Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483484 | Staphylococcus aureus strain NCTC13277 genome assembly, chromosome: 1 | 7 crisprs | csa3,cas3,DEDDh,DinG,WYL | 5 | 0 | 11 | 0 |
1. LS483484
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483484_1 | 848420-848504 | Unclear |
NA
Consensus repeat of LS483484_1
|
1 spacers
spacers of LS483484_1
>1.1|848446|33|LS483484|CRISPRCasFinder ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483484_1
The CRISPR arrays of LS483484_1 >merge|LS483484|1|848420-848504|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAAATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >LS483484|1|1|848420-848504|CRISPRCasFinder CACCCCAACTTGCATTGTCTGTAGAA ATTGGGAATCCAATTTCTCTTTGTTGGGGCCCA CACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>LS483484.1|SQI84027.1|847251_848244_+|peptide-chain-release-factor-2 MAEPNFWDNQTKAQDIIDKNNALKAIVNGYKTLQAEVDDMDATWDLLQEEFDGEMKEDLEQEVINFKAKVDEYELQLLLDGPHDANNAILELHPGAGGTESQDWANMLFRMYQRYCEKKGFKVKTVDYLPGDEAGIKSVTLLIKGHNAYGYLKAEKGVHRLVRISPFDSSGRRHTSFASCDVIPDFNNDEIEIEINPDDITVDTFRASGAGGQHINKTESAIRITHHPSGIVVNNQNERSQIKNREAAMKMLKSKLYQLKLEEQAREMAEIRGEQKEIGWGSQIRSYVFHPYSMVKDHRTNEETGKVDAVMDGDIGPFIESYLRQTMSHD >LS483484.1|SQI84026.1|844287_846819_+|protein-export-cytoplasm-protein-SecA-ATPaseRNA-helicase MGFLSKILDGNNKEIKQLGKLADKVIALEEKTAILTDEEIRNKTKQFQTELADIDNVKKQNDYLDKILPEAYALVREGSKRVFNMTPYKVQIMGGIAIHKGDIAEMRTGEGKTLTATMPTYLNALAGRGVHVITVNEYLSSVQSEEMAELYNFLGLTVGLNLNSKTTEEKREAYAQDITYSTNNELGFDYLRDNMVNYSEDRVMRPLHFAIIDEVDSILIDEARTPLIISGEAEKSTSLYTQANVFAKMLKQDEDYKYDEKTKSVHLTEQGADKAERMFKVENLYDVQNVDVISHINTALRAHVTLQRDVDYMVVDGEVLIVDQFTGRTMPGRRFSEGLHQAIEAKEGVQIQNESKTMASITFQNYFRMYNKLAGMTGTAKTEEEEFRNIYNMTVTQIPTNKPVQRNDKSDLIYISQKGKFDAVVEDVVEKHKAGQPVLLGTVAVETSEYISNLLKKRGIRHDVLNAKNHEREAEIVAGAGQKGAVTIATNMAGRGTDIKLGEGVEELGGLAVIGTERHESRRIDDQLRGRSGRQGDKGDSRFYLSLQDELMIRFGSERLQKMMSRLGLDDSTPIESKMVSRAVESAQKRVEGNNFDARKRILEYDEVLRKQREIIYNERNSIIDEEDSSQVVDAMLRSTLQRSINYYINTADDEPEYQPFIDYINDIFLQEGDITEDDIKGKDAEDIFEVVWAKIEAAYQSQKDILEEQMNEFERMILLRSIDSHWTDHIDTMDQLRQGIHLRSYAQQNPLRDYQNEGHELFDIMMQNIEEDTCKFILKSVVQVEDNIEREKTTEFGEAKHVSAEDGKEKVKPKPIVKGDQVGRNDDCPCGSGKKFKNCHGK >LS483484.1|SQI84025.1|843301_843874_+|Ribosomal-subunit-interface-protein MIRFEIHGDNLTITDAIRNYIEEKIGKLERYFNDVPNAVAHVKVKTYSNSATKIEVTIPLKNVTLRAEERNDDLYAGIDLINNKLERQVRKYKTRINRKSRDRGDQEVFVAELQEMQETQVDNDAYDDNEIEIIRSKEFSLKPMDSEEAVLQMNLLGHDFFVFTDRETDGTSIVYRRKDGKYGLIQTSEQ >LS483484.1|SQI84024.1|842566_843241_+|II-DNA/RNA-helicase-ComFC MNNCLSCGAKLYENITIYNLFKKPNRLCDRCKENWDNIKLDIKARRCSRCLKYLDQNEAYCLDCKFLSAHFNLMEQLYCQFQYDGLMKEMIHQYKFSKDYYLCELLAHLIEIPQTSYDYIVPIPSSPAHDLSRTFNPVEAVLKAKGIRFDKILKMSNRPKQSHLTKKERLADENPFIIDTELDLNGKEILLVDDIYTTGLTIHRAGCKLYAKNIRKFKVFAFAR >LS483484.1|SQI84023.1|841491_842574_+|helicase MDNVTRYKITESSQSSSQAYYHLSFELSEQQSYASEHIVRAIRMRQTILLYAVTGAGKTEMMFQGIQYARRQGDNIAIVSPRVDVVVEISKRIKDAFLNEDIDILHQQSSQQFEGHFVVCTVHQLYRFKQHFDTIFIDEVDAFPLSMDKSLQQALKSSSKVEHATIYMTATPPKQLLSEIPLENIIKLPARFHKKSLPVPKYRYFKLNNNKIQKMLYRILQDQINNQRYTLVFFNNIETMIKTFSIYKQKITKLTYVHSEDVFRFEKVEQLRNGQYDVIFTTTILERGFTMANLDVVVIDAHQYTQEALIQIAGRVGRKLECPTGKVLFFHEGVSMNMIQAKKEIQKMNKLALKRGWIDE >LS483484.1|SQI84022.1|840261_841128_+|EDD,-DegV-family-domain-protein MKIAVMTDSTSYLSQDLIDKYNIQIAPLSVTFDDGKNFTESNEIAIEEFYNKMASSQTIPTTSQPAIGEWITKYEMLRDQGYTDIIVICLSSGISGSYQSSYQAGEMVEGVNVHAFDSKLAAMIEGCYVLRAIEMVEEGYEPQQIIDDLTNMREHTGAYLIVDDLKNLQKSGRITGAQAWVGTLLKMKPVLKFEDGKIIPEEKVRTKKRAIQTLEKKVLDIVKDFEEVTLFVINGDHFEDGQALYKKLQDDCPSAYQVAYSEFGPVVAAHLGSGGLGLGYVGRKIRLT >LS483484.1|SQI84021.1|839476_840118_-|IMPACT-family-member-yigZ MTQNIITVKKEHIIENVISKSRFIAHIKPVQNEDEAKAFIAAIKKEHKDATHNCSAYTIGPEMNIQKANDDGEPTGTAGVPMLDILKKLDVHNACVVVTRYFGGIKLGGGGLIRAYSGAVRDVIYDIGRVELREAVPCIVTLNYDQTGKFEYELASTHFMLRNQTYTDKVSYYIDVVKSDYEAFINFLNQMTAGNFDLTEETPKQLPFDIPTE >LS483484.1|SQI84020.1|838257_839313_+|Undecaprenyl-phosphate-N-acetylglucosaminyl-1-phosphate-transferase MVTLLLVAVTMIVSLTITPIVIAISKRLNLVDKPNFRKVHTKPISVMGGTVILFSFLIGIWIGHPIETEIKPLIIGAIIMYVLGLVDDIYDLKPYIKLAGQIAAALVVAFYGVTIDFISLPMGTTIHFGFLSIPITVIWIVAITNAINLIDGLDGLASGVSAIGLITIGFIAILQANIFITMICCVLLGSLIGFLFYNFHPAKIFLGDSGALMIGFIIGFLSLLGFKNITIIALFFPIVILAVPFIDTLFAMIRRVKKGQHIMQADKSHLHHKLLALGYTHRQTVLLIYSISILFSLSSIILYVSPPLGVVLMFVLIIFSIELIVEFTGLIDNNYRPILNLISRKSSHKEE >LS483484.1|SQI84019.1|836869_837940_-|diguanylate-cyclase-domain-protein MFEAFIYNISVIVAGIYLFHRLQYSENKRMVFSKAYVTVLMTIVSLLLSVYPIPYREDYLIHLTFVPLLFLGRFTNMVYTLSATVIVAIVEIVVFNNSIMYGVTLIVIAAVTSAIGPFLKQNDVLSLLILNVVTIIILFGVALVSPIYTLSEVIILIPISLIITLASAITFVDIWHFFSLVNRYENEDKYDYLTGLGNVKEFDRHLNEISRKAEKEHQSIALLLIDIDGFKDVNDTYSHKSGDAVLKQMSQLLKNYVPNQFKIFRNGGEEFSVVIHNYSLDQSVKLAENIRSGVEKSSFHLPNKEVIKLSVSIGVGYLTDDDPKSQRKVFKDADDMVHVAKNQGRNKVMFNPIINL >LS483484.1|SQI84018.1|835912_836674_-|integral-membrane-protein MPDSITIIDENKVIDVVLIAGRILLESGAETYRVEDTMNRIAHSYGLHNTYSFVSSTAIIFSLNDRTSTRLIRVQERTTDLEKIALTNSLSRKISNKELTIDEAKSEFIHLQHASLQYSFLTNFFAAAIACGFFLFMFGGVASDCWIAVIAGGSAFLTFSFVQRYIQIKFFSEFVAAAVVISIAATFTKLGIATNQDIITIASVMPLVPGILITNAIRDLLAGELLAGMSRGVEAALTAFAIGAGVAIVLLII >LS483484.1|SQI84028.1|849012_849852_+|LysM-domain-protein MKKSLTVTVSSVLAFLALNNAAHAQQHGTQVKTPVQHNYVSNVQAQTQSPTTYTVVAGDSLYKIALEHHLTLNQLYSYNPGVTPLIFPGDVISLVPQNKVKQTKTVKSPVRKASQAKKVVQQPVQQASKKVVVKQAPKQTVAKTVNVAYKPAQVQKSVPTVPVAHNYNKSVANRGNLYAYGNCTYYAFDRRAQLGRSIGSLWGNANNWNYAAKVAGFKVDKTPEVGAIFQTAAGPYGHVGVVESVNPNGTITVSEMNYAGFNVKSSRTILNPGKYNYIH >LS483484.1|SQI84029.1|850025_850676_+|hydrolase MGVHQYFKRLSDMERLIRLPGKFKYFEHNVAAHSFKVTKIAQYLATVEEYHGRKINWKSLYEKALNHDFAEVFTGDIKTPVKYASSELKKLFSQVEEEMVETFIEEEIPLQYRDVYKQRLQEGKDDSLEGQILSVADKIDLLYETFGEIQKRNPEELFFEIYEMSLETIIQFDHLASVQDFINNIIPEMLTENFIPRTELRETTMNILNKGKEENE >LS483484.1|SQI84030.1|850672_850909_+|putative-DUF2198-containing-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >LS483484.1|SQI84031.1|851177_853163_+|excinuclease-ABC-subunit-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKRHQTLLGATGTGKTFTMSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKLKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRVERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDKGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >LS483484.1|SQI84032.1|853170_856017_+|Excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKDIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHNIEIESQTVQQMVDRIMELEARTKIQLLAPVIAHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNDVPTLDKNKNHTIEVVVDRLVVKDGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKRVCEVYKINMDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGKRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDKQNTEDK >LS483484.1|SQI84033.1|856627_857560_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >LS483484.1|SQI84034.1|857565_858408_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSIGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIVYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTRKVK >LS483484.1|SQI84035.1|858415_858901_+|O-acetyltransferase MRKFLSKEYHRTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQILNINIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >LS483484.1|SQI84036.1|858908_860348_+|TPR-domain-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDTAKALYEALLKEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >LS483484.1|SQI84037.1|860414_861350_+|Thioredoxin-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSAPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483484_2 | 906824-906903 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483484_2
|
1 spacers
spacers of LS483484_2
>2.1|906848|32|LS483484|CRISPRCasFinder ACCCCAACTTGCATTGCTTGTAAGCTGACTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483484_2
The CRISPR arrays of LS483484_2 >merge|LS483484|2|906824-906903|CRISPRCasFinder CCGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCCACCCCAACTTGCATTGCTTGTAAGCTGACTTTCCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCC >LS483484|2|2|906824-906903|CRISPRCasFinder CCGTCAGCTTCTGTGTTGGGGCCC ACCCCAACTTGCATTGCTTGTAAGCTGACTTT CCGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCC
>LS483484.1|SQI84152.1|905577_906570_+|Putative-cytosolic-protein MKENLLGTIIWSIATFYYSRMMKIMNLAILKIKIGGVNMLNIQDVSHLSKKEQKAYNRFVESVENGNLPVLPCIEMDLKEMQEETLNQSKIGGMPFLKSFKDIPLDENNVPMVLLAQINLNDLPEQQELFPVNEGILQFWISSEDQMYGMSENLKGNNINSRLVYIKEPITDLSLKDIQAHLKSLDADNEDIPFSGAFSIEFRLSKQTITCTDYKYDEDDLALWNKVNPSFALKSMFGGYDELMEPVCNTFTAKEPFNQLGGYPYFDQIDPRTNDQELKMYDRVLLQIDSTRDGNSSIIWGDLGIANILVKSTDLEAMKFDDYMYSWDCS >LS483484.1|SQI84150.1|905133_905514_+|Glycine-cleavage-system-H-protein MAVPNELKYSKEHEWVKVEGNVATIGITEYAQSELGDIVFVELPETDDEINEGDTFGSVESVKTVSELYAPISGKVVEVNEELEDSPEFVNESPYEKAWMVKVEISDESQLEALLTAEKYSEMIGE >LS483484.1|SQI84148.1|904619_904976_+|Arsenate-reductase MIKFYQYKNCTTCKKAAKFLDEYGVSYEPIDIVQHTPTINEFKTIIANTGVEINKLFNTHGAKYRELDLKNKLQTLSDDEKLELLSSDGMLVKRPLAVMGDKITLGFKEDQYKETWLA >LS483484.1|SQI84145.1|904155_904476_-|Thioredoxin MQAIKSNESFKSVINSDTPVIVKFEAGWCPDCRAMDLWIDPIVEQYNDYQWYTVNRDELEDVVVENEVMGIPSLLVFKNGDKIAHLHSANAKSPEQVESFLAETFK >LS483484.1|SQI84144.1|903466_904006_+|nitroreductase-family-protein MELQQAIANRRSVKKFKRDMHIDDALLYQAIEKAADAPNHGMREPWRVVHVPKDRLGDMSKDISKFAFPNELDKQQCHYDAVTKLGGMLLLILKTDPRQRQNDENYFAFGAYAQNLMLLLYEAGIGTCWKSPLYIYDPKVRKTLGIKKDEVLAGFLYLTDLEEDMPKAPRKNRNLITLY >LS483484.1|SQI84141.1|902667_903384_+|3-dehydroquinate-dehydratase-I-AroC-I MTHVEVVATITPQLYIEETLIQKINHRIDAIDVLELRIDQFENVTVDQVAEMITKLKVMQDSFKLLVTYRTKLQGGYGQFTNDSYLNLISDLANINGIDMIDIEWQADIDIEKHQRIITHLQQYNKEVIISHHNFESTPPLDELQFIFFKMQKFNPEYVKLAVMPHNKNDVLNLLQAMSTFSDTMDCKVVGISMSKLGLISRTAQGVFGGALTYGCIGEPQAPGQIDVTDLKAQVTLY >LS483484.1|SQI84139.1|902097_902520_-|Organic-hydroperoxide-resistance-protein MAIHYETKATNVGGRKGHVYTDDRALDIDIVPPAQADGKATNPEQLFAAGYASCFNGAFDLILKQNKVRDAHPEVTLTVRLEDDPDSESPKLSVSIDATIKNVISQEEAEKYLQMAHEFCPYSKATQGNINVDLNVNVVD >LS483484.1|SQI84137.1|901204_901699_-|lactococcal-prophage-ps3-protein-05 MIEIKTLTNNDFNEYKRLVSTVNEEFTQDSHYSQTMTDTLIHDILNQGSPKCIVFGCYENETLIATAALEQIRYVGKEHKSLIKYNFVTNNDKSINSELINFIINYARQNNYESLLTSIVSNNIGAKVFYSALGFDILGFEKNAIKIGNTYFDEHWLFYDLINK >LS483484.1|SQI84134.1|900431_901049_-|LysE-type-translocator-protein MVTAIIHGFILAIGLILPLGAQNVFIFNQGANQPKYRYVLPAIITAGLSDSLFIIIAVVGVSIIIMSLPILQAIIYIVGLIFLMYMAWTIWHDKPSTDGEAQIMSPMKQVSFALSVSLLNPHAILDTIGVIGSSAALYSGSNKIAFTIACISVSWLWFFLLAILGKMVGSIDKTGKLLTIINKISSIIIIIVALMILQKLIQLLF >LS483484.1|SQI84132.1|899774_900359_+|phosphoglycerate-mutase MLAKTLYLMRHGQTLFNFKGLIQGFGDSPLTELGIAQAQKARSYYETKGINFDLYASSTQERASDTLENVAPNQSYQRFKGLKEWHFGLFEGESVYLFDNLYKPEDLFGDRIVPFKGEARQQVEDRIVKTLHDIMSQTKNNALVVSHGTIMGVFLRYCLKLDEALKHNIGNCNILKFEYDNGTFKFVELIDPNL >LS483484.1|SQI84154.1|907157_907547_+|DNA-primase/-small-primase-like-protein MMAIVNKVIIVEGKSDKKRVQQVIAEPVNIICTHGTMSIDKLDDMIESLYDKQVFVLADSNDEGDRIRNWFKRYLSESEHIFIDKTYCQVANCPKQYLAHVLSKHGFTCKKETPFLPNINNERLVLVNE >LS483484.1|SQI84155.1|907539_907836_+|Thioredoxin MNNSLDIKDVTTFYEEGKHLIYGYTPTCGTCKVSERMLDITNEILQLPLLKIDLNFYPQFCKDMQIMSTPILLLMNKDKEVKRIYAFQSVTDLLENLK >LS483484.1|SQI84158.1|908085_909111_+|Methionine-ABC-transporter-ATP-binding-protein MIELKEVVKEYRTKNKEVLAVDHVNLSIRAGSIYGVIGFSGAGKSTLIRMFNHLEAPTSGEVIIDGDHIGQLSKNGLRAKRQKVSMIFQHFNLLWSRTVLKNIMFPLEIAGVPRRRAKQKALELVELVGLKGREKAYPSELSGGQKQRVGIARALANDPTVLLCDEATSALDPQTTDEILDLLLKIREQQNLTIILITHEMHVIRRICDEVAVMESGKVIEHGPVTQVFENPQHAVTKRFVKEDLNDDFETSLTELEPLEKDAYIVRLVFAGSTTTEPIVSSLSTAYDIKINILEANIKNTKNGTVGFLVLHIPYISSIDFGKFEKELIERQVKMEVLRHG >LS483484.1|SQI84159.1|909103_909799_+|Methionine-ABC-transporter-permease-protein MGKSFSEIINEMITMPNIQWPEVWTAIVETLYMTVVSTIFAFILGLILGVLLFLSAKGKSIGARLFYSIVSFIVNLFRAIPFIILILLLIPFTSLILGTISGPTGALPALIIGAAPFYARLVEIAFKEIDKGVIEAAWSMGANTWTVIRKVLLPEAMPALVSGITVTAIALVGSTAVAGVIGAGGLGNLAYLTGFTRNQNDVILVSTVFILIIVFIIQFIGDWLTNKLDKR >LS483484.1|SQI84161.1|909816_910638_+|Methionine-ABC-transporter-substrate-binding-protein MKKLFGLILVLTFAVVLAACGNGSKSGSDDKKITVGASPAPHAEILEKAKPLLEKKGYELDIKTINDYTTPNKLLDKGEIDANYFQHTPYLNTEKKDKGYKIVSAGNVHLEPMAVYSKKYKSLKELPKGATVYVSNNPAEQGRFLKFFVDAGLIKIKKGVKIEDAKFSDITENKKDIKFNNKQSAEFLPKIYQNEDADAVIINSNFAIEQKLNPKKDSIAVESAKDNPYANLIAVKEGHQDDKKIKALIEVLQSKDIQDFINEKYNGAVIPAK >LS483484.1|SQI84163.1|911453_911648_+|CsbD-like-protein MADESKFEQAKGNVKETVGNVTDNKNLENEGKEDKASGKAKEFVENAKEKATDFIDKVKGNKGE >LS483484.1|SQI84165.1|911881_912733_-|membrane-protein MQQFKWINILKGFAMGTSDLVPGVSGGTIALLLGIYNQFIASISGIFSRRFWPSFTFLIPIIIGMLLAMGSLSNLFNYLLSQHHIPTMFFFGGLIIGIVPYLLKISNYKTSFTTKHYMMVIAGIAILIVITLMNNSDKHAGETLTLSTGLIIKYFIAGMCASSAMLLPGISGSFMLLVFGVYGTVMLAISEVVKLNFAGLPILLAVGFGVLAGFIISSKIIQYFLTHHKLMTFALIIGFVVGSLFAVFPGLPTNIVMWFVSLVVFIIGFIVSLTLGRITAENE >LS483484.1|SQI84167.1|913060_913822_+|iron-sulfur-cluster-assembly-ATPase-SufC MASTLEIKDLHVSIEDKEILKGVNLTINTDEIHAIMGPNGTGKSTLSSAIMGHPSYEVTKGEVLLDGVNILELEVDERAKAGLFLAMQYPSEITGVTNADFMRSAINAKREEGQEINLMQFIKKLDKNMDFLDIDKDMAQRYLNEGFSGGEKKRNEILQLMMLEPKFAILDEIDSGLDIDALKVVSKGINQMRGENFGALMITHYQRLLNYITPDKVHVMYAGKVVKSGGPELAKRLEEEGYEWVKEEFGSAE >LS483484.1|SQI84169.1|913919_915227_+|Iron-sulfur-cluster-assembly-protein-SufD MTTDILNISEEQLVDYSKAHNEPSWMTELRKKALKLTETLEMPKPDKTKLRKWDFDSFKQHDVKGDVYQSLSQLPESVREIIDVDHSKNLVIQHNNTIAYTQVDDNASKDGVIVEGLADALMNHSDLVQKYFMKDAVTVDEHRITALHTALVNGGVFVYVPKNVVVEHPVQYVVLHDDENASFYNHVIIVTEESAEVTYVENYLSNASGEGNQLNIISEVIAGANSNITYGSVDYMDKGFTGHIIRRGITEADASINWALGLMNEGSQIIDNTTNLFGDRSTSSLKSVVVGTGEQKINLTSKIVQYGKETDGYILKHGVMKEHASSVFNGIGYIKHGGTKSIANQESRVLMLSEHARGDANPILLIDEDDVQAGHAASVGRVDPDQLYYLMSRGISQREAERLVIHGFLDPVVRELPIEDVKRQLREVIERKVSK >LS483484.1|SQI84170.1|915341_916583_+|Selenocysteine-lyase MAEHSFDVNEVIKDFPILDQKVNGKRLAYLDSTATSQTPVQVLNVLEDYYKRYNSNVHRGVHTLGSLATDGYENARETVRRFINAKYFEEIIFTRGTTASINLVAHSYGDANVEEGDEIVVTEMEHHANIVPWQQLAKRKNATLKFIPMTADGELNIEDIKQTINDKTKIVAIAHISNVLGTINDVKTIAEIAHQHGAIISVDGAQAAPHMKLDMQEMNADFYSFSGHKMLGPTGIGVLFGKRELLQKMEPIEFGGDMIDFVSKYDATWADLPTKFEAGTPLIAQAIGLAEAIRYLERIGFDAIHKYEQELTIYAYEQMSAIEGIEIYGPPKDRRAGVITFNLQDVHPHDVATAVDTEGVAVRAGHHCAQPLMKWLNVSSTARASFYIYNTKEDVDQLINALKQTKEFFSYEF |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483484_3 | 955945-956030 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483484_3
|
1 spacers
spacers of LS483484_3
>3.1|955975|26|LS483484|CRISPRCasFinder CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483484_3
The CRISPR arrays of LS483484_3 >merge|LS483484|3|955945-956030|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGGCGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGGAAAGCCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG >LS483484|3|3|955945-956030|CRISPRCasFinder AAAGTCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG CGGGGCCCCAACACAGAAGCTGGTGG AAAGCCAGCTTACAATAATGTGCAAGTTGG
