Contig_ID | Contig_def | CRISPR array number | Contig Signature genes | Self targeting spacer number | Target MGE spacer number | Prophage number | Anti-CRISPR protein number |
---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134497 | Campylobacter jejuni strain NCTC13268 genome assembly, chromosome: 1 | 1 crisprs | DEDDh,WYL,cas2,cas1,cas9 | 0 | 12 | 4 | 0 |
CRISPR_ID | CRISPR_location | CRISPR_type | Repeat_type | Spacer_info | Cas_protein_info | CRISPR-Cas_info | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134497_1 | 1614344-1614973 | TypeII |
NA
Consensus repeat of LR134497_1
|
9 spacers
spacers of LR134497_1
>1.1|1614380|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT AAAATAATCTTTTTGTCATCAATATCAACA >1.2|1614446|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT AGATTGAAGTGTGGTAAAGGCTGTAGCACT >1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT AATCCTAATAATTTAACAGCAGGCATTCTA >1.4|1614578|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT TTTTGTTGAGTGGGTTATGAGACAAAAGAA >1.5|1614644|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT AATTACAAAATTTCTCAATCGGTTATAATA >1.6|1614710|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR ATAGCGATGGTAATTGGCTTGAAAATATAG >1.7|1614776|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR GAACCTTTAGAGTATAACGATAATCAAGTT >1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR CCAGCAAGCCGTGCAATTTTAATACACTGG >1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR TAATTGTCTTATTTTTGTAAGGTATAAATA >1.10|1614382|29|LR134497|PILER-CR AAATAATCTTTTTGTCATCAATATCAACA >1.11|1614448|29|LR134497|PILER-CR GATTGAAGTGTGGTAAAGGCTGTAGCACT >1.12|1614514|29|LR134497|PILER-CR ATCCTAATAATTTAACAGCAGGCATTCTA |
cas2,cas1,cas9 |
CRISPR arrays and Neighbor proteins around LR134497_1
The CRISPR arrays of LR134497_1 >merge|LR134497|1|1614344-1614973|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR,PILER-CR ATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAAAATAATCTTTTTGTCATCAATATCAACAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAGATTGAAGTGTGGTAAAGGCTGTAGCACTGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAATCCTAATAATTTAACAGCAGGCATTCTAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTTTTGTTGAGTGGGTTATGAGACAAAAGAAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAATTACAAAATTTCTCAATCGGTTATAATAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATATAGCGATGGTAATTGGCTTGAAAATATAGGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATGAACCTTTAGAGTATAACGATAATCAAGTTGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATCCAGCAAGCCGTGCAATTTTAATACACTGGGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTAATTGTCTTATTTTTGTAAGGTATAAATAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT >LR134497|1|1|1614344-1614973|CRISPRCasFinder ATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT AAAATAATCTTTTTGTCATCAATATCAACA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT AGATTGAAGTGTGGTAAAGGCTGTAGCACT GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT AATCCTAATAATTTAACAGCAGGCATTCTA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT TTTTGTTGAGTGGGTTATGAGACAAAAGAA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT AATTACAAAATTTCTCAATCGGTTATAATA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT ATAGCGATGGTAATTGGCTTGAAAATATAG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT GAACCTTTAGAGTATAACGATAATCAAGTT GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT CCAGCAAGCCGTGCAATTTTAATACACTGG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT TAATTGTCTTATTTTTGTAAGGTATAAATA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT >LR134497|1|1|1614344-1614973|CRT ATTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT AAAATAATCTTTTTGTCATCAATATCAACA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT AGATTGAAGTGTGGTAAAGGCTGTAGCACT GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT AATCCTAATAATTTAACAGCAGGCATTCTA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT TTTTGTTGAGTGGGTTATGAGACAAAAGAA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT AATTACAAAATTTCTCAATCGGTTATAATA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT ATAGCGATGGTAATTGGCTTGAAAATATAG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT GAACCTTTAGAGTATAACGATAATCAAGTT GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT CCAGCAAGCCGTGCAATTTTAATACACTGG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT TAATTGTCTTATTTTTGTAAGGTATAAATA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT >LR134497|1|1|1614345-1614578|PILER-CR TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAA AATAATCTTTTTGTCATCAATATCAACAG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAG ATTGAAGTGTGGTAAAGGCTGTAGCACTG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAA TCCTAATAATTTAACAGCAGGCATTCTAG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTTTTGTTGAGTGGGTTATGAGACAAAAGAAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAATTACAAAATTTCTCAATCGGTTATAATAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT ATAGCGATGGTAATTGGCTTGAAAATATAG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT GAACCTTTAGAGTATAACGATAATCAAGTT GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT CCAGCAAGCCGTGCAATTTTAATACACTGG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT TAATTGTCTTATTTTTGTAAGGTATAAATA >LR134497|1|2|1614674-1614973|PILER-CR AATAATCTTTTTGTCATCAATATCAACAG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAG ATTGAAGTGTGGTAAAGGCTGTAGCACTG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAA TCCTAATAATTTAACAGCAGGCATTCTAG TTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATTTTTGTTGAGTGGGTTATGAGACAAAAGAAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAATAATTACAAAATTTCTCAATCGGTTATAATAGTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT ATAGCGATGGTAATTGGCTTGAAAATATAG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT GAACCTTTAGAGTATAACGATAATCAAGTT GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT CCAGCAAGCCGTGCAATTTTAATACACTGG GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT TAATTGTCTTATTTTTGTAAGGTATAAATA GTTTTAGTCCCTTTTTAAATTTCTTTATGGTAAAAT
>LR134497.1|VEI83643.1|1613033_1614224_+|Molybdopterin-biosynthesis-protein-MoeA MLMSYEESLKILHSHIKTYEKIEKIALTECLGRILAQDIKAPKNQPEFPTSAMDGYAIKFEDQDKPLKILGLTPAGTMPQFSVQNGTCVKTFTGSLMSEGSDTLVPVENIRIENDTLFIEKKVPQAFAVRAVGENYKKDEILLKKGTRLNYSEIALLAELGFFHISVFIKPIVGVLSSGSEIKDLGEALENPAQIRSSNHIAIANLAKNLNCDTRVFPLLKDDEKATFSTLESALQSCDILVTTGGVSMGDFDFLKKAIKEYEIIIDKADIKPGRHIKIAKANEKFIIALPGFPYSAMVMFNLYAREILNSWLLQPKDYICKAFLQGSYKKKTPYLEFVACNIKFENGRILANLEGKKEGSSAIINNLNNKAALMVVPKECEILENESLVNIIFMP >LR134497.1|VEI83642.1|1612583_1613030_+|molybdopterin-synthase-catalytic-subunit MEHFTLYQDSLDIPKIYSQWYEFAKDKNCGALLTFCGIVREEGGIEALSFDIYEPLLKKWFDEWQKRVDFDGISLLFAHSIGDVAVHESSYFAGILSKQRKLGLKLLNEFVEDFKASAPIWKYDVINKERIYAKERSTKLCGAGLLKG >LR134497.1|VEI83641.1|1612361_1612583_+|molybdopterin-synthase-sulfur-carrier-subunit MVKVEFLGPINKENLELEVKNLKELKEILQKDESLKEWLELCAVSLNDEIIFDENTKLKTGDKIALLPPVCGG >LR134497.1|VEI83640.1|1610818_1612360_+|oxidoreductase MNRRNFLKFNALTLASMGVAYANPMHDMHSMHKNHSINHDLDTSFINFAPKNLKLLDPKQFPQGEILKALPLLKNESKEKNIFRATLEIKENHIELIKGKKTLFYTYNGLVPAPKIEVFEGDKLEILVKNKLKEATTIHWHGVPVPPDQDGSPHDPILAGEERIYRFEIPQDSAGTYWYHPHPHYTASKQVFMGLAGAFVIKAKKDALSHLKEKDLMISDLRLDENAQIPNNNLNDWLNGREGEFVLINGQFKPKIKLATNERIRIYNATAARYLNLRIQGAKFILVGTDGGLIEKAIYKEELFLSPASRVEVLIDAPKDGNFKLESAYYDRDKMMVKEEPNTLFLANINLKKENVELPKNLKIFKPSEEPKEFKEIIMSEDHMQMHGMMGKSEGELKIALASMFLINGKSYDLKRIDLSSKLGVVEDWIVINKSHMDHPFHIHGTQFELISSKLNGKVQKAEFRALRDTINVRPNEELRLRMKQDFKGLRMYHCHILEHEDLGMMGNLEVKE >LR134497.1|VEI83639.1|1609546_1610695_-|carboxynorspermidine-decarboxylase