Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134331 | Lactobacillus rhamnosus strain NCTC13764 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DinG,WYL,DEDDh,csa3,c2c9_V-U4,cas3,cas14j | 0 | 0 | 2 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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LR134331_1 | 970164-970309 | Orphan |
NA
Consensus repeat of LR134331_1
|
1 spacers
spacers of LR134331_1
>1.1|970207|60|LR134331|CRISPRCasFinder CGCAGACTTCTGCGCTGGGGAGCGCGTTATGGGCGTAAACCAGAATATAAGCGGCCTTAA |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134331_1
The CRISPR arrays of LR134331_1 >merge|LR134331|1|970164-970309|CRISPRCasFinder GCGTGATGGCCGGTCTTTGGCCATTGCGCCCAAGGTCCTTACACGCAGACTTCTGCGCTGGGGAGCGCGTTATGGGCGTAAACCAGAATATAAGCGGCCTTAAGCGTGATGACCGGTCTTTGGCCATTGCGCCCAAGGTCCTTACA >LR134331|1|1|970164-970309|CRISPRCasFinder GCGTGATGGCCGGTCTTTGGCCATTGCGCCCAAGGTCCTTACA CGCAGACTTCTGCGCTGGGGAGCGCGTTATGGGCGTAAACCAGAATATAAGCGGCCTTAA GCGTGATGACCGGTCTTTGGCCATTGCGCCCAAGGTCCTTACA
>LR134331.1|VEF59601.1|969521_970061_+|acid-resistance-membrane-protein MLNRKSFGFDWGQFITGILFLIAAFVVLRYPLATLKTVTFIFAVVAIIRGIAILAGYSTLRQFTGKLAWISLLMGIFDLVIGLVFLLNAGFGMATITMMFAIWFLVDSVGSLFNVGHLRIAGTGWFILYLILDILAVIVSLMLFMQPVVAAVTLVTLLAMFFVLFGIECIVIAFARRNI >LR134331.1|VEF59599.1|966425_969320_+|excinuclease-ABC-subunit-A MANDKIVIHGARAHNLKNIDVTIPRNKLVVMTGLSGSGKSSLAFDTLYAEGQRRYVESLSAYARQFLGQMEKPDVDSIDGLSPAISIDQKTTSKNPRSTVGTVTEINDYLRLLWARVGHPICPNDGTPITSQSVEQMVDRVLALPEKSRIQILSPIVRRKKGSHKKVFAKIMREGYVRMRVDGEVMDATADYELDKNKAHDIDIVIDRIVVKPEARSRLFDSFEAALRLSEGYANVDVIGGDTLRFSEHFACPICGFTIGEMEPRLFSFNAPFGACPECDGLGVKLTVDMDLVVPDPSMTLAQGAIAPWNPISSQYYPELLAQAATAFKVRMDVPFKKLTKRERNVVLNGSDGKPFHFHYENDFGGVRDVDVPFEGVLTNISRRYAETNSDFTRQQMRGYMTALPCPVCHGKRLNRQALAVKISGRDIAEVSDLAIKDALPFFKQVHLSEAETVIAQPIVKEVVDRLTFLVNVGLGYLTLSRSAGTLSGGEAQRIRLATQIGSNLSGVMYVLDEPSIGLHQRDNDRLIASLKKMRDLGNTLIVVEHDEDTMRAADYLIDVGPGAGEHGGRIMASGTPKQVARVRKSITGQYLSGRKFIPVPLKRRPGNGKVIRLEGASDHNLKHINVDFPLGKFIVVSGVSGSGKSTLVNSILRRALAQKLNHNSEKPGPYDKILGYKNIEKLINIDQSPIGRTPRSNPATYTSVFDDIRGLFAETNEAKLRGYKKGRFSFNIKGGRCENCKGDGIIKIEMNFLPDVYVPCEVCHGKRYNSETLEVTYKGKNIAEVLDMTVEEATAFFKNIPKIRRKLQTIVDVGLGYVKLGQSATTLSGGEAQRMKLASELQKLSTGKNFYILDEPTTGLHTDDIKRLLEVLERLVDEGNTVLVIEHNLDVVKTADWVIDLGPEGGDGGGQVIATGTPEEVAEVADSYTGQYLKPVLIRDTKRTKEAAAGSSKQAKATKTSTK >LR134331.1|VEF59597.1|964229_966245_+|excinuclease-ABC-subunit-B MIERIADRKFDLVSPYKPAGDQPQAIAKLTKGFEEGKKAQILLGATGTGKTFTMSNIIANLNKPTLILSHNKTLAGQLYGEFKEFFPHNAVEYFVSYYDYYQPEAYVPSTDTYIEKDSAINDEIDKLRHSATSALLERNDVIVVASVSSIFGLGDPHEYKNHVLSLRTGMTIDRNTLLRQLVDIQFDRNDIDFQRGRFRVRGDVVEIFPASRDDHAIRVEFFGDEIDRITEVDALTGEVIGTRDHVAIFPATHFMTSDEQMERAIKSISAELEDRLKVLRGENKLLEAQRLEQRTNYDIEMMREMGFTSGIENYSRHMDGRKPGEPPYTLLDFFPKDFTIMVDESHVTMPQVKGMYNGDRARKQMLINYGFRLPSALDNRPLKIDEFEKHVKRILYVSATPGPYELSRVPKEDIAEQIIRPTGLLDPKIEVRPVMGQIDDLVGEINKRIDAHERVFITTLTKKMAEDLTDYLKDMGIKVRYLHSDIKTLERTQIIRDLRLGKFDVLIGINLLREGIDVPEVSLIAILDADKEGFLRAERSLIQTIGRASRNEHGKVIMYADKVTDSMKAAIDETRRRRAIQEKFNEEHHIQPKTIIKPIRAAISTYEQSDDEKADAKKTFAEVDYEDMSKADKKELVANLRSQMQAAAKKLDFEQAASLRDTILELQADMS >LR134331.1|VEF59595.1|963189_963837_+|HD-superfamily-hydrolase MGMHQFIQGLSNLETLRRAPGFFKYQEHSVAAHSFKVAEIAQMLGDVEELAGNKVNWQMLYEKSLNHDYTERFIGDIKTPVKYATPTLRQMLADVEATMTENFIKNEIPHDFQDRYRRRLSEGKDETLEGQILSVADKIDLLYEGFGEIEKGNPEQVFLDIYSESLSTILQFKNRPSVRYFLDEVLPDMLDEKFASRDQLAKLTKETMAEHETGK >LR134331.1|VEF59593.1|961136_962603_+|FtsX-like-permease-family MLAFPAFLIGIGMGIGGLAVAFHILNQRFIVQGNTFRLFLVIDWWPIFLGAIFMFLVTLVAAWRPAHRAASVSPIAAVQMLPESVKISRRSRRLSPIERLLRSPTAKLAYKQYRRLGWSKLTMIATLSLSLMIFIGLTGFFRSVLTLNNETFTQQADVTIASTAAVDAIPWTFEPSEDAGIKQATVTGTKQMQLAHAPKAFGDKINIIVVSDRLFQTAFQNQPTVLTSSQLVVNSKTGQREQRWQLPRDFSGTLQLINRRGEKQFTQSIRVVTKTTAALGKWQFGDQSGLVLSRDRYLKLLKALAINDRELDYSIQTQLTQAKFHDSVAKILRKMVPQGALNDQIANRAQESSFGLAIQVMVYGFLTLLTLVSLANIVNHIFANLLQRRRSLAMLQSVGMTPRQITSMIGLENGFLFGTSLVIGSILGTGLTWLLYRVANTGIAFNYRVPWQEILIAGGMLMLIWAVFTGVSHQILKHQDLDQLIWLS >LR134331.1|VEF59591.1|960233_961130_+|FtsX-like-permease-family