Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134086 | Staphylococcus aureus strain NCTC13142 genome assembly, chromosome: 1 | 6 crisprs | cas3,DEDDh,RT,DinG,csa3,WYL | 3 | 0 | 19 | 1 |
1. LR134086
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134086_1 | 639332-639419 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134086_1
|
1 spacers
spacers of LR134086_1
>1.1|639362|28|LR134086|CRISPRCasFinder GGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134086_1
The CRISPR arrays of LR134086_1 >merge|LR134086|1|639332-639419|CRISPRCasFinder AAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCAAAAAGAAATTCTACAGGCAATGTAAGTTGG >LR134086|1|1|639332-639419|CRISPRCasFinder AAAAGAAATTCTACAGGCAATGCAAGTTGG GGTGTGGGCCCCAACACAGAGAATTTCA AAAAGAAATTCTACAGGCAATGTAAGTTGG
>LR134086.1|VDZ16598.1|638241_639180_+|Oxidoreductase-ion-channel MKQFVNLGKSDVEVFPIALGTNAVGGHNLYPNLDEEQGKDVVRQAINHGINLLDTAYIYGPERSEELVGEVVKEYPREQIKIATKGSHEFDENQEVHQNNQPEYLKQQVENSLKRLQTDYIDLYYIHFPDDNTPKDQAVAALQELKEQGKIKAIGVSNFTLDQLKEANKDGYVDVVQLEYNLLHRENEAVLQYCVDHQITFIPYFPLASGILAGKYDENTKFSDHRTTRRDFKPGVFEENVRRVKALESIAAAHQTSIANIVLAFYLTRPAIDVIIPGAKLAEQVVENIKAADIVLSDDEIQYIDELFPIED >LR134086.1|VDZ16597.1|637161_637794_+|Putative-membrane-spanning-protein MLCEVIAIYKNPKYRIIKYNDEYLMVNIINNWLVLFIPLLNWLTPKRYIKISQEELESLNTFKPAKNNAFWPALGSSVLFSVTFRKYMPLFNVRLEKTIVIAIFFVVFLGILFFYLNLNRRLALSVFTMNKEKSQKMILLPNLKHFFFIIFAYLYFGGFSFFTLYALITIDVQNIIIFICWGAVTMFFFFINIVPIGIKKAHVILLKKAE >LR134086.1|VDZ16596.1|636401_637022_+|membrane-spanning-protein MLCESKIINKNPKYRIIKYNDEYLMIDIISTWISLFFPFINWFITKRYVKISREEFENLNIVKPAKKNVFWPVAGSSALLGVALRKYTHLLDVQLDKKLVIAICCITFIGILIFYVRLIKKSSLNIYNTKNKRSKIFLIPTLKNVCFTLFGYILFGGLTMLFLDALLSMSYQNIIVYFAWITAIMGFFLVNIALIIDKNIHVILKN >LR134086.1|VDZ16595.1|635722_636355_+|Putative-membrane-spanning-protein MLCESKVINKNPKYRIIKYESEYLMIDLASNWIVFFFPFINWLIPKTYVKITKNDYEKLNIVKPVKNKSIGWTIFAGIVLLGGTVRRNTYLFDFQLEKLIVWSSCFISFLGVIFFYCYLNKKLTLNVYKENKNNELKLRLLPSFKNMCFTIFYYLFTGFMSYGAFYLLVFENVQNLILYISWLFMTMLFMLMNMHSIIDKKVHIFLKSNK >LR134086.1|VDZ16594.1|634324_635719_+|Phage-protein MSIDMYLDRSRNQASSVGNLSQTMNSNYDALEKAITQFINDDALKGKAYTSAKQFFSTVLIPLSTSMKTLSDLTKQACDNFVSRYTSEVDSISLKESELEEDIRSLSQQITRYENLTNNLKKHASDNQQAISSNQQIIQTLGQQKHELEEKLRKLREFNQKSPEIFKEVEEFQKIVQQGLTQAQNFWNFSTNQFNIPSGKELDWAKASHEKYLKVAMGKIEHKAEKETLNKADFAVIKAYAKEHPEDDIPKSIMKYINDNKDSIKRDIGLDITSTLLEQGGINASKFGVFINTAGGVKGPAGPNSFVEVKRTSGNVFIENGSKFAKGGKYLGKGVAGVGFGIGMYDDLANDDKTFGEALSHNGMTLAAGSVAAFGVAALVSNPVGWAVVGILTAGIIGSIVSDYLYQNNYFGIKDKVDWAGHKIDEGIDAVNKTAEKAVDSVGNTIGDATKSISNHINPMKWSW >LR134086.1|VDZ16593.1|633260_633701_-|DNA-binding-protein MNLEFNIAVHVLAFLTKHHSEKFNSSSLAELTCLNPVQLRRVTTQLVDLKMINTIRGKDGGYLANDQSADVSLATLYKHFVLEKKHHTRLFTGDEGSHCQIARNIATTMSHYQQDEQNIIINFYNGKTIKDVIEDIQKEDLCHENI >LR134086.1|VDZ16592.1|631951_633274_-|putative-dehydrogenase,-Mercuric-ion-reductase-like-protein MKTYDLIVIGFGKAGKTLAKYAASTGQHVAVIEQSSKMYGGTCINIGCIPSKTLVHDGLEGKSFEASYNRKNDVVNALNNKNYHLLADDNNIDVLDFKAQFKSNTEVNLLDQHGDIADSITAPHIIINTGATSVIPNIKDLDQAKHVFDSTGLLNINYQPKHLVIVGGGYIALEFASMFANLGSKVTVLERGESFMPREDQDVVAHAITDLENKGIALHTNVETTELSSDDHHTTVRTNVGNFEADAVLLAIGRKPNTDLALENTDIELGDRGEIKVNAHLQTTVPHIYAAGDVKGGLQFTYISLDDYRIIKSALYGNQSRTTDNRGSVPYTVFIDPPLSRVGLTSKEAAAQHYDYTEHQLLVSAIPRHKINNDPRGLFKVVINNENNMILGATLYGKQSEELINIIKLAIDQNIPYTVLRDNIYTHPTMAESFNDLFNF >LR134086.1|VDZ16591.1|631558_631900_+|Putative-cytosolic-protein MKNTFLICDECQAVNIRTLQKKLEKLDPDAEIVIGCQSYCGPGRRKTFTFVNNRPLAALTEEELIEKVSQQLKKPRDSEEEERLRKRHEERKRRKEEQDRKLKEKLEKRKAQQ >LR134086.1|VDZ16590.1|630305_631382_+|Phosphomevalonate-kinase MIQVKAPGKLYIAGEYAVTEPGYKSVLIALDRFVTATIEEADQYKGTIHSKALHHNPVTFSRDEDSIVISDPHAAKQLNYVVTAIEIFEQYAKSCDIAMKHFHLTIDSNLDDSNGHKYGLGSSAAVLVSVIKVLNEFYDMKLSNLYIYKLAVIANMKLQSLSSCGDIAVSVYSGWLAYSTFDHEWVKHQIEDTTVEEVLIKNWPGLHIEPLQAPENMEVLIGWTGSPASSPHFVSEVKRLKSDPSFYGDFLEDSHRCVEKLIHAFKTNNIKGVQKMVRQNRTIIQRMDKEATVDIETEKLKYLCDIAEKYHGASKTSGAGGGDCGITIINKDVDKEKIYDEWTKHGIKPLKFNIYHGQ >LR134086.1|VDZ16589.1|629309_630293_+|Diphosphomevalonate-decarboxylase MIKSGKARAHTNIALIKYWGKKDEALIIPMNNSISVTLEKFYTETKVTFNDQLTQDQFWLNGEKVSGKELEKISKYMDIVRNRAGIDWYAEIESDNFVPTAAGLASSASAYAALAAACNQALDMQLSDKDLSRLARIGSGSASRSIYGGFAEWEKGYSDETSYAVPLESNHFEDDLAMIFVVINQHSKKVPSRYGMSLTRNTSRFYQYWLDHIDEDLAEAKAAIQDKDFKRLGEVIEENGLRMHATNLGSTPPFTYLVQESYDVMALVHECREAGYPCYFTMDAGPNVKILVEKKNKQQIIDKLLTQFDNNQIIDSDIIATGIEIIE >LR134086.1|VDZ16599.1|639677_640214_+|putative-NAD(P)H-dependent-FMN-containing-oxidoreductase-ywqN MITVLFGGSRPNGNTAQLTKFALQDLEYQWIDVTQHQFKPIRDVRHTAETITSYDDDYLPILDKILASDTIIFASPVYWYSISAPLKAFIEHWSETLQDKRYPNFKAQMAEKDFRVILVGGDCPKIKAKPAITQMKYSLDFLGATLNGYIIGTAEKPGDIMKDNYALARATEWNSILQ >LR134086.1|VDZ16600.1|640382_640859_+|acetyltransferase MFKVRQATEKDVVQIRDVATKAWFNTYLNIYAATTVNHLLEASYNEHHLKKRLQEQLFLVVEEGNDIVGFANFIYGEELYLSAHYVKPESQHTGYGTALLNEGLSRFEDKFEGVYLEVDNKNEEAVAYYKEQGFTILRSYEPEMYGEKLDLALMYKAF >LR134086.1|VDZ16601.1|640898_642194_+|Deoxyguanosinetriphosphate-triphosphohydrolase MTNAYVDLKLVEEKVFKDPIHRYIHVEDQLIWDLIKTKEFQRLRRIRQLGTLYLSFHTAEHSRFGHSLGVYEIVRRLIDESFIGHDAWDNKDRPLALCAALLHDLGHGPFSHSFEKIFNTDHEAYTQAIITGDTEVNAVLRKVAPEFPREVAEVINKTHHNKLVISMISSQIDADRMDYLQRDAYFTGVSYGAFDMERILRLMRPSKDEVLIKESGMHAVENFIMSRYQMYWQIYFHPVSRGGEVLLNNCLKRAKQLYNEGYEFKLHPHDFIPFFEETVTIEQYVELDEAVVTYYLEKWTKEDDAILSDLASRFINRDLFKYIPFDGSIITISELQELFEAGGINPDYYFVSEAFSDLPYDYDRPGSNRKPIHLLRQDGTIREISNQSLVIHSITGINRQDYKLYYPREMVAKIKDKTIREAIENLINELN >LR134086.1|VDZ16602.1|642236_642743_+|Putative-cytosolic-protein MSEKKGFNFNIIKNDPLDGHKGTNIGSISLDNIAPVFIDVANKEAFIDIGGMHARAKVEKGVKWITDKAAVEGDEAKEYWLCWVTTERNEQGPYYAGLTACYLLVNKAIRRGYKSMPEHVNMMDKSMKHHIIIDQIGDENKAILKDFLMNHDEGMWKHSSDALHQAFN >LR134086.1|VDZ16603.1|643241_644252_+|Alcohol-dehydrogenase MRAAVVTKDHKVSIEDKKIRALKPGEALVQTEYCGVCHTDLHVKNADFGDVTGVTLGHEGIGKVIEVAEDVESLKIGDRVSIAWMFESCGRCEYCTTGRETLCRSVKNAGYTVDGAMAEQVIVTADYAVKVPEKLDPAAASSITCAGVTTYKAVKVSNVKPGQWLGVFGIGGLGNLALQYAKNVMGAKIVAFDINDDKLAFAKELGADAIINSKDVDPVAEVMKLTDNKGLDATVVTSVAKTPFNQAVDVVKAGARVVAVGLPVDKMNLDIPRLVLDGIEVVGSLVGTRQDLREAFEFAAENKVTPKVQLRKLEEINDIFEEMENGTITGRMVIKF >LR134086.1|VDZ16604.1|644328_644436_+|Uncharacterised-protein MKDSENLVFFGFEVLFVFYKMAYIYEALIKYGIVN >LR134086.1|VDZ16605.1|644528_644945_+|Uncharacterized-beta-barrel-protein-ywiB MDKKVSIQTKQVLKQHNEKEKFEFTTEGTWQQRQSNFIRYVEQIEDATVNVTIKVDDDSVKLIRKGDINMNLHFVEGQTTTTFYDISAGRIPLEVKTLRILHFVSGDGGKLKIHYELYQDNEKMGSYQYEINYKEIGE >LR134086.1|VDZ16606.1|644941_646603_+|Arginyl-tRNA-synthetase MNIIDQVKQTLVEEIAASINKAGLADEIPDIKIEVPKDTKNGDYATNIAMVLTKIAKRNPREIAQAIVDNLDTEKAHVKQIDIAGPGFINFYLDNQYLTAIIPEAIEKGDQFGHVNESKGQNVLLEYVSANPTGDLHIGHARNAAVGDALANILTAAGYNVTREYYINDAGNQITNLARSIETRFFEALGDNSYSMPEDGYNGKDIIEIGKDLAEKHPEIKDYSEEARLKEFRKLGVEYEMAKLKNDLAEFNTHFDNWFSETSLYEKGEILEVLAKMKELGYTYEADGATWLRTTDFKDDKDRVLIKNDGTYTYFLPDIAYHFDKVKRGNDILIDLFGADHHGYINRLKASLETFGVDSNRLEIQIMQMVRLMENGKEVKMSKRTGNAITLREIMDEVGVDAARYFLTMRSPDSHFDFDMELAKEQSQDNPVYYAQYAHARICSILKQAKEQGIEVTAANDFTTITNEKAIELLKKVADFEPTIESAAEHRSAHRITNYIQDLASHFHKFYNAEKVLTDDIEKTKAHVAMIEAVRITLKNALAMVGVSAPESM >LR134086.1|VDZ16607.1|646936_647572_+|endonuclease-III-domain-protein MLGTDELYKLLYRHMGPQNWWPADNDIEMMLGAILVQNTRWRNAEIALNQIKEHTHFNPNHILELSIETLQSLIHSSGFYKSKSLTIKTLLTWLARHHFNYQEINERYKGELRKELLSLKGIGSETADVLLVYIFGRIVFIPDSYTRKIYDKLGYENTKSYDQLKKVVTLPNHFTNQDANEFHALLDVFGKHYFRDKDIKNYDFLEPYFKK >LR134086.1|VDZ16608.1|647944_648832_+|Periplasmic-binding-protein MKKSLIAFILIFMLVLSGCGMKDNHKQGSDDNGSSKSPYHRIVSLMPSNTEILYELGLGKYIVGVSTVDDYPKDVKKGKKQFDALNLNKEELLKAKPDLILAHESQKATANKVLSSLEKQGIKVVYVKDAQSIDETYNTFKQIGKLTHHDKQAEQLVEETKDNIDKVIDSIPAHHKKSKVFIEVSSKPEIYTAGKHTFFNDMLEKLEAQNVYSDINGWNPVTKESIIKKNPDILISTEAKTRSDYMDIIKKRGGFNKINAVKNTRIEVVNGDEVSRPGPRIDEGLKELRDAIYRK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134086_3 | 1989503-1989592 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134086_3
|
1 spacers
spacers of LR134086_3
>3.1|1989535|26|LR134086|CRISPRCasFinder CGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACA |
DEDDh |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134086_3
The CRISPR arrays of LR134086_3 >merge|LR134086|3|1989503-1989592|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTT >LR134086|3|3|1989503-1989592|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTT CGAAATTCTCTGTGTTGGGGCCCACA CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAATTTCTTTT
>LR134086.1|VDZ17893.1|1988611_1989370_-|Methionine-aminopeptidase MIVKTEEELQALKEIGYICAKVRNTMQAATKPGITTKELDNIAKELFEEYGAISAPIHDENFPGQTCISVNEEVAHGIPSKRVIREGDLVNIDVSALKNGYYADTGISFVVGESDDPMKQKVCDVATMAFENAIAKVKPGTKLSNIGKAVHNTARQNDLKVIKNLTGHGVGLSLHEAPAHVLNYFDPKDKTLLTEGMVLAIEPFISSNASFVTEGKNEWAFETSDKSFVAQIEHTVIVTKDGPILTTKIEEE >LR134086.1|VDZ17892.1|1988008_1988395_-|putative-staphylococcal-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA >LR134086.1|VDZ17891.1|1987292_1987994_-|Transporter-yvqF MTHKYISTQMLIIFTALMIIANFYYIFFEKIGFLLVLLLGCVLVYVGYLYFHKIRGLLAFWIGALLIAFTLLSNKYTIIILFVFLLLLIVRYLIHKFKPKKVVATDEVMTSPSFIKQKWFGEQRTPVYVYKWEDVQIQHGIGDLHIDLTKAANIKENNTIVVRHILGKVQVILPVNYNINLHVAAFYGSTYVNEKSYKVENNNIHIEEMMKPDNYTVNIYVSTFIGDVEVIYR >LR134086.1|VDZ17890.1|1986252_1987296_-|Sensor-histidine-kinase-VraS MNHYIRTIGSMLILVYSMLAAFLFIDKVFVNIIYFQGMFYTQIFGIPVFLFLNLIIILLCIIVGSVLAYKINQQNDWIKTQIERSMEGETVGINDQNIEIYSETLDLYHTLVPLNQELHKLRLKTQNLTNENYNINDVKVKKIIEDERQRLARELHDSVSQQLFAASMMLSAIKETKLEPPLDQQIPILEKMVQDSQLEMRALLLHLRPLGLKDKSLGEGIKDLVIDLQKKVPMKVVHEIQDFKVPKGIEDHLFRITQEAISNTLRHSNGTKVTVELFNKDDYLLLRIQDNGKGFNVDEKLEQSYGLKNMRERALEIGATFHIVSLPDSGTRIEVKAPLNKEDSYDD >LR134086.1|VDZ17889.1|1985633_1986263_-|Two-component-transcriptional-regulator-VraR,-LuxR-family MTIKVLFVDDHEMVRIGISSYLSTQSDIEVVGEGASGKEAIAKAHELKPDLILMDLLMEDMDGVEATTQIKKDLPQIKVLMLTSFIEDKEVYRALDAGVDSYILKTTSAKDIADAVRKTSRGESVFEPEVLVKMRNRMKKRAELYEMLTEREMEILLLIAKGYSNQEIASASHITIKTVKTHVSNILSKLEVQDRTQAVIYAFQHNLIQ >LR134086.1|VDZ17888.1|1984303_1985521_+|ribonuclease-BN MSKKDHSSSKYLNSVKEAQEESKKKNKSNPKIDVDRTYIEPQQFQSKKPKKDDQVFFLSRLNKPAKYKKDSNFLSYLIYRIGKDDASGLAAQMTYHFVLAMFPMLLFLLTLLPFFNIKQSQITNMLSNAPAETSTLIKSVIGDITQNSSGGLLSIGLILAIWSASNGMTAIMNSFNVAYDVEDSRNGIVLKLLSVVFTVVMGVVFVVALALPTLGSVISHFLFGPLGFDEQVKWIFNLIRIVLPIIIIFIIFIVLYSVAPNVKTKLKSVLPGAVFTSIIWLAGSFGFGWYISNFGNYSKTYGSIAGIIILLLWLYITSFIIIVGAEINAIIHQRSVIKGKTPEEAALEHDDNNKNHYNENTRYEYDEDSNATHQRTYHVDEHPSDTYPEDDKNIKDKIVDKLKKD >LR134086.1|VDZ17887.1|1983750_1984026_+|exported-protein MENKFVPGILIGAVIGGAISLADKSTRQALVQSVKDAKNGNRTRKPSKVSKIKDEVLYWKDVVEEIRRNNPELERSLKDAKETFVNRKNQR >LR134086.1|VDZ17886.1|1983279_1983744_+|Low-molecular-weight-protein-tyrosine-phosphatase MVDVAFVCLGNICRSPMAEAIMRQRLKDRNIHDIKVHSRGTGSWNLGEPPHEGTQKILNKHNIPFDGMISELFEATDDFDYIVAMDQSNVDNIKSINPNLKGQLFKLLEFSNMEESDVPDPYYTNNFEGVYDMVLSSCDNLIDYIVKDANLKEG >LR134086.1|VDZ17885.1|1982932_1983139_-|Uncharacterized-protein-conserved-in-bacteria MAMTNEEKVLAIREKLNIVNQGLLDPEKYKNANEEELTDIYDFVQSRERLSPSEVTAIADALGQLRHD >LR134086.1|VDZ17884.1|1981673_1982921_-|aminopeptidase-PepS MTNYKEKLQQYAELLVKVGMNVQPKQPVFIRSSVETLELTHLIVEEAYHCGASDVRVVYSDPTLKRLKFENESVEHFANHELKSYDVEARMDYVKRGAANLALISEDPDLMDGIDSQKLQAFQQQNARAFKGYMESVQKNQFPWVVAAFPSKAWAKRVYPELSVEEAYIKFIDEVFDIVRIDGNDPVENWRQHIANLSVYAQKLQQKNYHALHYVSEGTDLTVGLAKNHIWEDATSYVNGKEQAFIANIPTEEVFTAPDRNRVDGYVTNKLPLSYNGTIIDQFKLMFKDGEIIDFSAEKGETVLKDLINTDEGSRRLGEVALVPDDSPISNRNTIFYNTLFDENAACHLAIGSAYAFNIQGGTEMTVEEKIASGLNDSNVHVDFMIGSSDLTIYGIFEDGSKELVFENGNWASTF >LR134086.1|VDZ17894.1|1989897_1990884_+|Integral-membrane-protein MNDQWYKHLIGARTIKTGIAIFLTAVFCMALDLTPIYAILTAVVTIEPTAKASLIKGYRRLPATVIGAGFAVLFTYLFGDQSPFTYALSATFTILFCTKLKLQVGTNVAVLTSLAMIPGIHDAYIFNFLSRTLTAIIGLVTSGLINFMVFPPKYYGQVEEKLSKTDALMYKLFYNRCQELILSRLQSDKSEKAYKNIFNLNNQVETLISYQRDELSYHKKKECDWKLLNQLTKRAYTNRLFITHLSNIIYLPKNTRVNFSGDEKMALLKISSSIKDIFYDGSFKREDDSVETLRSTIKALEISGENQIKSHILYEVLMIYRLLDSRYA >LR134086.1|VDZ17895.1|1991314_1991728_-|Uncharacterised-protein MKPTKVILRDASYLHSKTSITFILKDVVIEEDNKIYYFDTSATFEDQEVKFEFALFDSDMDNLKHMDYDNPVTEIYFIEPDLHFTIIDFNQELLCIYIDFDSGLRHSNMATESGISLRINVAKSDFTKFINELASLH >LR134086.1|VDZ17896.1|1991952_1992684_-|CobB/CobQ-like-glutamine-amidotransferase-domain-containing-protein MHELTIYHFMSDKLNLYSDIGNIIALRQRAKKRNIKVNVVEINETEGITFDECDIFFIGGGSDREQALATKELSKIKTPLKEAIEDGMPGLTICGGYQFLGKKYITPDGTELEGLGILDFYTESKTNRLTGDIVIESDTFGTIVGFENHGGRTYHDFGTLGHVTFGYGNNDEDKKEGIHYKNLLGTYLHGPILPKNYEITDYLLEKACERKGIPFEPKEIDNEAEIQAKQVLIDRANRQKKSR >LR134086.1|VDZ17897.1|1992685_1993999_-|UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--2,-6-diaminopimelate-ligase MRQWTAIHLAKLARKASRAVGKRGTDLPGQIARKVDTDILRKLAEQVDDIVFISGTNGKTTTSNLIGHTLKANNIQIIHNNEGANMAAGITSAFIMQSTPKTKIAVIEIDEGSIPRVLKEVTPSMMVFTNFFRDQMDRFGEIDIMVNNIAETISNKGIKLLLNADDPFVSRLKIASDTIVYYGMKAHAHEFEQSTMNESRYCPNCGRLLQYDYIHYNQIGHYHCQCGFKREQAKYEISSFDVAPFLHLNINDEKYDMKIAGDFNAYNALAAYSVLRELGLNEQTIKNGFETYTSDNGRMQYFKKERKEAMINLAKNPAGMNASLSVGEQLEGEKVYVISLNDNAADGRDTSWIYDADFEKLSKQQIEAIIVTGTRAEELQLRLKLAEVEVPIIVERDIYKATAKTMDYKGFTVAIPNYTSLAPMLEQLNRSFEGGQS >LR134086.1|VDZ17898.1|1994290_1994791_+|Ferritin-like-protein-2 MLSKNLLEALNDQMNHEYFAAHAYMAMAAYCDKESYEGFANFFIQQAKEERFHGQKIYNYINDRGAHAEFRAVSAPKIDFSSILETFKDSLSQEQEVTRRFYNLSEIARQDKDYATISFLNWFLDEQVEEESMFETHINYLTRIGDDSNALYLYEKELGARTFDEE >LR134086.1|VDZ17899.1|1995179_1995407_+|DNA-polymerase-III-polC-type MIQDAFVALDFETANGKRTSICSVGMVKVIDSQITETFHTLVNPQDYFHNKILKFMAYNQKMLKMHLRLTTYFHI >LR134086.1|VDZ17900.1|1995403_1995733_+|DNA-polymerase-III-polC-type MMQFIADLPVVAHNAAFDMNVLHQSIQNIGLPTPNLTYFCSYQLAKRTVDSYRYGLKHMMEFYQLDFHGHHDALNDAKACAMITFRLLKNYENLTYVTNIYGKNLKDKG >LR134086.1|VDZ17901.1|1995800_1996871_-|DNA-polymerase-IV MTERRIIHIDMDYFFAQVEMRDNPKLKGKPVIVGGKASSRGVVSTASYEARKYGVHSAMPMSQAHKLCPNGYFVTSNFGAYRETSAQIMSIFRSYTDKVEPMSLDEAYLDITELVRPDLPASKIAQYIRKDILEQTHLTASAGVSYNKFLAKLASGMNKPDGLTVIDYQNVHDILMTLDIGDFPGVGKASKKVMHDNGIFNGRDLYEKTEFELIRLFGKRGRGLYNKARGIDHSEVKSSRVRKSVGTERTFATDVNDDEEILRKVWELSGKTAERLNKLQKSAKTVTVKIKTYQFETLSKQMSLRDSVSSEEDIYNIAYLLYNDLKDPDVPIRLIGVTVGNLEQSTYKNMTIYDFI >LR134086.1|VDZ17902.1|1997117_1997648_-|Permease MHKIDLTTNNFQMRRFIILQLVIALFVILFTYKWALGVTAVVDQNIIINLVYGFAGFIILLILHELIHRALFLLFKKDSKPMFNIKKDRILFQTADACFNKWQFSIIMLSPLFLLSTGLLILIKVFGYSSLIFMFSMHTAYCFIDILLVALTISSSFKYVQQDEDSIYLYHQKPTQ >LR134086.1|VDZ17903.1|1997817_1999179_-|RNA-methyltransferase,-TrmA-family MQAIAKNDIKMGTVVDLTHEGHGVVKIDRFPIFIPQALINEQIEYKIIKVKKNFAIGKLLNINTRSENRVAPPCIYYERCGGCQLQHLSYEAQLEMKKEQVINLFQRKAHFDNSKFNDTVGMTDPWRYRNKSQIPVGKNEQNEVIMGFYRQRSHDIIDMESCLIQDSQHQEVMNEVKSILKDLNVSIYQEQLKKGLMRHLVVRTGYHTDEMMIIFVTNGKKWPQKNAVVEKILDAFPNVTSIKQNINDSHSNVIMGRQSITLYGKDTIIDQLTDSTFKISDQSFYQINSEQTEKLYNKAIEYAQLTGNEVVLDTYCGIGTIGLYMAPHAKHVYGVEVVPSAIEDAQQNATINQCNNTTFVCGKAEEVILQWKAQGIKPDVVMVDPPRKGCDETFIQTLLTLEPKRIVYISCNPATQQRDALLLAEKYQLEEVTPVDMFPQTTHVETVALFNLK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134086_4 | 2238680-2238782 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134086_4
|
1 spacers
spacers of LR134086_4
>4.1|2238717|29|LR134086|CRISPRCasFinder TGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGC |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134086_4
The CRISPR arrays of LR134086_4 >merge|LR134086|4|2238680-2238782|CRISPRCasFinder AGCATCCAACTGTATTCCTCTATTTTTCAACTTTAGTTGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGCAGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGT >LR134086|4|4|2238680-2238782|CRISPRCasFinder AGCATCCAACTGTATTCCTCTATTTTTCAACTTTAGT TGTTAGGGGCTCTTATGCAGTTGATGCGC AGCATCCAACTGTGTTCCTCTATTTTTCAACTTTAGT
>LR134086.1|VDZ18150.1|2237532_2238624_+|Lytic-regulatory-protein MFTYFKSAFKNAKPQLLITLIYALIAFAVIAVVYLLANFQLAKYVQTIAIYSQFGQKPPVDAYLKVIAILLIAAVVSLFVLVQIFIGITNVMKRAMSHEKVKFTDLFIAFKKGNYLKSVLIGLVSIAMIIVLSLLTSLLYKLFSPVSEMIMNSVQSSYADSTHLIGIAITTQSIIIIVVLLIKAIITWLLLIPIFNFMTSFVESTNDKVKTHLANGFKAMKNGQKTFFKFFIGILLLNLIIILFKTPVGYLISFNTQSLSQSVAENIIRVYTVMTIILFVVIHAIILMGIVQYYLKRGQKITKDKVKTADKDKKVVTEPKNTKVENDKVATSVETKTEKAQDSLNDNTTKTMTSDKPEDNQPK >LR134086.1|VDZ18149.1|2236286_2237267_+|Cobalt-zinc-cadmium-resistance-protein MSHSHHHHDHMHSHVTTNNKKVLFISFLIIGLYMFIEIIGGLLANSLALLSDGIHMFSDTFSLGVALVAFIYAEKNATTTKTFGYKRFEVLAALFNGVTLFVISILIVFEAIKRFFVPSEVQSKEMLIISIIGLIVNIVVAFFMFKGGDTSHNLNMRGAFLHVIGDLLGSVGAITAAILIWAFGWTIADPIASILVSVIILKSAWGITKSSINILMEGTPSDVDIDEVITTIKKDSRIQSVHDCHVWTISNDMNALSCHVVVDHTLTMKECELLLENIEHDLLHLNIHHMTIQLETPNHKHDESIICSGTHSHSHNHHAHHHAHVH >LR134086.1|VDZ18148.1|2235964_2236285_+|Zn(II)-or-Co(II)-specific-transcriptional-repressor-protein MSEQYSEIHTDTLERVTEIFKALGDYNRIRIMELLSVSEASVGHISHQLNLSQSNVSHQLKLLKSVHLVKAKRQGQSMIYSLDDIHVATMLKQAIHHANHPKESGL >LR134086.1|VDZ18147.1|2235147_2235813_-|oxidoreductase-ylbE MNILVIGANGGVGSLLVQQLAKENVPFTAGVRQSDQLNALKSQGMKAILVDVENDSIETLTETFKPFDKVIFSVGSGGNTGADKTIIVDLDGAVKSMIASKEANIKHYVMVSTYDSRRQAFDDSGDLKPYTIAKHYADDYLRRSGLNYTILHPGALTNAAGSGKIEAAQYFDGKGEIPREDVATVLKEIVTSNHFNYQEFQIISGEQDIKDALTQFEIEKD >LR134086.1|VDZ18146.1|2233773_2234712_-|mannose-6-phosphate-isomerase MPLFLQPILKTKLWGGQRLSEFGYQLDNDTTGECWCVSAHPNGTSEIINGPYQGQTLDRIWSEHRELFGDFPSKDFPLLTKIVDARESLSIHVHPDNSYAYEHENGQYGKSECWYIIDAEEDAEIVIGTLAESREEVANHVQHGTIESILRYIKVKPGEFYFIPAGTVHTISSGILAYETMQSSDITYRLYDFNRQDNQYNDRPLNIEKALDVIQYNAPLPNILPESEIIENHKCTHIVSNDFFTLVKWEISGTLNYMKPREFCLVTVLEGEGQMIVDGEIFKLTTGTNFILTSEDLDSVFEGDFTLMISYV >LR134086.1|VDZ18145.1|2233512_2233743_-|membrane-protein MKQFLYIALVCGVIAGLGAFLHIPQYPSMTIPRIVAILGIISAMLTFKDKQISASLKFSALLINVLPLCGTFVASN >LR134086.1|VDZ18144.1|2231465_2232839_-|EVE-domain-protein MTAETNYFWLNCGYNRWNHNEPLVGQTALFESGAHFNPSQGFRAFKKAKVGDQVIFYQVQTDTGLLGCGEIISVETGAQNKIRVQFRFNEQLKPLTADYLKRSEALEFRMSNMKETLFNQITAEEFDLISGLGKGEIKIPRYFFLAETEEFEPGNQYTIYTHTYNGIKRNGYHFYTQLEEGDNIIFYNRTKNQSVVGIGEVSKHIHEKPPIPGRTNSTVIEVSYEKDITPITLSTLNKHPKLKNLYFLQENAKQAIASMSQAQYDAIIEMSDNNGLKSPFEMVQKPDMLESEKEEALKPFILLVVDRKEEGLKAANDLLQKANANPVITTGHPDFSEDMLYGKYLPNETGALYYREGFITQLMPKKDKSYLVIDNFNRIDTDIFQTYINVLEGYEVTLPRYNKDGNMIKWSRQKDSFYYFNPNWHIVGITYDSLEEIKEKYSEQFLKYTRIVKVKHD >LR134086.1|VDZ18143.1|2230596_2231010_-|thiol-disulfide-oxidoreductase MPIVYYDGNCIYCYNYVIWLIQHDLPRNYRFATLKGEVGQQFFKQHPEAANKNSVILQKGDRIYFESQAIIQLITALPNRTKLLGVGLWLVPKPVRNFGYRMFANNRNRMWKTTWHQPNDYEKSFFLDDNAKVKLTD >LR134086.1|VDZ18142.1|2229953_2230397_-|Non-specific-DNA-binding-protein-Dps-/-Iron-binding-ferritin-like-antioxidant-protein-/-Ferroxidase MSNQQDVVKELNQQVANWTVAYTKLHNFHWYVKGPNFFSLHVKFEELYNEASQYVDELAERILAVGGNPVGTLTECLEQSIVKEAAKGYSAEQMVEELSQDFTNISKQLEKAIEIAGNAGDDVSEDMFIGMQTSVDKHNWMFKSYLS >LR134086.1|VDZ18141.1|2229121_2229832_+|Purine-nucleoside-phosphorylase MTKGTPHIQPNGVKIAKTVLMPGDPLRAKYIADNFLENVEQFNDVRNMFGYTGAYKGKEVSVMGSGMGIPSIGIYSYELYNFFDVDTIIRIGSCGALQENVNLYDVIIAQAASTNSNYVDQYNIPGHFAPIADFELVTKAKNVADQIGATTHVGNVLSSDTFYNADPTFNAAWKKMGILGIEMESAGLYLNAIHAGKKALGIFTVSDHILRDEATTPEERQNSFTQMMEIALEIAE >LR134086.1|VDZ18151.1|2240737_2241595_-|Putative-cytosolic-protein MDNVKAIFLDMDGTILHENNQASTYTKDVINRLREKGYKVFLATGRSHSEIHQLVPQDFAVNGIISSNGTIGEVDGEIIFKHGLSLAQVQQIINLAKRQQIYYEVFPFEGNRVSLKEDETWMRDMIRSQDPINGVSHSEWSSRQDALAGKIDWVTKFPEGEYSKIYLFSSNLEKITAFRDELKQNHVQLQISVSNSSRFNAETMAYQTDKGTGIKEMIAHFGIHQDETLVIGDSDNDRAMFEFGHYTVAMKNARPEIQALTSDVTAYTNEEDGAAKYLAKHFLAD >LR134086.1|VDZ18152.1|2241662_2242445_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MLIQLDQIGRMKQGKTILKNISWQIAKGDKWILYGLNGAGKTTLLNILNAYEPATTGGVNLFGEMPGKVGYSAETVRQHIGFVSHSLLEKFQDGERVIDVVISGAFKSIGVYQDIDDEVRNEAHQLLKLVGISAKAQQYIGYLSTGEKQRVMIARALMGQPQVLILDEPAAGLDFIARESLLNILDSLSDSYPTLAMIYVTHFIEEITGNFTKILLLKDGESVQQGLIDDILTSENMSRFFQKNVAVQRWNNRFSMAMLE >LR134086.1|VDZ18153.1|2242676_2244482_-|glucosamine--fructose-6-phosphate-aminotransferase MCGIVGYIGYDNAKELLLKGLEKLEYRGYDSAGIAVVNDDNTTVFKEKGRIAELRKVADSSDFDGPVGIGHTRWATHGVPNHENSHPHQSSNGRFTLVHNGVIENYEELKGEYLQGVSFISETDTEVIVQLVEYFSNQGLSTEEAFTKVVSLLHGSYALGLLDAEDKDTIYVAKNKSPLLLGVGEGFNVIASDALAMLQVTSEYKEIHDHEIVIVKKDEVIIKDADGNVVERDSYIAEIDASDAEKGVYAHYMLKEIHEQPAVMRRIIQEYQDAEGNLKIDQDIINDVKEADRIYVIAAGTSYHAGLVGKEFLEKWAGVPTEVHVASEFVYNMPLLSEKPLFVYISQSGETADSRAVLVETNKLGHKSLTITNVAGSTLSREADHTLLLHAGPEIAVASTKAYTAQIAVLSILSQIVAKEHGREADIDLLRELAKVTTAIEAIVDDAPIMEQIATDFLETTRNAFFIGRTIDYNVSLEGALKLKEISYIQAEGFAGGELKHGTIALIEDGTPVVALATQENVNLSIRGNVKEVVARGAHPCIISMEGLEKEGDTYVIPHVHELLTPLVSVVALQLISYYAALHRDLDVDKPRNLAKSVTVE >LR134086.1|VDZ18154.1|2245162_2246701_+|PTS-system,-mannitol-specific-IIBC-component MSQTEEKKGIGRRVQAFGSFLSSMIMPNIGAFIAWGFIAAIFIDNGWLPNKDLATLAGPMITYLIPLLIAFSGGRLIYDLRGGIIAATATMGVIVALPDTPMLLGAMIMGPLVGWLMKKTDQLIQPRTPQGFEMLFNNFSAGILGFIMTIAGFKILAPIMKFIMHILSVAVESLVHAHLLPLVSILVEPAKIVFLNNAINHGVFTPLGADQAAKAGQSILYTIESNPGPGLGILLAYMIFGKGTAKATSYGAGIIHFLGGIHEIYFPYVLMRPLLFIAVILGGMTGVATYQATGFGFKSPASPGSFIVYCLNAPRGEFLHMLLGVFLAALVSFVVATLIMKFTREPKQDLEAATAQMENTKGKKSSVASKLVSSDKNVNTEENASGNVSETSSSDDDPEALLDNYNTEDVDAHNYNNINHVIFACDAGMGSSAMGASMLRNKFKKAGINDITVTNTAINQLPKDAQLVITQKKLTDRAIKQTPNAIHISVDNFLNSPRYEELLNNLKKDDQA >LR134086.1|VDZ18155.1|2246735_2248868_+|PTS-system-mannitol-(Cryptic)-specific-transporter-subunit-IIA MLLSTREKEMIALLIKYHGQYITIHDIAQQLAVSSRTIHRELKGVESYLTSFSLTLERANKKGLRIAGADSDLNDLKQSIAQLQTIDLSVEEQKVIIIYALIQAKEPVKQYSLAQEIGVSVQTLAKMLDDLELDLNKYQLSLSRKRGEGIYLVGTESKKREFLSQLMVNNLNSTSVYSVIENHFVFHSLNQIHKDFVDLERIFNVERLLMDYLSALPYQLTESSYLTLTVHIVLSISRIKNGEYVALNDDIYDSVQNTFEHKVASELADKLDQIYDVTFNQAEIAFITIHLRGAKRKNLNDTSLNNRCEENKIKAFVNKVEMISGMTFADLDTLVDGLTLHLNPAINRLQANIETYNPLTDMIKFKYPRLFENVRLALNDCWPDLIFPESEIAFIVLHFGGSIKNQGNRFLNILVVCSSGMGTSRLLSTRLEQVFSEIERITQASVSDLKSLDLSQYDGIISTVNLDIDTPYLMVNPLLPDSDISYVAQFLNTKSTFQETHDKSSNMNDKDDVHVETKDIDGNTSFENEQTSNLTSVFEKHLSDEKSEQLMHHMRSGLTLLDSVKIVSTEVKQWQTYIADYLYQCDAIKDPTSFAELLEQRLIDNPGWILSPYPVAIPHLRDNMIKHPMILITVLEEPLTLPSIQNDNQTIKYMISMFIPDNDFMASLVSDLSEFLSLKLESIDTFMENPQELETLLRSKFLERIKKQFI >LR134086.1|VDZ18156.1|2248879_2249314_+|PTS-system-mannitol-specific-transporter-subunit-IIA MSELFSNDNIFLNVNVNSQNEAIEKAGKALVDSGAVTDAYIQAMKDREQVVSTFMGNGLAIPHGTDEAKTNVIHSGLTLLQIPEGVDWDGEVVKVVVGIAGKDGEHLDLLSKIAITFSEEENVDRIVQAKSAEEIKQVFEEADA >LR134086.1|VDZ18157.1|2249313_2250420_+|Mannitol-1-phosphate-5-dehydrogenase MKAVHFGAGNIGRGFIGYILADNNVKVTFADVNEEIINALAHDHQYDVILADESKTTTRVNNVDAINSMQPSEALKQAILEADIITTAVGVNILPIIAKSFASFLKEKTNHVNIVACENAIMATDTLKKAVLDITGPLGNNIHFANSAVDRIVPLQKNENILDVMVEPFYEWVVEKDAWYGPELNHIKYVDDLTPYIERKLLTVNTGHAYLAYAGKFAGKATVLDAVKDSSIEAGLRRVLAETSQYITNEFDFTEAEQAGYVEKIIDRFNNSYLSDEVTRVGRGTLRKIGPKDRIIKPLTYLYNKDLERTGLLNTAALLLKYDDTGDQETVEKNNYIKEHGLKAFLSEYAKVDDGLADEIIEAYNSLS >LR134086.1|VDZ18158.1|2250738_2258055_-|putative-surface-anchored-protein MNLFRQQKFSIRKFNVGIFSALIATVTFISINPTTASAAEQNQPAQNQPAQPADPNAQPNANAGAQANPTAQPAAPANQGGQADPAANQGGQANPAGGAVQPAAGTTQPAGQGNQADPNNAAQAQPGNQAAPANQAGQGNNQATPNNNATPANQTQPANAPAGAQPAAAVAANGQTQDPNASNTGEGSINTTLTFDDPAISTDENRQDPTVTVTDKVNGYSLINNGKIGFVNSELRRSDMFDKNNPQNYQARGNVAALGRVNANDSTDHGNFNGISKTVNVKPDSELIINFTTMQTNSKQGATNLVIKDAKKNTELATVNVAKTGTAHLFKVPTDADRLDLQFIPDNTAVADASRITTNKDGYKYYSFIDNVGLFSGSHLYVKNRDLAPKATNNKEYTINTEIGNNGNFGASLKADQFKYEVTLPQGVTYVNDSLTTTFPNGNEDSTVLKNMTVNYDQTANKVTFTSQGVTTARGTHTKEVLFPDKSLKLSYKVNIANIDTPKNIDFNEKLTYRTASDVVINNAQPEVTLTADPFSVAVEMNKDALQQQVNSQVDNSHYTTASIAEYNKLKQQADTILNEDANHVETANRASQADIDGLVTKLQAALIDNQAAIAELDAKAQEKITAAQQSKKVTQDEVAALVTKINNDKNNAIAEINKQTTAQGVTTEKDNGIAVLEQDVITPTVKPQAKQDIIQAVTTRKQQIKKSTASLQDEKDVANDKIGKIETKAIKDIDAATTNAQVEAIKTKAINDINQTAPATTAKAEALEEFDEVVQAQIDQAPLNPDTTNEEVAEAIERINAAKVSGVKAIEATTTAQDLERVKNEEIFKIENITDSTQTKMDAYKEVKQAATARKAQNATVSNATDEEVAEANAAVDAAQTEGLHDIQVVKSQQEVADTKAKVLDKINAIQTQSRVKPAADTEVDNAYNTRKQEIQNSNASTTEEKEAAYTELDAKKQEARTNLDAANTNSAVTTAKDNGIAAINQVQAATTKKSDAKAEIAQKASERKTAIEAMNDSTSEEQQAAKDKVDQAVVTANADIDNAAANSDVDNAKTTNEATIAAITPDANVKPQAKQAIADKVQAQETAIDANNGAITEEKAAAKQQVQTEKTTADTAIDGAHSNAEVEAAKNAEIAKIEAIQPATTTKDNAKQAIATKANERKTAIAQTQDITAEEIAAANADVDNAVIQANSNIEAANSQNDVDQAKTTGETSIDQVTPTVNKKATARNEITTTLNNKLQEIQATPDATDEEKQDAETEANTENAKANQAITAATTNAEVDEAKTNAEAAINAVTPKVMKKQAAKDEIDQLQAAQTAVINNDQNATNEEKEAAIQQLATAVTDAKNNITAATDNNGVDTAKDAGKNSIQSTQPATAVKSNAKNDVDQAVTTQNQAIDNTTGATTEEKNAAKDLVSKAKEKAYQDILNAQTTNDVTQLKDQAVADIQGITADTTIKDVAKGELTAKANEQKALIAQTADATTEEKEQANQQVDAQLTQGNQNIENAQSIDDVNTAKDNAVQAIDPIQASTDVKTNARAELLNEMQNKITEILNDNTTTNEEKGKDIGPVRAAYEEGLNNINVANSTGDVTTAKDAAVQKVQQLHANPVKKPAGKTELDQAAADKKTQIEQTPNASQQEINDAKQEVDTELNQAKTNIDQSSTDDYVDAAVRDGKAKINAVKTFSEYKKDALAKIADAYNAKVNEADNSNASTSSEIAEAKQKLAELKQTADQNVNQATSKDDIEVQIHNDLDNINDYTIPTGKKESATTDLYAYADQKKNNISADTNATQDEKQQAIKQVDQNVQTALESINNGVDNSDVDDALTQGKATIDAVQVDATVKAKANQAIDAKAQETKESIDQSDQLTAEEKTEALATIKQITDQAKQGITDATTTAEVEKAKAQGLEAFDNIQIDSTEKQKAIEELETALDQIEAGVNVDSDATTEEKEVFTNALEEILSKATEDISDQTTNAEIATVKNSALEQLKAQRINPEVKKNALEAIREVVNKQIEIIKNADADASAKEIARTDLGRYFDRFADDLDKTQTNAEVAELQNVTIPAIEAIVPQNDPDANHSSSDNNDATANTNVNAEPDNAGQPNVTESTDNANADTSSTTTNNHNDAATGETTATSTNNSSTDDANDKPTANNNSSVDASIDNSATGNGTTDKPATTESTEKTSSADSKDNASVNDSNQNAEVNNSAESQPTNGKVAQPKSENKAKVEKDGRDSTNQSMVESTTETLPSADITEPNVPSNTSKDKEESTSNQTDAGQLKSETNVASNEADKSPSKADTEVSNKPSTSASSEAKDKMTSTEDSQKADMATADTKDNQASIGSSADANNKATQNDGANASPATVSNGSNSANQDMLNVTKPEENKANAKSDQQGKVNKPKQQAKTLPDTGMSHNDDLPYAELALGAGMAFLIRRFTKKDQQTEE >LR134086.1|VDZ18159.1|2258331_2259687_-|Phosphoglucosamine-mutase-/-FemD,-factor-involved-in-methicillin-resistance MGKYFGTDGVRGVANQELTPELAFKLGRYGGYVLAHNKGEKHPRVLVGRDTRVSGEMLESALIAGLISIGAEVMRLGIISTPGVAYLTRDMGAELGVMISASHNPVADNGIKFFESDGFKLSDEQENEIEALLDQENPELPRPVGNDIVHYSDYFEGAQKYLSYLKSTVDVNFEGLKIVLDGANGSTSSLAPFLFGDLEADTETIGCSPDGYNINEKCGSTHPEKLAEKVVETESDFGLAFDGDGDRIIAVDENGQIVDGDQIMFIIGQEMHKNQELNNDMIVSTVMSNLGFYKALEQEGIKSNKTKVGDRYVVEEMRRGNYNLGGEQSGHIVMMDYNTTGDGLLTGIQLASVIKMTGKSLSELAGQMKKYPQSLINVRVTDKYRVEENVDVKEVMTKVEVEMNGEGRILVRPSGTEPLVRVMVEAATDEDAERFAQQIADVVQDKMGLDK >LR134086.1|VDZ18160.1|2259713_2260646_-|ybbR-like-family-protein MLESKWGLRFIAFLLALFFFLSVNNVFGNIFNTGNLGQKSSKTIQDVPVEILYNTKDLHLTKAPETVNVTISGPQSKIIKIENPEDLRVVIDLSNAKAGKYQEKYQVKGLADDIHYSVKPKLANITLENKVTKKMTVQPDVSQSDIDPLYKITKQEVSPQTVKVTGGEEQLNDIAYLKATFKTNKKINGDTKDVAEVTAFDKKLNKLNVSIQPNEVNLQVKVEPFSKKVKVNVKQKGSLADDKELSSIDLEDKEIEIFGSRDDLQNISEVDAEVDLDGISESTEKTVKINLPEHVTKAQPSETKAYINVK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134086_5 | 2318948-2319072 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134086_5
|
1 spacers
spacers of LR134086_5
>5.1|2318985|51|LR134086|CRISPRCasFinder ATGATTTCCCATGATTTTTTAGTATTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134086_5
The CRISPR arrays of LR134086_5 >merge|LR134086|5|2318948-2319072|CRISPRCasFinder CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCAATGATTTCCCATGATTTTTTAGTATTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTATCCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACGCTTGATATCA >LR134086|5|5|2318948-2319072|CRISPRCasFinder CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCA ATGATTTCCCATGATTTTTTAGTATTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTAT CCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACGCTTGATATCA
>LR134086.1|VDZ18206.1|2315711_2317376_-|Acetolactate-synthase,-catabolic MTDKKYTAADMVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGVVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPAESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGLISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELDTQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISDKVDEPFINQQHLDELEQLRAHIDQETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDETTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVDFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >LR134086.1|VDZ18205.1|2314970_2315675_-|alpha-acetolactate-decarboxylase MASVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHVRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFTNANIDYKDISDEIREAE >LR134086.1|VDZ18204.1|2314166_2314592_+|Truncated-cell-surface-protein-map-w MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNSIDPSTIKQIQIVVK >LR134086.1|VDZ18203.1|2313056_2313872_-|hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVITAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSTGNHNNDRRILEALVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >LR134086.1|VDZ18202.1|2311306_2312824_+|glycosyl-transferases-group-1-family-protein MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKQVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNHYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRFKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKAFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYHKVENMQNNDIKKIFTIHTNHFMSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKKLDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAISFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRALYTKTSLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSQ >LR134086.1|VDZ18201.1|2311018_2311297_+|Uncharacterised-protein MTLNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIVFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLETFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK >LR134086.1|VDZ18200.1|2309291_2310146_-|Peptidase,-M23/M37-family MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWHFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTMEQIWIDKANQFGVAVTWKDNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTYKNKGKVNTDYFYFGKDIIAPANGTVEKVANGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDIIGKVGNSGNSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFINNRELIKGDVVCGLQGE >LR134086.1|VDZ18199.1|2306805_2309232_+|Hyaluronate-lyase-precursor MTYRMKKWQKISTITLLMAGVITFNDSEFRSVDKHQIAVADTNVQTTDYEKLRNTWLNVNYGYNQYDENNDAMKKKFEATEKEATNLLSSMKTESDRKYLWENSKDLDTKSADMTRTYRNIEKIAEAMKHKNTKLNTPDNKNKVKDALEWLHKNAYGKEPTDKVKELTENFKNKTSRNTNLNWWDYEIGTPRALTNTLILLNGDISSDEKKKYTAPIKTFAPESDKILSSVGQPEQAKGGNLVDIAKVKLLESIIEEDTTMMKESIDAFNKVFTYVQSNATGKERNGFYKDGSYIDHQDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETSFKDSNQNDTTLKSWIDEGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHSVSATVMKSLLRLSDAMDDSTKAKYKQIVKTSVKSDSSYKQNDYLSSYSDISKMKSLMEDSTISTNDLTQQLKIYNDMDRVTYHNKGLDFAFGLSMTSKNVARYESINNENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATADMKRLAGTTTIENEEPKGTDVKKSSKTFVGGTKFDDQHASIGMDFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKSTDSSKNPVTTIENRKTNGYTLYTDDKQTTASDNQDTNSVFLESTNKPKNNIGYHFLNKSKITVKKESHTGKWSDINKSQKSEDKTDEYYEVTQKHSDKDNKYGYVLYPGITKDNFKSKASQVTVVKQDDDFHVVKDNESVWAGVNYSDSAKTFEINGTKVEVKAKGMFILKKKNDKTYECSFYNPESTNPASDIESKISMTGYSITNKDTSTTNESGVRFELTK >LR134086.1|VDZ18198.1|2305981_2306398_-|transcriptional-regulator,-MerR-family MKTKEVVALMNISQDTLRYYEKVGVIPPVNRDENGYRIYNDSDLNWIYLVKNLRNAGVSIESLIEFCRLAQLPKNENIQAQQKQILNKQLEELNENLKTIHDARDLLQYKIDNYDNHIAKINASDNHDANVERLWERK >LR134086.1|VDZ18197.1|2305063_2305912_-|oxidoreductase,-aldo/keto-reductase-family MNHIEISKDVKIPVLGFGVFQIPQEQTAEAVKEAIKAGYRHIDTAQSYLNETEVGQGIEASGIDRSELFITTKVWIENVNYEDTIKSIERSLQRLNLDYLDLVLIHQPYNDVYGSWRALEELKENGKIKAIGVSNFGVDRIVDLGIHNQIQPQVNQIEINPFHQQEEQVAALQQENVVVEAWAPFAEGKNQLFQNQLLQAIADKYNKSIAQVILRWLVERDIVVLAKSVNPERMAQNLDIFDFELTEEDKQQIATLEESNSQFFSHADPEMIKALTSRELDV >LR134086.1|VDZ18207.1|2319470_2319869_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >LR134086.1|VDZ18208.1|2319882_2320320_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKATYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >LR134086.1|VDZ18209.1|2320559_2321363_-|tRNA-pseudouridine-synthase-A MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNRAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEVSDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND >LR134086.1|VDZ18210.1|2321367_2322174_-|Transmembrane-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters MKNKLIIGRYLPINSFVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFFCHSPLTYLWVFALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPFAIILFVLKYSGV >LR134086.1|VDZ18211.1|2322163_2323024_-|ATPase-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters MTIRFDNVSYTYQKGTPYQHQAIHDVNTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALLKPTTGTVTVDDITITHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMNLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSILAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKAIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKDKEKLADWHIGLPEIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >LR134086.1|VDZ18212.1|2323020_2323830_-|cobalt-import-ATP-binding-protein MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIEKVKSGEIFYNNQAITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRKVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKINQMLGYQTSFLTYEGLVDQL >LR134086.1|VDZ18213.1|2324367_2324736_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV >LR134086.1|VDZ18214.1|2324752_2325697_-|DNA-directed-RNA-polymerase-alpha-subunit MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED >LR134086.1|VDZ18215.1|2325771_2326161_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV >LR134086.1|VDZ18216.1|2326184_2326550_-|30S-ribosomal-protein-S13 MARIAGVDIPREKRVVISLTYIYGIGTSTAQKILEEANVSADTRVKDLTDDELGRIREVVDGYKVEGDLRRETNLNIKRLMEISSYRGIRHRRGLPVRGQKTKNNARTRKGPVKTVANKKK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134086_6 | 2561444-2561527 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134086_6
|
1 spacers
spacers of LR134086_6
>6.1|2561469|34|LR134086|CRISPRCasFinder GCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134086_6
The CRISPR arrays of LR134086_6 >merge|LR134086|6|2561444-2561527|CRISPRCasFinder ACAGACAATGCAAGTTGGGGTGTGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCCACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGA >LR134086|6|6|2561444-2561527|CRISPRCasFinder ACAGACAATGCAAGTTGGGGTGTGG GCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCC ACAGACAATGCAAGTTGGGGTGGGA
>LR134086.1|VDZ18450.1|2560428_2561178_+|membrane-protein MSNTNKHYIEEEYATEQSRFFKRDIGFIFLYIFLVNILPIIIVFLTFGLVAIFTQQAPWDFSFPISMNISYLLAVILSLAIFRRMHEDAFIPMIRSQIVASTKYKWHILISFTLSIVLFLLLNHFEIFALNVDSFTVFDIYPLIREYGSISLIAIFSLTIILNTLICQLIFRHILIQELSRLIPLKITIVLSVILETLYYYPYINTWWEFIPALILASSATYLYLKSNRNFMVSYFYQLAVILVLHIFM >LR134086.1|VDZ18449.1|2558656_2560234_-|Ferredoxin-dependent-glutamate-synthase MTFLTVMQFIVNIIIIGFLLTVIVIGLIWLIKDKRQSQHSVLRNYPLLARIRYISEKMGPELRQYLFSGDNEGKPFSRNDYKNIVLAGKYNSRMTSFGTTKDYQDGFYIQNTMFPMQRNEISVDNTTLLSTFIYKIANERLFSREEYRVPTKIDPYYLSDDHAIKLGEHLKYPFILKRIVGQSGMSYGALGKNAITALSKGLAKAGTWMNTGEGGLSEYHLKGNGDIIFQIGPGLFGVRDKEGNFSEGLFKEVAQLSNVRAFELKLAQGAKTRGGHMEAEKVNEEIAKIRNVEPYKTINSPNRYEFIHNAEDLIRFVDQLQQLGQKPVGFKIVVSKVSEIETLVRTMVELDKYPSFITIDGGEGGTGATFQELQDGVGLPLFTALPIVSGMLEKYGIRDKVKLAASGKLVTPDKIAIALGLGADFVNIARGMMISVGCIMSQQCHMNTCPVGVATTDAKKEKALIVGEKQYRVTNYVTSLHEGLFNIAAAVGVSSPTEITADHIVYRKIDGELQTIHDYKLKLIS >LR134086.1|VDZ18448.1|2558033_2558489_+|lipoprotein MKKLCSLIVVALVCIIALSACGKEQTKTYEGDVSGKHVLTSITYKNDKVLKQSTINTIKYDDLGMDKDEAKKLFAKSESIFKDLKGVKYKVDYKDKKAIEHLDIDYTEVDMKKLNKRLGVSTKENKDISFEKLEKQLKHRGLKEKDKMDDK >LR134086.1|VDZ18447.1|2557417_2557675_-|prevent-host-death-family-protein MIITSPTEARKDFYQLLKNVNNNHEPIYISGNNAENNAVIIGLEDWKSIQETIYLESTGTMDKVREREKDNSGTTNIDDIDWDNL >LR134086.1|VDZ18446.1|2557151_2557418_-|addiction-module-toxin MSNYTVKIKNSAKSDLKKIKHSYLKKSFLEIVETLKNDPYKITQSFEKLEPKYLERYSRRINHQHRVVYTVDDRNKEVLILSAWSHYD >LR134086.1|VDZ18445.1|2555720_2556797_-|endoglucanase-M MNQSVKLLKHLTDVNGIAGYEMQVKEAMRNYIEPVSDQIIEDNLGGIFGKKNAENGQYSIMISGHMDEVGFMVTKIDKHGFISFTPVGGWWNQVMLSQKVTITTDSGKEIRGIIGSKPPHVLTPEERKKPMEIKNMFIDIGVSSKGEAEEAGVEVGNMVTPYSEFEVLANNKYLTAKAFDNRYGCALAIEVLQRLKDKNIGINLYSGATVQEEVGLRGAKVAANTIKPDLAIAVDVGIAYDTPGMSGQTSDSKLGGGPVVIMMDATSIAHQGLRKHIKDVAKKHNIEVQWDTTPGGGTDAGSIHVANEGIPTMTIGVTLRYMHSNVSVLNVDDYENSIRLVTEIVRSLNDETYKNIMW >LR134086.1|VDZ18444.1|2554712_2555375_-|ABC-superfamily-ATP-binding-cassette-transporter,-ABC-protein MLLEIKDLVYEASDRVILNHINLKVDKGETIAIIGPSGSGKSTFQKIICNLISPTSGTLYFKDKPYDDYEPEILRRHISYLMQQSDLFGETIEDNMIFPSLARNDKFDKKRAKQLIKDVGLGHYQLSSKIEHMSGGERQRIAIARQLMYTPDILLLDESTSALDIHNKEKIENIIFKLADQGVAIMWITHSDDQSMRHFQKRITIVDGQISNIEELNQHE >LR134086.1|VDZ18443.1|2553943_2554720_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MSNTALGLTALLLVIPIIISYKEGLHIIKDLIVATLRAVVQLIILGFLLHYIFKINDKWLLVLCVFVIIVNASWNTISRSSPVMHHVFWISFVAIFVGTALPLAGTIATGAIQFTANEVIPIGGMLANNGLIAINLAYQNLDRAFVQDGTNIESKLSLAATPKLASKGAIRESIRLAIVPTIDSVKTYGLVSIPGMMTGLIIGGVPPLQAIKFQLLVVFIHTTATIMSALIATYLSYGQFFNARHQLVARNTDVKSES >LR134086.1|VDZ18442.1|2552362_2553550_-|chloramphenicol-resistance-protein MSIMRLFTFILSIFIVGMVEMMVAGIMNLMSQDLHVSEAVVGQLVTMYALTFAICGPILVKLTNRFSSRPVLLWTLLIFIIGNGIIAVAPNFSILVVGRIISSAAAALIIVKVLAITAMLSAPKNRGKMIGLVYTGFSGANVFGVPIGTVIGDLVGWRYTFLFLIIVSIIVGFLMMIYLPKDQEIQRGSVNHEAPSHENHVTSKILRPAEVAKYLIITFLVLIANSVTFVFINPLILSNGHDMSFVSLALLVNGIAGVIGTSLGGIFSDKITSKRWLMISVSIFIVMMLLMNLILPGSGLLLAGLFIWNIMQWSTNPAVQSGVIQHVEGDTSQVMSWNMSSLNAGIGVGGIIGGLVMTHVSVQAITYTSAIIGALGLIVVLTLKNNHYAKTFKSS >LR134086.1|VDZ18441.1|2550948_2552301_+|Carboxylesterase-type-B MKINTTGGQIYGITQDRLDIFLGIPYAEPPVHDNRFKHSTLKTQWSEPIDATEIQPIPPQPDNKLEDFFSSQSATFTEHEDCLYLNIWKQHNDQSKKPVIIYFYGGSFENGHGTAELYQPAHLVQNNDIIVITCNYRLGALGYLDWSYFNKGFHSNNGLSDQINVIKWVHQFIESFGGDANNITLMGQSAGSMSILTLLKIPDIEPYFHKVVLLSGALRLDTLESARNKAQHFQKMMLDYIDTDDVTSLSTDDILMLMAKLKQSRGPSKGLDLIYAPIKTDYIQNNYPTTKPIFACYTKDEGDIYITSEQKKLSPQRFIDIMELNDIPLKYEDVQTAKQQSLAITHCYFKQPMKQFLQQLNIQDSNAQLWLAEFAWHDTSSAHYRSAYHILDMIFWFGNLQILSAHQYPITDHLKFLSRQMQNDLANFAKSGKMPWPIYHNERRYYRTYQ >LR134086.1|VDZ18451.1|2561643_2562837_-|Antibiotic-resistance-protein MKGAMAWPFLRLYILTLMFFSANAILNVFIPLRGHDLGATNTVIGIVMGAYMLTAMVFRPWAGQIIARVGPIKVLRIILIINAIALIIYGFTGLEGYFVARVMQGVCTAFFSMSLQLGIIDALPEEHRSEGVSLYSLFSTIPNLIGPLVAVGIWNANNISLFAIVIIFIALTTTFFGYRVTFAEQEPDTSDKIEKMPFNAVTVFAQFFKNKELLNSGIIMIVASIVFGAVSTFVPLYTVSLGFANAGIFLTIQAIAVVAARFYLRKYIPSDGMWHPKYMVSVLSLLVIASFVVAFGPQVGAIIFYGSAILIGMTQAMVYPTLTSYLSFVLPKVGRNMLLGLFIACADLGISLGGALMGPISDLVGFKWMYLICGMLVIVIMIMSLLKKPTPRPANSL >LR134086.1|VDZ18452.1|2562848_2563598_-|nickel-transport-ATP-binding-protein MIKIKDVEKSYQSAHVFKRRRTPIVKGVSFECPIGATIAIIGESGSGKSTLSRMILGIEKPDKGCVTLNDHPMHKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVREILFEVMCQCDGQPKDVMEVQAITLLEEVGLSKAYMDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPKYILFDEAISSLDMSIQTQILDLLIHLRETRQLSYIFITHDIQAATYLCDQLIIFKNGKIEEQIPTSALHKSDNAYTRELIEKQLSF >LR134086.1|VDZ18453.1|2563590_2564406_-|Oligopeptide-transporter-putative-ATPase-domain-protein MTLLTVKHLTITDTWTDQPLVSDVNFTLTKGETLGVIGESGSGKSITCKSIIGLNPERLGVTGDITFDGKPMLSLSEAQLKKYRGKDIAMVMQQGSRAFDPSTTVGKQMFETMKVHTSMSTQEIEKTLIEYMDYLSLKDPKRILKSYPYMLSGGMLQRLMIALALALKPKLIIADEPTTALDTITQYDVLEAFIDIKKHFDCAMIFISHDLTVINKIADRVVVMKNGQLIEHGTRESVLHHPKHVYTKYLLSTKKKINDHFKHVMRGDVHD >LR134086.1|VDZ18454.1|2564402_2565272_-|Oligopeptide-transporter-putative-membrane-permease-domain-protein MIILKRLLQDKGAVVALGIIVLYVFLGLAAPLVTFYDPNHIDTANKFAGMSFQHLLGTDHLGRDILTRLIYAIRPSLLYVFVALFVSVLIGSILGFLSGYFQGFVDALIMRACDVMLAFPSYVVTLALIALFGMGAENIIMAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTASDHVRFAKTIGMNDMKIIHKHIMPLTLADIAIISSSSMCSMILQISGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMFAPGIAIVIIVMAFNFLSDALQIAIDPRISSKDKLRSVKKGVVQS >LR134086.1|VDZ18455.1|2565268_2566204_-|Oligopeptide-transporter-putative-membrane-permease-domain-protein MFKFILKRIALMFPLVIVVSFMTFLLTYITNENPAVTILHAQGTPNVTPELIAETNEKYGFNDPLLIQYKNWLLEAMQFNFGTSYITGDPVAERIGPAFMNTLKLTIISSVMVMITSIILGVVSALKRGKFTDRAIRSVAFFLTALPSYWIASILIIYVSVKLNILPTSGLTGPESYILPVIVITIAYAGIYFRNVRRSMVEQLNEDYVLYLRASGVKSITLMLHVLRNALQVAVSIFCMSIPMIMGGLVVIEYIFAWPGLGQLSLKAILEHDFPVIQAYVLIVAVLFIIFNTLADIINALLNPRLREGAR >LR134086.1|VDZ18456.1|2566216_2567815_-|Oligopeptide-transporter-putative-substrate-binding-domain-protein MRKLTKMSAMLLASGLILTGCGGNKGLEEKKENKQLTYTTVKDIGDMNPHVYGGSMSAESMIYEPLVRNTKDGIKPLLSKKWDVSEDGKTYTFHLRDDVKFHDGTPFDADAVKKNIDAVQENKKLHSWLKISTLIDNVKVKDKYTVELNLKEAYQPALAELAMPRPYVFVSPKDFKNGTTKDGVKKFDGTGPFKLGEHKKDESADFNKNDQYWGEKSKLNKVQAKVMPAGETAFLSMKKGETNFAFTDDRGTDSLDKDSLKQLKDTGDYQVKRSQPMNTKMLVVNSGKKDNAVSDKTVRQAIGHMVNRDKIAKEILDGQEKPATQLFAKNVTDINFDMPTRKYDLKKAESLLDEAGWKKGKDSDVRQKDGKNLEMAMYYDKGSSSQKEQAEYLQAEFKKMGIKLNINGETSDKIAERRTSGDYDLMFNQTWGLLYDPQSTIAAFKAKNGYESATSGIENKDKIYNSIDDAFKIQNGKERSDAYKNILKQIDDEGIFIPISHGSMTVVAPKDLEKVSFTQSQYELPFNEMQYK >LR134086.1|VDZ18457.1|2567957_2569259_-|Uncharacterized-protein-conserved-in-bacteria MSKLLMIGTGPVAIQLANICYLKSDYEIDMVGRASTSEKSKRLYQAYKKEKQFEVKIQNEAHQHLEGNFEINRLYKDVKNVKGEYETVVMACTADAYYDTLQQLSLETLQSVKHVILISPTFGSQMIVEQFMSKFNKDIEVISFSTYLGDTRIVDKEAPNHVLTTGVKKKLYMGSTHSNSTMCQRISALAEQLKIQLEVVESPLHAETRNSSLYVHPPLFMNDFSLKAIFEGTDVPVYVYKLFPEGPITMTLIREMRLMWKEMMAILQAFRVPSVNLIQFMVKENYPVRPETLDEGDIEHFEILPDILQEYLLYVRYTAILIDPFSQPDENGHYFDFSAVPFKQVYKNEQDVVQIPRMPSEDYYRTAMIQHIGKMLGIKTPMIDQFLTRYEASCQAYKDMHQDQQLSSQFNTNLFEGDKALVTKFLEINRTLS >LR134086.1|VDZ18458.1|2569251_2570070_-|nicotianamine-synthase MNNFNNEIKLILQQYLEKFEAHYERVLQDDQYIEALETLMDDYSEFILNPIYEQQFNAWRDVEEKAQLIKSLQYITAQCVKQVEVIRARRLLDGQASTTGYFDNIEHCIDEEFGQCSIASNDKLLLVGSGAYPMTLIQVAKETGASVIGIDIDPQAVDLGRRIVNVLAPNEDITITDQKVSELKDIKDVTHIIFSSTIPLKYSILEELYDLTNENVVVAMRFGDGIKAIFNYPSQETAEDKWQCVNKHMRPQQIFDIALYKKAAIKVGITDV >LR134086.1|VDZ18459.1|2570080_2570902_-|Putative-Similar-to-diaminopimelate-epimerase MNRQVIEFSKYNPSGNMTILVHSKHDASEYASIANQLMAATHVCCEQVGFIESTQNDDGNDFHLVMSGNEFCGNATMSYIHHLQESHLLKDQQFKVKVSGCSDLVQCAIHDCQYYEVQMPQAHRVVPTTINMGNHSWKAIEIIYETYVHYVIPVKQVTTEIQHLVESYVRKQQWNHKYKTVGMMLFDEQRQFLQPLIYIPEIQSLIWENSCGSGTASIGVFNNYQRNDACKDFTVHQPGGSILVTSKRCHQLGYQTSIKGQVTTVATGKAYIE >LR134086.1|VDZ18460.1|2571780_2572146_-|Uncharacterised-protein MLKEKESFRLLYQAIREIADKIGDNQLETNSVSLLLLDFDFEHEVFDELYLAILKYLNTVSIENISHSELLNLIENTIPEDREINTFVKNKIIIGFANNYFPELQVLANEIKSDMASSLKQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134086_7 | 2687289-2687370 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134086_7
|
1 spacers
spacers of LR134086_7
>7.1|2687313|34|LR134086|CRISPRCasFinder ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134086_7
The CRISPR arrays of LR134086_7 >merge|LR134086|7|2687289-2687370|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGGATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAATTTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG >LR134086|7|7|2687289-2687370|CRISPRCasFinder TTCTACAGGCAATGCAAGTTGGGG ATGGGCCCCAACAAAGAGAAATTGGATTCCCAAT TTCTACAGACAATGCAAGTTGGGG
