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Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134268 | Staphylococcus aureus strain NCTC6131 genome assembly, chromosome: 1 | 6 crisprs | cas3,DEDDh,DinG,csa3,WYL | 3 | 1 | 8 | 0 |
1. LR134268
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0
| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134268_1 | 773302-773385 | Unclear |
NA
Consensus repeat of LR134268_1
|
1 spacers
spacers of LR134268_1
>1.1|773327|34|LR134268|CRISPRCasFinder TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134268_1
The CRISPR arrays of LR134268_1 >merge|LR134268|1|773302-773385|CRISPRCasFinder GTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCTTTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATCGTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT >LR134268|1|1|773302-773385|CRISPRCasFinder GTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT TTGTTGGGGCCCACACCCCAACTTGCACATTATC GTAAGCTGACTTTACGTCAGCTTCT
>LR134268.1|VED72061.1|771870_772806_+|Thioredoxin-reductase MTEIDFDIAIIGAGPAGMTAAVYASRANLKTVMIERGIPGGQMANTEEVENFPGFEMITGPDLSTKMFEHAKKFGAVYQYGDIKSVEDKGEYKVINFGNKELTAKAVIIATGAEYKKIGVPGEQELGGRGVSYCAVCDGAFFKNKRLFVIGGGDSAVEEGTFLTKFADKVTIVHRRDELRAQRILQDRAFKNDKIDFIWSHTLKSINEKDGKVGSVTLTSTKDGSEETHEADGVFIYIGMKPLTAPFKDLGITNDVGYIVTKDDMTTSVPGIFAAGDVRDKGLRQIVTATGDGSIAAQSAAEYIEHLNDQA >LR134268.1|VED72058.1|770364_771804_+|TPR-domain-protein MAQKNNNVIPMTFDDAFYRKMANQKFKQREYKRAAEYFEKVLELSPDDLEIQIDYAQCLVQLGIAKKAEHLFYDNIIYNRHLEDSFYELSQLNIEVNEPNKAFLFGINYVIVSDDQDYRDELDQMFDVKYQSEEQIELEAQLFVVQILFQYLFSQGRLKDAKNYVLHQPQEVQDHRVVRNLLAMCYLYLGEYDRAKALYEALLQEDSTDIYALCHYTLLLYNTKENEQYQKYLKILNKVVPMNDDESFKLGIVLSYLKQYRASQQLLYPLYKKGKFLSIQMYNALAYNYYYLGEEDESHYYWDKLKQISKVEIGHAPWVIENSKEVFDQHILPLLQSDDSHYRLYGIFLLDQLNGKEIVMTESIWQVLENLNNYEKLYLTYLVQGLTLNKLDFIHRGLLTLYHNELFVSENDLMVAWINQGELIIAEKVDLTDVEPYIGAFIYLYFKNQPRNVTKKQITTWLGITQYKLNKMIEFLLSI >LR134268.1|VED72055.1|769871_770357_+|O-acetyltransferase MRKFLSKTHHHTNPLWHVYRLVKFSKVFKNVIIIEFSKFIPSMVLKRHIYKQLLNISIGNQSSIAYKVMLDIFYPELITIGSNSVIGYNVTILTHEALVDEFRYGPVTIGSNTLIGANATILPGITIGDNVKVAAGTVVSKDIPDNGFAYGNPMYIKMIRR >LR134268.1|VED72052.1|769024_769864_+|prolipoprotein-diacylglyceryl-transferase MGIVFNYIDPVAFNLGPLSVRWYGIIIAVGILLGYFVAQRALVKAGLHKDTLVDIIFYSALFGFIAARIYFVIFQWPYYAENPGEIIKIWHGGIAIHGGLIGGFIAGVIVCKVKNLNPFQIGDIVAPSIILAQGIGRWGNFMNHEAHGGPVSRAFLEQLHLPNFIIENMYINGQYYHPTFLYESIWDVAGFIILVNIRKHLKLGETFFLYLTWYSFGRFFIEGLRTDSLMLTSNIRVAQLVSILLILISISLIIYRRIKYNPPLYSKVGALPWPTKKVK >LR134268.1|VED72049.1|768086_769019_+|HPr-kinase/phosphorylase MLTTEKLVETLKLDLIAGEEGLSKPIKNADISRPGLEMAGYFSHYASDRIQLLGTTELSFYNLLPDKDRAGRMRKLCRPETPAIIVTRGLQPPEELVEAAKELNTPLIVAKDATTSLMSRLTTFLEHALAKTTSLHGVLVDVYGVGVLITGDSGIGKSETALELVKRGHRLVADDNVEIRQINKDELIGKPPKLIEHLLEIRGLGIINVMTLFGAGSILTEKRIRLNINLENWNKQKLYDRVGLNEETLSILDTEITKKTIPVRPGRNVAVIIEVAAMNYRLNIMGINTAEEFSERLNEEIIKNSHKSEE >LR134268.1|VED72045.1|765874_767710_+|Excinuclease-ABC-subunit-A MDKPFKKLTERQRDILLYGSGDKEIEFTFTQRQGGTRKRTMVFEGVVPNISRRFHESPSEYTREMMSKYMTELPCETCHGQRLSREALSVYVGGLNIGEVVEYSISQALNYYKNINLSEQDQAIANQILKEIISRLTFLNNVGLEYLTLNRASGTLSGGEAQRIRLATQIGSRLTGVLYVLDEPSIGLHQRDNDRLINTLKEMRDLGNTLIVVEHDDDTMRAADYLVDIGPGAGEHGGQIVSSGTPQKVMKDKKSLTGQYLSGKKRIEVPEYRRPASDRKISIRGARSNNLKGVDVDIPLSIMTVVTGVSGSGKSSLVNEVLYKSLAQKINKSKVKPGLYDKIEGIDQLDKIIDIDQSPIGRTPRSNPATYTGVFDDIRDVFAQTNEAKIRGYQKGRFSFNVKGGRCEACKGDGIIKIEMHFLPDVYVPCEVCDGKRYNRETLEVTYKGKNIADILEMTVEEATQFFENIPKIKRKLQTLVDVGLGYVTLGQQATTLSGGEAQRVKLASELHKRSTGKSIYILDEPTTGLHVDDISRLLKVLNRLVENGDTVVIIEHNLDVIKTADYIIDLGPEGGSGGGTIVATGTPEDIAQTKSSYTGKYLKEVLERDK >LR134268.1|VED72042.1|764880_765858_+|Excinuclease-ABC-subunit-A MKEPSIVVKGARAHNLKNIDIELPKNKLIVMTGLSGSGKSSLAFDTIYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMDKPDVDTIEGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVATVTEIYDYIRLLYARVGKPYCPNHHIEIESQTVQQMVDRIMELETRTKIQLLAPVISHRKGSHEKLIEDIGKKGYVRLRIDGEIVDVNEVPELDKNKNHTIEVVVDRLVVKEGIETRLADSIETALELSEGQLTVDVIDGEDLKFSESHACPICGFSIGELEPRMFSFNSPFGACPTCDGLGQKLTVDVDLVVPDKDKTLNEGAIEPWIPTSSDFYPTLLKTCL >LR134268.1|VED72039.1|763037_764873_+|excinuclease-ABC-subunit-B MSNVIKEVGKPTLIIAHNKTLAGQLYSEFKEFFPENRVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTFIEKDASINDEIDQLRHSATSALFERDDVIIIASVSCIYGLGNPEEYKDLVVSVRVGMEMDRSELLRKLVDVQYTRNDIDFQRGTFRVRGDVVEIFPASKEELCIRVEFFGDEIDRIREVNYLTGEVLKEREHFAIFPASHFVTREEKMKVAIERIEKELEERLKELRDENKLLEAQRLEQRTNYDLEMMREMGFCSGIENYSVHLTLRPLGSTPYTLLDYFGDDWLVMIDESHVTLPQVRGMYNGDRARKQVLVDHGFRLPSALDNRPLKFEEFEEKTKQLVYVSATPGPYEIEHTDKMVEQIIRPTGLLDPKIEVRPTENQIDDLLSEIQTRIERNERVLVTTLTKKMSEDLTTYMKEAGIKVNYLHSEIKTLERIEIIRDLRMGTYDVIVGINLLREGIDIPEVSLVVILDADKEGFLRSNRSLIQTIGRAARNDRGEVIMYADKMTDSMKYAIDETQRRREIQMKHNEKHGITPKTINKKIHDLISATVENDENNDKAQTVIPKKMTKKERQKTIDNIEKEMKQAAKDLDFEKATELRDMLFELKAEG >LR134268.1|VED72037.1|762888_763008_+|excinuclease-ABC-subunit-B MVEHYPFKIHSDFEPQGDQPQAIKEIVEGIKAGKDIKLY >LR134268.1|VED72034.1|762383_762620_+|putative-DUF2198-containing-protein MIWYFSAAFFPCVLVVLFSVITRSKWVGTILTLILIGASIYKEYFHNEWIIFIDVVSLLAGYLIIDQLEFHKHQDEDR >LR134268.1|VED72064.1|773633_774545_+|ATP-binding-protein-UPF0042,-contains-P-loop MDNNEKEKSKSELLVVTGLSGAGKSLVIQCLEDMGYFCVDNLPPVLLPKFVELMEQGNPSLRKVAIAIDLRGKELFNSLVAVVDKVKSESDVIIDVMFLEASTEKLISRYKETRRAHPLMEQGKRSLINAINDEREHLSQIRSIANFVIDTTKLSPKELKERIRRYYEDEEFETFTINVTSFGFKHGIQMDADLVFDVRFLPNPYYVVDLRPLTGLDKDVYNYVMKWKETEIFFEKLTDLLDFMIPGYKKEGKSQLVIAIGCTGGQHRSVALAERLGNYLNEVFEYNVYVHHRDAHIESGEKK >LR134268.1|VED72067.1|774541_775537_+|2-phospho-L-lactate-transferase-like-protein MRQIKVVLIGGGTGLSVMARGLREFPIDITAIVTVADNGGSTGKIRDEMDIPAPGDIRNVIAALSDSESVLSQLFQYRFEENQISGHSLGNLLIAGMTNITNDFGHAIKALSKILNIKGRVIPSTNTSVQLNAVMEDGEIVFGETNIPKKHKKIDRVFLEPNDVQPMEEAIDALREADLIVLGPGSLYTSVISNLCVNGISDALIHSDAPKLYVSNVMTQPGETDGYSVKDHIDAIHRQAGQPFIDYVICSTQTFNAQVLKKYEEKHSKPVEVNKAELEKESINVKTASNLVEISENHLVRHNTKVLSTMIYDIALELISTIPFVPSDKRK >LR134268.1|VED72070.1|775647_776592_+|sporulation-Regulator-WhiA-C-terminal-domain-protein MSFASEMKNELTRIDVDEINAKAELSALIRMNGALSLSNQQFVINVQTENATTARRIYSLIKRVFNVEVEILVRKKMKLKKNNIYICRTKMKAKEILDELGILKDGIFTHEIDHSMIQDDEMRRSYLRGAFLAGGSVNNPETSSYHLEIFSQNESHAEGLTKLMNSYELNAKHLERKKGSITYLKEAEKISDFLSLIGGYQALLKFEDVRIVRDMRNSVNRLVNCETANLNKTVSAAMKQVESIKLIDKEIGIENLPDRLREIARIRVEHQEISLKELGEMVSTGPISKSGVNHRLRKLNDLADKIRNGEQIEL >LR134268.1|VED72073.1|777155_777599_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MNLIPTVIETTNRGERAYDIYSRLLKDRIIMLGSQIDDNVANSIVSQLLFLQAQDSEKDIYLYINSPGGSVTAGFAIYDTIQHIKPDVQTICIGMAASMGSFLLAAGAKGKRFALPNAEVMIHQPLGGAQGQATEIEIAANHILKNT >LR134268.1|VED72076.1|777925_778129_+|malolactic-protein MKGIELLNNPFLNKGTAFTNEERKQLGLEGLLPANVRTLEQQAEQCYEQFKAKQTDFEKTFIFNGNF >LR134268.1|VED72079.1|778115_779099_+|malolactic-protein MAIFNRNRTLFYKLTSEHLVEFMPIIYDPVIAQSIEQYNENFSRPQDAVFLSVDRQDQIEQELRNVANGRDIRLIVVTDAEGILGIGDWGVDGVDIAIGKLIVYTAAAGINPSQVLPVSLDVGTNNEQLLNDDLYLGNRHKRVDDETYYAFVDKFVSAVRKEYPNALLHWEDFGRGHAKNILDKYEDTLPTFNDDIQGTGIVTLAGVLGALNISKVDYTNQTFLVYGGGTAGMGITNILKDELIKQGVSEEKANQHFYIMDKQGLLFDDMDDLTEAQQVFAKNRNEFSNTVNWKNLKEVIENIKPTVLIGTSTQTGCIYRRCSKRDV >LR134268.1|VED72082.1|779091_779244_+|malolactic-protein MFKHTERPMIFPLSNPTKLAEATAQDLLKWTNGKALIELVSHIMTLNTMV >LR134268.1|VED72085.1|779368_779518_+|malolactic-protein MVNPDEPGAAVLPPVEKIHQCSRAIAKAVAQSVIDQGLNAETMMILTNH >LR134268.1|VED72088.1|779864_780668_-|Cell-division-inhibitor MIMKQYLITGGTGMVGSQLVNEIKKSDSHITILTRHDQISNDKKISYVNWAKSGWEHKVPQNIDVVINLAGATLNKRWTPEYKQTLMLSRIQSTQALYELFKSRNKAPKVLFNASATGYYPPDLFMSYTEVYKTLPFDFLSDIVYQWERFAQQFEQLGTRVVIGRFGIILSNEGGALQTMKLPYEYYIGGKLGSGQQWYSWIHINDLIQAILFLINKETASGPFNLTAPIPERQNLFGYTLARAMHKPHETWAPSLAMRLILGQCQQ >LR134268.1|VED72090.1|781365_781953_+|Uncharacterised-protein MSNQNYDYKTNEDGSKKKMSTTAKVVSIATVLLLLGGLVFAIFAYVDHSNKAKERMLNEQKQEQKEKRQKENAEKERKKKQQEEKEQNELDSQTNQYQQLPQQNQYQYVPPQQQAPTKQRPAKEENDDKASKDESKDKDDKASQDKSDDNQKKTDDNKQPAQPKPQPQQPTPKPNNNQQNNQSNQQAKPQASQTK |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134268_2 | 943071-943225 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134268_2
|
2 spacers
spacers of LR134268_2
>2.1|943124|13|LR134268|PILER-CR ATTGGAAATCCAA >2.2|943190|5|LR134268|PILER-CR CTGTG >2.3|943168|35|LR134268|CRISPRCasFinder GCCCCTCCCCAACTTGCATTGCTTGTAGAATTTCA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134268_2
The CRISPR arrays of LR134268_2 >merge|LR134268|2|943071-943225|PILER-CR,CRISPRCasFinder AACTTGCATTACTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCTCCCAACTTGCATTGCTTGTAGAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGGCCCCTCCCCAACTTGCATTGCTTGTAGAATTTCATTTCGAAATTCTCTGTGTTGAGG >LR134268|2|1|943071-943214|PILER-CR AACTTGCATTACTTGTAGAAATTGGAAATCCAATTGGGGCTCCGCTCCCAACT TGCATTGCTTGTA GAATTTCTTTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGGGCCCCTCCCCAACTTGCATTGC TTGTA GAATTTCATTTCGAAATTCT >LR134268|2|2|943145-943225|CRISPRCasFinder TTTCGAAATTCTCTGTGTTGGGG GCCCCTCCCCAACTTGCATTGCTTGTAGAATTTCA TTTCGAAATTCTCTGTGTTGAGG
>LR134268.1|VED72708.1|942757_943066_+|Putative-cytosolic-protein MEEALKDSILGALEMVIDPELGIDIVNLGLVYKVNVDDEGVCTVDMTLTSMGCPMGPQIIDQVKTVLAEIPEIQDTEVNIVWSPPWTKDMMSRYAKIALGVS >LR134268.1|VED72705.1|941819_942644_-|hydrolase MQPHLICLDLDGTLLNDNKEISSYTKQVLNELQQRGHQIMIATGRPYRASQMYYHELNLTTPIVNFNGAYVHHPKDKNFKTCHEILDLGIAQNIIQGLQQYQVSNIIAEVKDYVFINNHDPRLFEGFSMGNPRIQTGNLLVHLKESPTSILIEAEESKIPEIKNMLTHFYADHIEHRRWGAPFPVIEIVKLGINKARGIEQVRQFLNIDRNNIIAFGDEDNDIEMIEYARHGVAMENGLQELKDVANNITFNNNEDGIGRYLNDFFNLNIRYYC >LR134268.1|VED72702.1|940451_941768_-|Coenzyme-A-disulfide-reductase MPKIVVVGAVAGGATCASQIRRLDKESDIIIFEKDRDMSFANCALPYVIGEVVEDRKYALAYTPEKFYDRKQITVKTYHEVIAINDERQTVSVLNRKTNEQFEESYDKLILSPGASANSLGFESDITFTLRNLEDTDAIDQFIKANQVDKVLVVGAGYVSLEVLENLYERGLHPTLIHRSDKINKLMDADMNQPILDELDKREIPYRLNEEIDAINGNEITFKSGKVEHYDMIIEGVGTHPNSKFIESSNIKLDRKGFIPVNDKFETNVPNIYVIGDIATSHYRHVDLPASVPLAWGAHRAASIVAEQIAGNDTIEFKGFLGNNIVKFFDYTFASVGVKPNELKQFDYKMVEVTQGAHANYYPGNSPLHLRVYYDTSNRQILRAAAVGKEGADKRIDVLSMAMMNQLTVDELTEFEVAYAPPYSHPKDLINMIGYKAK >LR134268.1|VED72699.1|939750_940140_+|Protein-of-uncharacterised-function-(DUF1516) MLHLHILSWVLAIILFIATYLNISKNQGGTPYFKPLHMVLRLFMLLTLISGFWILIQSFMNGGANHMLLTLKMLCGVAVVGLMEVSIAKRKRHEQSHTMFWITIALIIITMVLGVILPLGPISKLFGIG >LR134268.1|VED72696.1|938522_939425_+|Fumarylacetoacetate-hydrolase-family-protein MKFLSFKYNDKTSYGVKVKREDAVWDLTQVFADFAEGDFHPKTLLAGLQQNHTLDFQEQVRKAVVAAEDSGKAEDYKISFNDIEFLPPVTPPNNVIAFGRNYKDHANELNHEVEKLYVFTKAASSLTGDNATIPNHKDITDQLDYEGELGIVIGKSGEKIPKALALDYVYGYTIINDITDRKAQSEQDQAFLSKSLTGGCPMGPYIVTKDELPLPENVNIVTKVNNEIRQDGNTGEMILKIDELIEEISKYVALHPGDIIATGTPAGVGAGMQPPKFLQPGDEVKVTIDNIGTLTTYIAK >LR134268.1|VED72692.1|936377_938357_+|ATP-dependent-nuclease,-subunit-A MKTGSYRSATYKDIVILERSFGQARNLQQAFKNEDIPFHVNSREGYFEQTEVRLVLSFLRAIDNPLQDIYLVGLMRSVIYQFKEDELALIRILSPNDDYFYQSIVNYINDEAADAILVDKLKMFLSDIQSYQQYSKDHPVYQLIDKFYNDHYVIQYFSGLIGGRGRRANLYGLFNKAIEFENSSFRGLYQFIRFIDELIERGKDFGEENVVGPNDNVVRMMTIHSSKGLEFPFVIYSGLSKDFNKRDLKQPVILNQQFGLGMDYFDVDKELAFPSLASVAYRAVAEKELVSEEMRLVYVALTRAKEQLYLIGRVKNDKSLLELEQLSISGEHIAVNERLTSPNPFHLIYSILSKHQSASIPDDLKFEKDIAQIEDSSRPNVNISIVYFEDVSTETILDNDEYRSVNQLETMQNGNEDVKAQIKHQLDYRYPYVNDTKKPSKQSVSELKRQYETEESGTSYERVRQYRIGFSTYERPKFLSKQGKRKANEIGTLMHTVMQHLPFKKERISEVELHQYIDGLIDKHIIEADAKKDIRMDEIMTFINSELYSIIAEAEQVYRELPFVVNQALVDQLPQGDEDVSIIQGMIDLIFVKDGVHYFVDYKTDAFNRRRGMTDEEIGTQLKNKYKIQMKYYQNTLQTILNKEVKGYLYFFKFGTLQL >LR134268.1|VED72689.1|934702_936376_+|ATP-dependent-nuclease,-subunit-A MTIPEKPQGVIWTDAQWQSIYATGQDVLVAAAAGSGKTAVLVERIIQKILRDGIDVDRLLVVTFTNLSAREMKHRVDQRIQEASIADPANAHLKNQRIKIHQAQISTLHSFCLKLIQQHYDVLNIDPNFRTSSEAENILLLEQTIDEVIEQHYDILDPAFIELTEQLSSDRSDDQFRMIIKQLYFFSVANPDPTNWLDQLVTPYEEEAQQAQLIQLLTDLSKVFITAAYDALNKAYDLFSMMDGVDKHLAVIEDERRLMGRVLEGGFIDIPYLTGHEFGARLPNVTAKIKEANEMMVDALEDAKLQYKKYKSLIDKVKSDYFSREADDLKADMQQLAPRVKYLARIVKDVMSEFNRKKRSKNILDFSDYEHFALQILTNEDGSPSEIAESYRQHFQEILVDEYQDTNRVQEKILSCIKTGDEHNGNLFMVGDVKQSIYKFRQADPSLFIKKYQRFTIDGDGTGRRIDLSQNFRSRKEVLATTNYIFKHMMDEQVGEVNYDESAQLYYGAPYDESDHPVNLKVLVEADQEHSDLTGSEQEAHFIVEQVKDILEHQKSL >LR134268.1|VED72686.1|931225_934702_+|helicase-exonuclease-AddAB,-AddB-subunit MTLNAYLGRAGTGKSTKMLTEIKQKMKADPLGDPIILIAPTQSTFQLEQAFVNDPELNGSLRTEVLHFERLSHRIFQEVGSYSEQKLSKAATEMMIYNIVQEQQKYLKLYQSQAKYYGFSEKLTEQIQDFKKYAVTPEHLESFIADKNMQTRTKNKLEDIALIYREFEQRIQNEFITGEDALQYFIDCMPKSEWLKRADIYIDGFHNFSTIEYLIIKGLIKYAKSVTIILTTDGNHDQFSLFRKPSEVLRHIEEIANELNISIERQYFNQSYRFNNQDLKHLEQEFDALQINRVACQGHINILESATMREEINEIARRIIVDIRDKQLRYQDIAILYRDESYAYLFDSILPLYNIPYNIDTKRSMTHHPVMEMIRSLIEVIQSNWQVNPMLRLLKTDVLTASYLKSAYLVDLLENFVLERGIYGKRWLDDELFNVEHFSKMGRKAHKLTEDERNTFEQVVKLKKDVIDKILHFEKQMSQAATVKDFATAFYESMEYFELPNQLMTERDELDLNGNHEKAEEIDQIWNGLIQILDDLVLVFGDEPMSMDRFLEVFDIGLEQLEFVMIPQTLDQVSIGTMDLAKVDNKQHVYLVGMNDGTMPQPVTASSLITDEEKKYFEQQANVELSPTSDILQMDEAFVCYVAMTRAKGNVTFSYSLMGSSGDDKEISPFLTQIQALFNRLEITNIPRYHEVAPLSLMQHVKQTKIALFEALRSWLDDEIVADSWLDAYQVIRDSDHLNQGLDYLMSALTFDNETVQLGETLSKDLYGKEINASVSRFEGYQQCPFKHYASHGLKLNERTKYELQNFDLGDIFHSVLKYISERINGDFKQLDLKKIRQLTNEALEEILPKVQFNLLNSSAYYRYLSRRIGAIVETTLSALKYQGTYSKFMPKHFETSFRRKPRTNDELIAQTLTTTQGIPINIRGQIDRIDTYTKNDTSFVNIIDYKSSEGSAILDLTKVYYGMQMQMMTYMDIVLQNKQRLGLTDIVKPGGLLYFHVHEPRIKFKSWADIDEDKLEQDLIKKFKLSGLVNADQAVIDALDIRLEPKFTSDIVPVGLNKDGSLSKRGSQVADEATIYKFIQHNKENFIETASNIMDGHTEVAPLKYKQKLPCAFCSYQSVCHVDGMIDSKRYRTVDETINPIEAIQNININDEFGGEQ >LR134268.1|VED72684.1|930490_931066_+|Signal-peptidase-I MKKELLEWIISIAVAFVILFIVGKFIVTPYTIKGESMDPTLKDGERVAVNIIGYKTGGLEKGNVVVFHANKNDDYVKRVIGVPGDKVEYKNDTLYVNGKKQDEPYLNYNLKHKQGDYITGTFQVKDLPNANPKSNVIPKGKYLVLGDNREVSKDSRAFGLIDEDQIVGKVSFRFWPFSEFKYNFNPENTKN >LR134268.1|VED72681.1|929951_930311_+|Signal-peptidase-I MKKVVKYLISLILAIIIVLFVQTFVIVGHVIPNNDMSPTLNKGDRVIVNKIKVTFNQLNNGDIITYRRGNEIYTSRIIAKPGQSMRFVRDNYTVMTDRLTHLMPRTEKLKILVCAILKN >LR134268.1|VED72711.1|943703_945518_+|acyltransferase MNKTKGFTKYKKMRYMPGLDGLRAIAVLGIIIYHLNKQWLTGGFLGVDTFFVISGYLITSLLLKEYDDTGIIKLKSFWIRRLKRLLPAVIVLLMVVGTATLLLKSDNIIRVKHDIIAAIFYVSNWWYIAKDVNYFEQFSFMPLKHLWSLAIEEQFYIFFPVILVTLLLTIKKRYKIGFIFWGVSIISLGLMMFIYSINGDHSRVYFGTDTRLQTLLLGVILAFLWPPFKLKNDPPKVVKYVIDSIGSLSFIVLILLFFIINDETNWIYDGGFYLISILTLFIIASVVHPSTWIAKIFSNPVLVFIGKRSYSLYLWHFAVISFVHSYYVDGQIPVYVYFIDISLTIIFAELSYRFIETPFRKEGIKALNWRPSYIPQFIRMVIVVTLLIPFMLILVGAFNKYGKDIIGEKANSFDTTIEDNYSMRIAPIDNIHIDGLVSEKKKESSDVYNNIKPLLIGDSVMVDIGESFKSSVPKSRIDGKVGRQLYQTLPLVKANYSQYKKSSDQVVLELGTNGDFTDKQLDDLLNQFGKAKIYLVNTRVPRIYEANVNRLLADAAKRKSNVTLIDWYKRSQGHSEYFAPDGVHLEYKGVLALKDEILKALKKK >LR134268.1|VED72714.1|945720_946146_+|Clpb MDINKMTYAVQSALQQAVELSQQHKLQNIEIEAILSAALNESESLYKSILERANIEVDQLNKAYEDKLNTYASVEGDNIQYGQYISQQANQLITKAESYMKEYEDEYISMEHILRSAMDIDQTTKHYINNKVEVIKELLKK >LR134268.1|VED72718.1|946159_946894_+|chaperone-protein-ClpB MTSQNPEVNYEALAKYGRDLVEEVRQGKMDPVIGRDEEIRNTIRILSRKTKNNPVLIGEPGVGKTAIVEGLAQRIVKKDVPESLLDKTVFELDLSALVAGAKYRGEFEERLKAVLKEVKESDGRIILFIDEIHMLVGAGKTDGAMDAGNMLKPMLARGELHCIGATTLNEYREYIEKDSALERRFQKVAVSEPDVEDTISILRGLKERYEVYHGVRIQDRALVAALNCLIVTSLIVFYQIKRLI >LR134268.1|VED72721.1|946839_948327_+|chaperone-protein-ClpB MSDRYITDRFLPDKAIDLVDQACATIRTEMGSNPTELDQVNRRVMQLEIEESALKNESDNASKQRLQELQEELANEKEKQAALQSRVESEKEKIANLQEKRAQLDESRQALEDAQTNNNLEKAAELQYGTIPQLEKELRELEDNFQDEQGEDTDRMIREVVTDEEIGDIVSQWTGIPVSKLVETEREKLLHLSDILHKRVVGQDKAVDLVSDAVVRARAGIKDPNRPIGSFLFLGPTGVGKTELAKSLAASLFDSEKHMIRIDMSEYMEKHAVSRLIGAPPGYIGHDEGGQLTEAVRRNPYSVILLDEVEKAHTDVFNVLLQILDEGRLTDSKGRSVDFKNTIIIMTSNIGSQVLLENVKETGEITESTEKAVMTSLNAYFKPEILNRMDDIVLFKPLSIDDMSMIVDKILTQLNIRLLEQRISIEVSDDAKAWLGQEAYEPQYGARPLKRFVQRQIETPLARMMIKEGFPEGTTIKVNLNSDNNLTFNVEKIHE >LR134268.1|VED72724.1|948385_949087_-|LysR-family-regulatory-protein MTEDGHTFLPIAQSFIEQYESGIKHIQLKKTMFQSKLNVVVSSYIATFIMPKFLKSFFNEHPFIDVSLHVKNENIEKDINNHTYDIGISRNQPKLREVHSEKVCEGKIVLIAPNKENNHLLTEASLFEKYKIISDNHPEYWSSLKNNILNIYEKAQFLSINDVHTSIKLIEMNQGISFLPIYITKNSNYNISVINTKILQAPISFTYIYSKKENPEILAFIKSFKKYIANEQL >LR134268.1|VED72727.1|949083_949254_-|LysR-family-regulatory-protein MNLDWYYTFVILAKTLNYRLASEEINLTIPSIHKQIKNLEQHLNVKLFELIKIKLS >LR134268.1|VED72730.1|949627_950188_+|HMGL-like-protein MVKILLPISDLHIKEKLNFSNKYYIQKIKDCLDILKKDKKGVDICFEDATRTSREKLKEYMEIISKYQVRTVTFADTVGCSTPLEYGDIFNYFVKKYSNIIFSAHCHNDLGLATANTLAAILNGAKQIETTFLGIGERAGNAPIEEIITILTKKQIESTEFTLPDVYKLVLIFLKFSIFKYQKTNL >LR134268.1|VED72733.1|950253_950505_+|2-isopropylmalate-synthase MYQYLVPSDLGLKNSQVVQFPISNISSKKILHNKFKSIVNTEEIDENISFYKLVNKFSPEVAPEDTVDLLQIIKRRSKDGNFK >LR134268.1|VED72736.1|950556_951129_+|Sua5-YciO-YrdC-YwlC-family-protein MIVPTDTNYNLCSLPNNDLCIDKIFEYKKRSKDKPLSLFIDKPEDWKLYGDNQNTEIVDKLVEIFWPGPLNIILKNKTSYNYMLNNSDSIAIGCVQNKTMRRFISYINSPIAITSANISGTANDILITENEAIKHMGENVRYMLRSQNKTNYKTSSTIIKVTDNKIELLREGDIKFEEIKERLGTGIIYE >LR134268.1|VED72739.1|951246_952137_+|major-facilitator-superfamily-protein MASYGIAAFLFSLYKEKCFKICNLKDSNKLVVSEIFKIIGLLLLLYQNQYLILVVAQILLGLSYSMMTGVDTAIIKRNITNEKYVQNKSNSYMFLSLLISGIIGSYLYGINIKWPIIMTGIFSILTIIIIRCTLVENRELNLIGETKGKIKKFLPEEKFWILHYSFLRALILGFFIGFIPINIYNDLKLNNLQFISVLTCYTVMGYLSSRYLTKYLNYKFVSEICLVIFLIIYTYQSFIAVTISMIFLGISSGLTRPQTINKLSSSSNLRVMLNYAETLYFIFNIAFLLMGVTYIQ |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134268_3 | 1610342-1610421 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134268_3
|
1 spacers
spacers of LR134268_3
>3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder ATTGGGTATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134268_3
The CRISPR arrays of LR134268_3 >merge|LR134268|3|1610342-1610421|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAAATTGGGTATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCCCGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA >LR134268|3|3|1610342-1610421|CRISPRCasFinder CCCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA ATTGGGTATCCAATTTCTCTGTGTTGGGGCCC CGCCAACTTGCATTGCCTGTAGAA
>LR134268.1|VED74913.1|1608906_1610064_-|Oxygen-independent-coproporphyrinogen-III-oxidase MDKKSEKRGIKMTVQSAYIHIPFCVRICTYCDFNKYFIQNQPVDEYLDALITEMSTAKYRNLKTMYVGGGTPTALSINQLERLLKAIRDTFTITGEYTFEANPDELTKEKVQLLEKYGVNRISMGVQTFKPELLSVLGRTHNTEDIYASVLNAKNAGIKSISLDLMYHLPKQTIEDFEQSLDLALDMDIQHISSYGLILEPKTQFYNMYRKGLLKLPNEDLGADMYQLLMSKIEQSPFHQYEISNFALDGHESEHNKVYWFNEEYYGFGAGASGYVDGVRYTNINPVNHYIKAINKESKAILVSNKPSLTERMEEEMFLGLRLNEGVSSSRFKKKFDQSIESVFGQTINNLKEKKLIVEKNDAIALTNRGKVIGNEVFEAFLIND >LR134268.1|VED74910.1|1607828_1608806_-|Heat-inducible-transcription-repressor-HrcA MITDRQLSILNAIVEDYVDFGQPVGSKTLIERHNLNVSPATIRNEMKQLEDLNYIEKTHSSSGRSPSQLGFRYYVNRLLEQTSHQKTNKLRRLNQLLVENQYDVSSALTYFADELSNISQYTTLVVHPNHKQDIINNVHLIRANPNLVIMVIVFSSGHVEHVHLASDIPFSNDKLNTISNFVTNKLTEFNQNLQDDIISFVQSEQEEIFINKLLNTMNNHISNQSNSIYMGGKVKLIDALNESNVSSIQPILQYIESNRIAELLQDISSPNINVKIGNEIDDSLSDISIVTSQYHFDETLKGQIAVIGPTAMHYQNVIQLLNRIW >LR134268.1|VED74907.1|1607170_1607797_-|Heat-shock-protein-GrpE MTNKDESVEKNTESTVEETNVKQNIDDSVEQAEESKGHLQDEAIEETSDENVIEEIDPKDQKINELQQLADENEEKYLRLYAEFENYKRRIQKENEINKTYQAQRVLTDILPAIDNIERALQIEGDDETFKSLQKGVQMVHESLINALKDNGLEVIKTEGEAFDPNIHQAVVQDDNPDFESGEITQELQKGYKLKDRVLRPSMVKVNQ >LR134268.1|VED74904.1|1606796_1607102_-|DnaK-protein MSKIIGIDLGTTNSCVTVLEGDEPKVIQNPEGSRTTPSVVAFKNGETQVGEVAKRQAITNPNTVQSIKRHMGTDYKVDIEGKSYTPQENLSYDFTKLKKYS >LR134268.1|VED74901.1|1605631_1606828_-|DnaK-protein MILQNLKNTAESYLGEKVDKAVITVPAYFNDAERQATKDAGKIAGLEVERIINEPTAAALAYGLDKTDKDEKVLVFDLGGGTFDVSILELGDGVFEVLSTAGDNKLGGDDFDQVIIDYLVAEFKKENGVDLSQDKMALQRLKDAAEKAKKDLSGVSQTQISLPFISAGENGPLHLEVNLTRSKFEELSDSLIRRTMEPTRQAMKDAGLTNSDIDEVILVGGSTRIPAVQEAVKKEIGKEPNKGVNPDEVVAMGAAIQGGVITGDVKDVVLLDVTPLSLGIEILGGRMNTLIERNTTIPTSKSQIYSTAVDNQPSVDVHVLQGERPMAADNKTLGRFQLTDIPPAERGKPQIEVTFDIDKNGIVNVTAKDLGTNKEQRITIQSSSSLSDEEIDRMVKRC >LR134268.1|VED74898.1|1605266_1605554_-|DnaK-protein MKKTLTDLGENIGEEDKKSAEEKKDALKTALEGQDIEDIKSKKEELEKVIQELSAKVYEQAAQQQQQAQGANAGQNNDSTVEDAEFKEVKDDDKK >LR134268.1|VED74895.1|1603991_1605131_-|Chaperone-protein-DnaJ MAKRDYYEVLGISKDASKDEIKKAYRKLSKKYHPDINKEEGADEKFKEISEAYEVLSDDNKRASYDQFGHDGPQGFGGQGFNGSDFGGFSGFGGGGFEDIFSSFFGGGRQRDPNAPQKGDDLQYTMTLTFEEAVFGTTKEISIRKDVTCETCHGDGAKPGTSKKTCSYCNGAGHVAVEQNTILGRVRTEQVCPKCNGSGQEFEEACPTCHGKGTENKTVKLEVKVPEGVDNEQQIRLAGEGSPGVNGGPAGDLYVVFRVKPSEKFKRDGDDIYYKLNVSFPQAALGDEIKIPTLNNEVMLTIPAGTQTGKQFRLKEKGIKNVHGYGYGDLYVDIKVVTPTKLTDRQKELMKEFAQLNGEEINEQPSNFKDRAKRFFKGE >LR134268.1|VED74892.1|1603049_1603988_-|Ribosomal-protein-L11-methyltransferase MNWTELSIIINHEAVELATNILENHGSNGVVIEDSDDLINQPEDKYGEIYALKKEDYPDKGVRLKAYFNEMTYDDKLRQRIKDELLNLDELDQHNVQFSEQIIAETDWENEWKNYFHPFRASKKFTIVPSWETYAKEADEELCIELDPGMAFGTGDHPTTSMCLKAIETYVLPQHSVIDVGTGSGILSIASHLIGVKRIKALDIDEMAVSVAKENFRRNHCETLIEAVPGNLLKDETEKFDIVIANILAHIIDEMIEDAYNTLNEGGYFITSGIIKEKYEGIQSHMERVGFKIISEQHDNGWVCLVGQKVSE >LR134268.1|VED74889.1|1602295_1603048_-|Putative-cytosolic-protein MQRYFIDQNADVSQRFFITKKEDIHHITNVMRYDVGSKIILTFNDQTVYLCEIADITSDKIAVDLKEKQNINTELPVDVTICSGLIKADKYEWLLQKATELGASSFIAVSMERSIVKLNEAKVAKKIERWQKIIKEAAEQSYRLVIPSIQFESNLKLICDTIDNYDYILIAYEEEAKDGELSNFKQTLQQFKAQDKVLMIFGPEGGLSENEISLFSNTSTVVGLGPRILRAETAPLYALSAISYENELMG >LR134268.1|VED74886.1|1600942_1602289_-|MiaB-family-protein,-possibly-involved-in-tRNA-or-rRNA-modification MSTVAFHTLGCKVNHYETEAIWQLFKEANYERVDFEANADVFVINTCTVTNTGDKKSRQIIRRAIRQNPDAVICVTGCYAQTSSAEIMEIPGVDVVVGTQDRHKLLGYIDEFRKERQPINGVGNIMKNRKYEELDVPYFTDRTRASLKIQEGCNNFCTFCIIPWARGLMRSRDPEKVVEQATQLVNSGYKEIVLTGIHTGGYGQDLKDYNLAQLLRDLETINGLERIRISSIEASQLTDEVIDVLERSTKVVRHLHIPLQSGSDTVLKRMRRKYTMDRFSERLTKLHKALPDLAVTSDVIVGFPGETEAEFQETYDFIVKHKFSELHVFPYSPRIGTPAARMDDQIDEEIKNERVHKLITLSNQLGKLYASKFDQDVLEVIPEEQGDTEGTLVGYADNYMKVQFEGDESLIGQIVKVKITQANYPLNEGQAIKVVDFATNKSDREVLV >LR134268.1|VED74916.1|1610592_1611501_-|Translation-elongation-factor-LepA MRTVPIDNKNYNDLREALEKLQLNDASLEFEPESSQALGFGYRTGFLGMLHMEIIQERIEREFGIELIATAPSVIYQCILRDGSEVTVDNPAQMPDRDKIDKIFEPYVRATMMVPNDYVGAVMELCQRKRGQFINMDYLDDIRVNIVYELPLAEVVFDFFDQLKSNTKGYASFDYEFIENKESNLVKMDILLNGDKVDALSFIVHRDFAYERGKALVEKLKTLIPRQQFEVPVQAAIGQKIVARTNIKSMGKNVLAKCYGGDISRKRKLLEKQKAGKAKMKAVGNVEIPQDAFLAVLKMDDE >LR134268.1|VED74919.1|1611482_1612415_-|Translation-elongation-factor-LepA MDNEQRLKRRENIRNFSIIAHIDHGKSTLADRILENTKSVETRDMQDQLLDSMDLERERGITIKLNAVRLKYEAKDGNTYTFHLIDTPGHVDFTYEVSRSLAACEGAILVVDAAQGIEAQTLANVYLALDNELELLPVINKIDLPAAEPERVKQEIEDMIGLDQDDVVLASAKSNIGIEEILEKIVEVVPAPDGDPEAPLKALIFDSEYDPYRGVISSIRIVDGVVKAGDKIRMMATGKEFEVTEVGINTPKQLPVDELTVGDVGYIIASIKNVDDSRVGDTITLASRPASEPLQGYKKMNPMVYCGLFR >LR134268.1|VED74923.1|1612760_1613012_+|30S-ribosomal-protein-S20 MANIKSAIKRVKTTEKAEARNISQKSAMRTAVKNAKTAVSNNADNKNELVSLAVKLVDKAAQSNLIHSNKADRIKSQLMTANK >LR134268.1|VED74926.1|1613056_1614031_-|DNA-polymerase-III-delta-subunit MSDNIVAIYGDVPELVEKQSAEIISQFLKSDRDDFNFVKYNLYETEIAPIVEETLTLPFFSDKKAILVKNAYIFTGEKSPKDMAHNVDQLIEFIEKYDGENLIVFEIYQNKLDERKKLTKTLKKHARLKKIEQMSEEEIKKWIQSKLNENFKDIKRDALDLFIELTGINFNIVSQEIEKLILFLGDRPTINKQDVNQIINRSLEQNVFLLTEYIQKRNKEQAIHLVKDLITMKEEPIKLLALITSNYRLFYQCKILSQKGYSGQQIAKTIGVHPYRVKLALGQVRHYQLDELLNIIDACAETDYKLKSSYMDKQLILELFILSL >LR134268.1|VED74929.1|1614087_1616268_-|competence-protein-ComEC MIVGVLWNSSKVLSTFLFILLLYIAYRKNKIVYAPISLFLIIFSSWYLHYSQQAIFNYINYIERNSQFNERAQVIQIQRQGSDTYKGRLSLKNEIYPFFLTNKKNFDLKKIESRNCIVKGQFKVNDNKFVTLKLQSIVVQSCLESNRSNLIEKHKQFIMKRIYDSGIKFPDRIMALITGDVKEINEQFKERVKEIGIYHLLAVSGSHIAAIVFLIYQPLKRLNLPLFFIKGITIIVLALFAQYTNYAPSAVRAIIMTTLVLLITKQIKIKGIQLLAFAFIIMFILNPLVVYDIGFQFSFIISFFIMLLFPFLQQLSKLQSLFIITFIAQLASFIVAIPNFHQLQWVGFLSNLIFVPYYSIILFPLSILFFITSHFIVGLTPLNYLVDLSFNFHDWLLYLFTRIKQSHFSVPKFNDWIFIIFIISVYYIFWLLAKRKYILVTFWTIIILTLLITFPTNSHHKITMLNVGQGDSILYEGGKNQNVLIDTGGKVFDDTKQPSYSISKYHILPTLNERGINELEYLILTHPHNDHIGEVEYIISHIKIKHIVIYNKGYSSNTLMLLSKLSHKYNIKLMDVRQVSSFKLGDSSFLFFDSFIPNSRDKNEYSIITMITYQNKKVLLMGDASKNNEYLLLKKYNLPEIDILKVGHHGSKTSSSKEFIEMIKPKISLISSGKNNMYHLPNIEVVKRLQRIRSRIYNSQQNGQVTIDLDDNLKVDSNSYRNASGL >LR134268.1|VED74932.1|1616293_1616725_-|ComE-operon-protein-2 MAQSHLLALRSTCQRLSVGATIVKDNRIIAGGYNGSVAGEVHCIDEGCLIEDGHCIRTIHAEMNALLQCAKQGVSTEGATIYVTHFPCLNCTKSIIQAGIKRIYYAEDYHNHEYATKLLKQSGIEFKKIPFSPEYVAKYLTKG >LR134268.1|VED74935.1|1616846_1617524_-|ComE-operon-protein-1 MYQFLLRYKDFLTQWKLYIISAVVLIMVLIGFIFWRQDDYTSRDFENKDTALKQSTSENSSLSKLEDVQAKDGDNSKNKGPVYVDIKGAVKHPNVYKMTSKDRVVDLLDKAQLLDDADVSQINLSEKLTDQKMIFIPHKGQKNVEPQFGENSVHVKNGNTNNTKVNLNTASVSELMSVPGVGQAKANAIVEYRNQQGAFQEIDDLKKVKGFGSKTFDKLKSYFTT >LR134268.1|VED74938.1|1617572_1618289_-|Ubiquinone/menaquinone-biosynthesis-methyltransferase-UbiE/-COQ5 MSQYAEMSLVYDQLTQDQPYEKWFEIVKNHCKDESNILDVGCGTGSLTVQLEALGNVTGMDLSVDMLTVAAQKSANVNWLEGDMTSFDLQQQFDIITIFCDSLNYLQDETAVIETFINVYHHLTDSGVFIFDVHTVYKMMTLFNNQSYIDDKGDIFLAWDAVQGDLPLSVYHDMTFFIRHEDETYSRFDESHFQRTFDEKTYLSWLAQVGFKHVETFTDFNIDEHNEDAERLFFIAKK >LR134268.1|VED74941.1|1618291_1618645_-|Iojap-related-protein MNSQELLAIAVDAIDNKKGEDTISLEMKGISDMTDYFVVTHGNNERQVQAIARAVKEVANEQNIEVKRMEGYNEARWILIDLADVVVHVFHKDERNYYNIEKLYQDAPLESYGQVAY >LR134268.1|VED74944.1|1618645_1619230_-|hydrolase MNIDKAKRLAKEKLPEKRYNHSLRVAETAIKLAEIYDGDTSKVELAGVLHDFCKYDDLGKMYQIVRQYESGNDLLSYGSEILHGPVCAAIMEHEYGINDEEVLMAIKYHTTGRQQMTKTEKLIFIADYIEPGRTIPGVDDIRDMAYNQGSLDKTIYEISKRTVLFLIQKDITVYNKTIDCLNYYNYSDERIKDD |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134268_4 | 1821210-1821296 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134268_4
|
1 spacers
spacers of LR134268_4
>4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder CAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAAG |
csa3 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134268_4
The CRISPR arrays of LR134268_4 >merge|LR134268|4|1821210-1821296|CRISPRCasFinder CAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACACAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAAGCAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACA >LR134268|4|4|1821210-1821296|CRISPRCasFinder CAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACA CAGAGAATTTCAACAAGAAATTCTACAAG CAATGCGCGTTGGGGTACGGGCCCCAACA
