATATTTTAGGGACTTACGCTAAGGATTATGGATTTGACTTTAAAGAGAAAGCATTTGATTTTAAACAATTGAAAGCAAATCGTCAAGCTTATATTGATCGGATTCATGCTTCTTATGAGCGAGGCTTTGAGCAGAATGGTGTTGACCGTATTTATGATTATGCTGTCTTCAAAGATGCTCATACGGTAGAAATTGCAGGGCTGCTTTATACCGCACCGCATATTTTGATTGCCACAGGAGGACATCCTGTTTTTCCAGATATTGAGGGGGCACAATACGGTATCAGCTCGGACGGCTTTTTTGCCTTAGATGAGGTACCAAAACGTACGGCTGTGGTTGGGGCAGGCTATATTGCTGTGGAACTTGCTGGTGTTTTGCATGCTTTGGGGTCGAATACGGATTTGTTTATTCGTCACGATCGACCTTTAAGAAGTTTTGACAAAGCCATTGTGGATGTTTTAGTTGAGGAAATGACAGTTGGTGGTCCTTGCTTACACCCTCATTCAGAAGTGGCAAAGGTTGTCAAAAATACTGATGAGTCCTTGACCCTTTACCTCAAAGATGGCCAAGAAGTTGAGGTTGACCAGCTCATTTGGGCTATCGGTCGCAAGCCTAATCTAGAAGGTTTTGGTCTTGACAAAACTGGAGTGACGTTAAATGATAAAGGTTATATTGAGACAGATGCCTATGAAAACACGTCTGTCAAAGGTATTTATGCCGTGGGAGACGTTAATGGGAAACTGGCTTTAACTCCAGTTGCTGTGGCAGCTGGACGTCGCCTATCAGAGCGTCTTTTCAATAACAAAACAGACGAGAAATTGGACTACCAAAACGTTGCTACTGTGATTTTTAGTCACCCTGTTATTGGCTCTGTTGGCTTGTCAGAAGAAGCAGCAGTCAAACAGTATGGGCAAGAAGCAGTTAAAACATATCAATCACGTTTTACGTCTATGTTTACTGCTATCACTAACCATCGCCAACCTTGTCTGATGAAGTTGGTAACAGTCGGGGATACCGAAAAAATAGTTGGTCTTCACGGAATCGGCTATGGGGTTGATGAAATGATTCAGGGCTTTGCAGTAGCCATCAAAATGGGAGCAACCAAGGCGGATTTTGATAACACCGTTGCTATTCACCCAACTGGCTCAGAAGAATTTGTCACCATGCGCTAA

Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

>LS483415|609821:617221|613299_613986_+|SQG96514.1|DBSCAN-SWA
MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN
>LS483415|609821:617221|614079_615246_+|SQG96515.1|DBSCAN-SWA
MRYLTAGESHGLSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEEEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF
>LS483415|609821:617221|615306_615648_+|SQG96516.1|DBSCAN-SWA
MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADASASQLFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKVLVK
>LS483415|609821:617221|615868_617221_+|SQG96517.1|DBSCAN-SWA
MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHASYERGFEQNGVDRIYDYAVFKDAHTVEIAGLLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSNTDLFIRHDRPLRSFDKAIVDVLVEEMTVGGPCLHPHSEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFGLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNNKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR
>LS483415|609821:617221|609821_612032_-|SQG96512.1|DBSCAN-SWA
MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYENSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNTKNRE
>LS483415|609821:617221|612139_613303_+|SQG96513.1|DBSCAN-SWA
MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQG96512.1|609821_612032_-	phosphoglycerol transferase	W6LM83	Streptococcus_phage	6.5e-268	68.9
SQG96513.1|612139_613303_+	SAM-dependent methyltransferase	W6LLI2	Streptococcus_phage	3.4e-143	65.1
SQG96514.1|613299_613986_+	3-dehydroquinate dehydratase	W6LP76	Streptococcus_phage	7.0e-88	68.9
SQG96515.1|614079_615246_+	chorismate synthase	A0A291AU41	Pandoravirus	5.8e-34	32.8
SQG96516.1|615306_615648_+	hypothetical cytosolic protein	A0A1X9I5Y8	Streptococcus_phage	3.8e-18	40.2
SQG96517.1|615868_617221_+	glutathione reductase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	3.1e-31	24.2

