Overview of predicted results
Overview of the results
| Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| LR134481 | Haemophilus parainfluenzae strain NCTC10665 genome assembly, chromosome: 1 | 0 crisprs | cas1,cas3,DEDDh,WYL,DinG,csa3 | 0 | 0 | 4 | 0 |
1. LR134481
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0
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
|---|
| Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| DBSCAN-SWA_1 |
824324 : 887303
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134481|824324:887303|DBSCAN-SWA GTTAAGCACACTCCACTGAAAATGAAATCACCTCTTTAATACTTTTAGCACCTAATGCAATCATAATTAAACGATCGACACCTAAAGCCACGCCTGATGTATTGGGAATCCCTGCTTGTAATGCCGCCAGGAAGCGATGATCGATTTCACGTTGTGGTAAGCCTGCTTTTTCGCGTAGGCGGTTATCTTGCTCAAAGCGGTGTTGTTGTTCACGGGCATCAGTTAACTCGTGAAAACCATTTGCTAATTCTAATCCTTTATAATAAAACTCAAAGCGTTCTGCCACACGACTATCTTCTGGACTAAGTTGTGCAAGTGCAGCTTGTGAAGAGGGAAAATGATATACAGCAACAGGTGCTTCTTGCCCGATATTAGGTTCTACCACTTCGCTGAATAAAAATTGTAATAATGTGTCCCTGTCTTCATTTTCATCTGCCATGAAATGGTGTTTACGAGCCGCTTCAACTAATTCTTGACGAGTTGCAGAAAGTGGGTCTAATCCTACATATTCTTGAAATACGAACTGATAACTTAAGGTTTCTGCGGGTTTACAATCAAGAATTTGTTGTAATAAATCATCCACTTCATTCATCAGACGATACATATCAAAGTACGGTCTATACCATTCAAGCATGGTAAATTCTGGATTATGCCGATTGCCAGCCTCCTCATTACGGAATACTTTACCAATTTGAAAAATTGGCCCACTGCCAGCAGCCAGTAAACGTTTCATGTGATATTCCGGACTAGTGGAAAGCCAGAGTGTTTTTGATAATTCGCCAAAAGGTGCAATAAATTCGGTACTAAAGGTGGAAAGATGGAGATCGGTTACGCCAAATTCGCTTAAAACAGGTGTTTCTACCTCTAATAATCCACGATCAGTAAAGAATTCGCGAATATCAGCAATAATTTTTGCACGAGCCAGTAAATTTTTTATTGGAGCAGAAGGTTGCCATAGTGTTTGTTCATCGCTAAGTGCGGTCATTTTTTTCTCCATTTTGGGCACTAAGAGGAATGAGATTATTGTAAACAAGAGCGATTTTTAACTCAATAATCCAATTGAAGGGTTTATAAACGAAAACAGTTATCATCCCAAAATATATAAAAACTAACTTTTTTGAGTTAGATCACACTTTTAGTATTTTATCCGTTTATTCAGGAAAAAAGGTTACTAATTTGTAAACAAAAATGGCAGAATGGTAGCATGTTCCCTATTGCTTTTATTAGGGCGTTTCATTTTTTTACTTTTAATTGGAGGATATCGTGCAAACGGTTAATGTCGATATTGCTATTGTTGGTGCCGGTGGCGGCGGTTTACGTGCAGCAATTGCAGCAGCAGAAGCAAACCCTAACTTAAAGATCGCATTAGTTTCTAAGGTTTATCCTATGCGTAGCCATACGGTTGCAGCAGAAGGTGGTGCGGCCGCAGTAATTAAAGAGGAAGATTCCTACGATAAACACTTCCACGATACCGTTGCTGGTGGTGACTGGTTATGTGAACAAGATGTGGTGGAATACTTCGTTGAACATTCTCCAGTGGAAATGACTCAACTTGAACGTTGGGGTTGCCCTTGGAGCCGTAAAGCAGATGGCGATGTGAACGTGCGTCGTTTCGGTGGGATGAAAATCGAACGTACTTGGTTTGCGGCAGATAAAACGGGTTTCCACTTATTACACACACTTTTCCAAACATCTACTCAATATCCACAAATTCAACGCTTTGACGAGCACTTCGTTTTAGACATCTTAGTTGATGATGGCCACGCTCGCGGTATGGTGGCGATGAATATGATGGAAGGTACACTTATTCAAATCAACGCAAATGCGGTTGTGATTGCAACTGGTGGTGGTTGTCGTGCATTTAAATTCAACACCAACGGCGGTATCGTAACTGGTGATGGTTTATCAATGGCATATCGTCATGGTGTTCCTCTTCGTGATATGGAATTTGTGCAATATCATCCAACCGGCTTACCAAACACCGGTATCTTAATGACTGAAGGTTGTCGTGGTGAAGGCGGTATCTTAGTGAATAAAAACGGCTACCGTTATTTACAAGATTATGGTCTAGGCCCTGAAACCCCAATCGGTAAACCTGAAAACAAATATATGGAACTTGGTCCACGTGATAAAGTTTCACAAGCGTTCTGGCAAGAATGGAAAAAAGGCAACACCTTAAAAACGGCAAAAGGTGTTGATGTGGTTCATCTTGACTTACGTCACTTAGGTGAAAAATATTTACATGAACGTCTTCCATTCATTTGTGAATTAGCCAGTGCTTATGAAGGTGTAAACCCAGTTAATGAACCAATCCCTGTACGTCCTGTTGTTCACTACACCATGGGTGGTATTGAAGTGGATTACAACAGCGAAACTCGCATTAAAGGTTTATTTGCTGTGGGTGAATGTGCGTCTTCTGGTTTACATGGCGCAAACCGTTTAGGTTCTAATTCGCTTGCAGAATTAGTGGTTTTAGGCCGTGTTGCAGGTGAATATGCCGCACAACGTGCAGCAGAAGCACAACCTGCAAACCGTGCAGCAGTTGATGCGCAAGCGCAAGATGTTGTAGCTCGCCTTGAAGCACTTTATAACCAAGAAGGTAACGAATCTTGGTCTGAAATCCGTGACGAAATGGGTACCGTAATGGAAGAAGGTTGTGGTATCTACCGTGACCAAGAAAGCATGCAAAAAGCAGTAGATAAAATTGCTGAGCTTAAAGAACGTTATAAACGTATTCGTGTTGCAGACCGTTCAAGCGTATTCAATACCGATGTGCTTTACACCGTAGAATTAGGTTACATCCTTGATGTAGCTCAATCTATTGCAAACTCTGCAATTGAACGTAAAGAGTCTCGTGGTGCACACCAACGCTTAGACTACACTGAACGTGATGATGTGAATTATTTACAACACACCCTTGCTTACTACAATGGCGATGATGCACCGCGTATTGAATACAGCCCGGTGAAAATCACTAAATCTCAACCAGCAAAACGTGTTTATGGTGCTGAAGCAGAAGCGGCAGAAGCGGCTGCGAAAGCTAAGGAGCAAGCAAATGGCTAATTCACCGGTAATGACTGTAGAAGTATTACGCTACAACCCAGAAAACGATCAAGAGCCACATTTAAGCTCTTATCAAGTACCTTATGATAATCAAACCTCTCTTTTAGATGCGTTAGGTTACATTAAAGATAAACTTGAACCGTCTCTTTCTTATCGTTGGTCTTGCCGTATGGCAATCTGCGGTTCTTGTGGGATGATGGTCAATAACAAACCAAAATTGGCTTGTAAAACGTTCTTACGTGATTACAGTGGCCACATGCGTATTGAACCATTAGCAAACTTCCCTATTGAACGCGACTTAGTGGTTGATTTAAGCCACTTTATCGAAAGCTTAGAGGCAATTAAACCTTATATTATTGGTAACGAAGCACCAGCATTAGATGGTAAACCACATCCATCGAAAGAATTGCAAGTAAGCCGTACTAAACAAACTCCGGCACAGCTTGAAAAATATCGTCAATTCTCAATGTGTATTAACTGTGGTTTATGCTATGCGGCTTGTCCGCAATTTGGTTTAAATCCTGAATTCTTAGGCCCAGCAGCAATTACGATGGCACACCGTTACAACCTTGATAACCGTGACCATGGTAAAGCTCAACGTATGCCATTATTAAATGGTAAAAACGGTGTTTGGAGCTGTACTTTCGTGGGTTATTGTTCTGAAGTGTGTCCAAAACACGTGGATCCAGCTTCTGCAATCAACCAAGGCAAAGTGGAAAGTGCCAAAGATTATGTTATCTCAATGCTAAAACCAAAAGGCTAAGGGGAAGAATATGTCAGTAACAGTAAGTAAACGTAAAAAATATGTTCGCCCAATGACGGCTACTTGGTGGCAAAAATTGGATTTCTACAAAGCGTATATGGTGCGTGAAGCAACCTCTATCTTTGCTGTATGGTTCTGTATCGTATTGCTTTATGGCGTACTTTGCCTTGCAAGCAATCCTGTTCCAGGTCTAGGCATTATTGATTTCATCGGCTTCTTAAGAAATCCAATTGTGGTGTTCTTAAATATCATCACATTAATTGCGACTTTATATCACACAGCAACTTATTTCGTGATGACACCAAAAGTGATGAACATCATTGTTAAAAATGAGCGTTTACCACATCACGTGTTAAGAAATGCACTTTGGGCAGTTACAGCTGTGATTAGTGTTATCGCATTAATTTTAGTTTATATGTAGGGAGAGAAAAAATGGTCGAACAAAATCCAAAACGCTCTGGTGAACCACCAGTATGGTTGATGTTTGGTGCTGGCGGGACTGTCAGTGCGATTTTCTTCCCTGTGGTAATCTTAATCCTTGGTTTATTGTTACCATTCGGATTAATTGATCCACATAACTTAATTACATTCGCTTATTCTTGGATCGGAAAATTAGTTATCTTAGTTTTAACAATTTTCCCTATGTGGTGTGGTTTACACCGTATCCATCATGCGATGCACGATCTTAAAATCCACGTGCCAGCAGGCGGATTTATCTTTTACGGTTTGGCAATGATTTACACAATTTGGGTGTTATTTGCTGTATTAGGTTTGTAATTTAAAACAACACTAAATGGATAAATAAAAGTGCGGTCAAAAAAATGATCGCACTTTTTTTATTCTTTAAGCATAACTAAAATATTTTCTTAATCCAGAAAAACAAAAAACCCGACATTACGTCGGGTTTTCTTTTATCAAAAACTTTGATAATTATTCTGCAACAACGATAACATCTAATGTTGCAAATACTTCACCGTGAAGTTGGAAACGAACATCGTGATCACCAAGAGTACGGATTGGACCATTTGGTAAACGAACTTCGCTTTTCGCAATTTCAACACCAGCTGCAGTTACGGCTTCTGCTACATCACGAGTAGTGATTGCGCCGAATAAACGACCTTCATCACCTGCTTTAGATGCGATGGTAACAGAACCTAATGCAGTCACTTGTGCT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81 | Burkholderia_virus(17.5%) | tail,transposase,plate,terminase,tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_2 |
1023559 : 1038882
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134481|1023559:1038882|DBSCAN-SWA 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15 | Vibrio_phage(37.5%) | tRNA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_3 |
1323135 : 1331415
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134481|1323135:1331415|DBSCAN-SWA 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CGCGTTCAGAAAGAGCATTGACGACAGAAATCCCCACCCCGTGTAAACCACCGGCAAACTCATAGTTTTTATTTGAGAATTTACCGCCAGCATGAAGTTTGGTTAAGATGACTTCAACACCCGAAACCCCTTCAGTTGGATGAATATCCACTGGCATCCCACGACCATTATCGATGACTTCAAGAGATTGATCCGCATGTAAAATCACTTCAACTTTGGTGGCAAACCCAGCAAGTGCTTCGTCCACACTGTTATCGATAACTTCTTGAGCAAGGTGATTGGGACGGGTAGTGTCCGTGTACATACCTGGGCGGATTTGCACAGGTTCGAGATCTTTCAGAACCGTAATTTCTTGAGCGGAATAATTTGTAGTCATTTTTAAAATTAGTTACTTATTTATAAAAAATAAGCCTGATTTTATCAAAAAATGACGCATTTATAAAATCAAAGATATGCAGGAAAGGAGGGGGATCTTGAAAAGTGCAGTTAAAGTTTGAAATGAATAATAACCGCACAGATAATAGAAAAATGATTGCTATTCGATCCCAATCAATTTATGTGTTTGTAAACTTAACAGCCATCTCGGTTTATTCGTTCTTTGATTTAATTTTCCTAATTGTGTGATCGTTTCTAATAGATTCATCTTGCCATGAACTTCACAAGGAGAAAGATAGTAATATTTTGCTTGAATTTTATTTTCAATCATTTCACAAAAAGGAATAATATTGTCATCAGCAACAATGCGAACTTCATGTGCAAATGAAATACAACGCTTTTCGTATTTATGTGCATATAGACGTTTTGGGCTTGTGGCAATAAAATCAATTTGTGCTGGAACAGTGTTAAGACCATTAGTTTCAATTGCTAAAAAATAACCTAAACTTTTTAATTGATTAAGTATCATCTCTAATTTGGGCACAATAGTCGGCTCCCCACCTGTGATAATAATATTCTTTGCAGAAAATGACCGCACTTTATTGAGAATTTGTGATAAGGAGCAACGTTTAAATTGATGATAATTAGTATCACACCAGGTACAGGCAAGATTACATTTACCAAAACGGATAAAAATAGCGGGCATACCGGTATTAAAACCTTCTCCTTGAAGGCTTTCAAAAATCTCAACAATATTATAATACGGTTCTGAAATGATTTGTTTTTCCACCGTACTTATTCCTGATATTCACAAAATGATGTTGGCGTTTCCCATAATCGGATGGCAGAAATTGGTAATTTTTCATCATATTTTAGACGATGAAAAATAAAACGAGCCATTTCTTCAGCGGTACTACGAAAATTCACGCCAAAGGTTTTTGATTGTAATTCTTCTAGAAGTATTGCAATTTTACTTTCACGTTTACTGGTTTGATCGTAGATAAAAGCATGATCCATGGGATCTAAAATGGATTTTTTCACAATAGATTTTAAATCTGAAAAGTCCATCACCATTGATTTTTTTGCGCCATGAGTAATTAAATGACCGGTTATTTCGACTTGGAGTTTATAGGTATGGCCATGTAGATTTTGGCATTTACCATCATGACCATCTAATAGGTGTGCCATATCAAAACTAAATTCTTTGGATACTTTAAACATCTTTATTCTCTGCTTTTATTGACAAGTACTCTTGTAAACCTTTATGACGTAATTGACAGCTTGGACATTTACCACAGCCTCCTTCAACACCTTCATAGCAAGTATGGCTGTGCTGACGAACATAATCTAAGGCATTTAATTCATCGGCAAGAGCCCAAGTTTGGGCTTTGGTGAGATACATTAATGGTGTTTTTAAGTTGAACGAATAATCCATGGCTAAATTGAGGGTGACATTCATGGATTTGATGAATACATCACGACAATCCGGATAGCCACTGAAATCTGTTTCACATACACCTGTAATAATGTCGTTGATGCCTTGTTTTTTTGCATAAATCGCTGCATACAATAAGAATAGGGCATTACGACCATCCACAAAGGTATTGGGTAATTCACCATCTTTTTGCTCAATATCAAGGTTTTCATCCATTAAGGCATTATGAGTGATAGATTTAATAACGGATGTATCAATCAGTGTTTGCTTTACGCCAAGATCGTTAGCGATCCAACGGGCTTTTTCTAATTCAATTGCGTGGCGCTGGCCGTATTGAAAGGTGACGGTTTCGACATTTTCTACGCCATATTCGGCAATTGCTTGAATTAAACAGGTTGTGGAATCTTGTCCACCAGAGAAGATCACAAGGGCTTTACGATTGTGATTAGGATTTGAAATATTCATAGGATACCTAGTTTTTTTATGTAGGAGGTTTGCGAACTACAAGTTAAAAATGAGCTGGTATTGTAGAAGGCAAGGATAAAATTTGCAAGAAATAGGGTAATTTAAGCAGTAAAAACCAACAAAAGTTGTGGTACAATTTTGATGATTTAGTTTTTAAAAGGTAAACACAATGAAAAAATTAATACTTATTGTTGTTGCGACATTGGTGATTTCAGCTTGCGCAAATAAAGACGTTTATTTTAATGGTTCTGAAGGATCCCATTCAGGCATGAAATTTGACAAAGATGCTCATCATTGGGGAGTAAATCAATAGGTTATACTTATAATCTAAAAGCCATACTGTTGTATGGCTTTTTTATTAAATGACTTCTTCTTGACAATGTGGGCATGTCATTAAGTGTTCTTCATTATTGTGAACAATATAATGACCCATTTTTTTCGCTTTGGTATCAAGATATTTTGTATTATAGCGGTTTTCACCCACATTAAGAGGCACTCGCTCCACAATATTAATACCCGCTTTTTTCATGGTTTCTACTTTTTGCGGGTTATTTGTCATTAAGCGGACTTGTTTCACACCTAATAATTCAAACATATCGGCACACACATTAAAGTTACGCTCATCAGCTTTAAAGCCTAGTGCAAGATTCGCTTCGATAGTATCCATGCCTTGATCTTGCAAAGAATAAGCACGGATTTTATTAATTAAACCAATTCCGCGACCTTCTTCACGGTGATAAATTAATATACCTCGGCCTTCTTCACTAATTTGGCGTAATGCCGCAGCAAGTTGGAAACCACAATCGCATTTTAAACTGTGTAATGCATCGCCAGTTAAGCATTCAGAATGAATACGGGCAAGTACAGGTTCATCTTGATTTGAAATATCGCCCATTACCAAGGCAACGTGCTCTTTTTTTGTATCGGGAAATTCAAATCCAATCATTTTAAATATACCATATTCGGTCGGTAAATTGGCTTGAGCAACCAGTTCGATTTTTGACAT
Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134481|1323135:1331415|1329722_1330409_-|VEI31700.1|DBSCAN-SWA MNISNPNHNRKALVIFSGGQDSTTCLIQAIAEYGVENVETVTFQYGQRHAIELEKARWIANDLGVKQTLIDTSVIKSITHNALMDENLDIEQKDGELPNTFVDGRNALFLLYAAIYAKKQGINDIITGVCETDFSGYPDCRDVFIKSMNVTLNLAMDYSFNLKTPLMYLTKAQTWALADELNALDYVRQHSHTCYEGVEGGCGKCPSCQLRHKGLQEYLSIKAENKDV >LR134481|1323135:1331415|1323135_1325430_-|VEI31685.1|DBSCAN-SWA MGILVQQENRLENMSNINYEGIEQMPLRTFTEKAYLNYSMYVIMDRALPFIGDGLKPVQRRIVYAMSELGLNAAAKFKKSARTVGDVLGKFHPHGDSACYEAMVLMAQPFSYRYPLVDGQGNWGAPDDPKSFAAMRYTESRLSKISEILLTELGQGTVDFQPNFDGTLEEPQYLPARLPHILLNGTTGIAVGMATDIPPHNINEVADAAVMLLDNPKAGLDDVLNIIQGPDFPTEAEIISPKDDIRKMYETGRGSIKMRATWHKEDGEIIISALPHQSSPSKIIAQIAEQMTAKKLPMVEDIRDEADYENPVRIVLVPRSNRVDTDALMTHLFATTDLEKSYRVNMNMIGLDHKPAVKGLLQVLIEWLTFRRTTVTRRLQHRLDKVLARLHILEGLMIAFLNIDEVIEIIRTEDEPKQVLMARFNLSDEQAEAILNLRLRHLAKLEEHQLQAEKDKLEEERLNLELILGSEHRLNTLIKKEIQEDAKKYASPRMSQLVEREEAKAISESEMTPAEPVTVILSEMGWVRCAKGHDIDPKGLSYKAGDKYLAHACGKSNQPVIFIDSTGRSYALDPLSLPSARSQGEPLTGKLTLPVGAIIEQVIMEPEKQELLMTSDAGYGFICKFDDLIARNKAGKVLISLPENAKVLKPETLSESAPLLVSLTSADRMLIFPVRDLPVLSKGKGNKIISIPAANAKVRSELLVKLFLVSEKASLEFHSGKRKITLKPEDLQKFRAERGRKGSQLPRGLHSHADIVVIEPKHNS >LR134481|1323135:1331415|1330578_1330722_+|VEI31703.1|DBSCAN-SWA MKKLILIVVATLVISACANKDVYFNGSEGSHSGMKFDKDAHHWGVNQ >LR134481|1323135:1331415|1329304_1329730_-|VEI31697.1|DBSCAN-SWA MFKVSKEFSFDMAHLLDGHDGKCQNLHGHTYKLQVEITGHLITHGAKKSMVMDFSDLKSIVKKSILDPMDHAFIYDQTSKRESKIAILLEELQSKTFGVNFRSTAEEMARFIFHRLKYDEKLPISAIRLWETPTSFCEYQE >LR134481|1323135:1331415|1325401_1326595_-|VEI31688.1|DBSCAN-SWA MNEQRRDFFKNSALGLATITLGAGLSLVPSAQAEEKPSNTATTAVEKLPEIEAELTLAPNVPKPIERNHPAKVVVKLTALEQIMDLMDGVQFKFWTLNGSVPAPFIRVREGDMVEVQLSNSASSMMPHSIDFHAAAVPMGGAIASETPPTRTSTFQFRALRSGIYLYHCGSQPVDIHLAKGMYGLVLVEPKEGLPKVDREFYIMQSEFYTKGEFGDPGLQPFSMKKAIDERPEYVLFNGKVGATMDENALKAKNGETIRLFVGNAGPNLCSSFHLIGAVFDNVYVEGGTLINHNVQTTLIPSGSATMVETRIDVPGTYVFMDHSIFRAVNKGTMGHIVVEGEKNPNIYSGKLKDEAFKEDNPQKPQPVPYEIDSHKGMDMGHSPHEHSDGNSGATRK >LR134481|1323135:1331415|1328669_1329299_-|VEI31694.1|DBSCAN-SWA MEKQIISEPYYNIVEIFESLQGEGFNTGMPAIFIRFGKCNLACTWCDTNYHQFKRCSLSQILNKVRSFSAKNIIITGGEPTIVPKLEMILNQLKSLGYFLAIETNGLNTVPAQIDFIATSPKRLYAHKYEKRCISFAHEVRIVADDNIIPFCEMIENKIQAKYYYLSPCEVHGKMNLLETITQLGKLNQRTNKPRWLLSLQTHKLIGIE >LR134481|1323135:1331415|1326611_1328510_-|VEI31691.1|DBSCAN-SWA MTTNYSAQEITVLKDLEPVQIRPGMYTDTTRPNHLAQEVIDNSVDEALAGFATKVEVILHADQSLEVIDNGRGMPVDIHPTEGVSGVEVILTKLHAGGKFSNKNYEFAGGLHGVGISVVNALSERVDIQVKRNGEVYKIAFENGVKVEELEVIGTCGRRTTGTTVHFKPNPKYFDSKNFSVSRLRHLLRAKAVLCSGLEIKFVDKVNNTEDVWCYQDGLSDYLTEAVNGFETLPEKPFVGEFKGSTEAVSWALLWLPEGGELIAESYVNLIPTVQGGTHVNGLRQGLLNAMTEYCEFRNKLPRGVKLTADDIWDRCAYILSLKMQDAQFAGQTKERLSSRQSAVFVAGVLKDAFSLWLNQNVQDADRLAEMAISSAQRRLNAAKKVVRKKLVSGPALPGKLADCASQNLEKTELFLVEGDSAGGSAKQARDREYQAILPLRGKILNTWEVASDQVLASTEIHDIAVALGIDPDNEDLSQLRYGKVCILADADSDGLHIATLLCALFLRHFPKLVQDGHVYVAMPPLYRIDLGKEVFYALDENEKEAILERLKGKKGTLNVQRFKGLGEMDPSQLRETTMDPNTRRLVQLTYELGEDQGAETLELMDMLLAKKRAEDRKNWLQTNGDQVDLAV >LR134481|1323135:1331415|1330767_1331415_-|VEI31706.1|DBSCAN-SWA MSKIELVAQANLPTEYGIFKMIGFEFPDTKKEHVALVMGDISNQDEPVLARIHSECLTGDALHSLKCDCGFQLAAALRQISEEGRGILIYHREEGRGIGLINKIRAYSLQDQGMDTIEANLALGFKADERNFNVCADMFELLGVKQVRLMTNNPQKVETMKKAGINIVERVPLNVGENRYNTKYLDTKAKKMGHYIVHNNEEHLMTCPHCQEEVI |
8 | Bacillus_virus(33.33%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| DBSCAN-SWA_4 |
1548611 : 1638152
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134481|1548611:1638152|DBSCAN-SWA TATGCCTATTATTACTTTACCGGACGGTTCTAAACGTGAATTTGATCGTCCAGTTTCTGTGTTAGAAGTGGCTCAAGATATCGGAGCCGGTCTTGCCAAAGCAACCATCGCTGGCCGTGTAAACGGTGAACGTCGTGATGCGTGTGACATCATCAATGAAGATGCCAACCTTGAAATTATTACAGCAAAAGATGAAGACGGTTTAGAAATTATTCGTCACTCTTGCGCACACTTGCTTGGTCACGCAATCAAACAATTATTCCCCGATGTCAAAATGGCAATCGGTCCAACGATTGAAAATGGCTTCTATTATGACGTGGATTTAGACCGTTCTTTAACGCAAGAAGACATTGATGCTATCGAAAAACGTATGCTTGAATTGGCGAAAACCAATTATGACGTGATCAAAACTCCGGTAAGCTGGCAAGAAGCAAGAGATACTTTTGAAAAACGCGGTGAGCCATACAAAATGGCTATCTTAGATGAAAATATCGAACGTACCGCAACGCCTGCGCTTTATCATCACGAAGAATACATTGATATGTGTCGTGGACCACATGTGCCGAATATGCGTTTCTGCCACAACTTCAAATTAATGAAAGTTGCAGGTGCTTATTGGCGTGGCGATAGCAAAAATAAAATGTTACAACGTATCTATGGTACGGCTTGGGCAGATAAAAAACAATTAGCGGAATACTTAACTCGCTTAGAAGAAGCGGCAAAACGTGACCACCGTAAAATCGGTAAAGCGTTAGATTTATATCATATGCAAGAAGAAGCACCGGGTATGGTGTTCTGGCATAACGATGGTTGGACAATTTTCCGCGAATTAGAAACCTTCGTACGTACAAAATTAAAAGAATACGATTATCAAGAAGTAAAAGGTCCGTTCATGATGGACCGTGTGTTATGGGAAAAAACAGGTCACTGGCAAAACTACGGCGATTTGATGTTTACTACACAATCAGAAAACCGTGAATATGCGATTAAACCAATGAACTGCCCAGGACACGTTCAAATCTTTAACCAAGGTTTAAAATCTTACCGTGATTTACCAATCCGTATGGCGGAATTTGGTTCTTGTCACCGTAATGAACCATCAGGTTCTTTACACGGTTTAATGCGTGTGCGTGGCTTTACTCAAGACGATGCACACATTTTCTGTACTGAAGATCAAATTGAAAGTGAAGTAACCAGTTGTATCAAAATGGTTTACGACATTTACAGCACGTTCGGTTTCCAAAATATTCAGGTGAAATTATCTACTCGTCCTGAAAAACGTATCGGTGCAGATGATATGTGGGATCGTGCAGAAGCAGGTCTTGCGGCAGCATTAGCGCATAACGGACTTGAATATGAAATTCAAGAAGGTGAAGGCGCATTCTATGGTCCGAAAATTGAGTTTGCATTACGTGACTGTTTAGATCGTGAATGGCAATGCGGTACTATCCAATTAGACTTTGCATTACCTGGTCGTCTAAATGCGTCTTATGTGGCAGAAGACAATGATCGTCGTACACCAGTTATGATTCACCGTGCGATTTTAGGTTCGATTGAGCGTTTCATCGGTATCATTACTGAAGAATATGCGGGTTTCTTCCCTGCATGGTTAGCGCCAGTTCAAGCGATTGTGATGAATATTACAGATAGCCAAGCAGACTACGTTCAAAAAGTAGTAAAACAACTTTCTGATGCGGGATTACGTGTCAAAGCAGATTTACGTAATGAGAAAGTCGGCTTCAAGATTCGCGAACACACCTTACGTCGCGTACCTTATATGCTTGTTTGCGGTGATAAAGAAATCGCAGAAGGCAAAGTGGCTGTACGTACCCGTAAAGGTGCTGATTTAGGTACTTTCACGATTGAAGAGTTTGCAGAAATCTTAAAATCCCAAGTAAGACAACGTGAGTTGAAATTGTTAGGTGAAGAGTAGTAACTCAAGGAATTTAATAAAAGAGGACAAAATATAATCAGTCCTCTTTTATAAAGAAGATAAGAGACAGAATTTGCAATAAAAAACGACCGCACTTTTAACGCTTAAAAGGCGTTTTCCATCATAATTTCACCGTCTTTATGTACCCGATGAAGTGCGAAGCCTTTAGCTTTTAATTTCTCGTAACTTTCTTTTACCATATTCGGGTTGCCACAAATTAAGAAACGGGTATCGACTTTAGTAAAGGTGATATTTAACGCGTTTTCCAGTTCGCCGTTTTCTAATAATTGCGGAATTCTTTGGTTTAATGCGCCGGCAATTTTCTCTCGGGTAATGACTGGTTGATAGATGAATTTGTTGGCATATTTCCCCACAATAGCGTGGTCTTTTAAGTCGGCTAAATACTGTTCAAATATCAAATCATCTACATAAGAAACGGAATGCACTAAGACGACTTTATCGGCTTTTTGCCATAATGTTTCGTTTTCTAACATCGACAAAAACGGCGCAATGCCTGAACCGGTGGCGAGTAAAACAAGTTCTTTACCCTGAGGAATGCGGCTAACGGTAAAGAACCCGATAGGTTTTTTCTCTAATAATAAGCTGTCGCCTGCTTGCATTTGGTTAAAATGCCCTGACATGATGCCGTCTTCAATGAGGATGGCGTAAAAATCCAGATGATCCGCATTTTCGGCAGAAATCATGGAATAGGCACGGGAAATGTATCCATCTCCTTGCATAAACCCTAATTTGGCAAACTGACCGGCAATAAAATCAAAGTCCTTTGGGCGAGTGATACTGAAAGAAAGTAGCTTGGGTGTGTGTTTTTTAACCCAACGCACTTTCTGTTCGGTAAAAGGATATTCTTTTTTGTGCTCGTTCATAAATAGCTCCTGATTCCTGAATTAAAAAATAAAAGTAAAACAGCAAAAGCGGCAATCGTTAGGTAGGTGATATTTTATACGATTTGGACAAATCTTGCTATGCTTTTTCGGAGTAGGTAATTGATTGTCGTAAAAGGTTTTAAAATCAATTTTCCTCACAGCATTCGACTATTGCTTAACAAGGTAAAATTCTGTAAAATGCACCCGTTTTTGCTCATTCTTAGAGCATTAAAAATGAATTTAACTTCTGTTTTTGTATAGTAAAACAGAAGTTTTGAGGCTTAATTAATAGAGGAATATCATTATTAAAACCGTAAAAAAAGCTCCGGCAGCTAACCGCCCGAATCGCATTAACGATGAAATTCGAGTAAAAGAAGTTCGTTTGATTGACCAAGATGGTGAACAAGCGGGGATTGTATCAATTCAACAGGCCTTAGATATGGCAGAACAAGCAGCGCTTGATTTAGTTGAGATCAGTCCGAATGCCGAACCACCGGTTTGTCGTATTATGAACTACGGCAAGTTCCTCTATGAAAAGAGCAAAACCGCAAAAGAACAGAAGAAAAAACAAAAAGTCGTACAAGTAAAGGAAATTAAATTCCGTCCAGGTACAGATGAAGGTGACTACCAAGTTAAATTACGTAGCTTAATCCGTTTCTTAGAAGATGGCGATAAAGCGAAAATTACCGTACGTTTCCGTGGTCGTGAAATGGCTCACCAAGATATCGGTTTAGACGTATTAGAACGCGTTAAAAACGATTTGGCTGACATTTCAGTAGTGGAATCTGCACCGGGTAAACTAGAAGGTCGCCAAGCGGTAATGGTGTTAGCACCTAAGAAAAAATAATTTTTTATTTAGATCTAATCTAGATAATCGAATTTTCACTTCGGTGAGAATACAATTGCACATTAGGCAAACTACGCAGCCTAATTGCTTTTGGAGAAGGGCAATTCAATTTGCCATATTGGAATAATTAGTGCCTACAAGTAATCTTCGGATTCGCCTAATTATGTGTTTAACTTAAAATGCGGAGTTTTTTAACAATGCCTAAAATTAAAACAGTACGTGGTGCTGCTAAGCGTTTCAAAAAAACAGCTTCTGGCGGTTTCAAACGTAAACAATCTCACTTACGTCATATTTTGACTAAAAAGACAACTAAACGTAAACGTCATTTACGTCATAAATCAATGGTTGCGAAAGCAGACCAAGTTTTAGTAGTAGCTTGCTTACCATACGCATAAGCCGTTATTTAAGCAAAACGTACGATTAGTTAAAAATATTACATAGGAGATTAAATAATGGCTCGTGTAAAACGTGGTGTTATTGCAAGAGCACGCCATAAGAAAGTTCTTAAGGCTGCTAAAGGTTATTATGGTGCACGTTCACGCGTGTATCGCGTTGCTTTCCAAGCGGTGATCAAAGCTGGTCAATACGCATATCGTGACCGTCGTCAACGTAAACGTCAATTCCGTCAATTATGGATTGCACGTATCAACGCTGCAGCTCGTCAAAATGGTTTATCTTACAGCAAATTCATCAACGGCTTGAAAAAAGCATCTGTTGAAATCGACCGTAAGATCCTTGCTGATATCGCTGTATTCGACAAAGTGGCGTTCGCTGCATTAGTTGAAAAAGCAAAATCTGCACTTTAATTTTTTAAAGTTTAGATCAAAAATTAGGACGCTGAAAAGCGTCCTTTTTTATTACCTCCCAAAAAGAAAAAACCGCTACTCAAAACTTGAATAGCGGGGAGGTCTTAATTTATAAGAAACTTCAAAAAGATAACTGCAATATGCAGTGCACTAGCAATGTATCAGACTGTGTGTTTTTGAAATAGTTCGATATTTTTGAAAATTTTTTTAAAATATCAAAATTAAACCAAAATGAATGAATTTAGCCCTTTATAAAGGCGATAATTTGCTCTTCAATCCCTTTTTCATCTAATTTAATTTCAGCAAGTGCTTCTTGTTGTGTGCCTTGCGGAATAAAAATATCAGGTAAACCAAGTTGTAAAAGTGCGGTTGTTTTTCCATGAGAATTTAGCACTTCTGAAACAGCAGAACCTGCACCACCTTGAATCGCATTTTCTTCCAATGTTACAATGACGTCATGTGTATTCGCCACTTCTAGAATACGAGCTTCATCAATTGGTTTCACAAAGCGCATATCGACAACAGTCGCA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97 | Mannheimia_phage(25.0%) | capsid,tail,transposase,integrase,protease,tRNA | attL 1583221:1583239|attR 1630584:1630602 |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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| Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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