Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483415 | Streptococcus pyogenes strain NCTC8304 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DinG,csm6,cas3,DEDDh,csa3 | 1 | 5 | 10 | 1 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483415_1 | 779647-780012 | Orphan |
II-A
Consensus repeat of LS483415_1
|
5 spacers
spacers of LS483415_1
>1.1|779683|30|LS483415|CRT CTTACGAGCTGAGTTTACTCGTAGTAATCA >1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR CACTGATTGGACAAAGAATGCTCCAGTCCG >1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR GATTAGCTCAAGCATGCCTTTATAAATGTT >1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR CAGCTTGGATTTAATAGCAGACCATGTTTT >1.5|779947|30|LS483415|CRT GCACGAGTTTAACTCCCTTATTATTAGCTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483415_1
The CRISPR arrays of LS483415_1 >merge|LS483415|1|779647-780012|CRT,PILER-CR TTTAACTTGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACCTTACGAGCTGAGTTTACTCGTAGTAATCAGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACCACTGATTGGACAAAGAATGCTCCAGTCCGGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAACGATTAGCTCAAGCATGCCTTTATAAATGTTGTTTTAGAGCTATGTTGTGTTGAATGGTCCCAAAACCAGCTTGGATTTAATAGCAGACCATGTTTTGTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGGATGGTCCCAAAACGCACGAGTTTAACTCCCTTATTATTAGCTTGTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCTCCATTC >LS483415|1|1|779647-780012|CRT TTTAACTTGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CTTACGAGCTGAGTTTACTCGTAGTAATCA GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CACTGATTGGACAAAGAATGCTCCAGTCCG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC GATTAGCTCAAGCATGCCTTTATAAATGTT GTTTTAGAGCTATGTTGTGTTGAATGGTCCCAAAAC CAGCTTGGATTTAATAGCAGACCATGTTTT GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGGATGGTCCCAAAAC GCACGAGTTTAACTCCCTTATTATTAGCTT GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCTCCATTC >LS483415|1|1|779713-779946|PILER-CR GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC CACTGATTGGACAAAGAATGCTCCAGTCCG GTTTTAGAGCTATGCTGTTTTGAATGGTCCCAAAAC GATTAGCTCAAGCATGCCTTTATAAATGTT GTTTTAGAGCTATGTTGTGTTGAATGGTCCCAAAAC CAGCTTGGATTTAATAGCAGACCATGTTTT GTTTTAGAGCTATGTTGTTTTGGATGGTCCCAAAAC
>LS483415.1|SQG96673.1|778861_779494_+|membrane-protein MVENTKLLCSWVWLLALAILITIYSTWLWYPLEVDHLKLEQVVFMSKDAILHNYNGLLNYLTNPFVTRLEFANFHSSADGLKHFADVKWLFHLTQVVFLGLLYPTLKTFTQRLKTKRFWLLQKPLILAALFPLMIGLMASFIGFEHFFTLFHKVLFVGDSSWLFDPLKDPVIWILPEVFFLHCFLFFMIVYEIILWSLVGLARWQRLNVE >LS483415.1|SQG96672.1|778097_778862_+|haloacid-dehalogenase-like-hydrolase MPYKGYLIDLDGTIYQGKNRIPAGERFIKRLQEKGIPYLLVTNNTTRTPAMVQSMLANQFNVETGIETIYTATMATVDYMNDMNRGKTAYVIGETGLKSAIAAAGYVEELENPAYVVVGLDSQVTYEMLAIATLAIQKGALFIGTNPDLNIPTERGLMPGAGALNALLEAATRVKPVFIGKPNAIIMNKSLEVLGIQRSEAVMVGDNYLTDIMAGIQNDIATILVTTGFTRPEEVPTLPIQPDHVLSSLDEWRL >LS483415.1|SQG96671.1|777345_778098_+|oleoyl-[acyl-carrier-protein]-hydrolase MGLSYQEELTLPFELCDVKSDIKLPLLLDYCLMVSGRQSAQLGRSNNNLLVDYKLVWIVTDYEITIHRLPHFQETITIETKALSYNKFFCYRQFYIYDQEGGLLVDILAYFALLNPDTRKVATIPEDLVAPFKTDFVKKLYRVPKMPLLEQSIDRDYYVRYFDIDMNGHVNNSKYLDWMYDVLGCAFLKTHQPLKMTLKYVKEVSPGGQITSSYHLDQLNSYHQITSDGQLNAQAMIEWRAIKQTESEID >LS483415.1|SQG96670.1|776139_777336_+|coproporphyrinogen-III-oxidase MKNQEKWFIHRNILSSKWYNKTMSKKPTSAYVHIPFCTQICYYCDFSKVFIQNQPVDAYLRALIQEFDSYGIRDLKTLYIGGGTPTAITAKQLEYLLNHLERNLNLDDLEEFTIEANPGDLTLEKITVLQRSAVNRISLGVQTFNNKQLKQIGRSHNEEQIYSTIANLKAAGFHNISIDLIYALPGQTLDQVKENVAKALALDIPHLSLYSLILEHHTVFMNKMRRGKLNLPTEDLEAEMFEYIISEMEANGFEHYEISNFTKPGFESRHNLMYWDNVEYFGCGAGASGYLNGIRYQNRVPIQHYLKAVEAGNARLNEEVLRKEEMMEEELFLGLRKKTGVSIQRFQEKFGVSFEERYGNIARELQNQGLLVKDDAFVRMTKKGLFLGDSVAERFILD >LS483415.1|SQG96669.1|775501_776143_+|acetyltransferase-GNAT-Family MTKQQIEKLADLLPPFAATLYLDMIPEFQEGYASYVYQTQKEDTQNRRIKQLTKNFERLLDTPSFYVMPVTRKTAEQLLADKGLAYHLLSTVAANQVFAAAVNEDQTLFQVLRNGARVAFVILQEKGEFLEMTLGILETVTENEVPAAIVEAVQTYLLTDMQEKLPSLSIMVSQESSKLFYQEQGFVLLAKGCKPGNENDSDVCQLVKYFSKP >LS483415.1|SQG96668.1|774022_775378_+|phosphoglucosamine-mutase MGKYFGTDGVRGEANVELTPELAFKLGRFGGYVLSQHETERPKVFVARDTRISGEMLESALIAGLLSVGIEVYKLGVLATPGVSYLVRTEKASAGVMISASHNPALDNGIKFFGNDGFKLADDQELEIEALLDAPEDTLPRPSAEGLGTLVDYPEGLRKYEKFLVTTGTDLSGMTVALDTANGAASVSARDVFLDLNAEIAVIGEKPNGLNINDGVGSTHPEQLQELVKETGADLGLAFDGDSDRLIAVDETGEIVDGDRIMFIIGKYLSEKGLLAHNTIVTTVMSNLGFHKALDKQGINKAITAVGDRYVVEEMRSSGYNLGGEQSGHVIIMDYNTTGDGQLTAIQLAKVMKETGKSLSELAAEVTIYPQKLVNIRVENSMKDRAMEVPAIANIIAKMEDEMAGNGRILVRPSGTEPLLRVMAEAPTDAEVDYYVDTIADVVRTEIGCDN >LS483415.1|SQG96667.1|773012_773969_+|hypothetical-membrane-associated-protein MKRFLNSRPWLGMVSVFFAILLFLTAASSNHNNSSSQIYSPIETYTHSLKDVPIDMKYDSDKYFISGYSYGAEVYLTSTNRIKLDSEVNNDTRNFKIVADLTHSHPGTVSVNLRVENLPSGVTATVSPDKISVTIGKKESKVFPVRGSVDAKQIANGYEISKIETGVNKVEVTSDESTIALIDHVVAKLPDDQVLDRNYSSRVTLQAVSADGTILASAIDPAKTNLSVAVKKITKSVPIRVEAVGMMDDSLSDIQYKLSKQTAVISGSREVLEDIDEIIAEVNISDVTKNTSKTVSLSSSQVSIEPSVVTVQLTTTKK >LS483415.1|SQG96666.1|772164_773016_+|disA-bacterial-checkpoint-controller-nucleotide-binding-family-protein MNNLSSIDIKFLLSLFADPWLLAVHLLDILIVAYLIYRFIKALTGTKIMSLVQGVIFFLVLRFIAEWIGFTTITYLMNQVITYGVIAGVVIFTPEIRAGLEKFGRSTQVFLQKQYVSSESALVDALIKSVAYMGPRKIGALIAIEQTQTLQEYIATGIPLNADISSQLLINIFIPNTPLHDGAVIVGQNKIVAACAYLPLSESKAISKEFGTRHRAAIGLSENSDALTIIVSEETGAISVTRKGQFLHDLSTDEFETVLRTYLMSDSNVTLPWYKKILGGKSK >LS483415.1|SQG96665.1|770719_772057_-|UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate-2,-6-diaminopimelate-ligase MKTLLGIIAGKAAQSILTKLGRGSTYPGRLALACNKDILKDLSKDYDIVVVTGTNGKTLTTALTVGILKEAFGEIITNPSGANMITGITSTFLAAKKGKSGRQIAVLEIDEASLPRITTYLKPSLFVYTNIFRDQMDRYGEIYTTYQMIVDGARNAPKATILANGDSPIFSSKDIVNPVQYYGFDTAKHAPQLAHYNTEGILCPKCEHILQYRLNTYANLGDFICLNCGFKRPQLDYRLTELTTITNHSSEFIIDDQDYKINVGGLYNIYNALAAVSVAEFFGVSPEKIKAGFNKSKAVFGRQETFTIGDKSCTLILIKNPVGASQALEMIQLADYPFSLSVLLNANYADGIDTSWIWDANFELITQMPITEINAGGVRHSEIARRLRVTGFDDTKIKQAEKLEQIIETIEKQEAKHAYLLATYTAMLEFRSLLADRHVVEKEMI >LS483415.1|SQG96664.1|769928_770720_-|cobyric-acid-synthase MTYTSLKSPENQDYIYDLNIAHLYGNLMNTYGDNGNILMLKYVAEKLEARVTVDIVSINDTFEQDDYDIVFFGGGQDYEQSIVAKDLPSKKAALADYIANNKVVLAICGGFQLLGQYYVQANGVKIDGLGIMGHYTLNQHQNRFIGDIKIHNDEFNETYYGFENHQGRTFLSGDEKPLGRVVYGNGNNKEDQTEGVHYKNVYGSYFHGPILSRNVNLAYRLVTTALKKKYGSAISLPSYDDILKQEITEEYADLKSKASFNKV >LS483415.1|SQG96674.1|780654_782487_+|GTP-binding-protein-LepA MNSQDLKKRQEKIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILEKTETVSSREMQAQLLDSMDLERERGITIKLNAIELNYTAKDGETYIFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNDLEILPVINKIDLPAADPERVRHEVEDVIGLDASEAVLASAKAGIGIEEILEQIVEKVPAPTGDVDAPLQALIFDSVYDAYRGVILQVRIVNGIVKPGDKIQMMSNGKTFDVTEVGIFTPKAVGRDFLATGDVGYVAASIKTVADTRVGDTVTLANNPAKEALHGYKQMNPMVFAGIYPIESNKYNDLREALEKLQLNDASLQFEPETSQALGFGFRCGFLGLLHMDVIQERLEREFNIDLIMTAPSVVYHVHTTDEDMIEVSNPSEFPDPTRVAFIEEPYVKAQIMVPQEFVGAVMELSQRKRGDFVTMDYIDDNRVNVIYQIPLAEIVFDFFDKLKSSTRGYASFDYDMSEYRRSQLVKMDILLNGDKVDALSFIVHKEFAYERGKIIVEKLKKIIPRQQFEVPIQAAIGQKIVARSDIKALRKNVLAKCYGGDVSRKRKLLEKQKAGKKRMKAIGSVEVPQEAFLSVLSMDDDTKK >LS483415.1|SQG96675.1|782815_783547_+|SclB-protein MIQNLHQQIDNNSKLNVPQVPSSTYTTPSPDTSDLEGDISGIRQYLAQMNEYIKQHKEHDQEWKRELTRGIQQKLLDGKDGRDGAQGLAGERGATGPVGPQGPRGEQGKQGDRGEAGPQGPRGEQGKQGDRGKDGKDGQPGKPAPKTPEVPQKPDTAPHTPKTPQIPDHSKDVTPAPQNPSNRGLNKPQTQGGNQFAKTPAAHDTHRQLPATGETTNPFFTAAAVAIMTTAGVVAVAKRQENN >LS483415.1|SQG96676.1|783732_784170_+|methionine-sulfoxide-reductase-B METSEELKQRIGDLSYEVTQHAATESPFTGEYDHFFEKGIYVDIVSGEVLFSSLDKFNSGCGWPAFSKPIENRMVTNHDDSSYGMRRVEVKSREAGSHLGHVFSDGPKEAGGLRYCINSAALKFIPYDQMEKEGYAQWLTLFDET >LS483415.1|SQG96677.1|784299_785319_+|hypothetical-membrane-spanning-protein MSTHLRKLPGLLLCLLLALPAWCLGRLFLIIGAPVFAILLGMLLALFYEHRDKTKEGISFTSKYILQTAVVLLGFGLNLTQVMAVGMQSLPIIVSTIATALLVAYGSQKWLRLDVNTATLVGVGSSICGGSAIAATAPVIKAKDDEVAKAISVIFLFNMLAALLFPSLGQLLGLSNEGFAIFAGTAVNDTSSVTATATAWDAIHHSNTLDGATIVKLTRTLAILPITLGLSLYRAKKEHDIVTEENFSLRKSFPRFILFFLLASLITTLMTSLGVSADSFHSLKTLSKFFIVMAMAAIGLNTNLVKLIKTGGQAILLGAICWVAITLVSLAMQLSLGIW >LS483415.1|SQG96678.1|785525_785951_+|PTS-system-mannose-specific-transporter-subunit-IIA MKRKFLIGSHGRLASGLQSSIDILAGMGQALETIDAYVDDSDYTSQIDDFIAGVAADEQGLIFTDLLGGSVNQKMVTAVMNSGKDNIFLITNSNLATLLSLVFLKPGEALTKDEIVTVINESQVQLVDLVPETNSEDDFFD >LS483415.1|SQG96679.1|785969_786461_+|PTS-system-mannose/fructose-family-transporter-subunit-IIB MITQIRVDDRLIHGQVAVVWTKELNAPLLVVANDEAAKNEITQMTLKMAVPNGMKLLIRSVEDSIKLFNDPRATDKRIFVIVNSVKDACAIAKEVPDLEAVNVANVGRFDKSDPASKVKVTPSLLLNPEEMAAAKELVSLPELDVFNQVLPSNTKVHLSQLVN >LS483415.1|SQG96680.1|786477_787287_+|PTS-system,-mannose-specific-IIC-component MLVPATMAALAVLICFGGNYLTGQSMMERPLVVGLVTGLLLGDMKVGILMGASLEALFLGNVNIGGVIAAEPVTATAMATTFTIISHIDQKAAMTLAVPIGMLAAFVVMFLKNVFMNIFAPMVDKAAAANHQGKLVMLHYGTWIIYYLIIASISFIGILVGSGPVNAFVEHIPQNLMNGLSAAGGLLPAVGFAMLMKLLWTNKLAVFYLLGFVLTAYLKLPAVAVAALGAVICVISSQRDLELDAITRGAISKQTTFDSKESEEEDFFA >LS483415.1|SQG96681.1|787283_788111_+|phospotransferase-system-(PTS),-enzyme-II-component-D MTSQDNLTKEDRKMLRSVFWRSWTMNASRTGATQYHAVGVIYTLLPVINRFYKTDKDKAEALVRHTTWFNATMHINNFIMGLVASMEKKNSEDPDFDASAITAVKASLMGPISGVGDSFFWGILRVIAAGIGISLASAGSAMGAVVFLLLYNIPAFIIHYYSLYGGYSVGAGFIKKLYESGGIKIVTKTSSMLGLMMVGSMTASNVKFKTILTVAAKGAKEAASIQDYLDQLFIGIVPLMVTLAAFWLLRKKVNINWIMFGIMFLGIILGLLGIC >LS483415.1|SQG96682.1|788246_789896_+|two-component-sensor-kinase MRGEQVEEHFKKQLQDDISRHFSYQSLMLSLLLIGLFIIFSLAPQQLGLYRDINATATRYHRLISKQEALLDDLGKNSLLPFLNKNLSTADLSKHYFHLRHSSQTSPELLLFSPSQDLLFASNPHLGNVFSKSVYIQEVLRAAHPPKTLFKVAMDSEDGHYLMIIKPMIDQNQLKGYAFLVMSGKDFLHPTKTLTSELVIADKLDNTFTFSNREFIASSLDKINSQYLHHYFVFQDNRAFITRKVALQGGLWLYMYRPLIPMVSVMLFSLISSAVIFVILQRKSSGLANRIAAKNSRAINQMVRDMSAISRQEKRRIDLESQDEFQYLSDQINQMVERLQQLHDKTLDLETQKLLFEKRMLEAQFNPHFLYNTLETILITSHYDSALTEKIVIQLTKLLRYSLTDSSKPVLLKDDLSVIESYLVINQVRFEELQYSINLSPDLDSLAVPKLFLLPLIENAIKYGLKERHDVKINIACYYQDDHIIFSVRDNGSGIDAHYQKVIREQLEAGESHHGLINSYRRLKYHFSEVSLVFDQGDKQFNVSYHVKE >LS483415.1|SQG96683.1|789899_790688_+|response-regulator MYKLVIIEDEHIIRKWLRYAIDYKALDILVIGEAKDGKEGAVLIKESQPDIVLTDINMPIMTAFDMFEATKDQTYAKIILSGYADFPNARSAIHYGVLEFLTKPIEKAALWECLQTIIAKIEKQKGSNQKTDACVYIPLPQMTDQIPEVVKDILEWVHAHFQDKISTSRLAHDLGYSESYIYQNIKKHLQMPLSDYINQYRINQAIQLMQQEPDLMVYEIAQAVGIYDYRYFDRVFKKYLGQTVKAFKEEHFMKDTDRSKPC |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | LS483415.1 | 975276-975305 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | LS483415.1 | 1331407-1331436 | 1 | 0.967 |
1. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to position: 975276-975305, mismatch: 0, identity: 1.0
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagtaatca Protospacer ******************************
2. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to position: 1331407-1331436, mismatch: 1, identity: 0.967
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgtgctgagtttactcgtagtaatca Protospacer ****** ***********************
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448944 | Streptococcus phage Javan452, complete genome | 36987-37016 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779749-779778 | 30 | MK448960 | Streptococcus phage Javan492, complete genome | 37074-37103 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779749-779778 | 30 | MK448762 | Streptococcus phage Javan447, complete genome | 37207-37236 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779749-779778 | 30 | MK448772 | Streptococcus phage Javan483, complete genome | 37930-37959 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | MK448798 | Streptococcus phage Javan533, complete genome | 8398-8427 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | NC_004585 | Streptococcus prophage 315.2, complete genome | 10896-10925 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | MK448955 | Streptococcus phage Javan478, complete genome | 9992-10021 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | MK448966 | Streptococcus phage Javan508, complete genome | 10751-10780 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | KT388093 | Streptococcus phage A25, complete genome | 5355-5384 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | MK448772 | Streptococcus phage Javan483, complete genome | 10766-10795 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | MK448783 | Streptococcus phage Javan503, complete genome | 8313-8342 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | MK448967 | Streptococcus phage Javan510, complete genome | 8399-8428 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | KY349816 | Streptococcus phage Str01, complete genome | 30558-30587 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779881-779910 | 30 | NC_004588 | Streptococcus prophage 315.5, complete genome | 8548-8577 | 0 | 1.0 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448960 | Streptococcus phage Javan492, complete genome | 33511-33540 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448973 | Streptococcus phage Javan522, complete genome | 34924-34953 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448762 | Streptococcus phage Javan447, complete genome | 33644-33673 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448775 | Streptococcus phage Javan489, complete genome | 36329-36358 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448955 | Streptococcus phage Javan478, complete genome | 36920-36949 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448970 | Streptococcus phage Javan516, complete genome | 39929-39958 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448795 | Streptococcus phage Javan527, complete genome | 39953-39982 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448791 | Streptococcus phage Javan517, complete genome | 33780-33809 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448953 | Streptococcus phage Javan474, complete genome | 38050-38079 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448945 | Streptococcus phage Javan454, complete genome | 33883-33912 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448778 | Streptococcus phage Javan493, complete genome | 34564-34593 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448975 | Streptococcus phage Javan526, complete genome | 35346-35375 | 1 | 0.967 |
LS483415_1 | 1.1|779683|30|LS483415|CRT | 779683-779712 | 30 | MK448782 | Streptococcus phage Javan501, complete genome | 37704-37733 | 1 | 0.967 |
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LS483415_1 | 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779815-779844 | 30 | NZ_CP033508 | Mesorhizobium jarvisii strain ATCC 700743 plasmid pMJ700743a, complete sequence | 152078-152107 | 9 | 0.7 |