MFYEKIQTPAYILEEDKLRKNCELLASVGEKSGAKVLLALKGFAFSGAMKIVGEYLKGCTCSGLWEAKFAKEYMDKEIHTYSPAFKEDEIGEIASLSHHIVFNSLAQFHKFQAKTQKNSLGLRCNVEFSLAPKELYNPCGRYSRLGIRAKDFENVDLNAIEGLHFHALCEESADALEAVLKAFEEKFGKWIGQMKWVNFGGGHHITKKGYDVEKLIALCKNFSDKYGVQVYLEPGEAVGWQTGNLVASVVDIIENEKQIAILDTSSEAHMPDTIIMPYTSEVLNARILATRENEKISDLKESEFSYLLTGNTCLAGDVMGEYAFDKKLKIGDKIVFLDQIHYTIVKNTTFNGIRLPNLMLLNAKNELQMIREFSYKDYSLRN >LR134497.1|VEI83638.1|1608529_1609231_-|Putative-formate-dehydrogenase-specific-chaperone MDLEKLRLARSLYYQCLGELFVFSFSEERLSKLQEYLKTMQECLFDENLKSNFDILLKHLDDENSIQAFFKEYNLLFLSLKNSIPTTFSYIEEGFENSNPLLCVRQILVKSKIRRNEKFFKESEDSVGFCLLLMSEFLRQNEDDLAKELFEKVINKSIDEFLGDVFMNKNANLYKEIASIASAFMEFERLCFEVEKPAKINSKKVQNDLSRSEFLRREANKQRRTREKSQRIS >LR134497.1|VEI83637.1|1608363_1608555_-|tat-domain-protein MKNRREFLKKSAFALGAAGVLGSTTLALAKDEERKDLVKGKSKKKEVLFQRSANWENYYIKAE >LR134497.1|VEI83636.1|1607821_1608364_-|Formate-dehydrogenase-O,-major-subunit-@-selenocysteine-containing MSSVGENIKLTRRSFLKMAALSSLATPLLARSETLREASADELKEAYEGSKKVKTVCTACSVGCGIIAEVQNGVWVRQEIAQDHPVSSGGHCCKGSDMIDMVRSHVRLKYPMKKENGEWKRISYEQALSEIGEKLAAYRKENPESVMFLGSAKLNNEQAYYIRKFAAFFGTNNVDHQARI >LR134497.1|VEI83635.1|1605559_1607773_-|formate-dehydrogenase,-alpha-subunit MTNHLGDIQRSKCIIIIGANPAVNHPVGFRHFLKAKEKGAKLIVVDPRFTKSAAKADIYARIRPGTDIAFMYGMLKIIFDEGLEDTKYLDERVFGIDKIREEAAKWTAEEVENVTGISKELLVQITHEVAKNKPTTLIWAMGLTQHTVGTSNTRLAPIVQMVLGNIGKFGGGVNILRGHDNVQGASDMACLSENLPGYYPLNEATWRYYAKIWGVDYEWLLGNFVSKDWMHKTGLSLARWWAAALNGKDGNDAIDNAGTPLKALVVMGNGITSTAQQVKVKEGLEALELLVLADPFVNEAGIIAERKDGIYLLPAATQFETSGSVTATNRSGQWRFKVVDPLYESMEDQEILFELAKKLGFYEDFTKTLRDEKGEIVWPENATREIAKAVRSIGLNGWSPERLKKHTLYWDKFDEVTLEGKDEVAGEYYGLPWPCWSDKHPGSPVLYNTDIEVAKGGMGFRNNFGLEYEGESLLAKNAPLNSPIDTGYPQITKDNIEKVLGITLSAQEKEKMGSTWSYDDSNIIATKCIEKGIVPYGNAKARAVVWTFKDKIPLHREPLHSPRNDLVQKYPSFEDQKALYRVDTKFVSVQQAKDYSKEFPLNLVTARLVNLNGAGMENRASMYLTRLTPEMFCEINPELAKEQDIKAGDMIWVHSPEGTKIHVRVKVNPGVAKDMIFLPFHFTGVMQGVDLTHNFPEGTKPYASGESANTVTNYGYDIMCQIPETKGGLCRISKDGK >LR134497.1|VEI83634.1|1604921_1605563_-|Formate-dehydrogenase-O,-iron-sulfur-subunit;-Putative-formate-dehydrogenase-iron-sulfur-subunit MSKVNFANLEKERLKFFCDNERCIDCNGCAIACDEAHELPIHIRRRRVITLNEGIQGKEVSTSISCMHCDDAPCSIVCPVDCFYIRADGIVLHDKEICIGCGYCLYACPFGAPQFPKDSVFGNKGIMDKCTMCAGGPEATNSEKERELYGQNRIAEGKVPVCAAMCSTKALLVGESSKIEEIYHNRLMNRNYGIPNPSESLEWKIAYTGKERL >LR134497.1|VEI83644.1|1615117_1615549_-|CRISPR-associated-Cas2-family-protein MIEDKFMRVLLMFDVPTKSKKEQKLASKFRNNLIKLGYFMLQFSVYMRICKGLSSAKSSIENVKKILPPYGNVRALIITEKQFDKMELLLGGIVFNEKVNNETNLTLFDIDSHGEFKYKNSNNEEIQINKKQEKYHQQNLFEF >LR134497.1|VEI83645.1|1615541_1616432_-|CRISPR-associated-protein MSYDEAFKTLLISSNAKLNLELNHLVIKQDENIAKLFLKDINIIVLESLQISISSALFNAFAKYKIILLTCDETHSINGVFTPFLGHFQSAKIAKEQMNVSAQKKAILWQKIIKNKILNQAFILKKHNKIEQSNELINLAKKVSLNDSKNIEAVAAALYFKTLFSVSFSRDELCFENSALNYGYAIIRACIIRAVCISGLLPWLGIKHDNIYNSFALCDDLIEVFRASVDDCVLKLKGESEFLSKDDKRALIGNLQSKINFDGQNYPLNRAINHYVANFKNALLYEDELKIVKFDD >LR134497.1|VEI83646.1|1616428_1619383_-|CRISPR-associated-protein MARILAFDIGISSIGWAFSENDELKDCGVRIFTKAENPKTGESLALPRRLARSARKRLARCKARLNHLKHLIANEFKLNYEDYQSFDESLAKAYKGSLISPYELRFRALNELLSKQDFARVILHIAKRRGYDDIKNNGDEEKGKILKAIKQNEEKLVNYQSVGEYLYKEYFQKFKENSKEFINVRNKKESYERCIAQSFLKDELKLIFQKQREFGFSFSKKFEEEVLSVAFYKRALKDFSHLVGNCSFFTDEKRAPKNSPLAFMFVALTRIINLLNNLKNTEGILYTKDDLNALLNEVLKNGTLTYKQTKKLLGLSDDYEFKGEKGTYFIEFKKYKEFIKALGEHNLSQDDLNEIAKDITLIKDEIKLKKALAKYDLNQNQIDSLSKLEFKDHLNISFKALKLITPLMLEGKKYDEACNELNLKVAINEDKKDFLPAFNETYYKDEVTNPVVLRAIKEYRKVLNALLKKYGKVHKINIELAREVGKNHSQRAKIEKEQNENYKAKKDAELECEKLGLKINSKNILKLRLFKEQKEFCAYSGEKIKISDLQDEKMLEIDHIYPYSRSFDDSYMNKVLVFTKQNQEKLNKTPFEAFGNDSAKWQKIEVLAKNLPTKKQKRILDKNYKDKEQKDFKDRNLNDTRYIARLVLNYTKDYLDFLPLSDDENTKLNDTQKGSKVHVEAKSGMLTSALRHTWGFSTKDRNNHLHHAIDAVIIAYANNSIIKAFSDFKKEQESNSAELYAKKISELDYKNKRKFFEPFSGFRQKVLDKIDEIFVSKPERKKPSGALHEETFRKEEEFYQSYGGKEGVLKALELGKIRKVNGKIVKNGDMFRVDIFKHKKTNKFYAVPIYTMDFALKVLPNKAVARSKKGEIKDWILMDENYEFCFSLYKDSLILIQTKDMQEPEFVYYNAFTSSTVSLIVSKHDNKFETLSKNQKILFKNANEKEVIAKSIGIQNLKVFEKYIVSALGEVTKAEFRQREDFKK >LR134497.1|VEI83647.1|1619931_1620486_+|C4-dicarboxylate-anaerobic-carrier,-putative MALKIVISSYAELLLLLLACMYPVLISLKIRPITTVCALSLIALDYDPKDGNSINMADMVGQSDNVVGLFLNYQIYSVITYVVIIAILIPFYFAWIDKRDKEKGVLNDEVEIPQIIDPKCPTFYTLFPWLPVIFLFIAYFFTIKLDVVIANFVRISLVFLVEFARHRNARKLGEDMMVILKDYG >LR134497.1|VEI83648.1|1620478_1620700_+|cryptic-C4-dicarboxylate-transporter-DcuD,-degenerate MAEIFISVVSIIIAAGVCAKGIKALGGVNILANAVSNLGTGNFAWFEILLSIAILSFLVYFANAILNRICIKI >LR134497.1|VEI83649.1|1621616_1622378_-|Uncharacterised-protein MHNLNEALFQKKIKEIRLKAIASIICGFLGIIPYLGVLFVLASWILFFIVLYDLKIYGGAKNLFKNFLISVGIGFFGILVNTSILFAMLKPRTGIFGGLYFNQDNIFMAIAIFLVLHFAILALIFPFLKAFYYEIARTTKQKYFTYAFNTFYLGLLTLIIGIGLVFLLASLVFWILAWVKFKEFDEQELSNLEERLAKAQKKVFDFDLKWIKITMASFIILNLLVLTFSFILEVISFEDFRFYYTKKLYFTQP >LR134497.1|VEI83650.1|1622588_1623578_-|Phosphoribosylformylglycinamidine-cyclo-ligase MKISYEDAGVSIDNGNAFVEAIKPLVKETFNDNVVGGIGSFAGAFRMPSGFKKPVILGATDGVGTKLRLAIDAKKYDTIGQDLVAMCVNDLICNFATPLFFLDYYATAKLEVEVAKAVVSGIAKGCKMANCALIGGETAEMPGMYAKDDFDLAGFAVGMAEEDEIDRSKFVKNGDILLALPSSGLHSNGYSLARKVFFESLKLKFDDKIEGKNLIDILLEPTRIYVRDFLTLKPYISALAHITGGGLVENLPRVLPRGMGATIRKHHLKTPEIFYTIGQAVEESEMYRSFNMGVGLVMVVDPSNVSKVLENSDAFIIGEICINEGIVLE >LR134497.1|VEI83651.1|1623638_1624244_+|dephospho-CoA-kinase MKNAFFVTASIACGKSTFIEIANSLGFKSISADKIAHKILDENALELEKIFSPFNLKNLLTKEKKIDRKILGEIVFNNKEAKKTLENFTHPKIRAKILEQMQILDKENKAFFVEIPLFFESGAYENLGKVIVIYTPKELSLKRIMQRDKLSLEAAKVRLDSQIDIEEKLKKADFIIKNTNSYVDFRQECVKVIQEISKGKM >LR134497.1|VEI83652.1|1624240_1624990_+|diaminopimelate-epimerase MKFYKYCASGNDFVITNADRKEDRSALAKELCNRYEGIGGDGFIVILPHEKYDFEWEFYNNDGSRAAMCGNGSRAAAHFAHHINKINPNMSFLTGAGIIKAKVNQDKVEVSLGKIKSVQNTFEELGKTWQLCDTGVPHLVHFCQNLDEFDTILCQKMRQKYNANVNFVKILDENHLKVRTYERGVEDETLACGTGMGACFYLAFLNKKVQNKVKITPKSGEEVGFTYKNEELFFEGKVKYCFEANYNFS >LR134497.1|VEI83653.1|1624964_1625696_+|mannosyl-glycoprotein-endo-beta-N-acetylglucosamidase-domain-containing-protein MKPIIIFLSLFLIPLFADDLKNGFGEEYYKLDIDQKRQIFFIKMNEMFDQSFKKIEQERAFIEAFFKDAYKTGFRTSNQTNLEKLITIKNKYRIENLYDFAEYKKRIQKIPKSMGIAQALVESATGTSRFAREANNLFGEWTWGEKGLIPDLRHPDKKHKIKIFDSLQDSVYSYVLNLNRHFAYEKFRDARAKFASEGKEITGLEAIKTLDSYSERKGYYINLITKIIKRYNLEKYDTNSNNT |
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CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_ID | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|
CRISPR_ID | Spacer_Info | Spacer_region | Spacer_length | Hit_phage_ID | Hit_phage_def | Protospacer_location | Mismatch | Identity |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
LR134497_1 | 1.7|1614776|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614776-1614805 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 19421-19450 | 0 | 1.0 |
LR134497_1 | 1.11|1614448|29|LR134497|PILER-CR | 1614448-1614476 | 29 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 12857-12885 | 0 | 1.0 |
LR134497_1 | 1.2|1614446|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614446-1614475 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 12856-12885 | 1 | 0.967 |
LR134497_1 | 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614512-1614541 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 17734-17763 | 1 | 0.967 |
LR134497_1 | 1.6|1614710|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614710-1614739 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 8024-8053 | 1 | 0.967 |
LR134497_1 | 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614908-1614937 | 30 | KF148616 | Campylobacter phage CP8, complete genome | 68588-68617 | 1 | 0.967 |
LR134497_1 | 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614908-1614937 | 30 | NC_016562 | Campylobacter phage CPX, complete genome | 68355-68384 | 1 | 0.967 |
LR134497_1 | 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614908-1614937 | 30 | JX569801 | Campylobacter phage CP30A, complete genome | 116030-116059 | 1 | 0.967 |
