Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
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LR134471 | Campylobacter insulaenigrae strain NCTC12927 genome assembly, chromosome: 1 | 0 crisprs | DEDDh | 0 | 0 | 3 | 0 |
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---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
261770 : 272315
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134471|261770:272315|DBSCAN-SWA 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AAAAATAAGTGGATTAATTGCATTAGTTTTGAACATAGCATATTAATGACAGAAAAAATTGTTGAATTCTTATTACTCAAAAATAAATTTAAGATAAAATACAAAAAATATTTTTTAAAACATAGTATATTTTATTGTGTAGAGAAAGATCAGAATATAAGCTCCAATGGAGTATATTTATATAATGAATATAAAGAAAATAAACGGATGTTTTTAAGTATGAAGCAATATTATCAAAATAAAATATCTGAATTAAATGTAATATTTCAACAAAATGCTAATAAAACTATGTATCTATTTGGTGCACATACCTTTAGTCAATATTTAATATACAATGGTTTATATATAAAAAATATAAAAAATATACTAGATAATAATAAAAATAAATGGAATAAGAGATTGTATGGTACTGAATTATTTGTAAAAGATCCTCAAATAATAAAAAATGATAATAATGTTTTAGTGATTTTAAATTGTGGTATTTATAATGATGAAATTGAAATTGATATCTTAAAAATATGTAATTGTGAAATAATTAAAATTTAA
Protein sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134471|261770:272315|265834_266428_+|VEH93142.1|DBSCAN-SWA MENLNAYIKSHFADSIKVKNEILNDENLLNLIKQTSLKILDAYKKGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGLASIALSTDTSIMTAIGNDYGYENLFSRQVQAQGVSGDVFIGISTSGNSKNIIKALELCKEKNIISVGLTGASGGAMNELCDYCIKVPSSCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGF >LR134471|261770:272315|267083_267683_+|VEH93146.1|DBSCAN-SWA MIFLHRQNSLEQYIEKNYGVEIDLRFNGDLVLNHDVLIENQCYPLFKDKIRFVKNIPIICNIKESNLEEKVIKLLGDKYDYYFLDSQIPDILRLSKNGYQSKFIIRISDVEPYSEKLIQISKPKYVWIDYSQFDNFKIEHYKEFILSGIIPNIKKVIPILVSPELYDLSYVKFVKSIQEILPKGFAVCTKNPDLWSCYV >LR134471|261770:272315|263876_264815_+|VEH93138.1|DBSCAN-SWA MSKKVLITGGAGYIGSVLTPVLLEKGYEVCVIDNLMFNQVSILSHANNKKFAFINGDVLNEELIKKEVTKADIIIPLAALVGAPLCKRNPKLAHMINYEAVKMISDYATSSQIFIYPNTNSGYGIGEKDAMCTEESPLKPISEYGIDKVEVEKYLLNKGNCVTFRLATVFGISPRMRLDLLVNDFTYRAYKDKFIVLFEEHFRRNYIHVRDVVKGFIHGIENYDRMKGQAYNMGLSSANLTKRQLAETIKKYVPDFYIHSASIGEDPDKRDYLVSNDKLEATGWKPDYSLDDGIQELLRAFPMMKVNSFANI >LR134471|261770:272315|261770_262808_+|VEH93134.1|DBSCAN-SWA MDKNSKIYIAGHRGTAGSAILKRLQALGYTNLVFKTHDELDLTNNIAVKEFFEKEKPEYIFFAAAKLGHLGMQMPAELFYENLTMQNNIFHNAYLYDVKKLIFFGSSWMYPQSAENPIKEEYLLTDELEYNAESYALPKITGIKMCEAYNLQYNTNFLSVALTNLYGETKDFDFKTAKVLPAMLRKFHLAKLLNEKQYDNILKDLNMDTIESSVEHLNKNGIYENHIEIWGSGNTRREFIHSQDLADACIFIMNNIDFSHLYDKDVKQIKNTHINVGTGQDLSIKDLAYLIKDIVGFKGEIRFDTSKPDSPMNRLLDCSKIHSLGWKHKIELEDGIKNMYKWYLE >LR134471|261770:272315|264827_265847_+|VEH93140.1|DBSCAN-SWA