Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134294 | Streptococcus pneumoniae strain NCTC12977 genome assembly, chromosome: 1 | 2 crisprs | cas3,DinG,DEDDh,RT | 0 | 0 | 13 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR134294_1 | 1161750-1161835 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134294_1
|
1 spacers
spacers of LR134294_1
>1.1|1161775|36|LR134294|CRISPRCasFinder GAAAAAGATAGCGCTTGGCGCTGTCTATTTATTTTG |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134294_1
The CRISPR arrays of LR134294_1 >merge|LR134294|1|1161750-1161835|CRISPRCasFinder TTTTTGAAACGTTTCATTTTTGCTTGAAAAAGATAGCGCTTGGCGCTGTCTATTTATTTTGTTTTTGAAACGTTTCATTTTTGTTT >LR134294|1|1|1161750-1161835|CRISPRCasFinder TTTTTGAAACGTTTCATTTTTGCTT GAAAAAGATAGCGCTTGGCGCTGTCTATTTATTTTG TTTTTGAAACGTTTCATTTTTGTTT
>LR134294.1|VEE29213.1|1160820_1161738_-|ABC-transporter-membrane-protein MNSKAKQVSLWERIKKQKLLLLMTVPGLVLTFIFKYIPMYGVLIAFKDYNPLKGILGSDWIGFSEFTKFISSPNFGILLANTLKLSIYGLLLGFLPPIILAIMLNQLLSEKVKKRIQLILYAPNFISVVVIVGMIFLFFSVGGPINNFLSMFGMKADFLTNPDFFRPLYIFSGIWQGMGWASTLYTATLVNVDPALVEAARLDGANIFQRIWHIDIPALKPIMVIQFVLAAGGIMNVGYEKAFLMQTSLNLPTSEIISTYVYKVGLVSGDYSYSTAVGLFNAVINVVLLVAVNQIVKRMNNGEGI >LR134294.1|VEE29209.1|1159919_1160810_-|ABC-transporter-permease MKNSIMDTKFDRRILLLNKIIIVFIVLITLLPLLYIVVASFMDPKVLVSRGISFNPADWTVEGYQRVFSDQSILRGFINSLLYSFGFAALTVLLSVFTAYPLSKKDLVGRRWINYFLIVTMFFGGGLVPTYLLVKDLGMLNTPWAIIVPGAVNVWNIILARAYFQGLPEELVEAAVIDGANDLQIFFKIMLPLAKPIMFVLFLYAFVGQWNSYFDAMIYIKDPNLEPLQLVLRKILIQSQPGQDMIGAQAAMNEMKRLAELIKYATIVISSLPLIVMYPFFQKYFDKGIMAGSLKG >LR134294.1|VEE29206.1|1158274_1159891_-|ABC-transporter-substrate-binding-protein MKFKTFSKSAVLLTASLAVLAACGSKNTASSPDYKLEGVTFPLQEKKTLKFMTASSPLAPKDPNEKLILQRLEKETGVHIDWTNYQSDFAEKRNLDISSGDLPDAIHNDGASDVDLMNWAKKGVIIPVEDLIDKYMPNLKKILDEKPEYKALMTAPDGHIYSFPWIEELGEGKESIHSVNDMAWINKDWLKKLGLEMPKTTDDLIKVLEAFKNGDPNGNGEADEIPFTFISGNGNEDFKFLFAAFGIGDNDDHLVVGNDGKVDFTADNDNYKEGVKFIRQLQEKGLIDKEAFEHDWNSYIAKGHDQKFGVYFTWDKNNVTGSNESYDVLPVLAGPSGQKHVARTNGMGFARDKMVITSVNKNLELTAKWIDAQYAPLQSVQNNWGTYGDDKQQNIFELDQASNSLKHLPLNGTAPAELRQKTEVGGPLAILDSYYGKVTTMPDDAKWRLDLIKEYYVPYMSNDNNYPRVFMTQEDLDKIAHIEADMNDYIYRKRAEWIVNGNIDTEWDDYKKELEKYGLSDYLAIKQKYYDQYQANKN >LR134294.1|VEE29203.1|1156945_1158265_-|sucrose-6-phosphate-hydrolase MGDKKYTVEKANRFIAENKHLVNTQYKPEEHFSAEIGWINDPNGFVYFRGEYHLFYQFYPYDSVWGPMHWGHAKSKDLVTWEHLPVALAPDQDYDRNGCFSGSAIVKDDRLWLMYTGHIEEKTGVRQVQNMAFSDDGIHFEKISQNPVVTGTDLPDELIAADFRDPKLFEKDGRYYSVVAAKHKDNVGCIVLLGSDNLVEWQFESIFLKGVEHQGFMWECPDYFELDGKDCLIMSPMRYQREGDSYHNINSSLLFTGKVDWGEKRFIPESVQEIDHGQDFYAPQTLLDDQNRRILIAWMQTWGRTLPTHDQEHKWACAMTLPRILRLEDGKLRQFPVKKGQYQIQIDKDCHYHLGNDTDYLEFGYDSNAQQVYIDRSHLIQKILGEEEQDTSRRYVDIEAKELEVVLDKNSIEIFVNQGEASLTATYYLTVPAELSRID >LR134294.1|VEE29200.1|1155129_1156401_+|chromosome-segregation-helicase,-ATPase,-AAA-family MPDNLALRMRPKTIDQVIGQEHLVGPGKIIRRMVEANRLSSMILYGPPGIGKTSIASAIAGTTKYAFRTFNATVDSKKRLQEISEEAKFSGGLVLLLDEIHRLDKTKQDFLLPLLESGLVIMIGATTENPFFSVTPAIRSRVQIFELEPLSNQDVKEALQIALSNPERGFDFPIELDEDALDFIATSTNGDLRSAFNSLDLAVLSTPENDEGIHHITLDIMENSLQRSYITMDNDGDGHYDVLSALQKSIRGSDVDASLHYTARLIEAGDLPSLARRLTVIAYEDIGLANPEAQIHTVTALDAAQKIGFPEARILIANVVIDLALSPKSNSAYVAMDKALADLKTSGHLPIPRHLRDGHYSGSKELGNAQDYLYPHNYPGNWVKQDYLPEKIRNHHYFQAEDTGKYERALAQRKEAIDHLRKI >LR134294.1|VEE29197.1|1154620_1154860_-|Uncharacterised-protein MKREVISNGNDGPSQEILIFTKQIRHWILSDQVISGKRKLFFREDTPKEILDLYENIKSKLDFAYQEVHSNNGLKKYEK >LR134294.1|VEE29194.1|1153471_1153924_-|phage-like-protein MLVTYPALFYYDDTDGTEATYFVHFPDFEYSATQGEGISEALAMGSEWLGITVADLIESDGELPQPSDINSLSLIDNDPFKDDEDFVSTYDLDKSFISMVSVDVSEYLGSQEPIKKTLTIPKWADKLGREMGLNFSQTLTDAIADKKVQA >LR134294.1|VEE29191.1|1152710_1153181_-|Protein-of-uncharacterised-function-(DUF3013) MATYGFLDILEEELDKNFPFDFEISWDKRNHAVEVSFLLEAQNAAGVEMVDEDGEVSSDDILFEEAVLFYNPAKSTVNAEDYLTVIPYLPKKGFSREFLAYFVLFLKDTAEVGLDTLMDFLEDPEAEEFVMEWNQEVFEEGKVGLEEGEFYPYPRY >LR134294.1|VEE29188.1|1151624_1152692_-|putative-peptidase MKKIGTYLVYVLAVVFIMLAFACGTIAFAELGYSAVLAFTFGYAFALLSMYLIFILHELGHAFCGYLTGYRLVAFGLGHFILTKKSGRFHLSRTAILKNVGAQYIGLKEDESDQRIILMLSGGLMVHLGLILLAIVFGFLTRSWYFAGTWIFLNLSFFLNNILPVDITDGAKIWELLQHPENTKYAYLVLRHSAQTLLAPQEYDLKDFVQAVPEDARGSFADGVLGMQGEVSILEGKEEVAKQQFQALLERTTTPMMQTVAQLSLLHIALLEGDFEQAEQYASIRQVKSFLSLKLSNLQVIQAWYQLKVKKDVDRTRKALKIARQKMDSSRMLRDEKRYYENLLAELEKELAEGV >LR134294.1|VEE29184.1|1151194_1151623_-|MutT/nudix-family-protein;-7,8-dihydro-8--oxoguanine-triphosphatase MEIEISDFQGCKIALFCGDKLLTILRDDKDDIPCPNMWELPGGGREGDESPFECARREVYEELGIHLDEDCLLWSKIYPSVIFKGKKSVFMIGQLRQEQFDNIIFGDEGQGYKLMPIEEFLNSKQAVPQLQGRLRDYLEESL >LR134294.1|VEE29216.1|1161904_1162894_-|LacI-family-sugar-binding-transcriptional-regulator MVEQRKSITMKDVALEAGVSVGTVSRVINKEKGIKEVTLKKVEQAIKTLNYIPDYYARGMKKNRTETIAIIVPSIWHPFFSEFAMHVENEVYKRNNKLLLCSINGTNREQDYLEMLRHNKVDGVVAITYSPIEHYLTSGIPFVSIDRTYSDIAIPCVSSDNDAGGREAAKQLISKGCQHLAFVGGHNTTINETKRRRISFEKYVQEHKIPLSIFDLDETVTDYYGKLESFLEENSSIDGIFTINDFAALDVIDILEKNGKRIPHDVQIIGYDGIKMAGDRDYLLSTIEQPLEEMAKEAVRILFDIIDGKTVNLQTILPVKFVEGKTTKK >LR134294.1|VEE29219.1|1163256_1164738_-|transcriptional-activator MRDLLSKKSHRQLELLELLFEHKRWFHRSELAELLNCTERAVKDDLSHVKSAFPDLIFHSSTNGIRIINTDDSDIEMVYHHFFKHSTHFSILEFIFFNEGCQAESICKEFYISSSSLYRIISQINKVIKRQFQFEVSLTPVQIIGNERDIRYFFAQYFSEKYYFLEWPFENFSSEPLSQLLELVYKETSFPMNLSTHRMLKLLLVTNLYRIKFGHFMEVDKDSFNDQSLDFLMQAEGIEGVAQSFESEYNISLDEEVVCQLFVSYFQKMFFIDESLFMKCVKKDSYVEKSYHLLSDFIDQISVKYQIEIENKDNLIWHLHNTAHLYRQELFTEFILFDQKGNTIRNFQNIFPKFVSDVKKELSHYLETLEVCSSSMMVNHLSYTFITHTKHLVINLLQNQPKLKVLVMSNFDQYHAKFVAETLSYYCSNNFELEVWTELELSKESLEDSPYDIIISNFIIPPIENKRLIYSNNINTVSLIYLLNAMMFIRLDE >LR134294.1|VEE29222.1|1165180_1165345_+|GlsB MGIIANVFAGLVGAYAGQSLLGSWGPSIAGMALLPSIVGAAIVITVVSFFTGRK >LR134294.1|VEE29225.1|1165428_1165995_+|membrane-protein MSKAKKICFIIFCILILTIFLPVLIDYHQVSDLGIHLLSWRQNSVVEFYLARYVFWGTVVLSTLVLLSILVVMFYPKRYLEIQLETKNDTLKLKNSAIEGFVRSLVSDHRLIKNPTVHVNLRKNKCFVHVEGKILPSDNIADRCQIIQNEITNGLKQFFGIERQVKLEVAVKNYQPKPQNKKTVSRVK >LR134294.1|VEE29228.1|1166006_1166177_+|lipoprotein,-putative MEWLKQYRYPIIAGLIGVFLACLIVSFGFFKTIFVLILGALGVAAGLYIEKNYIDK >LR134294.1|VEE29231.1|1166215_1166824_+|general-stress-protein-24 MSNEKNTNTNVEKKDATVVAHEIKGELTYEDKVIQKIIGLSLENVSGLLGIDGGFFSNLKEKIVNSDDVTSGVNVEVGKTQVAVDLNVIVEYQKNVPALYSEIREIVSSEVAKMTDLEIVEINVNVVDIKTKEQHEADSVSLQDRVSDVAESTGEFTSEQFEKAKSGLGSGFSTVQEKVSEGVEAVKGAANGVVSHENTRVN >LR134294.1|VEE29234.1|1166854_1167058_+|CsbD-like-protein MSVEEKLNQAKGSIKEGVGKAIGDEKMEKEGAAEKVVSKVKEVAEDAKDAVEGAVEGVKNMLSGDDK >LR134294.1|VEE29237.1|1168208_1168979_-|Sulfite-exporter-TauE/SafE MVEIIYFLIIIIASGLGSISGMGGGIIIKPLMDSFGYHSVSDIAFYSSFSVFIMAIISTTKRFSQSKEIKWRLIFTVSFSSVLGGFLGHLIFQVLLSQLSVRLVSIVQMILLFVMLLVSFVLTDFKKTYQFDKIGFYMICGLLLGLISSFLGIGGGPLNVSLLMVFFSISIKEATMYSLAIIFFSQLSHLATIVVVTGLNQYHLAPVPVIFLASICGGVLGTVVSKVLPENWVRYCFKGMLFFVMGMTLYNLFHIL >LR134294.1|VEE29240.1|1168993_1169842_-|sulfatase-modifying-factor-1-(C-alpha-formyglycine-generating-enzyme-1) MKMKKIKGGTFMMGTNSEEGFLDDFEGPQVAVSVKDFSIADTPVTNQEFAQFVKETGYKTLAERQEWSFVFILFVPEAEREGYPHPAGAPWWLQVSNACWKHPYGENSNLVGLEDHPVVHVALEDALAFCNWSGMSLPTEAQWEYAARGGRQSEYPWGDTLLEGGYYHANTWQGRFPYENTALDGFIGTAPVYEFLPNDFGLYQMIGNVWEWCRNPRYTLLASFNEDDYELPKYGIQDEEYAIRGGSFLCHCSYCNRYRVAARNGCISTSTSSHLGFRCLKE >LR134294.1|VEE29243.1|1169838_1171314_-|arylsulfatase MVQTKQPNIILIVVDQMRADALSLNSKDKLVSTPTLDMMASVGYNFENAYSPVPSCVPARAALLTGLDQDKSGRVGYQDEVPWNFTNTLPKVFKDMGYQTECIGKMHVFPSRQRLGFDHVLLHDGYLHVDRKYDKAYGSQFDYASDYLAFLKGKVGYDVDLIDDGMDCNSWEARPWDKDEKLHPTNWVVSESILFLQRRDPTVPFFLKMSFEKPHAPLNPPKYYFDMYMERLPQFLDLHIGNWEVLEKQIPSIYALGGKLKEDDQRRMVAAYFGLITHIDHQISRFLTALKEFRHDKDTIIWFVSDHGDQLGEHYLFRKGYPYQGSIHIPSFIYDPAGLIAGNRGTIKQLVKIQDIFPSLVDLAGGTTTDELDGRSVKNLLFGQYEGWRTEFHGEHALGKDSSQYILTDQWKFIWFPVLNHYQLFDMKKDPHEMNDLYPSEKYQPIVRQMKKKLVDFLRYREEGFVVDEELVPVELSKITPTLTKTGDSQS |
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CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR134294_2 | 1755217-1755312 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134294_2
|
1 spacers
spacers of LR134294_2
>2.1|1755241|48|LR134294|CRISPRCasFinder TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134294_2
The CRISPR arrays of LR134294_2 >merge|LR134294|2|1755217-1755312|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAATTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGAAATGTGTAAAATTTTTATATATAA >LR134294|2|2|1755217-1755312|CRISPRCasFinder AATGTGTAAGATTTTTATATATAA TTTTTCTACACATACATTGTACATCTAAAAGAAAGCCCTGTCAAGAGA AATGTGTAAAATTTTTATATATAA
>LR134294.1|VEE30967.1|1754872_1755199_-|transcriptional-regulator MYFPTSSALIEFLILAVLEQGDSYGYEISQTIKLIANIKESTLYPILKKLEGNSFLTTYSREFQGRMRKYYSLTNGGIEQLLTLKDEWALYTDTINGIIEGSIRHDKN >LR134294.1|VEE30964.1|1754292_1754886_-|membrane-protein MTRTEYLTQLELYLKKLPEADRIEAMDYFRELFDDAGVEGEEELIASLGTPKEAAHEVLSNLLDKKINEAPAQKNNRQILHIALLALLAAPIGIPLGIAILVTLFAILVAALTVILAFFAVSILGIIGGFLFLVESFTILAQAKSAFILIFGSGLLAIGASSLVLLGISYVTRFFGLLIVRLVQFVLKKGKRGNQHA >LR134294.1|VEE30961.1|1753388_1754300_-|Uncharacterised-protein MRKWTKGFLIFGVVTTVIGFILLFVGIQSDGIKSLLSMSKEPIYDSRTEKLTFGKEVENLEITLHQHALTITDSFDDQIHISYHPSLSAHHDLITNQNDRTLSLTDKKLSETPFLSSGIGGILHIASSYSSRFEEVILQLPKGRTLKGINISANRGQTTIINASLENATLNTNSYILRIEGSRIKNSKLTTPNIVNIFDTVLTDSQLESTENHFHAENIQVHGKVELTAKDYLRIILDQKESQRINWDISSNYGSIFQFTREKPESRGTELSNPYKTEKTDVKDQLIARSDDNIDLISTPSRR >LR134294.1|VEE30959.1|1752261_1753326_-|Uncharacterised-protein MKQEWFESNDFIKTTSKNKPEEQAQEVADKAEETIADLDTPIEKNTQLEEEVSQAEVELESQQEEKIEAPEDSEARTEIEEKKASNSTEEEPDLSKETEKVTIAEESQEALPQQKATTKEPLLISKSLESPYIPDQAPKSRDKWKEQVLDFWSWLVEAIKSPTSKLETSITHSYTAFLLLILFSASSFFFSIYHIKHAYYGHIASINSRFPEQLAPLTLFSIISILVATTLFFFSFLLGSFVVRRFIHQEKDWTLDKVLQQYSQLLAIPIFLTAIASFFAFFDSLRFTALLCVISIGIILLASLHIITRPSQASETDSFYQLFLSVLVNGVIILLFFVAEVALIGDYLRILAFL >LR134294.1|VEE30956.1|1751223_1752084_+|Uncharacterised-protein MAKTFFIPNKQSILGEQEILNAKSILALLDGLESHSYDVVYLRQPLNRLEYIECAIVGQSQFLFKVSYADGQKAYRVNLPDLLTKTDWLIIKSFLDALLAYTGTDIEGLDGFDFEAYFQASIQAYLADPVARFTICQGIFNPIFFSRENLKSFLEADGLAQFEARVRAVQETDAYFARVSFYQDREGEVHGVYRLAQGVKTVLPREPFVPAAYIEQLMDKEVQWEIDLIQITGDGSKPEDYEAIACLDYAKFLEVLPLSFYHQLDANQIEVQPILDKDFKTLAQEK >LR134294.1|VEE30953.1|1750115_1751102_+|rhodanese-related-sulfurtransferase MAKDIRVLLYYLYTPIENAEQFAADHLAFCKSIGLKGRILVADEGINGTVSGDYETTQKYMDYVHSLPGMEELWFKIDEESEQAFKKMFVRYKKEIVHLGLEDNDFDNDINPLETTGAYLSPKEFKEALLDKDTVVLDTRNDYEYDLGHFRGAIRPDIRNFRELPQWVRDNKEKFMDKRVVVYCTGGVRCEKFSGWMVREGYKDVGQLHGGIATYGKDPEVQGELWDGKMYVFDERIAVDVNHVNPTIVGKDWFDGTPCERYVNCGNPFCNRRILTSEENEDKYLRGCSHECRVHPRNRYVSKNELTQAEVIERLAAIGESLDQAATV >LR134294.1|VEE30950.1|1748368_1749844_+|extracellular-solute-binding-protein