>LS483484.1|SQI84249.1|954549_955794_+|NAD-specific-glutamate-dehydrogenase MTENNNLVTSTQGIIKEALHKLGFDEGMYDLIKEPLRMLQVRIPVRMDDGTVKTFTGYRAQHNDAVGPTKGGVRFHPDVDEEEVKALSMWMTLKCGIVNLPYGGGKGGIVCDPRQMSIHEVERLSRGYVRAISQFVGPNKDIPAPDVFTNSQIMAWMMDEYSALDKFNSPGFITGKPIVLGGSHGRDRSTALGVVIAIEQAAKRRNMQIEGAKVVIQGFGNAGSFLAKFLYDLGAKIVGISDAYGALHDPNGLDIDYLLDRRDSFGTVTNLFEETISNKELFELDCDILVPAAISNQITEDNAHDIKASIVVEAANGPTTPEATRILTERGILLVPDVLASAGGVTVSYFEWVQNNQGYYWSEEEVNEKLREKLEAAFDTIYELSQNRKIDMRLAAYIIGIKRTAEAARYRGWA >LS483484.1|SQI84248.1|953250_954441_+|Ornithine-aminotransferase MTKSEKIIELTNHYGAHNYLPLPIVISEAEGVWVKDPEGNKYMDMLSAYSAVNQGHRHPKIIQALKDQADKVTLVSRAFHSDNLGEWYEKICKLAGKDKALPMNTGAEAVETALKAARRWAYDVKGIEPNKAEIIAFNGNFHGRTMAPVSLSSEAEYQRGYGPLLDGFRKVDFGDVDALKAAINKNTAAVLVEPIQGEAGINIPPEGYLKAIRELCDEHNVLFIADEIQAGLGRSGKLFARDWDNVKPDVYILGKALGGGVFPISVVLADKEVLDVFTPGSHGSTFGGNPLACAASIAALDVIVDEDLPGRSLELGDYFKEQLKQIDHPSIKEVRGRGLFIGVELNESARPYCEALKEEGLLCKETHDTVIRFAPPLIITKEELDLALEKIRHVFQ >LS483484.1|SQI84247.1|951815_952943_+|Putative-NADH-dependent-flavin-oxidoreductase MKSKYEPLFDKVVLPNGVELRNRFVLAPLTHISSNDDGTISDIELPYIEKRSQDVGITSNAASNVSDVGKAFPGQPSIAHDSDIEGLKRLATAMKKNGAKALVQIHHGGAQALPELTPDGDVVAPSPISLKSFGQKQEHSAREMTNEEIEQAIKDFGEATRRAIEAGFDGVEIHGANHYLIHQFVSPYYNRRNDVWANQYKFPIAVIEEVLKSKEVYGNKDFIVGYRLSPEEAESPGITMEITEELVNKISHMPIDYIHVSMMDTHATAREGKYAGQERLPLIHKWINGRMPLIGIGSIFTADDALDAVENVGVDLVAIGRELLLDYQFVEKIKDGREDEIINYFDPEREDNHHLTPNLWHQFNEGFYPLPRKDK >LS483484.1|SQI84246.1|951076_951454_+|general-stress-protein-13 MNNYKIGQHIKVRVTGIQPYGAFVETPNHTEGLIHISEIMDDYVHNLKKFLSEGQIVKAKILSIDDEGKLNLSLKDNDYFKNYERKKEKQSVLDEIRETEKYGFQTLKERLPIWIKQSKRAIRND >LS483484.1|SQI84245.1|950068_950662_+|Peptidyl-prolyl-cis-trans-isomerase MANYPQLNKEVQQGEIKVVMHTNKGDMTFKLFPNIAPKTVENFVTHAKNGYYDGITFHRVINDFMIQGGDPTATGMGGESIYGGAFEDEFSLNAFNLYGALSMANSGPNTNGSQFFIVQMKEVPQNMLSQLADGGWPQPIVDAYGEKGGTPWLDQKHTVFGQIIDGETTLEDIANTKVGPQDKPLHDVVIESIDVEE >LS483484.1|SQI84244.1|949621_950005_-|kinase-associated-B-family-protein MKLYRFSHKTGSYGVTIVEENGDDVLVKVEQVIKHPKQGDLHNPTETEGVFFHERKALSHFEKRYTKRSQLRDFNVDVLRYEDSLQQAITDLETKLKTQQTKHAEMSLASLARLKEDYSLQYKENFK >LS483484.1|SQI84243.1|947085_949491_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-A MSLLHIAVILPLIFALIIPILYRFFKRIHLGWFVLPVPIVIFIYMLTLIKTTMSGNTVMKTLNWMPHFGMNFDLYLDGLGLLFSLLISGIGSLVVLYSIGYLSKSEQLGNFYCYLLLFMGAMLGVVLSDNVIILYLFWELTSFSSFLLISFWRERQASIYGAQKSLIITVFGGLSLLGGIILLAIPTQSFSIQYMIQHASEIQNSPFFIFAMILIMIGAFTKSAQFPFYIWLPDAMEAPTPVSAYLHSATMVKAGLYLIARMTPIFAASQGWIWTVTLVGLITLFWASLNATKQQDLKGILAFSTVSQLGMIMAMLGIGAISYHYQGDDSKIYAAAFTAAIFHLINHATFKGALFMITGAVDHSTGTRDVKKLGGLLTIMPISFTITVITALSMAGVPPFNGFLSKESFLETTFTASKANLFSVDTLGYLFPIIGIVGSVFTFVYSIKFIMHIFFGQYKPEQLPKKAHEVSILMLLSPAILATLVIVFGLFPGILTNSIIEPATSSINHTVIDDVEFHMFHGLTPAFLSTLVIYILGILLIVTFSYWVKLLQRQPGKLTFNYWYNRSANVIPNYSEKMTNSYVTDYSRNNLVIIFGALILLTFVTVFSVPFNINFKDVSPIRIFEVCIVILLLSAAFLILFAKSRLFSIIMLSAVGYAVSVLFIFFKAPDLALTQFVVESISTALFLLCFYHLPNLNRYNEKRSFQLTNALIAGGVGLSVIIIGLIAYGNRHFESISKFYQEHVYDLAHGKNMVNVILVDFRGMDTLFESSVLGIAGLAVYTMIKLRKKRQTQGNEVKNHE >LS483484.1|SQI84242.1|946664_947093_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-B MNRQQNDLILQFAAVIIFFMVMVFGFSLFLAGHYTPGGGFVGGLLFASSLVIITIAFDIETMRKIFPLDFKILIGIGLVFCIATPIASWFLGKNFFTHVTFDIPLFILEPVHMTTAVFFDFGVLCAVVGTVMTIIISIGENE >LS483484.1|SQI84241.1|946323_946665_-|Na+/H+-antiporter-subunit MEIIMIFVSGILTAISVYLVLSKSLIRIVMGTTLLTHAANLFLITMGGLKHGTVPIYEANVKSYVDPIPQALILTAIVIAFATTAFFLVLAFRTYKELGTDNVESMKGVPEDD >LS483484.1|SQI84240.1|944834_946331_-|Na(+)-H(+)-antiporter-subunit-D MIESNMLVLTLVIPVITAILLVFIGKRPIIKRYVALGGTLLTLVAAIINLANVVKHGPLRVELGSWKAPYSIVFVLDIFSALLIITSIIITAIVILYSYQTIGIERERYYYYFSVLFMLIGIIGAFTTGDIFNLFVFFEVFLMSSYFLLVIGSTKIQLQETIKYVLVNVVSSSFFVMGVAILYSVVGTLNLADISNKLANLSAHDSGLVNIVFILFIFVFATKAGVFPMFVWLPSAYYAPPIPIIAFFGALLTKVGVYAITRTLSLFFSDNVSFSHYVILFLALLTIIFGCVGAVAYANIKKIILYNVMIAVGVILVGVAMMTESGMIGAIYYTLHDMLVKLALFLLIGIMIKITGTADLRQFGGLIKRYPVLGWSFFIAALSLAGIPPLSGFYGKFFIVQSTFERGFYLSGVIVLLSSLVVLYSVIRIFLQGFFGQPKGYDLNNKVDVKYLTTIAIVAVVITVLYGLSADYLYPMVKAGAETFYNPSTYVKAVLGGK >LS483484.1|SQI84250.1|956188_957118_-|putative-glycerophosphoryl-diester-phosphodiesterase MTNSSKSFTKFMAASAVFTMGFLSVPTAGAEQTNHIANKPQAIQWHTNLTNERFTTIAHRGASGYAPEHTFQAYDKSHNELKASYIEIDLQRTKDGHLVAMHDENVNRTTNGHGKVEDYTLDELKQLDAGSWFNKKYPKYARASYKNAKVPTLDEILERYGPNANYYIETKSPDVYPGMEEQLLASLKKHHLLNKNKLKNGHVMIQSFSDESLKKIHRQNKHVPLVKLVDKGELQQFNDQRLKEIRSYAIGLGPDYTDLTEQNTHHLKDLGFIVHPYTVNEKADMLRLNKYGVDGVFTNFADKYKEVIK >LS483484.1|SQI84251.1|957359_958739_-|Argininosuccinate-lyase MSNKAWGGRFEVQPEEWVDDFNASITFDQTLIDQDIEGSIAHATMLANQGIISQQDSEQIIQGLKSIQHDYHQDQIQFSASLEDIHLNIEHELIKRIGDAGGKLHTGRSRNDQVATDMHLYTKKQVQDIIALIKSLQSVIVDIASNNVDTIMPGYTHLQRAQPISFAHHIMTYFWMLQRDQQRFEDSLKRIDINPLGAAALSGTTYPIDRHETTALLNFGSLYENSLDAVSDRDYIIETLHNISLTMVHLSRFAEEIIFWSTDEAKFITLSDAFSTGSSIMPQKKNPDMAELIRGKVGRTTGHLMSMLMTLKGLPLAYNKDMQEDKEGLFDAVHTIKGSLRIFEGMIQTMTINKERLNQTVKEDFSNATELADYLVTKNIPFRTAHEIVGKIVLECIQQGHYLLDVPLSTYQQHHSSIDADIYDYLQPENCLKRRQSYGSTGQSSVKQQLDVAKQLLSQ >LS483484.1|SQI84252.1|958728_959934_-|argininosuccinate-synthase MKEKIVLAYSGGLDTSVAVQWLIDKGYDVVACCLDVGEGKDLDIVYKKALDMRAVECHIIDATKEFSDEYVSYAIKGNLMYENAYPLVSALSRPLIAKKLVEIAEKTNSVGIAHGCTGKGNDQVRFEVAIKALNPSLKAFAPVREWAWSREEEIDYAIKHNIPVSINHDSPYSIDQNLWGRANECGILEDPYAAPPEDAFDLTNALEETPDTADEIILTFDKGIPVQIDGKTYELDDLILTLNALAGKHGIGRIDHVENRLVGIKSREIYEAPAAEVILKAHKALETITLTKDVAHFKPIIEKQFAEQLYNGLWFSPLTDSLKLFIDSTQQYVSGDVRIKLFKGNAIVNGRKSPYTLYDEKLATYTKEDAFNQDAAVGFIDIYGLPTQVNAMLHGGYSNEQ >LS483484.1|SQI84253.1|960284_961616_+|Glucose-6-phosphate-isomerase MTHIQLDFSKTLEFFGEHELKQQQEIVKSIHKTIHEGTGAGSDFLGWVDLPVDYDKEEFSRIVEASKRIKENSDVLVVIGIGGSYLGARAAIEMLTSSFRNSNEYPEIVFVGNHLSSTYTKELVDYLADKDFSVNVISKSGTTTEPAVAFRLFKQLVEERYGKEEAQKRIFATTDKEKGALKQLATNEGYETFIVPDDVGGRYSVLTAVGLLPIATAGINIEAMMIGAAKAREELSSDKLEENIAYQYATIRNILYAKGYTTEMLINYEPSMQYFNEWWKQLFGESEGKDFKGIYPSSANYTTDLHSLGQYVQEGRRFLFETVVKVNHPKYDITIEKDSDDLDGLNYLAGKTIDEVNTKAFEGTLLAHTDGGVPNMVVNIPQLDEETFGYVVYFFELACAMSGYQLGVNPFNQPGVEAYKQNMFALLGKPGFEDLKKELEERL >LS483484.1|SQI84254.1|961941_962517_+|SNARE-associated-Golgi-family-protein MSFHQVEEWFEIFRQFGYLPGFILLYIRAIIPVFPLALYILINIQAYGPILGILISWLGLISGTFTVYLICKRLVDTERMQRIKQRTAVQRLISFIDRQGLIPLFILLCFPFTPNTLINFVASLSHIRPKYYFIVLASSKLVSTIILGYLGKEITTILTHPLRGILMLVVLIVFWIVGKKLEQHFMGSKKE >LS483484.1|SQI84255.1|962521_963046_+|Signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMAFRQGQLYRDDRPVDASYAKNRKIKDFSLRNFKKLDGDIIPPNNFVVLNDHDNNQHDSRQFGLIDKKDIIGNISLRYYPFSKWTIQFKS >LS483484.1|SQI84256.1|963061_963637_+|Signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKYNFNPENTKN >LS483484.1|SQI84257.1|963796_967273_+|helicase-exonuclease-AddAB,-AddB-subunit MTLHAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEISNELNISIERQYFNQLYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQINPMLRLLKTDVLTTSYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMERFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLNQIQSLFNQLEITNIPQYHEVNPLSLMQHAKQTKITLFEALRAWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLSQGLDYLMSALTFDNETVKLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSATLDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQTVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >LS483484.1|SQI84258.1|967273_970927_+|ATP-dependent-nuclease,-subunit-A MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYETGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPNPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDISYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFHEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIEKYQRFTLDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLSTTNYIFKHMMDEQVGEVRYDEAAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKVFDMKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELAQIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKEMAFPSLASVAYKAVAEKKLVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISIIYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYQYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSEQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADTKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >LS483484.1|SQI84259.1|971092_971995_+|Fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVERLYVFTKAASSLTGDNAKIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483484_4 | 1257067-1257159 | Unclear |
NA
Consensus repeat of LS483484_4
|
1 spacers
spacers of LS483484_4
>4.1|1257097|33|LS483484|CRISPRCasFinder AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA |
cas3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483484_4
The CRISPR arrays of LS483484_4 >merge|LS483484|4|1257067-1257159|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACTAATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCATAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT >LS483484|4|4|1257067-1257159|CRISPRCasFinder TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT AATAAGCGGAACGCCTGAGCTAAAGCTCATGCA TAAGAAACAGTAATCAATAAATTGATAACT
>LS483484.1|SQI85274.1|1256208_1256943_+|3-oxoacyl-[acyl-carrier-protein]-reductase MTKSALVTGASRGIGRSIALQLAEEGYNVAVNYAGSKEKAEAVVEEIKAKGVDSFAIQANVADADEVKAMIKEVVSQFGSLDVLVNNAGITRDNLLMRMKEQEWDDVIDTNLKGVFNCIQKATPQMLRQRSGAIINLSSVVGAVGNPGQANYVATKAGVIGLTKSAARELASRGITVNAVAPGFIVSDMTDALSDELKEQMLTQIPLARFGQDTDIANTVAFLASDKAKYITGQTIHVNGGMYM >LS483484.1|SQI85273.1|1255289_1256216_+|Malonyl-CoA-[acyl-carrier-protein]-transacylase MSKTAIIFPGQGAQKVGMAQDLYNNNDQATEILTSAANTLDFDILETMFTDEEGKLGETENTQPALLTHSSALLAALKNLNPDFTMGHSLGEYSSLVAADVLSFEDAVKIVRKRGQLMAQAFPSGVGSMAAVLGLDFDKVDEICKSLSSDDKIIEPANINCPGQIVVSGHKALIDELVEKGKSLGAKRVMPLAVSGPFHSSLMKVIEEDFSSYINQFEWRDAKFPVVQNVNAQGETDKEVIKSNMVKQLYSPVQFINSTEWLIDQGVDHFIEIGPGKVLSGLIKKINRDVKLTSIQTLEDVKGWNEND >LS483484.1|SQI85272.1|1254310_1255297_+|Fatty-acid/phospholipid-synthesis-protein MVKLAIDMMGGDNAPDIVLEAVQKAVEDFKDLEIILFGDEKKYNLNHERIEFRHCSEKIEMEDEPVRAIKRKKDSSMVKMAEAVKSGEADGCVSAGNTGALMSAGLFIVGRIKGVARPALVVTLPTIDGKGFVFLDVGANADAKPEHLLQYAQLGDIYAQKIRGIDNPKISLLNIGTEPAKGNSLTKKSYELLNQDHSLNFVGNIEAKTLMDGDTDVVVTDGYTGNMVLKNLEGTAKSIGKMLKDTIMSSTKNKIAGAILKKDLAEFAKKMDYSEYGGSVLLGLEGTVVKAHGSSNAKAFYSAIRQAKIAGEQNIVQTMKETVGESNE >LS483484.1|SQI85271.1|1253748_1254306_+|fatty-acid-biosynthesis-transcriptional-regulator,-putative MKLKKDKRREAIRQQIDSNPFITDHELSDLFQVSIQTIRLDRTYLNIPELRKRIKLVAEKNYDQISSIEEQEFIGDLIQVNPNVKAQSILDITSDSVFHKTGIARGHVLFAQANSLCVALIKQPTVLTHESSIQFIEKVKLNDTVRAEARVVNQTAKHYYVEVKSYVKHTLVFKGNFKMFYDKRG >LS483484.1|SQI85270.1|1251470_1253531_+|ATP-dependent-DNA-helicase-RecG MAKVNLIESPYSLLQLKGIGPKKIEVLQQLNIHTVEDLVLYLPTRYEDNTVIDLNQAEDQSNVTIEGQVYTAPVVAFFGRNKSKLTVHLMVNNIAVKCIFFNQPYLKKKIELNQTITVKGKWNRVKQEITGNRVFLNSQGTQTQENADVQLEPVYRIKEGIKQKQIRDQIRQALNDVTIHEWLTDELREKYKLETLDFTLNTLHHPKSKEDLLRARRTYAFTELFLFELRMQWLNRLEKSSDEAIEIDYDLDQVKSFIDRLPFELTEAQKSSVNEIFRDLKAPIRMHRLLQGDVGSGKTVVAAICMYALKTAGYQSALMVPTEILAEQHAESLIALFGDSMNVALLTGSVKGKKRKILLEQLENRTIDCLIGTHALIQDDVIFHNVGLVITDEQHRFGVNQRQLLREKGAMTNVLFMTATPIPRTLAISVFGEMDVSSIKQLPKGRKPIITTWAKHEQYDKVLMQMTSELKKGRQAYVICPLIESSEHLEDVQNVVALYESLQQYYGVSRVGLLHGKLSADEKDEVMQKFSNHEIDVLVSTTVVEVGVNVPNATFMMIYDADRFGLSTLHQLRGRVGRSDQQSYCVLIASPKTETGIERMTIMTQTTDGFELSERDLEMRGPGDFFGVKQSGLPDFLVANLVEDYRMLEVARDEAAELIQSGVFFENTYQHLRHFVEENLLHRSFD >LS483484.1|SQI85269.1|1249634_1251281_+|Dihydroxyacetone-kinase-family-protein MISKINGKLFADMIIQGAQNLSNNADLVDSLNVYPVPDGDTGTNMNLTMTSGREEVENNLSKNIGELGKTFSKGLLMGARGNSGVILSQLFRGFCKNIESESEINSKLLAESFQAGVETAYKAVMKPVEGTILTVAKDAAQAAIEKANNTEDCIELMEYIIVKANESLENTPNLLAVLKEVGVVDSGGKGLLCVYEGFLKALKGEKVEAKVAKLDKDEFVHDEHDFHGVINTEDIIYGYCTEMMVRFGKNKKAFDEQEFRQDMSQFGDSLLVINDEEIVKVHVHTEYPGKVFNYGQQYGELIKLKVENMREQHREVIRKEQHTAKPKMETVETAIITISMGEGISEIFKSMGATHIISGGQTMNPSTEDIVKVIEQSKCKRAIILPNNKNILMASEQAASIVDAEAVVIPTKSIPQGISALFQYDVDATLEENKAQMADSVNNVKSGSLTYAVRDTKIDGVEIKKDAFMGLIEDKIVSSQSDQLTTVTELLNEMLADDSEILTVIIGQDAEQAVTDNMINWIEEQYPDVEVEVHEGGQPIYQYFFSVE >LS483484.1|SQI85268.1|1249245_1249620_+|general-stress-protein,-Gls24-family MTLEISNDYGKIDISNEVIASVVGGKAVECYGIVGMASRQQVRDGIAEILGHENYAKGIKVTENNGVVDIDMYIIVSYGVKISEVANNVQSTVKYTLEKSLNVSVNSINIYVQGVRVNNTGKKA >LS483484.1|SQI85267.1|1248614_1248803_-|50S-ribosomal-protein-L28 MGKQCFVTGRKASTGNRRSHALNSTKRRWNANLQKVRILVDGKPKKVWVSARALKSGKVTRV >LS483484.1|SQI85266.1|1247592_1248234_+|thiamin-pyrophosphokinase MHINLLCSDRHLPQDIWAKSNEGKWGGVDRGALILLKHQIIPFFSVGDFDSVSKEERQLLTEQLQIKPVQAEKADTDLALAVDKAVALGFDSITIYGATGGRLDHFFGAIQLLLKKAYYKHDVHIEVIDQQNKIELLPKGQHTVEKDKSYPYISFIPMTDDVELSLAGFKYNLARQMLNIGSTLTISNEIESLQAKVTVHDGLILQIRSTDLN >LS483484.1|SQI85265.1|1246941_1247586_+|Ribulose-phosphate-3-epimerase MTKLYPSLLSVDFLDLQHELKRLEEAGVDGVHFDVMDGQFVPNISIGLPILDAVRKGTTLPIDVHLMIENPEKYIASFAEHGADMISIHVESTPHIHRAIQMIKHLDKKAGVVINPGTPISQIEPILDIVDYVLVMTVNPGFGGQSFIDQCVEKIAGLNAIKMERQLNFDIEVDGGVNTDTAKVCVENGATMLVTGSFFFKQEDYKKVTQALKG >LS483484.1|SQI85275.1|1257248_1257482_+|Acyl-carrier-protein-/-HmrB-protein-involved-in-methicillin-resistance MENFDKVKDIIVDRLGVDADKVTEDASFKDDLGADSLDIAELVMELEDEFGTEIPDEEAEKINTVGDAVKFINSLEK >LS483484.1|SQI85276.1|1257597_1258329_+|Ribonuclease-III MSKQKKSEIVNRFRKRFDTKMTELGFTYQNIDLYQQAFSHSSFINDFNMNRLDHNERLEFLGDAVLELTVSRYLFDKHPNLPEGNLTKMRATIVCEPSLVIFANKIGLNEMILLGKGEEKTGGRTRPSLISDAFEAFIGALYLDQGLDIVWKFAEKVIFPHVEQNELLGVVDFKTQFQEYVHQQNKGDVTYNLIKEEGPAHHRLFTSEVILQGEAIAEGKGKTKKESEQRAAESAYKQLKQIK >LS483484.1|SQI85277.1|1258475_1262042_+|putative-chromosome-partition-protein MVYLKSIDAIGFKSFADQTNVQFDKGVTAIVGPNGSGKSNITDAIKWVLGEQSAKSLRGSKMEDIIFSGAEHRKAQNYAEVQLRLDNHSKKLSVDENEVIVTRRLYRSGESEYYINNDRARLKDIADLFLDSGLGKEAYSIISQGRVDEILNAKPIDRRQIIEESAGVLKYKKRKAESLNKLDQTEDNLTRVEDILYDLEGRVEPLKEEAAIAKEYKTLSHQMKHSDIVVTVNDIDQYTNDNRQLDQRLNDLQGQQANKEADKQRLSQQIQQYKGKRHQLDNDVESLNYQLVKATEAFEKYTGQLNVLVERKKNQSETNARYEEEQENLIELLENISSEISEAQDTYKSLKSKQKELNAVIRELEEQLYVSDEAHDEKLEEIKNEYYTLMSEQSDVNNDIRFLKHTIEENEVKKSRLDSRLVEVFEQLKDIQGQIKTTKKEYQQTNKELSAVDKEIKNIEKDLTDTKKAQNEYEEKLYQAYRYTEKMKTRIDSLATQEEEYTYFFNGVKHILKAKNKELKGIHGAVAEIIDVPSKLTQAIETALGASLQHVIVDSEKDGRQAIQFLKERNLGRATFLPLNVIQSRAVATDIKSIAKEANGFISIASEAVKVAPEYQNIIGNLLGNTIIVDHLKHANELARAIKYRTRIVTLEGDIVNPGGSMTGGGARKSKSILSQKDELTTMRHQLEDYLRQTESFEQQFKELKIKSDQLSELYFEKSQKHNTLKEQVHHFEMELDRLTTQETQIKNDHEEFEFEKNDGYTSDKSRQTLSEKETHLESIKASLKRLEDEIERYTKLSKEGKESLTKTQQTLHQKQSDLAVVKERIKTQQQTIDRLNNQSQQTKHQLNDVKEKIAFFNSDEVMGEQAFQNIKDQINGQQETRTRLSDELDKLKQQRIELNEQIDAQEATLQVCHQDILAIENHYQDIKAEQSKLDVLIHHAIDHLNDEYQLTVERAKSEYTSDESIDALRKKVKLMKMSIDELGPVNLNAIEQFEELNERYTFLSEQRTDLRKAKETLEQIISEMDQEVTERFKETFHAIQGHFTAMFKQLFGGGDAELQLTEADYLTAGIDIVVQPPGKKLQHLSLLSGGERALTAIALLFAILKVRSAPFVILDEVEAALDEANVIRYAKYLNELSDETQFIVITHRKGTMEFADRLYGVTMQESGVTKLVSVNLNTIDDVLKEEQ >LS483484.1|SQI85278.1|1262041_1263292_+|Signal-recognition-particle-receptor-protein-FtsY-(=alpha-subunit) MSFFKRLKDKFATNKENDEVKSLTEEQGQDKLEDTHSEGSTQDVNDLAENAEVKKKPRKLSEADFDDDGLISIEDFEEIEAQKMGAKFKAGLEKSRQNFQEQLNNLISRYRKVDEDFFEALEEMLITADVGFNTVMTLTEELRMEAQRRNIQDTEDLREVIVEKIVEIYHQEDDNSEAMNLEDGRLNVILMVGVNGVGKTTTIGKLAYRYKMEGKKVMLAAGDTFRAGAIDQLKVWGERVGVDVISQSEGSDPAAVMYDAINAAKNKGVDILICDTAGRLQNKTNLMQELEKVKRVINRAVPDAPHEALLCLDATTGQNALSQARNFKEVTNVTGIVLTKLDGTAKGGIVLAIRNELHIPVKYVGLGEQLDDLQPFNPESYVYGLFADMIEQNEEITTVENDQIVTEEKDDNHGAK >LS483484.1|SQI85279.1|1263278_1263611_+|Signal-recognition-particle-associated-protein MGQNDLVKTLRMNYLFDFYQSLLTNKQRNYLELFYLEDYSLSEIADTFNVSRQAVYDNIRRTGDLVEDYEKKLELYQKFEQRREIYDEMKKHLSNPEQIQRYIQQLEDLE >LS483484.1|SQI85280.1|1263636_1265004_+|Signal-recognition-particle,-subunit-FFH/SRP54 MAFEGLSERLQATMQKMRGKGKLTEADIKIMMREVRLALLEADVNFKVVKEFIKTVSERALGSDVMQSLTPGQQVIKIVQDELTKLMGGENTSINMSNKPPTVVMMVGLQGAGKTTTAGKLALLMRKKYNKKPMLVAADIYRPAAINQLQTVGKQIDIPVYSEGDQVKPQQIVTNALKHAKEEHLDFVIIDTAGRLHIDEALMNELKEVKDIAKPNEIMLVVDSMTGQDAVNVAESFDDQLDVTGVTLTKLDGDTRGGAALSIRSVTQKPIKFVGMSEKLDGLELFHPERMASRILGMGDVLSLIEKAQQDVDQEKAKDLEKKMRESSFTLDDFLEQLDQVKNLGPLDDIMKMIPGMNKMKGLDKLNMSEKQIDHIKAIIQSMTPAERNNPDTLNVSRKKRIAKGSGRSLQEVNRLMKQFNDMKKMMKQFTGGGKGKKGKRNQMQNMLKGMNLPF >LS483484.1|SQI85281.1|1265438_1265714_+|30S-ribosomal-protein-S16 MAVKIRLTRLGSKRNPFYRIVVADARSPRDGRIIEQIGTYNPTSANAPEIKVDEALALKWLNDGAKPTDTVHNILSKEGIMKKFDEQKKAK >LS483484.1|SQI85282.1|1265901_1266405_+|16S-rRNA-processing-protein MRVEVGQIVNTHGIKGEIKVKSNSDFTDVRFQPGQVLTVVHNNNDLEYTVKSHRVHKGLHMLTFEGINNINDIEHLKGSSIYQERDHEDIVLEENEFYYSDIIGCTVFDDQETPIGRVINIFETGANDVWVIKESKEYLIPYIADVVKEVDVENKKIIITPMEGLLD >LS483484.1|SQI85283.1|1266404_1267142_+|tRNA-(Guanine37-N1)--methyltransferase MKIDYLTLFPEMFDGVLNHSIMKRAQENNKLQINTVNFRDYAINKHNQVDDYPYGGGQGMVLKPEPVFNAMEDLDVTEQARVILMCPQGEPFSHQKAVELSKADHIVFICGHYEGYDERIRTHLVTDEISMGDYVLTGGELPAMTMTDAIVRLIPGVLGNEQSHQDDSFSDGLLEFPQYTRPREFKGLTVPDVLLSGNHANIDAWRHEQKLIRTYNKRPDLIEKYPLTNADKQILERYKIGLKKG >LS483484.1|SQI85284.1|1267244_1267595_+|50S-ribosomal-protein-L19 MTNHKLIEAVTKSQLRTDLPSFRPGDTLRVHVRIIEGTRERIQVFEGVVIKRRGGGVSETFTVRKISSGVGVERTFPLHTPKIEKIEVKRRGKVRRAKLYYLRSLRGKAARIQEIR |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483484_5 | 2078374-2078565 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483484_5
