Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LS483488 | Helicobacter pylori strain NCTC11637 genome assembly, chromosome: 1 | 0 crisprs | DEDDh,cas14j,cas2,cas3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
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---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
58368 : 69256
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483488|58368:69256|DBSCAN-SWA AATGGGTTTTGAAAAAAGCATTTTAGACAATTTGAACGGGGTGCAAAAAATCGCTGCAAGCCACATTCAAGGGCCATTGCTCATTTTAGCGGGAGCTGGGAGCGGTAAGACTAAGACTTTAACGAGCCGTTTAGCGTATTTGATTGGCGCTTGTGGCGTGCCTAGCGAGAACACTTTAACGCTCACTTTCACCAATAAAGCGAGTAAAGAAATGCAAGAAAGGGCTTTGAAATTGTTGAAAAACCAAGCCCTTATCCCCCCCTTGCTTTGCACTTTCCATCGTTTTGGTTTGCTGTTTTTAAGGCAACACATGAGCCTTTTAAAAAGAGCATGCGATTTTTCGGTGCTAGATAGCGATGAAGTCAAAACGCTGTGCAAACAGCTCAAAATTTCAAACTTTAGAGCCAATATTTCTCAAATCAAAAACGGCATGATGGATTTGAGCGTGCAAGATAGCGAATGCTATAAAGCGTATGAGCTTTATCAAAACGCGCTTAAAAAAGACAATTTAGTGGATTTTGACGACTTGCTTTGTTTAAGCCTTAAGATTTTACAAGATAATGAAAAACTCGCCAAAGAGACTAGCGAACGCTACCATTACATTATGGTAGATGAATATCAAGACACGAACGCCTTGCAATTGGAATTTTTAAAACAATTGAGTTGCACGCATCATAATTTGTGCGTGGTGGGCGATGACGATCAGAGCATTTATGGTTTTAGGGGGTCTGATATTTCTAATATTTTAAATTTTTCCAAGCATTTTAAAGGGGCTAAAATAGTGAAATTAGAGACCAACTACCGCTCCAGCGCTGAGATTTTAGCGTGTGCTAATTCTTTGATTAGCCATAACCAACACCGCCATATTAAAACGCTTCAAAGTTTCAAAGGCTCGCATAAAAGCGTGATTTGTAAAGAATATTTGACGCAAAAAGAAGAGAGTTTGGATGTGGCTTATCAAATCAAAGCCCTTTTAAAGAAGGGCGAAAATTTAGAAAATATCGCTATTTTGTATCGCTTAAACGGGCTTAGCCGCAGCATTGAAGAGAGCTTGAACGCTTTGAATATCCCCTATAGGCTCATTGGAGCGGTGAGTTTTTATGAAAGAGCCGAGGTTAAAGACGCTTTGGCGTTCATGCATTTAGTGGCTAAAAAAGACGATCGCTTTTTTATCAAGCGCGTTTTAAACAAGCCCCCAAGAGGCCTTGGCAAGATCACTCAAGAATGGATTTTTTCTCTTTTAGATGAAGAGGATTTGAATTTAGAAGAGGCGTTAAAACTTGGGGCGTTTAAAGACAAATTAAACCCTAAAAACGAATACGCTTTGAACAAATTTATCGCTATGATAGGGCGTTTGAGGGAGGCTTTTGAAATTTCAGTAGAGGAGTTTTGCGCTCGGTTTTTAGAAGAGACTAACCTTTTAAAAAGCTATGAAAAAGAAGACAATTACGAAGAAAGAGAGGGCTTTGTTAAAGAGCTTTTAAGTTTAGTGAAAGAGCATTTTAAAACTAACCCCACGCATTCTTTACTGGATTTTTTGAATGAAAGCGTTCTGGATGCCCATAATACAGAAAACGCGCAAAAAGTGAGTTGCATGAGCGTGCATATGAGTAAGGGGTTAGAGTTTAAGCATGTGTTTGTGATCGGGTTAGAAGAGGGGTTTTTCCCGCATAGGGGGTTCAATCAAGAAAGCGATTTAGAAGAAGAAAGGCGCTTGGCTTACGTAGCGATCACTAGGGCTAAAGAAGGATTGCAGCTCTCTTATGTGAAAGAGCGTTCGTATTTTGGGAGGAAAATTTCTTGCTCGCCCTCTGTGTTTTTAGAAGAAGCCAAGCTGCTCAATCAAGACAACCCCCCTAAACAGGATCACCAAAAAGACGCGCCCATTAAAGTGGGGGACTTGATTAAGCATAAGATTTTTGGCACCGGGAGGGTTTTAGGCGTAGAAAAAGGCTTGAGCGGTGTGTGCTTGAAAATCAATTGCGGAGGGAATGTCTATGATAAAATCTCAGAAAAATTTGTAGAAAAAGTGGATAACGAGTTTTGAAAATTTTAATCCTTTTTTTGATAAGTTTAAACGCGCTCTTCGCCCTAGATTTGAACGCGCTTAAAACAGAGATTAAAGAAACTTACCTTAAAGAATACAAAGACTTGAAATTAGAAATTGAAACCATTAATTTAGAAATCCCAGAGCGTTTTTCTCACGCTTCCATTTTAAGCTATGAATTGAGCGCTTCTAACAAGCTTAAAAAAGATGGGGTCGTGTTTTTAAGGTTGGAAAATGAGCCTAATTTACGCCTACCGGTGCGTTATAGCGTGATAGGCAGCATGCAGGCTTTTAAAAGCATAGAGGCGATTAAAAAAGACGAAAACATCACCGCTAACAACACTCAAAAAGAGCGCATTCCTTTTGGCGTGCTTTCTAACCCCTTATTAGAGGGTGCGATTGATAGAGTGAGCGCGAAAAATTTTATCCCCCCTGACACGCTTTTAAGCGTGGATAAAACCCAAGCTTTAATCATCGTGCGTAAAAACGACATTATCACTGGGGTGTATGAAGAGGGGCAAATCAGCATAGAAATAAGCCTAAAAGCCCTAGAAAATGGCGCGCTTAATCAAATCATTCAAGCCAAAAATTTAGAAAGCAATAAAATCTTAAAAGCAAAAGTGTTGAGCGGCTCTAAAGCGCAAATCTTATAAAGGATATTCATGAAATTAGTTTTAGGCATCAGCGGAGCGAGCGGGATACCCCTAGCCTTGCGGTTTTTAGAGAAATTACCTAAAGAAATTGAAGTTTTTGTCGTGGCGTCTAAAAACGCGCATGTCGTGGCGTTAGAAGAATCTAACATTAACCTTAAAAACGCCATGAAGGATTTACGGCCTAGTGGTACTTTTTTCAACGAGCAAGACATTCATGCGAGCATCGCTTCAGGGAGTTATGGTATCCATAAAATGGCGATCATTCCAGCGAGCATGGACATGGTGGCTAAAATCGCGCATGGCTTTGGAGGGGATTTGATTTCTAGGAGCGCGTCTGTGATGCTTAAAGAAAAGCGCCCCTTACTCATTGCCCCTAGAGAAATGCCTTTAAGCGCTATCATGTTGGAAAATTTGCTCAAACTCGCCCATTCTAATGCGATCATTGCGCCGCCGGTGATGACTTATTACACCCAGAGCAAGACTTTAGAAGCGATGCAAGATTTTTTAGTGGGGAAGTGGTTTGACAGCTTAGGGATAGAAAATGACTTATACCCACGATGGGGAATGAACTGATGCAAAAAATCGGCATTTACCCAGGCACTTTTGATCCGGTCACTAACGGGCATATAGACATTATCCATCGATCCAGCGAATTGTTTGAAAAGCTCATTGTCGCTGTGGCGCATTCAAGCGCTAAAAACCCCATGTTTAGTTTAGATGAGCGCTTAAAAATGATGCAACTCGCCACTAAAAGTTTTACAAATGTAGAATGCGTGGCGTTTGAAGGGCTGTTAGCCAACTTGGCTAAAGAGTATCATTGTAAGGTGTTAGTTAGGGGCTTAAGGGTGGTGAGCGATTTTGAATACGAATTGCAAATGGGTTATGCGAACAAATCCTTAAACCACGAATTAGAGACCTTGTATTTCATGCCCACTTTACAAAACGCTTTCATAAGCTCTTCTATCGTGCGATCCATTATCGCGCATAAGGGCGATGCGAGCCATTTAGTGCCTAAAGAAATTTATCCTTTTATTTCAAAGGCTTAAAATGTATGTGGTGTTAGAAGGCGTTGATGGCGCGGGCAAAAGCACTCAAATAGGATTATTAAAAGACCGGTTTAAAAACGCCCTTTTTACCAAAGAGCCAGGGGGGACGAGAATGGGCGAGAGTTTAAGGCGTATCGCTTTAAATGAAAACATCAGCGAATTAGCCCGAGCGTTTTTATTCTTAAGCGATAGGGCTGAGCATATAGAAAGCGTGATCAAACCGGCATTGAAAGAAAAAAGACTCATTATTAGTGATAGGAGTTTGATTTCTGGCATGGCTTATAGCGAGTTTTCAAGCTTAGAATTAAACCTGCTCGCTACTCAAAGCGTCTTGCCTGAAAAAATCATTCTTTTAGTGATAGACAAAGAGGGTTTAAAACAGCGCTTAAGCCTTAAAAGTTTAGACAAAATAGAAAACCAAGGCACAGAAAAATTGCTCACCATCCAGCAAAAGCTCAAAACCCACGCTTATGCGTTAAGAGAAAAATTCGGGTGCGAAGTTTTGGAATTAGACGCTCAAAAAAGCGCTAAAAACTTGCACGAAAAAATCGTAGCCTTTATTGAATGCGTTGTTTGACTTGTTTGAAGCTTTCTTTTAAGCCCCTTTGTCCAAATTGCTTGAACGATTTGCCCTTAAGCTTAAAAGTAAGGGTTTTAGAGGGCGTGAGCGTGTATAGTTTTTACGCTTATAGCGAAATAGAAGAGCTCATTAAAAGCAAATACGCGCTGATTGGCTCTCGCATTTTGCCCTTGCTTTCTCAAAAAGCCGGTGCGGAATTTGTGAAAATCCTGCAAGAACAAGGTTTGAATATTCCCTTTTATGGCATCGCCATTGATGATAAAATCAAATCCTTTTACTCGCATTCCGCCGCGCTTTTAAAAGGCTTTTGTCAAGGCAATTTAAAGCCCACTTATGGGACTTTAAGGGCTAATAATGCTGTTTCGTATGCCGGGAAAAGCCTGGAATTTCGCGCCAACAACCCACGGGATTTCACTTTCAAAGGCGATGAGAATTTAGATTATTTTTTATTAGATGACATTATCACCACCGGCACCACCCTAAAAGAAGCCCTAAAATACCTTAAAACCCTAAACATCAAAGCCCACTTTGCGATCGCGCTTTGCAGCGCGGATGAATGAGTTATAATTTTATTTTTAAAAAGGATAAAACCATGCAAGCTTTTCGGTTAGAAGATGATGTTGATGACTATGTTAAAAAAGAATTGATTAATTTAGGGCTTATGAAAAATAAGG