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>LS483415|622998:667067|DBSCAN-SWA
TCTAATGGCCAAATTTCAAGTTGAAGTTAGCCAGTTTTAACATTTCTACTGGCGACTTGTAGTTGAAGAGTCGTTTAGGATAATGATTGATCCAATGTTCAATAGCAGCGACTTCTTTAGGGGTCGTTGTTTTGGTACCTTTAGGGAGACATCTGCGAATCAGGCGATTATGGTTTTCGTTAGTGCCTCTCTCCCATGACGCATAGGGATGGGCATAGTAGATGTCACTTGCTGGAAAGACATCTGATAAGCGAGAAAATTCTGTCCCGTTGTCTGCCGTGATAGAGTTGACGGTGTAGTCTTTTAGAATCCCCGTAAGAGCTTTATTGACAGCTTGAGCAGACTTATCCGGTATTAATCGAATCAGCTGATGACGTGTTTTCCTGTCCGTTAGGGTGAGTAAGCATTGATTTTTAGCCCTCGTCAGAATGACTGTATCAATCTCATAATGCCCAGCTTCAAGACGTTGGTTAATGCTATCTGGGCGTTGTTCAATACTCTTTCCTGCGGGTTTAAAATAAGGACTGGCATGTTTTCTAGCCTGCTTAGCCTTTCTCGGATAAAGCATAGCCTCCTTACCAAGACTTAATTTCCCATGATGAATCCAGTAATAGATGGTAGATACAGGGACTTGAACTCCCTTAGCTTTAACTATCATCTCAGGGGAATAGTTCTGACGCATGTAGTGTTCAATAGCCTCCCTATCTTGCTTACGCTGTCTAATGAGTCTAACAGAACGCTTGCGATTTTCTTGATAGACCAACTGAGCATGTTGAGCAGAATAAACGGCTTCAAACTTTCCTTTACGAACCTGTTGCCTAAGCAAGCCTCGCTTGATTTCATTATGAATGGTCTGGGGTGCCTTACCTAGTAAGCGAGCAATTTCACCCCGTTCTGTGGCTGAAAGATGAGAATAGAATGATTTTCTGGTAAAATTAATGTTAGACATGTTCATCTGATTTCTATACTGAATTGGGGAATTCTAGTATATCAGACGAACATGTCTTTTTTGTTTTACTTCATTTTACAACGTGGGGTCCAAAATGACATACTAAACAAACTGATTCTTCTCAATCTAATTTTTATTAGGTGAAATTCTTAGATGTTAATCAGAACGAGAATTGAAAAAAATACTTTTAACATCATCACTAGTTTTCACTCTTATAAATAGTAGGCTTATTTCTCTGGTAGCTGAATCTATGGGTGATAAAACATTACCAACTAACTTATAGAATAATTCTAACAATAGTTTAGAAATTATAAGTAAAACTGGAGATATTGATGTAGAGTAATCACTTTAATTCTTAATATATTTTAACTATAAGAAATGCCTATGATATTATTATAGGCATTTCTGTCATAATAGAACTAAAATAACAAAAAGGGTCATCTATTCTCTAACAAAGAAATTACTACAGAGGTAATAATCAGTGTCATGACTAATATAATTAGAGAAATCAATAAATAATTTTGTATATTAATTGTTTCTTTGTAAAAGTAAGATACTAAACTCATCGGAAAGAGGTACGTGAGTTTTTCTAAGATATTGCTAAAATAACGGAGTTGTAAAAATATTATTGCTAGAACATAGTTTGTTAGTATGAAAAAGCTAGTTGCTAAAATGTTATTCTTAAATATTTTTTGAAAACTAATTGCTTGAACAGATGACAACCCAATAGTAATTAGAAGAACAATTTGAATAATTAAAAAGTTTTTTAAATCTAGACCTATACTATTAGGCAAAAATTCTGAACTCTTATTAAATAATAAACTAGAAATCACTATTATCATAAGTGTCCAAATAGAAAATAAAAATGACGATAACATAAAAGCATTGAAACTATCAATTAAATATACTTTAATTGAACTTAGTTTAGTTAAAGTAATTTGTTGATTGATATAATCAGTTTTTGAGGAATAAGTAGAAGTGATAAGTGGAAATATAAGATATAAACCCATCATCGAAAGCATAAAAAATCCATAAAATAAATCATTAAGAATAAAAGGTTTATCTTGATAAGGGTTTAATAATAGAAAATAACCATTGCCAGCAATAATAATAAGTAGGATAGTAATTAAAAAAATTTTTAATCCTCTTATTTTAGAAAATCGAAAAAGTTCAGCTTTAATATATGTCATCGATGACCTCCTATCTAATTACTGAAAGATAATAGTCTTCAATTGATTCAGAAGAATTGATATTATTCTTTAATTCATCCTTAGAAATATCAGCAATTATGGTTTGTTTACTTAGAAATATAAATCGATTACAGATTTTATATAGGTCTGAGAGAATATGGCTACTAATGAGAATTGTTAACCCCTCTGCTTGATTTAACCTTAGTAACAAATTACGTAGTTCAACAATACCTTCTGGATCGATACCGTTAAAAGGTTCGTCAAGAATTAAAAACTTTGGGCTATTCATAAGAGCTAATGCAACTCCCAATCGTTGTTTCATGCCTAATGAATATTCTCCGAATTTCTTATTTCTAGCATGATATAAATCAACCTCATTAAGTAACTCTAAGCATTTTGATTCTGTATTTTTAAGCTTCTTTAATTTACCGAAATAAAGTAAATTATTAAATCCACTCAAATATGGGAAAAAATCCGGTGTATCAATTAGACTTGAAATAGAGTCCCTGTTGAACTCTTTATGATAATTTACGTCTCCATTATACTTTATTGGTAATTGAGATAAAATTGTTAGTAAAGTTGATTTACCAGCTCCGTTCCTTCCGACTAGTCCAATAATATCACCTTTTGAAATCTGTAAATTTATATCTTTAATGATAGTTTTATTTGAATACTTCTTTGAGACATTAGTTGTAGTAAGTATCATCTTGCAACCTTTCTATTCAATAAATAAGCTTTCAATTGGTTCTTGTAAAACCCTACCTAAAGCTAAAGCTAATTTTAAAGTAGGATCATATTTGTTATTTTCAATCATATTGATTGTTTGCCTTGAAACGCCACATTGTTTTGCTAGCTCATCTTGAGTGATCTTTTTTTCTTTTCTAAGTAACTTTATTTTATTATTCATTGTATTAATCTTCTCTATTATTTTTTTTAATTTGTAACTTCAACTTGATTAAATAATAGATATAAAATACAGTAGCGATTAGCAGGTATTTATAATCTGATTGGATACGATCAGCTAAAACATCCTTGGGAATATTTCCATAGTAAGTATTCATAATGAAGATATTAATAAATAATGAAATTCCAGAAATAGTAGTTAAAATAATACCAATTTTTTTAAAAGTGTCACCGTAAAAATATTTGTACATTTCATCCTTAGATTTTTCGCCAGCCATCTTTAATATAAATTTGTAATAAAGGTAGCACAATAACAAGATCAATAAATTTATGATAATAACTAAGATATATTCCATTTTTTTCTCCTCTTTGTCAAGAAATCTTGACATTATATTAGCAATTAAACAACAAAATGTCAAGAGCATTGGACAAAAAATATTAGAGTAATAACTAAAATCTTTTATTGATTCTGTGAAATGATACATGCTAACTCTATTAACCAATCACAGATTAGGAATGAGATATATTTAGATGAAAATTCTTTTGATTCTTTTGGAACTATAGGTAGGAATGATTTCAAAAAGATTTCTTTGTGTTCCTCCACAAAATACTCAATGTATTTAGGATTTGAATGATTATTTCCTAATTGCTGTAACATCGTTTGTTTGAAGATGGAATTATTGAAGTGATTACTATATATAACTAGTTTAAAAATTTCTTTAATGATTTGAATGCAGAACCCATCCGAGGGGAAATACATTTCTTGAGAAGTATTATAATTCAATGTTTGTAGAAAAATTTTTACTGAGTTCGTTGTTAGATTACAAATTCCATTAAGAATTCCTCGAATTGTCGAATCTGAGGAAGATTTTGTATCATCGACATCATCAAAGCCAAAATCAATAATTTTAACATGTTCAGATTTCATTCGCTCTCTTAGCGTTTGACCAAGTACTGTATAGTAAAGTTTAGATATCACATCGATATTAGACATAAGTTGCTCCTTTTGTCCAAAGAACTACCAGAAAATTTTATTATCTAGAATTAACTCACACTAAAAATAATTTCAAAATAAAATTATCATAAGTGATAAAATAAAATTTTTTTAGTGGTCTTCAATGCGAATCTTTTGGAACTATTTTTTACAAGATAGCTATCTTGTATTTATAGAATAATATGTTATTGTCAGTAAATATATGATATTATTTGGTTGAAAAAGGGAATGGCTGAATACCTTTAGAACCAGAGGTTTATGTAACATTTGATATCATTTTTTAAAAAATATTTCCTTAAAGGAGGATAGATTATGCTTGTGAAACTTTCAAATAATGTCTTAGAATTTCCTTTTACCTACTCACTACGTTTTAAGAAAAGGATAGATTTTGAAAATGAATTAAATATAATAACTAACCATCTTAGGCAAATCGATTGGTTTAATAGCTAACAACCCCTCTTTGATATAACGATAAATCGTTTTGGTAGAGGGGACGACTTCTTCAGGATGGTTTACTTTGTAAGTCTGAACAAAACTATCCACACTATGGAGACGAATGTTAGCCGTCAATGCAGATTCTAATTGTGCAATGAACCTAGCGGAGCAGCCATTCAATTTGAGGTAAGAACTCTTTTGACGATTGGTTTCATAGACACGTTGTCCATTATCAGCAAAATAGGCGTTGAAGAAGGTTTGTTTTCCATTCTTATCCTTTACTTGTTCTACTGAACCACGTTTTATTTCTCGGCAGATTGTAGAACGGTGACGACCCAGGAGTCGAGCAATCTCAACGGGTTTCTTTCCCATTTTGAGATAAGCAGCAATTTCACCCCGTTCTGTGGCTGAAAGATGAGAATAGGAGGATTTTCTGGTAGAATTAATATTAGACGTGTTCATCTGCTTTCCATACTGAATTGGGGAATTCTAGTATATCAGACAAACATGTCTTTTTTGTTGCACTTCA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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQG96523.1|622998_623946_-|transposase	