>LR134268.1|VED75604.1|1820285_1820822_+|membrane-protein MFSRNNNIFVDDLSVTKDNYLIAVLKMLVIFLVINYGTDVSYDHEYVGLFIILLGVVLLKVLNINLLSFKKLKFTHMLYIIFGFLLMYGLDYLYDMFAPPTLNEILIDEESEDAPYHLALLSNAIIPPITEEIICRGLIIRILFRNHLFLGFIVSTVFFTLIHESDTLIGYLPYFIQV >LR134268.1|VED75601.1|1819483_1820119_+|CAAX-amino-terminal-protease-family-protein MQKFKDLFYDDLSVARGNYFLTLLSAFFITIILLIGFVVSDTHILYGVFIVLIGIVLLRLFKINLLSFKKLTLSQVIYIIGGALLIYGLDYLYLHFHDVPTNEQELDRELQHTPLYMSIVTIAIIPAIVEEIVFRGMIIRVVFRKHLFIGLVVSSLVFASLHESDTWIGYLPYLYSGVIFGLIYLKTKRLEVVILIHFINNLSSLLILIWG >LR134268.1|VED75598.1|1818744_1819188_-|membrane-protein MNKASFDKKVKKQLWFLNKKEKQALDQRLSSITDKDNVNFNKPITFANGYLRENVFRSKETKSYSVFVTLVVMMFAYVALLGLFLFGLITSLSGVQFFVNPKVELSTTFVILTIIGAILLMIVSIYLIKITTSYFTKKLLEHKFNGH >LR134268.1|VED75595.1|1817307_1817532_-|putative-staphylococcal-protein MDYAHLNLEHFFARNDDLDVIRDRADFVMINNFTNEMMYRDGQIEGTIDLNQYYYKNRSNAASFIMMDYKKETK >LR134268.1|VED75592.1|1816177_1817032_-|peptidoglycan-endo-beta-N-acetylglucosaminidase MNKHKKGSIFGIIGLVVIFAVVSFLFFSMISDQIFFKHVKSDIKIEKLNVTLNDAAKKQINNYTSQQVSNKKNDAWRDASATEIKSAMDSGTFIDNEKQKYQFLDLSKYQGIDKNRIKRMLVDRPTLLKHTDDFLKAAKDKHVNEVYLISHALLETGAVKSELANGVEIDGKKYYNFYGVGALDKDPIKTGAEYAKKHGWDTPEKAISGGADFIHKHFLSSTDQNTLYSMRWNPKNPGEHQYATDIKWAESNATIIADFYKNMKTEGKYFKYFVYKDDSKHLKK >LR134268.1|VED75589.1|1814798_1816091_+|arsenical-pump-membrane-protein MMTTLATLIFLVTLLFVLWQPKGLDIGITALTGAFIAVITGVVSFSDVFEVTGIVWNATLTFVSVILISLILDKIGFFEWSAIHMLHASKGSGLKMFVYIILLGAVVAAFFANDGAALILTPIVLAMVKNIGFSKRAIFPFIIASGFIADTTSLPLIVSNLVNIISADYFNISFSQYLSRMIIPNLFSLLASLLVLWLYFRKAIPKTFEDNKIKRPIDAINDLKLFKISWIVLVILLFGYLISEFTKIPVSIFTGIIAFIFLILARKSNAVNIKQVIKGAPWNIVLFSIGMYIVVFGLRNAGITLILAKILEYISNYGLFSTILGMGFISAFLSSIMNNMPTVLIDAIAIGQSNIHGLLKEGLIYANVIGSDLGPKITPIGSLATLLWLHVLTQKDVKISWGTYFKTGIIITIPVLFFTLLGLYLTLILF >LR134268.1|VED75586.1|1814484_1814799_+|arsenical-resistance-operon-repressor-2 MTYKELATFLKVLSDPSRLEILDLLSCGELCACDLLEHFQFSQPTLSYHMKALVKTNFVTTRKIGNTHLYQLNHNIFESVINNLSKVHTSNQRCICHNLKTGEC >LR134268.1|VED75583.1|1812825_1813842_-|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase-family-protein MRVAIIGMGTAGVSVLRELVKHPKFNQLDIDLYDDKVNMGQGVPFQNDSSELLINMPSKKMSLNLDDETEFWKWYKQQTDFNFDEPAYLPRFVFGHYMKSYLSMFTKKYPNISTIYNKVQEIYTNSNIDETNLTYYICTTNSEQSWQAYDYVFLTCGTFAYHDPYNLKGKKGYIATPYPTYNTLDEVNEQDDIAIIGTGLASLDVVRYVAAHHPKLPITMTSRSANLPSVRGTMIDVSFKYLTKDKLNDIKKHHFGNAPLDTLVSLFLKECAEYDIDFKKLVHRRTGNHIADLKYDLARPTEMGIFQSMIEHLKENLNWIWNSLSIEDQHQFNQKYSK >LR134268.1|VED75581.1|1812340_1812829_-|pyridine-nucleotide-disulfide-oxidoreductase-family-protein MIQLNSNPMPPRTAELIIELIENKSLILKKDLEDVKHDGKLYYFSYKNQESVDIYNVVINATGAKSHLNELDQDDQLIKNLENRQIVQAHPMGGIQIIPETNQVISPRFGTLTNMIAIGQMTNGVNKLRNGVKMIVEQVAHTVSQLYDALESNEQQQRSDNQ >LR134268.1|VED75578.1|1810815_1811859_-|5-amino-6-(5-phosphoribosylamino)uracil-reductase MSQFMDYAIQLANMVQGQTGVNPPVGAVVVKEGRIVGIGAHLRKGDKHAEVQALDMAQQNAEGATIYITLEPCSHFGSTPPCVNKIIDCKIAKVVYATKDNSLNTHGDETLRDHGIEVECVDDERASQLYQDFFKAKAKQLPQITVKVSASLDGKQANDNGQSQWITNKEVKQDVYKLRHRHDAVLTGRRTVELDEPQYTTRIQDGKNPIKVILSKSGNIHFNQQIYQDESTPIWIYTENPNLTTNQTHIEIIYLKSCDLTTILHNLYKRGVGTLLVEAGPTTTSEFLQSNYIDEFILYYAPKLIGGSGNYQFYQTNDVIEIPDANQFEIVHSELLNQNVKLTLRKK >LR134268.1|VED75607.1|1821460_1822174_-|Transaldolase MAKLNVEVFADGADIEEMKAAYKNKQVDGFTTNPSLMAKAGVTDYKAFAEEAVKEIPDASISFEVFADDLETMEKEAAILKQYGENVFVKIPIVNTKGESTIPLIKKLSADNVRLNVTAVYTIEQVKEITEAVTEGVPTYVSVFAGRIADTGVDPLPLMKEAVKVTHSKDGVKLLWASCRELFNVIQADEIGADIITCPADVVKKVNTNLGRDINELSVDTVKGFAKDIQSSGLSIL >LR134268.1|VED75610.1|1822432_1822735_+|membrane-protein MSRSKKYFYLSSLMIILSFFFNTNNVFLSGLFNSFIKLILFCSVINSIILILSIIFADRSIKSLKPDADWIRIASKSLPWIILIVILVHIFSIVHTFGFI >LR134268.1|VED75613.1|1822989_1823355_+|CrcB-family-protein MQYVYIFIGGALGALLRYLISFLNTDGGFPIGTLIANLTGAFVMGLLTALTIAFFSNHPSLKKAITTGFLGALTTFSTFQLELIHMFDHQQFITLLLYAITSYVFGILLCYVGIKLGGGFS >LR134268.1|VED75616.1|1823351_1823705_+|CrcB-family-protein MISIILVMIGGGFGAIARSAITDYFNHKFTSKLPIATLIVNLIGSFLIGLTIGLSISTSWFPAFFVTGFLGGLTTFSTLAKELTLMMTPKFNINLFLNYSLLQFIIGFIACYIGYHI >LR134268.1|VED75619.1|1823954_1824788_-|aldo/keto-reductase-family-protein MEVITFYNGNTMPQIGLGTFRVENDENCMESVRYAIEQGYRSIDTAKVYGNEEQVGAGIRAGLESTGIAREDLFITSKLYFEDFGRENVAAAYEASLSRLGLKYLDLYLVHWPGTNEAVMVDTWKGMEDLYKNNKVKNIGVSNFEPEHLEALLAQVSIKPVINQVEYHPYLTQHKLKLYLAAQHIVMESWSPLMNAQILNDETIKDIAQELGKSPAQVVLRWNVQHGVVTIPKSVTPNRISENFRIFDFELSDEQMTRIDGLNQDKRIGPDPKTFEG >LR134268.1|VED75622.1|1824999_1825908_-|Uncharacterised-protein MDLSSPVVIGLIIAVVIALIFFVLFLVALGSKKKVKRQTEEKYEQQEQNIKKSHEEALEKERIQNKKTITKQQEDYNHMVSTKDREIDALKLFSKNHSEYVTDMRLIGIRERLVKEKRIRPEDMHIMANIFLPKDGFNNIERISHLVLTRTGLYIIDSQLLKGHVYNGISGGQFKDLPPMEQVFDTLDLDKSRPQTIVMDQNDDKRSLSFVNYSDQIEAIKQLAEDLQKHLGAKYTPTSILYFNPKNEGDVTISNYNQNSAVKVLVGAEQLDEFFNKFVFHGRIQYNVEDLQQMMDKIESFN >LR134268.1|VED75625.1|1826032_1827226_-|S-adenosylmethionine-synthase MLNNKRLFTSESVTEGHPDKIADQVSDAILDAILKDDPNARVACETTVTTGMALIAGEISTTTYVDIPKVVRETIKEIGYTRAKYGYDYETMAILTAIDEQSPDIAQGVDKALEYRDKDSEEEIEATGAGDQGLMFGYATNETETYMPLAIYLSHQLAKRLSDVRKDGTLNYLRPDGKVQVTVEYDENDNPVRIDTIVVSTQHAEDVTLEQIQEDIKAHVIYPTVPENLINDQTKFYINPTGRFVIGGPQGDAGLTGRKIIVDTYGGYARHGGGCFSGKDPTKVDRSAAYAARYVAKNIVAAGLADQCEVQLAYAIGVAEPVSIAIDTFGTGKVSEGQLVEAVRKHFDLRPAGIIKMLDLKQPIYKQTAAYGHFGRTDVLFPWEKLDKVEELKDAVK >LR134268.1|VED75628.1|1827596_1829189_+|phosphoenolpyruvate-carboxykinase MSVDTYTETTKIDKLLKKPTSHFQLSTTQLYNKILDNNEGVLTELGAVNASTGKYTGRSPKDKFFVSEPSYRDNIDWGEINQPIDEETFLKLYHKVLDYLDKKDELYVFKGYAGSDKDTMLKLTVINELAWHNLFAKNMFIRPESKEEATKIKPNFTIVSAPHFKADPEVDGTKSETFVIISFKHKVILIGGTEYAGEMKKGIFSVMNYLLPMQDIMSMHCSANVGEKGDVALFFGLSGTGKTTLSADPHRKLIGDDEHGWNKNGVFNIEGGCYAKAINLSKEKEPQIFDAIKYGAILENTVVSEDGSVDFEDNRYTENTRAAYPINHIDNIVVPSKAAHPNTIIFLTADAFGVIPPISKLNKDQAMYHFLSGFTSKLAGTERGVTEPEPSFSTCFGAPFFPLHPTVYADLLGELIDLHDVDVYLVNTGWTGGKYGVGRRISLHYTRQMVNQAISGKLKNAEYTKDSTFGLSIPVEIEDVPKTILNPINAWSDKEKYKAQAEDLIQRFEKNFEKFGEKVEHIAEKGSFNK >LR134268.1|VED75631.1|1829569_1830340_-|Dipeptidyl-aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase MDFIKRKRMPIESFTHQFEEITYLSDDLQVKALMMTPHHEVKRIVVYLRGGKGQVGRVRAGRLMQFSDSQTLVIGPYYRGNNGSEGKDEFYRGDLNDVTQLLRLLHNKYPHAFIHLVGFSRGGLQGLLTFQDLPVNSYIIWGGVSDIDLMYEERVDLRGMLRRMIGHPKKDRAAYEARQAIPNINENSPPILIVHGGKDQQVGIHHAYYLADQLELKGATHERFYQMAEGHVPRPPAMVETLTYIKEFMNQVELHS >LR134268.1|VED75634.1|1830320_1830800_-|phosphohydrolase MRVKFRDKDNRQVNLTFKKDNEIADGNHVLAIPSFKNQLLFTKHNLRGIEFPGGKRERGESSAEAVTRELYEETGAKVKNIHYIAQYTIETHDQTDFVKDVYFIEVESLVSKNNYLETAGPVLFNCINDIELAQRSFLLQDSTILKCVERVQSLGFYQT |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134268_5 | 2276473-2276611 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134268_5
|
1 spacers
spacers of LR134268_5
>5.1|2276524|37|LR134268|CRISPRCasFinder AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134268_5
The CRISPR arrays of LR134268_5 >merge|LR134268|5|2276473-2276611|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAAAGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGATTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA >LR134268|5|5|2276473-2276611|CRISPRCasFinder TTTTTAATATTTTTCTTTTGAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA AGCTCACAAAACCCTTGATATCATTGGTTTCCCATGA TTTTTAATATTTTTCTTTTAAGTTACTCGAAAATTTTTCTCTTTACTCGAA
>LR134268.1|VED77285.1|2276175_2276355_-|Uncharacterised-protein MTEIVEFLSDGKLASRLEIQETMGLQKSYTSELIAELKKLEIIGSEGRGLGTRYYLIRD >LR134268.1|VED77281.1|2275160_2275361_+|Uncharacterised-protein MSLSLVFSRWRFEIVVLWWNEFVVLWRYKNAVLWQFQNGVSIKKSQQDLELTVTYTFHTYIYRLVL >LR134268.1|VED77277.1|2273207_2274872_-|Acetolactate-synthase,-catabolic MTDKKYTAADIVIDTLKNNGVEYVFGIPGAKIDYLFNALIDDGPELIVTRHEQNAAMMAQGIGRLTGKPGVVLVTSGPGVSNLTTGLLTATSEGDPVLALGGQVKRNDLLRLTHQSIDNAALLKYSSKYSEEVQDPESLSEVMTNAIRIATSGKNGASFISIPQDVISSPVESKAISLCQKPNLGVPSEQDINDVIEAIKNASFPVLLAGMRSSSADETNAIRKLVERTNLPVVETFQGAGVISRELENHFFGRVGLFRNQVGDELLRKSDLVVTIGYDPIEYEASNWNKELDTQIINIDEVQAEITNYMQPKKELIGNIAKTIEMISEKVDEPFINQQHLDELEQLRTHIDEETGIKATHEEGILHPVEIIESMQKVLTDDTTVTVDVGSHYIWMARNFRSYNPRHLLFSNGMQTLGVALPWAISAALVRPNTQVVSVAGDGGFLFSSQDLETAVRKNLNIIQLIWNDGKYNMVEFQEEMKYKRSSGVDFGPVNFVKYAESFGAKGLRVTNQEELEAAIKEGYETDGPVLIDIPVNYKDNIKLSTNMLPDVFN >LR134268.1|VED77273.1|2272466_2273171_-|alpha-acetolactate-decarboxylase MTNVLYQHGTLGTLMAGLLKGTASINELLQHGDLGIATLTGSNGEVIFLDGKAYHANEHKEFVELKGDELTPYATVTKFVADTSYETKDKSSEAVFAEIKEKMLSENLFSAVKISGLFKKMHVRMMPAQEPPYTRLIDSARRQPEQTETYVKGSVVGFFTPELFHGIGSAGFHVHFANDDRNFGGHVLDFEVEDVKVEIQNIETFEQHFPIHDEDFINANIDYKDIADEIREAE >LR134268.1|VED77269.1|2271666_2272092_+|Truncated-cell-surface-protein-map-w MKLKSFVTATLALGLLSTVGAALPSHEASADSNNGYKEMTMDGYHTVPYTISVDGITALHRTYFVFPENKKVLYQEIDSKVKNELASQRGVTTEKINNAQTATYTLTLNDGNKKVVNLKKNDDAKNSIDPSTIKQIQIVVK >LR134268.1|VED77265.1|2270556_2271372_-|hydrolase MSKRLLLFDFDETYFKHNTNEEDLSHLREMEKLLEKLTNNNEVMTAVLTGSTFQSVMDKMDQVNMTFKPLHIFSDLSSKMFTWNNGEYVESETYKKKVLSEPFLFEDIEDILRHISAQYNVEFIPQRAFEGNETHYNFYFHSTGNHNKDRRILESLVRYANDQNYTARFSRSNPLAGDPENAYDIDFTPSNAGKLYATQFLMKKYNIPVKSILGFGDSGNDEAYLSYLEHAYLMSNSRDEALKQKFRLTKYPYYQGITLHVKEFVEGKYDY >LR134268.1|VED77261.1|2268807_2270325_+|glycosyl-transferases-group-1-family-protein MTTYMLMYSIPEKAGGITSVMLNRSKLLAEKGYSCALLTLDDKNYDPLRAKLTNSGRLHKEVKIVNLYEELKMLYDVENTEIENKNMQTFEKLNLLNQEGFYIQKDEYEEKKYARYFKDNNYIMYKKWINGQLSHIDYFQNRKRIKRHVFQNKILRKEITFNDKNKMSEVKYLSNDGFCYLSYWYGDNENIVNIFYFDKNSKEVLNFKNNKVFHSYWLDKNLTSNDVLILDGIGTYPKVENMQNNDVKKIFTIHTNHFLSPYSYGAEIKPEFRNMLLNLKELDTLVVLTKEQKDDIIKQFGDYNNIKVIPNAVSFEENLTQNIREKNSIIVLQRFVAMKNITHIISAINIVRKKVKDVKLHIYGTGTQKENYTKLIKKLKLQDNVFIHDYAFDIRGLYTKASLSVLTSDYEGLPMSLLEAMSYGVPVISYPINYGPKSIIQNNINGIITKKKDNINELAKKIIHVLKKETLISQFSENARTTIKTNFSYEAVSKKWIELIDEKSK >LR134268.1|VED77258.1|2268519_2268798_+|Uncharacterised-protein MTFNEYNYNNELILKLNKIEVQKNNEKISEVFKDYEILKPKIIFNGSNPYLALNHIIVAEIENYSSLEAFSKIYVDEDYYYNYGELIIKCKK >LR134268.1|VED77255.1|2266790_2267645_-|Peptidase,-M23/M37-family MNKTNFGDYLNKSKSRKIYKIFDQNLKREFSYWQFRKLFKSYTRQSDVHELKVCTQNDGTMEQIWIDKANQFGVAVIWKNNSIIGFVMRPLINYDAIKNETTLKYAVPTTDCYEVFWGGDNELYNYHYLYPHQRYAIDLVIKENHKTHKNQGKVNTDYFCFGKDIIAPANGTVEKVVNGVQDNSIGSTNESQFLGNYIVIKHAENEYSLIAHLQQYSIIVNEGQNVKYGDINGKVGNSGDSTEPHIHFQVMNDKNIEACTSLKIRFLNNRELIKGDVVCGLQGE >LR134268.1|VED77252.1|2264168_2266592_+|Hyaluronate-lyase-precursor MTYRMKKWQKLSTITLLMAGVITLSDGEFRSVDKHQIAVADTNTQTPNYEKLKNTWLDVNYGYDKYDESNPDMKKKFEATENEAKKLLSEMKTESGRTYLWESSKDIDTKSADMTRTYRNIEKIAEAMNHKDTKLNTQDNKNKVKDALEWMHKNAYGKEPDKKVADLTSNFKNKTSRNTNLNWWDYEIGTPRALTNTLLLLNGAISNDEKKKYTAPIKTFAPKSDKILSSVGQPEQAKGGNLVDISKVKLLESIIEEDATMMKESIDAFNKVFTYVQSNATGKERNGFYKDGSYIDHKDVPYTGAYGVVLLEGISQMMPMIKETPFNDSNQNDTTLKSWIDDGFMPLIYKGEMMDLSRGRAISRENETSHTASATVMKSLLRLSDAMDESTKAKYKQIVKTSVKSDSTYGQNDTLSSYSDISKMKSLMEDSTISTNGLTQQLKIYNDMDRVTYHNKDLDFAFGLSMTSKNVARYESINGENLKGWHTGAGMSYLYNSDVKHYRDNFWATANMKQLAGTTTIENEEPKGMDVKKSSKTFVGGTKFDDQHASIGMDFENQDKTLTAKKSYFILNDKIVFLGTGIKSTDSSKNPVTTIENRKANGYTLYTDDKQTTTSNDQETNSVFLESTDTKKNIGYHFLNESKITVKKESHTGKWSDINKSQKQDSKTNQYYEVTQKHSNTDSKYAYVLYPGLSKDDFNTKKDKVTVVKQDDGFHVVKDNESVWAGVNYSNSTQTFDINNTKVEVKAKGMFILKKKDDKTYECSFYNPESTNTASDIESKISMTGYSITNKNTSTSNESGVRFELTK >LR134268.1|VED77293.1|2278387_2278786_-|30S-ribosomal-protein-S9 MTLAQVEYRGTGRRKNSVARVRLVPGEGNITVNNRDVREYLPFESLILDLNQPFDVTETKGNYDVLVNVHGGGFTGQAQAIRHGIARALLEADPEYRGSLKRAGLLTRDPRMKERKKPGLKAARRSPQFSKR >LR134268.1|VED77297.1|2278799_2279237_-|50S-ribosomal-protein-L13 MRQTFMANESNIERKWYVIDAEGQTLGRLSSEVASILRGKNKVTYTPHVDTGDYVIVINASKIEFTGNKETDKVYYRHSNHPGGIKSITAGELRRTNPERLIENSIKGMLPSTRLGEKQGKKLFVYGGAEHPHAAQQPENYELRG >LR134268.1|VED77301.1|2279476_2280280_-|tRNA-pseudouridine-synthase-A MRILVEIAYQGNNFLGFQIQQNGRTVQQQFEKLLQRMHKRHVRIHPSSRTDRGVHAIQQYFHFDTELNIPMSQWQYAMNRTLPDDIYVNNVVTVDDDFHCRYDCVGKRYRYKVYQAQHRDPFQSGLKTFIPETLDLDKMNKAAQQFIGTHDFTGFCSQKTEVESKVRTLYQSEIVKTDDGFDYIVTGSGFLYNMVRVLVAFLIEVGKGRHEISDVPKLLESKNRKNVPFTAPAEGLYLEKIYLDENELLKDFGNDIKIHRKKSLQND >LR134268.1|VED77306.1|2280284_2281091_-|Transmembrane-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters MKNKLIIGRYLPNDSYVHHLDPRAKLMFVFLFIILIFFCHSPLTYLWVLALILFFMRLAKIQLWFLIKGLTPIFFFLIFTLMMHIFLTKGGYVLVEWHGITIETNGILEGLYISLRLIGIVMIATIMTLSTSPIDLTDAFERLLAPLKMFKLPVHQLSMIMSIALRFIPTLMDELDKIILAQKSRGSEISSGNIATRIKSFIPLLVPLFISAFQRAEELAVAMEVRGYDANVQRTSYRQLKWQLRDTLSLIMIIPIAIILFVLKYSGV >LR134268.1|VED77309.1|2281080_2281941_-|ATPase-component-of-general-energizing-module-of-ECF-transporters MSIRFNDVSYTYQQGTPYEHQAIHDINTEFEQGKYYAIVGQTGSGKSTLIQNINALIKPTSGTVTIDDVTVTHKTKDKYIRPVRKRIGMVFQFPESQLFEDTVEREMIFGPKNFKMDLDEAKNYAHRLLMDLGFSRDVMSQSPFQMSGGQMRKIAIVSVLAMNPDIIVVDEPTAGLDPQSKRQVMRLLKSLQTDENKTIILISHDMNEVARYADEVIVMKEGSIVSQTSPKELFKEKEKLAGWHIGLPDIVQLQYDFEQKHQTKLKDIALTEEAFVSLYKEWQHEK >LR134268.1|VED77311.1|2281937_2282747_-|cobalt-import-ATP-binding-protein MEDKNSVIVFKNVSFQYQSDASFTLKDVSFNIPKGQWTSIVGHNGSGKSTIAKLMIGIENVKSGEIFYNNQTITDDNFEKLRKDIGIVFQNPDNQFVGSIVKYDVAFGLENHAVPHDEMHRRVSEALKQVDMLERADYEPNALSGGQKQRVAIASVLALNPSVIILDEATSMLDPDARQNLLDLVRKVKSEHNITIISITHDLSEAMEADHVIVMNKGTVYKEGTAIEIFDHAEELTTIGLDLPFPIKMSQLLGNRTSFLTYEGLVNQL >LR134268.1|VED77315.1|2283284_2283653_-|50S-ribosomal-protein-L17 MGYRKLGRTSDQRKAMLRDLATSLIISERIETTEARAKEVRSVVEKLITLGKKGDLASRRNAAKTLRNVEILNEDETTQTALQKLFGEIAERYTERQGGYTRILKQGPRRGDGAESVIIELV >LR134268.1|VED77319.1|2283669_2284467_-|DNA-directed-RNA-polymerase-alpha-subunit MQPLSILKLREFLHEFSAVDNVVEDVSTIIMNIKQLALKIYSEEDKTLEIDVRDEGEVTASDITHDSDVEILNPELKIATVSKGGHLKIRLVANKGRGYALAEQNNTSDLPIGVIPVDSLYSPVERVNYTVENTRVGQSSDFDKLTLDVWTNGSITPQESVSLAAKIMTEHLNIFVGLTDEAQNAEIMIEKEEDQKEKVLEMSIEELDLSVRSYNCLKRAGINSVQELADKSEADMMKVRNLGRKSLEEVKYKLEDLGLGLRKED >LR134268.1|VED77323.1|2284423_2284615_-|DNA-directed-RNA-polymerase-alpha-subunit MIEIEKPRIETIEISEDAKFGKFVVEPLERGYGTTLGNSLRRILLSSLPGAAVKYIEIEGVFT >LR134268.1|VED77327.1|2284689_2285079_-|30S-ribosomal-protein-S11 MARKQVSRKRRVKKNIENGVAHIRSTFNNTIVTITDEFGNALSWSSAGALGFKGSKKSTPFAAQMASETASKSAMEHGLKTVEVTVKGPGPGRESAIRALQSAGLEVTAIRDVTPVPHNGCRPPKRRRV |