LR134497_1 | 1.12|1614514|29|LR134497|PILER-CR | 1614514-1614542 | 29 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 17735-17763 | 1 | 0.966 |
LR134497_1 | 1.5|1614644|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614644-1614673 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 2995-3024 | 2 | 0.933 |
LR134497_1 | 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614842-1614871 | 30 | MN530981 | Campylobacter phage DA10, complete genome | 33579-33608 | 2 | 0.933 |
LR134497_1 | 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614842-1614871 | 30 | KF751794 | Campylobacter phage CJIE4-2, complete genome | 13669-13698 | 2 | 0.933 |
LR134497_1 | 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614842-1614871 | 30 | KF751795 | Campylobacter phage CJIE4-3, complete genome | 11997-12026 | 2 | 0.933 |
LR134497_1 | 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614842-1614871 | 30 | KF751796 | Campylobacter phage CJIE4-4, complete genome | 12035-12064 | 2 | 0.933 |
LR134497_1 | 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614842-1614871 | 30 | KF751797 | Campylobacter phage CJIE4-5, complete genome | 13919-13948 | 3 | 0.9 |
LR134497_1 | 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614842-1614871 | 30 | KF751793 | Campylobacter phage CJIE4-1, complete genome | 14946-14975 | 3 | 0.9 |
LR134497_1 | 1.7|1614776|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614776-1614805 | 30 | MT710307 | Salmonella phage pSal-SNUABM-04, complete genome | 189179-189208 | 5 | 0.833 |
LR134497_1 | 1.1|1614380|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614380-1614409 | 30 | NZ_CP030933 | Enterococcus gilvus strain CR1 plasmid pCR1A, complete sequence | 617272-617301 | 6 | 0.8 |
LR134497_1 | 1.7|1614776|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614776-1614805 | 30 | NZ_AP017310 | Leptolyngbya sp. NIES-3755 plasmid plasmid2 DNA, complete genome | 85539-85568 | 6 | 0.8 |
LR134497_1 | 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614908-1614937 | 30 | NC_011226 | Borrelia duttonii Ly plasmid pl15, complete sequence | 13484-13513 | 6 | 0.8 |
LR134497_1 | 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614908-1614937 | 30 | NC_021794 | Cellulophaga phage phi18:3, complete genome | 4254-4283 | 6 | 0.8 |
LR134497_1 | 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614908-1614937 | 30 | NC_021803 | Cellulophaga phage phi13:2, complete genome | 4262-4291 | 6 | 0.8 |
LR134497_1 | 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614908-1614937 | 30 | NC_021789 | Cellulophaga phage phi19:3, complete genome | 5397-5426 | 6 | 0.8 |
LR134497_1 | 1.12|1614514|29|LR134497|PILER-CR | 1614514-1614542 | 29 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 244826-244854 | 6 | 0.793 |
LR134497_1 | 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614512-1614541 | 30 | NC_010180 | Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence | 201349-201378 | 7 | 0.767 |
LR134497_1 | 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614512-1614541 | 30 | NZ_CP031072 | Bacillus mycoides strain BPN401 plasmid pl395, complete sequence | 219035-219064 | 7 | 0.767 |
LR134497_1 | 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614512-1614541 | 30 | NZ_LR214986 | Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13 | 244826-244855 | 7 | 0.767 |
LR134497_1 | 1.4|1614578|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614578-1614607 | 30 | JX560521 | Acinetobacter phage phiAC-1, complete genome | 6842-6871 | 7 | 0.767 |
LR134497_1 | 1.6|1614710|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614710-1614739 | 30 | NC_022111 | Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence | 869172-869201 | 7 | 0.767 |
LR134497_1 | 1.6|1614710|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614710-1614739 | 30 | NZ_CP017943 | Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed2, complete sequence | 130023-130052 | 7 | 0.767 |
LR134497_1 | 1.10|1614382|29|LR134497|PILER-CR | 1614382-1614410 | 29 | CP015514 | Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence | 258473-258501 | 7 | 0.759 |
LR134497_1 | 1.10|1614382|29|LR134497|PILER-CR | 1614382-1614410 | 29 | AP014010 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C97-MedDCM-OCT-S27-C11, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 7192-7220 | 7 | 0.759 |
LR134497_1 | 1.1|1614380|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614380-1614409 | 30 | CP015514 | Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence | 258473-258502 | 8 | 0.733 |
LR134497_1 | 1.1|1614380|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614380-1614409 | 30 | AP014010 | Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C97-MedDCM-OCT-S27-C11, *** SEQUENCING IN PROGRESS *** | 7192-7221 | 8 | 0.733 |
LR134497_1 | 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR | 1614908-1614937 | 30 | NZ_CP023318 | Bacillus megaterium strain A plasmid p1, complete sequence | 118340-118369 | 9 | 0.7 |
LR134497_1 | 1.12|1614514|29|LR134497|PILER-CR | 1614514-1614542 | 29 | NC_027332 | Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome | 34972-35000 | 9 | 0.69 |
LR134497_1 | 1.12|1614514|29|LR134497|PILER-CR | 1614514-1614542 | 29 | KY000079 | Acinetobacter phage AM24, complete genome | 42537-42565 | 9 | 0.69 |
LR134497_1 | 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614512-1614541 | 30 | NC_027332 | Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome | 34972-35001 | 10 | 0.667 |
LR134497_1 | 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT | 1614512-1614541 | 30 | KY000079 | Acinetobacter phage AM24, complete genome | 42537-42566 | 10 | 0.667 |
1. spacer 1.7|1614776|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gaacctttagagtataacgataatcaagtt CRISPR spacer gaacctttagagtataacgataatcaagtt Protospacer ******************************
2. spacer 1.11|1614448|29|LR134497|PILER-CR matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 0, identity: 1.0
gattgaagtgtggtaaaggctgtagcact CRISPR spacer gattgaagtgtggtaaaggctgtagcact Protospacer *****************************
3. spacer 1.2|1614446|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
agattgaagtgtggtaaaggctgtagcact CRISPR spacer tgattgaagtgtggtaaaggctgtagcact Protospacer *****************************
4. spacer 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
aatcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer aatcctaacaatttaacagcaggcattcta Protospacer ********.*********************
5. spacer 1.6|1614710|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
atagcgatggtaattggcttgaaaatatag CRISPR spacer atagcgatggcaattggcttgaaaatatag Protospacer **********.*******************
6. spacer 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF148616 (Campylobacter phage CP8, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
taattgtcttatttttgtaaggtataaata CRISPR spacer taattgtcttatttttgtaaggtataagta Protospacer ***************************.**
7. spacer 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_016562 (Campylobacter phage CPX, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
taattgtcttatttttgtaaggtataaata CRISPR spacer taattgtcttatttttgtaaggtataagta Protospacer ***************************.**
8. spacer 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to JX569801 (Campylobacter phage CP30A, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.967
taattgtcttatttttgtaaggtataaata CRISPR spacer taattgtcttatttttgtaaggtataagta Protospacer ***************************.**
9. spacer 1.12|1614514|29|LR134497|PILER-CR matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 1, identity: 0.966
atcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer atcctaacaatttaacagcaggcattcta Protospacer *******.*********************
10. spacer 1.5|1614644|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
aattacaaaatttctcaatcggttataata CRISPR spacer aattataaaatttctcaatcggttttaata Protospacer *****.****************** *****
11. spacer 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MN530981 (Campylobacter phage DA10, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ccagcaagccgtgcaattttaatacactgg CRISPR spacer ccatcaagtcgtgcaattttaatacactgg Protospacer *** ****.*********************
12. spacer 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF751794 (Campylobacter phage CJIE4-2, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ccagcaagccgtgcaattttaatacactgg CRISPR spacer ccatcaagtcgtgcaattttaatacactgg Protospacer *** ****.*********************
13. spacer 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF751795 (Campylobacter phage CJIE4-3, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ccagcaagccgtgcaattttaatacactgg CRISPR spacer ccatcaagtcgtgcaattttaatacactgg Protospacer *** ****.*********************
14. spacer 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF751796 (Campylobacter phage CJIE4-4, complete genome) position: , mismatch: 2, identity: 0.933
ccagcaagccgtgcaattttaatacactgg CRISPR spacer ccatcaagtcgtgcaattttaatacactgg Protospacer *** ****.*********************
15. spacer 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF751797 (Campylobacter phage CJIE4-5, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ccagcaagccgtgcaattttaatacactgg CRISPR spacer ccttcaagtcgtgcaattttaatacactgg Protospacer ** ****.*********************
16. spacer 1.8|1614842|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to KF751793 (Campylobacter phage CJIE4-1, complete genome) position: , mismatch: 3, identity: 0.9
ccagcaagccgtgcaattttaatacactgg CRISPR spacer ccttcaagtcgtgcaattttaatacactgg Protospacer ** ****.*********************
17. spacer 1.7|1614776|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to MT710307 (Salmonella phage pSal-SNUABM-04, complete genome) position: , mismatch: 5, identity: 0.833
gaacctttagagtataacgataatcaagtt-- CRISPR spacer gaacctctggagtataacgataat--acttac Protospacer ******.*.*************** * **
18. spacer 1.1|1614380|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP030933 (Enterococcus gilvus strain CR1 plasmid pCR1A, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
aaaataatctttttgtcatcaatatcaaca CRISPR spacer aagataatatttttgtcatcaatcttataa Protospacer **.***** ************** *.* *
19. spacer 1.7|1614776|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_AP017310 (Leptolyngbya sp. NIES-3755 plasmid plasmid2 DNA, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
gaacctttagagtataacgataatcaagtt CRISPR spacer gcccctttagagtattacgacaatcaaact Protospacer * ************ ****.******..*
20. spacer 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_011226 (Borrelia duttonii Ly plasmid pl15, complete sequence) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
-taattgtcttatttttgtaaggtataaata CRISPR spacer attatt-tcttttttttgtaaggtataaggg Protospacer * *** **** ****************. .
21. spacer 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021794 (Cellulophaga phage phi18:3, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
taattgtcttatttttgtaaggtataaata CRISPR spacer tattgattctatgtttgtaaggtataaata Protospacer ** * .*..*** *****************
22. spacer 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021803 (Cellulophaga phage phi13:2, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
taattgtcttatttttgtaaggtataaata CRISPR spacer tattgattctatgtttgtaaggtataaata Protospacer ** * .*..*** *****************
23. spacer 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_021789 (Cellulophaga phage phi19:3, complete genome) position: , mismatch: 6, identity: 0.8
taattgtcttatttttgtaaggtataaata CRISPR spacer tattgattctatgtttgtaaggtataaata Protospacer ** * .*..*** *****************
24. spacer 1.12|1614514|29|LR134497|PILER-CR matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 6, identity: 0.793
atcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer aagataataatttagcagcagccattcca Protospacer * **********.****** *****.*
25. spacer 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_010180 (Bacillus mycoides KBAB4 plasmid pBWB401, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer aatactaataatttaacagcaacaattgat Protospacer *** *****************. ***
26. spacer 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_CP031072 (Bacillus mycoides strain BPN401 plasmid pl395, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer aatactaataatttaacagcaacaattgat Protospacer *** *****************. ***
27. spacer 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to NZ_LR214986 (Mycoplasma cynos strain NCTC10142 plasmid 13) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
aatcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer gaagataataatttagcagcagccattcca Protospacer .* **********.****** *****.*
28. spacer 1.4|1614578|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to JX560521 (Acinetobacter phage phiAC-1, complete genome) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
ttttgttgagtgggttatgagacaaaagaa CRISPR spacer ttttgtggagtgggttatgagcaaactaga Protospacer ****** ************** ** ..*
29. spacer 1.6|1614710|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NC_022111 (Prevotella sp. oral taxon 299 str. F0039 plasmid, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atagcgatggtaattggcttgaaaatatag CRISPR spacer gaagatttggtaattggcttgaaaatctaa Protospacer . ** ******************* **.
30. spacer 1.6|1614710|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP017943 (Phyllobacterium zundukense strain Tri-48 plasmid unnamed2, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.767
atagcgatggtaattggcttgaaaatatag CRISPR spacer atagcgatggtagttcgcttgaactttggg Protospacer ************.** ******* * .*
31. spacer 1.10|1614382|29|LR134497|PILER-CR matches to CP015514 (Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
aaataatctttttgtcatcaatatcaaca CRISPR spacer agtaaatcattttgccatcaatatcaatc Protospacer *. **** *****.************.
32. spacer 1.10|1614382|29|LR134497|PILER-CR matches to AP014010 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C97-MedDCM-OCT-S27-C11, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 7, identity: 0.759
aaataatctttttgtcatcaatatcaaca CRISPR spacer tttttttctttttgtcatcaacataaaca Protospacer * ***************.** ****
33. spacer 1.1|1614380|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to CP015514 (Vibrio vulnificus strain FORC_036 plasmid unnamed, complete sequence) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaataatctttttgtcatcaatatcaaca CRISPR spacer gagtaaatcattttgccatcaatatcaatc Protospacer .*. **** *****.************.
34. spacer 1.1|1614380|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to AP014010 (Uncultured Mediterranean phage uvMED isolate uvMED-CGF-C97-MedDCM-OCT-S27-C11, *** SEQUENCING IN PROGRESS ***) position: , mismatch: 8, identity: 0.733
aaaataatctttttgtcatcaatatcaaca CRISPR spacer gtttttttctttttgtcatcaacataaaca Protospacer . * ***************.** ****
35. spacer 1.9|1614908|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT,PILER-CR matches to NZ_CP023318 (Bacillus megaterium strain A plasmid p1, complete sequence) position: , mismatch: 9, identity: 0.7
taattgtcttatttttgtaaggtataaata CRISPR spacer attttgtcttatttttttaatgtatagggg Protospacer ************* *** *****.. .