>LR134086.1|VDZ18570.1|2686840_2687071_+|putative-DUF896-containing-protein MKILDRINELANKEKVQPLTVAEKQEQHALRQDYLSMIRGQVLTTFSTIKVVDPIGQDVTPDKVYDLRQQYGYIQN >LR134086.1|VDZ18569.1|2686300_2686621_+|Uncharacterised-protein MSETDESQGFERTHNILNINQSSLGVVTYITNKLKSTLKQHIIIACGKKRIDYRLSYNFYTTYYDNVEIKKIDCEYTYAMPIAILIRHMMSFDNDYFFAQLRHPVL >LR134086.1|VDZ18568.1|2685335_2685923_+|TetR-family-transcriptional-regulator MLGSEQMMESKSIDPRIVRTKQLLVDAFLKISREKKLSQITVKDITDIATLNRATFYAHFTDKEDLLDYTLSVTILKDLNDNLSISNVINEKVLRNIFISIASYIKDAAKSCELNSEAFCNKAHQRINNELEDIFAIMLENSYPEHQRDIIVNSASFLAAGISGLALHWFNTSQETADVFIDRNLPFLIHHIAHF >LR134086.1|VDZ18567.1|2683888_2684944_-|membrane-spanning-protein MTSIKTITPKDFIFRVLSGVAIGIVAGLVPNAILGEIFKYFMDYHPIFKTLLGVVVAIQFTVPALIGALVAMKFDLSPLAIAVVASAAYVGSGAAQFKNGAWMITGIGDLINTMITAAIAVLFILLIQHRVGSMALIVFPTVVGGISGAIGVLILPYTKMITTAIGNMVNGFTELQPIVMSILISMVFSLIIISPLSTVAIAFAIGITGLAAGSASIGISATEAVLIIGTSKVNRLGVPLSVFFGGVKMMIPNMVKYPILMLPILTTAIVSGLVSALVGIHGTKESAGFGFIGMVGPINAFKFMEVDSAWLSVLLIVVAFFVVPFVTAWLADIIYRKVFRLYTNDIFKFMG >LR134086.1|VDZ18566.1|2682579_2683281_-|Immunodominant-staphylococcal-antigen-A-precursor MKKTIMASSLAVALGVTGYAASTGHEAHAAEVNVDQAHLVDLAHNHQDQLNAAPIKDGAYDIHFVKDGFQYNFTSNGTTWSWSYEAANGQTAGFSNVAGADYTTSYNQGSNVQSVSYNAQSSNSNVEAVSAPTYHNYSTSTTSSSVRLSNGNTAGATGSSAAQIMAQRTGVSASTWAAIIARESNGQVNAYNPSGASGLFQTMPGWGPTNTVDQQINAAVKAYKAQGLGAWGF >LR134086.1|VDZ18565.1|2681815_2682304_-|Acetyltransferase,-GNAT-family MTINIIEYNRSYKEELIEFILSIQKNEFNIKIDRDDQPDLENIEHNYLNSGGQFWLAINNHQNIVGTIGLIRLDNNMSALKKMFVDEGYRNLKIGKKLLDKVIMTCKEQNIDGIYLGTIDKFISAQYFYSNNGFREIKRGDLPSSFPKLDVDNRFYYRNLKG >LR134086.1|VDZ18564.1|2679489_2681301_-|O-acetyltransferase-oatA MDTKDFKRLEKMYSPRYLPGLDGLRAFAVIGIIIYHLNAQWLSGGFLGVDTFFVISGYLITSLLISEYYRTQKIDLLEFWKRRLKRLIPAVLFLICVVLTFTLIFKPELIIQMKRDAIAAIFYVSNWWYISQNVDYFNQFAIEPLKHLWSLAIEEQFYLLFPLVITFLLHRFKPRNIIQTLFIVSLISLGLMIVIHFITGDNSRVYFGTDTRLQTLLLGCILAFIWPPFALKKDISKKIVVSLDIIGISGFAVLMTLFFIVGDQDQWIYNGGFYIISFATLFIIAIAVHPSSLFAKFLSMKPLLIIGKRSYSLYLWHYPIIVFVNSYYVQGQIPVYVYVIEIVLTALMAEISYRFIETPIRKKGFKAFAFLPKKKGQFARTVLVILLLVPSIVVLSGQFDALGKQHEAEKKEKKTEFKTTKKKVVKKDKQEDKQTANSKEDIKKSSPLLIGDSVMVDIGNVFTKKIPNAQIDGKVGRQLVDATPIVKSQYKDYAKKGQKVVVELGTNGAFTKDQLNELLDSFGKADIYLVSIRVPRDYEGRINKLIYEAAEKRSNVHLVDWYKASAGHPEYFAYDGIHLEYAGSKALTDLIVKTMETHATNKK >LR134086.1|VDZ18563.1|2678361_2679129_-|Secretory-antigen-precursor-SsaA MKKIVTATIATAGLATIAFAGHDAQAAEQNNNGYNSNDAQSYSYTYTIDAQGNYHYTWTGNWNPSQLTQNNTYYYNNYNTYSYNNASYNNYYNHSYQYNNYTNNSQTATNNYYTGGSGASYSTTSNNVHVTTTAAPSSNGRSISNGYASGSNLYTSGQCTYYVFDRVGGKIGSTWGNASNWASAAASSGYTVNNTPKAGAIMQTTQGYYGHVAYVEGVNSNGSVRVSEMNYGHGAGVVTSRTISANQAGSYNFIH >LR134086.1|VDZ18562.1|2677698_2678196_-|Glycosyl-4,4-diaponeurosporenoate-acyltransferase-precursor MKTMKKYIKTAFFCSMYWLIVQLNIANLGTRIPDKYFRQKHIIFKSFNFEKHGKFWNKWFYVRKWKHKILDGHQLNQNIYDQRHLMTINTDEIEKMIIETKRAELIHWISILPVIIFNKGPRLVKYINIFYAMITNVPIIIVQRYNRPRLTQLLRILKRRGERHD >LR134086.1|VDZ18561.1|2676212_2677706_-|Phytoene-desaturase,-neurosporene-or-lycopene-producing-/-4,4-diapolycopene-oxidase MTKHIIVIGGGLGGISAAIRMAQSGYSVSLYEQNNHIGGKVNRHESDGFGFDLGPSILTMPYIFEKIFEYSNKQMSDYVTIKRLPHQWRSFFPDGTTIDLYEGIKETGQHNVILSKQDIEELQNYLNYTRRIDRITEKGYFNYGLDTLSQIIKFHGPLNALINYDYVHTMQQAIDKRISNPYLRQMLGYFIKYVGSSSYDAPAVLSMLFHMQQEQGLWYVEGGIHHLANALEKLAREEGVTIHTGARVDNIKTYQRRVTGVRLDTGEFVKADYIISNMEVIPTYKYLIHLDTQRLNKLEREFEPASSGYVMHLGVACQYPQLAHHNFFFTENAYLNYQQVFHEKVLPDDPTIYLVNTNKTDHTQAPVGYENIKVLPHIPYIQDQPFTTEDYAKFRDKILDKLEKMGLTDLRKHIIYEDVWTPEDIEKNYRSNRGAIYGVVADKKKNKGFKFPKESQYFENLYFVGGSVNPGGGMPMVTLSGQQVADKINAREAKNRK >LR134086.1|VDZ18571.1|2687474_2687852_-|glyoxalase MIQSMWFNLHVQDLEKSAQFYKALGFKINRNPQMLDKMVGIQIGQTTVILIENKHFQNVSQQSLNTEPNEVMISLGVNTNEEVDQLVNKVKEAGGTVVQEPTVSQGFYGAMFKDLDGHHFNFLVC >LR134086.1|VDZ18572.1|2687868_2688690_-|NAD-dependent-epimerase/dehydratase-family-protein MKDILVIGATGKQGNAVVKQLLEDGWYVSALTRNKNNRKLSDIGHPHLSIVEGDLSDSDSLQSAMKGKYGLYSIQPIVKDDVSEELRQGMKIIEIAEQENIQHIVYSTAGGVNRNRTGPHFEVLAKIENRLMESNINATVIKPSFFMDNFLRIAKVEDERITLPEFINPNIKFTMISSIDIAKIASYIFAHPQSFTHQSIEIGSDEVTLSEAATIFSEVTGKSTVIEGEFVSSVAEKQWLEEKGYEVDFELMAEINPTRLSLSDWLKVQDYNK >LR134086.1|VDZ18573.1|2688708_2689008_-|Uncharacterized-protein-conserved-in-bacteria MSLNKEQRRITAEELQAHFEASTLSVQMIAEKLNVTTEDVEKALAMKAPLGIFSHQLQRFIHLVWDVRNVINDNIKENGQTPEPYTYLKGEKEDYWFLR >LR134086.1|VDZ18574.1|2689138_2689696_+|Transcriptional-regulator,-TetR-family MRKDAKENRQRIEEIAHKLFDEEGVENISMNRIAKELGIGMGTLYRHFKDKSDLCYYVIQRDLDIFITHFKQIKDDYHSDYEVMQVSLDYLLQFKIDNKALLQCIEAGNNKLRFYQSAFYQELFNFYYDLFKSDDDIYKKFKTDMLLQALSTSVFAFQIEHRHISIEAYRNYLLNIYLDEVERND >LR134086.1|VDZ18575.1|2689688_2690393_+|short-chain-dehydrogenase MTKIVLITGGNKGLGYASAEALKALGYKVYIGSRNDVRGQQASQKLGVHYVQLDVTSDYSVKNAYNMIAEKEGRLDILINNAGISGQFSAPSKLTPRDVEEVYQTNVFGIVRMMNTFVPLLEKSEQPVVVNVSSGLGSFGMVTNPETAESKVNSLAYCSSKSAVTMLTLQYAKGLPNMQINAADPGATNTDLVGDFSNNSKHVSEGIKPIIQLATIDADGPTGTFINGDGEMPW >LR134086.1|VDZ18576.1|2690490_2691501_+|5-carboxyvanillic-acid-decarboxylase MKSITFEEHYVIEDIQKETMNAISADPKGVPMKVMLEGLEKKTGFTNADELSHHDERIQFMNNQDVQIQVLSYGNGSPSNLVGQKAIELCQKANDQLANYIAQYPNRFVGFATLPINEPEAAAREFERCINDLGFKGALIMGRAQDGFLDQDKYDIIFKTAENLDVPIYLHPAPVNSDIYQSYYKGNYPEVTAATFACFGYGWHIDVGIHAIHLVLSGIFDRYPKLNMIIGHWGEFIPFFLERMDEALFAEHLNHPVSYYFKNNFYITPSGMLTKPQFDLVKKEVGIDRILYAADYPYIEPEKLGVFLDELGLTDEEKEKISYTNGAKLLGLSSNN >LR134086.1|VDZ18577.1|2691520_2692351_+|Esterase/Lipase METLELQGAKLRYHQVGQGPVLIFIPGANGTGDIFLPLAEQLKDHFTVVAVDRRDYGESELTEPLPDSASNPDSDYRVKRDAQDIAELAKSLSDEPVYILGSSSGSIVAMHVLKDYPEVVKKIAFHEPPINTFLPDSTYWKDKNDDIVHQILTEGLEKGMKTFGETLNIAPIDAKMMSQPADTEEGRIEQYKRTMFWSEFEIRQYTHSDITLDDFTKYNDKITLLNGTDSRGSFPQDVNFYINNETGIPIVDIPGGHLGYIQKPEGFADVLLNMWS >LR134086.1|VDZ18578.1|2692491_2693517_+|alcohol-dehydrogenase MKAIQIKKYNKNRDVQIRDITIPEIKSTEVLVKVAYAAINPLENLTINGSVKLIQNYKMPQTIGNELTGTIVKVGSKVEDYKLGDKIYSRLPIDRIGAFAEYVSIESNAIAKLPKNLNLKTGAAVPLTGLTAYQAITEELKAIPGKTLFIPGGSGSFGQMAVPIAKSLGLKVIVSGSPRLKDQFLAKGVDQYIDYKTENYCEVLSDIDYVIDTLGPNEFDKELSVMKPGGTIVSLINAPNKAFAVKNNFSPFKKLLFGLAGKKFDKKAQKKSIDYRFIFVRSDGEQLKILNKIIEQNNIIPDIDDHIFTIDEIDKALDYTFNHHTNGKVLIRIDNSDNTIY >LR134086.1|VDZ18579.1|2693737_2694628_-|Putative-GTPases-(G3E-family) MKIVIIGGFLGGGKTTVLNHLLAESLKESLKPAVIMNEFGKMSVDGALVSEDIPLSELTEGCICCAMKADVSEQLHQLYLKEQPDIVFIECSGIAEPVSVLDACLTPILAPFTTITHMIGVVDASMYKHIKSFPKDIQGLFYEQLAYCSVLFVNKIDSADVETTSKLLKDLEVINPEADIQVGMHGSVTLPISVRQMTVTSDNKHESLHKTINHQFVQSPVKCTKAEFIKRLACLPSHIYRLKGFMTFEDTAHTYLIQFTQGQYELTPVAFSKKVPEYLVLIGKGISKEDYQCLEQ >LR134086.1|VDZ18580.1|2694727_2696068_-|ferrous-iron-transporter-protein-B MLEVKYDMRTGHYTPIPNEPHYLVISHADKLNATEKAKLRLLIIKQKLDISLAESVVSSPIASEHVIEQLTLFQHERRHLRPKISATFLAWLLIFLMFALPIGIAYQFSDWFQNQYVSAWIEYLTQTTLLNHDILQHILFGDYGVLSLGTYSLVWALPVVILISLSTAIIDQTGFKSWMIWAIEPSMLRIGLQGNDIVPLLEGFGCNAAAISQAAHQCHTCTKTQCMSLISFGSSCSYQIGATLSIFSVAGKSWLFMPYLILVLLGGILHNRIWLKKNNQQLSVPLPYDRQLHMPNIRQMLLQMWQNIQMFIVQALPIFITICLIVSILSLTPILNVLSQIFTPILSLLGISSELSPGILFSMIRKDGMLLFNLHQGALLQGMTATQLLLLVFFSSTFTACSVTMTMLLKHLGGQSALKLIGKQMLTSLSLVIGVGIIVKIVMLII |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134086_3 | 3.1|1989535|26|LR134086|CRISPRCasFinder | 1989535-1989560 | 26 | LR134086.1 | 809217-809242 | 0 | 1.0 |
| LR134086_3 | 3.1|1989535|26|LR134086|CRISPRCasFinder | 1989535-1989560 | 26 | LR134086.1 | 1990995-1991020 | 0 | 1.0 |
| LR134086_3 | 3.1|1989535|26|LR134086|CRISPRCasFinder | 1989535-1989560 | 26 | LR134086.1 | 2345270-2345295 | 0 | 1.0 |
| LR134086_1 | 1.1|639362|28|LR134086|CRISPRCasFinder | 639362-639389 | 28 | LR134086.1 | 1989594-1989621 | 1 | 0.964 |
| LR134086_7 | 7.1|2687313|34|LR134086|CRISPRCasFinder | 2687313-2687346 | 34 | LR134086.1 | 1023201-1023234 | 2 | 0.941 |
1. spacer 3.1|1989535|26|LR134086|CRISPRCasFinder matches to position: 809217-809242, mismatch: 0, identity: 1.0
cgaaattctctgtgttggggcccaca CRISPR spacer cgaaattctctgtgttggggcccaca Protospacer **************************
2. spacer 3.1|1989535|26|LR134086|CRISPRCasFinder matches to position: 1990995-1991020, mismatch: 0, identity: 1.0
cgaaattctctgtgttggggcccaca CRISPR spacer cgaaattctctgtgttggggcccaca Protospacer **************************
3. spacer 3.1|1989535|26|LR134086|CRISPRCasFinder matches to position: 2345270-2345295, mismatch: 0, identity: 1.0
cgaaattctctgtgttggggcccaca CRISPR spacer cgaaattctctgtgttggggcccaca Protospacer **************************
4. spacer 1.1|639362|28|LR134086|CRISPRCasFinder matches to position: 1989594-1989621, mismatch: 1, identity: 0.964
ggtgtgggccccaacacagagaatttca CRISPR spacer ggtgtgggccccaacatagagaatttca Protospacer ****************.***********
5. spacer 7.1|2687313|34|LR134086|CRISPRCasFinder matches to position: 1023201-1023234, mismatch: 2, identity: 0.941
atgggccccaacaaagagaaattggattcccaat CRISPR spacer atgggccccaacaaagaggaattggatttccaat Protospacer ******************.*********.*****
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
275433 : 317526
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134086|275433:317526|DBSCAN-SWA CGTGCTATCGCTAACAATGTTATTACTTGAGCGTGTAGGTTTAATTATTATTTTGGCCTATGTGTTGATGAATATTCCATATTTTAAAAACTTAATGAATCGTCGACGTACATGGAAAGCACGTTGGCAATTATGTATTATTTTCAGTTTGTTTGCCTTAATGTCTAATTTAACTGGTATCGTCATCGATCATCAACATAGTTTGTCAGGAAGTGTGTACTTCCGTTTAGATGATGATGTATCTTTAGCTAACACACGTGTATTGACAATAGGTGTCGCAGGATTAGTTGGTGGCCCTTTTGTAGGTCTATTTGTTGGCGTTATTTCAGGTATTTTCAGAGTGTATATGGGTGGGGCGGATGCACAAGTTTATCTTATCTCATCTATATTTATCGGTATAATTGCTGGTTATTTTGGTTTACAAGCTCAAAGACGCAAGCGTTACCCGAGTATTGCGAAAAGTGCCATGATTGGAATTGTTATGGAAATGATTCAAATGTTGAGCATTTTAACATTTTCCCACGACAAAGCATATGCGGTTGACCTCATATCATTAATTGCACTACCAATGATTATTGTTAATAGCGTTGGTACGGCGATTTTTATGTCTATTATCATTTCAACATTAAAGCAAGAGGAGCAAATGAAGGCTGTTCAAACACATGATGTACTGCAATTGATGAACCAGACATTGCCGTATTTTAAAGAAGGATTGAATAGAGAATCGGCACAGCAAATTGCGATGATTATTAAAAATTTAATGAAAGTATCTGCCGTAGCAATTACAAGCAAAAATGAAATCTTATCGCATGTAGGTGCAGGTAGTGATCATCACATACCAACAAATGAAATATTAACAAGTCTGTCTAAAGATGTATTGAAATCAGGAAAGTTGAAAGAAGTTCATACTAAAGAAGAGATTGGTTGTAGTCATCCGAATTGCCCGCTTAGAGCAGCTATCGTGATACCACTTGAGATGCATGGTTCTATCGTCGGTACATTGAAGATGTATTTTACAAACCCTAATGATTTAACTTTTGTGGAACGTCAACTTGCAGAAGGATTGGCAAATATTTTTAGTAGCCAAATTGAACTTGGTGAAGCCGAAACGCAAAGTAAGTTATTGAAAGATGCTGAAATTAAGTCATTGCAGGCACAAGTGAGTCCGCATTTTTTCTTCAATTCAATTAACACGATTTCAGCTTTAGTTAGAATAAATAGCGAAAAGGCACGAGAGTTACTATTAGAATTGAGTTATTTTTTCAGAGCGAATTTACAAGGCTCAAAGCAACATACGATTACTTTAGATAAAGAGTTAAGTCAAGTGCGTGCATACTTATCACTCGAACAAGCACGTTATCCAGGAAGATTTAATATCAATATTAATGTTGAAGACAAGTATCGCGATGTGCTTGTACCACCATTTTTAATTCAAATTTTAGTTGAAAATGCCATCAAACATGCGTTTACGAATCGAAAGCAAGGTAACGATATTGACGTGTCAGTGATTAAAGAAACTGCAACACATGTACGTATTATTGTACAAGATAATGGTCAGGGTATTTCTAAAGATAAAATGCATTTGTTGGGAGAAACATCTGTAGAATCAGAGTCTGGAACTGGTAGTGCTTTAGAAAATTTAAACTTACGCCTAAAAGGATTATTTGGAAAATCCGCAGCATTACAATTTGAATCGACATCGAGCGGTACCACTTTTTGGTGTGTACTTCCTTATGAAAGACAAGAGGAGGAATAAATATGAAAGCATTAATCATAGATGATGAGCCATTAGCACGTAATGAATTAACATATTTATTAAATGAAATTGGTGGTTTTGAAGAAATTAATGAGGCAGAAAATGTAAAAGAAACATTGGAAGCACTACTGATAAATCAATATGACATTATATTTTTAGATGTCAATTTAATGGATGAAAATGGTATCGAATTAGGAGCTAAAATTCAAAAGATGAAAGAGCCACCTGCGATTATTTTTGCAACTGCACATGACCAATACGCAGTACAGGCATTTGAATTAAATGCGACAGATTATATTTTGAAACCGTTTGGTCAAAAACGTATTGAACAAGCAGTCAATAAAGTTCGTGCGACTAAAGCCAAAGATGATAATAGCGCAAGTGCAATTGCGAATGATATGTCGGCGAATTTTGATCAAAGTTTACCTGTTGAAATTGACGATAAAATTCACATGTTAAAGCAACAAAATATTATTGGGATTGGCACACATAATGGTATTACAACCATACATACAACAAATCATAAATACGAAACAACAGAGCCATTGAATCGTTATGAAAAACGATTGAATCCCGCTTATTTCATACGTATTCATCGTTCATATATTATTAACACGAAACACATTAAAGAAGTGCAACAATGGTTTAACTACACTTATATGGTAATATTGACAAATGGTGTCAAGATGCAAGTTGGACGTTCATTTATGAAAGATTTTAAAGCGTCGATAGGATTACTTTAACAGTAATCCTTTTTTTTATGCATTTTACCTATGATATTTTGTATTTCGGACTAAAAATCACGCAAATCGAAGTGAGCCATCTATACTTTAGTTAAATCAAACGTAGGAGGCAATGGTCGTGAAACAACAAAAAGACGCATCAAAACCAGCACACTTTTTTCACCAAGTCATTGTAATTGCTTTAGTACTCTTTGTATCGAAAATAATTGAATCATTTATGCCAATTCCTATGCCTGCATCAGTAATCGGTTTAGTATTATTATTTGTATTATTATGTACTGGTGCTGTTAAGTTAGGCGAAGTCGAAAAAGTAGGAACGACACTAACAAATAACATTGGCTTACTCTTCGTACCAGCCGGTATCTCAGTTGTTAACTCTTTAGGTGTCATTAGCCAAGCACCATTTTTAATCATTGGACTAATAATCGTCTCAACAATACTATTACTTATTTGTACTGGCTATGTCACACAAATTATTATGAAAGTTACTTCGAGATCTAAAGGTGACAAAGTCACAAAAAAGATCAAAATAGAGGAGGCACAAGCTCATGATTAACCACTTAGCACTAAACACACCTTACTTCGGAATACTGTTATCCGTTATACCATTTTTCTTAGCGACCATATTATTTGAAAAAACTAATCGTTTCTTCTTATTCGCACCGCTATTTGTCAGTATGGTATTTGGTGTGGCCTTCCTCTATTTAACAGGCATTCCGTATAAGACTTACAAAATAGGTGGAGATATTATTTACTTCTTCTTAGAACCGGCAACAATCTGTTTTGCGATTCCGTTATATAAAAAGCGTGAAGTGCTTGTTAAACATTGGCATCGTATCATCGGAGGTATTGGTATCGGTACAGTTGTAGCGTTATTAATTATTTTAACTTTTGCGAAGTTAGCACAATTTGCCAATGATGTTATTTTATCAATGTTACCTCAAGCAGCAACTACAGCGATTGCGTTACCAGTATCAGCTGGTATCGGTGGTATAAAAGAATTAACATCATTAGCAGTTATTTTAAATGGTGTCATTATTTATGCCCTAGGTAATAAATTCTTGAAGCTTTTCCGAATTACTAACCCTATTGCCCGAGGATTAGCACTTGGAACAAGTGGTCACACATTAGGTGTAGCACCAGCCAAAGAATTAGGACCTGTAGAAGAATCAATGGCAAGTATAGCTTTAGTGTTAGTTGGTGTAGTTGTTGTAGCAGTTGTGCCTGTCTTTGTAGCAATATTCTTCTAAAACGAAAAACCTAAGCAAGATAATAGCAATTTGAGCCATTGTTATTATCGTAAAAAAACGTCTATACTCCGGTTTATAACTGGGATATAGACGTTTTTATGTATGTATTACTTTTTACTAGGAATTATGGTATTTAGGCGTTCGTTTTATGTATTGCCACTTTTGAAAAATGGTAGAACGAATTAATTTAAACAAGAATTAAAATGTAAGTTATATCATTTGTGAAATTTCAATTAAATATTTTTCGACAAATTCTTGAAATTACTTAATGTCATCAACACTTTATAAAAAAACGGCGTATGCTTATATGTAAGAATGCAATTAAGAGGAGATTTTATAAATGAGTATGCAAAGTTCATATAAACGTTTAGTTAAAGTGCTACTAACGATTTTAGTGATTGTGTTTTCAATTTTACTAGTAGGTGGTTGGTATATTTTTAAAAATGAAGCACCTCGTCCAACAAAGATAGTAGATCAACAAGGTCATACGCTTGTTACAAAAGGCGAGCTGATCAGTGGGCAAGCGATATATGAGAAATATGGGTTAACAGATTATGGCTCCTACCTAGGCAATGGTTCCTATTTAGGTCCAGATTATACAGCAGAGGCATTACATCATTACCTGATTGGCATGCGTAAATATTATGCACAAGATATTTATCATAAGCAACTTCATAAATTAAATCATGCAGAGTTAGCCGTAGTTAAAGATAAAGTGATGAAAGAAATACGGATTAATCGTTATTCTGAAAAAGAAGATCAACTTGTATTAACGCCAGGACAAGTATACGGTCTAAAATATTTGCAAGATTATTATAAAAAAGAGTTTGTTAATAACCCTAAACAAGTAGGGTTAAATGAAAATATGATTAAACAGTTTCAAAATGATGATTATATGGTCGCAGGAAATAAAGTTGAACATTTAAGTCAATTCTTTTTCTGGGGTGCTTGGCTATCGTCAACAGATAGACCTGGAAAAACATTTTCATATACAAATAATTGGCCATACGATGTGGATGCAGGAAATACGTTGCCTAGTGCAGGGATTTTATGGACTGCTATATCTGTAACATTACTGATTGCAGGCTTGGCATTCATTATATATATTCAAAAGCGTTATCAATTTGACATGAAGCCGACGTATGAGTCGGAACGGGAACTACCAAAGATTGAAGTGGATCGTAAAATCACTGATAGTCAACGAAAAGTTGGGAAATATTTAGTCGTTGTCATGTTACTATTTTTGGTTCA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39 | Lactococcus_phage(28.57%) | lysis,transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
406216 : 417898
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134086|406216:417898|DBSCAN-SWA AATGTGGGAAAGTAAATTTGCAAAAGAATCATTAACGTTTGATGATGTGTTATTAATTCCAGCACAATCTGATATTTTACCGAAAGACGTTGATTTAAGCGTACAATTATCAGACAAAGTTAAATTGAATATTCCAGTTATTTCTGCTGGTATGGATACAGTAACTGAATCTAAAATGGCGATTGCTATGGCTCGTCAAGGTGGTTTAGGTGTTATTCATAAAAATATGGGCGTTGAAGAACAAGCGGACGAAGTTCAAAAAGTAAAACGCTCAGAAAATGGTGTTATTTCAAACCCATTTTTCTTAACACCAGAAGAAAGTGTTTATGAAGCGGAAGCATTAATGGGTAAATACCGTATTTCAGGTGTACCAATTGTTGATAATAAAGAAGATCGCAACTTAGTAGGTATTTTAACAAACCGTGACTTACGTTTTATTGAAGACTTCTCGATTAAAATTGTAGATGTAATGACGCAAGAAAATTTAATTACAGCTCCAGTGAATACAACACTTGAAGAAGCAGAAAAAATTCTCCAGAAACATAAAATTGAAAAGTTACCATTAGTTAAAGACGGACGTCTAGAAGGTCTTATTACTATTAAAGATATTGAAAAAGTTATCGAATTCCCTAATGCAGCAAAAGATGAACATGGTCGTCTACTTGTAGCCGCAGCAATTGGTATTTCAAAAGATACTGATATTCGTGCTCAAAAATTAGTCGAAGCAGGTGTGGATGTCTTAGTTATCGATACAGCACATGGTCACTCTAAAGGTGTTATCGATCAAGTGAAACATATTAAGAAGACTTACCCAGAAATCACATTAGTAGCAGGTAACGTAGCAACTGCAGAAGCAACAAAAGATTTATTTGAAGCGGGTGCAGATATTGTTAAAGTTGGTATTGGCCCAGGTTCAATTTGTACGACGCGTGTTGTAGCAGGTGTTGGTGTACCACAAATTACAGCAATTTATGATTGTGCAACTGAAGCACGCAAACATGGTAAAGCTATCATTGCTGATGGTGGTATTAAATTCTCAGGAGATATCATTAAAGCATTAGCTGCTGGTGGACATGCGGTTATGTTAGGTAGCTTATTAGCAGGTACTGAAGAAAGTCCAGGCGCAACAGAAATTTTCCAAGGTAGACAATATAAAGTATACCGTGGTATGGGCTCTTTAGGTGCGATGGAAAAAGGTTCAAACGATCGTTACTTCCAAGAGGACAAAGCACCTAAGAAATTTGTTCCTGAAGGTATCGAAGGACGTACGGCTTATAAAGGTGCGTTACAAGATACAATTTACCAATTAATGGGCGGTGTGCGTGCTGGTATGGGTTATACTGGTTCACACGATTTAAGAGAATTACGCGAAGAAGCACAATTTACACGTATGGGTCCTGCTGGTTTAGCAGAAAGCCATCCACATAATATTCAAATTACGAAAGAATCACCGAACTACTCATTCTAATTAAGATAAAGGAGAACGACAAATATGGAAATGGCAAAAGAACAAGAGTTAATCCTTGTCTTAGACTTTGGTAGCCAATACAACCAATTAATTACACGCCGAATTCGTGAAATGGGCGTTTATAGTGAATTACACGATCATGAAATTTCAATTGAAGAAATTAAGAAAATGAATCCAAAAGGTATCATCTTATCAGGTGGTCCAAATTCAGTTTATGAAGAAGGTTCATTTACAATTGATCCGGAAATATATAATTTAGGAATTCCAGTACTTGGTATTTGTTACGGCATGCAATTAACTACTAAATTATTAGGTGGTAAAGTTGAACGTGCCAATGAACGTGAATACGGTAAAGCAATCATTAATGCGAAGTCAGATGAGTTATTCGTTGGCTTACCAGCAGAACAAACTGTTTGGATGAGTCATTCTGATAAAGTTATTGAAATTCCAGAAGGCTTTGAAGTTATCGCTGATAGCCTAAGCACAGACTATGCAGCAATCGAAGATAAGAAACGTCGCATTTATGGTGTTCAATTCCATCCAGAAGTACGTCATACAGAATATGGTAATGATTTATTAAATAATTTTGTCCGTCGTGTTTGTGATTGTAAAGGTCAATGGACAATGGAAAACTTTATCGAAATCGAAATTGAAAAGATTCGTCAACGCGTAGGAGACCGTCGTGTATTATGTGCGATGAGTGGCGGCGTAGATTCATCTGTTGTAGCTGTACTATTGCATAAAGCAATTGGTGATCAACTAACATGTATCTTTGTAGACCATGGCTTACTTCGTAAAGGTGAAGGCGACATGGTTATGGAACAATTCGGTGAAGGGTTCAACATGAATATTATTCGTGTTAATGCGAAAGATCGTTTTATGAATAAATTAAAAGGTGTTTCAGATCCTGAACAAAAACGTAAAATCATTGGTAATGAATTTGTATATGTATTTGATGATGAAGCATCAAAACTCAAAGGTGTAGACTTCCTTGCGCAAGGAACACTATATACAGACGTCATCGAATCAGGTACTAAGACAGCACAAACAATCAAATCACACCACAATGTTGGTGGATTACCAGAAGACATGGAATTCGAATTAATCGAACCAATCAATACATTGTTTAAAGATGAAGTACGTAAATTAGGTATTGAACTAGGTATTCCAGAACATTTAGTGTGGAGACAACCATTCCCAGGACCTGGTCTTGGTATTCGTGTACTTGGAGAAATTACTGAAGATAAACTAGAAATCGTTAGAGAATCAGACGCGATTTTACGCCAAGTGATTAGAGAAGAAGGTCTTGAAAGAGAAATTTGGCAATACTTCACAGTGTTACCAAACATTCAATCAGTAGGTGTTATGGGAGACTACCGTACGTATGATCACACAGTAGGTATTCGTGCAGTAACATCTATCGACGGCATGACAAGTGATTTTGCACGCATCGATTGGGAAGTCTTACAAAAGATTTCAAGTCGTATCGTAAACGAAGTAGACCACGTCAACCGCGTAGTCTATGACATTACATCAAAACCACCAAGCACAATTGAGTGGGAATAATTATATATAGCAAATGATAGGCTGGAGTTACCGTGATTATGCGGTTTCCAGCCTTTTTTATTTTGCGTTGAATACGTTTTGAATACGGTATGCTTAAAAATTGATGTATTTTGCGAATTTATCAGCCACCTGATCACGTTGTTTTTCAGTTACGTGAGCGTAAATATCCATAGTTGTCTTGATGTCCCCGTGACCTAATCTGTCTTGTACTTCTTGAATAGAAAGGCCAGCCTCGAACAAAAGAGAACAATGAGTGTGTCTAAAACCATGAACTTTAATTCTCTTAAAACTATTCTTCTCACAAATTAAGTCCAATGCTTTATTGCAATGCTCGGGATATAGTTGTTTATTATCACGTACAGTAGTGAAAACATGTTGATGTTTATCAGAGGTATTGTGACCATATTTAAGGGACTCCACTCTTTGATGAGTGCGCCATGATTTCAATACACTTGCAGTTTTATCATCAATACTTATTGTTCTGTGAGATGATTTTGTTTTAGGCTCTTGTATTACCAGTTTATAATTTGCACCTCTTGCGCAAGTCTTATTAATAGATATGGTTTGTTTAGTAAAATCAATATCGTTCCATGTTAAAGCCATTAATTCTCCACGTCTAAAGCCAGTAAAAGCTAATGTTCGAAAAATAGCATAATATAATGGGTCATCTTCAACAAAAGTTAAAAACTGTTTCAATTCATCACTTGAATAATACTTTGTAGATGCGTCTTGTTGCGCTTCTTTTTTTCTGGGTGCTTTTGTATGTGCAAACGGATTATCAACGATTATCTTAAGGCTTACGGCATATTTAAACACATTAGATGTGTATATTCGTATAGCTTTAATATCAGAATACTTTTTGTTCCATTTATTAATAACTTTTTGGCAATATGGAACGGTTATTTTCTTAATAGGTACATCTTGGAAATGTTCTAATATAGCTGTATCAAATAAAGTTAAAACACGTTGATATGTGCTTTCTCTTACAGTATTTTGATACTGTTCAAGCCACAACTCATATACTTCTTTAAACGTCGTTATATCGTTGTTTAGAAAGCCATTTTGACTTACTTCTGTTTGAAGTTTTGCCTCAGCAATTTTAGCTTCTCTTTCAGTCTTAAAGCCTCGTCTAGTGGTTCTCTTTTGCTTACCAGTAATTGGATCAGTACCTAAATATGCGACAAACATATAGGCAGTCGAACCGTCTTTCTTCTTATATTTTTTAATCATATAAATCAATCCTTTCTATTGCCTGCAACGCGTGAGATTGGATTGACACGCCGTTAAGGAATGGCTACCTTGTGACGTGATGATTAATTAGTTTTTTCTTGATTTATCAATAATTTTTGTGTGTTAATAAAGGCTTTATATTTGTTTTCTTTATTAAGCTGTTCAATCATGTCTAAAATTTCAACTGTTAAAGAGTACTCTTCATCATCACCATCTTCTAAAAATAACATATTTCGAGAAAAACGAGGATCAATTTTCTCAAAGCTTACATTGAAAAAGGTTGCTAATTTTTCTGTATTTTCAGGATTGATTGTTGATCGTTCAGCAAAATAGCCTGATAAAGTTGAAGTTGGTATATTAGTATGCTGGGATATTTCTGCTTGCGTCTTTCCTTCAGACAATCGTTTTAGGTTTTTAGAAATAGTTTTTCTTAAGATTTTTTCGTGGTAACTTAATGAGGGTCTTGGCATTTTTTATCACTCCTTTACGTTATATTAACGAATAAATACGATTAAAACAATAGAAAATATGTAAAATAACGAATTTAAACGTTGACAAAACGAATAAACGCGTTTATAGTGACTTGTGAGGAGGTTAGATTAATGAATGAAAACGTAAAATTATTACTCAGAGCAGCAAGGATAAATAATGGTATGAGTCAAAAAAAGGCGGCTAGCTTATTAGGTGTACATTATCAAACTTTAGCATCTTGGGAAAAAGATAGTTCTGATTTATC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134086|406216:417898|417406_417898_+|VDZ16413.1|DBSCAN-SWA MVSDFESNDKITEVELLMHYNPKVINSKIKAMRSQIESLYHLNMNHVITNDNDMLVSVSYPLDKLVLYIIEEKDKLEYYMKTAQDRLNLFKDIIKNYSENEQQDVMRYMLSSGKVKNEGVIERLKVDIYKVESRKRQERQNQREELHRIEFNKHLEQVKKELS >LR134086|406216:417898|411989_412289_+|VDZ16408.1|DBSCAN-SWA MNWEIKNLMCDLKILKEKFEDLKDNHGSHFEDLYLHEPNHTLNKDDVIKEGFSYHERRIHNDQMFDLLLLYTEKFDELITRFDALEKASSFADQSQDNA >LR134086|406216:417898|410562_410949_-|VDZ16403.1|DBSCAN-SWA MPRPSLSYHEKILRKTISKNLKRLSEGKTQAEISQHTNIPTSTLSGYFAERSTINPENTEKLATFFNVSFEKIDPRFSRNMLFLEDGDDEEYSLTVEILDMIEQLNKENKYKAFINTQKLLINQEKTN >LR134086|406216:417898|416165_417224_+|VDZ16412.1|DBSCAN-SWA MKEFKEQFGYQLSNFDDMDIKGYANLYQKDIGKDVSMIEQGLKQLSITETEVLLPEQINRKLLGVLNMNEVNQSSNTWVGTLTKQLVSSENNFNIQELPTARKEVFKELLVNCELPQSLREVITITDDEHVESIPSLTYIKDKLATNGIELSLNGSSKYFDRREGHIYTEVSDSVVHGSDRTLDDLLKEIFINECVAYETTLLLDKNNSSGLIDKGNQDLSLYNQGIKEVSNTSIYDGIKQAMKDIPQTFRRNVSIVMNTEHHDKLIKELAQMGLGGLAGDLSNLFNVTNVVVTDDAHDVFVGDFGHAIYAKYEPIMYNKKKQALKGIYQFALNYVFDIKIIPELLRIVNIK >LR134086|406216:417898|415972_416179_+|VDZ16411.1|DBSCAN-SWA MLDHTNESVKRVFKYRDKQELLNKYHELLDKYFLHNISFYEEDKNNERIYGLVVHTKNKLGDEDYERV >LR134086|406216:417898|409342_410479_-|VDZ16402.1|DBSCAN-SWA MIKKYKKKDGSTAYMFVAYLGTDPITGKQKRTTRRGFKTEREAKIAEAKLQTEVSQNGFLNNDITTFKEVYELWLEQYQNTVRESTYQRVLTLFDTAILEHFQDVPIKKITVPYCQKVINKWNKKYSDIKAIRIYTSNVFKYAVSLKIIVDNPFAHTKAPRKKEAQQDASTKYYSSDELKQFLTFVEDDPLYYAIFRTLAFTGFRRGELMALTWNDIDFTKQTISINKTCARGANYKLVIQEPKTKSSHRTISIDDKTASVLKSWRTHQRVESLKYGHNTSDKHQHVFTTVRDNKQLYPEHCNKALDLICEKNSFKRIKVHGFRHTHCSLLFEAGLSIQEVQDRLGHGDIKTTMDIYAHVTEKQRDQVADKFAKYINF >LR134086|406216:417898|411081_411318_+|VDZ16404.1|DBSCAN-SWA MNENVKLLLRAARINNGMSQKKAASLLGVHYQTLASWEKDSSDLSRSKMLLMEKIYSIPLEYIFFGNENEFIRTKRRG >LR134086|406216:417898|411764_411989_+|VDZ16407.1|DBSCAN-SWA MNNEQKEVIQDIYNTLEAVAYNTSMEYIHNCVDGKKEWMENVNREEHLQAIIEWALQQIENNFNFENDTEMEEL >LR134086|406216:417898|411318_411579_+|VDZ16405.1|DBSCAN-SWA MSQLLSEQASQQLVNSIVDIAEKIALEKVKQSRKRYLIQKEVMEEYNVTHKVITEWEIMGLRKVKIGKTIRYDRQDIENVIEQMKN >LR134086|406216:417898|412380_414744_+|VDZ16409.1|DBSCAN-SWA MAIKKKDKIIGVKELEIPQELKLVPNWVLWRAEWNEKQQNYGKVPYSINGYRASTTNKKTWCDFESVSIEYEVDEQYSGIGFVLSDGNNFVCLDIDNAIDEKGQINSELALKMMRLTYCEKSPSGTGLHCFFKGKLPDNRKKKRTDLDIELYDSARFMTVTGCTIGQNDICDNQEVLNTLIDEYFKENLPVNDVVREESNTNMQLSDEDIINIMMKSKQKDKIKDLLQGTYESYFESSSEAVQSLLHYLAFYTGKNKQQMERIFLNYNNLTDKWESKRGNTTWGQLELDKAIKNQKTVYTKSIDEFNVIQQGSKDIKQLLNQLGHEERTKMEENWIEEGKRGRKPTTISPIKCAYILNEHLTFILFDDEENTKLAMYQFDEGIYTQNTTIIKRVISYLEPKHNSNKADEVIYHLTNMVDIKEKTNSPYLIPVKNGIFNRKTKQLEAFTPDYVFTTKISTKYNPNVVRPNLNGWDFDHWLYEIACADKEIVTLLWEVINDSMNGNYTRKKAIFFVGDGNNGKGTFQELISNLVGYKNVASLKVNEFDHEFKLSVLEGKAVVIGDDVPVGINIEDSSNFKSVVTGDSVLVNVKNKQPYRTEFRCTVIQSTNGMPKFTDKTGGTNRRLLIVPFNADFNDSNENVDIKEQYLKDNHVLEYVLYKAINLEFDRFTIPQVSKKMLEIYKQDNDSVYDFKIEEFDQWNIQKVPKKVVYYRYRAFCEENGYMGKMSDRTFYRRFEKYLGKEWNTDAKCRYSSIDELEEIVGYINRTLMPFGQQHRSYKNENLKIV >LR134086|406216:417898|406216_407683_+|VDZ16400.1|DBSCAN-SWA MWESKFAKESLTFDDVLLIPAQSDILPKDVDLSVQLSDKVKLNIPVISAGMDTVTESKMAIAMARQGGLGVIHKNMGVEEQADEVQKVKRSENGVISNPFFLTPEESVYEAEALMGKYRISGVPIVDNKEDRNLVGILTNRDLRFIEDFSIKIVDVMTQENLITAPVNTTLEEAEKILQKHKIEKLPLVKDGRLEGLITIKDIEKVIEFPNAAKDEHGRLLVAAAIGISKDTDIRAQKLVEAGVDVLVIDTAHGHSKGVIDQVKHIKKTYPEITLVAGNVATAEATKDLFEAGADIVKVGIGPGSICTTRVVAGVGVPQITAIYDCATEARKHGKAIIADGGIKFSGDIIKALAAGGHAVMLGSLLAGTEESPGATEIFQGRQYKVYRGMGSLGAMEKGSNDRYFQEDKAPKKFVPEGIEGRTAYKGALQDTIYQLMGGVRAGMGYTGSHDLRELREEAQFTRMGPAGLAESHPHNIQITKESPNYSF >LR134086|406216:417898|415403_415748_+|VDZ16410.1|DBSCAN-SWA MNRNRMKQIILEYIKNNDSTSFVEIENVFEEQGFKYKGNGAYTSGNHKNIIFWVGWNEEAFNIVADLKRDGLIEMQICPPMYYLIDGKGLKLPIVKNKNIKIDHWLPVTFSLVN >LR134086|406216:417898|407707_409249_+|VDZ16401.1|DBSCAN-SWA MEMAKEQELILVLDFGSQYNQLITRRIREMGVYSELHDHEISIEEIKKMNPKGIILSGGPNSVYEEGSFTIDPEIYNLGIPVLGICYGMQLTTKLLGGKVERANEREYGKAIINAKSDELFVGLPAEQTVWMSHSDKVIEIPEGFEVIADSLSTDYAAIEDKKRRIYGVQFHPEVRHTEYGNDLLNNFVRRVCDCKGQWTMENFIEIEIEKIRQRVGDRRVLCAMSGGVDSSVVAVLLHKAIGDQLTCIFVDHGLLRKGEGDMVMEQFGEGFNMNIIRVNAKDRFMNKLKGVSDPEQKRKIIGNEFVYVFDDEASKLKGVDFLAQGTLYTDVIESGTKTAQTIKSHHNVGGLPEDMEFELIEPINTLFKDEVRKLGIELGIPEHLVWRQPFPGPGLGIRVLGEITEDKLEIVRESDAILRQVIREEGLEREIWQYFTVLPNIQSVGVMGDYRTYDHTVGIRAVTSIDGMTSDFARIDWEVLQKISSRIVNEVDHVNRVVYDITSKPPSTIEWE >LR134086|406216:417898|411625_411772_+|VDZ16406.1|DBSCAN-SWA MKLYLVYVTLTSFLTILLLAISNMYVAFSVYGMMVTYGFNLTGGLENE |