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| CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134268_6 | 2467801-2467898 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134268_6
|
1 spacers
spacers of LR134268_6
>6.1|2467831|38|LR134268|CRISPRCasFinder CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTC |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134268_6
The CRISPR arrays of LR134268_6 >merge|LR134268|6|2467801-2467898|CRISPRCasFinder CGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGGCTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTCCGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG >LR134268|6|6|2467801-2467898|CRISPRCasFinder CGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG CTTATGCAGTTGACGTTTTACGTCCAACTGCGTTCCTC CGTCTTCTTCAAATTTATTTGTTAGAAAGG
>LR134268.1|VED77933.1|2466728_2467595_-|cation-diffusion-facilitator-family-transporter MSHNENLKLAQRGAYLSLIVYIILSIVKYVTGFVFNSAAVRADALNNMTDIIVSLAVIIGLKISIKPADRNHPYGHLKSENISSLLVSFVIMFVGIQVVIQNAPRLFKEDDVVPNEITIIVSLISGLVMLIVFAVNQRLAKRTKSSSLNSAAKDNLSDSLVSIGTAIGLIFTQIGFPIVDIILATLLGLLIVYTGFGIFKEAIFMLSDGFNETELEAYRNDILEVDEVQEVKSIKGRYHGSSVFIDVTIVVDANLSLVEAHQICDNVEHHLHKKGISSVYVHPEPDHL >LR134268.1|VED77930.1|2465715_2466402_-|Phosphoglycerate-mutase MPKLILCRHGQSEWNAKNLFTGWEDVNLSEQGINEATRAGEKVRENNIAIDVAFTSLLTRALDTTHYILTESKQQWIPVYKSWRLNERHYGGLQGLNKDDARKEFGEEQVHIWRRSYDVKPPAETEEQREAYLADRRYNHLDKRMMPYSESLKDTLVRVIPFWTDHISQYLLDGQTVLVSAHGNSIRALIKYLEDVSDEDIINYEIKTGAPLVYELTDDLEVIDKYYL >LR134268.1|VED77927.1|2464209_2465688_+|IS1272-transposase,-putative MMLKIILYAYTQSVFSGRRIEKLLHDSIRMMWLAQNQTPSYKTINRFRVNPNTDALIESLFIQFHSQCLKQNLIDDNSIFIDGTKVEANANRYTFVWKKSIQNHESKLNENSKALYRDLVEEKIIPEIKEDGDSDLTIEEIDLIGSHLDKEIEDLNHSIQNEDCTQIRKQTRKKRTEIKKFKKKFDDYSERKSKYEEQKSILKDRNSFSKTDHDATFMRMKEDHMKNGQLKPGYNLQIATNSQFVLSYDLFQNPTDTRTLIPFLTMIQNTFGYLPEYIVADAGYGSEQNYMAIIDDFNKTPLITYGMFIKDKTRKFKSDIFNTQNWKYDELNDEFICPNNKRIGFKRYANRNDRYGFKRDFKLYECDDCSACSLRQQCMKPNSKSNKKIMKNYNWEYFKAQINQKLSEPETKKIYSQRKIDVESVFGFMKAILGFTRMSVRGINKVKRELGFVLMALNIRKIAAQRAVHYKINIKKADFHQIINRNQLFYIA >LR134268.1|VED77924.1|2464042_2464213_+|putative-transposase MYKNYNMTQLTLPIETSVRIPQMIFHDMLMKLLKRYLIANSMNSDIIVAQHPIIQK >LR134268.1|VED77921.1|2463489_2463594_+|Uncharacterised-protein MKLDLQTARRNLNSPNIKTRKRALKIIKQHKRAK >LR134268.1|VED77918.1|2461876_2463316_-|transport-system-protein MSKKQKLTMIITMLMGGFFGLLNETLLVTALPSIMKDFEISYTQVQWLTTAFLLTNGIVIPLSALVIQRYTTRQVFLVGISIFFLGTLLGGLSPHFATLLVARIIQALGAGIMMPLMMTTILDVFQPHERGKYMGIFGLVIGLAPAIGPTLSGYLVEYFNWRSLFHVVAPIAAVTFLIGFKTIKNVGTTIKVPIDFISVIFSVLGFGGLLYGTSSISEKGFDNPIVLVSMIGGIVLVALFVLRQYRLSTPLLNFAVFKNKQFTVGIIIMGVTMVSMIGSETILPIFVQNLLHRSALDSGLTLLPGAIVMAFMSMTSGALYEKFGPRKLALVGMAIVVITTAYFVVMDEQTSTIMLATVYAIRMVGIALGLIPVMTHTMNQLKPEMNAHGSSMTNTVQQIAGSIGTAALITILSHASKNFSPTMSDYNGMNKIEMMNQIKIDTMLHGYHAGFLFALLITVISFFCSFMLQGKKKEVDSHQ >LR134268.1|VED77915.1|2460976_2461756_-|Cysteine-ABC-transporter,-substrate-binding-protein MKRLLFVVIAFVFILAACGNNSSKDKEASKDSKTINVGTEGTYAPFSFHDKDGKLTGYDIDVIKAVAKAEGLKLKFNETSWDSMFAGLDAGRFDVIANQVGINPDREKKYKFSKPYTFSSAVLVIRENEKDIKDFDDVKGKKLAQTFTSNYGKLAKDKGADITKVDGFNQSMDLLLSKRVDGTFNDSLSYLDYKKQKPNAKIKAIKGNAEQSKSAFAFSKKVDDETVQKFNDGLKKIEENGELAKIGKKWFGQDVSKSK >LR134268.1|VED77912.1|2460276_2460996_-|cystine-transport-system-permease-protein MFLNLNSEQLHALDAAKQAFGPMLEGLVKYSIPITLVTFVLGLIIALFTALMRISTSKVLRSIARVYVSIIRGTPMIVQLFIIFYGIPELGRLLTNDADNQWTLAPVVAAIIGLSLNVGAYASEIIRGGIISIPKGQTEAAYSIGMTYRQTIQRIILPQAIRVSIPALGNTFLSLIKDTSLLGFILVAEMFRKAQEVASTTYEYLTIYVLVALMYWVVCFIISIIQGIYESYIERGYRS >LR134268.1|VED77909.1|2459548_2460280_-|amino-acid-ABC-transporter,-ATP-binding-protein MIQLNNIHKSFNDVEVIKGIDLSVGKGEVVTLIGRSGSGKTTLLRMINALEIPTEGTVYVNGKTYTSKDKKSQIEVRKQSGMVFQSYNLFPHKTALENVMEGLITVKKLKKDEARGKSLELLEKVGLTHVKDQRPHALSGGQQQRVAIARALAMNPKVMLFDEPTSALDPELVNDVLKVIKDLANEGMTMVIVTHEMRFAKEVSNNIVFIHEGMIGEQGAPEEIFNNPKTEELKRFLNVINEE >LR134268.1|VED77907.1|2458201_2459452_+|FmhA-protein-of-FemAB-family MNFVTLTSDEFNAFTTKHFSHYTQSAIHYNHRVDLKGDVHLVGVKDDNGQVIAGCLLTEARTLKFFKYFYTHRGPVMDYTNQSLVAFFFKALTSYLKKQNCLYVLIDPYLIENLRNAEGEIVKSYDNRAFVRTMDTLGYKHQGFPVGYDSMSQIRWLSVLDLKDKTEDQLLKEMDYQTRRNIKKTYDIGVKTKTLTIDETQTFFDLFHMAEEKHGFKFRELPYFEEMQKLYDDHAMLKLAYIDLNEYLKTLQLKQQQLTAELSGVEEALEESPNSKKNKTKRTQLEQQLNSNKRKIDNTIEQIEQDGAVLNLASALFIYNEHEVYYLSSGSNPKYNAYMGAYHLQWEMIKFAKAHHIDRYNFYGITGDFSESAEDYGVQQFKKGFNAHVEEYIGDFIKPIKPMLYKLQTYLKHKRR >LR134268.1|VED77936.1|2468291_2469602_+|IgG-binding-protein-SBI MKNKYISKLLVGAATITLATMISNGEAKASENTQQSSTKHQTTQNNYVTDQQKAFYQVLHLKGITEEQRNQYIKTLREHPERAQEVFSESLKDSKNPDRRVAQQNAFYNVLKNDNLTEQEKNNYIAQIKENPDRSQQVWVESVQSSKAKERQNIENADKAIKDFQDNKAPHDKSAAYEANSKLPKDLRDKNNRFVEKVSIEKAIVRHDERVKSANDAISKLNEKDSIENRRLAQREVNKAPMDVKEHLQKQLDALVAQKDAEKKVAPKVEAPQIQSPQIEKPKAESPKVEVPQIQSPKVEVPQSKLLGYYQSLKDSFNYGYKYLTDTYKSYKEKYDTAKYYYNKYYQFKGLIDQTVLTTIGSGYGSYIKPLEIKENSGFAQKSYAQVRNYVTESINTGKVLYAFYQKPELVKTAIKAQETASSIKNTISKLLSFWK >LR134268.1|VED77939.1|2469541_2469721_-|Uncharacterised-protein MENEKRTADSIENQRFFLITVYYENYLKNDVKLEKIFLIDYFQNDNSLDIVFLIDDAVS >LR134268.1|VED77942.1|2470114_2471080_+|gamma-hemolysin-component-A-protein MNLKLNRKKVISMIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHEKGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >LR134268.1|VED77945.1|2471647_2472595_+|Leukocidin-S-subunit MLKNKILATTLSVSLLAPLANPLLENARAANDTEDIGKGNDVEIIKRTEDKTSNKWGVTQNIQFDFVKDKKYNKDALILKMQGFISSRTTYYNYKNTNHIKSMRWPFQYNIGLKTNDPNVSLINYLPKNKIESTNVSQTLGYNIGGNFQSAPSLGGNGSFNYSKSISYTQQNYVSEVEQQNSKSVLWGVKANSFVTASGQKSAFDSDLFVGYKPHSKDPRDYFVPDSELPPLVQSGFNPSFIATVSHEKGSGDTSEFEITYGRNMDVTHAIKRSTHYGNSYLDGHRIHNAFKNRNYTVKYEVNWKTHEIKVKGQN >LR134268.1|VED77948.1|2472596_2473574_+|Gamma-hemolysin-component-B MNMNKLVKSSVATSMALLLLSNTANAEGKITPVSVKKVDDKVTLYKTTATADSDKFKISQILTFNFIKDKSYDKDTLVLKAAGNINSGYERPNPKDYDFSKIYWGAKYNVSISSQSNDSVNVVDYAPKNQNEEFQVQNTLGYTFGGDISISNGLSGGLNGNTAFSETINYKQESYRTTLSRNTNYKNVGWGVEAHKIMNNGWGPYGRDSFHPTYGNELFLAGRQSSAYAGQNFISQHQMPLLSRSNFNPEFLSVLSHRQDGAKKSKITVTYQREMDLYQIRWNGFYWAGANYKNYKTRTFKSTYEIDWENHKVKLLDTKETEINK >LR134268.1|VED77951.1|2473632_2474100_-|BioX-protein MTSKDITQISVIAAILTILAVLKIPSIIPGLDFQLSAPAALLILAFFGIKKYFLGGLLSSVLLLIFGVFNPINVIISIIFRVIAIAVVYLLKINVLSLVLASILGSLVSRLLLSIILNLPVWVVLLNAIPGVIFTLVVAIPLYLTLRKRMAVLLR >LR134268.1|VED77954.1|2474110_2474557_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MCVTEQALNQGMTYIKNETVYTGSIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >LR134268.1|VED77957.1|2474532_2474802_-|6-carboxyhexanoate--CoA-ligase MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQNLTQECVSLNKR >LR134268.1|VED77960.1|2475126_2475564_-|8-amino-7-oxononanoate-synthase MFSDQENHASIIDGIKLSGLEKVIYKHLDIADLEKRLAECPNQNIQKIIISDSVFSTNGDVVDIGQLVSLKHKYNATLILDVSHSFGIENYSNYQGVDILTSSLSKACGAYGGVILSSNDVKDMLINHGRPLIYSVVCQFIICIL >LR134268.1|VED77963.1|2475512_2475926_-|8-amino-7-oxononanoate-synthase MMFQEQIDLLQQKGLYRSLKTVGYIDRQYIEVENQRCTNYTSNDYLGLGQIAFDKNDFEKFMRKYSYHLSSSRLISGSSAAYEEIETMLAGWLGYSACTILNSGYDANLTLFNISKIQIVSCFQIKKIMRVLLTVLS |
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| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134268_1 | 1.1|773327|34|LR134268|CRISPRCasFinder | 773327-773360 | 34 | LR134268.1 | 1067328-1067361 | 0 | 1.0 |
| LR134268_3 | 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder | 1610366-1610397 | 32 | LR134268.1 | 2349505-2349536 | 1 | 0.969 |
| LR134268_3 | 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder | 1610366-1610397 | 32 | LR134268.1 | 219523-219554 | 2 | 0.938 |
| LR134268_3 | 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder | 1610366-1610397 | 32 | LR134268.1 | 1067308-1067339 | 2 | 0.938 |
| LR134268_3 | 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder | 1610366-1610397 | 32 | LR134268.1 | 2153292-2153323 | 2 | 0.938 |
| LR134268_3 | 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder | 1610366-1610397 | 32 | LR134268.1 | 2508486-2508517 | 2 | 0.938 |
| LR134268_5 | 5.1|2276524|37|LR134268|CRISPRCasFinder | 2276524-2276560 | 37 | LR134268.1 | 2276435-2276471 | 2 | 0.946 |
1. spacer 1.1|773327|34|LR134268|CRISPRCasFinder matches to position: 1067328-1067361, mismatch: 0, identity: 1.0
ttgttggggcccacaccccaacttgcacattatc CRISPR spacer ttgttggggcccacaccccaacttgcacattatc Protospacer **********************************
2. spacer 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder matches to position: 2349505-2349536, mismatch: 1, identity: 0.969
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctgtgttggggccc Protospacer ****** *************************
3. spacer 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder matches to position: 219523-219554, mismatch: 2, identity: 0.938
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggccc Protospacer ****** ************* ***********
4. spacer 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder matches to position: 1067308-1067339, mismatch: 2, identity: 0.938
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggccc Protospacer ****** ************* ***********
5. spacer 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder matches to position: 2153292-2153323, mismatch: 2, identity: 0.938
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctttgttggggccc Protospacer ****** ************* ***********
6. spacer 3.1|1610366|32|LR134268|CRISPRCasFinder matches to position: 2508486-2508517, mismatch: 2, identity: 0.938
attgggtatccaatttctctgtgttggggccc CRISPR spacer attgggaatccaatttctctgtgtttgggccc Protospacer ****** ****************** ******
7. spacer 5.1|2276524|37|LR134268|CRISPRCasFinder matches to position: 2276435-2276471, mismatch: 2, identity: 0.946
agctcacaaaacccttgatatcattggtttcccatga CRISPR spacer agctcacaaaacccttgatatcactggtttctcatga Protospacer ***********************.*******.*****
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134268_4 | 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder | 1821239-1821267 | 29 | NZ_LR134403 | Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence | 202405-202433 | 5 | 0.828 |
| LR134268_4 | 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder | 1821239-1821267 | 29 | NC_021539 | Listeria phage LP-030-2, complete genome | 30990-31018 | 5 | 0.828 |
| LR134268_4 | 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder | 1821239-1821267 | 29 | KJ094023 | Listeria phage LP-101, complete genome | 36648-36676 | 5 | 0.828 |
| LR134268_4 | 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder | 1821239-1821267 | 29 | MN693250 | Marine virus AFVG_25M507, complete genome | 24474-24502 | 6 | 0.793 |
| LR134268_4 | 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder | 1821239-1821267 | 29 | MN693116 | Marine virus AFVG_25M217, complete genome | 37740-37768 | 6 | 0.793 |
| LR134268_4 | 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder | 1821239-1821267 | 29 | NZ_CP039965 | Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence | 1307898-1307926 | 7 | 0.759 |
| LR134268_4 | 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder | 1821239-1821267 | 29 | MH791411 | UNVERIFIED: Escherichia phage Ecwhy_1, complete genome | 54760-54788 | 7 | 0.759 |
| LR134268_4 | 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder | 1821239-1821267 | 29 | MT446416 | UNVERIFIED: Escherichia virus TH47, complete genome | 202998-203026 | 7 | 0.759 |
| LR134268_4 | 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder | 1821239-1821267 | 29 | MH494197 | Escherichia phage CMSTMSU, complete genome | 237333-237361 | 7 | 0.759 |
1. spacer 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder matches to NZ_LR134403 (Listeria monocytogenes strain NCTC7974 plasmid 6, complete sequence) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tagagaatatcaacaagaaattataaatg Protospacer .******* ************* ** * *
2. spacer 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder matches to NC_021539 (Listeria phage LP-030-2, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tagagaatatcaacaagaaattataaatg Protospacer .******* ************* ** * *
3. spacer 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder matches to KJ094023 (Listeria phage LP-101, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.828
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tagagaatatcaacaagaaattataaatg Protospacer .******* ************* ** * *
4. spacer 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder matches to MN693250 (Marine virus AFVG_25M507, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer aagagaattgcaacaagaaattctaatgc Protospacer ******** *************** .
