CRISPRimmunity

Overview of predicted results

Overview of the results

Contig_ID	Contig_def	CRISPR array number	Contig Signature genes	Self targeting spacer number	Target MGE spacer number	Prophage number	Anti-CRISPR protein number
LR134317	Streptococcus equi subsp. zooepidemicus strain NCTC6180 genome assembly, chromosome: 1	2 crisprs	cas3,csm6,DinG,RT,cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,DEDDh	0	17	9	0

1. LR134317

CRISPR-Cas detection and classification

Crispr_ID: LR134317_1

• CRISPR_ID: LR134317_1
• CRISPR_location: 91689-91778
• CRISPR_type: Orphan
• Repeat_type: NA
• Spacer_info: 1 spacers

Consensus repeat of LR134317_1

Consensus_repeat	Method
CTTTATGGGAGCGTGGATTGACAT	CRISPRCasFinder

spacers of LR134317_1

>1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder
CGTCAAAAATAATCTCTGGGATTTCCGCCCAGTCGTCTCGCC

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134317_1

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LR134317_1

>merge|LR134317|1|91689-91778|CRISPRCasFinder
CTTTATGGGAGCGTGGATTGACATCGTCAAAAATAATCTCTGGGATTTCCGCCCAGTCGTCTCGCCCTTCATGGGAGCGTGGATTGACAT

>LR134317|1|1|91689-91778|CRISPRCasFinder
CTTTATGGGAGCGTGGATTGACAT	CGTCAAAAATAATCTCTGGGATTTCCGCCCAGTCGTCTCGCC
CTTCATGGGAGCGTGGATTGACAT

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LR134317.1|VEF04977.1|99311_99941_+|uracil-phosphoribosyltransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|234653
LR134317.1|VEF04971.1|94959_95739_-|ferrichrome-ABC-transporter-ATP-binding-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224045
LR134317.1|VEF04963.1|90643_91297_+|hypothetical-cytosolic-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|370139
LR134317.1|VEF04951.1|84518_85442_+|Fe-S-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|224163
LR134317.1|VEF04957.1|86934_88269_+|transport-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|224173
LR134317.1|VEF04953.1|85454_86240_+|aminoglycoside-3'-phosphotransferase	unknown	unknown	gnl|CDD|270699
LR134317.1|VEF04975.1|97530_99162_+|polysaccharide-biosynthesis-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|240529
LR134317.1|VEF04967.1|92960_94013_-|ferrichrome-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439
LR134317.1|VEF04983.1|101314_101599_+|hypothetical-cytosolic-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|179410
LR134317.1|VEF04979.1|100172_100763_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit	unknown	unknown	gnl|CDD|178955
LR134317.1|VEF04947.1|83109_83688_+|membrane-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|226129
LR134317.1|VEF04973.1|95999_97445_-|UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--L-lysine-ligase	unknown	unknown	gnl|CDD|237588
LR134317.1|VEF04969.1|93996_94935_-|ferrichrome-binding-protein-precursor	unknown	unknown	gnl|CDD|238558
LR134317.1|VEF04955.1|86249_86807_+|rRNA-methylase	unknown	unknown	gnl|CDD|377744
LR134317.1|VEF04945.1|82155_82440_+|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	unknown
LR134317.1|VEF04981.1|100867_101314_+|Regulatory-protein-ylbF	unknown	unknown	gnl|CDD|226204
LR134317.1|VEF04959.1|88345_89137_+|pyruvate-formate-lyase-activating-enzyme	unknown	unknown	gnl|CDD|131546
LR134317.1|VEF04949.1|83677_84328_+|PAP2-superfamily-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239486
LR134317.1|VEF04961.1|89641_90577_+|putative-manganese-dependent-inorganic-pyrophosphatase	unknown	unknown	gnl|CDD|235458
LR134317.1|VEF04965.1|91965_92964_-|ferrichrome-ABC-transporter-permease	unknown	unknown	gnl|CDD|376439

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LR134317.1|VEF04977.1|99311_99941_+|uracil-phosphoribosyltransferase	gnl|CDD|234653	PRK00129, upp, uracil phosphoribosyltransferase; Reviewed.	1.87133e-147
LR134317.1|VEF04963.1|90643_91297_+|hypothetical-cytosolic-protein	gnl|CDD|370139	pfam08820, DUF1803, Domain of unknown function (DUF1803). This small domain is found in one or two copies in proteins from bacteria. The function of this domain is unknown.	6.38254e-35
LR134317.1|VEF04951.1|84518_85442_+|Fe-S-oxidoreductase	gnl|CDD|224163	COG1242, COG1242, Predicted Fe-S oxidoreductase [General function prediction only].	0
LR134317.1|VEF04957.1|86934_88269_+|transport-protein	gnl|CDD|224173	COG1253, TlyC, Hemolysins and related proteins containing CBS domains [General function prediction only].	1.46297e-131
LR134317.1|VEF04953.1|85454_86240_+|aminoglycoside-3'-phosphotransferase	gnl|CDD|270699	cd05150, APH, Aminoglycoside 3'-phosphotransferase. APH catalyzes the transfer of the gamma-phosphoryl group from ATP to aminoglycoside antibiotics such as kanamycin, streptomycin, neomycin, and gentamicin, among others. The aminoglycoside antibiotics target the 30S ribosome and promote miscoding, leading to the production of defective proteins which insert into the bacterial membrane, resulting in membrane damage and the ultimate demise of the bacterium. Phosphorylation of the aminoglycoside antibiotics results in their inactivation, leading to bacterial antibiotic resistance. The APH gene is found on transposons and plasmids and is thought to have originated as a self-defense mechanism used by microorganisms that produce the antibiotics. The APH subfamily is part of a larger superfamily that includes the catalytic domains of other kinases, such as the typical serine/threonine/tyrosine protein kinases (PKs), RIO kinases, actin-fragmin kinase (AFK), and phosphoinositide 3-kinase (PI3K).	5.02006e-84
LR134317.1|VEF04975.1|97530_99162_+|polysaccharide-biosynthesis-protein	gnl|CDD|240529	cd13124, MATE_SpoVB_like, Stage V sporulation protein B, also known as Stage III sporulation protein F, and related proteins. The integral membrane protein SpoVB has been implicated in the biosynthesis of the peptidoglycan component of the spore cortex in Bacillus subtilis. This model represents a subfamily of the multidrug and toxic compound extrusion (MATE)-like proteins. Proteins from the MATE family are involved in exporting metabolites across the cell membrane and are often responsible for multidrug resistance (MDR).	4.31221e-108
LR134317.1|VEF04967.1|92960_94013_-|ferrichrome-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	1.27948e-80
LR134317.1|VEF04983.1|101314_101599_+|hypothetical-cytosolic-protein	gnl|CDD|179410	PRK02302, PRK02302, hypothetical protein; Provisional.	2.8295e-46
LR134317.1|VEF04979.1|100172_100763_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit	gnl|CDD|178955	PRK00277, clpP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit; Reviewed.	9.00747e-129
LR134317.1|VEF04947.1|83109_83688_+|membrane-protein	gnl|CDD|226129	COG3601, COG3601, Predicted membrane protein [Function unknown].	3.95164e-52
LR134317.1|VEF04973.1|95999_97445_-|UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--L-lysine-ligase	gnl|CDD|237588	PRK14022, PRK14022, UDP-N-acetylmuramoyl-L-alanyl-D-glutamate--L-lysine ligase.	0
LR134317.1|VEF04969.1|93996_94935_-|ferrichrome-binding-protein-precursor	gnl|CDD|238558	cd01138, FeuA, Periplasmic binding protein FeuA. These proteins have predicted to function as initial receptors in ABC transport of metal ions in some eubacterial species. They belong to the TroA superfamily of periplasmic metal binding proteins that share a distinct fold and ligand binding mechanism. A typical TroA protein is comprised of two globular subdomains connected by a single helix and can bind their ligands in the cleft between these domains.	8.74848e-75
LR134317.1|VEF04955.1|86249_86807_+|rRNA-methylase	gnl|CDD|377744	pfam06962, rRNA_methylase, Putative rRNA methylase. This family contains a number of putative rRNA methylases. Note that many family members are hypothetical proteins.	1.34774e-70
LR134317.1|VEF04971.1|94959_95739_-|ferrichrome-ABC-transporter-ATP-binding-protein	gnl|CDD|224045	COG1120, FepC, ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, ATPase components [Inorganic ion transport and metabolism / Coenzyme metabolism].	9.93782e-123
LR134317.1|VEF04981.1|100867_101314_+|Regulatory-protein-ylbF	gnl|CDD|226204	COG3679, COG3679, Regulatory protein involved in competence development and sporulation [Replication, recombination and repair; Signal transduction mechanisms].	5.27816e-11
LR134317.1|VEF04959.1|88345_89137_+|pyruvate-formate-lyase-activating-enzyme	gnl|CDD|131546	TIGR02493, PFLA, pyruvate formate-lyase 1-activating enzyme. An iron-sulfur protein with a radical-SAM domain (pfam04055). A single glycine residue in EC 2.3.1.54, formate C-acetyltransferase (formate-pyruvate lyase), is oxidized to the corresponding radical by transfer of H from its CH2 to AdoMet with concomitant cleavage of the latter. The reaction requires Fe2+. The first stage is reduction of the AdoMet to give methionine and the 5'-deoxyadenosin-5-yl radical, which then abstracts a hydrogen radical from the glycine residue. [Energy metabolism, Anaerobic, Protein fate, Protein modification and repair].	6.98891e-112
LR134317.1|VEF04949.1|83677_84328_+|PAP2-superfamily-protein	gnl|CDD|239486	cd03392, PAP2_like_2, PAP2_like_2 proteins. PAP2 is a super-family of phosphatases and haloperoxidases. This subgroup, which is specific to bacteria, lacks functional characterization and may act as a membrane-associated lipid phosphatase.	3.2864e-54
LR134317.1|VEF04961.1|89641_90577_+|putative-manganese-dependent-inorganic-pyrophosphatase	gnl|CDD|235458	PRK05427, PRK05427, putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase; Provisional.	6.06588e-174
LR134317.1|VEF04965.1|91965_92964_-|ferrichrome-ABC-transporter-permease	gnl|CDD|376439	pfam01032, FecCD, FecCD transport family. This is a sub-family of bacterial binding protein-dependent transport systems family. This Pfam entry contains the inner components of this multicomponent transport system.	6.19109e-80

Protein sequences

>LR134317.1|VEF04963.1|90643_91297_+|hypothetical-cytosolic-protein
MIAIFNPDKLTRQPFFQDLIHYLNQHDDVTLRHIKQAFSHVKGIDKALEAYIQAGYICRKNRRYYLCLPLLDDLQQVTLEDLIFVDRASDLYEALMALVFETVLPNQTNQVLIKEKTTIDRDKLTLANYFYRLRRGEALSDEQLRLYALLGDVNQDYALKYMTSFLLKFARKEVVMQKRTDIFVNALELLGYIEKVEATKYCLKLAFDKDQLIFYAD
>LR134317.1|VEF04961.1|89641_90577_+|putative-manganese-dependent-inorganic-pyrophosphatase
MSKLLVFGHQNPDTDAIASSYAFDYLAKKAFDLDTEVVALGDPNEETAFALDYFGVSAPRVVTSAKAEGASHVILTDHNEFPQSISDIREVEVYGIVDHHRVANFETANPLYMRVEPVGSASSIVYRLFKENRVDVPKDIAGMLLSGLISDTLLLKSPTTHVSDHRVAAELAELAGVKLEEYGMAMLKAGTNLASKSEAELIDIDAKTFELNGNAVRVAQVNTVDIAEVLERKEAIEAAIREVMAREGYSDFVLMITDIVNSNSEILALGANMDKVEVAFDFKLEDNHAFLAGAVSRKKQVVPQLTESFGA
>LR134317.1|VEF04959.1|88345_89137_+|pyruvate-formate-lyase-activating-enzyme
MVEVDYGQVTGMVHSTESFGSVDGPGIRFIIFLQGCKMRCQYCHNPDTWAMETNQSQRRTVNDVLKEALQYRHFWGKKGGITVSGGEAMLQMDFITALFTEAKKLGIHTTLDTCGFAYRPTPEYHELLETLLAVTDLILLDLKEIDEEQHKLVTRQPNKNILQFARYLSDRQVPVWIRHVLVPGLTDIDDHLVRLDAFVKTLKNVDKFEVLPYHTMGEFKWRELGIPYQLEGVKPPTKERVENAKKLLHTESYTEYMNRIHQS
>LR134317.1|VEF04957.1|86934_88269_+|transport-protein
MEDPVSQPLLIQFLLLVILTLLNAFFSASEMALVSLNRSRVEQKAADGDKRYDRLLRVLEQPNNFLSTIQVGITFISLLSGASLSASLGQVISGWLGGSATAQTAGSIISLVFLTYVSIVLGELYPKRIAMNLKDKLAVVSAPVIIVLGKLVSPFVWLLSASTNLLSRITPMTFDDADERMTRDEIEYMLTNSEATLDAEEIEMLQGIFSLDEMMAREVMVPRTDAFMIDINDDTLDNIKEILKQSFSRIPVYDVDKDKVIGLIHTKRLLESGFRQGFENISMRKLLQEPLFVPETIFVDDLLRQLRNTQNQMAILLDEYGGVAGLVTLEDLLEEIVGEIDDETDKAEQFVHHIDDNTYIVTGTMTLNDFNEYFDTELESDDVDTIAGFYLTGIGTIPSQKEKESFACDSKQKHLVLVNDKVKDGRITKLKLTISNIEQNITED
>LR134317.1|VEF04955.1|86249_86807_+|rRNA-methylase
MIKRPIHVSHEFLKEVLDKQSIAVDATMGNGYDTAFLASLSQRVYAFDVQQQALTKTQERLEQQGLTNAELILAGHEQVDQYVKEPIRAAIFNLGYLPNADKTLITRPETTILALAKILDRLELGGRIAIMVYYGHDGGSREKEALLDYIGQLDQRQVTAMLYQPINQMNQPPFLIMLEKIAATD
>LR134317.1|VEF04953.1|85454_86240_+|aminoglycoside-3'-phosphotransferase
MKQRLIAGEELSLPPVLKKLLQNSLVYDSSSSAEARVYAIDKGQGYFLKTAAKGRLAKEAALTRYCHSKGLATEVLDYISGDQDWLLTAKVAGEDASHIEYLSDPKRLCRILVDHMLKLHSLSLSDFPVADKTLAYIEAAEAGYHQGRFNQCFLPPQQRFQSQEEAYRRIQELKLLLQHETLIHGDFCLPNMILDRWQFQSMIDWGEAGKSDRHIDLFWLIWSLQFNLKTDRYKDYVLDCYGRRHIDLDILDGIAAFEVFA
>LR134317.1|VEF04951.1|84518_85442_+|Fe-S-oxidoreductase
MTKRYQTLNEYYRRLFGAKIFKVPIDAGFDCPNRDGTVAHGGCTFCTVSGSGDAIVAPDAPIREQFYKEIDFMHRKWPEVNQYLVYFQNFTNTHDKLEVIRERYEQAINEPGVVGINIGTRPDCLPDETIAYLAELSERMHVTVELGLQTTYEATSQLINRAHSYDLYKETVQRLRQYPNINIVSHLINGLPGETHEMMIENVRRCVTDNDIQGIKLHLLHLMTNTRMQRDYHEGRLQLLSQKDYVSIICDQLEIIPEHIIIHRITGDAPRDMLIGPMWSLNKWEVLNAIDLEMERRNSWQGCKLKG
>LR134317.1|VEF04949.1|83677_84328_+|PAP2-superfamily-protein
MKHKQQHLLLSSFAMLLFVVLGYIVKFFPEDLTSFDSQLQLALRGHLPEGLTQFFKGITVAGNVSTQAVIVVVAVLALLALSWRAEALFVLSNGVFAALLIWVLKLLYQRPRPSIEHLVHASGYSFPSGHSMGSLLIIGSLLIICHQRLQSASLRWLVDIALLALILLIGLSRIYLGVHYPSDVLAGYALGFGILQLLYPFYDQKRFEWRFQLKQK
>LR134317.1|VEF04947.1|83109_83688_+|membrane-protein
MSKTHRLVMVAILSAISFCLMFVGFSIIPGASFLKIDFSIIPILLGLVLMDLKQAYLILAVRTLLRLALNNHGVNDLIGIPMNVIAVALFITAFALIWHRQKGLVTYVLASLVGTGLLTLGMVIMNYVFAIPLYAKFAGFDIKASIGTARYIFTMVIPFNLLEGLIFAIVFYFVYIAGKPILERYPNSYHET
>LR134317.1|VEF04945.1|82155_82440_+|Uncharacterised-protein
MIAIEMILTGQEPIRALKKELDRRLVQSICAPLTLGRLHALQRRYDSEVSRIATDTADHIQTIVNQLDSSIRGQGRTALEQAIKTQNRGYSSLM
>LR134317.1|VEF04965.1|91965_92964_-|ferrichrome-ABC-transporter-permease
MTATKRHVPLFLGLISGLVCLMIISLSIGESSMSPLEVVRVLFGKSTADMALIITNIRLPRILAACIGGGSLALSGLMLQSLTRNPLADSGILGINAGAGMAITLVISYSTSNSLTSRQGLPLMTISGAMATIVLVYLLSLRHGHIDPIRLIVTGVGLSTMLSSLMIAFVGNVNRYKVDYVIHWLSGQLTGDDWSKLSIVAPLLGITWLLAFSQAYKLNIMALNDEASMALGFKLHQYRTIVLALSAILSALSVILVGNITFIGLIAGHTSKRLVGADHRLSLPVSLFIGMILLLLADTIGRVYLVGGNIPTGILVSIIGASYFLYLMVKMN
>LR134317.1|VEF04967.1|92960_94013_-|ferrichrome-ABC-transporter-permease
MVQITKKLKMTAQHHTKPKLTKAAPPWLILTFISLTLVLAIYCSLRFGAVSLSHQELFHILLGNHGLGQKASIIWDIRLPRLILAALVGAALAVSGAIMQGITRNPIAEPGLLGINSGAGLALVIGYAFFPHLHYSTIILLSLLGSLLATLLILSLAYQTRKGYTQMRLILAGAMISMLLSAIGQGITTYCHLANAIIGWQAGGLIGVNWQMVSYVAPLIICGLVLSYLLAYHLTILSLSQEQAKALGQRTFLISLIFIGLVLLLSSAAVAVAGSISFVGLIIPHAITLVTAKDYRWILPLATLLGASFMLWVDFACRNINPPYETPLSALISFIGLPCFLWLVRKGGRF
>LR134317.1|VEF04969.1|93996_94935_-|ferrichrome-binding-protein-precursor
MKKLLLILTVFVTAFTLVACSSQSKQQESTSKASLSHKPKIAGVTYYGDIPAKPKRVVSLAATYTGYLAKLDLNLVGVTSYDKKNPVLTKSITQAKQVAATDLEAITALKPDLIVVGSTEENIDQLAKIAPLISIEYRKRDYLQVFSDFGRIFNKEKETNQWLADWKQKTSDYEKEVKQVTGSAATFTIMGLYEKEIYLFGKDWGRGGEIIHQAFHYDAPEKVTKEVFKQGYLSLSQEVLPDYIGDYVVVAAEDDQTGSALYESDLWQQIPAVTNNHVIKVNANVFYFTDPLSLEHQLEVLKKAILSNGANH
>LR134317.1|VEF04971.1|94959_95739_-|ferrichrome-ABC-transporter-ATP-binding-protein
MSTISAERISAGYDQSLIISNLSVTIPEGKVTTIIGANGCGKSTLLKTLARLLPLKAGQVLLDGQAIARLATKDVARTLAVLPQLQEATTATVYELVSYGRYPHQSYLGRLSQADKDKICWAMEVTSMAPYAHQAVDALSGGQRQRAWIAMALAQDTDIIFLDEPTTYLDMNHQLDILELLKELNQVSGKTIVMVLHDLNLSARYSDHLIAMKNGDIKYSGEVNQVMTPEMIQDIFQVKAQLVTDPLYNCPTLLTYQLI
>LR134317.1|VEF04973.1|95999_97445_-|UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--L-lysine-ligase
MITIEQLLTILKKDHNFREVLDQEGYHFNYSGLQFDSLSYDSRQADEQTLFFAKGATFKADFLKQAIAQGLKIYISEIDYQVGIPVILVNNIKHAMSLAAMAFYDYPQHKLKLLAFTGTKGKTTAAYFAYHMLKESHKPALLSTMNTTLDGKSFFKSQLTTPESLDLFAMMAQCVANGMTHLVMEVSSQAYLVGRVYGLIFDVGVFLNISPDHIGPIEHPSFEDYFYHKRLLMENSRAVVVNSGMEHFNILAEQVADKPHDFYGKGACNRLLQRQAFSFQAAGKLAGDYAIQLIGSFNQENAMAAGLACLRLGASLEDIRLGIAKTRVPGRMEVLTMTNQAKVFVDYAHNGDSLEKLLSVVEEHQKGQIYLILGAPGNKGESRRADFGQVINQHPNVRVILTADDPNFEDPQLISEEIASYIHREVDIIIDRKEAIKTGMERCQSKEDALIIAGKGADAYQIVKGQKAAYAGDLAIARSYL
>LR134317.1|VEF04975.1|97530_99162_+|polysaccharide-biosynthesis-protein
MSTEKKQLTQEQLMVQGAAWSTAGNFISRLLGVLYIIPWYIWMGQYAIQANALFNMGYNVYAYFLLISTTGLNVAIAKQVAKYNSMGQQEHSYQLIRSTLKVMLVLGLVFSVLMYLGSPIFARLSGGDETLVPIMHSLSLAVFVFPVMSVIRGIFQGYKEIKPYALSQIAEQLVRVIWMLLTTFFIMKMGSKDYIAAVTQSTFAAFIGMIASMAVLFYYFWTQGLLKAIFTKTEHSIPIDIKGLLIETLKESIPFIITGSAIQAFQLIDQWTFVNTMTLFTNYTRSQLWVLFGYFNANPAKITMVLIAVAASIGSVGIALLTENYVKKDMRAAARLIINNIEMLLMFLLPALTGAIILARPLYTVFYGSSEEQAVRLFVAVLCLTLLMALYTLFSPMLQALFENRKAIYYFAYGVFVKLVLQVPLIYLFHAYGPLLATTLGLLVPIYLMYRRLHQVTRFNRKLLHKRILLTVIETALMGLIVLLANWLLGYLFKPTGRLTSLLYLVIIGGLGMGVYAYMTLLTRQLDKLIGSRAARYRQKLGL
>LR134317.1|VEF04977.1|99311_99941_+|uracil-phosphoribosyltransferase
MGKCQVISHPLIQHKLSILRRQDTSTKDFRELVNEIAMLMGYEVSRDLPLEDVEIQTPVAKTVQKQLAGKKLAIVPILRAGIGMVDGFLSLVPAAKVGHIGMYRNEETLEPVEYLVKLPEDIDQRQIFIVDPMLATGGSAILAVDSLKKRGAANIKFVCLVAAPEGVKKLQEAHPDVDIYTAALDERLNDHGYIVPGLGDAGDRLFGTK
>LR134317.1|VEF04979.1|100172_100763_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit
MIPVVIEQTSRGERSYDIYSRLLKDRIIMLTGPVEDNMANSVIAQLLFLDAQDNTKDIYLYVNTPGGSVSAGLAIVDTMNFIKADVQTIVMGMAASMGTVIASSGAKGKRFMLPNAEYMIHQPMGGTGGGTQQTDMAIAAEHLLKTRHRLEKILAQNAGKTIKQIHKDAERDYWMSAEETLAYGFIDEIMENNELA
>LR134317.1|VEF04981.1|100867_101314_+|Regulatory-protein-ylbF
MLIINEELFAIEKAIEQLVQDIRTSSQYQTYALAKKAFEADLALQTELALFEELKRDYELKQGLLESCPDARALRCQLLHQKRQLDLHPLVAELRLAQVDLQEVLATISTAIAEAVSEDILVDTGLPLATNRPRHELGPYQNIKEKST
>LR134317.1|VEF04983.1|101314_101599_+|hypothetical-cytosolic-protein
MFQKQQRIGLVIYLYYNRDARKLMKYGDLYYHSKRSRYLIIYINKEDMEEKLKDISRLKFVKEVKASAFDDIDCDFVGNLHREPLEIQALPDQD

Crispr_ID: LR134317_2

• CRISPR_ID: LR134317_2
• CRISPR_location: 1337886-1339844
• CRISPR_type: TypeI
• Repeat_type: NA:I-C
• Spacer_info: 29 spacers
• Cas_protein_info: cas2,cas1,cas4,cas7,cas8c,cas5,cas3

Consensus repeat of LR134317_2

Consensus_repeat	Method
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CRISPRCasFinder
ATTTCAATCCACTCGCCCNTNNNNGGCGAGAC	CRT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	PILER-CR

spacers of LR134317_2

>2.1|1337918|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
TTGTTCCTGCATATTGATAATTACTACTATCAAGA
>2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
ATTCTTCGATTAAACAACTTGCAAAAACAGCTAGA
>2.3|1338052|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
GTTGGTACGATTGATGTTGATATTGACCTAACT
>2.4|1338117|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
TTTAGGCCTGTCACAACCCCTGCCACAGTCTCCT
>2.5|1338183|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
CGAGTGTTTAACGAGGCCAAAGAAGCTCCCGCAAGG
>2.6|1338251|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
GGGGCTGGCTTAAGCAAGGGCGACGTAAAAACG
>2.7|1338316|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
CAAGCGTAAGTGGGGGAAATAACATGGAATACACA
>2.8|1338383|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
GGTTCATCTTTTTTTAAATTATTTTAAAATTCAATA
>2.9|1338451|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
AGAATCATGCAAATGTTATCAAAACTATAATTAT
>2.10|1338517|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
TTTATCCGCCCAGTAGGCTGTTTTAATATCTTTCT
>2.11|1338584|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
CAAGCCAAGAACGATTACTTGAGTTTTTTGATATC
>2.12|1338651|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
CAAGCGTAAGTGGGGGAAATAACATGGAATACACA
>2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
GGTTCATCTTTTTTTAAATTATTTTAAAATTCAATA
>2.14|1338786|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
AGAATCATGCAAATGTTATCAAAACTATAATTAT
>2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
CTCCTAAAAAAGCTTGGTGCTTTGTTGTGCTGT
>2.16|1338917|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
CGTGGAGCTACGACAGAAATATCTAATCAACCT
>2.17|1338982|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
AAAAGTTTTTAATTGGAGCTTTTAAAAATGATG
>2.18|1339047|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT
TTTCAGTCGCCCTGTCTTGTATAACGGCAGACCCTT
>2.19|1339115|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TTCGTCTTGTTCCTGTGTTTGATGTGTCAAATACA
>2.20|1339182|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GGGGAAAGGATGTTGAGGTTATCAAAAATTCATT
>2.21|1339248|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GATTGCAACTTGGGATTTAGATTTGTTAAACGAA
>2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TTACTTTTTTGGGATTAGAGTTTGGTAACCCTA
>2.23|1339379|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
GGCAAGTAGTGTCTTCTCCACTTGTTGGGTATGA
>2.24|1339445|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
AATAAAACGAAAAATTATACTAAACTTTTGAACA
>2.25|1339511|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
ACAGTGTGATGCAAGGAAAAATTTAATGGTAAGAC
>2.26|1339578|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
TGATTGGTTAGTTGATATTACTTCTTGATTTTTATG
>2.27|1339646|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
CTAAACCAATGCCAGAGCCAATCGTTATTATTAGT
>2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
CAAGAATTGATGGTGTTGCTGAGGTAACATTCCTT
>2.29|1339780|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
AATCAATCGTATTATTGGTTAAGATACAGTCTT

CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134317_2

CRISPR arrays

The CRISPR arrays of LR134317_2

>merge|LR134317|2|1337886-1339844|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACTTGTTCCTGCATATTGATAATTACTACTATCAAGAATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACATTCTTCGATTAAACAACTTGCAAAAACAGCTAGAATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACGTTGGTACGATTGATGTTGATATTGACCTAACTATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACTTTAGGCCTGTCACAACCCCTGCCACAGTCTCCTATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACCGAGTGTTTAACGAGGCCAAAGAAGCTCCCGCAAGGATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACGGGGCTGGCTTAAGCAAGGGCGACGTAAAAACGATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACCAAGCGTAAGTGGGGGAAATAACATGGAATACACAATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACGGTTCATCTTTTTTTAAATTATTTTAAAATTCAATAATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACAGAATCATGCAAATGTTATCAAAACTATAATTATATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACTTTATCCGCCCAGTAGGCTGTTTTAATATCTTTCTATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACCAAGCCAAGAACGATTACTTGAGTTTTTTGATATCATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACCAAGCGTAAGTGGGGGAAATAACATGGAATACACAATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACGGTTCATCTTTTTTTAAATTATTTTAAAATTCAATAATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACAGAATCATGCAAATGTTATCAAAACTATAATTATATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGACCTCCTAAAAAAGCTTGGTGCTTTGTTGTGCTGTATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACCGTGGAGCTACGACAGAAATATCTAATCAACCTATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACAAAAGTTTTTAATTGGAGCTTTTAAAAATGATGATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACTTTCAGTCGCCCTGTCTTGTATAACGGCAGACCCTTATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACTTCGTCTTGTTCCTGTGTTTGATGTGTCAAATACAATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACGGGGAAAGGATGTTGAGGTTATCAAAAATTCATTATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACGATTGCAACTTGGGATTTAGATTTGTTAAACGAAATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACTTACTTTTTTGGGATTAGAGTTTGGTAACCCTAATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACGGCAAGTAGTGTCTTCTCCACTTGTTGGGTATGAATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACAATAAAACGAAAAATTATACTAAACTTTTGAACAATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACACAGTGTGATGCAAGGAAAAATTTAATGGTAAGACATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACTGATTGGTTAGTTGATATTACTTCTTGATTTTTATGATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACCTAAACCAATGCCAGAGCCAATCGTTATTATTAGTATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACCAAGAATTGATGGTGTTGCTGAGGTAACATTCCTTATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGACAATCAATCGTATTATTGGTTAAGATACAGTCTTATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC

>LR134317|2|2|1337886-1339844|CRISPRCasFinder
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	TTGTTCCTGCATATTGATAATTACTACTATCAAGA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	ATTCTTCGATTAAACAACTTGCAAAAACAGCTAGA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	GTTGGTACGATTGATGTTGATATTGACCTAACT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	TTTAGGCCTGTCACAACCCCTGCCACAGTCTCCT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CGAGTGTTTAACGAGGCCAAAGAAGCTCCCGCAAGG
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	GGGGCTGGCTTAAGCAAGGGCGACGTAAAAACG
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CAAGCGTAAGTGGGGGAAATAACATGGAATACACA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	GGTTCATCTTTTTTTAAATTATTTTAAAATTCAATA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	AGAATCATGCAAATGTTATCAAAACTATAATTAT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	TTTATCCGCCCAGTAGGCTGTTTTAATATCTTTCT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CAAGCCAAGAACGATTACTTGAGTTTTTTGATATC
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CAAGCGTAAGTGGGGGAAATAACATGGAATACACA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	GGTTCATCTTTTTTTAAATTATTTTAAAATTCAATA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	AGAATCATGCAAATGTTATCAAAACTATAATTAT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CTCCTAAAAAAGCTTGGTGCTTTGTTGTGCTGT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	CGTGGAGCTACGACAGAAATATCTAATCAACCT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	AAAAGTTTTTAATTGGAGCTTTTAAAAATGATG
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TTTCAGTCGCCCTGTCTTGTATAACGGCAGACCCTT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TTCGTCTTGTTCCTGTGTTTGATGTGTCAAATACA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	GGGGAAAGGATGTTGAGGTTATCAAAAATTCATT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	GATTGCAACTTGGGATTTAGATTTGTTAAACGAA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TTACTTTTTTGGGATTAGAGTTTGGTAACCCTA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	GGCAAGTAGTGTCTTCTCCACTTGTTGGGTATGA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	AATAAAACGAAAAATTATACTAAACTTTTGAACA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	ACAGTGTGATGCAAGGAAAAATTTAATGGTAAGAC
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TGATTGGTTAGTTGATATTACTTCTTGATTTTTATG
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	CTAAACCAATGCCAGAGCCAATCGTTATTATTAGT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	CAAGAATTGATGGTGTTGCTGAGGTAACATTCCTT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	AATCAATCGTATTATTGGTTAAGATACAGTCTT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC

>LR134317|2|1|1337886-1339844|CRT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	TTGTTCCTGCATATTGATAATTACTACTATCAAGA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	ATTCTTCGATTAAACAACTTGCAAAAACAGCTAGA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	GTTGGTACGATTGATGTTGATATTGACCTAACT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	TTTAGGCCTGTCACAACCCCTGCCACAGTCTCCT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CGAGTGTTTAACGAGGCCAAAGAAGCTCCCGCAAGG
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	GGGGCTGGCTTAAGCAAGGGCGACGTAAAAACG
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CAAGCGTAAGTGGGGGAAATAACATGGAATACACA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	GGTTCATCTTTTTTTAAATTATTTTAAAATTCAATA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	AGAATCATGCAAATGTTATCAAAACTATAATTAT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	TTTATCCGCCCAGTAGGCTGTTTTAATATCTTTCT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CAAGCCAAGAACGATTACTTGAGTTTTTTGATATC
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CAAGCGTAAGTGGGGGAAATAACATGGAATACACA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	GGTTCATCTTTTTTTAAATTATTTTAAAATTCAATA
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	AGAATCATGCAAATGTTATCAAAACTATAATTAT
ATTTCAATCCACTCGCCCGTATGGGGCGAGAC	CTCCTAAAAAAGCTTGGTGCTTTGTTGTGCTGT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	CGTGGAGCTACGACAGAAATATCTAATCAACCT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	AAAAGTTTTTAATTGGAGCTTTTAAAAATGATG
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TTTCAGTCGCCCTGTCTTGTATAACGGCAGACCCTT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TTCGTCTTGTTCCTGTGTTTGATGTGTCAAATACA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	GGGGAAAGGATGTTGAGGTTATCAAAAATTCATT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	GATTGCAACTTGGGATTTAGATTTGTTAAACGAA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TTACTTTTTTGGGATTAGAGTTTGGTAACCCTA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	GGCAAGTAGTGTCTTCTCCACTTGTTGGGTATGA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	AATAAAACGAAAAATTATACTAAACTTTTGAACA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	ACAGTGTGATGCAAGGAAAAATTTAATGGTAAGAC
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TGATTGGTTAGTTGATATTACTTCTTGATTTTTATG
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	CTAAACCAATGCCAGAGCCAATCGTTATTATTAGT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	CAAGAATTGATGGTGTTGCTGAGGTAACATTCCTT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	AATCAATCGTATTATTGGTTAAGATACAGTCTT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC

>LR134317|2|1|1339083-1339844|PILER-CR
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TTCGTCTTGTTCCTGTGTTTGATGTGTCAAATACA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	GGGGAAAGGATGTTGAGGTTATCAAAAATTCATT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	GATTGCAACTTGGGATTTAGATTTGTTAAACGAA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TTACTTTTTTGGGATTAGAGTTTGGTAACCCTA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	GGCAAGTAGTGTCTTCTCCACTTGTTGGGTATGA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	AATAAAACGAAAAATTATACTAAACTTTTGAACA
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	ACAGTGTGATGCAAGGAAAAATTTAATGGTAAGAC
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	TGATTGGTTAGTTGATATTACTTCTTGATTTTTATG
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	CTAAACCAATGCCAGAGCCAATCGTTATTATTAGT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	CAAGAATTGATGGTGTTGCTGAGGTAACATTCCTT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC	AATCAATCGTATTATTGGTTAAGATACAGTCTT
ATTTCAATCCACTCGCCCATGAAAGGCGAGAC

Neighbor Proteins Overview

Protein	Signature genes	Signature genes Name	Protein_function
LR134317.1|VEF07977.1|1348594_1349188_-|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	unknown
LR134317.1|VEF07946.1|1333994_1335107_-|peptide-methionine-sulfoxide-reductase	unknown	unknown	gnl|CDD|184456
LR134317.1|VEF07983.1|1349447_1349870_-|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	unknown
LR134317.1|VEF07937.1|1330143_1331232_-|cytoplasmic-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225197
LR134317.1|VEF07940.1|1331271_1332990_-|sensor-histidine-kinase	unknown	unknown	gnl|CDD|225519
LR134317.1|VEF07949.1|1335124_1335775_-|thiol:disulfide-oxidoreductase	unknown	unknown	gnl|CDD|239264
LR134317.1|VEF07925.1|1326875_1327556_-|Fumarate-and-nitrate-reduction-regulatory-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223736
LR134317.1|VEF07931.1|1328679_1329168_-|regulatory-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|239827
LR134317.1|VEF07968.1|1342841_1344725_-|CRISPR-associated-protein	cas8c	cd09642_cas8c_CAS-I-C	gnl|CDD|187773
LR134317.1|VEF07928.1|1327696_1328170_+|arginine-repressor	unknown	unknown	gnl|CDD|224355
LR134317.1|VEF07943.1|1332986_1333727_-|two-component-response-regulator-YesN-like	unknown	unknown	gnl|CDD|227095
LR134317.1|VEF07971.1|1344724_1345468_-|CRISPR-associated-protein	cas5	cd09752_cas5_CAS-I-C	gnl|CDD|273847
LR134317.1|VEF07956.1|1339992_1340286_-|CRISPR-associated-protein-Cas2	cas2	COG1343_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	gnl|CDD|187856
LR134317.1|VEF07934.1|1329424_1330129_-|B3/4-domain-containing-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|225917
LR134317.1|VEF07965.1|1341992_1342841_-|CRISPR-associated-protein	cas7	COG3649_cas7_CAS-I-C	gnl|CDD|187820
LR134317.1|VEF07962.1|1341319_1341991_-|CRISPR-associated-RecB-family-exonuclease-Cas4b	cas4	pfam01930_cas4_CAS-I	gnl|CDD|224385
LR134317.1|VEF07974.1|1345684_1348138_-|CRISPR-associated-helicase	cas3	COG1203_cas3_CAS-I	gnl|CDD|224124
LR134317.1|VEF07959.1|1340297_1341323_-|CRISPR-associated-protein-Cas1	cas1	cd09721_cas1_CAS-I-C	gnl|CDD|188360
LR134317.1|VEF07980.1|1349358_1349448_-|Uncharacterised-protein	unknown	unknown	unknown
LR134317.1|VEF07952.1|1335788_1336499_-|cytochrome-c-type-biogenesis-protein	unknown	unknown	gnl|CDD|223856

HMMScan for Signature genes

Protein	Cas_name	Cas_description	E-value	Identity	Coverage
LR134317.1|VEF07971.1|1344724_1345468_-|CRISPR-associated-protein	cas5	cd09752_cas5_CAS-I-C	5.9e-56	184.2	0.0
LR134317.1|VEF07956.1|1339992_1340286_-|CRISPR-associated-protein-Cas2	cas2	COG1343_cas2_CAS-I:CAS-II:CAS-III	4.9e-30	98.5	0.0
LR134317.1|VEF07962.1|1341319_1341991_-|CRISPR-associated-RecB-family-exonuclease-Cas4b	cas4	pfam01930_cas4_CAS-I	4.7e-32	106.1	1.9
LR134317.1|VEF07965.1|1341992_1342841_-|CRISPR-associated-protein	cas7	COG3649_cas7_CAS-I-C	4.8e-130	427.6	0.5
LR134317.1|VEF07974.1|1345684_1348138_-|CRISPR-associated-helicase	cas3	COG1203_cas3_CAS-I	1.2e-94	312.7	4.9
LR134317.1|VEF07968.1|1342841_1344725_-|CRISPR-associated-protein	cas8c	cd09642_cas8c_CAS-I-C	5.5e-116	383.1	6.5
LR134317.1|VEF07959.1|1340297_1341323_-|CRISPR-associated-protein-Cas1	cas1	cd09721_cas1_CAS-I-C	3.3e-146	481.4	0.0

rpsblast for functional proteins

Protein	Function_ID	Function_description	E-value
LR134317.1|VEF07946.1|1333994_1335107_-|peptide-methionine-sulfoxide-reductase	gnl|CDD|184456	PRK14018, PRK14018, bifunctional peptide-methionine (S)-S-oxide reductase MsrA/peptide-methionine (R)-S-oxide reductase MsrB.	2.37598e-164
LR134317.1|VEF07937.1|1330143_1331232_-|cytoplasmic-protein	gnl|CDD|225197	COG2315, MmcQ, Uncharacterized protein conserved in bacteria [Function unknown].	4.07742e-22
LR134317.1|VEF07940.1|1331271_1332990_-|sensor-histidine-kinase	gnl|CDD|225519	COG2972, COG2972, Predicted signal transduction protein with a C-terminal ATPase domain [Signal transduction mechanisms].	9.17555e-63
LR134317.1|VEF07949.1|1335124_1335775_-|thiol:disulfide-oxidoreductase	gnl|CDD|239264	cd02966, TlpA_like_family, TlpA-like family; composed of TlpA, ResA, DsbE and similar proteins. TlpA, ResA and DsbE are bacterial protein disulfide reductases with important roles in cytochrome maturation. They are membrane-anchored proteins with a soluble TRX domain containing a CXXC motif located in the periplasm. The TRX domains of this family contain an insert, approximately 25 residues in length, which correspond to an extra alpha helix and a beta strand when compared with TRX. TlpA catalyzes an essential reaction in the biogenesis of cytochrome aa3, while ResA and DsbE are essential proteins in cytochrome c maturation. Also included in this family are proteins containing a TlpA-like TRX domain with domain architectures similar to E. coli DipZ protein, and the N-terminal TRX domain of PilB protein from Neisseria which acts as a disulfide reductase that can recylce methionine sulfoxide reductases.	7.12346e-35
LR134317.1|VEF07925.1|1326875_1327556_-|Fumarate-and-nitrate-reduction-regulatory-protein	gnl|CDD|223736	COG0664, Crp, cAMP-binding proteins - catabolite gene activator and regulatory subunit of cAMP-dependent protein kinases [Signal transduction mechanisms].	1.56348e-40
LR134317.1|VEF07931.1|1328679_1329168_-|regulatory-protein	gnl|CDD|239827	cd04335, PrdX_deacylase, This CD includes bacterial (Agrobacterium tumefaciens and Caulobacter crescentus ProX, and Clostridium sticklandii PrdX) and eukaryotic (Plasmodium falciparum N-terminal ProRS editing domain) sequences. The C. sticklandii PrdX protein, a homolog of the YbaK and ProX proteins, and the prolyl-tRNA synthetase-editing domain (ProRS-INS), specifically hydrolyzes Ala-tRNA(Pro). In this CD, many of the eukaryotic editing domains are N-terminal and cis-acting, expressed from a multidomain ProRS, however, similar to the bacterial PrdX, the mammalian, amphibian, and echinoderm PrdX-like proteins are trans-acting, single-domain proteins.	6.00337e-60
LR134317.1|VEF07968.1|1342841_1344725_-|CRISPR-associated-protein	gnl|CDD|187773	cd09642, Cas8c_I-C, CRISPR/Cas system-associated protein Cas8c. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Large proteins, some contain Zn-finger domain; signature gene for I-C subtype; also known as Csd1 family.	3.35664e-116
LR134317.1|VEF07928.1|1327696_1328170_+|arginine-repressor	gnl|CDD|224355	COG1438, ArgR, Arginine repressor [Transcription].	8.79004e-63
LR134317.1|VEF07943.1|1332986_1333727_-|two-component-response-regulator-YesN-like	gnl|CDD|227095	COG4753, COG4753, Response regulator containing CheY-like receiver domain and AraC-type DNA-binding domain [Signal transduction mechanisms].	1.30254e-79
LR134317.1|VEF07971.1|1344724_1345468_-|CRISPR-associated-protein	gnl|CDD|273847	TIGR01876, cas_Cas5d, CRISPR-associated protein Cas5, subtype I-C/DVULG. CRISPR is a term for Clustered, Regularly Interspaced Short Palidromic Repeats. A number of protein families appear only in association with these repeats and are designated Cas (CRISPR-Associated) proteins. This small Cas family is represented by CT1134 of Chlorobium tepidum. This family belongs to a set of several Cas protein families, one each for a number of different CRISPR/Cas subtypes, that share a region of N-terminal sequence similarity modeled by TIGR02593. This family represents the Dvulg subtype of CRISPR/Cas locus.	1.42066e-92
LR134317.1|VEF07956.1|1339992_1340286_-|CRISPR-associated-protein-Cas2	gnl|CDD|187856	cd09725, Cas2_I_II_III, CRISPR/Cas system-associated protein Cas2. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Cas2 is present in majority of CRISPR/Cas systems along with Cas1; RNAse specific to U-rich regions; Possesses an RRM/ferredoxin fold.	4.31658e-31
LR134317.1|VEF07934.1|1329424_1330129_-|B3/4-domain-containing-protein	gnl|CDD|225917	COG3382, COG3382, Solo B3/4 domain (OB-fold DNA/RNA-binding) of Phe-aaRS-beta [General function prediction only].	7.00334e-92
LR134317.1|VEF07965.1|1341992_1342841_-|CRISPR-associated-protein	gnl|CDD|187820	cd09689, Cas7_I-C, CRISPR/Cas system-associated RAMP superfamily protein Cas7. CRISPR (Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats) and associated Cas proteins comprise a system for heritable host defense by prokaryotic cells against phage and other foreign DNA; Cas7 is a RAMP superfamily protein; Subunit of the Cascade complex; also known as Csd2 family.	4.81215e-135
LR134317.1|VEF07962.1|1341319_1341991_-|CRISPR-associated-RecB-family-exonuclease-Cas4b	gnl|CDD|224385	COG1468, COG1468, CRISPR-associated protein Cas4 (RecB family exonuclease) [Defense mechanisms].	3.00851e-31
LR134317.1|VEF07974.1|1345684_1348138_-|CRISPR-associated-helicase	gnl|CDD|224124	COG1203, COG1203, CRISPR-associated helicase Cas3 [Defense mechanisms].	5.81022e-82
LR134317.1|VEF07959.1|1340297_1341323_-|CRISPR-associated-protein-Cas1	gnl|CDD|188360	TIGR03640, cas1_DVULG, CRISPR-associated endonuclease Cas1, subtype I-C/DVULG. The CRISPR-associated protein Cas1 is virtually universal to CRISPR systems. CRISPR, an acronym for Clustered Regularly Interspaced Short Palindromic Repeats, is prokaryotic immunity system for foreign DNA, mostly from phage. CRISPR systems belong to different subtypes, distinguished by both nature of the repeats, the makeup of the cohort of associated Cas proteins, and by molecular phylogeny within the more universal Cas proteins such as this one. This model is of type EXCEPTION and provides more specific information than the EQUIVALOG model TIGR00287. It describes the Cas1 protein particular to the DVULG subtype of CRISPR/Cas system.	0
LR134317.1|VEF07952.1|1335788_1336499_-|cytochrome-c-type-biogenesis-protein	gnl|CDD|223856	COG0785, CcdA, Cytochrome c biogenesis protein [Posttranslational modification, protein turnover, chaperones].	8.62107e-42

Protein sequences

>LR134317.1|VEF07952.1|1335788_1336499_-|cytochrome-c-type-biogenesis-protein
MELTMLLMVSVFIAGLLSFFSPCIFPVLPVYLGILLDSDDSRSITIFGKKLYWYGIVKTLAFISGLSTIFIILGYGAGLLGNILYAAWFRYLLGAFVILLGIHQMEIVTIKKLQFQKSVAFQNKKDRNAVLNAFLLGITFSFGWTPCVGPVLSSVLALAASGGSGAWQGGFLMIIYTLGLGLPFLLLSFASGIVLKHFNKLKPHIPLLKKLGGLLIVVMGLLLMTGNLNSLSGLFE
>LR134317.1|VEF07949.1|1335124_1335775_-|thiol:disulfide-oxidoreductase
MKKTTFLTTGLACLALLTACSAKDKMAMNDNKKDHMTMTDDKSKMKKDQKDMMSDKKDMMSDDKHMSDADKASKNDGQMAPDFELKSIDGKTYRLSDFKGKKVYLKFWASWCSICLSTLGDTQSLATMKDKDFEVLTIVSPGHQGEKSEADFKKWFEGTDFKDLPVLLDPDGKLLEAYGVRSYPTEIFVGSDGVLAKKHIGYAKKSEIEKTLKEIK
>LR134317.1|VEF07946.1|1333994_1335107_-|peptide-methionine-sulfoxide-reductase
MEHKWKLLLLVFGALVFLGGVLMVFQRGYATSYHNNQVKLPAKGTSQLKKTANAKLPEKKKEIYLAGGCFWGVEEYFSNVDGVLDAVSGYANGRGDTTSYQLLHQTGHAETVQVVYDANRISLKELLLHYFRIIDPTSLNKQGNDRGSQYRTGVYYTDPSDLTTIDMVFQEKASDYKKKIVVEKAPLKSFTKAEEYHQDYLKKNPNGYCHINVNEASYPVIDKTKYPKPSKKEIKKKLSKDEYRVTQNNETEKAFSNRYWDSFEAGIYVDVVTGEPLFSSKDKFESGCGWPSFSRPISPDVLRYKTDKSFNMNRTEVRSRSGNSHLGHVFTDGPKDQGGLRYCINSLSIRFIPKAEMEAKGYGYLLTAVD
>LR134317.1|VEF07943.1|1332986_1333727_-|two-component-response-regulator-YesN-like
MYSLLIVEDEYLVRQGIRSLVDFDQFAIDRIAEAENGQVAWELFQENPYDIVLTDINMPKLNGIQLAELIKARAPKTHLVFLTGYDDFNYALSALKLGADDYLLKPFSKSDVEEMLKKLKQKLEKLKKTEALQKLVDKPQQEGSEIKLAIQERLADSSLTLKSLSSQLGFSPNYLSVLIKKDLGLPFQDYLIQERLKKAKLLLLTTDLRVYEIAEQVGFEDINYFSQRFKQLVGMTPRQYKKGDGQ
>LR134317.1|VEF07940.1|1331271_1332990_-|sensor-histidine-kinase
MKRYPLLVQLVSYFFLIVISLIAILGLIYYQTSSHNIRQLIERETRQSIRQSSQFIDAYIKPLKETTSALANHTSIQAFAKDANSNDQSQVLALMTTVLSTNSDLLSAVLVTKDGRMVTTNPKLTMTTSHDMMAELWYKSAIDRKAMPVLTPARQLSSHSKKDWVVSVTQEVVDQAGNNLGVLRLDIGYNTIKSSLDQLQLGRKGFAFIVNDKHEFVYHPKNTVYSSAKEMAAMKPYLAVTDGYTKSKDYFVYQRVIPDSQWTLIGVASLDQLYHVQRQIFWSFLGTGLLATIICGLGTVFVLRSWIGPIRRLQALILAIQNGNRQLRAEETGSPELADLARQFNAMLDQIDSLMVSVADKEKAIGQYRLQALASQINPHFLYNTLDTIIWMAEFNDSQRVVDVTKSLAKYFRLALNQGNEFISLVDELDHARQYLFIQKQRYGDKLHYEIKGLEKYQDFMIPKLILQPLVENAIYHGIKEVDRPGIIRVTVSEADRHVILSVWDNGKGISLADDSSQTLLERGGVGLKNVDQRLRLQYGHLYRMAITSEQAVFTEIKLYLPKALDSLDEAP
>LR134317.1|VEF07937.1|1330143_1331232_-|cytoplasmic-protein
MSLESDYFKRKSPIFEALIPYGFTQEGDTYCYQESFMEGDFKALITIKSSGQLSARVIDTDLGEDYLPLRNDRQQGVYVGQVRQAYLELLGRLSAACFRSTPFQTRQANQVATSISQQWNDPLDYPFEKFPNIATYRVSGKWYAMVLPLLADKLGQVPKVLQGQMVEVLTVRIAPNQLTHLLQQRGVYPAYHMSKKTWISLLLDGTLADDQLWELVTKSRQLANPNGLANPDGPDYWVIPANLSYYDIDAEFAANPDILWTQKASIKAGDYVFIYITAPTRSIRYACQVLRSDIPNQGYRKNAKIKTLMSLRLLHCYEDGLISLDLMKQYGVNAVRGPRRLSPQLVAFLKEKEYFKDVKQKE
>LR134317.1|VEF07934.1|1329424_1330129_-|B3/4-domain-containing-protein
MTQFIADQSFWELFPDAKLGVLLLRNYDNQEDSPQEVKQLLADSHDIAKQYLTEESFSDNEIIQVYRQAYQRFKTKKGARSSIEALLKRVANGQVLSSINPLVDIYNAASLRFGLPVGAEDSDCFVGDLRLTLTEGGDEFYLIGDSKNSPTLPNELCYKDDAGAVCRCLNWRDGERTMITDRTKNAFLIIEALDSKTQARLQDALKFIEDKAKRYLKAETALYTLDQASPSITL
>LR134317.1|VEF07931.1|1328679_1329168_-|regulatory-protein
MELFDKVDDTLKALAIDYQLVEHEPALTTEQADQFIEGIEGVRTKTMFLTTRKKNHFYLVIMDDTKRLDMNRFKELVGEKQIKMASAECLLAKMQLPPGVVSPFGLLNNEDKDIQVYVDKAIAHEARMSFHPNTNDKTIFIQTDDLFKFLAAIGYAVNIVDL
>LR134317.1|VEF07928.1|1327696_1328170_+|arginine-repressor
MNKKETRHQLIRSLISETTIHTQQELQERLRKNGISITQATLSRDMKELNLVKVTTGNDTHYEALAISQTRWEHRLRFYMEDALVMLRVVQHQIILKTLPGLAQSFGSILDAMQISEIVATICGDDTCLIICEDNEQAKACFEILSHYTPPFFFSNK
>LR134317.1|VEF07925.1|1326875_1327556_-|Fumarate-and-nitrate-reduction-regulatory-protein
MIRREDYQYLRKLDDFCHFSIEQFDKIVGQMEFRQAKKDHMLFFEGDKRDRLFLVTSGYFKIEQSDRTGTFTYTDFIRHGTIFPYGGLFTDDYYHFSVVAMTDVTYFYFPTDLFEDYSLHNQQQMKHLYSKMSSLLELHELKVRNLITSSASSRVIQSLAILLVEMGKDSDTLPFQLTTTDIAQMSGTTRETVSHVFRDLKKEGLIAVKGKYLTYLDKSYFLQYTT
>LR134317.1|VEF07956.1|1339992_1340286_-|CRISPR-associated-protein-Cas2
MMVLVTYDVNTETAAGRKRLRQVAKLCVDYGQRVQHSVFECSVTPAEFVEIKHKLTTIIDTEVDSIRFYLLGKHWQNRVETLGRSDSYDPDIGVLLL
>LR134317.1|VEF07959.1|1340297_1341323_-|CRISPR-associated-protein-Cas1
MKKLLNTLYLTQEDYYITKEGDNIVIKQDGKTVSRFPFRIIDGVVCFSYLGASPALIKLCTENQINLSFHTPQGRFCGRYVGATNGNVLLRREHYRLADRDESLEYAKRFILAKISNARKYLLRFRRDHRDQIDGKLFEEVNGELIWALEMVQATDNKDSLRGIEGQAANQYFRIFNDLVLTDKKAFTFGGRSKRPPLDRVNALLSFGYSLLTFECQSALEAVGLDSYVGFFHTDRPGRASLALDLVEEFRSYIVDRFVFSLINKGQLTKKHFDVKENGSILLTEKGRVTFIELWQKRKHVEVEHPFTKEKVKLMLLPYVQAQLLAKAIRGDIDSYPPFMI
>LR134317.1|VEF07962.1|1341319_1341991_-|CRISPR-associated-RecB-family-exonuclease-Cas4b
MVYVEDDYLMLSGIQHFQFCKRQWALIHIDQQWVDNEATAHGQILHTRADNPYIKEKRKDFFLSRAMHISSACLGLYGIMDVVEFHKDDSGVMVKGKRGRWLPRVVEYKRGKPKKDRRDIVQLVAQTMCLEETLNCQIAEGSLYYHSVNKKVQIAITDELRREVQELANQMHRFYGAKELPKAEYFKNCQLCSLVEVCKPRISKKVRNVDHYIAAAMVSEEII
>LR134317.1|VEF07965.1|1341992_1342841_-|CRISPR-associated-protein
MLEHKIDFMVTVEVKEANANGDPLSGNMPRTNAKGYGLMSDVSIKRKIRNRLQDMGQSIFVQANERIEDEFRSLENRFSAQFDKDDKDDDIERRANELWLDVRSFGQVFTYLKKSIGVRGPVSISMAKSLEPVVISSLQITRSTNGMEPKGDSSRSSDTMGTKHFVDYGIYVIKGSINAHFAEKTGFSEEDADIIKQALVSLFENDASSARPEGSMRVREVFWFTHSSKLGNVSSARVFDLLVFDMETPDKDRYEAYGIHLDEEKLAAYQAKGLTVEVLEGL
>LR134317.1|VEF07968.1|1342841_1344725_-|CRISPR-associated-protein
MDFFASLLRAYEHAEDIGLVDNQEQSGTILLPIYHTNRRSNGKDTIVVQLDKTGQFMKAEYLADGETIIFPVTVESVARSGKNPAPHPLVDKLTYFVSEHNQEQYESYHQQLKGWISACQDKQVMSYLSLIQQFILKEDFLDLICQSLFGKQLSRNGLKVTYALSEEKEKTVNLSACFLTFQIAQFIGFKTVSVTNFTALHKDYIAYLMSKQTANTICNISGQKEVLATKHRGLLGNAKLISVSNHAEAYKGRFRERDDVFRVGNQTSEKLHLMAKYFLEHEQTHVWLGSGQHMINWFSDDLANDSQLNITQALLLDPFDDEETFLSTPMISEENKSINRSFITGQRQFSDSASYYIAILNKTNDGRIALKYFRQLQASSLLKNLAVWQENYSWELQRKGNQFVQKLPSFKEIILAAYGVDRDRSLELDNDNFRSDQYQRLVTSLIDGKPLPDTIVKKLEANIKQRQKYRKHWHQVEHISLAILHKQNGEEFTPMLDRDNTNRSYLFGRLLGIYELIEKSRNNSKGRAKDELKRITNAERYWTAYANRPASLMRNLEDKIYPYSEYLKINEAGLWSKLEKEREEIIALLTSSLETTDFNKPLDYRFIFGYYAEKKYFYTPKDESEDA
>LR134317.1|VEF07971.1|1344724_1345468_-|CRISPR-associated-protein
MYRSRHFYMRVRGDIALFTNPATKGSSERSSYPVPTRQALQGIVDAVYHKPTITNVVTEVKVINQIQTELHGTRALLKDYGADLSYVSYLSDVEYLIKYHFVWNENRPDLVKDRLPSKHEAIMERSLRKGGRRDVFLGTRECLGLVEAISQQEYEAAQVASEHANQEIDLGIMFHSFAYPTDKKEPLRSYFTRTVMTNGRIRFKEQAECEIMNTLSSYTFKAAGPIKPVEEEFEGYQLDTIRETGGQ
>LR134317.1|VEF07974.1|1345684_1348138_-|CRISPR-associated-helicase
MILAHYQGETGLTPAKEQSLEEHSFQVAELARAAATSIKQGDLVFLLGLFHDLGKAEYRFQEKLLKKPNSHVDHAYAGARYLYDEIGKVLLGHVQQYPHSKSLVLYFRDIVAYVISAHHGMYDLRMTEPTEEVSRFAYNKLLHRMFQERPGYHYQKDVLPFVEVLEQSLPRYGYDHLADLITRAFYNFQLAWDKLDMADASEQDYYSGCFVRLYLSLLKNADVLDTINAYETVIEPLTEEKQEELRISYLEAVESLYASFGQSKLRLNAIRNKLAERVKGRGREDSTGIYRLNLPTGAGKTNLSLRYATHQMVYQQKKHFLYVTPFLSVLEQNALAMKQVIGEEGVLEHHSNVVREIDNTNQNNDDADEDRDSLRREYLIDSWDSPVVLTSMVQFFQTLFKTRSAHLRRFSSLIDSVVILDEVQSLPIEVTTLFNLTMTFLSRVMQTTLVLCTATQPVYDSESITHTLTYGGSKAEEADIVTVTDEEQLVFARTELCKLLDSDEKTSLVELAQTILEQEMSTLVILNTKPAVERLYQLLRDQTERPLYQLSTNMCPKHRLDVIAEIKNHLHNNVPLICVSTQLIEAGVDIDFERVIRSYAGIDSIVQAAGRCNREGRCPIGQVLLVNLTDDEENLSYLKEIKHKKDATETILYQKTSPIDIAALNEAFFNCYYENNKKRLDYPLGDNESVYQYLSSNAPSNIKKGKLRQAFKTAGQKMDLIQDRSIGVFVYYDDGVGPKRLKALENRLEKGAYPSFEELKAIKAELKALQPYTITLRDNHELLKATRSYLNGQVLFLEERYYHQTFGLTKEADSFIL
>LR134317.1|VEF07977.1|1348594_1349188_-|Uncharacterised-protein
MIYKENYIHWLTNFLGASLVSKGDNVSVSDGVDIIYCMEKREDEYDISISERGKVITQHRVLNSKLARLYYILLVKKALTTIKYPLLNSIGNVDSEELLRAQLNSEGLENYYSINKNGIGKVNFQNIGKDRLYYLDNKNNAYDIFFVSSKVLSVFYTSIVRLKWYEKWIEQLSSIEDISSDLYPVLLGFSHEGIEIL
>LR134317.1|VEF07980.1|1349358_1349448_-|Uncharacterised-protein
MFKIAELTEVDSAILDLILILVTIINMKS
>LR134317.1|VEF07983.1|1349447_1349870_-|Uncharacterised-protein
MALSQLEWEDVNQYEEVKGYGQRVWKHQGEYYLVREEGGIATQRVVYNLPNELFQLLDSGRKSLLEIDFYVKNNCWPPTEEEKNRIMREIAKDRPMVLISNPKNQMLFTQEELRKLIPIAEQKWIDWKGKLPDDYVSPLK