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CAGGGAATTGAATAAGCTTTTTAACACTTACACCACCCCCTTATTGCGCTTAAAAGACAAAGACGATAAAATCCATACCACTTTCATCCAAACCGGCACAGCTACCGGGCGTTTAAGCTCGCATTCGCCTAATTTGCAAAATATCCCAGTGCGATCGCCTAAAGGCTTACTCATTCGTAAGGGCTTTATCGCTAGCTCTAAAGAATATTGTTTATTAGGAGTGGATTATTCGCAGATTGAATTGCGCTTATTAGCCCATTTCAGCCAGGATAAGGATTTAATGGAGGCGTTTTTAAAGGGGCGAGACATCCATTTAGAAACTTCTAAGGCGTTGTTTGGAGAAGATTTGGCTAAAGAAAAACGATCCATCGCTAAAAGCATTAATTTTGGGCTGGTGTATGGCATGGGGAGTAAGAAATTGAGCGAAACTTTAAACATTTCTTTAAATGAGGCTAAAAGCTACATAGAAGCGTATTTCAAGCGATTCCCTAGCATCAAAGATTATTTAAACCGCATGAAAGAAGAGATTTTAAAAACTTCTAAAGCCTTCACTTTGCTTGGGCGTTATCGGGTGTTTGATTTTACCGGCGCAAATGACTATATCAAGGGCAATTATTTGCGAGAGGGCGTGAATGCGATTTTTCAAGGGAGTGCCAGCGATTTATTGAAATTAGGCATGCTCAAAGTGAGCGAGCGTTTCAAAAATAACCCTTCGGTGAGGCTGCTTTTGCAAGTGCATGACGAATTGATTTTTGAAATTGAAGAAAAAAACGCATTAGAGTTGCAGCAAGAAATCCAACGCATTCTTAATAATGAAGTGTATCCTTTGAGGGTGCCACTAGAAACGAGCGCGTTTGTGGCGAATCGTTGGAATGAACTAAAAGGTTAG
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LS483488|58368:69256|63285_65325_+|SQJ01865.1|DBSCAN-SWA MQAFRLEDDVDDYVKKELINLGLMKNKDFNVKSQMSPSLKSALLNASKTKDKTSYGEPDFSLEKYTHPKNKGSVIPIIIENKLYAKNLKKLKNSTLANDDHSISKFAVNGALHYAQNILRDKEKYKECIAIGIAGDDEENLLIEVYYVFASGINSHKLTSAKNLHFLENQESFNAFYKECTLTEEEKHFILIKTKAELNETAKKLNRLMHNHNITAPQRVLYVSGMLLSMQEIKGKKGGLKPSDLKGEITDTSRDGVLVFNQISEFLKTKNLSEEKRELMLASFKEISKDPQRDKETSLDKAISMLLEKDSSITKQIFTFLYEFVHKPINESDNTGHLDIMGELYSEFLKYALGDGKELGIVLTPPYVTKMMSELLGVNAKSFVMDLAAGSAGFLISSMVLMIEDIEKTYGKNTTKANEKIKDAKTTQLLGVELNAEMFSLATTNMILRGDGSSLIIKGNTFETNKKIYEDFKPNILLLNPPFSYEENGMPFIKLGLEYMQKGALGAIIIQDSAGSGQALKSNVEILKKHSLLASVKMPTDLFMPQAGVQTSVYIFKAHEPHDYERPVKFIDFRNDGFKRTKRGLNETSNPTKRYEEIIKIYKAGLNAKVSKELWGDLETIYIEDFIAKPHENKHAKDFNFEAHQKNETKPELEDFKRTIADYLSYEVGLILKNQTPPK >LS483488|58368:69256|61639_62113_+|SQJ01829.1|DBSCAN-SWA MQKIGIYPGTFDPVTNGHIDIIHRSSELFEKLIVAVAHSSAKNPMFSLDERLKMMQLATKSFTNVECVAFEGLLANLAKEYHCKVLVRGLRVVSDFEYELQMGYANKSLNHELETLYFMPTLQNAFISSSIVRSIIAHKGDASHLVPKEIYPFISKA >LS483488|58368:69256|60410_61067_+|SQJ01823.1|DBSCAN-SWA MKILILFLISLNALFALDLNALKTEIKETYLKEYKDLKLEIETINLEIPERFSHASILSYELSASNKLKKDGVVFLRLENEPNLRLPVRYSVIGSMQAFKSIEAIKKDENITANNTQKERIPFGVLSNPLLEGAIDRVSAKNFIPPDTLLSVDKTQALIIVRKNDIITGVYEEGQISIEISLKALENGALNQIIQAKNLESNKILKAKVLSGSKAQIL >LS483488|58368:69256|62114_62690_+|SQJ01832.1|DBSCAN-SWA MYVVLEGVDGAGKSTQIGLLKDRFKNALFTKEPGGTRMGESLRRIALNENISELARAFLFLSDRAEHIESVIKPALKEKRLIISDRSLISGMAYSEFSSLELNLLATQSVLPEKIILLVIDKEGLKQRLSLKSLDKIENQGTEKLLTIQQKLKTHAYALREKFGCEVLELDAQKSAKNLHEKIVAFIECVV >LS483488|58368:69256|61076_61640_+|SQJ01826.1|DBSCAN-SWA MKLVLGISGASGIPLALRFLEKLPKEIEVFVVASKNAHVVALEESNINLKNAMKDLRPSGTFFNEQDIHASIASGSYGIHKMAIIPASMDMVAKIAHGFGGDLISRSASVMLKEKRPLLIAPREMPLSAIMLENLLKLAHSNAIIAPPVMTYYTQSKTLEAMQDFLVGKWFDSLGIENDLYPRWGMN >LS483488|58368:69256|65321_66515_+|SQJ01868.1|DBSCAN-SWA MIGPLNSQLNAIKWGEFRLGDLFEASNGDFDIQKRHINHKGEFVITAGLSNNGVLGQSDIKAKVFESHTITIDMFGCAFYRSFAYKMVTHARVFSLKPKFEISHKIGLFLSTLFFGYPKKFVYENMCSWAKIKNDKVILPLKPTANAQTLENIDFDFMEKFIAELEQCRLAELQAYLKATGLENTTLSSDEENALNVFNNSIGGNTPCGLTWQSFKIVDIFEVKNTRNILARDVVKDSGTTPYLCASKENNAVNSYINYNADFLDRGNCIFIGGKTFVVTYQQKDFYSNDSHNLALYLKDTHSKTKLNQLFIITCIYKALNNKYSWGDSISNAKIQNDSILLPTNQHGKIDFHFMRTLINALMKQTIQGVAQYCDAKIQATKEIIRQETPIQKDSLF >LS483488|58368:69256|58368_60414_+|SQJ01820.1|DBSCAN-SWA MGFEKSILDNLNGVQKIAASHIQGPLLILAGAGSGKTKTLTSRLAYLIGACGVPSENTLTLTFTNKASKEMQERALKLLKNQALIPPLLCTFHRFGLLFLRQHMSLLKRACDFSVLDSDEVKTLCKQLKISNFRANISQIKNGMMDLSVQDSECYKAYELYQNALKKDNLVDFDDLLCLSLKILQDNEKLAKETSERYHYIMVDEYQDTNALQLEFLKQLSCTHHNLCVVGDDDQSIYGFRGSDISNILNFSKHFKGAKIVKLETNYRSSAEILACANSLISHNQHRHIKTLQSFKGSHKSVICKEYLTQKEESLDVAYQIKALLKKGENLENIAILYRLNGLSRSIEESLNALNIPYRLIGAVSFYERAEVKDALAFMHLVAKKDDRFFIKRVLNKPPRGLGKITQEWIFSLLDEEDLNLEEALKLGAFKDKLNPKNEYALNKFIAMIGRLREAFEISVEEFCARFLEETNLLKSYEKEDNYEEREGFVKELLSLVKEHFKTNPTHSLLDFLNESVLDAHNTENAQKVSCMSVHMSKGLEFKHVFVIGLEEGFFPHRGFNQESDLEEERRLAYVAITRAKEGLQLSYVKERSYFGRKISCSPSVFLEEAKLLNQDNPPKQDHQKDAPIKVGDLIKHKIFGTGRVLGVEKGLSGVCLKINCGGNVYDKISEKFVEKVDNEF >LS483488|58368:69256|62677_63253_+|SQJ01862.1|DBSCAN-SWA MRCLTCLKLSFKPLCPNCLNDLPLSLKVRVLEGVSVYSFYAYSEIEELIKSKYALIGSRILPLLSQKAGAEFVKILQEQGLNIPFYGIAIDDKIKSFYSHSAALLKGFCQGNLKPTYGTLRANNAVSYAGKSLEFRANNPRDFTFKGDENLDYFLLDDIITTGTTLKEALKYLKTLNIKAHFAIALCSADE >LS483488|58368:69256|66580_69256_+|SQJ01871.1|DBSCAN-SWA MEQPVIREGTLALIDTFAYLFRSYYMSAKNKPLTNDKGFPTGLLTGLVGMVKKFYKDRKNMPFIVFALESQTKTKRAEKLGEYKQNRKDAPKEMLLQIPIALEWLQKMGFTCVEVNGFEADDVIATLATLSPYKTRIYSKDKDFNQLLSDKIALFDGKTEFLAKDCVEKYGILPSQFTDYQGIVGDSSDNYKGVKGIGSKNAKELLQRLGSLEKIYENLDLAKNLLSPKMYQALIQDKASAFLSKELATLERGCIKEFDFLSCAFPSENPLLKIKDELKEYGFISTLRDLENSPTPLILENTPALENASALDGAPKKSCLIVLESVALLSAFLEKLEKTNARIFARLVLNKEKKVLALAFLLQDQGYFLPLEEALFSPFSLEFLQNAFFKMLQHAQIIGHDLKPLLSFLKAKYQVSLENIRIQDTQILAFLKNPEKVGFDEVLKEYLKEELIPHEKIKDFKIKAEKLELLSVELSALKRLCEYFEKGGLEENLLILAREIETPFVKVLMDMEFQGFKIDAPYFKRLEQEFKDELKVLERQILDLIGVDFNLNSPKQLGEILYEKLELPKNKSHSTDEKSLLKILDKHPSIPLILEYRELNKLFNTYTTPLLRLKDKDDKIHTTFIQTGTATGRLSSHSPNLQNIPVRSPKGLLIRKGFIASSKEYCLLGVDYSQIELRLLAHFSQDKDLMEAFLKGRDIHLETSKALFGEDLAKEKRSIAKSINFGLVYGMGSKKLSETLNISLNEAKSYIEAYFKRFPSIKDYLNRMKEEILKTSKAFTLLGRYRVFDFTGANDYIKGNYLREGVNAIFQGSASDLLKLGMLKVSERFKNNPSVRLLLQVHDELIFEIEEKNALELQQEIQRILNNEVYPLRVPLETSAFVANRWNELKG |
9 | uncultured_Caudovirales_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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DBSCAN-SWA_2 |
90062 : 134881
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LS483488|90062:134881|DBSCAN-SWA 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44 | Catovirus(22.22%) | transposase,protease,integrase | attL 85463:85515|attR 133584:133636 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