5. spacer 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder matches to MN693116 (Marine virus AFVG_25M217, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer agcaaaatttcaacaagagattctacaaa Protospacer . *.*************.*********.
6. spacer 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder matches to NZ_CP039965 (Pseudorhodobacter sp. S12M18 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer atgagaatttcaccaagaaattcggcatc Protospacer ********** ********** .**
7. spacer 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder matches to MH791411 (UNVERIFIED: Escherichia phage Ecwhy_1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tgtaaaatttcatcaaggaattctacaac Protospacer .. *.******* ****.**********
8. spacer 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder matches to MT446416 (UNVERIFIED: Escherichia virus TH47, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tgtaaaatttcatcaaggaattctacaac Protospacer .. *.******* ****.**********
9. spacer 4.1|1821239|29|LR134268|CRISPRCasFinder matches to MH494197 (Escherichia phage CMSTMSU, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
cagagaatttcaacaagaaattctacaag CRISPR spacer tgtaaaatttcatcaaggaattctacaac Protospacer .. *.******* ****.**********
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
234814 : 239429
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134268|234814:239429|DBSCAN-SWA CTTAGGCAATGTGAAAAATCTGATTTCTATTAATTATTTGATAGAAATCAGATTTTTTGATACGTATTTTATAATGTACAGCTCGTTGAGCTGCTATTTTCCTTACATTAACTGCCATTAATCCAAAACCTAGCTCTCGTTTAACTTTATTTATTCCTCGAACTGACATTCGAGTGAAACCCAAAATAGCCTTCATAAATCCAAAAACAGGCTCTACATCAATTTTTCTTTGACTATAGTTTTTTTCGTTTCTGGTTCAGAAAGCTTTTGATTAACTTGGGCTTTAAAGTATTCCCAATTATAATTCTTCATAATTTTCTTATTGGGTTTCGAATTTGGCTTCATGCATTAATGTCTCAAAGAACATGCTGCAGAGTCATCACATTCATATAGTTTGAAGTCACGTTTAAAACCATATCTATCATTACGGTATGCATATCTTTTAAAACCTATTCTTTTGTTATTAGGACATATAAATTCATCATTAAGTGCGTCATATTCCAATTTTGAGTGTTAAAAATGTCACTTTTAAACTTTCTAGTTTTATCTTTAATAAACATGCCATACGTAATAAGTGGCGTTTTATTAAAATCATCTATAATAGCCATATAGTTTTGCTAACTACCATAACCTGCATCAGCTACAATATACTCTGGTAAATAACCGAAGGTATTTTGAATCATTGTTAAAAACGGAATTAAAGTTCTAGTATCTGTTGGGTTTTGAAATAGGTCACAAGATAAAACAAATTGAGAATTTGTCGCTATTTGTAAATTGTATCCTGGCTTAAGTTGGCCATTTTTCATATGGTCTTCCTTCATTCTCATAAAAGCTGCATCATAATCAGTTTTAGAAAAGCTATTTCTATCTTTAAGAATCGATTTTTGTTCTTCATATTTACTTTTTCTTTCAGAATAATCATCGAATTTCTTTTTGAACTTCTTAATTTCGGTTCTTTTCTTACGAGTCTGTTTTCTAATTTGAGTACAATCTTCGATGTCTTTATCTAAATGACTACCAACTAAATCAATTTCTTCTGTTGTTAAATCGCTATCTCCGTCTTCTTTAATCTCTGATATTATTTTTTCTTCAACTAAGTCACCATATAATGCTTTTGAATTTTCGTTCAATTTCAATTCGTGATTTTGAATACTTTTCTTCCACACTAATGTATACCTATTGGCATTAACTTCTACTTTTGTACCATCAATAAAAATTGAATTATCATCAATAAGATTTTACTTTAAACATTGACTATGGAACTGAATAAATAAAGATTCAATTAACGCATCAGTATTAGGATTCACTCTAAAAAGATTAATAGTTTTATAAGAAGGTGTTTGATCTTGAGCTAACCACATCATTCGAATACTGTTATGAAGTAATTTTTCTATTTAAATGTTGAATGATATGGATTCTGTCAAAAACAATAGCTGCAATAGGAAAAATGTCGCGAAATAATCGAACTTATGCTTCATACATGTCAATAGCAACCGTCTTAATTTGTTGTCGATTTTTAAATAGAATCGCTCGAAATAGGTATGCAAGAATTTTGTAGTTCTATTTTCTAAAATATCTATAACAACAAGAGTGCCTTTATCTATCAAAATGAAACGCATTGACACAGTTGCATTATATTCAACACCACAACAATAACAGGTCTAAGGATTATACGTTACAGTATTTACCACTGTTGATTTTTATCGTTTATTCTTAATAATTCTACGATATTATTACGTCTAGGCGTACTTTTCTTCTTTAGTTTAGGTTTAATCACTTTAAATTATAGAGACGATTTCTCAGTTGTGTATTAAAAAAGCAGGAAGTTTTACCTTCCCACCATAAAAGATGAAGAACCTTTTAACAATATCTATCCCCATAGAATTCGTCCAACTAAATGTAAACGATTCAATGTTTCTCTATAAATATAGTTAATTTTGCTTAAAACTACTTGCAATCTTTGCCATATAATTCCTGCTTTATTTGTGTGGTTGAGATTCCTTCAGTACGTTTTAAGTATATGACTTCACATTTGTTTTTAAGGAAATCGAACTCTCCTTCCCAATCATGTCCCATGACAAAAGTGTCAACCTCATACTTAGTCACATCTTGATTTTTTTGTTTCCAGTTGTTTTCAGGGATAACTAAGTCAACATAGCGAATTGATTCTAACATCATTTTACGTTGTTCGTAATCATAATACGATTTTTTATTTTTAATTTGGTTAAACTCGTCAGTTGATAATGCAACTATCAGATAATCTCCCATTTCTCGGGCCCTTCTTAACAATTCTATGTGCCCATAATGCAATAAATCATAAGTTCCATAAGTTATTACTCTTTTCATCGTAAAGTCTCCTTATAATTTCAATCTTAACTTAATATAACATAGTTTAATTCAATATTGAATTCAGTAGTCTGATAAAATGTTTTAATTAGGTGATGAAAAATGTGATGCAAACATCACTATTAAATATTGATGAATATTAATAATTATAGCTCAATAATGTATAACGTAAAAATCTTATTATAGCCTTGACATAGTTTGAGAATGAATAATTAAATCGATAAAATATAACAGTATGAAATTTAAATAGTGAAATAAATTAGAAATGGTTGTCAATAGTGGTTTAAAAATACTGTTTTATGGCGATTTGAAAATGTCTTTTTTTAGGGGTTTAAGATTGTCGTATATTTAATGATTTTTCGTTTTTATAATCTTTTAATTGATAAGATTCTCCAGTAATTTTAAATACTTTTGAATGGTGAACTAACCGATCAATTATAGCTGCTGATACAATCTTATTACTAAATGACTCTCCCCAACTCGAAAATGCAATATTAGTCGTAATTATTGTTGATTTCATTTCATATCTTAGTGACATTAACTGGTAGAATAAATCAGCTTGTTCTTTGGTGATGGCAGAATAACAAATTTCATCAATGATAAGTAACTCTATTCTGCTTAATTGTTTTAATGTTTTATTAATGATTTCTTTGGAATCTGTGACAGTTAATAAGTCTATTAATTCTTTGAAAGTATAGAATCTAGTCTTTATATTTTGTTTACATGCTCTATTCCTAATGAGATTGCTAGGTGTGTTTTACCAACACCACTATTACCTAAGAAACAAATATTTATACTATCTTCTAAAAATGCATAGATTTTAAAGTGAGTATTTCTTGTTGATTTTTACTAGGTTGAAACATGAAATCAAAACCATGTAAATATTTTATTTTAGGGAAACGTGCTGAATTCACAGCACGTTTAAATTTTAATTCTGATTGGTATTCTATTTCTTTTTCCGTTAAATCAATCAATATTTCAGTTAATGATTTCTTATTTTTAAAAAGTAATTCAATATAGTTTGGATAATAATCTTTGAATTTTTTTAGTTTTAATATTTCAAAGTTATTGAGTAATTTTTGATGGTTCGTACTCATCGAAAGTCCTCTTAAATTTCGTCATACAGTAATAATGAATTTTCTATATACGTAAGAATTTCTTTGTTATCCTTATGTTTAAATACATCTGATTTTAATATTTCATTCATATCTTCAACGATATAATTAAATTTTCTTTCGGATAGATTGTGCCGTCTTATTAATTCACCATCATAATAAATCAGCAATTTATCAGTAGAATTATTGAATATCACTTTTACTTCTTCACCAATGTATTTAGTAGGTACCGAGTATTTATCTTTTCTAAAGTTAATCATCGATTCTTTAGAAACGATTCTTATACACTCATTTTCGTTGTAAGTATCTAGTAACTTGGCATTAAAAGAATTTGTATGTTCTTTTTTTCATAATTGAAAACGTCGATAGGTCGTTGTTCTGTTGCTTGTGAAATTTCTAAGTGATTTAATTCGTGACATAAATTATTTGCTGGCCCAATAAGTTCTACAACATCATAAAATTCATAATCGTATACTCTTAAACGTTGTTCAACAAATTTAGCTAATGATTCAACACCCCTTTTGTTTGAGGACGATAGGGTGTACAAGCAATAGGTTCAAAGTTGGTATCCTTACTAAATTGATAAAATAAATTATTAAAGACGACTTTTTTATATTGTGTTCTCGGTCGATCAACTACAGTTCTCATATTATCGAACCAGATTTCTTTTGGATATTCAAATAAGGTATCTTGTTTTCTATCCTAAGTTAATGTGATATGCTTCATTTTTGAATAGTGGAGAACGTAAAGAAAGATGTTGAATTGATAAGTTCTGCTAAACTTATCATGCATTATCATATCTTCTTTCCAGTCTACTTGAGCAGCTATACCGGGATTAGTTTCTACGCGTATAGTTGTTTTTTTAGTATCATTTTGTTTTTTATTTTTTACAGTATTCTCGTAGAATAATATATTTACCTTCATATCCCTTTTTCTCTATATATTTAAAAATGGCCATAGCTGTACATTCTAATTCAATTTTTAATCAATAATTTCTTTAAATGGATCTAGTTTTGATGCTTTCTTATTTTGTTATCTTTTCTTCAATCGTTTTATTTCATTTTCTTTTCCTGCTTCATAATATTTTTTAACTGTTCTTGGATCACAATTATATTGTCGACCAAGCTCAGCATAATTTGGTTTAATACCTTTCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134268|234814:239429|237490_237697_-|VED70721.1|DBSCAN-SWA MSLRYEMKSTIITTNIAFSSWGESFSNKIVSAAIIDRLVHHSKVFKITGESYQLKDYKNEKSLNIRQS >LR134268|234814:239429|235430_235979_-|VED70717.1|transposase|DBSCAN-SWA MWKKSIQNHELKLNENSKALYGDLVEEKIISEIKEDGDSDLTTEEIDLVGSHLDKDIEDCTQIRKQTRKKRTEIKKFKKKFDDYSERKSKYEEQKSILKDRNSFSKTDYDAAFMRMKEDHMKNGQLKPGYNLQIATNSQFVLSCDLFQNPTDTRTLIPFLTMIQNTFGYLPEYIVADAGYGS >LR134268|234814:239429|239306_239429_-|VED70731.1|transposase|DBSCAN-SWA MKGIKPNYAELGRQYNCDPRTVKKYYEAGKENEIKRLKKR >LR134268|234814:239429|234814_235009_-|VED70715.1|transposase|DBSCAN-SWA MKAILGFTRMSVRGINKVKRELGFGLMAVNVRKIAAQRAVHYKIRIKKSDFYQIINRNQIFHIA >LR134268|234814:239429|238267_238534_-|VED70725.1|transposase|DBSCAN-SWA MINFRKDKYSVPTKYIGEEVKVIFNNSTDKLLIYYDGELIRRHNLSERKFNYIVEDMNEILKSDVFKHKDNKEILTYIENSLLLYDEI >LR134268|234814:239429|238976_239198_-|VED70729.1|transposase|DBSCAN-SWA MKVNILFYENTVKNKKQNDTKKTTIRVETNPGIAAQVDWKEDMIMHDKFSRTYQFNIFLYVLHYSKMKHITLT >LR134268|234814:239429|238581_238821_-|VED70727.1|transposase|DBSCAN-SWA MYTLSSSNKRGVESLAKFVEQRLRVYDYEFYDVVELIGPANNLCHELNHLEISQATEQRPIDVFNYEKKNIQILLMPSY >LR134268|234814:239429|236760_237159_-|VED70719.1|DBSCAN-SWA MKRVITYGTYDLLHYGHIELLRRAREMGDYLIVALSTDEFNQIKNKKSYYDYEQRKMMLESIRYVDLVIPENNWKQKNQDVTKYEVDTFVMGHDWEGEFDFLKNKCEVIYLKRTEGISTTQIKQELYGKDCK >LR134268|234814:239429|237962_238256_-|VED70723.1|transposase|DBSCAN-SWA MSTNHQKLLNNFEILKLKKFKDYYPNYIELLFKNKKSLTEILIDLTEKEIEYQSELKFKRAVNSARFPKIKYLHGFDFMFQPSKNQQEILTLKSMHF |
9 | Lactococcus_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
720641 : 739647
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134268|720641:739647|DBSCAN-SWA TATGATGCAACAAACATTATCGCATTACTTTGGGTATGAAACGTTTCGACCAGGACAAGAAGAAATTATTAGCAAAGTATTAGACCATCGTAATGTGCTTGGTGTCTTACCAACTGGTGGAGGTAAGTCTATATGCTATCAAGTACCAGGTTTATTGTTAGGTGGTACAACAATTGTAATAAGTCCACTTATATCATTAATGAAAGATCAAGTGGATCAATTAAAAGCGATGGGAATTCAAGCTGCTTTTTTAAATAGTAGTTTGACTCAAAAAGAGCAACAACGTATTGAAAAAGCATTATCAAATGGAGAAATTCAATTTTTGTATGTTGCACCAGAAAGATTTGAAAACCGATATTTTTTAAATATGCTTCAGCGTATAAAGATTCATTTAGTCGCGTTTGATGAAGCGCATTGTATATCTAAATGGGGACATGATTTCAGACCGAGTTATCAAAACGTCATTTCTAAAGTATTTACGTTACCTCAAGATTTTACAATAATAGCGTTGACAGCAACTGCCACGGTTGAAGTACAGCAAGATATTAGAGAAAAGTTAAATATCGCTCAAACTGATCAAATTAAAACGAGTACTAAGCGTAGAAATTTAATTTTTAAAGTAAATCCTACTTATCAACGTCAAAAATTTATATTAGATTATATTAAAACACACGATGAAGATGCAGGTATTATTTATTGTTCTACACGTAAGCAAGTTGAAGAGCTTCAAGAAGCCTTAGAAAGCCAGAAAATTGAAAGTGTTATATATCATGCAGGTTTGAGCAATAAAGAAAGAGAAGAAGCGCAGAATGATTTCTTATTTGATCGTGTTAAAGTAGTTGTTGCTACAAATGCTTTTGGTATGGGTATTGATAAATCTAATGTACGTTTTGTTATACATTATAATATGCCTGGAGATTTAGAATCTTATTATCAAGAAGCGGGACGTGCAGGTCGTGACGGATTGAAGAGTGAATGTATTTTGTTATTTAGCGAACGCGATATCAATTTACACGAGTATTTTATAACAGTCTCACAAGCTGATGATGACTATAAAGATAAAATGGGCGAAAAGTTAACTAAAATGATTCAATATACAAAAACAAAAAAATGTTTAGAAGCAACAATTGTCCATTATTTTGAACCGAATGAAAAATTGGAAGAATGTGAACAATGTAGTAATTGTGTTCAACAAGATAAATCATATAATATGACACAAGAAGCTAAGATGATTATTAGTTGCATCGCTCGTATGAAACAACAAGAGAGTTATAGTGTTATCATTCAAGTGTTAAGAGGAGAGTCAACAGATTATATTAAGTATAAAGGTTATGACCAAATTTCAACCCATGGTTTAATGAAAGGTTACACAACATCAGAATTAAGTCACTTAATAGATGAATTAAGATTCAAAGGGTTCTTAAATGAAAATGATGAAATATTAATGTGTGATACTTCAATTAAAAAATTACTCAGTAATGAAGTAGAAGTATTCACAACACCATTTAAGCAAAAAGCGACTGAAAAAGTATTTATAAATACGGTTGAAGGGGTTGACCGAGCATTATTCAGTCAGTTGGTAGAAGTTCGTAAAAAGTTAAGTGACAAATTAACAATAGCACCTGTAAGTATATTTTCTGATTACACGTTAGAAGAATTTGCTAAACGTAAGCCTGCTTCGAAACAAGATATGATTAATATTGATGGCGTAGGTAGTTACAAATTAAAACATTATTGTCCAGCATTTTTTAGAAACGATTCAAAATTATAAAGCCAAAGTATAGTGAAGGCACCTAGTAAACATTCCTTGTTTTACTGGGTGTTTTTTGAATTCAAAGTAAAATAACACTATTTCTTAACTGGAGATTACCTATTATTCATTATTTTGTTAAAAAAGTTCAAGGATAAATCATTTAAATTTGAAAATTGTAATAAACGTGGTTAAATAGGGAATACATACATATAATCTCGGTTTTATGCTATGAGAAAAAAAGAGGTGGCAAAGTGATTAAGTTTAAAAATGTAACTAAGCGTTATGGCAAACATGTTGCTGTCGATAACATTAGTTTCAATATTAATGAAGGTGAATTTTTTGTGCTAATTGGACCTTCAGGTTGTGGAAAAACTACGACATTAAAAATGATTAATCGACTCATTCACTTAAGTGAAGGTTATATTTATTTTAAAGATAAACCAATAAGTGATTATCCAGTATACGAAATGCGTTGGGATATTGGATACGTATTGCAGCAGATTGCATTATTCCCACATATGACAATCAAAGAAAATATAGCACAAGTGCCACAAATGAAAAAGTGGAAAGAAAAAGATATAGATAAAAGAGTAGATGAATTACTTGAAATGGTTGGATTAGAACCTGAAAAATATAAAAACAGAAAACCTGATGAATTGTCAGGGGGACAACGACAACGTGTAGGAGTTATACGTGCGTTAGCAGCTGATCCACCAGTTATTTTAATGGATGAACCGTTTAGTGCATTAGACCCAATCAGCCGAGAAAAACTTCAAGATGATTTAATTGAATTACAAACTAAAATTAAGAAGACAATCATATTTGTTACACATGATATTCAAGAGGCGATGAAACTTGGTGATAAGATTTGTCTTTTGAATGAAGGTCATATTGAACAAATTGATACACCAGAAGGATTTAAAAATAATCCTCAAAGTGAATTTGTTAAACAATTTATGGGTAGTCATTTAGAAGATGATGCGCCATGTGTTGAAGAGAACGCAATTATCCGTGACTTGGGTATAATGAAACCAATCGATGAGGTTACATCTATGAGTGCTTATCCAATTGTTTATGACAATCAACAAATTGAAGTATTGTATCAACATTTATCAGAGAGCGAGCGTGTCATTGTCATGCAAGAAGATAGCGTAGGTCAATATGTTATTGATAGGAAAGATATCTTCAAATATTTGTCCCAGAAAAAGGAGGTAGCTCAACATGACTAACTTTTTCGACATATTGAGTGAACGTAAGGGGCAACTATTTTCGACAATGATAGAACATATTCAAATATCATTTATCGCATTATTGATTGCAACTGCTATTGCGGTACCATTAGGTATTTTATTGACGAAGACTAAAACGATATCTGAAATCGTAATGAATATTGCGGCAATTCTTCAAACCATACCATCGTTGGCATTATTAGGTTTAATGATTCCTTTATTTGGTATCGGTCGTGTGCCAGCAATTATTGCACTTGTAGTGTATGCGTTGTTACCAATTTTAAGGAATACGTATACTGGAATTAAAGAAGTTGATCCATCACTCATTGAAGCGGCTAAAGGTATAGGTATGAAGCCATTTAGACGTTTAACTAAAGTTGAACTTCCAATAGCAATGCCTGTTATAATGGCTGGTGTAAGAACGGCTATGGTATTAATTATAGGTACAGCAACACTAGCAGCATTAATTGGTGCAGGCGGACTAGGAGATTTAATTTTATTAGGTATAGACCGTAACAATGCATCATTGATATTATTAGGTGCAATTCCAGCAGCCTTATTGGCAATTATATTTGATTTAATTTTAAGATTTATGGCTAAATTGTCATATAAAAAGTTATTGATAACGTTAGGTGTTATAGTGATGATTATTATACTGGCCATCGCTATTCCTATGTTTGCACAAAAAGGTGATAAAATTACGTTAGCTGGAAAGCTTGGCTCCGAGCCTTCGATTATTACAAATATGTATAAAATTTTAATAGAAGAAGAGACCAAAAATACTGTAGAAGTGAAAGATGGTATGGGCAAAACAGCATTTTTATTTAATGCTTTAAAATCTGACGATATAGATGGGTATTTAGAGTTTACTGGAACAGTTTTAGGTGAATTAACAAAAGAACCATTGAAGTCAAAAGAAGAGAAAAAAGTATATGGTCAAGCTAAGCAAAGTCTTGAAAAGAAATATCAAATGACGATGTTAAAACCAATGAAATATAACAATACGTATGCTTTAGCTGTAAAACGTGATTTTGCTAAACAACATAATATACGTACAATTGGTGATTTAAATAAGGTTAAAGATCAACTTAAACCAGGATTTACATTGGAATTTAATGATCGTCCAGATGGTTACAAAGCTGTTCAAAAGGCTTATAATTTAAATTTAGATAACATACGTACAATGGAACCTAAGTTGAGATATCAAGCGATCAATAAAGGTAATATTAATTTAATAGATGCATATTCAACTGACGCTGAATTAAAACAATATGATATGGTTGTGTTAAAAGATGATAAGCACGTATTTCCACCATATCAAGGAGCGCCATTATTTAAAGAAAGCTTTTTAAAGAAACATCCAGAAATTAAGAAACCGTTAAACAAACTAGCAAACAAAATATCTGATGAAGATATGCAAATGATGAACTATAAAGTAACAGTTAAAAATGAAGACCCATATACAGTTGCGAAAGATTATTTAAAAGCAAAAGGGTTAATCAAATAACGACCAACGCCACATAAGATGAGGGGCACGCCATTATATCTTATGTGGCGTTGCTATATTTACATCTATGTTTATGTTCAATTTAAACATGCAATACTGATTAAAAAATATGACATGTTAAACACAATGTAAGCTAGTAATATGTGAAAATAGTAGCATTGCATTTTAGAAACATAGAGCGATATAATGAATATAAGTTTTTTAAAATTTCAGTTAATTCTAAGGAGGTTGTTTTTATTATGAAAGAACAACTTAATCAACTATCAGCATATCAGCCTGGTTTATCTCCAAGGGCATTGAAAGAAAAGTATGGCATTGAAGGAGATTTATATAAACTTGCATCAAATGAAAACTTGTATGGACCATCGCCTAAAGTTAAAGAAGCGATATCAGCACACTTAGATGAGTTATATTATTATCCTGAAACAGGATCACCGACATTAAAAGCGGCGATTAGTAAACATTTAAATGTAGATCAATCACGCATTTTATTTGGTGCGGGATTAGATGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134268|720641:739647|735628_736600_+|VED71955.1|DBSCAN-SWA MIAVNWNTQEDMTNMFWRQNISQMWVETEFKVSKDIASWKTLSEAEQDTFKKALAGLTGLDTHQADDGMPLVMLHTTDLRKKAVYSFMAMMEQIHAKSYSHIFTTLLPSSETNYLLDEWVLEEPHLKYKSDKIVANYHKLWGKEASIYDQYMARVTSVFLETFLFFSGFYYPLYLAGQGKMTTSGEIIRKILLDESIHGVFTGLDAQHLRNELSESEKQKADQEMYKLLNDLYLNEESYTKMLYDDLGITEDVLNYVKYNGNKALSNLGFEPYFEEREFNPIIENALDTTTKNHDFFSVKGDGYVLALNVEALQDDDFVFDNK >LR134268|720641:739647|733044_733443_+|VED71949.1|DBSCAN-SWA MKIIYFSFTGNVRRFIKRTELENTLEITAENCMEPVHEPFIIVTGTIGFGEVPEPVQSFLEVNHQYIRGVAASGNRNWGLNFAKAGRTISEEYNVPLLMKFELHGKNKDVIEFKNKVGNFNENHGREKVQSY >LR134268|720641:739647|736974_737946_+|VED71958.1|DBSCAN-SWA MKYLLKGKILLLLLILLTIISLFIGVSELSIKDIFHLSDSQQNILFSSRIPRTMSILIAGSSLALAGLIMQQMMQNKFVSPTTAGTMEWAKLGILIALLFFPTGHILLKLVFAVICSISGTFLFVKIIDFIKVKDVIFVPLLGIMMGGIVASFTTFISLRTNAVQSIGNWLNGNFAIITSGRYEILYLSIPLLALTYLFANHFTIVGMGKDFTNNLGLSYEKLINVALFITATITALVVVTVGTLPFLGLVIPNIISIYRGDHLKNAIPHTMMLGAIFVLFSDIVGRVIVYPYEINIGLTIGVFGTIIFLILLMKGRKNYAQQ 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16 | uncultured_Caudovirales_phage(38.46%) | holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
791829 : 808596
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134268|791829:808596|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134268|791829:808596|794223_794688_+|VED72126.1|DBSCAN-SWA MAKKKSPGTLAENRKARHDYNIEDTIEAGIVLQGTEIKSIRRGSANLKDSYAQVKNGEMYLNNMHIAPYEEGNRFNHDPLRSRKLLLHKREIIKLGDQTREIGYSIVPLKLYLKHGHCKVLLGVARGKKKYDKRQALKEKAVKRDVARDMKARY >LR134268|791829:808596|804980_805550_+|VED72179.1|terminase|DBSCAN-SWA MSELTAKQARFVNEYIRTLNVTQSAIKAGYSANSAHVTGCRLLKKPHIKQYIQEQKDKVIDENVLTAKELLHVLTNAAVGDETETKEVVVKRGEYKENPQSGKVQLVYNEHVELVEVPIKPSDRLKARDMLGKYHKLFTDKHDINGNVPIFINIGEWDGDDEDLDKTVQEVSNANPNHTVIVDDIPLED >LR134268|791829:808596|797699_797837_+|VED72138.1|DBSCAN-SWA MKNYLTYIGTISFITLAVALVANVFIAFALYILASAYGIKLLEVE >LR134268|791829:808596|797468_797687_+|VED72135.1|DBSCAN-SWA MTKLAYPMLYITRKEHGDTQKKVASKLGISPQRYQLKECGRAIFNLNECQILSEMYDMPIDELFSSSIKVNS >LR134268|791829:808596|798249_798543_+|VED72143.1|DBSCAN-SWA MNWEIKDLMCDIEVVKEKINDVAIKHGWFVEDKFVKNELETKQEHINFSASYLEHRIQNEHTVELLQVYLKEFGELIQKFHEIEKASLQADQSESNA >LR134268|791829:808596|801694_801922_+|VED72158.1|DBSCAN-SWA MPAPENLFVEYIEDGEVWYSPVVCMALNKAHNINFYDSDDVGCIDKAGTFSIKKFNPETGEFEQFSKMAQKEVTQ >LR134268|791829:808596|791829_794202_+|VED72123.1|DBSCAN-SWA MNLKQSIEEIINKPEYEPMSVSDFQDALGLSSADSFRDLIKVLVELEQSGLIERTKTDRYQKKHSSKGHSKLIKGTLSQNKKGFAFLRPEDEDMEDIFIPPTKINRALDGDTVIVEIHQSKGEHKGKIEGEVKSIEKHSVTQVVGTYSEARHFGFVIPDDKRIMQDIFIPKGQSLGAVDGHKVLVQITKYADGSDNPEGHISAILGHKNDPGVDILSIIYQHGIEIEFPDEVLEEAEAVPDHIENNEIKGRHDLRDELTITIDGADAKDLDDAISVKKLANGHTQLTVSIADVSYYVTEDSALDKEAYDRATSVYLVDRVIPMIPHRLSNGICSLNPHVDRLTLSCRMEIDASGRVVKHEIFDSVIHSDYRMTYDAVNQIITEKDPNIREQYKEITPMLDLAQDLSNRLIQMRKRRGEIDFDISEAKVLVNEDGIPTDVQLRQRGEGERLIESFMLIANETVAEHFSKLDVPFIYRVHEQPKSDRLRQFFDFITNFGIMIKGTGEDIHPTTLQKVQEEVEGRPEQMVISTMMLRSMQQAHYDDVNLGHFGLSAEYYTHFTSPIRRYPDLTVHRLIRKYLIEKSMDNKEVKRWEDKLPELAEHTSKRERRAIEAERDTDELKKAEYMIQHIGDEFEGIVSSVANFGMFIELPNTIEGMVHIANMTDDYYRFEERQMALIGERQAKVFRIGDTVKVKVTHVDVDERLIDFQIVGMPLPKNDRSQRPARGKTIQAKTRGKSLDKSKSDDKGRKKKSKHRKGKNQRNNDKSGNSKHKPFYKDKSVKKKARRKKK >LR134268|791829:808596|801273_801495_+|VED72152.1|DBSCAN-SWA MNKNQLKSEILEYIKAHAGTSFVEIERVFEENNFDYKGDGAYTSGQHPNVVFWIGWNQEAFDVIAELKKRQTY >LR134268|791829:808596|802046_802559_+|VED72161.1|DBSCAN-SWA MVYVMMNNKLFGHVYIKDCKVRQSFELASPKHTEGLIRSIEGHYVGYELHDGKQLSISDVMASQLFEDEYFMYGLQTYAESNNSDVFEYLENGFDTDTLEGIQSSNTDVISNIEMLYQIATGINEPVPELVEGLKLVTEFVQDENATQEDYKALERKLNDLKESYYSLSK >LR134268|791829:808596|802905_803247_+|VED72164.1|DBSCAN-SWA MQSIAEKETYHLPTEHLQVFNVIKNTSNKYITKTKILNQLGYEYNSSNERWLRRVINSLVYDHGYPIGCSYKPSERGYYIITTEQEKQQAMRSIKKLADGSMKRYEALKRIEV >LR134268|791829:808596|804112_804640_+|VED72173.1|DBSCAN-SWA MKLLKTKYCLYYRNGYNKLSEYQLLTQFNPAFINKKIKMCEFQIESMYHMSASTTTCDEIMGVVSVSYPIEKLVIKIIETKAGLQNYKNRSISNMALLKKVLNHYTEKEQKQVVKYMRSNGRYKPYNVIERLQVDLYQASIKQRSERQKQRNTAIKNSKIARVNAYYQSSHVKVV >LR134268|791829:808596|798630_799500_+|VED72146.1|DBSCAN-SWA MNEIKLEYDTHVSVVHYESLDSRSFKSFSKPKWSKLINKLSVPIEANYKYARGVAVYGDIKNGANDHGEIIKKHRNDVNVVYRGVIVLDYDEINDLKQLHEAISSALSNVAWFWHTSFSHTTEQARIRLYIPLNERISADDYRKYTKVLANKIGHKVDEGSYQPSRCFALPVIQKGHIFIKRVNDCPIIDVDMLEQWSKEFEQSSGSPNIKGYTRRDSAYWRDIAFGVSEGERNSTLASITGYLLRRYVDPNLVYGLVSAWASVCKPPINQSEVNNTFKSILKKDSKSS >LR134268|791829:808596|796349_797279_-|VED72132.1|DBSCAN-SWA MYDKKAIGQRIKNIRLKHGQTQEEFGKVFSASKGNVATWEKGLSLPNKERLSMISKYGDINVTQLLYNSNDDNSELEEKIFNDMLKKYPKESHIGKALRFPDYQKRKELMQAGINRTLSVPLLKNKFHTPELILESSTYLFITDEFLNYYINNYKSNSNILKFLERGLEDLQSTVYDYDLLDFHYELQNIFNDITLIFSSRDKSVNKNLLNYLETLLDKTINEIKELQIKYPDNKKSEEIIAIAIPNKQPKFKSEYSFDIDIGKTKDEKIDKINDELSTIIKNLIKNEPSLKSYLKENSSENIGDYDRT >LR134268|791829:808596|803260_803491_+|VED72167.1|DBSCAN-SWA METNQYEELSEVLELTENQKLRLYIYQERQNKNIKQDNKGATQSTEEKREKRQKILDIKDDVTRQNAIAKNIELFN >LR134268|791829:808596|799516_800974_+|VED72149.1|DBSCAN-SWA MENVTNDEVFEMIDSRTGVLNANDWKSQLRRSATTQALKKTTTNAEIILCNDESLKGLVQYDAFEKVTKLKRLPYWRSKGDANYYWADIDTTHVISHIDKLYNVQFSRDLIDTVIEKEAYQNRFHPIKSMIESKSWDGIKRIETLFIDYLGAEDNHYNREVTKKWMMGAVARIYQPGIKYDSMIILYGGQGVGKSTAVSKLGGHWYNQSIKTFKGDEVYKKLQGSWICEIEELSAFQKSTIEDIKGFISAIVDIYRASYGKRTERHPRQCVFVGTTNNYEFLKDQTGNRRFFPITTDKNKATKSPFDDLTPDVVQQMFAEAKVYFDEDPTDKALLLDKEASEMALKVQEAHSEKDALVGEIEEFLERPIPSDYWYRTLEEKRVSAHDVIDQDYIKLYGDGKLIELPNAKPGAYVWRDKVCSMEIWKVMMKRDDQPQQHHLRKIDKALRNTNYCDTVKKQTRYGEGIGKQYGFSVDLASYYQKLKV >LR134268|791829:808596|803501_804023_+|VED72170.1|DBSCAN-SWA MQTIKEIDKYKNNIHEYGNDINKLESNVNDAKNELASKNKEYQDLVINGKVEQADKLYSEIEKLEADYRVKNKRLTVMKRSLKQVVIKNCESMTQVADRLRDEYIDVYQADLNNYEQLKQELQEAENKLKAYNNEYYTKQKELSRYIDGKRRENDIQNIEFIGAVNIIEPFNV >LR134268|791829:808596|797838_798249_+|VED72140.1|DBSCAN-SWA MKTKQKYQLSKVVQVLEKVLYEKDKDIFLSAKDRFHFITDYRYNDTAFYEDVLKLVHKELFNILAELDFENEGFSILDEVTMTLSDVMKETQHVYRYSVIDEKGEHKHTTDRKGHVIGMLEWALDYIAGNIEVEEL >LR134268|791829:808596|805705_806410_-|VED72182.1|DBSCAN-SWA MNKKLLMNFFIVSPLLLATIATDFTPVPLSSNQIIKTAKASTNDNIKDLLDWYSSGSDTFTNSEVLDNSLGSMRIKNTDGSISLIIFPSPYYSPAFTKGEKVDLNTKRTKKSQHTSEGTYIHFQISGVTNTEKLPTPIELPLKVKVHGKDSPLKYWPKFDKKQLAISTLDFEIRHQLTQIHGLYRSSDKTGGYWKITMNDGSTYQSDLSKKFEYNTEKPPINIDEIKTIEAEIN >LR134268|791829:808596|801457_801637_+|VED72155.1|DBSCAN-SWA MLSLNLKKDRRIEMDICEPIVYMVDGKGLDLPIVRSKNIKTDHWLPVTFTISKKETQCV >LR134268|791829:808596|804642_804984_+|VED72176.1|transposase|DBSCAN-SWA MDKKQIKGFVCDYHKRTRSDALIDDDINTDEFFSIGDENSNEWMADDNIDDHIVKNHLEMIVDRVANDKEFYIFDSLIQGRSYKDISNVLECSEQSVRFWYETLLDKIVEVIE >LR134268|791829:808596|807795_808596_+|VED72185.1|DBSCAN-SWA MYKRLFISRVILIFALILVISTPNVLAESQPDPMPDDLHKSSEFTGTMGNMKYLYDDHYVSATKVKSVDKFLAHDLIYNISDKKLKNYDKVKTELLNEDLAKKYKDEVVDVYGSNYYVNCYFSSKDNVGKVTGGKTCMYGGITKHEGNHFDNGNLQNVLVRVYENKRNTISFEVQTDKKSVTAQELDIKARNFLINKKNLYEFNSSPYETGYIKFIENNGNTFWYDMMPAPGDKFDQSKYLMMYNDNKTVDSKSVKIEVHLTTKNG >LR134268|791829:808596|795250_796369_-|VED72129.1|integrase|DBSCAN-SWA MITIEHNLNLSHNIYKDAKRGTYYFRITYYDKTNTRKYITRKGFAQRKDAVKQCNKMMDELEGIGEELKKLPFDKLVDEYIDWYSARRKSSSVKALKTHTNNHLLPYFKSMDVFNITTQDVMKFQNKKLKEGHSGDYLKKMHVYLVSLLNHAMKFHELKQNVASLVGNFEIESQKRLNYWTLEQFNQFYEALATQQQKLFFKLLFYSGARKGEIRALTWRDINFDDDFIHINKTDYHGEVTAPKTKSAIRDIYLPTHMMYDIKDYLIWYKENNIYKDDYVLFGTFYKAYSESTIDRWFTNALKVLDEQLPNGQNFPRIVIHELRHSHASMLVNLGASVMIIAQRLGHSDTTEVYNRYGHLYPSTQKEIVKYL |
22 | Staphylococcus_phage(70.59%) | integrase,transposase,terminase | attL 788727:788742|attR 809158:809173 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
841147 : 885088