LS483415_1 | 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779815-779844 | 30 | NZ_CP033369 | Mesorhizobium loti strain SU343 plasmid pMLSU343a, complete sequence | 152078-152107 | 9 | 0.7 |
LS483415_1 | 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR | 779815-779844 | 30 | NZ_CP016080 | Mesorhizobium loti NZP2037 plasmid pML2037, complete sequence | 380602-380631 | 9 | 0.7 |
1. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448944 (Streptococcus phage Javan452, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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3. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448762 (Streptococcus phage Javan447, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
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31. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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33. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448779 (Streptococcus phage Javan497, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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35. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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48. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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49. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448797 (Streptococcus phage Javan531, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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50. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448949 (Streptococcus phage Javan460, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
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52. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer *****************************.
53. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer *****************************.
54. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer *****************************.
55. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448952 (Streptococcus phage Javan472, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer tttacgtgctgagtttactcgtagtaatca Protospacer .***** ***********************
56. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448794 (Streptococcus phage Javan525, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer tttacgtgctgagtttactcgtagtaatca Protospacer .***** ***********************
57. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer tttacgtgctgagtttactcgtagtaatca Protospacer .***** ***********************
58. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448765 (Streptococcus phage Javan459, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer tttacgtgctgagtttactcgtagtaatca Protospacer .***** ***********************
59. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448784 (Streptococcus phage Javan505, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
60. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448947 (Streptococcus phage Javan458, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
61. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448965 (Streptococcus phage Javan506, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
62. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
63. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448689 (Streptococcus phage Javan163, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
64. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448974 (Streptococcus phage Javan524, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
65. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
66. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
67. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448789 (Streptococcus phage Javan513, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
68. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448678 (Streptococcus phage Javan135, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgagctgagtttactcgtagccatca Protospacer ************************. ****
69. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448860 (Streptococcus phage Javan172, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaacgctccagtccg Protospacer ***************.**.***********
70. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448969 (Streptococcus phage Javan514, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctccagtctg Protospacer ***************.************.*
71. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448972 (Streptococcus phage Javan520, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctccagtctg Protospacer ***************.************.*
72. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448774 (Streptococcus phage Javan487, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctccagtctg Protospacer ***************.************.*
73. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448773 (Streptococcus phage Javan485, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctccagtctg Protospacer ***************.************.*
74. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctccagtctg Protospacer ***************.************.*
75. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448968 (Streptococcus phage Javan512, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctcaagcatgcctttataagtgtc Protospacer *************************.***.
76. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_009819 (Streptococcus phage P9, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagttcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer ******.**********************.
77. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_004589 (Streptococcus prophage 315.6, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctcaagcatgcctttataagtgtc Protospacer *************************.***.
78. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448871 (Streptococcus phage Javan196, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
79. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
80. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448697 (Streptococcus phage Javan185, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
81. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448693 (Streptococcus phage Javan177, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
82. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448696 (Streptococcus phage Javan183, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
83. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to NC_009819 (Streptococcus phage P9, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
84. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448868 (Streptococcus phage Javan188, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
85. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448866 (Streptococcus phage Javan184, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
86. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448699 (Streptococcus phage Javan189, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
87. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448867 (Streptococcus phage Javan186, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
88. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448698 (Streptococcus phage Javan187, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagctt Protospacer *.** *************************
89. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448796 (Streptococcus phage Javan53, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer attacgtgctgagtttactcgtagttatca Protospacer ***** ****************** ****
90. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448951 (Streptococcus phage Javan470, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttgcgtgctgagtttactcgtagtaatga Protospacer ***.** ********************* *
91. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448946 (Streptococcus phage Javan456, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaagaatgctcctgctcg Protospacer ************************ *..**
92. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448973 (Streptococcus phage Javan522, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
93. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_004585 (Streptococcus prophage 315.2, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
94. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448966 (Streptococcus phage Javan508, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
95. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
96. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NC_004584 (Streptococcus prophage 315.1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
97. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448778 (Streptococcus phage Javan493, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
98. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448978 (Streptococcus phage Javan532, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
99. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448785 (Streptococcus phage Javan507, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
100. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
101. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
102. spacer 1.2|779749|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cactgattggacaaagaatgctccagtccg CRISPR spacer cactgattggacaaaaaatgctcccgtcag Protospacer ***************.******** *** *
103. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448675 (Streptococcus phage Javan129, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer .** *************************.
104. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448859 (Streptococcus phage Javan170, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer .** *************************.
105. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448850 (Streptococcus phage Javan132, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer .** *************************.
106. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448680 (Streptococcus phage Javan139, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer .** *************************.
107. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448676 (Streptococcus phage Javan131, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer .** *************************.
108. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448688 (Streptococcus phage Javan161, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttataaatgtc Protospacer .** *************************.
109. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448955 (Streptococcus phage Javan478, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctcaagcatgcctttgtaaatatc Protospacer *********************.*****.*.
110. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448854 (Streptococcus phage Javan146, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctcaagcatgcctttgtaaatatc Protospacer *********************.*****.*.
111. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to JX409895 (Streptococcus phage JX01, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cagcttggatttaatagcagaccatgtttt CRISPR spacer caatttggatttgatagcagaccatgtttt Protospacer **..********.*****************
112. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448858 (Streptococcus phage Javan166, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
cagcttggatttaatagcagaccatgtttt CRISPR spacer caatttggatttgatagcagaccatgtttt Protospacer **..********.*****************
113. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448763 (Streptococcus phage Javan451, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagcct Protospacer *.** ***********************.*
114. spacer 1.5|779947|30|LS483415|CRT matches to MK448941 (Streptococcus phage Javan446, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
gcacgagtttaactcccttattattagctt CRISPR spacer gtaccagtttaactcccttattattagcct Protospacer *.** ***********************.*
115. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448679 (Streptococcus phage Javan137, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctctaacatgcctttataaatatc Protospacer ********* *.***************.*.
116. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448690 (Streptococcus phage Javan169, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctctaacatgcctttataaatatc Protospacer ********* *.***************.*.
117. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448682 (Streptococcus phage Javan143, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattagctctaacatgcctttataaatatc Protospacer ********* *.***************.*.
118. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448975 (Streptococcus phage Javan526, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cagcttggatttaatagcagaccatgtttt CRISPR spacer caatttggatttgatagcagaccatgttgt Protospacer **..********.*************** *
119. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448782 (Streptococcus phage Javan501, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.867
cagcttggatttaatagcagaccatgtttt CRISPR spacer caatttggatttgatagcagaccatgttgt Protospacer **..********.*************** *
120. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448701 (Streptococcus phage Javan197, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttatagatatc Protospacer .** ********************.**.*.
121. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448869 (Streptococcus phage Javan190, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttatagatatc Protospacer .** ********************.**.*.
122. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448864 (Streptococcus phage Javan180, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttatagatatc Protospacer .** ********************.**.*.
123. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448694 (Streptococcus phage Javan179, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttgtaaatatc Protospacer .** *****************.*****.*.
124. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MK448870 (Streptococcus phage Javan192, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer aataagctcaagcatgcctttatagatatc Protospacer .** ********************.**.*.
125. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to MK448845 (Streptococcus phage Javan118, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgtgctgagtttactcgctcccatca Protospacer ****** **************. . ****
126. spacer 1.4|779881|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to MN830258 (Lactobacillus phage JNU_P9, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
cagcttggatttaatagcagaccatgtttt CRISPR spacer taaagccgatttaatatcagaccatgcttt Protospacer .*. . ********* *********.***
127. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033508 (Mesorhizobium jarvisii strain ATCC 700743 plasmid pMJ700743a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattacctcaagcatgcctttccggttcaa Protospacer ***** *************** ... *
128. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP033369 (Mesorhizobium loti strain SU343 plasmid pMLSU343a, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattacctcaagcatgcctttccggttcaa Protospacer ***** *************** ... *
129. spacer 1.3|779815|30|LS483415|CRT,PILER-CR matches to NZ_CP016080 (Mesorhizobium loti NZP2037 plasmid pML2037, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
gattagctcaagcatgcctttataaatgtt CRISPR spacer gattacctcaagcatgcctttccggttcaa Protospacer ***** *************** ... *
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
37915 : 50350
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483415|37915:50350|DBSCAN-SWA GATGTCCTCCTATTTTCCAGTCGCTCCCTTGTCGGATTTGGTATCTTATATGAATAAACGTATTTTTGTTGAGAAAAAGGCTGACTTTGGCATTAAATCGGCTAGCCTTGTGAAAGAGTTGACACATAATCTACAACTGACTTCTTTGAAGGACTTGCGTATTGTGCAGGTTTATGATGTCTTCAATTTGGCTGAGGATTTACTGGCGCGTGCTGAGAAGCATATTTTCTCTGAGCAGGTGACAGACCGTCTTTTGACGGAAGCTGAAATCACTGCGGAGCTTGATAAGGTTGCCTTCTTTGCCATTGAGGCGCTTCCTGGTCAATTTGACCAACGTGCTGCTAGTTCGCAAGAAGCTTTGCTATTATTTGGAAGTGACAGTCAGGTTAAGGTCAATACAGCTGAGCTATACTTGATCAATAAGGATATTGCAGAAGCAGAGCTTGAAGCCGTTAAGAACTATCTTTTGAACCCTGTTGATTCGCGTTTCAAGGACATTACTTTGCCGCTTGAAGAGCAGGCTTTCTCTGTATCTGATAAGACGATCCCTAATCTTGATTTCTTTGAAAATTATAAAGCTGACGATTTTGCGGCCTATAAGGCAGAGCAGGGCTTGGCTATGGAGGTCGATGACCTTCTCTTCATCCAAGATTATTTCAAATCAATCGGACGTGTGCCAACTGAGACTGAGTTGAAAGTTTTGGATACTTACTGGTCAGACCACTGCCGTCACACAACCTTTGAAACTGAATTGAAGAACATTGATTTTTCAGCTTCTAAATTCCAAAAACAATTGCAGACAACTTATGATAAATATATCGCCATGCGTGATGAGCTTGGTCGTTCTGAAAAGCCACAAACACTTATGGATATGGCGACTATTTTTGGTCGTTATGAGCGTGCCAACGGTCGTCTGGACGATATGGAAGTCTCAGATGAAATCAATGCCTGCTCAGTTGAGATTGAAGTAGATGTTGATGGTGTGAAAGAGCCTTGGCTCCTCATGTTTAAGAATGAGACTCACAATCACCCAACAGAAATTGAGCCATTCGGTGGAGCGGCGACTTGTATCGGTGGTGCTATTCGTGACCCATTGTCAGGGCGTTCATACGTTTATCAGGCTATGCGTATTTCAGGCGCAGGCGATATCACGACTCCGATTGCGGAAACACGTACTGGTAAATTGCCACAACAGGTTATTTCTAAGACTGCGGCGCACGGCTATTCTTCATATGGTAACCAAATTGGACTTGCGACAACTTATGTGCGTGAGTACTTCCACCCTGGCTTCGTAGCCAAACGCATGGAGCTTGGAGCTGTGGTCGGAGCGGCACCTAAGGAAAATGTGGTTCGTGAAAAACCAGAAGCAGGTGATGTGGTAATCTTGCTTGGTGGTAAAACAGGGCGTGACGGTGTCGGCGGTGCGACAGGTTCATCTAAGGTTCAAACGGTTGAGTCTGTGGAAACAGCTGGCGCAGAGGTACAAAAAGGGAATGCCATCGAAGAGCGTAAGATTCAACGTCTCTTCCGTGATGGTGAAGTGACTCGTCTCATCAAAAAATCAAACGACTTTGGTGCGGGTGGTGTCTGTGTTGCTATCGGTGAATTGGCTGACGGTCTTGAAATCGATTTGGACAAGGTCCCACTTAAATACCAAGGTCTTAATGGTACTGAAATTGCAATCTCAGAATCTCAAGAGCGTATGTCAGTCGTTGTTCGTCCAAGTGATGTGGATGCCTTCATCGCAGCTTGCAACAAGGAAAATATCGATGCCGTTGTAGTTGCGACAGTTACCGAGAAACCAAATCTTGTCATGACTTGGAATGGTGAAACCATCGTTGACTTGGAACGCCGTTTCCTTGATACCAACGGTGTCCGTGTCGTTGTTGATGTTAAATTCGTTGACAAGGACTTGACAGTTCCAGAAGCACGCACAACATCAGCAGAGACACTTGAAGCAGATACGCTTAAGGTCTTGTCTGATCTCAACCATGCTAGTCAAAAAGGTCTTCAAACTATCTTTGACTCATCTGTTGGTCGCTCAACCGTTAACCACCCAATCGGTGGTCGTTACCAAATCACACCGACAGAAAGTTCTGTTCAAAAATTGCCAGTTCAACATGGTGTGACAAGAACAGCATCTGTTATGGCTCAAGGTTACAATCCTTATATTGCTGAGTGGTCACCTTACCACGGTGCTGCCTATGCTGTCATTGAAGCGACAGCTCGCTTGGTAGCAACGGGTGCTGACTGGTCTCGTGCACGTTTCTCTTACCAAGAGTACTTTGAGCGTATAGATAAACAGGCAGAGCGTTTTGGTCAGCCAGTATCAGCTCTTCTTGGTTCTATTGAGGCTCAGATTCAACTTGGTTTGCCATCAATCGGCGGTAAGGACTCTATGTCTGGTACTTTCGAAGACTTGACAGTACCACCAACCTTGGTAGCTTTCGGCGTGACAACAGCGGACAGCCGCAAGGTTCTCTCTCCTGAGTTTAAAGCGGCTGGCGAAAACATTTACTATATCCCAGGTCAAGCTATTTCAGAAGATATTGATTTTGACCTTATCAAGGCTAACTTTAGCCAGTTTGAAGCTATTCAAGCTCAACATAAGATTACAGCTGCCTCAGCCGCTAAATACGGTGGTGTCCTAGAAAGTCTTGCTCTCATGACTTTTGGTAACCGTATCGGTGCTTCTGTTGAAATTGCAGAGCTTGACAGCAGCTTGACAGCTCAACTCGGAGGTTTTGTCTTTACATCAGCTGAGGAAATTGCTGACGCGGTGAAAATCGGTCAAACTCAGGCAGACTTTACAGTCACTGTCAATGGAAATGACCTTGCTGGCGCTAGCCTTCTAGCAGCCTTCGAAGGCAAATTGGAAGAGGTTTACCCAACAGAATTCGAACAGGCAGACGCTCTTGAAGAAGTTCCTGCTGTGGTATCAGATACTGTTATCAAGGCTAAGGAAACAATTGAAAAACCAGTGGTTTACATTCCTGTCTTCCCTGGTACCAACTCAGAATATGATTCAGCTAAGGCCTTTGAACAGGTTGGAGCTAGTGTCAACTTGGTACCATTTGTAACCTTGAATGAGGTTGCTATTGCTGAGTCAGTTGACACTATGGTTGCTAATATTGCTAAGGCAAATATCATCTTCTTTGCTGGAGGCTTCTCAGCAGCGGATGAACCAGATGGGTCTGCTAAGTTTATCGTCAATATCTTGCTTAACGAGAAGGTCCGCGCAGCTATTGACAGCTTCATCGAAAAAGGTGGCCTTATCATCGGTATCTGTAATGGTTTCCAAGCCCTTGTTAAATCAGGTCTTCTTCCATACGGAAACTTCGAAGAAGCTGGTGAGACAAGTCCAACTCTCTTCTATAACGATGCCAACCAACACGTTGCCAAGATGGTTGAGACTCGTATCGCAAATACCAACTCACCTTGGTTGGCAGGAGTTGAGGTCGGCGATATTCATGCCATCCCAGTTTCACACGGTGAAGGTAAATTTGTTGTCAGCGCTTCTGAATTTGCAGAGCTAAGAGACAATGGTCAAATCTGGAGCCAATATGTGGACTTTGACGGACAACCATCTATGGATTCTAAATACAATCCAAACGGCTCTGTCAATGCCATCGAAGGGATTACCAGCAAGAATGGTCAAATCATCGGTAAGATGGGACACTCAGAACGCTGGGAAGACGGACTCTTCCAAAATATTCCTGGTAACAAAGACCAAACCTTGTTTGCTAGTGCAGTAAAATATTTTACAGGAAAATAATTTTTTCAAATTTTTTCATAAAACAGATAAGGAAACAAGAGCGAAGCGAGCTTAACTGTATCTTTCTGTCGTAGTGGTATTTGGGAGCCGTTGAGGCTAAGACTCAATGATTAGCTTGAAAATAGCTTGATAGATTTTCTATTTTGATGTTGGCATTGGTGACGATAGATCCAAAATTGAGAAAATCATCAAAGCTACTTAAGAAGAGATACAAAAAGAATTAGGAAAAAAGAATGACATACGAAGTAAAATCTCTAAATGAAGAATGTGGAGTCTTTGGTATCTGGGGGCATCCTCAGGCAGCTCAAGTCACTTACTTTGGGCTTCATAGCCTTCAACATCGCGGTCAAGAAGGAGCTGGTATTGTTTCAAATGACAATGGGAAACTCTATGGTTATCGAAATGTTGGGCTCCTTTCTGAAGTTTTTAAGAATCAATCTGAATTAGATAATTTAACTGGGAATGCGGCTATTGGACATGTTCGGTATGCTACTGCAGGTTCTGCAGATATTCGCAATATTCAGCCTTTTCTTTATAAATTTCATGACGGGCAATTTGCTTTATGCCATAATGGTAATTTGACAAATGCTATTTCCTTAAGGAAAGAATTAGAAAAGCAAGGTGCAATTTTCAATGCCTCCTCAGATACTGAAATTTTGATGCACTTGATTCGTCGAAGCCATAACTCAAGTTTCATGGGAAAGGTAAAAGAAGCTCTAAATACAGTAAAGGGTGGCTTTGCCTATCTACTGATGACAGAAAATAAACTCATTGCTGCTCTTGACCCTAATGCCTTTCGTCCTTTGTCAATTGGACAAATGCAAAATGGTGCCTGGGTTATTTCCAGTGAGACCTGTGCTTTTGAGGTGGTAGGCGCAAAATGGGTTAGAGATGTTGAACCTGGCGAAGTTATTCTTATAGACGATCGTGGTATTCAATGTGATTGTTATACTGATGAAACGCAACTGGCAATTTGTTCGATGGAATATGTCTATTTTGCAAGGCCGGATTCAACTATACATGGTGTTAATGTTCATACGGCTCGAAAAAATATGGGAAAGCGTCTTGCACAAGAATTTAAACAGGATGCTGATATTGTAATTGATGTCCCAAATTCGTCCTTATCGGCTGCTATGGGCTTTGCTGAAGAATCCGGATTACCAAATGAGATGGGTCTTGTAAAAAATCAGTATACGCAGCGAACCTTTATTCAACCGACACAAGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483415|37915:50350|45332_46880_+|SQG95971.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKSGIIDFAKELKNLGWDIISTGGTKVALDNAGVETIAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPNIHGGLLARRDVDSHLQAAKDNNIELIDLVVVNLYPFKETILRPDVTYDLAVENIDIGGPSMLRSAAKNHASVTVVVDPADYATVLGELADAGQTTLETRQRLAAKVFRHTAAYDALIAEYFTAQVGEAKPEKLTITYDLKQAMRYGENPQQDADFYQKALPTDYSIASAKQLNGKELSFNNIRDVDAAIRIIRDFKDRPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDYAYEADPVSIFGGIVVLNREVDAATAKKMHPIFLEIIIAPSYSEEALAILTNKKKNLRILELPFDAQAASEVEAEYTGVVGGLLVQNQDVVAENPSDWQVVTDRQPTEQEATALEFAWKAIKYVKSNGIIITNDHMTLGLGAGQTNRVGSVKIAIEQAKDHLDGAVLASDAFFPFADNIEEVAAAGVKAIIQPGGSVRDQDSIDAANKHGLTMIFTGVRHFRH >LS483415|37915:50350|37915_41689_+|SQG95967.1|DBSCAN-SWA MSSYFPVAPLSDLVSYMNKRIFVEKKADFGIKSASLVKELTHNLQLTSLKDLRIVQVYDVFNLAEDLLARAEKHIFSEQVTDRLLTEAEITAELDKVAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLFGSDSQVKVNTAELYLINKDIAEAELEAVKNYLLNPVDSRFKDITLPLEEQAFSVSDKTIPNLDFFENYKADDFAAYKAEQGLAMEVDDLLFIQDYFKSIGRVPTETELKVLDTYWSDHCRHTTFETELKNIDFSASKFQKQLQTTYDKYIAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLDDMEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGAGDITTPIAETRTGKLPQQVISKTAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPEAGDVVILLGGKTGRDGVGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRDGEVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELADGLEIDLDKVPLKYQGLNGTEIAISESQERMSVVVRPSDVDAFIAACNKENIDAVVVATVTEKPNLVMTWNGETIVDLERRFLDTNGVRVVVDVKFVDKDLTVPEARTTSAETLEADTLKVLSDLNHASQKGLQTIFDSSVGRSTVNHPIGGRYQITPTESSVQKLPVQHGVTRTASVMAQGYNPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGADWSRARFSYQEYFERIDKQAERFGQPVSALLGSIEAQIQLGLPSIGGKDSMSGTFEDLTVPPTLVAFGVTTADSRKVLSPEFKAAGENIYYIPGQAISEDIDFDLIKANFSQFEAIQAQHKITAASAAKYGGVLESLALMTFGNRIGASVEIAELDSSLTAQLGGFVFTSAEEIADAVKIGQTQADFTVTVNGNDLAGASLLAAFEGKLEEVYPTEFEQADALEEVPAVVSDTVIKAKETIEKPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEQVGASVNLVPFVTLNEVAIAESVDTMVANIAKANIIFFAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDSFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGNFEEAGETSPTLFYNDANQHVAKMVETRIANTNSPWLAGVEVGDIHAIPVSHGEGKFVVSASEFAELRDNGQIWSQYVDFDGQPSMDSKYNPNGSVNAIEGITSKNGQIIGKMGHSERWEDGLFQNIPGNKDQTLFASAVKYFTGK >LS483415|37915:50350|49858_50350_+|SQG95974.1|DBSCAN-SWA MKTPIISIIMGSKSDWATMQKTAEVLDNFGIAYEKKVVSAHRTPDLMFKYAEEARGRGIKIIIAGAGGAAHLPGIVAAKTTLPVIGVPVKSRALSGLDSLYSIVQMPGGVPVATMAIGEAGATNAALTALRILSIEDQNLADALAHFHEEQGKIAEESSGELI >LS483415|37915:50350|43404_44427_+|SQG95969.1|DBSCAN-SWA MSEKNAYAKSGVDVEAGYEVVERIKKHVARTERAGVMGVLGGFGGMFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIKYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYIATGKNNPVKLEEVVSGVAEGCVQAGVALIGGETAEMPGMYGEGDYDLAGFAVGVAEKSQIIDGSKVKEGDILLGLASSGIHSNGYSLVRRVFADYTGKELLPELEGKQLKDVLLEPTRIYVKAALPLIKEELVNGIGHITGGGFIENVPRMFADDLAAEIDEDKVPVLPIFKALEKYGDIKHEEMFEIFNMGVGLMLAVSPENVNRVKDLLDEPVYEIGRIIKKADDSVVIK >LS483415|37915:50350|48224_49580_+|SQG95973.1|DBSCAN-SWA MFQLLIINTLYQKANVYDIISNYNTKEVDVLKLLVVGSGGREHAIAKKLLASKGVDQVFVAPGNDGMTLDGLDLVNIVVSEHSRLIAFAKENEISWAFIGPDDALAAGIVDDFNSAGLRAFGPTKAAAELEWSKDFAKEIMVKYNVPTAAYGTFSDFEKAKAYIEEQGAPIVVKADGLALGKGVVVAETVEQAVEAAQEMLLDNKFGDSGARVVIEESLDGEEFSLFAFVNGDKFYIMPTAQDHKRAFDGDKGPNTGGMGAYAPVPHLPQSVVDTAVETIVRPVLEGMIAEGRPYLGVLYAGLILTADGPKVIEFNSRFGDPETQIILPRLTSDFAQNIDDIMMGIEPYITWQNDGVTLGVVVASEGYPLDYEKGVPLPEKTDGDIITYYAGAKFAENSELLLSNGGRVYMLVTTEDSVKAGQDKIYTQLAQQDTTGLFYRNDIGSKAIRE >LS483415|37915:50350|46937_48062_-|SQG95972.1|DBSCAN-SWA MKKFHRFLVSGVILLGFNGLVPTMPSTLISQQENLVHAAVLGDNYPSKWKKGNGIDSWNMYIRQCTSFAAFRLSSANGFQLPKGYGNACTWGHIAKNQGYPVNKTPSIGAIAWFDKNAYQSNAAYGHVAWVADIRGDTVTIEEYNYNAGQGPERYHKRQIPKSQVSGYIHFKDLSSQTSHSYPRQLKHISQASFDPSGTYHFTTRLPVKGQTSIDSPDLAYYEAGQSVYYDKVVTAGGYTWLSYLSFSGNRRYIPIKEPAQSVVQNDNTKPSIKVGDTVTFPGVFRVDQLVNNLIVNKELAGGDPTPLNWIDPTPLDETDNQGKVLGDQILRVGEYFTVTGSYKVLKIDQPSNGIYVQIGSRGTWVNADKANKL >LS483415|37915:50350|41922_43377_+|SQG95968.1|DBSCAN-SWA MTYEVKSLNEECGVFGIWGHPQAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIVSNDNGKLYGYRNVGLLSEVFKNQSELDNLTGNAAIGHVRYATAGSADIRNIQPFLYKFHDGQFALCHNGNLTNAISLRKELEKQGAIFNASSDTEILMHLIRRSHNSSFMGKVKEALNTVKGGFAYLLMTENKLIAALDPNAFRPLSIGQMQNGAWVISSETCAFEVVGAKWVRDVEPGEVILIDDRGIQCDCYTDETQLAICSMEYVYFARPDSTIHGVNVHTARKNMGKRLAQEFKQDADIVIDVPNSSLSAAMGFAEESGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMIDDSIVRGTTSRRIVGLLREAGASEVHVAIASPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHAVDEVCDIIGADSLTYLSLDGLIESIGLETKAPNGGLCVAYFDGHYPTPLYDYEEEYLRSLEEKTSFYIQKVK >LS483415|37915:50350|44594_45149_+|SQG95970.1|DBSCAN-SWA MKIAVFASGNGSNFQVIAEQFPVSFVFSDHRDAYVLERAQNLAIPSFAFELKEFENKAAYEQAIVDLLDKHEIDLVCLAGYMKIVGETLLLAYEGRIINIHPAYLPEFPGAHGIEDAWEAGVDQSGVTIHWVDSGVDTGQVIQQVRVPRLADDSLESFETRIHETEYQLYPAVLDSLGVERKVI |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
335493 : 390649
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483415|335493:390649|DBSCAN-SWA TATGATTCCTGTTGTTATTGAACAAACTAGCCGTGGAGAACGTTCTTATGACATTTATTCACGTTTATTAAAAGACCGTATTATCATGTTAACAGGGCCTGTCGAAGACAACATGCCCAACTCTGTCATAGCGCAGCTCTTATTCCTTGACGCGCAAGACAACACTAAAGATATCTACCTATATGTCAACACACCAGGTGGCTCTGTCTCAGCAGGCTTGGCTATTGTCGATACCATGAACTTTATCAAGGCCGATGTGCAAACTATTGTCATGGGTATGGCAGCTTCTATGGGGACAGTCATTGCTTCATCAGGAACAAAAGGCAAACGCTTTATGTTACCAAATGCAGAGTATATGATCCACCAGCCAATGGGTGGCACAGGCGGTGGCACGCAACAAACGGATATGGCTATCGCAGCAGAACATCTCTTAAAAACACGTCACCGTTTAGAAAAAATCTTAGCGCAAAATGCTGGAAAAACGATTAAACAAATCCATAAAGATGCTGAGCGTGATTATTGGATGAGTGCTGAAGAAACCTTGGCTTACGGTTTCATTGATGAAATCCTGGAAAATAACGAACTAAAATAAAGAGGATCTCTGCAAAAGTATTCTAGAAACTTCTAGGATGCTTTTTCTCTTAGAAAGGAAAATAATGATACAGCCTACTGCATTAAAACAGCTTCAAGAGTTAAAACGTCAGTTCAGATCCCTTTGCAACCAATTATGAGATAGTTTGAGGATGATCCTTAGCAGCTGTGTGCAAGAAGTTATGACGATTTCATAAAGGATGACCTAGCCAGTCTTTCTTCGTCTCTTTTACTTAAAGTGTGGTATAATCAGATTATGCTAGCCAAAATTAAAAAATGCATTGCCATTAAAGGTGTTGTAGATCGGCTTATCCTAGATCTCATAACAATGCTGTAGTACCGCCCTTACCTTGCTACTAAAGACGCTGTTGAAGCACAAATTGACTTGCAAAGGATCTTGACTGATAGGTATATGTCCGGTGGAATCGCCAAAGCAGCAAAAAGACCAAGACCCTTATTTGGTCTCTACCAAAATATAATAGAAAAGGATTTAGAATGTTTCAAAAACAAGAACGTATTGGACTCGTCGTTTACCTGTATTATAACCGAGATGCCAGAAAGTTATCAAAATTTGGTGATTTATATTACCATTCCAAGCGCTCTCGTTACCTCATTATTTATATTAATAAAAATGATTTAGACACAAAATTAGAAGAAATGAGACGTTTGAAATGTGTTAAAGACATTAGACCATCAGCTTTTGATGATATTGACCGCCAATTTGTAGGTAACCTTCATCGCGACGAAACAAACAACCATCAAAAGGGTTAACAACCCCCTAGTTACTGATTAGCGTTTCAGATTTAGTTAGCTTATTCAAGTAAGAAGGTTTTGACAGATGCTCACACTACTTCAAGACAATGAGACAACTAGAGCATTAGTGAATAACTGAGTTGACTGTCACTTCTTTAATAAGAACGGATAGGATTGGTCCTAAAATAGAGCACTGCAAAGATATGCCAGTGCTTTTTAGCTCATTTTTTGATAAAATAGAACTACTAAAAAGTGAAGGAAATAAGATGATCACAGGAAAACTCATAACCGTTGAAGGTCCAGATGGCGCAGGGAAAACGACTGTTTTAGAGCAACTCATTCCACTGTTAAAACAAAAAGTGGCTCAGGATATCTTGACAACAAGAGAGCCTGGAGGTGTTGCCATTTCAGAACACATTAGAGAACTTATTTTAGACATCAACCATACTGCTATGGACCCTAAAACAGAACTCTTACTTTATATTGCGGCTCGAAGGCAGCATTTGGTGGAAAAGGTACTACCAGCTCTTGAAGCAGGCCAGTTGGTTTTTATTGATCGTTTCATCGATAGTTCAGTAGCTTATCAAGGTGCGGGACGCGGTTTGATCAAAGCAGACATTCAGTGGCTCAACGAGTTCGCAACAGATGGTTTAGAGCCTGACTTGACCCTTTATTTTGATGTTCCTTCTGAAATTGGTTTAGCACGGATTAACGCGAACCAACAAAGAGAAGTCAATCGTTTAGATTTGGAAACAATAGAGATACATCAACGAGTACGAAAAGGATACCTAGCCTTAGCTAAGGAGCATCCAAAACGTATTGTCACAATTGATGCGACTAAACCATTGAAAGAAGTTGTCTCTGTAGCTTTGGAACATGTCTTAGCCTTGCTTTTAGCCTAGGATAAGGGAGGGTAGGAATGGATTTAGCGCAAAAAGCTCCTAACGTTTATCAAGCATTTCAGACGATTTTAAAGAAAGACCGTCTGAATCATGCTTATCTTTTTTCGGGTGATTTTGCTAATGAAGAAATGGCTCTTTTTTTAGCTAAGGTCATCTTTTGTGAACAGAAAAAGGATCAGACGCCCTGCGGGCATTGTCGCTCTTGTCAATTGATTGAACAAGGAGATTTTGCCGATGTGACGGTATTGGAACCAACAGGGCAAGTGATTAAAACGGATGTGGTCAAAGAAATGATGGCTAACTTTTCTCAGACAGGATATGAAGGAAAACGACAAGTTTTTATTATCAAAGATTGTGAAAAAATGCATGTAAATGCCGCTAATAGCTTGCTAAAATACATTGAGGAGCCTCAGGGAGAAGCTTACATGTTTTTGCTGACCAATGATGATAACAAAGTGCTTCCGACCATTAAAAGTCGGACACAGGTTTTTCAGTTTCCTAAAAACGAAGCCTATCTCTTCCAGTTAGCCCAAGAGCGAGGTTTATTAAGAAGTCAAGCTGATTTAGTGGCCAAACTGGCTAAAAATGTTGACCAATTAGAAGATTTGGCACAAAATAGTCATTTTTTAGAAGTGATGGCTCAGACTGAACGTTTTGTTTCAATCTGGTTAAAAGATCAGCTGCAAGCTTATTTAGCCTTGAATCACCTGGTACTGTTGGCAACCAAAAAAGAGGAGCAAGAGTTAATTTTGACCCTTTTGACACTACTCTTGGCAAGAGAGCAATCACAAACGCCCTTTAAACAATTGGAGGCTGTCTATCAGGCTAGGCTCATGTGGCAGAGCAATGTCAATTTTCAAAACACATTAGAATATATGGTGATGTCAGAATAAGTGCAATTGGAATTCGTTATGGGGAAACGAAGCTTGTCAAAAGACTTGCCCGTAGCGACCAAAGTAGCGGCGCATAGGGGCAAAAAAGCTTTTGAAGAAAATACTGCCCTTGCAACAGATTTGATGAAAGAAGTATCACGATTAATGATACAAAATCAACTTGAAATGACGTTTATTAATAGTGTCTTTCCCTTAGATCAGCATGTTGTCCTAATTCCCTTTTCAGCAGAAGAGCACATGGATTTTTACAACTGTTAAAAGATTTAGCGGCCGATTTTAGGTCAAGAAGTGAGCTGCCCCAGATTAACAGCCAAGAAGAAGCCAAGATTTATGGGCGCTTAGGACCGTGTGGCAGACCACTGTGCTGCTTTCGTTTTTGGGAAAATTTCTGACAGTATCTATTAAAATACTAAAAAATCAAAGGTTATCATTGACTTTGGGTAAAGCAACAAGCCCTTATGGCCGTTTGCTTTGCTGTCTCTATGATGAAGGTGGCTTTTACCAATAAAGCAAGAAAAAATTCCCTGAATATGGTACCATAGTAGAGACAAGTGATGGCCCTGCAACAGTAGCAGCCGTTGATATATTTACAGATCCCATTAAGGTGCGGTTAAAAGACCAGTTGACCTTAGTCACTTATGCTTTAGAGGAGGTTAAAGTAGGTGAATAAAAAAGAATTATTCGATGCTTTTGATGGATTTTCCCAAAATTTAATGGTTACTTTAGCTGAAATTGAAGCCATGAAAAAACAAGTCCAATCACTAGTAGAAGAAAACACGATTCTTCGCCTAGAAAATACAAAACTACGGGAACGTTTGAGTCACCTAGAACATGAAACGGTAGCTAAAAATCCTTCCAAACAAAGGAAGGATCACTTAGAGGGAATTTATGATGAAGGGTTTCATATCTGCAATTTTTTCTATGGACAACGTCGTGAAAATGATGAAGAATGTATGTTTTGCAGAGAATTATTAGATAGAAAGTAAGGGCATGCAGGTTCAAAAAAGTTTTAAAGACAAAAAAACAAGCGGAACCTTGTATTTGGTTCCAACCCCAATTGGCAATCTGCAGGACATGACCTTTAGAGCAGTGGCAACGTTAAAAGAGGTTGATTTTATTTGTGCAGAAGACACAAGAAACACAGGTCTTTTGCTAAAACACTTTGACATTGCTACCAAGCAAATCAGCTTTCATGAGCACAACTCCTATGAGAAGATTCCTGATTTAATTGATTTATTAATATCAGGACGGTCACTAGCTCAGGTATCTGATGCAGGAATGCCATCGATTTCTGATCCTGGGCATGATTTGGTCAAGGCTGCTATTGATAGTGATATCGCAGTCGTTGCTTTACCAGGTGCCTCAGCAGGGATTACAGCTTTGATTGCTAGTGGACTAGCTCCTCAACCCCATGTTTTTTATGGGTTTTTACCCAGAAAAGCAGGGCAACAAAAGGCTTTCTTTGAGGACAAACACCATTACACAGAAACACAAATGTTTTATGAATCACCCTATCGCATCAAAGATACCCTGACCAATATGTTGGCTTGTTATGGTGATCGTCAAGTGGTGCTTGTTAGAGAATTAACCAAGCTTTTTGAGGAGTACCAACGGGGGTTGATTTCAGAAATCTTGTCCTACCTTGAGGAAACACCCCTAAAAGGGGAGTGTCTGCTGATTGTGGCTGGAGCCCAAGTAGACAGTGAGATTGAGCTGACAGCTGATGTTGACTTAGTGTCTCTAGTGCAAAAAGAAATCCAAGCAGGAGCCAAGCCAAATCAGGCTATTAAAACAATTGCTAAAGCTTACCAGGTAAATCGCCAAGAGCTTTACCAACAATTTCATGACTTATAAGTCATCG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58 | Streptococcus_phage(33.33%) | protease,transposase,bacteriocin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
513315 : 525559
