Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134332 | Legionella pneumophila strain NCTC11193 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | cas1,cas2,cas4,cas3,RT,PD-DExK,DEDDh,DinG,WYL,csa3 | 0 | 6 | 7 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR134332_1 | 179916-182963 | TypeII |
NA
Consensus repeat of LR134332_1
|
42 spacers
spacers of LR134332_1
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cas4,cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134332_1
The CRISPR arrays of LR134332_1 >merge|LR134332|1|179916-182963|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTAGATATAAAAAGATTAAATCTTCTAGCGCACATCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTCACTACTCCTGAAGGTTATAATTTTTGCTATAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTCGAATACAATCCTAGTGTCTCTGTGTGAATTAAGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCAGGCACTGGTTCACTAGACACTGTAACATCTATCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCAATAACAAGCGAGCCTTTTGTACTAGAAGGTTTACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCTACCAGTTAATCGTAACTCAATCTCTTTTTCAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACATAGAATACATAAGTGCAAATTATTAAATGTTACCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTGAATGTAGAAACCAGATGCCACGAATTATTAGACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTTGTATAAACGTTCTGATATGACTTAGGTAATCTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCTAACCTGATTGCTCAACAAATAATGCTATTGGCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTCACTTTAGGCCAACGCCGATCCTCCGCTTCGAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCTCACATCTTACCCTCAGGGCGGATATTGTGAATCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACATTAATAATATTTTAGAAGATTGGCACATAATACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTGACGCAAAGGATTTATTAAAAACGCCTTGTAATCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACATTTTACCTTTTAACACATATTGATAGGCGTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTCCATAACTGAAACGTCCTTATGCCTCAACATAATGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACGAATTTGTCGGCCGCATAGACCGCTTTTATCAAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCTATTGCAAGCTAGTTTGATCGTGTTATTATAAGAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTGACAAACGTTTGTTTTTTAGACACAACACTAAAAGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCCTGAAAACCCGCCACAACCCGCGCCAGACTTGAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACACCAAGTCGAAACAACATACCGAGACCGTGTTGACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTACATTGTTACGTTCATTTCACTCAGTTTTTCATACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACAGCAATAACCCAAAGTTTCGCGCGCGTGCGCGGGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTATAACATCGGGATGGCGGTTTATTGGTTAAGTAACCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTCTTTTTTCAGATTTCATTTCCTTTTCCTTGTGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTTTTATCGTAAGCTTGATTAACTAGACATCTACTACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACGTTTTAATTTAATCATTATTGCTTCCTTATTAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTAAGATATTGGTCGATTGTTTGCAAGACGTCATCAAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCTAAATCAGCAGTCATCAAAACCCATATGATTGTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTCTCAGAATGGGAACGTTACACATCATATTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTAAGTATACGTTTCTTTGGGCTATTAGTTCTAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTCTCATATTTTAAAACAATAGAGTAATTCATTTTACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACAATCTTAATTTATGCGCCTTACCTTCTGCTTCATCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTATACTTAGACAATATCATCATTTCCTATGTTTCGACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACGCTATTCCAGATAGGTAGTTGTTTAGAGCATTTTGTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTCGATACTCCTTAGCGGTACTTGCTAAAGTAGTTCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACAAATAATTCTTGTGACTCACGTGCCGCCATTTGAACCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTAGGAATTGATTGGGGTAACGCCATCGCCATAGAAGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTACTTCATGACCCGGACATTTTACTAAAAAATTCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTCCTATACCTTGTCACAATTTCCTCATATGGCTCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACCATAATTGGGAATTGGTGTGAAATGCTCACCGTCCGCCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAACTTAATTGCGCCAGAAACAGCACCATTTATGGTTACAGCCCAATAATCCCTCATCTAAAAATTTAACTAATGAAAT >LR134332|1|1|179916-180310|PILER-CR CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TAGATATAAAAAGATTAAATCTTCTAGCGCACAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCACTACTCCTGAAGGTTATAATTTTTGCTATAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTCGAATACAATCCTAGTGTCTCTGTGTGAATTAAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CAGGCACTGGTTCACTAGACACTGTAACATCTAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CAATAACAAGCGAGCCTTTTGTACTAGAAGGTTTA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC >LR134332|1|1|179916-182963|CRISPRCasFinder CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TAGATATAAAAAGATTAAATCTTCTAGCGCACAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TCACTACTCCTGAAGGTTATAATTTTTGCTATAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC TTCGAATACAATCCTAGTGTCTCTGTGTGAATTAAG CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CAGGCACTGGTTCACTAGACACTGTAACATCTAT CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CAATAACAAGCGAGCCTTTTGTACTAGAAGGTTTA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC CTACCAGTTAATCGTAACTCAATCTCTTTTTCAA CCAATAATCCCTCATCTAAAAATCCAACCACTGAAAC ATAGAATACATAAGTGCAAATTATTAAATGTTAC 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>LR134332.1|VEF60358.1|179106_179700_+|CRISPR-associated-protein-Cas4 MDTSSYKLPVNMIRQYCFCPRIVYYHMVVGLKVAYPGWVQYGEEYQHKQQVLDKRRTLSKFKPISEQAVLRQNTMLEHPSYPFYGICDGIIEDELEIIPIELKSFASKISLGQKMQLTAYGMLSELIFEKPCTRGYIITGEKAKAKLIKIDEKSKFKVIEICAKIKKIFGTETLPYSTANGLQCIQCEFLNHCNDRF >LR134332.1|VEF60355.1|178826_179126_+|CRISPR-associated-endoribonuclease-Cas2 MQIRLYKEYIVSYDIRDNSIRRTIYERLKDIGLTPVQKSVFWGYLNEPEKRYLTNFLKKELAKQDTAFITPCKLAQEYEVNLINLELDELRKPDGHIIV >LR134332.1|VEF60352.1|177827_178820_+|CRISPR-associated-endonuclease-Cas1 MKHLTLSEQGSFCKLQGERILVFNKDQMVFEGTLNRLKTISIVKQGVTLTSNLLVACAMRGIQIFILDYSGKAVCSLQGGLHRTAKVRESQFKYIYTKEASNMAARFILAKIKKQSAVLKYFAKAKNRPENEKIILHAASQKMAGIVANITETNWIKLQDWRFTLLGFEGSAARIYWETVKEVNLVCSDFEGRRPRVNKDITNSMLNYAYSILSSWVWQAITNAGLELYAGILHTSKPGKPSLVLDLMEEFRPWCADRIIFKLHARAQKQNELTPALKKTLIGEMANLYAKPLPYHKRRISLESIIQRQVYHLSAVFSGEGKYKGYLFKW >LR134332.1|VEF60349.1|173712_177831_+|CRISPR-associated-protein-Cas9/Csx12,-subtype-II-B/NMENI MESSQILSPIGIDLGGKFTGVCLSHLEAFAELPNHANTKYSVILIDHNNFQLSQAQRRATRHRVRNKKRNQFVKRVALQLFQHILSRDLNAKEETALCHYLNNRGYTYVDTDLDEYIKDETTINLLKELLPSESEHNFIDWFLQKMQSSEFRKILVSKVEEKKDDKELKNAVKNIKNFITGFEKNSVEGHRHRKVYFENIKSDITKDNQLDSIKKKIPSVCLSNLLGHLSNLQWKNLHRYLAKNPKQFDEQTFGNEFLRMLKNFRHLKGSQESLAVRNLIQQLEQSQDYISILEKTPPEITIPPYEARTNTGMEKDQSLLLNPEKLNNLYPNWRNLIPGIIDAHPFLEKDLEHTKLRDRKRIISPSKQDEKRDSYILQRYLDLNKKIDKFKIKKQLSFLGQGKQLPANLIETQKEMETHFNSSLVSVLIQIASAYNKEREDAAQGIWFDNAFSLCELSNINPPRKQKILPLLVGAILSEDFINNKDKWAKFKIFWNTHKIGRTSLKSKCKEIEEARKNSGNAFKIDYEEALNHPEHSNNKALIKIIQTIPDIIQAIQSHLGHNDSQALIYHNPFSLSQLYTILETKRDGFHKNCVAVTCENYWRSQKTEIDPEISYASRLPADSVRPFDGVLARMMQRLAYEIAMAKWEQIKHIPDNSSLLIPIYLEQNRFEFEESFKKIKGSSSDKTLEQAIEKQNIQWEEKFQRIINASMNICPYKGASIGGQGEIDHIYPRSLSKKHFGVIFNSEVNLIYCSSQGNREKKEEHYLLEHLSPLYLKHQFGTDNVSDIKNFISQNVANIKKYISFHLLTPEQQKAARHALFLDYDDEAFKTITKFLMSQQKARVNGTQKFLGKQIMEFLSTLADSKQLQLEFSIKQITAEEVHDHRELLSKQEPKLVKSRQQSFPSHAIDATLTMSIGLKEFPQFSQELDNSWFINHLMPDEVHLNPVRSKEKYNKPNISSTPLFKDSLYAERFIPVWVKGETFAIGFSEKDLFEIKPSNKEKLFTLLKTYSTKNPGESLQELQAKSKAKWLYFPINKTLALEFLHHYFHKEIVTPDDTTVCHFINSLRYYTKKESITVKILKEPMPVLSVKFESSKKNVLGSFKHTIALPATKDWERLFNHPNFLALKANPAPNPKEFNEFIRKYFLSDNNPNSDIPNNGHNIKPQKHKAVRKVFSLPVIPGNAGTMMRIRRKDNKGQPLYQLQTIDDTPSMGIQINEDRLVKQEVLMDAYKTRNLSTIDGINNSEGQAYATFDNWLTLPVSTFKPEIIKLEMKPHSKTRRYIRITQSLADFIKTIDEALMIKPSDSIDDPLNMPNEIVCKNKLFGNELKPRDGKMKIVSTGKIVTYEFESDSTPQWIQTLYVTQLKKQP >LR134332.1|VEF60346.1|172919_173237_+|Uncharacterised-protein MNDLAKILSLKNLLTKNNINPSENFENIYSQITDDGLKKEIESRIIDYFSKLSLPEHVTIYDQLLLSLREKDAISHSNGIYFYLTHIKEIVILFHCLRYFSCMVM >LR134332.1|VEF60343.1|170094_172110_+|oligopeptidase-A MSTTVGLPQFSHIKIEHFKSHLDALLKNHLEEIDRLLKENHHYTWDNLIYPLDSLADELERFWSPFAHMHAVMDSETIRESYEACLPLLSAYDAAIGHNQDLYEAIKSIDQHSLNPAQKKIIADSIQDFELSGVALSKANKKRFEAIQSRLAELSSKFENNVLDATHAYTIHITEAERMAGLPEHALNTAKELAHEKGLDGFVLTLEYPCFQAVITHAEDRALREEMYRAYITRASDQGPNAGTFDNTPLIDEILSLRHEKAELLGFNNFAELSLATKMAASTNQVTEFIYDLISRTRDKGKAEFRQLEVFAQDKWNLSPVNPWDVAYLSEKRRQDLYSLSQEELRPYFPQPKVMQGLFAIVKKLFGMSIEEIEGVDVWHKDVQCYCIVDESNQTRGYIYTDLFARPHKRNGAWMDSMQSRRKLEDGTVQLPIATLTCNFAKPSANRPAMLSHDEVVTLFHEFGHCLHHVLTQVDYLGGSGINGVEWDAVELPSQFFENWCWDEHALSLLTSHADTGETLPSALYERLIAAKNFQSAMAMLRQMEFALFDFRIHQEYQTGKASFVPNILADVRSKTSVVPIVPYNRFQHSFSHIFGGGYAAGYYSYMWAEVLSSDAFARFEEEGIFNPKTGHDFLKSILEVGGSRKAADAFVEFRGRPATIDALLRHNGIL >LR134332.1|VEF60340.1|168661_169996_+|Uncharacterised-protein MTPIISHLLKIFPELNTQVKTDSLNWTFNTHLKQLGPDFYSKVARLHPILNMEYSVLCQHLRYNLSSPDYSSPEQIKEQLIDALKLAELLEYTYQHYLVVPREVVRLRRHKAIYKELLTELSGYSFALDNPEPESLKTSLSLTQAIREKTAQSNWYRIFISRSKRVINLLDNLDTGSKAFRDFVVLLDKYTNPFLAYLGWCFFAPRLFTNLFLILKHTIPGEWMGEKEKSLDWSDRFYAHLQRRWFELANDSVWFTVGILNCFVLVGALAPLSVYLSLFAFVFDVANTSLRAYIEIGRLQQLQKEYGELFDQEENEDQKKIIKEYQDLISYRIKFEILRSFLSVGGAVAVVIAMALSVPALGIINPIIPLIGAVLLLALWGVSLYLNNKLDEYRPVDNIEKPAPSVINKLSFFAPKNEKKESLHLSSKPEKVLEAEELIPAFTF >LR134332.1|VEF60337.1|166397_168404_-|transketolase MNSFTELANAVRMLSIDAVNQAQSGHPGMPLGMADIATVLWKKFLKFNPKNPHWFNRDRFVLSNGHGSMLLYSLLHLTGYNLDISELKNFRQLHSKTPGHPEHGHTPGVETTTGPLGQGLANSVGMALAERVLASTFNHDHFNLVDHYTYTFAGDGCLMEGISHEACSLAGTLGLGKLIVFYDDNGISIDGKVESWFTDDTTSRFKAYNWQVIGPIDGHDADQIEQAISAARENTTQPSLIICKTVIGLGSSVAGSEKAHGSPLSAQDINNVREFFNWKHAPFEIPDSIYKQWDHREQGEKEEQQWLQLLHEYRQQHPSEHDEFLRRANGDLPDDWQEISAGFLKQCLNNEKAIATRKASQQCIEFFAPILPEMFGGSADLTGSNNTDWSGSKAITAHNFSGNYLYYGVREFAMAAIMNGLAVHGGFIPYGGTFLVFADYARNAIRLSALMKQRVIYVLTHDSIGLGEDGPTHQPIEHIAMLRMTPGMTVWRPADLMETAVAWQQSLEHHNGPSALLLSRQNLPALAHGTDAADLIKKGGYIIADCEGKPDAILIATGSEVQLAITAAEKAKARGLQVRVVSMPCAERFLAQSDDYKNQVLPGQVRTRIAIEAASSAYWHQFVGFDGAVIGLDCFGVSAPATDAFNYLGITVEKIINTLDTLTKQTMV >LR134332.1|VEF60334.1|165323_166316_-|glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MTIRVAINGYGRIGRCILRSIFEYNRQNEFEVVAINDLSGIDVTAHLTRYDSTHGPFRSDVSIEGNMLIVDGHGIQVIAERDPAKLPWKQLDIDIVFECTGFFTSRDAAMGHINAGAKKVLISAPAKGVDTTVVYGVNHSVIKASDVIVSNASCTTNCLAPVVKVLNDAIGIESGLVNTVHAYTKDQMLLDGSHKDLRRARSATQSIIPTKTGAAAAVGLVLPELAGKLDGFAMRVPVLNVSVVDLTFQAKRATSVEEINDIMRKAKNRILQINEDPLVSCDFNHNPASAIFDTTETKVIGNLVKVVAWYDNEWGFSNRMIDTAHQMMNC >LR134332.1|VEF60331.1|164122_165313_-|phosphoglycerate-kinase MNLIKMSDIDLSGKRVLIREDLNVPIKDGMITSDQRLQAALPTIKSALDSGAAVIVLSHLGRPEEGKYEKKFSLEPVADYLRENLEYPVRFVKDYLSGVGVNPGELVVCENVRFNPGEKANDEALAKKLASLCDVFVMDAFGTAHRAQASTYGVAQYAPVAVAGPLLIRELEALNQVLKAPKKPIVAIVGGAKVSSKLSLLKQLVGMVDVLIPGGGIANTFLKAQGFEIGISLYEPDLLDEARHILILAKEKGCQIPLPTDVVVGKTFSETCPAFNKSLSNVAADDMILDIGPETIRDYVDLIHDANTIIWNGPVGVFEFPQFAYGTRAIAIAIAESDAFSIAGGGDTLAAVDLYDLNQQISYISTGGGAFLECLEGKTLPAVAILQERAKHVKTN >LR134332.1|VEF60364.1|183314_183752_+|zinc-metalloprotease MIDDSKAKPQVKLVRGQLQIIASRNIEHRRQLLSDWYKQKAFEVFSKRLDQLLSTAPWIKECPSINLRAMRSRWGSCAVNGKITLNTHLIKAPIACIDYVILHELCHHFEHNHSDKFYRLLNQVSPNWKQVKQYLDKAANLYLMT >LR134332.1|VEF60367.1|183741_184425_-|phage-repressor MTELNIKKEIGKRILEARKAKGLTLKALGELAGGLKQTRLTNWEQGVRTPGPEEIKSLARALDVSPAYLMCLSDELQFKEAKNPSQLIPLLDYRQACEASLHTGAESSGDKVFISVSTSLQPELSTDAFALKITDDSMMPEIRINDVLVIEPSVLPEPGDFVAVKINGKPETIICQYKKLSYTSSEFELLTLNDNWPNIKVSDDINVKIIGVLVQNLRCYKSPKVKS >LR134332.1|VEF60370.1|184577_185447_+|Legionella-vir-region-protein MMDFVINGDELEAMSGLPHFQQLTYLRGIRPYMDVKTGIVGIKRRISHQSISEQLYVEPHQGIKSQNFSRDQVRRSVSGLVRAGLIEVQSEGMHLILKCLLASSHYSAQNKAAINPPQKATIKPRGESLENTGLTEFEALKADTVESQKAAIPHKDNYYIYLLSQFEKFWSLYPEKKSKNNAQAVFEELKPNAELCHTIINALTAQINYRDTMKLQGTWVPPWKYPANWLAQRCWEDELPTDALQEKNHAEHTKNTRKRHATEDLFCPPCDVKDREHNNVIQLQRYLQS >LR134332.1|VEF60373.1|185412_185775_+|protein-LvrB MSSSSKDTFKAERRIDLLFSKFAAFYGHVWRSQFKDEVFLKFAKKEWQEALADFTDMVLTRAILNCREFYELPPTLPQLLYCCRQIRKQESFYVVKDVYQPANKAVVSSCLQKCKELLAK >LR134332.1|VEF60376.1|185787_185991_+|protein-LvrC MLVLTRKAGQQILIGKGLIQMKVLKVENDIISIGIKAPSHIDIDREEIYFRKLRQEQEAANDAEMAI >LR134332.1|VEF60379.1|185987_186290_+|LvrB2 MKTDKQLSKRAFQKIRTLYWGTVCLCAPSVSSAQNIESIINRTINYLQGGLARTVGVFCIIIAGYLCLARQKFPKEYFVMILVGMGIIFGGSSLYSTLIG >LR134332.1|VEF60384.1|186299_186581_+|type-IV-secretion-system-protein-VirB3 MSDLEISPIFNALTRPAMTAGVTFEYHMLNLIVSMCAFIGFSPLYGIIFIPLHVFGWLVCRYDTHFFTICAKRFLLPQAPNTSLWRVRAYEPF >LR134332.1|VEF60387.1|186567_189048_+|protein-LvhB4 MNLSKTLKHVYQEAKVSNLFPVTHLNSPCIFESQSGLVGSVIKVNGAAFEIEEAETLNHQRFLLHQALVSLDSRFIIYVTTHRQKISCPLIGEFKPGFAKDLDERYQQRFKDKNLYKNTLYITVVLKGDDTSKTGSWLQWAKSLSMKGNSELAEHHREQNIQILNRAVEQLHTNLNSFGASILGMQDEELGFSELLQFLGLVVNAGQTASFKHPVYSPPIANSIPQTFKQEAKYPEGHLGQYLSSCQLLFGECIQFQGNTQQDCLFGAMLSLKKYPTNTASILLDSMLSLDCEFIATHTFAPIGRDSALDTISKKRSKLLNAEDKALSQTTALTDLEDGIASETLLLGAHHHTVMLLAPNKSLLDAAILEATKRYGATGVVVVKETLGQEPAFWSQLPCNQHFITRASLITSQNFVDFCPLHNTQTSFSNENFLGGAVTLLETPSKTPVYFNYHARGSKTNPSKGHAAIFGGNNAGKTTLVNFLDAQMGRFGGRSFFIDRDESSKIYILASGNSSYIKIEPSNPIAMNPLQLPDTSENRSFLKSWFATLVQEDSERAIPSPIAEIINDCIDYSFEQLAPEFRTLSHLSQFLPVDFPRWPHLKRWLKRNDSRIDGEFHWLFDNQHDALNLDFDKVGFDVTYLMDQVQSIIATPVYLYLLHRMRQCLDGRLTSFIIAEAWQLFASPFWEKALREWLPTIRKKNGHFIFDTQSPKTITDSPIKHIVLDNLATLIAFPNPLADKETYMEHLKLTEAQFEAIKENTPESRIFLYKQDHEAFLCKLDLSGLSQYIRVLSANTQSVKLLDDIMQEVGHDPELWLPVFFERSKK >LR134332.1|VEF60390.1|189044_189755_+|protein-LvhB5 MKRTACFLIAVLGISGASHADILGVEDAQLIVLAMKQLGELQEQYRVLTDTYQTTRSQLDNLNQLKSMNSGHYGFGDFNNGLDTLQSWQSPVSTWQDALENLSGGNQQRYQALMDAYEKNHPSLDESSYARFTTPANVARFKEDKAVNRAVLVQTTESYNEINKHMEALHKLSQQIEKTPNTKGAIDLNSRLITEIGFIQLMSLRLQALISQQAAQENLSALQDRAEMAKFNRLPK >LR134332.1|VEF60393.1|189769_189916_+|protein-LvhB7 MKWLLSVLMIALLSGCSKPPDLDSPCHHFGQYCPQYPINDEPIMELTK |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134332_1 | 1.17|181092|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181092-181125 | 34 | NZ_CP021285 | Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence | 33767-33800 | 3 | 0.912 |