transposase	H7BW61	unidentified_phage	9.9e-32	33.8
SQG96524.1|624383_625136_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96525.1|625146_625842_-	multidrug ABC transporter ATPase	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	8.0e-31	36.3
SQG96526.1|625854_626043_-	transcriptional regulator	A0A142LP09	Marinitoga_camini_virus	7.7e-05	40.0
SQG96527.1|626047_626395_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96528.1|626499_627033_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96529.1|627345_627483_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96530.1|627432_627930_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96531.1|628204_628519_+	50S ribosomal protein L21	NA	NA	NA	NA
SQG96532.1|628530_628857_+	hypothetical ribosome-associated protein	NA	NA	NA	NA
SQG96533.1|628884_629178_+	LSU ribosomal protein L27p	NA	NA	NA	NA
SQG96534.1|629526_630441_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SQG96535.1|630437_630896_+	signal peptidase II	NA	NA	NA	NA
SQG96536.1|630885_631776_+	ribosomal large subunit pseudouridine synthase D	A0A2H4UV25	Bodo_saltans_virus	3.6e-07	25.3
SQG96537.1|632171_632693_+	Uracil phosphoribosyltransferase / Pyrimidine operon regulatory protein pyrR	NA	NA	NA	NA
SQG96538.1|632708_633968_+	uracil permease	Q9KX94	Enterobacteria_phage	2.7e-61	35.9
SQG96539.1|633977_634964_+	aspartate carbamoyltransferase catalytic subunit	M1HGA5	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	3.2e-25	32.6
SQG96540.1|635007_636090_+	carbamoyl phosphate synthase small subunit	R4TGJ8	Halovirus	4.7e-62	36.9
SQG96541.1|636335_639512_+	carbamoyl-phosphate synthase large chain	NA	NA	NA	NA
SQG96542.1|639687_640959_+	RND family efflux transporter MFP subunit	NA	NA	NA	NA
SQG96543.1|640958_641669_+	bacitracin ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.7e-36	42.5
SQG96544.1|641680_642901_+	permease family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96545.1|643154_644888_+	glycerophosphodiester phosphodiesterase	NA	NA	NA	NA
SQG96546.1|645014_645287_+	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
SQG96547.1|645296_645536_+	RNA binding protein	NA	NA	NA	NA
SQG96548.1|646467_649494_+	LPXTG-motif cell wall anchor domain protein	NA	NA	NA	NA
SQG96549.1|649513_649915_+	pyridoxamine 5'-phosphate oxidase family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96550.1|650094_650970_-	cation diffusion facilitator transporter family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96551.1|651105_651627_+	transcriptional regulator, TetR family	NA	NA	NA	NA
SQG96552.1|651841_652360_+	16S rRNA-processing protein	NA	NA	NA	NA
SQG96553.1|652349_653069_+|tRNA	tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96554.1|653080_654073_+	thioredoxin reductase	Q9JRK7	Streptococcus_phage	6.3e-29	54.9
SQG96555.1|654250_655309_+	regulatory protein	NA	NA	NA	NA
SQG96556.1|655321_656245_+	2-dehydropantoate 2-reductase	NA	NA	NA	NA
SQG96557.1|656545_657214_+	deoR-like helix-turn-helix domain-containing protein	A0A077SK06	Escherichia_phage	6.3e-17	32.2
SQG96558.1|657210_658122_+	1-phosphofructokinase	NA	NA	NA	NA
SQG96559.1|658118_660065_+	PTS system fructose-specific transporter subunit IIABC	NA	NA	NA	NA
SQG96560.1|660163_660757_+	N-acetylmuramidase	A0A249Y0X5	Enterococcus_phage	3.5e-11	33.8
SQG96561.1|660908_661616_+	mannosyl-glycoendo-beta-N-acetylglucosaminidase family protein	Q332B8	Clostridium_botulinum_C_phage	1.9e-11	36.4
SQG96562.1|661771_661891_-|transposase	degenerate transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96563.1|662572_663598_-|protease	igG-degrading protease	NA	NA	NA	NA
SQG96564.1|664101_664278_+	nucleoside diphosphate kinase	NA	NA	NA	NA
SQG96565.1|664505_664886_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96566.1|664885_665734_+	degV family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96567.1|665858_667067_+|head	poly A polymerase head domain-containing protein	H7BUW3	unidentified_phage	6.9e-38	45.0