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483415|513315:525559|DBSCAN-SWA CATGGCACTAATAGAAATGTCTGGTGTTACTAAAAAATACCGCCGCTCAACGACCGCCCTCAGAGACGTCAATGTTTCTGTTAACCAAGGTGAGTTTGTTTATCTCGTAGGCCCATCAGGTGCTGGTAAATCAACTTTTATCAAACTCCTTTACCGTGAAGAACAACTGACAACTGGTAAGCTATATGTGGGTGAATTCAATTTAACTAAGCTAAAAGCACGTGATGTTCCGATTCTTCGTCGTCACATCGGAGTAGTTTTTCAAGATTACAAACTGCTACCAAGAAAAACAGTCTTTGAAAATGTAGCTTACGCCATGGAAGTTATTGGTGAAAAGCGCCGCCACATTAAAAAACGCGTGCCAGAGGTACTCGATTTAGTTGGCTTGAAACATAAGATGCGTTCTTTTCCAAGTCAGCTATCAGGAGGGGAGCAGCAACGTGTGGCCATTGCGCGTGCGATTGTTAACAACCCTAAATTATTGATTGCAGATGAACCGACAGGGAATTTAGATCCTGAGATTTCATGGGAAATTATGCAGTTACTTGAACGTATTAATGTTCAGGGAACAACTATCTTAATGGCGACACACAACAGTCATATTGTGAATACATTTCGTCATCGTGTTGTTGCTATTGAAGATGGTCGCATAGTACGTGATGAAGAAAAAGGAGATTATGGTTACGATGATTAGATACTTTTTCCGTCATATTTGGGAATCCATTAAAAATCTTAAACGCAACTTTTGGATGACATTTGCTTCAGTTAGTATGGTGGCTGTTACATTGACTTTAGTTGGTGTTTTTGCGGCGACATTGTTGAATATACAGCGTGTTGCTTCGGGTGTTGAAAATAATGTCCATATCAATACCTACTTACAAGTTGATTCAACTGATGCTGCAAAAGTTATTCAAAATACTGCCGGTGAACCTGTTAATAACGATAACTACCACAGTGTTTACGACAAAATTGCTCAGATAAAAGGTGTCAAAAAGATTACATTTTCTAGCAAGGATGAACAATTGAAAAAATTGCAAGAAACCTTAGGTGATGTTTGGAATATGTATGACCAAGACACTAATCCGCTCCAAGATATCTATCTTATTGAGACCCAGACGCCTAAACAAGTTAAGGCGATCACTAAAAAGATCAGAACGATTGAAGGCGTAGAAGCCGCAGATTATGGAGGGATTAACTCCGATAAACTATTTAAGTTTTCAACATTAATTCAAACTTGGGGGCTGATCGGAACAGCAATGCTATTATTTGTAGCTGTCTTTCTCATTTCAAACACTATTCGTATGACTATTATGTCTCGTAAACGCGACATTGAAATTATGCGGTTAGTTGGTGCTAAAAATTCTTATATTCGAGGGCCTTTCTTTTTTGAAGGGGCTTGGGTTGGCTTGTTAGGAGCTGTTTTACCATCTCTTCTGATTTATTATGGATATGATCTTGTTTATAAGCATTTTGCACAAGAATTACAACGTAATAATCTCTCGATGTATCCGCTTGATCCTTATGTATATTACCTGATTGGTGCTTTGTTTGTCATAGGTATTATGATTGGTTCGCTTGGTTCAGTGCTTTCTATGAGACGTTATTTAAAATTCTAAAAAAAGCGCTGCTGACGAAACGTAGCGACCCCCAAAAGTTGGACCTCTTATGTTATTCCAAGGACTTCGTTTTGTATTGCACAGGACTGGTCCTTTTCATTTTGTTTTGATTCATTTGTTTATTTGTAATAGGCAATATAGTTTAAAATAGCAGTTTCTAAGGTTTCAAGAGAAGAAAAGCACCCCAAAAGTTAGATGTTTGATGTATCTAACTTTTGGGGTGTCATTCAAAATTTAGTGGCTCTTTTTTAGTAAAATACTATGATTTCAGTTTTAGGATAACCTCAAACAGTATCTAAAATAGCTATGTCAATGAAAAAAGGGGTTAGCATTTTTTTCGTGACAAATGGTAGTAGAAGGACCATGCCCAGGATAAACTCGGTAATGATTAGGTAAGGTGAATAGTTCTTGGCGAATACCAGTAATGAGGTCCTCAAAGTTACTGGTAGGTAAGTCAGTACGACCGATAGTTTCACGAAATAGAGCATCGCCAGTAACGACTAATTCATCTGAGTGGAAAACAAATGAGACTCCTCCCCAAGAATGACCAGGTGTTGGTAAAACTGTGAATTCAAAACCATTTAGTTGATAGGGTTGCTTTAATTTAAAAAAGTTCTCTGCCGGTCTTGCTATAACATTAATGATATCATCATGACGGCCTAAGCCAGATAAATTATCATCTGGGGAAGATAGCCAAGCGGCTTCTTTTTCTGAAACATAAACAGGTGGATGATCAAAAGCATCTCTGACCAAATCTAAACTAAAAATATGATCATAGTGAGTATGCGTTAAGAGGATAGCCACTAAAGGTTTTTCAAAGGATTTAATTTTAGAAATGATTTCTTGGCCGTTACTTCCTGGATCAATGAGGATAACAGCTTGATCATTAACGAGGTAATAAGTATTTTCACCAGCAATGTGGTTTATTGTTTTATAGATTTTCATAAGGATAGTGTACCAAAAAATCAAGGCTTTGTTAAAAAAAGAGTGGCGGAAAATAAATGGCAATTAGTTTCAGAAAATATGAGATCTCACAGCAATTTCTTGACACCGTTTTCATAAAGGTGTATCATAAAAGTAATCAATAAGCCAAGCCTAAAGCTGAACTTAGTTTAAGAACACTGACTTTTTGAGAGCAACCTAATCGGTTGACTAAAAAATATGAGGTGGAAGATATGTCAAAAGTTGCTATTGTTACTGGTGCTGGTCAAGGAATTGGATTTGCTATCGCGAAACGTCTTCATGCAGACGGCTTTAAAATAGGCATTTTAGACTATAATGAAGAGACTGCTCAGGCTGCGGTTGATAAACTATCACCTGAGGATGCTGTTGCAGTTGTAGCAGATGTTTCAAAACGTGACCAAGTTTTTGATGCTTTCCAAAAAGTTGTAGATACTTTTGGTGATTTGAATGTTGTTGTTAACAATGCAGGTGTTGCCCCAACAACCCCTCTTGACACGATTACTGAAGAGCAGTTTGAAAAGGCTTTTGCAATCAATGTCGGAGGAACGATTTGGGGAAGCCAAGCAGCTCAAAAACATTTTAGAGAATTAGGTCATGGCGGAAAAATTATAAATGCAACATCACAAGCAGGGTGTGAAGGGAATCCTAATTTGACTGTTTATGGTGGTACAAAATTTGCAGTTCGTGGTATTACACAGACTTTGGCAAAGGATTTGGCATCAGAAGGAATCACAGTCAATGCTTACGCACCAGGTATTGTTAAAACACCTATGATGTTTGCTATTGCCCATGAAGTTGGTAAAAATGCAGGCAAAGATGATGAATGGGGTATGGAGCAATTTGCAAAAGATATCACTTTGAAACGCTTGTCTGAACCAGAAGATGTTGCTAATGCAGTAGGCTTCCTAGCGGGAGATGATTCAAATTATATCACTGGACAAACAATAGTTGTCGATGGTGGTATGGTATTCCATTAAAAATGATTAATACTGACACTGTGAGTGAAACTCACAGTGTTTTTTATACTTCTTAAAAAATTATCCTATCTTGGTTATTGGAGTGATGGCACCTTTGAGGTATAGTCATGTTTTGTTTTATAGATATAGCGTGCTATAATAGACTTACTATGACCCAGAAAAAACTTAGAAAATATGCAGTAGTGGACTTGGAGGCTACTGGAGCAGGTCCCAATGCTTCTATTATTCAGGTTGGGATTGTTATTATCCAAGGAAATAAAATTATTGATAGTTATGAAACAGATGTTAATCCTCATGAATCTTTAGATGAGCATATTGTTCATTTGACAGGTATTACGGATAAGCAGTTGGCTAAAGCTCCGGATTTTGGTCAAGTGGCGCATCACATTTATCAATTGATTGAAGATTGTATTTTTGTTGCCCACAATGTAAAGTTCGATGCAAATTTATTGGCAGAAGCTCTTTTTTTGGAAGGATATGAGTTAACAATACCACGTGTTGATACTGTTGAATTAGCCCAACTATTTTTCCCTCGCTTTGAAAAGTATAACCTTGGTCACCTATCTAGGCAGCTCAATATTGATTTGGCAGAAGCTCATACTGCTATTGCAGATGCAAGAGCTACAGCTATACTGTTTTTAAGACTTTTACAAAAAATTGAGAGCCTTCCAATTGAGTGCTTAGAAAGCTTATTAGTCTATTCAGATAGCCTGCTATTTGAAACAGCAATGGTCATTCAAGAAGGATTAGCCAAAGCCAAACCTTATGATCCCAACAAATACATTAAAATCAGACAGATTCTCTTACCAAAGGGCCCAAAAGCTCCCAAGCCTTATCAAATATCAAAAAGCTTCCCTATTAATATGGCACTATTAGGTCTGGAAGAAAGGCCTAAACAGACTCAATTTGCTCAGTTAATTGACGAAGATTACCATCAGGGAGTAGCTAGTTTTATTGAAGCTCAGACAGGTATTGGAAAAACCTACGGCTACCTGCTACCCCTTTTGGCAAAAGAAGATCAAAACCAAATCATTGTCAGTGTGCCAACCAAACTTCTTCAAGACCAATTAATGGCTGGTGAAGTAGCTGCTATTCAAGAACAATTTCACATCGCCTGCCATAGTTTAAAAGGACCCGCCAATTACCTAAAGCTAGATAGCTTTGCAGATAGTTTGGACCAAAATGACCAGAACCGTTTGGTGAATCGTTATAAAATGCAATTATTGGTTTGGCTCTTAGAAACTAAGACAGGAGACCTTGACGAAATCAAACAAAAGCAGCGCTTTGCCGCTTATTTTGAGCAGCTTAAGCACGATGGAGACATTAAGCAGTCTTCTGAATTTTACAATTATGATTTTTGGAGAGTTAATTATGAAAAAGCCAAAACAGCCCGTCTCCTGATTACCAACCATGCTTATTTTTTACACCGTGTTCAAGATGACAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483415|513315:525559|513315_514008_+|SQG96425.1|DBSCAN-SWA MALIEMSGVTKKYRRSTTALRDVNVSVNQGEFVYLVGPSGAGKSTFIKLLYREEQLTTGKLYVGEFNLTKLKARDVPILRRHIGVVFQDYKLLPRKTVFENVAYAMEVIGEKRRHIKKRVPEVLDLVGLKHKMRSFPSQLSGGEQQRVAIARAIVNNPKLLIADEPTGNLDPEISWEIMQLLERINVQGTTILMATHNSHIVNTFRHRVVAIEDGRIVRDEEKGDYGYDD >LS483415|513315:525559|518500_519478_+|SQG96430.1|DBSCAN-SWA MSSDYYQNKEHQLAHDWSRIAGYAKELTGADYQELQAFFATSDGDYWLSSEKQEEKRVTYLNSASKAFIHFQQLLPETVKTYFVSATLTISSEVTLADLLGFEEYLYHVIEKDKKQDQLVLVDQEAPIVTEVSDQIYVEAIAKRIESLKQEGYPILVLFNSKKHLLLVSDYLDQWQVPHLAQEKNGTAYNIKKRFDQGEQTILLGLGSFWEGVDFIQADRMITLIARLPFDNPEDFFVKKMSHYLLEKGKNPFRDYFLPMTILRLKQAIGRTMRRQNQKSVVIILDRRLLTKSYGQVILEGLGQEFLISQQNFHDCLVETDCFLI >LS483415|513315:525559|523673_524651_+|SQG96434.1|DBSCAN-SWA MKNPKMTVIGGGTGISIILKSLRNEAVDITAVVTVADDGGSSGELRNAMQLAPPGDLRNVLLAMSDMPKFYERVFQYRFNESDGALAGHPLGNLIIAGISEMQGSTYNAIQILTKFFHITGKIYPSSEQALTLHAVFKDGHEVAGESSIAKYQGMIDHVYVTNTYNDQKPQASRKVVEAILESDMIVLGPGSLFTSILPNLVIPEIKEALRQTKAEVVYICNIMTQYGETEQFSDADHVAVLNQHLGRDLIDTVLVNVAKVPQAYMNSNKFDEYLVQVDHDFAGLCRAAKRVISSYFLRLENGGAFHDGNLVVEELMNLVRIVKQ >LS483415|513315:525559|519812_521006_+|SQG96431.1|DBSCAN-SWA MPKLSKRVLEMKESVTLAAGARAKALKAQGRDVLNLTLGEPDFFTPKHIQDKAIESIQNGTASFYTNASGLPELKAAIATYLKNQYGYHLSPDQIVAGTGAKFILYAFFMAVLNPGDQVLIPTPYWVSYSDQVKMAEGQPIFVQGLEENQFKVTVDQLERARTSKTKVVLINSPSNPTGMIYGAEELRAIGEWAVHNDILILADDIYGSLVYNGNQFVPISTLSEAIRRQTITVNGVAKSYAMTGWRVGFAAGEPEIISAMSKIIGQTTSNLTTVSQYAAIEAFCGSQSSLEEMRLAFEERLNITYPLLCQVPGFEVVKPQGAFYFFPNVKKAMEMTGFSDVTSFANAILEEVGLAVVSGAGFGAPENVRLSYATDIETLKEAIRRLHVFMESNEIN >LS483415|513315:525559|515239_515875_-|SQG96427.1|DBSCAN-SWA MKIYKTINHIAGENTYYLVNDQAVILIDPGSNGQEIISKIKSFEKPLVAILLTHTHYDHIFSLDLVRDAFDHPPVYVSEKEAAWLSSPDDNLSGLGRHDDIINVIARPAENFFKLKQPYQLNGFEFTVLPTPGHSWGGVSFVFHSDELVVTGDALFRETIGRTDLPTSNFEDLITGIRQELFTLPNHYRVYPGHGPSTTICHEKNANPFFH >LS483415|513315:525559|522786_523677_+|SQG96433.1|DBSCAN-SWA MSDKHINLVIVTGMSGAGKTVAIQSFEDLGYFTIDNMPPALVPKFLELIEQTNENRRVALVVDMRSRLFFKEINSTLDSIESNPSIDFRILFLDATDGELVSRYKETRRSHPLAADGRVLDGIRLERELLSPLKSMSQHVVDTTKLTPRQLRKTISDQFSEGSNQASFRIEVMSFGFKYGLPLDADLVFDVRFLPNPYYQVELREKTGLDEDVFNYVMSHPESEVFYKHLLNLIVPILPAYQKEGKSVLTVAIGCTGGQHRSVAFAHCLAESLATDWSVNESHRDQNRRKETVNRS >LS483415|513315:525559|514000_514930_+|SQG96426.1|DBSCAN-SWA MIRYFFRHIWESIKNLKRNFWMTFASVSMVAVTLTLVGVFAATLLNIQRVASGVENNVHINTYLQVDSTDAAKVIQNTAGEPVNNDNYHSVYDKIAQIKGVKKITFSSKDEQLKKLQETLGDVWNMYDQDTNPLQDIYLIETQTPKQVKAITKKIRTIEGVEAADYGGINSDKLFKFSTLIQTWGLIGTAMLLFVAVFLISNTIRMTIMSRKRDIEIMRLVGAKNSYIRGPFFFEGAWVGLLGAVLPSLLIYYGYDLVYKHFAQELQRNNLSMYPLDPYVYYLIGALFVIGIMIGSLGSVLSMRRYLKF >LS483415|513315:525559|516105_516870_+|SQG96428.1|DBSCAN-SWA MSKVAIVTGAGQGIGFAIAKRLHADGFKIGILDYNEETAQAAVDKLSPEDAVAVVADVSKRDQVFDAFQKVVDTFGDLNVVVNNAGVAPTTPLDTITEEQFEKAFAINVGGTIWGSQAAQKHFRELGHGGKIINATSQAGCEGNPNLTVYGGTKFAVRGITQTLAKDLASEGITVNAYAPGIVKTPMMFAIAHEVGKNAGKDDEWGMEQFAKDITLKRLSEPEDVANAVGFLAGDDSNYITGQTIVVDGGMVFH >LS483415|513315:525559|521026_522373_+|SQG96432.1|tRNA|DBSCAN-SWA MSKKLISIVDVKDYVGQEVTIGAWVANKSGKGKIAFVQLRDGSAFFQGVAFKPNFIEKYGEESGLEKFDVIKRLNQETSVYVTGIVKEDERSKFGYELDITDLEIIGESHEYPITPKEHGTDFLMDNRHLWLRSRKQMAVMQIRNAIIYATYEFFDQNGFIKFDSPILSENAAEDSTELFETDYFGKPAFLSQSGQLYLEAGAMALGRVFDFGPVFRAEKSKTRRHLTEFWMMDAEYSFLSHEESLDLQEAYVKALIQGVLDRAPQALDILERDVEALKRYITEPFKRVSYDDAITLLQEHEADEDTDYEHLEHGDDFGSPHETWISNYFGVPTFVVNYPASFKAFYMKPVPGNPERVLCADLLAPEGYGEIIGGSMREDNYDALVAKMDELGMDKSEYDFYLDLRKYGSVPHGGFGIGIERMVTFVAGTKHIREAIPFPRMLHRIRP >LS483415|513315:525559|524647_525559_+|SQG96435.1|DBSCAN-SWA MSFTTKVKEELIHLSTGDNNELAAIIKLSGSLGLAHQSLHLSITTENAKIARYIYSFIEDAYVIVPEIRYHQKTNLRKNRVYTVYVEQGVETILADLKLADSFFGLETGIEPQVLSDDNAGRSYLKGAFLTAGSIRDPESGKYQLEIYSVYLDHAQDLAQLMQKFMLDAKTIEHKSGAVTYLQKAEDIMDFLIIIGAMSCKEDFEAIKLLREARNDINRANNAETANIAKTISASMKTINNIIKIMDTIGLESLPIELQQVAQLRVKHPDYSIQQVADALEFPITKSGVNHRLRKINKIADDL >LS483415|513315:525559|516977_518438_+|SQG96429.1|DBSCAN-SWA MFCFIDIACYNRLTMTQKKLRKYAVVDLEATGAGPNASIIQVGIVIIQGNKIIDSYETDVNPHESLDEHIVHLTGITDKQLAKAPDFGQVAHHIYQLIEDCIFVAHNVKFDANLLAEALFLEGYELTIPRVDTVELAQLFFPRFEKYNLGHLSRQLNIDLAEAHTAIADARATAILFLRLLQKIESLPIECLESLLVYSDSLLFETAMVIQEGLAKAKPYDPNKYIKIRQILLPKGPKAPKPYQISKSFPINMALLGLEERPKQTQFAQLIDEDYHQGVASFIEAQTGIGKTYGYLLPLLAKEDQNQIIVSVPTKLLQDQLMAGEVAAIQEQFHIACHSLKGPANYLKLDSFADSLDQNDQNRLVNRYKMQLLVWLLETKTGDLDEIKQKQRFAAYFEQLKHDGDIKQSSEFYNYDFWRVNYEKAKTARLLITNHAYFLHRVQDDKDFARNKVLVFDEAQKLMLQLDQLSRHQLNLTFFYKQYRPS |
