Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134439 | Erysipelothrix rhusiopathiae strain NCTC8163 genome assembly, chromosome: 1 | 0 crisprs | DEDDh,csa3,WYL,cas3 | 0 | 0 | 2 | 0 |
1. LR134439
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| DBSCAN-SWA_1 |
204731 : 213579
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134439|204731:213579|DBSCAN-SWA TATGCGTAAATTGCCTTACAGTCAAGACGCTGAGATGGCTCTTTTAGGAACGCTATTGGTGTTCCCAGAGTCAGTTGCAGTTGTTGAAGAATATGATATGCAAGTCGATGACTTTTATAATACCGAGCACCAAAAAATATTTTCTCATATGTTAGAAATTATTGAACGTGGTCGTGTTTTAGATGCAACGACTTTAATAACCCGATTAAAAGATCAACACGAAATTGATAGTGTGGGTGGTGTGGAATACTTGTTTGCACTTACAGAAAACAGTGCAACACCAGCAAGTGTGAAACATTATATTGAAGTTGTTCAAGAAAAAGCTCAAATGCGCCGACTCATTGATGTTGGGCAGTCTATTGCTGAAAAGGGTTTTGACTCTACTACTGAACTTACAGCACTGCTTGATGAGGCAGAACAGAGAATTTTAGAAGTAACACGAGTTCGTCGAACAACTGAAATGCAACGCAGTCGTGAGGTCGTAAATGAAGTAATGGAGAATTTAAACCGAATTCGTGATAACCACGATCGCATTACTGGTTTAAAGACCAATTACAGTCATTTAGATAATGTCACAAACGGTTTGCAACGTGGCGATTTAATTATCTTAGCGGCGCGTCCATCTGTAGGTAAGACGGCTTTTGCCTTAAACCTTGCATTGAATGCAGCACGTCACAATAAAGATGAAAAAGCAGGAATGGCGATCTTCTCCCTTGAAATGCCTGCAACACATTTGATTTCACGTATGTTAAGTGCGCAATCTTCTGTTAAGAGTGAGTATTTACGAACGGGTAATCTAAACGATGAACAATTAAACAACGTCTATGCAGGCGCCAATGTTTTATCGAAACTCAATATCTTTATTGATGATAGTTCAACAATTACAGTTCCTGAAATTTTTTCGAAATGCCGAAAACTAAAATCCGAAGGTAATTTAGATATGATTGTGATTGACTATATTCAGTTGATTTCAGGACGTGGGAAAACAGAATCACGTCAACAAGAAGTTTCGGAAATCTCACGTGGACTCAAACAGTTGGCCCGTGAAATGGATTGCCCGGTTATTGCGCTCTCGCAATTATCACGTTTAGTGGAACGTCGAGACAGTAAAATTCCTCAATTGAGTGATTTACGTGAATCTGGTTCGATTGAGCAAGATGCGGATATTGTAATGTTCTTGTACCGTGAAGATTATTATAAAGACCGCGAAGGTGAAGAGGATGATGGTCCTCAAATGCCGAAACCAGAACAACAAGAAGTATTACTAAAAATGGCGAAACACCGTAATGGTGCATTGGCAGACATTACACTCATGTTCAATGCTTCCATTAGTAAGTTCTATGGTGTTGCCGGAGACGGAGGTAGAATGTAATATGAAAAAACATAAAAACCTCATTATGATATCTGTCGTATTTCTTTTTGCGATTGGGTTAGGGTACCTTTATAAGTCACCAACTTCAGCATCAGAAATTAAAACAGCGTATGAAGCAATCGATTCATCATCTGCTATATTTCCACAAGAAGTTGTAACTGTAAATGATAAACCTGTAGTGATTACAAAGCTTTATCGCGAACAAAAACTAGTAGGGGTCTTGAAAGATTCGACACGTCTACAGAAGATGTTTGATGAAGTGTATGAAAATGAATATAAAGAAGAATTCCCAGATTCTAAGTTGGGATTCATTGATGACCTTATTCAAGTAGATGAAATGAGTTTCAATGTTTATGAAGATCGTGATAATGATATTTTTGACTATCTCTATAAAGAAAACTTATTTGCGATTGAGGCAAATAAAGTCACATTCTCAAATGGAGCCATCATCTATGTAAAGAATTCTGAAGATTTTGATTCAGCGCGTGATAAATTCATACAAAACTTTACCAGTGAGAGCACATTTGATGCAATCAAAAATAATAAAAAAATTCCTGCAATTACGGACTATGGAACTAAGGATATTGATGTAAAAGTTAAAGAAACCGTTAAAGTAACGCGGGGACTTGCGACGAAGGATAAAATCCTAAAAGATGAAACAGAAATTCTGACATTCTTAAGTTATGGGTATAATCCAAAAGTTGAAACTTATAAAATTAAACCATTTGATACATTAGAAGGTATTGCATATCACAGTGGTATGAACGTTAATCAGATTCAATCCATTAATGCGGATAAAATCAAAGATGTGAATCAGGTGCTTGAAGTTGGATCAGAGCTTCGAGTAAGTAAGTTTGATTCACCATTCACAGTTACTGTAACCAAGCAACGTATGACGACGGAACCAGTATATCCTGAAAAAACAGTATATCAATCCGATCCAGAACTTGCGGAAGGTAAAGAAGTTGTGGATGTCGTGGAACAAAATGGTGCTCGTGATGTTATTTATGAAGATGTTTATGAGAATGGTGCATCCATCTCAACGAAAGAAATATCAAGTAAAGAAACTAAGAAACCAGTACGTGGTGTTATTCGATATGGTACAAAAGTTGAACCTAAAGTTGGTAGTGGTGCATGGCGTTGGCCTTTAGATAATGCCTATGTTCTTTGTGGTTATGGTTGTTATCCAAATCACTCGGGTACAGACTTTTCAACACACGGTAGTGGCTATGGACCAATCTACGCAATTGACCGTGGTGTTGTCACAACAAACTCATACGATCCAGGAGGATGGGGTAACTATATCGTTATTGACCATGGTAATGGATACAGATCCCTTTATGCCCATATGGCAAGTCCAGGTTATTTCCAAGCAGGACAAACTGTCGCAAAGGGTGAAAACATTGGTTATGTTGGTATGACGGGTCGAACAAGTTATCCACACGTCCATCTTGAAATTATTGTGGGTGGTGGAACACGTGTTGATGCATGTGGTGTTATTGGCTGTTAGTTTTTATCAAATCGAAGTATAAACGAGATTACGGTCTCGTTTGTGCTTTCCAAAAGGAGTTGGTCTAATGAAGCAACATAAAGAACTGAAATTAATCCTGATAACTTTTATAGTCTCAGTACTTATTACGTATGCAATCGAAACAGTGAGTGCGAATACGAGTGTTGTGGATTTATACAAATTAACCGACACATCTACATCAATCTTTCCACAAGAGTCTGAAGGAAAGTCTGATAAACCCATTGAAGTCACAAAACTTTATCGTGACGAAAAACTAGTGGGCATTATCAGCGACGGTTCGAAATTAAATAAGATGTTTGATAAGGTTTACGAAGAAGAATATAAAGCTGAATTCCCAGATTCAAAGCTAGGTTTTATCGATGACTTAATTCTCGTTAAAGAATTGAGCTTTAATCACTATGAAGATCGTGATGATGAAATATTTCAATATCTCTATGATGAAAAACTCTTTGCGATTGAAGTAAATCAAGTTACATTTTCTAATGGTGCGATCATTTATGTTAAGAATATCGATGACTTCAACAAAGCACGTGATACATTTATTCGGAACTTTACAGATGACAAAACATTTGATGCGATGAAAAACAATCGAAAAATTGAAAGCATCAAAGATTATGGGACACATGATGTTAATGTGGAAGTAGAAGAAACAGTTCAAATTAGCAAAGGATTGACATCCAAAGAAAATATTCTTATGAATGAAAGTGATGTTTTAACCTTTCTAAGTTATGGATATAATCCAAAAGTTGAAATTTATGAAGTCCAACCGTATGACACAATCGCAGGGATTGCTTGGCATAAAGGTATGGATGCAAATCAAATAAAATATATAAATAGTGATATAATTAAAGATGTAAACCAGGTGCTTGAGGTTGGATCGAAACTTCGAGTCAGTAAGTTTAATTCTCCTTTTACCGTTAAAATCACTCGAGAACGAATGACCTCAGAAGTTGTTTATCCCGAGTCAACAATCTACGAATCTGACCCAGAATTATCTGAAGGGAAGGAAGTTGTGGATGTTGTGGAACAAAATGGTAAGCGAGATGTGGTTTATGAAGATGTTATTGTGAATGGTGCTCCAAAGTCTTCGGAGGAAATTCGAACACAAGTAACGAAAGAGCCGATTCGTGGAAAAGTTCGTTATGGTACGAAGGTTGAACCACGGATTGGGTCGGGTAACTATCGTTGGCCGTTAGATAACGCGAATATTTCATGTGTCTATGGAAATTCATGTTACTACAACCATAATGGAACTGATTTTGTTCTCAATGGTGGTGGTTTTGGTCCAATATATGCAGTTGACCGAGGTGTTGTATCGGAAACTGTAAGTGGTTGTTTTGAAGGAAATTATGGATGTGGAAGTGGTTGGGGTAATCATATTGTGATTGATCATGGTAATGGTTATACAACGCTTTATGCACATATGGCTACAGGTCCTTACTTCAATGTTGGTGATCTTGTAAAACGTGGTGATAATATTGGATATATGGGTATGACAGGTACAACTTATGGTCCTCATGTTCATTTAGAGTTCCGCTATCACGGCGTGCGGGTAGACCCATGCACCGTAATGGGATGTTAGGTAAAGGAAGATGTTTATGAAATATTCAATGCTTGCGAGCGGTTCTAAAGGGAACTGTTGTCTTGTAGAATCGCAAGGGGTTCGAATTATGATTGATTGTGGAACCACAAAGCGTTATCTCAAACAAAGTTTTGAATCGCTAGCGCTAACATTTGATGATGTGGATTGTGTTTTGATTACACACGATCATGGTGATCATACTAGTCAGTTGAAGCATTTTGCTCACCATCAAATCTACTGTCCTTCGGAGATTATGTTTAACCATACAAAGGTAGAACCGTATACCCCATTTCACGTTGGACCGTTTATAATCACGGCAGTGAAAACATCTCACGACGCGGATGATTCAGTAGGATATATTGTTGATGACGGGAGTCGTAAACTTGTGTATATTACCGATACGGGTTACATTCGTGAGCAGGATTTTGAATTGATCAAAGATGCCGATTACTACATCTTGGAAAGCAATCACGATCCTGAATTACTGATGCAAACCAATCGTCCTTATGCCATTAAGCGTCGTATATTATCGGATACAGGTCACTTGTCTAATGAAGAAGCGGGTGTTCTGTTATCTAAAGTTGTTTCGGAAAAAACAAAGGAAATTTTACTAGCCCATCTTAGTTCGGAAGCTAATGATGAATATTTAGCCTTGTCAACGGTACGTGAATTAGTTGATAATGAGGGGATTGAATTCAATGTCGCTAAACAATTTGAAATTGTAATTGGAGGATATCAAATATGAAAAAAGATCAAGGATTTAAAAATACATTTATTGGAATTTTAGTTATTTTACTTGCATGGAATGGATTTCTAACCTATCAAGTCTACGACCTAAACAATCGTCCAACAGTCACTGAGAAGACCGAAGATGGTAAAACTGTAGAAAAAGTTGTTACAGAATTTGAAACAGATCCAACGAAAGTCGTTGAAAATGTTCGCGACCAAGTTGTGAGTGTATTAAATGTCCAAAGTGGACAACTTGCGGGTAGTGGATCAGGTGTAGTGTACAAAAATGAAGGTGGTAAGATTCACATTATCACCAATAATCACGTAACTGAAAAAGGTGAACAATACTATGTTCAATTCTCAAATGGCGAAAAAGTAGAAGCGAAACTTTTAGGCGCGGATCCTTTTACAGATTTAGCACTACTTCAAGTAGAAACTGATTCGGATGTGAAGCCAATGAAACTGGGGGATTCTTCTGTTGTTAAGGTGGGGGAATTTGTCCTCGCTATTGGAAGTCCAGTAGATTTAGAATTCGCAAACTCCGTAACATTTGGAGTTATTTCTGGAAAAGATCGTAAAGTTCCAGTTGATTTAAATGGAGACCGTAATCCGGATTGGGATATGGTTGTAATGCAAACAGATGCTGCAATTAACCCGGGAAATAGTGGTGGAGCACTTGTAAACATGAATGGAGAATTAATTGGTATTAATTCCATGAAACTCTCTTCAGCTCAAGTTGAAGGAATGGGATTCTCAATTCCTATCAATGAAGTGGTTCCAATCATTAAACAAATTGAAGAAACTGGAAAAGTACAATATCCAGTTATAGGGATTTCAGGTGTTTCGGTTTCTGAAATGAACCCATTCCTTAAAAATTACTATAAAGTTCCTTCAGATGTAAATGCGGGAGTATTTATTGCTGAGTTAACTCAAAATGGACCAGCACGTAAAGCAGATATTAAAGAGGGTGACATTCTAACCCATATTAATGACAAAGCCATTTCGAGTTATCGCGAGTTTAGACGTGAACTATATGCACATAAAGTCGGTGATACCGTTAAACTAACGATAAATCGTAATGGAGAAATTCACGAGGTAGAGGTAACATTGCAGTGATAAAAATTATCGCAATTGGAAAAATTAAAGAAAAACCAATGCAAGCACTGATTCAAGAATATGAGAAACGCCTTAAACCCATTCATTCTGTCGAAATGATTGAACTAACAAACTCAAATAAAAGCGATGTTACGAGTATCATTGAAGATGAATGTCAAAGAATACTTGAGAAAATTGATGATCGCGACTATGTGGTATTGATGGACTTAAGTGGAAAAGATTTGGACTCGGTTTCGATGAGTGAAAAAATAATGGATCTCATCGATATGGGAAAGCCAATCACATTTATTATTGGTGGTTCTCACGGTGTAAACCAATCAATAAGAGAACGTTCTAACTATCGTTGGAAGATTTCAAACCTTACTTTTCCACATCAACTTGTCCGCCTTATGTTGTATGAACAAGTGTATCGGTTTTTTATGATTTCAAAAAATCATCCATATCACAAGTAAAAAAAGACTAATCATTGTATTAATCTTTAAAATAGTATAAAATTGAAATGAAAAGTAGGAGGTTATACTTATGAAAGAGATTACAGTAACAGTTATTGATCCTGTTGGATTGCATGCGCGTCCTGCAACCGTAGCAGTAAATGCAGCAAGCAAATTCAAGAGCGAAATCAAAATCAGCTACAAAGGTAAAGCTGTAAACATGAAGTCAATCATGGGCGTTATGTCATTAGGAATTCCAACTCAGTCAGAAATCGTTATTTCTGCTGAAGGCGAAGATCAAGATGATGCAATCGCTACAATTGAAGAAGTACTAAAAGCACAAAAAGTAATTGCTTAATTTTATAATTAGAATAAAATAGAAGATGAGAATCTTCTATTTTTTTTATGCAGGAGGGAATTATGTCATTAGATAGATGGAATGAGTTGGCTCGCGATTATTCATGGATTGAGGAAGCAATGCAAACTATGGATGAAAGCACAAAACATGACGCTTTTTATAAGTCATTAGAATTTGGTACTGCAGGTATGCGCGGATTATTAGGAATCGGACCTAACCGCATGAATGTTTATACGGTAGCGAAAGCAAGTGTGGGATTTGCGAAATACTTAGTTGAGACATTTAAAGATCAAGAATTAAAAATAGCGATTGCATATGACAACCGTCATATGTCTAAAGAATTTGCGGACGTGAGTGCGATGGTATTATCAACTTACGGGATTAAAAGTTACATCTTTTCACAACCTCGTCCAACACCCGAGTTATCATTTGCAGTTAGAACGTTAAACTGTGTTGGTGGAATTGTTATTACAGCAAGTCATAACCCGAAAGAATACAATGGTTACAAAGTATACGATGAAAATGGATGTCAATTGGTGGATCACAAGATTGCTCGTGTTATTTCTCTTATCAATGAAGAACCGGATGAAACGAAGGTGGATATCAATCAGGGTAATCGTTCAATGATTACTTATATGGAAGCTGATTTTGATGAAACCTATAAAGATGCAATCCATTCAATTCAATTACGTCCAGAGGAAGTAAAAACCTTATCCGTTGTGTTTACATCGCAACATGGAACATCCTATCCACTTGTACCGGATATCTTAACGAATGCAGGATACAATGTTATTCCTGTCATGGAACAAAGTAATTATGACCCTAATTTTAGTAATACAAAAACTCCGAATCCCGAAGAAAAAGCGTCCTATGATTTAGCCGTGGAATATGCGGTAAAACACGATGCTGATCTTGTACTCAGTTGTGATCCGGATGCAGACCGTATGGGTATTGTGGTTAAACACCATGACGAGTATGTTTACCTTACCGGAAACCAAGGTGGATCCATACTTCAAGAATATATCTATGCAACACGAATTGAAAAAGAAACCATGCCTGAAAATCCAATTATGTTTAATACCGTCGTTACTTCTGACTTAGGAGAAAAGATTGCGCAATCTTACGGTGTGAATGTAGAGAAGACATTAACGGGTTTTAAATACATCGGTGATAGCATCGAAAATCACAATAAAGTGGGTGATTTTAATTTTGTATTTGGTTATGAAGAAAGCTACGGTTATCTTCTCGCAGATTTTGTGCGTGATAAAGATGCTTTGCAAGCATGTATGATGGTTGCGGAAGCGGCAAACTATTACAAAAATCATGGCTTAACACTCGTTGATGTTTTAAACGGTCTTTATGACAGACATGGTGCGTATCATGAAACACAAGTAGCAATTACGTTATCCGGACAAGAGGGTTTAAATCGTATTCAAGAAATCCTAACAACATTTAGAGAATCAAATATCGAAGCGTTTGCGGGAATTAAGGTTCTTTACCGAGATGATTATTTAACATCATCACGTTCAAACGGTGAAAGATTAACATTACCAAAATCGAATGTTATTAAGTATAGCCTTGAAGATGGATCTTGGATTGCAATTCGACCATCTGGTACGGAACCAAAATGCAAGTTTTACTATTGCGTTGTAGGTAAAACAATTGAAGAATCACTCTTAAAATTTGAAGCACTAAAAAAAGATATTAATGAAAGAGCGCAACTCGATTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134439|204731:213579|211056_211512_+|VEH83187.1|DBSCAN-SWA MIKIIAIGKIKEKPMQALIQEYEKRLKPIHSVEMIELTNSNKSDVTSIIEDECQRILEKIDDRDYVVLMDLSGKDLDSVSMSEKIMDLIDMGKPITFIIGGSHGVNQSIRERSNYRWKISNLTFPHQLVRLMLYEQVYRFFMISKNHPYHK >LR134439|204731:213579|211582_211849_+|VEH83188.1|DBSCAN-SWA MKEITVTVIDPVGLHARPATVAVNAASKFKSEIKISYKGKAVNMKSIMGVMSLGIPTQSEIVISAEGEDQDDAIATIEEVLKAQKVIA >LR134439|204731:213579|204731_206102_+|VEH83182.1|DBSCAN-SWA MRKLPYSQDAEMALLGTLLVFPESVAVVEEYDMQVDDFYNTEHQKIFSHMLEIIERGRVLDATTLITRLKDQHEIDSVGGVEYLFALTENSATPASVKHYIEVVQEKAQMRRLIDVGQSIAEKGFDSTTELTALLDEAEQRILEVTRVRRTTEMQRSREVVNEVMENLNRIRDNHDRITGLKTNYSHLDNVTNGLQRGDLIILAARPSVGKTAFALNLALNAARHNKDEKAGMAIFSLEMPATHLISRMLSAQSSVKSEYLRTGNLNDEQLNNVYAGANVLSKLNIFIDDSSTITVPEIFSKCRKLKSEGNLDMIVIDYIQLISGRGKTESRQQEVSEISRGLKQLAREMDCPVIALSQLSRLVERRDSKIPQLSDLRESGSIEQDADIVMFLYREDYYKDREGEEDDGPQMPKPEQQEVLLKMAKHRNGALADITLMFNASISKFYGVAGDGGRM >LR134439|204731:213579|209956_211060_+|VEH83186.1|protease|DBSCAN-SWA MKKDQGFKNTFIGILVILLAWNGFLTYQVYDLNNRPTVTEKTEDGKTVEKVVTEFETDPTKVVENVRDQVVSVLNVQSGQLAGSGSGVVYKNEGGKIHIITNNHVTEKGEQYYVQFSNGEKVEAKLLGADPFTDLALLQVETDSDVKPMKLGDSSVVKVGEFVLAIGSPVDLEFANSVTFGVISGKDRKVPVDLNGDRNPDWDMVVMQTDAAINPGNSGGALVNMNGELIGINSMKLSSAQVEGMGFSIPINEVVPIIKQIEETGKVQYPVIGISGVSVSEMNPFLKNYYKVPSDVNAGVFIAELTQNGPARKADIKEGDILTHINDKAISSYREFRRELYAHKVGDTVKLTINRNGEIHEVEVTLQ >LR134439|204731:213579|207679_209215_+|VEH83184.1|DBSCAN-SWA