MMGIVGHLTKEQLLGQKARTVTTILAMAVAATLTLATLIGIYSARHSMYQKNIQSTGGMQFAISQLDRQTAKAIGKDSAIAKSVVYQRQGTVDIKEPGVAKTMASPLLTLPKAAMQRLVKPVVLAGRLPKQPNEAILAQDLVTKQYRIGQIIQSRQQGKNIQLRIVGSYRGYAGLLPPDGVLTLGTVTGSKDYTVAAAFRDYSNFYGKLHALTSQHRVHSRQLAINNMALERAGESRDVKLRVMFALLVVVILSVIGFVSLALIYTSINLSVRSQTQRYGLLRSIGATPKQLRRLVYS >LR134331.1|VEF59589.1|959566_960232_+|ABC-transporter-family-protein MAILTARQLTKQYAGEAHPALDHANLTIEQGEFVAIVGPSGSGKSTLLHLLGGIDQPTSGEVRLYDTDIYALNQTQLAIFRRRQVGLIYQFYNLIPNLTVAENITLPADLDGRSIKEAVLTEMLTTLGLVEKASALPNQLSGGQQQRVAIGRALINHPAVILADEPTGNLDRRNSQDVMTLLRQANIKQGQTLVVITHDPDIASQADRIVRIDDGVVSGGR >LR134331.1|VEF59587.1|958456_959467_+|histidine-kinase-,-DNA-gyrase-B-,-and-HSP90-like-ATPase-family-protein MVKHAYWTMPETRQVFQLTAILIGILWTVLLLTSITVPDMRIWLVLVGGLATGISVWLTWCWARKFSYHFDQALLQLDMTKETEDNYLIDRNDEGLFSDFNNRLYHYARQMQAEREAIKRDRDHLNEAITDIAHQLRTPLAANSNLLEMMTESNWKTTRLALQAQQQHQAQLIEQLILLAKVDTHTLSQRREIVVLTDLGKAALSPFLRQIADKEITVDWQVPPALTINVNSVLVKEAFANVFKNAVAHTPVGGRMSVRGIGDPVRTRLMIMNTGQPIAAQDLPHLFERFYRGQYATANNVGIGLAIAAGITTANDGRLTAANTANGVQMTFEFFR >LR134331.1|VEF59585.1|957816_958464_+|transcriptional-regulatory,-C-terminal-family-protein MTYLIIEDEPALGKTLQTYFSRDEEVWLAATLAKATTIVKTEHPALIILDLGMPDGDGLAWLKRWRAYLTAKVIVLTANDDESTTIAGLDLADDYVVKPVSLKVLKARIAKQLPGESQQFGAVALNLRTGQVTKNGKPVRLTSAEQRLLAYFFVNPNQILTREQLLAALWDTREQFVADNTLTVTIKRLREKLEDDPAKPTLIRTVRGMGYFIDG >LR134331.1|VEF59583.1|955826_957554_+|phosphoglucomutase MSYRDTYQQWVDEPTLDPELKTDLKKMADDETTKEEAFAEPMAFGTAGMRGVLGAGIGRMNIYTVRQATEGLARFMDTLTDETKARGVAISYDSRYMSQEFAYQSAGVLGAHGIKSYVFDQLRPTPELSFAVRHLKTYAGIMITASHNPKQYNGYKIYGPDGGQMPPEESDKITKYARSADDLFAIKALNVHELRAKDLMQPIGEDVDEAYYAEVATVTINHDLIKTVGKNMSLVYSPLHGTGRIPAQMVLRNAGFENFRLVAKQSVADPEFATTPFPNPEFAQVFDLPIELGKKIGADVLIATDPDADRLGTAVKVGDHYQLLTGNQIASVLLHYILEARKQAGTLPKNGAVVKSIVSTELATAIAKDYGVDMINVLTGFKFIGDQIKHFQATGEHEFLFGFEESYGYLIKPFVRDKDAIQSTVLLAEVAAYYQSQGKTLWDGVQELYKKYGYYAEKTVGVDFEGVDGPKQMANLMTKFREEQPDDFAGVKIAKVEDFLSQEAKSADGTVEKLTMPSSNVLKYILADGTWIAIRPSGTEPKVKFYVGTKADTDAKAQEKLDAFEKALDAFRKEA >LR134331.1|VEF59603.1|970457_971345_+|putative-P-loop-containing-kinase