|
3 spacers
spacers of LS483484_5
>5.1|2078395|37|LS483484|CRT CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACAGAAAGTCAG >5.2|2078453|34|LS483484|CRT AACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCCTTTCGAAAT >5.3|2078508|37|LS483484|CRT CTAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACAGAAAGTCAG |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483484_5
The CRISPR arrays of LS483484_5 >merge|LS483484|5|2078374-2078565|CRT CTCTATGTTTGGGGCCCCACCCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCCTTTCGAAATTCTCTTTGTTGGGGCCCCACCCTAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACAGAAAGTCAGCTTCTTTGTTGGGGCCCCACT >LS483484|5|1|2078374-2078565|CRT CTCTATGTTTGGGGCCCCACC CCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACAGAAAGTCAG CTTCTATGTTGGGGCCCCGCC AACTTGCATTGTCTGTAGAATTTCCTTTCGAAAT TCTCTTTGTTGGGGCCCCACC CTAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACAGAAAGTCAG CTTCTTTGTTGGGGCCCCACT
>LS483484.1|SQI89108.1|2077284_2078232_-|Transcription-regulator-(contains-diacylglycerol-kinase-catalytic-domain) MRKRARIIYNPTSGKEQFKRELPDALIKLEKAGYETSAYATEKIGDATLEAERAMHENYDVLIAAGGDGTLNEVVNGIAEKPNRPKLGVIPMGTVNDFGRALHIPNDIMGALDVIIEGHSTKVDIGKMNNRYFINLAAGGQLTQVSYETPSKLKSIVGPFAYYIKGFEMLPQMKAVDLRIEYDGNVFQGEALLFFLGLTNSMAGFEKLVPDAKLDDGYFTLIIVEKSNLAELGHIMTLASRGEHTKHPKVIYEKAKAINISSFTDLQLNVDGEYGGKLPANFLNLERHIDVFAPNDIVNEELINNDHVDDNLIEE >LS483484.1|SQI89103.1|2075842_2077204_-|RNA-methyltransferase,-TrmA-family MQAIAKNDIKTGTVVDLTHEGHGVVKIDRFPIFIPQALINEQIEYKIIKVKKNFAIGKLLNINTRSENRVAPPCIYYERCGGCQLQHLSYEAQLEMKKEQVINLFQRKAHFDNSKINDTVGMTDPWRYRNKSQIPVGKNEQNEVIMGFYRQRSHDIIDMGSCLIQDSQHQEVMNEVKSILKDLNVSIYQEQLKKGLMRHLVVRTGYHTDEMMVIFVTNGKNWPQKNAVVEKILDAFPNVTSIKQNINDSHSNVIMGRQSITLYGKDTIIDQLTDSTFKISDQSFYQINSEQTEKLYNKAIEYAQLTGNEVVLDTYCGIGTIGLYMAPHAKHVYGVEVVPSAIEDAQQNATINQCNNTTFVCGKAEEVILQWKAQGIKPDVVMVDPPRKGCDETFIQTLLTLEPKRIVYISCNPSTQQRDALLLAEKYQLEEVTPVDMFPQTTHVETVALFNLK >LS483484.1|SQI89098.1|2075142_2075673_-|Permease MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLILLSAGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >LS483484.1|SQI89093.1|2073825_2074896_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGMTVIDYRNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSTRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >LS483484.1|SQI89090.1|2073204_2073759_+|DNA-polymerase-III-polC-type MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFSQQNIKVHGIQPEDVENAPTFDYVFPYMMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >LS483484.1|SQI89087.1|2072313_2072814_+|Ferritin-like-protein-2 MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEEAMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGTRTFDEE >LS483484.1|SQI89082.1|2070708_2072022_-|UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2,-6-diaminopimelate-ligase MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNGDDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISRFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYTVLRELGLNEQAIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >LS483484.1|SQI89074.1|2069975_2070707_-|CobB/CobQ-like-glutamine-amidotransferase-domain-containing-protein MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHNFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEKQAKQVLIDRANRQKKSR >LS483484.1|SQI89070.1|2069337_2069751_-|Uncharacterised-protein MKPTKVILKDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEIKFEFALFDSDMDNLKYIEYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMVTESGVSLRINVTKSGFTKFINELVSLH >LS483484.1|SQI89065.1|2068162_2069149_+|Integral-membrane-protein MNGQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQEIILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >LS483484.1|SQI89111.1|2079054_2080482_-|aspartyl/glutamyl-tRNA-amidotransferase-subunit-B MHFETVIGLEVHVELKTDSKMFSPSPAHFGAEPNSNTNVIDLAYPGVLPVVNKRAVDWAMRAAMALNMEIATESKFDRKNYFYPDNPKAYQISQFDQPIGENGYIDIEVDGETKRIGITRLHMEEDAGKSTHKGEYSLVDLNRQGTPLIEIVSEPDIRSPKEAYAYLEKLRSIIQYTGVSDVKMEEGSLRCDANISLRPYGQEKFGTKAELKNLNSFNYVRKGLEYEEKRQEEELLSGGEIGQETRRFDESTGKTILMRVKEGSDDYRYFPEPDIVPLYIDDAWKERVRQTIPELPDERKAKYVNELGLPAYDAHVLTLTKEMSDFFESTIEHGADVKLTSNWLMGGVNEYLNKNQVELLDTKLTPENLAGMIKLIEDGTMSSKIAKKVFPELAAKGGNAKQIMEDNGLVQISDEATLLKFVNEALDNNEQSVEDYKNGKGKAMGFLVGQIMKASKGQANPQLVNQLLKQELDKR >LS483484.1|SQI89114.1|2080494_2081952_-|aspartyl/glutamyl-tRNA(Asn/Gln)-amidotransferase-subunit-A MSIRYESVENLLTLIKDKKIKPSDVVKDIYDAIEETDPTIKSFLALDKENAIKKAQELDELQAKDQMDGKLFGIPMGIKDNIITNGLETTCASKMLEGFVPIYESTVMEKLHNENAVLIGKLNMDEFAMGGSTETSYFKKTVNPFDHKAVPGGSSGGSAAAVAAGLVPFSLGSDTGGSIRQPAAYCGVVGMKPTYGRVSRFGLVAFASSLDQIGPLTRNVKDNAIVLEAISGADANDSTSAPVDDVDFTSEIGKDIKGLKVALPKEYLGEGVADDVKEAVQNAVETLKSLGAVVEEVSLPNTKFGIPSYYVIASSEASSNLSRFDGIRYGYHSKEAHSLEELYKMSRSEGFGKEVKRRIFLGTFALSSGYYDAYYKKSQKVRTLIKNDFDKVFENYDVVVGPTAPTTAFNLGEEIDDPLTMYANDLLTTPVNLAGLPGISVPCGQSNGRPIGLQFIGKPFDEKTLYRVAYQYETQYNLHDVYEKL >LS483484.1|SQI89119.1|2081953_2082256_-|Aspartyl-tRNA(Asn)-amidotransferase-subunit-C;-Glutamyl-tRNA(Gln)-amidotransferase-subunit-C MTKVTREEVEHIANLARLQISPEETEEMANTLESILDFAKQNDSADTEGVEPTYHVLDLQNVLREDKAIKGIPQELALKNAKETEDGQFKVPTIMNEEDA >LS483484.1|SQI89125.1|2082622_2084161_+|Sodium/proline-symporter MLTMGTALSQQVDANWQTYIMIAVYFLILIVIGFYGYKQATGNLSEYMLGGRSIGPYITALSAGASDMSGWMIMGLPGSVYSTGLSAMWITIGLTLGAYINYFVVAPRLRVYTELAGDAITLPDFFKNRLNDKNNVLKIISGLIIVVFFTLYTHSGFVSGGKLFESAFGLDYHFGLILVAFIVIFYTFFGGYLAVSITDFFQGVIMLIAMVMVPIVAMMNLNGWGTFHDVAAMKPTNLNLFKGLSFIGIISLFSWGLGYFGQPHIIVRFMSIKSHKMLPKARRLGISWMAVGLLGAVAVGLTGIAFVPAYHIKLEDPETLFIVMSQVLFHPLVGGFLLAAILAAIMSTISSQLLVTSSSLTEDFYKLVRGEEKAKTHQKEFVMVGRLSVLAVAIVAIAIAWNPNDTILNLVGNAWAGFGASFSPLVLFALYWKGLTRAGAVSGMVSGALVVIVWIAWIKPLAHINEIFGLYEIIPGFIVSVIVTYVVSKLTKKPGAFVETDLNKVRDIVREK >LS483484.1|SQI89130.1|2084249_2085449_-|Lipoprotein-(pheromone-precursor) MKRTLVLLITAIFILAACGNHKDDQAGKDNQKHNNSSNQVKEIATDKNVQGDNYRTLLPFKESQARGLLQDNMANSYNGGDFEDGLLNLSKEVFPTDKYLYQDGQFLDKKTINAYLNLKYTKREIDKMSEKDKKDKKANENLGLNPSHEGETDPEKIAEKSPAYLSNILEQDFYGGGDTKGKNIKGMTIGLAMNSVYYYKKEKDGPTFSKKLDDSEVKKQGKQMASEILSRLRENDDLKDIPIHFAIYKQSSEDSITPGEFITQATAEKSQTKLNEWHNINEKSALLPSSTAADYDENLNNNFKQFNDNLQSYFSNFTQAVGKVKFVDKKPQRLVVDLPIDYYGQAETIGITQYVTEQANKYFDKIDNYEIRIKDGNQPRALISKTKDDKEPQVHIYSN >LS483484.1|SQI89134.1|2085461_2087465_-|DNA-ligase MADLSSRVNELHDLLNQYSYEYYVEDNPSVPDSEYDKLLHELIKIEEEHPEFKTVDSPTVRVGGEAQASFNKVNHDTPMLSLGNAFNEDDLRKFDQRIREQIGNVEYMCELKIDGLAVSLKYVDGYFVQGLTRGDGTTGEDITENLKTIHAIPLKMKEPLNVEVRGEAYMPRRSFLRLNEEKEKNDEQLFANPRNAAAGSLRQLDSKLTAKRKLSVFIYSVNDFTDFNARSQSEALDELDKLGFTTNKNRARVSDIDGVLEYIEKWTSQRESLPYDIDGIVIKVNDLDQQDEMGFTQKSPRWAIAYKFPAEEVVTKLLDIELSIGRTGVVTPTAILEPVKVAGTTVSRASLHNEDLIHDRDIRIGDSVVVKKAGDIIPEVVRSIPERRPEDAVTYHMPTHCPSCGHELVRIEGEVALRCINPKCQAQLVEGLIHFVSRQAMNIDGLGTKIIQQLYQSELIKDVADIFYLTEEDLLPLDRMGQKKVDNLLAAIQQAKDNSLENLLFGLGIRHLGVKASQVLAEKYETIDRLLTVTEAELVEIHDIGDKVAQSVVTYLENEDIRALIQKLKDKHVNMIYKGIKTSDIEGHPEFSGKTIVLTGKLHQMTRNEASKWLASQGAKVTSSVTKNTDVVIAGEDAGSKLTKAQSLGIEIWTEQQFVDKQNELNS >LS483484.1|SQI89138.1|2087468_2089661_-|ATP-dependent-DNA-helicase-UvrD/PcrA MNALLNHMNTEQSEAVKTTEGPLLIMAGAGSGKTRVLTHRIAYLLDEKDVSPYNVLAITFTNKAAREMKERVQKLVGDQAEVIWMSTFHSMCVRILRRDADRIGIERNFTIIDPTDQKSVIKDVLKNENIDSKKFEPRMFIGAISNLKNELKTPADAQKEATDYHSQMVATVYSGYQRQLSRNEALDFDDLIMTTINLFERVPEVLEYYQNKFQYIHVDEYQDTNKAQYTLVKLLASKFKNLCVVGDSDQSIYGWRGADIQNILSFEKDYPEANTIFLEQNYRSTKTILNAANEVIKNNSERKPKGLWTANTNGEKIHYYEAMTERDEAEFVIREIMKHQRNGKKYQDMAILYRTNAQSRVLEETFMKSNMPYTMVGGQKFYDRKEIKDLLSYLRIIANSNDDISLQRIINVPKRGVGPSSVEKVQNYALQNNISMFDALGEADFIGLSKKVTQECLNFYELIQSLIKEQEFLEIHEIVDEVLQKSGYREMLERENTLESRSRLENIDEFMSVPKDYEENTPLEEQSLINFLTDLSLVADIDEADTENGVTLMTMHSAKGLEFPIVFIMGMEESLFPHIRAIKSEGDHEMQEERRICYVAITRAEEVLYITHATSRMLFGRPQSNMPSRFLKEIPESLLENHSSGKRQTIQPKAKPFAKRGFSQRTTSTKKQVSSSDWNVGDKVMHKAWGEGMVSNVNEKNGSIELDIIFKSQGPKRLLAQFAPIEKKED >LS483484.1|SQI89143.1|2089657_2090350_-|geranylgeranylglyceryl-diphosphate-synthase MYDIKKWRHIFKLDPAKHISDDDLDAICMSQTDAIMIGGTDDVTEDNVIHLMSRVRRYPLPLVLEISNIESVMPGFDFYFVPTVLNSTDVAFHNGTLLEALKTYGHSIDFEEVIFEGYVVCNADSKVAKHTKANTDLTTEDLEAYAQMVNHLYRLPVMYIEYSGIYGDVSKVQAVSEHLTETQLFYGGGISSEQQATEMAAIADTIIVGDIIYKDIKKALKTVKIKESSK >LS483484.1|SQI89148.1|2090532_2090835_-|His-repressor MQIEKLRGAALDELFDAILTLENREECYQFFDDLCTVNEIQSLSQRLQVAKMIKQGYTYATIEQESGASTATISRVKRSLQWGNDAYTMILDRMNIETNE >LS483484.1|SQI89153.1|2090943_2092239_-|adenylosuccinate-lyase MIERYSREEMSNIWTDQNRYEAWLEVEILACEAWSELGHIPKADVQKIRQNAKVNVERAQEIEQETRHDVVAFTRQVSETLGEERKWVHYGLTSTDVVDTALSFVIKQANDIIEKDLERFIDVLAEKAKNYKYTLMMGRTHGVHAEPTTFGVKMALWYTEMQRNLQRFKQVREEIEVGKMSGAVGTFANIPPEIESYVCKHLGIGTAPVSTQTLQRDRHAYYIATLALIATSLEKFAVEIRNLQKTETREVEEAFAKGQKGSSAMPHKRNPIGSENITGISRVIRGYITTAYENVPLWHERDISHSSAERIMLPDVTIALDYALNRFTNIVDRLTVFEDNMRNNIDKTFGLIFSQRVLLALINKGMVREEAYDKVQPKAMISWETKTPFRELIEQDESITSVLTKEELDECFDPKHHLNQVDTIFERAGLA |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483484_6 | 2384623-2384748 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483484_6
|
1 spacers
spacers of LS483484_6
>6.1|2384660|52|LS483484|CRISPRCasFinder CTGGTTTCTCATGATTTTTTAATGTTTTTATTTTGAGTTACTCGAAAATTTT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483484_6
The CRISPR arrays of LS483484_6 >merge|LS483484|6|2384623-2384748|CRISPRCasFinder CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACTCTTGATATCACTGGTTTCTCATGATTTTTTAATGTTTTTATTTTGAGTTACTCGAAAATTTTCCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCA >LS483484|6|5|2384623-2384748|CRISPRCasFinder CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACTCTTGATATCA CTGGTTTCTCATGATTTTTTAATGTTTTTATTTTGAGTTACTCGAAAATTTT CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCA
>LS483484.1|SQI90140.1|2381411_2383076_-|Acetolactate-synthase,-catabolic MTDKKYTAADMVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGVVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPVESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGVISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELETQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISEKVDEPFINQQHLDELEQLRTHIDEETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDDTTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >LS483484.1|SQI90139.1|2380670_2381375_-|alpha-acetolactate-decarboxylase MASVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHVRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGAVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIQDEDFINANIDYKDIADEIREAE >LS483484.1|SQI90138.1|2379854_2380280_+|Truncated-cell-surface-protein-map-w MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNQLASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNSIDPSTIKQIQIVVK >LS483484.1|SQI90137.1|2378744_2379560_-|hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVITVVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILHHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSTGNHNNDRRILEVLVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >LS483484.1|SQI90136.1|2377679_2378534_-|Peptidase,-M23/M37-family MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWQFRKLFKSYTWQSDVHELKVCTQNDGTIEQIWIDKANQFGVAVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKNLGKVNADYFCFGKDIIAPANGTVEKVVNGVQDNSIGSTKESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFINNRELIKGDVVCGLQGE >LS483484.1|SQI90135.1|2375193_2377620_+|Hyaluronate-lyase-precursor MTYRMKKWQKLSTITLLMAGVITLNGGEFRSIDKHQIAVADTNVQTTDYEKLRNIWLDVNYGYDKYDENNPDMKKKFEATENEAEKLLKEMKTESDRKYLWESSKDLDTKSADMTRTYRNIEKISEAMKHKNTKLKTDENKTKVKDALEWLHKNAYGKEPDKKVADLTSNFKNKTSRNTNLNWWDYEIGTPRALTNTLILLQEDFTDEEKKKYTAPIKTFAPDSDKILSSVGKSEPAKGGNLVDISKVKLLESIIEEDKDMMKKSIDSFNTVFTYAQNSATGKERNGFYKDGSYIDHQDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETPFNDSNQNDTTLKSWIDDGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHSASATVMKSLLRLSDTMDKSTKAKYKKIVKTSVESDSSYKQTDYLSSYSDISKMKSLMEDSTISTNGLTQQLKIYNDMDRVTYHNKGLDFAFGLSMTSKNVARYESINGENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATADMKRLAGTTTLDNEEPKSTDVKKSSKTFVGGTKFDDQHASIGMDFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKSTDSSKNPVTTIENRKANDYKLYKDDTQTTNSDNQETNSLFLESTNSTQNNIGYHFLNESKITVKKESHTGKWSDINKSQKDIQKTDEYYEVTQKHSNTDSKYAYVLYPGLSKDVFKSKASKVTVVKQEDDFHVVKDNESVWAGINYSDSAKTFEINNTKVEVKAKGMFILTKKDDNTYECSFYNPESTNSVSDIESKISMTGYSIINKNTSTSNESGVRFELTK >LS483484.1|SQI90134.1|2374370_2374787_-|transcriptional-regulator,-MerR-family MKTKEVVALMNISQDTLRYYEKVGVIPPVNRDENGYRIYNDNDLNWIYLVKNLRNAGVSIESLIEFCRLAQLPKNENIQAQQKQILNKQLEELNENLKTIHDARDLLQYKIDNYDNHIAKINASDNHDDNVERLWERK >LS483484.1|SQI90133.1|2373452_2374301_-|oxidoreductase,-aldo/keto-reductase-family MNHIEISKDVKIPVLGFGVFQIPQEQTAEAVKEAIKAGYRHIDTAQSYLNETEVGQGIEASGIDRSELFITTKVWIENVNYEDTIKSIERSLQRLNLDYIDLVLIHQPYNDVYGSWRALEELKETGKIKAIGVSNFGVDRIVDLGIHNQIQPQVNQIEINPFHQQEEQVAALQQENVVVEAWAPFAEGKNQLFQNQLLQAIADKYNKSIAQVILRWLVERDIVVLAKSVNPERMAQNLDIFDFELTEEDKQQIATLEESNSQFFSHADPEMIKALTSRELDV >LS483484.1|SQI90132.1|2373106_2373232_-|Doubtful-CDS.-No-database-matches MTYIPFSIITLITGIIMHMTMYFVKFECRKMPLFMTIIFTI >LS483484.1|SQI90131.1|2372858_2373152_-|Uncharacterised-protein MSENAIIHDDYFYNLKAVKTHNIAKNVNKSLLNDKGVSIGKFIQKLKGKNPTWRYPKIKWTISKNKGQSYGGSYWKLINNKGKRIASLTKEGKILRE >LS483484.1|SQI90141.1|2384805_2386242_-|divergent-AAA-domain-containing-protein MTSSKYIEYLQTEVEGQLLDRKRASINPKDVAQHISAFANAEGGKLVIGIEDNGEISGFNHSKAKKKEVYIEAPFEHLYRIPKYTYEIIEVKKRDGTMDEILIFDIEPSYDAIITLKDDSVYLRINDKSRKLTHNQITNLEYDRGSRRFEEELVEYSSIEDVNEELVDEFKQLLNTNVDNEKLLKARGFMREGKLTVAGLLLFSNHINVYLPGARIRFMRYEGTKEESGTRLNIVKDITFDKALPVAIREARAFINTQLREYTFLGKEGRFVTLPEYPEFAWFEGMINSIVHRRYDNQGDHIRIKMFDDRLEISSPGALPASVTLENIKEERYSRNPKLAAALTQYKWVRESNEGVGRIFDEMKQYFLDDPVYSEPNNSSVQLALKNNIIARKKRETGRVSNIITPELFESLNEQQELIVRHLYNQGELTASKIANIIQRSVPTARKRLKELEEMNIISTHGSSKNDPKRTYYLLGFE >LS483484.1|SQI90142.1|2386590_2386989_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >LS483484.1|SQI90143.1|2387002_2387440_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >LS483484.1|SQI90144.1|2387688_2388483_-|tRNA-pseudouridine-synthase-A MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRIHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTDLNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQQRDPFQSGLKTFIPEPLDLDKMNRAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEVSDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSL >LS483484.1|SQI90145.1|2388487_2389294_-|Transmembrane-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters MKNKLIIGRYLPINSFVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFFCHSPLTYLWMFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVKRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPIAIILFVLKYSGV >LS483484.1|SQI90146.1|2389283_2390144_-|ATPase-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters MIIRFDNVSYTYQKGTPYQHQAIHDVNTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALLKPTTGTVTVDDITITHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMNLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSILAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKTIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKDKEKLADWHIGLPEIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >LS483484.1|SQI90147.1|2390140_2390950_-|cobalt-import-ATP-binding-protein MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIEKVKSGEIFYNNQAITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALEQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRKVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTATEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGHQTSFLTYEGLVDQL >LS483484.1|SQI90148.1|2391352_2392081_+|transposase MSIKPKVDIDVLLYMFQEYEKGVSFQYLIDTLQLDINVNTLYPKYKYYKTHGIETLLTQKQYNHYSKELKLKVVNEYLNSNQSTQDIAIKYNIRSSTQVKNWIKMYTVGKEIKNQSPKTGVYIMKARKTTFEERVTIVEYYLNHKQSYREVAEHFNISYGQIYQWVHKYQAHGKNGLVDGRGKGKPKSMMTPEEQKEAEIQALKAQNRLLEMENDVLKKFQALEREMIQRENKSRHTKRSKR >LS483484.1|SQI90149.1|2392104_2392893_+|insertion-element-protein MCRILGISRASYYKWVHYQSSELELENEQLKREIESIYHKYNGIYGYRRIYIYIRLKLGKQVNRKRIYRLMKELNLKAVIRQKRKPYRRSTPQITSENKLNRQFDIDTPNKVWLTDVTEFKIKEGSKIYLSAIYDLGAKRIVSYELGPSNNNQLVFKTFNQAIEKVENTKGILFHSDRGFQYTSKTFKHMLDECGMIQSMSRVSKCIDNGPMEGVWGTIKSEIFRGNKHFKFNSVEEATKTIHDFILFFNHERITLKMADSV >LS483484.1|SQI90150.1|2393145_2393514_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483484_7 | 2424630-2424710 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LS483484_7