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134268|841147:885088|DBSCAN-SWA AGTGGCCGAACACTCATTTGACGTTAATGAAGTAATCAAGGATTTTCCGATATTAGATCAAAAAGTCAATGGCAAACGTTTAGCATATCTTGATTCAACAGCGACAAGTCAAACGCCTGTGCAAGTGTTAAATGTTTTAGAGGATTACTACAAGCGTTATAATTCAAACGTTCATCGTGGTGTTCATACATTAGGATCATTGGCAACTGATGGGTATGAAAATGCCCGTGAAACCGTTCGTCGTTTTATTAATGCGAAGTATTTTGAAGAAATCATTTTTACACGCGGAACAACTGCGTCGATTAACCTTGTAGCACATAGCTATGGTGATGCAAATGTTGAAGAGGGCGATGAAATTGTTGTCACTGAAATGGAACATCATGCCAATATTGTTCCTTGGCAACAGTTAGCAAAACGTAAAAATGCGACATTGAAATTTATACCAATGACAGCTGACGGTGAATTAAACATCGAAGATATTAAGCAAACGATTAATGATAAAACAAAGATCGTAGCTATTGCACATATTTCTAATGTACTCGGTACAATTAATGATGTTAAAACCATTGCAGAAATAGCTCATCAACATGGTGCAATTATCAGTGTTGATGGGGCACAAGCAGCACCACATATGAAACTTGATATGCAAGAAATGAATGCTGATTTTTATAGTTTTAGTGGTCATAAAATGCTTGGACCAACAGGTATTGGCGTATTATTTGGTAAACGTGAGTTACTACAAAAAATGGAACCGATTGAGTTCGGTGGCGACATGATTGATTTTGTAAGTAAGTATGATGCAACATGGGCTGATTTACCTACTAAATTTGAGGCGGGTACTCCATTAATTGCTCAAGCAATTGGGCTTGCAGAAGCTATTCGCTATTTAGAACGCATAGGTTTTGATGCAATTCATAATTATGAACAAGAATTAACGATATATGCTTATGAGCAAATGTCTGCAATTGAAGGAATTGAAATTTATGGCCCGCCAAAGAATCGTCGTGCAGGTGTAATAACGTTTAATTTACAAGATGTACATCCACACGATGTTGCTACAGCCGTAGATACAGAAGGTGTAGCAGTTAGAGCTGGGCATCATTGTGCGCAACCGTTAATGAAATGGTTAAATGTGTCTTCAACAGCTAGAGCGAGTTTTTATATATACAACACGAAAGAAGACATTGATCAGTTAATAAATGCCTTGAAACAAACGAAGGAGTTTTTCTCTTATGAATTTTAATAATCTAGATCAATTATATAGATCTGTCATTATGGATCATTATAAAAATCCTAGAAATAAAGGTGTATTAGATAACGGGTCTATGACAGTAGATATGAATAACCCGACATGCGGTGACCGTATACGACTAACATTTGATATAGAAGATGGCATTATAAAAGATGCTAAGTTTGAAGGTGAAGGTTGTTCGATTTCAATGGCAAGTGCATCGATGATGACACAAGCTGTTAAAGGTCATTCACTTGGAGAAGCAATGCAAATGAGCCAAGAATTTACGAAAATGATGCTTGGTGAAGACTATGTGATTACAGAAGAAATGGGAGATATTGAAGCATTGCAAGGTGTATCTCAATTCCCAGCTCGTATTAAATGTGCCACATTAGCTTGGAAAGCATTGGAAAAAGGTACTGTTGCTAAAGAAGGTAAAGCAGAAGGTACGACTGAAGAAGAATAGAATGCTGTTAATCATAGATGATTTTGATATTAGACATATAAAAGTATAAAAATTTTTATAAGATGTCATGTCATTGTTATAATATGGTTTACATCATGAATTAAAAACTTACGCACGCCGTTGTAAATATATTTTTAAGGAGTGATTGAAATGGCTAAAAAAGCACCTGATGTTGGGGATTATAAATATGGATTCCACGACGATGATGTGTCCATTTTCAGATCAGAACGTGGTTTAACTGAGAATATCGTTAGAGAAATTTCTAACATGAAAAATGAGCCGGAATGGATGTTAGATTTCCGTCTTAAATCATTAAAATTGTTTTATAAAATGCCAATGCCTCAATGGGGTGGCGACTTATCAGAATTGAATTTCGATGACATTACTTACTATGTAAAGCCTTCAGAACAAGCTGAACGTTCATGGGATGAAGTGCCAGAAGAAATTAAAAGAACTTTCGATAAATTAGGAATTCCTGAAGCTGAACAAAAATATTTAGCTGGCGTTTCTGCTCAATATGAATCTGAAGTTGTTTACCATAATATGGAAAAAGAACTTGAAGAAAAAGGTATTATCTTTAAAGATACAGATAGTGCTTTACAAGAAAATGAAGAATTATTCAAAAAATACTTTGCTTCTGTAGTACCTGCAGCAGATAACAAATTTGCGGCGTTAAACTCAGCAGTATGGTCAGGTGGTTCGTTCATTTATGTACCTAAAAATATCAAACTAGATACGCCACTACAAGCTTATTTCCGTATTAACTCTGAGAACATGGGTCAATTTGAACGTACATTAATCATTGCTGATGAAGGTGCTTCTGTACATTACGTAGAAGGTTGTACTGCACCAGTTTATACAACTAGTTCTTTACACTCTGCTGTTGTGGAAATCATTGTGCATAAAGATGCGCACGTTCGTTATACTACGATTCAAAACTGGGCGAACAATGTATACAACTTAGTTACGAAACGTACTTTTGTTTATGAAAACGGAAATATGGAATGGGTAGATGGTAACTTAGGTTCTAAGTTAACGATGAAATATCCAAACTGTGTTCTTTTAGGTGAAGGTGCAAAAGGTAGTACATTATCTATTGCATTTGCTGGTAAAGGACAAGTTCAAGATGCCGGTGCTAAAATGATTCATAAAGCGCCAAATACATCTTCAACGATTGTTTCTAAATCTATTTCTAAAAATGGTGGTAAAGTTATTTATCGTGGTATTGTACATTTTGGACGTAAAGCAAAAGGCGCTCGTTCAAATATTGAGTGTGATACATTAATCTTAGATAACGAATCAACATCAGATACAATTCCATATAACGAAGTATTCAACGATCAAATATCATTAGAACATGAAGCGAAGGTTTCAAAAGTTTCTGAAGAACAATTATTCTATCTAATGAGTCGTGGTATTTCTGAAGAAGAAGCGACAGAAATGATTGTTATGGGATTCATCGAACCATTCACAAAAGAACTTCCAATGGAATACGCGGTCGAAATGAACCGTTTAATCAAGTTCGAAATGGAAGGTAGTATTGGATAGCTTTAAACCGCGTTGTTAAGCCATTCTTAACTTCCGGAAATGGCTATTGATACCATTTTGATACCATTTACTTGTCAAAAATGGCTATTGCATCGTGTTTTTTCTGAGTGTATAAATGGCTGTAAGTGCCCATCGTTTCAGTGATTTGAGCATGTCTCATGAGTGACTGTAAAACGAAAATATCTACACCATTATTTGCAAGATAAGATGCATAAGAATGTCTTAACGCGTGAATGTTATAATGGGGGAAAGCTTTTTGAAATTTCTTTTGAACATGACTGTAATGTTTGGGAGCCATTCCTCCGAAAATAAAATAACTACGTTCATCAAAATATTTGTTTAACTCTTTTTCACGTTGATGTCGTTCAGTTAACATTGTATTGATGAATTTAGGTAAAGGAACAATATCCTCTGAACTATCTGTTTTTGGTCTCGGATATATAGTTCTATTAGAGATGTCCATTGTTTTATTTATGGATATCTCTTTTTTGTATTTATTGTAGTCTGTCCAAACAAGAGCCATAGCTTCGCCAATCCTTAAACCTGTATAAAACATTAATGTAAATAACTCTCTGTAATCTTGCTCTTCAATGTCTTTGATTCTTTCTTCAAATTCTTCACGCATCATAAACTTAGGTTTTGGCTTTACACGCGGAATAGGTTTAATTGATATTGTTGGATCTGTACGTAATCCAAAGTATTTTTTGGCATAATTAATTACAACTTTAAAACCTGACCAAATTGTACGAGCAGAATTTGTTGATGCTACATTCTCTATTAGATATTTACGAAACTCTTGGCATTGATTTTGCGTTATCTTATTCATTTTTATGTGCCCGAACTTAGCTTTAAAATGTTTATGATATTCATTTTGTTTGCGTCGTTTTGTTTTAGGTCTCAAATCGCTATTTTCTAAGTAGTGATGAAAAACATAATCAAATGTTTTCGAATCACTATATCCTTCGTTTACGTCATTCAAAAAAATAGCCTCTGCTCTCTTAGCTTCACGCTTAGTTGAAAAACCGCGTTGCATCTTACGTTTGTTATTACCGTATACATCTTTATATCTAATGGAAAAATACCATTTACCTGTATTATCATCCTTATATACTGGCATTTTACTTCTCCCTCCTCAAAATTGGCAAAAAATAATAAGGGTAGGCGGGCTACCCGTGATTTATTCTTGTAAAAGTAATCAATTTAACTTATAATATATTTAAGATAACTCGAGAAGGATTAACGCTGGGTCCCAAAATGGGGTAGGTGCATAAGCACTGAGCATTCCTATGTGCCTGGGGTTATCTTTTTTTATTTCTTAAACTATCAACAAACTTTGTTGGATTCTTTCTTATTAGACTAATAATAAACTCAATGAATTGTTGAGAATACGTGAAAGACTCTTGTTTCCCTATTGTATGCTTATATGCATATTTTTCATCACTTTTGATATCATAAAAATCAATTATTAAATTCAATACATATTGATTGAACCCTTTAGAATAAGACATGTTTATGCTTTTCTTCTTAAGTCTTTCGTTTACTGCTGTAATCACGTTTTTAAATGAATATTTATGTGTATCTGATGGATCTTTATATTCTTTTACAAAATCTACTTTGTTATCTGCATCTTTATGAACAGCTACTAGGAAATCAGCATTTTCTGTCTTCTTTGTAATATACAAATTTTGTTTGATACCAATTGAAAATTTATCAGAATTATATTCATTACTTAAAACATCTATATCATTGGATTCT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77 | Staphylococcus_virus(49.33%) | holin,tail,portal,capsid,terminase,head | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_5 |
1042614 : 1051086
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134268|1042614:1051086|DBSCAN-SWA AGTGAAAGTAGCAGTCATTATGGGCAGTTCTTCCGATTGGAAAATTATGCAAGAGAGTTGTAACATGTTGGATTATTTTGAAATTCCGTACGAAAAACAAGTAGTATCCGCACATCGTACGCCAAAAATGATGGTTCAATTTGCTTCTGAAGCGAGAGAAAGAGGTATAGACATTATCATTGCAGGCGCTGGCGGTGCGGCACATTTACCAGGTATGGTTGCATCATTAACAACGCTACCAGTTATTGGAGTACCAATTGAAACAAAAAGTTTAAAGGGTCTAGATTCTTTATTATCTATTGTTCAAATGCCAGGAGGTATTCCGGTTGCAACGACTGCAATTGGTGCAGCAGGTGCTAAAAATGCAGGTATACTTGCAGCAAGAATGTTAAGTATTCAAAAGTCTTCTTTAGTTGAAAAACTAAATCAGTATGAATCTTCGTTAATTCAAAAAGTGGAGGACATGCAAAATGAACTTCAATAAATTAAAGTTTGGTGCGACTATTGGCATTATTGGTGGTGGTCAGCTTGGAAAGATGATGGCACAATCAGCTCAAAAAATGGGTTATAAAGTGGCTGTATTGGATCCTGCTGAAGATTGTCCATGTAGATACGTTGCACACGAATTTATACAAGCTAAGTATGACGATGAAAAGGCACTCAATCAATTAGGACAAAAATGTGATGTGATTACTTATGAATTTGAAAACATTTCAGCCCAACAATTAAAACTATTATGTGAAAAGTACAATATTCCGCAAGGTTACCAAGCTATACAGTTATTACAAGACCGCTTAACTGAAAAAGAAACATTAAAAAGTGCTGGTACCAAAGTTGTCCCATTCATTTCAGTAAAAGAATCTACAGATATTGACAAAGCAATTGAAACATTAGGATATCCTTTTATTGTAAAAACTAGATTTGGTGGCTACGATGGCAAAGGTCAAGTTTTAATTAACAACGAAAAAGACTTACAAGAAGGTTTTAAATTAATTGAAACTAGTGAATGCGTAGCTGAAAAATATTTGAATATCAAGAAAGAAGTATCACTTACTGTTACAAGAGGAGACAACAATCAAATCACTTATTTCCCATTACAAGAAAATGAGCATAGAAATCAAATACTTTTCAAAACAATTGTTCCAGCGAGAATAGATAAAACAGCTGAGGCGAAAGAGCAAGTTAATAAAATTATCCAATCGATTCATTTCATTGGAACATTTACAGTTGAATTTTTTATAGATAGTAACAACCAATTGTATGTGAACGAGATTGCACCAAGGCCTCACAATTCCGGACATTATTCAATTGAAGCGTGTGATTATTCACAATTTGATACTCATATTTTAGCAGTTACCGGACAATCATTACCAAATTCAATTGAATTATTAAAGCCTGCAGTCATGATGAACTTACTAGGTAAAGACTTAGATTTATTGGAAAATGAATTTAATGAACATCCAGAGTGGCACTTACATATTTATGGTAAGTCTGAGCGTAAAGATAACAGAAAAATGGGTCATATGACTGTACTAACGAATGATGTAAACCAAACTGAACAAGATATGTACGCTAAATTTGAGGGGAGTAATTAAAGCATGACATTATTATATGAAGGAAAAGCGAAGCGCATTTTCTCAACAAATCAAGAAAATGAATTAAGAGTTGAATATAAAGATGAAGTTACTGCTGGAAACGGTGCTAAGAAAGACACAATGGCAGGTAAGGGGCGATTAAATAATCAAATTACTTCTATTATATTTAAATATTTACAAGAAAATGGAATAGAAAGTCACTTTATTAAGCAATTATCTGAAACAGAACAATTAGTTAAGCCTGTGAAAATAATTCCATTAGAAGTAGTTGTTCGTAATATTGCTAGCGGATCTATTACAAAGCGTTTAGGTTTTGAAAATGGTGAAGTTTTTAGAGAACCACTTGTGGAATTTTTCTATAAAAATGATGCATTAAATGATCCTTTGATTACAGATGATCACATCAAATTACTGAATATTGCGACAGATAAAGATATTGAAACATTAAAAACGAAAGCGCTAGAAATTAATAAAGTATTAAAACAATTAATGGATGCGATGAATTTAAAATTAGTAGATTTTAAAATCGAATTTGGAAAGACTGAGACTGGTCAAATTTTGTTAGCGGATGAAATATCTCCAGATACATGTCGAATTTGGGATAAAGCTACCAATGCAAACTTTGATAAAGATGTATATAGAAATAACACTGGATCACTGATTGAAACATATCAAATATTTTTAAACAAATTGGAGGATTTAAAATAATGAAAACAATTGAACTACATATCACATTACAACCACAAGTATTAGATACGCAAGGACAAACGCTTACTCGAGCTGTACATGATTTAGGTTATGCACAAGTGAATGATATTCGTGTAGGAAAAGTATTATATATGACAGTGGATGAGGTTAGTGATGAAAAGGTACACAACATTATTACAACTCTAAGTGAAAAATTGTTTGCAAATACAGTGATTGAAGAATATAGCTATAAAGTGTTAGATGATGAAAAGGAGAATGCATAAAATGAAATTTGCGGTTCTTGTTTTTCCAGGTTCGAATTGTGATAGAGACATGTTTAATGCTGCTATTAAAAGTGGTGTTGAAGCGGAATATGTAGATTATAGAGAAACATCACTAAGTGGATTTGATGGCGTACTTATTCCTGGTGGATTTTCATTCGGGGATTACTTAAGATCTGGGGCAATGGCTAGTGTAGCGCCGATTATTTCTGAAGTTAAACGTCTTGCAGCTGAAGGTAAGCCAGTATTAGGTGTTTGTAATGGGTTTCAAATTTTAACTGAAATTGGCTTATTACCTGGTGCATTATTGCATAACGATTCACATTTATTTATTAGTAGAAATGAAGAGTTAGAAATAGTGAATAATCAAACGGCATTTACAAATCTTTATGAACAAGGTGAAAAAGTTATATATCCTGTAGCTCACGGTGAAGGTCATTATTATTGTACTGATGAAATATATCAACAATTAAAAGCTAACAATCAAATTATTCTGAAATATGTGAATAATCCGAACGGTTCATATGATGATATTGCAGGAATTGTTAACGAAAAAGGCAATGTGTGTGGCATGATGCCACATCCTGAAAGAGCTTTAGAAACGTTGTTAGGTACTGATAGTGGTGTGAAATTATTTGAAGCGATGGTAAAAAGTTGGAGGGAACAACATGTCTAAATTTATCGAACCAAGCGTTGAAGAAATTAAACTTGAAAAAGTATATCAAGATATGGGATTAAGTGATCAAGAATATGAAAAAGTTTGCGATATTTTAGGCAGACAACCTAACTTTACAGAAACAGGTATCTTTTCTGTTATGTGGAGTGAACATTGTTCTTATAAACATTCTAAACCGTTTTTAAAGCAATTTCCTACGTCAGGTGAGCATGTGCTTATGGGTCCAGGTGAAGGTGCAGGGGTAGTCGATATCGGTGATAATCAAGCCGTAGTATTTAAAGTAGAATCTCACAATCATCCATCAGCAATTGAACCATACCAAGGGGCTGCTACAGGCGTTGGTGGAATCATTCGTGACATTGTCTCTATTGGGGCTAGACCTATTAATTTGTTAAACAGTCTTAGATTTGGAGAATTAGATAATAAGCAAAACCAACGATTACTTAAAGGTGTTGTTATAGGGATTGGTGGCTACGGTAACTGTATTGGTATACCAACAACAGCTGGTGAAATTGAATTTGATGAACGATACGATGGCAATCCACTAGTTAATGCAATGTGCGTTGGTGTTATCAATCACGACATGATTCAAAAAGGCACAGCAAAAGGTGTAGGTAATTCGGTCATTTATGTTGGTTTGAAAACTGGTCGAGATGGTATTCATGGTGCTACTTTTGCATCTGAAGAATTGACGGAAGAAAGCGAAAGTAAACGACCTTCTGTACAAATCGGTGATCCATTTGTAGGTAAAAAATTAATGGAAGCAACACTTGAAGCAATTACATTTGATGAATTAGTTGGTATTCAAGATATGGGTGCTGCTGGTTTAACATCTTCATCTTCTGAAATGGCGGCAAAAGGTGGTAGTGGTTTACATTTGAGATTAGAACAAGTGCCAACACGTGAGCCAGGTATTTCTCCTTACGAAATGATGCTTTCAGAAACTCAAGAACGTATGTTACTAGTTGTTGAAAAAGGTACTGAACAAAAATTCTTAGATTTATTTGATAAGCACGAATTGGATAGTGCTGTTATAGGTGAAGTTACAGATACAAATCGTTTTGTTTTAACATATGAAGACGAAGTTTATGCTGACATTCCAGTTGAACCACTAGCTGATGAAGCACCTGTATATATTTTAGAAGGAGAAGAAAAAAATTATAATACTTCTAAAAATGATTATACACACATCGATGTTAAAGATACTTTCTTTAAATTACTTAAACATCCGACTATAGCATCTAAACACTATTTATATGATCAATACGACCAACAAGTTGGTGCCAATACGATAATTAAGCCAGGACTTCAAGCATCGGTAGTTCGTGTGGAAGGCACAAATAAGGCAATTGCTTCAACAATTGATGGTGAAGCGCGTTATGTATATAACAATCCATATGAAGGTGGAAAGATGGTAGTAGCTGAAGCTTATCGTAATTTAATTGCGGTTGGAGCTACACCATTAGCAATGACTGACTGCTTAAATTATGGTTCTCCTGAAAAGAAAGAAATTTATCAACAGCTGATAGATTCAACGAAGGGTATGGCAGAAGCATGCGAAATTCTTAAGACACCAGTAGTTTCTGGTAATGTATCTTTATATAACGAAACGAAAGGTACTTCTATTTTCCCAACACCAGTTGTTGGAATGGTAGGTTTGATTGAAAATGTAAATTATTTAAATGATTTTGAACCTCAAGTTGGAGATAAATTATATTTAATCGGTGATACTAAGGACGACTTTGGTGGTAGTCAACTTGA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134268|1042614:1051086|1042614_1043097_+|VED73053.1|DBSCAN-SWA MKVAVIMGSSSDWKIMQESCNMLDYFEIPYEKQVVSAHRTPKMMVQFASEARERGIDIIIAGAGGAAHLPGMVASLTTLPVIGVPIETKSLKGLDSLLSIVQMPGGIPVATTAIGAAGAKNAGILAARMLSIQKSSLVEKLNQYESSLIQKVEDMQNELQ >LR134268|1042614:1051086|1044211_1044916_+|VED73059.1|DBSCAN-SWA MTLLYEGKAKRIFSTNQENELRVEYKDEVTAGNGAKKDTMAGKGRLNNQITSIIFKYLQENGIESHFIKQLSETEQLVKPVKIIPLEVVVRNIASGSITKRLGFENGEVFREPLVEFFYKNDALNDPLITDDHIKLLNIATDKDIETLKTKALEINKVLKQLMDAMNLKLVDFKIEFGKTETGQILLADEISPDTCRIWDKATNANFDKDVYRNNTGSLIETYQIFLNKLEDLK >LR134268|1042614:1051086|1049488_1050517_+|VED73074.1|DBSCAN-SWA MSKAYEQSGVNIHAGYEAVERMSSHVKRTMRKEVIGGLGGFGATFDLSQLNMTAPVLVSGTDGVGTKLKLAIDYGKHDSIGIDAVAMCVNDILTTGAEPLYFLDYIATNKVVPEVIEQIVKGISDACVETNTALIGGETAEMGEMYHEGEYDVAGFAVGVVEKDGYVDGSEVKEGQVVIGLASSGIHSNGYSLVRKLINESGIDLASNFDNRPFIDVFLEPTKLYVKPVLALKKEVSIKAMNHITGGGFYENIPRALPAGYAARIDTTSFPTPKIFDWLQQQGNIDTNEMYNIFNMGIGYTVIVDEKDASRALKILAEQDVEAYQIGHIVKNESTAIELLGV >LR134268|1042614:1051086|1043083_1044208_+|VED73056.1|DBSCAN-SWA MNFNKLKFGATIGIIGGGQLGKMMAQSAQKMGYKVAVLDPAEDCPCRYVAHEFIQAKYDDEKALNQLGQKCDVITYEFENISAQQLKLLCEKYNIPQGYQAIQLLQDRLTEKETLKSAGTKVVPFISVKESTDIDKAIETLGYPFIVKTRFGGYDGKGQVLINNEKDLQEGFKLIETSECVAEKYLNIKKEVSLTVTRGDNNQITYFPLQENEHRNQILFKTIVPARIDKTAEAKEQVNKIIQSIHFIGTFTVEFFIDSNNQLYVNEIAPRPHNSGHYSIEACDYSQFDTHILAVTGQSLPNSIELLKPAVMMNLLGKDLDLLENEFNEHPEWHLHIYGKSERKDNRKMGHMTVLTNDVNQTEQDMYAKFEGSN >LR134268|1042614:1051086|1044915_1045179_+|VED73062.1|DBSCAN-SWA MKTIELHITLQPQVLDTQGQTLTRAVHDLGYAQVNDIRVGKVLYMTVDEVSDEKVHNIITTLSEKLFANTVIEEYSYKVLDDEKENA >LR134268|1042614:1051086|1048011_1049496_+|VED73071.1|DBSCAN-SWA MFNYSGLNEECGVFGIWNHPEAAQLTYMGLHSLQHRGQEGAGIVVSDQNELKGERGLGLLTEAIKDDQMERLKGYQHAIGHVRYATSGNKGIENIQPFLYHFYDMSVGICHNGNLINAKSLRQNLEKQGAIFHSSSDTEVIMHLIRRSKAPTFEEALKESLRKVKGGFTFAILTKDALYGAVDPNAIRPLVVGKMKDGTYILASETCAIDVLGAEFVQDIHAGEYVVINDKGITVKSYTHHTTTAISAMEYIYFARPDSTIAGKNVHAVRKASGKKLAQESPVNADMVIGVPNSSLSAASGYAEEIGLPYEMGLVKNQYVARTFIQPTQELREQGVRVKLSAVKDIVDGKNIILVDDSIVRGTTIRRIVKMLKDSGANKVHVRIASPEFMFPSFYGIDVSTTAELISASKSPEEIKDYIGADSLAYLSVDGLIESIGLDYDAPYSGLCVESFTGDYPAGLYDYEANYKAHLSHRQKQYISKNKHFFDSEGNLNV >LR134268|1042614:1051086|1050519_1051086_+|VED73077.1|DBSCAN-SWA MVKIAIFASGSGSNFENIVDHVELGKLENIEVTALYTDHQNAFCIDRAKKHDIPVYINEPKQFDSKAAYEQHLVTLLNKDKVEWIILAGYMRLIGPDLLASFEGKILNIHPSLLPKYKGIDAIGQAYHSGDTITGSTVHYVDSGMDTGEIIEQRQCDIRPDDSKEQLEEKVKKLEYELYPSVIAKIVK >LR134268|1042614:1051086|1045844_1047941_+|VED73068.1|DBSCAN-SWA MSKFIEPSVEEIKLEKVYQDMGLSDQEYEKVCDILGRQPNFTETGIFSVMWSEHCSYKHSKPFLKQFPTSGEHVLMGPGEGAGVVDIGDNQAVVFKVESHNHPSAIEPYQGAATGVGGIIRDIVSIGARPINLLNSLRFGELDNKQNQRLLKGVVIGIGGYGNCIGIPTTAGEIEFDERYDGNPLVNAMCVGVINHDMIQKGTAKGVGNSVIYVGLKTGRDGIHGATFASEELTEESESKRPSVQIGDPFVGKKLMEATLEAITFDELVGIQDMGAAGLTSSSSEMAAKGGSGLHLRLEQVPTREPGISPYEMMLSETQERMLLVVEKGTEQKFLDLFDKHELDSAVIGEVTDTNRFVLTYEDEVYADIPVEPLADEAPVYILEGEEKNYNTSKNDYTHIDVKDTFFKLLKHPTIASKHYLYDQYDQQVGANTIIKPGLQASVVRVEGTNKAIASTIDGEARYVYNNPYEGGKMVVAEAYRNLIAVGATPLAMTDCLNYGSPEKKEIYQQLIDSTKGMAEACEILKTPVVSGNVSLYNETKGTSIFPTPVVGMVGLIENVNYLNDFEPQVGDKLYLIGDTKDDFGGSQLEKLIYGKVNHEYESLDLSSEVEKGESIKTAIREGLLSHVQTVGKGGLLITLAKLSAHYGLGLKSSIDITNAQLFSETQGRYVVSVKSGKTLNIDNAIEIGLLTDSDNSK >LR134268|1042614:1051086|1045180_1045852_+|VED73065.1|DBSCAN-SWA MKFAVLVFPGSNCDRDMFNAAIKSGVEAEYVDYRETSLSGFDGVLIPGGFSFGDYLRSGAMASVAPIISEVKRLAAEGKPVLGVCNGFQILTEIGLLPGALLHNDSHLFISRNEELEIVNNQTAFTNLYEQGEKVIYPVAHGEGHYYCTDEIYQQLKANNQIILKYVNNPNGSYDDIAGIVNEKGNVCGMMPHPERALETLLGTDSGVKLFEAMVKSWREQHV |
9 | Synechococcus_phage(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_6 |
1791135 : 1868423
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134268|1791135:1868423|DBSCAN-SWA TATGTATCAAACAATTATTATCGGAGGCGGACCTAGCGGCTTAATGGCGGCAGTAGCTGCAAGCGAACAAAGTAGCAATGTGTTACTCATTGAAAAAAAGAAAGGTCTAGGTCGTAAACTCAAAATATCTGGTGGCGGTAGATGTAACGTAACTAATCGATTACCATATGCTGAAATTATTAAGAACATTCCTGGAAATGGGAAATTTTTATATAGTCCCTTTTCAATTTTTGATAATGAATCCATCATAGATTTTTTTGAGTCTAGGGGTGTTAAATTAAAAGAAGAAGATCACGGGCGGATGTTTCCAGTTTCCAACAAGGCACAAGACGTCGTTGATACTTTAGTGACAACTATAGAAAAACAACATGTAACAGTTAAGGAAGAAGAGGCAGTGAGTCGCATCGAAGTAAAAGAAGATCAAACCTTTACAGTACACACTCAAATTAATAGTTATGACAGCCATTCGCTAGTAATCGCAACTGGTGGAACAAGTGTCCCTCAAACTGGTTCAACAGGTGATGGTTATAAATTCGCTCAAGATTTAGGTCATACCATCACTGAATTATTCCCTACTGAGGTATCTATTACATCAGCTGAACCTTTCATCAAATCCAATCGTCTAAAAGGTTTAAGTTTAAAAGATGTTGAATTGTCAGTACTTAAGAAAAATGGTAAAAAACGCATTAGTCATCAAATGGATATGTTATTTACTCATTTTGGTATCAGTGGTCCAGCTGCATTAAGATGTAGTCAGTTTGTTTATAAAGAACAAAAAAATCAAAAAACACAATATGTTTCCATGGCAATCGATGCATTTCCTGAATTAAACCATGAACAATTAAAACAACACATCACATCATTATTATCCGACACACCAGATAAAATCATTAAAAACAGCTTGCATGGACTAATTGAGGAACGCTACTTACTGTTCATGTTAGAACAAGCTGGCGTTGATGAAAATATCACTGCACACCACTTATCAAATCAACAATTGAACGACTTAGTAAATATGTTTAAAGGGTTTGTATTTAAGGTAAACGGAACATTACCTATAGACAAGGCGTTTGTCACTGGTGGCGGTGTATCACTTAAAGAAATCCAACCTAAAACAATGATGTCTAAATTAGTTCCCGGATTATTTTTATGCGGCGAAGTATTAGATATACATGGTTATACTGGTGGTTATAATATTACAAGCGCACTCGTAACAGGACATGTCGCTGGATTATATGCCGGTCATTACGCACATGCATCAATGGAATAATAGTATAAAATTTGGTTTAATTCTCTTTAGTAGATCAACTTTTTCATTCAATTAAAAATGACCTTAATATAACTGAGTCACTAAAAAGTGTTGTTATATTAAGGTCATTTCGTTAATTATGATTCTTTTTCATTTTTAGTACGTCTTCTAGCTAATAATGCTGCGCCTGTAATTAGTGCTAATTCTTTTAATGGTAAATCCATTTCTTCAGAACCAGTATTTGGAAGTTCTTTTTCAACTTTGCGCACTTCTTGTTTATCTTCTTTTTTAATAGGCGTACAAACTTTTGGAGCAAGTTGCCCCACTTTTGGTGACGCTTTTATCACTTCAGCAGGTAATTTAATTGCTAAAATTTCATCAATAATGAATTGCGTATGTTGTTTGATGTCATTTAATGTCGCATCTTCATCGATCATTCTATTACCATCTGCAACATATTGATCTATTAACGCTTTCACTTTAGCCAATTGTTCTGGTGTTGCAATCGCTTTGAATTTCGCATAGGTTTGTTGCGCAATATTTTCAATGCGCATTAAGCTATGTTCTTTTTCAGTAATTACTGCTTCTATATCGCCTAATGCAACATTAAATCGTTTTAAAACCGCATCAACATCAGCATTAGTGCGTGCTGTTTTTAATTCTTCATCCATTTGTAATTTTAATGCAGTTATAGCTTTTAATGCATCTGCCTTATTACGATCACTTACTTTTCGATAATTTTGTACTAAATGCGTAACACGTGCAATATCTTGGTTGATTGTTTTTTCGGCCTCCGGTTTTTTAACAGGATGCACATCTAAACCTTGTATTGTTTGAAGATTAAATGATGCTGTTTTATCCACTTGTGCATTGCTACGGTCATGATCAAGTTGTCCGATTGCTGCGTCATAAATATTTTGTAACTGTGCTAAAACACTATTTCTTTCTTCTACCGTTGCTTGAACATTCGCTTCAATTGCTTGTTTTTTATCATTGAGCAATGTTGTCAATTGTTCTCGAGCAGACGCCTTTCTGTTAATAACAGGTTCGATTTCACGAATTTCGTTTTTCCCATCATGCAATAAATATGCCACATCAGCATTAGTCACTGCACTAGCAATGTGTTGTTTCGCTTTTATTAATGCTTGTTCTACTTGTGCTATTGCAGCATTTTGTTCTTCATCTGTCGCTTCATTATTTGATTTGATTAAATTAATTTTATGAGTAGCGATATTTTGAATTTGTTGTAACGCTGTTGTTTTAACTGTTGTCGCTGGTTTAATTTTTGAAATAATATTTTGAGCATCGATACTATTTTGATTAACTTGCGCAGTCTTATCTGCATGATTGATCTGATCAATAGCCTGATTAAGTGCTTGTTCTACTAAATGTTTAGCAGCTAATCTTTCTTCTTCGGTAGATAAATCACTTTGATCAATAAGTGCATTTTGAGCTTCAGCTTTTGCGCTGACAGATTGACGCGCTGCTGGTTTAACTTGAACTTTAGGTAAAATCACTTTGATGTTGTTGTTACCATCAGCCTCAGTTTGATCCACTTCTGCATTCGTTTTGTTTTGTGCAATATCATTTTTAATTGCATTAACAATTTTATTTAACGCAGCAATAGCAACATTTCGTTCATCTTGCGTTGTATCTAGCGTATTTCGTATTGCATCGAGTTGATTATTATTACTTTCATCAATGTTATCCAACGCTGCACGTTTGCGTCTAACTTTCGGTTTAATTTGTTCGATTGCCTTAATCGTTTGATTTCTAACATCATTGACAGCTGCATCTTGTGTCGTATTGTCTATATTTTGTTGACCTTGTTTAAGTGTGTCGTTAATTTGTTGGTTTGCTTCATCTAATTCATCAGTCGTAGCATGTGGTGTATCTTTTATAGATTCTACTTGGTTAACTGCGCTCGCTTTTATGGCTTCTTGAGCTTCAGGTTTAACCACAATGTGCGGTTCTACGCCTTTTAACGTAGCAATACCATTTGATTCAACACGTTTCACATCATTATTCGCTATTGCTTGATCGATGTTTTGTAATGCACGTTTTTCATTATTCGCTAATTGATTTAAAGCAACTTGTTTTTCTTCATCAGTCGCATGTTCCGCTTGCTCAATTTCGTGCTTTTTAACCTCATATTGTTGCTTTACTGCATCTCTAGCAGTTGCTCTAACAATATGGTCAGGCGTCACTAATGCAATGTCGTCAAGCGCTTGATTTGTTGAGTCATTAACTTGCTGATTTGTTCTATCATTTGTGATATTTGTCATAGCTTTAGCAACTAAATCATTGATTTTATCTAACGCCGCTTGTCTTTCTTCTGCTGTCGCTTCTTTATCTTGATTAATTTGCGCACGTAATTCATTCGCTTTTTGATTGATTTTTTCACGTGCTGCTGGTTTAACTTTTGTTTCAGGTTGAATCATTTTTATCGCAGTTATACCATCTGTTGCTGCTTGATTCACCTGACTATTCGTTTGAGCTTGGTCAATAGCTGCAAGTGCTTTTTCTTTTTCTTTAGCTAATGCTTGTAAAGCAACTTCTTTCTCATTATCTGTTGAATCAAGACTATTATCAATTTGCTGTTGCTTTTCTTTAACAGCTTTTTCAATATCTGCAATTGCCTTTGGTTTAATTACTACTTCAGCTTCAACATTATCTATAGCATTAATCGCTTGATTTGTAGTTGCGTCTACCTGATCATTTGTTTGGTTTTGATTAATTTGATTAAATGCTTGATCTTTAAGTTGATTGATTTGATTAACTGCAGCCTGCTTTTCTTCGTCAGTTGCATTAGGTGTTTGTTTAACCGCTTCAATACGCTTCGCCACTTCAGCAGTGATTTTATCTCGCGCTGCTTGTTTTTTTACTACGTCAACTTGAACAGCATCGATATTATTCTCTGCCACTGTCGCAGCTTGGTCTACTTCTGCATTTGTATTAGCTAGTTTAATACTTTCAATAGCTTGTTGTCTGTCTTGATTTAAAATGTTGATTGCAGCATTCTTCTCATCATCTGTTGCATCTGGTGTAGCATTGATTTCAGCTAATTTAGCATTATAATGCTGATTGATTTGTGCTAATACTGCAGGTTTTTTAACAATATTTGGCTGAATCGCATTCATTGCTTGTTTACCTGCTTGTAATGCTTGATCTACTTCTGCATTTGTATCAGCTTGATTTATATTATTAATTGCCGTTGCTAAATCTTGATCTACTTGATTTAATGCTACTTGCTTTTCTTCATCAGTTGCATTTGTGTTTTGATTAATTTCTTGCTTTTTAGCAGTTGCTAAGTCCGTTAATACACCTGTGGCTGATTGTTTCTTCGTTACATGCGGTTGAACTGTACCGATTTGATTGACTGCATCGTCTCTAATACTATTGACCATCGCAGTAGTAGACGTCACACCAATATCAGTTAATGCTCTATTTTTAAGTGTATTGACACGATCTATTGCTTCTTGTTTCTCTTCTCGAGTCGCGCCAGGTGTAGCATTGATATTTGATATCGCCTCACGTGCTTTTTCATTTACAGTATTACGAGCATCCGTTTTAACTTGTGTCGCCGGTTGAATCGCAAGTATATTTTGTGTGCCCTGATCTTTTGCTTGTGCAACTTCTTGATTCGTATCTGCTGCATTAATATTTTGCTTCGCTGTGGCTACAGCTTGATCAAGCAATTGTTGTGCTGCTTGTTGCTCTTCTAAGGTCGCATCATTATTATTAAATATCG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90 | Staphylococcus_phage(96.72%) | tRNA,transposase,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_7 |
2002272 : 2105748
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR134268|2002272:2105748|DBSCAN-SWA 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MKIFICEDDPKQRENMVTIIKNYIMIEEKPMEIALATDNPYEVLEQAKNMNDIGCYFLDIQLSTDINGIKLGSEIRKHDPVGNIIFVTSHSELTYLTFVYKVAAMDFIFKDDPAELRTRIIDCLETAHTRLQLLSKIIALKRLS |
149 | Staphylococcus_phage(75.49%) | holin,tail,terminase,capsid,head,protease,integrase,lysis,transposase | attL 1998396:1998415|attR 2056998:2057017 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_8 |
2464042 : 2505110
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LR134268|2464042:2505110|DBSCAN-SWA 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>LR134268|2464042:2505110|2470114_2471080_+|VED77942.1|DBSCAN-SWA MNLKLNRKKVISMIKNKILTATLAVGLIAPLANPFIEISKAENKIEDIGQGAEIIKRTQDITSKRLAITQNIQFDFVKDKKYNKDALVVKMQGFISSRTTYSDLKKYPYIKRMIWPFQYNISLKTKDSNVDLINYLPKNKIDSADVSQKLGYNIGGNFQSAPSIGGSGSFNYSKTISYNQKNYVTEVESQNSKGVKWGVKANSFVTPNGQVSAYDQYLFAQDPTGPAARDYFVPDNQLPPLIQSGFNPSFITTLSHEKGKGDKSEFEITYGRNMDATYAYVTRHRLAVDRKHDAFKNRNVTVKYEVNWKTHEVKIKSITPK >LR134268|2464042:2505110|2474532_2474802_-|VED77957.1|DBSCAN-SWA MYSIKMRSSNQDVHISGAETICEFDKIEQTVQRFYNKGFFHENGQPDFLNIKIQKIMEPIQQIKALQIIEDDKANLQNLTQECVSLNKR >LR134268|2464042:2505110|2474110_2474557_-|VED77954.1|DBSCAN-SWA MCVTEQALNQGMTYIKNETVYTGSIILSAISGKRLDSFGQRGIRATHFSFEDINNKGDLNERVTDALAIASCINAHPYVKGELCVSDDLTYTTGYFASAKIGYHRLFDIKPVNTRYGGRIIFVDDRIDLNHYISFLESTPKQVVYETV >LR134268|2464042:2505110|2476912_2478271_-|VED77969.1|DBSCAN-SWA 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>LR134268|2464042:2505110|2503883_2505110_-|VED78049.1|holin|DBSCAN-SWA MLSIKHLTKIYSGNKKAVDDISLDIQSGEFIAFIGTSGSGKTTALRMINRMIEATEGQIEIDGKDVRSMNPVELRRNIGYVIQQIGLMPHMTIKENIVLVPKLLKWTKEEKDKRAKELIKLVDLPESFLERYPAELSGGQQQRIGVVRALAAEQDIILMDEPFGALDPITRDTLQDLVKTLQRKLGKTFIFVTHDMDEAIKLADKICIMSEGKVVQFDTPDNILRHPANDFVRDFIGQNRLIQDRPNDKTVESVMIKPITIQAEATLNDAVHIMRQKRVDTIFVVDRDNHLLGFLDIEDINQGIRGHKSLRDTMQQHIYTVQIDSKLQDSVRTILKRNVRNVPVVDDQQRLVGLITRANVVDIVYDTIWGDSEDTVQTEHVGKDTASSKVHEQHTTNVKVRDIGDDKS >LR134268|2464042:2505110|2497570_2498176_-|VED78028.1|DBSCAN-SWA MAANTKVRIEGSKNLIDAAKKHDVKKVIAQSIAFMYEPGEGLANEETSLDFNSTGDRKVTVDGVVGLEEETARMDEYVVLRFGWLYGPGTWYGKDGMIYNQFMDGQVTLSDGVTSFVHLDDAVETSIQAIHFENGIYNVADDAPVKDSEFAEWYKEQLGVEPNIDIQPAQPFERGVSNEKFKAQGGTLIYKTWKDGMNPIK >LR134268|2464042:2505110|2472596_2473574_+|VED77948.1|DBSCAN-SWA 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>LR134268|2464042:2505110|2498298_2498421_-|VED78031.1|DBSCAN-SWA MSKIFVTGATGLIGIKLVQRLKEEGHEVAGFTTSENGQQS >LR134268|2464042:2505110|2496352_2497288_+|VED78025.1|DBSCAN-SWA MNYNGQNETITIKQLLAQTSGIPSDITSEDSVTNKNNRLNDVTRAIMGDELHHKPGKEFEYSNMNYDLLGLIIQNVTKQSYTKYITNSWLKPLHMTHTSFKQTNNKSKHDAIGYELQGSTPVVSKPEFNLWDTPSAYMMTSTEDLEHWIKFQLNPPNKYKSLVQQSHKNLSSTIGEPNANAYASGWFTNNDEHLVFHSGTLDNFSSFILLNPKQNYGIVVLANLNSEYVPKLVEHLNTQIVNHKRYSTVASMLNQYKDQFNIVTVLMTTLILLAFIFSAYRAWQMRHGKIILRKSKLTTFLSWLTLCYVSL |
43 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,holin | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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