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>LS483415|683811:723791|DBSCAN-SWA
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MKKSVTLLSIGLASLLLAACAPHKSQKSSWNTIKEKGVLKVATPGTYQPTSFYNDNNELVGYEVDMVKEIGKRLNIKVKFVETGFDQAFTSVDSGRVDISLNNFDITPKRQKKYNISTPYKYGVGGMIVRADGSSNMAKKDLSDWKGKKAAGASGTEYMKVAQKQGAELVTYDNVTGDVYLNDVANGRTDFIPNDYPAQKLFVDYMLSQNPNLNVKMSDVQYNPTEQGIVMNKKDDSLKKKIDAVIKDMIKDGSLKKISETYYAGQDLTKPFGKDKKIPVIDTKDVN
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MTNNQTLDILLDVYAYNHAFRIAKALPNIPKTVLYLLEMLKERRELNLAFLAEHAAENRTIEDQYHCSLWLNQSLEDEQIANYILDLEVKVKNGAIIDFVRSVSPILYRLFLRLITSEIPNFKAYIFDTKNDQYDTWHFQAMLESDHEVFKAYLSQKQSRNVTTKSLADMLTLTSLPQEIKDLVFLLRHFEKAVRNPLAHLIKPFDEEELHRTTHFSSQAFLENIITLATFSGVIYRREPFYFDDMNAIIKKELSLWRQSIV
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MNTTVSTILVSLGTNLATDAVQKANNPARAIDDLMTLIGFEKIHAWAEKARIKHAADLDDFKHKLAEEILQIATDKLKDPSLNILGPALEASKYHIEQETIRNMFARLIASDIDSSKENLVHPSFVEIIKQLSPLDAQNLSIIFNYKYTDIPVANYYLTYKNGRGMKLAHPDVFLLNPEQNMLDYNSSSLENLRRMGIIEILYNQSKHDEHQYSLLRNNNYLDDIAKHTQSNDPNFQDIYVQPGITRLTYFGQDFCETCLPPK
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MSIHISAKKGDIADKILLPGDPLRAKFIAENFLEDAVCFNEVRNMFGYTGTYKGHRVSVMGTGMGMPSISIYARELIVDYGVKTLIRVGTAGAIDPEVHVRELVLAQAAATNSNIIRNDFPEFDFPQIADFGLLDKAYHIAREMGVTTHVGNVLSSDVFYTNMPERNMALGKLGVKAIEMEAAALYYLAAQHHVKALGIMTISDNLNDPTEDTTAEERQTTFTDMMKIGLETLIAND
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MANLSDNIKYFRKQNKLTQKELAKKLKIAPTAISAWEVGRNKPLMDNIEQMTSIFGIPKSKLLGDEIYKIQETASPELIPSTLQKITATSSQLEHSRQLIVLDTAETLLNQQKEIKNNEDTVVELFSYNYYDQPASAGTGQYLNDVQVETIELPVDYDADFVIPVYGDSMGPEYHSEDYVFVKLSVDLSDGDIGVFEYYGDAYIKQLLINAEGAFLHSFNSKYDDIPIDRDSDFRIIGEVIGSYSEK
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>LS483415|683811:723791|716581_717052_-|SQG96613.1|DBSCAN-SWA
MKELQLTNIEAQQLITLLKVIATQHNKTLTNNTSGHIDIVGQNHKRFILNYFYSTNSKVFHLRETEHNYTLIRINLNNKFHKNSNGEKIWGNRINIFSEEEYYLKADESTHYKAYPLPYETIKDTNDFLEMMSNLFDYTNINNPQDANINIQEDLI
>LS483415|683811:723791|719049_719301_+|SQG96616.1|DBSCAN-SWA
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>LS483415|683811:723791|683811_685041_+|SQG96583.1|protease|DBSCAN-SWA
MAGSRTNDIKVYCSFCGKSQDDVKKIIAGNNVFICNECVALSQEIIKEELAEEVLADLTEVPKPKELLDVLNQYVVGQDRAKRALSVAVYNHYKRVSFTESRDDDDVDLQKSNILMIGPTGSGKTFLAQTLAKSLNVPFAIADATSLTEAGYVGEDVENILLKLIQAADYNVERAERGIIYVDEIDKIAKKGENVSITRDVSGEGVQQALLKIIEGTVASVPPQGGRKHPNQEMIQIDTKNILFIVGGAFDGIEEIVKQRLGEKVIGFGQNSRKIDDNASYMQEIISEDIQKFGLIPEFIGRLPVVAALEQLNTSDLIRILTEPRNALVKQYQALLSYDGVELEFDKAALEAIATKAIERKTGARGLRSIIEETMLDIMFEIPSQEDVTKVRITKAAVEGKSKPVLETA
>LS483415|683811:723791|696471_697164_+|SQG96595.1|DBSCAN-SWA
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>LS483415|683811:723791|703431_704073_-|SQG96602.1|DBSCAN-SWA
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>LS483415|683811:723791|686598_688698_-|SQG96586.1|protease|DBSCAN-SWA
MTHFSGKDPFVNMDDIFNQLMANMGGYRSENPRYLVNGREITPEEFQHYRQTGQLPVATTKATNSQMLTPKADSVLTQLGTNLTQEARQGHLDPVIGRNKEIQDTAEILARRTKNNPVLVGDAGVGKTAVIEGLAQAIVNGDVPAAIKNKEIVSIDISSLEAGTQYRGSFEETIQNLIQEVKEAGNIILFFDEIHQIVGAGATSSDSGSKGLADILKPALSRGELTLIGATTQDEYRNTILKNAALARRFNEVKVNAPSAEDTFHILMGIRNLYEQHHHITLPDNVLKAAVDYSIQYIPQRSLPDKAIDLLDMTAAHLAAQHPVTDLKTLETEIAKQKESQEKAVAKEDFEKALAAKTRIETLQKQIEQHNQSQNVTATVNDIAESVERLTGIPVSNMGTNDLERLKGISSRLKSHVIGQDEAVAAVARAIRRNRAGFDDGNRPIGSFLFVGPTGVGKTELAKQLALDLFGSKDAIIRLDMSEYNDRTAVSKLIGTTAGYVGYDDNNNTLTERVRRNPYAIVLLDEIEKADPQIITLLLQVLDDGRLTDGQGNTINFKNTVIIATSNAGFGQQDTETSESNIMDRIAPYFRPEFLNRFNSIIKFNHLQKENLEEIVDLMLAEVNQTTAKKGISLTIADDAKAHLIDLGYNHAMGARPLRRIIEQEIRDRITDYYLDHQEVKKLQAILKEGQLVIRQNDQ