11 | Streptococcus_phage(55.56%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
609821 : 617221
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483415|609821:617221|DBSCAN-SWA ATTATTCTCTATTTTTGGTGTTATCCTCTTTTAGTTCAGAAGTTGCCGCGTCAGCTTCTACGGGATTTAGTTCTAAGTAAGATGGTGCTTTAAAAAGTTTCTGAGTTGATTTATGACCATTTTTACTGTATAAACTTGTTGACTCTGATCCGAGTTTTGCTGAAATATCTTTCAGTTGTTTTAACTGCTTAGTGTAGATAAACTGGTTAGGATCAATAGCTTTTAGACCATTTTGAGTATCAAAGCGCAGGAGATCACCCGTTTGAATAGCGTCGCTAGCTGCTAGTTGTTGAGCAACAGCAGAGCGAATTTCCTTAGTTTTGGCTATAGTCATTTCATCGGGATTAGTGATTTCTAAACCTGTTTGCGTGTTGTACAGACGTCCACTATAGTTAGTGTATTCAGGAGTCATATAAGTCCCAGATGTTCGTTGTGCCACAATCTGGCTATTTTGAGGTGATAATAAATCTTGTCCTAATTGAACAAACTGACTAGTGTCAATACCAAGTATGTGGAGTAAAGTAGGAAGAGCATCGATTTCACCGCCAAAGGTTTCTTTGATACTACCATTCGTATAACCTGGAATATGGATCATATACGGGACTCGTTGTAGCATAGCATTATCATATTCAGACCAAGTTTCAGAATCTTTACCAAGAAGTGGAGCAAGACTAGAATTACGAGAATTTGAAATACCATAATGGTCACCATATAAAACAAAAATAGAATTCTCGTACAAACCAGTGGCTTTCAAGTAATCAAAAAAAGATTTAAGGGCAGCGTCTAAATAATTGGCAGTAGCAAAGTAACCATTGATCGTTTCATCGTCTGTTTTGGCTAAAGGAAAACCTTCTTCACTACTTTCGCCTTTTAGACTAGTATAAGGATAGTGATTACTCACAGTGATAAACTTGGTATAAAAAGGTTGTTGCATCTGTTCAAGATATTTTATGGAATCCTTAAACATGTACTTATCATTTAACCCATATTGAAAAGAGTTCTTACTATTTTGTTTAGAGAAGTAGCTAGAATCAAAAAAATAATTATAGCCCCATTGTTTATAAGCATTATTGCGATTCCAGAAAGTTCCAACGTTACCATGAAAGACAGCGCTGGTATAGCCACCTTTTTGGGCTAAAATACTTGGAGTAGCAAATTGTGTATTTTCACCACCGTAGTTCACCATAAAAGAACCACTATTTAAACCAAATAAGGAATTCTCCATCATGGTTTCAGCATCAGAAGTTTTACCTGCTTTAACCTGATGAAAAAAGTTAGGGAATGCTAAGGTAGCATTTGAGTGATAAAGCGAGTTGATAAAAGGCGTTACCTCATATTCTTTATCTCCTTCTTTTAGTTTATAATCTATTAAGAATTGTTGAAAGCTTTCTAAATGAAGAACAATAATATTTTTGCCTTTTCCAATTCCAAAATACTGAGGATCAGGTGCTGCATAATGTCCTTTGACATAAGTTTTAACATCAATTAATTCTTCTGCAGTAGCTCCATTTCGTTCTTTTTGAGCTTGATAGGTTTGATTGCCGCTATAGAGGGTAAACGCTGGTAATCCTAAAGCTCTCACAATATAAGTATTTGAAAAGCCACGTGTTAATAGTTCAGGACGATCAATTTCTGCTAAAAAAAGATTAATAGAAAGCAATAGACTAGATAAAGCGGTGATGGCAAATGCTGCGCGCTTGTTAAAAGGACGTTGATCATTTTTGATTTTTTTAGTGATAGATAAACTAATTAGAATAATAAAATCAAGAATATAGATAATATCCCAGATGCGTAAAAGGTTTAAAGCAGAGTCCCCTAATCCAGCGGAGACTTTACTACTAGCTAGCATGGCACTCACTGTAATAAAGTCTGAAAATTCTCGGTAATATATAGAATTTGATATCAAGAGAATGTTAAGGATAATATAAACCACCCAAGAACAGATATAAAAGGCTCGGGTATTCTTAACGTAAAGAGCAACCCCCAAAAGTAAAAAAGCTAGTGGGATTGGATTGATAATAGTTAGAAAGACTTGGTATATATTTCCCAAATCTAGTGAAAAGTCTGTATGATATGCCCACAGGGTCTTTATCCAGTAACAAAAGAGTAGAGTAATTATAAAACCCAATCTTGTGTTGATAAAACCTGTGATAAGTGTTTTAAATTTCTTCACAGTAGCAACTTCCTTATCGTTTTTTCCTAAAGATGTCATCTCCAAATAAAATCTCAGATTAAATTATACCAAAAATGTGAAGCTAATGCTTGTTGTAAGTTCAAATTTAGTAGGATTTTTTATCAGATTTTGTTATAATAAAAACTATGAATAAACTCTATATTGATTCTTTTGTCGAAAAGAAGCTGACAGCAGGGGTACAATTATTAGATGAAAAAGATTTTTCTAATATAAAGGAAAAAAATCAGTTGGTTCAACTGGTGACCAAGTCCAATCGTCCCATTGGAACAGCATATATCTCTAAGCAAAATAAAGGAATTGGTTGGTATCTAGGACCAGAAAAAATCGACTTGTCTATCTCTTATTTTGTTAGTCTATTTTCAGTTGCTAAGGCCAAAAGACAAGATTTTGCTCAATCGGACGAGACCAATGCTTATCGCCTTTTTAATCAAGAAGGAGACGGTTTTGGTGGAGTAACAATTGATCTTTATAAAGATTTTGCAGTCTTTTCATGGTACAATGCCTTTGTCTATGACAAAAAAGAAATGATTATGGAGGCTTTTCAACAGGTTTTTCCTGAAGTCAAAGGAGCTTATGAAAAGTGTCGCTTTAAAGGTCCAGATACTGAAACTGCTCATCTGTATGGTGAGCTGGCACAAGAAACCTTTTCGATTTTAGAAAATGGCATAGCCTATCAAGTCTTCTTGAATGAGGGCTTAATGACAGGTATTTTTCTAGACCAGCATGATGTTAGAAGAGCACTAGTAGATGGTTTAGCTATGGGCAAGTCCCTTCTTAACCTATTTTCCTATACAGCTGCCTTTTCTGTAGCAGCTGCTATGGGTGGTGCTATCGAGACCACTTCTGTGGACTTGGCTAAACGATCGAGAGAATTATCACTAGCTCATTTTGAGCATAACCAGTTAAACTTAGCCTCACATCATTTTGTGGTGATGGATGTTTTTGAATACTTCAAATATGCCAAACGGAAAAAATTAATCTTTGATGTGATTGTGATTGACCCACCAAGCTTTGCTAGAAATAAAAAACAAACTTTCTCTGTGAGCAGGGACTACCACAAATTAATCACAGAGGCCTTGGACATATTGAGTCCTAAGGGAACTATTATAGCTTCAACAAATGCTGCTAATATGACTGTTAGCCAGTTCAAAAAGCAAATTATCAAAGGATTTGGAAGTCGTCGTCCTGAGTCTATGACTCTCCAGCAGCTTCCGAGTGACTTTACTATCAATAAAGCAGATGAAAGAAGTAACTATTTAAAGGTATTTACTATAAAGGTACGAGAATGAGAATTGTAGCACCAGTCATGCCAAGACATTTTGACGAGGCTCAAGCCATTGATATTTCTAAATATGAAGATGTTAATTTAATTGAATGGCGAGCAGACTTTCTTCCCAAGGATGAGATTGTCGCAGTAGCACCAGCTATTTTTGAAAAATTTGCCGGAAAAGAAATTATCTTTACCCTTCGGACCGTTCAAGAAGGGGGGAATATTACCCTTTCAAGTCAGGAGTATGTTGATATTATCAAAGAAATCAATGCTATTTATAATCCAGACTATATTGACTTTGAGTATTTTACGCACAAGTCAGTATTTCAAGAAATGCTTGATTTTCCAAATCTTATTTTGTCTTATCACAACTTTGAAGAGACTCCTGAAAATTTAATGGAAGCTTTTTCAGAAATGACCAAGTTGGCACCGCGTGTGGTTAAAATTGCTGTGATGCCCCAGAGTGAACAAGATGTTCTAGATTTGATGAACTATACCAGAGGCTTTAAGACGCTCAATCCTGAGCAAGAATTTGCAACTATATCTATGGGGAAATTAGGAAGATTGTCTCGTTTTGCGGGAGATGTCATTGGCTCTTCCTGGACATACGTTTCATTAGATCATGTTAGCGGTCCAGGTCAAGTGACTCTCAATGATATGAAACGTATTATTGAGGTCTTAGAAATGGATATCTCTAACTAGTGAATGGTCTAAAAATATTATTTCTACAATAGTTAAGAAATGATGTTTTTAGATTAATGTTTTTAAAATAAGTGGAACCAAAAAGGAGAAAAATTGCGTTATTTAACAGCAGGAGAATCTCATGGGCTATCCTTAACAGCTATTATTGAAGGTATACCAGCAGGATTAACTCTTCATCCAGCGGATATTGATCACGAATTACAGCGACGTCAAGGAGGTTATGGCCGTGGTGCCAGAATGTCTATTGAGACTGATCGGGTTCAAATATCCTCAGGAGTTCGTCATGGCAAAACAACAGGGGCCCCCATTACCTTAACGGTAATTAATAAGGACCACCAAAAATGGCTAGATGTCATGGCTGTAGGAGACATTGAAGAGACTCTCAAGTTAAAGCGTCGTGTTAAGCATCCTAGACCAGGACATGCGGATTTGGTAGGAGGTATTAAATATCATTTTAACGATTTAAGAGATGCCTTAGAGCGTTCCTCGGCTAGAGAAACAACGATGAGAGTGGCTGTAGGCGCTGTTGCTAAACGTATCTTAGCTGAACTTGGAATTGATATGTTACATCATATCTTAATATTTGGTGGTATAACGATCACAATACCTTCTAAGCTCTCTTTTAGAGAGCTGCAAGAAAGGGCTCTCCATTCAGAATTATCTATTGTTAATCCAAAGCAAGAAGAAGAAATTAAAACGTATATTGATAAGATAAAAAAAGAAGGGGATACCATTGGTGGTATTATCGAAACGATAGTTCAAGGGGTGCCAGCAGGTCTTGGATCTTATGTCCAATGGGATAAAAAATTAGATGCCAAGCTGGCTCAAGCAGTTCTTTCCATTAATGCTTTTAAAGGGGTGGAATTTGGAGTTGGGTTTGATATGGGATTCCAAAAGGGCTCTCAGGTAATGGATGAAATCACCTGGACACCTACCCAGGGCTATGGTCGTCAAACAAACCACTTAGGTGGCTTTGAAGGTGGCATGACCACAGGACAACCTCTTGTTGTTAAAGGGGTTATGAAGCCCATTCCTACTTTGTATAAACCACTCATGTCGGTAGATATTGATAGTCATGAACCTTATAAAGCAACGGTGGAACGCTCTGATCCGACGGCCTTACCAGCTGCAGGGGTTATCATGGAAAATGTAGTGGCGACGGTGCTTGCCAAAGAGATTTTAGAGACCTTTTCTTCTACTACCATGTCTGAATTGCAAAAAGCTTTTTCGGACTATCGCGCCTACGTCAAGCAATTTTAGATAGCGAGATACTGGCTTTTATGGTATCATACAGGTATTAATGAACAAAAGGAGACTGTCATGTCACAGGAAATTTATGACTATGCTAATCAACTTGAAAGAGCAGTTCGTGCTCTGCCAGAATACCAAAAAGTGTTAGAAGTAAAAGAGGCCATTCAAGCAGACGCTAGTGCTAGCCAACTGTTTGATGAGTTTGTCGCTATGCAAGAAAAAATCCAAGGGATGATGCAATCAGGCCAAATGCCAACGGCTGAAGAACAAACAAGCATTCAAGAACTTAGCCAAAAGATTGAAGCTAATGACCAGCTAAAAGCTTATTTTGAAGCGCAGCAGGCCTTATCTGTTTACATGAGTGATATTGAGCGTATTGTATTTGCTCCGTTGAAAGTTTTAGTCAAGTAAGCCAATTAAGATAGGAAAAAAACAGATTGCTGGCAGCTCGTCAGGATCTGTTTTTTAGTGTTTATTTTCTTTGTATCAGAAAGTTGAGCCTCTTTCTTATTTGTGATATAGTCAAATAAAGTGACCAAAATAGCAGGCCAGTAGTGGCTTTAATGAAGGCAAGTTGTCTGCTAACTGGCTATGCTAAAACATCAGTATTAGAAAGTAAAAGGTGATAAAAATGGTTATTCCTTATGATTATATTGTTATTGGTGGAGGGAGTGCAGGTATTGCTTCTGCGAACAGGGCAGCCATGCATGGGGCCAAAGTATTGTTAGCTGAAGGTAAAGAGATTGGGGGAACCTGTGTTAACCTAGGCTGCGTTCCTAAAAAAGTCATGTGGTATGGCGCTCAAGTAGCAGATATTTTAGGGACTTACGCTAAGGATTATGGATTTGACTTTAAAGAGAAAGCATTTGATTTTAAACAATTGAAAGCAAATCGTCAAGCTTATATTGATCGGATTCATGCTTCTTATGAGCGAGGCTTTGAGCAGAATGGTGTTGACCGTATTTATGATTATGCTGTCTTCAAAGATGCTCATACGGTAGAAATTGCAGGGCTGCTTTATACCGCACCGCATATTTTGATTGCCACAGGAGGACATCCTGTTTTTCCAGATATTGAGGGGGCACAATACGGTATCAGCTCGGACGGCTTTTTTGCCTTAGATGAGGTACCAAAACGTACGGCTGTGGTTGGGGCAGGCTATATTGCTGTGGAACTTGCTGGTGTTTTGCATGCTTTGGGGTCGAATACGGATTTGTTTATTCGTCACGATCGACCTTTAAGAAGTTTTGACAAAGCCATTGTGGATGTTTTAGTTGAGGAAATGACAGTTGGTGGTCCTTGCTTACACCCTCATTCAGAAGTGGCAAAGGTTGTCAAAAATACTGATGAGTCCTTGACCCTTTACCTCAAAGATGGCCAAGAAGTTGAGGTTGACCAGCTCATTTGGGCTATCGGTCGCAAGCCTAATCTAGAAGGTTTTGGTCTTGACAAAACTGGAGTGACGTTAAATGATAAAGGTTATATTGAGACAGATGCCTATGAAAACACGTCTGTCAAAGGTATTTATGCCGTGGGAGACGTTAATGGGAAACTGGCTTTAACTCCAGTTGCTGTGGCAGCTGGACGTCGCCTATCAGAGCGTCTTTTCAATAACAAAACAGACGAGAAATTGGACTACCAAAACGTTGCTACTGTGATTTTTAGTCACCCTGTTATTGGCTCTGTTGGCTTGTCAGAAGAAGCAGCAGTCAAACAGTATGGGCAAGAAGCAGTTAAAACATATCAATCACGTTTTACGTCTATGTTTACTGCTATCACTAACCATCGCCAACCTTGTCTGATGAAGTTGGTAACAGTCGGGGATACCGAAAAAATAGTTGGTCTTCACGGAATCGGCTATGGGGTTGATGAAATGATTCAGGGCTTTGCAGTAGCCATCAAAATGGGAGCAACCAAGGCGGATTTTGATAACACCGTTGCTATTCACCCAACTGGCTCAGAAGAATTTGTCACCATGCGCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483415|609821:617221|615868_617221_+|SQG96517.1|DBSCAN-SWA