MGE targeting detection<

CRISPR_ID	Spacer_Info	Spacer_region	Spacer_length	Hit_phage_ID	Hit_phage_def	Protospacer_location	Mismatch	Identity
LR134317_2	2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1337985-1338019	35	MK448950	Streptococcus phage Javan464, complete genome	16645-16679	0	1.0
LR134317_2	2.4|1338117|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338117-1338150	34	MK448862	Streptococcus phage Javan178, complete genome	17866-17899	0	1.0
LR134317_2	2.5|1338183|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338183-1338218	36	MK448862	Streptococcus phage Javan178, complete genome	18033-18068	0	1.0
LR134317_2	2.11|1338584|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338584-1338618	35	MK448862	Streptococcus phage Javan178, complete genome	22834-22868	0	1.0
LR134317_2	2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338852-1338884	33	MK448858	Streptococcus phage Javan166, complete genome	26364-26396	0	1.0
LR134317_2	2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338852-1338884	33	MK448945	Streptococcus phage Javan454, complete genome	21337-21369	0	1.0
LR134317_2	2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338852-1338884	33	MK448854	Streptococcus phage Javan146, complete genome	23994-24026	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448946	Streptococcus phage Javan456, complete genome	14678-14710	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448871	Streptococcus phage Javan196, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448976	Streptococcus phage Javan528, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448961	Streptococcus phage Javan494, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448697	Streptococcus phage Javan185, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448693	Streptococcus phage Javan177, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448766	Streptococcus phage Javan465, complete genome	12738-12770	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448696	Streptococcus phage Javan183, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448868	Streptococcus phage Javan188, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448866	Streptococcus phage Javan184, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448699	Streptococcus phage Javan189, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339314-1339346	33	MK448867	Streptococcus phage Javan186, complete genome	11771-11803	0	1.0
LR134317_2	2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1337985-1338019	35	MK448791	Streptococcus phage Javan517, complete genome	14940-14974	1	0.971
LR134317_2	2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1337985-1338019	35	NC_004587	Streptococcus prophage 315.4, complete genome	15035-15069	1	0.971
LR134317_2	2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1337985-1338019	35	NC_003157	Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome	16305-16339	1	0.971
LR134317_2	2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1337985-1338019	35	MK448977	Streptococcus phage Javan530, complete genome	14940-14974	1	0.971
LR134317_2	2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1337985-1338019	35	MK448793	Streptococcus phage Javan523, complete genome	16382-16416	1	0.971
LR134317_2	2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1337985-1338019	35	MK448788	Streptococcus phage Javan511, complete genome	14940-14974	1	0.971
LR134317_2	2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338852-1338884	33	MK448794	Streptococcus phage Javan525, complete genome	20524-20556	1	0.97
LR134317_2	2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338852-1338884	33	MK448970	Streptococcus phage Javan516, complete genome	26589-26621	1	0.97
LR134317_2	2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338852-1338884	33	MK448795	Streptococcus phage Javan527, complete genome	27128-27160	1	0.97
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LR134317_2	2.14|1338786|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338786-1338819	34	NC_007045	Staphylococcus phage PT1028, complete genome	3325-3358	6	0.824
LR134317_2	2.17|1338982|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338982-1339014	33	NZ_LR214986	Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13	273944-273976	6	0.818
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LR134317_2	2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338718-1338753	36	MH355583	Enterococcus phage vB_EfaS_LM99, complete genome	32492-32527	9	0.75
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LR134317_2	2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338718-1338753	36	NC_042126	Enterococcus phage vB_EfaS_AL3, complete genome	35089-35124	9	0.75
LR134317_2	2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338718-1338753	36	MK721187	Enterococcus phage vB_EfaS_Ef6.1, complete genome	32386-32421	9	0.75
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LR134317_1	1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder	91713-91754	42	MK448763	Streptococcus phage Javan451, complete genome	27155-27196	10	0.762
LR134317_2	2.17|1338982|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT	1338982-1339014	33	JX094500	Cronobacter phage CR5, complete genome	221760-221792	10	0.697
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LR134317_2	2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339713-1339747	35	NZ_MK748462	Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Bali-16-03 clone Ren-Bali-16-03, complete sequence	20397-20431	10	0.714
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LR134317_2	2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339713-1339747	35	KJ019069	Synechococcus phage ACG-2014j isolate Syn7803US103, complete genome	22724-22758	10	0.714
LR134317_2	2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339713-1339747	35	NC_031900	Synechococcus phage S-CAM4 isolate 0809SB33, complete genome	22724-22758	10	0.714
LR134317_2	2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339713-1339747	35	KU686202	Synechococcus phage S-CAM4 isolate 1010NB23, complete genome	22803-22837	10	0.714
LR134317_2	2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339713-1339747	35	KU686200	Synechococcus phage S-CAM4 isolate 0309CC44, complete genome	22722-22756	10	0.714
LR134317_2	2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR	1339713-1339747	35	KJ019089	Synechococcus phage ACG-2014j isolate Syn7803US23, complete genome	22778-22812	10	0.714

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tttaggcctgtcacaacccctgccacagtctcct	Protospacer
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6. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448945 (Streptococcus phage Javan454, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

8. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448946 (Streptococcus phage Javan456, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

9. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448871 (Streptococcus phage Javan196, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

10. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448976 (Streptococcus phage Javan528, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

11. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448961 (Streptococcus phage Javan494, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

12. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448697 (Streptococcus phage Javan185, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

13. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448693 (Streptococcus phage Javan177, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

14. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448766 (Streptococcus phage Javan465, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

15. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448696 (Streptococcus phage Javan183, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

16. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448868 (Streptococcus phage Javan188, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

17. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448866 (Streptococcus phage Javan184, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

18. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448699 (Streptococcus phage Javan189, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

19. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448867 (Streptococcus phage Javan186, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0

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*********************************

20. spacer 2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448791 (Streptococcus phage Javan517, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971

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*****************************.*****

21. spacer 2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_004587 (Streptococcus prophage 315.4, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971

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*****************************.*****

22. spacer 2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_003157 (Streptococcus pyogenes strain NIH1 putative methionine sulfoxide reductase gene, complete cds; and integrated temperate phage PhiNIH1.1, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971

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*****************************.*****

23. spacer 2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448977 (Streptococcus phage Javan530, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971

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*****************************.*****

24. spacer 2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448793 (Streptococcus phage Javan523, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971

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*****************************.*****

25. spacer 2.2|1337985|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448788 (Streptococcus phage Javan511, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.971

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*****************************.*****

26. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448794 (Streptococcus phage Javan525, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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********************************.

27. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448970 (Streptococcus phage Javan516, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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********************************.

28. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448795 (Streptococcus phage Javan527, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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********************************.

29. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448953 (Streptococcus phage Javan474, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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********************************.

30. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448765 (Streptococcus phage Javan459, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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ctcctaaaaaagcttggtgctttgttgtgctgc	Protospacer
********************************.

31. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448950 (Streptococcus phage Javan464, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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ctcctaaaaaagcttggtgctttgttgtgctgc	Protospacer
********************************.

32. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448673 (Streptococcus phage Javan119, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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ctcctaaaaaagcttggtgctttgttgtgctgc	Protospacer
********************************.

33. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448784 (Streptococcus phage Javan505, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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************.********************

34. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448947 (Streptococcus phage Javan458, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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************.********************

35. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448689 (Streptococcus phage Javan163, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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************.********************

36. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448974 (Streptococcus phage Javan524, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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************.********************

37. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448789 (Streptococcus phage Javan513, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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************.********************

38. spacer 2.22|1339314|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448678 (Streptococcus phage Javan135, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.97

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************.********************

39. spacer 2.7|1338316|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943

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caagcgtaagtggaggaaataaaatggaatacaca	Protospacer
*************.******** ************

40. spacer 2.12|1338651|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448862 (Streptococcus phage Javan178, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.943

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caagcgtaagtggaggaaataaaatggaatacaca	Protospacer
*************.******** ************

41. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448946 (Streptococcus phage Javan456, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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************.*******************.

42. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448775 (Streptococcus phage Javan489, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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ctcctaaaaaagtttggtgctttgttgtgctgc	Protospacer
************.*******************.

43. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448944 (Streptococcus phage Javan452, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

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ctcctaaaaaagcttggtgctttgttgcgctgc	Protospacer
***************************.****.

44. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448941 (Streptococcus phage Javan446, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.939

ctcctaaaaaagcttggtgctttgttgtgctgt	CRISPR spacer
ctcctaaaaaagtttggtgctttgttgtgctgc	Protospacer
************.*******************.

45. spacer 2.21|1339248|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448681 (Streptococcus phage Javan141, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941

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*******..*************************

46. spacer 2.21|1339248|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MK448672 (Streptococcus phage Javan117, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.941

gattgcaacttgggatttagatttgttaaacgaa	CRISPR spacer
gattgcagtttgggatttagatttgttaaacgaa	Protospacer
*******..*************************

47. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448957 (Streptococcus phage Javan484, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.909

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ctcctaaaaaagtttggtgctttgttgcgctgc	Protospacer
************.**************.****.

48. spacer 2.15|1338852|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK448933 (Streptococcus phage Javan420, complete genome) position: , mismatch: 4, identity: 0.879

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************.***************** ..

49. spacer 2.9|1338451|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY954948 (Bacteriophage PT1028, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

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atgaaaca-gcaaatgttatcaaaagtattattaa	Protospacer
  *** ** **************** *** **** 

50. spacer 2.9|1338451|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007045 (Staphylococcus phage PT1028, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

-agaatcatgcaaatgttatcaaaactataattat	CRISPR spacer
atgaaaca-gcaaatgttatcaaaagtattattaa	Protospacer
  *** ** **************** *** **** 

51. spacer 2.14|1338786|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to AY954948 (Bacteriophage PT1028, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

-agaatcatgcaaatgttatcaaaactataattat	CRISPR spacer
atgaaaca-gcaaatgttatcaaaagtattattaa	Protospacer
  *** ** **************** *** **** 

52. spacer 2.14|1338786|34|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_007045 (Staphylococcus phage PT1028, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.824

-agaatcatgcaaatgttatcaaaactataattat	CRISPR spacer
atgaaaca-gcaaatgttatcaaaagtattattaa	Protospacer
  *** ** **************** *** **** 

53. spacer 2.17|1338982|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 6, identity: 0.818

aaaagtttttaattggagcttttaaaaatgatg	CRISPR spacer
aaaagtttttaattgaagtttttaaaagatatt	Protospacer
***************.**.********.  ** 

54. spacer 2.3|1338052|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK799832 (Synechococcus phage S-B05, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758

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* ********** ********* ****   *  

55. spacer 2.3|1338052|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP011014 (Lactobacillus mucosae LM1 plasmid pLM1, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758

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  **.********** **********  ***.   

56. spacer 2.3|1338052|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN692989 (Marine virus AFVG_117M66, complete genome) position: , mismatch: 8, identity: 0.758

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*  *.****** **************.** . *

57. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448946 (Streptococcus phage Javan456, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

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************* ****** ************       **       

58. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448871 (Streptococcus phage Javan196, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

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************* ****** ************       **       

59. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448858 (Streptococcus phage Javan166, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

cgtcaaaaataatctctgggatttccgcccagtcgtctcgcc-------	CRISPR spacer
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************* ****** ************       **       

60. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448697 (Streptococcus phage Javan185, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

cgtcaaaaataatctctgggatttccgcccagtcgtctcgcc-------	CRISPR spacer
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************* ****** ************       **       

61. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448693 (Streptococcus phage Javan177, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

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************* ****** ************       **       

62. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448696 (Streptococcus phage Javan183, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

cgtcaaaaataatctctgggatttccgcccagtcgtctcgcc-------	CRISPR spacer
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************* ****** ************       **       

63. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448868 (Streptococcus phage Javan188, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

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************* ****** ************       **       

64. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448866 (Streptococcus phage Javan184, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

cgtcaaaaataatctctgggatttccgcccagtcgtctcgcc-------	CRISPR spacer
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************* ****** ************       **       

65. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448699 (Streptococcus phage Javan189, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

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cgtcaaaaataatatctgggttttccgcccagt-------ccaaaatta	Protospacer
************* ****** ************       **       

66. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448867 (Streptococcus phage Javan186, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.786

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************* ****** ************       **       

67. spacer 2.8|1338383|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015270 (Enterococcus phage EFRM31, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

ggttcatctttttttaaattattttaaaattcaata	CRISPR spacer
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 . *** ****.*****************  .* **

68. spacer 2.8|1338383|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH193369 (Enterococcus phage LY0322, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

ggttcatctttttttaaattattttaaaattcaata	CRISPR spacer
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 . *** ****.*****************  .* **

69. spacer 2.8|1338383|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH355583 (Enterococcus phage vB_EfaS_LM99, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

ggttcatctttttttaaattattttaaaattcaata	CRISPR spacer
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 . *** ****.*****************  .* **

70. spacer 2.8|1338383|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH203383 (Ecterococcus phage vB_EfaS_AL3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

ggttcatctttttttaaattattttaaaattcaata	CRISPR spacer
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 . *** ****.*****************  .* **

71. spacer 2.8|1338383|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT520979 (Enterococcus phage vB_EfaS-271, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

72. spacer 2.8|1338383|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to KF728385 (Enterococcus phage IME_EF3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

73. spacer 2.8|1338383|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_042126 (Enterococcus phage vB_EfaS_AL3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

74. spacer 2.8|1338383|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK721187 (Enterococcus phage vB_EfaS_Ef6.1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

75. spacer 2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_015270 (Enterococcus phage EFRM31, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

76. spacer 2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH193369 (Enterococcus phage LY0322, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

77. spacer 2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH355583 (Enterococcus phage vB_EfaS_LM99, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

78. spacer 2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH203383 (Ecterococcus phage vB_EfaS_AL3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

79. spacer 2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MT520979 (Enterococcus phage vB_EfaS-271, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

80. spacer 2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to KF728385 (Enterococcus phage IME_EF3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

81. spacer 2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_042126 (Enterococcus phage vB_EfaS_AL3, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

82. spacer 2.13|1338718|36|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to MK721187 (Enterococcus phage vB_EfaS_Ef6.1, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.75

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 . *** ****.*****************  .* **

83. spacer 2.17|1338982|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP039703 (Clostridium butyricum strain 29-1 plasmid p-butyl_plas_29-1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.727

aaaagtttttaattggagcttttaaaaatgatg	CRISPR spacer
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     ********** *****.******** * 

84. spacer 2.17|1338982|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LT635894 (Buchnera aphidicola (Cinara pseudotaxifoliae) strain BCipseudotaxifoliae isolate 3056 plasmid pLeu) position: , mismatch: 9, identity: 0.727

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*  * ************* **** *****   .

85. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448852 (Streptococcus phage Javan140, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.762

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*.*********** ****** ************       **       

86. spacer 1.1|91713|42|LR134317|CRISPRCasFinder matches to MK448763 (Streptococcus phage Javan451, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.762

cgtcaaaaataatctctgggatttccgcccagtcgtctcgcc-------	CRISPR spacer
catcaaaaataatatctgggttttccgcccagt-------ccaaaacta	Protospacer
*.*********** ****** ************       **       

87. spacer 2.17|1338982|33|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX094500 (Cronobacter phage CR5, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.697

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 . ... **.********** *********** 

88. spacer 2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK748464 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-PNG-07060 clone Ren-PNG-07060, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714

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*** **** *****************.. *.. ..

89. spacer 2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK748465 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-PNG-07113 clone Ren-PNG-07113, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714

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*** **** *****************.. *.. ..

90. spacer 2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK748462 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Bali-16-03 clone Ren-Bali-16-03, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714

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*** **** *****************.. *.. ..

91. spacer 2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_MK748463 (Candidatus Endohaliclona renieramycinifaciens plasmid p-ren_Ren-Pal-02 clone Ren-Pal-02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.714

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*** **** *****************.. *.. ..

92. spacer 2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019069 (Synechococcus phage ACG-2014j isolate Syn7803US103, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714

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  .  * * ************ **.********* 

93. spacer 2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_031900 (Synechococcus phage S-CAM4 isolate 0809SB33, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714

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  .  * * ************ **.********* 

94. spacer 2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU686202 (Synechococcus phage S-CAM4 isolate 1010NB23, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714

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  .  * * ************ **.********* 

95. spacer 2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KU686200 (Synechococcus phage S-CAM4 isolate 0309CC44, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714

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  .  * * ************ **.********* 

96. spacer 2.28|1339713|35|LR134317|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KJ019089 (Synechococcus phage ACG-2014j isolate Syn7803US23, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.714

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  .  * * ************ **.********* 

Prophage detection

Region	Region Position	Protein_number	Hit_taxonomy	Key_proteins	Att_site
DBSCAN-SWA_1	70339 : 193287	117	Streptococcus_phage(28.57%)	transposase,protease,bacteriocin,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_2	254203 : 315217	54	Paenibacillus_phage(18.18%)	transposase,protease,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_3	356613 : 400299	46	Streptococcus_phage(95.12%)	holin,protease,terminase,tail,head	NA
DBSCAN-SWA_4	524704 : 578869	53	Streptococcus_phage(23.08%)	transposase,bacteriocin,tRNA	NA
DBSCAN-SWA_5	630607 : 677982	44	Streptococcus_phage(35.71%)	transposase,tRNA,integrase	attL 630574:630633|attR 659565:660979
DBSCAN-SWA_6	885853 : 935240	67	Streptococcus_pyogenes_phage(49.02%)	portal,terminase,integrase,transposase,tail	attL 886947:886960|attR 935511:935524
DBSCAN-SWA_7	1046588 : 1054288	8	Streptococcus_phage(83.33%)	transposase	NA
DBSCAN-SWA_8	1919475 : 1929660	6	Synechococcus_phage(33.33%)	NA	NA
DBSCAN-SWA_9	2150027 : 2199012	50	Liberibacter_phage(15.38%)	transposase,protease,tRNA,integrase	attL 2197964:2197981|attR 2200200:2200217

Sequences of DBSCAN-SWA_1

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1

>LR134317|70339:193287|DBSCAN-SWA
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>LR134317|70339:193287|106181_106382_+|VEF04997.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA
MDHYRALAINDMQDISGGNAAGNAVIGGLGGLKTGITFCKIPHLVQKGVCIAGFTAGGAYLAYKVN

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
VEF04916.1|70339_71677_+|transposase	DDE transposase	NA	NA	NA	NA
VEF04917.1|72055_72298_+	family protein	NA	NA	NA	NA
VEF04919.1|72477_73272_+	glutamate racemase	NA	NA	NA	NA
VEF04921.1|73268_74258_+	dITP/XTP pyrophosphatase	A0A2H4UUV7	Bodo_saltans_virus	9.1e-12	28.9
VEF04923.1|74233_74755_+	phosphoesterase	NA	NA	NA	NA
VEF04925.1|74751_75213_+	CBS domain containing protein	NA	NA	NA	NA
VEF04927.1|75209_75956_+	site-specific tyrosine recombinase XerD-like protein	NA	NA	NA	NA
VEF04929.1|75955_76663_+	segregation and condensation protein A	A0A1B1IVW1	uncultured_Mediterranean_phage	3.7e-07	30.2
VEF04931.1|76659_77199_+	segregation and condensation protein B	A0A1B1IVT7	uncultured_Mediterranean_phage	4.0e-14	33.9
VEF04933.1|77444_78167_+	ribosomal large subunit pseudouridine synthase B RluB	NA	NA	NA	NA
VEF04935.1|78163_78442_+	membrane protein	A0A2H4PQM5	Staphylococcus_phage	2.5e-15	48.2
VEF04937.1|78600_79149_+|tRNA	tRNA (cytosine34-2'-O-)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF04939.1|80163_80547_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF04941.1|80557_81751_+	Predicted lipase	NA	NA	NA	NA
VEF04943.1|81747_82140_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF04945.1|82155_82440_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF04947.1|83109_83688_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF04949.1|83677_84328_+	PAP2 superfamily protein	NA	NA	NA	NA
VEF04951.1|84518_85442_+	Fe-S oxidoreductase	A0A2H4PQV5	Staphylococcus_phage	4.0e-38	51.8
VEF04953.1|85454_86240_+	aminoglycoside 3'-phosphotransferase	NA	NA	NA	NA
VEF04955.1|86249_86807_+	rRNA methylase	A0A2H4PQV0	Staphylococcus_phage	1.8e-33	41.2
VEF04957.1|86934_88269_+	transport protein	NA	NA	NA	NA
VEF04959.1|88345_89137_+	pyruvate formate-lyase activating enzyme	A0A2P0VNQ0	Tetraselmis_virus	2.9e-21	28.4
VEF04961.1|89641_90577_+	putative manganese-dependent inorganic pyrophosphatase	NA	NA	NA	NA
VEF04963.1|90643_91297_+	hypothetical cytosolic protein	NA	NA	NA	NA
VEF04965.1|91965_92964_-	ferrichrome ABC transporter permease	A0A2H4IY97	uncultured_Caudovirales_phage	7.3e-17	27.4
VEF04967.1|92960_94013_-	ferrichrome ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
VEF04969.1|93996_94935_-	ferrichrome-binding protein precursor	NA	NA	NA	NA
VEF04971.1|94959_95739_-	ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein	NA	NA	NA	NA
VEF04973.1|95999_97445_-	UDP-N-acetylmuramoylalanyl-D-glutamate--L-lysine ligase	NA	NA	NA	NA
VEF04975.1|97530_99162_+	polysaccharide biosynthesis protein	NA	NA	NA	NA
VEF04977.1|99311_99941_+	uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF04979.1|100172_100763_+|protease	ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit	A0A223W000	Agrobacterium_phage	1.2e-54	56.2
VEF04981.1|100867_101314_+	Regulatory protein ylbF	NA	NA	NA	NA
VEF04983.1|101314_101599_+	hypothetical cytosolic protein	NA	NA	NA	NA
VEF04985.1|101912_102548_+	thymidylate kinase	M1PSC7	Streptococcus_phage	5.5e-71	66.8
VEF04987.1|102561_103437_+	DNA polymerase III subunit delta'	M1NSC1	Streptococcus_phage	2.5e-77	50.3
VEF04989.1|103433_104234_+	stage 0 sporulation protein YaaT-like	NA	NA	NA	NA
VEF04991.1|104226_104550_+	DNA replication initiation control protein	M1PFV3	Streptococcus_phage	1.4e-30	61.3
VEF04993.1|104554_105421_+	tetrapyrrole methylase	M1PLC5	Streptococcus_phage	1.2e-113	70.5
VEF04995.1|105928_106123_+|bacteriocin	bacteriocin-like peptide	NA	NA	NA	NA
VEF04997.1|106181_106382_+|bacteriocin	bacteriocin associated protein	NA	NA	NA	NA
VEF05000.1|107047_107629_+	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
VEF05002.1|107966_109472_+	glycerol kinase	NA	NA	NA	NA
VEF05004.1|109645_110290_+	translaldolase	A0A0C5AMY8	Cyanophage	1.4e-45	46.0
VEF05007.1|110672_112661_+	transketolase	NA	NA	NA	NA
VEF05009.1|112842_114114_-	cell surface-anchored protein SclI	NA	NA	NA	NA
VEF05011.1|114480_114738_+	enterocin A Immunity family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05013.1|114774_115506_+	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.1e-27	30.0
VEF05015.1|115510_117139_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF05017.1|117734_118853_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05019.1|119218_119500_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05021.1|119946_120765_+	gamma-glutamyl kinase	A0A1X9I5D0	Streptococcus_phage	2.7e-38	37.3
VEF05023.1|120764_122012_+	gamma-glutamyl phosphate reductase	A0A1X9I5D4	Streptococcus_phage	9.4e-115	55.8
VEF05025.1|122031_122448_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05027.1|122522_123320_-|transposase	transposase	A0A0C5AC89	Paenibacillus_phage	7.0e-47	46.5
VEF05029.1|123406_124093_-|transposase	transposase	A0A0C5AJ29	Paenibacillus_phage	2.5e-32	39.4
VEF05031.1|124169_124685_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
VEF05033.1|124708_125512_+|transposase	transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	9.8e-65	51.9
VEF05035.1|125667_126618_+	S-adenosyl-methyltransferase MraW	NA	NA	NA	NA
VEF05037.1|126621_126945_+	cell division protein	NA	NA	NA	NA
VEF05039.1|126948_129204_+	penicillin binding protein 2x	NA	NA	NA	NA
VEF05041.1|129205_130213_+	phospho-N-acetylmuramoyl-pentapeptide- transferase	NA	NA	NA	NA
VEF05043.1|130295_131639_+	helicase	A0A1B1IS59	uncultured_Mediterranean_phage	1.2e-46	30.7
VEF05045.1|132147_133404_-|transposase	transposase for insertion sequence element IS1557	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	7.5e-128	56.2
VEF05047.1|133696_134152_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05049.1|134659_135487_+	extracellular solute-binding protein	NA	NA	NA	NA
VEF05051.1|135834_136638_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
VEF05053.1|136637_137381_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	1.4e-28	39.3
VEF05055.1|137490_137718_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF05057.1|137777_138695_+	thioredoxin reductase	G3MA85	Bacillus_virus	2.8e-84	49.5
VEF05059.1|138816_140211_+	amino acid permease	NA	NA	NA	NA
VEF05061.1|140486_141947_+	nicotinate phosphoribosyltransferase	G3MA18	Bacillus_virus	7.2e-98	41.6
VEF05064.1|141943_142768_+	NAD synthetase	G3MA24	Bacillus_virus	1.2e-73	58.2
VEF05066.1|143467_144802_+	aminopeptidase	NA	NA	NA	NA
VEF05068.1|144844_147010_-	penicillin-binding protein 1A	NA	NA	NA	NA
VEF05070.1|146996_147605_-	Holliday junction-specific endonuclease	NA	NA	NA	NA
VEF05072.1|147680_148196_+	hypothetical cytosolic protein	NA	NA	NA	NA
VEF05074.1|148317_148641_+	DivIVA protein	NA	NA	NA	NA
VEF05076.1|149086_150241_+	RNA methylase family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05078.1|150254_151706_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF05080.1|151852_152338_-	S-ribosylhomocysteinase	NA	NA	NA	NA
VEF05082.1|152494_154105_+	phosphohydrolase	NA	NA	NA	NA
VEF05084.1|154266_154893_+	guanylate kinase	K4JYM5	Abalone_herpesvirus	4.7e-22	34.5
VEF05086.1|154918_155236_+	DNA-directed RNA polymerase subunit omega	NA	NA	NA	NA
VEF05088.1|155299_157684_+	primosome assembly protein PriA	NA	NA	NA	NA
VEF05090.1|157750_158686_+|tRNA	methionyl-tRNA formyltransferase	E3SNR5	Prochlorococcus_phage	8.9e-09	37.8
VEF05092.1|158669_159998_+	ribosomal RNA small subunit methyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF05094.1|160035_160776_+	protein phosphatase	NA	NA	NA	NA
VEF05097.1|160772_162668_+	serine/threonine-protein kinase	A0A1B1IUU3	uncultured_Mediterranean_phage	7.5e-23	36.3
VEF05099.1|162800_163493_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF05101.1|163489_164494_+	sensor histidine kinase	NA	NA	NA	NA
VEF05103.1|164486_165128_+	two-component response regulator	NA	NA	NA	NA
VEF05105.1|165161_166562_+	cyclophilin type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase protein	A0A1V0S9I2	Catovirus	8.6e-24	41.7
VEF05107.1|166561_166924_+	polyribonucleotide nucleotidyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF05109.1|167310_168237_-	cysteine synthase	A0A1X9I5F1	Streptococcus_phage	5.9e-138	81.3
VEF05111.1|168357_168999_-	Xaa-Pro dipeptidase	A0A1X9I5T8	Streptococcus_phage	2.4e-61	57.4
VEF05113.1|169054_170377_+	competence protein ComF	A0A1X9I5S6	Streptococcus_phage	4.5e-123	53.0
VEF05115.1|170351_171017_+	comF operon protein C ComFC	NA	NA	NA	NA
VEF05117.1|171092_171641_+	ribosome-associated factor Y	NA	NA	NA	NA
VEF05119.1|171824_172133_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
VEF05121.1|172591_173224_-|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
VEF05123.1|180239_180551_-	Staphylococcal protein of uncharacterised function (DUF960)	NA	NA	NA	NA
VEF05124.1|180800_181334_-	hypothetical cytosolic protein	NA	NA	NA	NA
VEF05126.1|181556_182333_-	recombination regulator RecX	NA	NA	NA	NA
VEF05133.1|182396_183365_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
VEF05135.1|183361_184729_+	RNA methyltransferase	A0A2K5B251	Erysipelothrix_phage	1.8e-71	33.3
VEF05137.1|185049_185307_+|bacteriocin	bacteriocin subunit	NA	NA	NA	NA
VEF05139.1|185323_185518_+|bacteriocin	bacteriocin subunit	NA	NA	NA	NA
VEF05141.1|186151_186901_+	response regulator protein	NA	NA	NA	NA
VEF05144.1|186900_188235_+	sensor histidine kinase	NA	NA	NA	NA
VEF05146.1|188356_188488_-|bacteriocin	bacteriocin	NA	NA	NA	NA
VEF05148.1|188587_189946_-	peptide ABC transporter BlpC/ComB-like protein	NA	NA	NA	NA
VEF05150.1|189956_192113_-|bacteriocin	bacteriocin transport/processing ATP-binding protein	F2Y2R6	Organic_Lake_phycodnavirus	6.2e-21	28.5
VEF05152.1|192371_192590_+|bacteriocin	bacteriocin ubericin-A	NA	NA	NA	NA
VEF05154.1|192589_192886_+	putative immunity protein	NA	NA	NA	NA
VEF05156.1|193038_193287_+|bacteriocin	bacteriocin	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_2

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2

>LR134317|254203:315217|DBSCAN-SWA
TATGTCCAAGAGAAGCCCAAAATCAGTAGAAGAAAAGTTAGAGCTTGTACAGCTGTATCAAGAACAAGGAGTATCTATTTCAACCTTAGTTAGTTCTTATGGAGTGGCTAGTACAACTATCAAGAAGTGGATTAGAAAATACGAAAACTCAGGCATAGATGGTCTTAAAGAAAGTCGAACTTGGAAACAATACAGTAAAGAATTGAAGGAACAAGCTGTACAAGACTATTTAAACAACTTAGGAAGTTTAGAGACGATTATTGAGAAATATCATATTTCTAGTCAAAGTGTTCTCAAACGTTGGATAAACCAGTATACTAGTGATAAAGCATTACAAACTACTAGTAAAGGACTAAGTCGTATGAAGCAAGGACGAAAAACCACTTTTGAAGAACGTGTTGAGATTGTCAACTTCACCATTGCTCATGATAAGGACTATCAAGCAGCTATTGAAAAATACGGTATTTCTTACCAACAAGTTTATTCATGGGTAAGAAAGTTTGAGAAGGACGGTAGCCAAGGACTTCTAGACCGCAGAGGGAAAGGGTTAGAAAGTAAGCTTAACCTTACTCCGGAAGAAGAGTTACAGCTTAAAATCAAACAGTTAGAGGAACGCAATCGTTACCTTGAAATGGAGGTAGGATTGCTAAAAAAGTTAGAAGAAATCAGACGCAGAAACCGACGGTAAGAATCGGACGTTACTTAGAAGAATTTCAAGCTATTAAAGATTATTCCGATAAGCATAGTGAAGCCTCTATTAGCCAGTTATGCCAATTGATTGGTGTATCTCGATCAGGTTATTATAAGTGGCTTAATCACAAAGAGACGACATCTGAGGAGACAAATCGAACACTATTAAAAACCATAAAGGAACTTCATACCAAACGCAAGGGGATTTTAGGGTATCGTCGAATGACGCGAGCTGTCAATCGGAAACTTGGAACAACTTATAACAAGAAGCGAATTCGTCGCCTAATGCGCATTCTTGGTATCTCCTCAATTATCCGTCGTTCTCGTGGTTATTGCACGAAAACCAGTTTTGTGAATATCGAAGAGAACATTCTCAATAGAGAATTTGCAGCTCATGCCCCTAATCAAAAATGGTGTACAGATGTGACTTTCTTACAGTATGGACGAGGTTGTAAGGCTTATTTAAGTGCTATTAAAGACCTTTATGACGGCTCTATCGTAGCTTACCATATCAGTAAGCACAATGATAATCTACTTGTTATGGAAACTCTAAGAAAGGCAATAGAGATTAACTCAGGAGCCACACCATTGCTTCATAGTGATAGAGGCTCCCAGTACACGTCGCGGGAATATCGCATGGTAACAACACAGTATCAGATGACACGTTCAATGTCACGAGTTGGTAAATGCATTGACAATGCCCCAATTGAGAGCTTCTTTGGTCACTTTAAGACGGAGTGTTATGACTTGAAGGATTACAAGACGTTTGAGGAGTTAGTTTATGATATTGATGACTATATCTATTTTTACAATAACGAACGATTTCAAGAGAAGCACAACGGCCTTGCCCCTCTTGAAGTGAGGAACAAGGCCGTTGCTTAATCTTTTATTATTTCATTGTCTACTTGACAGGGAGCAGTTCATAAAACGATAAGCTTTTTGTCATCTAGTTGATAGCCAATGATTAAAAGGCTATGGGTAGTGTTTTAGTTATTGCTTTCTTTTGCGTCTAGTTAGGAAGCCTAATCCGAGAAGAGAGAGTAAACCTGTTCCCAATACTGTGATCAAGCTGCCTGTGTCATTTGTTTTTGGCAGTGATTTGCCGCTAGATTGGCTAGTAATGGTTGATGGCTTGGTTGGTTTTTGAGGTTTAGCTTCTGACTGAGGCGCAGGTTTAGGTTGAGGTTTTGTCTCTGGTTGAGGTGTAGGTTTAGGTTCTGGCTTGGATTCTGGTTTAGGATCCATTGGCTTAGGTGCAGGGTCAGGCATTGGATCTGGGGTAGGAGTAGGATTTTCTCCTTGAGGCCCTTGCTCTCCGCGTTCACCTTGAGGCCCTTGCTCTCCGCGTTCACCTTGAGGCCCTTGCTCTCCGCGTTCACCTTGAGGCCCTTGCTCCCCGCGTTCACCTTGAGGTCCTTGCTCCCCGCGTTCACCTTGAGGCCCTTGCTCTCCGCGTTCACCTTGAGGTCCTTGCTCTCCGCGTTCACCTTGAGGTCCTTGCTCCCCGCGTTCACCTTGAGGTCCTTGCTCTCCGCGTTCACCTTGAGGTCCTTGTTCCCCACGTTCACCTTTTTCTCCATCTTTACCATCACGTCCAGGGTCTCCTTTAGGACCAGGAATGCCTTGTTGCCCAGGATCCCCTTTTTCACCCTTAGGCCCAGGTTGCCCATCCTTGCCATCTTGTCCGTCACGTCCAGGAGCACCGTCTTTTCCTGTATCGCCCTTAGGTCCTTTTTCTCCGGTTTCCCCTTTGTCTCCTCTAGGCCCTTGAGGGCCGGCAGGGCCACGTTCCCCTTTTTCACCTGGCTTACCTTGTTTCCCAGGCTCTCCGCGTTCGCCTTTTTCTCCATCTTTACCATCACGTCCAGGGTCACCTTTAGGACCTGGAATGCCTTGTTGCCCAGGATCTCCTTTTTCACCCTTAGGTCCTCTTTCGCCTGGTTTACCAGGCTCTCCGTCTTTACCATCACGTCCCGGCTTACCTTGAGGTCCTGGAACACCAGGTTTACCTGGTTTCCCGTCTTTACCAGGTTCACCAGCAGGCCCACGTTCGCCACGTGGTCCAGTATCCCCTTTAGGACCGGCAGATCCTTGAGGGCCGGCTGGGCCAGGAAGTCCCTGTTCTCCACGAGGCCCTTGTTTACCCTCTTCACCTCTAGGTCCACGTTGGCCATTTAAACCATGTTTAATTAATCGTTGATTGATTATTTTTTCACCAAGTTCTGGATCGTATTTTCCATTTTGATTCTCATCTTTGTAAATGATGATTGTATAGCCTACGTTATTTTTATTATCAATGATATCTACTGCGTAGCAACCGCAGTGATTCTTTTCAGGAGTTTGTCTATTTATCTGAATAAAGTCTGTCCCTAAAAGACTTTGATATTTTTTATATCCATTTTTATCTTCTGTTAAATACAAATTTAAAGTTAAATCAGAAGTGGGGATTTTCATTTCAGGTAAGTTTAATCCAAGATTATAAAGTTGTACTGCTTGATCTTTATATTGATTAGCAAAATCTTCATCCGCAAAACTTATTAACATAGCAAGTGCCAGTCTTTGTTTAATATTTAAACCCAAGCTCTCAATATGATTTATATTTGTTATATAAGCTGTATTAGTAAAGTGCCAAATTGCATGCTGAGTAACTACTCTGAATTCATCATTAGTCAGGTTAAACATATTATTATTAGGATAACCATTAGCCAAAACTGTTAAAATTGAATTAATTAGCTTAGCATTCTTATGTTTTGATGAAGGATTTGAATATTTTAAAAATAAAGCATTAGTTCCTATATGTTTGGTATATTTTGGAATTTTTACTGTTCCTGACTGTGACCAGTCCTCTGGCCATTGCTCCTCCTTATTGAAGCAATACGTAATGTGTTTTTTACTTGTTGTCTTTACAGGTGCAACATATAAAAAATATGGTGAAGATTGTCGTGTATTGTCTCTAAAACCATAGTAATATTCCTCCGCCAACACTCTAGCTGAGCCGCTGATGAAGCTGCCTGACATGATGATACAGAGCGTCGAGGCTGCTAGCATCTTCTTCATTGTTTTTTTCATTGTTTCTCTCTCCTTTAAATTTAGAAATAATCATTCCTAAGCCTTTCTTTTTCCAGAGAATACTTTAGCATGACGCTTGCTGGCTGTGAATAGCTTTCTGATAATTGGTCTCCGTAGTTTCGTTTTTTTTTTTTTTTAATTAAATTCAAAATTATCTGATATTGCAACCGATTGCTGAGGACCTAAAGAAAATTGATGCTATCAGGATTGTTTGTCTTGGTAGCTGATCAGCAAGGTGAATGTTCGTCTTTTATCATTATTTTGGCTTCCTTTATCAGGTAATTGTTCATTATTTCTAATAACTATTAGAAAATATTCCTCAGCAAGCTTGAAGTGTTCATGATTTTGACGTTCTCCTTATTTGTAGCCTTCTAGCTTTTTCTAGGCTGGTTTTGTCTCATTTTTTCTTGACAAGAGGGCTGTAAAATGATTAAATTAACCATACTTAATTTTGTGGTAAACCACATCTAAAACTAGATAGATTCATATCTTTAGAAAGTTAATGACATAATGAAAACTAAATTGCATATACTATTGGTATTCTTTTTTGCGCTGGTGCTTGCGGGCTGTCAAGCCGGTCAGCAGGCGTCTCATCGTACGGATCAGCTGAGGATTGCTTGGGGTGAGGATTTTGGTGATGTCAATCCTCATCGCTACAATCCTGATCAATTTATTATTCAGGACATGGTTTATGAGGGTTTGGTTCGATACGGTGATAAGGGGAAAATTGAGCCAGCGTTAGCAGAGAGCTGGACGATTAGCCCAGATGGCAAAACCTATACCTTTAACCTGAGACAGGCTAAATTTTCAGACGGCTCTGATTTTAATGCTCAAAATGTCAAACGGAATTTTGATACGATTTTCTCTGAGCATAATAAGGGCAATCATAACTGGTTTCACTTTACTAACCAATTGGAGAGCTACAGGGCTTTAGATGACCATACCTTTGAGATTAAGCTAAAGGAGGCTTATAGTGCGACTCTTTATGATTTGTCAATGATTAGGCCGATTAGGTTTTTGGCTGATGCTGGTTTTCCTGATGGCGATGATACCAATAAGCATAATGTTAAAAAGCCAATTGGTACCGGGCAGTGGGTTGTTAAAGAGAAAAAGGCAAATGAATACATTACCTTTACACGTCATGAGGGCTATTGGGGAGAAAAGCCAAAGCTAAAGGAAGTAACCATCAAGATTATGCCTGATGCTGAGACAAGAGCCTTGGCGTTTGAGGCTGGTGATAT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2

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>LR134317|254203:315217|313849_314740_+|VEF05395.1|protease|DBSCAN-SWA
MKHKMLTFCLLLSIFVSQLRILHVSAETSSKTQYNILIKESLDINKVKKQLDNQGIIVLDEIPEINVLTIATSNDPSMILEKNCNYIDDISRNNTFTVNPKMTYQFGYSFYLDSDSNYWNKQWDMQRSISTSSRFWHKSSGEATIGVIDSGIPDNNTEISSKVISVQNFTEDPVTKAIDVNNVLDKTGHGTSVVGQMSSNGYYTGIAPGMKVRMYKVFEEGNAQDEWILKAIIQAAKDDVDVINLSLGQYLLKDSSNIDEDRTALINSYQRAINYAHKQGSVVVASVGDEGANLNN
>LR134317|254203:315217|276838_277483_+|VEF05339.1|DBSCAN-SWA
MVKELSKEEIQERIAKRVALELPNNSLVNLGIGLPTKVARFLPEGVTIMLQSENGFVGLDKVGDEIDPTIVNAGGQPVGIIPGGAFFDSTTSFGIIRGGHVDATVLGALQIDEKGNIANYLIPGKMVPGMGGAMDLLVGAKKVIVAMEHTNKGKWKILKECSLPLTAAGVVDKIVTEMGVFIVTPEGIAVEEIHPDYTFEEVQEVTEARLICPN
>LR134317|254203:315217|254203_254890_+|VEF05291.1|transposase|DBSCAN-SWA
MSKRSPKSVEEKLELVQLYQEQGVSISTLVSSYGVASTTIKKWIRKYENSGIDGLKESRTWKQYSKELKEQAVQDYLNNLGSLETIIEKYHISSQSVLKRWINQYTSDKALQTTSKGLSRMKQGRKTTFEERVEIVNFTIAHDKDYQAAIEKYGISYQQVYSWVRKFEKDGSQGLLDRRGKGLESKLNLTPEEELQLKIKQLEERNRYLEMEVGLLKKLEEIRRRNRR
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MAFPEKMTLLGTFINLVTYQFIGLILITAITILISSKVKSPLTGFALSAASVFVPSFLMDIFQAGIPHKVLSILSVSTASTPNIMLKLAYDGFFGSFWVDGLVIVMIRLAFAFLCLYLAYLSMKRVSQ
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MKVLLYLEAENYLRKSGIGRAIKHQAKALSLVGQEFTTDPKDDYDLVHLNTYGLKSWLLMSKAQKAGKKVIMHGHSTEEDFRNSFIFSNLVSPLFKAYLCRFYNKADAIITPTPYSKALIEHYGVKTPIFAVSNGIDLEQYGANADKEAAFRRYFNLKEGEKVVMGAGLFFLRKGIDEFVKVAEMMPDVRFIWFGDTNKWVIPARVRQIVNGKHPDNVIFPGYIKGDVYEGAMTGADAFFFPSREETEGIVVLEALASHQHLVLRDIPVYEGWIDQDSAELAKDTSGFVAALRRILSGESNKTEAGYRVAEGRSLDRIAHQLVAIYQKVMEL
>LR134317|254203:315217|260171_261113_+|VEF05299.1|DBSCAN-SWA
MIKKLISTFGALLMISIVTFVLVKLSSANPAEQYLRLSKISITPEALHDARLYLGLDKPLWEQYVTWLSDILVGNFGTSYVLKVPVLPLVVERFFATLMLSLTSFLLVLVIAFPLGVVSGLFEYSLFDRLVRLFSFVAVSMPSFWLGYLLIIAFSVKLNLLPVSGKVGASSLILPSITLSFSLIGQYTALIRKAISEQLTSLHVENARLRGVKTYYIVKHHLIRNAFPAIATGLSLTFVYLMTGSIIVEDIFSWNGIGSLFVMSLKAADIPVIQACMLLFGALFLLHHVITQELVSFIDPRLRKTKEEACPNT
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MMYIEMIDETKQVSQEMMEQTIDLLNFAAKTIGKEDKEMAVTFVTNDRSHALNLEYRDTDRPTDVISLEYKPELPIAFSQEDLELDPDLAGMIQEFDAYIGELFISVDKAHEQAEAYGHSFEREMGFLAVHGFLHINGYDHYTPEEEKEMFTLQEEILTAYGLTRQ
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MEPFQISDQFYLDGRPLQILSGAIHYFRIHPDDWYHSLYNLKALGFNTVETYIPWNLHEAKEGSYDFSGQLDVEAFLTLAQRLGLYAIVRPSPYICAEWEFGGLPAWLLTKNCHIRSSDPAYLAYVRRYYEELLPRLARHEWQQGGNILMFQLENEYGSYGEDKAYLKAIKALMEEHLSAPLFTADGPWRATLRAGSLIEDDVFVTGNFGSRAQENFADMQAFFSEHGKHWPLMCMEFWDGWFNRWHEPIIKRDPEELADAVMEVLAQGGINLYMFHGGTNFGFMNGCSARKQLDLPQVTSYDYDAILDEAGNPTAKFYAIQKRLTAELSEIEVTPPLIKPLMSLPLIGLKDKVSLFSTLEQISTCQRDCYPRNMEALGQSTGYILYRTHLLKDKREDERLRLIDSRDRAQVFLDGKKVATQYQETIGDDIIINQQHALSQVDVLIENMGRVNYGHKLTAPSQSKGLGRGMMADLHFVTNWEMYCLPLDDLSQLCFDGDFYEGQPGFYHYQFECHEPEASYIDMTGFGKGCVFINNHPIGRFWEVGPLLTLYIPKGYFNKGLNDIVIFETEGVYQDSIRLVDRPISIDYPQADDRTDQT
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MSKIIGITGGIASGKSTAVALIRQAGYQVIDADQVVHELQKKGGKLYQVLLETFGQDILLPSGQLDRPKLAELLFAHSENMAKSSQQQNAIIREALAKQKEELSQTEAIFFMDLPLLVELGYQDWFDAIWLLYVDEETQLKRLMKRNQLTELAARQRIASQLPMSQKRAYADLVIDNTGDLQALEAQISKALQDLEA
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MHYSTDISLNHPDDLFALFGSNERHLKMIESHLNVVIHARTERVQIIGDDERAVELARLTIQALLVLVGRGMVINTSDVVTALSMADSDRLDQFVALYEEEIIKDFYGKPIRVKTLGQKAYVDSIKHHDVVFGIGPAGTGKTFLAVTLAVTALKRGQVKRIILTRPAVEAGESLGFLPGDLKEKVDPYLRPVYDALYQILGKEQTTRLMERDIIEIAPLAYMRGRTLDDAFVILDEAQNTTIMQMKMFLTRLGFQSKMIVNGDTSQIDLPRHITSGLIDAAQKLQAIKQIDFVYFSAKDVVRHPVVAEIIKAYEIVGSKAELSKSNPNQLQHQAKATEQPKTEVSQSTSGLTTYEVIGELPKEDKTS
>LR134317|254203:315217|273883_274786_-|VEF05333.1|DBSCAN-SWA
MDIKHLRFFIAIVENNFNLSRTAQQLYISQPTLSIMINDFEEKQGIKLFNKKYNKILGLTMTGKQFYEDSLEVIRKYDKMHQNLFSTNQKLDGNITIGIPPLILSIVFSKIMPEIILENPNIHFNIKEYGANRLRQELILENVDIAILLHPERIAANTIDSFQIQESELCVFVSKNHHLANKKILTWIELHNEKLAIFDRTFMIHHLIKEKCKYSDINPQIILESASWDFLINSTRINPQLMTIIPKPTVDSYGFQDIVAIPMENPIPWKVMVSRLKKDHYSTIEEYIFNKMLEKFHVIE
>LR134317|254203:315217|283807_285124_+|VEF05357.1|DBSCAN-SWA
MTKFEDFIQQKLVPVAGRLGSNRFLIAIRDGITYAMPLILIGSFLMVIASLPIPGWEAWLGEIGVSTYLWKGVDSSFNLIALVAAFGISYSLAKQYKADGISAGIINISAFLTVTPFTVPFVNESGKALGEVAGIAPSYLSSGGLFVAIVLGLVNGYAYQWFMKKDIRIKMPEGVPPAVSKSFSAIIPGAVIIVFWLAVYAFLDHFSLPNVHDIVKSVLGVPFGLLGSTLFGNFIVVLLNGFLWFCGVHGGNVLNNPIMKPIWLSNLTENMAAHKAGQELPHVFTSVFMDSFVFIGGAGATIGLVLALAWLARRRKASQQAKVLSPLTLIPGFFNINEPTMFGLPVVLNLLTVIPFVLAPVMNLFVAYFAFASGIVPGTYADPGWTMPPVISGFLATGSWQASVLQLVLIILDILLYLPFIINVERRWQASEQTKNEG
>LR134317|254203:315217|266936_267152_+|VEF05315.1|DBSCAN-SWA
MRKAFYTWLMAQRHSTSNKPAALLADLVFEDTTFPKHTDDFETISRYLEEEASFAFNLGQFDQIWEDYLSH
>LR134317|254203:315217|265235_266093_+|VEF05311.1|DBSCAN-SWA
MNHLLATVITGLVKEENSQFYLVQKEGLSFALAKEEGSHSLGDMVKGFVYTDMKHRLRLTTKPIDSRRDHYGWGEVTTVRRDLGVFVDTGIPDKEIVVSLDVLPELKDLWPKKGDRLYLKLVVDKKDRIWGLPAEPEIFQRLASPAYDNMQNQSLPAIVYRLKLSGTFVYLPENNMLGFIHPSERYTEPRLGQVLTARVIGFRERDRTLNLSLKPRSFEMLENDAQMILTYLKSNGGYMTLNDKSSPEDIKAIFGISKGQFKKALGGLMKANKIKQDVTGTELIS

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
VEF05291.1|254203_254890_+|transposase	transposase	A0A0C5AJ29	Paenibacillus_phage	2.5e-32	39.4
VEF05293.1|254976_255774_+|transposase	transposase	A0A0C5AC89	Paenibacillus_phage	7.0e-47	46.5
VEF05295.1|255882_257961_-	collagen-binding collagen-like cell surface-anchored protein FneC	NA	NA	NA	NA
VEF05297.1|258471_260094_+	nickel-binding extracellular protein	NA	NA	NA	NA
VEF05299.1|260171_261113_+	nickel or oligopeptide transport system permease protein	NA	NA	NA	NA
VEF05301.1|261097_261904_+	binding-protein-dependent transport system membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF05303.1|261891_262680_+	nickel or oligopeptide transport ATP-binding protein	W6JKT0	Anomala_cuprea_entomopoxvirus	7.5e-09	24.5
VEF05305.1|262666_263347_+	ABC transporter ATP-binding protein	F2Y1V6	Organic_Lake_phycodnavirus	1.1e-05	24.6
VEF05307.1|263779_264508_+	uridylate kinase	NA	NA	NA	NA
VEF05309.1|264544_265102_+	ribosome recycling factor	NA	NA	NA	NA
VEF05311.1|265235_266093_+	S1 RNA binding domain	NA	NA	NA	NA
VEF05313.1|266430_266940_+	methionine sulfoxide reductase A	NA	NA	NA	NA
VEF05315.1|266936_267152_+	D-alanyl-D-alanine carboxypeptidase	NA	NA	NA	NA
VEF05317.1|267254_268358_+	phosphate starvation-inducible protein PhoH	W8D063	Erwinia_phage	7.4e-47	49.3
VEF05319.1|268401_268977_+	uracil DNA glycosylase superfamily protein	NA	NA	NA	NA
VEF05321.1|269031_269658_+	acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF05323.1|269995_270496_+|protease	putative metalloprotease	NA	NA	NA	NA
VEF05325.1|270476_270878_+	diacylglycerol kinase	NA	NA	NA	NA
VEF05327.1|271014_271911_+	GTP-binding protein Era	NA	NA	NA	NA
VEF05329.1|272149_272314_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05331.1|272618_273005_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF05333.1|273883_274786_-	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
VEF05335.1|274977_276168_+	acetyl-CoA acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF05337.1|276182_276833_+	acetate CoA-transferase alpha subunit	NA	NA	NA	NA
VEF05339.1|276838_277483_+	acetate CoA-transferase beta subunit	NA	NA	NA	NA
VEF05341.1|277519_278293_+	3-hydroxybutyrate dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
VEF05343.1|278383_279715_+	permease	NA	NA	NA	NA
VEF05345.1|279857_280067_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05347.1|280211_280688_+	MutT/nudix family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05349.1|280850_282053_-	repressor protein	NA	NA	NA	NA
VEF05351.1|282232_283132_+	dihydrodipicolinate synthase	NA	NA	NA	NA
VEF05353.1|283155_283473_+	sugar phosphotransferase system (PTS), lactose /cellobiose-specific family, IIB component	NA	NA	NA	NA
VEF05355.1|283482_283815_+	PTS system cellobiose-specific transporter subunit IIA CelA	NA	NA	NA	NA
VEF05357.1|283807_285124_+	sugar phosphotransferase system (PTS), IIC component	NA	NA	NA	NA
VEF05359.1|285188_286547_+	PTS system cellobiose-specific IIC component CelC	NA	NA	NA	NA
VEF05361.1|286721_291362_+	glycosyl hydrolase family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05363.1|291493_293293_+	beta-galactosidase precursor	NA	NA	NA	NA
VEF05365.1|293635_294526_+	formamidopyrimidine-DNA glycosylase	G3MA33	Bacillus_virus	1.8e-27	32.7
VEF05367.1|294525_295119_+	dephospho-CoA kinase	NA	NA	NA	NA
VEF05369.1|295284_297198_-	collagen-binding collagen-like cell surface-anchored protein FneC	NA	NA	NA	NA
VEF05371.1|298000_298237_+	preprotein translocase subunit SecG	NA	NA	NA	NA
VEF05373.1|298315_300640_+	exoribonuclease R	Q0GXV6	Lactococcus_phage	2.6e-89	39.9
VEF05375.1|300642_301110_+	ssrA-binding protein	W5RAM5	Staphylococcus_phage	4.9e-40	55.0
VEF05377.1|301395_302328_-	bactoprenol glucosyl transferase	V5USA4	Oenococcus_phage	6.6e-81	49.2
VEF05379.1|302436_303105_-	nitroreductase family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05381.1|303474_304560_-	Xaa-Pro dipeptidase	NA	NA	NA	NA
VEF05383.1|304733_305735_+	Catabolite control protein A	NA	NA	NA	NA
VEF05385.1|305804_307280_+	cytoplasmic alpha-amylase	NA	NA	NA	NA
VEF05387.1|307575_308574_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF05389.1|308575_309910_+	glycosyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF05391.1|310484_312431_+|tRNA	threonyl-tRNA synthetase	A0A2K9L297	Tupanvirus	1.2e-124	39.7
VEF05393.1|313281_313464_+|transposase	transposase IS116/IS110/IS902 family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05395.1|313849_314740_+|protease	lantibiotic leader peptide processing serine protease	A0A2H4PQH1	Staphylococcus_phage	4.9e-25	29.9
VEF05397.1|314836_315217_+|protease	lantibiotic leader peptide processing serine protease	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_3