14 | Staphylococcus_phage(27.27%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
741785 : 749606
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134086|741785:749606|DBSCAN-SWA ATTATGACGTAATGTCTAATTTGTGTAATGTCACAGTTATCGTAGTTCCTACATCTATATCACTGCTTACACTGATTTTTGCGTTATTTTGTTGCGCGAGTTCATTAGCTATATATAAGCCTAATCCAGAACCACCCGTTTTTGTATTACGAGAGTTTTCTACTCTGAATGTACGTTCGAATATACGTTCTTGTAGTTCTGGTATAATGCCAATACCTTCATCGCTAATAGCAATGTCGATAGTATCTTGATCTTTGTTTTCACTAATATTAATATCAATGCGACTACCAACATTTGAAAATTTTAGCGCATTATCAAGTAAGTTTGTTAAAATACGCTCAAGTGGCGTTCGATATTGATAAAATGCATCAATTTCGCTACAGAAATTCACTTCTAATGTGCGGTTTTCATGTTTGATACGTTGCTCATATGGTTGCAATATTGATACAAGTAATTGGTCTAGTTGTATTAATTCTGGGGGATATGTTTTACCTGTATTTAAAGTGATAATATGAGTCATATCATCAAATAATGTTGATAATCTGTTTGCTTGTTTAATTAATATGTCGTATGACTCTTTAATCTCATGATCCTTTGTGATTATACCATCACGTAGTCCTTCAGAATATGAAATAATGCTTGCTAAAGGTGTTTTTAAATCATGGGCTAAGTTTTGAATCAGTTCTGTTTTTTCTTGTTGTTCGGATTTAATTTGATTCATTTGTTGCGTAATTTCAGAAGCCATTTTATTAAAAGATTGATTTAATTCATAAATTTCTTTTGGTGAATTAAACGTTTTATCATTGCTTGCGTAATTTCCGTTAGCAAATTGCTTAGTTTTTATATTAAACTGCTTAATTTTTTGTATAAGTGGATTAATAAAAATACTACATATTAATAAGGTTAAACAGCTTGTAATTATTGTCGTTAAGGTCAAAGTTAGTGTCATATGGCCGTTAAACCACATTAAAATATATGCAATTGCTAAAATAGTTGAAGTTAATAGTATACTCGATACGACGCCAATAATGATTTGACTTCTAATTGATAACACCATTATCGGCTCCTTTCAAATTTATATCCTAATCCCCATACAGTTGTGATGGTATATGTTGTAAAGCTCTCTTTTTCTAATTTTTCTCTAATACGGTGTATATGGACATTCACGGTATTAGCATCTTCGTAATAGTCATATCCCCAAACTTTTTCAAGTAATTCTGATTTAGAAATAACTTCATTTTCTCTAGAAGCTAAATACCACAATAACTCAAATTCCTTAATACGCATAGGGACTTCGTGACCATTTACAGTCACAACTTTACTTAAGTTAATAAGTGTTAATTCATCAAACGACAGTTGTTCAACTGGTTGATGATGGTATTTCTTCATTCTTGTAAGTAAATTATTAATACGTAAAACGAGTTCCCTTGGACTAAATGGTTTTTTGACATAGTCATCTGCACCTAAAGTTAAGGCGTAAATGGTATCATGTTCTTGTGTTTTGGCAGTTAAATAGATAAAGGGGATATCTAATTTTTGCCTTTTCATTTCTTTGACAATGTCGTAACCATTAACTTCTGGCATCATGATATCAAGTACCATGATATCAATATCATTTGATAGTAAAGAAATTGCTTCTTTACCGCTAGTTGTCGTTGTTACTTTGTAACCTTCATATTCAAAATAGGTTTGACAAATGTCTACAATGTCTTGTTCATCATCCACGATCAGTAAGTGGGTCATCTATTTTTTCACCTCTGTTCTTACGACCTCTAAAGTAATTAATGATTTCTTTAAGTGAAATCTGTTTTAACAATGAGTGACTCATTAGTAAAAGGATAAAGAAAGTTAATTGAAGAGGATACGTAAATATCATATCTGCTAAGATATAATTTATCATAACAAAGGCTCCAAAGAAACTAGCAGCATATGCAAAAACTCCAAAAATTAAACCTAATCCAATTGCAATCTCTCCAAGTGGAACAATAATATCAAATAATGACGTCGTATGTGCAACTATATTTGCGAAAAACCACTTATACCACTCTGGTGAATCAGTATTGTTAGCTATGACTGGGACTAAACCTTTCAGCGTAAATCCGCCCGTTAATTTTTCGTAGCCTTGCATTAACATAACAATACCTGAACCCACACGAATGATAAATGTAACGAGTAGCAATAATTTATTCATGATGTTCACATTCTTTCTATTTATTGTGTGTAATTTATATAAACATAAGATTAAGCAACATAATGCGATTTGTAGTGTTATGTGAACAGGAAGTGTTTGAGCTCATGGGCTGCTTAAGCTAAACAAACCTCAAGCTCTAAAAATATTTACTTATGTGCTCTACAATCTTATGGGATTTAATAGTTGTATATATATTGAAAAAAGGAAAGTATGATTTCTACAAGCTAGGGGGGGCTGTGAAATCATACGCTTTCCATTGAGTAATGAGTGTAATGTATATTTTTAAAATTTGTAATGTATAGTAATAGTATGTTGTAAATAAAAGTTTAACTCAGAAATTGATTATTTTAATTTAGCGCCGCCGAAGATGACGTGAGCTTTTTTACAATAGATTGTTACTTCATCATATTTGCTTAAATCTACATTTTTAAGATCAAATGTTTGTTTTTCTTTATCGTAGTCAACCATTGCGATTTCTTTACCGTTTTTAATGTCGCCATTTTTTGTTAGGTAGACGTATAAATCTGGACCTTTTGATGATTTGTAGTTAGTAAGCATTAATTTACCATTTTTAATCTCAGCTTTACCTTCAACAGTTTCACCGTTTTTAGAACTGAATGTACCTGTTAGGTGTTTTGTTTTATCAGTTTTAACATTGCTGTCTTCTGACTTTGTTTTTTGTTCAGTTTTGTTACCTTGATCTTGTGAATTAGAATTACCACAAGCGCCTAAAGTTAATACAGCGGCAACAGCACCAACTGCTAAAAAATATTTTGTATTCATGCTAACTCCTCATTTCTTCAATTTGATAAGTTAAGTTTAAAATGAAGGCAAATAATATGCCATTAACTAATTCTTAACTTCGTTTAAATATCGCTTAACTAATATTGAAGAAAGAATAATTTGAAAATGAAAATAATTGTCTGATTTAAATAAATAGGAGGCAAAATAAGAAGAGGGCGGTTTTTTAAGTAAGAAAATATTTATCTAAACTAGTTATCACTATAAAACACTTCTGATATATCGAACTAAGAATATCAGAAGTGTTTTATAGTTTTGGTATTAAAATTTATAAACCTTTTGCCACAATAAAAACAACAAGAAAATAAGATAGACGATTAAATACAAGTACCAATATGGTGTTAAAACCATCATAACGATAAATGAAATGTTAATAATGATAAGTCCTTTAATCATTAGTTTCTTTATTTTGTTATTATTTTCAGCAGTTTCATCTAAGTTATTAAATGTTGAAATAAACAACATAATACCACCAATGATGAAAATGGCAGGGGCTAAAAATGGAATAGACATATATATTGATTGTGTACTTGAAAAGTCGGTAACACGTTGTGTTAAACTGACAACAATCGTTAATATGATAGCAATAAATTTTTGGTCTGTAATGTATACAGGTTTTAATTTTTTATCAATGTAAAACTGTAGTATCGTCCAAATGATAAACATTGTTATAGTACACAGAGTAATAAAGTTATATTTATCAATTATGAATGTATTTATAAAGGCGTTTATCGTAATAGATAACAACATTGCACTTAATGATAAATGTTGCATTTGATGCCTATATAAATTGAATCCAGTTATAAGTATGACGATAGCAATATTAATTAATATATATACAATCATGATGGACTCCTGTTCGTTATACTTCAATCAACTATTATATCAATTAATATATTGTTATTCATTAGATATGACTTGTAAAAAGTAAAATAAGTTATCCTTTATACACCTTTTTTATTACTCCAAAGTAATGTATGAAGTTGTGGTAACACATAAACGTGATTCATATCATTACTTTGCATAACTAAATCCACCAACTGCTCGTAGCGTTCTAACAACTTTTCGGTATGATTATCTACGCTGTCTGATAAATATGGGTTACCAACTTGTAAATAGAAGGGAATATTTGGATAACGGTGGTGTATCATTTTGGCAAAATCATAATCTTTATCATCGAATACAACTACTTTTAAGTTTAATGAGGAAGGTACACATTGTGTAATCACTTCATCTAACTTTTTTAAATCTGGTGTCATAGTTGAACTTGGTGGTTTTGGACTAATCGTTAAATCATCAATTTGTGTCATCCAAGGTTGGAATTTACTGCCTTGTGTCTCCAGTGCGCTGAAAATACCTTTATCTTGAAATAAGTTAACTAACTCTTGGATACCTTTAATTAATGCTGGGTTACCACCAGAAATTGTAACGTGGTTAAATAAATCGCCACCAATACGTTTTAATTCATCATAAATTTCTTCAGCGGTCATGAGTTTTATATCGCCTTTAGCACTACCATCCCAAGTAAATGCAGAATCACACCAGCTACAGCGATAATCACATCCAGCTGTTCTCACAAACATCGTTTTTCTACCGATTACTCGACCTTCACCCTGAATGGTTGGGCCGAATATTTCGAGTACAGGAATTTTAGCCATTAGTTACACCTGTTCCTTTGGTCTAAATACGACATAACTTGTTGGTGTTTCTCTTACAAATACTTGAATACATTTTGGTTGGTGTTCGAGCGATGCCAAACTTTCTTTAACAATTTGATAAATTGTTTCCGCTACGATTTCAGTTGAAGGGATTTTGTTTTTAAAAGCAGGTAAGTTATTTAACAGTTGATGGTCAAATTTACCGTGTATCATCTTTTTCAAATGGCTAAAGTTCACTAAGAAGCCAGTGTCATCTAGTTTATCACCGACAATTGTTAAATTAACAAAGTAAGTATGACCATGGACATTTTGACAAATACCTGCTTCTTCACATGGAATGTGATGTGCAGCTGAAAAATTAAAATCTTTATTTAATTCGAATTGATATGGATGCGTTGTACTAGGATAGATTTGTTGTAACATTTTAAAGCGCTCCTTTACTTTCAAGATATTGATTTAGTCCACGTTGACGTAAATGACAAGCTGGACATTCACCACAGCCATCCCCAATGATACCGTTATAGCATGTTAATGTTTTTGTACGAATATAATCTAAAACTTCGAGTTCATCACTTAATTTCCACGTTTCTGCTTTGTTTAACCACATTAAAGGAGTATGAATGACAAAATCTTTGTCCATAGCTAGGCTTAATGTTACGTTCATTGATTTTATAAAACTATCGCGACAGTCTGGGTAGCCTGAAAAGTCTGTTTCACATACGCCTGTAATAATATGCTTAGCCCCAATTTGATAAGCTAGAGCGCCTGCAAACGACAAGAAAAGTAAATTTCTAGCTGGAACAAATGTATTAGGTATACCATCTTCATTATTAGTAATTTCCATATCATGTTGTGTTAATGCGTTTGGAGTAAGTTGTGATAATAATGACATATCTAAAACGTGATGTTTCATTCCTTGATCTTGTGCAATTTGTTTTGCGACTTCAATTTCAGTATCATGTCTTTGGCCATAATTAAACGTTACGAGTTCAACTTCTTTGAAATGTTTTTTTGCATAAAAGAGACATGTTGTACTGTCTTGACCACCACTAAAGACAACGATGGCTTTTTCATTATTTAATACACTTTCCATTTTGTAATTGCTCCTATCATTAATAATATTAATAAAGAGGTTAATGGCATTGATAAGCCCGTTTTTAATTTATAAAATAAAAAAAGCCTATCTCCATAAAAGATAGACGAAAGAAATGGGTTGCTCCTATAATATATATTAAAGGTTTACCAACGAATGTTTGAAATTTCAATGTCTAGTTTTTTATAGAGGGTTTCAGCTAGGAACCTCTGATATTCATTTATGTACGATGAATAGAATATACCATATATTAGTTAAAATCAAGGTCAGGATAATGACAATGCTTTTAAAGTTTTAGCTACATCCAATACATATTATAAAAATAAAACACATTTAGAACGGAGTATACAATGATTCTAGTCATAGATAATAATGATTCATTTACATATAATTTAATAGACTATATTAAGACTCAAACGAAACTAACAGTTCAAGTTGTTGGTATTGATAATCTGCTGATAGAAGACGTCATTAATATGAAGCCAAAAGCAATTGTTATTTCACCTGGGCCGGGTAATCCGGATGATTATCCTATCTTGAATGAAGTGTTAGAACAATTTTATCAGCGTGTACCTATACTAGGTGTATGTTTAGGATTTCAATGTATCGTGTCTTATTTTGGTGGAAATATCATTCACGGCTATCATCCTGTACACGGACATACTACACAGTTACGCCATACCAATGAAGGTATTTTTCAAGGACTGCCTCAAAATTTCAATGTAATGCGTTATCATTCATTAATTGCTGACGGAGCGACTTTTCCAAATTGCTTAAAGATTACAGCAAAAAACGATGCAGCGATTATTATGGCATTTGAGCATATTAGATTTCCGGTTTTTGGTGTGCAATATCATCCTGAATCTATTTTGAGTGAATACGGTTATCGACAAGTTGAATTATTTTTATCGAAGGTAGGTGATTACTGTGAGAATAGAATATAATTATCGCTACTATTTAACTGAAAATGAATATAAGCAATACCATATTCAATTAAAGGGATTTATAAAGAAGTATGTTGCTACTAAGTTGGCTGATGTGGGAGAAGTGATACACTTTGCACAAGCGCAGCAACGACAAGGTAGATATGTCTCGTTATATTTAAGTTACGAAGCGGCAAAGTATTTTAATCATGTTATGTGTACACATTCATTAGCTAAAGATGATATTTATGCAGTAGCTTATAGTTTTGAAAAAGCGGAAAGCATAAATTCAACATATGAACATCAAACTTCTTATGTATCAAAGCATCATTTTTCATTTGTTGAATCTTCTGAGGTTATGATGACTAATATTAAACGTGTCCAACAAGCAATTGTCGAAGGCGAAACGTATCAAGTGAACTATACGGCGCGCTTAACAGATAACATTTATTATCCTATTAGTACTTTATATGAACGATTAACTCAATTTAGTAATGGTAATTATACTGCGTTATTACAAACAGATGAAATCCAAGTAGCGTCTATCTCACCAGAATTATTTTTTCAAAAAGGACAATTTAACAATGTCGATAACGTTATCATAAGCAAACCGATGAAAGGGACAATGCCTAGAGGAAAAACGGAAGCTGAAGATCAACAGTATTATAAAACATTGCAAACTTCTTCGAAAGATCGTGCAGAAAATGTCATGATTGTTGATTTACTAAGAAACGATATAGGGAGAATATCACAGAGTGGCTCAATTAAGGTGTATAAACTATTTTTTATTGAGGCATATAAAACTGTATTTCAAATGACTTCGATGGTAAGTGGAACTTTAAAAAATAATACAGACTTAACTCAAATTTTAACATCGTTATTTCCTTGTGGTTCGATAACAGGTGCACCGAAACTGAATACAATGAAATATATTAAACAATTAGAAAGTTCACCTCGTGGTATATACTGCGGAGCAATTGGACTATTACTTCCAACTGAAGATGATAAAATGATTTTTAATATTCCAATTCGTACTATTGAGTATAAATATGGACAAGCGATTTATGGAGTCGGAGCAGGTATTACAATTGATTCTAAGCCAAAAGATGAAGTAAATGAATTTTACGCAAAAACCAAGATTTTGGAGATGTTATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134086|741785:749606|746437_746857_-|VDZ16708.1|DBSCAN-SWA MLQQIYPSTTHPYQFELNKDFNFSAAHHIPCEEAGICQNVHGHTYFVNLTIVGDKLDDTGFLVNFSHLKKMIHGKFDHQLLNNLPAFKNKIPSTEIVAETIYQIVKESLASLEHQPKCIQVFVRETPTSYVVFRPKEQV >LR134086|741785:749606|744317_744758_-|VDZ16705.1|DBSCAN-SWA MNTKYFLAVGAVAAVLTLGACGNSNSQDQGNKTEQKTKSEDSNVKTDKTKHLTGTFSSKNGETVEGKAEIKNGKLMLTNYKSSKGPDLYVYLTKNGDIKNGKEIAMVDYDKEKQTFDLKNVDLSKYDEVTIYCKKAHVIFGGAKLK >LR134086|741785:749606|742840_743527_-|VDZ16703.1|DBSCAN-SWA MTHLLIVDDEQDIVDICQTYFEYEGYKVTTTTSGKEAISLLSNDIDIMVLDIMMPEVNGYDIVKEMKRQKLDIPFIYLTAKTQEHDTIYALTLGADDYVKKPFSPRELVLRINNLLTRMKKYHHQPVEQLSFDELTLINLSKVVTVNGHEVPMRIKEFELLWYLASRENEVISKSELLEKVWGYDYYEDANTVNVHIHRIREKLEKESFTTYTITTVWGLGYKFERSR >LR134086|741785:749606|743501_743975_-|VDZ16704.1|DBSCAN-SWA MNKLLLLVTFIIRVGSGIVMLMQGYEKLTGGFTLKGLVPVIANNTDSPEWYKWFFANIVAHTTSLFDIIVPLGEIAIGLGLIFGVFAYAASFFGAFVMINYILADMIFTYPLQLTFFILLLMSHSLLKQISLKEIINYFRGRKNRGEKIDDPLTDRG >LR134086|741785:749606|748454_749606_+|VDZ16711.1|DBSCAN-SWA MRIEYNYRYYLTENEYKQYHIQLKGFIKKYVATKLADVGEVIHFAQAQQRQGRYVSLYLSYEAAKYFNHVMCTHSLAKDDIYAVAYSFEKAESINSTYEHQTSYVSKHHFSFVESSEVMMTNIKRVQQAIVEGETYQVNYTARLTDNIYYPISTLYERLTQFSNGNYTALLQTDEIQVASISPELFFQKGQFNNVDNVIISKPMKGTMPRGKTEAEDQQYYKTLQTSSKDRAENVMIVDLLRNDIGRISQSGSIKVYKLFFIEAYKTVFQMTSMVSGTLKNNTDLTQILTSLFPCGSITGAPKLNTMKYIKQLESSPRGIYCGAIGLLLPTEDDKMIFNIPIRTIEYKYGQAIYGVGAGITIDSKPKDEVNEFYAKTKILEML >LR134086|741785:749606|741785_742841_-|VDZ16702.1|DBSCAN-SWA MVLSIRSQIIIGVVSSILLTSTILAIAYILMWFNGHMTLTLTLTTIITSCLTLLICSIFINPLIQKIKQFNIKTKQFANGNYASNDKTFNSPKEIYELNQSFNKMASEITQQMNQIKSEQQEKTELIQNLAHDLKTPLASIISYSEGLRDGIITKDHEIKESYDILIKQANRLSTLFDDMTHIITLNTGKTYPPELIQLDQLLVSILQPYEQRIKHENRTLEVNFCSEIDAFYQYRTPLERILTNLLDNALKFSNVGSRIDINISENKDQDTIDIAISDEGIGIIPELQERIFERTFRVENSRNTKTGGSGLGLYIANELAQQNNAKISVSSDIDVGTTITVTLHKLDITS >LR134086|741785:749606|745720_746434_-|VDZ16707.1|DBSCAN-SWA MAKIPVLEIFGPTIQGEGRVIGRKTMFVRTAGCDYRCSWCDSAFTWDGSAKGDIKLMTAEEIYDELKRIGGDLFNHVTISGGNPALIKGIQELVNLFQDKGIFSALETQGSKFQPWMTQIDDLTISPKPPSSTMTPDLKKLDEVITQCVPSSLNLKVVVFDDKDYDFAKMIHHRYPNIPFYLQVGNPYLSDSVDNHTEKLLERYEQLVDLVMQSNDMNHVYVLPQLHTLLWSNKKGV >LR134086|741785:749606|746858_747527_-|VDZ16709.1|DBSCAN-SWA MESVLNNEKAIVVFSGGQDSTTCLFYAKKHFKEVELVTFNYGQRHDTEIEVAKQIAQDQGMKHHVLDMSLLSQLTPNALTQHDMEITNNEDGIPNTFVPARNLLFLSFAGALAYQIGAKHIITGVCETDFSGYPDCRDSFIKSMNVTLSLAMDKDFVIHTPLMWLNKAETWKLSDELEVLDYIRTKTLTCYNGIIGDGCGECPACHLRQRGLNQYLESKGAL >LR134086|741785:749606|745037_745622_-|VDZ16706.1|DBSCAN-SWA MIVYILINIAIVILITGFNLYRHQMQHLSLSAMLLSITINAFINTFIIDKYNFITLCTITMFIIWTILQFYIDKKLKPVYITDQKFIAIILTIVVSLTQRVTDFSSTQSIYMSIPFLAPAIFIIGGIMLFISTFNNLDETAENNNKIKKLMIKGLIIINISFIVMMVLTPYWYLYLIVYLIFLLFLLWQKVYKF >LR134086|741785:749606|747877_748471_+|VDZ16710.1|DBSCAN-SWA MILVIDNNDSFTYNLIDYIKTQTKLTVQVVGIDNLLIEDVINMKPKAIVISPGPGNPDDYPILNEVLEQFYQRVPILGVCLGFQCIVSYFGGNIIHGYHPVHGHTTQLRHTNEGIFQGLPQNFNVMRYHSLIADGATFPNCLKITAKNDAAIIMAFEHIRFPVFGVQYHPESILSEYGYRQVELFLSKVGDYCENRI |
10 | Hokovirus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
761578 : 773845
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134086|761578:773845|DBSCAN-SWA TATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAATTTGTATGGACCATCGCCAAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGAAGTTATATTAATGATTTCTAGAGCTGTATTAACGCCAGGGGATACTATTGTTACAAGTGAAGCGACATTCGGTCAATATTATCACAATGCGATTGTTGAATCAGCTAATGTGATACAAGTACCTTTAAAAGATGGTGGCTTCGATTTAGAAGGTATTTTAAAAGAAGTTAATGAAGATACGTCATTGGTATGGTTATGTAATCCAAATAATCCTACAGGTACATATTTTAATCATGAGAGCTTAGATTCGTTTTTATCTCAAGTACCTCCACATGTACCAGTAATTATAGATGAAGCTTATTTTGAATTTGTGACAGCAGAGGACTACCCGGATACACTTGCTTTGCAACAAAAATATGACAATGCTTTCTTATTACGTACATTTTCAAAGGCGTATGGATTAGCGGGTTTACGTGTAGGATATGTGGTAGCAAGTGAACATGCGATTGAAAAATGGAACATCATTAGACCACCATTTAATGTGACACGTATATCTGAATACGCAGCAGTTGCAGCACTTGAAGATCAACAATATTTAAAAGAGGTAACACATAAAAATAGTGTTGAACGCGAAAGATTTTATCAATTACCTCAAAGTGAGCATTTCTTACCAAGTCAAACGAATTTTATATTTGTAAAAACAAAGCGGGTAAATGAACTTTATGAAGCGCTTTTAAATGTAGGGTGTATTACGCGACCATTTCCAACTGGTGTTAGAATTACAATTGGTTTTAAAGAACAAAATGATAAAATGCTAGAAGTTTTATCAAACTTTAAATACTAATAGAAAAGGGCACCACATGGTATGAATATGTGCCAAAATGCAGTGTGAATTATGAGGTGAGAGCATTTATTGTAAAAAGCAACAATAGATGATATTGTTTTGTATCAATTGCTTTTTTGCTATACTGAATTAATACTGATATTTTGAGGAGAAGATTAAAATGACCCGTAAATCAATCGCGATTGATATGGATGAAGTATTGGCAGATACATTAGGAGAAATCATTGATGCTGTCAATTTTAGAGCGGATTTAGGTATTAAAATGGAAGCTTTGAATGGTCAAAAACTTAAACATGTTATTCCTGAACATGATGGATTAATTACAGAAGTATTGAGAGAACCAGGCTTCTTCAGACATCTTAAAGTGATGCCGCATGCACAAGAAGTTGTAAAAAAATTAACTGAACATTATGATGTATATATTGCTACAGCAGCAATGGATGTACCAACATCATTTAGTGATAAATATGAATGGTTACTAGAGTTCTTTCCATTCTTAGATCCACAGCATTTTGTTTTTTGTGGTAGAAAAAACATTGTTAAAGCTGATTATTTAATAGATGACAATCCTAGACAGCTTGAAATTTTTACTGGTACACCGATTATGTTTACAGCAGTGCATAATATTAATGATGATCGATTTGAACGCGTAAATGGTTGGAAAGATGTAGAACAGTATTTTTTAGATAATATTGAGAAATAAAAATATATCACTTGAAGCATTTTATGTAGCAAAGATGATGGATATACTATTATGAAGTTGGGACTGGACGACGAAATAAATTTTGCGAAAATATCATTTCCGTCCCGCTCTCAATAAATGTTAGTCTATCTCATTATTATAAATCGGATGAATGTGTAAATCTATGGCAGATTACACGTCATCCGATTTTTTATAGGATTTGAAAAAGGCGCATAAACCACTATGATTTAAAATACAACATCAATCATTTTAGTGGCATGCGCCAAAATTATATGTCTGTTTTTGAAACAGGGTAATAGCTTAAAGCTAATAAAAACGAATATAAGGTGCGTTGAATCTTATGATTACACTCTAAACCTAATATAATATCCCGTTAAGATCATTCCGGATGCTTACAAATCATTGACAGTAAGTAACTGAATGGCATTTGGTATAACCTCAATATCAATAGGTGTTTCTAATGAAATTTCGCCATCAATATCAACTTTCATTGCTGGATCTGTTGTAAGTGAAATCTTTTTACCAGGTATATGCTCAATACCTTGAGTAATTTCATTCCAATTCATGCTATCACGCTTTTTAAAAATATCATTTAAAATACTGAAACTTTGTTCATTAAAAATGAAAGTGTTCAGTTCACCATCTTGAGGAGACAAATCAGTCAATGGTATACGACTACCACCAATGAATGGACCATTTGCTGTAAGTATCATGGTCGTTTCGCCAGAATATGTCTTATCATCAATTGATAATTGATAATTAAATTGTGTTGGATTTAGCAGTGTTTTAACAGTTGATCCAATATAACTTAATTTACCAAATATATCTTTTGACCCATCTTGTACGTTTTCAGCGTTTTGAACAATTAGACCTAAGCCAACAAAGTTGAGTGCATATTGATTATTTACTTTTATTACATCGTATGTACCAACTTGTGCAGAAATCATTTGTTCACTAGCTTGTTTATGATTAGGTGCAATATTTAGCGTTTTTGTAAAATCATTAAAAGTACCGCCTGGTAAAATGCCGATAGGGAGTTGAAGATTATGTGCCATAACACCATTTATAAGTTCGTTAACCGTGCCATCACCGCCAAGAATAAATAATATATCTACATCTTTTGCATAGTTTTTAGTTTTGATTTCTTGGCAATATTTAATAATGTCACCTTCGCTTTCACTCAATTGAATAGAAAGATGCTTACAAATTGAACTTAATGCTGTTGTAACTTCCCCAATACCTTGATTAATATTTTTTAATCCACTGTGTTCATGGTAAAAGAGGACACCATGTGTATATTTGTTTTCCATAGTTTAGCCTACTTTCTAAAAATTGGTTCATTAAATATATATACCCACTTTTAATTGCTAATACCAAAAATATGTTTTTAAATAGAGAAAATGGTAATAAATGAAATTAATCTCTATAGAGTGGGACGAGAAAATATAGTTATAGCTGTCTATAATGAGCATATTAAGTTTTTATTTATACTGATAACTTGAATTTAATTAATGGAAACCTATAAAAAAACAGTAAGCCATTTAAATGACTTACTGTTTTTTAATTTAGGTCAACAATATTAACGAATACCTTTCATTGCTTTAATAATTAAAGGTGAGAATGCTAATACAATTGTTGTAACAATAATTGCAACAACACCTAAGAAAATAAAGTAATTTGTTTGACCTAGTGGTTCTATTAACTTAACTAATGTACCATTGATTGCTTGTGCAGAAGCGTTAGTTAAGTACCAAATACTCATCATTTGGGCATTAAATGCTTTAGGTGCTAACTTAACAGCAGCACTATTACCCGTTGGTGATAAGCATAGCTCACCGATAACACAAATAATGTACGATAAAATAACCCAGTTAACTGAGAAGTTTGATGAACCTGATGCATAACCTACAATACCAATTAGTATGTATGACGCACCTGCTAAGAACGTACCAATTGCAAATTTTACTGGCAGGCTAGGTTGTTTAGTTCCAAGCTTTTGCCATAAAAGTGAAATAATTGGAGCTAATAATAAAATAAATAATGGGTTAATTGATTGGAAGATCGCTTCACCAAAGTTTGTTTTCCAACCAAATAAGTTTAATTTCATATCTGAATGTTCAATTCCATAAATGTTTAATACATTAGACCCTTGTTCTTGAATAGCCCAGAACACCATTCCAAGAATAAATAATGGAATAAATGCTTTAACACGAGAACGTTCAGTATCAGTGACATCTTTACTTCTAATAATTAAAGTGAAGTAAATGATTGGTAATGCAATACCTAATACTAAAACAGTATTACTAACTAAGTTAAATGATAATGAGTTAGTTAATGCACCAATAACGATAATTAATACAATTGCTAAGACAACACTTCCGATAATAAGACCATACTTTTTCTTTTCAGCTGGTGTCAATGGGTTAGTAGGTTTCATACCAACGCTACCTAAGTTTTTGCGGTTGAAAAGTACATACCATACTAAACCTAATGCCATACCAACTGCTGCAATCAAGAATCCGCCGTGGAAGTTTTTAACATTAACAAAGTGTTGCAAAATAATAGGTGATAATAATGCACCCATATTAACTGACATATAGAAAATAACAAAACCTGCATCCATACGTCTATCATTTTCAGGATATAAACGGCCAACGATATTTGAAATATTTGGCTTCATTAAACCTGAACCAATAATGATGAAGAACATTGATGTGAATAAGCCGATTAATGCAAATGGTAAGCTTAAACAAATATGTCCGATAATAATAAAGACTGCACCTAATAAAGTAGCGCCTCTAGTACCTGTAATTCTGTCAGCAATCCATCCGCCTGGTATTGATGTCATATAGATTAATGAACCATAAACTGACATAATTGACATAGCTGTTGTTTTATCAATTCCAAGGCCATTATCTGTTACGGCAAAGTACATGTAGAAAATGAGTAGGGCACGCATGCCATAATAACTAAACCTTTCCCAGAACTCTACAAAGAAGAGTACACCTAGTCCTCGAGGATGCCCGAAAAATCCTGTTTGAGGTATGTCTTGAATTTGATTTCCATGGGAGTTTTGTTGTGTCATTTATACATCCCATCCTTTCTTCCCCTAATACAATAGTTTAAGTAAATTTGATTGTACCTTATCAACTAAATATTCCAATAAATCACAAAAAAATAAAAATATTGAGAATATTCTGTTATTAAGCGCGCACAATTAATTAGAGATAATATAAAAAT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TTTTGGAGACAAAATATATCTCAAATGTGGGTTGAAACAGAATTTAAAGTATCAAAAGACATTGCAAGTTGGAAGACTTTGTCAGAAGCTGAACAAGACACATTTAAAAAAGCATTAGCTGGTTTAACAGGCTTAGATACACATCAAGCAGATGATGGTATGCCTTTAGTCATGCTACATACGACTGACTTAAGAAAAAAAGCAGTTTATTCATTTATGGCGATGATGGAGCAAATACACGCGAAAAGTTATTCGCATATTTTCACAACGTTATTACCATCTAGTGAAACAAACTATTTATTAGATGAATGGGTTTTAGAAGAACCACATTTAAAATATAAATCAGATAAAATTGTTGCTAATTACCACAAACTTTGGGGTAAAGAAGCTTCCATATATGACCAATATATGGCCAGAGTTACGAGTGTATTTTTAGAAACATTCTTATTCTTCTCTGGTTTCTATTATCCGCTATATTTAGCTGGTCAAGGGAAAATGACGACATCAGGAGAAATCATTCGTAAAATTCTTTTAGATGAATCTATTCATGGTGTGTTTACTGGTTTAGATGCACAGCATTTACGAAATGAACTATCTGAAAGTGAGAAGCAAAAAGCTGATCAAGAAATGTATAAATTGCTAAATGACTTGTATTTAAATGAAGAGTCATACACAAAAATGTTATACGATGATCTTGGAATCACTGAAGATGTGTTAAACTATGTTAAATATAATGGAAATAAAGCACTTTCAAATTTAGGTTTTGAACCTTATTTTGAGGAACGTGAATTTAACCCAATCATTGAGAATGCCTTAGATACAACAACTAAAAACCATGACTTCTTCTCTGTAAAAGGTGATGGTTATGTATTAGCATTAAATGTAGAAGCATTACAAGATGATGACTTTGTATTTGACAACAAATAATAATTAAAATTAAAAAGACCTTCACATGAAAGGGCAAAGCGATGACATTCGCTTCCGACATGTTGAAGGTCTTTTCTCTATGCTTAAAAACGTATGCACATTTTGAAAAAGTAAAAATTGCATTTAATGATGTCAATGAGGCTAGAAAGTATACAAGATATTGCATTACAAAAGGGTGTGCTATTTTACTATATACATCTAAAATACACATTTACAAAAATTGATTTCTATTTTAATTGCAAATATCAATAAAATCGACAATAAATTATTTGAAAGGCTATTGAAATGAGTGACAAAAAACGATACCATTAATGAGAAATGTTATCAATGATAATAATTATCATTAAATTAAAGGGAGAAAATTTTGTAATGAAGTATTTATTAAAGGGAAAAATTTTGCTTCTATTACTTATATTGCTAACAATCATTTCGTTGTTTATAGGTGTCAGTGAACTGTCTATTAAAGATATCTTTCATTTATCAGACTCACAGCAAAATATATTGTTCTCAAGCCGAATACCGAGAACGATGAGTATTTTAATTGCTGGTAGTTCATTAGCTTTAGCTGGCCTAATCATGCAACAAATGATGCAAAATAAGTTTGTTAGTCCAACTACAGCTGGGACGATGGAGTGGGCAAAATTAGGTATCTTAATTGCCTTATTATTCTTTCCAACTGGTCATATTTTATTAAAATTAGTATTTGCTGTTATTTGCAGCATCGGCGGAACATTTTTATTTGTTAAAATTATTGATTTTATCAAAGTGAAAGATGTCATCTTTGTACCACTATTAGGGATTATGATGGGTGGCATTGTTGCTAGTTTTACAACGTTTATCTCATTACGTACGAACGCAGTTCAAAGCATTGGTAACTGGCTTAACGGGAACTTTGCCATTATCACAAGTGGACGTTATGAAATCTTGTATTTAAGTATTCCTCTTTTAGCATTGACATATCTTTTTGCGAATCATTTCACAATTGTAGGAATGGGTAAAGACTTTACCAATAATTTAGGTTTGAGTTACGAAAAATTAATTAACATCGCATTGTTTATTACTGCAACTATTACAGCATTGGTAGTGGTGACTGTTGGAACATTACCGTTCTTAGGACTAGTAATACCAAATATTATTTCGATTTATAGAGGCGATCATTTAAAAAATGCTATCCCTCATACGATGATGTTAGGTGCCATCTTTGTATTGTTTTCTGATATAGTTGGCAGAATTGTAGTTTATCCTTATGAAATTAATATTGGTTTAACAATAGGTGTATTTGGAACAATCATTTTCCTTATCTTACTTATGAAAGGTAGGAAAAATTATGCGCAACAATAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134086|761578:773845|764916_766422_-|VDZ16724.1|DBSCAN-SWA MTQQNSHGNQIQDIPQTGFFGHPRGLGVLFFVEFWERFSYYGMRALLIFYMYFAVTDNGLGIDKTTAMSIMSVYGSLIYMTSIPGGWIADRITGTRGATLLGAVFIIIGHICLSLPFALIGLFTSMFFIIIGSGLMKPNISNIVGRLYPENDRRMDAGFVIFYMSVNMGALLSPIILQHFVNVKNFHGGFLIAAVGMALGLVWYVLFNRKNLGSVGMKPTNPLTPAEKKKYGLIIGSVVLAIVLIIVIGALTNSLSFNLVSNTVLVLGIALPIIYFTLIIRSKDVTDTERSRVKAFIPLFILGMVFWAIQEQGSNVLNIYGIEHSDMKLNLFGWKTNFGEAIFQSINPLFILLLAPIISLLWQKLGTKQPSLPVKFAIGTFLAGASYILIGIVGYASGSSNFSVNWVILSYIICVIGELCLSPTGNSAAVKLAPKAFNAQMMSIWYLTNASAQAINGTLVKLIEPLGQTNYFIFLGVVAIIVTTIVLAFSPLIIKAMKGIR >LR134086|761578:773845|772873_773845_+|VDZ16731.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSIGGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINIALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRIVVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ >LR134086|761578:773845|761578_762634_+|VDZ16721.1|DBSCAN-SWA MKEQLNQLSAYQPGLSPRALKEKYGIEGDLYKLASNENLYGPSPKVKEAISAHLDELYYYPETGSPTLKAAISKHLNVDQSRILFGAGLDEVILMISRAVLTPGDTIVTSEATFGQYYHNAIVESANVIQVPLKDGGFDLEGILKEVNEDTSLVWLCNPNNPTGTYFNHESLDSFLSQVPPHVPVIIDEAYFEFVTAEDYPDTLALQQKYDNAFLLRTFSKAYGLAGLRVGYVVASEHAIEKWNIIRPPFNVTRISEYAAVAALEDQQYLKEVTHKNSVERERFYQLPQSEHFLPSQTNFIFVKTKRVNELYEALLNVGCITRPFPTGVRITIGFKEQNDKMLEVLSNFKY >LR134086|761578:773845|772545_772728_+|VDZ16730.1|DBSCAN-SWA MTFASDMLKVFSLCLKTYAHFEKVKIAFNDVNEARKYTRYCITKGCAILLYTSKIHIYKN >LR134086|761578:773845|766759_767260_-|VDZ16725.1|DBSCAN-SWA MAHGRQQDELQDITLLGNQDNTYNFDYRPDVLESFDNKHQGRDYFVKFNCPEFTSLCPITGQPDFATIYISYIPNVKMVESKSLKLYLFSFRNHGDFHEDCMNIIMNDLIELMDPHYIEVWGKFTPRGGISIDPYTNYGRPNSKYEKMAEHRLMNHDLYPEKIDNR >LR134086|761578:773845|763729_764647_-|VDZ16723.1|DBSCAN-SWA MENKYTHGVLFYHEHSGLKNINQGIGEVTTALSSICKHLSIQLSESEGDIIKYCQEIKTKNYAKDVDILFILGGDGTVNELINGVMAHNLQLPIGILPGGTFNDFTKTLNIAPNHKQASEQMISAQVGTYDVIKVNNQYALNFVGLGLIVQNAENVQDGSKDIFGKLSYIGSTVKTLLNPTQFNYQLSIDDKTYSGETTMILTANGPFIGGSRIPLTDLSPQDGELNTFIFNEQSFSILNDIFKKRDSMNWNEITQGIEHIPGKKISLTTDPAMKVDIDGEISLETPIDIEVIPNAIQLLTVNDL >LR134086|761578:773845|769307_771413_+|VDZ16728.1|DBSCAN-SWA MKTMEEKKYNHIELNNEVTKRREDGFFSLEKDQEALVAYLEEVKDKTIFFDTEIERLRYLVDNDFYFNVFDIYSEADLIEITDYAKSIPFNFASYMSASKFFKDYALKTNDKSQYLEDYNQHVAIVALYLANGNKAQAKQFISAMVEQRYQPATPTFLNAGRVRRGELVSCFLLEVDDSLNSINFIDSTAKQLSKIGGGVAINLSKLRARGEAIKGIKGVAKGVLPIAKSLEGGFSYADQLGQRPGAGAVYLNIFHYDVEEFLDTKKVNADEDLRLSTISTGLIVPSKFFDLAKEGKDFYMFAPHTVKEEYGVTLDDIDLEKYYDDMVANPNVEKKKKNAREMLNLIAQTQLQSGYPYLMFKDNANRVHPNSNIGQIKMSNLCTEIFQLQETSIINDYGIEDEIKRDISCNLGSLNIVNVMESGKFRDSVHSGMDALTVVSDVANIQNAPGVRKANSELHSVGLGVMNLHGYLAKNKIGYESEEAKDFANIFFMMMNFYSIERSMEIAKERGIKYQDFEKSDYANGKYFEFYTTQEFEPQFEKVRELFDGMVIPTSEDWKKLQQDVEQYGLYHAYRLAIAPTQSISYVQNATSSVMPIVDQIERRTYGNAETFYPMPFLSPQTMWYYKSAFNTDQMKLIDLIATIQTHIDQGISTILYVNSEISTRELARLYVYAHYKGLKSLYYTRNKLLSVEECTSCSI >LR134086|761578:773845|771532_772504_+|VDZ16729.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >LR134086|761578:773845|762794_763337_+|VDZ16722.1|DBSCAN-SWA MTRKSIAIDMDEVLADTLGEIIDAVNFRADLGIKMEALNGQKLKHVIPEHDGLITEVLREPGFFRHLKVMPHAQEVVKKLTEHYDVYIATAAMDVPTSFSDKYEWLLEFFPFLDPQHFVFCGRKNIVKADYLIDDNPRQLEIFTGTPIMFTAVHNINDDRFERVNGWKDVEQYFLDNIEK >LR134086|761578:773845|768946_769345_+|VDZ16727.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >LR134086|761578:773845|767279_768146_-|VDZ16726.1|DBSCAN-SWA MNPKVKGIIAILISAIGFSFMSVFFRLAGDLPVFQKSLARNLVAMFIPLFFIYKYHQPMFGKLSSQPLLLTRSTLGLIGVLLNIYAIDHMVLSDADSLMKLNPFWTILLSIVFLHEKVRKYQITAMIIAILGMLLIVKPEFSSSMIPSLAGLFSGIFAASAYTCVRALSTREAPYTIVFYFSLFSVIVLIPFTAYTYEPMSQMQILYLLGAGLAAAVGQIGVTLAYSFAAAKDISIFTYASIIFTAILGFILFGESPDFYATLGYVVIIGASYYMFEKARRDAKIIKK |