|
1 spacers
spacers of LS483484_7
>7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder CACATTATTGTAAGCTGACTTTTCGTCACCT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LS483484_7
The CRISPR arrays of LS483484_7 >merge|LS483484|7|2424630-2424710|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCACATTATTGTAAGCTGACTTTTCGTCACCTTCTATGTTGGGGCCCCGCCAATTTG >LS483484|7|6|2424630-2424710|CRISPRCasFinder TCTATGTTGGGGCCCCGCCAACTTG CACATTATTGTAAGCTGACTTTTCGTCACCT TCTATGTTGGGGCCCCGCCAATTTG
>LS483484.1|SQI90193.1|2423926_2424277_-|Transcriptional-regulator-SarV MSNKVQRFIEAERELSQLKHWLKTTHKISIEEFVVLFKVYEAEKISGKELRDTLHFEMLWDTSKIDVIIRKIYKKELISKLRSETDERQVFYFYSTSQKKLLDKITKEIEVLSVTN >LS483484.1|SQI90192.1|2422613_2423825_+|Major-facilitator-family-transporter MTNQGSLNKSPIFTKSFTINFFVNFIVYLCMYLLLVVIAGYSKQAFDASDSLAGLVVGLFIVGSLIGRFATGKFVNQIGPKRLLFIGLIALIITQLLYFIDGSLAFLIFVRLINGIATAVVTTATGTIAAYVTPVNRKSEGISLFSLSLVLGTAIGPFLGMLLITKYAIDLLFIICVILGILGVIISLFIKVDFEVTNSKTETNVIDKPRFSIHQFIAKEAIPVAVIMLLIGVTYASILTYLQAFAIERHLVTAASYFFICYAIASLITRPIAGRLMDDKNENIIVYPAFIMLFLSFVCLISSYQSWLILLAGACLGLGYGNLSSAMQSIAIKVSPPIKYGIATSTFYVGLDAGVGFGPSFLGLFTHMFSYSEIFGFMAALAIITMLVYFLIHGRHVTRNAMN >LS483484.1|SQI90191.1|2422180_2422621_+|MarR-family-regulatory-protein MLSQEFFNSFITIYRPYLKLTEPILEKHNIYYGQWLILRDIAKHQPTTLIEISHRRAIEKPTARKTLKALIENDLITVENSLEDKRQKFLTLTPKGHELYEIVCLDVQKLQQAVVAKTNISQDQMQETINVMNQIHEILLKEAHND >LS483484.1|SQI90190.1|2421253_2422018_-|glyoxalase-like-domain-protein MILKFDHIIHYIDQLDRFSFPGDVIKLHSGGYHHKYGTFNKLGYINENYIELLDVENNEKLKKMAKTIEGGVAFATQIVQEKYEQGFKNICLRTNDIEAVKNKLQSEQVEVVGPIQMERDTHKDGKVKWQLLYIMNQDDDEIKPPFFIQWEESDSMRTKKLQKYFQKQFSIETVIVKSKNRSQTVSNWLKWFDMDIVEENDHYTDLILKNDDIYFRIEDGKVSKYHSVIIKDAQATSPYSIFIRGAIYRFEPLV >LS483484.1|SQI90189.1|2421010_2421262_+|membrane-protein MRTIILSLFIIMNIVAIIMTLSQPLTVNYFSLRVILIFFTFILSIFFILIKSSRLNNILTILSIALAIIHMGILAHSTYVYLY >LS483484.1|SQI90188.1|2419356_2420622_-|FmhB-protein-of-FemAB-family-involved-in-peptidoglycan-interpeptide-biosynthesis MEKMHITNQEHDAFVKSNPNGDLLQLTKWAETKKLTGWYARRIAVGRDGEIQGVAQLLFKKVPKLPYTLCYISRGFVVDYSNKEALNALLDSAKEIAKAEKAYAIKIDPDVEVDKGTDALQNLKALGFKHKGFKEGLSKDYIQPRMTMITPIDKNDDELLNSFERRNRSKVRLALKRGTTVERSDREGLKTFAELMKITGERDGFLTRDISYFENIYDALHEDGDAELFLVKLDPKENIAKVNQELNELHAEIAKWQQKMETSEKQAKKAQNMINDAQNKIAKNEDLKRDLEALEKEHPEGIYLSGALLMFAGSKSYYLYGASSNEFRDFLPNHHMQYTMMKYAREHGATTYDFGGTDNDPDKDSEHYGLWAFKKVWGTYLSEKIGEFDYVLNQPLYQLIEQVKPRLTKAKIKISRKLKRK >LS483484.1|SQI90187.1|2416072_2419240_-|RND-multidrug-efflux-transporter;-Acriflavin-resistance-protein MIKKLLQFSLGNKFAIFLMVVLVVLGGVYASAKLKLELLPNVQNPVISVTTSMPGATPQSTQDEISSKIDNQVRSLAYVKNVKTQSIQNASIVTVEYENNTDMDKAEEQLKKEIDKIKFKDEVGQPELRRNSMDAFPVLAYSFSNKENDLKKVTKVLNEQLIPKLQTVDGVQNAQLNGQTNREITLKFKQNELEKYGLTADDVENYLKTATRTTPLGLFQFGDKDKSIVVDGQYQSVDAFKNINIPLTLAGGQGQSQSQSDNKQNSAMSDVNQASPQQNSKTSASNNISGMPTAKLGDLADITVGDVRTSISKTNGKDAVNLQITKAQDANTVQVAKDVQRKIDTFVDENKDFNVTKTMDTAKPVEKSLYTMVEKASLGTIVAIIVILLFLRNIRTTAISIISIPLSLLMALIALKLSDVSLNILTLGALTVAIGRVIDDSIVVVENIYRRLTDSEEQLKGENLIISATTEVFKPIMSSTLVTIIVFLPLVFVSGSVGEMFRPFALAIAFSLLASLLVSITLVPALAATLFKKGVKRRNKQHQEGLGVVSTTYKKVLHWSLNHKWIVIILSTLILVTTIVFGGPRLGTSFISAGDDKFLAITYTPKPGETEQAVLNHAKDVEKYLKQKKHVKTIQYSVGGSSPVDPTGSTNSMAIMVEYDNDTPNFDVEADKVIKHADGFKHPGEWKNQDLGTGAGNKSVEVTVKGPSMDAIKSTVKDIEQKMKQVKGLANVKSDLSQTYDQYEIKIDQNKAAENGISASQLAMHLNENLPEKTVTTVKENGKTVDVKVKQNKQTDWSEDKLNNITLKKPTGGTIKLGDIATLVKTTTPSKLTQEQGDYATTVSAKVTNKDVGGTTRQVMSKINNLDKPNNVKVNIGGASDDINNAMTQLAFAMLAAIIIVYLILVITFKGGLAPFTILFSLPFTVIGVIIALLITGETISVPSLIGMLMLIGIVVTNAIVLIDRVINNEQQGMEMKEALIEAGGTRIRPILMTAIATIGALVPLLFGQDSSILISKGLAATVIGGLISSTLLTLVVVPVIYEILFTLKKRFTKR >LS483484.1|SQI90186.1|2415568_2415886_+|Uncharacterised-protein MQFYLILLAILYLIVSFISIFKMEVVFTRILRIIMGVLLLFVLALTTMSFPKENWWVFIVLLLLVGNVEVTGFKMLKKDLKGVNILNLMSLFIFVIYFILTIVLF >LS483484.1|SQI90185.1|2415159_2415324_+|DNA-repair/chromosome-segregation-ATPase MSLENQLAELKYDYVRLQGDLEKRESLNLDTSALVRQLKDIENEIRNVRAQMQD >LS483484.1|SQI90184.1|2414118_2415027_-|AEC-family-malonate-efflux-carrier MTEQFTMIILLIALGYFLKRINYIKATDSQVIATLVLNVTLPSLVIVNLNSAELKLSLSILPILMIIYGIVAKMIAVWFFRKYDNHMRGSVGMMTGAMNIGLFAYPLIEVIWPKTGLIYFGMADIGGAFVMFGITYFVGSYFSEGSDQFDFKYLGKKLLQSVPLVTYIVMFILNISHIHLPHVAIDFFSILSHANMPLSMILLGVMLNFTLERKYIPATIKYLCLHYGLALVAGLLVHVLLPVSDDMIKTTLLVTWMFPVGVAIISYGIQFKYRTLPFIGMTTNLTIIISIIILYVYQAVFV >LS483484.1|SQI90194.1|2424853_2425876_-|Molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-A MVEQIKDKLGRPIRDLRLSVTDRCNFRCDYCMPKEVFGDDFVFLPKNELLTFDEMARIAKVYAELGVKKIRITGGEPLMRRDLDVLIAKLNQIDGIEDIGLTTNGLLLKKHGQKLYDAGLRRINVSLDAIDDTLFQSINNRNIKATTILEQIDYATSIGLNVKVNVVIQKGINDDQIIPMLEYFKDKHIEIRFIEFMDVGNDNGWDFSKVVTKDEMLTMIEQHFEIDPVEPKYFGEVAKYYRHKDNGVQFGLITSVSQSFCSTCTRARLSSDGKFYGCLFATADGFNVKAFIRSGVTDEELKEQFKALWQIRDDRYSDERTAQTVANRQRKKINMNYIGG >LS483484.1|SQI90195.1|2425895_2426495_-|molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-mobA MKAIILAGGHSVRFGKPKAFAEVNGETFYSRVIKTLESTNMFNEIIISTNAQLATQFKYPNVVIDDENHNDKGPLAGIYTIMKQHPEEELFFVVSVDTPMITGKAVSTLYQFLVSHLIENHLDVAAFKEDGRFIPTIAFYSPNALGAITKALHSDNYSFKNVYHELSTDYLDVRDVDAPSYWYKNINYQHDLDALIQKL >LS483484.1|SQI90196.1|2426501_2426735_-|Molybdopterin-converting-factor,-subunit-1 MKVLYFAEIKDILQKAQEDIVLEQALTVQQFENLLFERYPQINNKKFQVAVNEEFVQKSDFIQPNDTVALIPPVSGG >LS483484.1|SQI90197.1|2426740_2427187_-|Molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-E MKQFEIVTEPIQTEQYREFTINEYQGAVVVFTGHVREWTKGVKTEYLEYEAYIPMAEKKLAQIGDEINEKWPGTITSIVHRIGPLQISDIAVLIAVSSPHRKDAYRANEYAIERIKEIVPIWKKEIWEDGSKWQGHQKGNYEEAKREE >LS483484.1|SQI90198.1|2427200_2427686_-|Molybdopterin-guanine-dinucleotide-biosynthesis-protein-B MILQIVGYKKSGKTTLMRHIVSFLKSHGYTVATIKHHGHGKEDIQLQDSDVDHMKHFEAGADQSIVQGFQYQQTVTRVDNQNLTQIIEKSVTIDTNIVLVEGFKNADFEKVVVYRNEEELQVLQQLTNVCYSINVREHEDFTAFEQWLLNKIKNDCDTQLT >LS483484.1|SQI90199.1|2427682_2428942_-|Molybdopterin-biosynthesis-protein-A MVVEKRNPIPVKEAIQRIVNQQSTMPAITVALEKSLNHILAEDIVATYDIPRFDKSPYDGFAIRSVDSQGASGQNRIEFKVIDHIGAGSVSDKLVGDHEAVRIMTGAQIPNGADAVVMFEQTIELEDTFTIRKPFSKNENISLKGEETTTGDVVLKKGQVINPGAIAVLATYGYAEVKVIKQPSVAVIATGSELLDVNDVLEDGKIRNSNGPMIRALAEKLGLEVGIYKTQQDDLDSGIQVVKEAMEKHDIVITTGGVSVGDFDYLPEIYKAVKAEVLFNKVAMRPGSVTTVAFADGKYLFGLSGNPSACFTGFELFVKPAVKHMCGALEVFPQIIKATLMEDFTKANPFTRFIRAKATLTSAGATVVPSGFNKSGAVVAIAHANCMVMLPGGSRGFKAGHTVDIILTESDAAEEELLL >LS483484.1|SQI90200.1|2429004_2429499_+|Molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-C MTEFTHINQQGHAKMVDVSDKQITKRTAVAHSSITVNETIYKQISNNTNTKGNVLNTAQIAGIMAAKNTSTIIPMCHPLPLTGIDVHFNWDETNAPLYTLNIQTTVSTTGKTGVEMEALTAASATALTIYDMTKAVDKGMIIGETYLESKSGGKSGDFQRQLDQ >LS483484.1|SQI90201.1|2429500_2430007_-|molybdenum-cofactor-biosynthesis-protein-B MGEHQNVKLNRTVKAAVLTVSDTRNFDTDKGGQCVLQLLQVDNVEVSDAHYTIVKDEKVAITTQVKKWLEEDVDVIITTGGTGIAQRDVTIEAVKPLLTKEIEGFGELFRYLSYVEDVGTRALLSRAVAGTVNDKLIFSIPGSTGAVKLALEKLIKPELNHLIHELTK >LS483484.1|SQI90202.1|2430035_2431040_-|Molybdopterin-biosynthesis-MoeB-protein MSQERYSRQILFKQIGEIGQNKINQKCALIIGMGALGTHVAEGLVRAGIAKLIIVDRDYIEFSNLQRQTLFTEEDALKMMPKVVAAKKHLLALRSDVDIDDYIDHVDYYFLETHGQDVDVIIDATDNFETRQLINDFAYKHRIPWIYGGVVQSTYTEAAFIPGKTPCFNCLVPQLPALNLTCDTVGVIQPAVTMATSLQLRDAMKVLTEQPIDTKITYGDIWEGSHYSFGFSKMQRTACTTCGDVPSYPYLNKNEQRYATLCGRDTVQYENTSITHDILVQFLKQHQLNYRSNSYMVMFEFKGHRIVAFKGGRFLIHGMTRTSDATHLMNLLFG >LS483484.1|SQI90203.1|2431207_2431813_-|Molybdenum-transport-ATP-binding-protein-modC MLKINLKYQLKNTLIRINIDDTEPKIYAVRGPSGIGKTTVLNMIAGLRKADEAIIEVNGQLLTDTAKNVNVKIQQRRIGYLFQDYQLFPNMTVYKNITFMAEPSEHIDQLIQTLNIDHLMKQYPMTLSGGEAQRVALARALSTKPDLILLDEPFSSLDDTTKDESITLVKRIFNEWQIPIIFVTHSNYEAEQMAHEIITIG |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LS483484_1 | 1.1|848446|33|LS483484|CRISPRCasFinder | 848446-848478 | 33 | LS483484.1 | 1081785-1081817 | 1 | 0.97 |
| LS483484_1 | 1.1|848446|33|LS483484|CRISPRCasFinder | 848446-848478 | 33 | LS483484.1 | 2458882-2458914 | 1 | 0.97 |
| LS483484_7 | 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder | 2424655-2424685 | 31 | LS483484.1 | 1108063-1108093 | 1 | 0.968 |
| LS483484_7 | 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder | 2424655-2424685 | 31 | LS483484.1 | 1728840-1728870 | 1 | 0.968 |
| LS483484_3 | 3.1|955975|26|LS483484|CRISPRCasFinder | 955975-956000 | 26 | LS483484.1 | 2198423-2198448 | 2 | 0.923 |
| LS483484_3 | 3.1|955975|26|LS483484|CRISPRCasFinder | 955975-956000 | 26 | LS483484.1 | 2258505-2258530 | 2 | 0.923 |
| LS483484_5 | 5.1|2078395|37|LS483484|CRT | 2078395-2078431 | 37 | LS483484.1 | 861712-861748 | 2 | 0.946 |
| LS483484_5 | 5.2|2078453|34|LS483484|CRT | 2078453-2078486 | 34 | LS483484.1 | 308817-308850 | 2 | 0.941 |
| LS483484_5 | 5.2|2078453|34|LS483484|CRT | 2078453-2078486 | 34 | LS483484.1 | 383575-383608 | 2 | 0.941 |
| LS483484_5 | 5.2|2078453|34|LS483484|CRT | 2078453-2078486 | 34 | LS483484.1 | 815281-815314 | 2 | 0.941 |
| LS483484_5 | 5.2|2078453|34|LS483484|CRT | 2078453-2078486 | 34 | LS483484.1 | 848485-848518 | 2 | 0.941 |
| LS483484_5 | 5.2|2078453|34|LS483484|CRT | 2078453-2078486 | 34 | LS483484.1 | 1108000-1108033 | 2 | 0.941 |
| LS483484_5 | 5.2|2078453|34|LS483484|CRT | 2078453-2078486 | 34 | LS483484.1 | 1855437-1855470 | 2 | 0.941 |
| LS483484_5 | 5.2|2078453|34|LS483484|CRT | 2078453-2078486 | 34 | LS483484.1 | 2424594-2424627 | 2 | 0.941 |
| LS483484_5 | 5.2|2078453|34|LS483484|CRT | 2078453-2078486 | 34 | LS483484.1 | 2566690-2566723 | 2 | 0.941 |
| LS483484_7 | 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder | 2424655-2424685 | 31 | LS483484.1 | 861836-861866 | 2 | 0.935 |
| LS483484_7 | 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder | 2424655-2424685 | 31 | LS483484.1 | 911106-911136 | 2 | 0.935 |
| LS483484_7 | 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder | 2424655-2424685 | 31 | LS483484.1 | 955936-955966 | 2 | 0.935 |
| LS483484_7 | 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder | 2424655-2424685 | 31 | LS483484.1 | 2067837-2067867 | 2 | 0.935 |
1. spacer 1.1|848446|33|LS483484|CRISPRCasFinder matches to position: 1081785-1081817, mismatch: 1, identity: 0.97
attgggaatccaatttctctttgttggggccca CRISPR spacer attgggaatccaatttctctgtgttggggccca Protospacer ******************** ************
2. spacer 1.1|848446|33|LS483484|CRISPRCasFinder matches to position: 2458882-2458914, mismatch: 1, identity: 0.97
attgggaatccaatttctctttgttggggccca CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttgggaccca Protospacer ****************************.****
3. spacer 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder matches to position: 1108063-1108093, mismatch: 1, identity: 0.968
cacattattgtaagctgacttttcgtcacct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **************************** **
4. spacer 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder matches to position: 1728840-1728870, mismatch: 1, identity: 0.968
cacattattgtaagctgacttttcgtcacct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer **************************** **
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cggggccccaacacagaagctggtgg CRISPR spacer cggggccccaacacaaaagctggcgg Protospacer ***************.*******.**
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ccaacttgcacattattgtaagctgacagaaagtcag CRISPR spacer ccaacttgcacattattgtaagctggcggaaagtcag Protospacer *************************.*.*********
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9. spacer 5.2|2078453|34|LS483484|CRT matches to position: 383575-383608, mismatch: 2, identity: 0.941
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aacttgcattgtctgtagaatttcctttcgaaat CRISPR spacer aacttgcattgtttgtagaatttcttttcgaaat Protospacer ************.***********.*********
11. spacer 5.2|2078453|34|LS483484|CRT matches to position: 848485-848518, mismatch: 2, identity: 0.941
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aacttgcattgtctgtagaatttcctttcgaaat CRISPR spacer aacttgcattgcctgtagaatttcttttcgaaat Protospacer ***********.************.*********
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aacttgcattgtctgtagaatttcctttcgaaat CRISPR spacer aacttgcattgtctgtagaatttctttttgaaat Protospacer ************************.***.*****
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cacattattgtaagctgacttttcgtcacct CRISPR spacer cacattattgtaagctggcttttcgtcagct Protospacer *****************.********** **
18. spacer 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder matches to position: 955936-955966, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgacttttcgtcacct CRISPR spacer cacattattgtaagctgacttttcgccagct Protospacer *************************.** **
19. spacer 7.1|2424655|31|LS483484|CRISPRCasFinder matches to position: 2067837-2067867, mismatch: 2, identity: 0.935
cacattattgtaagctgacttttcgtcacct CRISPR spacer cacattatcgtaagctgacttttcgtcagct Protospacer ********.******************* **
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
407049 : 425268