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3

>LR134317|356613:400299|DBSCAN-SWA
TATGCCGATTATAAAGTTTGTGATTGAGCACTGTTCTAAAGCGGTAATTGAGGATATTAAGCGTCTGATGGAGGAGAATAAGTCCCTTTTTGCAGTGACTTCAACCCCTGGGCTTAAGATTGTTCACGACATTTTTTATCAACGTGCAAGTGTGATTTCCGTACACCCTCGATTAAAGACTGCCAATTTAATTTTACTTCATATAAGTCTCCAAGTAGAATCAGAAGGATGTTTTGGCTTTGATGGTTATGATGACTGGTGTCAGGTAACTTCTGAGCTAACACTGGATTACTATTTGTCCTTTCATAAATCTATTGGCTACGACTTACTCTTCGTAGAAGCTAGGGCTGGTGTGAAAGACAACTATTATGAGACAAATTCTTTGAGGCAAGACCTGATTCCTTATATTTCATCTGTTCGTTATGAGGATGAGGCGGAGCGTTTTCTTCGTGAAATTTATCCAGAAGCTCTTGATAGACCCATGCCAATAGATGCTTTTGACGTGGCCTCACGATTGAAGTTGGAAGCTAAGCCTCATGATTTTGATAGTTGTAGTCAGGTGCTAGGAAGGACGTATTTCAAGTCGATCAAAGAAGAGACTGGCACGGTTGCGGAAGGAACAGTTCTTTATGATACCAGTCATGGTAATGCTGGTAGACTCAGTAACACGATTATCCATGAGTGTTTTCATTGGTATAAACATAGGCACTATTTTGCCTTGAAGAATTTGTTAGAGTCAGATCAAGCTGTCTATGGCGATACTGGGACTGCCAGGTATTGGTTGGAAAGACAAGCTAAGGCTATCACTCCTCGAATTCTTATGCCCAAGGAGATGTTTCTAAAGAAAGCTCAGGCCTTGATAGAGCACTGGAAAACCTATTCTCAGTTGGGCTATCTCGCTATTTTGGAACAGGTTATCTCTGAGCTGGCCAACTTCTTTCAGGTCTCAAAACAATCGGCGAAGATTCGTCTCGTTGAACTAGGATTTAGAGAAGTCAAGGGAATTTTAGAATACATTGATGGTGCTTATCTTCCTCTATTTGCTTTTGGGGATATAGAACTCAAAAACAATCAGACCTTCTCGATTTCTCTTGTGGAGCTGGAGCGGTTGGTGGAAGAGGATGAGTCGTTTGCGAAGGTACTACGCTCAGGTCTCTATGTTTATATTGAGTCTCACTTGGTGATGAATCTACCGCAGTTTGTGACCAAAGATGATCTAGGCAACCTTGTTTTGACAGAAGAGGCTCGCTATCATCTAGATGAGTGTGCCTTGTTGTTTGAATACCACCGTGCAGATGGTGTTAAGAAGGAGATTACCTATCAAGATTTTGTCTTGAACCGTTCTCAGTTTAGCAACATCTCTTTTGAGTTGGTTTATCACAATGGCTATGAAAATTCAACCAAAGAAAGGCAAGAACAGGCCCTCCTCAAACAGTTGGAAGAGGAAGATGAGATTTACAACAAGCTCTCCAATGATTTTGAAGCTTCCATGCAGGTTATCAAAAAATGGCGTAAGGTAACTTACAAGGAAATTGGCGAAGAACTTCATTACACGGAAAAACAAATTAGTCGATTTTTCAAAGGTGATGGTAGTATTGAGTTATTCATTAAGGTATGTGTTTATCTGAACCTACCACCTAGTATCTCCATGCACTTGCTAGAAAAGTCTAAGTGGAAATTAGATCCAGGAAATATCACCCATCGCCGCTATCAGCTGGTCTTGAATACGTTTCATAGTCAATCAGTGGACCAAGTCAAAGTATTCTTAGAAAAAGTTGGGGTTTCAATTTGAGCAAAACGGACATGAAGGTGTCCGTTTTTTAGTACATTTTTTATTAAATTTAGCAAGTATTCCAGTTCTTTATATAGGAAACTATCGATCTTATAAGGAAAATGAATCGGACATCAAGGTGTCTGATTCATTTTTTATTTCTATGAGATACTAAGGTTGTAAACAAACCTAGTTAATAACTTGCTACTGATCATAGCCGACACCTTAAGGTTATTAGCTAGGAGTGTCTAGTCAGTCTGTTAGGTGTACTGACCGCTACAAGAAGGAAAATACGATGCGGTCAAGAATATCTTTAGCATGCCTTGATTTGTTATCTGTACTTTCCCTTGTTAGGAAATGTATGCCAACAGATGACAAACAAGGACAATATTTATAACGAATGTCAAAAGCAGGAATGCTCGCTAGAAGTGGGACTTTTAGAGGGGCAGGTGCTAGCTCCTATGTTGGCTGAGAACCAACAAGTTATTGAGGATATGCGTCTCAGAAGAGATACCCTTCGGTCTTGGAGACCAGCTAAACGGTTAAATGTTTATGTATTGGTTGCTTTTATCCCAGTATATTCTGAAGAATATAATCAAACAGAACGCATCTACAAAGATGCTGTTGAGAACTTTTTGAATGAGTTTCGTACACGTAAGTCCAAAAATATTGAAGAGATTATTTCATACGAAGAATGGATTGATACGGATGAATCTACACTTCACAGTTCTACTGAAGAATTGGAAGAATTCATGTTCGCAGAAATGCTGCAAGATTTACTTGAGAAAGTAAGGCAAGTAGATAAGGATTTGTATGATATCACTTTGGGTTTACTCGCCAAAGGGTTTGATGAGAGCATTGAGGATGTCTTTGCTAGGATTGGGGTCAAACGTTCTACGGGTTTCTATCGCTTGCCAAAAGCTCGTGCTTTGGTGGCGGCTTTATTGAAGGAATTAAATCCGAAATAGTGTTTATATTTGACACTAGCGATGTTTTTGGTATAATTTAAGTAGAAGTAGTCGGAGAGTAATACCGACTCTAAAAAGAAAATACTCTAAAGTTGATGTAGTCGTAAGGGTCGCGACTCTAAAAAGAAAGACCCTTTTTTCGTATGATAGAGGTTTAGTTTATGTCAAAAATCAATAAGAATAGTCTGTATTTTCATCTACTAACTCAAGACTATTTCGATACTTACCAATATTTGGATGAGTTTCAAGAAGATAATGCGCGTGGACATGGTGTTATGGTTCTTGATATCAATAATCAACTGATTGCAATTCCGCTTCGCTCCGGTATTCCTGAGCATCTTAGGAATGCAAGTCATTTATTCCCTTACACAACCTATAGACGTCACGATGGAAGAATGTGTCTGAAGGCTTTAGATTTCAGTAAGTTGACGATTATCGAGGAAAAATATATTGACAATTCAAGAATATATCACTTTAAAAATCCAAATGAGAAGATTTTTTATCTAAGAAATTCAAATCGTATTTTCTCACGAGTTAAGAATTACGTAAATAAGTATATTGAGATTTGTTCAAAGATTGAAAAGGGAGAAACTGTCACTTTTAGGACATTGAACCCATACCGATTTAGCACTCTACGCAACTTTCATGATGAATTGGGAATAGCAATTTCCAAGGAAGATTTCATCAATCAATTAAGGAAATAGTTTTTATCACATATAAAATGGTTCACTACCTGAATTAGTAGTGAACCATTTTTTTGTGTGTCTAGTCCTTCTGATAAAAGGAACATTCATAACCATCAGCTCGGAGGTTAATGTCAGACATCCAGTCTGGTGCAATCCCCATCAAGGTTGAAATTTCTTCAAGGTCTTGGTCTTGATCACACTCAATGATGACTTCATCATGGACATGACCGACAATCTTGAACTCACTAAGTTGTCTCATCGAGTAGGCAAGAATATCACGGCTGATGGCCTGGACAATGTTCTCGACAAACTTTGGTCCATAGCTTTCAAGTCGCTCCCAACGTTTAGCAGTTCCTGTACCTTCATAGGTAACAGACTCTCCACCAAATTGGTTCTCACCCATCTTGGGTTTGACGTAGGCAAGTTTTCTTCCAGAGGGGAGTATGATGAATAACATCCCTTTAGAAACTTCGAATTGAATGCCGTGTGTCTCAGTTTGGATCTGCTCCTTGACGGCAGTTTTCACAGCCCTATCCACGTCCCACCAAAAGAGAACTATGTTGGGGTTAGCCTGTCGCCATGAATCTACAAGTGGTTGCAGCTCCTGTTCCTCAAGTCCCATATCAATGGCTCCCATTGCTTTAAGAGCACCAACTGCTCCGCCATATCCACAAGCCAACTCCGCAATTTTCCCTTTTTGACGAAGGTCTGCGTTTTGCCCATGTTTCTCGACTGGAACTCCAAACATCTGTGAAGCAGACATACAGTAGATGTCTTTTCCTTCTTCAAAGACCTTGCTCCGCCATGTCTCGCCTGCAAGATGGGACAAAACACGCGCCTCAATAGCAGAGAAATCACACACGATGAACTTCTTACCCTTACTTGGAACAAAAGCAGTTCGAATAAGTTGGGATAAGGTATCTTGCGTATCGTAAAGGAGTTCAGTAGCTCCTAGGTCACCAGTTTTGAACAGTTCCTAGCTTCTTCGAGGTCAGGGAGATGGTTCTGTGGGAGATTCTGAACCTGAATATTTCTTCCAGAGTTTCCTGTTACCCAAACTTTTCCATTTCGTCTGACGATGAAAAATCCAGTGGGAGTCGAGGCACAGTAAACCTTTCCTTGATAGTCAACTAAGGTTGTCTTGTCTTTGACTTCGTGTTGATTTTTAGGGGATAACCAAATGTTGACGATGTAGGCTGTTTTCCAGTTTTCGACATCTTCATGCTTTTTACTGACAAGTGCAGCCCGACCTGATAAGTGAGCTAAGGCTTGAATGATATCGGCATTCTGCTTTATTGTGGTTGTGTACTGAATGGTATTGTTAGAGGCATAATAACCATCCCAATTGGGTAATTCGTCAAAAATAATATCGGGATTTTCATCTATCATCCAATTTCCAAATACTTTGTCTCGAAAAGTTCTTAACCAAATAGGAAGGGAACGTACAGGTACTGAAATTGTTGTTGAGGTCTTGTTTTTCTTTTCGACAAATGGTATTTCAGCTCGCCTTAATAAGGTTTTACAGCGGTCAATTTTTCGTTGTTTAGAGAAGTGAAAACGAAGAATTCCTTCGTT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MDESQRKQIWKMRAEGLGYGLIGRATGLSRDSVKKYCKRNPALLGHGAATKQMAKADQNDGLRCPQCYQALKTHKIGRPKKFCSDKCRKVWWATHSDEHDKSKTAYEDLTCQQCGRSFLSYANPNRKFCSHSCYIQSRFYKGETNDKPTKNGN
>LR134317|356613:400299|386279_389399_+|VEF05550.1|tail|DBSCAN-SWA
MAGNIKGITIEIGGDTQPLQDALKGVNKQASEATKELRQIDKALKFDTGNVTLLSQKQEVLAKQVETTKEKLATLRQAQAQVEAQFKADSIGADQYRAFQRELETTKNVLNSYESKLENVSRTILENGSQVDSNKTKLQALQSEQAQLESENEKLTSSFKLQESALSSNASESDKLALAHQKVTGHSEILERQIQNLEKQLELTKSEFGDQSIEANKLEKTLNETKVAYNQLQNEMEELASSSDVAKTSLSETNQLLKADLLMEFGDQISELSQKLIDFGKQSLDAFLEIDEGMDVIVTKTGATGAALDEMTDMAKQLATEIPTDFNTAGTAVGLLNTQFDLTGDALKSASTQLIQFSEINGSDVSSSAISAKQAIEAYGLQASDLARILDTVTYTSQETGVGVQELMDKAVAGAPQIKSLGLSFDDGVTLMGRFEKAGVDSSAALSSLSKAAVAYAKDGLTLKDGLAGTVEQIKQSTSETEALSLASEVFGSKAGPRMVDAIKRGALTFEDLAGTAEKASGIVTQTYEGTLDPIDQFTTAQNSAKLAMAEIGDAIASTLAPVLQVLAELLQQVATWFSGLSEPIKQFLVIVGLLVAGFGLLLPVFLALQAATMAMGTTIVGLLTAAAPIVDMVLGIIAVITLLVVGIQQLWQHNEGFRTAILEIWTAISSFISTVIQEVSSFIMSIWGTLTTWWSENQQLILDAANTVWNAISTVITTVMTILGPLIQASWENIKLIITTAWEMIKVVVETAINVVLGIIKAVMQIITGDWSGAWETIKQVVSTVWEAVKSLISIVLNTIAQFISNSLNGIKGTMANLLNSIKSVVSNVWNNIKSTISSILTSIGSTVSSVWNGMKAAISGVLSGISSTVSSVWNGVKSTITNAINGAKNAVSSAINAIKNLFNFQIRWPHIPLPHFSVSGSANPLDWLKGGLPKISIQWYAKGGILTKPTAFGMTGNSLMIGGEAGREAVLPLNNQTLGSIGRSIAATMPNKGITITVNITDVVIREEADMKKLADYVAGRLADEMARQALLRGGTV
>LR134317|356613:400299|385677_386097_+|VEF05548.1|DBSCAN-SWA
MRESITIAGTTYELATNAYTPIAYKEQFGKDYFQDLFSMVNSQAILAKLDQLEEGEDLQAHHIDVSILSDFDMTFFHRIFWVFVKSANPRVKPFVDFYMEMEEFPVQDIAPVLMNMLNQGMSTRKKQMKQKQRVRKSSQ
>LR134317|356613:400299|360116_360899_-|VEF05483.1|DBSCAN-SWA
MCDFSAIEARVLSHLAGETWRSKVFEEGKDIYCMSASQMFGVPVEKHGQNADLRQKGKIAELACGYGGAVGALKAMGAIDMGLEEQELQPLVDSWRQANPNIVLFWWDVDRAVKTAVKEQIQTETHGIQFEVSKGMLFIILPSGRKLAYVKPKMGENQFGGESVTYEGTGTAKRWERLESYGPKFVENIVQAISRDILAYSMRQLSEFKIVGHVHDEVIIECDQDQDLEEISTLMGIAPDWMSDINLRADGYECSFYQKD
>LR134317|356613:400299|384063_384402_+|VEF05540.1|head,tail|DBSCAN-SWA
MKIAPLRERLSFQIRQIVQDEIGNETSTWIPLFDRWCSCRPLTLTEKDGSVTKLEQEKVQFTLRYEKAILGLHSLTTHIQFRGQTCEIESIDGDTVPRQLIYIVAIREESYD
>LR134317|356613:400299|383806_384064_+|VEF05538.1|DBSCAN-SWA
MVSLAEAKQYLKVEHEDEDGLIEQLLETSQQLCEDILRQTTYSDVLKTAILYGVAYLYEHREDANHKELKKTLYHLLLAERKDVF
>LR134317|356613:400299|394922_395327_+|VEF05558.1|holin|DBSCAN-SWA
MKELLATNKVLFSAIGGLIGSIFGEVDGFLFALMVFISIDYITGLMAAAVEKRLASNIGFKGIFKKIAILFLVSVGHLIDTEIIKQGGAIRTMVIFFYLSNEGLSILENAVRIGLPIPEKLQALLKQFNEKEGD

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
VEF05477.1|356613_358404_+	Domain of uncharacterised function (DUF955)	A0A1B0RXB2	Streptococcus_phage	1.4e-79	34.6
VEF05479.1|358754_359351_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05481.1|359512_360055_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05483.1|360116_360899_-	prophage LambdaSa04, DNA polymerase	A0A1X9I6L4	Streptococcus_phage	4.3e-134	87.7
VEF05485.1|360988_362977_-	putative phage-related DNA polymerase	D0R0B0	Streptococcus_phage	1.1e-170	86.1
VEF05487.1|363024_363192_-	Uncharacterised protein	E4ZFK2	Streptococcus_phage	2.8e-06	54.9
VEF05489.1|363210_363774_-	Phage protein	E4ZFK3	Streptococcus_phage	5.6e-91	93.4
VEF05491.1|363778_364819_-	Phage protein	M1Q218	Streptococcus_phage	5.2e-183	89.0
VEF05493.1|364892_365216_-	Uncharacterised protein	D0R0B4	Streptococcus_phage	1.2e-29	68.9
VEF05495.1|365212_365326_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05497.1|365573_367862_+	putative phage-related protein	A0A1B0RXC5	Streptococcus_phage	0.0e+00	87.9
VEF05499.1|368117_368399_+	Putative nuclease p44	A0A1X9I6B2	Streptococcus_phage	3.9e-45	96.8
VEF05501.1|368379_369756_+	transcription regulatory protein SNF2	A0A1X9I6B0	Streptococcus_phage	4.5e-259	97.8
VEF05503.1|369748_370225_+	phage protein	D0R0B9	Streptococcus_phage	2.1e-83	99.4
VEF05505.1|370419_370602_+	Uncharacterised protein	A0A1B0RXC3	Streptococcus_phage	3.8e-25	96.7
VEF05507.1|370649_371687_+	S-adenosylmethionine synthetase	Q6DMV3	Streptococcus_phage	1.8e-188	96.5
VEF05509.1|372087_372585_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF05511.1|372823_373285_+	zinc-finger protein	M1Q209	Streptococcus_phage	1.8e-87	97.4
VEF05513.1|373256_374510_+	Modification methylase HpaI	A0A1B0RXJ0	Streptococcus_phage	3.2e-240	97.6
VEF05515.1|374509_375100_+	HNH endonuclease	A5H1L2	Xanthomonas_virus	2.8e-16	55.1
VEF05517.1|375096_376377_+	DNA (cytosine-5-)-methyltransferase	M1NSK8	Streptococcus_phage	1.6e-247	98.8
VEF05519.1|376449_376698_+	Uncharacterised protein	D0R0C7	Streptococcus_phage	5.9e-37	92.7
VEF05521.1|376699_376912_+	Uncharacterised protein	M1PFX9	Streptococcus_phage	3.5e-30	90.0
VEF05524.1|377194_377668_+|terminase	P27 family phage terminase small subunit	A0A1B0RXI5	Streptococcus_phage	1.7e-85	98.7
VEF05526.1|377664_379257_+|terminase	Phage terminase large subunit	D0R0D0	Streptococcus_phage	0.0e+00	98.5
VEF05528.1|379310_380558_+	protein kinase	A0A142CJL8	Brazilian_marseillevirus	5.3e-09	25.6
VEF05532.1|380617_381892_+	Portal protein	A0A1B0RXD8	Streptococcus_phage	3.0e-241	97.0
VEF05534.1|381884_382580_+|protease	ATP-dependent Clp protease, protease subunit	A0A1B0RXJ9	Streptococcus_phage	2.3e-123	97.4
VEF05536.1|382598_383804_+|head	Major head protein Gp17	A0A1B0RXF4	Streptococcus_phage	3.6e-228	99.0
VEF05538.1|383806_384064_+	uncharacterised phage protein	A0A1X9I695	Streptococcus_phage	8.6e-39	96.5
VEF05540.1|384063_384402_+|head,tail	prophage LambdaSa04, head-tail adaptor,putative	A0A1X9I694	Streptococcus_phage	3.2e-57	97.3
VEF05542.1|384394_384763_+	prophage pi2 protein 37	A0A1X9I688	Streptococcus_phage	2.0e-49	86.1
VEF05544.1|384769_385096_+	prophage pi2 protein 38	E4ZFM8	Streptococcus_phage	7.8e-53	91.7
VEF05546.1|385097_385667_+	Prophage pi2 protein 39	A0A1B0RXE2	Streptococcus_phage	2.9e-103	99.5
VEF05548.1|385677_386097_+	prophage pi2 protein 40	M1NSJ8	Streptococcus_phage	2.8e-71	99.3
VEF05550.1|386279_389399_+|tail	Phage tail length tape-measure protein	Q6DMT2	Streptococcus_phage	3.5e-267	72.4
VEF05552.1|389395_390121_+	Uncharacterised protein	Q6DMT1	Streptococcus_phage	3.3e-80	57.1
VEF05554.1|390120_393036_+	prophage minor structural protein	Q6DMT0	Streptococcus_phage	0.0e+00	64.4
VEF05556.1|393048_394905_+	Phage structural protein	Q6DMS9	Streptococcus_phage	3.7e-256	73.4
VEF05558.1|394922_395327_+|holin	phage holin	D0R0E9	Streptococcus_phage	6.7e-46	74.8
VEF05560.1|395328_396798_+	putative phage-associated cell wall hydrolase	E4ZFN7	Streptococcus_phage	1.5e-228	79.7
VEF05562.1|396906_397308_+	Zinc-finger protein	NA	NA	NA	NA
VEF05564.1|397304_397466_+	phage lysin	Q6DMS7	Streptococcus_phage	1.7e-08	60.8
VEF05566.1|397522_398731_+	site-specific recombinase	Q6DMS6	Streptococcus_phage	3.6e-103	52.0
VEF05568.1|398733_399771_+	putative site-specific recombinase	Q6DMS5	Streptococcus_phage	4.3e-137	71.0
VEF05570.1|399816_400299_+	putative site-specific recombinase	Q6DMS5	Streptococcus_phage	1.4e-21	35.4

Sequences of DBSCAN-SWA_4

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4

>LR134317|524704:578869|DBSCAN-SWA
ACTAAGCACGAGAGGAGACGAAGGTTGTCTTCTCTTTTGTGATGTTCAAAGCGAGGAAGATGCGTTTTTTAAAGTTGTCAAAGTTCCGAAATCCGAACGCATTGCGCTTGATATCTTTGATAAGTTTGTTAGTGGCTTCTAACTTAGCGTTAGAATAAGGCAGTTCAATGGCATTGGTGATGTAATCTTGGTAGCGACTAAAGGTATTTAGAGCTGTTTTAAAAGTCTGATTAAGATGTGGTAGTGTGTCATGAATTAAACCAAAGAAATGCTTGGCATTCTTTTCTTGCAGGTGAAAAAGGAGCAGCTGGTACAGGTCATAATAAGATTTTAACTCAGGCACTAGTGAGAAGATCTTATTGAGACATTCTCTAGGAGTTAAGGTTTGTCTGAAGGTGCGAGAATAGAAAGGCTTAAGAGACCGTTTTCTGCTATCCTTTTGAATAAGCTTCCAGTAGTACTTAAGAGCTCTATATTTAAGAGACTTCTTGTCAAATGGTTTCATGATGTCACTACGTGTTTGCTTGAGAGCTCTATTGATGTGCTGGACAATGTGAAAACGATCGAGAACGATTTTAGCCTTAGGAAATAGAATTTTAATGAGAGGAATATAACTTCCAGACATATCGACAGTGACGACTTTCACCTTGTTTCTAGCCTCTTTAGAGTACTTAAAGAAATGATTTCGGATGGTTGTTTGACGTCTGTTATCAAGAATGGTAATGATTTTCTTAGTGTTAAAATCCTGAGCAATGAAGGCTAATTTGCCTTTCTGATAAGAGAACTCATCCCAAGAGAGAACTTCTGGCAAATTGGCGTAATCCTCTCGGAAATGATACTGCTTAAGCTTGCGATAGACGGTAGAAGTGGAGATAGCGAGCTTAGAAGCGATATGGGTGAGAGCCTCTCTGTTGAGTAAAAGCTGAGCGATTTTCTGTCTCACCATCTCAGAAATTTGGCAGTTTTTCTTAACCAGGGTAGTTTCAGATACAGTGACTTTTCGACAGGATTTGCATTGAAACCTTCTTTTTTTCAAACGAATGAGACTAGGAAAGCCTCCAATTTCGATAAAGGGAATTTTAGAGGGCTTCTGGAAGTCATACTTAATTTGTTTACCCCTACAGTGCTTACATTTAGGAGGGTTATAGTCTAGTGTAGCGATGACTTCGATATGTGTATCATGTTGGATAGCTTTAGTCAAGGTGATATGTTTGTCTTTGATTCCAATGAGTTGTGTGGTATTATTGAGGTGTTCCATAAGATACTTTCTAATGAGTTGTTTAGTCGCTTTTCATTATAAGTCTTATGGGACTTTTTGGTACTCAAAAAGCCCTATAATCTCCACAGTGGAGTTACCCACTACAGAAATTATAGAGCCCATATTATTTGAGGAGAAGAGATCATGGAGAGGCTGCTTCAAGCTATTGTAACTGCAACAGCTAATCGTGAGAAAATGCTTATTAGAATCAGTGGTCATGGTGCCTCTGGTAAATCAACCTTTGCAGGTCGTCTGCTGCAGGCTTTGCCTGACGGACAAGGTCAATTATTAGAAACAGACCCCTATATCATTGCTAATGAATTTAGTCAGGCTGTTTTGATTAGCTACCCTTATCAGGGAAAAGAGGTGCTTCATAGTATAACAGCCTGTCACCCTGCTAGGCATGAATTGGCCAGTCTGAGGCGTGACATCATGATGTTTAAGCAAGGATTGGATTTTTTGAGTATTGATACCCCTTGGGCGCCCTCTCGTCTGGTTAAGGGTGATGTGCCGATTCTTATTGTCGAAGGCATGTCAACAACCTTTTTAGAGCCAGAGCTGTTTGACTTATCGCTTTACTTTTATACAGATGATGACACAGAGCTCCAAAGGCGGCTTGGTAGAGATACTAGCGTTAGAGGTCGCAATTCGGAGTTCATTCAGCAGAGCCATGCCAATAGGCGCGCTCAATATGCTTGTTATCTGCACCCTTACCACCAGCAATTTGATATTGTGATCAATCAATCACAAAACCGCTTTATAGTCGAAACATGTCATATCAGTGAAAATTAGCCTTAGTTTGCCCTGTTTGTTGGTCAATGAAGTAGGCAGTATGCGGCGCTGACGAGCTGTTTCTTTTATGTGTCTAAGCAAAAAACTTGGTCTCACAGCATAAAAAATTCGACAGGCTATTGATAAAGCCTGTCGAATCTTTCATCTATTAGTGATTAGCGAGCAACACGACGACGTGCTGCTTTTTTACGATTTTCCTCTACAAATGCTGCTTTTTCTTCCTCAGGGTCAATAATAGTCTTTTTAACAGCAAATACCGCACCTGCAACTGTAGCAGCAGTAGCAAGAACACCTGTAGCAAGACCTTTTGCGAATCCATGTTTGTTAGCCATAATCATTCTCCATTTCTATTAAGAGGACCATAACTGTCTCTCAATCTTATGTTATAATATATGGTAGCGAAAAAGATTAGAAAATTCAAGTAAAAGACTTTTTCAGCTGCTTTTTAAGTAGAAAGACAATAAATGACAAAAGAAAAGATAATTGTGATTGTAGGCCCGACTGCTGTTGGCAAGACAGCTCTAGGGATTGCCTTGGCTGGTGCCTTTAATGGTGAAATTATATCTGGAGATAGTCAGCAGGTTTATCGTCACCTTGATATTGGGACAGCTAAGGCTAGTGCCAGGGAGCAGGCTCTTGCGGTTCATCATTTGATTGACATTCGTGAGGTGACAGAGTCTTACTCAGCCTTTGATTTCGTGCAGGACGCTAAGCGAGCTATTGAAGATATTGTTAGCCGCGGTAAGCTGCCGATTATTGTTGGTGGTACGGGCTTGTATCTACAAAGCCTGTTAGAGGGCTATCATCTAGGAGGAGATCTTGATCAAAAGGAGCTACTTGCTTATCGGCAGCAGCTAGAGACACTGACAGATACAGAGCTTTATCAGCTATTAGCTAGTAAGGGCATTCACCTTGATCAGGTTAACCGCAGGCGTGCCATTCGCTCACTTGAGCTAAATCAATTTGCTAGGGATTTAGAAAATCAAGAGGCCCCCTATAACCCCTTGATCATTGGCTTGACTGATGAGCGAGAGGTTATTTATGAGCGGATTAATAAGCGGGTGGATCTGATGATGGCTTCTGGCCTATTGGAGGAGGCAAGGTGGCTTTTTGAGCAGTATCCAGCTGTTCAGGCTAGTCGAGGGATCGGTTATAAGGAGCTCTTCCCTTACTTTCAGGGTCAGGCTAGTCTAGAAGAAGCAACAGCCACACTAAAGCAGCAAACACGCCGCTTTGCTAAACGACAGCTGACTTGGTTTCGTAACCGTATGGCAGTGCGCTTTGACTCGATTAGCGAGGCTTCTTACCCACAGGCGATATATGATAGGGTGGAGCGCTTTTTGAAGGAGCCTTAGGAAGCTATCGATGGCAAACTAGCTGAAAATAGCTAAAACTATGCTATAATAAACACTACGGAATTTGGAGGATTAGTCGCGTTCATGATAGAGACAAAGGCAAGGCAGGAAAGAGTCATTTTACTAGGTGTGGTCCTAGAGGCAGCTGACCATGCTGAGCTATCAATGACAGAGCTGGCTAGTCTAGCCAAGACCGCAGGTGCAGAGGTCGTTGATTGCTATCTGCAAAGGAGGGAGCGCTATGATAGCAAGACCTTTGTTGGCTCTGGTAAGCTGGCTGAAATCAAAGAAATGGTTGCTGCCAATGAGATTGATACAGTGATTGTGAACAATCGCTTAACTGCTCGGCAAAATGCCAATTTGGAGGCTGCCTTGGGCATTAAGGTCATTGACCGCATGCAGCTGATTCTTGATATTTTTGCGATGCGAGCGAGAAGCCATGAAGGAAAATTGCAGGTGCATTTGGCGCAGCTCAAATACATGCTGCCAAGACTGGTCGGTCAGGGCGTCATGCTCAGTCGTCAGGCCGGAGGAATTGGGAGTCGTGGTCCCGGTGAGAGCCAGCTGGAGCTGAACAGGCGCTCTATTCGCCATCAGATTGCAGATATTGAACGGCAGCTAGCTGCTGTCGAAAAAAACCGTCAAACAATTCGTAATCGCCGCATGACCTCTGATGTCTTTAATATTGGACTGATCGGCTATACCAATGCAGGCAAGTCTACTATTATGACTATGTTGACTGGTGACAAACAATATGAGGCTGATGAACTGTTTGCAACGCTTGATGCTACTACCAAGCAAATTTACCTGCAAAATCAGTTTCAGGCAACTTTGACAGACACCGTAGGCTTTATCCAAGATTTACCAACGGAGCTTGTGGCTGCCTTTAAGTCGACATTAGAGGAAAGTCGGCATGTTGATTTACTCTTACATGTGATTGATGCTAGTGACCCTAATCATTTGGAGCATGAGAGGGTTGTTCTAGACATCTTGAAGGATTTGGACATGCTTGATATTCCAAGACTGGCTATTTATAACAAGATGGATAAGGTAGCTAGCTTGACCGCAACAGTTTTTCCAAATGTCAGGCTGTCAGCACGTGATAACAACAGCCGCAGCCTCTTAAGACAGCTGCTTATTGATCAGATTCGAGACATGTTTGAGCCATTTTCGATCAAGCTCTGTCAGGATCAAGCCTACAAATGCTATGACCTCAACAGGTTGGCGTTATTGGAGCCTTATAGCTTTGATAAGGAGATTGAGGAGATTTCTGGCTATATTGCTCCCAAAAATAAATGGAGACTAGAAGAATTTTATGACTGATTATATTCAATTGGCAAAGACTTATGGAGGCTTTACGAGCTTAGATACGGTTTATTTGCAAAATTGCTTGGAGAGCTTGACGGACCAGCAAAAATTAGCTGTCATCACACCACCTCCGAGTGTTATTAATGCTTATTTTGCAGAAATATATCAGAAGCAATCACCAAAAGCAGCGACAGATTATTATTTTGAGCTATCAAGGGCCTTGAAGCTGTTCACCTCAGAGCCGTCATTTGATGAGGTGAAGCCCTTTATCCGCTTAAATTTGTTGG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4