11 | uncultured_Caudovirales_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
824538 : 834560
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134086|824538:834560|DBSCAN-SWA CATGCCAATTATTACAGATGTTTACGCTCGCGAAGTCTTAGACTCTCGTGGTAACCCAACTGTTGAAGTAGAAGTATTAACTGAAAGTGGCGCATTTGGTCGTGCATTAGTACCATCAGGTGCTTCAACTGGTGAACACGAAGCTGTTGAATTACGTGATGGAGACAAATCACGTTATTTAGGTAAAGGTGTTACTAAAGCAGTTGAAAACGTTAATGAAATCATCGCACCAGAAATTATTGAAGGTGAATTTTCAGTATTAGATCAAGTATCTATTGATAAAATGATGATCGCATTAGACGGTACTCCAAACAAAGGTAAATTAGGTGCAAATGCTATTTTAGGTGTATCTATCGCAGTAGCACGTGCAGCAGCTGACTTATTAGGTCAACCACTTTACAAATATTTAGGTGGATTTAATGGTAAGCAGTTACCAGTACCAATGATGAACATCGTTAATGGTGGTTCTCACTCAGATGCTCCAATTGCATTCCAAGAATTCATGATTTTACCTGTAGGTGCTACAACGTTCAAAGAATCATTACGTTGGGGTACTGAAATTTTCCACAACTTAAAATCAATTTTAAGCAAACGTGGTTTAGAAACTGCAGTAGGTGACGAAGGTGGTTTCGCTCCTAAATTTGAAGGTACTGAAGATGCTGTTGAAACAATTATCCAAGCAATCGAAGCAGCTGGTTACAAACCAGGTGAAGAAGTATTCTTAGGATTTGACTGTGCATCATCAGAATTCTATGAAAATGGTGTATATGACTACAGTAAGTTCGAAGGCGAACACGGTGCAAAACGTACAGCTGCAGAACAAGTTGACTACTTAGAACAATTAGTAGACAAATATCCTATCATTACAATTGAAGACGGTATGGACGAAAACGACTGGGATGGTTGGAAACAACTTACAGAACGTATCGGTGACCGTGTACAATTAGTGGGTGACGATTTATTCGTAACAAACACTGAAATTTTAGCAAAAGGTATTGAAAACGGAATTGGTAACTCAATCTTAATTAAAGTTAACCAAATCGGTACATTAACTGAAACATTTGATGCAATCGAAATGGCTCAAAAAGCTGGTTACACAGCAGTAGTTTCTCACCGTTCAGGTGAAACAGAAGATACAACAATTGCTGATATCGCTGTTGCTACAAACGCTGGTCAAATTAAAACTGGTTCATTATCACGTACTGACCGTATTGCTAAATACAATCAATTATTACGTATCGAAGATGAATTATTTGAAACTGCTAAATATGACGGTATCAAATCATTCTACAACTTAGATAAATAATCATTTTAAACATTAAGTACTGCCATAATTTTAGTTGAGGATTATTATGTCGGTATAAATTGAATAAAGTTTTTGAGTTCACGCTTAAAAAGTTCACGCTTGTATTTATAACCTGCCACAGAGTTGAGACTGTGGTAGGTTTTTTATTTTGGATGGCTTCAAATCATGATTTATAAGGGGCTTGATAAATCATGAGGTAACTAATAACACATATTTAACTTGTATTCTTAAACTGGTATAATAAATTTATGTTGAAATGAATATTGTATGACAGGGTATTCACTTTTATTAAGAGGTAAAATTAAATAAAGGTTTTATAGAACGTATTTAAATATATGAGGAGTAAACAAATGGCTGATAGAACGAATAAAGAAATTAAAACAGGACGCTTTATTGCAACTGCATCAATCGTATTCTCAATATTATTGATTATTCATTACTTTGTTTCGTTGGATAATGCGACTGCCAAAGCATTACTTAATTTAACGAATCAAAACACTTCAGATAAAGCGATTGATTACATTTTAAACAGCTTTAGATTCACTGGTATTATGTATATTTTGGCTTATCTAGCAGGCTTCATCACTTTTTGGAATCGACATACTTATGTGTGGTGGTTTATGTTTGCAGTTTATGTATCAAATAGTTTGTTTACGTTGATTAATTTATCAATCACAATTCAAGCAATAAAAGCTGCACACGGTGCGTACTTAACATTGCCAATTTTAATTGTTATTATAGGTTCGGTTGCATTAGCGATTTATATGCTTGTTGTTTCAATTAAGCGTAAAAGTACATTTAATCGCTAGAAAATTGATTTTAACAATAAAAATATGATATACTACTTGTCGTATATAAGGAACGGAGGACAATTTATGCATACATTTTTAATCGTATTATTAATCATTGATTGTATTGCATTAATAACTGTTGTACTACTCCAAGAAGGTAAAAGCAGTGGACTTTCAGGTGCCATCAGTGGTGGTGCTGAGCAGTTATTCGGTAAACAAAAACAACGTGGCGTCGATTTATTCTTAAATAGATTAACAATTATTTTATCAATATTATTTTTTGTACTTATGATTTGCATAAGTTATCTTGGTATGTAAGGTCCGGCGATGTAAATGTCGGGCTTTTTTATTTATAATTAAGAATGTAATAGTTTAACAATAAGCTATGTAAAATATATAGCCTAGTTAAGTATGCAAAGGGAGCGTTAGATTTATGCAGATAAAATTACCAAAACCTTTCTTTTTTGAAGAAGGCAAACGTGCCGTGTTATTATTACATGGATTTACAGGCAATTCGTCTGATGTACGTCAATTAGGTCGATTTTTACAAAAAAAGGGATATACTTCGTATGCACCGCAATATGAAGGTCATGCAGCACCACCAGAAGAGATACTTCAATCAAGTCCTTTTGTTTGGTTTAAAGATGCTTTAGATGGCTATGACTACCTTGTTGAACAAGGTTATGATGAAATCGTTGTTGCTGGCTTGTCATTAGGTGGCGATTTTGCATTAAAATTAAGCTTAAATAGAGATGTAAAGGGTATTGTAACGATGTGTGCACCTATGGGTGGCAAAACTGAAGGTGCCATTTATGAAGGCTTTTTAGAATATGCACGCAATTTTAAAAAGTATGAAGGTAAAGATCAAGAAACGATTGACAACGAAATGCATCATTTTAAACCAACTGAAACTTTAAAAGAATTAAGTGAAGCATTAGATACGATTAAAGATCAAGTTGATGAGGTGTTTGACCCAATTTTAGTGATTCAAGCAGAAAACGACAATATGATTGATCCACAATCCGCAAATTATATATATGAACATGTAGACTCTGACGATAAAAATATCAAGTGGTACAGTGAATCTGGACATGTTATTACGATTGATAAAGAAAAAGAACAAGTATTTGAAGATATTTATCAATTTTTAGAGTCATTAGATTGGTCAGAATAAAAAGAGATTTTAACATTAGAAAGGAGGGGCATAATGAATTTAAAGCAATCAATAGAAGAGATTATTAATCAACCTGAATATGAACCTATGTCAGTGTCAGATTTTCAAGATGCATTAGGTTTAAGTAGTGCCGACTCATTTAGAGATTTAATTAAGGTGCTCGTAGAATTAGAACAATCAGGATTAATTGAACGTACAAAAACAGACAGATATCAAAAAAAGCATAGTTCAAAAGGTCATTCAAAATTGATAAAGGGAACGTTAAGTCAAAATAAAAAAGGCTTTGCATTCTTAAGACCTGAAGATGAGGATATGGAAGATATATTTATTCCCCCAACAAAAATTAATCGTGCCTTAGATGGAGATACTGTAATTGTAGAAATACATCAATCTAAAGGTGAACATAAAGGTAAAATTGAAGGGGAAGTTAAGTCGATTGAGAAGCATTCAGTAACTCAAGTTGTTGGTACGTATAGTGAAGCTAGACATTTCGGATTTGTTATTCCAGATGATAAACGTATTATGCAAGATATTTTCATTCCTAAAGGACAAAGTTTAGGTGCAGTAGATGGGCATAAGGTACTTGTTCAAATTACTAAATATGCTGATGGTTCAGATAATCCAGAAGGACATATTTCTGCTATTTTAGGACATAAAAATGATCCTGGCGTAGATATTTTATCTATTATCTATCAACATGGCATAGAAATTGAATTTCCTGATGAAGTGTTACAAGAAGCTGAAGCAGTACCTGATCATATTGAGAATACTGAAATTAAAGGCCGTCATGATTTACGTGATGAATTGACAATCACAATTGATGGTGCTGATGCTAAAGACTTAGATGACGCAATTAGTGTTAAAAAGTTAGCGAACGGTAATACGCAATTAACTGTAAGTATTGCTGATGTCAGTTATTATGTAACTGAAGATTCAGCTTTAGATAAAGAAGCTTATGATAGAGCGACAAGTGTATATCTTGTTGACCGTGTGATCCCGATGATTCCACATCGATTAAGCAATGGTATTTGTTCATTAAATCCTCACGTTGATCGTTTAACGTTAAGCTGTCGCATGGAAATTGATGCTAGTGGTCGCGTTGTTAAACATGAAATTTTTGATAGTGTTATACATTCTGATTATCGAATGACGTATGATGCGGTAAATCAGATTATTACTGAAAAGGATCCTGCGATTCGAGAGCAGTATAATGAAATTACGCCTATGCTAGATTTAGCACAAGATTTATCTAATCGTTTGATTCAAATGAGAAAACGACGTGGTGAAATCGATTTTGATATTAGTGAAGCAAAAGTATTAGTTAACGAAGATGGTATACCTACAGATGTTCAATTAAGACAACGTGGCGAGGGTGAACGTCTAATTGAATCATTTATGTTAATTGCAAATGAAACAGTTGCTGAACATTTTAGTAAGTTAGATGTACCTTTTATTTACCGAGTGCATGAGCAACCTAAATCAGATCGCTTAAGACAATTCTTTGATTTTATTACAAACTTTGGCATCATGATTAAGGGTACTGGCGAAGATATTCATCCAACAACACTTCAAAAGGTTCAAGAAGAAGTAGAAGGTCGACCTGAACAAATGGTCATTTCAACAATGATGTTACGTTCAATGCAACAAGCGCATTATGATGATGTGAACTTGGGACATTTTGGCTTATCAGCTGAATATTATACGCATTTTACATCACCAATTAGACGTT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AATATCCCCATTACTTTTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134086|824538:834560|827841_830214_+|VDZ16779.1|DBSCAN-SWA MNLKQSIEEIINQPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSKGHSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVEIHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLQEAEAVPDHIENTEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGNTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPAIREQYNEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTIKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGHKKKGKQRKGKNERKNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >LR134086|824538:834560|832876_834112_-|VDZ16783.1|transposase|DBSCAN-SWA MRHDIYEGVLFYIMKGIKPNYAELGRQYNCDPRTVKKYYEAGKENELERLKKRQQNKKASKLDPFKEIINKKIELGCTAMAIFKYIEKKGYEGKYTILREYCKNKKQNETKKATIRVETNPGIAAQVDWKEDMVMHDKFGRTYQFNIFLYVLHYSKMKYITLTWDRKQDTLFECLKDAFEYTEGVPKEIWFDNMRTVVDRPRTQYKKVVFNNLFYQFSKDANFEPIACRPYRPQTKGSVESLAKFVEQRLRPYDYEFYDAVELIGLVNDLCHELNHLEISQATEQRPIDVFNYEEKEHLNSFNAKLLDTYIENECIRIVSKESMINFRKGKYSVPTKYIGEEVQVIFNNSTDELLIYYDGELIRRHNLSERKFNYIVEDMSEILKSDVFKHKDDKEILTYIENSLLLYDEI >LR134086|824538:834560|832097_832865_-|VDZ16782.1|transposase|DBSCAN-SWA MNTNHQKLLNNFEILKLKKFKDYYPNYIELLSKNEKSLTEILIDLTEKEIEYQSELKFKRAVNSARFPKIKYLHDFDFMFQPSINQQEILTLKSMHFLEDSINICFLGNSGVGKTHLAISLGIEACKQNIKTRFYTFKELIDLLTVSDSKGIINKTLKQLSRIELLIIDEIGYTPITKEQADLFYQLMSLRYEWKSTIITTNIPFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYRLKDYKTEKSLNIRQS >LR134086|824538:834560|826193_826652_+|VDZ16776.1|DBSCAN-SWA MADRTNKEIKTGRFIATASIVFSILLIIHYFVSLDNATAKALLNLTNQNTSDKAIDYILNSFRFTGIMYILAYLAGFITFWNRHTYVWWFMFAVYVSNSLFTLINLSITIQAIKAAHGAYLTLPILIVIIGSVALAIYMLVVSIKRKSTFNR >LR134086|824538:834560|824538_825843_+|VDZ16775.1|DBSCAN-SWA MPIITDVYAREVLDSRGNPTVEVEVLTESGAFGRALVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGKGVTKAVENVNEIIAPEIIEGEFSVLDQVSIDKMMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADLLGQPLYKYLGGFNGKQLPVPMMNIVNGGSHSDAPIAFQEFMILPVGATTFKESLRWGTEIFHNLKSILSKRGLETAVGDEGGFAPKFEGTEDAVETIIQAIEAAGYKPGEEVFLGFDCASSEFYENGVYDYSKFEGEHGAKRTAAEQVDYLEQLVDKYPIITIEDGMDENDWDGWKQLTERIGDRVQLVGDDLFVTNTEILAKGIENGIGNSILIKVNQIGTLTETFDAIEMAQKAGYTAVVSHRSGETEDTTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDELFETAKYDGIKSFYNLDK >LR134086|824538:834560|830235_830700_+|VDZ16780.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGDQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >LR134086|824538:834560|834209_834560_-|VDZ16784.1|DBSCAN-SWA MKKVMGILLASTLILGACGHHQDSAKKESTSHKKKENDNEELNEELKEFKSKKNMDIKIKGDTIVSDKFEAKIKEPFIINEKDEKKKYIAFKMEITAKKDDKDLNPSSIVNGGYKM >LR134086|824538:834560|827067_827808_+|VDZ16778.1|DBSCAN-SWA MQIKLPKPFFFEEGKRAVLLLHGFTGNSSDVRQLGRFLQKKGYTSYAPQYEGHAAPPEEILQSSPFVWFKDALDGYDYLVEQGYDEIVVAGLSLGGDFALKLSLNRDVKGIVTMCAPMGGKTEGAIYEGFLEYARNFKKYEGKDQETIDNEMHHFKPTETLKELSEALDTIKDQVDEVFDPILVIQAENDNMIDPQSANYIYEHVDSDDKNIKWYSESGHVITIDKEKEQVFEDIYQFLESLDWSE >LR134086|824538:834560|831628_832042_-|VDZ16781.1|DBSCAN-SWA MTSISHDYINITQDDKNTVNKLRDGYLLSDKKYKDWTEHNQDQIKKGKTAQAMFIYELRGDGNINLNVHKYSEDKTVDSKSFKFSKLKTEDFSHRAETREEVEKKEKEFEEEYKKEQEREKEKEKHKDDDHSGLDEV >LR134086|824538:834560|826718_826952_+|VDZ16777.1|DBSCAN-SWA MHTFLIVLLIIDCIALITVVLLQEGKSSGLSGAISGGAEQLFGKQKQRGVDLFLNRLTIILSILFFVLMICISYLGM |
10 | Lactococcus_phage(42.86%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
949367 : 993184
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134086|949367:993184|DBSCAN-SWA 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41 | Lactococcus_phage(33.33%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
1024555 : 1033028
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR134086|1024555:1033028|DBSCAN-SWA AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCGGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGCGGTATAGACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACGACGCTACCAGTTATTGGAGTGCCGATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTATAGATTCTTTATTATCAATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAACGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAATCCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCATTATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGCTGTATTGGATCCTGCTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCCAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAAGTTGTCCCGTTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATCAAGAAAGAAGTATCACTTACTGTTACAAGAGGAAACAACAATCAAATTACTTATTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAAGCATGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAGTAGAAAAATGGGGCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGTATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGGGCTAAGAAAGACACAATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAACAATTATCTGAAACAGATCAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTCCGTAATATTGCTAGTGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTGGAATTTTTCTATAAAAATGATGCATTAAATGATCCTTTGATTACAGATGATCACATCAAATTACTGAATATTGCGACAGATAAAGATATTGAAACATTAAAAACGAAAGCGCTAGAAATTAATCAAGTATTAAAACAATTAATGGATGCGATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGGTCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGACTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTGTTAGATGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCGGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATAGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAAAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCATTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGTGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAGCTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAATGAAAAAGGCAATGTATGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGCTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGGCCTGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATAGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAGTCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATATCAAGGGGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAACAAAACCAAAGATTACTTAAAGGTGTTGTAAAGGGTATCGGAGGTTATGGTAACTGCATTGGTATTCCAACAACTGCTGGTGAAATCGAATTTGATGAACGTTATGATGGCAATCCACTTGTTAATGCAATGTGTGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCGTCTGAAATGGCGGCAAAAGGTGGTAGTGGGTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTATGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTTACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGATGACGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAGATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAGCATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGACCAACAAGTTGGTGCCAATACGATAATTAAGCCAGGACTTCAAGCATCGGTAGTACGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCGATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGAAATTTAATTGCCGTGGGTGCAACACCATTAGCAATGACAGATTGTTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATCTATCAACAGTTGATAGATTCAACGAAAGGTATGGCAGAAGCATGCGACATTCTTAAGACACCAGTAGTTTCTGGAAATGTATCTTTATATAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCAACACCAGTTGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTGAACCTCAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR134086|1024555:1033028|1032461_1033028_+|VDZ16980.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVEHVESGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHGIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFAGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRKCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >LR134086|1024555:1033028|1027785_1029975_+|VDZ16977.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVKGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYDDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKDYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACDILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEFESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNFKVTTPYTEISENVSDIKQIWEGAIAQCLTTQD >LR134086|1024555:1033028|1025024_1026149_+|VDZ16973.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGNNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDSRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >LR134086|1024555:1033028|1026856_1027120_+|VDZ16975.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >LR134086|1024555:1033028|1029953_1031438_+|VDZ16978.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKIKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >LR134086|1024555:1033028|1027121_1027793_+|VDZ16976.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEKLEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV >LR134086|1024555:1033028|1031430_1032459_+|VDZ16979.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGAVEKDDYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQNVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >LR134086|1024555:1033028|1024555_1025038_+|VDZ16972.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARESGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGIDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQNPSLVEKLNHYESSLIQKVEDMQNELQ >LR134086|1024555:1033028|1026152_1026857_+|VDZ16974.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETDQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINQVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
1233340 : 1302250
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LR134086|1233340:1302250|DBSCAN-SWA AGTGAGCTATTTAGTTACAATAATTGCATTTATTATTGTTTTTGGTGTACTAGTAACTGTTCATGAATATGGCCATATGTTTTTTGCGAAAAGAGCAGGCATTATGTGTCCAGAATTTGCGATCGGTATGGGGCCAAAAATTTTTAGTTTTAGAAAAAATGAAACACTTTACACTATTAGGTTATTGCCTGTTGGTGGATATGTTCGTATGGCAGGAGATGGCTTAGAAGAGCCACCAGTCGAGCCCGGTATGAACGTTAAAATTAAACTGAATGAAGAAAATGAAATAACACATATCATATTAGATGATCATCATAAGTTTCAACAAATTGAAGCGATCGAAGTTAAAAAATGTGATTTTAAGGATGACTTATTCATAGAAGGTATCACTGCTTATGATAATGAAAGACATCATTTTAAAATTGCTAGAAAGTCTTTCTTTGTTGAAAATGGTAGCTTAGTTCAAATTGCTCCGAGAGACAGACAATTTGCACATAAAAAGCCATGGCCGAAATTTTTAACATTATTTGCGGGACCGTTATTTAACTTTATATTAGCTTTAGTCCTATTTATTGGTCTTGCATATTATCAAGGTACACCTACGTCTACTGTAGAACAAGTCGCAGATAAGTATCCAGCACAACAAGCAGGATTACAAAAAGGTGATAAAATTGTTCAAATTGGCAAATATAAAATATCTGAATTTGATGATGTTGATAAGGCGTTAGATAAAGTTAAAGATAATAAGACGACTGTTAAATTTGAACGTGATGGTAAAACGAAGTCAGTTGAATTAACACCTAAAAAGACTGAAAGAAAACTGACTAAAGTAAGTTCAGAGACGAAGTATGTTCTCGGATTCCAACCAGCGAGTGAACATACACTTTTTAAACCAATTGTATTCGGATTTAAAAGCTTTTTAATCGGTAGTACTTATATTTTTACAGCTGTAGTAGGTATGTTGGCTAGTATATTTACGGGCGGATTCTCATTTGATATGTTAAATGGTCCGGTTGGTATTTATCATAACGTAGACTCAGTTGTTAAAGCGGGTATCATTAGCTTAATTGGTTACACTGCGTTATTAAGTGTAAACTTAGGTATTATGAATTTAATTCCTATTCCTGCACTAGACGGTGGTCGTATTTTATTTGTTATATATGAAGCGATTTTCAGAAAACCAGTTAATAAAAAAGCGGAAACAACGATTATTGCTATTGGTGCCATTTTCATGGTCGTTATTATGATATTAGTAACGTGGAATGATATTCGACGATATTTCTTATAATTTAGGAGGATAAATAATTATGAAGCAATCCAAAGTTTTTATACCAACGATGCGTGACGTGCCATCAGAAGCAGAAGCACAAAGTCATCGTTTATTATTGAAATCGGGTTTGATAAAACAAAGTACAAGTGGGATTTATAGTTATTTACCGCTAGCAACACGTGTGTTAAATAATATTACTGCAATTGTGCGACAAGAAATGGAACGTATCGATTCTGTTGAAATTTTAATGCCAGCGTTACAACAAGCTGAATTATGGGAAGAATCAGGACGTTGGGGTGCATATGGCCCAGAATTAATGCGTTTACAAGATAGACATGGAAGACAATTTGCATTAGGTCCAACACATGAAGAATTAGTTACATCAATAGTAAGAAATGAATTGAAATCATACAAACAATTACCGATGACATTATTCCAAATTCAATCTAAATTCCGTGATGAAAAGAGACCACGTTTTGGTTTACTTCGTGGTCGTGAATTTATTATGAAAGATGCGTATTCATTCCATGCTGACGAGGCATCATTAGATCAAACGTATCAAGATATGTATCAAGCGTATAGCCGTATTTTTGAGAGAGTTGGCATTAACGCAAGACCAGTAGTTGCAGATTCAGGTGCTATTGGCGGTAGCCATACACATGAATTTATGGCATTAAGTGCTATCGGTGAGGATACAATCGTTTACAGTAAAGAAAGCGATTATGCTGCTAACATCGAAAAAGCAGAAGTCGTTTACGAACCAAATCATAAGCATACTACTGTGCAACCTATAGAAAAATTGAAACACCAAATGTTAAGACTGCGCAAGAATTGGCAGACTTTTTAGGTAGACCAGTAGATGAAATCGTTAAAACGATGATTTTCAAAGTTGATGGCGAATATATTATGGTTTTAGTGCGTGGACATCATGAAATTAATGACATTAAATTAAAATCTTATTTCGGCACAGATAATATTGAATTAGCAACACAAGACGAAATTGTTAATTTAGTTGGTGCAAATCCTGGTTCACTAGGTCCTGTAATTGATAAAGAAATCAAAATTTATGCAGATAATTTTGTGCAAGATTTAAATAATTTAGTTGTCGGTGCTAACGAAGATGGTTATCACTTAATTAATGTAAATGTAGGTAGAGACTTCAACGTTGATGCATATGGCGATTTCCGTTTTATTTTAGAAGGCGAAAAGTTAAGTGATGGTTCAGGCGTTGCACATTTTGCTGAAGGTATTGAAGTTGGTCAAGTATTTAAATTGGGTACTAAGTATTCAGAATCAATGAATGCTACATTCTTAGATAATCAAGGAAAAGCTCAACCGTTAATTATGGGTTGTTATGGTATTGGAATTTCTAGAACGCTAAGTGCAATTGTTGAACAAAATCACGATGATAATGGTATTGTTTGGCCTAAATCAGTTACTCCATTTGATTTACATTTAATTTCTATTAATCCTAAGAAAGATGATCAACGAGAACTAGCGGATGCACTATATGCTGAATTTAATACTAAATTTGATGTGTTGTACGATGATCGTCAGGAACGTGCGGGTGTCAAATTTAATGATGCCGATTTAATTGGTTTACCACTGCGAATTGTTGTTGGTAAACGTGCATCGGAAGGTATTGTAGAAGTTAAAGAACGTTTAACAGGTGATAGCGAAGAAGTCCACATTGATGACTTAATCACTGTCATTACAAATAAATATGATAACTTAAAATAATTAAGATCGAATGAATTATAAGAGTAGGAAAAAGCTGAAAGAAATCAGATGCTTATGTCCTGCTCTTATTATTTTTGATATAATGATTATTCGATGAAAAATGACTGAAGACATAGTATAATTAAAGATAAATTTGTTTTAACAATATTATGATTAGCCAAATATAAAGCATTTAATTTTCTATCATTACTATGCTCACATAATCTAAATATTGTTCGAACACGTAAAAGTAATTTCTATTTAAGGTGGTAATTGTCTTGGCAATGACAGAGCAACAAAAATTTAAAGTGCTTGCTGATCAAATTAAAATTTCAAATCAATTAGATGCTGAAATTTTAAATTCAGGTGAACTGACACGTATAGATGTTTCTAACAAAAACAGAACATGGGAATTTCATATTACATTACCACAATTCTTAGCTCATGAAGATTATTTATTATTTATAAATGCAATAGAGCAAGAGTTTAAAGATATCGCCAACGTTACATGTCGTTTTACGGTAACAAATGGCACGAATCAAGATGAACATGTAATTAAATACTTTGGACACTGTATTGACCAAACAGCTTTATCTCCAAAAGTTAAAGGTCAATTGAAACAGAAAAAGCTTATTATGTCTGGAAAAGTATTAAAAGTAATGGTATCAAATGACATTGAACGTAATCATTTTGATAAGGCATGCAATGGAAGTCTTATCAAAGCGTTTAGAAATTGTGGTTTTGATATCGATAAAATCATATTCGAAACAAATGATAATGATCAAGAACAAAACTTAGCTTCTTTAGAAGCACATATACAAGAAGAAGACGAACAAAGTGCACGATTGGCAACAGAGAAACTTGAAAAAATGAAAGCTGAAAAAGCGAAACAACAAGATAACAACGAAAGTGCTGTCGATAAGTGTCAAATTGGTAAGCCGATTCAAATTGAAAATATTAAACCAATTGAATCTATTATTGAGGAAGAGTATAAAGTTGCAATAGAGGGTGTCATTTTTGATATTAACTTAAAAGAACTTAAAAGTGGTCGTCATATCGTAGAAATTAAAGTGACTGACTATACGGACTCTTTAGTTTTAAAAATGTTTACTCGTAAAAACAAAGATGATTTAGAACATTTTAAAGCGCTAAGTGTTGGTAAATGGGTTAGGGCTCAAGGTCGTATTGAAGAAGATACATTTATTAGAGATTTAGTTATGATGATGTCTGATATTGAAGAGATTAAAAAAGCGACAAAAAAAGATAAGGCTGAAGAAAAGCGTGTAGAATTCCACTTGCATACTGCAATGAGTCAAATGGATGGTATACCAAATATTAGTGCGTATGTTAAACAGGCAGCAGACTGGGGACATCCAGCCATTGCGGTTACAGACCATAATGTTGTGCAAGCATTTCCAGATGCTCACGCAGCAGCGGAAAAACATGGTATTAAAATGATATACGGTATGGAAGGTATGTTAGTTGATGATGGTGTTCCGATTGCATACAAACCACAAGATGTCGTATTAAAAGATGCTACTTATGTTGTATTCGACGTTGAGACAACTGGTTTATCAAATCAGTATGATAAAATCATCGAGCTTGCAGCTGTGAAAGTTCATAACGGCGAAATCATCGATAAGTTTGAAAGGTTTAGTAATCCGCATGAACGATTATCGGAAACGATTATCAATTTGACGCATATTACTGATGATATGTTAGTAGATGCCCCTGAGATTGAAGAAGTACTTACAGAATTTAAAGAATGGGTTGGCGATGCGATATTCGTAGCACATAATGCTTCGTTTGATATGGGCTTCATCGACACGGGATATGAACGTCTTGGATTTGGACCATCTACGAATGGTGTTATCGATACATTAGAATTATCTCGTACGATTAATACTGAATATGGTAAACATGGTTTAAATTTCTTAGCTAAAAAATACGGTGTAGAATTAACGCAACATCACCGTGCCATTTATGATACAGAGGCAACAGCTTACATTTT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62 | Staphylococcus_phage(23.81%) | transposase,head,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_9 |
1497352 : 1586098
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LR134086|1497352:1586098|DBSCAN-SWA 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107 | Staphylococcus_phage(79.01%) | terminase,holin,protease,capsid,portal,integrase,tRNA,head,tail | attL 1507548:1507565|attR 1582161:1582178 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_10 |
1641216 : 1649546