MTESLDLVIITGMSGAGKTVAMQAFEDLGYFCVDNMPPALLPKFWELVKESGKISKVALVVDLRSRAFYDQIIDMLANLDNNAYVHSRILFLDATDEELVSRYKETRRSHPLAMEGRLMDGIKKERVLLTELRNRAQVVIDTTTLSPRQLREKIFLNFKENNSQPAFHIEVMSFGFKYGLPIDADIVMDVRFLPNPFYIKAYRPKTGLDPDVYDYVMDNEDAESFYNKFYALLAEIMPKYKAEGKTSVTIAIGCTGGQHRSVAFAERIGKAFSDAYAVDITHRDIKKHKETVNRS >LR134331.1|VEF59605.1|971341_972370_+|Uncharacterized-UPF0052-family-protein MSRETKFIRVIRGRRPKVVVIGGGTGLPVILHSLHEQDADVTAIVTVADDGGSSGTIRNYINVVPPGDIRNVLVALSELPSLYLDIFQYRFNTTDAFFAGHAIGNLIIAALSEMKGGIFPAVQQLSEMMQVDGHVYPASNTPLTLNAEFTDGTKLSGEAEITAAGKNIKHISVSETDPANGEPKAVQEVIDAIMDADVVVLGPGSLFTSILPNLMIGNLGDAVKKTKAEVIYIVNIMTQKGETQNFTDADHVRVLNEQMGENFVDTVLVNIEPVPDNYLDHQKYNEILTPVKHNYQGLRDMGCRVISEDFLKLRDRGVFHDGDKVAKEILNLAFQVSAKTRR >LR134331.1|VEF59607.1|972374_973322_+|Sporulation-transcription-regulator-WhiA MASFASIVKKELTQLEVHPEHAKAELSALIRMNGSLTLMAHRFVLNIQTENPAIARRIYSLIRQVYHHEANLVVHRKMKLKKNYQYIVRLTEGVNDILSDLAILDPTTMAISTTVPASVLKEPQRMRSYLRGAFLASGSVNNPETSRYHLEIYSLYADHNAGILKMMNHFHLNARTVERRSGYIVYLKEAEKIADFLQVIGATNAMLKFEDIRIVRDMRNSVNRLVNCETANMNKTIDAAQKQIENINYLKDHVGLDNLPTKLREIAVLRLAHPDVSLQELGAMVPGGTISKSGVNHRLRKLNQIAEGYQQPEDA >LR134331.1|VEF59609.1|973612_973861_+|transcriptional-regulator MVKPITLDEQLCFAIYKAQKQYNHFYAQALAPFKLTYPQYITLLSLYEHGTMSVKQVGQTLELDSGTLTPLMKRLDQSQTLN >LR134331.1|VEF59611.1|973880_974054_+|transcriptional-regulator MSLTKKALDARDQIFEHVGSCMKLMNLPQSEYDHIKSEVARVDEHLSAIADNAYPEA >LR134331.1|VEF59613.1|974173_974764_+|ATP-dependent-Clp-protease-proteolytic-subunit MLVPTVVEQTSRGERAYDIYSRLLKDRIIMLSGEVNDQMANSVIAQLLFLDAQDSERDIYLYINSPGGVITSGLAMLDTMNFIKSDVQTIAIGMAASMASVLLAGGTKGKRFALPNSTILIHQPSGGAQGQQTEIEIAAEEILKTRKKMNQILADATGQTVEQIKKDTERDHYMSAQEAKDYGLIDDILVNKNNQK >LR134331.1|VEF59615.1|975959_976997_+|central-glycolytic-genes-regulator MHTELAWLKAIAPDLMGVVTKRYQVLQFINWMAPVGRRTLAEQMKISERALRTETDFLRGQGLLESSKSGMVLTAKGLETFHGLDHLMNQLLGIKDDEKRLATHLEIDHCLVVSGDADQSSRVLDELGKTLNSTLQLLLPPGHLTIAVMGGTTMAHLASQLTFQLSAGRELSFVPARGGLGEAVTIQANSIAAAMAEATDSKYRALYVPENLSSESYESLIKEPSVKEVLTLIDKAQVVIHSVGDALVMAKRRGMSPDTIRMLKAKHAVAEAFGVFYDAEGKVVYKIPQIGLQLADLDHIPYVFAVAAGKSKAKAIAAYMQHAPSRTWLLTDVGATNSILTGATR >LR134331.1|VEF59617.1|977033_978056_+|glyceraldehyde-3-phosphate-dehydrogenase MTVKIGINGFGRIGRLAFRRIYELGAKSNDIQVVAINDLTSPTMLAHLLKYDSTHGTFPGEVSATDNGIVVDGKEYRVYAEPQAQNIPWVKNDGVDYVLECTGFYTSAEKSQAHLDAGAKRVLISAPAGKIKTIVYNVNDDTLNADDKIVSAGSCTTNCLAPMAYFLNQEFGIEVGTMTTVHAYTSTQMLLDGPVRGGNLRAARSAAANTIPHSTGAAKAIGLVIPELNGKLQGHAQRVSVVDGSLTELVSILKTKNVTADQVNEAIKKHTENNPSFGWNEDEIVSSDVIGTTYGSIFDPTQTEVTTAGDYQLVKTVAWYDNEYGFTCQMIRTLLKFATL >LR134331.1|VEF59619.1|978238_979429_+|phosphoglycerate-kinase MAKLIVSDLDVKDKKVLIRVDFNVPIKDGVIGDDNRIVAALPTIQYVIDHGGKAILLSHLGRVKTEEDKAKLTLKPVAERLSELLKKPVTFVPATRGKELEDAIAKLNDGDVLLMENTRFEDLDGKKESGNDPELGKYWASLGDLFVNDAFGTAHRKHASNVGIASNMKQTAAGFLMEKEIKFLGDAVDNPKHPFIAILGGAKVSDKIGVIENLVPKADKILIGGGMTYTFYAAKGMSIGNSLVEKDKIDLAKKIMDQAGDKLLLPVDSVVAPEFSNDAPHKVVEGDIPDGYMALDIGPKTIQEFKDALKGAKTVVWNGPMGVFEMSNYAEGTLEVGRALGDLKDATTIIGGGDSTAAAKQLGIAPKITHISTGGGASLEYLEGKTLPGIAAISDK >LR134331.1|VEF59621.1|979506_980262_+|triosephosphate-isomerase MRTPFIAGNWKMNKNPKETQAFLDAVKGKLPDASKVETVIGAPAIDLTTLVAGAEGTPLKTAAENCYFEDEGAFTGETSPKALKEMGVDYVIIGHSERRGYFHETDEDINKKAKAIFKNNLLPIICCGESLAQREAGQTEDWVASQIEAALAGLSADQVKVSVLAYEPIWAIGTGKTATADQAQEVVAHIRATVEKLYNKDTADAVRILYGGSVKPANVKELMAKPDIDGGLVGGASMDPDSFIALANYQD |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
838653 : 892687
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134331|838653:892687|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134331|838653:892687|889183_889855_-|VEF59458.1|DBSCAN-SWA MLHRRSLPLYFSGTAFMIFIIFLIGILNQASWIQTTDQHVIAFVTRFHVDALKPILIVITELGNPSILIFLTLGLAGVLLIYRYRIAALFTASVGAMMGILNIGIKYLVQRPRPFIADPQIRALVQAGGFSFPSGHSSGTMMFYGTLILLAWTFVRRPTVKWTITLLAGGMIGLTGYSRIFVRVHYPTDVFAGFALGFALLMLSWWYFSPYFSRRHQRHEKSR >LR134331|838653:892687|879105_880122_+|VEF59442.1|transposase|DBSCAN-SWA