MKQHKELKLILITFIVSVLITYAIETVSANTSVVDLYKLTDTSTSIFPQESEGKSDKPIEVTKLYRDEKLVGIISDGSKLNKMFDKVYEEEYKAEFPDSKLGFIDDLILVKELSFNHYEDRDDEIFQYLYDEKLFAIEVNQVTFSNGAIIYVKNIDDFNKARDTFIRNFTDDKTFDAMKNNRKIESIKDYGTHDVNVEVEETVQISKGLTSKENILMNESDVLTFLSYGYNPKVEIYEVQPYDTIAGIAWHKGMDANQIKYINSDIIKDVNQVLEVGSKLRVSKFNSPFTVKITRERMTSEVVYPESTIYESDPELSEGKEVVDVVEQNGKRDVVYEDVIVNGAPKSSEEIRTQVTKEPIRGKVRYGTKVEPRIGSGNYRWPLDNANISCVYGNSCYYNHNGTDFVLNGGGFGPIYAVDRGVVSETVSGCFEGNYGCGSGWGNHIVIDHGNGYTTLYAHMATGPYFNVGDLVKRGDNIGYMGMTGTTYGPHVHLEFRYHGVRVDPCTVMGC >LR134439|204731:213579|209231_209960_+|VEH83185.1|DBSCAN-SWA MKYSMLASGSKGNCCLVESQGVRIMIDCGTTKRYLKQSFESLALTFDDVDCVLITHDHGDHTSQLKHFAHHQIYCPSEIMFNHTKVEPYTPFHVGPFIITAVKTSHDADDSVGYIVDDGSRKLVYITDTGYIREQDFELIKDADYYILESNHDPELLMQTNRPYAIKRRILSDTGHLSNEEAGVLLSKVVSEKTKEILLAHLSSEANDEYLALSTVRELVDNEGIEFNVAKQFEIVIGGYQI >LR134439|204731:213579|206103_207612_+|VEH83183.1|DBSCAN-SWA MKKHKNLIMISVVFLFAIGLGYLYKSPTSASEIKTAYEAIDSSSAIFPQEVVTVNDKPVVITKLYREQKLVGVLKDSTRLQKMFDEVYENEYKEEFPDSKLGFIDDLIQVDEMSFNVYEDRDNDIFDYLYKENLFAIEANKVTFSNGAIIYVKNSEDFDSARDKFIQNFTSESTFDAIKNNKKIPAITDYGTKDIDVKVKETVKVTRGLATKDKILKDETEILTFLSYGYNPKVETYKIKPFDTLEGIAYHSGMNVNQIQSINADKIKDVNQVLEVGSELRVSKFDSPFTVTVTKQRMTTEPVYPEKTVYQSDPELAEGKEVVDVVEQNGARDVIYEDVYENGASISTKEISSKETKKPVRGVIRYGTKVEPKVGSGAWRWPLDNAYVLCGYGCYPNHSGTDFSTHGSGYGPIYAIDRGVVTTNSYDPGGWGNYIVIDHGNGYRSLYAHMASPGYFQAGQTVAKGENIGYVGMTGRTSYPHVHLEIIVGGGTRVDACGVIGC >LR134439|204731:213579|211911_213579_+|VEH83189.1|DBSCAN-SWA MSLDRWNELARDYSWIEEAMQTMDESTKHDAFYKSLEFGTAGMRGLLGIGPNRMNVYTVAKASVGFAKYLVETFKDQELKIAIAYDNRHMSKEFADVSAMVLSTYGIKSYIFSQPRPTPELSFAVRTLNCVGGIVITASHNPKEYNGYKVYDENGCQLVDHKIARVISLINEEPDETKVDINQGNRSMITYMEADFDETYKDAIHSIQLRPEEVKTLSVVFTSQHGTSYPLVPDILTNAGYNVIPVMEQSNYDPNFSNTKTPNPEEKASYDLAVEYAVKHDADLVLSCDPDADRMGIVVKHHDEYVYLTGNQGGSILQEYIYATRIEKETMPENPIMFNTVVTSDLGEKIAQSYGVNVEKTLTGFKYIGDSIENHNKVGDFNFVFGYEESYGYLLADFVRDKDALQACMMVAEAANYYKNHGLTLVDVLNGLYDRHGAYHETQVAITLSGQEGLNRIQEILTTFRESNIEAFAGIKVLYRDDYLTSSRSNGERLTLPKSNVIKYSLEDGSWIAIRPSGTEPKCKFYYCVVGKTIEESLLKFEALKKDINERAQLD |
8 | Streptococcus_phage(33.33%) | protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| DBSCAN-SWA_2 |
1691781 : 1700143
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134439|1691781:1700143|DBSCAN-SWA ATTATTTAAAGAGTTCATTATTTTCTTCCAACATTTCTATCTTAATTTCGGGTAATTCTTTCAAACTCGTCAGTTTAAATACATCCATAAATGAGTTTGTCACTTCATAGAGTATTGGACGACCAACTGAATCAGCTCGTCCACATTCCTGAATTAAATCCAATGCTTCCAATCTTCGACACATCATGTCACTATTAACACCGCGTATTTCTTCAATTTCTAAACGCGTTATCGGTTGTTTGTATGCAATAATCGCAAGTGTTTCGAGAGCAGCTTGAGATAATTGACGGTTTTTATTAAATTCAAGCATATCGGAAATGGTCTCGTGCAGTTCTTTTTTAGTAATTAACTTGTAAACTGAACCAAACTCAACCAGTTCCAATCCACGATTCGAATCCATTAAACTTATTTTATAATCTTGTATTTTGTTATTAAATGCTTCGTCATCAATTCCAAGAGCGAGCATTAATTGTTCTTTATCAACGCCTTCTTCCCCAAAGGCAAATAAAATGCCTTCAATAATTGCAAAATCAGTCATTAAATCGCCCCTTTCAGATAGACCTCTTCATCTTGATAACTCATTTTTAAATCTCCCATTCGTAACATATCTAAAACTGCTAAGAATGATACGAGCAGGTATTGCAGGGTGGGTGCTTGAGACAATACATGGTCAAGAGACAAAACGACACCACCCTGAAACACTCTTCTTAAATCTTCTACGACTTCGTCAACTGAGAGTTCCGCTCGTTCTATAGATACATCCTGAGGGTGCGCTAACTTAAAACGACTCATTACTTTCATCATTGCATTCATAAGGTCATAGGGCGTTTGTTCATAAGTAATCGAATCTTGTAAACTCGTCTTAATTTCTTTAAACAAACCCGATGAGATTGGTTTTGCGAATTGCTTTGAACGTTCTTCATAACGCTCTGCCAATTCAATGCTGACCTCTTTATAACGTTGATACTCAATAAGTCGTCTCACAAGGTCATTCTCATCATCTTCTACATCTTTTGCATCCAGTTCACTTTTATCTCTAGGCAACAGACGTTTGCTTTTGTATTCAATTAAACCGGCAAGTTCACTAAGATATTCAGACGCTACTTCAAGTTTTTGATCTCGAACGCTATCTATAAAAGCAATGTACTGATCCGCCAATTCATCAATATTCAAATCAAAAAGATCTAGTTTTTTATCCTTAATTAGATAAAGCATTAAATCCAAGGGACCACTAAATTGATCAATAGATACTTCAAAATTCATGGTTATTCTCCAATCTAAACTATTATAGCACGGCTGCGATTAAATTTGGTTTTTCAACAGGTTCTTGTCCCATCACAAAACATGATACTGTATTGTTTTTATGATCATCGGTTATTGGTGAATCGCTATATAAAGTAGCAAGTAAATCACCCGCATGAATTAAATCTCCAATTTCTTTTCGAAGTACAATCCCCGCTTTATAATCAATAATATCGTCTTTTGTTTGTCTTCCTGCACCTAAGTGCATGGATACAATACCTAATTCCATTGCTTTTAAATCGTGTAAGTAACCATCTTGCTCAGCGAACACTTCGACTTCATATTTAGCTTTCGTAAAGGAATCAAGATCATCAAAAATTGAAATGTCTCCACCTTGTGCTTCAATCCATTTTAAGAATGTTTCATAAGCTGCACCACTTCGTAATGTTTCTTTTGCGAGTTCATAACCACTTTCTGATGAATCAGAAAGTTCTGCTTGGTACAGCATATATCCTGATGCTACAAGACACAATTCCTCTAATTCCTTTGGTCCTTCGTTTTTTAAAGTCATAATTGCTTCTTCTACTTCAAGTGCATTTCCAATTGAATGTCCTAACGGTTGATTCATATTTGAAAGCATCGCATTAACCTCACGTCCAAGATTCCGGCCAATCGTGATCATTGTATTTGCTAACTCACGCGCATCCTCGACATTTTTCATAAATGCGCCTTCACCATATTTCACATCAAGTAAAATACAGTCTGCACCTCCTGCCAATTTCTTTGACATGATGGATGATGCAATTAAAGGTATCGCATTAACTGTTCCCGTTACATCTCGAAGCGAATAGAGAACTTTATCTGCGTAAACCAAATTTCCAGTTTGACCAATGACTGCAAGATTAATAGCATTAACTTGATCAATGAAATCTTGACTTGAAACCTCGATGTTGAAACCAGCGATGGATTCTAACTTATCAAGTGTTCCACCTGTATGACCTAAGCCTCTACCACTCATTTTCGCAACTTTTGCACCTGCTGCCGCAACAATTGGGCTCAAGATAATTGTAGTTTTATCACCTACACCACCTGTTGAATGCTTATCCACTTTCTTGCCAACAATGGATGACAAATCAATAACATCTCCACTACGCATCATCGCATCTGTCAATGCTGTTGTCTCGTCGAGACTCATTCCTTTTAATACAATTGCCATGAGCAATGCACTGGTTTGATAATCTTTAACCGTACCATCTGTAACACCATGAATCCAAAAATTAATCTCTTCATGAGTTAATTCCATACCGTCACGTTTCTTTTCAATTATTTCTACTATTGTCATAATTATATCCTCTCGTAAGTTACTTGTTTAAAAGTACTGTATTCAACCTGATTCTTGATCTTGAATTCTAAATCAGAAAAATCCGGAAAAAATGTATCACCAATTACATCATTTGGTATATACGAAATGATTAACTCGTGAGCAAAAGGCAAACTTTGAGCGTAAATTTCTCCGCCACCCGCGATAAAAATATCTTCGCTCGATTCTTTGTGTTGCATTAAAAATGCCCTAAGATCTGGAATTGCATTTTCAATCGAAGCGTTTCGTGTTACGACATAGATTTCTCGATTATCAAGCTTTTTAGGAAGACCCTCAAACGTTTTTCGACCCATAACCACTTTTTGATTCAGTGTCGACTTTCTAAAATGCTGTAGATCTTCTTTATTATGCCATGGCATCGACCCATTTAAACCAATGGTGCGATGGTTATTCATCGCGACAATAATTTTAATCATCACACACTCACCTTTGCTTTTATTAATGGATGTGGATCATAGCCGACTACTTCAAAATCTTCAAACTTGAAATCTGTAATTTTTTCTTGGTTTCCATGAATTATGAGTTGTGGTAAAGATTTCGGTTCGCGTGCTAATTGCATTTGAACTGCATCATAATGATCATTGTAAATATGTAAATCACCAAAAGTATGGACAAATTCTCCAACCTCTAAATCGCAGACTTTAGCTATCATGTGTAACAACAGCGCATACGAAGCAATATTAAATGGAACACCCAAAAATACATCTGCACTACGCTGATAAAGTTGCAATGATAATTTTCGATCATTACTTACATAAAACTGCATAAATGCGTGACAAGGTGGTAATGCCATTTGATCAACTTCGGTCGGATTCCAAGCACTCATAATAATACGACGTGAATACGGGTTTGTTTTAATTGTTTCAATAACGTTATTAATCTGGTCAACACCACCAAAATCACGCCATTGTTTACCATAAACGGGACCCAACTCTCCATATTTTTGAGCAAACAAATCATCAGCTACAATGCGTGCAATAAACTCATCCATGGTTTCGCCATTGTAATCATCTGATTTTTTGAAAAGTTCGTATGGCCATTCATTCCAAATTCGAACCTTGTTCTCGACAAGCCATTTAATATTGGTATCGCCGCTTACAAACCATAAAAGTTCTTTCGCAAGCGATGGAAAATGAACTTTTTTAGTTGTAAGCAAGGGAAAACCCTTGCTTAAATCAAAACGCATTTGATAACCAAAAACGCCTGTCGTACCTGTTCCCGTACGATCTTCTCTTCGTGAACCTTCGTCTAATACAAATTGACACATTTCCAAATAATTTTTCATTTTATCACCTACATTCTATTATACAAAAAAATCACTCTCTTTGGTACTATTTCGGATATAAGAACTCAAGATGTTCTGCAATTAAGATAAATTTTTCATCATTAATTTCTAATCTACCTTTCACAGAAATTAAACTTCCTGGTTTACATGAGTTTGTGGTTGTCTCACTTGCACCGCGCCATAGTAAAATCGGAAATGTATCCTTTCTGAAAATACCCGTTGGCGTTCTAAAATTTGAAGTGACACTAACATGCATCAATGCATAACTTTCATTTGAGTGGTCCTCAATGGGCACCGGCATGGTTTCAATGTGTCCAACTAGCTGTACAAAGTTCATTTTGACCTCCTTTTCTTCATAATGTGGGTTACCCCACACTCATAAATTTACTGCAAATAAAAACCTTCCTAATATTTTTTTCAAAAAAACAACAAAAAAGGTTAGATTCTCTAGAATCTAACCTAATTATTCGAATTAACCATCCGTAAAAATGTATCGTCACTATCCACAATCACATCCACAAGATTGGCCAATGCATCATACGATAAATCACGAATCATTTCCAAATACTCAAAGTACGAAACTCCATCGAAGTGAGCACGTCCCAATGTAATTGCAAGTTCATCTGTTTTACTTAGTGACATAATCATTTCACCATAATATCGCTTCTTCAACTGGTTAAACATTGCTTCATCATGCTTTAAATGATTCATGCGGTACTTAATAATTTCTTTAAACGATTCGTGCTTATGCCCTTCATTCACAAAATAGATGACACCAAATGATTCACGGATATCGACATCATAGCCATATGAGTTTGAAACGATTCCTTCATCAAGCCAAACCTGATAGTCGGGGATCATTTCTGAAAAATTCATCTCTAAAAGCATACGTATCAAAAACTCATCTTTTAATTTATCATTGCGATTATAAGGAAATTTAAATGAATAGGTCATTTTCGGAACTTCTACATCCCCTTGAATTTCCCGTTCTTTAAACGCAACATGATGCGGTTCTTCATCAAACAAATCCATTACATTTTCACTCACAGCATGATGTGATTGCGTTTCTTCTAAGACGATCTCCGCAACCTT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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134439|1691781:1700143|1692317_1693043_-|VEH84555.1|DBSCAN-SWA MNFEVSIDQFSGPLDLMLYLIKDKKLDLFDLNIDELADQYIAFIDSVRDQKLEVASEYLSELAGLIEYKSKRLLPRDKSELDAKDVEDDENDLVRRLIEYQRYKEVSIELAERYEERSKQFAKPISSGLFKEIKTSLQDSITYEQTPYDLMNAMMKVMSRFKLAHPQDVSIERAELSVDEVVEDLRRVFQGGVVLSLDHVLSQAPTLQYLLVSFLAVLDMLRMGDLKMSYQDEEVYLKGAI >LR134439|1691781:1700143|1696147_1697404_-|VEH84560.1|DBSCAN-SWA MKTIKNDFNEKVYTFTTPSALSVTIVHRPGFKRSSAVYGTPFGALNLKQSLDGNVIEHKSGVAHFLEHKLFEDESKDILSQFAELGASGNAFTSYEQTMYYFGHNGDLEAPLRLLIQFVSKFSVSEESVEKEKGIIIEEIKMYDQMPDMRLLNETYVNLFHHYPFIYDIAGTEKSVTETTRADLLRAFEMNYSDHRMSLTIVTPMDPQKVAEIVLEETQSHHAVSENVMDLFDEEPHHVAFKEREIQGDVEVPKMTYSFKFPYNRNDKLKDEFLIRMLLEMNFSEMIPDYQVWLDEGIVSNSYGYDVDIRESFGVIYFVNEGHKHESFKEIIKYRMNHLKHDEAMFNQLKKRYYGEMIMSLSKTDELAITLGRAHFDGVSYFEYLEMIRDLSYDALANLVDVIVDSDDTFLRMVNSNN >LR134439|1691781:1700143|1697390_1698617_-|VEH84561.1|DBSCAN-SWA MNEELILKNDIKVYQINEEKFHEVYLSLKIVFKLESRTNTIANLLTRMMGDRLIENPTKTSLAQRHDMLYGAKTSALTYTLGTYQVIDLGIKMIHERFTNELLLDKQIKLLEDMYLYPLLTEQTLEEAKKNLRISHMHIKENASQNALVKGFKHAGEGQLFGLSAFGDLDDLDSVSLKDIQNLHTRCIQEFNKQIYLVGGVDRACNFDAFTVGHSMPINESLLKTEISNSYLEERYKGSQSELVCVYETSITPYDDLYYAYLVFIAYLGQLPTSLLFQNIREKHSLCYSIYASRQVYDGIFYIATGVSDKNVEKALSLIEDQFEIVRNEPLDLKAAINYLDLSLEGNTERIKSIADHTFRNNMLQVDESIETMQEKIRAVTESDVKAVLTKITEPFIFAYRGENDENN >LR134439|1691781:1700143|1693065_1694364_-|VEH84556.1|DBSCAN-SWA MTIVEIIEKKRDGMELTHEEINFWIHGVTDGTVKDYQTSALLMAIVLKGMSLDETTALTDAMMRSGDVIDLSSIVGKKVDKHSTGGVGDKTTIILSPIVAAAGAKVAKMSGRGLGHTGGTLDKLESIAGFNIEVSSQDFIDQVNAINLAVIGQTGNLVYADKVLYSLRDVTGTVNAIPLIASSIMSKKLAGGADCILLDVKYGEGAFMKNVEDARELANTMITIGRNLGREVNAMLSNMNQPLGHSIGNALEVEEAIMTLKNEGPKELEELCLVASGYMLYQAELSDSSESGYELAKETLRSGAAYETFLKWIEAQGGDISIFDDLDSFTKAKYEVEVFAEQDGYLHDLKAMELGIVSMHLGAGRQTKDDIIDYKAGIVLRKEIGDLIHAGDLLATLYSDSPITDDHKNNTVSCFVMGQEPVEKPNLIAAVL >LR134439|1691781:1700143|1691781_1692318_-|VEH84554.1|DBSCAN-SWA MTDFAIIEGILFAFGEEGVDKEQLMLALGIDDEAFNNKIQDYKISLMDSNRGLELVEFGSVYKLITKKELHETISDMLEFNKNRQLSQAALETLAIIAYKQPITRLEIEEIRGVNSDMMCRRLEALDLIQECGRADSVGRPILYEVTNSFMDVFKLTSLKELPEIKIEMLEENNELFK >LR134439|1691781:1700143|1695734_1696025_-|VEH84559.1|DBSCAN-SWA MNFVQLVGHIETMPVPIEDHSNESYALMHVSVTSNFRTPTGIFRKDTFPILLWRGASETTTNSCKPGSLISVKGRLEINDEKFILIAEHLEFLYPK >LR134439|1691781:1700143|1698634_1700143_+|VEH84562.1|DBSCAN-SWA MIQYNSIVHQYDVNRKNGDIMIKPNDAVFLTDLYEFTMAYTYFKQNRHEEIVYFDMFTRKIPNQGGYLIFNGLSKLIETINNFKFTQSHIDYLYEQGFTDPKFLDYLLNLELNLDIWAVEDGTVVFQNEPLVTVRGTVIEAQLIETLLLLSINYSTLVTTKASRIVNAARGRAVLEFGARRAHGYDSSVDGARAAIIAGCIGTSHTLAGYQYGAHVSGTMAHSYIQLHDSEFEAFMSFAEINPDNAIFLVDTYDTLGSGIPNAIKVAHEYLIPNGFRLKAIRLDSGDLAYLSKEARKMLDQAGLQDCKIMASNSLDEYLIDDLIYQGAQIDSFGVGENLITSKSEPVLGGVYKLVAQERADGTLTPKIKVSENIEKITNPSYKRLYRFYDNHTNKALADYIALADEVIPTDTITIFDPSAPWKKKTLTDYQVRELQVPIYQNGKCVYELPNLEEIALYSQKELETIWDEVKRLHYPHRYYVDLSQKLYDLKLELLHNISKNK >LR134439|1691781:1700143|1694366_1694819_-|VEH84557.1|DBSCAN-SWA MIKIIVAMNNHRTIGLNGSMPWHNKEDLQHFRKSTLNQKVVMGRKTFEGLPKKLDNREIYVVTRNASIENAIPDLRAFLMQHKESSEDIFIAGGGEIYAQSLPFAHELIISYIPNDVIGDTFFPDFSDLEFKIKNQVEYSTFKQVTYERI >LR134439|1691781:1700143|1694818_1695688_-|VEH84558.1|DBSCAN-SWA MKNYLEMCQFVLDEGSRREDRTGTGTTGVFGYQMRFDLSKGFPLLTTKKVHFPSLAKELLWFVSGDTNIKWLVENKVRIWNEWPYELFKKSDDYNGETMDEFIARIVADDLFAQKYGELGPVYGKQWRDFGGVDQINNVIETIKTNPYSRRIIMSAWNPTEVDQMALPPCHAFMQFYVSNDRKLSLQLYQRSADVFLGVPFNIASYALLLHMIAKVCDLEVGEFVHTFGDLHIYNDHYDAVQMQLAREPKSLPQLIIHGNQEKITDFKFEDFEVVGYDPHPLIKAKVSV |
9 | Bacillus_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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