MKIIRSQTPLRLGLAGGGTDINLYSDKYTGYVLNATISLYIHCTLIERDDEKIIFDSSDTKMYVEYDSKKFLENDGKLDLYKAIYNRLIKDYIKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGIIKAFVEWLNLPLGDYEIALLSYEIEREDMGIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYDQKRVIVNPLRIKNWIMSELEARILLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDEKSLNAMHAIKQDALDMKEALFKADFDKIAQILGKSWQSKKIISDIVSNDELERIHSLAMQNGAYSGKTSGAGAGGFMFFLVDPIKKYKLKQILNQEQGYIQEFYFTKEGARSWKI >LR134471|261770:272315|262824_263685_+|VEH93136.1|DBSCAN-SWA MKKTALITGFTGQVGSQMADFLLENTDYDVIGMMRWQEPMDNIYHLSDRINKKDRISIFYADLNDYSSLQKLFETKRPDVIFHLAAQSYPKTSFDIPIETLQTNIIGTANILENIKILKAKDGYDPVVHICSSSEVYGRAKAGIKLNEETTFHGASPYSISKIGTDYLGRFYGEAYGIKTYVTRMGTHSGPRRSDVFFESTVAKQIALIEAGYQEPVIKVGNLSSVRTFQDCRDAIRAYYLLSLESEKGNVPCGEAFNIAGEEAFKLPEVVDILLNFSTMGGGLKL >LR134471|261770:272315|268472_268964_+|VEH93150.1|DBSCAN-SWA MDIKHIYQDIGNILHIPLYDHTNGVIIKSDKVKVKDLDIVIIEGLHTLYKEVIGDFVKIKIYIDSDEADSQKINRDSLERNHEKSKIIDTIKKREKDYKDYLEKQKDNANFLVVVRNGKFIIELKDILLNNYLQREYNGEYKDLIKTIQDIFTIILQNRWVLN >LR134471|261770:272315|268963_269698_+|VEH93152.1|DBSCAN-SWA MINDIARLKKYVEEYQELNKIFGNILDAPSKGGNISVKDGEYLIIKSSGEDLKRNHKISILKNNINSFSCYNGIFSTNIIKPSMEVKMHMVFKNKYVAHYHPVYILPYLCANNYNFYDYEVVDFALPGDELYAILHKNYVYKEKGIVMLKNHGVIIYAEKIQDMHMLYAKLKNDFFDQNNFIYTPDDAIDIGNFELWLFRNAIENIAKDKNLNLTSLKRSEINKLVNLPDEKYRKKIMESENIE >LR134471|261770:272315|266428_267100_+|VEH93144.1|DBSCAN-SWA MQAIVLAGGLGTRLQSVIKDLPKPMAPINGKPFLEYLLQYLQKQGIKEVILSVSYKYELIQEYFKDKFENINIIYNIEKELLGTGGAIKDALKFVKNETFVLNGDTFFDIDLNKLFLNGSKICIALKQMRDFDRYGAIEIDKNNIIKSFKEKTYVKQGLINGGIYLISKDIFNNFNLDNKFSFEEFLQENYKKLNINSVVFDDYFIDIGIPQDYNRGVNDFFT >LR134471|261770:272315|271184_272315_+|VEH93156.1|DBSCAN-SWA MLDYIVRKKCAVGCSEKLEILSKVKFPVFCGCVLDDRELDLIAEEEVVISQDGVVQLKKLIPLEILYASGHDSGATGLIWNQHHEEFSKFILNFEPKNVLEIGGGHGKLAKHCLENSDINWTIMEPNPTHKNPKVQYIESFFNATDLKHGVYDTIIHSHTLEHIYDPHNFLSEICTLLNGGGYMIFSIPNLKEYLKNKWINCISFEHSILMTEKIVEFLLLKNKFKIKYKKYFLKHSIFYCVEKDQNISSNGVYLYNEYKENKRMFLSMKQYYQNKISELNVIFQQNANKTMYLFGAHTFSQYLIYNGLYIKNIKNILDNNKNKWNKRLYGTELFVKDPQIIKNDNNVLVILNCGIYNDEIEIDILKICNCEIIKI >LR134471|261770:272315|269694_271170_+|VEH93154.1|DBSCAN-SWA MNVIIPATGIGRRFKEAGYKDLKPFVQVKKNKVILDYVLECFDTQKDVFYFIVQESEKNKFEYFIQSRNIDAKVIIYKGEKLGPAGSLYGVMSQLQNILNEEVIISYCDFGQKWNYKDFLKFIQENQEAQGIIPCYTGYHPHLLPLENVYAACKVYKNSYEVYKVIEKYDSQNKFEEYYSSGIYYFRTLKLAVDAICKQIEAKDMISGEYYVSITNNYLKNVLCYPFVEKFYQFGTPKDFEYAKSKLNNQDFDNEYIKIDNVVILAAGRGERFINLNFDQPKPFLPLGNSFLVEKIIKTLKNIKGKIRCIGAEDHKKYWNSVNEEVVYVKPNKIGAAYSYKESCGDLKGDVLILPCDLIAKHIDNNFKMLQEKSEIIIFVTQASKYNYDNPDYFTWIIGEHGVVEKISVKYRLDDSNLVMIGSFYFKQNLILMEAIEKIFKDNICTNGEFFIDNVFELLINSYNICYVVVDNYFSYGTPDEYLENKYWFDI >LR134471|261770:272315|267675_268263_+|VEH93148.1|DBSCAN-SWA MFNLNDVAKKYKLIMVDIDNTLFNYTFAHKKALENVMLQFNFSIEDYNHAKKSLDKRNLAANHHKKELYFKIICENKNIHFAKAKEMFELYTFTFIENIKVDKTMFNFLSYVKKLNKKVIAITNFYFIEQMNKLNRANLTGMIDYLVCSEEFELEKPNKALINRALELYKEPIDDEEIIMIGDSAVDNFLGGGIG |