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MTETKLMALREAINLAMTEEMRKDDTIYLMGEDVGVYGGDFGTSVGMIEEFGAKRVKDTPISEAAIAGAAIGSAITGLRPIVDLTFMDFITIALDAIVNNGAKNNYMFGGGLITPATFRVASGSGIGSAAQHSQSLEAWLTHIPGIKVVAPGTANEAKGLLKSAIRDNNIVIFMEPKALYGKKEEVNQDPDFYIPLGKGDIKREGTDVTIVSYGRMLERVLQAAEELAADGINVEVVDPRTLIPLDKELIINSVKKTGKLMLVNDAYKTGGFIGEIAAMVTESEAFDYLDHPIVRLASEDVPVPYARVLEQAILPDVAKIKATIVKMVNKGN
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MSNLSSIDTKFLLSLIDDPLMLVVHLLDILIVAYLIYRFIKSLAGTKIMSLVQGVIFFIIIRVIAEWIGFTTITYLMNQVITYGVIAGVVIFAPEIRAGLEKFGRSTQVFLQKQSLSDEEMLVDALLKSVAYMGPRKIGALIAIEQTQTLQEYIATGIPLNADISSQLLINIFIPNTPLHDGAVIVANNKIAAACAYLPLSESMSISKEFGTRHRAAIGLSENSDAVTIIVSEETGAVSIARKGQFLHDLSTEELEAVLKTHLMNEPGVTLPWYKKILGGKAK
>LR134317|524704:578869|531005_531770_+|VEF05823.1|DBSCAN-SWA
MAQRIILITGASGGLAQAIIRQLPREDYLILLGRSKDRLDSLYQARGNKECYEIAIQDPAAIEALVDELYQRHGRIDVLINNAGFGAFKAFDDFSAEEIEAMFRVNSLASIHFARLLGHKMAEQGSGHIMNIVSMAGLIASVKSSIYSATKFAVIGFSNALRLELAERQVYVTTVNPGPIATPFFEQADPSGQYLASVARFTLQADTVAKKIVAAIGKKKREINLPISLALAHKCYTLFPTISDYLARKVFNYK
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MKYIVNKSHNPAFNIALEAYAFRELVDEDELFILWINEPAIIIGKHQNTIQEINKEYIDQHGIHVVRRLSGGGAVYHDLNNLNYTIISNKTAEGAFDFKTFSQPVIETLADLGVKANFTGRNDIEIDGKKICGNAQAYYKGRMMHHGCLLFDVDMTVLGDALKVSKDKIESKGVKSVRARVTNILNELPEKISVEAFSDKILAKMKETYPDMTEYVLSEDELTKIQQSAEDQFGSWDWTYGKAPEYTIERNVRYPAGKISTFANVDNSVIKNLKIYGDFFGIKDVQDIENLLIGCKYEYADVLERLQTIDTTQYFSRMTVEEVAKAIVA
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MEHLNNTTQLIGIKDKHITLTKAIQHDTHIEVIATLDYNPPKCKHCRGKQIKYDFQKPSKIPFIEIGGFPSLIRLKKRRFQCKSCRKVTVSETTLVKKNCQISEMVRQKIAQLLLNREALTHIASKLAISTSTVYRKLKQYHFREDYANLPEVLSWDEFSYQKGKLAFIAQDFNTKKIITILDNRRQTTIRNHFFKYSKEARNKVKVVTVDMSGSYIPLIKILFPKAKIVLDRFHIVQHINRALKQTRSDIMKPFDKKSLKYRALKYYWKLIQKDSRKRSLKPFYSRTFRQTLTPRECLNKIFSLVPELKSYYDLYQLLLFHLQEKNAKHFFGLIHDTLPHLNQTFKTALNTFSRYQDYITNAIELPYSNAKLEATNKLIKDIKRNAFGFRNFDNFKKRIFLALNITKEKTTFVSSRA
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MELQFLGTGAGQPAKHRNVSSLVLKLLDEINEVWMFDCGEGTQRQILETTIKPRKIKKIFITHLHGDHIFGLPGFLSSRAFQASEEQTDLEIYGPVGIKSYVTNSIRISGSKLPYQIHYHEFDDTSMGKILETDKFIVYAERLAHTIFCMGYRVVQKDLEGTLDAEALRAAGVPFGPLFGKVKNGQDIELEDGTKIFAKDFISEPRKGKIITIIGDTRKTSASVRLAKDADVLVHESTYGKGDERMARNHGHSTNMQAAQIARDAGAKRLLLNHVSARFLGRDCRQMEKDAATIFENVKVVRDLEEVII
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MSFLEHYQSGNLVLPTALLFHYKDIFKSSDDFLVWQFFYLQNTTRLDELAPSQIANALGKSVAEVNKAISSLTSQGLLDMKTIELAGEIEIIFDASPVLVTLDQLLARDEKGELEQQNTNQLKLLVDEFERELGRFLSPMELEDLEKTIHDDQTDLDLVREALREAVFNGKTNWKYIQAILRNWRKEGITSLRQLEEKKRAREDMTASEVTVSDDFLAAMNLWSN
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MLNSDKMIASLEQQDLEQAESYFQKALKEDSSEALLALAEYLESIGFLPHAKTIYLQVCESYPEVNINLAQIAAEDNAIEEAFMYLDRIPEDSADYLSALLVMADLYDLEGLTDVAREKLLQAAELSQEPIVIFGLAEIEMSLEHFSEAIEQYAKLDNRHILELTGISTYQRIGRAYAYLGKFEAAVEFLEKALVIEYDDETVFELATILYDQAAYQKANLYFKQLETMNADFLGYEYPYAMSLREEHRTEEALRLAQQGLRKNAFDPQLLLLASQLAFELHDPAGSEQYLLRAKEVAVDDEEVIMRLSSLYLDMERFEEVIALEHEEIDHVLTKWNLAKAYQALEQQEKALTIYKDIEGDLKENPDFLQDYAYLLREFGYTDQAVKQAKRYLQQVPDDIHMQGFLDDLRDD
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MTDINIIALGGVREYGKNFYLVEINDSMFILDAGLKYPETEQLGVDLVIPSLDYVIENKDKVQGVFLSHGHADAIGALPYLLAEVPVPVFGSELTIELAKLFVKANNSTKRFKNFHVVDSDTEIEFKDGLVSFFKTTHSIPESLGVVIGTDKGNIVYTGDFKFDQASREGYQTDLARLADIGKEGVLALLADSANATSNEQTASEAEVGEEMDKVIAHADGRIIIAAVASNLVRIQQVFDSAAAYSRRVVLTGTDAENIVRTALRLKKLVIADEKLLIKPKDMSKFEDHELIVLEAGRMGEPINSLQKMAIGRHRHVQIKDGDLVYIVTTPSAAKEAMVARVENLIYKAGGSVKLITQHLRVSGHANARDLQLMINLVKPKYLFPIQGEYRDLAAHAHLAEEAGMLPENIHIMKRGDIMVFDGEGFLHEGAVPASDVMIDGNAIGDVGNIVLRDRKVLSEDGIFIVAITVSKKEKRIISKAKVNTRGFVYVKKSRDILRESAELVNTTVGNYLQGDHFDWSELKSSVREELSRFLFEQTKRRPAILPVVMEVR
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MDLTQYIASIENYPKEGITFRDISPLMASGKAYSYAIREIVQYACDKGIDMIVGPEARGFIIGCPVAVELGIGFAPVRKPGKLPREVISASYEKEYGLDTLTMHADAIKPGQRVLIVDDLLATGGTVKATIDLVEKLGGIVAGCAFLIELDGLNGRQAIGDYDCKVLMHFPG
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MTEQFFDKALACREIEAIPGLLEFDIPVRGDNRGWFKENFQKEKMIPLGFPEQFFTAGKLQNNISFSRKHVLRGLHAEPWDKYISVADEGKVLGAWVDLREGDSFGHTYQTVIDASKGIFVPRGVANGFQVLTDKVAYTYLVNDYWALELKPKYAFVNYADPSLGIAWESLEQAEVSEADKSHPFLEAVKPLRQEDLS
>LR134317|524704:578869|576552_576708_-|VEF05907.1|bacteriocin|DBSCAN-SWA
MEKQNSLTQFQELNSSELNQITGGDWWSEILNFNRSQKYKHTSVGSNNIIV
>LR134317|524704:578869|536431_537118_+|VEF05835.1|tRNA|DBSCAN-SWA
MESHLSKRLRHVAAYVPDGAKLLDVGSDHAYLPIFLVEAGHIQEAIAGEVVKGPFASALKNVSQYGLTEHIEVRLADGLAAFEARDAVDCITICGMGGRLIADILAAGKEKLQGIERLILQPNNREDELRAWLSANAFRIIAETIMTENGKYYEIIVAEPGQQSLTDQEQRFGPFLSQERSSVFVAKWQKERDKLVYALSCVPATKPVERASISQKIKAIEEVISHES
>LR134317|524704:578869|559057_560827_+|VEF05874.1|DBSCAN-SWA
MAVEIIMPKLGVDMQEGEIIEWKKQEGDPVNEGDILLEIMSDKTNMELEAEDSGVLLKITRQAGETVPVTEVIGYIGAAGETIDVSSPAAADVNVARTTEDLQAAGLEVPKAPDQGSAPSAPKAELAADEYDIIVVGGGPAGYYAAIRGAQLGGKIAIVEKSEFGGTCLNVGCIPTKTYLKNAEILDGIKIAAGRGINLASTNYTIDMDKTVDFKNTVVKTLTGGVQGLLKANKVTIFNGLGQVNPDKTVTIGAQTIEGRNIILATGSKVSRINIPGIDSKLVLTSDDILDLREMPKSLAVMGGGVVGIELGLVWASYGVEVTVIEMADRIIPAMDKEVSLELQKILAKKGMTIKTSVGVSEIVEANNQLTLKLNNGEEVVAEKALLSIGRVPQMNGLEKLNLEMDRNRIKVNDYQETSIPGIYAPGDVNGTKMLAHAAYRMGEVAAENAMHGSKIRKANLKYTPAAVYTHPEVAMVGLTEEQAREQYGDLLIGKNSFTGNGRAIASNEAHGFVKVIADAKYHEILGVHIIGPAAAEMINEAATIMEAELTVDELLLSIHGHPTFSEVMYEAFADVLGEAIHNPPKRKK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
VEF05808.1|524704_525961_-|transposase	transposase for insertion sequence element IS1557	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	7.5e-128	56.2
VEF05810.1|526105_526753_+	phosphoribulokinase/uridine kinase family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05812.1|526908_527085_-	putative uncharacterized protein ORF 3	NA	NA	NA	NA
VEF05815.1|527217_528108_+|tRNA	tRNA delta(2)-isopentenylpyrophosphate transferase	NA	NA	NA	NA
VEF05817.1|528192_529431_+	GTPase	NA	NA	NA	NA
VEF05819.1|529423_530062_+	cystathionine beta-lyase	NA	NA	NA	NA
VEF05821.1|530076_531006_+	ribonuclease Z	NA	NA	NA	NA
VEF05823.1|531005_531770_+	short chain dehydrogenase	NA	NA	NA	NA
VEF05825.1|531766_533977_+	single-stranded-DNA-specific exonuclease	A7KV88	Bacillus_phage	2.1e-64	27.9
VEF05827.1|533985_534354_+	Pyrimidine dimer DNA glycosylase	NA	NA	NA	NA
VEF05829.1|534433_534952_+	adenine phosphoribosyltransferase	A0A1V0SKE5	Klosneuvirus	1.6e-31	48.0
VEF05831.1|535018_535696_+	DNA replication protein DnaD	A0A1X9I617	Streptococcus_phage	6.4e-09	40.5
VEF05833.1|535695_536358_+	endonuclease III	NA	NA	NA	NA
VEF05835.1|536431_537118_+|tRNA	tRNA-m1A22 methylase	NA	NA	NA	NA
VEF05837.1|537107_537896_+	NIF3 (NGG1p interacting factor 3) family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05839.1|537914_539060_+	FAD dependent oxidoreductase	NA	NA	NA	NA
VEF05842.1|539116_539986_+	glucose-1-phosphate thymidyl transferase	K7QKA7	Escherichia_phage	7.8e-100	63.2
VEF05843.1|539985_540582_+	dTDP-4-keto-6-deoxyglucose-3,5-epimerase	NA	NA	NA	NA
VEF05845.1|540772_541819_+	dTDP-glucose 4,6-dehydratase	I7HTA3	Enterobacteria_phage	7.7e-70	44.2
VEF05847.1|541996_542473_+	mutator MutX protein (7,8-dihydro-8-oxoguanine-triphosphatase)	NA	NA	NA	NA
VEF05849.1|542535_543717_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF05851.1|543706_544945_+	tetra tricopeptide repeat family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05853.1|545022_546693_-	fibronectin/fibrinogen-binding protein Fbp-like	A0A1J0F9J4	Only_Syngen_Nebraska_virus	6.0e-08	41.3
VEF05855.1|547044_548040_+	exported protein	NA	NA	NA	NA
VEF05858.1|548053_548923_+	ABC transporter permease	NA	NA	NA	NA
VEF05860.1|548919_549678_+	ABC transporter ATP-binding protein	W6JKT0	Anomala_cuprea_entomopoxvirus	1.5e-09	26.1
VEF05862.1|549887_551549_+	metallo-beta-lactamase superfamily protein	NA	NA	NA	NA
VEF05864.1|551654_552440_+	esterase	NA	NA	NA	NA
VEF05866.1|552849_554760_+	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2K9L3Z8	Tupanvirus	1.6e-52	29.9
VEF05868.1|555265_556234_+	Pyruvate dehydrogenase E1 component alpha subunit	NA	NA	NA	NA
VEF05870.1|556313_557312_+	TPP-dependent acetoin dehydrogenase complex, E1 component, beta subunit	NA	NA	NA	NA
VEF05872.1|557435_558845_+	branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2	NA	NA	NA	NA
VEF05874.1|559057_560827_+	dihydrolipoamide dehydrogenase	A0A2K5B2C5	Erysipelothrix_phage	4.0e-34	26.0
VEF05875.1|561061_562051_+	lipoate-protein ligase	NA	NA	NA	NA
VEF05877.1|562690_563479_-	cobyric acid synthase	NA	NA	NA	NA
VEF05879.1|563478_564822_-	Mur ligase family protein	NA	NA	NA	NA
VEF05881.1|564923_565775_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF05883.1|565771_566728_+	hypothetical membrane associated protein	NA	NA	NA	NA
VEF05885.1|566780_568133_+	phosphoglucosamine mutase	NA	NA	NA	NA
VEF05887.1|568083_568854_+	acetyltransferase GNAT Family	NA	NA	NA	NA
VEF05889.1|568920_570051_+	coproporphyrinogen III oxidase	NA	NA	NA	NA
VEF05891.1|570061_570814_+	acyl-ACP thioesterase	NA	NA	NA	NA
VEF05893.1|570813_571581_+	haloacid dehalogenase	NA	NA	NA	NA
VEF05895.1|571577_572225_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF05897.1|572515_573016_+	50S ribosomal protein L10	NA	NA	NA	NA
VEF05899.1|573080_573446_+	50S ribosomal protein L7/L12	NA	NA	NA	NA
VEF05901.1|573725_574982_-|transposase	transposase for insertion sequence element IS1557	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	7.5e-128	56.2
VEF05903.1|575145_575619_+|transposase	transposase	D9CGB6	Hyperthermophilic_Archaeal_Virus_2	1.3e-11	35.1
VEF05905.1|576080_576371_+|transposase	transposase of IS200 family	A0A1P8BMC0	Lactococcus_phage	6.5e-11	40.2
VEF05907.1|576552_576708_-|bacteriocin	bacteriocin-like peptide	NA	NA	NA	NA
VEF05909.1|577682_578081_-	N-terminal fragment of BlpB	NA	NA	NA	NA
VEF05911.1|578352_578595_-	lactococcin transport/processing ATP-binding protein LcnC-like	NA	NA	NA	NA
VEF05913.1|578764_578869_+|bacteriocin	bacteriocin	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_5

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5

>LR134317|630607:677982|DBSCAN-SWA
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MSKRGKIKLSTKTKGIIAGAVALTVVVIGGVLWKQQQDTISDQNIKLPYSAVNVTEGTIASSTLLSGTVKALSEEYVYFDASKGSDATVTVKVGDQVTQGQQLVQYNTTVPQAAYDTAVRNLNKIGRQINHLKTYGVPAATTETSKDEETGQETTTTIQPSAQQNASYAQQLQDLNDSYADAQAEVNKAQQALNETVVVSGVSGTVVEVNNDIDPSSKNSQTLVHVATEGKLQVKGTLTEYDLANIKVGQAVKIKSKVYADQEWTGKISYVSNYPTDANAGGSATGGSGSSSSTGATYDYKIDITSPLNQLKQGFTVSVEVINEAKHALVPVTAIVNKGKKHFVWVYDDSTAKAKKVEVTLGNADAERQEVSAGLKVGDIVIANPDKNIKEGEKLEDVISADTKASKDSKKSSKESEVIK

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
630574:630633	attL	NA	NA	NA	NA
VEF06020.1|630607_631867_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.2e-165	70.1
VEF06022.1|632669_633536_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
VEF06024.1|633854_634040_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF06026.1|634111_635341_+	Major Facilitator Superfamily protein	NA	NA	NA	NA
VEF06028.1|635632_636253_-	lipoprotein	NA	NA	NA	NA
VEF06030.1|636514_637708_+	membrane protein	A0A2H4JC87	uncultured_Caudovirales_phage	2.9e-36	32.9
VEF06032.1|637937_638252_+	50S ribosomal protein L21	NA	NA	NA	NA
VEF06034.1|638264_638597_+	ribosomal protein	NA	NA	NA	NA
VEF06035.1|638618_638912_+	LSU ribosomal protein L27p	NA	NA	NA	NA
VEF06036.1|639306_640215_+	LysR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
VEF06037.1|640485_640923_+	lipoprotein signal peptidase	NA	NA	NA	NA
VEF06038.1|640924_641803_+	RNA pseudouridylate synthase	NA	NA	NA	NA
VEF06040.1|641882_642497_-	membrane-associated alkaline phosphatase	M1Q152	Streptococcus_phage	3.6e-27	38.5
VEF06043.1|642857_643379_+	bifunctional pyrimidine regulatory protein PyrR uracil phosphoribosyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF06045.1|643394_644654_+	uracil permease	Q9KX94	Enterobacteria_phage	3.5e-61	38.1
VEF06047.1|644711_645647_+	aspartate carbamoyltransferase	A7RB08	Paramecium_bursaria_Chlorella_virus	4.0e-25	31.3
VEF06049.1|645669_646761_+	carbamoyl phosphate synthase small subunit	R4TGJ8	Halovirus	4.7e-62	36.7
VEF06051.1|647117_650351_+	carbamoyl phosphate synthase large subunit	NA	NA	NA	NA
VEF06053.1|650559_651822_+	exported protein	NA	NA	NA	NA
VEF06055.1|651821_652532_+	ABC transporter ATP-binding protein	G9BWD6	Planktothrix_phage	2.5e-35	41.7
VEF06057.1|652543_653767_+	permease	NA	NA	NA	NA
VEF06059.1|653759_654377_+	membrane protein	M1Q152	Streptococcus_phage	1.4e-39	47.4
VEF06061.1|654810_655083_+	30S ribosomal protein S16	NA	NA	NA	NA
VEF06063.1|655092_655332_+	RNA binding protein	NA	NA	NA	NA
VEF06065.1|655498_656137_+|integrase	resolvase/integrase	M9Q1K0	Clostridium_phage	5.3e-13	28.9
VEF06067.1|656344_659590_+	InlA-like domain containing cell surfaced-anchored protein	NA	NA	NA	NA
VEF06069.1|659598_660858_-|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.2e-165	70.1
VEF06071.1|661734_662250_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
659565:660979	attR	NA	NA	NA	NA
VEF06073.1|662273_663077_+|transposase	transposase	A0A1B1P773	Bacillus_phage	3.7e-64	51.5
VEF06075.1|663476_663995_+	16S rRNA-processing protein RimM	NA	NA	NA	NA
VEF06077.1|663984_664716_+|tRNA	tRNA (guanine-N(1)-)-methyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF06079.1|664715_665708_+	pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase family protein	Q9JRK7	Streptococcus_phage	1.8e-28	51.6
VEF06081.1|665839_666898_+	regulatory protein	NA	NA	NA	NA
VEF06083.1|666909_667833_+	2-dehydropantoate 2-reductase	NA	NA	NA	NA
VEF06085.1|668245_668959_+	DeoR family regulatory protein	NA	NA	NA	NA
VEF06087.1|668955_669867_+	1-phosphofructokinase	NA	NA	NA	NA
VEF06089.1|669863_671810_+	fructose-specific phosphotransferase system (PTS), IIABC component	NA	NA	NA	NA
VEF06092.1|672333_672933_+	mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase family protein	A0A249Y0X5	Enterococcus_phage	1.6e-11	35.2
VEF06094.1|673492_673690_+	transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
VEF06096.1|673694_674138_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF06098.1|674231_674462_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF06100.1|674869_676228_+	conserved integral membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF06102.1|676674_677385_+	mannosyl-glycoprotein endo-beta-N-acetylglucosaminidase family protein	A0A088F6W1	Sulfitobacter_phage	2.7e-05	36.2
VEF06104.1|677601_677982_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_6

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6

>LR134317|885853:935240|DBSCAN-SWA
ACTAGGTTATTTTCTTCAAATACTTGTCAAAGGACAGACTTAGGGCATATTTCTTGCGCCTCATGCTCATTTTCTTACCAAAATCCAAGCGCTTAAGCACGGCTAAGCAAAATTTATCCATCACGTTCAGATTAAAAGCTAACTGCTTATTCAAGGTCTTATTGGCATCTTCTCTAAAAACAACATCTAGCAACCAGTGCATGCTCTCTATTTGCCAATGCCCTCGGACATAGTCCCCAAATTCTCTAGCACTAACCTGACAACTCAATATAAAGTAGCGGGACTCTTCGCTTTCTTGACCATTCTTATCAAGATGAATACGAGCTCGTCCAATACTTTGAATATGACCAAATTCAGGATGGGTCTTCCTCAGCCAACTGACATCATGAATCACTTCATATGCTCTCGTCTCTATTTGACCATGCGCTTTTTCAACGGTGTGATAATGATCATCCGCATCTTGACTCATCTCAAAAAATGGCACAATATCCTCTAACAGGGTCTTCTGATTCTCTTTAACAGCTAAGCAATAATCAGCTTTCTTCTTGATAATCTTATCCGCAATGGCCTTTTGAGTTCCCATCGCATCAATGCTCACCATACAATCTTTGACTGAAATCATATCCAATAACTCTGGAATCGCAGTGATTTCATTACTCTTCTCATTAGTCGCTACTTGACCATAGGAAATCCCTAAATCCGTCGCATAAGCGGTCACAATATGTAAGGCTTTCTGCTTAGCGCTGCCATTGCCTCGAATCGTTTTCCCATCAATAGCGACTAGCCGTTTCGAAAAGCTAAAAAGATTCCTAGAGGATAAGTCTGATTCTTCTAGAATGTCTGACCACATTTGGGTGACTTCTACCAATACTTGGGGATCCAAAGTCGCAAAAACTCTCTGAAGGGTATCATGGGAGGGAATCCCATTTTCCAACTGAAGAACCGTTTTTAGAGTAGCTTCATAAGCCTGACCAAATGCCTCTATTTCATCCCAGTATTCCGCTCCAGATAAGCGCGCAAAGAAAATAAGAAGGACGATATCTGATAACACATGTTTTACTTTCCAAGGTTCTCGGTCATCTCTTACGGTAATTAAAAATTTGATAATGTTGTCCATCATAAAACCCTCCACTATTAGTATAGCGAAGGATTTGATGTTTTGGTATGAAATTGTTTTCTGAAAACTAAATTTTCTTCATGCGTTTGTCGTGTTTTTAAGTATCATTGTTTGCCTTAAATTATCTGATAGAGTAAAATAGCTAAAGCTTATAGAAAGCTATTATTTTACAGTGCGAACACGCATTGTATTTGTACCACCTGTACCAACTGGCACACCTGCAACAATAACGATATTATCTCCTGATTGCACCAAACCAGTCTCAAGAGCTACACGCTCTGCTACCTCAAACATATCATCTGTTGATGCTGGTCTTTCAGCAAGCACTGGAATCACACCCCAGTTAATCATCAAGGCACGTTGAACCTTTTCATCAAAGGTCACAGCCAAGATGTCAGCATCAGGACGGAACTTAGAAATGGCACGAGCTGTGTTTCCTGTTTCAGTGATGGTCACAACAAGCTTGATATCCATTGAGTGTGTTGCATCTTTAACAGCTGAAGCAATCACGTCAGTTTTATTGGTACGTGGGAAGGCAGATGAATCTAAACGACCATACTCATTAAGAAGAGTTTGTGCATTTTTATCAATTGTAGCCATTGTACGAACTGCCTCAACAGGGTATTTACCATTTGCTGATTCACCAGAAAGCATTGTCGCGTCTGTACCGTCAATAACCGCGTTGAAAACGTCAGATACCTCTGAACGAGTTGCACGTGGTTTTTCAGTCATTGTCTCAAGCATGTTAGTTGCTGTGATGACTGCTTTACCTGCTGCATTTACCTTGGTGATAATCATTTTTTGGAAGACTGGAACCATTTCAAACGGCACTTCAATCCCCATGTCACCACGAGCAATCATGATACCATCTGCAGCTTCGATGATTTCATCAAGGTTATCAATACCTTGTTGGTTTTCGATTTTAGCAAATAATTGAACATGCTCATTGCCTGTTTCACGACAAATCTCACGAACCTCTTCAACGTCCTTGGCAGTACGAACAAATGAAATAGCAATAAAGTTAAGACCTTGCTCAAGACCAAAACGAATATCAGCATTGTCACGTTCTGCTAAAGCTGGGAAAGGAATCTTGGTATTAGGGATATTAACACCCTTTTGCTTTGCAATGATTCCATCGTTTTCAACCTCAACGATAAACTCACGCTTTGCAATGTCCTTTTCGATAACCTTTAGGCCAAGCTTTCCATCGTCAATAAGAATAGTGTGGCCAACCTCAACCTCATCATAAATATCAAGAGCACCAGCTACATTCAAGGCAATCACATCACGAGTTGACTGAATGCCTTGTGCTGTCGCAACACGAATACGCTCACCAGTCACATAGCTATATTCTTTGGCATCGTCAGCAAACAATTCTGTACGCATTTCTGGTCCTTTTGTATCCAAAAGGAAACCAACCTTTTGACGTGCCAGCTTTTCAGCAAGACGAACAGTAGCCATACGGTCACCCTGCTCTTTGTGGTCACCATGTGAGAAGTTAAAGCGGAAAACATTAGCACCTGCTTCAATCAATTCAGCGATCTTTTTAGCTGATTGTTCAACGTCTAATTGACCAGCCCAATAGCCGTCCTCACCATATTTTTTACCGCCGCGAATTTCAACCGCAGGACCAAGTGTTGCAACAATTTTTACACGTTTATTCATTTTATTATGAAACTCCCTTATTTTTTAGTTGATTAACAAAGATTACCAGATCTTACTTATCCTATTGTGCTAATGAACGGTTCAAAGCAGCATAGTCTAAGCGAGCCTTGTGCGGGTTATTAACAACAATGTTACCCTCATCAGTAAGGCTGAACAAGGCACCGTCCTCTGCACTTCCAAGAATCGGACTTTCAACAAGCTCTTCATTATGAATACCAACAGCCAAGCCACCTTTGCCTTCCTTGAGCAACTCAACAGCGTGCGCTCCCATCCATGACGCAATCACACGATCACGCGCAGTTGGAGAGCCACCGCGAAGGATATGACCAAGGTTTGTCACACGAAGGTCACTTTCATCTCCAGCTTCTTTTAGCTGCTGCGCAAAGGCCTCGCCACTCATAACACCCTCAGCTAAAACGATAATATGGTGATTTTTTCCTCTATTTTCAAAATCGTCTTTAATTGTTGAGACCACTTTATGAATGTCAAATTCCTCTTCAGGAACGATGATTTGATCTGCTCCACTTGCAATACCTGCCCAAAGTGCGATATCACCTGCATTGCGTCCCATCACTTCAACAACAAAGGTCCGTCCATGACTTGATGAGGTATCGCGAAGCTTATCAATAGCCTCTACCGCAGTATTGACCGCAGTGTCAAATCCGATAGTATAGTCTGTTCCAGCAATATCGTTATCAATCGTCCCTGGGATACCTACTGCAGGGAAGCCATGCTCAGTCAAGCGCATCGCACCATGGTAAGAACCATCACCACCAATGACAACTACCCCTTCAATGCCATGCTTTTTTAGCTGCTCAATACCAGCCAATTGCCCCTCAAGCTGAGCAAACTCTGGGTAGCGAGCTGAATAAAGGAAGGTCCCGCCGCGAGAAATCTTATCACCAACCTCTTTTGAGCCTAGTGGAAAGATATCACCATCAACCATACCAGCATAGCCGCGGTTAATACCATAGACTTCCATTCCTTCTGAAATTGCTTTACGAACAACTGCACGAATAGCAGCATTCATACCAGGGGCGTCACCACCACTGGTTAAAACAGCAATACGTTTCATTTTTTGGTACTCCTTTAATTAATTTAACGTTTTTATTATAGCACATTCGTTTGCAAATTACTTCACTAATTCGCTATTTTTATCGAAAAACCGTTTTCAACACGTAGGGGCTAATAGCCTCCTCCAAATCCTTACTAACATCAACCCTAATATGGTTTAACTCTAAGGTTTCTTTGCCTTCTTGATAATGGATAATAACAGGAGTCTCCCCTGAAAAGGCTGTTAATATGTCAGAAATAGCAGCATCATGCTGATGGTTTTCAACCAATAGCCAATACCTTTGACTCTGAGCTAATTGAAGCTGGTGACAGACTAGCTGCAAGCGGTTATCTCTTTCTTTTACCCTGCCATTGATATAGTAAATATGCCCCTCTTTTAGGTCTTGCTTATAGACAGCATATTGCTCAGGAAAAAGGGTAACATCTAATTTTTTCTTGGTATCAGTAACACTCAAAAAGGCCATCTGTTGTCCGCTTGATTTTGTCCGAATAACCCTGATCGCATCTATTTGAACCAGCAAAGTAGCTTCTGTATCCTTCACTAGCTTTGTGATTGGTGTGACTGCTACTGTGCTTTTTTCAGCGACAGCTAGCAAGGGGTGCTTACTCATGCCAACACCAAGCAAATCCTGCTCAAAGTAATATTTCTCAGCAGCTGAATAATCCTCAGTCTCTACCCAGCTAAAGGAGGAATCCGCAAAAAGTGATCCCAATTCATTGACAAAGGTTAGCAGTCCTTCTAAGTTGTTAATGATTTTTTGGCGATTTTTTTCAAACCCATCAAACAGGCCTATTTTGATAAGGGGCTCTAAGAAGCTGGTTTTCTGGTATTTTTCAGGAATGCTGCACAAAAAGCTTTCAACACTGGTAAAGGGCCTATTTTCAATGATCCAATAGGAAAATTCTCTAGGAAGACCCTTGATGTTTTTTAAGCCCATATAAATCTTATGACGCTCAATTTTATCATTGAAGGGAATGGTGTTTATCGTCACCTGAGCGGCCTTAAAGCCAAAATCTAACGCATCTGTGATGTAATCACTGCTAGAATAATTCATCATGACATCAAAAAATACCTCAGGATAGTGCGCTTTAAAATAGGCCAGCTGAAAGGCTAGGGCAGCATAAGCAAAGGCATGGCTGCGGT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_6