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LR134086|1641216:1649546|DBSCAN-SWA ATTAATTACAACATTCTCGATTATGCTGATGATCGACAAAACGTACAGGATGTCCATAAATTTTTGAAATTTCAACTTCATCAAGTGATTTAAACTCATCAGTTGTACCATGGAAATGCAAATGCTTATTTAAACATGCTACTTCAGTAGCAGTATCTGCTACAACACCAATATCATGAGTAACTAAGATAATAGTGATACCTTCTTGTTTTAATTGATCTAAAGTATTATAAAATTCACTTACATGTTTTGCATCAATACCATTCGTCGGTTCATCAAGTACTAATACTGCAGGTTCTGAAATCAATGCTCGAGCAATCATTACACGTTGTTGTTGACCACCTGATAATTCTGCTATATTTTTATGAATTAAATCACTTATATTCAGTCTTTCTAGTACTTTAATCACTTTTTCATTATCTTTGCTATTAAATGTTTGGAAAAGACGTTTTGTCTTTGTTAATCCGCTTAAAACAACTTCTTTAACACTTGCTGGGAAACCTGAATTAAAGGCATTTGCTTTTTGTGATACATAGCTTAATTTAATTGATGTTTTCTTATTTTTAAAATCAATACCTTCAACAAAAATCTCACCACTTTGTAAAGGTAATAATCCTAGAATCAACTTCAATAATGTTGATTTACCAGCACCATTTGGTCCAACAATTGCTAAAAATTCACCTTTATTTATTTTAATGTTTATATTTTCTAACACTTTTTTATGATCATAGTAGTAATTGACATTCTTCAATTCAAAGACTGGTGTCATCGTATTCTCACCTCGCATTCAACTATACAACTCCTAGTAACATATGTAAACAGTAATGTTTACGACTCAAAATAAGACAAAATAAAGAGATATGCCCCCTTCAAGTTTTATTTATCGCATTTCTTGAAGAGAGCATTATCATTTTATTGTTGCATAACCTTATTTTTTAATTCTGGGTCAAATTGCTGTTGTTTCAACATTTCAATTTCAAGTTTATATGGCGGTTTTTTATTTTTCTTATCTTCACCAACATAAGGTGTTTCTAAGATTTTCGGAATATCTTTAAAACTATCATGATGCACAATGTAATTTAATGCATCAAAACCAATGTAACCGAAGCCAATATTTTCATGTCGGTCTTTTTGAGCGCCACGGTCATTTTTAGAATCATTGACATGAACAACTTTGATTCTGTCGACTCCAATGATTTTATCAAATTCATTTAATACGCCATCAAAGTCCTCTTTCACATTATATCCAGCATCATGCGTATGACATGTATCAAAACATACTGATAAACGTTCGTTATTATGAACTCCATCAATAATACGTGCTAACTCTTCAAACGAGCGACCAATCTCAGTACCTTTACCTGCCATCGTTTCAAGCGCAATACGTACATTATTGTCATTCGTTAAAACTTCATTTAATCCTTCAATAATCTTATTAATTCCGGCATCAACACCAGCTCCAACATGCGCACCTGGATGTAATACAATATCTTTAGCGCCTATAGCTTGCGTTCTTTCAATTTCTTGTTGCAAGAAATCTACACCAAGATTAAACGTTTCTGGTTTGGTTGTATTTGCAATATTAATGATGTATGGTGCATGAACAACAATATTAGATAAGCCATATTTTTCCATCACTTCATGACCTTTAGTTATATTTAAATCTTCAATACTTTTACGGCGCGTATTTTGAGGTGCACCAGTATAAATCATAAATGTTGTTTCACCATATTCATGCGCTTCTATAGCAGAACCTTCTAACATCTTTTTACCACTCATTGAAACATGTGATCCTAATAACATAAAACACACCTAACCTTTTTTGTTTTGCTTACGTTTTTGTCTATTTTGCTGCTTACTAAATTGTTTACGCTCTTGACGTTTCATTTTTTCAACTTCTTGCTTAAATTTCTTCTTATAACCTGGTTTAACTTTGTTTTTAATTTTACTTCGAACTTTGTTCTTCACTTGATTAGTTAAATGGTCATCTTTGCGCATTCTTGCTTGACGCTGATTGTGCGCTTTAACTTCTTTTAACTCACCATCTTTAATATCAACAGTATTGAAAACAAAACCGCGATTTTCTATTAATGAAATATTGTGTTCTTCATCAGGACTATAAAGCGTTATTGCTACACCTTTATAATTCCCACGACCAGTTCGTCCGACTCTATGTGTAAAGAAGTCAATATCATTTGGCACATCAAAATTGATGACATGACTAACACCTTCAATATCAATACCACGAGATGCTAAATCGCTGGCAATAACGTATTGGAATTCTAAATTACGTATACGTTTCATTTGTTGTTTACGTTCACGTGGCGTTAAACCACCATGAATCATACCAACTTTAATACCAGCTTCATTTAGTGAACGTGCTAAATCATTTGCATTATCTCTACTATTACAGAAAATAATACATAAGTATGGATTTAGTATATCAATTAAATTTAAAGTCTTTTCAACTTTAGCTGCACCTTTAGTAGGTATTAAAAAGAATTCGATGTTCTTTTTATTTTGTTTTTTACTGTCGACAGCTACATATTCTGGATGACTTAAATATTTATTTAAAAATGGTTGTAACTGTTGTGGAATTGTAGCACTAAACACCGCAATATTTGCATTATCTTCCAATCTTGCAGCAATGTAATCTACATCTTCAATTAATCCTAAGTCAATCATAAGATCCGCTTCATCAATAACTAAATATGATGCTAAGTGCACATGTAAATGTCCCGTTTTAGCTAAGTCATTAATTCTAGTAGGGGTGCCTATAATCAATTGTGGTTGTGCATTACAACGTTGTCTATCTTTCTCTATATCTGTACCACCAATAAAAACTTTAACTGAAACGCCAGCTTTAAATTGGCTTAAATGGTTCGCTGCATCGTATAGTTGTTGTGCAAGTTCTCTTGTTGGTGCAACTACGATTGCTTGTGGTTCTTTTATTTCACTATCAATTAACTGCATTAATGGTAATAAAAATGCATGAGATTTCCCTGTACCCGTTTGAGATTGACCAATTAAATTTGTTCTCTTTAGTATTCTTGGAATAATTCGATTCTGAATTTCAGTTGGTTTTTCAAAATTAAGGTCTTTCACAGCGTCAATTAAACTAGATTCTAGATTAAATTGTTCGAATGGATGTTTTGCCATGATTTGGCCTCCTTATATGTTCATCTTTACTATTATAAAGTATAAATGTGCTATTTTAAATAAAAATATTAAAACCTCGAAATTTCAAAATTTAGAAATCCCGAGATTTTAGTTTAAATATATTGAAATGGATCTGTATTAATTGTAGATGCTTCAACATCTATATTTATTTTTTCTGTATTGAACCAATTCATTAGTAACGTTTTTAAACCTTCTTTCATCACATATTCGCTGTAATGATTAATATCAATTAAGTTCACACCATGAATTTTAGCATCTAAGGCATCATGATGTTTAATATCACCTGTAACAAAGACATCTGCGCCTTGTTGGACAGCTTGATATTCATATCCAATACCTGAACCACCAATAATTGCAATACGTTTAATTTTCTGATTAGACTTACCAACAAAACGGACACTTGGGATATTTAATTTAGATTTAATATCAGCTGCGAAATCTTCCAATGTCATTTGATTATCCACTTCTGCCATAACGCCAAGTCCATAAAGGGATGTTTGTTTTATCTCAATAAAATCAAATACCGGTGTTTCATATGGATGGTATTGTTTAATTAATTGCTCAGCCCTTGACTTTTGATATGCATCTATCATAAATTCAATTTTAACTTCATCTACATATTCAATTTTATCAATTTGTCCTATTGTTGGATTAGCTTCACCAACTGGTTTGAATTGCCCTCTTCCTTCACTTTCAAAGAAACAATATTCATAATTACCTTCTTGTGCTAATCCATTTTCACTAAGCTTATCTTTAAATGGTCCAACATTATCCTTAGGTATATATGTTTGAACTTTATAGTATACACCTTGTTGATTATTGATTATTGAAATGTTCTTCAAACCCATCGCCTTCGCCAACATCATATTGACACCATACGGATTTACATCTAAATTTGTATGCATCGCTATTAAATTAATGTCATGTTGAATTAGTTTTCTAATAATCAAACCATAACCATTAGCTTTTAATGATGTTACGCCTTTAAAGATTAGAGGATGATGACTAATAATAGTATTATAACCTTTTTCGATTGCTTCATTTACTACTTCCAACGTACAGTCTAATGCTGTTAAAACACCAGTAACTTCAACATCTTCATCACCTATTAACAATCCTACATTATCCCAAGATTCAGCAGTACTAAATGGCACATGATGATCTAACAATGTCATTAAATCAGCTATTTTCATTACTATAACACCCTTTCAATTACAGCAATTTCGTCATTAATTTGAGCTAAACGTTGATGATGTTGTTCAGTATTGAGTTTCGATTTAATATGATAAAGTGCTTCTAACTCTCTTTGCCATTTTTTTATAAAATATTCATTTTTGTTGTTCAGCAATTTTGGTCCGAATTTCAATTCATCAGATGATAGCTCTATTAATTGTGTAGAATATTCTGCTACAACAATTTCATAAATATGGCCTTTTTCTTCCATTATTATTTCATCAATTATTTCATAATTCAATTGTTGTAATGTTTGTCTTAAATTTTCAGTTTGGATATTACTTTGTAAAATCAACCTTGGATGTTGACTTAACTTATCTTGCCCATCTTTTAAAATTTTAGCAATAAGTGGTCCGCCCATACCACAAATTGTGATATTATCGATTACGTCCTCGGGATGAATAACACTTAAGCCATCCCCTAAACGTACATCAATTCTATCTTCTAATTGATTTGCAGCTACATTTTTCACTGCAGCTTGAAAGGGGCCTTGAATAACTTCTCCTGCAATACCGCATTCGCATAAATGGTTTTGAATTGCATAGATTGGCAAATAAGCATGATCTGAGCCAATATCCGCGATTGTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_10 >LR134086|1641216:1649546|1642127_1643018_-|VDZ17569.1|DBSCAN-SWA MLLGSHVSMSGKKMLEGSAIEAHEYGETTFMIYTGAPQNTRRKSIEDLNITKGHEVMEKYGLSNIVVHAPYIINIANTTKPETFNLGVDFLQQEIERTQAIGAKDIVLHPGAHVGAGVDAGINKIIEGLNEVLTNDNNVRIALETMAGKGTEIGRSFEELARIIDGVHNNERLSVCFDTCHTHDAGYNVKEDFDGVLNEFDKIIGVDRIKVVHVNDSKNDRGAQKDRHENIGFGYIGFDALNYIVHHDSFKDIPKILETPYVGEDKKNKKPPYKLEIEMLKQQQFDPELKNKVMQQ >LR134086|1641216:1649546|1644487_1645588_-|VDZ17571.1|DBSCAN-SWA MKIADLMTLLDHHVPFSTAESWDNVGLLIGDEDVEVTGVLTALDCTLEVVNEAIEKGYNTIISHHPLIFKGVTSLKANGYGLIIRKLIQHDINLIAMHTNLDVNPYGVNMMLAKAMGLKNISIINNQQGVYYKVQTYIPKDNVGPFKDKLSENGLAQEGNYEYCFFESEGRGQFKPVGEANPTIGQIDKIEYVDEVKIEFMIDAYQKSRAEQLIKQYHPYETPVFDFIEIKQTSLYGLGVMAEVDNQMTLEDFAADIKSKLNIPSVRFVGKSNQKIKRIAIIGGSGIGYEYQAVQQGADVFVTGDIKHHDALDAKIHGVNLIDINHYSEYVMKEGLKTLLMNWFNTEKINIDVEASTINTDPFQYI >LR134086|1641216:1649546|1645590_1646268_-|VDZ17572.1|tRNA|DBSCAN-SWA MISLNNRLTTVSRFLKQGTIADIGSDHAYLPIYAIQNHLCECGIAGEVIQGPFQAAVKNVAANQLEDRIDVRLGDGLSVIHPEDVIDNITICGMGGPLIAKILKDGQDKLSQHPRLILQSNIQTENLRQTLQQLNYEIIDEIIMEEKGHIYEIVVAEYSTQLIELSSDELKFGPKLLNNKNEYFIKKWQRELEALYHIKSKLNTEQHHQRLAQINDEIAVIERVL >LR134086|1641216:1649546|1643027_1644374_-|VDZ17570.1|DBSCAN-SWA MAKHPFEQFNLESSLIDAVKDLNFEKPTEIQNRIIPRILKRTNLIGQSQTGTGKSHAFLLPLMQLIDSEIKEPQAIVVAPTRELAQQLYDAANHLSQFKAGVSVKVFIGGTDIEKDRQRCNAQPQLIIGTPTRINDLAKTGHLHVHLASYLVIDEADLMIDLGLIEDVDYIAARLEDNANIAVFSATIPQQLQPFLNKYLSHPEYVAVDSKKQNKKNIEFFLIPTKGAAKVEKTLNLIDILNPYLCIIFCNSRDNANDLARSLNEAGIKVGMIHGGLTPRERKQQMKRIRNLEFQYVIASDLASRGIDIEGVSHVINFDVPNDIDFFTHRVGRTGRGNYKGVAITLYSPDEEHNISLIENRGFVFNTVDIKDGELKEVKAHNQRQARMRKDDHLTNQVKNKVRSKIKNKVKPGYKKKFKQEVEKMKRQERKQFSKQQNRQKRKQNKKG >LR134086|1641216:1649546|1641216_1642002_-|VDZ17568.1|DBSCAN-SWA MRGENTMTPVFELKNVNYYYDHKKVLENINIKINKGEFLAIVGPNGAGKSTLLKLILGLLPLQSGEIFVEGIDFKNKKTSIKLSYVSQKANAFNSGFPASVKEVVLSGLTKTKRLFQTFNSKDNEKVIKVLERLNISDLIHKNIAELSGGQQQRVMIARALISEPAVLVLDEPTNGIDAKHVSEFYNTLDQLKQEGITIILVTHDIGVVADTATEVACLNKHLHFHGTTDEFKSLDEVEISKIYGHPVRFVDHQHNRECCN >LR134086|1641216:1649546|1647728_1649546_-|VDZ17574.1|DBSCAN-SWA MRIDQSIINEIKDKTDILDLVSEYVKLEKRGRNYIGLCPFHDEKTPSFTVSEDKQICHCFGCKKGGNVFQFTQEIKDISFVEAVKELGDRVNVAVDIEATQSNSNVQIAPDDLQMIEMHELIQEFYYYALTKTVEGEQALTYLQERGFTDALIKERGIGFAPDSSHFCHDFLQKKGYDIELAYEAGLLSRNEENFSYYDRFRNRIMFPLKNAQGRIVGYSGRTYTGQEPKYLNSPETPIFQKRKLLYNLDKARKSIRKLDEIVLLEGFMDVIKSDTAGLKNVVATMGTQLSDEHITFIRKLTSNITLMFDGDFAGSEATLKTGQHLLQQGLNVFVIQLPSGMDPDEYIGKYGNDAFTTFVKNDKKSFAHYKVSILKDEIAHNDLSYERYLKELSHDISLMKSSILQQKAINDVAPFFNVSPEQLANEIQFNQAPANYYPEDEYGGYDEYGGYIEPEPIGMAQFDNLSRQEKAERAFLKHLMRDKDTFLNYYESVDKDNFTNQHFKYVFEVLHDFYAENDQYNISDAVQYVNSNELRETLISLEQYNLNDEPYENEIDDYVNVINEKGQETIESLNHKLREATRIGDVELQKYYLQQIVAKNKERM >LR134086|1641216:1649546|1646398_1647505_-|VDZ17573.1|DBSCAN-SWA MSDNTVKIKKQTIDPTLTLEDVKKQLIEKGKKEGHLSHEEIAEKLQNFDIDSDQMDDFFDQLNDNDISLVNEKDSSDTDEKLNPSDLSAPPGVKINDPVRMYLKEIGRVNLLSAQEEIELAKRIEQGDEVAKSRLAEANLRLVVSIAKRYVGRGMLFLDLIQEGNMGLIKAVEKFDFNKGFKFSTYATWWIRQAITRAIADQARTIRIPVHMVETINKLIRVQRQLLQDLGRDPAPEEIGEEMDLPAEKVREILKIAQEPVSLETPIGEEDDSHLGDFIEDQEAQSPSDHAAYELLKEQLEDVLDTLTDREENVLRLRFGLDDGRTRTLEEVGKVFGVTRERIRQIEAKALRKLRHPSRSKRLKDFMD |
7 | Staphylococcus_phage(16.67%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_11 |
1718988 : 1728031
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LR134086|1718988:1728031|DBSCAN-SWA ATTATTCGTCGTATGAGATTAAACTCATAACATCGTAATCTTTAATTTTTTCAATACCATTTAAATATTTCAATTCAATTATAAATGCAATACCTACTACGATACCGCCTAATTTTTCAACTAATTTTATTGCTGCTTCAATCGTACCACCAGTAGCTAATAAATCATCTGTAATTAACACACGTTGACCTGGTTTAATTGCATCTTTGTGCATTGTTAAAACATTTGTACCATATTCTAGGTCATACTCATAACGAATGACTTCACGAGGTAATTTCCCTTCTTTTCTAACAGGTGCAAAGCCAATCCCCATTGAATAAGCTACAGGACAGCCAATGATAAAGCCACGCGCTTCAGGTCCTACAACGATATCAACATCTCTGTCTTTTGCGTATTCTACAATTTTATCTGTTGCATAGCCATATGCTTCACCATTATCCATAATTGTAGTAATATCCTTGAAACTAACACCTGGTTTCGGCCAATCTTGAACTTCTGATACGTATTGCTTTAAATCCATTAATATTTCCTCCTAAATTGCTCACGACAATTGTGACTTTATCCAATTTTTTATTTCTGAAAAATCTTGATATAATAATTGCTTTTCAACATCCATACGTTGTTGTCTTAATTGATATACTTTGCTGGAATCAATCGATCTTTTATCAGGTTGTTGATTGATTCGAATTAAACCATCTTCTTGTGTTACAAATTTTAAATCTAAGAAAACTTTCAACATGAATTTAAGTGTATCTGGTTTCACACTTAAATGTTGACACAATAACATACCCTCTTTCTGGATATTTGTTTCTTGTTTAGTTATTAATGCTTTATAACACTTTTTAAAAATATCCATATTAGGTATACCATCGAAGTAAATCGAATGATTATGTTGCAAAACTATATAAAGTTGAGAAAATTGCAGTTGTTGCAAGGAATTAGACAAGTCTTCCATTGACGTTGGTAAATCTCTTAATACTACTTTATCAGTTTGATGTTTAATTTCTTCACCATAATAATATTCATTCGCATTTACTTTATCACTTTTAGGATGAATAAGCACGACAATATTTTCATCATTTTCTGTAAAAGGTAAACTTTTTCGCTTACTTCTATAATCTAATATTTGCTGTTCATTCATCGCAATATCTTGAATAATTAATTGCGGTGATTGATTACCATTCCATTCGTTGATTTGAACAGATCCTAATATATTAATTGGCTGTTCATCTTGTAACTCAGGTTCTAAGTGACCATTTTGCCAAAATAGCGCGGCGATATTACTTTCACCAAGTGTCAATTTTAGATGATTTTTTTGTTGACCGATCGCCTTAACTGAAGAAACTGACAAATCATCCATTTCAAAAATAGGTCTAGAAAAATCTGTTCCGAAGGGTCTTAAACGATTCATATCACGAATATTTTTAATCGTTATATCATTTTCTGTTAATAATACGTCTACTGGCTTTACGGGATCTAACGAAGTTGTTTTAGATAATTCTTTCATCCATTTATTTAAACCTTCAGCTAACGATTCTATATTTTCAATATCCATCGTCATACCTGCAGCCATATGATGGCCGCCAAATTTAGCGATTAACTCTTGATGTGCTGATAGTATTTCAAACATCGACACTTGATCAATTGATCTGGCGGAACCTTTTGCATGATTTTGCTCCCTATCAATATTTAAAATTAATGTTGGCAAAGCAAATGTTTCGACAATTTTCGAAGCAACAATACCTAAGACACCTTCATGCCAATTTTCTTTTGCTAAAAGTAAAAATAAATCTCCCTTTTTAACTTTCGTTTCTGCCATAGCCATTGCTTCTTCTGTGATAGTTGCTACAATATCTTTTCTTTCACGGTTAAAATGTTCAACTTGTTCTGCTAAAAATGCAGCTTCTTCTTCGTCGTCAGTCATCAACAATTCGCAAGCTAATGATGCGTCATCTAAACGACCTACAGCATTAAGTCTAGGTCCAATAATAAAACCAATTGTTTCTTCATCAATATTGTCATTGTATCCCGCTTCTTTTAGCAACGCTTTAACAGAGGTCGGACATTGATCATTTAAGACTTTTAATCCTTGTTTCACTAATGATCGATTTTCATCAGTTAAGGATACTAAATCCGCAATGGTACCTATCGCAACTAATGCTTTAAAATAATCAGGTACATTTTCAATCAATGCTTGTGCTAATTTGTACGCAACACCTGCACCACACAATTGTTGGAACGGATAATTAAACGATGGATGCATTGGATGTACGATTGCATATGCTTCTGGTAATGTACTACCAATTTCATGATGATCAGTTACAATGACATCAACTCCTAAATCTTGAACCATTTTAATTTCATTATGACCTTGTATGCCATTATCAACAGTTATGATTAATGTTATGCCTTCATCATGAGCATTTCTAAATGCTAGTTCGTTTGGTCCATATCCTTCGGTAAAGCGGTTAGGAATATGCCATCCTACTTGTGCACCTAAAAGTTGTAATGTTGTCACTAAAATTGTAGTTGAGGTAACACCGTCGGCATCGTAATCACCATAAACTAGGATTTTCTCATCATTCGCTATCGCTCTTTTAATTCTTTCAATAGTCTTAGTCATATCGCTCAATTGCAGTGCATCATGATTGATATCTGTATCTGAGATGATGGCTTCTATTGTTTGTTCATCAATAATCGATTTACTTTCTAATATTTTTTTTACGATTGGCGTTAACTTTAATTTTGATGTTAATTCATCACTTATGTATTCAGCTGGTTTAGTTAATTTCCACTTATACTTCGGTTTAATCATATATATTTACGCCTCATTTCCAAAAGACATTATATCTAAAATTACTTTAAATAAAAAGCACTTATCTAAATAATCAAGACTTTAATTATACCATTTTTTAAAAATGAATGCGGGAACTTATTTATATATATTTTGTTAAATTTAAACAAAGTAAAAAGCGGTATGTGAACTCTTTATTGTTTCACATACCGCTTAATTCATTTTAAACTAAAATCTTTTCATCGTTCGATTTCTTTTCTTTATATACAACTAATTTGTGTTTCGGCGATTTTTTCAGCTGACGTTTTTTCATTATTCCCCATAGCGGAACGGCAATGAAGATTGAAGAGAATACACCAGAAATCAATCCGATAAATAATGCTAAAGTAAAGTTGAATATCGTAGGAGCACCGAAGAATAGTATAGCAACTACTACTACAATAACTGTTAATACTGTATTAATTGAACGTGTCATTGTCTGTCTAATTGATCTATTAACGATATCATCAATTTGTTCTGTTGTCGTAATCACTTTAACCTTTTGTAAGTTTTCACGTACACGGTCAAACGTTACGATTGTATCATTAATTGAATAACCGACAATTGTTAATACAGCGGCGATAAATGTTAAATCTACTTCAATTCTAAATAAACTGAAAATCGCTACTATAATGAATACATCATGTAATAATGCCAATACAGATGAAAGACCCATGCGCCATTCAAATCGTAATGATACATAGATGATGATACCTATCGATGCATAGATTAATGCAAGCATTGCATTTTTTGCTAATTCCTGTCCAATAATTGGTGATACAGTATTAATTTGAGGTGTGTCACCGAATTTCGATTTAATATTATCACTCAATTTATTATCTTGAGCACGCGTTAAATCGTCTTTAAATTGAACAGTTGCTACTTTATTATCTTTACCATTGATTTGAATTTGATCCGCTTTAAGTCCACTATCTTTTACAACTTGCTCAACCTTTTGTTGAGTAATTGCTTGTTTAGATTGGAAATCTACACGTGTACCACTTGAGAAATCAATTCCTAAGTTTAACTTGAAGATATAAAGAATAACTAAACCGACAACTACAATTAAAATACTTACTCCAATTAATGGCTTAGCTAATTTAACAAAATTCCATTTCTCGAATGAAGTTTTAAGGTCATGAACATCTACACCTTCATTAATATCATGTCGTTTATTCTTTTTAACACCAAATAACCAAAATTGATTTTTGAATATATTTGATGAAACAAGTAATGATAATAAGAATCTTGATAAGAACACGGCTGTAACAAAGATCATTAGAATACCTAATAATAACATTGTCGCGAAACCTTTAACTGAACTTTCACCGAAGAAGAATAATACTGCTGCGGCGATAACTGTTGTTAAGTTAGAATCAAAAATTGTTAGGAACGAACTTTTGTTTGCTTTAGAAAAGGCTTGCTTTATCGTTCTACCTATTCGAAGTTCATCCTTAATACGCTCATACATGATAATATTGGCATCTACAGCCATACCTACACCTAATACCAACGCCGCTAATCCTGGTAAAGTTAGAACCCCGGAAATGAAATTAAATGCTACTAACGTTAGATAGATATAAGTTGTCAATGCAATAATCGCTACTAAACCAGGTAATCGGTAGAATCCAAGCATGAATAAATAAATTAATGCTACACCAATAAACGATGCAAACACAGTTTTATCTAATGCATCTTGACCAAATTGTGCACCTACTGAGTTTGAATAAATTTCTTTCAAGTCAACTGGTAAAGAACCTGCATTTAACAATTCGGCGATTTGTTTTGCTTTTTTAACGCCTTCTTGTCCTTTAAATCCACCAGAGATTTCTACGCTATCAGAATTGATTGGTTGATCAACACTTGCTGCAGAAATAAATTTAGGGTTTTTCTTTTGTGCTTCTTTTTTATAGCTGTCACCTTTTTTGAAATCTAACCAAACAACCATGACATTATCACGTTTCTTAGAGATTTCTTCCGTTACTTTTTTAAATTTGTTTTTGTCTTTTACTTTAAAAGTAACTGTAGGCTGGTTTGTTTCCTGTTTAAATTCTTGTTTGGCAGATCCCTGTTTAATATCAGAACCGCTTAATTTTACTTTATCTTCTGCATCGCGAATTGTTAAATTAGCCTGAGAAGATAAAATTTTACGTGCTTCATTCTGGTCTGTTACACCAGCAAGTTGAACTCTAATTCTATTAGGTTCTTCAACTTGAATTTTAGGTTCGGAAACACCTAAAACGTTAACACGATTTTCTAATGTTTGCGCTGTTGATTGTAAGGCTTTTTTATCTATTTTGTCGCCTTTATTTAAAGGATCGACTTGATAAAGCACCTCAAATCCACCTTGCAAATCAAGTCCTAAATTGACATTCTTTATAACACTTTTATAAGTTGCAGCCATTCCGGCAAACAACAATACGACTAAAAGCAAGAACGCAATTATTCTACTACTTTTCTTCACATGAACACCTCATTATTTACGTATGTATTTAGAATACTTGAATACTATTTTATAACGCAAGTTAAATCTTTCTTACAAAATTTATTAGCCTTATACATATTAACATACTAGAGCAGGGAGTAAAAATAGTCATAGATATATTTAATTTAAATTTAACAATTATTATGTATCACAATTTCTTTTTTTGGAATAAAAATAAGCTATTCTACATACTACTTATAACTTAAAAAGGATGAAACGCTATTCGTTTCATCCTTTTTAATACCACTTCTCGTTATGAAGGGTCAACTTGTTTAATAGCAGGTTTTTCGAAAGTTAATTCAGTACCATGACCATTAACTGTAATAACAACAGTTGTTTCATCTACTGCTTTAACAGTACCTTTAATACCACCAATAGTTGTAATTCTTTGACCAGATTGAATGTTATTAATCAACTCACGATGCTGTTTCGCACGTTTTTGTTGTGGTCTAATCATCAAGAAATACATAACCGCAAAAATTACGACTATATATATTAGTAATGAAAATTGCATTTTATACGCTCCTCTTGCTTAAAAGTTTTTTGGGTTCTCAACATTTAATCCATATTGCTCGAAGAATTCTTCTTTGAAATCTAAAAGACGATCTTCTCGAATGGCTTGTCTTATATCTTCCATTAATTTTAGCAGAAAATGTAAATTATGAATAGTAGTAAGACGAATACCAAAAGTTTCCTCTGCCTTGATTAAATGACGTATATACGCTCTTGAATAGTTTTGACATGTATAACAGTCACAATTCTCATCTAACGGTCTTAAATCATCTGCAAATTTTGCATTTTTAATAACTAAACGACCTTGCGATGTCATACAAGTACCATTTCTGGCAATACGTGTCGGTAAGACACAATCAAACATATCCATGCCGCGAATACTACATTCGATTAACGCATCTGGAGATCCTACACCCATTAAATATCTTGGTTTATCTTTAGGCATAAACTGCTCTGTATGTTCAACCATTTTATACATAACCGGTTTAGGTTCACCAACTGACAAACCGCCGATTGCATAACCAGGAAAATCTAATTCTACTAAATCCTTTGCACTTTGTTCTCTTAAATCTTCATATTCGCCACCTTGTATAATGCCGAACAATGCTTGATCTTCAGGTCTTTGGTGTGCATCTAGACATCTTTTCGCCCAACGTGTTGTACGTTCAATAGATTTTTTTACATAATCATATTCAGCAGGCATTGGTGGACATTCATCAAATGCCATCATAATATCAGAACCTAAATCATTTTGAATTTGCATTGATTTCTCAGGACTCAAAAATAATTTAGACCCATTAGTATGATGTCTAAATTCCACGCCTTCTTCTGTAATTTTACGTAAATTACTTAAACTAAACACTTGGAAACCGCCTGAATCTGTTAGAATCGGACCATCCCAATTCATGAATTTATGTAATCCCCCAGCGTGTTTGATAATATCATTTCCGGGTTGTAACCACAAATGATATGTGTTGCCCAAAATGATTTTTGCTTCAATTTGTCTTAACTCTTCTGGACTCATTGTTTTAACGGTTGCTTTAGTACCAACTGGCATAAACATAGGTGTTTCAAATGAACCGTGTGGTGTGTGCACGATACCTAAACGCGCACCTGATTGTTTACAAGTTTTAATGTGTTCGTATGTTACTGCAGGCATATTCAAAATCCTCACATTCTTTTTATATAATTAACATTGCATCGCCAAAACTAAAGAATCTATATTCTAAATTTACTGCCGTTTTATAAGCATTCAGAACATTTTCACGAGTACTAAACGCTGATACTAGCATAACTAATGTTGATTTTGGTAAATGAAAATTAGTAATCTGGCCATCAATTGCTTTAAAATCAAATCCTGGATAAATAAATATATTAGTCCAGCCACTCGTTTCAACAAATTTATCATGATCGCGTCGAATTGTTTCAAGTGTACGTGTTGAAGTTGTACCAACTGATATAATGCGATGTCCTTTGGACTCAGTATCATTTAATAAATCAGCTGTTTCTTGTGTCATTTGATAATATTCACTATGCATTTCGTGGTCATTCACATCATCGACGCTCACCGGTCTAAACGTACCTAACCCAACATGTAATGTAACAAATGCGATATTAACACCTTTATTTTTAATTTCAGTTAATAACTCATCAGTAAAATGTAATCCTGCTGTTGGTGCTGCCGCTGAACCACTTTCTTTAGCGTAAACTGTTTGATAACGATCTGGATCATCTAAACGTTCTTTGATGTATGGTGGCAGTGGCATTTCCCCTAATTCATCTAATCTTTCTTGTAAAATACCTTCATAATGTAAACGCATGATGCGTCCACCTTGATCCATTTCTTTTATGCATTCAGCTATAATTTTGCCATTACCAAAATTCAATTTATTACCAACTTTAATACGCTTAGCTGGTTTCAGTAAGACTTCCCAATCATTACCTTCAATTTGAGTTAACATTAACATTTCAACTTTTGCACCAGTTTCTTCTTTTAAACCAAAAAGTCTAGCTGGCATTACTCGCGTATCGTTAAGCACTAATGTATCACCAGGTCTAAAATACTCAATGATATCTTTGAAATGTAAATGTTTCATTTCACCAGTTTCTCTATCCATGACTAATAAACGACTATGATCACGATCTTTTAAAGGCGTTTGAGCAATTAATGATTCTGGTAAGTCATAGTCAAATTCTTCAAAATTCACGTTATTCTCTCTCCTCATTCGACTTTGCAAAATGTTCATAAGCTAATGGTGTTGCTTTTCTGCCACGTGGCGTACGTTCTAAAAAGCCTTTCTGAATAAGAAATGGCTCATAAACGTCCTCAATTGTAATACGTTCTTCACCAATTGTTACGGCAATCGTATCTAAACCAACAGGTCCACCATTATACTGCTTAATAATACAGTTCATCATTTTATGATCAATGTAATCTAGTCCGTGTTGATCAACTTGAAGTAAACCTAATGCGTGCTTCGTTGTTTCAATGTATATTTGTTCATCTTCATTCACTTGCTGGAAGTCTCTTACCCGCTTCAATAGTCGATTTGCTACTCTTGGAGTCCCTCTAGAACGTTTAGCAAGTTCAATGGCACTTTCTTCATCAATACCTGTGCCTAAAACCTCAGCTGTTCTAATAATGATTTCTTTTAAATCTGATTCATTATAATATTCTAATCTTAAGTGCACACCAAATCGATCCCTTAGTGGACCTGTTAAGCTGCCAGCTCGCGTTGTTGCACCTACCAAAGTGAATGGAGGTAAGTCGATACGGATACTTCTAGCCTCATCGCCTTTACCAATGATAATATCTAAAAAGAAATCTTCCATTGCAGGGTATAACACTTCTTCAACAACACTACTCAGTCTGTGTATTTCATCAATAAACAAAACATCTCCAGGTTGAAGTCCTGATAAAATTGCAGCCAAATCACCAGGTCTTTCTAATGAAGGCCCTGATACTGTACGTATATTAACTTCCATTTCATTGGCAATGATATTAGATAATGTTGTCTTACCTAATCCAGGGGGGCCAAAAAGCAATACATGATCTAATGGTTCATGACGAAGTTTAGCCGCTTTAATAAATACTTCTAAATTACTTTTTATTGAATTTTGACCAATATATTGTCGTAATCTCGTAGGTCTAAGCGACAATTCGAAATCAGTTTCTTCACTATGCATTGATTGATCAACCATACGCTCATTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_11 >LR134086|1718988:1728031|1727026_1728031_-|VDZ17653.1|DBSCAN-SWA MNERMVDQSMHSEETDFELSLRPTRLRQYIGQNSIKSNLEVFIKAAKLRHEPLDHVLLFGPPGLGKTTLSNIIANEMEVNIRTVSGPSLERPGDLAAILSGLQPGDVLFIDEIHRLSSVVEEVLYPAMEDFFLDIIIGKGDEARSIRIDLPPFTLVGATTRAGSLTGPLRDRFGVHLRLEYYNESDLKEIIIRTAEVLGTGIDEESAIELAKRSRGTPRVANRLLKRVRDFQQVNEDEQIYIETTKHALGLLQVDQHGLDYIDHKMMNCIIKQYNGGPVGLDTIAVTIGEERITIEDVYEPFLIQKGFLERTPRGRKATPLAYEHFAKSNEERE >LR134086|1718988:1728031|1724558_1724819_-|VDZ17650.1|DBSCAN-SWA MQFSLLIYIVVIFAVMYFLMIRPQQKRAKQHRELINNIQSGQRITTIGGIKGTVKAVDETTVVITVNGHGTELTFEKPAIKQVDPS >LR134086|1718988:1728031|1725999_1727025_-|VDZ17652.1|tRNA|DBSCAN-SWA MNFEEFDYDLPESLIAQTPLKDRDHSRLLVMDRETGEMKHLHFKDIIEYFRPGDTLVLNDTRVMPARLFGLKEETGAKVEMLMLTQIEGNDWEVLLKPAKRIKVGNKLNFGNGKIIAECIKEMDQGGRIMRLHYEGILQERLDELGEMPLPPYIKERLDDPDRYQTVYAKESGSAAAPTAGLHFTDELLTEIKNKGVNIAFVTLHVGLGTFRPVSVDDVNDHEMHSEYYQMTQETADLLNDTESKGHRIISVGTTSTRTLETIRRDHDKFVETSGWTNIFIYPGFDFKAIDGQITNFHLPKSTLVMLVSAFSTRENVLNAYKTAVNLEYRFFSFGDAMLII >LR134086|1718988:1728031|1724837_1725977_-|VDZ17651.1|tRNA|DBSCAN-SWA MPAVTYEHIKTCKQSGARLGIVHTPHGSFETPMFMPVGTKATVKTMSPEELRQIEAKIILGNTYHLWLQPGNDIIKHAGGLHKFMNWDGPILTDSGGFQVFSLSNLRKITEEGVEFRHHTNGSKLFLSPEKSMQIQNDLGSDIMMAFDECPPMPAEYDYVKKSIERTTRWAKRCLDAHQRPEDQALFGIIQGGEYEDLREQSAKDLVELDFPGYAIGGLSVGEPKPVMYKMVEHTEQFMPKDKPRYLMGVGSPDALIECSIRGMDMFDCVLPTRIARNGTCMTSQGRLVIKNAKFADDLRPLDENCDCYTCQNYSRAYIRHLIKAEETFGIRLTTIHNLHFLLKLMEDIRQAIREDRLLDFKEEFFEQYGLNVENPKNF >LR134086|1718988:1728031|1719528_1721802_-|VDZ17648.1|DBSCAN-SWA MIKPKYKWKLTKPAEYISDELTSKLKLTPIVKKILESKSIIDEQTIEAIISDTDINHDALQLSDMTKTIERIKRAIANDEKILVYGDYDADGVTSTTILVTTLQLLGAQVGWHIPNRFTEGYGPNELAFRNAHDEGITLIITVDNGIQGHNEIKMVQDLGVDVIVTDHHEIGSTLPEAYAIVHPMHPSFNYPFQQLCGAGVAYKLAQALIENVPDYFKALVAIGTIADLVSLTDENRSLVKQGLKVLNDQCPTSVKALLKEAGYNDNIDEETIGFIIGPRLNAVGRLDDASLACELLMTDDEEEAAFLAEQVEHFNRERKDIVATITEEAMAMAETKVKKGDLFLLLAKENWHEGVLGIVASKIVETFALPTLILNIDREQNHAKGSARSIDQVSMFEILSAHQELIAKFGGHHMAAGMTMDIENIESLAEGLNKWMKELSKTTSLDPVKPVDVLLTENDITIKNIRDMNRLRPFGTDFSRPIFEMDDLSVSSVKAIGQQKNHLKLTLGESNIAALFWQNGHLEPELQDEQPINILGSVQINEWNGNQSPQLIIQDIAMNEQQILDYRSKRKSLPFTENDENIVVLIHPKSDKVNANEYYYGEEIKHQTDKVVLRDLPTSMEDLSNSLQQLQFSQLYIVLQHNHSIYFDGIPNMDIFKKCYKALITKQETNIQKEGMLLCQHLSVKPDTLKFMLKVFLDLKFVTQEDGLIRINQQPDKRSIDSSKVYQLRQQRMDVEKQLLYQDFSEIKNWIKSQLS >LR134086|1718988:1728031|1722004_1724284_-|VDZ17649.1|DBSCAN-SWA MKKSSRIIAFLLLVVLLFAGMAATYKSVIKNVNLGLDLQGGFEVLYQVDPLNKGDKIDKKALQSTAQTLENRVNVLGVSEPKIQVEEPNRIRVQLAGVTDQNEARKILSSQANLTIRDAEDKVKLSGSDIKQGSAKQEFKQETNQPTVTFKVKDKNKFKKVTEEISKKRDNVMVVWLDFKKGDSYKKEAQKKNPKFISAASVDQPINSDSVEISGGFKGQEGVKKAKQIAELLNAGSLPVDLKEIYSNSVGAQFGQDALDKTVFASFIGVALIYLFMLGFYRLPGLVAIIALTTYIYLTLVAFNFISGVLTLPGLAALVLGVGMAVDANIIMYERIKDELRIGRTIKQAFSKANKSSFLTIFDSNLTTVIAAAVLFFFGESSVKGFATMLLLGILMIFVTAVFLSRFLLSLLVSSNIFKNQFWLFGVKKNKRHDINEGVDVHDLKTSFEKWNFVKLAKPLIGVSILIVVVGLVILYIFKLNLGIDFSSGTRVDFQSKQAITQQKVEQVVKDSGLKADQIQINGKDNKVATVQFKDDLTRAQDNKLSDNIKSKFGDTPQINTVSPIIGQELAKNAMLALIYASIGIIIYVSLRFEWRMGLSSVLALLHDVFIIVAIFSLFRIEVDLTFIAAVLTIVGYSINDTIVTFDRVRENLQKVKVITTTEQIDDIVNRSIRQTMTRSINTVLTVIVVVVAILFFGAPTIFNFTLALFIGLISGVFSSIFIAVPLWGIMKKRQLKKSPKHKLVVYKEKKSNDEKILV >LR134086|1718988:1728031|1718988_1719507_-|VDZ17647.1|DBSCAN-SWA MDLKQYVSEVQDWPKPGVSFKDITTIMDNGEAYGYATDKIVEYAKDRDVDIVVGPEARGFIIGCPVAYSMGIGFAPVRKEGKLPREVIRYEYDLEYGTNVLTMHKDAIKPGQRVLITDDLLATGGTIEAAIKLVEKLGGIVVGIAFIIELKYLNGIEKIKDYDVMSLISYDE |
7 | uncultured_Mediterranean_phage(50.0%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_12 |
1765098 : 1772150