MKNWKKYAFASASVVALAAGLAACGNLTGNSKKAADSGDKPVIKMYQIGDKPDNLDELLANANKIIEEKVGAKLDIQYLGWGDYGKKMSVITSSGENYDIAFADNYIVNAQKGAYADLTELYKKEGKDLYKALDPAYIKGNTVNGKIYAVPVAANVASSQNFAFNGTLLAKYGIDISGVTSYETLEPVLKQIKEKAPDVVPFAIGKVFIPSDNFDYPVANGLPFVIDLEGDTTKVVNRYEVPRFKEHLKTLHKFYEAGYIPKDVATSDTSFDLQQDTWFVREETVGPADYGNSLLSRVANKDIQIKPITNFIKKNQTTQVANFVISNNSKNKEKSMEILNLLNTNPELLNGLVYGPEGKNWEKIEGKENRVRVLDGYKGNTHMGGWNTGNNWILYINENVTDQQIENSKKELAEAKESPALGFIFNTDNVKSEISAIANTMQQFDTAINTGTVDPDKAIPELMEKLKSEGAYEKVLNEMQKQYDEFLKNKK >LR134294.1|VEE30947.1|1747235_1748159_+|ABC-transporter-permease MAKKKIKKEKIDNVGIHSFSKKADIFFSIISGLIALSCILPFVFVIIISVTDEKSLLQYGYSFFPSQFGLDGFEFLAQFKDKILQALFISVFVTVVGTLTNVFITTTYAYAISRTTFKYRRFFTIFVLLSMLFNAGLVPGYIMVTRVLQLGDTVWALIVPMLLSPFNIILMRSFFKKTIPEAILESARIDGASEARIFFQICLPLSLPGIATITLLTALGFWNDWFNALLYIKSDNLYPLQYLLMQIQQNMDYIAKAVGLTGQLGVALPKETGRMAMVVVATLPIAILYPFFQRYFVKGLTIGGVKE >LR134294.1|VEE30944.1|1746292_1747222_+|ABC-transporter-permease MKKFSKTLRDNWIFLLMVLPGALWLILFFYIPVFGNVVAFKDYHMTSNGFIDSIINSKWVGLDNFRFLFSSRDAFIITRNTVLYNLGFIFLGLVVSVGIAIILSELRSKRMVKIFQTSMLFPYFLSWVIISFFTDAFLNIDKGVFNHLLESLGLKEVNFYADLGIWPYLLLFLGIWKGFGYSSVMYYATIMGIDPTYYEAATVDGASKWQRIRNVTIPQLTPLVTVLTILAVGNIFRADFGLFYQIPHNAGQLYNVTNVLDVYVFNGLTQTADIGMAAAAGLYQSVVGLILVILSNLLARRVDPNSALF >LR134294.1|VEE30941.1|1745752_1745974_+|surface-anchored-protein MSLQIKLKKLAKELSKLLKDSNLETVDKDVLENSQEELQKAVLFLADEKGSEHTEAELIDNLKEVIAKLKANA >LR134294.1|VEE30970.1|1755337_1756504_-|cyanate-permease MKKQSLFFVPGIILIGVSLRTPFTVLPIILGNISQGLEVEVSSLGVLTSLPLLMFTLFSPFSTQLAQKIGLEHLFTYSLFFLTIGSLIRLINLPLLYLGTLMVGASVAVINVLLPSLIQANQPKKIGFLTTLYVTSIGIATALASYLAVPITQASSWKGLILLLTLLCLATFLVWLPNHRYNHRLAPQTKQKSQIKVMRNKQVWAIIIFSGFQSLIFYTVMTWLPTMSIHAGLSSHEAGLLTSILSLISIPFSMTIPSLTTSLSTRNRQLMLTLVSLAGVVGISMLFFPINNFIYWLAIHLLIGTATSALFPYLMVNFSLKTSAPEKTAQLSGLSQTGGYILAAFGPTLFGYSFDLFHSWVPSVAALLLIDILMTVALFTVDRADKIL >LR134294.1|VEE30973.1|1756654_1757719_+|glycosyl-transferase MTQNVESLLVSIVISAYNEEKYLPGLIEDLKNQTYPKENIEILFINAMSTDGTTAIIQQFIKEDTEFNSIRLYNNPKKNQASGFNLGVKHSVGDLILKIDAHSKVTETFVMNNVAIIQQGEFVCGGPRPTIVEGKGKWAETLHLVEENMFGSSIANYRNSSEDRYVSSIFHGMYKREVFQKVGLVNEQLGRTEDNDIHYRIREHGYKIRYSPSILSYQYIRPTFKKMLHQKYLNGLWIGLTSHVQFKCLSLFHYVPCLFVLSLVFSLALLPITFVFITLLLGAYFLLLSLLTLLTLLKHKNGFLIVMPFLLFSIHFAYGFGTIVGLIRGFKWKKEYKRTIIYLDKISQINKNML >LR134294.1|VEE30976.1|1757760_1759611_+|nucleoside-diphosphate-sugar-isomerase MNKKLTDYVIDLVEILNKQQKQVFWGIFDIFSMVVSIIVSYILFYGLINPAPVDYIIYTSLAFLFYQLMIGFWGLNASISRYSKITDFMKIFFGVTASSVLSYSICYAFLPLFSIRFIILFILLSTFLILLPRITWQLIYSRRKKGSGDGEHRRTFLIGAGDGGALFMDSYQHPTSELELVGILDKDSKKKGQKLGGIPVLGSYDNLPELAKRHQIERVIVAIPSLDPSEYERILQMCNKLGVKCYKMPKVETVVQGLHQAGTGFQKIDITDLLGRQEIRLDESRLGAELTGKTILVTGAGGSIGSEICRQVSRFNPERIVLLGHGENSIYLVYHELIRKFQGIDYVPVIADIQDYDRLLQVFEQYKPAIVYHAAAHKHVPMMERNPKEAFKNNIRGTYNVAKAVDEAKVPKMVMISTDKAVNPPNVMGATKRVAELIVTGFNQRSQSTYCAVRFGNVLGSRGSVIPVFERQIAEGGPVTVTDFRMTRYFMTIPEASRLVIHAGAYAKDGEVFILDMGKPVKIYDLAKKMVLLSGHTESEIPIVEVGIRPGEKLYEELLVSTELVDNQVMDKIFVGKVNVMPLESINQKIGEFRTLSGDELKQAIIAFANQTTHIE >LR134294.1|VEE30979.1|1759869_1760502_-|phosphatase MTSITAIFFDLDGTLVDSSIGIHNAFTYTFKELGVPSPDAKTIRGFMGPPLESSFATCLSKDQISEAVQIYRSYYKAKGIYEAQLFPQIIDLLEELSSSYPLYITTTKNTSTAQDMAKNLEIHHFFDGIYGSSPEAPHKADVIHQALQTHQLAPEQAIIIGDTKFDMLGARETGIQKLAVTWGFGEQADLLNYQPDYIAHKPLEVLAYFQ >LR134294.1|VEE30982.1|1760523_1761396_-|L-serine-dehydratase,-alpha-subunit MFYSIKELVEQADLDFQGNVAELMITTEFELTGREREEVFLLMERNLEVMKASVQLGLNENKSRSGLTGGDAAKLDHYIKNEKTLSDYTILSAARNAIAVNEHNAKMGLVCATPTAGSAGCLPSVLTAAIEKLDLSHEQQLDFLFAAGAFGLVIANNASISGAEGGCQAEVGSASAMSAAALTLAAGGTPYQASQAIAFVIKNMLGLICDPVAGLVEVPCVKRNAMGASFAFIAADMALAGIESKIPVDEVIDAMYQVGASMPTAFRETAEGGLATTPTGRRLQKEIFGE >LR134294.1|VEE30985.1|1761404_1762076_-|putative-L-serine-dehydratase-beta-subunit MKSLRFQSVFDIIGPVMIGPSSSHTAGAVRIGKIVSSIFDDTPTEVEFQLFNSFAKTYRGHGTDLALVAGILGMDTDDPEIPNSLEIAHKRGIKIVWTIQKDSNAPHPNTTKITVKNAHKTISVTGISIGGGNIQVTELNGFAVSLNMNTPTIIIVHQDIPGMIALVTEALSRYGINIAQMNVTREKAGEKAIMIIEVDSRNCDEAIEEIRKIPHLHNVNFFK >LR134294.1|VEE30988.1|1762317_1762890_+|LysM-domain-protein MKSITKKIKATLAGVAALFAVFAPSFVSAQESSTYTVKEGDTLSEIAETHNTTVEKLAENNHIDNIHLIYVGQELVIDGPVAPVATPAPATYAAPAAQDETVSAPVVSETVVSTVSGSEAEAKEWIAQKESGGSYTATNGRYIGRYQLTDSYLNGDYSAENQERVADAYVAGRYGSWTAAKNFWLNNGWY >LR134294.1|VEE30991.1|1763713_1763962_+|bacteriocin,-putative MVCSILASTSVLAVWVDGGQWNYGVGWTGTFGYSDYLHSTRYHTATVRHGGRTSKDYAKPEAWARASLTKIPPTGMEYFYGF 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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
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Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
108076 : 169460
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134294|108076:169460|DBSCAN-SWA 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52 | Staphylococcus_phage(33.33%) | bacteriocin,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
257590 : 368162
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134294|257590:368162|DBSCAN-SWA 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107 | Streptococcus_phage(12.9%) | transposase,integrase,tRNA,protease | attL 349195:349254|attR 351600:352141 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
379660 : 436249