36. spacer 1.12|1614514|29|LR134497|PILER-CR matches to NC_027332 (Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.69
atcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer ccattaataatttaacagcagtcataaac Protospacer . .***************** ***
37. spacer 1.12|1614514|29|LR134497|PILER-CR matches to KY000079 (Acinetobacter phage AM24, complete genome) position: , mismatch: 9, identity: 0.69
atcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer ccattaataatttaacagcagtcataaac Protospacer . .***************** ***
38. spacer 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to NC_027332 (Acinetobacter phage YMC13/03/R2096, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
aatcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer gccattaataatttaacagcagtcataaac Protospacer . . .***************** ***
39. spacer 1.3|1614512|30|LR134497|CRISPRCasFinder,CRT matches to KY000079 (Acinetobacter phage AM24, complete genome) position: , mismatch: 10, identity: 0.667
aatcctaataatttaacagcaggcattcta CRISPR spacer gccattaataatttaacagcagtcataaac Protospacer . . .***************** ***
Region | Region Position | Protein_number | Hit_taxonomy | Key_proteins | Att_site | Prophage annotation | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DBSCAN-SWA_1 |
1098121 : 1168914
Sequences of DBSCAN-SWA_1
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_1 >LR134497|1098121:1168914|DBSCAN-SWA 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87 | Campylobacter_phage(39.02%) | tRNA,capsid,terminase,protease,plate,tail | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_2 |
1212160 : 1219128
Sequences of DBSCAN-SWA_2
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134497|1212160:1219128|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_2 >LR134497|1212160:1219128|1212813_1213647_+|VEI83251.1|DBSCAN-SWA MEKITLKCNKNILNLLKQYNIYTKTYIENPRRFSRLKTKDFITIPLKNNQLESAAGLGIEEYCAFKFSNILHEMGSFSFSGSFLPHYAKVGRYCSIADGVSMFNFQHPIDRISTASFTYETNHSFINDACQNHINKTFPIVNHNPSSSITHLIIQDDVWIGKDVLLKQGITLGTGCVIGQRAVVTKDVPPYAIVAGIPAKIIKYRFDEKTIERLLKIQWWRYHFADFYDIDLNLKINQYLDLLEEKIIKKSISYYNPNKLYFRDILELKSKKIFNLF >LR134497|1212160:1219128|1215484_1216240_-|VEI83254.1|DBSCAN-SWA MKVFIINLERSLDRKEHIQKQIQKLFEKNLSLKNKLEFIFFKAIDAKNKEHLEFKDHFPWWGSWVLGRELSDGEKACFASHYKLWQECVKLDEPIIILEDDVEFSDEFLNNGAEYIDELLKSKYEYIRLCYLTQGKMLKLNDNFLFTLDSIGGTQGYLIKPISALKFIDNLKFWIKPVDNVMDMYYYSKVFTITYTPLLLKTTDINSTIEERKKDKRPIFKRIIKEICRLYFIYLKFTYKQKAIKFLRREV >LR134497|1212160:1219128|1213638_1214466_-|VEI83252.1|DBSCAN-SWA MPQLSIIIPLFNSCDFILRALQSCINQTLKDIEILIIDDKSKDNSLNMVLEFAKKDPRIKIFQNEENLGTFASRNLGVLHSSSDFIMFLDSDDFLTPGACEIAFKEMKKGFDLLCFDAFVHRVKTKQFYRFKQDGVFNQKEFLEFLSKQRHFCWSVWAKCFRKDIILKNFEKVKFEKVKIDERLSYGEDVLFCYIYFMFCEKIAVFKTCIYHYEFNPNGRYENKNKEILNQNYYDKKKSNEIIKRLSKEFLHDEFHQKLFEVLEREEVGVKNRLK >LR134497|1212160:1219128|1216239_1216800_-|VEI83255.1|DBSCAN-SWA MISLVEKEWQEHQKIAQASEILKGQIAKVGELLCECLKKGGKILICGNGGSAADAQHFAAELSGRYKKERKALAGIALTTDTSALSAIGNDYGFEFVFSRQVEALGNENDVLIGISTSGKSPNVLEAFKKAKELNMLCLGLSGKGGGMMNKLCDHNLVVPSDDTVRIQEMHILIIHTLCQIIDEGF >LR134497|1212160:1219128|1214524_1215478_+|VEI83253.1|DBSCAN-SWA MKIFIHLPTWLGDAVMASPALYAIKEHFKNAQFILYGSLVSTALFKEFPNSKIIIENKQSRYKQALSLRKELGKIDFSFAFRSAFSSKIILHILKTKQRYFFDKNKHKEEHQVLKYLYFIENSLSIKAHFKDLKLPFKLKFQNPLVLKNGKKILGLNPGASFGSAKRWDVSYFAKVALNFSQSHEILIFGAGKAEQELCNEIYQILKEQNIKVKNLCNKTTIKTLCQNIAFCDLFITNDSGPMHISAVYKVKTVAIFGPTKFTQTSPWQNENARWVHLNLACMPCMQKTCPLKHHKCMKDLKPEIIIEVSKQLLFLN >LR134497|1212160:1219128|1212160_1212826_+|VEI83250.1|DBSCAN-SWA MSLAIIPARGGSKGIKNKNLVLLNNKPLIYYTIKAALNAKSISKVVVSSDSDEILNYAKSQNVDILKRPISLAQDDTTSDKVLLHALKFYKDYEDVVFLQPTSPLRTNIHIDKAFNLYKNSNANALISVSECDNKILKAFVCNDYGDLAGICNDEYPFMPRQKLPKTYMSNGAIYILKIKEFLNNPSFLQNKTKHFLMDESSSLDIDCLEDLKKVEQIWKK >LR134497|1212160:1219128|1218174_1219128_-|VEI83257.1|DBSCAN-SWA MKIAITGGAGFIGSQLALNLQEKHEILIIDKMRSSATFENGNLQSFGHFKNLLEFDGELFAGDINDEKVLKKIEDFKPEIIFHQAAISDTTVFDQTKVLQTNLNTFKDFIELSIDLNAKLIYASSASVYGDAKSPQTVGKDEEPKNPYAFSKLMMDKLAKKYYDKAHLVGLRYFNVYGKGEFYKNKTASMVLQFGHQILAGKNPRLFEGSDQIYRDFTYIKDVISANLIALDSKCGVYNVGSGKARTFQDIVDILQKELKTDLPCEYIPNPYVKSYQFHTEAKLDQTWDYQPKFSLEEGIKDYLGEIKRLFEKEVNA >LR134497|1212160:1219128|1216796_1218182_-|VEI83256.1|DBSCAN-SWA MLEFLSQQKPKILIIGDFMVDNYTWCDCSRISPEAPVLVAKTLKEDKRLGGAANVYANLKSLGADVFALGVVGDDKSGKFLQENLKGEFLIQKGRKTPFKNRIMAHNQQVLRLDEEDTSAILLENELIALFDEKIKDFKAVVLSDYAKGVLTPKVCKAVIEKAKALNIPVLVDPKGSDFSKYSGATLLTPNKKEALEALKFENLEGKNLEKGIKKLKEDFALRYSIITLSEAGIALFDENLKIAPAKALEVYDVTGAGDSVIAVLAFCLANEIEIFKACELANEAAAVVVSKIGSVSVSFDEIKSFKHVDFEKKIKSKEELLALLKQNDKKIVFTNGCFDIVHFGHIKYLEKAKRLGDVLVVGLNSDASVKSLKGESRPVNSEFQRACMLAAFYFVDFVVVFDEDTPLELISFLKPDILVKGADYKDKIVVGADIVSKVELIDFEEGFSTSKIIEKIKDKK |
8 | uncultured_Mediterranean_phage(16.67%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_3 |