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LR134086|1765098:1772150|DBSCAN-SWA TTTATTTTTGACATACTGGACAATAATGACTATTTCTTGTCGCGATGATTTTTGTTTCAATTTGACTTCCACACACTTTGCATACCGGCTGCTTATATACATTAAGATGCAATTGCATCTCACCAGTTTTTCCATCAGCATGACGATAATCTGAAATACTTGTACCGCCATATTTAATACCTTCTTCTAGTACTTCTCTAACATAATAAAAAACCATTTCTTGTTGTTGGTGTGTTAAGTCTTTTACTTTTTTATCTGGTAAAACACCTGCACGAAACAACGCTTCACATGCGTAAATATTTCCACAACCTGCGATTACTTTATGATCCAAAATCACTTGTTTGATTGGTTTATTCTTATTAGACTGTTGATGAATTCGATTTAAATAATACGTCAATGCTTCATTTGAAAAAGGTTCAGGCGCTATTTCTAAAAATGAAGGGTAAGATGCTACAGACGCAACATTTCTAATTTCTCCAAAACGCCGTATATCTGAATAAATTAACTTTTTGTCATTTGACAACTCAAAAATAACATGCCAATGCTTACGATAATTAGGTATCATAATATCTTCAAGTTCATCTACAATGAAAAAACCACCCGCCATACCTAAATGACTAATTAATGTACGTTGTTCTCGTTTATTATCTAGCTGAAAAACGATATATTTACTTCTTCGTTCTACATTTGTAATGGTATAGCCTTCCGATAAAGTTTTAAAAGTATCTAATTCAATTCCTTTTATAATTGTTTCCTTGCCTTGAGCTTTACCTTCAATTACTTTATCCGAAAATTTAACGTGTTCAATTTTTTGATTTATAACGTAGGGTTCAATTCCTCTTTTTACATGTTCTACTTCTGGTAATTCGGGCATACCATTAACCTCACTTTATTTTGCATCATACCAAGTTGCACCATAACTTGAGTCTACTTTTAATGGAACATCTAATTGCAATGCATTTTCCATTATCTCTTCTACAAATTCACTAAATGAATCTACTTCTGACTTAGGTACTTCAAAAATTAATTCATCGTGTACTTGTAATAATAGTTTAGCTTGATATGTTGTCTCTTTCATTTTTTGTGCAAATTTAACCATTGCCAGTTTAATGATATCTGCAGCACTGCCTTGTATTGGCGTATTCATAGCAGTACGTTCAGCAAAGCCGCGTAAATTAAAGTTACGACTCGTAATATCAGGAATATAGCGTCGACGATGTAGCAATGTTTCCACATAACCTAAAGCTTTGGCATCTTTTACAATATCAGACATATATTGTTTTACACCTGGGAAACTAGCTAAATAATCATCAATGAATGCTTTTGCTTTTTTACGAGTAATACCTAAACTTTGACTTAAACCATAATCACTTATCCCATAAACAATTCCAAAGTTAACCGCTTTTGCTTGACGACGCATTAAACTATCGACTTGATCAGCTTCTACACCAAATACTTTCATAGCAGTTGCTGTATGAATATCATCGCCGTTGATAAATGCTTCTTTCATACTCTCATCTTGTGTAATGTGTGCTAATACACGCAATTCAATTTGAGAATAATCTGCTGATAATATAACGCTATCTTTTGAAGTTGGTTTAAAGGCTTTTCTTATTTTACGCCCTTCTTCAAGTCTAACCGGAATATTTTGTAAATTAGGATCTACACTTGATAAACGTCCAGTTTGCGCTAAAGTTTGGTTAAAACGTGTATGGATACGTTGATCATCACTAATTACCTTTTGCAATCCTTCAACATAAGTAGACTGTAACTTAGATAATTGACGATATTCTAAAATATAATCAATGATAGGATGTTCACCTTGCAATTGCTCTAAGACATCTACAGCAGTAGAATATCCTGTTTTCGTCTTTTTAATAACAGGTAATTGTAATGTCTCAAACAATACAACACCTAATTGCTTAGGAGAATTTATATTAAAATCTTCACCAGCTGCATCATGGATATTTCGAATCAAGACGTCTAATTTTTCTTGAATTTCTTTTTCCATTTCTTCTAAATCATGAACATCTGTAAATATACCAATTTCTTCCATTTCACTTAAAATCTTAGCTAGCGGTAGCTCTAAATCAGCTAAGAGTTCTACCTGATTGTATTCTTCTAATTGTTTATCCATATTTGGTTTCGCAAAGTAAATTGCATCAGTAATAGAAGCAACATATGGATTTAAAACATCATCTTCAGGTACCTTAAATTTCTTACCTTTTCCATATATACTCACATCGTCTTTCACAAAACTTTGACCGTACAATGAAACAACTGATTGAACATCACTAATCGTACGAGATGGATCAATTATATAACTGGCCAACATAATATCGAAAGAAATATTTTGAATATCAATTCCCAATCTATGTGATGCTACATATGTTTTTTAGCATCATATACGACTTTTTTCGTATTCGGATTTTCTAACCATGAAACTAGTTCGGCATAATTATTTATGTCATCCGCATTAATTACAATATGTTTCTCACCTGTAAATAAAGAGAATTTTAAAATATTATTTCGCAAATAGTTACCACCGTCTAATTCGAAATGGATGGCCGCTTCTTTCAATGAAGTAAAATCAACATTATCAAAAGACGTTTCAATTTCAATTGTCTTTTCTATTGCATCTTCAACGCTTGCTGATTGATCAATGTCAGCCAACAATTGTTTGAATTCTAACTTCTTAAACAATTCGATTTTTTCTTGTTGTTCATCTTGATGAGTCATTAACGTATCTTCAAGTTTTACTTCAATCGGACTATCTACATTAATCGTTGCTAATTCTTTACTCATTAATGCATCTTCTTTGCTATTTTGAAGTTTCTCTTTTAACTTTTTACCTGAAATTTCATCTAAATGTTCATAGACACCTTCTACTGTGTCAAATTGGTTTAGCAATTTTATTGCTGTTTTCTCTCCAACACCTGCAACACCTGGTATATTATCAGAAGTATCTCCCATTAATCCTTTCATATCAATAATTTGATTAGGTGTTAACCCGTTGTATTTTTCCGCAATAAAGTCAGGTGTATAATGATCAACATCAGTAACACCTTTTTAGTGTAATAAATGGTTACATTATCCGTTGCAAGTTGTGTTAAATCTCGGTCTCCCGTAATAATAATTGTCTGAAAGCCCGCTTTATCTGCTTCTTTACTTAAAGTTCCGATAATATCATCTGCCTCATAGTTATCTAATTCATAACGTTTAATATGATATGCATCTAATAATTGGCGTATATAAGGAAATTGCTCACTTAGTTCAGGCGGCGTTTTCTGGCGTCCACCTTTATATTCACTATATTTTTCATGTCTGAAAGTCGTTTTACCTGCATCAAACGCTACTAAAAAATGATTTGGCTTTTCTTCTTTTAAAATCTTCTCTAGTAACATTGCAAAACCATATACTGCATTGGTATGAATGCCTGCTTTGTTTGATAACAAAGGTAATGCATAAAAAGCTCTAAAACTTAAGCTATTACCATCGATTAATACTAATTTATTCACAATTTTAACCTCCAGAACTAATTTATATATATTTTAGCATATTCGACTGTGATGTCGTAATTAAAGAAACTATCTCATAGAGTATTTATACACGACCTAATTTCAAATAAAACAAGTGACTATATAGACTAAGCTAAAAAATAAAAATGACATAATCATGATTGTTCTTGATTAGCACTCCATAAAGTCAGGTTAAAAGTCCAACTTTTGAGATGCACATTATCATTTCATGATTATGTCTACTTTTTAATATTTTTATGCTGCTATTTTAAATTTTTATAGGTAAGAATAAGTTATGAATCGTCAGAACCAAATGGAATATATTTAACTTTGGTCATTTTCGGTAATTCTTCATAATTATTAAACCACTCTTGGTAATTTTTATTGATTGGTGACGGATGATGCATATAATGTTCAAACGGCAATGATTCCACTGTATAAACCTCTTGTCGTGGATGATCTTTAATTTGTTGTTTTAATAACTGAACTCTTTTTTCATGTTCATAATGAACATAAATAAATGCACTAAGATATATCATAGCTAAAACTAGTGATGCAACTTTAATAAAATTAACATTGATTGACTTATATTTCCGAAATTCTTTTAATAAAATAATTAAAATGATTACATGTATCGTATAAACAATCAAAAAATTACCTGGTTCTATTGGAGTAACAATGACTAGTGTCGACGCCGAAACACATATTGCAATAAGTAAGGAATATAAAGTGATTTGTGTTTTACGATCATTAATAGACAAATAAATACCTACAAATATCGAAAACGCAAAGTAACCACATACAATTACGTTCACAAAACCAACCAATCCAATATCTGTATTTTTATTTAATAAAAACTGATTGTAAAATAGTAAATAATAAAGCGGTAAAGTGATAAATCCTATCATAATGATACGACGCTTTAATATTGTTAAATGTACATACCGATCACTTCTAAGCAGTAGATAAATAATAAGCGCTGCAATCATACTTAAAATTATAATCTGACTGAAAATGACACCATATGGAAGTGACGTTGATATCATTTCTGCAAATTTTGAAAAGATACCTTGATTATTTGAAACTTGTTGATATTCTGATCCTTCAAATAAAATTTTGCGATAATTTGGATTGGAAAACATAATGATTGTACCTATAGTAGCAATCATAAATGAAAACAATAATTTATAATTAAGTGTTCGATTTGCAGTAAATTCATACAGAAAAGCTAAAATTAAAATGATACAGTGGAATAATGTCACATTCTCCATAAATAATTGACCGAAGAAGCATAAAACATAGAATAGTACAGTAACACTTACCGGCTGCTTTTCTTTATATATAATTGCATTAATACAATAATAAATAATAAAGAGTGAAATTAGTGTTGATGTCGCATAATTATAAAATCCTGCAAACCAGCCATATGTATCTGCATAAATAGCACTTGGTAAAATTAACATTAAAGAAAATGCTAACAAATAATAGCTTGTCCACGCTTTACAACGTGTAATGTGCATAATCATCCAAATGATGCCCATACTAATGAGACCATATGAAAGCCAACGTAACCAGCTTACATGTACAGCTATAATTTCAAAGATATTTCCGATATAGCGACCATTAAGTGATGCAAATCCTACTTTTAAAATATCAGTATTATAATTGCTAAACCATTGTAAATCATCGTGCATGAGTGGTAGTAAGATACCCATAAAAGTATAAAACAATAATATCGCAATTAATATCAAAGTTGTCTTGTGTAATTGAATTGTTTTCACTTTGCTAATCCTCAAATCTAGTTAAATTTTCCTCAACTTGTAGGTCGAAAAATTAATTCAATATTTTTAATGTATTTCTAATTTTCACCTATGCATGTTTCCTCAATCAAATTAGATAAACAAGGTATTTAATATTACTTTCAACAATTTATCTAAATCGCCCCTCGTCTTTTTCTATGACGAATGATTACACTTGTCTATTCAAGTGTTTAAATTAAGATTTATTTCCGTTCAAATAAAACTTATTACTTTTTAATTAAGCATCTATTTTAAGCGCGTTACTAAAATTTCTTTATTATAATAAATATATTATAAAATTGCTTGATTCACAACAATCTATTACTTATAACTTACAAATCGACATATGCAAATGACAAAATTGACAACCGAATTTATTCCACTTCATTAACTCTAATTTAATACCAATAGAGATTTGAACGAAATAAAAAAGCAGCAACAACTTCGTGAAAAATACACGCGCTGTTACCACTTTAATTTTTATTCTTTATAATCTTTTAGAATAACTTTGAACGTTGAGCCTTTGCCAACTTGACTATTCACTTCAATATTGCCTTGGTGGGCCTCTACTATATGCTTTGTAATTGATAATCCAAGACCTGTCCCACCAGAATCTCTACTTCGTGCTTTATCTACTCTATAAAATCTTTCAAAAATACGTTGTTGGTCTTCTAATTTAATACCTATACCAAAATCTTGTACTTCGAAAATGACACGAAAGTCATCTCGATACACACGAACGTTAATATCTCCATCTTCATAAGAATAGTTAATTGCATTCGTTAACAAATTCGTGATAACTTGAGCAATTTTACTTTCTTGTGCTTTAACAATGACATCTTTTTCAATATCAGTATGAATGGAAATATTTTTTGATTGGCTTGAGTCATCATATTATCAATAATACGCCGCGTTAAATCTGATAAATTCATATAGTCTGTATCTAACTCTGTATGTTGCTCAATATGCGATAAATCTAACAGATCTGTTACTAAAGATTCTATTCGATTTGATTCTTTTAAAATTATGTTTAAAAACATGTCTAATGATTCCGCATCATTTTTTGCACCATCAATAAGCGTTTCAGCAAACCCCTTAATTGAAGTAATAGGTGTTTTTAATTCATGTGAAACATTTGCTACAAATTCACGTCTTAGATTTTCAAGTTGTTTCAGATTTGTTATGTCATGCATCACAACTAAAATCCCTTGCAAACTTTTTTGAGACCTAGTTAAAATCGGAACGCATGAAATATCAAAATACTTGGCATGGACTTGGTTTATTGCAACTTCCAATTGTTCATAAATAGGTTTTTCAACTTTAAAACTTTCTAAAATTAATTGCTCAATTTCAGTATTAACATAACCGTGATAGCCTACTTGTTCAATATTATGCGAGATGTTGAACTGTTCATAATACGCTTTATTTGCAACAACGATTTTTCCATTTCGATCTATCATTAAAATAGCACTTGGAATATTTTCAATCGTTGTTTTTAAACGATTGGATTGCATTTTTTGCTCATTATTAAGCTTTTGAAGGCGTCGTGCTAGATCATTGGTAGACACAAAAAGCGCTTTAGTTTCTATAACATTACTTTCAGGTACACGTATGTGATAATAACCATTTGCCAACAATTGTGTTGCATAAGTAACTTCTTGAATGGGACGGATTAATGTACGCTTAAAACTACGGCTTGCAAAATACAGACAAATGAGTACAACTAAACATGTCAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_12 >LR134086|1765098:1772150|1765986_1767468_-|VDZ17692.1|DBSCAN-SWA MGIDIQNISFDIMLASYIIDPSRTISDVQSVVSLYGQSFVKDDVSIYGKGKKFKVPEDDVLNPYVASITDAIYFAKPNMDKQLEEYNQVELLADLELPLAKILSEMEEIGIFTDVHDLEEMEKEIQEKLDVLIRNIHDAAGEDFNINSPKQLGVVLFETLQLPVIKKTKTGYSTAVDVLEQLQGEHPIIDYILEYRQLSKLQSTYVEGLQKVISDDQRIHTRFNQTLAQTGRLSSVDPNLQNIPVRLEEGRKIRKAFKPTSKDSVILSADYSQIELRVLAHITQDESMKEAFINGDDIHTATAMKVFGVEADQVDSLMRRQAKAVNFGIVYGISDYGLSQSLGITRKKAKAFIDDYLASFPGVKQYMSDIVKDAKALGYVETLLHRRRYIPDITSRNFNLRGFAERTAMNTPIQGSAADIIKLAMVKFAQKMKETTYQAKLLLQVHDELIFEVPKSEVDSFSEFVEEIMENALQLDVPLKVDSSYGATWYDAK >LR134086|1765098:1772150|1768102_1768615_-|VDZ17694.1|DBSCAN-SWA MNKLVLIDGNSLSFRAFYALPLLSNKAGIHTNAVYGFAMLLEKILKEEKPNHFLVAFDAGKTTFRHEKYSEYKGGRQKTPPELSEQFPYIRQLLDAYHIKRYELDNYEADDIIGTLSKEADKAGFQTIIITGDRDLTQLATDNVTIYYTKKVLLMLIIIHLTLLRKNTTG >LR134086|1765098:1772150|1768908_1770396_-|VDZ17695.1|DBSCAN-SWA MKTIQLHKTTLILIAILLFYTFMGILLPLMHDDLQWFSNYNTDILKVGFASLNGRYIGNIFEIIAVHVSWLRWLSYGLISMGIIWMIMHITRCKAWTSYYLLAFSLMLILPSAIYADTYGWFAGFYNYATSTLISLFIIYYCINAIIYKEKQPVSVTVLFYVLCFFGQLFMENVTLFHCIILILAFLYEFTANRTLNYKLLFSFMIATIGTIIMFSNPNYRKILFEGSEYQQVSNNQGIFSKFAEMISTSLPYGVIFSQIIILSMIAALIIYLLLRSDRYVHLTILKRRIIMIGFITLPLYYLLFYNQFLLNKNTDIGLVGFVNVIVCGYFAFSIFVGIYLSINDRKTQITLYSLLIAICVSASTLVIVTPIEPGNFLIVYTIHVIILIILLKEFRKYKSINVNFIKVASLVLAMIYLSAFIYVHYEHEKRVQLLKQQIKDHPRQEVYTVESLPFEHYMHHPSPINKNYQEWFNNYEELPKMTKVKYIPFGSDDS >LR134086|1765098:1772150|1765098_1765971_-|VDZ17691.1|DBSCAN-SWA MPELPEVEHVKRGIEPYVINQKIEHVKFSDKVIEGKAQGKETIIKGIELDTFKTLSEGYTITNVERRSKYIVFQLDNKREQRTLISHLGMAGGFFIVDELEDIMIPNYRKHWHVIFELSNDKKLIYSDIRRFGEIRNVASVASYPSFLEIAPEPFSNEALTYYLNRIHQQSNKNKPIKQVILDHKVIAGCGNIYACEALFRAGVLPDKKVKDLTHQQQEMVFYYVREVLEEGIKYGGTSISDYRHADGKTGEMQLHLNVYKQPVCKVCGSQIETKIIATRNSHYCPVCQK >LR134086|1765098:1772150|1767479_1768082_-|VDZ17693.1|DBSCAN-SWA MKGLMGDTSDNIPGVAGVGEKTAIKLLNQFDTVEGVYEHLDEISGKKLKEKLQNSKEDALMSKELATINVDSPIEVKLEDTLMTHQDEQQEKIELFKKLEFKQLLADIDQSASVEDAIEKTIEIETSFDNVDFTSLKEAAIHFELDGGNYLRNNILKFSLFTGEKHIVINADDINNYAELVSWLENPNTKKVVYDAKKHM >LR134086|1765098:1772150|1770894_1771203_-|VDZ17696.1|DBSCAN-SWA MLTNAINYSYEDGDINVRVYRDDFRVIFEVQDFGIGIKLEDQQRIFERFYRVDKARSRDSGGTGLGLSITKHIVEAHQGNIEVNSQVGKGSTFKVILKDYKE >LR134086|1765098:1772150|1771196_1772150_-|VDZ17697.1|DBSCAN-SWA MTCLVVLICLYFASRSFKRTLIRPIQEVTYATQLLANGYYHIRVPESNVIETKALFVSTNDLARRLQKLNNEQKMQSNRLKTTIENIPSAILMIDRNGKIVVANKAYYEQFNISHNIEQVGYHGYVNTEIEQLILESFKVEKPIYEQLEVAINQVHAKYFDISCVPILTRSQKSLQGILVVMHDITNLKQLENLRREFVANVSHELKTPITSIKGFAETLIDGAKNDAESLDMFLNIILKESNRIESLVTDLLDLSHIEQHTELDTDYMNLSDLTRRIIDNMMTQANQKIFPFILILKKMSLLKHKKVKLLKLSRIC |
7 | Bacillus_virus(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_13 |
1850982 : 1905054
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LR134086|1850982:1905054|DBSCAN-SWA ATTATGATTCTTTTTCATTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGCGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAACCAGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGTGCACTTCTTGTTTATCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCAGGTTGCCCCACTTTTGGTGATACATTCGTCACTTCAGCTGGCAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAACAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCAATCATTCTATTGCCATCTGCAACATATTGATCAATTAATGCTTTTACTTTAGCTAATTGTTCTGGTGTTGCGATTGATTTGAATTTCGCATATGTTTGTTGAGCAATGTTATCAATGCGCAGTAAGCTATTTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACTTTAAATCGTTTTAAAACTGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTATTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCAGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGCACTAAATGTGTAACACGTGCAAGATCATCATTAATCGTTTTTTCAGCATCTGGCTTTTTAATAGGATGTACATCTAAATCATGTATTGTTTGTAGATTTAATGATGCTGTTTTATCAACTTGTGCATTGCTACGATCTTGATCAATTTGTCCAATAGCAGTGTCATAAATGTTTTGTAACTGCGCTAAAATACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAACATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCATTGAGCAATGTTGTTAATTGTTCTCGCGCAGTTGATTTTCTATTAATAACAGGTTCAATTTCACGAATTTCATTTTTACCATCATGCAATAGATATGCTACATCAGCATTCGTCACTGCACTTGCAATTTGTTGTTTCGCTTTTATTAATGCTTGTTCTACTTGTGCTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCATTATTTGCTTTAATTAAATTTATTTTATTTGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAGTGCTGTTGTTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTGTGAAATTATCTTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGTGCAGTCTTATCAGCATGATTAATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGATCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTAACAGAATGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTATTGTTACCATCCGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGCGCAATGTCATTTTTGATAGTATTTACAATTTTATTTAACTCAGCAATAGCAATATTTCGTTCATCTTGCGTAGTATCTAGCGTATTTCGGATTGCATCGAGTTGGTTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTGCGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATCGTTTGATTTCTAACATCATTTACAGCTACATCTTGTGTTGTATTGTCTATATCTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTTATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGATTATCTGCGCTCGCTTTTATGGCTTGTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCTATTTCTTGCTTTTTAGCCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGCTGCTCTAATAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCTCCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCGTTAACTTGCTGATCTGTTCTATCATTCGTGATATTTGTCATAGCTTGAGTAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTGATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAACTCGAGTTTCAGGTTGAATAATTTTTATCGCAGTTATACCATCTGTTGCCGCTTGATTCACTTGCTCGTTCGTTTGAGCTTGTTCAATTGCTACAAGGGCTTTTTCTTTTTCTCTAGCTAATGCTTGTGTAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAATACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTGTCTATAGCATTTATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGGTTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACAGCAGCCTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGTTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGTGCTGCTTGCTTTTTCACTACGTCAACTTGAACAGCATCAATATTATTTTCTGCTGTTATCGCAGCTTGGTCTACTTCATTATTGGTATTCGCTTGATTAAGACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTCAACGTATTAATTGCAGCATTTTTCTCATCATCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATGCTGCAGGTTTTTTTACAATATTTGGCTGAATCGCATTAATTGCTTGTGCACCTAATTGTTGCGCTTGATCTACTTCCGCGTTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAAGTGCAGCTGCTAATTCTTGGTCTACTTGATTTAATGCTATTTGCTTTTCTTCAGTTGTTGCATTTGTATTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAATCGTTTAATACACCTGTAGCTGTTTGCTTCTTAGTTACATGCGGTTGAACAGCACCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATGCTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCGATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGCATTGACACGATCTATCGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCACCAGGTGTAGCATTGATATTTGTTATCACCTCACGTGCTTTTTCATTTACAGTATTACGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTCGCTGGTTGAATCACAACTATATTTTGCATACCTTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGCAATTGTTGTGCTGCTTGTTGCTCTTCTAAGGTCGCATCATTATTATTAAATATCGCATTATGTTGCGTTTCAGCACTTTGATCAATAGCATTTTTAGCATCTGTTTTAACCTTTGTAGCTGGTTCAATGGCTTGTATACCTTGAATTGCATTTGTCTTCACTTGCTCCACATCTGCATTGGTATTAGCATTTAAAATGTTAGCATTCGCAGCAGCTACAGCAGCATTTACTTTGTCAATCGCTGCCTGTCTTTCTTCTTGAGTCGCATCAGGATTAGCATTGATCTCAGCGATATGTTGTTGTGCATCATGTGATACGGCATCTCTTGCTGCCTGCTTGACAACAGTTACAGGCGCAATAGGATTAATGGCATTCAGACCATCACCTTTGGCTGTATCCACATCATCATTGGTTGTCGCTTGATTGATTTGCTCTAAAGCGTGGTTCGTAGCTTGCGTTAATTCATTCAATGCTGCATTTTTCTCTTCTTGTGTTGCTTCTCTATTACTATTTATCTGTTGTCTTTTTGTTGCTGTTGCTTGGTTAATTGCATCTCTTGCTGCTTGTTTGTGTGTTACTTGAGGGACAACAGCTCCAATAGTATTAATACCATTATTTTTAGCTGTTTCAACATCAGCATTGGTAGTAGCATTCGTAACATTATCAATAGCATCTGTTTCATCCGTTGTTAATTGATTTAATGCATCTTGAATTTCATCTTGAGTAGCATCTGGTGTGTTATTGATAATTTCTCTTTGTTTCGCAGCTTTATCACGTATTGCTTGTTTAGCATTTGGTTTAACAACTGGTGTTGCAGTGTCTCTACTTAAAGTCTGTATACCTTGATCTTTAATTCTAGTAACACCATCATCAGTCGTTTGGTCACCAATATTTCCAATAATTTCATTTTTATGTTCCTCGATGACTTGAATCGCTGCTTGTTTTTCTTCATCTGTCAGTTCATCATTTTGGTTAACTAAATCTTCCATGTCATCAACTTTTCTATTAACGGCATTTTCAGCGTCAACACTTCGAATTAACGTATGTTGCATTTGATTTGCTAATGAATCGATATCTGCCTGAGAAACTCTTTTGTTTAAAGGTACATTGTTACGGTTTTCATCTAAAATTGTTTGTGCGCGTCTTTTAAGATCATTAAAAATATCTAATGATGCAAATGTATAATCCGCTTGTTGAATACGTCTATCAACTTCAGCTTGTAGTGCGTCTTTATTCATGATGATATCGATTGTATACGGTTCAGTGCTTACTGTATGACTTTCTGCAGGTGAATTAATAAAATCTTGTGAAAATGTTTTATACGTTAACGTATCGTTAAATGTTACTGTTCTTGGTGTTGGCACATTGTTCACACGTAGCTTATACTTCAAATCCAATATTTTATCAGGCATAAGTCGTGCCGGTGAATTCCCTGAACCT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54 | Staphylococcus_phage(88.37%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_14 |
1912346 : 1919686
Sequences of DBSCAN-SWA_14
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_14 >LR134086|1912346:1919686|DBSCAN-SWA AATGTGTAAAGTCCTAAAAATACCAAGAAGTACTTATTATGATTCTATAAAAAGAAGAGATAATAAAAACACTAAAGATGATTCAAACGTAGAACGTGCTGTCATAAATATTTTTAATTCTAATAGAAAAGTCTTTGGTACAAGACGAATTAAAAATAATTTAAATGACAAGGGTCTTACTGTATCAAGGCGAAAGATAGCTCGTATCATGAAAAAACATAATCTAGTTTCTGTTTATACGAAAGCTAAATACAAAAATCATCCAAAAGAAACTAATGAAAAACGAATTAAAAATCATTTGAATCGCGCTTTTAATAGAGAACAACCAATGGAGACATTAGTAAGTGATTTGACATATGTAAAAGTCGGAGGAACATGGCATTACATATGTTTATTTATAGATCTATTTAATAGAGAAATTGTTGGTTACAGTGCAGGTAAAAATAAGGACGCAAATTTAGTATCAAAAGCAATCAGCAGAATAAATCATAATCTTGAACAAATCAAACTATTCCACACTGATAGAGGCAAAGAATTTGATAATCATTTGATAGATGAAGTCCTAGAAACATTTAAAATCAAACGTTCATTAAGTACCAAAGGTTGTCCTTATGATAACGCAGTTGCGGAAGCAACGATGAAAGCAATGAAAACCGAATTTGTAAAACAAATGCAATTTGAAAACTTAGAACAGTTAGAAACAGAATTATTTGATTATGTAAATTGGTACAACAATTTTAGACCACATTCTTCATTACAGTATTTGACGCCAGTGGCATTTAAAAATCTACACATGAAAACTGTCTAAAAAAATGTTGACATACCAATTTTATTAGAATATATGCTGATACACTACCTAATAATGAAATTTGTCTATCAGATGACGGATTGACGATTAATGAATTAGAAATGTTGGGTATTGATATAAACACAAAAACGAGAACTAAACTTATACAAAATATTTTAAATCAATTTAATTTAAAATTAGTTGATAAAGAAATTACAGCGGATGTTAAAAATGAGAGTTTTGCTCAGTCTAAACATAATTTAATTCAAGGCATATTGAAAATTTATGACCTTACTTTAACTACTAAATCTAACGTTACAAACATATTCTATGAAGAAGTATTTGAATTCTTATATGACCAAGAAATAAGAGGTTTAGCACAAGTTTCTGTTTCTGGAGAATCAGGTTTAAAATATTCTATTGATTATATTGTTTCTGAAACAAAATCACAACCAGAAAAACTAGTTAACTTTACAAACAACTTAAATTTCAACAAAATAACTAATGAAGCTTATATTTACCGTGATATCAAACCAAACAGACCATCCAGAAACAAATTAGAACCTATCATGTTGATAATTGTAAATGATGTAGATCATCCGATAAATGAAAGAGCACAAACTGTAGCAGAACATGAAAACCTTGAGATATTAAAATGGTCTAATAAATCAAAAATCATTGAAACTTTAACCTCATAAATTAGCAGTAGTCCCTTATTTATATTCTTTAATTTCCAAACCATATCGTGCAAATAGAAAAGCAGATAACTTTTTTATTTGCACGTTTTATTTTAGAACAAAAAAGAACAAGGTCAAAGAGTCAGAAAAACTTTTTCTTGATACGTATTTGACACTTGCTCTTTTAAGAAAACTAACAATTCATTGTATTTCCGTTAAATTAACGGAGAATTCGGATTACCTAGATAGATTTACCTCTAGAGTGTTAAAAAATTGTACATTCTTAAACAATCATAAATGTACGTTATTAAATTATCATTTCCACTGGAGAATCATGTCGACTAAAAGATTATAAAAGTAAAAATACATTTAAAAGCACGTCATTTTCAAACCGCCATAAAACAGCATTTTTAAACCGCTATTGACATAAAACATATTTAGAATAAATCATTTAGAAAAATTAAATAATTTAACCGGCAATAAACTAACTATTTACATGAATCTATAAAACACTTAGAACAAAAGTTCGAAAAACGCACTTTATGATTGTATAGTGATATCAAATATACTTATCAGTGAGTATTAAGAAATACTTCCATTTTAATACTCTTAGAATCAACAACTTTATTATCTCCGTAAATATTTAAAAACTTATATGGAACAAAAGGTACTAGTTCTTTTTTAGGAAATAAGTCAAACCAAAAACTTGTATTGTTCTTTTCAGTAAATTTTATATATCCAGATTCAAATGCAGAACCATCAAACTCGTATAGCTTTTTTTCTTTAGTGAGCCAGTGTCTTGCTTTGTAATCTAGTTCCTGAATAGTAACCATATTCTTATTTGTAGTTATTGTAAATCCAAGTGATTGTCTATTGTCGATTGTTACCTGTACAGTAATTAATTTATCTCTTTCATTTTCTGAACTATTAAATGTAAGACCACCATACATACAACAACCTCCAAAATTTTGGTTTATATCCGGTTCAGATTTAGGTATTATACATGTATAAAAATATGGAACGCCAAAAATGTCTACTTTTTTATCTTTATAATTGTTAGCTAATTCTGTATTTTCTAATTCAGTTTTAACCTCATTATAACTCTTATACTCAATTGGAAAAATTAAATCATGAGATAAAAACTGTCTAGAATTAATAACTCCTCTTCCTTCAACAGGTGGAGACGTATAAAGATTCATTACATTACCCATAGTTCCCTTATTATTTTTATAATCACTTACTTTATTTAGTTCGTCTAATTTAGGATCGGGTTGAGCATTCACATAATTCATATTATGAAAAACTATTTCTAGAATCAAAATAATAATTACAGTAGATAATTTCTTCATAAAACCTCCTCTAACTTATTCAGTCTATTTGACAATGAACCTTATTATAAATTCACGCTTATAGATAGTTCAGGTTGTAGTGTGTCGATAGCATTGTTTTAAAACTAAAAATTCACTAGCAGAATAAATTAAAATTCTATTTATCATTATTACTAATTACAACAAATAATTTTGAATCCGTATTCAAGATAATATATAAATTTCAAATTTTACTACAATTCAAATCATTTTCCTCTCATATAATGGTTTAATTTCATGATTCAGTTGATAATCATCAATCACTTAATCTTTATATAAAAATACATCAATATGATAATTAGATGAGCTAACTGTTCTATTATCACTATAAAATTGAAAAAACTCTGCTCCCACTGAACCTTTTACGTTATATAAATCATAATAAAATGATTGATCTTGATGATTATGAGAATGAAAGAAAATGCATCCTTTTTGTATGTTACCGGTATCTTTATTGTATATTTTATATAAATTTTCTAATTTAAATCGAACTTTAGTGTCTAATTCTTGTACTGTTACTTTAGCCTTTTTGGTTTTTATAACAAAACCTTCTTGTTGGACACCATCTTTAAATACATTAACGCCTATAACTTTCTCTTCATCTAATTGATTTCCATCATGTATCGTAACTCCTCCGTATAAGCATGATGTTTTTTCTTCAGTTAAGCCTACACATTTATTTCCAAAATACAGTCCATAAATATCTATATTTTTTCCTTTAAATTGATTTGCTAAATCTGATGAGTTAAACTCAACTTTCAAACTAGAAGTTTTAAGTACGGATATATCAATATTTTTTAATATTATAGTATTATTCAGTAGTTGATCTGTACTAATTTTATTTGACTCGTCTAATTGCCACGTTATATCAGTATAATAGCTTGTTAAATTAAATAACTTACTACTATCTAGATCAGATTTTTTCTTTAAATCTTTTTTGTCTACTTCAGCATTAACATAATTATTATTAATAAGACATAATAAAGTTATTATAATTGCAGCTATGTAGAACAATCTCATAAGCTTTTTAATATTTTTTATAATATTCTCTCCCTCAATTATTTTTTGGTTAAATGAACTTCTACATTAATAGATTTACTCTCAACTGTTTTATTATCATTATAAATTAGTAAATATTTAGTCGGATAAAATTTTTTACCAGATTCAGGCATCAAATCATACCAAAAAGAATGACCACTTCCTTCGATAAACTTTATATAGCCAGTCTCATAAGGCGAACTGTTAAATTCATATAAATTTTTATGCTTAAGTAAATAGTTTCTAACTTTATAATCTATTTCTTGTGCTGTTATGTTTTTCTTATTAGTAGGTATATCAAAAGATAATGAATTTCTCTCGTTTTCATAAACTTTAATTAAGATATTATGAGAGTTATCAGTTGAATTATTTTTATCTATTTGATTTCCATCATGCTCGGTCACACCGCCATACATACACGTTTTTTCAATTAATCTACCATCATTTAATTCCATATTATCCGATGAAAAATAGCATTGATTATAATAGTTTGTCCCAAACAAATCTACGTTTTTATTTTTATATTTATCCGAAAGGCTTTTATTATTAAATTCTGTTTTTAAAATTTTAGAACCACTTATTTTAAATAATAAATCATGTTGTAAAAACTTTTCTTGGGATTTAATGTTTGTTTCTGATACGTGTTTATCATCATACAAATACCTCATATTATCCATTAGACCAGTGAATTCACTCGCTTTATTCAATTGTTCTGGTTTAGGATTGCCATTTAACATAAATAGTAAGCTGCAAGACTTAACACATATGAAGATAAAGGCAAATAACTTCATTACAACAACTCCATATTTTAATTTTTTATAAATTTGATGTATTACAGGGAATATTTAACATACACATTAGCCCTAGAGACTTTAAAATTTAAATAGTTAATACATATATTAATTTCGTATAAATTCGCATTTTAGTGTTAAAACTAATTATCATTAGTTACTATCTACATATGATATTTCGACATCAAGATGAAATTTTTCAGATTCTATTATTTTATTATCTTCATAAATTTTCAAAAAACTTACAGGCAGTCCATCTCCTGTATAAAACAAATCATATGAAAATGATTTTTCATTATTTAAATGAAATAAAACTTTCCCATTATTAAAACCTGAATAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_14 >LR134086|1912346:1919686|1912346_1913153_+|VDZ17825.1|transposase|DBSCAN-SWA MCKVLKIPRSTYYDSIKRRDNKNTKDDSNVERAVINIFNSNRKVFGTRRIKNNLNDKGLTVSRRKIARIMKKHNLVSVYTKAKYKNHPKETNEKRIKNHLNRAFNREQPMETLVSDLTYVKVGGTWHYICLFIDLFNREIVGYSAGKNKDANLVSKAISRINHNLEQIKLFHTDRGKEFDNHLIDEVLETFKIKRSLSTKGCPYDNAVAEATMKAMKTEFVKQMQFENLEQLETELFDYVNWYNNFRPHSSLQYLTPVAFKNLHMKTV >LR134086|1912346:1919686|1918921_1919686_-|VDZ17832.1|DBSCAN-SWA MLNVLLLILNLIAICSVNNAYANEEDPKIESLCKKSSVDPIALHNINDDYINNRFTTVKSIVSTTEKFLDFDLLFKSINWLDGISAEFKDLKVEFSSSAISKEFLGKTVDIYGVYYKAHCHGEHQVDTACTYGGVTPHENNKLSEPKNIGVAVYKDNVNVNTFIVTTDKKKVTAQELDIKVRTKLNNAYKLYDRMTSDVQKGYIKFHSHSEHKESFYYDLFYIKGNLPDQYLQIYNDNKTIDSSDYHIDVYLFT >LR134086|1912346:1919686|1913254_1913830_+|VDZ17826.1|DBSCAN-SWA MLGIDINTKTRTKLIQNILNQFNLKLVDKEITADVKNESFAQSKHNLIQGILKIYDLTLTTKSNVTNIFYEEVFEFLYDQEIRGLAQVSVSGESGLKYSIDYIVSETKSQPEKLVNFTNNLNFNKITNEAYIYRDIKPNRPSRNKLEPIMLIIVNDVDHPINERAQTVAEHENLEILKWSNKSKIIETLTS >LR134086|1912346:1919686|1915440_1916196_-|VDZ17828.1|DBSCAN-SWA MRLFYIAAIIITLLCLINNNYVNAEVDKKDLKKKSDLDSSKLFNLTSYYTDITWQLDESNKISTDQLLNNTIILKNIDISVLKTSSLKVEFNSSDLANQFKGKNIDIYGLYFGNKCVGLTEEKTSCLYGGVTIHDGNQLDEEKVIGVNVFKDGVQQEGFVIKTKKAKVTVQELDTKVRFKLENLYKIYNKDTGNIQKGCIFFHSHNHQDQSFYYDLYNVKGSVGAEFFQFYSDNRTVSSSNYHIDVFLYKD >LR134086|1912346:1919686|1917921_1918641_-|VDZ17831.1|DBSCAN-SWA MKRILIIVVLLFCYSQNHIATADVGVLNLRNYYGSYPIEDHQSINPENNHLSHQLVFSMDNSTVTAEFKNVDDVKKFKNHAVDVYGLSYSGYCLKNKYIYGGVTLAGDYLEKSRRIPINLWVNGEHQTISTDKVSTNKKLVTAQEIDTKLRRYLQEEYNIYGFNDTNKGRKYGNKSKFSSGFNAGKILFHLNDGSSFSYDLFDTGTGQAESFLKIYNDNKTVETEKFHLDVEISYKDES >LR134086|1912346:1919686|1916234_1917005_-|VDZ17829.1|DBSCAN-SWA MKLFAFIFICVKSCSLLFMLNGNPKPEQLNKASEFTGLMDNMRYLYDDKHVSETNIKSQEKFLQHDLLFKISGSKILKTEFNNKSLSDKYKNKNVDLFGTNYYNQCYFSSDNMELNDGRLIEKTCMYGGVTEHDGNQIDKNNSTDNSHNILIKVYENERNSLSFDIPTNKKNITAQEIDYKVRNYLLKHKNLYEFNSSPYETGYIKFIEGSGHSFWYDLMPESGKKFYPTKYLLIYNDNKTVESKSINVEVHLTKK >LR134086|1912346:1919686|1917158_1917887_-|VDZ17830.1|DBSCAN-SWA MKKFKYSFILVFILLFNIKDHTYAQGDIGVGNLRNFYTKHDYIDLKGVTDKNLPIANQLEFSTGTNDLISESNNWDEISKFKGKKLDIFGIDYNGPCKSKYMYGGATLSGQYLNSARKIPINLWVNGKHKTISTDKIATNKKLVTAQEIDVKLRRYLQEEYNIYGHNNTGKGKEYGYKSKFYSGFNNGKVLFHLNNEKSFSYDLFYTGDGLPVSFLKIYEDNKIIESEKFHLDVEISYVDSN >LR134086|1912346:1919686|1914381_1915158_-|VDZ17827.1|DBSCAN-SWA MKKLSTVIIILILEIVFHNMNYVNAQPDPKLDELNKVSDYKNNKGTMGNVMNLYTSPPVEGRGVINSRQFLSHDLIFPIEYKSYNEVKTELENTELANNYKDKKVDIFGVPYFYTCIIPKSEPDINQNFGGCCMYGGLTFNSSENERDKLITVQVTIDNRQSLGFTITTNKNMVTIQELDYKARHWLTKEKKLYEFDGSAFESGYIKFTEKNNTSFWFDLFPKKELVPFVPYKFLNIYGDNKVVDSKSIKMEVFLNTH |