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134294|379660:436249|DBSCAN-SWA TTTACCCCAATTTTCCATGATGAATCCAATAGTAAATGGTTGAAATTCCCACGTTAACCCCTTTAGCCACAACCATCATTTCAGGCAAAAATTTTTGGTTATGATAGTGGAGAATCTTTTCCTTTAGTTCCTTGGTCACGCTTGATCTCTTGACCGAGTGCTTGCGATTATTTTCATAAGACTGTTGAGCATAGTCGGCAGAATAAACCTCTTTGAAGCGCCCTTTTCCAAGACATTTTCGGACTGTCCTACGCTTGATTTTAGTGTGGATAGTTTGAGGAGCTTTTCCAAGTAGAGAGGCAATTTCTCTATTTGATTTTCCTTCTTTTTTCCATCTTTCGATTAAGCGACGGCTATCGATTGTCAAATGTTTACCTTTTGTAGTATAATTGTCTTGCATTTCTGTGCCTTTCTTGTGTTTGTGGTTGAACAACAAGTATAACACAGAGGTGTTTTCTTATGCCTACAAGAGCTATCGGCTAGTTGAACCATCTAATTTTTAGGAGGGCTGGGTGGCTAACTTCATTATAGAACTTTCATTTACGAACATATAGTAAAATGAAACAAGAACAGAACAAATCGATCAGGACAGTAAAATCTATTTCTAACAATGTTTTAGAAGCAGAGGTGTACTATTCTAGTTTCAATCTACTATATTTTTATTTTTTATCAAAAAATACTTTACAAGTTCTTAAAAACATGATATAGTAATAAAGCTTAGAAAATGAGATGATGTTTTCTAGCAAATATAAACCCGAGTAAAAAATGCCTACGGACAGGCAGGGTTGAATGCCGAAGCGTGGTTGAAAAGCCACATTATTGATAGGGTTAAAAGCCTACTTTTATAAGTTGATGTTAGGACACTTGTTCTAATTCATAAATTTTTAGTGTGGTGAAAGCACACGTCATCTTGTGAAACGATCAATAAAGTACGTAATATTTGCTACTAGAGAGTTAGGAAACATCGGGAACAGACATACTCAACAGAAACCAAAATAAACACGTCAGAAGATTGCAGAGCAGGTGAAAACCTGCTCTTTTTTCATGAGTCAACCTTTAGTTCCTTAGTTTTCATAAGGTCCTAAAAATATTGAAAGGAGTATGTTTTGAAAGAGTTAGATCAAAACCAAGCCCCAATTTATGAGGCCTTGGTGAAGTTACGCAAGAAAAGGATTGTTCCCTTTGATGTTCCAGGTCACAAGCGTGGACGGGGAAATCCAGAACTTGTCGAACTCTTAGGAGAAAAATGTGTAGGCATTGATGTCAATTCGATGAAACCCTTGGATAATTTGGGCCATCCTATTTCGATTATTCGTGATGCAGAGGAGCTGGCTGCAGATGCTTTTGGAGCTAGCCATGCCTTTCTAATGATTGGTGGAACAACTTCATCGGTGCAGACTATGATTCTGGCAACCTGCAAGGCAGGAGATAAGATTATTCTGCCACGAAATGTCCATAAATCTGCTATCAATGCGTTGGTTCTATGTGGTGCCATTCCCATCTATATCGAGATGAGTGTAGATCCTAAGATTGGTATCGCTTTAGGTCTTGAAAATGACCGAGTAGCACAGGCCATAAAGGACCATCCAGATGCTAAGGCTATCCTAATCAACAATCCTACTTACTACGGCATCTGTTCAGACCTAAAGGGGTTGACAGAAATGGCTCATGAAGCTGGCATGATGGTTTTAGTAGATGAAGCCCACGGAGCGCATTTGCATTTCACTGATAAACTTCCAATTTCTGCTATGGATGCAGGGGCTGATATGGCAGCAGTTTCCATGCATAAGTCTGGTGGGAGTTTGACCCAAAGCTCCATTTTACTTATCGGGGAGCAGATGAATTCTGAATACGTTCGTCAGATAATTAACCTGACCCAGTCTACATCTGCCTCTTACTTGTTGATGGCTAGTTTGGATATTTCACGTCGCAACTTGGCCCTTCGTGGTAAAGAGTCGTTTGAGAAAGTCATTGAGCTATCTGAGTATGCCCGCCGTGAAATCAATGCTATCGGTGGCTACTATGCCTACTCAAAAGAGCTAATAGACGGTGTTTCGGTTTGCGATTTTGACGTAACTAAGCTGTCAGTTTACACTCAGGGTATTGGCTTAACAGGTATCGAGGTTTATGACCTCTTGCGAGACGAATACGACATTCAGATCGAGTTTGGTGATATCGGCAATATCTTGGCCTATATTTCCATCGGCGACCGCATCCAAGACATCGAGCGCTTGGTTGGTGCTCTGGCTGATATTAAGAGACTCTATTCAAGAGATGGAAAAGATTTGATAGCAGGAGAATATATTCAGCCCGAGTTAGTGCTGTCTCCGCAAGAAGCCTTCTATTCAGAAAGAAAAAGTTTAACTTTGGATGATTCTGTTGGACAGGTCTGTGGAGAATTTGTCATGTGCTATCCTCCAGGGATTCCTATCTTGGCTCCTGGTGAACGCATTACACGAGAAATTGTCGACTATATCCAATTCGCCAAGGAACGTGGTTGCTCCCTCCAAGGGACGGAAGATCCAGAGGTCAATCATATCAACGTCATTAAGAGAAAGACAAACTATAAGAAAAGTCAATAGTTTTATCTAAACTATTTCTTATTTCAATTTGATGATTTGGCGATGATTTTAGAGCACGGCAAAAAGCCCTTGAATTAGAAGCGGTCAATCGCTTAATTTCTATCAGCTTATCAAATCCTGCCTCAATCCTTTTCTGAGGATTAGGGTAGCGTGTCAAGAGTTGGTAGGTATATTCTGAATGCTTTCCAACGATTTTATCCAACTCAGGAAAGATGATATCAAGACAACGAGTGTATTGTACTTTCCAATCAGACTGTTTTTCTTGAGACGATGAATATGTCTAGCCAGTATTTTTAGGTCTACTTGCCGATTATCGTGTTGAAATTGTTCACGATTGGGGTCAGAAAGAAGTTTAAGAGCGATGCCATGAGCGTCTTTCTTATCCGTTTTAGTCTTGCGAAGTGATAATGATTTGGCAAATTCCTTGATGAGCAAAGGATTGTAGGTGTAAACTTTATATCCTTGTTCATGCAGGAAGTTCAGTAGATTAAAGGCATAATGTCCAGTATCTTCAAGAGCGATGAGACAGTCTTGGTTGAGCTGTCGAAGAGACAGATCTAAGAGTTCAAAACCAGCTTTATTATTTGAAAAAGTGAGTGGTTTAAGAACAGTTTTCCTGAAACATTCAAGGCTGTAACATCGTGTTTATTTTTAGCGACATCAATGCCCACATAAAGCATGGGAGTACCTCCAGATATAGTATTTCAAGTCTACTTAGTTATCTACGAACTTTTTGCCTTGTTACCTTAGACGAGATAAAACGTCTATGCGTTATCAAACTCATTACCAATTGAAACAAAAAGCTGTGGTTAGACCCTTTCGGAAATCGTCAAGCGATTGGAGGAAATGAACTAATCCACAGTGGCTTATTCCAAGTATACCACTTGGGCTTTGGCAGTAGCTAACTGCGCTAAATATAATATAAGGAGAAATAGATGGATTTATGGTTTTCTGAAGTTCATACTCCAGATGTCAAATTGTCTCTGAGAACAGCCAAGCAACTTTACGCTGGAAAAAGTGAATGGCAGGATATCGAAGTCTTGGATACGCCAGCTTTTGGGAAAATACTGATTTTAAATGGCCATGTCTTGTTCTCAGATGCGGATGATTTCGTCTACAATGAAATGACCGTTCACGTTCCCATGGCTGTCCACCCAAATCCAAAGAAAGTATTGGTTATTGGGGGTGGTGACGGCGGTGTTGCCCAAGTATTAACACTCTATCCTGAACTGGAACAAATCGATATCGTGGAACCGGATGAGATGTTGGTCGAGGTCTGTCGTGAGTATTTCCCAGACTTTGCTGCAGGGCTAGATGATCCTCGTGTTACCATTTACTACCAAAATGGGCTACGCTTTTTGCGAAACTGCGAAGATGATTACGATATTATCATCAACGATGCGACAGATCCATTTGGCCATACGGAAGGACTCTTTACCAAGGAATTCTACGGCAATAGTTATCGAGCTCTGAAGGAAGACGGCATCATGATTTACCAGCATGGGAGTCCCTTCTTTGACGAGGATGAGTCGGCCTGCCGAAGCATGCACCGCAAGGTCAATCAAGCCTTTCCAATCAGTCGGGTTTATCAGGCCCATATTCCAACTAGCCCAGCTGGCTATTGGTTGTTTGGATTTGCATCGAAAAAATACCACCCTGTCAAAGATTTTGACAAGGAAGGTTGGAAAAAACGCCAGCTTTTCACAGAATACTACACTGCAAACTTACACGTGGGAGCCTTTATGTTGCCCAAGTATGTTGAGGACATTTTAGAAGAAGAGGAAGGAAAAAAATGAGTCGTTTACTAGTTATTGGTTGTGGGGGCGTTGCCCAAGTTGCTATTTCAAAAATTTGTCAAGATAGCGAAACATTTACAGAGATTATGATTGCTAGCCGTACCAAGTCAAAATGCGATGACTTGAAAGCGAAGCTAGAAGGCAAAACAAGTACTAAAATTGAAACTGCAGCACTTGATGCTGACAAGGTAGAAGAGGTCATTACCTTGATTGAAAGCTACAAACCAGAAGCTGTTTTGAATGTAGCTCTGCCTTATCAAGATTTAACCATTATGGATGCTTGTTTGGCAACAGGTGTTCACTATATCGATACAGCCAACTACGAAGCAGAAGACACAGAAGACCCTGAGTGGCGTGCTATCTACGAAAAACGTTGTAAGAAACTTGGTTTTACAGCCTACTTTGACTACTCATGGCAGTGGGCTTATCAAGAGAAATTCAAAGAAGCAGGCTTGACTGCTCTTCTTGGTTCTGGTTTTGACCCAGGTGTAACTAGTGTCTTTTCAGCTTATGCCCTCAAACACTATTTTGATGAAATCCATTATATCGACATTTTAGACTGTAATGGCGGTGACCACGGTTATCCATTTGCAACCAACTTTAATCCAGAAATTAATCTCCG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>LR134294|379660:436249|406623_407124_+|VEE27191.1|DBSCAN-SWA MIDQLSKYYSCRILTEKDIPSILSLYESNPLYFQHCPPEPNFATVKEDMLCLPEGKAKADKFFVGFWNGFDLVAVMDFVYAYPDEETVFIGLFMVDQAYQRKGIGSHIVTEALAYFAKNFRKARLAYVKGNPQSQHFWEKQGFKSIGCEVKQELYTVVIVEQSLED >LR134294|379660:436249|385292_386420_+|VEE27146.1|DBSCAN-SWA