371312 : 423865
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LS483488|371312:423865|DBSCAN-SWA 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57 | Helicobacter_phage(26.67%) | tRNA,transposase,protease,integrase | attL 367337:367353|attR 426789:426805 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1296684 : 1303879
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483488|1296684:1303879|DBSCAN-SWA CATGCAAACCTTGTTTAAAGAAATTACCCCTAAACGCTATGTCAATGGCAATGAGATGAAAGAAAATTCTAGCAATGTCCTAGATCAGTATTTCACTAAGCCTAGTGTGGCTTTAAAGTGCTTTCAAAAAGCTTGTGAAGTGATTAAAAAATACGAAAATCCAGATGGCTTTATTTTTTTAGAGCCAAGTGCAGGCGATGGGGTGTTTTATGACTTGTTTCCTAAAAATAGGCGCATTGGTATAGACATTGAACCCAAAAGAGATGGATTTATTCCATGCGATTTTGTGAATTACCCAACCGCTAAAGCGATTGGGCTTTTTCTTGCTTCATAGCTCCATAACTAGCTAGATCCAATATGTTTCCATATTTAGAACTAACCCCGTTAGAGGAAGCTCCACAAGCTTTGACACACTCATTAGTGTGATGAGTGTAATCGCTTCGGATAATCCCTACCCTAGCTTTATCTGTCTTTACTTTATGCCTATCATCTAGCATGCCTAAAGCGTAGTTTCTGATATTGACGCTCGCATTATAATCTCTGTGGTGTGTGGTTTTACAATGAGGACAAGTGAATTTAGTGATGCTTTCATGTTTTTTGCCTGTATTGACCCCACAATAAGAACATAATTGAGAGCTAGGGAAAAATCTGTCTATGCCTAATAGGGTTTTGCCTTTTCTTTGGGCTTTGTATTCCAACATAGTAAGGAATTTCCCCCAACTCGCATTAGCAAGGCTTTTAGAATGATAGGTTTTCATAAGAGCTTTAATATTCAAAGTTTCTACTCCTATCAAATCGTATTGATTGGTTATCTCATTACTGATTTTATGCAAGTAGTCATCTCTAGTGTTTGAACAAGCTAAATGCAATCTGGATACCTTTTTAGCTTGTTTTTTCCTGTTGTTGGAACCTTTTACTTTTTTACTTAACCTCCTTTGCGCTTTAGTGAGTTTCTTTTCTAATTTTTGATAAAAGCGAATGTGTGGGTATTCTATTTTATCGCTTGTAACAATGAGCGTTCTTAAGCCCATGTCTAAACCTACCGCTTTTTTGATAATGGTGGGGTTAGGGATAGGCTCTTTAGTTTCATAGGATAGAGAACAAAAATATTGATCCGCTATGCAAGAAATAAAAGCCTGTTTGATAACGCTATCTTTAGGCAAGTCTCTGTGTAATTTAGCCTTAATGCCCTCTTTGAATTTAGGGAGAGCGATGGTTTGAGTTTCTGTTTTGATTTCTATGTTTTGAGGGATTGCAAAAGATTGTTTAGCGTTTTTCTTGGATTTGAATTTAGGGTATCTCGCTCTTTTACTGAAGAAATTATCATAAGCGCTCACCAGCTGTCTTAACGCCATTTGCAAGCTTTGAGAATTGCATTCATTGAGATAATGGTATTTTTCTTGCCGCTTGATTTGGGTTAAGACTTTTTGCATGGTGAAGTAAGTTTCTTTAATGCCTTTTGCGTATTGCTTTTGCCGGTAATCTAAAAAGTAGTTATACACGACTCTAGAACAGCCAAAATGTTTAGAAATCAATTCTTTTTGTTGGGCGTTAGGATAAATTCTAAACTTGATAGCGTTAAGCAAAAATAACTCCTTATCTTTATCTTGTATTATTATACAATGTTTTTATAAATAATGAATAAGGATAGAGGAATGAGGAAAAACCATTATCCATTAAGGGGGTATATTCCAACCAACAGAAGTAAGCATAATCTAAAAGCCCATTTGATTTTAGTGTGTAAATACAGAAAAAAGTTATTGCAAGGGGATTTGAATAACTTTATTAAGTCTGTTATAGATGAGATAGCCACCCAAAGCAATCTCATTATCATTGCGATGGAAAGCGATATAGATCATTTGCACTTAATGGTTCAATATATCCCTAGAATGTCTATTAGTTCCATTATTGCTAAAATCAAACAAATCACTACTTATAGAGTTTGGCGCGATAAAAGATTTATCCCCTTATTGCAAAAACACTTTTGGAAAGAAAAAACTTTTTGGACTGATGGATTTTTTGCTTGCTCTATCGGTGAGGCTAACCCTGAAACGATCAAGGCGTATATAGAAAATCAAGGTTAGTTTTACTTAAGGTTTTTATAGTTCCTAGCGGAACTAAAGCATTCATCCCAAACACTAAAGATATTTGGGATTTCTGCTTGGGTGGTTTAAATTATAAACTGCCTACGCATCAAAAAGTGATTTGCTTGGGCAACCCTCCTTTTGGGCATCGTGGGGTTATGGCGTTAGAATTTATCAACCATGCTAAAAGTTGTGATTTTGTGTGTTTTATCCTACCCATGTTCTTTGAAAGTCAAGGAAAAGGCTCTATTAAATATCGTGTGAAAGGTTTGAATCTGCTTTATAGCGAACGCTTAGAAAAAAATGCGTTTATAGATTTTAAAAATAAAGAAGTGGATGTGCATTGCGTGTTCCAAATTTGGAGCAAGAAGTATCAAAACAAAAAAAGTGAATTTTCTTGGTATAAGAATCGCCATAAAGAACCCTTTGGCGAGTATATCAAGGTTTTCACGGTTTCATTAGCTAAAAACAGAGAATGCGGTAAAGAGTGGATTTTTAATCAAAAAGCGTCTTTTTACATTTCATCAACTTTTTATAAAAGCACACAAATTGTAGAGAACTTTGAGGAAGTTAAGTATCAATCTGGTATTGCTGTGGTATTTACTAGCACTAACAAGGCTTTAAACGCTAAATTAAAAAAACTATTCCAAGAAATTGATTGGACAAAATACGCAAGTTTAGCGACTAATTCTTGCTATCATTTAGGAAAAAGTCATATTTTTCAAGCCTTATATGATCATTTGGATAGCTTAAAGGATAATTGATGGACTTAGAACAAACTTTTTTGAAAATTATTGAAAAAAAACATAAAGAATTGAATTTAGGGCAAGACTACAACGCTATTTTTTCAAAAATTAGAGATTTTGAAGCCAACGCTATAGGGCAGATTGGCGAAGAGTTTTTAAAAAATGTGCTTAACGCTATAGATGAAGTGATCAATGATGGCATTATTCATGATGAATACGATATTATGACAAAAAGCGGTGTATCCTTTGAAGTTAAAACAGCACAAAAAGGCAGAACTAACAACACTTTTTTAGTTCAATGGTATAAACCCACGATACAACTATGATTTTTTGGTTTGCTTAGGAGTGTGCGAAGACAAATTGCTTTATAGAATTTTTAAAAAAGATGGAATCCATTACATTCATAAAGAAAGAAAATACTTTATGAAACAAAATGAGTTTAAAAAGCAACTAGTGCCAATGAATCCTGATAATCAAGTCAATTATAAACTCACTCTCAATATTAAAGAATTGAAAGAAATTACAAACCTCATCAAAGAGTTAAAAAGGGTTTTAGGGTTAGATTAATATTTTTAGATAGAATTGGGTGGAATAAAATGTTTTTAGGAATAGAGTTTGCTTATCTTGTCTTTAAGAAAGTCCAATGAAGTGGAGGATAAGATGTCTAAGATTTCAAATAATTATAACCCGTCTTTGATGGTAAGGGATTACCACAGGGTTGGTTCGCGCACAAGAAAAGAAGAAAATAAGGAAATTCAAAATCTTTCAGAGAATGATGAAAAAATCAAATTAGCCAAACAAGCTAAGCATGATAACCTAGCCATAGGGGATTTAGAAAGTCGCCTTAAAAGCTTAAAAGGCATGGATAAAGACGCTAAAGAATTGGTGGGGATTTCTAAAGCTTACGCTCACAATAATGAAAAAGATCGAAGCGATTTTGAGCATTTTAAAAGCCGTTTGGACAAAGCGATTGATTCTTTCAACCAAAAATCAGGCAATGATAGTTTGAAACTCCCTGGCAATATTGACATTGACGACACGAAGGCTTTGGAAAAATTTTCAAAATCATTAGAAAGTGAGAAAGAAAACATTCAAAACTCTTTGCACCAGTGGAAAAAACAGCTCGCTGAAACGAATCATTTAAACAAGGAATACAACACCTTAGATAAAACAAGACTGAACGCTCAAAAATTCCAAGATGTCCATGACACAAGCAAGATCACCCCATCTCGCTTGCAAGACTTGCTCGCTTGAAAGAGTTTGCTTATAGCGAGCCTTGTTTAGACGAAGAAGATAAAAAGGCTGTTTTAGAGGTTTTAAATTCCAAACAGCTCACGCAAGGCAAACGCTCTCTTTTGTTTGAAGAAGCTTTGTGCGAGTTTCTGGGCGTTAAGCATGCGTTAGTGTTTAACAGCGCGACTTCAGCCCTTTTAACGCTCTATAGGAATTTTAGCGATTTTGACGCTGATTGTAATGAAATAATCACCACCCCTATAAGCTTTGTAGCGACGGCTAACATGCTTTTAGAAAGCAGTTACAAACCCGTATTTGCTGAAGTCAAAAACGATGGCAATATAGATGAATTAGCCCTAGAAAAGCTCATTACTAAAAAAACCAAAGCCATAGTGAGCGTGGATTATGCCGGTAAAAGCGTGGAAGTAGGAAGCATTCAAAAGCTTTGCAAAAAACATTCTTTGAGTTTTCTTTCTGACAGCTCGCATGCTTTAGGGAGCGAGTATCAAAACAAAAAAGTAGGAGGCTTTGCGTTAGCGAGCGTGTTTAGTTTCCATGCCATTAAGCCTATCACTACGGCTGAAGGGGGAGCGGTCGTTACTAATAATAGCGAATTGTATGAAAAAATGAAATTGTTTCGCTCTCATGGCATGCTCAAAAAAGATTTTTTTGAAGGCGAAGTCAAAAGCATAGGGCATAACTTCCGCTTGAATGAAATCCAAAGCGCTTTGGGTTTGAGCCAGCTTAAAAAAGCCCCCTTTTTAATGCAAAAAAGAGAAGAAGCCGCTCTAACCTATGACAGGATTTTTAAAGATAACCCTTATTTCACCCCTTTACACCCCTTGTTAAAAGATAAAAGCTCTAACCACCTTTACCCTATTTTAATGCACCAAAAATTTTTTGCATGCAAAAAACTCATTTTAGAAAATTTGCACAAGCGTGGCATTTTAGCCCAAGTGCATTACAAGCCCATTTACCAATACCAATTGTACCAACAGCTCTTCAATACAGCCCCATTAAAAAGCGCAGAAGATTTTTATAACGCTGAAATTTCCTTGCCTTGTCATGCGAATTTAAATTTAGAGAGCGTTCAAAACATCGCTCATGGCGTTTTAAAAACTTTTGAGAATCTTAAGATAGAATGAGTTTCATTTATAGGGCTTCAAATTTTAATCATTAAGAATGGTGCGGAAGAAAGGAATCGAACCTTCATGCCTTGCGGCGCTAGATCCTAAGTCTAGTGCGTCTACCAATTTCGCCACTTCCGCACACCGCACGCCATCGCATGCATTAAGAAGTAGAAAATAAAGAAGCAGTATTTTAGCTGTTTAATCCTTTAAAAATACTGAAAAATTGAAGTTTTTTAAAATTTGGAGTTTTTTCTGGCTTTTAGGGGGTTTTAAATTCTTTTAAGGTATTCTAACAAGACTATATCATTGAGATAGTTTTAAGGAAATTAAGGAACAAAATGGAAGTTTCACGCAAGAAAATTTACAACCCCAATTCTACAGAAAGTGTGAATGAAAGAAAGATTTTTGGGGGTAATCCTACAAGCATGTTTGATTTGAATAAGATCAAGTATCAATGGGCGGATCATTTGTGGAAAACGATGCTCGCTAACACTTGGTTTGCTGAAGAAGTGAGCATGAATGATGACAAAAGGGATTATTTGAAATTGAGTGCAGAAGAAAAGATCGGCTATGACAGAGCTTTAGCGCAACTCATTTTTATGGACAGCTTGCAAACGAATAATTTAATTGACAATATCAATCCCTTCATCACCAGCCCCGAAATCAATTTGTGTTTGGTGCGTCAAGCTTATGAAGAAGCCTTACACAGCCATGCGTATGCGGTGATGGTAGAAAGCATTAGCGCGAATACTGAAGAGATTTATGACATGTGGCGTAACGATATGCAATTAAAAAGCAAGAATGACTATATCGCGCAAGTGTATATGGAATTAGCCAAAAACCCCACAGAAGAAAACATTCTCAAAGCGCTTTTTGCGAACCAGATTTTAGAGGGGATTTATTTTTATAGCGGGTTTAGCTATTTTTACACTTTGGCTAGGAGCGGTAAAATGCTAGGATCAGCGCAAATGATTCGTTTTATCCAAAGAGATGAGGTAACGCATTTGATTTTATTCCAAAACATGATCAACGCTTTAAGGAATGAAAGAGCGGATCTCTTCACGCCGCAATTGATTAATGAAGTCATAGGAATGTTTAAAAAAGCGGTAGAAATTGAAGCTTTGTGGGGGGATTATATCACGCAAGGCAAGATTTTAGGGCTCACTTCCAGCTTGATTGAGCAATACATCCAGTTTTTAGCGGATAGCCGTTTGAGTAAGGTGGGTATCGCTAAAGTTTATGGCGTCCAACACCCCATTAAATGGGTAGAGAGCTTTTCAAGTTTCAATGAGCAACGCTCTAATTTCTTTGAAGCTAGGGTGAGTAATTACGCTAAAGGGAGCGTGAGTTTTGATGATTTTTAAGGGGCTTGTTTGAATAGTATTAAAAACCATTTGATGTGTGAAGAAATCCATAAGCGTTTCAATTTGCACCCCAAAGTGAGAAAGGCTATGGAGAGCATTGAAAGAGAAGTTTTTGTGCCAGCCCCCTTCAAGCATTTTGCCTACACTTTAAACGCGCTTTCTATGCAAGCGCAACAATACATTTCTTCGCCCCTGACCGTGGCCAAAATGACGCAATATTTAGAAATTGATCATGTGGATAGCGTGCTAGAAATTGGCTGCGGGAGCGGCTATCAAGCGGCGGTTTTGTCTCAAATTTTCAGGCGCGTTTTTAGCATTGAAAGGATTGAAAGCCTGTATATAGAAGCGCGTTTGCGCCTTAAAACTCTCGGTTTAGACAACATTCATGTTAAATTCGCTGATGGGAATAAGGGCTGGGATCAATACGCCCCCTATGATAGGATTTTATTCTCTGCTTGTGCTAAAAATATCCCTCAAGCGCTGATTGATCAGCTTGAAGAAGGCGGGATATTAGTCGCGCCCATTCAAGAAAACAACGAGCAAGTCATCAAACGCTTTGTGAAGCAAAATAACGCCTTGCGCGTCCAAAAAGTGTTAGAAAAATGCTCGTTTGTGCCTGTTGTAGATGGGGTGCAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LS483488|1296684:1303879|1300128_1300767_+|SQJ09561.1|DBSCAN-SWA MLILSLRKSNEVEDKMSKISNNYNPSLMVRDYHRVGSRTRKEENKEIQNLSENDEKIKLAKQAKHDNLAIGDLESRLKSLKGMDKDAKELVGISKAYAHNNEKDRSDFEHFKSRLDKAIDSFNQKSGNDSLKLPGNIDIDDTKALEKFSKSLESEKENIQNSLHQWKKQLAETNHLNKEYNTLDKTRLNAQKFQDVHDTSKITPSRLQDLLA >LS483488|1296684:1303879|1298338_1298767_+|SQJ09557.1|transposase|DBSCAN-SWA