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483484|407049:425268|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483484|407049:425268|407049_407241_-|SQI82673.1|DBSCAN-SWA MNLNIDWSKDFQEFQEILNSGIHPEWLYCAKANLVLEPAYTGEGKQFFSTQDIINASKIIPFF >LS483484|407049:425268|425019_425268_-|SQI82699.1|integrase|DBSCAN-SWA MNDKFINIGYIFTNAAGGPIDLNKINNIIKGGAIKETTEISSIKKPATTHTLHHSHISTLAQLGINLKAMQEHVGHSDYKKI >LS483484|407049:425268|414260_415970_+|SQI82687.1|DBSCAN-SWA METGKSDVLDKIEKINKKDSALQEIIPKGYEIEHHQCGVALYQLIPSKKEGEPDKKVFITNTIPQITERFEDIESNEVSFNMLFYDNKTPVNIAVSAEEISDSRQLLKLVNKKLDVTSSTSTKLVDYINISKRYNPPLNVKVATRLGHVKGYFIYPYQEVMKDSNVKLFSNDKGFQKLIDSFRSKGTLQGYSKKVFAQIKDLPMVMVMLYASLGSVLLREFGLQPFIVEISGSTSTGKTFTLNLVSSVWGTSDLITTWSSTQNSIESMASFLNSFPMFKDDTRNTHPKFVASATYNFSSGESKSRSNINLTLNAKKEWRNILISTGESSIANMADEKAGVSARVVTLQDPPYPDNFDFTTLDKSFRENYGTLGLAFIKQYESKKDVYKNAFESYQRYFNQKGSNEIMQRLGRAFALLQVTGEVLNDIDGFEHDHFKIIEQAYDSMVKNNKTIDKPKQLLEELLQYLDANRNNIVGDGYDSVNYGDVKAVYKHDFLCIKNETVKNKLGHEMQTITGQWDKKGYLIKDKKRIQKQVKHKSQRHLGYAIKKEIIEELGFDFSISHNPYTESY >LS483484|407049:425268|420800_421769_+|SQI82695.1|DBSCAN-SWA MKPFESHNKQLKILRRRGMEVPSSAKRDLENENYYNIINGYKDLFLELDVNGNFLVPDKYKQGTHFKEVFSLYKLDRKFRNVLLEYLLVFETHIKSRISYYFSEKYREPHSYLYFKNYSSDTSKTDSIVKMVATFSSVMSNRKNKPLKHYINTHNGVPLWILVNYLTLGNVSKMYSNLDDDLRLEVAKDYKRKLERDYKTRVQITPSDVDSILQQAHMFRNVCAHEERLYDYKIDRAKSRANIFANYNKIYDKEYVPTMNGSYVFDLLISLCLFLNKHDYIKLVKNMDKLISNYSHSFYTITIDDLYTKMNFPDQTKILDML >LS483484|407049:425268|416279_416660_+|SQI82688.1|DBSCAN-SWA MDKEQLKKYIYEYVKEYKEIPIYQLEDLFKEINHDYIGRTSITHDKDENIVFWSGWNKITMFALIELVKSEQLDLVYRGSFIMRYLLDGRVPNLPLAICYPEDGQQTDVPSWVPMVLRINKEEKIK >LS483484|407049:425268|408356_408599_+|SQI82676.1|DBSCAN-SWA MAGGPRRGGRRRKKVCYFTANGITHIDYKDTELLKRFISERGKILPRRVTGTSAKYQRMLTTAIKRSRHMALLPYVKEEQ >LS483484|407049:425268|418380_419034_+|SQI82691.1|DBSCAN-SWA MTTTTITGDTWDVYFNDRRYRNLLGDFEDLITETKSLIRQGYKTDVIKNKMDNKALSLQSKFKELGQILLDEHEEKIVEIQQKEKESSYENPQVEMLKRQDIEAKVNLIDAEELFNLVYNANPKTTNVYELNIYKKAIESRLTEDENVRLKPYFDVLVEKVIYPYRNNEEYQKLEYNYNVLRQFGLQNNGQPVIKHSDGDIEIINIQSKYNEVFRNA >LS483484|407049:425268|418005_418350_+|SQI82690.1|DBSCAN-SWA MSEFEVKEKTYNLPNEHRQVLNVIRNTSNKYITKTKLLNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDYGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIEV >LS483484|407049:425268|411037_411661_-|SQI82679.1|DBSCAN-SWA MVESNDELKKELGRFLKSIRKQKGKTASEISKQMQYSQGHISGIENGVKSFPSNKLIESYLMNIKDTNEEYNFYVDEIAKITKNKVKLNKVSNVTNKMEIIDRMMDIPYSREFISFDDNNEKSFTIFNISINDLHFHLQDINNYKFYKGIRLTDNDKNNIDKILNNYFENKSVIIKENTKTLRDKNENWEQLVKLSDYIDDKLDKKN >LS483484|407049:425268|411974_412247_+|SQI82681.1|DBSCAN-SWA MPRTKLQDFPSKENTVTEPEQVVVNPLFAKPNTLAGIFGISYSSVNRILKEWEKDHKGINDLYYSLSSTMIVISIPRFEEYMKARHKKWM >LS483484|407049:425268|416656_417298_+|SQI82689.1|DBSCAN-SWA MNIETIVNEFETRAGTLLRYYTGLLEHSKVQPCCFKLYNDPFDMVYVVMNNKLFGHVYIKDCKVRKSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKQLSISDMMASQLFEDEYFMYGLQTYVESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVIANIEMLYQLATGINEPARELVEGLKLVTEFVQDENATQEDYKALERKLNDLKASYYSLSK >LS483484|407049:425268|412398_412545_+|SQI82683.1|DBSCAN-SWA MRKQVIITKTVVGWYNIKDTQHNLMLNIPPKVFEQYFPDVSKDVKLRV >LS483484|407049:425268|409662_410877_-|SQI82678.1|DBSCAN-SWA MWVREITKNNSTAYRYLERYTDPLTGKYKTVSVTRNKNNVRSQKDAQLELNKIIEQRLKHYSTKQLENLTFHDACDEWLEHYKTHSGSKPTTIKEKKSNTNTVKNAIDSKVLISKITHTYLQNIINEWAKSHSIGHVQSLVIVIRSVFKYAFKYYDLHDISVLDKIDIPKKAQTRNEFQAKRNNYLEDSEVKELLECFDYLIKHKRHATRKRNYEMVKALVEFQINNGMRIGELLAIKTDNVDVENKTLEIDGTINWVTDVVTGAFGVKETTKTSKSYRTIGLTAQSINLLKKLMLENKKENQWNDKFIDRGYIFTNTAGSPIDLNKVNNIIKEATDISSINKRVTTHTLRHTHISTLAQLGINLKAIQERVGHSDYKTTLEIYTHVTDKMAKDMMNKLEGIGS >LS483484|407049:425268|419086_419614_+|SQI82692.1|DBSCAN-SWA MKLLKTKNCLYYRNGDNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHLSASTTTCDEIMGIVSVSYPIEKLVIKIIETKARLQNYKNRSISNMVLLKTVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNIAIENSKIARVNAYHQSSHVKVV >LS483484|407049:425268|407801_408305_+|SQI82675.1|DBSCAN-SWA MLNRVVLVGRLTKDPEYRTTPSGVSVATFTLAVNRTFTNAQGEREADFINCVVFRRQADNVNNYLSKGSLAGVDGRLQSRNYENQEGRRVFVTEVVCDSVQFLEPKNAQQNGGQRQQNEFQDYGQGFGGQQSGQNNSYNNSSNTKQSDNPFANANGPIDISDDDLPF >LS483484|407049:425268|422465_422978_+|SQI82697.1|DBSCAN-SWA MKQQMLSKVLLSTVVVMGSIAGSSLVMDDNAHAEQKSDNIGKLNQKNESTLHLSFEKGIKGTVDKNGKLTLSDGKTSKVMPTNAKDKKGNDVVLVYKKVKDGFDVQVIKSSQERKTNWVKCGLGTVGGAGTGGLGGASAASVIPGLGTVAGAIIGGVSGGATGAAASCFG >LS483484|407049:425268|419954_420524_+|SQI82694.1|terminase|DBSCAN-SWA MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKIIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELIEVPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGDVPIFINIGEWDGDDEELDKTVKDVSNANPNHTVIVDDIPLED >LS483484|407049:425268|412986_413313_+|SQI82685.1|DBSCAN-SWA MNWEINDLFSDLKLLKDRFEDLKDNHGWHFEELYPHEPNHNLNKDELIREGASYHERRIHNNQMFDLFHLYIEQFDNIIEKFYEIEKASSENFGEESDDAKNSIKVAE >LS483484|407049:425268|423935_424943_-|SQI82698.1|DBSCAN-SWA MNRKTPKTTDGLMRHIRDNKGIQINGSTEKNQLRNIGYFHGFKGYNFFLNKEEELNFEKFSELHALYSFDTEIKNLFYKHVMFCETAIKNRLLEIVCVNSGFDLDSLFQKSLTYYKSYSPGSSKYKKHLKNTTRLRRDIYDMIHEHCNSKPYIYHYIHQDRTVPLYAVFELFTLGNLVFFTRCMSQNLNIEAQKQLKLYSPAFDQSKDILGDIIDCMKGLRNAIAHNGVLYDCRFKTGETSNRLKEYLAVKMDIHNLDFDRIIDYLILLILICSGLSYSKAELQRIIRQFEQNLDFLRSKISESTYDKIIGVRARPKLRSLKNFINNLDFYLKTD >LS483484|407049:425268|411809_411974_+|SQI82680.1|DBSCAN-SWA MFMTVKEVAQLLRISERHTYKLLQKNVIPHTKIGGKILVNKERLLETLEKKEVK >LS483484|407049:425268|408830_409550_-|SQI82677.1|DBSCAN-SWA MEHNNNINKKYKKFSRGSIIYLDFGINIGHEFSGRHFGIVLNKNDSPYNSLVTVVPLSSKNKKHYLPLQNIVFKTSLSILNKTVDNIEFDLDVINHVIFTVIEIINKNNLQNTLEQNTIDYLDDFAIKTRFPTEREVINKSKNIVESFNLYNDPKNFSALFNYLLIDVNDRKSKVNNLREVINKYKKFDKNTFACTQNVVTISKLRILKINAEDPSGRMKLDFDSMKLVDNEIKNKLIN >LS483484|407049:425268|421946_422348_+|SQI82696.1|DBSCAN-SWA MKHVKENDLAHGEFGKWLEKVGLDKYQASRFIKVANEQSKLHSSANLGLKALYQIATIPVEHREEKQQTSSGEMKTPYEMTNKEREEFKRQLKQRDEENAQLQSQMEQAQRSEEIARKQYKYGLNNYIFTIKF >LS483484|407049:425268|412258_412432_+|SQI82682.1|DBSCAN-SWA MKMYLTYICLVSLLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGEITTCENKLLLQKQ >LS483484|407049:425268|413377_414247_+|SQI82686.1|DBSCAN-SWA MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWSKLVNKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKNGANDHGEIIKKHRNDKNVIYRDVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALINVAWFWHTSYSHRTEQARIRLYIPLNERISADDYRKYSKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIMDVDMLEQWLKEYEQSNVSPSVIGYTRRDSKYWRELCFGTTEGNRNNALASLVGHLLRCHVNDYIVYSFALLWGQFACKPPMKEQEINATFQSILNKHYNN >LS483484|407049:425268|419616_419958_+|SQI82693.1|transposase|DBSCAN-SWA MDKQQIKGFVCDYHERTRSDVLIDDDINTDEFFSIGDENSNEWMADDNIDDHIVKNHLEMIVDQVANDKEFYIFDSLIQGRSYKDISSVLECSEQSVRLWYETLLDKIVEVIE >LS483484|407049:425268|412602_412986_+|SQI82684.1|DBSCAN-SWA MEIKQKYQLSKVVKILEVVLYEEDKFQSDKDYHYQDKAFYEYALKLVHNGLFNILAELDFEDEVFLILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIVGNIEVEVL >LS483484|407049:425268|407484_407781_+|SQI82674.1|DBSCAN-SWA MRTYEVMYIVRPNIEEDAKKALVERFNGILATEGAEVLEAKDWGKRRLAYEINDFKDGFYNIVRVKSDNNKATDEFQRLAKISDDIIRYMVIREDEDK |
27 | Staphylococcus_phage(90.48%) | transposase,terminase,integrase | attL 410272:410286|attR 425548:425562 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
732669 : 742106
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483484|732669:742106|DBSCAN-SWA TATGTATAAAAATTATAACATGACCCAACTTACACTACCAATAGAAACTTCTGTTAGAATTCCTCAAAATGATATTTCACGATATGTTAATGAAATTGTTGAAACGATACCTGATAGCGAATTCGATGAATTCAGACATCATCGTGGCGCAACATCCTATCATCCAAAAATGATGTTAAAAATTATCTTATATGCATACACTCAATCTGTATTTTCTGGTCGTAGAATAGAGAAATTACTTCATGACAGTATTCGAATGATGTGGTTAGCTCAAAATCAAACACCTTCTTATAAAACTATTAATCGTTTTAGAGTAAATCCTAATACTGATGCATTAATTGAATCTTTATTTATTCAGTTTCATAGTCAATGTTTAAAGCAAAATCTTATTGATGATAGTTCAATTTTTATTGATGGTACAAAAGTAGAAGCTAATGCCAATAGGTATACATTTGTGTGGAAGAAAAGTATTCAAAATCACGAATCGAAATTGAACGAAAATTCAAAAGCATTATATCGTGACTTAGTTGAAGAAAAAATAATACCAGAGATAAAAGAAGATGGAGATAGCGATTTAACAATAGAAGAAATAGATTTAATTGGTAGTCATTTAGATAAAGAAATCGAAGATTTAAATCATTCTATTCAGAACGAAGATTGTACTCAAATTAGAAAACAGACCCGTAAAAAAAGAACTGAGATTAAGAAGTTCAAAAAGAAATTTGATGATTATTCCGAAAGAAAAAGTAAATATGAAGAACAAAAATCGATTCTTAAAGATAGAAATAGCTTTTCTAAAACTGATCATGATGCAACTTTTATGAGAATGAAGGAAGACCATATGAAAAATGGCCAACTTAAGCCAGGATACAATTTACAAATAGCGACAAATTCTCAATTTGTTTTATCCTATGACCTATTTCAAAACCCGACAGATACTAGAACTTTAATTCCATTTTTAACAATGATTCAAAATACCTTCGGTTATTTACCGGAGTATATTGTAGCTGATGCAGGTTATGGTAGTGAGCAAAACTATATGGCTATTATAGATGATTTTAATAAAACGCCACTTATTACGTATGGTATGTTTATTAAAGATAAAACGAGAAAGTTTAAAAGTGACATTTTTAACACTCAAAACTGGAAATATGACGAACTTAATGATGAATTTATATGTCCTAATAACAAAAGAATAGGTTTTAAAAGGTTCTGTTGCAAAGTTAGAAATATAGTATAATAGTCAACAAAAATGAGGTGCAGAGGATGAATTATTTCAGATATAAGCAATTTGACAAAGATGTCATTACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTAAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTGAGAGAACGAGGCATCTATGTTCATCATTCAACAATTTATCGATGGGTACAGGAATATGCTCCTATTTTGTATCAAATTTGGAAGAAAAAGAATAAGCAAGCTTATTATAAATGGCATATAGATGAGACGTATATCAAAATTAAAGGGCAATGGAATTATTTATATCGCGCTATTGATGCAGATGGCCATACACTAGATATTTCGTTACGTAAGAAACGAGATAATCACTCAGCATATACGTTTATTAAACGTCTTATTAAACAATTTGGCAAACCTCAAATGATAATTACAGACCAAGCCCCTTCAACGAAGGTGGCAATGTCCAAAGTGATTAAAGATTTTAAACTTACCCCCAACTGTCATTGTACCTCTAAATATTTAAATAATCTCATTGAACAAGATCATCGTCATATCAAAGTAAGGAAAATAAGTTATCAAAGTATCAATACGGCAAAGAATACGATCAAAGGCATTGAATGTATTTATGGACTATATAAAAAGAACCGCAGATCTCTTCAGATCTACGGGTTTTCGCCATGCCGTGTAATTAGCATCATGCTAGCTAGTTAATACGAAGTATTATTTTAAACATAAGGTTAGACACTTATTTTTTAACTTTGCAACAGAACCTCCTATTTTTAGTAATATTTATAGCCCTAACAGTTAGATAAACTGCATTTATAAAACCCAAAATAGTATATGGAATTAAAATATATAAATTTTCTAATTGAACTAAGAAAGTTAACCCAACTAAAAATAAAACATTCAAAACGGTAGACATAATAAAAGCTATATCTAACTCATTTTTTTTATTCAAAATACATTCCTCCTTTTTTAAAATTTTACCATAGTTGCTTTATTGATGTTGAGCCTCGGAACCCTTAACAATCCCAAAACTTGTCGAATGGTCGGCTTAATAGCTCACGCTATGCCGACATTCGTCTGCAAGTTTAGTTAAGGGTTCTTCTCAACGCACAATAAATTTTCTCGGCATAAATGCGTGTCTATGCGTAGACATGGAGACACTTCAGAATTATGGAGTGATTACATGAGTTTAACTATTTTTCTTTATTCAGTTTTAGGAAGTTTATTAGCAAATTATATCTACGAAAAATCTTCGAAAAGAAGTTCAGCTCATGATAACGAGTTTACCTATGATGAATGAAGTCATTGGAAATCCACTACTAGATAAATTTATGAAAGATTTAATTATTCAAATTTTAGCAATGATTTCAGAACAAGAAAGAAATGAAAGTAAACGTCGACAAGCTCAAGGGATTCAAGTCGCCAAAGAAAAAGGTATATATAAAGGGAGACCTATTCTGTATTCTCCCAATGCTAAAGACCCACAAAAGCGTTTAGTTTATTACCGAGTTGTTGAATTACTTGAACAGGGTAAATCTATAAGTACTATAGCTAAAGAAGTTGGTATTACACGTCAAACTATATATAGAATAAAAAATAGTAAATAAAATAACATAGACAATAATCTATATAGATGTTAATCTATTTAATGTCTAGGAGGTTTATTCATGTCTTATAAAGAACTATCAACAATATTAAAAATTTTATCAGATTCAAGTAGGTTAGAAATATTAGATTTACTTTCTTGTGGTGAGCTATGCGCTTGTGACTTATTAGAACACTTTCAATTCTCACAACCTACACTAAGTCATCATATGAAGTCATTAGTAGATAATGAATTAGTTACAACACGAAAAGACGGCAATAAACATTGGTATCAACTTAATCATGCTATTTTAGATGATATTATCCAAAACTTGAACATCATTAATACATCTAATCAAAGATGTGTATGTAAAAATGTGGAATCAGGTGACTGTTGATGACTATTTTAGCAATTGTAATTTTTCTTTTAACTTTAACCTTTGTGATTTGGCAACCAAAAGGTTTAGATATTGGTATTACAGCTTTAATTGGAGCTGTTGTTGCTATCATTACAGGAGTCGTAAGTCTTTCTGATGTATTAGAAGTAACAGGTATTGTTTGGAATGCAACTTTAACTTTTGTGGCTGTTATTCTTATTTCATTAATATTAGATGAAATTGGTTTTTTTGAATGGTCTGCGATACATATGGTCAAGGCTTCAAACGGTAATGGCTTAAAAATGTTTGTTTTTATTATGTTACTTGGAGCAATTGTAGCAGCATTTTTCGCAAATGATGGTGCAGCTTTAATCTTAACGCCTATTGTATTAGCGATGGTAAGGAATCTAGGATTTAATCAAAAAGTGATTTCCCCCTTTATTATTGCCAGTGGTTTTATTGCTGATACTACATCACTTCCCTTAATTGTAAGTAACTTAGTTAATATCGTTTCTGCAGATTACTTCGATATTGGATTTATTGAATATTTTAGCCGAATGATCATTCCTAATATATTCTCTCTGATTGCTAGTATTCTCGTTTTATGGTTATATTTCAGAAAATCCATACCTAAAACGTTCGATACAGAAAATCTATCAGATCCTAAAAGTGCAATTAAAGATTCTAAGTTATTTAAGCTTTCATGGATAGTATTAGCAGTACTACTCGTTGGATATCTTGTTAGCGAGTTTATCCAAATTCCTGTATCAATTATTGCTGGTATTATTGCTTTTATCTTTGTAATATTAGCTCGTAAATCTAAAGCAGTTCATACAAAACAAGTGATTAAAGGTGCACCATGGAATATCGTTGTATTCTCTATTGGTATGTATCTTGTTGTGTTTGGACTAAAAAATGTAGGTATTACAACGGTCCTTGGGGATGTTTTAACAAACATTTCAAATTATGGGTTATTTAGCAGCATCATGGGTATCGGCTTTATAGCTGCTTTCTTATCTTCGATTATGAACAACATGCCAACTGTTTTAATAGATGCAATAGCGATTGGCCAATCCAGTGCTACAGGAATATTAAAAGAAGGCATGGTTTATGCGAATGTCATAGGTTCTGATTTAGGACCTAAAATTACGCCAATTGGTTCTTTAGCAACATTATTGTGGCTACATGTCTTAACACAAAAAGGTGTGAAGATTTCGTGGGGAACATACTTTAAAACTGGAATTATCATCACTATTCCAGTCCTATTTGTAACACTCTTAGGTTTATACCTTACACTAATCATATTTTAAGAAAAGGGGCTTTAATTATGGATAAGAAAACAATTTATTTTATATGTACAGGAAACTCTTGTCGTAGCCAAATGGCTGAAGGTTGGGGAAAGGAAATATTGGGTGAAGGTTGGAATGTCTATTCTGCTGGTATTGAAACACATGGTGTTAATCCTAAAGCAATAGAAGCTATGAAAGAAGTAGATATTGATATATCAAACCATACGTCAGACTTGATTGATAATGATATTTTAAAACAATCAGATTTGGTCGTAACGTTATGTAGTGATGCAGACAATAATTGTCCTATTTTACCACCAAACGTTAAAAAAGAGCATTGGGGTTTTGATGATCCAGCAGGTAAAGAATGGTCAGAATTCCAACGTGTTAGAGACGAGATTAAATTAGCTATAGAAAAGTTTAAATTGAGATAATCATAAACACCTCTTATTTAGTTAATAAGAGGTGTTTTGCCATTTAAAGAACAAAATTTGTGCCATATACAATATGCCCT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483484|732669:742106|735885_737175_+|SQI83487.1|DBSCAN-SWA MTILAIVIFLLTLTFVIWQPKGLDIGITALIGAVVAIITGVVSLSDVLEVTGIVWNATLTFVAVILISLILDEIGFFEWSAIHMVKASNGNGLKMFVFIMLLGAIVAAFFANDGAALILTPIVLAMVRNLGFNQKVISPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIVSADYFDIGFIEYFSRMIIPNIFSLIASILVLWLYFRKSIPKTFDTENLSDPKSAIKDSKLFKLSWIVLAVLLVGYLVSEFIQIPVSIIAGIIAFIFVILARKSKAVHTKQVIKGAPWNIVVFSIGMYLVVFGLKNVGITTVLGDVLTNISNYGLFSSIMGIGFIAAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSSATGILKEGMVYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKGVKISWGTYFKTGIIITIPVLFVTLLGLYLTLIIF >LS483484|732669:742106|740596_741223_+|SQI83492.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MIKLENVFVKKGNKNILDGCNFNFEKGKSYALVGESGAGKSTLLNIIAGFEDVSQGSIYIEDKLLKKKVDFYRYTLGYLFQNFALLENQTISQNLGLALKFKKNKKDNMNLKKEVLKKVGLDLDIKRIVSSLSGGEQQRVALARLILKDPKIILADEPTGSLDTKNGKIVIDLLLKLLDENKTMIVVTHDLELAKRFDVIVNISELRS >LS483484|732669:742106|732669_733908_+|SQI83479.1|transposase|DBSCAN-SWA MYKNYNMTQLTLPIETSVRIPQNDISRYVNEIVETIPDSEFDEFRHHRGATSYHPKMMLKIILYAYTQSVFSGRRIEKLLHDSIRMMWLAQNQTPSYKTINRFRVNPNTDALIESLFIQFHSQCLKQNLIDDSSIFIDGTKVEANANRYTFVWKKSIQNHESKLNENSKALYRDLVEEKIIPEIKEDGDSDLTIEEIDLIGSHLDKEIEDLNHSIQNEDCTQIRKQTRKKRTEIKKFKKKFDDYSERKSKYEEQKSILKDRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMKNGQLKPGYNLQIATNSQFVLSYDLFQNPTDTRTLIPFLTMIQNTFGYLPEYIVADAGYGSEQNYMAIIDDFNKTPLITYGMFIKDKTRKFKSDIFNTQNWKYDELNDEFICPNNKRIGFKRFCCKVRNIV >LS483484|732669:742106|737967_738261_+|SQI83489.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MKKKFVSSCIASTILFGTLLGVTYKAEAATVHVAGGVWSHGIGKHYVWSYYSHNKRNHGSTAVGKYSSFSGVARPGVQSKASAPKAWGGNKTFYSLH >LS483484|732669:742106|735193_735511_+|SQI83485.1|DBSCAN-SWA MMNEVIGNPLLDKFMKDLIIQILAMISEQERNESKRRQAQGIQVAKEKGIYKGRPILYSPNAKDPQKRLVYYRVVELLEQGKSISTIAKEVGITRQTIYRIKNSK >LS483484|732669:742106|738335_740270_+|SQI83490.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA MKKFKLFLDFSTLLLISGLLFLFFFKENEEIIPESSNILTISNWDKSNSKSKVLDVIESGAKNQNIQIIKSVKDFDNKKEFFVFNSKRNNSDFIRNKTSLLTPSDLLNREIKGKYYIIGEHFNVEELTSELKKAGLTSEVEYINRNILFFELVIDNDLLVPFIFLGVLYLLYFLYDRGYNLKFYAIQKLHGFSTTRIIFHNIHIKIIYWLVLTTIFFIANILIIHIANLELDFLMFIRRFIVLLFVFACITTLLWLISYSLLLKLSIPLTLKGKKGYKFSIFMGTFTKCIMVLILSFLLAQNLNAYTKLKNIYDSEKIWQKLDNYYTLEISPNIRNSEEKQILETNIYNLIKKSEQLGGLLLKNNNIANPDKNNYIPENGNVFFINNNFLNFYKNINHDFKMIVNHSDKINVFIPPRLQYQKSEIQKNHQGWIDFQKQQNKKVDVQVLSKNVSVFSFDRTTNLKFGYLDSPIVMLLTPDDLTGDFYLAAVSQGGYLFKDLDTLKQLLKDNHLEEEISGITNYKDSVLNELNETKTKMIITIVTIIINVFILLIATVFETIQYFSWNKKQLLLRKIHGYSLFSSNVRYLTISILLSIMLAYTTHILFGSKILLFIIMSIAIIQHLLQIAYIKYLEKYFKDLMREI >LS483484|732669:742106|733934_734609_+|SQI83481.1|transposase|DBSCAN-SWA MNYFRYKQFDKDVITVAVGYYLRYALSYRDISEILRERGIYVHHSTIYRWVQEYAPILYQIWKKKNKQAYYKWHIDETYIKIKGQWNYLYRAIDADGHTLDISLRKKRDNHSAYTFIKRLIKQFGKPQMIITDQAPSTKVAMSKVIKDFKLTPNCHCTSKYLNNLIEQDHRHIKVRKISYQSINTAKNTIKGIECIYGLYKKNRRSLQIYGFSPCRVISIMLAS >LS483484|732669:742106|740273_740585_+|SQI83491.1|DBSCAN-SWA MKRTLIIVTIVLLIIILSLLLVRNEHLDRFNPLLKEKVSYAKVPKDTQDYRNITVYSKNGEKKSYKLDFLGYDPTKEYVKVNHKGKYVRSIEYITKDIPSFLK >LS483484|732669:742106|734643_734856_-|SQI83484.1|DBSCAN-SWA MNKKNELDIAFIMSTVLNVLFLVGLTFLVQLENLYILIPYTILGFINAVYLTVRAINITKNRRFCCKVKK >LS483484|732669:742106|737192_737588_+|SQI83488.1|DBSCAN-SWA MDKKTIYFICTGNSCRSQMAEGWGKEILGEGWNVYSAGIETHGVNPKAIEAMKEVDIDISNHTSDLIDNDILKQSDLVVTLCSDADNNCPILPPNVKKEHWGFDDPAGKEWSEFQRVRDEIKLAIEKFKLR >LS483484|732669:742106|741584_742106_+|SQI83493.1|transposase|DBSCAN-SWA MYKNYNMTQLTLPIETSVRIPQNDISRYVNEIVETIPDSEFDEFRHHRGATSYHPKMMLKIILYAYTQSVFSGRRIEKLLHDSIRMMWLAQNQTPSYKTINRFRVNPNTDALIESLFIQFHSQCLKQNLIDDNSIFIDGTKVEANANRYTFVWKKSIQNHESKLNEKFKSIIS >LS483484|732669:742106|735571_735886_+|SQI83486.1|DBSCAN-SWA MSYKELSTILKILSDSSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSHHMKSLVDNELVTTRKDGNKHWYQLNHAILDDIIQNLNIINTSNQRCVCKNVESGDC |