MVIPYDYIVIGGGSAGIASANRAAMHGAKVLLAEGKEIGGTCVNLGCVPKKVMWYGAQVADILGTYAKDYGFDFKEKAFDFKQLKANRQAYIDRIHASYERGFEQNGVDRIYDYAVFKDAHTVEIAGLLYTAPHILIATGGHPVFPDIEGAQYGISSDGFFALDEVPKRTAVVGAGYIAVELAGVLHALGSNTDLFIRHDRPLRSFDKAIVDVLVEEMTVGGPCLHPHSEVAKVVKNTDESLTLYLKDGQEVEVDQLIWAIGRKPNLEGFGLDKTGVTLNDKGYIETDAYENTSVKGIYAVGDVNGKLALTPVAVAAGRRLSERLFNNKTDEKLDYQNVATVIFSHPVIGSVGLSEEAAVKQYGQEAVKTYQSRFTSMFTAITNHRQPCLMKLVTVGDTEKIVGLHGIGYGVDEMIQGFAVAIKMGATKADFDNTVAIHPTGSEEFVTMR >LS483415|609821:617221|612139_613303_+|SQG96513.1|DBSCAN-SWA MNKLYIDSFVEKKLTAGVQLLDEKDFSNIKEKNQLVQLVTKSNRPIGTAYISKQNKGIGWYLGPEKIDLSISYFVSLFSVAKAKRQDFAQSDETNAYRLFNQEGDGFGGVTIDLYKDFAVFSWYNAFVYDKKEMIMEAFQQVFPEVKGAYEKCRFKGPDTETAHLYGELAQETFSILENGIAYQVFLNEGLMTGIFLDQHDVRRALVDGLAMGKSLLNLFSYTAAFSVAAAMGGAIETTSVDLAKRSRELSLAHFEHNQLNLASHHFVVMDVFEYFKYAKRKKLIFDVIVIDPPSFARNKKQTFSVSRDYHKLITEALDILSPKGTIIASTNAANMTVSQFKKQIIKGFGSRRPESMTLQQLPSDFTINKADERSNYLKVFTIKVRE >LS483415|609821:617221|609821_612032_-|SQG96512.1|DBSCAN-SWA MTSLGKNDKEVATVKKFKTLITGFINTRLGFIITLLFCYWIKTLWAYHTDFSLDLGNIYQVFLTIINPIPLAFLLLGVALYVKNTRAFYICSWVVYIILNILLISNSIYYREFSDFITVSAMLASSKVSAGLGDSALNLLRIWDIIYILDFIILISLSITKKIKNDQRPFNKRAAFAITALSSLLLSINLFLAEIDRPELLTRGFSNTYIVRALGLPAFTLYSGNQTYQAQKERNGATAEELIDVKTYVKGHYAAPDPQYFGIGKGKNIIVLHLESFQQFLIDYKLKEGDKEYEVTPFINSLYHSNATLAFPNFFHQVKAGKTSDAETMMENSLFGLNSGSFMVNYGGENTQFATPSILAQKGGYTSAVFHGNVGTFWNRNNAYKQWGYNYFFDSSYFSKQNSKNSFQYGLNDKYMFKDSIKYLEQMQQPFYTKFITVSNHYPYTSLKGESSEEGFPLAKTDDETINGYFATANYLDAALKSFFDYLKATGLYENSIFVLYGDHYGISNSRNSSLAPLLGKDSETWSEYDNAMLQRVPYMIHIPGYTNGSIKETFGGEIDALPTLLHILGIDTSQFVQLGQDLLSPQNSQIVAQRTSGTYMTPEYTNYSGRLYNTQTGLEITNPDEMTIAKTKEIRSAVAQQLAASDAIQTGDLLRFDTQNGLKAIDPNQFIYTKQLKQLKDISAKLGSESTSLYSKNGHKSTQKLFKAPSYLELNPVEADAATSELKEDNTKNRE >LS483415|609821:617221|615306_615648_+|SQG96516.1|DBSCAN-SWA MSQEIYDYANQLERAVRALPEYQKVLEVKEAIQADASASQLFDEFVAMQEKIQGMMQSGQMPTAEEQTSIQELSQKIEANDQLKAYFEAQQALSVYMSDIERIVFAPLKVLVK >LS483415|609821:617221|614079_615246_+|SQG96515.1|DBSCAN-SWA MRYLTAGESHGLSLTAIIEGIPAGLTLHPADIDHELQRRQGGYGRGARMSIETDRVQISSGVRHGKTTGAPITLTVINKDHQKWLDVMAVGDIEETLKLKRRVKHPRPGHADLVGGIKYHFNDLRDALERSSARETTMRVAVGAVAKRILAELGIDMLHHILIFGGITITIPSKLSFRELQERALHSELSIVNPKQEEEIKTYIDKIKKEGDTIGGIIETIVQGVPAGLGSYVQWDKKLDAKLAQAVLSINAFKGVEFGVGFDMGFQKGSQVMDEITWTPTQGYGRQTNHLGGFEGGMTTGQPLVVKGVMKPIPTLYKPLMSVDIDSHEPYKATVERSDPTALPAAGVIMENVVATVLAKEILETFSSTTMSELQKAFSDYRAYVKQF >LS483415|609821:617221|613299_613986_+|SQG96514.1|DBSCAN-SWA MRIVAPVMPRHFDEAQAIDISKYEDVNLIEWRADFLPKDEIVAVAPAIFEKFAGKEIIFTLRTVQEGGNITLSSQEYVDIIKEINAIYNPDYIDFEYFTHKSVFQEMLDFPNLILSYHNFEETPENLMEAFSEMTKLAPRVVKIAVMPQSEQDVLDLMNYTRGFKTLNPEQEFATISMGKLGRLSRFAGDVIGSSWTYVSLDHVSGPGQVTLNDMKRIIEVLEMDISN |
6 | Streptococcus_phage(66.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
622998 : 667067
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483415|622998:667067|DBSCAN-SWA TCTAATGGCCAAATTTCAAGTTGAAGTTAGCCAGTTTTAACATTTCTACTGGCGACTTGTAGTTGAAGAGTCGTTTAGGATAATGATTGATCCAATGTTCAATAGCAGCGACTTCTTTAGGGGTCGTTGTTTTGGTACCTTTAGGGAGACATCTGCGAATCAGGCGATTATGGTTTTCGTTAGTGCCTCTCTCCCATGACGCATAGGGATGGGCATAGTAGATGTCACTTGCTGGAAAGACATCTGATAAGCGAGAAAATTCTGTCCCGTTGTCTGCCGTGATAGAGTTGACGGTGTAGTCTTTTAGAATCCCCGTAAGAGCTTTATTGACAGCTTGAGCAGACTTATCCGGTATTAATCGAATCAGCTGATGACGTGTTTTCCTGTCCGTTAGGGTGAGTAAGCATTGATTTTTAGCCCTCGTCAGAATGACTGTATCAATCTCATAATGCCCAGCTTCAAGACGTTGGTTAATGCTATCTGGGCGTTGTTCAATACTCTTTCCTGCGGGTTTAAAATAAGGACTGGCATGTTTTCTAGCCTGCTTAGCCTTTCTCGGATAAAGCATAGCCTCCTTACCAAGACTTAATTTCCCATGATGAATCCAGTAATAGATGGTAGATACAGGGACTTGAACTCCCTTAGCTTTAACTATCATCTCAGGGGAATAGTTCTGACGCATGTAGTGTTCAATAGCCTCCCTATCTTGCTTACGCTGTCTAATGAGTCTAACAGAACGCTTGCGATTTTCTTGATAGACCAACTGAGCATGTTGAGCAGAATAAACGGCTTCAAACTTTCCTTTACGAACCTGTTGCCTAAGCAAGCCTCGCTTGATTTCATTATGAATGGTCTGGGGTGCCTTACCTAGTAAGCGAGCAATTTCACCCCGTTCTGTGGCTGAAAGATGAGAATAGAATGATTTTCTGGTAAAATTAATGTTAGACATGTTCATCTGATTTCTATACTGAATTGGGGAATTCTAGTATATCAGACGAACATGTCTTTTTTGTTTTACTTCATTTTACAACGTGGGGTCCAAAATGACATACTAAACAAACTGATTCTTCTCAATCTAATTTTTATTAGGTGAAATTCTTAGATGTTAATCAGAACGAGAATTGAAAAAAATACTTTTAACATCATCACTAGTTTTCACTCTTATAAATAGTAGGCTTATTTCTCTGGTAGCTGAATCTATGGGTGATAAAACATTACCAACTAACTTATAGAATAATTCTAACAATAGTTTAGAAATTATAAGTAAAACTGGAGATATTGATGTAGAGTAATCACTTTAATTCTTAATATATTTTAACTATAAGAAATGCCTATGATATTATTATAGGCATTTCTGTCATAATAGAACTAAAATAACAAAAAGGGTCATCTATTCTCTAACAAAGAAATTACTACAGAGGTAATAATCAGTGTCATGACTAATATAATTAGAGAAATCAATAAATAATTTTGTATATTAATTGTTTCTTTGTAAAAGTAAGATACTAAACTCATCGGAAAGAGGTACGTGAGTTTTTCTAAGATATTGCTAAAATAACGGAGTTGTAAAAATATTATTGCTAGAACATAGTTTGTTAGTATGAAAAAGCTAGTTGCTAAAATGTTATTCTTAAATATTTTTTGAAAACTAATTGCTTGAACAGATGACAACCCAATAGTAATTAGAAGAACAATTTGAATAATTAAAAAGTTTTTTAAATCTAGACCTATACTATTAGGCAAAAATTCTGAACTCTTATTAAATAATAAACTAGAAATCACTATTATCATAAGTGTCCAAATAGAAAATAAAAATGACGATAACATAAAAGCATTGAAACTATCAATTAAATATACTTTAATTGAACTTAGTTTAGTTAAAGTAATTTGTTGATTGATATAATCAGTTTTTGAGGAATAAGTAGAAGTGATAAGTGGAAATATAAGATATAAACCCATCATCGAAAGCATAAAAAATCCATAAAATAAATCATTAAGAATAAAAGGTTTATCTTGATAAGGGTTTAATAATAGAAAATAACCATTGCCAGCAATAATAATAAGTAGGATAGTAATTAAAAAAATTTTTAATCCTCTTATTTTAGAAAATCGAAAAAGTTCAGCTTTAATATATGTCATCGATGACCTCCTATCTAATTACTGAAAGATAATAGTCTTCAATTGATTCAGAAGAATTGATATTATTCTTTAATTCATCCTTAGAAATATCAGCAATTATGGTTTGTTTACTTAGAAATATAAATCGATTACAGATTTTATATAGGTCTGAGAGAATATGGCTACTAATGAGAATTGTTAACCCCTCTGCTTGATTTAACCTTAGTAACAAATTACGTAGTTCAACAATACCTTCTGGATCGATACCGTTAAAAGGTTCGTCAAGAATTAAAAACTTTGGGCTATTCATAAGAGCTAATGCAACTCCCAATCGTTGTTTCATGCCTAATGAATATTCTCCGAATTTCTTATTTCTAGCATGATATAAATCAACCTCATTAAGTAACTCTAAGCATTTTGATTCTGTATTTTTAAGCTTCTTTAATTTACCGAAATAAAGTAAATTATTAAATCCACTCAAATATGGGAAAAAATCCGGTGTATCAATTAGACTTGAAATAGAGTCCCTGTTGAACTCTTTATGATAATTTACGTCTCCATTATACTTTATTGGTAATTGAGATAAAATTGTTAGTAAAGTTGATTTACCAGCTCCGTTCCTTCCGACTAGTCCAATAATATCACCTTTTGAAATCTGTAAATTTATATCTTTAATGATAGTTTTATTTGAATACTTCTTTGAGACATTAGTTGTAGTAAGTATCATCTTGCAACCTTTCTATTCAATAAATAAGCTTTCAATTGGTTCTTGTAAAACCCTACCTAAAGCTAAAGCTAATTTTAAAGTAGGATCATATTTGTTATTTTCAATCATATTGATTGTTTGCCTTGAAACGCCACATTGTTTTGCTAGCTCATCTTGAGTGATCTTTTTTTCTTTTCTAAGTAACTTTATTTTATTATTCATTGTATTAATCTTCTCTATTATTTTTTTTAATTTGTAACTTCAACTTGATTAAATAATAGATATAAAATACAGTAGCGATTAGCAGGTATTTATAATCTGATTGGATACGATCAGCTAAAACATCCTTGGGAATATTTCCATAGTAAGTATTCATAATGAAGATATTAATAAATAATGAAATTCCAGAAATAGTAGTTAAAATAATACCAATTTTTTTAAAAGTGTCACCGTAAAAATATTTGTACATTTCATCCTTAGATTTTTCGCCAGCCATCTTTAATATAAATTTGTAATAAAGGTAGCACAATAACAAGATCAATAAATTTATGATAATAACTAAGATATATTCCATTTTTTTCTCCTCTTTGTCAAGAAATCTTGACATTATATTAGCAATTAAACAACAAAATGTCAAGAGCATTGGACAAAAAATATTAGAGTAATAACTAAAATCTTTTATTGATTCTGTGAAATGATACATGCTAACTCTATTAACCAATCACAGATTAGGAATGAGATATATTTAGATGAAAATTCTTTTGATTCTTTTGGAACTATAGGTAGGAATGATTTCAAAAAGATTTCTTTGTGTTCCTCCACAAAATACTCAATGTATTTAGGATTTGAATGATTATTTCCTAATTGCTGTAACATCGTTTGTTTGAAGATGGAATTATTGAAGTGATTACTATATATAACTAGTTTAAAAATTTCTTTAATGATTTGAATGCAGAACCCATCCGAGGGGAAATACATTTCTTGAGAAGTATTATAATTCAATGTTTGTAGAAAAATTTTTACTGAGTTCGTTGTTAGATTACAAATTCCATTAAGAATTCCTCGAATTGTCGAATCTGAGGAAGATTTTGTATCATCGACATCATCAAAGCCAAAATCAATAATTTTAACATGTTCAGATTTCATTCGCTCTCTTAGCGTTTGACCAAGTACTGTATAGTAAAGTTTAGATATCACATCGATATTAGACATAAGTTGCTCCTTTTGTCCAAAGAACTACCAGAAAATTTTATTATCTAGAATTAACTCACACTAAAAATAATTTCAAAATAAAATTATCATAAGTGATAAAATAAAATTTTTTTAGTGGTCTTCAATGCGAATCTTTTGGAACTATTTTTTACAAGATAGCTATCTTGTATTTATAGAATAATATGTTATTGTCAGTAAATATATGATATTATTTGGTTGAAAAAGGGAATGGCTGAATACCTTTAGAACCAGAGGTTTATGTAACATTTGATATCATTTTTTAAAAAATATTTCCTTAAAGGAGGATAGATTATGCTTGTGAAACTTTCAAATAATGTCTTAGAATTTCCTTTTACCTACTCACTACGTTTTAAGAAAAGGATAGATTTTGAAAATGAATTAAATATAATAACTAACCATCTTAGGCAAATCGATTGGTTTAATAGCTAACAACCCCTCTTTGATATAACGATAAATCGTTTTGGTAGAGGGGACGACTTCTTCAGGATGGTTTACTTTGTAAGTCTGAACAAAACTATCCACACTATGGAGACGAATGTTAGCCGTCAATGCAGATTCTAATTGTGCAATGAACCTAGCGGAGCAGCCATTCAATTTGAGGTAAGAACTCTTTTGACGATTGGTTTCATAGACACGTTGTCCATTATCAGCAAAATAGGCGTTGAAGAAGGTTTGTTTTCCATTCTTATCCTTTACTTGTTCTACTGAACCACGTTTTATTTCTCGGCAGATTGTAGAACGGTGACGACCCAGGAGTCGAGCAATCTCAACGGGTTTCTTTCCCATTTTGAGATAAGCAGCAATTTCACCCCGTTCTGTGGCTGAAAGATGAGAATAGGAGGATTTTCTGGTAGAATTAATATTAGACGTGTTCATCTGCTTTCCATACTGAATTGGGGAATTCTAGTATATCAGACAAACATGTCTTTTTTGTTGCACTTCA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45 | unidentified_phage(15.38%) | head,tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
683811 : 723791