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MASKKMEKAIILAITTNKTQKEIAEEIGISPFTFSKWKKTDIFKELKDKYQKEYLSDLTAPAIRTLHGLLNAKSELVRLQAATDILDRTGYKPTDKQEISVDEPIVLANSWVQDNGS
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MAVITLKISEQEKSFLQGMAKFEGISLSELIRKKTLKSLEDEYDARVADMALEDYENYLENGGQVLSWAALMNEVDL
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MDETKQAIIERVRVRLADETSLKEGLLDELTQTAIDRINLKVGDTVFNPLFNSIAVDVVVKMYRRMYYEGINTENSDTISIKFVTDILAEYGDELASYKKDRLTSLNKKVVRFL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
VEF06663.1|885853_886972_-|transposase	transposase IS1548-like	NA	NA	NA	NA
886947:886960	attL	NA	NA	NA	NA
VEF06666.1|887131_888634_-	pyruvate kinase	NA	NA	NA	NA
VEF06669.1|888695_889709_-	6-phosphofructokinase	NA	NA	NA	NA
VEF06672.1|889788_892899_-	DNA polymerase III alpha subunit	A0A291AVG1	Streptomyces_phage	6.8e-114	29.2
VEF06675.1|893140_893512_+	GntR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
VEF06678.1|893511_894210_+	ABC transporter ATP-binding protein	A0A2H4PQG7	Staphylococcus_phage	1.1e-19	28.9
VEF06681.1|894219_895014_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF06684.1|895060_895672_-	membrane protein	M1Q152	Streptococcus_phage	9.5e-52	54.5
VEF06687.1|896266_896455_-	phage protein	A3F673	Streptococcus_phage	8.8e-17	70.7
VEF06690.1|896694_897846_+	Sdn	A7J2B8	Streptococcus_phage	1.3e-150	90.8
VEF06693.1|897959_898823_-	phage protein	Q938J2	Temperate_phage	4.6e-84	74.0
VEF06696.1|898810_899335_-	phage protein	Q938J3	Temperate_phage	8.3e-89	90.8
VEF06698.1|899410_900097_+|transposase	transposase	A0A0C5AJ29	Paenibacillus_phage	2.5e-32	39.4
VEF06701.1|900183_900981_+|transposase	transposase	A0A0C5AC89	Paenibacillus_phage	7.0e-47	46.5
VEF06704.1|901172_901787_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
VEF06707.1|901788_902211_-	collagen-like repeat phage protein	NA	NA	NA	NA
VEF06710.1|902220_902994_-	phage protein	A0A097PAV0	Streptococcus_pyogenes_phage	3.5e-112	83.7
VEF06713.1|903004_903607_-	phage protein	A0A097PAX9	Streptococcus_pyogenes_phage	4.7e-88	95.4
VEF06716.1|903618_904383_-	phage-associated cell wall hydrolase	A0A097PAT3	Streptococcus_pyogenes_phage	8.3e-138	90.6
VEF06719.1|904384_904720_-	N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase	A3F664	Streptococcus_phage	3.7e-42	85.2
VEF06722.1|904721_905021_-	Phage protein	J7KH30	Streptococcus_phage	4.5e-15	43.2
VEF06725.1|905033_905156_-	phage protein	A0A097PAU6	Streptococcus_pyogenes_phage	1.8e-15	97.5
VEF06728.1|905169_905520_-	phage protein	A0A097PAX5	Streptococcus_pyogenes_phage	7.8e-51	87.9
VEF06731.1|905530_907387_-	phage structural protein	A0A097PAT0	Streptococcus_pyogenes_phage	9.7e-249	72.0
VEF06734.1|907391_910823_-	phage protein	A0A097PBF5	Streptococcus_pyogenes_phage	0.0e+00	89.2
VEF06737.1|910823_912305_-|tail	siphovirus tail component family protein	A0A097PAW9	Streptococcus_pyogenes_phage	2.9e-256	85.6
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VEF06743.1|914103_914562_-	phage protein	A0A097PAX1	Streptococcus_pyogenes_phage	2.5e-73	88.8
VEF06746.1|914534_914852_-	phage protein	A0A097PAS6	Streptococcus_pyogenes_phage	1.9e-48	92.4
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VEF06764.1|916852_917146_-	phage protein	A0A097PBF3	Streptococcus_pyogenes_phage	1.9e-42	90.7
VEF06767.1|917159_918050_-	phage protein	A0A097PAW2	Streptococcus_pyogenes_phage	3.3e-85	98.8
VEF06770.1|918069_918639_-	phage scaffold protein	A0A097PAW3	Streptococcus_pyogenes_phage	1.9e-54	84.2
VEF06773.1|918745_918886_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF06775.1|918966_919875_-	phage protein	A0A097PBF2	Streptococcus_pyogenes_phage	1.8e-83	93.9
VEF06778.1|919867_921169_-|portal	portal protein	A0A097PAT2	Streptococcus_pyogenes_phage	8.6e-228	94.5
VEF06781.1|921168_922443_-|terminase	terminase large subunit	A0A097PAV9	Streptococcus_pyogenes_phage	1.3e-233	92.7
VEF06784.1|922432_922786_-	phage protein	A0A097PAR5	Streptococcus_pyogenes_phage	2.1e-19	49.2
VEF06787.1|922843_923101_-	toxin-antitoxin system, toxin component, RelE family	A0A1S5SCV8	Streptococcus_phage	1.1e-14	51.3
VEF06790.1|923097_923331_-	toxin-antitoxin system, antitoxin component, ribbon-helix-helix fold protein	NA	NA	NA	NA
VEF06793.1|923500_923938_-	phage protein	A0A097PBF1	Streptococcus_pyogenes_phage	1.8e-73	95.2
VEF06796.1|924129_924510_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF06799.1|924647_924857_-	phage protein	A3F626	Streptococcus_phage	8.3e-08	77.8
VEF06802.1|924828_925341_-	phage protein	Q708P9	Streptococcus_phage	2.5e-66	77.4
VEF06805.1|925337_925679_-	phage protein	M1PKX3	Streptococcus_phage	2.8e-13	42.0
VEF06808.1|925856_926654_-	phage protein	J7KGZ1	Streptococcus_phage	1.2e-131	85.3
VEF06811.1|926650_927571_-	phage RecT family protein	A0A240FHW0	Streptococcus_phage	7.3e-80	58.3
VEF06813.1|927626_927833_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
VEF06816.1|927869_928103_-	phage protein	Q938N1	Temperate_phage	3.9e-22	66.2
VEF06819.1|928083_928467_-	phage protein	Q938N2	Temperate_phage	1.6e-17	39.5
VEF06822.1|928937_929051_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
VEF06825.1|929047_929188_-	phage protein	NA	NA	NA	NA
VEF06830.1|929189_929480_-	phage protein	J7KBR0	Streptococcus_phage	1.0e-40	85.4
VEF06833.1|929668_929884_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF06836.1|929798_930026_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF06839.1|930038_930764_-	phage antirepressor protein	A0A141E1D3	Streptococcus_phage	3.4e-109	84.1
VEF06842.1|930831_931023_-	prophage LambdaSa1, Cro/CI family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
VEF06845.1|931116_931809_+	Uncharacterised protein	A0A1S5S8Y9	Streptococcus_phage	1.3e-94	75.2
VEF06848.1|931784_931994_-	Uncharacterised protein	A0A1S5S8T7	Streptococcus_phage	1.3e-24	81.5
VEF06851.1|932027_932186_-	Uncharacterised protein	J7KH24	Streptococcus_phage	4.5e-22	94.2
VEF06854.1|932347_933142_+	phage transcriptional repressor	A0A097PBE5	Streptococcus_pyogenes_phage	1.8e-87	64.7
VEF06857.1|933356_934031_+	NYN domain	A0A0R6PGY5	Moraxella_phage	5.4e-48	47.5
VEF06860.1|934151_935240_+|integrase	integrase	J7KBT5	Streptococcus_phage	9.2e-183	87.8
935511:935524	attR	NA	NA	NA	NA

Sequences of DBSCAN-SWA_7

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7

>LR134317|1046588:1054288|DBSCAN-SWA
GTTAGTAAATATCTTTACAATGCCCAAACTCAAGCGCTAAAATAACCATCTTATCATCTTGAATATCACAAATAAGCCGATAATCACCAATACGATAACGCCACTCATTAGCATGATTTCCTGCCAAACCCTTACCATTTGCGCGTGGGTTATCTGTTCCCTCTAAATGCTTATCAATCCAAGCAAATAGCAACCTCTGAATTTGCTTATCTACTTTCTTAATCTGCTTTTGAGCCTTTTTAGAATACTCTATATGATACATATTATAAGCCTAGCTCTTTCTTAAAATCCGCATGGCTAATTGTCTCAGGGTCTGCTTTATATTCAGCATAGGCTTGATGATAGAGTTTTAAATCATACTCATCTTCAATATCCCGCTCAAGAGCTTTTTTAAATAGACTTGATAAACTTTGCCCTGTGAGTTGAGCATAACTTTTGAAAAATATTTCTTCTTCTTGATTTAATCTGATAGTAACTGTACTCATAGTCGTTTACCTCGTTTCTTTGTGTTACATTGTAACACAACCTTAAGAAACTGTCAATCTACCAATAGGCTAAAATCCTCTAAATATTGGCTCTATAATTTCTGTAATGGGTAAATTCATTATGAAGATTATAGGGCTTTTTGAGTACCCAAAAAGTTCCATAAGGCTTATCATGAAAAGCGACCAGACCATCATTAGAAAGTGTCTTATGGAACAGATTCATCATACCACACTACTCATCGGAATCAAAGATCAAAATATCACCTTGAAAAAGGCTATCCAGCATGATACTCATATCGAAGTCAGCGCTACACTGGACTATCAGTCTCCTAGGTGTAGACACTGCAAAGGGAAACAAATCATATACGACTTCCAGAAACCTTCTAAAATTCCCTTCATCGACATTTGGGGATTCCCTAGCCTTATCCGATTGAAAAAGAAAAGGCGACCTTCGTCTCCTCTCGTGCTTAGCTATCAGTCACCCACTACAGTTGACATGAAGCCAAAACTAAAAGCACTCTAGGACAGTCCTAGAATGCTTTAAAATCAAGGCTTGTAAACCTTTTAATCTAAAATCAAATTATTTTTTAAGGTTGTAGAATGATTTGATCCCTTTGTATTGTGCAACTTCACCAAGTTGATCTTCGATGCGAAGCAATTGGTTGTATTTAGCGATACGGTCAGTACGTGACAATGAACCTGTTTTGATTTGGCCAGCGTTTGTTGCCACTGCGATGTCAGCGATTGTTGAATCTTCAGTTTCACCTGAGCGGTGTGATACAACAGCAGTGTAGCCAGCTTCCTTAGCCATTTCGATAGCTTCAAAGGTTTCAGTCAAAGTACCGATTTGGTTAACCTTGATAAGAATTGAGTTAGCTGCACCTTCTTTGATACCACGAGCAAGGTATTCAGTATTTGTAACGAAGAAGTCATCACCAACCAATTGAACACGTTTGCCTAGGCGCTCAGTAAGTGCTTTCCAGCCTTCCCAGTCATTTTCGTCCATACCGTCTTCGATTGTGATAATTGGGTATTTGTTAACCAATTCTTCAAGGTAGTCAATTTGCTCTGCAGATGTACGAACAGCAGCGCCTTCACCTTCAAACTTAGTGTAGTCGTAGACTTTGCGCTCTTTATCGTAGAATTCTGATGACGCACAGTCAAAACCAATCATAATACCATTTTCACCAGCTTCATAGCCAGCAGCTTCGATAGCCTTAAGGATTGTTTCTACACCATCTTCAGTTCCTTCAAATTTAGGAGCAAATCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTAACAAGTCCACGCGCTTTAAGGATTTTCTTAAGGGCATGGAATACCTCAGCACCCCAACGAAGACCTTCTTTGAAGGTAGGTGCACCAACTGGCATAATCATGAACTCTTGGAATGCAATTGGAGCATCTGAGTGAGAACCACCGTTGATAATATTCATCATAGGAGTTGGAAGAACTTTAGTATTGAATCCTCCAAGGTAAGTGTAAAGTGGCACCTCAAGGTAGTCAGCAGCAGCACGCGCTACAGCGATAGACACACCAAGAATAGCATTAGCACCAAGCTTACCTTTGTTTGGAGTACCGTCAAGAGCGATCATGGCTCTGTCAATAGCTTGTTGATCGCGAACATCATAACCAATGATCGCTTCAGCGATAATGTTGTTAACGTTGTCAACTGCCTTTTGAGTACCAAGACCAAGGTAACGAGATTTGTCGCCATCACGAAGTTCTACTGCTTCATGCTCACCAGTAGAAGCTCCTGAAGGAACCATACCACGTCCGAAAGCACCTGATTCAGTATAAACTTCCACTTCAAGTGTTGGGTTACCGCGTGAGTCAAGGACTTCGCGAGCGTAAACATCAGTAATAATTGACATTATAATACTCTCCTTATGAGTTTTAATATTTTACATGTTAATAATACCACAAACTAGGGCCTTAAGCAACTTAAAAACTAATTTCATGAAATGAGACGCCTGTTTTCAAATTTATTTTCTTTGCTTTCAGCTCCTTACAAAAGCCGATCAAATACCTAGTAAATGCTTTATCATTGGTATTTGGCGCAGTTAATAGTATAATGACAGTATCATATGCTTGAAAGGACTGGTATGGACTCATTAGATACAAGGCTCTTAAAGGGAGCTTCAGGAGAAAACCGATTTGATCCCGATCAACAGCGCTATTATTTAGGAACCTATGCTGAAAGGATTGTCTTAGCGCTTCCATTGACAGAGGTTGATCATGAAAAGGCTAAAAGCTACATCACAGCCCAGCTGCCTCACCTCAAAGAGGCTTATTTCCCCTTGTCATTCAAATTATCCTCTGAATTCGGATCCGCTTATCAAATGTACTACATGAAATTGGCCCAACAAAACGCTCTGTCTGCCACTATTGTAGATGAGAAAAGAGCTGTCTCTCCTTTTGCTCTAATCATTCATAGCGACCATGCCATCACCAAAGAGGAAACCAATCTCAAGGCTATACTAGACAAGCCCTTTGACAACAAGCCTGCTGAGCAAACAAAGACTAAGGACAAATCCCTCTGGCAGAGGCTCTTTCACTAGTCCTCACTCTCCAATAGCTCCTGCAATCATCTGCCGGAGTTCTGAGTGTTATGATCCTTATCGGTATAGGGAGCTAAGAACAGGCTGGAGCTTGTATTGCCTTATCCCTATGTGCTTTTTGCAGTAAAAATCCCTTAGAATGGTCTAAGGGATTTATCAGCATGGTAGCGTGGCGTTGAGAGCTTACCTAAACCAGCTACTAAAGAATTCTTTGATGTGATCAAACAAATCTAGAAACCAACCCCGCCATGTCTGATTGTACAGACCATCAGGTCTGCCCTCACGTTCTATATATCCATCAGGGTAGCGACACCAACCATTTCCAAAAGGAATACAATTTCCTTGAGAATGTGTAGCAGCAAATACCGTTTGTGGCTGTGTAGGGTTTGTTGGATTGATCGGTGCTAGGGCTAGGACTGCAACAGCACCTGCTACACACAATGCTTTAGTTATTTTCATTGATATTCTCCTTAACATCTTATTTTCTTTGGTTAACCACTGCTAGGTCTTCCAAAAAGAGTGTAACATGCTGATTGATAGCCATAAATAGCTGCTCGTCAGGTTTCCTCCGCAGTTTCGTTTTTTTTTTTTTAATTAAAAGGATAATCGTCTGATTTTATTACAAAATATCTCATGTAGCAACAGCCCAATAGCACTAAGGCCTTGTCTATCTCTACTGACTGGCTTGAACCAGCTTTTTGGGTATAGTTCAAGGAGGCCATAGCCTGACCATTCAAAAAGCTTGAAAAAGCATAGCCCAGCATGGACTGCTTTTTCAAGCTTTTTCGTAATATAAAGTATCAGCCCTTGTCACATTAGAAGCGGATACGTTCACGTGTTTTTTCATAGGAATTGACAAAACGCTCTGTCACTCCTGGCTCGACTGTCTCCAAGGCATAAGAAATCTCATCAAACGATGCCTGATAGTCATTGTCCACCTCGAATAATTTCAAGGCATGCTCAAAGCTATTTTGCACGCCAGCTTCAAAGGAACGATAACGGTTAGAGTACTGGAGCAGCTGCTCTGTCAAGGTAGCATGCTGAACCACTTGGTAGGTTAGCTCCTCTAGATTAGCAATAGCAGCTGTTGCCACCTCAGATAGGCGGGACACCGCTTCAATGTTGATGCGTCCTCTGCTCAGCTCGTCCATCAATGCCTCTAGCTGCGAGCTAGTGGTAAAGAAGGTACTCAGAAAATCCTGTGGAATTCCCGGTAAATTGCGCTTTTCCATATAACGCTTAATCATGTGAAGCTGTGTGACGTAGATTTCTAAGTGCTGGCGAGCCTGTGACTCAATCTTTTCAATGTCTTTAACAGCAGCAAAGACGTCCATCTGACCAGACTCTACAGAAGCCAACGTCTTGATACTACGATCAAGAATCAGCTGTAGCTCTGAAAATGGCTTTTCCTGCTGATCAAAGGCTTCAGCAATCTCAAGGACATTGTCTTCGATATCTTTGAGGTCTTTGTCAAAGGCCTTGATATTTAAGCCTTCATTTTCACTCAAGATATACTTACGTGATAGACGAGCAATCTCATGCTTCAACTGCTCGTTGTTGTGCTTGGCGTGAGCCAGGTATCTTGGTAATATTTTGCTATTTTTAGCAACCACCTTGTAGGCTGCAATCTCACGCTCAAAGAGCTCATACAGTGAGTCGATACGCTCTTGAATGTGAGTATTTTCATCTCTAGCTCGGTCCAAATCAAGGGTGACCAGCTCTGATGAGTTGGCACGAATAGACTCACGAATCTCTTGAAAGCGGGCTTCAATATTTTTTTCTGGAAAATGATAATTTTCCTCCAGCAAACGACGATAGCCTGTCTCCAGATCGTCCAATTGATCCGGAAAATCATCTTCAAGCTTTGCTACAATAGCAGGGATCTGCTCTGTAATTTGCCCCAAGGCAATCGTGTGCTCCTCAGCCTTATCCAAAACCTCCGCTGCTTCAACAGGGTCACCTGATGAATTAAGGGCAACAAATTGTGAAAACTCTGCTTCAATATTCTTCATTTGCTTTTCAATTTCGGCCATTGTTGATCCGAAATTATCTTCATTTTCAGCAACGGAAGCCTGCAACTTTTCGTACAAATCTAGTGCATGAGTAACACGCGCGCTGTTTTTTTCTTCCTGCTCCTTTAATATGCCAAGTGCTTCACGAATAGCGGTAATATCCTCTTCAACGAGATTCAATTGACTCTCAACGCTATTAATCTCATGCTTGGCACGAATGAAATTAAAGGTGTCATTTAAGTGCTCAGCCTCAAAGATATGCTTTTCAATATCGGTAAAGGTATTTAGGGTCAAATCAACCCACTTTTGATTCCATTCACGAAATGAGGTCTGGCTTTGACCAATCAAGTGAAGAGACTTGACTTCCTCGATTTCGTCATTAACAGGAAGGCCAAATAAAGCTTGTTTTCGTTCTTCTAGACTGGTAATTAATGTGTCATTACGCTTGCGTATAATAACACCCACTAAATAAGCAATAATCACTAGTAAGACTATGGCCACAATCAGCAAGATAATTCCGCTTGACATCTTAATCTCCTTATTATTTAGATGCGATTGATCAACTGCCGGTTCAGTAGGAACAACTAGCAAGAATCGCCTTTTATTATATTATCAAAAATACACTATAACGTTACGATTATAACATACTTTTAGGTGCTTTTCAAAATATATTTGACTAAATGTCAAGCGTACTATAGACCGCATTTTCCTCAATAAATTCACGCCTTGGCTCAACACGATCGCCCATCAGCATGTCAAAAATCCGATCAGCCTCTGCCGCATCATCTACGGTCACACGTGCCATTAGACGATTGTCAGGGTCCATTGTTGTTTCCCAAAGCTGGTGATCGTCCATCTCTCCTAGACCCTTATAGCGTTGAATAGTCGGCCTTGAGCGCCCTGTGCTGTGTCTTTCAAGAGCAGCCTTTAGCTCCTCTTCTTGGTTGACTCCCGGTTGAATGTATTCCTTAATCTCGCTGCCAACCTTAACACCATAAATCGGTGGCTGAGCAATGTAAACATAGCCAGCCTCTAATACTGGTCGCATGAAGCGATAAATCAACGTTAACAAAAGCGTTCTGATATGAGCTCCATCGACATCTGCATCAGTCATGATGACCAGCTTTTGATAGCGAGCTCTAGAAACATCAAACTCCGCTCCAAAGCCTGTCCCCATAGCAGTAAAGAGGCTTCTGATTTCTTCGTTAGCAAGGATTTTATCCATCGTTGCTTTTTCAACGTTTAAAATTTTACCACGAATAGGCAGAATAGCCTGAAACTCACGATTGCGGCCTGACTTCGCTGATCCACCAGCCGAATCCCCCTCCACGATGAAAAGCTCATTTTGACTAGCATCATTTGAGGAGCAATCAGCCAGCTTTCCTGGTAAATTGGAAATCTCTAGGCCTGATTTTTTGCGGGTTACTTCACGCGCTCTCTTGGCAGCAATGCGAGCCTTAGAGGCTAGAATCCCCTTTTCAACAATCTTACGGGCAACCTGCGGATTCTCTAGTAGAAAGCGCTGAAGAGCTTCGCTAAACAGGCGATTGGTAATCTTAACAACCTCAGAATTTCCTAGCTTTGTCTTTGTTTGCCCTTCAAACTGTGGGTTAGGGTGCTTGACTGAGATGACAGCAGTCAAGCCCTCACGAACGTCCTCACCAGTCAGATTATCCTCGTTTTCCTTGAGAATTTTAGCCTTCTTAGCATAGTCATTAATCACACGCGTTAGAGCTGTTCTAAAGCCCTGCTCATGGGTACCACCCTCATGTGTGTGAATATTGTTGGCAAAGCTCATAACAGTCTCATGATAGCCTGTAGTGTACTGCATCGCCACTTCAACTGTTATCCCCTCCAGCTCACCATCAGAATAAATCGGAGTATCAAAGATGACCTCCTTGTTGTCATTTAAAAAGGCAACATAAGAGCCAATACCACCCTCGTAATGGAAATGCTCTTCTCTTTCAAGACCAGCTCGTTTATCTGTAATTGAGATTTTTAAGCCACGATTAAGAAAGGCTAGCTCTTGAATACGCTTTGCCAGGACTTGATAGTCAAATTCTGTTGTTTCTGTAAAGATCTCTGGATCAGGTGTAAAATGCACTGTTGTTCCTGTAACATCAGTCGTTCCAATGATGGCTAGATCATCTACTACAGCACCACGCCTAAACTCCTGATAGTGGATATGCCCATTTTTATAGACACGAACATCAAGCTGTGTGGATAAGGCATTAACAACTGAGGAACCTACACCATGAAGTCCTCCAGAAACCTTGTAGCCACCACCGCCAAACTTTCCACCAGCATGCAAAACTGTAAAAACAGTCTCTACAGCAGGCCGGCCTGTCTTGGCTTGAATATCAACTGGGATACCACGTCCGTCATCAATAACTGTAATGGAATTATCTGCCTCAATAAAAACCTGAATATGGCTGGCAAAGCCTGCCAAGGCTTCATCGATAGAATTATCAACGATCTCCCAAACTAGGTGATGTAAGCCCTCCTTGGCAGTTGAGCCGATATACATTCCAGGACGCATGCGAACAGCCTCTAGCCCCTCTAAGACCTGAATCTGGCTAGCGTCATACTCTTGAGCCTTGTCTTCTAATTGTTTATTTCCTTCAACCAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_7

>LR134317|1046588:1054288|1047193_1047595_+|VEF07152.1|transposase|DBSCAN-SWA
MKIIGLFEYPKSSIRLIMKSDQTIIRKCLMEQIHHTTLLIGIKDQNITLKKAIQHDTHIEVSATLDYQSPRCRHCKGKQIIYDFQKPSKIPFIDIWGFPSLIRLKKKRRPSSPLVLSYQSPTTVDMKPKLKAL
>LR134317|1046588:1054288|1046588_1046849_-|VEF07146.1|DBSCAN-SWA
MYHIEYSKKAQKQIKKVDKQIQRLLFAWIDKHLEGTDNPRANGKGLAGNHANEWRYRIGDYRLICDIQDDKMVILALEFGHCKDIY
>LR134317|1046588:1054288|1049830_1050106_-|VEF07161.1|DBSCAN-SWA
MKITKALCVAGAVAVLALAPINPTNPTQPQTVFAATHSQGNCIPFGNGWCRYPDGYIEREGRPDGLYNQTWRGWFLDLFDHIKEFFSSWFR
>LR134317|1046588:1054288|1047652_1048960_-|VEF07155.1|DBSCAN-SWA
MSIITDVYAREVLDSRGNPTLEVEVYTESGAFGRGMVPSGASTGEHEAVELRDGDKSRYLGLGTQKAVDNVNNIIAEAIIGYDVRDQQAIDRAMIALDGTPNKGKLGANAILGVSIAVARAAADYLEVPLYTYLGGFNTKVLPTPMMNIINGGSHSDAPIAFQEFMIMPVGAPTFKEGLRWGAEVFHALKKILKARGLVTAVGDEGGFAPKFEGTEDGVETILKAIEAAGYEAGENGIMIGFDCASSEFYDKERKVYDYTKFEGEGAAVRTSAEQIDYLEELVNKYPIITIEDGMDENDWEGWKALTERLGKRVQLVGDDFFVTNTEYLARGIKEGAANSILIKVNQIGTLTETFEAIEMAKEAGYTAVVSHRSGETEDSTIADIAVATNAGQIKTGSLSRTDRIAKYNQLLRIEDQLGEVAQYKGIKSFYNLKK
>LR134317|1046588:1054288|1049191_1049647_+|VEF07158.1|DBSCAN-SWA
MDSLDTRLLKGASGENRFDPDQQRYYLGTYAERIVLALPLTEVDHEKAKSYITAQLPHLKEAYFPLSFKLSSEFGSAYQMYYMKLAQQNALSATIVDEKRAVSPFALIIHSDHAITKEETNLKAILDKPFDNKPAEQTKTKDKSLWQRLFH
>LR134317|1046588:1054288|1052335_1054288_-|VEF07167.1|DBSCAN-SWA
MVEGNKQLEDKAQEYDASQIQVLEGLEAVRMRPGMYIGSTAKEGLHHLVWEIVDNSIDEALAGFASHIQVFIEADNSITVIDDGRGIPVDIQAKTGRPAVETVFTVLHAGGKFGGGGYKVSGGLHGVGSSVVNALSTQLDVRVYKNGHIHYQEFRRGAVVDDLAIIGTTDVTGTTVHFTPDPEIFTETTEFDYQVLAKRIQELAFLNRGLKISITDKRAGLEREEHFHYEGGIGSYVAFLNDNKEVIFDTPIYSDGELEGITVEVAMQYTTGYHETVMSFANNIHTHEGGTHEQGFRTALTRVINDYAKKAKILKENEDNLTGEDVREGLTAVISVKHPNPQFEGQTKTKLGNSEVVKITNRLFSEALQRFLLENPQVARKIVEKGILASKARIAAKRAREVTRKKSGLEISNLPGKLADCSSNDASQNELFIVEGDSAGGSAKSGRNREFQAILPIRGKILNVEKATMDKILANEEIRSLFTAMGTGFGAEFDVSRARYQKLVIMTDADVDGAHIRTLLLTLIYRFMRPVLEAGYVYIAQPPIYGVKVGSEIKEYIQPGVNQEEELKAALERHSTGRSRPTIQRYKGLGEMDDHQLWETTMDPDNRLMARVTVDDAAEADRIFDMLMGDRVEPRREFIEENAVYSTLDI
>LR134317|1046588:1054288|1050462_1052187_-|VEF07164.1|DBSCAN-SWA
MSSGIILLIVAIVLLVIIAYLVGVIIRKRNDTLITSLEERKQALFGLPVNDEIEEVKSLHLIGQSQTSFREWNQKWVDLTLNTFTDIEKHIFEAEHLNDTFNFIRAKHEINSVESQLNLVEEDITAIREALGILKEQEEKNSARVTHALDLYEKLQASVAENEDNFGSTMAEIEKQMKNIEAEFSQFVALNSSGDPVEAAEVLDKAEEHTIALGQITEQIPAIVAKLEDDFPDQLDDLETGYRRLLEENYHFPEKNIEARFQEIRESIRANSSELVTLDLDRARDENTHIQERIDSLYELFEREIAAYKVVAKNSKILPRYLAHAKHNNEQLKHEIARLSRKYILSENEGLNIKAFDKDLKDIEDNVLEIAEAFDQQEKPFSELQLILDRSIKTLASVESGQMDVFAAVKDIEKIESQARQHLEIYVTQLHMIKRYMEKRNLPGIPQDFLSTFFTTSSQLEALMDELSRGRINIEAVSRLSEVATAAIANLEELTYQVVQHATLTEQLLQYSNRYRSFEAGVQNSFEHALKLFEVDNDYQASFDEISYALETVEPGVTERFVNSYEKTRERIRF
>LR134317|1046588:1054288|1046850_1047072_-|VEF07149.1|DBSCAN-SWA
MSTVTIRLNQEEEIFFKSYAQLTGQSLSSLFKKALERDIEDEYDLKLYHQAYAEYKADPETISHADFKKELGL

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
VEF07146.1|1046588_1046849_-	plasmid stabilisation system protein	A0A1S5S8E8	Streptococcus_phage	3.7e-21	50.0
VEF07149.1|1046850_1047072_-	RelB protein	A0A1X9I609	Streptococcus_phage	1.8e-32	95.9
VEF07152.1|1047193_1047595_+|transposase	transposase	A0A1S5SBP9	Streptococcus_phage	1.1e-19	53.8
VEF07155.1|1047652_1048960_-	Enolase	A0A1X9I5Z8	Streptococcus_phage	3.6e-242	97.2
VEF07158.1|1049191_1049647_+	hypothetical cytosolic protein	W6LLD2	Streptococcus_phage	1.8e-15	36.0
VEF07161.1|1049830_1050106_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF07164.1|1050462_1052187_-	septation ring formation regulator	NA	NA	NA	NA
VEF07167.1|1052335_1054288_-	DNA gyrase subunit B	G3M9Z3	Bacillus_virus	2.9e-142	45.4

