Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134286 | Legionella oakridgensis strain NCTC11531 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DEDDh,RT,cas3,WYL,DinG,csa3,PD-DExK | 0 | 0 | 11 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR134286_1 | 1162502-1162593 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134286_1
|
1 spacers
spacers of LR134286_1
>1.1|1162525|46|LR134286|CRISPRCasFinder AAATCCATAACGTATTCGGAAATAATGCCAGTAACCAATGTAAGGT |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134286_1
The CRISPR arrays of LR134286_1 >merge|LR134286|1|1162502-1162593|CRISPRCasFinder TATTAATGCTAAAAAAAAGACTGAAATCCATAACGTATTCGGAAATAATGCCAGTAACCAATGTAAGGTTATTAATGCTAAAAAAAAGACTG >LR134286|1|1|1162502-1162593|CRISPRCasFinder TATTAATGCTAAAAAAAAGACTG AAATCCATAACGTATTCGGAAATAATGCCAGTAACCAATGTAAGGT TATTAATGCTAAAAAAAAGACTG
>LR134286.1|VEE01851.1|1161990_1162179_+|transposase MQAAVDYLRAQGEVINEEDEKRLSPLGLKYVNLLGYFSFMLPKVVAEGQLRPLNVAEKLGLA >LR134286.1|VEE01850.1|1160264_1160570_-|Putative-transposase MAMPFNRQEYFQSLIGFPIPSSTQWQLMEELAGCALLVFPALEILAANGSLIHNDDTVLRIIDTIRHNRLNPDKKRTGIYTTVLLAQNSAHKIALFYNSHC >LR134286.1|VEE01849.1|1159303_1160029_-|ABC-transporter-ATP-binding-protein MAALTAIAGLTSSLGNCFLAFVYNIGLLQDGLNLLKHQPDVADNKSASSHTISKGNVEIDDINLTCFTKDSLRSQIAIVPQHLNLFHRSIFENIAYGCRHVSKEEVIAAAKKAKCHDFITSLEHQYETIIGEQGVKLSGGQRQRIAIARAILKNAPILLFDEATSALDSATEQAIQEALETLLKDKTALIIAHRLSTLKAMDKILVLENGPIVESGSHNELLAVKEAYYNYWTQQSSEFIR >LR134286.1|VEE01848.1|1158648_1159257_-|dihydrofolate-reductase-and-methyltransferase MLAKCSVFIATSLDGFIARNNGSIDWLMKANTLVPPGEDGGYKEFISTVDGLIMGRHSFEMVLSFESWPYGDLPIIVLSSQPIEIPDRLKTNVSASSETPTDLVKRLTKRGFKRLYIDGGITIQNFIADNLISDLTITIAPVLLGSGRSLFGRLVHDIELEHLETKCIGGGFTQLKYRMHPIADTKAIKKKIRIRSTSFMMK >LR134286.1|VEE01847.1|1158085_1158610_-|methyltransferase MEKFYLDFLQNHIPSEGSVLDVGCGTGEPIAQFLIKRGYKVTGVDASKKMIDLCNKRFPNGKWLLSDMRTLNLQDKFHAVIAWHSLFHLPHDDQRMVLKSLSSLVEQNGLLLFTSGPEYGEVWGDNGGHDLYHASLSAEEYTQILLDCHFKVLIHKVRDPECGEATVWVAQKKG >LR134286.1|VEE01846.1|1156951_1157974_+|spectinomycin-phosphotransferase MLIKPDLKDEEIVRCLRNVYGLDVDKIFFLPLGADLNTAVYRVTTSTERDYFLKLRSGEFNEASVLVPKYLADLGFRQVIPPLTTTDGQFWTSLASFKVVIYPYVKGRNGVEVNLSDKQWIEFGATMKRFHSADIPQTITTGVQTETFSSKWHQTVRVFLGRIDNEVFEEPIATKMALFLKSQKGEILELIRCAEHLASKLQKQPHENILCHADIHGWNLFIDEGGALYVVDWDTLLFAPKERDLMFIGSGLGDSGRTPFEDEALFYNGYGPTNINDDAIAYYRCQRVIEDIGVYCEQIFLSDEGGEDRLQSFKYLQSNFLPNGTIERAFQSCKSRENQK >LR134286.1|VEE01845.1|1156253_1156532_-|SidC-homolog MYISSNEPTAPRYIHINPQTNKVHLLVPISYGDEINHADGCDKTTAALQDLFNREALDELDTYQHTLQLDIQLLDEGSEQRIAKEERLIQSI >LR134286.1|VEE01844.1|1155091_1156225_+|ABC-transporter-permease MARFSLFRLHGLVVKEFVQLKRDRFTMALIIGLPIIQLLLFGLAINVNPKHLPTALMNYDQGPFARTLIHGLENTNYFKFVYFPHTEKEAQYLLSTNQVKFILTIPSDFSRKLIRKEHPAALLEADGTDPVSVVYALSASNNLMSTVFNNDLIGSIHEPIQHQTPAELRTHINYNASAITQYNIVPGLLGLVLSMTFVMVSAMALARERERGNWECLLATSLKPLEVMIGKSLPLIVIGYLQVFIILIIAVSFFRIPFLGSLWLFLLIILPFILANLFVGILFSTFAKNQLEASQLSTLFMMPSLLLSGFAFPFKGMPYWAQFIGNLLPLTHFNNIVRGMMLKGIGFHEVMIDLGPILLFMCVSLFLALRFYKQTLD >LR134286.1|VEE01843.1|1154164_1155091_+|ABC-transporter-ATP-binding-protein MQVMNEQWIIDVYGLSKQFNGKMAVNELSLQIKQGEIFGFLGSNGSGKTTTIRMLCGLIQPDKGRGTCLGYDVISQAALIKSSLGYVPQTFSLYQDLTVEENLKFIARANNEKNYLNRINEIIGDLNLHPYRNVLAGNLSGGWKQQVSLAAALIHQPRLLLLDEPTSGVDPKTRQAFWSYISYLTTTGITVLVSTHYMDEAEKCNRLAYIVNGELMIQGTLDQMMQQVKLFAFLVEGSNLAHLANELQNKSQVEQVVHWGNSLRVCDSNAFLLKELIDAYPNYQWNAVTANLEEVFIHLVHSKISKGR >LR134286.1|VEE01842.1|1153335_1154181_+|hemolysin-D MLRCVFFLLIISLMNCSCSRQPLKQVNGYVEGRYTYIATSVSGRLIRLNVTRGTPVKRGQLLFNLEVEPELKEEQIAHARVKQAQNARDAIIAKLAYAKVTYERNKKLIEIKAIQQSLLDQEKSKYDVLLAQLAQAEDDLSALSLNLKQAQWRLQQNNSVAPIDGMVFDIYYRIGEYTHANQAVLSLLAPEDVKAIFYVNGLDVSALQLGQQISVFNAGHKESYKAQIDYISPSVEFTPPVIYSDQTHEKLTYRIEAKFRTQDAFHVHPGQPVTINYASHE >LR134286.1|VEE01853.1|1164380_1165547_-|RhoGAP-domain-protein-(GTPase-activator-of-small-GTPases) MAGPYNTHTIVNVFRSIVQLISQYQELLHTQGIFRIPGSKEEIERLLEQLIGDHFNVEVLSNYIMNENTVNNEHLHNVLGMISAMLKESQILASTDDLLVSFSKKLKSLLESHQEEDIKNTIAAQLLDNFISDLLLSKRIDHQRAGEILYHYFHLMHQVGKYQEINFMTYNNLAIIIAPGLTNELSLYTGNNLLDLTSYVSQLTPVLENYIAETKWDCDFKKYHADKLDHLENTRYSLREQLEHMKEASRKSVTTPMKSYMLQASMIKAQIDAIKEVQQDHSLKKKAKKKLGKQLDPLQEEQSDLLSKISELAPKIKAMNSGQQQIQKEIDMLTHSGNRVTSCENPSNNSNLVQFSIFEPSSSNACTVLPTIPEEKEEFEDQEEYIHQ >LR134286.1|VEE01854.1|1165855_1166287_+|Uncharacterised-protein MDTNIELNAMNPSESRSNEEIGTTDEVVNATSEDVYKYQKISLLIPKLITTIEQIEMLDQNTEMNIELKKSRKRLASIVIDNTSPNAEDIKEFTDSLSSALYGLSTGMSLIDMRGMIPEKKNRAVDLFADISLIQEDIVKLAS >LR134286.1|VEE01855.1|1166484_1169460_+|rtx-repeat-protein MPTTRKLDWNKVALAAKKLGKEIGTALMGVITTPLNAIGATAEFAKETGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQKTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQKTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKIGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNGLVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNRLVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWLQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNGLVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPAVKSGAETAYTSTKNALVQAGNWIQNTGWPDVKSAAQNAFKAARDFCSSKISQLSDKVAELHDKAVEKIDKYLDDYLADDGGGLLLSSPKSSSSVTNILSDDAYTSPGTSRDNVSEKDNDKGNTIERRLG >LR134286.1|VEE01856.1|1169771_1171379_+|Virulence-factor-mviN-homolog MSNDKTLNVKATGTVALAIMVSRVLGLIREVLFNALFGSAAMGIFLIAFRAPNLLRDLFAEGALSVSFITVFSKKIETEGDQSAWQLASKMLTLTSIFMSVLCLLGIIFAKYIIFILAPGFSANDIETTVFLTQLMFPFILLVSLAAIVMGMLNSKNVFGVPALASSFFNMGSILGGALCGWLIDPSFGERALIGLSVGTVIGGLLQLGVQFPSLRKVGFRFRPNFHWYDSGIRKTLILTIPAVIAASAVQVNVLINSGFASYLGKEAVTWLNSAFRLMQFPLGMLGVAIATITLPVVSRLAATSNHSQLGPTLARAIRLAIFLTMPAAVGLWFFANPIISFIYGHGKFHASDSLQTAYALQFYALGLVAYSCIKVLSPAFYAIDKKWSPMIVSFATIILNIILNYYLIFKLNMGHCGLALSTTVSATVNFLILYILMSRLHNMQNRYLCSTTLRCILAAATLGFVCQFIFAYGTDFLYHPSFWVRGVSLVISISFAASVYFAICVLLRVDEAKSIFIIIYQRFGSPVDLKSKQV >LR134286.1|VEE01857.1|1171511_1173527_+|lipolytic-enzyme,-GDSL-family MAISKRESKKNLTHFVVFGDSLSDGKNMGEKFSFLGSWVKSLWLKALGLDKSPKERFTNGYTWADSFRATLISKFLNDDKIKNDSDHRFGKYNLNNADISDEVLSQSPFIRKRYTLDDVIAESRKVKRKQRVEDREEGHLFTAKQEGTPEDIINPGHIVDSTDIADAAIAHRYKTNAQRATLRNKMRLLNASTLQESSDDISDQIITDPRYSKYVQEYYSLDDGRTAQYNGQNFFANYSQGGATSYDYSWKGLFLSLFAPFTSIKLFFTRLIVSNLSKQVDQFLVDLEKQEDYEDKERTLITVFSGANDLITVNSEPTKEAANLAVQSNIDNIEKLLQQGFKNIMLCNLPDLSLTPRFQGTSREGQAHEITEYFNTQLEEKYKKLKEKYPSCSIDFFNINSIFTKIYTDVRDNPQSEYAQYFDSKKLKEAYKDSTDYTMTPERTSPGSKHMFWDDVHPTATMHALLMSEFYKNIDALGKYKITAPAEQSPEQLCKKFRQKYHEKLENSWFGFLSSNKELPINYKEPAKALNSILRFALDKNNKKADYIRRAMIDLGWWVNNEPNMCIPALADAMWVLDPTLARKLEAKLDPHLEQPHSNSPRMMMGALNAGVSRHKTVPPELALSPEVEKKLKMMQKLPNKNKESTLSQAKGNTTFETPKLSSKDNVLTFA >LR134286.1|VEE01858.1|1174181_1174304_-|Uncharacterised-protein MHLIELLHKTFAEQLPQVHKNRLKSLMGTSKVAVSTNKLY >LR134286.1|VEE01859.1|1174492_1177894_+|putative-RNA-helicase MYLESNQIVFSPSDLAQFMDSPFASWMDHLAVTNPEYLPSPDENNELLSVLHDMGNQHESEVLASFEAKGLTIANLRNRTDSYQATIDAMKNGVDVIYQAHLELLPFKGYADFLIKVQGKSIFGDYCYEVWDTKLAKYVKPNFLVQLSCYAEMLDVMQQARADHITIILGNKEQKRFRLNDYFYFYQNLKHQFLLLHQQFEPFKSPDPALSKSWGRWSTHAKNLLLKADHLIQVATITSGQIKKLNQAGIYTMTALANSDYKTVKGIKYELFEQLKAQAKIQKDSIGKDVPAYQLINHENGRKQGLALLPPKSKNDIFFDIEGFPLEDGGLEYLWGVTYFDENDQRRYMDFWAHDKDQEKESFRSFVEWVYKRWQQDLSMHIYHYASYEVTACRKLMSRYGVCEYEIDQLLRNGVFVDLYKIVKSALLIGEPRYSIKNVEHLYRAKRDTEVGSGGDSVVVYERWRENPDGDTWQTSKILNDIRSYNIDDCNSTQELVRWLREKQEACGISFLGQTELIEPEIKEEVNERIKLRDRLLKRALQLHSEGHELLSKLHSVMAWSIEFHRREAKPVFWRLFDRLGLSEEELFEDMDCLAYCQRTEKPPYKSTPKARNLVYEYSFDPDQEFKANAKEYYLLGNETPDGKNIKAICHNEGSDLDHGIIALQIKNEPDSLITLIPNEYIDPDPIPQAITKQAESFANGMLAQTAIVDFLGKSIPRIKDHTSGQAIAPSHDPERRLNEIIKAVVNLDNSYLTIQGPPGAGKTYTGKHLIAELIKKGKKVGVSSNSHKAINNLLINTAKYCQKMGIAGHFSCKSKTDSVIDDLNINVLENKDISSFLQPGCVVGTTAWGFSRDDLEHAFDYLFIDEAGQVSVANLIAMSRSTSNIILMGDQMQLGQPSQGSHPDDSGLSILDYLLHSTPTIPDSMGIFLGTTYRMHSAVNQFISEAIYEGKLETAPENDEQLITVPVGYNGILNKEAGIIPVPVIHEGNTQGSDEEVAQIFSLAHELLGRTFNDKRGRQRTIDWDDILFVAPYNFQVNKFKAALGDKARVGSVDKFQGQEAPIVFLSMCASSANESPRGVNFLFDKNRINVAISRAQCMAVIVYSPALLDSVPNNIEQIAMMNMFCQLVKNR >LR134286.1|VEE01860.1|1177907_1178624_+|hydrolase MKKGQTFILIHGAWHASWCWKPIAKELIAKGHKVLMPDLPGHGQKKQISSSIGFTDYVNSVIQLVQHQQEQVILVGHSMAGLIISAVAERIPEAIGELVFVAGYVPHDQKSLFSLALESESNNLTPFLIIDELLQEIRLQISADLINIFFNCCKRADAQKAMSRLQAQPIRPFNEPVQIGEKYTRTPKRSLVCRYDKALLLSDQLRMSREVTDNIIYLDADHAVYYSGAKLIVDELLK >LR134286.1|VEE01861.1|1178637_1179540_+|O-Methyltransferase-involved-in-polyketide-biosynthesis MREKILKDHNVATTSLLANYWKNEAKSKENWLSLTQMQGTRENDLFKDPLMQNFVNEQVKEEAEQRLDKRMWLPLATRTRFFRQTVSDAVKNKEVKQVIILGSGFDTLPARKIKYTQQFGVRFFEIDQPQILKCKEQIYAEQCIHKNATYIPLDYVNGDLIAALTNNDIDFTKPTLILWEGNTFYLEKEDVLRILRDLSSKFSHMVITFDYMHTLMQTSTQQLDSSAKEKCLEKTLDEFASKKSPFKAFFEPGEIVSLCTKLGIQCVDHKTAAQLAKEYEVDQEPYYTAETYSMVTFEHK >LR134286.1|VEE01862.1|1179872_1181099_+|coiled-coil-protein MGLEIYTWKSSRKGLGFTTPVKSTLLGGNVGHAAVELTFPADEKGDELAKKYQDIRGLAISKRTEIVPEQQADGNYKPKEQINYFVYFSWWPGNSNGHHINSHRDDLEAEWRHEPSHKIKSYTKGYLYGENVPEDNKTNVKGSLVREKTITKVKEFSHAHLKHDIENDPAYKELTARKDALLAENKLLTDKLTNYMQEVKQARIENREPNKALDLTEAENAQCSMIPKEISRISAQIDLCKRDFEERHLSVGEAPAAIVRIPTTYDHNAPDFALDAEKILEEMASLSQSAVAYNYTKFNCSTTATQVVKAGIDDELKMTMEAGGFDVEKASKAYISTPTSFCAFSKKIQSELLHLNTKQDIVEQRQNDAPDRSPAIEIDFKARLRDITQESRKVEERNEVDTGFVRRR |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
27193 : 39811
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134286|27193:39811|DBSCAN-SWA GATGGCTGAGCGTGGGTTGGCAATTGACCATACAACGGTTTATCGCTGGATCCAGCACTATGCACCAGAGCTTAAAAAGCGGATAGATTGGTACAAAAAACACTACTCCACTCGATGGCACTTGGATGATACCTACATTAAAATTAAAGGAAAATGGAAATCCCTCTATCGGGCCATTGATGAAAATGGCAATACTATTGATTTTTATTTGTCCCATCGGCGTAATGCAAAAGCGGCTAAACGATTCCTGAAAAGGCTTATTAAAAATAACCCAAGCTGCGATATTTCTGTTATCAATACGGATAAAAACCCAGCTTAGAACCAAGCGATTAGAGAATTAAAACAAGAAGGAAGCTTCTCTCAGCGAGTAGAACATCACCAAATTAAATATCGTAATAACCGACATGAATCAGATCACGGAAAACTAAAGCGACTTATTAATCCAGCTAGAGGGTTTCAATCCATGAAAACGGCTAATGCCTCCATTAAAGGGTTTGAAGTGATGCGAATGTTTAAAAAAGGACAATTTAATATTTGGATGTATGGCAATCGGAATGAGGTGTCATTTATTAACCAGTTATTTCATGTATATAGCTGAACTACGCCCTGAGTTTGTGTTTTTGTAGCTTTTATATTTTTTGCAACGCAGCCGAAAAATCACCATGCAGGGGGAAGAAACAAAGCCTAGCCTAATCATGATCTATTTGGGCTATATTTGACCGCTTGGGGGTATCTGAACAAGACTTAAAATTACCTGGTTCAGAATATAATCATTAAAAATTGAAGACAAACTCCGTTGCGAGACATACCTGTCCAATGAATAGATAGATTTATTCCAGTATTCTCGCTTTATTTCTATACCCAACAAATACTCGATAGCATTCAGCAATGATTTAAACTGGAAGTGTAATAAAATAATGATAAGCTTCTATGGTCTTTGAAGTCCAATAATGGGAATAGGGTTCATGTCCGAATCTACAGCCACCATTGTGAACTTTCCTTCTGTACATAGTTTACGCTCGCCAGTTATCAAGATTTCAGAAAACATTTTCACGTCAACAGTTAGACTTGTTTTGCCATGCCTCTCAACGACAGCAACGAGATCGATGAGTTCACCGACTTTGACTGGAACTTTAAACTCTATCTTATCACTTGCAACGGTGACAACAGTAGATCGAGTGAAGCGGGTTGCCGCGATACTTGCTGCCATATCCATCCACTCCAAAGCGTGTCCGCCAAAAAGCGTCCCGACATGATTTACCTGATTTGGGAAAACAATCTGCATCATACGCGTTTCCATTGCTGTGTTTTGGTTCATTATTAATCCGATAGAATTTTAATTAAGAATATAGTGTAACTGAAATTCTAGTTTAATGGGATTATGCTCAGTTTGAGCTAGATAACGTACCGGCCTGTTGTAAAAGATGCGCTATTTTTGATCATGCAATGTGATATAACTGAAAACAAAAGAAAATTAACAAGTCTTTTAATATTAATCACTACAGCATCTATGTAGGCCTGGATCTGCATATTATCAAGACCACGATACTTCGCTTTTGAAAGGCAATGATAGTTTTTTAATTCATTCATAACACCTTCAATTTTCCATAAACATTCTCGAAATTTTTCTTTAAATTCCTCAGTTTCCATTTTAATTTTCACTTTTTGAAATAAATCGGCATGAATATGCCGTGCCATAACTCGAATGTCTCTATTCTTCATTTGAGGCACTTGGCAAATTGCTTTTAAAGAGCATTCACGGCAATCTTTTGTATGGGTACGATAAGAAATATAACCCTCGGAATTTATTTTTCCTGGTTTAAATTCAATATTTGCAAAGCAAATATAAGTTTTTTTAATCTCATCATAATTAATTCCATGTATTTCTTTATCAGGAGTTTTACCACTACGTGTAGTAAATAATGGTATAAATTCTTGGATACCCATATCATTCAGGGATGAAATAACTTCTCCAGAACCATATGCTCTATCTGCTATAACTTCTCTCAACATTAATTTATTTTTTAATTGAACTATTAAGTCTAAGTAAGGCTGAGAGTCATGTACTGCTCCAGTTGTAATCTTTATGGCACTAATTACACGGCTTTTACTATCACAACACACATGTGCTTTATATTTTAAACTTCTTAATGTTCCTGATTTAAAAGCTAACGTTGCATCAGGATCGGTTTTGCTCCGATGAGTTTTATTAGAAATATGCCACTTATTTTCAGAGATGCCATCTTTAGATGGTTTTATATTTTTAGGAACTTCTTTATTTAATGGCTTCATCGAGTTCAACGAGGCATTTGCTTGAATTAACGTACTATCTGTCATCACACTCTGGCTTTGAAGAAGACCAGCTTGCTGACATTGTTCGACAATGGATTGAAAAAATTTTTCGAAAACCTCAATCGTATAGCGTTTTTTAATGCGACTCAAACTTGCGTGATGGGGAATAGAGTCATTTAGTGTTAATCCACAAAACCATCGGTAGCAAATATTATAATGAATATCTTGAACTAGTTGTCTCGTCGATTTGATGGAAAATATATAACCTATCAGCATCATTCGAAAATATAATTCTGGTGCAACTGAAGGACCTCCATTATTGGGGCAATAGCAAGACTCGGTAATCTCTTCAATAAATGAAAAGTCGATGCATTCATTAACTTTTCTTAAATAGTGCTTTTTAGGTATTAGTTTATCCAGTGATAAATAATCAGTATGTTGGGATTTGTCGAGAATTCTTCCTTGCATTTAACTTCTTGTTATTCAATTAAAATTGATGGATTAGATCCTTTTTATCAGAGTGTGTAAAGTTTCCTCATCTTTTACAACAGGCCGGTACCTTATCTATTGCGACACGAAAGCTGCACTGAAGAGTTGTCTGCCTTTCAATGGACTGTGGCGCAGACCGTTCATACCACTGAACGAAGCTAGGGCCATGAATAAAGAGCTGGCCTGACAATGTAACAAAAGAGGGGAAGCTCTCTGGGGGACGTATCGTGAGAGAAGCCCTTCCTGGTAGCCATATCTGGGTAAGTGCTAGCTAATTGGTATGGTGAATGTAATGTGAGTCCGCGACAAAGACCGTTAGTACGAACAAGTGGAAATGGCTAATACACTTGAACCAAAAGGTAACGGAAGCTGGAGCCAGGTTTGGATATTCTGGCTCGTGGTCAGTATGCTTCCCGGTTGAAAGTGGGCACCTAACCCAATGTACTTTTCTATGCGGAACGTGAGAACCCATTTGAGTTCCGGTTAAACTGGTAGGTTGGCTGCGAGGCCAACCGATGACTCAGGTGGTGTAGGAGGTTAGAAAAAGCAAATGCTTCGTCGTAATAACGAGGATACGAGTTGCAATATTACTCGATGCGAAAGCATGCTGACGTCTAGCTGGTCTTTAATGGCGAGAAATCTTGAAGAATCACTTGTAATGAAGGAAGGCAAATGATAATTCAGTTATCAAATGGTGCACCTTCAGCTAAGGATAACGCCTGGAATACAATTAATTGGAAGAAAGTTGAGTTTGAGGTGAAGCGACTTCAAGTGCGTATCGCCAAGGCTGTTGAAGAAAAACGTTTTGGCAAGGTCAACGCGCTCCAATGGATTCTAACCCACTCACGCAATGCAAAATTACTTGCAGTGAAGAGGGTTACGAAAAATCGTGGCATAAAGACACCAGGGATTGATGGAGAAACCTGGCTGACATCGAAAAAGAAAATAAGAGCAGTTGATACACTTAGTCGCAAAGGATATAAATCACAGCCTATGCGACGAATCTACATCCCTAAAAAGAATGGCAAAAAAAGGCCGCTTGGGATACCAACTATGAAAGATAGAGCGATTCAAGCGTTACATCAATCTGCATTGGAACCAATAACGGAAACTACTGCAGACAAAAACTCCTACGGATTTCGACCGGGTCGAAGCTGTGTAGATGCAATTGCGCAATGTTTCGTTCTTTTATCACGGAGAACATCTGCAGATTGGGTTCTTGAGGGTGATATAAAAGCGTGTTTTGATAAAATATCTCATCCATGGCTAATGGATAATATTTCAATGGACAAGAAAGTTCTTAATCAATGGCTATCTGCAGGTTTTGTTTACGAAAATGTATGGAATGAAACGGTAGAAGGTACTCCGCAAGGTGGAGTGGCCTCCCCAACGTTAGCAAACATGGCTCTGGACGAACTTGAAAAAGTTATCAAACAGATAACCAAAAGGTCTGATAAGGTGCTCATAGTACGTTATGCAGATGATTTTATTATTACGGGTAACTCTAGGAAAATAAAATCAAGCCAGCAATAAAAAGCTTTCTAGCGGAAAGAGGTTTAACCCTTTCAGACGAGAAGACGCATATCACACACATTGGAGAAGGTTTTGATTTTCTTGGTTTCAATATTCGTAAATACAAAGGCAAGTTACTTATAAAGCCGAGTAAAGATAGCATCAAAAACTTTCTAGCGAATATTAGAGAAACTATCAAAGCGCAAAGAGGTGCATCAGCGATAAACTTAATCCGAATTTTAAATCCTAAAATTCGTGGTTGGGCAAACTATTATATAAATGTTGTCTCGAAGCATATCTTCAATTATGTTGATACGAATATTTTCCAATCAATCTGGAAATGGTGCAAAAGGAATCATCCAAATAAGGCAGGCTATTGGATAAGAAAGAACTATTTCCCTTCTATAGAAAACCGTAATTGGATATTTGCAGCAAATGAGAGGTGCTCGAATGATGAACGGACGTCAGTTTCTAATTTGGTTCAGGCTGTCCATATAAAAATAAAAAGGCATGTCAAAATCAAAGCCGAGGCTTATCCGTACTGCAGAAAATATAAACGATACTTTGACATGAGGTCGAATTCATCTTGAAGCTGCAACATCATAGATGCTGAAAGCCAAAACTGCCAAATAACAGACGGATCACCAAAAGGTTGGTTTTATAAAGGCTTGAGCCGTGTGCAGGGAAACCCGCACGCACGGTTCTTA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134286|27193:39811|38673_38937_-|VEE00884.1|DBSCAN-SWA MNSKKKEKHQKAFISKKSVILMVLTGFWTANVLAGTMGHLSEQATWNWVGTFSVGPVWESAGQAQAFDLTPDIEKTYAANQSANNFV >LR134286|27193:39811|39676_39811_+|VEE00886.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTANATIKGFEVMRMFKKGQFNIWMYGNRNDVSFINQLFHVYS >LR134286|27193:39811|32420_33401_-|VEE00878.1|DBSCAN-SWA MNHENQTPYTQLHPNAILDAIESTGLLCTGSLIALNSYENRVYQIGIENDEPLIAKFYRPNRWSSEAILEEHQFSLELVQHEIPIISPLIINDQTLHHYHDFRFALFPRRGGHALELDNSEQLEWMGRFIGRIHRISAFKSFEHRMQLNPQTYGHNPYKLLLEQNFIPDYLIPNFCKTAETALQKIEQIFKSIVHVDQIRLHGDCHAGNVLWNESGPHIVDLYDCLMGPAIQDIWMLLSGEKEQMDLQLEKILRGYCEFHDFNPRERHLIEALRTLRMLHFSGWLAKRWTDPAFPLSFPWFNTPVYWQNQIVNLNEQIELLDQIEC >LR134286|27193:39811|28120_28510_-|VEE00875.1|DBSCAN-SWA MNQNTAMETRMMQIVFPNQVNHVGTLFGGHALEWMDMAASIAATRFTRSTVVTVASDKIEFKVPVKVGELIDLVAVVERHGKTSLTVDVKMFSEILITGERKLCTEGKFTMVAVDSDMNPIPIIGLQRP >LR134286|27193:39811|39214_39532_+|VEE00885.1|transposase|DBSCAN-SWA MAERGLAIDHTTVYRWIQHYAPELKKRIDWYKKHYSTRWHLDDTYIKIKGKWKSLYRAIDENGNTIDFYLSHRRNAKAAKRFLKKLIKNNPSCDISVINTDKNSA >LR134286|27193:39811|27655_27790_+|VEE00874.1|transposase|DBSCAN-SWA MKTANASIKGFEVMRMFKKGQFNIWMYGNRNEVSFINQLFHVYS >LR134286|27193:39811|28587_29952_-|VEE00876.1|transposase|DBSCAN-SWA MQGRILDKSQHTDYLSLDKLIPKKHYLRKVNECIDFSFIEEITESCYCPNNGGPSVAPELYFRMMLIGYIFSIKSTRQLVQDIHYNICYRWFCGLTLNDSIPHHASLSRIKKRYTIEVFEKFFQSIVEQCQQAGLLQSQSVMTDSTLIQANASLNSMKPLNKEVPKNIKPSKDGISENKWHISNKTHRSKTDPDATLAFKSGTLRSLKYKAHVCCDSKSRVISAIKITTGAVHDSQPYLDLIVQLKNKLMLREVIADRAYGSGEVISSLNDMGIQEFIPLFTTRSGKTPDKEIHGINYDEIKKTYICFANIEFKPGKINSEGYISYRTHTKDCRECSLKAICQVPQMKNRDIRVMARHIHADLFQKVKIKMETEEFKEKFRECLWKIEGVMNELKNYHCLSKAKYRGLDNMQIQAYIDAVVINIKRLVNFLLFSVISHCMIKNSASFTTGRYVI >LR134286|27193:39811|36225_37062_+|VEE00880.1|DBSCAN-SWA MALLTRRERGENKRNPTMNLCLFGNAITAMWSRFQTIFTSGQVPGNRSRLLSYNYIKINSFCDKGFLFVQKIAKELIGDFRDHIYVTDRYSAYDFLPDKNRQVCWAHLKRDFQKISERPGVSGKIGKKLLKAYERLFTFWKTEYDPNMLAFKKPRKRLRYFKAKLLRHLREGSRCTHKATARTCINILESVDSLWNFFETPNVPPTNNHAAHQLRPLVISKKLTFGTQSERGSRFIERIFSVAATCKQQQKDVLVFIMDALQKWISIHQNLDAPLQGA >LR134286|27193:39811|38296_38614_-|VEE00883.1|DBSCAN-SWA MGVAVGFTGQAGLTGVIWDDANPEFNNFTYNNKIQHTHVATKGALLVDMDFWLIPWINDSIAVGYECTDWGKSSLGRAPEKTLNTGLILNHLYTNGLMFNLTYLA >LR134286|27193:39811|33662_36263_+|VEE00879.1|DBSCAN-SWA MKISTEGTIILIAGSTHLPIDDFIDDILQKVTSHTNLVITAAPGAGKTTRLPPELLSVVAGKILVLEPRRMASIAAAHRVAEENNWLVGEEVGYQVRFVNKTSHKTRLIYMTEALLARHMIHHPELDDVDIVILDEFHERSLYVDLTLGLIRELQELGHHIKIVVMSATLEAEKIAEYLGNCPVISVPGKLFELTIRYQKSTQLLTPKYQFYEHLFQVIKEAQRQTDKDILVFLPGAREIERAKRYLLDWKESKKIEVLTLHGSLPLEAQRIALQKSSAQRIILATNIAESSVTLDGVDTVIDSGLVKIMKQDLRTGFSRLEISRISLASAIQRAGRAARQFPGVCYRMWNQHDESSFVKSNIPEILCSDLSDSLLFLANQHISNFQNFSWFERPPHVNIERATFSLQAAGAIQNNNELTSIGRQLLDFPLPLRLGRLLIAGIENNCIDLAAKIAALLQERDILRKEMANHFQADHFECDVTPRLKILNKFLKDGSSHEGHFTILQTVAQSYQQILDLAKKLKKAELPAYLEEDEARQLLLMLSFGDRLCRRRKNSDRALMVGGRGVKLSDRTLVKRSEFFIALNGFEESGEAETLINQASGINKEFLFKHFSDHIIKKRDIIFEAEKSQFYQREFKTLWDLPIEEPNFSLATSVHVAEKLPDILTDNWASTLKKNENLHEWYQKIIFLRFHKALIPPHIQDELESLFDGDALKKSFCLTVFRQACFGESKMTLVLQKNLVYFFELNISETLRSILQTELPNRLKVPSGSMIPIHYSTVEHPFLRVRIQEVFGWEETPKILFQSVSVVLHLLGPNFRPVQVTSDLESFWKNGYSEIRKELRIRYPKHQWPLNPADGIAHAKGARRK >LR134286|27193:39811|27193_27511_+|VEE00873.1|transposase|DBSCAN-SWA MAERGLAIDHTTVYRWIQHYAPELKKRIDWYKKHYSTRWHLDDTYIKIKGKWKSLYRAIDENGNTIDFYLSHRRNAKAAKRFLKRLIKNNPSCDISVINTDKNPA >LR134286|27193:39811|37365_38286_-|VEE00882.1|DBSCAN-SWA MKKYCINALIALILGVASMTTAYAKEPVWTFSLPSPKNVTVSPVGKTKVMYTITNNSSRSKHLALVTSIPKRPSTPGLSSTGCFLPATKGGVTGRCTVTIDVDGSKIPQTGIHSGPYLCESGSLQQCYQPSTGHELNITLNTKLYTVTPRGDGHETISPSTPKTVNYGETQQFTVTANTGYTLSNTVGGTCPAGSWSRNTYTTGAITANCSVSFSATINTTIIAAGYYYNGTDNYPLLANSTDGGATWIYRISSSTPTLPSDFSYGYLFSANVSTTSFLPESLRSALSKIENPNYTVAPKNNYAIE >LR134286|27193:39811|30645_31506_+|VEE00877.1|DBSCAN-SWA MIIQLSNGAPSAKDNAWNTINWKKVEFEVKRLQVRIAKAVEEKRFGKVNALQWILTHSRNAKLLAVKRVTKNRGIKTPGIDGETWLTSKKKIRAVDTLSRKGYKSQPMRRIYIPKKNGKKRPLGIPTMKDRAIQALHQSALEPITETTADKNSYGFRPGRSCVDAIAQCFVLLSRRTSADWVLEGDIKACFDKISHPWLMDNISMDKKVLNQWLSAGFVYENVWNETVEGTPQGGVASPTLANMALDELEKVIKQITKRSDKVLIVRYADDFIITGNSRKIKSSQQ >LR134286|27193:39811|37058_37313_+|VEE00881.1|transposase|DBSCAN-SWA MNDYQQYFKEKLYERMWKLEGVMNELKIYHDLKRAQYRGLENTQIKAYFAAMALNTKRLIFFATQPLSEHIRLRNKAGVFRRIG |
14 | Escherichia_phage(50.0%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
77662 : 117766
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134286|77662:117766|DBSCAN-SWA 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MLDRIAGIGPEISSQNLTIVMDLSATNPMAHYGAIIVCDDKEILLKSVNSTHNNPMLHGELSVIHTLFNNGF >LR134286|77662:117766|96709_97255_-|VEE00941.1|DBSCAN-SWA MSKVFTKEDTKYSKPERPDKKLPAIKNYMTPNGFAMLQAELRNLISNERPEIVKVVSWAASNGDRSENGDYIYGKKRLREIDRRIRYLTKRLESAQIVDPKLQVGLTQVFFGATVQYINENGESHCVKIVGLDEADINEGKISWVSPLAKTLLKAKVGDHRTLRVGDKECHLTVTHISYIV |
43 | Escherichia_phage(33.33%) | transposase,protease,integrase | attL 69747:69762|attR 113897:113912 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1450807 : 1528977
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134286|1450807:1528977|DBSCAN-SWA AATGAAGCTATTAGCGATTGATACCTCGACTGAAATAGCCAGTATAGCGTTGCTGACTGGAAATGAGTTACTTTGTGAGGAACAAAGTAACCCTAAAACACATGCACAATTTATTTTACCTATGATTGATAAATTAATGGTAAGTGCTGGTTTGCAAATGAAGGAGCTTGATGGCATTGTATTTGGACGTGGGCCAGGAAGTTTCACTGGCTTGCGCATTGCCTGTAGTATTGCCAAAGGATTAGCTTATGCTCATGATTTGGGATTAATTCCCGTAAGTAATTTAGCCGCTATAGCGTGGTCAGCTCGTCAACAAATGCAGGAGTTGCATCTACCTGTATTAACTGTATTAGACGCGCGCATGCATGAAATGTATTGGGCTTATTTTACTAAGAATCAATGGGTCGCAGAGGAAAGGGTCAATTCAGTACATGAAATAAATATACTTGCAGAGCAATCTGTAATTCTTGCTGGAGTAGGAATTGATTTATATTGGGAAGATTTTACTTCCAAGACTAAATCTCTTGTCCGTGAAAAATTGCTTATATATCCTTCTGCCGCCGCTATGATTCAATTGGCTCAATTTTCTGCATTAAAACCTGTTTCAGCAGCTTCGGCCCAACCTGTATACATCCGAAATAAAGTCACCTAGGAGTCTTTCATGGATAAAAAATTATTGGAACTATTAGTTTGCCCTTTATGTAAAGGAAAATTATTATTAAAAAAACAAGAACTAATCTGTAAATTTGATCGGCTGGCTTTTCCTATTCATGATGATATTCCTGTCATGTTGGAGCATGAAGCTCGAGTTATCCCCCTGGAAGAAAAAGATAAATTAGAAACAAAGCATTAAGGACGTTAACTCATATATTCTAACCTGCATTCAATGATTTAAAAACTTTGGTGGAATTTAATGCGCGGAGGGCTGGGTGATAATTACTTTGTTTCACCCTCGCCATGAAAAATTATTTCACTAGGGTCTGTTGACATTTCACCAGCCCCTACGTGCCGCGGCTTGTCCGCGGCATCTAGTAGATGGTCAAATTTAAATCTGCACTATCTAATTCATTGATTAATGAGAGCAAACTCATAATATAACGGTTCTCACAGCAAGTATAAAACGAGTTTGCAATGCTTAGACTTATGCTCAATGATGAGTATTGGTCAAAGCTAAGGGAGCTCATGCTACAGCATCGTATTTATGACAAGCCAAATCTTCGCATGATAATGGAGGCAATGTTGTATCGCATGCGAGTTGATTGCCCTTGGCGCGACCTGCCAGCAGAATTTGGATGCTGGAATTCAATCTATCAAAAATTTAATCGATGGTCATCAAAAGGTAAATTGATGGCGATATTCAAATCACTTTCTCAAGAGCCAGATCTTGATTGGGAGTTTATTGACGGCGGTATGGTAAAAGCGCATCAACACAGTGCAGGAGCAGCTTCTAATGAAAATCAAGCTATAGGAAAATCTAGAGGCGGCAATACAACAAAAATTCATATGGCTGTTGATGCCTATGGCTTACCTATTGATTTTGAAATAACAGGTGGTGAAGTGCACGACTGTAAAGTGGCACCAGAATTTATCGAAAAATTACCTACGGCGGGCCACACTGTTGCTGACAAAGGCTACGATAGTGACGAAGTAAGAGATACAATTCAAGACAATGGAAAATAAATTTAATCGAGGGACTTAATCCTGATTGGCGCGATCTATATAAAGAAATTTGCCAATGATTTAGATCCACTAGATGCCGCGGACAAGCCGCGGCACGTAGAGGGCTGGTGAAATGTCAACAGACCCTAGTTTGTGATACTCTTGCACTTATAAAAATGGATTATTGCTTGGTGATGTATTTTTTACGCCAAAACAATAAAAATGCAGGAATCATCATCAATACAATTCCCATCGAAAAGACAAATCTAAAATGTGATGCGCTGCCAAAATTCATAAATTCAACTGGGGGAATGAATCCTACTATTAAAGTCATGGTGCAGCCGCATAATCCTAAAATACACGTTAAATAATAGCCGATTTTTTTTCCGGGTATCGCAAAAGGCCTTTCAATATGCGCAAATTTACTTTTTAATCTCCATGCAGCGATAAACATCAAGACATACATCATAATATAAAGCTCTGTACTTAATGCTGTAAACAACCAATAAATAGCATTCACGGTTGGAAATAATAAAAACCCACTACAAAGAAGGGTTACCAGGATGGCTTGAATAATTAAAATTCTTGAGGCAACACCACGCTTATTTAGTTGACACAAAAAATTAGGCAAGAAATTGTGGTTGGCTGCCATAAGCAAGCCTTTGGCAGGTGAAATAATCCAATTAATCATACTTCCTAAACTGCCTAATAACAAAAGCACTATAAGAATAGGGAGTAACCAGGTTAAGTTATAAGCATGTAAAAAATTATTAAAGGCTTGTAATACGCCATCAATAAGGCTTATTTTTTCTTTAGGAAGTACAAAAGCAATTGCTAGAGAGCCAAATATCATTGTGGTTAAAATCAATAATACAGAAAAAAACATCGCTCGAGGAAAGTTTTTCTGCGGGTTATCCACATTACGAACGTGAACTGCTGCAAGCTCCATACCTAGAAATGAAGTCATAATTGCAGTGAGTGATACCCATGATTGACTGTCACTCCATTGGGGCAGTAAATGAGTCAGACTTAAATTAATTGCTATGGGATTGCCTTTAATGACCCAGACGGCTGCAAGAAAAATAATAAATCCCATAGGAATAATCATTCCTAAAATGGCGCAAAGACCTGCAAAATTCGCTGAAGCGCGTAAACCCGATAAAGCAATAAACGTGAGCGACCAAAAGATAATGAGAATAACGGAAATCAAATAGTATTTATTTTGCGCAAGTTCGGGGTTAATTAAATAAGCGAGTACCCCTGCAATGAAGGATAAAATGGTTGGATACCAGACTAAAGTATTAATCCATTGTAACCAAATGGTAAAAAAAGCGAGATTTTCACCGTAGGCATGTTTTACCCAACTGTAAATTCCTCCTTCTTCATCAGACCAGGTTGATGATAATTCAGCTGAAACTAATGCAACCGGGATTAGGAATACAATTGCCGAAAAAATAAAGAAAAAAATTAATGAAGAACCGAATAAAGCTGTTCCTGGCAAGTTTCTGATGCTATCAATTGCACCAGTAATCAATAAGACCAAAGCAAGGACAGATATTTTTTCAGAAGACCAATTGTTCATTAATTAATTCTATTTGTTAAAATGCTATACATTATATAGGAAGTTATTGATTGATGTTACATTTTTTTATCCTGCCCATGCATCTTTATTCATTTTTAAGAAAATTAACTATTCTAAAAAATTTTTTTGTGGGTACCGGATAAGGATTTTATTAGATCCTGTGTTTGCTTGATTCCGTTCTGGCTGAGGGGTACTGCCATTGACTTGGGATTTGTCGTCGTCCTCGCGAAAGCGGGGACCCATTTTGATAAGACACAATGTTCCAATAAAAATGGATTTCCGCTTTTTTCGAAAATGACGAACCAGTAATGATTCACTATCTTGGCGAGGTCACGACTCGTCCTTTTTAAATCCGCCCTTACATGCTGGAGATTGCGTAACAGTTTTGTTTCTTTTTTCCCATTCATCAGGAGTAAACAAATGCATGCTTAACGCATGTAATCCAAGTTCAAATTCTTTGTAAAGCAACTTATTTAATAACCTATGTCGAGCAATTCGCGATAAGTCATTGAAATGAAAGGATACAACGGTCACTTTAAAATGGGTTTGTGCGCCTTCAGGCACATGATGATTACCTGACTCATCCTCTACATTTAAATAAACAGGTGTTAACTCCTGATGTAATAATTCTTCAATACGGTTTTTACGCGACATATTTAACTCAACATTTATTATTGTTCGATTGATATTATATCTTAAAAGCCACTAGAACCGGGCTTTTAAGATATAGGTAGATTAAGAACGGCAATTCGCAGGGACATATCGATTATTTGTAGCAGGATTATTAACTGTACAAGTCCACGTAATTGCATCGGTTGGCGGAGCGCCGGCCTGTAAAGCATTACCGCCAGATCGAGGCGTTAAAGTAAGTGTAATACCCTGCGCTAACGCAGTGTAAGTTATTGTAATTACGCCAGTCCCATTGTCTACAGCGATATTGTTAACGATAGGTGTCTGTGCAGGTGCGACCCAGCCTTGACTTAATTGGGCAGCACCGCTTGATGCGTTTTCAGAAACTGTAGTTTTTGCTGCGGAGGCAAGGCTTAATCCTTCCGTAACGCGAGCTCTTACTACATAATCCTGATAGGCCGGAATAGCTATTGCGGCGAGAACACCAATGATTGCCACTACTATCATCAACTCAATTAAAGTAAAACCTTTTTGCTTCATTGTTAGCTCCCTAATTAATTACATCCATAAATATATAAATCGATCACAAATAGGTCATACAACGATACAACTAACCTTATCCTGGTAGAAAAAGATAAAGTCCTATTTGATCTTTTTACGTTATGCTAAGTTTAGCAGAAATCCTTTAAATATGTATTATATTTACATTTATTGTTTTGATTTATGTTTAAGTTAAATATAAATATTTTTGGAATAACCTAGAGTAAACGGGTGAAGCATAACCGAAGATGAGTATAAATAATACTCGGTTATGCTCGCTCCTATAAGTTAACTATTTGCCTTGAAGTACTTTGGGTACTAATTTATTTTTTAAACGAACATAATCAGGAAGTCCATTTACATAATCAGGATAAGCTTCGCCTTGAATCAATGGCGACAAATAGCGTTTGCATGCTTCTGTGATTCCCATTCCATCAGCAGCAATGTATTCTTTAGGTAAAGCTTTCTCTTGATTGGCAACATCTGCCAAGGCTGCATGACCAATAGACCATTGATAGGGTTCATCTTGTTCGCGTACGATAATGGGCATAACAGCATTGTAGCCTTTAACGGCAAATTCTACGGCGGC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>LR134286|1450807:1528977|1451467_1451659_+|VEE02092.1|DBSCAN-SWA MDKKLLELLVCPLCKGKLLLKKQELICKFDRLAFPIHDDIPVMLEHEARVIPLEEKDKLETKH >LR134286|1450807:1528977|1473774_1474689_+|VEE02110.1|DBSCAN-SWA MMMNQEYRGSIYAILSGFLYSFIGYFGISAINGHLSASTMLFWRFLISSIIILFIMLPKINESRDSYKNMFLAFLTGIFFYGISTWLYFLASLYIGSGLAMVIFFTYPVVIMLLNYFFYGQSIPQIYYLAILIILFGMVFMVDLDASFNLWGMVFAIASAFFYACYIIGSKRNVLSPNMSTFMVCLGCTVTSFFVSFFNHSFVVPTSITVWTHLFGISIIATVIPILLFLYSLKYISSEKASILSVLEPVFVVVFGVLLLGEKIQLWSVVGMFFVLAGAVITLFSHKINLSHLRVLSMRRENVG >LR134286|1450807:1528977|1517985_1518669_+|VEE02142.1|DBSCAN-SWA MKIDLERLCRRLGYHFKNSAYLKQALTHCSVGSENYERFEFLGDSILSFVIANELFHRFPLQSEGQLSRLRSFLVRGEMLVELAKEIELGDFLFLGQGELKSGGFRRASILSDALEAVFAAVFLDGGIDCAKEVILKLYRIRLESPNLNDCLKDAKTQLQEYLQAEKIPLPEYILTKIEGDEHNQIFYITCSVNGMKQQTFGQGSNRRKAEQLAAKAMLERLRSVAP >LR134286|1450807:1528977|1459658_1461074_+|VEE02099.1|tRNA|DBSCAN-SWA 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58 | Tupanvirus(25.0%) | transposase,protease,tRNA,integrase | attL 1509554:1509571|attR 1529402:1529419 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
2134533 : 2262388
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134286|2134533:2262388|DBSCAN-SWA 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115 | Escherichia_phage(26.32%) | integrase,protease,transposase,holin | attL 2133467:2133485|attR 2274001:2274016 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
2396699 : 2403516
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134286|2396699:2403516|DBSCAN-SWA CTCAAACATCTAATAGCTCCTCTGTATAAGGTCTGGCAGGATAATGAAAACGCACTACTCCATCTGCTTCCCCATGCATAAATTGCTTCACCTGAGGTTCGGTAGATTTTAATAACTCCTGTGGGGTTCCTTCTCCTATAATTTTTCCACCAAATATAAGGTAGATATAATCAGCAATAGAACACGTTTCTTCTACATCATGAGAAACAATGATGGTTGTCGTATGCAGCAATTCATTTAGTCTTTTAATGAGCCGAACCAGAACACCCAGTGAAATAGGATCTTGTCCAGTAAAAGGCTCATCGTACATCATAAGCTCTGGGTCCAAAGCAATTGTGCGTGCTAAAGCAACACGTCTTGCCATTCCGCCAGACAACTGGGCCGGCATTAAATCAACAGCTCCACGTAGGCCAACAGCCTCAAGTTTCATTAATACAATATTTCGTAACATGGATGCATTTAATTGCGTGTGTTCCCGTAAAGGAAAAGCAACATTATCAAATACTGATAGATGGGTAAATAAAGCAGAGCTTTGAAAAAGAAGCCCCATATTACGCCTTGCTTCATATAGAGCTTTGCGAGGCAATTGGTGCATATTTTGGTCATTTACATGAATAACACCACTATCGGGCTTCAACTGTGCACCAATGAGCTGCAATAAGGTCGTCTTTCCAGAACCACTCGGCCCCATAATCGCGGTAATATTACCTCGTTTAACTTTCATATTAATGCCATCGAAGATGCGACGCTTTTCACGAGTAAAAATTAAATTCTTTATTTCAACCCAATTTTCAGGCATTCTCTATTTTTCCAGTTTAGCCAAAAGTAGGAGTATATACTGGATCACAAAAAAAAATGAGCTATTTAATTCTATTTATTCAAATGTTTTTTTGATAGAATCAAAATTAGACAAAAAAACAATAAATAAGCTTATGAATTTTTGTAAATTAGGGCTTGCCGTTATTGAGACTGAAGCACAAGCCGTCTTTGAATTAACCCAAAGAATTGATAACCGATTTGAAAAGGCCTGTGAATTACTGCTTGCCTGTAAAGGACGGATCGTTGTAACTGGCATGGGGAAATCAGGACATATAGCCAATAAAATTGCTGCTACTTTATCAAGTACAGGCAGTCCTTCTTTTTTTATGCACCCAGGTGAGGCAAGCCATGGTGATCTGGGAATGATTACTCGGCAAGACACAGTAATCGCCATCTCCCACTCAGGCAATACCGCAGAGTTGGTTACCTTACTTCCTTTATTAAAGCGCTTGGAAATACCTCTTATCACCTTAACTGGTAATCCTGAATCTGCTTTAGCAAAAGCATCAGACGTTAATTTAGATGTCGGTATTAAACAAGAGGCATGTCCGCTTGGGCTGGCCCCCACAACAAGCACCACAGTGGCACTGGTGATGGGGGATGCACTAGCTATTGCGCTGTTGCAGGCTCGAGGGTTCAGTGAAGAGGATTTTGCTTTATCTCATCCGGGAGGCTCTTTGGGCAAACGGCTTTTATTACGTATTGACGAGCTCTGTCACCAAGGGGAACAGTTGCCGCTTGTTCATGAAAATGCAACTGTTAGTGAAGCGCTTATCGAAGTAACCGAAAAAAAACTAGGTATGACTTGTGTTATTGATAATAAAGGATACCTTACTGGTATCTATACGGATGGGGACATTCGACGGACTTTAACACATCAATACGATATTAACACTACTCCAATTAAAGAAGTAATGACGCGTAATGCACGCACTATTTACAAGGGAATGCTTGCTGCTGAAGCCTTAGCTATGATGCAAAAATACAGTATAACATCACTGATTGTAATTGATGAAGAAACAAGGCCTGCTGCCGTGATTCATCTTCATGATTTGTTAAAAGCAGGTATTTTTTAATGATCCAGTTAATAGAAAAAGCGAAAAATATAAAATGCCTCATCTGTGATCTCGATGGTGTACTCACCGATGGTTTTTTATATATTGATACTCATTGTAATGAGCAGAAAACATTTCATATTCATGATGGCGTTGGCTTAAAATTACTTATGGCAATCGGCATTGAAGTCGCTGTTATCACTGGCTCTCATAATCCGTTAGTTGATCATCGCATGCAACAACTAGGTATTTTTCATTATTACAAAGATAAAATAGATAAAACAGAAGCTTACAATCAACTCAAAATAGCCTTAAGCCTTAAAGATGAACAATTCGCTTACATAGGTGACGATATTCCAGACATACCAATTATGCAACAAGTAGGTCTTAGTGTTGCTGTTGCCGATGCAACTTATTTAGCTAAAGAAATTGCCATGTGGCAAACTAGTTTACCAGGCGGTCGTGGGGCTGTACGTGAATTATGCGACTTTATTCTTAATGCACAGGGCAAAATGGATTTAGCCATATCAGGTTATTTAAAACAATGAACGCAGCAAAACAATTTATGTGGCTTTTTTTTACATTAATTCTTCTAGCTTGTTCAGGCTGGTATTACAGCCATTCTACAACATTAATTCGCCTGGATCATGAAACTTTGGCAAATTCAGTAGATACGACAATCTCTCACGTAACAGTGCGTCAGTTTAATCAAAAAGGTACCCTAGCCAATTTATTAACCGCACCCCTCTTGCAACATATTCAAAAAGGTAATGTTTATTTATTTGAAAATCCTCATATTATTGTAAGCGAGGACGAACAAGCACCTTGGGATATTCGTTCAGAAAAAGGCAAATCGATTGATGGAGGGAAACAAGTTACGTTCCTTGGTAACGTGATTGTACATCAAAATAAAGGTAATAAATCCCAGGAAAGTACCTTAAAAACAGAGGAAGTCACCTACTTCCCAAAAGAAAAGAAAGCAATTTCCAATGTTTTAGTAACTTATGAACAATCAGGTAACATCGTTCAATCTACTGGAATGAATGCTTATCTGGATGAAAAACGAGTAGAGTTACTTCATCGAGCCCGAGGAAGTTATGTTCCAGCAAATGGTTAGATACAGTGCGTCACATCAGTATTTTAAATTGTGGTTCTGCTTATGGTTTTTTTTAACATTTGCTTGTTCTTCATATGCATTGTCAGAAGATAAAGAAAAAGTCATGCATGTAATGGCCGACTCAGCAGATTTGAGCCAACAACAACATAAAGGTATTTATACGGGTAATGTTGAACTCATACAAGGGACAACGAATCTACGGGCAACAAAAGCTATCACTTTAGGTAATGAAAAGAATCAACTTGTTGTAGCCATCGCAAGTGGGGCTCCTGGACAACAAGCTCATTATTGGACAACGACGGATCCAAAGAAACCCCCACTGCATGCATATGCTGATACCATACGTTATTATCCCTTACGTCATTTAATTGAATTAATAGGAAATGCTCGAGTTGAACAAGGGAATAACTCATTCTCTGCAACCAAAATAAGTTATGATACTGAAAAGCAACATGTTTTATCTCAGGGCGATGGCAGCAAAAGAATAATGATTATTTATCATCCAGAAAAGAAACCATCATGAGTATTCTAGAAGCACAAAACCTCAAAAAATCGTTTAAATCACGCACAGTGGTTGATGGAGTTACCCTTCACATAAACAAAGGCGAATGTGTTGGTTTGCTAGGACCCAATGGTGCAGGAAAAACGACTTGCTTTTATATGATAGTAGGACTACAAGCATGTGATGAAGGGAAAATTTTCTTGTCTGAAAAGGATATTACATCAAGTGCCATGCATCAACGAGCCCGATTAGGAATCAGCTACCTTCCCCAAGAGGCTTCTGTATTCCGTAAGCTTACTGTTGCTGAAAATATTATGGCTATATTAGAATTAAGAGCTGATTTAAGTGAACAAGCTCGACAAGAAAAGCTTGACCTCTTGCTTCAAGAGTTTCATATTTCCCATCTAGACAAAAGTCTAGGTATGTCTTTATCAGGAGGAGAGCGGCGACGGGTTGAAATTGCTAGAGCTTTAGCCATAGAGCCTTCTTTTATTTTACTTGATGAGCCTTTTGCTGGAGTTGATCCCATTTCAGTAATTGATATCAAAAAAATTATTCAACATTTATGTAATAAAGGCATTGGGGTACTCATCACTGATCATAATGTTAGAGAAACATTAGATATCTGTGAACGCGCCTATATTGTTAGCCAAGGAAAAATATTGTGTGAAGGAACACCTGATATTATATTGGCTAACCAACAAGTAAGGGCTGTTTATTTAGGTGATGACTTTACTCTATAAATGAAATGTAGGTGAATAACCCTAAGAAAATCTTGCTCATTAAAGGCCAGCAGTTGGTTTTCGAGAATTGTTCACAAAATTGAAACAAAAGATGCTCTTGCTCCATACTATAGTTGGATCTCACGGACTGAAAGAAAATTCGGGGTGTAGCGCAACACAATTCGGATATATAAAGCGACTACTTTAAAATACGATTCTTATACCAAATTTTAATTTAATATGTTACTCATCATCGATAATTACGACTCATTTACTTACAATCTAGTACAATATTTTCAATGCTTAAACCAAGAGGTGATTGTTTTCACCCATGATCAAATTACTTTGTCGCAAATAAGGAAGCTTAAACCAGGCTACTTAGTGATTTCTCCTGGACCCAAAGCCCCCAAGGATGCCGGTATTTCAATGGAAGTAATTTATAATTTTTATCAAGATATCCCAATATTAGGAATTTGCCTTGGGCATCAATGCATTGCAGAGGTTTTTGGCGGTAAAATTATATCCGCTCCTGAAATAATGCATGGAAAAACATCGACCATTATACATAATCAACAAAAGATATTTACAAATATCCCGAATCAATTCAAAGCAACTCGTTATCATTCCCTAGCGGTTGATAAGGACAGTCTGCCAGATTGTTTCTCCATTGATGCATGGGCAGATAATACCATTATGGCAATTTCACATCGTCAATATCCCATTTTTGGTCTACAATTCCATCCAGAAGCAATATTAAGCCAGCATGGTCTAAAACTATTAGAAAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134286|2396699:2403516|2399669_2400212_+|VEE02919.1|DBSCAN-SWA MFQQMVRYSASHQYFKLWFCLWFFLTFACSSYALSEDKEKVMHVMADSADLSQQQHKGIYTGNVELIQGTTNLRATKAITLGNEKNQLVVAIASGAPGQQAHYWTTTDPKKPPLHAYADTIRYYPLRHLIELIGNARVEQGNNSFSATKISYDTEKQHVLSQGDGSKRIMIIYHPEKKPS >LR134286|2396699:2403516|2402736_2403516_+|VEE02923.1|DBSCAN-SWA MNSVLQRITHKKLEEISLAKKKRPLDSLKQQPLMEQRNFCGALQAQESPAIIAEIKRASPSKGIIREDFNVVEITKIYALHGARCLSVLTDIDFFQGHPDYLAQAKMHCNLPVLRKDFILDTYQIYESLALGADCILLIVALLDDAQLIEFCQLAQELGMAVLVESHTQEELERALRLPTPLIGVNNRSLHTFHTNIQLSIDLKHYIPKDRITITESGINTHADIRLMQSHGINTFLVGESLMRAKDIGKALDQLIEGI >LR134286|2396699:2403516|2401709_2402744_+|VEE02922.1|DBSCAN-SWA MKHNLLFEQLIAKKNLSTEQVHDVLHACMSGEYSDVQIATFLALMRMKVETTDELIAAAEVMQQLAHHIELGTNLIDIVGTGGDGKNTFNVSTACSFVVASAGFPVAKHGNRSVSSRSGSADLLEKAGFELNLTDEQMQMCMNQCGLAFLFAPHYHPAMQYARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPARVKKQVVGVFSGFWQKPLASVLARLGSERALVVSSQDGLDEISIAAPTNIVEYREGRFNHWILNPTDYGINHHSLNEIIIDSPEQSLDYIQAVFSGKLGAPRDIVLLNSAAAIYCAGNELSFEQALEHAKLAIDSGKAKQCFTRLRQLTQTLNKESNHE >LR134286|2396699:2403516|2400208_2400934_+|VEE02920.1|DBSCAN-SWA MSILEAQNLKKSFKSRTVVDGVTLHINKGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQACDEGKIFLSEKDITSSAMHQRARLGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRADLSEQARQEKLDLLLQEFHISHLDKSLGMSLSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIIQHLCNKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPDIILANQQVRAVYLGDDFTL >LR134286|2396699:2403516|2401153_2401720_+|VEE02921.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQCLNQEVIVFTHDQITLSQIRKLKPGYLVISPGPKAPKDAGISMEVIYNFYQDIPILGICLGHQCIAEVFGGKIISAPEIMHGKTSTIIHNQQKIFTNIPNQFKATRYHSLAVDKDSLPDCFSIDAWADNTIMAISHRQYPIFGLQFHPEAILSQHGLKLLENFLTYET >LR134286|2396699:2403516|2396699_2397497_-|VEE02915.1|DBSCAN-SWA MPENWVEIKNLIFTREKRRIFDGINMKVKRGNITAIMGPSGSGKTTLLQLIGAQLKPDSGVIHVNDQNMHQLPRKALYEARRNMGLLFQSSALFTHLSVFDNVAFPLREHTQLNASMLRNIVLMKLEAVGLRGAVDLMPAQLSGGMARRVALARTIALDPELMMYDEPFTGQDPISLGVLVRLIKRLNELLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLIFGGKIIGEGTPQELLKSTEPQVKQFMHGEADGVVRFHYPARPYTEELLDV >LR134286|2396699:2403516|2398592_2399120_+|VEE02917.1|DBSCAN-SWA MIQLIEKAKNIKCLICDLDGVLTDGFLYIDTHCNEQKTFHIHDGVGLKLLMAIGIEVAVITGSHNPLVDHRMQQLGIFHYYKDKIDKTEAYNQLKIALSLKDEQFAYIGDDIPDIPIMQQVGLSVAVADATYLAKEIAMWQTSLPGGRGAVRELCDFILNAQGKMDLAISGYLKQ >LR134286|2396699:2403516|2397630_2398593_+|VEE02916.1|DBSCAN-SWA MNFCKLGLAVIETEAQAVFELTQRIDNRFEKACELLLACKGRIVVTGMGKSGHIANKIAATLSSTGSPSFFMHPGEASHGDLGMITRQDTVIAISHSGNTAELVTLLPLLKRLEIPLITLTGNPESALAKASDVNLDVGIKQEACPLGLAPTTSTTVALVMGDALAIALLQARGFSEEDFALSHPGGSLGKRLLLRIDELCHQGEQLPLVHENATVSEALIEVTEKKLGMTCVIDNKGYLTGIYTDGDIRRTLTHQYDINTTPIKEVMTRNARTIYKGMLAAEALAMMQKYSITSLIVIDEETRPAAVIHLHDLLKAGIF >LR134286|2396699:2403516|2399116_2399689_+|VEE02918.1|DBSCAN-SWA MNAAKQFMWLFFTLILLACSGWYYSHSTTLIRLDHETLANSVDTTISHVTVRQFNQKGTLANLLTAPLLQHIQKGNVYLFENPHIIVSEDEQAPWDIRSEKGKSIDGGKQVTFLGNVIVHQNKGNKSQESTLKTEEVTYFPKEKKAISNVLVTYEQSGNIVQSTGMNAYLDEKRVELLHRARGSYVPANG |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2563599 : 2618847