12 | Synechococcus_phage(40.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
764020 : 807524
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134471|764020:807524|DBSCAN-SWA ATTATAAAATTTCCCTTTGTCCTTTAGAATCAGGCTCACTTAAAACACCCATTTGAGTGAGTTGTTCTATGATATTAGCAGCGCGATTATAACCTATTTTTAAACGTCTTTGAACATAGGAAATGCTAGTTTTTCTATCTTCTATAACTATAGCTTTAGCTTCTTCATAAAGCTCATCTAGATTTTCATCATTAAAATCACTTCTTCTATTATTTAATTCGGAATTATCATCTTTTAAAAAACTTTCATCATATTCTACAATTTGTTGTTGTTTTAAAAATTCCACTATGTTCTCTATCTCATTTTCACTTGCAAATGGAGCATGCAAACGCACAAGAGAACTTATTCCTGGTGGAGTAAATAAGCAATCTCCTCTACCCAAGAGACTTTCAGCACCCATACTATCAAGTATAACTTTGGAATCTATTTTTTGCCCTACTTTGTATGAAATTCTACTTGGCAAATTTGCTTTAACAACACCAGTAACCACATCAACAGAAGGTCTTTGAGTAGCAACAATAAGATGAATACCACTTGCTCTTGCCATTTGCGCTAAACGTCCTATGTAAAATTCTACATCTTTGCCAGCTGTCATCATTAAATCAGCAAGTTCATCAATAATCACGACGATAAAAGGTAAAATTTCTCCACCTTGATCTTTAATTTTTTCATTGTAATTTTCGATATTTTTAGTTTTTGCTTCTGCCATTAAACGATATCTTCTTTCCATTTCAGCTACCATATTAGACAAAGCATTTACCGCTTTCTTAGGATCAGTAATTACAGGAGTAAGCAAATGCGGTATATCATTATAAATACTAAATTCAAGCATTTTAGGATCAATCATCATAAGTCTTAAAGTTTTTGGAGAATTTCTATAAAGTAAAGACAAAAGCATAGAGTTTATTCCTACACTTTTACCACTTCCTGTAGTTCCTGCTATTAAAAGATGGGGAAGTTTTTTAAGATCCGTAACGAAAGGATCTCCTACTATATCTTTTCCTAAAGCTATAGTTAAAGGAGAGTTTGAATTTTTAAAAACATTACTTTCTAAAACTTCTCTTAAGTAAATAGTTTCTATTCTTTCATTTGGAACTTCTATACCAACTACATCTTTACCAGGGATAGGCGCTTGAATTCTTATAGTTTGTGCTTTTAAAGCCATTGCTAAATCATCTTGCAAAGATAAAATTTTACTTACTTTTACATCAGCAGCTGGTCTAAATTCAAAAGTTGTTACAACAGGACCAGTGTAGGTTCTAACAACATCTCCACCAATTTTAAATCGTCTTAATTTTTCTAATAAATCATATATTTTTCTATCAATTTCTTCTTCATTAATTTCATTTTTACCTTCACTTGGCATAGATAAAAAATCTAAAGGTGGCAAGATAAAATCTTGTGGTTTTTCACAAACTCCAAATTCAAGTTCTTTTAATAGAGCTTTATTTTCACTTAATCCATCTATTATAGAATGGTGACGTAAGTTCTCTTTTTCTTTTTCTTGTTTTTCCATAACAAAATATTCTTCAGAAATCATAATTTCTTCTTTTTCTTCAGAGAAAAAATCATCTTTCTCTTTTTTAGCTCTAAGTTCATCGATACTTATAGGTTTTGCAAAAGCTTCTTCGCTAAAATCAAGCTCTTTAACTTCACTTTGTGGAAAAAAATATTCATCTTTAAATTCTTTTATTTCTTTTGTTTCTTCACTGCCTAAAAAATTTGTTTTACCTTTGATTTTATTAAATTCAATTTCTTTTTGTGCTTCGATTGCATTTAACTCTTCTATTCTTTTAAAATCCTCACTTAATTCTTCTAAGATTTTTTCTTTTTGTAAGGCTTTATACTCTTCAAGCAATCTAGTCTTTTTAAGCATTTCTTCTCTTTGTTTTAATTCTTTTGCAAAAAAAGAATCTTCTTGAACTTCTTTCTCATCTTCTACATCTATATTCCGTCTTTTATAACTTGGCTCATCTAAATTTTTACTTTTTAAAATTTGAGTATATATATCTTCGCTTTTATTTTTATACTTCGATAAATATTCTTCAGGCGTCATTTCTTCTTCCTTTGTATTTATTTTACTAGCCTTTTGCATGAAATTTGCCACAGGCTCAGAAAGTTCATGTATAAAACTAGAACTCATATTTTTTTCATCATCATTTATCACAAATTCATCTAAATTTTGATTTTTTAATTCCTCTAAACTAAATTTCTTTTCTTCTAACGGATCTTCTTTCACCACATTTTCTTTTTTTAAATTTATTTCAACTTCTCTTTCTTTTATCAGCAATTCTTGTTTAAGTTTTTCTTGCTCTTCTTTGGTTTCATCTTGGTATTTATCACCACCAAAAAATCCAAAAATCTTATTTTTAATCAATGTTTCAAGTTTTACATAAAAATCAAAATCAATTTCTATCTTAAAAAATTCTTTTAAAATTTGCGGGTAAGTTATACTAAAAGCAAAAGACAAAAGCAGTATTATCAAAATAACTGAACCTACTTTTCCAAAAAGTCCATTGAGTATCAAAAACATTGCAGAAGCTATATAACCTTTATCTTGTAAAAACATTGCACCAAATATCAATAAAGCAATAACACAAGAAATCACAGCAATACTATGTCTACGTTTTATGAAATCTAACTTATAATCATTTTTATAAAACAAGTAATTAAACCAAAATAAAGTAAAGGGATAAAATTTGGTTAAAGATCCAAACAAAAAATAACTAAGTCGTGCTACAAAATACCCTAGCATACTTACCAAAGACTTCTCAGGTATCAAGGCACTAAAACAAAAATACAAAATCAAAAGATTAGAAATTACAAAAATAGCCTCTTTTTTTATAGCAAATCCTTTAAAATAAAAAGGCTATTATATCAAAATTACAATTACATATAGTTTAACAAACTCATTTGAGAAATTTTAGCTGTTGCCGAAAGCATTGCTTGATAAGACACCATTGATTGCATAAATTGCATATAAGTTTCTCCATAATCAGCATCAGTTACACCGCTTTTAATAGTAGATACATTTACATTTAAAAAAGTCATTCTTTTGTTAGTTTCTTCTATAGAATTCGTATATGCTCCTATGGTTGTATGTGTTTTTCTCACATGTTCTTGTAAATGATCAATTCTTGCTAGTGCACCTTGTAATCCAGTATTTCTAGGATCTTTACCTTCAGAATCTGCTCTCATAGTGCCATTTAAAACTGCATCTATCATCTCATCTAAATCTTTAACTAAATCTACATTAGGATCATCAATAGTCAAAGAATTATTAGCACTAAAGGTAAAACTTGATCCAGGTCTTACTTGTCCAGGAGGATTTGAAGGTGGAAAATTAGCATTTGAATTAGTATCTTTCATAGTTAAACCAATGTTTGTATTGGTTGAAAATTTATCACTGATACTGATTCTTCCTTTGTAATCCATACTTACTTCAACAAAATCTTTTGAATTGGATATGTTTTGTTGAATAGTTTGAAAATCGTTATTATTTAAGGTGCCATTGGCATTTGCATTAATAGTCGCATTTGGCACATTATCACTTGCAAACATACCTAAAATATCATTTAATTGTTTATAAGTAATATCTTGAGGATTAGTAACAACACCTGTGGTAGTCCCATTTGCTTCATTGTATTGGGAATGAGTTATAGGAAAGTTTATAGTTTGACCAGCATTATTAGTATAACTTACTGTAGAAGTTTCCAAATTTATATTTACATTATAAGTCCTGCCACTTTTAGAAGTAATATTCATTTGAAGCTCTTGTCCTGCCATGCTTCCATTAGCATTAGCTATTACTTCGCTTAATTTTGTCTCATCGCTTGCATATTGGCTTGTTCCTCTAATAACTTGAGAAACATTTCCAAAGACTTTATTGCCATCTTTTTCAAAAGCTACATCAAAATCTTTTCCATTAGTTTTATTACCATTAACATCACTTTTTATAAAATCTGTTTGATGGATATTTAATTGAAAATTTTGATTACCAATAGTTATATTTACGGGATTAGTGATATTATTCAAATTTCCATTAGGAGCAGCTTGTCGCATTATCTCATTAGCAAGTCGATCTTGATCCCATCCAGCTGCTCTAGCCGCATCTTGTAACTGTTGAAGTTGTGCTTTGTCTGTCACTTGCGGGGTTAAAGCAACAGCGTGAAAATCTAAAGAACTATTTCCTTCTTTTAAATTCTTAATCTCGATCTGACCGCTATCATTTATAGTAACATCTACAAGTTTATTTGCATCTGTATTACCATAAAGTTTACCTATATTTTCTAAAACATCACCGATTTTATCTTCAGGACCTATGTTTAGAGTAGCTTTAAAACTTGTTCCATCAGGTTTTACACCTTGAACATACATAGAAGATTTTGGAAAAGGAAGTTTGGTGCTCTCGTATTCAAAATCCTTGTCTATATCAAGCTTACCACCTGCGACATAATTTTGACCTATAAGATGAGAAAATTTAGAATCTCCATTTAAATACTTCTTATCGCTAGGACTATTTTTTACATCATATCTATTATCTATCAAAGAAACATTAGTAGAAATAACTTTTTTTATATTGCTATCTGGTTTAAAAAACAAATCCCAACCAGGTACATTATAAGGTATTTCAGTCCCTGAACCGCTTACGACAAAGATATTATCTTTATTTCCGCTATAATTTCCATTTTTATCAAAAGGTCTTATAGCCGTGTTTGAACCTGCAAAAAGATACTGCCCATTAACACTAGTATTTGCGATATTAACTATAGATTCTTTTACAAGTTTTAATTCTTTTGCTATAGCTTCTCTTGATGTTTGATCATTACCATCACTTGCTGCTTTAGTTAAAAGTACTTTAAATTTTTCCAAAAGCTCAGTAATATTTTTTAAAGCAGTATCTGTATTTTTCGCAATTTCTTGTGCTGATTGAGTTCCTTGAATGATTTGATTAATATTTGCTAATTCGTATTCTAACCTCGAACCATTTATGTAAGTAT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54 | Campylobacter_phage(90.91%) | portal,integrase,capsid,tail,terminase,head,protease | attL 769367:769409|attR 807926:807968 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
881753 : 893024
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134471|881753:893024|DBSCAN-SWA AATGAAAATAGACAATAATCAAAATTATCCAGCGCAACTTCCAGTGCTTATTGAAGATGAATTATTTTTATATCCTTTTATGATTACCCCTATTTTTCTAAATGATATACAAAACATCAAAGCTTTAGATGTAGCCATACAAAATGAAACCATGATATTTGTTGCGCCTTCGAAAATAGAAGGTGGGAGAAGTTTTAATGATATTTATGATTGTGGAGTTATTGGAAATATCATGAGAAAGGTTCCGCTTCCAGATGGCAGAATCAAAATTTTATTTCAAGGTTATGCTAAAGCTAAAATTATCAAACCAATCTCAGATGATCCTTTAAGTGCTTTAGTAGATTTAATCCATCAAGAATCTTTATGTTCTACAAAAAAAGAAGCTATTATTGAAGTGTTAAAAGAAAAAGCTAAAGCATTGTCTATGGTTAGTCATTATTTTCCGCCAGATCTTTTAAGAACGATCGAAGAAGATGGTGATCCTAGCAGAATTTGTGATTTAATATTAAATTCCATCAAAATAAAAAAACATCAAGCATATGAATTTTTTATAGAAACAAATTTAGAAATCAAACTTCTAAATTTAATCGACCATCTTGCTAAAGAAATAGAAGCCAATAAAATACAAAAAGAAATCAAAAATAAAGTACATTCTAAAATAGATAAAGTCAACAAAGAATACTTTCTTAAAGAACAATTAAAACAAATTCAAAGAGAATTAGGGAGTGACATACAAAAAGAAAGTGAAGTTGAAGAATACAATAAAAAGTTAGAAAATAAAAAACCTTTTATGTATGATGATGCATACAAAGAAATCAAAAAACAAATACAAAAATACGAAAGAATTCATCAAGACAATTCTGAAGCTTCCATGGTGCAAACTTACATAGAAACTGTTTTAGATATACCATTTGAATCTTTATCAAAGAAAAAATTAAATTTGTTAGATGTAACCAAACAATTAAACACAGATCATTATGCTTTAGAAAAGCCAAAAGAACGTATTGAAGAATATTTTGCCGTAAAAGAACTTTTAGAAAAACGCAAAATCAAAGATAAAGATGGCGCTAAAGTAATTTTATGTTTAGTTGGTCCTCCTGGTGTTGGCAAGACTTCCCTTGCTAACTCAATAGCCAAAGCTCTAAAAAGGGAATTAGTTCGAATTGCTCTTGGTGGTTTAGAAGATGTAAACGAATTAAGAGGTCATAGAAGAACTTATATAGGAGCTATGCCAGGTCGCATAGTACAAGGACTCATTGAAGCCAAACAAAGCAACCCTGTCGTTGTTTTAGATGAAATAGATAAATTAAGTCGCAACCATAGAGGAGATCCTAGTGCTGTTTTGTTAGAAATTTTAGATCCTGAACAAAACACCAAATTTAGAGATTATTATCTTAATTTCAATATAGATTTAAGTAAAATTATATTTGTAGCAACTGCAAATGATGCAAGTTTGATTCCAGTTGCTTTAAAAGATAGAATGGAATTTATAGAACTTAGTTCATATACCCCTCAAGAAAAATTTCAAATTGCAAAGAATTTTTTAATTCCCGATGAAATTAAAAAACATGGTCTAAAAAATGAAGAAATTTCTTTCGATAAAAAAGTTATAGAATTAATAATTAGTGATTATACAAGAGAGTCTGGAGTAAGAAATTTAAGAAGAAAAATTGCTGAAATATGCAGAAAATGTGTTAAAAAACTTCTCTTAGATAAAGATCTTCACACTATAAAAATTAGTACTAAAAATATAAAAGATTTTCTTGATAAGAAAGTATTTGAAATAGAAAAACATGAAAAAGAAAATAAAATTGGTCAGGTCAATGGTTTAGCTTGGACTGCTGTAGGTGGAGATGTTTTAAAAATTGAAGCTATTAAAATCAAAGGCAAAGGCGAACTCACACTTACTGGGAGCTTGGGAGATGTAATGAAAGAATCTGCTAAAATTTCTTTTAACCTCATTAAAAATTTAATTGATCAAAATATCATTAAAATTCCTAAGAATATAATCTACAAAAATGATGAAAATGTTTATAACTTATATAATTTACACATTCACGTCCCAGATGGTGCAACGCCTAAAGATGGTCCAAGTGCAGGCATAACGATCACAACCGCTATTGCATCTATTTTTAGCAACAAAAAAGTAAAATCTAATGTTGCTATGACAGGTGAAATTGATCTCATGGGTAATGTTTTACCAATAGGTGGATTGAAAGAGAAATTAATCGCAGCATATAAAGCTGAAATAAAAATAGCTATCATTCCATATAAAAATTTTGAGAGAGATTTGAAAGATATCCCTCAAGAAGTTATACAAAATATGGAAATCATAGGTGTAAAAAATTTAGAAGAAGTATTAAAGATAGCTCTTATTTAAAGCTATCTTTTAATAACTTATTGATATAAAAGTCTTATTAAAAATATAAAATTTTATTATTATTTAATTTTTATGATATTTAAATATTATTTCTTGACAATAAAGTGCTATATTGTAACATAATTCATCCTAAAGCATGTTATTTTATAAAATAAGAGTAATTTTATGTTATTCTATATAAAAGATCAATGAAAAAGGAAGGGTAAATGAAAAATATAGACAAATCATTTTTAGGTCATCCAAAACCATTATTTAGTTTATCTATGACAGAGCTTTGGGAAAGATTTTCTTTTTACGGTATTCGACCTTTATTAGTGCTTTTTATGGCAGCTAGTATTAGTGTAGGAGGCTTGAATATAAGCAAAGAAGAAGCTGCAGCTATAGCTGGAATTTTTGGAGGTTGCTTATATCTTGCTGCTTTACCTGGAGGTTGGTTGGCCGATAATTATTTAGGACAAAAAAAAGCTATATTTATAGGATCTATTATTATCGCTCTTGGACATTTATCTATAGCTTTATCCATATTTAATTCAACAATGTTTTTTGTTGGATTAGCTTTTATAGTTATAGGAACAGGACTTTTTAAAACATGCGCTTCTGTTGTAGTAGGTATGCTTTATAGTCAAGAAGATCCAAGACGTGATTCAGGTTTTACAATTTTTTATATGGGAATTAACTTAGGAGCTTTTATAGCACCTTTAATTTGTGGTTTTTTACAAGTGAAATATGGATGGCATATAGGCTTTGGTGCTGGTGGTATAGGTATGCTTATTGCTTTGCTTATTTTTTATTTTAAAACTATTCCCGATTTGGTTGATTTTGATAAGAATGTCGGGATTAAATATTCTTGGGATAAGCCTATAAAATACAACAAAAATGTTTTGTGGTTTGCTATAGTAGCTGTTGTGATTTTAATTGCTTTATCTTTTTTTATTTTTGGAGGATTTATTAAATTAAATCCTATAACTATTGCGAAAAATATGGTATTTATCATATTGTTTTATGCTGGAATCTACTTTTTATATTTATTCTTCTTTAGTTCTCTTAATAATGATGAAAAGAAAAAATTATTAGTTTTTATTATTTTATTTTTTTCAGCTGCTGTATTTTGGTCTGTTTTTGAACAACAATACACTTCTTTTAATTTCTTTGCCGACACATTAACTAATAGAAATTTTTTAGGATTTGAAATTCCAACAGTATGGTTTCAATCTATCAATGCTTTATTTATTATAGCATTTGCTCCAATAGTAGCGTTTGTATGGACCATTTTAGCTAAAATGAAATTTGAAATTTCTTCTATTAGTAAATTTACATTAGGATTGATAGGCGCTGCATTAGGATTTTTTGTAATGGTATTAGCTTCTAAAAGTGTTATAAGTAGCAACGATCTTGCCTCTCCTTTATGGTTAGTACTAAGCTTTTTCTTTTTGACACTAGGAGAACTTTGCTTAAGTCCTGTAGGATTATCTTTAATGACAAAAATAGCACCAAATTTAATAAAAGCTCAAGTAATGGGGCTTTGGTTTGTTAGTCTTTCATTAGGAAATATCATCGCAGGCTTAATTGGAGGTGAAGCAAGCAAAGATAATGCAAATGCTCTAGTGGATTTATTTTCTCAATGCATATGGATTCTCTTGGCTATGGCTTTTATTTTGTTTATTTTCAAAAATAAAATAAATAAAATGATAAATCATTAAGGAGAATAAGATGAATATTCATAAAGAAAGAATTCAAAAATTACAAGATTTGATGAAAAACAACAATATAGATATTTATATTATTTTAAGCGCAGATCCTCATTTAAGCGAATATCTACCAGAATATTATAAAAGTAAGGTTTTTATGAGTGGCTTTAGTGGCTCTGTAGGGACTTTGGTATTTACACAAACACAATCTTATCTATGGGTAGATGGACGTTATTGGCTACAAGCTGAAAAAGAATTAGAGGGCAGTGGCATGGTTTTACAAAAACAAGATAGCTCCAATACTTTTTTAGGATGGATTAAAAATAATTACAGTAAAAAAGAGACTTTAGGGGTAGATTTTGCTATCTTACCTTTAGAAATTTTAAAAGAACTAAATAAATATATTAATGTTATTAATAAAGATTTTATTAATAGCTTATGGGAAAAACGTCCTAGTCTACCTACAAATAAAATTTATGAACACGAAGAAAAATACTGCTCACATACGAGAAAAGAAAAACTACAAATGATTAGGGAACAAATGTCTCAACTTAATGCAAAAGCACATCTTATTTCCAGTTTAGACGATATAGCTTGGATTATAAATTTAAGAGGATCGGATGTATCATATATTCCTGTGTTTTTAAGCCATCTCTTAATTCTAGAAGATTTAGCCTATCTTTTTGTAGATACAAATAAAATTGAAACAACTTTAGTGGAAAAATTAAAACAAGATGGCATAGAACTTAAGCCATACGAATGTGTACAAGATGAACTTAAAAAACTTCATCACATTAATTTATTAATAGAACCAGCAAAAATGACGGCATTATTAATAAATTCCCTAGATCAAAGTGTCACTATCATAGAAAATTTAAATCCTAGTACCAATTTAAAATCACAAAAAAATATTAAAGAAATTGCTTTTATAG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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134471|881753:893024|889588_890080_-|VEH94346.1|DBSCAN-SWA MEKEIILESNTLITSKTDLKGNIIYANSYFLKYAGYQMGEILYKPHNIVRHPDMPRTVFKYLWNYIQEGKEIFAFVKNKTKFNDYYWVFANVTASFDQKGNIINYYSVRRKPKKEAVDTIKEVYKTLLKAEQNGGIKAGIEELVKIVNSYKMSYNQLILELQA >LR134471|881753:893024|889027_889519_-|VEH94343.1|DBSCAN-SWA MSQERVLNSDTLITSKTNLRGEIIYANDDFLKYSDYSIKEVLYKPHSLMRHPDMPRTVFKYLWNYIQEGKEIFAFVKNKTKFNDYYWVFANVTASFDQKGNIINYYSVRRKPKKEAVDTIKEVYKTLLKAEKDGGIKAGIEELQNIMKSHSMTYNQLMLALQK >LR134471|881753:893024|890103_891315_-|VEH94348.1|DBSCAN-SWA MIELNKIYQAKQKISEFILKTPFVHSSFLSDFLHTDIFLKCENLQKTGAYKIRGAYNAIANLSEKQKAQGVIAASAGNHAQGVAISAKKFGIKAVIVMPEATPLLKVSATKNLDAQVILKGNNFDEAYAFALDYVKQYNLNFIHPFEDENIIAGQGTLMLEMLDEASDLDMILVPVGGGGLISGIASAAKQINPDIKIVGVSAKGAPAMFESFHSKNIINSKSVRTIADGIAVRDVNKINFNIIVECVDEFIQVDDEEIANAVLYLLEKHKMIVEGAGASTIAALLHKKVNLDKCKKVGVVLSGGNIDVQMLNIIIEKGLFKSFRKMCINVTLVDKPGALTALSDTIKEANANIIKIDYDRFSTKLDYGDAMISITLETKGMEHQELVRKILFEKGFHFSEIS >LR134471|881753:893024|885842_887624_+|VEH94337.1|DBSCAN-SWA MNIHKERIQKLQDLMKNNNIDIYIILSADPHLSEYLPEYYKSKVFMSGFSGSVGTLVFTQTQSYLWVDGRYWLQAEKELEGSGMVLQKQDSSNTFLGWIKNNYSKKETLGVDFAILPLEILKELNKYINVINKDFINSLWEKRPSLPTNKIYEHEEKYCSHTRKEKLQMIREQMSQLNAKAHLISSLDDIAWIINLRGSDVSYIPVFLSHLLILEDLAYLFVDTNKIETTLVEKLKQDGIELKPYECVQDELKKLHHINLLIEPAKMTALLINSLDQSVTIIENLNPSTNLKSQKNIKEIAFIEDAMIEDGVALCKFFSWLEEAIKNNEKISELDVDKEVTKFRSQSPYYISNSFATIAGFNSNSAFVHYKATDESYAYLQKDGLLLLDSGGQYKNGTTDITRVVPIGKMNAEQIHDYTLVLKAHIAISRTIFPENIATPLLDAITRAPLWEEQLDYMHGTGHGVGYFLNVHEGPQVLSYFAPLLEKNKAKEGMVTSIEPGIYRPNKWGIRLENLVAHTKVQNQKNTEFGNFLYFKPLTLCPFEPSCIDLTLLDQKEKDWLNNYHQEVYQKLSPKLNDNIKVLQWLTIRTQKL >LR134471|881753:893024|884338_885832_+|VEH94334.1|DBSCAN-SWA