1498655 : 1507745
Sequences of DBSCAN-SWA_3
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134497|1498655:1507745|DBSCAN-SWA 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Protein sequences of DBSCAN-SWA_3 >LR134497|1498655:1507745|1505431_1505767_-|VEI83537.1|DBSCAN-SWA MLKKLTEKYISAFNKKDINEVANLLNENFVLEDPVVKRIEGKEECLKAIENIFKNCKKLSFSAKNIFQDKNTTFIEFILILDDTRLEGVDIIEWHDEKIVELRAYLDIPKG >LR134497|1498655:1507745|1499669_1500896_-|VEI83532.1|DBSCAN-SWA MILITSAKYSSSDFTLEFGKIPPSFLPLGNKRLYEYQIELFKNCNQKVFLSLPSDFKLSKFDEKKLKELNVEILFVPNNLSLGESVVYCLNVCCAFDEKLYILHGDTFFKELVFKENSLQVAKVKENYDWAYLDNEFHAPLKTIEDNLILSGAYSFSHPQFLIKCIVESSYSFVDGMKVYSKAYPFDIIKNNTWLDFGLITSYFHSKKSVSTQRSFNNIDISNGYIKKSSSWQEKIKAEINWFDNLPKELFIYTPKVITYEDSYEIEYLCNNTLAELYVFGKLPSYVWKKIFKSLKEFLDKLHSFKSNDKDINFNCKEKTLKRLQEFSKQSGIDLHKNIVINSKSYPSVLALVDKLDFYMNDMNEISLIHGDFCFSNIMYDFRAGAIKTFDPRGCDFNGKITPCGGGI >LR134497|1498655:1507745|1503243_1505103_-|VEI83535.1|DBSCAN-SWA MNIVIPIAGLGSRFAKAGFDKPKPFIDVLGKPMIVRVLENLKYKGARYILIARKEHLIKEKKLVDEIKNNFNVEFIAIDKLTEGTACTVLYARKYINNDTPLMIANSDQIVDIDITDFINDSFKRGLDGSILTFVDKEKNSKWSFVKLNNDLVVEAKEKEAISEFATVGIYFFNKGKIFVESAIDMIVENDRVNNEFYTCPVYNYTIKNGAKIGIYNIDFYQMHGIGTPEDLEKYKKYKEIDELSLITRDQCPITYSKNIEIINSRQFPLFCGCIEQDQKKDIICEEQFAVCRDSGVLFLNKLIPLDILYKNGHYAGNIGKIWDEHHKEFAKFIFQIRPKNILEIGGGHGKLSQFFLEMDNVNWTIVEPNIENKFENVNYIDGFFSKDICNNEQYDTIIHSHVLEHVYDPNEFFSEISSFFNNDKGYMIFSIPNMSKWLKNKYSNCLFFEHTILLDENVVDYILGNNNFTIIVKKYFKEHSIFYLVKKDVRSVKITLENKYLENKVDFGNMLRFYKNKVEYINSYIKQTPKKVYLFGAHLFSQNLIYSGLDTSKIVCILDNDLNKQKKRLYGTKFIVRSPKILINDSNALVILNAGIYNDEIEKDIIENINNKIEIIKC >LR134497|1498655:1507745|1505099_1505429_-|VEI83536.1|DBSCAN-SWA MKNYKLDKMIRGWFVGNFDPSVFKTNDVEVGVKEYKKGDTEEKHHHKIATEITVIISGKVRMNDKIYSKGDIVMINPGEATDFEALEDAINVVVKLPGANNDKYLGECQ >LR134497|1498655:1507745|1499374_1499704_-|VEI83531.1|DBSCAN-SWA MEKLLLVGGGYDFAKLVHSVFGLYDFIIAGFFECKFNGNNIEFFIEEDANILDIQKEFLNIFDIDDNIKALTLHLFLSMLPLHNDFKEKQIAFLANAFILYDKFFKESK >LR134497|1498655:1507745|1507109_1507745_-|VEI83540.1|DBSCAN-SWA MIIISHRGFWHNHNEKNSIAAFDRSFINLYGLETDLRDMGGGIVISHDMASEICLKLEDFFKLYKKYNANLPLALNIKADGLQNSLKQLIEKYEITNYFVFDMSVPDALLYIDLNFNVFTRQSEYEKEPSFYDKAHGIWMDEFYSHWIDKNIIKKHIDNGKSVCIVSPELHKRDFKKEWQEYKQIEKELQIQDKLMICTDYPDEAMRFFND >LR134497|1498655:1507745|1501330_1503250_-|VEI83534.1|DBSCAN-SWA MLNNADILIKKAIDNWSYEFLDNFLNNENLSDEHLLLMYKLGRYNFFLENIDYIDRLSSFLNTDSKDLYDFIHTCLKDKTVNENFLLGNYKNSYMSFLSSHLDVIDFGDFNFFLKILNEVKKSQDLILQSFFLKNSIDFFYINSSDIFFKGGIYFIMLEIIYNNFLNTLGGRLYYDKLRFIAGRYFISKKSYSGSRIALCLNGQLRPGWRDSIKALIDSFSHLGNIDVFIYSWDVESLWPGSGGNGAGWIRRFFHPMLNECPRELIMSNIDFSKKFPNVFGVISREFNKKIFIKDVLVLDNKIKKVILESYSKVVNRLGELKNDSKIYYGIYQVYKAMEEYEKQNNFKYDFVIRVRPDYIIEKNDIKIEDLHLLELNDIYDARYFCGLDGSLQIGRRSAMEIYMKTWVYAKENKENPYFNTYLKHFPQTCMSPGNGFLSHYVLSQWTDFLKLKVVKMNIKFSHLNHFLFDNISFPDVKNELNKDIWHIKKNKIFNEVQIGKIIDFFDLIAKKYKIISKNRNNLAKIKIQNHLAYKLGQAMIDNSKSILGYIRMPFVLFYIRYKHQKELQRRKTNPELVLPPLEDCSDYEEALKIKNYFSYKLGEALIQASKNWYKGGYVKFLFFDLFALNQNKIKSKKK >LR134497|1498655:1507745|1500892_1501291_-|VEI83533.1|DBSCAN-SWA MKTLLIDLDGTLTIDEEHVDYIDKKPNIILIKTLKEYKKQGFKINIFTSRNMRTFDGDLEKIKTHTLPTITTWLQKHDVPYDEIIIGKPWCGYDGFYVDDKAIRPSEFISLNYEQIKELLKKENPHKDGGNK >LR134497|1498655:1507745|1498655_1499378_-|VEI83530.1|DBSCAN-SWA MIIIFPMAGLSSRFAKAGYDKPKYMLDLKGNSVFFHAVNSFKKYFKDFKFLFIYREIENTSDFIKEECEKLGIKSYESVRLEQETLGQAHTVRLGLERANIKDDESILIFNIDTFRPNFSLPTTLDFCKIDGCLEVFEADGEQWSFVLTDENDNVIKTTEKERISNLCSSGLYYFKKTKDFKEIFDRMKAENDFSKGELYIAPMYNYLIKKGLLIKYHKILLDEIIFCGTPDEYEILISI >LR134497|1498655:1507745|1505759_1506485_-|VEI83538.1|DBSCAN-SWA MLNIVVPIAGKSYFFDNEKDGFPKPFIEICGKTMLEHFVKNYENIKNKRFIFILKEEDVKRYHLDDAINVLTNNQSKIIILKNETQGMVCSVLMAIDEINLNDSLLIVNMDQIFECDLNEVISDLSLNDAGVLSFESVHPRWAYVKCDENNFVLEAFEKKPVSKNAIAGFYYFNKAEFFITSAFDMIKKDVNYEGKYFIAPILNELILQDKKIINISIDKNRYFTFYSHAKINEYERIKNA >LR134497|1498655:1507745|1506478_1507117_-|VEI83539.1|DBSCAN-SWA MTKIKAIIFDMDGVLIEAKDWHYEALNRALKLFGMEITRYEHLTTFDGLPTKDKLKMLSLDRGLPKSLHSFINELKQQYTMEIVYSLCKPRFHHEYALSKLKFEGYKMAVCSNSIRNSIEVMMKKSALENYLDFYISNEDVKKGKPDPEMYLKAIERLKLNPKECMIVEDNENGIKAARASGANVMIVGKVSEVNYENIKNHICKFEKELKC |
11 | Synechococcus_phage(50.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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DBSCAN-SWA_4 |
1516261 : 1526502
Sequences of DBSCAN-SWA_4