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQG96583.1|683811_685041_+|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpX	G3M9Z9	Bacillus_virus	1.7e-137	60.5
SQG96584.1|685050_685650_+	ribosome biogenesis GTP-binding protein YsxC	NA	NA	NA	NA
SQG96585.1|685797_686541_+	virulence factor relevant regulator	NA	NA	NA	NA
SQG96586.1|686598_688698_-|protease	ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit	H6X3M6	Enterobacteria_phage	5.6e-120	39.2
SQG96587.1|689075_689759_+	ribose-5-phosphate isomerase A	NA	NA	NA	NA
SQG96588.1|689835_691047_+	phosphopentomutase	NA	NA	NA	NA
SQG96589.1|691062_691503_+	arsenate reductase	A0A2H4J8T1	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-34	54.5
SQG96590.1|691486_692296_+	purine nucleoside phosphorylase	Q5YBA4	Grouper_iridovirus	6.6e-53	42.2
SQG96591.1|692958_693672_+	Purine nucleoside phosphorylase	NA	NA	NA	NA
SQG96592.1|693664_694453_+	LytR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SQG96593.1|694531_695386_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SQG96594.1|695658_696195_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96595.1|696471_697164_+	orotidine 5'-phosphate decarboxylase	NA	NA	NA	NA
SQG96596.1|697221_697851_+	orotate phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96597.1|698047_699502_+	amidase	NA	NA	NA	NA
SQG96598.1|699619_700483_+	cystine-binding protein	NA	NA	NA	NA
SQG96599.1|700511_701162_+	amino-acid ABC transporter permease yckA	NA	NA	NA	NA
SQG96600.1|701294_701948_+	uracil-DNA glycosylase	A0A0B5IW78	Pandoravirus	3.4e-39	40.1
SQG96601.1|702105_703374_+	dihydroorotase	NA	NA	NA	NA
SQG96602.1|703431_704073_-	glycerol-3-phosphate acyltransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96603.1|704207_706157_+	topoisomerase IV subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	5.6e-122	42.0
SQG96604.1|706223_707042_+	phosphate ABC transporter ATPase	NA	NA	NA	NA
SQG96605.1|707275_709699_+	topoisomerase IV subunit	G3M9Z5	Bacillus_virus	1.2e-97	33.3
SQG96606.1|709821_710844_+	branched-chain amino acid aminotransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96607.1|710944_712078_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96608.1|712233_712464_+	branched-chain amino acid aminotransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96609.1|712853_714059_+	30S ribosomal protein S1	NA	NA	NA	NA
SQG96610.1|714322_714616_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96611.1|714670_715675_+|transposase	transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	1.7e-61	50.6
SQG96612.1|715779_716556_-	Domain of uncharacterised function DUF1828	NA	NA	NA	NA
SQG96613.1|716581_717052_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96614.1|717111_717855_-	Phage transcriptional repressor	J7KJ52	Streptococcus_phage	1.1e-70	58.3
SQG96615.1|718202_718994_-	phage protein	A0A1S5SAN8	Streptococcus_phage	3.6e-35	36.8
SQG96616.1|719049_719301_+	phage protein	A0A141E1R7	Streptococcus_phage	1.0e-12	56.0
SQG96617.1|719287_719545_-	Uncharacterised protein	M1PRU3	Streptococcus_phage	2.4e-09	61.1
SQG96618.1|719851_720148_+	enterotoxin	NA	NA	NA	NA
SQG96619.1|720171_720303_+	exotoxin H precursor	NA	NA	NA	NA
SQG96620.1|721867_722335_-	SpeA variant	A0A097PAT7	Streptococcus_pyogenes_phage	2.5e-76	89.0
SQG96621.1|722657_723791_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>LS483415|929294:1021352|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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SQG96823.1|931731_932688_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQG96824.1|932698_933295_-	type I restriction-modification system specificty subunit	NA	NA	NA	NA
SQG96825.1|933386_936023_-	permease family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96826.1|936037_936739_-	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	4.9e-36	37.0
SQG96827.1|936856_937399_+	bacterial regulatory s, tetR family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96828.1|937541_938183_-	bacterial regulatory s, gntR family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96829.1|938345_938834_-	general stress protein, Gls24 family	NA	NA	NA	NA
SQG96830.1|938844_939045_-	csbD-like family protein	J7KJ36	Streptococcus_phage	1.8e-07	50.0
SQG96831.1|939085_939625_-	response regulator	NA	NA	NA	NA
SQG96832.1|939637_939826_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQG96833.1|939836_940424_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQG96834.1|940484_940733_-	transglycosylase associated family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96835.1|941095_943414_-	DNA helicase II / ATP-dependent DNA helicase PcrA	A7KV33	Bacillus_phage	2.7e-131	41.0
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SQG96837.1|945385_946621_+	cation diffusion facilitator transporter family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96838.1|946990_947764_-	protein B	NA	NA	NA	NA
SQG96839.1|948132_948969_-	polar amino acid ABC uptake transporter substrate binding protein	NA	NA	NA	NA
SQG96840.1|948984_949614_-	histidine ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.3e-27	35.5
SQG96841.1|949623_950265_-	histidine transporter permease	NA	NA	NA	NA
SQG96842.1|950371_950707_-	phosphonoacetate hydrolase	NA	NA	NA	NA
SQG96843.1|950752_950869_-	hupothetical protein	NA	NA	NA	NA
SQG96844.1|950865_952008_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96845.1|952160_953309_-	Mannitol-1-phosphate 5-dehydrogenase, MtlD	NA	NA	NA	NA
SQG96846.1|953336_953774_-	PTS system, mannitol-specific IIA component, MtlA	NA	NA	NA	NA
SQG96847.1|953775_955746_-	Mannitol operon activator	NA	NA	NA	NA
SQG96848.1|955753_957520_-	PTS system, mannitol-specific IIBC component	NA	NA	NA	NA
SQG96849.1|957642_959457_-	glutamine-fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)	A0A1J0F994	Only_Syngen_Nebraska_virus	2.8e-99	37.4
SQG96850.1|959623_960181_-	Signal peptidase I	NA	NA	NA	NA
SQG96851.1|960310_961813_-	pyruvate kinase	NA	NA	NA	NA
SQG96852.1|961875_962889_-	6-phosphofructokinase	NA	NA	NA	NA
SQG96853.1|962968_966079_-	DNA polymerase III subunit alpha	A0A2L1IZ23	Streptomyces_phage	1.1e-119	29.9
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SQG96857.1|968254_968869_-	membrane protein	M1Q152	Streptococcus_phage	6.2e-51	52.3
SQG96858.1|969459_969648_-	paratox	A3F673	Streptococcus_phage	6.5e-20	81.4
SQG96859.1|969885_970686_+	streptodornase	NA	NA	NA	NA
SQG96860.1|970957_971392_+	phage membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQG96861.1|971770_972667_-	phage-associated cell wall hydrolase	Q938J4	Temperate_phage	1.0e-150	82.6
SQG96862.1|972663_972774_-	phage membrane protein	A7J2B4	Streptococcus_phage	3.0e-09	94.4
SQG96863.1|972782_973010_-|holin	prophage LambdaSa03, holin	A7J2B3	Streptococcus_phage	2.0e-31	100.0
SQG96864.1|973006_973282_-|holin	phage holin	A7J2B2	Streptococcus_phage	2.6e-41	100.0
SQG96865.1|973291_973909_-	phage protein	Q938J7	Temperate_phage	1.4e-79	89.3
SQG96866.1|973911_974073_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG96867.1|974086_975997_-	phage infection protein	Q938J9	Temperate_phage	6.0e-121	71.3
SQG96868.1|976009_977017_-	phage hyaluronidase	A7J2A8	Streptococcus_phage	2.6e-139	72.2
SQG96869.1|977013_979050_-	phage protein	A3F656	Streptococcus_phage	0.0e+00	84.1
SQG96870.1|979046_979826_-|tail	phage tail protein	A3F655	Streptococcus_phage	1.9e-68	55.5
SQG96871.1|979857_983124_-	tape measure domain protein	U6E979	Streptococcus_phage	1.6e-04	30.4
SQG96872.1|983138_983468_-	phage protein	A0A1P8BLR3	Lactococcus_phage	2.0e-11	41.5
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SQG96874.1|983914_984568_-|tail	phage major tail protein	D7RWD5	Brochothrix_phage	1.4e-40	52.0
SQG96875.1|984577_984967_-	phage protein	Q38611	Lactococcus_phage	3.5e-44	68.2
SQG96876.1|984963_985194_-	phage protein	A0A097BY98	Enterococcus_phage	2.1e-12	59.4
SQG96877.1|985308_985617_-	phage protein	A0A2P1JTW8	Anoxybacillus_phage	4.3e-13	40.2
SQG96878.1|985613_985967_-	phage protein	A0A2H4J002	uncultured_Caudovirales_phage	9.7e-25	49.6
SQG96879.1|985980_986223_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG96880.1|986210_986432_-|capsid	Phage major capsid protein	O34062	Streptococcus_phage	1.9e-10	77.8
SQG96881.1|986431_987307_-|head	phage head protein	A0A286QP97	Streptococcus_phage	1.8e-67	52.4
SQG96882.1|987306_987687_-	structural protein	A0A0K2CNR0	Brevibacillus_phage	5.2e-08	37.9
SQG96883.1|987696_988230_-	phage protein	A0A141E0S7	Streptococcus_phage	1.4e-14	83.9
SQG96884.1|988341_989085_-	antirepressor	M1PKL6	Streptococcus_phage	5.3e-73	56.9
SQG96885.1|989086_989335_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96886.1|989449_989629_-	Uncharacterised protein	M1NRK8	Streptococcus_phage	2.6e-18	79.7
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SQG96889.1|990223_991849_-|head	phage head morphogenesis, SPP1 gp7 family domain protein	U6E9F1	Streptococcus_phage	1.1e-46	43.8
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SQG96891.1|993343_994651_-|terminase	terminase large subunit	A0A2H4IYR5	uncultured_Caudovirales_phage	5.9e-184	75.2
SQG96892.1|994628_995060_-|terminase	phage terminase small subunit	A0A1S5SCD2	Streptococcus_phage	1.3e-47	69.9
SQG96893.1|995628_996069_-	phage encoded transcriptional regulator, ArpU family	Q938L8	Temperate_phage	7.2e-78	97.3
SQG96894.1|996339_996975_-	phage protein	L0P368	Streptococcus_phage	5.5e-87	67.9
SQG96895.1|996974_997367_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG96896.1|997379_997580_-	Uncharacterised protein	A0A0E3T873	Gordonia_phage	4.6e-08	45.3
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SQG96904.1|999960_1000380_-	single-stranded DNA-binding protein ssb	Q938M7	Temperate_phage	3.1e-70	97.1
SQG96905.1|1000372_1001047_-	Single-stranded DNA-binding protein	Q938M8	Temperate_phage	5.8e-103	96.9
SQG96906.1|1001047_1001530_-	phage protein	Q938M9	Temperate_phage	1.6e-49	98.8
SQG96907.1|1001550_1001805_-	phage protein	Q938N0	Temperate_phage	1.8e-41	97.6
SQG96908.1|1001785_1002139_-	phage protein	A0A097PAU3	Streptococcus_pyogenes_phage	2.8e-16	54.0
SQG96909.1|1002151_1002289_-	phage protein	J7KBQ4	Streptococcus_phage	2.7e-07	78.4
SQG96910.1|1002279_1003062_-	phage replication protein	A0A097PAQ0	Streptococcus_pyogenes_phage	1.8e-143	97.3
SQG96911.1|1003048_1003879_-	dnaD and phage-associated domain-containing protein	A0A1S5S918	Streptococcus_phage	6.4e-67	54.7
SQG96912.1|1003892_1004207_-	Transcriptional regulator, Cro/CI family	A0A1P8VVN6	Streptococcus_phage	2.7e-50	95.2
SQG96913.1|1004222_1004357_-	phage protein	A0A1P8VVR9	Streptococcus_phage	2.5e-18	97.7
SQG96914.1|1004353_1004650_-	phage protein	A0A097PAT8	Streptococcus_pyogenes_phage	3.1e-48	98.0
SQG96915.1|1004728_1004914_-	phage regulatory protein	A0A1X9I6I3	Streptococcus_phage	3.3e-16	72.1
SQG96916.1|1005080_1005320_+	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG96917.1|1005451_1005652_-	helix-turn-helix family protein	A0A141E205	Streptococcus_phage	2.1e-08	61.4
SQG96918.1|1005703_1006345_+	phage protein	J7KJ31	Streptococcus_phage	1.5e-116	100.0
SQG96919.1|1006443_1006602_-	phage membrane protein	J7KH24	Streptococcus_phage	6.4e-21	90.4
SQG96920.1|1006660_1006876_+	Uncharacterised protein	J7KBX0	Streptococcus_phage	2.5e-28	95.7
SQG96921.1|1006861_1007011_-	Uncharacterised protein	J7KH12	Streptococcus_phage	4.3e-19	91.8
SQG96922.1|1007105_1007207_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
1007307:1007322	attL	NA	NA	NA	NA
SQG96923.1|1007366_1008191_+	phage transcriptional repressor	A0A097PBE5	Streptococcus_pyogenes_phage	8.4e-120	84.8
SQG96924.1|1008203_1009013_+	phage protein	J7KDP1	Streptococcus_phage	3.8e-24	35.8
SQG96925.1|1009069_1009222_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG96926.1|1009262_1010351_+|integrase	integrase	Q38159	Streptococcus_phage	3.8e-205	100.0
SQG96927.1|1010625_1011246_+	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG96928.1|1011502_1013767_-	glycogen phosphorylase	Q8B3H5	Iris_mild_mosaic_virus	1.6e-11	43.7
1011495:1011510	attR	NA	NA	NA	NA
SQG96929.1|1013801_1015295_-	4-alpha-glucanotransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96930.1|1015410_1016430_-	LacI family transcription regulator	C6ZCU4	Enterobacteria_phage	5.7e-17	27.8
SQG96931.1|1016672_1017920_+	maltose/maltodextrin-binding protein	NA	NA	NA	NA
SQG96932.1|1018193_1019555_+	maltose/maltodextrin ABC transport system permease	NA	NA	NA	NA
SQG96933.1|1019554_1020391_+	maltose transport system permease	NA	NA	NA	NA
SQG96934.1|1020764_1021352_+|transposase	truncated transposase	Q9MBM9	Staphylococcus_prophage	4.1e-28	40.8