LR134332_1 | 1.17|181092|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181092-181125 | 34 | NC_006366 | Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence | 43841-43874 | 3 | 0.912 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | MN693625 | Marine virus AFVG_250M334, complete genome | 30638-30671 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NZ_CP020506 | Serratia marcescens strain 95 plasmid unnamed1, complete sequence | 6512-6545 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NZ_CP022274 | Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence | 85367-85400 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NZ_CP026551 | Citrobacter sp. SL156 plasmid unnamed2 | 80071-80104 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NZ_CP022697 | Citrobacter farmeri strain AUSMDU00008141 plasmid pAUSMDU8141-2, complete sequence | 56497-56530 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NC_019013 | Escherichia coli strain G3/10 plasmid pSYM1, complete sequence | 9531-9564 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | CP052139 | Klebsiella pneumoniae strain F17KP0040 plasmid pF17KP0040-1, complete sequence | 96043-96076 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | MN699848 | Citrobacter pasteurii strain 175G8 plasmid pCfr-OXA-198, complete sequence | 136300-136333 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NZ_KY416992 | Escherichia coli strain FAM21805 plasmid unnamed, complete sequence | 46142-46175 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NZ_CP020508 | Serratia marcescens strain BWH-35 plasmid unnamed, complete sequence | 187130-187163 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NZ_CP017222 | Escherichia coli strain FAM21845 plasmid pFAM21845_2, complete sequence | 38341-38374 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NC_019254 | Shigella sp. MO17 plasmid pMO17_54, complete sequence | 16864-16897 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT | 180024-180057 | 34 | NZ_CP049048 | Enterobacter hormaechei strain Y233 plasmid p233-142, complete sequence | 109547-109580 | 7 | 0.794 |
LR134332_1 | 1.13|180810|33|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 180810-180842 | 33 | NC_011245 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl28, complete sequence | 27872-27904 | 8 | 0.758 |
LR134332_1 | 1.13|180810|33|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 180810-180842 | 33 | NC_011265 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl27, complete sequence | 21445-21477 | 8 | 0.758 |
LR134332_1 | 1.15|180951|31|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 180951-180981 | 31 | NZ_AP014824 | Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence | 8512-8542 | 9 | 0.71 |
LR134332_1 | 1.13|180810|33|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 180810-180842 | 33 | NZ_CP041195 | Weissella cibaria strain CBA3612 plasmid pCBA3612-02, complete sequence | 6048-6080 | 10 | 0.697 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | NZ_CP040051 | Acinetobacter baumannii strain VB16141 plasmid unnamed1, complete sequence | 65151-65184 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | NZ_CP012007 | Acinetobacter baumannii strain Ab04-mff plasmid pAB04-1, complete sequence | 55277-55310 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | CP040054 | Acinetobacter baumannii strain VB35179 plasmid unnamed1, complete sequence | 51450-51483 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | NZ_CP012005 | Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978-mff plasmid pAB3, complete sequence | 53921-53954 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | MF399199 | Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-4, complete sequence | 177496-177529 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | NZ_AP014650 | Acinetobacter baumannii strain IOMTU433 plasmid pIOMTU433, complete sequence | 93937-93970 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | NZ_CP050433 | Acinetobacter baumannii strain PM194229 plasmid pPM194229_1, complete sequence | 119339-119372 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | LT605060 | Acinetobacter calcoaceticus strain NCTC7364 genome assembly, plasmid: 2 | 43536-43569 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | NZ_KU744946 | Acinetobacter baumannii strain A297 (RUH875) plasmid pA297-3 clone Global clone 1 (GC1), complete sequence | 171009-171042 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | NZ_KT779035 | Acinetobacter baumannii strain D4 plasmid pD4, complete sequence | 103008-103041 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | NZ_MK323043 | Acinetobacter baumannii strain Acb-45063 plasmid pAb45063_b, complete sequence | 4445-4478 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 181669-181702 | 34 | CP033562 | Acinetobacter nosocomialis strain 2010S01-197 plasmid p2010S01-197-1, complete sequence | 61395-61428 | 10 | 0.706 |
LR134332_1 | 1.10|180596|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 180596-180629 | 34 | NC_019509 | Cronobacter phage ESP2949-1, complete genome | 8672-8705 | 12 | 0.647 |
LR134332_1 | 1.10|180596|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT | 180596-180629 | 34 | MH845412 | Cronobacter phage CS01, complete genome | 13237-13270 | 12 | 0.647 |
1. spacer 1.17|181092|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP021285 (Legionella pneumophila subsp. pneumophila strain Allentown 1 (D-7475) plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcaaa CRISPR spacer gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcgtt Protospacer *******************************.
2. spacer 1.17|181092|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_006366 (Legionella pneumophila str. Lens plasmid pLPL, complete sequence) position: , mismatch: 3, identity: 0.912
gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcaaa CRISPR spacer gaatttgtcggccgcatagaccgcttttatcgtt Protospacer *******************************.
3. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN693625 (Marine virus AFVG_250M334, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcctgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer tcactactcctgaaggttttaattggatatatga Protospacer ****************** ***** ***.*
4. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020506 (Serratia marcescens strain 95 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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5. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022274 (Citrobacter freundii strain 18-1 plasmid pA18-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
6. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP026551 (Citrobacter sp. SL156 plasmid unnamed2) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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7. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP022697 (Citrobacter farmeri strain AUSMDU00008141 plasmid pAUSMDU8141-2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
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8. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019013 (Escherichia coli strain G3/10 plasmid pSYM1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
9. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to CP052139 (Klebsiella pneumoniae strain F17KP0040 plasmid pF17KP0040-1, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
10. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to MN699848 (Citrobacter pasteurii strain 175G8 plasmid pCfr-OXA-198, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
11. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KY416992 (Escherichia coli strain FAM21805 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
12. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP020508 (Serratia marcescens strain BWH-35 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
13. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP017222 (Escherichia coli strain FAM21845 plasmid pFAM21845_2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
14. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019254 (Shigella sp. MO17 plasmid pMO17_54, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
15. spacer 1.2|180024|34|LR134332|PILER-CR,CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP049048 (Enterobacter hormaechei strain Y233 plasmid p233-142, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.794
tcactactcc-tgaaggttataatttttgctataa CRISPR spacer -catcactttatgaaggttattatttttgctaaaa Protospacer **..***.. ********** ********** **
16. spacer 1.13|180810|33|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011245 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl28, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
attaataatattttagaagattggcacataata CRISPR spacer gaaaataatattttagaaggttggtacatgcaa Protospacer . ****************.****.****. *
17. spacer 1.13|180810|33|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_011265 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl27, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.758
attaataatattttagaagattggcacataata CRISPR spacer gaaaataatattttagaaggttggtacatgcaa Protospacer . ****************.****.****. *
18. spacer 1.15|180951|31|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014824 (Geminocystis sp. NIES-3709 plasmid pGM3709_03, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.71
attttaccttttaacacatattgataggcgt CRISPR spacer attttaccctttaacacatcttggaaacgag Protospacer ********.********** ***. *. .
19. spacer 1.13|180810|33|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP041195 (Weissella cibaria strain CBA3612 plasmid pCBA3612-02, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.697
attaataatattttagaagattggcacataata CRISPR spacer gcatataatattttaaatgattggcacactagg Protospacer .. ***********.* **********. * .
20. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP040051 (Acinetobacter baumannii strain VB16141 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
21. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012007 (Acinetobacter baumannii strain Ab04-mff plasmid pAB04-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
22. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP040054 (Acinetobacter baumannii strain VB35179 plasmid unnamed1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
23. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP012005 (Acinetobacter baumannii strain ATCC 17978-mff plasmid pAB3, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
24. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to MF399199 (Acinetobacter baumannii strain D46 plasmid pD46-4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
25. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_AP014650 (Acinetobacter baumannii strain IOMTU433 plasmid pIOMTU433, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
26. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP050433 (Acinetobacter baumannii strain PM194229 plasmid pPM194229_1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
27. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to LT605060 (Acinetobacter calcoaceticus strain NCTC7364 genome assembly, plasmid: 2) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
28. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KU744946 (Acinetobacter baumannii strain A297 (RUH875) plasmid pA297-3 clone Global clone 1 (GC1), complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
29. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_KT779035 (Acinetobacter baumannii strain D4 plasmid pD4, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
30. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_MK323043 (Acinetobacter baumannii strain Acb-45063 plasmid pAb45063_b, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
31. spacer 1.25|181669|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP033562 (Acinetobacter nosocomialis strain 2010S01-197 plasmid p2010S01-197-1, complete sequence) position: , mismatch: 10, identity: 0.706
ttcttttttcagatttcatttccttttccttgtg CRISPR spacer cctgatcttcagattcgatttccttttccttttc Protospacer ... *.********. ************** *
32. spacer 1.10|180596|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_019509 (Cronobacter phage ESP2949-1, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
ctaacctgattgctcaacaaataatgctattggc CRISPR spacer tacggttgattgcttaacaaaaaatgctatgatg Protospacer . . .********.****** ******** .
33. spacer 1.10|180596|34|LR134332|CRISPRCasFinder,CRT matches to MH845412 (Cronobacter phage CS01, complete genome) position: , mismatch: 12, identity: 0.647
ctaacctgattgctcaacaaataatgctattggc CRISPR spacer tacggttgattgcttaacaaaaaatgctatgatg Protospacer . . .********.****** ******** .