8 | Staphylococcus_phage(66.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_15 |
1953171 : 2018046
Sequences of DBSCAN-SWA_15
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_15 >LR134086|1953171:2018046|DBSCAN-SWA TATGACAAGAGAAAGAAGATCATTTAGTTCAGAGTTTAAGTTACAAATGGTTAGATTATATGAAAATGGTAAGCCTAGGAATGAAATTATACGCGAGTATGATTTAACACCTTCGGCGTTAGGAAAATGGATAAAGCAACATCAAAACACGGGTACATTCAATCACCAAGATAACTTATCAGATGAAGAAAAAGAGCTGATTAAATTACGTAAAGAAGTTCAACATTTAAAAATGGAGAACGATATTTTAAAGCAAGCAGCGCTGATCATGGGACGAAAATAGAAGTCATTCAAAAGAATGCACATCAATATTCAGTATCAGCAATGTGTAAAGTCCTAAAAATACCAAGAAGTACTTATTATGATTCTATAAAAAGAAGAGATAATAAAAACACTAAAGATGATTCAAACGTAGAACGTGCTGTCATAAATATTTTTAATTCTAATAGAAAAGTCTTTGGTACAAGACGAATTAAAAATAATTTAAATGACAAGGGTCTTACTGTATCAAGGCGAAAGATAGCTCGTATCATGAAAAAACATAATCTAGTTTCTGTTTATACGAAAGCTAAATACAAAAATCATCCAAAAGAAACTAATGAAAAACGAATTAAAAATCATTTGAATCGCGCTTTTAATAGAGAACAACCAATGGAGACATTAGTAAGTGATTTGACATATGTAAAAGTCGGAGGAACATGGCATTACATATGTTTATTTATAGATCTATTTAATAGAGAAATTGTTGGTTACAGTGCAGGTAAAAATAAGGACGCAAATTTAGTATCAAAAGCAATCAGCAGAATAAATCATAATCTTGAACAAATCAAACTATTCCACACTGATAGAGGCAAAGAATTTGATAATCATTTGATAGATGAAGTCCTAGAAACATTTAAAATCAAACGTTCATTAAGTACCAAAGGTTGTCCTTATGATAACGCAGTTGCGGAAGCAACGATGAAAGCAATGAAAACCGAATTTGTAAAACAAATGCAATTTGAAAACTTAGAACAGTTAGAAACAGAATTATTTGATTATGTAAATTGGTACAACAATTTTAGACCACATTCTTCATTACAGTATTTGACGCCAGTGGCATTTAAAAATCTACACATGAAAACTGTCTAAAAAAATGTTGACATACCAGTCTGCAACGATATCCTCTTGTAATTGATTACGAATATAATTTTCAATCACTTTTTTATTTCTACCTACTGTATCCACATAAAATCCTTTACACCAAAACTTTCTATTTCCATATCTATACTTTAAGTTAGCATGTCTATCAAATATCATTAAACTACTTTTCCCTTTTAAATAGCCAACAAATGATGATACCCCAAGTTTGGGTGGTATACTAACTAACATATGGATATGATCTTTACATGCCTCTGCTTCAATTATCTCTACACCTTTTCTTTCACATAATTGACGCAATATAATCCCTATATCTTTTTTTATTTTTCCATATATCACTTGTCTTCTGTATTTAGGTGCAAAGACAATATGATACTTACAATTCCATTTTGTATGTGCTAAACTGTTTGTGTCAGATGACATTAAATAGCATCTCCTCGTGTTGATTATTTTGGTTGGCTGACCAATATTTATTCTAGCACGTAGAGATGCATTTTTTGTGACAATGGTAGAACCTTTTCTGAACCATACGCATAGCGTATGGTTTTCTTTTTACAATAAAAAGAAACCTTGTTTTACAAGGTTTCTAATACGTTATGTTATGTAAATAACAGTTAATTATACCGGTGGTCGGGGTCGAACCGACACTCCACAAGTGGAACGGGATTTTGAGTCCCGCGCGTCTGCCAATTCCGCCACACCGGCTTAATGGTAAACAAAAAACTTCCCTTTGGAAGCAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTCGTTCCGGGAAGGAACGTGTTCTAAAAGTTGAACTACTCCCGCAAATATTAAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTACACCTATACCTCATTCCAGGAAGGAATGTATTCTAAGAGTTGAAATACTCCCGCATTATTATTAAATTATGGAGCGGAAGATAGGATTTGCACCTATACCTCGTTCCGGGAAGGAACGTGTTCTAAAAGTTGAACTACTCCCGCATAAACCTGGAGGCGGCAACCGGATTTGAACCGGTGATAAAGGTTTTGCAGACCTCTGCCTTACCACTTGGCTATGCCGCCAATAACTGGGCTAGCTGGATTCGAACCAACGAGTGACGGAGTCAAAGTCCGTTGCCTTACCGCTTGGCTATAGCCCATTAATAATAAGGGCGGCTGAAGGGGATCGAACCCTCGAATGTCGGAACCACAATCCGATGTGTTAACCACTTCACCACAGCCGCCATGGCAGGGGCAGTAGGAATCGAACCCACACCAAAGGTTTTGGAGACCTCTATTCTACCGTTGAACTATGCCCCTATTAAAAATAATAAATGGAGGGGGGCAGATTCGAACTGCCGAACCCGAAGGAGCGGATTTACAGTCCGCCGCGTTTAGCCACTTCGCTACCCCTCCATAAATGGTGCCGGCCAGAGGACTTGAACCCCCAACCTACTGATTACAAGTCAGTTGCTCTACCAATTGAGCTAGGCCGGCTAAGAAATGGTTCAGGACAGAGTCGAACTGCCGACACATGGAGCTTCAATCCATTGCTCTACCAACTGAGCTACTGAACCATAATAAAAATGTAATGATGGCGGTCTCGACGGGAATCGAACCCGCGATCTCCTGCGTGACAGGCAGGCGTGTTAACCGCTACACTACGAGACCTATAAAATATTGCGGGAGGCGGATTTGAACCACCGACCTTCGGGTTATGAGCCCGACGAGCTACCGAACTGCTCCATCCCGCGATAATAAAAAATAATGGCGGAGGAAGAGGGATTCGAACCCCCGCGGCCCGTTAAGGCCCTGTCGGTTTTCAAGACCGATCCCTTCAGCCGGACTTGGGTATTCCTCCATTATTATAGGTAAATCGCTATTAATTATAAAATTAAATGGCGGTCTCGACGGGAATCGAACCCGCGATCTCCTGCGTGACAGGCAGGCGTGTTAACCGCTACACTACGAGACCATTAGTAAAACGGAGGAAGAGGGATTCGAACCCCCGCGAGCCGTTAAGCCCCTGTCGGTTTTCAAGACCGATCCCTTCAGCCGGACTTGGGTATTCCTCCAAAATTATATGGACCTTGCAGGACTCGAACCTGCGACCGAACGGTTATGAGCCGTTAGCTCTAACCAACTGAGCTAAAGGTCCTAAATATAATTTTACAACTAATAAATAGTGGCGGTGGAGGGGATCGAACCCCCGACCTCACGGGTATGAACCGTACGCTCTAGCCAGCTGAGCTACACCGCCTTATATAGTTTGTAAATAATATGGTGGAGACTAGCGGGATCGAACCGCTGACCTCCTGCGTGCAAAGCAGGCGCTCTCCCAGCTGAGCTAAGCCCCCATAATAATTACAGTATATCGGGAAGACAGGATTCGAACCTGCGACCCCTTGGTCCCAAACCAAGTGCTCTACCAAGCTGAGCTACTTCCCGTATAATTAACGCGCCCGATAGGAGTCGAACCCATAACCTCTTGATCCGTAGTCAAACGCTCTATCCAATTGAGCTACGGGCGCATATGTTTTTATTGAAAATGGTGCCGAGGACCGGAATCGAACCGGTACGGTGATCACTCACCGCAGGATTTTAAGTCCTGTGCGTCTGCCAGTTCCGCCACCCCGGCACTATAAAAATGGAGCAGAAGACGGGATTCGAACCCGCGACCCCAACCTTGGCAAGGTTGTATTCTACCGCTGAACTACTTCTGCATATGCGGGTGAAGGGAGTCGAACCCCCACGCCGTAAGGCGCTAGATCCTAAGTCTAGTGCGTCTGCCAATTCCGCCACACCCGCAAGTAGTGAGCCATAGAGGATTCGAACCTCTGACCCTCTGATTAAAAGTCAGATGCTCTACCAACTGAGCTAATGGCTCTAATGGCTGGGCTAGCTGGATTCGAACCAACGAGTGACGGAGTCAAAGTCCGTTGCCTTACCGCTTGGCTATAGCCCAATATATAGATGGTGGAGGGGGGCAGATTCGAACTGCCGAACCCGAAGGAGCGGATTTACAGTCCGCCGCGTTTAGCCACTTCGCTACCCCTCCAGCTTATTCAGTTAATTAATAATCAAAATGGTGGAGAATGACGGGTTCGAACCGCCGACCCTCTGCTTGTAAGGCAGATGCTCTCCCAGCTGAGCTAATTCTCCAATATAATGACTCCTACGGGACTCGAACCCGTGTTACCGCCGTGAAAGGGCGGTGTCTTAACCGCTTGACCAAGGAGCCATGGCTCCACAGGTAGGACTCGAACCTACGACCGATCGGTTAACAGCCGATAGCTCTACCACTGAGCTACTGTGGATTAATATTAATGCCTGGCAACGTTCTACTCTAGCGGAACGTAAGTTCGACTACCATCGACGCTAAGGAGCTTAACTTCTGTGTTCGGCATGGGAACAGGTGTGACCTCCTTGCTATAGTCACCAGACATATGAATGTAATTTATACATTCAAAACTAGATAGTAAGTAAAAGTGATTTTGCTTCGCAAAACATTTAAATTTGATTAAGTCTTCGATCGATTAGTATTCGTCAGCTCCACATGTCACCATGCTTCCACCTCGAACCTATTAACCTCATCATCTTTGAGGGATCTTATAACCGAAGTTGGGAAATCTCATCTTGAGGGGGGCTTCATGCTTAGATGCTTTCAGCACTTATCCCGTCCACACATAGCTACCCAGCTATGCCGTTGGCACGACAACTGGTACACCAGAGGTATGTCCATCCCGGTCCTCTCGTACTAAGGACAGCTCCTCTCAAATTTCCTACGCCCACGACGGATAGGGACCGAACTGTCTCACGACGTTCTGAACCCAGCTCGCGTACCGCTTTAATGGGCGAACAGCCCA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56 | Bacillus_phage(21.43%) | protease,transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_16 |
2036151 : 2099995
Sequences of DBSCAN-SWA_16
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_16 >LR134086|2036151:2099995|DBSCAN-SWA 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MTNLETYFKNSQPLNEYIDGMKTNQDTVLSIYQSFELPEDDSRIKKIKEMNYSKVLVITEDWCGDAMMNLPILKHISEALNLEVRVFHRDDDTKLIDQYLTNGKSRAIPIFVFLNDQFEQETVWGPRANEVQKFVTDVRSDKLPSKDHPDYADLEKETHLVISNRYKTDASFWKAVYNSILNKLENK |
85 | Staphylococcus_phage(95.83%) | terminase,holin,capsid,transposase,head,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_17 |
2107456 : 2131855
Sequences of DBSCAN-SWA_17
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_17 >LR134086|2107456:2131855|DBSCAN-SWA 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23 | Staphylococcus_phage(27.27%) | terminase,protease,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_18 |
2520889 : 2575535
Sequences of DBSCAN-SWA_18
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_18 >LR134086|2520889:2575535|DBSCAN-SWA 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>LR134086|2520889:2575535|2528869_2530081_+|VDZ18424.1|DBSCAN-SWA MQSSSSKTKQFSFLLLITLGVMTAFGPLTIDMYVPSLPKVQGDFGSTTSEIQLTLSFTMIGLALGQFIFGPLSDAFGRKRIAVSILITFILASGLSVFVTQLPLFLTLRLIQGLTGGGVIVIAKASAGDKFSGNALAKFLASLMVVNGIITILAPLAGGLALSVATWRAIFTILTIVALIILIGVASQLPKTPKEELKQVNFSSVIKDFGSLLKKPAFIIPMLLQGLTYVMLFSYSSASPFITQKLYNMTPQQFSIMFAVNGVGLIIVSQVVALLVEKLHRHILLIILTIIQVVGVALIILTLTFHLPLWVLLIAFFLNVCPVTSIGPLGFTMAMEERTGGSGNASSLLGLFQFILGGTVAPLVGLKGEFNTSPYMIIIFITAILLVSLQIIYFKMIKKQHVA >LR134086|2520889:2575535|2564402_2565272_-|VDZ18454.1|DBSCAN-SWA MIILKRLLQDKGAVVALGIIVLYVFLGLAAPLVTFYDPNHIDTANKFAGMSFQHLLGTDHLGRDILTRLIYAIRPSLLYVFVALFVSVLIGSILGFLSGYFQGFVDALIMRACDVMLAFPSYVVTLALIALFGMGAENIIMAFILTRWAWFCRVIRTSVMQYTASDHVRFAKTIGMNDMKIIHKHIMPLTLADIAIISSSSMCSMILQISGFSFLGLGVKAPTAEWGMMLNEARKVMFTHPEMMFAPGIAIVIIVMAFNFLSDALQIAIDPRISSKDKLRSVKKGVVQS >LR134086|2520889:2575535|2562848_2563598_-|VDZ18452.1|DBSCAN-SWA MIKIKDVEKSYQSAHVFKRRRTPIVKGVSFECPIGATIAIIGESGSGKSTLSRMILGIEKPDKGCVTLNDHPMHKKKVRRHQIGAVFQDYTSSLHPFQTVREILFEVMCQCDGQPKDVMEVQAITLLEEVGLSKAYMDKYPNMLSGGEAQRVAIARAICINPKYILFDEAISSLDMSIQTQILDLLIHLRETRQLSYIFITHDIQAATYLCDQLIIFKNGKIEEQIPTSALHKSDNAYTRELIEKQLSF |
46 | Bacillus_phage(30.0%) | holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
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| DBSCAN-SWA_19 |
2640278 : 2648406
Sequences of DBSCAN-SWA_19
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_19 >LR134086|2640278:2648406|DBSCAN-SWA TTTAATTAATAATATTTTTCACTTGGTATAAAAAGCGTCGGCGCTCTGGTATCGGAAATACTGGATAAATATGGAATTGGTAATATCCAGGTATAAAGTCATGTTCGATACCTTTCGCACTCAACAATTGCGATAAGTTCAAAGCATCTGGGTACAGTACTTCTTTTGTGCCAACAGTTAATGTAATACGACCTAAACCATCTAAGTCACCATTAATTGGTGATACTTTGTAGTTATCTAAAGGCGTGTCCCCTGCCCATTGTTCAGCTAAGAACACACTGCCATCCACACCTACCATTGGGTCTTTCTTTAAGTAGTCAGGAATTTCAGGATGCTGCATCGTTGCATCTAAAACTGGTGAAATTAATACAATATGTCCTGGTTGCACAATATGTTTTTCTTTTAACAATTGAGCAAATGATAAAGCAATTTGACCGCCCGCAGAGTCACCCATTACAACGATTTGTTTAGAATCTGCTACTTGATTCAATAAATCATGGTACAACTTTTCAAAAAGTACATACGTCGCTTGATAATCTTGATGCGGAATCTTCGGATATACTGGCATGATGACTTTAGCATTGAGTGTTTCTGCAAGTTCATCAATAAATTCGAAATGAATTTTGAGTGGGTCTTGGAACCATGCCCCTCCATGTGCATATAATATAACGCGTTGATGCTTATCTTGTTTATCGTTAACGGTATAAACGGTTGAACCGTAGTGCTTATCCACTGTTACTGGCATCTTAAACTGATAATTGGTGCCCTCATATTCACCTGCTGTCTGTGGCGCCATTTTTTCTAATGCTTTCATCGCTTCTTCTTTATACATAAAACGACGCTTAGCTCTAGATAATCGTATACCTTGTTCTAACATATAACTTTTCACACTGCGTTTTTCTTTAATTCTAATATGTGCGTATGCTGCTACTAAAAATCCAAACGCAAGTGTAGACCATTTTTTACGCATTTGTCGTCACTCCTCTTTGATGATTTCTACTATAGTATTAATGTACCATGCTGATTCTTATTACTACCAATATTTACTGGGAAATAAGTTATGATGTCTACATAATCTTAGCAATGCTAATCATTTGCGATATTCATGCTCATCGACATCGTTATTCACACTATCATTCATTTGCTTAAGATGATGTTCAAAACGTTGCATATCGATAAAACGCCCTTGACGATGCATTTCTTTTCCATTCATAAAAATTAAATCCACAGGTACAGTGAAAATATTTAATTCTCCAGCAATAGCTTCCACCTGACTTTGATTAATCACAGCTAATGGCACATTGGGATATGATTGCATCAAGTCTTCAATTTGTGGTAAAACGGCATGACACACGCTACACTGATCGCGCATGACATGTACGACTGCTAACGGATATTGATGAATAAATTCACGGAATGCTTCGACACTATTTAATTGCTTAACCATTTCGAACACCTTCTTACTTTTTATATTTTAAAATGAAGTCATTATTTTGTTGCTAAAATGTCTTGAAACACTTGTGGCACAGAGGTTATCTTCTTATCGCTCAATCTGTAAAAACCGCCTGTCTGTGTACCAATACAATGCACGCCATGTGCGGACACAATTTCAAACTGAAACACCCATTTCATCTTGCTTGCTTTAACTAAGTAAATACGACCTACTGGTTTGTCATGTATTGTGACAGGTACTTTATACTCTGCTTCCGTTTTCATAAGTATAGGTGAAATGCCTTGATTGATCATTGTTGAGTAATTCATGTGCTGATTAATAAATGCTGTTCTCAAATCTTCGAACCATCTAATATAAACGATATTACTAACGACACCCATCGCATCAATGTCGTAACCATTCACTTCGATTTCTTTCTCTGCAACTAATAGACCTTCTGTTGTCATAATGACAAATCTCCTTATCTTACAAATAGATTTAAAATCATGTTAATTTATTTTTATTACTTTCATGATAAAAATACAAGCAATTGAACTTTATTACGGAAAATCAAACTTTTCAATGAGACTATTAATTTGGCTAGTCGCGAAGATGCATTTTTCTAAAATGTGACAAAAACATAAGCAATGTTTTCTATATCTAACACTAATATTTAACTTATTATCATCAACACATCTGCTATACATCATTGCGCACTAAAAACAGGCTGGAACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATATTTTCTAATTGAAAATTATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTCGGTCTTCGACTGGCACTGCTCCCTCAGGAGTCTCGCCATTAGTACTACGTATTAACATGTAATTTTACTTTGAAATACTTTAAAAAAATAAGACACTTTCGCATAATTTAATAAATACCACTAAACTAAATTAACGAGGTGCCTTATGTATAAAAATTATAACATGACCCAACTTACACTACCAATAGAAACTTCTGTTAGAATTCCTCAAAATGATATTTCGCGATATGTTAATGAAATTTTTGAAACGATACCTGATAGCGAATTCGATGAATTCAGACATCATCGTGGCGCAACATCCTATCATCCAAAAATGATATTAAAAATCATCTTATATGCATATACTCAATCTGTATTTTCTGGTCGTAGAATAGAGAAATTACTTCATGACAGTATTCGAATGATGTAGTTAGCTCAAGATCAAATACCTTCTTATAAAACTATTAATCGTTTTAGAGTGAATCCTAATACTGATGCGTTAATTGAATCTTTATTTATTCAGTTCCATAGTCAATGTTTAAAGAAAAATCTTATTGATGATAATTCAATTTTTATTGATGGTACAAAAGTAGAAGCTAATGCCAATAGATATACATTTGTGTGGAAGAAAAGTATTCAAAATCACGAATCGAAATTGAACGAAAATTCAAAAGCATTATATCGTGACTTAGTTGAAGAAAAATAATACCAGAGATAAAAGAAGATGGATATAGCGATTTAACAATAGAAGAAATAGATTTAATTGGTAGTCATTTAGATAAAGAAATCGAAGATTTAAATCATTCTATTGAGAACGAAGATTGTGCTCAAATTAGAAAATAGACCCGTAAAAAAGAACTAAGATTAAGAAGTTCAAAAATAAATTTGATGATTATTCTGAAAGAAAAAGTAAATATGAAGAGCAAAAATCGATTCTTAAAGATAGAAATAGCTTTTCTAAAACTGATCATGATGCAACTTTTATGAGAATGAAAGAAGACCATATGAAAAATGGCCAACTTAAGCCAGGATACAATTTACAAATAGCGACAAATTCTCAATTTGTTTTATCCTATGACCTATTTCAAAATCCAACAGATACTGGAACATTAATTCCATTTTCAACACTCAAAATTGGAAATATGACGAACTTAATGATGAATTTATATGTCCTAATAACAAAAGAATAGGTTTTAAAAGATATGCATACCATAATGATAGATATGGTTTTAAACGAGACTTCAAACTATATGAATGTGATGACTGTTCATCATGTTCTTTGAGACATCAATGCATGAAGCCAAATTCGAAATCCAATAAGAAAATTATGAAGAATTATAATTGGGAATACTTTAAAGCCCAAATTAATCAAAAGCGTTCTGAACCAGAAACGAAAAAAATCTATAGTCAAAGAAAAATTGATGTAGAGCCTGTTTTTGGATTTATGAAAGCTATTTTGAGTTTCATTCGTATGTCAGTTCGAGGAATAAATAAAGTTAAACGAGAGCTAGGTTTTGTATTAATGGCACTTAATATAAGGAAAATAGCAGCTCAACGAGCTGTACATTATAAAATACATATCAAAAAAGCTAATTTCTATCAAATAATTAATAGAAATCAGCTTTTTTACATTGCCTAAGAACTTAATGTCTCAAGCTCTTTTGTAACGTATTCTGTTTCAACTCGCTACTTCGCATACGCACTACGAATGACAAAAAGTTCATTCATTTGATATGCTGTTTAATTTTTAATCATTATTTGACTGTCATAATTAGCTTACCTGGATCAGCATCTTGTACATCTTCAATGACAAGTTCTTTATTTTCAAGATTTGTAATAATCATTGGTGTAACGATGCTTGGTGCGTGTGATTTCAAGTATGCTAAATTCACTTTCATTAATGGTTGACCTTGTGTTACTTTTTCATCAACGTTAATCAGACTTTCGAATCCTTCGCCATTCAGTTTCACTGTATCGATACCAATATGAATAAGTACTTCGACACCACTTTCAGATTCTAATCCTATCGCATGTTTCGTAGGGAAGATTGTTTTCACTGTACCATCAAACGGTGCTACAATTTCACCTTTTTCAGGGATAAAGCCAACACCATCACCCATCATTTTACCAGCGAATACTTGATCAGGTACTTCTGATAATGGAATGATTTGACCGACACCTGGTGCATAGATATCTGTTGTTCCAAGTGCTTCTACGTGAACTGGTTCATCTGACATTTCTTCAGTCACTGTCGTTTCACTTGGTTTCGTAATTTCACCACTCATAATCTTGGCCATATCATGTTTAATTTGATCTGATTTTGGACCAAAGATAGCTTGCATATTGTTTCCAACTTCTAATACACCTGATGCGCCTAAAGCTTTAATACCTGCTACATCTACTTTTGATTTATCAACCACTTCTACGCGCAGACGTGTAATACATGCATCTAAATGTTTAATGTTTTCTTTTCCACCCATTGCATCTAAGACATCAAATGGTAATTTTGCGACACTAGAGTTACGAATTTCAGTTTCTTCATCTTCACGACCTGGTGTTTTCAATTTAAACTTACGAATTGCAAAGTCGAATAAGAAGTAATACACGATAGCATATACAATACCGACTGGAATAACTAATAATGCGTGTGAACGATCCCAGTTTAATAAACCATATAAAATATAATCTATGAAACCACCTGAGAATGTCATACCAATTTTAACGCCTAATAAATGCATTACTAAGAATGATGTACCAGCTAATAATACGTGAATTCCATAAAGTACTGGTGCTACAAATAAGAATGAAAATTCTAATGGCTCAGTGATACCAGTTAAAAATGCAGTTAATCCTGCTGATAACATTAAACCACCCACGACTTTTTTACGTTCTGGTCGTGCATTTTTATAAATCGCAAATGCTGCCGCTGGTAAACCAAACATCATAAATGGATATTTACCAGTAGTAAATGCACCAGCAGTAAATGGTACGCCATCTTTCAATTGTGCCATCCAAATACGTTGGTCACCACGAACTAATTCACCTGCGTGATTTGTATAACTACCGAATTCAAACCAGAACGGTGAATAGAAAATATGATGTAAACCAAATGGAATTAATGAGCGTTCAATAATACCGAATATAAACGTTGTTAATGTTAAATTTTTATTTAATAAGAAATTCGATAAACTATTTAATCCGTCTTGAATTGGTGGCCACGCAAAGCTTAAAACCACACCTGTTGCAATCGCTACGACCGATGTCACAATCGGTACAAATCGTTTACCTGCAAAGAATCCTAAAAATGGTGGTAGTGTAATGTTATAAAATTTGTTGTAGCACCATGCGGCTAAAGCACCCATGATAATACCGCCAAACACACCCGTTTGTAATGTTGGAATACCTAATACTAAGGCATGTGCCGGTTCTTTCGCTGCTTGACTTAATTCTTTTGCCCCTTTGGCATATGAGAAAATGTCATCAATTGTAATGTGCAACACTTTCCCCATTGTTGCATTCATAATTAAGTAACCTACTAGCGCTGCTAATGCTGCAACACCGTCTCCTCCTGCTAATCCAAGTGCTGTACCAACTGCAAATAATAATGGCAAGTTATCAAATACAACTTGTCCTGCTGCTTCCATGACCGACGAAATCATTACAATGATATCGTTTTTTAACCATGGTGCAATTTCTACTAATTGTTCGTTGTGCATTGCGTTACCAAACGCTAATAAAATACCAGCTGCTGGTAAAATCGCAACAGGTAACATTAATGCTTTACCGATACGTTGCAATTGTCCAAACAATTTCTTAAACATATAAACATCCCCTATCTCAATTTCCGCTTCCATGTACAAAAAAAGCAGGCATGAACAAACAAGACTATTCTCATAGTGCGGTTGTTTGCTCATGCCTGCATTACCAGTAACACGCAAGTGATATCTAATTCATAGCTATTATACATATTTGTAAAAGCGTTTTCAACAACTTTTTCACAATTTTATCATCAATTCAGTACGATCATTTGTGATAAATAAACAAAACGGCAATTCCCATTTTGTTGAAATAGAAATTACCGTTTTTATAGTTCAATTCAATTGTGATAACCTTTAAATCAGTTATAAGAAACGTTTTGCTGCCACTGAAATTGGTGGAATTTGATCTAAATCTAAATGCTTATCTTCAGTAATTGATCTAAATGCCCACTTACCATAACCAAGCGCTTCTTCATTTACAATTTTACCTGGTAATGGCGCAGCATTAGGATCAACATATACATCTACAATCGTTGGTACATCTTGTGCTAATGCCTCTTCGACTATAGCATCTACTTCGCTAGCACTCTTAATTGTATAACCTTTACCACCTGCTGCCTCAGCAAATTTTGCATGATCCATATCAGAAAAATCAACTGCATATTCTAATTCACCAGCTGCTTGTTGTTCATATTTAATAAATGCTAACTGTTTGTTATTAAGTACAAATACAGTTAAAGGTAAATCATATTGTACTGCTGTAGCGAAGTCTTGCATTACCATTTGGAATGCACCGTCACCAGCAATGGCAATCGCTTGTCTATTTGGATATGCAATTTTTGATGCCATAGCTCCTGGAAGACCGCAACCCATTGTACCTAACCAACTTGAAATGATGAACTTGTTGTTCACACCAAGATTTAAATAACGTGTAGACCAAACTGTTGCAGTACCAACATCTGCTGAAATTACTGCATCATCTTTAATAAATTTGTTAATTGATGCCATTAAACGTTCTGGACGTAATGGTTTGCTATTATTATTTTTATCTTGTTCCATCCATTTATCCCAAACCGCTTTACGTTCTAACGTTTTGTTTAAAAATGGTCTTTCCGCAACATGTTTAATATTTTCAGTTAACTGATGCAATGCAATTTTACTGTCTCCAACAATTCCTACATTAATATTAAAACGATGTCCGATATTTTTAGGATTTGTGTCGATTTGGATTGCTTTAATATTTTTCTTAGGTAAGTAATCTACATATGGATAGTTTGTACCTACCATAATTAGTAAATCTGCATCCTGCATTGTCTGATATGAGGTTTTTGTACCTATTTTACCTAAGTTACCAATACTGTATGGATGGTCATCCGGTAAGATTGTCTTAGCAGGTAATGAATGAACGACCGGAATTTTTGCCGCTTCAACAAACGCACGTAGCTCATCTTTCGCATGTTTTGCACCAACACCAATCAACATAACCGGCTTTTTACTCTTATTGATTAATTTAACAGCTTTTTTAATGTCTTTATATTTTGGTGATACAACAGTTGGTCTTGATGTATCTACTGGTTTATTCGTTGTATCTTTAATTTTTTCAGTTAATAAGTCGTTAGGACAAATAACAACAGCTACACCTTTTTGTTCATATGCCGTACGAATTGCTTCGTTAACAATTTCAAACACATTGTCACCTTTTTCAATTTGGTGATTATAAATGGCTACATCTTCACATAATTTTTGTAAATTTGTTTCTTGGAATGCTTTCGTTCCAAGTGCTGTACTATTCGTTTGTCCAGATAATATTAATTGCGGTACATTATCCATTTTGGCATCATACATACCATTTAATAAATGAATTAAACCAGGGCCACCGATACTTAATGCCACACCGATTTTACCAGTTAATTTTGTGTAACCAGCAGCCGCTAAGCTTGCTACTTCTTCATGACGTACATGATAAAATTTAAATTGATCTCTCACTGTACGTAAACTATCGACTACTGCGTCGATTGAGTCTCCTGGAATACCATACAAGTGATCTATATCCCATGCTTGTAATGCTTTAACTAATGCTTCATTTGCTTTTATTTTTGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_19 >LR134086|2640278:2648406|2643839_2644184_+|VDZ18534.1|transposase|DBSCAN-SWA MKPNSKSNKKIMKNYNWEYFKAQINQKRSEPETKKIYSQRKIDVEPVFGFMKAILSFIRMSVRGINKVKRELGFVLMALNIRKIAAQRAVHYKIHIKKANFYQIINRNQLFYIA >LR134086|2640278:2648406|2640278_2641247_-|VDZ18528.1|DBSCAN-SWA MRKKWSTLAFGFLVAAYAHIRIKEKRSVKSYMLEQGIRLSRAKRRFMYKEEAMKALEKMAPQTAGEYEGTNYQFKMPVTVDKHYGSTVYTVNDKQDKHQRVILYAHGGAWFQDPLKIHFEFIDELAETLNAKVIMPVYPKIPHQDYQATYVLFEKLYHDLLNQVADSKQIVVMGDSAGGQIALSFAQLLKEKHIVQPGHIVLISPVLDATMQHPEIPDYLKKDPMVGVDGSVFLAEQWAGDTPLDNYKVSPINGDLDGLGRITLTVGTKEVLYPDALNLSQLLSAKGIEHDFIPGYYQFHIYPVFPIPERRRFLYQVKNIIN >LR134086|2640278:2648406|2643023_2643251_+|VDZ18532.1|transposase|DBSCAN-SWA MNPNTDALIESLFIQFHSQCLKKNLIDDNSIFIDGTKVEANANRYTFVWKKSIQNHESKLNENSKALYRDLVEEK >LR134086|2640278:2648406|2644299_2646399_-|VDZ18535.1|DBSCAN-SWA MEAEIEIGDVYMFKKLFGQLQRIGKALMLPVAILPAAGILLAFGNAMHNEQLVEIAPWLKNDIIVMISSVMEAAGQVVFDNLPLLFAVGTALGLAGGDGVAALAALVGYLIMNATMGKVLHITIDDIFSYAKGAKELSQAAKEPAHALVLGIPTLQTGVFGGIIMGALAAWCYNKFYNITLPPFLGFFAGKRFVPIVTSVVAIATGVVLSFAWPPIQDGLNSLSNFLLNKNLTLTTFIFGIIERSLIPFGLHHIFYSPFWFEFGSYTNHAGELVRGDQRIWMAQLKDGVPFTAGAFTTGKYPFMMFGLPAAAFAIYKNARPERKKVVGGLMLSAGLTAFLTGITEPLEFSFLFVAPVLYGIHVLLAGTSFLVMHLLGVKIGMTFSGGFIDYILYGLLNWDRSHALLVIPVGIVYAIVYYFLFDFAIRKFKLKTPGREDEETEIRNSSVAKLPFDVLDAMGGKENIKHLDACITRLRVEVVDKSKVDVAGIKALGASGVLEVGNNMQAIFGPKSDQIKHDMAKIMSGEITKPSETTVTEEMSDEPVHVEALGTTDIYAPGVGQIIPLSEVPDQVFAGKMMGDGVGFIPEKGEIVAPFDGTVKTIFPTKHAIGLESESGVEVLIHIGIDTVKLNGEGFESLINVDEKVTQGQPLMKVNLAYLKSHAPSIVTPMIITNLENKELVIEDVQDADPGKLIMTVK >LR134086|2640278:2648406|2643528_2643735_+|VDZ18533.1|transposase|DBSCAN-SWA MRMKEDHMKNGQLKPGYNLQIATNSQFVLSYDLFQNPTDTGTLIPFSTLKIGNMTNLMMNLYVLITKE >LR134086|2640278:2648406|2641765_2642176_-|VDZ18530.1|DBSCAN-SWA MTTEGLLVAEKEIEVNGYDIDAMGVVSNIVYIRWFEDLRTAFINQHMNYSTMINQGISPILMKTEAEYKVPVTIHDKPVGRIYLVKASKMKWVFQFEIVSAHGVHCIGTQTGGFYRLSDKKITSVPQVFQDILATK >LR134086|2640278:2648406|2641367_2641724_-|VDZ18529.1|DBSCAN-SWA MVKQLNSVEAFREFIHQYPLAVVHVMRDQCSVCHAVLPQIEDLMQSYPNVPLAVINQSQVEAIAGELNIFTVPVDLIFMNGKEMHRQGRFIDMQRFEHHLKQMNDSVNNDVDEHEYRK >LR134086|2640278:2648406|2642711_2642975_+|VDZ18531.1|transposase|DBSCAN-SWA MYKNYNMTQLTLPIETSVRIPQNDISRYVNEIFETIPDSEFDEFRHHRGATSYHPKMILKIILYAYTQSVFSGRRIEKLLHDSIRMM >LR134086|2640278:2648406|2646666_2648406_-|VDZ18536.1|DBSCAN-SWA MAKIKANEALVKALQAWDIDHLYGIPGDSIDAVVDSLRTVRDQFKFYHVRHEEVASLAAAGYTKLTGKIGVALSIGGPGLIHLLNGMYDAKMDNVPQLILSGQTNSTALGTKAFQETNLQKLCEDVAIYNHQIEKGDNVFEIVNEAIRTAYEQKGVAVVICPNDLLTEKIKDTTNKPVDTSRPTVVSPKYKDIKKAVKLINKSKKPVMLIGVGAKHAKDELRAFVEAAKIPVVHSLPAKTILPDDHPYSIGNLGKIGTKTSYQTMQDADLLIMVGTNYPYVDYLPKKNIKAIQIDTNPKNIGHRFNINVGIVGDSKIALHQLTENIKHVAERPFLNKTLERKAVWDKWMEQDKNNNSKPLRPERLMASINKFIKDDAVISADVGTATVWSTRYLNLGVNNKFIISSWLGTMGCGLPGAMASKIAYPNRQAIAIAGDGAFQMVMQDFATAVQYDLPLTVFVLNNKQLAFIKYEQQAAGELEYAVDFSDMDHAKFAEAAGGKGYTIKSASEVDAIVEEALAQDVPTIVDVYVDPNAAPLPGKIVNEEALGYGKWAFRSITEDKHLDLDQIPPISVAAKRFL |
9 | Staphylococcus_phage(28.57%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
Click the colored protein region to show detailed information
| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134086.1|VDZ17892.1|1988008_1988395_-|putative-staphylococcal-protein |
1988008_1988395_-
Protein sequences of LR134086.1|VDZ17892.1|1988008_1988395_-|putative-staphylococcal-protein>LR134086.1|VDZ17892.1|1988008_1988395_-|putative-staphylococcal-protein MNYVERYIEQFLRATVRNNIKHYLLMLDEKMKNLDDYMRYLITKKEQLSKLIDSLMLTLENKYIDIAEAFQIQCAREINNQEIENIKSELNKVEAYYAQIETQIQQTSTEKIATEKTSYLINYMNAVA |
128 aa aa | NA | NA | NA | 1953171-2018046 |
yes
Self-targetings in the prophage
1. spacer 1.1|639362|28|LR134086|CRISPRCasFinder matches to LR134086 position: 1989621-1989594, mismatch: 1 ggtgtgggccccaacacagagaatttca CRISPR spacer ggtgtgggccccaacatagagaatttca Protospacer ****************.*********** 2. spacer 3.1|1989535|26|LR134086|CRISPRCasFinder matches to LR134086 position: 1990995-1991020, mismatch: 0 cgaaattctctgtgttggggcccaca CRISPR spacer cgaaattctctgtgttggggcccaca Protospacer ************************** |