Nucleotide sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134497|1516261:1526502|DBSCAN-SWA AATGGATAAATTTAAAAATATCTTTTTAAATAAAGTTTTTAATAAAAATCAAGAGCAATATGCTTTAATCTATGAAGAACAAAAATATACTTACAATGATTTGTATAATAACATCATCAATAAAATCAATTTATTAACAAAGCTTAAAGATATAAATATTGTGGGTATTACAGGAGATTATGATTTTGAAAGTATAAGTTTATTTTTAGCATGTATTGAGCTTAATAAAATAATCATTCCATTTATCAATGAAAGTGAGATTGACAACAAACTTGCCGAAGTTAATTGCGATATTTTATTTAAAAACAATCAATACGAGCTACAGAAAAAATATTGTAACAATCATGATTTAATCCAAAAACTCATAGATGATAACAAACCTGGTTTAATTTTATTTTCAAGTGGCAGCACAGGTAAACCTAAAGCTATGGTGCATAATCTTGATAAGATTTTAAATGCCTATCTTAATAAAAAATCAAAAAAACTTAATATTTTATTGTTTTTAATGTTTGATCATATAGGTGGTTTAAATACTTTGTTTAACTGTCTTAGTATGAATGCTTGTGCAATTGCTATAAAGGAAAGAAAAAATATTGAAGCTCTAGCTCAAACCATAGAAAAATATCAAATTTCACTCTTGCCTGCTTCACCTTCTTTACTTAGTTTAATGTTGGTAGCAAATGTAATTGAAAAATATAATTTAAGCTCTTTAAAGATTATTAGCTATGGCACAGAAAAAATGCCAGAAGCTTTGCTTGTAAAATTAAAACAAACTTTTCCAAAAGTTAAATTTCATCAAACCTTTGGTACAAGCGAAGTAGGCATAGCTCAAACAAAAAGCTTCGGAAATTACTTTAAATTGGAAAATATAGCATATAAAATTATCAACAACGAGCTATTTTTAAAAAGCAATATGCAAAGTTTGGGTTATTTAAATGCTGATAACTCTGTTTTTACAAATGATGGATACTTTGCTACTGGCGATTTGGTTGAAGTGATTAATGAAAATGGTGAAGAATATATTAAAATTATCGGAAGAAACAAAGAAGTTATTAATGTTGGCGGAGAAAAAGTATTACCCCAAGAAGTAGAGGGTATATTAATGCAAATACCATTTATACAAGATTGTTTAGTCTATGGACAAAATAATCCTCTAACGGGCCAAAGTGTCTGTGTAAAGATTGTATTAGAACAAAATGAAAATCCTGCTAATTTAGAAGCCAAAAAGGAAATAAGACTATTTTGCAAAGATAAACTAGCTAGCTATAAAATACCAACCAAAGTAGAGATTGTTCAAAAGTTAGAAATCAGCGAACGGTTTAAAAAAATAAGAAATTCTTAACTCTTTCTTATTTTTTGTAAATTTCACCCCTTCTTCCCAAACTCCCTCTTCAACCTAGGCACATCTTTGAATATAAATTTGATATACCCCCCCCCATACCAATTTTTATTAGCCTGTATTAAAGCTTCACCTAGTTTATAAGTAAAACATTCTTTTTCTTTTAAAGCTTCATTATAATCAGGATAAGTTTCTAAAGGAGGTAAAGCTAAATTTGGATTTTCTTTTATTTTTTCTTCATAGGCTTTTTGTTCAAATTTATGTTTGTCTTTTATATAAGATAATACATAAGGCATTCTTATATATCCTAATATACTTTTTGAATTAGCGATTAAAGCTTGTCCTAGTTTATAAGATAAATGGTTTTGAATACGAGCTTTAGCTGAATTAGCTTGAATAAAAGTAATTTTAGGATTTATTATGCTCATTTTTATACCCAAAGATTTAGCAAGTTTTTTACTTTCTAATTTTTTAATAATCAAATCTTGTTCTAGATTAGCTAATTTTAAACGTTGTTTTTTAATAGGAAAAGAATTAAGTTCATTTTGTAGGGTTGTTTTTTCTTGATTTAAAGTAAAGATGATATTATCTTTTTCTTTGATTTGTTTTTGCAAAGGAGCTAATTTAACTGGATCCATTCTAAAATTATATTCTTCTATAGCTGTTTTATAATCCTCTACTGGAGGAACTAAATAAGTAAAATCATATTCTTTGTCAATTGTAATATTTTCATTTTGTATAAGTTTAATTTCTTCACTAAAGTCAAATTTTCCATTTTGATCAGCTAATAGAAAAGCGGATACGCCAAAAAAATTTAAAACATTGATTTTATTATTAATTAAAAGAGTGCCTGCTGAATTTTCGGTATGAGGTAAATTGTTATAATTAAAGAAAATATATGATTGCTTATCAATTATAAAATTAGTTTCATAAAATCCAAAACAATAATTATAAGCTGCTGCATTCTTAACTATACTTTTTTTTAGATTTTGTATAACTATGCTAGAATAAGTTTTTCTAATCTGATCATTAGTTTTAGCATATTTTACCTTATTCCATACATGTATTGCACATATATAATAATTAATGAAAGTATGTGGAAATTGTAATTTTATATCATTTTTTAAATAATATACTTTTTCTCTATGTTGTAAATCTTTTTCCTCTGTTAAAATTATATCTTCTTTATTGCATATAAACATATCTGGGGTACAAATAGAAAAGTTGGGGTTAATTTTACACATATTCAGCATTCTAGGAGGATAAAAATTCTCTATATTATGTGCAATATTTTTTCCAAGATTATACATAATTGTAGAAATTTGATGAGCTGGATCTGGATGCGATAAATAAAAATAATGGATATTTTTATTTATATAAAAGTCATGAACACTTATAAAATTAAATCCGTATTTTTGACAACATTGTTTGTGTGCAGAATGAATAATATTGGCGAGTTTATTATGTTGATTAAAAAAATGTTGTTCAAATAATAATAAATCAACTACTTTGATATTTAAAAAAAATAATTCCTCAAATAACCAGTTAATATTTCTATAAGACTGCTCAATAGTCATATTTTGACAGATAACTTCATATAAATCTACTATATTAGTTTCCACAATTATTAAATCAGCTTCTTTGATTATTTTAATATTTTCTTGCTTATGTAATGTATATATTTTCGATAATGCAGAACTTCCACCTAAAGACAAATTATACAATGTGATATTTTCTTGCCTTAAGCCAAGTTGCAAACCATTAAAAACCAACGAATTGCTTGCGCCCAATAAAACAATTTTTTTCATAAATAATTCCTTAAATATTATAATTTATTTTTTAATTTTTAAAATTAATTTAGTTTATAGAATTATTGCCATCATCAAGCAAAACTACATTTTTATTGTTCATTTTTAAACCTTTCATAATCACTAGGCACACCAATATCTATAAAATAATCATTAAAAATTTCAGCTCTAGTCTTTAATTTTTCACAATTTTCTTGTAAAAACTCTTCAAAAGAAAATTTTTTCTCTAAATCAAATTCATTAAAAATATCTTTAGTTAAAAGATAAATTCCACCATTGATTAAACTTTGCTTTTTAAATATTTTTTCCTCAAAAGAAATCACAAAACCTTGCTCATTAACATTTACTGTGCCATATCTATCAAAATCATTCATTTGTTTTAAAGCAAGGCAAATTTTACTTCCATTTAGCTTTAATTTGCTTAAATCTATGCCAAAAAAAGTATCGCCATTTAAAACATAAACTTCATTTTTTATAAATTTCAAAGCCTCTTTTATAGCTCCACCCGTTCCTAGAGGCTCTTTTTCTATACCGTATTTTATTTTTATGCCTAAAAACTCATCTTTAAAATACTCTTTTATCACTTCATATTTGTATGATACCGCTAAGATAACTTCTTTTATGCCTTGCTTTTTAAGATACTCAAAAATAAATTCTAAAAAAGGCTTATCATTTATCGGTGCCATAGGCTTTGGAATGTCTTTTATAACACTTTTAAGCCTTGTTCCTAAGCCGCCACAAAGTATTATTGCTTGCAAGAAAAACCTTTGCCGAAAAGCTCTTCTTCAACGATAGCACAAATAATATGTCCTATTAAAATATGTGCTTCCTGAATTCTTGGAGTGCAAGTTGAAGGCACTTTGATACAATAATCACAAAGCTCATTCATAGCCCCGCCATTAGCTCCGCTTAAGCCTATGCTTATGATTTCTTTTTGCTTGCAAAGCTCTAAAGCCTTTAAAATATTTTTACTATTTCCACTTGTAGAAATTCCTATAAAAACATCTCCCTTAACTCCTTGAGCTTGCACTTGTCTTGCAAACAAATTTTCATAACCATAATCATTGCTAATAGCAGTTAATATACTCGTGTCCGTTGAAAGTGCAATACTTGCGATCCCTGGTCTATCAAAATAAAATCTACTTACAAATTCCCCTGCAATATGCTGTGCATCTGCTGCGCTACCACCATTTCCTGCAAGTAAAGTTTTGTTACCATTTTTATAAGCTTTTATGACTTCTAATGAAGCATTCTTAATAAGAGTTATTAAATTCTCATCTTTTAAAATTTGCTCTTTTGCTAAAATAGAATCTGTAAAATGTTCTTTTATATAGGAATTTAAATTCTCCATGATTTAACCCCCTCTTTTGTAAATGAAAAATCTTGCACATAACCTTGCTCTTTGCTTAAAGCTTTGATTAAGTTGTATTTTTTTGTAGGATCCACAAAGAAAAACATAAATCCACCTGCTCCTGCTCCACTAGTTTTGCCACTATAAGCTCCATTATCTATAGCTAGTTTATAAATTCTTTCAAGCTCATCATTGCTAACGATTTCTGAAATGATTTTTTTTGACTGCCAAGACTTGCCTAAAATTTTCGCCAAAGTATCAAAATCCGCCTTAAATAAAGCTTCTTTCATCTTTATAGCATCTTGTTTTATAGCGTGCATAGCTTCAAGGGATTTTTCATCTCCGAGCTTTCCTTTTTTATGCTCTTCTATATCTTTTGCTTCTCTTGTGATATTTGTAAAATAAAGCACAATTCTAGCTTCAAGCTCACTAGCTATCCAGTTTTTAATACGCAAAGGATTAACAATGACTCTTTTATTGTTATAAAATTCCATAAAATTAA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Protein sequences of DBSCAN-SWA_4 >LR134497|1516261:1526502|1520152_1520758_-|VEI83554.1|DBSCAN-SWA MENLNSYIKEHFTDSILAKEQILKDENLITLIKNASLEVIKAYKNGNKTLLAGNGGSAADAQHIAGEFVSRFYFDRPGIASIALSTDTSILTAISNDYGYENLFARQVQAQGVKGDVFIGISTSGNSKNILKALELCKQKEIISIGLSGANGGAMNELCDYCIKVPSTCTPRIQEAHILIGHIICAIVEEELFGKGFSCKQ >LR134497|1516261:1526502|1522801_1523842_-|VEI83557.1|DBSCAN-SWA MLKDSKIYIAGHGGTLGKTLYNTLIDEGFNNIIVKTRKELDLVDQKAVTDFFAKEKPEYVFLCAAKLDTLGLFTPADVIYENSVLQANIIHSSYQNNVKKLVFYGSAWAYPQKAINPIKEENLLDGKLDLKAIAYGLPKIIGTKMCESYNLQYGTNFITLYLANLYGETTEFDLQKAKVLPALLRKFHLAKLLDENKIDEVLKDLQMNSLEQAMEYLQKFGVSKDSVEIWGGGSVIREFIHAKDLADASIYVMKNIDFKDIVSSNEPHFNVGSGEFLSIKELAFLIKNIVGFKGEIMFNNSKPDSTMDRMLDSSRLQNLGWKAKIKLEDGIKMMYEWYLKEQNIRQ >LR134497|1516261:1526502|1525031_1525652_-|VEI83559.1|DBSCAN-SWA MSNIDAKALSLGVSDSSPWDLEMAQRGFKVIEYDASIEKCPYSHENIIFHKKFIGNINNENTITLAQALKDNNLDESRPNILQCDIENCEWDMLENIDISILNKYFSQVIFEFHGCNPEEQDGVEKRISLLKKLNEYFIPIHTHLNNHGKIFYSKGLFFSTTLEVSYLRRNELNLMQGLHYRKECGNLQNLDFPVWPSNPEIPLRF >LR134497|1516261:1526502|1517625_1519407_-|VEI83552.1|DBSCAN-SWA MKKIVLLGASNSLVFNGLQLGLRQENITLYNLSLGGSSALSKIYTLHKQENIKIIKEADLIIVETNIVDLYEVICQNMTIEQSYRNINWLFEELFFLNIKVVDLLLFEQHFFNQHNKLANIIHSAHKQCCQKYGFNFISVHDFYINKNIHYFYLSHPDPAHQISTIMYNLGKNIAHNIENFYPPRMLNMCKINPNFSICTPDMFICNKEDIILTEEKDLQHREKVYYLKNDIKLQFPHTFINYYICAIHVWNKVKYAKTNDQIRKTYSSIVIQNLKKSIVKNAAAYNYCFGFYETNFIIDKQSYIFFNYNNLPHTENSAGTLLINNKINVLNFFGVSAFLLADQNGKFDFSEEIKLIQNENITIDKEYDFTYLVPPVEDYKTAIEEYNFRMDPVKLAPLQKQIKEKDNIIFTLNQEKTTLQNELNSFPIKKQRLKLANLEQDLIIKKLESKKLAKSLGIKMSIINPKITFIQANSAKARIQNHLSYKLGQALIANSKSILGYIRMPYVLSYIKDKHKFEQKAYEEKIKENPNLALPPLETYPDYNEALKEKECFTYKLGEALIQANKNWYGGGYIKFIFKDVPRLKREFGKKG >LR134497|1516261:1526502|1525956_1526502_-|VEI83561.1|DBSCAN-SWA MAIEFNIQESKILKGVYIITPNKFRDLRGEIWTAFTSKAVDKLLPNGLKFIHDKFIHSKHNVIRGIHGDVKTYKLATCVYGEIHQVVVDCRKDSPTYLKYEKFIINQDNQQIILVPAGFGNAHYVTSESAVYYYKCAYKGDYVDAPDQFTYAWNDERIGIDWPTNSPILSERDILATKNKG >LR134497|1516261:1526502|1525648_1525954_-|VEI83560.1|DBSCAN-SWA MEKLLQELNVNIKVGNQLSYQILMSNIISNLDIDKRDKEILFLLLQDRDRNYIRINNNEQCYRNIVNYLNLIRPLELPLYDLLRIGGNGDGGYVMYNGGGI >LR134497|1516261:1526502|1521761_1522793_-|VEI83556.1|DBSCAN-SWA MKKTALITGFTGQVGSQMADFLLENTDYDVIGMMRWQEPMDNIYHLSDRINKKDRISIFYADLNDYSSLQKLFESQRPDAIFHLAAQSYPKTSFDIPIETLQTNIIGTANILENIRILKAKDGYDPVVHICSSSEVYGKAKAGVKLNEETAFHGASPYSISKIGTDYLGRFYGEAYNIRTFVTRMGTHSGPRRSDVFFESTVAKQIALIEAGYQEPVIKVGNLSSVRTFQDARDAIRAYYLLSLESEKGKVPCGEAFNIAGEEAFKLPEVIDILLGFSIRKDIKVEQDEQRLRPIDADYQMFDNTKIKSFINWKPEIAARKMFEDLLNHWRDEIKKGRIPLNR >LR134497|1516261:1526502|1520745_1521765_-|VEI83555.1|DBSCAN-SWA MKTIRTQTPLRLGLAGGGTDINLYCDKYTGYVLNATISLYIHCTLIEREDGKIIFDSPDTNSYSEYESKEFLGDDGKLDIFKSIYNRIVKDFTKKPLSFSLHTYSDVPSGSGLGGSSTLVVGVIKAFAEWLNLPLGEYEIAKLAYEIEREDLGIVGGAQDQYAATFGGFNFMEFYNNKRVIVNPLRIKNWIASELEARIVLYFTNITREAKDIEEHKKGKLGDEKSLEAMHAIKQDAIKMKEALFKADFDTLAKILGKSWQSKKIISEIVSNDELERIYKLAIDNGAYSGKTSGAGAGGFMFFFVDPTKKYNLIKALSKEQGYVQDFSFTKEGVKSWRI >LR134497|1516261:1526502|1519499_1520165_-|VEI83553.1|DBSCAN-SWA MQAIILCGGLGTRLKSVIKDIPKPMAPINDKPFLEFIFEYLKKQGIKEVILAVSYKYEVIKEYFKDEFLGIKIKYGIEKEPLGTGGAIKEALKFIKNEVYVLNGDTFFGIDLSKLKLNGSKICLALKQMNDFDRYGTVNVNEQGFVISFEEKIFKKQSLINGGIYLLTKDIFNEFDLEKKFSFEEFLQENCEKLKTRAEIFNDYFIDIGVPSDYERFKNEQ >LR134497|1516261:1526502|1523834_1525022_-|VEI83558.1|DBSCAN-SWA MQKDSKIYIAGHSGLVGSAILNELKQQGYKNLVFKTHFELDLTNQKAVADFFEREKPEYVILAAAKAGGILANNTYRADFIYQNLMIECNVIHNAYLHKVKKLLFIASTTVYPKNATLPTSEEQMLSGDLEYTNKPYAIAKISGLMLCESYNLQYNTNFIAITPTNLYGNNDKFDLEKSHVLPGILRKMHLAKLLNEKRYEDLLNDLKFDSIEEAKNYLKKFGVDKDNVEIWGSGKPTREFLHSQDLANACLFIMNNIDFKDLKSDNTEIINTHLNIGPHKNITIKELAELIKNIVGFKGNLVFNLNRPDGAMQKFTDCSKIHSLGWKHKIDLEKGIQMMYEWYKNNQETQNNNNSSIRWGGGLNFEYFIFSNIQSFYTNNIYDFANSTKRVCNA >LR134497|1516261:1526502|1516261_1517602_+|VEI83551.1|DBSCAN-SWA MDKFKNIFLNKVFNKNQEQYALIYEEQKYTYNDLYNNIINKINLLTKLKDINIVGITGDYDFESISLFLACIELNKIIIPFINESEIDNKLAEVNCDILFKNNQYELQKKYCNNHDLIQKLIDDNKPGLILFSSGSTGKPKAMVHNLDKILNAYLNKKSKKLNILLFLMFDHIGGLNTLFNCLSMNACAIAIKERKNIEALAQTIEKYQISLLPASPSLLSLMLVANVIEKYNLSSLKIISYGTEKMPEALLVKLKQTFPKVKFHQTFGTSEVGIAQTKSFGNYFKLENIAYKIINNELFLKSNMQSLGYLNADNSVFTNDGYFATGDLVEVINENGEEYIKIIGRNKEVINVGGEKVLPQEVEGILMQIPFIQDCLVYGQNNPLTGQSVCVKIVLEQNENPANLEAKKEIRLFCKDKLASYKIPTKVEIVQKLEISERFKKIRNS |
11 | Tupanvirus(25.0%) | NA | NA |
Homologous phage analysis in the prophage regionThe bacterium proteins that are colored denote the protein is present at specific phage-related keywords (such as 'capsid', 'head', 'integrase', 'plate', 'tail', 'fiber', 'coat', 'transposase', 'portal', 'terminase', 'protease' or 'lysin' and 'tRNA')
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Acr ID | Acr position | Acr size | Homology with known anti | Neighbor HTH/AcRanker | Neighbor Aca | In prophage | Protospacer in prophage |
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