MKNIDKSFLGHPKPLFSLSMTELWERFSFYGIRPLLVLFMAASISVGGLNISKEEAAAIAGIFGGCLYLAALPGGWLADNYLGQKKAIFIGSIIIALGHLSIALSIFNSTMFFVGLAFIVIGTGLFKTCASVVVGMLYSQEDPRRDSGFTIFYMGINLGAFIAPLICGFLQVKYGWHIGFGAGGIGMLIALLIFYFKTIPDLVDFDKNVGIKYSWDKPIKYNKNVLWFAIVAVVILIALSFFIFGGFIKLNPITIAKNMVFIILFYAGIYFLYLFFFSSLNNDEKKKLLVFIILFFSAAVFWSVFEQQYTSFNFFADTLTNRNFLGFEIPTVWFQSINALFIIAFAPIVAFVWTILAKMKFEISSISKFTLGLIGAALGFFVMVLASKSVISSNDLASPLWLVLSFFFLTLGELCLSPVGLSLMTKIAPNLIKAQVMGLWFVSLSLGNIIAGLIGGEASKDNANALVDLFSQCIWILLAMAFILFIFKNKINKMINH >LR134471|881753:893024|887642_889016_-|VEH94340.1|DBSCAN-SWA MKNILYIGTTLSVLGCIMVMSLAEFISAGILVLLCVVFIIGIYIHKNDEEFNDKILHLSQELKNGNFDERVIYIKCRNKKLKEIADNLNNTIDGLEAYLREINTSIACSQKGEYFRRAIPEGLKGIFVHNINFINRSLDDIEKTGKTVFKNALSRELMDLSLSSQNKNLNDLSNALNKIIRLMREVFGDIKIISDTAQKNGIEIGSLQESISSMMQVADESKNAVNTFASNAQNINSIVEVIRDIADQTNLLALNAAIEAARAGEHGRGFAVVADEVRQLAEKTQKATGEITLAIQVMNQEIGSIQENSEKVFGIANSSDSKIADFSEAFRELEGKSSHLGKEFVNFASELTLSAMKIDHILYKSDVYLTLNGSKNELQNLAPVSTLCNDEDAKNIFCPLVTPHELETKGDYIQTKADKAVKLAKNEVIDKLTYDAIISDIRELEKESRMIMDKLEV >LR134471|881753:893024|881753_884132_+|VEH94330.1|protease|DBSCAN-SWA MKIDNNQNYPAQLPVLIEDELFLYPFMITPIFLNDIQNIKALDVAIQNETMIFVAPSKIEGGRSFNDIYDCGVIGNIMRKVPLPDGRIKILFQGYAKAKIIKPISDDPLSALVDLIHQESLCSTKKEAIIEVLKEKAKALSMVSHYFPPDLLRTIEEDGDPSRICDLILNSIKIKKHQAYEFFIETNLEIKLLNLIDHLAKEIEANKIQKEIKNKVHSKIDKVNKEYFLKEQLKQIQRELGSDIQKESEVEEYNKKLENKKPFMYDDAYKEIKKQIQKYERIHQDNSEASMVQTYIETVLDIPFESLSKKKLNLLDVTKQLNTDHYALEKPKERIEEYFAVKELLEKRKIKDKDGAKVILCLVGPPGVGKTSLANSIAKALKRELVRIALGGLEDVNELRGHRRTYIGAMPGRIVQGLIEAKQSNPVVVLDEIDKLSRNHRGDPSAVLLEILDPEQNTKFRDYYLNFNIDLSKIIFVATANDASLIPVALKDRMEFIELSSYTPQEKFQIAKNFLIPDEIKKHGLKNEEISFDKKVIELIISDYTRESGVRNLRRKIAEICRKCVKKLLLDKDLHTIKISTKNIKDFLDKKVFEIEKHEKENKIGQVNGLAWTAVGGDVLKIEAIKIKGKGELTLTGSLGDVMKESAKISFNLIKNLIDQNIIKIPKNIIYKNDENVYNLYNLHIHVPDGATPKDGPSAGITITTAIASIFSNKKVKSNVAMTGEIDLMGNVLPIGGLKEKLIAAYKAEIKIAIIPYKNFERDLKDIPQEVIQNMEIIGVKNLEEVLKIALI >LR134471|881753:893024|891983_893024_-|VEH94352.1|tRNA|DBSCAN-SWA MHFEEKIILNKALFSSLFNGEIQCFNSPSSAYRTRAEFSIYHDENNKIHYAMHENKKKIPIQKFEKAEKVIQEFMPILLENINEKLAHKLFGIEFLSTKLDLSVTLLYHKNIEEIFEDLKKLSCDLNIKLIARSKGKKIVFNGENLRQELDINGKKIFYEFNNECFIQPNTYINEKMIEWVLSCIKKDEKKDLLELYCGYGNFTIALASNFNEILATEISKKNIEFALRNCILNDISNISFVRLSSEELSQAFEKQREFNRLKNINLDTFNISHVLVDPPRAGLDENVIKLINKFQNIIYISCNPITLKNDLEILCNTHKIIQFAFFDQFAGTPHLECGIYLKKYH >LR134471|881753:893024|891591_891987_+|VEH94350.1|DBSCAN-SWA MLNIYPYVLILHLFCAIFFVGFLFTDIFFLKYSKKNTILNINNAFKIMPCIVLILFISGLYLAYFHLNLLNWLFITKIFFALCIFILILFSLFYKIILKKQNPLHKNIHPIIFIFTIIIIICAKLMFYIAI |
9 | Acinetobacter_phage(25.0%) | tRNA,protease | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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