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134286|2563599:2618847|DBSCAN-SWA AATGTGTGATGCACTAAGTCATAATATCCCAGAGACCCATGACACCATTGTATGCCACTGCTTGTCTCATGGCTTTCGTAATTTTGATGAGTTACAGGGATTTTACCCAGAACATTGTCTGCCCATCATGAAAAGTCGTTCAATTCCATTTAAGATGGATGAGGAATCCAAACAACTTGGGCATGATGCAAAGCAGCGTCTAATTTATCATCAAAAGCACAGCAGACCTGCTATGCTTGAAGCCCGAGCGTACATGGAAAATCTGCTGTCATCCAAACATGGCCATTAAGAATGTGTGTGCCCATGAAGCCTTATTTCGTTGAATAGATTTTAGAGTTTTTACTGGCAATGGATCTTTATGTTTTTCTACAGGGAGAGATGCACCAGTTAGCGCAGCCTCATTAATCATAACATTCACCGAATCGATTAGTCTAATGTCGGCGGGTACAATATTGCATTTTTTTAGAACAACGCGATCGCCAGGGCTAAGATTTTTAGCTTCGTAATTTTCCTCTTTTTTATTACTGATAATAGAGCATTAAGGTGAGAGCATTTTTTTTAATACCCTCAATGTAGTTTCAGCCCTCAACTCATGGAAAAACTCTAGAAAAGAGTTAAAAATAATAATAGTTAAAATGGCTGCAATTATAAGAATCAAAATTAAAAAAATTAGAAATTGTCGCGCTAATATGGAATACCAATGCACAGGTCTGATATCTATAAGTTCATTTAATTCCCGTTTCAGTTAATGCATGCCATGGCTTCATAATACTTTCCCTATTTAGCGGAGAGGAATTTATTTTTTTCTTGTGAATTATTCTTATTTCATTATGGTTTAAATATAATAAATTTACTTATAAAATCCTTCATGCTAAAAGTTAAAGGATGCATTCAAAATAAATATATTTCTATGAAAATATATTTCAGGAAATAACAAATGGAATTTTTGCACCGCAAAAAGATACCCCTCTTAATATTAACGATTCTAATTTGTTTTTACTTGATTGTAATACCAGGAAAATTGTCAAAAGAGCCTAAAATAACGCTGCAATCCAAATTCTCAGCTGAAATAAAATTACCTAACCCAACATACATCAGTAATAGTTCTATTGAAGAAGTATTGAAAAAACGTCGTTCCGCAAGGCTATATAAGGATGAAGCAATAACATTACAGCATGTTGCTCAATTACTCTGGGCCTCACAAGGTATAACCTCCAAAAATGGTTTTCGTACGACTCCTTCAGCAGGGGCTCTTTATCCATTGGAAGTTTATCTAGTAAGTGGGAACATAGATAAATTACCATCAGGCATATACCATTACTTACCTTCTAAACATGTGTTAAAAAAATTAAAAGATGATGATGTACGGGTCCAACTTGCTAAAGCGGCATTTAGACAAGATGCTATCGAATTAGGGGCAGTTGCTATTGTTATAGCAGCAGAATTTTCTCGCACAACGAATAAATATGGCGATAAAGGGAAGAAATTTGTTTTTATGGAGGCTGGTCACGCTGCACAAAATATTTATTTGCAATCTGTATCGTTAAATCTTGGAACCGTTTCCATAGGCGCATTTGATGAAAATCAAGTTAAGGCGATCCTGGATATTAAAGAGGAACCATTATATATTCTTCCCATAGGGAAAATTTAAAGAACATTAAATCAAGATTTATAAACAATCTAAGATTTCACTTAATAATAGGAAAAAGTAATTTTCATCAGTTTCTTTAAAAGAAATTATGGCTCATGTTCATACATGTCAACCTTGTTCTCCAACTGCACAAGCACTTTTTACGTAACTATAACCATGCTTCTGCTAAGAATTCCTTATCAGGTCGGCTTGTCCCACAAGTCATTGGCTCTGGCGCCGCGTTTCGATTCCGCGAGGTAACTTCTTATGACTCACCTAATCTTTCCAGTATTCCCGTTGTTGGATAAAGACTGCCTAGAATATAGTCCAAGTATAGCCCTGTTTTAAATAACTATGCGCCAGCAAACGTGACATTAATGTTTAAAAATTAACATTATTTTTCACCCTCCTGAGTGAGTGTCCAAATAAAAAAATCTAAACTATTCCCAACGGGTTGATTAACTTCAGATTCACCAAAATCTATTGTTGTAGAATAAGAAAATTTTTTATGTCGATATAATACATACCATGGGGGGACGAAAGGTAAGAAAAGAAGATAAAATAATCAAATAATATGTTTATCTAGTCCTTAATTAAGACTGGTTGACGCGACTTAGCAACATTCCTGTAAATAAGATTAGCTTATAACCTAAAACAATAGTATAATGGTAATTAGCTAGAAAATGTCTACTTTTACACTCTCCAAATCGTCGTTTTATTCATTTAATCCCACGCTCTGTAGTTTTAATTTTTGACCGGTTTCCGGCTAAATTCGCCTATACAGGCATTTTAATAAATATTTAAGGATACTTATGTCTCAAACAGTAAATGGGGTTGTTAAATGGTTCAACGAAACTAAAGGATTTGGTTTTATAGAGCAAGAGTGTGGCCCGGACGTGTTTGCTCACTTTAAAGAAATTGCAAGTTCCGGATTTAGGACTCTCACTGAAGGTCAACGGGTAAAATTCATTGTAACGCAAGGAGCAAAAGGTCTTCAAGCACAGAATATAATAGCCCTTTAATTCAAATAACCAATATTCTTTCTACCACTATACCTCATTGCAGATGTAGTGGTTACTTTATAGTGGCTACTTTAAGGACGATACCGTGAGACAAAATAAAATTTATGTAGGCAACCTACCCTTTGGAATTACCGAAGCGGCATTACAAGCAGAGTTTTCTAAATACGGTAAAGTAGAGGAACTTCTTTTAATAAAAGATCGTTTTACTGGCCACGTCAAAGGATTTGGCTTTATAACCTTTAGTACCCAGCAAGAAGCTGAATCCTCTTTAAAAATGAATGGGCAATTGCTGGTGGGGCGTGCATTAAAAGTAACTATGGCCCAAGTGAATTACACCTCGCGCGTGCGTCATCGATAAGTTATTTTAGGTTTTCCACGTATCCTACAGTAAGTACCAGCAATCAAAAACAGAAGCAAATTCTTTCTGTCAATTTAAAAATATCGTTCCAAGTTGCCCACCGCATAGTGCTCAAATTCTCTGCCTATAGATTGTAAACCCAAAATGTTTTGTACGGATCTTTCTTAATTAAGTGATTGGTTCGAGCCTGTGGTAATGAATAATATATTATTGATTTATATATTTATTTTATGCTAATTTCAAAAATAAATAGACCAATAAAGGAGCACACTCAAAATATAATTAACACTAAATTTTATTGCAAACCATTTGTTTTAATTTAAGGGATAAGATTTACAGGAGAGTAACATGTTTGAATATATCATACAAAAAGCAAAAATCATTTATCTTTATTTTTTTGCCTATAGAAAATATGAGTTTATCAATAGATGTAATATATTATTAAATCAATTTTTTGACAAAATTGAAGAGATAGAGCCTGAGTATGTGAGTCATTTTAACTGGGATGAACTTAAAGATGAGTTTAAAACTGATATCTTTAATCTTATCTCCACTGATAACTGGACAGTTTTTCATGATATCGTTGTTAATTTGAATGAAGAATCTTTAACTAAGATTACTGATTTTGCAGCAGAAACATTTGTAATTGTCTTATTAAGAGAAAATACCGCTGAACTTTTATCTCAGATAAAGGAAGAATTAAAACAAAAAATAGACAAAAAAAGCTTTATTGCATTAAATAAAATTTTCAATTTGTATTTAGAATTAAAATCCCTGTATGAAATCAATTCACTTGAATCTCCTACGGAAGCTCTTATCATCACCAAAACTGTTTTTGAAGCATTTTTAAAGTCTTTCATATCAGAACCTCTGGTGAATAAATGGTTGAGTATATTACAAAAGCCAATTGCATCTAATGAACCTACTCTCCCGTTACGCTTTAAATATCTTGAATTTGAAGGTTATACCTTGCAACCAACACCTCCTCATATTAAAAATGCAGCAATATATGAAAATCCACAACAAGAGCAATTTATTTTTAAAAAAGCCAAGCACTTAGAAGATATTTTAGCAAGCACAATTGCGAGTGCTATAGCCCATCCACTTTGTTCAAGCATATTGCCGACTCAGGCCGTTTGTTCAGATAAAGATAGTGTATTTCTAACTCAGCCATTTTTGGCTAATTTAAAAACTATCGTTCCCAGACATCTGGATTTTATTACCTCCCGAAATTCTCTATTTCAAAGCGGACAATTATTTTCGAAATTTCAAAATGAAAAATATAAAGAAGATAGTCAATTTTTGACAGAATTTTGTCATATTATTGCCACGAGTTTTTTAGTGTCAGATTGGGATTTGCATCTTGGCAATATAGTATTAAATAAAAAACATCTTTATAAAATTGATCATGATTGGGCTTTAGATGAATTAGGGCAAATTAAGATTTTATCATTTTTTGCAAAACGAAATATTTTAAATACTGTTTATCAAGATCGATTTCCCCCAAGTAATGCATTAAGAGATTATCAGTATCTATTTAATACTCATGAATTTTTTGATGCATTGAGAAACATTGCAGACAAAGCCGAGCAAACTTTAAATACAACTCTAGTAAATGTCCATAATACATTGTTGAAAACATTAATTCTCTTTACAGAAGAGGAAAAACATACTGCCTTAAATGGGTTAATGGTTAGGCTCGGCGGCCAATTTACTGATAACCAGTATCAGCTTGACAATTGGTGTGAAGATATTGTCAATACTATTGGCAAAGGCTTGCAACATCGTATTCATTGTATGAGATTAATGGCCATTTGTTCTGAACTTCATAATCTTGAAGATACTTTTGAGATTGAAAAACAATTGCATGTGATCCAGGAGTATTTGCTACAAAATGATAAAGAGTTGACTATAGGGTATAAAATTATCCCCCTGGAAGCTCAAACACTAATTAGACAGGGTTTAAGAAAACTGACGATGGAAAACGTGA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41 | Lactococcus_phage(16.67%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2994036 : 3003286