12 | Staphylococcus_phage(57.14%) | transposase,bacteriocin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
793662 : 801482
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483484|793662:801482|DBSCAN-SWA ATTATGTCGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTTACAGTCATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATGCGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAGTAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCATGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAATGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAATAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCGAGTGGGACAACAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCGATGACTGGTACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAACCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTTAGCAACATAATGTGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGTTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAAAATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTATCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGCTAATGTTGTGATAATAGCACCAGCTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGTCAAAATAAGAGGAGGGCGGTTTTTTAAGTGAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATAGCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTTTAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTATTATTATTTTCAGCAGATTCATCTAAGCTATTAAATGTTGAAATAAATAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGCGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATCGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATAGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTACGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCTACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATCTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCGTCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACGCATTGTGCAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCAGGCGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTCAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATTCGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGACCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAATTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAAAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACACGGAATGTGATGTGCAGC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483484|793662:801482|798313_798733_-|SQI83823.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKENLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >LS483484|793662:801482|796193_796634_-|SQI83820.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAAGAIITTLALGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >LS483484|793662:801482|793662_794718_-|SQI83785.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTMTVTLHKLDITT >LS483484|793662:801482|799753_800347_+|SQI83825.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDIINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDEAIIMAFEHITFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI >LS483484|793662:801482|794717_795404_-|SQI83786.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >LS483484|793662:801482|797596_798310_-|SQI83822.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVDLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVIAQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPDIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >LS483484|793662:801482|798734_799403_-|SQI83824.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >LS483484|793662:801482|800330_801482_+|SQI83826.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFENAESINSTYEHQTTYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEVYKTVFQMTSMVSGTLKTNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >LS483484|793662:801482|795378_795852_-|SQI83813.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIVVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >LS483484|793662:801482|796913_797498_-|SQI83821.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVVLITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNSLDESAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
813454 : 827592
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483484|813454:827592|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCACCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCAGTATTAACGCCAGGGGACACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAGGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGACTTAGATGGCATTTTAAAAGAAGTTAATGATGACACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACGTATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCATCACATGTTCCGGTACTCATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCATTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGCGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGTGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCACTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGGTAAAATGTTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACGAATAGTAAGTGGGCACCACATGGTATGAATATGTGACAAAATGCAGTGTGAATGATGAGGTGAGAGTATTCAGTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATCAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTAAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACACCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTAAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTCAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTCTTAGATCCACAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATCGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATAGCTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAAATATGTCACTCGAAGCCTTTCATGTAGCAAATAAAATGCATATACTGGGGCCCCAACAAAGAGAATTTCGAAAAGAAATTCTACAAACAATGCAAGTTGGGGCGGGGCCCCAACATAAAGAAATACTTTTTCTTTAGAAATTAGTATTTCTTATGCATGAGTGTAACTCATGCAATCCTATTTTTAAGTACACATTAGCTGTGACTAATGATAAAGAATCGCTACATAATCAACCATTAGTCGTTCTTTATCATTTCCATCCCACTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTTAATCTATGGCAGATTACACTTCATCCGATTTTTTATAGAATTTGAAAAAGGCACATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATACCAACAAATATTACGTACGTTGAATCTTATGATTACACTTTAAACCTAATATAATATCGCGTTAATATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGCAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGTTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATACTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATTCGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGATAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTGACAGTTGATCCAATATAACTCAATTTACCAAATATATCTTTTGAACCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTATTTTAATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCTATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCAATAGGGAGTTGAAGGTCGTGTGTCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAATCTTTAGCTTTAATTTCTTGGCAATATTTAATTATGTCACCTTCGTTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCCGTTGTAACTTCCCCGATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTATTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGTTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAACTGAAATTGATGTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGTTGTCTATAACGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATATCTTGAATTTAATTATTAGAAACCAATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTGAATTAGGCCAACAATATTAACGAATACCTTTCATTGCTTTAATAATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAAGAAGATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAATGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCAAAGTTCACCGATAACACAGATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTCACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAAATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATAAATGTTCAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGATAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACAGCTGCAATCAAGAATCCACCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATGTTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTACCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACGCCTAGCCCTCGAGGATGCCCGAAAAATCCTGTTTGAGGTATGTCTTGAATTTGATTTCCATGGGAGTTTTGTTGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483484|813454:827592|815765_816683_-|SQI83891.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSENEGDIIKYCQEIKAKDYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMTHDLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKINNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILSANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPTMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >LS483484|813454:827592|815218_815353_+|SQI83890.1|DBSCAN-SWA MSLEAFHVANKMHILGPQQREFRKEILQTMQVGAGPQHKEILFL >LS483484|813454:827592|819317_820184_-|SQI83894.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGKLSSQPLLLTRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQTQVLYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKVIKK >LS483484|813454:827592|813454_814513_+|SQI83867.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLDGILKEVNDDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPSHVPVLIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNGKMLEVLSNFKYE >LS483484|813454:827592|821346_823452_+|SQI83898.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRARRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMAIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >LS483484|813454:827592|826830_827592_+|SQI83977.1|DBSCAN-SWA MIQVGNLTKTINNQMILDDISIEIEKGKLTSLIGPNGAGKSTLLSAICRLIRFDEGEVKIDGQLMSDYKNNDLSKKISILKQTNHTEMNITVEQLVNFGRFPYSKGRLTKEDHEIVNDALDLLQLQDIRKRNIKSLSGGQRQRAYIAMTIAQDTEYILLDEPLNNLDMKHAVQIMQTLKMLAHKMNKAIVIVLHDINFASCYSDQIVAMKNGQLVKSDLKDNVIQSSVLSDLYDMDIQIEHIRNQRICLYFKD >LS483484|813454:827592|814671_815214_+|SQI83889.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNSWKDVEQYFLDNIEK >LS483484|813454:827592|820985_821384_+|SQI83895.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >LS483484|813454:827592|816952_818458_-|SQI83892.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVILAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >LS483484|813454:827592|818797_819298_-|SQI83893.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEQMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >LS483484|813454:827592|823571_824543_+|SQI83943.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >LS483484|813454:827592|825877_826834_+|SQI83976.1|DBSCAN-SWA MRNNNKKIMLLIAVTFLISMLYLFVGIDFDIFEYQFSSRLRKFILIILVGAAIATSVVIFQAITNNRLLTPSIMGLDAVYLFIKVLPVFLFGIQSVWVTNVYLNFILTLITMVLFALILFQGIFKIGHFSIYFILLIGVLLGTFFRSITGFIQLIMDPESFLAIQSSMFANFNASNSNLVTFSAVLLVIILVITIFLLPYLDVLLLGRAEAINLGISYEKLTRILLVIVSVLVSVSTALVGPITFLGLLTVNLAHELMKTYEHKYILIATICLSWISLFSAQWVVENVFEATTEMSILIDLIGGSYFIYLLVRRRNAQ >LS483484|813454:827592|824919_825891_+|SQI83944.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ |
13 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1083313 : 1091786
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483484|1083313:1091786|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LS483484|1083313:1091786|1085879_1086551_+|SQI84589.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPVISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQKLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >LS483484|1083313:1091786|1086543_1088733_+|SQI84592.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGIGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEALYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLADSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPIVGMVGLIENVDYLNDFQPQVGDKLYVIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESIDLSSEVKKGESIKTAIRQGVLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSLIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >LS483484|1083313:1091786|1085614_1085878_+|SQI84585.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLEDEKENA >LS483484|1083313:1091786|1083782_1084907_+|SQI84580.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESKDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGIKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKIAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >LS483484|1083313:1091786|1090188_1091217_+|SQI84599.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIETNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDAPRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >LS483484|1083313:1091786|1084910_1085615_+|SQI84582.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMHAMSLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >LS483484|1083313:1091786|1091219_1091786_+|SQI84614.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFGSKAAYEQHLVTLLNEDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >LS483484|1083313:1091786|1083313_1083796_+|SQI84577.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKTMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >LS483484|1083313:1091786|1088711_1090196_+|SQI84595.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPLLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKMLAQESPVKADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHYFDSEGNLNV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1305113 : 1408525