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>LS483415|1035496:1086349|DBSCAN-SWA
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Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQG96948.1|1035496_1036012_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96949.1|1036032_1036839_+|transposase	transposase, IS861	A0A1B1P773	Bacillus_phage	1.1e-63	49.3
SQG96950.1|1037138_1038011_-	nicotinate-nucleotide pyrophosphorylase	NA	NA	NA	NA
SQG96951.1|1038234_1039545_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQG96952.1|1039622_1039916_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96953.1|1039948_1040302_+	DNA-binding protein	A0A1B1P773	Bacillus_phage	2.0e-06	35.2
SQG96954.1|1040347_1040518_+|transposase	transposase	U5P429	Shigella_phage	1.5e-07	46.3
SQG96955.1|1040687_1041419_-	16S pseudouridylate synthase	NA	NA	NA	NA
SQG96956.1|1041533_1041899_+	thioesterase superfamily protein	NA	NA	NA	NA
SQG96957.1|1042018_1043239_-	sugar (and other) transporter family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96958.1|1043612_1045097_+	hypothetical cytosolic protein	NA	NA	NA	NA
SQG96959.1|1045201_1045603_-	phenylacetic acid degradation protein PaaI	NA	NA	NA	NA
SQG96960.1|1045687_1046200_-	phosphorylase superfamily protein	F5CA76	Streptococcus_phi-m46.1-like_phage	6.6e-91	96.5
SQG96961.1|1046411_1047767_-|tRNA	tRNA (uracil-5-)-methyltransferase	D0R096	Streptococcus_phage	8.0e-253	98.2
SQG96962.1|1047848_1049300_-	cell envelope-related function transcriptional attenuator common domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
SQG96963.1|1049507_1049999_-	shikimate kinase	NA	NA	NA	NA
SQG96964.1|1049991_1051275_-	3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96965.1|1051385_1052351_-	ribonuclease BN-like family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96966.1|1052352_1053213_-	methionine aminopeptidase Map	NA	NA	NA	NA
SQG96967.1|1053228_1054512_-	cytosolic protein containing multiple CBS domains	NA	NA	NA	NA
SQG96968.1|1054520_1055063_-	acetyltransferase family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96969.1|1055230_1055701_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96970.1|1055654_1056365_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96971.1|1056627_1057233_-	immunoglobulin G-binding protein G	NA	NA	NA	NA
SQG96972.1|1057589_1058849_-	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase	NA	NA	NA	NA
SQG96973.1|1059022_1060219_-	S-adenosylmethionine synthetase	A0A2H4PQS6	Staphylococcus_phage	4.5e-138	65.4
SQG96974.1|1060755_1063134_-	leucine Rich Repeat family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96975.1|1063336_1064278_+	biotin-protein ligase	NA	NA	NA	NA
SQG96976.1|1064550_1066221_-	DNA polymerase III subunits gamma and tau	E7DN81	Pneumococcus_phage	5.1e-47	40.6
SQG96977.1|1066220_1066718_-	GAF domain-containing protein	NA	NA	NA	NA
SQG96978.1|1066862_1067672_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQG96979.1|1067724_1067988_-	membrane protein	NA	NA	NA	NA
SQG96980.1|1068067_1068694_-	uridine kinase	A0A1V0SAA3	Catovirus	1.7e-35	39.7
SQG96981.1|1068791_1069877_+	ATP-dependent RNA helicase	Q5GF26	Diachasmimorpha_longicaudata_entomopoxvirus	1.6e-33	32.3
SQG96982.1|1069987_1071262_-	polysaccharide deacetylase family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96983.1|1071356_1072784_-	NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
SQG96984.1|1072968_1074702_-	Phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase of PTS system	NA	NA	NA	NA
SQG96985.1|1074706_1074970_-	Phosphotransferase system, phosphocarrier protein HPr	NA	NA	NA	NA
SQG96986.1|1075363_1075582_+	glutaredoxin	A0A249XUR7	Enterococcus_phage	2.3e-13	48.0
SQG96987.1|1075601_1077761_+	ribonucleotide-diphosphate reductase subunit alpha	A8E2R1	Enterococcus_phage	3.6e-263	63.6
SQG96988.1|1078093_1079053_+	ribonucleoside-diphosphate reductase subunit beta	A0A096XT60	Enterococcus_phage	1.8e-126	69.9
SQG96989.1|1079027_1080341_+	chloride channel protein	NA	NA	NA	NA
SQG96990.1|1080436_1080730_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
SQG96991.1|1080762_1081116_+	DNA-binding protein	A0A1B1P773	Bacillus_phage	1.2e-06	35.2
SQG96992.1|1081161_1081332_+|transposase	transposase	U5P429	Shigella_phage	1.5e-07	46.3
SQG96993.1|1081371_1081587_+	Transposase	U5P429	Shigella_phage	7.0e-10	43.9
SQG96994.1|1081683_1082379_-|protease	CAAX amino terminal protease family protein	NA	NA	NA	NA
SQG96995.1|1082397_1083159_-	hypothetical membrane spanning protein	NA	NA	NA	NA
SQG96996.1|1083155_1083377_-	XRE family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SQG96997.1|1083730_1086349_-|tRNA	Alanyl-tRNA synthetase	A0A1V0SK38	Klosneuvirus	1.5e-61	33.9