MKLEQVPTPAYVIDLAKLEANCRILQYVQEEAGCKVLLAQKAYSLYKTYPLISQYLSGTTASGLYEAKLAREEFPGEVHVFAPAFKDEDMEELLGITDHIVFNSERQLRKHGSRCREAGVSVGLRLNPQCSTQGDHALYDPCAPGSRFGVTIDKIPSDLLDLVDGLHFHTLCEQGADDLQTTLKEVEEQFGPYLHEVKWLNMGGGHHITREGYDVDLLISEIKRIRKTYNLEIYIEPGEAIALNAGYLATEVLDIVENGMEILVLDASATCHMPDVLEMPYRPPLRNGFEAQEKAHTYRLSSNTCLTGDVIGDYSFENPVQIGDRLYFQDMAIYSFVKNNTFNGIGLPSLYLMDEQGDCSLLKAFGYQDFKGRLS >LR134294|379660:436249|430312_431173_+|VEE27243.1|DBSCAN-SWA 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MTEINWKDNLRIAWFGNFLTGASISLVVPFMPIFVENLGVGSQQVAFYAGLAISVSAISAALFSPIWGILADKYGRKPMMIRAGLAMTITMGGLAFVPNIYWLIFLRLLNGVFAGFVPNATALIASQVPKEKSGSALGTLSTGVVAGTLTGPFIGGFIAELFGIRTVFLLVGSFLFLAAILTICFIKEDFQPVAKEKAIPTKELFTSVKYPYLLLNLFLTSFVIQFSAQSIGPILALYVRDLGQTENLLFVSGLIVSSMGFSSMMSAGVMGKLGDKVGNHRLLVVAQFYSVIIYLLCANASSPLQLGLYRFLFGLGTGALIPGVNAILSKMTPKAGISRVFAFNQVFFYLGGVVGPMAGSAVAGQFGYHAVFYATSLCVAFSCLFNLIQFRTLLKVKEI >LR134294|379660:436249|423013_423409_+|VEE27227.1|DBSCAN-SWA MDSQDNKRKWKNRDLISSLEFAITGIFTAIKEERNMRKHAVTALVVILAGFVFQVSRIEWLFLLLSIFLVVAFEIINSAIENVVDLASHYHFSMLAKNAKDMAAGAVLVVSLFAALTGALIFLPRIWDLLF >LR134294|379660:436249|423425_424325_+|VEE27229.1|DBSCAN-SWA MTFKSGFVAILGRPNVGKSTFLNHVMGQKIAIMSDKAQTTRNKIMGIYTTDKEQIVFIDTPGIHKPKTALGDFMVESAYSTLREVDTVLFMVPADEARGKGDDMIIERLKAAKVPVILVVNKIDKVHPDQLLSQIDDFRNQMDFKEIVPISALQGNNVSRLVDILSENLDEGFQYFPSDQITDHPERFLVSEMVREKVLHLTREEIPHSVAVVVDSMKRDEETDKVHIRATIMVERDSQKGIIIGKGGAMLKKIGSMARRDIELMLGDKVFLETWVKVKKNWRDKKLDLADFGYNEREY 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60 | Streptococcus_phage(40.0%) | transposase,tRNA,integrase,holin,protease | attL 435847:435862|attR 436415:436430 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
446203 : 551485
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134294|446203:551485|DBSCAN-SWA TATGGCATATTCAATAGATTTTCGTAAAAAAGTTCTCTCTTATTGTGAGCGAATAGGTAGTATAACAGAAGCATCACACGTTTTCCAAATCTCACGTAATACCATTTATGGCTGGTTAAAGCTAAAAGAGAAAACAGGAGAGTTAAACCACCAAGTAAAAGGAACAAAACCAAGAAAGGTTGATAGAGATAGACTTAAAAACTATCTTACTGACAATCCAGACGCTTATTTGACTGAAATAGCTTCTGACTTTGGCTGTCATCCAACTACCATCCACTATGCGCTCAAAGCTATGGGCTACACTCGAAAAAAAGAACCACACCTACTATGAACAAGACCCAGAAAAAGTAGCCTTATTTCTTAAAAATTTTAATAGTTTAAAGCACCTAGCACCTGTTTAGATTGATGAAACAGGATTCGATACTTATTTTTATCGAGAATATGGTCGCTCATTAAAAGGTCAGTTAATAAGAGGTAAAGTATCTGGAAGAAGATATCAGAGGATTTCTTTGGTTGCAGGTCTAACAAATGGTGAGTTAATCGCTCCAATGACTTACGAAGAGACGATGACGAGCGACTTTTTTGAAGTATGGTTTCAGAAGTTTTTCTTACCAACATTAACCACACCATCGGTTATTATAGTAAAATGAAATAAGAATAGGACAAATCGATCAGGACAGTAAAATCGAATTCTAACAATGTTTTAGAAGTCTATATGTACTATTCTAGTTTCAATATACCATAACTGCTCCTAGTCAACCTGCAAGTCCTGTCCCAGCTCCAAGCTCAGCTCCGATTCAAGATCCTAGAGTGGTAGCAAGCGCTTCGGCTAGCTCAACGAGCACACAAGCTCAAGAGCAAGTTGACAAGTCTGAACTTCGTGCCTTGAGTCAAGAGTTAGACCAACGCTTGAAAGCTTTGGCAACAGTATCTGATCCAAAAATCGATGCAACCAAGGCTGTCCTCCTAGATGCTCAAAAAGCTCCGGAAGATAGTGCCTTGACAGAGTAAGGTCTGCATACTGCAGTAGAGTCTGTGAAGGCTGCCTTGGACTCTCTCAAAGATGTGAAAGCAAATGCTAGCGACAGCAAGCCTGCACAGGACAAGAAGGATGCAAAACAAGGAACGGAAGATAGTAAGGATTCAGATAAGATGACTGAAACAAACTCAGTTCCGGCAGGAGTGATTGTGGTCAGTCTACTTGCCCTCCTAGGCGTGATTGCCTTCTGGCTGATTCGCCGTAAGAAAGAGTCAGAAATCCAGCAATTAAGCACGGAATTGATCAAGGTTCTAGGACAGCTAGATGCAGAAAAAGCGGATAAAAAAGTCCTTGCCAAAGCCCAAAACCTTCTCCAAGAAACCCTTGATTTCGTGAAAGAAGAAAATGGCTCAGCAGAGACAGAAACTGAACTAGTAGAGGAGCTTAAAGCAATCCTTGACAAACTCAAGTAAAACATGATTTATGAAATGTCAGACCTAAAAGACATTTTCGTTCACAAAAGCAGTGACGAGTAATCCTTGTCGTTGCTTTTTGGCTATTTTGGGGGATAAGATCCGCCTTGACTAGCAAAAGAAAAGATTGGTCCAATAGTGCCCGATACGATTTTGCGTAGCAGAAAGCTTACAAATAAAATTGAATATAGTAAAATAGGATTAGAATTATTAAGAAAGTTGGTTCTTTATTGGAAACGATAGTATTTTTAATCTCTGTTTTTCTAGCAGGTGTTTTATCCTTTTTTTCTCCTTGTATTTTTCCTCTTCTGCCAGTCTATGCTGGGATTTTATTGGATGATCAAGAAAGTGCAAAAAGCTTTTCTTTGTTTGGGAGAAAGGTTCTCTGGTCAGGCTTGATTCGAACACTTTGCTTTATCGCTGGTATCTCTCTCATTTTCTTTATTCTAGGCTTTGGTGCTGGTTACTTTGGTCATATTCTCTATGCAAATTGGTTTCGATATGTCATGGGAGCTATTATTATCATTTTGGGTCTTCACCAGATGGAAATTTTTCATTTGAAGAAATTAGAAGTTCAAAAAAGTTTTACCTTTAAAAAATCAGATTCTAATCGTTATTGGTCAGCTTTTTTACTTGGTATTACCTTTAGCTTTGGTTGGACACCTTGTATTGGTCCAGTTTTAAGTTCTGTTTTAGCACTTGCGGCTTCTGGAGGCAATGGCGCTTGGCAAGGAGCGATTTATACTCTCATTTACACTCTGGGCATGGCCCTTCCTTTCTTGGTATTGGCACTAGCTTCAGGTCTAGTCATGCCATATTTTAGTAAAATCAAGCGTCATATGATGCTACTAAAGAAAATTGGTGGTTTCCTCATTGTTTTAATGGGAATTTTGTTACTATTAGGACAAGTAAATGTTCTAGCTGGAATTTTTGAATAAAGGAGGACAAATGAAAAAAGTAATGTTTGCTGGCTTAAGTCTCTTGTCATTAGTTGTATTGATGGCCTGTGGTGAGGAAGAAACTAAAAAGACTCAAGCAGCACAACAGCCAAAACAACAAACGACTGTACAACAAATTGCTGTTGGAAAAGATGCTCCAGACTTCACATTGCAATCCATGGATGGCAAAGAAGTTAAGTTATCTGATTTTAAGGGTAAAAAGGTTTACTTGAAGTTTTGGGCTTCATGGTGTGGTCCATGCAAGAAAAGTATGCCAGAGTTGATGGAACTAGCGGCGAAACCAGATCGTGATTTCGAAATTCTTACTGTCATTGCACCAGGAATTCAAGGTGAAAAAACTGTTGAGCAATTCCCACAATGGTTCCAGGAACAAGGATATAAGGATATCCCAGTTCTTTATGATACCAAAGCAACCACCTTCCAAGCTTATCAAATTCGAAGCATTCCTACAGAATATTTAATTGATAGCCAAGGAAAGATTGGAAAGATTCAATTTGGTGCTATCAGTAATGCGGATGCAGAAGCAGCATTTAAAGAAATGAACTAGAATCGATAAAATCTGATTACAAGATGTAGTCAGATTTTGGTAACTTCTAAAACTAACTTCCAGTTTCCCACAACCTAGCTTTTAGTATGAGAAAAACGCGTGACATCAGTGGAAATCCGTCTTAGACTAACTTCCACTGGTTTTCTTTTTCTTGATATATAAGGGTTCAAAAGCGAAAAGACTCAGAAAAAGTGCACGACAAATAGCCCTAAAACAGAGTCGTCTTAGAGTAACTTCCAGTTTTGGGAGAGAGATGGAAGTTACTTTGAGAAGTTACGGTAGTCAGATTTTTTTAGAAAAACATTTTATAAATATTCACATATCTCCTATATTTATGGTAAAATAGAATTATCAGTTTATTTTGGAGTCAAAGATGAATATATTTAGAACAAAGAATGTTAGTTTAGATAAAACAGAGATGCATAGGCATTTGAAGTTATGGGATTTGATTTTGCTGGGTATTGGAGCCATGGTAGGGACAGGTGTTTTTACAATCACAGGTACTGCAGCTGCTACACTTGCTGGTCCAGCACTAGTGATTTCAATCGTTATTTCTGCCTTGTGTGTGGGATTATCAGCCCTCTTTTTTGCAGAATTTGCCTCGCGAGTACCCGCTACAGGAGGTGCCTATAGTTACCTCTATGCTATCTTAGGAGAATTCCCTGCTTGGTTGGCTGGTTGGTTAACCATGATGGAGTTCATGACAGCCATATCAGGCGTAGCTTCGGGTTGGGCAGCTTATTTTAAAGGCTTGCTCTCTCAATACGGGATAGCCCTTCCTCAGGCTTTAAATGGTACCTTTAATCCTCAAGCAGGGACATTTGTTGATTTATTGCCTATTCTTGTCTTGGTCTTGGTGACTTCGCTTGTTTTACTAAATGCCAAGGCAGCCTTACGCTTTAATTCGATTCTAGTTATTTTGAAATTTTCCGCTTTAGCTCTCTTTGTTTTAGTAGGAATTTGGAATATTAAGTTTGATAATTGGAGCAATTTTGCTCCTTACGGTTTTGGACAAATCTATGGAGCTAGTACTGGTATTATGGCTGGTGCGTCCTTGATGTTCTTCGGTTTTTTGGGATTTGAATCCATCTCTATGGCTGTAGATGAAGTCAAGACTCCTCAAAAAAATATTCCTAGAGGGATTGTCTTATCGCTTTCTATCGTAACCATTCTCTATGCCTTGGTGACCCTTGTTTTGACTGGTGTGGTTCACTATAGTCATTTAAATGTCGATGATGCCGTTGCCTTTGCCCTTCGTAGTGTTGGGATTAGTTGGGCAGCCAACTATGTGTCATTAGTGGCTATCTTGACCTTGATTACAGTTTGTATTTCGATGACCTATGCCCTATCGCGTATGATTTACAGTTTAGCACGTGACGGCTTAGTGCCTGCTGCCTTTAAGGAACTGACGAAGACTAGCAAGGTACCAAAGAATGCTACTATCTTGACAGGTCTAGCTTCAGCAGTAGCAGCAGGAATGTTCCCACTAGCCAGTATTGCAGCCTTTTTAAATATTTGTACCTTAGCCTACTTGATCCTGCTGGCTTATGGTCTGATTCGCTTACGGAAAGAAAAAGGAATGCCCAAAGCTGGGGAATTTAAAACACCATTGGTACCTCTGTTACCAATTTTATCGATCATCATTTGTTTATCCTTCATGTTACAGTATAATGTGAACACCTGGATTGCTTTCCTAGTTGCGTTGTTAGTAGGAAGTATTATTTACTTCACTTATGGCTATAAGCATTCTACCATAGAAGAATAAAGTGAAAGTCTATTGAGTTGTTGACACTCAGCAGATTTTTATATGTGAAAGAAATTTCAAATTTTTTCTAAAAATATCTTGACAGATTAAATTTTCAGGAGTAGAATATTTACTAGTTAATTAAATGGTTAAGGAGTTGTTCATGAAGAAACAAAATTTATTTTTAGTCCTGTTAAGTGTCTTTCTTTTATGCTTGGGGGCTTGTGGTCAAAAGGAAAGTCAGACAGGAAAGGGGATGAAAATTGTGACCAGTTTTTATCCTATCTACGCTATGGTT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108 | Streptococcus_phage(24.0%) | transposase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
580003 : 707701
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134294|580003:707701|DBSCAN-SWA 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116 | Bacillus_virus(10.34%) | bacteriocin,transposase,tRNA,holin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
729734 : 764435
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134294|729734:764435|DBSCAN-SWA 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>LR134294|729734:764435|737195_737414_-|VEE27924.1|DBSCAN-SWA MSISPRFETLEQAIASKDLEKVREAFKKMNSTWTINESVVRDNSIAHYGRVETAISFLPSSMEIEPTDESGT >LR134294|729734:764435|762636_763446_-|VEE28005.1|DBSCAN-SWA MLLQKELIPMIEANLPNMAYAEKDIAKFFLKQQPLNDYSSKALCEYLNVSKATLTRFAKKCGFKGFRQFIFKYQEMIHEKEKLALYTEATEKVLSDYEEMLRKTYTVLDEVQLERIAEMIETAERVYLYGKGSSVLALQEMKMRFMRLGVIGEVLSDEDMILWSSLLLNENCLVIGASISGQTDIVLEGLQKAADKGAKTVLMTTRKFDEEDCFFDELLLLASTDHLSYGNRISPQFPILLITDCLFSNYLESPERQYYYNQTIIHKEE |
40 | Staphylococcus_phage(33.33%) | transposase,bacteriocin,holin,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
834507 : 886788
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR134294|834507:886788|DBSCAN-SWA 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60 | Bacillus_virus(15.0%) | transposase,holin,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_8 |
952281 : 998699
Sequences of DBSCAN-SWA_8
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8 >LR134294|952281:998699|DBSCAN-SWA CTCATTTTTTCTCCCTCAGGTAAGCATGGATGGCTTCACGATTATTCTCCAATTCTCCATCGACAATGGCAAACTCAATCTCTGTTAAAATCTCTCCCAAGTCTGGGCCTGGCTGATAGCCATATTCCTTGATCAAAATATCGCCATTAATCTGAATCTCTTTCTTGTCATGGATAGTCAAGCTTTGGTATTTTTCTGTGATGGCTTGTGGGTTGACTTCTTTTCCTTGAGCTTGACGAAGATTTTCAGCCTGTAAAAGCAAATCTATGTCAAAGCGATAACAATCTCGCTTGCTCAATTCTCCATTTTCACGCAGAGCCAAAATAATCAGCAAATCCTGAACTTGCTTGGCAAACTGGCGTGAGGTCTTCCAAGATTTCAAAAATGACTGCGCATTTTCAATCTCCAAAGCCCATAGTAAAGCCGCCCAGGCTTGTTCAGAGGATTCAAAAGTAAAATCAGTCTCCAAATCAAACAGTCTGTTGAGCTTGTCCTGGCTAGATGCCATATCAGGGAGATAGTCATAAGCTTGACTCTCAATCATGGAAGCCAAGCCCCTTCTCCAAAATGGAGCCAGCAAGAGTTTATCAAACTCGACGAAGGTACGCTCTACAGAAATTTTCTCCAAAAGCGGCGTCAAGGTCTTCATAGCTTTAAATGTTTCTGGCTCAAGTGCAAAACCAAGACTAGCCTGAAAACGGAAACCACGCATAATCCGTAAAGCATCTTCGTTGAAACGCTCACTAGCCACTCCAACTGCTCGCAAGACTTGCTTTTCCAAATCTTCTAAACCATGGAACAAGTCAACGATTTCTCCTGTCTCATCCAAGGCAAAGGCGTTGACTGTGAAATCACGGCGTTTGAGGTCTTCTTCTAGCGATCGTACAAAGGAAACCGCACTGGGTCTGCGATAGTCCACATAGACATCCTCTGTCCGAAAGGTTGTTACCTCATACTCCTCATCCCCATCTAAGACCAAGACGGTTCCATGCTCGATTCCGATATCGGCTGTTCGCGGAAAAATCTGCTTGGTCTCTTCTGGATAAGAAGACGTCGCAATATCCACATCGTGGATAGGGTTATGGAGAAGGGCATCTCGAACAGAGCCCCCAACAAAATAAGCCTCAAAGCCTGCTTCTTTAATTTTTTCTAATACTGGTAAAGCCTTCTGAAATTCAGAAGGCATTTGCGTTAATCTCATAATAAGTGTTCTAATCCATAGACAAGCTCATGACGCTTGACAACTTCTTTAATTCCCAAATTGACTCCTGTCATGAAGGAGATGCGATCATAGGAGTCATGACGGAGGGTCAACCCTTCTCCCTGATTGCCAAAGATGACTTCCTGATGAGCTACCAAGCCTGGCAAACGAACTGAGTGGATGCGCATACCATCAAAGTCAGCACCACGAGCACCAGCAATCAGCTCTTCCTCATCTGCTGCGCCTTGCTGAATGGACTCTCGAACCTCTGCCATCAACTCAGCTGTTTTAATGGCTGTTCCACTCGGAGCATCCTTTTTCTTGTCATGATGGAGCTCAATAATCTCCACATTTGGGAAATATTTGGCAGCCTGCGTCGCAAATTGCATGAGTAAGACAGCACCCAAGGCAAAGTTAGGGGCAATCAGGCCACCCAAGTCTTGGGCACGAGAAAATTCTTTTAGCTCTGCAATTTCTTCACTCGTGAAACCAGTCGTTCCAACTACTGGAGCAAAGCCATTTTCAAGAGCAAAACGTGTATTTTCGTAGGCAACAGCTGGAGTAGTAAAATCTATCCAGACATCCGCTTCAAAACCAGCTAAATCAGCCTTATCCTTGAAAACAGGAATACCCTGCCATTCTGACTCAGACTCAAAAGGATCCAAAACTGCTACCAAGTCCAAGTCTGGATCAGTCAATACCATCTGACAAGCAGCCTGGCCCATCTTTCCCTTAAAACCGGCAATAATTACTCGAATACTCATCTCTACTCCTGTCTAAGATACAAAGTCCGTAAGAACACAAAGTGAAAATAGGAATTCCAATCAAGAAGTGTCTACTTCTTGGAAGAACTATCTTTTTCACACAGGGTTCCAGGCGTGTTCAATTATCAAGATACAAAGGACCTTAGCTGCCTCTGAAAAATAGGGAATGGCACTGACTTTCCACGAAAGGCAAGACAGGCATCTTTTTTCAAGAGGCAGGTAGTCCGTGTTCAATTTCTAAGATACAAGGCATCTTAACTAGCCTAGAAGCGCCAACTAAATCACTGGAATATAACCCAGAGCAATACTTCCTGCTCCTAGGTGCGTTCCAATGACACTACCAAATGTAGCAAGTGAAACATCCGAACCCAAGCCAAAATCAAGCAAGTGCTGACGCAATTCTTCAGCCTTTTCAGGAGCATTCCCATGAATGACAATGACCCGGTATTGACCTGAAGCCGTTGTTTCCTTGATAATTTCAATTAAGCGCTTGGTGGCCTTCTTTTCAGTACGAACTTTTTCGTAAACTTCAATCACACCTTGATCGTTAAAATAAAGGATTGGCTTAATGCTAAGCAAATTGCCCAAAATGGCAGCCCCATTTGAAAGGCGTCCACCTTTTACCAAATGATCCAAGTCATCTACCATGATAAAGGCTGACGTACGGCTGATTTGAATGGCTAGCTTATCCTGAATGCTGGCAAAATCATCGCCCTGATCACGCCAATTAAAGACGCTTTCAACCATGATGCCTAGGGGAGCACTTGTAATCAAAGTGTCTGGGAAAGCAATGGTTAAGCCCTCATAGTCATCGACCATATACTGGATATTTTGGTAAAAACCTGAAATTCCAGAAGATAGGAAAAGCCCCAAGGCATGTGTATAGCCTTGTTCTTTGAGCGAAGTTAAGATCTCATCTAACTTGGCAATACTTGGTTGACTGGTCTTAGGCAATTCAGAAGCCTGAGCCATTTTTTGGTAAAATTCCTCAGCAGACAGATTGATGCCTTCGACATATTCCTCACCATCAATATTGACAGGAATATCCAAGACAAACAAGTCTTCTCTTTGCAAGGTCTCTTCACTGAGATAAGCAGAGGAATCTGTGAAAACAGCTAATTTCATATTAGAACTCCAAATTAATTCCTGGTAAGTCTAATGCAATTTCAGTCACTTCGTAAGTCAAACGATTGAGCATGTTCAAACATGGACGAGCCAAGGTTTCCACCTCTTCTTGGTTCAATTCACTTGGTTCATTGACAATACGGCCATCGATATGGTTTACTTGTGAGATTGTTCCACTAATGACAAACTTATCAAATACAATCATAAAGCTCAAGATGACAATCAAGGAAGTCACTTGATTTTCTTGGTCATGTTGGAGCAATTGGAAATTCACATCCACCTTGGTTTCAGGAGCTCCATTTTCATTTTCCCATTCAAAATTACGTGCATCAAAATGATACTGACTAACAAATTCTTGTTCACGTTTAAGATTCATGTCTTTCTCCATCGGCTACAATATTATAAGCTATTGTACCATAATTTTTTATTTTCATCTAGTTTTCTAGGATTTAGTCAATCCCAATTTCAGCACGAACTACATCTGTGATAGTATCAACATAGTAGTCCACTTCTTCTGTTGTAGGCGCTTCTGCCATAACACGCAAGAGGGGCTCTGTTCCACTTGGACGAACAAGGATACGGCCGTTCCCCGCCATTTCTTCTTCCATCTTCTCGATGATGGCCTTGATAGCTGGCACTTCCATGGCCTTTTCCTTCATGACGTTTTCCACTCGGATATTAACTAATTTTTGTGGATAAATCGTTACTTCTGCCGCCAACTCTGATAAGCTCTTACCAGTTTCCTTCATGATTTTAGTCAATTGAACTGCTGATAATTGACCATCACCTGTGGTATTGTAATCCATCAAGATAACGTGACCAGACTGTTCACCACCAAGGTTGTAACCTGATTTTCTCATTTCTTCAACAACGTAGCGGTCACCAACTGCAGTAACTGCCTTGTTAATACCTTCGCGATTCAAGGCCTTGTGGAAACCAAGGTTAGACATAACAGTTGTCACAATTGTATTTTGAGCCAATTGTCCTTTTTCAGAAAGGTATTTTCCGATGATGTACATAATCTTGTCACCATCGACGATGTCACCATTCTCATCAACAGCAATCAAGCGGTCACTGTCTCCATCAAAGGCCAAACCAATAGCTGACCCACTTTCTTTGACCACTTCTTGAAGGGCTTCTGGATGTGTTGAACCAACATTAAGGTTGATGTTAAGACCGTCTGGTGTTTCCCCGATAACCGTCAATTGGGCACCAAGGTCTGCAAAGATTTGACGGGCACTGGTAGAAGCTGCTCCATTAGCTGTATCCAAGGCAACCTTCATTCCATCAAGAGGAGTTCCAGTTGAAACAAGGTATCCTTCATACTTACGCAAGCCTTCTGGATAATCTACCAAAATTCCTAAGCCTTCTGCACTTGGACGAGGAAGAGTGTCTTCCTCAGCATCTAGCAAGGCTTCAATTTCTGCTTCTTTTTCATCATCTAGTTTGAAGCCATCACCGCCAAAGAACTTGATTCCGTTATCAAGGGCTGGGTTGTGGCTAGCAGAAATCATGACACCGGCACTTGCTCCTTCAGTTTCAACCAAGTAAGCTACTGCTGGTGTTGCAAGGACACCAAGTTTGTATACGTGAATCCCTACTGAAAGGAGACCTGCCACCAAGGCCGATTCCAACATTTCCCCTGAAATACGTGTGTCACGTCCTACAAAGACTTTCGGCGCTTCCGTTTCATGTTGACTAAGAACATAGCCTCCAAAACGTCCTAGTTTAAAGGCTAATTCTGGTGTTAGTTCTAGGTTAGCTTCTCCACGGACTCCATCAGTCCCAAAATATTTACCCATTGTTATAAAATCCTTTTCTATTTTTAATTCGTTTTTGAACTAGTTGCTTTCGTTGACGAAGATGTCTCCGATGAACTGCTTGTACTTGAATTTGATGTGCTTGAACTT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>LR134294|952281:998699|965837_966356_-|VEE28627.1|DBSCAN-SWA MVELKKEAVKDVTSLTKAAPVALAKTKEVLNQAVADLYVAHVALHQVHWYMHGRGFLVWHPKMDEYMEALDGQLDEISERLITLGGSPFSTLTEFLQNSEIEEEAGEYRNVEESLERVLVIYRYLSELFQKGLDVTDEEGDDVTNGIFAGAKTETDKTIWMLAAELGQAPGL >LR134294|952281:998699|982986_984069_+|VEE28671.1|DBSCAN-SWA MSKLQQILTYLKSEKLDVAVVSDPVTINYLTDFYSDPHERQMFLFVLADQEPLLFVPALEVERASSTVSFPVVGYVDSENPWQKIKHALPQLDFKRVAVEFDNLILTKYHGLKTVFETAEFDNLTPRIQRMRLIKSADEVQKMMVAGLYADKAVHVGFDNISLDKTETDIIAQIDFAMKREGYEMSFDTMVLTGDNAANPHGIPAANKVENDALLLFDLGVLVNGYASDMTRTVAVGKPDQFKKDIYNLTLEAQQAALDFIKPGVTAHEVDRAAREVIEKAGYGEYFNHRLGHGIGMDVHEFPSIMEGNDMVIEEGMCFSVEPGIYIPGKVGVRIEDCGVVTKDGFDLFTSTSKDLLYFD >LR134294|952281:998699|994021_995125_-|VEE28721.1|DBSCAN-SWA 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53 | Streptococcus_phage(23.53%) | transposase,tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_9 |
1225445 : 1277671
Sequences of DBSCAN-SWA_9
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9 >LR134294|1225445:1277671|DBSCAN-SWA 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45 | Streptococcus_phage(33.33%) | transposase,holin,integrase | attL 1232001:1232017|attR 1241225:1241241 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_10 |
1448810 : 1586309
Sequences of DBSCAN-SWA_10
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_10 >LR134294|1448810:1586309|DBSCAN-SWA 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120 | Bacillus_phage(21.05%) | holin,transposase,protease,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_11 |
1600779 : 1711689
Sequences of DBSCAN-SWA_11
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_11 >LR134294|1600779:1711689|DBSCAN-SWA 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113 | Streptococcus_phage(68.92%) | bacteriocin,tail,transposase,tRNA,integrase,capsid,terminase,holin,portal,protease,head | attL 1647606:1647626|attR 1682267:1682287 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_12 |
1921086 : 1967420
Sequences of DBSCAN-SWA_12