MTHSQTNTHKHYQQLSFSDRATIQALQAAGDTATVIAQKLHRSKATISREITRGSVTQLDSKRHSHQVYLAETAQAMHDRKRDRTGHYAFLKTGRAFFKALARELTRKPRVHSVDSFVHFYRDQGKACPSTTTVYRYIDAGLLELDNMTLPKKLRRRIKGYKNAHKRKNKKIYGDSIELRPAAVNDRTGVGHWEGDLVKGIRLADEPALMTLTERYSRTEIIVKIPDYHAGTCLKALQDTIDDYGAKEFESITFDNGSEFAKLSEIVGTQIYFAHPYSPWERGTNENANGLLREFFPKGKSLRAVTLVEIQAVQSALNHRPRRILNYLRPCDYYRCMA >LR134331|838653:892687|849465_849930_+|VEF59375.1|DBSCAN-SWA MNKKLTFTVTVLAGLMFGAGATTIADNVWQGHQNIVETKNNIDKLTAKIHASKSSLSDLQHQLSDAQAQYASLKQQYDNDMASKDAEIQQKIIEGQRAVAQKQAEVDAKQQTINDLTSQLEAAKQANNDLSQAIKDAQSIKDYSDQAVKSVNAK 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65 | Lactobacillus_phage(86.67%) | head,transposase,tail,portal,tRNA,integrase,terminase | attL 818250:818309|attR 881783:881858 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1048242 : 1060813
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134331|1048242:1060813|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134331|1048242:1060813|1057242_1057422_+|VEF59777.1|DBSCAN-SWA MTFIRAMTLVFNVQTVLLLLGLICMVVGIWWLFGFGVGMLAVGTTLISVAVIINFNKGR >LR134331|1048242:1060813|1060197_1060488_+|VEF59783.1|DBSCAN-SWA MSVTTEDLKRALRISHNEDDAMLSAYLLTAKQFVISAVDQTLTDENFGDDPRFDFAVSLLAQHWYINRGVDGATYVPDSVVSMIQQLRGVDYATGK >LR134331|1048242:1060813|1050995_1051187_+|VEF59761.1|DBSCAN-SWA MAQRVSTKFGWQWHDYVQADADCDRYWAAKKAEKRSLIEATKKSPRAATQGEKKTSEKIYIDF >LR134331|1048242:1060813|1054183_1054525_+|VEF59771.1|DBSCAN-SWA MTKTAYRKAALVDVKHDRDKWAELGALVKERYLVRSMTPKDWFIIVKQREGYEIEVYPTFEMSDGFQFSHVNLLTRSSYGSISHIAYHELCSSASDTISSIDRMIDLVKDKRY >LR134331|1048242:1060813|1050663_1050885_+|VEF59757.1|DBSCAN-SWA MNLFSKEEIALDHELGNLIDDIQLNVHGIAEDSTVTVDGKYIPNSELAVTTAKELLRVSEILKMYENEDDADD >LR134331|1048242:1060813|1050877_1051012_+|VEF59759.1|DBSCAN-SWA MISIITWLLSHPLIVPALCMAFMVGAVCGAYAQFSEDDRHGTKG >LR134331|1048242:1060813|1058597_1060142_+|VEF59781.1|head,protease|DBSCAN-SWA 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18 | uncultured_Caudovirales_phage(28.57%) | head,tail,portal,protease,integrase,terminase | attL 1041758:1041771|attR 1050464:1050477 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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