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>LS483415|1299361:1370973|DBSCAN-SWA
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Protein sequences of DBSCAN-SWA_9

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MTDELIKPLLEEIERKDDRLYMQSNVIAVLMTAVLMLLMISIALQSYYEPQIYGLRAQLSRTQKQLKRASEDRARQTKRIAELTHNGG

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQG97183.1|1299361_1300279_-|tRNA	glycyl-tRNA synthetase alpha subunit	NA	NA	NA	NA
SQG97184.1|1300649_1301183_-	hypothetical membrane spanning protein	NA	NA	NA	NA
SQG97185.1|1301314_1302154_-	2,5-diketo-D-gluconic acid reductase	A0A2H4PQR8	Staphylococcus_phage	2.5e-50	40.3
SQG97186.1|1302276_1303425_-	N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase	NA	NA	NA	NA
SQG97187.1|1303542_1305174_-	Sodium-dependent phosphate transporter	A0A1B1ITU5	uncultured_Mediterranean_phage	2.7e-05	38.8
SQG97188.1|1305375_1306098_+	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
SQG97189.1|1306226_1307069_-	EDD, DegV family domain-containing protein	A0A1X9I5J4	Streptococcus_phage	1.3e-91	61.9
SQG97190.1|1307361_1307919_+	TetR family transcriptional regulator	A0A1X9I6A2	Streptococcus_phage	3.2e-14	60.3
SQG97191.1|1307954_1308779_-	haloacid dehalogenase	NA	NA	NA	NA
SQG97192.1|1308780_1309398_-	HAD superfamily hydrolase	NA	NA	NA	NA
SQG97193.1|1309416_1309506_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG97194.1|1309594_1310572_-	tagatose 1,6-diphosphate aldolase	NA	NA	NA	NA
SQG97195.1|1310721_1311072_-	tagatose-6-phosphate kinase	NA	NA	NA	NA
SQG97196.1|1311081_1311597_-	galactose-6-phosphate isomerase subunit	NA	NA	NA	NA
SQG97197.1|1311611_1312037_-	galactose-6-phosphate isomerase subunit	A0A222YX14	Synechococcus_phage	1.4e-06	27.9
SQG97198.1|1312293_1313745_-	PTS system galactitol-specific family transporter subunit IIC	NA	NA	NA	NA
SQG97199.1|1313770_1314076_-	PTS system galactose-specific transporter subunit IIB	NA	NA	NA	NA
SQG97200.1|1314068_1314542_-	phosphoenolpyruvate-dependent sugar phosphotransferase system, EIIA 2 family protein	NA	NA	NA	NA
SQG97201.1|1314778_1315549_+	lactose phosphotransferase system repressor	A0A077SK06	Escherichia_phage	6.4e-21	27.8
SQG97202.1|1315752_1315956_-	copper chaperone	NA	NA	NA	NA
SQG97203.1|1315969_1318201_-	copper-exporting ATPase	A0A218MNH6	uncultured_virus	2.6e-115	37.5
SQG97204.1|1318200_1318635_-	copAB ATPase metal-fist type repressor	NA	NA	NA	NA
SQG97205.1|1318806_1319796_+	esterase / lipase	NA	NA	NA	NA
SQG97206.1|1319926_1320277_-	truncated ribosome-binding factor A	NA	NA	NA	NA
SQG97207.1|1320482_1323344_-	translation initiation factor IF-2	E3T4N3	Cafeteria_roenbergensis_virus	4.5e-19	25.2
SQG97208.1|1323363_1323666_-	ribosomal protein in infB 5'region	NA	NA	NA	NA
SQG97209.1|1323658_1323955_-	putative cytoplasmic protein	NA	NA	NA	NA
SQG97210.1|1323970_1325116_-	transcription elongation factor	NA	NA	NA	NA
SQG97211.1|1325302_1325839_-	ribosome maturation factor rimP	NA	NA	NA	NA
1325946:1325962	attL	NA	NA	NA	NA
SQG97212.1|1326083_1326263_-	paratox	A3F673	Streptococcus_phage	5.2e-19	79.7
SQG97213.1|1326329_1327124_-	streptococcal phage DNAse	A7J2B8	Streptococcus_phage	8.9e-26	35.6
SQG97214.1|1327368_1328583_-	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	A0A1P8VVM5	Streptococcus_phage	9.7e-165	60.5
SQG97215.1|1328579_1328693_-	phage membrane protein	A7J2B4	Streptococcus_phage	2.2e-07	82.9
SQG97216.1|1328694_1329150_-|holin	holin	A0A0M4R3G6	Streptococcus_phage	3.0e-63	81.5
SQG97217.1|1329160_1329775_-	phage protein	Q938J7	Temperate_phage	1.8e-66	79.4
SQG97218.1|1329777_1330209_-	phage protein	A3F661	Streptococcus_phage	7.6e-64	90.0
SQG97219.1|1330220_1332239_-	Phage infection protein	Q938J9	Temperate_phage	3.0e-171	69.4
SQG97220.1|1332251_1333259_-	phage hyaluronidase	A7J2A8	Streptococcus_phage	2.6e-139	72.2
SQG97221.1|1333255_1335292_-	phage protein	A3F656	Streptococcus_phage	0.0e+00	84.1
SQG97222.1|1335288_1336068_-|tail	phage tail protein	A3F655	Streptococcus_phage	1.9e-68	55.5
SQG97223.1|1336099_1339366_-	tape measure domain protein	U6E979	Streptococcus_phage	1.6e-04	30.4
SQG97224.1|1339380_1339677_-	phage protein	A0A0S2MYH1	Enterococcus_phage	1.3e-09	42.2
SQG97225.1|1339834_1340110_-	phage protein	D7RWD6	Brochothrix_phage	1.2e-14	45.9
SQG97226.1|1340155_1340809_-|tail	phage major tail protein	D7RWD5	Brochothrix_phage	1.9e-37	50.9
SQG97227.1|1340818_1341208_-	phage protein	Q38611	Lactococcus_phage	3.5e-44	68.2
SQG97228.1|1341204_1341570_-	phage protein	A0A097BY98	Enterococcus_phage	7.7e-17	46.3
SQG97229.1|1341550_1341745_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97230.1|1341744_1341858_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97231.1|1341854_1342208_-	phage protein	A0A2H4J002	uncultured_Caudovirales_phage	9.7e-25	49.6
SQG97232.1|1342297_1342465_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97233.1|1342474_1343551_-|head	phage head protein	A0A2H4J022	uncultured_Caudovirales_phage	5.5e-103	56.0
SQG97234.1|1343550_1343931_-	structural protein	A0A0K2CNR0	Brevibacillus_phage	5.2e-08	37.9
SQG97235.1|1343940_1344474_-	phage protein	A0A141E0S7	Streptococcus_phage	1.4e-14	83.9
SQG97236.1|1344585_1345329_-	antirepressor	M1PKL6	Streptococcus_phage	5.3e-73	56.9
SQG97237.1|1345330_1345579_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG97238.1|1345693_1345873_-	Uncharacterised protein	M1NRK8	Streptococcus_phage	2.6e-18	79.7
SQG97239.1|1345968_1346238_-	phage protein	A0A097PAR8	Streptococcus_pyogenes_phage	2.3e-34	84.1
SQG97240.1|1346297_1346477_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG97241.1|1346467_1348093_-|head	phage head morphogenesis, SPP1 gp7 family domain protein	U6E9F1	Streptococcus_phage	1.1e-46	43.8
SQG97242.1|1348073_1349576_-|portal	phage portal protein, SPP1 family	C9W9H5	Streptococcus_virus	2.4e-141	54.5
SQG97243.1|1349587_1350895_-|terminase	terminase large subunit	A0A2H4IYR5	uncultured_Caudovirales_phage	5.9e-184	75.2
SQG97244.1|1350872_1351304_-|terminase	phage terminase small subunit	A0A1S5SCD2	Streptococcus_phage	1.3e-47	69.9
SQG97245.1|1351402_1351588_+	phage protein	D6PSW1	Lactobacillus_phage	1.7e-09	54.0
SQG97246.1|1351639_1352017_+	phage protein	I3NLB2	Bifidobacterium_phage	3.3e-15	44.0
SQG97247.1|1352154_1352616_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG97248.1|1352634_1353549_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97249.1|1354126_1354561_-	autolysin regulatory protein	J7KDQ1	Streptococcus_phage	6.2e-74	97.9
SQG97250.1|1354834_1355470_-	phage protein	L0P368	Streptococcus_phage	2.0e-89	69.4
SQG97251.1|1355471_1355738_-	phage protein	A7J287	Streptococcus_phage	1.6e-16	60.0
SQG97252.1|1355740_1355902_-	phage protein	A7J285	Streptococcus_phage	1.2e-22	94.3
SQG97253.1|1355902_1357225_-	SNF2 family phage protein	A7J284	Streptococcus_phage	4.6e-253	98.0
SQG97254.1|1357221_1357497_-	phage protein	A7J283	Streptococcus_phage	8.6e-45	96.7
SQG97255.1|1357862_1360247_-	phage DNA primase/helicase protein	A7J282	Streptococcus_phage	8.8e-287	97.6
SQG97256.1|1360251_1362183_-	phage DNA polymerase	A7J280	Streptococcus_phage	0.0e+00	87.8
SQG97257.1|1362225_1362789_-	phage protein	D2J040	Enterococcus_phage	7.4e-51	57.9
SQG97258.1|1362802_1363960_-	phage protein	A7J278	Streptococcus_phage	1.7e-219	99.7
SQG97259.1|1363959_1364259_-	phage protein	A7J277	Streptococcus_phage	1.0e-38	92.9
SQG97260.1|1364346_1364550_-	phage protein	A7J276	Streptococcus_phage	9.4e-33	100.0
SQG97261.1|1364546_1364699_-	phage protein	A7J275	Streptococcus_phage	4.4e-19	100.0
SQG97262.1|1364695_1365079_-	phage protein	A7J274	Streptococcus_phage	6.1e-65	99.2
SQG97263.1|1365075_1365282_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97264.1|1365274_1365445_-	phage protein	A7J273	Streptococcus_phage	2.0e-20	89.3
SQG97265.1|1365441_1365717_-	phage protein	A7J272	Streptococcus_phage	1.7e-45	95.6
SQG97266.1|1365775_1365985_-	phage protein	M1Q1B4	Streptococcus_phage	7.7e-14	53.6
SQG97267.1|1366275_1366623_+	Cro/CI family phage transcriptional regulator	A0A126GGQ7	Streptococcus_phage	1.5e-41	73.5
SQG97268.1|1366626_1367013_+	peptidase	Q7Y4M1	Streptococcus_phage	2.2e-38	58.4
SQG97269.1|1367137_1368859_+	prophage Lp2 protein 4	NA	NA	NA	NA
SQG97270.1|1368915_1369773_+	Site-specific DNA methylase	A0A2H4UUI2	Bodo_saltans_virus	9.9e-15	29.3
SQG97271.1|1369893_1370973_+|integrase	integrase	A7J266	Streptococcus_phage	7.5e-177	93.3
1371019:1371035	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_10

