Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483440 | Gemella morbillorum strain NCTC11323 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | cas3,cas9,WYL,DEDDh,csa3 | 0 | 2 | 5 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LS483440_1 | 639099-639175 | Unclear |
NA
Consensus repeat of LS483440_1
|
1 spacers
spacers of LS483440_1
>1.1|639124|27|LS483440|CRISPRCasFinder TCAAAGTTACATATCTAAAAATCAAGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483440_1
The CRISPR arrays of LS483440_1 >merge|LS483440|1|639099-639175|CRISPRCasFinder GTAACTTTGGTGTAACTTTCAAAAATCAAAGTTACATATCTAAAAATCAAGTGTAACTTTGGTGTAACTTTCAAAAA >LS483440|1|1|639099-639175|CRISPRCasFinder GTAACTTTGGTGTAACTTTCAAAAA TCAAAGTTACATATCTAAAAATCAAGT GTAACTTTGGTGTAACTTTCAAAAA
>LS483440.1|SQH55183.1|637446_639090_+|Predicted-P-loop-ATPase-and-inactivated-derivatives MYESTATPDRYTFTGGTTSGGAVIYDNKFLYSHHATDPCCGQLVNSFDLIRIHKFSNLDDNVKDGTPVSKYPSYTAMKKLALEDANVAVLMNSEMVANAKDIFNVVGEETSKDDELDWLSQLERSEEGKIQKTINNIVLILEHDPNLKGKIAIDTFSNRGLVFGKLPWDKHYDASKDHRDWSEVDDASFSRYLESVYKITGQDKQDKALLIVSDSNRINYVEQYLTNLKWDGVPRIDTLLIDYFGAEDNAFTREAIRKSLVAAVARAIIGGVKFDVMTILAGPQGVGKSTFFSILGKEWFNDSLQTFEGKEASELIQGSWIVEVGELTAMNRHDTNAIKQFLSKREDIYREAYGRRTSKYPRRCVFYGTSNDDEFLKDPTGNRRFWPIDICLGDIKKSVWEDLPKEVDQVWAEAYTLFVMGESLQLSKAAEELANIAREHHKESNAKEGLIRDYLDKPITENWYSLDKGARLQILSGKFDNDAPVVYRQKVCAVEVYEECLKGDLRFMKRSDAKEINQIISNIVGWIKEEKSSRFGVYGPQKGFKRV >LS483440.1|SQH55182.1|636688_637387_+|Predicted-P-loop-ATPase-and-inactivated-derivatives MQANRLLGIAKANHRKATVWQNTDISWLDFVETLKSPVRTQEKYEEFLKLKKSEQDELKDVGGFTGAKLLDGRRKATNIISRDVVCLDLDNIQPNMTDDILKRVGSLGCTAVVYSTRKHSNYTPRLRVLIPLDESCSPDEYEPIARKLGSLLGIENCDPTTFEVNRFMYYPSCSVDSDFIYQFYPGQFCSRKGILNMYDDWTDINTWPHVPGQDTRQKQLLARQQDPLLKMV >LS483440.1|SQH55181.1|634698_636672_+|bifunctional-3'-5'-exonuclease/DNA-polymerase MQHLSIDIETRSSVNIAKSGAYKYAQSDDFEILMFSYKLNDLPVQLVDLKQGEKIPPYIVGLLDDENCIKHAYNAAFEWFCLNQAGYETNISQWRCTMVHATYLGLPAGLSMTGNAIGIADDKKKLTTGSRLIQYFSVPCKPTKTNGGRTWNDPHHDLDKWKLYCEYNMQDVEAEYTIYQHLKAFEVPSKEQRLWEMDILMNSKGVKIDKALVESILKIDAESTEKLTEEAYQITELENPNSISQLKSWVESQLDEDLPGLTKDVISNLLSRDNLPLKVKRVLEIRQQLGKTSVSKYSAMENAMCEDDRVRGLLQFYGANRTGRWAGRLVQVQNLPRNYISTLDTARELAKLGNFEGLKILYNNVPDTLSQLVRTAFITSKDKFIISDFSAIEARVIAWLAGEEWVNEVFATHGKIYEATASQMFNVPIDKIKKGNPEYELRQRGKVATLALGYQGGESALIAMGADRMGLSDDELTDIKVRWREANKNIVRLWYAVGDAVIQAMNGNGTQYVRGLEIQREWDMMYGLDFITIKLPSDRKLYYPKPFLQTNQFGKDALHYYGVNQTTKKWEVNSTYGGKLVENIVQAIARDCLAETLLRLYEKNYDVVMHIHDEVVIDAYDDEKLEDVNNILAEPINWAPGLILKGAGFETKYYMKD >LS483440.1|SQH55180.1|633939_634650_+|Protein-of-uncharacterised-function-(DUF2815) MTNETTAVVQNVRLSYVNVFKPYSNSPEQAPKYSATILLPKSDLASKQSLDAAIQAATQKGLNEKWNGIMPPVVANPIHDGDGVKQDGTPFGDECKGCWVFTASSNADRQPQIVDRNVQPILDQSQIYSGVYANVAINVFPYIHTGKKGVGFGLTHIQKVRDGEVLGGAPVSADKVFNALGGAQQSANPFPNPQQYQQPMQQPMQQQPVQQYQQPMQQQPVQQNTFGVDPITGLPL >LS483440.1|SQH55179.1|632730_633912_+|Protein-of-uncharacterised-function-(DUF2800) MTEINHKERAHAKLSASGASRWATCPGSVQMEDGIPDSESVYAKEGTLAHELSELKLKHYLDPKGFGKRKLNAAVKKLKENGLYQTEMDSYTDSYVDFIKEKALSYSSQPYIEIEKRVDFSSWVPGGFGTCDCIIIQGNTLSIVDLKYGKGVPVSAEQNEQLILYALGAYEAFSLIYQIEHVEMNIVQPRLNNISSWTANLTELLLWGDYFKVQAEKALSGEGELVPSAKACKFCKARNICTARAENNLTLESEIHLNPNEIPKDKLYEYISRGEDIAKWVNDLKAYALNLCLAGEDVKGLKAVAGRTSRSWSNQDEALKKLIDGGIDEAIIYDKVPLTLAKLEKALGKEQFTTLVGDMVVTSEGKPTLVFENDKRPSITNTVNVTSIFKPLN >LS483440.1|SQH55178.1|632302_632731_+|Uncharacterised-protein MELKVNVNVIIASKEDVNLLEDVLIKLGNGEFNVGSISTQNISSVPTNINQPVQEIQNVVPITPAQNTAPVQTQPVQTAVPTTAKTYTLEDLQRASGALVQAGKIQQLQGLLQQFNAVSLAHLAQENFGAFALKLRELGADI >LS483440.1|SQH55177.1|631927_632287_+|Uncharacterised-protein MRKNVGVNLTQAIRNYIFNNPGCSKYDLVNDLGFPYSKMRMAISKLKNNGEILIENGCYTALESLSYLKEYNQTPEEFSRREYLKKLVDVVISNIQECTDHNIKIQYIQEGRRLLKDLK >LS483440.1|SQH55176.1|631761_631950_+|Uncharacterised-protein MGIRRYSDIIEDIRFMSNKISDILDEVHFDSLERRKIREAQDILDNKVCEMEDFKNEEECWS >LS483440.1|SQH55175.1|631361_631757_+|Protein-of-unknwon-function-(DUF3310) MTENNIKDPQHYKIGNLETIDLIQKTVKDFGSVCQANILKYGIRANKKHENPKDDIQKIIRYGEFWLNHLEDKPASSPRVEEIATIDKLKDMLNEQEKELIQDKKIKCVVLDGKQVPKEIAQDLLDRLGGM >LS483440.1|SQH55174.1|630777_631284_+|Uncharacterized-protein-conserved-in-bacteria MNKYELHNKLIELQELQRKVDSHIKIWNKIHIETALCEEFHEWYNAIGFFKDWKQNKTPKEKQLDELADCLAFALSLMNNDKQVYSIDRCAFILKRIENKNHKKAMINEIETGYLFNKRVGNTVYIQSTEFAIELILDIAMIYYSLEALFEAYIKKSMVNIQRQKEGY >LS483440.1|SQH55184.1|639476_639758_+|VRR-NUC-domain MIEKQIEKYLTKKIKDLKGLCLKFESPGYTGVPDRIIILKNKPVAFVELKRPIGGRYSARQKLVERDFNRLGQKVYKVKNKEEVDKLVEELIK >LS483440.1|SQH55185.1|639754_641146_+|DNA-methylase MKDFIPHKYQLTAINHVINVPKCGLFLDMGLGKTVSTLTAIKELKYNRFQVNKVLIIAPKKVAEGTWSKEKDKWSHTKDFRVSLVLGSQQKRIKALSVSADIYIINRENIPWLVDYLRNDWYFDTVVIDESSSFKNSQSKRFKALKMVLPKINRLIELTGTPSPNGVEDLWAQIYLLDQGERLEKYITHFRNRYMEPNNRNRSQIFDYKVKEGVYDHIINKISDICISMKTEDYLELPDLSYNEIPVILSDKARKDYDKMERDFVLEIEDAAEEITAVNAAALSNKLLQISNGAVYDSSGVYTEVHNAKIDSFLELVESLQGRSLLVFYNFQHDKERIKKALEKSNLVVRELKTVQDEDDWNARKIDILLTHPASAAYGLNLQEGGNHVCWFGLTWNLEHYQQANKRLHRQGQKEKVIIHHLVTQGTRDEDVMRALDSKADVQEEIMQSLKARIKKVKEGVNK >LS483440.1|SQH55186.1|641142_641328_+|Predicted-transcriptional-regulator MTNLQKIMDQMKITDKELHKVSGVHFNVIKLIRTGQRLSPRFKTLKRLADVLGCSPKDIGG >LS483440.1|SQH55187.1|641333_641549_+|Uncharacterised-protein MIGNKERISLSLFLFGVLIGTILMASNSFVFKKENEELKIQNHKLEQKLLKLYEEQAEQTKRTAERNGVGG >LS483440.1|SQH55188.1|641553_641790_+|Uncharacterised-protein MTKNKLLDLNNHLFEVLERINDDELQGEKLQEEMARAKTITQIGNTIISNASLALEAKKYKDEFGRGTTLPLMIENGK >LS483440.1|SQH55189.1|641779_642238_+|Uncharacterised-protein MENSGWFKKGCKPNETSFKKGNIPWNKGLKGLTGANRTSFKKGNLPHNTREMYSERLSKDGYIEIKVGRNKWLGKHRYIWEQHYKKEVPKGKVIIFLDGNNRNFDIDNLKLISRGALLILNRRYRHILKDKELMRSCVDLSELIYTLSKKKK >LS483440.1|SQH55190.1|642249_642648_+|Uncharacterised-protein MNEVRIKLWFKNGEFLETLIDAADVIDIKKACDRVRQGTVRNKDLKITVSNKTFYVDDVEKGVYCRDYPFTIHEPLSTVKIEERNGIEDEFNDIKYKFDDYITRIEERFLIAMIMFTLIVLTLVAACRILGG >LS483440.1|SQH55191.1|642652_643036_+|YopX-protein MLQPKVYIKKLDLVLPVEIINFHEKTVEVYLNDNADYVQFDFDEVRFLKNTGYKDKNGNCICEYDIVKYHDDGEDEDLKGSIFIVVKEQCGTSYYLEYHGFNMANLINSYQDITVIGNICESEELVE >LS483440.1|SQH55192.1|643032_643236_+|Uncharacterised-protein MKYKLIIKMKNGEVLEFLTDIRSINRLKLRYGIRNKNSTIEIVGQLIKISEIENYKYAKVDFDAGIF >LS483440.1|SQH55193.1|643247_643508_+|Uncharacterised-protein MNKEQKIQELTKRIENSQAEIDELKKELEKLQKKPYKISYPKDGAEVYYFDDYTGEIEKRLFDIDHSYDKYLYEIGLSFQTEQQAE |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483440_1 | 1.1|639124|27|LS483440|CRISPRCasFinder | 639124-639150 | 27 | NZ_CP016476 | Synechococcus sp. PCC 7003 plasmid unnamed2, complete sequence | 237931-237957 | 4 | 0.852 |
LS483440_2 | 2.1|651643|27|LS483440|CRISPRCasFinder | 651643-651669 | 27 | NC_011256 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl70, complete sequence | 21014-21040 | 5 | 0.815 |
LS483440_1 | 1.1|639124|27|LS483440|CRISPRCasFinder | 639124-639150 | 27 | NC_011774 | Bacillus cereus G9842 plasmid pG9842_140, complete sequence | 2198-2224 | 6 | 0.778 |
LS483440_2 | 2.1|651643|27|LS483440|CRISPRCasFinder | 651643-651669 | 27 | NC_014633 | Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence | 881287-881313 | 6 | 0.778 |
LS483440_2 | 2.1|651643|27|LS483440|CRISPRCasFinder | 651643-651669 | 27 | MN693747 | Marine virus AFVG_250M949, complete genome | 19208-19234 | 6 | 0.778 |
1. spacer 1.1|639124|27|LS483440|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP016476 (Synechococcus sp. PCC 7003 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 4, identity: 0.852
tcaaagttacatatctaaaaatcaagt CRISPR spacer tcaaagttaaatttctaaaaatcatat Protospacer ********* ** *********** .*
2. spacer 2.1|651643|27|LS483440|CRISPRCasFinder matches to NC_011256 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl70, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.815
actcagggagatgtaaaagaagatatt CRISPR spacer tttaaggaagatgtaaaaaaagatatt Protospacer .* ***.**********.********
3. spacer 1.1|639124|27|LS483440|CRISPRCasFinder matches to NC_011774 (Bacillus cereus G9842 plasmid pG9842_140, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
tcaaagttacatatctaaaaatcaagt CRISPR spacer aataaataacatatctaaaaatcaaga Protospacer **.* ******************
4. spacer 2.1|651643|27|LS483440|CRISPRCasFinder matches to NC_014633 (Ilyobacter polytropus DSM 2926 plasmid pILYOP01, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actcagggagatgtaaaagaagatatt CRISPR spacer ttccacgtagatgtaaaagaagatatc Protospacer ..** * ******************.
5. spacer 2.1|651643|27|LS483440|CRISPRCasFinder matches to MN693747 (Marine virus AFVG_250M949, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.778
actcagggagatgtaaaagaagatatt CRISPR spacer gttataggagatgtaacagaagatatt Protospacer ..* .********** **********
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
628212 : 664840
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483440|628212:664840|DBSCAN-SWA TTTAGCTATCTAAATACTTAATTCTTTCTTCGCATATTCTATAATCAATCTTAAATGATTCTGATATGTGAGTAATATTGTTTATTTCTTTAATTTCTTCATCTGACACAATAAAATAGCTTGCAAATAGGTCAGCTTCTATCTCTTGCCTTGATAATGGTACTCTTGAAATACGTCTAAGAAAATGCAAGTTTGAACCTCTGTGCAAAATAAAGTGTCCTAGTTCGTGAGCCATAGTATATCGTTTGTCCTCGTCAGATAAGTTATTATTAATGTGTATGTAGTGATATGTTTTGTTACTAATTTCTAACGTATGATATAGCCCTTTATTTGTTCCTAAATCGTTAAATAGTATTGTTACTCCTAATTGTCTAGCGATATTGAATGGATTAGTTGTTCCAAATTCCTCAACTAAGGAATAGTAGACATCTTTAATTGTCATTTTCAGTTTTGTGACGTGCCATAGCAATTCTTGCTGCTTGCTCGATTGAAGCACGCACTAATTCTTTTGTTACTTCATCCATTGGTTCCCCGCTATACATTAAGGCTTGATTACTATTTAAATTGTCCATTAAATCGTTAACCATATTTGCTATATCAATTTCTTTTTGGTTTGCTTTATCTTCTACTAAATCAGATTTATTTATCCCAAAATAATTAGCCATCATTTCTATTTTATCTATTCTAGGATAAGATTTTCCGTTTACCCAATCACTTATTGTTGAATAACTTATTCCTAAACTTTCAGATAGTTGGGTTCTTGAAACTTTATTAATTCTTAAATATCTTTTCAAATTATTGCTCATTGTTTTTTTGTTACCTAAATTACTCATGTTATCACCTCTTTTATGCTTTTATTATACGATATTATCGTAAAAAATTCAATCTTTTTTTAAAAAAATACGAAAAAACCGAAAAAAATACTTGACTTTACGATTTAACCGTAATATAATAAATTCAGGAGGTGAGGAAATGATACCTAATAAAACAAGGTTACCTTTGGCAGAATGGAGAAAAAGAAAATTGAAATTATCTCAACTAGAAGCCTCTAAACTAATAGGTGTAAGCAAAGACACTCTTAGTAATTATGAGCGCGGAACAAGTTTTCCAGATGTACCCATAATAAAAAAAATTGAAAAAGTATACGGTATAAAATATGACCAAATTATTTTTTTAACTTACGTTAACGATTAAATCGCAATTATTTTTTTTAATCATTAGTTACGGTTTAACCGTAATCTTAATAAAAAAAAGAAAGGAGAAAATTAATGGTTGAAAAAGAAAAAGTTATAAATAATAAAACATTAAAATCTGAAACAGTAGTGACAGATGGGAAAAATTATTCGAGTATAAAAATTACCCCCAACTCTATTGAATTGAGGGTGGGGAAGATTAAAAGTTAATATAAACTTTATCTTCTTTTTGAATTAATTCTTTATTTGATTTAAGTATGATCCTATCTTTATGCTGCTCAAAATATAATATTACTTCTTTAGGCAAAAGTTGAAGTTGAGCAATCACATCTTTACTTTGTTCGATAATAATTCTTGTAATTTCACCGTCACCAACGAAAGATGTATCAATATTGATTTTACCCTCAGTCAAAACTAAAGAATAATTTAAACTAATATCATTCATTATAATTCACCTCCTTTGAGGTAATTATATCACAAAAAGAAAGGAGTGATTAATATGTTCTCTAGTGATTTTATTGACAAACTTATCGACACAATCGCGGAGAAAGTTTATCAGATTTTAAAAGAAAAGTTAGTTCTTGATAGAAGGTTTAACCAAAAAGAACTCTGCAGAGAGTTAAATATAGGTCAAGATACCTTAGCTGAACTTAATATTCGAGGACTTAGACCTACTAAAGTAGGTAGACAATACATTTACCTAGAAAGCGAAGTTAATAAGTTTTTAAAAGAAAATACAATTTAAATTTAAGAGATCTAGCACATATCAAAGAAGTTAATGAAAGGGGTAAAAGAATAGAGATGAGCGTTCAATTTAAATGTATATATGTGGTGCTTATGTTAATAAATTTATGTTTAATTATTTACGCCCAGAAAACGAAAAATAGAACTTTAGAGATAGTCACCTGGGCGATAGTATTACATGTTCCGTTTATTTATTTCATATTGAGCTATTAATAGTGAAAGAAGGTCAAACATTTATGAAAGAGTTTAATAAGTTAATAAATGAACGTTTAAAAGAATTAAACATGAGTAAATACAAGTTAGCAAAGTTAACGGGGATTTTTGAACAAACAATTTATTCCATTTTAAAAGGGGAATCAAAGAATCCTAGATTAAATCACGTAATTAAAATAGCAACGGTATTAGACATAGATTTAAACAAATTGAAAGGAGAACAGCAATGATTAAACATTTACAAAAAAGAACATTAAACCTAATATACTGGACATTTACAATAATTTTCCTGTGTGCATTAGCAATGACTAAATTTGAGTTCGAACAACTTTTTGCAGGATACATATTAGTAACTGGGTCAATGTGGGTTGGATTTGATAAGAGATTTGAAAAGTATTTTGAATAGGAGGAACAAATTGAATAAATATGAATTACATAACAAATTAATAGAATTACAAGAACTGCAAAGAAAAGTTGATAGTCATATCAAAATATGGAACAAAATACACATAGAAACTGCTTTATGTGAAGAATTTCACGAATGGTACAACGCTATAGGATTTTTCAAAGATTGGAAACAAAATAAAACTCCAAAAGAAAAACAACTTGATGAATTAGCAGACTGTTTAGCATTTGCACTATCTCTAATGAACAATGATAAGCAAGTATATAGCATTGATAGATGTGCTTTTATTCTAAAACGTATTGAAAATAAAAATCATAAAAAAGCTATGATCAATGAAATTGAAACGGGATACTTATTTAATAAGCGAGTTGGAAACACTGTATATATCCAATCAACAGAGTTTGCTATTGAGTTAATCCTAGATATTGCAATGATTTATTATTCTTTAGAAGCTTTGTTTGAAGCGTACATTAAAAAATCAATGGTTAATATTCAAAGGCAAAAAGAGGGGTATTAAAAAAAGCAGCCGTTAAAACAACAGCTACTTAATAAAAAATTCAATTATAAAATAACACAAAAAAGGAGAAAAAGCAAGTGACAGAAAATAACATTAAAGATCCACAACATTACAAAATTGGAAATTTAGAAACAATAGATCTAATTCAAAAAACAGTAAAAGACTTTGGCAGTGTTTGTCAAGCTAACATTTTGAAATACGGAATCAGAGCTAATAAGAAACACGAAAATCCAAAGGATGATATTCAGAAAATAATTAGATATGGTGAATTTTGGTTAAATCATTTAGAGGATAAGCCAGCAAGCAGTCCTCGAGTTGAAGAAATAGCAACCATAGACAAGTTAAAAGATATGCTGAACGAACAAGAGAAAGAGCTTATCCAGGATAAGAAGATTAAGTGTGTTGTTCTTGACGGTAAGCAAGTTCCAAAAGAGATTGCACAAGATTTATTAGATAGGTTAGGAGGTATGTAGCACAATGGGAATTAGAAGATATTCCGACATTATCGAAGATATCCGTTTTATGAGTAATAAAATATCTGACATACTTGACGAAGTACATTTTGACAGTTTGGAAAGACGAAAAATAAGAGAAGCACAAGATATCTTAGACAACAAAGTCTGTGAAATGGAGGATTTTAAAAATGAGGAAGAATGTTGGAGTTAATTTAACTCAAGCAATTAGGAATTATATTTTTAATAATCCTGGTTGCAGCAAATATGATTTGGTTAATGACTTAGGTTTTCCTTATTCCAAAATGAGGATGGCTATAAGTAAACTAAAAAATAATGGTGAAATTTTAATCGAAAATGGATGTTATACGGCTCTGGAAAGCTTGTCTTATTTAAAAGAGTATAATCAAACACCCGAAGAGTTCTCAAGAAGAGAATATCTTAAAAAATTAGTAGATGTAGTAATATCCAATATCCAAGAATGTACTGACCACAATATTAAGATCCAATACATTCAAGAAGGCAGAAGATTATTAAAAGATTTAAAATAAAGGAGATTTTTAAAAATGGAATTAAAAGTAAACGTAAATGTAATTATTGCGAGCAAAGAAGATGTGAATTTGTTGGAAGATGTTCTTATTAAACTGGGTAATGGTGAATTTAATGTGGGAAGCATTTCTACCCAAAATATATCATCAGTTCCAACTAATATAAATCAACCAGTTCAAGAAATTCAAAATGTTGTCCCAATTACCCCAGCGCAAAATACCGCTCCAGTACAAACTCAACCGGTGCAAACAGCAGTGCCAACGACTGCGAAAACTTATACTTTAGAAGATTTACAACGTGCTTCTGGTGCATTAGTGCAAGCTGGAAAAATTCAACAGTTGCAAGGCTTATTACAACAATTTAATGCTGTATCATTGGCACATTTAGCACAGGAGAACTTTGGAGCTTTTGCGCTTAAATTAAGGGAGTTAGGGGCGGATATCTAATGACTGAAATTAATCACAAAGAAAGGGCGCATGCTAAGCTTAGCGCTAGCGGTGCTAGTAGGTGGGCGACTTGTCCTGGTAGCGTGCAGATGGAAGATGGTATTCCAGATAGCGAATCTGTGTATGCAAAGGAAGGGACTTTAGCGCACGAATTAAGTGAACTTAAACTTAAGCATTATTTAGATCCAAAAGGATTTGGAAAAAGAAAGCTTAATGCAGCAGTTAAAAAGCTTAAAGAAAATGGATTATATCAAACTGAAATGGATTCTTATACAGATTCTTATGTGGATTTCATTAAAGAAAAAGCCTTGAGTTATTCATCTCAGCCTTACATTGAGATTGAAAAAAGAGTTGATTTTTCTAGCTGGGTTCCGGGAGGATTTGGGACTTGTGACTGTATTATTATTCAAGGCAACACGCTTTCTATCGTTGATTTGAAATACGGTAAAGGTGTTCCTGTTTCAGCAGAACAAAATGAAC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>LS483440|628212:664840|663256_663457_+|SQH55218.1|DBSCAN-SWA MQHNEVLPIHLIAQELSEKTVELAHYKVAYQQLNEEVEELKGLKELIDSNKELKELVEEIKSKEDK >LS483440|628212:664840|651489_651744_+|SQH55204.1|DBSCAN-SWA MVKYITNVEFKDRYTWEIIPKGTELELTEERAEEIINVLGEEALIKEGENRTQGDVKEDIEEALIKEGENRSPGDVKEDDKEVE >LS483440|628212:664840|629183_629405_+|SQH55168.1|DBSCAN-SWA MIPNKTRLPLAEWRKRKLKLSQLEASKLIGVSKDTLSNYERGTSFPDVPIIKKIEKVYGIKYDQIIFLTYVND >LS483440|628212:664840|644779_645205_+|SQH55197.1|DBSCAN-SWA MAKLTLKQRKFADEYIISGNIEQSALNAGYSANYSRSQSHKLLANVGIKSYIDERLKEIESEKTATQQEVLEYLTSVMRGEHKEQTLIGRGQGFQEITNISVSAKDRLKAADILNKIHMAREEKSATATENIVIVDRWEDG >LS483440|628212:664840|632730_633912_+|SQH55179.1|DBSCAN-SWA 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56 | Streptococcus_phage(40.62%) | holin,terminase,portal,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
797959 : 809449
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483440|797959:809449|DBSCAN-SWA GATGAGTAACAAAAGAATTTTTATTAAAAAGCGTCAAGGATATAATAAGGAAGAATTACAGCTGAAAAATACGCTAAATCTAGAGTATAATCTAGATTTAGATAATGTTCAGGTGTATGTTATTTATGATATTTACAATATTGATGAAGAAACTTATAAACTAGCTAAAACTTCGGTATTTTCTGAAGTCGTTGTTGATGAAGTTTTTGAGAGTATTGATTTAGAAGAAGGAAAATATTTCGCTTATGAAGTGCTCCCTGCTCAATACGATCAAAGAGCTGATAGTGCGACTCAGTGTATAAAGTTGCTTAATGCGAAAAGCGAAGCAACTGTTAGAAGTGGTAAGCTAGTTATTTTTGATAAAAAATTAAATTCTGATGAATTGAAATTAGTGGAAAATTATCTAGTAAATCCAATTGAAGCACGAGTTAAGGATTTATCAGTATTAGAATTTTCACTAAATTCTGAACCTAAACCTCTTAAAAAACTGGATGGATTTTTGGAATATTCTCACTTGCAGTTAGAAGCTGTAAAAAAAGAGTTTTCTCTAGCAATGAATATAGAAGATTTAGAATTTATTCAAAGTTATTTTAAAACAGAAGGACGTATTCCAACTGAAACTGAGATTTATGTTCTTGATTGTTATTGGAGTGATCACTGCCGTCATACAACATTTGAAACTGTTCTTGATGAAATTAATATTGAGTCTGAACTTTTCAAAAAGGAAATGCAAGATGCGTTTGATTACTATCTAAAAGTTCGTGGAGAGCTTAATCGTGAAGATAAACCGTTAACACTTATGGATATGGCAAGTATTATTGGTAAATATCATGTTGGTATATTAAATGATGAAAATATCGAAGTGAGTGAAGAAATTAATGCATGTTCATTCTTTACAACTATTCAAAATAAAGGTAAAGAAGAACGTTGGTTAATTCAGTTTAAAAACGAAACACATAATCATCCAAGTGAAATTGAACCATTTGGTGGGGCAAGTACTTGTATAGGAGGAGCTATTCGAGATCCACTATCAGGACGTAGTTATGTATATCAAGCTATGCGTATCTCTGGAAGTGGAAATATTCTCCAAAAACATGAAGATACTTTAGCACATAAACTTCCACAGGTAGAGATAGCAAAAGGAACAGCGCACGGTAACTCATCGTATGGGAATCAAATTGGTTTAGCAACAACGTTTGTTCGTGAAATTTATGATGATAGTTATGTTGCTAAACATATGGAAGTTGGAGCTGTTGTAGGAGCTGTAAAAGAAGGAGATTATAAACGTGAAACTTTAGTCGCTGGAGATATTGTTGTGATGATTGGTGGTCGTACTGGTCGTGATGGTATCCAAGGCGCAAGTGGTTCAAGTGTTGAGCACACAAATGATTCTTTAGAAACTATGTCAAGTCAAGTACAGAAAGGTAATGCTCCTGAAGAAAGAAAATTACAAAGGTTGTTTAGAAAACCAGAAGTTACTAGACTTATTAAAAAATGTAATGACTTTGGTGCTGGCGGAGTTTGTGTTTCTATCGGAGAGTTATCAGACGGTATTGAAATTCACCTTGATAAAGTTCTAACAAAATATAAAGGACTTAATGCAACGGAACTTGCTACTAGTGAATCGCAAGAGAGAATGTCTGTTGCGATTGACAGAAAAGATTATGATGCATTTGTTCGTGAATGTGAAAAAGAAAATATTGAGTATGCACATGTTGCAACTGTAACAGACCGTCGCCGCTTAGAAATGTATTACAATGATGAAAAAGTAGTAGACATGAGTGCAGATTTCTTGGAAACAAGTGGTGTAAGACAACATACTAAAGCAACATTAGTAGATAATAAAGCTAAAAATCCATTTACAGATAAAGAATTTTCTAGAGAAGCTGTGTTAAAAGAACTTGGAGAATTAAATGTAACTTGCCAAAAAGGATTAGCTTCAAAATTCGACTCTTCAATTGGAGCTTCAACAGTTCTTATGCCATTTGCAGGTCGTCATAAACTTACACCTGTTCAAGCAAGTGTTCAAGCATTACCAACATTGCACTCAACAAGCGATACGGCAACGATCCTTACATATGGATTTATTCCGAAAATTTCATACTATTCACCATTTTTATCTTCTATCTACGCAGTGTTAGAATCAGTAGCTAAAGTTTATGCAGTCGGTGGTACACGAGAAAGTCTTTACTTCTCATTCCAAGAGTATTTCGAAAAACTTGGTAAAGATAGCTCTAAATGGGGTAAAGTTACTCAAAGTTTATTAGGAAGTATTTATGCTCAACGTGAAATTGGTCGTCCAAGTATTGGCGGAAAAGATAGTATGTCAGGAACGTTCAATGATCTTAATGTTGTAGAAACACTAATTTCATTTGCCTGCGTGCCTGTAAAAATAAATGATGTTATAACTCCAGAGTTGAAAGAAGTTGGTAACAAACTTTATTATGTGCCAGTAGTAAAAGATGAAAAAGGATATCCAGATATTGCAGCTACTTTAGAAAATTATGAACTTGTTCATAAATATATTAAAGAAGGTAAAGTAGTTTCAGCATATGTTCAAGAAGAAGGTAGCTTAGCCGCTTCTCTAGTTAAAATGTCATTAGGTAACGATTTAGGATTTGAAGTAGAAAAAGAAAATATTTTAAACTTTGATCCAGCATCATTAGTAGTGGAAGCAAAAGAAAAATTACCATTTGAATGTATTGGTAAAGTAAGCAGTAGAATTATAATAAACAATGAATTATTTACACATAATGATATATATGAAGCTTATACAGCTACTCTAAATGATATTTATCCGATGTATCAAAACGAAGATAAAGGAACTGTAGAAAATCTTCATACAGAAAATAAAGGACGAAAATATTATCCAGAATATGTAGAGGATGTAAAAGTAGTTATACCTGTCTTCCCTGGTACGAACTGTGAGTATGATAGTGAGAAAGCATTTATTGAAGCAGGAGCAACTCCTACGACAGTAGTAATCAGAAATACTCGAGAAAATGATATTAATGAATCAATAGAAGAGTTTGTAAATGCAGTAAAAGAATCTCATATCATTATGTTCCCAGGTGGATTTTCTAGTGGAGATGAACCAGACGGAAGTGCTAAGTATATTGTTAACTTCTTAAAAAATGAAAAGGTAAAAAATGCTATTCACAAACATTTAGCTGAGAAAAAACTTATATTAGGAATCTGTAATGGATTCCAGGCATTGCTTAAATCAGGATTACTTCCTTATGGAGAAATACGTGAATTGAATGAGGATGACCTTACGTTATACCGAAATGATAGTTATGAACATATTTCAACAACAGCATTTACTCGTGTAGCAAATGCAAATTCACCTTGGTTACAAGATTTTACAATCGGAACTGAACACGAAGTGGTATTTAGTCATGGAGAAGGAAAAGTAGTTGGTCTTAATATAGACAAATTCAAACACTTAATTGCTTTCCAATACTGTGATTTTAATGGAAATGCAACATTAAATGGTAGATTTAACCCTAATGGATCTTACTTAGCAACAGAAGGTTTAATAAGTGAAGATGGACTTATCCTTGGTAAGATGGGACACAGTGAACGTTTTGGAGAAAGTTTATATAAAACAAATACAATAAAAGTCAAACAAGATATATTTAAAAATGGTGTAAATTATTTCAAAGGGGAAAAATAAAATGAAATTACTATACGAAGGAAAAGCAAAACAATTATTCGAATGTGAAAATAAAGATGAAATTTATGTTCATTATAAAAATAGTGCGACAGCATTTAATGGAGTTAAAAAAGAAGAATTTGAACATAAAGGAATTTTTAACAATACAATTACTTCTTTAATCTTTGAGTATTTAGAAAAAGAAGGTGTTGAAACACATTTTATAAAAAAAATTAATGAAACAGACCAACTTTGTAAACATGTTACGATAATTCCGTTAGAAGTTATTGTAAGAAACATAGTAGCAGGTTCAATGGCTAAAAAGTATGGTATAGAAGAAGGAAAAAAATTAGCAAAACCTGTTTTTGAACTTAGCTATAAAAATGATGATTTGAATGATCCTCTTATTAATGATGACCACGCTGTGGCATTAGAAATAGTAACAGAAGAAGAACTTGCGAATATACGTGAGCAAGCATTAAAAATTAATTCTTTACTTCAAAAATTATATTTAAAAGCAAACTTAGTATTAGTAGATTTCAAAATTGAATTTGGAAAAGATAAAAACGGTAAAATCATTTTAGCTGATGAAATTTCTCCAGATACATGCCGACTTTGGGATAAAGATACAAATGAGAAATTAGATAAAGATAGATTTAGACGTGATTTAGGTTCTGTAATGGAAGCTTACGAAGAAGTTTTAAGGAGATTAGAAGATGCGAGGGCTTAACGAAGAATGTGGAGTGTTTGGAATTTGGGGACATCCAGAAGCAAGTAATGTTACATATTTTGGGTTGCACAGCTTACAACACCGTGGTCAAGAAGGTGGAGGAATCGTTTCTAACGATAAAGAAGTTTTACGTGGGCATAGGGATCTTGGATTAATATCTGAGGTTTTCCGTGATAAAAAAAAGTTAGAAAATCTACTAGGGAGTAGTGCCATTGGGCATGTTCGTTATGCGACGTCAGGTAGCAATAATATCCAAAACATTCAGCCATTTTTATTTCATTTTTATGATATGAGTGTTGGGATATGTCATAACGGTAACCTTATTAATGCAAAAACACTACGTCGTGAATTAGAACAAGATGGAGCGATTTTCCATTCTTCATCTGATACAGAGGTACTTATTCATCTAATTCGACGAAGTAAGGAAAAGGGATTTAAAGCACAACTTAAAGATGCCCTTTGTAAAATTAAAGGTGGTTTTACCTACTTAGTATTAACAAAAGATACTATGTATGGTGCTGTTGATCCGAATAGCTTGCGTCCACTTGCTATCGGTAAAATGAAAAATGGTGCATATGTTGCTGCTAGTGAAACATGCGCTATTGATGTAGTAGG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ATAAATGGAGGACGCGTCTTATTAGTTTGTGCTAGTGGCGAAAACTTGCAAGCCGCACGTGAAAAAGTATATAATGAAATAGGAAAAATAGAATGCGATGACTTGTTTTTCCGTAAAGATATAGGTCATCATTCATTATAATATTATGTAAATGAAGTAAAAATATAGAATCTAGGAGATACTTTAATGATAGAAAGATATAGTAGAGAACCTATGCGTAGTATTTTCAGTGATGAAAATCGTTTTAAAGCATATTTAGAAGTAGAACTTTTTGCAACTGAAGCATGGAGTAAACTAGGAGTTGTTCCAGAAAATGATGTAAAAAAATTATTTGAAAATGCTAAGTTTGATTTAGAAGGAATCTTAGAATTAGAAAAAGAAACTAAACATGATATTGTCGCATTTACTCGTAATGTGTCTAGTTATTTGGGAGAAGAAAAAAAATGGGTTCATTATGGGCTTACTTCTACTGATGTTGTTGATACAGCATATGGTTATTTATACAAACAAGCTAACGATATCATCATGGAAGATTTACTAAAATTCCAAGAGGTATTAAAAGAAAAAGCTTTAGAATATAAATTTACACCATGTATCGGCCGTACTCATGGGGTACATGCTGATATCAGTAGTTTCGGATTAAAATTTGCTTTATATTATGATGAATTCAACCGTCATATTGAGCGCTTTAAAGCAGTTAGAAAAATAATAGAAGTAGGTAAAATTTCTGGAGCAGTTGGAACATTCTCTAACACTCCACCTGAAGTTCAAGATTATGTGTGCGAAAAATTAGGAATTCAGTCAAGTAACATTTCAACACAAACATTACAACGTGATCGTCATGCCGATTATTATTCAACGTTGGCTTTAATAGCAAGTTCTATTGAAAAAATTGGTGTAGAAATTCGTCACTTACAGCGTACTGAAGTCCGTGAAGCGGAAGAATTTTTCTCAAAAAATCAAAAAGGTTCTAGTGCGATGCCGCACAAACGAAATCCAATTTCAAGTGAAAATATGGCAGGATGTGCAAGAATTATGCGTGGATATATGTTAGCTTCATATGAAAATATTCCACTTTGGCATGAACGTGATATTTCTCACTCAAGTGCAGAACGCATTTTAAGTAGTGATGCAACAACATTATTAGACTATATGTTGAATAGATTTACAAATGTTGTTAAAAACTTAACAGTATTTACAGATAATATGATAAAAAATATTTATGCGACTAATGGTGTTATCTTTGCTCAAAGAACAATGAGTAATTTAATAGAAAAATATGATTTTTCTCGTGAAGAAGCATACGATTTAGTTCAACCACTTGCCATGAAATCTTGGTTCGAAGGTATACCATTTAGACAACTTTTAGAGGAAAACGAAGTTATTCAAAACACTGTTTCTAAAGAAGTACTAGATAGCTGCTTTGCACTAGAAGTACATTTGGTTAATATTGATAAGATTTATAAACGTATTCCAGGTTTAGAAGACTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483440|797959:809449|797959_801634_+|SQH55344.1|DBSCAN-SWA MSNKRIFIKKRQGYNKEELQLKNTLNLEYNLDLDNVQVYVIYDIYNIDEETYKLAKTSVFSEVVVDEVFESIDLEEGKYFAYEVLPAQYDQRADSATQCIKLLNAKSEATVRSGKLVIFDKKLNSDELKLVENYLVNPIEARVKDLSVLEFSLNSEPKPLKKLDGFLEYSHLQLEAVKKEFSLAMNIEDLEFIQSYFKTEGRIPTETEIYVLDCYWSDHCRHTTFETVLDEINIESELFKKEMQDAFDYYLKVRGELNREDKPLTLMDMASIIGKYHVGILNDENIEVSEEINACSFFTTIQNKGKEERWLIQFKNETHNHPSEIEPFGGASTCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRISGSGNILQKHEDTLAHKLPQVEIAKGTAHGNSSYGNQIGLATTFVREIYDDSYVAKHMEVGAVVGAVKEGDYKRETLVAGDIVVMIGGRTGRDGIQGASGSSVEHTNDSLETMSSQVQKGNAPEERKLQRLFRKPEVTRLIKKCNDFGAGGVCVSIGELSDGIEIHLDKVLTKYKGLNATELATSESQERMSVAIDRKDYDAFVRECEKENIEYAHVATVTDRRRLEMYYNDEKVVDMSADFLETSGVRQHTKATLVDNKAKNPFTDKEFSREAVLKELGELNVTCQKGLASKFDSSIGASTVLMPFAGRHKLTPVQASVQALPTLHSTSDTATILTYGFIPKISYYSPFLSSIYAVLESVAKVYAVGGTRESLYFSFQEYFEKLGKDSSKWGKVTQSLLGSIYAQREIGRPSIGGKDSMSGTFNDLNVVETLISFACVPVKINDVITPELKEVGNKLYYVPVVKDEKGYPDIAATLENYELVHKYIKEGKVVSAYVQEEGSLAASLVKMSLGNDLGFEVEKENILNFDPASLVVEAKEKLPFECIGKVSSRIIINNELFTHNDIYEAYTATLNDIYPMYQNEDKGTVENLHTENKGRKYYPEYVEDVKVVIPVFPGTNCEYDSEKAFIEAGATPTTVVIRNTRENDINESIEEFVNAVKESHIIMFPGGFSSGDEPDGSAKYIVNFLKNEKVKNAIHKHLAEKKLILGICNGFQALLKSGLLPYGEIRELNEDDLTLYRNDSYEHISTTAFTRVANANSPWLQDFTIGTEHEVVFSHGEGKVVGLNIDKFKHLIAFQYCDFNGNATLNGRFNPNGSYLATEGLISEDGLILGKMGHSERFGESLYKTNTIKVKQDIFKNGVNYFKGEK >LS483440|797959:809449|806863_808099_+|SQH55350.1|DBSCAN-SWA MAKVLVVGAGGREHAIAYKFNQEGHEVYMAGINPAVEKFGICIDIKEDDIPSYALENNIDLVFVGPEVPLVNGLVDKLQEKGIRAFGPSKKAAQLEGSKVFSKMMMEKYNIPTAKHESFSDYEKASEYLSQQKAPIVLKADGLAAGKGVIIAETLEEAQYELKEMMCNSKFAAAGANVVIEEFLSGEEFSLMCFVSDRKVYPMEIAQDHKRTFDNDEGLNTGGMGAYCPLKKITQDDVNEGLEKVVQPMVDAMSSEGMPFYGILYAGLMKCADGVKTIEFNVRFGDPESEVLLLKLESSLYEISNNIIDGKDVQLKWNKDAFIGVVMAAKGYPEKSEKGAVINGLEKLTTPVFHMGTKQVDDNIVINGGRVLLVCASGENLQAAREKVYNEIGKIECDDLFFRKDIGHHSL >LS483440|797959:809449|805343_806864_+|SQH55349.1|DBSCAN-SWA MTKRALISVSDKTNIVEFAKGLEKHGFEIISTGGTFTYLKNNGVACISIEDVTHFPEILEGRVKTLHPKIHGGLLSKRGNELHNKHVAENNIEYIDLVCVNLYPFEATVKKEGVSEEEIIENIDIGGPSMLRSAAKNFNDVTVVTDIRDYDRILNELENGGITLATRRSLAIKVFNTTASYDAAIANYFNKADNLIPEKLTLSYTLEDTLRYGENPHQKAYHYVQDNNESYALQNAVQLHGKEMSYNNIQDASAALDILAEFDEIACVAVKHMNPCGVAIGKDVFEAYSRAYDADPVSIFGGIVAVNGVVDKATAEKMHSIFLEIILAVDYDDEALEILTKKKNLRIYKLGEKNNNHEQQIKSVRGGILVQDFNSALAENYEVVTDKQPTKEQMSDLEFGLKVVKHVKSNAIVVVKNGQTLGIGAGQMNRVGSCKIALEQAGALADGAVLASDAFFPMRDSADLAAEYNIAAIVQPGGSIRDQESIDACNEKGMAMLFSKIRHFKH >LS483440|797959:809449|808144_809449_+|SQH55351.1|DBSCAN-SWA MIERYSREPMRSIFSDENRFKAYLEVELFATEAWSKLGVVPENDVKKLFENAKFDLEGILELEKETKHDIVAFTRNVSSYLGEEKKWVHYGLTSTDVVDTAYGYLYKQANDIIMEDLLKFQEVLKEKALEYKFTPCIGRTHGVHADISSFGLKFALYYDEFNRHIERFKAVRKIIEVGKISGAVGTFSNTPPEVQDYVCEKLGIQSSNISTQTLQRDRHADYYSTLALIASSIEKIGVEIRHLQRTEVREAEEFFSKNQKGSSAMPHKRNPISSENMAGCARIMRGYMLASYENIPLWHERDISHSSAERILSSDATTLLDYMLNRFTNVVKNLTVFTDNMIKNIYATNGVIFAQRTMSNLIEKYDFSREEAYDLVQPLAMKSWFEGIPFRQLLEENEVIQNTVSKEVLDSCFALEVHLVNIDKIYKRIPGLED >LS483440|797959:809449|804780_805347_+|SQH55348.1|DBSCAN-SWA MKKQVAIFASGTGSNFEKIADDNRLKEKMDIALLVCDKPNAAVIKKAQDRNINTYVFSTKDFASKQDYEAAILEQVKDLDYIFLAGYMRIISPYFLENYKKTILNLHPSLLPKYKGKDAIEQAYKAQEREVGISIHYVNEELDGGEVIAQKSLIVKDGETLKEVTARIHELEHELYPNVILKLVEEAL >LS483440|797959:809449|802329_803787_+|SQH55346.1|DBSCAN-SWA MRGLNEECGVFGIWGHPEASNVTYFGLHSLQHRGQEGGGIVSNDKEVLRGHRDLGLISEVFRDKKKLENLLGSSAIGHVRYATSGSNNIQNIQPFLFHFYDMSVGICHNGNLINAKTLRRELEQDGAIFHSSSDTEVLIHLIRRSKEKGFKAQLKDALCKIKGGFTYLVLTKDTMYGAVDPNSLRPLAIGKMKNGAYVAASETCAIDVVGAEFVCNVGAGELVIIDDKGIRIEKYTEDTKVAIAAMEYVYFARPDSNIAGVNVHTARKRTGRRLAIEQPAPDADMVIGVPNSSLSAASGYAEESGLPYEMGLIKNQYVARTFIQPTQELREQGVRMKLSAVKGVVSGKSIVLVDDSIVRGTTSKRIVQLLKEAGAREVHVRISAPPLIFPSFYGIDISTTEELIAANKTQDEICEIIGADSLGYLSEDGLIESIGLDYDAPYTGLCMDCFNGDYSAGLYDYEEDYLKSMTNIQKKFLQERGKNNE >LS483440|797959:809449|801635_802343_+|SQH55345.1|DBSCAN-SWA MKLLYEGKAKQLFECENKDEIYVHYKNSATAFNGVKKEEFEHKGIFNNTITSLIFEYLEKEGVETHFIKKINETDQLCKHVTIIPLEVIVRNIVAGSMAKKYGIEEGKKLAKPVFELSYKNDDLNDPLINDDHAVALEIVTEEELANIREQALKINSLLQKLYLKANLVLVDFKIEFGKDKNGKIILADEISPDTCRLWDKDTNEKLDKDRFRRDLGSVMEAYEEVLRRLEDARA >LS483440|797959:809449|803779_804784_+|SQH55347.1|DBSCAN-SWA MSKKYEESGVSLEAGYKSVELIKKHVARTKNLGMMSAIGGFGGAFDLSSYNFKNPVLISGTDGVGTKLKLAFELDIHNTIGIDVVAMCVNDILAQGAQPLFFLDYLAVGKNYPEQVEQIVEGVAEGCVQAGCAIVGGETAEMAGFYDDGEYDIAGFSVGAAEKEDLLSPENTKAGQVVIGLPSTGVHSNGFSLVRKIIRDNNISLDEKFGDSTIGKTLLTPTKIYVKEVLKVLKEVKVAGIAHITGGGFHENLPRCLKEGLGMKINKDSYEVPEIFKYLQEKGNIDEAEMYNIFNMGVGMALVVNKEDVEKTLSLLDDAFVLGEVVNESGIEII |
8 | Synechococcus_phage(28.57%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1132690 : 1139320
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483440|1132690:1139320|DBSCAN-SWA CATGGCTACAAAAATTACTAGAGAAGATATTTTAAAAAGAATTAAAGAAGAAAATGTGAAATACATTAGATTACAATTTACAGATATTACTGGTACAATAAAAAATGTAGAGGTGCCTGTAAGCCAAATTGAAAAAGTTTTAGATAATAAAATGATGTTTGATGGTTCTTCTATAGAAGGCTTTGTTCGTATTGAAGAAAGTGATATGTATTTATACCCAGATTTAAACACATTCTTAGTATTCTCATGGGATAGTGAATATGGAAAAGTAGCACGCTTTATCTGTGATGTGTATACTGTTGACGGAAAACCTTTTGCCGGTGATCCACGCGGTAATTTAAAACGAATTCTTAAAAAAATGAATGAATTAGGTTTTGATACATTAAATTTAGGACCAGAACCAGAATTTTTCCTATTTAGGCTTAAAGAAAATGGCGAACCTAGTTTAGAATTGAATGATAATGGTGGTTATTTTGACTTAGCTCCTGTTGATCTTGGGGAAAATGTACGACGTGATATTGTTTTAGAATTAGAGAACCTTGGTTTTGATATCGAAGCCAGTCATCATGAGGTGGCTCCAGGTCAACACGAAATAGATTTCAAATATGATGATGTAATCTCAGCTTGTGATAACATTCAAACTTTTAAACTTATTGTCAAAACTATAGCGAGAAAACACGGTCTACATGCAACATTTATGCCTAAACCTATGTTTGGTATCAATGGTTCTGGTATGCACTGTAATGTCTCTTTATTTAGTAAAGGAGAAAATAGTTTTTATGATAAAAACAGCAAAAACGGCCTTTCAGAAACAGCTTCCCATTTTATCGCTGGAATTTTAAAACATGCACGTAGTTTCACAGCCGTTTGTAACCCTACAGTTAACTCTTATAAACGTCTAGTGCCCGGATATGAAGCACCTTGTTATGTTGCTTGGTCTACTTCCAATAGATCTCCATTAGTTAGAGTACCCGCATCTCGTGGAAAATCAACACGTGTAGAGGTTAGATCTGTTGATCCAGCTGCTAATCCATACTTAGCAATGTCTACTATTCTAGCTGCCGGTCTAGATGGTATAGAAAACAAACTTGTTCCTGCTGATGAAGTAAAAAGTAATATTTATGTCATGACTCGTGAGGAAAGAATTGCAAATGGAATAGATGAACTCCCTTCTACTTTATATACAGCACTTAAAGAACTAAACTCTTCATCAATCATGAAAGAAGCTCTTGGTAAACACATCTTCTATAATTTTATCGAAGCAAAATCTATAGAATGGGATTCATTTAGAACACAAGTTACAGATTGGGAAATTGATCATTATTTAAAAAATTATTAATTATAAGATAAAGGAAGTCAATGTACTGACTTCCTTTAATCTATATTTTCAAAAAATCCCTAATTTTAAAATTAGGGATTTTTACTATTAATTAATATTTAGATAATAATTGCACTAATGTTTCTTTTGGTTGGTAACCTGTTTTTTCTTCTAAAACTTCACCATTTTTCATTACAAGTAATGTAGGAATTGACATTACTCCGTATTCTCCAGCTGCTTCTTGATTTTCATCTACATTAATTTTATAGAATTCAATGTTAGTAAGCTCATTTGAAACTTCTTCTAACACTGGCGCTAGCATTTTACAAGGACCACACCATGGTGCCCAAAAGTCAAAAACCTTAACGCTGTCTGTTTTTGATAATTCAAAAAATTCTTTATCTGTAATCTCTCTCATTATTTTATCTCCTTTTACTTTATATAATTCTATCTTATTATAATATTATCACTTATTCAACTATTTTGCATTTTCAAGAATACTACATCATTGGCATCTGAGGTTGCATAGGCAATTCCTCTGTAATATCAGCTACAACTGCTTCTGTTGATAAGAATAAACTAGACACACTCGCAGCATTTTGTAACGCTGAACGAGTTACTTTCGTTGGGTCTACTATTCCCGCTTTTATCATATCAACCCATTCTTCTGTAGCAGCATTAAACCCTATACCTATTTCTTCAGATTTTAGTTTTTCAACAATAACACTACTTTCTAATCCTGCGTTTTCTGCAATCTGACGAACCGGTGCTTCTAGTGCTTTTTTTATAATATTAATACCTGTTTGTTCATCACCTGTAGCTACTAATTTTTCCACTTCAGAAATCACTTGAACAAGAGCTGTTCCTCCTCCTGCAACAATTCCTTCTTCGACCGCAGCACGAGTTGAATTAAGCGCGTCTTCTATGCGTAGTTTTTTCTCTTTTAGTTCTGTTTCTGTCGCTGCACCAACTTTTATTACAGCTACACCACCTGATAATTTTGCTAAGCGTTCCTGTAACTTCTCACGATCAAACTCTGAAGTTGATTCTGCATATAATGATTTTATTTGGCTTTTACGACTTTCTATATCTTCTTTATTTCCCTTACCATCAACAATAATCGTACGTTCTTTTGTAACATTTACTTTTGATGAATTACCTAACATTGTAATATTCGCATCCTTAAGATCTAATCCTAAGTCTTCTGTTATTAATGTTGCTCCTGTTAATATAGAAATATCTTCTAAAATTGCTTTTCTTCTTTCACCAAAACCAGGTGCTTTAACAGCTACTACATTGAATGTCCCGCGCAATTTGTTGACTACCAACGTCGCTATAGCTTCTTGTTCGACATCATCCGCTATAATAAGAAGTGGTTTGGCAGCAGCAACTACTTCTTCTAAAACTGGCAAAATTTCTTGAACTGCATTAATCTTTTTATCAGTAACAAGAATATATGGATTGTCTAAATCCGCTAGCATTTTCTCTGTATCGCTTACCATATATGGCGAAAGATATCCACGGTCAAACTGCATACCTTCTACAACTTCTAGCATAGTTTCTAATCCTTGAGATTCTTCGATAGTAATAACACCGTCATTTCCTACTTTATCCATTGCTTCAGAAATAAACTTACCTACTTCTTCATCCGCAGCAGAAATAGCACCTACTTGAGCTATTTTACCTTTAGAATCTACAGTTACGCTAATTTCACGAAGACGTTCAACTGCAACTTTGACTGCACGCTCCATTCCGCGACGCAGCCCGACAGGATTTGCCCCGCTAGTTACATTTTTAAGACCTTCCGTTATCATTGATTGTGCCAAAATTGTTGCTGTAGTAGTACCATCTCCTGCAATTTCATTAGTTTTATTTGCAACTTCGGCTACTAATTTGGCCCCCATATTTTCATAAGGATCTTCTAATTCTATTTCTTTAGCTATCGATACTCCATCATTTGTGATTAGTGGTGATCCAAACTTTCTATCTAACACAACATTACGCCCCTTAGGTCCTAATGTTACTTTAACAGCATTAGCAAGCTTATCAACACCACGCTTCATTGATTGACGTGCATCTTCTGAAAATTTTAACTCTTTAACCATATATCCTCCTAATCTTCTATTACTGCAAGAACTTCCTCTTCATTAACTAAATAATATTCTTGCCCTTCAAAATCTACTTTTTTATACTTATCAGAAAAAACTACTTTACTTCCTGCACTTAGTTCTCCTTCATTATCAGTAGATAGTAAACAACTCTCACCCAACGCTACTACTATTCCAATGTTAGATGTATCCTCTTTAGAAGCCAAGACAATTCCACTAGTTGTCGCTTTCTCTACCTCAATTTTTTTTAGTAAAACATTGTCAAATAACGGTTTAATCATTTCTATTACCTCTTTTTTTAAATTATGTCATTAATAATTATATATCATATTAACTTTAAAGCAAAATAAATAATTTATTAATAAAATCTTCTTTATATATATTCTTTATATATAATAAAAAAGATTTTTCTACTGTTCATAATAAAACAAAAGTCAAATAAAGTCAAATTATTGATTTTTATTTTTTAAGTGCATTTATATTTAACTTTTATCGTTATATTTTAAATTATAAAAAATTTCTACTAATTAGCTATATAATTATTTTTATTTTATTTTTTTTAAACAAATTATTTTTATATAAAAGCGTTTCATGTTAAAATTTAAAATGTATATTAATACACCTAATTATAATTTATAGATACAGGAGGAAAAACAATGAAATATATAGTTGTTGGAACATCGCACTTCGGATATGAAGCAGTTCAAACTATTTTAAAAAATGACAAAAATGCTGATATTCATTTATATGAGAGAGGCTCTAGCGCTTCTTTTATGGGATGAGGTAGTCAATCTTATTTAGATGGGACATCTAAAGCATTATCAGAATTACACTTTGCAACAGAAAAATCTTATGCTGAACAAGGAATTAATATTCACTGCAATAGCGATGTTATAGGATTGAATGCAAAAGAGAAATACATAATAGTAAAAACTTCTTCTGGAGAAGAAGAAAAACAAAACTATGATAAACTTCTTTTAAGCCCAGGTGGCGCAGCAATTAAACCACCATTTGAAGGAATAGAATTAGAGAATATTCATACATTCCGTGGCCCAGAAGATACTCAAGCAGTATACGATTGCATGCAAAAAAGTAAAAAAACAGTAGTTGTAGGTGGTGGCTATATCGGCCTTGAAGTTGCAGAATCTTATGCAAAACATGGCATCGATGTTACAATCGTTGATTTTGCTCCAAGGATTCTAAATACATATCTAGACCAAGAACTTACTGATATCCTAACTAATGAAGGTGCAAAACACAACCTTAAAGTTCATGGTGGGGAAAAAGTTCTTTCATTTAAAGGTGAAAACGGAAAAGTTACATCTGTTGTAACAGACAAAGGCGAATATGAAGCAGACACAGTAATTATGTCAGTTGGAGTTCGCCCTGACGCTTCATGGTTAAATGGTGAATTAGAATTAACTGAACGCGGCTTTGTTATAACTAATGAATACCTAGAAACATCTGCTAAAGATGTATATGCTGGTGGAGACTCTACACTTCTACCATACGCTCCTACTCGCGGTCAATTACCAATTGCACTTGCTACTTTAGCACGACGTCAAGGAGTAATTGCAGCATTAAATGCTATGGGAATCAAAACTAAAATGCCTGCTGTTAATGGTACATCAGCATTATCATTCTTTGATTATAAATTTGTGAGTACTGGATTATCACAAAATGGTGTTAACCTTTATGATGGCAAGGTCTCTTCTAAATATGTAGAGGAGAAGATTTACCCAGACTTTATGAGAAAAGAAAATAATCTTGTTCACATGAAAATCTACTTCGATGAAGATACACACAGAGTTTTAGGAGCTCAATTAATGTCTAAACATGACGTTTCTAGCGCTATCGCAGCATTATCTATAGCTATCGCATCAGACTGGACTTTAGAACAATTAGCACTTGCTGACATATTCTTCCAACCAGAATTTGATCGCCCATGGCACTTCATTAATGTACTTGCAATGGCAGCCCTTGATTATAAATTAGGTGGAGCAGATAAATTACTATTCTAATAAAACACTAAAAAAGTTCGTTGGAAAATTCCAATGAACTTTTTAATTACCAGAAATCACTTGGTCTAAATTCGATACTATTCTTGCTCTACCTTGAACTTTGAAATTAACAATATTATCAAACACATTTAGGATAATGACCTCTCCCTTATTTAATATTTCTAAAGCTTCTTCATTATTTGTTTTCTTAGTGATTACCTTCACATTATCAACTTCTGCCCTTATAATAATATAGCTAGTTTCTTTCATAATATACTCCTTATCTCTTTACAATTCTTCAAATTATAACTTAATTTTATATTGAATATCTTTGACTAGTTCTGTATCTTCTAAAAAAACACCAGTTTTTTTACTAGTTACTGTTTTTGAGCCTATTTTTTTAATACCACGCATTGCCATACACATATGCTCCGCTTCTATAATTACATATACACCTTTAGGTTGTAATTGCTCTTCTATTGCATTTACCAACATAAGTGTCATATCTTCTTGAATTTGAAGTCTACGGCTTGCACTCTCTACAAGACGCGCCAATTTACTAAGACCAGTGATTTTTTTATTATTAGGAACATAAGCGATATGGCAAACTCCGTAAAAAGGTAGCATGTGATGTTCGCATAACGAATAAAATTGAATATCTTTGACTAATATTGGTTCATCGTTCTCTGATTCAAAAAATGTATTAATTTCTTCTTTTGGATCCATATTAGTTTTAGACAGTAACTCTTCATACATATTTACACATCTTTTCGGTGTATCTATTAATCCAGCTCTTGAAGTATCTTCACCTATATTTTCTAATAATGTTTTTATTAGTTGTTGTGATTGTTCCTTATTTTTCAAAATTAACCTCCGAATTTTATAAAAAAAGAAGTTACCCGTAAGTAACTCCTCTTAAAATTAAATTTTTATTATTTAACTGCGTCTTTAAGAGCTTTACCAGCTTTGAATGCAGGTACTTTGCTTGCAGCGATTTCGATAACTTCGTTAGTTTGAGGGTTACGTCCTTTACGAGCAGCTCTCTCTCTAACTTCAAAATTACCAAATCCAATAATTTGGATTTTTTCACCTTTAGCTAAAGTTTCTTCAACTGTTTCTACGAATGCTTCGATAGCAGCAGTTGCTTGTTTTTTTTGTAGTCCTGATTTTTCAGCTACTTTTGAAATTAATTCTGATTTATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483440|1132690:1139320|1139047_1139320_-|SQH55665.1|DBSCAN-SWA MNKSELISKVAEKSGLQKKQATAAIEAFVETVEETLAKGEKIQIIGFGNFEVRERAARKGRNPQTNEVIEIAASKVPAFKAGKALKDAVK >LS483440|1132690:1139320|1134507_1136112_-|SQH55659.1|DBSCAN-SWA MVKELKFSEDARQSMKRGVDKLANAVKVTLGPKGRNVVLDRKFGSPLITNDGVSIAKEIELEDPYENMGAKLVAEVANKTNEIAGDGTTTATILAQSMITEGLKNVTSGANPVGLRRGMERAVKVAVERLREISVTVDSKGKIAQVGAISAADEEVGKFISEAMDKVGNDGVITIEESQGLETMLEVVEGMQFDRGYLSPYMVSDTEKMLADLDNPYILVTDKKINAVQEILPVLEEVVAAAKPLLIIADDVEQEAIATLVVNKLRGTFNVVAVKAPGFGERRKAILEDISILTGATLITEDLGLDLKDANITMLGNSSKVNVTKERTIIVDGKGNKEDIESRKSQIKSLYAESTSEFDREKLQERLAKLSGGVAVIKVGAATETELKEKKLRIEDALNSTRAAVEEGIVAGGGTALVQVISEVEKLVATGDEQTGINIIKKALEAPVRQIAENAGLESSVIVEKLKSEEIGIGFNAATEEWVDMIKAGIVDPTKVTRSALQNAASVSSLFLSTEAVVADITEELPMQPQMPMM >LS483440|1132690:1139320|1136771_1136897_+|SQH55661.1|DBSCAN-SWA MKYIVVGTSHFGYEAVQTILKNDKNADIHLYERGSSASFMG >LS483440|1132690:1139320|1134119_1134425_-|SQH55658.1|DBSCAN-SWA MREITDKEFFELSKTDSVKVFDFWAPWCGPCKMLAPVLEEVSNELTNIEFYKINVDENQEAAGEYGVMSIPTLLVMKNGEVLEEKTGYQPKETLVQLLSKY >LS483440|1132690:1139320|1137014_1138136_+|SQH55662.1|DBSCAN-SWA MNAKEKYIIVKTSSGEEEKQNYDKLLLSPGGAAIKPPFEGIELENIHTFRGPEDTQAVYDCMQKSKKTVVVGGGYIGLEVAESYAKHGIDVTIVDFAPRILNTYLDQELTDILTNEGAKHNLKVHGGEKVLSFKGENGKVTSVVTDKGEYEADTVIMSVGVRPDASWLNGELELTERGFVITNEYLETSAKDVYAGGDSTLLPYAPTRGQLPIALATLARRQGVIAALNAMGIKTKMPAVNGTSALSFFDYKFVSTGLSQNGVNLYDGKVSSKYVEEKIYPDFMRKENNLVHMKIYFDEDTHRVLGAQLMSKHDVSSAIAALSIAIASDWTLEQLALADIFFQPEFDRPWHFINVLAMAALDYKLGGADKLLF >LS483440|1132690:1139320|1136120_1136396_-|SQH55660.1|DBSCAN-SWA MIKPLFDNVLLKKIEVEKATTSGIVLASKEDTSNIGIVVALGESCLLSTDNEGELSAGSKVVFSDKYKKVDFEGQEYYLVNEEEVLAVIED >LS483440|1132690:1139320|1138178_1138385_-|SQH55663.1|DBSCAN-SWA MKETSYIIIRAEVDNVKVITKKTNNEEALEILNKGEVIILNVFDNIVNFKVQGRARIVSNLDQVISGN >LS483440|1132690:1139320|1132690_1134028_+|SQH55657.1|DBSCAN-SWA MATKITREDILKRIKEENVKYIRLQFTDITGTIKNVEVPVSQIEKVLDNKMMFDGSSIEGFVRIEESDMYLYPDLNTFLVFSWDSEYGKVARFICDVYTVDGKPFAGDPRGNLKRILKKMNELGFDTLNLGPEPEFFLFRLKENGEPSLELNDNGGYFDLAPVDLGENVRRDIVLELENLGFDIEASHHEVAPGQHEIDFKYDDVISACDNIQTFKLIVKTIARKHGLHATFMPKPMFGINGSGMHCNVSLFSKGENSFYDKNSKNGLSETASHFIAGILKHARSFTAVCNPTVNSYKRLVPGYEAPCYVAWSTSNRSPLVRVPASRGKSTRVEVRSVDPAANPYLAMSTILAAGLDGIENKLVPADEVKSNIYVMTREERIANGIDELPSTLYTALKELNSSSIMKEALGKHIFYNFIEAKSIEWDSFRTQVTDWEIDHYLKNY >LS483440|1132690:1139320|1138418_1138979_-|SQH55664.1|DBSCAN-SWA MKNKEQSQQLIKTLLENIGEDTSRAGLIDTPKRCVNMYEELLSKTNMDPKEEINTFFESENDEPILVKDIQFYSLCEHHMLPFYGVCHIAYVPNNKKITGLSKLARLVESASRRLQIQEDMTLMLVNAIEEQLQPKGVYVIIEAEHMCMAMRGIKKIGSKTVTSKKTGVFLEDTELVKDIQYKIKL |
9 | Moumouvirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1281391 : 1328185
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483440|1281391:1328185|DBSCAN-SWA ATTATTTTAAATTATCTAACGCATTAATACGTTCTTTAACACTATCATATTGTTCTTGATATGCTACTTGTTTTTCTTTTTCTTTAGCTACAACAGCTTCTGGAGCAGAACCAACAAATTTTTCATTAGAAAGTTTTTTGTTTACTCTATCTAATTCTTGTTGTAATTTCTCTAGTTCCTTTCCTAGACGTTCTTTTTCTTTAACTACATCGATTAAATCACTTAATGAAACGTAGATTTCAGCACCTGGTAAAATACGACTGATGTCAGTTTCACTCGCTTCTACTTCACGTTCTATGATAAGTTCGCTAGGACGAGCAAACTTTTCTAAATATGAACTCCCACTTAATAATACTTCTTTTACGTTTTCTTGAGCATATTTAATCTTAATAGGTATTTCACGTGACATAGGTGCATTAACTTCACTACGAATATTACGCACTGCTGTTATTACATCTTGGATAAATTGCATATCTTCCGTTTCTTTTTCAAATACTAAGTTTGAATCTACTTCAGCTAATTGGCTAGTCACAATACTGTCTCCTACGTGAGGAATGTGTTGCCAAATTTCTTCTGTAACAAACGGCATAAATGGATGTAGCATTTTTAGTGAAGCGTCTAGTACATATACTAAAATAGATTTAGTAGTTTTCTTAGCAACTTCATCTTCTCCATTTAATGGAATCTTAGCAATTTCAATATACCATGAACAAAACTCTTCCCACACAAAGTTATACAGAATACGACTTGCTTCTCCAAACTCATATTTCTCAAATAATCTTTCGAAATCTTCAATAGTTTTAGCAAGTTTTGTTAAGATATATTTATCAGCTAGTGTTTTTTCTCCTGATAAATCTATATCATTGTACTCAAACCCTTCTAGATTCATAATTACGAAACGAGAAGCGTTCCAGATTTTATTGATATAGTTCCAACTTGCTTCAATTTTTTCAGTTGAGTAACGTAAATCTTGTCCTGGTGTTGAGTTTGTAGCTAAGAAGTAACGTAAGCTATCGGCTCCGTATTGTTCAATTACTTCCATCGGATCTACACCATTACCAAGAGACTTACTCATCTTACGGCCTTGTTCATCACGAACTAAACCGTGGATTAAACAATCTTCAAATGGACGAGTTCCTGTAAATTCTAATCCCTGGAATACCATACGAGCAACCCAGAAGAAGATAATATCGTATCCAGTTACTAGACAGCTGTTTGGATAGTAACGTTTGAAATCTTCACTTTCTAAATCCGGCCATCCTAATGTTGAGAATGGGAATAATGCTGAAGAGTACCAAGTATCAAGAACATCTTCATCTTGGACATAGTTTTCTATATCTTTAGGTGGATTTACATCCACATAAACTTCACCAGTTTCTTTGTGATACCAAGCTGGAATACGATGTCCCCACCATAATTGACGAGAAATACACCAGTCTTGAATATTTTCCATCCATGTATTTAATGTATGCTCAAAACGTGGTGGATAAAAATTAACTTTTCCATCTTCATCTTTTTGATTTTCTAAAACTTTATCAGCAAGAGGTTTCATATCAACAAACCATTGTTTAGAAAGATATGGCTCAACAACCGCACCACTACGTTCTGAATGCCCTACTGAGTGAAGATGTTTTTCGATTTTGAAACAAACTCCACTTTCTTGCAAGTCTGCAATAAGTGCTTTTCGACATTCAAAACGATCCATACCATTATATTTATCTGCATGCTCGTTCATTACAGCACCTTCATCCATAACGATAATACGTGGTAAGTTATGACGTTCCCCTACTTCAAAGTCATTTGGATCGTGCGCTGGAGTAATCTTAACAACGCCACTTCCAAAATCTTTTTCAACATATTCATCTGCAACAACTGGAATTTCTTTATTTGTCACTGGTAGAAGAACTGTTTTACCAATGTATTTTTGATATCTCTCATCTTCAGGATGAACCGCAACAGCAGTATCTCCAAATAGAGTTTCTGGACGTGTAGTTGCTACTTCTAAATAATCTCCACTTTCGTCAGCTAAGAAATATTTAAGATGATAAAATGCACCTTCTACGTCTTTGTGAATTACTTCAATATTAGAAAGAGCTGTTCTTTGAACTGGATCCCAGTTAATAATTTTTTCTCCGCGATAAATAGTTCCATTATTATAATGGTCTACAAAGATTTTTGTTACAGCTTTGTTTAATCCTTCATCAAGGGTAAATCTTTCACGAGAATAATCAAGACCCAATCCTAATTTTGCCCATTGCGCACGAATATAACCAGCATATTCTTCTTTCCATTCCCACGCACGCTCTAAGAATTTTTCACGACCTAAGTCATAACGTGAAATTCCTTCCTCACGCATTTTTGCTTCTACTTTCGCTTGAGTCGAAATACCCGCATGATCCATTCCTGGAAGATAAAGTACATCAAATCCTTTTAGACGTTTGTAACGTATTAACATATCTTGTAATGTTGTATCCCATGCGTGTCCAATATGTAATTTCCCAGTTACGTTTGGTGGTGGAATTACTATTGTATATGGATTTTTATTACTTTTATTGTCGGCTTTAAAAACTTCTTTTTCTAACCACCAATTGTAACGATTTTGTTCAACTTCGGTCGGATTATATTTTGTAGACATTTCAGTCATAGCTTTTCCTCCTAATTATTAAATATTTTTAATTTCTCACTTTATTTATTAAGTTTATTTGTGGCTTATATATTAAATTTTAGATAAAAAAATAACCTTCATCCTGATATAAGGACGAAAGTTTCCGTGGTACCACCTTTATTCTAATTATAATTAGCACTTAATAAGATTAACGCTCTAACCACGTTTAAAGCTACTTACCTTTCACTCTAAATGCTCACCGTCTACTTCAAAGTCCTGCCTAGGAGAAATCTCTCAACCACTGATTTCTTTTCTGTATCCTACGGTACGCAAGAACTTCTACTTATCGGCTCATCGCATATATTTTATAATTAAAATACGTTTAATATAATATCACAATTCACAAAAGAATGCAAGGAATATATCGCTCTATGATAAATATCTAGATATTTTTAAAAAACCAGTCTACTATTTCTAATAGACTGGTTATTCTCATTAATCTTCTTTTTTATTTTCCCATGCTGTAGCGTTATTTATTTTTATCGGTAAATTATCTAAGTAAAATTCTGGATCTTTCCCTTGCTTATGCTGTTTAACATAGTCTTTTAACACTACATAAACTACGCCAGAAAGACCGATAATAGCGATTAAGTTAAGTAAACTCATGATACCCATTGTTATATCAGCAAGACCCCAAACTAAGTCTAGGTCCATTACGCTTCCGATATACACAAATATACATACAATAACACGATATACATTTACCGCCCATTTTTTAGGTAGTAAATATTGAATATTAGTTTCTCCATAGTAGTAGTTCCCAATAACTGAACTATATCCAAATAAAAAGATTGCTACGATTAAGAAAACAGTACCTATACTTCCAATTTGAGAAGTAAGTGCAGCCTGTGTAAGTCTAATACCTTGTAAGCTACCTTTCCCATACTCTATACCTGGGTATAACAAAATTAAAAATGCTGTCGCTGTACATACTAAACAAGTATCAAAATATACTCCAAGTGTTTGGATAAACCCTTGTTTAGCAGGATGAGTACTATCAGCTGTCGCTGCTGCGTTCGGTGTAGAACCAAGACCCGCTTCGTTAGTAAACATTCCTCGTTTTACCCCAAGTAAAATTGAAGTCCCCATACCAATTACACCACCACCAACTTGTTCAAGACCAAAAGCAGATCTTACAATTTGGCTAAATACTCCTGGAATTTTATCAAAATTAATAATCATAATTATAAAAACTATAAATAAATAAATAACAGCCATAATAGGAACTAACCATTGAGTAATTTTTACAACTTTTGTCACTCCTCCAAAAATAACAAAAACTGTAAGCACTAGAAGTGCAATACCTGCAACTTTAGAATTAATATTGTAAATCTCTAATGATTGAGCTATAGTATTTGTTTGTACTGAGTTGAATGCAATACCATAAGTTATTGAAATAACAATCGCGAACAATACACCCATCCATTTTTGACCAAGACCTTTTTCCATATAGTATGCTGGCCCCCCACGATAAACACCTTTTCTATCGCGCACTTTATATACTTGGGCAAGCGTAGATTCTGCAAAAGACGAGGCACCCCCAAAAAGAGCCATTACCCACATCCAAAATACTGAACCAGGACCTCCTAATGCTATCGCAATAGCAACACCAGCAATAGTTCCTGTTCCCACACGTGATGCAGCAGAAATAGTAAAGGCTTGGAATGCTGATACTCCTTTTTGTTCTCCATCTTTTCCTACTTTTGGTTTTTCAGAAATTAATCTGAACATTTCTTTTATATAAGTAAATTGAACAAATTTCGTACTAAATGTAAAATAAATACCTGTAACAATTACTAATCCAATTAGAAAGTATGACCACATAAAGTCATTTAGACTAGTAAGTAAATCCATTATATTCATAATAAAGTCTCCTTAATATAATAAAGTAAAGTTAGAAATTTTAATTTATAATTATTAACTTCATTATTATACTTGAATATACTTTATTATCTAAATATATGTTATATTTTCTAACACTTCTTAATCTTCTGATATAGAGAATCTTTTTAAAATATTATAGTTTATCTTATCTTCTATAACAAAAAAATCTTTTTAGATTATAAAGTTTCACTATTTTAATCTAAAAAGATTTCTACACATAATGTATATTAGTTAATTAATTTTGTAGAATAGTAAAATTATTCTATATCTTCTTTTTTATCTTCCATTTCTTGGTTAAATTATAAATAATAACTTTTTCCATCTTCTACAGGATGAATTAACATTCTACCTCTTGACTTTAACTCCACTCTTATTTCATCATAACTTAGTTTTCCATAATCTAATTTTTCATAAAGCACATATTTTTTACTCCTTATTTTATACCACATAT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51 | Erysipelothrix_phage(41.94%) | holin,terminase,head,portal,tail,protease,tRNA,bacteriocin,capsid | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1384896 : 1391258
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483440|1384896:1391258|DBSCAN-SWA 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TCTCTATTTTCCTTTTCTGCTCGCAACTTAAACTCTGACATACAGTCAATCAATAATTTGTCTAAAAATATTGTTTTATTTTTATCATCTTCACTAGTATCTTTTACACTTAAAGTTAAATAATTTAATTCTTCAACAAGTTTATTCAATCTTGTTGTTTGACGACAAATTGTTTCTAGATAATATTTATATTCTTCTCCTTTTATTATTCCGTCTAACATTCCTTCTGCCGTTGATTGAATTGAAGTTATAGGAGTTTTAATATCATGTGATAATTGGGCTATCATAAGGGATTTTTCTTTTTCACTTTCTTCCAATGATTCAAAACTTTCTTTTAAATGTTTTGCCATTTCATTGAATGATAACGATAATTCTCTAAACTCAGTAGGACCTTCTACAGTATTACTAATATCAAAATTTTTCTCACTTATACTAATCGTTTGTCTCTTTAGAACACGTAATGACTTAAATACACCTTTTAATAATATAATACTAATTGTAGCTCCAATTAGCCCCGCAATTATTGTAATCACAACTATAAAATATGTATCTTTTTTTTCAATTAACATTAAATTTGAAGCCCAAAAAACAGCCATAATAGTTATTAAAAATGATAAAATATATCCAACAATAATATAATCTCTTAATTTCATACTATATTTCCTTTCCATTTTTAAACTTGTTTTTCCATTTTGTATCCTAGACCCCATACAGTTTTTACACTTGGTGTTTTTTTTGTCGAATATTTCGTTAAAATTCTTCTTAAAGAGTGTATATGCACATTTAGCGTGTTTGCATCTTCTACATATTCATCTTGCCAAATTTTTTCATACAATTCTGTTTTAGAAAAAACACGATCCGGATTATTAGCCAGTAGCCATAATAATTCAAAAGATTTCACGGTTAGTTCTAATTGTCTATCATTTACCATAGCAATTCTACTACTATAGTTAATTTCTAAATCACCTAGAGTTGAAATATTTTCACTACTATTTTTTTCAATTCTACGTAGTATATTTTTAACTCTTAAAACTAATTCTCTTGGACTAAATGGTTTTACTATATAATCATCTGCTCCCAAACTTAAAGCGTAGATTTTATCTGGCTCTGTTGTTTTCGCTGTTATGAATAAAAATGGTTGTTCCTCATCTAAATACTGTACTTCGCTGATTAAATCATAGCCATCCATATTTGGCATCATTATATCTGTAATTATTAAAGAATATTTATTTTTCTTGTATTTCTCTAAAGCTTCTTTACCATCATTAGCGATATCAACATCATATCCATCTTGCTCTAAATATCGTTTATTTATCTCCGTTATTTCTATTTCATCATCTACTAATAAAATTTTATTAACCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483440|1384896:1391258|1386504_1386843_-|SQH55893.1|DBSCAN-SWA MKKDSICQVNIINQQNVTTAMNYLEKEKVQKSLRILTKFTDNKQINIIFYLLAVEELCVCDIACLLDLSMASASHHLRKLANGNILDTRREGKIIYYFIKDEEIRDFFNQLG >LS483440|1384896:1391258|1389118_1389376_-|SQH55897.1|DBSCAN-SWA MANSKYITRLKRSEGQLRGIQKMIEEERECIDIITQLSAVRSSVDRVIELLITENLMECINNPLENPFEQKEKIEKAIKYIVKSK >LS483440|1384896:1391258|1384896_1385661_+|SQH55892.1|DBSCAN-SWA MENIIEINNLTFKYNNKNTLFEKLNVDIEKGKITTLLGKNGCGKSTLIKILAKNLNYNSGSVKIEGKELNSYSLKELASILAIVYQKNETPREITVYDMVSFARLPYQNIFFYKPNASDVEKIEFALEKTNLKTYRDKRVDELSGGQLQRVYIAMALAQSTDIIILDEPTTFLDIKYQKSIMQLVRDLNKSLGITIIMVLHDINQALAYSDNIIALLDGKVIKNDKAENFFDEELLNKLYDADIKIEDGKVISW >LS483440|1384896:1391258|1390568_1391258_-|SQH55899.1|DBSCAN-SWA MVNKILLVDDEIEITEINKRYLEQDGYDVDIANDGKEALEKYKKNKYSLIITDIMMPNMDGYDLISEVQYLDEEQPFLFITAKTTEPDKIYALSLGADDYIVKPFSPRELVLRVKNILRRIEKNSSENISTLGDLEINYSSRIAMVNDRQLELTVKSFELLWLLANNPDRVFSKTELYEKIWQDEYVEDANTLNVHIHSLRRILTKYSTKKTPSVKTVWGLGYKMEKQV >LS483440|1384896:1391258|1389519_1390548_-|SQH55898.1|DBSCAN-SWA MKLRDYIIVGYILSFLITIMAVFWASNLMLIEKKDTYFIVVITIIAGLIGATISIILLKGVFKSLRVLKRQTISISEKNFDISNTVEGPTEFRELSLSFNEMAKHLKESFESLEESEKEKSLMIAQLSHDIKTPITSIQSTAEGMLDGIIKGEEYKYYLETICRQTTRLNKLVEELNYLTLSVKDTSEDDKNKTIFLDKLLIDCMSEFKLRAEKENRDIFIKVIPENAKIVSNYNKIQRIIVNLIGNAFKYSPSGTKIEIVAEIQNQELSISIIDEGCGIKEEEIDNIFKRLYRVEASRNMKTGGYGLGLAIAKQLALQINGDILVESEYGKGSKFTLKINC >LS483440|1384896:1391258|1386854_1387469_-|SQH55894.1|DBSCAN-SWA MIQNVVTSIILYSGTAVDLLIILMLFFAKRKSRKDIINIYLGQFLGSVSLILLSLLFAFVLHYIPSKEILGLLGLIPIFLGLKVLLLGDSDGEAIAKEGLRKDNKNLIFLVAMITFASCGADNIGIFVPYFITLNLVDLIVALLTFLVMIYLLVFSAQKLAQVPSVEETLEKYSRWFIAVVYLGLGIYILIENNSFDMLWTMLG >LS483440|1384896:1391258|1388692_1388989_+|SQH55896.1|DBSCAN-SWA MKNNISMKDFYEKYNNEELTILDVRENHEYAAGYIPSAQNFPLSSLGIEFTKLDKNQKYYVICQAGGRSARAYDFLEAQGFDIINIEGGMSNWPGEKK >LS483440|1384896:1391258|1388292_1388598_+|SQH55895.1|DBSCAN-SWA MFFLFTKIDSISTTELENKLKENIQLIDVRTPGEFRRGHIKNAKNIPLNEISNFTPIADKKIYVICHSGARSKLAAKKLKKRGFDVINVQGGMHAWRGKVV |
8 | Staphylococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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