Sequences of DBSCAN-SWA_8

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_8

>LR134317|1919475:1929660|DBSCAN-SWA
AATGAAAAAAGTCTATCAATTGTTAACTTCAGGAGCAATCCTTTTAGGTGTTAATGGCGCAATATCCTCTACCACAACAGCGATTTCACAAGGCCAGTCGGGTATCGTGCACGCTGCTGTTTTAGGAGACAACTATCCAAGTAAGTGGAAACAGGGCTTCGGAGCTGATCCTTGGAACATGTACTTACGTCAATGCACTTCCTTTGTAGCATTCCGACTGCATTCCTCAAATGGATTCAGCCTGCCTAGAGGCTATGGTAATGCTGAAAGCTGGGGACGTATAGCTAAACACCAAGGCTATCATGTTGATCATATACCTAGAGTTGGCGCTGTTGCTTGGTGGGATAAGGGCTTTAACCAATCACATGCTCTATATGGACACGTCGCCTGGGTAGCAGAGGTCAATGGTGACACTGTTGTTATTGAGGAATACAACTATAATGCCGGACAAGGACCTGAAAAATACCATAAACGACAGATTCATAAGCATCAGGTAAGTGGTTACATTCACTTCAAGGATCTGGATCACAACTCTACCAGCCACACGCAGGTGTCGCATGCTTCTCAAGCAGGACCAGCTAGTTTAGCCAAAACTGGTACCTATTATTTTTCAAAACAAAGTCCTATAAAGGCTGAAGCTACATTAGCAAGTCCTGATTTAGCTTACTATCATACTGGACAGTTAGTGCACTATGACCAAACCCTTGTCGCTGATGGCTATGAATGGCTCAGCTATATCGGTCATTCAGGAAATCGTCGCTACATTCCAATTCACAAATTGCCGGTTCAGCCTCAGCAACATAGTCAAGCCTCTATAGATAAACCAAAGCCTGTGGCGACCACTCCTATCAAGGTTGGAGATACTGTAGCCTTTCCTGGTGTTTTTCGGGTCGATCAGGTCGCTCAGAACATGATTGCAAGCAGTGAATTAGCCGGTGGAGAGCCAACCTCCTTAAACTGGATAGACCCAGCTCCACTCCACGAAACGGACCATAAAGGACGTATTGCTGGAAATCAGATTTTGCAGGTGGGTGATTATTTTGTCGTTTCAGGAACCTATAAGGTTCTAAAGGTTGATCAGCCTAGCAAGGGGATTTACGTGCAAATGGGTTCACGTGGAACATGGTTAACAATAGATAAGGCAAAGAAGGTCTAAAACCTTTAGGCTAACGAAAAAGCCTTTTATGATAATGCTTTCCTAATACATGCAGCAGCTGTATCCTTTGCAATATCCTATCTAAGTGATGCATCTAGAGCTCAAAATACTCAAATACTGATTGATAACGGATCTGGTCACTGTTACCACAACAAAAAATAAAGCCTTGTTCCTTCATAAATTCTTGTATTAGTCATAGTAAAAAGAGGCTGAAACAATAGTATGACCACCAAATAAAACAAGCAAACAAGTCTAGTTTTCTGAGATTATGAAAACTAGACTTGTTCGCTTTTTAATGAATCCAACTAGGTAATAAAGTATATTAACCAAGAATTTCTAAAGTGCAACTCTTTTGGCTCCAGTCTCTTTTTACTTTATTAATGTCTAAAATGCCTCACACCTGTGAAAATCATGGTTATACCATGCTGATTGGCAGCTGCAATAGATTCTGAATCACGAATAGAGCCTCCAGGCTGGATAATAGCCTTGATACCAGCGGCAGCAATTTCTTCAATGCTGTCTGCAAATGGGAAGAAGGCATCGCTAGCAAGAACTGCTCCCTCAAGCTGCCCCGTTGCTTGCGCAATAGCAATACGAACAGAGGCTATTCGGTTTGTTTGCCCTGGACCAACGCCCAAAGTCATATGATCATTAGCAATGATAATCGCATTAGACTTGACATATTTGATGGTTTTCCAAGCAAATGCTAGAGCAGCCATTTCCTGTTCATTTGGCTGACGCTTTGTCACCACTATCCAATCTGCCGGAGACTCTGTGACAACATCTTGATTTTGCACTAGTAGACCACCAAGAACTCCTGTATATTCTGCTTCTATTTCACTAGCCTCCTGAGCAGCAAATGGCAATTCAAGAATTCGCAAGTGCTTCTTTTTATGGGTGAGAACAGCTAGCGCTTCTTTAGAATAGCTTGGTGCAATGATCAATTCAAGAAAAATAGCATGAAGCTTTTCCGCTGTCGCTAAATCCACCTCACGATTTAGGACAACAATACCACCAAAGATAGACACCGGATCAGCTGCATAAGCAAAATCCCAAGCTGTCTCAATATCATCTGCCTGACCAATACCACATGGATTCATATGCTTAAGTGCTACAACAGTTGGACGCTCCTTAAAATCACGAATAATACGAATCGCAGCATCTGCATCACGAATATTGTTGAATGATAGCTCTTTTCCATTTAGCTGCTTGGCTGAAGCAATTGAATAGGTTGTTGGGAGCGCTCTTTGGTAAAAATCTGCAGCCTGTTGAGGATTTTCACCGTAACGCATGCTTTGCTTCAAATCATAGGTAAGCGTGAGCTTTTCAGGCTTTGTCTCACCTGCTTGTCTTGTAAAATAATCTGCAATCACTGCATCATAGGCTGCAGTATGGCGAAAAGCTTTAGCTGCTAAGCTTTGACGGGTTTGGTAACTTGTACTGCCAGTGCTAGCCAACTCTCCTAAAACGAGCGGATAATCTGTCGGATCAACCACTACCGTAACACTAGCATGATTTTTAGCCGCTGAACGCAACAGTGAAGGACCACCAATATCAACCATATCAACAGCGACATCATAAGTGATATCTGAACGACAAATGGTTTCTTTGAAGGGATAAAGGTTAACAACAACAAGGTCTATTAATTCAATCCTGTTTTGCTTTGCTGCCTGTAAGTGGTGCTCAATGTCACGACGAGCAAGTAAGCCACCATGAATGAGAGGATGCAGCGTTTTTACCCGTCCGTCCATCATTTCAGGAAAGCCTGTCACATCGTCAATAGCAACAGTAACTACACCAGCCTCTTCAAGAGCAAGCCTTGTTCCTCCTGTTGATATAATATCCCAGCCAAGATGCTTAAGCTCCCTAGCAAGGTCCACAATCCCTCTTTTATCTGATACGCTAATTAAGGCGCGTTTAGTCATTTTAAGTTCTCCTTAGAAAAGCCTATTTTCCTCAATAGCAGTGCCATCATCAAACAAGTCTTCTAGCCTTTGTTAGCCACCATTAGCGCAGCTGCTATGATAAACGACATGCCACAACAAGGAAAATAGTTATTAATCTTACACAATCAGCGGTTAAGCCGCTCTACTCCAAGACTATCCAATACCTCTGGATACAATTGGTATTCTGCTTCATGAATTCTGGCTTCAAAGCTTTCAAGAGTATCATCACTCAAACGTGGTACTCGTACCTGTTTGATGATTTTTCCCGTATCAATACCACTATCAACCCAATGAACAGTCACTCCTGACTGACGAACACCTGCTTGCCAAGCATCTAAAATACCATGTGCTCCTGGAAATTCTGGCAAATAAGCTGGGTGAATGTTGATGATTTTTCCTTCGTAAGCATCAAGTAAGGTTGTACTCACAATTTTCATATAGCCGGCAAGGACGATGAGATCAATCTGATGCCGCTGCAGCAGTGCCACAAGAGTCTGCTCATAGGCTTGCTTATTCTCAAAGTCCTTTAGTTCAAAGCTGTAGGACAGAACACCCAAAGCACAGGCTCTACTTAAAACATGAGCATCGCAATGATCAGAAAAAACAAAGGCAACCGGAAACTGTTCTGCAATCGTTTGAAAATTGGAGCCATTACCAGAAGCAAAAACGGCAATTCTTGTCATGGCTTCATCACCACACTAGCAACTGTTCTGGTCACAACGCGACCAATGTCATACACAGGCTCATCAAGACAGGCCTTCACCTGCTCAACGTGCTCTGGCTTGACAGCAAGCACCATGCCGATCCCCATATTAAAAATCTCAAACATTTCTTCATGATTGATCTTACCATATGTCTCAAGGACTTTAAAAATGGGCAGCACAGGTAAGCTGGCTTCTTCAATTTCAGCGGCTAGTTCTTTGGAAAACATACGAGGTAGGTTTTCAATAAAGCCGCCACCCGTAATATGAGCGATTCCTGCCACTAAGCCGCTTTTAATGAGTGGTAACACAGCCTTGACATAAATACGAGTTGGCTCAAGAAGTACCTCCTTAAGCTTTTTCCCATCAAGCTCTGGAAGCAGCTCCTCACCAGTATATCCAGCAAAAATACGACGAACCAAGGAATAACCATTTGAATGAACTCCACTTGATGCCAAACCTAGGAGATGATCTCCCTCAGCTACTCTTGAACCATCAATCAGCTGAGATTTCTCAGCAATACCAACCGCAAAACCGGCAAGATCATAGTCATCTTGACCATACATACCAGGCATCTCAGCAGTTTCTCCACCGATAAGAGCAGCACCTGCTTGAACACAGCCCTCAGCAATACCTGCCACCACCTGCTCTAATTTAGCAGGCTCATTTTTTCCTGCTGCAAGGTAATCAAGAAAATACAGGGGTTCGGCACCTGCTGCAATAATATCATTGACACACATTGCCACACAATCCTGACCAATCGTGTCATGCTTATCGTACTGGATTGCAAGCATTAGCTTTGTTCCGACACCATCTGTCCCTGAAACCAAAACAGGCTCCTTAACACCAGTCTTTGACAGGTCAAACAGACCACCAAAGCCTCCTAGACCACCCATAACACCCAATCGTTTGCTACGCTCGGCATGCTTTTTTATTCGCTCAACAAGCTCATAGCCTGCTTCAACATCGACACCTGATTGAGCATAAGCATTTTTAGACATTTTCTCCTCCTTATTTTAGCTGCCTAGATCATTTATTCTGTGTTAGCCATAAAGTGCTACTTCGTCACCTGATCAATGTGAAAGCTTACCTTTTCTTCTAAGCTCTTGAGATAAGCCTCCTCATAGTCATAAAGCGGCGTTGGATACTGACCGTCAAAATAAGCCACACAAAGCCCACCATTTGGTGATTTTGTAT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AACATGCTTTATAGCTGCTAAAAGCAGCTCCTGATCCAAATGAAACACATCATAAACCTGCACAATACGCAAATCAACCAGTGTCTTTAACTGCAGCTGATGCCTCAATTCCTTTAACAGGGCCTGGGCCTTAATCTGAAAATCAGCCCTTTTTTCAACAAAAATTCGTTTATTCATAGTTAACAT

Protein sequences of DBSCAN-SWA_8

>LR134317|1919475:1929660|1924334_1925792_-|VEF09346.1|DBSCAN-SWA
MTYDVKSLNEECGVFGIWGHPHAAQVTYFGLHSLQHRGQEGAGIISNDSGELHQHRDVGLLSEVFKDSSDLDKLKGHAAIGHVRYATAGTASINNIQPFLYRFTDAQFGLCHNGNLTNAISLKKALESEGAIFNASSDTEILMHLIRRSHHPEFLGKVKEALNTVKGGFAYLLMTEHQLIAALDPNGFRPLSIGRMKNGAWVVSSETCAFEVVGAEWVRDVMPGEVIIIDDQGITYDCYTTTTQLAICSMEYIYFARPDSTIAGVNVHTARKRMGKRLAQEFQHEADIVVGVPNSSLSAAMGFAEASGLPNEMGLVKNQYTQRTFIQPTQELREQGVRMKLSAVSGVVKGKRVVMVDDSIVRGTTSRRIVNLLREAGATEVHVAIGSPELKYPCFYGIDIQTRRELISANHTAAEVCDIIGADSLTYLSLDGLIEAIGLDTKSPNGGLCVAYFDGQYPTPLYDYEEAYLKSLEEKVSFHIDQVTK
>LR134317|1919475:1929660|1921007_1922555_-|VEF09341.1|DBSCAN-SWA
MTKRALISVSDKRGIVDLARELKHLGWDIISTGGTRLALEEAGVVTVAIDDVTGFPEMMDGRVKTLHPLIHGGLLARRDIEHHLQAAKQNRIELIDLVVVNLYPFKETICRSDITYDVAVDMVDIGGPSLLRSAAKNHASVTVVVDPTDYPLVLGELASTGSTSYQTRQSLAAKAFRHTAAYDAVIADYFTRQAGETKPEKLTLTYDLKQSMRYGENPQQAADFYQRALPTTYSIASAKQLNGKELSFNNIRDADAAIRIIRDFKERPTVVALKHMNPCGIGQADDIETAWDFAYAADPVSIFGGIVVLNREVDLATAEKLHAIFLELIIAPSYSKEALAVLTHKKKHLRILELPFAAQEASEIEAEYTGVLGGLLVQNQDVVTESPADWIVVTKRQPNEQEMAALAFAWKTIKYVKSNAIIIANDHMTLGVGPGQTNRIASVRIAIAQATGQLEGAVLASDAFFPFADSIEEIAAAGIKAIIQPGGSIRDSESIAAANQHGITMIFTGVRHFRH
>LR134317|1919475:1929660|1919475_1920630_+|VEF09339.1|DBSCAN-SWA
MKKVYQLLTSGAILLGVNGAISSTTTAISQGQSGIVHAAVLGDNYPSKWKQGFGADPWNMYLRQCTSFVAFRLHSSNGFSLPRGYGNAESWGRIAKHQGYHVDHIPRVGAVAWWDKGFNQSHALYGHVAWVAEVNGDTVVIEEYNYNAGQGPEKYHKRQIHKHQVSGYIHFKDLDHNSTSHTQVSHASQAGPASLAKTGTYYFSKQSPIKAEATLASPDLAYYHTGQLVHYDQTLVADGYEWLSYIGHSGNRRYIPIHKLPVQPQQHSQASIDKPKPVATTPIKVGDTVAFPGVFRVDQVAQNMIASSELAGGEPTSLNWIDPAPLHETDHKGRIAGNQILQVGDYFVVSGTYKVLKVDQPSKGIYVQMGSRGTWLTIDKAKKV
>LR134317|1919475:1929660|1923255_1924278_-|VEF09345.1|DBSCAN-SWA
MSKNAYAQSGVDVEAGYELVERIKKHAERSKRLGVMGGLGGFGGLFDLSKTGVKEPVLVSGTDGVGTKLMLAIQYDKHDTIGQDCVAMCVNDIIAAGAEPLYFLDYLAAGKNEPAKLEQVVAGIAEGCVQAGAALIGGETAEMPGMYGQDDYDLAGFAVGIAEKSQLIDGSRVAEGDHLLGLASSGVHSNGYSLVRRIFAGYTGEELLPELDGKKLKEVLLEPTRIYVKAVLPLIKSGLVAGIAHITGGGFIENLPRMFSKELAAEIEEASLPVLPIFKVLETYGKINHEEMFEIFNMGIGMVLAVKPEHVEQVKACLDEPVYDIGRVVTRTVASVVMKP
>LR134317|1919475:1929660|1925910_1929660_-|VEF09348.1|DBSCAN-SWA
MLTMNKRIFVEKRADFQIKAQALLKELRHQLQLKTLVDLRIVQVYDVFHLDQELLLAAIKHVFSEQVTDQVLSEEAVQADLKRYAFFAIEALPGQFDQRAASSQEALLLLGASTGVTVLTSQLYLVNQDIAAEELEALKQYLLNPVDSRFKDISAGIDYRDFSVADKVIPALDFFSDYTAEDFARYRSEQGLAMEVEDLLFIQDYFRSKGRVPTETELRVLDTYWSDHCRHTTFETELKRLDFSASQFEKQLQATYETYLAMRDELGRSEKPQTLMDMATIFGRYERANGRLEDLEVSDEINACSVEIEVDVDGVKEPWLLMFKNETHNHPTEIEPFGGAATCIGGAIRDPLSGRSYVYQAMRLSGAGDITSPLSETRKGKLPQQVISRRAAHGYSSYGNQIGLATTYVREYFHPGFVAKRMELGAVVGAAPKENVVREKPRTGDVVVLLGGKTGRDGIGGATGSSKVQTVESVETAGAEVQKGNAIEERKIQRLFRRGDVTRLIKKSNDFGAGGVCVAIGELAAGLNINLDKIPLKYAGLNGTEIAISESQERMAVVICPKDLEAFMSACHKENIHAAVVATVTEKPNLVMTWNGQTIVDIERSFLETNGVRVSVAAKVVDSGAPIPEARQTTAETLEADTIAVLSDLNHASQKGLQTLFDSSVGRSTVIHPLGGRYQMTPVEGSVQKLPVQHGVTKTASVIAQGYHPYIAEWSPYHGAAYAVIEATARLVATGSHWHKARFSYQEYFQRMDKQAERFGQPVAALLGAIEAQVQLGLPSIGGKDSMSGSFEELTVPPTLVAFGVTTAHVDHILSPEFKAAGENIYYIPGQAISEVIDFELIKSNFRSFAAIQARHKISSASAVKYGGIIETLALAAFGNQLGACVTLAELDRSLTAQLGGFIFTSKEEITGVIKLGQTTSDFTLVVNDVKLSGARLLKAFEGSLEQVYPTVFQQAGELKPVPVVTTALAAQFKEKIAQPVVYIPVFPGTNSEYDSAKAFEREGARVNLVPFVTLNEAAIDVSVDTMVDHIHQAHIIFLAGGFSAADEPDGSAKFIVNILLNEKVRAAIDTFIEKGGLIIGICNGFQALVKSGLLPYGRFEAVHEASPTLFYNDANQHVAKIVETRIANTNSPWLAGVKVGDIHAVAVSHGEGKLVVTERELAELCENGQIFSQYVDLDGKPSMDSRYNPNGSVNAIEGLTSKNGQIIGKMGHSERFEEGLFQNIPGNKDQWLFRSAVHYFRGDHVDID
>LR134317|1919475:1929660|1922701_1923259_-|VEF09343.1|DBSCAN-SWA
MTRIAVFASGNGSNFQTIAEQFPVAFVFSDHCDAHVLSRACALGVLSYSFELKDFENKQAYEQTLVALLQRHQIDLIVLAGYMKIVSTTLLDAYEGKIINIHPAYLPEFPGAHGILDAWQAGVRQSGVTVHWVDSGIDTGKIIKQVRVPRLSDDTLESFEARIHEAEYQLYPEVLDSLGVERLNR

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
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VEF09341.1|1921007_1922555_-	bifunctional phosphoribosylaminoimidazolecarboxamide formyltransferase/IMP cyclohydrolase	Q58MG4	Prochlorococcus_phage	5.5e-72	47.6
VEF09343.1|1922701_1923259_-	phosphoribosylglycinamide formyltransferase	M4QRX9	Synechococcus_phage	9.0e-25	37.6
VEF09345.1|1923255_1924278_-	phosphoribosylaminoimidazole synthetase	A0A0E3FGG1	Synechococcus_phage	1.3e-58	41.4
VEF09346.1|1924334_1925792_-	amidophosphoribosyltransferase	A0A0M3SGR2	Mollivirus	1.8e-56	34.0
VEF09348.1|1925910_1929660_-	phosphoribosylformylglycinamidine synthase protein	A6N228	Microbacterium_phage	1.2e-40	26.1

Sequences of DBSCAN-SWA_9

Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_9

>LR134317|2150027:2199012|DBSCAN-SWA
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MANRRMLSKTVVQTQRFLRLPLEAQALYCHLVVNADDDGIVEAFPVMRMINANEDSLNLLTLKQYLFLLNNEMVYFIKDFFEQNTIKADRYTPSSHRQLLIDYLKDNQLLECLNLGPRLINYLQNTRVQVGTSLDPDGNRNIIKDKISKDRIGKDKLSQDKIGLDNDPFSSRLTDDIWLMETLWHRELTRQEKVLLEGLTVSDSLLQLAIHKTAELEPKKQNMSYVKGILMNWEARGFITADQVIASEKDYCPLEISNVEVSEDFIAAMDIWKD
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MVKRRIRNVIKQVFLSEEENQKLLNRMKQDGFSNFSRFARKQLLKPDFETWLVSFPEYQTLTNRLLFIGRTINSIAKSATQFGKISPQDLMELGQLMEELVEHVEKQIREDKQRVAKK
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MSKQTFTTTFAGKPLVVEVGQVAKQANGATVVRYGESTVLTAAVMSKKMSTGDFFPLQVNYEEKMYAAGKFPGGWMKREGRPSTDATLTARLIDRPIRPMFAEGFRNEVQVINTVLSYDEDASAPMAAMLGSSLALSISDIPFNGPIAGVQVAYVEGEFIINPDKAQQEASLLELTVAGTKDAINMVESGAKELPEAIMLEALLVGHKAIQELIAFQEDIVAAVGKEKAEVELLQVAADLQAEIIETYNADLQQAVQVEEKKAREAATEAVKERVIAAYEERYAADEEHDRIMRDVTEILEQMEHAEVRRLITEDKVRPDGRRVDEIRPLAAEIDFLPRVHGSGLFTRGQTQALSVLTLAPMGDTQIIDGLEPEYKKRFLHHYNFPQYSVGETGRYGAAGRREIGHGALGERALAQVLPSLEEFPYAIRLVAEVLESNGSSSQASICAGTLALMAGGVPIKAPVAGIAMGLISDGTNYTVLTDIQGLEDHFGDMDFKVAGTRQGITALQMDIKIEGITPQILEEALAQAKKARFEILDLIEATIAEPRPELAPTAPKIDTIKIDVDKIKVVIGKGGETIDKIIAETGVKIDIDEEGNVSIYSSDQDAINRAKEIIASLVREAKVGEVYHAKVVRIEKFGAFVNLFDKTDALVHISEIAWSRTANVSDVLEIGEEVDVKVIKVDDKGRIDASMKALVPRPPKPEKSEAKKEGKHD
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MTNHIAKLIEESGKKLTEISSATNIAYPTLSGYNQGIRQPKKGNAQKLADYFGVSMAYILGLDDNKQAPSTMNIITDSFKISEISSVTPFKSDMEKLKKGIELGEIHLSMPLNDGFSDDFRRILARYLINHEEEFMKTFTKHMNSLKRESEIWQTWIQTEEYRIRQEDRHKK
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MKPMRNVALVISAMLLLSSQSFVSAVAAQDNQPTIAVQAQAAAEANVSARMRSDQPVIEANIATSQPVSQSTEATILLKDAKGNTINSTAYTMQAGQSRFSVWFDLTNLKVSDYSISVSVPDKEKAFSGSTAPIHFDGKPTKNTPETEQKNSNPVPANNQPKPAASGRVTSTEQPQNVPSETASANHMTRTNHRSDKVLKASSSNTPSAAKSIDSAEKDKGMLSDSAVQDKEQKGFPWLLSSLIAITAAALLALVIKAVHRK
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MGLPTILMFVVMIGLIWFMQRQQKKQAQERQNQLNAIEKGDEIVTIGGMFAVVDEVDLAAKRIVLDVDGVYLPFELSAIKRVVEKGSAVTSADVDTTETAVDDTAVEASDEAESAIETN
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MTFVLMTDSTADLDSFWAKEHNIDIVGLTVECDGKVYKTVGPDRLTSDALLAMMKSGSQPKTSQINVGQFEEVFRHYAADNQALLYIAFSSVLSGTYQSAVMARELVLEDYPDAVIEIVDSLAAAGGEGYLTMLASEARDNGKSLLETKAIIEGILPRLRTYFLVDDLFHLVRGGRLSKGSAFIGSLVNIKPLLWIDASGKLVPIAKIRGRKKAIKEIADRATKDIADSTVVVSYTSDQTGADNLREQLLAHEGISDVFMLPLGPVIAAHTGPDTLAVFVIGKEKR
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MIKIYDTMTRSLREFVPITDKVVNMYVCGPTVYNYIHIGNARSAVAFDTIRRYFEYAGYTVNYISNFTDVDDKIIKAAKAAGLSPKQLADQFIAAFMEDTKALGVKPATKNPRVMDYMDEIIVFIAALIKKGYAYESAGDVYFRVAKAANYAKLANKTIADLEAGASGRTDTETALKENPLDFALWKSAKAGEIAWASPWSSGRPGWHIECSVMATELLGDTIDIHGGGADLEFPHHTNEIAQSEAKTGKSFANYWMHNGFVNVDNEKMSKSLGNFVTVHDLLKTVDGQTLRFFLATQHYRKPINFTEKAIHDAGVNLKYLKNTLQQPTVATADASQLNAFITAFKAAMNDDFNTANGITVLFDMAKWINSGAYSEAVKSAFEEMLAVFGIVFEAESLDTEIEQLIAERQEARANRDFAKADAIRDQLAAQGIKLLDTKDGVRWIRD
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MKQILIINGSLRTGSFNHQLAQAAEQLLEGKAAVSYLDWEQVPMFSQDLEASTPESVAGVREAIQAADAIWIFSPVYNFAIPGSIKNLLDWVSRALDLSDPSGPSAINGKVVTVSSVANGGHEQLFAQYQDLLPFIRTTVVGNFTKAAVNPEAWATGVLDISEETRQSLAAQAEALLEAIN
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MSYNRKIIRTSSYLEIWEYETPIFSSDNTEIEENRTSLKEKTKRKTFDELTSDEQEERIKRISKTRKNTKWKLQRLIDTNFDDKTSFLTLTTKENIQDRQYFNILFDKFIKRLNYHIYHSKKRLIKYIAVLERQKRGAWHAHILLFSFPFIPHKDLLAIWRLGAVRINKLDSLDDSSNAGRYVSKYMEKDIGQELLESLGKKAFYSSRNLQKPEEIKLLTNENIEDLVQADDILYESTYNSKVFRKGHLVNNEVKYRKIKIDKE

Homologous phage analysis in the prophage region

Protein_ID	Protein_Def	Hit_ID	Hit_Def	E-value	Identity
VEF09752.1|2150027_2150471_+|tRNA	D-tyrosyl-tRNA(Tyr) deacylase	NA	NA	NA	NA
VEF09754.1|2150616_2151891_-	streptokinase	Q4ZCZ1	Staphylococcus_virus	3.4e-19	25.2
VEF09756.1|2152645_2153494_+	leucine-rich protein	NA	NA	NA	NA
VEF09758.1|2153643_2154777_+	Multiple sugar-binding transport ATP-binding protein msmK	G9BWD6	Planktothrix_phage	3.6e-20	31.8
VEF09760.1|2154960_2156580_+	glucan 1,6-alpha-glucosidase	NA	NA	NA	NA
VEF09762.1|2156688_2157051_+	transport accessory protein	NA	NA	NA	NA
VEF09764.1|2157164_2157524_+	preprotein translocase subunit YajC	NA	NA	NA	NA
VEF09766.1|2157697_2158447_+	UDP pyrophosphate synthase	R9W0U9	Flavobacterium_phage	1.1e-22	43.2
VEF09768.1|2158456_2159251_+	phosphatidate cytidylyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF09770.1|2159282_2160548_+|protease	pheromone-processing membrane metalloprotease	NA	NA	NA	NA
VEF09772.1|2160832_2162674_+|tRNA	prolyl-tRNA synthetase	NA	NA	NA	NA
VEF09774.1|2162725_2163283_+|tRNA	prolyl-tRNA synthetase	NA	NA	NA	NA
VEF09776.1|2163617_2168015_+	DNA polymerase III	A0A0K2SUJ2	Clostridium_phage	1.2e-18	38.4
VEF09778.1|2168136_2168565_+	MarR family transcriptional regulator	NA	NA	NA	NA
VEF09780.1|2168694_2169240_+	NADPH-dependent FMN reductase	NA	NA	NA	NA
VEF09782.1|2169366_2169981_-	peptide deformylase	E3SLL2	Synechococcus_phage	2.1e-11	38.2
VEF09784.1|2170367_2171774_+	fibronectin-binding protein FneB	NA	NA	NA	NA
VEF09786.1|2172039_2172309_+	30S ribosomal protein S15	NA	NA	NA	NA
VEF09788.1|2172677_2174822_+	polyribonucleotide nucleotidyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF09790.1|2174814_2175567_+	polynucleotide phosphorylase/polyadenylase	NA	NA	NA	NA
VEF09792.1|2175578_2176115_+	serine acetyltransferase	NA	NA	NA	NA
VEF09795.1|2176236_2177580_+|tRNA	cysteinyl-tRNA synthetase	A0A1V0SAQ2	Catovirus	9.3e-52	30.6
VEF09797.1|2177572_2177980_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF09799.1|2178196_2178985_+	membrane protein	NA	NA	NA	NA
VEF09801.1|2179033_2179780_+	SpoU rRNA methylase family protein	NA	NA	NA	NA
VEF09803.1|2179780_2180299_+	hypothetical cytosolic protein	NA	NA	NA	NA
VEF09805.1|2180490_2181351_+	DegV family protein	NA	NA	NA	NA
VEF09808.1|2181877_2182324_+	50S ribosomal protein L13	NA	NA	NA	NA
VEF09810.1|2182343_2182736_+	SSU ribosomal protein S9p (S16e)	NA	NA	NA	NA
VEF09812.1|2182831_2184052_-|integrase	integrase	NA	NA	NA	NA
VEF09814.1|2184094_2184364_-	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
VEF09816.1|2184370_2185165_-	Rep protein	NA	NA	NA	NA
VEF09818.1|2185330_2186062_-	serine/threonine protein phosphatase 1	A0A127AVW0	Bacillus_phage	1.3e-10	28.4
VEF09820.1|2186079_2186469_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF09822.1|2186510_2186825_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF09824.1|2186914_2188237_-	FtsK/SpoIIIE family protein	A0A1S5SFB5	Streptococcus_phage	6.9e-31	30.5
VEF09826.1|2188257_2189016_-	endonuclease/exonuclease/phosphatase	NA	NA	NA	NA
VEF09828.1|2189061_2189160_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF09830.1|2189289_2189805_-	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF09832.1|2189892_2190516_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF09834.1|2191007_2192162_-|integrase	integrase	Q938N9	Temperate_phage	1.8e-43	31.7
VEF09836.1|2192216_2192735_-	putative transcriptional regulator, Cro/CI family	NA	NA	NA	NA
VEF09838.1|2192881_2193166_+	DNA-binding protein	NA	NA	NA	NA
VEF09840.1|2193174_2193999_+	DnaD and phage-associated domain protein	A0A1P8BL54	Lactococcus_phage	4.7e-30	68.0
VEF09843.1|2194013_2194304_+	Uncharacterised protein	NA	NA	NA	NA
VEF09845.1|2194296_2194659_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
VEF09847.1|2194658_2195015_+|transposase	transposase	NA	NA	NA	NA
VEF09849.1|2195357_2196863_+	Type I restriction-modification system methylation subunit	A0A220A2U4	Liberibacter_phage	7.3e-53	29.7
VEF09851.1|2196852_2197971_+	type I restriction-modification system specificity determinant	A0A240FAT6	Liberibacter_phage	1.3e-27	42.5
2197964:2197981	attL	NA	NA	NA	NA
VEF09853.1|2198025_2199012_+|integrase	integrase/recombinase, phage integrase family protein	A0A2H4JAA2	uncultured_Caudovirales_phage	8.1e-37	29.5
VEF09853.1|2198025_2199012_+|integrase	integrase/recombinase, phage integrase family protein	A0A2H4JAA2	uncultured_Caudovirales_phage	8.1e-37	29.5
2200200:2200217	attR	NA	NA	NA	NA