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
183314 : 215063
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134332|183314:215063|DBSCAN-SWA TGTGATTGATGATTCAAAAGCCAAACCGCAAGTCAAATTAGTACGCGGTCAACTTCAAATTATTGCATCAAGGAATATAGAACATAGACGGCAGCTGTTGTCAGATTGGTATAAGCAGAAAGCTTTTGAAGTTTTTAGCAAAAGGTTAGATCAACTTCTATCAACAGCCCCTTGGATAAAAGAATGTCCTTCGATAAATTTAAGAGCGATGCGTTCCCGGTGGGGTAGCTGTGCGGTTAATGGGAAAATAACACTTAATACTCACCTTATTAAAGCACCGATAGCATGTATTGATTACGTGATACTCCACGAGCTATGTCACCATTTTGAACATAATCACAGCGATAAGTTTTATCGTCTATTAAATCAGGTTAGCCCCAACTGGAAGCAGGTAAAACAATATCTCGATAAAGCGGCCAATTTATATCTTATGACTTAACTTTGGGAGACTTATAACATCTAAGATTCTGAACTAAAACACCGATAATCTTAACGTTAATATCATCACTTACCTTAATATTTGGCCAATTATCATTTAGTGTTAACAGTTCAAATTCTGAAGAAGTATAAGATAATTTTTTATACTGACATATGATCGTTTCTGGCTTACCATTGATTTTAACTGCTACAAAATCACCCGGTTCTGGCAAAACAGAAGGCTCAATCACCAAGACATCGTTGATTCTAATTTCAGGCATCATACTGTCATCTGTTATTTTCAAGGCAAATGCATCCGTGCTTAATTCTGGTTGTAAAGACGTACTCACAGAAATAAAAACCTTATCGCCAGATGACTCCGCACCAGTATGCAATGAAGCCTCACAAGCCTGCCGATAATCCAAAAGCGGTATTAACTGACTAGGATTTTTCGCTTCCTTGAACTGCAGCTCATCCGACAAACACATCAAATAAGCAGGCGAAACATCCAGTGCCCTTGCCAGCGATTTTATCTCTTCAGGCCCCGGAGTACGAACACCCTGTTCCCAATTTGTTAGGCGCGTTTGTTTCAACCCCCCAGCAAGCTCGCCAAGAGCCTTTAAAGTCAAACCTTTTGCCTTCCGTGCCTCAAGAATACGTTTGCCAATTTCCTTTTTGATATTCAGTTCAGTCAAATTTACCCCTAAAAATGAGAGTTAACTATTGCAATATCACTCTTGGTGATATAAATTAGTTATAAATTCACATATTGTGAATAATAATCTTTTATTTTTATAAAGATATCACATTATGGAAATAAAAACGAGGATGAATAGGGATATTACCCATGATGGATTTTGTGATTAATGGTGATGAGTTAGAGGCAATGAGTGGGTTACCCCATTTCCAGCAACTAACTTATTTAAGAGGGATACGACCTTATATGGACGTTAAAACCGGAATAGTCGGCATCAAAAGGCGCATCAGTCATCAGTCTATTTCTGAGCAGCTTTATGTTGAACCGCATCAAGGCATAAAAAGCCAGAATTTTTCGCGTGATCAGGTTCGGCGTTCGGTTTCAGGATTGGTTCGTGCTGGCTTAATCGAAGTGCAATCCGAAGGGATGCATCTGATTTTAAAATGTCTTTTGGCTTCATCGCATTATTCTGCCCAAAATAAAGCCGCCATAAACCCGCCACAGAAAGCCACCATAAAGCCGCGCGGGGAATCCCTTGAAAATACTGGGCTAACCGAGTTTGAGGCACTAAAAGCCGACACAGTAGAATCCCAAAAAGCCGCCATACCTCATAAAGATAATTATTATATTTATTTATTATCGCAATTCGAAAAATTTTGGTCGCTTTATCCCGAGAAAAAATCAAAGAACAACGCACAAGCCGTATTTGAAGAGCTAAAGCCTAATGCTGAACTGTGCCATACCATCATCAACGCACTGACAGCCCAAATTAATTATCGTGACACCATGAAACTACAAGGCACTTGGGTGCCACCTTGGAAATACCCAGCAAATTGGCTTGCTCAACGCTGCTGGGAGGATGAATTACCTACGGATGCATTACAGGAGAAGAACCATGCAGAGCATACAAAAAATACTCGTAAACGTCACGCCACAGAAGACCTGTTCTGCCCACCCTGTGATGTCAAAGACCGAGAGCACAACAATGTCATCCAGCTCCAAAGATACCTTCAAAGCTGAGAGACGTATTGATTTGCTGTTCTCCAAATTTGCTGCCTTTTATGGCCATGTTTGGAGAAGTCAGTTTAAGGATGAAGTGTTTTTGAAATTTGCCAAAAAAGAATGGCAAGAAGCATTGGCTGATTTTACTGATATGGTACTGACCAGGGCAATTTTGAATTGCCGTGAGTTTTATGAATTACCGCCTACGCTGCCGCAATTGTTGTATTGCTGCAGACAAATCAGGAAACAAGAGTCATTTTATGTGGTCAAGGATGTGTATCAACCTGCAAACAAAGCCGTTGTGAGTTCCTGTTTGCAGAAGTGCAAGGAACTTTTAGCAAAATAACTGGAGAACATCATGTTGGTTTTAACACGAAAAGCAGGGCAACAGATTTTAATAGGCAAGGGCTTGATTCAAATGAAGGTATTGAAAGTAGAAAACGACATCATCAGCATTGGGATAAAGGCCCCATCGCACATCGATATCGACAGAGAGGAAATTTATTTTCGTAAACTGCGACAAGAACAAGAAGCAGCCAACGATGCGGAGATGGCGATATGAAAACGGACAAACAACTGAGCAAAAGAGCCTTTCAAAAAATCAGAACCTTGTATTGGGGAACTGTTTGTTTGTGCGCGCCTTCCGTCTCTTCTGCGCAAAACATTGAAAGCATCATTAACCGAACCATCAATTACTTGCAAGGAGGCCTTGCACGAACCGTTGGCGTTTTTTGCATCATCATTGCAGGTTACCTGTGTTTGGCACGTCAAAAATTTCCTAAAGAATATTTTGTGATGATTCTGGTAGGAATGGGGATCATTTTTGGCGGCTCTTCCCTGTATTCAACACTCATTGGATAGGAGATTCTTGTGAGCGATTTGGAAATAAGCCCCATATTCAATGCGCTGACCCGTCCGGCAATGACGGCTGGTGTGACCTTTGAATACCATATGTTAAACCTCATTGTCTCAATGTGCGCCTTTATTGGATTCTCCCCACTGTACGGGATAATTTTTATTCCACTGCATGTTTTTGGATGGCTAGTGTGTCGATACGACACCCACTTTTTTACCATCTGCGCAAAGCGTTTCTTATTGCCACAAGCTCCCAATACGTCATTATGGAGGGTTCGCGCTTATGAACCTTTCTAAGACATTAAAGCACGTTTATCAGGAAGCAAAAGTGTCTAATTTGTTTCCTGTAACGCATCTTAATAGCCCCTGCATCTTTGAGTCGCAATCAGGCTTGGTTGGGTCGGTGATTAAGGTGAATGGTGCGGCTTTTGAAATCGAAGAAGCTGAGACTCTAAATCACCAACGCTTCTTGCTCCATCAGGCATTAGTGAGTTTGGATTCGCGTTTCATTATTTATGTGACCACGCACCGACAAAAAATATCATGCCCTTTGATTGGGGAATTTAAGCCAGGATTTGCCAAGGATCTGGATGAGCGTTATCAACAACGATTTAAAGATAAAAACCTGTATAAAAATACCCTGTACATTACTGTTGTACTTAAAGGGGATGACACCAGTAAAACAGGATCTTGGTTGCAGTGGGCAAAAAGCCTCTCGATGAAGGGAAACAGTGAGCTTGCTGAACACCATAGAGAACAAAACATCCAAATCCTAAATCGTGCTGTTGAGCAATTGCATACGAACCTCAACTCTTTTGGGGCATCGATACTCGGCATGCAGGATGAGGAATTAGGTTTTAGCGAGCTGCTTCAATTCCTTGGGTTGGTTGTCAATGCAGGCCAAACAGCGTCATTCAAACATCCTGTGTACAGCCCACCAATAGCGAACTCGATCCCTCAGACCTTCAAACAAGAGGCCAAATACCCCGAAGGACACCTCGGCCAATATTTAAGTAGCTGTCAGCTTTTATTTGGAGAGTGCATCCAGTTTCAGGGAAATACTCAACAGGATTGTCTATTTGGTGCGATGCTGTCACTCAAAAAATACCCCACCAACACCGCCAGTATCCTCTTGGACTCCATGTTATCGCTGGATTGTGAATTTATTGCCACCCACACTTTTGCCCCCATTGGCCGTGACAGTGCCTTGGATACGATTTCTAAAAAACGCTCCAAACTTTTAAATGCCGAGGACAAGGCATTAAGCCAAACCACTGCACTAACCGATTTGGAAGATGGAATTGCCAGTGAAACCCTGTTGCTAGGTGCACATCATCACACCGTGATGTTATTGGCACCAAACAAGTCGTTATTGGATGCAGCCATACTGGAAGCCACCAAACGGTATGGAGCTACTGGAGTTGTTGTGGTGAAAGAAACACTAGGACAAGAGCCCGCTTTCTGGAGCCAATTGCCGTGCAACCAGCATTTTATAACGCGAGCCTCCCTGATTACCTCTCAAAATTTTGTGGACTTTTGCCCATTACACAACACTCAAACGAGCTTTTCCAATGAGAACTTTTTAGGTGGCGCGGTTACCTTACTTGAAACCCCATCGAAAACACCAGTCTATTTCAACTACCATGCACGAGGCTCTAAAACCAACCCCTCCAAAGGACACGCCGCCATTTTCGGAGGAAATAACGCAGGAAAAACCACACTGGTAAACTTTCTTGATGCACAAATGGGGCGTTTTGGTGGAAGAAGTTTTTTCATTGACCGGGATGAGTCCTCCAAAATTTATATTTTGGCTTCCGGTAACAGCTCTTACATCAAAATAGAGCCATCCAATCCAATCGCCATGAATCCCTTGCAACTGCCGGATACCTCAGAAAATCGTTCATTTCTGAAGTCATGGTTTGCAACCTTGGTACAAGAAGATAGCGAACGTGCTATCCCAAGTCCTATTGCTGAAATCATCAATGACTGTATCGATTACAGCTTTGAACAACTCGCCCCTGAATTCAGG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MEAIKACFSPGATGLLSPLQDFLEDEHVSEILLNKPQEVFIEQHGQLTRFDIPVLTSQYLRRLFLLIANENKQTLSESTPVLSGNLADGSRVQLVMPPASLHETLSIRKFTLKQVSFEDYKAKGFFSSARGVGVKEYSECIGKTDGLLELYDAKSWQEFIRQAILQKKNIIISGGTSSGKTTFLNSCVGQIPLHERLITLEDTYEMDVPHSNIVRLKALKQIGDHAQKITMQDLVQATLRLRPDRIIMGEIRGRELFDFVSACSTGHSGALATIHANNPKVAFMRMAQLYKLNQVAGMDETDIYKVLHEVIDVIVQLQKTTDGRRLVEVYYKHA >LR134332|183314:215063|204200_205628_-|VEF60440.1|DBSCAN-SWA MNNSIGKSKTPLQYKVFHTLLGFAVFFSLITVPAEAQVIQIHGILTSSELLWWPVVFFVLRLIHGVYGFAYLRHAVYAVLLFHAIYVLFLKFAIWLPASSFWKMQEPYTQVLGRDFVYLIKSSLFLWVCALLPIRFASSANHKYYGYIFWVSLVAFCFLDMGWLNMHKNTPDTQIVVPLLIFGLLNIFYNWLSVVIARIEHIESPIQSDRHLLKFQLPQVLKNDGNTFKYHHMLFCSSIVFFIASKTMAAKFISIGFLTINVGGIVFSLAYLAADMMTDVYGIERTKQMVLFVIFCNLLFVFDVWVTNMLAIGENEPYRAILHNQARMFIASATAFFLGMTINSTVISLIKSRQRKRGISLKKEFITTVWTRIATSSAFGIIIDVSLFSLVAFYGIVPTEKLASVIVFEDAYKISYEVFLAPVSILMIYFLKVKEKVDIYDELSNLNPFRIDTNYKVSANKFAENYMKPAERNDG |
38 | Aeromonas_phage(16.67%) | protease,transposase,integrase | attL 172638:172669|attR 210528:210559 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
546266 : 584692
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134332|546266:584692|DBSCAN-SWA AATGCACCCAAATTATTATTTGTCACCTTTAGCTGTAGCTATAGCATTAGGGATTGCTTCACCTGTGAAGGCAGCCGACCCGATCCCTTTACAAAAGTCATCTTTTTCTGAAGTCACACAAAAATTTCAATTGACTTTGCCTGGTGTTATGAAAGGTGCTGTAGTTTCAACGAATAGTTTGCAGTTTATAAGACAGCATACTGATGGGAATAAAGTGACGCATGTTCGTATGCAGCAACAATATGCCGGGTTTCCAGTTTTTGGTGGTTACGCTATTCTGCACAGTAAGAATGCCACTCCTAGTTTAGCGACGGCAAAATCTGATGTGAAAATGAATGGTGTGATTTATGATGGGTTGCAAGCAGAATTAGGCCAGCCTAAACCTTCATTTGTGAAAAATGCTTCTTTGGCATTACAACAATTTAAGGATAAATACGCGAATAAACAAATTAGTGAAGATCAAGTAACCCCAATGATTTATATTGATGAAAAACATCAAGCTCATTGGGCTTACAAAGTCAGCGTTTTAGTTATCCATGACGATAGAATTCCTGAGCGACCAACAGCAATTATTGATGCAGAAACCAATAAGCCTTTTGTTCAATGGGATGATGTAAAAACGGAAAAAGTTCAAGCAAAAGGGATGGGCTTTGGTGGAAATCGTAAAATTGGTGAATATCAATTTGGCAAGGACTTGCCATTATTAGAAATCACACGTGATTCAAGTGTTGAAATGTGCTTTATGGAAAATACCGATGTTAAAGTAGTCGACATGGGACATAAGTACTATTCAAATAACAAACCTATGCAATTTACTTGTAAAGAGACTCCCGACACTCAATCGACTAAAACTTATTATACCGGATATTCGGCTGATGGTTATGATAGAGATAATGGAGCCGCTTCTCCTACCAATGACGCATTGTATGCAGGTTATGTCATTAAACACATGTACCATGATTGGTATGGGGTGGAGGCATTGACTAAATCAGATGGATCGCCAATGCAATTAGTTATGAGAGTGCATTATGGTCAAGGCTATGAAAACGCCTACTGGGACGGCAAACAAATGACCTTTGGTGATGGTGACACCATGATGTATCCTTTGGTTTCTCTAGGTGTAGGTGGCCATGAAATCAGTCACGGGTTCACCGAACAACATTCTGGACTTGAATATTTCGGTCAGTCTGGTGGCATGAATGAGTCGTTTTCAGATATGGCTGCCCAAGCTGCTGAATATTATTCGGTTGGAAAAAACAGCTGGCAAATCGGCCCGGAAATAATGAAAGAAGACAGTGGTTATGACGCATTGCGTTACATGGATAAACCAAGCCGTGATGGTATGTCTATTGATGTAGCTGATGATTATTATGGTGGGTTAGATGTTCATTACTCCAGTGGAGTGTATAACCATTTATTCTACATATTAGCCAATCAACCTAATTGGAATCTTCGAATGGCTTTTGATGTCATGGTGAAAGCCAATATGGATTATTGGACACCTTATTCAACATTTGATGAGGGTGGTTGCGGTATGTTGAGTGCTGCCAAAGACCTGGGTTACAATCTGGATGATGTTAAGAAGTCATTGAGTGAAGTGACTATAAATTATCAATCTTGTTATGTCGATTAATTCATTTTATTGATTGATAAAATTTAGCCAGAAGTCGACTGATGACTTCTGGCTTTTCCATATGAATATGGTGTCCACCATCTAACCTCTCAATTTTAATATTTTTTACTGCTTGAATCCTTGCTTTCATCTTATCCGAATCAAATGAAAATCCTTTGCTGGCCCAAATAAGGTAAGTTTGAGCTTTTATTTCTGTAAGGCAGGAAAGAACTTGTGCTTCAGTCATTTGTAATGGAGATGGGGCTAATAGCCTGCGATCGTGTCTCCAATAATATAGACCATTTTCTTGTTGAATTCCGCGTTCGCAAAGTGACTTGGCAATATCCAGAGAAACATATCCTTTAACGGATCGGGCAAGAGCAGCATGTTCAAACTTATTGTAGCCTTTTGCCTTTTTTGATTGTTTTTGTGATAGATAGTCCAGGTATTTTGACAGTTGCTGGCATGCTGTTTCTGCCGGGTGAGAAAAAGGGCCTAAACCTTCGATTAAGCTTAATGAAAGAAAACGATCCGGCGCAACCCCAGCTACAAGACTTCCCAAGCAGGCTCCCATAGAGTGCCCTAGCAAGTGAAGCTTATTTAGTCCCAAGGCATTAATAATTTCAACAACAGTAAATATTCCATCAGTAAAATGATATATACATCCTGGGGGTAAGTGTGAAGAATGACCATGTCCAGGTAGATCTACGGCTATAAAATAGTAATCATTCTGTAAATGTTCAGCAATATTATCAAAACTATTAGCATTATCTAACCAACCGTGCAAGGCAAGAATAGGCGGATTATCAGGATTTCCCCATACTTTGCATGCTATAGATAGTCCCGGGATACTTAAAATCTTTGTTTTCATCAATTTTCTTTGGTTTGTAGGTAATAGTTATAGCTTATTACTTTATACGCAGGGATGTAAATTCAGTTTTTAAAATAGTCAGGACTTGCGAAAAAAATAATCTCTTCGCTAAAAAATGCTTTTAATCCAGTCATTTAGTTTATTTAATCTTCCTCATCAAAATCAATTTTTGCCTTGGTCTTGGTTTTTTTCGCAAGTCTTGATAGTAATTGAAATAGACAAAAAGCAATAAAGTAAGTCGATTATTGGGTTGACTTGTAACAAACTATAAAAGATCACAAAATAAATGGCTTTACTGGTTTTTGGGGAAGGGCCAATATTATGATAAATAAAAATAATTCAGAGTCCGAGTTAATCATGTTTAATGACAAATTCTTTTCAAAATGTGGGTTATAATTATAGAGCAATACATTAATCCTATTACCATTATACTGATTATAGAAACCTAAATGAGAGATAGAGTATCTATGCAACCTGAGGTGCGCAGCGTATCGCTGATAACATATAATATTCATAAAGGTTTTGGGGTAGGTGCAGTAAGGTTTTTGCTTCCAGAAATGCGAGATGCTATCGCTGGATTAAATCCGGACTTTGTTTTTTTACAAGAAGTGCAAGGTAAACATAGAAAACGCGAAAAAAGAATTGTCAGTTGGCCTGATTCCCCTCAATGTGAGTACATTGCTGAGAATATATGGCCACATTACGTTTATGCAAAGAATGCAGTATATCAATCTGGCCACCACGGAAATGCTATTTTAAGCAAATACCCGTTCGAGAGTTTTGAAAGTATTAATCTTTCAAACATGAACAGAGCATCAAGAGGTATACTTCATACCCAATTAAAATTGGATAATAATATTATTCATCTTTTGTGTGTTCATTTAGGCCTATTCAAGGCAGAGCGTACTGAGCAATGTAAGGCATTGATACAGCGTATTAAAGATGTTGTGCCTAAAAATGAGCCTTTGATAATGGCAGGAGATTTTAATGATTGGCGTCATGTTATTTCTAAAATCCTTGCTGAAAACTTAGGGATTGAAGAAGCTTTTGTCGCGCTTGAAGGACAACATGCCCGTTCATTTCCTGCAATAAAACCTGCTTTGTGTGTCGACAGGGTGTATTTTCGCGGGATGAAAGTTCAAGAGGTTGCTTGTTTACAGGGCAAACCTTGGCGGATGTTATCTGATCATTTACCCTTGTATGCACGTTTTGAATTATTATGACAGGGTTACCTCCAGTCTCTTTGTTGAAAAAGATTTTTAATGCGGTCATTTGGTTTATTCCAACTCCCTCATTTAAAATTTTTTGCCTTGACCATGGGGTTTTTAGCAAGCCTTGTATGATTAAAATTAAAGCGACAGCCTTCCTGGTCGAGAGAAGGTTCTGTCGCTATTGCAACTTTACTCCATGTCGTTTTGGTATTCACCCAAACAAGCCATACTGTTTAAGCGGGCTCTCTTAATTAAAGCCTCTTGCGCTTTGGCAATATTTGCTTTGTTTCCACACCATTCCTTTAAGCAATCCTCTTGTAATGCTCTTCCAAATGAAAAACTTAATAACCAGGGTTGGTGGCCAATTTGATTGATTGCATTCAAGTTAGCGGTAGCCTGTTGGGGTGTTTGGCCACCGGAGAGGAAATTAATGGTGGGTACTGACGCTGGAACATTATTACGAAATACACTAATGGTGTAGTCAGCCACTTCTTCAGGATCGCTAAACGGGGCCACTTCTTTACCACAGGTAACCATACTCGGTTTAAGTATAATATGCTCCAACTCCACTTGATGGATAAACAAGGTATGAAACAGCTCATGGAGAACCATTTCACAGACTTCTGCACAATGTTCTATGCTATGGTTGCCATCCATTAATACTTCAGGCTCAACAATTGGGACGATGCCGACTGATTGACAAGCAGCAGCGTAACGGCCCAAATTTTCAGCTCCTGTTTTGATTGCAGTTAGGCTGGGAGTGTATTCGGAAATTGAATAAACGTTTCTCCATTTTGCGAATTTTGCACCTAATTTTTTAAAATGAAGTAGACGCTCAGTTAAACCATCTAATCCCTGGGTAACTTTTTCATGTTCTGTATTGGCTAAATCAACAAGCCCTTTGTCTACTTTAATTCCAGGAATAATGCCTTTATTAGCAAAAAGCTCAGGAATTGGTGTTCCATGCTCATCAGTTTGAGTAAAAGTTTCCTCAAATAAAATGACGCCGTTGATATACTGTTCTAAATCAGGAGTGGTCGCTAGTAACAAGCGATAATCTCTTCGATTTTCCTCGGTATTTTCTGTATTGATTGACGCAAAGCGTTTGCCAATTGTACTGTTGCTTTCATCTGCAGCTAAAATACCTTTTCCTTCATGCAGCATTTGCTCCATGGTATTTGATAATTCTTCATAACTCATAGCGTCTTTATCTCCTCATTATCGGGTGTCGACCTTTCGAAGTGGTTTGGCACCTATTAAATTTAAATAACGATTAGTCATCTTTTGTCAAATCCGGGTTATTTAC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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134332|546266:584692|558067_559192_+|VEF61489.1|DBSCAN-SWA MIKHAILVSGLIVSFLASAAEMSFLAQLTEVPGASGHEKNVRHLVQKQWQPYMEELKIDGMGNLIGQRRDNQKGPKLLFMAHLDETGFMVESITPDGFLKVIPLGGIANSVIYAQRWTVSTPKGSVLAYSGMDSPHLLGDKKMLGSPDINALFLDIGAENKEQAQKEFAIQPGLEVTPVSEFSQLSKNRFLGKALDDRLGLAVISDALRAVKQQPNQLYLAATVQEEVGMRGASTVYKATHPDIAINVEVGIADDYPMLLADRKGRIGLGKGPSLFVYDKSMIPNQELINWIMELANKNNIPLQLEVEPGYGEDGSKVQASGMGVPVVNIGIPIRYAHQHAGIFDKRDYDNTVKLLSLIAESLNQEVVDKIKKS >LR134332|546266:584692|553326_554064_+|VEF61470.1|DBSCAN-SWA MNKENHSGIYLLPNLLTTVSLFAAFYSIVASTKGQYEAAIVAMFIGMIADSLDGRIARLTNTQTEFGAQYDSLSDMVTFGVAPSLLLYNLTLHQLGKFGWLVAFIYTAAVALRLARFNTQIGKSDKRYFQGLPCPPAAAVMASFAWICFQNEWENLIVSLFTAVLALIVSVLMVSNLRYYSFKEVDYKGKVPFLYVLVMILLFVAIAANPAIVLFASSGIYALSGPMLTVISLHKMRKQRRNMSK >LR134332|546266:584692|579788_580085_-|VEF61550.1|DBSCAN-SWA MSRDTKNLILKAIILFVSLTALVNHAMAMNLLGIGPNPKNLPKDNDVRATFNHCKSCDKSTTPPLIITTPVPIIYYPGCRPIQSCDAYGHCEQKEDCY 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41 | Prochlorococcus_phage(14.29%) | protease,tRNA,holin,transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
959499 : 966339
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134332|959499:966339|DBSCAN-SWA TTTAGTCAGTCATTAGTTTCTGTAATGCTTTCCCGATGTTATCTGCCCTCATTAAACTCTCTCCAATCAAAAAGGCATTAATGCCATGGGATTGCATTAATTTTATGTCTTCACGGGTGTTGATTCCGCTTTCAGTAATAATAATTTTATCTTTAGGAACAAATTGTTTTAATTGGATACTCAGTTGAATGTCTGTTTTAAAGTTGTGTAGGCTGCGGTTATTAATGCCTATAAGGGGGGTGGGTAAGCGTAATGCTCTTTCTAATTCATCTTGCGTGTGGCTTTCAACCAAAACAGACATTTTAAGTTCTTGAGCCAGTTGGCAAAAATCCATTAATTGAACATCATCTAATAATGCGACAATCAGTAAAATGCAATCAGCACCCAAGACAAGGCTTTCATAGATTTGATAAGAATCAATAATAAAGTCTTTACGCAATACGGGCAAAGTGGTTTTTGATTTTGCTAAAGCCAAATAATCAGGATGACCTTGAAAAAACTCAATATCCGTTAAAACGGATAAGCATCTTGCGCCATTTTGGGTATAAATCTTGGCAATTTCTGCAACATTAAAATCTTTTCGAATTAAACCTTTGCTTGGAGAAGCCTTTTTTATCTCAGCTATGACTGCAGGTGAGGTATTGGATTTTAAAGCAGTTATGAAGTCACGCATTTCCCCCGGCTGTTGTTTTGACAGAACATGTAAAGGCTTATTTTTTTTCGCAACTGCAACTTCTTCTAGTTTATGTTTTGCTATTCGTTCCAGGATACTATTCATGATTTGATTCTTTATTTAAAGTTTGGGTCAATAATCGGAGTTTGTTAAAACAAAGATTTGCCTTACCACTATCAATGGCAATTCTTGCTTCCTCTATGGCCGCATCAAACGATATGCCATCTTTGGCACAATAAATGGCTGCGGCAGAATTGAGAAGGACTATATCTCGAGCTGGGCCAGAATCACCTGAAAGTACGGATTGAATCAAATGCAGGCTTTGCTCTGGTGAGTCGACTATGATTGCATCTAAAGAAGAATGCTTTAGACCATAATCTTCAGGAGAAATGAACCATTGCTTAAAATTTCCATCTCGGTATTCAACTACTTCACTTTTCGCTGCAATACTAATCTCATCCAGTCCATCTTGAGAGCTTATTACTAATGATCTTTCACTACCTAAGTTAGCCAGAACAGTGGCTATTGTTTTGAGCCAATTCGTTGAAAACACACCAACTACTTGTCGTTTTACCTGAGCCGGGTTAATCAGTGGACCAAGTAAATTAAATAAAGTTCTTATTCCTAATTGTTGCCTTGCAGCTCTCGCGTGTTGCATGGCGGGATGATAATGTGGCGCAAACAAGAAAGCCAATTGACACTGGTTGATGCAGTTTTGTACCTGTGAGTCAGAAAGATTGAGTATAAATCCGGCTTGTTCTAATAGATCAGCGCTACCGCTACGACTCGAAACAGAACGGTTACCATGCTTTGCAACTTTTATTCCTGCTGCAGCTACAACAAAACTACAGGCTGTCGATACGTTAAAAGTATTTCTTCCATCACCGCCAGTGCCAACTATATCTATCAGGGGATTTCCCAAATCTATTTTGTGGGCTAATTGTCTCATGACTTGAGCCGCTGCAGTAAGTTCATTGACTGTTTCACCTTTCATGCGCATTAATGCCAGAAAGGTTGCAATTTGCACATCACTAAATTCACCTGTCATACAAGCATGGATGACCTCTTGCATCTGGTCTGAGCTTAAATCCTGTCGGGATAGAAGTTGTTCAAATAGAAGTTTGGGTTTCATAGCGTAAAAAATTCTCGAGTATTTGCAAGCCAAATTGACTTAATATGGCTTCAGGATGAAATTGTAGACCAAAAAGAGGAAATTGACGATGTGATATTGCCATTATTGTATCGTCTGCCCACGCATCTATCGAAAAGCAATTGGGCAAGCTCATGATATCCACGGCTAAAGAATGATATCTCGTCGCTTGAAAGTGATTTGGTATTCCTGTGAATAAGCCTTGGTAATGATGGGTGATTTCTGAGGTTTTACCATGCATGATTTCTGGTGCCGGGATGATTTTGCCTCCAAATGCCTGAGCTATGCACTGATGGCCAAGGCAAATACCCAATATCGGAATATGCTTGTGAAACTCTTTAATGACTTCTATAGAGATTCCTGATTCATCAGGAGAGTTGGGTCCCGGTGAAATGACCAGGTATTGCGGAGCTGATTGCCTGATAGTATCGATTTGAATTTCGTCATTTTTAAAAACTTCAACTTTTTGATTTAAGCTCTGGAAGTACTGTACCAGGTTGTATGTAAATGAATCGTAGTTATCAATAATTAGTAACATAAGTATAATTAAAATGTATTCTTTTAAATGAGGCTACAAAGCAAATTCTTCACCCAAATAAACTTGCCTTACTTGTTGATTGGCAAGTATCGCTTTGGGAGTTCCTTCGCAAAGAATTTTTCCCTGACTTACAATATAAGCGCGTTCGCAAATGTCTAAAGTCTCTCTCACGTTATGATCTGTAATTAAAACCCCTATACCTTTATCACATAAATGCAGGATAATTTTTTTGATATCGATTACAGAAATTGGATCAACCCCGGCAAAAGGCTCATCAAGCAAGATAAAGGATGGTTCTATTGCCAGGGCTCTTGCAATCTCAACGCGTCTTCTTTCGCCGCCCGATAAGGCCATGCCCAAGCTGTTTTCTATGTGAGAAATATGAAACTCTTGTAAGAGAAGATCCAGCTTTTCTTCACGTTTTTGATCATCTAAATCTTTTCTTAGTTCCAGAATCGCCATGATATTTTCAGCGACAGTAAGCTTTCTAAAAACGGAGGCTTCTTGCGGAAGGTAACTAATACCATGCCTTGCTCTTAGGTGCATTGCGTCTTGAGTTATGTCTGTTCCGTTAAGAATAATATGGCCTTCATCACAGGATTGCAGACCTACAATCATATAAAAACAAGTGGTTTTACCCGCCCCGTTAGGACCCAATAAACCGACACATTCACCTTGCTTAATGTGAATGCTAACACCATTCACAACCGTCCGGCCCTTAAATGATTTTTTTAATTGTTTAGCCTCTAGTAAACTCATGATTTCTTTTCAGGATAAATAATGATTGTCGTTCTTGTTTTTTCGTCACTATGTGATAAAACATGTTGTTCCTGAGTATCATAACTAATTTTTGCCGCTGAAAGAGAGTTGGGTCCTTGCTCTATGCGAGCATTCCCAATTAATTCGATTAAATGTTTTAGCGGATAATATTTTATAGTGTCAGCATAGGCATGGAATGGGGGTTTATCAGGGGCTGTTGTAGTCCAATAATGAGCTTGCTTGTCTTTAGAGCCTTCGGCAACGGCTAAAGTGAGTTGATTTTTGGCATCTCCTTGCGTAATGGCTTTTTCTGCACGCAAATTGGTTGACCCTTGAACAAACTCAACATTTCCTATATAGACTCCCTGATGATTTTTCTGATTTAAATCGGCTGAATCAGAAACTACTTGCACCATTTTTTCCTTATCAAACGGAAGAGCATTTCCTGAAATGGAGCACAACATCAACAATAGTAGTATAATGTATTTAACCTTTAGCTGGGTCATAGCTACCTCTGGCTTTATGGAGTAATTCTACTCTTTTTTCATCCAAATAGGCATTCATTCCAGTAGACTGTATGATATTGCCTGGTTGTTCAAAGGTTACAAAAAGACTTGTTGTTGCTTTTTTTTCCTTGGGATAATAAGTAATCTCTTCAGTTTTTAAAGTGCTTTCCCTGGTGCTTTCTCCCGGATTTTGATGAACTACTACTTGCTCTATAAAAGTAATTTGTTTACCACCATCAAACGATTTTGCTCGTAATGAATTGATTTCCCACGCGGGTTGATTGTCTTGCTTAATAATAATATGGGGGTTTTTAAGCAAATGGAGATTGTTGTTAGGAATATATTCTACCTGTGGAGTGGTTAATAAGTTAATTAACACACCTTCTGAATTAAATTGCTTTACGGTAAGCTGCGAAATCGTTGTGTCAACTTCATTTGACAACGATTTCTTATTGATAATAGCCTGATTAAAATGAGCATAATACCAACCAGATCCTGCTAAAATAAGCAAGGTCAAGAATAGCCAAATTGCTTGTTTGGTAATATTCATTGTTTTAAATAGCCTGTGATTGCCAATTCTGCTTTATTTTGTGCGTTAAGAATTAAGTCACATAATTCACGAACTGCGCCTCTACCACCAGTCCGCTCTGTTCTCCAATCAGCAAATTCCAGAACTTGTGGCACAGCATTACTGACTGCAACTCCTAATCCCACTTGTTGTATCAAGGGTAAATCTGGCAAATCATCGCCAATATAGGCAAACTCATCATCATTGAGTCCCAATGTTTTTTTTAGATGTTGGTAAGCGCTACGTTTATCAACTTGACCTTTATAGTAATGAGTTATCCCTAATTGTTCCATTCGATGGTCAACTACAGCATTTTGTGCTGTGGTAATGATTGCAACTTGTATCCCGGCGGCCATTAATAATTTTAATCCCATTCCATCTTGTACATGGAATGATTTCAGTTCATTGCCGTGATTATCAATGTGAAGTAAGCCATCACTGAGCACCCCGTCCACATCACAAATAAGACATTTAATTTTTTTCGCTTTTTCCAATAGTTCGTTCATTTCTATCTCTGTATTAAAAAACACCTGCTTTTAGCAAGTCATGTAAATGGAGTACCGCATAAGGTCTATTATCATTTTCAACTACTACCAAGGATGTGATGCTATATTTTTGCATGATTGCTAAAGCTTCAGCAGCCAACATGCCTTTAGAAATAGTTCTGCAGTTTTTAGTCATGACATCCTTGATTAGAGTAGTGTTGATATTAAATTGACGTGTCAATGTTCGCCGGATATCTCCATCAGTATATACACCCACTAAATAGCCATGGTTGTCTACAACACAAGTCATTCCCAGCTTTTTATTCGTGACTTCAATTAAAGCGTCACTCACTGTTGCGTTTTCATTCGCTAAGGGAAGTTGCTCTCCTGTATGACATAAATCGTCTATTTTTAGCAACAATTTTTTGCCAAGTGCGCCTCCAGGATGGGAAAGAGCGAAGTCCTCTGCACTAAATCCCCGTGCTTGTAAAAGAGATATAGCCAATGCATCCCCCATAACCAGCGATACCGTAGTACTGGTTGTTGGAGCAAGACCCAGAGGGCAAGCTTCTTGTTTAATACTGACATCCAGGTTGACATCGGCAGATTTAGCCAGAGTTGATTGTTTATTGCCGGTCAATGTAATTAAGGGGACTTCAAGCCTTTTTAATAATGGAAGCAAAGTAACTATTTCATGGGTATTGCCCGAATTGGAAATGGCAACAACTATATCCTGGCGAGTTATCATACCCAAGTCTCCATGACTTGCTTCTCCAGGATGCATAAAAAAAGCGGGGCTGCCAGTGCTGGAAAAAGTAGAGGCCAGTTTATTAGCTATATGGCCAGATTTTCCCATGCCTGTGACGACGATACGTCCTTTGCATGATAAGAGTAATTCACAAGCTTTTTCAAAATGTTCATCAATTCGTTGAGTTAGCTCAAATACAGCTTGTGCTTCAGTTTCAATAACTGCTAGTCCAAGTGTGCAAAAGTTCATAGGTCATTGAGTCGTAATTTTGTTTGGTTTTCATTCTAACATAATGTATTTAAATGATGTACCCTATATTTCAGTAACTGATACCAACTAATGGCTTATAACATTATTATTTATTAAAATAACACTCAAGTTGAACTTAAATAATAAAAAACGTCTTTTATTTAATTTTTATGATTAATTTTTGAAAAAATTGGTATTGTAAAAAAACTTTTAAAAAGTTTTTTTTTAATGGAAACGCAATTATTAAACACATTTTTATTTATCCAGTATATACTTCTTAATTAAAGATATAATAAAGCATTACCTGTCTTTGATAGATATCAAACTGACATCATTACCCGTTAAAATAATAAGTGGATAATAAAGCATGCCTGATAATTGGGTTGAAATAAAAAATCTATTCTTTAGCCTTGATGATCGCTGCATTTTTGATGGCATTGATATGGTGGTTAAGCAAGGCAAGATTACCGCTATTATGGGACCCAGTGGTTCTGGAAAGACTACTTTACTGCGGTTAATTGGTGCGCAATTGAGGCCTGATAGTGGCCAAATTTATGTTAATGGTCAGAATATTCATCAATTATCCCGCAAATCACTTTATGAAACCAGGCGAAACATGGGATTGCTTTTTCAAAGTAGTGCCTTATTTACACACCTTTCAGTATTTGAAAATGTTGCCTTTCCATTAAGAGAACATACTGAATTAAACGCGTCCATGATAAGAAACATTGTATTAATGAAGCTCGAAGCGGTTGGTTTGCGTGGAGCCGCCCATCTAATGCCCGCTCAATTATCAGGGGGAATGTGCAGGAGAGTTGCATTAGCCAGAACCATTGCTCTTGATCCTGTATTAATGATGTATGATGAGCCTTTTACCGGTCAAGATCCAATTTCCATGGGGGTATTGGTCAGATTAATACAACGATTGAATCAATTATTGCATACCACCACTATTATCGTATCTCATGATGTTGAAGAAACTTGTTCAATTGCAGATTATATCTACTTAATATCAGGGGGTAAAATTATAGGTCAAGGTACTCCGGATGAATTAAAGCGATCTATTGAGCCTCAGATAAGACAGTTTATGCATGGAGAAGCGGATGGGGTAGTGCCTTTCCATTATCCGGCAAAACCGTATACAGAGGAGTTATTAAATGCTTGA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134332|959499:966339|964211_965174_-|VEF62508.1|DBSCAN-SWA MNFCTLGLAVIETEAQAVFELTQRIDEHFEKACELLLSCKGRIVVTGMGKSGHIANKLASTFSSTGSPAFFMHPGEASHGDLGMITRQDIVVAISNSGNTHEIVTLLPLLKRLEVPLITLTGNKQSTLAKSADVNLDVSIKQEACPLGLAPTTSTTVSLVMGDALAISLLQARGFSAEDFALSHPGGALGKKLLLKIDDLCHTGEQLPLANENATVSDALIEVTNKKLGMTCVVDNHGYLVGVYTDGDIRRTLTRQFNINTTLIKDVMTKNCRTISKGMLAAEALAIMQKYSITSLVVVENDNRPYAVLHLHDLLKAGVF >LR134332|959499:966339|963104_963674_-|VEF62503.1|DBSCAN-SWA MNITKQAIWLFLTLLILAGSGWYYAHFNQAIINKKSLSNEVDTTISQLTVKQFNSEGVLINLLTTPQVEYIPNNNLHLLKNPHIIIKQDNQPAWEINSLRAKSFDGGKQITFIEQVVVHQNPGESTRESTLKTEEITYYPKEKKATTSLFVTFEQPGNIIQSTGMNAYLDEKRVELLHKARGSYDPAKG >LR134332|959499:966339|960268_961303_-|VEF62491.1|DBSCAN-SWA MKPKLLFEQLLSRQDLSSDQMQEVIHACMTGEFSDVQIATFLALMRMKGETVNELTAAAQVMRQLAHKIDLGNPLIDIVGTGGDGRNTFNVSTACSFVVAAAGIKVAKHGNRSVSSRSGSADLLEQAGFILNLSDSQVQNCINQCQLAFLFAPHYHPAMQHARAARQQLGIRTLFNLLGPLINPAQVKRQVVGVFSTNWLKTIATVLANLGSERSLVISSQDGLDEISIAAKSEVVEYRDGNFKQWFISPEDYGLKHSSLDAIIVDSPEQSLHLIQSVLSGDSGPARDIVLLNSAAAIYCAKDGISFDAAIEEARIAIDSGKANLCFNKLRLLTQTLNKESNHE >LR134332|959499:966339|959499_960276_-|VEF62488.1|DBSCAN-SWA MNSILERIAKHKLEEVAVAKKNKPLHVLSKQQPGEMRDFITALKSNTSPAVIAEIKKASPSKGLIRKDFNVAEIAKIYTQNGARCLSVLTDIEFFQGHPDYLALAKSKTTLPVLRKDFIIDSYQIYESLVLGADCILLIVALLDDVQLMDFCQLAQELKMSVLVESHTQDELERALRLPTPLIGINNRSLHNFKTDIQLSIQLKQFVPKDKIIITESGINTREDIKLMQSHGINAFLIGESLMRADNIGKALQKLMTD >LR134332|959499:966339|961892_962618_-|VEF62497.1|DBSCAN-SWA MSLLEAKQLKKSFKGRTVVNGVSIHIKQGECVGLLGPNGAGKTTCFYMIVGLQSCDEGHIILNGTDITQDAMHLRARHGISYLPQEASVFRKLTVAENIMAILELRKDLDDQKREEKLDLLLQEFHISHIENSLGMALSGGERRRVEIARALAIEPSFILLDEPFAGVDPISVIDIKKIILHLCDKGIGVLITDHNVRETLDICERAYIVSQGKILCEGTPKAILANQQVRQVYLGEEFAL >LR134332|959499:966339|963670_964198_-|VEF62505.1|DBSCAN-SWA MNELLEKAKKIKCLICDVDGVLSDGLLHIDNHGNELKSFHVQDGMGLKLLMAAGIQVAIITTAQNAVVDHRMEQLGITHYYKGQVDKRSAYQHLKKTLGLNDDEFAYIGDDLPDLPLIQQVGLGVAVSNAVPQVLEFADWRTERTGGRGAVRELCDLILNAQNKAELAITGYLKQ >LR134332|959499:966339|962614_963124_-|VEF62500.1|DBSCAN-SWA MTQLKVKYIILLLLMLCSISGNALPFDKEKMVQVVSDSADLNQKNHQGVYIGNVEFVQGSTNLRAEKAITQGDAKNQLTLAVAEGSKDKQAHYWTTTAPDKPPFHAYADTIKYYPLKHLIELIGNARIEQGPNSLSAAKISYDTQEQHVLSHSDEKTRTTIIIYPEKKS >LR134332|959499:966339|961280_961859_-|VEF62494.1|DBSCAN-SWA MLLIIDNYDSFTYNLVQYFQSLNQKVEVFKNDEIQIDTIRQSAPQYLVISPGPNSPDESGISIEVIKEFHKHIPILGICLGHQCIAQAFGGKIIPAPEIMHGKTSEITHHYQGLFTGIPNHFQATRYHSLAVDIMSLPNCFSIDAWADDTIMAISHRQFPLFGLQFHPEAILSQFGLQILENFLRYETQTSI >LR134332|959499:966339|965541_966339_+|VEF62511.1|DBSCAN-SWA MPDNWVEIKNLFFSLDDRCIFDGIDMVVKQGKITAIMGPSGSGKTTLLRLIGAQLRPDSGQIYVNGQNIHQLSRKSLYETRRNMGLLFQSSALFTHLSVFENVAFPLREHTELNASMIRNIVLMKLEAVGLRGAAHLMPAQLSGGMCRRVALARTIALDPVLMMYDEPFTGQDPISMGVLVRLIQRLNQLLHTTTIIVSHDVEETCSIADYIYLISGGKIIGQGTPDELKRSIEPQIRQFMHGEADGVVPFHYPAKPYTEELLNA |
9 | Acinetobacter_phage(42.86%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1211921 : 1276867
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134332|1211921:1276867|DBSCAN-SWA TTCAATCCTTTGATGAGATTAATCTTGCAATATGGTTTGCCCAGGAATCCAATGCCTCTTTGCGTTGGGGTAGCATCTCATTTTTATTATAAGTAGCCATAATACGAGGCATTTTGTGGCCAAGACATTTTTCTATCACCACGGGATCAATATTTAGTGACTCACCCAATTGTGTCGCAAAGGTTCTTCTTAAGTCATGGGCAGTCCATTCAGGAATTCCCACCCGATTCTGAATTCTTTTAATTGCGCGTGGAAGGGCATCTTTGGACATAGGAACATCGATTGTTATGCCTGGAATTACAAAAGGGGAGACAGATTGTTCTTTAAACTGAAGTAGTAATTTTTTTGTAAGTTCACTCAAGTGTATTTTTACAGTTATTCCTCCTTTTGAATGCTCGGGAGGAATAGTCCATAAAGATTGCTCAAAATCAAATTGATGCCATTGTGCCAGTCGGATTTCACCTGTTCTAACACCAGTAAGTATAATAACTTTAATTGCTAACCTGGCTGATTCAGACATTTGGCTTTTATCGCTTTCAAGGAATTTCCATATTATTCTTATTTCTTCGGGCGATAGTACCCGCTCCCTGGGCTTTTCAATACCACCGATATCACGTGATCGTATATTGGTAGCTGGATTATATTGAATATAACCACGACTCACTGCATAGTTTAGAACTTGTTTAATAGTGCTGAGAATGCGATTCGCATGAATTGGCGCTCCTCGTTGTACTATTTTGTCAAGGGCGATTGTAATATCTTTGGTTTGTAACTTATCAAGTACAGTATCGCCTAGTAGAGGAATTATTTCTGAGTCAATCTGATATTTGATAGGGCGTGGTTGCTTTCTATTTTTAACGGCATAATTTTCGTACCAAGACTGTATTAATTTTGAAAAGGTATTGTCTTCTTTTAATTTTTCTAGCTTGGTATTTTCTATAGGATTTATACCTTGCTCTTTTAAACTTTGCGCTTTAGCAAGATATTCACGAGCCTGTTTTAGACTAATAGCTGGATATTTTCCTAAGGTCATTTTTTGACGTTTACCATTCATACTAAAACGGTAAAACCAAGATTTATTACCACTTGGCATTACTCTAATACCTAATCCAGAAGATTCTATTTTTTCAAACCAGGTGGTCTCTGGCGCGAGATTTTTAATATAGCTATCGATAAATTTCATCTACACAGTCCTTTTTATTTTGGTACCATTTTTGGTACCAAAATTTATGTATAGGTATATTATCAAATGATACTAATTGAATTGCTAAAACTCAATTATTTCTTATAAATAAAGGGTTTTTTGCTATTTTTGAAATTAAATGATATTGTTTGATATCGGTATAATAAAGTTTCGTAATCAAGAGGTCGGAGGTTCGACTCCTCTCAGCGGCATAGTAAAATCAATGGGTTAGTAAAACTTATATTTTAATTTCTATAACGTGTCGAATATGTGTCGAACATTCATGAAGCTATAATATCTGGGTCTTTCCCAAATACGGGGGCATTTTATCAAGCACATAATACTCTAACTCTTAATCGGTAGTTTTCAAAGTTTCTAAACCCATAAGCTCTTCGTTGTATTAATTTCATTTTCCGATGAAATCCTTCAGTGATGCCATTTGATTTACTAAACCGCCACATACAGGCAATTTCTTCTTTCCATGAATCTAAGGTTTTTCCCAGGGCAACTAATGATTTAAATGGGCTTTGTTTCAAGTTCTGAATCATTTTTAAGAAGAGAGGAATGATTTTACGGCATCGTACTTTAGTTAGAGTTTTATTCATTAATAGCTCATGAAGCTGTTGTTGGAAGTGATAAATGGCTTCAATGAAGGAATCAGAGCCGATTTAAGCGACACAGATTTACATGAAGCTGTTGTTGGAAGTGATAAATGGCTTCAATGGCTGGATTTTCAGCGAGGAAAGTGTCTCGCTTTATTTTCTTATGAGATGTGAGTTTATCTGGTTTGGTTCGCAACAAAGCCAATAGACCTCGGTTATTTTTAATTGAGCTGGATAACTCACGATAAGTCATCATACATTGATGTTGTACTAATCGAATGACGTGAAACCTATCAGCTACTATTTTAGCGTTTGGGAAATGCTTTTTGACCAGAGAGCGGTAGGTATTACTTAAATCCATACAGACCACTTGAACACGGTCTTTCCCTTTTAAAGAGTTAAGGTAGTGATTTAAATCAACCTCTCTTCGTCCTTTAACGATATCAAACACTTTATGCTTTTTAAGGTCACATAAGGTAGTTGCAAAGCCATGTTTTCGACTAAAGAAGTGCTCATCAAGACCTAACACTTTTGGACAAGGCGTATTGAGCAATTCATTTCCTTCTATTTGATAGCGTCTATGATACCAACGTTCAATGGTTGCTTTCCCTTGTTTAAATTGAAGAGATAACTCTTTCTGGGAAATACCACTCGTATGGTGATGAAATATTTGAACTTGTAAACGCTCTGTAGACCGTTGATATTTAGCAATTCCGGGAAATTGTTGATTACCATAACGACCGCATTCATTGCAAAACAGTTTGTATGCTTTGAATCGAAGAATAGTCCGTCTGTGACCTATTAATTCATGATGAACCTTTCGTTCATAACTCGATTTCTTTCGAACCTTTTTGCTTGAACAATGAGAACAGCGTGGTAAACGGTTATAGGTTAAATCCAATAACAAGGGTTGATAACCACTTACTTTTTTTATAGAAAAACCAGGTAAATTTAGGATAACATCATGTCTCGGCACTTTAATCTCCTTTTTGATCGCGAAATCAAGAGGTTAGTTTATACTAACTTGATTAAAGTGCCCCCTTTGTTGGGGTAGAGCCTAATATCTGTCTAAAAAACAAAGGGTAATAATGGGGACGATTACTTATAGTTATAAATCTACCTCGAGCTCCTCAGCAGAAATTGAGGATATTGAGTTTAGTAGAACATCAACAACACGAAGAATAATTCGACCTATGATTGTTGAGAATAATGAGCGACCAGATGCTAGTATCAAAATTGAGATTATTCATCAAAAAGCAGAAAAAGGATTGTTCGAAGATATTCCAACTGAAAAATTGTCTAAGTATAAGGCTAAAGATATTGGTAAGTTAGTTCTAAGTAGTGAGGAGACATTGTCTCTTTTTAATCATCTTTGCAACCTATACTTAATTCATAAAGAAAATGGAATTCCGTCTGGCTATCATGAATTTGAAGTTGATGAAAATAGTAGATTAATGTCAATAGACTCGAAAAGAGCAGCTATTATTGAAACACTAATTCAGCAGGGATACTCAGAAGAAGTATGGGAAAAATTGGTTGAAAATTCTCCTGACTTAGCGACTAAACTTAGTATAGCTCGGTTATATCAAACACGCATGACTGCCTTAGAGCAATTTAGAACAATGCTATCCTGTGATCATAGTGAGCAAGATTGGCAATCCTTTTTTGAGAATAATAATTGGATATTTGGTTATGGATTGAATTATAAAATTTTAAAAGCCATTACAGGACAACCTCATTATGGAGGCGTAGTAATTGATGGAAGTGGAACTAATAAGGGAGATTTCTTAAGTGCTACTCAAGGATATTTAAAATTTACGGTATTAGTTGAAATTAAAAGATCAGACACCAAGCTATTAGCCTCAAAAAGATATAGAAATGATGTGGTATTACCTAGTGAAGATTTAATAGGAGGGGTTTCTCAATTAAGAGTGAATGGTAGAACCTGGGAGCAGCAAGGATCTCAACTACCAAAAAATAGAGATCTCCTAGAAGATGACTCTATTTATACTATTCAGCCACGAAAAATTTTGGTTATCGGCAATACTAATGAATTAAACGATCGATTAAAGCGTGAAAACTTTGAGTTATTTCGTAGAGGACAAAGTGATATTGAAATCCTAACCTTCGATGAACTGTTAAATCGGGCACAATTCATAACAGAACACACTGAGGCAATCAAAGATGGCTAGTATTCATTGAAGGAAATTAATGATGCACTTAAGCAGGAGTAATTTGAGTCATTTTCTCCAGCATCTATGATGTCTAATAGATTCATTGTGGGGGAAATGCCTCATCTCTGTGTTTTATTACTCTGATAAATCAAATTCTAACTGTCTTGGTCGAGAAATCAAATTGCCTTCCAAATCAACAACCGCATCTCTTAAATCATGATGACTCTTGTCTAAACTTAGTATGTCTTTGGTGAACAATTCGGTATTTCCACTTCCCATTAATACTGCAGGACCATAATATCTATATCGATTAAATTGGCTAATAATATTTGCTTCATACTCAGCCGCAATTTGACCTAATTCAAATCGCCAGATCCTTATAACCCTTATTCGAGCACGATCTACGGAGGGAAATCGACGTTCTATGGAGAGGTTTGTTATACCAATCTTGTATAGAAGTTCACCATCGTCTTTTTTTACAGCAATGTAATACAACAAACCGGGCTTTGTTTGATCAAAACCTGACACCGCACAACCTGGACAACCAGATTTATTACCCCTTACATGATTAACAGGGGATTGCCAAAACGAACCATGTACTAGGCATATTATTTCAACATGCTTGTGAGATGATTTGTAATCAACCTTTGAATAGTCATAAAGAGCTCCATGCACCTCCTTTGCTTCCTGAACGAACTCTTCAGTTGTTCGAGTCCTTATCATTGCCGCACTTTCATCGCCGCACTTTGGACATCCTACATCCCTTATATGATTGGACGGCTTTTGGTCGAATGGACCATGGTCTGGGCAGATGATAGTTACCTTGGTTAATGCATTGACGTACCGTACCTGAGAATAGTCATACTTATTCCCATGTGCTCTTTTCGCATCTTCAATGAAACGTTGGATGGAATGACTCAGTTTATTAGCTGTATTAATTCTACCGCACTGAGGGCAACCAAAACCCTTTAGATGTGACATTAATTGCTGAAAAAACAAGCCGTGATCCGGACATATAATTTCAATCTTACTTTCAACGTT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53 | Pseudomonas_phage(15.38%) | protease,transposase,integrase | attL 1214747:1214767|attR 1229304:1229324 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_5 |
1348972 : 1354909
Sequences of DBSCAN-SWA_5
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134332|1348972:1354909|DBSCAN-SWA TATGCACGAACAGTTTCTGCTTGCAGCACTTGAACAAGCCAAACTGGGGAGAGGCTTTTGTGCCCCCAATCCCAGCGTTGGGGCGGTTGCTGTGCAAAATGGTAATATTATAGCACAGGCATGGCATAGAGGTGCAGGTACACCGCATGCAGAACAATTATTGTTATCACAAATTCCACCCCAAACGCCAGGGGTTACGCTTTATGTCACGCTGGAGCCTTGTAATCATTGGGGCAAAACTCCCCCTTGTGTTGATGCTATTATCAATCATGGTATAGAGGAGGTTGTTTTTTCCTATTTTGATCCAAACCCCATTGTTGCCAAAAGTAACTCCTCAGAAAAATTACGTGAACATGGAATACAAGTCAGGCATATTCCTGTAAAGGCAATTGATGTGTTCTATAAAAGCTATGCTTATTGGACTATGACCCATAAACCAAGAGTCACTGTTAAAATAGCACAAACTTTTGATGGTAAAATTGGAAAGTCTGAGGGAGCTCGAGTGGTTTTGTCCAATGCTTTATGCGAACAGTTCACTCATCAAATGCGTGCTGCCAGTGATGTCATATTAACCAGTGCCAAGACAGTTCAAATGGATAATCCAAGAATGAACGCCAGATTAGATAGTGGATTGGTAGCAAAGCCAGTTGCCATTGTTGACCGCAATTTAAGTTTGTCTGATGACACAATCATTTTTTCGACAGCAAAACATTGCCACATTTATCATCAACCACAAGCAAATCAGGCAAAGACTTATCCTAATAGCACTCATTATGCGATGCCTTTGCAAAATGGGTTGATGGACCTGGAGGCAATAATAACTCATCTTGGTCAACTGGGATATCATGACGTATGGGTTGAGGCGGGCGGAGCTATTTTTTCTGCGTTACATAGTAAGGGATTGGTGCATAGAACCTATTTGTATTTAGTTCCCGGCAGTTTAGGGCATCAAGCGATTTCAGCTTATCAACAACAGGGGATTTTTGAAAAAGCTCATACGGTGAGTTGGCAAGCTATGGGTGACAATATGATAGCATGTTTGGATTGGCAGGAGGATGAGTGTTTACCGGATTGATAGAAAATACAGGCAAAGTATTAATGAATAGGCAAGGAGAAAATTCTAGTCGTTTAGTCGTATCTTCAAGCTATCAGGATTTGAAACCTGGTGAGAGTATCGCTGTAAATGGGGTTTGTTTAACCCTTTTGCCAGCAGATTTTCCTGAACTGTGTTTTGATATTTCACCTGAAACTCTGCATGTTACCACATTGTCAAAATTATCATCTGGCGACATGGTTAATCTTGAAAGAGCTATGCTGGCATCAACCCGCTTTGGTGGTCATTATGTATCGGGTCATGTAGACACCAGGGCCAAAGTGAAATCCATTCGTGCTGTTAATGAATTTATCGCGATGGATTTGGATGGTTTTATCCCAGAACATAATCATTATTTAATACCCAAAGGTAGCATTACAGTAGATGGAGTTAGCTTGACTATTAATACTGTATCAGAACAAACCGTCGGACTCATGCTGGTGCCACATACATTATCAATGACCAATCTCGGTTCATTGAGAGTGGGCCAGCAAGTCAATATTGAATTTGATTATCTTACCCGTATTGTGGCTCATCAGCTTCAAATTATCGGGAAATTGAACCTAGAGGAAGTGTCATGAAACATTCATTAGCAACAATAGAAGAGGCTGTGGCGACACTTAAAGCCGGTAAAATGATTATTCTAATGGATGATGAAGATAGAGAGAATGAAGGTGATTTGGTGATTGCTGCTGAGCACGCTACTCCTGAAGCCATTAATTTTATGTCTCGTCTTGGTTGCGGTTTAATTTGTTTGCCTATGGCTGAAGAATTGATAGACAAACTCCAACTGCCCATGATGGCTCGGCATAACAAATCGCCGTATGGAACGGCGTTTACGGTTTCGATTGAAGCAGCTAACGGTGTCTCCACAGGCATCTCAGCAAGAGACAGAGCTCGAACAATTCAAGTGGCTATTGATCCAAAAAGCGGGCCATCTGATATCATTTCACCTGGACATGTTTTTCCTTTACGGGCTAGAAAGAGAGGAGTTTTAGAAAGACCAGGTCAAACAGAAGGCAGTGTTGACTTGGTAAAACTTGCCGGATTGACCCCGGCCGCAGTGATTTGTGAAATCATTAATGAAGATGGAACAATGAGCAGACGTGATGAATTAGCTCTTTTTTCAAAAAAACATCAAATCCCTTTAGTCACCATTAAAGATTTAATTCAGTACAGAGTACGGCATGAAAATCTGATTCATCCCGTTGCAACCACACAAATTCCTCTGGAGGAGAACGGTGTTTTTACTATGACTGTTTTTGAGAATCAGATAGATTCCTGTGAACATTTTGTCTTGGTTAAACCCCCTTTGTATGGTAATCAAGTGCCTTTGGTTCGAATTCATTCTGAGTGCATAACAGGTGATGTTTTTGGCTCCAGAAAATGTGATTGTGGAAAGCAACTGGAGTTGTCTTTATCCCAGATCGGAGCGGAAGGCGGTATATTAATTTATTTGCGTCAGGAAGGCCGCGGAATAGGTTTGGCAAACAAATTAAAGGCGTATGCTTTGCAAGAGCAGGGGTTTGATACAGTCGATGCTAATCTGGAATTAGGATTGCCCGCTGACGATAGAGATTATGCCGTAGCATACCAAATACTGAAATATTTAGGGGTTGAAGCATTAAGGTTGCTGACAAATAATCCTTTAAAAATCGCTTCTCTTGAGCGTTATGGAATGAAGATTACTCAACGCATTCCTTTGGAAATTGAGCCCTCCAGAGAAAATCACAGTTATTTAAAAACCAAAAAAATAAAACTGGGGCATTTATTAGCCATTGATTAGGATAAACATGAGAGAGATAAAAACAATTGTTAGTGATGGTGTCACGTTTCCAATAGCGCTAGTTGTAAGTACTTTTAATGAACTGATAACCTCTGCATTAAAAAAAGGGGCGTTAGATAGATTGACTGAACTGGGTTTTAAATCGGAGGACATTACCTTAGTTGAGGTTCCTGGCGCAGTAGAGATTCCGTTTGTTGCACAGTTGCTAGCGAAAAAACAAAAAGTAGAAGTCATAGTGGCACTTGGAGCAGTTATCCGTGGTGAAACCTCTCATTATGATTACGTTTGTGATCAGGTCAGCCAGGGATGCCAAAGGGTTATGTTAGATTATAATATTCCGGTTATCTTTGGTGTATTAACTACTGAAAATGATGAGCAGGCTTTGGCAAGAGTGGGAGGAACTCACGGCCATAAAGGGAGAGATGCGATAGATTGTGCGGTTTCCATGCGTTCTATTAAACAACAATTGCAATAGTTCTATTAATTTTGCTCAAATTTCTGTTATTTATATCTTCATTTTGATAGAATTGAATCCCGTTTACATGCAAATTAAATTGAACACCAAATTGGTGGATTCGGCATTTTGAGCGGGGTCAAAAAATGACAAAATATATTTTTATTACTGGCGGGGTTGTGTCTTCTTTAGGAAAAGGCATAGCAGCCGCATCTCTTGCAGCTATTCTTGAAGCTCGTGGTCTTCGCGTTACGTTGATAAAGCTTGATCCCTACATTAACGTTGATCCTGGTACTATGAGTCCCTTTCAGCATGGCGAGGTTTTCGTAACGAATGACGGGGCGGAGACCGATTTGGATTTGGGACATTATGAGCGCTTTGTTAAAACAACAATGACCAAGCGTAATAATTTCACATCGGGAAAAATTTACGAAAATGTAATTAAGAAAGAAAGACGTGGTGATTATTTAGGAGGGACAGTTCAGGTTATTCCTCATATTACTAATGAAATCAAACGCTGTATCAAACTCGGTGCGGATGCATTCGATGTGGCTATGGTTGAAATAGGAGGAACTGTTGGTGATATTGAATCATTACCCTTTCTTGAAGCAATTAGGCAGATGCGTATTGAGTTAGGTTCACAACGAGCGATATTTATTCATCTTACTTTGGTTCCTTATATTGCTACTTCTGGGGAAACCAAAACCAAACCAACTCAACACTCGGTAAAGGAATTGCGTTCTATTGGTATCCAGCCAGATGTATTGATTTGCCGTTCAGAAAAACCATTATCCATGGCAGACAGGGCTAAAATCGCACTATTCACTAATGTTGAAAAAGAAGCTGTGATTTCTCTTGAGGATGCGAATAGTATTTATCAAATACCTATGATTCTACATGCGCAGCATTTAGACGAAATTGTTGTTAAGAAACTAAGCCTGGAAGCTAAGCAGGCTGATTTGAGCGAGTGGCAACGAGTAGTTGATATGCAAGCAGTTCAAACGATGACAGTGAAAATCGCTATGGTAGGTAAATATACGGAGCTGAATGATGCCTACAAGTCGATTAATGAAGCTTTATTGCATGCTGGAATTCATACTGAAACAAAAGTAGAAATTATCTATTTTGATGCTGAGATGATAGAAAAGCATGGCGCTTTATTGCTTGAATCCATTGATGCTATTTTGGTACCTGGTGGTTTTGGTGAGAGAGGAGTCGAAGGCAAAATTAAGGCTATCCAATATGCTCGGGAGCATAAAGTTCCTTTTTTAGGGATATGTTTGGGTATGCAAACAGCTGTTATTGAATTTGCGAGAAATGTAGTCGGTTTGACAGGAGCTAATTCGACCGAGTTCAATAAAGAAACATTGTATCCAGTGCTTGGTTTAATTAGTGAATGGATGGATGCCGATGGCAGCAAGCAGATCAGGGACGAAAATACTGACTTGGGTGGAACCATGCGTTTGGGCGGACAATACTGTCATCTTGCTGAAGGCACTCTGGCAAGAAAAGTTTATGGCAAACCACAAATTATAGAGCGCCATCGCCATCGATATGAAGTCAATAACAAGTATGTGGATAGTTTGGTAAAACATGGCTTAATTATTTCAGGGCGATCAGCAGATAATTCACTGGTTGAGATGATAGAATTAGCGGACCACCCCTGGTTTTTAGCTTGTCAGTTTCATCCTGAATTCACATCAAATCCAAGAGATAGTCATCCTCTATTTAAGGAGTTTGTACTTGCAGCTCGTATTCACCATCAAGAGAAGGACAAAAAATGAGATTATGTGGTTTTGAAGCAGGCTTGGATAAGCCATTGTTTTTGATTGCCGGCCCTTGTGTTATTGAAAGTGAAGAATTGGCTTTAGAGACCGCAGGATATTTAAAGGAAATGTGCAGTCAGTTGAATATCCCTTTCATCTATAAGTCTTCTTTTGATAAAGCAAACCGTTCATCTATTTCCAGTTACAGGGGGCCTGGCTTTGAAAAAGGGTTATCGATTCTGGAAAAGGTTAAATCACAAATAGGTGTTCCTGTTTTGACTGATGTTCATGAAGACACGCCCTTATTTGAAGTCTCCAGTGTGGTAGATGTATTACAAACGCCAGCCTTCCTATGCAGACAAACCAATTTTATCCAAAAAGTTGCTGCCATGAATAAGCCGGTTAATATTAAAAAAGGACAGTTTCTTGCTCCCTGGGAAATGAAACATGTTATTGCGAAGGCAAAGGCGCAAGGTAATGAGCAAATTATGGCTTGTGAGCGAGGAGTGAGCTTCGGCTACAATAATTTGGTTTCTGATATGCGTTCCCTCGTTATCATGCGTGAAACCGGCTGTCCAGTGGTTTATGATGCAACACATTCGGTTCAATTGCCCGGGGGCAATAATGGTGTATCCGGGGGGCAGAGAGAATTTATTCCGGCTCTTGCAAGAGCAGCTGTAGCTGTTGGAATATCAGGGTTATTTATGGAAACTCACCCTGATCCGGATAAGGCACTAAGTGATGGTCCCAATAGTTGGCCTCTAGATAAAATGAAACAACTTTTGGAATCATTGAAAGCAGCGGATGAAGTATATAAAAAGTACAGTACTGATTTCTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_5 >LR134332|1348972:1354909|1352450_1354088_+|VEF63507.1|DBSCAN-SWA MTKYIFITGGVVSSLGKGIAAASLAAILEARGLRVTLIKLDPYINVDPGTMSPFQHGEVFVTNDGAETDLDLGHYERFVKTTMTKRNNFTSGKIYENVIKKERRGDYLGGTVQVIPHITNEIKRCIKLGADAFDVAMVEIGGTVGDIESLPFLEAIRQMRIELGSQRAIFIHLTLVPYIATSGETKTKPTQHSVKELRSIGIQPDVLICRSEKPLSMADRAKIALFTNVEKEAVISLEDANSIYQIPMILHAQHLDEIVVKKLSLEAKQADLSEWQRVVDMQAVQTMTVKIAMVGKYTELNDAYKSINEALLHAGIHTETKVEIIYFDAEMIEKHGALLLESIDAILVPGGFGERGVEGKIKAIQYAREHKVPFLGICLGMQTAVIEFARNVVGLTGANSTEFNKETLYPVLGLISEWMDADGSKQIRDENTDLGGTMRLGGQYCHLAEGTLARKVYGKPQIIERHRHRYEVNNKYVDSLVKHGLIISGRSADNSLVEMIELADHPWFLACQFHPEFTSNPRDSHPLFKEFVLAARIHHQEKDKK >LR134332|1348972:1354909|1351857_1352325_+|VEF63504.1|DBSCAN-SWA MREIKTIVSDGVTFPIALVVSTFNELITSALKKGALDRLTELGFKSEDITLVEVPGAVEIPFVAQLLAKKQKVEVIVALGAVIRGETSHYDYVCDQVSQGCQRVMLDYNIPVIFGVLTTENDEQALARVGGTHGHKGRDAIDCAVSMRSIKQQLQ >LR134332|1348972:1354909|1354084_1354909_+|VEF63510.1|DBSCAN-SWA MRLCGFEAGLDKPLFLIAGPCVIESEELALETAGYLKEMCSQLNIPFIYKSSFDKANRSSISSYRGPGFEKGLSILEKVKSQIGVPVLTDVHEDTPLFEVSSVVDVLQTPAFLCRQTNFIQKVAAMNKPVNIKKGQFLAPWEMKHVIAKAKAQGNEQIMACERGVSFGYNNLVSDMRSLVIMRETGCPVVYDATHSVQLPGGNNGVSGGQREFIPALARAAVAVGISGLFMETHPDPDKALSDGPNSWPLDKMKQLLESLKAADEVYKKYSTDF >LR134332|1348972:1354909|1350641_1351850_+|VEF63501.1|DBSCAN-SWA MKHSLATIEEAVATLKAGKMIILMDDEDRENEGDLVIAAEHATPEAINFMSRLGCGLICLPMAEELIDKLQLPMMARHNKSPYGTAFTVSIEAANGVSTGISARDRARTIQVAIDPKSGPSDIISPGHVFPLRARKRGVLERPGQTEGSVDLVKLAGLTPAAVICEIINEDGTMSRRDELALFSKKHQIPLVTIKDLIQYRVRHENLIHPVATTQIPLEENGVFTMTVFENQIDSCEHFVLVKPPLYGNQVPLVRIHSECITGDVFGSRKCDCGKQLELSLSQIGAEGGILIYLRQEGRGIGLANKLKAYALQEQGFDTVDANLELGLPADDRDYAVAYQILKYLGVEALRLLTNNPLKIASLERYGMKITQRIPLEIEPSRENHSYLKTKKIKLGHLLAID >LR134332|1348972:1354909|1350030_1350645_+|VEF63498.1|DBSCAN-SWA MFTGLIENTGKVLMNRQGENSSRLVVSSSYQDLKPGESIAVNGVCLTLLPADFPELCFDISPETLHVTTLSKLSSGDMVNLERAMLASTRFGGHYVSGHVDTRAKVKSIRAVNEFIAMDLDGFIPEHNHYLIPKGSITVDGVSLTINTVSEQTVGLMLVPHTLSMTNLGSLRVGQQVNIEFDYLTRIVAHQLQIIGKLNLEEVS >LR134332|1348972:1354909|1348972_1350046_+|VEF63495.1|DBSCAN-SWA MHEQFLLAALEQAKLGRGFCAPNPSVGAVAVQNGNIIAQAWHRGAGTPHAEQLLLSQIPPQTPGVTLYVTLEPCNHWGKTPPCVDAIINHGIEEVVFSYFDPNPIVAKSNSSEKLREHGIQVRHIPVKAIDVFYKSYAYWTMTHKPRVTVKIAQTFDGKIGKSEGARVVLSNALCEQFTHQMRAASDVILTSAKTVQMDNPRMNARLDSGLVAKPVAIVDRNLSLSDDTIIFSTAKHCHIYHQPQANQAKTYPNSTHYAMPLQNGLMDLEAIITHLGQLGYHDVWVEAGGAIFSALHSKGLVHRTYLYLVPGSLGHQAISAYQQQGIFEKAHTVSWQAMGDNMIACLDWQEDECLPD |
6 | Staphylococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_6 |
2303924 : 2314048
Sequences of DBSCAN-SWA_6
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134332|2303924:2314048|DBSCAN-SWA ATTATAAGTAACAGCCTACGCCATCATATCCAACGACACGACATTCTTTATAAGCCGATTGATCCAATTCATAGCTTACGGAACCATAATAAGCATAAATCTTTCCATCCTTGGCTTTTTCAATACGTGGCTTCTGATAGCTTACACCAGTTTCACAGCTTGACTTAGCTTGAATCCAGGTCGCAGTACTGTCATTAATGATGTTTTTACCAGGTTTTAATCTATTCTCTCCACATTCATGCGTTGCCAGAGCAATCATTTTAGGCGCTGAGAATAAGACATCATAAGCATTTAATGCTGCCTGCACAGCATTATCCGCATCCAATATTCCATGTCCACAAGGTTTTTTGCCGACACAAGATTTATTGGTGTCGTTGCTTTGCCCAAACTCATGCGTAGTAACATATAAAATTTGTTCAACTTGTTCAGGTTTCAAAGCCTTATTACTGACAGCAAAAATTAAACCTGCTACCCCGGCTACATGAGGCGAAGCCATACTCGTCCCTTGATAAAAATCAAAGCCTGATGAATTGTATCCACCTCCCGGGTTTACGGTAGATAAAATACCTCCCGAAGTGCCATAACGCTTATCACCTCCCGGTGCTGCAAGGGTTATACTGGGCCCATAATTTGAAAAGTACGAACGCAATCCTTCTGGTCCGGTGGAAGCAACCTTGATCGTTCCATTGCACACTGCAGGAGCATTATAGTGTTCCCAAACATTATCATTTCCGGCAGCAACCGCGACTACAGCCCCTTTCTTGCGAGCAAAGAATAAAGCCTCTTGTAAAGCTTCGTCGCAATAATCAATTTCTTTTCCAGGCTCTAAATCGACACCAAAACTCATATTTAATACCTTGGCTGGATGTATATTTTTAGGAACTCCCGGAACATCACCTCCAACAGCCCAATAGATACTATTCACCACAGCACTTTCATAAAACATACCATTTTCGGCAGGAATTTTAACAGTCAGAATTTTTAAATCCTCACCAACTCCGTTCATGACATCGCCATAACCGGCAATGGTACCGGCAACATGGGTGCCATGGTAAGATCTGGTTTCATCAGATAAATCATTGTTATTCCCGGCAAAATTCCATCCAAATACATTACCTTCGTTATCTTTTACAAGGTTATTCACCAAACTGTCATTCAATGCAATCCCAGTATCTAAAACCGCAACAACTATCGGCTTCCTAGACTTTCCTGTAGTATATGCCCATGCGCCATCTCTTAAACCAGGCCTGGACTCCAAACGAATTCCCGCTGGCCTTTCGAATTCATCCCATTGACTCTCATGGGATAACAATTGACTTAACTCCTGGTTTATTACTGGATCAGGGAGAGGCTTAAAATGTCCTATTCTGTCTTTAACTGCATAAAGTACATTGGGATTTTTGCGCAAACGTTCTAAAACTTTGGCTGTAACATCTTCTTCTTTAGACTTGACAATAGCATGGGAATTCGATGTATCAAAAATAAGCGAATAAGCGCCATTGGCCATAGGCTTCATTTCTTTAACGGGTATTTGAACAGATTTAATGACTTGTGATTTCAGTGAAGCAATAGTGGCGGGTTGCTGTTTATATTTAATGATAACCCTGATTGTTTCAGTTTCAGTCATAGCAAAACTGCCACAAGCAAGCGATAAAAGACTTAATCCCAATATTCCTGATTTCAAACCCATACTTCAATCTCCTTTTTAAAGTCAATCCGTAGCCTTGACCAATTTTTAAAAATAAAACCACCTCAGTATGCAGGAGAATAAATATCAACTCAAGAATCAATAAGCCATGAGATTAAATTAAAATCGAGCAATCATTGGACTTCATGTTTTTCCCTATATTCTGTGGGAGTGATTCCTGTCCATCGTTTGAATGCTTTTGAAAAATTGGATGTATCTTGAAAACCCAATAAAAAACAGATCTCGGTCATGGAAATATTATTATTGAGCAAAAATGTCTTTGCTTTTTGTTCTCTTACCTCATCAAGCAACTCTTGGTAAGTCACATCCAATCTCTGCAAATGACGTCTTAGAGTACGAGAAGTCATACATAATCGACTGGCTATCTCATCCATGCTGACGTGATTTAAATTCTGATTGATTAAAATAGATTTAATCTTGCTTGCCATATCCTCTTTTAATGACATTTTTTTTTCAAGTTCTTGCAATTGCCTTTTTGCCAGTTGATAACTGACATCGTCAGCAAAATGGATGGGATAATTCAGTTCCTCCGCTTTAAACCAAACGCGAGTAGCCTCTGTATTAAAAATAATTTTAGTCTGAAAAATTGTTTGATAATATTTTGCATAAGGAGGTTCATCGTAATTTAACTCAATCTTGAGCAATGGGTCATTACAACTAATCAAAAAATTTCTCATTTTAATAAGATGAGTAATTGCCAATTCAGTTATAAAACGTGATAAAACCATTTCTTTTGTGTGTGGTAATAACTTGATATAAGCACTGTTTTCAGTATTAAACTGGCGTAACTCCAGAGACAACAAATTGGTTCGTGTATTAAGGTAACTGAGCACAGTTTGTATAGCAGTTCCAAATGTAGGACTGCTCATTGCTGCATACCCAAGAAAACCGTGATTGACTATAGATAAGTTTTGACCAAAAACCAAACCCAATTCCGGACAATTGCTTAATTTATAAGCTTCCAAAATAACCTGGTTAAATTCATCCTGAGTTAAGTAGGCATCAGGATCATGTACTCTTATCAGATCAAAGCCAATTTTTTCTAAAAAATGGTTAATCCCAAATTGTTCAAGACATTTTTCCAGAGTAGAAAGATAATTTGCCGCTATAACCAGATCCATCAACAGGCTTTTCTTTTTTAAGTGATAAGTGAATTAATTCTAATCTATATTAGAGTATAAGATCCAATAATGTATAAAAATTCAAGATTTAGTTATCTTGACTAAATCTTGAATAAAATTAGTTTAATAACGATAATGATCCGGCTTGTAAGGTCCATTTTTATCAACGCCGATATAATCAGCCTGCTCATTACTTAATTGAGTTAATTTTGCACCAATACGTCCCAAATGCAAACGGGCTACTTTTTCATCCAAAACTTTTGGAAGTACATATACTTGATTCTGGTATTGGCTAGAGTTTTGGAACAGCTCAATCTGCGCTAATACTTGATTGGTAAAGGAAGCAGACATGACAAAGCTCGGATGGCCTGTAGCGCAGCCCAAATTCACTAAACGCCCTTCAGCCAGGATAATAATCCGCTTTCCATCAGGAAAAATCACATGATCAACCTGCGGCTTGATATTTTCCCATTGATACTGTTTTAAGCTTTGAATATCAATTTCGGAATCAAAATGGCCTATGTTGCACAATATCGCCTGATTACGCATACGTTTCATGTGATCGTGAGTTACAACATGGTAATTGCCAGTAGCTGTAACTACGATATCCACTTGTTCAGCAACATCATCCAGAGTGACTACTCTGTAGCCTTCCATTGCTGCCTGAAGTGCGCAAATAGGATCAATTTCTGCGACAAGTACAGTGGCTCCCTGTCCGCGCAAGGCCTGAGCGCAACCTTTCCCTACGTCACCATAGCCTAGAATCAAGGCAACCTTACCAGCTATCATAACATCTGTTGCACGTTTTAACCCATCAAGCAGGGATTCCCGACATCCATACAAATTATCAAATTTGGATTTGGTCACCGCATTATTAACATTAATGGCTGGAATTTTTAATTGTCCATGTTTCGCCATTTCGTACAGCCTGGCTACACCTGTAGTGGTTTCCTCAGATACTCCCTTAATTGCAGTCAGTAATTTGGGATGTTTCTGGTGAACAACTTGTGTCAGATCCCCGCCATCATCTAATAATAAATTAGGTGTCCAACCATTGGGGCCACTTAAAGTTTGCTCAACACACCACCAATATTCTTCTTCTGTTTCGCCCTTCCAGGCAAAAACAGGGATTCCTTTTGCAGCAATAGCGGAAGCTGCATGATCCTGAGTAGAAAAAATATTGCAGGAAGACCAGCGTACTTCAGCACCCAATGCAACCAGGGTCTCAATCAATACTGCGGTTTGAATCGTCATATGCAGACAACCTGCAATCCGAGCGCCTTGAAGTGGTTTTTTCGCAGAAAATTCCTCGCGTAAAGCCATTAAACCCGGCATTTCGGTTTCAGCTATCGCTATTTCTTTTCGCCCCCAGTCCGCTAATGAAATCTCTGCTACTTTATAATCTTGTAATGTATTGATTTTCTGTACTCCTTCTTCTACCAGTTCCATTAGAGTATCCTTAAAAAATTATAATGCCTTGCTTAATTCAGCTACTTTGTCCAATCGCTCCCATGGAAAACTCTCCCTGCCATAGTGCCCATAAGTTGCCGTCTGCCTATAAATAGGACGAAGCAAATCGTGTTGGTCGATAATACCTTGCGGTGTTAAATCAAAATGCGTATGAATTAAATCAATTATTTCGCTGTTTTTTAGTCGTCCAGTACCAAAAGTATCAACAAAAATAGATGTAGGTTCAGCAACACCAATAGCATAGGAAATCTGTAACTCGCATTTATCCGCCAAACCAGCCGCCACAATATTCTTGGCAACATGTCTTGCGGCGTATGCTGCGGAGCGATCTACCTTCGAAGGATCTTTACCTGAAAAACAGCCTCCGCCATGTCTTGCCATACCACCATAAGTATCAACAATGATTTTACGGCCGGTTAAGCCACAATCGCCCAAAGGACCACCAATTACGAAGCGTCCTGTCGGATTAATGAAATACCGGGTCTTATCATTGAGCCATTCAGCAGGAAGAACTGATTTAATAATTTCTTCACGGATCGCCTCAACCAAATCTTTATGCTCAATATCAGGTGAATGCTGCGTAGAAAAAACAACAGTATCCACTTCAACCGGCATCCCTTGTTCATATTTCAAAGTAAGTTGACATTTTGCATCAGGTCTTAACCAGGGTAATTGGCCTGATTTACGAGCTTTAGCTAATT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AATGCTACGATAGAAGGAGTTGTTCTGTGACCTTCACTATTTTCAATTACCTTCGGTTTGTCACCTTCCATGACAGCAACACAAGAGTTCGTAGTACCCAGGTCTATACCTATTATTTTAGCCAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_6 >LR134332|2303924:2314048|2312113_2314048_-|VEF65490.1|DBSCAN-SWA MAKIIGIDLGTTNSCVAVMEGDKPKVIENSEGHRTTPSIVAFTDDNEILVGQSAKRQSVTNPEKTLFAIKRLIGRRFDDPIVQKDIKMVPYKIMKADNGDAWVRVKDQDKAPPQISAEVLRKMKKTAEDYLGEEVKEAVITVPAYFNDSQRQATKDAGRIAGLEVKRIINEPTAAALAYGMDKKRGDSVIAVYDLGGGTFDISIIEIAEVDGEHQFEVLATNGDTFLGGEDFDLALIEYLASEFKKDTGIDLHNDPLALQRLKEAAEKAKIELSSAQQTDVNLPYITADASGPKHLNIKLTRAKLESLVEKLVERTIEPCKTALKDAGLTVSQINEVILVGGQTRMPLVQKTVEEFFGKEPRKDVNPDEAVAVGAAIQAAVLSGEVKDILLLDVTPLSLGIETMGGVMTKLIEKNTTIPTKATQVFSTADDNQTAVTVHVLQGEREQASANKSLGRFDLRDIPPAPRGVPQIEVTFDIDANGILNVSAKDKATGKAQSIVIKASSGLSEEEVAAMVKDAQSHAEEDKKFKEMAELRNQADSLIHSCEKSMKDLADELSEDEKRGIETAISELKEAVQGTDKARIEDKLKVLTDASAKMAERIYAKKSSEGQAAQGQTQSQESTKPAEEGVVDAEFEEVKEEDKK >LR134332|2303924:2314048|2309576_2310689_-|VEF65488.1|DBSCAN-SWA MINKSAILALADGTVYEGLSVGASGDSVGELVFNTSMTGYQEMLTDPSYARQIITLTTAHVGNTGCNMEDMESTKVWAAGLVMRNCTAIPSNYRAEQSFPDWLSKNGVVAISGIDTRALTLKLREKGSIGACISTNVEKPEIVVAKAKSFAGLQGADLALEVTRQTIERWHEGRGMWSLDKQPQQLHVVAYDFGVKHNILRILHDKGCHITIVPAKTSAEEVLAMNPNGVFLSNGPGDPQACDYAIKATQVFLDNNIPLFGICLGFQILALACGGITKKMKFGHHGSNHPVVETTGKKRVFITSQNHGFAVDEDSLPNCLEVTHRSLFDNSLQGIRHKTKPAFGFQGHPEASPGPHDIDILFNEFLNLMK >LR134332|2303924:2314048|2303924_2305613_-|VEF65484.1|protease|DBSCAN-SWA MGLKSGILGLSLLSLACGSFAMTETETIRVIIKYKQQPATIASLKSQVIKSVQIPVKEMKPMANGAYSLIFDTSNSHAIVKSKEEDVTAKVLERLRKNPNVLYAVKDRIGHFKPLPDPVINQELSQLLSHESQWDEFERPAGIRLESRPGLRDGAWAYTTGKSRKPIVVAVLDTGIALNDSLVNNLVKDNEGNVFGWNFAGNNNDLSDETRSYHGTHVAGTIAGYGDVMNGVGEDLKILTVKIPAENGMFYESAVVNSIYWAVGGDVPGVPKNIHPAKVLNMSFGVDLEPGKEIDYCDEALQEALFFARKKGAVVAVAAGNDNVWEHYNAPAVCNGTIKVASTGPEGLRSYFSNYGPSITLAAPGGDKRYGTSGGILSTVNPGGGYNSSGFDFYQGTSMASPHVAGVAGLIFAVSNKALKPEQVEQILYVTTHEFGQSNDTNKSCVGKKPCGHGILDADNAVQAALNAYDVLFSAPKMIALATHECGENRLKPGKNIINDSTATWIQAKSSCETGVSYQKPRIEKAKDGKIYAYYGSVSYELDQSAYKECRVVGYDGVGCYL >LR134332|2303924:2314048|2310784_2311924_-|VEF65489.1|DBSCAN-SWA MEQRDYYELLEVSRNASDAEIKKAYRRLAMKYHPDRNPGDTSAEEKFKEIQKAYNILSDKQKRAAYDQFGHAGVDPSMGGGPGGFGGFGGFGDVFEDIFENIFSGGRGHGRQSRGQRGADLQFNVQLTLEEAAIGKEVEITVPRHGTCTVCEGSGAKKGTSPKTCETCQGMGQVRIQQGFFSIQQTCPTCHGEGKIISDPCASCHGQGRVRESKKINVKIPAGVDNGDRVRLSGEGEAGVHGGGSGDLYVQISLKKHAIFERHENDLHCEVPISFATAALGGSIEVPTLEGRVTLKIPAETQTGKVFRLRSKGMKSVRGYGQGDLLCKVVVETPVNLSREQKELLNKLQDSLENAKGTHSPKTSSWFAGVKKFFEDMKF >LR134332|2303924:2314048|2308219_2309368_-|VEF65487.1|DBSCAN-SWA MNEVYVFTSESVSEGHPDKIADQISDAILDAILAQDPKARVACEVLVKTGMVLVGGEITTKAWVDVEEITRHVIKDIGYNSSQMGFDWESCAVLSAIGKQSPDIAQGVDNQQTKILGAGDQGLMFGYASRETDVFMPAPIAYAHRLMEKLAKARKSGQLPWLRPDAKCQLTLKYEQGMPVEVDTVVFSTQHSPDIEHKDLVEAIREEIIKSVLPAEWLNDKTRYFINPTGRFVIGGPLGDCGLTGRKIIVDTYGGMARHGGGCFSGKDPSKVDRSAAYAARHVAKNIVAAGLADKCELQISYAIGVAEPTSIFVDTFGTGRLKNSEIIDLIHTHFDLTPQGIIDQHDLLRPIYRQTATYGHYGRESFPWERLDKVAELSKAL >LR134332|2303924:2314048|2305744_2306752_-|VEF65485.1|DBSCAN-SWA MDLVIAANYLSTLEKCLEQFGINHFLEKIGFDLIRVHDPDAYLTQDEFNQVILEAYKLSNCPELGLVFGQNLSIVNHGFLGYAAMSSPTFGTAIQTVLSYLNTRTNLLSLELRQFNTENSAYIKLLPHTKEMVLSRFITELAITHLIKMRNFLISCNDPLLKIELNYDEPPYAKYYQTIFQTKIIFNTEATRVWFKAEELNYPIHFADDVSYQLAKRQLQELEKKMSLKEDMASKIKSILINQNLNHVSMDEIASRLCMTSRTLRRHLQRLDVTYQELLDEVREQKAKTFLLNNNISMTEICFLLGFQDTSNFSKAFKRWTGITPTEYREKHEVQ >LR134332|2303924:2314048|2306875_2308201_-|VEF65486.1|DBSCAN-SWA MELVEEGVQKINTLQDYKVAEISLADWGRKEIAIAETEMPGLMALREEFSAKKPLQGARIAGCLHMTIQTAVLIETLVALGAEVRWSSCNIFSTQDHAASAIAAKGIPVFAWKGETEEEYWWCVEQTLSGPNGWTPNLLLDDGGDLTQVVHQKHPKLLTAIKGVSEETTTGVARLYEMAKHGQLKIPAINVNNAVTKSKFDNLYGCRESLLDGLKRATDVMIAGKVALILGYGDVGKGCAQALRGQGATVLVAEIDPICALQAAMEGYRVVTLDDVAEQVDIVVTATGNYHVVTHDHMKRMRNQAILCNIGHFDSEIDIQSLKQYQWENIKPQVDHVIFPDGKRIIILAEGRLVNLGCATGHPSFVMSASFTNQVLAQIELFQNSSQYQNQVYVLPKVLDEKVARLHLGRIGAKLTQLSNEQADYIGVDKNGPYKPDHYRY |
7 | Bacillus_phage(16.67%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_7 |
2355876 : 2412478
Sequences of DBSCAN-SWA_7
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR134332|2355876:2412478|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_7 >LR134332|2355876:2412478|2389102_2389405_-|VEF65560.1|DBSCAN-SWA MSLLNQFRSNVLSSINAHIGKIFILICLLIMAQGTFAADALSAAEEVVKDTYNGSIKTYLYVGEAVAAVVTLMFTRNIKTLGGVGAMAIFLNVVAMLAGV >LR134332|2355876:2412478|2401078_2401600_-|VEF65575.1|DBSCAN-SWA MKEKKRSKTSKYLSNLVLILALSMMVSSAVISYFFIRQNELLISSLKMQAQNKQILIKDVWNNIVKKETRADIAILLSVLPVKDEVEVQAIKKDYLRDFSELTGTSSTADIVKEVKKEIERYGEYIDNLYLDQVTIQNKATAIEGSNKLYSEIAFFLQIFSVVLIILRKDFTE >LR134332|2355876:2412478|2405733_2406687_-|VEF65582.1|DBSCAN-SWA MMRTTTGYFFMAEKSYTKPALTVSQQLEFLFSQGLQIEDQKLAIRALETVSYYRLSSYLLPFKQSHNAKNPRQFKENATFEQVWQLYQFDRELRLLVADAIEKIEVAFRAALTNVTSIRFNPFWYVERNYFKAKAGANRERDFFDDYLKTIKTISTNKQELFIQHYHKNYDKPYFPPIWMMVEALSFGVCSKMFNNIQSKDVRNEIASFLGQHTTVIESWIKSLTYTRNLCAHHSRLWNRWLVIPPLIPKNAPIKTHIDGNYRFQLIAFIIDQLLETIAPESNWKIKLFELFERNEQFSGIEMGFINNWRDDPIWHC >LR134332|2355876:2412478|2394641_2396777_-|VEF65569.1|DBSCAN-SWA 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MKQMAMIFSLGLLIATAEGAQIKTVRNYEDIFINASIKEPNNLMLEDDRIQQIKAPGNTLVDACNGKANCKLIDDTTGILTFLPSPLYHTRAFTINLLTEKGLFYNVRVEPKPIASQTIVFKSYRNPVIRARAPHTSSYEKVMVGFLRALVNGYLPEGFTQTIPKNPSVYKAQKTQLKRLLTVNGNRMRGEIFELKNVTNQPIDAKESWFNWPGTKGVALAKTHLAPFETTRLYRIS >LR134332|2355876:2412478|2404897_2405203_+|VEF65580.1|DBSCAN-SWA MSFQARLDIIIIKKSGPEEGVYIRAGTTNRKADTEMIKELNRIVSNQTFDEQPLTALNSEAIDFRAALEQFEKIRKIDKKDLETVVILMDYQGKKVPTVQG >LR134332|2355876:2412478|2391880_2392555_+|VEF65565.1|DBSCAN-SWA MDMLDLYCDYLIFQNKYATATGLSDLVDGAFAHNKVTRFLRFEHFGSKSLWHYVKKPVRSQETVGGVLILDDSIEEKPYSDENEVNCWYYSHAKGAVLKGINILYCMVRYADFSVSIGYKVIKKDIAYCDIKTRQTRRKSSVNKNQLFQSLIAQAITNKVMFDYVLADNWFGSKANMVHIHKDLQKSFIIGIKSNLTLALSENDAKNGRYQQVRALELEEDILA >LR134332|2355876:2412478|2357398_2358919_-|VEF65535.1|DBSCAN-SWA MTDNLLSGAPDAFILNTKWDQLDWPSIEKNVYRLQVRIAKAVSNKQHGKVKSLQWLLVNSISAKLLAVRRVTTAKGSKTPGIDGVVWTTSEEKCEAVRNLKARGYKATPLRRIYIPKKNGKERPLSIPTLKDRAMQALYLLALEPVGETTADLNSYGFRPKRSTHDAIYQCYATLARKNCAQWILEGDIKACFDEIDHGWLKSNIIIDQRVLTQWLQAGYMEKNQLFETARGTPQGGPASPLLANMVLDGLEREIHSGCGQGNKINYIRFADDFIVTANSPDILKEKVMPIISNFLAQRGLSLSQEKTKIVHIEEGFDFLGFNVRKYKGKFLTTPSKDSIKSVQMKIKETVKKGYGWKGSELISALNPIIKGWANYHRKVVSKATFSELDNYIYQETFRWTMRKFSGHNRYKAMDRYFRNRSLTRRWIFSDVVKAKDGTKKYVCINKMMDIKIQRHVKIRSSANPYLPEYVKYFEDRKKWAKDCSFVQRIKDKQLNVIGSEYLLGE >LR134332|2355876:2412478|2394049_2394637_-|VEF65568.1|DBSCAN-SWA MIEQHLRPLYQRLCVNPITPVLIERVTPNQVTFFSGVLGLLVIPALWLNLPYLAISLLLLSGYCDTLDGTIARLTNHSSDWGSVLDIMTDRVVEVGVVFALWAINPNERGLGSLLMMASILLCITSFLVVGIFKTNDSEKSFHYSPGLIERAEAFVFFIAMMLWPNHFLSLAMIFSLLVIGTAMHRLYEFHKQSI >LR134332|2355876:2412478|2398467_2398965_-|VEF65571.1|DBSCAN-SWA MLNNSVETSINKPFISKIIQIYLSVTKVLEKIALPVLVLFMRLWMAKIFWYSGMTKISNWQSTVFLFREEYKVPFVPPEITACLATSFELACPVLLIFGFATRLATLPLLAMTAVIQFTYLDLIDHRYWAMLLALILFYGPGSLSLDHLISKKFGLLASSRGDVA >LR134332|2355876:2412478|2396795_2397677_-|VEF65570.1|DBSCAN-SWA MSEINYSTVQYYLVLILIFIYLSLFVLEKKWPLRKATRPLLPRLAINFTFTLLVYVIASLFISPLAKATVLFTFSHDFGLLSMLPFNQWVVFILGFLLMDLSFYYWHALNHKLPLLWRFHVVHHADPDLDVSTAMRFHCVEIMYSSLFRLVQLGLIGVSPLLFFCYEFFFQAHTFFQHSNIKLPFRFERLINKIIVTPRMHGIHHSNYLNETNSNYGVVFSFWDRLHQTIKLDIPQQAIIIGVPGYSKPSDNSLIRLLLMPIKAQRHYWQIKKDFHFSRKSKTSDKKVRTLCE >LR134332|2355876:2412478|2411059_2412478_+|VEF65587.1|transposase|DBSCAN-SWA MDLAIEDSAAWSEAIFGSVDLGDKRLTHRLAQIGKQLTSLPGGSLPESCEGQDALIEGSYRFLRNKRVTASQIAEGGYQVTSWLSQRIPTLLAIEDTTTLSYTHQIKESLGDLGGPKEKSNRGFHVHTTMLMDAEQEKTIGLIAQERWCRDIKERGKKNHRRVRLYTEKESYKWEKNTRELERRLGSKMSDVISVCDREADIFEYIQYKLDNHQRFIVRASHNRKLEGSYGYLFQMLPSATILGTYTIAIAQKANRKKRQAALELKTASVTFSLPERRAKARELKPITLNVVIAKEKNPSESDCLEWVLLTTEATTTLECARKITRYYEMRWRIEDFHKAWKSGVGAEEQRMQSIENLEKMIVILSFVAIRLLQLKEYFEYPTTLVINDSSTSCDELLTDAKWKVLWNSVERKSLPEKIPTAAWAYKAIAKLGGWTDSKRTGKAAWSTIWKGWFRLQERVEGLRIANELMEM >LR134332|2355876:2412478|2382375_2382984_-|VEF65552.1|DBSCAN-SWA 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54 | Wolbachia_phage(33.33%) | transposase | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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