MRKNHYPLRGYIPTNRSKHNLKAHLILVCKYRKKLLQGDLNNFIKSVIDEIATQSNLIIIAMESDIDHLHLMVQYIPRMSISSIIAKIKQITTYRVWRDKRFIPLLQKHFWKEKTFWTDGFFACSIGEANPETIKAYIENQG >LS483488|1296684:1303879|1296985_1298269_-|SQJ09556.1|transposase|DBSCAN-SWA MLNAIKFRIYPNAQQKELISKHFGCSRVVYNYFLDYRQKQYAKGIKETYFTMQKVLTQIKRQEKYHYLNECNSQSLQMALRQLVSAYDNFFSKRARYPKFKSKKNAKQSFAIPQNIEIKTETQTIALPKFKEGIKAKLHRDLPKDSVIKQAFISCIADQYFCSLSYETKEPIPNPTIIKKAVGLDMGLRTLIVTSDKIEYPHIRFYQKLEKKLTKAQRRLSKKVKGSNNRKKQAKKVSRLHLACSNTRDDYLHKISNEITNQYDLIGVETLNIKALMKTYHSKSLANASWGKFLTMLEYKAQRKGKTLLGIDRFFPSSQLCSYCGVNTGKKHESITKFTCPHCKTTHHRDYNASVNIRNYALGMLDDRHKVKTDKARVGIIRSDYTHHTNECVKACGASSNGVSSKYGNILDLASYGAMKQEKAQSL >LS483488|1296684:1303879|1299530_1299839_+|SQJ09559.1|DBSCAN-SWA MDLEQTFLKIIEKKHKELNLGQDYNAIFSKIRDFEANAIGQIGEEFLKNVLNAIDEVINDGIIHDEYDIMTKSGVSFEVKTAQKGRTNNTFLVQWYKPTIQL >LS483488|1296684:1303879|1298844_1299531_+|SQJ09558.1|DBSCAN-SWA MGGLNYKLPTHQKVICLGNPPFGHRGVMALEFINHAKSCDFVCFILPMFFESQGKGSIKYRVKGLNLLYSERLEKNAFIDFKNKEVDVHCVFQIWSKKYQNKKSEFSWYKNRHKEPFGEYIKVFTVSLAKNRECGKEWIFNQKASFYISSTFYKSTQIVENFEEVKYQSGIAVVFTSTNKALNAKLKKLFQEIDWTKYASLATNSCYHLGKSHIFQALYDHLDSLKDN >LS483488|1296684:1303879|1300763_1301891_+|SQJ09562.1|coat|DBSCAN-SWA MKEFAYSEPCLDEEDKKAVLEVLNSKQLTQGKRSLLFEEALCEFLGVKHALVFNSATSALLTLYRNFSDFDADCNEIITTPISFVATANMLLESSYKPVFAEVKNDGNIDELALEKLITKKTKAIVSVDYAGKSVEVGSIQKLCKKHSLSFLSDSSHALGSEYQNKKVGGFALASVFSFHAIKPITTAEGGAVVTNNSELYEKMKLFRSHGMLKKDFFEGEVKSIGHNFRLNEIQSALGLSQLKKAPFLMQKREEAALTYDRIFKDNPYFTPLHPLLKDKSSNHLYPILMHQKFFACKKLILENLHKRGILAQVHYKPIYQYQLYQQLFNTAPLKSAEDFYNAEISLPCHANLNLESVQNIAHGVLKTFENLKIE >LS483488|1296684:1303879|1303249_1303879_+|SQJ09564.1|DBSCAN-SWA MNSIKNHLMCEEIHKRFNLHPKVRKAMESIEREVFVPAPFKHFAYTLNALSMQAQQYISSPLTVAKMTQYLEIDHVDSVLEIGCGSGYQAAVLSQIFRRVFSIERIESLYIEARLRLKTLGLDNIHVKFADGNKGWDQYAPYDRILFSACAKNIPQALIDQLEEGGILVAPIQENNEQVIKRFVKQNNALRVQKVLEKCSFVPVVDGVQ >LS483488|1296684:1303879|1296684_1297017_+|SQJ09555.1|DBSCAN-SWA MQTLFKEITPKRYVNGNEMKENSSNVLDQYFTKPSVALKCFQKACEVIKKYENPDGFIFLEPSAGDGVFYDLFPKNRRIGIDIEPKRDGFIPCDFVNYPTAKAIGLFLAS >LS483488|1296684:1303879|1299843_1300080_+|SQJ09560.1|DBSCAN-SWA MVCLGVCEDKLLYRIFKKDGIHYIHKERKYFMKQNEFKKQLVPMNPDNQVNYKLTLNIKELKEITNLIKELKRVLGLD >LS483488|1296684:1303879|1302214_1303240_+|SQJ09563.1|DBSCAN-SWA MEVSRKKIYNPNSTESVNERKIFGGNPTSMFDLNKIKYQWADHLWKTMLANTWFAEEVSMNDDKRDYLKLSAEEKIGYDRALAQLIFMDSLQTNNLIDNINPFITSPEINLCLVRQAYEEALHSHAYAVMVESISANTEEIYDMWRNDMQLKSKNDYIAQVYMELAKNPTEENILKALFANQILEGIYFYSGFSYFYTLARSGKMLGSAQMIRFIQRDEVTHLILFQNMINALRNERADLFTPQLINEVIGMFKKAVEIEALWGDYITQGKILGLTSSLIEQYIQFLADSRLSKVGIAKVYGVQHPIKWVESFSSFNEQRSNFFEARVSNYAKGSVSFDDF |
10 | Aureococcus_anophage(28.57%) | coat,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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