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR134286|2994036:3003286|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR134286|2994036:3003286|2994036_2995719_-|VEE03437.1|protease|DBSCAN-SWA MLKLGILSLGLLSIAHNALATSAHDSVRVIIKYKEQITSVSSLKSQIKQSTQLPVKQLNPMANGAYLLILDATNSAFSKEMDNEDTTSLVLERLRKNPQVLYAVKDRVSYFKPVPDPEILDAGNILSHEIQWDEFSRPAGIMLESKPGSRDGAWFYTTGLSKEPVVVAVLDTGIALNENLINNLVKDDAGNIWGWNFAGNNNNLMDETRSYHGTHVAGTIAGYGHVMSGMGEDLKILPLKIPGSNGMFYESSVINAIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKILNMSFGVDKGPNEEIDYCDQALQEAVFFARDNGAVLAVAAGNDNVWEHFNAPAICNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSVTLAAPGGDKRYGLWGGILSTVNPGGGYGGSGFDFYQGTSMATPHVAGVAGLILAASNKELGSEQIEQLLYMTTHDFGVSSDSNKSCVGKKPCGHGILDAENAVKAAAAGYDLLFSSPKIESLTMQNCGKNSLTPGKSRVVLKGVTWILDNTACESMDSFQKPHIEQTKNGSIIAHYGSVSYRLDQRAYKECHVIGYDGVGCYL >LR134286|2994036:3003286|2998645_2999758_-|VEE03440.1|DBSCAN-SWA MMNQPAILALADGTIYKGISIGASGDCVGELVFNTSLTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHIGNTGCNHEDMESNKVWASGLVIRNASILHSNYRAEQSLQDWLKKNGVVGIADIDTRDLTLRLREKGALGACISTDVDNPELVLTKAKSFSGLQGVDLALEVSRKTIERWHVGLGEWGKNSQPQQFHVVAYDFGVKHNILRILYDKGCHLTLVPARTSAAEVMAMDPDGIFLSNGPGDPQACDYAIRATQEFLEHNIPLFGICLGFQILALACGGVTKKMKFGHHGANHPVIETEGKKRVFITSQNHGFAVDEESLPDCLAITHRSLFDNTLQGIRHKEKPALGFQGHPEASPGPHDIEIIFNEFIQLMS >LR134286|2994036:3003286|2996052_2997378_-|VEE03438.1|DBSCAN-SWA MELVDKVGVRGNMIHDYKVADMALASWGRKEIAIAETEMPGLMALREEYGATKPLKGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAAAAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLAGPNNWAPNLLLDDGGDLTQIIHQKYPQLLPNIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGELSIPAINVNDSVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMVAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGAVVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHEHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDVQSLKKYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIILLAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFSNQVLAQIELFKNADQYEKQVYVLPKLLDEKVARLHLGRIGVKLTQLTDEQSKYLGVDIKGPYKPDHYRY >LR134286|2994036:3003286|2997388_2998537_-|VEE03439.1|DBSCAN-SWA MNESHVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILMQDPNARVACEVFVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEAVTRQVVKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNKETKILGAGDQGLMFGYASRETDVYMPAPIAYAHRLMEKQSYLRKSGALPWLRPDAKCQLTLKYEHGIPVEVDTVVFSTQHAAEISHNDLIEAVREEIINTTLPVEWLTRRTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVETFGTGRLKDNEIIELVNTHFDLTPQGIIEYHDLLRPIYRQTATYGHYGRETFPWERLDKVAELRKAL >LR134286|2994036:3003286|3001336_3003286_-|VEE03442.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDGEVLVGQSAKRQAVTNPDNTLFAIKRLIGRRFDDAVVQKDIKMVPYKIVKADNGDAWVCVKNQDKAPPQISAEVLSKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDVSIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIDYLASEFKKDSGIDLHSDPLALQRLKDAAEKAKIELSSSQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGIMTKLIEKNTTIPTKTAQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLSDIPAAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSDEEVDAMIKDAKSHAEEDKKFKEMADLRNQADSLIHSCEKSMKDLATELTDDEKKGIETAIAELKEAIQGTDKAKIEDKLKVLSDASAKMAERVYAKKASEGQAGQGQAHQEQAQTQAHESAKTDESVVDAEFEEVKDDKK >LR134286|2994036:3003286|2999893_3001033_-|VEE03441.1|DBSCAN-SWA MEKRDYYELLEVSRTASDAEIKKAYRKLAMKYHPDRNPGDSEAEEKFKEIQSAYSVLSDPQKRAAYDQFGHAGVDPSMRGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRASGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAALGKEVQITVPRHGTCTVCNGSGAKAGTQPKTCETCNGVGQVRIQQGFFSIQQTCPHCHGEGKTISDPCSSCHGQGRIRESKKLTVKIPPGVDNGDRVRLSGEGEAGMHGGGPGDLYVQVSIKKHTIFERHENDLHCEVPISFITAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPQETQTSKVFRLRGKGMKSVRGHGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLTKFHESLENAKGNHSPRSNSWFAGVKKFFEDMKF |
6 | Bacillus_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
3186980 : 3237464
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LR134286|3186980:3237464|DBSCAN-SWA 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43 | Caldibacillus_phage(11.11%) | transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
3427718 : 3505090
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LR134286|3427718:3505090|DBSCAN-SWA 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60 | Staphylococcus_phage(22.22%) | integrase,protease,transposase | attL 3429159:3429173|attR 3439465:3439479 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
3772557 : 3821849
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LR134286|3772557:3821849|DBSCAN-SWA 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MQTRLDVFTIKSPSLLPDPYGLLQVAQPTQPLADLPGQIEQYDLAQVPVESYEEPKEGIIPKRMNYIYIVNPIDACTPQNNHLETIALFKKLYPDYITTLWITSSAYTPEQQKSLINWAKKNKIHLIDSSILDGHIGPSEQMYQLELLRRNYAAATDQLRLAILYHFGGIYSDVDVVADPDPLHRLPEELKAPQGLYIHKGDVRFTRSNQHPLDVYKMAKRFGDSPESYCQIHYGSSNDFILAVRHCHILQKIQEKIASKYLVPAAELLKEVEYQNPSSGAYLSFDPDRPWPTQGFLKQWTIEVTGPTSLNDIYEQEFPQLDDAIEQNERFLRSFYFTNELSWLKLKKEQIAFPEKATEIVVTSLLYDLTMESGSLRLDRYMAFLSKEQMVDVLKILSQQYPKQLENVKFVFPYDKSIHSLLLSHRDQFPALSQSLFTEADEVKSSPGNNLISTTNHTKLEKTETPDPSTVPPDRNTPATLNRHGFFQPVIEFFEKINPSKSISGDLHVLRR |
49 | Vibrio_phage(12.5%) | transposase,tRNA,holin,integrase | attL 3787007:3787024|attR 3824249:3824266 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
3835823 : 3866361
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LR134286|3835823:3866361|DBSCAN-SWA 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MKGQFSSSLPLAKLSIEEMQVAIPKLDRGIDALKGFDIKTISKGNEPEIVALSQRISRLIIGIFGNDTFEYNQYHSFSNLSYLSLSLHNNPSDIRGIIRHKVEHAISTLESIKQGFLEELEEIDRLGFGVRAIKAYEGLSLHPKIEIAVNALFLDGHYANAIEDSVKALSEMVRLKSGFTEDGVALMQKAFSPKNPKLKFNLLEDRSDEDEQKGFMDLFTGAVSGLRNPRAHKIIKDDPDMGLEFIAFVSLLAKLLDKTLVNENHMATPRAITQ |
34 | Bacillus_phage(28.57%) | transposase,integrase | attL 3826229:3826244|attR 3858726:3858741 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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