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10

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MARTPFTQELLHQIFDDTGTMSLELIAERLPDWSEKDIKLRLAAWRYRNNIAYTMANGEIDTFEIINNRKAISEEVSAGRQLKLEEYFKQVQATAEIINKPTASDTNRLKAIQLQQVAMDEIPDQYFKELTELYG
>LS483415|1714595:1730328|1721212_1721386_+|SQG97584.1|DBSCAN-SWA
MKIKLFYQKHNESLDDFEYRVNLFTLSVSVIDIKFSEATYGNYEDMSTTTSLLVLYR
>LS483415|1714595:1730328|1715478_1715712_+|SQG97574.1|DBSCAN-SWA
MVFKSKGGVDLKKNKVRGYRNMLGFTQEELGNKLGITKQSYHNKEVGKNSFKDSEKLVFKELLLPLFPDITLEDIFF
>LS483415|1714595:1730328|1723958_1724621_+|SQG97590.1|DBSCAN-SWA
MKKKLVLATALLTVGVATNVKAEAYGNQRIWGFRTDWQEGRDFGAKPIRKGDNEIKVKTAPEAVLTVYEWKNNKWELIKDEVRNGGIYSHETYREEGGSNEQIPRRVLSGGDGLITFPLKKNAQLGDKYKLILTVGGFYLAGGEWTVGESIPKDEEEKDEVEIQKFIDGLEQKEREAEEQKYAEELFKQQQQEEAKKTWHQRLSDSIQDQWWNFKDWWRG
>LS483415|1714595:1730328|1717806_1718136_+|SQG97580.1|DBSCAN-SWA
MTLPENYRRVLNLIKVGADNSITEAEISLILKLEERSVQSIISSLITRYNIPIIGIRHGFNRGYLIPANKEELLDGAKAFYNQVQKEQERLSVLLNADLTSYKELLKGG
>LS483415|1714595:1730328|1723037_1723400_+|SQG97588.1|DBSCAN-SWA
MNAKEQLKELKPLFALMTLFEEQRDKDIKLMNAFRNPEEIKNIEKGTAKQLLYLAKERDKRLAMIAALQDEKQIAVIKARYVDGLSWDEIPDKLGYSRNTVFKLHREALEVLDEQEERYS
>LS483415|1714595:1730328|1718411_1719269_+|SQG97582.1|DBSCAN-SWA
MAIYEARGFSSYLYPYKGPLEPFDYIAQFRPLKPPEDIDIEEYKRTQAPYCLSGKVTAEKNGSYKRNNASLVYRDLIFLDYDEIETGVNLPKIVSQTLWEYSYIIYPTIKHTPEKPRYRLVMKPSDAMTEATYKQVVKEIADKIGLPFDLASLTWSQLQGLPVTTGDPEDYQRYVNHGLDYPVPKNGSTPNRQVVTTYTPRPRSQRSITMRVIDTLFNGFGNEGGRNVALTKFVGLLFNKWVDCDLETAYELVQIANSVTTKPLPIDEIDRTFTSIAKAEYRKRG
>LS483415|1714595:1730328|1728636_1730328_+|SQG97594.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MDTKTLIASEIAKVVPELEQDAIFNLLETPKNSDMGDLAFPAFSLAKVLRKAPQMIASELAEQIDESQFEKVVAVGPYINFFLDKAKISSQVLEQVITAGSDYAQQDEGQGRNVAIDMSSPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSLAHIFAKMGYQPVKINHLGDWGKQFGMLIVAYKKWGDEAAVQAHPIDELLKLYVRINAEAETDPTIDEEAREWFRKLEDGDKEATELWQWFRDESLLEFNRLYDQLHVTFDSYNGEAFYNDKMDEVLDLLEAKNLLVESKGAQVVNLEKYGIEHPALIKKSDGATLYITRDLAAALYRKRTYDFAKSVYVVGNEQAAHFKQLKAVLKEMGYDWSDDMTHVAFGLVTKGGAKLSTRKGNVILLEPTVAEAINRAASQIEAKNPNLADKEAVAHAVGVGAIKFYDLKTDRMNGYDFDLEAMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKADFTPSATTTYSLADAESWEIIKLIQDFPRIIKRTSDNFEPSIMAKFAINLAQSFNKYYAHTRILDDNSERDNRLALCYATATVLKEALRLLGVDAPNEM
>LS483415|1714595:1730328|1719237_1720926_+|SQG97583.1|DBSCAN-SWA
MLKQNTEREGRTIEQEDLKNLENEITEARENEDKYFSTFKGVRGQLIKECQEMKDEAFKIAYDGVMADSKHLENVKAGRLTEVQHEELAKEKGQEASEKALPKTPLGVAIMLKHYLRFIRVKPEAQGQKAPLYFFHPDHGVWLEDNEFLQDLISVIFPNATEKQAFDTLYKIARQSQLKEIQREYTVIGNQLYNYKTGQFEELTPDITVTRKIKTGYNKKAKEPTIKGWKPTAWLLELFDGDAELYNLAIQIIKASITGQSLQKIFWLFGEGGTGKGTFQQLLINLVGMDNVASLKITELAKSRFTTSILLGKSIVIGDDIQKDAVIKDTSDIFSLATGDIMTIEDKGKRPYSIRLNMTVVQSSNGLPRMNGDKSAIDRRFRILPFTKVFKGKPNKAIRNDYINRKEVLEYLLKLAIETPITDINPKASIEILEEHHKEMNPVIDFVSKFFTDELTSEFIPNSFVYHVWKGFLEYYDIKQIKSERGLHKEIKSNLPEGFEAGQKVIPVGRQLHTGFYPKEDLPLFASASYANGRASPEKRKKPKNERGYYNHWPTHKKQKKT
>LS483415|1714595:1730328|1721391_1721565_+|SQG97585.1|DBSCAN-SWA
MKLKLHTRGGNTITIQGDRTLYDELIKYLLSGQQPNWVASPSAIINLSDIIAITKEK
>LS483415|1714595:1730328|1727559_1727766_-|SQG97592.1|DBSCAN-SWA
MPCFSKKIDKEKAATVSASRAKELEDRLSHQPLIDDYREKMQDASDVIQYITKRIEDQLNKELTNGKN
>LS483415|1714595:1730328|1723374_1723758_+|SQG97589.1|DBSCAN-SWA
MSKKNAIRKLKEFHRWQRIANSLDLTYTELYQFDIEYHPTRRKHLEISRECALEELDAIRYAINQLSKVEYRQILIECYLISEEKTQQDIMEELNRSQSWYYESKKRALLEFVEFYRDGTLKNNVRL
>LS483415|1714595:1730328|1721566_1722076_+|SQG97586.1|DBSCAN-SWA
MRTFSDTPKTFTFHYTFKDFDTAQVACHAILGYMTGTYEQPVIDATYHNDDQGGHANQLVLKYVEDRKLSKVFKRICDSFKDYYNQPEDMTDEELDHQRVVSLSKSTQGKVNNRDTLIAFISDHNQLAEHLSMNYKEMTPEDLGAILESISQAFNHLYDMVVEGQLLVK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
SQG97573.1|1714595_1715387_-	transcriptional regulator	A0A1S5SE31	Streptococcus_phage	7.5e-09	48.5
SQG97574.1|1715478_1715712_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
SQG97575.1|1715766_1716174_+	phage protein	A0A1X9I5V7	Streptococcus_phage	8.5e-49	68.7
SQG97576.1|1716187_1716805_+	pRha family phage regulatory protein	A0A159B6D5	Gordonia_phage	2.2e-11	38.8
SQG97577.1|1717050_1717383_+	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97578.1|1717379_1717601_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
SQG97579.1|1717603_1717795_+	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97580.1|1717806_1718136_+	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97581.1|1718138_1718411_+	Uncharacterised protein	A0A1X9I5U9	Streptococcus_phage	6.1e-19	60.0
SQG97582.1|1718411_1719269_+	replication protein	A0A1X9I6L2	Streptococcus_phage	2.6e-124	74.8
SQG97583.1|1719237_1720926_+	phage/plasmid primase, P4 family, C-terminal domain protein	A0A1X9I717	Streptococcus_phage	2.5e-259	82.1
SQG97584.1|1721212_1721386_+	Uncharacterised protein	A0A1X9I5U0	Streptococcus_phage	1.9e-10	59.6
SQG97585.1|1721391_1721565_+	phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97586.1|1721566_1722076_+	phage protein	A0A1X9I5U4	Streptococcus_phage	1.1e-29	63.5
SQG97587.1|1722149_1722638_+	phage protein	A0A1X9I5V2	Streptococcus_phage	1.4e-45	54.9
SQG97588.1|1723037_1723400_+	phage protein	A0A2H4JFS1	uncultured_Caudovirales_phage	1.3e-05	29.9
SQG97589.1|1723374_1723758_+	phage protein	Q938L8	Temperate_phage	3.7e-14	41.7
SQG97590.1|1723958_1724621_+	secreted phage protein	NA	NA	NA	NA
SQG97591.1|1725017_1727573_-	DNA mismatch repair protein mutS	A0A1V0SGG8	Hokovirus	3.0e-43	23.4
SQG97592.1|1727559_1727766_-	cytoplasmic protein	NA	NA	NA	NA
SQG97593.1|1727908_1728346_-	arginine repressor	NA	NA	NA	NA
SQG97594.1|1728636_1730328_+|tRNA	arginyl-tRNA synthetase	A0A2I2L3K1	Orpheovirus	1.9e-73	32.4

Anti-CRISPR protein detection

Acr ID	Acr position	Acr size	Homology with known anti	Neighbor HTH/AcRanker	Neighbor Aca	In prophage	Protospacer in prophage
LS483415.1|SQG97259.1|1363959_1364259_-|phage-protein	1363959_1364259_-	99 aa aa	NA	NA	NA	1299361-1370973	yes

Protein sequences of LS483415.1|SQG97259.1|1363959_1364259_-|phage-protein

>LS483415.1|SQG97259.1|1363959_1364259_-|phage-protein
MIEVTFKAESMASVFDAMREALDMPKTATEDVVEEKSAPEKKEESVTLTLADIKKMAKAKVEEGKSKHIKEVLKEMDVAKVGELEEYQFAEFVEKLEAL

Self-targetings in the prophage

CRISPR ID	CRISPR type	Spacer info	Spacer location	Spacer length	Protospacer location	Mismatch
LS483415_1	Orphan	1.1|779683|30|LS483415|CRT	779683-779712	30	1331436-1331407	1

1. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to LS483415 position: 1331436-1331407, mismatch: 1

cttacgagctgagtttactcgtagtaatca	CRISPR spacer
cttacgtgctgagtttactcgtagtaatca	Protospacer
****** ***********************