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LS483484|1305113:1408525|DBSCAN-SWA CATGTATAACGGTATATTACCAGTATATAAAGAACGTGGTTTAACAAGTCATGACGTCGTATTCAAATTGCGTAAAATTTTAAAGACTAAAAAAATAGGGCACACTGGTACGCTTGATCCTGAAGTTGCAGGCGTGTTACCGGTATGTATAGGTAATGCAACGAGAGTTAGTGATTATGTTATGGATATGGGTAAAGCTTATGAGGCAACGGTATCGATAGGCAGAAGTACAACAACTGAAGATCAAACGGGTGATACATTGGAAATGAAGGGTGTACATTCAGCTAATTTCAACAATGACGATATTGACCGATTGTTAGAAAGTTTTAAAGGTATCATTGAACAAATTCCGCCAATGTATTCATCAGTCAAGGTGAATGGTAAAAAATTATATGAATATGCGCGTAATAATGAAACAGTTGAAAGACCAAAGCGTAAAGTTAATATTAAAGATATTGGGCGTATATCTGAATTAGATTTTAAAGAAAATGAGTGTCATTTTAAAATACGTGTCATCTGTGGCAAAGGTACATATATTAGAACGTTAGCGACTGATATCGGTGTGAAATTAGGCTTTCCGGCACATATGTCGAAATTAACGCGAATCGAGTCTGGTGGATTTGTGTTGAAAGATAGCCTTACATTAGAACAAATAAAAGAACTTCATGAGCAGGATTCATTGCAAAATAAATTGTTTCCTTTAGAATATGGATTAAAGGGTTTGCCAAGTATTAAAATTAAAGATTCGCACATAAAAAAACGTATTTTAAATGGGCAGAAATTTAATAAAAATGAATTTGATAACAAAATTAAAGACCAAATTGTATTTATTGATGATGATTCAGAAAAAGTATTAGCAATTTATATGGTACACCCTACAAAAGAATCAGAAATTAAACCTAAAAAAGTCTTTAATTAAAGGAGATAGAATTTATGAAAGTCATAGAAGTGACACATCCTATACAATCTAAACAGTATATTACAGAGGATGTTGCAATGGCATTCGGATTTTTCGATGGCATGCATAAAGGTCATGACAAAGTCTTTGATATATTAAACGAAATAGCTGAGGCACGCAGTTTAAAAAAAGCGGTGATGACATTTGACCCGCATCCGTCTGTCGTGTTGAATCCTAAAAGAAAACGAACAACCTATTTAACACCACTTTCAGATAAAATCGAAAAAATTAGCCAACATGATATTGATTATTGTATAGTGGTTAATTTTTCATCTAGGTTTGCTAATGTGAGCGTTGAAGATTTTGTTGAAAATTATATAATTAAAAATAATGTAAAAGAAGTCATTGCTGGTTTTGATTTTACTTTTGGTAAATTTGGAAAAGGTAATATGACTGTTCTTCAAGAATATGACGCGTTTAATACGACAATTGTGAATAAACAAGAAATTGAAAATGAAAAAATTTCTACAACTTCTATTCGTCAAGATTTAATCAATGGTGAGTTGCAAAAAGCGAATGATGCTTTAGGCTATATATATTCTATTAAAGGCACTGTAGTGCAAGGTGAAAAAAGGGGAAGAACTATTGGCTTCCCAACAGCTAACATTCAACCTAGTGATGATTATTTGTTACCTCGTAAAGGTGTTTATGCCGTTAGTATTGAAATCGGCACTGAAAATAAATTATATCGAGGGGTAGCTAACATAGGTGTAAAGCCAACATTTCATGATCCTAACAAAGCAGAAGTTGTCATCGAAGTGAATATCTTTGACTTTGAGGATAATATTTATGGTGAACGAGTGACAGTGAATTGGCATCATTTCTTACGTCCTGAGATTAAATTTGATGGTATCGACCCATTAGTTAAACAAATGAACGATGATAAATCGCGTGCTAAATATTTATTAGCAGTTGATTTTGGTGATGAAGTAGCTTATAATATTTAGAGTTGCGTATAGTTATATAAACAATCTATACCACACCTTTTTCTTAGTAGGTCGAATCTCCAACGCCTAACTCGGATTAAGGAGTATTCAAACATTTTAAGGAGGAAATTGATTATGGCAATTTCACAAGAACGTAAAAACGAAATCATTAAAGAATACCGTGTACACGAAACTGATACTGGTTCACCAGAAGTACAAATCGCTGTACTTACTGCAGAAATCAACGCAGTAAACGAACACTTACGTACACACAAAAAAGACCACCATTCACGTCGTGGATTATTAAAAATGGTAGGTCGTCGTAGACATTTATTAAACTACTTACGTAGTAAAGATATTCAACGTTACCGTGAATTAATTAAATCACTTGGTATCCGTCGTTAATCTTAATATAACGTCTTTGAGGTTGGGGCATATTTATGTTCCAACCTTAATTTATATTAAAAAGTTTTTTACAAATATTAACATTTATTATATGTTAAGCTAATATTGAGTGAATAATAAGGTTACAATGAGATAAAGATGATATAAGTACACCTAGAGTAATAATCAAGATATTAAAAATAAAGTATGTTTTTTAAAAAAATATAACTTATATTTATACTGATAAGGGTGGGACGATAAGTCTATTTTGTAAATAATAGATGGATATCCCGCTCTCTTTTTTTCCAATTCAATATTTTATAACTAATATTAAAATACGATAATAAATGATATGATATAACTATTAGATTCAAGAGAGGAGATTTATAATGTCTCAAGAAAAGAAAGTTTTTAAAACTGAATGGGCAGGAAGATCTTTAACGATTGAAACAGGGCAATTAGCTAAACAAGCAAATGGCGCTGTATTGGTTCGTTATGGAGATACAGTCGTGTTATCGACGGCAACTGCATCAAAAGAACCTCGTGATGGAGATTTCTTCCCATTAACAGTGAACTATGAAGAAAAAATGTACGCTGCGGGTAAAATTCCTGGTGGATTTAAAAAGAGAGAAGGACGTCCTGGTGACGATGCAACATTAACTGCGCGATTAATTGATAGACCAATTAGACCTTTATTCCCTAAAGGATATAAGCATGATGTTCAAATTATGAACATGGTATTAAGTGCAGATCCTGATTGTTCACCACAAATGGCTGCAATGATTGGTTCATCTATGGCGCTTAGTGTGTCGGATATTCCATTCCAAGGGCCAATCGCCGGTGTAAATGTGGGTTATATTGATGGTAAATATATCATTAACCCAACAGTAGAAGAAAAAGAAGTTTCTCGTTTAGACCTTGAAGTAGCTGGTCATAAAGATGCAGTAAACATGGTAGAAGCAGGCGCTAGTGAGATTACTGAACAAGAAATGTTAGAGGCGATTTTCTTTGGTCATGAAGAGATTCAACGTTTAGTTGATTTCCAACAACAAATCGTCGACCACATTCAACCTGTTAAACAAGAATTTATTCCAACAGAGCGTGATGAAGCGCTAGTTGAACGTGTAAAATCTTTAACCGAAGAAAAAGGACTTAAAGAAACAGTTTTAACATTTGATAAACAACAACGAGATGAAAATCTTGATAACTTAAAAGAAGAAATCGTCAATGAATTTATCGATGAAGAAGATCCAGAGAATGAATTACTTATTAAAGAAGTTTATGCAATTTTAAATGAATTAGTGAAAGAAGAAGTTCGACGTTTAATTGCAGATGAAAAAATTAGACCAGACGGCCGTAAACCTGATGAAATCCGTCCATTAGATTCTGAAGTTGGTATTTTACCTAGAACGCATGGTTCAGGTCTATTTACACGTGGTCAAACTCAAGCACTTTCAGTTTTAACATTAGGTGCTTTAGGTGATTATCAATTAATTGATGGTTTAGGACCTGAAGAAGAAAAAAGATTCATGCATCATTATAACTTCCCGAATTTTTCAGTAGGTGAAACTGGTCCAGTACGTGCGCCAGGTCGTCGTGAAATTGGACATGGTGCGTTAGGTGAAAGAGCATTAAAATATATTATTCCTGATACTGCTGATTTCCCATATACAATTCGTATTGTAAGTGAGGTACTTGAATCAAACGGTTCATCATCTCAAGCGTCAATTTGTGGATCAACATTAGCTTTAATGGATGCGGGCGTACCGATTAAAGCACCAGTTGCTGGTATTGCTATGGGCCTTGTTACACGTGAAGATAGCTATACGATTTTAACAGATATCCAAGGTATGGAAGATGCATTAGGTGATATGGACTTTAAAGTCGCTGGTACTAAAGAAGGTATTACAGCAATCCAAATGGATATTAAAATTGACGGTTTAACGCGTGAAATTATCGAAGAGGCTCTAGAACAAGCGAGACGTGGTCGTTTAGAAATAATGAATCATATGTTACAAACAATTGATCAACCACGTACTGAATTAAGTGCTTACGCGCCAAAAGTTGTAACTATGACAATTAAACCAGATAAGATTAGAGATGTTATCGGACCTGGTGGTAAAAAAATTAACGAAATTATTGATGAAACAGGCGTTAAATTAGATATCGAACAAGATGGTACTATCTTTATTGGTGCCGTTGATCAAGCTATGATAAATCGTGCTCGTGAAATCATTGAGGAAATTACACGTGAAGCGGAAGTAGGTCAAACTTATCAAGCCACTGTTAAACGTATTGAAAAATACGGTGCGTTTGTAGGCCTATTCCCGGGTAAAGATGCGTTGCTTCACATTTCACAAATTTCAAAAAATAGAATTGAAAAAGTGGAAGATGTATTAAAAATTGGTGACACAATTGAAGTTAAAATTACTGAAATTGATAAACAAGGTCGAGTAAATGCATCACACAGAGCATTAGAAGAATAATATTTAAAGTCATATGACGACAATGTATCGTCATGTGATTTTTTTATGCCATTTTTTACGAAGTGACCCATTTTGAATTTGTTGTATTGAACATTTTAAAACGCTTTATTATTTTGTGTACAACTGTTAATTATCCTGTATGTATAGTGATTAATAGTGTACATCAAGTATTTTTTAACTTATAATGAATAGTGAGTTTATATATGGACGGGTAACAAATTTAGGAGGTAAGATTTTGAGTTTAAT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MKHKSVYLLCFLILPILLLTSVSAYAVSNPVGEPSHAVKPKIEKYDLSHYRSIYSEKGDWNPFGQEEISRQINNVSDFFFSMTKILAGVTDYAIENLFQLDVINDFADKIGDFVGDIYQKLLSNLAITLFIIVCFNAFIIFSVQGNAREALKRAFLIMCLIGFGVGILANAGNIIRGTNNIGKDLNNIIMNSTSSIDGNIDYIHENSGMNHIRNQLFDMTIYRTYLVMNYGTVDEKEIKAKGKDRIDNILKLDYDKKSEKELDDIVKDEVEKKNNKYMTQGYVFQKLAISVIGFIITLFMSIVFLSISFAKLIFSTFALFLFLFLVFSWIVSFIPGFELSVFSAFAKTLGYIILSACMTFLFVIVGLCIKLANSFIDPDSQNAYFLNSIFIIVILFVMYKKRAQIINFVSRGNISFSPSAIGAGVMNRTQERFNKIRHEQAQNKKAKRENQRDEPAPPLQNDNDLRRRQQYKPMPLFINKENQKNGNKRREQQESMNGNDVKSASVESNANNYSKQPQKASQQEHQVRETRQRKDIQRSPQVVNQPLNNENHSINRKEQKSVQTAYDTDVQKRQIQNATQNQQSRQSGNRNQPITRNSQSKDRLKEQKDINKHGK |
106 | Staphylococcus_phage(28.57%) | protease,transposase,head,tRNA,lysis | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1556325 : 1641911
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LS483484|1556325:1641911|DBSCAN-SWA CTTATGGATATAAACGGTTTAATAATCTTGGGAATGGCGCTGTTTCACGAACGTGTTCAACACCAGAAATCCATGCGACTGTACGCTCTAAACCTAAACCAAATCCACAGTGTGGTACACTACCATAACGACGTAAGTCTAAGTAGTAACTATATGCTTCTTCGTCTAATCCATGTTCTTTAACGCGTTGTTCTAACAATTCTAAGTCATCCACACGTTCAGAACCACCTATAATTTCACCGTATCCTTCAGGTGCAATTAAGTCTGCACATAATACAGTTTCTTCATTCTCAGGATTTGGTTGCATATAGAAAGGCTTAATTTTAGTTGGATAATTAGTAATAAATACCGGTAAATCATAATGATTAGCAATGGCTGTTTCATGTGGCGCACCAAAATCTTCGCCCCATTCAATATCATCAAAGCCTTCTGCTTTCAAGAACTCAATTGCATCATCATATGAAATTCTAGGGAATGGTGTCGCAACTTTTTCAAGTTTTGATGTATCACGCTCTAACATTTTCAACTCTAGTTTACAATTTTCTAAAACTGATTTTACTACATGTGTTACATATTGTTCTTGAATTTCTAAACTTTCAGCATGATTTGTGAAAGCCATTTCCCCTTCAATCATCCAGAACTCGATCAAGTGTCTACGTGTTTTTGATTTTTCAGCTCTGAAAGTTGGACCAAATGAAAATACTTTTCCGTGTGCCATTGCCGCAGCTTCTAAGTATAACTGACCACTTTGAGATAAAAACGCATCTTGATCAAAGTATTTAGTATGGAATAATTCACTTGTACCTTCTGGTGCACTTGCTGTCAAAATTGGTGGATCAACCTTTGTAAATCCATCTTTGTTGAAAAATTCATACGTTGCACGAATAACTTCATTTCTAATTTTCATTACAGCATGTTGTTTTTTAGAACGTAACCATAAATGACGGTGATCCATTAAGAATTCTGTACCATGATTTTTAGGTGTAATCGGATAGTCATGCGCTTCTGAAATAACTTCAATTGATTTCACTTGCATTTCGTATCCTAAGTCAGAACGATTATCTTCTGTAATTGTGCCTGTAACATATAGAGATGATTCTTGAGTAATTTCTTTCGCAAGTTTGAATACCTCTTCATCAACTTCTGATTTAACTACTACGCCTTGCATAAAGCCTGTTCCATCACGTAATTGTAAAAAGGCGATTTTACCACTTGAACGTTTATTTGTTAGCCAAGCACCAATTGTAACGTCTTGGTTTAAATGATCTTTCGCTTGTTTAATCGTTGTTTTCATAACCATTCTCCTATTTATTTTTTCGTTATACAATACTCATTCATTTTAACAAAATCCGCTTTCAAGTTCTAGAACTAGACTAAAAGATAACGTGTAAATGGTAATGATTTAAGCACAGATTTGAACATTAATTTATATTAAGACAATACAATCATCAGTTTCAGACAAAATATATAATAAAGCCTCAATATTATTAGTATGAAGGTCGTTTTTTGTGCTAACATTCAAGTTTAATTATAAAACTCAAATTTTGACGACCAAACAAAAATTCTTGTAACAGAACATAGCACATGTCATGTCACAAGAATTTTACTTTGTATTTTACTTTTTCTTTTTTTGAATTTGTCTTAATAATTTTCCAAACTGTTGAATGTCGCCTTTTTTCTGACGATAATTTTCAAGTGTTTGTTCAAAAAAGTTTTTATAATTACTGTTTATGAGTCGATCATCAAATGAAACTATTATGCCGCGATCATTTTCATTTCTAATTAATCTTCCAAGTCCTTGTCTAAAACGTGTAACTGCATCAGGTAATACATATTCCTTGAAAGTTGAAGTGAATTCAGAATCCATAAGCCAATATTTTGCATTATGCTTGTTCATAAACGGTAACTTCGCTATCATCACACATTTAATACCATTTGCTTGAAAATCAAAGCCTTCAAAAAATGTTGACGTACCAAGCAGTATGGCTTTATCAAAATTATTAAACTGTTGTACTATTTTATAATTTTGGTTCTGCTGTTGTGTTAATACAACATAATCTTCAAATTCTGGCAATTCATTTAGCATATCTTGTACCATATGCATCATTTTATAACTCGTAAATAAGACTAAACATTTTGATGACGTTATAGTCGTATATTCAATAATATAGCTTACAATCGATGCTACATACTCATCTATATTTTTATATTGATAAGATGCTACATCACTCGGTATAAATACACTTGTATTTTTTGCACTTTGTAACGATGTGTTAACTTCAAATGTATTAAAGTGAACATCTTTGTTGAATAACTGTTTGAAAGCATCAAACGAATGATTAAATTTTAAAGTACCAGATATAAAAATAAGTGATTTAAATTTTTCCAATACTTGTTTCGTTAATACATCTTTTACAGCGTAATCTTTCACATATAAACGTATTGTTGATTTTTGAGATAGATTTTTAATTGAAATGAAACTAGTATGTCCAGCTTTTAAACTTTGTTCGATATTTTTAAATTTATCTTTTAAATACAACAACTGTTTCCGTAATGATTTAACTGTTTTATGACTAATGCCATTGAATATTTCTAGCGTCTTATTTAACTTATCGATAATCGCATGTAAATCCTTCAAAATGTCTTTTGTTTCAAAAGTAAATACATTATGGAAGCGATGAATATCATCATCATAAACATCAGAATCATTGATAATCGTAAATATCGTTGAGAACAATTGCTCATTTAACTCATGAATCTCATTCATACTAGCCTTCAAGCCAAAAATATCAATTGGTGCAATATCTAATTTTTCCAAAATCCGCTGCTTTTCCAGTTGATCAATTGCCTTTAACAATTTTTCATTTTCGTTTTTACCAATCAAACCAAGCTGATACTTAATATCAGCATAACTCAACTCATTTGTCACTTGATTTAAGGCATAGTCTGGTAAGCGATGTGCTTCATCCACTATACAATCATCAAACAATTGATATATTGAATTTTCAACATCAGAATGAATTAAATGTGCATGATTTGTAATACCAATTTGAATGTTCTGTGCATTTCGCTTAATAAAATTATAATAATGAACATCGTGACGTGCCGGTACATATGTTTCAATTTTCTGGTCAAAATACATCTTTTGACCACCTTTTAAATTTAATTCCTGTATATCTCCGGACGGCGTCTCTGTAATCCAAATCAGCAATTGCATTTTCAAGATATTCACTTCGTAATTACTTGTGTCATCTTTTAAAATTTGACTAATAAGTCCCAATGAAATGTAATCACTTTTACTTTTAATCAATAGTGCATTAATTTTAAAATTCAACGCTTCATTCATTGCTGGAATATCTTTTTCTAACAATTGACTTTGCAGTAATTTAGTATTGGTAGAAATCATGACATGCTTCCCAGTTTCAATATTATACATCAAGGCCGCAAGTAAATATGCTAATGATTTACCACTGCCTAGTGATGCTTCAATCATTGCTTTTTCACTATGCATGAGCTGATCTAATATAGTTTCCGCTAAATATAATTGTTGCGGTCGATATGTTAAGCCAAGTTGATCTACAGCTTTGCTATATAAAGACTTCAAGCTGCCATTATAATTTGTTGTCGGCTTTTTAAAATCAACTTGCTTACGATATATTATCTGTTCGAACTTTTCGTACGATTTATCCAATGGCTTTGCATCATATTGCCTAACCATCTCAAAGAAAATATCATACAAATCGTATTTCAACTGTTTACTTAAATAATATAATTGCTTTAAAGTATCTAACGGTAACTTTTCAAATTTTTCAAAAGCTAATATCATCAATTTAGCAGTAGTAGCGGCATCTTCGTCAGCTCGATGGGCATTTGCTAAGGTAATACCATGTGCCTCCGCTAATTCACTTAATTGATAACTTTTATCTGTAGGAAAAGCTATTTTAAAGATTTCTAGTGTATCTATAACTTTTTTGGGACGATATTGAATATTACAATCTTTAAATGCCTTTTTAATAAAATTTAAATCAAAATCTACATTATGAGCGACAAAAATGCAATCTTTTATCTTATCGTAGATTTCTTCTGCAACTTGGTTGAAATATGGCGCTTGTTGTAGCATATTTTCTTCAATGGATGTTAACGCTTGAATGAAAGGCGGAATCTCTAAATTTGTTCTAATCATAGAATGATATGTATCAATAATTTGGTTATTGCGCACAAACGTTATACCAATTTGAATGATATCGTCAAAATCTAATTGGTTGCCTGTTGTTTCCAAATCCACAACGGCATAGGTTGCCATACCCATAGCTATCTCTCCTTGCTTTAGTGTTAAAAATCTATATCTGCACTAATTAAACGGTGTGATTCACCCGCTTCATCTCTAACAATTAGATAGCCATCGTAATCTAAATCAATTGCTTGTCCTTTAAACTGTTTATCATTTTCTGTAAATAGCAACGTTCTATTCCAGATATTAGAAGCTGCAATATATTCTTCACGAATTTCAGAAAAAGGTAACGTTAAAAATTGATTATATCTTTTTTCAATTTCTTGAAGTAATCTCTCTAAAAATTGATATCTATCTAATTTATTTTTATCATGTAATTGTATACTTGTTGCTCTATATCTAATACTTTCATCAAAGTCTTCTAGTTGTTGCGTCAAATTAATACCTATACCACATATTATTGCTTCTATACCATCATTATTAGCAACCATTTCAGTTAAGAAACCACACACTTTACCATTATCAATATATATATCATTCGGCCATTTCACTTTGACTTCATCTTGACTAAAATGTTGAATCGCATCTCTTATCCCTAATGCAATAAATAAATTAAATTTAGATATCATTGAGAATGCAACGTTAGGTCTTAATACAACAGACATCCATAGTCCTTGCCCTTTTGAAGAACTCCAATGTCTATTAAATCGCCCGCGACCTTTCGTTTGTTCATCACTCAAGATAAAAAATGAAGATTGATTTCCAACAA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MTLQQKILSHFATYDNFNSDDVVETFGISKTHAKSTLSKLKKKGKIEMESWGIWRVIESQLHLSVVERKKEILEEQFELLARLNEQSEDPREIEERIKLMIRLANQF >LS483484|1556325:1641911|1638120_1638990_-|SQI86436.1|DBSCAN-SWA MKKINDRDLAELSGYWAYQDLDKRYVIRVNNNKYRLIEDYSDNPNSKSFGGTDAKVFELVNSNNELTGQQAIIFQGTNNNKSIGSNNPFRGKVADDWIENIKLMNDKNKSTSLLEQNNAYIKSYEQKLKDADTLKSSDFLRKYKKNPSTYKNKTIKSDGGNSQGGASANHQGMINPNKNIVSTNPAMLPKSIWENFKSQNFENMINYHSKFDILSWLQDPFATPTLGKRVNLETGVPTMDGLVNSHLGYKRKLNPRYNTYKDLAVYKIKSVKDTMIKNGKKVKKLLKSI |
102 | Staphylococcus_phage(74.68%) | protease,portal,capsid,head,tRNA,terminase,integrase,tail | attL 1591090:1591118|attR 1636990:1637018 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1700459 : 1708771
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483484|1700459:1708771|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTTTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATTAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAAATGCTGTTGTTTTAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTAATCCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCTGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGTGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTGTTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGTTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATCTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTAATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGGCCAGTTCGGCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCTATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCGTTATCTCTACTATTACAGAAAACAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTCTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCGATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAATCATTAATTCTAGTAGGGGTACCTATAATCAATTGAGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACACCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTCAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGAACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTCACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATTAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGAGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCATGACTTTTGACATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACATCTTGTTGATTATTTATTATTGAAATGTTCTTCAATCCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATGAGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACACCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTTCTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGACGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTATTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGCGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCGATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACATCCTCAGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTACTAATTGGTTTGCAGCTACATTTTTCACAGCAGCTTGAAAAGGGCCTTGAATAACTTCTCCAGCAATACCGCATTCGCATAAATGGTTTTGTATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_8 >LS483484|1700459:1708771|1703730_1704831_-|SQI86508.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFRTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPHGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQDVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDACQKSWAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAANIKSKLNIPSVRFVGESNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFEYI >LS483484|1700459:1708771|1704833_1705511_-|SQI86509.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLVDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHRQRLAQINDEIAVIERVL >LS483484|1700459:1708771|1700459_1701245_-|SQI86505.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >LS483484|1700459:1708771|1702270_1703617_-|SQI86507.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPEQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIVFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIEDRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >LS483484|1700459:1708771|1705641_1706748_-|SQI86510.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD >LS483484|1700459:1708771|1701370_1702261_-|SQI86506.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQHFDPELKNKVMQQ >LS483484|1700459:1708771|1706971_1708771_-|SQI86511.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIASDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTAFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKALNDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYSLNDEPYENEIDDYVNVINENGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1778207 : 1787250