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_12 >LR134294|1921086:1967420|DBSCAN-SWA GATGAAAGAGAAAAATATGTGGAAAGAATTGTTGAATCGTGCAGGCTGGATTTTGGTCTTTTTACTTGCCGTCCTTTTATATCAGGTTCCCCTAGTGGTTACCTCTATTTTGACTTTAAAAGAAGTAGCCCTGCTACAGTCAGGGCTGATAGTTACTGGCCTTTCAATTGTGGTTCTGGCTCTATTTATTATGGGAGCTCGTAAAACCAAGTTAGCTAGTTTTAATTTTTCTTTTTTTAGAGCTAAAGATTTGGCACGTTTGGGCTTGAGTTATTTAGTTATTGTCGGGTCAAATATACTTGGTTCTATCTTGTTGCAACTGTCAAATGAGACGACAACAGCTAACCAGTCTCAGATTAACGATATGGTTCAGAATAGTTCTCTGATTTCTAGCTTCTTCTTGCTAGCCTTGCTTGCTCCAATTTGTGAGGAAATCTTGTGCCGTGGGATTGTTCCTAAAAAGATTTTCCGAGGCAAGGAGAACTTGGGATTTGTAGTCGGTACGATTGTGTTTGCTTTATTACATCAACCAAGTAATTTACCTTCTTTATTGATTTATGGAGGTATGTCGACAGTTCTATCTTGGACAGCCTACAAGACCCAACGTTTGGAAATGTCGATCTTACTTCACATGATTGTTAATGGGATTGCTTTCTGTTTGTTGGCTCTTGTGGTGATTATGAGTCGGACATTAGGGATTTCTGTTTAAGATTATTGACAATTGCTTACTTGTTTCTACTAGGGAAAGATGAATGCAATCGTGTCCATCTTTTTCTTTTTATGGTAAAATAGAAAAATAATATGATGAAAATCCTTGAGGGAGTGACCGATATGTCAAGTAAAGCCAATCATGCAAAGACAGTTATTTGCGGAATTATCAATGTAACCCCAGACTCCTTTTCGGACGGTGGTCAATTTTTTGCTCTTGAGCAGGCACTCCAGCAGGCTCGTAAATTGATAGCAGAAGGAGCCAGTATGCTCGATATCGGCGGAGAATCGACTCGGCCGGGCAGTAGCTATGTTGAGATAGAAGAGGAAATCCAGCGTGTTGTTCCAGTGATCAAAGCGATTCGCAAGGAAAGTGATGTCCTCATCTCTATTGATACTTGGAAGAGTCAAGTAGCAGAGGCTGCTTTGGCTGTTGGTGCCGATCTAGTCAATGATATCACTGGTCTTATGGGTGATGAGAAAATGGCTCATGTGGTAGCTGAAGCGAGAGCGCAAGTGGTCATCATGTTTAATCCAGTTATGGCGCGACCTCAGCACCCTAGCTCGCTCATCTTCCCTCATTTTGGTTTTGGTCAAGCTTTTACAGAGGAAGAGTTAGCTGACTTTGAAACATTGCCAATCGAAGAATTGATGGAGGCTTTCTTTGAACGAGCACTAGCGAGAGCGGCAGAAGCTGGTATTGCACCAGAAAATATCCTGTTGGATCCAGGAATTGGCTTTGGTCTGACCAAGAAAGAAAATCTGCTTCTTTTACGGGACCTGGATAAACTACATCAGAAGGGCTATCCAATCTTTCTCGGAGTGTCGCGCAAGCGATTTGTCATCAATATCCTTGAAGAAAGTGGGTTTGAAGTCAATCCTGAGACAGAGCTTGGTTTCCGAAATCGGGACACGGCTTCGGCTCATGTAACCAGTATCGCTGCGAGACAGGGTGTAGAAGTGGTGCGCGTGCATGACGTAGCTAGTCACAGGATGGCAGTTGAAATTGCCTCTGCCATTCGTCTGGCTGATGAGGCGGAAAATTTAGATTTAAAACAATATAAATAAGATGAAAGAAATTGAAAACAATCAGTGGATTGCTAACTACCGGACGGATCAACCGCATTTTGGCTTGGAACGAATGGTGGAACTGTTAGCTTTGCGTGGCAATCCCCATCTCAAACTCAAGGTCCTCCATATCGGAGGGACTAACGGCAAGGGCTCGACTATTGCTTTTTTGAAAAAGATGCTAGAAAAGCTAGGGTTGAGAGTTGGCGTGTTTAGCTCGCCCTATCTCATTCATTACACAGACCAGATTAGCATCAATGGGGAATCGATCTCAGAAGCGAGGCTAGAAGCTCTCATGGCAGACTATCAGTCTTTGCTGGAGGGAGAAGTGGTCGCCAATTTACAGGGCACAACCGAGTTTGAGATTATCACAGCCCTGGCCTATGACTACTTTGCCTCAGAGCAAGTAGATGTGGCCATCATGGAAGTTGGCATGGGTGGACTTTTGGATAGTACCAATGTCTGTCAGCCCATTTTGACAGGAATTACAACTATTGGCTTGGATCATGTGGCCCTACTTGGTGACACCTTGGAGGCCATAGCAGAGCAGAAGGCAGGTATTATCAAACAAGGGATGCCCTTGGTAACAGGGCGTATTGCTCCAGAAGCCTTGGCTGTGATTGACCGCATTGCGGAAGGAAAAGATGCGCCGAGACTTGCCTACGGGACAGATTATCAGGTTCGTCATCAAGAAAGTGTGGTGACAGGGGAAGTCTTTGACTATACAAGTGCTGTCAGACAAGGTCGCTTCCAGACTAGCCTGCTTGGTTTGTACCAAATAGAGAATGCTGGGATGGCCATAGCTTTACTTGATACTTTTTGTCAAGAAGATGGTCGAGAGCTAGCAAGCAATGACTTTCTTGGTCAAGCCTTGGAAGAAACAAGTTGGCCGGGGCGTTTGGAAATCGTGTCAAGAGATCCCTTGATGATTTTGGATGGAGCCCACAATCCCCATGCTATCAAGGCCTTGTTGGTAACCTTGCAAGAACGTTTTGCAGATTATCATAAGGAAATCCTCTTCACTTGTATCAAAACCAAGGCCTTGGAGGATATGTTGGACTTGTTGGGAGCCATGCCAGATACCGAGCTTACTCTAACACATTTTGCGGATAGTCGGGCGACGGATGAAAGCGTGCTGAAAGAGGCAGCTAAGTCTAGAAATCTCAGCTACCAAGATTGGCATGATTTTCTAGAGCAGAATTTGACAGATAAAAAAGAAGAGAAACAAACAGTTAGGATTGTCACAGGTTCCTTGTATTTCTTGAGCCAAGTGAGGGCCTATCTGATGGAGAGGAAGAACGAGAATGGATAGACAAAAGATTGAAGCAGCTGTAAAAATGATTATCGAGGCTGTAGGAGAGAACGCTAATCGCGAGGGCTTGCAGGAAACACCTGCTCGTGTAGCCCGTATGTATCAAGAGATTTTTTCAGGTCTTGGTCAAACAGCAGAGGAACATTTGTCAAAATCCTTTGAAATTATTGACGATAATATGGTGGTAGAAAAGGATATCTTTTTCCATACCATGTGTGAACACCACTTCTTGCCATTTTATGGTAGAGCGCACATTGCCTACATTCCAGATGGTCGTGTGGCAGGCTTGTCTAAGCTAGCCCGTACGGTTGAAGTTTATTCGAAAAAACCACAAATTCAAGAACGTTTGAATATCGAAGTGGCTGATGCCTTGATGGACTATCTAGGTGCTAAAGGAGCCTTTGTTGTCATTGAGGCGGAACATATGTGTATGAGTATGCGTGGTGTTAGAAAACCAGGCACTGCAACCTTGACGACAGTAGCTCGTGGTCTATTTGAAACAGATAAGGACCTCCGCGACCAAGCTTATCGTTTAATGGGGCTATAAAAAGAATCCGCTTCAAGCGGATTTTTCTAGAAAGGAATCATTATGGATCAACTGCAGATTAAGGATTTGGAAATGTTTGCCTATCATGGTCTTTTTCCTAGTGAGAAAGAATTGGGGCAGAAATTTGTCGTTTCAGCCATCCTATCCTATGATATGACCAAGGCAGCTACAGACTTGGATTTAACAGCCTCTGTCCATTACGGAGAATTGTGTCAGCAGTGGACGACTTGGTTTCAGGAAACGAGTGAAGATTTGATTGAAACGGTAGCCTATAAACTGGTGGAACGTACCTTTGAGTCTTATCCTCTTGTCCAAGAAATGAAGTTGGAACTGAAAAAACCTTGGGCACCGGTGCATTTGTCACTAGATACTTGCTCGGTAACCATTCATCGCCGCAAGCAACGAGCCTTTATCGCCCTAGGAAGCAATATGGGAGATAAACAAGCAAACTTGAAGCAAGCCATTGACAAACTGCGAGCTCGTGGCATCTATATTCTCAAAGAGTCCAGTGTCTTAGCGACGGAGCCTTGGGGTGGAGTGGAGCAGGATAGCTTTGCCAATCAAGTGGTTGAGGTGGAAACCTGGCTACCAGCACAAGACTTGTTAGAAACCTTGTTAGCCATTGAGTCAGAGCTGGGACGGGTGAGAGAAGTGCATTGGGGACCTCGTTTGATTGATTTGGACTTGCTCTTTGTGGAGGACCAGATCCTTTATACAGACGACCTCATATTGCCTCATCCTTACATAGCGGAACGCCTTTTTGTCCTTGAGTCCTTACAGGAAATTGCGCCTCATTTTATCCATCCGATATTAAAACAACCGATCCGCAACTTGTATGATGCTTTGAAAAAATAGAAAAACTCTAGTTTTCAGTTACTTGCAACTGAAGGCTAGAGTTTTTAAAATAGGTCATTTTCTTCTGGGAGGAGGATAGTTTCTCTACCGTCCATGTCTAAAACCAGTACTCTTGGGGGATAACGAGGGTCGAAAGGATGGTTAAAGTCAAAATCAATGGCTGTAGGGAGGTGTTGACTTGAAAAGTGGAAGGTAATCTTTCCTTGGTTATTAAGCAATTGAAACTCGAGTTCTTCTTCCAATTCAAAGACATTTTTTAAGAAATGATCGATGATATACCAAAAAGAGTCAATGATGTCATCGGGCAAGCTGGTAACAATGCCAAAACTAGCAGACCGCATGTGGGTATTGGTAAAAGCCATATCTCTGTCCCCTTTCTTTTCCCTTATCATACAGCAAATAGGATTAAAAATCAAGAAAAGGTGATTTTTTGAAAAGGATTTTAACTACAGGGAAAAAGAAGGAAAAAAATTCCCAAAAATCTACCGAAGTTAATAGGTAAATTCCCAA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45 | Pneumococcus_phage(20.0%) | integrase,transposase,protease | attL 1912748:1912778|attR 1959332:1959362 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_13 |
1982613 : 2029792
Sequences of DBSCAN-SWA_13
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_13 >LR134294|1982613:2029792|DBSCAN-SWA 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39 | Aeribacillus_phage(16.67%) | holin,transposase,integrase,tRNA | attL 2012705:2012720|attR 2020041:2020056 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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