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483415|683811:723791|DBSCAN-SWA AATGGCAGGAAGTAGAACTAACGATATTAAAGTATACTGTTCATTTTGTGGTAAAAGCCAGGATGACGTTAAAAAAATTATCGCAGGAAATAATGTTTTCATTTGCAATGAATGCGTAGCTTTATCACAAGAAATTATAAAAGAAGAATTGGCTGAAGAAGTCCTTGCCGATTTGACAGAAGTTCCAAAACCAAAAGAGCTCCTTGATGTTTTAAATCAATATGTGGTTGGTCAAGATCGTGCTAAACGTGCTTTATCAGTTGCTGTGTACAATCATTATAAGCGTGTCTCGTTTACAGAAAGTCGTGATGACGATGATGTGGATTTACAAAAGTCCAACATTTTGATGATTGGACCAACAGGTTCAGGAAAAACCTTCTTAGCACAAACTCTGGCTAAAAGCCTCAATGTACCATTTGCTATTGCAGATGCAACTTCTTTGACTGAAGCAGGGTATGTTGGAGAAGATGTGGAAAATATTTTACTCAAACTGATTCAGGCTGCTGACTATAATGTCGAACGAGCAGAGCGTGGTATTATTTATGTTGATGAAATAGATAAGATTGCTAAAAAAGGTGAGAACGTATCTATCACACGTGATGTATCTGGTGAAGGTGTACAGCAAGCCCTTCTTAAAATTATTGAAGGTACGGTAGCAAGTGTTCCCCCACAAGGTGGGCGGAAGCACCCTAATCAAGAAATGATCCAAATTGATACAAAAAATATCTTGTTTATTGTTGGCGGGGCTTTTGATGGCATCGAGGAGATTGTTAAACAACGTTTAGGTGAAAAAGTTATTGGTTTTGGTCAAAACAGCCGTAAAATTGATGACAATGCTTCTTATATGCAAGAAATTATTTCAGAAGATATTCAAAAGTTTGGGCTTATTCCAGAATTTATTGGCCGCTTACCAGTTGTGGCAGCCCTTGAACAACTAAACACATCAGATTTGATTCGAATCTTAACAGAGCCAAGGAATGCTCTTGTCAAGCAATATCAGGCCCTTCTTTCCTATGATGGGGTTGAATTAGAATTTGATAAAGCAGCTCTTGAAGCTATCGCAACTAAAGCCATTGAACGTAAGACAGGAGCACGTGGTCTTCGTTCTATTATCGAAGAAACGATGCTTGACATCATGTTTGAAATTCCAAGCCAAGAAGATGTCACAAAAGTGCGTATCACCAAGGCTGCTGTCGAAGGCAAGTCAAAACCCGTTTTAGAGACAGCTTAAGGAGAAATAATGGCTGAAGAACAAGTCTTAAATACCCATAACGCCTCAATTTTATTGAGCGCTGCCAATAAATCTCATTACCCCCAAGATGATTTGCCAGAAATTGCCCTTGCTGGACGTTCAAATGTTGGTAAATCAAGTTTTATTAATACCATATTGGGGCGCAAAAATTTGGCAAGAACCTCAAGCAAGCCAGGAAAAACCCAACTATTAAATTTTTTCAATATTGATAACAAGCTTAGATTTGTGGATGTCCCTGGTTATGGCTATGCCAAGGTTTCTAAAAGTGAACGGGCCAAATGGGGAAAGATGATCGAAGAATACTTAACCAGCAGAGACAATCTGCGTGCAGTCGTGAGTTTGGTTGATTTACGTCATGCCCCTTCAAAAGAAGATATTCAGATGTATGACTTTTTGAAGTACTATGACATTCCTGTTATTGTTGTGGCAACCAAAGCAGATAAGATTCCTCGTGGCAAATGGAACAAACATGAGTCTGTGGTCAAGAAAGCTTTGAATTTTGACAAATCTGATACTTTTATAGTATTTTCTTCGGTAGAACGTATTGGTATCGATGATTCTTGGGATGCTATTTTAGAGCAGGTCTAGCGATAGGTGTTGATTTATCTATGCTAAAACATTCTCAGTAGAGGGTGTTTTTCTTATCGAAAACATAAAAAATCATAGTTAGGTTTACCGATTTTACTTGACGCCTTAATGATGACATGCTAGTATTTTATATTAAGGAGATGAGTCATGACACAAGTAGCCCAAGGGCGCTCTAAAGGAAAGTCATTGTTATGCCATCAATGCAATGCCCTTTTTGTATTTATTATTTTTCTTATCTTGCTTGCTGTACTTTTTGGTGTTCGATATCGTAATAGCTCTATTGAAGGTATCTGGCGAACAACAAGCATTGATCAGAAGTTAGGCGATGATTTTGCTAAACGTCTTACTGGTTTGCATCAGAGCCCTCTTATTGATGATAGTTTATTAACGTCATCTCAGATGATACTAACAGTTAAAAATAACAACGTTGACTTGAGTTTTAGTGTTCAAGTTGAACGAGACATTTTTGTCAAACGTTTAGCTGCTTATCACCAAAATGAATTATTAAAGACATTAAAGGAAAATCATTTAGTTGTTGGTGACTTGAGTAGTAAAGAACGCCAAATTATTGAGAATAGTATGCCAGCTAGCCATGAATTAGAAATGATTTTAGATCAAGCTTTTGAGAAATTAGCTTCTCAGATCGGAGGCAAATATAATCAAAAAACAGGACATTTATCTGCTGTTGTTCTCAAAGGAAAAGTTAATCGTATTTTGCACACCATTGATATCAAAGAAGAAGTAGCAGCGGGACATACTTCTTTTTCAAAAGGATTGCTCACACCTAATGGTTATTTTGATTACACCAGATTTGGAAAGAAACTTGAGTTATTAGGCGATGAAAAAATTATTTTTAAAAAAGCGCTAAAAAAAAGTCCGTCAAGTGTATAACGTAGTCACAAGACGGATTTTTTCATGTTTTGAAAATTATTCAATTGAAGAAGTTTATTACTGATCGTTTTGCCTAATCACTAGTTGTCCTTCTTTTAGGATTGCCTGAAGTTTTTTGACTTCTTGATGGTCAAGATAATAATCAGTTATACGGTCACGAATTTCCTGTTCGATAATACGTCGTAATGGACGAGCTCCCATAGCGTGATTGTACCCTAAATCTATCAAATGAGCTTTAGCGTCATCAGCAATCGTTAAACTAATACCTTTTTTTGCGGTGGTTTGATTTACTTCAGCTAGCATTAAATCAACAATTTCTTCTAAATTTTCTTTTTGCAGATGATTAAATTTAATGATACTATTAAAACGGTTCAAAAACTCTGGTCTGAAATAAGGTGCAATGCGATCCATAATGTTAGACTCAGAAGTTTCCGTATCTTGTTGGCCAAAACCGGCATTTGATGTAGCAATAATAACGGTATTTTTAAAGTTAATAGTATTTCCTTGTCCATCTGTCAATCGTCCATCATCTAACACTTGTAGAAGAAGTGTAATGATTTGAGGATCAGCTTTTTCAATTTCATCTAGTAAGACAATAGCATAAGGGTTACGACGAACACGCTCAGTTAGGGTATTATTATTATCATCGTAGCCAACATAACCAGCCGTTGTCCCAATCAATTTTGACACAGCAGTGCGATCGTTATATTCGGACATATCAAGTCGAATAATAGCATCTTTGGAACCAAATAAATCAAGTGCTAATTGTTTAGCTAACTCTGTTTTACCAACACCAGTTGGACCCACAAAAAGGAAAGAACCTATTGGACGGTTACCATCATCAAAACCTGCTCGATTTCGTCGAATAGCACGTGCTACTGCTGCGACAGCCTCATCTTGTCCGATGACATGGCTTTTTAAGCGGCTGCTAATTCCTTTGAGCCTTTCTAAATCATTAGTCCCCATGTTAGAGACAGGAATACCAGTTAAGCGCTCTACAGACTCTGCGATATCATTGACTGTAGCAGTAACATTTTGGCTTTGGTTATGTTGCTCAATTTGCTTTTGTAATGTTTCAATCCGTGTTTTTGCTGCTAAAGCTTTTTCAAAGTCTTCTTTGGCGACAGCTTTTTCTTGACTCTCTTTTTGTTTAGCTATTTCAGTTTCGAGTGTTTTTAAGTCAGTGACCGGGTGTTGCGCAGCTAAATGAGCAGCTGTCATATCCAGTAAGTCAATTGCTTTATCTGGCAGGCTACGCTGTGGGATGTATTGAATAGAATAATCAACAGCAGCTTTTAGAACATTATCAGGAAGGGTAATATGGTGGTGTTGTTCATAAAGATTACGAATACCCATTAAAATGTGAAAAGTATCTTCAGCTGATGGTGCATTCACTTTAACTTCATTAAAGCGACGAGCAAGAGCAGCATTTTTTAAAATAGTATTGCGGTATTCGTCTTGAGTAGTAGCACCAATCAGTGTTAATTCTCCTCGTGACAAGGCTGGTTTAAGAATATCTGCAAGTCCCTTTGAGCCTGAATCACTGCTTGTGGCACCAGCACCAACTATTTGATGAATTTCATCAAAAAATAAGATGATATTCCCAGCTTCTTTTACTTCTTGAATCAAGTTTTGAATGGTCTCTTCAAAGGAACCACGATACTGTGTACCAGCTTCAAGACTAGAAATGTCAATTGATACGATTTCCTTGTTTTTAATAGCGGCTGGGACATCTCCATTAACAATGGCTTGAGCTAAACCTTCAATGACTGCAGTTTTACCGACACCAGCATCTCCGACAAGGACAGGATTATTTTTAGTTCGTCGTGCCAAGATTTCAGCGGTATCTTGAATTTCTTTGTTACGACCAATGACGGGGTCAAGATGCCCTTGACGAGCTTCTTGTGTTAAGTTAGTTCCGAGTTGAGTCAATACACTATCAGCTTTAGGTGTTAACATTTGAGAATTTGTTGCTTTGGTTGTCGCTACAGGGAGTTGTCCTGTTTGACGATAGTGTTGGAATTCTTCGGGAGTTATTTCGCGACCGTTAACGAGATAGCGGGGATTTTCGCTACGATAACCACCCATGTTTGCCATTAATTGGTTGAAAATATCATCCATATTTACAAAAGGATCTTTACCAGAAAAATGTGTCATATCAGTTACCTCGCAATAAAAAATAGACTATAAGATGTTTGTAAGCAGTCGCAGAATCGTTGTTAGGATTTCACATGATAGGAAATCCTTTGCTAATAGAATGATTCAGACA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39 | Streptococcus_phage(30.77%) | protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
929294 : 1021352
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483415|929294:1021352|DBSCAN-SWA 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114 | Streptococcus_phage(45.71%) | integrase,tRNA,head,terminase,capsid,transposase,portal,tail,holin | attL 1007307:1007322|attR 1011495:1011510 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
1035496 : 1086349
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483415|1035496:1086349|DBSCAN-SWA 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50 | Bacillus_phage(18.75%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1299361 : 1370973
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483415|1299361:1370973|DBSCAN-SWA 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89 | Streptococcus_phage(61.02%) | integrase,head,tRNA,terminase,portal,tail,holin | attL 1325946:1325962|attR 1371019:1371035 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1714595 : 1730328
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483415|1714595:1730328|DBSCAN-SWA 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>LS483415|1714595:1730328|1717806_1718136_+|SQG97580.1|DBSCAN-SWA MTLPENYRRVLNLIKVGADNSITEAEISLILKLEERSVQSIISSLITRYNIPIIGIRHGFNRGYLIPANKEELLDGAKAFYNQVQKEQERLSVLLNADLTSYKELLKGG >LS483415|1714595:1730328|1721566_1722076_+|SQG97586.1|DBSCAN-SWA MRTFSDTPKTFTFHYTFKDFDTAQVACHAILGYMTGTYEQPVIDATYHNDDQGGHANQLVLKYVEDRKLSKVFKRICDSFKDYYNQPEDMTDEELDHQRVVSLSKSTQGKVNNRDTLIAFISDHNQLAEHLSMNYKEMTPEDLGAILESISQAFNHLYDMVVEGQLLVK >LS483415|1714595:1730328|1717379_1717601_+|SQG97578.1|DBSCAN-SWA MKSIKELNEIANDILVDYEGLCGQLIDILDVLDLAAQEYNKETTSAIINTSCSALKCLISDHDKTTHKYRKEL >LS483415|1714595:1730328|1728636_1730328_+|SQG97594.1|tRNA|DBSCAN-SWA MDTKTLIASEIAKVVPELEQDAIFNLLETPKNSDMGDLAFPAFSLAKVLRKAPQMIASELAEQIDESQFEKVVAVGPYINFFLDKAKISSQVLEQVITAGSDYAQQDEGQGRNVAIDMSSPNIAKPFSIGHLRSTVIGDSLAHIFAKMGYQPVKINHLGDWGKQFGMLIVAYKKWGDEAAVQAHPIDELLKLYVRINAEAETDPTIDEEAREWFRKLEDGDKEATELWQWFRDESLLEFNRLYDQLHVTFDSYNGEAFYNDKMDEVLDLLEAKNLLVESKGAQVVNLEKYGIEHPALIKKSDGATLYITRDLAAALYRKRTYDFAKSVYVVGNEQAAHFKQLKAVLKEMGYDWSDDMTHVAFGLVTKGGAKLSTRKGNVILLEPTVAEAINRAASQIEAKNPNLADKEAVAHAVGVGAIKFYDLKTDRMNGYDFDLEAMVSFEGETGPYVQYAHARIQSILRKADFTPSATTTYSLADAESWEIIKLIQDFPRIIKRTSDNFEPSIMAKFAINLAQSFNKYYAHTRILDDNSERDNRLALCYATATVLKEALRLLGVDAPNEM >LS483415|1714595:1730328|1717050_1717383_+|SQG97577.1|DBSCAN-SWA MKYRVETNPFSKDRYTPEQLEMFKNRQLSKDKAEAFFTRLYNQHIAWVIIANVMTEYVIKFRKSATSFEEAWDALDYQRTTEIVFRAVNGLPCSEKDSGELETYLSEVSA >LS483415|1714595:1730328|1716187_1716805_+|SQG97576.1|DBSCAN-SWA 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22 | Streptococcus_phage(61.54%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | ||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483415.1|SQG97259.1|1363959_1364259_-|phage-protein |
1363959_1364259_-
Protein sequences of LS483415.1|SQG97259.1|1363959_1364259_-|phage-protein>LS483415.1|SQG97259.1|1363959_1364259_-|phage-protein MIEVTFKAESMASVFDAMREALDMPKTATEDVVEEKSAPEKKEESVTLTLADIKKMAKAKVEEGKSKHIKEVLKEMDVAKVGELEEYQFAEFVEKLEAL |
99 aa aa | NA | NA | NA | 1299361-1370973 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|779683|30|LS483415|CRT matches to LS483415 position: 1331436-1331407, mismatch: 1 cttacgagctgagtttactcgtagtaatca CRISPR spacer cttacgtgctgagtttactcgtagtaatca Protospacer ****** *********************** |