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483484|1778207:1787250|DBSCAN-SWA TTTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCACCTAATTTTTCGACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAGTCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAACATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAGGGAATTAGACAAATCTTCCATTGACGTAGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGTTGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCGTTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAATTCAGGTTCTAAGTGTCCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTCAGATGATTTTTTTGTTGACCTATCGCCTTAACTGAAGAAACTGATAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACATCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGGTGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCATTTTTAACTTTCATTTCTGCCATTGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCGCGGTTAAATTGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAATGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAATGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGCTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAATGCGTCATGATTGATATCTGTATCTGAAATGATGGATTCAATTGCTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTAATGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAACTGACGTTTTTTCATTATTCCCCAAAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTAGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTGTTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTACCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAGGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAATATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGGGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTGAAAGTAACTGTTGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCTTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGGTCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTTGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTGATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATAAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAGTAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCTCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGCGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATCGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATAGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTTAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCGTCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAATCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCAGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATACGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTAAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAATATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGCGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCGCCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTTGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGTTTCAATAGTCGATTGGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATAGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTACCAGCTCGTGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAGCACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGCCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_9 >LS483484|1778207:1787250|1784056_1785196_-|SQI87589.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >LS483484|1778207:1787250|1783777_1784038_-|SQI87588.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >LS483484|1778207:1787250|1778747_1781021_-|SQI87586.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQAIESIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEQFNRERKDIVATITEEAMAMAEMKVKNGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKQQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDVFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >LS483484|1778207:1787250|1781223_1783503_-|SQI87587.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQYWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKGSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >LS483484|1778207:1787250|1786245_1787250_-|SQI87617.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >LS483484|1778207:1787250|1778207_1778726_-|SQI87585.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE >LS483484|1778207:1787250|1785218_1786244_-|SQI87616.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNIEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTKSKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
1923665 : 1992572
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LS483484|1923665:1992572|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCTTTTTTAGAACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGTGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAACCAGTATTTGGAAGTTCTTTTACAACTTTTCGCACTTCTTGTTTATCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCAGGTTGCCCCACTTTTGGTGACGCTTTTATCACTTCAGCAGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAATAATGAGTTGCGTATCTTTTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAACCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATGCTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATCGCTTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAATGTGTAACACGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACGTCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGTTGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATGTTTTGTAACTGTGCTAAAATACTATTTCTTTCTTCTACTGTTGCTTGAACATTCGCTTCAATTGCTTGTTTCTTATCGTTGAATAATGTTGTTAATTGTTCTCGCGCAGTTGCTTTTTTATTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCCCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACCAGCAATTTGTTGTTTAGCTTTAATTAACTCTTTTTCAACTTGTACTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCGTTATTTGCTTTAATTAAATTAATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAATGCTGTTGCTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGCGCAGTCTTATCTGCGTGATTGATCTGATCAATAGCTTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTGACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTTGTTACCATCAGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAACGCAGCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTTGTATCTAGCGTATTTCGTATTGCATCGAGTTGATTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTGCGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATCGTTTGGTTTCTAACATCATTGACAGCTGCATCTTGTGTCGTATTGTCTATATCTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTTATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCTGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGGTTATCTGCGCTCGCTTTTATGGCTTCTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATTAATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGTGCTTTTTAGCTTCATATTGTTGCTTAACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCGTCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCATTAACTTGCTGATTTGTTCTATCATTCGTGATATTTGTCATAGCTTTAGCAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTAATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAATTTTTGTTTCAGGTTGAATAATTTTAATCGCTGATACACCATTTGTTGCCGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGCTAATGCTTGTAAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTAATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAACGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACTGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCTACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACAACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCCGCATTTGTATTTGCTTGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAGTATTGATCGCAGCATTTTTCTCATCATCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAACTAATTTAGCACTATAATGCTGATTGGTTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTTACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTTTGTACCTAATTGTTGTGCTTGATCTACTTCTGCATTAGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAAATCTTGGTCTACTTGATTTAATGCTACTTGCTTTTCTTCAGTGGTTGCATTTGTATTTTGATTAATTTCTTGTTTTTTTGCAGTTGCTAAGTCCGTTAATACACCTGTAGCAGTTTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGCACCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCATTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATTTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGTTATCGCCTCTCGCGCTTTTTCATTTACAGCATTGCGTGCATCCGTTTTAACTTGTGTTGCCGGTTGAATCACAACTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGCAATTGTTGTGCTGCTTGTTGCTCTTCTAAGGTCGCATCATTATTATTAAATATCGCATTATGTTGCGTTTCCGCACTTTGATCAATAGCGTTTTTAGCATCTGTTTTAACCTTTGTAGCTGGTTCAATGGCTTGTATACCTTGAATTGCATTTGTCTTTACTTGCTCAACATCAGCATTGGTATTAGCATTTAATATATTAGTATTCGCAACAGCTACAGCAGCATTTACTTTCTCTATTGCTGCTTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTTGCATTGATCTCTGCGATATGCTGTTGTGCATCATGTGATACGGCATCTCTTGCTGCTTGCTTGACAACAGTTACAGGCGCAATAGGATTAATGGCATTCAGACCATCACCTTTGGCAGTATCTACATCATCATTGGTTGTCGCTTGATTGATTTGTTCTAATGCGTGGTTCGTGGCTTGCGTTAATTCATTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCTTGTGTTGCTTCTCTATTGCTATTTATTTGTTGTCGTTTCGTTGCTGTCGCTTGATTAATTGCATCTCTTGCAGCTTGTTTGTGTGTCACTTGTGGCGCAACTGCACCAATTGTATTAATACCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCAGCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTTGTTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCATCTTGAGTAGCATCTGGCGTGTGATTGATAATTTCTCTTTGTTTCGCTGCTTTATCACGTATAGCTTGTTTAGCATTTGGTTTAACAACTGGTGTTGCAGTGTCTCCACTTAAAGTCTGTATACCTTGATCTTTAATTCTAGTAACGCCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTCCCAATAATTTCATTTTTATGTTCCTCGATGACTTGAATCGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAACTAAATCTTCCATGTCATCAACTTTTCTATTAACGGCATTTTCAGCGTCAACACTGCGAATTAACGTATGTTGCATCTGATTTGCTAATGAATCGATATCTGCTTGAGAAACTCTTTTGTTTAAAGGTACATTGTTACGGTTTTCATCTAAAATTGTTTGTGCGCGTCTTTTAAGATCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCCGCTTGTTGAATTCGTCTATCGACTTCGGCTTGCAATGCGTCTTTATTCATGATGATATCAATTGTATATGGATTTGTACTTACAGTATGACTTTCAGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGAATATGTTTTATACGTTAATGTATCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTTGGCACATTGTTCACACGTAGCTTATACTTCAAATCCAATATTTTATCAGGCATTAGTCGTGCCGGCGAATTCCCTGTACCT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68 | Staphylococcus_phage(93.62%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
2079054 : 2171141
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LS483484|2079054:2171141|DBSCAN-SWA ATTATCTTTTATCTAATTCTTGTTTTAATAGTTGATTTACTAATTGTGGATTAGCTTGACCTTTAGACGCTTTCATAATTTGACCAACTAAGAAGCCCATAGCTTTGCCTTTACCATTTTTGTAATCTTCAACTGATTGTTCGTTATTGTCTAATGCTTCATTTACAAATTTTAGAAGTGTTGCTTCATCAGAAATTTGAACTAAGCCATTATCTTCCATAATTTGTTTAGCATTACCACCTTTAGCTGCTAACTCTGGGAAGACTTTCTTCGCAATTTTACTGCTCATTGTTCCGTCTTCGATAAGTTTAATCATACCTGCTAAATTTTCTGGTGTTAATTTTGTATCTAATAATTCTACTTGATTTTTATTTAAATATTCGTTTACGCCACCCATTAACCAGTTAGATGTTAATTTAACATCTGCGCCGTGTTCAATTGTTGATTCAAAGAAATCTGACATTTCTTTAGTCAATGTTAATACGTGTGCATCGTATGCAGGTAAGCCTAATTCATTTACATACTTAGCTTTACGCTCATCTGGTAATTCAGGAATTGTCTGACGAACACGCTCTTTCCAAGCATCATCAATATATAAAGGTACAATGTCAGGCTCTGGGAAGTAACGGTAATCATCAGAACCTTCTTTAACACGCATTAAAATTGTTTTACCTGTAGATTCATCAAATCGACGTGTTTCTTGTCCGATTTCTCCACCACTTAACAATTCTTCTTCTTGGCGTTTTTCTTCATATTCTAAACCTTTACGTACATAGTTAAATGAGTTTAAGTTTTTCAATTCAGCTTTAGTACCAAATTTTTCTTGACCATATGGACGCAAAGAGATGTTAGCATCACAGCGTAAAGATCCCTCTTCCATTTTAACGTCTGATACACCAGTGTATTGAATAATTGAACGTAATTTTTCTAAATATGCATATGCTTCTTTAGGTGAACGAATATCTGGTTCAGATACGATTTCAATTAGCGGTGTACCTTGACGGTTCAAGTCAACTAATGAATACTCACCTTTATGCGTCGACTTACCAGCATCTTCTTCCATGTGAAGACGAGTAATACCGATTCGTTTTGTTTCACCGTCGACTTCGATATCGATATACCCATTTTCACCAATTGGTTGATCAAATTGAGAAATTTGATATGCCTTTGGATTATCTGGATAGAAATAGTTCTTACGGTCAAACTTAGATTCTGTTGCGATTTCCATATTTAGTGCCATTGCAGCACGCATTGCCCAGTCTACTGCACGCTTATTAACAACTGGTAAGACACCTGGATATGCTAAGTCGATAACATTTGTATTTGAGTTAGGTTCTGCTCCAAAATGCGCTGGTGATGGAGAAAACATTTTTGAGTCCGTTTTTAACTCTACGTGAACTTCAAGTCCTATAACTGTTTCAAAATGCATGATTTCCACTCCTTATAATTTTTCATAAACGTCATGTAAATTGTATTGTGTTTCATATTGATAAGCGACACGATATAACGTTTTTTCATCGAATGGTTTACCAATGAACTGTAAACCGATTGGTCGGCCATTTGATTGTCCACAAGGAACAGAAATACCAGGTAATCCAGCTAAGTTTACTGGTGTTGTTAATAAATCATTGGCATACATTGTTAATGGATCATCAATTTCTTCACCTAAATTAAACGCAGTTGTAGGCGCTGTTGGACCAACTACTACATCATAATTTTCGAATACTTTATCAAAGTCATTTTTAATCAATGTTCTAACTTTTTGAGATTTTTTATAGTAAGCATCGTAGTAACCTGAACTTAATGCAAATGTACCTAAGAAAATACGACGTTTTACTTCTTTACCGAAACCTTCAGATCTTGACATTTTATATAATTCTTCTAATGAATGAGCTTCTTTAGAATGATAACCATAACGAATTCCGTCAAAACGAGAAAGGTTTGACGAAGCTTCTGATGATGCAATCACGTAATATGATGGAATACCAAATTTAGTATTTGGCAATGATACTTCCTCAACGACAGCACCTAAAGATTTTAAAGTTTCTACAGCGTTTTGAACTGCTTCTTTTACGTCATCAGCTACACCTTCACCTAAGTATTCTTTAGGTAATGCAACTTTTAATCCTTTAATATCTTTACCAATTTCAGATGTAAAGTCTACATCATCAACAGGTGCACTTGTAGAGTCATTAGCATCTGCACCAGAAATAGCTTCTAATACGATTGCATTATCTTTTACATTTCGAGTCAATGGACCAATTTGGTCTAATGAAGATGCAAATGCAACTAATCCAAATCGAGATACACGACCGTATGTTGGTTTCATACCGACAACACCACAATATGCAGCCGGTTGTCTAATTGAACCACCAGTGTCTGAACCTAAGCTAAATGGTACTAAGCCAGCTGCAACTGCTGCTGCAGATCCACCTGATGAACCACCTGGTACTGCTTTATGGTCAAATGGGTTAACTGTTTTTTTGAAATAAGATGTTTCTGTTGAACCACCCATTGCAAACTCATCCATATTTAATTTACCGATTAAAACGGCATTCTCATTATGTAGTTTTTCCATTACAGTAGATTCGTAAATTGGCACAAAACCTTCTAACATTTTACTTGCACATGTTGTTTCTAATCCGTTTGTAATAATGTTATCTTTTATACCCATTGGAATACCAAATAATTTGCCATCCATTTGGTCTTTTGCTTGTAATTCATCCAATTCTTGCGCTTTTTTAATTGCATTTTCTTTATCCAGCGCTAGAAAAGACTTAATTGTTGGATCAGTCTCTTCAATTGCATCATATATATCTTTAACAACATCAGATGGTTTGATTTTTTTGTCTTTAATTAAAGTTAATAAATTCTCAACCGATTCGTAGCGAATGCTCATCTTACGCGTCCTCCTCATTCATGATTGTAGGCACTTTAAATTGTCCATCTTCTGTTTCTTTGGCATTTTTCAAAGCTAATTCTTGCGGAATACCTTTAATTGCTTTATCTTCACGTAAAACGTTTTGTAAATCTAAAACGTGATATGTAGGTTCAACGCCTTCTGTATCAGCGCTATCATTTTGTTTTGCAAAATCTAAAATGCTTTCTAATGTGTTGGCCATTTCTTCCGTTTCTTCAGGAGAAATTTGAAGTCTTGCAAGATTCGCGATATGCTCAACTTCTTCACGTGTTACTTTTGTCATTAATAAAAGCCTCCTTTAAGTCATTCATCACTAAATTGTATCAAATTTCCAATTAAAAATCTAAGTATTTATGAGGTACTACTTTAATTTCATATAAACTGTATAAACATTATCATTCGTTTACCAAATCATTTTTTATGAAAACAACACCCTTTTATTATTAGACAACCCAATTCAATATTATGATTATGCAATTTTAATTATAAAAATTTGCTCATATCTAAAAAATACGAAAGCGTTTTCTATATTGGTATACAAGTATTTCAAAAAGAATAAATTTAATTTTCCTACTTTTCTAAACATTTATCTTTATGTATAATGTTTTCAAGTAACTAAATTATAAATTAAATAAAGGGAGTGTTTATCATGCTTACAATGGGGACAGCATTAAGTCAACAAGTAGATGCCAATTGGCAAACTTATATTATGATTGCCGTCTACTTCTTGATACTAATCGTTATTGGCTTTTACGGTTACAAGCAAGCAACTGGTAACCTAAGCGAGTACATGTTAGGCGGACGTAGTATTGGACCGTATATTACTGCATTATCAGCTGGAGCTTCAGATATGAGTGGATGGATGATTATGGGTCTACCTGGTTCTGTCTATAGTACTGGTCTTTCGGCAATGTGGATTACAATCGGCTTAACATTAGGTGCTTATATAAATTACTTTGTTGTTGCTCCTAGACTTCGCGTTTATACCGAATTAGCTGGAGATGCAATTACATTACCAGATTTCTTTAAAAATCGTTTAAACGATAAAAATAATGTGTTAAAGATTATTTCTGGATTGATTATCGTAGTATTCTTTACATTATATACACATTCTGGTTTCGTATCTGGTGGTAAATTATTTGAAAGTGCTTTTGGATTAGATTATCATTTCGGTTTAATATTAGTTGCTTTCATTGTCATTTTCTATACTTTCTTTGGTGGATATTTAGCTGTATCAATTACAGATTTCTTCCAAGGTGTCATTATGTTAATTGCGATGGTTATGGTCCCTATTGTTGCTATGATGAATTTAAACGGCTGGGGAACGTTTCATGATGTAGCAGCTATGAAACCTACAAATTTAAATTTATTTAAAGGGTTATCATTTATAGGAATTATCTCTCTATTTTCATGGGGATTAGGTTATTTCGGTCAACCTCATATCATTGTAAGGTTTATGTCTATTAAATCACACAAGATGCTACCTAAAGCTAGACGTTTAGGTATTAGCTGGATGGCTGTTGGTTTATTAGGCGCTGTGGCTGTTGGTTTAACAGGTATTGCATTCGTACCTGCTTATCATATTAAACTAGAAGATCCTGAGACATTATTCATCGTGATGAGTCAAGTACTCTTCCATCCTCTTGTAGGTGGTTTCTTACTTGCTGCGATTCTAGCAGCAATTATGAGCACCATTTCTTCACAATTACTTGTAACGTCTAGTTCTTTAACTGAAGACTTTTATAAATTAGTTCGTGGTGAAGAAAAAGCTAAAACACATCAAAAAGAATTCGTTATGGTTGGACGTTTATCTGTATTAGCAGTAGCAATTGTTGCCATCGCGATTGCATGGAATCCAAACGACACAATTCTAAACTTAGTAGGTAATGCTTGGGCCGGATTTGGTGCATCGTTCAGTCCACTTGTGCTATTTGCACTTTACTGGAAAGGTTTGACACGTGCCGGTGCTGTAAGTGGAATGGTTTCAGGTGCCTTAGTCGTTATCGTTTGGATTGCGTGGATTAAACCATTGGCACATATCAACGAAATATTCGGCTTATATGAAATTATTCCTGGATTT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108 | Staphylococcus_phage(89.87%) | protease,holin,transposase,capsid,head,tRNA,terminase,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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